Merge openmpi (4.1.2-1) import into refs/heads/workingbranch

ia64

Gbp-Pq: Name ia64.patch

Turn off warning that openfabric is not available

Last-Updated: 2021-09-02
Forwarded: not-needed

because it breaks some overlying layers/appications in Debian.
Also exclude openfabric/openib by default.
See: #979041

Gbp-Pq: Name no-warning-unused.patch

fix-underlinking

Desciption: Fix underlinking
  Prevents symbol lookup error: ../openmpi4/mca_mtl_ofi.so:
  undefined symbol: fi_dupinfo when linked with --as-needed
Bug-Debian: https://bugs.debian.org/899104
Last-Update: 2018-05-23

Gbp-Pq: Name fix-underlinking.patch

Makefile.ompi-rules: don't set silent building

Gbp-Pq: Name verbose-ompi-rules.patch

fix test-suite to build on ppc64el

Origin: Vendor
Bug-Debian: https://bugs.debian.org/cgi-bin/bugreport.cgi?bug=848218
Forwarded: no
Last-Update: 2016-12-15

Test suite hangs on ppc64el. This is due to a bug in test/class/opal_fifo.c.
thread_test() must end with pthread_exit(NULL), not return NULL.
Last-Update: 2016-12-15
Gbp-Pq: Name opal_fifo.patch

Support for the HPPA architecture

Bug-Origin: https://bugs.debian.org/cgi-bin/bugreport.cgi?bug=776730
Last-Updated: 2016-09-04
Forwarded: no

Gbp-Pq: Name hppa.patch

Change install libdir to openmpi3

Last-Updated: 2019-03-09
Forwarded: no

This is needed to ensure that libopenmpi2, libopenmpi3 do not collide.

Gbp-Pq: Name libdir.patch

Fix build problems on hurd-i386

Forwarded: partially
Last-Update: 2018-10-24

This patch allows Open MPI to build on Debian GNU/HURD.

Also, the memory:linux MCA component is disabled, since its use of POSIX API
in malloc hooks called very early at startup causes troubles.

Also changes by Samuel Thibault <sthibault@debian.org>
See bugs.debian.org/846965

Gbp-Pq: Name build_hurd

Fix problems in manpages

Forwarded: no
Last-Update: 2018-04-08

In some man page headers, a macro (-*-) is used which makes lintian
 choke and probably should not be there anyway.

Gbp-Pq: Name manpage_macros

mpifort

===================================================================

Gbp-Pq: Name mpifort.patch

Enable non-gfortran compilation

Last-Updated: 2020-01-13
Forwarded: no

Gbp-Pq: Name pkg-config.patch

openmpi (4.1.2-1) unstable; urgency=medium

  * Nww upstream release

[dgit import unpatched openmpi 4.1.2-1]

Import openmpi_4.1.2.orig.tar.xz

[dgit import orig openmpi_4.1.2.orig.tar.xz]

Import openmpi_4.1.2-1.debian.tar.xz

[dgit import tarball openmpi 4.1.2-1 openmpi_4.1.2-1.debian.tar.xz]

Merge openmpi (4.1.2~rc1-5) import into refs/heads/workingbranch

ia64

Gbp-Pq: Name ia64.patch

Turn off warning that openfabric is not available

Last-Updated: 2021-09-02
Forwarded: not-needed

because it breaks some overlying layers/appications in Debian.
Also exclude openfabric/openib by default.
See: #979041

Gbp-Pq: Name no-warning-unused.patch

fix-underlinking

Desciption: Fix underlinking
  Prevents symbol lookup error: ../openmpi4/mca_mtl_ofi.so:
  undefined symbol: fi_dupinfo when linked with --as-needed
Bug-Debian: https://bugs.debian.org/899104
Last-Update: 2018-05-23

Gbp-Pq: Name fix-underlinking.patch

Makefile.ompi-rules: don't set silent building

Gbp-Pq: Name verbose-ompi-rules.patch

fix test-suite to build on ppc64el

Origin: Vendor
Bug-Debian: https://bugs.debian.org/cgi-bin/bugreport.cgi?bug=848218
Forwarded: no
Last-Update: 2016-12-15

Test suite hangs on ppc64el. This is due to a bug in test/class/opal_fifo.c.
thread_test() must end with pthread_exit(NULL), not return NULL.
Last-Update: 2016-12-15
Gbp-Pq: Name opal_fifo.patch

Support for the HPPA architecture

Bug-Origin: https://bugs.debian.org/cgi-bin/bugreport.cgi?bug=776730
Last-Updated: 2016-09-04
Forwarded: no

Gbp-Pq: Name hppa.patch

Change install libdir to openmpi3

Last-Updated: 2019-03-09
Forwarded: no

This is needed to ensure that libopenmpi2, libopenmpi3 do not collide.

Gbp-Pq: Name libdir.patch

Fix build problems on hurd-i386

Forwarded: partially
Last-Update: 2018-10-24

This patch allows Open MPI to build on Debian GNU/HURD.

Also, the memory:linux MCA component is disabled, since its use of POSIX API
in malloc hooks called very early at startup causes troubles.

Also changes by Samuel Thibault <sthibault@debian.org>
See bugs.debian.org/846965

Gbp-Pq: Name build_hurd

Fix problems in manpages

Forwarded: no
Last-Update: 2018-04-08

In some man page headers, a macro (-*-) is used which makes lintian
 choke and probably should not be there anyway.

Gbp-Pq: Name manpage_macros

mpifort

===================================================================

Gbp-Pq: Name mpifort.patch

Enable non-gfortran compilation

Last-Updated: 2020-01-13
Forwarded: no

Gbp-Pq: Name pkg-config.patch

openmpi (4.1.2~rc1-5) unstable; urgency=medium

  * Drop unused and broken link to libopen-orted-mpir.so

[dgit import unpatched openmpi 4.1.2~rc1-5]

Import openmpi_4.1.2~rc1-5.debian.tar.xz

[dgit import tarball openmpi 4.1.2~rc1-5 openmpi_4.1.2~rc1-5.debian.tar.xz]

Merge openmpi (4.1.2~rc1-4) import into refs/heads/workingbranch

ia64

Gbp-Pq: Name ia64.patch

Turn off warning that openfabric is not available

Last-Updated: 2021-09-02
Forwarded: not-needed

because it breaks some overlying layers/appications in Debian.
Also exclude openfabric/openib by default.
See: #979041

Gbp-Pq: Name no-warning-unused.patch

fix-underlinking

Desciption: Fix underlinking
  Prevents symbol lookup error: ../openmpi4/mca_mtl_ofi.so:
  undefined symbol: fi_dupinfo when linked with --as-needed
Bug-Debian: https://bugs.debian.org/899104
Last-Update: 2018-05-23

Gbp-Pq: Name fix-underlinking.patch

Makefile.ompi-rules: don't set silent building

Gbp-Pq: Name verbose-ompi-rules.patch

fix test-suite to build on ppc64el

Origin: Vendor
Bug-Debian: https://bugs.debian.org/cgi-bin/bugreport.cgi?bug=848218
Forwarded: no
Last-Update: 2016-12-15

Test suite hangs on ppc64el. This is due to a bug in test/class/opal_fifo.c.
thread_test() must end with pthread_exit(NULL), not return NULL.
Last-Update: 2016-12-15
Gbp-Pq: Name opal_fifo.patch

Support for the HPPA architecture

Bug-Origin: https://bugs.debian.org/cgi-bin/bugreport.cgi?bug=776730
Last-Updated: 2016-09-04
Forwarded: no

Gbp-Pq: Name hppa.patch

Change install libdir to openmpi3

Last-Updated: 2019-03-09
Forwarded: no

This is needed to ensure that libopenmpi2, libopenmpi3 do not collide.

Gbp-Pq: Name libdir.patch

Fix build problems on hurd-i386

Forwarded: partially
Last-Update: 2018-10-24

This patch allows Open MPI to build on Debian GNU/HURD.

Also, the memory:linux MCA component is disabled, since its use of POSIX API
in malloc hooks called very early at startup causes troubles.

Also changes by Samuel Thibault <sthibault@debian.org>
See bugs.debian.org/846965

Gbp-Pq: Name build_hurd

Fix problems in manpages

Forwarded: no
Last-Update: 2018-04-08

In some man page headers, a macro (-*-) is used which makes lintian
 choke and probably should not be there anyway.

Gbp-Pq: Name manpage_macros

mpifort

===================================================================

Gbp-Pq: Name mpifort.patch

Enable non-gfortran compilation

Last-Updated: 2020-01-13
Forwarded: no

Gbp-Pq: Name pkg-config.patch

openmpi (4.1.2~rc1-4) unstable; urgency=medium

  * Move java docs to openmpi-doc package
  * Add Breaks/Replaces for file move libopenmpi-dev -> openmpi-doc
  * Delete obsolete breaks/replaces

[dgit import unpatched openmpi 4.1.2~rc1-4]

Import openmpi_4.1.2~rc1-4.debian.tar.xz

[dgit import tarball openmpi 4.1.2~rc1-4 openmpi_4.1.2~rc1-4.debian.tar.xz]

Merge openmpi (4.1.2~rc1-3) import into refs/heads/workingbranch

ia64

Gbp-Pq: Name ia64.patch

Turn off warning that openfabric is not available

Last-Updated: 2021-09-02
Forwarded: not-needed

because it breaks some overlying layers/appications in Debian.
Also exclude openfabric/openib by default.
See: #979041

Gbp-Pq: Name no-warning-unused.patch

fix-underlinking

Desciption: Fix underlinking
  Prevents symbol lookup error: ../openmpi4/mca_mtl_ofi.so:
  undefined symbol: fi_dupinfo when linked with --as-needed
Bug-Debian: https://bugs.debian.org/899104
Last-Update: 2018-05-23

Gbp-Pq: Name fix-underlinking.patch

Makefile.ompi-rules: don't set silent building

Gbp-Pq: Name verbose-ompi-rules.patch

fix test-suite to build on ppc64el

Origin: Vendor
Bug-Debian: https://bugs.debian.org/cgi-bin/bugreport.cgi?bug=848218
Forwarded: no
Last-Update: 2016-12-15

Test suite hangs on ppc64el. This is due to a bug in test/class/opal_fifo.c.
thread_test() must end with pthread_exit(NULL), not return NULL.
Last-Update: 2016-12-15
Gbp-Pq: Name opal_fifo.patch

Support for the HPPA architecture

Bug-Origin: https://bugs.debian.org/cgi-bin/bugreport.cgi?bug=776730
Last-Updated: 2016-09-04
Forwarded: no

Gbp-Pq: Name hppa.patch

Change install libdir to openmpi3

Last-Updated: 2019-03-09
Forwarded: no

This is needed to ensure that libopenmpi2, libopenmpi3 do not collide.

Gbp-Pq: Name libdir.patch

Fix build problems on hurd-i386

Forwarded: partially
Last-Update: 2018-10-24

This patch allows Open MPI to build on Debian GNU/HURD.

Also, the memory:linux MCA component is disabled, since its use of POSIX API
in malloc hooks called very early at startup causes troubles.

Also changes by Samuel Thibault <sthibault@debian.org>
See bugs.debian.org/846965

Gbp-Pq: Name build_hurd

Fix problems in manpages

Forwarded: no
Last-Update: 2018-04-08

In some man page headers, a macro (-*-) is used which makes lintian
 choke and probably should not be there anyway.

Gbp-Pq: Name manpage_macros

mpifort

===================================================================

Gbp-Pq: Name mpifort.patch

Enable non-gfortran compilation

Last-Updated: 2020-01-13
Forwarded: no

Gbp-Pq: Name pkg-config.patch

openmpi (4.1.2~rc1-3) unstable; urgency=medium

  * Update versions:
    - libmca_common_ompio.so 41.29.1 ->  41.29.2
    - libmca_common_ofi.so 10.0.1 -> 10.0.2
Closes: #995150
  * Add autopkg test for unlinked shared libs
  * Add alpha, ppc64, sparc64 to the 'nojava' arch list
  * Only install javadocs via d/rules inside conditional

[dgit import unpatched openmpi 4.1.2~rc1-3]

Import openmpi_4.1.2~rc1-3.debian.tar.xz

[dgit import tarball openmpi 4.1.2~rc1-3 openmpi_4.1.2~rc1-3.debian.tar.xz]

Import openmpi_4.1.2~rc1.orig.tar.xz

[dgit import orig openmpi_4.1.2~rc1.orig.tar.xz]

Merge openmpi (4.1.1-5) import into refs/heads/workingbranch

Workaround for issue running on remote host

Last-Updated: 2021-05-13
Forwarded: not-needed

Gbp-Pq: Name pr8596.patch

Don't ship lib

Bug-Origin: https://github.com/open-mpi/ompi/pull/8892/commits/952328c3827b9d9b0b54d0a0a068d494bfef1974
Last-Updated: 2021-09-02
Forwarded: not-needed

The orted-mpir library was split to avoid global CFLAGS, which might
optimize out MPIR functionality. The library has been made a `noinst`
libtool convenience library to prevent its installation or appearance as
a  dependency of other libraries.

Gbp-Pq: Name no-ship-orted-mpir.patch

ia64

===================================================================

Gbp-Pq: Name ia64.patch

Turn off warning that openfabric is not available

Last-Updated: 2021-09-02
Forwarded: not-needed

because it breaks some overlying layers/appications in Debian.
Also exclude openfabric/openib by default.
See: #979041

Gbp-Pq: Name no-warning-unused.patch

fix-underlinking

Desciption: Fix underlinking
  Prevents symbol lookup error: ../openmpi4/mca_mtl_ofi.so:
  undefined symbol: fi_dupinfo when linked with --as-needed
Bug-Debian: https://bugs.debian.org/899104
Last-Update: 2018-05-23

Gbp-Pq: Name fix-underlinking.patch

Makefile.ompi-rules: don't set silent building

Gbp-Pq: Name verbose-ompi-rules.patch

fix test-suite to build on ppc64el

Origin: Vendor
Bug-Debian: https://bugs.debian.org/cgi-bin/bugreport.cgi?bug=848218
Forwarded: no
Last-Update: 2016-12-15

Test suite hangs on ppc64el. This is due to a bug in test/class/opal_fifo.c.
thread_test() must end with pthread_exit(NULL), not return NULL.
Last-Update: 2016-12-15
Gbp-Pq: Name opal_fifo.patch

Support for the HPPA architecture

Bug-Origin: https://bugs.debian.org/cgi-bin/bugreport.cgi?bug=776730
Last-Updated: 2016-09-04
Forwarded: no

Gbp-Pq: Name hppa.patch

Change install libdir to openmpi3

Last-Updated: 2019-03-09
Forwarded: no

This is needed to ensure that libopenmpi2, libopenmpi3 do not collide.

Gbp-Pq: Name libdir.patch

Fix build problems on hurd-i386

Forwarded: partially
Last-Update: 2018-10-24

This patch allows Open MPI to build on Debian GNU/HURD.

Also, the memory:linux MCA component is disabled, since its use of POSIX API
in malloc hooks called very early at startup causes troubles.

Also changes by Samuel Thibault <sthibault@debian.org>
See bugs.debian.org/846965

Gbp-Pq: Name build_hurd

Fix problems in manpages

Forwarded: no
Last-Update: 2018-04-08

In some man page headers, a macro (-*-) is used which makes lintian
 choke and probably should not be there anyway.

Gbp-Pq: Name manpage_macros

mpifort

===================================================================

Gbp-Pq: Name mpifort.patch

Enable non-gfortran compilation

Last-Updated: 2020-01-13
Forwarded: no

Gbp-Pq: Name pkg-config.patch

Memory leak in MPI_Allreduce when using a repeatedly created and freed MPI_Datatype

Bug-Origin: https://github.com/open-mpi/ompi/issues/8827
Last-Updated: 2021-05-10
Forwarded: not-needed

Gbp-Pq: Name pr8827.patch

openmpi (4.1.1-5) unstable; urgency=medium

  * Include pr8596.patch from 4.1.0-9 in 4.1.1

[dgit import unpatched openmpi 4.1.1-5]

Import openmpi_4.1.1-5.debian.tar.xz

[dgit import tarball openmpi 4.1.1-5 openmpi_4.1.1-5.debian.tar.xz]

Merge openmpi (4.1.0-10) import into refs/heads/workingbranch

Workaround for issue running on remote host

Last-Updated: 2021-05-13
Forwarded: not-needed

Gbp-Pq: Name pr8596.patch

Backport of grequest fix

Bug-Origin:  https://github.com/open-mpi/ompi/pull/8347
Bug-Debian: https://bugs.debian.org/cgi-bin/bugreport.cgi?bug=979480
Forwarded: not-needed
Last-Updated: 2021-01-20

Gbp-Pq: Name grequest-fix.patch

Fix external PMIx v4.x check

Bug-Origin: https://github.com/open-mpi/ompi/pull/8337
Last-Updated: 2021-01-09
Forwarded: not-needed

Gbp-Pq: Name external-pmix-fix.patch

Include missing plugin mca_op_avx.so

Bug-Origin: https://github.com/open-mpi/ompi/issues/8323
Last-Updated: 2021-01-02
Forwarded: not-needed

Gbp-Pq: Name missing-symbol.patch

ia64

===================================================================

Gbp-Pq: Name ia64.patch

Turn off warning that openfabric is not available

Last-Updated: 2021-01-21
Forwarded: not-needed

because it breaks some overlying layers/appications in Debian.
Also exclude openfabric/openib by default.

Gbp-Pq: Name no-warning-unused.patch

fix-underlinking

Desciption: Fix underlinking
  Prevents symbol lookup error: ../openmpi4/mca_mtl_ofi.so:
  undefined symbol: fi_dupinfo when linked with --as-needed
Bug-Debian: https://bugs.debian.org/899104
Last-Update: 2018-05-23

Gbp-Pq: Name fix-underlinking.patch

Makefile.ompi-rules: don't set silent building

Gbp-Pq: Name verbose-ompi-rules.patch

fix test-suite to build on ppc64el

Origin: Vendor
Bug-Debian: https://bugs.debian.org/cgi-bin/bugreport.cgi?bug=848218
Forwarded: no
Last-Update: 2016-12-15

Test suite hangs on ppc64el. This is due to a bug in test/class/opal_fifo.c.
thread_test() must end with pthread_exit(NULL), not return NULL.
Last-Update: 2016-12-15
Gbp-Pq: Name opal_fifo.patch

Support for the HPPA architecture

Bug-Origin: https://bugs.debian.org/cgi-bin/bugreport.cgi?bug=776730
Last-Updated: 2016-09-04
Forwarded: no

Gbp-Pq: Name hppa.patch

Change install libdir to openmpi3

Last-Updated: 2019-03-09
Forwarded: no

This is needed to ensure that libopenmpi2, libopenmpi3 do not collide.

Gbp-Pq: Name libdir.patch

Fix build problems on hurd-i386

Forwarded: partially
Last-Update: 2018-10-24

This patch allows Open MPI to build on Debian GNU/HURD.

Also, the memory:linux MCA component is disabled, since its use of POSIX API
in malloc hooks called very early at startup causes troubles.

Also changes by Samuel Thibault <sthibault@debian.org>
See bugs.debian.org/846965

Gbp-Pq: Name build_hurd

Fix problems in manpages

Forwarded: no
Last-Update: 2018-04-08

In some man page headers, a macro (-*-) is used which makes lintian
 choke and probably should not be there anyway.

Gbp-Pq: Name manpage_macros

mpifort

===================================================================

Gbp-Pq: Name mpifort.patch

Enable non-gfortran compilation

Last-Updated: 2020-01-13
Forwarded: no

Gbp-Pq: Name pkg-config.patch

Memory leak in MPI_Allreduce when using a repeatedly created and freed MPI_Datatype

Bug-Origin: https://github.com/open-mpi/ompi/issues/8827
Last-Updated: 2021-05-10
Forwarded: not-needed

Gbp-Pq: Name pr8827.patch

openmpi (4.1.0-10) unstable; urgency=medium

  * Rebuild against ucx 1.10.1~rc1+really.1.10.0-1 for buster

[dgit import unpatched openmpi 4.1.0-10]

Import openmpi_4.1.0-10.debian.tar.xz

[dgit import tarball openmpi 4.1.0-10 openmpi_4.1.0-10.debian.tar.xz]

Import openmpi_4.1.1.orig.tar.xz

[dgit import orig openmpi_4.1.1.orig.tar.xz]

Merge openmpi (4.1.0-8) import into refs/heads/workingbranch

Backport of grequest fix

Bug-Origin:  https://github.com/open-mpi/ompi/pull/8347
Bug-Debian: https://bugs.debian.org/cgi-bin/bugreport.cgi?bug=979480
Forwarded: not-needed
Last-Updated: 2021-01-20

Gbp-Pq: Name grequest-fix.patch

Fix external PMIx v4.x check

Bug-Origin: https://github.com/open-mpi/ompi/pull/8337
Last-Updated: 2021-01-09
Forwarded: not-needed

Gbp-Pq: Name external-pmix-fix.patch

Include missing plugin mca_op_avx.so

Bug-Origin: https://github.com/open-mpi/ompi/issues/8323
Last-Updated: 2021-01-02
Forwarded: not-needed

Gbp-Pq: Name missing-symbol.patch

ia64

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Gbp-Pq: Name ia64.patch