fix hardcoded origin name in checkAdjustedClone

init: Fix a crash when the repo's was cloned from a repo that had an
adjusted branch checked out, and the origin remote is not named "origin".

The only other hardcoding of the name of origin is in:

- Upgrade.V2, which can be ignored probably
- Annex.Branch, which doesn't fail if it has some other name, but just
  doesn't set up the git-annex branch with quite as linear a history in
  that case.

Merge branch 'master' of ssh://git-annex.branchable.com

remove part of comment that is no longer relevant

crippledfilesystem override not needed

Added a comment

bug: init crash with remote name other than "origin"

Merge branch 'master' of ssh://git-annex.branchable.com

directory CoW on export

Completing Cow support for directory.

directory CoW on import

Added a comment

directory CoW on store

Not for exports to directory yet though.

directory CoW on retrieve

directory: When cp supports reflinks, use it when getting content from a
directory special remote.

Not yet for imports from directory though, and not for store.

Note that, when it's chunked, using cp --reflink would not speed it up, and
when reflink was not supported, would unnecessarily write the chunk to a
file before reading it back in. So, only using a fileRetriever in the
NoChunks case is necessary to keep chunking fast.

fileCopier is told not to verify, because the special remote interface
does not yet support verification in passing. AFAICS, fileCopies can
never return False when not verifying so the added giveup should never
actually happen.

Added a comment: thanks

comment

split out Annex.CopyFile

Goal is to use it in Remote.Directory, but also it's nice to shrink Remote.Git.

Added a comment: comment to joey response on cp --reflink workaround

tag confirmed

note

correction

comment

update

comment

fsck: avoid redundant checksum when transfer is Verified

When downloading content from a remote, if the content is able to be
verified during the transfer, skip checksumming it a second time.

Note that in this case, the fsck output does not include "(checksum)"
which it does when the checksumming is done separately from the download.

This commit was sponsored by Brock Spratlen on Patreon.

Merge branch 'master' of ssh://git-annex.branchable.com

is importtree CoW from directory?

one-off unlocked annex files that go against largefiles configuration

comment

fix comment location

Merge branch 'master' of ssh://git-annex.branchable.com

comment

Added a comment: hybrid encryption

Added a comment: Can I manually decrypt my files?

forget: Preserve currently exported trees

Avoiding problems with exporttree remotes in some unusual circumstances.

This commit was sponsored by Brett Eisenberg on Patreon.

thoughts

split out Logs.Export.Pure

This will allow Annex.Branch to use it, in transitions code.

This commit was sponsored by Luke Shumaker on Patreon.

comment

idea

bug report

change back to git-remote-gcrypt 1.4 url forms, with a note that that version is needed

Merge branch 'master' of ssh://git-annex.branchable.com

update

fix URI for rsync over ssh as per woffs' suggestion in #git-annex

fix URI for rsync over ssh as per woffs' suggestion in #git-annex

update

comment and analysis

Added a comment

removed

removed

Added a comment: Waiting as well

Added a comment: Waiting as well

Added a comment: Waiting as well

Added a comment

Added a comment: un-adding annexed files

Added a comment: un-adding annexed files

Added a comment

Added a comment: lockContent for special remotes w/o changing the protocol

Added a comment: un-adding a key

Added a comment

Added a comment

Added a comment

add 2 missing man page files to cabal file

Only useful when using cabal install to install it with man pages.
It's hard to remember to list new man page files here.

diffdriver: Support unlocked files

Merge branch 'master' of ssh://git-annex.branchable.com

comment

note on the order

initial report on diff driver behavior on unlocked files

comment

comment typo

comment

Added a comment: Workaround

fix url

Merge branch 'master' of /home/b-git-annex/source

Added a comment: running untrusted code

remove webapp debug check box

It can't enable or disable debug output, after recent changes, w/o
restarting git-annex, or perhaps messing with the Annex monad's
internals. Doesn't seem worth supporting it any longer.

comment and close, open related todo

fastDebug Annex.Branch reads and writes

Reads of cached data are not debugged, only cache misses are, and since
many commands pre-cache location log data, this avoids a slew of
fastDebug calls when running commands such as git-annex get --from

fix fastDebug to check if debugging is actually enabled

Had to add to AnnexRead an indication of whether debugging is enabled.

Could have just made setupConsole not install a debug output action that
outputs, and have enableDebug be what installs that, but then in the
common case where there is no debug selector, and so all debug output is
selected, it would run the debug output action every time, which entails
an IORef access. Which would make fastDebug too slow..

use fastDebug everywhere it can be used

None of these are likely to yeild a noticable speedup though.

implement fastDebug

Most of the changes here involve global option parsing: GlobalSetter
changed so it can both run an Annex action to set state, but can also
change the AnnexRead value, which is immutable once the Annex monad is
running.

That allowed a debugselector value to be added to AnnexRead, seeded
from the git config. The --debugfilter option's GlobalSetter then updates
the AnnexRead.

This improved GlobalSetter can later be used to move more stuff to
AnnexRead. Things that don't involve a git config will be easier to
move, and probably a *lot* of things can be moved eventually.

fastDebug, while implemented, is not used anywhere yet. But it should be
fast..

semigroup and monoid instances for DebugSelector

mempty is NoDebugSelector, so it does not default to matching
everything, or nothing, in a chain like foo <> mempty

refactoring

Moving argument parsing to before Annex monad code
is a first step toward letting argument parsing set
AnnexRead values, which are immutable inside that monad.

comment

Merge branch 'master' of ssh://git-annex.branchable.com

added --debugfilter (and annex.debugfilter)

switch from hslogger to purpose-built Utility.Debug

This uses a DebugSelector, rather than debug levels, which will allow
for a later option like --debug-from=Process to only
see debuging about running processes.

The module name that contains the thing being debugged is used as the
DebugSelector (in most cases; does not need to be a hard and fast rule).
Debug calls were changed to add that. hslogger did not display
that first parameter to debugM, but the DebugSelector does get
displayed.

Also fastDebug will allow doing debugging in places that are used in
tight loops, with the DebugSelector coming from the Annex Reader
essentially for free. Not done yet.

update

Added a comment: still an issue in Ubuntu Focal

removed

Added a comment: still an issue in focal

start splitting out readonly values from AnnexState

Values in AnnexRead can be read more efficiently, without MVar overhead.
Only a few things have been moved into there, and the performance
increase so far is not likely to be noticable.

This is groundwork for putting more stuff in there, particularly a value
that indicates if debugging is enabled.

The obvious next step is to change option parsing to not run in the
Annex monad to set values in AnnexState, and instead return a pure value
that gets stored in AnnexRead.

comments

Avoid excess commits to the git-annex branch when stall detection is enabled

When git-annex transferrer started up, and the journal contained something,
it would commit it to the git-annex branch. This caused excess commits to
the branch, in cases where normally several changes would be journalled and
committed together. That generated some excess git objects and was also
just noisy on stdout.

Since transferrer uses enableInteractiveBranchAccess, it does not need to
commit journalled changes, since the optimisation that avoids checking
the journal when reading from the branch is disabled for processes that
call that.

This commit was sponsored by Svenne Krap on Patreon.

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