improve wording

squelch protocol error on shutdown

Update working tree files fully atomically

This avoids commit churn by the assistant when eg,
replacing a file with a symlink.

But, just as importantly, it prevents the working tree being left with a
deleted file if git-annex, or perhaps the whole system, crashes at the
wrong time.

(It also probably avoids confusing displays in file managers.)

optimise last commit

Rather than re-adding a direct mode file unnecessarily when it's not
changed, just re-stage the symlink.

assistant: Fix bug that could cause direct mode files to be unstaged from git.

My test case for this bug is to have the assistant running and syncing to
a remote, and create a file in the annex. Then at the command line run
git annex drop. The assistant sees that the file is gone, sees it's a wanted
file, and downloads it from the remote.

With a directory special remote and a small file, I was seeing around 1
time in 3, a race where the file got unstaged from git after it got
downloaded.

Looking at what direct mode content managing code does in this case, it
deletes the symlink, and then adds the file content back. It would be
possible, sometimes, to avoid removing the symlink and do this atomically.
And I probably should.. but in some cases, particularly where the file
needs to be run through `cp` (multiple direct mode files with same
content), there's no way to atomically replace the symlink with the
content.

Anyway, the bug turns out to be something that the watcher does right for
indirect mode, but not for direct mode. When it got an add event, it
checked to see if this was a new file, or one we've already added. In the
latter case, no add event was queued. But that means that only the rm event
is queued, and so it unstages the file.

Fixed by queueing an add event even when the file is already in git.

Tested by running hundreds of drops in a loop; file remained staged.

clarification

blog for the part of the day I didn't waste writing a lolcat filter

Added a comment

Merge branch 'master' of ssh://git-annex.branchable.com

drop --auto: Fix bug that prevented dropping files from untrusted repositories.

This is a corresponding bug to the one I fixed yesterday in the assistant.

Added a comment: Ask for more money :-)

fix up some weird write-in choices

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Added a comment

poll vote (get webapp working on Android)

poll vote (direct mode (aka real files instead of symlinks))

poll vote (optimize file transfer using rsync in the case of changing files)

poll vote (direct mode (aka real files instead of symlinks))

poll vote (direct mode (aka real files instead of symlinks))

poll vote (direct mode (aka real files instead of symlinks))

poll vote (upload and download rate limiting)

poll vote (encrypted git remotes using git-remote-gcrypt)

poll vote (encrypted git remotes using git-remote-gcrypt)

poll vote (don't work on features, work on making it easier to install and use)

poll vote (upload and download rate limiting)

poll vote (upload and download rate limiting)

poll vote (get webapp working on Android)

poll vote (optimize file transfer using rsync in the case of changing files)

poll vote (start windows port now)

poll vote (don't work on features, work on making it easier to install and use)

Added a comment: don't work on features option

poll vote (get webapp working on Android)

poll vote (start windows port now)

poll vote (Handle duplicate files)

poll vote (start windows port now)

poll vote (encrypted git remotes using git-remote-gcrypt)

poll vote (get webapp working on Android)

tweak formatting :)

rename forum/Stupid_mistake:_recoverable__63__.txt to forum/Stupid_mistake:_recoverable__63__.mdwn

poll vote (get webapp working on Android)

poll vote (direct mode (aka real files instead of symlinks))

poll vote (don't work on features, work on making it easier to install and use)

poll vote (upload and download rate limiting)

Better txt formatting

poll vote (start windows port now)

Asked a new questioin

poll vote (get webapp working on Android)

poll vote (don't work on features, work on making it easier to install and use)

poll vote (don't work on features, work on making it easier to install and use)

poll vote (direct mode (aka real files instead of symlinks))

Added a comment: Duplicate files

poll vote (encrypted git remotes using git-remote-gcrypt)

poll vote (Waiting for Fedora/CentOS rpm repository.)

poll vote (don't work on features, work on making it easier to install and use)

poll vote (don't work on features, work on making it easier to install and use)

poll vote (direct mode (aka real files instead of symlinks))

poll vote (Handle duplicate files)

poll vote (deltas: speed up syncing modified versions of existing files)

poll vote (deltas: speed up syncing modified versions of existing files)

poll vote (encrypted git remotes using git-remote-gcrypt)

poll vote (get webapp working on Android)

poll vote (don't work on features, work on making it easier to install and use)

poll vote (get webapp working on Android)

poll vote (get webapp working on Android)

poll vote (don't work on features, work on making it easier to install and use)

poll vote (upload and download rate limiting)

poll vote (don't work on features, work on making it easier to install and use)

poll vote (get webapp working on Android)

poll vote (don't work on features, work on making it easier to install and use)

poll vote (don't work on features, work on making it easier to install and use)

poll vote (get webapp working on Android)

poll vote (deltas: speed up syncing modified versions of existing files)

poll vote (encrypted git remotes using git-remote-gcrypt)

poll vote (don't work on features, work on making it easier to install and use)

poll vote (don't work on features, work on making it easier to install and use)

poll vote (don't work on features, work on making it easier to install and use)

poll vote (don't work on features, work on making it easier to install and use)

poll vote (get webapp working on Android)

poll vote (encrypted git remotes using git-remote-gcrypt)

poll vote (upload and download rate limiting)

poll vote (encrypted git remotes using git-remote-gcrypt)

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