pass --git-dir, rather than changing cwd

If .git is a gitlink file, setting cwd to it will fail, but --git-dir
will succeed. And this is the only place where it sets cwd when running
git, everywhere else already uses --git-dir.

Note that, git-annex's submodule fixup code usually converts gitlink
files to symlinks, so this wasn't usually problem. Still, worth fixing.

This commit was sponsored by Svenne Krap on Patreon.

Merge remote-tracking branch 'origin/master'

analysis

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Fix bug that prevented linux standalone bundle from working on a fresh install

Bug was introduced in version 8.20201007, lost a necessary mkdir.

This commit was sponsored by Noam Kremen on Patreon.

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initial report on a failing test on windows about storeKey when already present

this protocol is not draft for some time

turns out this was fixed in 2014

Merge branch 'master' of ssh://git-annex.branchable.com

urk

Added a comment: windows build with magic

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rename to avoid windows stupididy about legal filenames

add

add

update chunk log after speculated chunks are verified to be present

Only done in checkPresentChunks, although retrieveChunks could also do
it. Does not seem necessary though, because git-annex never retrives
content without first checking if it's present AFAICR. And really this will
only be needed when using fsck. Puttting it here, rather than in fsck
avoids breaking an abstraction boundary, and is nice and inexpensive.

speculatively use remote's configured chunk size as a fallback

When a special remote has chunking enabled, but no chunk sizes are
recorded (or the recorded ones are not found), speculatively try chunks
using the configured chunk size.

This makes eg, git-annex fsck --from remote be able to fix up the
location log of a file that the git-annex branch does not indicate is
stored on the remote.

Note that fsck does *not* fix up the chunk log to indicate the chunk
size. So, changing the chunk config of the remote after that will still
prevent accessing the chunks stored on it. Maybe fsck should, but I
wanted to start with this and see if it's needed.

close

Added a comment: cannot find this mentioned Windows build :|

Fix a broken link

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Merge branch 'master' of ssh://git-annex.branchable.com

devblog

move: Improve resuming a move that was interrupted after the object was transferred

In cases where numcopies checks prevented the resumed move from dropping
the object from the source repository, it now relies on a log of recent
moves to replicate the behavior of the interrupted command.

Performance: Probably noticable impact, since it has to add to the log,
check the log, and remove from the log. Seems worth it to avoid this
annoying edge case. The log functions are pretty well optimised to avoid
unncessary work.

An performance improvement to make later would be to avoid cleanup doing
anything if it's not written to the log file, and has confirmed that the
log file does not contain the log line.

This commit was sponsored by Jake Vosloo on Patreon.

removed

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report/idea on minting chunked keys to try from special remote

more log file actions

Which will be needed soon.

And use more ByteStrings for speed.

This commit was sponsored by Graham Spencer on Patreon.

improve name

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 New bug report

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add, import: Fix a reversion in 7.20191009 that broke handling of --largerthan and --smallerthan

This commit was sponsored by Jochen Bartl on Patreon.

bug

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Merge branch 'master' of ssh://git-annex.branchable.com into master

design done

update

fix build warning

more thoughts

don't try to remove pre-commit-annex and post-update-annex-hooks

Those are not installed by git-annex but by the user, and so removal
will never find the default content, and so if the user did install
them, it would display a misleading message.

Seems better, since the user installed them, to let the user remove them
if they want to.

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Merge branch 'master' of ssh://git-annex.branchable.com into master

close

switch to Haskell2010

When I put in Haskell98 this spring, I was under the mistaken
apprehension that ghc defaulted to that. But it actually its default
is a third mode, which is closer to Haskell2010 but with some differences.
The manual says "By default, GHC mainly aims to behave (mostly) like a
Haskell 2010 compiler"

Fixed two cases where the Haskell98 do indentation flexability let
wrongly indented code build. That is one of the places where
ghc does not behave like Haskell2010 by default.

The other place that I think I was concerned about, is GHC manual
section 19.1.1.3. Expressions and patterns. But that only seems to
affect code using bottoms, so would only affect pure functions throwing
an error, which I don't think git-annex does in many places as it's
pretty horrid style. And it would only affect rare cases like shown in
that section. If it did happen, it would mean that the error was not
thrown before specifying Haskell98, and then was. Haskell2010 behaves
the same as Haskell98.

This commit was sponsored by Denis Dzyubenko on Patreon.

Added a comment: copying directly from directory special remote to the cloud

Added a comment: building the standalone distribution on CentOS

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Fix typo

initial report

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Added a comment: dropunused and copies

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devblog

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Fix a memory leak introduced in the last release

The problem was this line:

cleanup = and <$> sequence (map snd v)

That caused all of v to be held onto until the end, when the cleanup action
was run.

I could not seem to find a bang pattern that avoided the leak, so I
resorted to a IORef, rather clunky, but not a performance problem because
it will only be written once per git ls-files, so typically just 1 time.

This commit was sponsored by Mark Reidenbach on Patreon.

enable profiling in dev build

blew a day investigating this and still don't understand it fully

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add a few missing copyrights

Merge branch 'master' of ssh://git-annex.branchable.com into master

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This commit was sponsored by Ethan Aubin.

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This commit was sponsored by Ethan Aubin.

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close as notabug

Merge branch 'master' of ssh://git-annex.branchable.com into master

profiling

Currently a bit stuck, but at least starting to get some clues on this
memory leak.

This commit was sponsored by Ethan Aubin.

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Merge branch 'master' of ssh://git-annex.branchable.com into master

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Merge branch 'master' of ssh://git-annex.branchable.com into master

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this was closed a long time ago, but a rename made it re-appear

Fix build on Windows with network-3

inet_addr was removed, but all this needs is localhost, so hardcoding it
should work fine.

It may be that this windows ifdef is no longer needed. It was added in 2013
with a note that getAddrInfo didn't work on windows, but it seems likely
such a problem would have been fixed since.

Merge branch 'master' of ssh://git-annex.branchable.com into master

change from deprecated and removed aNY_PORT to defaultPort

(Both are just 0 internally.)