rust: Bind `ostree_repo_list_commits_starting_with`

I wanted to use this as a fallback for
https://github.com/ostreedev/ostree-rs-ext/pull/351/commits/30dee81c22ad5cb90e77198d3ddbcc25d388afb5

Merge pull request #2702 from thesamesam/bashism

buildutil/glibtests.m4: fix bashism

Merge pull request #2700 from jlebon/pr/staged-docs

docs: Add section about staged deployments

buildutil/glibtests.m4: fix bashism

configure scripts need to be runnable with a POSIX-compliant /bin/sh.

On many (but not all!) systems, /bin/sh is provided by Bash, so errors
like this aren't spotted. Notably Debian defaults to /bin/sh provided
by dash which doesn't tolerate such bashisms as '=='.

This retains compatibility with bash.

Fixes configure warnings/errors like:
```

checking whether to build static libraries... no
./configure: 14795: test: unexpected operator
```

Signed-off-by: Sam James <sam@gentoo.org>

Merge pull request #2698 from cgwalters/update-gir

docs: Add section about staged deployments

I was explaining staged deployments to someone today and was looking for
a doc but we didn't have any. Fix that.

Merge pull request #2699 from cgwalters/drop-debian-testing

ci: Also drop seccomp on debian testing

ci: Also drop seccomp on debian testing

I didn't deep dive into debugging this but I'm pretty sure it's
 https://gitlab.gnome.org/GNOME/glib/-/issues/2580
which is us having an older Docker in the middle here.

rust: Update to latest git

In the future I may try to add CI that requires this to be
sync'd...

Merge pull request #2692 from GeorgesStavracas/gbsneto/transaction-leak

lib/commit: Unref repo on success

Merge pull request #2697 from tkfu/docs/add-related-projects

docs: Add aktualizr and TorizonCore to related projects

docs: Add aktualizr and TorizonCore to related projects

Signed-off-by: Jon Oster <jon.oster@toradex.com>

Merge pull request #2693 from lucab/ups/libostree-fix-annotation

libostree: fix a typo in annotation

libostree: fix a typo in annotation

This fixes a typo in the `allow-none` annotation on
`ostree_sysroot_deployment_set_kargs_in_place` argument.

Merge pull request #2691 from cgwalters/rev-parse-single

cli/rev-parse: Add `--single` option

In the current "ostree native container" flow, we're inserting
a commit object into the repo but with no refs.

We have hacks in a few places to find the commit digest via e.g.
`find repo/objects -name *.commit` but that's a horrible hack.
Add `ostree rev-parse --single` which will print the single commit,
and error out if there is not exactly one commit.

Co-authored-by: Jonathan Lebon <jonathan@jlebon.com>

Merge pull request #2690 from cgwalters/cli-less-goto-1

cli/rev-parse: Port to new code style

lib/commit: Unref repo on success

Commit 540e60c3 introduced _ostree_repo_auto_transaction_new(), a
private constructor to OstreeRepoAutoTransaction, by factoring out
some code from _ostree_repo_auto_transaction_start(). This factored
code increased the refcount of the 'repo' variable.

Subsequent commit 71304e854c made ostree_repo_prepare_transaction()
use ths newly introduced constructor. However, in this function, the
happy path assumed no ref was taken, and therefore did not unref it.
Commit 71304e854c didn't add the corresponding unref either.

This leaks a reference to OstreeRepo when calling
ostree_repo_prepare_transaction().

Plug this leak by using g_clear_object() to clear the repo field
of OstreeRepoAutoTransaction, instead of simply setting it to NULL.

Closes https://github.com/flatpak/flatpak/issues/4928

cli/rev-parse: Port to new code style

Prep for future changes.

Merge pull request #2684 from ostreedev/dependabot/submodules/libglnx-26375b5

build(deps): bump libglnx from `c59eb27` to `26375b5`

Bumps libglnx from `c59eb27` to `26375b5`.

---
updated-dependencies:
- dependency-name: libglnx
  dependency-type: direct:production
...

Signed-off-by: dependabot[bot] <support@github.com>

Merge pull request #2689 from jlebon/pr/ficlone-direct-payload

lib/commit: Directly use FICLONE for payload link

tests/kolainst/staged-deploy: parse `rpm-ostree status --json` instead

Don't parse `rpm-ostree status` output, it's not meant for that. Use
`--json` output instead.

While we're here, fix an obsolete reference to Ansible.

Related: https://github.com/coreos/rpm-ostree/pull/3938

lib/commit: Directly use FICLONE for payload link

The idea of payload linking is to reflink between objects where
possible. Instead of relying on `glnx_regfile_copy_bytes` to hit the
`FICLONE` path, just call `FICLONE` directly. At that point in the code,
we've already established that the source and dest repos are on the same
filesystem and that it supports `FICLONE`.

Related: https://gitlab.gnome.org/GNOME/libglnx/-/merge_requests/41
Related: https://github.com/ostreedev/ostree/pull/2684#issuecomment-1204068437

Merge pull request #2688 from LukasKalbertodt/main

Update to `libtest-mimic` 0.5.0

Update to `libtest-mimic` 0.5.0

Merge pull request #2686 from cgwalters/include-cleanups

Handle conflicts between newer glibc and kernel headers

Move FIFREEZE/FITHAW ioctl invocations into linuxfsutil.c

Should help avoid conflicts between glibc and linux headers.

Closes: https://github.com/ostreedev/ostree/issues/2685

Remove unused `linux/fs.h` includes

Prep for fixing conflicts introduced by newer glibc.
cc https://github.com/ostreedev/ostree/issues/2685

Merge pull request #2683 from cgwalters/sync-deny

deny.toml: Add `Unicode-DFS-2016`

deny.toml: Add `Unicode-DFS-2016`

This is used by the unicode crate now and is definitely a compatible
FOSS license.

Merge pull request #2678 from cgwalters/release-2022-5

Release 2022 5

rust-bindings: Fix `cargo fmt`

configure: post-release version bump

Release 2022.5

Merge pull request from GHSA-gqf4-p3gv-g8vw

Fix sign ed25519 verify

Merge pull request #2675 from HuijingHei/update-doc

Update doc about adding new function to libostree

Merge pull request #2676 from render-se/debos-docs

add debos to readme distribution build tools

docs add debos to readme distribution build tools

rust: Add a test case for ed25519

Specifically, I verified that *before* the previous patch to the
ed25519 C code, the last bit of code would fail with a SIGSEGV when
trying to read the empty signature.

sign/ed25519: Verify signatures are minimum length

The ed25519 signature verification code does not
check that the signature is a minimum/correct length.
As a result, if the signature is too short, libsodium will end up
reading a few bytes out of bounds.

Reported-by: Demi Marie Obenour <demi@invisiblethingslab.com>
Co-authored-by: Demi Marie Obenour <demi@invisiblethingslab.com>
Closes: https://github.com/ostreedev/ostree/security/advisories/GHSA-gqf4-p3gv-g8vw

Update doc about adding new function to libostree

Merge pull request #2669 from HuijingHei/fix-kargs

Fix `ostree admin kargs edit-in-place` fails issue

Merge pull request #2672 from cgwalters/initialize-sysroot-cleanups

sysroot: Have `ensure_writable` also always initialize

Merge pull request #2673 from cgwalters/assert-boot

sysroot: Add a few more assertions about `boot_fd`

sysroot: Add a few more assertions about `boot_fd`

These places are all safe, but it would catch bugs in the future
more clearly to trip an assertion here.

sysroot: Have `ensure_writable` also always initialize

For historical reasons we have a fair bit of distinct sysroot
initialization going on.  A lot of code is calling *just* the new
`ensure_writable()` API, which does basically what you'd expect...
except if we're not using a mount namespace.

Which is the case in unit tests and legacy setups.
Change this API to also ensure the sysroot is fully initialized
even in those cases.  Specifically we'll have `self->sysroot_fd`.

For now, callers that need `/boot` also need to separately
call `_ensure_boot_fd()`.

deploy: Ensure sysroot is initialized for kargs in place

Even without a mount namespace set up.

Merge pull request #2671 from matthiasbeyer/readme-rust-bindings-fix

Fix link to rust bindings

Add test to verify `ostree admin kargs edit-in-place` working

Fix `ostree admin kargs edit-in-place` fails issue

Add func to set kernel arguments in place, instead of create new
deployment
Fix https://github.com/ostreedev/ostree/issues/2664

Merge pull request #2668 from cgwalters/sync-cargo-deny

Fix link to rust bindings

ostree-rs was merged into ostree, so link to the rust bindings within
this repository.

Signed-off-by: Matthias Beyer <mail@beyermatthias.de>

Merge pull request #2666 from saqibali-2k/pr/bls-append

ostree-repo: bls-append-except-default followup

deny: Sync with rpm-ostree

This extends the license set basically and ignores private repos
(which we don't have any yet).

ostree-repo: bls-append-except-default followup

This PR is followup from https://github.com/coreos/coreos-assembler/pull/2863
Summary of changes:
- Moved bls-append-except-default parsing logic to reload_sysroot_config()
- Made sure heap allocated memory is being freed

Merge pull request #2667 from cgwalters/deploy-require-repo

lib: Stop using old `ostree_sysroot_get_repo()` API

lib: Stop using old `ostree_sysroot_get_repo()` API

It's falliable, and in one place we were actually ignoring
the error and leaving a `NULL` repo object which is just a trap
for people coming along later since it's rarely nullable.

Quite a while ago we switched to loading the repo at the same time
as the sysroot; convert callers in the library to use this infallible
accessor.

Prep for another patch which will use the repo object.

Merge pull request #2632 from saqibali-2k/pr/prune-commit-only

lib/prune: speed up pruning by retrieving only commits

Merge pull request #2661 from cgwalters/port-cap-std

lib/prune: speed up pruning by retrieving only commits

After landing the new --commit-only functionality, we still noticed
exceedingly long pruning times in large repos. Lets add an optimization
that will only retrieve commit objects when --commit-only flag is used.

tests/inst: Port to cap-std

Part of an ongoing effort.

Merge pull request #2660 from cgwalters/fix-load-file-api

repo: Metadata return values from `load_file` are not nullable

Merge pull request #2655 from nikita-dubrovskii/sdboot_rename

Merge pull request #2659 from cgwalters/hackaround-cosa-systemd-unit-check

tests/staged-deploy.sh: Hack around cosa systemd unit check

https://github.com/coreos/coreos-assembler/pull/2921 broke this
test which is intentionally causing a systemd unit to fail.

As they say, necessity is the mother of invention.  They don't
say though that need always causes particularly *beautiful* things
to be invented...

s390x: rename sd-boot to sdboot

Signed-off-by: Nikita Dubrovskii <nikita@linux.ibm.com>

repo: Metadata return values from `load_file` are not nullable

The pattern this API uses in C is to allow the input parameters
pointer targets to be `NULL`, and it doesn't return values in that
case.

A further complexity here is that the API will still return `NULL`
for symbolic links.

But Rust can't express this pattern as is, so we were always
returning values but in `Option<T>` wrappers that the caller needed
to unwrap for the metadata.

(We really want an even more efficient API here that avoids the glib
 objects entirely, e.g. no reason not to pass directly back a type
 that lets Rust directly read from the fd for bare repos, but
 that can come later)

Merge pull request #2656 from cgwalters/bump-cap-std

rust: Bump semver to 0.15 && bump cap-std 0.25

Merge pull request #2658 from jlebon/pr/pinger

tests/inst/destructive: stop disabling fedora-coreos-pinger

tests/inst/destructive: stop disabling fedora-coreos-pinger

It was removed from FCOS:
https://github.com/coreos/fedora-coreos-tracker/issues/770

Bump to cap-std 0.25 and io-lifetimes 0.7

Prep for bumping ostree-rs-ext, which will help bump rpm-ostree,
which will get it out of having two copies of rustix.

rust: Bump semver to 0.15

Prep for some breaking changes.

Fix clippy lint in cap-std bits

ci/rust: Change MSRV to `cargo check`

No reason to codegen just to throw it away.  We could test here too,
but eh.

ci/rust: Enable `cap-std-apis` in default build, add a no-feature build

Our CI was missing coverage of `cap-std-apis`.

Merge pull request #2639 from HuijingHei/admin-kargs-edit-in-place

RFE: Add a hidden option to `ostree admin kargs edit-in-place` to update all existing deployments in place

RFE: Add a hidden option to `ostree admin kargs edit-in-place` to
update all existing deployments in place

Example:
$ sudo ostree admin kargs edit-in-place --append-if-missing=rw
See https://github.com/ostreedev/ostree/issues/2617

This will not add duplicate key, if there is `TESTARG=VAL1` in the
kernel arguments, `--append-if-missing=TESTARG=VAL2` will be ignored.

Merge pull request #2651 from cgwalters/misc-declare-and-initialize-2

cli: Port to C99 style (3)

Merge pull request #2654 from jlebon/pr/drop-packit

Drop `.packit.yaml`

Drop `.packit.yaml`

This repo is already hooked to the @CoreOS/continuous COPR repo for
multi-arch RPM builds of the latest commits.

It's possible we will use Packit in the future to help with the release
process. But for now, let's just drop this file since it's not needed
and the Packit failures are marking git main CI as failed.

Merge pull request #2652 from smcv/not-always-xattrs

test-basic-c: Don't assert that extended attributes are available

test-basic-c: Don't assert that extended attributes are available

Not all filesystems support extended attributes. This test uses
/var/tmp to try to get an extended-attributes-capable filesystem,
but that might not succeed.

Signed-off-by: Simon McVittie <smcv@debian.org>

cli/refs: Port to C99 style

General background cleanup.

cli/remote-list: Port to C99 style

General background cleanup.

cli/gpg-sign: Port to C99 style

General background cleanup.

Merge pull request #2650 from cgwalters/misc-declare-and-initialize-1

Merge pull request #2649 from cgwalters/misc-declare-and-initialize

cli: a few "Port to C99 style"

cli/diff: Port to C99 style

General background cleanup.

cli/config: Port to C99 style

General background cleanup.

cli/unlock: Port to C99 style

General background cleanup.

cli/undeploy: Port to C99 style

General background cleanup.

cli/os-init: Port to C99 style

General background cleanup; motivated by a recent PR which
was using pre-C99 code as a base.

Merge pull request #2643 from cgwalters/rust-2021

rust: Switch to 2021 edition, bump MSRV, a few `format!` updates

Merge pull request #2646 from cgwalters/bindings-tests

rust-bindings: Wire up `tests/`

Merge pull request #2645 from cgwalters/fsck-more-cleanups

fsck: A few more cleanups

rust-bindings: Wire up `tests/`

Because the source is in a subdirectory, we lose out on cargo target
autodiscovery.

I noticed this when I edited one of the tests in a way that
should have failed, but didn't...

fsck: Use `load_variant_if_exists`

This cleans up error handling here.

fsck: Move most commit processing into helper function

The inner loop was way too long; split out most of the heavy
lifting around backrefs and tombstones into a helper function.

fsck: De-indent loop

Could have done this in the previous change, but wanted to avoid
excessive diff noise.