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Merge branch 'master' of ssh://git-annex.branchable.com

include bugs/todos tagged datalad

sometimes they are not signed with an author

initial report about fresh test fail

merge from git-repair

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Added a comment: git-annex uninit --fast

removed myself as the author, damn cut/paste ;)

assigned to datalad project

fixed

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Merge branch 'master' of ssh://git-annex.branchable.com

test: avoid unnecessary tests of variants of git remote

Configuring chunking and encryption for a git remote has no effect, so
skip testing those variants in the TestRemote call.

It would be better if TestRemote itself could do this, but it
doesn't seem possible there. There is no way to look at a Remote and
tell if it supports chunking or encryption.

Note that, while the test suite displays output as it it's testing
exporting, it actually skips doing anything for the tests when run on
the git remote. So at least does not waste time even though the output
is not ideal.

This commit was sponsored by Noam Kremen on Patreon.

remove blank

update test suite after git-annex trust behavior change

fix format of message

newlines are eaten

add testremote of a git remote to test suite

The test suite contains its own tests that test a lot of basic stuff
about git remotes, mostly in passing to set up other situations.
But testremote does try some unusual edge cases, which may as
well be tried for git remotes as well as directory, especially since
it's so little code to add it.

This commit was sponsored by Kevin Mueller on Patreon.

close

idea

Added a comment: Specific to repository location in /private

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Added a comment: checkout borg remote

report on fresh test fails

merged fix from kyle

avoid using wildcard near bug kyle fixed

adjustTree: Consider submodule deletions

In addition to regular file deletions, the removefiles argument passed
to adjustTree may contain removed submodules.  When making the new
tree, filter these out in the same way that is done for regular files
so that the deletion is propagated.

Merge branch 'master' of ssh://git-annex.branchable.com

Behavior change: --trust-glacier option no longer overrides trust

Since that can lead to data loss, which should never be enabled by an
option other than --force.

This commit was sponsored by Jake Vosloo on Patreon.

Behavior change: --trust option no longer overrides trust

Since that can lead to data loss, which should never be enabled by an
option other than --force.

I suppose that using --trust was in some situation, safer than --force,
because it doesn't entirely disable checking for data loss, but only
disables checking involving data that is on the specified repository.
But it seems better to be able to say that data loss only happens with
--force.

This commit was sponsored by Graham Spencer on Patreon.

Behavior change: git-annex trust now needs --force

Since unconsidered use of trusted repositories can lead to data loss.

Trusted has always been this way, but it used to be acceptable for
git-annex to be set up so that data could be lost without using --force,
and most or all other ways that can happen have already been eliminated.

This commit was sponsored by Mark Reidenbach on Patreon.

Merge branch 'master' of ssh://git-annex.branchable.com

wording

improve wording

Merge branch 'master' into requirednumcopies

mincopies

This is conceptually very simple, just making a 1 that was hard coded be
exposed as a config option. The hard part was plumbing all that, and
dealing with complexities like reading it from git attributes at the
same time that numcopies is read.

Behavior change: When numcopies is set to 0, git-annex used to drop
content without requiring any copies. Now to get that (highly unsafe)
behavior, mincopies also needs to be set to 0. It seemed better to
remove that edge case, than complicate mincopies by ignoring it when
numcopies is 0.

This commit was sponsored by Denis Dzyubenko on Patreon.

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branch

docs for requirednumcopies

Not implemented yet.

the author of this forum post deleted it, so remove comments

Merge branch 'master' of ssh://git-annex.branchable.com

update

removed

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promote forum post to bug report

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wrong, wrong, wrong

fix --time-limit

It got broken in several ways by the streaming seeking optimisations
around version 8.20201007.

Moved time limit checking out of the matcher, which was a hack in the
first place. So everywhere that uses Limit.getMatcher needs to check
time limit. Well, almost everywhere. Command.Info uses it, but it does
not make sense to time limit getting info. And Command.MultiCast uses it
just to build up a list of files that then get passed to a command, so
it would never have hit the timeout in a useful way.

This implementation is a little more expensive when at time limit than
necessary, since it continues seeking only to discard everything after the
time limit. I did try making it close the file handles to force a faster
shutdown, but that didn't work and hung. Could certianly be improved
somehow, but seeking is probably not the expensive bit when a time limit
is hit, so this seems acceptable for now.

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add pointer to annex.largefiles config docs

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add: Significantly speed up adding lots of non-large files to git

* add: Significantly speed up adding lots of non-large files to git,
  by disabling the annex smudge filter when running git add.
* add --force-small: Run git add rather than updating the index itself,
  so any other smudge filters than the annex one that may be enabled will
  be used.

fix bad annex.largefiles example syntax

Git.Queue: allow providing git common options like -c

update year

avoid combining queued commands with different params

I don't think this affected git-annex currently, but if the same command
was queued twice with different params, one set of params was thrown
away, and the files going with those were run with the other set of
params.

comment and todo

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Added a comment: Difference to import/add?

Added a comment: rename or move files

Added a comment: Adding external files

Added a comment: annex.largefiles

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