Manual merge of version 4.0.2-5+rpi1 and 4.0.3-6 to produce 4.0.3-6+rpi1

Merge openmpi (4.0.3-6) import into refs/heads/workingbranch

Turn off warning that openfabric is not available

Last-Updated: 2019-11-19
Forwarded: no

because it breaks some overlying layers/appications in Debian

Gbp-Pq: Name no-warning-unused.patch

fix-underlinking

Desciption: Fix underlinking
  Prevents symbol lookup error: ../openmpi4/mca_mtl_ofi.so:
  undefined symbol: fi_dupinfo when linked with --as-needed
Bug-Debian: https://bugs.debian.org/899104
Last-Update: 2018-05-23

Gbp-Pq: Name fix-underlinking.patch

Makefile.ompi-rules: don't set silent building

Gbp-Pq: Name verbose-ompi-rules.patch

fix test-suite to build on ppc64el

Origin: Vendor
Bug-Debian: https://bugs.debian.org/cgi-bin/bugreport.cgi?bug=848218
Forwarded: no
Last-Update: 2016-12-15

Test suite hangs on ppc64el. This is due to a bug in test/class/opal_fifo.c.
thread_test() must end with pthread_exit(NULL), not return NULL.
Last-Update: 2016-12-15
Gbp-Pq: Name opal_fifo.patch

Support for the HPPA architecture

Bug-Origin: https://bugs.debian.org/cgi-bin/bugreport.cgi?bug=776730
Last-Updated: 2016-09-04
Forwarded: no

Gbp-Pq: Name hppa.patch

Change install libdir to openmpi3

Last-Updated: 2019-03-09
Forwarded: no

This is needed to ensure that libopenmpi2, libopenmpi3 do not collide.

Gbp-Pq: Name libdir.patch

Fix build problems on hurd-i386

Forwarded: partially
Last-Update: 2018-10-24

This patch allows Open MPI to build on Debian GNU/HURD.

Also, the memory:linux MCA component is disabled, since its use of POSIX API
in malloc hooks called very early at startup causes troubles.

Also changes by Samuel Thibault <sthibault@debian.org>
See bugs.debian.org/846965

Gbp-Pq: Name build_hurd

Fix problems in manpages

Forwarded: no
Last-Update: 2018-04-08

In some man page headers, a macro (-*-) is used which makes lintian
 choke and probably should not be there anyway.

Gbp-Pq: Name manpage_macros

mpifort

===================================================================

Gbp-Pq: Name mpifort.patch

Enable non-gfortran compilation

Last-Updated: 2020-01-13
Forwarded: no

Gbp-Pq: Name pkg-config.patch

openmpi (4.0.3-6) unstable; urgency=medium

  * libopenmpi-dev now depends on zlib1g-dev

[dgit import unpatched openmpi 4.0.3-6]

Import openmpi_4.0.3-6.debian.tar.xz

[dgit import tarball openmpi 4.0.3-6 openmpi_4.0.3-6.debian.tar.xz]

Import openmpi_4.0.3.orig.tar.xz

[dgit import orig openmpi_4.0.3.orig.tar.xz]

Merge version 4.0.2-4+rpi1 and 4.0.2-5 to produce 4.0.2-5+rpi1

Merge openmpi (4.0.2-5) import into refs/heads/workingbranch

no-warning-unused

Gbp-Pq: Name no-warning-unused.patch

fix-underlinking

Gbp-Pq: Name fix-underlinking.patch

verbose-ompi-rules

Gbp-Pq: Name verbose-ompi-rules.patch

opal_fifo

Gbp-Pq: Name opal_fifo.patch

hppa

Gbp-Pq: Name hppa.patch

libdir

Gbp-Pq: Name libdir.patch

build_hurd

Gbp-Pq: Name build_hurd

manpage_macros

Gbp-Pq: Name manpage_macros

openmpi (4.0.2-5) unstable; urgency=medium

  * Fix typos in d/changelog
  * Ship orte-server. Closes: #946542

[dgit import unpatched openmpi 4.0.2-5]

Import openmpi_4.0.2-5.debian.tar.xz

[dgit import tarball openmpi 4.0.2-5 openmpi_4.0.2-5.debian.tar.xz]

Merge version 3.1.3-11+rpi1 and 4.0.2-4 to produce 4.0.2-4+rpi1

Merge openmpi (4.0.2-4) import into refs/heads/workingbranch

no-warning-unused

Gbp-Pq: Name no-warning-unused.patch

fix-underlinking

Gbp-Pq: Name fix-underlinking.patch

verbose-ompi-rules

Gbp-Pq: Name verbose-ompi-rules.patch

opal_fifo

Gbp-Pq: Name opal_fifo.patch

hppa

Gbp-Pq: Name hppa.patch

libdir

Gbp-Pq: Name libdir.patch

build_hurd

Gbp-Pq: Name build_hurd

manpage_macros

Gbp-Pq: Name manpage_macros

openmpi (4.0.2-4) unstable; urgency=medium

  * Version numbers on libs changed:
   - libmpi_java.so now version 40.20.0
   - libmca_common_monitoring.so now 50.10.0
   - libmca_common_ompio.so now 41.19.2
   - libmca_common_verbs.so now 40.20.0
   - libmca_common_ofi.so, liboshmem.so no longer produced
   - Closes: #945170,
  * Close old bug: Closes #945121
  * Update postinst scripts, remove preinst scripts; remove stuff no longer
    needed post buster

[dgit import unpatched openmpi 4.0.2-4]

Import openmpi_4.0.2-4.debian.tar.xz

[dgit import tarball openmpi 4.0.2-4 openmpi_4.0.2-4.debian.tar.xz]

Import openmpi_4.0.2.orig.tar.xz

[dgit import orig openmpi_4.0.2.orig.tar.xz]

Merge version 3.1.3-10+rpi1 and 3.1.3-11 to produce 3.1.3-11+rpi1

Merge openmpi (3.1.3-11) import into refs/heads/workingbranch

pmix-modex

Gbp-Pq: Name pmix-modex.patch

fix-underlinking

Gbp-Pq: Name fix-underlinking.patch

openjdk10

===================================================================

Gbp-Pq: Name openjdk10.patch

verbose-ompi-rules

Gbp-Pq: Name verbose-ompi-rules.patch

opal_fifo

Gbp-Pq: Name opal_fifo.patch

hppa

Gbp-Pq: Name hppa.patch

hurd-maxhostnamelen

Gbp-Pq: Name hurd-maxhostnamelen.patch

libdir

Gbp-Pq: Name libdir.patch

build_hurd

Gbp-Pq: Name build_hurd

manpage_macros

Gbp-Pq: Name manpage_macros

openmpi (3.1.3-11) unstable; urgency=medium

  [ Alastair McKinstry ]
  * Build-Depend on gfortran | fortran-compiler
  * Drop B-D on gcc >= 4, obsolete
  * Drop -g flag if compiling with flang

  [ Andreas Beckmann ]
  * Team upload.
  * Add Breaks against mpich and lam predating mpi-$MULTIARCH alternatives.

[dgit import unpatched openmpi 3.1.3-11]

Import openmpi_3.1.3-11.debian.tar.xz

[dgit import tarball openmpi 3.1.3-11 openmpi_3.1.3-11.debian.tar.xz]

Merge version 3.1.3-9+rpi1 and 3.1.3-10 to produce 3.1.3-10+rpi1

Merge openmpi (3.1.3-10) import into refs/heads/workingbranch

pmix-modex

Gbp-Pq: Name pmix-modex.patch

fix-underlinking

Gbp-Pq: Name fix-underlinking.patch

openjdk10

===================================================================

Gbp-Pq: Name openjdk10.patch

verbose-ompi-rules

Gbp-Pq: Name verbose-ompi-rules.patch

opal_fifo

Gbp-Pq: Name opal_fifo.patch

hppa

Gbp-Pq: Name hppa.patch

hurd-maxhostnamelen

Gbp-Pq: Name hurd-maxhostnamelen.patch

libdir

Gbp-Pq: Name libdir.patch

build_hurd

Gbp-Pq: Name build_hurd

manpage_macros

Gbp-Pq: Name manpage_macros

openmpi (3.1.3-10) unstable; urgency=medium

  * Remove obsolete debian/TODO comments
  * Include cleanups of alternatives handling by Andreas Beckmann.
Closes: #915025
  * Add Breaks: libmpich-dev (<< 3.3~b1-5) to libopenmpi-dev as the mpi
    alternatives handling changed.

[dgit import unpatched openmpi 3.1.3-10]

Import openmpi_3.1.3-10.debian.tar.xz

[dgit import tarball openmpi 3.1.3-10 openmpi_3.1.3-10.debian.tar.xz]

Merge version 3.1.3-3+rpi1 and 3.1.3-9 to produce 3.1.3-9+rpi1

Merge openmpi (3.1.3-9) import into refs/heads/workingbranch

pmix-modex

Gbp-Pq: Name pmix-modex.patch

fix-underlinking

Gbp-Pq: Name fix-underlinking.patch

openjdk10

===================================================================

Gbp-Pq: Name openjdk10.patch

verbose-ompi-rules

Gbp-Pq: Name verbose-ompi-rules.patch

opal_fifo

Gbp-Pq: Name opal_fifo.patch

hppa

Gbp-Pq: Name hppa.patch

hurd-maxhostnamelen

Gbp-Pq: Name hurd-maxhostnamelen.patch

libdir

Gbp-Pq: Name libdir.patch

build_hurd

Gbp-Pq: Name build_hurd

manpage_macros

Gbp-Pq: Name manpage_macros

openmpi (3.1.3-9) unstable; urgency=medium

  * Re-enable external pmix now that it works with 32-bit systems again.
Closes: #918713.
[dgit import unpatched openmpi 3.1.3-9]

Import openmpi_3.1.3-9.debian.tar.xz

[dgit import tarball openmpi 3.1.3-9 openmpi_3.1.3-9.debian.tar.xz]

Merge openmpi (3.1.3-7) import into refs/heads/workingbranch

pmix-modex

Gbp-Pq: Name pmix-modex.patch

fix-underlinking

Gbp-Pq: Name fix-underlinking.patch

openjdk10

===================================================================

Gbp-Pq: Name openjdk10.patch

verbose-ompi-rules

Gbp-Pq: Name verbose-ompi-rules.patch

opal_fifo

Gbp-Pq: Name opal_fifo.patch

hppa

Gbp-Pq: Name hppa.patch

hurd-maxhostnamelen

Gbp-Pq: Name hurd-maxhostnamelen.patch

libdir

Gbp-Pq: Name libdir.patch

build_hurd

Gbp-Pq: Name build_hurd

manpage_macros

Gbp-Pq: Name manpage_macros

openmpi (3.1.3-7) unstable; urgency=medium

  * Standards-Version: 4.3.0
  * Use dh-fortran-mod and place mod files in $fmoddir/openmpi to avoid
    collision with mpich. Closes: #917133
  * Patch to remove PMIX_MODEX (removed in latest pmix release)

[dgit import unpatched openmpi 3.1.3-7]

Import openmpi_3.1.3-7.debian.tar.xz

[dgit import tarball openmpi 3.1.3-7 openmpi_3.1.3-7.debian.tar.xz]

Merge openmpi (3.1.3-5) import into refs/heads/workingbranch

fix-underlinking

Gbp-Pq: Name fix-underlinking.patch

openjdk10

===================================================================

Gbp-Pq: Name openjdk10.patch

verbose-ompi-rules

Gbp-Pq: Name verbose-ompi-rules.patch

opal_fifo

Gbp-Pq: Name opal_fifo.patch