Merge version 4.0.5-7+rpi1 and 4.1.0-7 to produce 4.1.0-7+rpi1

Merge openmpi (4.1.0-7) import into refs/heads/workingbranch

Backport of grequest fix

Bug-Origin:  https://github.com/open-mpi/ompi/pull/8347
Bug-Debian: https://bugs.debian.org/cgi-bin/bugreport.cgi?bug=979480
Forwarded: not-needed
Last-Updated: 2021-01-20

Gbp-Pq: Name grequest-fix.patch

Fix external PMIx v4.x check

Bug-Origin: https://github.com/open-mpi/ompi/pull/8337
Last-Updated: 2021-01-09
Forwarded: not-needed

Gbp-Pq: Name external-pmix-fix.patch

Include missing plugin mca_op_avx.so

Bug-Origin: https://github.com/open-mpi/ompi/issues/8323
Last-Updated: 2021-01-02
Forwarded: not-needed

Gbp-Pq: Name missing-symbol.patch

ia64

===================================================================

Gbp-Pq: Name ia64.patch

Turn off warning that openfabric is not available

Last-Updated: 2021-01-21
Forwarded: not-needed

because it breaks some overlying layers/appications in Debian.
Also exclude openfabric/openib by default.

Gbp-Pq: Name no-warning-unused.patch

fix-underlinking

Desciption: Fix underlinking
  Prevents symbol lookup error: ../openmpi4/mca_mtl_ofi.so:
  undefined symbol: fi_dupinfo when linked with --as-needed
Bug-Debian: https://bugs.debian.org/899104
Last-Update: 2018-05-23

Gbp-Pq: Name fix-underlinking.patch

Makefile.ompi-rules: don't set silent building

Gbp-Pq: Name verbose-ompi-rules.patch

fix test-suite to build on ppc64el

Origin: Vendor
Bug-Debian: https://bugs.debian.org/cgi-bin/bugreport.cgi?bug=848218
Forwarded: no
Last-Update: 2016-12-15

Test suite hangs on ppc64el. This is due to a bug in test/class/opal_fifo.c.
thread_test() must end with pthread_exit(NULL), not return NULL.
Last-Update: 2016-12-15
Gbp-Pq: Name opal_fifo.patch

Support for the HPPA architecture

Bug-Origin: https://bugs.debian.org/cgi-bin/bugreport.cgi?bug=776730
Last-Updated: 2016-09-04
Forwarded: no

Gbp-Pq: Name hppa.patch

Change install libdir to openmpi3

Last-Updated: 2019-03-09
Forwarded: no

This is needed to ensure that libopenmpi2, libopenmpi3 do not collide.

Gbp-Pq: Name libdir.patch

Fix build problems on hurd-i386

Forwarded: partially
Last-Update: 2018-10-24

This patch allows Open MPI to build on Debian GNU/HURD.

Also, the memory:linux MCA component is disabled, since its use of POSIX API
in malloc hooks called very early at startup causes troubles.

Also changes by Samuel Thibault <sthibault@debian.org>
See bugs.debian.org/846965

Gbp-Pq: Name build_hurd

Fix problems in manpages

Forwarded: no
Last-Update: 2018-04-08

In some man page headers, a macro (-*-) is used which makes lintian
 choke and probably should not be there anyway.

Gbp-Pq: Name manpage_macros

mpifort

===================================================================

Gbp-Pq: Name mpifort.patch

Enable non-gfortran compilation

Last-Updated: 2020-01-13
Forwarded: no

Gbp-Pq: Name pkg-config.patch

openmpi (4.1.0-7) unstable; urgency=medium

  * Also disable ofi BTL to avoid libfabric issues
    (user can re-enable on systems with RDMA hardware)
Closes: #979041
  * Backport grequest fix from 4.1.x. Closes: #979480

[dgit import unpatched openmpi 4.1.0-7]

Import openmpi_4.1.0-7.debian.tar.xz

[dgit import tarball openmpi 4.1.0-7 openmpi_4.1.0-7.debian.tar.xz]

Import openmpi_4.1.0.orig.tar.xz

[dgit import orig openmpi_4.1.0.orig.tar.xz]

Merge version 4.0.5-5+rpi1 and 4.0.5-7 to produce 4.0.5-7+rpi1

Merge openmpi (4.0.5-7) import into refs/heads/workingbranch

ia64

===================================================================

Gbp-Pq: Name ia64.patch

Turn off warning that openfabric is not available

Last-Updated: 2019-11-19
Forwarded: no

because it breaks some overlying layers/appications in Debian

Gbp-Pq: Name no-warning-unused.patch

fix-underlinking

Desciption: Fix underlinking
  Prevents symbol lookup error: ../openmpi4/mca_mtl_ofi.so:
  undefined symbol: fi_dupinfo when linked with --as-needed
Bug-Debian: https://bugs.debian.org/899104
Last-Update: 2018-05-23

Gbp-Pq: Name fix-underlinking.patch

Makefile.ompi-rules: don't set silent building

Gbp-Pq: Name verbose-ompi-rules.patch

fix test-suite to build on ppc64el

Origin: Vendor
Bug-Debian: https://bugs.debian.org/cgi-bin/bugreport.cgi?bug=848218
Forwarded: no
Last-Update: 2016-12-15

Test suite hangs on ppc64el. This is due to a bug in test/class/opal_fifo.c.
thread_test() must end with pthread_exit(NULL), not return NULL.
Last-Update: 2016-12-15
Gbp-Pq: Name opal_fifo.patch

Support for the HPPA architecture

Bug-Origin: https://bugs.debian.org/cgi-bin/bugreport.cgi?bug=776730
Last-Updated: 2016-09-04
Forwarded: no

Gbp-Pq: Name hppa.patch

Change install libdir to openmpi3

Last-Updated: 2019-03-09
Forwarded: no

This is needed to ensure that libopenmpi2, libopenmpi3 do not collide.

Gbp-Pq: Name libdir.patch

Fix build problems on hurd-i386

Forwarded: partially
Last-Update: 2018-10-24

This patch allows Open MPI to build on Debian GNU/HURD.

Also, the memory:linux MCA component is disabled, since its use of POSIX API
in malloc hooks called very early at startup causes troubles.

Also changes by Samuel Thibault <sthibault@debian.org>
See bugs.debian.org/846965

Gbp-Pq: Name build_hurd

Fix problems in manpages

Forwarded: no
Last-Update: 2018-04-08

In some man page headers, a macro (-*-) is used which makes lintian
 choke and probably should not be there anyway.

Gbp-Pq: Name manpage_macros

mpifort

===================================================================

Gbp-Pq: Name mpifort.patch

Enable non-gfortran compilation

Last-Updated: 2020-01-13
Forwarded: no

Gbp-Pq: Name pkg-config.patch

openmpi (4.0.5-7) unstable; urgency=medium

  * Undo NO_PMIX_ARCH for armel, mipsel no longer needed as atomic
    primitives now provided in external pmix. Closes: #971669

[dgit import unpatched openmpi 4.0.5-7]

Import openmpi_4.0.5-7.debian.tar.xz

[dgit import tarball openmpi 4.0.5-7 openmpi_4.0.5-7.debian.tar.xz]

Manual merge of version 4.0.4-1+rpi1 and 4.0.5-5 to produce 4.0.5-5+rpi1

Merge openmpi (4.0.5-5) import into refs/heads/workingbranch

ia64

===================================================================

Gbp-Pq: Name ia64.patch

Turn off warning that openfabric is not available

Last-Updated: 2019-11-19
Forwarded: no

because it breaks some overlying layers/appications in Debian

Gbp-Pq: Name no-warning-unused.patch

fix-underlinking

Desciption: Fix underlinking
  Prevents symbol lookup error: ../openmpi4/mca_mtl_ofi.so:
  undefined symbol: fi_dupinfo when linked with --as-needed
Bug-Debian: https://bugs.debian.org/899104
Last-Update: 2018-05-23

Gbp-Pq: Name fix-underlinking.patch

Makefile.ompi-rules: don't set silent building

Gbp-Pq: Name verbose-ompi-rules.patch

fix test-suite to build on ppc64el

Origin: Vendor
Bug-Debian: https://bugs.debian.org/cgi-bin/bugreport.cgi?bug=848218
Forwarded: no
Last-Update: 2016-12-15

Test suite hangs on ppc64el. This is due to a bug in test/class/opal_fifo.c.
thread_test() must end with pthread_exit(NULL), not return NULL.
Last-Update: 2016-12-15
Gbp-Pq: Name opal_fifo.patch

Support for the HPPA architecture

Bug-Origin: https://bugs.debian.org/cgi-bin/bugreport.cgi?bug=776730
Last-Updated: 2016-09-04
Forwarded: no

Gbp-Pq: Name hppa.patch

Change install libdir to openmpi3

Last-Updated: 2019-03-09
Forwarded: no

This is needed to ensure that libopenmpi2, libopenmpi3 do not collide.

Gbp-Pq: Name libdir.patch

Fix build problems on hurd-i386

Forwarded: partially
Last-Update: 2018-10-24

This patch allows Open MPI to build on Debian GNU/HURD.

Also, the memory:linux MCA component is disabled, since its use of POSIX API
in malloc hooks called very early at startup causes troubles.

Also changes by Samuel Thibault <sthibault@debian.org>
See bugs.debian.org/846965

Gbp-Pq: Name build_hurd

Fix problems in manpages

Forwarded: no
Last-Update: 2018-04-08

In some man page headers, a macro (-*-) is used which makes lintian
 choke and probably should not be there anyway.

Gbp-Pq: Name manpage_macros

mpifort

===================================================================

Gbp-Pq: Name mpifort.patch

Enable non-gfortran compilation

Last-Updated: 2020-01-13
Forwarded: no

Gbp-Pq: Name pkg-config.patch

openmpi (4.0.5-5) unstable; urgency=medium

  * Drop amd64 from NO_PMIX_ARCH (debugging test). Closes: #970698
  * Update Breaks/Replaces to cope with bug regression below

[dgit import unpatched openmpi 4.0.5-5]

Import openmpi_4.0.5-5.debian.tar.xz

[dgit import tarball openmpi 4.0.5-5 openmpi_4.0.5-5.debian.tar.xz]

Import openmpi_4.0.5.orig.tar.xz

[dgit import orig openmpi_4.0.5.orig.tar.xz]

Merge version 4.0.3-9+rpi1 and 4.0.4-1 to produce 4.0.4-1+rpi1

Merge openmpi (4.0.4-1) import into refs/heads/workingbranch

ia64

===================================================================

Gbp-Pq: Name ia64.patch

Use Infiniband on OpenMPI 4.0+

Bug-Origin: https://bugs.debian.org/962180
Last-Updated: 2020-06-09
Forwarded: not-needed

Gbp-Pq: Name use-openib.patch

Turn off warning that openfabric is not available

Last-Updated: 2019-11-19
Forwarded: no

because it breaks some overlying layers/appications in Debian

Gbp-Pq: Name no-warning-unused.patch

fix-underlinking

Desciption: Fix underlinking
  Prevents symbol lookup error: ../openmpi4/mca_mtl_ofi.so:
  undefined symbol: fi_dupinfo when linked with --as-needed
Bug-Debian: https://bugs.debian.org/899104
Last-Update: 2018-05-23

Gbp-Pq: Name fix-underlinking.patch

Makefile.ompi-rules: don't set silent building

Gbp-Pq: Name verbose-ompi-rules.patch

fix test-suite to build on ppc64el

Origin: Vendor
Bug-Debian: https://bugs.debian.org/cgi-bin/bugreport.cgi?bug=848218
Forwarded: no
Last-Update: 2016-12-15

Test suite hangs on ppc64el. This is due to a bug in test/class/opal_fifo.c.
thread_test() must end with pthread_exit(NULL), not return NULL.
Last-Update: 2016-12-15
Gbp-Pq: Name opal_fifo.patch

Support for the HPPA architecture

Bug-Origin: https://bugs.debian.org/cgi-bin/bugreport.cgi?bug=776730
Last-Updated: 2016-09-04
Forwarded: no

Gbp-Pq: Name hppa.patch

Change install libdir to openmpi3

Last-Updated: 2019-03-09
Forwarded: no

This is needed to ensure that libopenmpi2, libopenmpi3 do not collide.

Gbp-Pq: Name libdir.patch

Fix build problems on hurd-i386

Forwarded: partially
Last-Update: 2018-10-24

This patch allows Open MPI to build on Debian GNU/HURD.

Also, the memory:linux MCA component is disabled, since its use of POSIX API
in malloc hooks called very early at startup causes troubles.

Also changes by Samuel Thibault <sthibault@debian.org>
See bugs.debian.org/846965

Gbp-Pq: Name build_hurd

Fix problems in manpages

Forwarded: no
Last-Update: 2018-04-08

In some man page headers, a macro (-*-) is used which makes lintian
 choke and probably should not be there anyway.

Gbp-Pq: Name manpage_macros

mpifort

===================================================================

Gbp-Pq: Name mpifort.patch

Enable non-gfortran compilation

Last-Updated: 2020-01-13
Forwarded: no

Gbp-Pq: Name pkg-config.patch

openmpi (4.0.4-1) unstable; urgency=medium

  * New upstream release
  * Update libversions:
    libmpi.so 40.20.3 -> 40.20.4
    libopen-pal.so 40.20.3 -> 40.20.4
    libopen-rte.so 40.20.3 -> 40.20.4
    libmpi_usempif08: 40.21.0 -> 40.21.1
  * Updated build config for ia64, thanks to John Paul Adrian Glaubitz.
Closes: #963729
[dgit import unpatched openmpi 4.0.4-1]

Import openmpi_4.0.4.orig.tar.xz

[dgit import orig openmpi_4.0.4.orig.tar.xz]

Import openmpi_4.0.4-1.debian.tar.xz

[dgit import tarball openmpi 4.0.4-1 openmpi_4.0.4-1.debian.tar.xz]

Merge version 4.0.3-8+rpi1 and 4.0.3-9 to produce 4.0.3-9+rpi1

Merge openmpi (4.0.3-9) import into refs/heads/workingbranch

Use Infiniband on OpenMPI 4.0+

Bug-Origin: https://bugs.debian.org/962180
Last-Updated: 2020-06-09
Forwarded: not-needed

Gbp-Pq: Name use-openib.patch

Turn off warning that openfabric is not available

Last-Updated: 2019-11-19
Forwarded: no

because it breaks some overlying layers/appications in Debian

Gbp-Pq: Name no-warning-unused.patch

fix-underlinking

Desciption: Fix underlinking
  Prevents symbol lookup error: ../openmpi4/mca_mtl_ofi.so:
  undefined symbol: fi_dupinfo when linked with --as-needed
Bug-Debian: https://bugs.debian.org/899104
Last-Update: 2018-05-23

Gbp-Pq: Name fix-underlinking.patch

Makefile.ompi-rules: don't set silent building

Gbp-Pq: Name verbose-ompi-rules.patch

fix test-suite to build on ppc64el

Origin: Vendor
Bug-Debian: https://bugs.debian.org/cgi-bin/bugreport.cgi?bug=848218
Forwarded: no
Last-Update: 2016-12-15

Test suite hangs on ppc64el. This is due to a bug in test/class/opal_fifo.c.
thread_test() must end with pthread_exit(NULL), not return NULL.
Last-Update: 2016-12-15
Gbp-Pq: Name opal_fifo.patch

Support for the HPPA architecture

Bug-Origin: https://bugs.debian.org/cgi-bin/bugreport.cgi?bug=776730
Last-Updated: 2016-09-04
Forwarded: no

Gbp-Pq: Name hppa.patch

Change install libdir to openmpi3

Last-Updated: 2019-03-09
Forwarded: no

This is needed to ensure that libopenmpi2, libopenmpi3 do not collide.

Gbp-Pq: Name libdir.patch

Fix build problems on hurd-i386

Forwarded: partially
Last-Update: 2018-10-24

This patch allows Open MPI to build on Debian GNU/HURD.

Also, the memory:linux MCA component is disabled, since its use of POSIX API
in malloc hooks called very early at startup causes troubles.

Also changes by Samuel Thibault <sthibault@debian.org>
See bugs.debian.org/846965

Gbp-Pq: Name build_hurd

Fix problems in manpages

Forwarded: no
Last-Update: 2018-04-08

In some man page headers, a macro (-*-) is used which makes lintian
 choke and probably should not be there anyway.

Gbp-Pq: Name manpage_macros

mpifort

===================================================================

Gbp-Pq: Name mpifort.patch

Enable non-gfortran compilation

Last-Updated: 2020-01-13
Forwarded: no

Gbp-Pq: Name pkg-config.patch

openmpi (4.0.3-9) unstable; urgency=medium

  * Add config to use Infiniband on 4.0+. Closes: #962180

[dgit import unpatched openmpi 4.0.3-9]

Import openmpi_4.0.3-9.debian.tar.xz

[dgit import tarball openmpi 4.0.3-9 openmpi_4.0.3-9.debian.tar.xz]

Merge version 4.0.3-6+rpi1 and 4.0.3-8 to produce 4.0.3-8+rpi1

Merge openmpi (4.0.3-8) import into refs/heads/workingbranch

Turn off warning that openfabric is not available

Last-Updated: 2019-11-19
Forwarded: no

because it breaks some overlying layers/appications in Debian

Gbp-Pq: Name no-warning-unused.patch

fix-underlinking

Desciption: Fix underlinking
  Prevents symbol lookup error: ../openmpi4/mca_mtl_ofi.so:
  undefined symbol: fi_dupinfo when linked with --as-needed
Bug-Debian: https://bugs.debian.org/899104
Last-Update: 2018-05-23

Gbp-Pq: Name fix-underlinking.patch

Makefile.ompi-rules: don't set silent building

Gbp-Pq: Name verbose-ompi-rules.patch

fix test-suite to build on ppc64el

Origin: Vendor
Bug-Debian: https://bugs.debian.org/cgi-bin/bugreport.cgi?bug=848218
Forwarded: no
Last-Update: 2016-12-15

Test suite hangs on ppc64el. This is due to a bug in test/class/opal_fifo.c.
thread_test() must end with pthread_exit(NULL), not return NULL.
Last-Update: 2016-12-15
Gbp-Pq: Name opal_fifo.patch

Support for the HPPA architecture

Bug-Origin: https://bugs.debian.org/cgi-bin/bugreport.cgi?bug=776730
Last-Updated: 2016-09-04
Forwarded: no

Gbp-Pq: Name hppa.patch

Change install libdir to openmpi3

Last-Updated: 2019-03-09
Forwarded: no

This is needed to ensure that libopenmpi2, libopenmpi3 do not collide.

Gbp-Pq: Name libdir.patch

Fix build problems on hurd-i386

Forwarded: partially
Last-Update: 2018-10-24

This patch allows Open MPI to build on Debian GNU/HURD.

Also, the memory:linux MCA component is disabled, since its use of POSIX API
in malloc hooks called very early at startup causes troubles.

Also changes by Samuel Thibault <sthibault@debian.org>
See bugs.debian.org/846965

Gbp-Pq: Name build_hurd

Fix problems in manpages

Forwarded: no
Last-Update: 2018-04-08

In some man page headers, a macro (-*-) is used which makes lintian
 choke and probably should not be there anyway.

Gbp-Pq: Name manpage_macros

mpifort

===================================================================

Gbp-Pq: Name mpifort.patch

Enable non-gfortran compilation

Last-Updated: 2020-01-13
Forwarded: no

Gbp-Pq: Name pkg-config.patch

openmpi (4.0.3-8) unstable; urgency=medium

  * Undo 64-bit;
  * Add breaks to avoid libhwloc.so.5/so.15 collision. Closes: #961631

[dgit import unpatched openmpi 4.0.3-8]

Import openmpi_4.0.3-8.debian.tar.xz

[dgit import tarball openmpi 4.0.3-8 openmpi_4.0.3-8.debian.tar.xz]

Manual merge of version 4.0.2-5+rpi1 and 4.0.3-6 to produce 4.0.3-6+rpi1

Merge openmpi (4.0.3-6) import into refs/heads/workingbranch

Turn off warning that openfabric is not available

Last-Updated: 2019-11-19
Forwarded: no

because it breaks some overlying layers/appications in Debian

Gbp-Pq: Name no-warning-unused.patch

fix-underlinking

Desciption: Fix underlinking
  Prevents symbol lookup error: ../openmpi4/mca_mtl_ofi.so:
  undefined symbol: fi_dupinfo when linked with --as-needed
Bug-Debian: https://bugs.debian.org/899104
Last-Update: 2018-05-23

Gbp-Pq: Name fix-underlinking.patch