Tests are now working in /var/lib/pysam

Only install needed files

Enable running tests (needs more work)

Enable proper cleaning by preserving original Cython created files.

Next try to install python-pysam

This does not work ...

Add package carrying test data

Test suite needs installed samtools.

Enable proper cleanup after running tests

Add DEP3 comment

Ensure that test suite is really running and we are not trying to fetch files from upstream (== removing four tests from test suite in a patch)

Fix format of debian/copyright

According to lintian the section should be python

Prevent uploading distribute_setup

Add X-Python-Version: >= 2.6

cme fix dpkg-control; I need this package for just injected fitgpc

Corrected version number.

Debhelper 9.

Normalised with config-model-edit.

Merge tag 'upstream/0.7.5'

Upstream version 0.7.5

# gpg: Signature made Fri 09 Aug 2013 18:34:40 JST using RSA key ID 2295D502
# gpg: Good signature from "Charles Plessy <plessy@debian.org>"

Imported Upstream version 0.7.5

Merge tag 'upstream/0.7.4'

Upstream version 0.7.4

# gpg: Signature made Fri 09 Aug 2013 18:34:36 JST using RSA key ID 2295D502
# gpg: Good signature from "Charles Plessy <plessy@debian.org>"

Imported Upstream version 0.7.4

Merge tag 'upstream/0.7.3'

Upstream version 0.7.3

# gpg: Signature made Fri 09 Aug 2013 18:34:33 JST using RSA key ID 2295D502
# gpg: Good signature from "Charles Plessy <plessy@debian.org>"

Imported Upstream version 0.7.3

Merge tag 'upstream/0.7.2'

Upstream version 0.7.2

# gpg: Signature made Fri 09 Aug 2013 18:34:29 JST using RSA key ID 2295D502
# gpg: Good signature from "Charles Plessy <plessy@debian.org>"

Imported Upstream version 0.7.2

Merge tag 'upstream/0.7.1'

Upstream version 0.7.1

# gpg: Signature made Fri 09 Aug 2013 18:34:23 JST using RSA key ID 2295D502
# gpg: Good signature from "Charles Plessy <plessy@debian.org>"

Imported Upstream version 0.7.1

added python-all-dev dependency to support multiple python versions

deactivate pysam tests, it was testing the installed python-pysam vs. samtools packages

run pysam tests

new upstream release 0.7

use dh python2

bump Standards-Version: 3.9.3 (no changes)

Merge tag 'upstream/0.7'

Upstream version 0.7

Imported Upstream version 0.7

remove python2.7-dev dependency, decreased version of cython dependency

# New upstream release.

Imported Upstream version 0.6

Merge commit 'upstream/0.6'

Corrected watch file.

New upstream release.

Merge commit 'upstream/0.5'

Imported Upstream version 0.5

Needs python2.7-dev because of cython.

Build-depends on python-setuptools (>= 0.6c11).

 # Small progresses on collation of copyright notices and license statements.

 # This is a draft package that is not ready for upload.

 # Build-depends on python-setuptools.

 # Issue 54 fixed upstreaml; removed patch system.

 # Issue 54 fixed upstream. Removed patch system.

 # New upstream release.

Imported Upstream version 0.4.1

Merge commit 'upstream/0.4.1'

Merge commit 'upstream/0.4'

Imported Upstream version 0.4

 # Allow the use of backported versions of debhelper.

# Using quilt as a patch system.

# Patch fixing upstream issue n°54.

Description: pytype not defined for FloatType tags
URL: http://code.google.com/p/pysam/issues/detail?id=54

 # Build-depends on zlib1g-dev.

zlib1g-dev is pulled by other packages necessary to build pysam, but it looks
like a direct need since the binary package depends on zlib1g.

 # Added python:Depends substitution variable.

 # Build-depends on python-dev.

 # DRAFT package.

 # Sample files from dh-make 0.57.

Imported Upstream version 0.3.1

Imported Upstream version 0.3

Imported Upstream version 0.2

Imported Upstream version 0.1.2

Imported Upstream version 0.1.1

Imported Upstream version 0.1