nipy (0.1.999-2) unstable; urgency=low
authorYaroslav Halchenko <debian@onerussian.com>
Sun, 12 Feb 2012 15:59:44 +0000 (15:59 +0000)
committerYaroslav Halchenko <debian@onerussian.com>
Sun, 12 Feb 2012 15:59:44 +0000 (15:59 +0000)
  * Recommend sympy (thanks Chris Filo Gorgolewski for the report)
  * Respect PYTHONPATH while running tests

[dgit import unpatched nipy 0.1.999-2]

21 files changed:
1  2 
debian/changelog
debian/compat
debian/control
debian/copyright
debian/docs
debian/gbp.conf
debian/patches/jaunty-dsc-patch-nodbg
debian/patches/karmic-dsc-patch-nodbg
debian/patches/lenny-dsc-patch-nodbg
debian/patches/lucid-dsc-patch-nodbg
debian/patches/lucid-dsc-patch-nodoc
debian/patches/series
debian/pycompat
debian/python-nipy-doc.docs
debian/python-nipy-doc.examples
debian/python-nipy-doc.links
debian/python-nipy-doc.lintian-overrides
debian/pyversions
debian/rules
debian/source/format
debian/source/options

index 0000000000000000000000000000000000000000,0000000000000000000000000000000000000000..007622527f0ef7d94bec6fa013a700b3f0dee8eb
new file mode 100644 (file)
--- /dev/null
--- /dev/null
@@@ -1,0 -1,0 +1,158 @@@
++nipy (0.1.999-2) unstable; urgency=low
++
++  * Recommend sympy (thanks Chris Filo Gorgolewski for the report)
++  * Respect PYTHONPATH while running tests
++
++ -- Yaroslav Halchenko <debian@onerussian.com>  Sun, 12 Feb 2012 10:59:44 -0500
++
++nipy (0.1.999-1) unstable; urgency=low
++
++  * Alpha release in preparation for upcoming 0.2.0 release (Closes: #581394)
++  * No changes within upstream codebase (Closes: #643225)
++  * Do not unittest if nocheck is provided (Closes: #649620)
++  * Boosted policy compliance to 3.9.2 -- no changes
++  * Patch lucid-dsc-patch-nodoc to avoid trying to build -doc on lucid
++    due to the failure to install needed build-depends
++
++ -- Yaroslav Halchenko <debian@onerussian.com>  Sun, 27 Nov 2011 22:06:21 -0500
++
++nipy (0.1.2+201100720-2) unstable; urgency=low
++
++  * Merged commits from upstream contributed by Matthew Brett to fix failing
++    unittests on big-endians.  Current upstream point:
++    upstream/0.1.2+20110404-74-g698b432
++
++ -- Yaroslav Halchenko <debian@onerussian.com>  Sat, 23 Jul 2011 22:34:15 -0400
++
++nipy (0.1.2+201100720-1) unstable; urgency=low
++
++  * Fresh upstream snapshot: 2c11ae604762105a4adaa46c57e95dc1998485eb
++    - might address FTBFS due to tests on some architectures
++
++ -- Yaroslav Halchenko <debian@onerussian.com>  Wed, 20 Jul 2011 10:01:30 -0400
++
++nipy (0.1.2+20110404-1) unstable; urgency=low
++
++  * Fresh upstream snapshot: c213cc2421686b5485e43db54ec2ac8a5fa06ea6
++    - Relies on external nibabel module instead of internal outdated
++      copy.  Should close 611316, which would be done upon successfull
++      build across the architectures.
++      - Does not use PyNIfTI any longer, so it is removed from *Depends
++      now
++    - Absorbed all Debian patches
++  * No cdbs was used since nearly a year ago -- removed it from Build-Depends
++
++ -- Yaroslav Halchenko <debian@onerussian.com>  Mon, 04 Apr 2011 09:54:56 -0400
++
++nipy (0.1.2+20110114-1) unstable; urgency=low
++
++  * Fresh upstream snapshot: 136acf09beff315226e4cfa07066b1f5998e9d5e
++    * Carries numpydoc compatible with sphinx >= 1.0 (Closes: #588625)
++  * Do not compress objects.inv necessary for intersphinx (Closes: #608763)
++  * Added few patches (submitted upstream) to fix building of documentation
++    - 0001-make-few-classes-new-style-derive-from-object.patch
++    - 0002-make-classes-without-new-style-derive-from-object.patch
++    - 0003-import-similarity_measures-as-_sms-in-histogram_regi.patch
++  * Adjusted debian/rules:
++    - run unittests now against default python version
++      on the installed version of nipy.  Skipped unittests due to known
++      failures or non-labile tests subject to random data:
++        test_slice_from_3d, test_screen, test_lips3_disjoint, test_mu2tet,
++      test_input_effects, test_same_basis, test_fullrank, test_ec,
++        test_apply_affine, test_lips1_disjoint, test_dtrsm
++    - assure Agg matplotlib backend during documentation build and unittests
++  * Added *-dsc-patch-nodbg backport-dsc patches to avoid building of -dbg
++    package since python-scipy-dbg is missing on lenny or ubuntu releases
++    prior maverick (not sufficient anyways due to other missing versioned
++    build-dependencies atm -- matplotlib, sympy)
++  * Versioned Build-Dependency sympy >= 0.6.6
++
++ -- Yaroslav Halchenko <debian@onerussian.com>  Fri, 14 Jan 2011 19:33:28 -0500
++
++nipy (0.1.2+20101206-1) UNRELEASED; urgency=low
++
++  * Fresh upstream snapshot: a0fd6c6c62d91315cdeb8bc81e19f355b12f8013
++    Never officially released, thus changelogs moved upstairs
++
++ -- Yaroslav Halchenko <debian@onerussian.com>  Thu, 13 Jan 2011 21:02:35 -0500
++
++nipy (0.1.2+20100526-2) unstable; urgency=medium
++
++  * Strict version dependency on NumPy to assure ABI compatibility in the
++    future (Closes: #590737). Thanks Kumar Appaiah for the reminder.
++  * debian/copyright:
++    - Added missing copyrights/licenses
++    - Adjusted formatting to match DEP5 rev 135
++    - Citing BSD-3 license verbatim to be compliant with 3.9.0
++  * Boosted policy compliance to 3.9.1 (BSD-3 license verbatim)
++  * Medium urgency for faster propagation of RC bug fix into squeeze
++  * Added gbp.conf file for easy building using g-b-p
++
++ -- Yaroslav Halchenko <debian@onerussian.com>  Fri, 06 Aug 2010 11:17:05 -0400
++
++nipy (0.1.2+20100526-1) unstable; urgency=low
++
++  * Fresh upstream snapshot -- needed a new orig.tar.gz since some
++    files were moved/removed
++  * Switching to dh from cdbs:
++    - Assure no documentation is built during binary-arch builds
++      (closes: #581204, #581783)
++    - Build for all supported Python versions
++    - Expanded Build-Depends with all necessary -dbg packages
++      (e.g. cython-dbg, python-all-dbg)
++    - Added dvipng into Build-Depends for avoiding problems during
++      documentation build
++
++ -- Yaroslav Halchenko <debian@onerussian.com>  Tue, 11 May 2010 21:17:20 -0400
++
++nipy (0.1.2+20100505-1) unstable; urgency=low
++
++  * Fresh upstream snapshot (Closes: #577898). Switching from bzr rev to
++    git dated versioning for nipy for now
++  * Debian packaging moved to be on top of a newly created
++    git repository for nipy upstream
++  * Adhering to a new deb source format 3.0 (quilt)
++  * Policy compliance to 3.8.4 (no changes due)
++  * Switching over to NeuroDebian team
++  * -doc: no pdf's for Documentation (removed texlive,
++    texlive-latex-extra from Build-Depends) (Closes: #567757)
++  * Confirming (and refactoring) NMUs from Kumar (THANKS!):
++    + As promised, closing the issue with absent i386 builds (Closes: #562246)
++    + Adding both PATH= and MPLCONFIGDIR= for building docs
++    + Addressed fortran binding issue with patchless solution:
++      unexport of LDFLAGS in debian/rules which brings -shared back
++      to game (see #535699 for more information)
++
++ -- Yaroslav Halchenko <debian@onerussian.com>  Tue, 04 May 2010 23:01:12 -0400
++
++nipy (0.1.2+1741-2.2) unstable; urgency=low
++
++  * Non-maintainer upload.
++  * Use $(CURDIR) instead of $(PWD) in debian/rules. (Closes: #535699)
++
++ -- Kumar Appaiah <akumar@debian.org>  Sun, 31 Jan 2010 08:40:11 -0600
++
++nipy (0.1.2+1741-2.1) unstable; urgency=medium
++
++  * Non-maintainer upload.
++  * Fix "FTBFS: Tries to write to $HOME during build" using Peter Green's
++    patch.
++  * In addition, make package buildable by hacking the build system to use
++    -shared and -lpython<ver> for all gfortran using modules. (Closes:
++    #535699)
++
++ -- Kumar Appaiah <akumar@debian.org>  Sun, 31 Jan 2010 00:40:11 -0600
++
++nipy (0.1.2+1741-2) unstable; urgency=low
++
++  * Adjusted long descriptions to follow the guidelines and to become
++    complete sentences with redundant prefixes (closes: #532860)
++
++ -- Yaroslav Halchenko <debian@onerussian.com>  Fri, 12 Jun 2009 16:56:54 -0400
++
++nipy (0.1.2+1741-1) unstable; urgency=low
++
++  * Initial release (Closes: #522353)
++
++ -- Experimental Psychology Maintainers <pkg-exppsy-maintainers@lists.alioth.debian.org>  Tue, 14 Apr 2009 18:21:44 -0400
++
diff --cc debian/compat
index 0000000000000000000000000000000000000000,0000000000000000000000000000000000000000..7f8f011eb73d6043d2e6db9d2c101195ae2801f2
new file mode 100644 (file)
--- /dev/null
--- /dev/null
@@@ -1,0 -1,0 +1,1 @@@
++7
diff --cc debian/control
index 0000000000000000000000000000000000000000,0000000000000000000000000000000000000000..e2f1df5cb27cdffee7e64daa87a298de48df68a9
new file mode 100644 (file)
--- /dev/null
--- /dev/null
@@@ -1,0 -1,0 +1,82 @@@
++Source: nipy
++Section: python
++Priority: extra
++Maintainer: NeuroDebian Team <team@neuro.debian.net>
++Uploaders: Yaroslav Halchenko <debian@onerussian.com>, Michael Hanke <michael.hanke@gmail.com>
++Build-Depends: debhelper (>= 7.0.50~), python-all-dev (>= 2.5), python-support (>= 0.6),
++                         python-scipy (>= 0.5), python-numpy (>= 1.2), python-matplotlib (>= 0.98.3),
++                         python-sphinx (>= 0.6), cython,
++                         python-nibabel, python-nose, python-sympy (>= 0.6.6),
++                         liblapack-dev,
++                         python-all-dbg, python-numpy-dbg, python-scipy-dbg, cython-dbg,
++                         graphviz, dvipng
++Standards-Version: 3.9.2
++Homepage: http://neuroimaging.scipy.org
++Vcs-Browser: http://git.debian.org/?p=pkg-exppsy/nipy.git
++Vcs-Git: git://git.debian.org/git/pkg-exppsy/nipy.git
++
++
++Package: python-nipy
++Architecture: all
++Depends: ${shlibs:Depends}, ${misc:Depends}, ${python:Depends},
++         python-scipy, python-numpy (>=1.2),
++         python-nibabel,
++         python-nipy-lib (>= ${source:Version}),
++Recommends: python-matplotlib,
++         mayavi2,
++         python-sympy,
++Suggests: python-mvpa
++Provides: ${python:Provides}
++XB-Python-Version: ${python:Versions}
++Description: Analysis of structural and functional neuroimaging data
++ NiPy is a Python-based framework for the analysis of structural and
++ functional neuroimaging data.  It provides functionality for
++  - General linear model (GLM) statistical analysis
++  - Combined slice time correction and motion correction
++  - General image registration routines with flexible cost functions,
++    optimizers and re-sampling schemes
++  - Image segmentation
++  - Basic visualization of results in 2D and 3D
++  - Basic time series diagnostics
++  - Clustering and activation pattern analysis across subjects
++  - Reproducibility analysis for group studies
++
++
++Package: python-nipy-lib
++Architecture: any
++Depends: ${shlibs:Depends}, ${misc:Depends}, ${python:Depends}
++Provides: ${python:Provides}
++XB-Python-Version: ${python:Versions}
++Description: Analysis of structural and functional neuroimaging data
++ NiPy is a Python-based framework for the analysis of structural and
++ functional neuroimaging data.
++ .
++ This package provides architecture-dependent builds of the libraries.
++
++
++Package: python-nipy-lib-dbg
++Architecture: any
++Section: debug
++Depends: ${shlibs:Depends}, ${misc:Depends}, ${python:Depends},
++         python-nipy-lib (= ${binary:Version})
++Provides: ${python:Provides}
++XB-Python-Version: ${python:Versions}
++Description: Analysis of structural and functional neuroimaging data
++ NiPy is a Python-based framework for the analysis of structural and
++ functional neuroimaging data.
++ .
++ This package provides debugging symbols for architecture-dependent
++ builds of the libraries.
++
++
++Package: python-nipy-doc
++Architecture: all
++Section: doc
++Depends: ${misc:Depends}, libjs-jquery
++Recommends: python-nipy
++Description: documentation and examples for NiPy
++ This package contains NiPy documentation in various formats (HTML,
++ TXT) including
++  * User manual
++  * Developer guidelines
++  * API documentation
index 0000000000000000000000000000000000000000,0000000000000000000000000000000000000000..c30f0bfe85e524f37bcce07360388c372d61df74
new file mode 100644 (file)
--- /dev/null
--- /dev/null
@@@ -1,0 -1,0 +1,105 @@@
++Format-Specification: http://svn.debian.org/wsvn/dep/web/deps/dep5.mdwn?op=file&rev=135
++Name: NiPy
++Maintainer: Matthew Brett <matthew.brett@gmail.com>
++Source: http://github.com/nipy/nipy
++
++
++Files: *
++Copyright: 2006-2010, NIPY Developers
++License: BSD-3
++  Redistribution and use in source and binary forms, with or without
++  modification, are permitted provided that the following conditions are
++  met:
++  .
++  * Redistributions of source code must retain the above copyright
++     notice, this list of conditions and the following disclaimer.
++  * Redistributions in binary form must reproduce the above
++     copyright notice, this list of conditions and the following
++     disclaimer in the documentation and/or other materials provided
++     with the distribution.
++  * Neither the name of the NIPY Developers nor the names of any
++     contributors may be used to endorse or promote products derived
++     from this software without specific prior written permission.
++  .
++  THIS SOFTWARE IS PROVIDED BY THE COPYRIGHT HOLDERS AND CONTRIBUTORS
++  "AS IS" AND ANY EXPRESS OR IMPLIED WARRANTIES, INCLUDING, BUT NOT
++  LIMITED TO, THE IMPLIED WARRANTIES OF MERCHANTABILITY AND FITNESS FOR
++  A PARTICULAR PURPOSE ARE DISCLAIMED. IN NO EVENT SHALL THE COPYRIGHT
++  OWNER OR CONTRIBUTORS BE LIABLE FOR ANY DIRECT, INDIRECT, INCIDENTAL,
++  SPECIAL, EXEMPLARY, OR CONSEQUENTIAL DAMAGES (INCLUDING, BUT NOT
++  LIMITED TO, PROCUREMENT OF SUBSTITUTE GOODS OR SERVICES; LOSS OF USE,
++  DATA, OR PROFITS; OR BUSINESS INTERRUPTION) HOWEVER CAUSED AND ON ANY
++  THEORY OF LIABILITY, WHETHER IN CONTRACT, STRICT LIABILITY, OR TORT
++  (INCLUDING NEGLIGENCE OR OTHERWISE) ARISING IN ANY WAY OUT OF THE USE
++  OF THIS SOFTWARE, EVEN IF ADVISED OF THE POSSIBILITY OF SUCH DAMAGE.
++
++Files: nipy/io/imageformats/*
++Copyright: 2006-2010, Michael Hanke <michael.hanke@gmail.com>
++           2009-2010, Matthew Brett <matthew.brett@gmail.com>
++License: Expat
++  Permission is hereby granted, free of charge, to any person obtaining a copy
++  of this software and associated documentation files (the "Software"), to deal
++  in the Software without restriction, including without limitation the rights
++  to use, copy, modify, merge, publish, distribute, sublicense, and/or sell
++  copies of the Software, and to permit persons to whom the Software is
++  furnished to do so, subject to the following conditions:
++  .
++  The above copyright notice and this permission notice shall be included in
++  all copies or substantial portions of the Software.
++  .
++  THE SOFTWARE IS PROVIDED "AS IS", WITHOUT WARRANTY OF ANY KIND, EXPRESS OR
++  IMPLIED, INCLUDING BUT NOT LIMITED TO THE WARRANTIES OF MERCHANTABILITY,
++  FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE AND NONINFRINGEMENT. IN NO EVENT SHALL THE
++  AUTHORS OR COPYRIGHT HOLDERS BE LIABLE FOR ANY CLAIM, DAMAGES OR OTHER
++  LIABILITY, WHETHER IN AN ACTION OF CONTRACT, TORT OR OTHERWISE, ARISING FROM,
++  OUT OF OR IN CONNECTION WITH THE SOFTWARE OR THE USE OR OTHER DEALINGS IN
++  THE SOFTWARE.
++
++Files: nipy/io/imageformats/testing/lightunit.py
++Copyright: 2009, The IPython Development Team
++License: BSD-3
++
++Files: nipy/neurospin/*
++Copyright: 2003-2010, CEA-INRIA-INSERM
++License: BSD-3
++
++Files: examples/neurospin/neurospy/configobj.py
++Copyright: 2005-2006, Michael Foord <fuzzyman AT voidspace DOT org DOT uk>
++           2005-2006, Nicola Larosa <nico AT tekNico DOT net>
++License: BSD-3
++
++Files: libfffpy/randomkit/distributions.c
++Copyright: 2005, Robert Kern <robert.kern@gmail.com>
++License: Expat
++   Permission is hereby granted, free of charge, to any person obtaining a
++   copy of this software and associated documentation files (the
++   "Software"), to deal in the Software without restriction, including
++   without limitation the rights to use, copy, modify, merge, publish,
++   distribute, sublicense, and/or sell copies of the Software, and to
++   permit persons to whom the Software is furnished to do so, subject to
++   the following conditions:
++
++   The above copyright notice and this permission notice shall be included
++   in all copies or substantial portions of the Software.
++
++   THE SOFTWARE IS PROVIDED "AS IS", WITHOUT WARRANTY OF ANY KIND, EXPRESS
++   OR IMPLIED, INCLUDING BUT NOT LIMITED TO THE WARRANTIES OF
++   MERCHANTABILITY, FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE AND NONINFRINGEMENT.
++   IN NO EVENT SHALL THE AUTHORS OR COPYRIGHT HOLDERS BE LIABLE FOR ANY
++   CLAIM, DAMAGES OR OTHER LIABILITY, WHETHER IN AN ACTION OF CONTRACT,
++   TORT OR OTHERWISE, ARISING FROM, OUT OF OR IN CONNECTION WITH THE
++   SOFTWARE OR THE USE OR OTHER DEALINGS IN THE SOFTWARE.
++
++Files: libfffpy/randomkit/randomkit.c
++Copyright: 2003-2005, Jean-Sebastien Roy <js@jeannot.org>
++           1997-2002, Makoto Matsumoto and Takuji Nishimura
++License: BSD-3
++
++Files: nipy/fixes/scipy/stats/models
++Copyright: 2006, Jonathan E. Taylor
++License: BSD-3
++
++Files: debian/*
++Copyright: 2009-2010, Yaroslav Halchenko <debian@onerussian.com>
++           2009-2010, Michael Hanke <michael.hanke@gmail.com>
++License: BSD-3
diff --cc debian/docs
index 0000000000000000000000000000000000000000,0000000000000000000000000000000000000000..e845566c06f9bf557d35e8292c37cf05d97a9769
new file mode 100644 (file)
--- /dev/null
--- /dev/null
@@@ -1,0 -1,0 +1,1 @@@
++README
diff --cc debian/gbp.conf
index 0000000000000000000000000000000000000000,0000000000000000000000000000000000000000..115e7bc9982a681d6a3bb6dc7d97e42601ef3edd
new file mode 100644 (file)
--- /dev/null
--- /dev/null
@@@ -1,0 -1,0 +1,5 @@@
++[DEFAULT]
++upstream-branch = master
++debian-branch = debian
++upstream-tag = upstream/%(version)s
++debian-tag = debian/%(version)s
index 0000000000000000000000000000000000000000,0000000000000000000000000000000000000000..c3570cc96c48dfdf1f55844d8c89b5d380efde67
new file mode 120000 (symlink)
--- /dev/null
--- /dev/null
@@@ -1,0 -1,0 +1,1 @@@
++lenny-dsc-patch-nodbg
index 0000000000000000000000000000000000000000,0000000000000000000000000000000000000000..c3570cc96c48dfdf1f55844d8c89b5d380efde67
new file mode 120000 (symlink)
--- /dev/null
--- /dev/null
@@@ -1,0 -1,0 +1,1 @@@
++lenny-dsc-patch-nodbg
index 0000000000000000000000000000000000000000,0000000000000000000000000000000000000000..35ab8828638653a85a35e05e41c0d7dc32c7b634
new file mode 100644 (file)
--- /dev/null
--- /dev/null
@@@ -1,0 -1,0 +1,37 @@@
++From: Yaroslav Halchenko <debian@onerussian.com>
++Subject: Disable building of -dbg packages since distribution lacks scipy-dbg
++
++Vendor: Debian
++
++--- a/debian/control
+++++ b/debian/control
++@@ -8,7 +8,6 @@
++                         python-sphinx (>= 0.6), cython,
++                         python-nibabel, python-nose, python-sympy (>= 0.6.6),
++                         liblapack-dev,
++-                        python-all-dbg, python-numpy-dbg, python-scipy-dbg, cython-dbg,
++                         graphviz, dvipng
++ Standards-Version: 3.9.2
++ Homepage: http://neuroimaging.scipy.org
++@@ -52,21 +51,6 @@
++  This package provides architecture-dependent builds of the libraries.
++ 
++ 
++-Package: python-nipy-lib-dbg
++-Architecture: any
++-Section: debug
++-Depends: ${shlibs:Depends}, ${misc:Depends}, ${python:Depends},
++-         python-nipy-lib (= ${binary:Version})
++-Provides: ${python:Provides}
++-XB-Python-Version: ${python:Versions}
++-Description: Analysis of structural and functional neuroimaging data
++- NiPy is a Python-based framework for the analysis of structural and
++- functional neuroimaging data.
++- .
++- This package provides debugging symbols for architecture-dependent
++- builds of the libraries.
++-
++-
++ Package: python-nipy-doc
++ Architecture: all
++ Section: doc
index 0000000000000000000000000000000000000000,0000000000000000000000000000000000000000..c3570cc96c48dfdf1f55844d8c89b5d380efde67
new file mode 120000 (symlink)
--- /dev/null
--- /dev/null
@@@ -1,0 -1,0 +1,1 @@@
++lenny-dsc-patch-nodbg
index 0000000000000000000000000000000000000000,0000000000000000000000000000000000000000..40aae28dc69445a03483c968bbdd8c65967503e9
new file mode 100644 (file)
--- /dev/null
--- /dev/null
@@@ -1,0 -1,0 +1,50 @@@
++Subject: lucid fails to install necessary components for doc building in clean environment
++
++so dropping -doc package for lucid
++
++--- a/debian/control
+++++ b/debian/control
++@@ -5,10 +5,9 @@
++ Uploaders: Yaroslav Halchenko <debian@onerussian.com>, Michael Hanke <michael.hanke@gmail.com>
++ Build-Depends: debhelper (>= 7.0.50~), python-all-dev (>= 2.5), python-support (>= 0.6),
++                         python-scipy (>= 0.5), python-numpy (>= 1.2), python-matplotlib (>= 0.98.3),
++-                        python-sphinx (>= 0.6), cython,
+++                        cython,
++                         python-nibabel, python-nose, python-sympy (>= 0.6.6),
++                         liblapack-dev,
++-                        graphviz, dvipng
++ Standards-Version: 3.9.2
++ Homepage: http://neuroimaging.scipy.org
++ Vcs-Browser: http://git.debian.org/?p=pkg-exppsy/nipy.git
++@@ -50,15 +49,3 @@
++  .
++  This package provides architecture-dependent builds of the libraries.
++ 
++-
++-Package: python-nipy-doc
++-Architecture: all
++-Section: doc
++-Depends: ${misc:Depends}, libjs-jquery
++-Recommends: python-nipy
++-Description: documentation and examples for NiPy
++- This package contains NiPy documentation in various formats (HTML,
++- TXT) including
++-  * User manual
++-  * Developer guidelines
++-  * API documentation
++--- a/debian/rules
+++++ b/debian/rules
++@@ -78,11 +78,11 @@
++ override_dh_clean:
++      : # I: Custom cleaning
++      rm -rf build doc-stamp nipy/neurospin/__config__.py
++-     $(MAKE) -C doc clean
+++     #$(MAKE) -C doc clean
++      dh_clean
++ 
++ 
++ # We build documentation only for -indep
++-binary-indep: doc-stamp
+++binary-indep:
++ 
++ binary: binary-arch binary-indep
index 0000000000000000000000000000000000000000,0000000000000000000000000000000000000000..e69de29bb2d1d6434b8b29ae775ad8c2e48c5391
new file mode 100644 (file)
--- /dev/null
--- /dev/null
diff --cc debian/pycompat
index 0000000000000000000000000000000000000000,0000000000000000000000000000000000000000..0cfbf08886fca9a91cb753ec8734c84fcbe52c9f
new file mode 100644 (file)
--- /dev/null
--- /dev/null
@@@ -1,0 -1,0 +1,1 @@@
++2
index 0000000000000000000000000000000000000000,0000000000000000000000000000000000000000..8137b041cf99a0384d1a3c2c1f60c66d910a700c
new file mode 100644 (file)
--- /dev/null
--- /dev/null
@@@ -1,0 -1,0 +1,1 @@@
++doc/build/html
index 0000000000000000000000000000000000000000,0000000000000000000000000000000000000000..2c8fad4608850e9f7334d43cd3a877640e76a076
new file mode 100644 (file)
--- /dev/null
--- /dev/null
@@@ -1,0 -1,0 +1,1 @@@
++examples/*.py
index 0000000000000000000000000000000000000000,0000000000000000000000000000000000000000..4d75e6cf38697784ac2393e89451724854cf17c5
new file mode 100644 (file)
--- /dev/null
--- /dev/null
@@@ -1,0 -1,0 +1,1 @@@
++usr/share/javascript/jquery/jquery.js usr/share/doc/python-nipy-doc/html/_static/jquery.js
index 0000000000000000000000000000000000000000,0000000000000000000000000000000000000000..636341d3406acf65da20952bb299a3eec4ed6de3
new file mode 100644 (file)
--- /dev/null
--- /dev/null
@@@ -1,0 -1,0 +1,4 @@@
++# Explicit license file is desired for the completeness of the documentation
++#
++
++python-nipy-doc binary: extra-license-file usr/share/doc/python-nipy-doc/html/_sources/license.txt
index 0000000000000000000000000000000000000000,0000000000000000000000000000000000000000..b3dc41ebcd3c727b1db7817a87949ee7e1adcf51
new file mode 100644 (file)
--- /dev/null
--- /dev/null
@@@ -1,0 -1,0 +1,1 @@@
++2.5-
diff --cc debian/rules
index 0000000000000000000000000000000000000000,0000000000000000000000000000000000000000..908535e66eef5c7614a46bea073d890a1b8ce8e2
new file mode 100755 (executable)
--- /dev/null
--- /dev/null
@@@ -1,0 -1,0 +1,88 @@@
++#!/usr/bin/make -f
++# -*- mode: makefile; coding: utf-8 -*-
++
++export DH_VERBOSE=1
++
++PYVER = $(shell pyversions -vd)
++
++# To fix distutils fragile nature: when seing LDFLAGS=, which is set
++# by dpkg-buildpackage it stops providing -shared flag, so for the
++# minimalistic fix (alternative to NMU-ed #535699 with explicit
++# -shared) we just unexport LDFLAGS
++unexport LDFLAGS
++
++# Mega rule
++%:
++      dh --buildsystem=python_distutils $@
++
++override_dh_auto_test:
++    : # Do not test just after build, lets install and then test
++
++override_dh_auto_build:
++      dh_auto_build
++      echo "backend : Agg" >| build/matplotlibrc
++
++#
++# Documentation
++#
++doc-stamp:
++      : # I: Generate documentation
++      export PYTHONPATH=$$PWD/`/bin/ls -d build/lib.*$(PYVER)` \
++                 MPLCONFIGDIR=$(CURDIR)/build HOME=$(CURDIR)/build; \
++     cd doc; $(MAKE) html
++      : # I: Use jquery from Debian package
++      -rm doc/build/html/_static/jquery.js
++      touch $@
++
++
++#override_dh_auto_install:
++#     dh_auto_install
++
++test:
++ifeq (,$(filter nocheck,$(DEB_BUILD_OPTIONS)))
++      : # I: Unittest only the default python version for now against "installed" materials
++      cd debian; \
++       PYTHONPATH=$$(/bin/ls -d $(CURDIR)/debian/tmp/usr/lib/python$(PYVER)/*-packages):$$PYTHONPATH \
++     MPLCONFIGDIR=$(CURDIR)/build \
++        ../tools/nipnost nipy
++else
++      : # Skip unittests due to nocheck
++endif
++
++override_dh_install: test
++      : # I: Move libraries into the python-nipy-lib and -lib-dbg packages
++      find debian/tmp/ -iname *.so | \
++        while read so; do \
++          d=$$(dirname $$so); \
++              if [ $${so%_d.so} = $${so} ]; then suf=""; else suf="-dbg"; fi; \
++          d=$$(echo $$d | sed -e "s,debian/tmp/,debian/python-nipy-lib$$suf/,g"); \
++          mkdir -p $$d; echo "Moving $$so under $$d"; mv $$so $$d; \
++        done
++      : # I: Move leftovers into python-nipy
++      mkdir -p debian/python-nipy
++      mv debian/tmp/* debian/python-nipy/
++      : # I: Fix up interpreter which might be -dbg one
++      sed -i -e 's,/usr/bin/python-dbg,/usr/bin/python,g' debian/python-nipy/usr/bin/*
++      : # I: Assure versioned dependency on NumPy
++      if [ -x /usr/bin/dh_numpy ]; then dh_numpy;     fi
++
++      dh_install
++
++
++## immediately useable documentation and exemplar scripts/data
++override_dh_compress:
++      : # I: Avoiding compression of what should not be compressed
++      dh_compress -X.py -X.html -X.pdf -X.css -X.jpg -X.txt -X.js -X.json -X.rtc -Xobjects.inv
++
++
++override_dh_clean:
++      : # I: Custom cleaning
++      rm -rf build doc-stamp nipy/neurospin/__config__.py
++      $(MAKE) -C doc clean
++      dh_clean
++
++
++# We build documentation only for -indep
++binary-indep: doc-stamp
++
++binary: binary-arch binary-indep
index 0000000000000000000000000000000000000000,0000000000000000000000000000000000000000..163aaf8d82b6c54f23c45f32895dbdfdcc27b047
new file mode 100644 (file)
--- /dev/null
--- /dev/null
@@@ -1,0 -1,0 +1,1 @@@
++3.0 (quilt)
index 0000000000000000000000000000000000000000,0000000000000000000000000000000000000000..6a8bb0db0ed140aa59c337efe06c9c913a769d7b
new file mode 100644 (file)
--- /dev/null
--- /dev/null
@@@ -1,0 -1,0 +1,1 @@@
++extend-diff-ignore = "(^|/)nipy/COMMIT_INFO.txt$"