run-unit-test: Pass -blastdb_version 4 to fix tests on 32 bit
authorIain Lane <iain@orangesquash.org.uk>
Fri, 4 Sep 2020 11:39:42 +0000 (12:39 +0100)
committerIain Lane <iain@orangesquash.org.uk>
Fri, 4 Sep 2020 11:39:42 +0000 (12:39 +0100)
debian/tests/run-unit-test

index 7e48969bb7318c81c3670658697d6f462b2e8a3c..4347372e46e7acf121a616321f1f91aed85525c6 100644 (file)
@@ -14,7 +14,7 @@ cd $AUTOPKGTEST_TMP
 find . -name "*.gz" -exec gunzip \{\} \;
 
 echo '---Creating Database--'
-/usr/bin/makeblastdb -in testdatabase.fa -parse_seqids -dbtype nucl -out testdb
+/usr/bin/makeblastdb -blastdb_version 4 -in testdatabase.fa -parse_seqids -dbtype nucl -out testdb
 echo '---Searching Database for Hits---'
 /usr/bin/blastn -query test.fa -db testdb -task blastn -dust no -outfmt "7 qseqid sseqid evalue bitscore" -max_target_seqs 2
 echo '---Search and Fetch An Entry From Database---'