Revert "Merge branch 'blastdbv4' into 'master'"
authorAaron M. Ucko <ucko@debian.org>
Sun, 20 Sep 2020 00:50:10 +0000 (20:50 -0400)
committerAaron M. Ucko <ucko@debian.org>
Sun, 20 Sep 2020 00:50:10 +0000 (20:50 -0400)
Fixed on the C++ side in #969608.  This reverts commit
762364cedeed8cbf9ed6acc5d42e479ddcf72b48, reversing changes made to
e46881b79153db2f10891dbb81fef89844ba1ab8.

debian/tests/run-unit-test

index 4347372e46e7acf121a616321f1f91aed85525c6..7e48969bb7318c81c3670658697d6f462b2e8a3c 100644 (file)
@@ -14,7 +14,7 @@ cd $AUTOPKGTEST_TMP
 find . -name "*.gz" -exec gunzip \{\} \;
 
 echo '---Creating Database--'
-/usr/bin/makeblastdb -blastdb_version 4 -in testdatabase.fa -parse_seqids -dbtype nucl -out testdb
+/usr/bin/makeblastdb -in testdatabase.fa -parse_seqids -dbtype nucl -out testdb
 echo '---Searching Database for Hits---'
 /usr/bin/blastn -query test.fa -db testdb -task blastn -dust no -outfmt "7 qseqid sseqid evalue bitscore" -max_target_seqs 2
 echo '---Search and Fetch An Entry From Database---'