Added the tests directory as I think this will solve all the non building problems
authorJorge Soares <j.s.soares@gmail.com>
Fri, 28 Nov 2014 09:08:12 +0000 (09:08 +0000)
committerJorge Soares <j.s.soares@gmail.com>
Fri, 28 Nov 2014 09:08:12 +0000 (09:08 +0000)
92 files changed:
debian/rules
tests/AlignmentFile_test.py [new file with mode: 0644]
tests/SamFile_test.py [new file with mode: 0644]
tests/TestUtils.py [new file with mode: 0644]
tests/_compile_test.pyx [new file with mode: 0644]
tests/_compile_test.pyxbld [new file with mode: 0644]
tests/_cython_flagstat.pyx [new file with mode: 0644]
tests/_cython_flagstat.pyxbld [new file with mode: 0644]
tests/compile_test.py [new file with mode: 0644]
tests/cython_flagstat.py [new file with mode: 0644]
tests/faidx_test.py [new file with mode: 0644]
tests/pysam_data/Makefile [new file with mode: 0644]
tests/pysam_data/ex1.bed [new file with mode: 0644]
tests/pysam_data/ex1.fa [new file with mode: 0644]
tests/pysam_data/ex1.fq [new file with mode: 0644]
tests/pysam_data/ex1.sam.gz [new file with mode: 0644]
tests/pysam_data/ex10.sam [new file with mode: 0644]
tests/pysam_data/ex3.sam [new file with mode: 0644]
tests/pysam_data/ex4.sam [new file with mode: 0644]
tests/pysam_data/ex5.sam [new file with mode: 0644]
tests/pysam_data/ex6.sam [new file with mode: 0644]
tests/pysam_data/ex7.sam.donottest [new file with mode: 0644]
tests/pysam_data/ex8.sam [new file with mode: 0644]
tests/pysam_data/ex9_fail.sam [new file with mode: 0644]
tests/pysam_data/ex9_nofail.sam [new file with mode: 0644]
tests/pysam_data/example_btag.sam [new file with mode: 0644]
tests/pysam_data/example_empty_header.sam [new file with mode: 0644]
tests/pysam_data/example_unmapped_reads_no_sq.sam [new file with mode: 0644]
tests/pysam_data/example_user_header.sam [new file with mode: 0644]
tests/pysam_data/issue100.sam [new file with mode: 0644]
tests/pysam_data/rg_with_tab.sam [new file with mode: 0644]
tests/pysam_data/softclip.sam [new file with mode: 0644]
tests/pysam_data/tag_bug.sam [new file with mode: 0644]
tests/pysam_data/test.gtf [new file with mode: 0644]
tests/pysam_data/test.gtf.gz [new file with mode: 0644]
tests/pysam_data/test_unaligned.sam [new file with mode: 0644]
tests/python_flagstat.py [new file with mode: 0644]
tests/refactoring.pl [new file with mode: 0644]
tests/refactoring.txt [new file with mode: 0644]
tests/samtools_test.py [new file with mode: 0644]
tests/tabix_data/example.bed.gz [new file with mode: 0644]
tests/tabix_data/example.bed.gz.tbi [new file with mode: 0644]
tests/tabix_data/example.gtf.gz [new file with mode: 0644]
tests/tabix_data/example.gtf.gz.tbi [new file with mode: 0644]
tests/tabix_data/example.sam.gz [new file with mode: 0644]
tests/tabix_data/example.sam.gz.tbi [new file with mode: 0644]
tests/tabix_data/example.vcf.gz [new file with mode: 0644]
tests/tabix_data/example.vcf.gz.tbi [new file with mode: 0644]
tests/tabix_data/example.vcf40 [new file with mode: 0644]
tests/tabix_data/example_badcomments.bed.gz [new file with mode: 0644]
tests/tabix_data/example_badcomments.bed.gz.tbi [new file with mode: 0644]
tests/tabix_data/example_badcomments.gtf.gz [new file with mode: 0644]
tests/tabix_data/example_badcomments.gtf.gz.tbi [new file with mode: 0644]
tests/tabix_data/example_badcomments.sam.gz [new file with mode: 0644]
tests/tabix_data/example_badcomments.sam.gz.tbi [new file with mode: 0644]
tests/tabix_data/example_badcomments.vcf.gz [new file with mode: 0644]
tests/tabix_data/example_badcomments.vcf.gz.tbi [new file with mode: 0644]
tests/tabix_data/example_comments.bed.gz [new file with mode: 0644]
tests/tabix_data/example_comments.bed.gz.tbi [new file with mode: 0644]
tests/tabix_data/example_comments.gtf.gz [new file with mode: 0644]
tests/tabix_data/example_comments.gtf.gz.tbi [new file with mode: 0644]
tests/tabix_data/example_comments.sam.gz [new file with mode: 0644]
tests/tabix_data/example_comments.sam.gz.tbi [new file with mode: 0644]
tests/tabix_data/example_comments.vcf.gz [new file with mode: 0644]
tests/tabix_data/example_comments.vcf.gz.tbi [new file with mode: 0644]
tests/tabix_data/example_unicode.vcf [new file with mode: 0644]
tests/tabix_data/gtf_toofew_fields.gtf.gz [new file with mode: 0644]
tests/tabix_data/gtf_toomany_fields.gtf.gz [new file with mode: 0644]
tests/tabix_data/gtf_wrong_fields.gtf.gz [new file with mode: 0644]
tests/tabix_data/vcf/10.vcf [new file with mode: 0644]
tests/tabix_data/vcf/11.vcf [new file with mode: 0644]
tests/tabix_data/vcf/12.vcf [new file with mode: 0644]
tests/tabix_data/vcf/13.vcf [new file with mode: 0644]
tests/tabix_data/vcf/15.vcf [new file with mode: 0644]
tests/tabix_data/vcf/16.vcf [new file with mode: 0644]
tests/tabix_data/vcf/18.vcf [new file with mode: 0644]
tests/tabix_data/vcf/2.vcf [new file with mode: 0644]
tests/tabix_data/vcf/20.vcf [new file with mode: 0644]
tests/tabix_data/vcf/21.vcf [new file with mode: 0644]
tests/tabix_data/vcf/22.vcf [new file with mode: 0644]
tests/tabix_data/vcf/23.vcf [new file with mode: 0644]
tests/tabix_data/vcf/24.vcf [new file with mode: 0644]
tests/tabix_data/vcf/3.vcf [new file with mode: 0644]
tests/tabix_data/vcf/4.vcf [new file with mode: 0644]
tests/tabix_data/vcf/5.vcf [new file with mode: 0644]
tests/tabix_data/vcf/6.vcf [new file with mode: 0644]
tests/tabix_data/vcf/7.vcf [new file with mode: 0644]
tests/tabix_data/vcf/8.vcf [new file with mode: 0644]
tests/tabix_data/vcf/9.vcf [new file with mode: 0644]
tests/tabix_data/vcf/README.txt [new file with mode: 0644]
tests/tabix_data/vcf/issue85.vcf [new file with mode: 0644]
tests/tabix_test.py [new file with mode: 0644]

index 90b3ebe1bbb6171a83aa1bdbcaeae970de863eee..6961e23a06dd54340f29a63e66320a5d8a07119a 100755 (executable)
@@ -42,10 +42,10 @@ override_dh_auto_build: debian/savefiles
 #                                                && HTSLIB_LIBRARY_DIR=$(HTSLIBDIR) HTSLIB_INCLUDE_DIR=/usr/include PYTHONPATH=${build_dir} ${interpreter} ./tabix_test.py '
 # endif
 
-override_dh_install-indep:
-#      dh_install -p $(TESTPKG)
-#      cd debian/$(TESTPKG)/usr/share/doc/python-pysam/tests; \
-#          make clean; \
-#          rm -f log.txt ; \
-#          chmod a+x tabix_test.py
+override_dh_install-indep:
+       dh_install -p $(TESTPKG)
+       cd debian/$(TESTPKG)/usr/share/doc/python-pysam/tests; \
+           make clean; \
+           rm -f log.txt ; \
+           chmod a+x tabix_test.py
 
diff --git a/tests/AlignmentFile_test.py b/tests/AlignmentFile_test.py
new file mode 100644 (file)
index 0000000..785e508
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,2057 @@
+#!/usr/bin/env python
+'''unit testing code for pysam.
+
+Execute in the :file:`tests` directory as it requires the Makefile
+and data files located there.
+'''
+
+import pysam
+import unittest
+import os
+import shutil
+import sys
+import collections
+import subprocess
+import logging
+from TestUtils import checkBinaryEqual, checkURL
+
+IS_PYTHON3 = sys.version_info[0] >= 3
+
+SAMTOOLS = "samtools"
+WORKDIR = "pysam_test_work"
+DATADIR = "pysam_data"
+
+
+class BasicTestBAMFetch(unittest.TestCase):
+
+    '''basic first test - detailed testing
+    if information in file is consistent
+    with information in AlignedSegment object.'''
+
+    def setUp(self):
+        self.samfile = pysam.AlignmentFile(
+            os.path.join(DATADIR, "ex3.bam"),
+            "rb")
+        self.reads = list(self.samfile.fetch())
+
+    def testARqname(self):
+        self.assertEqual(
+            self.reads[0].query_name,
+            "read_28833_29006_6945",
+            "read name mismatch in read 1: %s != %s" % (
+                self.reads[0].query_name, "read_28833_29006_6945"))
+        self.assertEqual(
+            self.reads[1].query_name,
+            "read_28701_28881_323b",
+            "read name mismatch in read 2: %s != %s" % (
+                self.reads[1].query_name, "read_28701_28881_323b"))
+
+    def testARflag(self):
+        self.assertEqual(
+            self.reads[0].flag, 99,
+            "flag mismatch in read 1: %s != %s" % (
+                self.reads[0].flag, 99))
+        self.assertEqual(
+            self.reads[1].flag, 147,
+            "flag mismatch in read 2: %s != %s" % (
+                self.reads[1].flag, 147))
+
+    def testARrname(self):
+        self.assertEqual(
+            self.reads[0].reference_id, 0,
+            "chromosome/target id mismatch in read 1: %s != %s" %
+            (self.reads[0].reference_id, 0))
+        self.assertEqual(
+            self.reads[1].reference_id, 1,
+            "chromosome/target id mismatch in read 2: %s != %s" %
+            (self.reads[1].reference_id, 1))
+
+    def testARpos(self):
+        self.assertEqual(
+            self.reads[0].reference_start, 33 - 1,
+            "mapping position mismatch in read 1: %s != %s" %
+            (self.reads[0].reference_start, 33 - 1))
+        self.assertEqual(
+            self.reads[1].reference_start, 88 - 1,
+            "mapping position mismatch in read 2: %s != %s" %
+            (self.reads[1].reference_start, 88 - 1))
+
+    def testARmapq(self):
+        self.assertEqual(
+            self.reads[0].mapping_quality, 20,
+            "mapping quality mismatch in read 1: %s != %s" %
+            (self.reads[0].mapping_quality, 20))
+        self.assertEqual(
+            self.reads[1].mapping_quality, 30,
+            "mapping quality mismatch in read 2: %s != %s" % (
+                self.reads[1].mapping_quality, 30))
+
+    def testARcigar(self):
+        self.assertEqual(
+            self.reads[0].cigartuples,
+            [(0, 10), (2, 1), (0, 25)],
+            "read name length mismatch in read 1: %s != %s" %
+            (self.reads[0].cigartuples, [(0, 10), (2, 1), (0, 25)]))
+        self.assertEqual(
+            self.reads[1].cigartuples, [(0, 35)],
+            "read name length mismatch in read 2: %s != %s" %
+            (self.reads[1].cigartuples, [(0, 35)]))
+
+    def testARcigarstring(self):
+        self.assertEqual(self.reads[0].cigarstring, '10M1D25M')
+        self.assertEqual(self.reads[1].cigarstring, '35M')
+
+    def testARmrnm(self):
+        self.assertEqual(
+            self.reads[0].next_reference_id, 0,
+            "mate reference sequence name mismatch in read 1: %s != %s" %
+            (self.reads[0].next_reference_id, 0))
+        self.assertEqual(
+            self.reads[1].next_reference_id, 1,
+            "mate reference sequence name mismatch in read 2: %s != %s" %
+            (self.reads[1].next_reference_id, 1))
+        self.assertEqual(
+            self.reads[0].next_reference_id, 0,
+            "mate reference sequence name mismatch in read 1: %s != %s" %
+            (self.reads[0].next_reference_id, 0))
+        self.assertEqual(
+            self.reads[1].next_reference_id, 1,
+            "mate reference sequence name mismatch in read 2: %s != %s" %
+            (self.reads[1].next_reference_id, 1))
+
+    def testARmpos(self):
+        self.assertEqual(self.reads[
+                         0].next_reference_start, 200 - 1, "mate mapping position mismatch in read 1: %s != %s" % (self.reads[0].next_reference_start, 200 - 1))
+        self.assertEqual(self.reads[
+                         1].next_reference_start, 500 - 1, "mate mapping position mismatch in read 2: %s != %s" % (self.reads[1].next_reference_start, 500 - 1))
+        self.assertEqual(self.reads[
+                         0].next_reference_start, 200 - 1, "mate mapping position mismatch in read 1: %s != %s" % (self.reads[0].next_reference_start, 200 - 1))
+        self.assertEqual(self.reads[
+                         1].next_reference_start, 500 - 1, "mate mapping position mismatch in read 2: %s != %s" % (self.reads[1].next_reference_start, 500 - 1))
+
+    def testARQueryLength(self):
+        self.assertEqual(
+            self.reads[0].query_length, 35,
+            "insert size mismatch in read 1: %s != %s" %
+            (self.reads[0].query_length, 35))
+        self.assertEqual(
+            self.reads[1].query_length, 35,
+            "insert size mismatch in read 2: %s != %s" %
+            (self.reads[1].query_length, 35))
+        self.assertEqual(
+            self.reads[0].query_length, 35,
+            "insert size mismatch in read 1: %s != %s" %
+            (self.reads[0].query_length, 35))
+        self.assertEqual(
+            self.reads[1].query_length, 35,
+            "insert size mismatch in read 2: %s != %s" %
+            (self.reads[1].query_length, 35))
+
+    def testARseq(self):
+        self.assertEqual(self.reads[0].query_sequence, "AGCTTAGCTAGCTACCTATATCTTGGTCTTGGCCG", "sequence mismatch in read 1: %s != %s" % (
+            self.reads[0].query_sequence, "AGCTTAGCTAGCTACCTATATCTTGGTCTTGGCCG"))
+        self.assertEqual(self.reads[1].query_sequence, "ACCTATATCTTGGCCTTGGCCGATGCGGCCTTGCA", "sequence size mismatch in read 2: %s != %s" % (
+            self.reads[1].query_sequence, "ACCTATATCTTGGCCTTGGCCGATGCGGCCTTGCA"))
+        self.assertEqual(self.reads[3].query_sequence, "AGCTTAGCTAGCTACCTATATCTTGGTCTTGGCCG", "sequence mismatch in read 4: %s != %s" % (
+            self.reads[3].query_sequence, "AGCTTAGCTAGCTACCTATATCTTGGTCTTGGCCG"))
+
+    def testARqual(self):
+        self.assertEqual(pysam.toQualityString(self.reads[0].query_qualities), "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<9/,&,22;;<<<",
+                         "quality string mismatch in read 1: %s != %s" % (pysam.toQualityString(self.reads[0].query_qualities), "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<9/,&,22;;<<<"))
+        self.assertEqual(pysam.toQualityString(self.reads[1].query_qualities), "<<<<<;<<<<7;:<<<6;<<<<<<<<<<<<7<<<<", "quality string mismatch in read 2: %s != %s" % (
+            pysam.toQualityString(self.reads[1].query_qualities), "<<<<<;<<<<7;:<<<6;<<<<<<<<<<<<7<<<<"))
+        self.assertEqual(pysam.toQualityString(self.reads[3].query_qualities), "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<9/,&,22;;<<<",
+                         "quality string mismatch in read 3: %s != %s" % (pysam.toQualityString(self.reads[3].query_qualities), "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<9/,&,22;;<<<"))
+
+    def testARquery(self):
+        self.assertEqual(self.reads[0].query_alignment_sequence, "AGCTTAGCTAGCTACCTATATCTTGGTCTTGGCCG", "query mismatch in read 1: %s != %s" % (
+            self.reads[0].query_alignment_sequence, "AGCTTAGCTAGCTACCTATATCTTGGTCTTGGCCG"))
+        self.assertEqual(self.reads[1].query_alignment_sequence, "ACCTATATCTTGGCCTTGGCCGATGCGGCCTTGCA", "query size mismatch in read 2: %s != %s" % (
+            self.reads[1].query_alignment_sequence, "ACCTATATCTTGGCCTTGGCCGATGCGGCCTTGCA"))
+        self.assertEqual(self.reads[3].query_alignment_sequence, "TAGCTAGCTACCTATATCTTGGTCTT", "query mismatch in read 4: %s != %s" % (
+            self.reads[3].query_alignment_sequence, "TAGCTAGCTACCTATATCTTGGTCTT"))
+
+    def testARqqual(self):
+        self.assertEqual(pysam.toQualityString(self.reads[0].query_alignment_qualities), "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<9/,&,22;;<<<",
+                         "qquality string mismatch in read 1: %s != %s" % (pysam.toQualityString(self.reads[0].query_alignment_qualities), "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<9/,&,22;;<<<"))
+        self.assertEqual(pysam.toQualityString(self.reads[1].query_alignment_qualities), "<<<<<;<<<<7;:<<<6;<<<<<<<<<<<<7<<<<", "qquality string mismatch in read 2: %s != %s" % (
+            pysam.toQualityString(self.reads[1].query_alignment_qualities), "<<<<<;<<<<7;:<<<6;<<<<<<<<<<<<7<<<<"))
+        self.assertEqual(pysam.toQualityString(self.reads[3].query_alignment_qualities), "<<<<<<<<<<<<<<<<<:<9/,&,22",
+                         "qquality string mismatch in read 3: %s != %s" % (pysam.toQualityString(self.reads[3].query_alignment_qualities), "<<<<<<<<<<<<<<<<<:<9/,&,22"))
+
+    def testPresentOptionalFields(self):
+        self.assertEqual(self.reads[0].opt(
+            'NM'), 1, "optional field mismatch in read 1, NM: %s != %s" % (self.reads[0].opt('NM'), 1))
+        self.assertEqual(self.reads[0].opt(
+            'RG'), 'L1', "optional field mismatch in read 1, RG: %s != %s" % (self.reads[0].opt('RG'), 'L1'))
+        self.assertEqual(self.reads[1].opt(
+            'RG'), 'L2', "optional field mismatch in read 2, RG: %s != %s" % (self.reads[1].opt('RG'), 'L2'))
+        self.assertEqual(self.reads[1].opt(
+            'MF'), 18, "optional field mismatch in read 2, MF: %s != %s" % (self.reads[1].opt('MF'), 18))
+
+    def testPairedBools(self):
+        self.assertEqual(self.reads[0].is_paired, True, "is paired mismatch in read 1: %s != %s" % (
+            self.reads[0].is_paired, True))
+        self.assertEqual(self.reads[1].is_paired, True, "is paired mismatch in read 2: %s != %s" % (
+            self.reads[1].is_paired, True))
+        self.assertEqual(self.reads[0].is_proper_pair, True, "is proper pair mismatch in read 1: %s != %s" % (
+            self.reads[0].is_proper_pair, True))
+        self.assertEqual(self.reads[1].is_proper_pair, True, "is proper pair mismatch in read 2: %s != %s" % (
+            self.reads[1].is_proper_pair, True))
+
+    def testTags(self):
+        self.assertEqual(self.reads[0].tags,
+                         [('NM', 1), ('RG', 'L1'),
+                          ('PG', 'P1'), ('XT', 'U')])
+        self.assertEqual(self.reads[1].tags,
+                         [('MF', 18), ('RG', 'L2'),
+                          ('PG', 'P2'), ('XT', 'R')])
+
+    def testAddTags(self):
+        self.assertEqual(sorted(self.reads[0].tags),
+                         sorted([('NM', 1), ('RG', 'L1'),
+                                 ('PG', 'P1'), ('XT', 'U')]))
+
+        self.reads[0].setTag('X1', 'C')
+        self.assertEqual(sorted(self.reads[0].tags),
+                         sorted([('X1', 'C'), ('NM', 1), ('RG', 'L1'),
+                                 ('PG', 'P1'), ('XT', 'U'), ]))
+        self.reads[0].setTag('X2', 5)
+        self.assertEqual(sorted(self.reads[0].tags),
+                         sorted([('X2', 5), ('X1', 'C'),
+                                 ('NM', 1), ('RG', 'L1'),
+                                 ('PG', 'P1'), ('XT', 'U'), ]))
+        # add with replacement
+        self.reads[0].setTag('X2', 10)
+        self.assertEqual(sorted(self.reads[0].tags),
+                         sorted([('X2', 10), ('X1', 'C'),
+                                 ('NM', 1), ('RG', 'L1'),
+                                 ('PG', 'P1'), ('XT', 'U'), ]))
+
+        # add without replacement
+        self.reads[0].setTag('X2', 5, replace=False)
+        self.assertEqual(sorted(self.reads[0].tags),
+                         sorted([('X2', 10), ('X1', 'C'),
+                                 ('X2', 5),
+                                 ('NM', 1), ('RG', 'L1'),
+                                 ('PG', 'P1'), ('XT', 'U'), ]))
+
+    def testAddTagsType(self):
+        self.reads[0].tags = None
+        self.assertEqual(self.reads[0].tags, [])
+
+        self.reads[0].setTag('X1', 5.0)
+        self.reads[0].setTag('X2', "5.0")
+        self.reads[0].setTag('X3', 5)
+
+        self.assertEqual(sorted(self.reads[0].tags),
+                         sorted([('X1', 5.0),
+                                 ('X2', "5.0"),
+                                 ('X3', 5)]))
+
+        # test setting float for int value
+        self.reads[0].setTag('X4', 5, value_type='d')
+        self.assertEqual(sorted(self.reads[0].tags),
+                         sorted([('X1', 5.0),
+                                 ('X2', "5.0"),
+                                 ('X3', 5),
+                                 ('X4', 5.0)]))
+
+        # test setting int for float value - the
+        # value will be rounded.
+        self.reads[0].setTag('X5', 5.2, value_type='i')
+        self.assertEqual(sorted(self.reads[0].tags),
+                         sorted([('X1', 5.0),
+                                 ('X2', "5.0"),
+                                 ('X3', 5),
+                                 ('X4', 5.0),
+                                 ('X5', 5)]))
+
+        # test setting invalid type code
+        self.assertRaises(ValueError, self.reads[0].setTag, 'X6', 5.2, 'g')
+
+    def testTagsUpdatingFloat(self):
+        self.assertEqual(self.reads[0].tags,
+                         [('NM', 1), ('RG', 'L1'),
+                          ('PG', 'P1'), ('XT', 'U')])
+        self.reads[0].tags += [('XC', 5.0)]
+        self.assertEqual(self.reads[0].tags,
+                         [('NM', 1), ('RG', 'L1'),
+                          ('PG', 'P1'), ('XT', 'U'), ('XC', 5.0)])
+
+    def testOpt(self):
+        self.assertEqual(self.reads[0].opt("XT"), "U")
+        self.assertEqual(self.reads[1].opt("XT"), "R")
+
+    def testMissingOpt(self):
+        self.assertRaises(KeyError, self.reads[0].opt, "XP")
+
+    def testEmptyOpt(self):
+        self.assertRaises(KeyError, self.reads[2].opt, "XT")
+
+    def tearDown(self):
+        self.samfile.close()
+
+
+class BasicTestBAMFile(BasicTestBAMFetch):
+
+    def setUp(self):
+        self.samfile = pysam.AlignmentFile(
+            os.path.join(DATADIR, "ex3.sam"),
+            "r")
+        self.reads = [r for r in self.samfile]
+
+
+class BasicTestSAMFile(BasicTestBAMFetch):
+
+    def setUp(self):
+        self.samfile = pysam.AlignmentFile(
+            os.path.join(DATADIR, "ex3.sam"),
+            "r")
+        self.reads = [r for r in self.samfile]
+
+
+class BasicTestSAMFetch(BasicTestBAMFetch):
+    def setUp(self):
+        self.samfile = pysam.AlignmentFile(
+            os.path.join(DATADIR, "ex3.sam"),
+            "r")
+        self.reads = list(self.samfile.fetch())
+
+
+# needs to be implemented
+# class TestAlignedSegmentFromSamWithoutHeader(TestAlignedSegmentFromBam):
+#
+#     def setUp(self):
+#         self.samfile=pysam.AlignmentFile( "ex7.sam","r" )
+#         self.reads=list(self.samfile.fetch())
+
+
+class TestIO(unittest.TestCase):
+
+    '''check if reading samfile and writing a samfile are consistent.'''
+
+    def checkEcho(self,
+                  input_filename,
+                  reference_filename,
+                  output_filename,
+                  input_mode, output_mode,
+                  use_template=True):
+        '''iterate through *input_filename* writing to *output_filename* and
+        comparing the output to *reference_filename*.
+
+        The files are opened according to the *input_mode* and *output_mode*.
+
+        If *use_template* is set, the header is copied from infile
+        using the template mechanism, otherwise target names and
+        lengths are passed explicitely.
+
+        '''
+
+        infile = pysam.AlignmentFile(os.path.join(DATADIR, input_filename),
+                               input_mode)
+        if use_template:
+            outfile = pysam.AlignmentFile(output_filename,
+                                    output_mode,
+                                    template=infile)
+        else:
+            outfile = pysam.AlignmentFile(output_filename,
+                                    output_mode,
+                                    referencenames=infile.references,
+                                    referencelengths=infile.lengths,
+                                    add_sq_text=False)
+
+        iter = infile.fetch()
+
+        for x in iter:
+            outfile.write(x)
+        infile.close()
+        outfile.close()
+
+        self.assertTrue(
+            checkBinaryEqual(os.path.join(DATADIR, reference_filename),
+                             output_filename),
+            "files %s and %s are not the same" % (reference_filename,
+                                                  output_filename))
+
+    def testReadWriteBam(self):
+
+        input_filename = "ex1.bam"
+        output_filename = "pysam_ex1.bam"
+        reference_filename = "ex1.bam"
+
+        self.checkEcho(input_filename, reference_filename, output_filename,
+                       "rb", "wb", use_template=True)
+
+    # Disabled - should work, files are not binary equal, but are
+    # non-binary equal:
+    # diff <(samtools view pysam_ex1.bam) <(samtools view pysam_data/ex1.bam)
+    # def testReadWriteBamWithTargetNames(self):
+    #     input_filename = "ex1.bam"
+    #     output_filename = "pysam_ex1.bam"
+    #     reference_filename = "ex1.bam"
+
+    #     self.checkEcho(input_filename, reference_filename, output_filename,
+    #                    "rb", "wb", use_template=False)
+
+    def testReadWriteSamWithHeader(self):
+
+        input_filename = "ex2.sam"
+        output_filename = "pysam_ex2.sam"
+        reference_filename = "ex2.sam"
+
+        self.checkEcho(input_filename,
+                       reference_filename,
+                       output_filename,
+                       "r", "wh")
+
+    # Release 0.8.0
+    # no samfiles without header
+    def testReadWriteSamWithoutHeader(self):
+
+        input_filename = "ex2.sam"
+        output_filename = "pysam_ex2.sam"
+        reference_filename = "ex1.sam"
+
+        self.checkEcho(input_filename,
+                       reference_filename,
+                       output_filename,
+                       "r", "w")
+
+    def testReadSamWithoutTargetNames(self):
+        '''see issue 104.'''
+        input_filename = os.path.join(DATADIR,
+                                      "example_unmapped_reads_no_sq.sam")
+
+        # raise exception in default mode
+        self.assertRaises(ValueError, pysam.AlignmentFile, input_filename, "r")
+
+        # raise exception if no SQ files
+        self.assertRaises(ValueError, pysam.AlignmentFile,
+                          input_filename, "r",
+                          check_header=True)
+
+        infile = pysam.AlignmentFile(
+            input_filename,
+            check_header=False,
+            check_sq=False)
+        
+        # TODO
+        # result = list(infile.fetch(until_eof=True))
+        # self.assertEqual(2, len(result))
+
+    def testReadBamWithoutTargetNames(self):
+        '''see issue 104.'''
+        input_filename = os.path.join(
+            DATADIR, "example_unmapped_reads_no_sq.bam")
+
+        # raise exception in default mode
+        self.assertRaises(ValueError, pysam.AlignmentFile, input_filename, "r")
+
+        # raise exception if no SQ files
+        self.assertRaises(ValueError, pysam.AlignmentFile, input_filename, "r",
+                          check_header=True)
+
+        infile = pysam.AlignmentFile(
+            input_filename, check_header=False, check_sq=False)
+        result = list(infile.fetch(until_eof=True))
+
+    # TODO
+    def testReadSamWithoutHeader(self):
+        input_filename = os.path.join(DATADIR, "ex1.sam")
+
+        # reading from a samfile without header is not 
+        # implemented
+        self.assertRaises(ValueError,
+                          pysam.AlignmentFile,
+                          input_filename,
+                          "r")
+
+        # TODO
+        # without check_header header is no read
+        # leading to segfault
+        # self.assertRaises(ValueError,
+        #                   pysam.AlignmentFile,
+        #                   input_filename,
+        #                   "r",
+        #                   check_header=False)
+
+    # TODO
+    # def testReadUnformattedFile(self):
+    #     '''test reading from a file that is not bam/sam formatted'''
+    #     input_filename = os.path.join(DATADIR, 'Makefile')
+
+    #     # bam - file raise error
+    #     self.assertRaises(ValueError,
+    #                       pysam.AlignmentFile,
+    #                       input_filename,
+    #                       "rb")
+
+    #     # sam - file error, but can't fetch
+    #     self.assertRaises(ValueError,
+    #                       pysam.AlignmentFile,
+    #                       input_filename,
+    #                       "r")
+
+    #     self.assertRaises(ValueError,
+    #                       pysam.AlignmentFile,
+    #                       input_filename,
+    #                       "r",
+    #                       check_header=False)
+
+    def testBAMWithoutAlignedSegments(self):
+        '''see issue 117'''
+        input_filename = os.path.join(DATADIR, "test_unaligned.bam")
+        samfile = pysam.AlignmentFile(input_filename, "rb", check_sq=False)
+        samfile.fetch(until_eof=True)
+
+    def testBAMWithShortBAI(self):
+        '''see issue 116'''
+        input_filename = os.path.join(DATADIR, "example_bai.bam")
+        samfile = pysam.AlignmentFile(input_filename, "rb", check_sq=False)
+        samfile.fetch('chr2')
+
+    def testFetchFromClosedFile(self):
+
+        samfile = pysam.AlignmentFile(os.path.join(DATADIR, "ex1.bam"),
+                                "rb")
+        samfile.close()
+        self.assertRaises(ValueError, samfile.fetch, 'chr1', 100, 120)
+
+    def testClosedFile(self):
+        '''test that access to a closed samfile raises ValueError.'''
+
+        samfile = pysam.AlignmentFile(os.path.join(DATADIR, "ex1.bam"),
+                                "rb")
+        samfile.close()
+        self.assertRaises(ValueError, samfile.fetch, 'chr1', 100, 120)
+        self.assertRaises(ValueError, samfile.pileup, 'chr1', 100, 120)
+        self.assertRaises(ValueError, samfile.getrname, 0)
+        # TODO
+        self.assertRaises(ValueError, samfile.tell)
+        self.assertRaises(ValueError, samfile.seek, 0)
+        self.assertRaises(ValueError, getattr, samfile, "nreferences")
+        self.assertRaises(ValueError, getattr, samfile, "references")
+        self.assertRaises(ValueError, getattr, samfile, "lengths")
+        self.assertRaises(ValueError, getattr, samfile, "text")
+        self.assertRaises(ValueError, getattr, samfile, "header")
+
+        # write on closed file
+        self.assertEqual(0, samfile.write(None))
+
+    def testAutoDetection(self):
+        '''test if autodetection works.'''
+
+        # TODO
+        # samfile = pysam.AlignmentFile(os.path.join(DATADIR, "ex3.sam"))
+        # self.assertRaises(ValueError, samfile.fetch, 'chr1')
+        # samfile.close()
+
+        samfile = pysam.AlignmentFile(os.path.join(DATADIR, "ex3.bam"))
+        samfile.fetch('chr1')
+        samfile.close()
+
+    # TOOD
+    # def testReadingFromSamFileWithoutHeader(self):
+    #     '''read from samfile without header.
+    #     '''
+    #     samfile = pysam.AlignmentFile(os.path.join(DATADIR, "ex7.sam"),
+    #                             check_header=False,
+    #                             check_sq=False)
+    #     self.assertRaises(NotImplementedError, samfile.__iter__)
+
+    def testReadingFromFileWithoutIndex(self):
+        '''read from bam file without index.'''
+
+        shutil.copyfile(os.path.join(DATADIR, "ex2.bam"), 'tmp_ex2.bam')
+        samfile = pysam.AlignmentFile('tmp_ex2.bam',
+                                      "rb")
+        self.assertRaises(ValueError, samfile.fetch)
+        self.assertEqual(len(list(samfile.fetch(until_eof=True))),
+                         3270)
+        os.unlink('tmp_ex2.bam')
+
+    # def testReadingUniversalFileMode(self):
+    #     '''read from samfile without header.
+    #     '''
+
+    #     input_filename = "ex2.sam"
+    #     output_filename = "pysam_ex2.sam"
+    #     reference_filename = "ex1.sam"
+
+    #     self.checkEcho(input_filename,
+    #                    reference_filename,
+    #                    output_filename,
+    #                    "rU", "w")
+
+    def testHead(self):
+        '''test IteratorRowHead'''
+        samfile = pysam.AlignmentFile(os.path.join(DATADIR, "ex1.bam"),
+                                      "rb")
+        l10 = list(samfile.head(10))
+        l100 = list(samfile.head(100))
+        self.assertEqual(len(l10), 10)
+        self.assertEqual(len(l100), 100)
+        self.assertEqual(list(map(str, l10)),
+                         list(map(str, l100[:10])))
+
+    def testWriteUncompressedBAMFile(self):
+        '''read from uncompressed BAM file, see issue #43'''
+
+        input_filename = "ex2.sam"
+        output_filename = "pysam_uncompressed.bam"
+        reference_filename = "uncompressed.bam"
+
+        self.checkEcho(input_filename,
+                       reference_filename,
+                       output_filename,
+                       "r", "wb0")
+
+        self.checkEcho(input_filename,
+                       reference_filename,
+                       output_filename,
+                       "r", "wbu")
+
+    def testEmptyBAM(self):
+        samfile = pysam.Samfile(os.path.join(DATADIR, "empty.bam"),
+                                "rb")
+        self.assertEqual(samfile.mapped, 0)
+        self.assertEqual(samfile.unmapped, 0)
+        self.assertEqual(samfile.nocoordinate, 0)
+
+
+class TestFloatTagBug(unittest.TestCase):
+
+    '''see issue 71'''
+
+    def testFloatTagBug(self):
+        '''a float tag before another exposed a parsing bug in bam_aux_get.
+
+        Fixed in 0.1.19
+        '''
+        samfile = pysam.AlignmentFile(os.path.join(DATADIR, "tag_bug.bam"))
+        read = next(samfile.fetch(until_eof=True))
+        self.assertTrue(('XC', 1) in read.tags)
+        self.assertEqual(read.opt('XC'), 1)
+
+
+class TestLargeFieldBug(unittest.TestCase):
+
+    '''see issue 100'''
+
+    def testLargeFileBug(self):
+        '''when creating a read with a large entry in the tag field
+        causes an error:
+            NotImplementedError: tags field too large
+        '''
+        samfile = pysam.AlignmentFile(os.path.join(DATADIR, "issue100.bam"))
+        read = next(samfile.fetch(until_eof=True))
+        new_read = pysam.AlignedSegment()
+        new_read.tags = read.tags
+        self.assertEqual(new_read.tags, read.tags)
+
+
+class TestTagParsing(unittest.TestCase):
+
+    '''tests checking the accuracy of tag setting and retrieval.'''
+
+    def makeRead(self):
+        a = pysam.AlignedSegment()
+        a.query_name = "read_12345"
+        a.reference_id = 0
+        a.query_sequence = "ACGT" * 3
+        a.flag = 0
+        a.reference_id = 0
+        a.reference_start = 1
+        a.mapping_quality = 20
+        a.cigartuples = ((0, 10), (2, 1), (0, 25))
+        a.next_reference_id = 0
+        a.next_reference_start = 200
+        a.template_length = 0
+        a.query_qualities = pysam.fromQualityString("1234") * 3
+        # todo: create tags
+        return a
+
+    def testNegativeIntegers(self):
+        x = -2
+        aligned_read = self.makeRead()
+        aligned_read.tags = [("XD", int(x))]
+        self.assertEqual(aligned_read.opt('XD'), x)
+        # print (aligned_read.tags)
+
+    def testNegativeIntegers2(self):
+        x = -2
+        r = self.makeRead()
+        r.tags = [("XD", int(x))]
+        outfile = pysam.AlignmentFile(
+            "test.bam",
+            "wb",
+            referencenames=("chr1",),
+            referencelengths = (1000,))
+        outfile.write(r)
+        outfile.close()
+
+    def testCigarString(self):
+        r = self.makeRead()
+        self.assertEqual(r.cigarstring, "10M1D25M")
+        r.cigarstring = "20M10D20M"
+        self.assertEqual(r.cigartuples, [(0, 20), (2, 10), (0, 20)])
+        # unsetting cigar string
+        r.cigarstring = None
+        self.assertEqual(r.cigarstring, None)
+
+    def testCigar(self):
+        r = self.makeRead()
+        self.assertEqual(r.cigartuples, [(0, 10), (2, 1), (0, 25)])
+        # unsetting cigar string
+        r.cigartuples = None
+        self.assertEqual(r.cigartuples, None)
+
+    def testLongTags(self):
+        '''see issue 115'''
+
+        r = self.makeRead()
+        rg = 'HS2000-899_199.L3'
+        tags = [('XC', 85), ('XT', 'M'), ('NM', 5),
+                ('SM', 29), ('AM', 29), ('XM', 1),
+                ('XO', 1), ('XG', 4), ('MD', '37^ACCC29T18'),
+                ('XA', '5,+11707,36M1I48M,2;21,-48119779,46M1I38M,2;hs37d5,-10060835,40M1D45M,3;5,+11508,36M1I48M,3;hs37d5,+6743812,36M1I48M,3;19,-59118894,46M1I38M,3;4,-191044002,6M1I78M,3;')]
+
+        r.tags = tags
+        r.tags += [("RG", rg)] * 100
+        tags += [("RG", rg)] * 100
+
+        self.assertEqual(tags, r.tags)
+
+    def testArrayTags(self):
+
+        r = self.makeRead()
+
+        def c(r, l):
+            r.tags = [('ZM', l)]
+            self.assertEqual(r.opt("ZM"), list(l))
+
+        # signed integers
+        c(r, (-1, 1))
+        c(r, (-1, 100))
+        c(r, (-1, 200))
+        c(r, (-1, 1000))
+        c(r, (-1, 30000))
+        c(r, (-1, 50000))
+        c(r, (1, -1))
+        c(r, (1, -100))
+        c(r, (1, -200))
+        c(r, (1, -1000))
+        c(r, (1, -30000))
+        c(r, (1, -50000))
+
+        # unsigned integers
+        c(r, (1, 100))
+        c(r, (1, 1000))
+        c(r, (1, 10000))
+        c(r, (1, 100000))
+
+        # floats
+        c(r, (1.0, 100.0))
+
+
+class TestClipping(unittest.TestCase):
+
+    def testClipping(self):
+
+        self.samfile = pysam.AlignmentFile(
+            os.path.join(DATADIR, "softclip.bam"),
+            "rb")
+
+        for read in self.samfile:
+
+            if read.query_name == "r001":
+                self.assertEqual(read.query_sequence, 'AAAAGATAAGGATA')
+                self.assertEqual(read.query_alignment_sequence, 'AGATAAGGATA')
+                self.assertEqual(pysam.toQualityString(read.query_qualities),
+                                 None)
+                self.assertEqual(
+                    pysam.toQualityString(read.query_alignment_qualities),
+                    None)
+
+            elif read.query_name == "r002":
+
+                self.assertEqual(read.query_sequence, 'GCCTAAGCTAA')
+                self.assertEqual(read.query_alignment_sequence, 'AGCTAA')
+                self.assertEqual(
+                    pysam.toQualityString(read.query_qualities),
+                    '01234567890')
+                self.assertEqual(
+                    pysam.toQualityString(read.query_alignment_qualities),
+                    '567890')
+
+            elif read.query_name == "r003":
+
+                self.assertEqual(read.query_sequence, 'GCCTAAGCTAA')
+                self.assertEqual(read.query_alignment_sequence, 'GCCTAA')
+                self.assertEqual(
+                    pysam.toQualityString(read.query_qualities),
+                    '01234567890')
+                self.assertEqual(
+                    pysam.toQualityString(read.query_alignment_qualities),
+                    '012345')
+
+            elif read.query_name == "r004":
+
+                self.assertEqual(read.query_sequence, 'TAGGC')
+                self.assertEqual(read.query_alignment_sequence, 'TAGGC')
+                self.assertEqual(
+                    pysam.toQualityString(read.query_qualities),
+                    '01234')
+                self.assertEqual(
+                    pysam.toQualityString(read.query_alignment_qualities),
+                    '01234')
+
+
+class TestIteratorRow(unittest.TestCase):
+
+    def setUp(self):
+        self.samfile = pysam.AlignmentFile(os.path.join(DATADIR, "ex1.bam"),
+                                     "rb")
+
+    def checkRange(self, rnge):
+        '''compare results from iterator with those from samtools.'''
+        ps = list(self.samfile.fetch(region=rnge))
+        sa = list(pysam.view(os.path.join(DATADIR, "ex1.bam"),
+                             rnge,
+                             raw=True))
+        self.assertEqual(len(ps), len(
+            sa), "unequal number of results for range %s: %i != %i" % (rnge, len(ps), len(sa)))
+        # check if the same reads are returned and in the same order
+        for line, (a, b) in enumerate(list(zip(ps, sa))):
+            d = b.split("\t")
+            self.assertEqual(
+                a.query_name, d[0], "line %i: read id mismatch: %s != %s" % (line, a.reference_id, d[0]))
+            self.assertEqual(a.reference_start, int(d[3]) - 1, "line %i: read position mismatch: %s != %s, \n%s\n%s\n" %
+                             (line, a.reference_start, int(d[3]) - 1,
+                              str(a), str(d)))
+            qual = d[10]
+            self.assertEqual(pysam.toQualityString(a.query_qualities), qual, "line %i: quality mismatch: %s != %s, \n%s\n%s\n" %
+                             (line, pysam.toQualityString(a.query_qualities), qual,
+                              str(a), str(d)))
+
+    def testIteratePerContig(self):
+        '''check random access per contig'''
+        for contig in self.samfile.references:
+            self.checkRange(contig)
+
+    def testIterateRanges(self):
+        '''check random access per range'''
+        for contig, length in zip(self.samfile.references,
+                                  self.samfile.lengths):
+            for start in range(1, length, 90):
+                # this includes empty ranges
+                self.checkRange("%s:%i-%i" % (contig, start, start + 90))
+
+    def tearDown(self):
+        self.samfile.close()
+
+
+class TestIteratorRowAll(unittest.TestCase):
+
+    def setUp(self):
+        self.samfile = pysam.AlignmentFile(os.path.join(DATADIR, "ex1.bam"),
+                                     "rb")
+
+    def testIterate(self):
+        '''compare results from iterator with those from samtools.'''
+        ps = list(self.samfile.fetch())
+        sa = list(pysam.view(os.path.join(DATADIR, "ex1.bam"),
+                             raw=True))
+        self.assertEqual(
+            len(ps), len(sa), "unequal number of results: %i != %i" % (len(ps), len(sa)))
+        # check if the same reads are returned
+        for line, pair in enumerate(list(zip(ps, sa))):
+            data = pair[1].split("\t")
+            self.assertEqual(pair[0].query_name, data[
+                             0], "read id mismatch in line %i: %s != %s" % (line, pair[0].reference_id, data[0]))
+
+    def tearDown(self):
+        self.samfile.close()
+
+
+class TestIteratorColumn(unittest.TestCase):
+
+    '''test iterator column against contents of ex4.bam.'''
+
+    # note that samfile contains 1-based coordinates
+    # 1D means deletion with respect to reference sequence
+    #
+    mCoverages = {'chr1': [0] * 20 + [1] * 36 + [0] * (100 - 20 - 35),
+                  'chr2': [0] * 20 + [1] * 35 + [0] * (100 - 20 - 35),
+                  }
+
+    def setUp(self):
+        self.samfile = pysam.AlignmentFile(os.path.join(DATADIR, "ex4.bam"),
+                                     "rb")
+
+    def checkRange(self, contig, start=None, end=None, truncate=False):
+        '''compare results from iterator with those from samtools.'''
+        # check if the same reads are returned and in the same order
+        for column in self.samfile.pileup(
+                contig, start, end, truncate=truncate):
+            if truncate:
+                self.assertGreaterEqual(column.reference_pos, start)
+                self.assertLess(column.reference_pos, end)
+            thiscov = len(column.pileups)
+            refcov = self.mCoverages[
+                self.samfile.getrname(column.reference_id)][column.reference_pos]
+            self.assertEqual(thiscov, refcov, "wrong coverage at pos %s:%i %i should be %i" % (
+                self.samfile.getrname(column.reference_id), column.reference_pos, thiscov, refcov))
+
+    def testIterateAll(self):
+        '''check random access per contig'''
+        self.checkRange(None)
+
+    def testIteratePerContig(self):
+        '''check random access per contig'''
+        for contig in self.samfile.references:
+            self.checkRange(contig)
+
+    def testIterateRanges(self):
+        '''check random access per range'''
+        for contig, length in zip(
+                self.samfile.references, self.samfile.lengths):
+            for start in range(1, length, 90):
+                # this includes empty ranges
+                self.checkRange(contig, start, start + 90)
+
+    def testInverse(self):
+        '''test the inverse, is point-wise pileup accurate.'''
+        for contig, refseq in list(self.mCoverages.items()):
+            refcolumns = sum(refseq)
+            for pos, refcov in enumerate(refseq):
+                columns = list(self.samfile.pileup(contig, pos, pos + 1))
+                if refcov == 0:
+                    # if no read, no coverage
+                    self.assertEqual(
+                        len(columns),
+                        refcov,
+                        "wrong number of pileup columns returned for position %s:%i, %i should be %i" % (
+                            contig, pos,
+                            len(columns), refcov))
+                elif refcov == 1:
+                    # one read, all columns of the read are returned
+                    self.assertEqual(
+                        len(columns),
+                        refcolumns,
+                        "pileup incomplete at position %i: got %i, expected %i " %
+                        (pos, len(columns), refcolumns))
+
+    def testIterateTruncate(self):
+        '''check random access per range'''
+        for contig, length in zip(self.samfile.references, self.samfile.lengths):
+            for start in range(1, length, 90):
+                # this includes empty ranges
+                self.checkRange(contig, start, start + 90, truncate=True)
+
+    def tearDown(self):
+        self.samfile.close()
+
+
+class TestIteratorColumn2(unittest.TestCase):
+
+    '''test iterator column against contents of ex1.bam.'''
+
+    def setUp(self):
+        self.samfile = pysam.AlignmentFile(os.path.join(DATADIR, "ex1.bam"),
+                                     "rb")
+
+    def testStart(self):
+        # print self.samfile.fetch().next().reference_start
+        # print self.samfile.pileup().next().reference_start
+        pass
+
+    def testTruncate(self):
+        '''see issue 107.'''
+        # note that ranges in regions start from 1
+        p = self.samfile.pileup(region='chr1:170:172', truncate=True)
+        columns = [x.reference_pos for x in p]
+        self.assertEqual(len(columns), 3)
+        self.assertEqual(columns, [169, 170, 171])
+
+        p = self.samfile.pileup('chr1', 169, 172, truncate=True)
+        columns = [x.reference_pos for x in p]
+
+        self.assertEqual(len(columns), 3)
+        self.assertEqual(columns, [169, 170, 171])
+
+    def testAccessOnClosedIterator(self):
+        '''see issue 131
+
+        Accessing pileup data after iterator has closed.
+        '''
+        pcolumn = self.samfile.pileup('chr1', 170, 180).__next__()
+        self.assertRaises(ValueError, getattr, pcolumn, "pileups")
+
+
+class TestHeaderSam(unittest.TestCase):
+
+    header = {'SQ': [{'LN': 1575, 'SN': 'chr1'},
+                     {'LN': 1584, 'SN': 'chr2'}],
+              'RG': [{'LB': 'SC_1', 'ID': 'L1', 'SM': 'NA12891',
+                      'PU': 'SC_1_10', "CN": "name:with:colon"},
+                     {'LB': 'SC_2', 'ID': 'L2', 'SM': 'NA12891',
+                      'PU': 'SC_2_12', "CN": "name:with:colon"}],
+              'PG': [{'ID': 'P1', 'VN': '1.0'}, {'ID': 'P2', 'VN': '1.1'}],
+              'HD': {'VN': '1.0'},
+              'CO': ['this is a comment', 'this is another comment'],
+              }
+
+    def compareHeaders(self, a, b):
+        '''compare two headers a and b.'''
+        for ak, av in a.items():
+            self.assertTrue(ak in b, "key '%s' not in '%s' " % (ak, b))
+            self.assertEqual(av, b[ak])
+
+    def setUp(self):
+        self.samfile = pysam.AlignmentFile(os.path.join(DATADIR, "ex3.sam"),
+                                           "r")
+
+    def testHeaders(self):
+        self.compareHeaders(self.header, self.samfile.header)
+        self.compareHeaders(self.samfile.header, self.header)
+
+    def testNameMapping(self):
+        for x, y in enumerate(("chr1", "chr2")):
+            tid = self.samfile.gettid(y)
+            ref = self.samfile.getrname(x)
+            self.assertEqual(tid, x)
+            self.assertEqual(ref, y)
+
+        self.assertEqual(self.samfile.gettid("chr?"), -1)
+        self.assertRaises(ValueError, self.samfile.getrname, 2)
+
+    def tearDown(self):
+        self.samfile.close()
+
+
+class TestHeaderBam(TestHeaderSam):
+
+    def setUp(self):
+        self.samfile = pysam.AlignmentFile(os.path.join(DATADIR, "ex3.bam"),
+                                           "rb")
+
+
+class TestHeaderFromRefs(unittest.TestCase):
+
+    '''see issue 144
+
+    reference names need to be converted to string for python 3
+    '''
+
+    # def testHeader( self ):
+    #     refs = ['chr1', 'chr2']
+    #     tmpfile = "tmp_%i" % id(self)
+    #     s = pysam.AlignmentFile(tmpfile, 'wb',
+    #                       referencenames=refs,
+    #                       referencelengths=[100]*len(refs))
+    #     s.close()
+
+    #     self.assertTrue( checkBinaryEqual( 'issue144.bam', tmpfile ),
+    #                      'bam files differ')
+    #     os.unlink( tmpfile )
+
+
+class TestHeader1000Genomes(unittest.TestCase):
+    '''see issue 110'''
+    # bamfile = "http://ftp.1000genomes.ebi.ac.uk/vol1/ftp/technical/phase2b_alignment/data/NA07048/exome_alignment/NA07048.unmapped.ILLUMINA.bwa.CEU.exome.20120522_p2b.bam"
+    bamfile = "http://ftp.1000genomes.ebi.ac.uk/vol1/ftp/technical/phase3_EX_or_LC_only_alignment/data/HG00104/alignment/HG00104.chrom11.ILLUMINA.bwa.GBR.low_coverage.20130415.bam"
+
+    def testRead(self):
+
+        if not checkURL(self.bamfile):
+            return
+
+        f = pysam.AlignmentFile(self.bamfile, "rb")
+        data = f.header.copy()
+        self.assertTrue(data)
+
+
+class TestUnmappedReads(unittest.TestCase):
+
+    # TODO
+    # def testSAM(self):
+    #     samfile = pysam.AlignmentFile(os.path.join(DATADIR, "ex5.sam"),
+    #                             "r")
+    #     self.assertEqual(len(list(samfile.fetch(until_eof=True))), 2)
+    #     samfile.close()
+
+    def testBAM(self):
+        samfile = pysam.AlignmentFile(os.path.join(DATADIR, "ex5.bam"),
+                                "rb")
+        self.assertEqual(len(list(samfile.fetch(until_eof=True))), 2)
+        samfile.close()
+
+
+class TestPileupObjects(unittest.TestCase):
+
+    def setUp(self):
+        self.samfile = pysam.AlignmentFile(os.path.join(DATADIR, "ex1.bam"),
+                                     "rb")
+
+    def testPileupColumn(self):
+        for pcolumn1 in self.samfile.pileup(region="chr1:105"):
+            if pcolumn1.reference_pos == 104:
+                self.assertEqual(
+                    pcolumn1.reference_id, 0,
+                    "chromosome/target id mismatch in position 1: %s != %s" %
+                    (pcolumn1.reference_id, 0))
+                self.assertEqual(
+                    pcolumn1.reference_pos, 105 - 1,
+                    "position mismatch in position 1: %s != %s" %
+                    (pcolumn1.reference_pos, 105 - 1))
+                self.assertEqual(
+                    pcolumn1.nsegments, 2,
+                    "# reads mismatch in position 1: %s != %s" %
+                    (pcolumn1.nsegments, 2))
+        for pcolumn2 in self.samfile.pileup(region="chr2:1480"):
+            if pcolumn2.reference_pos == 1479:
+                self.assertEqual(
+                    pcolumn2.reference_id, 1,
+                    "chromosome/target id mismatch in position 1: %s != %s" %
+                    (pcolumn2.reference_id, 1))
+                self.assertEqual(
+                    pcolumn2.reference_pos, 1480 - 1,
+                    "position mismatch in position 1: %s != %s" %
+                    (pcolumn2.reference_pos, 1480 - 1))
+                self.assertEqual(
+                    pcolumn2.nsegments, 12,
+                    "# reads mismatch in position 1: %s != %s" %
+                    (pcolumn2.nsegments, 12))
+
+    def testPileupRead(self):
+        for pcolumn1 in self.samfile.pileup(region="chr1:105"):
+            if pcolumn1.reference_pos == 104:
+                self.assertEqual(
+                    len(pcolumn1.pileups), 2,
+                    "# reads aligned to column mismatch in position 1"
+                    ": %s != %s" %
+                    (len(pcolumn1.pileups), 2))
+
+
+# self.assertEqual( pcolumn1.pileups[0]  # need to test additional
+# properties here
+
+    def tearDown(self):
+        self.samfile.close()
+
+    def testIteratorOutOfScope(self):
+        '''test if exception is raised if pileup col is accessed after
+        iterator is exhausted.'''
+
+        for pileupcol in self.samfile.pileup():
+            pass
+
+        self.assertRaises(ValueError, getattr, pileupcol, "pileups")
+
+
+class TestContextManager(unittest.TestCase):
+
+    def testManager(self):
+        with pysam.AlignmentFile(os.path.join(DATADIR, 'ex1.bam'),
+                           'rb') as samfile:
+            samfile.fetch()
+        self.assertEqual(samfile._isOpen(), False)
+
+
+class TestExceptions(unittest.TestCase):
+
+    def setUp(self):
+        self.samfile = pysam.AlignmentFile(os.path.join(DATADIR, "ex1.bam"),
+                                     "rb")
+
+    def testMissingFile(self):
+
+        self.assertRaises(IOError, pysam.AlignmentFile, "exdoesntexist.bam", "rb")
+        self.assertRaises(IOError, pysam.AlignmentFile, "exdoesntexist.sam", "r")
+        self.assertRaises(IOError, pysam.AlignmentFile, "exdoesntexist.bam", "r")
+        self.assertRaises(IOError, pysam.AlignmentFile, "exdoesntexist.sam", "rb")
+
+    def testBadContig(self):
+        self.assertRaises(ValueError, self.samfile.fetch, "chr88")
+
+    def testMeaninglessCrap(self):
+        self.assertRaises(ValueError, self.samfile.fetch, "skljf")
+
+    def testBackwardsOrderNewFormat(self):
+        self.assertRaises(ValueError, self.samfile.fetch, 'chr1', 100, 10)
+
+    def testBackwardsOrderOldFormat(self):
+        self.assertRaises(ValueError, self.samfile.fetch, region="chr1:100-10")
+
+    def testOutOfRangeNegativeNewFormat(self):
+        self.assertRaises(ValueError, self.samfile.fetch, "chr1", 5, -10)
+        self.assertRaises(ValueError, self.samfile.fetch, "chr1", 5, 0)
+        self.assertRaises(ValueError, self.samfile.fetch, "chr1", -5, -10)
+
+        self.assertRaises(ValueError, self.samfile.count, "chr1", 5, -10)
+        self.assertRaises(ValueError, self.samfile.count, "chr1", 5, 0)
+        self.assertRaises(ValueError, self.samfile.count, "chr1", -5, -10)
+
+    def testOutOfRangeNegativeOldFormat(self):
+        self.assertRaises(ValueError, self.samfile.fetch, region="chr1:-5-10")
+        self.assertRaises(ValueError, self.samfile.fetch, region="chr1:-5-0")
+        self.assertRaises(ValueError, self.samfile.fetch, region="chr1:-5--10")
+
+        self.assertRaises(ValueError, self.samfile.count, region="chr1:-5-10")
+        self.assertRaises(ValueError, self.samfile.count, region="chr1:-5-0")
+        self.assertRaises(ValueError, self.samfile.count, region="chr1:-5--10")
+
+    def testOutOfRangNewFormat(self):
+        self.assertRaises(
+            ValueError, self.samfile.fetch, "chr1", 9999999999, 99999999999)
+        self.assertRaises(
+            ValueError, self.samfile.count, "chr1", 9999999999, 99999999999)
+
+    def testOutOfRangeLargeNewFormat(self):
+        self.assertRaises(ValueError, self.samfile.fetch, "chr1",
+                          9999999999999999999999999999999, 9999999999999999999999999999999999999999)
+        self.assertRaises(ValueError, self.samfile.count, "chr1",
+                          9999999999999999999999999999999, 9999999999999999999999999999999999999999)
+
+    def testOutOfRangeLargeOldFormat(self):
+        self.assertRaises(
+            ValueError, self.samfile.fetch, "chr1:99999999999999999-999999999999999999")
+        self.assertRaises(
+            ValueError, self.samfile.count, "chr1:99999999999999999-999999999999999999")
+
+    def testZeroToZero(self):
+        '''see issue 44'''
+        self.assertEqual(len(list(self.samfile.fetch('chr1', 0, 0))), 0)
+
+    def tearDown(self):
+        self.samfile.close()
+
+
+class TestWrongFormat(unittest.TestCase):
+
+    '''test cases for opening files not in bam/sam format.'''
+
+    def testOpenSamAsBam(self):
+        self.assertRaises(ValueError,
+                          pysam.AlignmentFile,
+                          os.path.join(DATADIR, 'ex1.sam'),
+                          'rb')
+
+    def testOpenBamAsSam(self):
+        # test fails, needs to be implemented.
+        # sam.fetch() fails on reading, not on opening
+        # self.assertRaises( ValueError, pysam.AlignmentFile, 'ex1.bam', 'r' )
+        pass
+
+    def testOpenFastaAsSam(self):
+        # test fails, needs to be implemented.
+        # sam.fetch() fails on reading, not on opening
+        # self.assertRaises( ValueError, pysam.AlignmentFile, 'ex1.fa', 'r' )
+        pass
+
+    def testOpenFastaAsBam(self):
+        self.assertRaises(ValueError,
+                          pysam.AlignmentFile,
+                          os.path.join(DATADIR, 'ex1.fa'),
+                          'rb')
+
+
+class ReadTest(unittest.TestCase):
+
+    def checkFieldEqual(self, read1, read2, exclude=[]):
+        '''check if two reads are equal by comparing each field.'''
+
+        # add the . for refactoring purposes.
+        for x in (".query_name",
+                  ".query_sequence",
+                  ".flag",
+                  ".reference_id",
+                  ".reference_start",
+                  ".mapping_quality",
+                  ".cigartuples",
+                  ".next_reference_id",
+                  ".next_reference_start",
+                  ".template_length",
+                  ".query_length",
+                  ".query_qualities",
+                  ".bin",
+                  ".is_paired", ".is_proper_pair",
+                  ".is_unmapped", ".mate_is_unmapped",
+                  ".is_reverse", ".mate_is_reverse",
+                  ".is_read1", ".is_read2",
+                  ".is_secondary", ".is_qcfail",
+                  ".is_duplicate"):
+            n = x[1:]
+            if n in exclude:
+                continue
+            self.assertEqual(getattr(read1, n), getattr(read2, n),
+                             "attribute mismatch for %s: %s != %s" %
+                             (n, getattr(read1, n), getattr(read2, n)))
+
+
+class TestAlignedSegment(ReadTest):
+
+    '''tests to check if aligned read can be constructed
+    and manipulated.
+    '''
+
+    def testEmpty(self):
+        a = pysam.AlignedSegment()
+        self.assertEqual(a.query_name, None)
+        self.assertEqual(a.query_sequence, None)
+        self.assertEqual(pysam.toQualityString(a.query_qualities), None)
+        self.assertEqual(a.flag, 0)
+        self.assertEqual(a.reference_id, 0)
+        self.assertEqual(a.mapping_quality, 0)
+        self.assertEqual(a.cigartuples, None)
+        self.assertEqual(a.tags, [])
+        self.assertEqual(a.next_reference_id, 0)
+        self.assertEqual(a.next_reference_start, 0)
+        self.assertEqual(a.template_length, 0)
+
+    def testStrOfEmptyRead(self):
+        a = pysam.AlignedSegment()
+        s = str(a)
+        self.assertEqual(
+            "None\t0\t0\t0\t0\tNone\t0\t0\t0\tNone\tNone\t[]",
+            s)
+
+    def buildRead(self):
+        '''build an example read.'''
+
+        a = pysam.AlignedSegment()
+        a.query_name = "read_12345"
+        a.query_sequence = "ACGT" * 10
+        a.flag = 0
+        a.reference_id = 0
+        a.reference_start = 20
+        a.mapping_quality = 20
+        a.cigartuples = ((0, 10), (2, 1), (0, 9), (1, 1), (0, 20))
+        a.next_reference_id = 0
+        a.next_reference_start = 200
+        a.template_length = 167
+        a.query_qualities = pysam.fromQualityString("1234") * 10
+        # todo: create tags
+        return a
+
+    def testUpdate(self):
+        '''check if updating fields affects other variable length data
+        '''
+        a = self.buildRead()
+        b = self.buildRead()
+
+        # check qname
+        b.query_name = "read_123"
+        self.checkFieldEqual(a, b, "query_name")
+        b.query_name = "read_12345678"
+        self.checkFieldEqual(a, b, "query_name")
+        b.query_name = "read_12345"
+        self.checkFieldEqual(a, b)
+
+        # check cigar
+        b.cigartuples = ((0, 10), )
+        self.checkFieldEqual(a, b, "cigartuples")
+        b.cigartuples = ((0, 10), (2, 1), (0, 10))
+        self.checkFieldEqual(a, b, "cigartuples")
+        b.cigartuples = ((0, 10), (2, 1), (0, 9), (1, 1), (0, 20))
+        self.checkFieldEqual(a, b)
+
+        # check seq
+        b.query_sequence = "ACGT"
+        self.checkFieldEqual(
+            a, b,
+            ("query_sequence", "query_qualities", "query_length"))
+        b.query_sequence = "ACGT" * 3
+        self.checkFieldEqual(
+            a, b,
+            ("query_sequence", "query_qualities", "query_length"))
+        b.query_sequence = "ACGT" * 10
+        self.checkFieldEqual(a, b, ("query_qualities",))
+
+        # reset qual
+        b = self.buildRead()
+
+        # check flags:
+        for x in (
+                "is_paired", "is_proper_pair",
+                "is_unmapped", "mate_is_unmapped",
+                "is_reverse", "mate_is_reverse",
+                "is_read1", "is_read2",
+                "is_secondary", "is_qcfail",
+                "is_duplicate"):
+            setattr(b, x, True)
+            self.assertEqual(getattr(b, x), True)
+            self.checkFieldEqual(a, b, ("flag", x,))
+            setattr(b, x, False)
+            self.assertEqual(getattr(b, x), False)
+            self.checkFieldEqual(a, b)
+
+    def testUpdate2(self):
+        '''issue 135: inplace update of sequence and quality score.
+
+        This does not work as setting the sequence will erase
+        the quality scores.
+        '''
+        a = self.buildRead()
+        a.query_sequence = a.query_sequence[5:10]
+        self.assertEqual(pysam.toQualityString(a.query_qualities), None)
+
+        a = self.buildRead()
+        s = pysam.toQualityString(a.query_qualities)
+        a.query_sequence = a.query_sequence[5:10]
+        a.query_qualities = pysam.fromQualityString(s[5:10])
+
+        self.assertEqual(pysam.toQualityString(a.query_qualities), s[5:10])
+
+    def testLargeRead(self):
+        '''build an example read.'''
+
+        a = pysam.AlignedSegment()
+        a.query_name = "read_12345"
+        a.query_sequence = "ACGT" * 200
+        a.flag = 0
+        a.reference_id = 0
+        a.reference_start = 20
+        a.mapping_quality = 20
+        a.cigartuples = ((0, 4 * 200), )
+        a.next_reference_id = 0
+        a.next_reference_start = 200
+        a.template_length = 167
+        a.query_qualities = pysam.fromQualityString("1234") * 200
+
+        return a
+
+    def testTagParsing(self):
+        '''test for tag parsing
+
+        see http://groups.google.com/group/pysam-user-group/browse_thread/thread/67ca204059ea465a
+        '''
+        samfile = pysam.AlignmentFile(os.path.join(DATADIR, "ex8.bam"),
+                                "rb")
+
+        for entry in samfile:
+            before = entry.tags
+            entry.tags = entry.tags
+            after = entry.tags
+            self.assertEqual(after, before)
+
+    def testUpdateTlen(self):
+        '''check if updating tlen works'''
+        a = self.buildRead()
+        oldlen = a.template_length
+        oldlen *= 2
+        a.template_length = oldlen
+        self.assertEqual(a.template_length, oldlen)
+
+    def testPositions(self):
+        a = self.buildRead()
+        self.assertEqual(a.get_reference_positions(),
+                         [20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29,
+                          31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39,
+                          40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49,
+                          50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59])
+
+        self.assertEqual(a.get_aligned_pairs(),
+                         [(0, 20), (1, 21), (2, 22), (3, 23), (4, 24),
+                          (5, 25), (6, 26), (7, 27), (8, 28), (9, 29),
+                          (None, 30),
+                          (10, 31), (11, 32), (12, 33), (13, 34), (14, 35),
+                          (15, 36), (16, 37), (17, 38), (18, 39), (19, None),
+                          (20, 40), (21, 41), (22, 42), (23, 43), (24, 44),
+                          (25, 45), (26, 46), (27, 47), (28, 48), (29, 49),
+                          (30, 50), (31, 51), (32, 52), (33, 53), (34, 54),
+                          (35, 55), (36, 56), (37, 57), (38, 58), (39, 59)])
+
+        self.assertEqual(
+            a.get_reference_positions(),
+            [x[1] for x in a.get_aligned_pairs()
+             if x[0] is not None and x[1] is not None])
+        # alen is the length of the aligned read in genome
+        self.assertEqual(a.reference_length,
+                         a.get_aligned_pairs()[-1][0] + 1)
+        # aend points to one beyond last aligned base in ref
+        self.assertEqual(a.get_reference_positions()[-1],
+                         a.reference_end - 1)
+
+    def testFullReferencePositions(self):
+        '''see issue 26'''
+        a = self.buildRead()
+        a.cigar = [(4, 30), (0, 20), (1, 3), (0, 47)]
+
+        self.assertEqual(100,
+                         len(a.get_reference_positions(full_length=True)))
+
+    def testBlocks(self):
+        a = self.buildRead()
+        self.assertEqual(a.get_blocks(),
+                         [(20, 30), (31, 40), (40, 60)])
+
+    # Disabled as not backwards compatible
+    # def testFancyStr(self):
+    #     a = self.buildRead()
+    #     output = a.fancy_str()
+    #     self.assertEqual(len(output), 9)
+
+
+class TestDeNovoConstruction(ReadTest):
+
+    '''check BAM/SAM file construction using ex6.sam
+
+    (note these are +1 coordinates):
+
+    read_28833_29006_6945      99      chr1    33      20      10M1D25M        =       200     167     AGCTTAGCTAGCTACCTATATCTTGGTCTTGGCCG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<9/,&,22;;<<<     NM:i:1  RG:Z:L1
+    read_28701_28881_323b      147     chr2    88      30      35M     =       500     412     ACCTATATCTTGGCCTTGGCCGATGCGGCCTTGCA     <<<<<;<<<<7;:<<<6;<<<<<<<<<<<<7<<<<     MF:i:18 RG:Z:L2
+    '''
+
+    header = {'HD': {'VN': '1.0'},
+              'SQ': [{'LN': 1575, 'SN': 'chr1'},
+                     {'LN': 1584, 'SN': 'chr2'}], }
+
+    bamfile = os.path.join(DATADIR, "ex6.bam")
+    samfile = os.path.join(DATADIR, "ex6.sam")
+
+    def setUp(self):
+
+        a = pysam.AlignedSegment()
+        a.query_name = "read_28833_29006_6945"
+        a.query_sequence = "AGCTTAGCTAGCTACCTATATCTTGGTCTTGGCCG"
+        a.flag = 99
+        a.reference_id = 0
+        a.reference_start = 32
+        a.mapping_quality = 20
+        a.cigartuples = ((0, 10), (2, 1), (0, 25))
+        a.next_reference_id = 0
+        a.next_reference_start = 199
+        a.template_length = 167
+        a.query_qualities = pysam.fromQualityString("<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<9/,&,22;;<<<")
+        a.tags = (("NM", 1),
+                  ("RG", "L1"))
+
+        b = pysam.AlignedSegment()
+        b.query_name = "read_28701_28881_323b"
+        b.query_sequence = "ACCTATATCTTGGCCTTGGCCGATGCGGCCTTGCA"
+        b.flag = 147
+        b.reference_id = 1
+        b.reference_start = 87
+        b.mapping_quality = 30
+        b.cigartuples = ((0, 35), )
+        b.next_reference_id = 1
+        b.next_reference_start = 499
+        b.template_length = 412
+        b.query_qualities = pysam.fromQualityString("<<<<<;<<<<7;:<<<6;<<<<<<<<<<<<7<<<<")
+        b.tags = (("MF", 18),
+                  ("RG", "L2"))
+
+        self.reads = (a, b)
+
+    # TODO
+    # def testSAMWholeFile(self):
+
+    #     tmpfilename = "tmp_%i.sam" % id(self)
+
+    #     outfile = pysam.AlignmentFile(tmpfilename,
+    #                             "wh",
+    #                             header=self.header)
+
+    #     for x in self.reads:
+    #         outfile.write(x)
+    #     outfile.close()
+    #     self.assertTrue(checkBinaryEqual(tmpfilename, self.samfile),
+    #                     "mismatch when construction SAM file, see %s %s" % (tmpfilename, self.samfile))
+
+    #     os.unlink(tmpfilename)
+
+    def testBAMPerRead(self):
+        '''check if individual reads are binary equal.'''
+        infile = pysam.AlignmentFile(self.bamfile, "rb")
+
+        others = list(infile)
+        for denovo, other in zip(others, self.reads):
+            self.checkFieldEqual(other, denovo)
+            self.assertEqual(other.compare(denovo), 0)
+
+    # TODO
+    # def testSAMPerRead(self):
+    #     '''check if individual reads are binary equal.'''
+    #     infile = pysam.AlignmentFile(self.samfile, "r")
+
+    #     others = list(infile)
+    #     for denovo, other in zip(others, self.reads):
+    #         self.checkFieldEqual(other, denovo)
+    #         self.assertEqual(other.compare(denovo), 0)
+
+    def testBAMWholeFile(self):
+
+        tmpfilename = "tmp_%i.bam" % id(self)
+
+        outfile = pysam.AlignmentFile(tmpfilename, "wb", header=self.header)
+
+        for x in self.reads:
+            outfile.write(x)
+        outfile.close()
+
+        self.assertTrue(checkBinaryEqual(tmpfilename, self.bamfile),
+                        "mismatch when construction BAM file, see %s %s" % (tmpfilename, self.bamfile))
+
+        os.unlink(tmpfilename)
+
+
+class TestDeNovoConstructionUserTags(TestDeNovoConstruction):
+
+    '''test de novo construction with a header that contains lower-case tags.'''
+
+    header = {'HD': {'VN': '1.0'},
+              'SQ': [{'LN': 1575, 'SN': 'chr1'},
+                     {'LN': 1584, 'SN': 'chr2'}],
+              'x1': {'A': 2, 'B': 5},
+              'x3': {'A': 6, 'B': 5},
+              'x2': {'A': 4, 'B': 5}}
+
+    bamfile = os.path.join(DATADIR, "example_user_header.bam")
+    samfile = os.path.join(DATADIR, "example_user_header.sam")
+
+
+class TestEmptyHeader(unittest.TestCase):
+
+    '''see issue 84.'''
+
+    def testEmptyHeader(self):
+        s = pysam.AlignmentFile(os.path.join(DATADIR,
+                                             'example_empty_header.bam'))
+        self.assertEqual(s.header, {'SQ': [{'LN': 1000, 'SN': 'chr1'}]})
+
+
+class TestHeaderWithProgramOptions(unittest.TestCase):
+    '''see issue 39.'''
+
+    def testHeader(self):
+        s = pysam.AlignmentFile(os.path.join(DATADIR,
+                                             'rg_with_tab.bam'))
+        self.assertEqual(
+            s.header,
+            {'SQ': [{'LN': 1575, 'SN': 'chr1'},
+                    {'LN': 1584, 'SN': 'chr2'}],
+             'PG': [{'PN': 'bwa',
+                     'ID': 'bwa',
+                     'VN': '0.7.9a-r786',
+                     'CL': 'bwa mem -p -t 8 -M -R '
+                     '@RG\tID:None\tSM:None\t/mnt/data/hg19.fa\t'
+                     '/mnt/analysis/default-0.fastq'}]})
+
+
+class TestTruncatedBAM(unittest.TestCase):
+
+    '''see pull request 50.'''
+
+    def testTruncatedBam(self):
+
+        s = pysam.AlignmentFile(os.path.join(DATADIR, 'ex2_truncated.bam'))
+        iterall = lambda x: len([a for a in x])
+        self.assertRaises(IOError, iterall, s)
+
+
+class TestBTagSam(unittest.TestCase):
+
+    '''see issue 81.'''
+
+    compare = [[100, 1, 91, 0, 7, 101, 0, 201, 96, 204, 0, 0, 87, 109, 0, 7, 97, 112, 1, 12, 78, 197, 0, 7, 100, 95, 101, 202, 0, 6, 0, 1, 186, 0, 84, 0, 244, 0, 0, 324, 0, 107, 195, 101, 113, 0, 102, 0, 104, 3, 0, 101, 1, 0, 212, 6, 0, 0, 1, 0, 74, 1, 11, 0, 196, 2, 197, 103, 0, 108, 98, 2, 7, 0, 1, 2, 194, 0, 180, 0, 108, 0, 203, 104, 16, 5, 205, 0, 0, 0, 1, 1, 100, 98, 0, 0, 204, 6, 0, 79, 0, 0, 101, 7, 109, 90, 265, 1, 27, 10, 109, 102, 9, 0, 292, 0, 110, 0, 0, 102, 112, 0, 0, 84, 100, 103, 2, 81, 126, 0, 2, 90, 0, 15, 96, 15, 1, 0, 2, 0, 107, 92, 0, 0, 101, 3, 98, 15, 102, 13, 116, 116, 90, 93, 198, 0, 0, 0, 199, 92, 26, 495, 100, 5, 0, 100, 5, 209, 0, 92, 107, 90, 0, 0, 0, 0, 109, 194, 7, 94, 200, 0, 40, 197, 0, 11, 0, 0, 112, 110, 6, 4, 200, 28, 0, 196, 0, 203, 1, 129, 0, 0, 1, 0, 94, 0, 1, 0, 107, 5, 201, 3, 3, 100, 0, 121, 0, 7, 0, 1, 105, 306, 3, 86, 8, 183, 0, 12, 163, 17, 83, 22, 0, 0, 1, 8, 109, 103, 0, 0, 295, 0, 200, 16, 172, 3, 16, 182, 3, 11, 0, 0, 223, 111, 103, 0, 5, 225, 0, 95],
+               [-100, 200, -300, -400],
+               [-100, 12],
+               [12, 15],
+               [-1.0, 5.0, 2.5]]
+
+    filename = os.path.join(DATADIR, 'example_btag.sam')
+
+    def testRead(self):
+
+        s = pysam.AlignmentFile(self.filename)
+        for x, read in enumerate(s):
+            if x == 0:
+                self.assertEqual(read.tags, [('RG', 'QW85I'), ('PG', 'tmap'), ('MD', '140'), ('NM', 0), ('AS', 140), ('FZ', [100, 1, 91, 0, 7, 101, 0, 201, 96, 204, 0, 0, 87, 109, 0, 7, 97, 112, 1, 12, 78, 197, 0, 7, 100, 95, 101, 202, 0, 6, 0, 1, 186, 0, 84, 0, 244, 0, 0, 324, 0, 107, 195, 101, 113, 0, 102, 0, 104, 3, 0, 101, 1, 0, 212, 6, 0, 0, 1, 0, 74, 1, 11, 0, 196, 2, 197, 103, 0, 108, 98, 2, 7, 0, 1, 2, 194, 0, 180, 0, 108, 0, 203, 104, 16, 5, 205, 0, 0, 0, 1, 1, 100, 98, 0, 0, 204, 6, 0, 79, 0, 0, 101, 7, 109, 90, 265, 1, 27, 10, 109, 102, 9, 0, 292, 0, 110, 0, 0, 102, 112, 0, 0, 84, 100, 103, 2, 81, 126, 0, 2, 90, 0, 15, 96, 15, 1, 0, 2, 0, 107, 92, 0, 0, 101, 3, 98, 15, 102, 13, 116, 116, 90, 93, 198, 0, 0, 0, 199, 92, 26, 495, 100, 5, 0, 100, 5, 209, 0, 92, 107, 90, 0, 0, 0, 0, 109, 194, 7, 94, 200, 0, 40, 197, 0, 11, 0, 0, 112, 110, 6, 4, 200, 28, 0, 196, 0, 203, 1, 129, 0, 0, 1, 0, 94, 0, 1, 0, 107, 5, 201, 3, 3, 100, 0, 121, 0, 7, 0, 1, 105, 306, 3, 86, 8, 183, 0, 12, 163, 17, 83, 22, 0, 0, 1, 8, 109, 103, 0, 0, 295, 0, 200, 16, 172, 3, 16, 182, 3, 11, 0, 0, 223, 111, 103, 0, 5, 225, 0, 95]), ('XA', 'map2-1'), ('XS', 53), ('XT', 38), ('XF', 1), ('XE', 0)]
+                                 )
+
+            fz = dict(read.tags)["FZ"]
+            self.assertEqual(fz, self.compare[x])
+            self.assertEqual(read.opt("FZ"), self.compare[x])
+
+    def testWrite(self):
+
+        s = pysam.AlignmentFile(self.filename)
+        for read in s:
+            before = read.tags
+            read.tags = read.tags
+            after = read.tags
+            self.assertEqual(after, before)
+
+
+class TestBTagBam(TestBTagSam):
+    filename = os.path.join(DATADIR, 'example_btag.bam')
+
+
+class TestDoubleFetch(unittest.TestCase):
+    '''check if two iterators on the same bamfile are independent.'''
+
+    filename = os.path.join(DATADIR, 'ex1.bam')
+
+    def testDoubleFetch(self):
+
+        samfile1 = pysam.AlignmentFile(self.filename, 'rb')
+
+        for a, b in zip(samfile1.fetch(multiple_iterators=True),
+                        samfile1.fetch(multiple_iterators=True)):
+            self.assertEqual(a.compare(b), 0)
+
+    def testDoubleFetchWithRegion(self):
+
+        samfile1 = pysam.AlignmentFile(self.filename, 'rb')
+        chr, start, stop = 'chr1', 200, 3000000
+        # just making sure the test has something to catch
+        self.assertTrue(len(list(samfile1.fetch(chr, start, stop))) > 0)
+
+        for a, b in zip(samfile1.fetch(chr, start, stop),
+                        samfile1.fetch(chr, start, stop,
+                                       multiple_iterators=True)):
+            self.assertEqual(a.compare(b), 0)
+
+    def testDoubleFetchUntilEOF(self):
+
+        samfile1 = pysam.AlignmentFile(self.filename, 'rb')
+
+        for a, b in zip(samfile1.fetch(until_eof=True),
+                        samfile1.fetch(until_eof=True,
+                                       multiple_iterators=True)):
+            self.assertEqual(a.compare(b), 0)
+
+
+class TestRemoteFileFTP(unittest.TestCase):
+
+    '''test remote access.
+
+    '''
+
+    # Need to find an ftp server without password on standard
+    # port.
+
+    url = "ftp://ftp.sanger.ac.uk/pub/rd/humanSequences/CV.bam"
+    region = "1:1-1000"
+
+    def testFTPView(self):
+        return
+        if not checkURL(self.url):
+            return
+
+        result = pysam.view(self.url, self.region)
+        self.assertEqual(len(result), 36)
+
+    def testFTPFetch(self):
+        return
+        if not checkURL(self.url):
+            return
+
+        samfile = pysam.AlignmentFile(self.url, "rb")
+        result = list(samfile.fetch(region=self.region))
+        self.assertEqual(len(result), 36)
+
+
+class TestRemoteFileHTTP(unittest.TestCase):
+
+    url = "http://genserv.anat.ox.ac.uk/downloads/pysam/test/ex1.bam"
+    region = "chr1:1-1000"
+    local = os.path.join(DATADIR, "ex1.bam")
+
+    def testView(self):
+        if not checkURL(self.url):
+            return
+
+        samfile_local = pysam.AlignmentFile(self.local, "rb")
+        ref = list(samfile_local.fetch(region=self.region))
+
+        result = pysam.view(self.url, self.region)
+        self.assertEqual(len(result), len(ref))
+
+    def testFetch(self):
+        if not checkURL(self.url):
+            return
+
+        samfile = pysam.AlignmentFile(self.url, "rb")
+        result = list(samfile.fetch(region=self.region))
+        samfile_local = pysam.AlignmentFile(self.local, "rb")
+        ref = list(samfile_local.fetch(region=self.region))
+
+        self.assertEqual(len(ref), len(result))
+        for x, y in zip(result, ref):
+            self.assertEqual(x.compare(y), 0)
+
+    def testFetchAll(self):
+        if not checkURL(self.url):
+            return
+
+        samfile = pysam.AlignmentFile(self.url, "rb")
+        result = list(samfile.fetch())
+        samfile_local = pysam.AlignmentFile(self.local, "rb")
+        ref = list(samfile_local.fetch())
+
+        self.assertEqual(len(ref), len(result))
+        for x, y in zip(result, ref):
+            self.assertEqual(x.compare(y), 0)
+
+
+class TestLargeOptValues(unittest.TestCase):
+
+    ints = (65536, 214748, 2147484, 2147483647)
+    floats = (65536.0, 214748.0, 2147484.0)
+
+    def check(self, samfile):
+
+        i = samfile.fetch()
+        for exp in self.ints:
+            rr = next(i)
+            obs = rr.opt("ZP")
+            self.assertEqual(exp, obs,
+                             "expected %s, got %s\n%s" %
+                             (str(exp), str(obs), str(rr)))
+
+        for exp in [-x for x in self.ints]:
+            rr = next(i)
+            obs = rr.opt("ZP")
+            self.assertEqual(exp, obs,
+                             "expected %s, got %s\n%s" %
+                             (str(exp), str(obs), str(rr)))
+
+        for exp in self.floats:
+            rr = next(i)
+            obs = rr.opt("ZP")
+            self.assertEqual(exp, obs,
+                             "expected %s, got %s\n%s" %
+                             (str(exp), str(obs), str(rr)))
+
+        for exp in [-x for x in self.floats]:
+            rr = next(i)
+            obs = rr.opt("ZP")
+            self.assertEqual(exp, obs, "expected %s, got %s\n%s" %
+                             (str(exp), str(obs), str(rr)))
+
+    def testSAM(self):
+        samfile = pysam.AlignmentFile(
+            os.path.join(DATADIR, "ex10.sam"),
+            "r")
+        self.check(samfile)
+
+    def testBAM(self):
+        samfile = pysam.AlignmentFile(
+            os.path.join(DATADIR, "ex10.bam"),
+            "rb")
+        self.check(samfile)
+
+
+class TestPileup(unittest.TestCase):
+    '''test pileup functionality.'''
+
+    samfilename = "pysam_data/ex1.bam"
+    fastafilename = "pysam_data/ex1.fa"
+
+    def setUp(self):
+
+        self.samfile = pysam.AlignmentFile(self.samfilename)
+        self.fastafile = pysam.Fastafile(self.fastafilename)
+
+    def checkEqual(self, references, iterator):
+
+        for x, column in enumerate(iterator):
+            (contig, pos, reference_base,
+             read_bases, read_qualities, alignment_mapping_qualities) \
+                = references[x][:-1].split("\t")
+            self.assertEqual(int(pos) - 1, column.reference_pos)
+
+    def testSamtoolsStepper(self):
+        refs = pysam.mpileup(
+            "-f", self.fastafilename,
+            self.samfilename)
+        iterator = self.samfile.pileup(
+            stepper="samtools",
+            fastafile=self.fastafile)
+        self.checkEqual(refs, iterator)
+
+    def testAllStepper(self):
+        refs = pysam.mpileup(
+            "-f", self.fastafilename,
+            "-A", "-B",
+            self.samfilename)
+
+        iterator = self.samfile.pileup(
+            stepper="all",
+            fastafile=self.fastafile)
+        self.checkEqual(refs, iterator)
+
+
+class TestLogging(unittest.TestCase):
+
+    '''test around bug issue 42,
+
+    failed in versions < 0.4
+    '''
+
+    def check(self, bamfile, log):
+
+        if log:
+            logger = logging.getLogger('franklin')
+            logger.setLevel(logging.INFO)
+            formatter = logging.Formatter(
+                '%(asctime)s %(levelname)s %(message)s')
+            log_hand = logging.FileHandler('log.txt')
+            log_hand.setFormatter(formatter)
+            logger.addHandler(log_hand)
+
+        bam = pysam.AlignmentFile(bamfile, 'rb')
+        cols = bam.pileup()
+        self.assertTrue(True)
+
+    def testFail1(self):
+        self.check(os.path.join(DATADIR, "ex9_fail.bam"),
+                   False)
+        self.check(os.path.join(DATADIR, "ex9_fail.bam"),
+                   True)
+
+    def testNoFail1(self):
+        self.check(os.path.join(DATADIR, "ex9_nofail.bam"),
+                   False)
+        self.check(os.path.join(DATADIR, "ex9_nofail.bam"),
+                   True)
+
+    def testNoFail2(self):
+        self.check(os.path.join(DATADIR, "ex9_nofail.bam"),
+                   True)
+        self.check(os.path.join(DATADIR, "ex9_nofail.bam"),
+                   True)
+
+# TODOS
+# 1. finish testing all properties within pileup objects
+# 2. check exceptions and bad input problems (missing files, optional fields that aren't present, etc...)
+# 3. check: presence of sequence
+
+
+class TestAlignmentFileUtilityFunctions(unittest.TestCase):
+
+    def testCount(self):
+
+        samfile = pysam.AlignmentFile(os.path.join(DATADIR, "ex1.bam"),
+                                      "rb")
+
+        for contig in ("chr1", "chr2"):
+            for start in range(0, 2000, 100):
+                end = start + 1
+                self.assertEqual(
+                    len(list(samfile.fetch(contig, start, end))),
+                    samfile.count(contig, start, end),
+                    'number mismatch for %s:%i-%i %i != %i' % (
+                        contig, start, end,
+                        len(list(samfile.fetch(contig, start, end))),
+                        samfile.count(contig, start, end)))
+
+                # test empty intervals
+                self.assertEqual(
+                    len(list(samfile.fetch(contig, start, start))),
+                    samfile.count(contig, start, start),
+                    'number mismatch for %s:%i-%i %i != %i' % (
+                        contig, start, start,
+                        len(list(samfile.fetch(contig, start, start))),
+                        samfile.count(contig, start, start)))
+
+                # test half empty intervals
+                self.assertEqual(len(list(samfile.fetch(contig, start))),
+                                 samfile.count(contig, start))
+
+                self.assertEqual(
+                    len(list(samfile.fetch(contig, start))),
+                    samfile.count(contig, start),
+                    'number mismatch for %s:%i %i != %i' % (
+                        contig, start,
+                        len(list(samfile.fetch(contig, start))),
+                        samfile.count(contig, start)))
+
+    def testMate(self):
+        '''test mate access.'''
+
+        with open(os.path.join(DATADIR, "ex1.sam"), "rb") as inf:
+            readnames = [x.split(b"\t")[0] for x in inf.readlines()]
+        if sys.version_info[0] >= 3:
+            readnames = [name.decode('ascii') for name in readnames]
+
+        counts = collections.defaultdict(int)
+        for x in readnames:
+            counts[x] += 1
+
+        samfile = pysam.AlignmentFile(os.path.join(DATADIR, "ex1.bam"),
+                                      "rb")
+
+        for read in samfile.fetch():
+            if not read.is_paired:
+                self.assertRaises(ValueError, samfile.mate, read)
+            elif read.mate_is_unmapped:
+                self.assertRaises(ValueError, samfile.mate, read)
+            else:
+                if counts[read.query_name] == 1:
+                    self.assertRaises(ValueError, samfile.mate, read)
+                else:
+                    mate = samfile.mate(read)
+                    self.assertEqual(read.query_name, mate.query_name)
+                    self.assertEqual(read.is_read1, mate.is_read2)
+                    self.assertEqual(read.is_read2, mate.is_read1)
+                    self.assertEqual(
+                        read.reference_start, mate.next_reference_start)
+                    self.assertEqual(
+                        read.next_reference_start, mate.reference_start)
+
+    def testIndexStats(self):
+        '''test if total number of mapped/unmapped reads is correct.'''
+
+        samfile = pysam.AlignmentFile(os.path.join(DATADIR, "ex1.bam"),
+                                      "rb")
+        self.assertEqual(samfile.mapped, 3235)
+        self.assertEqual(samfile.unmapped, 35)
+        self.assertEqual(samfile.nocoordinate, 0)
+
+
+class TestSamtoolsProxy(unittest.TestCase):
+
+    '''tests for sanity checking access to samtools functions.'''
+
+    def testIndex(self):
+        self.assertRaises(IOError, pysam.index, "missing_file")
+
+    def testView(self):
+        # note that view still echos "open: No such file or directory"
+        self.assertRaises(pysam.SamtoolsError, pysam.view, "missing_file")
+
+    def testSort(self):
+        self.assertRaises(pysam.SamtoolsError, pysam.sort, "missing_file")
+
+
+class TestAlignmentFileIndex(unittest.TestCase):
+
+    def testIndex(self):
+        samfile = pysam.AlignmentFile(os.path.join(DATADIR, "ex1.bam"),
+                                "rb")
+        index = pysam.IndexedReads(samfile)
+        index.build()
+        reads = collections.defaultdict(int)
+
+        for read in samfile:
+            reads[read.query_name] += 1
+
+        for qname, counts in reads.items():
+            found = list(index.find(qname))
+            self.assertEqual(len(found), counts)
+            for x in found:
+                self.assertEqual(x.query_name, qname)
+
+
+if __name__ == "__main__":
+    # build data files
+    print ("building data files")
+    subprocess.call("make -C %s" % DATADIR, shell=True)
+    print ("starting tests")
+    unittest.main()
+    print ("completed tests")
diff --git a/tests/SamFile_test.py b/tests/SamFile_test.py
new file mode 100644 (file)
index 0000000..d714a64
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,1927 @@
+#!/usr/bin/env python
+'''unit testing code for pysam.
+
+Execute in the :file:`tests` directory as it requires the Makefile
+and data files located there.
+'''
+
+import pysam
+import unittest
+import os
+import shutil
+import sys
+import collections
+import subprocess
+import logging
+from TestUtils import checkBinaryEqual, checkURL
+
+IS_PYTHON3 = sys.version_info[0] >= 3
+
+SAMTOOLS = "samtools"
+WORKDIR = "pysam_test_work"
+DATADIR = "pysam_data"
+
+
+class BasicTestBAMFetch(unittest.TestCase):
+
+    '''basic first test - detailed testing
+    if information in file is consistent
+    with information in AlignedRead object.'''
+
+    def setUp(self):
+        self.samfile = pysam.Samfile(
+            os.path.join(DATADIR, "ex3.bam"),
+            "rb")
+        self.reads = list(self.samfile.fetch())
+
+    def testARqname(self):
+        self.assertEqual(
+            self.reads[0].qname,
+            "read_28833_29006_6945",
+            "read name mismatch in read 1: %s != %s" % (
+                self.reads[0].qname, "read_28833_29006_6945"))
+        self.assertEqual(
+            self.reads[1].qname,
+            "read_28701_28881_323b",
+            "read name mismatch in read 2: %s != %s" % (
+                self.reads[1].qname, "read_28701_28881_323b"))
+
+    def testARflag(self):
+        self.assertEqual(
+            self.reads[0].flag, 99,
+            "flag mismatch in read 1: %s != %s" % (
+                self.reads[0].flag, 99))
+        self.assertEqual(
+            self.reads[1].flag, 147,
+            "flag mismatch in read 2: %s != %s" % (
+                self.reads[1].flag, 147))
+
+    def testARrname(self):
+        self.assertEqual(
+            self.reads[0].rname, 0,
+            "chromosome/target id mismatch in read 1: %s != %s" %
+            (self.reads[0].rname, 0))
+        self.assertEqual(
+            self.reads[1].rname, 1,
+            "chromosome/target id mismatch in read 2: %s != %s" %
+            (self.reads[1].rname, 1))
+
+    def testARpos(self):
+        self.assertEqual(
+            self.reads[0].pos, 33 - 1,
+            "mapping position mismatch in read 1: %s != %s" %
+            (self.reads[0].pos, 33 - 1))
+        self.assertEqual(
+            self.reads[1].pos, 88 - 1,
+            "mapping position mismatch in read 2: %s != %s" %
+            (self.reads[1].pos, 88 - 1))
+
+    def testARmapq(self):
+        self.assertEqual(
+            self.reads[0].mapq, 20,
+            "mapping quality mismatch in read 1: %s != %s" %
+            (self.reads[0].mapq, 20))
+        self.assertEqual(
+            self.reads[1].mapq, 30,
+            "mapping quality mismatch in read 2: %s != %s" % (
+                self.reads[1].mapq, 30))
+
+    def testARcigar(self):
+        self.assertEqual(
+            self.reads[0].cigar,
+            [(0, 10), (2, 1), (0, 25)],
+            "read name length mismatch in read 1: %s != %s" %
+            (self.reads[0].cigar, [(0, 10), (2, 1), (0, 25)]))
+        self.assertEqual(
+            self.reads[1].cigar, [(0, 35)],
+            "read name length mismatch in read 2: %s != %s" %
+            (self.reads[1].cigar, [(0, 35)]))
+
+    def testARcigarstring(self):
+        self.assertEqual(self.reads[0].cigarstring, '10M1D25M')
+        self.assertEqual(self.reads[1].cigarstring, '35M')
+
+    def testARmrnm(self):
+        self.assertEqual(
+            self.reads[0].mrnm, 0,
+            "mate reference sequence name mismatch in read 1: %s != %s" %
+            (self.reads[0].mrnm, 0))
+        self.assertEqual(
+            self.reads[1].mrnm, 1,
+            "mate reference sequence name mismatch in read 2: %s != %s" %
+            (self.reads[1].mrnm, 1))
+        self.assertEqual(
+            self.reads[0].rnext, 0,
+            "mate reference sequence name mismatch in read 1: %s != %s" %
+            (self.reads[0].rnext, 0))
+        self.assertEqual(
+            self.reads[1].rnext, 1,
+            "mate reference sequence name mismatch in read 2: %s != %s" %
+            (self.reads[1].rnext, 1))
+
+    def testARmpos(self):
+        self.assertEqual(self.reads[
+                         0].mpos, 200 - 1, "mate mapping position mismatch in read 1: %s != %s" % (self.reads[0].mpos, 200 - 1))
+        self.assertEqual(self.reads[
+                         1].mpos, 500 - 1, "mate mapping position mismatch in read 2: %s != %s" % (self.reads[1].mpos, 500 - 1))
+        self.assertEqual(self.reads[
+                         0].pnext, 200 - 1, "mate mapping position mismatch in read 1: %s != %s" % (self.reads[0].pnext, 200 - 1))
+        self.assertEqual(self.reads[
+                         1].pnext, 500 - 1, "mate mapping position mismatch in read 2: %s != %s" % (self.reads[1].pnext, 500 - 1))
+
+    def testARisize(self):
+        self.assertEqual(self.reads[0].isize, 167, "insert size mismatch in read 1: %s != %s" % (
+            self.reads[0].isize, 167))
+        self.assertEqual(self.reads[1].isize, 412, "insert size mismatch in read 2: %s != %s" % (
+            self.reads[1].isize, 412))
+        self.assertEqual(self.reads[0].tlen, 167, "insert size mismatch in read 1: %s != %s" % (
+            self.reads[0].tlen, 167))
+        self.assertEqual(self.reads[1].tlen, 412, "insert size mismatch in read 2: %s != %s" % (
+            self.reads[1].tlen, 412))
+
+    def testARseq(self):
+        self.assertEqual(self.reads[0].seq, "AGCTTAGCTAGCTACCTATATCTTGGTCTTGGCCG", "sequence mismatch in read 1: %s != %s" % (
+            self.reads[0].seq, "AGCTTAGCTAGCTACCTATATCTTGGTCTTGGCCG"))
+        self.assertEqual(self.reads[1].seq, "ACCTATATCTTGGCCTTGGCCGATGCGGCCTTGCA", "sequence size mismatch in read 2: %s != %s" % (
+            self.reads[1].seq, "ACCTATATCTTGGCCTTGGCCGATGCGGCCTTGCA"))
+        self.assertEqual(self.reads[3].seq, "AGCTTAGCTAGCTACCTATATCTTGGTCTTGGCCG", "sequence mismatch in read 4: %s != %s" % (
+            self.reads[3].seq, "AGCTTAGCTAGCTACCTATATCTTGGTCTTGGCCG"))
+
+    def testARqual(self):
+        self.assertEqual(self.reads[0].qual, "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<9/,&,22;;<<<",
+                         "quality string mismatch in read 1: %s != %s" % (self.reads[0].qual, "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<9/,&,22;;<<<"))
+        self.assertEqual(self.reads[1].qual, "<<<<<;<<<<7;:<<<6;<<<<<<<<<<<<7<<<<", "quality string mismatch in read 2: %s != %s" % (
+            self.reads[1].qual, "<<<<<;<<<<7;:<<<6;<<<<<<<<<<<<7<<<<"))
+        self.assertEqual(self.reads[3].qual, "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<9/,&,22;;<<<",
+                         "quality string mismatch in read 3: %s != %s" % (self.reads[3].qual, "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<9/,&,22;;<<<"))
+
+    def testARquery(self):
+        self.assertEqual(self.reads[0].query, "AGCTTAGCTAGCTACCTATATCTTGGTCTTGGCCG", "query mismatch in read 1: %s != %s" % (
+            self.reads[0].query, "AGCTTAGCTAGCTACCTATATCTTGGTCTTGGCCG"))
+        self.assertEqual(self.reads[1].query, "ACCTATATCTTGGCCTTGGCCGATGCGGCCTTGCA", "query size mismatch in read 2: %s != %s" % (
+            self.reads[1].query, "ACCTATATCTTGGCCTTGGCCGATGCGGCCTTGCA"))
+        self.assertEqual(self.reads[3].query, "TAGCTAGCTACCTATATCTTGGTCTT", "query mismatch in read 4: %s != %s" % (
+            self.reads[3].query, "TAGCTAGCTACCTATATCTTGGTCTT"))
+
+    def testARqqual(self):
+        self.assertEqual(
+            self.reads[0].qqual, "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<9/,&,22;;<<<",
+            "qquality string mismatch in read 1: %s != %s" %
+            (self.reads[0].qqual, "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<9/,&,22;;<<<"))
+        self.assertEqual(
+            self.reads[1].qqual, "<<<<<;<<<<7;:<<<6;<<<<<<<<<<<<7<<<<",
+            "qquality string mismatch in read 2: %s != %s" %
+            (self.reads[1].qqual, "<<<<<;<<<<7;:<<<6;<<<<<<<<<<<<7<<<<"))
+        self.assertEqual(
+            self.reads[3].qqual, "<<<<<<<<<<<<<<<<<:<9/,&,22",
+            "qquality string mismatch in read 3: %s != %s" %
+            (self.reads[3].qqual, "<<<<<<<<<<<<<<<<<:<9/,&,22"))
+
+    def testPresentOptionalFields(self):
+        self.assertEqual(
+            self.reads[0].opt('NM'), 1,
+            "optional field mismatch in read 1, NM: %s != %s" %
+            (self.reads[0].opt('NM'), 1))
+        self.assertEqual(
+            self.reads[0].opt('RG'), 'L1',
+            "optional field mismatch in read 1, RG: %s != %s" %
+            (self.reads[0].opt('RG'), 'L1'))
+        self.assertEqual(
+            self.reads[1].opt('RG'), 'L2',
+            "optional field mismatch in read 2, RG: %s != %s" %
+            (self.reads[1].opt('RG'), 'L2'))
+        self.assertEqual(
+            self.reads[1].opt('MF'), 18,
+            "optional field mismatch in read 2, MF: %s != %s" %
+            (self.reads[1].opt('MF'), 18))
+
+    def testPairedBools(self):
+        self.assertEqual(self.reads[0].is_paired, True,
+                         "is paired mismatch in read 1: %s != %s" % (
+            self.reads[0].is_paired, True))
+        self.assertEqual(self.reads[1].is_paired, True,
+                         "is paired mismatch in read 2: %s != %s" % (
+            self.reads[1].is_paired, True))
+        self.assertEqual(self.reads[0].is_proper_pair, True,
+                         "is proper pair mismatch in read 1: %s != %s" % (
+            self.reads[0].is_proper_pair, True))
+        self.assertEqual(self.reads[1].is_proper_pair, True,
+                         "is proper pair mismatch in read 2: %s != %s" % (
+            self.reads[1].is_proper_pair, True))
+
+    def testTags(self):
+        self.assertEqual(self.reads[0].tags,
+                         [('NM', 1), ('RG', 'L1'),
+                          ('PG', 'P1'), ('XT', 'U')])
+        self.assertEqual(self.reads[1].tags,
+                         [('MF', 18), ('RG', 'L2'),
+                          ('PG', 'P2'), ('XT', 'R')])
+
+    def testAddTags(self):
+        self.assertEqual(sorted(self.reads[0].tags),
+                         sorted([('NM', 1), ('RG', 'L1'),
+                                 ('PG', 'P1'), ('XT', 'U')]))
+
+        self.reads[0].setTag('X1', 'C')
+        self.assertEqual(sorted(self.reads[0].tags),
+                         sorted([('X1', 'C'), ('NM', 1), ('RG', 'L1'),
+                                 ('PG', 'P1'), ('XT', 'U'), ]))
+        self.reads[0].setTag('X2', 5)
+        self.assertEqual(sorted(self.reads[0].tags),
+                         sorted([('X2', 5), ('X1', 'C'),
+                                 ('NM', 1), ('RG', 'L1'),
+                                 ('PG', 'P1'), ('XT', 'U'), ]))
+        # add with replacement
+        self.reads[0].setTag('X2', 10)
+        self.assertEqual(sorted(self.reads[0].tags),
+                         sorted([('X2', 10), ('X1', 'C'),
+                                 ('NM', 1), ('RG', 'L1'),
+                                 ('PG', 'P1'), ('XT', 'U'), ]))
+
+        # add without replacement
+        self.reads[0].setTag('X2', 5, replace=False)
+        self.assertEqual(sorted(self.reads[0].tags),
+                         sorted([('X2', 10), ('X1', 'C'),
+                                 ('X2', 5),
+                                 ('NM', 1), ('RG', 'L1'),
+                                 ('PG', 'P1'), ('XT', 'U'), ]))
+
+    def testAddTagsType(self):
+        self.reads[0].tags = None
+        self.assertEqual(self.reads[0].tags, [])
+
+        self.reads[0].setTag('X1', 5.0)
+        self.reads[0].setTag('X2', "5.0")
+        self.reads[0].setTag('X3', 5)
+
+        self.assertEqual(sorted(self.reads[0].tags),
+                         sorted([('X1', 5.0),
+                                 ('X2', "5.0"),
+                                 ('X3', 5)]))
+
+        # test setting float for int value
+        self.reads[0].setTag('X4', 5, value_type='d')
+        self.assertEqual(sorted(self.reads[0].tags),
+                         sorted([('X1', 5.0),
+                                 ('X2', "5.0"),
+                                 ('X3', 5),
+                                 ('X4', 5.0)]))
+
+        # test setting int for float value - the
+        # value will be rounded.
+        self.reads[0].setTag('X5', 5.2, value_type='i')
+        self.assertEqual(sorted(self.reads[0].tags),
+                         sorted([('X1', 5.0),
+                                 ('X2', "5.0"),
+                                 ('X3', 5),
+                                 ('X4', 5.0),
+                                 ('X5', 5)]))
+
+        # test setting invalid type code
+        self.assertRaises(ValueError, self.reads[0].setTag, 'X6', 5.2, 'g')
+
+    def testTagsUpdatingFloat(self):
+        self.assertEqual(self.reads[0].tags,
+                         [('NM', 1), ('RG', 'L1'),
+                          ('PG', 'P1'), ('XT', 'U')])
+        self.reads[0].tags += [('XC', 5.0)]
+        self.assertEqual(self.reads[0].tags,
+                         [('NM', 1), ('RG', 'L1'),
+                          ('PG', 'P1'), ('XT', 'U'), ('XC', 5.0)])
+
+    def testOpt(self):
+        self.assertEqual(self.reads[0].opt("XT"), "U")
+        self.assertEqual(self.reads[1].opt("XT"), "R")
+
+    def testMissingOpt(self):
+        self.assertRaises(KeyError, self.reads[0].opt, "XP")
+
+    def testEmptyOpt(self):
+        self.assertRaises(KeyError, self.reads[2].opt, "XT")
+
+    def tearDown(self):
+        self.samfile.close()
+
+
+class BasicTestBAMFile(BasicTestBAMFetch):
+
+    def setUp(self):
+        self.samfile = pysam.Samfile(
+            os.path.join(DATADIR, "ex3.sam"),
+            "r")
+        self.reads = [r for r in self.samfile]
+
+
+class BasicTestSAMFile(BasicTestBAMFetch):
+
+    def setUp(self):
+        self.samfile = pysam.Samfile(
+            os.path.join(DATADIR, "ex3.sam"),
+            "r")
+        self.reads = [r for r in self.samfile]
+
+
+class BasicTestSAMFetch(BasicTestBAMFetch):
+    def setUp(self):
+        self.samfile = pysam.Samfile(
+            os.path.join(DATADIR, "ex3.sam"),
+            "r")
+        self.reads = list(self.samfile.fetch())
+
+
+# needs to be implemented
+# class TestAlignedReadFromSamWithoutHeader(TestAlignedReadFromBam):
+#
+#     def setUp(self):
+#         self.samfile=pysam.Samfile( "ex7.sam","r" )
+#         self.reads=list(self.samfile.fetch())
+
+
+class TestIO(unittest.TestCase):
+
+    '''check if reading samfile and writing a samfile are consistent.'''
+
+    def checkEcho(self,
+                  input_filename,
+                  reference_filename,
+                  output_filename,
+                  input_mode, output_mode,
+                  use_template=True):
+        '''iterate through *input_filename* writing to *output_filename* and
+        comparing the output to *reference_filename*.
+
+        The files are opened according to the *input_mode* and *output_mode*.
+
+        If *use_template* is set, the header is copied from infile
+        using the template mechanism, otherwise target names and
+        lengths are passed explicitely.
+
+        '''
+
+        infile = pysam.Samfile(os.path.join(DATADIR, input_filename),
+                               input_mode)
+        if use_template:
+            outfile = pysam.Samfile(output_filename,
+                                    output_mode,
+                                    template=infile)
+        else:
+            outfile = pysam.Samfile(output_filename,
+                                    output_mode,
+                                    referencenames=infile.references,
+                                    referencelengths=infile.lengths,
+                                    add_sq_text=False)
+
+        iter = infile.fetch()
+
+        for x in iter:
+            outfile.write(x)
+        infile.close()
+        outfile.close()
+
+        self.assertTrue(
+            checkBinaryEqual(os.path.join(DATADIR, reference_filename),
+                             output_filename),
+            "files %s and %s are not the same" % (reference_filename,
+                                                  output_filename))
+
+    def testReadWriteBam(self):
+
+        input_filename = "ex1.bam"
+        output_filename = "pysam_ex1.bam"
+        reference_filename = "ex1.bam"
+
+        self.checkEcho(input_filename, reference_filename, output_filename,
+                       "rb", "wb", use_template=True)
+
+    # Disabled - should work, files are not binary equal, but are
+    # non-binary equal:
+    # diff <(samtools view pysam_ex1.bam) <(samtools view pysam_data/ex1.bam)
+    # def testReadWriteBamWithTargetNames(self):
+    #     input_filename = "ex1.bam"
+    #     output_filename = "pysam_ex1.bam"
+    #     reference_filename = "ex1.bam"
+
+    #     self.checkEcho(input_filename, reference_filename, output_filename,
+    #                    "rb", "wb", use_template=False)
+
+    def testReadWriteSamWithHeader(self):
+
+        input_filename = "ex2.sam"
+        output_filename = "pysam_ex2.sam"
+        reference_filename = "ex2.sam"
+
+        self.checkEcho(input_filename,
+                       reference_filename,
+                       output_filename,
+                       "r", "wh")
+
+    # Release 0.8.0
+    # no samfiles without header
+    def testReadWriteSamWithoutHeader(self):
+
+        input_filename = "ex2.sam"
+        output_filename = "pysam_ex2.sam"
+        reference_filename = "ex1.sam"
+
+        self.checkEcho(input_filename,
+                       reference_filename,
+                       output_filename,
+                       "r", "w")
+
+    def testReadSamWithoutTargetNames(self):
+        '''see issue 104.'''
+        input_filename = os.path.join(DATADIR,
+                                      "example_unmapped_reads_no_sq.sam")
+
+        # raise exception in default mode
+        self.assertRaises(ValueError, pysam.Samfile, input_filename, "r")
+
+        # raise exception if no SQ files
+        self.assertRaises(ValueError, pysam.Samfile,
+                          input_filename, "r",
+                          check_header=True)
+
+        infile = pysam.Samfile(
+            input_filename,
+            check_header=False,
+            check_sq=False)
+        
+        # TODO
+        # result = list(infile.fetch(until_eof=True))
+        # self.assertEqual(2, len(result))
+
+    def testReadBamWithoutTargetNames(self):
+        '''see issue 104.'''
+        input_filename = os.path.join(
+            DATADIR, "example_unmapped_reads_no_sq.bam")
+
+        # raise exception in default mode
+        self.assertRaises(ValueError, pysam.Samfile, input_filename, "r")
+
+        # raise exception if no SQ files
+        self.assertRaises(ValueError, pysam.Samfile, input_filename, "r",
+                          check_header=True)
+
+        infile = pysam.Samfile(
+            input_filename, check_header=False, check_sq=False)
+        result = list(infile.fetch(until_eof=True))
+
+    # TODO
+    def testReadSamWithoutHeader(self):
+        input_filename = os.path.join(DATADIR, "ex1.sam")
+
+        # reading from a samfile without header is not 
+        # implemented
+        self.assertRaises(ValueError,
+                          pysam.Samfile,
+                          input_filename,
+                          "r")
+
+        # TODO
+        # without check_header header is no read
+        # leading to segfault
+        # self.assertRaises(ValueError,
+        #                   pysam.Samfile,
+        #                   input_filename,
+        #                   "r",
+        #                   check_header=False)
+
+    # TODO
+    # def testReadUnformattedFile(self):
+    #     '''test reading from a file that is not bam/sam formatted'''
+    #     input_filename = os.path.join(DATADIR, 'Makefile')
+
+    #     # bam - file raise error
+    #     self.assertRaises(ValueError,
+    #                       pysam.Samfile,
+    #                       input_filename,
+    #                       "rb")
+
+    #     # sam - file error, but can't fetch
+    #     self.assertRaises(ValueError,
+    #                       pysam.Samfile,
+    #                       input_filename,
+    #                       "r")
+
+    #     self.assertRaises(ValueError,
+    #                       pysam.Samfile,
+    #                       input_filename,
+    #                       "r",
+    #                       check_header=False)
+
+    def testBAMWithoutAlignedReads(self):
+        '''see issue 117'''
+        input_filename = os.path.join(DATADIR, "test_unaligned.bam")
+        samfile = pysam.Samfile(input_filename, "rb", check_sq=False)
+        samfile.fetch(until_eof=True)
+
+    def testBAMWithShortBAI(self):
+        '''see issue 116'''
+        input_filename = os.path.join(DATADIR, "example_bai.bam")
+        samfile = pysam.Samfile(input_filename, "rb", check_sq=False)
+        samfile.fetch('chr2')
+
+    def testFetchFromClosedFile(self):
+
+        samfile = pysam.Samfile(os.path.join(DATADIR, "ex1.bam"),
+                                "rb")
+        samfile.close()
+        self.assertRaises(ValueError, samfile.fetch, 'chr1', 100, 120)
+
+    def testClosedFile(self):
+        '''test that access to a closed samfile raises ValueError.'''
+
+        samfile = pysam.Samfile(os.path.join(DATADIR, "ex1.bam"),
+                                "rb")
+        samfile.close()
+        self.assertRaises(ValueError, samfile.fetch, 'chr1', 100, 120)
+        self.assertRaises(ValueError, samfile.pileup, 'chr1', 100, 120)
+        self.assertRaises(ValueError, samfile.getrname, 0)
+        # TODO
+        self.assertRaises(ValueError, samfile.tell)
+        self.assertRaises(ValueError, samfile.seek, 0)
+        self.assertRaises(ValueError, getattr, samfile, "nreferences")
+        self.assertRaises(ValueError, getattr, samfile, "references")
+        self.assertRaises(ValueError, getattr, samfile, "lengths")
+        self.assertRaises(ValueError, getattr, samfile, "text")
+        self.assertRaises(ValueError, getattr, samfile, "header")
+
+        # write on closed file
+        self.assertEqual(0, samfile.write(None))
+
+    def testAutoDetection(self):
+        '''test if autodetection works.'''
+
+        # TODO
+        # samfile = pysam.Samfile(os.path.join(DATADIR, "ex3.sam"))
+        # self.assertRaises(ValueError, samfile.fetch, 'chr1')
+        # samfile.close()
+
+        samfile = pysam.Samfile(os.path.join(DATADIR, "ex3.bam"))
+        samfile.fetch('chr1')
+        samfile.close()
+
+    # TOOD
+    # def testReadingFromSamFileWithoutHeader(self):
+    #     '''read from samfile without header.
+    #     '''
+    #     samfile = pysam.Samfile(os.path.join(DATADIR, "ex7.sam"),
+    #                             check_header=False,
+    #                             check_sq=False)
+    #     self.assertRaises(NotImplementedError, samfile.__iter__)
+
+    def testReadingFromFileWithoutIndex(self):
+        '''read from bam file without index.'''
+
+        shutil.copyfile(os.path.join(DATADIR, "ex2.bam"), 'tmp_ex2.bam')
+        samfile = pysam.Samfile('tmp_ex2.bam',
+                                "rb")
+        self.assertRaises(ValueError, samfile.fetch)
+        self.assertEqual(len(list(samfile.fetch(until_eof=True))),
+                         3270)
+        os.unlink('tmp_ex2.bam')
+
+    # def testReadingUniversalFileMode(self):
+    #     '''read from samfile without header.
+    #     '''
+
+    #     input_filename = "ex2.sam"
+    #     output_filename = "pysam_ex2.sam"
+    #     reference_filename = "ex1.sam"
+
+    #     self.checkEcho(input_filename,
+    #                    reference_filename,
+    #                    output_filename,
+    #                    "rU", "w")
+
+    def testHead(self):
+        '''test IteratorRowHead'''
+        samfile = pysam.Samfile(os.path.join(DATADIR, "ex1.bam"),
+                                "rb")
+        l10 = list(samfile.head(10))
+        l100 = list(samfile.head(100))
+        self.assertEqual(len(l10), 10)
+        self.assertEqual(len(l100), 100)
+        self.assertEqual(list(map(str, l10)),
+                         list(map(str, l100[:10])))
+
+
+class TestFloatTagBug(unittest.TestCase):
+
+    '''see issue 71'''
+
+    def testFloatTagBug(self):
+        '''a float tag before another exposed a parsing bug in bam_aux_get.
+
+        Fixed in 0.1.19
+        '''
+        samfile = pysam.Samfile(os.path.join(DATADIR, "tag_bug.bam"))
+        read = next(samfile.fetch(until_eof=True))
+        self.assertTrue(('XC', 1) in read.tags)
+        self.assertEqual(read.opt('XC'), 1)
+
+
+class TestLargeFieldBug(unittest.TestCase):
+
+    '''see issue 100'''
+
+    def testLargeFileBug(self):
+        '''when creating a read with a large entry in the tag field
+        causes an errror:
+            NotImplementedError: tags field too large
+        '''
+        samfile = pysam.Samfile(os.path.join(DATADIR, "issue100.bam"))
+        read = next(samfile.fetch(until_eof=True))
+        new_read = pysam.AlignedRead()
+        new_read.tags = read.tags
+        self.assertEqual(new_read.tags, read.tags)
+
+
+class TestTagParsing(unittest.TestCase):
+
+    '''tests checking the accuracy of tag setting and retrieval.'''
+
+    def makeRead(self):
+        a = pysam.AlignedRead()
+        a.qname = "read_12345"
+        a.tid = 0
+        a.seq = "ACGT" * 3
+        a.flag = 0
+        a.rname = 0
+        a.pos = 1
+        a.mapq = 20
+        a.cigar = ((0, 10), (2, 1), (0, 25))
+        a.mrnm = 0
+        a.mpos = 200
+        a.isize = 0
+        a.qual = "1234" * 3
+        # todo: create tags
+        return a
+
+    def testNegativeIntegers(self):
+        x = -2
+        aligned_read = self.makeRead()
+        aligned_read.tags = [("XD", int(x))]
+        # print (aligned_read.tags)
+
+    def testNegativeIntegers2(self):
+        x = -2
+        r = self.makeRead()
+        r.tags = [("XD", int(x))]
+        outfile = pysam.Samfile("test.bam",
+                                "wb",
+                                referencenames=("chr1",),
+                                referencelengths = (1000,))
+        outfile.write(r)
+        outfile.close()
+
+    def testCigarString(self):
+        r = self.makeRead()
+        self.assertEqual(r.cigarstring, "10M1D25M")
+        r.cigarstring = "20M10D20M"
+        self.assertEqual(r.cigar, [(0, 20), (2, 10), (0, 20)])
+        # unsetting cigar string
+        r.cigarstring = None
+        self.assertEqual(r.cigarstring, None)
+
+    def testCigar(self):
+        r = self.makeRead()
+        self.assertEqual(r.cigar, [(0, 10), (2, 1), (0, 25)])
+        # unsetting cigar string
+        r.cigar = None
+        self.assertEqual(r.cigar, [])
+
+    def testLongTags(self):
+        '''see issue 115'''
+
+        r = self.makeRead()
+        rg = 'HS2000-899_199.L3'
+        tags = [('XC', 85), ('XT', 'M'), ('NM', 5),
+                ('SM', 29), ('AM', 29), ('XM', 1),
+                ('XO', 1), ('XG', 4), ('MD', '37^ACCC29T18'),
+                ('XA', '5,+11707,36M1I48M,2;21,-48119779,46M1I38M,2;hs37d5,-10060835,40M1D45M,3;5,+11508,36M1I48M,3;hs37d5,+6743812,36M1I48M,3;19,-59118894,46M1I38M,3;4,-191044002,6M1I78M,3;')]
+
+        r.tags = tags
+        r.tags += [("RG", rg)] * 100
+        tags += [("RG", rg)] * 100
+
+        self.assertEqual(tags, r.tags)
+
+
+class TestClipping(unittest.TestCase):
+
+    def testClipping(self):
+
+        self.samfile = pysam.Samfile(os.path.join(DATADIR, "softclip.bam"),
+                                     "rb")
+        for read in self.samfile:
+
+            if read.qname == "r001":
+                self.assertEqual(read.seq, 'AAAAGATAAGGATA')
+                self.assertEqual(read.query, 'AGATAAGGATA')
+                self.assertEqual(read.qual, None)
+                self.assertEqual(read.qqual, None)
+
+            elif read.qname == "r002":
+
+                self.assertEqual(read.seq, 'GCCTAAGCTAA')
+                self.assertEqual(read.query, 'AGCTAA')
+                self.assertEqual(read.qual, '01234567890')
+                self.assertEqual(read.qqual, '567890')
+
+            elif read.qname == "r003":
+
+                self.assertEqual(read.seq, 'GCCTAAGCTAA')
+                self.assertEqual(read.query, 'GCCTAA')
+                self.assertEqual(read.qual, '01234567890')
+                self.assertEqual(read.qqual, '012345')
+
+            elif read.qname == "r004":
+
+                self.assertEqual(read.seq, 'TAGGC')
+                self.assertEqual(read.query, 'TAGGC')
+                self.assertEqual(read.qual, '01234')
+                self.assertEqual(read.qqual, '01234')
+
+
+class TestIteratorRow(unittest.TestCase):
+
+    def setUp(self):
+        self.samfile = pysam.Samfile(os.path.join(DATADIR, "ex1.bam"),
+                                     "rb")
+
+    def checkRange(self, rnge):
+        '''compare results from iterator with those from samtools.'''
+        ps = list(self.samfile.fetch(region=rnge))
+        sa = list(pysam.view(os.path.join(DATADIR, "ex1.bam"),
+                             rnge,
+                             raw=True))
+        self.assertEqual(len(ps), len(
+            sa), "unequal number of results for range %s: %i != %i" % (rnge, len(ps), len(sa)))
+        # check if the same reads are returned and in the same order
+        for line, (a, b) in enumerate(list(zip(ps, sa))):
+            d = b.split("\t")
+            self.assertEqual(
+                a.qname, d[0], "line %i: read id mismatch: %s != %s" % (line, a.rname, d[0]))
+            self.assertEqual(a.pos, int(d[3]) - 1, "line %i: read position mismatch: %s != %s, \n%s\n%s\n" %
+                             (line, a.pos, int(d[3]) - 1,
+                              str(a), str(d)))
+            qual = d[10]
+            self.assertEqual(a.qual, qual, "line %i: quality mismatch: %s != %s, \n%s\n%s\n" %
+                             (line, a.qual, qual,
+                              str(a), str(d)))
+
+    def testIteratePerContig(self):
+        '''check random access per contig'''
+        for contig in self.samfile.references:
+            self.checkRange(contig)
+
+    def testIterateRanges(self):
+        '''check random access per range'''
+        for contig, length in zip(self.samfile.references, self.samfile.lengths):
+            for start in range(1, length, 90):
+                # this includes empty ranges
+                self.checkRange("%s:%i-%i" % (contig, start, start + 90))
+
+    def tearDown(self):
+        self.samfile.close()
+
+
+class TestIteratorRowAll(unittest.TestCase):
+
+    def setUp(self):
+        self.samfile = pysam.Samfile(os.path.join(DATADIR, "ex1.bam"),
+                                     "rb")
+
+    def testIterate(self):
+        '''compare results from iterator with those from samtools.'''
+        ps = list(self.samfile.fetch())
+        sa = list(pysam.view(os.path.join(DATADIR, "ex1.bam"),
+                             raw=True))
+        self.assertEqual(
+            len(ps), len(sa), "unequal number of results: %i != %i" % (len(ps), len(sa)))
+        # check if the same reads are returned
+        for line, pair in enumerate(list(zip(ps, sa))):
+            data = pair[1].split("\t")
+            self.assertEqual(pair[0].qname, data[
+                             0], "read id mismatch in line %i: %s != %s" % (line, pair[0].rname, data[0]))
+
+    def tearDown(self):
+        self.samfile.close()
+
+
+class TestIteratorColumn(unittest.TestCase):
+
+    '''test iterator column against contents of ex4.bam.'''
+
+    # note that samfile contains 1-based coordinates
+    # 1D means deletion with respect to reference sequence
+    #
+    mCoverages = {'chr1': [0] * 20 + [1] * 36 + [0] * (100 - 20 - 35),
+                  'chr2': [0] * 20 + [1] * 35 + [0] * (100 - 20 - 35),
+                  }
+
+    def setUp(self):
+        self.samfile = pysam.Samfile(os.path.join(DATADIR, "ex4.bam"),
+                                     "rb")
+
+    def checkRange(self, contig, start=None, end=None, truncate=False):
+        '''compare results from iterator with those from samtools.'''
+        # check if the same reads are returned and in the same order
+        for column in self.samfile.pileup(contig, start, end,
+                                          truncate=truncate):
+            if truncate:
+                self.assertGreaterEqual(column.pos, start)
+                self.assertLess(column.pos, end)
+            thiscov = len(column.pileups)
+            refcov = self.mCoverages[
+                self.samfile.getrname(column.tid)][column.pos]
+            self.assertEqual(
+                thiscov, refcov, "wrong coverage at pos %s:%i %i should be %i" % (
+                self.samfile.getrname(column.tid), column.pos, thiscov, refcov))
+
+    def testIterateAll(self):
+        '''check random access per contig'''
+        self.checkRange(None)
+
+    def testIteratePerContig(self):
+        '''check random access per contig'''
+        for contig in self.samfile.references:
+            self.checkRange(contig)
+
+    def testIterateRanges(self):
+        '''check random access per range'''
+        for contig, length in zip(self.samfile.references, self.samfile.lengths):
+            for start in range(1, length, 90):
+                # this includes empty ranges
+                self.checkRange(contig, start, start + 90)
+
+    def testInverse(self):
+        '''test the inverse, is point-wise pileup accurate.'''
+        for contig, refseq in list(self.mCoverages.items()):
+            refcolumns = sum(refseq)
+            for pos, refcov in enumerate(refseq):
+                columns = list(self.samfile.pileup(contig, pos, pos + 1))
+                if refcov == 0:
+                    # if no read, no coverage
+                    self.assertEqual(
+                        len(columns),
+                        refcov,
+                        "wrong number of pileup columns returned for position %s:%i, %i should be %i" % (
+                            contig, pos,
+                            len(columns), refcov))
+                elif refcov == 1:
+                    # one read, all columns of the read are returned
+                    self.assertEqual(
+                        len(columns),
+                        refcolumns,
+                        "pileup incomplete at position %i: got %i, expected %i " %
+                        (pos, len(columns), refcolumns))
+
+    def testIterateTruncate(self):
+        '''check random access per range'''
+        for contig, length in zip(self.samfile.references, self.samfile.lengths):
+            for start in range(1, length, 90):
+                # this includes empty ranges
+                self.checkRange(contig, start, start + 90, truncate=True)
+
+    def tearDown(self):
+        self.samfile.close()
+
+
+class TestIteratorColumn2(unittest.TestCase):
+
+    '''test iterator column against contents of ex1.bam.'''
+
+    def setUp(self):
+        self.samfile = pysam.Samfile(os.path.join(DATADIR, "ex1.bam"),
+                                     "rb")
+
+    def testStart(self):
+        # print self.samfile.fetch().next().pos
+        # print self.samfile.pileup().next().pos
+        pass
+
+    def testTruncate(self):
+        '''see issue 107.'''
+        # note that ranges in regions start from 1
+        p = self.samfile.pileup(region='chr1:170:172', truncate=True)
+        columns = [x.pos for x in p]
+        self.assertEqual(len(columns), 3)
+        self.assertEqual(columns, [169, 170, 171])
+
+        p = self.samfile.pileup('chr1', 169, 172, truncate=True)
+        columns = [x.pos for x in p]
+
+        self.assertEqual(len(columns), 3)
+        self.assertEqual(columns, [169, 170, 171])
+
+    def testAccessOnClosedIterator(self):
+        '''see issue 131
+
+        Accessing pileup data after iterator has closed.
+        '''
+        pcolumn = self.samfile.pileup('chr1', 170, 180).__next__()
+        self.assertRaises(ValueError, getattr, pcolumn, "pileups")
+
+
+class TestHeaderSam(unittest.TestCase):
+
+    header = {'SQ': [{'LN': 1575, 'SN': 'chr1'},
+                     {'LN': 1584, 'SN': 'chr2'}],
+              'RG': [{'LB': 'SC_1', 'ID': 'L1', 'SM': 'NA12891', 'PU': 'SC_1_10', "CN": "name:with:colon"},
+                     {'LB': 'SC_2', 'ID': 'L2', 'SM': 'NA12891', 'PU': 'SC_2_12', "CN": "name:with:colon"}],
+              'PG': [{'ID': 'P1', 'VN': '1.0'}, {'ID': 'P2', 'VN': '1.1'}],
+              'HD': {'VN': '1.0'},
+              'CO': ['this is a comment', 'this is another comment'],
+              }
+
+    def compareHeaders(self, a, b):
+        '''compare two headers a and b.'''
+        for ak, av in a.items():
+            self.assertTrue(ak in b, "key '%s' not in '%s' " % (ak, b))
+            self.assertEqual(av, b[ak])
+
+    def setUp(self):
+        self.samfile = pysam.Samfile(os.path.join(DATADIR, "ex3.sam"),
+                                     "r")
+
+    def testHeaders(self):
+        self.compareHeaders(self.header, self.samfile.header)
+        self.compareHeaders(self.samfile.header, self.header)
+
+    def testNameMapping(self):
+        for x, y in enumerate(("chr1", "chr2")):
+            tid = self.samfile.gettid(y)
+            ref = self.samfile.getrname(x)
+            self.assertEqual(tid, x)
+            self.assertEqual(ref, y)
+
+        self.assertEqual(self.samfile.gettid("chr?"), -1)
+        self.assertRaises(ValueError, self.samfile.getrname, 2)
+
+    def tearDown(self):
+        self.samfile.close()
+
+
+class TestHeaderBam(TestHeaderSam):
+
+    def setUp(self):
+        self.samfile = pysam.Samfile(os.path.join(DATADIR, "ex3.bam"),
+                                     "rb")
+
+
+class TestHeaderFromRefs(unittest.TestCase):
+
+    '''see issue 144
+
+    reference names need to be converted to string for python 3
+    '''
+
+    # def testHeader( self ):
+    #     refs = ['chr1', 'chr2']
+    #     tmpfile = "tmp_%i" % id(self)
+    #     s = pysam.Samfile(tmpfile, 'wb',
+    #                       referencenames=refs,
+    #                       referencelengths=[100]*len(refs))
+    #     s.close()
+
+    #     self.assertTrue( checkBinaryEqual( 'issue144.bam', tmpfile ),
+    #                      'bam files differ')
+    #     os.unlink( tmpfile )
+
+
+class TestHeader1000Genomes(unittest.TestCase):
+    '''see issue 110'''
+    # bamfile = "http://ftp.1000genomes.ebi.ac.uk/vol1/ftp/technical/phase2b_alignment/data/NA07048/exome_alignment/NA07048.unmapped.ILLUMINA.bwa.CEU.exome.20120522_p2b.bam"
+    bamfile = "http://ftp.1000genomes.ebi.ac.uk/vol1/ftp/technical/phase3_EX_or_LC_only_alignment/data/HG00104/alignment/HG00104.chrom11.ILLUMINA.bwa.GBR.low_coverage.20130415.bam"
+
+    def testRead(self):
+
+        if not checkURL(self.bamfile):
+            return
+
+        f = pysam.Samfile(self.bamfile, "rb")
+        data = f.header.copy()
+        self.assertTrue(data)
+
+
+class TestUnmappedReads(unittest.TestCase):
+
+    # TODO
+    # def testSAM(self):
+    #     samfile = pysam.Samfile(os.path.join(DATADIR, "ex5.sam"),
+    #                             "r")
+    #     self.assertEqual(len(list(samfile.fetch(until_eof=True))), 2)
+    #     samfile.close()
+
+    def testBAM(self):
+        samfile = pysam.Samfile(os.path.join(DATADIR, "ex5.bam"),
+                                "rb")
+        self.assertEqual(len(list(samfile.fetch(until_eof=True))), 2)
+        samfile.close()
+
+
+class TestPileupObjects(unittest.TestCase):
+
+    def setUp(self):
+        self.samfile = pysam.Samfile(os.path.join(DATADIR, "ex1.bam"),
+                                     "rb")
+
+    def testPileupColumn(self):
+        for pcolumn1 in self.samfile.pileup(region="chr1:105"):
+            if pcolumn1.pos == 104:
+                self.assertEqual(
+                    pcolumn1.tid, 0, "chromosome/target id mismatch in position 1: %s != %s" % (pcolumn1.tid, 0))
+                self.assertEqual(
+                    pcolumn1.pos, 105 - 1, "position mismatch in position 1: %s != %s" % (pcolumn1.pos, 105 - 1))
+                self.assertEqual(
+                    pcolumn1.n, 2, "# reads mismatch in position 1: %s != %s" % (pcolumn1.n, 2))
+        for pcolumn2 in self.samfile.pileup(region="chr2:1480"):
+            if pcolumn2.pos == 1479:
+                self.assertEqual(
+                    pcolumn2.tid, 1, "chromosome/target id mismatch in position 1: %s != %s" % (pcolumn2.tid, 1))
+                self.assertEqual(
+                    pcolumn2.pos, 1480 - 1, "position mismatch in position 1: %s != %s" % (pcolumn2.pos, 1480 - 1))
+                self.assertEqual(
+                    pcolumn2.n, 12, "# reads mismatch in position 1: %s != %s" % (pcolumn2.n, 12))
+
+    def testPileupRead(self):
+        for pcolumn1 in self.samfile.pileup(region="chr1:105"):
+            if pcolumn1.pos == 104:
+                self.assertEqual(
+                    len(pcolumn1.pileups), 2,
+                    "# reads aligned to column mismatch in position 1"
+                    ": %s != %s" %
+                    (len(pcolumn1.pileups), 2))
+
+
+# self.assertEqual( pcolumn1.pileups[0]  # need to test additional
+# properties here
+
+    def tearDown(self):
+        self.samfile.close()
+
+    def testIteratorOutOfScope(self):
+        '''test if exception is raised if pileup col is accessed after
+        iterator is exhausted.'''
+
+        for pileupcol in self.samfile.pileup():
+            pass
+
+        self.assertRaises(ValueError, getattr, pileupcol, "pileups")
+
+
+class TestContextManager(unittest.TestCase):
+
+    def testManager(self):
+        with pysam.Samfile(os.path.join(DATADIR, 'ex1.bam'),
+                           'rb') as samfile:
+            samfile.fetch()
+        self.assertEqual(samfile._isOpen(), False)
+
+
+class TestExceptions(unittest.TestCase):
+
+    def setUp(self):
+        self.samfile = pysam.Samfile(os.path.join(DATADIR, "ex1.bam"),
+                                     "rb")
+
+    def testMissingFile(self):
+
+        self.assertRaises(IOError, pysam.Samfile, "exdoesntexist.bam", "rb")
+        self.assertRaises(IOError, pysam.Samfile, "exdoesntexist.sam", "r")
+        self.assertRaises(IOError, pysam.Samfile, "exdoesntexist.bam", "r")
+        self.assertRaises(IOError, pysam.Samfile, "exdoesntexist.sam", "rb")
+
+    def testBadContig(self):
+        self.assertRaises(ValueError, self.samfile.fetch, "chr88")
+
+    def testMeaninglessCrap(self):
+        self.assertRaises(ValueError, self.samfile.fetch, "skljf")
+
+    def testBackwardsOrderNewFormat(self):
+        self.assertRaises(ValueError, self.samfile.fetch, 'chr1', 100, 10)
+
+    def testBackwardsOrderOldFormat(self):
+        self.assertRaises(ValueError, self.samfile.fetch, region="chr1:100-10")
+
+    def testOutOfRangeNegativeNewFormat(self):
+        self.assertRaises(ValueError, self.samfile.fetch, "chr1", 5, -10)
+        self.assertRaises(ValueError, self.samfile.fetch, "chr1", 5, 0)
+        self.assertRaises(ValueError, self.samfile.fetch, "chr1", -5, -10)
+
+        self.assertRaises(ValueError, self.samfile.count, "chr1", 5, -10)
+        self.assertRaises(ValueError, self.samfile.count, "chr1", 5, 0)
+        self.assertRaises(ValueError, self.samfile.count, "chr1", -5, -10)
+
+    def testOutOfRangeNegativeOldFormat(self):
+        self.assertRaises(ValueError, self.samfile.fetch, region="chr1:-5-10")
+        self.assertRaises(ValueError, self.samfile.fetch, region="chr1:-5-0")
+        self.assertRaises(ValueError, self.samfile.fetch, region="chr1:-5--10")
+
+        self.assertRaises(ValueError, self.samfile.count, region="chr1:-5-10")
+        self.assertRaises(ValueError, self.samfile.count, region="chr1:-5-0")
+        self.assertRaises(ValueError, self.samfile.count, region="chr1:-5--10")
+
+    def testOutOfRangNewFormat(self):
+        self.assertRaises(
+            ValueError, self.samfile.fetch, "chr1", 9999999999, 99999999999)
+        self.assertRaises(
+            ValueError, self.samfile.count, "chr1", 9999999999, 99999999999)
+
+    def testOutOfRangeLargeNewFormat(self):
+        self.assertRaises(ValueError, self.samfile.fetch, "chr1",
+                          9999999999999999999999999999999, 9999999999999999999999999999999999999999)
+        self.assertRaises(ValueError, self.samfile.count, "chr1",
+                          9999999999999999999999999999999, 9999999999999999999999999999999999999999)
+
+    def testOutOfRangeLargeOldFormat(self):
+        self.assertRaises(
+            ValueError, self.samfile.fetch, "chr1:99999999999999999-999999999999999999")
+        self.assertRaises(
+            ValueError, self.samfile.count, "chr1:99999999999999999-999999999999999999")
+
+    def testZeroToZero(self):
+        '''see issue 44'''
+        self.assertEqual(len(list(self.samfile.fetch('chr1', 0, 0))), 0)
+
+    def tearDown(self):
+        self.samfile.close()
+
+
+class TestWrongFormat(unittest.TestCase):
+
+    '''test cases for opening files not in bam/sam format.'''
+
+    def testOpenSamAsBam(self):
+        self.assertRaises(ValueError,
+                          pysam.Samfile,
+                          os.path.join(DATADIR, 'ex1.sam'),
+                          'rb')
+
+    def testOpenBamAsSam(self):
+        # test fails, needs to be implemented.
+        # sam.fetch() fails on reading, not on opening
+        # self.assertRaises( ValueError, pysam.Samfile, 'ex1.bam', 'r' )
+        pass
+
+    def testOpenFastaAsSam(self):
+        # test fails, needs to be implemented.
+        # sam.fetch() fails on reading, not on opening
+        # self.assertRaises( ValueError, pysam.Samfile, 'ex1.fa', 'r' )
+        pass
+
+    def testOpenFastaAsBam(self):
+        self.assertRaises(ValueError,
+                          pysam.Samfile,
+                          os.path.join(DATADIR, 'ex1.fa'),
+                          'rb')
+
+
+class ReadTest(unittest.TestCase):
+
+    def checkFieldEqual(self, read1, read2, exclude=[]):
+        '''check if two reads are equal by comparing each field.'''
+
+        # add the . for refactoring purposes.
+        for x in (".qname", ".seq", ".flag",
+                  ".rname", ".pos", ".mapq", ".cigar",
+                  ".mrnm", ".mpos", ".isize", 
+                  ".qual",
+                  ".bin",
+                  ".is_paired", ".is_proper_pair",
+                  ".is_unmapped", ".mate_is_unmapped",
+                  ".is_reverse", ".mate_is_reverse",
+                  ".is_read1", ".is_read2",
+                  ".is_secondary", ".is_qcfail",
+                  ".is_duplicate"):
+            n = x[1:]
+            if n in exclude:
+                continue
+            self.assertEqual(getattr(read1, n), getattr(read2, n),
+                             "attribute mismatch for %s: %s != %s" %
+                             (n, getattr(read1, n), getattr(read2, n)))
+
+
+class TestAlignedRead(ReadTest):
+
+    '''tests to check if aligned read can be constructed
+    and manipulated.
+    '''
+
+    def testEmpty(self):
+        a = pysam.AlignedRead()
+        self.assertEqual(a.qname, None)
+        self.assertEqual(a.seq, None)
+        self.assertEqual(a.qual, None)
+        self.assertEqual(a.flag, 0)
+        self.assertEqual(a.rname, 0)
+        self.assertEqual(a.mapq, 0)
+        self.assertEqual(a.cigar, [])
+        self.assertEqual(a.tags, [])
+        self.assertEqual(a.mrnm, 0)
+        self.assertEqual(a.mpos, 0)
+        self.assertEqual(a.isize, 0)
+
+
+    def testStrOfEmptyRead(self):
+        a = pysam.AlignedRead()
+        s = str(a)
+        self.assertEqual(
+            "None\t0\t0\t0\t0\tNone\t0\t0\t0\tNone\tNone\t[]",
+            s)
+
+
+    def buildRead(self):
+        '''build an example read.'''
+
+        a = pysam.AlignedRead()
+        a.qname = "read_12345"
+        a.seq = "ACGT" * 10
+        a.flag = 0
+        a.rname = 0
+        a.pos = 20
+        a.mapq = 20
+        a.cigar = ((0, 10), (2, 1), (0, 9), (1, 1), (0, 20))
+        a.mrnm = 0
+        a.mpos = 200
+        a.isize = 167
+        a.qual = "1234" * 10
+        # todo: create tags
+        return a
+
+    def testUpdate(self):
+        '''check if updating fields affects other variable length data
+        '''
+        a = self.buildRead()
+        b = self.buildRead()
+
+        # check qname
+        b.qname = "read_123"
+        self.checkFieldEqual(a, b, "qname")
+        b.qname = "read_12345678"
+        self.checkFieldEqual(a, b, "qname")
+        b.qname = "read_12345"
+        self.checkFieldEqual(a, b)
+
+        # check cigar
+        b.cigar = ((0, 10), )
+        self.checkFieldEqual(a, b, "cigar")
+        b.cigar = ((0, 10), (2, 1), (0, 10))
+        self.checkFieldEqual(a, b, "cigar")
+        b.cigar = ((0, 10), (2, 1), (0, 9), (1, 1), (0, 20))
+        self.checkFieldEqual(a, b)
+
+        # check seq
+        b.seq = "ACGT"
+        self.checkFieldEqual(a, b, ("seq", "qual"))
+        b.seq = "ACGT" * 3
+        self.checkFieldEqual(a, b, ("seq", "qual"))
+        b.seq = "ACGT" * 10
+        self.checkFieldEqual(a, b, ("qual",))
+
+        # reset qual
+        b = self.buildRead()
+
+        # check flags:
+        for x in (
+                "is_paired", "is_proper_pair",
+                "is_unmapped", "mate_is_unmapped",
+                "is_reverse", "mate_is_reverse",
+                "is_read1", "is_read2",
+                "is_secondary", "is_qcfail",
+                "is_duplicate"):
+            setattr(b, x, True)
+            self.assertEqual(getattr(b, x), True)
+            self.checkFieldEqual(a, b, ("flag", x,))
+            setattr(b, x, False)
+            self.assertEqual(getattr(b, x), False)
+            self.checkFieldEqual(a, b)
+
+    def testUpdate2(self):
+        '''issue 135: inplace update of sequence and quality score.
+
+        This does not work as setting the sequence will erase
+        the quality scores.
+        '''
+        a = self.buildRead()
+        a.seq = a.seq[5:10]
+        self.assertEqual(a.qual, None)
+
+        a = self.buildRead()
+        s = a.qual
+        a.seq = a.seq[5:10]
+        a.qual = s[5:10]
+
+        self.assertEqual(a.qual, s[5:10])
+
+    def testLargeRead(self):
+        '''build an example read.'''
+
+        a = pysam.AlignedRead()
+        a.qname = "read_12345"
+        a.seq = "ACGT" * 200
+        a.flag = 0
+        a.rname = 0
+        a.pos = 20
+        a.mapq = 20
+        a.cigar = ((0, 4 * 200), )
+        a.mrnm = 0
+        a.mpos = 200
+        a.isize = 167
+        a.qual = "1234" * 200
+
+        return a
+
+    def testTagParsing(self):
+        '''test for tag parsing
+
+        see http://groups.google.com/group/pysam-user-group/browse_thread/thread/67ca204059ea465a
+        '''
+        samfile = pysam.Samfile(os.path.join(DATADIR, "ex8.bam"),
+                                "rb")
+
+        for entry in samfile:
+            before = entry.tags
+            entry.tags = entry.tags
+            after = entry.tags
+            self.assertEqual(after, before)
+
+    def testUpdateTlen(self):
+        '''check if updating tlen works'''
+        a = self.buildRead()
+        oldlen = a.tlen
+        oldlen *= 2
+        a.tlen = oldlen
+        self.assertEqual(a.tlen, oldlen)
+
+    def testPositions(self):
+        a = self.buildRead()
+        self.assertEqual(a.positions,
+                         [20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29,
+                          31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39,
+                          40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49,
+                          50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59])
+
+        self.assertEqual(a.aligned_pairs,
+                         [(0, 20), (1, 21), (2, 22), (3, 23), (4, 24),
+                          (5, 25), (6, 26), (7, 27), (8, 28), (9, 29),
+                          (None, 30),
+                          (10, 31), (11, 32), (12, 33), (13, 34), (14, 35),
+                          (15, 36), (16, 37), (17, 38), (18, 39), (19, None),
+                          (20, 40), (21, 41), (22, 42), (23, 43), (24, 44),
+                          (25, 45), (26, 46), (27, 47), (28, 48), (29, 49),
+                          (30, 50), (31, 51), (32, 52), (33, 53), (34, 54),
+                          (35, 55), (36, 56), (37, 57), (38, 58), (39, 59)])
+
+        self.assertEqual(
+            a.positions,
+            [x[1] for x in a.aligned_pairs
+             if x[0] is not None and x[1] is not None])
+        # alen is the length of the aligned read in genome
+        self.assertEqual(a.alen, a.aligned_pairs[-1][0] + 1)
+        # aend points to one beyond last aligned base in ref
+        self.assertEqual(a.positions[-1], a.aend - 1)
+
+    def testBlocks(self):
+        a = self.buildRead()
+        self.assertEqual(a.blocks,
+                         [(20, 30), (31, 40), (40, 60)])
+
+    # Disabled as not backwards compatible
+    # def testFancyStr(self):
+    #     a = self.buildRead()
+    #     output = a.fancy_str()
+    #     self.assertEqual(len(output), 9)
+
+
+class TestDeNovoConstruction(ReadTest):
+
+    '''check BAM/SAM file construction using ex6.sam
+
+    (note these are +1 coordinates):
+
+    read_28833_29006_6945      99      chr1    33      20      10M1D25M        =       200     167     AGCTTAGCTAGCTACCTATATCTTGGTCTTGGCCG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<9/,&,22;;<<<     NM:i:1  RG:Z:L1
+    read_28701_28881_323b      147     chr2    88      30      35M     =       500     412     ACCTATATCTTGGCCTTGGCCGATGCGGCCTTGCA     <<<<<;<<<<7;:<<<6;<<<<<<<<<<<<7<<<<     MF:i:18 RG:Z:L2
+    '''
+
+    header = {'HD': {'VN': '1.0'},
+              'SQ': [{'LN': 1575, 'SN': 'chr1'},
+                     {'LN': 1584, 'SN': 'chr2'}], }
+
+    bamfile = os.path.join(DATADIR, "ex6.bam")
+    samfile = os.path.join(DATADIR, "ex6.sam")
+
+    def setUp(self):
+
+        a = pysam.AlignedRead()
+        a.qname = "read_28833_29006_6945"
+        a.seq = "AGCTTAGCTAGCTACCTATATCTTGGTCTTGGCCG"
+        a.flag = 99
+        a.rname = 0
+        a.pos = 32
+        a.mapq = 20
+        a.cigar = ((0, 10), (2, 1), (0, 25))
+        a.mrnm = 0
+        a.mpos = 199
+        a.isize = 167
+        a.qual = "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<9/,&,22;;<<<"
+        a.tags = (("NM", 1),
+                  ("RG", "L1"))
+
+        b = pysam.AlignedRead()
+        b.qname = "read_28701_28881_323b"
+        b.seq = "ACCTATATCTTGGCCTTGGCCGATGCGGCCTTGCA"
+        b.flag = 147
+        b.rname = 1
+        b.pos = 87
+        b.mapq = 30
+        b.cigar = ((0, 35), )
+        b.mrnm = 1
+        b.mpos = 499
+        b.isize = 412
+        b.qual = "<<<<<;<<<<7;:<<<6;<<<<<<<<<<<<7<<<<"
+        b.tags = (("MF", 18),
+                  ("RG", "L2"))
+
+        self.reads = (a, b)
+
+    # TODO
+    # def testSAMWholeFile(self):
+
+    #     tmpfilename = "tmp_%i.sam" % id(self)
+
+    #     outfile = pysam.Samfile(tmpfilename,
+    #                             "wh",
+    #                             header=self.header)
+
+    #     for x in self.reads:
+    #         outfile.write(x)
+    #     outfile.close()
+    #     self.assertTrue(checkBinaryEqual(tmpfilename, self.samfile),
+    #                     "mismatch when construction SAM file, see %s %s" % (tmpfilename, self.samfile))
+
+    #     os.unlink(tmpfilename)
+
+    def testBAMPerRead(self):
+        '''check if individual reads are binary equal.'''
+        infile = pysam.Samfile(self.bamfile, "rb")
+
+        others = list(infile)
+        for denovo, other in zip(others, self.reads):
+            self.checkFieldEqual(other, denovo)
+            self.assertEqual(other.compare(denovo), 0)
+
+    # TODO
+    # def testSAMPerRead(self):
+    #     '''check if individual reads are binary equal.'''
+    #     infile = pysam.Samfile(self.samfile, "r")
+
+    #     others = list(infile)
+    #     for denovo, other in zip(others, self.reads):
+    #         self.checkFieldEqual(other, denovo)
+    #         self.assertEqual(other.compare(denovo), 0)
+
+    def testBAMWholeFile(self):
+
+        tmpfilename = "tmp_%i.bam" % id(self)
+
+        outfile = pysam.Samfile(tmpfilename, "wb", header=self.header)
+
+        for x in self.reads:
+            outfile.write(x)
+        outfile.close()
+
+        self.assertTrue(checkBinaryEqual(tmpfilename, self.bamfile),
+                        "mismatch when construction BAM file, see %s %s" % (tmpfilename, self.bamfile))
+
+        os.unlink(tmpfilename)
+
+
+class TestDeNovoConstructionUserTags(TestDeNovoConstruction):
+
+    '''test de novo construction with a header that contains lower-case tags.'''
+
+    header = {'HD': {'VN': '1.0'},
+              'SQ': [{'LN': 1575, 'SN': 'chr1'},
+                     {'LN': 1584, 'SN': 'chr2'}],
+              'x1': {'A': 2, 'B': 5},
+              'x3': {'A': 6, 'B': 5},
+              'x2': {'A': 4, 'B': 5}}
+
+    bamfile = os.path.join(DATADIR, "example_user_header.bam")
+    samfile = os.path.join(DATADIR, "example_user_header.sam")
+
+
+class TestEmptyHeader(unittest.TestCase):
+
+    '''see issue 84.'''
+
+    def testEmptyHeader(self):
+
+        s = pysam.Samfile(os.path.join(DATADIR, 'example_empty_header.bam'))
+        self.assertEqual(s.header, {'SQ': [{'LN': 1000, 'SN': 'chr1'}]})
+
+
+class TestBTagSam(unittest.TestCase):
+
+    '''see issue 81.'''
+
+    compare = [[100, 1, 91, 0, 7, 101, 0, 201, 96, 204, 0, 0, 87, 109, 0, 7, 97, 112, 1, 12, 78, 197, 0, 7, 100, 95, 101, 202, 0, 6, 0, 1, 186, 0, 84, 0, 244, 0, 0, 324, 0, 107, 195, 101, 113, 0, 102, 0, 104, 3, 0, 101, 1, 0, 212, 6, 0, 0, 1, 0, 74, 1, 11, 0, 196, 2, 197, 103, 0, 108, 98, 2, 7, 0, 1, 2, 194, 0, 180, 0, 108, 0, 203, 104, 16, 5, 205, 0, 0, 0, 1, 1, 100, 98, 0, 0, 204, 6, 0, 79, 0, 0, 101, 7, 109, 90, 265, 1, 27, 10, 109, 102, 9, 0, 292, 0, 110, 0, 0, 102, 112, 0, 0, 84, 100, 103, 2, 81, 126, 0, 2, 90, 0, 15, 96, 15, 1, 0, 2, 0, 107, 92, 0, 0, 101, 3, 98, 15, 102, 13, 116, 116, 90, 93, 198, 0, 0, 0, 199, 92, 26, 495, 100, 5, 0, 100, 5, 209, 0, 92, 107, 90, 0, 0, 0, 0, 109, 194, 7, 94, 200, 0, 40, 197, 0, 11, 0, 0, 112, 110, 6, 4, 200, 28, 0, 196, 0, 203, 1, 129, 0, 0, 1, 0, 94, 0, 1, 0, 107, 5, 201, 3, 3, 100, 0, 121, 0, 7, 0, 1, 105, 306, 3, 86, 8, 183, 0, 12, 163, 17, 83, 22, 0, 0, 1, 8, 109, 103, 0, 0, 295, 0, 200, 16, 172, 3, 16, 182, 3, 11, 0, 0, 223, 111, 103, 0, 5, 225, 0, 95],
+               [-100, 200, -300, -400],
+               [-100, 12],
+               [12, 15],
+               [-1.0, 5.0, 2.5]]
+
+    filename = os.path.join(DATADIR, 'example_btag.sam')
+
+    def testRead(self):
+
+        s = pysam.Samfile(self.filename)
+        for x, read in enumerate(s):
+            if x == 0:
+                self.assertEqual(read.tags, [('RG', 'QW85I'), ('PG', 'tmap'), ('MD', '140'), ('NM', 0), ('AS', 140), ('FZ', [100, 1, 91, 0, 7, 101, 0, 201, 96, 204, 0, 0, 87, 109, 0, 7, 97, 112, 1, 12, 78, 197, 0, 7, 100, 95, 101, 202, 0, 6, 0, 1, 186, 0, 84, 0, 244, 0, 0, 324, 0, 107, 195, 101, 113, 0, 102, 0, 104, 3, 0, 101, 1, 0, 212, 6, 0, 0, 1, 0, 74, 1, 11, 0, 196, 2, 197, 103, 0, 108, 98, 2, 7, 0, 1, 2, 194, 0, 180, 0, 108, 0, 203, 104, 16, 5, 205, 0, 0, 0, 1, 1, 100, 98, 0, 0, 204, 6, 0, 79, 0, 0, 101, 7, 109, 90, 265, 1, 27, 10, 109, 102, 9, 0, 292, 0, 110, 0, 0, 102, 112, 0, 0, 84, 100, 103, 2, 81, 126, 0, 2, 90, 0, 15, 96, 15, 1, 0, 2, 0, 107, 92, 0, 0, 101, 3, 98, 15, 102, 13, 116, 116, 90, 93, 198, 0, 0, 0, 199, 92, 26, 495, 100, 5, 0, 100, 5, 209, 0, 92, 107, 90, 0, 0, 0, 0, 109, 194, 7, 94, 200, 0, 40, 197, 0, 11, 0, 0, 112, 110, 6, 4, 200, 28, 0, 196, 0, 203, 1, 129, 0, 0, 1, 0, 94, 0, 1, 0, 107, 5, 201, 3, 3, 100, 0, 121, 0, 7, 0, 1, 105, 306, 3, 86, 8, 183, 0, 12, 163, 17, 83, 22, 0, 0, 1, 8, 109, 103, 0, 0, 295, 0, 200, 16, 172, 3, 16, 182, 3, 11, 0, 0, 223, 111, 103, 0, 5, 225, 0, 95]), ('XA', 'map2-1'), ('XS', 53), ('XT', 38), ('XF', 1), ('XE', 0)]
+                                 )
+
+            fz = dict(read.tags)["FZ"]
+            self.assertEqual(fz, self.compare[x])
+            self.assertEqual(read.opt("FZ"), self.compare[x])
+
+    def testWrite(self):
+
+        s = pysam.Samfile(self.filename)
+        for read in s:
+            before = read.tags
+            read.tags = read.tags
+            after = read.tags
+            self.assertEqual(after, before)
+
+
+class TestBTagBam(TestBTagSam):
+    filename = os.path.join(DATADIR, 'example_btag.bam')
+
+
+class TestDoubleFetch(unittest.TestCase):
+    '''check if two iterators on the same bamfile are independent.'''
+
+    filename = os.path.join(DATADIR, 'ex1.bam')
+
+    def testDoubleFetch(self):
+
+        samfile1 = pysam.Samfile(self.filename, 'rb')
+
+        for a, b in zip(samfile1.fetch(multiple_iterators=True),
+                        samfile1.fetch(multiple_iterators=True)):
+            self.assertEqual(a.compare(b), 0)
+
+    def testDoubleFetchWithRegion(self):
+
+        samfile1 = pysam.Samfile(self.filename, 'rb')
+        chr, start, stop = 'chr1', 200, 3000000
+        # just making sure the test has something to catch
+        self.assertTrue(len(list(samfile1.fetch(chr, start, stop))) > 0)
+
+        for a, b in zip(samfile1.fetch(chr, start, stop),
+                        samfile1.fetch(chr, start, stop,
+                                       multiple_iterators=True)):
+            self.assertEqual(a.compare(b), 0)
+
+    def testDoubleFetchUntilEOF(self):
+
+        samfile1 = pysam.Samfile(self.filename, 'rb')
+
+        for a, b in zip(samfile1.fetch(until_eof=True),
+                        samfile1.fetch(until_eof=True,
+                                       multiple_iterators=True)):
+            self.assertEqual(a.compare(b), 0)
+
+
+class TestRemoteFileFTP(unittest.TestCase):
+
+    '''test remote access.
+
+    '''
+
+    # Need to find an ftp server without password on standard
+    # port.
+
+    url = "ftp://ftp.sanger.ac.uk/pub/rd/humanSequences/CV.bam"
+    region = "1:1-1000"
+
+    def testFTPView(self):
+        return
+        if not checkURL(self.url):
+            return
+
+        result = pysam.view(self.url, self.region)
+        self.assertEqual(len(result), 36)
+
+    def testFTPFetch(self):
+        return
+        if not checkURL(self.url):
+            return
+
+        samfile = pysam.Samfile(self.url, "rb")
+        result = list(samfile.fetch(region=self.region))
+        self.assertEqual(len(result), 36)
+
+
+class TestRemoteFileHTTP(unittest.TestCase):
+
+    url = "http://genserv.anat.ox.ac.uk/downloads/pysam/test/ex1.bam"
+    region = "chr1:1-1000"
+    local = os.path.join(DATADIR, "ex1.bam")
+
+    def testView(self):
+        if not checkURL(self.url):
+            return
+
+        samfile_local = pysam.Samfile(self.local, "rb")
+        ref = list(samfile_local.fetch(region=self.region))
+
+        result = pysam.view(self.url, self.region)
+        self.assertEqual(len(result), len(ref))
+
+    def testFetch(self):
+        if not checkURL(self.url):
+            return
+
+        samfile = pysam.Samfile(self.url, "rb")
+        result = list(samfile.fetch(region=self.region))
+        samfile_local = pysam.Samfile(self.local, "rb")
+        ref = list(samfile_local.fetch(region=self.region))
+
+        self.assertEqual(len(ref), len(result))
+        for x, y in zip(result, ref):
+            self.assertEqual(x.compare(y), 0)
+
+    def testFetchAll(self):
+        if not checkURL(self.url):
+            return
+
+        samfile = pysam.Samfile(self.url, "rb")
+        result = list(samfile.fetch())
+        samfile_local = pysam.Samfile(self.local, "rb")
+        ref = list(samfile_local.fetch())
+
+        self.assertEqual(len(ref), len(result))
+        for x, y in zip(result, ref):
+            self.assertEqual(x.compare(y), 0)
+
+
+class TestLargeOptValues(unittest.TestCase):
+
+    ints = (65536, 214748, 2147484, 2147483647)
+    floats = (65536.0, 214748.0, 2147484.0)
+
+    def check(self, samfile):
+
+        i = samfile.fetch()
+        for exp in self.ints:
+            rr = next(i)
+            obs = rr.opt("ZP")
+            self.assertEqual(exp, obs,
+                             "expected %s, got %s\n%s" %
+                             (str(exp), str(obs), str(rr)))
+
+        for exp in [-x for x in self.ints]:
+            rr = next(i)
+            obs = rr.opt("ZP")
+            self.assertEqual(exp, obs,
+                             "expected %s, got %s\n%s" %
+                             (str(exp), str(obs), str(rr)))
+
+        for exp in self.floats:
+            rr = next(i)
+            obs = rr.opt("ZP")
+            self.assertEqual(exp, obs,
+                             "expected %s, got %s\n%s" %
+                             (str(exp), str(obs), str(rr)))
+
+        for exp in [-x for x in self.floats]:
+            rr = next(i)
+            obs = rr.opt("ZP")
+            self.assertEqual(exp, obs, "expected %s, got %s\n%s" %
+                             (str(exp), str(obs), str(rr)))
+
+    def testSAM(self):
+        samfile = pysam.Samfile(
+            os.path.join(DATADIR, "ex10.sam"),
+            "r")
+        self.check(samfile)
+
+    def testBAM(self):
+        samfile = pysam.Samfile(
+            os.path.join(DATADIR, "ex10.bam"),
+            "rb")
+        self.check(samfile)
+
+
+class TestPileup(unittest.TestCase):
+    '''test pileup functionality.'''
+
+    samfilename = "pysam_data/ex1.bam"
+    fastafilename = "pysam_data/ex1.fa"
+
+    def setUp(self):
+
+        self.samfile = pysam.Samfile(self.samfilename)
+        self.fastafile = pysam.Fastafile(self.fastafilename)
+
+    def checkEqual(self, references, iterator):
+
+        for x, column in enumerate(iterator):
+            (contig, pos, reference_base,
+             read_bases, read_qualities, alignment_mapping_qualities) \
+                = references[x][:-1].split("\t")
+            self.assertEqual(int(pos) - 1, column.pos)
+
+    def testSamtoolsStepper(self):
+        refs = pysam.mpileup(
+            "-f", self.fastafilename,
+            self.samfilename)
+        iterator = self.samfile.pileup(
+            stepper="samtools",
+            fastafile=self.fastafile)
+        self.checkEqual(refs, iterator)
+
+    def testAllStepper(self):
+        refs = pysam.mpileup(
+            "-f", self.fastafilename,
+            "-A", "-B",
+            self.samfilename)
+
+        iterator = self.samfile.pileup(
+            stepper="all",
+            fastafile=self.fastafile)
+        self.checkEqual(refs, iterator)
+
+
+class TestLogging(unittest.TestCase):
+
+    '''test around bug issue 42,
+
+    failed in versions < 0.4
+    '''
+
+    def check(self, bamfile, log):
+
+        if log:
+            logger = logging.getLogger('franklin')
+            logger.setLevel(logging.INFO)
+            formatter = logging.Formatter(
+                '%(asctime)s %(levelname)s %(message)s')
+            log_hand = logging.FileHandler('log.txt')
+            log_hand.setFormatter(formatter)
+            logger.addHandler(log_hand)
+
+        bam = pysam.Samfile(bamfile, 'rb')
+        cols = bam.pileup()
+        self.assertTrue(True)
+
+    def testFail1(self):
+        self.check(os.path.join(DATADIR, "ex9_fail.bam"),
+                   False)
+        self.check(os.path.join(DATADIR, "ex9_fail.bam"),
+                   True)
+
+    def testNoFail1(self):
+        self.check(os.path.join(DATADIR, "ex9_nofail.bam"),
+                   False)
+        self.check(os.path.join(DATADIR, "ex9_nofail.bam"),
+                   True)
+
+    def testNoFail2(self):
+        self.check(os.path.join(DATADIR, "ex9_nofail.bam"),
+                   True)
+        self.check(os.path.join(DATADIR, "ex9_nofail.bam"),
+                   True)
+
+# TODOS
+# 1. finish testing all properties within pileup objects
+# 2. check exceptions and bad input problems (missing files, optional fields that aren't present, etc...)
+# 3. check: presence of sequence
+
+
+class TestSamfileUtilityFunctions(unittest.TestCase):
+
+    def testCount(self):
+
+        samfile = pysam.Samfile(os.path.join(DATADIR, "ex1.bam"),
+                                "rb")
+
+        for contig in ("chr1", "chr2"):
+            for start in range(0, 2000, 100):
+                end = start + 1
+                self.assertEqual(
+                    len(list(samfile.fetch(contig, start, end))),
+                    samfile.count(contig, start, end),
+                    'number mismatch for %s:%i-%i %i != %i' % (
+                        contig, start, end,
+                        len(list(samfile.fetch(contig, start, end))),
+                        samfile.count(contig, start, end)))
+
+                # test empty intervals
+                self.assertEqual(
+                    len(list(samfile.fetch(contig, start, start))),
+                    samfile.count(contig, start, start),
+                    'number mismatch for %s:%i-%i %i != %i' % (
+                        contig, start, start,
+                        len(list(samfile.fetch(contig, start, start))),
+                        samfile.count(contig, start, start)))
+
+                # test half empty intervals
+                self.assertEqual(len(list(samfile.fetch(contig, start))),
+                                 samfile.count(contig, start))
+
+                self.assertEqual(
+                    len(list(samfile.fetch(contig, start))),
+                    samfile.count(contig, start),
+                    'number mismatch for %s:%i %i != %i' % (
+                        contig, start,
+                        len(list(samfile.fetch(contig, start))),
+                        samfile.count(contig, start)))
+
+    def testMate(self):
+        '''test mate access.'''
+
+        with open(os.path.join(DATADIR, "ex1.sam"), "rb") as inf:
+            readnames = [x.split(b"\t")[0] for x in inf.readlines()]
+        if sys.version_info[0] >= 3:
+            readnames = [name.decode('ascii') for name in readnames]
+
+        counts = collections.defaultdict(int)
+        for x in readnames:
+            counts[x] += 1
+
+        samfile = pysam.Samfile(os.path.join(DATADIR, "ex1.bam"),
+                                "rb")
+
+        for read in samfile.fetch():
+            if not read.is_paired:
+                self.assertRaises(ValueError, samfile.mate, read)
+            elif read.mate_is_unmapped:
+                self.assertRaises(ValueError, samfile.mate, read)
+            else:
+                if counts[read.qname] == 1:
+                    self.assertRaises(ValueError, samfile.mate, read)
+                else:
+                    mate = samfile.mate(read)
+                    self.assertEqual(read.qname, mate.qname)
+                    self.assertEqual(read.is_read1, mate.is_read2)
+                    self.assertEqual(read.is_read2, mate.is_read1)
+                    self.assertEqual(read.pos, mate.mpos)
+                    self.assertEqual(read.mpos, mate.pos)
+
+    def testIndexStats(self):
+        '''test if total number of mapped/unmapped reads is correct.'''
+
+        samfile = pysam.Samfile(os.path.join(DATADIR, "ex1.bam"),
+                                "rb")
+        self.assertEqual(samfile.mapped, 3235)
+        self.assertEqual(samfile.unmapped, 35)
+        self.assertEqual(samfile.nocoordinate, 0)
+
+
+class TestSamtoolsProxy(unittest.TestCase):
+
+    '''tests for sanity checking access to samtools functions.'''
+
+    def testIndex(self):
+        self.assertRaises(IOError, pysam.index, "missing_file")
+
+    def testView(self):
+        # note that view still echos "open: No such file or directory"
+        self.assertRaises(pysam.SamtoolsError, pysam.view, "missing_file")
+
+    def testSort(self):
+        self.assertRaises(pysam.SamtoolsError, pysam.sort, "missing_file")
+
+
+class TestSamfileIndex(unittest.TestCase):
+
+    def testIndex(self):
+        samfile = pysam.Samfile(os.path.join(DATADIR, "ex1.bam"),
+                                "rb")
+        index = pysam.IndexedReads(samfile)
+        index.build()
+        reads = collections.defaultdict(int)
+
+        for read in samfile:
+            reads[read.qname] += 1
+
+        for qname, counts in reads.items():
+            found = list(index.find(qname))
+            self.assertEqual(len(found), counts)
+            for x in found:
+                self.assertEqual(x.qname, qname)
+
+
+if __name__ == "__main__":
+    # build data files
+    print ("building data files")
+    subprocess.call("make -C %s" % DATADIR, shell=True)
+    print ("starting tests")
+    unittest.main()
+    print ("completed tests")
diff --git a/tests/TestUtils.py b/tests/TestUtils.py
new file mode 100644 (file)
index 0000000..d005cd9
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,52 @@
+import sys
+import os
+
+IS_PYTHON3 = sys.version_info[0] >= 3
+
+if IS_PYTHON3:
+    from itertools import zip_longest
+    from urllib.request import urlopen
+else:
+    from itertools import izip as zip_longest
+    from urllib2 import urlopen
+
+
+def checkBinaryEqual(filename1, filename2):
+    '''return true if the two files are binary equal.'''
+    if os.path.getsize(filename1) != os.path.getsize(filename2):
+        return False
+
+    infile1 = open(filename1, "rb")
+    infile2 = open(filename2, "rb")
+
+    def chariter(infile):
+        while 1:
+            c = infile.read(1)
+            if c == b"":
+                break
+            yield c
+
+    found = False
+    for c1, c2 in zip_longest(chariter(infile1), chariter(infile2)):
+        if c1 != c2:
+            break
+    else:
+        found = True
+
+    infile1.close()
+    infile2.close()
+    return found
+
+
+def checkURL(url):
+    '''return True if URL is available.
+
+    A URL might not be available if it is the wrong URL
+    or there is no connection to the URL.
+    '''
+    try:
+        urlopen(url, timeout=1)
+        return True
+    except:
+        return False
+
diff --git a/tests/_compile_test.pyx b/tests/_compile_test.pyx
new file mode 100644 (file)
index 0000000..db6b5b6
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,29 @@
+from pysam.calignmentfile cimport AlignmentFile, AlignedSegment
+from pysam.ctabix cimport Tabixfile
+
+cdef AlignmentFile samfile
+cdef Tabixfile tabixfile
+
+
+def testCountBAM(AlignmentFile samfile):
+    '''test reading from a BAM file accessing
+    the flag field directly.'''
+
+    cdef AlignedSegment read
+    cdef int n = 0
+    
+    for read in samfile.fetch():
+        flag = read._delegate.core.flag
+        n += 1
+            
+    return n
+
+def testCountGTF(Tabixfile tabixfile):
+    '''test reading from a tabixfile.'''
+    
+    cdef int n = 0
+
+    for entry in tabixfile.fetch():
+        n += 1
+
+    return n
diff --git a/tests/_compile_test.pyxbld b/tests/_compile_test.pyxbld
new file mode 100644 (file)
index 0000000..87dfb3e
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,8 @@
+# link against pysam
+def make_ext(modname, pyxfilename):
+    from distutils.extension import Extension
+    import pysam
+    return Extension(name = modname,
+                     sources = [pyxfilename],
+                     include_dirs = pysam.get_include(),
+                     define_macros = pysam.get_defines()) 
diff --git a/tests/_cython_flagstat.pyx b/tests/_cython_flagstat.pyx
new file mode 100644 (file)
index 0000000..f0f03bb
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,18 @@
+from pysam.calignmentfile cimport AlignmentFile, AlignedSegment
+from pysam.calignmentfile cimport pysam_get_flag
+from pysam.calignmentfile cimport BAM_FPROPER_PAIR, BAM_FPAIRED
+
+def count(AlignmentFile samfile):
+    cdef int is_proper = 0
+    cdef int is_paired = 0
+    cdef AlignedSegment read
+    cdef int f
+
+    for read in samfile:
+        f = pysam_get_flag(read._delegate)
+        if f & BAM_FPAIRED:
+            is_paired += 1
+        if f & BAM_FPROPER_PAIR:
+            is_proper += 1
+
+    return is_paired, is_proper
diff --git a/tests/_cython_flagstat.pyxbld b/tests/_cython_flagstat.pyxbld
new file mode 100644 (file)
index 0000000..0e05b76
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,8 @@
+def make_ext(modname, pyxfilename):
+    from distutils.extension import Extension
+    import pysam
+    return Extension(name=modname,
+                     sources=[pyxfilename],
+                     extra_link_args=pysam.get_libraries(),
+                     include_dirs=pysam.get_include(),
+                     define_macros=pysam.get_defines())
diff --git a/tests/compile_test.py b/tests/compile_test.py
new file mode 100644 (file)
index 0000000..5744dbe
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,46 @@
+'''
+compile_test.py - check pyximport
+=================================
+
+test script for checking if compilation against
+pysam and tabix works.
+'''
+# clean up previous compilation
+import os
+try:
+    os.unlink('_compile_test.c')
+    os.unlink('_compile_test.pyxbldc')
+except OSError:
+    pass
+
+
+import pyximport
+pyximport.install(build_in_temp=False)
+import _compile_test
+
+import unittest
+import pysam
+
+
+class BAMTest(unittest.TestCase):
+
+    input_filename = "pysam_data/ex1.bam"
+
+    def testCount(self):
+
+        nread = _compile_test.testCountBAM(
+            pysam.Samfile(self.input_filename))
+        self.assertEqual(nread, 3270)
+
+
+class GTFTest(unittest.TestCase):
+
+    input_filename = "tabix_data/example.gtf.gz"
+
+    def testCount(self):
+        nread = _compile_test.testCountGTF(
+            pysam.Tabixfile(self.input_filename))
+        self.assertEqual(nread, 237)
+
+if __name__ == "__main__":
+    unittest.main()
diff --git a/tests/cython_flagstat.py b/tests/cython_flagstat.py
new file mode 100644 (file)
index 0000000..33b56f7
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,12 @@
+import pysam
+
+import pyximport
+pyximport.install()
+import _cython_flagstat
+
+is_paired, is_proper = _cython_flagstat.count(
+    pysam.AlignmentFile("ex1.bam", "rb"))
+
+print ("there are alignments of %i paired reads" % is_paired)
+print ("there are %i proper paired alignments" % is_proper)
+
diff --git a/tests/faidx_test.py b/tests/faidx_test.py
new file mode 100644 (file)
index 0000000..c454e83
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,87 @@
+import pysam
+import unittest
+import os
+
+DATADIR = "pysam_data"
+
+
+class TestFastaFile(unittest.TestCase):
+
+    sequences = {
+        'chr1':
+        b"CACTAGTGGCTCATTGTAAATGTGTGGTTTAACTCGTCCATGGCCCAGCATTAGGGAGCTGTGGACCCTGCAGCCTGGCTGTGGGGGCCGCAGTGGCTGAGGGGTGCAGAGCCGAGTCACGGGGTTGCCAGCACAGGGGCTTAACCTCTGGTGACTGCCAGAGCTGCTGGCAAGCTAGAGTCCCATTTGGAGCCCCTCTAAGCCGTTCTATTTGTAATGAAAACTATATTTATGCTATTCAGTTCTAAATATAGAAATTGAAACAGCTGTGTTTAGTGCCTTTGTTCAACCCCCTTGCAACAACCTTGAGAACCCCAGGGAATTTGTCAATGTCAGGGAAGGAGCATTTTGTCAGTTACCAAATGTGTTTATTACCAGAGGGATGGAGGGAAGAGGGACGCTGAAGAACTTTGATGCCCTCTTCTTCCAAAGATGAAACGCGTAACTGCGCTCTCATTCACTCCAGCTCCCTGTCACCCAATGGACCTGTGATATCTGGATTCTGGGAAATTCTTCATCCTGGACCCTGAGAGATTCTGCAGCCCAGCTCCAGATTGCTTGTGGTCTGACAGGCTGCAACTGTGAGCCATCACAATGAACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGATGTGTGTTCTCATCAACCTCATACACACACATGGTTTAGGGGTATAATACCTCTACATGGCTGATTATGAAAACAATGTTCCCCAGATACCATCCCTGTCTTACTTCCAGCTCCCCAGAGGGAAAGCTTTCAACGCTTCTAGCCATTTCTTTTGGCATTTGCCTTCAGACCCTACACGAATGCGTCTCTACCACAGGGGGCTGCGCGGTTTCCCATCATGAAGCACTGAACTTCCACGTCTCATCTAGGGGAACAGGGAGGTGCACTAATGCGCTCCACGCCCAAGCCCTTCTCACAGTTTCTGCCCCCAGCATGGTTGTACTGGGCAATACATGAGATTATTAGGAAATGCTTTACTGTCATAACTATGAAGAGACTATTGCCAGATGAACCACACATTAATACTATGTTTCTTATCTGCACATTACTACCCTGCAATTAATATAATTGTGTCCATGTACACACGCTGTCCTATGTACTTATCATGACTCTATCCCAAATTCCCAATTACGTCCTATCTTCTTCTTAGGGAAGAACAGCTTAGGTATCAATTTGGTGTTCTGTGTAAAGTCTCAGGGAGCCGTCCGTGTCCTCCCATCTGGCCTCGTCCACACTGGTTCTCTTGAAAGCTTGGGCTGTAATGATGCCCCTTGGCCATCACCCAGTCCCTGCCCCATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTGTTGTTGGTTTTCTGTTTCTTTGTTTGATTTGGTGGAAGACATAATCCCACGCTTCCTATGGAAAGGTTGTTGGGAGATTTTTAATGATTCCTCAATGTTAAAATGTCTATTTTTGTCTTGACACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAAAACAGTCTAGATGAGAGAGAACTTCCCTGGAGGTCTGATGGCGTTTCTCCCTCGTCTTCTTA",
+        'chr2':
+        b"TTCAAATGAACTTCTGTAATTGAAAAATTCATTTAAGAAATTACAAAATATAGTTGAAAGCTCTAACAATAGACTAAACCAAGCAGAAGAAAGAGGTTCAGAACTTGAAGACAAGTCTCTTATGAATTAACCCAGTCAGACAAAAATAAAGAAAAAAATTTTAAAAATGAACAGAGCTTTCAAGAAGTATGAGATTATGTAAAGTAACTGAACCTATGAGTCACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAACTATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACATCTAAATGAAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACATTGCAAGACAGACTTCATCAAGATATGTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACATGAAGGAAAAAAATTCTAAAATCAGCAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCATCAGAATAACAATGGGCTTCTCAGCAGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGATTGGATCTAATTTTTGGACTTCTTAAAGAAAAAAAAACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCTAAACTAAGCATCATAAATGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGCTAAGATAATTCATCATCACTAAACCAGTCCTATAAGAAATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAATACTCACCATCATAAATACACACAAAAGTACAAAACTCACAGGTTTTATAAAACAATTGAGACTACAGAGCAACTAGGTAAAAAATTAACATTACAACAGGAACAAAACCTCATATATCAATATTAACTTTGAATAAAAAGGGATTAAATTCCCCCACTTAAGAGATATAGATTGGCAGAACAGATTTAAAAACATGAACTAACTATATGCTGTTTACAAGAAACTCATTAATAAAGACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGGAGTAGCTATACTTATATCAGATAAAGCACACTTTAAATCAACAACAGTAAAATAAAACAAAGGAGGTCATCATACAATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGATATAACCATCCTACTAAATACATATGCACCTAACACAAGACTACCCAGATTCATAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAGGGATGAGAAATTACCTAATTGGTACAATGTACAATATTCTGATGATGGTTACACTAAAAGCCCATACTTTACTGCTACTCAATATATCCATGTAACAAATCTGCGCTTGTACTTCTAAATCTATAAAAAAATTAAAATTTAACAAAAGTAAATAAAACACATAGCTAAAACTAAAAAAGCAAAAACAAAAACTATGCTAAGTATTGGTAAAGATGTGGGGAAAAAAGTAAACTCTCAAATATTGCTAGTGGGAGTATAAATTGTTTTCCACTTTGGAAAACAATTTGGTAATTTCGTTTTTTTTTTTTTCTTTTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCATGCCAGAAAAAAATATTTACAGTAACT",
+    }
+
+    def setUp(self):
+        self.file = pysam.FastaFile(os.path.join(DATADIR, "ex1.fa"))
+
+    def testFetch(self):
+        for id, seq in list(self.sequences.items()):
+            self.assertEqual(seq, self.file.fetch(id))
+            for x in range(0, len(seq), 10):
+                self.assertEqual(seq[x:x + 10], self.file.fetch(id, x, x + 10))
+                # test x:end
+                self.assertEqual(seq[x:], self.file.fetch(id, x))
+                # test 0:x
+                self.assertEqual(seq[:x], self.file.fetch(id, None, x))
+
+        # unknown sequence returns ""
+        # change: should be an IndexError
+        self.assertEqual(b"", self.file.fetch("chr12"))
+
+    def testOutOfRangeAccess(self):
+        '''test out of range access.'''
+        # out of range access returns an empty string
+        for contig, s in self.sequences.items():
+            self.assertEqual(self.file.fetch(contig, len(s), len(s) + 1), b"")
+
+        self.assertEqual(self.file.fetch("chr3", 0, 100), b"")
+
+    def testFetchErrors(self):
+        self.assertRaises(ValueError, self.file.fetch)
+        self.assertRaises(IndexError, self.file.fetch, "chr1", -1, 10)
+        self.assertRaises(ValueError, self.file.fetch, "chr1", 20, 10)
+
+        # does not work yet
+        # self.assertRaises( KeyError, self.file.fetch, "chrX" )
+
+    def testLength(self):
+        self.assertEqual(len(self.file), 2)
+
+    def testSequenceLengths(self):
+        self.assertEqual(1575, self.file.get_reference_length("chr1"))
+        self.assertEqual(1584, self.file.get_reference_length("chr2"))
+
+    def tearDown(self):
+        self.file.close()
+
+
+class TestFastqFile(unittest.TestCase):
+
+    def setUp(self):
+        self.file = pysam.FastqFile(os.path.join(DATADIR, "ex1.fq"))
+
+    def testCounts(self):
+        self.assertEqual(len([x for x in self.file]), 3270)
+
+    def testMissingFile(self):
+        self.assertRaises(IOError, pysam.FastqFile, "nothere.fq")
+
+    def testSequence(self):
+        s = self.file.__next__()
+        # test first entry
+        self.assertEqual(s.sequence, b"GGGAACAGGGGGGTGCACTAATGCGCTCCACGCCC")
+        self.assertEqual(s.quality, b"<<86<<;<78<<<)<;4<67<;<;<74-7;,;8,;")
+        self.assertEqual(s.name, b"B7_589:1:101:825:28")
+
+        for s in self.file:
+            pass
+        # test last entry
+        self.assertEqual(s.sequence, b"TAATTGAAAAATTCATTTAAGAAATTACAAAATAT")
+        self.assertEqual(s.quality, b"<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<;;;<<<;<<8;<;<")
+        self.assertEqual(s.name, b"EAS56_65:8:64:507:478")
+
+if __name__ == "__main__":
+    unittest.main()
diff --git a/tests/pysam_data/Makefile b/tests/pysam_data/Makefile
new file mode 100644 (file)
index 0000000..eb6c1d8
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,63 @@
+SAM=$(wildcard *.sam)
+BAM=$(SAM:%.sam=%.bam)
+BAI=$(BAM:%.bam=%.bam.bai)
+
+# ex2.bam - bam file without index
+
+all: ex1.pileup.gz \
+       ex1.sam ex1.bam \
+       ex2.sam.gz ex2.sam ex2.bam \
+        uncompressed.bam \
+       $(BAM) $(BAI) \
+       example_bai.bam \
+        rg_with_tab.bam \
+       ex2_truncated.bam \
+       empty.bam empty.bam.bai
+
+# ex2.sam - as ex1.sam, but with header
+ex2.sam.gz: ex1.bam ex1.bam.bai
+       samtools view -h ex1.bam | gzip > ex2.sam.gz
+
+#%.bam: %.sam ex1.fa.fai
+#      samtools import ex1.fa.fai $< $@
+
+uncompressed.bam: ex2.sam
+       samtools view -buS $< > $@
+
+%.bam: %.sam
+       samtools view -bS $< > $@
+
+%.sam: %.sam.gz
+       gunzip < $< > $@
+
+ex1.fa.fai:ex1.fa
+               samtools faidx ex1.fa
+ex1.bam:ex1.sam.gz ex1.fa.fai
+               samtools import ex1.fa.fai ex1.sam.gz ex1.bam
+
+%.bam.bai:%.bam
+               samtools index $<
+
+ex1.pileup.gz:ex1.bam ex1.fa
+               samtools pileup -cf ex1.fa ex1.bam | gzip > ex1.pileup.gz
+
+ex2_truncated.bam: ex2.bam
+       head -c 124000 ex2.bam > ex2_truncated.bam
+
+empty.bam: ex2.sam
+       grep "^@" $< | samtools view -Sb - > $@
+
+example_unmapped_reads_no_sq.bam: example_unmapped_reads_no_sq.sam
+       touch tmp.list
+       samtools import tmp.list $< $@
+       rm -f tmp.list
+
+example_bai.bam: ex1.bam
+       cp ex1.bam $@
+       samtools index $@
+       mv $@.bai example_bai.bai
+
+clean:
+       rm -fr *.bam *.bai *.fai *.pileup* \
+               *~ calDepth *.dSYM pysam_*.sam \
+       ex2.sam ex2.sam.gz ex1.sam
diff --git a/tests/pysam_data/ex1.bed b/tests/pysam_data/ex1.bed
new file mode 100644 (file)
index 0000000..0d0f498
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,2 @@
+chr1   10      100
+chr1   100     1000
diff --git a/tests/pysam_data/ex1.fa b/tests/pysam_data/ex1.fa
new file mode 100644 (file)
index 0000000..b4ed0cf
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,56 @@
+>chr1
+CACTAGTGGCTCATTGTAAATGTGTGGTTTAACTCGTCCATGGCCCAGCATTAGGGAGCT
+GTGGACCCTGCAGCCTGGCTGTGGGGGCCGCAGTGGCTGAGGGGTGCAGAGCCGAGTCAC
+GGGGTTGCCAGCACAGGGGCTTAACCTCTGGTGACTGCCAGAGCTGCTGGCAAGCTAGAG
+TCCCATTTGGAGCCCCTCTAAGCCGTTCTATTTGTAATGAAAACTATATTTATGCTATTC
+AGTTCTAAATATAGAAATTGAAACAGCTGTGTTTAGTGCCTTTGTTCAACCCCCTTGCAA
+CAACCTTGAGAACCCCAGGGAATTTGTCAATGTCAGGGAAGGAGCATTTTGTCAGTTACC
+AAATGTGTTTATTACCAGAGGGATGGAGGGAAGAGGGACGCTGAAGAACTTTGATGCCCT
+CTTCTTCCAAAGATGAAACGCGTAACTGCGCTCTCATTCACTCCAGCTCCCTGTCACCCA
+ATGGACCTGTGATATCTGGATTCTGGGAAATTCTTCATCCTGGACCCTGAGAGATTCTGC
+AGCCCAGCTCCAGATTGCTTGTGGTCTGACAGGCTGCAACTGTGAGCCATCACAATGAAC
+AACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGATGTGTGTTCTCATCAACCTCATACACACAC
+ATGGTTTAGGGGTATAATACCTCTACATGGCTGATTATGAAAACAATGTTCCCCAGATAC
+CATCCCTGTCTTACTTCCAGCTCCCCAGAGGGAAAGCTTTCAACGCTTCTAGCCATTTCT
+TTTGGCATTTGCCTTCAGACCCTACACGAATGCGTCTCTACCACAGGGGGCTGCGCGGTT
+TCCCATCATGAAGCACTGAACTTCCACGTCTCATCTAGGGGAACAGGGAGGTGCACTAAT
+GCGCTCCACGCCCAAGCCCTTCTCACAGTTTCTGCCCCCAGCATGGTTGTACTGGGCAAT
+ACATGAGATTATTAGGAAATGCTTTACTGTCATAACTATGAAGAGACTATTGCCAGATGA
+ACCACACATTAATACTATGTTTCTTATCTGCACATTACTACCCTGCAATTAATATAATTG
+TGTCCATGTACACACGCTGTCCTATGTACTTATCATGACTCTATCCCAAATTCCCAATTA
+CGTCCTATCTTCTTCTTAGGGAAGAACAGCTTAGGTATCAATTTGGTGTTCTGTGTAAAG
+TCTCAGGGAGCCGTCCGTGTCCTCCCATCTGGCCTCGTCCACACTGGTTCTCTTGAAAGC
+TTGGGCTGTAATGATGCCCCTTGGCCATCACCCAGTCCCTGCCCCATCTCTTGTAATCTC
+TCTCCTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTGTTGTTGGTTTTCTG
+TTTCTTTGTTTGATTTGGTGGAAGACATAATCCCACGCTTCCTATGGAAAGGTTGTTGGG
+AGATTTTTAATGATTCCTCAATGTTAAAATGTCTATTTTTGTCTTGACACCCAACTAATA
+TTTGTCTGAGCAAAACAGTCTAGATGAGAGAGAACTTCCCTGGAGGTCTGATGGCGTTTC
+TCCCTCGTCTTCTTA
+>chr2
+TTCAAATGAACTTCTGTAATTGAAAAATTCATTTAAGAAATTACAAAATATAGTTGAAAG
+CTCTAACAATAGACTAAACCAAGCAGAAGAAAGAGGTTCAGAACTTGAAGACAAGTCTCT
+TATGAATTAACCCAGTCAGACAAAAATAAAGAAAAAAATTTTAAAAATGAACAGAGCTTT
+CAAGAAGTATGAGATTATGTAAAGTAACTGAACCTATGAGTCACAGGTATTCCTGAGGAA
+AAAGAAAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAACTATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTT
+AGTCTTGCTAGAGATTTAGACATCTAAATGAAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATAC
+ATTGCAAGACAGACTTCATCAAGATATGTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACATGAAG
+GAAAAAAATTCTAAAATCAGCAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCAT
+CAGAATAACAATGGGCTTCTCAGCAGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGATTGGATCTAATT
+TTTGGACTTCTTAAAGAAAAAAAAACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCTAAACTA
+AGCATCATAAATGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGCTAAGATA
+ATTCATCATCACTAAACCAGTCCTATAAGAAATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAAT
+TAAAGTTCAATACTCACCATCATAAATACACACAAAAGTACAAAACTCACAGGTTTTATA
+AAACAATTGAGACTACAGAGCAACTAGGTAAAAAATTAACATTACAACAGGAACAAAACC
+TCATATATCAATATTAACTTTGAATAAAAAGGGATTAAATTCCCCCACTTAAGAGATATA
+GATTGGCAGAACAGATTTAAAAACATGAACTAACTATATGCTGTTTACAAGAAACTCATT
+AATAAAGACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAACAGAAACCA
+AATGAGAGAAGGAGTAGCTATACTTATATCAGATAAAGCACACTTTAAATCAACAACAGT
+AAAATAAAACAAAGGAGGTCATCATACAATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGATAT
+AACCATCCTACTAAATACATATGCACCTAACACAAGACTACCCAGATTCATAAAACAAAT
+ACTACTAGACCTAAGAGGGATGAGAAATTACCTAATTGGTACAATGTACAATATTCTGAT
+GATGGTTACACTAAAAGCCCATACTTTACTGCTACTCAATATATCCATGTAACAAATCTG
+CGCTTGTACTTCTAAATCTATAAAAAAATTAAAATTTAACAAAAGTAAATAAAACACATA
+GCTAAAACTAAAAAAGCAAAAACAAAAACTATGCTAAGTATTGGTAAAGATGTGGGGAAA
+AAAGTAAACTCTCAAATATTGCTAGTGGGAGTATAAATTGTTTTCCACTTTGGAAAACAA
+TTTGGTAATTTCGTTTTTTTTTTTTTCTTTTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCATGC
+CAGAAAAAAATATTTACAGTAACT
diff --git a/tests/pysam_data/ex1.fq b/tests/pysam_data/ex1.fq
new file mode 100644 (file)
index 0000000..92801c3
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,13080 @@
+@B7_589:1:101:825:28
+GGGAACAGGGGGGTGCACTAATGCGCTCCACGCCC
++
+<<86<<;<78<<<)<;4<67<;<;<74-7;,;8,;
+@B7_589:1:101:825:28
+TGTGTCCATGTACACACGCTGTCCTATGTACTTAT
++
+0;0'0;<<<<<<8<;<<<<;;3<<;;<<<8<<<<<
+@B7_589:1:110:543:934
+AAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAATACT
++
+<<<<<5<<;<<<<<<;<<<<<<<<<<<;<<<<<<<
+@B7_589:1:110:543:934
+ACAAGCCAGAAGAGATTGGATCTAATTTTTGGACT
++
+<<<<<<<<<<<<;<<<<<;;<<<;;<<<<<,,;<<
+@B7_589:1:122:337:968
+ACAGGGGGCTGCGCGGTTTCCCATCATGAAGCACT
++
+<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;;<;;;;
+@B7_589:1:122:337:968
+GCTTTACTGTCTAAACTATGAAGAGACTATTGCCA
++
+%454<75!7<+!990<9<6<<<<6<</<<<<<<<<
+@B7_589:1:122:77:789
+ACTATATTTATGCTATTCAGTTCTAAATATAGAAA
++
+<<<:<4<<9<:7<<<:<<<7<<<<<<<<<<9<9<<
+@B7_589:1:122:77:789
+GGACGCTGAAGAACTTTGATGCCCTCTTCTTCCAA
++
+9<;<:<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_589:1:168:69:249
+ATATGCTGTTTACAAGAAACTCATTAATAAAGACA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;;<
+@B7_589:1:168:69:249
+TTCAGCAAGAAGATATAACCATCCTACTAAATACA
++
+;0;<;;<<<<<<<<<<<<<;<<<8<<<<<<<<<<<
+@B7_589:1:29:529:379
+CAGTTTCTGCCCCCAGCATGGTTGTACTGGGCAAT
++
+<<<<<<<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<;<672;<<<
+@B7_589:1:29:529:379
+GACTCTATCCCAAATTCCCAATTACGTCCTATCTT
++
+;<<<:<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_589:2:30:644:942
+TACCTAATTGGTACAATGTACAATATTCTGATGAT
++
+85%+;<<9;<9<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_589:2:30:644:942
+TATATCAGATAAAGCACACTTTAAATCAACAACAG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<9;<9<
+@B7_589:2:73:730:487
+AGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGATGTGTGTT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<:<<<;<;<<
+@B7_589:2:73:730:487
+TAGCCATTTCTTTTGGCATTTGCCTTCAGACCCTA
++
+<;;<<2;<;<<<;0<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_589:2:9:49:661
+TACACACAAAAGTACAAAACTCACAGGTTTTATAA
++
+<<6<5<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<<<<
+@B7_589:2:9:49:661
+TGCTAAACTAAGCATCATAAATGAAGCGGAAATAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<;:<<;;;7<9;9
+@B7_589:3:71:478:175
+ACAGAGCTTTCAAGAAGTATGAGATTATGTAAAGT
++
+<<<<<<<<<<<;<<<<<;<<<<<<<<<<;<<<<<;
+@B7_589:3:71:478:175
+TAGACATCTAAATGAAAGAGGCTCAAAGAATGCCA
++
+<<<<;<96<<<<;<<<<<<<<<77<<<<<<<<<<;
+@B7_589:3:82:13:897
+ATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCAGCAGAATA
++
+<<<<;<<<<<<;<;<;5<51;<1<<<<%<<<<,58
+@B7_589:3:82:13:897
+CATAAATGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCT
++
+,<2<;<<;<<<<;;;<<;<<<<<<<;;;;<<<<<<
+@B7_589:4:54:989:654
+ACTTATCATGACTCTATCCCAAATTCCCAATTACG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<9<<<<<1<<<88;
+@B7_589:4:54:989:654
+TCCCTGCCCCATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTT
++
+,<1<2<<<;9)9<<;<<;<<<4<<<;<<<<<<<<<
+@B7_589:5:147:405:738
+AGGGATTAAATTCCCCCACTTAAGAGATATAGATT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;;
+@B7_589:5:147:405:738
+ATCAGATAAAGCACACTTTAAATCAACAACAGTAA
++
+<9/<:<<<<<<<<7</<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_589:5:198:564:731
+ACAAAGGAGGTCATCATACAATGATAAAAAGATCA
++
+<6<;<<<<<<:7<<;<<<8<<+<<<<<<<<<<<<<
+@B7_589:5:198:564:731
+ATAGATTGGCAGAACAGATTTAAAAACATGAACTA
++
+<<<<<;<<<<<<;<<:<<;9<<<<<<<<1;<<58<
+@B7_589:5:50:950:562
+CTATTTTTGTCTTGACACCCTACTAATATTTGTCT
++
+<<3<<<8<;<<<<<<+<<8<&<<<<7<<<<<<<<<
+@B7_589:5:50:950:562
+GCCCCATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTGCTGC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<&<<8<<<<<<<5<:<+<:+;
+@B7_589:5:68:440:424
+ACACTTTAAATCAACAACAGTAAAATAAAACAAAG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_589:5:68:440:424
+TGGTACAATGTACAATATTCTGATGATGGTTACAC
++
+<<2<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_589:6:108:958:42
+AAAGTACAAAACTCACAGGTTTTATAAAACAATTA
++
+<<<;;</<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<+
+@B7_589:6:108:958:42
+TATGCCCTGCTAAACTAAGCATCATAAATGAAGGG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<1<<<<<<9<<;<5<:
+@B7_589:6:114:714:317
+AACCCCAGGGAATTTGTCAATGTCAGGGAAGGAGC
++
+;8<;:<<;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_589:6:114:714:317
+TGCCAGCACAGGGGCTTAACCTCTGGTGACTGCCA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<5;<;
+@B7_589:6:120:14:944
+CAAAAGGTGATGTGTGTTCTCATCAACCTCATACA
++
+:;<<;<;<;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_589:6:120:14:944
+CAAAGATGAAACGCGTAACTGCGCTCTCATTCACT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<;<<<<<<<:;8;;7
+@B7_589:6:33:356:636
+TTTTTTTCTTTTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT
++
+<<<<<<<8;<<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<;;3&3
+@B7_589:7:112:203:90
+CCTGTCACCCAATGGACCTGTGATATCTGGATTCT
++
+;<;:;<;;;<<<<<<<<<:<<<7<<<<<<<<<<<<
+@B7_589:7:112:203:90
+CTTGAGAACCCCAGGGAATTTGTCAATGTCAGGGA
++
+<<:<<<<<<<<.<<<<<<<<<<<<6<:867<8884
+@B7_589:7:154:26:712
+ATTGAGACTACAGAGCAACTAGGTAAAAAATTAAC
++
+<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;
+@B7_589:7:154:26:712
+TTAATAAAGACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAA
++
+;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_589:7:72:916:763
+CTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTGTTGTTGGT
++
+<;;:<<<<<<<;<<;;;<<<<<<<<<;;<;<<<<<
+@B7_589:7:72:916:763
+GTCCTATCTTCTTCTTAGGGAAGAACAGCTTAGGT
++
+</:8<8)<<<<:<<<<<;.89<:67<.;<<7+336
+@B7_589:7:76:306:561
+GGTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAACAGAAACCAA
++
+9<7<<9<<<<<<7<<71<71*7<<<<<<<<<<1<<
+@B7_589:7:76:306:561
+TACAGAGCAACTAGGTAAAAAATTAACATTACAAC
++
+<<)<<<<<<8<<8<<<<<<<;;;<<1<<3;=7<<9
+@B7_589:7:93:634:323
+CTTAAAGAAAAAAAAACCTGTCAAACACGAATGTT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<<<<,<<<
+@B7_589:7:93:634:323
+TAAAGTTCAATACTCACCATCATAAATACACACAA
++
+<<<<;<;<<<<;;<<2<:<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_589:8:113:968:19
+GAAAACTATATTTATGCTATTCAGTTCTAAATATA
++
+8;<;8;9<<<<<<<9<:<<<<<<<<<;<<<<<<<<
+@B7_589:8:118:829:36
+AGTATTGGTAAAGATGTGGGGAAAAAAGTAAACTC
++
+<8<<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_589:8:118:829:36
+TAATTGGTACAATGTACAATATTCTGATGATGGTT
++
+<<<<<<<<<:<2<<<<<<:<<<<<<<<<<<<71;<
+@B7_589:8:139:727:808
+AAGTAAATAAAACACATAGCTAAAACTAAAAAAGC
++
+<<;<<<<<<<<<;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_589:8:139:727:808
+ACAAATACTACTAGACCTAAGAGGGATGAGAAATT
++
+<<<<<<<<<<<<<:<;<<<<<<<<9;<;9<6;<<9
+@B7_589:8:157:935:374
+CAGTTACCAAATGTGTTTATTACCAGAGGGATGGA
++
+<<<<<<<<<<;<<;;<<<<<<<<<::8'5++;+11
+@B7_589:8:157:935:374
+TCTTCATCCTGGACCCTGAGAGATTCTGCAGCCCA
++
+94988994.<:<+42::<<<<<:<:<4<<<<;<1<
+@B7_589:8:2:434:715
+AGAGAGAACTTCCCTGGAGGTCTGATGGCGTTTCT
++
+<<<<<<<<<:;<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_589:8:2:434:715
+CTTGTTGTTGGTTTTCTGTTTCTTTGTTTGATTTT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<0<<<68<<<+
+@B7_589:8:74:674:124
+CACTGAACTTCCACGTCTCATCTAGGGGAACAGGG
++
+<<<<<<<<<<<<:<;<<<<;<<<<;9;<<;;.;;;
+@B7_589:8:74:674:124
+TTCTTATCTGCACATTACTACCCTGCAATTAATAT
++
+;;;;;<<:<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_591:1:191:462:705
+CAGATCCAGATTGCTTGTGGTCTGACAGGCTGCAAC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<;<<<<::<6
+@B7_591:1:191:462:705
+CATCCCTGTCTTACTTCCAGCTCCCCAGAGGGAAAG
++
+<<'<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_591:1:60:837:923
+CATCAACCGCATACACTCACATGGTTTAGGGGTATA
++
+0<4<<<02.<99+<+&!<<<<+<<<<<<<<<<<<3<
+@B7_591:1:60:837:923
+TTCACGCCAGCTCCCTGTCACCCAATGGACCTCTGA
++
+<<<<<4<<+<<*<<<<88<<<<<'*<4-+<<4&<40
+@B7_591:2:123:924:645
+TATATCAGATAAAGCACACTTTAAATCAACAACAGT
++
+;<<<<*<<<<<<</7<2<8<<<<<<<4<<<<<<<<<
+@B7_591:2:123:924:645
+TGAATAAAAAGGGATTAAATTCCCCCACTTAAGAGA
++
+<<<<<<<<<<<<;<<<<<<;<<<<<<<6:<7<1<+<
+@B7_591:2:134:868:252
+AAGAACTTTGATGCCCTCTTCTTCCAAAGATGAAAC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;:<<<:<<<
+@B7_591:2:134:868:252
+ATGAACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGA
++
+<;<<<8<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_591:2:13:100:876
+ACAGGGATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGT
++
+<8<<<*<2<7<<<6<<<<<<6<<8<<<<5<<<<4<9
+@B7_591:2:13:100:876
+AGAATATATAAAGTCAACATGAAGGAAAAAAATTCT
++
+;9<$<<<$<<<<<<<<75<<<<<<<9<9<<<<<<<<
+@B7_591:2:223:583:968
+AATATAGTTGAAAGCTCTAACAATAGACTAAACCAA
++
+<<<<<<<29<<<<4<<<<<<<<<<<7<<7<..<<47
+@B7_591:2:223:583:968
+TATGAGGCACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAG
++
+1<';<<&%-:<<<<<:66%<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_591:2:240:603:890
+GCTCCCAAGAGGGAAAGCTTTCAACGCTTCTAGCCA
++
+;+&+//&<<<<<<<<<<9<<<8<<<<9<<<<<<<<<
+@B7_591:2:240:603:890
+TCACAATGAACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<:<<:<<;<<<<<8865
+@B7_591:2:279:124:41
+GAATTAACCCAGTCAGACAAAAANNAAGAAAAAAGA
++
+<<<<<<<7/<8<<<<<<<<<<4*!!<<7<7<<5<<3
+@B7_591:2:279:124:41
+GCTAGAGATTTAGACATCTAAATGAAAGAGGCTCAA
++
+:17<8<<<:&<<<<<<:;'<<<<<<<<<<;<<<<<<
+@B7_591:2:27:280:592
+AATAACAATGGGCTTCTCAGCGGAAACCTTACAAGC
++
+<<<<<<<<<<<8<<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_591:2:27:280:592
+AGAGATTTAGACATCTAAATGAAAGAGGCTCAAAGA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<5<
+@B7_591:2:309:798:997
+TTTTTTTTTTTTTTTTTTCTCTTTTTTTTTTTTTTT
++
+466;<<744077+&7097&%&4<9<<<9<<<::<<<
+@B7_591:2:323:639:311
+AAGCCGTTCTATTTGTAATGAAAACTATATTTAGGC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<2<<<<<<;<<<<<<81<
+@B7_591:2:323:639:311
+TACCAAATGTGTTTATTACCAGAGGGATGGAGGGAA
++
+-94<<<<<<<4<<<<<<<<2<<<<<7<<<-<<<<<<
+@B7_591:2:46:220:58
+CAAATCTGCGCTTGTACTTCTAAATCTATAAAAAAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<<:<;
+@B7_591:2:46:220:58
+TTCCACTTTGGAAAACAATTTGGTAATTTCGTTTTT
++
+98<<<2<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_591:3:168:69:605
+TACCCGAGGGATGGAGGGTAGAGGGACGCTGAAGTG
++
+<<<4(<<<<<<<<<<<<<(1<6<-<2<<7<<6<<++
+@B7_591:3:168:69:605
+TCTGACAGGCGGCAACTGTGAGCCATCACAATGAAC
++
+'<'<144<0<&<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_591:3:179:496:161
+AAAAACATGAACTAACTATATGCTGTTTACAAGAAA
++
+<<<<<9<<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_591:3:179:496:161
+AAGTACAAAACTCACAGGTTTTATAAAACAATTAAT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<+
+@B7_591:3:277:458:330
+AATGTCAGGGAAGGAGCCTTTTGTCAGTTACCAAAT
++
+<<7<<<<<<<<<2<<<%,<6<&<<,<<<<:<<<<(7
+@B7_591:3:277:458:330
+TGATATCTGGATTCTGGGAAATTCTTCATCCTGGAC
++
+<<<<<8;<<<1<;7<<<;<<<<<<<<7<<7<<<<;7
+@B7_591:3:291:404:199
+TATAAAACAATTAATTGAGACTACAGAGCAACTAGG
++
+<<<<<<<7<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_591:3:291:404:199
+TGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:
+@B7_591:3:305:565:952
+GTCCGTGTCCTCCCATCTGGCCTCGTCCACACTGGT
++
+5(<1<147<81<*8--8<<<7<91<<<;+<+<<<<<
+@B7_591:3:305:565:952
+TAATACTATGTTTCTTATCTGCACATTACTACCCTG
++
+7<<<<<<<<<7<<<<<<<<<7<<<;;<;<;<<<<<+
+@B7_591:3:45:294:380
+ATAATTGTGTCCATGTACACACGATGTCATATGTAC
++
+<<<<<<<<9<<<<<<<<<70<<7<6272&:3<+</%
+@B7_591:3:45:294:380
+CCTCGTCCACACTGGTTCGCTTGAAAGCTTGGGCTG
++
+;<+<7<<<<;7<,<7<<<+/7;<<;<<;7<<<;<<<
+@B7_591:4:103:111:720
+CAGTTACCAAATGTGTTTATTACCAGAGGGATGGAG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<5<<<5;<5<:;
+@B7_591:4:103:111:720
+TCTTCATCCTGGACCCTGAGAGATTCTGCAGCCCAG
++
+;4<<<;)<<-<9<;<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_591:4:159:508:571
+CAAAACCTCATATATCAATATTAACTTTGAATAAAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;
+@B7_591:4:159:508:571
+TGGAAAAAGATGTTCTACGCAAACAGAAACCAAATG
++
+9<6<<<<<<<<<<<;<<;<<<<<;<<<<<<<<<<<<
+@B7_591:4:216:650:516
+GAACAGCTTAGGTATCAATTTGGTGTTCTGTGTAAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;
+@B7_591:4:216:650:516
+TTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTT
++
+;9;<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_591:4:329:339:408
+CAATCCAGAAGAGATTGGATCTAATTTTTGGACTTC
++
+7<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_591:4:329:339:408
+TAAATGAAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATAC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<;
+@B7_591:4:92:411:955
+GGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAACAG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<;
+@B7_591:4:92:411:955
+TACTAAATACATATGCACCTAACACAAGACTACCCA
++
+2<+<<<<9<<<<<<<;+<;<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_591:5:124:978:501
+AATTTGGTAATTTCGTTTTTTTTTTTTTCTTTTCTC
++
+<9<;<<::<;<<;<4<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_591:5:124:978:501
+ATGTAACAAATCTGCGCTTGTACTTCTAAATCTATA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;
+@B7_591:5:134:751:831
+AGCTCCCTGTCACCCAATGGACCTGTGATATCTGGA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<948
+@B7_591:5:134:751:831
+ATACACACACATGGTTTAGGGGTATAATACCTCTAC
++
+;:<4<8<<<;<;<<5<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_591:5:243:557:560
+AAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACATTGCA
++
+<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<89<<9<;
+@B7_591:5:243:557:560
+CTAAGCAGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGATTGGAT
++
+69&<;&<&<<;6.<<<+<<<;;<<<<<<<<;<<<<<
+@B7_591:5:254:542:848
+CCAAGCAGAAGAAAGAGGTTCAGAACTTGAAGACAA
++
+<<<;<<<<<<<<<<<<<<<;4<;8<<<;;9<9;8;9
+@B7_591:5:254:542:848
+CTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAAC
++
+,:4<8<<<<<<<<<<<<<;:<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_591:5:289:132:526
+CACCCGGTCCCTGCCCCATCTCTTGTAATCTCTCTC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<<<<<<<<<
+@B7_591:5:289:132:526
+TCTATTTTTGTCTTGACACCCAACTAATATTTGTCT
++
+;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_591:5:42:540:501
+CTATATTTATGCTATTCAGTTCTAAATATAGAAATT
++
+;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_591:5:90:828:633
+CTGCAGCCCAGATCCAGATTGCTTGTGGTCTGACAG
++
+<<<;<;<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_591:5:90:828:633
+GGATGGAGGGAAGAGGGACGCTGAAGAACTTTGATG
++
+<<<<<<<<<<<8<;96<;<<<<<99<2<<;<96<8;
+@B7_591:6:11:646:628
+GTACTTATCATGACTCTATCCCAAATTCCCAATTAC
++
+<<<3<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<<6<
+@B7_591:6:11:646:628
+TTCTGCCCCCAGCATGGTTGTACTGGGCAATACATG
++
+<<<<<<<<<<6<<<<<<<<<<<<</<;<<<<<<6<;
+@B7_591:6:155:12:674
+CTATATTTATGCTATTCAGTTCTAAATATAGAAATT
++
+;<<<<<<<<<<;<<<<;<<<<8<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_591:6:181:191:418
+AAACTATATTTATGCTATTCAGTTCTAAATATAGAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<988
+@B7_591:6:181:191:418
+AGGGAAGAGGGACGCTGAAGAACTTTGATGCCCTCT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_591:6:190:42:671
+TATTGCCAGATGAACCACACATTAATACTATGTTTC
++
+<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_591:6:190:42:671
+TGTGTAAAGTCTCAGGGAGCCGTCCGTGTCCTCCCA
++
+<<<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_591:6:29:575:453
+TACTACCCTGCAATTAATATAATTGTGTCCATTTAC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<1<:<9<&<98
+@B7_591:6:29:575:453
+TCTGGCCTCGTCCACACTGGTTCTCTTGAAAGCTTG
++
+;<<<;;<:<<<;<;<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<
+@B7_591:7:116:814:89
+ACTATGCTAAGTATTGGTAAAGATGTGGGGAAAAAA
++
+:38<;<;<<<<;<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<
+@B7_591:7:116:814:89
+CCTAATTGGTACAATGTACAATATTCTGATGATGGT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<;<<;<<66<
+@B7_591:7:129:956:115
+AGTTTCTGCCCCCAGCATGGTTGTACTGGGCAATAC
++
+<<:<9<4<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_591:7:129:956:115
+GCTCCCCAGAGGGAAAGCTTTCAACGCTTCTAGCCA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;877-
+@B7_591:7:157:447:758
+AAAGATGTTCTACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGA
++
+<<<;<<5<</<<6<5<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_591:7:157:447:758
+ACAAAACCTCATATATCAATATTAACTTTGAATAAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<;<
+@B7_591:7:200:192:373
+AGTGCCTTTGTTCACATAGACCCCCTTGCAACAACC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<:<;5<<;<<
+@B7_591:7:200:192:373
+CTCTCATTCACTCCAGCTCCCTGTCACCCAATGGAC
++
+<<<8<<<4<4<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_591:7:22:632:176
+AAAGGAGGTCATCATACAATGATAAAAAGATCAATT
++
+<9<<<<<<<-;<;<<7;6;<<<<<<<<<;<<<<<<<
+@B7_591:7:22:632:176
+AGATATAGATTGGCAGAACAGATTTAAAAACATGAA
++
+<<<<<;<<<<<<;<<;<:<<<:<<:<<<;<<<;;;:
+@B7_591:7:68:242:834
+AAATAAAAAAGCAAAAACAAAAACTATGCTAAGTAT
++
+<<68<<<<<<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_591:7:68:242:834
+TACTACTAGACCTAAGAGGGATGAGAAATTACCTAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<
+@B7_591:7:89:67:709
+TTTTTTTTTTTGTCTTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTT
++
+:7:::9:7:<<7<'<<477<<<<<<<<<:<<<<<:<
+@B7_591:8:4:841:340
+TTCAAATGAACTTCTGTAATTGAAAAATTCATTTAA
++
+<<<<<<<<;<<<<<<<<;<<<<<;<;:<<<<<<<;;
+@B7_593:1:12:158:458
+CTGGGAAATTCTTCATCCTGGACCCTGAGAGATTCT
++
+<77<<<7<<<<<<<<<<<<5<4;<<;5<;;+2<+;;
+@B7_593:1:12:158:458
+TAATAATGCTACATGGATGATTATGAAATCAATGTT
++
+++++++$((+*+++++++++++++&+++++++++++
+@B7_593:1:189:876:833
+CAAGACTACCCAGATTCATAAAACAAATACTACTAG
++
+<<<<<<<<<<<8<8<<<<<;<;;<<;<<<<<;<<<6
+@B7_593:1:189:876:833
+TTAAAATTTAACAAAAGTAAATAAAACACATAGCTA
++
+7;<<<<:;;<</<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_593:1:19:695:59
+AACAGGAACAAAACCTCATATATCAATATTAACTTT
++
+<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<;<<;;<;<<7<<<<;
+@B7_593:1:19:695:59
+GTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAACAGAAACCAAAT
++
+;+;8<<<<<<<<<<<5<<+<:<<;<<<<<<<<<<<<
+@B7_593:1:200:559:765
+GGAAGGAGCATTTTGTCAGTTACCAAATGTGTTTAT
++
+<<<<<<<<<<<<<<7<<<<<<;<<;;4<7<9;<<-;
+@B7_593:1:200:559:765
+TGGACCCTGAGAGATTCTGCAGCCCAGATCCAGATT
++
+8<;;4<3;<;<<<<<<5<<;;<<98;;<<<<;<<<<
+@B7_593:1:215:861:605
+GAAAAACTATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTC
++
+;<<<<<;:<7:<<<;<<<<<<<;:<<<<<<<<<<<<
+@B7_593:1:215:861:605
+NAAGACAAGTCTCTTATGAATTAACCCAGTCAGACA
++
+!+++++++++++++++++++++++++++++++++++
+@B7_593:1:36:485:632
+AAAAGGTCTTTCAAAAGGTGATGTGTGTTCTCATCA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<5<<<;<18;
+@B7_593:1:36:485:632
+GGCATTTGCCTTCAGACCCTACACGAATGCGTCTCT
++
+0;;;<<;<<<;<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<
+@B7_593:1:85:361:418
+AGCCAGAAGAGATTGGATCTAATTTTTGGACTTCTT
++
+;;;5<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_593:1:85:361:418
+GAAGATACATTGCAAGACAGACTTCATCAAGATATG
++
+<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<;4;<<<<3
+@B7_593:2:104:744:280
+CATATGGAAAGGTTGTTGGGATTTTTTTAATGATTC
++
+'&+74*0<'/.47:8<<<<;<7''6/1<<<.<<68<
+@B7_593:2:104:744:280
+TGGGCTGTAATGATGCCCCTTGTCCATCACCCGGTC
++
+<<<<<<<<<<<<<<;<;<<<<:4<<4<<0<;80+;:
+@B7_593:2:125:875:553
+AACAGTAAAATAAAACAAAGGAGGTCATCATACAAT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;<;
+@B7_593:2:125:875:553
+TAATTGGTACAATGTACAATATTCTGATGATGGTTA
++
+-;<;:;<<;6<<<<<<6<;<:<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_593:2:128:555:941
+AACCAAAAGAGAGAAGGAGTAGTTATACACATATCA
++
+55--555560355$55555555.57757$7555577
+@B7_593:2:133:460:542
+CCTATAAGCCGTTCTATTTGTAATGAAAACTATATT
++
+<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<;
+@B7_593:2:133:460:542
+TTACCAAATGTGTTTATTACCAGAGGGATGGAGGGA
++
+;:;7;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_593:2:259:467:737
+CTATGTACTTATCATGACTCTATCCCAAATTCCCAA
++
+8<<<<<<<:<<<<<<<<;<;<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_593:2:259:467:737
+TCACAGTTTCTGCCCCCAGCATGGTTGTACTGGGCA
++
+<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<'<<.<<<<<<;;;<67
+@B7_593:2:270:430:269
+AAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACATTGCA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;;7;:
+@B7_593:2:270:430:269
+CCAGAAGAGATTGGATCTAATTTTTGGACTTCTTAA
++
+28<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_593:2:273:348:37
+AGAAATGCGCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAA
++
+9;7;;0<++1<<<;<7<+;;1<<<;<17<<<<<<<<
+@B7_593:2:273:348:37
+GAATAACAATGGGCTTCTCAGCAGAAACCTTACACG
++
+<<<<<<<9<49<<<;<<<<*<<19<15;<</5<;.5
+@B7_593:2:313:531:169
+GAAAGAGGTTCAGAACTTGAAGACAAGTCTCTTATG
++
+<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<:<<:<;<<;<2
+@B7_593:2:313:531:169
+GTGAGAAGTTTGGAAAAACTATTTGAGGAAGTAATT
++
+98;<;;<<;8<<<<<<<<<<<8<<<<<<<<8<<<<<
+@B7_593:2:43:239:977
+TGAACTTCTGTAATTGAAAAATTCATTTAAGAAATT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7;7;<;
+@B7_593:2:68:140:542
+AAAAACAAAAACTATGCTAAGTATTGGTAAAGATGT
++
+;;<<;7<<<<<<:<<<:<<<:<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_593:2:68:140:542
+GGGATGAGAAATTACCTAATTGGTACAATGTACAAT
++
+<<<8;<<;<<<<<;<<;<<<<<8;<-<8<82;;;-8
+@B7_593:2:68:692:347
+TATCAATTTGGTGTTCTGTGTAAAGTCTCATGGAGC
++
+<<<<<<<<<+6<;<<<<3<:<<<<6<8<<<&*/;*0
+@B7_593:2:68:692:347
+TGTCTTGATTTACTTGTTGTTGGTTTTCTGTTTCTT
++
+9<;;;;<<<:<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_593:2:81:435:410
+AGACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGT
++
+;<;;<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_593:2:81:435:410
+ATTAATTGAGACTACAGAGCAACTAGGTAAAAAATT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<;<<;;
+@B7_593:3:102:856:670
+AAACCTCATATATCAATATTAACTTTGAATAAAAAG
++
+<<<<<<<;<<<;<<;:<<<<<<<<<<:;;<<;<<<7
+@B7_593:3:102:856:670
+AGAGAAGGAGTAGCTATACTTATATCAGATAAAGCA
++
+;;<<<<:<<<:<<4<<<<<<<<;<<;<<<<<<<<<<
+@B7_593:3:115:649:259
+ATTAATTGAGAATACAGAGCAACTAGGTAAAAAATT
++
+;<;<<;<<<<;&<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_593:3:115:649:259
+GGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<;<<9
+@B7_593:3:148:437:481
+CGCTTCTAGCCATTTCTTTTGGCATTTGCCTTCAGA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<;<<<<;0;8
+@B7_593:3:148:437:481
+GTACTGGGCAATACATGAGATTATTAGGAAATGCTT
++
+<<<;<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_593:3:180:89:582
+ATGCTAAGATAATTCATCATCACTAAACCAGTCCTA
++
+<<<<<<<<<7<<<<<<<<<7<<<:<<<:<<::77:<
+@B7_593:3:180:89:582
+TAAAAAATTAACATTACAACAGGAACAAAACCTCAT
++
+;<<<<<<4<<<:<<<<<<<<<6<<<<<<<<<<;<<<
+@B7_593:3:194:168:684
+AAAACAGTCTAGATGAGAGAGAACTTCCCTGGAGGT
++
+;<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_593:3:194:168:684
+CTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTGTTGTTGGTT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<.<<6-<<
+@B7_593:3:196:11:27
+AAGACCCAGTTAGCCGTCCGTGTCCTCCCATCTGGC
++
+96&6<'<7:!!<,:;+7<<6:<<<<<<<<<7<7;:<
+@B7_593:3:196:11:27
+CTATGTTTCTTATCTGCNCATTACTACCCTGCAATT
++
+<<<<<<<<;<<<<<<<8!4<<<;+<88;8<+2,8<;
+@B7_593:3:303:131:673
+ACAAGAAACTCATTAATAAAGACATGAGTTCAGGTA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<;;;
+@B7_593:3:303:131:673
+ATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGATATAACCATC
++
+<;<<<<<<<<:<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_593:3:310:193:629
+CATACAATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGAT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<;
+@B7_593:3:310:193:629
+TACACTAAAAGCCCATACTTTACTGCTACTCAATAT
++
+9<9<6;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_593:4:104:153:698
+CCAGATACCATCCCTGTCTTACTTCCAGCTCCCCAG
++
+;<<<<<<;6<<<<<<<<<<;<<<<;<;;;<.<::50
+@B7_593:4:104:153:698
+CTAATGCGCTCCACGCCCAAGCCCTTCTCACAGTTT
++
+69<<)9<<:5:6<<<16:<6/<6<1<<<<<:<:<<<
+@B7_593:4:106:316:452
+CTATATTTATGCTATTCAGTTCTAAATATAGAAATT
++
+:<<<<<;<<<<:<<:<<<<<<7<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_593:4:142:63:937
+GAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGATGTGTGTTCTCATC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<;<<:<<:<:
+@B7_593:4:142:63:937
+TTCTTTTGGCATTTGCCTTCAGACCCTACACGAATG
++
+;;;<;<<<<;<<<<<;:<<<<<<<;<<<<<<<<<<<
+@B7_593:4:28:781:723
+AATACCTCTACATGGCTGATTATGAAAACAATGTTC
++
+<<<<<<<<<7<<<;;<<;;<<;<5<4<7<;7<+:<9
+@B7_593:4:28:781:723
+ACTGAACTTCCACGTCTCATCTAGGGGAACAGGGAG
++
+8488<::;4;;<:;;;::<;7<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_593:4:29:794:282
+CACATTAATACTATGTTTCTTATCTGCACATTACTA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<&<<;:<<8<<8
+@B7_593:4:29:794:282
+TAAAGTCTCAGGGAGCCGTCCGTGTCCTCCCATCTG
++
+7<<<<45::-<<<<<;<<-;<<;<<<<<<<<<<<<<
+@B7_593:4:30:117:411
+TCTTGACACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAAAACA
++
+;88<<<<<:<7<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_593:4:30:117:411
+TCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTGCTGCATCCCTGTC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<:<<<<<<<<<:
+@B7_593:4:30:812:345
+TATGTTTCTTATCTGCACATTACTACCCTGCAATTA
++
+;<;<<<<5<<<:<;<:<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_593:4:30:812:345
+TCATCTAGGGGAACAGGGAGGTGCACTAATGCGCTC
++
+<<<<<<<7<;<<7<;77;3<&0-;<5<;6<1'13<:
+@B7_593:4:315:201:673
+AAGATATGTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACAT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<<<:;
+@B7_593:4:315:201:673
+TTGGACTTATTAAAGAAAAAAAAACCTGTCAAACAC
++
+;;;;<-;;&;;<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_593:5:171:343:758
+ACTAATATTTGTCTGAGCAAAACAGTCTAGATGAGA
++
+:+;;<<<<<;<;:<<<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_593:5:171:343:758
+GCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<59<<<9;<<3
+@B7_593:5:267:71:603
+TTGGCCATCACCCAGTCCCTGCCCCATCTCTTGTAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<9;
+@B7_593:5:267:71:603
+TTTAATGATTCCTCAATGTTAAAATGTCTATTTTTG
++
+9;;<;<<<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<
+@B7_593:5:299:743:762
+AAAATTAAAATTTAACAAAAGTAAATAAAACACATA
++
+;<<<1<<<<<+<;<;7<<;<<<<<<<<<;<<;;<<7
+@B7_593:5:299:743:762
+CAAGACTACCCAGATTCATAAAACAAATACTACTAG
++
+<<<;<<<<<<<<<:;<<<.<:<<<<<<<<<<;;;;;
+@B7_593:5:30:599:589
+CTACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGGAGCAGC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<;<&<<;
+@B7_593:5:30:599:589
+TCATAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAGGGATGA
++
+90<;<<<<<<<<+<<<;;<;<;<<<<<<<<6<<8<<
+@B7_593:6:118:121:760
+GAGATTTAGACATCTAAATGAAAGAGGCTCAAAGAA
++
+:<<<;;<<<<6<;<<<;<<<<;<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_593:6:119:428:415
+GCTATACTTATATCAGATAAAGCACACTTTAAATCA
++
+84<<<<;;<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_593:6:119:428:415
+TAAATTCCCCCACTTAAGAGATATAGATTGGCAGAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9;;<;;;
+@B7_593:6:185:96:948
+CTAAATGAAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATA
++
+6<;;<;<<;<<<<<747<<<<<<<<77<<<<<<<<<
+@B7_593:6:185:96:948
+TTTAAAAATGAACAGAGCTTTCAAGAAGTATGAGAT
++
+<<<<<<<<<;6<<<<<<<<<;<<<;;<<<<<<<;<;
+@B7_593:6:38:332:54
+CCATCATAAATACACACAAAAGTACAAAACTCACAG
++
+<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<0;;;<;;
+@B7_593:6:38:332:54
+TGGCAGAACAGATTTAAAAACATGAACTAACTATAT
++
+8;;&<;<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_593:6:61:628:681
+CAGAGGGAAAGCTTTCAACGCTTCTAGCCATTTCTT
++
+95<<<<<<<<;<<<<;<<<:<<;;<<<<<<<<<<<<
+@B7_593:6:61:628:681
+GCCATCACAATGAACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<:<<;;;;;;
+@B7_593:7:15:244:876
+AAAAGTAAACTCTCAAATATTGCTAGTGTGAGTATA
++
+;<<<7<<<<<.2<-<<<<<<<<<:<<<<<<<<<2<<
+@B7_593:7:15:244:876
+GTACAATATTCTGATGATGGTTACACTAAAAGCCCA
++
+<<<<<<;<<<<<<<<;<<;;;<<<<<:<<<9;<<<;
+@B7_593:7:189:530:40
+AAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAATAC
++
+<<<<<<<<<<;<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<;<<<;
+@B7_593:7:189:530:40
+CCCCACTTAAGAGATATAGATTGGCAGAACAGATTT
++
+883;<<<<<<<<<:<<<<<<<<3<;<<<<<<<<;<<
+@B7_593:7:256:354:173
+CATTAATAAAGACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<3<<;
+@B7_593:7:256:354:173
+TCAATTCAGCAAGAAGATATAACCATCCTACTAAAT
++
+-9<<:9<<;6<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_593:7:283:186:707
+AATACATATGCACCTAACACAAGACTACCCAGATTC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<;<;<<<<8
+@B7_593:7:283:186:707
+CGCTTGTACTTCTAAATCTATAACAAAATTAAAATT
++
+889;<7;<7<<7<<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_593:7:307:481:625
+AAAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAACTATTTGAGGAAG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;;;9<;
+@B7_593:7:307:481:625
+TCAACATGAAGGAAAAAAATTCTAAAATCAGCAAGA
++
+;4<<4<;;<<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_593:7:67:302:762
+GTAATCTCTCTCCTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCC
++
+:8;88<;<<<;<<8<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_593:7:67:302:762
+TTACGTCCTATCTTCTTCTTAGGGAAGAACAGCTTA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;65;<-<;<:8<<<3
+@B7_593:7:6:585:132
+GCCCCTTGACCACCACCCAGTCCCTGCCCCATCTCT
++
+:<473$'<+5;7*+<7<&<37<7<<<<7;;7<<:<7
+@B7_593:7:6:585:132
+TGTACTTATCATGTTTCTTTCCTAATTTTTCAATTA
++
+6666166&6)+61))646+6&)&%&-44))1'144'
+@B7_593:7:87:89:696
+TGGTTCTCTTGAAAGCTTGGGCTGTAATGATGCCCC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<:;<<<;<<
+@B7_593:7:87:89:696
+TTCCTATGGAAAGGTTGTTGGGAGATTTTTAATGAT
++
+;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_595:1:209:345:87
+AAACAGTCTAGATGAGAGAGAACTTCCCTGGAGGT
++
+<<;<<<<5<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_595:1:209:345:87
+TTACTTGTTGTTGGTTTTCTGTTTCTTTTTTTGAT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<-<<<6<<<+8<
+@B7_595:1:209:653:400
+AGGAGCATTTTGTCAGTTACCAAATGTGTTTATTA
++
+<69<98<+<<6<<4<<<<</4<<:<4<<<<<<<<<
+@B7_595:1:209:653:400
+CTAGAGTCCCATTTGGAGCCCCTCTAAGCCGTTCT
++
+<;<9<<+<2<9<,;;64;<<<<;8<00*1<48:+8
+@B7_595:1:252:19:955
+AGCCAGTTCTTTTGGCATTTGCCTTCAGACCCTCC
++
+<8<884<<<<<<68<<<<<<<2<;<<;<+<<<;<<
+@B7_595:1:252:19:955
+TGAACAAAAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGA
++
+<<<<<<<<<<4<<<<9<<+9)9<<4:9+<<0<909
+@B7_595:1:81:1000:375
+ACCCTGAGAGATTCTGCAGCCCAGCTCCAGATTGC
++
+;8<;+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_595:1:81:1000:375
+NATGTCAGGGAAGGAGCATTTTGTCAGTTACCAAA
++
+!.............................+.(+.
+@B7_595:2:178:77:424
+CTACCCTGCAATTAATATAATTGTGTCCATGTACA
++
+:5:8<;<;:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_595:2:178:77:424
+TGCGCTCCACGCCCAAGCCCTTCTCACAGTTTCTG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<6<<;<<<<<<<<6<;<<<<6
+@B7_595:2:251:121:479
+GGCTGCAACTGTGAGCCATCACAATGAACAACAGG
++
+<<<<<<<<<<<;:<<<<;:;:<:<;:188;7:<+(
+@B7_595:2:251:121:479
+GGGAAAGCTTTCAACGCTTCTAGCCATTTCTTTTG
++
+<<<<<6'..663;&<<;<<9<<<9<<<<<<<<<<<
+@B7_595:2:29:729:70
+AAACAGAAACCAAATGAGAGAAGGAGTAGCTATAC
++
+<<<:<<<<<<7<<<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_595:2:29:729:70
+ANTATTANCTTTGANNAAAAAGGGATTAAATTCCC
++
+:!<:<<8!::::5:!!:.77::33888633:8777
+@B7_595:3:229:543:583
+ATAACCATCCTACTAAATACATATGCACCTAACAC
++
+</<;+5<855;<6<<<<;<<<<<<9<<<<<<<<<<
+@B7_595:3:229:543:583
+TCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTACGCAA
++
+<<<<<<<<<<8<8<9<<<<8<<588<<<<*<2:2*
+@B7_595:3:297:637:86
+CAATGTTCCCCAGATACCATCCCTGTCTTACTTCC
++
+<<<<<<<<<<<<;+<+;<;<:<<<<<9<<957<;(
+@B7_595:3:297:637:86
+TCTCAGCTAGGGGAACAGGGAGGTGCACTAATGCG
++
+<:75<;<;;<<<<<<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_595:3:57:735:151
+CTATCCCAAATTCCCAATTACGTCCTATCTTCTTC
++
+<<<<<<<<8<<8<:<<*<:<<<4<<<;,<<<<:<:
+@B7_595:3:57:735:151
+TAAACTCTCACCTTATTGCTGCATCCCTGTCTTCC
++
+07;+79:;<)<<9<+8<:<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_595:3:85:964:950
+AACAGATTTAAAAACATGAACTAACTATATGCTGT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<;:
+@B7_595:3:85:964:950
+GAGGTCATCATACAATGATAAAAAGATCAATTCAG
++
+<<8::<<;;<<<;<<6<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_595:4:12:402:843
+AGGGAGGTGCACTAATGCGCTCCACGCCCAAGCCC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;;<
+@B7_595:4:12:402:843
+ATATAATTGTGTCCATGTACACACGCTGTCCTATG
++
+<7<+<<11<9<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_595:4:319:250:718
+AAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAACTATTTG
++
+<;:<<<<;<<<:<<<<<<49:<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_595:4:319:250:718
+AGTTGAAAGCTCTAACAATAGACTAAACCAAGCAG
++
+<<<<<<<<<<<;<<5<5;<851;85;)9;;8594;
+@B7_595:4:58:703:72
+GTACACACGCTGTCCTATGTACTTATCATGACTCT
++
+5&<<7;+95;7'6<<<<<.<<<<<;<<9<7<<<<<
+@B7_595:4:58:703:72
+TCCACGCCCAAGCCCTTCTCACAGTTTCTGCCCCC
++
+2<7<<<<<<<<<<<8:<<<<8<(<8<:::8.::<3
+@B7_595:4:84:802:737
+CATAGACCCCCTTGCAACAACCTTGAGAACCCCAG
++
++<1<-;69;;;;8;:<<6<;<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_595:4:84:802:737
+CTTAACCTCTGGTGACTGCCAGAGCTGCTGGCAAG
++
+<<<<<<<<<<;9<9<<<;<<;73;<<<<<37;1+.
+@B7_595:5:184:912:258
+ATTCTAAAATCAGCAAGAGAAAAGCATACAGTCAT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<
+@B7_595:5:184:912:258
+GTTATGCCCTGCTAAACTAAGCATCATAAATGAAG
++
+<;;<<<<;:<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_595:5:36:649:554
+AAGAGATTGGATCTAATTTTTGGACTTCTTAAAGA
++
+<<<<<888;<<<;<<<;<;<8<<<<8<<<<<<<<<
+@B7_595:5:36:649:554
+CAGGAAGATACATTGCAAGACAGACTTCATCAAGA
++
+<<<<<4<<8<<<<<<8<6<<88<<<<<<<-;<;0;
+@B7_595:5:84:91:614
+GAACCACACATTAATACTATGTTTCTTATCTGCAC
++
+<<;;<<<7<<<<<<<;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_595:5:84:91:614
+TTTCCCATCATGAAGCACTGATCTTCCACGTCTCA
++
+;4<<<<<-84<<<;<<<<8<7.<4<<;77&:%<::
+@B7_595:6:119:730:190
+AGTCTCTTATGAATTAACCCAGTCAGACAAAAATA
++
+<<<9<;;<<<;<<<<<<<8<<<1<<918<;;;<<<
+@B7_595:6:119:730:190
+AGTCTTGCTAGAGATTTAGACATCTAAATGAAAGA
++
+;;;3;<<:<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_595:6:137:811:130
+AAAATTTAACAAAAGTAAATAAAACACATAGCTAA
++
+<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_595:6:137:811:130
+AGACTACCCAGATTCATAAAACAAATACTACTAGA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9;;;
+@B7_595:6:290:270:557
+ACATTACTACCCTGCAATTAATATAATTGTGTCCA
++
+87:9;;;<851+:5.<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_595:6:290:270:557
+GGAACAGGGAGGTGCACTAATGCGCTCCACGCCCA
++
+<<<<<<<<<<<<<;<<<<9<:;<<<<<<5<0<<;+
+@B7_595:6:47:720:789
+CCCTTGGCCATCACCCGGTCCCGGCCCCTTCTCTT
++
+<<72<<<<<<<<;;<7;,0<2;*7<2;<*;;<<64
+@B7_595:6:47:720:789
+TCCTCAATGTTAAAATGTCTATTTTTGTCTTGACA
++
+/)040<.878<<<<;8<;<9<9;<<<<<<<<<<93
+@B7_595:6:52:751:360
+AAAAACTATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:76<<<<;9:;:
+@B7_595:6:52:751:360
+AGAGAAAAGCATACAGTCATCTATAAAGGAAATCC
++
+<-<9<<<<<6<<<8<<;;<<9<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_595:6:99:557:427
+AACAAAATTAAAATTTAACAAAAGTAAATAAAACA
++
+<<-<<<<9<<<<<:<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_595:6:99:557:427
+ATTCATAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAGGGA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<+;<7:8:;
+@B7_595:7:123:610:472
+GTCTGAGCAAAACAGTCTAGATGAGAGAGAACTTC
++
+:<::+<<9<<9<<<<=<<<<<=<<<<<<<<?<<<<
+@B7_595:7:123:610:472
+TGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTGT
++
+<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<+:<<<<<<<<;
+@B7_595:7:149:123:265
+AAGAGGGATGAGAAATTACCTAATTGGTACAATGT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9
+@B7_595:7:149:123:265
+AGCAAAAACAAAAACTATGCTAAGTATTGGTAAAG
++
+<;&<<<<<:<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_595:7:166:203:416
+AATTACGTCCTATCTTCTTCTTAGGGAAGAACAGC
++
+<<<<<<<<::<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_595:7:166:203:416
+ATGAGATTATTAGGAAATGCTTTACTGTCATAACT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<;<<<<<97<
+@B7_595:7:188:802:71
+ATGCTATTCAGTTCTAAATATAGAAATTGAAACAG
++
+<<<<<<<<<;<<<<<9<<<:<<<:<<<<<<:<<<;
+@B7_595:7:188:802:71
+TGCCCTCTTCTTCCAAAGATGAAACGCGTAACTGC
++
+;;;;<:::<<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_595:7:190:481:295
+GAAGAACAGCTTAGGTATCAATTTGGTGTTCTGTG
++
+;<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_595:7:190:481:295
+TCATAACTATGAAGAGACTATTGCCAGATGAACCA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<9<7<2::
+@B7_595:7:242:4:593
+ATATACACACGCTGTCCTATGTACTTATCATGACT
++
+1.%55877+8+88808887+7;7;18:8;;;.&;8
+@B7_595:7:242:4:593
+TCCACGCCCAAGCCCTTCTCACAGTTTCTGCCCCC
++
+<<<<<<<<<<<8<<<<-<<<<<88;<;<<8<;88<
+@B7_595:8:26:242:35
+ATAAAACAAAGGAGGTCATCATACAATGATAAAAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<;
+@B7_595:8:26:242:35
+ATATTTTGATGATGGTTACACTAAAAGCCCATACT
++
+<<<77!!7<;<<<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_597:2:100:563:301
+GAACTTCTGTAATTGAAAAATTCATTTAAGAAATT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:;8;;;
+@B7_597:2:132:493:921
+ACGGGGTTGCCAGCACAGGGGCTTAACCTCTGGTG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<;<<<<;;88:
+@B7_597:2:132:493:921
+GTTCTCAAGGTTGTTGCAAGGGGGTCTATGTGAAC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<77;0<;;6777
+@B7_597:2:165:431:857
+GAACTTTGATGCCCTCTTCTTCCAAAGATGAAACG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<6&:<7<:76,;;
+@B7_597:2:165:431:857
+TTGGGGTCTGACAGGCTGCAACTGTGAGCCATCAC
++
+''7'/;'1%0447<<<*<6<<<*<*<<<<6<<<<<
+@B7_597:2:168:829:88
+ACAGACTTCATCAAGATATGTAGTCATCAGACTAT
++
+<,,;<838883;;;<<<<<;<8<8;<<<<<<<<<<
+@B7_597:2:168:829:88
+TAACTGAACCTATGAGTCACAGGTATTCCTGAGGA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<6<<<<<<9;4;2
+@B7_597:2:42:28:552
+AAGAAGATATAACCATCCTACTAAATACATATGCA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;<3<:;9;8
+@B7_597:2:42:28:552
+ACTCAATATATCCATGTAACAAATCTGCGCTTGTA
++
+</8:<<:<<<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_597:3:10:394:392
+TCATCAAGATATGTAGTCATCAGACTATCTAAATT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<;<<;;:6&;
+@B7_597:3:10:394:392
+TTGGACTTCTTAAAGAAAAAAAAACCTGTCAAACA
++
+28-:;0-<0<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_597:3:115:646:430
+CACAGGTTTTATAAAACAATTAATTGAGACTACAG
++
+5;5<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_597:3:115:646:430
+GTTATGCCCTGCTAAACTTAGCATCATAAATGAAG
++
+<7<<<<<<<<<<<<;<<<<<;<7<<<<;5;<;67<
+@B7_597:3:133:707:886
+ACCTAATAAATACATATGCACCTAACACAAGACTA
++
+%5-2;&6<<<<<;<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_597:3:133:707:886
+AGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAAC
++
+<<<<7;<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<5<;66<
+@B7_597:3:157:361:309
+CCTGCTAAACTAAGCATCATAAATGAAGGGGAAAT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;<;<<;<
+@B7_597:3:157:361:309
+TACACACAAAAGTACAAAACTCACAGGTTTTATAA
++
+:<-<5<0<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_597:3:39:966:551
+ACATTAATACTATGTTTCTTATCTGCACATTACTA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<;<&<<&<<;
+@B7_597:3:39:966:551
+AGGGAGCCGTCCGTGTCCTCCCATCTGGCCTCGTC
++
+8;;;;;<<6'<<<+8<<<1<<<<4<<<<<<<<<<<
+@B7_597:3:46:981:766
+TCTTTTGGCATTTGCCTTCAGACCCTACACGAATG
++
+<<<<<<<<<<<<<;<<<<<-<;<<<<-<-<;-:6;
+@B7_597:3:46:981:766
+TGCCCCCAGCATGGTTGTACTGGGCAATACATGAG
++
+/<<<;/;<<316<<<3<<<<7<<<7<<<;<<<<<7
+@B7_597:3:53:616:842
+CTTATCATGACTCTATCCCAAATTCCCACTTACGT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;07<<<<<-&<<-<4;
+@B7_597:3:53:616:842
+TCACCCAGTCCCTGCCCCATCTCTTGTAATCTCTC
++
+;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_597:3:67:620:344
+AGCTTTCAACGCTTCTAGCCATTTCTTTTGGCATT
++
+<<<<2<:2<<<<<<7<<<<:<<*<<<<<<***3<<
+@B7_597:3:67:620:344
+CCCCCGCCCAAGCCCTTCTCACAGTTTCTGCCCCC
++
++++*+++#++++++,++++++++,,+,&+,,,,+,
+@B7_597:3:73:273:488
+AAAACAGTCTAGATGAGAGAGAACTTCCCTGGAGG
++
+</<<:<<9;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_597:3:73:273:488
+CTCTCTCCTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTG
++
+<<<<<2<88<88<<<8<<1<<<<<<68<<<;<;<*
+@B7_597:4:138:211:582
+CATTAATAAAGACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGG
++
+:<8;<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_597:4:138:211:582
+TGAGACTACAGAGCAAATAGGTAAAAAATTAACAT
++
+<<;<<<<<<<<<<<<<&;<;<7<<;<<<<<<<5<<
+@B7_597:4:144:492:61
+AAATACTCACCATCATAAATACACACAAAAGTACA
++
++;;3;,:7<:;<<7<<<<<<<;;<<<<<<<<<<<<
+@B7_597:4:144:492:61
+AACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCTAAAC
++
+<<<;<<<<<<<<<<<;<<<<<<7:<<<<::;9;;6
+@B7_597:4:146:961:63
+TACTTATATCAGATAAAGCACACTTTAAATCAACA
++
+7;;<<<<<;<<<7<<<<<<<<;;<<;<;<<;<<<7
+@B7_597:4:146:961:63
+TGAATAAAAAGGGCTTAAATTCCCCCACTTAAGGG
++
+<<+<<<<::+1<;&<<88<<<<;;.<0;;85(;(8
+@B7_597:4:38:999:463
+GCGGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGATTGGATCTA
++
+.*:&<<0<0!<<+<<<<<<<<<<<<<0<<<<<<<<
+@B7_597:4:38:999:463
+TAGACATCTAAATGAAAGNNGCNNNAAGAATGCCA
++
+7<<<<<<<<:07<<:<<7!!<<!!!::<88<<<<4
+@B7_597:5:125:957:753
+TTTTTTTTTTTTCTCTCCTCTTTTTTTTTTTTTTT
++
+<8<<<;<8;8//++(,(+++&++(/+008880;;/
+@B7_597:5:160:434:853
+ATATAATTGTGTCCATGTACACACGCTGTCCTATG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<,<<<<:<<<<,<:
+@B7_597:5:160:434:853
+GCTTGGGCTGTAATGATGCCCCTTGGCCATCACCC
++
+;;*4;<;<<<;<<<<<<<8<<<;<<<<<<<<8<<<
+@B7_597:5:58:684:520
+AGACAGACTTCATCAAGATATGTAGTCATCAGACT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:;;<<
+@B7_597:5:58:684:520
+ATTTTTGGACTTCTTAAAGAAAAAAAAACCTGTCA
++
+<85;;:<<<7<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_597:5:6:882:784
+CATGGCTGATTATGAAAACAATGTTCCCCAGATAC
++
+4;7<;64<<:<<4<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_597:5:6:882:784
+CTGGATTCTGGGAAATTCTTCATCCTGGACCCTGA
++
+<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<:6::::<,2
+@B7_597:5:98:995:929
+GTCCTATAAGAAATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGT
++
+<;<;<8<;<<;1;<<<<<;<;;;08;<;<1&0+8<
+@B7_597:5:98:995:929
+TATAACAATATTAACTTTGAATAAAAAGGGATTAA
++
+&<+<'7<<+<&<<<7+4<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_597:6:106:595:322
+GAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTGC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<::
+@B7_597:6:106:595:322
+GCAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTATAAAGGAAA
++
+;+<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<7<<<<<<<<<<<
+@B7_597:6:193:661:771
+AAACTCATTAATAAAGACATGAGTTCAGGTAAAGG
++
+<<<<<<<<<;<<<;;;<<<<<;<<<=;<:;5:9::
+@B7_597:6:193:661:771
+GCAAGAAGATATAACCATCCTACTAAATACATATG
++
+:&<<<<<<<<<<<<<;<<<;<<;<<<<<<<<<<<<
+@B7_597:6:20:592:496
+CTCAAAGAATGCCAGGAAGATACATTGCAAGACAG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<==<<<<<<:<
+@B7_597:6:20:592:496
+TCTCAGCGGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGATTGG
++
+97<7;<;<;<<<<;<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_597:6:29:249:878
+ATTGTGTCCATGTACACACGCTGTCCTATGTACTT
++
+<,;<9<;<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<><<<
+@B7_597:6:29:249:878
+TCTCACAGTTTCTGCCCCCAGCATGGTTGTACTGG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<:<<=<<:<<6&
+@B7_597:6:73:420:812
+CTAAGTATTGGTAAAGATGTGGGGAAAAAAGTAAA
++
+5'<<<,<&,<<,<<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_597:6:73:420:812
+CTAATTGGTACAATGTACAATATTCTGATGATGGT
++
+<<<<<1<<<<::1<7<:<96<9<:<<:4<70:11<
+@B7_597:7:103:731:697
+AATTAACCCAGTCAGACAAAAATAAAGAAAAAAGA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<:<<6<<<<<<<:<;:
+@B7_597:7:103:731:697
+CTTGCTAGAGATTTAGACATCTAAATGAAAGAGGC
++
+:::;3:<<<<<<<:<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_597:7:113:408:211
+AAACTCATTAATAAAGACATGAGTTCAGGTAAAGG
++
+<:;:;:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_597:7:113:408:211
+GAGACTACAGAGCAACTAGGTAAAAAATTAACATT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<:&<<<&:<<<<<<<<<<;:/
+@B7_597:7:31:948:254
+CCTCTACATGGCTGATTATGAAAACAATGTTCCCC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<:<<8<;;;;<
+@B7_597:7:31:948:254
+TGAAGCACTGAACTTCCACGTCTCATCTAGGGGAA
++
+7;;;98<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<<<<<<<
+@B7_597:7:41:34:211
+CACCTAACACAAGACTACCCAGATTCATAAAACAA
++
+7</::<<7<<<<<<;<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_597:7:41:34:211
+GTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAACAG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<3:;5;
+@B7_597:7:5:753:806
+AAAATATAGTTGAAAGCTCTAACAATAGACTAAAC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7:-<;;3;;
+@B7_597:7:5:753:806
+ATGTAAAGTAACTGAACCTATGAGTCACAGGTATT
++
+;:<:<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_597:7:94:273:165
+AGAAAGAAGATATAACCATCCTACTAAATACATAT
++
+;3&;;:<<:<-<-<<8:<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_597:7:94:273:165
+TTACAAGAAACTCATTAATAAAGACATGAGTTCAG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:;;:7
+@B7_597:8:147:360:141
+TGCGCTTGTACTTCTAAATCTATAACAAAATTAAA
++
+<<<<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7
+@B7_597:8:147:360:141
+TTTGGTAATTTAGTTTTTTTTTTTTCTTTTCTCTT
++
+<86<<<<73<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_597:8:186:850:838
+GGAAGAGGGACGCTGAAGAACTTTGATGCCCTCTT
++
+<;<;<;<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_597:8:186:850:838
+GTTCTATTTGTAATGAAAACTATATTTATGCTATT
++
+<<<<<;<<<<<<<<<<<:<<<<<;<<<;</<<;<<
+@B7_597:8:35:118:589
+TCATAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAGGGATG
++
+67<<<<<;<<<<<<<:7<<<<:<<<<<<<<<<<<<
+@B7_597:8:35:118:589
+TGTTCTACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGGA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<:<<<<<9
+@B7_597:8:48:805:860
+AAACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCTAAA
++
+<<<<<<<;<<<<<<<41;<<8<<<<<<<8+<4,+;
+@B7_597:8:48:805:860
+AAAGTACAAAACTCACAGGTTTTATAAAACAATTA
++
+<<<;3<;7<<97<7<<<<7<4<<<<<<<<<<;8<+
+@B7_610:1:12:88:200
+ACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTT
++
+<<<<<<<<<<<;<<<<<<<;<<<:<<<<<<9<<5<
+@B7_610:1:12:88:200
+GAAGATATAACCATCCTACTAAATACATATGCACC
++
+9<<;<<<;<;6;<;:<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_610:1:139:152:856
+AGAGGGACGCTGAAGAACTTTGATGCCCTCTTCTT
++
+<<<<<;<<<<<<<<<<;<;<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_610:1:139:152:856
+CTAAGCCGTTCTATTTGTAATGAAAACTATATTTA
++
+<<<<<<<<;<<<<<<<<<<;<;<<<;<<<<;<;;;
+@B7_610:1:37:652:403
+CCCCTCTAAGCCGTTCTATTTGTAATGAAAACTAT
++
+<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_610:1:37:652:403
+TTTTGTCAGTTACCAAATGTGTTTATTACCAGAGG
++
+<;<<<<:<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_610:2:189:831:878
+AGAAAAAAAAACCTGTCAAACACGAATGTTATGCC
++
+<9<<<<<<<<<<;9<:<<<<<6<<<<<<<;<<<<<
+@B7_610:2:189:831:878
+AGGAAGATACATTGCAAGACAGACTTCATCAAGAT
++
+:<<<2<<<<<<<<<<:8<8<<<<<<<<<<87489;
+@B7_610:2:194:688:289
+TCAGACCCTACACGAATGCGTCTCTACCACAGGGG
++
+;8;%28<;<<<<<<<<;<<<<;<<<<<<<<<<<<<
+@B7_610:2:194:688:289
+TGTGTGTTCTCATCAACCTCATACACACACATGGT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<:;
+@B7_610:2:6:529:366
+CATACAATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_610:2:6:529:366
+GCTACTCAATATATCCATGTAACAAATCTGCGCTT
++
+9;8;8<:<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_610:2:75:887:149
+TACAACAGGAACAAAACCTCATATATCAATATTAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<;<<<<<<<;<;;;
+@B7_610:2:75:887:149
+TACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGGAGTAGC
++
+:<:<0<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_610:3:102:825:507
+TGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<;;<
+@B7_610:3:102:825:507
+TTTGTCTGAGCAAAACAGTCTAGATGAGAGAGAAC
++
+<05<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<<<<
+@B7_610:3:120:63:653
+AACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGATG
++
+<<;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_610:3:120:63:653
+TCTTCTTCCAAAGATGAAACGCGTAACTGCGCTCT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<9<<<
+@B7_610:3:137:895:681
+CTTCCTATGGAAAGGTTGTTGGGAGATTTTTAATG
++
+4;5+6;<<<<<<<<<9;<4<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_610:3:137:895:681
+GCCTCGTCCACACTGGTTCTCTTGAAAGCTTGGGC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<-8<<
+@B7_610:3:148:340:479
+TCTGTGTAAAGTCTCAGGGAGCCGTCCGTGTCCTC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<:<:<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_610:3:148:340:479
+TTGTTGTTGGTTTTCTGTTTCTTTGTTTGATTTGG
++
+<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_610:3:182:23:585
+AGAACAGCTTAGGTATCAATTTGGTGTTCTGTGTA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<
+@B7_610:3:182:23:585
+ATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTGTTGT
++
+9:<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_610:3:5:863:302
+ACGTCTCATCTAGGGGAACAGGGAGGTGCACTAAT
++
+:4:29:<<<9;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_610:3:5:863:302
+TGAAAACAATGTTCCCCAGATACCATCCCTGTCTT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<
+@B7_610:3:82:998:566
+ATCTGGCCTCGTCCACACTGGTTCTCTTGAAAGCT
++
+<9<9<<<<2<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_610:3:82:998:566
+GCACATTACTACCCTGCAATTAATATAATTGTGTC
++
+<<<<<<<:<<0<<<<:<82<<::<4<<;<<4<4<;
+@B7_610:3:84:101:328
+AATGGACCTGTGATATCTGGATTCTGGGAAATTCT
++
+<<<;<<<<<<<<;<<<<<<<<<<:<;;<44;;<;<
+@B7_610:3:84:101:328
+TATAATACCTCTACATGGCTGATTATGAAAACAAT
++
+<<<<<<<<:<<<<<<<<<6<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_610:3:85:219:371
+GACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGT
++
+<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_610:3:85:219:371
+TAACATTACAACAGGAACAAAACCTCATATATCAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<;<;
+@B7_610:4:139:989:144
+ACTAAAAAAGCAAAAACAAAAACTATGCTAAGTAT
++
+<&<<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_610:4:139:989:144
+ACTACTAGACCTAAGAGGGATGAGAAATTACCTAA
++
+<<<<<<<<<<<<6<<<<<<<<<;<<<<<<<;;<;;
+@B7_610:4:15:805:420
+ATGAAGAGACTATTCACATGTGAACCACACATTTA
++
+;73;;;;67.;1<<+*.;*&<4947<&474&*9*(
+@B7_610:4:15:805:420
+GAACAGTTTAGGTATCAATTTGGTGTTCTTTGTAA
++
+<64<59&996<(64<)7).68<0<0<<7741<1:<
+@B7_610:4:198:59:675
+AATCTGCGCTTGTACTTCTAAATCTATAACAAAAT
++
+<<<<<4<4<:<<<;7<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_610:4:198:59:675
+ACTAAATACATATGCACCTAACACAAGACTATCCT
++
+<.<<<<<<;<<<<<<<<<<<**<;<;2<;6;&*2&
+@B7_610:4:67:317:249
+CTACATGGCTGATTATGAAATCTATGTTCCCCATA
++
+<<<<<<;<<<<;:;<<7;<<.<&3<;;<<(;;6.<
+@B7_610:4:67:317:249
+TTCCCATCATGACGCACCGAACTTCCACGTCTCAT
++
+.5;7;++;<8.;&:7<<.5<<<<7<<7<<<<<<;7
+@B7_610:5:102:915:87
+AACAATAGACTAAACCAAGCAGAAGAAAGAGGTTC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<3<<;<<<<;
+@B7_610:5:102:915:87
+CACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAA
++
+;<8<;;<<<<7;<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_610:5:120:596:847
+AACCTATGAGTCACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGA
++
+<<<<<<<<<<<<<;<<<9<<<<<<<;:<62;58;2
+@B7_610:5:120:596:847
+TCAACATGAAGGAAAAAAATTCTAAAATCAGCAAG
++
+;/<<:<;<<<<<<<<<<<<<;;<<<<<;<<<<<<<
+@B7_610:5:136:260:254
+AAATTAACATTACAACAGGAACAAAACCTCATATA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<><<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_610:5:136:260:254
+GTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAACAGAAACCAAA
++
+;:;;<<<<<<<<<<<<<<;<;<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_610:5:147:68:353
+AACAACCTTGAGAACCCCAGGGAATTTGTCAATGT
++
+<;<;<<7<<<<<<<7<<;;<7<4<8<<<8.;4;;;
+@B7_610:5:147:68:353
+CCTTTGATATCTGGATTCTGGGAAATTCTTCATCC
++
+<<;;<<<<<<<<+;<<;<<0;<<<<;<<<<<<<<<
+@B7_610:5:51:904:391
+ACCTATGAGTCACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<;:;<2<6;;;;;
+@B7_610:5:51:904:391
+TATCTAAAGTCAACATGAAGGAAAAAAATTCTAAA
++
+;<96<<<<<<7<<7<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<
+@B7_610:5:7:761:623
+CCGGCATGGTTGTACTGGGCAATACATGAGATTAT
++
+::';-8);<<<<;<1<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_610:5:7:761:623
+CTTTCAACGCTTCTAGCCATTTCTTTTGGCATTTG
++
+<<<<<<<<<<<<<8<<<<;;<0<<<<<;;<;<;;&
+@B7_610:6:107:252:533
+AGAGAAGGAGTAGCTATACTTATATCAGATAAAGC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;<<;9
+@B7_610:6:107:252:533
+CAAGACTACCCAGATTCATAAAACAAATACTACTA
++
+3<<<<+<<96<<<<<<;<<<<<<;<<<<<<<<<<<
+@B7_610:6:111:379:700
+ACACTAAAAGCCCATACTTTACTGCTACTCAATAT
++
+7<<:<<<<02<<6&<</<<</+9/98*<966/3/<
+@B7_610:6:111:379:700
+CGCACTGGCAATATTTGTGTGTTTACTTTTTTGCA
++
+:1+&;;6;:;918;);;):,19.9:).):::.&3(
+@B7_610:6:143:620:158
+ACTTTACTGCTACTCAATATATCCATGTAACAAAT
++
+<4;<;<;<;6<<7<;<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<
+@B7_610:6:143:620:158
+CAATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGATATA
++
+<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<
+@B7_610:6:148:776:486
+AACTGTGAGCCATCACAATGAACAACAGGAAGAAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;
+@B7_610:6:148:776:486
+AGCTTTCAACGCTTCTAGCCATTTCTTTTGGCATT
++
+;:<<<;<<;<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_610:7:116:157:612
+GTAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAATACTCACCATC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_610:7:116:157:612
+TTAAGAGATATAGATTGGCAGTACAGATTTAAAAA
++
+;;<<<<<<<<<<<<<<<<;<</<<<<<<<<<<<<<
+@B7_610:7:117:857:942
+AGAGAGAACTTCCCTGGAGGTCTGATGGCGTTTCT
++
+<<;<<<<<<<9<<<8<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<
+@B7_610:7:117:857:942
+GGTTTTCTGTTTCTTTGTTTGATTTGGTGGAAGAC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:6<;;7;9<;
+@B7_610:7:158:943:467
+AAAGCTCTAACAATAGACTAAACCAAGCAGAAGAA
++
+<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<;;<<<<<<<<<;8<<
+@B7_610:7:158:943:467
+AGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGTT
++
+<:<<;;<:5<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<;<<<
+@B7_610:7:15:696:693
+TCAAACACGAATGTTAATCCCTGCTAAACTAATCA
++
+)6<:7<.7<6.<0&&<&3:&7<<7<0<<<<<<<<<
+@B7_610:7:15:696:693
+TCTAAAGTCAACATGAAGGAAAAAAATTCTAAAAT
++
+2:+:7<<3<<<<<6+36<<<<<<<6<<6&<<;<.7
+@B7_610:7:177:469:800
+AAAATCAGCAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTATA
++
+=<<<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_610:7:177:469:800
+TTGGAAAAACTATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;;<<<;<;
+@B7_610:7:26:749:174
+CAGATTCATAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<9<8<<<9<;94
+@B7_610:7:26:749:174
+TAACAAAAGTAAATAAAACACATAGCTAAAACTAA
++
+(<<)<<<<6<<<<<<<<<<&:<3<<<6<<<)<:<<
+@B7_610:7:34:144:868
+AATTACCTAATTGGTACAATGTACAATATTCTGAT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<4;<
+@B7_610:7:34:144:868
+AGCTAAGGAATGGGAAAGGTGTGGGGAAAAAAGTA
++
+&9+&7<&&0&<6<.0<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_610:7:35:378:681
+GCGTCTCTACCACAGGGGGCTGCGCGGTTTCCCAT
++
+:<5-<);;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@B7_610:7:35:378:681
+GTGTGTTCTCATCAACCTCATACACACACATGGTT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<:<
+@B7_610:8:163:757:432
+CCAGATGAACCACACATTAATACTATGTTTCTCAT
++
+1+<8<<<<<<;<5<;<<<<<;5<<<<<<<<<<<<<
+@B7_610:8:163:757:432
+GGTTTCCCATCATGAAGCACTGAACTTCCACGTCT
++
+<<<<<<<;<<<<<<<<;<;<<<<<<<<<<<<83:<
+@B7_610:8:68:570:705
+AACAGATTTAAAAACATGAACTAACTATATGCTGT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<8<
+@B7_610:8:68:570:705
+CATCATACAATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGA
++
+4<;4<;;:<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<;<
+@B7_610:8:95:426:791
+CCAAATGTGTTTATTACCAGAGGGATGGAGGGAAG
++
+<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<,<<
+@B7_610:8:95:426:791
+GNTCCAGATTGCTTGTGGTCTGACAGGCTGCAACT
++
+!!!!<<<<<;;<<<<;<<;<;;<<<<<<<<<<<<<
+@EAS112_32:7:113:809:364
+GATGCCCTCTTCTTCCAAAGATGAAACGCGTAACT
++
+;<;;;<<<:<6<<<::<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS112_32:7:113:809:364
+TATAGAAATTGAAACAGCTGTGTTTAGTGCCTTTG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<;<;<<<4
+@EAS112_32:7:135:401:735
+AATTGTAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAATACTCAC
++
+<<::7<<<<<<::<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS112_32:7:135:401:735
+CCTTACAAGCCAGAAGAGATTGGATCTAATTTTTG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<8<<<<<<;
+@EAS112_32:7:168:117:441
+TCATAACTATGAAGAGACTATTGCCAGATGAACCA
++
+<<3<<<<<<<<<<<<<<<<<<<+<<17;<;:<995
+@EAS112_32:7:168:117:441
+TCTTCTTAGGGAAGAACAGCTTAGGTATCAATTTG
++
+;;;;3;<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS112_32:7:272:328:400
+CAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAA
++
+<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<;:7
+@EAS112_32:7:272:328:400
+CTAAATACATATGCACCTAACACAAGACTACCCAG
++
+4;<<<<<7<;<<<-<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS112_32:7:322:391:742
+ATCAATATTAACTTTGAATAAAAAGGGATTAAATT
++
+<63<<<<9<<<:<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS112_32:7:322:391:742
+CATCACTAAACCAGTCCTATAAGAAATGCTCAAAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;;
+@EAS112_32:7:42:804:114
+ATACTTTACTGCTACTCAATATATCCATGTAACAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<:<;;<;;
+@EAS112_32:7:42:804:114
+TCAAATATTGCTAGTGGGAGTATAAATTGTTTTCC
++
+;9<<;<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS112_32:8:88:90:59
+ATAATACCTCTACATGTCTGATTATGAAAACAATG
++
+<<<<<<<4;7;<<<;;47;&9..1;6&4<755;1;
+@EAS112_32:8:88:90:59
+TGCACCTCCCTGTTCACCTAGATGCTAGGAGGACA
++
+=7595=92=72.=+5(:4=9092((.2&(&%07%.
+@EAS112_32:8:89:254:332
+AAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACATCT
++
+<<<<<<:<;<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS112_32:8:89:254:332
+GAATTAACCCAGTCAGACAAAAATAAAGAAAAAAG
++
+==================;=========;=7;;<;
+@EAS112_34:4:12:273:89
+AGTCTTTCCTGACAAGCAAATGCTAAGATAATTCA
++
+<:737<288<<<7<<<<<<<<<:9<<<<<<<<<<<
+@EAS112_34:4:12:273:89
+CCATCAGAATAACAATGGGCTTCTCAGCGGAAACC
++
+==========<====:=========+===4414;;
+@EAS112_34:4:17:989:186
+TTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACATCTAAATGAAA
++
+87;38$<3=/<==============9=========
+@EAS112_34:4:17:989:186
+TTATGAATTAACCCAGTCAGACAAAAATAAAGAAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<;<7;::::
+@EAS112_34:4:22:206:150
+AAAAAAGAGCAACTAGGTAAAAAATTAACATTACA
++
+8&)<)<<<<+<<+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS112_34:4:22:206:150
+GAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGC
++
+==========================::=5&;<2<
+@EAS112_34:4:74:570:695
+CACACTGGTTCTCTTGAAAGCTTGGGCTGTAATGA
++
+=========================7====;8<8;
+@EAS112_34:4:74:570:695
+TTGGGAGATTTTTAATGATTCCTCAATGTTAAAAT
++
+.;:8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS112_34:4:92:412:435
+AGATTCATAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAGG
++
+<;<52:=,====:=========<============
+@EAS112_34:4:92:412:435
+CTACGCAAACAGAAACCAANTGAGAGAAGGAGTAG
++
+<<<<<<<4<<<<<<<<<66!<<<<<<6<<77<<97
+@EAS112_34:6:127:153:861
+CTCAGGGAGCCGTCCGTGTCCTCCCATCTGGCCTC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<=<*<<<24;;::
+@EAS112_34:6:127:153:861
+TTTTCTGTTTCTTTGTTTGATTTGGTGGAAGACAT
++
+:;:6;9<<1;<<95<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS112_34:6:130:865:838
+AAAGCATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCATCA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;:<;3
+@EAS112_34:6:130:865:838
+AATGCTAAGATAATTCATCATCACTAAACCAGTCC
++
+;<:84<<<4<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS112_34:6:145:144:263
+TTTCGTTTTTTTTTTTTTTTTTTCCCCTTTCTTTT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<+4+4&+&(&&*2&8&&&)&
+@EAS112_34:6:43:47:279
+AAAACTATGCTAAGTATTGGTAAAGATGTGGGGAA
++
+<:<<79<<<19<<<1<<9<<+<<<<<3<3<<<<<<
+@EAS112_34:6:43:47:279
+TAGACCTAAGAGGGATGAGAAGTTACCTAATTGGT
++
+<<<<<<<<<<<<<;:<-<<<<<<<<<<<<:;;+7;
+@EAS112_34:6:71:85:629
+CCTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGA
++
+<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<5<9<<+6
+@EAS112_34:6:71:85:629
+TTGACACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAAAACAG
++
+,,1<1<7&%<9+:<<9<<9<<<<<<<<5<<<<<<<
+@EAS112_34:6:75:615:555
+AAGTTTGGAAAAACTATTTGAGGAAGTAATTGGGG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;<<<29<;.484
+@EAS112_34:6:75:615:555
+TGAAGGAAAAAAATTCTAAAATCAGCAAGAGAAAA
++
+;<<<;<<<<<<<<<:;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS112_34:7:118:523:591
+GAGGGACGCTGAAGAACTTTGATGCCCTCTTCTTC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<;;<;
+@EAS112_34:7:118:523:591
+GGTCTGACAGGCTGCAACTGTGAGCCATCACAATG
++
+4:--&0:67<<8:<<<<<<<<<<<:4<<<<<<<<<
+@EAS112_34:7:141:80:875
+AGCCGAGTCACGGGGTTGCCAGCACAGGGGCTTAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<8;<<8+7;-7
+@EAS112_34:7:141:80:875
+AGCTGTGTTTAGTGCCTTTGTTCAACCCCCTTGCA
++
+6/<;84<;<;<<<<<<5<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS112_34:7:142:457:584
+GGAAGAACAGCTTAGGTATCAATTTGGTGTTCTGT
++
+8::<:<<9<<.<:<<<<<<<<<<<7<<<<<<<<<<
+@EAS112_34:7:142:457:584
+TGAAGAGACTATTTCCAGATGAACCACACATTAAT
++
+<<<<<<<<<<<<</<<,6<66<<<;<;;<*4744.
+@EAS112_34:7:71:62:254
+AAAAAAGTAAACTCTCAAATATTGCTAGTGGGAGT
++
+<<<<<<;8<<<<;<:<<<<<<<;<<;<<<<<<<<<
+@EAS112_34:7:71:62:254
+GGTTACACTAAAAGCCCATACTTTCCTGCTACTCA
++
+<<<<<<7<<<<7<<<<<3<<<<<<&<<.<<::<:%
+@EAS112_34:7:86:498:373
+CACTAATGCGCTCCACGCCCAAGCCCTTCTCACAG
++
+):)4:<5<<<<;89<<<969<<<:<<<<<<<<<<<
+@EAS112_34:7:86:498:373
+GATACCATCCCTGTCTTACTTCCAGCTCACCAGAG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<5:<<<:<;7+67
+@EAS112_34:7:96:489:453
+AAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGCTAAGAT
++
+;<;;;<<<<5:<<:<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS112_34:7:96:489:453
+AGAAAAGCATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;;;:
+@EAS112_34:8:103:812:255
+ATGTTAAAATGTCTATTTTTGTCTTGACACCCAAC
++
+7:777:7<<::7<7<7<<:7<7<:<<<<<<<<<7<
+@EAS112_34:8:103:812:255
+TGATGCCCCTTGGCCATCACCCAGTCCCTGCCCCC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<9<<;<<<39;;<;32:7;7+
+@EAS112_34:8:174:557:872
+GGTAAAGATGTGGGGAAAAAAGTAAACTCTCAAAT
++
+.77<:<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS112_34:8:174:557:872
+TGGTACAATGTACAATATTCTGATGATGGTTACAC
++
+<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<7<<;<<6:<<2117
+@EAS112_34:8:179:13:782
+GACAGTCTACAACTGTGAGCCATCACAATGAACAA
++
+&37.3&;3'*<3<;9<9<<5<<<<<<<<<9<<<<<
+@EAS112_34:8:179:13:782
+TGATGCCCTCTTCTTCCAAAGATGAAACGCGTAAC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<:7<<<<::<7<:-:1
+@EAS112_34:8:30:816:90
+ACTACCCTGCAATTAATATAATTGTGTCCATGTAC
++
+:<3:%9299<<<<<<<<<5<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS112_34:8:30:816:90
+AGGGAGGTGCACTAATGCGCTCCACGCCCCAGCCC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<::1&(1::7
+@EAS112_34:8:45:800:733
+ACATGAAGGAAAAAAATTCTAAAATCAGCAAGAGA
++
+<<<</<<<<<<<<<<<<<<<2<9<<<<<5*5;599
+@EAS112_34:8:45:800:733
+ATAAATGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTG
++
+<7<<7&<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS112_34:8:4:841:339
+ACCTCATACACACACATGGTTTAGGGGTATAATAC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<;<7<<&;;<5<+<;7<<;
+@EAS112_34:8:4:841:339
+CTTCAGACCCTACACGAATGCGTCTCTACCACAGG
++
+77-):22<<<33;<5<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_26:1:113:367:659
+AGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACATGAAGGAAA
++
+<<5<0&9;<3<<<<<9<<<<4<;<9<9<<<<7<3<
+@EAS114_26:1:113:367:659
+CACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGCGAGAA
++
+=9====8==========:=:=====9=:=&====5
+@EAS114_26:1:155:807:19
+AAAAGGGATTAAATTCCCCCACTTAAGAGATATAG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<9+<<<<<<9<<9;4<<<<:
+@EAS114_26:1:155:807:19
+CAACAGTAAAATAAAACAAAGGAGGTCATCATACA
++
+:==4=5:====:============:==========
+@EAS114_26:1:171:527:247
+AACAAATGCTACTAGACCTAAGAGGGATGAGAAAT
++
+<547*9)&&7+;+<<7<<<;<<<;3<<<<<<<<<<
+@EAS114_26:1:171:527:247
+AGAAGGAGTAGCTAGACTTATATCAGATAAAGCAC
++
+=4==4===8==99=&=8+9=19+.2.6'=99+999
+@EAS114_26:1:324:238:736
+AGACAGACTTCATCAAGATATGTAGTCATCAGACT
++
+<<<9<<<70,<<4<<<<<7<4<7<<<<<0<<<<<7
+@EAS114_26:1:324:238:736
+TCAAGAAGTATGAGATTATGTAAAGTAACTGAACC
++
+===================================
+@EAS114_26:1:35:522:294
+GGTTCAGAACTTGAAGACAAGTCTCTTATGAATTA
++
+===============================:=:=
+@EAS114_26:1:35:522:294
+TTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_26:1:99:212:522
+ACGAATGCGTCTCTACCACAGGGGGCTGCGCGGTT
++
+================8==;====;=;===1==:8
+@EAS114_26:1:99:212:522
+AGAGACTATTGCCAGATGAACCACACATTAATACT
++
+<1<16<7<3<<;;<8<<<<<<<<<<<<;<<<<9<<
+@EAS114_26:2:130:609:467
+AAATTCCCCCACTTAAGAGATATAGATTGGCAGAA
++
+===:2===;<====>==>=>=>=>>>==>>>=>>>
+@EAS114_26:2:130:609:467
+CAATACTCACCATCATAAATACACACAAAAGTACA
++
+==8=====;==8==;=4=;;8=====;6=177.==
+@EAS114_26:2:214:950:32
+ACAAGAAACTCATTAATAAAGACATGAGTTCAGGT
++
+>>=>>>>==>=>>>==>=>=:=====;=:=6:::6
+@EAS114_26:2:214:950:32
+AGAAGATATAACCATCCTACTAAATACATATGCAC
++
+=&==4======:;==6<==:===============
+@EAS114_26:2:237:497:165
+GAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGC
++
+9=:=======2=27======<>&<=,==4>4=>>=
+@EAS114_26:2:237:497:165
+TACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCATCAGAATAA
++
+8===<8===========37=<===7=;7=8=====
+@EAS114_26:2:315:219:7
+GAAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACATTG
++
+7==::<2=8<<<=====>888<=2=>==>,>,>>8
+@EAS114_26:2:329:458:365
+GTGTTCTGTGTAAAGTCTCAGGGAGCCGTCCGTGT
++
+==========================9========
+@EAS114_26:2:329:458:365
+TTGTTGTTGGTTTTCTGTTTCTTTGTTTGATTTGG
++
+====:==9========>==7>==9>=7=>=>>=>>
+@EAS114_26:2:73:513:102
+GTCTCATCTAGGGGAACAGGGAGGTGCACTAATGC
++
+==::===8=>=====>=>=>>>=>>==>=>>>>>>
+@EAS114_26:2:73:513:102
+TGAAAACAATGTTCCCCAGATACCATCCCTGTCTT
++
+===========================;=======
+@EAS114_26:3:117:284:589
+ACAAAATATAGTTGAAAGCTCTAACAATAGACTAA
++
+==================================0
+@EAS114_26:3:117:284:589
+GAACCTATGAGTCACAGGTATTCCTGAGGAAAAAG
++
+==8==;==================;==========
+@EAS114_26:3:284:261:124
+ACAGCTGTGTTTAGTGCCTTTGTTCAACCCCCTTG
++
+===27===.====&===========;;========
+@EAS114_26:3:287:665:495
+GAATTGTAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAATACTCA
++
+===,9=;;====7=====5===;==1=========
+@EAS114_26:3:287:665:495
+TGGATCTAATTTTTGGACTTCTTAAAGAAAAAAAA
++
+==========================98====8=8
+@EAS114_26:4:100:238:596
+ATGAGAAATTACCTAATTGGTACAATGTACAATAT
++
+======9=====;=======5===;====/=;===
+@EAS114_26:4:100:238:596
+CAAAAACTATTCTAAGTATTGGTAAAGATGTGGGG
++
+4<<<<;<3<3&<3<1<5<31<<3<<<<<<2<<;<,
+@EAS114_26:4:110:840:431
+CTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCTAAACTAA
++
+77<;7<<<<<<<<<4<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_26:4:110:840:431
+GTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACATGAAGGA
++
+=====================5:======54=+3+
+@EAS114_26:4:123:1001:580
+AGGTTTTATAAAACAATTAATTGAGACTACAGAGC
++
+<.00..3<6<<<<<<<3;<<08<<<<<6<<<<<<<
+@EAS114_26:4:123:1001:580
+GGGAANTAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAAT
++
+=====!=====================1.8131*=
+@EAS114_26:4:253:285:104
+CTCTCATTCACTCCAGCTCCCTGTCACCCAATGGA
++
+======================:========7==;
+@EAS114_26:4:253:285:104
+GTGATGTGTGTTCTCATCAACCTCATACACACACA
++
+2<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_26:4:306:388:342
+CCGTCCGTGTCCTCCCATCTGGCCTCGTCCACACT
++
+================5====:=====;==1=4==
+@EAS114_26:4:306:388:342
+GGGGAAGACATAATCCCACGCTTCCTATGGAAAGG
++
+9/<9;<<<;<;<<7<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_26:4:40:352:151
+ATTACGTCCTATCTTCTTCTTAGGGAAGAACAGCT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<;<<9<<<<:<<<<;<99<3<
+@EAS114_26:4:40:352:151
+TTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTT
++
+;=;;5=:-=9=====;;==================
+@EAS114_26:5:139:331:63
+GACACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAAAACAGTC
++
+7===================:=:============
+@EAS114_26:5:139:331:63
+TTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTT
++
+====================<<=============
+@EAS114_26:5:228:189:826
+AAGCCCTTCTCACAGTTTCTGCCCCCCGCATGGTT
++
+;9=========;=1======9=====1;=<3=:6;
+@EAS114_26:5:228:189:826
+ATCATGACTCTATCCCAAATTCCCAATTACGTCCT
++
+:74=:.==1==========================
+@EAS114_26:5:238:31:968
+ACACCATCCCTGTCTTACTTCCAGCTCCCCAGAGG
++
+=(.7=5%===9:7==+==77===============
+@EAS114_26:5:238:31:968
+ATTCTGCAGCCCAGCTCCAGATTGCTTGTGGTCTG
++
+9======8====*=====,=1=======<=7:::,
+@EAS114_26:5:43:114:617
+AATCATAAATACACACAAAAGTACAAAACTCACAG
++
++=22=6=================9===========
+@EAS114_26:5:43:114:617
+AATGTTATGCCCTGCTAAACTAAGCATCATAAATG
++
+=============;=========;===========
+@EAS114_26:6:129:694:359
+CCCTGAGAGATTCTGCAGCCCAGATCCAGATTGCT
++
+7777<7<7;77+<3<<;<<;<<<<;<<<<<<<<<<
+@EAS114_26:6:129:694:359
+TGTCAGTTACCAAATGTGTTTATTACCCGAGGGAT
++
+============+7=======:==;;;'=;==7;=
+@EAS114_26:6:140:253:322
+AATTTTTGGACTTCTTAAAGAAAAAAAAACCTGTC
++
+<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<;;;<<;
+@EAS114_26:6:140:253:322
+GAAATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAA
++
+=;===;54:====================>>===>
+@EAS114_26:6:183:697:555
+AAAGAATGCCAGGAAGATACATTGCCAGACAGACT
++
+=====================:===&==:;==5;;
+@EAS114_26:6:183:697:555
+AGAAATCTTAGAAGCCAGAAGAGATTGGATCTAAT
++
+<<<;&,.;);&96<84<<81<<&<<<9<<8<8<<1
+@EAS114_26:6:46:13:880
+AAAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACATC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<7<3<<<9<+;;<9
+@EAS114_26:6:46:13:880
+AGAAAAGCATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCA
++
+=&====8==========0=================
+@EAS114_26:7:13:172:720
+AATTCATTTAAGAAATTACAAAATATAGTTGAAAG
++
+============:3<==:====<=9=3===;==83
+@EAS114_26:7:157:876:302
+AAAGACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGA
++
+===:=8=;==:892=,28==88==28====8=;;8
+@EAS114_26:7:157:876:302
+CAACTAGGTAAAAAATTAACATTACAACACGAACA
++
+2<<;<<<22<<<<<<77<<<<22<7<<<<%-<<1<
+@EAS114_26:7:218:858:445
+AAAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAACTATTT
++
+;===5=;=======;==3======9;,79==;===
+@EAS114_26:7:218:858:445
+GAAAAAAATTCTAAAATCAGCAAGAGAAAAGCATA
++
+;<<<<<<<8;:<<<<<<;<<:<<<<<<<<<<<<;<
+@EAS114_26:7:245:323:744
+ACCTCTACATGGCTGATTATGAAAACAATGTTCCC
++
+/.848299;&;9;9;=2.=7========;;=====
+@EAS114_26:7:245:323:744
+GATTCTGGGAAATTCTTCATCCTGGACCCTGAGAG
++
+<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<+<<<<<<<4<
+@EAS114_26:7:37:79:581
+TTAAAATTTAAAAAAAGTAAATAAAACACATAGCT
++
+<>4<>>>>;>>&>->9>9;4>->>>>,4>9>,<1>
+@EAS114_26:7:37:79:581
+TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCATGCCAGAAAA
++
+3,,,===6===<===<;=====-============
+@EAS114_26:7:86:308:648
+GAAGAACAGCTTAGGTATCAATTTGGTGTTCTGTG
++
+<7<<<;<<<<+;<<<2<5<<<77;<<2<;;<<<<<
+@EAS114_26:7:86:308:648
+TATTAGGAAATGCTTTACTGTCATAACTATGAAGA
++
+=8=====;=8======;=======35==;=;.;25
+@EAS114_28:1:144:242:602
+ATCAGCAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTATAAAGG
++
+========================;=====<;;<<;
+@EAS114_28:1:144:242:602
+ATGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_28:1:168:389:889
+GAAATTACAAAATATAGTTGAAAGCTCTAACAATAG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<;9;;<<<<
+@EAS114_28:1:168:389:889
+TAACTGAACCTATGAGTCACAGGTATTCCTGAGGAA
++
+;<<;;56;==================8========8
+@EAS114_28:1:168:609:646
+GGAAAAAAGTAAACTCTCAAATATTGCTAGTGGGAG
++
+;;<<<<=======;;:;======;==<=========
+@EAS114_28:1:168:609:646
+GGTTACACTAAAAGCCCATACTTTACTGCTACTCAA
++
+<<<<<<<<<<<;<<<<<:<8<<<<;<<<<<4<<<9<
+@EAS114_28:1:220:801:282
+AACCTCATATATCAATATTAACTTTGAATAAAAAGG
++
+;7;87;===;==;====:===<==7===========
+@EAS114_28:1:220:801:282
+AATTCATCATCACTAAACCAGTCCTATAAGAAATGC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<+<;<<<<<::<<:
+@EAS114_28:1:232:351:909
+ACATGGCTGATTATGAAATCAATGTTCCCCAGATGC
++
+<<<<<99<<<<<<99<7<'<9<<<6<<+<;7;<<&;
+@EAS114_28:1:232:351:909
+CCATCATGAAGCGCTGAACTTCCACGTCTCATCTAG
++
+:8%3<8====130=8==+===;=3=8===48==;3*
+@EAS114_28:1:28:708:463
+CCCAATGGACCTGTGATATCTGGATTCTGGGAAATT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<9;<:<<
+@EAS114_28:1:28:708:463
+GTATAATACCTCTACATGGCTGATTATGAAAACAAT
++
+;;<;<<====3=====5===================
+@EAS114_28:2:114:938:216
+CTAACAATAGACTAAACCAAGCAGAAGAAAGAGGTT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<4;
+@EAS114_28:2:114:938:216
+GAGTCACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGA
++
+<<<<7<6<<<<<<<6<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_28:2:141:7:963
+CACTTTAAATCAACAACAGTAAAATAAAACAAAGGA
++
+<<<<<<<<<<<<;<:<<<<<<1<<&<;<;<<;,<;5
+@EAS114_28:2:141:7:963
+TACAATGTACAATATTCTGATGATGGTTACACTAAA
++
+95+<<9<<5<;;<<;<<;'<<<<<;<<<7<9<<<<<
+@EAS114_28:2:149:650:44
+CGCTCCACGCCCAAGCCCTTCTCACAGTTTCTGCCC
++
+;8<<</<<:<<595<<9<<<<<<<<<<<<<<3<9<<
+@EAS114_28:2:149:650:44
+CTGTCTTACTTCCAGCTCCCCAGAGGGAAAGCTTTC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;6<<;<<7<<<
+@EAS114_28:2:167:905:852
+AGAAAAGCATACAGTCATCTATAAAGAAAATCCCAT
++
+<<<7<<<<<<<<<<<<<<:<:<<:::&.<:<66:3<
+@EAS114_28:2:167:905:852
+CAAATGCTAAGATAATTCATCATCACTAAACCAGTC
++
++<<<9;7;<<+<<<<<39<;9<;9<<7<<<<<<<<<
+@EAS114_28:2:251:819:772
+TCCCCCACTTAAGAGATATAGATTGGCAGAACAGAT
++
+6+7++1<<%<<<<<<<+<+<9<<99<9<<<<<<9<<
+@EAS114_28:2:251:819:772
+TTCAATACTCACCATCATAAATACACACAAAAGTAC
++
+<3<<<9<9<3<</<<<<<<59<3<9<<</9/++*/'
+@EAS114_28:2:28:474:566
+ACTGAACTTCCACGTCTCATCTAGGGGAACAGGGAG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<;<;;<<7;8;<
+@EAS114_28:2:28:474:566
+TGAACCACACATTAATACTATGTTTCTTATCTGCAC
++
+;<<<+<<<<5<<<<<<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_28:2:329:437:643
+AAGATACATTGCAAGACAGACTTCATCAAGATATGT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;<<<<1
+@EAS114_28:2:329:437:643
+TTTTGGACTTCTTAAAGAAAAAAAAACCTGTCAAAC
++
+885<8;;<;3,8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_28:2:55:562:403
+CAACAGGAACAAAACCTCATATATCAATATTAACTT
++
++<<&<<<<<<<<<<+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_28:2:55:562:403
+CAAGCAAATGCTAAGATAATTCATCATCACTAAACC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;<<<<<<<;<;:
+@EAS114_28:3:110:984:98
+AAGGAGGTCATCATACAATGATAAAAAGATCAATTC
++
+98<<<<<<2<<<<<<;;<;;<<<5;5;<<;;<<<<+
+@EAS114_28:3:110:984:98
+ACTAAAACCCCATACTTTACTGCTACTCAATATATC
++
+:81<<<<+;;8<+<8<<<<<;<<<8;<<<<<<<<8;
+@EAS114_28:3:173:627:465
+GTAAACTCTCAAATATTGCTAGTGGGAGTATAAATT
++
+:<<<<;<;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_28:3:173:627:465
+TGATGGTTACACTAAAAGCCCATACTTTACTGCTAC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<2;;4;;7
+@EAS114_28:3:176:402:458
+AAATAGCTAAAACTAAAAAAGCAAAAACAAAAACTA
++
+</<+<4&;<<<<7<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_28:3:176:402:458
+CCTAAGAGGGATGAGAAATTACCTAATTGGTACAAT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<;;<;
+@EAS114_28:3:202:275:776
+CAAATACTACTAGACCTAAGAGGGATGAGAAATTAC
++
+;<<<<;;<<<<<<<;<<<<<<<;<<<<<<<<<<;<<
+@EAS114_28:3:202:275:776
+TCTACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGGAGTAG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<9<;;<<<;<;<;
+@EAS114_28:3:250:628:423
+CAATGGGCTTCTCAGCGGAAACCTTACAAGCCAGAA
++
++<<4;;9;;7.;7<;7<;<<<;;<<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_28:3:250:628:423
+CTCTTTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACATCTAAATG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<:;<<<<:<<<<;;;;;;4
+@EAS114_28:3:279:763:945
+CTGCACATTACTACCCTGCAATTAATATAATTGTGT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<4:<<47<:<;<<</<9<
+@EAS114_28:3:279:763:945
+GCCGTCCGTGTCCTCCCATCTGGCCTCGTCCACACT
++
++9:-+<:1-44<<':<;<+<-<<<;:<<;;<<<<<0
+@EAS114_28:3:308:509:948
+AATATATCCATGTAACAAATCTGCGCTTGTACTTCT
++
+;;+;;;.8<<;;;<<<<<<<<<<<<<8<<<<<;<<<
+@EAS114_28:3:308:509:948
+AATTCAGCAAGAAGATATAACCATCCTACTAAATAC
++
+<9<<<<<<<;<7<<;<<<<<<<;<<<<7<<;2;<<<
+@EAS114_28:3:32:492:907
+CAAACACGAATGTTATGCCCTGCTAAACTAAGCATC
++
+8<;<4<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_28:3:32:492:907
+TGTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACATGAAGGA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;;<<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_28:3:78:773:660
+ATTCTGCAGCCCAGCTCCAGATTGCTTGTGGTCTGA
++
+<<<<<<<<;<<<<<<<<<8<8<<;<<<;<<;7<<4:
+@EAS114_28:3:78:773:660
+CCCCAGATACCATCCCTGTCTTACTTCCAGCTCCCC
++
+7<;7<<<7;9<<8;<<<<<<;<<<<<<<<<<7<<<<
+@EAS114_28:4:13:701:55
+AAACCAAATGAGAGAAGGAGTAGCTATACTTATATC
++
+<<<<<<<<<9<<<9<<<<<<6<<<<<<<6<<6<<6+
+@EAS114_28:4:13:701:55
+TTCATAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAGGGATG
++
+0:+<7<;9<;<<<<<<<3<<<<<;;<<<:<<3<<<<
+@EAS114_28:4:149:572:877
+ATGTAAAGTAACTGAACCTATGAGTCACAGGTATTC
++
+=>7><>;>+>>/;>>=>=>=:>><>=<<==;)<=8;
+@EAS114_28:4:149:572:877
+GAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACATTGCAAGA
++
+6<94693<;<<<<;;<<<<<<<<<<;9<<<<<<<<<
+@EAS114_28:4:215:246:640
+AAAAGCATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCATCA
++
+<<<<<<<<<<9<;<<<<<<<<<<9;<<<<<<3;<;3
+@EAS114_28:4:215:246:640
+AAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGCTAAGAT
++
+;<<,<<<96<<:<:<9<6<97<<<<<9<<<<9<<9<
+@EAS114_28:4:305:707:258
+AAAAAGATGTTCTACGCAAGCAGAAACCAAATGAGA
++
+3<<7<,;<<<<0<66<6+<%<<<.<<<<<<<<<9<<
+@EAS114_28:4:305:707:258
+GAACAAAACCTCATATATCAATATTAACTTTGAATA
++
+9<<<<<<<<<<<<;<<-<<;;<;<<9<<;<<+99;7
+@EAS114_28:4:322:631:245
+CCCTGCCCCATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTGC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<0<<<<<<<<<<<<<<<<5;
+@EAS114_28:4:322:631:245
+TATTTTTGTCTTGACACCCAACTAATATTTGTCTGA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_28:4:9:55:730
+ATCCCTGTCTTACTTCCAGCTCCCCAGAGGGAAAGC
++
+<:<;;<6<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_28:4:9:55:730
+CAGCCCAGCTCCAGATTGCTTGTGGTCTGACAGGCT
++
+>>=>>+==>>==<==<=8=><:;8/;7</5724-2;
+@EAS114_28:5:104:350:749
+AAATATAGAAATTGAAACAGCTGTGTTTAGTGCCTT
++
+<<8<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<0;<<<9;<85;;;
+@EAS114_28:5:104:350:749
+TGCCCTCTTCTTCCAAAGATGAAACGCGTAACTGCG
++
+;<93;9;<3;<<<;<<<<<;<<<<<<;<<<<<<<<<
+@EAS114_28:5:11:868:62
+TCTTAGGGAAGAACAGCTTAGGTATCAATTTGGTGT
++
+;;77;;7<<<<<<<<7<<<;<7<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_28:5:11:868:62
+TTTACTGTCATAACTATGAAGAGACTATTGCCAGAT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<;<<<<(7:7039
+@EAS114_28:5:163:832:715
+TAAAAACATGAACTAACTATATGCTGTTTACAAGAA
++
+<<0;<9<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<;;;<6
+@EAS114_28:5:163:832:715
+TAAAACAAAGGAGGTCATCATACAATGATAAAAAGA
++
+;<<<<9<<<<<<<<;;<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_28:5:206:671:49
+ACCATCCCTGTCTTACTTCCAGCTCCCCAGAGGGAA
++
+;<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_28:5:206:671:49
+GCTTGTGGTCTGACAGGCTGCAACTGTGAGCCATCA
++
+<<<<<<;<<<<8<<<;;<<<3<<8<8<35+,55;,3
+@EAS114_28:5:209:778:588
+AACAGTCTAGATGAGAGAGAACTTCCCTGGAGGTCT
++
+;8;98;;;<3<<<<<<<<<;<<;<<<<<;<<<<<<<
+@EAS114_28:5:209:778:588
+TTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTT
++
+<<<<<<<<;<<<<<<<<<;<<<;<8<8<<<<;7;;;
+@EAS114_28:5:23:944:377
+AATGTTATGCCCTGCTAAACTAAGCATCATAAATGA
++
+<<<<<<<<9<<<<;<<<<<<<<<;<7<<<<;8;<<;
+@EAS114_28:5:23:944:377
+AGTACAAAACTCACAGGTTTTATAAAACAATTAATT
++
+<;7;8<<<<:<;<:<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<;
+@EAS114_28:6:11:151:750
+GTTTTTATTTTTTTCCTCTCTCTTTTTTTTTTTTTT
++
+:'1:%4;4<<<+;6;&9+6;/<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_28:6:155:68:326
+CCCATTTGGAGCCCCTCTAAGCCGTTCTATTTGTAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<
+@EAS114_28:6:155:68:326
+GTCAGGGAAGGAGCATTTTGTCAGTTACCAAATGTG
++
+;<<<:6<<<<<<6<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_28:6:175:705:982
+CATGGTTTAGGGGTATAATACCTCTACATGGCTGAT
++
+')'''''')'''''*')*)'*)')))+,'*)+'*,!
+@EAS114_28:6:175:705:982
+CTGGATTCTGGGAAATTCTTCATCCTGGACCCTGAG
++
+<<<<;<<;<<<<<<<<<<<<<;<<+<:;39;+<40<
+@EAS114_28:6:185:87:475
+AAGAAACTCATTAATAAAGACATGAGTTCAGGTAAA
++
+<<4<<<+<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_28:6:185:87:475
+ATTGAGACTACAGAGCAACTAGGTAAAAAATTAACA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<6;
+@EAS114_28:6:187:996:432
+TGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAAAGTTC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;<<;
+@EAS114_28:6:187:996:432
+TTGAATAAAAAGGGATTAAATTCCCCCACTTAAGAG
++
+;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_28:6:51:506:878
+TAATCTCTCTCCTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<4<<<<<<<<<<0<<<<<:;
+@EAS114_28:6:51:506:878
+TTTGTCTGAGCAAAACAGTCTAGATGAGAGAGAACT
++
+<970;49;<;+<<<:<<<;;<<<<<<<<<<<<<<<;
+@EAS114_28:6:54:263:585
+TGAAAGCTTGGGCTGTAATGATGCCCCTTGGCCATC
++
+1:::6<<<<;;;<4<<<<<<<<6<<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_28:6:54:263:585
+TGTCCATGTACACACGCTGTCCTATGTACTTATCAT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:;<<;<:;::<<;;:;4
+@EAS114_28:7:133:514:754
+AGCTATACTTATATCAGATAAAGCACACTTTAAATC
++
+;;4;<;<;<<<<<<<<;<<<<<<;<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_28:7:133:514:754
+TAAATTTGAATAAAAAGGGATTAAATTCCCCCACTT
++
+***&,,,+(*,*********+*)*(***(**((*)(
+@EAS114_28:7:157:786:424
+GCTTTACTGTCATAACTATGAAGAGACTATTGCCAG
++
+<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<;<<;<<;<<<<+4:70
+@EAS114_28:7:157:786:424
+TTAGGTATCAATTTGGTGTTCTGTGTAAAGTCTCAG
++
+;<;2;;<<<;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_28:7:178:276:693
+GTTCAGAACTTGAAGACAAGTCTCTTATGAATTAAC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;
+@EAS114_28:7:178:276:693
+TTGGAAAAACTATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAAC
++
+:;<;<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_28:7:215:863:521
+ACTCACCATCATAAATACACACAAAAGTACAAAACT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<;
+@EAS114_28:7:215:863:521
+TAAGAGATATAGATTGGCAGAACAGATTTAAAAACA
++
+;<<<<<<<<<<<<<;<<;<;<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_28:7:242:354:637
+AACTATATTTATGCTATTCAGTTCTAAATATAGAAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<6<;;
+@EAS114_28:7:242:354:637
+CCCTCTTCTTCCAAAGATGAAACGCGTAACTGCGCT
++
+8<;;;;;<<<8;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_28:7:287:492:169
+CGCTCTCATTCACTCCAGCTCCCTGTCACCCAATGG
++
+;/;6<<<<4(<(<<<<6<<<<<<<<<<;<<<<<<<<
+@EAS114_28:7:287:492:169
+GTGTTTAGTGCCTTTGTTCAACCCCCTTGCAACAAC
++
+<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8;;<;6<<;
+@EAS114_28:7:57:324:546
+GTCATCTATAAAGGAAATCCCATCAGAATAACAATG
++
+;;5<;,<<<;;<<<<<<<97<<<<<<<<<<9<<<<<
+@EAS114_28:7:57:324:546
+TAATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGATT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<8:8<<;::;;;
+@EAS114_30:1:134:379:893
+AGTTTCTGCCCCCAGCATGGTTGTACTGGGCAATA
++
+<<<<<<<<<<<<<5<<<<;<<<<<;<:5;<<4+<<
+@EAS114_30:1:134:379:893
+CGCTGTCCTATGTACTTATCATGACTCTATCCCAA
++
+7137::;<<<<<<<;<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<
+@EAS114_30:1:154:818:165
+GAACAGGGAGGTGCACTAATGCGCTCCACGCCCAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<:7;:;
+@EAS114_30:1:154:818:165
+TTCTTATCTGCACATTACTACCCTGCAATTAATAT
++
+;;;;<<<;<;;<;<<<<;<<;;;<<;<<<<<<<<<
+@EAS114_30:1:176:168:513
+ATTTGTAATGAAAACTATATTTATGCTATTCAGTT
++
+<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:&<<<<:;0;;
+@EAS114_30:1:176:168:513
+TTTGATGCCCTCTTCTTCCAAAGATGAAACGCGTA
++
+;0;;;7:<<<<<<<;<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_30:1:188:863:790
+CATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTC
++
+;<7<<<55<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_30:1:188:863:790
+TTAATTGAGACTACAGAGCAACTAGGTAAAAAATT
++
+++<;<<;;;:<<<<:<:<<:1<<1<<<6:6;4;;4
+@EAS114_30:1:243:10:911
+TATTCAGTTCTAAATATAGAAATTGAAACAGCTGT
++
+;<;;;<4;9:<<<;<<;<<<<<;;<<<<<<<<<<<
+@EAS114_30:1:64:526:339
+ACATTACAACAGGAACAAAACCTCATATATCAATA
++
+<<<<<<<<;<<<<<<<<<<7<:<<<<<<<<<8:<:
+@EAS114_30:1:64:526:339
+CAAATGAGAGAAGGAGTATCTATACTTATATCAGA
++
+3<<<7<<;<<<<<<<<<<<;<<<<;<<<<<<<<<<
+@EAS114_30:2:111:142:21
+ATCAGAATAACAATGGGCTTCACAGCGGAAACCTT
++
+;88<:<;;<6<;;<<<:<<<<;<<<<<<<<;<<<<
+@EAS114_30:2:111:142:21
+CTTGCTAGAGATTTAGACATCTAAATGAAAGAGGC
++
+<<<<<<<<:<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;9
+@EAS114_30:2:226:885:729
+AAAAGGGATTAAATTCCCCCACTTAAGAGATATAG
++
+<<<;<<<<<<;<;<<<<<<<:;<<;4;%;<<;<<.
+@EAS114_30:2:226:885:729
+GCTGAACTTACATCAGATAAAGCACACTTTAAATC
++
+/*220%.(;<%<3.<<<4<<<<86;<8<<8<<<<<
+@EAS114_30:2:272:750:698
+GTGTTTATTACCAGAGGGATGGAGGGATGACGGAC
++
+<)<<<<<7;<<<4<;7<<<<78068:(%<3*861,
+@EAS114_30:2:272:750:698
+TGCAGCCCAGATCCAGATTGCTTGTGGTCTGACAG
++
+0<;8;64;<<<;<;.<+;:<4;4<;<<<<<<<<<<
+@EAS114_30:2:297:949:26
+ACCAGTCCTATAAGAAATGCTCAAAAGAATTGTAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;
+@EAS114_30:2:297:949:26
+CATATATCAATATTAACTTTGAATAAAAAGGGATT
++
+5<;<;<;:<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_30:2:303:428:326
+AAAATTAAAATTTAACAAAAGTAAATAAAACACAT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<;
+@EAS114_30:2:303:428:326
+TTTTTTTTTTTTTTTTTCTCTTTTTTTTTTTTTTT
++
+4<;<<;<;<4<<8;;;;.8+;<<;<8<;<;<<<<<
+@EAS114_30:2:30:887:404
+CAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGATGTG
++
+<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<:(<<<7;7
+@EAS114_30:2:30:887:404
+TTGCCTTCAGACCCTGCACGAATGCGTCTCTACCA
++
+<<<<5<;::<<<;<<.<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_30:2:315:412:921
+GTAAAGATGTGGGGAAAAAAGTAAACTCTCAAATA
++
+4-<79;<<<4:;:<<<<<<<<4<<<38<<;<<<<<
+@EAS114_30:2:315:412:921
+TTCTGATGATGGTTACACTACAAGCCCATACTGTA
++
+<;<;<<<<<<<;<<<<<<<<8<<<;<<:<<;;+<8
+@EAS114_30:2:82:963:128
+ATTAAAGTTCAATACTCACCATCATAAATACACAC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<;<<;
+@EAS114_30:2:82:963:128
+GGCAGAACAGATTTAAAAACATGAACTAACTATAT
++
+585<;<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_30:3:139:117:262
+AGGGGCTTAACCTCTGGTGACTGCCAGAGCTGCTG
++
+<<<<;<<<<<<<<<<<<<:<<<<<:<<8<<<<:<:
+@EAS114_30:3:139:117:262
+GTTCTCAAGGTTGTTGCAAGGGGGTCTATGTGAAC
++
+<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;<<<<<37;3
+@EAS114_30:3:14:697:541
+TAAAAGCAGCAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTAT
++
+8<<<<&6<;8<<<<<<<<<<<<;<<<<;<<<<<<8
+@EAS114_30:3:14:697:541
+TTGGAAAAACTATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<;;;;8;;<
+@EAS114_30:3:161:366:544
+CTTCTGTAATTGAAAAATTCATTTAAGAAATTACA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<
+@EAS114_30:3:181:582:435
+CAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGCTAAGATAATT
++
+<<<<<<<<;<<<<<;<<4<<<<<<;<<<<<<<<<<
+@EAS114_30:3:181:582:435
+GAAATCCCATCAGAATAACAATGGGCTTCTCAGCA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;::
+@EAS114_30:3:187:294:947
+ACAGGGGGCTGCGCGGTTTCCCATCATGAAGCACT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<&<<%:<)7;7::4
+@EAS114_30:3:187:294:947
+AGAGACTATTGCCAGATGAACCACACATTAATACT
++
+<<:<<8181;<8<<<<<<<<8<<<<<<<<<<<<<:
+@EAS114_30:3:215:840:760
+AAGTATTGGTAAAGATGTGGGGAAAAAAGTAAACT
++
+<<<8<::<;;<<<:<7<7<;;;<<<<<<<<<<;<<
+@EAS114_30:3:215:840:760
+CTGATGATGGTTACACTAAAAGCCCATACTTTCCT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<;<<<88<+<<:<;3585,+:
+@EAS114_30:3:24:195:604
+TCACAGTTTCTGCCCCCAGCATGGTTGTACTGTGC
++
+<;<<<<<<<<<89<<<<<868<8;6<8;3(38&<8
+@EAS114_30:3:24:195:604
+TGTCCTATGTACTTATCATGACTCTATCCCAAATT
++
+;6<02;<<<<59<<;<;<<<<9<3<<<<<<<<<;<
+@EAS114_30:3:302:288:657
+AGGTATCAATTTGGTGTTCTGTGTAAAGTCTCAGG
++
+<:5<<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_30:3:302:288:657
+CCAGATGAACCACACATTAATACTATGTTTCTTAT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<;<<
+@EAS114_30:3:35:361:546
+TGCACTAATGCGCTCCACGCCCAAGCCCTTCTCAC
++
+:4;4;;<<;4<8<;;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_30:3:35:361:546
+TTACTTCCAGCTCCCCAGAGGGAAAGCTTTCAACG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<;<5<<<<<;<2<<<:<8<4
+@EAS114_30:3:39:348:594
+AAGCATCATAAATGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTC
++
+<<;;<;:<;<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<
+@EAS114_30:3:39:348:594
+CTAAAATCAGCAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTA
++
+<<;<<<<<<<<<;<;;<<<<<<<<<<;<<<:<:<:
+@EAS114_30:4:183:852:253
+ACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGATGT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<;;<8
+@EAS114_30:4:183:852:253
+CCATTTCTTTTGGCATTTGCCTTCAGACCCTACAC
++
+;<9<;<<<<<<<<;<<<<<;<<<;<<<<;<<<<<<
+@EAS114_30:4:317:378:535
+AGCTTGGGCTGTAATGATGCCCCTTGGCCATCACC
++
+;7;':<77<<;<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_30:4:317:378:535
+GCTGTCCTATGTACTTATCATGACTCTATCCCAAA
++
+<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<;<<;<8<;:7:1(
+@EAS114_30:4:327:795:103
+AACCTTGAGAACCCCAGGGAATTTGTCAATGTCAG
++
+;::;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_30:4:327:795:103
+ACAGGGGCTTAACCTCTGGTGACTGCCAGAGCTGC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;
+@EAS114_30:4:328:537:640
+AAGTATGAGATTATGTAAAGTAACTGAACCTATGA
++
+<;<<<<<<;<<<<<<<<<:;<<8<<<;:<<<;<;9
+@EAS114_30:4:328:537:640
+GGAAGATACATTGCAAGACAGACTTCATCAAGATA
++
+;:<<;<<<<<::<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_30:5:327:991:508
+ACCCCAGGGAATTTGTCAATGTCAGGGAAGGAGCA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;:<7:47;:75;
+@EAS114_30:5:327:991:508
+TCTGGATTCTGGGAAATTCTTCATCCTGGACCCTG
++
+0:;::<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_30:5:32:461:154
+ACAGGTTTTATAAAACAATTAATTGAGACTACAGA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<+<;;
+@EAS114_30:5:32:461:154
+TTACAAGAAACTCATTAATAAAGACATGAGTTCAG
++
+;;</<<<<<;:<.<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_30:6:137:741:866
+ACACTAAAAGCCCATACTTTACTGCTACTCAATAT
++
+<<<<8<<;;;<<<<;<<<;;;<;4<<8;<<;%<8;
+@EAS114_30:6:137:741:866
+GATGAGGGGAAAAAAGTAAACTCTCAAATATTGCT
++
+<;0:%<:9<<<:<<<<;<<:<<;0;<<<<<::<<6
+@EAS114_30:6:157:42:763
+TCTGGGAGCCGTCCGTGTCCTCCCATCTGGCCTCG
++
+4++;((2(5;24<./<:<<<<<<<<;<<88<<<<9
+@EAS114_30:6:157:42:763
+TTTCTTATCTGCACATTACTACCCTGCAATTATTA
++
+<<;<;<<<<<;<:4<<<<<<<<<;;4<<<:;;+;+
+@EAS114_30:6:163:312:891
+CCCAGCTCCAGATTGCTTGTGGTCTGACAGGCTGC
++
+<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<:;;<;;<;0
+@EAS114_30:6:163:312:891
+TTCCCCAGATACCGTCCCTGTCTTACTTCCAGCTC
++
+0.<;;8<<<0<<<<<<<<<<6<<<<<<8<<<<<<<
+@EAS114_30:6:214:565:337
+AAATGAAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATAC
++
+<;<<<<<<<<<<<<<<;<<<<9<<<<<;;;;<<<<
+@EAS114_30:6:214:565:337
+CAGAATAACAATGGGCTTCTCAGCAGAAACCTTAC
++
+;;<;<1<9<<<8<<<<<;<<<<<<8<<<;<<<<<<
+@EAS114_30:6:220:809:850
+GGGGGGAAAAAGATGTGCTACACAAAAAGATTCCA
++
+<<;7;<<0::8<-6:<0624-*<&-93-,8+(&08
+@EAS114_30:6:220:809:850
+TTCATAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAGGGAT
++
+9+5<;*<<<2:0<<8:<*00<<<:<*<<<<<<<<&
+@EAS114_30:6:238:803:383
+ACAATTAATTGAGACTACAGAGCAACTAGGTAAAA
++
+<<<<<<<<<<<<;<<<<<;<;<<;<<;<<<9<;<<
+@EAS114_30:6:238:803:383
+ACTCATTAATAAAGACATGAGTTCAGGTAAAGGGG
++
+;;<;;<<<<<<<<<<<<<<<<;:<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_30:6:243:209:110
+AAAACATGAACTAACTATATGCTGTTTACAAGAAA
++
+;<;;;:<:<:;<<;;<;<;<;7<<;<<;;<;<<<<
+@EAS114_30:6:243:209:110
+CACAGGTTTTATAAAACAATTAATTGAGACTACAG
++
+<<<<<;<;<<<;<<<<<<<<<<<;<:;<<:;;+85
+@EAS114_30:6:277:397:932
+TTTCTTTTCACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACTT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:8(,0%(
+@EAS114_30:6:290:146:36
+CTTTCCCATCCCCCGGTCCCTGCCCCATCTCTTGT
++
+7;%%%<8-4<(<<<7<<<:<:<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_30:6:290:146:36
+TTATCATGACTCTATCCCAAATTCCCAATTACGTC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<<<<<;;<;;<
+@EAS114_30:6:326:309:149
+CAACCTTGAGAACCCCAGGGAATTTGTCAATGTCA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<;;;;:
+@EAS114_30:6:326:309:149
+CTCCCTGTCACCCAATGGACCTGTGATATCTGGAT
++
+;;<<;<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_30:6:41:461:436
+TAAAGTAACTGAACCTATGAGTCACAGGTATTCCT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<;<;;;:;
+@EAS114_30:6:41:461:436
+TAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACATGAAGGAA
++
+;<986<;6<<<<<<<;<<<<<<<<<;<<<<<<<<<
+@EAS114_30:6:49:656:507
+AAGGAAATCCCATCAGAATAACAATGGGCTTCTCA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<;9
+@EAS114_30:6:49:656:507
+TCCTGACAAGCAAATGCTAAGATAATTCATCATCA
++
+%44;;<:<<;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_30:6:4:665:771
+GAATAAAAAGGGATTAAATTCCCCCACTTAAGAGA
++
+<;<<;<18<;<8<<<<;<;;<<<<1<<<<6;;;;;
+@EAS114_30:6:4:665:771
+GTGCTTTATCTGATATCAATGCCGATAAACTGCCT
++
+<<<<<<<<<<<<%<8<3:7:77<(7,:3(:&2:(0
+@EAS114_30:6:62:386:959
+AAAAGCTTTCAACGCTTCTAGCCATTTCTTTTGGC
++
+%;71131((<<6<92(+<1<<;<-3<8<<;<;;<<
+@EAS114_30:6:62:386:959
+AATGAACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGT
++
+<<8<<<<;<<<<-<<87;</<;<+<;5<+;;<3;+
+@EAS114_30:7:269:944:220
+ATCTTCTTCTTAGGGAAGAACAGCTTAGGTATCAA
++
+<;<;8<<;7<<<<<;<<-<<<<<<;<<<;<<<<<<
+@EAS114_30:7:269:944:220
+TGGGCAATACATGAGATTATTAGGAAATGCTTTAC
++
+<<<<<<<8<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<;<<;81
+@EAS114_30:7:283:799:560
+ACATAGACCCCCTTGCAACAACCTTGAGAACCCCA
++
+<4<6<8;;6<<<+;<:<<;<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_30:7:283:799:560
+GGGGTTGCCAGCACAGGGGCTTAACCTCTGGTGAC
++
+<<<<+<<<<8<<<+<<<<<;<<:07;8;7402447
+@EAS114_30:7:310:155:312
+CAGCAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTATAAAGGA
++
+;<<<;<<<8<<<<<<<<<<<<;<<<<<8<<<<8<<
+@EAS114_30:7:310:155:312
+CATAAATGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCT
++
+2;<<;<<;<<;;/<<<<<<;<<<<8<<<<<<<<<<
+@EAS114_30:7:319:11:255
+TACCCAGATTCATAAAACAAATACTACTAGACCTA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<:
+@EAS114_30:7:319:11:255
+TCTATAAAAAAATTAAAATTTAACAAAAGTAAATA
++
+;8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<
+@EAS114_30:7:59:871:351
+GTAAAAAATTAACATTACAACAGGAACAAAACCTC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<;
+@EAS114_30:7:59:871:351
+TAAAGACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAG
++
+;<<<<<:<;<<<4;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_30:7:71:311:202
+TATGAGATTATGTAAAGTAACTGAACCTATGAGTC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<:4<<<<<<<<<<<<8;4;:
+@EAS114_30:7:71:311:202
+TCAAGATATGTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAA
++
+;6<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<
+@EAS114_32:1:199:760:42
+ACCCAATTAATATTTTTCTTAGCAAAACAGTCTAG
++
+58*5.<+<<<<,4<<**<90**9<<<<<<4<<<<<
+@EAS114_32:1:199:760:42
+CTCTCTAATTTTTGCTGCTTCCATGTCTTACTCTG
++
++2&2&2&22222220222&220-222-22-22-22
+@EAS114_32:1:208:971:600
+AAAAAAACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGC
++
+<<<<<<<3*+<4/<<<<7<<<<0<<:<8<<<<0<<
+@EAS114_32:1:208:971:600
+AGATATGTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACAT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<8<<:<<<0;44<<:4<:<
+@EAS114_32:2:163:618:570
+AGGCTGCAACTGTGAGCCATCACAATGAACAACAG
++
+<<<<<<<8<<<<<<<<<<<<<+<.7<<..<;&;8;
+@EAS114_32:2:163:618:570
+GGAAAGCTGTCAACGCTTCTAGCCATTTCTTTTGG
++
+<9774<88&:8<:8<8:8<8<<<<<;88<88<<<<
+@EAS114_32:2:197:170:559
+CTCATTCACTCCAGCTCCCTGTCACCCAATGGACC
++
+<:<;;:<5<5<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_32:2:197:170:559
+TTCTCAAGGTTGTTGCAAGGGGGTCTATGTGAACA
++
+:;;;;<<<<<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_32:2:247:900:123
+AAAACATGAACTAACTATATGCTGTTTACAAGAAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9;<;
+@EAS114_32:2:247:900:123
+AATTCAGCAAGAAGATATAACCATCCTACTAAATA
++
+;;;;.<<4<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_32:2:283:577:398
+ACAATGGGCTTCTCAGCGGAAACCTTACAAGCCAG
++
+;8;;&<<<;<;67<;<;<<<<<<<<;<<<<<<<<<
+@EAS114_32:2:283:577:398
+CTAGAGATTTAGACATCTAAATGAAAGAGGCTCAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<;<<<<<
+@EAS114_32:2:306:119:56
+CTTCTCACAGTTTCTGCCCCCAGCATGGTTGTACT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<
+@EAS114_32:2:306:119:56
+TCCATGTACACACGCTGTCCTATGTACTTATCATG
++
+;;;;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_32:3:236:475:254
+AGATAAAGCACACTTTAAATCAACAACAGTAAAAT
++
+<:<<<<<;9<7<;<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<
+@EAS114_32:3:236:475:254
+TTCCCCCACTTAAGAGATATAGATTGGCAGAACAG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:::<:;</;/
+@EAS114_32:3:307:113:346
+AATTCAGCAAGAAGATATAACCATCCTACTAAATA
++
+<<<<9<<1<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_32:3:307:113:346
+ATGCTGTTTACAAGAAACTCATTAATAAAGACATG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<8
+@EAS114_32:4:156:21:69
+AAAAATGAACAGAGCTTTCAAGAAGTATGAGATTA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<4<<<:<;<;;
+@EAS114_32:4:156:21:69
+TTGCAAGACAGACTTCATCAAGATATGTAGTCATC
++
+<:3:<<;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_32:4:20:41:138
+CATTTCTTTTGGCATTTGCCTTCAGACCCTACACG
++
+;;;<;<<<::<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_32:4:20:41:138
+GTCTTTCAAAAGGTGATGTGTGTTCTCATCAACCT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<;<<<<<(<<
+@EAS114_32:4:228:587:504
+GCACATTACGACCCGGCAAGGTGTATAATTGTGTC
++
+;4;4;&&82&04+&&48;3&3&*<7<47<<;-<-8
+@EAS114_32:4:228:587:504
+GTGCACTAATGCGCTCCACGCCCAAGCCCTTCTCA
++
+<<<<7<<7;7<<3<<<<7<<<<<*3<<<<74<:<*
+@EAS114_32:4:246:647:765
+GATCAATTCAGCAAGAAGATATAACCATCCTACTA
++
+9<+,<<&,39<,<;<<<<<<<&<<<<;0<<3;<<<
+@EAS114_32:4:246:647:765
+TATGCTGTTTACAAGAAACTCATTAATAAAGACAT
++
+;<<<<<<<<<;<&<<3+3<<<3<<9&</:/87</8
+@EAS114_32:4:42:923:169
+ACAGTTTCTGCCCCCAGCATGGTTGTACTGGGCAA
++
+9<<<;9<<<<<;<;<<.<<;<;6<<<<1;8<<-0;
+@EAS114_32:4:42:923:169
+TTCCTATGTACTTATCATGAATCTATCCCAAATTC
++
+&;972<;&<9<,;;;<<<;<&99<<;<;;3<<3<<
+@EAS114_32:4:5:396:292
+ATACATATGCACCTAACACAAGACTACCCAGATTC
++
+<:<6<7<:<:;;;<<<;<7<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_32:4:5:396:292
+TAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAACAGA
++
+<<<<<<<<<<<<<<;;<<<<:<<<<;;<;;3/&+8
+@EAS114_32:4:7:282:424
+CAAAAACAAAAACTATGCTAAGTATTGTTAAAGAT
++
+1<<<<<9<<<<<31<77;;;;7<3<<2+;<3<<<<
+@EAS114_32:4:7:282:424
+TAATTGGTACAATGTACAATATTCTGATGATGGTT
++
+<<<3<<<9<<<<3<<<<<9<<<9,<;;9;&*;3,.
+@EAS114_32:5:109:199:592
+ACGAATATTATGCCCTGCTAAACTAAGCATCATAA
++
+;9<9<:&:<<<<;;<;;<<<<<<<<<;<<<<<<<<
+@EAS114_32:5:109:199:592
+AGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACATGAAGGAAA
++
+<<<<<<<<<<<;:<;;<<:;6<<;:;:<<+;;;<;
+@EAS114_32:5:182:313:319
+AATTTGGTGTTCTGTGTAAAGTCTCAGGGAGCCGT
++
+</<;185;8<;;87<;8<<<<8<;83<<<<<<<<<
+@EAS114_32:5:182:313:319
+GATGAACCACACATTAATACTATGTTTCTTATCTG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<<;<;
+@EAS114_32:5:267:170:250
+CATAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAGGGATGA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<;<<<<<<<<<<<<;
+@EAS114_32:5:267:170:250
+CATAGCTAAAACTAAAAAAGCAAAAACAAAAACTA
++
+-<;<5-:<<<<;<<<<<<<;;<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_32:5:78:583:499
+TTTACGCTATTCAGTACTAAATATAGAAATTGAAA
++
+&6&9774&<;67<44&-4<;<9<7<<<<<;<<<<<
+@EAS114_32:6:122:342:296
+AAAGCTTGGGCTGTAATGATGCCCCTTGGCCATCA
++
+<:;:<<<;<2<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_32:6:122:342:296
+TCCTATGTACTTATCATGACTCTATCCCAAATTCC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<*<<<<9<
+@EAS114_32:6:178:342:866
+AACAAATCTGCGCTTGTACTTCTAAATCTATAAAA
++
+<<9<<<&;;<<<<77<;<<<5;:<<<:<<<<<<<<
+@EAS114_32:6:178:342:866
+ATACATATGCACCTAACACAAGACTACCCAGATTC
++
+;<<<<<;<<<8<<;<;<3<8/<<<<6<<</<8;<<
+@EAS114_32:6:179:735:569
+ATGTTAAAATGTCTATTTTTGTCTTGACACCCAAC
++
+<5<3:<<<<5;8<<<55;<:</:<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_32:6:179:735:569
+CATCACCCGGTCCCTGCCCCATCTCTTGTAATCTC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<3<<<<<<<<4/<;<<
+@EAS114_32:6:199:818:124
+AACTATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_32:6:199:818:124
+ACTAAACCAAGCAGAAGAAAGAGGTTCAGAACTTG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;<<;7<<<<<<9<9;
+@EAS114_32:6:78:909:394
+ATTGCTTGGTGTCTGACAGGCTGCAACTGTGAGCC
++
+6167&+&&/&//734/3<<<9*<;;3<3<;9<<3<
+@EAS114_32:6:78:909:394
+TACCAGAGGGATGGAGGGAAGAGGGACGCTGAAGA
++
+<<<<<<8<<<&<<<-<<<14,4;<<-0<2+<)/82
+@EAS114_32:6:88:162:587
+GGTTTTCTGTTTCTTTGTTTGATTTGGTGGAAGAC
++
+386;;388-<8;<;68<<;;<;<6<<<8<<<<<<<
+@EAS114_32:6:88:162:587
+TTCTGTGTAAAGTCTCAGGGAGCCGTCCGTGTCCT
++
+<;<<<<<<<<<;<5<;<;<<7<++<<2&*:322+7
+@EAS114_32:7:174:597:66
+TCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTGCTGCATCCCT
++
+9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<
+@EAS114_32:7:174:597:66
+TCTTCTTCTTAGGGAAGAACAGCTTAGGTATCAAT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;<<;6;<
+@EAS114_32:7:201:959:19
+CTCTACATGGCTGATTATTAAAACAATGTTCCCCA
++
+;4;.9<:0&/<5<::<<9/.<<<<<<<<<<<<;<<
+@EAS114_32:7:201:959:19
+TATCTGGATTCTGGGAAATTCTTCATCCTGGACCC
++
+<<<<<<<<<<<<<<;<<<:<;<<;<<;+;+<3494
+@EAS114_32:7:256:407:470
+AACGCTTCTAGCCATTTCTTTTGGCATTTGCCTTC
++
+<<<<<<<<;<;<<<<<<<<<;;<</<<;;83;7;9
+@EAS114_32:7:256:407:470
+CAGCATGGTTGTACTGGGCAATACATGAGATTATT
++
+7.47;0;;5<4033*<<<<<9,<<<<<;<<<<<3<
+@EAS114_39:1:12:884:219
+GAGCCATCACAATGAACAACAGGAAGAAAAGGTCT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<5:<
+@EAS114_39:1:12:884:219
+GCTTTCAACGCTTCTAGCCATTTCTTTTGGCATTT
++
+7;::<:<<<7<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_39:1:28:350:895
+ATATAGTTGAAAGCTCTAACAATAGACTAAACCAA
++
+<<<<<<<<;<;<<<<<<<<<;;<<;<<<<<;;<;8
+@EAS114_39:1:28:350:895
+TATGAGTCACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAA
++
+:<;<<<:;<-<<<<<4;77<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_39:1:43:1120:878
+ACTAATGCGCTCCACGCCCAAGCCCTTCTCACAGT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<<<<<<<<<<=7;7
+@EAS114_39:1:43:1120:878
+TAATTGTGTCCATGTACACACGCTGTCCTATGTAC
++
+<<<;<<;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_39:1:70:147:84
+ATAGACCCCCTTGCAACAACCTTGAGAACCCCAGG
++
+<<<:<;<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;
+@EAS114_39:1:70:147:84
+CCAGCACAGGGGCTTAACCTCTGGTGACTGCCAGA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<;(5<<
+@EAS114_39:1:71:636:533
+GCCTCGTCCACACTGGTTCTCTTGAAAGCTTGGGC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<5<<<-847
+@EAS114_39:1:71:636:533
+GTGGAAGACATAATCCCACGCTTCCTATGGAAAGG
++
+,51(<<8<:<<<<<<<;<;<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_39:1:73:302:1574
+AAGGTTGTTGGGAGATTTTTAATGATTCCTCAATG
++
+7<88;;<;;<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<1<
+@EAS114_39:1:73:302:1574
+CCTCGTCCACACTGGTTCTCTTGAAAGCTTGGGCT
++
+<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<+:;<<;:8;<<<
+@EAS114_39:1:98:641:1040
+CAGAACAGATTTAAAAACATGAACTAACTATATGC
++
+<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;
+@EAS114_39:1:98:641:1040
+TAAAACAAAGGAGGTCATCATACAATGATAAAAAG
++
+4<<<<7<<<<<<<<<:<<;<;<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_39:2:18:967:582
+AAGCCGTTCTATTTGTAATGAAAACTATATTTATG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<;<<<<<8
+@EAS114_39:2:18:967:582
+ACGCTGAAGAACTTTGATGCCCTCTTCTTCCAAAG
++
+<:<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_39:2:38:670:564
+CAGGTTTTATAAAACAATTAATTGAGACTACAGAG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<:<<<<;<5<;
+@EAS114_39:2:38:670:564
+CTAACTATATGCTGTTTACAAGAAACTCATTAATA
++
+3<<<3:<<<<<:;<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_39:2:41:576:1016
+CTCTCCTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTC
++
+<<<<<<<<<<<<<<;<<<;<<<<<<<<<<<4<::<
+@EAS114_39:2:41:576:1016
+TGTCTGAGCAAAACAGTCTAGATGAGAGAGAACTT
++
+:<;<<<<<6<<<<;<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_39:2:57:1064:925
+TGACAAGCAAATGCTAAGATAATTCATCATCACTA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<
+@EAS114_39:2:5:1219:137
+AAAACTAAAAAAGCAAAAACAAAAACTATGCTAAG
++
+<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<
+@EAS114_39:2:5:1219:137
+ACCTAAGAGGGATGAGAAATTACATAATTGGTACA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<(<<<<<<:9<;=
+@EAS114_39:3:11:1238:1728
+AGAGATTTAGACATCTAAATGAAAGAGGCTCAAAG
++
+<<7<<<<<;<<<<<<<<<<<<;<<<;<<<<<<;;<
+@EAS114_39:3:11:1238:1728
+TCCCATCAGAATAACAATGGGCTTCTCAGCGGAAA
++
+:677<;<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_39:3:55:464:146
+AAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGATATAACCATCC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_39:3:55:464:146
+CTCAATATATCCATGTAACAAATCTGCGCTTGTAC
++
+;(;;;;<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_39:3:6:1064:1805
+TAAAATTTAACAAAAGTAAATAAAACACATAGCTA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_39:3:6:1064:1805
+TTGGTAATTTCGTTTTTTTTTTTTTCTTTTCTCTT
++
+;88<;<;;<<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_39:3:88:84:1558
+AGTAACTGAACCTATGAGTCACAGGTATTCCTGTG
++
+<<;<<<<<<<<<<<<;;<<<<<<<::<<<<<<7&<
+@EAS114_39:3:88:84:1558
+ATCAGACTATCTAAAGTCAACATGAAGGAAAAAAA
++
+;;<<;<<;<<5<<<<<<;<<:<<<;<<<<<<;<<<
+@EAS114_39:4:10:1312:1558
+AACTAACTATATGCTGTTTACAAGAAACTCATTAA
++
+<<:<<<;<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_39:4:10:1312:1558
+AGGTTTTATAAAACAATTAATTGAGACTACAGAGC
++
+5<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<<<<;8;<
+@EAS114_39:4:30:432:228
+ATCCTACTAAATACATATGCACCTAACACAAGACT
++
+<76<<<:<<<<<<<;<:<<<<<:<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_39:4:30:432:228
+GACATGAGTTCAGGGAAAGGGGTGGAAAAAGATGT
++
+<<<<<<<<<<<<<<8<<<<<<<<<<<<:<<<<<;;
+@EAS114_39:4:30:570:902
+AAAAACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCTA
++
+<<<<<<<<<<<;4<<:<<44<<<<<<<<<<<4<<+
+@EAS114_39:4:30:570:902
+ATACTCACCATCATAAATACGCACAAAAGTACAAA
++
+<:<6:6<&:<<6<<<<<<<<.<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_39:4:43:1047:1626
+GATGAGAGAGAACTTCCCTGGAGGTCTGATGGCGT
++
+<<4<<<<<<<<<<<:<<<;<<<<<:<7<<;<<<<<
+@EAS114_39:4:43:1047:1626
+GTTGGTTTTCTGTTTCTTTGTTTGATTTGGTGGAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<:<<<<:+;-4:(
+@EAS114_39:4:58:271:612
+AGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAACTA
++
+<;<<<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<<<+47<<;<::
+@EAS114_39:4:58:271:612
+ATGAAGGAAAAAAATTCTAAAATCAGCAAGAGCAA
++
+;:2=<<;<<<<<<:67:<<:<<<<<<<<<<<<,<<
+@EAS114_39:4:93:77:1338
+GCTGCTTACAAGAAGCGCATTAATAAAGACATGAG
++
+<<<<*<2<<<:<4<&<6<8<4<::<8<<<<82;;7
+@EAS114_39:4:93:77:1338
+GTCATCATACAATGAAAAAAAGATCAATTCAGCAA
++
+<<7<7<<<<<1<7<<&97;;<1<;1<<7<;7<<;<
+@EAS114_39:5:17:1222:783
+AAGAAAGAGGTTCAGAACTTGAAGACAAGTCTCGT
++
+<<<<<<<)<<<16<<;<<<6<4<:<4<+://<7)<
+@EAS114_39:5:17:1222:783
+TGAGAAGTTTGGAAAAACTATTTGAGGAAGTAATT
++
+6<<<8<69<8199<7<<<6<<<<<<<<<1:<:<<:
+@EAS114_39:5:42:1223:1087
+CAGTCCCTGCCCCATCTCTTGTAATCTCTCTCCTT
++
+<<<<<<<<<<<<<5<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_39:5:42:1223:1087
+TTGTCTTGACACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAA
++
+;:<<<:<7<<<;;<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<
+@EAS114_39:5:50:972:1286
+AGAGGGATGGAGGGAAGAGGGACGCTGAAGAACTT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<6<<7:7:;
+@EAS114_39:5:50:972:1286
+TTGTGGTCTGACAGGCTGCAACTGTGAGCCATCAC
++
+:;;7;7;;0<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_39:5:61:1000:1534
+CTTGAAGACAAGTCTCTTATGAATTAACCCAGTCA
++
+<<<<4:<:<1)<<<<<<<+<:44<</7<<<)4:<)
+@EAS114_39:5:61:1000:1534
+GGGGAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGATTTAGA
++
+<<;<<<<;;<<;6;<<<;<4;<<7<<<<<;<<<<<
+@EAS114_39:5:93:312:331
+AACTCATTAATAAAGACATGAGTTCAGGTAAAGGG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<=<<
+@EAS114_39:5:93:312:331
+ATCCTACTAAATACATATGCACCTAACACAAGACT
++
+<;;:;<6<<<<;<:<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_39:6:13:1034:1144
+AAAGATGAAACGCGTAACTGCGCTCTCATTCACTC
++
+<<:%<9)<<<<<<8<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_39:6:13:1034:1144
+AATTGAAACAGCTGTGTTTAGTGCCTTTGTTCACA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<3<<<;<<;<++
+@EAS114_39:6:34:380:815
+AAGAGGTTCAGAACTTGAAGACAAGTCTCTTATGA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;:
+@EAS114_39:6:34:380:815
+ATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGATTT
++
+;;;;<<<<<<;<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<;<
+@EAS114_39:6:71:644:1792
+AAAAGTACAAAACTCACAGGTTTTATAAAACAATT
++
+<<<<;<<<<<<:;/<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_39:6:71:644:1792
+CCTGCTAAACTAAGCATCATAAATGAAGGGGAAAT
++
+<<<<<<<;<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<;<;:<:<
+@EAS114_39:6:76:282:1668
+AACAAAAACTATGCTAAGTATTGGTAAAGATGTGG
++
+<<<<<:<<<8<8<<<<<::<<<<7<<<<<<2<<<8
+@EAS114_39:6:76:282:1668
+TACAATGTACAATATTCTGATGATGGTTACACTAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;<<<<<<;<;<<<8
+@EAS114_39:6:7:492:1088
+ACAGGTTTTATAAAACAATTAATTGAGACTACAGA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<:<<<<<<6;
+@EAS114_39:6:7:492:1088
+TGAACTAACTATATGCTGTTTACAAGAAACTCATT
++
+4;<<75<<::<:<<<-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_39:6:85:1224:625
+GAACTCCCCTGGAGGTCTGATGGCGTTTCTCCCTC
++
+17;;7&-;<;<;:<6<<:;<<<<<<<;<<<<<<<<
+@EAS114_39:6:85:1224:625
+GCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTCCTT
++
+<<<<<<<<<;<<;<<7<<:<<7.<<<:&7<<.<;<
+@EAS114_39:6:94:1273:1462
+AAGATGTTCTACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGA
++
+<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<:<<<<:6:7;744;
+@EAS114_39:6:94:1273:1462
+CCTAACACAAGACTACCCAGATTCATAAAACAAAT
++
+8.<<<;<:<<<<;<<;;;<<<;<;<;<<<<<<<<<
+@EAS114_39:7:100:708:1984
+AGATGAACCACACATTAATACTATGTTTCTTATCT
++
+:8<(8<)9<;<<<<+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_39:7:100:708:1984
+TACCACAGGGGGCTGCGCGGTTTCCCATCATGAAG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<7%:
+@EAS114_39:7:23:1126:1886
+ACACTAAAAGCCCATACTTTACTGCTACTCAATAT
++
+5*.:.5<<::<<<<<<<<:5<<<<<<<<<<:2<<<
+@EAS114_39:7:23:1126:1886
+GGAGGTCATCATACAATGATAAAAAGATCAATTCA
++
+7<<<7<<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<<;8<;<<5<
+@EAS114_39:7:32:562:1695
+GATGATGGTTACACTAAAAGCCCATACTTTACTGC
++
+:5:::<88/<:<<<<<<<<<7<9<<&<959<<<<<
+@EAS114_39:7:32:562:1695
+TAAAACAAAGGAGGTCATCATACAATGATAAAAAG
++
+<<<<<<<<<<<<<<8<<<<<:<<<<<<<:<8<<<<
+@EAS114_39:7:57:1114:2032
+TAACTATATGCTGTTTACAAGAAACTCATTAATAA
++
+<7<<<<<<<<<<<<<<<<<777<<<7<<<<<3<<7
+@EAS114_39:7:57:1114:2032
+TATTACAATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAG
++
+;+!5<4<<<<<<<<<<<<<;<&<;7<<<<<<<<<<
+@EAS114_39:7:90:406:631
+CATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTGTTG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<:;<<<<;<<8;<8
+@EAS114_39:7:90:406:631
+TGAGAGAGAACTTCCCTGGAGGTCTGATGGCGTTT
++
+<<<:<:<<<-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_45:1:100:979:1863
+ATTACAAAACTCACAGGTTTTATAAAACAATTAAT
++
+6&,*3;6;66;9(572692;;;79;4)9;96;59+
+@EAS114_45:1:100:979:1863
+TTATGCCCTGCTAAACTAAGCATCATAAATGAAGG
++
+;<;;;;;;;7;;;79;;77;9;;99;974;677-6
+@EAS114_45:1:12:1296:358
+CTTGAAAGCTTGGTCTGTAATGATGCCCCTTGGCC
++
+-770074;;6;&42;:2;;;:;;;;:;;/:;;;;:
+@EAS114_45:1:12:1296:358
+GTCCATGTACACACGCTGTCCTATGTACTTATCAT
++
+;;;6;7;7;;;;;7;9;;-*1;9;699/99/7477
+@EAS114_45:1:2:1422:1820
+CACCTAACACAAGACTACCCAGATTCATAAAACAA
++
+*4617;;4;1;;79;/7&,4;9;;;7<;;<<<;<<
+@EAS114_45:1:2:1422:1820
+TACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGGAGTAGC
++
+;7;;;;;;;;:;;;;;;;;;;;;;;;;;;;77777
+@EAS114_45:1:30:1882:1210
+ATCATCACTAAACCAGTCCTATAAGAAATGCTCAA
++
+776778;5;;;;8;;7:8;;;;;;;<<<;;;;;<;
+@EAS114_45:1:30:1882:1210
+GCAGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGATTGGATCTA
++
+;;::;;;;:;;;;;:;;;;;;9;;:7;;8:77777
+@EAS114_45:1:33:1407:94
+TAGGTATCAATTTGGTGTTCTGTGTAAAGTCTCAG
++
+;;;;;;;6:;;:::7;:;;;;:::;;;;:;47771
+@EAS114_45:1:33:1407:94
+TTACTTGTTGTTGGTTTTCTGTTTCTTTGTTTGAT
++
+77477;4;;;;;44;;;;;;7;;;;;;;9;;;;;<
+@EAS114_45:1:77:1000:1780
+AGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAG
++
+777774;;4-7;;;;;;:;;;:;;;<;;;;<<<<;
+@EAS114_45:1:77:1000:1780
+TGAATTAACCCAGTCAGACAAAAATAAAGAAAAAA
++
+;;;:;;;;;;;/;;;7:4;;7;;;;;;;;;77777
+@EAS114_45:1:84:275:1572
+AGGGACGCTGAAGAACTTTGATGCCCTCTTCTTCC
++
+777777::7:;74;:;:7;:::;;;;:;;8;;;<;
+@EAS114_45:1:84:275:1572
+TTATGCTATTCAGTTCTAAATATAGAAATTGAAAC
++
+/6;;;4;;;;;;;;7;;4;.4;;;;;6;;;77077
+@EAS114_45:1:95:1530:28
+AAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACATTGCA
++
+;;;;;;;;;;:;;;;;;;8;;;;;;;;;;;77747
+@EAS114_45:1:95:1530:28
+AATGGGCTTCTCAGCAGAAACCTTACAAGCCAGAA
++
+77741(9;;994;5;;4;;1;;;;;1;<;<<<<;<
+@EAS114_45:1:9:1289:215
+AGGGACGCTGAAGAACTTTGATGCCCTCTTCTTCC
++
+7747*7;;;;+;;:2;7;:1;;9:;:;:;;:;::;
+@EAS114_45:1:9:1289:215
+TATGCTATTCAGTTCTAAATATAGAAATTGAAACA
++
+;;;;;;9;;;67;;;;;99;9;;;;;;;;977747
+@EAS114_45:2:13:1507:1146
+AAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAGA
++
+88788;,;:-:2;;;;;;;;:;:;;;;;;;;;;;;
+@EAS114_45:2:13:1507:1146
+CAGAAGAAAGAGGTTCAGAACTTGAAGACAAGTCT
++
+;<9;;;;<<;;;;<<;<;;;;<;;<<;<;<99777
+@EAS114_45:2:15:1497:1530
+AATTACGTCCTATCTTCTTCTTAGGGAAGAACAGC
++
+0<;;;9;;86<;;;<<&<<.<<;)3;7;654-471
+@EAS114_45:2:15:1497:1530
+TAATCTCTCTCCTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCC
++
+77778:;;;:;;;;:9;:;;;;;;;;;9;:;;;;;
+@EAS114_45:2:1:1140:1206
+TCCCATTTGGAGCCCCTCTAAGCCGTTCTATTTGT
++
+;;;;;;;;;;;;;:9;;7;;:;:;97;:;:88888
+@EAS114_45:2:1:1140:1206
+TTTATTACCAGAGGGATGGAGGGAAGAGGGACGCT
++
+77977::99;;;:;;<;;;:;;;<<;<;;;;<;;;
+@EAS114_45:2:20:413:1334
+CCGTGTCCTCCCATCTGGCCTCGTCCACACTGGTT
++
+7<<;<<<.;<;67;7;;;:;;3;<59+...77677
+@EAS114_45:2:20:413:1334
+TTGGTTTTCTGTTTCTTTGTTTGATTTGGTGGAAG
++
+88878777;:;:1:;9;;;6;;;6;9;;;;;296;
+@EAS114_45:2:23:1754:796
+CTTCTAAATCTATAAAAAAATTAAAATTTAACAAA
++
+;<<;<;<;<;<;<<;;;;;<<<<;;<<<<<97999
+@EAS114_45:2:23:1754:796
+CTTTGGAAAACAATTTGGTAATTTCGTTTTTTTTT
++
+88897;;;;:;:;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
+@EAS114_45:2:33:1445:1357
+TATGAATTAACCCAGTCAGACAAAAATAAAGAAAA
++
+;;<;<<<<<<;;;<9:;:;;;;;:;:;;;;99777
+@EAS114_45:2:33:1445:1357
+TTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACATCTAAATGAAA
++
+88888;;;;;;;:;;;;;;;:;9;;;;;;;;;;;;
+@EAS114_45:2:41:199:388
+AGAAAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAACTATTTGAGG
++
+;;<<<<<;;<<<<<<;;<;;<<;;<<<<<<99999
+@EAS114_45:2:41:199:388
+TCTAAAGTCAACATGAAGGAAAAAAATTCTAAAAT
++
+84898;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
+@EAS114_45:2:49:163:904
+GCTCTCATTCACTCCAGCTCCCTGTCACCCAATGG
++
+;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;78958
+@EAS114_45:2:49:163:904
+TCTTTCAAAAGGTGATGTGTGTTCTCATCAACCTC
++
+79779<<<<<;;;;9;;<<7<;*9<<<7<<;<<;<
+@EAS114_45:2:54:1886:719
+CTGTTTACAAGAAACTCATTAATAAAGACATGAGT
++
+;;;9;;<;;;9;;;;;:;<9;:;;;;9;;;99799
+@EAS114_45:2:54:1886:719
+TTCAGCAAGAAGATATAACCATCCTACTAAATACA
++
+883777;;:;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
+@EAS114_45:2:59:396:359
+GGGTATAATACCTCTACATGGCTGATTATGAAAAC
++
+28288;;;;;;;;;::;;;;:;;;;;;;;;;;;;;
+@EAS114_45:2:59:396:359
+TCACCCAATGGACCTGTGATATCTGGATTCTGGGA
++
+<<9;;<;<;;;;<;;9;;;;;<;;;;;<;;77677
+@EAS114_45:2:76:1765:700
+AAAAAGGGATTAAATTCCCCCACTTAAGAGATATA
++
+77777;;;;7;7;<;;;;+;;<9<<<79;<1<<77
+@EAS114_45:2:76:1765:700
+GTCCTATAAGAAATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGT
++
+;;6;;;;;;;;;6;;;;6;;;;;;;;;;;;88878
+@EAS114_45:2:79:554:354
+AAATAAAACAAAGGAGGTCATCATACAATGATAAA
++
+17;<;;+<<;;;;93;;:;3;;;;1;;;;<77744
+@EAS114_45:2:79:554:354
+CAATGTACAATATTCTGATGATGGTTACACTAAAA
++
+98988;7;;;;:;;;;;;;;;;:;;;:;;;;;9;;
+@EAS114_45:3:26:1867:162
+ATATAACCATCCTACTAAATACATATGCACCTAAC
++
+;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;78698
+@EAS114_45:3:26:1867:162
+ATATATCCATGTAACAAATCTGCGCTTGTACTTCT
++
+97999:;<<9;;<:<<;;;<;;<<<<<<<;;<<<<
+@EAS114_45:3:27:1881:486
+AAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGATGTGTGTTCTC
++
+99797;;9:<:;;;<;;;;<<<;;;;<;<;;<<<<
+@EAS114_45:3:27:1881:486
+CCAAAGATGAAACGCGTAACTGCGCTCTCATTCAC
++
+;;;;;;;;;;;;;;1;;;;;;;;78;8;8;8878/
+@EAS114_45:3:2:1200:1076
+CATTTGCCTTCAGACCCTACACGAATGCGTCTCTA
++
+7779779;9;:;;4;;9;;:7;<<<7;;;:<;<<;
+@EAS114_45:3:2:1200:1076
+GATGTGTGTTCTCATCAACCTCATACACACACATG
++
+;;;;;;;;;;/;;;;;;;;6;;9;489;;;88888
+@EAS114_45:3:32:1379:738
+TTAAGAAATTACAAAATATAGTTGAAAGCTCTAAC
++
+;;;;;;;8;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;88888
+@EAS114_45:3:35:896:1588
+CTAGACCTAAGAGGGATGAGAAATTACCTAATTGG
++
+77999:.:<<;<;;;<<;<;<<<<<;<;;<<<<;;
+@EAS114_45:3:35:896:1588
+GAGTAGCTATACTTATATCAGATAAAGCACACTTT
++
+;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;8;;;;;8;;;88989
+@EAS114_45:3:39:208:644
+ATTGTAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAATACTCACC
++
+<;<<<<<;;:<<;;<<<<<<;;;;;;.<;<79997
+@EAS114_45:3:39:208:644
+TTTGAATAAAAAGGGATTAAATTCCCCCACTTAAG
++
+78899;;;;4;;;;;;;;;;;;;;;;;;8;;8;;;
+@EAS114_45:3:3:1377:1663
+CTGCGCTCTCATTCACTCCAGCTCCCTGTCACCCA
++
+<<;;;;<:;;:<;;<;;<;:;;<;9;;::977676
+@EAS114_45:3:3:1377:1663
+GGTGATGTGTGTTCTCATCAACCTCATACACACAC
++
+6-88663;8;81;;66;8;;89939;;;67;2;;;
+@EAS114_45:3:3:864:1888
+AATGTTATGCCCTGCTAAACTAAGCATCATAAATG
++
+888588;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;8;;;;;;;;
+@EAS114_45:3:3:864:1888
+CAACATGAAGGAAAAAAATTCTAAAATCAGCAAGA
++
+;<<;;<<;;;<;;<<;<;<<;<<;8<<:<;79799
+@EAS114_45:3:41:653:1568
+AACTATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTT
++
+977979;:;<;;;;;;<<5;<;<;<<<;;;;;;;;
+@EAS114_45:3:41:653:1568
+GGTTCAGAACTTGAAGACAAGTCTCTTATGAATTA
++
+;;;;;;;8;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;88888
+@EAS114_45:3:44:1578:1674
+CCTCTTCTTCCAAAGATGAAACGCGTAACTGCGCT
++
+;<<;<<;<<;;;;;9<;9;;<9:;;<:;9;76669
+@EAS114_45:3:44:1578:1674
+GCTGCAACTGTGAGCCATCACAATGAACAACAGGA
++
+62631;;4;;;8;;48;;7;8;;;;;;;;;8;;;;
+@EAS114_45:3:75:217:337
+GACAGGCTGCAACTGTGAGCCATCACAATGAACAA
++
+4779797;;;<;:4;;<<<77<;;;7<<;<;<;<<
+@EAS114_45:3:75:217:337
+GAGGGAAGAGGGACGCTGAAGAACTTTGATGCCCT
++
+;;;;;;;;;;;;;;;;;;8;;;;;;;;;;;88787
+@EAS114_45:3:90:1403:1635
+TGTCTTGACACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAAA
++
+86878;;;8;788;;;;;;;;;;;;;8;5;;;;;;
+@EAS114_45:3:90:1403:1635
+TTGTAATCTCTCTCCTTTTTGCTGCATCCCTGTCT
++
+<<;<;<<<<;<;<;;<<<<<9;<.;;<:;99.979
+@EAS114_45:4:48:310:473
+TGAATTAACCCAGTCAGACAAAAATAAAGAAAAAA
++
+<<<;<<;;;<<;;<;;;;;;;;;;;;;;;;89799
+@EAS114_45:4:48:310:473
+TTTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACATCTAAATGAA
++
+77999;;6;;;;;;;;;;;;;;;9;;;;;;;;;;;
+@EAS114_45:4:73:1208:495
+AGATGAAACGCGTAACTGCGCTCTCATTCACTCCA
++
+8-889<<;<;;:<;<;;;;;;<<;;<;;;;<<;;;
+@EAS114_45:4:73:1208:495
+TAAATATAGAAATTGAAACAGCTGTGTTTAGTGCC
++
+;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;5;;;;;37377
+@EAS114_45:4:7:1347:375
+CTAAAAGCCCATACTTTACTGCTACTCAATATATC
++
+;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;9;;;8;;;;;97777
+@EAS114_45:4:7:1347:375
+GGAAAAAAGTAAACTCTCAAATATTGCTAGTGGGA
++
+47999<<<;;;;;;:5;:;<;;<;;;;;<;;;;;<
+@EAS114_45:4:87:323:895
+ATCTGGATTCTGGGAAATTCTTCATCCTGGACCCT
++
+;<<;;;;<<;<959;;;<;:<<;9<;;;4377788
+@EAS114_45:4:87:323:895
+GGTATAATACCTCTACATGGCTGATTATGAAAACA
++
+55777;;;939;9;;9;;;;9;;;;;;;;;;;;;;
+@EAS114_45:4:88:55:1187
+GTCACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAG
++
+;;<;;;<<99<<;;<;;;;;:;49;:;;;;87898
+@EAS114_45:4:88:55:1187
+GTCATCAGACTATCTAAAGTCAACATGAAGGAAAA
++
+7769,7;;;;;;;;;;;;;;9;;;;;;;;;;;;;;
+@EAS114_45:5:56:1757:1319
+CATTAATAAAGACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGG
++
+&7778<<<<<8<;<<:::;<:<4<<:<:;8<8<;<
+@EAS114_45:5:56:1757:1319
+TTTATAAAACAATTAATTGAGACTACAGAGCAACT
++
+;;;;9;;;;;;;;;;;;;4;9;98;;;;;9388&7
+@EAS114_45:5:62:841:1994
+ATATCCATGTAACAAATCTGCGCTTGTACTTCTAA
++
+87878;;6:;;:<<<<:<:;;;<;<<<;<;;<;<<
+@EAS114_45:5:62:841:1994
+TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT
++
+!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!
+@EAS114_45:5:66:959:1311
+CAGAGCTGCTGGCAAGCTAGAGGCCCATCTGGAGC
++
+;;4;;;+;;;-01;;&-;;4;;&;;73)(&**274
+@EAS114_45:5:66:959:1311
+GGGAAGGAGCATTTTGTCAGTTACCAAATGTGTTT
++
+67.68:4::6;;;7:6:;:5;8;;<<:;;<;;;;<
+@EAS114_45:5:82:843:1838
+CTAGGTAAAAAATTAACATTACAACAGGAACAAAA
++
+;<<;:;;<<<;;<<<<;;<<;;;;;<;;;;68887
+@EAS114_45:5:82:843:1838
+TGTTCTACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGGA
++
+888829;;;;;;;;;;;;;;:;;;;;;;;;;;;;;
+@EAS114_45:5:85:401:1190
+TACACACACATGGTTTAGGGGTATAATACCTCTAC
++
+64778:;69739:;+9::7;;;<;6<;7;;;;;7<
+@EAS114_45:5:85:401:1190
+TCACTCCAGCTCCCTGTCACCCAATGGACCTGTGA
++
+4;;;1;;;;;;.6;;;(;;/;/;3;;;7;(3&063
+@EAS114_45:5:91:89:666
+GAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACAT
++
+74752;;4;;;;;;;;7);;;4;;;;)4;;;;;13
+@EAS114_45:6:14:1211:1332
+AGGAAGATACATTGCAAGACAGACTTCATCAAGAT
++
+978961;;991;97;<;;<;<<;;;;;<;;<:8:<
+@EAS114_45:6:14:1211:1332
+TTTCAAGAAGTATGAGATTATGTAAAGTAACTGAA
++
+;;.;;;;;;;3;;;;;6;;;;;;8;;;;;;63777
+@EAS114_45:6:37:156:134
+AGAGAAAAGCATACAGTCATCTATAAAGGAAATCC
++
+99998<<<<:<<<<<<<;<<><<<<<<<<<<<<<<
+@EAS114_45:6:37:156:134
+GGAAAAACTATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACC
++
+;;;;;;;;;;9;;;;;;;;;;;;;;;9;;;77679
+@EAS114_45:6:39:956:676
+TAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAGGGATGAGA
++
+899985;;<;:9;;:9<;:9:5;<;;;<;<;<<<<
+@EAS114_45:6:39:956:676
+TGAGAGAAGGAGTAGCTATACTTATATCAGATAAA
++
+;;;;;;;;;;;;9;;;;;;;;;;;;;;;9957777
+@EAS114_45:6:44:77:1255
+CTCATTAATAAAGACATGAGTTCAGGTAAAGGGGT
++
+;;;;;;;8;;;7;8;;;;;;;;;;886;;;76777
+@EAS114_45:6:44:77:1255
+TAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGATATAACCATC
++
+79998;;;9:;<696<;.<;;<<;<;<;<;;;<8;
+@EAS114_45:6:45:1769:1130
+ACCCAATGGACCTGTGATATCTGGATTCTGGGAAA
++
+;;;;;;;;;;;;9;;;;;;19;;;9;;;;176777
+@EAS114_45:6:45:1769:1130
+TGTTCTCATCAACCTCATACACACACATGGTTTAG
++
+88989;<;97;9<<;<;;;;9<98<<<<<<<;<<<
+@EAS114_45:6:47:1791:444
+AAGAGGGATGAGAAATTACCTAATTGGTACAATGT
++
+978879;:;;<:;;<<;:<9<<<<;6;;;;<<<<;
+@EAS114_45:6:47:1791:444
+TACTTATATCAGATAAAGCACACTTTAAATCAACA
++
+;3;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;877977
+@EAS114_45:6:59:1548:1096
+CCCTGCCCCATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTG
++
+88888;;88;;;;8;;9;;;<<<<<<<<<<<<<<;
+@EAS114_45:6:59:1548:1096
+GTCCTATGTACTTATCATGACTCTATCCCAAATTC
++
+;.;;;;;;;;6;;;;;;;;;;;;;;;73;;77777
+@EAS114_45:6:5:730:1436
+GAAGAACTTTGATGCCCTCTTCTTCCAAAGATGAA
++
+7977979;;;;;;;;;7;3<;2<;26;<;<<;;<<
+@EAS114_45:6:5:730:1436
+TATTCAGTTCTAAATATAGAAATTGAAACAGCTGT
++
+;;;;;;;;;;;;;;;;;;8;;;;;8;;;;;67777
+@EAS114_45:6:86:693:234
+AAGTAACTGAACCTATGAGTCACAGGTATTCCTGA
++
+;;;;;;;;;;;;;;;;9;;;;;;;;99;;&70777
+@EAS114_45:6:86:693:234
+GTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACATGAAGGA
++
+83997;<;;;;98;;3*6<<;<:8;;;;;<;;<<<
+@EAS114_45:6:86:859:1779
+TTTTTTTCATTTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT
++
+;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;8;;)7699
+@EAS114_45:6:90:561:850
+ACAGGAACAAAACCTCATATATCAATATTAACTTT
++
+;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;9;9;6;77777
+@EAS114_45:6:90:561:850
+TACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGGAGTAGC
++
+78376<;;9<;<<;:9<<<6;<;<;;8;;<;/;;;
+@EAS114_45:6:93:1475:542
+TGAAAGCTTGGGCTGTAATGATGCCCCTTGGCCAT
++
+98987:9:<:;:;;;;;<<;<;<;;;;<<<;;;<<
+@EAS114_45:6:93:1475:542
+TTATCATGACTCTATCCCAAATTCCCAATTACGTC
++
+;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;9;;;9;;;77777
+@EAS114_45:7:14:1256:204
+AAATGTCTATTTTTGTCTTGACACCCAACTAATAT
++
+66777:;;37;;:;;0;:;;;;):;;:7;;;;;;;
+@EAS114_45:7:14:1256:204
+TCACCCAGTCCCTGCCCCATCTCTTGTAATCTCTC
++
+<<<<<;;;;;;<;;;;;;;<;<;;;;<:-;79697
+@EAS114_45:7:14:978:1296
+ATACAATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGAT
++
+;6;;;;;;;;;;;:;;;;;;;6;;;;;;;;77777
+@EAS114_45:7:14:978:1296
+CAATATTCTGATGATGGTTACACTAAAAGCCCATA
++
+77177;9;2:;;:;;(;;9;<;;;;:;;;:7;<<;
+@EAS114_45:7:24:1374:211
+AGCCCTTCTCACAGTTTCTGCCCCCAGCATGGTTG
++
+;;:<<;<;:;;;;;;;;;;<::;;;6;;2+74917
+@EAS114_45:7:24:1374:211
+TGCAATTAATATAATTGTGTCCATGTACACACGCT
++
+77661;;;5;;:;;:;:;;;;;;8:;;;:;;;;;:
+@EAS114_45:7:2:168:1878
+AAAAAACCTGGCAAACACGAATGTTATGACATGTN
++
+;<:;;<:<;<;<;;;;:;<;:::&9:&:68&6&*!
+@EAS114_45:7:2:168:1878
+TAAATACACACAAAAGTAGAAAACGCACCAGTTTT
++
+*3/6)9.;;;;;;;;5;;);;;3;(;;;+(;7.)3
+@EAS114_45:7:33:1566:588
+ACAGCTTAGGCATCAATTTGGTGTTCTGTGTAAAG
++
+-6246;;97;77;;97;;;;;;9;7;79;)&;37;
+@EAS114_45:7:33:1566:588
+TACTGTCATAACTATGAAGAGCCTATTGCCAGATG
++
+<;.;;;;6;;;;6;;29;;;<+9;;;.3;;73797
+@EAS114_45:7:35:538:1882
+TATGCACCTAACACAAGACTACCCAGATTCATAAA
++
+;);43.50;3;93;;4;3;;;9-7.;*;;966*75
+@EAS114_45:7:35:538:1882
+TCTATAACAAAATTAAAATTTAACAAAAGTAAATA
++
+73797;;3<;;<6;;<<<;8:;:;<;:<:;<<;;;
+@EAS114_45:7:37:763:1437
+AAAGATGTTCTACGCAAACAGAAACCAAATGAGAG
++
+;;;;;6;;;;;;;;;:;6;5;5;;;;;76;767/7
+@EAS114_45:7:37:763:1437
+TAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAGGGATGAGA
++
+79979;<;<;;;<;;;;;;6:;<:;<:8;<<<<;<
+@EAS114_45:7:45:1339:1807
+GACATCTAAATGAAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGG
++
+77797;;:;::&:;;0:;8;;4;;:;;6;;;;;;;
+@EAS114_45:7:69:1130:832
+ATAGTTGAAAGCTCTAACAATAGACTAAACCAAGC
++
+;;2<;<;;<;9;<;;;;;;;7;8;;7;;;;77437
+@EAS114_45:7:69:1130:832
+TCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTGGAAA
++
+6)377;3;;;;;;;;;1;;;;;;;;;;;;;;;;;;
+@EAS114_45:7:6:758:988
+AAACAAAGGAGGTCATCATACAATGATAAAAAGAT
++
+3+;0;0;;;0;;;;;;5;;;9;;;;90;;;57560
+@EAS114_45:7:6:758:988
+ATTCTGATGATGGTTACACTAAAAGCCCATACTTT
++
+3-7*73;;399:9;9;7<-(<;;<;;:;9::;;7;
+@EAS114_45:7:88:451:1773
+ATAAATACACACAAAAGTACAAAACTCACAGGTTT
++
+;;:::<:;:<<;:6::;:;;:::;;<;;;367177
+@EAS114_45:7:88:451:1773
+ATTGGCAGAACAGATTTAAAAACATGAACTAACTA
++
+973776;;;;;;;;;::;;;;;;;;;;;;;;3;;;
+@EAS114_45:7:97:1584:777
+CCAGATGAACCACACATTAATACTATGTTTCTTAT
++
+<<;<;;;;<;<;<<;;;;;;;;;;;;;;:;79979
+@EAS114_45:7:97:1584:777
+GTCTCAGGGAGCCGTCCGTGTCCTCCCATCTGGCC
++
+66746,9::9;;;;:;;;;;;;;;;;;;;;:;;;;
+@EAS114_45:7:9:512:826
+AACTTCCACGTCTCATCTAGGGGAACAGGGAGGTG
++
+67<<<;;;<;;<<;;<;<:;9;;;9;;;;<59777
+@EAS114_45:7:9:512:826
+ACCACACATTAATACTATGTTTCTTATCTGCACAT
++
+76777:;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;:;;;
+@EAS139_11:1:35:631:594
+ATCATGACTCTATCCCAAATTCCCAATTACGTCCT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS139_11:1:35:631:594
+ATGATGCCCCTTGGCCATCACCCGGTCCCTGCCCC
++
+<<<<4<<<<<.<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS139_11:1:59:742:549
+ACAAGCAAATGCTAAGATAATTCATCATCACTAAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<
+@EAS139_11:1:59:742:549
+TTAACATTACAACAGGAACAAAACCTCATATATCA
++
+-<<<3<<<<6<<6<<<<<6<<<<6<<<<<<<<<<<
+@EAS139_11:1:81:1019:558
+ACAAAACTCACAGGTTTTATAAAACAATTAATTGA
++
+<<<<<<<<<<<6<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<
+@EAS139_11:1:81:1019:558
+TGAACTAACTATATGCTGTTTACAAGAAACTCATT
++
+<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS139_11:1:84:92:1246
+GAAAAAAGTAAACTCTCAAATATTGCTAGTGGGAG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<8<<<<<<5<<<<<<<<<<<<
+@EAS139_11:1:84:92:1246
+GTTACACTAAAAGCCCATACTTTACTGCTACTCAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<5<:<<5<<<<<<<<<<<<<
+@EAS139_11:2:31:628:1820
+AACCAGTCCTATAAGAAATGCTCAAAAGAATTGTA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<
+@EAS139_11:2:31:628:1820
+CAGGAACAAAACCTCATATATCAATATTAACTTTG
++
+<<<<<<:<<<<:6<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS139_11:2:42:333:516
+AGACAAGTCTCTTATGAATTAACCCAGTCAGACAA
++
+<<<<<5<*<2<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<</
+@EAS139_11:2:42:333:516
+TCTTTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACATCTAAATG
++
+<<<<<<<<7<63<7<<<<<<<<<<<7<<<<<<<<<
+@EAS139_11:2:55:296:1457
+CACTTTAAATCAACAACAGTAAAATAAAACAAAGG
++
+-<%63<<<<<1<<<<<5<<<<<<<<<<<<<<<7<<
+@EAS139_11:2:55:296:1457
+CCCACTTAAGAGATATAGATTGGCAGAACAGATTT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS139_11:2:63:816:921
+AAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACATCT
++
+<<<<<<<<<4<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS139_11:2:63:816:921
+TGAAGACAAGTCTCTTATGAATTAACCCAGTCAGA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<4<846
+@EAS139_11:2:6:251:1557
+AAAACAATGTTCCCCAGATACCATCCCTGTCTTAC
++
+<<<<<<<<<<<<6:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS139_11:2:6:251:1557
+CCTGAGAGATTCTGCAGCCCAGCTCCAGATTGCTT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS139_11:2:71:83:58
+AAAGAAAAAAGAATTTTAAAAATGAACAGAGCTTT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS139_11:2:71:83:58
+CCAGGAAGATACATTGCAAGACAGACTTCATCAAG
++
+8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS139_11:3:34:970:1374
+ATGTGTTTATTACCAGAGGGATGGAGGGAAGAGGG
++
+<<<<<<<<<<<<<<;7<77;<<;<;;9;;:86:::
+@EAS139_11:3:34:970:1374
+CTGGACCCTGAGAGATTCTGCAGCCCAGATCCAGA
++
+<6<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS139_11:3:43:1229:1855
+ATGTACAATATTCTGATGATGGTTACACTAAAAGC
++
+8<<<<;8<<<;;5<<28<<<<<<<<<<<<7;;<<;
+@EAS139_11:3:43:1229:1855
+CAACAGTAAAATAAAACAAAGGAGGTCATCATACA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<4<<<<<<<<<
+@EAS139_11:3:65:556:1505
+CAATGAACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<6<<<<<<<<<<<
+@EAS139_11:3:65:556:1505
+TGCCTTCAGACCCTACACGAATGCGTCTCTACCAC
++
+<6<8<<4<8;;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS139_11:3:81:12:1231
+AAAAAGCAAAAACAAAAACTATGCTAAGTATTGGT
++
+<<<<<<<7<<<<<<<5<'<6/<<<5<<<<<<2<<<
+@EAS139_11:3:81:12:1231
+TTACCTAATTGGTACAATGTACAATATTCTGATGA
++
+<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<4<<6
+@EAS139_11:4:26:137:1382
+AATGTTATGCCCTGCTAAACTAAGCATCATAAATG
++
+<<-<8<<<<<<:<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS139_11:4:26:137:1382
+AGACTATCTAAAGTCAACATGAAGGAAAAAAATTC
++
+<<<<<<7<<<77<<<<<<</<<+<<<<<<7<+<<<
+@EAS139_11:4:36:1184:994
+GCCAGAAGAGATTGGATCTAATTTTTGGACTTCTT
++
+<84<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS139_11:4:36:1184:994
+TACATTGCAAGACAGACTTCATCAAGATATGTAGT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<<8<
+@EAS139_11:4:36:1231:1381
+AAGAGATATAGATTGGCAGAACAGATTTAAAAACA
++
+<<<<<<;<<<<<<<<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS139_11:4:36:1231:1381
+TAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAATACTCACCATCA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS139_11:4:38:557:1441
+GATAAAAATAAAAAAGCAAAAACAAAAACTATGCT
++
+<&<<<<<,<<<<<<<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS139_11:4:38:557:1441
+TAAGAGGGATGAGAAATTACCTAATTGGTACAATG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<
+@EAS139_11:4:50:30:15
+AGATTATGTAAAGTAACTTAACCTATGAGTCCAAG
++
++:79.68872.:9&:92/.299169/5+/6/3/&2
+@EAS139_11:4:50:30:15
+TACATTGCAAGACAGTCGTCAGCAAGATATGTAGT
++
+1-%-22&&)&11,&/&&176<&<<<222<,6,<<<
+@EAS139_11:4:63:527:1923
+GCTTTACTGTCATAACCATGAAGAGACTATTGCCA
++
+9<<<8<-8;;8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS139_11:4:63:527:1923
+TACACGAATGCGTCTCTACCACAGGGGGCTGCGCG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<3<<<<<<<<<<<<
+@EAS139_11:5:32:686:735
+AAGTTTGGAAAAACTATTTGAGGAAGTAATTGGGG
++
+<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS139_11:5:32:686:735
+CAGAAGAAAGAGGTTCANANNNTGANGACAAGTCT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<!<!!!<<<!<<<<<<<<<
+@EAS139_11:5:41:314:1173
+AAGAAAAAAAAACCTGTCAAACACGAATGTTATGC
++
+<;<<<<<<<;;<<<<<-<<<;;;<;8<*;;<<<<'
+@EAS139_11:5:41:314:1173
+AATTAAAGTTCAATACTCACCATCATAAATACACA
++
+<<2**<<82/<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS139_11:5:52:1278:1478
+GCTTGTACTTCTAAATCTATAACAAAATTAAAATT
++
+<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<
+@EAS139_11:5:52:1278:1478
+GTTTTTTTTTTTTTCTTTTCTCTTTTTTTTTTTTT
++
+.8::<<<<<<<;<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS139_11:5:61:38:1182
+AGGGAGCCGTCCGTGTCCTCCCATCTGGCCTCGTC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<5<<<<
+@EAS139_11:5:61:38:1182
+GTTTGATTTGGTGGAAGACATAATCCCACGCTTCC
++
+9:;<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS139_11:5:64:199:1288
+GTAAAATAAAACAAAGGAGGTCATCATACAATGAT
++
+<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<;<<<;<
+@EAS139_11:5:64:199:1288
+TACAATGTACAATATTCTGATGATGGTTACACTAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS139_11:5:78:775:555
+AATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAAAG
++
+<<-<%4/<<<<<<<<<<<<<<<<<5<<<0<<<<<<
+@EAS139_11:5:78:775:555
+TTTTTGGACTTCTTAAAGAAAAAAAAACCTGTCAA
++
+6:<<<<:<<<<6:<<)::8<6<<:<<)<::63832
+@EAS139_11:6:11:285:1567
+ACATGGCTGATTATGAAAACAATGTTCCCCAGATA
++
+<8<4<<<;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS139_11:6:11:285:1567
+CCCTGAGAGATTCTGCAGCCCAGATCCAGATTGCT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS139_11:6:11:360:1577
+GAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGATGTGTGTTCT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<4<;;<<;;<;<<<8<<<<
+@EAS139_11:6:11:360:1577
+TTTGGCATTTGCCTTCAGACCCTACACGAATGCGT
++
+1<1<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS139_11:6:13:682:680
+AGAATAACAATGGGCTTCTCAGCGGAAACCTTACA
++
+<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<;<;<<<<<<<<
+@EAS139_11:6:13:682:680
+ATAAGAAATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAA
++
+<<<<<<<<<<:<5<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS139_11:6:17:1179:393
+CTAATTGGTACAATGTACAATATTCTGATGATGGT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<:4<
+@EAS139_11:6:17:1179:393
+TGCTAAGTATTGGTAAAGATGTGGGGAAAAAAGTA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS139_11:6:19:306:982
+ATTTTTGGACTTCTTAAAGAAAAAAAAACCTGTCA
++
+<<<<<<<<<9<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS139_11:6:19:306:982
+GACAGACTTCATCAAGATATGTAGTCATCAGACTA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<
+@EAS139_11:6:75:946:1035
+AACCCCCTTGCAACAACCTTGAGAACCCCAGGGAA
++
+<<<<<<<<<<;<<<;<<<<<<<8;<6<<<<44<:4
+@EAS139_11:6:75:946:1035
+AATGGACCTGTGATATCTGGATTCTGGGAAATTCT
++
+<<)4</<5<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<66<<<<
+@EAS139_11:6:82:164:1924
+GAGGGATGGAGGGAAGAGGGACGCTGAAGAACTTT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<<<<<<3<<'<7<8
+@EAS139_11:6:82:164:1924
+GCCCAGCACCAGATTGCTTGTGGTCTGACAGGCTG
++
+6<<<<<<-<<<<<<<<<2<<06<9<<<<<1<<<<<
+@EAS139_11:6:89:1151:1878
+CCATCACAATGAACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTC
++
+<;;<<<<<;;;<<<<4;;::;<;8;;<;;8:<8<4
+@EAS139_11:6:89:1151:1878
+CTTTCAACGATTCTAGCCATTTCTTTTGGCATTTG
++
+8<66,,<<<<<<:<<<<<9<<<:<<<<<<<<<<<<
+@EAS139_11:7:24:1345:1627
+AGATTGGCAGAACAGATTTAAAAACATGAACTAAC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<8<3
+@EAS139_11:7:24:1345:1627
+NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
++
+!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!
+@EAS139_11:7:42:1091:1726
+CAGGGAAGGAGCATTTTGTCAGTTACCAAATGTGT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<<<<<<8:<.<:
+@EAS139_11:7:42:1091:1726
+TCTGGGAAATTCTTCATCCTGGACCCTGAGAGATT
++
+4443838<4<8<87<<3</8<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS139_11:7:46:695:738
+CAAAGATGAAACGCGTAACTGCGCTCTCATTCACT
++
+<<<<2<5<<-<<<<<<<4<<<<<<<<<<<<<<3<<
+@EAS139_11:7:46:695:738
+TGAAACAGCTGAGTTTAGCGCCTGTGTTCACATAG
++
+<;<<<<;<<),&4<3<<7&7<0;)).3;79;7<;0
+@EAS139_11:7:50:1229:1313
+ACATAGCTAAAACTAAAAAAGCAAAAACAAAAACT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS139_11:7:50:1229:1313
+TTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCATGCCA
++
+<<<<,<&<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS139_11:7:53:458:581
+CTCAATTAATTGTTTTATAAAACCTGTGAGTTTTG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<99<<<<<
+@EAS139_11:7:53:458:581
+TTATGCCCTGCTAAACTAAGCATCATAAATGAAGG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS139_11:7:60:163:1612
+AGCAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTATAAAGGAA
++
+<<<<<<<<<21<<<<<<<<<3<--<+<<<+<<63<
+@EAS139_11:7:60:163:1612
+GGGAACTAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAAT
++
+-<<<<)<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<<<<<<<
+@EAS139_11:7:74:213:877
+AGATGTTCTACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAA
++
+<<<<<<<&<<-<-<<<7<<<<<77<<<<<<<<<<<
+@EAS139_11:7:74:213:877
+TTAACATTACAACAGGAACAAAACCTCATATATCA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS139_11:7:92:367:1495
+ACCACAGGGGGCTGCGCGGTTTCCCATCATGAAGC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<6<<<6<<
+@EAS139_11:7:92:367:1495
+CTGTCATAACTATGAAGAGACTATTGCCAGATGAA
++
+<8<88<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS139_11:8:17:437:1378
+ACCAGTCCTATAAGAAATGCTCAAAAGAATTGTAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS139_11:8:17:437:1378
+ATCAATATTAACTTTGAATAAAAAGGGATTAAATT
++
+<<7<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS139_11:8:26:1221:222
+AAACAGCTGTGTTTAGTGCCTTTGTTCAACCCCCT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS139_11:8:26:1221:222
+CTGCGCTCTCATTCACTCCAGCTCCCTGTCACCCA
++
+<<<<<<<:<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS139_11:8:38:842:395
+GTAACTGCGCTCTCATTCACTCCAGCTCCCTGTCA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<93<;9
+@EAS139_11:8:76:205:587
+GAATAACAATGGGCTTCTCAGCGGAAACCTTACGA
++
+8<<5<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<</<
+@EAS139_11:8:76:205:587
+TGCTAGAGATTTAGACATCTAAATGAAAGAGGCTC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS139_11:8:82:566:1096
+CAAAAGGTGATGTGTGTTCTCATCAACCTCATACA
++
+<<<<<<<<<<:<<<<<<<:<<<<<<:<<<<<<<<<
+@EAS139_11:8:82:566:1096
+CTGCGCTCTCATTCACTCCAGCTCCCTGTCACCCA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<;<;
+@EAS139_11:8:96:1314:1448
+CCTATGAGTCACAGGTATTCCTGAGGAAAAATAAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<5<4<<<<-<<<
+@EAS139_11:8:96:1314:1448
+GTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACATGAAGGA
++
+<<<<7<<:<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS139_19:1:14:420:712
+TGAGAGAGAACTTCCCTGGAGGTCTGATGGCGTTTCTCCC
++
+1::::<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS139_19:1:14:420:712
+TGTTGGTTTTCTGTTTCTTTGTTTGATTTTTTTGAAGACA
++
+<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<;<<<-;<<<&,<&*8111:6
+@EAS139_19:1:1:1598:843
+TCAGCGGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGATTGGATCTAAT
++
+1)::6::<<;<98<<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS139_19:1:1:1598:843
+TGCCAGGAAGATACATTGCAAGACAGACTTCATCAAGATA
++
+<<<<<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<4:8::
+@EAS139_19:1:36:481:1079
+GTAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAATACTCACCATCATAAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<::::8
+@EAS139_19:1:36:481:1079
+TCCCCCACTTAAGAGATATAGATTGGCAGAACAGATTTAA
++
+:11+)*<4;<<<<<<<<<;;<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<
+@EAS139_19:1:40:1596:1433
+CCATCACAATGAACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<1<<<<<::;::
+@EAS139_19:1:40:1596:1433
+GCTTTCAACGCTTCTAGCCATTTCTTTTGGCATTTGCCTT
++
+-:8:1841<4;<88<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS139_19:1:47:352:1492
+AGGGAGCCGTCCGTGTCCTCCCATCTGGCCTCGCCCACTA
++
+:<<<::<24<04-&<;<<2<<<&<60)&<5<<6*8:)9+*
+@EAS139_19:1:47:352:1492
+TTTGTTTTGTATGGTGGAAGACATAATCCCACGCTTCCTA
++
++7+/7+/%%1'6+3++1;:</<<5<)27<<9<)9<<9<7<
+@EAS139_19:1:53:463:1132
+ATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGATATAACCATCC
++
+;::;:<<<<<<<<:<<;<<<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS139_19:1:53:463:1132
+ATTTAAAAACATGAACTAACTATATGCTGTTTACANGAAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<8<<<<<<<8<!1488
+@EAS139_19:1:58:726:1746
+AGATTGGCAGAACAGATTTAAAAACATGAACTAACTATAT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<6<<<<8<<<<<<<<:8:8:88
+@EAS139_19:1:58:726:1746
+CAATTTAAATCAACAACAGTAAAATAAAACAAAGGAGGTC
++
+&:&::;<<<76<<:<<6<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS139_19:1:82:946:392
+CAATATATCCATGTAACAAATCTGCGCTTGTACTTCAAAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<<<8<<8<<:4488
+@EAS139_19:1:82:946:392
+GAAAACAATTTGGTAATTTCGTTTTTTTTTTTTTCTTTTC
++
+:;:;:,::<:;<<<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS139_19:1:85:1521:58
+AAATTAACATTACAACAGGAACAAAACCTCATATATCAAT
++
+:::86<<:<<8<<<<;<<8<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<
+@EAS139_19:1:85:1521:58
+CTGACAAGCAAATGCTAAGATAATTCATCATCACTAAACC
++
+<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<;;:7:
+@EAS139_19:1:87:1222:878
+TATAGGGCCTTTGTTCAAACCCCTTGCAACAACCTTGAGA
++
+&+6<6&<:<<9<1112<<;)9227</);;;2-79;)/769
+@EAS139_19:1:87:1222:878
+TCAGCGCGTCACTCCGCTCTCATTCACCCCAGCTCCCTGT
++
+!!;*:885<&<<<)8&<:<<<8<8<::*<4<88<<<8<<<
+@EAS139_19:1:99:1632:76
+AAAGAAAAAAAACCCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTG
++
+<<<<<<<<<<<<*<<<<8<9<<<<<<<<<9;;;;<18:;:
+@EAS139_19:1:99:1632:76
+TTGTAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAATACTCACCATCATA
++
+4641::<<4<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS139_19:2:12:1335:1372
+GAAGAACAGATTTAAAAACATGAACTAACTATATGCTGTT
++
+:&;;;<*<<<9<<<<<<<<<<<<<<4<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS139_19:2:12:1335:1372
+TAAAGTTCAATACTCACCATCATAAATACACACAAAAGTA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<99::.:
+@EAS139_19:2:29:1822:1881
+AGAAAAAAGAATTTTAAAAATGAACAGAGCTTTCAAGAAG
++
+<<<<<<<<<<<<4<<<<<<<<<<<<<<:<<<:<<;:::::
+@EAS139_19:2:29:1822:1881
+ATGAAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACATTGCAA
++
+;87;;<<<;<5<5<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<:<<<<<<
+@EAS139_19:2:2:1217:398
+CAATTAATTGAGACTACAGAGCAACTAGGTAAAAAATTAA
++
++;;:9<<66<<<;+<<7<<<<;<<+;<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS139_19:2:2:1217:398
+TAAATGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGC
++
+<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<7<<<3<<<<;<<<<9:7::
+@EAS139_19:2:33:1193:664
+GCCCCATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTTCTGCATCCC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<%:<'<9:::9
+@EAS139_19:2:33:1193:664
+TATTTTTGTCTTGACACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAA
++
+;;;;;;<;;-9<<<:</+9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS139_19:2:57:1672:1890
+CCCCCCCCCCCCCCCCCAGCCACTGCGGCCCCCCCAGCCA
++
+-+)%)'-'+,,<066,))090+:&486083:5&&:<<5<0
+@EAS139_19:2:57:1672:1890
+TATTCAGTTCTAAATATAGAAATTGAAACAGCTGTGTTTA
++
+:;;;9<8;;*<<<<<<:<<<<<<<<1:<<<<<<<<<<<7<
+@EAS139_19:2:82:154:1333
+TTAAAATTTAACAAAAGTAAATAAAACACACAGCTAAAAC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<;;:;:
+@EAS139_19:2:82:154:1333
+TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTT
++
+:5'::<<<;<<<<<<</3<<<&4&7<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS139_19:3:10:349:1147
+GCTAGAGATTTAGACATCTAAATGAAAGAGGCTCAAAGAA
++
+:/:::<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS139_19:3:24:1135:563
+CTGCGCTCTCATTCACTCCAGCTCCCTGTCACCCAATGGA
++
+6+96:87<&8<<79:<;<<<<:<<;<<<<<<;;<<<<<<<
+@EAS139_19:3:24:1135:563
+GCTGTGTTTAGTGCCTTTGTTCAACCCCCTTGCAACAACC
++
+<<<<:<<<<:1:<<<<<<.<<<<<<<<;<;;;43+:30::
+@EAS139_19:3:4:1502:1911
+CTACACGAATGCGTCTCTACCACAGGGGGCTGCGCGGTTT
++
+:+:::5/;99<;<&<*<-9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS139_19:3:4:1502:1911
+TACACACACATGGTTTAGGGGTATAATACCTCTACATGGC
++
+<<<:4<<<<<<;<<<<;9;5<95<;<<;9+;1612:1:::
+@EAS139_19:3:58:923:1915
+GCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGGAGTAGCTATACTTA
++
+:+;;;8<<<<<<,<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS139_19:3:58:923:1915
+TATCAATATTAACTTTGAATAAAAAGGGATTAAATTCCCC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;<<<<<<<:::::
+@EAS139_19:3:5:538:401
+AAGGTGATGTGTGTTCTCATCAACCTCATACACACACATG
++
+<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<;<::7<<;<53:<98;;;;;
+@EAS139_19:3:5:538:401
+TTTGCCTTCACACCCTACACGAATGCGTCTCTGCCACAGG
++
+671&7::49:&0<<<(<::<&<<<:<<<<<<<&<<<<1<<
+@EAS139_19:3:66:718:481
+AACAACAGTAAAATAAAACAAAGGAGGTCATCATACAATG
++
+::5::1<;;<<<<<<1<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<<<<<
+@EAS139_19:3:66:718:481
+AAGAGATATAGATTGGCAGAACAGATTTAAAAACATGAAC
++
+<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<;<<<<<<<;<<<:1:;:
+@EAS139_19:3:73:1158:535
+AATAAAGATATGTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACAT
++
++;6+;<;<<<<<<<<<0<<;<<<;<<<8<<<<<<<<<<<<
+@EAS139_19:3:73:1158:535
+CCTATGAGTCACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<;;<<<<<9<<9::8:8
+@EAS139_19:3:73:936:1509
+CTCCTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTTATTT
++
+<<<<<<<<<7<<7<<<<<<<;<<<<<<<<<:<:<;%8:::
+@EAS139_19:3:73:936:1509
+TTGTCTGAGCAAAACAGTCTAGATGAGAGAGAACTTCCCT
++
+99;66:<<;-<<<<:<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS139_19:3:75:732:442
+CGGTCCCTGCCCCATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTGC
++
+7,*&28<61:88<.7<:<<:6<1<85:<:1<5<&::<<&<
+@EAS139_19:3:75:732:442
+CTATCCCAAATTCCCAATTACGTCCTATCTTCTTCTTAGG
++
+<<<<<;<<<<<9<<<;<<;<<<5<<;8<<<<<<<<;:9%%
+@EAS139_19:3:87:133:930
+CAGTCTCAGGGCGCCGTCCGTTTCCTCCCATCTGGCCTCG
++
+)8&)907)-;9&,<<9)<;<<0<;<<99<<<<<<;<<9<<
+@EAS139_19:3:87:133:930
+TTATCTGCACATTACTACCCTGCAATTAATATAATTGTGT
++
+<<<7<<<<;<<;7<<7<<;;<<<;<5;<;;;5;;<:/48:
+@EAS139_19:3:88:1656:896
+AGGGAAGAGGGATGCTGAAGAACTTTGATGCCCTCTTCTT
++
+<<<9<<<<<<<9<<<;<<<<<<<<<;6<<;7<<<<::9:;
+@EAS139_19:3:88:1656:896
+TGCAGCCCAGATCCAGATTGCTTGTGGTCTGACAGGCTGC
++
+6/8::*9/*3*'<88<:9*<<<8<<<;<<<<<<<<;<<<<
+@EAS139_19:4:13:1155:631
+ACCCTGAGAGATTCTGCAGCCCAGCTCCAGATTGCTTGTG
++
+<<<<<<;<<;<<<<<<;<<<<<9<;<;94<<%<<<7:777
+@EAS139_19:4:13:1155:631
+AGGGGTATAATACCTCTACATGGCTGATTATGAAAACAAT
++
+;:398<<;<<<<<;<3<;;<<<<;;<<<<<<<<<<;<<;<
+@EAS139_19:4:18:1335:1514
+ATTGGTACAATGTACAATATTCTGATGATGGTTACACTAA
++
+::/::<<;<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS139_19:4:18:1335:1514
+CTTTAAATCAACAACAGTAAAATAAAACAAAGGAGGTCAT
++
+<<<;<<<<<<<<<<<<<<<;<:<<;<<<<<<;<;<;;;9;
+@EAS139_19:4:1:156:196
+AAAAGGGATTAAATTCCCCCACTTAAGAGATATAGATTGG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<:;9:9
+@EAS139_19:4:1:156:196
+ACTTATATCAGATAAAGCACACTTTAAATCAACAACAGTA
++
+:::::<<<<<<<<<<<<<4<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS139_19:4:26:1312:1400
+ACTGAACCTATGAGTCACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAA
++
+<<<<;<<<:<<:<;<:<<<;:;<<<<<<:<8<1;;:::88
+@EAS139_19:4:26:1312:1400
+TATGTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACATGAAGGAAA
++
+::77:<;:+6<+<<<;<<74<<<;<<;<<<<<<<<<<<;<
+@EAS139_19:4:26:274:1078
+AATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGATTTAGAC
++
+<<<2<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;:;;;:::::
+@EAS139_19:4:26:274:1078
+GTCATCTATAAAGGAAATCCCATCAGAATAACAATGGGCT
++
+9:*:64<<;<<<<<<<<<;8;<<:<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS139_19:4:68:1122:79
+ATGGCTGATTATGAAAACAATGTTCCCCAGATACCATCCC
++
+::77*:1<<<<<<<<<<<<<<<:;<<<;<<<<<<8<<<<<
+@EAS139_19:4:68:1122:79
+TGAGAGATTCTGCAGCCCAGCTCCAGATTGCTTGTGGTCT
++
+<<<<<<<<<<<<<;<<<<;<<<<<<;<<<4;<<4;99::;
+@EAS139_19:4:69:1593:819
+ATTGAGACTACAGAGCAACTAGGTAAAAAATTAACATTAC
++
+<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<;;<:<<<<<:<<<<<:777:
+@EAS139_19:4:69:1593:819
+CAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAACAGAA
++
+);::7<<<<:;<<<<<<<<<<<<<<<9<<9<3<<<<<<<<
+@EAS139_19:4:77:1780:693
+GGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGAT
++
+:**::799<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS139_19:4:77:1780:693
+TGAAGACAAGTCTCTTATGAATTAACCCAGTCAGACAAAA
++
+<<<<<<<<<<<<;<<:<<;<<<<<<<<<<<<;<<<;;:69
+@EAS139_19:4:78:806:800
+AAATTAAAGTTCAATACTCACCATCATAAATACACACAAA
++
+::;9:<<<;<<:<<<<:<.<1:<<1<<<<<<;<<<<<<<<
+@EAS139_19:4:78:806:800
+AACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCTAAACTAAGC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<4<<:<1<0<;<9;<:78::::
+@EAS139_19:5:29:411:1208
+AAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAATACTCAC
++
+<<<<;<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;;;;
+@EAS139_19:5:29:411:1208
+CCCCCACTTAAGAGATATAGATTGGCAGAACAGATTTAAA
++
+766+6<996<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS139_19:5:40:758:116
+GTCTCTACCACAGGGGGCTGCGCGGTTTCCCATCATGAAG
++
+25/8/:<75:2<<<<<<7<<;<<<<<<<88;<<<<<<<<<
+@EAS139_19:5:40:758:116
+GTGTGTTCTCATCAACCTCATACACACACATGGTTTAGGG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<:7262
+@EAS139_19:5:4:939:2021
+AAATACTACTAGACCTAAGAGGGATGAGAAATTACCTAAT
++
+;;;;:8;<5:<<<7/<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS139_19:5:4:939:2021
+GGAGTAGCTATACTTATATCAGATAAAGCACACTTTAAAT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<97<<<;<<;<7;<<:48::
+@EAS139_19:5:57:366:844
+AAATTCCCCCACTTAAGAGATATAGATTGGCAGAACAGAT
++
+;;;7:8&555<,;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS139_19:5:57:366:844
+TAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAATACTCACCATCATAAAT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<::::7:
+@EAS139_19:5:61:1885:163
+AGCAAGAAGATATAACCATCCTACTAAATACATATGCACC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<9::::4
+@EAS139_19:5:61:1885:163
+ATACTTTACTGCTACTCAATATATCCATGTAACAAATCTG
++
+;:;;;;<<8<<:<<:<;<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS139_19:5:66:1381:181
+GGACTTCTTAAAGAAAAAAAAACCTGTCAAACACGAATGT
++
+;;;+;;&<7<<<+<<<<<<<;<;8<<<;<<<<8<<<;<<<
+@EAS139_19:5:66:1381:181
+TTGCAAGACAGACTTCATCAAGATATGTAGTCATCAGACT
++
+<<6<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<::4:7
+@EAS139_19:5:68:306:409
+AACTTTGAATAAAAAGGGATTAAATTCCCCCACTTAAGAG
++
+::2:7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS139_19:5:68:306:409
+CCTATAAGAAATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:;:;;
+@EAS139_19:5:70:318:1631
+TAAGAAATTACAAAATATAGTTGAAAGCTCTAACAATAGA
++
+<<<<<<;<<<<<<<<<<<<;9:<<<<<<<<<<<<<:::78
+@EAS139_19:5:74:668:424
+GACTTCTTAAAGAAAAAAAAACCTGTCAAACACGAATGTT
++
+;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;::;;
+@EAS139_19:5:74:668:424
+GTAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAATACTCACCATCATAAA
++
+:::::<<96<<<<<;<<<;<<5<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS139_19:5:89:525:113
+GACGCTGAAGAACTTTGATTCCCTCTTCTTCCAAAGATGA
++
+);:+4-&<<+<<:<+<)<<<7<8<8:<:<<:<82::<<2<
+@EAS139_19:5:89:525:113
+TATTTATGCTATTCAGTTATAAATATAGAAATTGAAACAG
++
+<1<7<6;+0;7;7'<70;-<7<:<:<<5<<:9<5:7:%:7
+@EAS139_19:5:95:944:247
+GGTACAATGTACAATATTCTGATGATGGTTACACTAAAAG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<:;:::
+@EAS139_19:5:95:944:247
+GTAAAGATGTGGGGAAAAAAGTAAACTCTCAAATATTGCT
++
+:7::;<<<<<;;<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<
+@EAS139_19:6:21:1601:1666
+GAAAGCTCTAACAATAGACTAAACCAAGCAGAAGAAAGAG
++
+7<<<<<<<<:<<7<<<:<<<<<<4<<44<<914<;:5:::
+@EAS139_19:6:21:1601:1666
+TATTACTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAA
++
+-;;3&1<<<<<<<<<<<<1<<<</<<<<<</<<<<<<<<<
+@EAS139_19:6:52:1455:1212
+CCATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTGCTGCATCCCTGT
++
+6::4::;4%;9:<79)<:<;<<:4::7<<9<&+71<9;<<
+@EAS139_19:6:52:1455:1212
+TTCTTAGGGAAGAACAGCTTAGGTATCAATTTGGTGTTCT
++
+<9<<<99<;<<9<;<-<<<6<<75;;<*%<5<3+.8:*5;
+@EAS139_19:6:72:308:839
+AGTTACCAAATGTGTTTATTACCAGAGGGATGGAGGGAAG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<;<99494416:
+@EAS139_19:6:72:308:839
+ATCGTGGACCCTGAGAGATTCTGCAGCCCAGATCCAGATT
++
+:8:.:<;<<5<<<<<<<<<<<<<<<<;:<<<<<<<<<<<<
+@EAS139_19:6:75:1503:1399
+CAAGAAGATATAACCATCCTACTAAATACATATGCACCTA
++
+&;;8;<<<;<<<<,6<<70<<7<<<<<<9<<<<<<<<<<<
+@EAS139_19:6:75:1503:1399
+CATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTACGC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<;<<<<<<;<<<<:::711
+@EAS139_19:6:78:1029:512
+AGATAATTCATCATCACTAAACCAGTCCTATAAGAAATGC
++
+;;;;;<;;<<<.<<6;<<;<;8<<<<::<<<<<<<<;<<<
+@EAS139_19:6:78:1029:512
+TCAGCAGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGATTGGATCTAAT
++
+<0:;<<<<<<<<<:<<:;<<<;<7<<;<7;;;:6;::672
+@EAS139_19:6:82:1051:921
+GCAAATAGGTAAAAAATTAACATTACAACAGGAACAAAAC
++
+3-::-7<;+:9<;<<<5<;9,::53-;:3<<<<9<<3<<<
+@EAS139_19:6:82:1051:921
+GGGGAAATAAAGTCAAGGCTTTCCTGACAAGCAAATGCTA
++
+<<<<<9<799<<<<7::/<<<9<7:9:;2:7552+9''66
+@EAS139_19:6:84:438:1505
+ATTAATATAATTGTGTCCATGTACACACTCTGTCCTATGT
++
+:0::413::;:::0:179::3<;<:<9<&6<<<;<019<<
+@EAS139_19:6:84:438:1505
+GCACTAATGCGCTCCACGCCCAAGCCCTTCTCACAGTTTC
++
+35<<:;9<;<;5<<<:<3<<7:<9/<)<<:::9<&5;;+1
+@EAS139_19:7:44:1807:833
+ATATCCATGTAACAAATCTGCGCTTGTACTTCTAAATCTA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;<<<;<<9<<<<<89;;;:
+@EAS139_19:7:44:1807:833
+CTCTCAAATATTGCTAGTGGGAGTATAAATTGTTTTCCAC
++
+:6:9:<<<6<88<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS139_19:7:85:262:751
+CCATGTAACAAATCTGCGCTTGTACTTCTAAATCTATAAC
++
+22;99;<<8<<<<<<<;<;<<<<<;<<;<<<<<<<<<<<+
+@EAS139_19:7:85:262:751
+TACAATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGATATAACC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:::92
+@EAS139_19:7:92:288:1354
+TCTCCTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATT
++
+<<<<<<:<<<<<<<<<<<8<<:<<<<;;<8<<<8<:8+::
+@EAS139_19:7:92:288:1354
+TGTCTTGACACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAAAACAGT
++
+::::;;;<<<<9;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS188_4:5:103:870:105
+AAACTAAGCATCATAAATGAAGGGGAAATAAAGTC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<<<<<;<<7;
+@EAS188_4:5:103:870:105
+ATAAAACAATTAATTGAGACTACAGAGCAACTAGG
++
+<<<<<<<<<<<<<=<:<;<<<<<<<<<<*<<<<<<
+@EAS188_4:5:166:776:590
+CTTGAAAGCTTGGGCTGTAATGATGCCCCTTGGCC
++
+<;:;<<;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS188_4:5:166:776:590
+TAATTGTGTCCATGTACACACGCTGTCCTATGTAC
++
+<<<<<</<<<<<<<<<<<<<'<=<:26.</79<::
+@EAS188_4:5:202:326:680
+ACTTATCATGACTCTATCCCAAATTCTCAATTACG
++
+<<<<<<<4<<<*<<<*<<<7..:7<3*:7.7<+.;
+@EAS188_4:5:202:326:680
+GTAATGATGCCCCTTGGCCATCACCCGGTCCCTGC
++
++33<81<:*<;<;;30;<<<;<<<8<<<<<<<<<<
+@EAS188_4:5:295:547:216
+ATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS188_4:5:295:547:216
+TAAAAAATTAACATTACAACAGGAACAAAACCTCA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<;
+@EAS188_4:5:302:997:951
+ATGAACTTCTGTAATTGAAAAATTCATTTAAGAAA
++
+<<<<<<<<<<;<<:<<52<<:;;<6<<;<:<2:9/
+@EAS188_4:5:308:552:77
+TTTTCTTTTTTTTCTTTTCTCTTTTTTTTTTTTTT
++
+1;-<%<;8<<<<<&<5-<58:5:<<<<<<<<<<<<
+@EAS188_4:5:8:377:655
+CTATTTTTGTCTTGACACCCAACTAATATTTGTCT
++
+;<8;;:<;<<:<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;
+@EAS188_4:5:8:377:655
+CTGCCCCATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTGCT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS188_4:7:282:567:481
+GGAACAGGGAGGCGCACTAATGCGCTCCACGCCCA
++
+<<<<<<<<<<<<3<7<7<<<<;<<0)<<<<<<<<3
+@EAS188_4:7:282:567:481
+TGCAATTAATATAATTGTGTCCACGTACACACGCT
++
+<9<6<;<9<<<;<<<;<5<7<5</7<<<<<<<<<<
+@EAS188_4:7:296:401:60
+AATGAAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACA
++
+<<*<<<<7<<)<<3<<<9<<<<<<<<<<<<<<;<<
+@EAS188_4:7:35:408:348
+AAGAAACGCGTAACTGCGCTCTCATACACTCCAGC
++
+4,'3<6;)2);<3<-6<;<;7+7<5+<<<7<<<<<
+@EAS188_4:7:35:408:348
+GGTTCTCAAGGTTGTTGCAATGGGGTCTATGTGAA
++
+.73<;<<:77<<<<<<<<<<-<<;<<<<<<<<<<<
+@EAS188_4:7:78:583:670
+CAGGGAATTTGTCAATGTCAGGGAAGGAGCATTTT
++
+8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS188_4:7:78:583:670
+TAACCTCTGGTGACTGCCAGAGCTGCTGGCAAGCT
++
+<<<<<<<<<<;;;<;;<<<:7;5;<5;;<2--8-;
+@EAS188_4:7:96:899:106
+TCTATAAAGGAAATCCCATCAGAATAACAATGGGC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS188_4:7:96:899:106
+TTCCTGACAAGCAAATGCTAAGATAATTCATCATC
++
+;;;;<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS188_7:1:115:683:296
+AACAGTCTAGATGAGAGAGAACTTCCCTGGAGGTC
++
+<<<<;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS188_7:1:115:683:296
+CTCTCCTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTC
++
+<<<<<<<<<<<8<<<<<<<<<<6<<<<3<<<<<<<
+@EAS188_7:1:177:522:118
+TAAACTAAGCATCATAAATGAAGGGGAAATAAAGT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<
+@EAS188_7:1:177:522:118
+TCTCAATTAATTGTTTTATAAAACCTGTGAGTTTT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<57<<<<
+@EAS188_7:1:290:286:763
+TTAAAATTTAACAAAAGTAAATAAAACACATAGCT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<8<<
+@EAS188_7:1:290:286:763
+TTTTTTTTTTTTCTTTTCTCTTTTTTTTTTTTTTT
++
+<<<<;<<<<<<<&<<<<&77<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS188_7:1:316:949:122
+TCTCCTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCT
++
+59899<<<<;;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS188_7:1:316:949:122
+TTAGGGAAGAACAGCTTAGGTATCAATTTGGTGTT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<0<:<<
+@EAS188_7:1:77:251:446
+CAGCATGGTTGTACTGGGCAATACATGAGATTATT
++
+<<9<<<<<<<<<<<<<97<<<<<<<<<96<<<+<<
+@EAS188_7:1:77:251:446
+TTATCATGACTCTATCCCAAATGCCCAATTACGTC
++
+<<24,:8<<<:1<<<:35<:<:,<<<<<<:5:<<<
+@EAS188_7:2:152:765:744
+ACTTCCCTGGAGGTCTGATGGCGTTTCTCCCTCGT
++
+6<;6<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS188_7:2:152:765:744
+TTTTCTGTTTCTTTGTTTGATTTGGTGGAAGACAT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<&<7293<<
+@EAS188_7:2:172:622:707
+ACATGGCTGATTATGAAAACAATGTTCCCCAGATA
++
+92<3996;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<
+@EAS188_7:2:172:622:707
+TTCTTCATCCTGGACCCTGAGAGATTCTGCAGCCC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<:<5:<<
+@EAS188_7:2:187:227:818
+CAGCACAGGGGCTTAACCTCTGGTGACTGCCAGAG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<3<;<<
+@EAS188_7:2:187:227:818
+CCCCCTTGCAACAACCTTGAGAACCCCAGGGAATT
++
+<<9<<;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS188_7:2:19:736:559
+AAGACTTCATCAAGATATGTAGTCATCAGACTATC
++
+)<7<2;;4<<4<<<<;<<<<<<<<<<7<<<<<<<<
+@EAS188_7:2:19:736:559
+TGAACCTATGAGTCACAGGTATTCCTGAGGAAAAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<
+@EAS188_7:2:218:877:489
+TATAGAAATTGAAACAGCTGTGTTTAGTGCCTTTG
++
+9<<<8<<<;<9<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<
+@EAS188_7:2:259:219:114
+GAAATTGAAACAGCTGTGTTTAGTGCCTTTGTTCA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<7<7<<<<<0<<9<
+@EAS188_7:2:259:219:114
+TTGATGCCCTCTTCTTCCAAAGATGAAACGCGTAA
++
+666<:6/:6::6::<:::<<<;<<<<<<<<;<<<<
+@EAS188_7:3:100:735:530
+GCACACTTTAAATCAACAACAGTAAAATAAAACAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS188_7:3:100:735:530
+TGATGATGGTTACACTAAAAGCCCATACTTTACTG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS188_7:3:101:572:491
+CAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGATGTG
++
+8<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS188_7:3:101:572:491
+TTCCAAAGATGAAACGCGTAACTGCGCTCTCATTC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<1<<<
+@EAS188_7:3:13:122:187
+AGCATTTTGTCAGTTACCAAATGTGTTTATTACCA
++
+<<&<;;<<<;7<<<<;<;<<<<<<<<<<<<;<<<<
+@EAS188_7:3:13:122:187
+GACTGCCAGAGCTGCTGGCAAGCTAGAGTCCCCTT
++
+<<<<<<<;<;<<<;<<<<:;6<<<<;;;;:<<%%<
+@EAS188_7:3:15:568:42
+TTTTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGT
++
+!!;:<8<;<<<8<<<<<<<<8<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS188_7:3:15:568:42
+TTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTATA
++
+!!!!!!!!!++++!!!!!!!!!!!!!!!!!!!,!,
+@EAS188_7:3:182:104:921
+ATCAAGATATGTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<
+@EAS188_7:3:182:104:921
+CACGAATGTTATGCCCTGCTAAACTAAGCATCATA
++
+;<;<<<<<<:<<<<<:<<:<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS188_7:3:200:712:439
+CGTCACCCGGTCCCTGCCCCATCTCTTGTAATCTC
++
+<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS188_7:3:200:712:439
+GTTGGGAGATTTTTAATGATTCCTCAATGTTAAAA
++
+<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<7
+@EAS188_7:3:296:224:724
+ATAGTTGAAAGCTCTAACAATAGACTAAACCAAGC
++
+<<<<;<<<<<<7;<<<<<6<<<06<<<<<<2(<<<
+@EAS188_7:3:296:224:724
+TGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAAC
++
+8<<<5<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<<<;<9<
+@EAS188_7:3:76:333:905
+AATTGTGTCCATGTACACACGCTGTCCTATGTACT
++
+<<;<<<<;7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS188_7:3:76:333:905
+TTTCTGCCCCCAGCATGGTTGTACTGGGCAATACA
++
+<<<<<7;<;<<6<<6<<7<<7<)&<4+6)0+<;(0
+@EAS188_7:4:164:719:947
+AAATTAACATTACAACAGGAACAAAACCTCATATA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<;<<<<<
+@EAS188_7:4:164:719:947
+ACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGGAGTAGCT
++
+===,=========6====)================
+@EAS188_7:4:171:104:398
+AGGGAGGTGCACTAATGCGCTCCACGCCCAAGCCC
++
+=========)===97===3===4===4==,)=/)=
+@EAS188_7:4:171:104:398
+CAATTAATATAATTGTGTCCATGTACACACGCTGT
++
+79<+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS188_7:4:21:443:404
+AGAGAACTTCCCTGGAGGTCTGATGGCGTTTCTCC
++
+=9=9=9==:==========================
+@EAS188_7:4:21:443:404
+TTCCTCTGTCTTGATTTACTTGTTGTTGGTTTTCT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<;<<;+<<<<<<
+@EAS188_7:4:238:441:727
+GTAATTGAAAAATTCATTTAAGAAATTACAAAATA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<<<;;<<
+@EAS188_7:4:259:869:641
+GTTGGGAGATTTTTAATGATTCCTCAATGTTAAAA
++
+99=:=9=99<=========<=<<============
+@EAS188_7:4:259:869:641
+TGATGCCCCTTGGCCATCACCCAGTCCCTGCCCCA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<,;<:<<<<<<<<<1
+@EAS188_7:4:92:693:228
+AAGGTTTTATAAAAAAATTAATTGAGACTACAGAG
++
+6=77=<<=======&====================
+@EAS188_7:4:92:693:228
+AGCATCATAAATGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTCT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;9<<
+@EAS188_7:5:112:51:128
+AGACCCCCTTGCAACAACCTTGAGAACCCCAGGGA
++
+++<<<<<<<<<<<<<5<<<<<<<<<<<<<<;<;<6
+@EAS188_7:5:112:51:128
+CCCAATGGACCTGTGATATCTGGATTCTGGGAAAT
++
+;9<;;:<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS188_7:5:115:249:673
+TAAAGAAAAAAAAACCTGTCAAACACGAATGTTAT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<6<
+@EAS188_7:5:115:249:673
+TAAATACACACAAAAGTACAAAACTCACAGGTTTT
++
+:<<<;<<<;<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS188_7:5:163:982:695
+CTCAGCAGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGATTGGA
++
+<:<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS188_7:5:163:982:695
+TCAAAGAATGCCAGGAAGATACATTGCAAGACAGA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<;
+@EAS188_7:5:308:354:124
+GCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACTT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<;<<<<<<<<
+@EAS188_7:5:308:354:124
+TGAGCAAAACAGTCTAGATGAGAGAGAACTTCCCT
++
+%+<)2<<<<<<<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS188_7:5:74:329:459
+ACAGAGCAACTAGGTAAAAAATTAACATTACAACA
++
+</<;<8/<<9<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS188_7:5:74:329:459
+TAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGCTAAG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;<<;9;599
+@EAS188_7:6:107:447:488
+TAATTGGTACAATGTACAATATTCTGATGATGGTT
++
+<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS188_7:6:107:447:488
+TGCTAAGTATTGGTAAAGATGTGGGGAAAAAAGTA
++
+<<3<<<<<<6<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<<
+@EAS188_7:6:107:636:642
+AAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGCTAAGATAATTC
++
+<<<<<<<;<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS188_7:6:107:636:642
+GTCATCTATAAAGGAAATCCCATCAGAATAACAAT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS188_7:6:11:994:584
+GAAGGAAAAAAATTCTAAAATCAGCAAGAGAAAAG
++
+<<<<;<<<<<<<;<:<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<
+@EAS188_7:6:11:994:584
+GGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGTTT
++
+<<<<<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<<6<<<<<<3<6
+@EAS188_7:6:191:540:493
+AAAAGCCCATACTTTACTGCTACTCAATATATCCA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;
+@EAS188_7:6:191:540:493
+GTGGGGAAAAAAGTAAACTCTCAAATATTGCTAGT
++
+<<9<1<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS188_7:6:194:998:663
+ACCTAACACAAGACTACCCAGATTCATAAAACAAA
++
+;</<<<7<<<<;<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS188_7:6:194:998:663
+TCTACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGGAGTA
++
+<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<
+@EAS188_7:6:205:873:464
+AGATTGCTTGTGGTCTGACAGGCTGCAACTGTGAG
++
+<<<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<:<<,:<:<<<<::
+@EAS188_7:6:205:873:464
+CCCCAGAGGGAAAGCTTTCAACGCTTCTAGCCATT
++
+<-((+:+;289<--;<;-;<:;;<<<;;<<<<<<<
+@EAS188_7:6:46:122:479
+AAGAAAGAGGTTCAGAACTTGAAGACAAGTCTCTT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<
+@EAS188_7:6:46:122:479
+AAGTGAGAAGTTTGGAAGAACTATTTGAGGAAGTA
++
+<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS188_7:7:19:886:279
+CCCATTTGGAGCCCCTCTAAGCCGTTCTATTTGTA
++
+<9<<<<<<<<<<<<6<28:<<85<<<<<2<;<9<<
+@EAS188_7:7:19:886:279
+GAAAGGAGCATTTTGTCAGTTACCAAATGTGTTTA
++
+9%<2)2.2::<;<<<2<<<<<<<<<<<<<<<<<;<
+@EAS188_7:7:213:309:373
+TAGACATCTAAATGAAAGAGGCTCAAAGAATGCCA
++
+<<<86<82<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<
+@EAS188_7:7:213:309:373
+TTAAAAATGAACAGAGCTTTCAAGAAGTATGAGAT
++
+<;<<<<<<;<7<<<<<-<<<<<<<<<<<<<<4<7<
+@EAS188_7:7:243:876:758
+AGCCCAGATCCAGATTGCTTGTGGTCTGACAGGCT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<;78<<
+@EAS188_7:7:243:876:758
+CCCAGATACCATCCCTGTCTTACTTCCAGCTCCCC
++
+0%3<1;.70;3363;31;<<<<<<6<<<;<<<<<<
+@EAS188_7:7:67:719:786
+GGATGAGAAATTACCTAATTGGTACACTGTACAAT
++
+;;<<<<<<&<<:13&<1<<<:<<<)/&/))<'6-<
+@EAS188_7:7:67:719:786
+TAAAAAAAAAAAAGCAAAAACAAAAACTATGCTAA
++
+$<<;<-1<<<8<<*&<;<;,<<3<<<<33<<<33<
+@EAS188_7:8:60:182:718
+GTCCCTGCCCCATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<<<;<;<<
+@EAS188_7:8:60:182:718
+TGACACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAAAACAGT
++
+<<<:<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS188_7:8:64:350:174
+CCTAACACAAGACTACCCAGATTCATAAAACAAAT
++
+709<<;<;<<<<<<<;7<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS188_7:8:64:350:174
+GTTCTACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGGAG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<6<<<<<:<
+@EAS192_3:1:114:19:769
+AAACACGAATGTTATGCCCTGCTAAACTAAGCATC
++
+5+;+3/6;<+;/8<8*/<7/59<97147<;;9<7<
+@EAS192_3:1:114:19:769
+TAAAGTCAACATGAAGGAAAAAAATTCTAAAATCA
++
+<<<<<*2;6;<<<4.;;<&;;<.<40)<);5-/7;
+@EAS192_3:1:225:195:543
+AACAACCTTGAGAACCCCAGGGAATTTGTCAATGT
++
+;;8;;+;(<<<<<<<<7;<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS192_3:1:225:195:543
+GGTTGCCAGCACAGGGGCTTAACCTCTGGTGACTG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<;::388998
+@EAS192_3:3:194:378:230
+AATACTACTAGACCTAAGAGGGATGAGAAATTACC
++
+<<;<8<<:<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS192_3:3:194:378:230
+ATGAGAGAAGGAGTAGCTATACTTATATCAGATAA
++
+<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS192_3:3:221:881:916
+TAACACAAGACTACCCAGATTCATAAAACAAATAC
++
+<<;<<8<<;<<<<<<<;<<<<28<:<8<:;<;;;<
+@EAS192_3:3:221:881:916
+TAATTCTAAATCTAGAACAAAATTAAAATTTAACA
++
+44%-4(5<;9/,:<68:1<:8<:<<84;<<<<<;<
+@EAS192_3:3:257:611:440
+ACCCTGAGAGATTCTGCAGCCCAGATCCAGATTGC
++
+2<;;8<;;<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS192_3:3:257:611:440
+GGAGCATTTTGTCAGTTACCAAATGTGTTTATTAC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<<<<;<<<<8<<+5
+@EAS192_3:3:27:973:518
+CTGATTATGAAAACAATGTTCCCCAGATACCATCC
++
++<<<<<<9<<<<<<<<<<<;<;<<<<<<<<<<<<<
+@EAS192_3:3:27:973:518
+TCCAGATTGCTTGTGGTCTGACAGGCTGCAACTGT
++
+<<<<<<<<<<<<<<;<<<<7<<<<<<<<88;0:8;
+@EAS192_3:3:285:349:797
+ATCATAAATGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS192_3:3:285:349:797
+GTTTTAAAAAACCAATAATTGAGACTACAGAGCAA
++
+;;<<<7.:<<<..<.<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS192_3:3:309:187:267
+ATTGAGACTACAGAGCAACTAGGTAAAAAATTAAC
++
+<:0;<;<4<<7<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS192_3:3:309:187:267
+GGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;<;<;68;;8
+@EAS192_3:3:88:866:774
+ATGTAACAAATCTGCTCTTGTACTTCTAAATCTAT
++
+<<<;<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<68<<<<<<
+@EAS192_3:3:88:866:774
+TTGTTTTCCACTTTGGAAAACAATTTGGTAATTTC
++
+<<<;<<<<:<<<<<:<8<<<<<<<<<<8<<<<<<<
+@EAS192_3:4:184:237:476
+ATCATACAATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAA
++
+<;2<;<4<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS192_3:4:184:237:476
+ATGAACTAACTATATGCTGTTTACAAGAAACTCAT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<;<;;<
+@EAS192_3:4:255:549:422
+AAGTCATCTATAAAGGAAATCCCATCAGAATAACA
++
+&<;;+<;4;<<<<<<<<<<<;<;<<;<<<<<<<<<
+@EAS192_3:4:255:549:422
+CTCTTTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACATCTAAAT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<:<<<<<<;;;<
+@EAS192_3:4:293:168:240
+ATGAACAGAGCTTTCAAGAAGTATGAGATTATGTA
++
+<<<<;<<<;;;<;<<;;;<<;;<<::::<<;;+;7
+@EAS192_3:4:293:168:240
+CAAAGAATGCCAGGAAGATACATTGCAAGACAGAC
++
++;;;;<8<<86<<<<<<<;;8;7;<;<8<8;<<<<
+@EAS192_3:4:312:915:751
+AATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAAAGCTA
++
+<:-<<<99:::);:7<4;8<<<<<<<;<2<+8<;<
+@EAS192_3:4:312:915:751
+ATCTATAAAGGAAATCCCATCAGAATAACAATGGG
++
+<2<<<<<<<8;<<<<<<<<:<<<<8<<<<<84,4:
+@EAS192_3:4:63:5:870
+AAAGAAAAAAGAATTTTAAAAATGAACAGAGCTTT
++
+<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<;;<<<
+@EAS192_3:4:63:5:870
+GAAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACATTG
++
+:<;<;<<<4:;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS192_3:5:197:914:256
+ACTAGACCTAAGAGGGATGAGAAATTACCTAATTG
++
+<5;<8<5/;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS192_3:5:197:914:256
+TCAGATAAAGCACACTTTAAATCAACAACAGTAAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8;:::
+@EAS192_3:5:223:142:410
+CTATTCAGTTCTAAATATAGAAATTGAAACAGCTG
++
+8;<<<;<<<<;<<<<<<;<;<<<<<<<<<<<<;<<
+@EAS192_3:5:27:577:849
+AGTCTCTTATGAATTAACCCAGTCAGACAAAAATA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;:<<<;<<<<<<;;;
+@EAS192_3:5:27:577:849
+TTAGACATCTAAATGAAAGAGGCTCAAAGAATGCC
++
+5:<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS192_3:5:287:334:110
+GATGAATACTAAGATTGATGTAGCAGCTTTTGCAA
++
+.5+7)09<))&-&:33953<-./&&&)((;+3399
+@EAS192_3:5:287:334:110
+TATGTAAAGTAACTGAACCTATGAGTCACAGGTAT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<4;<<<<<<<::6<55:.
+@EAS192_3:6:116:464:261
+CAATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGATATA
++
+;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS192_3:6:116:464:261
+CTATATGCTGTTTACAAGAAACTCATTAATAAAGA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<;<<<<<<<<<;;8<
+@EAS192_3:6:170:169:57
+GGCTTGACCTCTGGTGACTGCCAGAGCTGCTGGCC
++
+<<<<<;<<<<<<;<<<<<<<<<<<<:<<<<<;;+%
+@EAS192_3:6:170:169:57
+TGCAACAACCTTGAGAACCCCAGGGAATTTGTCAA
++
+778<:<<<9<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS192_3:6:175:437:950
+CCAAATTCCCAATTACGTCCTATCTTCTTCTTAGG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:59
+@EAS192_3:6:175:437:950
+CCTGCCCCATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTGC
++
+;;5:;;9<<:<;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS192_3:6:185:868:496
+CCCTTGGCCATCACCCAGTCCCTGCCCCATCTCTT
++
+<<<<<<<<<<<<;<<<;<<<<<<<<<<<9<<;<<<
+@EAS192_3:6:185:868:496
+GATTTTTAATGATTCCTCAATGTTAAAATGTCTAT
++
+:;;<;;<<<<<<<<;4<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS192_3:6:201:195:757
+CCTGCCCCATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTGC
++
+:<':<:<<46<:<;:<;<;<<9<<<<<<<<;<<<<
+@EAS192_3:6:201:195:757
+TATGTACTTATCATGACTCTATCCCAAATTCCCAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<;;;;8
+@EAS192_3:6:216:292:528
+GGGAGATTTTTAATGATTCCTCAATGTTAAAATGT
++
+;:;;8<<<<<<<<<<<<<:<<;<<<<<<<<<<<<<
+@EAS192_3:6:216:292:528
+TAATGATGCCCCTTGGCCATCACCCAGTCCCTGCC
++
+<;<;<<<<<<<;<<<<<<<<;;;;:;;:<%<;1;:
+@EAS192_3:6:235:505:553
+GGTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAACAGAAACCAA
++
+;8518<<<<<;<;<<<;<<;<.<<<<<<<<<<<<<
+@EAS192_3:6:235:505:553
+GTAAAAAATTAACATTACAACAGGAACAAAACCTC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;:;:
+@EAS192_3:6:326:887:180
+CTAAACCAGTCCTATAAGAAATGCTCAAAAGAATT
++
+8:<<:<5<<<;7<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<
+@EAS192_3:6:326:887:180
+TGGGCTTCTCAGCAGAAACCTTACAAGCCAGAAGC
++
+;<<<<<;<<<<<<<<<8<<<<<<<<<<<<0<;;<+
+@EAS192_3:6:45:183:25
+CAGCGGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGATTGGATC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<86;<;:;
+@EAS192_3:6:45:183:25
+CTAAACCAGTCCTATAAGAAATGCTCAAAAGAATT
++
+;1<<;<<<;;;;<<<<<+<<<<<<<<<9<<<<<<<
+@EAS192_3:7:149:354:667
+CTTCCAGCTCCCCAGAGGGAAAGCTTTCAACGCTT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<><<<<<<<<;<:<<<<
+@EAS192_3:7:149:354:667
+GAGGTGCACTAATGCGCTCCACGCCCAAGCCCTTC
++
+;<;;;<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS192_3:7:298:644:697
+CTATGTTTCTTATCTGCACATTACTACCCTGCAAT
++
+8:<8;<;:7;<<;4;:+<7<<<<;<<<<<<<<<<<
+@EAS192_3:7:298:644:697
+TCCACGTCTCATCTAGGGGAACAGGGAGGTGCACT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<::;;;6<8:;;9;98;668;
+@EAS192_3:7:66:891:294
+AGCACACTTTAAATCAACAACAGTAAAATAAAACA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<;<<<<
+@EAS192_3:7:66:891:294
+TAATTGGTACAATGTACAATATTCTGATGATGGTT
++
+:<<5;;<<<4<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS192_3:7:78:692:671
+AATGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACA
++
+<<);<<;;<<<<<;<<<<<<<<<<<<<6<<<<<<<
+@EAS192_3:7:78:692:671
+CAGCAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTATAAAGGA
++
+<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<:<<:<<<:8<<0;;
+@EAS192_3:7:93:945:176
+CCAGAGGGAAAGCTTTCAACGCTTCTAGCCATTTC
++
+6;;;8<<3<<8.<;6)<<<<<9<<<<<<<<<<<<<
+@EAS192_3:7:93:945:176
+GTGAGCCATCACAATGAACAACAGGAAGAAAAGGT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<;;<;:7;<3
+@EAS192_3:8:6:104:118
+AAGAATTTTAAAAATGAACAGAGCTTTCAAGAAGT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<=<<<<<<
+@EAS192_3:8:6:104:118
+TCTAAATGAAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGA
++
+;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS192_3:8:6:237:885
+AAAATCAGCAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTATA
++
+<<<<1:<;:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS192_3:8:6:237:885
+TATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGT
++
+<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;;<;
+@EAS1_103:1:151:159:43
+AACCTCATACACACACATGGTTTAGGGGTATAATA
++
+;;4;6<<;<<<<7<77<6;<6<<<<<;;<<<<<<<
+@EAS1_103:1:151:159:43
+TCTCATTCACTCCAGCTCCCTGTCACCCAATGGAC
++
+<<<<<<<;<<<8<<<;<;8<<<<7<77;;79<09+
+@EAS1_103:1:228:736:747
+AAGATATGTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACA
++
+<<<<<<<<<;<<<<<<<;;<<;<<<<;::<;;7;7
+@EAS1_103:1:228:736:747
+TTGGACTTCTTAAAGAAAAAAAAACCTGTCAAACA
++
+<07<<&<;+<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<
+@EAS1_103:1:274:176:479
+CCTATCTTCTTCTTAGGGAAGAACAGCTTAGGTAT
++
+7)<<7<626<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<3<<<
+@EAS1_103:1:274:176:479
+GAAATGCTTTACTGTCATAACTATGAAGAGACTAT
++
+<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<;<<9<59<<<<
+@EAS1_103:1:2:831:692
+GTGTTCTCATCAACCTCATACACACACATGGTTTA
++
+2749'979<9<<<6;<<<0<;<<<<<3<<<<<<<<
+@EAS1_103:1:2:831:692
+TCCAGCTCCCTGTCACCCAATGGACCTGTGATATC
++
+<<<<<<<<;<<<<<<<<<<9<<:9<<<;;96<796
+@EAS1_103:2:184:980:396
+AAGGAGGTCATCATACAATGATAAAAAGATCAATT
++
+<<;;<77;;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_103:2:184:980:396
+ACATGAACTAACTATATGCTGTTTACAAGAAACTC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<
+@EAS1_103:2:226:302:758
+GGAAAGCTTTCAACGCTTCTAGCCATTTCTTTTGG
++
+;<<<<9;<<<<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_103:2:226:302:758
+TGCTTGTGGTCTGACAGGCTGCAACTTTGAGCGNT
++
+<<<<<<<;;;,<;<92;66<;))42<&2&(/1!!!
+@EAS1_103:2:234:167:381
+AAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGCTAAGAT
++
+<<;<;<<<<;<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_103:2:234:167:381
+AGAGAAAAGCATACAGTCATCTATAAAGGAAATCC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<;;7<;;
+@EAS1_103:2:235:805:373
+TATCTTCTTCTTAGGGAAGAACAGCTTAGGTATCA
++
+<<;<<<<<<9<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_103:2:235:805:373
+TTTACTGTCATAACTATGAAGAGACTATTTCCAGA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;<<<<<<;;<99;
+@EAS1_103:2:307:252:632
+ACCATCCTGCTAAATACATATGCACCTAACACAAG
++
+<77<;,5<,9<<<<<<;<<<<<7<;<<<<<<<<<<
+@EAS1_103:2:307:252:632
+ATGTTCTACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:;;<;;
+@EAS1_103:3:253:175:31
+CAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGGAGTAGCTATA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<:<;;;
+@EAS1_103:3:253:175:31
+TTCATAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAGGGAT
++
+;+;<;<<<<<<<<9<<9<<<<<;<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_103:3:277:921:474
+AAAATATAGTTGAAAGCTCTAACAATAGACTAAAC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<5<<;;;;;
+@EAS1_103:3:277:921:474
+AAAGAAAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAACTATTTGA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_103:3:320:505:814
+ACAGTCTAGATGAGAGAGAACTTCCCTGGAGGTCT
++
+<2<;;5<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_103:3:320:505:814
+CTGTCTTGATTTACTTGTTGTTGGTTTTCTTTTTC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<;<<8<<76<<<<;<&<<<7
+@EAS1_103:3:323:196:855
+ACAAGCAAATGCTAAGATAATTCATCATCACTAAA
++
+<<<<<<<7<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<;7:
+@EAS1_103:3:323:196:855
+TAAAAAATTAACATTACAACAGGAACAAAACCTCA
++
+&<<<<<<09<<7<7;<;<<0<<<<<;<<<<<<<<<
+@EAS1_103:3:41:474:283
+TGAACCACACATTAATACTATGTTTCTTATCTGCA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<+<<
+@EAS1_103:3:41:474:283
+TTTGGTGTTCTGTGTAAAGTCTCAGGGAGCCGTCC
++
+6/;;;88;;<:;48<<<<<;<;<<<<<<<<<<;<<
+@EAS1_103:4:143:560:194
+GTTGTACTGGGCAATACATGAGATTATTAGGAAAT
++
+9:<;7<:::<:<;<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<
+@EAS1_103:4:143:560:194
+TCTAGCCATTTCTTTTGGCATTTGCCTTCAGACCC
++
+<<<<;;<<<<<<<<<<<6<;<<<<;;<<;9<999<
+@EAS1_103:4:164:79:134
+ACAATGGGCTTCTCAGCGGAAACCTTACAAGCCAG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<
+@EAS1_103:4:164:79:134
+AGATAATTCATCATCACTAAACCAGTCCTATAAGA
++
+<;<;<<<;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_103:4:231:815:626
+GATCAATACAGCAAGAAGATATAACCATCCTACTA
++
+'<4%<<<22<<,<<;<<4;<<<<<<<<<<<<<<7<
+@EAS1_103:4:231:815:626
+GCTGTTTACAAGAAACTCATTAATAAAGACATGAG
++
+<;<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;5<<<;:;
+@EAS1_103:4:235:899:847
+AGAAACTCATTAATAAAGACATGAGTTCAGGTAAA
++
+<<3<;<<<<<<<<<;;<<<<<<<+<<<+6<8<3/<
+@EAS1_103:4:235:899:847
+ATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGATATAACCAT
++
+<7<<<<<<<<:<<<<:<</<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_103:4:294:525:849
+AGGAGCATTTTGTCAGTTACCAAATGTGTTTATTA
++
+;<;:;:<;<;<<<3<<<;<;<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_103:4:294:525:849
+CTGGCAAGCTAGAGTCCCATTTGGAGCCCCTCTAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9+<:<<<<9;;15
+@EAS1_103:4:61:433:385
+ACTGTGAGCCATCACAATGAACAACAGGAAGAAAA
++
+<*97<<<<&9<<;<&<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<
+@EAS1_103:4:61:433:385
+GGATGGAGGGAAGAGGGACGCTGAAGCACTTTGAT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;<<6<<)91<<;;,;
+@EAS1_103:5:141:711:813
+TATTACCAGAGGGATGGAGGGAAGAGGGACGCTGA
++
+=<5<5<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_103:5:141:711:813
+TATTTGTAATGAAAACTATATTTATGCTATTCAGT
++
+<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<:+<
+@EAS1_103:5:188:20:592
+CTACTAGACCTAAGAGGGATGAGAAATTACCTAAT
++
+2<<7;<<<<,;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_103:5:188:20:592
+GAGTAGCTATACTTATATCAGATAAAGCACACTTT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<<<:<<<;<;;<
+@EAS1_103:5:285:241:560
+GAAATTACAAAATATAGTTGAAAGCTCTAACAATA
++
+<<<<<<<<<<;<<<<;<<<<<<<<<<<<;<;;;<.
+@EAS1_103:5:285:241:560
+TAAAGTAACTGAACCTATGAGTCACAGGTATTCCT
++
+:<<<<;<<,<<<<5<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_103:5:319:165:698
+ATCACCCAGTCCCTGCCCCATATCTTGTAATCTCT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<3<9<<<<<<<;<<<<<
+@EAS1_103:5:319:165:698
+TGACACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAAAACAGT
++
+;5;2;<:;<<:<<<<<<<<<;:;<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_103:6:7:858:437
+CAATGAACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<3<<<<<<<<<33
+@EAS1_103:6:7:858:437
+CCATTTCTTTTGGCATTTGCCTTCAGACCCTACAC
++
+7;<4;;:;80<;<;<<<<<<:<<;<<<;;<<<<<<
+@EAS1_103:7:112:578:782
+AAAATAAAACACATAGCTAAAACTAAAAAAGCAAA
++
++<<<%<<<<6<;<<<<6:<<<<:<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_103:7:112:578:782
+CAGATTCATAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAG
++
+<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<
+@EAS1_103:7:139:578:951
+AAAAACATGAACTAACTATATGCTGTTTACAAGAA
++
+<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<0;;
+@EAS1_103:7:139:578:951
+GAGGTCATCATACAATGATAAAAAGATCAATTCAG
++
+;<0;:&<:9<<<7<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<
+@EAS1_103:7:166:84:766
+ATAACACAAGACTACCCAGATTCATAAAACAAATA
++
+%8<=+<-<<<</<<<<8<<<<<;<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_103:7:166:84:766
+GGAAAAAGATGTTCTACGCAAACAGAAACCAAATG
++
+<<<<<<<<;<<<<<<<<;<<<<<<;<<<7<;::93
+@EAS1_103:7:311:100:539
+AAATTCTTCATCCTGGACCCTGAGAGATTCTGCAG
++
+;<;<<;;<;<<;<<<<<;9<<<;<<<<<<<<9<<;
+@EAS1_103:7:311:100:539
+CAGTTACCAAATGTGTTTATTACCAGAGGGATGGA
++
+<<<<;<<<<;<<<<<;<<<<<<<<<:<::;7;<0;
+@EAS1_103:7:313:83:546
+TCATTCACTCCAGCTCCCTGTCACCCAATGGACCT
++
+;)<994<;<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<5<<<<
+@EAS1_103:7:313:83:546
+TGCAACAACCTTGAGAACCCCAGGGAATTTGTCAA
++
+<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<4<<<:<;<<9
+@EAS1_103:7:53:783:78
+AAAAACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCTA
++
+<;;;;<<0<,<<<<<<<<<;<<<;<;<<<<;<<<<
+@EAS1_103:7:53:783:78
+TGCAAGACAGACTTCATCAAGATATGTAGTCATCA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;<7;<:;
+@EAS1_105:1:115:226:443
+AAATCTGCGCTTGTACTTCTAAATCTATAAAAAAA
++
+<<;;<;<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_105:1:115:226:443
+ATATAACCATCCTACTAAATACATATGCACCTAAC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<;<<<<<
+@EAS1_105:1:141:415:738
+AAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGCTAAGA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<;<<;<<<<6:
+@EAS1_105:1:141:415:738
+TTACCTAGTTGCTCTGTAGTCTCAATTAATTGTTT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<;<8<<<
+@EAS1_105:1:234:185:359
+AAGGAGTAGCTATACTTATATCAGATAAAGCACAC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;9--:
+@EAS1_105:1:234:185:359
+CAGATTCATAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAG
++
+<<4<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_105:1:28:745:352
+ATATGCACCTAACACAAGACTACCCAGATTCATAA
++
+<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_105:1:28:745:352
+CTTCTAAATCTATAACAAAATTAAAATTTAACAAA
++
+4;;*;<<<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_105:1:297:283:948
+CCAGATTGCTTGTGGTCTGACAGGCTGCAACTGTG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<9;)+1;19-
+@EAS1_105:1:297:283:948
+TGTCTTACTTCCAGCTCCCCAGAGGGAAAGCTTTC
++
+6;;3;6<<66<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_105:1:329:407:872
+TTCGTTTTTTTTTTTTTTTTTTCCCTTTTTTTTTT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<6;<<&4::<++<(&;<<
+@EAS1_105:1:3:903:957
+AAGCCAGAAGAGATTGGATCTAATTTTTGGACTTC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<;;<;<;<<<<<<66<;<<;
+@EAS1_105:1:3:903:957
+ATTCATCATCACTAAACCAGTCCTATAAGAAATGC
++
+<%12<&<<<;<:<<<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_105:1:45:239:851
+CTAAGAGGGATGAGAAATTACCTAATTGGTACAAT
++
+*2*0<<<<<<<<<<<<<<<<9<<3<<<<<<<<<<<
+@EAS1_105:1:45:239:851
+TGAGAGAAGGAGTAGCTATACTTATATCAGATAAA
++
+<<88;<208<9<;6<<<6269;94<&401-662&2
+@EAS1_105:1:87:430:995
+GAAAAGAGTTAAAAACATGAACTAACTATATGCTG
++
+1<4%81<..1<<<<<0<<<<<0.<<9<<(<6<<6<
+@EAS1_105:1:87:430:995
+TACTCACCATCATAAATACACACAAAATTACAAAA
++
+<<;<<7;;;<;<<777;7(77;;1;7;%117;,7(
+@EAS1_105:2:110:584:649
+CCATGTACACACGCTGTCCTATGTACTTATCATGA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<::<38
+@EAS1_105:2:110:584:649
+CTGTAATGATGCCCCTTGGCCATCACCCGGTCCCT
++
+++:4686<<68<;<;<;<<<:<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_105:2:146:374:692
+AAATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<</<<<<<<<<<<<<<<<<<:
+@EAS1_105:2:146:374:692
+ATTAAATTCCCCCACTTAAGAGATATAGATTGGCA
++
+<4:<<<1:<:<::<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<;
+@EAS1_105:2:179:532:82
+CCATCACCCGGTCCCTGCCCCATCTCTTGTAATCT
++
+<:96<6<<<<89<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_105:2:179:532:82
+TGTACTTATCATGACTCTATCCCAAATTCCCAATT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<3<;<;<<<<:<8<<<
+@EAS1_105:2:280:662:939
+AAGAGAAAAGCATACAGTCATCTATAAAGGAAATC
++
+<<;<;<<<<<:<<<;<<<;<<;<<<<<<<<<<<;<
+@EAS1_105:2:280:662:939
+CCTCTTTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACATCTAAA
++
+<<<<<<<<<<<<<;<<<;;7<<<<<<<<<<<<:8<
+@EAS1_105:2:299:360:220
+ATTCAGTTCTAAATATAGAAATTGAAACAGCTGTG
++
+<<<<<<<9<9<<<<<<<<<<<<<<<<<5<;<0<<<
+@EAS1_105:2:299:360:220
+GAAGAACTTAGATGCCCTCTTCTTCCAAAGATGAA
++
+66<;;4;<<()<<4<<<<<<;<<;<<<<<<<<<<<
+@EAS1_105:2:301:161:195
+ACAGTAAAATAAAACAAAGGAGGTCATCATACAAT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<:<<<<
+@EAS1_105:2:301:161:195
+GTACAATGTACAATATTCTGATGATGGTTACACTA
++
+''6%6<6<<<4<<<<<<<<)<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_105:3:176:431:647
+ATCATGACTCTATCCCAAATTCCCAATTACGTCCT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<2<<<<<<<<6<<<<9<<6<
+@EAS1_105:3:176:431:647
+CCATCACCCAGTCCCTGCCCCATCTCTTGTAATCT
++
+<(9(<<<7;<<7<<<<<<<7<<<<<<7<<<<<<<<
+@EAS1_105:3:182:404:693
+ACCTCATACACACACATGGTTTAGGGGTATAATAC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:::<6<;<94;77
+@EAS1_105:3:182:404:693
+GCGTCTCTACCACAGGGGGCTGCGCGGTTTCCCAT
++
+<;7;;4<<<<<<<7<<7<<<<<<<<<8<<<<<<<<
+@EAS1_105:3:232:364:583
+CAATTAATTGAGACTACAGAGCAACTAGGTAAAAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<
+@EAS1_105:3:232:364:583
+TCATTAATAAAGACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTG
++
+;%;7;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_105:3:308:66:538
+CGCTTGTACTTCTAAATCTATAACAAAATTAAAAT
++
+996999;<9;<:<<<<<:<<7<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_105:3:308:66:538
+TATAACCATCCTACTAAATACATATGCACCTAACA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<;<
+@EAS1_105:3:329:177:267
+CATGAGATTATTAGGAAATGCTTTACTGTCATAAC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<9;
+@EAS1_105:3:329:177:267
+TACGTCCTATCTTCTTCTTAGGGAAGAACAGCTTA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_105:3:7:35:528
+TTTTTTTTTTGTTCTTTACTCTTTTTTTTTTTTTT
++
+<<<<<<<<<<5<<<(<<%<<-8<<<<<<<<<8<<<
+@EAS1_105:3:86:823:683
+ACTTTGATGCCCTCTTCTTCCAAAGATGAAACGCG
++
+<4<<<<<<<<:<<6<<7<<<8<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_105:3:86:823:683
+CAGTTCTAAATATAGAAATTGAAACAGCTGTGTTT
++
+<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;9<<<
+@EAS1_105:6:134:853:558
+AATATAATTGTGTCCATGTACACACGCTGTCCTAT
++
+<<<<8<<<7<<<<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_105:6:134:853:558
+GGAACAGGGAGGTGCACTAATGCGCTCCACGCCCA
++
+==========================9=9=;<;<5
+@EAS1_105:6:162:594:858
+CTACCACAGGGGGCTGCGCGGTTTCCCATCATGAA
++
+90;<99;==99==;4=:========;=====;===
+@EAS1_105:6:162:594:858
+GTGTTCTCATCAACCTCATACACACACATGGTTTA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<9<;<<<<<<<<<<3<<<;
+@EAS1_105:6:172:827:592
+AATTGTAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAATACTCAC
++
+=;=======;==;===:==========;==9<<.3
+@EAS1_105:6:172:827:592
+TAGATTGGCAGAACAGATTTAAAAACATGAACTAA
++
+8<<<<;7;7<<<<;<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_105:6:23:885:274
+ACAAAGGAGGTCATCATACAATGATAAAAAGATCA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<4<;;<
+@EAS1_105:6:23:885:274
+CTACTACTCAATATATCCATGTAACAAATCTGCGC
++
+2+*27==;;==<<.;:<=<=<==============
+@EAS1_105:6:267:953:459
+ACCTTACAAGCCAGAAGAGATTGGATCTAATTTTT
++
+<<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<
+@EAS1_105:6:267:953:459
+CATCACTAAACCAGTCCTATAAGAAATGCTCAAAA
++
+%<07<94========<<==================
+@EAS1_105:7:110:355:323
+ACCTTGAGAACCCCAGGGAATTTGTCAATGTCAGG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<;;<<8;
+@EAS1_105:7:110:355:323
+CCCAATGGACCTGTGATATCTGGATTCTGGGAAAT
++
+6069;1<<;4<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_105:7:168:247:414
+AAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAATA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<*<<<<<<<<<;:6<<<<<;
+@EAS1_105:7:168:247:414
+TAAATTCCCCCACTTAAGAGATATAGATTGGCAGA
++
+,;;;,146<6;6<<8<<<<1<8<<<<<<<<<<;1<
+@EAS1_105:7:289:472:86
+ATGAACTTCTGTAATTGAAAAATTCATTTAAGAAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;;;
+@EAS1_105:7:45:462:455
+TCCCTGTCTTACTTCCAGCTCCCCAGACGGAACGC
++
+<<<<<<8<<<;<;<<<;<<<<<<<6;8&:80;733
+@EAS1_105:7:45:462:455
+TCTAGGGGAACAGGGAGGTGCACTAATGCGCTCCA
++
+62*<;;;;<<;<<9;;<<<<<<<<<<<<<<<<;<<
+@EAS1_105:7:57:722:347
+ACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGATGT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_105:7:57:722:347
+CGCGTAACTGCGCTCTCATTCACTCCAGCTCCCTG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;
+@EAS1_105:8:160:130:351
+CAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAAT
++
+4<;;<;<<<-<<<<<<<<<<;;<<<<;<<<<<<<<
+@EAS1_105:8:160:130:351
+TGGATCTAATTTTTGGACTTCTTAAAGAAAAAAAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<4<<<<<;<<<:<<:<
+@EAS1_105:8:179:119:876
+ATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGATATAACCAT
++
+<<<<<<<7<<<<<<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_105:8:179:119:876
+TTAAAAACATGAACTAACTATATGCTGTTTACCAG
++
+<<<<<<<7<<<<<<<8<<<6<<<<<<7<<<:0&<0
+@EAS1_105:8:24:718:322
+AACTCATTAATAATGTCATGAGTTCAGGTAAAGGG
++
+5:+:0;**&+<00&<&<<<5<28<<;;<83<<<<<
+@EAS1_105:8:24:718:322
+ACAATTAATTGAGACTACAGACCAATTATGTAAAA
++
+5/7<3+<;<1<<1<95<.&&.&&.<&)5)1)17<%
+@EAS1_105:8:254:617:73
+AACTATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTT
++
+<<:<<<9;<<<;;<:<-<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_105:8:254:617:73
+GCAGAAGAAAGAGGTTCAGAACTTGAAGACAAGTC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<6;:;4%
+@EAS1_105:8:256:404:584
+ACTGTCCTATGTACTTATCATGACTCTATCCCAAA
++
+&&326+23<3<<<+:<</<<8<<<:7:<<<<<<<<
+@EAS1_105:8:256:404:584
+GTTTCTGCCCCCAGCATGGTTGTACTGGGCAATAC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<3;<:;;3:3:</
+@EAS1_105:8:96:720:940
+AAAGGAAATCCCATCAGAATAACAATGGGCTTCTC
++
+<<<<<<;<<<<<<<<<<;9<<8<<6<;:;<;;.;;
+@EAS1_105:8:96:720:940
+TAAGATAATTCATCATCACTAAACCAGTCCTATAA
++
+*<<<<;<<<9<<;,<;0<;<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_108:1:111:796:737
+ATCATGACTCTATCCCAAATTCCCAATTACGTCCT
++
+<3<<<<<<<<<<<7<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_108:1:111:796:737
+CCCCAGCATGGTTGTACTGGGCAATACATGTGATT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<:<<;7;<<<<993<4%:%<<
+@EAS1_108:1:131:518:588
+AAAATCAGCAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTATA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<1<<
+@EAS1_108:1:131:518:588
+ATAAATGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTG
++
+<.<<<<<<<<4<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_108:1:148:286:316
+AGAACTTCCCTGGAGGTCTGATGGCGTTTCTCCCT
++
+;::::;9/:<9<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_108:1:148:286:316
+CCTCTGTCTTGATTTACTTGTTGTTGGTTTTCTGT
++
+<<<<<<<<+<<7<<<<<<<6<<<6<142<<<6<2<
+@EAS1_108:1:155:809:543
+AAATTTAACAAAAGTAAATAAAACACATAGCTAAA
++
+<<<+0<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_108:1:155:809:543
+TACATATGCACCTAACACAAGACTACCCAGATTCA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<7<;<<<<<<<<<<<1<;<;
+@EAS1_108:1:16:438:245
+TTGAATAAAAAGGGATTAAATTCCCCCACTTAAGA
++
+8*8<5'<77;;;;;7<7<<7-<;<<<;;<<<;;79
+@EAS1_108:1:189:863:213
+CTACTAGACCTAAGAGGGATGAGAAATTACCTAAT
++
+7:<7<<<<44;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_108:1:189:863:213
+TATACTTATATCAGATAAAGCACACTTTAAATCAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<;<<<<;7<9;<
+@EAS1_108:1:242:419:512
+AATGGGCTTCTCAGCAGAAACCTTACAAGCCAGAA
++
+<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<8<(<30
+@EAS1_108:1:242:419:512
+CTAAACCAGTCCTATAAGAAATGCTCAAAAGAATT
++
+*:<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_108:1:277:194:143
+TGGGCTGTAATGATGCCCCTTGGCCATCACCCGGT
++
+<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<9;<<<8</<<6<:
+@EAS1_108:1:277:194:143
+TTTTTAATGATTCCTCAATGTTAAAATGTCTATTT
++
+;<<;<<<;8;<0<7<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<<
+@EAS1_108:1:328:614:638
+AAAGGTTGTTGGGAGATTTTTAATGATTCCTCAAT
++
+<<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_108:1:328:614:638
+ACTGGTTCTCTTGAAAGCTTGGGCTGTAATGATGC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<4/;<<9<<<<7<<*:
+@EAS1_108:1:33:779:821
+AATGTTATGCCCTGCTAAACTAAGCATCATAAATG
++
+<<730<<<<9<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_108:1:33:779:821
+TGAAGGAAAAAAATTCTAAAATCAGCAAGAGAAAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;<<
+@EAS1_108:1:49:911:980
+ACAATGTACAATATTCTGATGATGGTTACACTAAA
++
+<<<<<<<<<<;<<<<<<<8<<<<;<;<<88-<;33
+@EAS1_108:1:49:911:980
+GGGGAAAAAAGTAAACTCTCAAATATTGCTAGTGG
++
+44:7<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_108:1:65:787:74
+TGTAATGAAAACTATATTTATGCTATTCAGTTCTA
++
+44848=:1661/66==?:<=:?6><<<<1>><<<<
+@EAS1_108:2:102:543:160
+CAACAGGAACAAAACCTCATATATCAATATTAACT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<6<:<
+@EAS1_108:2:102:543:160
+CAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAA
++
+9==9=====;=====================<===
+@EAS1_108:2:116:966:193
+ATTAACATTACAACAGGAACAAAACCTCATATATC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<
+@EAS1_108:2:116:966:193
+GACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGT
++
+===================================
+@EAS1_108:2:170:326:433
+CTTCCCTGGAGGTCTGATGGCGTTTCTCCCTCGTC
++
+:44<<<<<<<<<<:6<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_108:2:170:326:433
+TTGTTGGTTTTCTGTTTCTTTGTTTGATTTGGTGG
++
+=====<=9===:=<:==2=======2:===9==/5
+@EAS1_108:2:176:653:957
+AAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAACAGAA
++
+===::=============<==<====<========
+@EAS1_108:2:176:653:957
+ACATTACAACAGGAACAAAACCTCATATATCAATA
++
+????????????<<???@<<<<<@<<<<<<<<<<<
+@EAS1_108:2:204:737:61
+AAAGTGAGAAGTTTGGAAAAACTATTTGAGGAAGT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<9<+4:<0
+@EAS1_108:2:204:737:61
+TCAGCAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTATAAAGG
++
+(7=72=;==2=====<===<<==============
+@EAS1_108:2:240:593:842
+ATCTGGATTCTGGGAAATTCTTCATCCTGGACCCT
++
+============<================9===:=
+@EAS1_108:2:240:593:842
+CATGGTTTAGGGGTATAATACCTCTACATGGCTGA
++
+*<<<;<<6<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_108:2:266:994:429
+ACAGGTTTTATAAAACAATTAATTGAGACTACAGA
++
+</<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<;<<<<<<<<<<<
+@EAS1_108:2:266:994:429
+TGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAG
++
+=====================9=======4===:=
+@EAS1_108:2:316:176:543
+ATGTCTATTTTTGTCTTGACACCCAACTAATATTT
++
+<<)/3<<<&<*<<0<<8<<82</5<<<<<88<<<<
+@EAS1_108:2:316:176:543
+CATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTGCTGCATCC
++
+====<=9===<<<=====9====<<=3==,96==9
+@EAS1_108:2:49:271:588
+CACATGGTTTAGGGGTATAATACCTCTACATGGCT
++
+<<<<<<<<<<<<<<5:<<<<<<:<<<<<<<:7%9<
+@EAS1_108:2:49:271:588
+GCTGCGCGGTTTCCCATCATGAAGCACTGAACTTC
++
+:0=:===:<===;;===;=================
+@EAS1_108:2:62:879:264
+AATGAAAACTATATTTATGCTATTCAGTTCTAAAT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<2<<
+@EAS1_108:2:62:879:264
+GGACGCTGAAGAACTTTGATGCCCTCTTCTTCCAA
++
+====:=<============================
+@EAS1_108:2:82:879:246
+AAGAGGGACGCTGAAGAATTTTGATGCCCTCTTCT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<&<<<77<<-<<<6<62<
+@EAS1_108:2:82:879:246
+ACAACTGTGAGCCATCACAATGAACAACAGGAAGA
++
+%+=661;&===:&==1<5======1==========
+@EAS1_108:2:85:580:481
+AAAAAAGTAAATAAAACACATAGCTAAAACTAAAA
++
+=)====77========8=3====3===========
+@EAS1_108:2:85:580:481
+CTAACACAAGACTACCCAGATTCATAAAACAAATA
++
+<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<;<<<<6:<<
+@EAS1_108:3:216:988:883
+AAGCCAACACAATGAACAACAGGAAGAAAAGGTCT
++
+(=/1+=&:=&======<==<===============
+@EAS1_108:3:216:988:883
+AGAGGGACGCTGAAGAACTTTGATGCCCTCTTCTT
++
+<<<<<<<<<<<<8;<;88<;8;;;;828;8;8;;;
+@EAS1_108:3:24:319:429
+GTTATGCCCTGCTAAACTAAGCATCATAAATGAAG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<1<<-6<<</<
+@EAS1_108:3:24:319:429
+TAATAAATACACACAAAAGTACAAAACTCACAGGT
++
+0%=3%=3====<=9=====89==93==9=6=====
+@EAS1_108:3:75:934:439
+AAGAGACTATTGCCAGATGAACCACACATTAATAC
++
+==7=:=========================<====
+@EAS1_108:3:75:934:439
+CCCATCATGAAGCACTGAACTTCCACGTCTCATCT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;
+@EAS1_108:3:82:356:253
+AGTTTCTGCCCCCAGCATGGTTGTACTGGGCAATA
++
+97;7<<;;<<<<<7;<<:<<<9<<;<<<9<<<<<<
+@EAS1_108:3:82:356:253
+GAAAGCTTTCAACGCTTCTAGCCATTTCTTTTGGC
++
+===================<========;===39=
+@EAS1_108:4:163:611:211
+TAAAGTCAACATGAAGGAAAAAAATTCTAAAATCA
++
+<<<<9<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_108:4:163:611:211
+TGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAAC
++
+============8===============;=6;;<;
+@EAS1_108:4:248:753:731
+TATGCTATTCAGTTCTAAATATAGAAATTGAAACA
++
+<<<<<<<<<<<8<<<<<<<<<<<<:<<<<&<:<.:
+@EAS1_108:4:248:753:731
+TGAAGAACTTTGATGCCCTCTTCTTCCAAAGATGA
++
+7;55;=,=89=====3===9=======9=======
+@EAS1_108:4:31:622:216
+ATTTAACAAAAGTAAATAAAACACATAGCTAAAAC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<<96<7
+@EAS1_108:4:37:604:389
+ATGTTCTACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGG
++
+<<<<<<<<<3<<<<<4<<<<<9<2;949<;35:95
+@EAS1_108:4:37:604:389
+TCATAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAGGGATG
++
+00;:;========9========<9========<==
+@EAS1_108:4:75:166:463
+GTGAGAAGTTTGGAAAAACTATTTGAGGAAGTAAT
++
+<<<<<==============================
+@EAS1_108:4:75:166:463
+TAACAATAGACTAAACCAAGCAGAAGAAAGAGGTT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<++3
+@EAS1_108:4:91:521:517
+CCACACTGGTTCTCTTGAAAGCTTGGGCTGTAATG
++
+8;8<4=:===7===9=============<======
+@EAS1_108:4:91:521:517
+CCCTGCAATTAATATAATTGTGTCCATGTACACAC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<<8<<;;;<<
+@EAS1_108:5:115:193:231
+GAAGAGATTGGATCTAATTTTTGGACTTCTTAAAG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<<6<7
+@EAS1_108:5:115:193:231
+TATAAGAAATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAA
++
+=========7===========<=============
+@EAS1_108:5:11:555:330
+CGCTTGTACTTCTAAATCTATAAAAAAATTAAAAT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<4<;<
+@EAS1_108:5:11:555:330
+GGAAAACAATTTGGTAATTTCGTTTTTTTTTTTTT
++
+6;6;9766+<<<<9:2=<===6=============
+@EAS1_108:5:175:149:296
+AAAAATTAACATTACAACAGGAACAAAACCTCATA
++
+=;==26==;==;================7======
+@EAS1_108:5:175:149:296
+AAGGGGAAATAAAGTCAAGCCTTTCCTGACAAGCA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<49<<<<<<<<<<<<;4
+@EAS1_108:5:180:905:36
+CCTCCGTGTCCTCCCATCTGGCCTCGTCCACACTG
++
+6%%<;<662<<*;<<<8<<:<<<<<<<<<<<<<<;
+@EAS1_108:5:180:905:36
+TACTATGTTTCTTATCTGCACATTACTACCCTGCA
++
+==========8===;;=========;==77%41=;
+@EAS1_108:5:229:717:121
+ACTATGAAGAGACTATTGCCAGATGAACCACACAC
++
+=================<)=<4<0=.<<<71;41&
+@EAS1_108:5:229:717:121
+TTCTTCTGAGGGAAGAACAGCTTAGGTATCAATTT
++
+6;-;7<<(<<<<<8<18<7<<<<<<<<<;<<<<<<
+@EAS1_108:5:321:712:224
+AGATAAAGCACACTTTAAATCAACAACAGAAAAAT
++
+<<<<<<<<2<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<(<<:<,
+@EAS1_108:5:321:712:224
+ATGAGAAATTACCTAATTGGTACAATGTACAATAT
++
+=;===7;===7=========;=:;=========;=
+@EAS1_108:5:89:942:84
+AAAACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCTAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;
+@EAS1_108:5:89:942:84
+TACAAAACTCACAGGTTTTATAAAACAATTAATTG
++
+===================>=>>>==>>===>==>
+@EAS1_108:6:159:493:275
+ACAAAACTCACAGGTTTTATAAAACAATTAATTGA
++
+=====3=============================
+@EAS1_108:6:159:493:275
+TGCTGTTTACAAGAAACTCATTAATAAAGACATGA
++
+4949;<<<<<<<<<<<6<;<<<<;<<<<<*<<<<<
+@EAS1_108:6:165:464:123
+CATACACACACATGGTTTAGGGGTATAATACCTCT
++
+===============7==============8====
+@EAS1_108:6:165:464:123
+GTCTCTACCACAGGGGGCTGCGCGGTTTCCCATCA
++
+9;<)<<%<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_108:6:222:579:961
+AGTCCTATAAGAAATGCTCAAAAGAATTGTAAAAG
++
+=58====;==8=======;================
+@EAS1_108:6:222:579:961
+CAGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGATTGGATCTAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<:7;;;68
+@EAS1_108:6:71:187:824
+AGACAGACTTCATCAAGATATGTAGTCATCAGACT
++
+;===;======3==;==========4=;=7;;3;6
+@EAS1_108:6:71:187:824
+TCTAATTTTTGGACTTCTTAAAGAAAAAAAAACCT
++
+0040;<7<<<<0<7<<<;<7*<<<<<7<<771<<<
+@EAS1_108:6:73:735:329
+AAAGGGATTAAATTCCCCCACTTAAGAGATATAGA
++
+================;==;====;=;=======;
+@EAS1_108:6:73:735:329
+TAGCTATACTTATATCAGATAAAGCACACTTTAAA
++
+;;;9;<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<2<<<<<<<
+@EAS1_108:6:77:48:860
+CTCTGTCTTGATTTACTTGTTGTTTGTTTTCTGTT
++
+=========;===========9==*;5=;=;=,7=
+@EAS1_108:6:77:48:860
+TAGATGAGAGAGAACTTCCCTGGAGGTCTGATGGC
++
+;8;8;<9<9<<<<<<<<<4<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_108:6:94:294:387
+ACCATCATAAATACACACAAAAGTACAAAACTCAC
++
+779=53=9===;=:=;=========;=========
+@EAS1_108:6:94:294:387
+GAATGTTATGCCCTGCTAAACTAAGCATCATAAAT
++
+<<<<<<<;<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<;)7;;
+@EAS1_108:6:95:235:746
+CTAAGCATCATAAATGAAGGGGAAATAAAGTCAAG
++
+==&=;===7=3===8======;=;8===8=====;
+@EAS1_108:6:95:235:746
+TCTAAAATCAGCAAGAGAAAAGCATACAGACATCT
++
+<<<<;<<<<<<<<79<<<<<<<<<<<<<<*;;;<9
+@EAS1_108:7:108:440:208
+CCCATCCTACTAAATACATATGCACCTAACACAAG
++
++35:486<<4<<<<<<<<<<<-<<<<<7<<)<<<-
+@EAS1_108:7:108:440:208
+TTCAGGTAAAGGGGAGGAAAAAGATGTTCTACGCA
++
+<<<;<<<<<<<<<</<<<<;<<<;<<;<;<64/:+
+@EAS1_108:7:222:538:267
+ATAATTGTGTCCATGTACACACGCTGTCCTATTTA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<74;;39%6+
+@EAS1_108:7:222:538:267
+TCTGGCCTCGTCCACACTGGTTCTCTTGAAAGCTT
++
+52/8-<<7<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_108:7:266:556:252
+CCCATCTGGCCTCGTCCACACTGGTTCTCTTGAAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<4;;<;;;<7;;
+@EAS1_108:7:266:556:252
+GATTTGGTGGAAGACATAATCCCACGCTTCCTATG
++
+.8558<72<(<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_108:7:82:926:112
+CAATGTCAGGGAAGGAGCATTTTGTCAGTTGCCAA
++
+<1:/<*6<<6<<<<<6<<<<<<4<<<<82<+<<<<
+@EAS1_108:7:82:926:112
+CTGCTGGCAAGCTAGAGTCCCATTTGGAGCCCCTC
++
+<;<<<<<<<<<5<<<<<<<<<<<<<<<;<<1:<4<
+@EAS1_108:8:118:440:850
+AATTGAAAAATTCATTTAAGAAATTACAAAATATA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<949<<<<
+@EAS1_108:8:129:477:427
+ATGGACCTGTGATATCTGGATTCTGGGAAATTCTT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<<<::<9<;<<;<<
+@EAS1_108:8:129:477:427
+TACACACACATGGTTTAGGGGTATAATACCTCTAC
++
+<<<9;<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_108:8:19:929:765
+AAAAACATGAACTAACTATATGCTGTTTACAAGAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;77<
+@EAS1_108:8:19:929:765
+ATCAACAACAGTAAAATAAAACAAAGGAGGTCATC
++
+<3+<<;<<;<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_93:1:131:946:353
+TCTCTTGAAAGCTTGGGCTGTAATGATGCCCCTTG
++
+<<:<<66<<<6<<4<<<:8<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_93:1:131:946:353
+TGTACACACGCTGTCCTATGTACTTATCATGACTC
++
+<<<<<<<<<<<<<;<<<<;;<<<<<<<;<:52;<2
+@EAS1_93:1:179:629:513
+GTCAACATGAAGGAAAAAAATTCTAAAATCAGCAA
++
+<;,<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_93:1:179:629:513
+GTCACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<;<;<<<<<<<<<<<<<;<<<
+@EAS1_93:1:20:635:509
+CAGCTTAGGTATCAATTTGGTGTTCTGTGTAAAGT
++
+<<<<<<<<<;<<<<;<<<;<;;;<<<;<<<<<<(8
+@EAS1_93:1:20:635:509
+TGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTGT
++
+50<59<<9<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<6<<<<<
+@EAS1_93:1:214:784:690
+AAATCCCATCAGAATAACAATGGGCTTCTCAGCGG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<4<44
+@EAS1_93:1:214:784:690
+GATAATTCATCATCACTAAACCAGTCCTATAAGAA
++
+-<7<<7<:<<2<<<<;<<<<<;<<<<3<<<<<<<<
+@EAS1_93:1:216:381:608
+TAATTGTGTCCATGTACACTCGCTGTCCTATGTAC
++
+55<99<<<99;<;<<(<39&7<<<<<<<<<<<<<9
+@EAS1_93:1:216:381:608
+TTCTCACAGTTTCTGCCCCCAGCATGGTTGTACTG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;+<6:<;26;
+@EAS1_93:1:253:59:242
+CCCCATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTGCTGCA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<</<<9;<
+@EAS1_93:1:253:59:242
+TTTGTCTTGACACCCAACTAATATTTGTCTGAGCA
++
+<<<:<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_93:1:264:988:663
+CGAGGGGAACAGGGAGGTGCACTAATGCGCTCCAC
++
+(%<:4<4<<7<<1-:<1766<66<<<<+<:<;8;<
+@EAS1_93:1:264:988:663
+TGGCTGATTATGAAAACAATGTTCCCCAGATACCA
++
+<<<<<<<<<<<1<4<<<4<<0<;<-<74*(<&51-
+@EAS1_93:1:92:213:217
+ACAGTCTAGATGAGAGAGAACTTCCCTGGAGGTCT
++
+<<<<<:<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_93:1:92:213:217
+TGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTGT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<4<
+@EAS1_93:2:173:995:93
+GCTGGAGGGAAGAGGGACGCTGAAGAACTTTGATG
++
+<(0<<9<<<7<<<<<<7<<<<<<<<<7<<<<<<<<
+@EAS1_93:2:173:995:93
+TAATGAAAACTATATTTATGCTATTCAGTTCTAAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7:<<<<;:<:<<<<:7
+@EAS1_93:2:286:923:549
+TCAAATGAACTTCTGTAATTGAAAAATTCATTTAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_93:2:30:466:652
+AAAAATGAACAGAGCTTTCAAGAAGTATGAGATTA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<4;7<<<7
+@EAS1_93:2:30:466:652
+AAGAGGCTAAAAGAATGCCAGGAAGATACATTGCA
++
+<<<<<;3;&<<<<<<<</6<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_93:2:313:711:530
+ACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTT
++
+<7;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_93:2:313:711:530
+TAATTGAGACTACAGAGCAACTAGGTAAAAAATTA
++
++<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<:
+@EAS1_93:3:181:93:694
+ACTCATTAATAAAGACATGAGTTCAGGTAAAGGGG
++
+<4;8<<+<<:<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_93:3:181:93:694
+TTAATTGAGACTACAGAGCAACTAGGTAAAAAATT
++
+++<<<<<<;<<<<<<:;8<<;<<<5;<;<<<+<<<
+@EAS1_93:3:79:879:15
+AGACTACAGAGCAACTAGGTAAAAAATTAACATTA
++
+<;;5;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_93:3:79:879:15
+AGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGCTAAGATA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<2<;<<1<
+@EAS1_93:4:160:896:275
+AAAACTATATTTATGCTATTCAGTTCTAAATATAG
++
+============<====<==<====<==<==;=:6
+@EAS1_93:4:160:896:275
+AGGGAAGAGGGACGCTGAAGAACTTTGATGCCCTC
++
+;;;9;<<<<<<;<;;<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<
+@EAS1_93:4:321:271:138
+GTGTAAAGTCTCAGGGAGCCGTCCGTGTCCTCCCA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;9<<;<<;;<88;&
+@EAS1_93:4:321:271:138
+TTTGGTGGAAGACATAATCCCACGCTTCCTATGGA
++
+261:5969==9=:=<==<=================
+@EAS1_93:4:325:352:67
+ATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGCTAA
++
+==================<========<=<;-===
+@EAS1_93:4:325:352:67
+TACAGAGCAACTAGGTAAAAAATTAACATTACAAC
++
+;<8<<<;;<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_93:5:197:52:58
+AAATGAACAGAGCTTTCAAGAAGTATGAGATTATG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<2<<<<<<;<<<<
+@EAS1_93:5:197:52:58
+TCTAAATGAAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGA
++
+<7;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_93:5:246:177:525
+CATCATAAATACACACAAAAGTAAAAAACTCACAG
++
+%<(4<2<<<<<:<;<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_93:5:246:177:525
+TCTTAAAGAAAAAAAAACCTGTCAAACACGAATGT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<1<<<<<<;;;<8;;
+@EAS1_93:5:256:444:399
+CTGCTACTCAATATATCCATGTAACAAATCTGCGC
++
+;+549<:<.<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_93:5:256:444:399
+GAAGATATAACCATCCTACTAAATACATATGCACC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<<-;<<8
+@EAS1_93:5:292:122:666
+GGGAAGAACAGCTTAGGTATCAATTTGGTGTTCTG
++
+<;<;;<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_93:5:292:122:666
+TACTGTCATAACTATGAAGAGACTATTGTCAGATG
++
+<<<<<<6<<<<<<<<8;<<<<<<<<<<3&9+;;(;
+@EAS1_93:5:62:969:12
+TATAAAGGAAATCCCATCAGAATAACAATGGGCTT
++
+<<;<;<::<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_93:5:62:969:12
+TCTTGCTAGAGATTTAGACATCTAAATGAAAGAGG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_93:5:66:372:343
+ATTACAAAATATAGTTGAAAGATCTAACAATAGAC
++
+<<<<<<<<<<8<<<<<6<<<8&8<<<<<58<:<::
+@EAS1_93:5:66:372:343
+TATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTGG
++
+;<1;89<<<<<;<9<<<<9<<<;8<9<;<<<<<;8
+@EAS1_93:6:132:717:233
+AGAGAACTTCCCTGGAGGTCTGATGGAGTTTCTCC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_93:6:132:717:233
+TGTTGGTTTTCTGTTTCTTTGTTTGATTTGGTGGA
++
+<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<7<<<<&-<4<1
+@EAS1_93:6:159:273:253
+TTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACATCTAAATGAAA
++
+<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_93:6:191:948:257
+AACTAATATTTGTCTGAGCAAAACAGTCTAGATGA
++
+:;;;;<<<<<<5<5<<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_93:6:191:948:257
+CTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGAT
++
+:<<<<<<<<9<:<<<<<<:<<<<;<<<<8<<<<7<
+@EAS1_93:6:216:47:302
+AAAAAAAAACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCT
++
+<<<<<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<+<<<<<//6;<
+@EAS1_93:6:216:47:302
+AATACTCACCATCATAAATACACACAAAAGTACAA
++
+<<;<8<:<6<<<;<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_93:6:218:144:794
+GGGTGCATTGCTATGTTGCGGTCGCTTTGCCTCCT
++
+++(3:&)5<9035<3):-<53<+&&-+)<<&)&<6
+@EAS1_93:6:218:144:794
+TTTTTTTTTTTTTCTTTTCTCTTTTTTTTTTTTTT
++
+;92/;5:<6)+<5)67</9<&<&<<<:<<<57<<<
+@EAS1_93:6:238:514:194
+AAACTATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTT
++
+<<6<<<<:9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_93:6:238:514:194
+AATAGACTAAACCAAGCAGAAGAAAGAGGTTCAGA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<;<;<
+@EAS1_93:6:255:441:47
+AACAACAGTAAAATAAAACAAAGGAGGTCATCATA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<6<;:<;<
+@EAS1_93:6:255:441:47
+TGGTACAATGTACAATATTCTGATGATGGTTACAC
++
+;;7<;:<<<<<<<<<<;<<<<<<<<;<<<<<<<<<
+@EAS1_93:6:271:244:568
+ATGGACCTGTGATATCTGGATTCTGGGAAATTCTT
++
+;<<<<<<;<;<<<<<<<<<<;;<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_93:6:271:244:568
+CTTGCAACAACCTTGAGAACCCCAGGGAATTTGTC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<.<<<<<<
+@EAS1_93:6:45:601:439
+AATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAAAG
++
+<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<4<<<<9<<<<<<;;
+@EAS1_93:6:45:601:439
+ATAAAAAGGGATTAAATTCCCCCACTTAAGAGATA
++
+<8<<<<<<1<<<<<<<<)<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_93:7:14:426:613
+AGGGAGGGAGGGAAGAGGGACGCTGAAGAACTTTG
++
+:<<<<&<<<<<<<<<<<<<<6<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_93:7:14:426:613
+GTAATGAAAACTATATTTATGCTATTCAGTTCTAA
++
+======;=;==========;;==3=;==-=<;<;<
+@EAS1_93:7:252:171:323
+GCTATTCAGTTCTAAATATAGAAATTGAAACAGCT
++
+;8<;<=3=6==:====;;======;==========
+@EAS1_93:7:270:995:918
+AAAATTCATTTAAGAAATTACAAAATATAGTTGAA
++
+<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<8<8<8<<<<:<;4;4
+@EAS1_93:7:319:280:57
+AAAGGAAATCCCATCAGAATAACAATGGGCTTCTC
++
+<<<<<<<-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_93:7:319:280:57
+TGCTAGAGATTTAGACATCTAAATGAAAGAGGCTC
++
+;==========;=====6;=========;=<;6;;
+@EAS1_93:8:13:325:483
+AAAAACATGAACTAACTATATGCTGTTTACAAGAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;
+@EAS1_93:8:13:325:483
+ATCATACAATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAA
++
+;:;<;=:========;==========;========
+@EAS1_93:8:14:601:624
+AAAAGGTGATGTGTGTTCTCATCAACCTCATACAC
++
+1;;;;==5===.(=9=5=========8====;===
+@EAS1_93:8:14:601:624
+CTGCGCTCTCATTCACTCCAGCTCCCTGTCAACCC
++
+<<1<<<<<<<<<<<<<<<<<3<<::<<7<<1,<:(
+@EAS1_95:1:16:823:343
+AGACATAACCCCACGCTTCCTATGGAAAGGTTGTT
++
+<<<:<<<;+;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_95:1:16:823:343
+TCCCATCTGGCCTCGTCCACACTGGTTCTCTTGAA
++
+================================4==
+@EAS1_95:1:196:533:921
+AAATGTGTTTATTACCAGAGGGATGGAGGGAAGAG
++
+=====1========8===:===7======971=3=
+@EAS1_95:1:196:533:921
+CCTGAGAGATTCTGCAGCCCAGATCCAGATTGCTT
++
+7<<<<7<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_95:1:202:341:984
+GGAGGTCATCATACAATGATAAAAAGATCAATTCA
++
+<<<(<8&<92<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_95:1:202:341:984
+TGAACTAACTATATGCTGTTTACAAGAAACTCATT
++
+=========================4;========
+@EAS1_95:1:249:986:224
+CTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGAT
++
+=========5======7878===98==7=9==.-=
+@EAS1_95:1:249:986:224
+TATTTGTCTGAGCAAAACAGTCTAGATGAGAGAGA
++
+<<<3<;<;;<<;8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_95:1:261:504:780
+TCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTGTTGTT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<</2<<<9<<<5<<,<<
+@EAS1_95:1:261:504:780
+TTTGTCTGAGAAAAACAGTCTAGATGAGAGAGAAC
++
+80;8(;0==8+====;==49===============
+@EAS1_95:1:301:54:240
+AACAGGGAGGTGCACTAATGCGCTCCACGCCCAAG
++
+<<<<:<9<<<<:<<<<9<<<<<<690<<6</<(83
+@EAS1_95:1:301:54:240
+CCCTGCAATTAATATAATTGTGTCCATGTACACAC
++
+&..*3===1=========5.5==5===4====:5=
+@EAS1_95:1:77:589:741
+AGTAAAATAAAACAAAGGAGGTCATCATACAATGA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<
+@EAS1_95:1:77:589:741
+TGGTTACACTAAAAGCCCATACTTTACTGCTACTC
++
+8=;;==606;=========================
+@EAS1_95:2:142:353:398
+CAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAA
++
+===================================
+@EAS1_95:2:142:353:398
+GGTAAAAAATTAACATTACAACAGGAACAAAACCT
++
+=================================9=
+@EAS1_95:2:162:503:769
+AGAGGGACGCTGAAGAACTTTGATGCCCTCTTCTT
++
+========================:==========
+@EAS1_95:2:162:503:769
+AGGCTGCAACTGTGAGCCATCACAATGAACAACAG
++
+;:;1;=8=;:+=====;&==7==============
+@EAS1_95:2:198:691:595
+ACACACATGGTTTAGGGGTATAATACCTCTACATG
++
+==============&===============;7;=1
+@EAS1_95:2:198:691:595
+CATGAAGCACTGAACTTCCACGTCTCATCTAGGGG
++
+:=:;=;===========;=================
+@EAS1_95:2:211:954:174
+AAAGAAAAAACAAAAACTATGCTAAGTATTGGTAA
++
+====*=====6========================
+@EAS1_95:2:211:954:174
+AGACCTAAGAGGGATGAGAAATTACCTAATTGGTA
++
+===============================777=
+@EAS1_95:2:228:915:631
+AAGATATGTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACA
++
+=================;==========4======
+@EAS1_95:2:228:915:631
+ATTATTAAAGAAAAAAAAACCTGTCAAACACGAAT
++
+&-))-*===/=========9====4==========
+@EAS1_95:2:278:918:892
+AGCCCAGCTCCAGATTGCTTGTGGTCTGACAGGCT
++
+=============:====================8
+@EAS1_95:2:278:918:892
+CCATCCCTGTCTTACTTCCAGCTCCCCAGAGGGAA
++
+=6=3=<===&=========================
+@EAS1_95:2:40:918:950
+AATATAATTGTGTCCATGTACACACGCTTTCCTTT
++
+=========,=9=====2=7===7=0==&=+3=-=
+@EAS1_95:2:40:918:950
+GTTCTCTTGAAAGCTTGGGCTGTAATGATGCCCCT
++
+=0=&&33======;=====.===============
+@EAS1_95:3:268:523:511
+ACACTGGTTCTCTTGAAAGCTTGGGCTGTAATGAT
++
+8<7<99<<<<<<<<<:<<<<<<4<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_95:3:268:523:511
+TGTCCATGTACACACGCTGTCCTATGTACTTATCA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<6<:9<<3<44
+@EAS1_95:3:303:970:243
+AACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCTAAAC
++
+<<0+<<<,<4<:<:<<<<<<<<<<<::<<<<<<<<
+@EAS1_95:3:303:970:243
+CAGACTTCATCAAGATATGTAGTCATCAGACTATC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<<<<<<<<8<8<
+@EAS1_95:3:308:956:873
+ATAAAAATAAGTGTGTCCATGTACACACGCTGTCC
++
+91.97&9499&-1*98*19999839999.9&9799
+@EAS1_95:3:308:956:873
+CTCATCTAGGGGAACAGGGAGGTGCACTAATGCGC
++
+<<<<<<<<<<<<<;<;<;1<<<<<.<9<;<<<<+;
+@EAS1_95:4:174:157:573
+CAGAAACCAAATGAGAGAAGGAGTAGCTATACTTA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_95:4:174:157:573
+TAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAGGGATGAGA
++
+8<<<<4<<<<<<<<;<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_95:4:176:971:874
+TAAAATCAGAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTATA
++
+<<<<<:<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_95:4:176:971:874
+TGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTG
++
+<<<<<<<<<<<<<:<;<<<<<<<<<<<<<5<<<<7
+@EAS1_95:4:184:17:636
+TACACACACATGGTTTAGGGGTATAATACCTCTAC
++
+8<89<<:<<<;;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_95:4:184:17:636
+TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCACAGGT
++
+!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!77777777
+@EAS1_95:4:224:592:744
+GATATGTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACATG
++
+6<6<<<<<<9+<6-<<<:<:<:<<<<<:<<<<<<<
+@EAS1_95:4:224:592:744
+TATGAGATTATGTAAAGTAACTGAACCTATGAGTC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<7<<<<<<<&<*<<
+@EAS1_95:4:238:124:196
+TTTTTTTTCTTTTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTT
++
+<0<9.<5.5<<<<9<1<<5<<85<5<<<9<:<<<<
+@EAS1_95:4:61:631:567
+AAGAAGATATAACCATCCTACTAAATACATATGCA
++
+<<7<<<<<<<<</<<;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_95:4:61:631:567
+CATTAATAAAGACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_95:4:66:179:118
+CCATGTACACACGCTGTCCTATGTACTTATCATGA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<;<<6<<
+@EAS1_95:4:66:179:118
+TGGGCTGTAATGATGCCCCTTGGCCATCACCCAGT
++
+<<99<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<:<<<<<<<
+@EAS1_95:4:71:517:742
+AACTATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTT
++
+<<<<<<2<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_95:4:71:517:742
+AAGCAGAAGAAAGAGGTTCAGAACTTGAAGACAAG
++
+<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<48:4<<<<3
+@EAS1_95:5:257:654:116
+TAACAATAGACTAAACCAAGCAGAAGAAAGAGGTT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;:<<<<<<<<<88
+@EAS1_95:5:257:654:116
+TCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTGGAAA
++
+0+37<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_95:5:263:511:936
+CAAATAGGTAAAAAATTAACATTACAACAGGAACA
++
++<<%<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_95:5:263:511:936
+CAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGCTAAGATAATT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<;<<:<:<<<<<<
+@EAS1_95:5:284:212:932
+CTTTAAATCAACAACAATAAAAAAAAACAAAGGAG
++
+<<9<<<<<<<<<<<<<&&<<<<5<<<<8<<<1:<:
+@EAS1_95:5:284:212:932
+TGATGATGGTTACGCTAAAAGTCCATGCTTTACTG
++
+82%<8:<-:<<:**:<-<<8<)/2/<:/<<<<<<<
+@EAS1_95:6:174:650:125
+AAGCATCATAAATGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_95:6:174:650:125
+CAGGTTTTATAAAACAATTAATTGAGACTACAGAG
++
+===;===============================
+@EAS1_95:6:185:312:167
+CTGAAGAACTTTGATGCCCTCTTCTTCCAAAGATG
++
+===========================;855;===
+@EAS1_95:6:185:312:167
+TGGTCTGACAGGCTGCAACTGTGAGCCATCACAAT
++
+<<8:<8<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_95:6:194:696:490
+ACATTAATACTATGTTTCTTATCTGCACATTACTA
++
+========;======;==========8==:=====
+@EAS1_95:6:194:696:490
+TTCCACGTCTCATCTAGGGGAACAGGGAGGTGCAC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;5<<<<<:<1<8<<<8
+@EAS1_95:6:53:156:845
+ACACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAAAACAGTCT
++
+171(*00,0;;&;7=77=;5;;(;1:=5=======
+@EAS1_95:6:53:156:845
+TTGTAATCTCTCTCCTTTTTGCTGCATCCCTGTCT
++
+<<<<<<8<<<.<<<<.6<<--<-<<<<<<<6<<<<
+@EAS1_95:6:87:734:888
+ATACCATCCCTGTCTTACTTCCAGCTCCCCAGAGG
++
+===========;8=========;;=;====;;3(;
+@EAS1_95:6:87:734:888
+TGCGCTCCACGCCCAAGCCCTTCTCACAGTTTCTG
++
+56<<86;:<<<4;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_95:7:155:530:532
+AGCAAGAAGATATAACCATCCTACTAAATACATAT
++
+===================================
+@EAS1_95:7:155:530:532
+TGCGCTTGTACTTCTAAATCTATAACAAAATTAAA
++
+:<<<><<8<<<<<><<<<<><<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_95:7:280:607:113
+ATCCATGTAACAAATCTGCGCTTGTACTTCTAAAT
++
+===================;===;=====<=7=9:
+@EAS1_95:7:280:607:113
+GGAGTATAAATTGTTTTCCACTTTGGAAAACAATT
++
+18<-<<<<<<<<<<<<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_95:7:282:817:710
+TGGAGGGAAGAGGGACGCTGAAGAACTTTGATGCC
++
+366=6;======8====:========;========
+@EAS1_95:7:282:817:710
+TTTGTAATGAAAACTATATTTATGCTATTCAGTTC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;:<<<<:8,<<8
+@EAS1_95:7:310:800:761
+AAAGCACACTTTAAATCAACAACAGTAAAATAAAA
++
+===========================+=======
+@EAS1_95:7:310:800:761
+CAATATTCTGATGATGGTTACACTAAAAGCCCATA
++
+1<<:<:<:<<<<:<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_95:7:46:522:426
+AAAGACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGA
++
+<<<<<:<<<<<<1/<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_95:7:46:522:426
+GGTAAAAAATTAACATTACAACAGGAACAAAACCT
++
+=======================:==;<===78==
+@EAS1_95:7:55:506:125
+CTTTACTGTCATAACTATGAAGAGACTACTGCCAG
++
+118%67;1;8,4:187<4>::1:818;;&::<>.;
+@EAS1_95:7:55:506:125
+TCTACCACAGGGGGCTGCGCGGTTTCCCATCATGA
++
+<<<<<<<<<;<9<;<<;558<<<<5(5*<<<<<51
+@EAS1_95:7:61:702:720
+ATTTGTCTGAGCAAAACAGTCTAGATGAGAGAGAA
++
+<<<4<4+0;<<:<<<<<<<<-<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_95:7:61:702:720
+CTCTCCTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTC
++
+==============;=======&=========3:=
+@EAS1_95:7:74:866:49
+CATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTC
++
+====================9==91==<=6==;:=
+@EAS1_95:7:74:866:49
+CCAACCTACTAAATACATATGCACCTAACACAAGA
++
+:8<&<<<<7<<<<:<<<<<<8<5<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_97:2:128:629:484
+AAAAAAGTAAATAAAACACATAGCTAAAACTAAAA
++
+:(::<</*;<<99<<<-<;<<<<4<<<<<<<<<<<
+@EAS1_97:2:128:629:484
+GATTCATAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAGGG
++
+<<49<<<<<9<<<<99<<<<<<<<<<<<+<-)7))
+@EAS1_97:2:193:420:78
+ATAAATGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<;
+@EAS1_97:2:193:420:78
+TTGAGACTACAGAGCAACTAGGTAAAAAATTAACA
++
+81<<;<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_97:2:59:882:980
+AATATAATTGTGTCCATGTACACACGCTGTCCTAT
++
+<<<<<<<<<8<<<<<9<+<<<9<<<1<<77889+6
+@EAS1_97:2:59:882:980
+GGGCTGTAATGATGCCCCTTGGCCATCACCCGGTC
++
+7339%<6<<<<<;<<9<<8<<<<;<<<<<<<<<<<
+@EAS1_97:2:96:419:327
+TACTAAATACATATGCACCTAACACAAGACTACCC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<;;9<9
+@EAS1_97:2:96:419:327
+TCTAAATCTATAACAAAATTAAAATTTAACAAAAG
++
+;1<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_97:2:9:203:653
+CACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAAAACAGTCTA
++
+37))&<8<<<<<7<4<;<777<<:<<<<<<<<;<<
+@EAS1_97:2:9:203:653
+TCCCTGCCCCATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<::<9<<<<<;;;<
+@EAS1_97:3:147:423:584
+GAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9;;96
+@EAS1_97:3:147:423:584
+GCATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCATCAGAA
++
+27<;<3<<<+<<;<<<;;-4<<<<<;<<<<<<<<<
+@EAS1_97:3:160:173:889
+TATGAGTCACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;0<7<<;<<<;7<09
+@EAS1_97:3:160:173:889
+TCAAGATATGTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAA
++
+;)<</<8<<<<<<</<;<<<<;<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_97:3:277:144:848
+TAACAATAGACTAAACCAAGCAGAAGAAAGAGGTT
++
+<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<3<<9;;6;
+@EAS1_97:3:277:144:848
+TATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTGG
++
+<<<)63<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_97:3:73:292:429
+GAAAGCTTTCAACGCTTCTAGCCATTTCTTTTTGC
++
+<<<<<<<<<<7<<;<<<<<<<2<<<5<<<<<:%)<
+@EAS1_97:3:73:292:429
+TTCTCACAGTTTCTGCCCCCAGCATGGTTGTACTG
++
+;6;6;<<<<<;<<<<;<<<<<<<<7<<<<<<5<<<
+@EAS1_97:4:261:267:597
+GGGTAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAAT
++
+<<<<<<<<<;<<<<<7<<<<<<<<<:7<7<;44:;
+@EAS1_97:4:261:267:597
+TTGAGAATAAAGAGCAACTAGGTAAAAAATTAACA
++
+*-1<9<+1<+<<<<:<<;9<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_97:4:274:287:423
+CTAAATCTATAAAAAAATTAAAATTTAACAAAAGT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<
+@EAS1_97:4:274:287:423
+TTTTTTTTTTTTTTTTTCTCTTTTTTTTTTTTTTT
++
+7<<<<9<<9<<<.<<<<90-<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_97:4:290:121:79
+ATTGGTAAAGATGTGGGGAAAAAAGTAAACTCTCA
++
+<1<<:<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_97:4:290:121:79
+TGATGATGGTTACACTAAAAGCCCATACTTTACTG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<7;<<
+@EAS1_97:4:77:29:126
+ACAGGGAATTTGTCAATGTCAGGGAAGGAGCATTT
++
+()9;;<<<<<<<<<<5<<<7<<<<<<;<<<;7<<<
+@EAS1_97:4:77:29:126
+GCACAGGGGCTTAACCTCTGGTGACTGCCAGAGCT
++
+<<<<<<<<<<3<<<<<<<;;;7<;<<449<-:977
+@EAS1_97:4:83:731:540
+CTAGGTAAAAAATTAACATTACAACAGGAACAAAA
++
+;7<:+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_97:4:83:731:540
+TAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGCTAAG
++
+<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<:<7<*;&;<;;9
+@EAS1_97:5:154:952:558
+AAAGACTACCCAGATTCATAAAACAAATACTACTA
++
+%<<9;;<<;;;<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_97:5:154:952:558
+GCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGGAGTAGCTAT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<:<
+@EAS1_97:5:219:174:684
+AAAAAAACTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCT
++
+<<<<:;+9<<<;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_97:5:219:174:684
+AGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACATGAAGGAAA
++
+<<<<<<<<<<<8<8<<<7<<;<<<<<2<;&;;;;9
+@EAS1_97:5:28:538:148
+AAAAAAAAACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCT
++
+<<<<<<<<<<7;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_97:5:28:538:148
+TCATCAAGATATGTAGTCATCAGACTATCTAAAGT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<+771;
+@EAS1_97:5:318:177:383
+TACTACCCTGCAATTAATATAATTGTGTCCATGTA
++
+;<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<;1'<;
+@EAS1_97:5:318:177:383
+TCTTGAAAGCTTGGGCTGTAATGATGCCCCTTGGC
++
+5:9;7;777<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<4
+@EAS1_97:5:84:927:843
+CCAGCATGGTTGTACTGGGCAATACATGAGATTAT
++
+<<<<<<<<<<<<<;9;;4;<<0<<7<<9<;<:<5<
+@EAS1_97:5:84:927:843
+TTACGTCCTATCTTCTTCTTAGGGAAGAACAGCTT
++
+588;<:<<<<<<<6<<<<;<<<:/<<3<:;<*<<<
+@EAS1_97:6:222:305:337
+TTTTTTTTTTTTTTTTTTCCCTTTTTTTTTTTTTT
++
+;;;;;<<';<<<<*;<<<78;7<7<;<<<<<<<<<
+@EAS1_97:6:308:667:658
+AAAGATCACTTCAGCAATAAGATATAACCATCCTA
++
+<9;;;45;&<;&.<5683;84+<;<;+8<;<<8;<
+@EAS1_97:6:308:667:658
+TAAAAACATGAACTAACTATATCCTTCTTACAATA
++
+9<96<<<;<96<<9<51<<<<<1:9++<9*%4;*5
+@EAS1_97:6:93:334:858
+CTGCCCCCAGCATGGTTGTACTTGGCAATACATGA
++
+<<<<<<<<;<<<<;;<<9<<<<&;&<<9<9;/;&;
+@EAS1_97:6:93:334:858
+GTACTTATCATGACTCTATCCCAAATTCCCAATTA
++
+;<;+;;<<;<<<<<;<<<<;;8<<<<8<<<<<<<<
+@EAS1_97:7:20:979:96
+GAAATTGAAACAGCTGTGTTTAGTGCCTTTGTTCA
++
+'9996;(:;-<;1<<<<=<<<<=<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_97:7:264:642:506
+AAATATAGAAATTGAAACAGCTGTGTTTATTGTAT
++
+<<;<<<<<<;<<<;:;;:;;<<;<<<<;*+;*&.4
+@EAS1_97:7:264:642:506
+ACTTCATCCAAAGATGAAACGCGTAACTGCGCTCT
++
+&;(-/)-1&:<<9<25<<<<2<1<';8<<<:888<
+@EAS1_97:7:28:979:519
+AAAAAGTAAACTCTCAAATATTGCTAGTGGGAGTA
++
+<<<<<6<<<<<<<<<<<<<<<8<<<<<<<<6<<<<
+@EAS1_97:7:28:979:519
+CCCATACTTTACTGCTACTCAATATATCCATGTAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;;;9:
+@EAS1_97:7:63:727:203
+AAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAGA
++
+<<;7<<;<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_97:7:63:727:203
+AGTCTCTTATGAATTAACCCAGTCAGACAAAAATA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;<<;
+@EAS1_97:7:9:648:712
+AAGAAGTATGAGATTATGTAAAGTAACTGAACCTA
++
+<9<;<<<<<<<;<<<<<8<<<<9<<;<<8)<:1<:
+@EAS1_97:7:9:648:712
+TACATTGCAAGACAGACTTCATCAAGATATGTAGT
++
+*;0;;;95<<<<7<<<;;<<<;;<<<<;<<<<<<<
+@EAS1_97:8:36:927:478
+AAAAGGTCTTTCAAAAGGTGATGTGTGTTCTCATC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<:<:<<<<8<9;<8
+@EAS1_97:8:36:927:478
+GACCCTACACGAATGCGTCTCTACCACAGGGGGCT
++
+,6;;;3;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_99:1:17:595:863
+AAGCTACTCAATATATCCATGTAACAAATCTGCGC
++
+))55))+2&<<,:5<,0657<<<<:<:<:<<<<<<
+@EAS1_99:1:17:595:863
+ATAACCATCCTACTAAATACACATGCACCTAACTC
++
+:<4:<<1:<<<9<+<+1<%<7&&9-71<17)7</4
+@EAS1_99:1:187:715:521
+AAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACATCT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<;<<;<;;
+@EAS1_99:1:187:715:521
+GCATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCATCAGAA
++
+<7<:<9<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_99:1:34:649:318
+AAGAATAACAATGGGCTTCACAGCGGAACCCTTAC
++
+)<7<<3<<<<<<+<1<;<8&<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_99:1:34:649:318
+ATGAAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACAT
++
+9<<3<<<9<<<<<<<<<7<<9<<0<<.0<*:77,;
+@EAS1_99:1:86:871:319
+GGCTTCTCAGCGGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGA
++
+<<<<<:<<<:<:<<<<<<<<<<<<8<<:<1;<::)
+@EAS1_99:1:86:871:319
+TGCTAAGATAATTCATCATCACTAAACCAGTCCTA
++
+7;+1;<:<<<<<<<<;<<;<<9<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_99:2:152:355:962
+CAGTCATCTATAAAGGAAATCCCATCAGAATAACA
++
+&<.9.<;+;<;<<<<<<<<<<::<<:<<<<<<<<<
+@EAS1_99:2:152:355:962
+TATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGT
++
+<;<<<<<;8<<<<<<<<<;5;;88<<3<<<<<&0;
+@EAS1_99:2:162:257:203
+AAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGATATAACCATCC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<<
+@EAS1_99:2:162:257:203
+ATATCCATGTAACAAATCTGCGCTTGTACTTCTAA
++
+<;<;:<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_99:2:188:782:483
+CTAAAATCAGCAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTA
++
+7<<<<<<4<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_99:2:188:782:483
+GAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<7<;77
+@EAS1_99:3:118:851:285
+CCCAATTACGTCCTATCTTCTTCTTAGGGAAGAAC
++
+3+7<<<;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_99:3:118:851:285
+TGGGCAATACATGAGATTATTAGGAAATGCTTTAC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<;<:<<<<;;
+@EAS1_99:3:135:543:760
+ATTTGCCTTCAGACCCTACACGAATGCGTCTCTAC
++
+;;.;;8;<8;<<32;<<<<<7<<<<<9<<<<<<<<
+@EAS1_99:3:135:543:760
+TTCAAAAGGTGATGTGTGTTCTCATCAACCTCATA
++
+<<<<;;<;<<<<<<<9<<<<<<<<<<<;<<<<5<:
+@EAS1_99:3:187:791:153
+AATACATGAGATTATTAGGAAATGCTTTACTGTCA
++
+:;55&<99<<1<;<<8<<;<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_99:3:187:791:153
+TACACGAATGCGTCTCTACCACAGGGGGCTGCGCG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:+;;<;<88*6;68
+@EAS1_99:3:21:423:169
+ACTAAAAGCCCATACTTTACTGCTACTCAATATAT
++
+<<<<<;<<<<<<;<<<<<;;<<<<<<<<9+:5<;;
+@EAS1_99:3:21:423:169
+GGAGTATAAATTGTTTTCCACTTTGGAAAACAATT
++
+;376;0<<<<99<<<<<<-;<4<<<<<<<<<;<<<
+@EAS1_99:3:61:183:767
+GTAAAGTCTCAGGGAGCCGTCCGTGTCCTCCCATC
++
+6&.;;<3<363<<<<<<<<8<<<6<<<<3<<<<<<
+@EAS1_99:3:61:183:767
+TTGCCAGATGAACCACACCTTAATACTATGTTTCT
++
+<<<<<<<<<<;<<<9<9<+<<<8<<<<<<;8<<<<
+@EAS1_99:5:147:479:41
+CTCCTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTT
++
+;:;:;<::<:<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_99:5:147:479:41
+TACGTCCTATCTTCTTCTTAGGGAAGAACAGCTTA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<::6<<;<<<;;9;;6
+@EAS1_99:5:191:885:623
+TGCAAGACAGACTTCATCAAGATATGTAGTCATCA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<;;;;
+@EAS1_99:5:191:885:623
+TTAAAGAAAAAAAAACCTGTCAAACACGAATGTTA
++
+66<<<<<<<<<<<<<2<<<<9<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_99:6:135:354:66
+GATACATTGCAAGACAGACTTCATCAAGATATGTA
++
+;;;;7<<<<:<<<<;<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_99:6:135:354:66
+TATGAGATTATGTAAAGTAACTGAACCTATGAGTC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<;<<2<;;;
+@EAS1_99:6:177:562:806
+ACAGTGTAGATGAGAGAGACCTTCCCTGGAGGTCT
++
+)2<9;'/:<5<<<:<<:<:&5:&<8,<<+:<&<<<
+@EAS1_99:6:177:562:806
+TGATTTACTTGTTGTTGGTTTTCTGTTTCTTTTTT
++
+<;<29<99<<;<<<9<20<9<<5;;<<<<<<<+.<
+@EAS1_99:6:181:392:500
+GGAAATCCCATCAGAATAACAATGGGCTTCTCAGC
++
+/5<<;(88<<<;<;<<6<<<<<7<<<<<<<7<<<<
+@EAS1_99:6:181:392:500
+TTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACATCTAAATGAAA
++
+<<<<<:<<<2<<<<;5<<<<29+<<)</65<7.24
+@EAS1_99:6:63:48:631
+CAATACATGAGATTATTAGGAAATGCTTTACTGTC
++
+<<<<<<;<<7</<<<<<<;;;<<<;<;<<7;;);<
+@EAS1_99:6:63:48:631
+TCCTATCTTCTTCTTAGGGAAGAACAGCTTAGGTA
++
+;*:;;<2<<2779;:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_99:7:126:361:250
+AAAAAATTAACATTACAACAGGAACAAAACCTCAT
++
+<<<<<<;9<<<<<<<<<<<<<<;;;<<<;<664;;
+@EAS1_99:7:126:361:250
+TCTACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGGAGTA
++
+72:;7</<<<:<-7<<:<<<<<<<:<6<+:<<<<<
+@EAS1_99:7:171:196:287
+ATAACAATGGGCTTCTCAGCAGAAACCTTACAAGC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;6<<<<<<2:8<0:
+@EAS1_99:7:171:196:287
+ATAATTCATCATCACTAAACCAGTCCTATAAGAAA
++
+<;;;98;<;&<;;<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_99:7:183:645:699
+GTGGCCCTCCCCCATTCCCTGCCCCATCTCTTGTA
++
+&)))2-&420<<<'--<6:6-<7<<<+:7<65<<<
+@EAS1_99:7:183:645:699
+TATCCCAAATTCCCAATTACGTCCTATCTTCTTCT
++
+<<9<9<<<<<<<<<;<<;<<*175;173<;;;<-/
+@EAS1_99:7:37:400:627
+ACATGAGATTATTAGGAAATGCTTTACTGTCATAA
++
+<<<<<<7+<<<<<<2615<<6<<<<5<<1<<;:74
+@EAS1_99:7:37:400:627
+TCTTAGGGAAGAACAGCTTAGGTATCAATTTGGTG
++
+474*;<<9<;<<<;<<:<<<<<<;<<<<<<;<<;<
+@EAS1_99:8:117:578:853
+AATGAACTTCTGTAATTGAAAAATTCATTTAAGAA
++
+<;<9<<<<<;<<;<<<<<<<<<<<,<98;<;;&92
+@EAS1_99:8:152:778:228
+ATCATAAATACACACAAAAGTACAAAACTCACAGG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;
+@EAS1_99:8:152:778:228
+ATTTAAAAACATGAACTAACTATATGCTGTTTACA
++
+<;;7=<<<<<<;<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_99:8:187:199:369
+TGAAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACATT
++
+;<><<<<<<<<7<<<<<<<<=<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS1_99:8:27:228:31
+AAATAAAACAAAGGAGGTCATCATACAATGATAAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<;9<:;<<<<<<75<<<<<
+@EAS1_99:8:27:228:31
+GGTTACACTAAAAGCCCATACTTTACTGCTACTCA
++
+99;;;<<<<<<:<<;<;<<;<<<<;<<;<<<<<<<
+@EAS1_99:8:99:756:130
+GAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGATGTGTGTTCT
++
+;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<6<<;<
+@EAS1_99:8:99:756:130
+GACCCTACACGAATGCGTCTCTACCACAGGGGGCT
++
+;;<<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS218_1:2:10:686:1024
+ACAAGAAACTCATTAATAAAGACATGAGTTCAGGT
++
+<:<<<<:<<<<<<<<<<:<:<<<<<<<<<<<5<<<
+@EAS218_1:2:10:686:1024
+CATACAATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGA
++
+&<<<3<<<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<<<<7<<<<
+@EAS218_1:2:15:1763:1143
+AAACAAATACTACTAGACCTAAGAGGGATGAGAAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS218_1:2:15:1763:1143
+TGAGAGAAGGAGTAGCTATACTTATATCAGATAAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS218_1:2:18:1498:1475
+CTTGGGCTGTAATGATGCCCCTTGGCCATCACCCG
++
+<<<<<7<<<<<<+<<-3<<3<:<2<1<<:<<<<<+
+@EAS218_1:2:18:1498:1475
+GAAAGGTTGTTGGGAGATTTTTAATGATTCCTCAA
++
+:<4<*7<<<<<<<:<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS218_1:2:19:752:816
+CGTCCGTGTCCTCCCATCTGGCCTCGTCCACACTG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<7;<;<<767277;6
+@EAS218_1:2:19:752:816
+TTTGGTGGAAGACATAATCCCACGCTTCCTATGGA
++
++<<+<--/<<<<4<2<<<<45<<<:<<<<<<+<<<
+@EAS218_1:2:26:211:481
+ACAAAATATAGTTGAAAGCTCTAACAATAGACTAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<<<:<7<<<
+@EAS218_1:2:26:211:481
+CACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAA
++
+:<:<<<<<<9:5<<<<<<<<<<<<<<:<:<<<<<<
+@EAS218_1:2:40:1291:1045
+CTAACACAAGACTACCCAGATTCATAAAACAAATA
++
+*<<<9<<<<<<:0<9<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<
+@EAS218_1:2:40:1291:1045
+GTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTACGCAACAAG
++
+<<<<<<<<<5<<5<<<<7<<<<<<<<<5<9<&%73
+@EAS218_1:2:64:1318:1711
+GGAAGAGGGACGCTGAAGAACTTTGATGCCCTCTT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS218_1:2:64:1318:1711
+TGAAAACTATATTTATGCTATTCAGTTCTAAATAT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<:<<<<<2<<<<
+@EAS218_1:4:14:1872:1521
+TCAAAGAATGCCAGGAAGATACATTGCAAGTCAGA
++
+7<<<<77<<<3<3<7.'<<<<<7<67<+.0%4*<4
+@EAS218_1:4:14:1872:1521
+TCATCAAAAACCTTACAAGCCAGAAGAGATTGGAT
++
+/1<%73&7<1<3577,<<<7/733<<<<<<<<1<<
+@EAS218_1:4:15:856:340
+CACGCTGTCCTATGTACTTATCATGACTCTATCCC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS218_1:4:15:856:340
+CCCCAGCATGGTTGCACTGGGCAATACATGAGATT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<77<<
+@EAS218_1:4:28:315:310
+AAACTGTTCTCTTGAAAGCTTGGGCTGTAATGATG
++
++%,768<<:<:<2<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS218_1:4:28:315:310
+CATGTACACACGCTGTCCTATGTACTTATCATGAC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<+.<<.<+7<*17
+@EAS218_1:4:37:1626:862
+ACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAAAACAGTCTAG
++
+:663<<3<<<<<<<<<<:<<<<7<<<<<<<<<<<<
+@EAS218_1:4:37:1626:862
+TCTCCTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS218_1:4:61:1369:440
+AAAGACATGATTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGA
++
+<<<<<<<<<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS218_1:4:61:1369:440
+CAGGTTTTATAAAACAATTAATTGAGACTACAGAG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<8
+@EAS218_1:4:62:561:531
+AGCTATACTTATATCAGATAAAGCACACTTTAAAT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS218_1:4:62:561:531
+TACTAGACCTAAGAGGGATGAGAAATTACCTAATT
++
+<<7<<<<:<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS218_1:4:71:832:743
+ACCCAGTCCCTGCCCCATCTCTTGTAATCTCTCTC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS218_1:4:71:832:743
+CTATGTACTTATCATGACTCTATCCCAAATTCCCA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<*<<<<<<<
+@EAS218_1:4:73:42:1038
+AAACAGTCTAGATGAGAGAGAACTTCCCTGGAGGT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS218_1:4:73:42:1038
+TCTGTCTTGATTTACTTGTTGTTGGTTTTCTGTTT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<.<<<<<
+@EAS218_1:4:75:555:1591
+TGAACTTCTGTAATTGAAAAATTCATTTAAGAAAT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<6<<<<
+@EAS218_1:6:49:905:27
+CCACAGGGGGCTGCGCGGTTTCCCATCCTGAAGCA
++
+<<;<.89<9.<2<9<:91+447.9,04&000(,+(
+@EAS218_1:6:49:905:27
+GAAGAGACTATTGCCAGTTGAACCACACATTAATA
++
+99515<<&<<6595-56%;86&<;<<<6<<<<6;<
+@EAS218_1:6:66:1282:1215
+GTGATGTGTGTTCTCATCAACCTCATACACACACA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;;;
+@EAS218_1:6:66:1282:1215
+TTCAGACCCTACACGAATGCGTCTCTACCACAGGG
++
+::;<;<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS218_1:6:77:1529:522
+AAAACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCTAA
++
+<<;<<<<<<<<<<<4<<4<;;:;2:7<<<2*<;;8
+@EAS218_1:6:77:1529:522
+AAAGTTCAATACTCACCATCATAAATACACACAAA
++
+<<<;7;,<<<<<<.<,6<<6<<<<<<<;<<<<<<<
+@EAS218_1:6:88:1413:14
+AATGAAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACA
++
+<<<<<<<<<<<;;;<<<<<<;<;;<<<<<<<<<<<
+@EAS218_1:8:13:1729:1844
+ATGAACTTCTGTAATTGAAAAATTCATTTAAGAAA
++
+<<<;;<;7<<<<4<<<<762;6<<<<<<<;6;618
+@EAS218_1:8:16:1081:1894
+AAGGTGATGTGTGTTCTCATCAACCTCATACACAC
++
+;5;;&<;<<<<<<<<;<;<<;<<<;<<<<<<<<<<
+@EAS218_1:8:16:1081:1894
+AGATGAAACGCGTAACTGGGCTCTCATTCACTCCA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<<<<;<<;<<<<<<<+
+@EAS218_1:8:26:785:882
+CAGTTTCTGCCCCAAGCATGGTTGTACTGGGCAAT
++
+<<<0<<<<<<<<<6,<<)<<<<<<<&<<0<<,<'<
+@EAS218_1:8:26:785:882
+TACTTATCATGACTCTATCCCAAATTCCCAATTAC
++
+<<&5&<<<<5.;5<'<<;.76<<<<<7<7<<<<<<
+@EAS218_1:8:61:1797:113
+CAGATAGCTTGTGGTCTGACAGGCTGCAACTGTGA
++
+<<0<<&<<<<;<<4;;3<;<:<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS218_1:8:61:1797:113
+GGGATGGAGGGAAGAGGGACGCTGAAGAACTTTGA
++
+<<<<<<;<<<<;:<3<<<<;;<<<8<<;:<<;3<.
+@EAS218_1:8:70:445:1289
+CTAATTTTTGGACTTCTTAAAGAAAAAAAAACCTG
++
+<<<<<<<<<<2<<<<<<<<<<:<<<<<<<;;;;<:
+@EAS218_1:8:70:445:1289
+GAATTGTAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAATACTCA
++
+<<<:<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS218_1:8:82:1540:77
+ATTGAGACTACAGAGCAACTAGGTAAAAAATTAAC
++
+<48;<;</;<<<<<<:<<0<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS218_1:8:82:1540:77
+GAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<<<:8
+@EAS218_1:8:90:706:1276
+AATTAACATTACAACAGGAACAAAACCTCATATAT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<:<:<
+@EAS218_1:8:90:706:1276
+GTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAACAG
++
+<;<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<
+@EAS218_4:1:34:1614:558
+CAACATGAAGGAAAAAAATTCTAAAATCAGCAAGA
++
+<<<<<<<<<<<7<<<<<8<<<<<<2<<<<<<<<<<
+@EAS218_4:1:34:1614:558
+GTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCTAAACTAAGC
++
+<<9<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS218_4:1:48:9:409
+CAGCTCCCTGTCACCCAATGGACCTGTGATATCTG
++
+<<<<+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS218_4:1:48:9:409
+GTTTAGTGCCTTTGTTCACATAGACCCCCTTGCAA
++
+<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS218_4:1:84:1505:1037
+GTCAACATGAAGGAAAAAAATTCTAAAATCAGCAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<::)
+@EAS218_4:1:84:1505:1037
+TGCCCTGCTAAACTAAGCATCATAAATGAAGGGGA
++
+<<966<<7<<<<7<<<<9<<;<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS218_4:1:9:206:901
+AGTCTAGATGAGAGAGAACTTCCCTGGAGGTCTGA
++
+<<<<<<<<<<<<<.<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS218_4:1:9:206:901
+CTTCCTCTGTCTTGATTTACTTGTTGTTGGTTTTC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<5<<5<<%%:<<<7
+@EAS218_4:3:12:630:707
+ATTTAAAAACATGAACTAACTATATGCTGTTTACA
++
+<:<<<<<<<;<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS218_4:3:12:630:707
+CACAAAAGTACAAAACTCACAGGTTTTATAAAACA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS218_4:3:39:1671:1928
+AGCCCATACTTTACTGCTACTCAATATATCCATGT
++
+<<<<<<<;<<<<;<<<<<4<<<;3<<<;<<<<<<<
+@EAS218_4:3:39:1671:1928
+CAAATATTGCTAGTGGGAGTATAAATTGTTTTCCA
++
+<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS218_4:3:41:1281:1785
+ACTATCTAAAGTCAACATGAAGGAAAAAAATTCTA
++
+<6<<<6<<<<<<:<<6<:<<<<<<<<<<<<6<<<<
+@EAS218_4:3:41:1281:1785
+GGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAACTAT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<;<<<<<<<8<
+@EAS218_4:3:65:85:1547
+AAATCAGCAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTATAA
++
+<<<<<<;:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS218_4:3:65:85:1547
+GTTTGGAAAAACTATTTGAGGAAGTAATTGGGGAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<:<<<
+@EAS218_4:5:41:118:1246
+ACCAGAGGGATGGAGGGAAGAGGGACGCTGAAGAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<</<<<<<<1<<(
+@EAS218_4:5:41:118:1246
+CTCCAGATTGCTTGTGGTCTGACAGGCTGCAACTG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS218_4:5:63:875:1339
+CCCCAGATACCATCCCTGTCTTACTTCCAGCTCCC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<
+@EAS218_4:5:63:875:1339
+GGGAACAGGGAGGTGCACTAATGCGCTCCACGCCC
++
+;;<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS218_4:7:71:31:1973
+AAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACATTGC
++
+<<<<<7<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS218_4:7:72:1288:1211
+ATTGGTACAATGTACAATATTCTGATGATGGTTAC
++
+<);<:<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS218_4:7:72:1288:1211
+GATAAAGCACACTTTAAATCAACAACAGTAAAATA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS218_4:7:85:923:726
+ACAAAATATAGTTGAAAGCTCTAACAATAGACTAA
++
+<<<<<<<7<<<<<<<<<<<55<<<9<*<<<991<4
+@EAS218_4:7:85:923:726
+GTAAAGTAACTGAACCTATGAGTCACAGGTATTCC
++
+<:<<<%3<<1<<86<<-<<<<<<<<<<<<6<<1<<
+@EAS218_4:7:87:964:826
+CACAGGGGGCTGCGCGGTTTCCCATCATGAAGCAC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<1<<8;4;;<
+@EAS218_4:7:87:964:826
+TGAAGAGACTATTGCCAGATGAACCACACATTAAT
++
+)6<<<<<<:;<6<<::<<<;<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS218_4:7:89:1487:520
+CACGAATGCGTCTCTACCACAGGGGGCTGCGCGGT
++
+8<<<6/<<<<<<<<<:<<8<:<<3<<:668<86<3
+@EAS218_4:7:89:1487:520
+TATGAAGAGACTATTGCCAGATGAACCACACATTA
++
+4;;/<<<<<:<;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS218_4:7:90:1873:89
+GAGATTCTGCAGCCCAGATCCAGATTGCTTGTGGT
++
+<<<<;49<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS218_4:7:90:1873:89
+GCATTTTGTCAGTTACCAAATGTGTTTATTACCAG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<7<<<7
+@EAS219_1:1:22:490:2011
+ATAACAATGGGCTTCTCAGCGGAAACCTTACAAGC
++
+<7<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS219_1:1:22:490:2011
+GCTAGAGATTTAGACATCTAAATGAAAGAGGCTCA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS219_1:1:37:1004:1136
+CCAGGGAATTTGTCAATGTCAGGGAAGGAGCATTT
++
+<<<<<<<<<<<<<<;<<<;<<<<<:<<;;369<<<
+@EAS219_1:1:37:1004:1136
+GTCACCCAATGGACCTGTGATATCTGGATTCTGGG
++
+</8<<<<7<+<<<<<<<,<<<<<<<<<6<<<<1<<
+@EAS219_1:1:44:1466:425
+GTCCGTGTCCTCCCATCTGGCCTCGTCCACACTGG
++
+6-<<9<<:<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS219_1:1:44:1466:425
+TTATCTGCACATTACTACCCTGCAATTAATATAAT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<;<<<<<<
+@EAS219_1:1:50:257:341
+AAATTAACATTACAACAGGAACAAAACCTCATATA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<6<<<<
+@EAS219_1:1:50:257:341
+TGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS219_1:1:5:497:687
+AAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGATGTGTGTTCTC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS219_1:1:5:497:687
+TTGCCTTCAGACCCTACACGAATGCGTCTCTACCA
++
+<8<<8<<<;<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS219_1:1:60:1420:660
+AATGCTAAGATAATTCATCATCACTAAACCAGTCC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<8<<<<
+@EAS219_1:1:60:1420:660
+GTAAAAAATTAACATTACAACAGGAACAAAACCTC
++
+99<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS219_1:1:63:28:1549
+AAAAAGTAAACTCTCAAATATTGCTAGTGGGAGTA
++
+<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS219_1:1:63:28:1549
+TACAATATTCTGATGATGGTTACACTAAAAGCCCA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7;<<<<7
+@EAS219_1:1:67:191:668
+ACTATGAAGAGACTATTGCCAGATGAACCACACCT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<6<<;<;<;<<<<<<6;%2
+@EAS219_1:1:67:191:668
+CCAATTACGTCCTATCTTCTTCTTAGGGAAGAACA
++
+<<<<<7<<7<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS219_1:3:11:706:1030
+ATCTCTTGTAATCTCTCTCATCTTTGCTGCATCCC
++
+<<<2<<2<<<<<<<<<<<<0<&<<<+<:2<4<<):
+@EAS219_1:3:11:706:1030
+ATGTCTATTTTTGTCTTGACACCCAACTAATATTT
++
++<5069+9<<<<+<;<<<<;<<77<7<<;<<;<<<
+@EAS219_1:3:33:1168:1762
+AGATTGCTTGTGGTCTGACAGGCTGCAACTGTGAG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;<;<<<<<<<<:;2::
+@EAS219_1:3:33:1168:1762
+GTCTTACTTCCAGCTCCCCAGAGGGAAAGCTTTCA
++
+79<9;3<<<4<<<97<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS219_1:3:4:1620:413
+CATCACAATGAACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCA
++
+<<<<<<<<<<6<<<6<<<;<6<9-1<;<&66<<<2
+@EAS219_1:3:4:1620:413
+TCTAGCCATTTCTTTTGGCATTTGCCTTCAGACCC
++
+-<<<7<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS219_1:3:62:603:1552
+AATTTGGTGTTCTGTGTAAAGTCTCAGGGAGCCGT
++
+8::;:<<6<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS219_1:3:62:603:1552
+GAACCACACATTAATACTATGTTTCTTATCTGCAC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<;<
+@EAS219_1:3:88:465:1877
+AAAGCACACTTTAAATCAACAACAGTAAAATAAAA
++
+<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<
+@EAS219_1:3:88:465:1877
+TAAGAGGGATGAGAAATTACCTAATTGGTACAATG
++
+<<<<<<<:<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<7;<<<<
+@EAS219_1:3:90:219:528
+ACGAATGTTATGCCCTGCTAAACTAAGCATCATAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<9
+@EAS219_1:3:90:219:528
+GTACAAAACTCACAGGTTTTATAAAACAATTAATT
++
+;:<5<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS219_1:5:5:259:250
+GTCTCTTATGAATTAACCCAGTCAGACAAAAATAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<;5<<5<;7<::
+@EAS219_1:5:5:259:250
+TATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGT
++
+8<83;<<<<<<<<<<5<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS219_1:5:6:1067:91
+CTTGACACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAAAACA
++
+3<;<<:;9;<<7;;<;<<<;<<<;<<<<<<<<<<<
+@EAS219_1:5:6:1067:91
+CTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGAT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<:8<<
+@EAS219_1:7:16:1343:1621
+AAATTCTAAAATCAGCAAGAGAAAAGCATACAGTC
++
+;<<9;7=====;;==<==================<
+@EAS219_1:7:16:1343:1621
+AAGTGAGAAGTTTGGAAAAACTATTTGAGGAAGTA
++
+<<<<<<<<8<<<<;<<<;<;<<<<<<<:;4;71:;
+@EAS219_1:7:18:571:1110
+GAGGTGCACTAATGCGCTCCACGCCCAAGCCCTTC
++
+7<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<788<<<;6<
+@EAS219_1:7:18:571:1110
+TAATATAATTGTGTCCATGTACACACGCTGTCCTA
++
+9<<;<;==;;=;=<;<===================
+@EAS219_1:7:20:1444:328
+AAAAGATGTTCTACGCAAACAGAAACCAAATGAGA
++
+<<<<;<<<<<<<<;<<<<<<<<;<<<<<;<;;8:7
+@EAS219_1:7:20:1444:328
+TACTAAATACATATGCACCTAACACAAGACTACCC
++
+9<3<<==;=<===;=<=====<<===========<
+@EAS219_1:7:35:392:2042
+ATAAATCTATAAAAAAATTAAAATTTAACAAAAGT
++
++<<<<</<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS219_1:7:35:392:2042
+TAACACAAGACTACCCAGATTCATAAAACNAATAC
++
+======;==========<<=======7=;!<7;;;
+@EAS219_1:7:50:1339:1154
+CATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTGCTGCATCC
++
+==========<<==============;==7<;<<;
+@EAS219_1:7:50:1339:1154
+GTCTTGACACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAAAA
++
+7;7;8;<5<:86<<;<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<
+@EAS219_1:7:62:1076:540
+CCCCCACTTAAGAGATATAGATTGGCAGAACAGAT
++
+<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<;<7;
+@EAS219_1:7:62:1076:540
+TAAATCAACAACAGTAAAATAAAACAAAGGAGGTC
++
+6<<;:+=====5=:6===================2
+@EAS219_1:7:94:1655:1921
+AAAAGCATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCATC
++
+<<<<;:===<==;<==<;================;
+@EAS219_1:7:94:1655:1921
+TTTGGAAAAACTATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAA
++
+<<<8<<<<<<<<<8<<8;8<;<;<;;<<9+868<;
+@EAS219_FC30151:1:18:1418:237
+CCTTGAGAACCCCAGGGAATTTGTCAATGTCAGGG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<7<
+@EAS219_FC30151:1:18:1418:237
+CTGGGAAATTCTTCATCCTGGACCCTGAGAGATTC
++
+<<:<<<<<<<<:<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<:
+@EAS219_FC30151:1:53:140:421
+AACCAAATGAGAGAAGGAGTAGCTATACTTATATC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS219_FC30151:1:53:140:421
+GATTCATAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAGGG
++
+<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS219_FC30151:1:54:436:1452
+AAGACAAGTCTCTTATGAATTAACCCAGTCAGACA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<;<<<
+@EAS219_FC30151:1:54:436:1452
+AGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTGCT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS219_FC30151:1:55:8:1412
+ATATAATTGTGTCCATGTACACACGCTGTCCTATG
++
+<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS219_FC30151:1:55:8:1412
+GCCCAAGCCCTTCTCACAGTTTCTGCCCCCAGCAT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS219_FC30151:1:76:34:691
+ATATATCAATATTAACTTTGAATAAAAAGGGATTA
++
+<<<<<<16<<<<<916<<<499<966161919<<<
+@EAS219_FC30151:1:88:1454:418
+CCAGGAAGATACATTGCAAGACAGACTTCATCAAG
++
+:<<:<<<<<<<<<<<::::<:<:<9<5<<<<<<8:
+@EAS219_FC30151:1:88:1454:418
+GAAGAGATTGGATCTAATTTTTGGACTTCTTAAAG
++
+<<<<<<<<<<6<96<<<1911<<<1<<<<<<<<<1
+@EAS219_FC30151:3:13:674:1717
+AGAAAAGCATGCAGTCATCTATAAAGGAAATCCCA
++
+<<<<<<<<<<%<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;:;;;
+@EAS219_FC30151:3:13:674:1717
+TAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGCTAAG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS219_FC30151:3:40:1128:1940
+CCCCTTACAACAACCTTGAGAACCCCAGGGAATTT
++
+<<<:///77:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS219_FC30151:3:40:1128:1940
+CCGAGTCACGGGGTTGCCAGCACAGGGGCTTAACC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<5;;<<<9;;;;7:
+@EAS219_FC30151:3:55:74:1040
+CTACCACAGGGGGCTGCGCGGTTTCCCATCATGAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<
+@EAS219_FC30151:3:55:74:1040
+GGAAATGCTTTACTGTCATAACTATGAAGAGACTA
++
+;;;;;<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS219_FC30151:3:73:1458:1337
+AAATGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGAC
++
+<<<<<;;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<7;;;;
+@EAS219_FC30151:3:73:1458:1337
+AGGTAAAAAATTAACATTACAACAGGAACAAAACC
++
+<</<<<<<<<6:<::<<<1<<:<<<<<<<<<<<<<
+@EAS219_FC30151:3:81:1723:1820
+ATGAGAGAGAACTTCCCTGGAGGTCTGATGGCGTT
++
+;6;;;<<<<<<<<<<<2<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS219_FC30151:3:81:1723:1820
+CATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTGTTG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<:
+@EAS219_FC30151:3:90:1906:1528
+CACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAA
++
+:<<<<<<<<<3:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS219_FC30151:3:90:1906:1528
+TTACAAAATATAGTTGAAAGCTCTAACAATAGACT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<:<<<:<<<<;<<<<<;:7:;
+@EAS219_FC30151:3:9:1595:1826
+ACTAATATTTGTCTGAGCAAAACAGTCTAGATGAG
++
+;76;;6:9<9<963;<<7<<<<<<<;<;<<<<<<<
+@EAS219_FC30151:3:9:1595:1826
+ATCTCTCTCCTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS219_FC30151:5:29:817:854
+AGGGGCTTAACCTCTGGTGACTGCCAGAGCTGCTG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS219_FC30151:5:29:817:854
+GTTCTCAAGGTTGTTGCAAGGGGGTTTATGTGAAC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<1..;:;;;;1%407)07&7.
+@EAS219_FC30151:5:54:1351:910
+ACTAAAAGCCCATACTTTACTGCTACTCAATATAT
++
+<<<<<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<18<<:<
+@EAS219_FC30151:5:54:1351:910
+ACTCTCAAATATTGCTAGTGGGAGTATAAATTGTT
++
+<7<7;;<<<<<;<<;;<<;<<<<<<<<<<<<<<;<
+@EAS219_FC30151:5:63:424:1643
+GACCCTACACGAATGCGTCTCTACCACAGGGGGCT
++
+9+<<<+7<<<<<<<<<<<<<<<<<8<<<<<<<<<<
+@EAS219_FC30151:5:63:424:1643
+GGTCTTTCAAAAGGTGATGTGTGTTCTCATCAACC
++
+;;<<<<<<;<<<<<<<<<<5;9;<<<<<<<<<<;<
+@EAS219_FC30151:5:6:1243:981
+ATGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAA
++
+<;<;;<<<;3;;3<<<;<<;<7%<<<.1<<<..<3
+@EAS219_FC30151:5:6:1243:981
+TTACCTAGTTGCTCTGTAGTCTCAATTAATTGTTT
++
+<<<<8<<8<<<<2<<<<<<<<8<55<<8*<<8<<<
+@EAS219_FC30151:5:70:348:972
+GAGAGAACTTCCCTGGAGGTCTGATGGCGTTTCTC
++
+<99<-7<<7<<<87<<<)<<<<<<8<<<<<<<<<<
+@EAS219_FC30151:5:70:348:972
+TCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTGTTGTTGGTTTT
++
+<.<<3+.7<<7<<:78:<<7<:<7:<3<<7.:::<
+@EAS219_FC30151:5:72:1426:1883
+ACATAATCCCACGCTTCCTATGGAAAGGTTGTTGG
++
+;9<;<;0<;<;<<<<;<<<;:<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS219_FC30151:5:72:1426:1883
+CATCTGGCCTCGTCCACACTGGTTCTCTTGAAAGC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<
+@EAS219_FC30151:7:11:1261:1200
+AAAAAAAACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTG
++
+<<<<<<<:<<6<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS219_FC30151:7:11:1261:1200
+TTGCAAGACAGACTTCATCAAGTTATGTAGTCATC
++
+<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<;<<<;<:<<8<<:<<
+@EAS219_FC30151:7:51:1429:1043
+TATTTGTAATGAAAACTATATTTATGCTATTCAGT
++
+9<5<<<<<<<<<<<<<9<<<9<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS219_FC30151:7:87:1289:83
+ACATGAAGGAAAAAAATTCTAAAATCAGCAAGAGA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<;<<<<<<:
+@EAS219_FC30151:7:87:1289:83
+ATGCCCTGCTAAACTAAGCATCATAAATGAAGGGG
++
+<<<::<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS219_FC30151:7:94:1440:2016
+AACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCTAAAC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;;;<<:<8:::75
+@EAS219_FC30151:7:94:1440:2016
+CACAAAAGTACAAAACTCACAGGTTTTATAAAACA
++
+:<8<<<<9<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS220_1:2:11:1274:1230
+TGAGCAAAACAGTCTAGATGAGAGAGAACTTCCCT
++
+.<<<<<<<<<<<<<<<<5<<<<<<<<<<5<<<<<<
+@EAS220_1:2:11:1274:1230
+TTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7;;;;
+@EAS220_1:2:43:656:1866
+TGAACTTCTGTAATTGAAAAATTCATTTAAGAAAT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7;;:;
+@EAS220_1:2:47:591:698
+CAAATCTGCGCTTGTACTTCTAAATCTATAACAAA
++
+7;;;;:<<:<:<<<<<7<<:<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS220_1:2:47:591:698
+TCCTACTAAATACATATGCACCTAACACAAGACTA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<
+@EAS220_1:2:50:513:882
+AAAACAAATACTACTAGACCTAAGAGGGATGAGAA
++
+<<<<:<<<<<:<<:<<<<::<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS220_1:2:50:513:882
+GGAGTAGCTATACTTATATCAGATAAAGCACACTT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;;;;
+@EAS220_1:2:52:1779:1664
+CCCTGCCCCATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<71<<<<<<<<<<<<<<%
+@EAS220_1:2:52:1779:1664
+TGTTAAAATGTCTATTTTTGTCTTGACACCCAACT
++
+6;;:;<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS220_1:2:54:91:1232
+AAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAACTATTTGAGGAAG
++
+;;;;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS220_1:2:54:91:1232
+AAAGCTCTAACAATAGACTAAACCAAGCAGAAGAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS220_1:2:62:1109:804
+TAGAGTCCCATTTGGAGCCCCTCTAAGCCGTTCTA
++
+<<<<<<<<<<<<<:<<:<<<<<<:<:<<<<;;;;;
+@EAS220_1:2:62:1109:804
+TGTCAGTTACCAAATGTGTTTATTACCAGAGGGAT
++
+<<<<<:<<<::<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS220_1:2:63:267:545
+ATGAGAGAGAACTTCCCTGGAGGTCTGATGGCGTT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS220_1:2:63:267:545
+CTTGATTTACTTGTTGTTGGTTTTCTGTTTCTTTG
++
+<<<<<<<<<<<<:<<<<<::<<<<<<.<<<;;;;5
+@EAS220_1:2:72:1809:1398
+AATACATGAGATTATTAGGAAATGCTTTACTGTCA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<::<9<<<<<<<<<6<<:
+@EAS220_1:2:72:1809:1398
+CTATCTTCTTCTTAGGGAAGAACAGCTTAGGTATC
++
+;:;;:<7:7<:<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS220_1:4:100:20:1199
+AAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCA
++
+:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS220_1:4:100:20:1199
+CAGTCATCTATAAAGGAAATCCCATCAGAATAACA
++
+7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<4<<
+@EAS220_1:4:14:1665:1772
+GGGCTGTAATGATGCCCCTTGGCCATCACCCGGTC
++
+<&7<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS220_1:4:14:1665:1772
+TATAATGGTGTCCATGTACACACGCTGTCCTATGT
++
+<<<<<7*<<<<<<<<<78<5<<7<<5<556<(73(
+@EAS220_1:4:46:1566:668
+CTACTAAATACATATGCACCTAACACAAGACTACC
++
+5<<:<<<<<<<<<<<<:<:<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS220_1:4:46:1566:668
+TTAATAAAGACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS220_1:4:69:88:1154
+ATAACTATGAAGAGACTATTGCCAGATGAACCACA
++
+<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS220_1:4:69:88:1154
+CACGAATGCGTCTCTACCACAGGCGGCTGCGCGGT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<2<<<<:<<<<<7
+@EAS220_1:4:6:1178:1105
+GATAATTCATCATCACTAAACCAGTCCTATAAGAA
++
+<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS220_1:4:6:1178:1105
+GGAACAAAACCTCATATATCAATATTAACTTTGAA
++
+<:<<9<<<<::7<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS220_1:4:70:766:2016
+AAAAAAATTCTAAAATCAGCAAGAGAAAAGCATAC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS220_1:4:70:766:2016
+ATAAATGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS220_1:6:24:105:1046
+AGATTCATAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAGG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS220_1:6:24:105:1046
+CATAGCTAAAACTAAAAAAGCAAAAACAAAAACTA
++
++<<<</<<<<<.<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS220_1:6:7:1547:1933
+AATATTTGACTGAGCAAAACAGTCTAGATGAGAGA
++
+<<<<<<<<-<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS220_1:6:7:1547:1933
+CTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTGCTGCATCCCTG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<8<<<<<<<<
+@EAS220_1:8:18:1757:95
+ATGAGTCGCAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<1<:<<<<<<:<<<;:<
+@EAS220_1:8:18:1757:95
+CTTCATCAAGATATGTAGTCATCAGACTATCTAAA
++
+<<<6<&:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS220_1:8:33:672:473
+ATGTCAGGGAAGGAGCATTTTGTCAGTTACCAAAT
++
+<<<<<<<<7<7<7<<62<<<<66<15*/99*5241
+@EAS220_1:8:33:672:473
+TCATCCTGGACCCTGAGAGATTCTGCAGCCCAGCT
++
+5<70<<55<4<24.5<<<<<<<<<6<<<<<<2<<<
+@EAS220_1:8:38:1576:1923
+CACAGGGGGCTGCGCGGTTTCCCATCATGAAGCAC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<:;<<;<
+@EAS220_1:8:38:1576:1923
+CTGTCATAACTATGAAGAGACTATTGCCAGATGAA
++
+8;<98<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS220_1:8:45:178:1321
+AGGTTTTATAAAACAATTAATTGAGACTACAGAGC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<:<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS220_1:8:45:178:1321
+CATAAATGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS220_1:8:46:1528:799
+ATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGATATAAC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<
+@EAS220_1:8:46:1528:799
+CATGTAACAAATCTGCGCTTGTACTTCTAAATCTA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS220_1:8:46:485:482
+AGAGATTCTGCAGCCCAGATCCAGATTGCTTGTGG
++
+<<<<<::<<<<<<<<6<<<<<<<<<6<<<<<<<<<
+@EAS220_1:8:46:485:482
+ATTACCAGAGGGATGAAGGGAAGAGGGACGCTGAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<6<<<<<:<:89<
+@EAS220_1:8:5:996:2000
+AGTCAACATGAAGGAAAAAAATTCTAAAATCAGCA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:
+@EAS220_1:8:5:996:2000
+CACGAATGTTATGCCCTGCTAAACTAAGCATCATA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS220_1:8:66:1046:167
+ACAATGTACAATATTCTGATGATGGTTACACTAAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS220_1:8:66:1046:167
+ACACTTTAAATCAACAACAGTAAAATAAAACAAAG
++
+<<<<<:<<<<<<<<<<<<<9<;77<9<7<<;<9;-
+@EAS220_1:8:83:1456:1854
+AAGATCAATTCAGCAAGAAGATATAACCATCCTAC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<2<
+@EAS220_1:8:83:1456:1854
+AAGCCCATACTTTACTGCTACTCAATATATCCATG
++
+<<67<:<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS221_1:2:23:127:880
+CGGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGATTGGATCTAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS221_1:2:23:127:880
+TAAGAAATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAAT
++
+<<<<<<<<<%<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS221_1:2:24:1037:84
+TGCCCTCTTCTTCCAAAGATGAAACGCGTAACTGC
++
+<;<<;<<<7<<7&<<<<<<;<<<;<<<<<<<<<<<
+@EAS221_1:2:24:1037:84
+TTCAGTTCTAAATATAGAAATTGAAACAGCTGTGT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<;:<57<
+@EAS221_1:2:29:1486:672
+AATTGAAACAGCTGTGTTTAGTGCCTTTGTTCACA
++
+<<:<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<++
+@EAS221_1:2:3:542:428
+AAGACATGAGTTCAGGTACAGGGGTGGAAAAAGAT
++
+<<876</3<8874:<8:<)<5<<<;<<<<7<<<:<
+@EAS221_1:2:3:542:428
+AGAGCAACTAGGTAAAAAATTAACATTACAACAGG
++
+7<4<<<6<<,<9)<<<<6<,<<7<<7<<<<<<<<1
+@EAS221_1:2:3:945:2005
+AACCAAGCAGAAGAAAGAGGCTCAGAACTTGAAGA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<%<<<<<<;<<<<<<<
+@EAS221_1:2:3:945:2005
+GAAAAACTATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCT
++
+7<<<<;;<<;<<<<<7<<<<<<<<<;<<<<<<<<<
+@EAS221_1:2:52:1144:509
+AAAAGGGATTAAATTCCCCCACTTAAGAGATATAG
++
+<<<<:<<<<<<<<<<;::;:<;<<<<<<<<<<<<<
+@EAS221_1:2:52:1144:509
+TGTAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAATACTCACCAT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<;<;<<;<<
+@EAS221_1:2:73:955:728
+AATTCATCATCACTAAACCAGTCCTATAAGAAATG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<
+@EAS221_1:2:73:955:728
+TACAACAGGAACAAAACCTCATATATCAATATTAA
++
+;<-<<6<;<<<6<<<<;7<6<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS221_1:2:8:327:522
+AACAGGAACAAAACCTCATATATCAATATTAACTT
++
+<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<:<<<
+@EAS221_1:2:8:327:522
+TTCTACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGGAGT
++
+;;4;<-<-<<<7<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS221_1:2:90:986:1224
+CTGTGTTTAGTGCCTTTGTTCAACCCCCTTGCAAC
++
+<7*37;;;;;;;9<<;<7<<<<<<<<<<<;;<<<<
+@EAS221_1:2:91:856:504
+CTAGATGAGAGAGAACTTCCCTGGAGGTCTGATGG
++
+:::<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<:<<<<<
+@EAS221_1:2:91:856:504
+GTTGTTGGTTTTCTGTTTCTTTGTTTGATTTGGTT
++
+<<<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<7<<<&;<<<&&<&
+@EAS221_1:4:36:1402:1709
+AGCTTAGGTATCAATTTGGTGTTCTGTGTAAAGTC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<;<<<:9<<
+@EAS221_1:4:36:1402:1709
+TTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATT
++
+;;;:<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<
+@EAS221_1:4:3:248:1491
+TTAAAATTTAACAAAAGTAAATAAAACACATAGCT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:8:<
+@EAS221_1:4:41:519:609
+AACAAAAACTATGCTAAGTATTGGTAAAGATGTGG
++
+<4;<;<<<<<<<<;4:<<;<<<<<<<<<<<;<<<<
+@EAS221_1:4:41:519:609
+TACCTAATTGGTACAATGGACAATATTCTGATGAT
++
+1<<<<<<<<<<<<<<<4<-:<+6<<<<<<<<<<<<
+@EAS221_1:4:4:1732:88
+GCTGTAATGATGCCCCTTGGCCATCACCCGGTCCC
++
+:<4<:<<:<::<<<<<::<<<<<:<:<<<<<<<<<
+@EAS221_1:4:4:1732:88
+TGTACACACGCTGTCCTATGTACTTATCATGACTC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<2<8;8<;<8;<2;2:<:<
+@EAS221_1:4:68:64:783
+AAGACATAATCCCACGCTTCCTATGGAAAGGTTGT
++
+<<9<8<6<<<<<;<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS221_1:4:68:64:783
+TCCGTGTCCTCCCATCTGGCCTCGTCCACACTGGT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<<<<<;<<<9:<<:9
+@EAS221_1:4:87:1375:1303
+AGGAGCATTTTGTCAGTTACCAAATGTGTTTATTA
++
+<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS221_1:4:87:1375:1303
+GAGAGATTCTGCAGCCCAGATCCAGATTGCTTGTG
++
+:<;<(<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<
+@EAS221_1:6:38:1071:155
+ATGCCCCTTGGCCATCACCCAGTCCCTGCCCCATC
++
+<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<8<<<:<<:;;8:;
+@EAS221_1:6:38:1071:155
+TAAAATGTCTATTTTTGTCTTGACACCCAACTAAT
++
+<<62<<<<<<3<<<<</<<<<<<<%<<<<<<<<<<
+@EAS221_1:6:4:1131:104
+ACTTTGGAAAACAATTTGGTAATTTCGTTTTTTTT
++
+61;;;<<<<<<<<<;:<<<:<<;<<<<;<<<<<<<
+@EAS221_1:6:4:1131:104
+ATGTAACAAATCTGCGCTTGTACTTCTAAATCTAT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<<::
+@EAS221_1:6:57:1342:1166
+AAAGACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGA
++
+<<<<<;<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS221_1:6:57:1342:1166
+CAGAGCAACTAGGTAAAAAATTAACATTACAACAG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;<;
+@EAS221_1:6:60:1037:1146
+AAAAGCATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCATC
++
+<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS221_1:6:60:1037:1146
+GTGAGAAGTTTGGAAAAACTATTTGAGGAAGTAAT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<:;;;;;;<
+@EAS221_1:6:69:735:1915
+AATTTGTCAATGTCAGGGAAGGAGCATTTTGTCAG
++
+<<::<<<7<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS221_1:6:69:735:1915
+ACTGCCAGAGCTGCTGGCAAGCTAGAGTCCCATTT
++
+<<<<<<<<;<<<<<<<<<;<<<<;<8<<<<;1:<<
+@EAS221_1:6:89:1164:573
+AAAAAACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCT
++
+3<<<6<%7<<08<<4<3<<103<1<<<<<<<<<<<
+@EAS221_1:6:89:1164:573
+AGACTTCATCAAGAGATGTAGTCATCAGACTATCT
++
+<:<<;<2<<<<<<<&:2<;<;<<<<;,+;:<<4:<
+@EAS221_1:6:92:1807:1185
+AGCATGGTTGTACTGGGCAATACATGAGATTATTA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<:<<<<;<<<;<<;
+@EAS221_1:6:92:1807:1185
+CTCTATCCCAAATTCCCAATTACGTCCTATCTTCT
++
+<<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<><<<<<
+@EAS221_1:6:96:491:1891
+AGAAGTTTGGAAAAACTATTTGAGGAAGTAATTGG
++
+<:<<<<<::<<<<<<<<<<<<<<<<:<<::7<<:7
+@EAS221_1:6:96:491:1891
+GTCAACATGAAGGAAAAAAATTCTAAAATCAGCAA
++
+:;5<<7<;:<<;<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<
+@EAS221_1:8:15:881:1932
+CACTTAAGAGATATAGATTGGCAGAACAGATTTAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<:<<<2<26<8<<;;.
+@EAS221_1:8:15:881:1932
+CACTTTAAATCAACAACAGTAAAATAAAACAAAGG
++
+)<4<<<<<<<4<<4<<4<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS221_1:8:4:679:110
+AATGTTCCCCAGATACCATCCCTGTCTTACTTCCA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS221_1:8:4:679:110
+TCCAGATTGCTTGTGGTCTGACAGGCTGCAACTGT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<::<;;:7
+@EAS221_1:8:58:369:244
+CTGTAATGATGCCCCTTGGCCATCACCCAGTCCCT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS221_1:8:58:369:244
+TTGGGAGATTTTTAATGATTCCTCAATGTTAAAAT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;<<<<<<<<<<<
+@EAS221_1:8:60:1020:1259
+CTATGAAGAGACTATTGCCAGATGAACCACACATT
++
+<;<<<<;<<<<<<<<<;<<<<<<<8<<<<<:<:<<
+@EAS221_1:8:60:1020:1259
+TAGGGAAGAACAGCTTAGGTATCAATTTGGTGTTC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS221_1:8:65:1928:1125
+CATCACAATGAACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCA
++
+<<;<<<7<<7<;<7<<<<<<<7<<<<;<.-;<+88
+@EAS221_1:8:65:1928:1125
+GGCATTTGCCTTCAGACCCTACACGAATACGTCTC
++
+<+<<<2<4<<<0<<4<<<<<6<<<6<<<'<<<<0<
+@EAS221_1:8:67:1797:1931
+GGGAAAGCTTTCAACGCTTCTAGCCATTTCTTTTG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS221_1:8:67:1797:1931
+TGGTCTGACAGGCTGCAACTGTGAGCCATCACAAT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<
+@EAS221_1:8:70:1349:1788
+ATTATATCAGATAAAGCACACTTTAAATCAACAAC
++
+&<8<<<85:580;<:0-><;>588>9<>7:<0<9;
+@EAS221_1:8:70:1349:1788
+TACTAGACCTAAGAGGGATGAGAAATTACCTAATT
++
+<7;<<8<74;;<1<<71<;7<;;<;<7<<<<<<<<
+@EAS221_1:8:73:108:1621
+GAACTTCCCTGGAGGTCTGATGGCGTTTCTCCCTC
++
+<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS221_1:8:73:108:1621
+GTTTTCTGTTTCTTTGTTTGATTTGGTGGAAGACA
++
+<<<<<<<<71<<<<<<<<<+<<<<70:0<9<<61<
+@EAS221_1:8:77:781:676
+TCATGAAGCACTGAACTTCCACGTATCATCTAGGG
++
+<<<<<<<5<<5<<<<<<<<<<<<13<<2<<<<<,<
+@EAS221_1:8:77:781:676
+TTGCCAGATGAACCACACATTAATACTATGTTTCT
++
+:<;<2<<<<<<26<<<<6<;<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS221_1:8:78:1478:1446
+GGAAGAGGGACGCTGAAGAACTTTGATGCCCTCTT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<:<<<;
+@EAS221_1:8:78:1478:1446
+TGTGGTCTGACAGGCTGCAACTGTGAGCCATCACA
++
+<8,8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS221_1:8:84:1013:1074
+GCAAGGGGGTCTATGTGAACAAAGGCACTAAACAC
++
+<7<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS221_1:8:84:1013:1074
+TTGATGCCCTCTTCTTCCAAAGATGAAACGCGTAA
++
+8;;<;8744<7<<4<<47<<<<<<7<<<<<<<<<<
+@EAS221_1:8:8:1351:1986
+CCCAAGCCCTTCTCACAGTTTCTGCCCCCAGCATG
++
+<8;<<<<<<<<<<<;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS221_1:8:8:1351:1986
+TCTTACTTCCAGATCCCCAGAGGGAAAGCTTTCAA
++
+<<<<<<<<<<<<-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS221_3:2:100:1147:124
+AAAAAAGAATTTTAAAAATGAACAGAGCTTTCAAG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<
+@EAS221_3:2:100:1147:124
+AATGCCAGGAAGATACATTGCAAGACAGACTTCAT
++
+<<<<96<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<
+@EAS221_3:2:22:1623:709
+GAAGACAAGTCTCTTATGAATTAACCCAGTCAGAC
++
+<<<<<<<<<7<<<<<<<:<<<<<<<<:85:<:2<<
+@EAS221_3:2:22:1623:709
+GGGAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGATTTAGAC
++
+<'<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS221_3:2:2:491:1886
+CTCTTTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACATCTAAAT
++
+<<:<8:<<<:<<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<:
+@EAS221_3:2:59:1576:946
+AACTGTGAGCCATCACAATGAACAACAGGAAGAAA
++
+<:<<<<<<<<<<<<:<:<<<<<<<8<<::1<<<<<
+@EAS221_3:2:59:1576:946
+CAACGCTTCTAGCCATTTCTTTTGGCATTTGCCTT
++
+9<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS221_3:2:60:590:1760
+AAAGTAACTGAACCTATGAGTCACAGGTATTCCTG
++
+<:<<<<<2<<<<:<::<<<::<<<<<6<<<<<<<6
+@EAS221_3:2:60:590:1760
+TCATCAAGATATGTAGTCATCAGACTATCTAAAGT
++
+<8<-<<<<<<<82<<<4<<<<<<<<<<<<<8<<<<
+@EAS221_3:2:67:1467:1447
+AAAGTTCAATACTCACCATCATAAATACACACAAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<
+@EAS221_3:2:67:1467:1447
+ATAGATTGGCAGAACAGATTTAAAAACATGAACTA
++
+<<<<<::<<:<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS221_3:2:67:1864:477
+AATGATGCCCCTTGGCCATCACCCAGTCCCTGCCC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS221_3:2:67:1864:477
+TAAAATGTCTATTTTTGTCTTGACACCCAACTAAT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS221_3:2:76:1729:813
+TAATTTCGTTTTTTTTTTTTTCTTTTCTCTTTTTT
++
+<+6<<<&1<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS221_3:2:76:1729:813
+TCTGCGCTTGTACTTCTAAATCTATAAAAAAATTA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS221_3:4:12:276:1797
+ACTATTGCCAGATGAACCACACATTAATACTATGT
++
+<<<<<<<<<<<<:</<<9<:<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS221_3:4:12:276:1797
+TCTGTGTAAAGTCTCAGGGAGCCGTCCGTGTCCTC
++
+)9<02)<<<<<<<<<<<<<1<<<<&<<<<9<<<<<
+@EAS221_3:4:21:132:1423
+GCCAGATGAACCACACATTAATACTATGTTTCTTA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS221_3:4:21:132:1423
+TCAATTTGGTGTTCTGTGTAAAGTCTCAGGGAGCC
++
+:<<<<<6<<;<<;<5<;<<<<<<;<6<<<<<<<<<
+@EAS221_3:4:29:1061:574
+ATGTGTTTATTACCAGAGGGATGGAGGGAAGAGGG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<;<<8<:<<<<
+@EAS221_3:4:29:1061:574
+GGTCTGACAGGCTGCAACTGTGAGCCATCACAATG
++
+<87<5<<9<<<66<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS221_3:4:30:1452:1563
+ATGAATTAACCAAGTCAGACAAAAATAAAGAAAAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<:<<<<1<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS221_3:4:30:1452:1563
+GATTTAGACATCTAAATGAAAGAGGCTCAAAGAAT
++
+<<39<<<59<<:<<+<<<6<<:<<<<<<<<<<<<<
+@EAS221_3:4:41:1308:619
+CATTGCAAGACAGACTTCATCAAGATATGTAGTCA
++
+0<9476<<<<<0<<<2<&<0<.<<<<<<<<<.<<<
+@EAS221_3:4:41:1308:619
+GAAGTATGAGATTATGTAAAGTAACTGAACCTATG
++
+<6+<*<<<<<<<:<<<<<<<:<<&<<<<1<6<11:
+@EAS221_3:4:57:1675:720
+TATAAGAAATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS221_3:4:57:1675:720
+TCATATATCAATATTAACTTTGAATAAAAAGGGAT
++
+<,<<<<<<:<<<<<<<<:9<<<<<<<<;<<<<<<<
+@EAS221_3:4:66:584:407
+GCATTTGCCTTCAGACCCTACACGAATGCGTCTCT
++
+<<<*9<9<<<1<<<<<<<<*<59<4<)<2<<<<<<
+@EAS221_3:4:66:584:407
+GGGCAATACATGAGATTATTAGGAAATGCTTTACT
++
+<<84<<<766<<<.6<<<<<<4<<7<<<<<<<7<<
+@EAS221_3:4:78:1314:1275
+AGGAAATCCCATCAGAATAACAATGGGCTTCTCAG
++
+<<<<<<<<6:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<1<
+@EAS221_3:4:78:1314:1275
+GAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<6<<<<<<<<<<<<8
+@EAS221_3:4:81:687:1379
+CCTAAGAGGGATGAGAAATTACCTAATTGGTACAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<
+@EAS221_3:4:81:687:1379
+TAAATAAAACACATAGCTAAAACTAAAAAAGCAAA
++
+<<<<<<<<<<<:<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS221_3:4:90:247:212
+ACTTCCAGCTCCCCAGAGGGAAAGCTTTCAACGCT
++
+7655:;87;<;;;8<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<
+@EAS221_3:4:90:247:212
+TGACAGGCTGCAACTGTGAGCCATCACAATGAACA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<6<8<
+@EAS221_3:6:20:492:850
+AGTATGAAAACAATGTTCCCCAGATGCCGTCCCGG
++
+:.5:+.;;&91:;79:766:1:9+6&:1&&:+:))
+@EAS221_3:6:20:492:850
+CCTGAGAGATTCTGCAGCCCAGCTCCAGATTGCTT
++
+<7<<<<<<<<<<<.<54<7&<<<7<74<2<<<2<<
+@EAS221_3:6:26:227:1053
+ATTCTTCATCCTGGACCCTGAGAGATTCTGCAGCC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS221_3:6:26:227:1053
+GGTTTAGGGGTATAATACCTCTACATGGCTGATTA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<
+@EAS221_3:6:51:1486:1131
+ATAAGAAATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAA
++
+<<<<<<<<<<,<6<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<
+@EAS221_3:6:51:1486:1131
+TCAGCAGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGATTGGAT
++
+<<<<<<<<<;<<<<<<<<<1<5<<8<<<'<;<<;1
+@EAS221_3:6:70:843:706
+AATGATTCCTCAATGTTAAAATGTCTATTTTTGTC
++
+<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS221_3:6:70:843:706
+ATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTGCTGCATCCC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<5<<5<<<<<<
+@EAS221_3:8:33:1240:846
+ACCTTACAAGCCAGAAGAGATTGGATCTAATTTTT
++
+<<<<<<<<<<<<7<<2<;<<;<<<;<<<:6:<<<:
+@EAS221_3:8:33:1240:846
+ATAAGAAATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAA
++
+<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS221_3:8:34:956:1309
+AACTATGAAGAGACTATTGCCAGATGAACCACACA
++
+<<<<<<7<<<<<<<<<<<6<<<<<<<<<<<:<8<8
+@EAS221_3:8:34:956:1309
+AGCTTAGGTATCAATTTGGTGTTCTGTGTAAAGTC
++
+9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS221_3:8:50:1203:1094
+AAATATAGTTGAAAGCTCTAACAATAGACTAAACC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS221_3:8:50:1203:1094
+ACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAG
++
+<7<<<<<5:+63<<<<<<<<<<<<<<<<2<<<<<<
+@EAS221_3:8:55:932:613
+TAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACATGAAGGAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<<<<<<<<<<<<<
+@EAS221_3:8:55:932:613
+TGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCTAAACTAAG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS221_3:8:63:1265:820
+CTCTCCTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTC
++
+<<<<<<<<<<27<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<03<
+@EAS221_3:8:63:1265:820
+TGTCTTGACACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAAA
++
+<<<<<<3<<1<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<+<
+@EAS221_3:8:65:463:703
+GAAACCTTACAAGCCAGAAGAGATTGGATCTAATT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<
+@EAS221_3:8:65:463:703
+TGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAAAGTT
++
+<<3<9<<<<<<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS221_3:8:74:770:1712
+ACATTACTACCCTGCAATTAATATAATTGTGTCCA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<5<<<<<<<<<<<<7<<
+@EAS221_3:8:74:770:1712
+GAGCCGTCCGTGTCCTCCCATCTGGCCTCGTCCAC
++
+3.&::6<<<9<6:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS221_3:8:7:1864:1569
+AAAAACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCTA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS221_3:8:7:1864:1569
+AGATATGTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACAT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<8<<<<
+@EAS51_62:1:38:250:647
+AATAATAAAATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGA
++
++<&+<1<,<<7<<7<<<<<<<1,<<<<7<<2<<<<
+@EAS51_62:1:38:250:647
+ACTATATGCTGTTTACAAGAAACTCATTAATAAAT
++
+<<<<<<<9<<9<<<<<<<6<<<<<<<<<<8<779%
+@EAS51_62:2:133:8:379
+ATAAGATAATTCATCATCACTAAACCAGTCCTATA
++
+&=========='==7==0=2====28===00====
+@EAS51_62:2:133:8:379
+GGAAATCCCATCAGAATAACAATGGGCTTCTCAGC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8;<<8<<<:6<
+@EAS51_62:2:258:266:101
+ACGCTGTCCTATGTACTTATCATGACTCTATCCCA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<5<;,<-2<<<<;68<<6
+@EAS51_62:2:258:266:101
+CCATCACCCAGTCCCTGCCCCATCTCTTGTAATCT
++
+%==/7&8=======:===6================
+@EAS51_62:2:260:147:818
+AAAATTTGGTAATTTAGTTTTTTTTTTTTTCTTTT
++
+6.=..++==6=76==&===========99======
+@EAS51_62:2:260:147:818
+ATCCATGTAACAAATCTGCGCTTTTACTTCTAAAT
++
+<<<<<<3<<<<<;<<<<)<1<<<&<7<<<;<4/9<
+@EAS51_62:3:103:443:166
+ACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCTAAACT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<1<-;;;<
+@EAS51_62:3:103:443:166
+TACACACAAAAGTACAAAACTCACAGGTTTTATAA
++
+7<4<4<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS51_62:3:169:292:652
+ATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTGCTGCATCCC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<6<<-<<<<8<
+@EAS51_62:3:169:292:652
+GCAAAACAGTCTAGATGAGAGAGAACTTCCCTGGA
++
+79919-<-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<6<<<<<<<
+@EAS51_62:3:200:263:280
+AGTAAAATAAAACAAAGGAGGTCATCATACAATGA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<;8<;1
+@EAS51_62:3:200:263:280
+TTGGTACAATGTACAATATTCTGATGATGGTTACA
++
+)<<<8<:<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS51_62:3:263:74:407
+AAGCTTTCAACGCTTCTAGCCATTTCTTTTGGCAT
++
+;;88<::+;<)<5<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS51_62:3:263:74:407
+CTGCAACTGTGAGCCATCACAATGAACAACAGGAA
++
+<<<<2<<<<<<:<<<9<<4<<<<:<<<<9<999.7
+@EAS51_62:3:314:386:190
+AGACCCCCTTGCAACAACCTTGAGAACCCCAGGGA
++
+++<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<<<<
+@EAS51_62:3:314:386:190
+CACTCCAGCTCCCTGTCACCCAATGGACCTGTGAT
++
+76;%;<<3<9;<69<<<7;;;<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS51_62:3:50:312:219
+ACTGCTACTCAATATATCCATGTAACAAATCTGCG
++
+<,;83:<::6<<<<<<<;:<;<<<<;<<<<<<<<<
+@EAS51_62:3:50:312:219
+TCCTACTAAATACATATGCACCTAACACAAGACTA
++
+<<<<<<<<<<<;<<<<<;<;<<<;<<<<<<;;;;;
+@EAS51_62:3:55:340:837
+TCCACACTGGTTCTCTTGAAAGCTTGGGCTGTAAT
++
+61378<::<<<5:<;;:<<<<<<<<<<<<;<<<<<
+@EAS51_62:3:55:340:837
+TTAATATAATTGTGTCCATGTACACACGCTGTCCT
++
+<<;<<;<<<<<8<;<<<;<7<<<;<<<<<93+79(
+@EAS51_62:3:68:996:104
+AGAGGGATGAGAAATTACCTAATTGGTACAATGTA
++
+<1<8<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS51_62:3:68:996:104
+TACTTATATCAGATAAAGCACACTTTAAATCAACA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<
+@EAS51_62:4:156:857:494
+CTCATACACACACATGGTTTAGGGGTATAATACCT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<6<<<<<<<<<<<<<<:<<
+@EAS51_62:4:156:857:494
+GTTTCCCATCATGAAGCACTGAACTTCCACGTCTC
++
+<<<8<:5<<;<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS51_62:4:187:907:145
+TTTCTTCTCTCTCTTTTTTTTTTTTTTTATTGCAT
++
+<<<+;;,6<<<<6<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS51_62:4:282:962:46
+GAAAAAAGTAAACTCTCAAATATTGCTAGTGGGAG
++
+69<<<<<:<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS51_62:4:282:962:46
+TACTTTACTGCTACTCAATATATCCATGTAACAAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<
+@EAS51_62:4:308:614:911
+AAAAACAATTTGGTAATTTAGTTTTTTTTTTTTTC
++
+%<<<;:<::<6,<<<<<<:<:<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS51_62:4:308:614:911
+TGCGCTTGTACTTCTAAATCTATAACAAAATTAAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<<<8<
+@EAS51_62:5:119:38:945
+ATTCTAAAATCAGCAAGAGAAAAGCATACAGTCAT
++
+=;;8=====:========<================
+@EAS51_62:5:119:38:945
+TCACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<8<<<<<8<<<8<;<<7<:<<
+@EAS51_62:5:131:779:345
+GTCCACACTGGTTCTCTTGAAAGCTTGGGCTGTAA
++
+============================9====;=
+@EAS51_62:5:131:779:345
+TGGAAGACATAATCCCACGCTTCCTATGGAAAGGT
++
+<<7<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<;<<
+@EAS51_62:5:154:669:853
+GTGTAAAGTCTCAGGGAGCCGTCCGTGTCCTCCCA
++
+============<===.====<:=<9=<<<9;:;2
+@EAS51_62:5:154:669:853
+TGGTTTTCTGTTTCTTTGTTTGATTTGGTGGAAGA
++
+<::<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS51_62:5:192:716:235
+ATACACACACATGGTTTAGGGGTATAATACCTCTA
++
+======================9==:<==:;;69;
+@EAS51_62:5:192:716:235
+GACCCTACACGAATGCGTCTCTACCACAGGGGGCT
++
+<5<<<8<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS51_62:5:236:498:526
+ACTAATGCGCTCCACGCCCAAGCCCTTCTCACAGT
++
+===================================
+@EAS51_62:5:236:498:526
+CAGCACATTACTACCCTGCAATTAATATAATTGTG
++
+<%88<;<:8<<<<:<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS51_62:5:290:319:736
+CGAGTCACGGGGTTGCCAGCACAGGGGCTTAACCT
++
+==;=======7====6=;==:;;====66=::27:
+@EAS51_62:5:290:319:736
+GTTCTCAAGGTTGTTGCAAGGGGGTCTATGTGAAC
++
+<<<<<<:7:<.<<<<7<<.<.<<.9*<4<:<4%74
+@EAS51_62:5:295:882:282
+AATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAAAG
++
+<<:<8<-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS51_62:5:295:882:282
+CAGAAGAGATTGGATCTAATTTTTGGACTTCTTAA
++
+========================<6<======8;
+@EAS51_62:5:86:697:941
+AAAAAAATCCCGGAAGATACATTGCAAGACAGACT
++
+1<<%<<<1:<58<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS51_62:5:86:697:941
+GTATGAGATTATGTAAAGTAACTGAACCTATGAGT
++
+=====================<=<==<<====;=5
+@EAS51_62:6:12:484:836
+AAACACATAGCTAAAACTAAAAAAGCAAAAACAAA
++
+<<<<</<4<<&7<<<<;<<<<<<<<<<<<<1<<<<
+@EAS51_62:6:12:484:836
+AAATACTACTAGACCTAAGAGGGATGAGAAATTAC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<7<:<<<<<<9<<<<<<<<
+@EAS51_62:6:148:170:895
+AAAGTGAGAAGTTTGGAAAAACTATTTGAGGAAGT
++
+<<9<<<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS51_62:6:148:170:895
+AAGAGGTTCAGAACTTGAAGACAAGTCTCTTATGA
++
+<<<<<<<<<<9<<<<<6<<<<<<<<<<<<<<<<6<
+@EAS51_62:6:50:542:881
+CCTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGA
++
++2<<<;<3;29<6<5;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS51_62:6:50:542:881
+TCCCAATTACGTCCTATCTTCTTCTTAGGTAAGAA
++
+<<<<<4<09<<9<<2<<<<<<<<<<<2/.&2<%<7
+@EAS51_62:7:144:28:475
+AGGAAATGCTTTACTGTCATAACTATGAAGAGACT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<::8<
+@EAS51_62:7:144:28:475
+CAGCTTAGGTATCAATTTGGTGTTCTGTGTAAAGT
++
+;;;9;<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS51_62:7:157:784:936
+GCTTAGGTATCAATTTGGTGTTCTGTGTAAAGTCT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<;<<<<814<4<
+@EAS51_62:7:157:784:936
+TGATTTACTTGTTGTTGGTTTTCTGTTTCTTTGTT
++
+<:<<<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS51_62:7:162:195:761
+AACATGAACTAACTATATGCTGTTTACAAGAAACT
++
+<<8<<:<<:<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS51_62:7:162:195:761
+TCACAGGTTTTATAAAACAATTAATTGAGACTACA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<:<<<<;;
+@EAS51_62:7:178:286:414
+CACGCCCAAGCCCTTCTCACAGTTTCTGCCCCCAG
++
+68;38::<<;<<8;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS51_62:7:178:286:414
+TTACTTCCAGCTCCCCAGAGGGAAAGCTTTCAACG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<8<<<<<<<<<1<<<1;998
+@EAS51_62:7:196:511:896
+ATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGATTT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<4<88;<<
+@EAS51_62:7:196:511:896
+GAAAAGCATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCAT
++
+8<<<<<;<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS51_62:7:248:17:435
+ATAACCATCCTACTAAATACATATGCACCTAACAC
++
+<1<<88++<:<<:;<;<<<:<<<;<<<<<<<<<<<
+@EAS51_62:7:248:17:435
+CATGAGTTCAGGAAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTC
++
+<<<<8<<<888<+<<<<<;<:<<<<8<<<<<;3<3
+@EAS51_62:7:312:236:655
+GAGAAATTACCTAATTGGTACAATGTACAATATTC
++
+<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS51_62:7:312:236:655
+TGCTAAGTATTGGTAAAGATGTGGGGAAAAAAGTA
++
+<<8;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS51_62:7:96:836:737
+ATCAACCTCATACACACACATGGTTTAGGGGTATA
++
+<<<<<<71<<<<<<<<<<899<:5<<<96858<<.
+@EAS51_62:7:96:836:737
+TCCCATCATGAAGCACTGAACTTCCACGTCTCATC
++
+1<;<7;;1;8;;8:<<1<;<<;<<<<<<<<<<;<<
+@EAS51_62:8:52:967:804
+AACTAAGCATCATAAATGAAGGGGAAATAAAGTCA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<
+@EAS51_62:8:52:967:804
+TTACCTAGTTGCTCTGTAGTCTCAATTAATTGTTT
++
+===============<=======<<===<======
+@EAS51_64:2:326:153:231
+ATTGTTTTCAACTTTGGAAAACAATTTGGTAATTT
++
+::6=68=<*$;*=========6=============
+@EAS51_64:2:326:153:231
+TGCTACTCAATATATCCATGTAACAAATCTGCGCT
++
+<<<<<<<<<9<<<<<<<<<,<<<<<<8<<8.;.;4
+@EAS51_64:3:143:310:958
+CTGCACATTACTACCCTGCAATTAATATAATTGTG
++
+84<;<6<<<<;<<<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS51_64:3:143:310:958
+GTCTCATCTAGGGGAACAGGGAGGTGCACTAATGC
++
+<<<<<<<<<<<8<8<<<<<;;7<<<;6;<<+4;;;
+@EAS51_64:3:190:727:308
+ACAGCTGTGTTTAGTGCCTTTGTTCAACCCCCTTG
++
+;;<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS51_64:3:190:727:308
+GGTGCAGAGCCGAGTCACGGGGTTGCCAGCACAGG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<::<<<844
+@EAS51_64:3:255:45:399
+AAAAACTATGCTAAGTATTGGTAAAGATGTGGGGA
++
+<5<5<4$;;7/<<<177&7;<<<<<<;<<4<<<<<
+@EAS51_64:3:255:45:399
+GGTACAATGTACAATATTCTGATGATGGTTACACT
++
+<<3<8<<8<0<<;<<<0<<<</+8<611<<;71;7
+@EAS51_64:3:285:417:147
+AGTCAAAATTAAAGTTCAATACTCACCATCATAAA
++
+<..)<<<<;<<<<7<;-<<;<<<<<;8<<<<<<<<
+@EAS51_64:3:285:417:147
+TTGGATCTAATTTTTGGACTTCTTAAAGAAAAAAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<;8<<<<<<<<<;6<:<;<<;
+@EAS51_64:3:309:303:278
+CTATGAAGAGACTATTGCCAGATGAACCACACATT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<+<<+<<7<<<<<5<<<;;;
+@EAS51_64:3:309:303:278
+TCAATTTGGTGTTCTGTGTAAAGTCTCAGGGAGCC
++
+<:<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS51_64:3:67:782:132
+ATATTTGTCTGAGCAAAACAGTCTAGATGAGAGAG
++
+;;<;;;<<;;<<<;<<<;<<<;<<<<<<<<<<<<;
+@EAS51_64:3:67:782:132
+TCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTGTTGTTGGTTTT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<;4<<<<
+@EAS51_64:3:7:268:263
+TCGTACAGAAGTTTAATGGAGCCTTGGGACCTTAC
++
+!!66'&+/&'8+2''1+'611'&6&+/&+.&+1'&
+@EAS51_64:3:7:268:263
+TTGCGTTATTTGAGTTGGTGGAAGACATAATCCCA
++
+',)*&2<$7+<<<'<-<7<<<<<<<7<<</4/;<<
+@EAS51_64:3:80:885:513
+GAAATTCTTCATCCTGGACCCTGAGAGATTCTGCA
++
+<7<<<;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS51_64:3:80:885:513
+GCATTTTGTCAGTTACCAAATGTGTTTATTACCAG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<2:<;<<75<7;
+@EAS51_64:3:90:435:691
+GGGAATTTGTCAATGTCAGGGAAGGAGCATTTTGT
++
+;;<;;;+<<:<<<:<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<;
+@EAS51_64:3:90:435:691
+TCTGGTGACTGCCAGAGCTGCTGGCAAGCTAGAGT
++
+<<<<<<<<<<;<<<;<<<<:<<<;<81;<<1;784
+@EAS51_64:4:102:467:897
+AGCATGGTTGTACAGGGCAATACATGAGATTATTA
++
+83333<+02<:<.&<+<.<::7<<::<<<<:<<<<
+@EAS51_64:4:102:467:897
+GCTTTCAACGCTTCTAGCCATTTCTTTTGTCTTTT
++
+<<<<9<<<<9<2<<<&,/</<<<<7<<;&&<$;*<
+@EAS51_64:4:116:738:142
+AAAGTTCAATACTCACCATCATAAATACACACAAA
++
+<:<7;+:<<:<<<;<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS51_64:4:116:738:142
+TGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCTAAACTAAG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<;<<<<<<<:;2
+@EAS51_64:4:163:31:455
+CTTACTTCCAGCTCCCCAGAGGGACAGCTNNCAAC
++
+<+<<<<<<<;0+<<<<;06070-9(0(9<!!5)05
+@EAS51_64:4:163:31:455
+GGGAGGTGCACTAATGCGCTCCACGCCCAAGCCCT
++
+8;<<;<<<78+<=</<<=;23<=<<<<<<<<<<<<
+@EAS51_64:4:179:389:585
+TGGCCACTTTTTATCGCATTTCCCTTTAGAACCTA
++
+<.4<9.4+.+'&-220<+<4<6<<20*6;<0(9<%
+@EAS51_64:4:179:389:585
+TGTGAAATGAATGAGATTATTAGGAAATGCTTTAC
++
+;<)<;*;9*+<;<<,,<,<4<4<<<<<;<4<9494
+@EAS51_64:4:181:476:394
+AACAATATTAACTTTGAATAAAAAGGGATTAAATT
++
+<+;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS51_64:4:181:476:394
+TCATCACTAAACCAGTCCTATAAGAAATGCTCAAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<:<<<:;;
+@EAS51_64:4:189:467:475
+CTACATGGCTGATTATGAAAACAATGTTCCCCAGA
++
+*.;*;7<75<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS51_64:4:189:467:475
+TATCTGGATTCTGGGAAATTCTTCATCCTGGACCC
++
+<<<<<<<<<<<<;;;<<<<<<<<<:<<<<:+<<;;
+@EAS51_64:4:189:571:366
+AACAAATACTACTAGACCTAAGAGGGATGAGAAAT
++
+<<;<<<<<:<<<;<<<;;;<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS51_64:4:189:571:366
+TCTACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGGAGTA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<:<<99;;;
+@EAS51_64:4:318:345:156
+GGACCCTGAGAGATTCTGCAGCCCAGATCCAGATT
++
+<<<<<<<<:<<<<<<<<5<:5<<<3:'<72')*;9
+@EAS51_64:4:318:345:156
+TTATGAAAACAATGTTCCCCAGATACCATCCCTGT
++
+;8<8<<<<<;<<:<<;<;77<<<<<;<<;<<<<<<
+@EAS51_64:4:57:786:414
+CTCATTCACTCCAGCTCCCTGTCACCCAATGGACC
++
+;;;8;1;:<<<<;<::;;<<<<;<;;<<<<<<<<<
+@EAS51_64:4:57:786:414
+TGCAACAACCTTGAGAACCCCAGGGAATTTGTCAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<:<<:;;7<7
+@EAS51_64:5:177:24:389
+AGCTTTCAAGAAGTATGAGATTATGTAAAGTAACT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<;;<;9969;
+@EAS51_64:5:177:24:389
+CAAGACAGACTTCATCAAGATATGTAGTCATCAGA
++
++<<;<9<<<9<<;<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS51_64:5:202:39:380
+CAGGGAAGGAGCATTTTGTCAGTTACCAAATGTGT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<:;<<18<84:<&<+<
+@EAS51_64:5:202:39:380
+CTTCATCCTGGACCCTGAGAGATTCTGCAGCCCAG
++
+/92/;2<+2<<<<64<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<
+@EAS51_64:5:290:247:509
+AGCCCATACTTTACTGCTACTCAATATATCCATGT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<4<<<<<<92<;;;<;96;19
+@EAS51_64:5:290:247:509
+TCTCAAATATTGCTAGTGGGAGTATAAATTGTTTT
++
+49';<<<<<8;<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS51_64:6:118:41:489
+ACAATTAATTGAGACTACAGAGCAACTAGGTAAAA
++
+<+<<;<<<38<<<<5<<3<<<<3<<8<<<<<<<<<
+@EAS51_64:6:118:41:489
+CCCTGCTAAACTAAGCATCATAAATGAAGGGGAAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<95:
+@EAS51_64:6:124:128:489
+CTCTGTCTTGATTTACTTGTTGTTGGTTTTCTGTT
++
+::55<<<8<<<6<<;<<<<<<<<7<<<<<<<<<<<
+@EAS51_64:6:124:128:489
+GTCCTATCTTCTTCTTAGGGAAGAACAGCTTAGGT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<6:6<<-4<::;;<<:48<
+@EAS51_64:6:143:763:480
+AAACGCGTAACTGCGCTCTCATTCACTCCAGCTCC
++
+::3<:6<<<:<<<<7<<<<<<<<)6<<<1<<<<;<
+@EAS51_64:6:143:763:480
+CTGAAGGTTGTTGCAAGGGGGTCTATGTGAACAAA
++
+;<&-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS51_64:6:195:348:703
+CAGTTACCAAATGTGTTTATTACCAGAGGGATGGA
++
+<9<<9</<<<<<<<<<<<<<<2<8<<<<<<<<<<<
+@EAS51_64:6:195:348:703
+TAATGAAAACTATATTTATGCTATTCAGTTCTAAA
++
+<<<<<<<;<<<<<;:<<<<<<<<<<<<:<1:<:7<
+@EAS51_64:6:206:994:556
+ATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGTC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<4<<;<<
+@EAS51_64:6:206:994:556
+NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
++
+!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!
+@EAS51_64:6:210:809:735
+AAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACATCT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS51_64:6:210:809:735
+GAGGTTCAGAACTTGAAGACAAGTCTCTTATGAAT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<5<<
+@EAS51_64:6:213:54:878
+CTCTGTCTTGATTTACTTGTTGTTGGTTTTTTGTT
++
+<<<<<<<<<;<<<<<<<<:<<:<<++<<<<%<%<<
+@EAS51_64:6:300:622:86
+GGTTACACTAAAAGCCCATACTTTACTGCTACTCA
++
+<:<<<:<6;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS51_64:6:300:622:86
+TCATACAATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<
+@EAS51_64:6:54:695:952
+ACAGTAAAATAAAACAAAGGAGGTCATCATACAAT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<
+@EAS51_64:6:54:695:952
+GGTTACACTAAAAGCCCATACTTTACTGCTACTCA
++
+277%<9<4)<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS51_64:7:104:965:517
+AGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACATTGCAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<8<<;<<
+@EAS51_64:7:104:965:517
+NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
++
+!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!
+@EAS51_64:7:140:752:822
+CATCACTAAACCAGTCCTATAAGAAATGCTCAAAA
++
+;<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS51_64:7:140:752:822
+GCTTCTCAGCGGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGAT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<<;<:;
+@EAS51_64:7:152:918:824
+TACTATGTTTCTTATCTGCACATTACTACCCTGCA
++
+;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS51_64:7:152:918:824
+TTTCCCATCATGAAGCACTGAACTTCCACGTCTCA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<8
+@EAS51_64:7:92:493:891
+AAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAACTATTTG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<8
+@EAS51_64:7:92:493:891
+AGTCAACATGAAGGAAAAAAATTCTAAAATCAGCA
++
+<383<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS51_66:1:282:274:50
+ATTACCAGAGGGATGGAGGGAAGAGGGACGCTGAA
++
+</7;/:<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS51_66:1:282:274:50
+CCCCTCTAAGCCGTTCTATTTGTAATGAAAACTAT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<99<9<5909;5;
+@EAS51_66:1:289:207:323
+CCATACTTTACTGCTACTCAATATATCCATGTAAC
++
+<<<:<<<<<:<<<<<<<<<<;<<899<<13)939;
+@EAS51_66:1:289:207:323
+CTAGTGGGAGTATAAATTGATTTCCACTTTGGAAA
++
+&</<7<<:<7::<<<<+3<-7<<:<7<<<<<<<<<
+@EAS51_66:1:64:182:741
+AAAAAAACAAATTAAACTCTAACAAAAGTAAATAA
++
+(+;1&(9*%0<*(*&<*5,/+<,&<&<<6<<<<<<
+@EAS51_66:3:102:511:946
+ATGTAAAAGTGACTGTTATTGTCTTGACACCCAAC
++
+<%-4:6<:/&46;/*;<*84<0<'<&*<2<<<<<<
+@EAS51_66:3:102:511:946
+CCCAGTCCCTGCCCCATCTCGGGTAATCTCTCTCC
++
+<<9<<;<<<<;<<<<;<<7;%<5<<0<<<)<.<.+
+@EAS51_66:3:155:375:623
+AAGGAGTAGCTATACTTATATCAGATAAAGCACAC
++
+;;;;<<:<<<<;<<;<<<<<<;<<;<<<<<<<<<<
+@EAS51_66:3:155:375:623
+CAATATTAACTTTGAATAAAAAGGGATTAAATTCC
++
+0<<<<<;<<<<<<<<<<<<<4<<8<<<<<<<<;<;
+@EAS51_66:3:166:532:438
+AACAAATACTACTAGACCTAAGAGGGATGAGAAAT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<;<<;<<;<<<<;<;:;;<;<
+@EAS51_66:3:166:532:438
+AACTAAAAAAGCAAAAACAAAAACTATGCTAAGTA
++
+<<&7<<<<<<<+<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS51_66:3:233:191:520
+TGAACTTCTGTAATTGAAAAATTCATTTAAGAAAT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<2<8<<
+@EAS51_66:3:246:711:981
+AAAAAAACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGC
++
+;;:;7<<:5:<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS51_66:3:246:711:981
+AGACTTCATCAAGATATGTAGTCATCAGACTATCT
++
+<<<<<<<<;<<<<:;<<;;<:<<<4<<:4;00<;<
+@EAS51_66:3:263:689:572
+AAAGAAAAAAAAACCTGTCAAACACGAATGTTATG
++
+<9<2<<<<<<<<<22;;02<<<9<<;9<9<<;<<3
+@EAS51_66:3:263:689:572
+AAGATATGTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACA
++
+<<<<;<<<<<;<<<<<<&;;<<<;<<:<+;;7;;7
+@EAS51_66:3:29:381:169
+ATCTGGATTCTGGGAAATTCTTCATCCTGGACCCT
++
+<<<<<<<<<<<2<288;<<;<<:4<:<<;&92929
+@EAS51_66:3:29:381:169
+CATCAACCTCATACACACACATGGTTTAGGGGTAT
++
+2<82<;66<:<;<:<;<;<8<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS51_66:3:39:59:738
+GAGATTATTAGGAAATGCTTTACTGTCATAATTAT
++
+3<8.<<<<<<<-<<<<3<388;;880<0<0)-722
+@EAS51_66:3:39:59:738
+GTCCTATGTTCTTCTTAGGGAAGAACAGCTTAGGT
++
+;.;4;<;3<<9<<9<&<<9<<<<<;<9<;<<;9<<
+@EAS51_66:4:188:460:1000
+GTGTCCATGTACACACGCTGTCCTATGTACTTATC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<7<<;:4;44<;;:8;;9;;
+@EAS51_66:4:188:460:1000
+TCTTGAAAGCTTGGGCTGTAATGATGCCCCTTGGC
++
++;+077<7;<57<;;8<<<<<<<<<<8<<<<<<<<
+@EAS51_66:4:191:40:536
+ATAAAAAAAGACTACCCAGATTCATAAAACAAATA
++
++1<<,<&<<:<.;<7/7<<<<;.<<<<<<<<<<<<
+@EAS51_66:4:191:40:536
+CAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAA
++
+<<<<<<<<8<<;<<8<<;<;;<<8<<<<<</<74/
+@EAS51_66:4:209:92:210
+GAGATTATTAGGAAATGCTTTACTGTCATAACTAT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<5<7<<;;;<;<
+@EAS51_66:4:209:92:210
+TTAGGGAAGAACAGCTTAGGTATCAATTTGGTGTT
++
+;9;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS51_66:4:240:264:231
+CAACAGATCAAGAAGGAGGGGCAATGGACGAGTTA
++
+%15+5022))0&<<)0)+7:4+&<0<<:0<<<7<<
+@EAS51_66:4:240:264:231
+TGTAATGAAAACTATATTTATGCTATTCAGTTCTA
++
+9;,;;62<9<)29<<<;96<<<;<<7<<<<<<;<<
+@EAS51_66:4:277:482:316
+CACTAATGCGCTCCACGCCCAAGCCCTTCTCACAG
++
+<<<<<<<<<<<<<<;<;<<<:<;<<<<;<<<1<1;
+@EAS51_66:4:277:482:316
+TGTCCTATGTACTTATCATGACTCTATCCCAAATT
++
+9998;<<<<<;;<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<
+@EAS51_66:4:310:287:420
+AAGACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGAT
++
+<<<<;<;<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS51_66:4:310:287:420
+TACAGAGCAACTAGGTAAAAAATTAACATTACAAC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;;;
+@EAS51_66:4:322:350:374
+ACTTCTTAAAGAAAAAAAAACCTGTCAAACACGAA
++
+<+;8&84<<<:<<<<<<<<<<;<<<<<<<;<<<<<
+@EAS51_66:4:322:350:374
+CATTGCAAGACAGACTTCATCAAGATATGTAGTCA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;
+@EAS51_66:5:210:674:911
+TCATAAATACACACAAAAGTACAAAACTCACAGGT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<;
+@EAS51_66:5:210:674:911
+TGGCAGAACAGATTTAAAAACATGAACTAACTATA
++
+27;2<;<<5<<<<;;<<<<<;<<<<<<;<<<<<<<
+@EAS51_66:5:269:280:716
+TGATATCTGGATTCTGGGAAATTCTTCATCCTGGA
++
+6;<;;6:;<<<;64;<<<<<<<<;<<;<<;<<<<<
+@EAS51_66:5:269:280:716
+TTTGTCAATGTCAGGGAAGGAGCATTTTTTCAGTT
++
+<<<<<<<<<2<<:2:1<<7/2/:3<<<<*<3($<<
+@EAS51_66:5:273:545:1001
+AACAAAGGAGGTCATCATACAATGATAAAAAGATC
++
+<7(<<72;<2;27<;:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS51_66:5:273:545:1001
+AGATTTAAAAACATGAACTAACTATATGCTGTTTA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<;;<<<<<<;<8;28<8;<<8
+@EAS51_66:5:285:395:450
+GTCATCTATAAAGGAAATCCCATCAGAATAACAAT
++
+8)3<8+;<)<<<<<<<<97:7<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS51_66:5:285:395:450
+TATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGT
++
+<<<<<<<;<<<;<<<<<;:<:7<;<;7<7<<;;7<
+@EAS51_66:5:308:400:602
+ATAGACCCCCTTGCAACAACCTTGAGAACCCCAGG
++
+;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;;<<;<;76
+@EAS51_66:5:308:400:602
+CCTGTCACCCAATGGACCTGTGATATCTGGATTCT
++
+;77;2<<;<7<<;<<<;<;<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS51_66:6:284:442:747
+AAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACATTGC
++
+<;<<<<<:<;<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS51_66:6:310:747:415
+TGAGTCACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<;<<<<<;<;<;
+@EAS51_66:6:310:747:415
+TGTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACATGAAGG
++
+;<<<;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS51_66:7:174:987:334
+ACACCCAAGCCCTTCTCACAGTTTCTGCCCCCAGC
++
+<<;4<<<<;;</4<4<+<<<<<;<<<<<</<93+2
+@EAS51_66:7:174:987:334
+GTCCATGTACACACGCTGTCCTATGTACTTATCAT
++
+,;<;;<<<&<<<1<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<
+@EAS51_66:7:4:234:610
+AAAAAACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTCCT
++
+<<<<<<<<7;<<<;7<7;7;7<;-<-<&<<<0%06
+@EAS51_66:7:4:234:610
+AAAAATCAACATCACAAATACACACAAAAGTACAA
++
+<:+:'+&<+'<+'2&<:<7<2<':2<:<<7<7<<<
+@EAS51_66:7:84:411:336
+GCTTGTACTTCTAAATCTATAAAAAAATTAAAATT
++
+<<<;<<<;<<<<<<<<<<<<:<<;<<<<<<;8<;<
+@EAS51_66:8:36:688:722
+ATGTCTATTTTTGTCTTGACACCCAACTAATATTT
++
+<;;<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS51_66:8:36:688:722
+GTCCCTGCCCCATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS51_66:8:43:972:506
+AGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGATTGGATCTAAT
++
+<;<<<<<<<<<<<<6;<;<<<<<<<<<<:;;<;<<
+@EAS51_66:8:43:972:506
+TAAGAAATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAAT
++
+;<<<<<<<+;<;<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<
+@EAS51_66:8:66:655:769
+TCATCCTGGACCCTGAGAGATTCTGCAGCCCAGCT
++
+8<<;:69<;:;9<2<*9<;6<<<<<17<;<3+<;<
+@EAS51_66:8:66:655:769
+TTTGTCAGTTACCAAATGTGTTTATTACCAGAGGG
++
+8;<<<<<8<<<<<;<<<7<;<<<<<;<7<27<;;7
+@EAS51_66:8:9:80:353
+AATTAATATAATTGTGTCCATGTACACACGCTGTC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<6<<<;;<<5<<2;2
+@EAS51_66:8:9:80:353
+CCTCGTCCACACTGGTTCTCTTGAAAGCTTGGGCT
++
+;;5;:8<:<:;:;<<<<;<:<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS51_78:7:113:43:634
+ATTTGTCTGAGAAAAACAGTCTAGATGAGAGAGAA
++
+;9;1;<5:<<<%<<<<;<<<;<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS51_78:7:113:43:634
+CTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTGTTGTTTTT
++
+<<<<<<<<<<<<.<<<<<<<<<<<<</<<2;;%%;
+@EAS51_78:7:147:64:416
+AAACAATGTCCCCCAGATACCATCCCTGTCTTACT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<;<<<<;;:<;;;;;
+@EAS51_78:7:147:64:416
+CTCATCTAGGGGAACAGGGAGGTGCACTAATGCGC
++
+/;49;:6<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS51_78:7:164:727:977
+GAAATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAA
++
+;<;<;<:<:<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS51_78:7:164:727:977
+TACAAGCCAGAAGAGATTGGATCTAATTTTTCGAC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<;;79;
+@EAS51_78:7:186:199:927
+CTACGCGAATGCGTCTCTACCACAGGGGGCTGCGC
++
+-;++)6<*8+;&<&/<<<<7<<71<<<<<6<<<7<
+@EAS51_78:7:186:199:927
+TGGCATTTGCCTTCAGACCCTACACGAATGCGTCT
++
+<77<<<<2<;<<<<<06<<<<<<<<60<<684/6&
+@EAS51_78:7:215:516:299
+AAGCTATGCTAAGTATTGGTAAAGATGTGGGGAAA
++
+;;))7<8:855<<4<;:<<87<<<7<<;<<<*3<<
+@EAS51_78:7:215:516:299
+AATTACCTAATTGGTACAATGTACAATATTCTGAT
++
+<<<<<<;<<<<;;;;<;;<<<<;<<9<;<<1;7/;
+@EAS51_78:7:270:448:491
+GTAATCTCTCTCCTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<&<<.<<<<<<<:;;;<;
+@EAS51_78:7:270:448:491
+TTTGTCTGAGCAAAACAGTCTAGATGAGAGAGAAC
++
+7;;;;+2;<<+<<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS51_78:7:303:402:142
+AGCATTTTGTCAGTTACCAAATGTGTTTATTACCA
++
+;;;;;<9<<8;<<<<7<<;<<<<;<<<<<<<<<<<
+@EAS51_78:7:303:402:142
+TCCCATTTGGAGCCCCTCTAAGCCGTTCTATTTGT
++
+<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<46<648;;';
+@EAS51_78:7:316:961:576
+TGTGATATCTGGATTCTGGGAAATTCTTCATCCCG
++
+<<<<<<<;<<<<;<<:<<;<;<<:;<9+34;;6%/
+@EAS51_78:7:316:961:576
+TTACGGGTGTAATCTCTCTACATGGCTAATTATGA
++
+(++%%+++),+,+*++,+,,-,**+,-&-,+-+--
+@EAS54_61:1:115:868:887
+CATACACACACATGGTTTAGGGGTATAATACCTCT
++
+==;==8=;=;=========================
+@EAS54_61:1:115:868:887
+TCTCATTCACTCCAGCTCCCTGTCACCCAATGGAC
++
+>>>>>>>>>>>>>>;<>>>>><<>>>;<+<</;;1
+@EAS54_61:2:168:61:867
+GATGTTCTACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAG
++
+====7====================7======6==
+@EAS54_61:2:168:61:867
+TCATAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAGGGATG
++
+;7<<<<<<<<<<<<<7<<:<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_61:2:66:757:918
+CCATCCTACTAAATACATATGCACCTAACACAAGA
++
+<9<45;<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_61:2:66:757:918
+GGGGTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAACAGAAACC
++
+===================================
+@EAS54_61:3:150:933:810
+AGCTTTCAACGCTTCTAGCCATTTCTTTTGGCATT
++
+:89===:=:=;;==;====================
+@EAS54_61:3:150:933:810
+CAATGAACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGG
++
+===================================
+@EAS54_61:3:155:758:710
+ATCAGATAAAGCACACTTTAAATCAACAACAGTAA
++
+=46=4=5===:========:=7=7======11===
+@EAS54_61:3:155:758:710
+TTTGAATAAAAAGGGATTAAATTCCCCCACTTAAG
++
+=======8================6=:7===:=:=
+@EAS54_61:3:20:762:748
+CACAATGAACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAA
++
+===================================
+@EAS54_61:3:20:762:748
+TTCTTTTGGCATTTGCCTTCAGACCCTACACGAAT
++
+=:747;7=;;==7=;==7===7==7;=========
+@EAS54_61:4:143:69:578
+ATTGGGAGCCCCTCTAAGCCGTTCTATTTGTAATG
++
+222&<21<<<<12<7<01<<<<<0<<<<<<<20<<
+@EAS54_61:4:83:452:970
+AATGAAAACTATATTTATGCTATTCAGTTCTAAAT
++
+==========================;========
+@EAS54_61:4:83:452:970
+AGGGATGGAGGGAAGAGGGACGCTGAAGAACTTTG
++
+<<<39<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_61:4:86:660:932
+AATACATATGCACCTAACACAAGACTACCCAGATT
++
+================================9:=
+@EAS54_61:4:86:660:932
+ATATAAAAAAATTAAAATTTAACAAAAGTAAATAA
++
+&<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_61:6:126:541:194
+AGTACGACCAGCTCCCCAGAGGGAAAGCTTTCAAC
++
++%&:/+(46=47&71/2==;=;8====28212===
+@EAS54_61:6:126:541:194
+CAGCCCAGATCCAGATTGCTTGTGGTCTGACAGGC
++
+<<<<<<<<8<<<<<8<<<<<<<<<8<<<428+<80
+@EAS54_61:6:25:949:33
+AAAGTAACTGAACCTATGAGTCACAGGTATTCCTG
++
+=;===/8========*==&;6=&=&:=6&:=::67
+@EAS54_61:6:25:949:33
+GATATGTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACATG
++
+-<4<666<<-7<5<<<<<(<<<<<<<<<<<<<<-<
+@EAS54_61:7:114:506:971
+ACTAAATACATATGCACCTAACACAAGACTACCCA
++
+;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_61:7:114:506:971
+GGGTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAACAGAAACCA
++
+===================================
+@EAS54_61:7:64:37:257
+CCGTGTCCTCCCATCTGGCCTCGTCCACACTGGTT
++
+================<=====;===8;4======
+@EAS54_61:7:64:37:257
+TTTGATTTGGTGGAAGACATAATCCCACGCTTCCT
++
+;47<<47+9<4<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_61:8:165:441:708
+CCATCATAAATACACACAAAAGTACAAAACTCACA
++
+6+<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_61:8:165:441:708
+CTTAAAGAAAAAAAAACCTGTCAAACACGAATGTT
++
+=<===============================99
+@EAS54_61:8:4:173:814
+CTGCTACTCAATATATCCATGTAACAAATCTGCGC
++
+<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_61:8:4:173:814
+GATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGATATAACCA
++
+=====================<==========;==
+@EAS54_65:2:127:288:655
+ACTAGGTAAAAAATTAACATTACAACAGGAACAAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;<<;;
+@EAS54_65:2:127:288:655
+TGTTCTACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGGA
++
+<<:<3<<:<.<<<;<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_65:2:182:924:833
+TTTTTTTTTTTTTATTTGCGCTTTTTTTTTTTTTT
++
+<<<<<<<<<<<<<)7<<)3/:07<<9<9<<==<7<
+@EAS54_65:2:264:157:150
+GGAAAAATGGACAAGATTCTGATGAGGGTTACACT
++
+.3%:+<<*;*<2<<1<1*,*<<7<<+<<<&<<<<<
+@EAS54_65:2:264:157:150
+TAAAGCACACTTTAAATCAACAACAGTAAAATAAA
++
+<<<<<<9<9<<<<.9;<<9&<97<;9933309605
+@EAS54_65:2:94:356:809
+AAATCTATAACAAAATTAAAATTTAACAAAAGTAA
++
+<<<<3<<<<;;<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_65:2:94:356:809
+CTAAATACATATGCACCTAACACAAGACTACCCAG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<:;
+@EAS54_65:3:102:884:63
+GTCTTGACACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAAAA
++
+<;7;;<<8<;8;<<<8<<<<<<8<<<8;<<<<<<<
+@EAS54_65:3:102:884:63
+TGTCTTCCTCTGTCTTGATTTCCTTGTTGTTGGTT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<3<<<%<<<9<<9<<7+;<
+@EAS54_65:3:155:541:234
+CTAAATACATATGCACCTAACACAAGACTACCCAG
++
+<<7<<<<<<<<<<<<<<<4<<<<<<<<<<<;;;08
+@EAS54_65:3:155:541:234
+TGCGCTTGTACTTCTAAATCTATAAAAAAATTAAA
++
+78;<7<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<;<<<<
+@EAS54_65:3:214:946:229
+AAATGAACAGAGCTTTCAAGAAGTATGATATTATG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<::<;;;<;<;7<:<<7<2
+@EAS54_65:3:214:946:229
+ACAAAGAATGCCAGGAAGATACATTGCAAGACAGA
++
+)+<<<*<<77;8<;7<<8<4<;<88<<<<<<<<<<
+@EAS54_65:3:273:901:459
+CCAGCATGGTTGTACTGGGCAATACATGAGATTAT
++
+<<8<<<;<;8<;<;<;7+8<788<;;22<27;77;
+@EAS54_65:3:273:901:459
+TGTCCTATGTACTTATCATGACTCTATCCCAAATT
++
+4;+/+7,;<8+&<;;82;;<8<8<2<;<<<<<<<<
+@EAS54_65:3:290:558:349
+ACCATCCCTGTCTTACTTCCAGCTCCCCAGCGGGA
++
+<<<;<<;<;<188<<<8::<686+4:<<6:&3)*&
+@EAS54_65:3:290:558:349
+TCTCAGCTAGGGGAACAGGGAGGTGCACTAATGCG
++
+2;2;;'5&;<<5<<;5/<<<<<7<<;+;<<+1<8<
+@EAS54_65:3:320:20:250
+AAATAAAACACATAGCTAAAACTAAAAAAGCAAAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<;+:<;<<3
+@EAS54_65:3:320:20:250
+TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCATGCCAGAAA
++
++'''/<<<<7:;+<;::<<<;;<<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_65:3:321:311:983
+ATTTATGCTATTCAGTTCTAAATATAGAAATTGAA
++
+;;4;;<7<<<<<<77<<<<<<<<<<17<<<<<<<<
+@EAS54_65:3:326:652:890
+TTCTGTAATTGAAAAATTCATTTAAGAAATTACAA
++
+<<<<<<<<<<2<<<<<<<<<<<<<<+<8:<<9998
+@EAS54_65:4:137:319:642
+CTTGTTGTTGGTTTTCTGTTTCTTTTTTTGATTTT
++
+<<<<<<<<<27<<<<<<<<<<<<<<&;<<&3;;<%
+@EAS54_65:4:174:753:617
+ATATATCCATGTAACAAATCTGCGCTTGTACTTCT
++
+<;<;<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_65:4:174:753:617
+GATATAACCATCCTACTAAATACATATGCACCTAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<<<<
+@EAS54_65:4:192:714:341
+AAATTAAAATTTAACAAAAGTAAATAAAACACATA
++
+<<<3;<<<<9:<<</<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_65:4:192:714:341
+ACACAAGACTACCCAGATTCATAAAACAAATACTA
++
+<<9<<<<<<<<<<<8<<<<<;<<;8<<<88;;;;9
+@EAS54_65:4:193:38:987
+AGGGAAGAACAGCTTAGGTATCAATTTTGTGTTCT
++
+<<<;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_65:4:193:38:987
+TGAGATTATTAGGAAATGCTTTACTGTCATAACTA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<:;:;;
+@EAS54_65:4:246:313:499
+ACAATGAACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAG
++
+<<<<<<<<<<<<<;<;<<<<<<<<;<<<<<;;<<<
+@EAS54_65:4:246:313:499
+CTTTAAACGCTTCTAGCCATTTCTTTTGGCATTTG
++
++;77%;;;&:;:7;<<<<<6<:<<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_65:4:325:795:213
+AGACTACAGAGCAACTAGGTAAAAAATTAACATTA
++
+<<<0<<;<<<<;<<;:<<<<<<<<<<<;<<<<<9<
+@EAS54_65:4:325:795:213
+GGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATG
++
+<<<<<<<;<<<<;;<<<<<<<<<<<<;:<</;/;;
+@EAS54_65:4:61:346:384
+CAACTAAGAAGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGATT
++
+7&$+&,<<+;;<;;<<6<<8<<<;<<;<<<<<<<<
+@EAS54_65:4:61:346:384
+CTAAATGAAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGAT
++
+<<;<<<<<<<<9<;<<9;<6<2;<6<<<;9*558;
+@EAS54_65:4:91:267:655
+CAGGGAGCCGTCCGTGTCCTCCCATCTGGCCTCGT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;:;;7<9477<74;
+@EAS54_65:4:91:267:655
+TGTTGTTGGTTTTCTGTTTCTTTGTTTGATTTGGT
++
+;,:;5:<6:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_65:6:115:538:276
+CAAATGTGTTTATTACCAGAGGGATGGAGGGAAGA
++
+:<<<<<<<<;;<5<<;<<<<<<<<;<<<<<<<<<<
+@EAS54_65:6:115:538:276
+TATTTGTAATGAAAACTATATTTATGCTATTCAGT
++
+<<<<<<<<;<<<;;<<<;<:<<<:<<<<<<;;;7;
+@EAS54_65:6:164:797:930
+AGCTAGAGACCCATTTGGAGCCCCTCTAAGCCGTT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<;;;:<<<<<;<;<<<<<,::
+@EAS54_65:6:164:797:930
+GTCAGGGAAGGAGCATTTTGTCAGTTACCAAATGT
++
+;;:;8<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_65:6:18:376:416
+GCAAAACAGTCTAGATGAGAGAGAACTTCCCTGGA
++
+70<<<<<<<7<7<<<2<<<<<<<<<<8<<<<<<<<
+@EAS54_65:6:18:376:416
+TTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGTTT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<;:(<<
+@EAS54_65:6:277:590:364
+CTCTACATGGCTGATTATGAAAACAATGTTCCCCA
++
+:::<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_65:6:277:590:364
+CTGGGAAATTCTTCATCCTGGACCCTGAGAGATTC
++
+<<<<<8<<<<<<<<;<<<<<;;<7<<;;7858;;8
+@EAS54_65:6:326:71:741
+TCTCGTTTTTTTTTCTTTCTTTTCTCTTTTTTTTT
++
+!!<66<<<<<<<<<&<<7&<<<<:<*<<<<<<<<1
+@EAS54_65:6:49:183:435
+CCATCATGAAGCACTGAACTTCCACGTCTCATCTA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<;:;8;:
+@EAS54_65:6:49:183:435
+GACTATTGCCAGATGAACCACACATTAATACTATG
++
+1<7<<<<;:<<<<<;<<<;<<<;<;<<<<<<<<<<
+@EAS54_65:6:67:56:806
+TATAAAGGAAATCCCATCAGAATAACAATGGGCTT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<:7:
+@EAS54_65:6:67:56:806
+TCCTGACAAGCAAATGCTAAGATAATTCATCATCA
++
+844:8;7<88;8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_65:7:117:452:744
+AATATTAACTTTGAATAAAAAGGGATTAAATTCCC
++
+<;;<;<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_65:7:117:452:744
+ACCAGTCCTATAAGAAATGCTCAAAAGAATTGTAA
++
+<<<<<<<<<<;<<<;<<<<<<<<<<:<<<<<<<;;
+@EAS54_65:7:155:629:357
+AGAAGAGATTGGATCTAATTTTTGGACTTCTTAAA
++
+<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<6<<<<<<<<<;<<<
+@EAS54_65:7:155:629:357
+AGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACATTGCAA
++
+<<<<<<<<8<8<<6<<<<<<<<;<9<5<;<;;941
+@EAS54_65:7:159:253:353
+ATAAAACAATTAATTGAGACTACAGAGCAACTAGG
++
+<8<<<<:<<;;<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_65:7:159:253:353
+GAAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAGGC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<0,%4(+,
+@EAS54_65:7:56:57:985
+TTCTGTCTTCTCTCCTGTCTTCTTTTCTCTTCTTT
++
+<9'<.<7<<2<<;77<7<<<<7<7<<<<7<<<2<<
+@EAS54_65:7:56:57:985
+TTTTTTCTCTTTTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTT
++
+666666*6&1666+64666666666&266666666
+@EAS54_65:7:68:825:405
+AAAACCTCATATATCAATATTAACTTTGAATAAAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;;9
+@EAS54_65:7:68:825:405
+AAACCAAATGAGAGAAGGAGTAGCTATACTTATAT
++
+<<<;<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_65:8:10:975:766
+AATAACACAAGACTACCCAGATTCATAAAACAAAT
++
+++4<<+<+<<<<8<<22;<<<<<2<<<<<<<<<<<
+@EAS54_65:8:10:975:766
+TTAATAAAGACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGAAA
++
+<<<<<<<<;<<<<;<:<<;<6;;<<<:6-:+1+;;
+@EAS54_65:8:140:924:923
+GAACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGAT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<5;<;
+@EAS54_65:8:140:924:923
+TTTTAGCCATTTCTTTTGGCATTTGCCTTCAGACC
++
+<<&<<;;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_65:8:147:687:428
+ATATGCACCTAACACAAGACTACCCAGATTCATAA
++
+;1<''48;4)<<:<<<<;<<6;<<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_65:8:147:687:428
+ATGTTCTACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_65:8:178:187:610
+AAATACACACAAAAGTACAAAACTCACAGGTTTTA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_65:8:178:187:610
+TTGGCAGAACAGATTTAAAAACATGAACTAACTAT
++
+66:,:<7<<<<<<<1<<<<<<<<<<<<<<<2<<<<
+@EAS54_65:8:240:719:799
+AGATTGGCAGAACAGATTTAAAAACATGAACTAAC
++
+<:<<<<<:<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_65:8:240:719:799
+TTAAAGTTCAATACTCACCATCATAAATACACACA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<
+@EAS54_65:8:305:819:245
+AAATTCATTTAAGAAATTACAAAATATAGTTGAAA
++
+8<<<<8<;<<<<<;<8<<8<8<<<<8<<<899<<+
+@EAS54_65:8:76:493:708
+TTTATGCTATTCAGTTCTAAATATAGAAATTGAAA
++
+5/)63.&1517(544(055(0454&7706566679
+@EAS54_67:1:138:186:274
+GGCCTCGTCCACACTGGTTCTCTTGAAAGCTTGGG
++
+<;<<<<<6;<<<<<3<<36;3;<9<<<<<<3;<<<
+@EAS54_67:1:138:186:274
+TAATTGTGTCCATGTACACACGCTGTCCTATGTAC
++
+=39====9===;=;=;=9=;=====;===-=+=-7
+@EAS54_67:1:159:222:274
+GAACCACACATTAATACTATGTTTCTTATCTGCAC
++
+=;9====;=9==59=+==9========9===5;7=
+@EAS54_67:1:159:222:274
+GTCTGGGGAAAGTCTCAGGGAGCCGTCCGTGTCCT
++
+''7*<&<'<<<<.<2<<<<<<<<<<+<<<8<8<<;
+@EAS54_67:1:15:381:715
+GACTAAACCAAGCAGAAGAAAGAGGTTCAGAACTT
++
+;=====;===9==;===9;;;=4;9=====;====
+@EAS54_67:1:15:381:715
+GGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAACTAT
++
+<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<97;<<<<<<<<9<<
+@EAS54_67:1:88:54:900
+ATCAACAACAGAAAAATAAAACAAAGGAGGTCATC
++
+.....&.....,.......................
+@EAS54_67:1:88:54:900
+TGATGATGGTTACACTAAAAGCCCATACTTCACTG
++
+============;=================;9===
+@EAS54_67:2:22:471:500
+GTAAATAAAACACATAGCTAAAACTAAAAAAGCAA
++
+=9===0====;=77<==8;====;===========
+@EAS54_67:2:22:471:500
+TACTACTAGACCTAAGAGGGATGAGAAATTACCTA
++
+=======<=<====:<2===9==;=;9;;=;;;;5
+@EAS54_67:3:114:736:433
+AACAAAACCTCATATATCAATATTAACTTTGAATA
++
+;<<9<8;<<<<8<8<;<<;;;0<<8;<;<<47;;;
+@EAS54_67:3:114:736:433
+ATGTTCTACGCAAACAGAAACCAAGTGAGAGAAGG
++
+<9<9+9;<6<9<<;9<<<<<;<<<99<<<<<<<<<
+@EAS54_67:3:172:196:746
+AAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGCT
++
+<<<;><<+<<<<:<<<<2<;<<<;<<<<<<<<<<<
+@EAS54_67:3:172:196:746
+GCATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCATCAGAA
++
+<<<<<<<<9<<<<9<<<<<<<<<;<<<<6<<<<;<
+@EAS54_67:3:175:730:949
+TTATGCTATTCAGTTCTAAATATAGAAATTGAAAC
++
+<<<<;+<<<<7<;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_67:3:197:261:624
+GACTATCTAAAGTCAACATGAAGGAAAAAAATTCT
++
+<<<<<<<<<<<;<<<<<<<;<<;<<<<<<;<<<9<
+@EAS54_67:3:197:261:624
+GCCCTGCTAAACTAAGCATCATAAATGAAGGGGAA
++
+866;2:/;<<<;:<<<;<;;<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_67:3:47:471:858
+ACACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAAAACAGTCT
++
+/;9<<63<<<<3<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<
+@EAS54_67:3:47:471:858
+CATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTGTTG
++
+<<;<<<<<<<<9<<<4;;<<<<;<<<<<.<<4;<4
+@EAS54_67:4:142:943:582
+TTCAAATGAACTTCTGTAATTGAAAAATTCATTTA
++
+<<<<<<;<<<<<<:<<;<<<<;<<<;<<<:;<<<5
+@EAS54_67:4:145:607:216
+AACGCGTAACTGCGCTCTCATTCACTCCAGCTCCC
++
+<<<<<<<<8<<<<<<<<<<4<<<7<:<<1<<;;99
+@EAS54_67:4:145:607:216
+TGAAAAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGA
++
+/;<<&<<8<<<<<<<<<<<<<;872<<<<<<<<<<
+@EAS54_67:4:7:526:343
+TCATCCTGGACCCTGAGAGATTCTGCAGCCCAGCT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<:<<<5<<<<<<5;<<<+8<;
+@EAS54_67:4:7:526:343
+TGAAAACAGTGTTCCCCAGATACCATCCCTGTCTT
++
+(7:;;;<<;;;<1<1<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_67:5:117:33:262
+AATTAACATTACAACAGGAACAAAACCTCATATAT
++
+<<;;<<;<:8<7<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_67:5:117:33:262
+ACAAGCAAATGCTAAGATAATTCATCATCACTAAA
++
+<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;
+@EAS54_67:5:124:241:608
+CTGAACTTCCACGTCTCATCTAGGGGAACAGGGAG
++
+9;;<<;<<<;<<<;<:<<<<;<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_67:5:124:241:608
+GGGTATAATACCTCTACATGGCTGATTATGAAAAC
++
+<<<<<<<<<;<<<<<<<<<;;<<<;<<<<;;8;;:
+@EAS54_67:5:127:828:697
+ATGCCAGGAAGATACATTGCAAGACAGACTTCATC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;;<;
+@EAS54_67:5:127:828:697
+TAAAGAAAAAAAAACCTGTCAAACACGAATGTTAT
++
+;<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_67:5:149:639:910
+CAATGGGCTTCTCAGCAGAAACCTTACAAGCCAGA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<;;<<;<<;<
+@EAS54_67:5:149:639:910
+TCACTAAACCAGTCCTATAAGAAATGCTCAAAAGA
++
+<;49;<<;;<<<<8;<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<
+@EAS54_67:5:71:408:741
+AGTCATCTATAAAGGAAATCCCATCAGAATAACAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<
+@EAS54_67:5:71:408:741
+TCCTGACAAGCAAATGCTAAGATAATTCATCATCA
++
+;7;<;<0<<<<<<<<:;<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_67:6:107:395:312
+CAAAATATAGTTGAAAGCTCTAACAATAGACTAAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;;<:<<<<
+@EAS54_67:6:107:395:312
+CAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGT
++
+;<;;<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_67:6:109:953:668
+CAATATATCCATGTAACAAATCTGCGCTTGTACTT
++
+;<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<;<<
+@EAS54_67:6:109:953:668
+CCACTTTGGAAAACAATTTGGTAATTTCGTTTTTT
++
+<:)9<<<<<<<<8:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_67:6:198:503:669
+CAATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGATATA
++
+5<<:<<;<<<<<<<;;<<9<<<<<<<<;<<<<;<<
+@EAS54_67:6:198:503:669
+CAGATTTAAAAACATGAACTAACTATATGCTGTTT
++
+<<<<<<<<<<;8<<<<<;<<<<<<;<;<8<<8<<<
+@EAS54_67:6:43:859:229
+TTCAAATGAACTTCTGTAATTGAAAAATTCATTTA
++
++37<=<.;<<7.;77<5<<0<<<;<<<27<<<<<<
+@EAS54_67:6:46:285:790
+AACGCGTAACTGCGCTCTCATTCACTCCAGCTCCC
++
+;;<8<;<<<<88<8<<;;<;<<;<<<<<<<<;<<<
+@EAS54_67:6:46:285:790
+TCAAGGTTGTTGCAAGGGGGTCTATGTGAACAAAG
++
+!!<<3<<<;;<<<<<<<<<;<;7<<7<<<<<<;<<
+@EAS54_67:7:101:752:996
+AACCTTACAAGCCAGAAGAGATTGGATCTAATTTT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<9<<<<<<;<<;;;;
+@EAS54_67:7:101:752:996
+AAGAAATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATT
++
+<<<<<<<<7<7<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<
+@EAS54_67:7:197:399:319
+CAAAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAGGGATGA
++
+&<+==<<5<<<8<89;;<<<<<<8<<<<<<<<<<<
+@EAS54_67:7:197:399:319
+TAGAAACCAAATGAGAGAAGGAGTAGCTATACTTA
++
++<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<;;<<;
+@EAS54_67:8:19:855:491
+TGGCATTTGCCTTCAGACCCTACACGAATGCGTCT
++
+8<<<<;:<<<<:<<<<<:<;;<<<<<<<;<<<;<;
+@EAS54_67:8:19:855:491
+TGTGTGTTCTCATCAACCTCATACACACACATGGT
++
+<<<<<<<<<<<;<<.:<<<<;;;<4<:<:<7<;;;
+@EAS54_67:8:46:900:610
+GATATCTGGATTCTGGGAAATTCTTCATCCTGGAC
++
+<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<;;4;<
+@EAS54_67:8:46:900:610
+TACATGGCTGATTATGAAAACAATGTTCCCCAGAT
++
+<;5<;<<<;<<<<<<;<<<<<<<<<<8<<<<<8<<
+@EAS54_71:2:125:628:79
+GCTGAAGAACTTTGATGCCCTCTTCTTCCAAAGA
++
+95&<<<<<<<63<<<6<<<<8<;<<8<<<<<<<<
+@EAS54_71:2:125:628:79
+TTTATGCTATTCAGTTCTAAATATAGAAATTGAAA
++
+==================<6<====<<:<==7;::
+@EAS54_71:2:204:264:413
+CAATGAACAACAGAAAGAAAAGTTCTTTCAAAAGG
++
+1==(4=::;/7::&===;====/=;===;;=====
+@EAS54_71:2:204:264:413
+TGCCCTCTTCTTCCAAAGATGAAACGCGTAACTG
++
+<<<<<<<<<<<<<;:59<+<<:<<<9<<;:62<)
+@EAS54_71:2:85:686:696
+AATCAGCAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTATAAA
++
+==================<=====:==<=<;=:==
+@EAS54_71:2:85:686:696
+TAAACTAAGCATCATAAATGAAGTGGAAATAAAG
++
+:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_71:3:186:989:869
+ACACACATGGTTTAGGGGTATAATACCTCTACATG
++
+;<<;:<<<7:<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_71:3:186:989:869
+GGGAAATTCTTCATCCTGGACCCTGAGAGATTCT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7;:<<<<<<<<<$<
+@EAS54_71:3:254:32:275
+GATGGAGGGAAGAGGGACGCTGAAGAACTTTGAT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<:<::<:2*<
+@EAS54_71:3:254:32:275
+TGCAACTGTGAGCCATCACAATGAACAACAGGAAG
++
+(6+<;+6:9<<:7:<95<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_71:3:257:288:731
+AAGAAGATATAACCATCCTACTAAATACATATGCA
++
+<<:<<7<<<<<;<5<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_71:3:257:288:731
+TGCTGTTTACAAGAAACTCATTAATAAAGACATG
++
+<<<<<<<<8<8<<;<;<<<;<<<5<;;88.8<6<
+@EAS54_71:3:267:821:860
+GCATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCATCAGA
++
+$&<<<.<:;6<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_71:3:267:821:860
+TCTTTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACATCTAAATG
++
+;<<<<<8<<<<<8<<;<8<<<<<5<;<<<<<2;<5
+@EAS54_71:3:78:855:352
+AAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAACTATTT
++
+2<<<<<<<9<<4<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_71:3:78:855:352
+AACAATAGACTAAACCAAGCAGAAGAAAGAGGTTC
++
+<<<<<<<<;<<<<<<<<<;<<<<<<<<;<;<<:<:
+@EAS54_71:4:127:725:381
+AATTACAAAATATAGTTGAAAGCTCTAACAATAGA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<;;;;;<<8:
+@EAS54_71:4:127:725:381
+TGAACCTATGAGTCACAGGTATTCCTGAGGAAAA
++
++<<.<<;<;<<<3;<;<<<<<<6<8;<<<<<<<1
+@EAS54_71:4:13:981:659
+CGGGACAATGGACGAGGTAAACCGCACATTGACAA
++
++)---3&&3&--+0)&+3:7777).333:<06<<<
+@EAS54_71:4:13:981:659
+TGTAGCCCCTCTAAGGCGTTCTATTTGTAATGAA
++
+()&)06636;;<664*6;<<<<<<<<<<<<<<<1
+@EAS54_71:4:14:88:306
+AAAGAATGCCAGGAAGATACATTGCAAGACAGAC
++
+<<<<<<8<<<<<<;<<<3<<<8<<;<;;<15<:6
+@EAS54_71:4:14:88:306
+AGAAGAGATTAGATCTAATTTTTGGACTTCTTAAA
++
+<1;<;<;<4<&<<<:<<<:<<<<;<<<<<<<<<<<
+@EAS54_71:4:165:397:25
+GCAACTGTGAGCCATCACAATGAACAACAGGAAGA
++
+<<7<<<<<<)97<6<:3:60:3+37-37+<:33:3
+@EAS54_71:4:165:397:25
+TTCAACGCTTCTAGCCATTTCTTTTGGCATTTGC
++
+&(33'60;-'+'<7;<<*3-<;;183<<<;<;<<
+@EAS54_71:4:169:256:888
+AGGTTCAGAACTTGAAGACAAGTCTCTTATGAATT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<;<<;<<:;;<
+@EAS54_71:4:169:256:888
+ATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGT
++
+&<<:<;<<;;<8<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_71:4:169:862:829
+AAAGGTCTTTCAAAAGGTGATGTGTGTTCTCATCA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<;<;<<<<:<;;<78
+@EAS54_71:4:169:862:829
+GCCATTTCTTTTGGCATTTGCCTTCAGACCCTAC
++
+,1<6<<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<<<<
+@EAS54_71:4:206:741:810
+ACTAACTATATGCTGTTTACAAGAAACTCATTAA
++
+<3<<;5<<<<<;:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_71:4:206:741:810
+CAAAAGTACAAAACTCACAGGTTTTATAAAACAAT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;:-;<<
+@EAS54_71:4:209:159:130
+CTTATCATGACTCTATCCCAAATTCCCAATTACGT
++
+;:6<:<8::;<<<;<-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_71:4:209:159:130
+GCCCCCAGCATGGTTGTACTGGGCAATACATGAG
++
+<<<<<<8<<<<<<&<<+7<<4<<<22<;<<<<3<
+@EAS54_71:4:233:97:262
+ACCACACATTAATACTATGTTTCTTATCTGCCCA
++
+<<<<<<<<<<<;<;<<:<<<<<<<<<<<<.<&77
+@EAS54_71:4:233:97:262
+GTATCAATTTGGTGTTCTGTGTAAAGTCTCAGGGA
++
+--;;7<;<;;:;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_71:4:252:428:683
+TGTCTTGATTTACTTGTTGTTGGTTTTCTGTTTCT
++
+<<<<<<;<<<<<<<<7<<7<<&+<<<<:<&<<<4<
+@EAS54_71:4:284:269:882
+TTTCTTTTCTCTTTTTTTTTTTTTTGTTTTTGCA
++
+<;<<<<<8<7<8;<<<;<7<<<<<;272;73&&)
+@EAS54_71:4:328:669:662
+GGAAGGAGCATTTTGTCAGTTACCAAATGTGTTT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<+9;<;;.<<<
+@EAS54_71:4:328:669:662
+TCTTCATCCTGTACCCTGAGAGATTCTGCAGCCCA
++
+4<<;<<8<.<88.<<;4<<<<<<<4<.<<<<7<<<
+@EAS54_71:4:72:63:435
+CCTTGCAACAACCTTGAGAACCCCAGGGAATTTG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<;<;;39:7:7
+@EAS54_71:4:72:63:435
+TGATATCTGGATTCTGGGAAATTCTTCATCCTGGA
++
+::<;<<<<;;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_71:4:73:182:444
+AACTTCCCTGGAGGTCTGATGGCGTTTCTCCCTCG
++
+:1<4;;::<<;<<<<;<<<<<<<<<<<;<<<<<<<
+@EAS54_71:4:73:182:444
+CTTGATTTACTTGTTGTTGGTTTTCTGTTTCTTT
++
+<<<<;;<<<<<<<<<<<<;<;<<<<<:<<<<<7<
+@EAS54_71:5:153:543:671
+GCCCCATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTGCTG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<2<<7
+@EAS54_71:5:153:543:671
+TAAAATGTCTATTTTTGTCTTGACACCCAACTAAT
++
+;;;;;=;==================;=========
+@EAS54_71:5:16:434:204
+AGATGAGAGAGAACTTCCCTGGAGGTCTGATGGC
++
+<:7:<<<<<<<<<<<9<<<+<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_71:5:16:434:204
+CTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTGTTGTTGGT
++
+=================;)===8===:==7;<+%;
+@EAS54_71:5:81:685:141
+ACTGAACCTATGAGTCACAGGTATTCCTGAGGAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<;<<<',7,7
+@EAS54_71:5:81:685:141
+AGATATGTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACAT
++
+;+;(;)..=3.1=.7=;=8;==<4====;======
+@EAS54_71:6:172:896:83
+AGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGATGTGTGT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<:;;+;<<<<<<<<9;;;
+@EAS54_71:6:172:896:83
+CATTTGCCTTCAGACCCTACACGAATGCGTCTCTA
++
+;<.5.;;<+;<<<<<<<4<<<<<<<;<<<<<;<<<
+@EAS54_71:6:215:133:909
+TGTGTGTTCTCATCAACCTCATACACACACATGG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<996(
+@EAS54_71:6:215:133:909
+TTGCCTTCAGACCCTACACGAATGCGTCTCTACCA
++
+7758;<;<;8<<<<;<;<<<<<:;<<<<<<<<<<<
+@EAS54_71:6:224:932:942
+CTCTTGAAAGCTTGGGCTGTAATGATGCCCCTTGG
++
+<;<<;;<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_71:6:224:932:942
+GTCCATGTACACACGCTGTCCTATGTACTTATCA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<7<<(;3,
+@EAS54_71:6:228:354:203
+AATGGACCTGTGATATCTGGATTCTGGGAAATTC
++
+88<<<8<<<<<<<<<8<<<<<<<<<4<<<4/9/;
+@EAS54_71:6:228:354:203
+TCAACCTCATACACACACATGGTTTAGGGGTATAA
++
+%1<851<5<<<982<<<<<<<<::<<<<7<<<<3<
+@EAS54_71:6:264:705:89
+AAACATATGCACCTAACACAAGACTACCCAGATTC
++
+<(<2<&<)<<<7<8<<<<<<<<<<.<<<<<<<<<<
+@EAS54_71:6:264:705:89
+AAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAACAGAA
++
+<<<<<<<<<<;8<<<<<<<<<<<<<<<&<<,;;(
+@EAS54_71:6:324:515:230
+AAAACAGTCTAGATGAGAGAGAACTTCCCTGGAG
++
+7<<1<<<7<+<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_71:6:324:515:230
+CCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTGTTGTTGG
++
+<<;<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<8<<<4<<4<<34
+@EAS54_71:6:82:932:400
+GACACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAAAACAGTC
++
+<<;<<72<<7<<<<<<<<<<;<<<+7<<<<<<<<<
+@EAS54_71:6:82:932:400
+GTAATCTCTCTCCTCTTCGCTGCATCCCTGTCTT
++
+<<<<<<8<1<<<<8+<<&<<<8<<<<<<<+(,/8
+@EAS54_71:7:130:260:553
+AGCAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTATAAAGGAA
++
+<*;<<7<);<<;9;<5<*<9<;<<;;<7<<<<<1<
+@EAS54_71:7:130:260:553
+GTGAGAAGTTTGGAAAAACTATTTGAGGAAGCAC
++
+<<<<<1<<<<<<<<<<6<<81</<4*2;7:+90(
+@EAS54_71:7:194:867:616
+ATCCATGTAACAAATCTGCGCTTGTACTTCTATT
++
+<8<<<<<<<<<<<8<<4<<<<<<8<<3<<5<&(+
+@EAS54_71:7:194:867:616
+TTTTCCACTTTGGAAAACAATTTGGTAATTTCGTT
++
+38:;;:<:<<<<;<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<
+@EAS54_71:7:212:329:348
+AACCACACATTAATACTATGTTTCTTATCTGCAC
++
+8<6:<:<<<;<<<;<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_71:7:212:329:348
+CCCATCATGAAGCACTGAACTTCCACGTCTCATCT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:;;;<
+@EAS54_71:7:250:698:842
+AAAAAGTACAAAACTCACAGGTTTTATAAAACAA
++
+)<<<<<<<-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_71:7:250:698:842
+AAGAAAAAAAAACCTGTCAAACACGAATGTTATGC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;<24
+@EAS54_71:7:80:760:490
+CATGGCTGATTATGAAAACAATGTTCCCCAGATAC
++
+%::::+<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_71:7:80:760:490
+CTGGACCCTGAGAGATTCTGCAGCCCAGCTCCAG
++
+<<<<<<<<<<8<;<7<<<<<<;<;;<2<;<<<1,
+@EAS54_71:7:97:743:602
+AAGCAAATGCTAAGATAATTCATCATCACTAAACC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<:
+@EAS54_71:7:97:743:602
+ATTACAACAGGAACAAAACCTCATATATCAATAT
++
+<(&<:<<&<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_71:8:105:854:975
+ATTTAACAAAAGTAAATAAAACACATAGCTAAAAC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7:<;;;;5
+@EAS54_71:8:105:854:975
+TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTG
++
+<<<<;<:<<;<&<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_71:8:113:856:319
+AAATCAACAACAGTAAAATAAAACAAAGGAGGT
++
+<<<77<<:<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_71:8:113:856:319
+CCCACTTAAGAGATATAGATTGGCAGAACAGATTT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<<
+@EAS54_71:8:215:830:609
+AAGACATCTAAATGAAAGAGGCTCAAAGAATGC
++
++<)<:<<:<<<<<<<<<9<<<<<;<<<<<<<<<
+@EAS54_71:8:234:21:950
+TTTTTTTTTTTTCTCCTCTCTTTTTTTTTTTTT
++
+<<<<<<<<<&<;2;&-<,<+;<<<7<<<;<;<;
+@EAS54_71:8:321:642:388
+TACCAAATGTGTTTATTACCAGAGGGATGGAGG
++
+19<<<<<8<<<<<<<<;<<<<<<<<<<7<<<<<
+@EAS54_71:8:321:642:388
+TCCCATTTGGAGCCCCTCTAAGCCGTTCTATTTGT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<6<<<8;
+@EAS54_71:8:38:856:336
+AATGGACCTGTGATATCTGGATTCTGGGAAATT
++
+<<<<<<<<<<<;;<;<;<:69<<;<5-500373
+@EAS54_71:8:38:856:336
+CACACATGGTTTAGGGGTATAATACCTCTACATGG
++
+2;4;4<:;6:5:<<;:;<<;<<;<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_73:3:203:419:243
+GGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAACTAT
++
+;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_73:3:203:419:243
+TTGAAAGCTCTAACAATAGACTAAACCAAGCAGAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<9<;<8<<<;<<<;<<<4<77
+@EAS54_73:3:239:796:221
+ATAACTATGAAGAGACTATTGCCAGCTGACCCCCC
++
+<<<7<<7<<7<<7<;<<<<<,;;,+'<+/+99%:'
+@EAS54_73:3:239:796:221
+GGAAGAACAGCTTAGGTATCAATTTGGTGTTCTGT
++
+;;<<;<<;<<<+:<<<4<4<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_73:3:23:502:103
+AGTCCCTGCCCCATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTT
++
+<2<<<<<<<<<<.<<<<<<<:1&:<<<7<<<<<<:
+@EAS54_73:3:23:502:103
+GACACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAAAACAGTC
++
+4:386:6<:::<:<:4:+<::4<<<6<<<<<<<66
+@EAS54_73:3:29:833:612
+AAGCTCTAACAATAGACTAAACCAAGCAGAAGAAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;;<<;;
+@EAS54_73:3:29:833:612
+CAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGT
++
+<<;<<<;<::<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_73:3:313:827:992
+AAAGTCTCAGGGAGCCGTCCGTGTCCTCCCATCTG
++
+<<<<6<<<<:<<<<<66<<<:33:<<<80<;6<8+
+@EAS54_73:3:313:827:992
+TGTTTCTTTGTTTGATTTGGTGGAAGACATAATCC
++
+'187:1'<75<.*<<:5<..<<*<<917<<7<<17
+@EAS54_73:3:37:761:635
+CCTCTTCTTCCAAAGATGAAACGCGTAACTGCGCT
++
+<6<<<<<<6<<<<<<<<<<<<<<<<<8<8<<4<4<
+@EAS54_73:3:37:761:635
+TGTGAGCCATCACAATGAACAACAGGAAGAAAAGG
++
++37:<088<+<<;<<;<<<<<;<<;<<<<<<<<<<
+@EAS54_73:3:4:854:140
+CCTGACAAGCAAATGCTAAGATAATTCATCATCAC
++
+:9':<;<<<;<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_73:3:4:854:140
+GTCATCTATAAAGGAAATCCCATCAGAATAACAAT
++
+<<<6<<<:<6<<<:36:<<<<3<<8:.6<38::4<
+@EAS54_73:3:88:24:744
+GTCCTGTGATATCTGGATTCTGGGAAATTCTTCAT
++
+4%++88;-9<;<<<+8<<<:<;8:<<<<<<<<<<<
+@EAS54_73:3:88:24:744
+TGTCAATGTCAGGGAAGGAGCATTTTTGAAGTTTA
++
+<7*:<<::.'<<<<:<<:<<'<63'6+'303*%%+
+@EAS54_73:5:145:635:390
+TAAACCAGTCCTATAAGAAATGCTCAAAAGAATTG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<8<<<::;;;
+@EAS54_73:5:145:635:390
+TTGAATAAAAAGGGATTAAATTCCCCCACTTAAGA
++
++9;<<;<<<<<;;;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_73:5:169:714:644
+CCTAATTGGTACAATGTACAATATTCTGATGATGG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;<
+@EAS54_73:5:169:714:644
+GAAAAAAGTAAACTCTCAAATATTGCTAGTGGGAG
++
+;<<<<<<;<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_73:5:220:733:736
+CCATCCTACTAAATACATATGCACCTAACACAAGA
++
+:;<77;<<9<<<<<9;<<<<<<;<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_73:5:220:733:736
+TTAATAAAGACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<5<<;9
+@EAS54_73:5:231:339:551
+CTGAGAGATTCTGCAGCCCAGATCCAGATTGCTTG
++
+<;<<;<<<<<<<<<<;:<<<<<<<<<<<<<;<<<<
+@EAS54_73:5:231:339:551
+TGTCAGTTACCAAATGTGTTTATTACCAGAGGGAT
++
+<<<<<<;<<<<<<;<<<<<<<<<<;5<<46;<;:1
+@EAS54_73:5:255:796:239
+AAGGGATTAAATTCCCCCACTTAAGAGATAGAGAT
++
+<<3;;<7:<<<;(7<<7;<<;<<<<<<<<<7<<<<
+@EAS54_73:5:255:796:239
+ATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAAAGT
++
+<<<<<<<<6<<<<<<<<<<<<<<<<;6<<<:<:<<
+@EAS54_73:5:263:557:988
+AATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGATATAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<<<<<<<;<<<
+@EAS54_73:5:263:557:988
+CTGCTACTCAATATATCCATGTAACAAATCTGCGC
++
+1-41:<15+<<<<<<599<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_73:5:271:874:367
+AAAAAACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCT
++
+<<<<<<5;<<<:<<<;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_73:5:271:874:367
+ATATGTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACATTA
++
+<<<<<<<<<<<<<<4<;<;<:<;4<4<<99<7<+%
+@EAS54_73:5:3:233:911
+GTCTCATCTAGGGGAACAGGGAGGTGCACTAATGC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_73:5:3:233:911
+TGGCTGATTATGAAAACAATGTTCCCCAGATACCA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<;<;<<;<
+@EAS54_73:5:44:498:945
+ATAGGGATGGAGGGAAGAGGGCCGCTGAAGAACTT
++
+<%*50<7<4<<<7<,<<.<8/,9<:</<<<;<;<<
+@EAS54_73:5:44:498:945
+CCTATAAGCCGTTCTATTTGTAATGAAAACTATAT
++
+;<;<<<<<<<<<<9<;<:<<<<<<:<<<<;:;<3<
+@EAS54_73:5:53:61:31
+AAGAAACTCATTAATAAAGACATGAGTTCAGATAA
++
+<<<7;<7<<<;7<;;<7<7<7<;5<73<<</%;/;
+@EAS54_73:5:53:61:31
+CAATTCAGCAAGAAGATATAACCATCCTACTAAAT
++
+5;;<95<<5<<<<<<<<<<:5;<<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_73:7:134:243:630
+ACATTACTACCCTGCAATTAATATAATTGTGTCCA
++
+63<;37:<*&:<<<,,*<<:7<<7<<<<<<<::<<
+@EAS54_73:7:134:243:630
+TCATCTAGGGGAACAGGGAGGCGCACTAATGAGCT
++
+<<<:<<<<</<<<-<<<<6/<-<:<5+<::-2</2
+@EAS54_73:7:200:65:291
+CAATACTCACCATCATAAATACACACAAAAGTACA
++
+<<<<1<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<8<<<<:<;<
+@EAS54_73:7:200:65:291
+CTAACTATATGCTGTTTACAAGAAACTCATTAATA
++
+;9<;3<<9<7<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_73:7:223:440:667
+AATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGATT
++
+<<;;<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_73:7:223:440:667
+TTCAGAACTTGAAGACAAGTCTCTTATGAATTAAC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<;<<<<;;
+@EAS54_73:7:254:572:431
+AAGAGATATAGATTGGCAGAACAGATTTAAAAACA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<99;;;;;
+@EAS54_73:7:254:572:431
+ATCAGATAAAGCACACTTTAAATCAACAACAGTAA
++
+<63<;<;<<<:7<:<7;<:<<<<:<<<<7<<<<:<
+@EAS54_73:7:63:854:610
+AATTTGGTGTTCTGTGTAAAGTCTCAGGGAGCCGT
++
+:.5;2<:88<<72:<<;<<7<8;<;/<<<<<<<<<
+@EAS54_73:7:63:854:610
+GACTATTGCCAGATGAACCACACATTAATACTATG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;<<
+@EAS54_73:7:97:892:419
+AATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGCTA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_73:7:97:892:419
+GCAACTAGGTAAAAAATTAACATTACAACAGGAAC
++
+;8<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_81:2:128:394:455
+GTAATCTCTCTCCTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTC
++
+;=;9.=5=;=9====;;==================
+@EAS54_81:2:128:394:455
+TTAGGGAAGAACAGCTTAGGTATCAATTTGGTGTT
++
+======6==========;===9==;5===;==;==
+@EAS54_81:2:27:856:401
+ACCTCTACATGGCTGATTATGAAAACAATGTTCCC
++
+======6===;2==;===;=+=92=;5+=&556:6
+@EAS54_81:2:27:856:401
+TCATCTAGGGGAACAGGGAGGTGCACTAATGCGCT
++
+.'=.93======;;====;======;===;=;===
+@EAS54_81:2:280:512:316
+GGGAAGAACAGCTTAGGTATCAATTTGGTGTTCTG
++
+;9===;======;7==;;======;=====;====
+@EAS54_81:2:280:512:316
+TTACTGTCATAACTATGAAGAGACTATTGCCAGCT
++
+==<========6==4==6;;==:===;=2/:+8%6
+@EAS54_81:2:285:367:932
+ATAGACCCCCTTGCAACAACCTTGAGAACCCCAGG
++
+===========;======;=====;=======5==
+@EAS54_81:2:285:367:932
+GCGTAACTGCGCTCTCATTCACTCCAGCTCCCTGT
++
+9=5==;=;7===;==;===================
+@EAS54_81:2:317:72:221
+AAAAAAATTCTAAAATCAGCAAGAGAAAAGCATAC
++
+=========:======;==;===============
+@EAS54_81:2:317:72:221
+ATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGTC
++
+===========;=======;;:==6=;=====;==
+@EAS54_81:2:31:98:804
+CACGAATGCGTCTCTACCACAGGGGGCTGCGCGGC
++
+=======9===;============5=;9=;=;==&
+@EAS54_81:2:31:98:804
+CTTTACTGTCATAACTATGAAGAGACTATTGCCAG
++
+====;========7=====================
+@EAS54_81:2:49:330:699
+AAAGTTCAATACTCACCATCATAAATACACACAAA
++
+===/=;========;=;==================
+@EAS54_81:2:49:330:699
+TTTTGGACTTCTTAAAGAAAAAAAAACCTGTCAAA
++
+==;=================;======5;;;==5=
+@EAS54_81:2:5:491:391
+CCCTGCTCACAGTTTCTGCCCCCAGCATGGTTGTA
++
+-/+5-.&&:5+:92=6===========9=======
+@EAS54_81:2:5:491:391
+TTGGCATTTGCCTTCAGACCCTACACGAATGCGTC
++
+=========;===;==:4=========;3;==7;=
+@EAS54_81:6:11:801:386
+AAAGGGATTAAATTCCCCCACTTAAGAGATATAGA
++
+<<<<<<<<<<8<<<<<:4<::<854:5<:::;4+4
+@EAS54_81:6:11:801:386
+CACTATAAATCAACAACAGTAAAATAAAACAAAGG
++
+5<2:$6<<<38<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_81:6:122:589:134
+AAAACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCTAA
++
+;<;4<<538<<;<<;<<<<';,:<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_81:6:122:589:134
+ACAGACTTCATCAAGATATGTAGTCATCAGACTAT
++
+<<:<<:<:<<<<<:<8<<<<<<<:<::<<<4:<;;
+@EAS54_81:6:199:511:426
+AATTCTTCATCCTGGACCCTGAGAGATTCTGCAGC
++
+<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<:<<<<<<<<<;:<;
+@EAS54_81:6:199:511:426
+GGGGTATAATACCTCTACATGGCTGATTATGAAAA
++
+<:7:<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_81:6:204:779:181
+AACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGATG
++
+<<<<<<5<<:<<<<<8<<,<<<<<<<<<<91<91<
+@EAS54_81:6:204:779:181
+CTTTTGGCATTTGCCTTCAGACCCTACACGAATGC
++
+;:;/*<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_81:6:265:251:147
+AAAAGTACAAAACTCACAGGTTTTATAAAACAATT
++
+<<<<::<8<<<;<;8<8<<<<<<<<:<<<<<<<<<
+@EAS54_81:6:265:251:147
+TGTTATGCCCTGCTAAACTAAGCATCATAAATGAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<88<<<80:;<<<<<;:4;;:4
+@EAS54_81:6:273:424:207
+AAGAGATATAGATTGGCAGAACAGATTTAAAAACA
++
+<,<,<9<<9<<<<<<<<<<79<,599,<191<99+
+@EAS54_81:6:273:424:207
+TAAATCAACAACAGTAAAATAAAACAAAGGAGGTC
++
+;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_81:6:35:186:412
+ATAACCATCCTACTAAATACATATGCACCTAACAC
++
+<<<<<<<<4<<<<<:<<<<<<:<<<<<<<<<;;<:
+@EAS54_81:6:35:186:412
+CATGTAACAAATCTGCGCTTGTACTTCTAAATCTA
++
+<<4:6<;<&<:4<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_81:6:75:917:886
+ACTGGGCAATACATGAGATTATTAGGAAATGCTTT
++
+<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<71<<<:6<:8<
+@EAS54_81:6:75:917:886
+TTATCATGACTCTATCCCAAATTCCCAATTACGTC
++
+<<<<8<<<<<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_81:7:124:253:889
+CTAAGCATCATAAATGAAGGGGAAATAAAGTCAAG
++
+8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<
+@EAS54_81:7:124:253:889
+TCAGCAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTATAAAGG
++
+<<<<<<6<<:<<<<<<<<<<<<<;;<<;<<<<<<<
+@EAS54_81:7:166:979:531
+ATCCCACGCTTCCTATGGAAAGGTTGTTGGGAGAT
++
+81<<<3<*<<:<<<<<<<8<<<<<<<<<<<<:<<<
+@EAS54_81:7:166:979:531
+TGGTTCTCTTGAAAGCTTGGGCTGTAATGATGCCC
++
+<<</<<<<<<<<<9<<9<<;<7<<<<9<<<9<,)6
+@EAS54_81:7:226:869:36
+ATATATAAAGGAAATCCCATCAGAATAACAATGGG
++
+<0/)</<<<:<<<<<)<<7<<<<<+55<<1<<<:<
+@EAS54_81:7:226:869:36
+TGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTG
++
+:<<<<,:<;:.:<<:<<717,;2171717717116
+@EAS54_81:7:246:205:734
+CTCCAGGGAAGTTATCTCTCATCTAGANNNNNTTG
++
+<<<<<<:/<<<,6'</7;<-+9<<;<7!!!!!8<,
+@EAS54_81:7:246:205:734
+CTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTGTTGTTGGT
++
+<<<4<<6666<<6<:<<<3<<<:'<<:<<<<;6<+
+@EAS54_81:7:293:355:321
+GCTAGAGTCCCATTTGGAGCCCCTCTAAGCCGTTC
++
+<<<:<;<<<<<<<;<<<<<<<<<;<<;4<<<:+:<
+@EAS54_81:7:293:355:321
+TTACCAAATGTGTTTATTACCAGAGGGATGGAGGG
++
+<<4<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_81:7:324:472:791
+AAAGCCAATACTTTACTGCTACTCAATATATCCAT
++
+<<.)5*&;;11<<<,5<33:-<<6<<<<:<<<<<<
+@EAS54_81:7:324:472:791
+TGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGATATAACC
++
+<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<:3
+@EAS54_81:7:325:150:465
+AACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGATG
++
+<<:<<<<<<<<;<:<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_81:7:325:150:465
+TGATGCCCTCTTCTTCCAAAGATGAAACGCGTAAC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<3;;:
+@EAS54_81:7:74:596:137
+CTCTATCCCAAATTCCCAATTACGTCCTATCTTCT
++
+<<<<<<<<<</4<<<<<<*<:6<<<<<<<<;/3<<
+@EAS54_81:7:74:596:137
+GGTCCCTGCCCCATCGCTTGTAATCTCTCGCCTTT
++
++40778449779049'+*87489498949%89948
+@EAS54_81:8:130:912:658
+TACACACACATGGTTTAGGGGTATAATACCTCTAC
++
+<<<<<;<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<7<;;<
+@EAS54_81:8:130:912:658
+TCCCATCATGAAGCACTGAACTTCCACGTCTCATC
++
+;=;;;<<<<<=55=;==<=======<=========
+@EAS54_81:8:142:858:903
+ATGGTTGTACTGGGCAATACATGAGATTATTAGGA
++
+======;====5=======9======;===3=5=;
+@EAS54_81:8:142:858:903
+CTATCCCAAATTCCCAATTACGTCCTATCTTCTTC
++
+<<<<<;<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_81:8:14:360:580
+ACCCTACACGAATGCGTCTCTACCACAGGGGGCGG
++
+===========3===;5<==8;====79==.=5'5
+@EAS54_81:8:14:360:580
+ATGAGATTATTAGGAAATGCTTTACTGTCATAACT
++
+<,1<;<;;<<<<<1<<<;<7<<6<:;;<<<<<<;;
+@EAS54_81:8:159:71:155
+AAAGGTTGTTGGGAGATTTTTAATGATTCCTCGAT
++
+5;;9<<:<;:<<<<7<<7;<3<<<:<<<;<<<<<;
+@EAS54_81:8:159:71:155
+GTCCACACTGGTTCTCTTGAAAGCTTGGGCTGTAA
++
+=========;=<======;=:=3;==;=6<==;=;
+@EAS54_81:8:177:800:714
+CTAAATGAAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGAT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<;<;<<<<<;<
+@EAS54_81:8:177:800:714
+TTCTCAGCAGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGATTG
++
+=;3=+=<:=<========8================
+@EAS54_81:8:271:180:509
+AATACTCACCATCATAAATACACACAAAAGTACAA
++
+=============================='====
+@EAS54_81:8:271:180:509
+ATATAGATTGGCAGAACAGATTTAAAAACATGAAC
++
+<<<<<<<<<9<:<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS54_81:8:40:925:442
+GAGGTTCAGAACTTGAAGACAAGTCTCTTATGAAT
++
+;<;<<<<<<<<<<<3;<7;:<;;<<<;<<:<32<<
+@EAS54_81:8:40:925:442
+TTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCT
++
+=;=================================
+@EAS54_81:8:41:530:663
+AGAACAGATTTAAAAACATGAACTAACTATATGCT
++
+=8=;*=5==;;=====:=====;===;========
+@EAS54_81:8:41:530:663
+ATACTCACCATCATAAATACACACAAAATTACAAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7;;;;<<
+@EAS54_81:8:63:930:152
+ACTGGTTCTCTTGAAAGCTTGGGCTGTAATGATTC
++
+<<<<;<<<<<<<7<<;::<<)726;)<99<)&;&+
+@EAS54_81:8:63:930:152
+ATCCCACGCTTCCTATGGAAAGGTTGTTGGGAGAT
++
+;:4:8;:::;=:8;=;========;=:========
+@EAS54_81:8:78:735:536
+TTTTTTTTTTTTTCATTTCTCTTTTTTTTTTTTTT
++
+;9<<<<<<<.7<9'%1<<)2::<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_53:1:124:243:35
+GCATATCCAGATTGCTGGTGGTCTGACAGGCAGCA
++
+&+<+;<694;+&99<<2<;423<26<-<<<<,<3<
+@EAS56_53:1:124:243:35
+TGTGTTTATTACCAGAGGGATGGAGGGAAGAGCGA
++
+<<<<<;;<<<<<<:<<<.<<<:++5+:1(;1;$<(
+@EAS56_53:1:154:118:488
+AAAAGCATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCATC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:7<<<<7<:;;::
+@EAS56_53:1:154:118:488
+AAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGCTAAGA
++
+<<<;58<<95:<<;<;<<<;<<<;;<<<<<<<<<<
+@EAS56_53:1:23:403:981
+TACTGTCATAACTATGAAGAGACTATTGCCAGATG
++
+<8<<<;<<<<<<;<<<<<<8;<<<9<9,3;,6(91
+@EAS56_53:1:23:403:981
+TCTTCATAGGGAAGAACAGCTTAGGTATCAATTTG
++
+(;3+<&3<</7<<<<<<;<<<<<<<<<<<<</<2<
+@EAS56_53:1:47:303:887
+ACATTACTACCCTGCCATTAATATACTTGTGTCCA
++
+<<;;<+<9<<<<<9<(6<;//</<8(<<89;6084
+@EAS56_53:1:47:303:887
+CACACTGGTTCTCTTGAAAGCTTGGGCTGTAATGA
++
+<;<6<;<;<8<<<8<<<<;<<<.<<<<<<<8<8;<
+@EAS56_53:1:92:875:345
+AAATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAAA
++
+<<<;<.;7<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<
+@EAS56_53:1:92:875:345
+CGGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGATTGGATCTAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_53:2:170:265:818
+GAGGGGAAGCTTTCAACGCTTCTAGCACTTTCTTT
++
+<<<<<(5/959<8.<9<8<<<2<&59&&:22:8+(
+@EAS56_53:2:170:265:818
+TTCTCACAGTTTCTGCCCCCAGCATGGTTGTACTG
++
+3+;%;.;;<<9+;3;;;<<<;57<1<;<<<<<<<;
+@EAS56_53:2:59:286:290
+AAAGGAAATCCCATCAGAATAACAATGGGCTTCTC
++
+<<<<<<<<;<<<;<<<<<<<<<<<<<;;;<<;7;<
+@EAS56_53:2:59:286:290
+TCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGCTAAGATAAT
++
+77<<<<7<<<97<<,7<<<;<<<;<9<<<<<<<<<
+@EAS56_53:3:101:809:776
+GTACTTCTAAATCTATAAAAAAATTAAAATTTAAC
++
+<<<-<;7;<<<<:;<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_53:3:101:809:776
+TATGCACCTAACACAAGACTACCCAGATTCATAAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<
+@EAS56_53:3:107:738:484
+GGTCATCATACAATGATAAAAAGATCAATTCAGCA
++
+.8/<<<7<8<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<
+@EAS56_53:3:107:738:484
+TGAACTAACTATATGCTGTTTACAAGAAACTCATT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<
+@EAS56_53:3:126:558:408
+TTCTATTTGTAATGAAAACTATATTTATGCTATTC
++
+<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<7<;<<;;
+@EAS56_53:3:126:558:408
+TTTATTACCAGAGGGATGGAGGGAAGAGGGACGCT
++
+<:<<:;;<<<<<<<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_53:3:134:126:465
+AAAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAACTATTTGAGGAA
++
+<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<5<<:<<41
+@EAS56_53:3:134:126:465
+AAATCAGCAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTATAA
++
+<<;:&<3)<<7<:<<<<.:<<<<<8<<<<<<<<<<
+@EAS56_53:4:130:568:978
+TAAATATAGAAATTGAAACAGCTGTGTTTAGTGAC
++
+7<<;<<;<7<:;<7<<<<<<<<);4;+<7+3+%;<
+@EAS56_53:4:130:568:978
+TGAAACGCGAAACTGCACTCTCATTCACTCCAGCT
++
+--;066;;62<<<2&<+<+<2;<<2<<<;<<<7<<
+@EAS56_53:4:153:977:200
+TCATCAACCTCATACACACACATGGTTTAGGGGTA
++
+1:<83<<9;;9<<9;;<<;<<;;;;<;;<<<<<<;
+@EAS56_53:4:153:977:200
+TGTCACCCAATGGACCTGTGATATCTGGATTCTGG
++
+;<<;<<<<7<<;;;;;<<6<<<<<86;;8<;8;6;
+@EAS56_53:4:154:762:630
+AGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGATGTGTGTT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;
+@EAS56_53:4:154:762:630
+CCTTCAGACCCTACACGAATGCGTCTCTACCACAG
++
+<<-::<91<<<<;<;<<<<;<<<<<<<<;<<<<<<
+@EAS56_53:4:168:528:288
+CAGGCTGCAACTGTGAGCCATCACAATGAACAACA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<;<<;
+@EAS56_53:4:168:528:288
+GCTCCCCAGAGGGAAAGCTTTCAACGCTTCTAGCC
++
+8<%<31;<<;<;<<<<<<<;<<<<<<<<<<;<<<<
+@EAS56_53:4:45:707:147
+AAAAATTCTAAAATCAGCAAGAGAAAAGCATACAG
++
+<<<<<<;3<<<<<4;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_53:4:45:707:147
+ATGAGTCACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAG
++
+<<<<<<<<<<<<&<<<<:<<9<<<9<<<<75;;;<
+@EAS56_53:6:180:695:621
+ATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCATCAGAATA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;::<<<
+@EAS56_53:6:180:695:621
+TACTGAAAAGCAAATGCTAAGATAATTCATCATCA
++
+;&377<&<<;7<<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_53:7:22:22:934
+ATTTGTCTGAGCAAAACAGTCTAGATGAGAGAGAA
++
+<+72::72<<60<<<<<<<96<<<<0<<<<1<<<<
+@EAS56_53:7:22:22:934
+CTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTG
++
+<<<<<<<<<<<6<<<;<<<;84;<<48;<;6;<;)
+@EAS56_53:8:122:430:882
+CCTACTAAATACATATGCACCTAACACAAGACTAC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:;
+@EAS56_53:8:122:430:882
+CTATAAAAAAATTAAAATTTAACAAAAGTAAATAA
++
+0<<:<<<<<<<:3<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_53:8:179:549:753
+TACTACCCTGCAATTAATATAATTGTGTCCATGTA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<7<<<:<9<<
+@EAS56_53:8:179:549:753
+TGTCCTCCCATCTGGCCTCGTCCACACTGGTTCTC
++
+:77<</<<<::<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_53:8:28:701:724
+TGGACCCTGAGAGATTCTGCAGCCCAGCTCCAGAT
++
+.;..3;8.8<8;<<;9<9<<<7;<<<<<<<<7<<7
+@EAS56_53:8:28:701:724
+TTTTGTCAGTTACCAAATGTGTTTATTACCAGAGG
++
+<<<<<<7<<<<<<7::<:<<-<<::::::<747::
+@EAS56_57:1:122:38:103
+ATAAAACAATTAATTGAGACTACAGAGCAACTAGG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<3<<<<9<8;<
+@EAS56_57:1:122:38:103
+GAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTAC
++
+===;3<===:=======<=================
+@EAS56_57:1:125:884:276
+TTGCAAGACAGACTTCATCAAGATATGTAGTCATC
++
+<<<<<<<<<<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<;
+@EAS56_57:1:125:884:276
+TTTGGACTTCTTAAAGAAAAAAAAACCTGTCAAAC
++
+,;;3,<7<;7<<===;============;======
+@EAS56_57:1:189:130:136
+ATTTAGACATCTAAATGAAAGAGGCTCAAAGAATG
++
+==<<=================<<====<<=;=6==
+@EAS56_57:1:189:130:136
+GGCTTCTCAGCAGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGA
++
+823;23<7<57<7<<<<<;<<;<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_57:1:189:503:110
+ATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTGGA
++
+=;;6:==============================
+@EAS56_57:1:189:503:110
+CTAACAATAGACTAAACCAAGCAGAAGAAAGAGTT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<
+@EAS56_57:1:228:182:717
+GGTCTGACAGGCTGCAACTGTGAGCCATCCCCATG
++
+<=9============5==5=<,59<=1=<&;&;;7
+@EAS56_57:1:228:182:717
+TCTTACTTCCAGCTCCCCAGAGGGAAAGCTTTCAA
++
+778;8;474<<<;2;;<2<<<<<<<<;<;;9<<<<
+@EAS56_57:1:278:440:902
+AAGCACTGAACTTCCACGTCTCATCTAGGGGAACA
++
+=========<==<==============:;;=;=;;
+@EAS56_57:1:278:440:902
+ATACTATGTTTCTTATCTGCACATTACTACCCTGC
++
+<;7;4<;<;;;<<;<;;;<<<<<9<<<;<<<<;<<
+@EAS56_57:1:288:384:444
+TAACTTTGAATAAAAAGGGATTAAATTCCCCCACT
++
+;=9;;<====<=;=/=9;<========<=======
+@EAS56_57:1:288:384:444
+TCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;;;
+@EAS56_57:2:158:909:321
+ATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCATCAGAATA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_57:2:158:909:321
+TTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<
+@EAS56_57:2:178:192:499
+GTGAGCCATCACAATGAACAACAGGAAGAAAAGGT
++
+<<<<<<<;<1<<<<<<;<<;6<<3666;;;;;/6/
+@EAS56_57:2:178:192:499
+TCTAGCCATTTCTTTTGGCATTTGCCTTCAGACCC
++
+86<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_57:2:206:873:186
+ACAATAGACTAAACCAAGCAGAAGAAAGAGGTTCA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:;53
+@EAS56_57:2:206:873:186
+GTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTG
++
+;<<;--7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_57:2:236:841:20
+AAAGGAAATCCCATCAGAATAACAATGGGCTTCTC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<<:<<9<<<<;<:<9
+@EAS56_57:2:236:841:20
+GCTAAGATAATTCATCATCACTAAACCAGTCCTAT
++
+7;<<<;<<<<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<
+@EAS56_57:2:237:855:581
+CTAAACGCCCATACTTTACTGCTACTCAATATATC
++
+/+<<<&)2;66;/;;+<;;3133<3<3;9;<999<
+@EAS56_57:2:237:855:581
+TACAATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGATA
++
+<;4<7<<<;47<<74<:*<<2:<<7.799:2<<9:
+@EAS56_57:2:23:268:529
+TGAAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACATT
++
+7;<<<<<<57;-<<<<<<:<77<<<<<<<;<;<<<
+@EAS56_57:2:259:42:969
+GCTGTAATGATGCCCCTTGGCCATCACCCGGTCCC
++
+<<<<<;<<;<<3<<<;9<36<<29;<<;;;</;<2
+@EAS56_57:2:259:42:969
+GGAAAGGTTGTTGGGAGATTTTTAATGATTCCTCA
++
+<<<6<<<<<<-<<<<<<;<<;<6<<<<<<<;<<<<
+@EAS56_57:2:262:297:601
+TGGACCTGTGATATCTGGATTCTGGGAAATTCTTC
++
+<<<<;<<9<<57<<7<<<;<<;77-;;53<<;;<7
+@EAS56_57:2:262:297:601
+TGTTCTCATCAACCTCATACACACACATGGTTTAG
++
+;;<26;;;<;<7;<<<<<99<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_57:2:284:597:682
+AAAAAAAAACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCT
++
+<<<<<<<<9;;7<;:<<<:<;<<<<<<<<;<<<<;
+@EAS56_57:2:284:597:682
+TTCATCAAGATATGTAGTCATCAGACTATCTAAAG
++
+<<<<<<<9<<<<<;<<6<<<<<;<9<<<<<<1;;9
+@EAS56_57:2:44:153:969
+AAAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAACTATTTGAGGAA
++
+*:::7<77<:<<<<:<<(597:<:<9//7<529/0
+@EAS56_57:2:44:153:969
+AAAAGCATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCATC
++
+<<5<:7<72<51<7<*79<<<<<5<<<<<<<<<2<
+@EAS56_57:3:112:729:591
+ATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGATTT
++
+;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_57:3:112:729:591
+GAAGAAAGAGGTTCAGAACTTGAAGACAAGTCTCT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_57:3:119:761:239
+CGTCTCTACCACAGGGGGCTGCGCGGTTTCCCATC
++
+<<<<<<<<<<<<6<<<<<<;<2<<<<;<<<<<;;<
+@EAS56_57:3:119:761:239
+TGAAGAGACTATTGCCAGATGAACCACACATTAAT
++
+;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_57:3:285:489:327
+AATAGACTAAACCAAGCAGAAGAAAGAGGTTCAGA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<
+@EAS56_57:3:285:489:327
+CTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAA
++
+9;;<<8<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<;<
+@EAS56_57:3:319:174:811
+CACTGGTTCTCTTGAAAGCTTGGGCTGTAATGATG
++
+;7;3<<3.<<<<<<<<<<<4<<<<<<<<<<<<<0<
+@EAS56_57:3:319:174:811
+TTATCTGCACATTTCTACCCTGCAATTAATATAAT
++
+<<<<<<<<<;<<<<<<<<<;;<<<<<<<8<<;9<<
+@EAS56_57:3:41:739:907
+CAGAAGAGATTGGATCTAATTTTTGGACTTCTTAA
++
+;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_57:3:41:739:907
+GAATGCCAGGAAGATACATTGCAAGACAGACTTCA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<9<<<;;;;;
+@EAS56_57:3:81:786:340
+TACTATGTTTCTTATCTGCACATTACTACCCTGCA
++
+;<;<<<;<<;<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_57:3:81:786:340
+TCCACGTCTCATCTAGGGGAACAGAGAGGTGCACT
++
+<<<<7<<<<<<<<<<<<<<7<<;<&<<;;7<7;;;
+@EAS56_57:4:233:478:792
+GCCTTCAGACCCTACACGAATGCGTCTCTACCACA
++
+6<;9:<<9-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_57:4:233:478:792
+GTGTTCTCATCAACCTCATACACACACATGGTTTA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<+<<<<<<<9<<<+;;;
+@EAS56_57:4:262:965:756
+AGGGAGGTGCACTAATGCGCTCCACGCCCAAGCCC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;:<9;<
+@EAS56_57:4:262:965:756
+TTAATATAATTGTGTCCATGTACACACGCTGTCCT
++
+<<:<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_57:4:71:707:568
+CTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<;<;<
+@EAS56_57:4:71:707:568
+GTCTAGATGAGAGAGAACTTCCCTGGAGGTCTGAT
++
+;9;<;<<<<<;<<<<<;<<<:<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_57:4:98:862:154
+AAAGATCAATTCAGCAAGAAGATATAACCATCCTA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<:99<;
+@EAS56_57:4:98:862:154
+TGCTACTCAATATATCCATGTAACAAATCTGCGCT
++
+856:;7<:<<9<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_57:5:105:521:563
+TATGTACTTATCATGACTCTATCCCAAATTCCCAA
++
+;<)<9995<9<<59<7<<<<7<7<35,0,544<3(
+@EAS56_57:5:105:521:563
+TGTAATGCTGCCCCTTGGCCATCCCCCGGTCCCTG
++
+/8)-8/6(98<967<3<<979<<1<<<7<<<<7<<
+@EAS56_57:5:136:389:320
+TCCTATGTACTTATCATGACTCTATCCCAAATTCC
++
+.5:,666<)<8<:<<:66<<<<<<<<<<5<<7<<<
+@EAS56_57:5:136:389:320
+TTCTGCCCCCAGCATGGTTGTACTGGGCAATACAT
++
+7<<<<<;<<7<6<<;;<;<;;677<6;(27;<(97
+@EAS56_57:5:145:383:182
+AAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACATCT
++
+<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_57:5:145:383:182
+TTGAAGACAAGTCTCTTATGAATTAACCCAGTCAG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:;;;<;
+@EAS56_57:5:207:926:427
+GGGAAGAACAGCTTAGGTATCAATTTGGTGTTCTG
++
+;;7<<;4<<<2<<;<<<<<<<<<<7<;<<<<<<<<
+@EAS56_57:5:207:926:427
+TAGGAAATGCTTTACTGTCATAACTATGAAGAGAC
++
+<<<<<<7<<<<<;<<<<<6:<;<6<&<58<<6:::
+@EAS56_57:5:214:644:390
+AAAAACATGAACTAACTATATGCTGTTTACAAGAA
++
+<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;
+@EAS56_57:5:214:644:390
+AAATAAAACAAAGGAGGTCATGATACAATGATAAA
++
+<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<&<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_57:5:24:284:360
+AGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACATGAAGGAAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<;<9;<;99;;
+@EAS56_57:5:24:284:360
+CTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCTAAACTAA
++
+:;<;:<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<<<<<<
+@EAS56_57:5:266:133:789
+AAAAAATTAACATTACAACAGGAACAAAACCTCAT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<
+@EAS56_57:5:266:133:789
+GTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAACAGAAACCAAA
++
+9;;<<<<<<<<<<<<5<<;<5<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_57:5:303:542:924
+AATAAAACAAAGGAGGTCATCATACAATGATAAAA
++
+<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;
+@EAS56_57:5:303:542:924
+CAATGTACAATATTCTGATGATGGTTACACTAAAA
++
++<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_57:5:309:109:987
+AACAAATACTACTAGACCTAAGAGGGATGAGAAAT
++
+<<<<<<:<<;<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_57:5:309:109:987
+GAGAGAAGGAGTAGCTATACTTATATCAGATAAAG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<;<;;;
+@EAS56_57:5:30:788:376
+ACGTCTCATCTAGGGGAACAGGGAGGTGCACTAAT
++
+<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<:<;<<(<7;7;:(;
+@EAS56_57:5:30:788:376
+TGTTTCTTATCTGCACATTACTACCCTGCAATTAA
++
+:5<<4:88;9<<<<<;<<<<;<8<;<<<<1<<<<<
+@EAS56_57:5:324:728:956
+ATTTGTCAATGTCAGGGAAGGAGCATTTTGTCAGT
++
+<;;;;5;<<0<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<
+@EAS56_57:5:324:728:956
+TGCTGGCAAGCTAGAGTCCCATTTGGAGCCCCTCT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<<<:<::;;;;<:<
+@EAS56_57:5:53:544:889
+AGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACATTGCAAGA
++
+<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<;<<
+@EAS56_57:5:53:544:889
+GCTTCTCAGCGGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGAT
++
+,<;<<<;<<<<<<<<<:;;<<<<<;;<<<<<<<<<
+@EAS56_57:5:71:994:576
+AAGATAATTCATCATCACTAAACCAGTCCTATAAG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<5<<<<<<<<
+@EAS56_57:5:71:994:576
+TAGGTAAAAAATTAACATTACAACAGGAACAAAAC
++
+<<9;;<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_57:6:145:144:796
+ATTTGGTGTTCTGTGTAAAGTCTCAGGGAGCCGTC
++
+<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<;<<<<<<4;4;<;/
+@EAS56_57:6:145:144:796
+GGTTTTCTGTTTCTTTGTTTGATTTGGTGGAAGAC
++
+;<<<;<<<<<<<<<;<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_57:6:157:643:175
+GGGATGGAGGGAAGAGGGACGCTGAAGAACTTTGA
++
+;<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_57:6:157:643:175
+TTCTATTTGTAATGAAAACTATATTTATGCTATTC
++
+<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<)<<<<;<
+@EAS56_57:6:175:289:351
+CATCCTACTAAATACATATGCACCTAACACAAGAC
++
+<<<<<<<<<<;<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<9<<<
+@EAS56_57:6:175:289:351
+TGCGCTTGTACTTCTAAATCTATAAAAAAATTAAA
++
+9;;:+<<<<<;<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_57:6:190:289:82
+AGGGGTGCAGAGCCGAGTCACGGGGTTGCCAGCAC
++
+<<<<<<;<<<<<<<<<<;<<;<<<<;8<6;9;;2;
+@EAS56_57:6:190:289:82
+CTCAAGGTTGTTGCAAGGGGGTCTATGTGAACAAA
++
+<<<7<<<;<<<<<<<<8;;<7;4<;<;;;;;94<;
+@EAS56_57:6:21:553:57
+AAATACTACTAGACCTAAGAGGGATGAGAAATTAC
++
+<<<<<<<<<<<;;<<<;<<;<<;<<<;;9<;<;<9
+@EAS56_57:6:21:553:57
+AACAAAAGTAAATAAAACACATAGCTAAAACTAAA
++
+<<+<<<<<<<<<;<<<<8<<<<<<8<<<<<;<<<<
+@EAS56_57:6:234:787:12
+AAGCTTGGGCTGTAATGATGCCCCTTGGCCATCAC
++
+;;.<;;994<;9<<;;;<<<<<<<7<<<<<<<<<;
+@EAS56_57:6:234:787:12
+ACACGCTGGCCTATGTACTTATAATGACTCTATCC
++
+<;<<<9<<&+9;3;<993;<9<+94;9&41;08%9
+@EAS56_57:6:325:759:288
+GCTGCTGGCAAGCTAGAGTCCCATTTGGAGCCCCT
++
+8<;<<<<81<<<<<;<<;<<<;9</;6;;809034
+@EAS56_57:6:325:759:288
+GGAGCATTTTGTCAGTTACCAAATGTGTTTATTAC
++
+9;<9<;<;;<;<;<;<<<:<;<<<;<<<<<;<<<<
+@EAS56_57:6:44:280:641
+AACCCCCTTGCAACAACCTTGAGAACCCCAGGGAA
++
+;<<<<<<<<<<66<;<<<<<;<<2;;;<<;;;;,;
+@EAS56_57:6:44:280:641
+TCATTCACTCCAGCTCCCTGTCACCCAATGGACCT
++
+9;<<9;9;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_57:6:4:223:776
+AGTAACTGAACCTATGAGTCACAGGTATTCCTGAG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<:;<;2<
+@EAS56_57:6:4:223:776
+TGTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACATGAAGG
++
+<;9<;<0<<;<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_57:7:159:125:297
+GCAAGCTAGAGTCCCATTTGGAGCCACTCTAAGAC
++
+<<<<<<<<<<<<<<;<<<;<;<<6;)<:9;26;39
+@EAS56_57:7:159:125:297
+GGAAGGAGCATTTTGTCAGTTACCAAATGTGTTTA
++
+89<;;8<<;<;<4<;<8<<<<;;8<<<<<<<<<<<
+@EAS56_57:7:247:522:670
+CTATCCCAAATTCCCAATTACGTCCTATCTTCTTC
++
+;;;9;:<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_57:7:247:522:670
+TACATGAGATTATTAGGAAATGCTTTACTGTCATA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<5;<<<;
+@EAS56_57:7:273:562:954
+AAAGTTCAATACTCACCATCATAAATACACACAAA
++
+;<<+;95<<<;5;<<;:<<;<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_57:7:273:562:954
+TTTTTGGACTTCTTAAAGAAAAAAAAACCTGTCAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;:;;;;
+@EAS56_57:7:287:258:321
+TAATACTATGTTTCTTATCTGCACATTACTACCCT
++
+<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<42:<+<<<;<<;;;;
+@EAS56_57:7:287:258:321
+TGTAAAGTCTCAGGGAGCCGTCCGTGTCCTCCCAT
++
+:.<9<)<;<9<.<<:<:+5:<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_57:7:33:954:724
+CCTAAGAGGGATGAGAAATTACCTAATTGGTACAA
++
+;<;<;<<-7;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;
+@EAS56_57:7:33:954:724
+TCAGATAAAGCACACTTTAAATCAACAACAGTAAA
++
+;<<<<<<<<<<<<<8<<<<:<;;<<;;<;<<;;;;
+@EAS56_57:7:57:826:977
+ATTGGATCTAATTTTTGGACTTCTTAAAGAAAAAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<+<<<<<<<<6<9:6<<<<<
+@EAS56_57:7:57:826:977
+TGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAAAGTT
++
+875:6<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<;8<<<<<<
+@EAS56_57:7:76:786:458
+GGAGCATTTTGTCAGTTACCAAATGTGTTTATTAC
++
+<<.<<<<2<<:84<:<<<:<8<<)<)429<2<<8<
+@EAS56_57:7:76:786:458
+TCTGGGAAATTCTTCATCCTGGACCCTGAGAGATT
++
+;<;:7<.<<<<<8;<<<<<<<6<;8<<<<<<<<<<
+@EAS56_57:8:72:44:435
+AAAAGCAAAAACAAAAACTATGCTAAGTATTGGTA
++
+<<<<;7;<<<<;<<<<<<<<<<;<<<;<<<<<<<<
+@EAS56_57:8:72:44:435
+ATTGGTACAATGTACAATATTCTGATGATGGTTAA
++
+<<<<<<<<<<<2;<;<<;<<<;<<8<82<;22<8&
+@EAS56_59:1:126:526:276
+GAACTTCTGTAATTGAAAAATTCATTTAAGAAATT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<
+@EAS56_59:1:128:584:952
+ATCATACAATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<+<;<<<<<<;<<<;<<<+<66
+@EAS56_59:1:128:584:952
+GCCCATACTTTACTGCTACTCAATATATCCATGTA
++
+7<;9;0:<<<:<<:<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_59:1:219:294:861
+CTGGTTCTCTTGAAAGCTTGGGCTGTAATGATGCC
++
+;,;<;<<<;&<<<<<<<5<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_59:1:219:294:861
+TATAATTGTGTCCATGTACACACGCTGTCCTCTGT
++
+<<<<<<<<<<<<<9<<<5<9<<<9<<544<<'<+:
+@EAS56_59:1:248:122:558
+AATGTACAATATTCTGATGATGGTTACACTAAAAG
++
+<<<<:<<<<<<<<<<<<<;<<<<:<6:4<<::6:6
+@EAS56_59:1:248:122:558
+GGAAAAAAGTAAACTCTCAAATATTGCTAGTGGGA
++
+<;<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_59:1:278:906:933
+AATATAATTGTGTCCATGTACACACGCTGTCCTAT
++
+<88::<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_59:1:278:906:933
+TTCTCACAGTTTCTGCCCCCAGCATGGTTGTACTG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<.
+@EAS56_59:1:82:670:302
+AGTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTACG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<5
+@EAS56_59:1:82:670:302
+TCCTACTAAATACATATGCACCTAACACAAGACTA
++
+%448<7<<<<<<7<<<<<&<<7<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_59:1:93:490:901
+AGAAAAGCATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCA
++
+<<<<<<<;<<<;<<<;<<;<<;<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_59:1:93:490:901
+GTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGA
++
+<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<;<<<<<:<<1+4-8
+@EAS56_59:2:104:402:732
+AAATCAGCAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTATAA
++
+=========================7=;===;=:=
+@EAS56_59:2:104:402:732
+AATGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_59:2:162:272:415
+ACATGAACTAACTATATGCTGTTTACAAGAAACTC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<9;<<<<<
+@EAS56_59:2:162:272:415
+ATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGATATAACCAT
++
+=7=======;5==<<6==1==<=============
+@EAS56_59:2:177:266:842
+ACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGATGT
++
+=====)===========8=====7882855355'5
+@EAS56_59:2:177:266:842
+GGCATTTGCCTTCAGACCCTACACGAATGCGTCTC
++
+<9<<6;9<;9;;<<<<;;;9<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_59:2:177:552:234
+ACGCTGTCCTATGTACTTATCATGACTCTATCCCA
++
+::;:=;=99=====;;====;==========<===
+@EAS56_59:2:177:552:234
+GCTCCACGCCCAAGCCCTTCTCACAGTTTCTGCCC
++
+<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<9<969<<<<3<<<
+@EAS56_59:2:201:768:529
+AGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGTT
++
+==========================1=======;
+@EAS56_59:2:201:768:529
+CAGACTATCTAAAGTCAACATGAAGGAAAAAAATT
++
+3<:<9<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_59:2:239:1001:406
+AGCATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCATCAGA
++
+<<<<<<7<<<<<<<<8<;<<<7<<<<36<<3<:33
+@EAS56_59:2:239:1001:406
+CTTTCCTGACAAGCAAATGCTAAGATAATTCATCA
++
+0':.71;;:9==9=;====;=;=============
+@EAS56_59:2:60:677:921
+CATCAGACTATCTAAAGTCAACATGAAGGAAAAAA
++
+========9==;======8==>=============
+@EAS56_59:2:60:677:921
+GTGAGAAGTTTGGAAAAACTATTTGAGGAAGTAAT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_59:3:149:953:349
+AGCCCTTCTCACAGTTTCTGCCCCCAGCATGGTTG
++
+2;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_59:3:149:953:349
+TTCTTTTGGCATTTGCCTTCAGACCCTACACGAAT
++
+<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<;7:<:<<:<:;;::;
+@EAS56_59:3:166:626:836
+AGTACAAAACTCACAGGTTTTATAAAACAATTAAT
++
+<;;7<<<<<<;<7;<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<+
+@EAS56_59:3:166:626:836
+CTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCTAAACTAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<<;<;;;9
+@EAS56_59:3:182:1002:639
+AAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAACTATTTGAGGAAG
++
+<<;;9;9<<<<<<;<7;<;<<<<;;<<<;<<7;<<
+@EAS56_59:3:182:1002:639
+AACCAAGCAGAAGAAAGAGGTTCAGAACTTGAAGA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9-<<<<4<;<;;<;
+@EAS56_59:3:316:25:230
+GATGCCCCTTGGCCATCACCCGGTCCCTGCCCCAT
++
+8;8;<<;<;;<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_59:3:316:25:230
+TGTCCTATGTACTTATCATGACTCTATCCCAAATT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<);2;;
+@EAS56_59:4:119:651:88
+GATTGGATCTAATTTTTGGACTTCTTAAAGAAAAA
++
+<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_59:4:119:651:88
+GCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACATTGCAAGACA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9;<
+@EAS56_59:4:262:928:237
+TGAGTTCAGGTAAAGGTGTGGAAAAAGATGTTCTA
++
+;<<<<<;<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_59:4:262:928:237
+TTGAGACTACAGAGCAACTAGGTAAAAAATTAACA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<
+@EAS56_59:4:267:394:437
+AAACATCATAAATACACACAAAAGTACAAAACTCA
++
+&<&,<8.<;<<<;<8<8<7<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_59:4:267:394:437
+GGACTTCTTAAAGAAAAAAAAACCTGTCAAACACG
++
+<<<<<<<<<<;<;<<<<<;;<<<<<;<<:;8<;<8
+@EAS56_59:4:278:524:521
+CACATTAATACTATGTTTCTTATCTGCACATTACT
++
+<<<;<<;<<<<<<<;<<<<<<<<<<7;5;<<<;;<
+@EAS56_59:4:278:524:521
+CCCATCTGGCCTCGTCCACACTGGTTCTCTTGAAA
++
+7777,<;<<7<<<<;;<<;;<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_59:4:329:577:757
+AACGCGTAACTGCGCTCTCATTCACTCCAGCTCCC
++
+;;;888;<<<<<<6<<<2;<<<<<<;<<<<<<<<<
+@EAS56_59:4:329:577:757
+TCAAGGTTGTTGCAAGGGGGTCTATGTGAACAAAG
++
+!!<<<<9;<:<<;<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_59:5:113:694:725
+CTGTAATGATGCCCCTTGGCCATCACCCGGTCCCT
++
+;::<<:<:<<<<<<<<<<:<:<<<<<<;<<<<<<<
+@EAS56_59:5:113:694:725
+GTACACACGCTGTCCTATGTACTTATCATGACTCT
++
+<<<<<<<<<<<<9<<<<<:<<<<<<<<<<:;;<;;
+@EAS56_59:5:125:137:58
+AACTATATGCTGTTTACAAGAAACTCATTAATAAA
++
+<<9;<<<<<;<;<<<<;<<<<<<;<<<<<<<<<<<
+@EAS56_59:5:125:137:58
+GGTTTTATAAAACAATTAATTGAGACTACAGAGCA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<9;<
+@EAS56_59:5:181:713:140
+AGGGGAAATAAAGTCAAGTATTTCCTGACAAGCAA
++
+<7<<<<<<<<<<<<7<7<6+<<<5;<;<2<;;+;;
+@EAS56_59:5:181:713:140
+CTACAGAGCAACAAGGTAAAAAATTAACATTACAA
++
+78<+<7<-7;;;&<5<7<<<<7<<<<<<<<<<<7<
+@EAS56_59:5:198:929:684
+AAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGCTAAGA
++
+<<;<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<
+@EAS56_59:5:198:929:684
+GAAATCCCATCAGAATAACAATGGGCTTCTCAGCA
++
+<7<<<<;<<<<<<<<<<<<;<<<<<:<<<<::<:7
+@EAS56_59:5:232:336:46
+ATTTTTTTTTTTTCTTTTCTCTTGTTTCTTTTTTT
++
++<<<<<<<<<<<<6<<<<;<6<<&&<,3<<<<3,,
+@EAS56_59:5:325:544:349
+AAAATTAAAGTTCAATACTCACCATCATAAATACA
++
+<<<<57<<<7<;6<<<<;<7<7;<<7<<<<<<<<<
+@EAS56_59:5:325:544:349
+CAAGCCAGAAGAGATTGGATCTAATTTTTGGACTT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<6;;;<<
+@EAS56_59:5:90:629:652
+AGCCCATACTTTACTGCTACTCAATATATCCATGT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<;<<<<<<<<<
+@EAS56_59:5:90:629:652
+ATATTGCTAGTGGGAGTATAAATTGTTTTCCACTT
++
+<:<7::<:<<<<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<
+@EAS56_59:6:187:925:547
+GGCTGATTATGAAAACAATGTTCCCAAGATACCAT
++
+43<<<:9<;;;:7<<<<6<:<8<-4-/,81<(48:
+@EAS56_59:6:187:925:547
+TGAACTTCCACGTCTCATCTAGGGGAACAGGGAGG
++
+((988+&8<<;<09<;<<9<<4<<-<99<<;<9<;
+@EAS56_59:6:199:327:965
+ATCTGGATTCTGGGAAATTCTTCATCCTGGACCCT
++
+<5<:<<<58<:<<<<<<8<<<<<<<<<;<<<<<<<
+@EAS56_59:6:199:327:965
+NCAACAACCTTGAGAACCCCAGGGAATTTGTCAAT
++
+!,+*+++++++++++*+++++++**)+*+**+(**
+@EAS56_59:6:227:657:95
+GTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<8<85
+@EAS56_59:6:227:657:95
+GTCATCTATAAAGGAAATCCCATCAGAATAACAAT
++
+;3;<);<<<<<<<<<<<<18<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_59:6:286:753:854
+TCACCCAGTCCCTGCCCCATCTCTTGTAATCTCTC
++
+;<2<<<,57:<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_59:6:286:753:854
+TTATCATGACTCTATCCCAAATTCCCAATTACGTC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<3<<<<<<9999<;<<9;
+@EAS56_59:6:312:837:406
+AGGTGCACTAATGCGCTCCACGCCCAAGCCCTTCT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_59:6:312:837:406
+CTGCACATTACTACCCTGCAATTAATATAATTGTG
++
+;<;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_59:6:3:186:68
+AAGAAATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATT
++
+<<;<<<<<&:,<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_59:6:3:186:68
+TTACAAGCCAGAAGAGATTGGATCTAATTTTTGTA
++
+<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<;;<<<<<&%8
+@EAS56_59:6:89:457:591
+ATGCCCTGCTAAACTAAGCATCATAAATGAAGGGG
++
+<<<<<<<<<<<4<<<<<<<<<<<<8<7/4<<<<4+
+@EAS56_59:6:89:457:591
+CAGGTTTTATAAAACAATTAATTGAGACTACATAG
++
+797<<9<<<<<<<3<7<<<<<<<<<<)<<<<<07<
+@EAS56_59:7:260:985:520
+TCCCTGTCACCCAATGGACCTGTGATATCTGGATT
++
+;9;7<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_59:7:260:985:520
+TGCAACAACCTTGAGAACCCCAGGGAATTTGTCAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<;:;<<;<:<<<,:1;)<;
+@EAS56_59:7:318:679:883
+GATTTAGACATCTAAATGAAAGAGGCTCAAAGAAT
++
+<<;4<<;<:<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_59:7:319:246:304
+CTTGAGAACCCCAGGGAATTTGTCAATGTCAGGGA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;;:
+@EAS56_59:7:319:246:304
+TGTCACCCAATGGACCTGTGATATCTGGATTCTGG
++
+;;<;;;<<<<8;<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<;<<
+@EAS56_59:7:82:902:868
+CTGTCACCCAATGGACCTGTGATATCTGGATTCTG
++
+<<;;<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_59:7:82:902:868
+TTGCAACAACCTTGAGAACCCCAGGGAATTTGTCA
++
+<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_59:8:49:182:192
+ACACAAAAGTACAAAACTCACAGGTTTTATAAAAC
++
+<5<;<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_59:8:49:182:192
+GTTATGCCCTGCTAAACTGAGCATCATAAATGAAG
++
+=====================;============<
+@EAS56_59:8:80:542:549
+AGTAAACTCTCAAATATTGCTAGTGGGAGTATAAA
++
+=9====7=;=======;;==;========<=====
+@EAS56_59:8:80:542:549
+CTAAAAGCCCATACTTTACTGCTACTCAATATATC
++
+<<<<<<<<;<<<<<<<<:<<<<-<;;<;7<;3;9;
+@EAS56_61:1:119:880:781
+ACAAATCTGCGCTTGTACTTCTAAATCTATAACAA
++
+;8<<;<<<<:<84<<<<:<<<<<<<<<<<<<5<<<
+@EAS56_61:1:119:880:781
+ACATATGCACCTAACACAAGACTACCCAGATTCAT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<+<<<<7<<<<<
+@EAS56_61:1:210:880:606
+GGAGCATTTTGTCAGTTACCAAATGTGTTTATTAT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<:<<<<3<<8&
+@EAS56_61:1:210:880:606
+TCCTGGACCCTGAGAGATTCTGCAGCCCAGCTCCA
++
+.<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_61:1:303:184:14
+CAACCTTGAGAACCCCAGGGAATTTGTCAATGTCA
++
+<<<<<<8<0<<<<-<-98<<--<<<6;076;75+&
+@EAS56_61:1:303:184:14
+CAATGGACCTGTGATATCTGGATTCTGGGAAATTC
++
+:<<.<;;7<:<<<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_61:2:152:860:286
+AGACTATTGCCAGATGAACCACACATTAATACTAT
++
+<;<<<;<<0:<3<:<<2<<<<<7+<7+47<9(999
+@EAS56_61:2:152:860:286
+TTAGGTATCAATTTGGTGTTCTGTGTAAAGTCTCA
++
+2;5;8<<;5<<<;<2<8<<<<<<;8<;<<<<;<<<
+@EAS56_61:3:140:522:212
+CGCTGAAGAACTTTGATGCCCTCTTCTTCCAAAGA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<;<;95;
+@EAS56_61:3:140:522:212
+GACAGGCTGCAACTGTGAGCCATCACAATGAACAA
++
+:;8;:::<<:<<<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_61:3:165:665:220
+ACAATTAATTGAGACTACAGAGCAACTAGGTAAAA
++
+<:<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_61:3:165:665:220
+GGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;;<<<;;<;<<;
+@EAS56_61:3:208:118:673
+AAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACATTGCA
++
+<<<<<;;<;<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_61:3:208:118:673
+GAACAGAGCTTTCAAGAAGTATGAGATTATGTAAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<;;
+@EAS56_61:3:260:827:289
+AAACCTCATATATCAATATTAACTTTGAATAAAAA
++
+<<<<2<<<<;<<<<;<<<<<<:<<<&-<8<<88<3
+@EAS56_61:3:260:827:289
+TGTTCTACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGGA
++
+6;99+<<<<<<<<<<<<<<6<<<<<7<<<<<<<<<
+@EAS56_61:3:45:758:616
+ATAAATTGTTTTCCACTTTGGAAAACAATTTGGTA
++
+<<;<:<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_61:3:45:758:616
+CATACTTTACTGCTACTCAATATATCCATGTAACA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<6<<<<<<;;<
+@EAS56_61:3:5:45:441
+TTTTTTTTCTTTTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTT
++
+;;58:<:<(:<<11<&<1<<;<<<<><<<<<<<<<
+@EAS56_61:4:262:456:74
+TACCAAATGTGTTTATTACCAGAGGGATGGAGGGA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:;;:;7:<::7<7:3
+@EAS56_61:4:262:456:74
+TGGGAAATTCTTCATCCTGGACCCTGAGAGATTCT
++
+862;<<<:;<;<<<;;;<<<<;;<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_61:5:194:470:416
+AAACTATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTT
++
+<<<7<<;<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_61:5:194:470:416
+TCAGAACTTGAAGACAAGTCTCTTATGAATTAACC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;<<<<<<<<
+@EAS56_61:5:209:824:866
+ATCATCACTAAACCAGTCCTATAAGAAATGCTCAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;
+@EAS56_61:5:209:824:866
+CAGCAACAAAACCTCATATATCAATATTAACTTTG
++
+;<:&<<:<<<<;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_61:5:263:314:696
+AACTCATTAATAAAGACATGAGTTCAGGTAAAGGG
++
+<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<:<<;<775
+@EAS56_61:5:263:314:696
+AAGATCAATTCAGCAAGAAGATATAACCATCCTAC
++
+<<;<;:<<<<7<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_61:5:272:240:950
+CAGCAGAGCTTGGATCTAATTTTTGGACTTCTTCA
++
+6<<&:<<<&<::;&7<<<3<;<<;<:;:<8:<<(<
+@EAS56_61:5:272:240:950
+TCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAA
++
+37<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<;<<<<<<;
+@EAS56_61:6:10:106:737
+ACAAGAAACTCATTAATAAAGACATGAGTTCAGGT
++
+<<<;<1<;<<<<<<9<<<<;;<<<<<99<<94008
+@EAS56_61:6:10:106:737
+ACAATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGATAT
++
+<-<<;<<<<<<<<<<<;<<<<;<<;<<<<<<<<<<
+@EAS56_61:6:160:272:398
+AATGTTCCCCAGATACCATCCCTGTCTTACTTCCA
++
+9<<<3<<<<<<<<<<<9<<;8<<<<;<+.;;89..
+@EAS56_61:6:160:272:398
+GTGCACTAATGCGCTCCACGCCCAAGCCCTTCTCA
++
+3:,<,;;<<;<<1<<<<<<<;<;<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_61:6:226:370:91
+AGAATAACAATGGGCTTCTCAGCGGAAACCTTACA
++
+<':<6<;<<<;2<;<-7;;;<<<<<<<;;;<<7;<
+@EAS56_61:6:226:370:91
+AGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACATTGCAAGA
++
+8<<<;<8<8<;<<<8<<;7<7;8784<<,;864<&
+@EAS56_61:6:227:259:597
+AATATAGAAATTGAAACAGCTGTGTTTAGTGCCTT
++
+<8<;2;9;<;;-92<;;;<;<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_61:6:256:67:461
+TCATGTTTGTGTCTTTCTATGCATTTTTTTTTTTT
++
+!!7181!63:6-:!-163(-1%-18<<4<<<<<<<
+@EAS56_61:6:256:67:461
+TTGTTTTTTCTTCTTTTCTCTTTTTTTTTTTTTTT
++
+*.%53.:)1+9;3397;1795507+335;.&51)5
+@EAS56_61:6:283:963:234
+AAAAAGATGTTCTACGCAAACAGAAACCAAATGAG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<;<<;<<;<
+@EAS56_61:6:283:963:234
+ACATATGCACCTAACACAAGACTACCCAGATTCAT
++
+<5<;<;97;;:;<<7<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_61:6:307:208:477
+AAAGTCAAAATTAAAGTTCAATACTCACCATCATA
++
+<<<<<.<<<<<<<<<<<<;<;<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_61:6:307:208:477
+ACTTCTTAAAGAAAAAAAAACCTGTCAAACACGAA
++
+<<<<<<<;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<;:<<<88;
+@EAS56_61:7:280:133:495
+AGATGAACCACACATTAATACTATGTTTCTTATCT
++
+<:<9:<<7:<6<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_61:7:280:133:495
+CCATCATGAAGCACTGAACTTCCACGTCTCATCTA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;
+@EAS56_61:7:41:745:603
+CATTGCAAGACAGACTTCATCAAGATATGTAGTCA
++
+<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<6<:8<<:
+@EAS56_61:7:41:745:603
+TAATTTTTGGACTTCTTAAAGAAAAAAAAACCTGT
++
+;<<;;<;<8<<<<<<<<<<<;<<;<<<<<<<<<;<
+@EAS56_61:7:7:682:201
+CATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCATCAGAAT
++
+0:8;5<8<1:78<<<<<<<<<<<<:8<<2<<<<:<
+@EAS56_61:7:7:682:201
+GGAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACA
++
+<<<<<<<7<<7<<<<77&;-9<97<76<;<<993<
+@EAS56_61:8:60:358:494
+GGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAACA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<:<<;;4;
+@EAS56_61:8:60:358:494
+TACCCAGATTCATAAAACAAATACTACTAGACCTA
++
+7<77;<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_61:8:7:171:402
+GTGATATCTGGATTCTGGGAAATTCTTCATCCTGG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<;/<<<<;<<<<<;<<1<<<4
+@EAS56_61:8:7:171:402
+TCTACATGGCTGATTATGAAAACAATGTTCCCCAG
++
+:086::::847:<7<<7<<<<<<;7<<;<<<<7<<
+@EAS56_63:1:119:446:185
+TGGTCTGACAGGCTGCAACTGTGAGCCATCACAAT
++
++70730;<0<77;;<<<<<9<<<<<<9<<<<<<<<
+@EAS56_63:1:119:446:185
+TTACCAGAGGGATGGAGGGAAGAGGGACGCTGAAG
++
+<<<<<<<7<<<4<<<<9<<54<:<7<5:<::7-5;
+@EAS56_63:1:145:71:26
+CTAGGGGAACAGGGAGGTGCACTAATGCGCTCCAC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;;<<;<;<9<9;;99;
+@EAS56_63:1:145:71:26
+TTTCTTATCTGCACATTACTACCCTGCAATTAATA
++
+882;8;<;;887<<<;;<<<<;<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_63:2:119:161:322
+ATCAGAATAACAATGGGCTTCTCAGCAGAAACCTT
++
+<83<;<<;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_63:2:119:161:322
+CTTTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACATCTAAATGA
++
+<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<;<<<<<<<<<</6
+@EAS56_63:2:33:357:858
+AAAATTAAAGTTCAATACTCACCATCATAAATACA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<:<<<<;<<<<<<
+@EAS56_63:2:33:357:858
+AGGGATTAAATTCCCCCACTTAAGAGATATAGATT
++
+<;<:<<<<<<<<<;<9<<;<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_63:2:74:656:272
+AACAAAGGAGGTCATCATACAATGATAAAAAGATC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<
+@EAS56_63:2:74:656:272
+TGTACAATATTCTGATGATGGTTACACTAAAAGCC
++
+;;;</<<<<<5;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_63:3:40:594:752
+ATACACACACATGGTTTAGGGGTATAATACCTCTA
++
+<<<<<<<<<<;<<<;<<<::;<:;<;:<;;;<;<:
+@EAS56_63:3:40:594:752
+CTGCGCGGTTTCCCATCATGAAGCACTGAACTTCC
++
+;7;9<;;;<;<;:<<;;<<<<<<<<<;<<<<<<<<
+@EAS56_63:3:41:468:459
+AAATTTAACAAAAGTAAATAAAACACATAGCTAAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<;;7
+@EAS56_63:3:41:468:459
+TTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTT
++
++;<<<<<<<<<<<;&<<;;88&<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_63:3:93:1002:845
+AATTCCCAATTACGTCCTATCTTCTTCTTAGGGAA
++
+<<::;;;<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<
+@EAS56_63:3:93:1002:845
+GGGCAATACATGAGATTATTAGGAAATGCTTTACT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<;<<<;<<<</<
+@EAS56_63:4:141:9:811
+TTTCTTTTCTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTCTACAT
++
+<<<;<<<<<<<;<;<:<<<;<<<<<<<<..));;.
+@EAS56_63:4:184:659:377
+AAAAAGATGTTCTACGCAAACAGAAACCAAATGAG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;;;;
+@EAS56_63:4:184:659:377
+CAAAACTACCCAGATTCATAAAACAAATACTACTA
++
+1;<+<;<6;66<<;<<<<;;<<<8<<<<8<<;<<<
+@EAS56_63:4:38:28:122
+AAATATAGTTGAAAGCTCTAACAATAGACTAAACC
++
+<<<<<<;<<<<<<<;<<<<6<<<<<<:<<<<;;<<
+@EAS56_63:4:38:28:122
+GTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTG
++
+;9;9;-1<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<
+@EAS56_63:5:117:570:971
+ACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAG
++
+<<<<<<<<<<<<<;;;<<<<6<7;9;<:;<;<;;<
+@EAS56_63:5:117:570:971
+ACATGAAGGAAAAAAATTCTAAAATCAGCAAGAGA
++
+<,<9<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_63:5:123:998:248
+ATCACAATGAACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;9<<<68<
+@EAS56_63:5:123:998:248
+TTTCTTTTGGCATTTGCCTTCAGACCCTACACGAA
++
+;:;5;<;:<9<<<<<:<;<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_63:5:36:678:316
+ATTTGTCTGAGCAAAACAGTCTAGATGAGAGAGAA
++
+<<72.2,;;<)6<<<<:<<;;<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_63:5:36:678:316
+TTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTA
++
+<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<;<<<<,2<<<)
+@EAS56_63:5:96:788:614
+TAGGGGTATAATACCTCTACATGGCTGATTATGAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;6;<<;;<;;7;9
+@EAS56_63:5:96:788:614
+TTCCACGTCTCATCTAGGGGAACAGGGAGGTGCAC
++
+;9;;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_63:6:102:816:260
+AAATTACCTAATTGGTACAATGTACAATATTCTGA
++
+<<<<<<::<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_63:6:102:816:260
+TCAGATAAAGCACACTTTAAATCAACAACAGTAAA
++
+<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;;;;
+@EAS56_63:6:42:920:522
+AATTAATATAATTGTGTCCATGTACACACGCTGTT
++
+<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<:<<<<<<<:;;::&
+@EAS56_63:6:42:920:522
+CTGGTTCTCTTGAAAGCTTGGGCTGTAATGATGCC
++
+;;;;;99<;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_63:6:91:360:585
+AAGATGAAACGCGTAACTGCGCTCTCATTCACTCC
++
+<<<<9<<<<<;<<<;<<77<<<;<;;<;;<;<;;<
+@EAS56_63:6:91:360:585
+GACATCACAATGAACAACAGGAAGAAAAGGTCTTT
++
+5&&<<3:;<<<<<<)<<3<<<<<<<;;<<<<;<<<
+@EAS56_63:7:109:22:383
+ATGTACAATATTCTGATGATGGTTACACTAAAAGC
++
+<;9;<8<<<<<<;<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<
+@EAS56_63:7:109:22:383
+CAACAACAGTAAAATAAAACAAAGGAGGTCATCAT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;:<<;<<
+@EAS56_63:7:137:139:248
+GTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCTAAACTAAGC
++
+;;;99<<<;<;;<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<
+@EAS56_63:7:137:139:248
+TATCTAAAGTCAACATGAAGGAAAAAAATTCTAAA
++
+<<<<<<<<<9<<<<<<<<<<;<<<<<<<;;<;<;<
+@EAS56_63:7:166:42:147
+AATGCGCTCCACGCCCAAGCCCTTCTAACAGTTTC
++
+<<;<<<<<<<<<<<<<<<<;6<<64;)<<7;7;;;
+@EAS56_63:7:166:42:147
+CTGCACATTACTACCCTGCAATTAATATAATTGTG
++
+3.7;;;;:<<<77<<3<;<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_63:7:185:213:330
+CAATGTCAGGGAAGGAGCATTTTGTCAGTTACCAA
++
+<<<<<<<<<;<<;<<<<<;<<<<;;;<<;<<;<38
+@EAS56_63:7:185:213:330
+TCTGGGAAATTCTTCATCCTGGACCCTGAGAGATT
++
+;4<<<;<<<<<<<<;<<;;;<<<<9<<<<<<<<<<
+@EAS56_63:7:190:95:706
+TTCTCACAGTTTCTGCCCCCAGCATGGTTGTACTG
++
+<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<;;<;<;;<<;<;;<,
+@EAS56_63:7:190:95:706
+TTGTGTCCATGTACACACGCTGTCCTATGTACTTA
++
+9;97437;<;;<<;<;<<<<<<;<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_63:7:34:334:825
+CATTTAAGAAATTACAAAATATAGTTGAAAGCTCT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<3;<<<<6<<<<
+@EAS56_63:8:138:186:459
+CATTGCAAGACAGACTTCATCAAGATATGTAGTCA
++
+<*<<7<<0<7<<+<-:<<&<:6:4:0-:<<2.:5<
+@EAS56_63:8:138:186:459
+GCCAGAAGAGATTGGAGCTAATTTTTGGACTTCTT
++
++/2/;<:<&7:7</<2&<<<&<<<<<<<<<8<<:3
+@EAS56_63:8:150:508:757
+ATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTGTTGT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<8<<,<
+@EAS56_63:8:150:508:757
+CTTGACACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAAAACA
++
+6;;;<8<6;8<<8<<<<<;<<<<;<<<<;<<<<<<
+@EAS56_63:8:4:571:820
+AAGAGATATAGATTGGCAGAACAGATTTAAAAACA
++
+<<<<<<<<<<<9<<;9<;;;<;6;:<<<3:;;;:6
+@EAS56_63:8:4:571:820
+CAACAACAGTAAAATAAAACAAAGGAGGTCATCAT
++
+&<<7<<1<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_63:8:62:125:888
+CGGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGATTGGATCTAA
++
+,;3<<<8;;3<,<<<8;<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_63:8:62:125:888
+TGCCAGGAAGATACATTGCAAGACAGACTTCATCA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<::<<<:7<::<:;<<:
+@EAS56_65:1:163:846:223
+CCAGCTCCCTGTCACCCAATGGACCTGTGATATCT
++
+<7<5<*<<<<0<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_65:1:163:846:223
+GCCTTTGTTCACATAGACCCCCTTGCAACAACCTT
++
+<<<<;<<;4<<<;;9<<<<<+<<;<</27;;47;.
+@EAS56_65:1:178:305:843
+ATGTTTCTTATCTGCACATTACTACCCTGCAATTA
++
+<<<<<<<4<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_65:1:178:305:843
+CCACGTCTCATCTAGGGGAACAGGGAGGTGCACTA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<;<<:<<:<;:
+@EAS56_65:1:23:536:229
+AAAGCATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCATCA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<:<8<:<<;<<<<<<7<<<
+@EAS56_65:1:23:536:229
+AAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCA
++
+<<99<<<<<;<<<;2<<<<<<;<<<9<<<<<<<<<
+@EAS56_65:1:53:272:944
+CAACCCCCTTGCAACAACCTTGCGAACCCCAGGGA
++
+<<<<<<<<<<<<.7<.<<<<<<-<-<<<<<&<222
+@EAS56_65:1:53:272:944
+TGCGCTCTCATTCACTCCAGCTCCCTGTCACCCAA
++
+&94<4&8.6<6&;<:0:8;;:6;<;:<*<<<<<<<
+@EAS56_65:2:224:579:433
+ATAACAATGGGCTTCTCAGCAGAAACCTTACAAGC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<8<+8;:
+@EAS56_65:2:224:579:433
+TTCATCATCACTAAACCAGTCCTATAAGAAATGCT
++
+'<08/8<+<</<<:<<<<<8<<9<38<<<<<<<<;
+@EAS56_65:2:56:155:49
+ATCCTACTAAATACATATGCACCTAACACAAGACT
++
+;:5;;<5<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<=
+@EAS56_65:2:56:155:49
+ATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;<<<;<9<9;
+@EAS56_65:3:168:741:680
+AGGGACGCTGAAGAACTTTGATGCCCTCTTCTTCC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<1<<<<<<<<<
+@EAS56_65:3:168:741:680
+TGGTCTGACAGGCTGCAACTGTGAGCCATCACAAT
++
+<<5<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_65:3:47:64:359
+TTTTTTTTTTTCTCTCCTCTTTTTTTTTTTTTTTT
++
+<<<6<<<<<<<4<4</9<4@<<;<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_65:4:124:367:72
+AGACTACCCAGATTCATAAAACAAATACTACTAGA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;
+@EAS56_65:4:124:367:72
+CATAGCTAAAACTAAAAAAGCAAAAACAAAAACTA
++
+,<<<8,<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_65:4:126:966:514
+AGAAGAAGTAGCTATACTTATATCAGATAAAGCAC
++
+<4<<<%<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_65:4:126:966:514
+TAAAAAGGGATTAAATTCCCCCACTTAAGAGATAT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<;<<<;
+@EAS56_65:4:150:94:843
+AAAGGGATTAAATTCCCCCACTTAAGAGATATAGA
++
+<<<<<<<<7<<<6<<<<<<<<<<<6<<62<<<<<2
+@EAS56_65:4:150:94:843
+CAGATACATCCCACTTTAAATCAACCACAGTAAAA
++
+4<9<41*747*7<:9<:7:::<72;+<;::<7<<<
+@EAS56_65:4:296:78:421
+TCTTTTTTTCTTTTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTT
++
+!!<<<:<<<<..<::<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_65:4:296:78:421
+TGTTGGTGTTCGTTTTTTCTCCTGTTTCTTTTTCT
++
+<<*<4<<<;:<0<<<<<<<<+;<9<<1<<;<<<+:
+@EAS56_65:5:121:380:656
+AATGTGTTTATTACCAGAGGGATGGAGGGAAGAGG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<:<<83<:<<
+@EAS56_65:5:121:380:656
+GCCCAGCTCCAGATTGCTTGTGGTCTGACAGGCTG
++
+:;<<;<<1<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_65:5:131:742:561
+TCAAAAGGTGATGTGTGTTCTCATCAACCTCATAC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_65:5:131:742:561
+TGCCTTCAGACCCTACACGAATGCGTCTCTACCAC
++
+<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_65:5:211:84:84
+CTATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<:<<:<<:<<<44<4<<9<<
+@EAS56_65:5:211:84:84
+GCAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTATAAAGGAAA
++
+6:<<:<<<<<<9<<<<<<<<<<<;<<<;;;<;<3;
+@EAS56_65:5:262:53:888
+AAGACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGAT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_65:5:262:53:888
+TTGAGACTACAGAGCAACTAGGTAAAAAATTAACA
++
+<<<<<<<<;<<<<<<<<<<;<<;<;<;6<<;<;;<
+@EAS56_65:5:278:848:765
+GTACACACGCTGTCCTATGTACTTATCATGACTCT
++
+7;;<;5<55<<;;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_65:5:278:848:765
+TTCTCACAGTTTCTGCCCCCAGCATGGTTGTACTG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<4
+@EAS56_65:5:299:336:613
+ATCCTACTAAATACATATGCACCTAACACAAGACT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_65:5:299:336:613
+TACTCAATATATCCATGTAACAAATCTGCGCTTGT
++
+1;4(+<<5<4<1<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_65:5:30:92:753
+TATAATACCTCTACATGGCTGATTATGAAAACAAT
++
+<<<<<<;<<<<<<:<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_65:5:30:92:753
+TGGATTCTGGGAAATTCTTCATCCTGGACCCTGAG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_65:5:312:985:871
+ATAAAACACATAGCTAAAACTAAAAAAGCAAAAAC
++
+<8<<<<.<.<<<<:<<<<<.<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_65:5:312:985:871
+TAAGAGGGATGAGAAATTACCTAATTGGTACAATG
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<9<<
+@EAS56_65:5:37:611:267
+AATGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACA
++
+<<4<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_65:5:37:611:267
+TATAAAGGAAATCCCATAAGAATAACAATGGGCTT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_65:5:75:637:650
+CTGATTATGAAAACAATGTTCCCCAGATACCATCC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<:
+@EAS56_65:5:75:637:650
+GTCTCATCTAGGGGAACAGGGAGGTGCACTAATGC
++
+<<<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_65:6:197:759:975
+AAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAATA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_65:6:197:759:975
+AATTTTTGGACTTCTTAAAGAAAAAAAAACCTGTC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<;
+@EAS56_65:6:37:610:260
+CAAGCCCTTCTCACAGTTTCTGCCCCCAGCATGGT
++
+/74<.<4.&<<<:<<<<::<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_65:6:37:610:260
+CCAGAGGGAAAGCTTTCAACGCTTCTAGCCATTTC
++
+<<<;<;<<7<<<<<<<<<<<<<<;6<963;;;3;1
+@EAS56_65:6:46:173:214
+AACAATGGGCTTCTCAGCAGAAACCTTACAAGCCA
++
+<<2<<<<<<<<<<<5<<5<7<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_65:6:46:173:214
+CTAGAGATTTAGACATCTAAATGAAAGAGGCTCAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<3<<<<<<;
+@EAS56_65:6:66:257:524
+ATACATGAGATTATTAGGAAATGCTTTACTGTCAT
++
+<;<<<<<<<<3<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_65:6:66:257:524
+GCCTTCAGACCCTACACGAATGCGTCTCTACCACC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<%
+@EAS56_65:6:67:800:450
+TCACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGA
++
+9-<9<;<<<<9;5<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_65:6:67:800:450
+TTACAAAATATAGTTGAAAGCTCTAACAATAGACT
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<5<<<
+@EAS56_65:6:82:822:767
+AACAGCTTAGGTATCAATTTGGTGTTCTGTGTAAA
++
+<<9<<<<<<<<<<;;<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_65:6:82:822:767
+TTAGGAAATGCTTTACTGTCATAACTATGAAGAGA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<.<<.<,<
+@EAS56_65:7:118:775:467
+AACAGTAAAATAAAACAAAGGAGGTCATCATACAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<;
+@EAS56_65:7:118:775:467
+TGTACAATATTCTGATGATGGTTACACTAAAAGCC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_65:7:122:398:994
+GGGATTAAATTCCCCCACTTAAGAGATATAGATTG
++
+95:<9<<<<:9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_65:7:122:398:994
+TAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAATACTCACCATCA
++
+<:<9<<<<<<4<<<;9<<<<<98<;<<<:;<;<;7
+@EAS56_65:7:219:40:833
+CCCATACTTTACTGCTACTCAATATATCCATGTAA
++
+<<*<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_65:7:219:40:833
+GGAGGTCATCATACAATGATAAAAAGATCAATTCA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_65:7:288:552:440
+AGAGGGAACGCTTTCAACTCTTCTAGCCATTTCTT
++
+9<<%'%<<.2<<<<<<<<5:<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_65:7:288:552:440
+TGTGGTCTGACAGGCTGCAACTGTGAGCCTTCCAT
++
+<<<<71<77<<<:<<<&<4<<77<16<88&36+%%
+@EAS56_65:7:67:692:110
+ATTGCCAGATGAACCACACATTAATACTATGTTTC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_65:7:67:692:110
+GTATCAATTTGGTGTTCTGTGTAAAGTCTCAGGGA
++
+;;<<8<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_65:8:117:156:84
+GGTTCAGAACTTGAAGACAAGTCTCTTATGAATTA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_65:8:117:156:84
+TGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGATTTAG
++
+<;;<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_65:8:206:563:262
+ATTACGTCCTATCTTCTTCTTAGGGAAGAACAGCT
++
+<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7
+@EAS56_65:8:206:563:262
+ATTAGGAAATGCTTTACTGTCATAACTATGAAGAG
++
+<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<-;<4;
+@EAS56_65:8:218:173:667
+CCTGCCCCATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTGC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<6<<<<<<<<<<<<<<<<<.<
+@EAS56_65:8:218:173:667
+TAATGATTCCTCAATGTTAAAATGTCTATTTTTGT
++
+<<<<<<;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_65:8:24:415:944
+GTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTACGC
++
+<;;<<<<:<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<;<<<<<<
+@EAS56_65:8:24:415:944
+TAGGTAAAAAATTAACATTACAACAGGAACAAAAC
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<
+@EAS56_65:8:275:851:240
+CCCCAGAGGGAAAGCTTTCAACGTTTCTAGCCATT
++
+66614/&3616630666&66666&66666868666
+@EAS56_65:8:275:851:240
+GTGGTCTGACAGGCTGCAACTGTGAGCCATCACAA
++
+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<4<7<<<<<<
+@EAS56_65:8:317:83:500
+TTTTTTTTTTTTCTTTTCTCCTTTTTTTTTTGTTT
++
+;;;;;<<<<<<<3<<<)-;31<<)97<;9<<:<<<
+@EAS56_65:8:64:507:478
+TAATTGAAAAATTCATTTAAGAAATTACAAAATAT
++
+<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<;;;<<<;<<8;<;<
diff --git a/tests/pysam_data/ex1.sam.gz b/tests/pysam_data/ex1.sam.gz
new file mode 100644 (file)
index 0000000..8dd2bc4
Binary files /dev/null and b/tests/pysam_data/ex1.sam.gz differ
diff --git a/tests/pysam_data/ex10.sam b/tests/pysam_data/ex10.sam
new file mode 100644 (file)
index 0000000..f9fe3dd
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,16 @@
+@HD    VN:1.0
+@SQ    SN:1    LN:249250621
+read1  115     1       142618765       255     25M     =       142618765       25      CGACCCACTCCGCCATTTTCATCCG       IIGIIIHIGIIFIIIIIIIGIGIII       NM:i:0  ZP:i:65536      ZL:i:25
+read2  115     1       142618765       255     25M     =       142618765       25      CGACCCACTCCGCCATTTTCATCCG       IIGIIIHIGIIFIIIIIIIGIGIII       NM:i:0  ZP:i:214748     ZL:i:25
+read3  115     1       142618765       255     25M     =       142618765       25      CGACCCACTCCGCCATTTTCATCCG       IIGIIIHIGIIFIIIIIIIGIGIII       NM:i:0  ZP:i:2147484    ZL:i:25
+read4  115     1       142618765       255     25M     =       142618765       25      CGACCCACTCCGCCATTTTCATCCG       IIGIIIHIGIIFIIIIIIIGIGIII       NM:i:0  ZP:i:2147483647 ZL:i:25
+read5  115     1       142618765       255     25M     =       142618765       25      CGACCCACTCCGCCATTTTCATCCG       IIGIIIHIGIIFIIIIIIIGIGIII       NM:i:0  ZP:i:-65536     ZL:i:25
+read6  115     1       142618765       255     25M     =       142618765       25      CGACCCACTCCGCCATTTTCATCCG       IIGIIIHIGIIFIIIIIIIGIGIII       NM:i:0  ZP:i:-214748    ZL:i:25
+read7  115     1       142618765       255     25M     =       142618765       25      CGACCCACTCCGCCATTTTCATCCG       IIGIIIHIGIIFIIIIIIIGIGIII       NM:i:0  ZP:i:-2147484   ZL:i:25
+read8  115     1       142618765       255     25M     =       142618765       25      CGACCCACTCCGCCATTTTCATCCG       IIGIIIHIGIIFIIIIIIIGIGIII       NM:i:0  ZP:i:-2147483647        ZL:i:25
+read1  115     1       142618765       255     25M     =       142618765       25      CGACCCACTCCGCCATTTTCATCCG       IIGIIIHIGIIFIIIIIIIGIGIII       NM:i:0  ZP:f:65536      ZL:i:25
+read2  115     1       142618765       255     25M     =       142618765       25      CGACCCACTCCGCCATTTTCATCCG       IIGIIIHIGIIFIIIIIIIGIGIII       NM:i:0  ZP:f:214748     ZL:i:25
+read3  115     1       142618765       255     25M     =       142618765       25      CGACCCACTCCGCCATTTTCATCCG       IIGIIIHIGIIFIIIIIIIGIGIII       NM:i:0  ZP:f:2147484    ZL:i:25
+read5  115     1       142618765       255     25M     =       142618765       25      CGACCCACTCCGCCATTTTCATCCG       IIGIIIHIGIIFIIIIIIIGIGIII       NM:i:0  ZP:f:-65536     ZL:i:25
+read6  115     1       142618765       255     25M     =       142618765       25      CGACCCACTCCGCCATTTTCATCCG       IIGIIIHIGIIFIIIIIIIGIGIII       NM:i:0  ZP:f:-214748    ZL:i:25
+read7  115     1       142618765       255     25M     =       142618765       25      CGACCCACTCCGCCATTTTCATCCG       IIGIIIHIGIIFIIIIIIIGIGIII       NM:i:0  ZP:f:-2147484   ZL:i:25
diff --git a/tests/pysam_data/ex3.sam b/tests/pysam_data/ex3.sam
new file mode 100644 (file)
index 0000000..495d4fe
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,13 @@
+@HD    VN:1.0
+@SQ    SN:chr1 LN:1575
+@SQ    SN:chr2 LN:1584
+@RG    ID:L1   PU:SC_1_10      LB:SC_1 SM:NA12891      CN:name:with:colon
+@RG    ID:L2   PU:SC_2_12      LB:SC_2 SM:NA12891      CN:name:with:colon
+@PG    ID:P1   VN:1.0
+@PG    ID:P2   VN:1.1
+@CO    this is a comment
+@CO    this is another comment
+read_28833_29006_6945  99      chr1    33      20      10M1D25M        =       200     167     AGCTTAGCTAGCTACCTATATCTTGGTCTTGGCCG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<9/,&,22;;<<<     NM:i:1  RG:Z:L1 PG:Z:P1 XT:A:U
+read_28701_28881_323b  147     chr2    88      30      35M     =       500     412     ACCTATATCTTGGCCTTGGCCGATGCGGCCTTGCA     <<<<<;<<<<7;:<<<6;<<<<<<<<<<<<7<<<<     MF:i:18 RG:Z:L2 PG:Z:P2 XT:A:R
+read_28701_28881_323c  147     chr2    88      30      35M     =       500     412     ACCTATATCTTGGCCTTGGCCGATGCGGCCTTGCA     <<<<<;<<<<7;:<<<6;<<<<<<<<<<<<7<<<<
+test_clipped1  99      chr2    997     20      4S6M1D20M5S     =       200     167     AGCTTAGCTAGCTACCTATATCTTGGTCTTGGCCG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<9/,&,22;;<<<     NM:i:1  RG:Z:L1 PG:Z:P1 XT:A:U
diff --git a/tests/pysam_data/ex4.sam b/tests/pysam_data/ex4.sam
new file mode 100644 (file)
index 0000000..b2282b8
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,9 @@
+@HD    VN:1.0
+@SQ    SN:chr1 LN:100
+@SQ    SN:chr2 LN:100
+@RG    ID:L1   PU:SC_1_10      LB:SC_1 SM:NA12891
+@RG    ID:L2   PU:SC_2_12      LB:SC_2 SM:NA12891
+@CO    this is a comment
+@CO    this is another comment
+read_28833_29006_6945  99      chr1    21      20      10M1D25M        =       200     167     AGCTTAGCTAGCTACCTATATCTTGGTCTTGGCCG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<9/,&,22;;<<<     NM:i:1  RG:Z:L1
+read_28701_28881_323b  147     chr2    21      30      35M     =       500     412     ACCTATATCTTGGCCTTGGCCGATGCGGCCTTGCA     <<<<<;<<<<7;:<<<6;<<<<<<<<<<<<7<<<<     MF:i:18 RG:Z:L2
diff --git a/tests/pysam_data/ex5.sam b/tests/pysam_data/ex5.sam
new file mode 100644 (file)
index 0000000..b4526ec
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,5 @@
+@HD    VN:1.0
+@SQ    SN:chr1 LN:100
+@SQ    SN:chr2 LN:100
+read_28833_29006_6945  0       *       0       0       *       *       200     167     AGCTTAGCTAGCTACCTATATCTTGGTCTTGGCCG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<9/,&,22;;<<<
+read_28701_28881_323b  0       *       0       0       *       *       500     412     ACCTATATCTTGGCCTTGGCCGATGCGGCCTTGCA     <<<<<;<<<<7;:<<<6;<<<<<<<<<<<<7<<<<
diff --git a/tests/pysam_data/ex6.sam b/tests/pysam_data/ex6.sam
new file mode 100644 (file)
index 0000000..7ae90f3
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,5 @@
+@HD    VN:1.0
+@SQ    SN:chr1 LN:1575
+@SQ    SN:chr2 LN:1584
+read_28833_29006_6945  99      chr1    33      20      10M1D25M        =       200     167     AGCTTAGCTAGCTACCTATATCTTGGTCTTGGCCG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<9/,&,22;;<<<     NM:i:1  RG:Z:L1
+read_28701_28881_323b  147     chr2    88      30      35M     =       500     412     ACCTATATCTTGGCCTTGGCCGATGCGGCCTTGCA     <<<<<;<<<<7;:<<<6;<<<<<<<<<<<<7<<<<     MF:i:18 RG:Z:L2
diff --git a/tests/pysam_data/ex7.sam.donottest b/tests/pysam_data/ex7.sam.donottest
new file mode 100644 (file)
index 0000000..12befae
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,2 @@
+read_28833_29006_6945  99      chr1    33      20      10M1D25M        =       200     167     AGCTTAGCTAGCTACCTATATCTTGGTCTTGGCCG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<9/,&,22;;<<<     NM:i:1  RG:Z:L1 PG:Z:P1 XT:A:U
+read_28701_28881_323b  147     chr2    88      30      35M     =       500     412     ACCTATATCTTGGCCTTGGCCGATGCGGCCTTGCA     <<<<<;<<<<7;:<<<6;<<<<<<<<<<<<7<<<<     MF:i:18 RG:Z:L2 PG:Z:P2 XT:A:R
diff --git a/tests/pysam_data/ex8.sam b/tests/pysam_data/ex8.sam
new file mode 100644 (file)
index 0000000..5a16b4f
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,3 @@
+@HD    VN:1.0
+@SQ    SN:2    LN:48297693
+GJP00TM04CAQ5W 0       2       38297693        60      45H51M1D13M1D12M1D9M2D5M1D7M4D2M1I6M1D28M1D5M1D2M1D18M55H       *       0       0       CATGAAGAACCGCTGGGTATGGAGCACACCTCACCTGATGGACAGTTGATTATGCTCACCTTAACGCTAATTGAGAGCAGCACAAGAGGACTGGAAACTAGAATTTACTCCTCATCTCCGAAGATGTGAATATTCTAAATTCAGCTTGCCTCTTGCTTC IID7757111/=;?///:D>777;EEGAAAEEIHHIIIIIIIIIIIIIIBBBIIIIH==<<<DDGEEE;<<<A><<<DEDDA>>>D?1112544556::03---//25.22=;DD?;;;>BDDDEEEGGGA<888<BAA888<GGGGGEB?9::DD551 NM:i:15 MD:Z:51^T13^A12^A9^AA5^A7^AAAA8^T28^T5^A2^T18   RG:Z:GJP00TM04
diff --git a/tests/pysam_data/ex9_fail.sam b/tests/pysam_data/ex9_fail.sam
new file mode 100644 (file)
index 0000000..300d6e2
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,1022 @@
+@HD    VN:1.0  GO:none SO:coordinate
+@SQ    SN:CUTC000001   LN:810
+@SQ    SN:CUTC000002   LN:1213
+@SQ    SN:CUTC000003   LN:525
+@SQ    SN:CUTC000004   LN:620
+@SQ    SN:CUTC000005   LN:550
+@SQ    SN:CUTC000006   LN:723
+@SQ    SN:CUTC000007   LN:773
+@SQ    SN:CUTC000008   LN:667
+@SQ    SN:CUTC000009   LN:593
+@SQ    SN:CUTC000010   LN:556
+@SQ    SN:CUTC000011   LN:519
+@SQ    SN:CUTC000012   LN:537
+@SQ    SN:CUTC000013   LN:930
+@SQ    SN:CUTC000014   LN:944
+@SQ    SN:CUTC000015   LN:829
+@SQ    SN:CUTC000016   LN:1109
+@SQ    SN:CUTC000017   LN:513
+@SQ    SN:CUTC000018   LN:1043
+@SQ    SN:CUTC000019   LN:884
+@SQ    SN:CUTC000020   LN:567
+@SQ    SN:CUTC000021   LN:1001
+@SQ    SN:CUTC000022   LN:754
+@SQ    SN:CUTC000023   LN:1045
+@SQ    SN:CUTC000024   LN:1091
+@SQ    SN:CUTC000025   LN:606
+@SQ    SN:CUTC000026   LN:635
+@SQ    SN:CUTC000027   LN:563
+@SQ    SN:CUTC000028   LN:830
+@SQ    SN:CUTC000029   LN:1456
+@SQ    SN:CUTC000030   LN:872
+@SQ    SN:CUTC000031   LN:742
+@SQ    SN:CUTC000032   LN:553
+@SQ    SN:CUTC000033   LN:624
+@SQ    SN:CUTC000034   LN:641
+@SQ    SN:CUTC000035   LN:695
+@SQ    SN:CUTC000036   LN:1519
+@SQ    SN:CUTC000037   LN:536
+@SQ    SN:CUTC000038   LN:619
+@SQ    SN:CUTC000039   LN:643
+@SQ    SN:CUTC000040   LN:650
+@SQ    SN:CUTC000041   LN:571
+@SQ    SN:CUTC000042   LN:1457
+@SQ    SN:CUTC000043   LN:618
+@SQ    SN:CUTC000044   LN:1261
+@SQ    SN:CUTC000045   LN:544
+@SQ    SN:CUTC000046   LN:1234
+@SQ    SN:CUTC000047   LN:867
+@SQ    SN:CUTC000048   LN:792
+@SQ    SN:CUTC000049   LN:1076
+@SQ    SN:CUTC000050   LN:479
+@SQ    SN:CUTC000051   LN:584
+@SQ    SN:CUTC000052   LN:841
+@SQ    SN:CUTC000053   LN:518
+@SQ    SN:CUTC000054   LN:1052
+@SQ    SN:CUTC000055   LN:626
+@SQ    SN:CUTC000056   LN:773
+@SQ    SN:CUTC000057   LN:542
+@SQ    SN:CUTC000058   LN:566
+@SQ    SN:CUTC000059   LN:931
+@SQ    SN:CUTC000060   LN:755
+@SQ    SN:CUTC000061   LN:606
+@SQ    SN:CUTC000062   LN:640
+@SQ    SN:CUTC000063   LN:667
+@SQ    SN:CUTC000064   LN:1717
+@SQ    SN:CUTC000065   LN:695
+@SQ    SN:CUTC000066   LN:1735
+@SQ    SN:CUTC000067   LN:474
+@SQ    SN:CUTC000068   LN:813
+@SQ    SN:CUTC000069   LN:746
+@SQ    SN:CUTC000070   LN:1141
+@SQ    SN:CUTC000071   LN:624
+@SQ    SN:CUTC000072   LN:1097
+@SQ    SN:CUTC000073   LN:510
+@SQ    SN:CUTC000074   LN:638
+@SQ    SN:CUTC000075   LN:682
+@SQ    SN:CUTC000076   LN:1043
+@SQ    SN:CUTC000077   LN:727
+@SQ    SN:CUTC000078   LN:1124
+@SQ    SN:CUTC000079   LN:711
+@SQ    SN:CUTC000080   LN:578
+@SQ    SN:CUTC000081   LN:718
+@SQ    SN:CUTC000082   LN:1779
+@SQ    SN:CUTC000083   LN:630
+@SQ    SN:CUTC000084   LN:850
+@SQ    SN:CUTC000085   LN:590
+@SQ    SN:CUTC000086   LN:578
+@SQ    SN:CUTC000087   LN:727
+@SQ    SN:CUTC000088   LN:582
+@SQ    SN:CUTC000089   LN:632
+@SQ    SN:CUTC000090   LN:792
+@SQ    SN:CUTC000091   LN:553
+@SQ    SN:CUTC000092   LN:606
+@SQ    SN:CUTC000093   LN:1263
+@SQ    SN:CUTC000094   LN:1119
+@SQ    SN:CUTC000095   LN:1107
+@SQ    SN:CUTC000096   LN:1240
+@SQ    SN:CUTC000097   LN:578
+@SQ    SN:CUTC000098   LN:739
+@SQ    SN:CUTC000099   LN:959
+@SQ    SN:CUTC000100   LN:701
+@SQ    SN:CUTC000101   LN:1047
+@SQ    SN:CUTC000102   LN:961
+@SQ    SN:CUTC000103   LN:548
+@SQ    SN:CUTC000104   LN:579
+@SQ    SN:CUTC000105   LN:1376
+@SQ    SN:CUTC000106   LN:1202
+@SQ    SN:CUTC000107   LN:615
+@SQ    SN:CUTC000108   LN:634
+@SQ    SN:CUTC000109   LN:742
+@SQ    SN:CUTC000110   LN:645
+@SQ    SN:CUTC000111   LN:567
+@SQ    SN:CUTC000112   LN:715
+@SQ    SN:CUTC000113   LN:705
+@SQ    SN:CUTC000114   LN:548
+@SQ    SN:CUTC000115   LN:555
+@SQ    SN:CUTC000116   LN:1370
+@SQ    SN:CUTC000117   LN:715
+@SQ    SN:CUTC000118   LN:737
+@SQ    SN:CUTC000119   LN:595
+@SQ    SN:CUTC000120   LN:674
+@SQ    SN:CUTC000121   LN:858
+@SQ    SN:CUTC000122   LN:571
+@SQ    SN:CUTC000123   LN:656
+@SQ    SN:CUTC000124   LN:923
+@SQ    SN:CUTC000125   LN:487
+@SQ    SN:CUTC000126   LN:488
+@SQ    SN:CUTC000127   LN:548
+@SQ    SN:CUTC000128   LN:547
+@SQ    SN:CUTC000129   LN:593
+@SQ    SN:CUTC000130   LN:980
+@SQ    SN:CUTC000131   LN:605
+@SQ    SN:CUTC000132   LN:942
+@SQ    SN:CUTC000133   LN:599
+@SQ    SN:CUTC000134   LN:755
+@SQ    SN:CUTC000135   LN:544
+@SQ    SN:CUTC000136   LN:623
+@SQ    SN:CUTC000137   LN:680
+@SQ    SN:CUTC000138   LN:633
+@SQ    SN:CUTC000139   LN:4441
+@SQ    SN:CUTC000140   LN:894
+@SQ    SN:CUTC000141   LN:688
+@SQ    SN:CUTC000142   LN:683
+@SQ    SN:CUTC000143   LN:679
+@SQ    SN:CUTC000144   LN:698
+@SQ    SN:CUTC000145   LN:629
+@SQ    SN:CUTC000146   LN:534
+@SQ    SN:CUTC000147   LN:643
+@SQ    SN:CUTC000148   LN:614
+@SQ    SN:CUTC000149   LN:845
+@SQ    SN:CUTC000150   LN:652
+@SQ    SN:CUTC000151   LN:1332
+@SQ    SN:CUTC000152   LN:1091
+@SQ    SN:CUTC000153   LN:702
+@SQ    SN:CUTC000154   LN:677
+@SQ    SN:CUTC000155   LN:902
+@SQ    SN:CUTC000156   LN:557
+@SQ    SN:CUTC000157   LN:735
+@SQ    SN:CUTC000158   LN:940
+@SQ    SN:CUTC000159   LN:668
+@SQ    SN:CUTC000160   LN:2002
+@SQ    SN:CUTC000161   LN:665
+@SQ    SN:CUTC000162   LN:907
+@SQ    SN:CUTC000163   LN:497
+@SQ    SN:CUTC000164   LN:966
+@SQ    SN:CUTC000165   LN:645
+@SQ    SN:CUTC000166   LN:595
+@SQ    SN:CUTC000167   LN:651
+@SQ    SN:CUTC000168   LN:410
+@SQ    SN:CUTC000169   LN:1122
+@SQ    SN:CUTC000170   LN:1021
+@SQ    SN:CUTC000171   LN:804
+@SQ    SN:CUTC000172   LN:972
+@SQ    SN:CUTC000173   LN:1839
+@SQ    SN:CUTC000174   LN:647
+@SQ    SN:CUTC000175   LN:675
+@SQ    SN:CUTC000176   LN:647
+@SQ    SN:CUTC000177   LN:1713
+@SQ    SN:CUTC000178   LN:911
+@SQ    SN:CUTC000179   LN:664
+@SQ    SN:CUTC000180   LN:765
+@SQ    SN:CUTC000181   LN:950
+@SQ    SN:CUTC000182   LN:914
+@SQ    SN:CUTC000183   LN:1166
+@SQ    SN:CUTC000184   LN:834
+@SQ    SN:CUTC000185   LN:812
+@SQ    SN:CUTC000186   LN:793
+@SQ    SN:CUTC000187   LN:1148
+@SQ    SN:CUTC000188   LN:1376
+@SQ    SN:CUTC000189   LN:724
+@SQ    SN:CUTC000190   LN:762
+@SQ    SN:CUTC000191   LN:940
+@SQ    SN:CUTC000192   LN:707
+@SQ    SN:CUTC000193   LN:1596
+@SQ    SN:CUTC000194   LN:557
+@SQ    SN:CUTC000195   LN:596
+@SQ    SN:CUTC000196   LN:930
+@SQ    SN:CUTC000197   LN:1447
+@SQ    SN:CUTC000198   LN:566
+@SQ    SN:CUTC000199   LN:686
+@SQ    SN:CUTC000200   LN:685
+@SQ    SN:CUTC000201   LN:579
+@SQ    SN:CUTC000202   LN:1282
+@SQ    SN:CUTC000203   LN:1601
+@SQ    SN:CUTC000204   LN:1034
+@SQ    SN:CUTC000205   LN:1370
+@SQ    SN:CUTC000206   LN:530
+@SQ    SN:CUTC000207   LN:947
+@SQ    SN:CUTC000208   LN:655
+@SQ    SN:CUTC000209   LN:611
+@SQ    SN:CUTC000210   LN:700
+@SQ    SN:CUTC000211   LN:940
+@SQ    SN:CUTC000212   LN:496
+@SQ    SN:CUTC000213   LN:849
+@SQ    SN:CUTC000214   LN:713
+@SQ    SN:CUTC000215   LN:879
+@SQ    SN:CUTC000216   LN:686
+@SQ    SN:CUTC000217   LN:655
+@SQ    SN:CUTC000218   LN:1139
+@SQ    SN:CUTC000219   LN:712
+@SQ    SN:CUTC000220   LN:987
+@SQ    SN:CUTC000221   LN:581
+@SQ    SN:CUTC000222   LN:867
+@SQ    SN:CUTC000223   LN:1591
+@SQ    SN:CUTC000224   LN:661
+@SQ    SN:CUTC000225   LN:1490
+@SQ    SN:CUTC000226   LN:1207
+@SQ    SN:CUTC000227   LN:785
+@SQ    SN:CUTC000228   LN:700
+@SQ    SN:CUTC000229   LN:474
+@SQ    SN:CUTC000230   LN:539
+@SQ    SN:CUTC000231   LN:1095
+@SQ    SN:CUTC000232   LN:556
+@SQ    SN:CUTC000233   LN:609
+@SQ    SN:CUTC000234   LN:1335
+@SQ    SN:CUTC000235   LN:566
+@SQ    SN:CUTC000236   LN:612
+@SQ    SN:CUTC000237   LN:918
+@SQ    SN:CUTC000238   LN:572
+@SQ    SN:CUTC000239   LN:690
+@SQ    SN:CUTC000240   LN:539
+@SQ    SN:CUTC000241   LN:1861
+@SQ    SN:CUTC000242   LN:730
+@SQ    SN:CUTC000243   LN:775
+@SQ    SN:CUTC000244   LN:1439
+@SQ    SN:CUTC000245   LN:687
+@SQ    SN:CUTC000246   LN:754
+@SQ    SN:CUTC000247   LN:646
+@SQ    SN:CUTC000248   LN:543
+@SQ    SN:CUTC000249   LN:1182
+@SQ    SN:CUTC000250   LN:650
+@SQ    SN:CUTC000251   LN:732
+@SQ    SN:CUTC000252   LN:1040
+@SQ    SN:CUTC000253   LN:979
+@SQ    SN:CUTC000254   LN:1055
+@SQ    SN:CUTC000255   LN:971
+@SQ    SN:CUTC000256   LN:817
+@SQ    SN:CUTC000257   LN:606
+@SQ    SN:CUTC000258   LN:624
+@SQ    SN:CUTC000259   LN:516
+@SQ    SN:CUTC000260   LN:987
+@SQ    SN:CUTC000261   LN:1071
+@SQ    SN:CUTC000262   LN:588
+@SQ    SN:CUTC000263   LN:1389
+@SQ    SN:CUTC000264   LN:672
+@SQ    SN:CUTC000265   LN:954
+@SQ    SN:CUTC000266   LN:1072
+@SQ    SN:CUTC000267   LN:713
+@SQ    SN:CUTC000268   LN:1192
+@SQ    SN:CUTC000269   LN:540
+@SQ    SN:CUTC000270   LN:592
+@SQ    SN:CUTC000271   LN:901
+@SQ    SN:CUTC000272   LN:420
+@SQ    SN:CUTC000273   LN:670
+@SQ    SN:CUTC000274   LN:1088
+@SQ    SN:CUTC000275   LN:786
+@SQ    SN:CUTC000276   LN:846
+@SQ    SN:CUTC000277   LN:839
+@SQ    SN:CUTC000278   LN:901
+@SQ    SN:CUTC000279   LN:3005
+@SQ    SN:CUTC000280   LN:727
+@SQ    SN:CUTC000281   LN:982
+@SQ    SN:CUTC000282   LN:553
+@SQ    SN:CUTC000283   LN:513
+@SQ    SN:CUTC000284   LN:666
+@SQ    SN:CUTC000285   LN:480
+@SQ    SN:CUTC000286   LN:726
+@SQ    SN:CUTC000287   LN:1225
+@SQ    SN:CUTC000288   LN:783
+@SQ    SN:CUTC000289   LN:802
+@SQ    SN:CUTC000290   LN:1190
+@SQ    SN:CUTC000291   LN:1323
+@SQ    SN:CUTC000292   LN:700
+@SQ    SN:CUTC000293   LN:748
+@SQ    SN:CUTC000294   LN:840
+@SQ    SN:CUTC000295   LN:447
+@SQ    SN:CUTC000296   LN:475
+@SQ    SN:CUTC000297   LN:693
+@SQ    SN:CUTC000298   LN:838
+@SQ    SN:CUTC000299   LN:933
+@SQ    SN:CUTC000300   LN:1175
+@SQ    SN:CUTC000301   LN:795
+@SQ    SN:CUTC000302   LN:514
+@SQ    SN:CUTC000303   LN:650
+@SQ    SN:CUTC000304   LN:1015
+@SQ    SN:CUTC000305   LN:869
+@SQ    SN:CUTC000306   LN:1218
+@SQ    SN:CUTC000307   LN:943
+@SQ    SN:CUTC000308   LN:879
+@SQ    SN:CUTC000309   LN:758
+@SQ    SN:CUTC000310   LN:895
+@SQ    SN:CUTC000311   LN:1060
+@SQ    SN:CUTC000312   LN:1414
+@SQ    SN:CUTC000313   LN:1841
+@SQ    SN:CUTC000314   LN:1040
+@SQ    SN:CUTC000315   LN:769
+@SQ    SN:CUTC000316   LN:1400
+@SQ    SN:CUTC000317   LN:1097
+@SQ    SN:CUTC000318   LN:953
+@SQ    SN:CUTC000319   LN:793
+@SQ    SN:CUTC000320   LN:840
+@SQ    SN:CUTC000321   LN:734
+@SQ    SN:CUTC000322   LN:528
+@SQ    SN:CUTC000323   LN:492
+@SQ    SN:CUTC000324   LN:737
+@SQ    SN:CUTC000325   LN:681
+@SQ    SN:CUTC000326   LN:446
+@SQ    SN:CUTC000327   LN:836
+@SQ    SN:CUTC000328   LN:745
+@SQ    SN:CUTC000329   LN:1514
+@SQ    SN:CUTC000330   LN:773
+@SQ    SN:CUTC000331   LN:608
+@SQ    SN:CUTC000332   LN:814
+@SQ    SN:CUTC000333   LN:655
+@SQ    SN:CUTC000334   LN:697
+@SQ    SN:CUTC000335   LN:818
+@SQ    SN:CUTC000336   LN:650
+@SQ    SN:CUTC000337   LN:1787
+@SQ    SN:CUTC000338   LN:695
+@SQ    SN:CUTC000339   LN:1638
+@SQ    SN:CUTC000340   LN:903
+@SQ    SN:CUTC000341   LN:638
+@SQ    SN:CUTC000342   LN:659
+@SQ    SN:CUTC000343   LN:1335
+@SQ    SN:CUTC000344   LN:775
+@SQ    SN:CUTC000345   LN:834
+@SQ    SN:CUTC000346   LN:1356
+@SQ    SN:CUTC000347   LN:1566
+@SQ    SN:CUTC000348   LN:1240
+@SQ    SN:CUTC000349   LN:810
+@SQ    SN:CUTC000350   LN:885
+@SQ    SN:CUTC000351   LN:532
+@SQ    SN:CUTC000352   LN:434
+@SQ    SN:CUTC000353   LN:705
+@SQ    SN:CUTC000354   LN:740
+@SQ    SN:CUTC000355   LN:833
+@SQ    SN:CUTC000356   LN:680
+@SQ    SN:CUTC000357   LN:1362
+@SQ    SN:CUTC000358   LN:621
+@SQ    SN:CUTC000359   LN:1108
+@SQ    SN:CUTC000360   LN:721
+@SQ    SN:CUTC000361   LN:709
+@SQ    SN:CUTC000362   LN:908
+@SQ    SN:CUTC000363   LN:1044
+@SQ    SN:CUTC000364   LN:701
+@SQ    SN:CUTC000365   LN:798
+@SQ    SN:CUTC000366   LN:550
+@SQ    SN:CUTC000367   LN:1007
+@SQ    SN:CUTC000368   LN:1355
+@SQ    SN:CUTC000369   LN:469
+@SQ    SN:CUTC000370   LN:629
+@SQ    SN:CUTC000371   LN:1065
+@SQ    SN:CUTC000372   LN:415
+@SQ    SN:CUTC000373   LN:977
+@SQ    SN:CUTC000374   LN:547
+@SQ    SN:CUTC000375   LN:699
+@SQ    SN:CUTC000376   LN:1150
+@SQ    SN:CUTC000377   LN:576
+@SQ    SN:CUTC000378   LN:626
+@SQ    SN:CUTC000379   LN:1326
+@SQ    SN:CUTC000380   LN:621
+@SQ    SN:CUTC000381   LN:900
+@SQ    SN:CUTC000382   LN:1573
+@SQ    SN:CUTC000383   LN:634
+@SQ    SN:CUTC000384   LN:1186
+@SQ    SN:CUTC000385   LN:623
+@SQ    SN:CUTC000386   LN:1082
+@SQ    SN:CUTC000387   LN:948
+@SQ    SN:CUTC000388   LN:912
+@SQ    SN:CUTC000389   LN:1564
+@SQ    SN:CUTC000390   LN:1046
+@SQ    SN:CUTC000391   LN:1302
+@SQ    SN:CUTC000392   LN:1070
+@SQ    SN:CUTC000393   LN:519
+@SQ    SN:CUTC000394   LN:558
+@SQ    SN:CUTC000395   LN:802
+@SQ    SN:CUTC000396   LN:592
+@SQ    SN:CUTC000397   LN:903
+@SQ    SN:CUTC000398   LN:926
+@SQ    SN:CUTC000399   LN:1054
+@SQ    SN:CUTC000400   LN:626
+@SQ    SN:CUTC000401   LN:1078
+@SQ    SN:CUTC000402   LN:1369
+@SQ    SN:CUTC000403   LN:1616
+@SQ    SN:CUTC000404   LN:608
+@SQ    SN:CUTC000405   LN:1418
+@SQ    SN:CUTC000406   LN:583
+@SQ    SN:CUTC000407   LN:658
+@SQ    SN:CUTC000408   LN:1265
+@SQ    SN:CUTC000409   LN:745
+@SQ    SN:CUTC000410   LN:690
+@SQ    SN:CUTC000411   LN:609
+@SQ    SN:CUTC000412   LN:1061
+@SQ    SN:CUTC000413   LN:899
+@SQ    SN:CUTC000414   LN:925
+@SQ    SN:CUTC000415   LN:552
+@SQ    SN:CUTC000416   LN:559
+@SQ    SN:CUTC000417   LN:964
+@SQ    SN:CUTC000418   LN:855
+@SQ    SN:CUTC000419   LN:1045
+@SQ    SN:CUTC000420   LN:1479
+@SQ    SN:CUTC000421   LN:537
+@SQ    SN:CUTC000422   LN:1080
+@SQ    SN:CUTC000423   LN:792
+@SQ    SN:CUTC000424   LN:1201
+@SQ    SN:CUTC000425   LN:1332
+@SQ    SN:CUTC000426   LN:929
+@SQ    SN:CUTC000427   LN:606
+@SQ    SN:CUTC000428   LN:727
+@SQ    SN:CUTC000429   LN:1085
+@SQ    SN:CUTC000430   LN:504
+@SQ    SN:CUTC000431   LN:1231
+@SQ    SN:CUTC000432   LN:859
+@SQ    SN:CUTC000433   LN:728
+@SQ    SN:CUTC000434   LN:553
+@SQ    SN:CUTC000435   LN:1124
+@SQ    SN:CUTC000436   LN:1430
+@SQ    SN:CUTC000437   LN:1770
+@SQ    SN:CUTC000438   LN:831
+@SQ    SN:CUTC000439   LN:1062
+@SQ    SN:CUTC000440   LN:945
+@SQ    SN:CUTC000441   LN:1082
+@SQ    SN:CUTC000442   LN:2057
+@SQ    SN:CUTC000443   LN:1425
+@SQ    SN:CUTC000444   LN:1133
+@SQ    SN:CUTC000445   LN:1478
+@SQ    SN:CUTC000446   LN:755
+@SQ    SN:CUTC000447   LN:548
+@SQ    SN:CUTC000448   LN:1087
+@SQ    SN:CUTC000449   LN:594
+@SQ    SN:CUTC000450   LN:1012
+@SQ    SN:CUTC000451   LN:1777
+@SQ    SN:CUTC000452   LN:631
+@SQ    SN:CUTC000453   LN:914
+@SQ    SN:CUTC000454   LN:1701
+@SQ    SN:CUTC000455   LN:869
+@SQ    SN:CUTC000456   LN:1024
+@SQ    SN:CUTC000457   LN:802
+@SQ    SN:CUTC000458   LN:663
+@SQ    SN:CUTC000459   LN:951
+@SQ    SN:CUTC000460   LN:739
+@SQ    SN:CUTC000461   LN:658
+@SQ    SN:CUTC000462   LN:1055
+@SQ    SN:CUTC000463   LN:807
+@SQ    SN:CUTC000464   LN:1157
+@SQ    SN:CUTC000465   LN:1340
+@SQ    SN:CUTC000466   LN:1016
+@SQ    SN:CUTC000467   LN:646
+@SQ    SN:CUTC000468   LN:998
+@SQ    SN:CUTC000469   LN:687
+@SQ    SN:CUTC000470   LN:919
+@SQ    SN:CUTC000471   LN:1062
+@SQ    SN:CUTC000472   LN:1454
+@SQ    SN:CUTC000473   LN:875
+@SQ    SN:CUTC000474   LN:774
+@SQ    SN:CUTC000475   LN:671
+@SQ    SN:CUTC000476   LN:880
+@SQ    SN:CUTC000477   LN:1297
+@SQ    SN:CUTC000478   LN:722
+@SQ    SN:CUTC000479   LN:985
+@SQ    SN:CUTC000480   LN:797
+@SQ    SN:CUTC000481   LN:741
+@SQ    SN:CUTC000482   LN:598
+@SQ    SN:CUTC000483   LN:841
+@SQ    SN:CUTC000484   LN:1193
+@SQ    SN:CUTC000485   LN:856
+@SQ    SN:CUTC000486   LN:1020
+@SQ    SN:CUTC000487   LN:984
+@SQ    SN:CUTC000488   LN:1145
+@SQ    SN:CUTC000489   LN:862
+@SQ    SN:CUTC000490   LN:558
+@SQ    SN:CUTC000491   LN:484
+@SQ    SN:CUTC000492   LN:1097
+@SQ    SN:CUTC000493   LN:763
+@SQ    SN:CUTC000494   LN:2369
+@SQ    SN:CUTC000495   LN:993
+@SQ    SN:CUTC000496   LN:716
+@SQ    SN:CUTC000497   LN:590
+@SQ    SN:CUTC000498   LN:992
+@SQ    SN:CUTC000499   LN:1223
+@SQ    SN:CUTC000500   LN:956
+@SQ    SN:CUTC000501   LN:761
+@SQ    SN:CUTC000502   LN:1533
+@SQ    SN:CUTC000503   LN:951
+@SQ    SN:CUTC000504   LN:1599
+@SQ    SN:CUTC000505   LN:1393
+@SQ    SN:CUTC000506   LN:1064
+@SQ    SN:CUTC000507   LN:1198
+@SQ    SN:CUTC000508   LN:650
+@SQ    SN:CUTC000509   LN:1190
+@SQ    SN:CUTC000510   LN:1168
+@SQ    SN:CUTC000511   LN:926
+@SQ    SN:CUTC000512   LN:1528
+@SQ    SN:CUTC000513   LN:516
+@SQ    SN:CUTC000514   LN:886
+@SQ    SN:CUTC000515   LN:779
+@SQ    SN:CUTC000516   LN:955
+@SQ    SN:CUTC000517   LN:1795
+@SQ    SN:CUTC000518   LN:1028
+@SQ    SN:CUTC000519   LN:799
+@SQ    SN:CUTC000520   LN:1170
+@SQ    SN:CUTC000521   LN:1348
+@SQ    SN:CUTC000522   LN:611
+@SQ    SN:CUTC000523   LN:795
+@SQ    SN:CUTC000524   LN:767
+@SQ    SN:CUTC000525   LN:679
+@SQ    SN:CUTC000526   LN:1216
+@SQ    SN:CUTC000527   LN:1105
+@SQ    SN:CUTC000528   LN:757
+@SQ    SN:CUTC000529   LN:951
+@SQ    SN:CUTC000530   LN:446
+@SQ    SN:CUTC000531   LN:759
+@SQ    SN:CUTC000532   LN:751
+@SQ    SN:CUTC000533   LN:629
+@SQ    SN:CUTC000534   LN:903
+@SQ    SN:CUTC000535   LN:652
+@SQ    SN:CUTC000536   LN:584
+@SQ    SN:CUTC000537   LN:785
+@SQ    SN:CUTC000538   LN:3820
+@SQ    SN:CUTC000539   LN:582
+@SQ    SN:CUTC000540   LN:980
+@SQ    SN:CUTC000541   LN:613
+@SQ    SN:CUTC000542   LN:978
+@SQ    SN:CUTC000543   LN:1717
+@SQ    SN:CUTC000544   LN:1069
+@SQ    SN:CUTC000545   LN:770
+@SQ    SN:CUTC000546   LN:1249
+@SQ    SN:CUTC000547   LN:940
+@SQ    SN:CUTC000548   LN:1018
+@SQ    SN:CUTC000549   LN:962
+@SQ    SN:CUTC000550   LN:768
+@SQ    SN:CUTC000551   LN:576
+@SQ    SN:CUTC000552   LN:687
+@SQ    SN:CUTC000553   LN:1354
+@SQ    SN:CUTC000554   LN:664
+@SQ    SN:CUTC000555   LN:847
+@SQ    SN:CUTC000556   LN:1580
+@SQ    SN:CUTC000557   LN:950
+@SQ    SN:CUTC000558   LN:877
+@SQ    SN:CUTC000559   LN:857
+@SQ    SN:CUTC000560   LN:802
+@SQ    SN:CUTC000561   LN:1022
+@SQ    SN:CUTC000562   LN:1082
+@SQ    SN:CUTC000563   LN:623
+@SQ    SN:CUTC000564   LN:1403
+@SQ    SN:CUTC000565   LN:1766
+@SQ    SN:CUTC000566   LN:891
+@SQ    SN:CUTC000567   LN:864
+@SQ    SN:CUTC000568   LN:1010
+@SQ    SN:CUTC000569   LN:510
+@SQ    SN:CUTC000570   LN:812
+@SQ    SN:CUTC000571   LN:582
+@SQ    SN:CUTC000572   LN:677
+@SQ    SN:CUTC000573   LN:899
+@SQ    SN:CUTC000574   LN:1121
+@SQ    SN:CUTC000575   LN:601
+@SQ    SN:CUTC000576   LN:1757
+@SQ    SN:CUTC000577   LN:1015
+@SQ    SN:CUTC000578   LN:1147
+@SQ    SN:CUTC000579   LN:692
+@SQ    SN:CUTC000580   LN:638
+@SQ    SN:CUTC000581   LN:504
+@SQ    SN:CUTC000582   LN:945
+@SQ    SN:CUTC000583   LN:512
+@SQ    SN:CUTC000584   LN:761
+@SQ    SN:CUTC000585   LN:957
+@SQ    SN:CUTC000586   LN:611
+@SQ    SN:CUTC000587   LN:776
+@SQ    SN:CUTC000588   LN:658
+@SQ    SN:CUTC000589   LN:727
+@SQ    SN:CUTC000590   LN:833
+@SQ    SN:CUTC000591   LN:488
+@SQ    SN:CUTC000592   LN:774
+@SQ    SN:CUTC000593   LN:784
+@SQ    SN:CUTC000594   LN:835
+@SQ    SN:CUTC000595   LN:752
+@SQ    SN:CUTC000596   LN:523
+@SQ    SN:CUTC000597   LN:468
+@SQ    SN:CUTC000598   LN:1021
+@SQ    SN:CUTC000599   LN:982
+@SQ    SN:CUTC000600   LN:671
+@SQ    SN:CUTC000601   LN:1063
+@SQ    SN:CUTC000602   LN:482
+@SQ    SN:CUTC000603   LN:1087
+@SQ    SN:CUTC000604   LN:1043
+@SQ    SN:CUTC000605   LN:1176
+@SQ    SN:CUTC000606   LN:897
+@SQ    SN:CUTC000607   LN:764
+@SQ    SN:CUTC000608   LN:1724
+@SQ    SN:CUTC000609   LN:579
+@SQ    SN:CUTC000610   LN:657
+@SQ    SN:CUTC000611   LN:627
+@SQ    SN:CUTC000612   LN:1110
+@SQ    SN:CUTC000613   LN:1065
+@SQ    SN:CUTC000614   LN:765
+@SQ    SN:CUTC000615   LN:813
+@SQ    SN:CUTC000616   LN:1510
+@SQ    SN:CUTC000617   LN:906
+@SQ    SN:CUTC000618   LN:1733
+@SQ    SN:CUTC000619   LN:490
+@SQ    SN:CUTC000620   LN:841
+@SQ    SN:CUTC000621   LN:1331
+@SQ    SN:CUTC000622   LN:1082
+@SQ    SN:CUTC000623   LN:1310
+@SQ    SN:CUTC000624   LN:977
+@SQ    SN:CUTC000625   LN:1122
+@SQ    SN:CUTC000626   LN:613
+@SQ    SN:CUTC000627   LN:486
+@SQ    SN:CUTC000628   LN:1411
+@SQ    SN:CUTC000629   LN:1005
+@SQ    SN:CUTC000630   LN:1090
+@SQ    SN:CUTC000631   LN:715
+@SQ    SN:CUTC000632   LN:1475
+@SQ    SN:CUTC000633   LN:823
+@SQ    SN:CUTC000634   LN:949
+@SQ    SN:CUTC000635   LN:1125
+@SQ    SN:CUTC000636   LN:904
+@SQ    SN:CUTC000637   LN:472
+@SQ    SN:CUTC000638   LN:668
+@SQ    SN:CUTC000639   LN:788
+@SQ    SN:CUTC000640   LN:1314
+@SQ    SN:CUTC000641   LN:920
+@SQ    SN:CUTC000642   LN:952
+@SQ    SN:CUTC000643   LN:859
+@SQ    SN:CUTC000644   LN:1001
+@SQ    SN:CUTC000645   LN:1386
+@SQ    SN:CUTC000646   LN:1109
+@SQ    SN:CUTC000647   LN:708
+@SQ    SN:CUTC000648   LN:1011
+@SQ    SN:CUTC000649   LN:1061
+@SQ    SN:CUTC000650   LN:1213
+@SQ    SN:CUTC000651   LN:633
+@SQ    SN:CUTC000652   LN:667
+@SQ    SN:CUTC000653   LN:1364
+@SQ    SN:CUTC000654   LN:593
+@SQ    SN:CUTC000655   LN:1099
+@SQ    SN:CUTC000656   LN:1155
+@SQ    SN:CUTC000657   LN:482
+@SQ    SN:CUTC000658   LN:1122
+@SQ    SN:CUTC000659   LN:1060
+@SQ    SN:CUTC000660   LN:558
+@SQ    SN:CUTC000661   LN:957
+@SQ    SN:CUTC000662   LN:851
+@SQ    SN:CUTC000663   LN:1100
+@SQ    SN:CUTC000664   LN:868
+@SQ    SN:CUTC000665   LN:1147
+@SQ    SN:CUTC000666   LN:572
+@SQ    SN:CUTC000667   LN:1032
+@SQ    SN:CUTC000668   LN:703
+@SQ    SN:CUTC000669   LN:1411
+@SQ    SN:CUTC000670   LN:1938
+@SQ    SN:CUTC000671   LN:1586
+@SQ    SN:CUTC000672   LN:1165
+@SQ    SN:CUTC000673   LN:897
+@SQ    SN:CUTC000674   LN:845
+@SQ    SN:CUTC000675   LN:876
+@SQ    SN:CUTC000676   LN:756
+@SQ    SN:CUTC000677   LN:1253
+@SQ    SN:CUTC000678   LN:812
+@SQ    SN:CUTC000679   LN:581
+@SQ    SN:CUTC000680   LN:753
+@SQ    SN:CUTC000681   LN:1146
+@SQ    SN:CUTC000682   LN:925
+@SQ    SN:CUTC000683   LN:819
+@SQ    SN:CUTC000684   LN:913
+@SQ    SN:CUTC000685   LN:946
+@SQ    SN:CUTC000686   LN:1112
+@SQ    SN:CUTC000687   LN:1056
+@SQ    SN:CUTC000688   LN:941
+@SQ    SN:CUTC000689   LN:892
+@SQ    SN:CUTC000690   LN:780
+@SQ    SN:CUTC000691   LN:587
+@SQ    SN:CUTC000692   LN:696
+@SQ    SN:CUTC000693   LN:810
+@SQ    SN:CUTC000694   LN:1198
+@SQ    SN:CUTC000695   LN:1089
+@SQ    SN:CUTC000696   LN:596
+@SQ    SN:CUTC000697   LN:1100
+@SQ    SN:CUTC000698   LN:639
+@SQ    SN:CUTC000699   LN:1254
+@SQ    SN:CUTC000700   LN:709
+@SQ    SN:CUTC000701   LN:797
+@SQ    SN:CUTC000702   LN:915
+@SQ    SN:CUTC000703   LN:2222
+@SQ    SN:CUTC000704   LN:772
+@SQ    SN:CUTC000705   LN:1080
+@SQ    SN:CUTC000706   LN:1421
+@SQ    SN:CUTC000707   LN:1369
+@SQ    SN:CUTC000708   LN:475
+@SQ    SN:CUTC000709   LN:775
+@SQ    SN:CUTC000710   LN:1192
+@SQ    SN:CUTC000711   LN:1226
+@SQ    SN:CUTC000712   LN:373
+@SQ    SN:CUTC000713   LN:483
+@SQ    SN:CUTC000714   LN:647
+@SQ    SN:CUTC000715   LN:1087
+@SQ    SN:CUTC000716   LN:1006
+@SQ    SN:CUTC000717   LN:1179
+@SQ    SN:CUTC000718   LN:1032
+@SQ    SN:CUTC000719   LN:605
+@SQ    SN:CUTC000720   LN:807
+@SQ    SN:CUTC000721   LN:1042
+@SQ    SN:CUTC000722   LN:970
+@SQ    SN:CUTC000723   LN:831
+@SQ    SN:CUTC000724   LN:1140
+@SQ    SN:CUTC000725   LN:1293
+@SQ    SN:CUTC000726   LN:923
+@SQ    SN:CUTC000727   LN:754
+@SQ    SN:CUTC000728   LN:1052
+@SQ    SN:CUTC000729   LN:680
+@SQ    SN:CUTC000730   LN:825
+@SQ    SN:CUTC000731   LN:1366
+@SQ    SN:CUTC000732   LN:2118
+@SQ    SN:CUTC000733   LN:733
+@SQ    SN:CUTC000734   LN:1328
+@SQ    SN:CUTC000735   LN:1059
+@SQ    SN:CUTC000736   LN:1025
+@SQ    SN:CUTC000737   LN:964
+@SQ    SN:CUTC000738   LN:776
+@SQ    SN:CUTC000739   LN:1112
+@SQ    SN:CUTC000740   LN:1200
+@SQ    SN:CUTC000741   LN:634
+@SQ    SN:CUTC000742   LN:840
+@SQ    SN:CUTC000743   LN:1103
+@SQ    SN:CUTC000744   LN:1714
+@SQ    SN:CUTC000745   LN:612
+@SQ    SN:CUTC000746   LN:512
+@SQ    SN:CUTC000747   LN:1120
+@SQ    SN:CUTC000748   LN:957
+@SQ    SN:CUTC000749   LN:821
+@SQ    SN:CUTC000750   LN:475
+@SQ    SN:CUTC000751   LN:957
+@SQ    SN:CUTC000752   LN:743
+@SQ    SN:CUTC000753   LN:533
+@SQ    SN:CUTC000754   LN:1345
+@SQ    SN:CUTC000755   LN:476
+@SQ    SN:CUTC000756   LN:871
+@SQ    SN:CUTC000757   LN:843
+@SQ    SN:CUTC000758   LN:513
+@SQ    SN:CUTC000759   LN:775
+@SQ    SN:CUTC000760   LN:1275
+@SQ    SN:CUTC000761   LN:1375
+@SQ    SN:CUTC000762   LN:1001
+@SQ    SN:CUTC000763   LN:1114
+@SQ    SN:CUTC000764   LN:974
+@SQ    SN:CUTC000765   LN:398
+@SQ    SN:CUTC000766   LN:974
+@SQ    SN:CUTC000767   LN:689
+@SQ    SN:CUTC000768   LN:853
+@SQ    SN:CUTC000769   LN:1029
+@SQ    SN:CUTC000770   LN:1400
+@SQ    SN:CUTC000771   LN:667
+@SQ    SN:CUTC000772   LN:939
+@SQ    SN:CUTC000773   LN:1054
+@SQ    SN:CUTC000774   LN:779
+@SQ    SN:CUTC000775   LN:1247
+@SQ    SN:CUTC000776   LN:1848
+@SQ    SN:CUTC000777   LN:979
+@SQ    SN:CUTC000778   LN:852
+@SQ    SN:CUTC000779   LN:695
+@SQ    SN:CUTC000780   LN:675
+@SQ    SN:CUTC000781   LN:1312
+@SQ    SN:CUTC000782   LN:895
+@SQ    SN:CUTC000783   LN:451
+@SQ    SN:CUTC000784   LN:1063
+@SQ    SN:CUTC000785   LN:719
+@SQ    SN:CUTC000786   LN:915
+@SQ    SN:CUTC000787   LN:1050
+@SQ    SN:CUTC000788   LN:1056
+@SQ    SN:CUTC000789   LN:657
+@SQ    SN:CUTC000790   LN:630
+@SQ    SN:CUTC000791   LN:877
+@SQ    SN:CUTC000792   LN:1279
+@SQ    SN:CUTC000793   LN:875
+@SQ    SN:CUTC000794   LN:1121
+@SQ    SN:CUTC000795   LN:1009
+@SQ    SN:CUTC000796   LN:785
+@SQ    SN:CUTC000797   LN:546
+@SQ    SN:CUTC000798   LN:578
+@SQ    SN:CUTC000799   LN:854
+@SQ    SN:CUTC000800   LN:987
+@SQ    SN:CUTC000801   LN:604
+@SQ    SN:CUTC000802   LN:919
+@SQ    SN:CUTC000803   LN:1633
+@SQ    SN:CUTC000804   LN:984
+@SQ    SN:CUTC000805   LN:559
+@SQ    SN:CUTC000806   LN:788
+@SQ    SN:CUTC000807   LN:918
+@SQ    SN:CUTC000808   LN:846
+@SQ    SN:CUTC000809   LN:939
+@SQ    SN:CUTC000810   LN:946
+@SQ    SN:CUTC000811   LN:874
+@SQ    SN:CUTC000812   LN:886
+@SQ    SN:CUTC000813   LN:813
+@SQ    SN:CUTC000814   LN:1369
+@SQ    SN:CUTC000815   LN:827
+@SQ    SN:CUTC000816   LN:867
+@SQ    SN:CUTC000817   LN:1158
+@SQ    SN:CUTC000818   LN:742
+@SQ    SN:CUTC000819   LN:831
+@SQ    SN:CUTC000820   LN:942
+@SQ    SN:CUTC000821   LN:740
+@SQ    SN:CUTC000822   LN:1191
+@SQ    SN:CUTC000823   LN:2043
+@SQ    SN:CUTC000824   LN:1642
+@SQ    SN:CUTC000825   LN:1314
+@SQ    SN:CUTC000826   LN:723
+@SQ    SN:CUTC000827   LN:966
+@SQ    SN:CUTC000828   LN:995
+@SQ    SN:CUTC000829   LN:1118
+@SQ    SN:CUTC000830   LN:546
+@SQ    SN:CUTC000831   LN:995
+@SQ    SN:CUTC000832   LN:860
+@SQ    SN:CUTC000833   LN:970
+@SQ    SN:CUTC000834   LN:862
+@SQ    SN:CUTC000835   LN:458
+@SQ    SN:CUTC000836   LN:774
+@SQ    SN:CUTC000837   LN:824
+@SQ    SN:CUTC000838   LN:1083
+@SQ    SN:CUTC000839   LN:866
+@SQ    SN:CUTC000840   LN:959
+@SQ    SN:CUTC000841   LN:1275
+@SQ    SN:CUTC000842   LN:1271
+@SQ    SN:CUTC000843   LN:786
+@SQ    SN:CUTC000844   LN:598
+@SQ    SN:CUTC000845   LN:643
+@SQ    SN:CUTC000846   LN:1263
+@SQ    SN:CUTC000847   LN:968
+@SQ    SN:CUTC000848   LN:1210
+@SQ    SN:CUTC000849   LN:634
+@SQ    SN:CUTC000850   LN:1085
+@SQ    SN:CUTC000851   LN:792
+@SQ    SN:CUTC000852   LN:1049
+@SQ    SN:CUTC000853   LN:513
+@SQ    SN:CUTC000854   LN:839
+@SQ    SN:CUTC000855   LN:912
+@SQ    SN:CUTC000856   LN:1127
+@SQ    SN:CUTC000857   LN:796
+@SQ    SN:CUTC000858   LN:769
+@SQ    SN:CUTC000859   LN:455
+@SQ    SN:CUTC000860   LN:1067
+@SQ    SN:CUTC000861   LN:2816
+@SQ    SN:CUTC000862   LN:1486
+@SQ    SN:CUTC000863   LN:1037
+@SQ    SN:CUTC000864   LN:699
+@SQ    SN:CUTC000865   LN:1266
+@SQ    SN:CUTC000866   LN:719
+@SQ    SN:CUTC000867   LN:762
+@SQ    SN:CUTC000868   LN:1182
+@SQ    SN:CUTC000869   LN:825
+@SQ    SN:CUTC000870   LN:1325
+@SQ    SN:CUTC000871   LN:579
+@SQ    SN:CUTC000872   LN:851
+@SQ    SN:CUTC000873   LN:790
+@SQ    SN:CUTC000874   LN:793
+@SQ    SN:CUTC000875   LN:2194
+@SQ    SN:CUTC000876   LN:1237
+@SQ    SN:CUTC000877   LN:856
+@SQ    SN:CUTC000878   LN:1438
+@SQ    SN:CUTC000879   LN:2190
+@SQ    SN:CUTC000880   LN:793
+@SQ    SN:CUTC000881   LN:1844
+@SQ    SN:CUTC000882   LN:1184
+@SQ    SN:CUTC000883   LN:933
+@SQ    SN:CUTC000884   LN:1372
+@SQ    SN:CUTC000885   LN:373
+@SQ    SN:CUTC000886   LN:1141
+@SQ    SN:CUTC000887   LN:447
+@SQ    SN:CUTC000888   LN:1789
+@SQ    SN:CUTC000889   LN:593
+@SQ    SN:CUTC000890   LN:1020
+@SQ    SN:CUTC000891   LN:904
+@SQ    SN:CUTC000892   LN:1417
+@SQ    SN:CUTC000893   LN:823
+@SQ    SN:CUTC000894   LN:1315
+@SQ    SN:CUTC000895   LN:999
+@SQ    SN:CUTC000896   LN:716
+@SQ    SN:CUTC000897   LN:1244
+@SQ    SN:CUTC000898   LN:1059
+@SQ    SN:CUTC000899   LN:741
+@SQ    SN:CUTC000900   LN:762
+@SQ    SN:CUTC000901   LN:589
+@SQ    SN:CUTC000902   LN:1199
+@SQ    SN:CUTC000903   LN:1895
+@SQ    SN:CUTC000904   LN:417
+@SQ    SN:CUTC000905   LN:976
+@SQ    SN:CUTC000906   LN:1405
+@SQ    SN:CUTC000907   LN:1652
+@SQ    SN:CUTC000908   LN:1138
+@SQ    SN:CUTC000909   LN:1099
+@SQ    SN:CUTC000910   LN:777
+@SQ    SN:CUTC000911   LN:1057
+@SQ    SN:CUTC000912   LN:1065
+@SQ    SN:CUTC000913   LN:895
+@SQ    SN:CUTC000914   LN:745
+@SQ    SN:CUTC000915   LN:605
+@SQ    SN:CUTC000916   LN:719
+@SQ    SN:CUTC000917   LN:709
+@SQ    SN:CUTC000918   LN:799
+@SQ    SN:CUTC000919   LN:1057
+@SQ    SN:CUTC000920   LN:867
+@SQ    SN:CUTC000921   LN:629
+@SQ    SN:CUTC000922   LN:780
+@SQ    SN:CUTC000923   LN:856
+@SQ    SN:CUTC000924   LN:814
+@SQ    SN:CUTC000925   LN:786
+@SQ    SN:CUTC000926   LN:1193
+@SQ    SN:CUTC000927   LN:1094
+@SQ    SN:CUTC000928   LN:987
+@SQ    SN:CUTC000929   LN:1380
+@SQ    SN:CUTC000930   LN:1039
+@SQ    SN:CUTC000931   LN:487
+@SQ    SN:CUTC000932   LN:1016
+@SQ    SN:CUTC000933   LN:1449
+@SQ    SN:CUTC000934   LN:2138
+@SQ    SN:CUTC000935   LN:581
+@SQ    SN:CUTC000936   LN:1100
+@SQ    SN:CUTC000937   LN:1035
+@SQ    SN:CUTC000938   LN:966
+@SQ    SN:CUTC000939   LN:856
+@SQ    SN:CUTC000940   LN:802
+@SQ    SN:CUTC000941   LN:892
+@SQ    SN:CUTC000942   LN:1122
+@SQ    SN:CUTC000943   LN:923
+@SQ    SN:CUTC000944   LN:1125
+@SQ    SN:CUTC000945   LN:600
+@SQ    SN:CUTC000946   LN:1718
+@SQ    SN:CUTC000947   LN:856
+@SQ    SN:CUTC000948   LN:1062
+@SQ    SN:CUTC000949   LN:934
+@SQ    SN:CUTC000950   LN:1006
+@SQ    SN:CUTC000951   LN:1797
+@SQ    SN:CUTC000952   LN:1347
+@SQ    SN:CUTC000953   LN:930
+@SQ    SN:CUTC000954   LN:639
+@SQ    SN:CUTC000955   LN:776
+@SQ    SN:CUTC000956   LN:807
+@SQ    SN:CUTC000957   LN:1050
+@SQ    SN:CUTC000958   LN:774
+@SQ    SN:CUTC000959   LN:1496
+@SQ    SN:CUTC000960   LN:497
+@SQ    SN:CUTC000961   LN:1052
+@SQ    SN:CUTC000962   LN:949
+@SQ    SN:CUTC000963   LN:1105
+@SQ    SN:CUTC000964   LN:1040
+@SQ    SN:CUTC000965   LN:717
+@SQ    SN:CUTC000966   LN:1341
+@SQ    SN:CUTC000967   LN:866
+@SQ    SN:CUTC000968   LN:925
+@SQ    SN:CUTC000969   LN:1527
+@SQ    SN:CUTC000970   LN:1437
+@SQ    SN:CUTC000971   LN:1144
+@SQ    SN:CUTC000972   LN:744
+@SQ    SN:CUTC000973   LN:839
+@SQ    SN:CUTC000974   LN:872
+@SQ    SN:CUTC000975   LN:880
+@SQ    SN:CUTC000976   LN:785
+@SQ    SN:CUTC000977   LN:919
+@SQ    SN:CUTC000978   LN:1153
+@SQ    SN:CUTC000979   LN:844
+@SQ    SN:CUTC000980   LN:919
+@SQ    SN:CUTC000981   LN:902
+@SQ    SN:CUTC000982   LN:861
+@SQ    SN:CUTC000983   LN:1017
+@SQ    SN:CUTC000984   LN:660
+@SQ    SN:CUTC000985   LN:922
+@SQ    SN:CUTC000986   LN:1119
+@SQ    SN:CUTC000987   LN:359
+@SQ    SN:CUTC000988   LN:1490
+@SQ    SN:CUTC000989   LN:1621
+@SQ    SN:CUTC000990   LN:789
+@SQ    SN:CUTC000991   LN:1064
+@SQ    SN:CUTC000992   LN:687
+@SQ    SN:CUTC000993   LN:1092
+@SQ    SN:CUTC000994   LN:843
+@SQ    SN:CUTC000995   LN:1053
+@SQ    SN:CUTC000996   LN:552
+@SQ    SN:CUTC000997   LN:881
+@SQ    SN:CUTC000998   LN:1067
+@SQ    SN:CUTC000999   LN:817
+@SQ    SN:CUTC001000   LN:641
+@SQ    SN:CUTC001001   LN:901
+@SQ    SN:CUTC001002   LN:1005
+@SQ    SN:CUTC001003   LN:1411
+@SQ    SN:CUTC001004   LN:853
+@SQ    SN:CUTC001005   LN:621
+@SQ    SN:CUTC001006   LN:1374
+@SQ    SN:CUTC001007   LN:1122
+@SQ    SN:CUTC001008   LN:1098
+@SQ    SN:CUTC001009   LN:819
+@SQ    SN:CUTC001010   LN:939
+@SQ    SN:CUTC001011   LN:591
+@SQ    SN:CUTC001012   LN:580
+@SQ    SN:CUTC001013   LN:1057
+@SQ    SN:CUTC001014   LN:1551
+@SQ    SN:CUTC001015   LN:701
+@SQ    SN:CUTC001016   LN:885
+@SQ    SN:CUTC001017   LN:1209
+@SQ    SN:CUTC001018   LN:650
+@RG    ID:mu16_454_mu16        PL:454  LB:mu16 SM:mu16
+@RG    ID:upv196_454_upv196    PL:454  LB:upv196       SM:upv196
+CUESOXRA74     0       CUTC000001      1       10      77M1I222M       *       0       0       GCCTTTTATAATTATTATAAATTTCGGTTGACCCGACCCCATTAGACAGAGTCTATTAAAGCCCCGTGAAAGCCCGGCAAAACCCAGTAGCGCAGAGATCGGCGAGGGCGAATTTTCGATTGCATTTTCGTTCGTTTCTCTTCTGAATTTCTGTAATCTGTAACGATGTCTCAGACTACTGTCCTCAAGGTTGCTATGTCATGTCAGGGCTGTGTTGGAGCCGCCAAAAGGGTCTTGGGGAAACTGGAAGGTGTTGAAACATTTGACATCGACATAGATGCACAAAAGGTGACTGTGAAA    1BB@@BBHFHHHHHIIHIHFFF@@A@@>9>?999<0////8888>=??@DDDDFFFF???:;;;;AAA???DDDDFFFAAAAFFD8AAFFFC???CFFFFFFFFFFFFFFFFAAAAFFFFCCCF<<<<F?88FFFFFFFFFFFC:::666DAA:::DDFA@@@FFFFFFFFFDDDDDFFF?;;;FFFFFFFDDDDFFFFFFFFFFD666DBBBA>=424226622....666=?==4466444@?4444==?;;;9688<0...:::9<:7988989????984444A@?AABBA=?==;    AS:i:260        XS:i:239        XF:i:2  XE:i:3  XN:i:1  RG:Z:mu16_454_mu16
diff --git a/tests/pysam_data/ex9_nofail.sam b/tests/pysam_data/ex9_nofail.sam
new file mode 100644 (file)
index 0000000..ee31dca
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,1021 @@
+@HD    VN:1.0  GO:none SO:coordinate
+@SQ    SN:CUTC000001   LN:810
+@SQ    SN:CUTC000002   LN:1213
+@SQ    SN:CUTC000003   LN:525
+@SQ    SN:CUTC000004   LN:620
+@SQ    SN:CUTC000005   LN:550
+@SQ    SN:CUTC000006   LN:723
+@SQ    SN:CUTC000007   LN:773
+@SQ    SN:CUTC000008   LN:667
+@SQ    SN:CUTC000009   LN:593
+@SQ    SN:CUTC000010   LN:556
+@SQ    SN:CUTC000011   LN:519
+@SQ    SN:CUTC000012   LN:537
+@SQ    SN:CUTC000013   LN:930
+@SQ    SN:CUTC000014   LN:944
+@SQ    SN:CUTC000015   LN:829
+@SQ    SN:CUTC000016   LN:1109
+@SQ    SN:CUTC000017   LN:513
+@SQ    SN:CUTC000018   LN:1043
+@SQ    SN:CUTC000019   LN:884
+@SQ    SN:CUTC000020   LN:567
+@SQ    SN:CUTC000021   LN:1001
+@SQ    SN:CUTC000022   LN:754
+@SQ    SN:CUTC000023   LN:1045
+@SQ    SN:CUTC000024   LN:1091
+@SQ    SN:CUTC000025   LN:606
+@SQ    SN:CUTC000026   LN:635
+@SQ    SN:CUTC000027   LN:563
+@SQ    SN:CUTC000028   LN:830
+@SQ    SN:CUTC000029   LN:1456
+@SQ    SN:CUTC000030   LN:872
+@SQ    SN:CUTC000031   LN:742
+@SQ    SN:CUTC000032   LN:553
+@SQ    SN:CUTC000033   LN:624
+@SQ    SN:CUTC000034   LN:641
+@SQ    SN:CUTC000035   LN:695
+@SQ    SN:CUTC000036   LN:1519
+@SQ    SN:CUTC000037   LN:536
+@SQ    SN:CUTC000038   LN:619
+@SQ    SN:CUTC000039   LN:643
+@SQ    SN:CUTC000040   LN:650
+@SQ    SN:CUTC000041   LN:571
+@SQ    SN:CUTC000042   LN:1457
+@SQ    SN:CUTC000043   LN:618
+@SQ    SN:CUTC000044   LN:1261
+@SQ    SN:CUTC000045   LN:544
+@SQ    SN:CUTC000046   LN:1234
+@SQ    SN:CUTC000047   LN:867
+@SQ    SN:CUTC000048   LN:792
+@SQ    SN:CUTC000049   LN:1076
+@SQ    SN:CUTC000050   LN:479
+@SQ    SN:CUTC000051   LN:584
+@SQ    SN:CUTC000052   LN:841
+@SQ    SN:CUTC000053   LN:518
+@SQ    SN:CUTC000054   LN:1052
+@SQ    SN:CUTC000055   LN:626
+@SQ    SN:CUTC000056   LN:773
+@SQ    SN:CUTC000057   LN:542
+@SQ    SN:CUTC000058   LN:566
+@SQ    SN:CUTC000059   LN:931
+@SQ    SN:CUTC000060   LN:755
+@SQ    SN:CUTC000061   LN:606
+@SQ    SN:CUTC000062   LN:640
+@SQ    SN:CUTC000063   LN:667
+@SQ    SN:CUTC000064   LN:1717
+@SQ    SN:CUTC000065   LN:695
+@SQ    SN:CUTC000066   LN:1735
+@SQ    SN:CUTC000067   LN:474
+@SQ    SN:CUTC000068   LN:813
+@SQ    SN:CUTC000069   LN:746
+@SQ    SN:CUTC000070   LN:1141
+@SQ    SN:CUTC000071   LN:624
+@SQ    SN:CUTC000072   LN:1097
+@SQ    SN:CUTC000073   LN:510
+@SQ    SN:CUTC000074   LN:638
+@SQ    SN:CUTC000075   LN:682
+@SQ    SN:CUTC000076   LN:1043
+@SQ    SN:CUTC000077   LN:727
+@SQ    SN:CUTC000078   LN:1124
+@SQ    SN:CUTC000079   LN:711
+@SQ    SN:CUTC000080   LN:578
+@SQ    SN:CUTC000081   LN:718
+@SQ    SN:CUTC000082   LN:1779
+@SQ    SN:CUTC000083   LN:630
+@SQ    SN:CUTC000084   LN:850
+@SQ    SN:CUTC000085   LN:590
+@SQ    SN:CUTC000086   LN:578
+@SQ    SN:CUTC000087   LN:727
+@SQ    SN:CUTC000088   LN:582
+@SQ    SN:CUTC000089   LN:632
+@SQ    SN:CUTC000090   LN:792
+@SQ    SN:CUTC000091   LN:553
+@SQ    SN:CUTC000092   LN:606
+@SQ    SN:CUTC000093   LN:1263
+@SQ    SN:CUTC000094   LN:1119
+@SQ    SN:CUTC000095   LN:1107
+@SQ    SN:CUTC000096   LN:1240
+@SQ    SN:CUTC000097   LN:578
+@SQ    SN:CUTC000098   LN:739
+@SQ    SN:CUTC000099   LN:959
+@SQ    SN:CUTC000100   LN:701
+@SQ    SN:CUTC000101   LN:1047
+@SQ    SN:CUTC000102   LN:961
+@SQ    SN:CUTC000103   LN:548
+@SQ    SN:CUTC000104   LN:579
+@SQ    SN:CUTC000105   LN:1376
+@SQ    SN:CUTC000106   LN:1202
+@SQ    SN:CUTC000107   LN:615
+@SQ    SN:CUTC000108   LN:634
+@SQ    SN:CUTC000109   LN:742
+@SQ    SN:CUTC000110   LN:645
+@SQ    SN:CUTC000111   LN:567
+@SQ    SN:CUTC000112   LN:715
+@SQ    SN:CUTC000113   LN:705
+@SQ    SN:CUTC000114   LN:548
+@SQ    SN:CUTC000115   LN:555
+@SQ    SN:CUTC000116   LN:1370
+@SQ    SN:CUTC000117   LN:715
+@SQ    SN:CUTC000118   LN:737
+@SQ    SN:CUTC000119   LN:595
+@SQ    SN:CUTC000120   LN:674
+@SQ    SN:CUTC000121   LN:858
+@SQ    SN:CUTC000122   LN:571
+@SQ    SN:CUTC000123   LN:656
+@SQ    SN:CUTC000124   LN:923
+@SQ    SN:CUTC000125   LN:487
+@SQ    SN:CUTC000126   LN:488
+@SQ    SN:CUTC000127   LN:548
+@SQ    SN:CUTC000128   LN:547
+@SQ    SN:CUTC000129   LN:593
+@SQ    SN:CUTC000130   LN:980
+@SQ    SN:CUTC000131   LN:605
+@SQ    SN:CUTC000132   LN:942
+@SQ    SN:CUTC000133   LN:599
+@SQ    SN:CUTC000134   LN:755
+@SQ    SN:CUTC000135   LN:544
+@SQ    SN:CUTC000136   LN:623
+@SQ    SN:CUTC000137   LN:680
+@SQ    SN:CUTC000138   LN:633
+@SQ    SN:CUTC000139   LN:4441
+@SQ    SN:CUTC000140   LN:894
+@SQ    SN:CUTC000141   LN:688
+@SQ    SN:CUTC000142   LN:683
+@SQ    SN:CUTC000143   LN:679
+@SQ    SN:CUTC000144   LN:698
+@SQ    SN:CUTC000145   LN:629
+@SQ    SN:CUTC000146   LN:534
+@SQ    SN:CUTC000147   LN:643
+@SQ    SN:CUTC000148   LN:614
+@SQ    SN:CUTC000149   LN:845
+@SQ    SN:CUTC000150   LN:652
+@SQ    SN:CUTC000151   LN:1332
+@SQ    SN:CUTC000152   LN:1091
+@SQ    SN:CUTC000153   LN:702
+@SQ    SN:CUTC000154   LN:677
+@SQ    SN:CUTC000155   LN:902
+@SQ    SN:CUTC000156   LN:557
+@SQ    SN:CUTC000157   LN:735
+@SQ    SN:CUTC000158   LN:940
+@SQ    SN:CUTC000159   LN:668
+@SQ    SN:CUTC000160   LN:2002
+@SQ    SN:CUTC000161   LN:665
+@SQ    SN:CUTC000162   LN:907
+@SQ    SN:CUTC000163   LN:497
+@SQ    SN:CUTC000164   LN:966
+@SQ    SN:CUTC000165   LN:645
+@SQ    SN:CUTC000166   LN:595
+@SQ    SN:CUTC000167   LN:651
+@SQ    SN:CUTC000168   LN:410
+@SQ    SN:CUTC000169   LN:1122
+@SQ    SN:CUTC000170   LN:1021
+@SQ    SN:CUTC000171   LN:804
+@SQ    SN:CUTC000172   LN:972
+@SQ    SN:CUTC000173   LN:1839
+@SQ    SN:CUTC000174   LN:647
+@SQ    SN:CUTC000175   LN:675
+@SQ    SN:CUTC000176   LN:647
+@SQ    SN:CUTC000177   LN:1713
+@SQ    SN:CUTC000178   LN:911
+@SQ    SN:CUTC000179   LN:664
+@SQ    SN:CUTC000180   LN:765
+@SQ    SN:CUTC000181   LN:950
+@SQ    SN:CUTC000182   LN:914
+@SQ    SN:CUTC000183   LN:1166
+@SQ    SN:CUTC000184   LN:834
+@SQ    SN:CUTC000185   LN:812
+@SQ    SN:CUTC000186   LN:793
+@SQ    SN:CUTC000187   LN:1148
+@SQ    SN:CUTC000188   LN:1376
+@SQ    SN:CUTC000189   LN:724
+@SQ    SN:CUTC000190   LN:762
+@SQ    SN:CUTC000191   LN:940
+@SQ    SN:CUTC000192   LN:707
+@SQ    SN:CUTC000193   LN:1596
+@SQ    SN:CUTC000194   LN:557
+@SQ    SN:CUTC000195   LN:596
+@SQ    SN:CUTC000196   LN:930
+@SQ    SN:CUTC000197   LN:1447
+@SQ    SN:CUTC000198   LN:566
+@SQ    SN:CUTC000199   LN:686
+@SQ    SN:CUTC000200   LN:685
+@SQ    SN:CUTC000201   LN:579
+@SQ    SN:CUTC000202   LN:1282
+@SQ    SN:CUTC000203   LN:1601
+@SQ    SN:CUTC000204   LN:1034
+@SQ    SN:CUTC000205   LN:1370
+@SQ    SN:CUTC000206   LN:530
+@SQ    SN:CUTC000207   LN:947
+@SQ    SN:CUTC000208   LN:655
+@SQ    SN:CUTC000209   LN:611
+@SQ    SN:CUTC000210   LN:700
+@SQ    SN:CUTC000211   LN:940
+@SQ    SN:CUTC000212   LN:496
+@SQ    SN:CUTC000213   LN:849
+@SQ    SN:CUTC000214   LN:713
+@SQ    SN:CUTC000215   LN:879
+@SQ    SN:CUTC000216   LN:686
+@SQ    SN:CUTC000217   LN:655
+@SQ    SN:CUTC000218   LN:1139
+@SQ    SN:CUTC000219   LN:712
+@SQ    SN:CUTC000220   LN:987
+@SQ    SN:CUTC000221   LN:581
+@SQ    SN:CUTC000222   LN:867
+@SQ    SN:CUTC000223   LN:1591
+@SQ    SN:CUTC000224   LN:661
+@SQ    SN:CUTC000225   LN:1490
+@SQ    SN:CUTC000226   LN:1207
+@SQ    SN:CUTC000227   LN:785
+@SQ    SN:CUTC000228   LN:700
+@SQ    SN:CUTC000229   LN:474
+@SQ    SN:CUTC000230   LN:539
+@SQ    SN:CUTC000231   LN:1095
+@SQ    SN:CUTC000232   LN:556
+@SQ    SN:CUTC000233   LN:609
+@SQ    SN:CUTC000234   LN:1335
+@SQ    SN:CUTC000235   LN:566
+@SQ    SN:CUTC000236   LN:612
+@SQ    SN:CUTC000237   LN:918
+@SQ    SN:CUTC000238   LN:572
+@SQ    SN:CUTC000239   LN:690
+@SQ    SN:CUTC000240   LN:539
+@SQ    SN:CUTC000241   LN:1861
+@SQ    SN:CUTC000242   LN:730
+@SQ    SN:CUTC000243   LN:775
+@SQ    SN:CUTC000244   LN:1439
+@SQ    SN:CUTC000245   LN:687
+@SQ    SN:CUTC000246   LN:754
+@SQ    SN:CUTC000247   LN:646
+@SQ    SN:CUTC000248   LN:543
+@SQ    SN:CUTC000249   LN:1182
+@SQ    SN:CUTC000250   LN:650
+@SQ    SN:CUTC000251   LN:732
+@SQ    SN:CUTC000252   LN:1040
+@SQ    SN:CUTC000253   LN:979
+@SQ    SN:CUTC000254   LN:1055
+@SQ    SN:CUTC000255   LN:971
+@SQ    SN:CUTC000256   LN:817
+@SQ    SN:CUTC000257   LN:606
+@SQ    SN:CUTC000258   LN:624
+@SQ    SN:CUTC000259   LN:516
+@SQ    SN:CUTC000260   LN:987
+@SQ    SN:CUTC000261   LN:1071
+@SQ    SN:CUTC000262   LN:588
+@SQ    SN:CUTC000263   LN:1389
+@SQ    SN:CUTC000264   LN:672
+@SQ    SN:CUTC000265   LN:954
+@SQ    SN:CUTC000266   LN:1072
+@SQ    SN:CUTC000267   LN:713
+@SQ    SN:CUTC000268   LN:1192
+@SQ    SN:CUTC000269   LN:540
+@SQ    SN:CUTC000270   LN:592
+@SQ    SN:CUTC000271   LN:901
+@SQ    SN:CUTC000272   LN:420
+@SQ    SN:CUTC000273   LN:670
+@SQ    SN:CUTC000274   LN:1088
+@SQ    SN:CUTC000275   LN:786
+@SQ    SN:CUTC000276   LN:846
+@SQ    SN:CUTC000277   LN:839
+@SQ    SN:CUTC000278   LN:901
+@SQ    SN:CUTC000279   LN:3005
+@SQ    SN:CUTC000280   LN:727
+@SQ    SN:CUTC000281   LN:982
+@SQ    SN:CUTC000282   LN:553
+@SQ    SN:CUTC000283   LN:513
+@SQ    SN:CUTC000284   LN:666
+@SQ    SN:CUTC000285   LN:480
+@SQ    SN:CUTC000286   LN:726
+@SQ    SN:CUTC000287   LN:1225
+@SQ    SN:CUTC000288   LN:783
+@SQ    SN:CUTC000289   LN:802
+@SQ    SN:CUTC000290   LN:1190
+@SQ    SN:CUTC000291   LN:1323
+@SQ    SN:CUTC000292   LN:700
+@SQ    SN:CUTC000293   LN:748
+@SQ    SN:CUTC000294   LN:840
+@SQ    SN:CUTC000295   LN:447
+@SQ    SN:CUTC000296   LN:475
+@SQ    SN:CUTC000297   LN:693
+@SQ    SN:CUTC000298   LN:838
+@SQ    SN:CUTC000299   LN:933
+@SQ    SN:CUTC000300   LN:1175
+@SQ    SN:CUTC000301   LN:795
+@SQ    SN:CUTC000302   LN:514
+@SQ    SN:CUTC000303   LN:650
+@SQ    SN:CUTC000304   LN:1015
+@SQ    SN:CUTC000305   LN:869
+@SQ    SN:CUTC000306   LN:1218
+@SQ    SN:CUTC000307   LN:943
+@SQ    SN:CUTC000308   LN:879
+@SQ    SN:CUTC000309   LN:758
+@SQ    SN:CUTC000310   LN:895
+@SQ    SN:CUTC000311   LN:1060
+@SQ    SN:CUTC000312   LN:1414
+@SQ    SN:CUTC000313   LN:1841
+@SQ    SN:CUTC000314   LN:1040
+@SQ    SN:CUTC000315   LN:769
+@SQ    SN:CUTC000316   LN:1400
+@SQ    SN:CUTC000317   LN:1097
+@SQ    SN:CUTC000318   LN:953
+@SQ    SN:CUTC000319   LN:793
+@SQ    SN:CUTC000320   LN:840
+@SQ    SN:CUTC000321   LN:734
+@SQ    SN:CUTC000322   LN:528
+@SQ    SN:CUTC000323   LN:492
+@SQ    SN:CUTC000324   LN:737
+@SQ    SN:CUTC000325   LN:681
+@SQ    SN:CUTC000326   LN:446
+@SQ    SN:CUTC000327   LN:836
+@SQ    SN:CUTC000328   LN:745
+@SQ    SN:CUTC000329   LN:1514
+@SQ    SN:CUTC000330   LN:773
+@SQ    SN:CUTC000331   LN:608
+@SQ    SN:CUTC000332   LN:814
+@SQ    SN:CUTC000333   LN:655
+@SQ    SN:CUTC000334   LN:697
+@SQ    SN:CUTC000335   LN:818
+@SQ    SN:CUTC000336   LN:650
+@SQ    SN:CUTC000337   LN:1787
+@SQ    SN:CUTC000338   LN:695
+@SQ    SN:CUTC000339   LN:1638
+@SQ    SN:CUTC000340   LN:903
+@SQ    SN:CUTC000341   LN:638
+@SQ    SN:CUTC000342   LN:659
+@SQ    SN:CUTC000343   LN:1335
+@SQ    SN:CUTC000344   LN:775
+@SQ    SN:CUTC000345   LN:834
+@SQ    SN:CUTC000346   LN:1356
+@SQ    SN:CUTC000347   LN:1566
+@SQ    SN:CUTC000348   LN:1240
+@SQ    SN:CUTC000349   LN:810
+@SQ    SN:CUTC000350   LN:885
+@SQ    SN:CUTC000351   LN:532
+@SQ    SN:CUTC000352   LN:434
+@SQ    SN:CUTC000353   LN:705
+@SQ    SN:CUTC000354   LN:740
+@SQ    SN:CUTC000355   LN:833
+@SQ    SN:CUTC000356   LN:680
+@SQ    SN:CUTC000357   LN:1362
+@SQ    SN:CUTC000358   LN:621
+@SQ    SN:CUTC000359   LN:1108
+@SQ    SN:CUTC000360   LN:721
+@SQ    SN:CUTC000361   LN:709
+@SQ    SN:CUTC000362   LN:908
+@SQ    SN:CUTC000363   LN:1044
+@SQ    SN:CUTC000364   LN:701
+@SQ    SN:CUTC000365   LN:798
+@SQ    SN:CUTC000366   LN:550
+@SQ    SN:CUTC000367   LN:1007
+@SQ    SN:CUTC000368   LN:1355
+@SQ    SN:CUTC000369   LN:469
+@SQ    SN:CUTC000370   LN:629
+@SQ    SN:CUTC000371   LN:1065
+@SQ    SN:CUTC000372   LN:415
+@SQ    SN:CUTC000373   LN:977
+@SQ    SN:CUTC000374   LN:547
+@SQ    SN:CUTC000375   LN:699
+@SQ    SN:CUTC000376   LN:1150
+@SQ    SN:CUTC000377   LN:576
+@SQ    SN:CUTC000378   LN:626
+@SQ    SN:CUTC000379   LN:1326
+@SQ    SN:CUTC000380   LN:621
+@SQ    SN:CUTC000381   LN:900
+@SQ    SN:CUTC000382   LN:1573
+@SQ    SN:CUTC000383   LN:634
+@SQ    SN:CUTC000384   LN:1186
+@SQ    SN:CUTC000385   LN:623
+@SQ    SN:CUTC000386   LN:1082
+@SQ    SN:CUTC000387   LN:948
+@SQ    SN:CUTC000388   LN:912
+@SQ    SN:CUTC000389   LN:1564
+@SQ    SN:CUTC000390   LN:1046
+@SQ    SN:CUTC000391   LN:1302
+@SQ    SN:CUTC000392   LN:1070
+@SQ    SN:CUTC000393   LN:519
+@SQ    SN:CUTC000394   LN:558
+@SQ    SN:CUTC000395   LN:802
+@SQ    SN:CUTC000396   LN:592
+@SQ    SN:CUTC000397   LN:903
+@SQ    SN:CUTC000398   LN:926
+@SQ    SN:CUTC000399   LN:1054
+@SQ    SN:CUTC000400   LN:626
+@SQ    SN:CUTC000401   LN:1078
+@SQ    SN:CUTC000402   LN:1369
+@SQ    SN:CUTC000403   LN:1616
+@SQ    SN:CUTC000404   LN:608
+@SQ    SN:CUTC000405   LN:1418
+@SQ    SN:CUTC000406   LN:583
+@SQ    SN:CUTC000407   LN:658
+@SQ    SN:CUTC000408   LN:1265
+@SQ    SN:CUTC000409   LN:745
+@SQ    SN:CUTC000410   LN:690
+@SQ    SN:CUTC000411   LN:609
+@SQ    SN:CUTC000412   LN:1061
+@SQ    SN:CUTC000413   LN:899
+@SQ    SN:CUTC000414   LN:925
+@SQ    SN:CUTC000415   LN:552
+@SQ    SN:CUTC000416   LN:559
+@SQ    SN:CUTC000417   LN:964
+@SQ    SN:CUTC000418   LN:855
+@SQ    SN:CUTC000419   LN:1045
+@SQ    SN:CUTC000420   LN:1479
+@SQ    SN:CUTC000421   LN:537
+@SQ    SN:CUTC000422   LN:1080
+@SQ    SN:CUTC000423   LN:792
+@SQ    SN:CUTC000424   LN:1201
+@SQ    SN:CUTC000425   LN:1332
+@SQ    SN:CUTC000426   LN:929
+@SQ    SN:CUTC000427   LN:606
+@SQ    SN:CUTC000428   LN:727
+@SQ    SN:CUTC000429   LN:1085
+@SQ    SN:CUTC000430   LN:504
+@SQ    SN:CUTC000431   LN:1231
+@SQ    SN:CUTC000432   LN:859
+@SQ    SN:CUTC000433   LN:728
+@SQ    SN:CUTC000434   LN:553
+@SQ    SN:CUTC000435   LN:1124
+@SQ    SN:CUTC000436   LN:1430
+@SQ    SN:CUTC000437   LN:1770
+@SQ    SN:CUTC000438   LN:831
+@SQ    SN:CUTC000439   LN:1062
+@SQ    SN:CUTC000440   LN:945
+@SQ    SN:CUTC000441   LN:1082
+@SQ    SN:CUTC000442   LN:2057
+@SQ    SN:CUTC000443   LN:1425
+@SQ    SN:CUTC000444   LN:1133
+@SQ    SN:CUTC000445   LN:1478
+@SQ    SN:CUTC000446   LN:755
+@SQ    SN:CUTC000447   LN:548
+@SQ    SN:CUTC000448   LN:1087
+@SQ    SN:CUTC000449   LN:594
+@SQ    SN:CUTC000450   LN:1012
+@SQ    SN:CUTC000451   LN:1777
+@SQ    SN:CUTC000452   LN:631
+@SQ    SN:CUTC000453   LN:914
+@SQ    SN:CUTC000454   LN:1701
+@SQ    SN:CUTC000455   LN:869
+@SQ    SN:CUTC000456   LN:1024
+@SQ    SN:CUTC000457   LN:802
+@SQ    SN:CUTC000458   LN:663
+@SQ    SN:CUTC000459   LN:951
+@SQ    SN:CUTC000460   LN:739
+@SQ    SN:CUTC000461   LN:658
+@SQ    SN:CUTC000462   LN:1055
+@SQ    SN:CUTC000463   LN:807
+@SQ    SN:CUTC000464   LN:1157
+@SQ    SN:CUTC000465   LN:1340
+@SQ    SN:CUTC000466   LN:1016
+@SQ    SN:CUTC000467   LN:646
+@SQ    SN:CUTC000468   LN:998
+@SQ    SN:CUTC000469   LN:687
+@SQ    SN:CUTC000470   LN:919
+@SQ    SN:CUTC000471   LN:1062
+@SQ    SN:CUTC000472   LN:1454
+@SQ    SN:CUTC000473   LN:875
+@SQ    SN:CUTC000474   LN:774
+@SQ    SN:CUTC000475   LN:671
+@SQ    SN:CUTC000476   LN:880
+@SQ    SN:CUTC000477   LN:1297
+@SQ    SN:CUTC000478   LN:722
+@SQ    SN:CUTC000479   LN:985
+@SQ    SN:CUTC000480   LN:797
+@SQ    SN:CUTC000481   LN:741
+@SQ    SN:CUTC000482   LN:598
+@SQ    SN:CUTC000483   LN:841
+@SQ    SN:CUTC000484   LN:1193
+@SQ    SN:CUTC000485   LN:856
+@SQ    SN:CUTC000486   LN:1020
+@SQ    SN:CUTC000487   LN:984
+@SQ    SN:CUTC000488   LN:1145
+@SQ    SN:CUTC000489   LN:862
+@SQ    SN:CUTC000490   LN:558
+@SQ    SN:CUTC000491   LN:484
+@SQ    SN:CUTC000492   LN:1097
+@SQ    SN:CUTC000493   LN:763
+@SQ    SN:CUTC000494   LN:2369
+@SQ    SN:CUTC000495   LN:993
+@SQ    SN:CUTC000496   LN:716
+@SQ    SN:CUTC000497   LN:590
+@SQ    SN:CUTC000498   LN:992
+@SQ    SN:CUTC000499   LN:1223
+@SQ    SN:CUTC000500   LN:956
+@SQ    SN:CUTC000501   LN:761
+@SQ    SN:CUTC000502   LN:1533
+@SQ    SN:CUTC000503   LN:951
+@SQ    SN:CUTC000504   LN:1599
+@SQ    SN:CUTC000505   LN:1393
+@SQ    SN:CUTC000506   LN:1064
+@SQ    SN:CUTC000507   LN:1198
+@SQ    SN:CUTC000508   LN:650
+@SQ    SN:CUTC000509   LN:1190
+@SQ    SN:CUTC000510   LN:1168
+@SQ    SN:CUTC000511   LN:926
+@SQ    SN:CUTC000512   LN:1528
+@SQ    SN:CUTC000513   LN:516
+@SQ    SN:CUTC000514   LN:886
+@SQ    SN:CUTC000515   LN:779
+@SQ    SN:CUTC000516   LN:955
+@SQ    SN:CUTC000517   LN:1795
+@SQ    SN:CUTC000518   LN:1028
+@SQ    SN:CUTC000519   LN:799
+@SQ    SN:CUTC000520   LN:1170
+@SQ    SN:CUTC000521   LN:1348
+@SQ    SN:CUTC000522   LN:611
+@SQ    SN:CUTC000523   LN:795
+@SQ    SN:CUTC000524   LN:767
+@SQ    SN:CUTC000525   LN:679
+@SQ    SN:CUTC000526   LN:1216
+@SQ    SN:CUTC000527   LN:1105
+@SQ    SN:CUTC000528   LN:757
+@SQ    SN:CUTC000529   LN:951
+@SQ    SN:CUTC000530   LN:446
+@SQ    SN:CUTC000531   LN:759
+@SQ    SN:CUTC000532   LN:751
+@SQ    SN:CUTC000533   LN:629
+@SQ    SN:CUTC000534   LN:903
+@SQ    SN:CUTC000535   LN:652
+@SQ    SN:CUTC000536   LN:584
+@SQ    SN:CUTC000537   LN:785
+@SQ    SN:CUTC000538   LN:3820
+@SQ    SN:CUTC000539   LN:582
+@SQ    SN:CUTC000540   LN:980
+@SQ    SN:CUTC000541   LN:613
+@SQ    SN:CUTC000542   LN:978
+@SQ    SN:CUTC000543   LN:1717
+@SQ    SN:CUTC000544   LN:1069
+@SQ    SN:CUTC000545   LN:770
+@SQ    SN:CUTC000546   LN:1249
+@SQ    SN:CUTC000547   LN:940
+@SQ    SN:CUTC000548   LN:1018
+@SQ    SN:CUTC000549   LN:962
+@SQ    SN:CUTC000550   LN:768
+@SQ    SN:CUTC000551   LN:576
+@SQ    SN:CUTC000552   LN:687
+@SQ    SN:CUTC000553   LN:1354
+@SQ    SN:CUTC000554   LN:664
+@SQ    SN:CUTC000555   LN:847
+@SQ    SN:CUTC000556   LN:1580
+@SQ    SN:CUTC000557   LN:950
+@SQ    SN:CUTC000558   LN:877
+@SQ    SN:CUTC000559   LN:857
+@SQ    SN:CUTC000560   LN:802
+@SQ    SN:CUTC000561   LN:1022
+@SQ    SN:CUTC000562   LN:1082
+@SQ    SN:CUTC000563   LN:623
+@SQ    SN:CUTC000564   LN:1403
+@SQ    SN:CUTC000565   LN:1766
+@SQ    SN:CUTC000566   LN:891
+@SQ    SN:CUTC000567   LN:864
+@SQ    SN:CUTC000568   LN:1010
+@SQ    SN:CUTC000569   LN:510
+@SQ    SN:CUTC000570   LN:812
+@SQ    SN:CUTC000571   LN:582
+@SQ    SN:CUTC000572   LN:677
+@SQ    SN:CUTC000573   LN:899
+@SQ    SN:CUTC000574   LN:1121
+@SQ    SN:CUTC000575   LN:601
+@SQ    SN:CUTC000576   LN:1757
+@SQ    SN:CUTC000577   LN:1015
+@SQ    SN:CUTC000578   LN:1147
+@SQ    SN:CUTC000579   LN:692
+@SQ    SN:CUTC000580   LN:638
+@SQ    SN:CUTC000581   LN:504
+@SQ    SN:CUTC000582   LN:945
+@SQ    SN:CUTC000583   LN:512
+@SQ    SN:CUTC000584   LN:761
+@SQ    SN:CUTC000585   LN:957
+@SQ    SN:CUTC000586   LN:611
+@SQ    SN:CUTC000587   LN:776
+@SQ    SN:CUTC000588   LN:658
+@SQ    SN:CUTC000589   LN:727
+@SQ    SN:CUTC000590   LN:833
+@SQ    SN:CUTC000591   LN:488
+@SQ    SN:CUTC000592   LN:774
+@SQ    SN:CUTC000593   LN:784
+@SQ    SN:CUTC000594   LN:835
+@SQ    SN:CUTC000595   LN:752
+@SQ    SN:CUTC000596   LN:523
+@SQ    SN:CUTC000597   LN:468
+@SQ    SN:CUTC000598   LN:1021
+@SQ    SN:CUTC000599   LN:982
+@SQ    SN:CUTC000600   LN:671
+@SQ    SN:CUTC000601   LN:1063
+@SQ    SN:CUTC000602   LN:482
+@SQ    SN:CUTC000603   LN:1087
+@SQ    SN:CUTC000604   LN:1043
+@SQ    SN:CUTC000605   LN:1176
+@SQ    SN:CUTC000606   LN:897
+@SQ    SN:CUTC000607   LN:764
+@SQ    SN:CUTC000608   LN:1724
+@SQ    SN:CUTC000609   LN:579
+@SQ    SN:CUTC000610   LN:657
+@SQ    SN:CUTC000611   LN:627
+@SQ    SN:CUTC000612   LN:1110
+@SQ    SN:CUTC000613   LN:1065
+@SQ    SN:CUTC000614   LN:765
+@SQ    SN:CUTC000615   LN:813
+@SQ    SN:CUTC000616   LN:1510
+@SQ    SN:CUTC000617   LN:906
+@SQ    SN:CUTC000618   LN:1733
+@SQ    SN:CUTC000619   LN:490
+@SQ    SN:CUTC000620   LN:841
+@SQ    SN:CUTC000621   LN:1331
+@SQ    SN:CUTC000622   LN:1082
+@SQ    SN:CUTC000623   LN:1310
+@SQ    SN:CUTC000624   LN:977
+@SQ    SN:CUTC000625   LN:1122
+@SQ    SN:CUTC000626   LN:613
+@SQ    SN:CUTC000627   LN:486
+@SQ    SN:CUTC000628   LN:1411
+@SQ    SN:CUTC000629   LN:1005
+@SQ    SN:CUTC000630   LN:1090
+@SQ    SN:CUTC000631   LN:715
+@SQ    SN:CUTC000632   LN:1475
+@SQ    SN:CUTC000633   LN:823
+@SQ    SN:CUTC000634   LN:949
+@SQ    SN:CUTC000635   LN:1125
+@SQ    SN:CUTC000636   LN:904
+@SQ    SN:CUTC000637   LN:472
+@SQ    SN:CUTC000638   LN:668
+@SQ    SN:CUTC000639   LN:788
+@SQ    SN:CUTC000640   LN:1314
+@SQ    SN:CUTC000641   LN:920
+@SQ    SN:CUTC000642   LN:952
+@SQ    SN:CUTC000643   LN:859
+@SQ    SN:CUTC000644   LN:1001
+@SQ    SN:CUTC000645   LN:1386
+@SQ    SN:CUTC000646   LN:1109
+@SQ    SN:CUTC000647   LN:708
+@SQ    SN:CUTC000648   LN:1011
+@SQ    SN:CUTC000649   LN:1061
+@SQ    SN:CUTC000650   LN:1213
+@SQ    SN:CUTC000651   LN:633
+@SQ    SN:CUTC000652   LN:667
+@SQ    SN:CUTC000653   LN:1364
+@SQ    SN:CUTC000654   LN:593
+@SQ    SN:CUTC000655   LN:1099
+@SQ    SN:CUTC000656   LN:1155
+@SQ    SN:CUTC000657   LN:482
+@SQ    SN:CUTC000658   LN:1122
+@SQ    SN:CUTC000659   LN:1060
+@SQ    SN:CUTC000660   LN:558
+@SQ    SN:CUTC000661   LN:957
+@SQ    SN:CUTC000662   LN:851
+@SQ    SN:CUTC000663   LN:1100
+@SQ    SN:CUTC000664   LN:868
+@SQ    SN:CUTC000665   LN:1147
+@SQ    SN:CUTC000666   LN:572
+@SQ    SN:CUTC000667   LN:1032
+@SQ    SN:CUTC000668   LN:703
+@SQ    SN:CUTC000669   LN:1411
+@SQ    SN:CUTC000670   LN:1938
+@SQ    SN:CUTC000671   LN:1586
+@SQ    SN:CUTC000672   LN:1165
+@SQ    SN:CUTC000673   LN:897
+@SQ    SN:CUTC000674   LN:845
+@SQ    SN:CUTC000675   LN:876
+@SQ    SN:CUTC000676   LN:756
+@SQ    SN:CUTC000677   LN:1253
+@SQ    SN:CUTC000678   LN:812
+@SQ    SN:CUTC000679   LN:581
+@SQ    SN:CUTC000680   LN:753
+@SQ    SN:CUTC000681   LN:1146
+@SQ    SN:CUTC000682   LN:925
+@SQ    SN:CUTC000683   LN:819
+@SQ    SN:CUTC000684   LN:913
+@SQ    SN:CUTC000685   LN:946
+@SQ    SN:CUTC000686   LN:1112
+@SQ    SN:CUTC000687   LN:1056
+@SQ    SN:CUTC000688   LN:941
+@SQ    SN:CUTC000689   LN:892
+@SQ    SN:CUTC000690   LN:780
+@SQ    SN:CUTC000691   LN:587
+@SQ    SN:CUTC000692   LN:696
+@SQ    SN:CUTC000693   LN:810
+@SQ    SN:CUTC000694   LN:1198
+@SQ    SN:CUTC000695   LN:1089
+@SQ    SN:CUTC000696   LN:596
+@SQ    SN:CUTC000697   LN:1100
+@SQ    SN:CUTC000698   LN:639
+@SQ    SN:CUTC000699   LN:1254
+@SQ    SN:CUTC000700   LN:709
+@SQ    SN:CUTC000701   LN:797
+@SQ    SN:CUTC000702   LN:915
+@SQ    SN:CUTC000703   LN:2222
+@SQ    SN:CUTC000704   LN:772
+@SQ    SN:CUTC000705   LN:1080
+@SQ    SN:CUTC000706   LN:1421
+@SQ    SN:CUTC000707   LN:1369
+@SQ    SN:CUTC000708   LN:475
+@SQ    SN:CUTC000709   LN:775
+@SQ    SN:CUTC000710   LN:1192
+@SQ    SN:CUTC000711   LN:1226
+@SQ    SN:CUTC000712   LN:373
+@SQ    SN:CUTC000713   LN:483
+@SQ    SN:CUTC000714   LN:647
+@SQ    SN:CUTC000715   LN:1087
+@SQ    SN:CUTC000716   LN:1006
+@SQ    SN:CUTC000717   LN:1179
+@SQ    SN:CUTC000718   LN:1032
+@SQ    SN:CUTC000719   LN:605
+@SQ    SN:CUTC000720   LN:807
+@SQ    SN:CUTC000721   LN:1042
+@SQ    SN:CUTC000722   LN:970
+@SQ    SN:CUTC000723   LN:831
+@SQ    SN:CUTC000724   LN:1140
+@SQ    SN:CUTC000725   LN:1293
+@SQ    SN:CUTC000726   LN:923
+@SQ    SN:CUTC000727   LN:754
+@SQ    SN:CUTC000728   LN:1052
+@SQ    SN:CUTC000729   LN:680
+@SQ    SN:CUTC000730   LN:825
+@SQ    SN:CUTC000731   LN:1366
+@SQ    SN:CUTC000732   LN:2118
+@SQ    SN:CUTC000733   LN:733
+@SQ    SN:CUTC000734   LN:1328
+@SQ    SN:CUTC000735   LN:1059
+@SQ    SN:CUTC000736   LN:1025
+@SQ    SN:CUTC000737   LN:964
+@SQ    SN:CUTC000738   LN:776
+@SQ    SN:CUTC000739   LN:1112
+@SQ    SN:CUTC000740   LN:1200
+@SQ    SN:CUTC000741   LN:634
+@SQ    SN:CUTC000742   LN:840
+@SQ    SN:CUTC000743   LN:1103
+@SQ    SN:CUTC000744   LN:1714
+@SQ    SN:CUTC000745   LN:612
+@SQ    SN:CUTC000746   LN:512
+@SQ    SN:CUTC000747   LN:1120
+@SQ    SN:CUTC000748   LN:957
+@SQ    SN:CUTC000749   LN:821
+@SQ    SN:CUTC000750   LN:475
+@SQ    SN:CUTC000751   LN:957
+@SQ    SN:CUTC000752   LN:743
+@SQ    SN:CUTC000753   LN:533
+@SQ    SN:CUTC000754   LN:1345
+@SQ    SN:CUTC000755   LN:476
+@SQ    SN:CUTC000756   LN:871
+@SQ    SN:CUTC000757   LN:843
+@SQ    SN:CUTC000758   LN:513
+@SQ    SN:CUTC000759   LN:775
+@SQ    SN:CUTC000760   LN:1275
+@SQ    SN:CUTC000761   LN:1375
+@SQ    SN:CUTC000762   LN:1001
+@SQ    SN:CUTC000763   LN:1114
+@SQ    SN:CUTC000764   LN:974
+@SQ    SN:CUTC000765   LN:398
+@SQ    SN:CUTC000766   LN:974
+@SQ    SN:CUTC000767   LN:689
+@SQ    SN:CUTC000768   LN:853
+@SQ    SN:CUTC000769   LN:1029
+@SQ    SN:CUTC000770   LN:1400
+@SQ    SN:CUTC000771   LN:667
+@SQ    SN:CUTC000772   LN:939
+@SQ    SN:CUTC000773   LN:1054
+@SQ    SN:CUTC000774   LN:779
+@SQ    SN:CUTC000775   LN:1247
+@SQ    SN:CUTC000776   LN:1848
+@SQ    SN:CUTC000777   LN:979
+@SQ    SN:CUTC000778   LN:852
+@SQ    SN:CUTC000779   LN:695
+@SQ    SN:CUTC000780   LN:675
+@SQ    SN:CUTC000781   LN:1312
+@SQ    SN:CUTC000782   LN:895
+@SQ    SN:CUTC000783   LN:451
+@SQ    SN:CUTC000784   LN:1063
+@SQ    SN:CUTC000785   LN:719
+@SQ    SN:CUTC000786   LN:915
+@SQ    SN:CUTC000787   LN:1050
+@SQ    SN:CUTC000788   LN:1056
+@SQ    SN:CUTC000789   LN:657
+@SQ    SN:CUTC000790   LN:630
+@SQ    SN:CUTC000791   LN:877
+@SQ    SN:CUTC000792   LN:1279
+@SQ    SN:CUTC000793   LN:875
+@SQ    SN:CUTC000794   LN:1121
+@SQ    SN:CUTC000795   LN:1009
+@SQ    SN:CUTC000796   LN:785
+@SQ    SN:CUTC000797   LN:546
+@SQ    SN:CUTC000798   LN:578
+@SQ    SN:CUTC000799   LN:854
+@SQ    SN:CUTC000800   LN:987
+@SQ    SN:CUTC000801   LN:604
+@SQ    SN:CUTC000802   LN:919
+@SQ    SN:CUTC000803   LN:1633
+@SQ    SN:CUTC000804   LN:984
+@SQ    SN:CUTC000805   LN:559
+@SQ    SN:CUTC000806   LN:788
+@SQ    SN:CUTC000807   LN:918
+@SQ    SN:CUTC000808   LN:846
+@SQ    SN:CUTC000809   LN:939
+@SQ    SN:CUTC000810   LN:946
+@SQ    SN:CUTC000811   LN:874
+@SQ    SN:CUTC000812   LN:886
+@SQ    SN:CUTC000813   LN:813
+@SQ    SN:CUTC000814   LN:1369
+@SQ    SN:CUTC000815   LN:827
+@SQ    SN:CUTC000816   LN:867
+@SQ    SN:CUTC000817   LN:1158
+@SQ    SN:CUTC000818   LN:742
+@SQ    SN:CUTC000819   LN:831
+@SQ    SN:CUTC000820   LN:942
+@SQ    SN:CUTC000821   LN:740
+@SQ    SN:CUTC000822   LN:1191
+@SQ    SN:CUTC000823   LN:2043
+@SQ    SN:CUTC000824   LN:1642
+@SQ    SN:CUTC000825   LN:1314
+@SQ    SN:CUTC000826   LN:723
+@SQ    SN:CUTC000827   LN:966
+@SQ    SN:CUTC000828   LN:995
+@SQ    SN:CUTC000829   LN:1118
+@SQ    SN:CUTC000830   LN:546
+@SQ    SN:CUTC000831   LN:995
+@SQ    SN:CUTC000832   LN:860
+@SQ    SN:CUTC000833   LN:970
+@SQ    SN:CUTC000834   LN:862
+@SQ    SN:CUTC000835   LN:458
+@SQ    SN:CUTC000836   LN:774
+@SQ    SN:CUTC000837   LN:824
+@SQ    SN:CUTC000838   LN:1083
+@SQ    SN:CUTC000839   LN:866
+@SQ    SN:CUTC000840   LN:959
+@SQ    SN:CUTC000841   LN:1275
+@SQ    SN:CUTC000842   LN:1271
+@SQ    SN:CUTC000843   LN:786
+@SQ    SN:CUTC000844   LN:598
+@SQ    SN:CUTC000845   LN:643
+@SQ    SN:CUTC000846   LN:1263
+@SQ    SN:CUTC000847   LN:968
+@SQ    SN:CUTC000848   LN:1210
+@SQ    SN:CUTC000849   LN:634
+@SQ    SN:CUTC000850   LN:1085
+@SQ    SN:CUTC000851   LN:792
+@SQ    SN:CUTC000852   LN:1049
+@SQ    SN:CUTC000853   LN:513
+@SQ    SN:CUTC000854   LN:839
+@SQ    SN:CUTC000855   LN:912
+@SQ    SN:CUTC000856   LN:1127
+@SQ    SN:CUTC000857   LN:796
+@SQ    SN:CUTC000858   LN:769
+@SQ    SN:CUTC000859   LN:455
+@SQ    SN:CUTC000860   LN:1067
+@SQ    SN:CUTC000861   LN:2816
+@SQ    SN:CUTC000862   LN:1486
+@SQ    SN:CUTC000863   LN:1037
+@SQ    SN:CUTC000864   LN:699
+@SQ    SN:CUTC000865   LN:1266
+@SQ    SN:CUTC000866   LN:719
+@SQ    SN:CUTC000867   LN:762
+@SQ    SN:CUTC000868   LN:1182
+@SQ    SN:CUTC000869   LN:825
+@SQ    SN:CUTC000870   LN:1325
+@SQ    SN:CUTC000871   LN:579
+@SQ    SN:CUTC000872   LN:851
+@SQ    SN:CUTC000873   LN:790
+@SQ    SN:CUTC000874   LN:793
+@SQ    SN:CUTC000875   LN:2194
+@SQ    SN:CUTC000876   LN:1237
+@SQ    SN:CUTC000877   LN:856
+@SQ    SN:CUTC000878   LN:1438
+@SQ    SN:CUTC000879   LN:2190
+@SQ    SN:CUTC000880   LN:793
+@SQ    SN:CUTC000881   LN:1844
+@SQ    SN:CUTC000882   LN:1184
+@SQ    SN:CUTC000883   LN:933
+@SQ    SN:CUTC000884   LN:1372
+@SQ    SN:CUTC000885   LN:373
+@SQ    SN:CUTC000886   LN:1141
+@SQ    SN:CUTC000887   LN:447
+@SQ    SN:CUTC000888   LN:1789
+@SQ    SN:CUTC000889   LN:593
+@SQ    SN:CUTC000890   LN:1020
+@SQ    SN:CUTC000891   LN:904
+@SQ    SN:CUTC000892   LN:1417
+@SQ    SN:CUTC000893   LN:823
+@SQ    SN:CUTC000894   LN:1315
+@SQ    SN:CUTC000895   LN:999
+@SQ    SN:CUTC000896   LN:716
+@SQ    SN:CUTC000897   LN:1244
+@SQ    SN:CUTC000898   LN:1059
+@SQ    SN:CUTC000899   LN:741
+@SQ    SN:CUTC000900   LN:762
+@SQ    SN:CUTC000901   LN:589
+@SQ    SN:CUTC000902   LN:1199
+@SQ    SN:CUTC000903   LN:1895
+@SQ    SN:CUTC000904   LN:417
+@SQ    SN:CUTC000905   LN:976
+@SQ    SN:CUTC000906   LN:1405
+@SQ    SN:CUTC000907   LN:1652
+@SQ    SN:CUTC000908   LN:1138
+@SQ    SN:CUTC000909   LN:1099
+@SQ    SN:CUTC000910   LN:777
+@SQ    SN:CUTC000911   LN:1057
+@SQ    SN:CUTC000912   LN:1065
+@SQ    SN:CUTC000913   LN:895
+@SQ    SN:CUTC000914   LN:745
+@SQ    SN:CUTC000915   LN:605
+@SQ    SN:CUTC000916   LN:719
+@SQ    SN:CUTC000917   LN:709
+@SQ    SN:CUTC000918   LN:799
+@SQ    SN:CUTC000919   LN:1057
+@SQ    SN:CUTC000920   LN:867
+@SQ    SN:CUTC000921   LN:629
+@SQ    SN:CUTC000922   LN:780
+@SQ    SN:CUTC000923   LN:856
+@SQ    SN:CUTC000924   LN:814
+@SQ    SN:CUTC000925   LN:786
+@SQ    SN:CUTC000926   LN:1193
+@SQ    SN:CUTC000927   LN:1094
+@SQ    SN:CUTC000928   LN:987
+@SQ    SN:CUTC000929   LN:1380
+@SQ    SN:CUTC000930   LN:1039
+@SQ    SN:CUTC000931   LN:487
+@SQ    SN:CUTC000932   LN:1016
+@SQ    SN:CUTC000933   LN:1449
+@SQ    SN:CUTC000934   LN:2138
+@SQ    SN:CUTC000935   LN:581
+@SQ    SN:CUTC000936   LN:1100
+@SQ    SN:CUTC000937   LN:1035
+@SQ    SN:CUTC000938   LN:966
+@SQ    SN:CUTC000939   LN:856
+@SQ    SN:CUTC000940   LN:802
+@SQ    SN:CUTC000941   LN:892
+@SQ    SN:CUTC000942   LN:1122
+@SQ    SN:CUTC000943   LN:923
+@SQ    SN:CUTC000944   LN:1125
+@SQ    SN:CUTC000945   LN:600
+@SQ    SN:CUTC000946   LN:1718
+@SQ    SN:CUTC000947   LN:856
+@SQ    SN:CUTC000948   LN:1062
+@SQ    SN:CUTC000949   LN:934
+@SQ    SN:CUTC000950   LN:1006
+@SQ    SN:CUTC000951   LN:1797
+@SQ    SN:CUTC000952   LN:1347
+@SQ    SN:CUTC000953   LN:930
+@SQ    SN:CUTC000954   LN:639
+@SQ    SN:CUTC000955   LN:776
+@SQ    SN:CUTC000956   LN:807
+@SQ    SN:CUTC000957   LN:1050
+@SQ    SN:CUTC000958   LN:774
+@SQ    SN:CUTC000959   LN:1496
+@SQ    SN:CUTC000960   LN:497
+@SQ    SN:CUTC000961   LN:1052
+@SQ    SN:CUTC000962   LN:949
+@SQ    SN:CUTC000963   LN:1105
+@SQ    SN:CUTC000964   LN:1040
+@SQ    SN:CUTC000965   LN:717
+@SQ    SN:CUTC000966   LN:1341
+@SQ    SN:CUTC000967   LN:866
+@SQ    SN:CUTC000968   LN:925
+@SQ    SN:CUTC000969   LN:1527
+@SQ    SN:CUTC000970   LN:1437
+@SQ    SN:CUTC000971   LN:1144
+@SQ    SN:CUTC000972   LN:744
+@SQ    SN:CUTC000973   LN:839
+@SQ    SN:CUTC000974   LN:872
+@SQ    SN:CUTC000975   LN:880
+@SQ    SN:CUTC000976   LN:785
+@SQ    SN:CUTC000977   LN:919
+@SQ    SN:CUTC000978   LN:1153
+@SQ    SN:CUTC000979   LN:844
+@SQ    SN:CUTC000980   LN:919
+@SQ    SN:CUTC000981   LN:902
+@SQ    SN:CUTC000982   LN:861
+@SQ    SN:CUTC000983   LN:1017
+@SQ    SN:CUTC000984   LN:660
+@SQ    SN:CUTC000985   LN:922
+@SQ    SN:CUTC000986   LN:1119
+@SQ    SN:CUTC000987   LN:359
+@SQ    SN:CUTC000988   LN:1490
+@SQ    SN:CUTC000989   LN:1621
+@SQ    SN:CUTC000990   LN:789
+@SQ    SN:CUTC000991   LN:1064
+@SQ    SN:CUTC000992   LN:687
+@SQ    SN:CUTC000993   LN:1092
+@SQ    SN:CUTC000994   LN:843
+@SQ    SN:CUTC000995   LN:1053
+@SQ    SN:CUTC000996   LN:552
+@SQ    SN:CUTC000997   LN:881
+@SQ    SN:CUTC000998   LN:1067
+@SQ    SN:CUTC000999   LN:817
+@SQ    SN:CUTC001000   LN:641
+@SQ    SN:CUTC001001   LN:901
+@SQ    SN:CUTC001002   LN:1005
+@SQ    SN:CUTC001003   LN:1411
+@SQ    SN:CUTC001004   LN:853
+@SQ    SN:CUTC001005   LN:621
+@SQ    SN:CUTC001006   LN:1374
+@SQ    SN:CUTC001007   LN:1122
+@SQ    SN:CUTC001008   LN:1098
+@SQ    SN:CUTC001009   LN:819
+@SQ    SN:CUTC001010   LN:939
+@SQ    SN:CUTC001011   LN:591
+@SQ    SN:CUTC001012   LN:580
+@SQ    SN:CUTC001013   LN:1057
+@SQ    SN:CUTC001014   LN:1551
+@SQ    SN:CUTC001015   LN:701
+@SQ    SN:CUTC001016   LN:885
+@SQ    SN:CUTC001017   LN:1209
+@RG    ID:mu16_454_mu16        PL:454  LB:mu16 SM:mu16
+@RG    ID:upv196_454_upv196    PL:454  LB:upv196       SM:upv196
+CUESOXRA74     0       CUTC000001      1       10      77M1I222M       *       0       0       GCCTTTTATAATTATTATAAATTTCGGTTGACCCGACCCCATTAGACAGAGTCTATTAAAGCCCCGTGAAAGCCCGGCAAAACCCAGTAGCGCAGAGATCGGCGAGGGCGAATTTTCGATTGCATTTTCGTTCGTTTCTCTTCTGAATTTCTGTAATCTGTAACGATGTCTCAGACTACTGTCCTCAAGGTTGCTATGTCATGTCAGGGCTGTGTTGGAGCCGCCAAAAGGGTCTTGGGGAAACTGGAAGGTGTTGAAACATTTGACATCGACATAGATGCACAAAAGGTGACTGTGAAA    1BB@@BBHFHHHHHIIHIHFFF@@A@@>9>?999<0////8888>=??@DDDDFFFF???:;;;;AAA???DDDDFFFAAAAFFD8AAFFFC???CFFFFFFFFFFFFFFFFAAAAFFFFCCCF<<<<F?88FFFFFFFFFFFC:::666DAA:::DDFA@@@FFFFFFFFFDDDDDFFF?;;;FFFFFFFDDDDFFFFFFFFFFD666DBBBA>=424226622....666=?==4466444@?4444==?;;;9688<0...:::9<:7988989????984444A@?AABBA=?==;    AS:i:260        XS:i:239        XF:i:2  XE:i:3  XN:i:1  RG:Z:mu16_454_mu16
diff --git a/tests/pysam_data/example_btag.sam b/tests/pysam_data/example_btag.sam
new file mode 100644 (file)
index 0000000..2dd4990
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,6 @@
+@SQ    LN:200000000    SN:chr1
+QW85I:468:729  0       chr1    156268499       63      140M15H *       0       0       GTCCAGTCTCCTGTAATTCTTGGGCTTGACTAGGCTTCCGACAACCTGGAGGCATTGCTCTTTCAGGGTATACACTGCAGTGTGATGTTGGCAAAAACAGGCTGTCCATTAACATTGGAAGATGGCACAAACAATTCAGT    >>>>>>>====>=>>;:8,,((1*0536;;=<>;:;>>>>>>>>>>>>>>>>>>>><9=556.2<<<8===<<<9;9=>=>>>>>>>>>>>>>>>>.>>>===>>>>>>>4=>>==;<<896=>===<>>588-1.19<=    RG:Z:QW85I      PG:Z:tmap       MD:Z:140        NM:i:0  AS:i:140        FZ:B:S,100,1,91,0,7,101,0,201,96,204,0,0,87,109,0,7,97,112,1,12,78,197,0,7,100,95,101,202,0,6,0,1,186,0,84,0,244,0,0,324,0,107,195,101,113,0,102,0,104,3,0,101,1,0,212,6,0,0,1,0,74,1,11,0,196,2,197,103,0,108,98,2,7,0,1,2,194,0,180,0,108,0,203,104,16,5,205,0,0,0,1,1,100,98,0,0,204,6,0,79,0,0,101,7,109,90,265,1,27,10,109,102,9,0,292,0,110,0,0,102,112,0,0,84,100,103,2,81,126,0,2,90,0,15,96,15,1,0,2,0,107,92,0,0,101,3,98,15,102,13,116,116,90,93,198,0,0,0,199,92,26,495,100,5,0,100,5,209,0,92,107,90,0,0,0,0,109,194,7,94,200,0,40,197,0,11,0,0,112,110,6,4,200,28,0,196,0,203,1,129,0,0,1,0,94,0,1,0,107,5,201,3,3,100,0,121,0,7,0,1,105,306,3,86,8,183,0,12,163,17,83,22,0,0,1,8,109,103,0,0,295,0,200,16,172,3,16,182,3,11,0,0,223,111,103,0,5,225,0,95 XA:Z:map2-1     XS:i:53 XT:i:38 XF:i:1  XE:i:0
+QW85I:468:729  0       chr1    156268499       63      140M15H *       0       0       GTCCAGTCTCCTGTAATTCTTGGGCTTGACTAGGCTTCCGACAACCTGGAGGCATTGCTCTTTCAGGGTATACACTGCAGTGTGATGTTGGCAAAAACAGGCTGTCCATTAACATTGGAAGATGGCACAAACAATTCAGT    >>>>>>>====>=>>;:8,,((1*0536;;=<>;:;>>>>>>>>>>>>>>>>>>>><9=556.2<<<8===<<<9;9=>=>>>>>>>>>>>>>>>>.>>>===>>>>>>>4=>>==;<<896=>===<>>588-1.19<=    RG:Z:QW85I      PG:Z:tmap       MD:Z:140        NM:i:0  AS:i:140        FZ:B:s,-100,200,-300,-400       XA:Z:map2-1     XS:i:53 XT:i:38 XF:i:1  XE:i:0
+QW85I:468:729  0       chr1    156268499       63      140M15H *       0       0       GTCCAGTCTCCTGTAATTCTTGGGCTTGACTAGGCTTCCGACAACCTGGAGGCATTGCTCTTTCAGGGTATACACTGCAGTGTGATGTTGGCAAAAACAGGCTGTCCATTAACATTGGAAGATGGCACAAACAATTCAGT    >>>>>>>====>=>>;:8,,((1*0536;;=<>;:;>>>>>>>>>>>>>>>>>>>><9=556.2<<<8===<<<9;9=>=>>>>>>>>>>>>>>>>.>>>===>>>>>>>4=>>==;<<896=>===<>>588-1.19<=    RG:Z:QW85I      PG:Z:tmap       MD:Z:140        NM:i:0  AS:i:140        FZ:B:c,-100,12  XA:Z:map2-1     XS:i:53 XT:i:38 XF:i:1  XE:i:0
+QW85I:468:729  0       chr1    156268499       63      140M15H *       0       0       GTCCAGTCTCCTGTAATTCTTGGGCTTGACTAGGCTTCCGACAACCTGGAGGCATTGCTCTTTCAGGGTATACACTGCAGTGTGATGTTGGCAAAAACAGGCTGTCCATTAACATTGGAAGATGGCACAAACAATTCAGT    >>>>>>>====>=>>;:8,,((1*0536;;=<>;:;>>>>>>>>>>>>>>>>>>>><9=556.2<<<8===<<<9;9=>=>>>>>>>>>>>>>>>>.>>>===>>>>>>>4=>>==;<<896=>===<>>588-1.19<=    RG:Z:QW85I      PG:Z:tmap       MD:Z:140        NM:i:0  AS:i:140        FZ:B:C,12,15    XA:Z:map2-1     XS:i:53 XT:i:38 XF:i:1  XE:i:0
+QW85I:468:729  0       chr1    156268499       63      140M15H *       0       0       GTCCAGTCTCCTGTAATTCTTGGGCTTGACTAGGCTTCCGACAACCTGGAGGCATTGCTCTTTCAGGGTATACACTGCAGTGTGATGTTGGCAAAAACAGGCTGTCCATTAACATTGGAAGATGGCACAAACAATTCAGT    >>>>>>>====>=>>;:8,,((1*0536;;=<>;:;>>>>>>>>>>>>>>>>>>>><9=556.2<<<8===<<<9;9=>=>>>>>>>>>>>>>>>>.>>>===>>>>>>>4=>>==;<<896=>===<>>588-1.19<=    RG:Z:QW85I      PG:Z:tmap       MD:Z:140        NM:i:0  AS:i:140        FZ:B:f,-1.0,5.0,2.5     XA:Z:map2-1     XS:i:53 XT:i:38 XF:i:1 XE:i:0
diff --git a/tests/pysam_data/example_empty_header.sam b/tests/pysam_data/example_empty_header.sam
new file mode 100644 (file)
index 0000000..b1a3ca5
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,321 @@
+@SQ    SN:chr1 LN:1000
+XXX0000        0       chr1    100     170     171M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTC     *       AS:i:170        MS:i:50
+XXX0001        0       chr1    100     255     284M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGT    *       AS:i:283        MS:i:50
+XXX0002        0       chr1    100     205     206M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGA  *       AS:i:205        MS:i:50
+XXX0003        0       chr1    100     212     213M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCC   *       AS:i:212        MS:i:50
+XXX0004        0       chr1    100     208     209M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGG       *       AS:i:208        MS:i:50
+XXX0005        0       chr1    100     245     245M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGG   *       AS:i:245        MS:i:50
+XXX0006        0       chr1    100     251     251M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATC     *       AS:i:251        MS:i:50
+XXX0007        0       chr1    100     255     257M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAA       *       AS:i:257        MS:i:50
+XXX0008        0       chr1    100     255     285M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTT   *       AS:i:284        MS:i:50
+XXX0009        0       chr1    100     255     261M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTA   *       AS:i:261        MS:i:50
+XXX0010        0       chr1    100     255     289M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCG       *       AS:i:288        MS:i:50
+XXX0011        0       chr1    100     173     174M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCG  *       AS:i:173        MS:i:50
+XXX0012        0       chr1    100     255     265M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCC       *       AS:i:265        MS:i:50
+XXX0013        0       chr1    100     255     293M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATC   *       AS:i:292        MS:i:50
+XXX0014        0       chr1    100     166     167M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGA *       AS:i:166        MS:i:50
+XXX0015        0       chr1    100     247     247M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAA *       AS:i:247        MS:i:50
+XXX0016        0       chr1    100     255     295M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCA *       AS:i:294        MS:i:50
+XXX0017        0       chr1    100     210     211M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTC     *       AS:i:210        MS:i:50
+XXX0018        0       chr1    100     235     236M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTG    *       AS:i:235        MS:i:50
+XXX0019        0       chr1    100     195     196M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCC    *       AS:i:195        MS:i:50
+XXX0020        0       chr1    100     178     179M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGG     *       AS:i:178        MS:i:50
+XXX0021        0       chr1    100     255     259M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGG     *       AS:i:259        MS:i:50
+XXX0022        0       chr1    100     238     239M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACT *       AS:i:238        MS:i:50
+XXX0023        0       chr1    100     255     272M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCAC        *       AS:i:272        MS:i:50
+XXX0024        0       chr1    100     255     257M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAA       *       AS:i:257        MS:i:50
+XXX0025        0       chr1    100     255     268M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCA    *       AS:i:268        MS:i:50
+XXX0026        0       chr1    100     201     202M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGG      *       AS:i:201        MS:i:50
+XXX0027        0       chr1    100     180     181M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGT   *       AS:i:180        MS:i:50
+XXX0028        0       chr1    100     153     154M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCG      *       AS:i:153        MS:i:50
+XXX0029        0       chr1    100     255     280M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGA        *       AS:i:279        MS:i:50
+XXX0030        0       chr1    100     255     275M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCC     *       AS:i:274        MS:i:50
+XXX0031        0       chr1    100     255     259M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGG     *       AS:i:259        MS:i:50
+XXX0032        0       chr1    100     229     230M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCC  *       AS:i:229        MS:i:50
+XXX0033        0       chr1    100     229     230M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCC  *       AS:i:229        MS:i:50
+XXX0034        0       chr1    100     172     173M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGC   *       AS:i:172        MS:i:50
+XXX0035        0       chr1    100     246     246M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGA  *       AS:i:246        MS:i:50
+XXX0036        0       chr1    100     187     188M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACT    *       AS:i:187        MS:i:50
+XXX0037        0       chr1    100     189     190M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTG  *       AS:i:189        MS:i:50
+XXX0038        0       chr1    100     192     193M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTC       *       AS:i:192        MS:i:50
+XXX0039        0       chr1    100     221     222M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAA  *       AS:i:221        MS:i:50
+XXX0040        0       chr1    100     186     187M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCAC     *       AS:i:186        MS:i:50
+XXX0041        0       chr1    100     185     186M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCA      *       AS:i:185        MS:i:50
+XXX0042        0       chr1    100     255     299M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACT     *       AS:i:298        MS:i:50
+XXX0043        0       chr1    100     156     157M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTT   *       AS:i:156        MS:i:50
+XXX0044        0       chr1    100     255     270M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACC  *       AS:i:270        MS:i:50
+XXX0045        0       chr1    100     206     207M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGAC *       AS:i:206        MS:i:50
+XXX0046        0       chr1    100     255     262M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAA  *       AS:i:262        MS:i:50
+XXX0047        0       chr1    100     249     249M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGA       *       AS:i:249        MS:i:50
+XXX0048        0       chr1    100     226     226M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGT      *       AS:i:226        MS:i:50
+XXX0049        0       chr1    100     233     234M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACG      *       AS:i:233        MS:i:50
+XXX0050        0       chr1    100     162     163M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGT     *       AS:i:162        MS:i:50
+XXX0051        0       chr1    100     242     242M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATA      *       AS:i:242        MS:i:50
+XXX0052        0       chr1    100     255     288M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCC        *       AS:i:287        MS:i:50
+XXX0053        0       chr1    100     255     267M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCC     *       AS:i:267        MS:i:50
+XXX0054        0       chr1    100     196     197M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCA   *       AS:i:196        MS:i:50
+XXX0055        0       chr1    100     236     237M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGA   *       AS:i:236        MS:i:50
+XXX0056        0       chr1    100     223     223M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAA *       AS:i:223        MS:i:50
+XXX0057        0       chr1    100     171     172M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCG    *       AS:i:171        MS:i:50
+XXX0058        0       chr1    100     178     179M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGG     *       AS:i:178        MS:i:50
+XXX0059        0       chr1    100     255     269M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCAC   *       AS:i:269        MS:i:50
+XXX0060        0       chr1    100     195     196M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCC    *       AS:i:195        MS:i:50
+XXX0061        0       chr1    100     212     213M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCC   *       AS:i:212        MS:i:50
+XXX0062        0       chr1    100     255     258M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAG      *       AS:i:258        MS:i:50
+XXX0063        0       chr1    100     157     158M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTC  *       AS:i:157        MS:i:50
+XXX0064        0       chr1    100     173     174M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCG  *       AS:i:173        MS:i:50
+XXX0065        0       chr1    100     178     179M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGG     *       AS:i:178        MS:i:50
+XXX0066        0       chr1    100     186     187M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCAC     *       AS:i:186        MS:i:50
+XXX0067        0       chr1    100     255     290M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGG      *       AS:i:289        MS:i:50
+XXX0068        0       chr1    100     238     239M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACT *       AS:i:238        MS:i:50
+XXX0069        0       chr1    100     176     177M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAG       *       AS:i:176        MS:i:50
+XXX0070        0       chr1    100     255     288M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCC        *       AS:i:287        MS:i:50
+XXX0071        0       chr1    100     206     207M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGAC *       AS:i:206        MS:i:50
+XXX0072        0       chr1    100     224     224M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAA        *       AS:i:224        MS:i:50
+XXX0073        0       chr1    100     218     219M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTA     *       AS:i:218        MS:i:50
+XXX0074        0       chr1    100     237     238M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGAC  *       AS:i:237        MS:i:50
+XXX0075        0       chr1    100     250     250M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGAT      *       AS:i:250        MS:i:50
+XXX0076        0       chr1    100     255     265M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCC       *       AS:i:265        MS:i:50
+XXX0077        0       chr1    100     255     264M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGC        *       AS:i:264        MS:i:50
+XXX0078        0       chr1    100     242     242M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATA      *       AS:i:242        MS:i:50
+XXX0079        0       chr1    100     159     160M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTT        *       AS:i:159        MS:i:50
+XXX0080        0       chr1    100     248     248M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAG        *       AS:i:248        MS:i:50
+XXX0081        0       chr1    100     253     253M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCA   *       AS:i:253        MS:i:50
+XXX0082        0       chr1    100     199     200M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAA        *       AS:i:199        MS:i:50
+XXX0083        0       chr1    100     168     169M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATT       *       AS:i:168        MS:i:50
+XXX0084        0       chr1    100     249     249M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGA       *       AS:i:249        MS:i:50
+XXX0085        0       chr1    100     255     268M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCA    *       AS:i:268        MS:i:50
+XXX0086        0       chr1    100     255     298M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACAC      *       AS:i:297        MS:i:50
+XXX0087        0       chr1    100     229     230M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCC  *       AS:i:229        MS:i:50
+XXX0088        0       chr1    100     255     278M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCA  *       AS:i:277        MS:i:50
+XXX0089        0       chr1    100     198     199M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAA *       AS:i:198        MS:i:50
+XXX0090        0       chr1    100     255     273M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACC       *       AS:i:272        MS:i:50
+XXX0091        0       chr1    100     182     183M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGA *       AS:i:182        MS:i:50
+XXX0092        0       chr1    100     211     212M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCC    *       AS:i:211        MS:i:50
+XXX0093        0       chr1    100     207     208M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACG        *       AS:i:207        MS:i:50
+XXX0094        0       chr1    100     221     222M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAA  *       AS:i:221        MS:i:50
+XXX0095        0       chr1    100     177     178M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGG      *       AS:i:177        MS:i:50
+XXX0096        0       chr1    100     255     289M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCG       *       AS:i:288        MS:i:50
+XXX0097        0       chr1    100     255     276M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCT    *       AS:i:275        MS:i:50
+XXX0098        0       chr1    100     237     238M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGAC  *       AS:i:237        MS:i:50
+XXX0099        0       chr1    100     255     273M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACC       *       AS:i:272        MS:i:50
+XXX0100        0       chr1    100     255     264M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGC        *       AS:i:264        MS:i:50
+XXX0101        0       chr1    100     255     285M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTT   *       AS:i:284        MS:i:50
+XXX0102        0       chr1    100     233     234M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACG      *       AS:i:233        MS:i:50
+XXX0103        0       chr1    100     237     238M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGAC  *       AS:i:237        MS:i:50
+XXX0104        0       chr1    100     214     215M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCAT *       AS:i:214        MS:i:50
+XXX0105        0       chr1    100     154     155M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGT     *       AS:i:154        MS:i:50
+XXX0106        0       chr1    100     181     182M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTG  *       AS:i:181        MS:i:50
+XXX0107        0       chr1    100     255     265M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCC       *       AS:i:265        MS:i:50
+XXX0108        0       chr1    100     255     259M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGG     *       AS:i:259        MS:i:50
+XXX0109        0       chr1    100     186     187M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCAC     *       AS:i:186        MS:i:50
+XXX0110        0       chr1    100     172     173M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGC   *       AS:i:172        MS:i:50
+XXX0111        0       chr1    100     155     156M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTT    *       AS:i:155        MS:i:50
+XXX0112        0       chr1    100     209     210M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGT      *       AS:i:209        MS:i:50
+XXX0113        0       chr1    100     255     257M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAA       *       AS:i:257        MS:i:50
+XXX0114        0       chr1    100     255     260M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGT    *       AS:i:260        MS:i:50
+XXX0115        0       chr1    100     195     196M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCC    *       AS:i:195        MS:i:50
+XXX0116        0       chr1    100     200     201M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAG       *       AS:i:200        MS:i:50
+XXX0117        0       chr1    100     255     271M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCA *       AS:i:271        MS:i:50
+XXX0118        0       chr1    100     255     297M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACA       *       AS:i:296        MS:i:50
+XXX0119        0       chr1    100     163     164M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTA    *       AS:i:163        MS:i:50
+XXX0120        0       chr1    100     255     256M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGA        *       AS:i:256        MS:i:50
+XXX0121        0       chr1    100     255     284M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGT    *       AS:i:283        MS:i:50
+XXX0122        0       chr1    100     176     177M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAG       *       AS:i:176        MS:i:50
+XXX0123        0       chr1    100     251     251M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATC     *       AS:i:251        MS:i:50
+XXX0124        0       chr1    100     255     260M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGT    *       AS:i:260        MS:i:50
+XXX0125        0       chr1    100     255     285M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTT   *       AS:i:284        MS:i:50
+XXX0126        0       chr1    100     201     202M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGG      *       AS:i:201        MS:i:50
+XXX0127        0       chr1    100     165     166M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACG  *       AS:i:165        MS:i:50
+XXX0128        0       chr1    100     255     279M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAG *       AS:i:278        MS:i:50
+XXX0129        0       chr1    100     165     166M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACG  *       AS:i:165        MS:i:50
+XXX0130        0       chr1    100     204     205M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGG   *       AS:i:204        MS:i:50
+XXX0131        0       chr1    100     199     200M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAA        *       AS:i:199        MS:i:50
+XXX0132        0       chr1    100     208     209M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGG       *       AS:i:208        MS:i:50
+XXX0133        0       chr1    100     209     210M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGT      *       AS:i:209        MS:i:50
+XXX0134        0       chr1    100     183     184M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGAT        *       AS:i:183        MS:i:50
+XXX0135        0       chr1    100     255     266M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCC      *       AS:i:266        MS:i:50
+XXX0136        0       chr1    100     255     293M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATC   *       AS:i:292        MS:i:50
+XXX0137        0       chr1    100     255     285M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTT   *       AS:i:284        MS:i:50
+XXX0138        0       chr1    100     219     220M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAG    *       AS:i:219        MS:i:50
+XXX0139        0       chr1    100     247     247M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAA *       AS:i:247        MS:i:50
+XXX0140        0       chr1    100     192     193M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTC       *       AS:i:192        MS:i:50
+XXX0141        0       chr1    100     255     261M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTA   *       AS:i:261        MS:i:50
+XXX0142        0       chr1    100     212     213M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCC   *       AS:i:212        MS:i:50
+XXX0143        0       chr1    100     255     276M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCT    *       AS:i:275        MS:i:50
+XXX0144        0       chr1    100     177     178M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGG      *       AS:i:177        MS:i:50
+XXX0145        0       chr1    100     179     180M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGG    *       AS:i:179        MS:i:50
+XXX0146        0       chr1    100     255     263M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAG *       AS:i:263        MS:i:50
+XXX0147        0       chr1    100     255     272M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCAC        *       AS:i:272        MS:i:50
+XXX0148        0       chr1    100     255     299M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACT     *       AS:i:298        MS:i:50
+XXX0149        0       chr1    100     255     274M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCC      *       AS:i:273        MS:i:50
+XXX0150        0       chr1    100     255     300M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTC    *       AS:i:299        MS:i:50
+XXX0151        0       chr1    100     157     158M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTC  *       AS:i:157        MS:i:50
+XXX0152        0       chr1    100     161     162M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTG      *       AS:i:161        MS:i:50
+XXX0153        0       chr1    100     202     203M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGC     *       AS:i:202        MS:i:50
+XXX0154        0       chr1    100     171     172M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCG    *       AS:i:171        MS:i:50
+XXX0155        0       chr1    100     183     184M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGAT        *       AS:i:183        MS:i:50
+XXX0156        0       chr1    100     255     286M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTG  *       AS:i:285        MS:i:50
+XXX0157        0       chr1    100     255     257M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAA       *       AS:i:257        MS:i:50
+XXX0158        0       chr1    100     255     275M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCC     *       AS:i:274        MS:i:50
+XXX0159        0       chr1    100     255     276M    *       0       0       CCTCTTTTATAGCAGCATGAACCCGTCGGTTTTAAACACGGTGTCAGCGGTGGCCTCGGAAGTATGGCCCATTCGCGAACGATGCCGTCCCTTTCAAGACACCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCT    *       AS:i:275        MS:i:50
+XXX0174        16      chr1    201     255     300M    *       0       0       CCTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA    *       AS:i:298        MS:i:50
+XXX0238        16      chr1    202     255     299M    *       0       0       CTGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA     *       AS:i:297        MS:i:50
+XXX0286        16      chr1    203     255     298M    *       0       0       TGAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA      *       AS:i:296        MS:i:50
+XXX0249        16      chr1    204     255     297M    *       0       0       GAGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA       *       AS:i:295        MS:i:50
+XXX0201        16      chr1    205     255     296M    *       0       0       AGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA        *       AS:i:294        MS:i:50
+XXX0225        16      chr1    205     255     296M    *       0       0       AGACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA        *       AS:i:294        MS:i:50
+XXX0265        16      chr1    206     255     295M    *       0       0       GACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA *       AS:i:293        MS:i:50
+XXX0182        16      chr1    207     255     294M    *       0       0       ACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA  *       AS:i:292        MS:i:50
+XXX0275        16      chr1    207     255     294M    *       0       0       ACACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA  *       AS:i:292        MS:i:50
+XXX0168        16      chr1    209     255     292M    *       0       0       ACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA    *       AS:i:290        MS:i:50
+XXX0208        16      chr1    209     255     292M    *       0       0       ACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA    *       AS:i:290        MS:i:50
+XXX0264        16      chr1    209     255     292M    *       0       0       ACGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA    *       AS:i:290        MS:i:50
+XXX0258        16      chr1    210     255     291M    *       0       0       CGGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA     *       AS:i:289        MS:i:50
+XXX0226        16      chr1    211     255     290M    *       0       0       GGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA      *       AS:i:288        MS:i:50
+XXX0228        16      chr1    211     255     290M    *       0       0       GGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA      *       AS:i:288        MS:i:50
+XXX0263        16      chr1    211     255     290M    *       0       0       GGGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA      *       AS:i:288        MS:i:50
+XXX0205        16      chr1    212     255     289M    *       0       0       GGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA       *       AS:i:287        MS:i:50
+XXX0276        16      chr1    212     255     289M    *       0       0       GGATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA       *       AS:i:287        MS:i:50
+XXX0192        16      chr1    213     255     288M    *       0       0       GATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA        *       AS:i:286        MS:i:50
+XXX0298        16      chr1    213     255     288M    *       0       0       GATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA        *       AS:i:286        MS:i:50
+XXX0196        16      chr1    214     255     287M    *       0       0       ATCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA *       AS:i:285        MS:i:50
+XXX0291        16      chr1    215     255     286M    *       0       0       TCTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA  *       AS:i:284        MS:i:50
+XXX0245        16      chr1    216     255     285M    *       0       0       CTTTATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA   *       AS:i:283        MS:i:50
+XXX0284        16      chr1    220     255     281M    *       0       0       ATCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA       *       AS:i:278        MS:i:50
+XXX0227        16      chr1    221     255     280M    *       0       0       TCGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA        *       AS:i:277        MS:i:50
+XXX0166        16      chr1    222     255     279M    *       0       0       CGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA *       AS:i:276        MS:i:50
+XXX0294        16      chr1    222     255     279M    *       0       0       CGCCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA *       AS:i:276        MS:i:50
+XXX0300        16      chr1    224     255     277M    *       0       0       CCCGTGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA   *       AS:i:274        MS:i:50
+XXX0212        16      chr1    228     255     273M    *       0       0       TGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA       *       AS:i:271        MS:i:50
+XXX0313        16      chr1    228     255     273M    *       0       0       TGAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA       *       AS:i:271        MS:i:50
+XXX0318        16      chr1    229     255     272M    *       0       0       GAGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA        *       AS:i:270        MS:i:50
+XXX0193        16      chr1    230     255     271M    *       0       0       AGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA *       AS:i:268        MS:i:50
+XXX0315        16      chr1    230     255     271M    *       0       0       AGACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA *       AS:i:268        MS:i:50
+XXX0211        16      chr1    231     255     270M    *       0       0       GACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA  *       AS:i:267        MS:i:50
+XXX0295        16      chr1    231     255     270M    *       0       0       GACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA  *       AS:i:267        MS:i:50
+XXX0235        16      chr1    232     255     269M    *       0       0       ACCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA   *       AS:i:266        MS:i:50
+XXX0170        16      chr1    233     255     268M    *       0       0       CCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA    *       AS:i:265        MS:i:50
+XXX0310        16      chr1    233     255     268M    *       0       0       CCCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA    *       AS:i:265        MS:i:50
+XXX0252        16      chr1    234     255     267M    *       0       0       CCACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA     *       AS:i:265        MS:i:50
+XXX0206        16      chr1    235     255     266M    *       0       0       CACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA      *       AS:i:264        MS:i:50
+XXX0223        16      chr1    236     255     265M    *       0       0       ACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA       *       AS:i:263        MS:i:50
+XXX0229        16      chr1    236     255     265M    *       0       0       ACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA       *       AS:i:263        MS:i:50
+XXX0268        16      chr1    236     255     265M    *       0       0       ACACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA       *       AS:i:263        MS:i:50
+XXX0189        16      chr1    237     255     264M    *       0       0       CACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA        *       AS:i:262        MS:i:50
+XXX0299        16      chr1    237     255     264M    *       0       0       CACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA        *       AS:i:262        MS:i:50
+XXX0316        16      chr1    238     255     263M    *       0       0       ACACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA *       AS:i:261        MS:i:50
+XXX0224        16      chr1    239     255     262M    *       0       0       CACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA  *       AS:i:260        MS:i:50
+XXX0255        16      chr1    240     255     261M    *       0       0       ACCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA   *       AS:i:259        MS:i:50
+XXX0278        16      chr1    241     255     260M    *       0       0       CCACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA    *       AS:i:258        MS:i:50
+XXX0314        16      chr1    243     255     258M    *       0       0       ACGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA      *       AS:i:257        MS:i:50
+XXX0282        16      chr1    244     255     257M    *       0       0       CGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA       *       AS:i:256        MS:i:50
+XXX0311        16      chr1    244     255     257M    *       0       0       CGCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA       *       AS:i:256        MS:i:50
+XXX0176        16      chr1    245     255     256M    *       0       0       GCTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA        *       AS:i:255        MS:i:50
+XXX0188        16      chr1    246     254     255M    *       0       0       CTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA *       AS:i:254        MS:i:50
+XXX0290        16      chr1    246     254     255M    *       0       0       CTTTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA *       AS:i:254        MS:i:50
+XXX0187        16      chr1    248     252     253M    *       0       0       TTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA   *       AS:i:252        MS:i:50
+XXX0259        16      chr1    248     252     253M    *       0       0       TTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA   *       AS:i:252        MS:i:50
+XXX0292        16      chr1    248     252     253M    *       0       0       TTCCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA   *       AS:i:252        MS:i:50
+XXX0222        16      chr1    250     249     251M    *       0       0       CCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA     *       AS:i:249        MS:i:50
+XXX0256        16      chr1    250     249     251M    *       0       0       CCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA     *       AS:i:249        MS:i:50
+XXX0296        16      chr1    250     249     251M    *       0       0       CCCGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA     *       AS:i:249        MS:i:50
+XXX0281        16      chr1    252     248     249M    *       0       0       CGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA       *       AS:i:248        MS:i:50
+XXX0289        16      chr1    252     248     249M    *       0       0       CGTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA       *       AS:i:248        MS:i:50
+XXX0171        16      chr1    253     247     248M    *       0       0       GTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA        *       AS:i:247        MS:i:50
+XXX0181        16      chr1    253     247     248M    *       0       0       GTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA        *       AS:i:247        MS:i:50
+XXX0266        16      chr1    253     247     248M    *       0       0       GTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA        *       AS:i:247        MS:i:50
+XXX0319        16      chr1    253     247     248M    *       0       0       GTTTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA        *       AS:i:247        MS:i:50
+XXX0172        16      chr1    255     245     246M    *       0       0       TTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA  *       AS:i:245        MS:i:50
+XXX0317        16      chr1    255     245     246M    *       0       0       TTCTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA  *       AS:i:245        MS:i:50
+XXX0207        16      chr1    257     242     244M    *       0       0       CTTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA    *       AS:i:242        MS:i:50
+XXX0240        16      chr1    258     242     243M    *       0       0       TTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA     *       AS:i:242        MS:i:50
+XXX0246        16      chr1    258     242     243M    *       0       0       TTTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA     *       AS:i:242        MS:i:50
+XXX0203        16      chr1    259     240     242M    *       0       0       TTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA      *       AS:i:240        MS:i:50
+XXX0217        16      chr1    259     240     242M    *       0       0       TTGTACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA      *       AS:i:240        MS:i:50
+XXX0216        16      chr1    262     237     239M    *       0       0       TACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA *       AS:i:237        MS:i:50
+XXX0230        16      chr1    262     237     239M    *       0       0       TACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA *       AS:i:237        MS:i:50
+XXX0277        16      chr1    263     236     238M    *       0       0       ACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA  *       AS:i:236        MS:i:50
+XXX0308        16      chr1    263     236     238M    *       0       0       ACGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA  *       AS:i:236        MS:i:50
+XXX0288        16      chr1    264     235     237M    *       0       0       CGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA   *       AS:i:235        MS:i:50
+XXX0305        16      chr1    264     235     237M    *       0       0       CGATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA   *       AS:i:235        MS:i:50
+XXX0210        16      chr1    265     234     236M    *       0       0       GATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA    *       AS:i:234        MS:i:50
+XXX0164        16      chr1    266     233     235M    *       0       0       ATTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA     *       AS:i:233        MS:i:50
+XXX0221        16      chr1    267     232     234M    *       0       0       TTTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA      *       AS:i:232        MS:i:50
+XXX0163        16      chr1    268     231     233M    *       0       0       TTCGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA       *       AS:i:231        MS:i:50
+XXX0244        16      chr1    270     228     231M    *       0       0       CGCGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA *       AS:i:228        MS:i:50
+XXX0237        16      chr1    272     226     229M    *       0       0       CGCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA   *       AS:i:226        MS:i:50
+XXX0178        16      chr1    273     226     228M    *       0       0       GCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA    *       AS:i:226        MS:i:50
+XXX0202        16      chr1    273     226     228M    *       0       0       GCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA    *       AS:i:226        MS:i:50
+XXX0236        16      chr1    273     226     228M    *       0       0       GCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA    *       AS:i:226        MS:i:50
+XXX0304        16      chr1    273     226     228M    *       0       0       GCAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA    *       AS:i:226        MS:i:50
+XXX0270        16      chr1    274     225     227M    *       0       0       CAGGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA     *       AS:i:225        MS:i:50
+XXX0161        16      chr1    276     223     225M    *       0       0       GGGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA       *       AS:i:223        MS:i:50
+XXX0287        16      chr1    277     222     224M    *       0       0       GGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA        *       AS:i:222        MS:i:50
+XXX0306        16      chr1    277     222     224M    *       0       0       GGGTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA        *       AS:i:222        MS:i:50
+XXX0173        16      chr1    279     220     222M    *       0       0       GTGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA  *       AS:i:220        MS:i:50
+XXX0269        16      chr1    280     219     221M    *       0       0       TGATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA   *       AS:i:219        MS:i:50
+XXX0303        16      chr1    282     216     219M    *       0       0       ATCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA     *       AS:i:216        MS:i:50
+XXX0220        16      chr1    283     215     218M    *       0       0       TCACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA      *       AS:i:215        MS:i:50
+XXX0219        16      chr1    284     214     217M    *       0       0       CACTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA       *       AS:i:214        MS:i:50
+XXX0177        16      chr1    286     212     215M    *       0       0       CTTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA *       AS:i:212        MS:i:50
+XXX0257        16      chr1    287     211     214M    *       0       0       TTGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA  *       AS:i:211        MS:i:50
+XXX0241        16      chr1    288     210     213M    *       0       0       TGGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA   *       AS:i:210        MS:i:50
+XXX0167        16      chr1    289     209     212M    *       0       0       GGTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA    *       AS:i:209        MS:i:50
+XXX0261        16      chr1    290     208     211M    *       0       0       GTCTCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA     *       AS:i:208        MS:i:50
+XXX0312        16      chr1    293     205     208M    *       0       0       TCCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA        *       AS:i:205        MS:i:50
+XXX0272        16      chr1    294     204     207M    *       0       0       CCAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA *       AS:i:204        MS:i:50
+XXX0253        16      chr1    295     203     206M    *       0       0       CAAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA  *       AS:i:203        MS:i:50
+XXX0254        16      chr1    296     202     205M    *       0       0       AAAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA   *       AS:i:202        MS:i:50
+XXX0307        16      chr1    297     201     204M    *       0       0       AAAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA    *       AS:i:201        MS:i:50
+XXX0169        16      chr1    298     200     203M    *       0       0       AAGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA     *       AS:i:200        MS:i:50
+XXX0232        16      chr1    299     199     202M    *       0       0       AGGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA      *       AS:i:199        MS:i:50
+XXX0195        16      chr1    300     198     201M    *       0       0       GGCGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA       *       AS:i:198        MS:i:50
+XXX0179        16      chr1    302     196     199M    *       0       0       CGGACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA *       AS:i:196        MS:i:50
+XXX0160        16      chr1    305     193     196M    *       0       0       ACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA    *       AS:i:193        MS:i:50
+XXX0271        16      chr1    305     193     196M    *       0       0       ACGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA    *       AS:i:193        MS:i:50
+XXX0180        16      chr1    306     192     195M    *       0       0       CGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA     *       AS:i:192        MS:i:50
+XXX0185        16      chr1    306     192     195M    *       0       0       CGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA     *       AS:i:192        MS:i:50
+XXX0199        16      chr1    306     192     195M    *       0       0       CGGTCCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA     *       AS:i:192        MS:i:50
+XXX0191        16      chr1    310     188     191M    *       0       0       CCCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA *       AS:i:188        MS:i:50
+XXX0250        16      chr1    311     187     190M    *       0       0       CCATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA  *       AS:i:187        MS:i:50
+XXX0273        16      chr1    312     186     189M    *       0       0       CATGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA   *       AS:i:186        MS:i:50
+XXX0239        16      chr1    314     184     187M    *       0       0       TGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA     *       AS:i:184        MS:i:50
+XXX0301        16      chr1    314     184     187M    *       0       0       TGTTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA     *       AS:i:184        MS:i:50
+XXX0197        16      chr1    316     182     185M    *       0       0       TTAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA       *       AS:i:182        MS:i:50
+XXX0260        16      chr1    317     181     184M    *       0       0       TAGAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA        *       AS:i:181        MS:i:50
+XXX0190        16      chr1    319     179     182M    *       0       0       GAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA  *       AS:i:179        MS:i:50
+XXX0309        16      chr1    319     179     182M    *       0       0       GAAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA  *       AS:i:179        MS:i:50
+XXX0285        16      chr1    320     178     181M    *       0       0       AAAAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA   *       AS:i:178        MS:i:50
+XXX0214        16      chr1    322     176     179M    *       0       0       AAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA     *       AS:i:176        MS:i:50
+XXX0279        16      chr1    322     176     179M    *       0       0       AAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA     *       AS:i:176        MS:i:50
+XXX0280        16      chr1    322     176     179M    *       0       0       AAGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA     *       AS:i:176        MS:i:50
+XXX0242        16      chr1    323     175     178M    *       0       0       AGTTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA      *       AS:i:175        MS:i:50
+XXX0213        16      chr1    325     173     176M    *       0       0       TTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA        *       AS:i:173        MS:i:50
+XXX0233        16      chr1    325     173     176M    *       0       0       TTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA        *       AS:i:173        MS:i:50
+XXX0297        16      chr1    325     173     176M    *       0       0       TTCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA        *       AS:i:173        MS:i:50
+XXX0183        16      chr1    326     172     175M    *       0       0       TCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA *       AS:i:172        MS:i:50
+XXX0194        16      chr1    326     172     175M    *       0       0       TCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA *       AS:i:172        MS:i:50
+XXX0283        16      chr1    326     172     175M    *       0       0       TCCCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA *       AS:i:172        MS:i:50
+XXX0215        16      chr1    328     170     173M    *       0       0       CCTACGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA   *       AS:i:170        MS:i:50
+XXX0162        16      chr1    332     166     169M    *       0       0       CGTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA       *       AS:i:166        MS:i:50
+XXX0262        16      chr1    333     165     168M    *       0       0       GTGACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA        *       AS:i:165        MS:i:50
+XXX0200        16      chr1    335     163     166M    *       0       0       GACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA  *       AS:i:163        MS:i:50
+XXX0234        16      chr1    336     161     165M    *       0       0       ACTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA   *       AS:i:161        MS:i:50
+XXX0186        16      chr1    337     161     164M    *       0       0       CTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA    *       AS:i:161        MS:i:50
+XXX0218        16      chr1    337     161     164M    *       0       0       CTATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA    *       AS:i:161        MS:i:50
+XXX0248        16      chr1    338     160     163M    *       0       0       TATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA     *       AS:i:160        MS:i:50
+XXX0267        16      chr1    338     160     163M    *       0       0       TATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA     *       AS:i:160        MS:i:50
+XXX0247        16      chr1    339     158     162M    *       0       0       ATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA      *       AS:i:158        MS:i:50
+XXX0274        16      chr1    339     158     162M    *       0       0       ATATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA      *       AS:i:158        MS:i:50
+XXX0198        16      chr1    340     158     161M    *       0       0       TATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA       *       AS:i:158        MS:i:50
+XXX0251        16      chr1    340     158     161M    *       0       0       TATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA       *       AS:i:158        MS:i:50
+XXX0204        16      chr1    341     156     160M    *       0       0       ATGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA        *       AS:i:156        MS:i:50
+XXX0175        16      chr1    342     155     159M    *       0       0       TGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA *       AS:i:155        MS:i:50
+XXX0209        16      chr1    342     155     159M    *       0       0       TGGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA *       AS:i:155        MS:i:50
+XXX0243        16      chr1    343     154     158M    *       0       0       GGAAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA  *       AS:i:154        MS:i:50
+XXX0165        16      chr1    345     152     156M    *       0       0       AAGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA    *       AS:i:152        MS:i:50
+XXX0231        16      chr1    346     151     155M    *       0       0       AGATCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA     *       AS:i:151        MS:i:50
+XXX0293        16      chr1    349     148     152M    *       0       0       TCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA        *       AS:i:148        MS:i:50
+XXX0302        16      chr1    349     148     152M    *       0       0       TCCAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA        *       AS:i:148        MS:i:50
+XXX0184        16      chr1    351     146     150M    *       0       0       CAGGAAGGTAAGCCCCACCACCCCTCAGATCGTTGCCGGATCCACACTCAGCAACTCGGGCTTACCATAACCCCCGTAGATACTAGTCCCCGCCCGACGACAACAGTTTCTGAGATCCAAAAGCCGCCTCAAGGTGCAGACATAGGGCTA  *       AS:i:146        MS:i:50
diff --git a/tests/pysam_data/example_unmapped_reads_no_sq.sam b/tests/pysam_data/example_unmapped_reads_no_sq.sam
new file mode 100644 (file)
index 0000000..4d9f100
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,3 @@
+@HD    VN:1.0
+read_28833_29006_6945  0       *       0       0       *       *       200     167     AGCTTAGCTAGCTACCTATATCTTGGTCTTGGCCG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<9/,&,22;;<<<
+read_28701_28881_323b  0       *       0       0       *       *       500     412     ACCTATATCTTGGCCTTGGCCGATGCGGCCTTGCA     <<<<<;<<<<7;:<<<6;<<<<<<<<<<<<7<<<<
diff --git a/tests/pysam_data/example_user_header.sam b/tests/pysam_data/example_user_header.sam
new file mode 100644 (file)
index 0000000..cebe71d
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,8 @@
+@HD    VN:1.0
+@SQ    SN:chr1 LN:1575
+@SQ    SN:chr2 LN:1584
+@x1    A:2     B:5
+@x2    A:4     B:5
+@x3    A:6     B:5
+read_28833_29006_6945  99      chr1    33      20      10M1D25M        =       200     167     AGCTTAGCTAGCTACCTATATCTTGGTCTTGGCCG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<9/,&,22;;<<<     NM:i:1  RG:Z:L1
+read_28701_28881_323b  147     chr2    88      30      35M     =       500     412     ACCTATATCTTGGCCTTGGCCGATGCGGCCTTGCA     <<<<<;<<<<7;:<<<6;<<<<<<<<<<<<7<<<<     MF:i:18 RG:Z:L2
diff --git a/tests/pysam_data/issue100.sam b/tests/pysam_data/issue100.sam
new file mode 100644 (file)
index 0000000..6c0c2a8
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,27 @@
+@SQ    SN:chr1 LN:249250621
+@SQ    SN:chr10        LN:135534747
+@SQ    SN:chr11        LN:135006516
+@SQ    SN:chr12        LN:133851895
+@SQ    SN:chr13        LN:115169878
+@SQ    SN:chr14        LN:107349540
+@SQ    SN:chr15        LN:102531392
+@SQ    SN:chr16        LN:90354753
+@SQ    SN:chr17        LN:81195210
+@SQ    SN:chr18        LN:78077248
+@SQ    SN:chr19        LN:59128983
+@SQ    SN:chr2 LN:243199373
+@SQ    SN:chr20        LN:63025520
+@SQ    SN:chr21        LN:48129895
+@SQ    SN:chr22        LN:51304566
+@SQ    SN:chr3 LN:198022430
+@SQ    SN:chr4 LN:191154276
+@SQ    SN:chr5 LN:180915260
+@SQ    SN:chr6 LN:171115067
+@SQ    SN:chr7 LN:159138663
+@SQ    SN:chr8 LN:146364022
+@SQ    SN:chr9 LN:141213431
+@SQ    SN:chrM LN:16571
+@SQ    SN:chrX LN:155270560
+@SQ    SN:chrY LN:59373566
+@PG    ID:bwa  PN:bwa  VN:0.5.9-r16
+YILLUMINA-B8EC94_231:1:50:18506:14866#0        0       chr1    164170895       0       28M     *       0       0       AAAATAAAATAAAATAAAATAAAATAGG    IIIIIGIIIIIIIIHIIIIFIIGIDHIG    XT:A:R  NM:i:0  X0:i:46 X1:i:488        XM:i:0  XO:i:0  XG:i:0  MD:Z:28 XA:Z:chr7,-76584917,28M,0;chr7,-76086813,28M,0;chr19,-14658154,28M,0;chr12,-44420884,28M,0;chr4,-46749296,28M,0;chr16,-65813760,28M,0;chr12,-125218307,28M,0;chr22,-49521364,28M,0;chr8,-67441969,28M,0;chrX,-24771433,28M,0;chr2,-97418606,28M,0;chr17,-48859141,28M,0;chr19,-33212584,28M,0;chr7,-69136775,28M,0;chr5,-80182155,28M,0;chr5,-40957547,28M,0;chr1,-8992207,28M,0;chr4,-41653011,28M,0;chr3,-5149300,28M,0;chr3,+49488805,28M,0;chr5,+58266193,28M,0;chr22,+42021002,28M,0;chr11,+85612617,28M,0;chr7,+151315540,28M,0;chr17,+17559883,28M,0;chr11,+74995947,28M,0;chr12,+119190631,28M,0;chr8,+121033303,28M,0;chr9,+122813065,28M,0;chr1,+92280874,28M,0;chr3,+49184061,28M,0;chr2,+104675746,28M,0;chr6,+108461339,28M,0;chr20,+20548540,28M,0;chr10,+62601188,28M,0;chr4,+8350545,28M,0;chr1,+150194440,28M,0;chr20,+50633348,28M,0;chr1,+25648175,28M,0;chr19,+33713380,28M,0;chr8,+56596974,28M,0;chr10,+19488747,28M,0;chrX,+43980718,28M,0;chr22,+28827966,28M,0;chr7,+76248706,28M,0;chr12,+34385994,28M,1;chr22,+24200895,28M,1;chr11,+9935206,28M,1;chr7,+71057507,28M,1;chr8,+75964204,28M,1;chr11,+70749536,28M,1;chr6,+121876867,28M,1;chr8,+9904069,28M,1;chr2,+167975020,28M,1;chr8,+65343650,28M,1;chr2,+203338523,28M,1;chr6,+134519042,28M,1;chr19,+15588539,28M,1;chrX,+21005486,28M,1;chr1,+51600244,28M,1;chr6,+135071574,28M,1;chrX,+142060697,28M,1;chr3,+88036270,28M,1;chr11,+107768031,28M,1;chr1,+43452382,28M,1;chr3,+119162759,28M,1;chr7,+137682479,28M,1;chrY,+771178,28M,1;chrX,+821178,28M,1;chr3,+131863613,28M,1;chr4,+5198466,28M,1;chr8,+42219792,28M,1;chr18,+21867757,28M,1;chr1,+205771873,28M,1;chr7,+106381815,28M,1;chr3,+152231119,28M,1;chr18,+38121876,28M,1;chr18,+13226733,28M,1;chr2,+113982439,28M,1;chr13,+38527369,28M,1;chr16,+61112193,28M,1;chr13,+63276179,28M,1;chr6,+22044433,28M,1;chr8,+75971314,28M,1;chr1,+155919065,28M,1;chr10,+9075352,28M,1;chr14,+41766647,28M,1;chr4,+38881700,28M,1;chr14,+63221608,28M,1;chr1,+96460706,28M,1;chr1,+31541552,28M,1;chr2,+130852364,28M,1;chr2,+131240936,28M,1;chr16,+54409861,28M,1;chr7,+138085971,28M,1;chr6,+168960156,28M,1;chr7,+35021562,28M,1;chr3,+5192468,28M,1;chr5,+139685004,28M,1;chr16,+57887328,28M,1;chr1,+240683393,28M,1;chr7,+51529361,28M,1;chr15,+38755713,28M,1;chr17,+45077478,28M,1;chr7,+98657066,28M,1;chrX,+15178325,28M,1;chr15,+50856486,28M,1;chr6,+26677004,28M,1;chr11,+67754723,28M,1;chr11,+60378362,28M,1;chr13,+74834741,28M,1;chr7,+139512903,28M,1;chr15,+65775953,28M,1;chr22,+39161266,28M,1;chr5,+42576221,28M,1;chr6,+142807488,28M,1;chr16,+65067646,28M,1;chrY,+17168022,28M,1;chrY,+20444338,28M,1;chr6,+85793701,28M,1;chr7,+95669552,28M,1;chr2,+99252467,28M,1;chr5,+93286660,28M,1;chr12,+19541000,28M,1;chr9,+28932106,28M,1;chr7,+62487286,28M,1;chr5,+152475447,28M,1;chr10,+104206440,28M,1;chr4,+182765824,28M,1;chr19,+54584245,28M,1;chrY,+5218751,28M,1;chr4,+44370409,28M,1;chr6,+19294076,28M,1;chr19,+1191066,28M,1;chr5,+142819608,28M,1;chr13,+82093983,28M,1;chrX,+130954389,28M,1;chr6,+6847717,28M,1;chr11,+89143226,28M,1;chr2,+108524013,28M,1;chr5,+108771229,28M,1;chrX,+93364170,28M,1;chrX,+88234143,28M,1;chr17,+9723415,28M,1;chr6,+27707864,28M,1;chr3,+66057355,28M,1;chr3,+154005450,28M,1;chr15,+29887458,28M,1;chr14,+56232133,28M,1;chr2,+122434791,28M,1;chr8,+126235305,28M,1;chr16,+52177603,28M,1;chr4,+34178766,28M,1;chr8,+22882491,28M,1;chr18,+2552191,28M,1;chr17,+32715595,28M,1;chr16,+53061076,28M,1;chr2,+114903272,28M,1;chr4,+42337800,28M,1;chr6,+149777395,28M,1;chr1,+151096337,28M,1;chr6,+118477838,28M,1;chr3,+30600543,28M,1;chr19,+33567456,28M,1;chr8,+1217564,28M,1;chr4,+39872213,28M,1;chrX,+44688603,28M,1;chrX,+48314490,28M,1;chr1,+21650136,28M,1;chr21,+15675906,28M,1;chr9,+106120465,28M,1;chr13,+24047341,28M,1;chr2,+125770922,28M,1;chr22,+30263047,28M,1;chr2,+204843020,28M,1;chr12,+130100366,28M,1;chr10,+4068348,28M,1;chr17,+63322228,28M,1;chr11,+83019719,28M,1;chrX,+54143823,28M,1;chr7,+36425437,28M,1;chr16,+19178880,28M,1;chr18,+46417931,28M,1;chr6,+55717991,28M,1;chr3,+75664223,28M,1;chr1,+32452030,28M,1;chr15,+88159172,28M,1;chr2,+61851071,28M,1;chr7,+141613606,28M,1;chr17,+12596976,28M,1;chr19,+3414622,28M,1;chr7,+6890735,28M,1;chr20,+34272363,28M,1;chr9,+90994839,28M,1;chr18,+9638082,28M,1;chr1,+67650276,28M,1;chr1,+220568591,28M,1;chr4,+89058188,28M,1;chr4,+4140808,28M,1;chr1,+202088715,28M,1;chr11,+87269515,28M,1;chr11,+67474784,28M,1;chr4,+43167357,28M,1;chr7,+67457466,28M,1;chr16,+19891760,28M,1;chr20,+25234269,28M,1;chr12,+55369476,28M,1;chr4,+6141505,28M,1;chr10,+29354543,28M,1;chr5,+166192505,28M,1;chrX,+48884710,28M,1;chr6,+134330810,28M,1;chr4,+160376376,28M,1;chr4,+99817350,28M,1;chr10,+121317660,28M,1;chr12,+74218473,28M,1;chr9,+32910016,28M,1;chr8,+69378187,28M,1;chrY,+18963621,28M,1;chr5,+6914382,28M,1;chr2,+68235232,28M,1;chr10,+13942898,28M,1;chr2,+80178815,28M,1;chr17,+26736416,28M,1;chr20,+40349589,28M,1;chr15,+23140038,28M,1;chrX,+121086049,28M,1;chr3,+181657140,28M,1;chr15,+66492254,28M,1;chr10,+88050421,28M,1;chr5,+90017384,28M,1;chr17,+36256463,28M,1;chr7,+151013744,28M,1;chr8,+30617505,28M,1;chr6,+31902798,28M,1;chr6,+46224124,28M,1;chr6,+156992688,28M,1;chr11,+59390750,28M,1;chr13,+106355845,28M,1;chr20,+4185147,28M,1;chr9,+110284660,28M,1;chr10,+109112359,28M,1;chr14,+75178252,28M,1;chr10,+95667563,28M,1;chr2,+157160276,28M,1;chr4,+137463808,28M,1;chr4,+62742455,28M,1;chr21,+16861620,28M,1;chr13,+42603913,28M,1;chr5,+88099616,28M,1;chr18,+59093425,28M,1;chr7,+5592293,28M,1;chr2,+169057205,28M,1;chr2,+230616223,28M,1;chr17,+7532710,28M,1;chr11,+18249822,28M,1;chr11,+124575250,28M,1;chr17,+36208776,28M,1;chr12,+51408636,28M,1;chr3,+181394862,28M,1;chr8,+3343335,28M,1;chr4,+72726246,28M,1;chr4,+184703799,28M,1;chr9,+37367170,28M,1;chr3,+37229983,28M,1;chr18,+19786650,28M,1;chr3,+142855780,28M,1;chr16,+63684651,28M,1;chr2,+169863074,28M,1;chr5,+57467010,28M,1;chr16,+68641846,28M,1;chr1,+218080386,28M,1;chr3,+49931339,28M,1;chr8,+91965023,28M,1;chr1,+64882723,28M,1;chr10,+44040423,28M,1;chr1,+27841637,28M,1;chr3,+32964826,28M,1;chrX,-14075583,28M,1;chrY,-19735409,28M,1;chr3,-61210077,28M,1;chr12,-25148105,28M,1;chr6,-46827553,28M,1;chr8,-56057364,28M,1;chr5,-116062081,28M,1;chr6,-114038567,28M,1;chr1,-25697211,28M,1;chr2,-73266904,28M,1;chr5,-175028383,28M,1;chr8,-3051929,28M,1;chr22,-25543121,28M,1;chr6,-26792622,28M,1;chr17,-37194552,28M,1;chr17,-57538339,28M,1;chr1,-51140531,28M,1;chr13,-94647414,28M,1;chr20,-32448950,28M,1;chr1,-238865938,28M,1;chr6,-119062752,28M,1;chr20,-10852575,28M,1;chr11,-124936858,28M,1;chr11,-112719434,28M,1;chr8,-65050045,28M,1;chr11,-111428922,28M,1;chr3,-50585823,28M,1;chr17,-40620860,28M,1;chr9,-79518493,28M,1;chr6,-72507285,28M,1;chr12,-104465353,28M,1;chr2,-131394877,28M,1;chr2,-132001670,28M,1;chr8,-81578043,28M,1;chr20,-37724057,28M,1;chr22,-47141401,28M,1;chr6,-46531919,28M,1;chr9,-9009407,28M,1;chr11,-124465447,28M,1;chr21,-28931439,28M,1;chr18,-61702652,28M,1;chr4,-37711424,28M,1;chr1,-149741655,28M,1;chr13,-78712904,28M,1;chr14,-68009392,28M,1;chr2,-78892078,28M,1;chr1,-149356753,28M,1;chr5,-172533734,28M,1;chr2,-173762459,28M,1;chr2,-198549736,28M,1;chr2,-150821070,28M,1;chr11,-47699839,28M,1;chr17,-42866270,28M,1;chr5,-173490523,28M,1;chr6,-24001074,28M,1;chr1,-39682911,28M,1;chr4,-4222769,28M,1;chr10,-111743035,28M,1;chr11,-128684387,28M,1;chr20,-11257956,28M,1;chr20,-4149529,28M,1;chr5,-164974199,28M,1;chr3,-84991544,28M,1;chr5,-5908988,28M,1;chr2,-138324702,28M,1;chr5,-22429210,28M,1;chr15,-84551893,28M,1;chr6,-73756333,28M,1;chr14,-86022032,28M,1;chr12,-61162349,28M,1;chr13,-42155113,28M,1;chr16,-8376743,28M,1;chrX,-25947951,28M,1;chr13,-37707269,28M,1;chr20,-52341305,28M,1;chr8,-32439586,28M,1;chrX,-65037782,28M,1;chr15,-35588112,28M,1;chr6,-114826977,28M,1;chr16,-22957281,28M,1;chr2,-29152353,28M,1;chr11,-32021557,28M,1;chr14,-53067145,28M,1;chr15,-74660451,28M,1;chr9,-125814020,28M,1;chr2,-47888617,28M,1;chr6,-103141276,28M,1;chr2,-38287203,28M,1;chr14,-75792495,28M,1;chr3,-116403271,28M,1;chr12,-122920160,28M,1;chr1,-192176238,28M,1;chr17,-17438208,28M,1;chr2,-117287007,28M,1;chr11,-68195410,28M,1;chr16,-76921888,28M,1;chr1,-113847491,28M,1;chr5,-166230578,28M,1;chr12,-41106211,28M,1;chrX,-116017871,28M,1;chr6,-107154514,28M,1;chrX,-5600375,28M,1;chr5,-92345920,28M,1;chr5,-176706961,28M,1;chr11,-84337889,28M,1;chr14,-65707185,28M,1;chr7,-66648805,28M,1;chr7,-139066097,28M,1;chr10,-86865072,28M,1;chr3,-73488878,28M,1;chr5,-158663415,28M,1;chr2,-43545165,28M,1;chr6,-69160212,28M,1;chr20,-55152586,28M,1;chr3,-146595642,28M,1;chr10,-88376880,28M,1;chr8,-68384647,28M,1;chr16,-30821557,28M,1;chrX,-69242160,28M,1;chr8,-40818508,28M,1;chr3,-197716909,28M,1;chr2,-241964069,28M,1;chr1,-150748134,28M,1;chr17,-5098791,28M,1;chr2,-135759985,28M,1;chr8,-42470825,28M,1;chr1,-166779724,28M,1;chr16,-63793250,28M,1;chr10,-21864107,28M,1;chr18,-28817256,28M,1;chr17,-13910779,28M,1;chr17,-57348966,28M,1;chr7,-137391223,28M,1;chr19,-23655174,28M,1;chr17,-64986763,28M,1;chr16,-21167483,28M,1;chr11,-42817287,28M,1;chr11,-13533098,28M,1;chr22,-31622164,28M,1;chr4,-21126811,28M,1;chr18,-66802141,28M,1;chr10,-96291396,28M,1;chr4,-145004956,28M,1;chr1,-107823475,28M,1;chr11,-2255057,28M,1;chr19,-28323682,28M,1;chr5,-2777444,28M,1;chr4,-121847688,28M,1;chr13,-54002436,28M,1;chr4,-8970065,28M,1;chr13,-81895317,28M,1;chr6,-85079405,28M,1;chr4,-9504061,28M,1;chr2,-136295178,28M,1;chr3,-196067725,28M,1;chr8,-18303975,28M,1;chrX,-21470871,28M,1;chr3,-194098768,28M,1;chr22,-47888023,28M,1;chr19,-17652453,28M,1;chr3,-32034656,28M,1;chr1,-20438413,28M,1;chr11,-99259713,28M,1;chr3,-177057675,28M,1;chr9,-95123722,28M,1;chr18,-76417358,28M,1;chr6,-100247652,28M,1;chr3,-140933488,28M,1;chr19,-2486490,28M,1;chr15,-73938461,28M,1;chr13,-95995526,28M,1;chr11,-48289844,28M,1;chr5,-72218725,28M,1;chr18,-61103078,28M,1;chr1,-117442797,28M,1;chr7,-143195374,28M,1;chr14,-88665236,28M,1;chr10,-105896107,28M,1;chr12,-89971388,28M,1;chr19,-14741205,28M,1;chr1,-247103257,28M,1;chr13,-106746329,28M,1;chr17,-74646298,28M,1;chr22,-27259346,28M,1;chr8,-131520642,28M,1;chr18,-63913876,28M,1;chr1,-8696036,28M,1;chr3,-132074330,28M,1;chr8,-133889374,28M,1;chr14,-51395758,28M,1;chr4,-22649515,28M,1;chrX,-15236428,28M,1;chr2,-32796028,28M,1;chr19,-58872058,28M,1;chr11,-37627459,28M,1;chr20,-9564948,28M,1;chr8,-30080229,28M,1;chr13,-73402183,28M,1;chr17,-71119116,28M,1;chr8,-63170581,28M,1;chr9,-39465483,28M,1;chr9,-41610501,28M,1;chr9,-40793070,28M,1;chr12,-30506726,28M,1;chr16,-22438117,28M,1;chr12,-33319234,28M,1;chr21,-32371401,28M,1;chr5,-126791414,28M,1;chr8,-20355956,28M,1;chr15,-59301146,28M,1;chr2,-48648533,28M,1;chr7,-48022928,28M,1;chr5,-29797589,28M,1;chr12,-54092686,28M,1;chr16,-11434195,28M,1;chr17,-58971405,28M,1;chr19,-43931598,28M,1;chr7,-91707288,28M,1;chr3,-185465634,28M,1;chr8,-117592194,28M,1;chr4,-125205639,28M,1;chr6,-114161269,28M,1;chr13,-91715527,28M,1;chr10,-98692195,28M,1;chr7,-17789580,28M,1;chr2,-152298559,28M,1;chr19,-47866013,28M,1;chrX,-152022933,28M,1;chr6,-42355529,28M,1;chr7,-115116598,28M,1;chr4,-55514389,28M,1;chr1,-162526013,28M,1;chr6,-53169231,28M,1;chr8,-22225996,28M,1;chr4,-145044601,28M,1;chr1,-150288526,28M,1;chr12,-104184041,28M,1;chr10,-70469042,28M,1;chr8,-37870308,28M,1;chr7,-139506036,28M,1;chr19,-23655169,28M,1;chr1,-8943144,28M,1;chr9,-93078553,28M,1;chr16,-68274470,28M,1;chr1,-28021897,28M,1;chr17,-36306267,28M,1;chr17,-60297701,28M,1;chr4,-175699094,28M,1;chr3,-138640873,28M,1;chr14,-42606743,28M,1;chr10,-29007373,28M,1;chr8,-32366590,28M,1;chr4,-144977946,28M,1;chr3,-73413315,28M,1;chr5,-102654091,28M,1;
diff --git a/tests/pysam_data/rg_with_tab.sam b/tests/pysam_data/rg_with_tab.sam
new file mode 100644 (file)
index 0000000..d2cb7bb
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,3273 @@
+@SQ    SN:chr1 LN:1575
+@SQ    SN:chr2 LN:1584
+@PG    ID:bwa  PN:bwa  VN:0.7.9a-r786  CL:bwa mem -p -t 8 -M -R @RG    ID:None SM:None /mnt/data/hg19.fa       /mnt/analysis/default-0.fastq
+EAS56_57:6:190:289:82  69      chr1    100     0       *       =       100     0       CTCAAGGTTGTTGCAAGGGGGTCTATGTGAACAAA     <<<7<<<;<<<<<<<<8;;<7;4<;<;;;;;94<;     MF:i:192
+EAS56_57:6:190:289:82  137     chr1    100     73      35M     =       100     0       AGGGGTGCAGAGCCGAGTCACGGGGTTGCCAGCAC     <<<<<<;<<<<<<<<<<;<<;<<<<;8<6;9;;2;     MF:i:64 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_64:3:190:727:308 99      chr1    103     99      35M     =       263     195     GGTGCAGAGCCGAGTCACGGGGTTGCCAGCACAGG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<::<<<844     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS112_34:7:141:80:875 99      chr1    110     99      35M     =       265     190     AGCCGAGTCACGGGGTTGCCAGCACAGGGGCTTAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<8;<<8+7;-7     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS219_FC30151:3:40:1128:1940  163     chr1    112     99      35M     =       291     214     CCGAGTCACGGGGTTGCCAGCACAGGGGCTTAACC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<5;;<<<9;;;;7:     MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_62:5:290:319:736 69      chr1    113     0       *       =       113     0       GTTCTCAAGGTTGTTGCAAGGGGGTCTATGTGAAC     <<<<<<:7:<.<<<<7<<.<.<<.9*<4<:<4%74     MF:i:192
+EAS51_62:5:290:319:736 137     chr1    113     73      35M     =       113     0       CGAGTCACGGGGTTGCCAGCACAGGGGCTTAACCT     ==;=======7====6=;==:;;====66=::27:     MF:i:64 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_597:2:132:493:921   69      chr1    119     0       *       =       119     0       GTTCTCAAGGTTGTTGCAAGGGGGTCTATGTGAAC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<77;0<;;6777     MF:i:192
+B7_597:2:132:493:921   137     chr1    119     75      35M     =       119     0       ACGGGGTTGCCAGCACAGGGGCTTAACCTCTGGTG     <<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<;<<<<;;88:     MF:i:64 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_30:7:283:799:560        163     chr1    121     66      35M     =       283     197     GGGGTTGCCAGCACAGGGGCTTAACCTCTGGTGAC     <<<<+<<<<8<<<+<<<<<;<<:07;8;7402447     MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS192_3:1:225:195:543 99      chr1    123     99      35M     =       299     211     GGTTGCCAGCACAGGGGCTTAACCTCTGGTGACTG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<;::388998     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_589:6:114:714:317   99      chr1    126     99      35M     =       311     220     TGCCAGCACAGGGGCTTAACCTCTGGTGACTGCCA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<5;<;     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_39:1:70:147:84  163     chr1    128     73      35M     =       285     192     CCAGCACAGGGGCTTAACCTCTGGTGACTGCCAGA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<;(5<<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_7:2:187:227:818 163     chr1    129     99      35M     =       290     196     CAGCACAGGGGCTTAACCTCTGGTGACTGCCAGAG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<3<;<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_97:4:77:29:126    99      chr1    131     99      35M     =       315     219     GCACAGGGGCTTAACCTCTGGTGACTGCCAGAGCT     <<<<<<<<<<3<<<<<<<;;;7<;<<449<-:977     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_30:4:327:795:103        99      chr1    133     99      35M     =       302     204     ACAGGGGCTTAACCTCTGGTGACTGCCAGAGCTGC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_30:3:139:117:262        69      chr1    135     0       *       =       135     0       GTTCTCAAGGTTGTTGCAAGGGGGTCTATGTGAAC     <<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;<<<<<37;3     MF:i:192
+EAS114_30:3:139:117:262        137     chr1    135     76      35M     =       135     0       AGGGGCTTAACCTCTGGTGACTGCCAGAGCTGCTG     <<<<;<<<<<<<<<<<<<:<<<<<:<<8<<<<:<:     MF:i:64 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS219_FC30151:5:29:817:854    73      chr1    135     77      35M     =       135     0       AGGGGCTTAACCTCTGGTGACTGCCAGAGCTGCTG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:64 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS219_FC30151:5:29:817:854    133     chr1    135     0       *       =       135     0       GTTCTCAAGGTTGTTGCAAGGGGGTTTATGTGAAC     <<<<<<<<<<<<<<<1..;:;;;;1%407)07&7.     MF:i:192
+EAS192_3:6:170:169:57  163     chr1    138     99      35M     =       296     193     GGCTTGACCTCTGGTGACTGCCAGAGCTGCTGGCC     <<<<<;<<<<<<;<<<<<<<<<<<<:<<<<<;;+%     MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:2  UQ:i:30 H0:i:0  H1:i:1
+B7_595:4:84:802:737    99      chr1    140     68      35M     =       284     179     CTTAACCTCTGGTGACTGCCAGAGCTGCTGGCAAG     <<<<<<<<<<;9<9<<<;<<;73;<<<<<37;1+.     MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_4:7:78:583:670  163     chr1    142     99      35M     =       316     209     TAACCTCTGGTGACTGCCAGAGCTGCTGGCAAGCT     <<<<<<<<<<;;;<;;<<<:7;5;<5;;<2--8-;     MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_64:3:90:435:691  99      chr1    147     99      35M     =       318     206     TCTGGTGACTGCCAGAGCTGCTGGCAAGCTAGAGT     <<<<<<<<<<;<<<;<<<<:<<<;<81;<<1;784     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_7:3:13:122:187  163     chr1    153     99      35M     =       343     225     GACTGCCAGAGCTGCTGGCAAGCTAGAGTCCCCTT     <<<<<<<;<;<<<;<<<<:;6<<<<;;;;:<<%%<     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:1  UQ:i:4  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_1:6:69:735:1915 99      chr1    154     99      35M     =       321     202     ACTGCCAGAGCTGCTGGCAAGCTAGAGTCCCATTT     <<<<<<<<;<<<<<<<<<;<<<<;<8<<<<;1:<<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:5:66:959:1311        163     chr1    159     95      35M     =       336     212     CAGAGCTGCTGGCAAGCTAGAGGCCCATCTGGAGC     ;;4;;;+;;;-01;;&-;;4;;&;;73)(&**274     MF:i:18 Aq:i:31 NM:i:2  UQ:i:12 H0:i:0  H1:i:1
+EAS56_57:6:325:759:288 99      chr1    163     99      35M     =       341     213     GCTGCTGGCAAGCTAGAGTCCCATTTGGAGCCCCT     8<;<<<<81<<<<<;<<;<<<;9</;6;;809034     MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:7:82:926:112  99      chr1    164     99      35M     =       328     199     CTGCTGGCAAGCTAGAGTCCCATTTGGAGCCCCTC     <;<<<<<<<<<5<<<<<<<<<<<<<<<;<<1:<4<     MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:5:324:728:956 99      chr1    165     99      35M     =       322     192     TGCTGGCAAGCTAGAGTCCCATTTGGAGCCCCTCT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<<<:<::;;;;<:<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_103:4:294:525:849 163     chr1    167     99      35M     =       340     208     CTGGCAAGCTAGAGTCCCATTTGGAGCCCCTCTAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9+<:<<<<9;;15     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:7:159:125:297 163     chr1    170     99      35M     =       337     202     GCAAGCTAGAGTCCCATTTGGAGCCACTCTAAGAC     <<<<<<<<<<<<<<;<<<;<;<<6;)<:9;26;39     MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:2  UQ:i:26 H0:i:0  H1:i:1
+EAS54_65:6:164:797:930 99      chr1    173     99      35M     =       332     194     AGCTAGAGACCCATTTGGAGCCCCTCTAAGCCGTT     <<<<<<<<<<<<<<<;;;:<<<<<;<;<<<<<,::     MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+EAS54_81:7:293:355:321 163     chr1    174     99      35M     =       356     217     GCTAGAGTCCCATTTGGAGCCCCTCTAAGCCGTTC     <<<:<;<<<<<<<;<<<<<<<<<;<<;4<<<:+:<     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_595:1:209:653:400   163     chr1    175     99      35M     =       340     200     CTAGAGTCCCATTTGGAGCCCCTCTAAGCCGTTCT     <;<9<<+<2<9<,;;64;<<<<;8<00*1<48:+8     MF:i:18 Aq:i:59 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS220_1:2:62:1109:804 163     chr1    176     99      35M     =       350     209     TAGAGTCCCATTTGGAGCCCCTCTAAGCCGTTCTA     <<<<<<<<<<<<<:<<:<<<<<<:<:<<<<;;;;;     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_78:7:303:402:142 163     chr1    181     99      35M     =       343     197     TCCCATTTGGAGCCCCTCTAAGCCGTTCTATTTGT     <8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<46<648;;';     MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_71:8:321:642:388 163     chr1    181     99      35M     =       357     209     TCCCATTTGGAGCCCCTCTAAGCCGTTCTATTTGT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<6<<<8;     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:2:1:1140:1206        163     chr1    181     99      35M     =       368     222     TCCCATTTGGAGCCCCTCTAAGCCGTTCTATTTGT     ;;;;;;;;;;;;;:9;;7;;:;:;97;:;:88888     MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_28:6:155:68:326 99      chr1    182     99      36M     =       332     186     CCCATTTGGAGCCCCTCTAAGCCGTTCTATTTGTAA    <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_7:7:19:886:279  99      chr1    182     99      35M     =       337     190     CCCATTTGGAGCCCCTCTAAGCCGTTCTATTTGTA     <9<<<<<<<<<<<<6<28:<<85<<<<<2<;<9<<     MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_61:4:143:69:578  147     chr1    185     98      35M     =       36      -184    ATTGGGAGCCCCTCTAAGCCGTTCTATTTGTAATG     222&<21<<<<12<7<01<<<<<0<<<<<<<20<<     MF:i:18 Aq:i:35 NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_71:4:13:981:659  181     chr1    187     0       *       =       188     0       CGGGACAATGGACGAGGTAAACCGCACATTGACAA     +)---3&&3&--+0)&+3:7777).333:<06<<<     MF:i:192
+EAS54_71:4:13:981:659  121     chr1    188     37      34M     =       187     0       TGTAGCCCCTCTAAGGCGTTCTATTTGTAATGAA      ()&)06636;;<664*6;<<<<<<<<<<<<<<<1      MF:i:64 Aq:i:0  NM:i:2  UQ:i:14 H0:i:0  H1:i:1
+B7_610:1:37:652:403    163     chr1    193     99      35M     =       347     189     CCCCTCTAAGCCGTTCTATTTGTAATGAAAACTAT     <<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_66:1:282:274:50  163     chr1    193     99      35M     =       371     213     CCCCTCTAAGCCGTTCTATTTGTAATGAAAACTAT     <<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<99<9<5909;5;     MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:2:133:460:542   99      chr1    195     99      36M     =       356     197     CCTATAAGCCGTTCTATTTGTAATGAAAACTATATT    <<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<;    MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+EAS54_73:5:44:498:945  99      chr1    195     82      35M     =       377     217     CCTATAAGCCGTTCTATTTGTAATGAAAACTATAT     ;<;<<<<<<<<<<9<;<:<<<<<<:<<<<;:;<3<     MF:i:18 Aq:i:37 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+B7_610:1:139:152:856   99      chr1    198     99      35M     =       392     229     CTAAGCCGTTCTATTTGTAATGAAAACTATATTTA     <<<<<<<<;<<<<<<<<<<;<;<<<;<<<<;<;;;     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_591:2:323:639:311   163     chr1    200     99      36M     =       357     193     AAGCCGTTCTATTTGTAATGAAAACTATATTTAGGC    <<<<<<<<<<<<<<<<<<<2<<<<<<;<<<<<<81<    MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:1  UQ:i:23 H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_39:2:18:967:582 163     chr1    200     99      35M     =       398     233     AAGCCGTTCTATTTGTAATGAAAACTATATTTATG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<;<<<<<8     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_597:8:186:850:838   99      chr1    205     99      35M     =       389     219     GTTCTATTTGTAATGAAAACTATATTTATGCTATT     <<<<<;<<<<<<<<<<<:<<<<<;<<<;</<<;<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_53:3:126:558:408 163     chr1    206     99      35M     =       368     197     TTCTATTTGTAATGAAAACTATATTTATGCTATTC     <<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<7<;<<;;     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:6:157:643:175 163     chr1    206     99      35M     =       380     209     TTCTATTTGTAATGAAAACTATATTTATGCTATTC     <<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<)<<<<;<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_103:5:141:711:813 99      chr1    209     99      35M     =       370     196     TATTTGTAATGAAAACTATATTTATGCTATTCAGT     <<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<:+<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_65:6:115:538:276 163     chr1    209     99      35M     =       360     186     TATTTGTAATGAAAACTATATTTATGCTATTCAGT     <<<<<<<<;<<<;;<<<;<:<<<:<<<<<<;;;7;     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS219_FC30151:7:51:1429:1043  83      chr1    209     99      35M     =       59      -185    TATTTGTAATGAAAACTATATTTATGCTATTCAGT     9<5<<<<<<<<<<<<<9<<<9<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_30:1:176:168:513        163     chr1    210     99      35M     =       410     235     ATTTGTAATGAAAACTATATTTATGCTATTCAGTT     <<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:&<<<<:;0;;     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_95:7:282:817:710  99      chr1    211     99      35M     =       384     208     TTTGTAATGAAAACTATATTTATGCTATTCAGTTC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;:<<<<:8,<<8     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:1:65:787:74   83      chr1    213     88      35M     =       61      -187    TGTAATGAAAACTATATTTATGCTATTCAGTTCTA     44848=:1661/66==?:<=:?6><<<<1>><<<<     MF:i:18 Aq:i:21 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_66:4:240:264:231 121     chr1    213     66      35M     =       213     0       TGTAATGAAAACTATATTTATGCTATTCAGTTCTA     9;,;;62<9<)29<<<;96<<<;<<7<<<<<<;<<     MF:i:64 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_66:4:240:264:231 181     chr1    213     0       *       =       213     0       CAACAGATCAAGAAGGAGGGGCAATGGACGAGTTA     %15+5022))0&<<)0)+7:4+&<0<<:0<<<7<<     MF:i:192
+EAS1_93:7:14:426:613   99      chr1    214     99      35M     =       379     200     GTAATGAAAACTATATTTATGCTATTCAGTTCTAA     ======;=;==========;;==3=;==-=<;<;<     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_93:2:173:995:93   163     chr1    215     99      35M     =       382     202     TAATGAAAACTATATTTATGCTATTCAGTTCTAAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<7:<<<<;:<:<<<<:7     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_64:6:195:348:703 163     chr1    215     99      35M     =       353     173     TAATGAAAACTATATTTATGCTATTCAGTTCTAAA     <<<<<<<;<<<<<;:<<<<<<<<<<<<:<1:<:7<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:2:62:879:264  163     chr1    216     99      35M     =       396     215     AATGAAAACTATATTTATGCTATTCAGTTCTAAAT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<2<<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_61:4:83:452:970  99      chr1    216     99      35M     =       379     198     AATGAAAACTATATTTATGCTATTCAGTTCTAAAT     ==========================;========     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS218_1:2:64:1318:1711        99      chr1    218     99      35M     =       389     206     TGAAAACTATATTTATGCTATTCAGTTCTAAATAT     <<<<<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<:<<<<<2<<<<     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_589:8:113:968:19    83      chr1    219     99      35M     =       50      -204    GAAAACTATATTTATGCTATTCAGTTCTAAATATA     8;<;8;9<<<<<<<9<:<<<<<<<<<;<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:63 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_93:4:160:896:275  163     chr1    220     99      35M     =       387     202     AAAACTATATTTATGCTATTCAGTTCTAAATATAG     ============<====<==<====<==<==;=:6     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_591:6:181:191:418   163     chr1    221     99      36M     =       387     202     AAACTATATTTATGCTATTCAGTTCTAAATATAGAA    <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<988    MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_28:7:242:354:637        99      chr1    222     99      36M     =       417     231     AACTATATTTATGCTATTCAGTTCTAAATATAGAAA    <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<6<;;    MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_589:1:122:77:789    163     chr1    223     99      35M     =       396     208     ACTATATTTATGCTATTCAGTTCTAAATATAGAAA     <<<:<4<<9<:7<<<:<<<7<<<<<<<<<<9<9<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_591:5:42:540:501    147     chr1    224     99      36M     =       60      -200    CTATATTTATGCTATTCAGTTCTAAATATAGAAATT    ;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_591:6:155:12:674    83      chr1    224     99      36M     =       52      -208    CTATATTTATGCTATTCAGTTCTAAATATAGAAATT    ;<<<<<<<<<<;<<<<;<<<<8<<<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:4:106:316:452   147     chr1    224     99      36M     =       49      -211    CTATATTTATGCTATTCAGTTCTAAATATAGAAATT    :<<<<<;<<<<:<<:<<<<<<7<<<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:5:89:525:113 163     chr1    227     78      40M     =       397     210     TATTTATGCTATTCAGTTATAAATATAGAAATTGAAACAG        <1<7<6;+0;7;7'<70;-<7<:<:<<5<<:9<5:7:%:7        MF:i:18 Aq:i:39 NM:i:1  UQ:i:12 H0:i:0  H1:i:1
+EAS54_65:3:321:311:983 147     chr1    228     99      35M     =       51      -212    ATTTATGCTATTCAGTTCTAAATATAGAAATTGAA     ;;4;;<7<<<<<<77<<<<<<<<<<17<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:62 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_65:8:76:493:708  147     chr1    229     44      35M     =       73      -191    TTTATGCTATTCAGTTCTAAATATAGAAATTGAAA     5/)63.&1517(544(055(0454&7706566679     MF:i:18 Aq:i:44 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_71:2:125:628:79  163     chr1    229     99      35M     =       400     205     TTTATGCTATTCAGTTCTAAATATAGAAATTGAAA     ==================<6<====<<:<==7;::     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_32:5:78:583:499 83      chr1    229     74      35M     =       37      -227    TTTACGCTATTCAGTACTAAATATAGAAATTGAAA     &6&9774&<;67<44&-4<;<9<7<<<<<;<<<<<     MF:i:18 Aq:i:37 NM:i:2  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+EAS54_67:3:175:730:949 83      chr1    230     99      35M     =       70      -195    TTATGCTATTCAGTTCTAAATATAGAAATTGAAAC     <<<<;+<<<<7<;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:1:84:275:1572        163     chr1    230     99      35M     =       394     199     TTATGCTATTCAGTTCTAAATATAGAAATTGAAAC     /6;;;4;;;;;;;;7;;4;.4;;;;;6;;;77077     MF:i:18 Aq:i:62 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:4:248:753:731 99      chr1    231     99      35M     =       402     206     TATGCTATTCAGTTCTAAATATAGAAATTGAAACA     <<<<<<<<<<<8<<<<<<<<<<<<:<<<<&<:<.:     MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:1:9:1289:215 99      chr1    231     99      35M     =       394     198     TATGCTATTCAGTTCTAAATATAGAAATTGAAACA     ;;;;;;9;;;67;;;;;99;9;;;;;;;;977747     MF:i:18 Aq:i:59 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_595:7:188:802:71    163     chr1    232     99      35M     =       415     218     ATGCTATTCAGTTCTAAATATAGAAATTGAAACAG     <<<<<<<<<;<<<<<9<<<:<<<:<<<<<<:<<<;     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_93:7:252:171:323  83      chr1    234     99      35M     =       43      -226    GCTATTCAGTTCTAAATATAGAAATTGAAACAGCT     ;8<;<=3=6==:====;;======;==========     MF:i:18 Aq:i:62 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS192_3:5:223:142:410 147     chr1    235     99      35M     =       60      -210    CTATTCAGTTCTAAATATAGAAATTGAAACAGCTG     8;<<<;<<<<;<<<<<<;<;<<<<<<<<<<<<;<<     MF:i:18 Aq:i:39 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_30:1:243:10:911 83      chr1    236     99      35M     =       63      -208    TATTCAGTTCTAAATATAGAAATTGAAACAGCTGT     ;<;;;<4;9:<<<;<<;<<<<<;;<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:64 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:6:5:730:1436 163     chr1    236     99      35M     =       403     202     TATTCAGTTCTAAATATAGAAATTGAAACAGCTGT     ;;;;;;;;;;;;;;;;;;8;;;;;8;;;;;67777     MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:2:57:1672:1890       121     chr1    236     75      40M     =       236     0       TATTCAGTTCTAAATATAGAAATTGAAACAGCTGTGTTTA        :;;;9<8;;*<<<<<<:<<<<<<<<1:<<<<<<<<<<<7<        MF:i:64 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:2:57:1672:1890       181     chr1    236     0       *       =       236     0       CCCCCCCCCCCCCCCCCAGCCACTGCGGCCCCCCCAGCCA        -+)%)'-'+,,<066,))090+:&486083:5&&:<<5<0        MF:i:192
+EAS1_105:2:299:360:220 99      chr1    237     99      35M     =       403     201     ATTCAGTTCTAAATATAGAAATTGAAACAGCTGTG     <<<<<<<9<9<<<<<<<<<<<<<<<<<5<;<0<<<     MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_1:2:24:1037:84  163     chr1    238     99      35M     =       415     212     TTCAGTTCTAAATATAGAAATTGAAACAGCTGTGT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<;:<57<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_105:3:86:823:683  163     chr1    240     99      35M     =       408     203     CAGTTCTAAATATAGAAATTGAAACAGCTGTGTTT     <<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;9<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_53:4:130:568:978 99      chr1    246     88      35M     =       434     223     TAAATATAGAAATTGAAACAGCTGTGTTTAGTGAC     7<<;<<;<7<:;<7<<<<<<<<);4;+<7+3+%;<     MF:i:18 Aq:i:24 NM:i:1  UQ:i:26 H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:4:73:1208:495        163     chr1    246     99      35M     =       431     220     TAAATATAGAAATTGAAACAGCTGTGTTTAGTGCC     ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;5;;;;;37377     MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_97:7:264:642:506  99      chr1    247     99      35M     =       420     208     AAATATAGAAATTGAAACAGCTGTGTTTATTGTAT     <<;<<<<<<;<<<;:;;:;;<<;<<<<;*+;*&.4     MF:i:18 Aq:i:56 NM:i:3  UQ:i:28 H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_28:5:104:350:749        163     chr1    247     99      36M     =       415     204     AAATATAGAAATTGAAACAGCTGTGTTTAGTGCCTT    <<8<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<0;<<<9;<85;;;    MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_61:6:227:259:597 147     chr1    248     99      35M     =       61      -222    AATATAGAAATTGAAACAGCTGTGTTTAGTGCCTT     <8<;2;9;<;;-92<;;;<;<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:61 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS112_32:7:113:809:364        99      chr1    250     99      35M     =       413     198     TATAGAAATTGAAACAGCTGTGTTTAGTGCCTTTG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<;<;<<<4     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_7:2:218:877:489 83      chr1    250     86      35M     =       80      -205    TATAGAAATTGAAACAGCTGTGTTTAGTGCCTTTG     9<<<8<<<;<9<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:10 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_97:7:20:979:96    83      chr1    254     99      35M     =       79      -210    GAAATTGAAACAGCTGTGTTTAGTGCCTTTGTTCA     '9996;(:;-<;1<<<<=<<<<=<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:37 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_7:2:259:219:114 99      chr1    254     99      35M     =       411     192     GAAATTGAAACAGCTGTGTTTAGTGCCTTTGTTCA     <<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<7<7<<<<<0<<9<     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_39:6:13:1034:1144       99      chr1    256     99      35M     =       429     208     AATTGAAACAGCTGTGTTTAGTGCCTTTGTTCACA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<3<<<;<<;<++     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:2  UQ:i:48 H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_1:2:29:1486:672 147     chr1    256     99      35M     =       79      -212    AATTGAAACAGCTGTGTTTAGTGCCTTTGTTCACA     <<:<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<++     MF:i:18 Aq:i:29 NM:i:2  UQ:i:54 H0:i:0  H1:i:0
+EAS139_11:7:46:695:738 163     chr1    259     74      35M     =       428     204     TGAAACAGCTGAGTTTAGCGCCTGTGTTCACATAG     <;<<<<;<<),&4<3<<7&7<0;)).3;79;7<;0     MF:i:130        Aq:i:74 NM:i:3  UQ:i:18 H0:i:0  H1:i:0
+EAS139_11:8:26:1221:222        163     chr1    261     99      35M     =       446     220     AAACAGCTGTGTTTAGTGCCTTTGTTCAACCCCCT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:78 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_64:3:190:727:308 147     chr1    263     99      35M     =       103     -195    ACAGCTGTGTTTAGTGCCTTTGTTCAACCCCCTTG     ;;<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_26:3:284:261:124        83      chr1    263     99      35M     =       79      -219    ACAGCTGTGTTTAGTGCCTTTGTTCAACCCCCTTG     ===27===.====&===========;;========     MF:i:18 Aq:i:39 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS112_34:7:141:80:875 147     chr1    265     99      35M     =       110     -190    AGCTGTGTTTAGTGCCTTTGTTCAACCCCCTTGCA     6/<;84<;<;<<<<<<5<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:3:24:1135:563        163     chr1    266     99      40M     =       446     220     GCTGTGTTTAGTGCCTTTGTTCAACCCCCTTGCAACAACC        <<<<:<<<<:1:<<<<<<.<<<<<<<<;<;;;43+:30::        MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_1:2:90:986:1224 83      chr1    267     99      35M     =       67      -235    CTGTGTTTAGTGCCTTTGTTCAACCCCCTTGCAAC     <7*37;;;;;;;9<<;<7<<<<<<<<<<<;;<<<<     MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_28:7:287:492:169        99      chr1    269     99      36M     =       449     216     GTGTTTAGTGCCTTTGTTCAACCCCCTTGCAACAAC    <<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8;;<;6<<;    MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS218_4:1:48:9:409    99      chr1    271     75      18M5I12M        =       464     228     GTTTAGTGCCTTTGTTCACATAGACCCCCTTGCAA     <<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:130        Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:0  H1:i:0
+EAS139_19:1:87:1222:878        163     chr1    272     10      40M     =       435     203     TATAGGGCCTTTGTTCAAACCCCTTGCAACAACCTTGAGA        &+6<6&<:<<9<1112<<;)9227</);;;2-79;)/769        MF:i:18 Aq:i:10 NM:i:3  UQ:i:41 H0:i:0  H1:i:0
+B7_591:7:200:192:373   163     chr1    275     75      14M5I17M        =       451     212     AGTGCCTTTGTTCACATAGACCCCCTTGCAACAACC    <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<:<;5<<;<<    MF:i:130        Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:0  H1:i:0
+EAS56_65:1:163:846:223 163     chr1    278     74      11M5I19M        =       463     220     GCCTTTGTTCACATAGACCCCCTTGCAACAACCTT     <<<<;<<;4<<<;;9<<<<<+<<;<</27;;47;.     MF:i:130        Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:0  H1:i:0
+EAS114_30:7:283:799:560        83      chr1    283     66      35M     =       121     -197    ACATAGACCCCCTTGCAACAACCTTGAGAACCCCA     <4<6<8;;6<<<+;<:<<;<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:130        Aq:i:66 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:0  H1:i:0
+B7_595:4:84:802:737    147     chr1    284     68      35M     =       140     -179    CATAGACCCCCTTGCAACAACCTTGAGAACCCCAG     +<1<-;69;;;;8;:<<6<;<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:130        Aq:i:68 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:0  H1:i:0
+EAS51_66:5:308:400:602 163     chr1    285     71      35M     =       470     220     ATAGACCCCCTTGCAACAACCTTGAGAACCCCAGG     ;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;;<<;<;76     MF:i:130        Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:0  H1:i:0
+EAS54_81:2:285:367:932 163     chr1    285     74      35M     =       440     190     ATAGACCCCCTTGCAACAACCTTGAGAACCCCAGG     ===========;======;=====;=======5==     MF:i:130        Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:0  H1:i:0
+EAS114_39:1:70:147:84  83      chr1    285     73      35M     =       128     -192    ATAGACCCCCTTGCAACAACCTTGAGAACCCCAGG     <<<:<;<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;     MF:i:130        Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:0  H1:i:0
+EAS51_62:3:314:386:190 99      chr1    287     98      35M     =       459     207     AGACCCCCTTGCAACAACCTTGAGAACCCCAGGGA     ++<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<<<<     MF:i:18 Aq:i:29 NM:i:2  UQ:i:54 H0:i:0  H1:i:0
+EAS56_65:1:53:272:944  99      chr1    287     99      35M     =       447     195     CAACCCCCTTGCAACAACCTTGCGAACCCCAGGGA     <<<<<<<<<<<<.7<.<<<<<<-<-<<<<<&<222     MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:1  UQ:i:12 H0:i:0  H1:i:1
+EAS188_7:5:112:51:128  163     chr1    287     99      35M     =       477     225     AGACCCCCTTGCAACAACCTTGAGAACCCCAGGGA     ++<<<<<<<<<<<<<5<<<<<<<<<<<<<<;<;<6     MF:i:18 Aq:i:29 NM:i:2  UQ:i:54 H0:i:0  H1:i:0
+EAS56_57:6:44:280:641  163     chr1    288     99      35M     =       454     201     AACCCCCTTGCAACAACCTTGAGAACCCCAGGGAA     ;<<<<<<<<<<66<;<<<<<;<<2;;;<<;;;;,;     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_11:6:75:946:1035        99      chr1    288     99      35M     =       480     227     AACCCCCTTGCAACAACCTTGAGAACCCCAGGGAA     <<<<<<<<<<;<<<;<<<<<<<8;<6<<<<44<:4     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_7:2:187:227:818 83      chr1    290     99      35M     =       129     -196    CCCCCTTGCAACAACCTTGAGAACCCCAGGGAATT     <<9<<;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS219_FC30151:3:40:1128:1940  83      chr1    291     99      35M     =       112     -214    CCCCTTACAACAACCTTGAGAACCCCAGGGAATTT     <<<:///77:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:1  UQ:i:14 H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_71:4:72:63:435   99      chr1    293     99      34M     =       490     232     CCTTGCAACAACCTTGAGAACCCCAGGGAATTTG      <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<;<;;39:7:7      MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_93:6:271:244:568  99      chr1    294     99      35M     =       481     222     CTTGCAACAACCTTGAGAACCCCAGGGAATTTGTC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<.<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_59:7:82:902:868  99      chr1    295     99      35M     =       471     211     TTGCAACAACCTTGAGAACCCCAGGGAATTTGTCA     <<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_103:7:313:83:546  163     chr1    296     99      35M     =       454     193     TGCAACAACCTTGAGAACCCCAGGGAATTTGTCAA     <<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<4<<<:<;<<9     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_64:4:57:786:414  163     chr1    296     99      35M     =       453     192     TGCAACAACCTTGAGAACCCCAGGGAATTTGTCAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<:<<:;;7<7     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_59:7:260:985:520 163     chr1    296     99      35M     =       468     207     TGCAACAACCTTGAGAACCCCAGGGAATTTGTCAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<;:;<<;<:<<<,:1;)<;     MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS192_3:6:170:169:57  83      chr1    296     99      35M     =       138     -193    TGCAACAACCTTGAGAACCCCAGGGAATTTGTCAA     778<:<<<9<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_59:6:199:327:965 163     chr1    297     91      35M     =       494     232     NCAACAACCTTGAGAACCCCAGGGAATTTGTCAAT     !,+*+++++++++++*+++++++**)+*+**+(**     MF:i:18 Aq:i:19 NM:i:1  UQ:i:0  H0:i:0  H1:i:1
+B7_610:5:147:68:353    163     chr1    299     99      35M     =       486     222     AACAACCTTGAGAACCCCAGGGAATTTGTCAATGT     <;<;<<7<<<<<<<7<<;;<7<4<8<<<8.;4;;;     MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS192_3:1:225:195:543 147     chr1    299     99      35M     =       123     -211    AACAACCTTGAGAACCCCAGGGAATTTGTCAATGT     ;;8;;+;(<<<<<<<<7;<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_61:1:303:184:14  163     chr1    301     99      35M     =       479     213     CAACCTTGAGAACCCCAGGGAATTTGTCAATGTCA     <<<<<<8<0<<<<-<-98<<--<<<6;076;75+&     MF:i:18 Aq:i:61 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_30:6:326:309:149        163     chr1    301     99      35M     =       467     201     CAACCTTGAGAACCCCAGGGAATTTGTCAATGTCA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<;;;;:     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_30:4:327:795:103        147     chr1    302     99      35M     =       133     -204    AACCTTGAGAACCCCAGGGAATTTGTCAATGTCAG     ;::;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_105:7:110:355:323 99      chr1    303     99      35M     =       477     209     ACCTTGAGAACCCCAGGGAATTTGTCAATGTCAGG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<;;<<8;     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS219_FC30151:1:18:1418:237   99      chr1    304     99      35M     =       503     234     CCTTGAGAACCCCAGGGAATTTGTCAATGTCAGGG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<7<     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_589:7:112:203:90    163     chr1    305     99      35M     =       470     200     CTTGAGAACCCCAGGGAATTTGTCAATGTCAGGGA     <<:<<<<<<<<.<<<<<<<<<<<<6<:867<8884     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_59:7:319:246:304 99      chr1    305     99      35M     =       472     202     CTTGAGAACCCCAGGGAATTTGTCAATGTCAGGGA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;;:     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_589:6:114:714:317   147     chr1    311     99      35M     =       126     -220    AACCCCAGGGAATTTGTCAATGTCAGGGAAGGAGC     ;8<;:<<;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_30:5:327:991:508        99      chr1    312     99      35M     =       495     218     ACCCCAGGGAATTTGTCAATGTCAGGGAAGGAGCA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;:<7:47;:75;     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_97:4:77:29:126    147     chr1    315     99      35M     =       131     -219    ACAGGGAATTTGTCAATGTCAGGGAAGGAGCATTT     ()9;;<<<<<<<<<<5<<<7<<<<<<;<<<;7<<<     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:1  UQ:i:7  H0:i:1  H1:i:0
+EAS219_1:1:37:1004:1136        99      chr1    315     99      35M     =       473     193     CCAGGGAATTTGTCAATGTCAGGGAAGGAGCATTT     <<<<<<<<<<<<<<;<<<;<<<<<:<<;;369<<<     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_4:7:78:583:670  83      chr1    316     99      35M     =       142     -209    CAGGGAATTTGTCAATGTCAGGGAAGGAGCATTTT     8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_64:3:90:435:691  147     chr1    318     99      35M     =       147     -206    GGGAATTTGTCAATGTCAGGGAAGGAGCATTTTGT     ;;<;;;+<<:<<<:<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<;     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_1:6:69:735:1915 147     chr1    321     99      35M     =       154     -202    AATTTGTCAATGTCAGGGAAGGAGCATTTTGTCAG     <<::<<<7<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:5:324:728:956 147     chr1    322     99      35M     =       165     -192    ATTTGTCAATGTCAGGGAAGGAGCATTTTGTCAGT     <;;;;5;<<0<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_66:5:269:280:716 99      chr1    323     99      35M     =       490     202     TTTGTCAATGTCAGGGAAGGAGCATTTTTTCAGTT     <<<<<<<<<2<<:2:1<<7/2/:3<<<<*<3($<<     MF:i:18 Aq:i:58 NM:i:1  UQ:i:9  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_73:3:88:24:744   163     chr1    325     84      35M     =       484     194     TGTCAATGTCAGGGAAGGAGCATTTTTGAAGTTTA     <7*:<<::.'<<<<:<<:<<'<63'6+'303*%%+     MF:i:18 Aq:i:21 NM:i:5  UQ:i:53 H0:i:0  H1:i:0
+EAS1_108:7:82:926:112  147     chr1    328     99      35M     =       164     -199    CAATGTCAGGGAAGGAGCATTTTGTCAGTTGCCAA     <1:/<*6<<6<<<<<6<<<<<<4<<<<82<+<<<<     MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:1  UQ:i:10 H0:i:0  H1:i:1
+EAS56_63:7:185:213:330 163     chr1    328     99      35M     =       502     209     CAATGTCAGGGAAGGAGCATTTTGTCAGTTACCAA     <<<<<<<<<;<<;<<<<<;<<<<;;;<<;<<;<38     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_591:3:277:458:330   163     chr1    329     99      36M     =       490     197     AATGTCAGGGAAGGAGCCTTTTGTCAGTTACCAAAT    <<7<<<<<<<<<2<<<%,<6<&<<,<<<<:<<<<(7    MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:1  UQ:i:11 H0:i:0  H1:i:1
+B7_595:1:81:1000:375   163     chr1    329     90      35M     =       524     230     NATGTCAGGGAAGGAGCATTTTGTCAGTTACCAAA     !.............................+.(+.     MF:i:18 Aq:i:19 NM:i:1  UQ:i:0  H0:i:0  H1:i:1
+EAS220_1:8:33:672:473  99      chr1    330     99      35M     =       515     220     ATGTCAGGGAAGGAGCATTTTGTCAGTTACCAAAT     <<<<<<<<7<7<7<<62<<<<66<15*/99*5241     MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_65:6:164:797:930 147     chr1    332     99      35M     =       173     -194    GTCAGGGAAGGAGCATTTTGTCAGTTACCAAATGT     ;;:;8<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_28:6:155:68:326 147     chr1    332     99      36M     =       182     -186    GTCAGGGAAGGAGCATTTTGTCAGTTACCAAATGTG    ;<<<:6<<<<<<6<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_64:5:202:39:380  99      chr1    334     99      35M     =       513     214     CAGGGAAGGAGCATTTTGTCAGTTACCAAATGTGT     <<<<<<<<<<<<<<<<<;<<:;<<18<84:<&<+<     MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_11:7:42:1091:1726       99      chr1    334     99      35M     =       502     203     CAGGGAAGGAGCATTTTGTCAGTTACCAAATGTGT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<<<<<<8:<.<:     MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:5:66:959:1311        83      chr1    336     95      35M     =       159     -212    GGGAAGGAGCATTTTGTCAGTTACCAAATGTGTTT     67.68:4::6;;;7:6:;:5;8;;<<:;;<;;;;<     MF:i:18 Aq:i:31 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:1:200:559:765   99      chr1    337     99      36M     =       521     220     GGAAGGAGCATTTTGTCAGTTACCAAATGTGTTTAT    <<<<<<<<<<<<<<7<<<<<<;<<;;4<7<9;<<-;    MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_71:4:328:669:662 99      chr1    337     99      34M     =       512     210     GGAAGGAGCATTTTGTCAGTTACCAAATGTGTTT      <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<+9;<;;.<<<      MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:7:159:125:297 83      chr1    337     99      35M     =       170     -202    GGAAGGAGCATTTTGTCAGTTACCAAATGTGTTTA     89<;;8<<;<;<4<;<8<<<<;;8<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_7:7:19:886:279  147     chr1    337     99      35M     =       182     -190    GAAAGGAGCATTTTGTCAGTTACCAAATGTGTTTA     9%<2)2.2::<;<<<2<<<<<<<<<<<<<<<<<;<     MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:1  UQ:i:4  H0:i:1  H1:i:0
+B7_595:1:209:653:400   83      chr1    340     99      35M     =       175     -200    AGGAGCATTTTGTCAGTTACCAAATGTGTTTATTA     <69<98<+<<6<<4<<<<</4<<:<4<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:59 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_103:4:294:525:849 83      chr1    340     99      35M     =       167     -208    AGGAGCATTTTGTCAGTTACCAAATGTGTTTATTA     ;<;:;:<;<;<<<3<<<;<;<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_1:4:87:1375:1303        163     chr1    340     99      35M     =       529     224     AGGAGCATTTTGTCAGTTACCAAATGTGTTTATTA     <<<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:6:325:759:288 147     chr1    341     99      35M     =       163     -213    GGAGCATTTTGTCAGTTACCAAATGTGTTTATTAC     9;<9<;<;;<;<;<;<<<:<;<<<;<<<<<;<<<<     MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:7:76:786:458  163     chr1    341     99      35M     =       502     196     GGAGCATTTTGTCAGTTACCAAATGTGTTTATTAC     <<.<<<<2<<:84<:<<<:<8<<)<)429<2<<8<     MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_61:1:210:880:606 163     chr1    341     99      35M     =       518     212     GGAGCATTTTGTCAGTTACCAAATGTGTTTATTAT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<:<<<<3<<8&     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:1  H1:i:0
+EAS192_3:3:257:611:440 99      chr1    341     99      35M     =       524     218     GGAGCATTTTGTCAGTTACCAAATGTGTTTATTAC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<<<<;<<<<8<<+5     MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_78:7:303:402:142 83      chr1    343     99      35M     =       181     -197    AGCATTTTGTCAGTTACCAAATGTGTTTATTACCA     ;;;;;<9<<8;<<<<7<<;<<<<;<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_7:3:13:122:187  83      chr1    343     99      35M     =       153     -225    AGCATTTTGTCAGTTACCAAATGTGTTTATTACCA     <<&<;;<<<;7<<<<;<;<<<<<<<<<<<<;<<<<     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_64:3:80:885:513  163     chr1    344     99      35M     =       507     198     GCATTTTGTCAGTTACCAAATGTGTTTATTACCAG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<2:<;<<75<7;     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS218_4:7:90:1873:89  99      chr1    344     99      35M     =       531     222     GCATTTTGTCAGTTACCAAATGTGTTTATTACCAG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<7<<<7     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_610:1:37:652:403    83      chr1    347     99      35M     =       193     -189    TTTTGTCAGTTACCAAATGTGTTTATTACCAGAGG     <;<<<<:<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_53:8:28:701:724  163     chr1    347     99      35M     =       521     209     TTTTGTCAGTTACCAAATGTGTTTATTACCAGAGG     <<<<<<7<<<<<<7::<:<<-<<::::::<747::     MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_66:8:66:655:769  99      chr1    348     99      35M     =       515     202     TTTGTCAGTTACCAAATGTGTTTATTACCAGAGGG     8;<<<<<8<<<<<;<<<7<;<<<<<;<7<27<;;7     MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_73:5:231:339:551 163     chr1    350     99      35M     =       527     212     TGTCAGTTACCAAATGTGTTTATTACCAGAGGGAT     <<<<<<;<<<<<<;<<<<<<<<<<;5<<46;<;:1     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_26:6:129:694:359        163     chr1    350     88      35M     =       525     210     TGTCAGTTACCAAATGTGTTTATTACCCGAGGGAT     ============+7=======:==;;;'=;==7;=     MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1  UQ:i:6  H0:i:0  H1:i:1
+EAS220_1:2:62:1109:804 83      chr1    350     99      35M     =       176     -209    TGTCAGTTACCAAATGTGTTTATTACCAGAGGGAT     <<<<<:<<<::<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_589:8:157:935:374   99      chr1    353     99      35M     =       512     194     CAGTTACCAAATGTGTTTATTACCAGAGGGATGGA     <<<<<<<<<<;<<;;<<<<<<<<<::8'5++;+11     MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_591:4:103:111:720   99      chr1    353     99      36M     =       512     195     CAGTTACCAAATGTGTTTATTACCAGAGGGATGGAG    <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<5<<<5;<5<:;    MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_103:7:311:100:539 163     chr1    353     99      35M     =       508     190     CAGTTACCAAATGTGTTTATTACCAGAGGGATGGA     <<<<;<<<<;<<<<<;<<<<<<<<<:<::;7;<0;     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_64:6:195:348:703 83      chr1    353     99      35M     =       215     -173    CAGTTACCAAATGTGTTTATTACCAGAGGGATGGA     <9<<9</<<<<<<<<<<<<<<2<8<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:6:72:308:839 163     chr1    354     99      40M     =       517     203     AGTTACCAAATGTGTTTATTACCAGAGGGATGGAGGGAAG        <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<;<99494416:        MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:2:133:460:542   147     chr1    356     99      36M     =       195     -197    TTACCAAATGTGTTTATTACCAGAGGGATGGAGGGA    ;:;7;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_81:7:293:355:321 83      chr1    356     99      35M     =       174     -217    TTACCAAATGTGTTTATTACCAGAGGGATGGAGGG     <<4<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_591:2:323:639:311   83      chr1    357     99      36M     =       200     -193    TACCAAATGTGTTTATTACCAGAGGGATGGAGGGAA    -94<<<<<<<4<<<<<<<<2<<<<<7<<<-<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_71:8:321:642:388 83      chr1    357     99      33M     =       181     -209    TACCAAATGTGTTTATTACCAGAGGGATGGAGG       19<<<<<8<<<<<<<<;<<<<<<<<<<7<<<<<       MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_61:4:262:456:74  99      chr1    357     99      35M     =       504     182     TACCAAATGTGTTTATTACCAGAGGGATGGAGGGA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:;;:;7:<::7<7:3     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_610:8:95:426:791    99      chr1    359     99      35M     =       547     223     CCAAATGTGTTTATTACCAGAGGGATGGAGGGAAG     <<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<,<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_65:6:115:538:276 83      chr1    360     99      35M     =       209     -186    CAAATGTGTTTATTACCAGAGGGATGGAGGGAAGA     :<<<<<<<<;;<5<<;<<<<<<<<;<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_95:1:196:533:921  99      chr1    361     99      35M     =       526     200     AAATGTGTTTATTACCAGAGGGATGGAGGGAAGAG     =====1========8===:===7======971=3=     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_65:5:121:380:656 99      chr1    362     99      35M     =       542     215     AATGTGTTTATTACCAGAGGGATGGAGGGAAGAGG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<:<<83<:<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_11:3:34:970:1374        99      chr1    363     99      35M     =       520     192     ATGTGTTTATTACCAGAGGGATGGAGGGAAGAGGG     <<<<<<<<<<<<<<;7<77;<<;<;;9;;:86:::     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_3:4:29:1061:574 163     chr1    363     99      35M     =       563     235     ATGTGTTTATTACCAGAGGGATGGAGGGAAGAGGG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<;<<8<:<<<<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_53:1:124:243:35  99      chr1    364     60      35M     =       544     215     TGTGTTTATTACCAGAGGGATGGAGGGAAGAGCGA     <<<<<;;<<<<<<:<<<.<<<:++5+:1(;1;$<(     MF:i:18 Aq:i:60 NM:i:1  UQ:i:3  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_30:2:272:750:698        163     chr1    365     80      35M     =       538     208     GTGTTTATTACCAGAGGGATGGAGGGATGACGGAC     <)<<<<<7;<<<4<;7<<<<78068:(%<3*861,     MF:i:18 Aq:i:37 NM:i:2  UQ:i:13 H0:i:0  H1:i:1
+EAS56_53:3:126:558:408 83      chr1    368     99      35M     =       206     -197    TTTATTACCAGAGGGATGGAGGGAAGAGGGACGCT     <:<<:;;<<<<<<<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:2:1:1140:1206        83      chr1    368     99      35M     =       181     -222    TTTATTACCAGAGGGATGGAGGGAAGAGGGACGCT     77977::99;;;:;;<;;;:;;;<<;<;;;;<;;;     MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_103:5:141:711:813 147     chr1    370     99      35M     =       209     -196    TATTACCAGAGGGATGGAGGGAAGAGGGACGCTGA     =<5<5<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_66:1:282:274:50  83      chr1    371     99      35M     =       193     -213    ATTACCAGAGGGATGGAGGGAAGAGGGACGCTGAA     </7;/:<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS220_1:8:46:485:482  99      chr1    371     94      35M     =       530     194     ATTACCAGAGGGATGAAGGGAAGAGGGACGCTGAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<6<<<<<:<:89<     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+EAS56_63:1:119:446:185 163     chr1    372     99      35M     =       562     225     TTACCAGAGGGATGGAGGGAAGAGGGACGCTGAAG     <<<<<<<7<<<4<<<<9<<54<:<7<5:<::7-5;     MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_591:3:168:69:605    163     chr1    373     67      36M     =       565     228     TACCCGAGGGATGGAGGGTAGAGGGACGCTGAAGTG    <<<4(<<<<<<<<<<<<<(1<6<-<2<<7<<6<<++    MF:i:18 Aq:i:26 NM:i:4  UQ:i:59 H0:i:0  H1:i:0
+EAS114_32:6:78:909:394 163     chr1    373     81      35M     =       554     216     TACCAGAGGGATGGAGGGAAGAGGGACGCTGAAGA     <<<<<<8<<<&<<<-<<<14,4;<<-0<2+<)/82     MF:i:18 Aq:i:21 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS218_4:5:41:118:1246 99      chr1    374     99      35M     =       548     209     ACCAGAGGGATGGAGGGAAGAGGGACGCTGAAGAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<</<<<<<<1<<(     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_73:5:44:498:945  147     chr1    377     82      35M     =       195     -217    ATAGGGATGGAGGGAAGAGGGCCGCTGAAGAACTT     <%*50<7<4<<<7<,<<.<8/,9<:</<<<;<;<<     MF:i:18 Aq:i:37 NM:i:2  UQ:i:15 H0:i:0  H1:i:1
+EAS114_39:5:50:972:1286        163     chr1    377     99      35M     =       559     217     AGAGGGATGGAGGGAAGAGGGACGCTGAAGAACTT     <<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<6<<7:7:;     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_11:6:82:164:1924        163     chr1    378     99      35M     =       542     199     GAGGGATGGAGGGAAGAGGGACGCTGAAGAACTTT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<<<<<<3<<'<7<8     MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_93:7:14:426:613   147     chr1    379     99      35M     =       214     -200    AGGGAGGGAGGGAAGAGGGACGCTGAAGAACTTTG     :<<<<&<<<<<<<<<<<<<<6<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_61:4:83:452:970  147     chr1    379     99      35M     =       216     -198    AGGGATGGAGGGAAGAGGGACGCTGAAGAACTTTG     <<<39<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:6:157:643:175 83      chr1    380     99      35M     =       206     -209    GGGATGGAGGGAAGAGGGACGCTGAAGAACTTTGA     ;<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS218_1:8:61:1797:113 99      chr1    380     99      35M     =       551     206     GGGATGGAGGGAAGAGGGACGCTGAAGAACTTTGA     <<<<<<;<<<<;:<3<<<<;;<<<8<<;:<<;3<.     MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_591:5:90:828:633    163     chr1    381     99      36M     =       537     192     GGATGGAGGGAAGAGGGACGCTGAAGAACTTTGATG    <<<<<<<<<<<8<;96<;<<<<<99<2<<;<96<8;    MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_103:4:61:433:385  163     chr1    381     99      35M     =       579     233     GGATGGAGGGAAGAGGGACGCTGAAGCACTTTGAT     <<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;<<6<<)91<<;;,;     MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1  UQ:i:8  H0:i:0  H1:i:1
+EAS1_93:2:173:995:93   83      chr1    382     99      35M     =       215     -202    GCTGGAGGGAAGAGGGACGCTGAAGAACTTTGATG     <(0<<9<<<7<<<<<<7<<<<<<<<<7<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:1  UQ:i:7  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_71:3:254:32:275  99      chr1    382     99      34M     =       575     228     GATGGAGGGAAGAGGGACGCTGAAGAACTTTGAT      <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<:<::<:2*<      MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_95:7:282:817:710  147     chr1    384     99      35M     =       211     -208    TGGAGGGAAGAGGGACGCTGAAGAACTTTGATGCC     366=6;======8====:========;========     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:3:75:217:337 163     chr1    386     99      35M     =       568     217     GAGGGAAGAGGGACGCTGAAGAACTTTGATGCCCT     ;;;;;;;;;;;;;;;;;;8;;;;;;;;;;;88787     MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_591:6:181:191:418   83      chr1    387     99      36M     =       221     -202    AGGGAAGAGGGACGCTGAAGAACTTTGATGCCCTCT    <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_93:4:160:896:275  83      chr1    387     99      35M     =       220     -202    AGGGAAGAGGGACGCTGAAGAACTTTGATGCCCTC     ;;;9;<<<<<<;<;;<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:3:88:1656:896        99      chr1    387     99      40M     =       538     191     AGGGAAGAGGGATGCTGAAGAACTTTGATGCCCTCTTCTT        <<<9<<<<<<<9<<<;<<<<<<<<<;6<<;7<<<<::9:;        MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+B7_597:8:186:850:838   147     chr1    389     99      35M     =       205     -219    GGAAGAGGGACGCTGAAGAACTTTGATGCCCTCTT     <;<;<;<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS218_1:2:64:1318:1711        147     chr1    389     99      35M     =       218     -206    GGAAGAGGGACGCTGAAGAACTTTGATGCCCTCTT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_1:8:78:1478:1446        99      chr1    389     99      35M     =       560     206     GGAAGAGGGACGCTGAAGAACTTTGATGCCCTCTT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<:<<<;     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:2:82:879:246  163     chr1    391     99      35M     =       576     220     AAGAGGGACGCTGAAGAATTTTGATGCCCTCTTCT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<&<<<77<<-<<<6<62<     MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:0  H1:i:1
+B7_610:1:139:152:856   147     chr1    392     99      35M     =       198     -229    AGAGGGACGCTGAAGAACTTTGATGCCCTCTTCTT     <<<<<;<<<<<<<<<<;<;<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_95:2:162:503:769  99      chr1    392     99      35M     =       571     214     AGAGGGACGCTGAAGAACTTTGATGCCCTCTTCTT     ========================:==========     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:3:216:988:883 163     chr1    392     99      35M     =       584     227     AGAGGGACGCTGAAGAACTTTGATGCCCTCTTCTT     <<<<<<<<<<<<8;<;88<;8;;;;828;8;8;;;     MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS112_34:7:118:523:591        163     chr1    393     99      35M     =       563     205     GAGGGACGCTGAAGAACTTTGATGCCCTCTTCTTC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<;;<;     MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_65:3:168:741:680 163     chr1    394     99      35M     =       562     203     AGGGACGCTGAAGAACTTTGATGCCCTCTTCTTCC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<1<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:79 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:1:9:1289:215 147     chr1    394     99      35M     =       231     -198    AGGGACGCTGAAGAACTTTGATGCCCTCTTCTTCC     7747*7;;;;+;;:2;7;:1;;9:;:;:;;:;::;     MF:i:18 Aq:i:59 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:1:84:275:1572        83      chr1    394     99      35M     =       230     -199    AGGGACGCTGAAGAACTTTGATGCCCTCTTCTTCC     777777::7:;74;:;:7;:::;;;;:;;8;;;<;     MF:i:18 Aq:i:62 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_589:1:122:77:789    83      chr1    396     99      35M     =       223     -208    GGACGCTGAAGAACTTTGATGCCCTCTTCTTCCAA     9<;<:<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:2:62:879:264  83      chr1    396     99      35M     =       216     -215    GGACGCTGAAGAACTTTGATGCCCTCTTCTTCCAA     ====:=<============================     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:5:89:525:113 83      chr1    397     78      40M     =       227     -210    GACGCTGAAGAACTTTGATTCCCTCTTCTTCCAAAGATGA        );:+4-&<<+<<:<+<)<<<7<8<8:<:<<:<82::<<2<        MF:i:18 Aq:i:39 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+EAS114_39:2:18:967:582 83      chr1    398     99      35M     =       200     -233    ACGCTGAAGAACTTTGATGCCCTCTTCTTCCAAAG     <:<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_61:3:140:522:212 163     chr1    399     99      35M     =       568     204     CGCTGAAGAACTTTGATGCCCTCTTCTTCCAAAGA     <<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<;<;95;     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_71:2:125:628:79  83      chr1    400     99      34M     =       229     -205    GCTGAAGAACTTTGATGCCCTCTTCTTCCAAAGA      95&<<<<<<<63<<<6<<<<8<;<<8<<<<<<<<      MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_95:6:185:312:167  163     chr1    401     99      35M     =       562     196     CTGAAGAACTTTGATGCCCTCTTCTTCCAAAGATG     ===========================;855;===     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:4:248:753:731 147     chr1    402     99      35M     =       231     -206    TGAAGAACTTTGATGCCCTCTTCTTCCAAAGATGA     7;55;=,=89=====3===9=======9=======     MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_105:2:299:360:220 147     chr1    403     99      35M     =       237     -201    GAAGAACTTAGATGCCCTCTTCTTCCAAAGATGAA     66<;;4;<<()<<4<<<<<<;<<;<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1  UQ:i:7  H0:i:0  H1:i:1
+EAS114_45:6:5:730:1436 83      chr1    403     99      35M     =       236     -202    GAAGAACTTTGATGCCCTCTTCTTCCAAAGATGAA     7977979;;;;;;;;;7;3<;2<;26;<;<<;;<<     MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_591:2:134:868:252   99      chr1    404     99      36M     =       595     227     AAGAACTTTGATGCCCTCTTCTTCCAAAGATGAAAC    <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;:<<<:<<<    MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_597:2:165:431:857   99      chr1    406     99      35M     =       559     188     GAACTTTGATGCCCTCTTCTTCCAAAGATGAAACG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<6&:<7<:76,;;     MF:i:18 Aq:i:53 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_105:3:86:823:683  83      chr1    408     99      35M     =       240     -203    ACTTTGATGCCCTCTTCTTCCAAAGATGAAACGCG     <4<<<<<<<<:<<6<<7<<<8<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_30:1:176:168:513        83      chr1    410     99      35M     =       210     -235    TTTGATGCCCTCTTCTTCCAAAGATGAAACGCGTA     ;0;;;7:<<<<<<<;<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_7:2:259:219:114 147     chr1    411     99      35M     =       254     -192    TTGATGCCCTCTTCTTCCAAAGATGAAACGCGTAA     666<:6/:6::6::<:::<<<;<<<<<<<<;<<<<     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_1:8:84:1013:1074        121     chr1    411     71      35M     =       411     0       TTGATGCCCTCTTCTTCCAAAGATGAAACGCGTAA     8;;<;8744<7<<4<<47<<<<<<7<<<<<<<<<<     MF:i:64 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_1:8:84:1013:1074        181     chr1    411     0       *       =       411     0       GCAAGGGGGTCTATGTGAACAAAGGCACTAAACAC     <7<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:192
+EAS54_81:7:325:150:465 99      chr1    412     99      35M     =       598     221     TGATGCCCTCTTCTTCCAAAGATGAAACGCGTAAC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<3;;:     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS112_34:8:179:13:782 163     chr1    412     99      35M     =       568     191     TGATGCCCTCTTCTTCCAAAGATGAAACGCGTAAC     <<<<<<<<<<<<<<<<<:<<:7<<<<::<7<:-:1     MF:i:18 Aq:i:39 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS112_32:7:113:809:364        147     chr1    413     99      35M     =       250     -198    GATGCCCTCTTCTTCCAAAGATGAAACGCGTAACT     ;<;;;<<<:<6<<<::<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_595:7:188:802:71    83      chr1    415     99      35M     =       232     -218    TGCCCTCTTCTTCCAAAGATGAAACGCGTAACTGC     ;;;;<:::<<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_71:2:204:264:413 99      chr1    415     96      34M     =       593     213     TGCCCTCTTCTTCCAAAGATGAAACGCGTAACTG      <<<<<<<<<<<<<;:59<+<<:<<<9<<;:62<)      MF:i:18 Aq:i:27 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_28:5:104:350:749        83      chr1    415     99      36M     =       247     -204    TGCCCTCTTCTTCCAAAGATGAAACGCGTAACTGCG    ;<93;9;<3;<<<;<<<<<;<<<<<<;<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_1:2:24:1037:84  83      chr1    415     99      35M     =       238     -212    TGCCCTCTTCTTCCAAAGATGAAACGCGTAACTGC     <;<<;<<<7<<7&<<<<<<;<<<;<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_28:7:242:354:637        147     chr1    417     99      36M     =       222     -231    CCCTCTTCTTCCAAAGATGAAACGCGTAACTGCGCT    8<;;;;;<<<8;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_73:3:37:761:635  99      chr1    418     99      35M     =       581     198     CCTCTTCTTCCAAAGATGAAACGCGTAACTGCGCT     <6<<<<<<6<<<<<<<<<<<<<<<<<8<8<<4<4<     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:3:44:1578:1674       99      chr1    418     99      35M     =       573     190     CCTCTTCTTCCAAAGATGAAACGCGTAACTGCGCT     ;<<;<<;<<;;;;;9<;9;;<9:;;<:;9;76669     MF:i:18 Aq:i:64 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_610:3:120:63:653    99      chr1    420     99      35M     =       598     213     TCTTCTTCCAAAGATGAAACGCGTAACTGCGCTCT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<9<<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_97:7:264:642:506  147     chr1    420     99      35M     =       247     -208    ACTTCATCCAAAGATGAAACGCGTAACTGCGCTCT     &;(-/)-1&:<<9<25<<<<2<1<';8<<<:888<     MF:i:18 Aq:i:56 NM:i:2  UQ:i:13 H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_7:3:101:572:491 99      chr1    425     99      35M     =       600     210     TTCCAAAGATGAAACGCGTAACTGCGCTCTCATTC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<1<<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:3:27:1881:486        163     chr1    427     99      35M     =       607     215     CCAAAGATGAAACGCGTAACTGCGCTCTCATTCAC     ;;;;;;;;;;;;;;1;;;;;;;;78;8;8;8878/     MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_589:6:120:14:944    163     chr1    428     99      35M     =       621     228     CAAAGATGAAACGCGTAACTGCGCTCTCATTCACT     <<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<;<<<<<<<:;8;;7     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_11:7:46:695:738 83      chr1    428     74      35M     =       259     -204    CAAAGATGAAACGCGTAACTGCGCTCTCATTCACT     <<<<2<5<<-<<<<<<<4<<<<<<<<<<<<<<3<<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_39:6:13:1034:1144       147     chr1    429     99      35M     =       256     -208    AAAGATGAAACGCGTAACTGCGCTCTCATTCACTC     <<:%<9)<<<<<<8<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_63:6:91:360:585  99      chr1    430     99      35M     =       586     191     AAGATGAAACGCGTAACTGCGCTCTCATTCACTCC     <<<<9<<<<<;<<<;<<77<<<;<;;<;;<;<;;<     MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:4:73:1208:495        83      chr1    431     99      35M     =       246     -220    AGATGAAACGCGTAACTGCGCTCTCATTCACTCCA     8-889<<;<;;:<;<;;;;;;<<;;<;;;;<<;;;     MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS218_1:8:16:1081:1894        163     chr1    431     99      35M     =       624     228     AGATGAAACGCGTAACTGGGCTCTCATTCACTCCA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<8<<<<;<<;<<<<<<<+     MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:1  UQ:i:23 H0:i:0  H1:i:1
+EAS188_4:7:35:408:348  117     chr1    433     0       *       =       433     0       GGTTCTCAAGGTTGTTGCAATGGGGTCTATGTGAA     .73<;<<:77<<<<<<<<<<-<<;<<<<<<<<<<<     MF:i:192
+EAS188_4:7:35:408:348  185     chr1    433     35      35M     =       433     0       AAGAAACGCGTAACTGCGCTCTCATACACTCCAGC     4,'3<6;)2);<3<-6<;<;7+7<5+<<<7<<<<<     MF:i:64 Aq:i:0  NM:i:2  UQ:i:21 H0:i:0  H1:i:1
+EAS56_53:4:130:568:978 147     chr1    434     88      35M     =       246     -223    TGAAACGCGAAACTGCACTCTCATTCACTCCAGCT     --;066;;62<<<2&<+<+<2;<<2<<<;<<<7<<     MF:i:18 Aq:i:24 NM:i:2  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:0
+EAS139_19:1:87:1222:878        83      chr1    435     34      40M     =       272     -203    TCAGCGCGTCACTCCGCTCTCATTCACCCCAGCTCCCTGT        !!;*:885<&<<<)8&<:<<<8<8<::*<4<88<<<8<<<        MF:i:18 Aq:i:10 NM:i:6  UQ:i:42 H0:i:0  H1:i:0
+EAS51_64:6:143:763:480 117     chr1    436     0       *       =       436     0       CTGAAGGTTGTTGCAAGGGGGTCTATGTGAACAAA     ;<&-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:192
+EAS51_64:6:143:763:480 185     chr1    436     70      35M     =       436     0       AAACGCGTAACTGCGCTCTCATTCACTCCAGCTCC     ::3<:6<<<:<<<<7<<<<<<<<)6<<<1<<<<;<     MF:i:64 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_67:4:145:607:216 163     chr1    437     99      35M     =       596     194     AACGCGTAACTGCGCTCTCATTCACTCCAGCTCCC     <<<<<<<<8<<<<<<<<<<4<<<7<:<<1<<;;99     MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_67:6:46:285:790  121     chr1    437     72      35M     =       437     0       AACGCGTAACTGCGCTCTCATTCACTCCAGCTCCC     ;;<8<;<<<<88<8<<;;<;<<;<<<<<<<<;<<<     MF:i:64 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_67:6:46:285:790  181     chr1    437     0       *       =       437     0       TCAAGGTTGTTGCAAGGGGGTCTATGTGAACAAAG     !!<<3<<<;;<<<<<<<<<;<;7<<7<<<<<<;<<     MF:i:192
+EAS56_59:4:329:577:757 117     chr1    437     0       *       =       437     0       TCAAGGTTGTTGCAAGGGGGTCTATGTGAACAAAG     !!<<<<9;<:<<;<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<     MF:i:192
+EAS56_59:4:329:577:757 185     chr1    437     72      35M     =       437     0       AACGCGTAACTGCGCTCTCATTCACTCCAGCTCCC     ;;;888;<<<<<<6<<<2;<<<<<<;<<<<<<<<<     MF:i:64 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_105:7:57:722:347  163     chr1    439     99      35M     =       599     195     CGCGTAACTGCGCTCTCATTCACTCCAGCTCCCTG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_81:2:285:367:932 83      chr1    440     74      35M     =       285     -190    GCGTAACTGCGCTCTCATTCACTCCAGCTCCCTGT     9=5==;=;7===;==;===================     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_11:8:38:842:395 73      chr1    442     77      35M     *       0       0       GTAACTGCGCTCTCATTCACTCCAGCTCCCTGTCA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<93<;9     MF:i:32 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_93:8:14:601:624   163     chr1    446     99      35M     =       622     211     CTGCGCTCTCATTCACTCCAGCTCCCTGTCAACCC     <<1<<<<<<<<<<<<<<<<<3<<::<<7<<1,<:(     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:2  UQ:i:18 H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:3:3:1377:1663        99      chr1    446     99      35M     =       626     215     CTGCGCTCTCATTCACTCCAGCTCCCTGTCACCCA     <<;;;;<:;;:<;;<;;<;:;;<;9;;::977676     MF:i:18 Aq:i:61 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_11:8:26:1221:222        83      chr1    446     99      35M     =       261     -220    CTGCGCTCTCATTCACTCCAGCTCCCTGTCACCCA     <<<<<<<:<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:78 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_11:8:82:566:1096        99      chr1    446     99      35M     =       621     210     CTGCGCTCTCATTCACTCCAGCTCCCTGTCACCCA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<;<;     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:3:24:1135:563        83      chr1    446     99      40M     =       266     -220    CTGCGCTCTCATTCACTCCAGCTCCCTGTCACCCAATGGA        6+96:87<&8<<79:<;<<<<:<<;<<<<<<;;<<<<<<<        MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_65:1:53:272:944  147     chr1    447     99      35M     =       287     -195    TGCGCTCTCATTCACTCCAGCTCCCTGTCACCCAA     &94<4&8.6<6&;<:0:8;;:6;<;:<*<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_28:7:287:492:169        147     chr1    449     99      36M     =       269     -216    CGCTCTCATTCACTCCAGCTCCCTGTCACCCAATGG    ;/;6<<<<4(<(<<<<6<<<<<<<<<<;<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:2:49:163:904 163     chr1    450     99      35M     =       616     201     GCTCTCATTCACTCCAGCTCCCTGTCACCCAATGG     ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;78958     MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_591:7:200:192:373   83      chr1    451     75      36M     =       275     -212    CTCTCATTCACTCCAGCTCCCTGTCACCCAATGGAC    <<<8<<<4<4<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_26:4:253:285:104        163     chr1    451     99      35M     =       627     211     CTCTCATTCACTCCAGCTCCCTGTCACCCAATGGA     ======================:========7==;     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_103:1:151:159:43  99      chr1    452     99      35M     =       645     228     TCTCATTCACTCCAGCTCCCTGTCACCCAATGGAC     <<<<<<<;<<<8<<<;<;8<<<<7<77;;79<09+     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_61:1:115:868:887 163     chr1    452     99      35M     =       650     233     TCTCATTCACTCCAGCTCCCTGTCACCCAATGGAC     >>>>>>>>>>>>>>;<>>>>><<>>>;<+<</;;1     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_64:4:57:786:414  83      chr1    453     99      35M     =       296     -192    CTCATTCACTCCAGCTCCCTGTCACCCAATGGACC     ;;;8;1;:<<<<;<::;;<<<<;<;;<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_32:2:197:170:559        121     chr1    453     71      35M     =       453     0       CTCATTCACTCCAGCTCCCTGTCACCCAATGGACC     <:<;;:<5<5<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:64 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_32:2:197:170:559        181     chr1    453     0       *       =       453     0       TTCTCAAGGTTGTTGCAAGGGGGTCTATGTGAACA     :;;;;<<<<<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:192
+EAS1_103:7:313:83:546  83      chr1    454     99      35M     =       296     -193    TCATTCACTCCAGCTCCCTGTCACCCAATGGACCT     ;)<994<;<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<5<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:6:44:280:641  83      chr1    454     99      35M     =       288     -201    TCATTCACTCCAGCTCCCTGTCACCCAATGGACCT     9;<<9;9;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_591:1:60:837:923    163     chr1    457     61      36M     =       641     220     TTCACGCCAGCTCCCTGTCACCCAATGGACCTCTGA    <<<<<4<<+<<*<<<<88<<<<<'*<4-+<<4&<40    MF:i:18 Aq:i:24 NM:i:2  UQ:i:24 H0:i:0  H1:i:1
+EAS114_45:5:85:401:1190        163     chr1    458     99      35M     =       652     229     TCACTCCAGCTCCCTGTCACCCAATGGACCTGTGA     4;;;1;;;;;;.6;;;(;;/;/;3;;;7;(3&063     MF:i:18 Aq:i:55 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_62:3:314:386:190 147     chr1    459     98      35M     =       287     -207    CACTCCAGCTCCCTGTCACCCAATGGACCTGTGAT     76;%;<<3<9;<69<<<7;;;<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:29 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_103:1:2:831:692   99      chr1    462     99      35M     =       634     207     TCCAGCTCCCTGTCACCCAATGGACCTGTGATATC     <<<<<<<<;<<<<<<<<<<9<<:9<<<;;96<796     MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_65:1:163:846:223 83      chr1    463     74      35M     =       278     -220    CCAGCTCCCTGTCACCCAATGGACCTGTGATATCT     <7<5<*<<<<0<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS218_4:1:48:9:409    147     chr1    464     75      35M     =       271     -228    CAGCTCCCTGTCACCCAATGGACCTGTGATATCTG     <<<<+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_591:5:134:751:831   99      chr1    465     99      36M     =       651     222     AGCTCCCTGTCACCCAATGGACCTGTGATATCTGGA    <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<948    MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_30:6:326:309:149        83      chr1    467     99      35M     =       301     -201    CTCCCTGTCACCCAATGGACCTGTGATATCTGGAT     ;;<<;<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_59:7:260:985:520 83      chr1    468     99      35M     =       296     -207    TCCCTGTCACCCAATGGACCTGTGATATCTGGATT     ;9;7<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_589:7:112:203:90    83      chr1    470     99      35M     =       305     -200    CCTGTCACCCAATGGACCTGTGATATCTGGATTCT     ;<;:;<;;;<<<<<<<<<:<<<7<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_66:5:308:400:602 83      chr1    470     71      35M     =       285     -220    CCTGTCACCCAATGGACCTGTGATATCTGGATTCT     ;77;2<<;<7<<;<<<;<;<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_59:7:82:902:868  147     chr1    471     99      35M     =       295     -211    CTGTCACCCAATGGACCTGTGATATCTGGATTCTG     <<;;<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_53:4:153:977:200 163     chr1    472     99      35M     =       640     203     TGTCACCCAATGGACCTGTGATATCTGGATTCTGG     ;<<;<<<<7<<;;;;;<<6<<<<<86;;8<;8;6;     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_59:7:319:246:304 147     chr1    472     99      35M     =       305     -202    TGTCACCCAATGGACCTGTGATATCTGGATTCTGG     ;;<;;;<<<<8;<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<;<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS219_1:1:37:1004:1136        147     chr1    473     99      35M     =       315     -193    GTCACCCAATGGACCTGTGATATCTGGATTCTGGG     </8<<<<7<+<<<<<<<,<<<<<<<<<6<<<<1<<     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:2:59:396:359 99      chr1    474     99      35M     =       670     231     TCACCCAATGGACCTGTGATATCTGGATTCTGGGA     <<9;;<;<;;;;<;;9;;;;;<;;;;;<;;77677     MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:6:45:1769:1130       163     chr1    476     99      35M     =       635     194     ACCCAATGGACCTGTGATATCTGGATTCTGGGAAA     ;;;;;;;;;;;;9;;;;;;19;;;9;;;;176777     MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_105:7:110:355:323 147     chr1    477     99      35M     =       303     -209    CCCAATGGACCTGTGATATCTGGATTCTGGGAAAT     6069;1<<;4<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_28:1:28:708:463 99      chr1    477     99      36M     =       672     231     CCCAATGGACCTGTGATATCTGGATTCTGGGAAATT    <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<9;<:<<    MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_7:5:112:51:128  83      chr1    477     99      35M     =       287     -225    CCCAATGGACCTGTGATATCTGGATTCTGGGAAAT     ;9<;;:<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:29 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_61:1:303:184:14  83      chr1    479     99      35M     =       301     -213    CAATGGACCTGTGATATCTGGATTCTGGGAAATTC     :<<.<;;7<:<<<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:61 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_610:3:84:101:328    163     chr1    480     99      35M     =       673     228     AATGGACCTGTGATATCTGGATTCTGGGAAATTCT     <<<;<<<<<<<<;<<<<<<<<<<:<;;<44;;<;<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_71:6:228:354:203 99      chr1    480     99      34M     =       643     198     AATGGACCTGTGATATCTGGATTCTGGGAAATTC      88<<<8<<<<<<<<<8<<<<<<<<<4<<<4/9/;      MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_71:8:38:856:336  99      chr1    480     99      33M     =       656     211     AATGGACCTGTGATATCTGGATTCTGGGAAATT       <<<<<<<<<<<;;<;<;<:69<<;<5-500373       MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_11:6:75:946:1035        147     chr1    480     99      35M     =       288     -227    AATGGACCTGTGATATCTGGATTCTGGGAAATTCT     <<)4</<5<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<66<<<<     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_93:6:271:244:568  147     chr1    481     99      35M     =       294     -222    ATGGACCTGTGATATCTGGATTCTGGGAAATTCTT     ;<<<<<<;<;<<<<<<<<<<;;<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:8:129:477:427 99      chr1    481     99      35M     =       652     206     ATGGACCTGTGATATCTGGATTCTGGGAAATTCTT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<<<::<9<;<<;<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:2:262:297:601 163     chr1    482     99      35M     =       635     188     TGGACCTGTGATATCTGGATTCTGGGAAATTCTTC     <<<<;<<9<<57<<7<<<;<<;77-;;53<<;;<7     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_73:3:88:24:744   83      chr1    484     84      35M     =       325     -194    GTCCTGTGATATCTGGATTCTGGGAAATTCTTCAT     4%++88;-9<;<<<+8<<<:<;8:<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:21 NM:i:1  UQ:i:4  H0:i:1  H1:i:0
+B7_610:5:147:68:353    83      chr1    486     99      35M     =       299     -222    CCTTTGATATCTGGATTCTGGGAAATTCTTCATCC     <<;;<<<<<<<<+;<<;<<0;<<<<;<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:1  UQ:i:26 H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_78:7:316:961:576 99      chr1    488     65      35M     =       666     213     TGTGATATCTGGATTCTGGGAAATTCTTCATCCCG     <<<<<<<;<<<<;<<:<<;<;<<:;<9+34;;6%/     MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:1  UQ:i:4  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_61:8:7:171:402   99      chr1    489     99      35M     =       682     228     GTGATATCTGGATTCTGGGAAATTCTTCATCCTGG     <<<<<<<<<<<<<<<;/<<<<;<<<<<;<<1<<<4     MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_591:3:277:458:330   83      chr1    490     99      36M     =       329     -197    TGATATCTGGATTCTGGGAAATTCTTCATCCTGGAC    <<<<<8;<<<1<;7<<<;<<<<<<<<7<<7<<<<;7    MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_66:5:269:280:716 147     chr1    490     99      35M     =       323     -202    TGATATCTGGATTCTGGGAAATTCTTCATCCTGGA     6;<;;6:;<<<;64;<<<<<<<<;<<;<<;<<<<<     MF:i:18 Aq:i:58 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_71:4:72:63:435   147     chr1    490     99      35M     =       293     -232    TGATATCTGGATTCTGGGAAATTCTTCATCCTGGA     ::<;<<<<;;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_67:8:46:900:610  99      chr1    491     99      35M     =       684     228     GATATCTGGATTCTGGGAAATTCTTCATCCTGGAC     <<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<;;4;<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_64:4:189:467:475 99      chr1    493     99      35M     =       683     225     TATCTGGATTCTGGGAAATTCTTCATCCTGGACCC     <<<<<<<<<<<<;;;<<<<<<<<<:<<<<:+<<;;     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_32:7:201:959:19 99      chr1    493     99      35M     =       681     223     TATCTGGATTCTGGGAAATTCTTCATCCTGGACCC     <<<<<<<<<<<<<<;<<<:<;<<;<<;+;+<3494     MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:2:240:593:842 99      chr1    494     99      35M     =       660     201     ATCTGGATTCTGGGAAATTCTTCATCCTGGACCCT     ============<================9===:=     MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_66:3:29:381:169  163     chr1    494     99      35M     =       641     182     ATCTGGATTCTGGGAAATTCTTCATCCTGGACCCT     <<<<<<<<<<<2<288;<<;<<:4<:<<;&92929     MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_59:6:199:327:965 83      chr1    494     91      35M     =       297     -232    ATCTGGATTCTGGGAAATTCTTCATCCTGGACCCT     <5<:<<<58<:<<<<<<8<<<<<<<<<;<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:19 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:4:87:323:895 99      chr1    494     99      35M     =       671     212     ATCTGGATTCTGGGAAATTCTTCATCCTGGACCCT     ;<<;;;;<<;<959;;;<;:<<;9<;;;4377788     MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_30:5:327:991:508        147     chr1    495     99      35M     =       312     -218    TCTGGATTCTGGGAAATTCTTCATCCTGGACCCTG     0:;::<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_597:5:6:882:784     163     chr1    496     99      35M     =       686     225     CTGGATTCTGGGAAATTCTTCATCCTGGACCCTGA     <<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<:6::::<,2     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_28:6:175:705:982        99      chr1    496     89      36M     =       660     200     CTGGATTCTGGGAAATTCTTCATCCTGGACCCTGAG    <<<<;<<;<<<<<<<<<<<<<;<<+<:;39;+<40<    MF:i:18 Aq:i:19 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_65:5:30:92:753   99      chr1    497     99      35M     =       673     211     TGGATTCTGGGAAATTCTTCATCCTGGACCCTGAG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_26:7:245:323:744        163     chr1    499     99      35M     =       679     215     GATTCTGGGAAATTCTTCATCCTGGACCCTGAGAG     <;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<+<<<<<<<4<     MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:7:76:786:458  83      chr1    502     99      35M     =       341     -196    TCTGGGAAATTCTTCATCCTGGACCCTGAGAGATT     ;<;:7<.<<<<<8;<<<<<<<6<;8<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_63:7:185:213:330 83      chr1    502     99      35M     =       328     -209    TCTGGGAAATTCTTCATCCTGGACCCTGAGAGATT     ;4<<<;<<<<<<<<;<<;;;<<<<9<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_11:7:42:1091:1726       147     chr1    502     99      35M     =       334     -203    TCTGGGAAATTCTTCATCCTGGACCCTGAGAGATT     4443838<4<8<87<<3</8<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:1:12:158:458    99      chr1    503     84      36M     =       675     208     CTGGGAAATTCTTCATCCTGGACCCTGAGAGATTCT    <77<<<7<<<<<<<<<<<<5<4;<<;5<;;+2<+;;    MF:i:18 Aq:i:15 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_65:6:277:590:364 163     chr1    503     99      35M     =       681     213     CTGGGAAATTCTTCATCCTGGACCCTGAGAGATTC     <<<<<8<<<<<<<<;<<<<<;;<7<<;;7858;;8     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS219_FC30151:1:18:1418:237   147     chr1    503     99      35M     =       304     -234    CTGGGAAATTCTTCATCCTGGACCCTGAGAGATTC     <<:<<<<<<<<:<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<:     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_61:4:262:456:74  147     chr1    504     99      35M     =       357     -182    TGGGAAATTCTTCATCCTGGACCCTGAGAGATTCT     862;<<<:;<;<<<;;;<<<<;;<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_71:3:186:989:869 99      chr1    505     99      34M     =       655     185     GGGAAATTCTTCATCCTGGACCCTGAGAGATTCT      <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7;:<<<<<<<<<$<      MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_64:3:80:885:513  83      chr1    507     99      35M     =       344     -198    GAAATTCTTCATCCTGGACCCTGAGAGATTCTGCA     <7<<<;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_103:7:311:100:539 83      chr1    508     99      35M     =       353     -190    AAATTCTTCATCCTGGACCCTGAGAGATTCTGCAG     ;<;<<;;<;<<;<<<<<;9<<<;<<<<<<<<9<<;     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_81:6:199:511:426 163     chr1    509     99      35M     =       669     195     AATTCTTCATCCTGGACCCTGAGAGATTCTGCAGC     <<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<:<<<<<<<<<;:<;     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_3:6:26:227:1053 99      chr1    510     99      35M     =       663     188     ATTCTTCATCCTGGACCCTGAGAGATTCTGCAGCC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_7:2:172:622:707 99      chr1    511     99      35M     =       685     209     TTCTTCATCCTGGACCCTGAGAGATTCTGCAGCCC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<:<5:<<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_589:8:157:935:374   147     chr1    512     99      35M     =       353     -194    TCTTCATCCTGGACCCTGAGAGATTCTGCAGCCCA     94988994.<:<+42::<<<<<:<:<4<<<<;<1<     MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_591:4:103:111:720   147     chr1    512     99      36M     =       353     -195    TCTTCATCCTGGACCCTGAGAGATTCTGCAGCCCAG    ;4<<<;)<<-<9<;<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_71:4:328:669:662 147     chr1    512     99      35M     =       337     -210    TCTTCATCCTGTACCCTGAGAGATTCTGCAGCCCA     4<<;<<8<.<88.<<;4<<<<<<<4<.<<<<7<<<     MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1  UQ:i:23 H0:i:0  H1:i:1
+EAS51_64:5:202:39:380  147     chr1    513     99      35M     =       334     -214    CTTCATCCTGGACCCTGAGAGATTCTGCAGCCCAG     /92/;2<+2<<<<64<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<     MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_66:8:66:655:769  147     chr1    515     99      35M     =       348     -202    TCATCCTGGACCCTGAGAGATTCTGCAGCCCAGCT     8<<;:69<;:;9<2<*9<;6<<<<<17<;<3+<;<     MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_67:4:7:526:343   99      chr1    515     99      35M     =       698     218     TCATCCTGGACCCTGAGAGATTCTGCAGCCCAGCT     <<<<<<<<<<<<<<<:<<<5<<<<<<5;<<<+8<;     MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS220_1:8:33:672:473  147     chr1    515     99      35M     =       330     -220    TCATCCTGGACCCTGAGAGATTCTGCAGCCCAGCT     5<70<<55<4<24.5<<<<<<<<<6<<<<<<2<<<     MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:6:72:308:839 83      chr1    517     99      40M     =       354     -203    ATCGTGGACCCTGAGAGATTCTGCAGCCCAGATCCAGATT        :8:.:<;<<5<<<<<<<<<<<<<<<<;:<<<<<<<<<<<<        MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:2  UQ:i:40 H0:i:0  H1:i:1
+EAS56_61:1:210:880:606 83      chr1    518     99      35M     =       341     -212    TCCTGGACCCTGAGAGATTCTGCAGCCCAGCTCCA     .<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_71:7:80:760:490  99      chr1    520     99      34M     =       686     201     CTGGACCCTGAGAGATTCTGCAGCCCAGCTCCAG      <<<<<<<<<<8<;<7<<<<<<;<;;<2<;<<<1,      MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_11:3:34:970:1374        147     chr1    520     99      35M     =       363     -192    CTGGACCCTGAGAGATTCTGCAGCCCAGATCCAGA     <6<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+B7_593:1:200:559:765   147     chr1    521     99      36M     =       337     -220    TGGACCCTGAGAGATTCTGCAGCCCAGATCCAGATT    8<;;4<3;<;<<<<<<5<<;;<<98;;<<<<;<<<<    MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+EAS56_53:8:28:701:724  83      chr1    521     99      35M     =       347     -209    TGGACCCTGAGAGATTCTGCAGCCCAGCTCCAGAT     .;..3;8.8<8;<<;9<9<<<7;<<<<<<<<7<<7     MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_64:4:318:345:156 163     chr1    522     99      35M     =       695     208     GGACCCTGAGAGATTCTGCAGCCCAGATCCAGATT     <<<<<<<<:<<<<<<<<5<:5<<<3:'<72')*;9     MF:i:18 Aq:i:39 NM:i:1  UQ:i:6  H0:i:0  H1:i:1
+B7_595:1:81:1000:375   83      chr1    524     90      35M     =       329     -230    ACCCTGAGAGATTCTGCAGCCCAGCTCCAGATTGC     ;8<;+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:19 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:4:13:1155:631        163     chr1    524     99      40M     =       668     184     ACCCTGAGAGATTCTGCAGCCCAGCTCCAGATTGCTTGTG        <<<<<<;<<;<<<<<<;<<<<<9<;<;94<<%<<<7:777        MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS192_3:3:257:611:440 147     chr1    524     99      35M     =       341     -218    ACCCTGAGAGATTCTGCAGCCCAGATCCAGATTGC     2<;;8<;;<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+EAS114_26:6:129:694:359        83      chr1    525     88      35M     =       350     -210    CCCTGAGAGATTCTGCAGCCCAGATCCAGATTGCT     7777<7<7;77+<3<<;<<;<<<<;<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+EAS139_11:6:11:285:1567        163     chr1    525     99      35M     =       685     195     CCCTGAGAGATTCTGCAGCCCAGATCCAGATTGCT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+EAS1_95:1:196:533:921  147     chr1    526     99      35M     =       361     -200    CCTGAGAGATTCTGCAGCCCAGATCCAGATTGCTT     7<<<<7<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+EAS139_11:2:6:251:1557 163     chr1    526     99      35M     =       700     209     CCTGAGAGATTCTGCAGCCCAGCTCCAGATTGCTT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:78 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_3:6:20:492:850  99      chr1    526     78      35M     =       694     203     CCTGAGAGATTCTGCAGCCCAGCTCCAGATTGCTT     <7<<<<<<<<<<<.<54<7&<<<7<74<2<<<2<<     MF:i:18 Aq:i:10 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_73:5:231:339:551 83      chr1    527     99      35M     =       350     -212    CTGAGAGATTCTGCAGCCCAGATCCAGATTGCTTG     <;<<;<<<<<<<<<<;:<<<<<<<<<<<<<;<<<<     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+EAS139_19:4:68:1122:79 99      chr1    528     99      40M     =       687     199     TGAGAGATTCTGCAGCCCAGCTCCAGATTGCTTGTGGTCT        <<<<<<<<<<<<<;<<<<;<<<<<<;<<<4;<<4;99::;        MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_1:4:87:1375:1303        83      chr1    529     99      35M     =       340     -224    GAGAGATTCTGCAGCCCAGATCCAGATTGCTTGTG     :<;<(<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+EAS220_1:8:46:485:482  147     chr1    530     94      35M     =       371     -194    AGAGATTCTGCAGCCCAGATCCAGATTGCTTGTGG     <<<<<::<<<<<<<<6<<<<<<<<<6<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+EAS218_4:7:90:1873:89  147     chr1    531     99      35M     =       344     -222    GAGATTCTGCAGCCCAGATCCAGATTGCTTGTGGT     <<<<;49<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+EAS114_26:5:238:31:968 99      chr1    534     99      35M     =       717     218     ATTCTGCAGCCCAGCTCCAGATTGCTTGTGGTCTG     9======8====*=====,=1=======<=7:::,     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_28:3:78:773:660 163     chr1    534     99      36M     =       711     213     ATTCTGCAGCCCAGCTCCAGATTGCTTGTGGTCTGA    <<<<<<<<;<<<<<<<<<8<8<<;<<<;<<;7<<4:    MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_591:5:90:828:633    83      chr1    537     99      36M     =       381     -192    CTGCAGCCCAGATCCAGATTGCTTGTGGTCTGACAG    <<<;<;<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+EAS114_30:2:272:750:698        83      chr1    538     80      35M     =       365     -208    TGCAGCCCAGATCCAGATTGCTTGTGGTCTGACAG     0<;8;64;<<<;<;.<+;:<4;4<;<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:37 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+EAS139_19:3:88:1656:896        147     chr1    538     99      40M     =       387     -191    TGCAGCCCAGATCCAGATTGCTTGTGGTCTGACAGGCTGC        6/8::*9/*3*'<88<:9*<<<8<<<;<<<<<<<<;<<<<        MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1  UQ:i:9  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_61:6:126:541:194 163     chr1    540     97      35M     =       730     225     CAGCCCAGATCCAGATTGCTTGTGGTCTGACAGGC     <<<<<<<<8<<<<<8<<<<<<<<<8<<<428+<80     MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1  UQ:i:23 H0:i:0  H1:i:1
+EAS114_28:4:9:55:730   163     chr1    540     99      36M     =       722     218     CAGCCCAGCTCCAGATTGCTTGTGGTCTGACAGGCT    >>=>>+==>>==<==<=8=><:;8/;7</5724-2;    MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_95:2:278:918:892  99      chr1    541     99      35M     =       720     214     AGCCCAGCTCCAGATTGCTTGTGGTCTGACAGGCT     =============:====================8     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_7:7:243:876:758 99      chr1    541     99      35M     =       712     206     AGCCCAGATCCAGATTGCTTGTGGTCTGACAGGCT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<;78<<     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+EAS56_65:5:121:380:656 147     chr1    542     99      35M     =       362     -215    GCCCAGCTCCAGATTGCTTGTGGTCTGACAGGCTG     :;<<;<<1<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_11:6:82:164:1924        83      chr1    542     99      35M     =       378     -199    GCCCAGCACCAGATTGCTTGTGGTCTGACAGGCTG     6<<<<<<-<<<<<<<<<2<<06<9<<<<<1<<<<<     MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1  UQ:i:12 H0:i:0  H1:i:1
+EAS114_30:6:163:312:891        99      chr1    543     99      35M     =       709     201     CCCAGCTCCAGATTGCTTGTGGTCTGACAGGCTGC     <<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<:;;<;;<;0     MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_53:1:124:243:35  147     chr1    544     60      35M     =       364     -215    GCATATCCAGATTGCTGGTGGTCTGACAGGCAGCA     &+<+;<694;+&99<<2<;423<26<-<<<<,<3<     MF:i:130        Aq:i:60 NM:i:2  UQ:i:28 H0:i:0  H1:i:0
+B7_591:1:191:462:705   99      chr1    545     99      36M     =       721     212     CAGATCCAGATTGCTTGTGGTCTGACAGGCTGCAAC    <<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<;<<<<::<6    MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+B7_610:8:95:426:791    147     chr1    547     99      35M     =       359     -223    GNTCCAGATTGCTTGTGGTCTGACAGGCTGCAACT     !!!!<<<<<;;<<<<;<<;<;;<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:1  UQ:i:23 H0:i:1  H1:i:0
+EAS218_4:5:41:118:1246 147     chr1    548     99      35M     =       374     -209    CTCCAGATTGCTTGTGGTCTGACAGGCTGCAACTG     <<<<<<<<<<<<<<<+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS192_3:3:27:973:518  99      chr1    549     99      35M     =       691     177     TCCAGATTGCTTGTGGTCTGACAGGCTGCAACTGT     <<<<<<<<<<<<<<;<<<<7<<<<<<<<88;0:8;     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_1:8:4:679:110   99      chr1    549     99      35M     =       705     191     TCCAGATTGCTTGTGGTCTGACAGGCTGCAACTGT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<::<;;:7     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_105:1:297:283:948 163     chr1    550     99      35M     =       727     212     CCAGATTGCTTGTGGTCTGACAGGCTGCAACTGTG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<9;)+1;19-     MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS218_1:8:61:1797:113 147     chr1    551     99      35M     =       380     -206    CAGATAGCTTGTGGTCTGACAGGCTGCAACTGTGA     <<0<<&<<<<;<<4;;3<;<:<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_7:6:205:873:464 99      chr1    552     99      35M     =       743     226     AGATTGCTTGTGGTCTGACAGGCTGCAACTGTGAG     <<<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<:<<,:<:<<<<::     MF:i:18 Aq:i:63 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS219_1:3:33:1168:1762        99      chr1    552     99      35M     =       728     211     AGATTGCTTGTGGTCTGACAGGCTGCAACTGTGAG     <<<<<<<<<<<<<<<<;<<;<;<<<<<<<<:;2::     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_32:6:78:909:394 83      chr1    554     81      35M     =       373     -216    ATTGCTTGGTGTCTGACAGGCTGCAACTGTGAGCC     6167&+&&/&//734/3<<<9*<;;3<3<;9<<3<     MF:i:18 Aq:i:21 NM:i:2  UQ:i:19 H0:i:0  H1:i:0
+EAS1_103:2:226:302:758 163     chr1    556     99      35M     =       751     230     TGCTTGTGGTCTGACAGGCTGCAACTTTGAGCGNT     <<<<<<<;;;,<;<92;66<;))42<&2&(/1!!!     MF:i:18 Aq:i:33 NM:i:2  UQ:i:9  H0:i:0  H1:i:1
+EAS114_28:5:206:671:49 163     chr1    557     99      36M     =       719     198     GCTTGTGGTCTGACAGGCTGCAACTGTGAGCCATCA    <<<<<<;<<<<8<<<;;<<<3<<8<8<35+,55;,3    MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_597:2:165:431:857   147     chr1    559     99      35M     =       406     -188    TTGGGGTCTGACAGGCTGCAACTGTGAGCCATCAC     ''7'/;'1%0447<<<*<6<<<*<*<<<<6<<<<<     MF:i:18 Aq:i:53 NM:i:1  UQ:i:6  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_39:5:50:972:1286        83      chr1    559     99      35M     =       377     -217    TTGTGGTCTGACAGGCTGCAACTGTGAGCCATCAC     :;;7;7;;0<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_65:7:288:552:440 163     chr1    560     87      35M     =       747     222     TGTGGTCTGACAGGCTGCAACTGTGAGCCTTCCAT     <<<<71<77<<<:<<<&<4<<77<16<88&36+%%     MF:i:18 Aq:i:26 NM:i:4  UQ:i:26 H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_1:8:78:1478:1446        147     chr1    560     99      35M     =       389     -206    TGTGGTCTGACAGGCTGCAACTGTGAGCCATCACA     <8,8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_65:8:275:851:240 99      chr1    561     99      35M     =       743     217     GTGGTCTGACAGGCTGCAACTGTGAGCCATCACAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<4<7<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:31 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_95:6:185:312:167  83      chr1    562     99      35M     =       401     -196    TGGTCTGACAGGCTGCAACTGTGAGCCATCACAAT     <<8:<8<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_63:1:119:446:185 83      chr1    562     99      35M     =       372     -225    TGGTCTGACAGGCTGCAACTGTGAGCCATCACAAT     +70730;<0<77;;<<<<<9<<<<<<9<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_65:3:168:741:680 83      chr1    562     99      35M     =       394     -203    TGGTCTGACAGGCTGCAACTGTGAGCCATCACAAT     <<5<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:79 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_1:8:67:1797:1931        99      chr1    562     99      35M     =       750     223     TGGTCTGACAGGCTGCAACTGTGAGCCATCACAAT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:1:228:182:717 99      chr1    563     99      35M     =       729     201     GGTCTGACAGGCTGCAACTGTGAGCCATCCCCATG     <=9============5==5=<,59<=1=<&;&;;7     MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:2  UQ:i:10 H0:i:1  H1:i:0
+EAS112_34:7:118:523:591        83      chr1    563     99      35M     =       393     -205    GGTCTGACAGGCTGCAACTGTGAGCCATCACAATG     4:--&0:67<<8:<<<<<<<<<<<:4<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_3:4:29:1061:574 83      chr1    563     99      35M     =       363     -235    GGTCTGACAGGCTGCAACTGTGAGCCATCACAATG     <87<5<<9<<<66<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_591:3:168:69:605    83      chr1    565     67      36M     =       373     -228    TCTGACAGGCGGCAACTGTGAGCCATCACAATGAAC    '<'<144<0<&<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:26 NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:0  H1:i:1
+EAS221_3:4:90:247:212  99      chr1    567     99      35M     =       733     201     TGACAGGCTGCAACTGTGAGCCATCACAATGAACA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<6<8<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_61:3:140:522:212 83      chr1    568     99      35M     =       399     -204    GACAGGCTGCAACTGTGAGCCATCACAATGAACAA     :;8;:::<<:<<<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS112_34:8:179:13:782 83      chr1    568     99      35M     =       412     -191    GACAGTCTACAACTGTGAGCCATCACAATGAACAA     &37.3&;3'*<3<;9<9<<5<<<<<<<<<9<<<<<     MF:i:18 Aq:i:39 NM:i:2  UQ:i:11 H0:i:0  H1:i:1
+EAS114_45:3:75:217:337 83      chr1    568     99      35M     =       386     -217    GACAGGCTGCAACTGTGAGCCATCACAATGAACAA     4779797;;;<;:4;;<<<77<;;;7<<;<;<;<<     MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_53:4:168:528:288 163     chr1    570     99      35M     =       740     205     CAGGCTGCAACTGTGAGCCATCACAATGAACAACA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<;<<;     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_95:2:162:503:769  147     chr1    571     99      35M     =       392     -214    AGGCTGCAACTGTGAGCCATCACAATGAACAACAG     ;:;1;=8=;:+=====;&==7==============     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_32:2:163:618:570        163     chr1    571     99      35M     =       751     215     AGGCTGCAACTGTGAGCCATCACAATGAACAACAG     <<<<<<<8<<<<<<<<<<<<<+<.7<<..<;&;8;     MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_595:2:251:121:479   163     chr1    572     99      35M     =       750     213     GGCTGCAACTGTGAGCCATCACAATGAACAACAGG     <<<<<<<<<<<;:<<<<;:;:<:<;:188;7:<+(     MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:3:44:1578:1674       147     chr1    573     99      35M     =       418     -190    GCTGCAACTGTGAGCCATCACAATGAACAACAGGA     62631;;4;;;8;;48;;7;8;;;;;;;;;8;;;;     MF:i:18 Aq:i:64 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_62:3:263:74:407  163     chr1    574     99      35M     =       754     215     CTGCAACTGTGAGCCATCACAATGAACAACAGGAA     <<<<2<<<<<<:<<<9<<4<<<<:<<<<9<999.7     MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_71:3:254:32:275  147     chr1    575     99      35M     =       382     -228    TGCAACTGTGAGCCATCACAATGAACAACAGGAAG     (6+<;+6:9<<:7:<95<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:2:82:879:246  83      chr1    576     99      35M     =       391     -220    ACAACTGTGAGCCATCACAATGAACAACAGGAAGA     %+=661;&===:&==1<5======1==========     MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1  UQ:i:4  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_71:4:165:397:25  163     chr1    576     99      35M     =       759     217     GCAACTGTGAGCCATCACAATGAACAACAGGAAGA     <<7<<<<<<)97<6<:3:60:3+37-37+<:33:3     MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_610:6:148:776:486   163     chr1    578     99      35M     =       755     212     AACTGTGAGCCATCACAATGAACAACAGGAAGAAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_3:2:59:1576:946 99      chr1    578     99      35M     =       761     218     AACTGTGAGCCATCACAATGAACAACAGGAAGAAA     <:<<<<<<<<<<<<:<:<<<<<<<8<<::1<<<<<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_103:4:61:433:385  83      chr1    579     99      35M     =       381     -233    ACTGTGAGCCATCACAATGAACAACAGGAAGAAAA     <*97<<<<&9<<;<&<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_73:3:37:761:635  147     chr1    581     99      35M     =       418     -198    TGTGAGCCATCACAATGAACAACAGGAAGAAAAGG     +37:<088<+<<;<<;<<<<<;<<;<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:2:178:192:499 163     chr1    582     99      35M     =       768     221     GTGAGCCATCACAATGAACAACAGGAAGAAAAGGT     <<<<<<<;<1<<<<<<;<<;6<<3666;;;;;/6/     MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS192_3:7:93:945:176  99      chr1    582     99      35M     =       745     198     GTGAGCCATCACAATGAACAACAGGAAGAAAAGGT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<;;<;:7;<3     MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:3:216:988:883 83      chr1    584     99      35M     =       392     -227    AAGCCAACACAATGAACAACAGGAAGAAAAGGTCT     (=/1+=&:=&======<==<===============     MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:2  UQ:i:12 H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_39:1:12:884:219 99      chr1    584     99      35M     =       756     207     GAGCCATCACAATGAACAACAGGAAGAAAAGGTCT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<5:<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:6:61:628:681    163     chr1    586     99      36M     =       746     196     GCCATCACAATGAACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTC    <<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<:<<;;;;;;    MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_63:6:91:360:585  147     chr1    586     99      35M     =       430     -191    GACATCACAATGAACAACAGGAAGAAAAGGTCTTT     5&&<<3:;<<<<<<)<<3<<<<<<<;;<<<<;<<<     MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_11:6:89:1151:1878       99      chr1    587     99      35M     =       757     205     CCATCACAATGAACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTC     <;;<<<<<;;;<<<<4;;::;<;8;;<;;8:<8<4     MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:1:40:1596:1433       99      chr1    587     99      40M     =       756     209     CCATCACAATGAACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAG        <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<1<<<<<::;::        MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS219_1:3:4:1620:413  99      chr1    588     99      35M     =       768     215     CATCACAATGAACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCA     <<<<<<<<<<6<<<6<<<;<6<9-1<;<&66<<<2     MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_1:8:65:1928:1125        99      chr1    588     99      35M     =       784     231     CATCACAATGAACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCA     <<;<<<7<<7<;<7<<<<<<<7<<<<;<.-;<+88     MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_63:5:123:998:248 163     chr1    589     99      35M     =       776     222     ATCACAATGAACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;9<<<68<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_591:2:240:603:890   163     chr1    590     99      36M     =       740     186     TCACAATGAACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAA    <<<<<<<<<<<<<<<<<<;<:<<:<<;<<<<<8865    MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_61:3:20:762:748  163     chr1    591     99      35M     =       777     221     CACAATGAACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAA     ===================================     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_65:4:246:313:499 99      chr1    592     99      35M     =       757     200     ACAATGAACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAG     <<<<<<<<<<<<<;<;<<<<<<<<;<<<<<;;<<<     MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_103:6:7:858:437   99      chr1    593     99      35M     =       773     215     CAATGAACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<3<<<<<<<<<33     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_61:3:150:933:810 163     chr1    593     99      35M     =       755     197     CAATGAACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGG     ===================================     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_71:2:204:264:413 147     chr1    593     96      35M     =       415     -213    CAATGAACAACAGAAAGAAAAGTTCTTTCAAAAGG     1==(4=::;/7::&===;====/=;===;;=====     MF:i:18 Aq:i:27 NM:i:2  UQ:i:19 H0:i:0  H1:i:0
+EAS139_11:3:65:556:1505        163     chr1    593     99      35M     =       790     232     CAATGAACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<6<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_30:6:62:386:959 99      chr1    594     99      35M     =       752     193     AATGAACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGT     <<8<<<<;<<<<-<<87;</<;<+<;5<+;;<3;+     MF:i:18 Aq:i:57 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_591:2:134:868:252   147     chr1    595     99      36M     =       404     -227    ATGAACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGA    <;<<<8<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_595:1:252:19:955    99      chr1    596     84      35M     =       771     210     TGAACAAAAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGA     <<<<<<<<<<4<<<<9<<+9)9<<4:9+<<0<909     MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+EAS54_67:4:145:607:216 83      chr1    596     99      35M     =       437     -194    TGAAAAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGA     /;<<&<<8<<<<<<<<<<<<<;872<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_65:8:140:924:923 163     chr1    597     99      35M     =       767     205     GAACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGAT     <<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<5;<;     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_610:3:120:63:653    147     chr1    598     99      35M     =       420     -213    AACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGATG     <<;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_81:6:204:779:181 163     chr1    598     99      35M     =       779     216     AACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGATG     <<<<<<5<<:<<<<<8<<,<<<<<<<<<<91<91<     MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_81:7:325:150:465 147     chr1    598     99      35M     =       412     -221    AACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGATG     <<:<<<<<<<<;<:<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_105:7:57:722:347  83      chr1    599     99      35M     =       439     -195    ACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGATGT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_59:2:177:266:842 163     chr1    599     99      35M     =       784     220     ACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGATGT     =====)===========8=====7882855355'5     MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_30:4:183:852:253        163     chr1    599     99      35M     =       773     209     ACAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGATGT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<;;<8     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_30:2:30:887:404 163     chr1    600     99      35M     =       789     224     CAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGATGTG     <<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<:(<<<7;7     MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_7:3:101:572:491 147     chr1    600     99      35M     =       425     -210    CAACAGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGATGTG     8<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_589:2:73:730:487    99      chr1    604     99      35M     =       770     201     AGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGATGTGTGTT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<:<<<;<;<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_71:6:172:896:83  99      chr1    604     99      34M     =       786     217     AGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGATGTGTGT      <<<<<<<<<<<<<<<<<:;;+;<<<<<<<<9;;;      MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_53:4:154:762:630 163     chr1    604     99      35M     =       792     223     AGGAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGATGTGTGTT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_99:8:99:756:130   163     chr1    606     99      35M     =       798     227     GAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGATGTGTGTTCT     ;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<6<<;<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_11:6:11:360:1577        99      chr1    606     99      35M     =       781     210     GAAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGATGTGTGTTCT     <<<<<<<<<<<<<<<<<4<;;<<;;<;<<<8<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:3:27:1881:486        83      chr1    607     99      35M     =       427     -215    AAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGATGTGTGTTCTC     99797;;9:<:;;;<;;;;<<<;;;;<;<;;<<<<     MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS219_1:1:5:497:687   99      chr1    607     99      35M     =       789     217     AAGAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGATGTGTGTTCTC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:4:142:63:937    163     chr1    609     99      36M     =       777     204     GAAAAGGTCTTTCAAAAGGTGATGTGTGTTCTCATC    <<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<;<<:<<:<:    MF:i:18 Aq:i:78 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:1:36:485:632    163     chr1    610     99      36M     =       784     210     AAAAGGTCTTTCAAAAGGTGATGTGTGTTCTCATCA    <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<5<<<;<18;    MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_97:8:36:927:478   99      chr1    610     99      35M     =       798     223     AAAAGGTCTTTCAAAAGGTGATGTGTGTTCTCATC     <<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<:<:<<<<8<9;<8     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_71:4:169:862:829 163     chr1    611     99      35M     =       772     195     AAAGGTCTTTCAAAAGGTGATGTGTGTTCTCATCA     <<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<;<;<<<<:<;;<78     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS219_FC30151:5:63:424:1643   163     chr1    614     99      35M     =       798     219     GGTCTTTCAAAAGGTGATGTGTGTTCTCATCAACC     ;;<<<<<<;<<<<<<<<<<5;9;<<<<<<<<<<;<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_32:4:20:41:138  99      chr1    615     99      35M     =       774     194     GTCTTTCAAAAGGTGATGTGTGTTCTCATCAACCT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<;<<<<<(<<     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:2:49:163:904 83      chr1    616     99      35M     =       450     -201    TCTTTCAAAAGGTGATGTGTGTTCTCATCAACCTC     79779<<<<<;;;;9;;<<7<;*9<<<7<<;<<;<     MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_99:3:135:543:760  99      chr1    619     99      35M     =       787     203     TTCAAAAGGTGATGTGTGTTCTCATCAACCTCATA     <<<<;;<;<<<<<<<9<<<<<<<<<<<;<<<<5<:     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_65:5:131:742:561 163     chr1    620     99      35M     =       790     205     TCAAAAGGTGATGTGTGTTCTCATCAACCTCATAC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:78 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_589:6:120:14:944    83      chr1    621     99      35M     =       428     -228    CAAAAGGTGATGTGTGTTCTCATCAACCTCATACA     :;<<;<;<;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_11:8:82:566:1096        147     chr1    621     99      35M     =       446     -210    CAAAAGGTGATGTGTGTTCTCATCAACCTCATACA     <<<<<<<<<<:<<<<<<<:<<<<<<:<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_93:8:14:601:624   83      chr1    622     99      35M     =       446     -211    AAAAGGTGATGTGTGTTCTCATCAACCTCATACAC     1;;;;==5===.(=9=5=========8====;===     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:3:5:538:401  99      chr1    624     99      40M     =       788     204     AAGGTGATGTGTGTTCTCATCAACCTCATACACACACATG        <<<<;<<<<<<<<<<<<<<<;<::7<<;<53:<98;;;;;        MF:i:18 Aq:i:39 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS218_1:8:16:1081:1894        83      chr1    624     99      35M     =       431     -228    AAGGTGATGTGTGTTCTCATCAACCTCATACACAC     ;5;;&<;<<<<<<<<;<;<<;<<<;<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:3:3:1377:1663        147     chr1    626     99      35M     =       446     -215    GGTGATGTGTGTTCTCATCAACCTCATACACACAC     6-88663;8;81;;66;8;;89939;;;67;2;;;     MF:i:18 Aq:i:61 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_26:4:253:285:104        83      chr1    627     99      35M     =       451     -211    GTGATGTGTGTTCTCATCAACCTCATACACACACA     2<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS218_1:6:66:1282:1215        99      chr1    627     99      35M     =       794     202     GTGATGTGTGTTCTCATCAACCTCATACACACACA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;;;     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:3:2:1200:1076        163     chr1    629     99      35M     =       786     192     GATGTGTGTTCTCATCAACCTCATACACACACATG     ;;;;;;;;;;/;;;;;;;;6;;9;489;;;88888     MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_610:2:194:688:289   99      chr1    631     99      35M     =       795     199     TGTGTGTTCTCATCAACCTCATACACACACATGGT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<:;     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_67:8:19:855:491  99      chr1    631     99      35M     =       783     187     TGTGTGTTCTCATCAACCTCATACACACACATGGT     <<<<<<<<<<<;<<.:<<<<;;;<4<:<:<7<;;;     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_71:6:215:133:909 99      chr1    631     99      34M     =       789     193     TGTGTGTTCTCATCAACCTCATACACACACATGG      <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<996(      MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_610:7:35:378:681    99      chr1    632     99      35M     =       812     215     GTGTGTTCTCATCAACCTCATACACACACATGGTT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<:<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:5:40:758:116 163     chr1    632     99      40M     =       814     222     GTGTGTTCTCATCAACCTCATACACACACATGGTTTAGGG        <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<:7262        MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_103:1:2:831:692   147     chr1    634     99      35M     =       462     -207    GTGTTCTCATCAACCTCATACACACACATGGTTTA     2749'979<9<<<6;<<<0<;<<<<<3<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_105:6:162:594:858 99      chr1    634     99      35M     =       818     219     GTGTTCTCATCAACCTCATACACACACATGGTTTA     <<<<<<<<<<<<<<<<<9<;<<<<<<<<<<3<<<;     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:4:233:478:792 99      chr1    634     99      35M     =       791     192     GTGTTCTCATCAACCTCATACACACACATGGTTTA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<+<<<<<<<9<<<+;;;     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:2:262:297:601 83      chr1    635     99      35M     =       482     -188    TGTTCTCATCAACCTCATACACACACATGGTTTAG     ;;<26;;;<;<7;<<<<<99<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:6:45:1769:1130       83      chr1    635     99      35M     =       476     -194    TGTTCTCATCAACCTCATACACACACATGGTTTAG     88989;<;97;9<<;<;;;;9<98<<<<<<<;<<<     MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_53:4:153:977:200 83      chr1    640     99      35M     =       472     -203    TCATCAACCTCATACACACACATGGTTTAGGGGTA     1:<83<<9;;9<<9;;<<;<<;;;;<;;<<<<<<;     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_591:1:60:837:923    83      chr1    641     61      36M     =       457     -220    CATCAACCGCATACACTCACATGGTTTAGGGGTATA    0<4<<<02.<99+<+&!<<<<+<<<<<<<<<<<<3<    MF:i:18 Aq:i:24 NM:i:2  UQ:i:13 H0:i:0  H1:i:0
+EAS51_66:3:29:381:169  83      chr1    641     99      35M     =       494     -182    CATCAACCTCATACACACACATGGTTTAGGGGTAT     2<82<;66<:<;<:<;<;<8<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_62:7:96:836:737  99      chr1    642     99      35M     =       841     234     ATCAACCTCATACACACACATGGTTTAGGGGTATA     <<<<<<71<<<<<<<<<<899<:5<<<96858<<.     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_71:6:228:354:203 147     chr1    643     99      35M     =       480     -198    TCAACCTCATACACACACATGGTTTAGGGGTATAA     %1<851<5<<<982<<<<<<<<::<<<<7<<<<3<     MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_103:1:151:159:43  147     chr1    645     99      35M     =       452     -228    AACCTCATACACACACATGGTTTAGGGGTATAATA     ;;4;6<<;<<<<7<77<6;<6<<<<<;;<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_105:3:182:404:693 163     chr1    646     99      35M     =       812     201     ACCTCATACACACACATGGTTTAGGGGTATAATAC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:::<6<;<94;77     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS112_34:8:4:841:339  163     chr1    646     99      35M     =       793     182     ACCTCATACACACACATGGTTTAGGGGTATAATAC     <<<<<<<<<<<<<<<<<;<7<<&;;<5<+<;7<<;     MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_62:4:156:857:494 163     chr1    648     99      35M     =       838     225     CTCATACACACACATGGTTTAGGGGTATAATACCT     <<<<<<<<<<<<<<<<<6<<<<<<<<<<<<<<:<<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:6:165:464:123 99      chr1    650     99      35M     =       814     199     CATACACACACATGGTTTAGGGGTATAATACCTCT     ===============7==============8====     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_61:1:115:868:887 83      chr1    650     99      35M     =       452     -233    CATACACACACATGGTTTAGGGGTATAATACCTCT     ==;==8=;=;=========================     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_591:5:134:751:831   147     chr1    651     99      36M     =       465     -222    ATACACACACATGGTTTAGGGGTATAATACCTCTAC    ;:<4<8<<<;<;<<5<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_62:5:192:716:235 163     chr1    651     99      35M     =       798     182     ATACACACACATGGTTTAGGGGTATAATACCTCTA     ======================9==:<==:;;69;     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_63:3:40:594:752  99      chr1    651     99      35M     =       831     215     ATACACACACATGGTTTAGGGGTATAATACCTCTA     <<<<<<<<<<;<<<;<<<::;<:;<;:<;;;<;<:     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_95:4:184:17:636   121     chr1    652     76      35M     =       652     0       TACACACACATGGTTTAGGGGTATAATACCTCTAC     8<89<<:<<<;;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:64 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_95:4:184:17:636   181     chr1    652     0       *       =       652     0       TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCACAGGT     !!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!77777777     MF:i:192
+EAS1_108:8:129:477:427 147     chr1    652     99      35M     =       481     -206    TACACACACATGGTTTAGGGGTATAATACCTCTAC     <<<9;<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_81:8:130:912:658 163     chr1    652     99      35M     =       841     224     TACACACACATGGTTTAGGGGTATAATACCTCTAC     <<<<<;<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<7<;;<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:5:85:401:1190        83      chr1    652     99      35M     =       458     -229    TACACACACATGGTTTAGGGGTATAATACCTCTAC     64778:;69739:;+9::7;;;<;6<;7;;;;;7<     MF:i:18 Aq:i:55 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:3:4:1502:1911        163     chr1    652     99      40M     =       802     190     TACACACACATGGTTTAGGGGTATAATACCTCTACATGGC        <<<:4<<<<<<;<<<<;9;5<95<;<<;9+;1612:1:::        MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_95:2:198:691:595  163     chr1    655     99      35M     =       847     227     ACACACATGGTTTAGGGGTATAATACCTCTACATG     ==============&===============;7;=1     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_71:3:186:989:869 147     chr1    655     99      35M     =       505     -185    ACACACATGGTTTAGGGGTATAATACCTCTACATG     ;<<;:<<<7:<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_71:8:38:856:336  147     chr1    656     99      35M     =       480     -211    CACACATGGTTTAGGGGTATAATACCTCTACATGG     2;4;4<:;6:5:<<;:;<<;<<;<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:2:49:271:588  163     chr1    658     99      35M     =       830     207     CACATGGTTTAGGGGTATAATACCTCTACATGGCT     <<<<<<<<<<<<<<5:<<<<<<:<<<<<<<:7%9<     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:2:240:593:842 147     chr1    660     99      35M     =       494     -201    CATGGTTTAGGGGTATAATACCTCTACATGGCTGA     *<<<;<<6<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_28:6:175:705:982        147     chr1    660     89      36M     =       496     -200    CATGGTTTAGGGGTATAATACCTCTACATGGCTGAT    ')'''''')'''''*')*)'*)')))+,'*)+'*,!    MF:i:18 Aq:i:19 NM:i:1  UQ:i:0  H0:i:0  H1:i:1
+EAS221_3:6:26:227:1053 147     chr1    663     99      35M     =       510     -188    GGTTTAGGGGTATAATACCTCTACATGGCTGATTA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_78:7:316:961:576 147     chr1    666     65      35M     =       488     -213    TTACGGGTGTAATCTCTCTACATGGCTAATTATGA     (++%%+++),+,+*++,+,,-,**+,-&-,+-+--     MF:i:130        Aq:i:65 NM:i:5  UQ:i:36 H0:i:0  H1:i:0
+EAS56_63:5:96:788:614  163     chr1    667     99      35M     =       862     230     TAGGGGTATAATACCTCTACATGGCTGATTATGAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;6;<<;;<;;7;9     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:4:13:1155:631        83      chr1    668     99      40M     =       524     -184    AGGGGTATAATACCTCTACATGGCTGATTATGAAAACAAT        ;:398<<;<<<<<;<3<;;<<<<;;<<<<<<<<<<;<<;<        MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_81:6:199:511:426 83      chr1    669     99      35M     =       509     -195    GGGGTATAATACCTCTACATGGCTGATTATGAAAA     <:7:<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_67:5:124:241:608 99      chr1    670     99      35M     =       856     221     GGGTATAATACCTCTACATGGCTGATTATGAAAAC     <<<<<<<<<;<<<<<<<<<;;<<<;<<<<;;8;;:     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:2:59:396:359 147     chr1    670     99      35M     =       474     -231    GGGTATAATACCTCTACATGGCTGATTATGAAAAC     28288;;;;;;;;;::;;;;:;;;;;;;;;;;;;;     MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:4:87:323:895 147     chr1    671     99      35M     =       494     -212    GGTATAATACCTCTACATGGCTGATTATGAAAACA     55777;;;939;9;;9;;;;9;;;;;;;;;;;;;;     MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_28:1:28:708:463 147     chr1    672     99      36M     =       477     -231    GTATAATACCTCTACATGGCTGATTATGAAAACAAT    ;;<;<<====3=====5===================    MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_610:3:84:101:328    83      chr1    673     99      35M     =       480     -228    TATAATACCTCTACATGGCTGATTATGAAAACAAT     <<<<<<<<:<<<<<<<<<6<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_65:5:30:92:753   147     chr1    673     99      35M     =       497     -211    TATAATACCTCTACATGGCTGATTATGAAAACAAT     <<<<<<;<<<<<<:<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS112_32:8:88:90:59   73      chr1    674     37      35M     =       674     0       ATAATACCTCTACATGTCTGATTATGAAAACAATG     <<<<<<<4;7;<<<;;47;&9..1;6&4<755;1;     MF:i:64 Aq:i:0  NM:i:1  UQ:i:19 H0:i:0  H1:i:1
+EAS112_32:8:88:90:59   133     chr1    674     0       *       =       674     0       TGCACCTCCCTGTTCACCTAGATGCTAGGAGGACA     =7595=92=72.=+5(:4=9092((.2&(&%07%.     MF:i:192
+B7_593:1:12:158:458    147     chr1    675     84      36M     =       503     -208    TAATAATGCTACATGGATGATTATGAAATCAATGTT    ++++++$((+*+++++++++++++&+++++++++++    MF:i:18 Aq:i:15 NM:i:5  UQ:i:40 H0:i:0  H1:i:0
+B7_593:4:28:781:723    99      chr1    676     99      36M     =       855     215     AATACCTCTACATGGCTGATTATGAAAACAATGTTC    <<<<<<<<<7<<<;;<<;;<<;<5<4<7<;7<+:<9    MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_81:2:27:856:401  163     chr1    679     99      35M     =       871     227     ACCTCTACATGGCTGATTATGAAAACAATGTTCCC     ======6===;2==;===;=+=92=;5+=&556:6     MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_26:7:245:323:744        83      chr1    679     99      35M     =       499     -215    ACCTCTACATGGCTGATTATGAAAACAATGTTCCC     /.848299;&;9;9;=2.=7========;;=====     MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_597:7:31:948:254    99      chr1    680     99      35M     =       849     204     CCTCTACATGGCTGATTATGAAAACAATGTTCCCC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<:<<8<;;;;<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_65:6:277:590:364 83      chr1    681     99      35M     =       503     -213    CTCTACATGGCTGATTATGAAAACAATGTTCCCCA     :::<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_32:7:201:959:19 147     chr1    681     99      35M     =       493     -223    CTCTACATGGCTGATTATTAAAACAATGTTCCCCA     ;4;.9<:0&/<5<::<<9/.<<<<<<<<<<<<;<<     MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:1  UQ:i:14 H0:i:0  H1:i:1
+EAS56_61:8:7:171:402   147     chr1    682     99      35M     =       489     -228    TCTACATGGCTGATTATGAAAACAATGTTCCCCAG     :086::::847:<7<<7<<<<<<;7<<;<<<<7<<     MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_610:4:67:317:249    99      chr1    683     26      35M     =       840     192     CTACATGGCTGATTATGAAATCTATGTTCCCCATA     <<<<<<;<<<<;:;<<7;<<.<&3<;;<<(;;6.<     MF:i:18 Aq:i:26 NM:i:3  UQ:i:31 H0:i:0  H1:i:0
+EAS51_64:4:189:467:475 147     chr1    683     99      35M     =       493     -225    CTACATGGCTGATTATGAAAACAATGTTCCCCAGA     *.;*;7<75<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_67:8:46:900:610  147     chr1    684     99      35M     =       491     -228    TACATGGCTGATTATGAAAACAATGTTCCCCAGAT     <;5<;<<<;<<<<<<;<<<<<<<<<<8<<<<<8<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_28:1:232:351:909        99      chr1    685     80      36M     =       843     194     ACATGGCTGATTATGAAATCAATGTTCCCCAGATGC    <<<<<99<<<<<<99<7<'<9<<<6<<+<;7;<<&;    MF:i:18 Aq:i:39 NM:i:2  UQ:i:11 H0:i:0  H1:i:1
+EAS139_11:6:11:285:1567        83      chr1    685     99      35M     =       525     -195    ACATGGCTGATTATGAAAACAATGTTCCCCAGATA     <8<4<<<;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_7:2:172:622:707 147     chr1    685     99      35M     =       511     -209    ACATGGCTGATTATGAAAACAATGTTCCCCAGATA     92<3996;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_597:5:6:882:784     83      chr1    686     99      35M     =       496     -225    CATGGCTGATTATGAAAACAATGTTCCCCAGATAC     4;7<;64<<:<<4<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_71:7:80:760:490  147     chr1    686     99      35M     =       520     -201    CATGGCTGATTATGAAAACAATGTTCCCCAGATAC     %::::+<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:4:68:1122:79 147     chr1    687     99      40M     =       528     -199    ATGGCTGATTATGAAAACAATGTTCCCCAGATACCATCCC        ::77*:1<<<<<<<<<<<<<<<:;<<<;<<<<<<8<<<<<        MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_93:1:264:988:663  99      chr1    688     99      35M     =       875     222     TGGCTGATTATGAAAACAATGTTCCCCAGATACCA     <<<<<<<<<<<1<4<<<4<<0<;<-<74*(<&51-     MF:i:18 Aq:i:60 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_73:5:3:233:911   163     chr1    688     99      35M     =       868     215     TGGCTGATTATGAAAACAATGTTCCCCAGATACCA     <<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<;<;<<;<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_59:6:187:925:547 99      chr1    689     99      35M     =       857     203     GGCTGATTATGAAAACAATGTTCCCAAGATACCAT     43<<<:9<;;;:7<<<<6<:<8<-4-/,81<(48:     MF:i:18 Aq:i:37 NM:i:1  UQ:i:12 H0:i:0  H1:i:1
+EAS56_65:5:75:637:650  163     chr1    691     99      35M     =       868     212     CTGATTATGAAAACAATGTTCCCCAGATACCATCC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<:     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS192_3:3:27:973:518  147     chr1    691     99      35M     =       549     -177    CTGATTATGAAAACAATGTTCCCCAGATACCATCC     +<<<<<<9<<<<<<<<<<<;<;<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_3:6:20:492:850  147     chr1    694     10      35M     =       526     -203    AGTATGAAAACAATGTTCCCCAGATGCCGTCCCGG     :.5:+.;;&91:;79:766:1:9+6&:1&&:+:))     MF:i:18 Aq:i:10 NM:i:4  UQ:i:31 H0:i:0  H1:i:0
+EAS51_64:4:318:345:156 83      chr1    695     99      35M     =       522     -208    TTATGAAAACAATGTTCCCCAGATACCATCCCTGT     ;8<8<<<<<;<<:<<;<;77<<<<<;<<;<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:39 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_610:3:5:863:302     99      chr1    698     99      35M     =       866     203     TGAAAACAATGTTCCCCAGATACCATCCCTGTCTT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_67:4:7:526:343   147     chr1    698     99      35M     =       515     -218    TGAAAACAGTGTTCCCCAGATACCATCCCTGTCTT     (7:;;;<<;;;<1<1<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1  UQ:i:26 H0:i:0  H1:i:1
+EAS114_26:2:73:513:102 99      chr1    698     99      35M     =       868     205     TGAAAACAATGTTCCCCAGATACCATCCCTGTCTT     ===========================;=======     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_11:2:6:251:1557 83      chr1    700     99      35M     =       526     -209    AAAACAATGTTCCCCAGATACCATCCCTGTCTTAC     <<<<<<<<<<<<6:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:78 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_78:7:147:64:416  99      chr1    701     99      35M     =       870     204     AAACAATGTCCCCCAGATACCATCCCTGTCTTACT     <<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<;<<<<;;:<;;;;;     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+B7_595:3:297:637:86    163     chr1    704     99      35M     =       869     200     CAATGTTCCCCAGATACCATCCCTGTCTTACTTCC     <<<<<<<<<<<<;+<+;<;<:<<<<<9<<957<;(     MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_61:6:160:272:398 163     chr1    705     99      35M     =       891     221     AATGTTCCCCAGATACCATCCCTGTCTTACTTCCA     9<<<3<<<<<<<<<<<9<<;8<<<<;<+.;;89..     MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_1:8:4:679:110   147     chr1    705     99      35M     =       549     -191    AATGTTCCCCAGATACCATCCCTGTCTTACTTCCA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_30:6:163:312:891        147     chr1    709     99      35M     =       543     -201    TTCCCCAGATACCGTCCCTGTCTTACTTCCAGCTC     0.<;;8<<<0<<<<<<<<<<6<<<<<<8<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+EAS114_28:3:78:773:660 83      chr1    711     99      36M     =       534     -213    CCCCAGATACCATCCCTGTCTTACTTCCAGCTCCCC    7<;7<<<7;9<<8;<<<<<<;<<<<<<<<<<7<<<<    MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS218_4:5:63:875:1339 163     chr1    711     99      35M     =       879     203     CCCCAGATACCATCCCTGTCTTACTTCCAGCTCCC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_7:7:243:876:758 147     chr1    712     99      35M     =       541     -206    CCCAGATACCATCCCTGTCTTACTTCCAGCTCCCC     0%3<1;.70;3363;31;<<<<<<6<<<;<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:4:104:153:698   163     chr1    713     99      36M     =       896     219     CCAGATACCATCCCTGTCTTACTTCCAGCTCCCCAG    ;<<<<<<;6<<<<<<<<<<;<<<<;<;;;<.<::50    MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS112_34:7:86:498:373 163     chr1    716     99      35M     =       894     213     GATACCATCCCTGTCTTACTTCCAGCTCACCAGAG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<5:<<<:<;7+67     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:1  UQ:i:25 H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_95:6:87:734:888   163     chr1    717     99      35M     =       900     218     ATACCATCCCTGTCTTACTTCCAGCTCCCCAGAGG     ===========;8=========;;=;====;;3(;     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_26:5:238:31:968 147     chr1    717     99      35M     =       534     -218    ACACCATCCCTGTCTTACTTCCAGCTCCCCAGAGG     =(.7=5%===9:7==+==77===============     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:1  UQ:i:7  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_65:3:290:558:349 99      chr1    719     99      35M     =       869     185     ACCATCCCTGTCTTACTTCCAGCTCCCCAGCGGGA     <<<;<<;<;<188<<<8::<686+4:<<6:&3)*&     MF:i:18 Aq:i:59 NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_28:5:206:671:49 83      chr1    719     99      36M     =       557     -198    ACCATCCCTGTCTTACTTCCAGCTCCCCAGAGGGAA    ;<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_95:2:278:918:892  147     chr1    720     99      35M     =       541     -214    CCATCCCTGTCTTACTTCCAGCTCCCCAGAGGGAA     =6=3=<===&=========================     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_591:1:191:462:705   147     chr1    721     99      36M     =       545     -212    CATCCCTGTCTTACTTCCAGCTCCCCAGAGGGAAAG    <<'<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_28:4:9:55:730   83      chr1    722     99      36M     =       540     -218    ATCCCTGTCTTACTTCCAGCTCCCCAGAGGGAAAGC    <:<;;<6<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_105:7:45:462:455  163     chr1    723     99      35M     =       874     186     TCCCTGTCTTACTTCCAGCTCCCCAGACGGAACGC     <<<<<<8<<<;<;<<<;<<<<<<<6;8&:80;733     MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:2  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+EAS114_28:2:149:650:44 163     chr1    726     99      36M     =       902     212     CTGTCTTACTTCCAGCTCCCCAGAGGGAAAGCTTTC    <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;6<<;<<7<<<    MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_105:1:297:283:948 83      chr1    727     99      35M     =       550     -212    TGTCTTACTTCCAGCTCCCCAGAGGGAAAGCTTTC     6;;3;6<<66<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS219_1:3:33:1168:1762        147     chr1    728     99      35M     =       552     -211    GTCTTACTTCCAGCTCCCCAGAGGGAAAGCTTTCA     79<9;3<<<4<<<97<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:1:228:182:717 147     chr1    729     99      35M     =       563     -201    TCTTACTTCCAGCTCCCCAGAGGGAAAGCTTTCAA     778;8;474<<<;2;;<2<<<<<<<<;<;;9<<<<     MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_1:8:8:1351:1986 163     chr1    729     99      35M     =       911     217     TCTTACTTCCAGATCCCCAGAGGGAAAGCTTTCAA     <<<<<<<<<<<<-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1  UQ:i:12 H0:i:0  H1:i:1
+EAS51_64:4:163:31:455  163     chr1    730     99      35M     =       886     191     CTTACTTCCAGCTCCCCAGAGGGACAGCTNNCAAC     <+<<<<<<<;0+<<<<;06070-9(0(9<!!5)05     MF:i:18 Aq:i:31 NM:i:3  UQ:i:7  H0:i:0  H1:i:1
+EAS54_61:6:126:541:194 83      chr1    730     97      35M     =       540     -225    AGTACGACCAGCTCCCCAGAGGGAAAGCTTTCAAC     +%&:/+(46=47&71/2==;=;8====28212===     MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:4  UQ:i:40 H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_62:7:178:286:414 163     chr1    731     99      35M     =       907     211     TTACTTCCAGCTCCCCAGAGGGAAAGCTTTCAACG     <<<<<<<<<<<<<<<<8<<<<<<<<<1<<<1;998     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_30:3:35:361:546 163     chr1    731     99      35M     =       892     196     TTACTTCCAGCTCCCCAGAGGGAAAGCTTTCAACG     <<<<<<<<<<<<<<<<;<5<<<<<;<2<<<:<8<4     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_3:4:90:247:212  147     chr1    733     99      35M     =       567     -201    ACTTCCAGCTCCCCAGAGGGAAAGCTTTCAACGCT     7655:;87;<;;;8<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS192_3:7:149:354:667 99      chr1    734     99      35M     =       888     189     CTTCCAGCTCCCCAGAGGGAAAGCTTTCAACGCTT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<><<<<<<<<;<:<<<<     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_591:2:240:603:890   83      chr1    740     99      36M     =       590     -186    GCTCCCAAGAGGGAAAGCTTTCAACGCTTCTAGCCA    ;+&+//&<<<<<<<<<<9<<<8<<<<9<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:1  H1:i:0
+B7_591:7:129:956:115   163     chr1    740     99      36M     =       927     223     GCTCCCCAGAGGGAAAGCTTTCAACGCTTCTAGCCA    <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;877-    MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_53:4:168:528:288 83      chr1    740     99      35M     =       570     -205    GCTCCCCAGAGGGAAAGCTTTCAACGCTTCTAGCC     8<%<31;<<;<;<<<<<<<;<<<<<<<<<<;<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_65:8:275:851:240 147     chr1    743     99      35M     =       561     -217    CCCCAGAGGGAAAGCTTTCAACGTTTCTAGCCATT     66614/&3616630666&66666&66666868666     MF:i:18 Aq:i:31 NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:0  H1:i:1
+EAS188_7:6:205:873:464 147     chr1    743     99      35M     =       552     -226    CCCCAGAGGGAAAGCTTTCAACGCTTCTAGCCATT     <-((+:+;289<--;<;-;<:;;<<<;;<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:63 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_65:6:37:610:260  163     chr1    745     99      35M     =       913     203     CCAGAGGGAAAGCTTTCAACGCTTCTAGCCATTTC     <<<;<;<<7<<<<<<<<<<<<<<;6<963;;;3;1     MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS192_3:7:93:945:176  147     chr1    745     99      35M     =       582     -198    CCAGAGGGAAAGCTTTCAACGCTTCTAGCCATTTC     6;;;8<<3<<8.<;6)<<<<<9<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:6:61:628:681    83      chr1    746     99      36M     =       586     -196    CAGAGGGAAAGCTTTCAACGCTTCTAGCCATTTCTT    95<<<<<<<<;<<<<;<<<:<<;;<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_65:7:288:552:440 83      chr1    747     87      35M     =       560     -222    AGAGGGAACGCTTTCAACTCTTCTAGCCATTTCTT     9<<%'%<<.2<<<<<<<<5:<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:26 NM:i:2  UQ:i:33 H0:i:0  H1:i:0
+EAS56_53:2:170:265:818 163     chr1    748     10      35M     =       920     207     GAGGGGAAGCTTTCAACGCTTCTAGCACTTTCTTT     <<<<<(5/959<8.<9<8<<<2<&59&&:22:8+(     MF:i:18 Aq:i:10 NM:i:3  UQ:i:17 H0:i:0  H1:i:0
+B7_595:2:251:121:479   83      chr1    750     99      35M     =       572     -213    GGGAAAGCTTTCAACGCTTCTAGCCATTTCTTTTG     <<<<<6'..663;&<<;<<9<<<9<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_1:8:67:1797:1931        147     chr1    750     99      35M     =       562     -223    GGGAAAGCTTTCAACGCTTCTAGCCATTTCTTTTG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_103:2:226:302:758 83      chr1    751     99      35M     =       556     -230    GGAAAGCTTTCAACGCTTCTAGCCATTTCTTTTGG     ;<<<<9;<<<<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:33 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_32:2:163:618:570        83      chr1    751     99      35M     =       571     -215    GGAAAGCTGTCAACGCTTCTAGCCATTTCTTTTGG     <9774<88&:8<:8<8:8<8<<<<<;88<88<<<<     MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:0  H1:i:1
+EAS1_97:3:73:292:429   99      chr1    752     99      35M     =       920     203     GAAAGCTTTCAACGCTTCTAGCCATTTCTTTTTGC     <<<<<<<<<<7<<;<<<<<<<2<<<5<<<<<:%)<     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:1  UQ:i:4  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:3:82:356:253  99      chr1    752     99      35M     =       927     210     GAAAGCTTTCAACGCTTCTAGCCATTTCTTTTGGC     ===================<========;===39=     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_30:6:62:386:959 147     chr1    752     99      35M     =       594     -193    AAAAGCTTTCAACGCTTCTAGCCATTTCTTTTGGC     %;71131((<<6<92(+<1<<;<-3<8<<;<;;<<     MF:i:18 Aq:i:57 NM:i:1  UQ:i:4  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_62:3:263:74:407  83      chr1    754     99      35M     =       574     -215    AAGCTTTCAACGCTTCTAGCCATTTCTTTTGGCAT     ;;88<::+;<)<5<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_597:3:67:620:344    99      chr1    755     99      35M     =       905     185     AGCTTTCAACGCTTCTAGCCATTTCTTTTGGCATT     <<<<2<:2<<<<<<7<<<<:<<*<<<<<<***3<<     MF:i:18 Aq:i:33 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_610:6:148:776:486   83      chr1    755     99      35M     =       578     -212    AGCTTTCAACGCTTCTAGCCATTTCTTTTGGCATT     ;:<<<;<<;<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_61:3:150:933:810 83      chr1    755     99      35M     =       593     -197    AGCTTTCAACGCTTCTAGCCATTTCTTTTGGCATT     :89===:=:=;;==;====================     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_64:4:102:467:897 99      chr1    756     97      35M     =       940     219     GCTTTCAACGCTTCTAGCCATTTCTTTTGTCTTTT     <<<<9<<<<9<2<<<&,/</<<<<7<<;&&<$;*<     MF:i:18 Aq:i:37 NM:i:2  UQ:i:8  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_39:1:12:884:219 147     chr1    756     99      35M     =       584     -207    GCTTTCAACGCTTCTAGCCATTTCTTTTGGCATTT     7;::<:<<<7<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:1:40:1596:1433       147     chr1    756     99      40M     =       587     -209    GCTTTCAACGCTTCTAGCCATTTCTTTTGGCATTTGCCTT        -:8:1841<4;<88<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<        MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_610:5:7:761:623     99      chr1    757     99      35M     =       938     216     CTTTCAACGCTTCTAGCCATTTCTTTTGGCATTTG     <<<<<<<<<<<<<8<<<<;;<0<<<<<;;<;<;;&     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_65:4:246:313:499 147     chr1    757     99      35M     =       592     -200    CTTTAAACGCTTCTAGCCATTTCTTTTGGCATTTG     +;77%;;;&:;:7;<<<<<6<:<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:1  UQ:i:4  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_11:6:89:1151:1878       147     chr1    757     99      35M     =       587     -205    CTTTCAACGATTCTAGCCATTTCTTTTGGCATTTG     8<66,,<<<<<<:<<<<<9<<<:<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+EAS54_71:4:165:397:25  83      chr1    759     99      34M     =       576     -217    TTCAACGCTTCTAGCCATTTCTTTTGGCATTTGC      &(33'60;-'+'<7;<<*3-<;;183<<<;<;<<      MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_3:2:59:1576:946 147     chr1    761     99      35M     =       578     -218    CAACGCTTCTAGCCATTTCTTTTGGCATTTGCCTT     9<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_32:7:256:407:470        163     chr1    762     99      35M     =       939     212     AACGCTTCTAGCCATTTCTTTTGGCATTTGCCTTC     <<<<<<<<;<;<<<<<<<<<;;<</<<;;83;7;9     MF:i:18 Aq:i:63 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:3:148:437:481   163     chr1    764     99      36M     =       949     221     CGCTTCTAGCCATTTCTTTTGGCATTTGCCTTCAGA    <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<;<<<<;0;8    MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_65:8:140:924:923 83      chr1    767     99      35M     =       597     -205    TTTTAGCCATTTCTTTTGGCATTTGCCTTCAGACC     <<&<<;;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_103:4:143:560:194 99      chr1    768     99      35M     =       946     213     TCTAGCCATTTCTTTTGGCATTTGCCTTCAGACCC     <<<<;;<<<<<<<<<<<6<;<<<<;;<<;9<999<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:2:178:192:499 83      chr1    768     99      35M     =       582     -221    TCTAGCCATTTCTTTTGGCATTTGCCTTCAGACCC     86<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS219_1:3:4:1620:413  147     chr1    768     99      35M     =       588     -215    TCTAGCCATTTCTTTTGGCATTTGCCTTCAGACCC     -<<<7<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_589:2:73:730:487    147     chr1    770     99      35M     =       604     -201    TAGCCATTTCTTTTGGCATTTGCCTTCAGACCCTA     <;;<<2;<;<<<;0<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_64:4:179:389:585 163     chr1    770     24      35M     =       953     218     TGGCCACTTTTTATCGCATTTCCCTTTAGAACCTA     <.4<9.4+.+'&-220<+<4<6<<20*6;<0(9<%     MF:i:130        Aq:i:24 NM:i:7  UQ:i:103        H0:i:0  H1:i:0
+B7_595:1:252:19:955    147     chr1    771     84      35M     =       596     -210    AGCCAGTTCTTTTGGCATTTGCCTTCAGACCCTCC     <8<884<<<<<<68<<<<<<<2<;<<;<+<<<;<<     MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:2  UQ:i:46 H0:i:0  H1:i:1
+EAS54_71:4:169:862:829 83      chr1    772     99      34M     =       611     -195    GCCATTTCTTTTGGCATTTGCCTTCAGACCCTAC      ,1<6<<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<<<<      MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_103:6:7:858:437   147     chr1    773     99      35M     =       593     -215    CCATTTCTTTTGGCATTTGCCTTCAGACCCTACAC     7;<4;;:;80<;<;<<<<<<:<<;<<<;;<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_30:4:183:852:253        83      chr1    773     99      35M     =       599     -209    CCATTTCTTTTGGCATTTGCCTTCAGACCCTACAC     ;<9<;<<<<<<<<;<<<<<;<<<;<<<<;<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_32:4:20:41:138  147     chr1    774     99      35M     =       615     -194    CATTTCTTTTGGCATTTGCCTTCAGACCCTACACG     ;;;<;<<<::<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_63:5:123:998:248 83      chr1    776     99      35M     =       589     -222    TTTCTTTTGGCATTTGCCTTCAGACCCTACACGAA     ;:;5;<;:<9<<<<<:<;<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:4:142:63:937    83      chr1    777     99      36M     =       609     -204    TTCTTTTGGCATTTGCCTTCAGACCCTACACGAATG    ;;;<;<<<<;<<<<<;:<<<<<<<;<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:78 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_61:3:20:762:748  83      chr1    777     99      35M     =       591     -221    TTCTTTTGGCATTTGCCTTCAGACCCTACACGAAT     =:747;7=;;==7=;==7===7==7;=========     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_59:3:149:953:349 99      chr1    777     99      35M     =       915     173     TTCTTTTGGCATTTGCCTTCAGACCCTACACGAAT     <<<<<<<<;<<<<<<<<<<<;7:<:<<:<:;;::;     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_597:3:46:981:766    163     chr1    778     99      35M     =       933     190     TCTTTTGGCATTTGCCTTCAGACCCTACACGAATG     <<<<<<<<<<<<<;<<<<<-<;<<<<-<-<;-:6;     MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_81:6:204:779:181 83      chr1    779     99      35M     =       598     -216    CTTTTGGCATTTGCCTTCAGACCCTACACGAATGC     ;:;/*<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_11:6:11:360:1577        147     chr1    781     99      35M     =       606     -210    TTTGGCATTTGCCTTCAGACCCTACACGAATGCGT     1<1<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_81:2:5:491:391   99      chr1    782     99      35M     =       917     170     TTGGCATTTGCCTTCAGACCCTACACGAATGCGTC     =========;===;==:4=========;3;==7;=     MF:i:18 Aq:i:62 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_78:7:186:199:927 99      chr1    783     99      35M     =       802     54      TGGCATTTGCCTTCAGACCCTACACGAATGCGTCT     <77<<<<2<;<<<<<06<<<<<<<<60<<684/6&     MF:i:18 Aq:i:57 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_67:8:19:855:491  147     chr1    783     99      35M     =       631     -187    TGGCATTTGCCTTCAGACCCTACACGAATGCGTCT     8<<<<;:<<<<:<<<<<:<;;<<<<<<<;<<<;<;     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:1:36:485:632    83      chr1    784     99      36M     =       610     -210    GGCATTTGCCTTCAGACCCTACACGAATGCGTCTCT    0;;;<<;<<<;<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_59:2:177:266:842 83      chr1    784     99      35M     =       599     -220    GGCATTTGCCTTCAGACCCTACACGAATGCGTCTC     <9<<6;9<;9;;<<<<;;;9<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_1:8:65:1928:1125        147     chr1    784     99      35M     =       588     -231    GGCATTTGCCTTCAGACCCTACACGAATACGTCTC     <+<<<2<4<<<0<<4<<<<<6<<<6<<<'<<<<0<     MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:1  UQ:i:6  H0:i:0  H1:i:1
+EAS221_3:4:66:584:407  163     chr1    785     99      35M     =       954     204     GCATTTGCCTTCAGACCCTACACGAATGCGTCTCT     <<<*9<9<<<1<<<<<<<<*<59<4<)<2<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_71:6:172:896:83  147     chr1    786     99      35M     =       604     -217    CATTTGCCTTCAGACCCTACACGAATGCGTCTCTA     ;<.5.;;<+;<<<<<<<4<<<<<<<;<<<<<;<<<     MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:3:2:1200:1076        83      chr1    786     99      35M     =       629     -192    CATTTGCCTTCAGACCCTACACGAATGCGTCTCTA     7779779;9;:;;4;;9;;:7;<<<7;;;:<;<<;     MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_99:3:135:543:760  147     chr1    787     99      35M     =       619     -203    ATTTGCCTTCAGACCCTACACGAATGCGTCTCTAC     ;;.;;8;<8;<<32;<<<<<7<<<<<9<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:3:5:538:401  147     chr1    788     99      40M     =       624     -204    TTTGCCTTCACACCCTACACGAATGCGTCTCTGCCACAGG        671&7::49:&0<<<(<::<&<<<:<<<<<<<&<<<<1<<        MF:i:18 Aq:i:39 NM:i:2  UQ:i:10 H0:i:0  H1:i:1
+EAS54_71:6:215:133:909 147     chr1    789     99      35M     =       631     -193    TTGCCTTCAGACCCTACACGAATGCGTCTCTACCA     7758;<;<;8<<<<;<;<<<<<:;<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_30:2:30:887:404 83      chr1    789     99      35M     =       600     -224    TTGCCTTCAGACCCTGCACGAATGCGTCTCTACCA     <<<<5<;::<<<;<<.<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:1  UQ:i:13 H0:i:0  H1:i:1
+EAS219_1:1:5:497:687   147     chr1    789     99      35M     =       607     -217    TTGCCTTCAGACCCTACACGAATGCGTCTCTACCA     <8<<8<<<;<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_65:5:131:742:561 83      chr1    790     99      35M     =       620     -205    TGCCTTCAGACCCTACACGAATGCGTCTCTACCAC     <:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:78 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_11:3:65:556:1505        83      chr1    790     99      35M     =       593     -232    TGCCTTCAGACCCTACACGAATGCGTCTCTACCAC     <6<8<<4<8;;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:4:233:478:792 147     chr1    791     99      35M     =       634     -192    GCCTTCAGACCCTACACGAATGCGTCTCTACCACA     6<;9:<<9-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_65:6:66:257:524  99      chr1    791     99      35M     =       959     203     GCCTTCAGACCCTACACGAATGCGTCTCTACCACC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<%     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:1  UQ:i:4  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_53:4:154:762:630 83      chr1    792     99      35M     =       604     -223    CCTTCAGACCCTACACGAATGCGTCTCTACCACAG     <<-::<91<<<<;<;<<<<;<<<<<<<<;<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS112_34:8:4:841:339  83      chr1    793     99      35M     =       646     -182    CTTCAGACCCTACACGAATGCGTCTCTACCACAGG     77-):22<<<33;<5<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS218_1:6:66:1282:1215        147     chr1    794     99      35M     =       627     -202    TTCAGACCCTACACGAATGCGTCTCTACCACAGGG     ::;<;<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_610:2:194:688:289   147     chr1    795     99      35M     =       631     -199    TCAGACCCTACACGAATGCGTCTCTACCACAGGGG     ;8;%28<;<<<<<<<<;<<<<;<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_97:8:36:927:478   147     chr1    798     99      35M     =       610     -223    GACCCTACACGAATGCGTCTCTACCACAGGGGGCT     ,6;;;3;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_99:8:99:756:130   83      chr1    798     99      35M     =       606     -227    GACCCTACACGAATGCGTCTCTACCACAGGGGGCT     ;;<<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_62:5:192:716:235 83      chr1    798     99      35M     =       651     -182    GACCCTACACGAATGCGTCTCTACCACAGGGGGCT     <5<<<8<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS219_FC30151:5:63:424:1643   83      chr1    798     99      35M     =       614     -219    GACCCTACACGAATGCGTCTCTACCACAGGGGGCT     9+<<<+7<<<<<<<<<<<<<<<<<8<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_81:8:14:360:580  99      chr1    799     99      35M     =       963     199     ACCCTACACGAATGCGTCTCTACCACAGGGGGCGG     ===========3===;5<==8;====79==.=5'5     MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:1  UQ:i:6  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_78:7:186:199:927 147     chr1    802     99      35M     =       783     -54     CTACGCGAATGCGTCTCTACCACAGGGGGCTGCGC     -;++)6<*8+;&<&/<<<<7<<71<<<<<6<<<7<     MF:i:18 Aq:i:57 NM:i:1  UQ:i:8  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:3:4:1502:1911        83      chr1    802     99      40M     =       652     -190    CTACACGAATGCGTCTCTACCACAGGGGGCTGCGCGGTTT        :+:::5/;99<;<&<*<-9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<        MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_99:3:187:791:153  99      chr1    803     99      35M     =       958     190     TACACGAATGCGTCTCTACCACAGGGGGCTGCGCG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:+;;<;<88*6;68     MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_11:4:63:527:1923        99      chr1    803     99      35M     =       981     213     TACACGAATGCGTCTCTACCACAGGGGGCTGCGCG     <<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<3<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_81:2:31:98:804   99      chr1    805     99      35M     =       982     212     CACGAATGCGTCTCTACCACAGGGGGCTGCGCGGC     =======9===;============5=;9=;=;==&     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:1  H1:i:0
+EAS218_4:7:89:1487:520 163     chr1    805     99      35M     =       997     227     CACGAATGCGTCTCTACCACAGGGGGCTGCGCGGT     8<<<6/<<<<<<<<<:<<8<:<<3<<:668<86<3     MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS220_1:4:69:88:1154  99      chr1    805     99      35M     =       992     222     CACGAATGCGTCTCTACCACAGGCGGCTGCGCGGT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<2<<<<:<<<<<7     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1  UQ:i:17 H0:i:0  H1:i:1
+EAS114_26:1:99:212:522 163     chr1    806     99      35M     =       1002    231     ACGAATGCGTCTCTACCACAGGGGGCTGCGCGGTT     ================8==;====;=;===1==:8     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_610:7:35:378:681    147     chr1    812     99      35M     =       632     -215    GCGTCTCTACCACAGGGGGCTGCGCGGTTTCCCAT     :<5-<);;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_105:3:182:404:693 83      chr1    812     99      35M     =       646     -201    GCGTCTCTACCACAGGGGGCTGCGCGGTTTCCCAT     <;7;;4<<<<<<<7<<7<<<<<<<<<8<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:3:119:761:239 99      chr1    813     99      35M     =       999     221     CGTCTCTACCACAGGGGGCTGCGCGGTTTCCCATC     <<<<<<<<<<<<6<<<<<<;<2<<<<;<<<<<;;<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:6:165:464:123 147     chr1    814     99      35M     =       650     -199    GTCTCTACCACAGGGGGCTGCGCGGTTTCCCATCA     9;<)<<%<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:5:40:758:116 83      chr1    814     99      40M     =       632     -222    GTCTCTACCACAGGGGGCTGCGCGGTTTCCCATCATGAAG        25/8/:<75:2<<<<<<7<<;<<<<<<<88;<<<<<<<<<        MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_95:7:55:506:125   99      chr1    817     99      35M     =       982     200     TCTACCACAGGGGGCTGCGCGGTTTCCCATCATGA     <<<<<<<<<;<9<;<<;558<<<<5(5*<<<<<51     MF:i:18 Aq:i:35 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_105:6:162:594:858 147     chr1    818     99      35M     =       634     -219    CTACCACAGGGGGCTGCGCGGTTTCCCATCATGAA     90;<99;==99==;4=:========;=====;===     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS219_FC30151:3:55:74:1040    99      chr1    818     99      35M     =       975     192     CTACCACAGGGGGCTGCGCGGTTTCCCATCATGAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_39:7:100:708:1984       99      chr1    819     99      35M     =       1015    231     TACCACAGGGGGCTGCGCGGTTTCCCATCATGAAG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<7%:     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_11:7:92:367:1495        163     chr1    820     99      35M     =       987     202     ACCACAGGGGGCTGCGCGGTTTCCCATCATGAAGC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<6<<<6<<     MF:i:18 Aq:i:78 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS218_1:6:49:905:27   163     chr1    821     68      35M     =       1000    214     CCACAGGGGGCTGCGCGGTTTCCCATCCTGAAGCA     <<;<.89<9.<2<9<:91+447.9,04&000(,+(     MF:i:18 Aq:i:31 NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:0  H1:i:1
+EAS218_4:7:87:964:826  163     chr1    822     99      35M     =       999     212     CACAGGGGGCTGCGCGGTTTCCCATCATGAAGCAC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<1<<8;4;;<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS220_1:8:38:1576:1923        163     chr1    822     99      35M     =       987     200     CACAGGGGGCTGCGCGGTTTCCCATCATGAAGCAC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<:;<<;<     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_589:1:122:337:968   99      chr1    823     85      35M     =       981     193     ACAGGGGGCTGCGCGGTTTCCCATCATGAAGCACT     <<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;;<;;;;     MF:i:18 Aq:i:10 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_30:3:187:294:947        99      chr1    823     99      35M     =       1002    214     ACAGGGGGCTGCGCGGTTTCCCATCATGAAGCACT     <<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<&<<%:<)7;7::4     MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:2:49:271:588  83      chr1    830     99      35M     =       658     -207    GCTGCGCGGTTTCCCATCATGAAGCACTGAACTTC     :0=:===:<===;;===;=================     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_63:3:40:594:752  147     chr1    831     99      35M     =       651     -215    CTGCGCGGTTTCCCATCATGAAGCACTGAACTTCC     ;7;9<;;;<;<;:<<;;<<<<<<<<<;<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_610:8:163:757:432   99      chr1    837     99      35M     =       1013    211     GGTTTCCCATCATGAAGCACTGAACTTCCACGTCT     <<<<<<<;<<<<<<<<;<;<<<<<<<<<<<<83:<     MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_62:4:156:857:494 83      chr1    838     99      35M     =       648     -225    GTTTCCCATCATGAAGCACTGAACTTCCACGTCTC     <<<8<:5<<;<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_595:5:84:91:614     163     chr1    839     99      35M     =       1019    215     TTTCCCATCATGAAGCACTGATCTTCCACGTCTCA     ;4<<<<<-84<<<;<<<<8<7.<4<<;77&:%<::     MF:i:18 Aq:i:39 NM:i:1  UQ:i:13 H0:i:0  H1:i:1
+EAS51_64:7:152:918:824 163     chr1    839     99      35M     =       1033    229     TTTCCCATCATGAAGCACTGAACTTCCACGTCTCA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<8     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_610:4:67:317:249    147     chr1    840     26      35M     =       683     -192    TTCCCATCATGACGCACCGAACTTCCACGTCTCAT     .5;7;++;<8.;&:7<<.5<<<<7<<7<<<<<<;7     MF:i:130        Aq:i:26 NM:i:2  UQ:i:18 H0:i:0  H1:i:0
+EAS51_62:7:96:836:737  147     chr1    841     99      35M     =       642     -234    TCCCATCATGAAGCACTGAACTTCCACGTCTCATC     1<;<7;;1;8;;8:<<1<;<<;<<<<<<<<<<;<<     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_81:8:130:912:658 83      chr1    841     99      35M     =       652     -224    TCCCATCATGAAGCACTGAACTTCCACGTCTCATC     ;=;;;<<<<<=55=;==<=======<=========     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:3:75:934:439  163     chr1    842     99      35M     =       1001    194     CCCATCATGAAGCACTGAACTTCCACGTCTCATCT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_71:7:212:329:348 163     chr1    842     99      35M     =       1020    212     CCCATCATGAAGCACTGAACTTCCACGTCTCATCT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:;;;<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_65:6:49:183:435  163     chr1    843     99      35M     =       1005    197     CCATCATGAAGCACTGAACTTCCACGTCTCATCTA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<;:;8;:     MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_61:7:280:133:495 99      chr1    843     99      35M     =       1015    207     CCATCATGAAGCACTGAACTTCCACGTCTCATCTA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_28:1:232:351:909        147     chr1    843     80      36M     =       685     -194    CCATCATGAAGCGCTGAACTTCCACGTCTCATCTAG    :8%3<8====130=8==+===;=3=8===48==;3*    MF:i:18 Aq:i:39 NM:i:1  UQ:i:15 H0:i:0  H1:i:1
+EAS221_1:8:77:781:676  163     chr1    846     99      35M     =       1010    199     TCATGAAGCACTGAACTTCCACGTATCATCTAGGG     <<<<<<<5<<5<<<<<<<<<<<<13<<2<<<<<,<     MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1  UQ:i:18 H0:i:0  H1:i:1
+EAS1_95:2:198:691:595  83      chr1    847     99      35M     =       655     -227    CATGAAGCACTGAACTTCCACGTCTCATCTAGGGG     :=:;=;===========;=================     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_597:7:31:948:254    147     chr1    849     99      35M     =       680     -204    TGAAGCACTGAACTTCCACGTCTCATCTAGGGGAA     7;;;98<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:1:278:440:902 99      chr1    851     99      35M     =       1032    216     AAGCACTGAACTTCCACGTCTCATCTAGGGGAACA     =========<==<==============:;;=;=;;     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_589:8:74:674:124    163     chr1    854     99      35M     =       1041    222     CACTGAACTTCCACGTCTCATCTAGGGGAACAGGG     <<<<<<<<<<<<:<;<<<<;<<<<;9;<<;;.;;;     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:4:28:781:723    147     chr1    855     99      36M     =       676     -215    ACTGAACTTCCACGTCTCATCTAGGGGAACAGGGAG    8488<::;4;;<:;;;::<;7<<<<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_28:2:28:474:566 163     chr1    855     99      36M     =       1018    199     ACTGAACTTCCACGTCTCATCTAGGGGAACAGGGAG    <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<;<;;<<7;8;<    MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_67:5:124:241:608 147     chr1    856     99      35M     =       670     -221    CTGAACTTCCACGTCTCATCTAGGGGAACAGGGAG     9;;<<;<<<;<<<;<:<<<<;<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_59:6:187:925:547 147     chr1    857     99      35M     =       689     -203    TGAACTTCCACGTCTCATCTAGGGGAACAGGGAGG     ((988+&8<<;<09<;<<9<<4<<-<99<<;<9<;     MF:i:18 Aq:i:37 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:7:9:512:826  99      chr1    859     99      35M     =       1021    197     AACTTCCACGTCTCATCTAGGGGAACAGGGAGGTG     67<<<;;;<;;<<;;<;<:;9;;;9;;;;<59777     MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_95:6:194:696:490  99      chr1    862     99      35M     =       1026    199     TTCCACGTCTCATCTAGGGGAACAGGGAGGTGCAC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<;5<<<<<:<1<8<<<8     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_63:5:96:788:614  83      chr1    862     99      35M     =       667     -230    TTCCACGTCTCATCTAGGGGAACAGGGAGGTGCAC     ;9;;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:3:81:786:340  163     chr1    863     99      35M     =       1033    205     TCCACGTCTCATCTAGGGGAACAGAGAGGTGCACT     <<<<7<<<<<<<<<<<<<<7<<;<&<<;;7<7;;;     MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:0  H1:i:1
+EAS192_3:7:298:644:697 163     chr1    863     99      35M     =       1035    207     TCCACGTCTCATCTAGGGGAACAGGGAGGTGCACT     <<<<<<<<<<<<<<<::;;;6<8:;;9;98;668;     MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_65:1:178:305:843 163     chr1    864     99      35M     =       1037    208     CCACGTCTCATCTAGGGGAACAGGGAGGTGCACTA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<;<<:<<:<;:     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_610:3:5:863:302     147     chr1    866     99      35M     =       698     -203    ACGTCTCATCTAGGGGAACAGGGAGGTGCACTAAT     :4:29:<<<9;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:5:30:788:376  99      chr1    866     99      35M     =       1038    207     ACGTCTCATCTAGGGGAACAGGGAGGTGCACTAAT     <<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<:<;<<(<7;7;:(;     MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_64:3:143:310:958 163     chr1    868     99      35M     =       1048    215     GTCTCATCTAGGGGAACAGGGAGGTGCACTAATGC     <<<<<<<<<<<8<8<<<<<;;7<<<;6;<<+4;;;     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_73:5:3:233:911   83      chr1    868     99      35M     =       688     -215    GTCTCATCTAGGGGAACAGGGAGGTGCACTAATGC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_65:5:75:637:650  83      chr1    868     99      35M     =       691     -212    GTCTCATCTAGGGGAACAGGGAGGTGCACTAATGC     <<<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_26:2:73:513:102 147     chr1    868     99      35M     =       698     -205    GTCTCATCTAGGGGAACAGGGAGGTGCACTAATGC     ==::===8=>=====>=>=>>>=>>==>=>>>>>>     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_595:3:297:637:86    83      chr1    869     99      35M     =       704     -200    TCTCAGCTAGGGGAACAGGGAGGTGCACTAATGCG     <:75<;<;;<<<<<<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:1  UQ:i:26 H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_65:3:290:558:349 147     chr1    869     99      35M     =       719     -185    TCTCAGCTAGGGGAACAGGGAGGTGCACTAATGCG     2;2;;'5&;<<5<<;5/<<<<<7<<;+;<<+1<8<     MF:i:18 Aq:i:59 NM:i:1  UQ:i:6  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_95:3:308:956:873  99      chr1    870     99      35M     =       1068    233     CTCATCTAGGGGAACAGGGAGGTGCACTAATGCGC     <<<<<<<<<<<<<;<;<;1<<<<<.<9<;<<<<+;     MF:i:18 Aq:i:31 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_78:7:147:64:416  147     chr1    870     99      35M     =       701     -204    CTCATCTAGGGGAACAGGGAGGTGCACTAATGCGC     /;49;:6<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:4:30:812:345    163     chr1    871     99      36M     =       1036    201     TCATCTAGGGGAACAGGGAGGTGCACTAATGCGCTC    <<<<<<<7<;<<7<;77;3<&0-;<5<;6<1'13<:    MF:i:18 Aq:i:64 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_73:7:134:243:630 163     chr1    871     99      35M     =       1052    216     TCATCTAGGGGAACAGGGAGGCGCACTAATGAGCT     <<<:<<<<</<<<-<<<<6/<-<:<5+<::-2</2     MF:i:18 Aq:i:39 NM:i:2  UQ:i:29 H0:i:0  H1:i:1
+EAS54_81:2:27:856:401  83      chr1    871     99      35M     =       679     -227    TCATCTAGGGGAACAGGGAGGTGCACTAATGCGCT     .'=.93======;;====;======;===;=;===     MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_105:7:45:462:455  83      chr1    874     99      35M     =       723     -186    TCTAGGGGAACAGGGAGGTGCACTAATGCGCTCCA     62*<;;;;<<;<<9;;<<<<<<<<<<<<<<<<;<<     MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_93:1:264:988:663  147     chr1    875     99      35M     =       688     -222    CGAGGGGAACAGGGAGGTGCACTAATGCGCTCCAC     (%<:4<4<<7<<1-:<1766<66<<<<+<:<;8;<     MF:i:18 Aq:i:60 NM:i:1  UQ:i:4  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_63:1:145:71:26   163     chr1    875     99      35M     =       1040    200     CTAGGGGAACAGGGAGGTGCACTAATGCGCTCCAC     <<<<<<<<<<<<<<<<<;<;;<<;<;<9<9;;99;     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_589:1:101:825:28    163     chr1    879     99      35M     =       1079    235     GGGAACAGGGGGGTGCACTAATGCGCTCCACGCCC     <<86<<;<78<<<)<;4<67<;<;<74-7;,;8,;     MF:i:18 Aq:i:39 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+EAS218_4:5:63:875:1339 83      chr1    879     99      35M     =       711     -203    GGGAACAGGGAGGTGCACTAATGCGCTCCACGCCC     ;;<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_595:6:290:270:557   99      chr1    880     99      35M     =       1052    207     GGAACAGGGAGGTGCACTAATGCGCTCCACGCCCA     <<<<<<<<<<<<<;<<<<9<:;<<<<<<5<0<<;+     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_105:6:134:853:558 163     chr1    880     99      35M     =       1071    226     GGAACAGGGAGGTGCACTAATGCGCTCCACGCCCA     ==========================9=9=;<;<5     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_4:7:282:567:481 99      chr1    880     88      35M     =       1064    219     GGAACAGGGAGGCGCACTAATGCGCTCCACGCCCA     <<<<<<<<<<<<3<7<7<<<<;<<0)<<<<<<<<3     MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1  UQ:i:18 H0:i:0  H1:i:1
+EAS114_30:1:154:818:165        163     chr1    881     99      35M     =       1041    195     GAACAGGGAGGTGCACTAATGCGCTCCACGCCCAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<:7;:;     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_95:1:301:54:240   163     chr1    882     99      35M     =       1061    214     AACAGGGAGGTGCACTAATGCGCTCCACGCCCAAG     <<<<:<9<<<<:<<<<9<<<<<<690<<6</<(83     MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_595:4:12:402:843    163     chr1    885     99      35M     =       1072    222     AGGGAGGTGCACTAATGCGCTCCACGCCCAAGCCC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;;<     MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:4:262:965:756 99      chr1    885     99      35M     =       1069    219     AGGGAGGTGCACTAATGCGCTCCACGCCCAAGCCC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;:<9;<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS112_34:8:30:816:90  163     chr1    885     99      35M     =       1057    207     AGGGAGGTGCACTAATGCGCTCCACGCCCCAGCCC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<::1&(1::7     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_7:4:171:104:398 163     chr1    885     99      35M     =       1066    216     AGGGAGGTGCACTAATGCGCTCCACGCCCAAGCCC     =========)===97===3===4===4==,)=/)=     MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_64:4:163:31:455  83      chr1    886     99      35M     =       730     -191    GGGAGGTGCACTAATGCGCTCCACGCCCAAGCCCT     8;<<;<<<78+<=</<<=;23<=<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:31 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS192_3:7:149:354:667 147     chr1    888     99      35M     =       734     -189    GAGGTGCACTAATGCGCTCCACGCCCAAGCCCTTC     ;<;;;<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS219_1:7:18:571:1110 99      chr1    888     99      35M     =       1070    217     GAGGTGCACTAATGCGCTCCACGCCCAAGCCCTTC     7<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<788<<<;6<     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_59:6:312:837:406 163     chr1    889     99      35M     =       1048    194     AGGTGCACTAATGCGCTCCACGCCCAAGCCCTTCT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_61:6:160:272:398 83      chr1    891     99      35M     =       705     -221    GTGCACTAATGCGCTCCACGCCCAAGCCCTTCTCA     3:,<,;;<<;<<1<<<<<<<;<;<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_32:4:228:587:504        99      chr1    891     65      35M     =       1050    194     GTGCACTAATGCGCTCCACGCCCAAGCCCTTCTCA     <<<<7<<7;7<<3<<<<7<<<<<*3<<<<74<:<*     MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_30:3:35:361:546 83      chr1    892     99      35M     =       731     -196    TGCACTAATGCGCTCCACGCCCAAGCCCTTCTCAC     :4;4;;<<;4<8<;;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:6:84:438:1505        99      chr1    893     99      40M     =       1068    215     GCACTAATGCGCTCCACGCCCAAGCCCTTCTCACAGTTTC        35<<:;9<;<;5<<<:<3<<7:<9/<)<<:::9<&5;;+1        MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_66:4:277:482:316 163     chr1    894     99      35M     =       1098    239     CACTAATGCGCTCCACGCCCAAGCCCTTCTCACAG     <<<<<<<<<<<<<<;<;<<<:<;<<<<;<<<1<1;     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS112_34:7:86:498:373 83      chr1    894     99      35M     =       716     -213    CACTAATGCGCTCCACGCCCAAGCCCTTCTCACAG     ):)4:<5<<<<;89<<<969<<<:<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_62:5:236:498:526 163     chr1    895     99      35M     =       1048    188     ACTAATGCGCTCCACGCCCAAGCCCTTCTCACAGT     ===================================     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_39:1:43:1120:878        99      chr1    895     99      35M     =       1075    215     ACTAATGCGCTCCACGCCCAAGCCCTTCTCACAGT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<<<<<<<<<<=7;7     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:4:104:153:698   83      chr1    896     99      36M     =       713     -219    CTAATGCGCTCCACGCCCAAGCCCTTCTCACAGTTT    69<<)9<<:5:6<<<16:<6/<6<1<<<<<:<:<<<    MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_63:7:166:42:147  99      chr1    898     99      35M     =       1048    185     AATGCGCTCCACGCCCAAGCCCTTCTAACAGTTTC     <<;<<<<<<<<<<<<<<<<;6<<64;)<<7;7;;;     MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1  UQ:i:8  H0:i:0  H1:i:1
+B7_595:2:178:77:424    99      chr1    900     99      35M     =       1058    193     TGCGCTCCACGCCCAAGCCCTTCTCACAGTTTCTG     <<<<<<<<<<<<<<<6<<;<<<<<<<<6<;<<<<6     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_95:6:87:734:888   83      chr1    900     99      35M     =       717     -218    TGCGCTCCACGCCCAAGCCCTTCTCACAGTTTCTG     56<<86;:<<<4;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_28:2:149:650:44 83      chr1    902     99      36M     =       726     -212    CGCTCCACGCCCAAGCCCTTCTCACAGTTTCTGCCC    ;8<<</<<:<<595<<9<<<<<<<<<<<<<<3<9<<    MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_59:2:177:552:234 99      chr1    903     99      35M     =       1094    226     GCTCCACGCCCAAGCCCTTCTCACAGTTTCTGCCC     <<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<9<969<<<<3<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_595:4:58:703:72     163     chr1    905     99      35M     =       1088    218     TCCACGCCCAAGCCCTTCTCACAGTTTCTGCCCCC     2<7<<<<<<<<<<<8:<<<<8<(<8<:::8.::<3     MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_595:7:242:4:593     99      chr1    905     99      35M     =       1086    216     TCCACGCCCAAGCCCTTCTCACAGTTTCTGCCCCC     <<<<<<<<<<<8<<<<-<<<<<88;<;<<8<;88<     MF:i:18 Aq:i:53 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_597:3:67:620:344    147     chr1    905     99      35M     =       755     -185    CCCCCGCCCAAGCCCTTCTCACAGTTTCTGCCCCC     +++*+++#++++++,++++++++,,+,&+,,,,+,     MF:i:18 Aq:i:33 NM:i:2  UQ:i:19 H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_62:7:178:286:414 83      chr1    907     99      35M     =       731     -211    CACGCCCAAGCCCTTCTCACAGTTTCTGCCCCCAG     68;38::<<;<<8;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_66:7:174:987:334 163     chr1    908     99      35M     =       1082    209     ACACCCAAGCCCTTCTCACAGTTTCTGCCCCCAGC     <<;4<<<<;;</4<4<+<<<<<;<<<<<</<93+2     MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:1  UQ:i:26 H0:i:0  H1:i:1
+EAS219_FC30151:1:55:8:1412     163     chr1    910     99      35M     =       1072    197     GCCCAAGCCCTTCTCACAGTTTCTGCCCCCAGCAT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_1:8:8:1351:1986 83      chr1    911     99      35M     =       729     -217    CCCAAGCCCTTCTCACAGTTTCTGCCCCCAGCATG     <8;<<<<<<<<<<<;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_65:6:37:610:260  83      chr1    913     99      35M     =       745     -203    CAAGCCCTTCTCACAGTTTCTGCCCCCAGCATGGT     /74<.<4.&<<<:<<<<::<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_26:5:228:189:826        99      chr1    914     99      35M     =       1112    233     AAGCCCTTCTCACAGTTTCTGCCCCCCGCATGGTT     ;9=========;=1======9=====1;=<3=:6;     MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:1  UQ:i:16 H0:i:0  H1:i:1
+EAS56_59:3:149:953:349 147     chr1    915     99      35M     =       777     -173    AGCCCTTCTCACAGTTTCTGCCCCCAGCATGGTTG     2;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:7:24:1374:211        99      chr1    915     99      35M     =       1064    184     AGCCCTTCTCACAGTTTCTGCCCCCAGCATGGTTG     ;;:<<;<;:;;;;;;;;;;<::;;;6;;2+74917     MF:i:18 Aq:i:64 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_81:2:5:491:391   147     chr1    917     99      35M     =       782     -170    CCCTGCTCACAGTTTCTGCCCCCAGCATGGTTGTA     -/+5-.&&:5+:92=6===========9=======     MF:i:18 Aq:i:62 NM:i:1  UQ:i:12 H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_32:2:306:119:56 99      chr1    919     99      35M     =       1083    199     CTTCTCACAGTTTCTGCCCCCAGCATGGTTGTACT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_93:1:216:381:608  163     chr1    920     99      35M     =       1075    190     TTCTCACAGTTTCTGCCCCCAGCATGGTTGTACTG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;+<6:<;26;     MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_97:3:73:292:429   147     chr1    920     99      35M     =       752     -203    TTCTCACAGTTTCTGCCCCCAGCATGGTTGTACTG     ;6;6;<<<<<;<<<<;<<<<<<<<7<<<<<<5<<<     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_53:2:170:265:818 83      chr1    920     73      35M     =       748     -207    TTCTCACAGTTTCTGCCCCCAGCATGGTTGTACTG     3+;%;.;;<<9+;3;;;<<<;57<1<;<<<<<<<;     MF:i:18 Aq:i:10 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_59:1:278:906:933 99      chr1    920     99      35M     =       1071    186     TTCTCACAGTTTCTGCCCCCAGCATGGTTGTACTG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<.     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_63:7:190:95:706  99      chr1    920     99      35M     =       1078    193     TTCTCACAGTTTCTGCCCCCAGCATGGTTGTACTG     <<<<<<<<<<<<<<9<<<<<;;<;<;;<<;<;;<,     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_65:5:278:848:765 99      chr1    920     99      35M     =       1088    203     TTCTCACAGTTTCTGCCCCCAGCATGGTTGTACTG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<4     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_597:6:29:249:878    163     chr1    921     99      35M     =       1077    191     TCTCACAGTTTCTGCCCCCAGCATGGTTGTACTGG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<:<<=<<:<<6&     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:2:259:467:737   163     chr1    923     99      36M     =       1102    215     TCACAGTTTCTGCCCCCAGCATGGTTGTACTGGGCA    <<<<<<<<<<<<7<<<<<<<'<<.<<<<<<;;;<67    MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_30:3:24:195:604 163     chr1    923     99      35M     =       1098    210     TCACAGTTTCTGCCCCCAGCATGGTTGTACTGTGC     <;<<<<<<<<<89<<<<<868<8;6<8;3(38&<8     MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_32:4:42:923:169 163     chr1    925     99      35M     =       1099    209     ACAGTTTCTGCCCCCAGCATGGTTGTACTGGGCAA     9<<<;9<<<<<;<;<<.<<;<;6<<<<1;8<<-0;     MF:i:18 Aq:i:39 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_589:1:29:529:379    163     chr1    926     99      35M     =       1117    226     CAGTTTCTGCCCCCAGCATGGTTGTACTGGGCAAT     <<<<<<<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<;<672;<<<     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS218_1:8:26:785:882  163     chr1    926     99      35M     =       1107    216     CAGTTTCTGCCCCAAGCATGGTTGTACTGGGCAAT     <<<0<<<<<<<<<6,<<)<<<<<<<&<<0<<,<'<     MF:i:18 Aq:i:39 NM:i:1  UQ:i:21 H0:i:0  H1:i:1
+B7_591:7:129:956:115   83      chr1    927     99      36M     =       740     -223    AGTTTCTGCCCCCAGCATGGTTGTACTGGGCAATAC    <<:<9<4<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:3:82:356:253  147     chr1    927     99      35M     =       752     -210    AGTTTCTGCCCCCAGCATGGTTGTACTGGGCAATA     97;7<<;;<<<<<7;<<:<<<9<<;<<<9<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_30:1:134:379:893        99      chr1    927     99      35M     =       1095    203     AGTTTCTGCCCCCAGCATGGTTGTACTGGGCAATA     <<<<<<<<<<<<<5<<<<;<<<<<;<:5;<<4+<<     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_105:8:256:404:584 99      chr1    928     99      35M     =       1096    203     GTTTCTGCCCCCAGCATGGTTGTACTGGGCAATAC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<3;<:;;3:3:</     MF:i:18 Aq:i:60 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_7:3:76:333:905  163     chr1    929     99      35M     =       1076    182     TTTCTGCCCCCAGCATGGTTGTACTGGGCAATACA     <<<<<7;<;<<6<<6<<7<<7<)&<4+6)0+<;(0     MF:i:18 Aq:i:61 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_591:6:11:646:628    99      chr1    930     99      36M     =       1106    212     TTCTGCCCCCAGCATGGTTGTACTGGGCAATACATG    <<<<<<<<<<6<<<<<<<<<<<<</<;<<<<<<6<;    MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:5:136:389:320 99      chr1    930     99      35M     =       1100    205     TTCTGCCCCCAGCATGGTTGTACTGGGCAATACAT     7<<<<<;<<7<6<<;;<;<;;677<6;(27;<(97     MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_97:6:93:334:858   99      chr1    932     99      35M     =       1106    209     CTGCCCCCAGCATGGTTGTACTTGGCAATACATGA     <<<<<<<<;<<<<;;<<9<<<<&;&<<9<9;/;&;     MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:0  H1:i:1
+B7_597:3:46:981:766    83      chr1    933     99      35M     =       778     -190    TGCCCCCAGCATGGTTGTACTGGGCAATACATGAG     /<<<;/;<<316<<<3<<<<7<<<7<<<;<<<<<7     MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_71:4:209:159:130 99      chr1    934     99      34M     =       1109    210     GCCCCCAGCATGGTTGTACTGGGCAATACATGAG      <<<<<<8<<<<<<&<<+7<<4<<<22<;<<<<3<      MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:1:111:796:737 99      chr1    936     99      35M     =       1112    211     CCCCAGCATGGTTGTACTGGGCAATACATGTGATT     <<<<<<<<<<<<<<<:<<;7;<<<<993<4%:%<<     MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:1  UQ:i:4  H0:i:1  H1:i:0
+EAS218_1:4:15:856:340  99      chr1    936     99      35M     =       1093    192     CCCCAGCATGGTTGCACTGGGCAATACATGAGATT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<77<<     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+B7_610:5:7:761:623     147     chr1    938     99      35M     =       757     -216    CCGGCATGGTTGTACTGGGCAATACATGAGATTAT     ::';-8);<<<<;<1<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:1  UQ:i:6  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_97:5:84:927:843   99      chr1    938     99      35M     =       1138    235     CCAGCATGGTTGTACTGGGCAATACATGAGATTAT     <<<<<<<<<<<<<;9;;4;<<0<<7<<9<;<:<5<     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_65:3:273:901:459 99      chr1    938     99      35M     =       1098    195     CCAGCATGGTTGTACTGGGCAATACATGAGATTAT     <<8<<<;<;8<;<;<;7+8<788<;;22<27;77;     MF:i:18 Aq:i:59 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_32:7:256:407:470        83      chr1    939     99      35M     =       762     -212    CAGCATGGTTGTACTGGGCAATACATGAGATTATT     7.47;0;;5<4033*<<<<<9,<<<<<;<<<<<3<     MF:i:18 Aq:i:63 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_7:1:77:251:446  163     chr1    939     99      35M     =       1110    206     CAGCATGGTTGTACTGGGCAATACATGAGATTATT     <<9<<<<<<<<<<<<<97<<<<<<<<<96<<<+<<     MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_64:4:102:467:897 147     chr1    940     97      35M     =       756     -219    AGCATGGTTGTACAGGGCAATACATGAGATTATTA     83333<+02<:<.&<+<.<::7<<::<<<<:<<<<     MF:i:18 Aq:i:37 NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:0  H1:i:1
+EAS221_1:6:92:1807:1185        99      chr1    940     99      35M     =       1119    214     AGCATGGTTGTACTGGGCAATACATGAGATTATTA     <<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<:<<<<;<<<;<<;     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_81:8:142:858:903 99      chr1    943     99      35M     =       1121    213     ATGGTTGTACTGGGCAATACATGAGATTATTAGGA     ======;====5=======9======;===3=5=;     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_103:4:143:560:194 147     chr1    946     99      35M     =       768     -213    GTTGTACTGGGCAATACATGAGATTATTAGGAAAT     9:<;7<:::<:<;<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:3:148:437:481   83      chr1    949     99      36M     =       764     -221    GTACTGGGCAATACATGAGATTATTAGGAAATGCTT    <<<;<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_81:6:75:917:886  163     chr1    951     99      35M     =       1110    194     ACTGGGCAATACATGAGATTATTAGGAAATGCTTT     <<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<71<<<:6<:8<     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_99:3:118:851:285  163     chr1    953     99      35M     =       1133    215     TGGGCAATACATGAGATTATTAGGAAATGCTTTAC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<;<:<<<<;;     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_64:4:179:389:585 83      chr1    953     24      35M     =       770     -218    TGTGAAATGAATGAGATTATTAGGAAATGCTTTAC     ;<)<;*;9*+<;<<,,<,<4<4<<<<<;<4<9494     MF:i:18 Aq:i:24 NM:i:4  UQ:i:53 H0:i:0  H1:i:0
+EAS114_30:7:269:944:220        163     chr1    953     99      35M     =       1147    229     TGGGCAATACATGAGATTATTAGGAAATGCTTTAC     <<<<<<<8<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<;<<;81     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_63:3:93:1002:845 163     chr1    954     99      35M     =       1129    210     GGGCAATACATGAGATTATTAGGAAATGCTTTACT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<;<<<;<<<</<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_3:4:66:584:407  83      chr1    954     99      35M     =       785     -204    GGGCAATACATGAGATTATTAGGAAATGCTTTACT     <<84<<<766<<<.6<<<<<<4<<7<<<<<<<7<<     MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_99:6:63:48:631    163     chr1    957     99      35M     =       1143    221     CAATACATGAGATTATTAGGAAATGCTTTACTGTC     <<<<<<;<<7</<<<<<<;;;<<<;<;<<7;;);<     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_99:3:187:791:153  147     chr1    958     99      35M     =       803     -190    AATACATGAGATTATTAGGAAATGCTTTACTGTCA     :;55&<99<<1<;<<8<<;<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS220_1:2:72:1809:1398        99      chr1    958     99      35M     =       1145    222     AATACATGAGATTATTAGGAAATGCTTTACTGTCA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<::<9<<<<<<<<<6<<:     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_65:6:66:257:524  147     chr1    959     99      35M     =       791     -203    ATACATGAGATTATTAGGAAATGCTTTACTGTCAT     <;<<<<<<<<3<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:7:247:522:670 163     chr1    960     99      35M     =       1121    196     TACATGAGATTATTAGGAAATGCTTTACTGTCATA     <<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<5;<<<;     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_99:7:37:400:627   163     chr1    961     99      35M     =       1154    228     ACATGAGATTATTAGGAAATGCTTTACTGTCATAA     <<<<<<7+<<<<<<2615<<6<<<<5<<1<<;:74     MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_105:3:329:177:267 163     chr1    962     99      35M     =       1139    212     CATGAGATTATTAGGAAATGCTTTACTGTCATAAC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<9;     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_595:7:166:203:416   163     chr1    963     99      35M     =       1136    208     ATGAGATTATTAGGAAATGCTTTACTGTCATAACT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<;<<<<<97<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_81:8:14:360:580  147     chr1    963     99      35M     =       799     -199    ATGAGATTATTAGGAAATGCTTTACTGTCATAACT     <,1<;<;;<<<<<1<<<;<7<<6<:;;<<<<<<;;     MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_65:4:193:38:987  163     chr1    964     99      35M     =       1158    229     TGAGATTATTAGGAAATGCTTTACTGTCATAACTA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<:;:;;     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_66:3:39:59:738   163     chr1    965     99      35M     =       1142    212     GAGATTATTAGGAAATGCTTTACTGTCATAATTAT     3<8.<<<<<<<-<<<<3<388;;880<0<0)-722     MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1  UQ:i:12 H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_66:4:209:92:210  163     chr1    965     99      35M     =       1156    226     GAGATTATTAGGAAATGCTTTACTGTCATAACTAT     <<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<5<7<<;;;<;<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_26:7:86:308:648 99      chr1    970     99      35M     =       1161    226     TATTAGGAAATGCTTTACTGTCATAACTATGAAGA     =8=====;=8======;=======35==;=;.;25     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_65:8:206:563:262 163     chr1    971     99      35M     =       1137    201     ATTAGGAAATGCTTTACTGTCATAACTATGAAGAG     <<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<-;<4;     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_65:6:82:822:767  99      chr1    972     99      35M     =       1165    228     TTAGGAAATGCTTTACTGTCATAACTATGAAGAGA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<.<<.<,<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:5:207:926:427 163     chr1    973     99      35M     =       1159    221     TAGGAAATGCTTTACTGTCATAACTATGAAGAGAC     <<<<<<7<<<<<;<<<<<6:<;<6<&<58<<6:::     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_62:7:144:28:475  99      chr1    974     99      35M     =       1167    228     AGGAAATGCTTTACTGTCATAACTATGAAGAGACT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<::8<     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS219_FC30151:3:55:74:1040    147     chr1    975     99      35M     =       818     -192    GGAAATGCTTTACTGTCATAACTATGAAGAGACTA     ;;;;;<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_103:1:274:176:479 99      chr1    976     99      35M     =       1144    203     GAAATGCTTTACTGTCATAACTATGAAGAGACTAT     <<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<;<<9<59<<<<     MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_589:1:122:337:968   147     chr1    981     10      35M     =       823     -193    GCTTTACTGTCTAAACTATGAAGAGACTATTGCCA     %454<75!7<+!990<9<6<<<<6<</<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:10 NM:i:3  UQ:i:24 H0:i:0  H1:i:0
+EAS114_28:7:157:786:424        99      chr1    981     99      36M     =       1171    226     GCTTTACTGTCATAACTATGAAGAGACTATTGCCAG    <<<<<<<<<<<<<;<<<<<<;<<;<<;<<<<+4:70    MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_11:4:63:527:1923        147     chr1    981     99      35M     =       803     -213    GCTTTACTGTCATAACCATGAAGAGACTATTGCCA     9<<<8<-8;;8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+EAS1_95:7:55:506:125   147     chr1    982     99      35M     =       817     -200    CTTTACTGTCATAACTATGAAGAGACTACTGCCAG     118%67;1;8,4:187<4>::1:818;;&::<>.;     MF:i:18 Aq:i:35 NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:0  H1:i:1
+EAS54_81:2:31:98:804   147     chr1    982     99      35M     =       805     -212    CTTTACTGTCATAACTATGAAGAGACTATTGCCAG     ====;========7=====================     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_103:2:235:805:373 163     chr1    983     99      35M     =       1146    198     TTTACTGTCATAACTATGAAGAGACTATTTCCAGA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;<<<<<<;;<99;     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:1  UQ:i:26 H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_28:5:11:868:62  99      chr1    983     99      36M     =       1154    207     TTTACTGTCATAACTATGAAGAGACTATTGCCAGAT    <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<;<<<<(7:7039    MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_81:2:280:512:316 163     chr1    984     99      35M     =       1159    210     TTACTGTCATAACTATGAAGAGACTATTGCCAGCT     ==<========6==4==6;;==:===;=2/:+8%6     MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:1  UQ:i:4  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_93:5:292:122:666  99      chr1    985     99      35M     =       1159    209     TACTGTCATAACTATGAAGAGACTATTGTCAGATG     <<<<<<6<<<<<<<<8;<<<<<<<<<<3&9+;;(;     MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_53:1:23:403:981  99      chr1    985     99      35M     =       1151    201     TACTGTCATAACTATGAAGAGACTATTGCCAGATG     <8<<<;<<<<<<;<<<<<<8;<<<9<9,3;,6(91     MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:7:33:1566:588        99      chr1    985     76      35M     =       1166    216     TACTGTCATAACTATGAAGAGCCTATTGCCAGATG     <;.;;;;6;;;;6;;29;;;<+9;;;.3;;73797     MF:i:18 Aq:i:37 NM:i:1  UQ:i:10 H0:i:0  H1:i:1
+EAS139_11:7:92:367:1495        83      chr1    987     99      35M     =       820     -202    CTGTCATAACTATGAAGAGACTATTGCCAGATGAA     <8<88<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:78 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS220_1:8:38:1576:1923        83      chr1    987     99      35M     =       822     -200    CTGTCATAACTATGAAGAGACTATTGCCAGATGAA     8;<98<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_595:7:190:481:295   163     chr1    990     99      35M     =       1161    206     TCATAACTATGAAGAGACTATTGCCAGATGAACCA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<9<7<2::     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS112_32:7:168:117:441        99      chr1    990     99      35M     =       1151    196     TCATAACTATGAAGAGACTATTGCCAGATGAACCA     <<3<<<<<<<<<<<<<<<<<<<+<<17;<;:<995     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_73:3:239:796:221 163     chr1    992     99      35M     =       1160    203     ATAACTATGAAGAGACTATTGCCAGCTGACCCCCC     <<<7<<7<<7<<7<;<<<<<,;;,+'<+/+99%:'     MF:i:18 Aq:i:37 NM:i:4  UQ:i:26 H0:i:0  H1:i:1
+EAS220_1:4:69:88:1154  147     chr1    992     99      35M     =       805     -222    ATAACTATGAAGAGACTATTGCCAGATGAACCACA     <<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_3:8:34:956:1309 99      chr1    994     99      35M     =       1168    209     AACTATGAAGAGACTATTGCCAGATGAACCACACA     <<<<<<7<<<<<<<<<<<6<<<<<<<<<<<:<8<8     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:5:229:717:121 99      chr1    995     99      35M     =       1150    190     ACTATGAAGAGACTATTGCCAGATGAACCACACAC     =================<)=<4<0=.<<<71;41&     MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:1  H1:i:0
+EAS219_1:1:67:191:668  99      chr1    995     99      35M     =       1134    174     ACTATGAAGAGACTATTGCCAGATGAACCACACCT     <<<<<<<<<<<<<<<<<6<<;<;<;<<<<<<6;%2     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:1  UQ:i:4  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_64:3:309:303:278 163     chr1    996     99      35M     =       1178    217     CTATGAAGAGACTATTGCCAGATGAACCACACATT     <<<<<<<<<<<<<<<<+<<+<<7<<<<<5<<<;;;     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_1:8:60:1020:1259        99      chr1    996     99      35M     =       1157    196     CTATGAAGAGACTATTGCCAGATGAACCACACATT     <;<<<<;<<<<<<<<<;<<<<<<<8<<<<<:<:<<     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS218_4:7:89:1487:520 83      chr1    997     99      35M     =       805     -227    TATGAAGAGACTATTGCCAGATGAACCACACATTA     4;;/<<<<<:<;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_610:4:15:805:420    163     chr1    998     35      35M     =       1164    201     ATGAAGAGACTATTCACATGTGAACCACACATTTA     ;73;;;;67.;1<<+*.;*&<4947<&474&*9*(     MF:i:130        Aq:i:35 NM:i:4  UQ:i:33 H0:i:0  H1:i:0
+EAS56_57:3:119:761:239 147     chr1    999     99      35M     =       813     -221    TGAAGAGACTATTGCCAGATGAACCACACATTAAT     ;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS112_34:7:142:457:584        99      chr1    999     99      35M     =       1160    196     TGAAGAGACTATTTCCAGATGAACCACACATTAAT     <<<<<<<<<<<<</<<,6<66<<<;<;;<*4744.     MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:1  UQ:i:14 H0:i:0  H1:i:1
+EAS218_4:7:87:964:826  83      chr1    999     99      35M     =       822     -212    TGAAGAGACTATTGCCAGATGAACCACACATTAAT     )6<<<<<<:;<6<<::<<<;<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS218_1:6:49:905:27   83      chr1    1000    68      35M     =       821     -214    GAAGAGACTATTGCCAGTTGAACCACACATTAATA     99515<<&<<6595-56%;86&<;<<<6<<<<6;<     MF:i:18 Aq:i:31 NM:i:1  UQ:i:4  H0:i:0  H1:i:1
+EAS1_108:3:75:934:439  83      chr1    1001    99      35M     =       842     -194    AAGAGACTATTGCCAGATGAACCACACATTAATAC     ==7=:=========================<====     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_26:1:99:212:522 83      chr1    1002    99      35M     =       806     -231    AGAGACTATTGCCAGATGAACCACACATTAATACT     <1<16<7<3<<;;<8<<<<<<<<<<<<;<<<<9<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_30:3:187:294:947        147     chr1    1002    99      35M     =       823     -214    AGAGACTATTGCCAGATGAACCACACATTAATACT     <<:<<8181;<8<<<<<<<<8<<<<<<<<<<<<<:     MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_61:2:152:860:286 163     chr1    1004    99      35M     =       1171    202     AGACTATTGCCAGATGAACCACACATTAATACTAT     <;<<<;<<0:<3<:<<2<<<<<7+<7+47<9(999     MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_65:6:49:183:435  83      chr1    1005    99      35M     =       843     -197    GACTATTGCCAGATGAACCACACATTAATACTATG     1<7<<<<;:<<<<<;<<<;<<<;<;<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_73:7:63:854:610  163     chr1    1005    99      35M     =       1180    210     GACTATTGCCAGATGAACCACACATTAATACTATG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;<<     MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_3:4:12:276:1797 99      chr1    1006    99      35M     =       1190    219     ACTATTGCCAGATGAACCACACATTAATACTATGT     <<<<<<<<<<<<:</<<9<:<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_591:6:190:42:671    163     chr1    1008    99      36M     =       1192    220     TATTGCCAGATGAACCACACATTAATACTATGTTTC    <<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_65:7:67:692:110  99      chr1    1009    99      35M     =       1175    201     ATTGCCAGATGAACCACACATTAATACTATGTTTC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_99:3:61:183:767   99      chr1    1010    99      35M     =       1195    220     TTGCCAGATGAACCACACCTTAATACTATGTTTCT     <<<<<<<<<<;<<<9<9<+<<<8<<<<<<;8<<<<     MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:1  UQ:i:10 H0:i:0  H1:i:1
+EAS221_1:8:77:781:676  83      chr1    1010    99      35M     =       846     -199    TTGCCAGATGAACCACACATTAATACTATGTTTCT     :<;<2<<<<<<26<<<<6<;<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_3:4:21:132:1423 99      chr1    1012    99      35M     =       1178    201     GCCAGATGAACCACACATTAATACTATGTTTCTTA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_610:8:163:757:432   147     chr1    1013    99      35M     =       837     -211    CCAGATGAACCACACATTAATACTATGTTTCTCAT     1+<8<<<<<<;<5<;<<<<<;5<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+EAS114_30:3:302:288:657        99      chr1    1013    99      35M     =       1173    195     CCAGATGAACCACACATTAATACTATGTTTCTTAT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<;<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:7:97:1584:777        99      chr1    1013    99      35M     =       1200    222     CCAGATGAACCACACATTAATACTATGTTTCTTAT     <<;<;;;;<;<;<<;;;;;;;;;;;;;;:;79979     MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_61:7:280:133:495 147     chr1    1015    99      35M     =       843     -207    AGATGAACCACACATTAATACTATGTTTCTTATCT     <:<9:<<7:<6<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_39:7:100:708:1984       147     chr1    1015    99      35M     =       819     -231    AGATGAACCACACATTAATACTATGTTTCTTATCT     :8<(8<)9<;<<<<+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_32:5:182:313:319        99      chr1    1016    99      35M     =       1180    199     GATGAACCACACATTAATACTATGTTTCTTATCTG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<<;<;     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_103:3:41:474:283  99      chr1    1018    99      35M     =       1182    199     TGAACCACACATTAATACTATGTTTCTTATCTGCA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<+<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_28:2:28:474:566 83      chr1    1018    99      36M     =       855     -199    TGAACCACACATTAATACTATGTTTCTTATCTGCAC    ;<<<+<<<<5<<<<<<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_595:5:84:91:614     83      chr1    1019    99      35M     =       839     -215    GAACCACACATTAATACTATGTTTCTTATCTGCAC     <<;;<<<7<<<<<<<;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:39 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_67:1:159:222:274 99      chr1    1019    99      35M     =       1189    205     GAACCACACATTAATACTATGTTTCTTATCTGCAC     =;9====;=9==59=+==9========9===5;7=     MF:i:18 Aq:i:37 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS219_1:3:62:603:1552 163     chr1    1019    99      35M     =       1180    196     GAACCACACATTAATACTATGTTTCTTATCTGCAC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<;<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_71:7:212:329:348 83      chr1    1020    99      34M     =       842     -212    AACCACACATTAATACTATGTTTCTTATCTGCAC      8<6:<:<<<;<<<;<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<      MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_71:4:233:97:262  99      chr1    1021    99      34M     =       1175    189     ACCACACATTAATACTATGTTTCTTATCTGCCCA      <<<<<<<<<<<;<;<<:<<<<<<<<<<<<.<&77      MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:7:9:512:826  147     chr1    1021    99      35M     =       859     -197    ACCACACATTAATACTATGTTTCTTATCTGCACAT     76777:;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;:;;;     MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:4:29:794:282    163     chr1    1025    99      36M     =       1196    207     CACATTAATACTATGTTTCTTATCTGCACATTACTA    <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<&<<;:<<8<<8    MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_59:4:278:524:521 163     chr1    1025    99      35M     =       1224    234     CACATTAATACTATGTTTCTTATCTGCACATTACT     <<<;<<;<<<<<<<;<<<<<<<<<<7;5;<<<;;<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_597:3:39:966:551    99      chr1    1026    99      35M     =       1205    214     ACATTAATACTATGTTTCTTATCTGCACATTACTA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<;<&<<&<<;     MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_95:6:194:696:490  147     chr1    1026    99      35M     =       862     -199    ACATTAATACTATGTTTCTTATCTGCACATTACTA     ========;======;==========8==:=====     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_591:3:305:565:952   99      chr1    1030    99      36M     =       1213    219     TAATACTATGTTTCTTATCTGCACATTACTACCCTG    7<<<<<<<<<7<<<<<<<<<7<<<;;<;<;<<<<<+    MF:i:18 Aq:i:62 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:7:287:258:321 99      chr1    1030    99      35M     =       1194    199     TAATACTATGTTTCTTATCTGCACATTACTACCCT     <<<<<<<<<<<;<<<<<<<<42:<+<<<;<<;;;;     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:1:278:440:902 147     chr1    1032    99      35M     =       851     -216    ATACTATGTTTCTTATCTGCACATTACTACCCTGC     <;7;4<;<;;;<<;<;;;<<<<<9<<<;<<<<;<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:5:180:905:36  99      chr1    1033    99      35M     =       1212    214     TACTATGTTTCTTATCTGCACATTACTACCCTGCA     ==========8===;;=========;==77%41=;     MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_64:7:152:918:824 83      chr1    1033    99      35M     =       839     -229    TACTATGTTTCTTATCTGCACATTACTACCCTGCA     ;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:3:81:786:340  83      chr1    1033    99      35M     =       863     -205    TACTATGTTTCTTATCTGCACATTACTACCCTGCA     ;<;<<<;<<;<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:3:196:11:27     163     chr1    1035    65      36M     =       1198    199     CTATGTTTCTTATCTGCNCATTACTACCCTGCAATT    <<<<<<<<;<<<<<<<8!4<<<;+<88;8<+2,8<;    MF:i:18 Aq:i:24 NM:i:1  UQ:i:0  H0:i:0  H1:i:1
+EAS192_3:7:298:644:697 83      chr1    1035    99      35M     =       863     -207    CTATGTTTCTTATCTGCACATTACTACCCTGCAAT     8:<8;<;:7;<<;4;:+<7<<<<;<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:4:30:812:345    83      chr1    1036    99      36M     =       871     -201    TATGTTTCTTATCTGCACATTACTACCCTGCAATTA    ;<;<<<<5<<<:<;<:<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:64 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_65:1:178:305:843 83      chr1    1037    99      35M     =       864     -208    ATGTTTCTTATCTGCACATTACTACCCTGCAATTA     <<<<<<<4<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:5:30:788:376  147     chr1    1038    99      35M     =       866     -207    TGTTTCTTATCTGCACATTACTACCCTGCAATTAA     :5<<4:88;9<<<<<;<<<<;<8<;<<<<1<<<<<     MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_63:1:145:71:26   83      chr1    1040    99      35M     =       875     -200    TTTCTTATCTGCACATTACTACCCTGCAATTAATA     882;8;<;;887<<<;;<<<<;<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_30:6:157:42:763 163     chr1    1040    99      35M     =       1203    198     TTTCTTATCTGCACATTACTACCCTGCAATTATTA     <<;<;<<<<<;<:4<<<<<<<<<;;4<<<:;;+;+     MF:i:18 Aq:i:61 NM:i:1  UQ:i:10 H0:i:1  H1:i:0
+B7_589:8:74:674:124    83      chr1    1041    99      35M     =       854     -222    TTCTTATCTGCACATTACTACCCTGCAATTAATAT     ;;;;;<<:<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_30:1:154:818:165        83      chr1    1041    99      35M     =       881     -195    TTCTTATCTGCACATTACTACCCTGCAATTAATAT     ;;;;<<<;<;;<;<<<<;<<;;;<<;<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:3:319:174:811 99      chr1    1044    99      35M     =       1242    233     TTATCTGCACATTTCTACCCTGCAATTAATATAAT     <<<<<<<<<;<<<<<<<<<;;<<<<<<<8<<;9<<     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+EAS139_19:3:87:133:930 163     chr1    1044    99      40M     =       1198    194     TTATCTGCACATTACTACCCTGCAATTAATATAATTGTGT        <<<7<<<<;<<;7<<7<<;;<<<;<5;<;;;5;;<:/48:        MF:i:18 Aq:i:39 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS219_1:1:44:1466:425 163     chr1    1044    99      35M     =       1213    204     TTATCTGCACATTACTACCCTGCAATTAATATAAT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<;<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_62:5:236:498:526 83      chr1    1048    99      35M     =       895     -188    CAGCACATTACTACCCTGCAATTAATATAATTGTG     <%88<;<:8<<<<:<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:1  UQ:i:4  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_64:3:143:310:958 83      chr1    1048    99      35M     =       868     -215    CTGCACATTACTACCCTGCAATTAATATAATTGTG     84<;<6<<<<;<<<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_59:6:312:837:406 83      chr1    1048    99      35M     =       889     -194    CTGCACATTACTACCCTGCAATTAATATAATTGTG     ;<;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_63:7:166:42:147  147     chr1    1048    99      35M     =       898     -185    CTGCACATTACTACCCTGCAATTAATATAATTGTG     3.7;;;;:<<<77<<3<;<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_28:3:279:763:945        99      chr1    1048    99      36M     =       1210    198     CTGCACATTACTACCCTGCAATTAATATAATTGTGT    <<<<<<<<<<<<<<<<<<<4:<<47<:<;<<</<9<    MF:i:18 Aq:i:61 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_610:3:82:998:566    163     chr1    1050    99      35M     =       1227    212     GCACATTACTACCCTGCAATTAATATAATTGTGTC     <<<<<<<:<<0<<<<:<82<<::<4<<;<<4<4<;     MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_32:4:228:587:504        147     chr1    1050    65      35M     =       891     -194    GCACATTACGACCCGGCAAGGTGTATAATTGTGTC     ;4;4;&&82&04+&&48;3&3&*<7<47<<;-<-8     MF:i:130        Aq:i:65 NM:i:6  UQ:i:47 H0:i:0  H1:i:0
+B7_595:6:290:270:557   147     chr1    1052    99      35M     =       880     -207    ACATTACTACCCTGCAATTAATATAATTGTGTCCA     87:9;;;<851+:5.<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_73:7:134:243:630 83      chr1    1052    99      35M     =       871     -216    ACATTACTACCCTGCAATTAATATAATTGTGTCCA     63<;37:<*&:<<<,,*<<:7<<7<<<<<<<::<<     MF:i:18 Aq:i:39 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_53:1:47:303:887  163     chr1    1052    96      35M     =       1240    223     ACATTACTACCCTGCCATTAATATACTTGTGTCCA     <<;;<+<9<<<<<9<(6<;//</<8(<<89;6084     MF:i:18 Aq:i:25 NM:i:2  UQ:i:14 H0:i:0  H1:i:0
+EAS221_3:8:74:770:1712 163     chr1    1052    99      35M     =       1208    191     ACATTACTACCCTGCAATTAATATAATTGTGTCCA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<5<<<<<<<<<<<<7<<     MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_591:6:29:575:453    163     chr1    1056    99      36M     =       1228    208     TACTACCCTGCAATTAATATAATTGTGTCCATTTAC    <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<1<:<9<&<98    MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_97:5:318:177:383  163     chr1    1056    99      35M     =       1251    230     TACTACCCTGCAATTAATATAATTGTGTCCATGTA     ;<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<;1'<;     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_53:8:179:549:753 99      chr1    1056    99      35M     =       1218    197     TACTACCCTGCAATTAATATAATTGTGTCCATGTA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<7<<<:<9<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS112_34:8:30:816:90  83      chr1    1057    99      35M     =       885     -207    ACTACCCTGCAATTAATATAATTGTGTCCATGTAC     :<3:%9299<<<<<<<<<5<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_595:2:178:77:424    147     chr1    1058    99      35M     =       900     -193    CTACCCTGCAATTAATATAATTGTGTCCATGTACA     :5:8<;<;:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_95:1:301:54:240   83      chr1    1061    99      35M     =       882     -214    CCCTGCAATTAATATAATTGTGTCCATGTACACAC     &..*3===1=========5.5==5===4====:5=     MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:4:91:521:517  99      chr1    1061    99      35M     =       1239    213     CCCTGCAATTAATATAATTGTGTCCATGTACACAC     <<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<<8<<;;;<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:7:24:1374:211        147     chr1    1064    99      35M     =       915     -184    TGCAATTAATATAATTGTGTCCATGTACACACGCT     77661;;;5;;:;;:;:;;;;;;8:;;;:;;;;;:     MF:i:18 Aq:i:64 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_4:7:282:567:481 147     chr1    1064    88      35M     =       880     -219    TGCAATTAATATAATTGTGTCCACGTACACACGCT     <9<6<;<9<<<;<<<;<5<7<5</7<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1  UQ:i:14 H0:i:0  H1:i:1
+EAS188_7:4:171:104:398 83      chr1    1066    99      35M     =       885     -216    CAATTAATATAATTGTGTCCATGTACACACGCTGT     79<+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_66:8:9:80:353    163     chr1    1067    99      35M     =       1233    201     AATTAATATAATTGTGTCCATGTACACACGCTGTC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<6<<<;;<<5<<2;2     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_63:6:42:920:522  163     chr1    1067    99      35M     =       1244    212     AATTAATATAATTGTGTCCATGTACACACGCTGTT     <<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<:<<<<<<<:;;::&     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_95:3:308:956:873  147     chr1    1068    99      35M     =       870     -233    ATAAAAATAAGTGTGTCCATGTACACACGCTGTCC     91.97&9499&-1*98*19999839999.9&9799     MF:i:18 Aq:i:31 NM:i:3  UQ:i:23 H0:i:0  H1:i:1
+EAS139_19:6:84:438:1505        147     chr1    1068    99      40M     =       893     -215    ATTAATATAATTGTGTCCATGTACACACTCTGTCCTATGT        :0::413::;:::0:179::3<;<:<9<&6<<<;<019<<        MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:0  H1:i:1
+EAS51_62:3:55:340:837  163     chr1    1069    99      35M     =       1238    204     TTAATATAATTGTGTCCATGTACACACGCTGTCCT     <<;<<;<<<<<8<;<<<;<7<<<;<<<<<93+79(     MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:4:262:965:756 147     chr1    1069    99      35M     =       885     -219    TTAATATAATTGTGTCCATGTACACACGCTGTCCT     <<:<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS219_1:7:18:571:1110 147     chr1    1070    99      35M     =       888     -217    TAATATAATTGTGTCCATGTACACACGCTGTCCTA     9<<;<;==;;=;=<;<===================     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_95:2:40:918:950   163     chr1    1071    99      35M     =       1247    211     AATATAATTGTGTCCATGTACACACGCTTTCCTTT     =========,=9=====2=7===7=0==&=+3=-=     MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:2  UQ:i:17 H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_97:2:59:882:980   163     chr1    1071    99      35M     =       1263    227     AATATAATTGTGTCCATGTACACACGCTGTCCTAT     <<<<<<<<<8<<<<<9<+<<<9<<<1<<77889+6     MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_105:6:134:853:558 83      chr1    1071    99      35M     =       880     -226    AATATAATTGTGTCCATGTACACACGCTGTCCTAT     <<<<8<<<7<<<<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_59:1:278:906:933 147     chr1    1071    99      35M     =       920     -186    AATATAATTGTGTCCATGTACACACGCTGTCCTAT     <88::<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_595:4:12:402:843    83      chr1    1072    99      35M     =       885     -222    ATATAATTGTGTCCATGTACACACGCTGTCCTATG     <7<+<<11<9<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_597:5:160:434:853   163     chr1    1072    99      35M     =       1259    222     ATATAATTGTGTCCATGTACACACGCTGTCCTATG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<,<<<<:<<<<,<:     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS219_FC30151:1:55:8:1412     83      chr1    1072    99      35M     =       910     -197    ATATAATTGTGTCCATGTACACACGCTGTCCTATG     <<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_59:1:219:294:861 163     chr1    1073    99      35M     =       1244    206     TATAATTGTGTCCATGTACACACGCTGTCCTCTGT     <<<<<<<<<<<<<9<<<5<9<<<9<<544<<'<+:     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:1  UQ:i:6  H0:i:1  H1:i:0
+EAS220_1:4:14:1665:1772        163     chr1    1073    84      35M     =       1263    225     TATAATGGTGTCCATGTACACACGCTGTCCTATGT     <<<<<7*<<<<<<<<<78<5<<7<<5<556<(73(     MF:i:18 Aq:i:39 NM:i:1  UQ:i:9  H0:i:0  H1:i:1
+B7_591:3:45:294:380    163     chr1    1074    80      36M     =       1233    195     ATAATTGTGTCCATGTACACACGATGTCATATGTAC    <<<<<<<<9<<<<<<<<<70<<7<6272&:3<+</%    MF:i:18 Aq:i:39 NM:i:2  UQ:i:32 H0:i:0  H1:i:1
+EAS1_108:7:222:538:267 99      chr1    1074    99      35M     =       1228    189     ATAATTGTGTCCATGTACACACGCTGTCCTATTTA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<74;;39%6+     MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:1  UQ:i:4  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_93:1:216:381:608  83      chr1    1075    99      35M     =       920     -190    TAATTGTGTCCATGTACACTCGCTGTCCTATGTAC     55<99<<<99;<;<<(<39&7<<<<<<<<<<<<<9     MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:0  H1:i:1
+EAS54_67:1:138:186:274 99      chr1    1075    99      35M     =       1231    191     TAATTGTGTCCATGTACACACGCTGTCCTATGTAC     =39====9===;=;=;=9=;=====;===-=+=-7     MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_39:1:43:1120:878        147     chr1    1075    99      35M     =       895     -215    TAATTGTGTCCATGTACACACGCTGTCCTATGTAC     <<<;<<;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_4:5:166:776:590 163     chr1    1075    99      35M     =       1252    212     TAATTGTGTCCATGTACACACGCTGTCCTATGTAC     <<<<<</<<<<<<<<<<<<<'<=<:26.</79<::     MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_7:3:76:333:905  83      chr1    1076    99      35M     =       929     -182    AATTGTGTCCATGTACACACGCTGTCCTATGTACT     <<;<<<<;7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:61 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_597:6:29:249:878    83      chr1    1077    99      35M     =       921     -191    ATTGTGTCCATGTACACACGCTGTCCTATGTACTT     <,;<9<;<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<><<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_63:7:190:95:706  147     chr1    1078    99      35M     =       920     -193    TTGTGTCCATGTACACACGCTGTCCTATGTACTTA     9;97437;<;;<<;<;<<<<<<;<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_589:1:101:825:28    83      chr1    1079    99      35M     =       879     -235    TGTGTCCATGTACACACGCTGTCCTATGTACTTAT     0;0'0;<<<<<<8<;<<<<;;3<<;;<<<8<<<<<     MF:i:18 Aq:i:39 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_66:4:188:460:1000        99      chr1    1080    99      35M     =       1251    206     GTGTCCATGTACACACGCTGTCCTATGTACTTATC     <<<<<<<<<<<<<<<<7<<;:4;44<;;:8;;9;;     MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_95:3:268:523:511  99      chr1    1081    99      35M     =       1241    195     TGTCCATGTACACACGCTGTCCTATGTACTTATCA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<6<:9<<3<44     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_28:6:54:263:585 99      chr1    1081    99      36M     =       1254    209     TGTCCATGTACACACGCTGTCCTATGTACTTATCAT    <<<<<<<<<<<<<<<<<<<:;<<;<:;::<<;;:;4    MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_66:7:174:987:334 83      chr1    1082    99      35M     =       908     -209    GTCCATGTACACACGCTGTCCTATGTACTTATCAT     ,;<;;<<<&<<<1<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_71:6:224:932:942 99      chr1    1082    99      34M     =       1250    203     GTCCATGTACACACGCTGTCCTATGTACTTATCA      <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<7<<(;3,      MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:1:12:1296:358        99      chr1    1082    96      35M     =       1252    205     GTCCATGTACACACGCTGTCCTATGTACTTATCAT     ;;;6;7;7;;;;;7;9;;-*1;9;699/99/7477     MF:i:18 Aq:i:37 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_32:2:306:119:56 147     chr1    1083    99      35M     =       919     -199    TCCATGTACACACGCTGTCCTATGTACTTATCATG     ;;;;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_95:4:66:179:118   163     chr1    1084    99      35M     =       1262    213     CCATGTACACACGCTGTCCTATGTACTTATCATGA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<;<<6<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_105:2:110:584:649 99      chr1    1084    99      35M     =       1266    217     CCATGTACACACGCTGTCCTATGTACTTATCATGA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<::<38     MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS218_1:4:28:315:310  163     chr1    1085    99      35M     =       1242    192     CATGTACACACGCTGTCCTATGTACTTATCATGAC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<+.<<.<+7<*17     MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_595:7:242:4:593     147     chr1    1086    99      35M     =       905     -216    ATATACACACGCTGTCCTATGTACTTATCATGACT     1.%55877+8+88808887+7;7;18:8;;;.&;8     MF:i:18 Aq:i:53 NM:i:1  UQ:i:4  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_93:1:131:946:353  163     chr1    1087    99      35M     =       1249    197     TGTACACACGCTGTCCTATGTACTTATCATGACTC     <<<<<<<<<<<<<;<<<<;;<<<<<<<;<:52;<2     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_1:4:4:1732:88   99      chr1    1087    99      35M     =       1265    213     TGTACACACGCTGTCCTATGTACTTATCATGACTC     <<<<<<<<<<<<<<<<<2<8;8<;<8;<2;2:<:<     MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_595:4:58:703:72     83      chr1    1088    99      35M     =       905     -218    GTACACACGCTGTCCTATGTACTTATCATGACTCT     5&<<7;+95;7'6<<<<<.<<<<<;<<9<7<<<<<     MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_59:5:113:694:725 163     chr1    1088    99      35M     =       1266    213     GTACACACGCTGTCCTATGTACTTATCATGACTCT     <<<<<<<<<<<<9<<<<<:<<<<<<<<<<:;;<;;     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_65:5:278:848:765 147     chr1    1088    99      35M     =       920     -203    GTACACACGCTGTCCTATGTACTTATCATGACTCT     7;;<;5<55<<;;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:6:234:787:12  163     chr1    1092    97      35M     =       1257    200     ACACGCTGGCCTATGTACTTATAATGACTCTATCC     <;<<<9<<&+9;3;<993;<9<+94;9&41;08%9     MF:i:18 Aq:i:24 NM:i:2  UQ:i:15 H0:i:0  H1:i:0
+EAS218_1:4:15:856:340  147     chr1    1093    99      35M     =       936     -192    CACGCTGTCCTATGTACTTATCATGACTCTATCCC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_62:2:258:266:101 163     chr1    1094    99      35M     =       1285    226     ACGCTGTCCTATGTACTTATCATGACTCTATCCCA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<5<;,<-2<<<<;68<<6     MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_59:2:177:552:234 147     chr1    1094    99      35M     =       903     -226    ACGCTGTCCTATGTACTTATCATGACTCTATCCCA     ::;:=;=99=====;;====;==========<===     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_30:1:134:379:893        147     chr1    1095    99      35M     =       927     -203    CGCTGTCCTATGTACTTATCATGACTCTATCCCAA     7137::;<<<<<<<;<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_105:8:256:404:584 147     chr1    1096    99      35M     =       928     -203    ACTGTCCTATGTACTTATCATGACTCTATCCCAAA     &&326+23<3<<<+:<</<<8<<<:7:<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:60 NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_30:4:317:378:535        163     chr1    1096    99      35M     =       1258    197     GCTGTCCTATGTACTTATCATGACTCTATCCCAAA     <<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<;<<;<8<;:7:1(     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_66:4:277:482:316 83      chr1    1098    99      35M     =       894     -239    TGTCCTATGTACTTATCATGACTCTATCCCAAATT     9998;<<<<<;;<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_65:3:273:901:459 147     chr1    1098    99      35M     =       938     -195    TGTCCTATGTACTTATCATGACTCTATCCCAAATT     4;+/+7,;<8+&<;;82;;<8<8<2<;<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:59 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_59:3:316:25:230  163     chr1    1098    99      35M     =       1273    210     TGTCCTATGTACTTATCATGACTCTATCCCAAATT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<);2;;     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_30:3:24:195:604 83      chr1    1098    99      35M     =       923     -210    TGTCCTATGTACTTATCATGACTCTATCCCAAATT     ;6<02;<<<<59<<;<;<<<<9<3<<<<<<<<<;<     MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_32:4:42:923:169 83      chr1    1099    99      35M     =       925     -209    TTCCTATGTACTTATCATGAATCTATCCCAAATTC     &;972<;&<9<,;;;<<<;<&99<<;<;;3<<3<<     MF:i:18 Aq:i:39 NM:i:2  UQ:i:10 H0:i:0  H1:i:1
+EAS114_45:6:59:1548:1096       163     chr1    1099    99      35M     =       1297    233     GTCCTATGTACTTATCATGACTCTATCCCAAATTC     ;.;;;;;;;;6;;;;;;;;;;;;;;;73;;77777     MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:5:136:389:320 147     chr1    1100    99      35M     =       930     -205    TCCTATGTACTTATCATGACTCTATCCCAAATTCC     .5:,666<)<8<:<<:66<<<<<<<<<<5<<7<<<     MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_32:6:122:342:296        99      chr1    1100    99      35M     =       1256    191     TCCTATGTACTTATCATGACTCTATCCCAAATTCC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<*<<<<9<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:2:259:467:737   83      chr1    1102    99      36M     =       923     -215    CTATGTACTTATCATGACTCTATCCCAAATTCCCAA    8<<<<<<<:<<<<<<<<;<;<<<<<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS218_1:4:71:832:743  163     chr1    1102    99      35M     =       1290    223     CTATGTACTTATCATGACTCTATCCCAAATTCCCA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<*<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:5:105:521:563 163     chr1    1103    72      35M     =       1267    199     TATGTACTTATCATGACTCTATCCCAAATTCCCAA     ;<)<9995<9<<59<7<<<<7<7<35,0,544<3(     MF:i:18 Aq:i:10 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS192_3:6:201:195:757 163     chr1    1103    99      35M     =       1298    230     TATGTACTTATCATGACTCTATCCCAAATTCCCAA     <<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<;;;;8     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:7:6:585:132     163     chr1    1105    23      36M     =       1276    207     TGTACTTATCATGTTTCTTTCCTAATTTTTCAATTA    6666166&6)+61))646+6&)&%&-44))1'144'    MF:i:130        Aq:i:23 NM:i:7  UQ:i:59 H0:i:0  H1:i:0
+EAS1_105:2:179:532:82  99      chr1    1105    99      35M     =       1285    215     TGTACTTATCATGACTCTATCCCAAATTCCCAATT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<3<;<;<<<<:<8<<<     MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_591:6:11:646:628    147     chr1    1106    99      36M     =       930     -212    GTACTTATCATGACTCTATCCCAAATTCCCAATTAC    <<<3<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<<6<    MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_97:6:93:334:858   147     chr1    1106    99      35M     =       932     -209    GTACTTATCATGACTCTATCCCAAATTCCCAATTA     ;<;+;;<<;<<<<<;<<<<;;8<<<<8<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS218_1:8:26:785:882  83      chr1    1107    99      35M     =       926     -216    TACTTATCATGACTCTATCCCAAATTCCCAATTAC     <<&5&<<<<5.;5<'<<;.76<<<<<7<7<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:39 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_589:4:54:989:654    99      chr1    1108    99      35M     =       1296    223     ACTTATCATGACTCTATCCCAAATTCCCAATTACG     <<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<9<<<<<1<<<88;     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_4:5:202:326:680 163     chr1    1108    78      35M     =       1268    195     ACTTATCATGACTCTATCCCAAATTCTCAATTACG     <<<<<<<4<<<*<<<*<<<7..:7<3*:7.7<+.;     MF:i:18 Aq:i:37 NM:i:1  UQ:i:9  H0:i:0  H1:i:1
+B7_597:3:53:616:842    163     chr1    1109    99      35M     =       1288    214     CTTATCATGACTCTATCCCAAATTCCCACTTACGT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<;07<<<<<-&<<-<4;     MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_71:4:209:159:130 147     chr1    1109    99      35M     =       934     -210    CTTATCATGACTCTATCCCAAATTCCCAATTACGT     ;:6<:<8::;<<<;<-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_81:6:75:917:886  83      chr1    1110    99      35M     =       951     -194    TTATCATGACTCTATCCCAAATTCCCAATTACGTC     <<<<8<<<<<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_59:6:286:753:854 163     chr1    1110    99      35M     =       1288    213     TTATCATGACTCTATCCCAAATTCCCAATTACGTC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<3<<<<<<9999<;<<9;     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_30:6:290:146:36 99      chr1    1110    99      35M     =       1280    205     TTATCATGACTCTATCCCAAATTCCCAATTACGTC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<<<<<;;<;;<     MF:i:18 Aq:i:25 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:6:93:1475:542        163     chr1    1110    99      35M     =       1254    179     TTATCATGACTCTATCCCAAATTCCCAATTACGTC     ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;9;;;9;;;77777     MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_7:1:77:251:446  83      chr1    1110    99      35M     =       939     -206    TTATCATGACTCTATCCCAAATGCCCAATTACGTC     <<24,:8<<<:1<<<:35<:<:,<<<<<<:5:<<<     MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:1  UQ:i:11 H0:i:0  H1:i:1
+EAS1_105:3:176:431:647 163     chr1    1112    99      35M     =       1285    208     ATCATGACTCTATCCCAAATTCCCAATTACGTCCT     <<<<<<<<<<<<<<<<2<<<<<<<<6<<<<9<<6<     MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:1:111:796:737 147     chr1    1112    99      35M     =       936     -211    ATCATGACTCTATCCCAAATTCCCAATTACGTCCT     <3<<<<<<<<<<<7<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_26:5:228:189:826        147     chr1    1112    99      35M     =       914     -233    ATCATGACTCTATCCCAAATTCCCAATTACGTCCT     :74=:.==1==========================     MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_11:1:35:631:594 163     chr1    1112    99      35M     =       1271    194     ATCATGACTCTATCCCAAATTCCCAATTACGTCCT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_589:1:29:529:379    83      chr1    1117    99      35M     =       926     -226    GACTCTATCCCAAATTCCCAATTACGTCCTATCTT     ;<<<:<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_81:7:74:596:137  99      chr1    1119    91      35M     =       1294    210     CTCTATCCCAAATTCCCAATTACGTCCTATCTTCT     <<<<<<<<<</4<<<<<<*<:6<<<<<<<<;/3<<     MF:i:18 Aq:i:22 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_1:6:92:1807:1185        147     chr1    1119    99      35M     =       940     -214    CTCTATCCCAAATTCCCAATTACGTCCTATCTTCT     <<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<><<<<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_595:3:57:735:151    99      chr1    1121    94      35M     =       1314    228     CTATCCCAAATTCCCAATTACGTCCTATCTTCTTC     <<<<<<<<8<<8<:<<*<:<<<4<<<;,<<<<:<:     MF:i:18 Aq:i:26 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_81:8:142:858:903 147     chr1    1121    99      35M     =       943     -213    CTATCCCAAATTCCCAATTACGTCCTATCTTCTTC     <<<<<;<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:7:247:522:670 83      chr1    1121    99      35M     =       960     -196    CTATCCCAAATTCCCAATTACGTCCTATCTTCTTC     ;;;9;:<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:3:75:732:442 99      chr1    1121    99      40M     =       1293    212     CTATCCCAAATTCCCAATTACGTCCTATCTTCTTCTTAGG        <<<<<;<<<<<9<<<;<<;<<<5<<;8<<<<<<<<;:9%%        MF:i:18 Aq:i:60 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_99:7:183:645:699  99      chr1    1122    86      35M     =       1281    194     TATCCCAAATTCCCAATTACGTCCTATCTTCTTCT     <<9<9<<<<<<<<<;<<;<<*175;173<;;;<-/     MF:i:18 Aq:i:21 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS192_3:6:175:437:950 163     chr1    1126    99      35M     =       1298    207     CCAAATTCCCAATTACGTCCTATCTTCTTCTTAGG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:59     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_63:3:93:1002:845 83      chr1    1129    99      35M     =       954     -210    AATTCCCAATTACGTCCTATCTTCTTCTTAGGGAA     <<::;;;<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_62:6:50:542:881  163     chr1    1132    99      35M     =       1324    227     TCCCAATTACGTCCTATCTTCTTCTTAGGTAAGAA     <<<<<4<09<<9<<2<<<<<<<<<<<2/.&2<%<7     MF:i:18 Aq:i:63 NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_99:3:118:851:285  83      chr1    1133    99      35M     =       953     -215    CCCAATTACGTCCTATCTTCTTCTTAGGGAAGAAC     3+7<<<;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS219_1:1:67:191:668  147     chr1    1134    99      35M     =       995     -174    CCAATTACGTCCTATCTTCTTCTTAGGGAAGAACA     <<<<<7<<7<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_595:7:166:203:416   83      chr1    1136    99      35M     =       963     -208    AATTACGTCCTATCTTCTTCTTAGGGAAGAACAGC     <<<<<<<<::<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:2:15:1497:1530       99      chr1    1136    99      35M     =       1314    213     AATTACGTCCTATCTTCTTCTTAGGGAAGAACAGC     0<;;;9;;86<;;;<<&<<.<<;)3;7;654-471     MF:i:18 Aq:i:57 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_65:8:206:563:262 83      chr1    1137    99      35M     =       971     -201    ATTACGTCCTATCTTCTTCTTAGGGAAGAACAGCT     <<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_26:4:40:352:151 99      chr1    1137    99      35M     =       1327    225     ATTACGTCCTATCTTCTTCTTAGGGAAGAACAGCT     <<<<<<<<<<<<<<<;<<9<<<<:<<<<;<99<3<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:7:67:302:762    99      chr1    1138    99      36M     =       1313    211     TTACGTCCTATCTTCTTCTTAGGGAAGAACAGCTTA    <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;65;<-<;<:8<<<3    MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_97:5:84:927:843   147     chr1    1138    99      35M     =       938     -235    TTACGTCCTATCTTCTTCTTAGGGAAGAACAGCTT     588;<:<<<<<<<6<<<<;<<<:/<<3<:;<*<<<     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_99:5:147:479:41   163     chr1    1139    99      35M     =       1322    218     TACGTCCTATCTTCTTCTTAGGGAAGAACAGCTTA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<::6<<;<<<;;9;;6     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_105:3:329:177:267 83      chr1    1139    99      35M     =       962     -212    TACGTCCTATCTTCTTCTTAGGGAAGAACAGCTTA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_589:7:72:916:763    163     chr1    1142    99      35M     =       1340    233     GTCCTATCTTCTTCTTAGGGAAGAACAGCTTAGGT     </:8<8)<<<<:<<<<<;.89<:67<.;<<7+336     MF:i:18 Aq:i:63 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_64:6:124:128:489 99      chr1    1142    99      35M     =       1348    241     GTCCTATCTTCTTCTTAGGGAAGAACAGCTTAGGT     <<<<<<<<<<<<<<<<<6:6<<-4<::;;<<:48<     MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_66:3:39:59:738   83      chr1    1142    99      35M     =       965     -212    GTCCTATGTTCTTCTTAGGGAAGAACAGCTTAGGT     ;.;4;<;3<<9<<9<&<<9<<<<<;<9<;<<;9<<     MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1  UQ:i:18 H0:i:0  H1:i:1
+EAS1_99:6:63:48:631    83      chr1    1143    99      35M     =       957     -221    TCCTATCTTCTTCTTAGGGAAGAACAGCTTAGGTA     ;*:;;<2<<2779;:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_103:1:274:176:479 147     chr1    1144    99      35M     =       976     -203    CCTATCTTCTTCTTAGGGAAGAACAGCTTAGGTAT     7)<<7<626<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<3<<<     MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS220_1:2:72:1809:1398        147     chr1    1145    99      35M     =       958     -222    CTATCTTCTTCTTAGGGAAGAACAGCTTAGGTATC     ;:;;:<7:7<:<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_103:2:235:805:373 83      chr1    1146    99      35M     =       983     -198    TATCTTCTTCTTAGGGAAGAACAGCTTAGGTATCA     <<;<<<<<<9<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_30:7:269:944:220        83      chr1    1147    99      35M     =       953     -229    ATCTTCTTCTTAGGGAAGAACAGCTTAGGTATCAA     <;<;8<<;7<<<<<;<<-<<<<<<;<<<;<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_32:7:174:597:66 163     chr1    1148    99      35M     =       1307    194     TCTTCTTCTTAGGGAAGAACAGCTTAGGTATCAAT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;<<;6;<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:5:229:717:121 147     chr1    1150    99      35M     =       995     -190    TTCTTCTGAGGGAAGAACAGCTTAGGTATCAATTT     6;-;7<<(<<<<<8<18<7<<<<<<<<<;<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1  UQ:i:7  H0:i:0  H1:i:1
+EAS56_53:1:23:403:981  147     chr1    1151    99      35M     =       985     -201    TCTTCATAGGGAAGAACAGCTTAGGTATCAATTTG     (;3+<&3<</7<<<<<<;<<<<<<<<<<<<</<2<     MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:1  H1:i:0
+EAS112_32:7:168:117:441        147     chr1    1151    99      35M     =       990     -196    TCTTCTTAGGGAAGAACAGCTTAGGTATCAATTTG     ;;;;3;<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:6:52:1455:1212       99      chr1    1153    99      40M     =       1304    191     TTCTTAGGGAAGAACAGCTTAGGTATCAATTTGGTGTTCT        <9<<<99<;<<9<;<-<<<6<<75;;<*%<5<3+.8:*5;        MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_99:7:37:400:627   83      chr1    1154    99      35M     =       961     -228    TCTTAGGGAAGAACAGCTTAGGTATCAATTTGGTG     474*;<<9<;<<<;<<:<<<<<<;<<<<<<;<<;<     MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_28:5:11:868:62  147     chr1    1154    99      36M     =       983     -207    TCTTAGGGAAGAACAGCTTAGGTATCAATTTGGTGT    ;;77;;7<<<<<<<<7<<<;<7<<<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_66:4:209:92:210  83      chr1    1156    99      35M     =       965     -226    TTAGGGAAGAACAGCTTAGGTATCAATTTGGTGTT     ;9;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_81:2:128:394:455 163     chr1    1156    99      35M     =       1313    192     TTAGGGAAGAACAGCTTAGGTATCAATTTGGTGTT     ======6==========;===9==;5===;==;==     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_7:1:316:949:122 99      chr1    1156    99      35M     =       1321    200     TTAGGGAAGAACAGCTTAGGTATCAATTTGGTGTT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<0<:<<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_1:8:60:1020:1259        147     chr1    1157    99      35M     =       996     -196    TAGGGAAGAACAGCTTAGGTATCAATTTGGTGTTC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_65:4:193:38:987  83      chr1    1158    99      35M     =       964     -229    AGGGAAGAACAGCTTAGGTATCAATTTTGTGTTCT     <<<;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+EAS1_93:5:292:122:666  147     chr1    1159    99      35M     =       985     -209    GGGAAGAACAGCTTAGGTATCAATTTGGTGTTCTG     <;<;;<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_81:2:280:512:316 83      chr1    1159    99      35M     =       984     -210    GGGAAGAACAGCTTAGGTATCAATTTGGTGTTCTG     ;9===;======;7==;;======;=====;====     MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:5:207:926:427 83      chr1    1159    99      35M     =       973     -221    GGGAAGAACAGCTTAGGTATCAATTTGGTGTTCTG     ;;7<<;4<<<2<<;<<<<<<<<<<7<;<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_73:3:239:796:221 83      chr1    1160    99      35M     =       992     -203    GGAAGAACAGCTTAGGTATCAATTTGGTGTTCTGT     ;;<<;<<;<<<+:<<<4<4<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:37 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS112_34:7:142:457:584        147     chr1    1160    99      35M     =       999     -196    GGAAGAACAGCTTAGGTATCAATTTGGTGTTCTGT     8::<:<<9<<.<:<<<<<<<<<<<7<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_595:7:190:481:295   83      chr1    1161    99      35M     =       990     -206    GAAGAACAGCTTAGGTATCAATTTGGTGTTCTGTG     ;<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_26:7:86:308:648 147     chr1    1161    99      35M     =       970     -226    GAAGAACAGCTTAGGTATCAATTTGGTGTTCTGTG     <7<<<;<<<<+;<<<2<5<<<77;<<2<;;<<<<<     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_610:3:182:23:585    99      chr1    1163    99      35M     =       1336    208     AGAACAGCTTAGGTATCAATTTGGTGTTCTGTGTA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_591:4:216:650:516   99      chr1    1164    99      36M     =       1326    198     GAACAGCTTAGGTATCAATTTGGTGTTCTGTGTAAA    <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;    MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_610:4:15:805:420    83      chr1    1164    35      35M     =       998     -201    GAACAGTTTAGGTATCAATTTGGTGTTCTTTGTAA     <64<59&996<(64<)7).68<0<0<<7741<1:<     MF:i:18 Aq:i:35 NM:i:2  UQ:i:24 H0:i:0  H1:i:1
+EAS56_65:6:82:822:767  147     chr1    1165    99      35M     =       972     -228    AACAGCTTAGGTATCAATTTGGTGTTCTGTGTAAA     <<9<<<<<<<<<<;;<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:7:33:1566:588        147     chr1    1166    76      35M     =       985     -216    ACAGCTTAGGCATCAATTTGGTGTTCTGTGTAAAG     -6246;;97;77;;97;;;;;;9;7;79;)&;37;     MF:i:18 Aq:i:37 NM:i:1  UQ:i:22 H0:i:0  H1:i:1
+EAS1_93:1:20:635:509   163     chr1    1167    99      35M     =       1333    201     CAGCTTAGGTATCAATTTGGTGTTCTGTGTAAAGT     <<<<<<<<<;<<<<;<<<;<;;;<<<;<<<<<<(8     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_62:7:144:28:475  147     chr1    1167    99      35M     =       974     -228    CAGCTTAGGTATCAATTTGGTGTTCTGTGTAAAGT     ;;;9;<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_1:4:36:1402:1709        163     chr1    1168    99      35M     =       1326    193     AGCTTAGGTATCAATTTGGTGTTCTGTGTAAAGTC     <<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<;<<<:9<<     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_3:8:34:956:1309 147     chr1    1168    99      35M     =       994     -209    AGCTTAGGTATCAATTTGGTGTTCTGTGTAAAGTC     9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_62:7:157:784:936 163     chr1    1169    99      35M     =       1356    222     GCTTAGGTATCAATTTGGTGTTCTGTGTAAAGTCT     <<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<;<<<<814<4<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_61:2:152:860:286 83      chr1    1171    99      35M     =       1004    -202    TTAGGTATCAATTTGGTGTTCTGTGTAAAGTCTCA     2;5;8<<;5<<<;<2<8<<<<<<;8<;<<<<;<<<     MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_28:7:157:786:424        147     chr1    1171    99      36M     =       981     -226    TTAGGTATCAATTTGGTGTTCTGTGTAAAGTCTCAG    ;<;2;;<<<;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:1:33:1407:94 163     chr1    1172    99      35M     =       1360    223     TAGGTATCAATTTGGTGTTCTGTGTAAAGTCTCAG     ;;;;;;;6:;;:::7;:;;;;:::;;;;:;47771     MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_30:3:302:288:657        147     chr1    1173    99      35M     =       1013    -195    AGGTATCAATTTGGTGTTCTGTGTAAAGTCTCAGG     <:5<<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_71:4:233:97:262  147     chr1    1175    99      35M     =       1021    -189    GTATCAATTTGGTGTTCTGTGTAAAGTCTCAGGGA     --;;7<;<;;:;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_65:7:67:692:110  147     chr1    1175    99      35M     =       1009    -201    GTATCAATTTGGTGTTCTGTGTAAAGTCTCAGGGA     ;;<<8<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:2:68:692:347    163     chr1    1176    99      36M     =       1351    211     TATCAATTTGGTGTTCTGTGTAAAGTCTCATGGAGC    <<<<<<<<<+6<;<<<<3<:<<<<6<8<<<&*/;*0    MF:i:18 Aq:i:64 NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_64:3:309:303:278 83      chr1    1178    99      35M     =       996     -217    TCAATTTGGTGTTCTGTGTAAAGTCTCAGGGAGCC     <:<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_3:4:21:132:1423 147     chr1    1178    99      35M     =       1012    -201    TCAATTTGGTGTTCTGTGTAAAGTCTCAGGGAGCC     :<<<<<6<<;<<;<5<;<<<<<<;<6<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_73:7:63:854:610  83      chr1    1180    99      35M     =       1005    -210    AATTTGGTGTTCTGTGTAAAGTCTCAGGGAGCCGT     :.5;2<:88<<72:<<;<<7<8;<;/<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_32:5:182:313:319        147     chr1    1180    99      35M     =       1016    -199    AATTTGGTGTTCTGTGTAAAGTCTCAGGGAGCCGT     </<;185;8<;;87<;8<<<<8<;83<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS219_1:3:62:603:1552 83      chr1    1180    99      35M     =       1019    -196    AATTTGGTGTTCTGTGTAAAGTCTCAGGGAGCCGT     8::;:<<6<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:6:145:144:796 99      chr1    1181    99      35M     =       1372    226     ATTTGGTGTTCTGTGTAAAGTCTCAGGGAGCCGTC     <<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<;<<<<<<4;4;<;/     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_103:3:41:474:283  147     chr1    1182    99      35M     =       1018    -199    TTTGGTGTTCTGTGTAAAGTCTCAGGGAGCCGTCC     6/;;;88;;<:;48<<<<<;<;<<<<<<<<<<;<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_26:2:329:458:365        99      chr1    1186    99      35M     =       1364    213     GTGTTCTGTGTAAAGTCTCAGGGAGCCGTCCGTGT     ==========================9========     MF:i:18 Aq:i:78 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_67:1:159:222:274 147     chr1    1189    99      35M     =       1019    -205    GTCTGGGGAAAGTCTCAGGGAGCCGTCCGTGTCCT     ''7*<&<'<<<<.<2<<<<<<<<<<+<<<8<8<<;     MF:i:18 Aq:i:37 NM:i:3  UQ:i:17 H0:i:0  H1:i:1
+EAS114_32:6:88:162:587 99      chr1    1189    99      35M     =       1372    218     TTCTGTGTAAAGTCTCAGGGAGCCGTCCGTGTCCT     <;<<<<<<<<<;<5<;<;<<7<++<<2&*:322+7     MF:i:18 Aq:i:63 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_610:3:148:340:479   99      chr1    1190    99      35M     =       1364    209     TCTGTGTAAAGTCTCAGGGAGCCGTCCGTGTCCTC     <<<<<<<<<<<<<<<<:<:<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_3:4:12:276:1797 147     chr1    1190    99      35M     =       1006    -219    TCTGTGTAAAGTCTCAGGGAGCCGTCCGTGTCCTC     )9<02)<<<<<<<<<<<<<1<<<<&<<<<9<<<<<     MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_591:6:190:42:671    83      chr1    1192    99      36M     =       1008    -220    TGTGTAAAGTCTCAGGGAGCCGTCCGTGTCCTCCCA    <<<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_93:4:321:271:138  99      chr1    1193    99      35M     =       1394    236     GTGTAAAGTCTCAGGGAGCCGTCCGTGTCCTCCCA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;9<<;<<;;<88;&     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_62:5:154:669:853 163     chr1    1193    99      35M     =       1371    213     GTGTAAAGTCTCAGGGAGCCGTCCGTGTCCTCCCA     ============<===.====<:=<9=<<<9;:;2     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:7:287:258:321 147     chr1    1194    99      35M     =       1030    -199    TGTAAAGTCTCAGGGAGCCGTCCGTGTCCTCCCAT     :.<9<)<;<9<.<<:<:+5:<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_99:3:61:183:767   147     chr1    1195    99      35M     =       1010    -220    GTAAAGTCTCAGGGAGCCGTCCGTGTCCTCCCATC     6&.;;<3<363<<<<<<<<8<<<6<<<<3<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:4:29:794:282    83      chr1    1196    99      36M     =       1025    -207    TAAAGTCTCAGGGAGCCGTCCGTGTCCTCCCATCTG    7<<<<45::-<<<<<;<<-;<<;<<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_73:3:313:827:992 99      chr1    1197    99      35M     =       1379    217     AAAGTCTCAGGGAGCCGTCCGTGTCCTCCCATCTG     <<<<6<<<<:<<<<<66<<<:33:<<<80<;6<8+     MF:i:18 Aq:i:57 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:3:196:11:27     83      chr1    1198    65      36M     =       1035    -199    AAGACCCAGTTAGCCGTCCGTGTCCTCCCATCTGGC    96&6<'<7:!!<,:;+7<<6:<<<<<<<<<7<7;:<    MF:i:18 Aq:i:24 NM:i:4  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:0
+EAS139_19:3:87:133:930 83      chr1    1198    99      40M     =       1044    -194    CAGTCTCAGGGCGCCGTCCGTTTCCTCCCATCTGGCCTCG        )8&)907)-;9&,<<9)<;<<0<;<<99<<<<<<;<<9<<        MF:i:18 Aq:i:39 NM:i:3  UQ:i:28 H0:i:0  H1:i:1
+EAS114_45:7:97:1584:777        147     chr1    1200    99      35M     =       1013    -222    GTCTCAGGGAGCCGTCCGTGTCCTCCCATCTGGCC     66746,9::9;;;;:;;;;;;;;;;;;;;;:;;;;     MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS112_34:6:127:153:861        99      chr1    1202    99      35M     =       1374    207     CTCAGGGAGCCGTCCGTGTCCTCCCATCTGGCCTC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<=<*<<<24;;::     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_30:6:157:42:763 83      chr1    1203    99      35M     =       1040    -198    TCTGGGAGCCGTCCGTGTCCTCCCATCTGGCCTCG     4++;((2(5;24<./<:<<<<<<<<;<<88<<<<9     MF:i:18 Aq:i:61 NM:i:1  UQ:i:10 H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_65:4:91:267:655  99      chr1    1204    99      35M     =       1365    196     CAGGGAGCCGTCCGTGTCCTCCCATCTGGCCTCGT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;:;;7<9477<74;     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_597:3:39:966:551    147     chr1    1205    99      35M     =       1026    -214    AGGGAGCCGTCCGTGTCCTCCCATCTGGCCTCGTC     8;;;;;<<6'<<<+8<<<1<<<<4<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_11:5:61:38:1182 163     chr1    1205    99      35M     =       1388    218     AGGGAGCCGTCCGTGTCCTCCCATCTGGCCTCGTC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<5<<<<     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:1:47:352:1492        99      chr1    1205    99      40M     =       1385    220     AGGGAGCCGTCCGTGTCCTCCCATCTGGCCTCGCCCACTA        :<<<::<24<04-&<;<<2<<<&<60)&<5<<6*8:)9+*        MF:i:18 Aq:i:53 NM:i:3  UQ:i:28 H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_3:8:74:770:1712 83      chr1    1208    99      35M     =       1052    -191    GAGCCGTCCGTGTCCTCCCATCTGGCCTCGTCCAC     3.&::6<<<9<6:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_28:3:279:763:945        147     chr1    1210    99      36M     =       1048    -198    GCCGTCCGTGTCCTCCCATCTGGCCTCGTCCACACT    +9:-+<:1-44<<':<;<+<-<<<;:<<;;<<<<<0    MF:i:18 Aq:i:61 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_26:4:306:388:342        163     chr1    1211    99      35M     =       1398    222     CCGTCCGTGTCCTCCCATCTGGCCTCGTCCACACT     ================5====:=====;==1=4==     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:5:180:905:36  147     chr1    1212    99      35M     =       1033    -214    CCTCCGTGTCCTCCCATCTGGCCTCGTCCACACTG     6%%<;<662<<*;<<<8<<:<<<<<<<<<<<<<<;     MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:1  UQ:i:4  H0:i:1  H1:i:0
+EAS218_1:2:19:752:816  99      chr1    1212    99      35M     =       1394    217     CGTCCGTGTCCTCCCATCTGGCCTCGTCCACACTG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<7;<;<<767277;6     MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_591:3:305:565:952   147     chr1    1213    99      36M     =       1030    -219    GTCCGTGTCCTCCCATCTGGCCTCGTCCACACTGGT    5(<1<147<81<*8--8<<<7<91<<<;+<+<<<<<    MF:i:18 Aq:i:62 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS219_1:1:44:1466:425 83      chr1    1213    99      35M     =       1044    -204    GTCCGTGTCCTCCCATCTGGCCTCGTCCACACTGG     6-<<9<<:<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_1:4:68:64:783   163     chr1    1214    99      35M     =       1402    223     TCCGTGTCCTCCCATCTGGCCTCGTCCACACTGGT     <<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<<<<<;<<<9:<<:9     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_61:7:64:37:257   163     chr1    1215    99      35M     =       1389    209     CCGTGTCCTCCCATCTGGCCTCGTCCACACTGGTT     ================<=====;===8;4======     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:2:20:413:1334        99      chr1    1215    99      35M     =       1370    190     CCGTGTCCTCCCATCTGGCCTCGTCCACACTGGTT     7<<;<<<.;<;67;7;;;:;;3;<59+...77677     MF:i:18 Aq:i:60 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_53:8:179:549:753 147     chr1    1218    99      35M     =       1056    -197    TGTCCTCCCATCTGGCCTCGTCCACACTGGTTCTC     :77<</<<<::<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_95:1:16:823:343   99      chr1    1223    99      35M     =       1403    215     TCCCATCTGGCCTCGTCCACACTGGTTCTCTTGAA     ================================4==     MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:7:266:556:252 99      chr1    1224    99      35M     =       1392    203     CCCATCTGGCCTCGTCCACACTGGTTCTCTTGAAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<4;;<;;;<7;;     MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_59:4:278:524:521 83      chr1    1224    99      35M     =       1025    -234    CCCATCTGGCCTCGTCCACACTGGTTCTCTTGAAA     7777,<;<<7<<<<;;<<;;<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS219_FC30151:5:72:1426:1883  99      chr1    1226    99      35M     =       1405    214     CATCTGGCCTCGTCCACACTGGTTCTCTTGAAAGC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_610:3:82:998:566    83      chr1    1227    99      35M     =       1050    -212    ATCTGGCCTCGTCCACACTGGTTCTCTTGAAAGCT     <9<9<<<<2<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_591:6:29:575:453    83      chr1    1228    99      36M     =       1056    -208    TCTGGCCTCGTCCACACTGGTTCTCTTGAAAGCTTG    ;<<<;;<:<<<;<;<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:7:222:538:267 147     chr1    1228    99      35M     =       1074    -189    TCTGGCCTCGTCCACACTGGTTCTCTTGAAAGCTT     52/8-<<7<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_67:1:138:186:274 147     chr1    1231    99      35M     =       1075    -191    GGCCTCGTCCACACTGGTTCTCTTGAAAGCTTGGG     <;<<<<<6;<<<<<3<<36;3;<9<<<<<<3;<<<     MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_610:3:137:895:681   99      chr1    1232    99      35M     =       1418    221     GCCTCGTCCACACTGGTTCTCTTGAAAGCTTGGGC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<-8<<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_39:1:71:636:533 99      chr1    1232    99      35M     =       1398    201     GCCTCGTCCACACTGGTTCTCTTGAAAGCTTGGGC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<5<<<-847     MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_591:3:45:294:380    83      chr1    1233    80      36M     =       1074    -195    CCTCGTCCACACTGGTTCGCTTGAAAGCTTGGGCTG    ;<+<7<<<<;7<,<7<<<+/7;<<;<<;7<<<;<<<    MF:i:18 Aq:i:39 NM:i:1  UQ:i:10 H0:i:0  H1:i:1
+EAS51_66:8:9:80:353    83      chr1    1233    99      35M     =       1067    -201    CCTCGTCCACACTGGTTCTCTTGAAAGCTTGGGCT     ;;5;:8<:<:;:;<<<<;<:<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_39:1:73:302:1574        99      chr1    1233    99      35M     =       1429    231     CCTCGTCCACACTGGTTCTCTTGAAAGCTTGGGCT     <<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<+:;<<;:8;<<<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_62:5:131:779:345 163     chr1    1237    99      35M     =       1399    197     GTCCACACTGGTTCTCTTGAAAGCTTGGGCTGTAA     ============================9====;=     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_81:8:159:71:155  99      chr1    1237    99      35M     =       1428    226     GTCCACACTGGTTCTCTTGAAAGCTTGGGCTGTAA     =========;=<======;=:=3;==;=6<==;=;     MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_62:3:55:340:837  83      chr1    1238    99      35M     =       1069    -204    TCCACACTGGTTCTCTTGAAAGCTTGGGCTGTAAT     61378<::<<<5:<;;:<<<<<<<<<<<<;<<<<<     MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:4:91:521:517  147     chr1    1239    99      35M     =       1061    -213    CCACACTGGTTCTCTTGAAAGCTTGGGCTGTAATG     8;8<4=:===7===9=============<======     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_53:1:47:303:887  83      chr1    1240    96      35M     =       1052    -223    CACACTGGTTCTCTTGAAAGCTTGGGCTGTAATGA     <;<6<;<;<8<<<8<<<<;<<<.<<<<<<<8<8;<     MF:i:18 Aq:i:25 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS112_34:4:74:570:695 163     chr1    1240    99      35M     =       1436    231     CACACTGGTTCTCTTGAAAGCTTGGGCTGTAATGA     =========================7====;8<8;     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_95:3:268:523:511  147     chr1    1241    99      35M     =       1081    -195    ACACTGGTTCTCTTGAAAGCTTGGGCTGTAATGAT     8<7<99<<<<<<<<<:<<<<<<4<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:3:319:174:811 147     chr1    1242    99      35M     =       1044    -233    CACTGGTTCTCTTGAAAGCTTGGGCTGTAATGATG     ;7;3<<3.<<<<<<<<<<<4<<<<<<<<<<<<<0<     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS218_1:4:28:315:310  83      chr1    1242    99      35M     =       1085    -192    AAACTGTTCTCTTGAAAGCTTGGGCTGTAATGATG     +%,768<<:<:<2<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:4  UQ:i:70 H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:1:328:614:638 99      chr1    1243    99      35M     =       1428    220     ACTGGTTCTCTTGAAAGCTTGGGCTGTAATGATGC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<4/;<<9<<<<7<<*:     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_81:8:63:930:152  163     chr1    1243    99      35M     =       1410    202     ACTGGTTCTCTTGAAAGCTTGGGCTGTAATGATTC     <<<<;<<<<<<<7<<;::<<)726;)<99<)&;&+     MF:i:18 Aq:i:59 NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_59:1:219:294:861 83      chr1    1244    99      35M     =       1073    -206    CTGGTTCTCTTGAAAGCTTGGGCTGTAATGATGCC     ;,;<;<<<;&<<<<<<<5<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_63:6:42:920:522  83      chr1    1244    99      35M     =       1067    -212    CTGGTTCTCTTGAAAGCTTGGGCTGTAATGATGCC     ;;;;;99<;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:7:87:89:696     99      chr1    1245    99      36M     =       1419    210     TGGTTCTCTTGAAAGCTTGGGCTGTAATGATGCCCC    <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<:;<<<;<<    MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_81:7:166:979:531 163     chr1    1245    99      35M     =       1410    200     TGGTTCTCTTGAAAGCTTGGGCTGTAATGATGCCC     <<</<<<<<<<<<9<<9<<;<7<<<<9<<<9<,)6     MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_95:2:40:918:950   83      chr1    1247    99      35M     =       1071    -211    GTTCTCTTGAAAGCTTGGGCTGTAATGATGCCCCT     =0=&&33======;=====.===============     MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_93:1:131:946:353  83      chr1    1249    99      35M     =       1087    -197    TCTCTTGAAAGCTTGGGCTGTAATGATGCCCCTTG     <<:<<66<<<6<<4<<<:8<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_71:6:224:932:942 147     chr1    1250    99      35M     =       1082    -203    CTCTTGAAAGCTTGGGCTGTAATGATGCCCCTTGG     <;<<;;<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_97:5:318:177:383  83      chr1    1251    99      35M     =       1056    -230    TCTTGAAAGCTTGGGCTGTAATGATGCCCCTTGGC     5:9;7;777<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<4     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_66:4:188:460:1000        147     chr1    1251    99      35M     =       1080    -206    TCTTGAAAGCTTGGGCTGTAATGATGCCCCTTGGC     +;+077<7;<57<;;8<<<<<<<<<<8<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:1:12:1296:358        147     chr1    1252    96      35M     =       1082    -205    CTTGAAAGCTTGGTCTGTAATGATGCCCCTTGGCC     -770074;;6;&42;:2;;;:;;;;:;;/:;;;;:     MF:i:18 Aq:i:37 NM:i:1  UQ:i:17 H0:i:0  H1:i:1
+EAS188_4:5:166:776:590 83      chr1    1252    99      35M     =       1075    -212    CTTGAAAGCTTGGGCTGTAATGATGCCCCTTGGCC     <;:;<<;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_28:6:54:263:585 147     chr1    1254    99      36M     =       1081    -209    TGAAAGCTTGGGCTGTAATGATGCCCCTTGGCCATC    1:::6<<<<;;;<4<<<<<<<<6<<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:6:93:1475:542        83      chr1    1254    99      35M     =       1110    -179    TGAAAGCTTGGGCTGTAATGATGCCCCTTGGCCAT     98987:9:<:;:;;;;;<<;<;<;;;;<<<;;;<<     MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_32:6:122:342:296        147     chr1    1256    99      35M     =       1100    -191    AAAGCTTGGGCTGTAATGATGCCCCTTGGCCATCA     <:;:<<<;<2<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:6:234:787:12  83      chr1    1257    97      35M     =       1092    -200    AAGCTTGGGCTGTAATGATGCCCCTTGGCCATCAC     ;;.<;;994<;9<<;;;<<<<<<<7<<<<<<<<<;     MF:i:18 Aq:i:24 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_30:4:317:378:535        83      chr1    1258    99      35M     =       1096    -197    AGCTTGGGCTGTAATGATGCCCCTTGGCCATCACC     ;7;':<77<<;<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_597:5:160:434:853   83      chr1    1259    99      35M     =       1072    -222    GCTTGGGCTGTAATGATGCCCCTTGGCCATCACCC     ;;*4;<;<<<;<<<<<<<8<<<;<<<<<<<<8<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS218_1:2:18:1498:1475        163     chr1    1260    99      35M     =       1427    202     CTTGGGCTGTAATGATGCCCCTTGGCCATCACCCG     <<<<<7<<<<<<+<<-3<<3<:<2<1<<:<<<<<+     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:2:104:744:280   99      chr1    1262    64      36M     =       1421    195     TGGGCTGTAATGATGCCCCTTGTCCATCACCCGGTC    <<<<<<<<<<<<<<;<;<<<<:4<<4<<0<;80+;:    MF:i:18 Aq:i:21 NM:i:2  UQ:i:34 H0:i:0  H1:i:1
+EAS1_95:4:66:179:118   83      chr1    1262    99      35M     =       1084    -213    TGGGCTGTAATGATGCCCCTTGGCCATCACCCAGT     <<99<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<:<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:1:277:194:143 99      chr1    1262    99      35M     =       1444    217     TGGGCTGTAATGATGCCCCTTGGCCATCACCCGGT     <<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<9;<<<8</<<6<:     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:1  UQ:i:21 H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_97:2:59:882:980   83      chr1    1263    99      35M     =       1071    -227    GGGCTGTAATGATGCCCCTTGGCCATCACCCGGTC     7339%<6<<<<<;<<9<<8<<<<;<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+EAS220_1:4:14:1665:1772        83      chr1    1263    84      35M     =       1073    -225    GGGCTGTAATGATGCCCCTTGGCCATCACCCGGTC     <&7<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:39 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+EAS56_57:2:259:42:969  163     chr1    1265    99      35M     =       1426    196     GCTGTAATGATGCCCCTTGGCCATCACCCGGTCCC     <<<<<;<<;<<3<<<;9<36<<29;<<;;;</;<2     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:1  UQ:i:26 H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_1:4:4:1732:88   147     chr1    1265    99      35M     =       1087    -213    GCTGTAATGATGCCCCTTGGCCATCACCCGGTCCC     :<4<:<<:<::<<<<<::<<<<<:<:<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+EAS1_105:2:110:584:649 147     chr1    1266    99      35M     =       1084    -217    CTGTAATGATGCCCCTTGGCCATCACCCGGTCCCT     ++:4686<<68<;<;<;<<<:<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+EAS56_59:5:113:694:725 83      chr1    1266    99      35M     =       1088    -213    CTGTAATGATGCCCCTTGGCCATCACCCGGTCCCT     ;::<<:<:<<<<<<<<<<:<:<<<<<<;<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+EAS221_1:8:58:369:244  163     chr1    1266    99      35M     =       1436    205     CTGTAATGATGCCCCTTGGCCATCACCCAGTCCCT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:5:105:521:563 83      chr1    1267    10      35M     =       1103    -199    TGTAATGCTGCCCCTTGGCCATCCCCCGGTCCCTG     /8)-8/6(98<967<3<<979<<1<<<7<<<<7<<     MF:i:18 Aq:i:10 NM:i:3  UQ:i:45 H0:i:0  H1:i:0
+EAS188_4:5:202:326:680 83      chr1    1268    78      35M     =       1108    -195    GTAATGATGCCCCTTGGCCATCACCCGGTCCCTGC     +33<81<:*<;<;;30;<<<;<<<8<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:37 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+EAS192_3:6:216:292:528 99      chr1    1269    99      35M     =       1438    204     TAATGATGCCCCTTGGCCATCACCCAGTCCCTGCC     <;<;<<<<<<<;<<<<<<<<;;;;:;;:<%<;1;:     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_3:2:67:1864:477 163     chr1    1270    99      35M     =       1465    230     AATGATGCCCCTTGGCCATCACCCAGTCCCTGCCC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_11:1:35:631:594 83      chr1    1271    99      35M     =       1112    -194    ATGATGCCCCTTGGCCATCACCCGGTCCCTGCCCC     <<<<4<<<<<.<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+EAS112_34:8:103:812:255        99      chr1    1272    99      35M     =       1461    224     TGATGCCCCTTGGCCATCACCCAGTCCCTGCCCCC     <<<<<<<<<<<<<<<9<<;<<<39;;<;32:7;7+     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:1  UQ:i:12 H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_7:4:259:869:641 99      chr1    1272    99      35M     =       1435    198     TGATGCCCCTTGGCCATCACCCAGTCCCTGCCCCA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<,;<:<<<<<<<<<1     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_59:3:316:25:230  83      chr1    1273    99      35M     =       1098    -210    GATGCCCCTTGGCCATCACCCGGTCCCTGCCCCAT     8;8;<<;<;;<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+EAS221_1:6:38:1071:155 99      chr1    1274    99      35M     =       1465    226     ATGCCCCTTGGCCATCACCCAGTCCCTGCCCCATC     <<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<8<<<:<<:;;8:;     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:7:6:585:132     83      chr1    1276    23      36M     =       1105    -207    GCCCCTTGACCACCACCCAGTCCCTGCCCCATCTCT    :<473$'<+5;7*+<7<&<37<7<<<<7;;7<<:<7    MF:i:18 Aq:i:23 NM:i:2  UQ:i:19 H0:i:0  H1:i:0
+B7_595:6:47:720:789    99      chr1    1278    90      35M     =       1455    212     CCCTTGGCCATCACCCGGTCCCGGCCCCTTCTCTT     <<72<<<<<<<<;;<7;,0<2;*7<2;<*;;<<64     MF:i:18 Aq:i:25 NM:i:3  UQ:i:44 H0:i:0  H1:i:0
+EAS192_3:6:185:868:496 163     chr1    1278    99      35M     =       1442    199     CCCTTGGCCATCACCCAGTCCCTGCCCCATCTCTT     <<<<<<<<<<<<;<<<;<<<<<<<<<<<9<<;<<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_30:6:290:146:36 147     chr1    1280    99      35M     =       1110    -205    CTTTCCCATCCCCCGGTCCCTGCCCCATCTCTTGT     7;%%%<8-4<(<<<7<<<:<:<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:25 NM:i:4  UQ:i:37 H0:i:0  H1:i:0
+B7_593:5:267:71:603    99      chr1    1281    99      36M     =       1446    201     TTGGCCATCACCCAGTCCCTGCCCCATCTCTTGTAA    <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<9;    MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_99:7:183:645:699  147     chr1    1281    86      35M     =       1122    -194    GTGGCCCTCCCCCATTCCCTGCCCCATCTCTTGTA     &)))2-&420<<<'--<6:6-<7<<<+:7<65<<<     MF:i:18 Aq:i:21 NM:i:4  UQ:i:37 H0:i:0  H1:i:0
+EAS1_105:2:179:532:82  147     chr1    1285    99      35M     =       1105    -215    CCATCACCCGGTCCCTGCCCCATCTCTTGTAATCT     <:96<6<<<<89<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+EAS1_105:3:176:431:647 83      chr1    1285    99      35M     =       1112    -208    CCATCACCCAGTCCCTGCCCCATCTCTTGTAATCT     <(9(<<<7;<<7<<<<<<<7<<<<<<7<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_62:2:258:266:101 83      chr1    1285    99      35M     =       1094    -226    CCATCACCCAGTCCCTGCCCCATCTCTTGTAATCT     %==/7&8=======:===6================     MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_32:6:179:735:569        163     chr1    1286    99      35M     =       1461    210     CATCACCCGGTCCCTGCCCCATCTCTTGTAATCTC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<3<<<<<<<<4/<;<<     MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+EAS188_7:3:200:712:439 163     chr1    1286    99      35M     =       1435    184     CGTCACCCGGTCCCTGCCCCATCTCTTGTAATCTC     <7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:29 NM:i:2  UQ:i:49 H0:i:0  H1:i:0
+EAS1_103:5:319:165:698 99      chr1    1287    99      35M     =       1485    233     ATCACCCAGTCCCTGCCCCATATCTTGTAATCTCT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<3<9<<<<<<<;<<<<<     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1  UQ:i:24 H0:i:0  H1:i:1
+B7_597:3:53:616:842    83      chr1    1288    99      35M     =       1109    -214    TCACCCAGTCCCTGCCCCATCTCTTGTAATCTCTC     ;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_59:6:286:753:854 83      chr1    1288    99      35M     =       1110    -213    TCACCCAGTCCCTGCCCCATCTCTTGTAATCTCTC     ;<2<<<,57:<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:7:14:1256:204        99      chr1    1288    99      35M     =       1467    214     TCACCCAGTCCCTGCCCCATCTCTTGTAATCTCTC     <<<<<;;;;;;<;;;;;;;<;<;;;;<:-;79697     MF:i:18 Aq:i:64 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_591:5:289:132:526   99      chr1    1289    99      36M     =       1472    219     CACCCGGTCCCTGCCCCATCTCTTGTAATCTCTCTC    <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+EAS218_1:4:71:832:743  83      chr1    1290    99      35M     =       1102    -223    ACCCAGTCCCTGCCCCATCTCTTGTAATCTCTCTC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_66:3:102:511:946 99      chr1    1291    26      35M     =       1461    205     CCCAGTCCCTGCCCCATCTCGGGTAATCTCTCTCC     <<9<<;<<<<;<<<<;<<7;%<5<<0<<<)<.<.+     MF:i:18 Aq:i:26 NM:i:2  UQ:i:31 H0:i:0  H1:i:0
+EAS114_39:5:42:1223:1087       99      chr1    1293    99      35M     =       1479    221     CAGTCCCTGCCCCATCTCTTGTAATCTCTCTCCTT     <<<<<<<<<<<<<5<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:3:75:732:442 147     chr1    1293    99      40M     =       1121    -212    CGGTCCCTGCCCCATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTGC        7,*&28<61:88<.7<:<<:6<1<85:<:1<5<&::<<&<        MF:i:18 Aq:i:60 NM:i:1  UQ:i:11 H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_73:3:23:502:103  163     chr1    1294    99      35M     =       1486    227     AGTCCCTGCCCCATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTT     <2<<<<<<<<<<.<<<<<<<:1&:<<<7<<<<<<:     MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_81:7:74:596:137  147     chr1    1294    91      35M     =       1119    -210    GGTCCCTGCCCCATCGCTTGTAATCTCTCGCCTTT     +40778449779049'+*87489498949%89948     MF:i:18 Aq:i:22 NM:i:3  UQ:i:32 H0:i:0  H1:i:0
+EAS51_66:8:36:688:722  99      chr1    1295    99      35M     =       1469    209     GTCCCTGCCCCATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_7:8:60:182:718  163     chr1    1295    99      35M     =       1485    225     GTCCCTGCCCCATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<<<;<;<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_589:4:54:989:654    147     chr1    1296    99      35M     =       1108    -223    TCCCTGCCCCATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTT     ,<1<2<<<;9)9<<;<<;<<<4<<<;<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_97:2:9:203:653    163     chr1    1296    99      35M     =       1488    227     TCCCTGCCCCATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<::<9<<<<<;;;<     MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_28:4:322:631:245        163     chr1    1297    99      36M     =       1474    213     CCCTGCCCCATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTGC    <<<<<<<<<<<<<<<<<0<<<<<<<<<<<<<<<<5;    MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:6:59:1548:1096       83      chr1    1297    99      35M     =       1099    -233    CCCTGCCCCATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTG     88888;;88;;;;8;;9;;;<<<<<<<<<<<<<<;     MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS220_1:2:52:1779:1664        99      chr1    1297    99      35M     =       1462    200     CCCTGCCCCATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<71<<<<<<<<<<<<<<%     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_65:8:218:173:667 99      chr1    1298    99      35M     =       1448    185     CCTGCCCCATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTGC     <<<<<<<<<<<<<<<6<<<<<<<<<<<<<<<<<.<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS192_3:6:175:437:950 83      chr1    1298    99      35M     =       1126    -207    CCTGCCCCATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTGC     ;;5:;;9<<:<;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS192_3:6:201:195:757 83      chr1    1298    99      35M     =       1103    -230    CCTGCCCCATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTGC     :<':<:<<46<:<;:<;<;<<9<<<<<<<<;<<<<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_4:5:8:377:655   99      chr1    1299    99      35M     =       1473    209     CTGCCCCATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTGCT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_589:5:50:950:562    99      chr1    1301    99      35M     =       1473    207     GCCCCATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTGCTGC     <<<<<<<<<<<<<<<&<<8<<<<<<<5<:<+<:+;     MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_71:5:153:543:671 99      chr1    1301    99      34M     =       1465    199     GCCCCATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTGCTG      <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<2<<7      MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:2:33:1193:664        163     chr1    1301    99      40M     =       1474    213     GCCCCATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTTCTGCATCCC        <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<%:<'<9:::9        MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:1  UQ:i:4  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_93:1:253:59:242   99      chr1    1302    99      35M     =       1478    211     CCCCATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTGCTGCA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<</<<9;<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:6:52:1455:1212       147     chr1    1304    99      40M     =       1153    -191    CCATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTGCTGCATCCCTGT        6::4::;4%;9:<79)<:<;<<:4::7<<9<&+71<9;<<        MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:2:316:176:543 99      chr1    1305    99      35M     =       1469    199     CATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTGCTGCATCC     ====<=9===<<<=====9====<<=3==,96==9     MF:i:18 Aq:i:62 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS219_1:7:50:1339:1154        163     chr1    1305    99      35M     =       1481    211     CATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTGCTGCATCC     ==========<<==============;==7<;<<;     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_62:3:169:292:652 99      chr1    1306    99      35M     =       1510    239     ATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTGCTGCATCCC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<6<<-<<<<8<     MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS219_1:3:11:706:1030 99      chr1    1306    92      35M     =       1469    198     ATCTCTTGTAATCTCTCTCATCTTTGCTGCATCCC     <<<2<<2<<<<<<<<<<<<0<&<<<+<:2<4<<):     MF:i:18 Aq:i:26 NM:i:2  UQ:i:20 H0:i:0  H1:i:0
+EAS221_3:6:70:843:706  99      chr1    1306    99      35M     =       1449    178     ATCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTGCTGCATCCC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<5<<5<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_32:7:174:597:66 83      chr1    1307    99      35M     =       1148    -194    TCTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTGCTGCATCCCT     9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS220_1:6:7:1547:1933 163     chr1    1308    99      35M     =       1497    224     CTCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTGCTGCATCCCTG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<8<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:4:30:117:411    163     chr1    1309    99      36M     =       1482    209     TCTTGTAATCTCTCTCCTTTTTGCTGCATCCCTGTC    <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<:<<<<<<<<<:    MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_95:6:53:156:845   99      chr1    1311    99      35M     =       1487    211     TTGTAATCTCTCTCCTTTTTGCTGCATCCCTGTCT     <<<<<<8<<<.<<<<.6<<--<-<<<<<<<6<<<<     MF:i:18 Aq:i:56 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:3:90:1403:1635       99      chr1    1311    99      35M     =       1480    204     TTGTAATCTCTCTCCTTTTTGCTGCATCCCTGTCT     <<;<;<<<<;<;<;;<<<<<9;<.;;<:;99.979     MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:7:67:302:762    147     chr1    1313    99      36M     =       1138    -211    GTAATCTCTCTCCTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCC    :8;88<;<<<;<<8<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_78:7:270:448:491 99      chr1    1313    99      35M     =       1501    223     GTAATCTCTCTCCTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<&<<.<<<<<<<:;;;<;     MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_71:6:82:932:400  99      chr1    1313    97      34M     =       1486    208     GTAATCTCTCTCCTCTTCGCTGCATCCCTGTCTT      <<<<<<8<1<<<<8+<<&<<<8<<<<<<<+(,/8      MF:i:18 Aq:i:25 NM:i:2  UQ:i:15 H0:i:0  H1:i:0
+EAS54_81:2:128:394:455 83      chr1    1313    99      35M     =       1156    -192    GTAATCTCTCTCCTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTC     ;=;9.=5=;=9====;;==================     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_595:3:57:735:151    147     chr1    1314    94      35M     =       1121    -228    TAAACTCTCACCTTATTGCTGCATCCCTGTCTTCC     07;+79:;<)<<9<+8<:<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:26 NM:i:3  UQ:i:28 H0:i:0  H1:i:0
+EAS114_28:6:51:506:878 163     chr1    1314    99      36M     =       1501    223     TAATCTCTCTCCTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCT    <<<<<<<<<<<<<<<<<4<<<<<<<<<<0<<<<<:;    MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:2:15:1497:1530       147     chr1    1314    99      35M     =       1136    -213    TAATCTCTCTCCTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCC     77778:;;;:;;;;:9;:;;;;;;;;;9;:;;;;;     MF:i:18 Aq:i:57 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS219_FC30151:3:9:1595:1826   99      chr1    1316    99      35M     =       1494    213     ATCTCTCTCCTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_597:3:73:273:488    163     chr1    1318    99      35M     =       1512    229     CTCTCTCCTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTG     <<<<<2<88<88<<<8<<1<<<<<<68<<<;<;<*     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_32:1:199:760:42 163     chr1    1318    24      35M     =       1489    206     CTCTCTAATTTTTGCTGCTTCCATGTCTTACTCTG     +2&2&2&22222220222&220-222-22-22-22     MF:i:130        Aq:i:24 NM:i:5  UQ:i:51 H0:i:0  H1:i:0
+EAS1_95:7:61:702:720   163     chr1    1320    99      35M     =       1500    215     CTCTCCTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTC     ==============;=======&=========3:=     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_39:2:41:576:1016        163     chr1    1320    99      35M     =       1503    218     CTCTCCTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTC     <<<<<<<<<<<<<<;<<<;<<<<<<<<<<<4<::<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_7:1:115:683:296 99      chr1    1320    99      35M     =       1514    229     CTCTCCTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTC     <<<<<<<<<<<8<<<<<<<<<<6<<<<3<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_3:8:63:1265:820 99      chr1    1320    99      35M     =       1480    195     CTCTCCTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTC     <<<<<<<<<<27<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<03<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:7:92:288:1354        163     chr1    1321    99      40M     =       1480    199     TCTCCTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATT        <<<<<<:<<<<<<<<<<<8<<:<<<<;;<8<<<8<:8+::        MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_7:1:316:949:122 147     chr1    1321    99      35M     =       1156    -200    TCTCCTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCT     59899<<<<;;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS218_1:4:37:1626:862 163     chr1    1321    99      35M     =       1489    203     TCTCCTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_99:5:147:479:41   83      chr1    1322    99      35M     =       1139    -218    CTCCTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTT     ;:;:;<::<:<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:3:73:936:1509        163     chr1    1322    99      40M     =       1502    220     CTCCTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTTATTT        <<<<<<<<<7<<7<<<<<<<;<<<<<<<<<:<:<;%8:::        MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:1  UQ:i:4  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_62:6:50:542:881  83      chr1    1324    99      35M     =       1132    -227    CCTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGA     +2<<<;<3;29<6<5;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:63 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS112_34:6:71:85:629  163     chr1    1324    99      35M     =       1484    195     CCTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGA     <<<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<5<9<<+6     MF:i:18 Aq:i:63 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_93:6:191:948:257  163     chr1    1325    99      35M     =       1493    203     CTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGAT     :<<<<<<<<9<:<<<<<<:<<<<;<<<<8<<<<7<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_95:1:249:986:224  99      chr1    1325    99      35M     =       1499    209     CTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGAT     =========5======7878===98==7=9==.-=     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS219_1:5:6:1067:91   163     chr1    1325    99      35M     =       1483    193     CTTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGAT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<:8<<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_591:4:216:650:516   147     chr1    1326    99      36M     =       1164    -198    TTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTT    ;9;<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_65:6:18:376:416  163     chr1    1326    99      35M     =       1510    219     TTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGTTT     <<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<;:(<<     MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:1  UQ:i:7  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_28:5:209:778:588        163     chr1    1326    99      36M     =       1514    224     TTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTT    <<<<<<<<;<<<<<<<<<;<<<;<8<8<<<<;7;;;    MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_1:4:36:1402:1709        83      chr1    1326    99      35M     =       1168    -193    TTTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATT     ;;;:<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_26:4:40:352:151 147     chr1    1327    99      35M     =       1137    -225    TTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTT     ;=;;5=:-=9=====;;==================     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_26:5:139:331:63 99      chr1    1327    99      35M     =       1486    194     TTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTT     ====================<<=============     MF:i:18 Aq:i:79 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS220_1:2:11:1274:1230        163     chr1    1327    99      35M     =       1507    215     TTTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7;;;;     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_63:5:36:678:316  99      chr1    1328    99      35M     =       1500    207     TTTGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTA     <<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<;<<<<,2<<<)     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_610:3:102:825:507   163     chr1    1330    99      35M     =       1501    206     TGCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<;;<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:5:171:343:758   99      chr1    1331    99      36M     =       1494    199     GCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTG    <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<59<<<9;<<3    MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_39:6:85:1224:625        99      chr1    1331    99      35M     =       1532    236     GCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTCCTT     <<<<<<<<<;<<;<<7<<:<<7.<<<:&7<<.<;<     MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:1  UQ:i:13 H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_7:5:308:354:124 99      chr1    1331    99      35M     =       1507    211     GCTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACTT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<;<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_53:7:22:22:934   163     chr1    1332    99      35M     =       1500    203     CTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTG     <<<<<<<<<<<6<<<;<<<;84;<<48;<;6;<;)     MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:4:71:707:568  163     chr1    1332    99      35M     =       1518    221     CTGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<;<;<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_595:7:123:610:472   99      chr1    1333    99      35M     =       1504    206     TGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTGT     <<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<+:<<<<<<<<;     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_93:1:20:635:509   83      chr1    1333    99      35M     =       1167    -201    TGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTGT     50<59<<9<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<6<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_93:1:92:213:217   99      chr1    1333    99      35M     =       1515    217     TGCATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTGT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<4<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_67:3:47:471:858  163     chr1    1335    99      35M     =       1487    187     CATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTGTTG     <<;<<<<<<<<9<<<4;;<<<<;<<<<<.<<4;<4     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_39:7:90:406:631 163     chr1    1335    99      35M     =       1525    225     CATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTGTTG     <<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<:;<<<<;<<8;<8     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS219_FC30151:3:81:1723:1820  99      chr1    1335    99      35M     =       1524    224     CATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTGTTG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<:     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_610:3:182:23:585    147     chr1    1336    99      35M     =       1163    -208    ATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTGTTGT     9:<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_63:8:150:508:757 163     chr1    1336    99      35M     =       1483    182     ATCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTGTTGT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<8<<,<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_95:1:261:504:780  163     chr1    1337    99      35M     =       1501    199     TCCCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTGTTGTT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<</2<<<9<<<5<<,<<     MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_71:6:324:515:230 163     chr1    1339    99      35M     =       1512    207     CCTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTGTTGTTGG     <<;<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<8<<<4<<4<<34     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_589:7:72:916:763    83      chr1    1340    99      35M     =       1142    -233    CTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTGTTGTTGGT     <;;:<<<<<<<;<<;;;<<<<<<<<<;;<;<<<<<     MF:i:18 Aq:i:63 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:3:194:168:684   99      chr1    1340    99      36M     =       1512    208     CTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTGTTGTTGGTT    <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<.<<6-<<    MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_78:7:113:43:634  163     chr1    1340    99      35M     =       1500    195     CTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTGTTGTTTTT     <<<<<<<<<<<<.<<<<<<<<<<<<</<<2;;%%;     MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:2  UQ:i:8  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_71:5:16:434:204  163     chr1    1340    99      35M     =       1522    216     CTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTGTTGTTGGT     =================;)===8===:==7;<+%;     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_81:7:246:205:734 73      chr1    1340    65      35M     =       1340    0       CTGTCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTGTTGTTGGT     <<<4<<6666<<6<:<<<3<<<:'<<:<<<<;6<+     MF:i:64 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_81:7:246:205:734 133     chr1    1340    0       *       =       1340    0       CTCCAGGGAAGTTATCTCTCATCTAGANNNNNTTG     <<<<<<:/<<<,6'</7;<-+9<<;<7!!!!!8<,     MF:i:192
+EAS54_65:3:102:884:63  163     chr1    1341    99      35M     =       1481    175     TGTCTTCCTCTGTCTTGATTTCCTTGTTGTTGGTT     <<<<<<<<<<<<<<<<<3<<<%<<<9<<9<<7+;<     MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1  UQ:i:4  H0:i:0  H1:i:1
+EAS51_64:3:67:782:132  99      chr1    1343    99      35M     =       1498    190     TCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTGTTGTTGGTTTT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<;4<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS219_FC30151:5:70:348:972    163     chr1    1343    99      35M     =       1528    220     TCTTCCTCTGTCTTGATTTACTTGTTGTTGGTTTT     <.<<3+.7<<7<<:78:<<7<:<7:<3<<7.:::<     MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS218_4:1:9:206:901   99      chr1    1344    99      35M     =       1517    208     CTTCCTCTGTCTTGATTTACTTGTTGTTGGTTTTC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<5<<5<<%%:<<<7     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_7:4:21:443:404  99      chr1    1345    99      35M     =       1529    219     TTCCTCTGTCTTGATTTACTTGTTGTTGGTTTTCT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<;<<;+<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:1:148:286:316 163     chr1    1347    99      35M     =       1531    219     CCTCTGTCTTGATTTACTTGTTGTTGGTTTTCTGT     <<<<<<<<+<<7<<<<<<<6<<<6<142<<<6<2<     MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:6:77:48:860   99      chr1    1348    99      35M     =       1521    208     CTCTGTCTTGATTTACTTGTTGTTTGTTTTCTGTT     =========;===========9==*;5=;=;=,7=     MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:1  UQ:i:9  H0:i:0  H1:i:1
+EAS51_64:6:124:128:489 147     chr1    1348    99      35M     =       1142    -241    CTCTGTCTTGATTTACTTGTTGTTGGTTTTCTGTT     ::55<<<8<<<6<<;<<<<<<<<7<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_64:6:213:54:878  137     chr1    1348    99      35M     *       0       0       CTCTGTCTTGATTTACTTGTTGTTGGTTTTTTGTT     <<<<<<<<<;<<<<<<<<:<<:<<++<<<<%<%<<     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:1  UQ:i:4  H0:i:1  H1:i:0
+EAS218_1:4:73:42:1038  163     chr1    1349    99      35M     =       1513    199     TCTGTCTTGATTTACTTGTTGTTGGTTTTCTGTTT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<.<<<<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_103:3:320:505:814 99      chr1    1350    99      35M     =       1515    200     CTGTCTTGATTTACTTGTTGTTGGTTTTCTTTTTC     <<<<<<<<<<<<<<<<;<<8<<76<<<<;<&<<<7     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:2:68:692:347    83      chr1    1351    99      36M     =       1176    -211    TGTCTTGATTTACTTGTTGTTGGTTTTCTGTTTCTT    9<;;;;<<<:<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:64 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_71:4:252:428:683 137     chr1    1351    99      35M     *       0       0       TGTCTTGATTTACTTGTTGTTGGTTTTCTGTTTCT     <<<<<<;<<<<<<<<7<<7<<&+<<<<:<&<<<4<     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_71:4:73:182:444  99      chr1    1354    99      34M     =       1533    214     CTTGATTTACTTGTTGTTGGTTTTCTGTTTCTTT      <<<<;;<<<<<<<<<<<<;<;<<<<<:<<<<<7<      MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS220_1:2:63:267:545  163     chr1    1354    99      35M     =       1524    205     CTTGATTTACTTGTTGTTGGTTTTCTGTTTCTTTG     <<<<<<<<<<<<:<<<<<::<<<<<<.<<<;;;;5     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_99:6:177:562:806  99      chr1    1356    99      35M     =       1515    194     TGATTTACTTGTTGTTGGTTTTCTGTTTCTTTTTT     <;<29<99<<;<<<9<20<9<<5;;<<<<<<<+.<     MF:i:18 Aq:i:35 NM:i:1  UQ:i:10 H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_62:7:157:784:936 83      chr1    1356    99      35M     =       1169    -222    TGATTTACTTGTTGTTGGTTTTCTGTTTCTTTGTT     <:<<<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_595:1:209:345:87    163     chr1    1360    99      35M     =       1513    188     TTACTTGTTGTTGGTTTTCTGTTTCTTTTTTTGAT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<-<<<6<<<+8<     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:1  UQ:i:21 H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:1:33:1407:94 83      chr1    1360    99      35M     =       1172    -223    TTACTTGTTGTTGGTTTTCTGTTTCTTTGTTTGAT     77477;4;;;;;44;;;;;;7;;;;;;;9;;;;;<     MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_589:8:2:434:715     163     chr1    1363    99      35M     =       1527    199     CTTGTTGTTGGTTTTCTGTTTCTTTGTTTGATTTT     <<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<0<<<68<<<+     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:1  UQ:i:10 H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_65:4:137:319:642 137     chr1    1363    99      35M     *       0       0       CTTGTTGTTGGTTTTCTGTTTCTTTTTTTGATTTT     <<<<<<<<<27<<<<<<<<<<<<<<&;<<&3;;<%     MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:2  UQ:i:9  H0:i:0  H1:i:1
+B7_610:3:148:340:479   147     chr1    1364    99      35M     =       1190    -209    TTGTTGTTGGTTTTCTGTTTCTTTGTTTGATTTGG     <<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_26:2:329:458:365        147     chr1    1364    99      35M     =       1186    -213    TTGTTGTTGGTTTTCTGTTTCTTTGTTTGATTTGG     ====:==9========>==7>==9>=7=>=>>=>>     MF:i:18 Aq:i:78 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_65:4:91:267:655  147     chr1    1365    99      35M     =       1204    -196    TGTTGTTGGTTTTCTGTTTCTTTGTTTGATTTGGT     ;,:;5:<6:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_1:2:91:856:504  99      chr1    1366    99      35M     =       1520    189     GTTGTTGGTTTTCTGTTTCTTTGTTTGATTTGGTT     <<<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<7<<<&;<<<&&<&     MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:2:170:326:433 99      chr1    1367    99      35M     =       1535    203     TTGTTGGTTTTCTGTTTCTTTGTTTGATTTGGTGG     =====<=9===:=<:==2=======2:===9==/5     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_93:6:132:717:233  99      chr1    1368    99      35M     =       1529    196     TGTTGGTTTTCTGTTTCTTTGTTTGATTTGGTGGA     <<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<7<<<<&-<4<1     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:1:14:420:712 99      chr1    1368    99      40M     =       1525    197     TGTTGGTTTTCTGTTTCTTTGTTTGATTTTTTTGAAGACA        <<<<<<<<<<<<;<<<<<<<;<<<-;<<<&,<&*8111:6        MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:3  UQ:i:21 H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_39:4:43:1047:1626       163     chr1    1369    99      35M     =       1523    189     GTTGGTTTTCTGTTTCTTTGTTTGATTTGGTGGAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<:<<<<:+;-4:(     MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:2:20:413:1334        147     chr1    1370    99      35M     =       1215    -190    TTGGTTTTCTGTTTCTTTGTTTGATTTGGTGGAAG     88878777;:;:1:;9;;;6;;;6;9;;;;;296;     MF:i:18 Aq:i:60 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_62:5:154:669:853 83      chr1    1371    99      35M     =       1193    -213    TGGTTTTCTGTTTCTTTGTTTGATTTGGTGGAAGA     <::<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_610:7:117:857:942   99      chr1    1372    99      35M     =       1527    190     GGTTTTCTGTTTCTTTGTTTGATTTGGTGGAAGAC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:6<;;7;9<;     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:6:145:144:796 147     chr1    1372    99      35M     =       1181    -226    GGTTTTCTGTTTCTTTGTTTGATTTGGTGGAAGAC     ;<<<;<<<<<<<<<;<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_32:6:88:162:587 147     chr1    1372    99      35M     =       1189    -218    GGTTTTCTGTTTCTTTGTTTGATTTGGTGGAAGAC     386;;388-<8;<;68<<;;<;<6<<<8<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:63 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_1:8:73:108:1621 99      chr1    1373    99      35M     =       1532    194     GTTTTCTGTTTCTTTGTTTGATTTGGTGGAAGACA     <<<<<<<<71<<<<<<<<<+<<<<70:0<9<<61<     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS112_34:6:127:153:861        147     chr1    1374    99      35M     =       1202    -207    TTTTCTGTTTCTTTGTTTGATTTGGTGGAAGACAT     :;:6;9<<1;<<95<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_7:2:152:765:744 163     chr1    1374    99      35M     =       1534    195     TTTTCTGTTTCTTTGTTTGATTTGGTGGAAGACAT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<&<7293<<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_73:3:313:827:992 147     chr1    1379    99      35M     =       1197    -217    TGTTTCTTTGTTTGATTTGGTGGAAGACATAATCC     '187:1'<75<.*<<:5<..<<*<<917<<7<<17     MF:i:18 Aq:i:57 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_64:3:7:268:263   121     chr1    1381    22      35M     =       1381    0       TTGCGTTATTTGAGTTGGTGGAAGACATAATCCCA     ',)*&2<$7+<<<'<-<7<<<<<<<7<<</4/;<<     MF:i:64 Aq:i:0  NM:i:4  UQ:i:22 H0:i:0  H1:i:0
+EAS51_64:3:7:268:263   181     chr1    1381    0       *       =       1381    0       TCGTACAGAAGTTTAATGGAGCCTTGGGACCTTAC     !!66'&+/&'8+2''1+'611'&6&+/&+.&+1'&     MF:i:192
+EAS139_19:1:47:352:1492        147     chr1    1385    99      40M     =       1205    -220    TTTGTTTTGTATGGTGGAAGACATAATCCCACGCTTCCTA        +7+/7+/%%1'6+3++1;:</<<5<)27<<9<)9<<9<7<        MF:i:18 Aq:i:53 NM:i:3  UQ:i:14 H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_11:5:61:38:1182 83      chr1    1388    99      35M     =       1205    -218    GTTTGATTTGGTGGAAGACATAATCCCACGCTTCC     9:;<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_61:7:64:37:257   83      chr1    1389    99      35M     =       1215    -209    TTTGATTTGGTGGAAGACATAATCCCACGCTTCCT     ;47<<47+9<4<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:7:266:556:252 147     chr1    1392    99      35M     =       1224    -203    GATTTGGTGGAAGACATAATCCCACGCTTCCTATG     .8558<72<(<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_93:4:321:271:138  147     chr1    1394    99      35M     =       1193    -236    TTTGGTGGAAGACATAATCCCACGCTTCCTATGGA     261:5969==9=:=<==<=================     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS218_1:2:19:752:816  147     chr1    1394    99      35M     =       1212    -217    TTTGGTGGAAGACATAATCCCACGCTTCCTATGGA     +<<+<--/<<<<4<2<<<<45<<<:<<<<<<+<<<     MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_26:4:306:388:342        83      chr1    1398    99      35M     =       1211    -222    GGGGAAGACATAATCCCACGCTTCCTATGGAAAGG     9/<9;<<<;<;<<7<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:1  UQ:i:14 H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_39:1:71:636:533 147     chr1    1398    99      35M     =       1232    -201    GTGGAAGACATAATCCCACGCTTCCTATGGAAAGG     ,51(<<8<:<<<<<<<;<;<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_62:5:131:779:345 83      chr1    1399    99      35M     =       1237    -197    TGGAAGACATAATCCCACGCTTCCTATGGAAAGGT     <<7<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<;<<     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_1:4:68:64:783   83      chr1    1402    99      35M     =       1214    -223    AAGACATAATCCCACGCTTCCTATGGAAAGGTTGT     <<9<8<6<<<<<;<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_95:1:16:823:343   147     chr1    1403    99      35M     =       1223    -215    AGACATAACCCCACGCTTCCTATGGAAAGGTTGTT     <<<:<<<;+;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:1  UQ:i:10 H0:i:0  H1:i:1
+EAS219_FC30151:5:72:1426:1883  147     chr1    1405    99      35M     =       1226    -214    ACATAATCCCACGCTTCCTATGGAAAGGTTGTTGG     ;9<;<;0<;<;<<<<;<<<;:<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_81:7:166:979:531 83      chr1    1410    99      35M     =       1245    -200    ATCCCACGCTTCCTATGGAAAGGTTGTTGGGAGAT     81<<<3<*<<:<<<<<<<8<<<<<<<<<<<<:<<<     MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_81:8:63:930:152  83      chr1    1410    99      35M     =       1243    -202    ATCCCACGCTTCCTATGGAAAGGTTGTTGGGAGAT     ;:4:8;:::;=:8;=;========;=:========     MF:i:18 Aq:i:59 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_610:3:137:895:681   147     chr1    1418    99      35M     =       1232    -221    CTTCCTATGGAAAGGTTGTTGGGAGATTTTTAATG     4;5+6;<<<<<<<<<9;<4<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:7:87:89:696     147     chr1    1419    99      36M     =       1245    -210    TTCCTATGGAAAGGTTGTTGGGAGATTTTTAATGAT    ;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:2:104:744:280   147     chr1    1421    64      36M     =       1262    -195    CATATGGAAAGGTTGTTGGGATTTTTTTAATGATTC    '&+74*0<'/.47:8<<<<;<7''6/1<<<.<<68<    MF:i:18 Aq:i:21 NM:i:3  UQ:i:33 H0:i:0  H1:i:0
+EAS56_57:2:259:42:969  83      chr1    1426    99      35M     =       1265    -196    GGAAAGGTTGTTGGGAGATTTTTAATGATTCCTCA     <<<6<<<<<<-<<<<<<;<<;<6<<<<<<<;<<<<     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS218_1:2:18:1498:1475        83      chr1    1427    99      35M     =       1260    -202    GAAAGGTTGTTGGGAGATTTTTAATGATTCCTCAA     :<4<*7<<<<<<<:<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:1:328:614:638 147     chr1    1428    99      35M     =       1243    -220    AAAGGTTGTTGGGAGATTTTTAATGATTCCTCAAT     <<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_81:8:159:71:155  147     chr1    1428    99      35M     =       1237    -226    AAAGGTTGTTGGGAGATTTTTAATGATTCCTCGAT     5;;9<<:<;:<<<<7<<7;<3<<<:<<<;<<<<<;     MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+EAS114_39:1:73:302:1574        147     chr1    1429    99      35M     =       1233    -231    AAGGTTGTTGGGAGATTTTTAATGATTCCTCAATG     7<88;;<;;<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<1<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_7:3:200:712:439 83      chr1    1435    99      35M     =       1286    -184    GTTGGGAGATTTTTAATGATTCCTCAATGTTAAAA     <;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<7     MF:i:18 Aq:i:29 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_7:4:259:869:641 147     chr1    1435    99      35M     =       1272    -198    GTTGGGAGATTTTTAATGATTCCTCAATGTTAAAA     99=:=9=99<=========<=<<============     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS112_34:4:74:570:695 83      chr1    1436    99      35M     =       1240    -231    TTGGGAGATTTTTAATGATTCCTCAATGTTAAAAT     .;:8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_1:8:58:369:244  83      chr1    1436    99      35M     =       1266    -205    TTGGGAGATTTTTAATGATTCCTCAATGTTAAAAT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS192_3:6:216:292:528 147     chr1    1438    99      35M     =       1269    -204    GGGAGATTTTTAATGATTCCTCAATGTTAAAATGT     ;:;;8<<<<<<<<<<<<<:<<;<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS192_3:6:185:868:496 83      chr1    1442    99      35M     =       1278    -199    GATTTTTAATGATTCCTCAATGTTAAAATGTCTAT     :;;<;;<<<<<<<<;4<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:1:277:194:143 147     chr1    1444    99      35M     =       1262    -217    TTTTTAATGATTCCTCAATGTTAAAATGTCTATTT     ;<<;<<<;8;<0<7<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:5:267:71:603    147     chr1    1446    99      36M     =       1281    -201    TTTAATGATTCCTCAATGTTAAAATGTCTATTTTTG    9;;<;<<<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<    MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_65:8:218:173:667 147     chr1    1448    99      35M     =       1298    -185    TAATGATTCCTCAATGTTAAAATGTCTATTTTTGT     <<<<<<;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_3:6:70:843:706  147     chr1    1449    99      35M     =       1306    -178    AATGATTCCTCAATGTTAAAATGTCTATTTTTGTC     <<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_595:6:47:720:789    147     chr1    1455    90      35M     =       1278    -212    TCCTCAATGTTAAAATGTCTATTTTTGTCTTGACA     /)040<.878<<<<;8<;<9<9;<<<<<<<<<<93     MF:i:18 Aq:i:25 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_66:3:102:511:946 147     chr1    1461    26      35M     =       1291    -205    ATGTAAAAGTGACTGTTATTGTCTTGACACCCAAC     <%-4:6<:/&46;/*;<*84<0<'<&*<2<<<<<<     MF:i:130        Aq:i:26 NM:i:5  UQ:i:78 H0:i:0  H1:i:0
+EAS112_34:8:103:812:255        147     chr1    1461    99      35M     =       1272    -224    ATGTTAAAATGTCTATTTTTGTCTTGACACCCAAC     7:777:7<<::7<7<7<<:7<7<:<<<<<<<<<7<     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_32:6:179:735:569        83      chr1    1461    99      35M     =       1286    -210    ATGTTAAAATGTCTATTTTTGTCTTGACACCCAAC     <5<3:<<<<5;8<<<55;<:</:<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS220_1:2:52:1779:1664        147     chr1    1462    99      35M     =       1297    -200    TGTTAAAATGTCTATTTTTGTCTTGACACCCAACT     6;;:;<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_71:5:153:543:671 147     chr1    1465    99      35M     =       1301    -199    TAAAATGTCTATTTTTGTCTTGACACCCAACTAAT     ;;;;;=;==================;=========     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_1:6:38:1071:155 147     chr1    1465    99      35M     =       1274    -226    TAAAATGTCTATTTTTGTCTTGACACCCAACTAAT     <<62<<<<<<3<<<<</<<<<<<<%<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_3:2:67:1864:477 83      chr1    1465    99      35M     =       1270    -230    TAAAATGTCTATTTTTGTCTTGACACCCAACTAAT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:7:14:1256:204        147     chr1    1467    99      35M     =       1288    -214    AAATGTCTATTTTTGTCTTGACACCCAACTAATAT     66777:;;37;;:;;0;:;;;;):;;:7;;;;;;;     MF:i:18 Aq:i:64 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:2:316:176:543 147     chr1    1469    99      35M     =       1305    -199    ATGTCTATTTTTGTCTTGACACCCAACTAATATTT     <<)/3<<<&<*<<0<<8<<82</5<<<<<88<<<<     MF:i:18 Aq:i:62 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_66:8:36:688:722  147     chr1    1469    99      35M     =       1295    -209    ATGTCTATTTTTGTCTTGACACCCAACTAATATTT     <;;<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS219_1:3:11:706:1030 147     chr1    1469    92      35M     =       1306    -198    ATGTCTATTTTTGTCTTGACACCCAACTAATATTT     +<5069+9<<<<+<;<<<<;<<77<7<<;<<;<<<     MF:i:18 Aq:i:26 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_591:5:289:132:526   147     chr1    1472    99      36M     =       1289    -219    TCTATTTTTGTCTTGACACCCAACTAATATTTGTCT    ;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_589:5:50:950:562    147     chr1    1473    99      35M     =       1301    -207    CTATTTTTGTCTTGACACCCTACTAATATTTGTCT     <<3<<<8<;<<<<<<+<<8<&<<<<7<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:0  H1:i:1
+EAS188_4:5:8:377:655   147     chr1    1473    99      35M     =       1299    -209    CTATTTTTGTCTTGACACCCAACTAATATTTGTCT     ;<8;;:<;<<:<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_28:4:322:631:245        83      chr1    1474    99      36M     =       1297    -213    TATTTTTGTCTTGACACCCAACTAATATTTGTCTGA    <<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:2:33:1193:664        83      chr1    1474    99      40M     =       1301    -213    TATTTTTGTCTTGACACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAA        ;;;;;;<;;-9<<<:</+9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<        MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_93:1:253:59:242   147     chr1    1478    99      35M     =       1302    -211    TTTGTCTTGACACCCAACTAATATTTGTCTGAGCA     <<<:<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_39:5:42:1223:1087       147     chr1    1479    99      35M     =       1293    -221    TTGTCTTGACACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAA     ;:<<<:<7<<<;;<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:3:90:1403:1635       147     chr1    1480    99      35M     =       1311    -204    TGTCTTGACACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAAA     86878;;;8;788;;;;;;;;;;;;;8;5;;;;;;     MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:7:92:288:1354        83      chr1    1480    99      40M     =       1321    -199    TGTCTTGACACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAAAACAGT        ::::;;;<<<<9;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<        MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_3:8:63:1265:820 147     chr1    1480    99      35M     =       1320    -195    TGTCTTGACACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAAA     <<<<<<3<<1<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<+<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_65:3:102:884:63  83      chr1    1481    99      35M     =       1341    -175    GTCTTGACACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAAAA     <;7;;<<8<;8;<<<8<<<<<<8<<<8;<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS219_1:7:50:1339:1154        83      chr1    1481    99      35M     =       1305    -211    GTCTTGACACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAAAA     7;7;8;<5<:86<<;<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:4:30:117:411    83      chr1    1482    99      36M     =       1309    -209    TCTTGACACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAAAACA    ;88<<<<<:<7<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_63:8:150:508:757 83      chr1    1483    99      35M     =       1336    -182    CTTGACACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAAAACA     6;;;<8<6;8<<8<<<<<;<<<<;<<<<;<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS219_1:5:6:1067:91   83      chr1    1483    99      35M     =       1325    -193    CTTGACACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAAAACA     3<;<<:;9;<<7;;<;<<<;<<<;<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS112_34:6:71:85:629  83      chr1    1484    99      35M     =       1324    -195    TTGACACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAAAACAG     ,,1<1<7&%<9+:<<9<<9<<<<<<<<5<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:63 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_103:5:319:165:698 147     chr1    1485    99      35M     =       1287    -233    TGACACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAAAACAGT     ;5;2;<:;<<:<<<<<<<<<;:;<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_7:8:60:182:718  83      chr1    1485    99      35M     =       1295    -225    TGACACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAAAACAGT     <<<:<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_71:6:82:932:400  147     chr1    1486    97      35M     =       1313    -208    GACACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAAAACAGTC     <<;<<72<<7<<<<<<<<<<;<<<+7<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:25 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_73:3:23:502:103  83      chr1    1486    99      35M     =       1294    -227    GACACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAAAACAGTC     4:386:6<:::<:<:4:+<::4<<<6<<<<<<<66     MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_26:5:139:331:63 147     chr1    1486    99      35M     =       1327    -194    GACACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAAAACAGTC     7===================:=:============     MF:i:18 Aq:i:79 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_95:6:53:156:845   147     chr1    1487    99      35M     =       1311    -211    ACACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAAAACAGTCT     171(*00,0;;&;7=77=;5;;(;1:=5=======     MF:i:18 Aq:i:56 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_67:3:47:471:858  83      chr1    1487    99      35M     =       1335    -187    ACACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAAAACAGTCT     /;9<<63<<<<3<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_97:2:9:203:653    83      chr1    1488    99      35M     =       1296    -227    CACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAAAACAGTCTA     37))&<8<<<<<7<4<;<777<<:<<<<<<<<;<<     MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_32:1:199:760:42 83      chr1    1489    24      35M     =       1318    -206    ACCCAATTAATATTTTTCTTAGCAAAACAGTCTAG     58*5.<+<<<<,4<<**<90**9<<<<<<4<<<<<     MF:i:18 Aq:i:24 NM:i:3  UQ:i:34 H0:i:0  H1:i:0
+EAS218_1:4:37:1626:862 83      chr1    1489    99      35M     =       1321    -203    ACCCAACTAATATTTGTCTGAGCAAAACAGTCTAG     :663<<3<<<<<<<<<<:<<<<7<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_93:6:191:948:257  83      chr1    1493    99      35M     =       1325    -203    AACTAATATTTGTCTGAGCAAAACAGTCTAGATGA     :;;;;<<<<<<5<5<<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:5:171:343:758   147     chr1    1494    99      36M     =       1331    -199    ACTAATATTTGTCTGAGCAAAACAGTCTAGATGAGA    :+;;<<<<<;<;:<<<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS219_FC30151:3:9:1595:1826   147     chr1    1494    99      35M     =       1316    -213    ACTAATATTTGTCTGAGCAAAACAGTCTAGATGAG     ;76;;6:9<9<963;<<7<<<<<<<;<;<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS220_1:6:7:1547:1933 83      chr1    1497    99      35M     =       1308    -224    AATATTTGACTGAGCAAAACAGTCTAGATGAGAGA     <<<<<<<<-<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1  UQ:i:12 H0:i:0  H1:i:1
+EAS51_64:3:67:782:132  147     chr1    1498    99      35M     =       1343    -190    ATATTTGTCTGAGCAAAACAGTCTAGATGAGAGAG     ;;<;;;<<;;<<<;<<<;<<<;<<<<<<<<<<<<;     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_95:1:249:986:224  147     chr1    1499    99      35M     =       1325    -209    TATTTGTCTGAGCAAAACAGTCTAGATGAGAGAGA     <<<3<;<;;<<;8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_95:7:61:702:720   83      chr1    1500    99      35M     =       1320    -215    ATTTGTCTGAGCAAAACAGTCTAGATGAGAGAGAA     <<<4<4+0;<<:<<<<<<<<-<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_78:7:113:43:634  83      chr1    1500    99      35M     =       1340    -195    ATTTGTCTGAGAAAAACAGTCTAGATGAGAGAGAA     ;9;1;<5:<<<%<<<<;<<<;<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:1  UQ:i:4  H0:i:0  H1:i:1
+EAS56_53:7:22:22:934   83      chr1    1500    99      35M     =       1332    -203    ATTTGTCTGAGCAAAACAGTCTAGATGAGAGAGAA     <+72::72<<60<<<<<<<96<<<<0<<<<1<<<<     MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_63:5:36:678:316  147     chr1    1500    99      35M     =       1328    -207    ATTTGTCTGAGCAAAACAGTCTAGATGAGAGAGAA     <<72.2,;;<)6<<<<:<<;;<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_610:3:102:825:507   83      chr1    1501    99      35M     =       1330    -206    TTTGTCTGAGCAAAACAGTCTAGATGAGAGAGAAC     <05<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_95:1:261:504:780  83      chr1    1501    99      35M     =       1337    -199    TTTGTCTGAGAAAAACAGTCTAGATGAGAGAGAAC     80;8(;0==8+====;==49===============     MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1  UQ:i:10 H0:i:0  H1:i:1
+EAS51_78:7:270:448:491 147     chr1    1501    99      35M     =       1313    -223    TTTGTCTGAGCAAAACAGTCTAGATGAGAGAGAAC     7;;;;+2;<<+<<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_28:6:51:506:878 83      chr1    1501    99      36M     =       1314    -223    TTTGTCTGAGCAAAACAGTCTAGATGAGAGAGAACT    <970;49;<;+<<<:<<<;;<<<<<<<<<<<<<<<;    MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:3:73:936:1509        83      chr1    1502    99      40M     =       1322    -220    TTGTCTGAGCAAAACAGTCTAGATGAGAGAGAACTTCCCT        99;66:<<;-<<<<:<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<        MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_39:2:41:576:1016        83      chr1    1503    99      35M     =       1320    -218    TGTCTGAGCAAAACAGTCTAGATGAGAGAGAACTT     :<;<<<<<6<<<<;<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_595:7:123:610:472   147     chr1    1504    99      35M     =       1333    -206    GTCTGAGCAAAACAGTCTAGATGAGAGAGAACTTC     :<::+<<9<<9<<<<=<<<<<=<<<<<<<<?<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_7:5:308:354:124 147     chr1    1507    99      35M     =       1331    -211    TGAGCAAAACAGTCTAGATGAGAGAGAACTTCCCT     %+<)2<<<<<<<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS220_1:2:11:1274:1230        83      chr1    1507    99      35M     =       1327    -215    TGAGCAAAACAGTCTAGATGAGAGAGAACTTCCCT     .<<<<<<<<<<<<<<<<5<<<<<<<<<<5<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_62:3:169:292:652 147     chr1    1510    99      35M     =       1306    -239    GCAAAACAGTCTAGATGAGAGAGAACTTCCCTGGA     79919-<-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<6<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_65:6:18:376:416  83      chr1    1510    99      35M     =       1326    -219    GCAAAACAGTCTAGATGAGAGAGAACTTCCCTGGA     70<<<<<<<7<7<<<2<<<<<<<<<<8<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:3:194:168:684   147     chr1    1512    99      36M     =       1340    -208    AAAACAGTCTAGATGAGAGAGAACTTCCCTGGAGGT    ;<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_597:3:73:273:488    83      chr1    1512    99      35M     =       1318    -229    AAAACAGTCTAGATGAGAGAGAACTTCCCTGGAGG     </<<:<<9;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_71:6:324:515:230 83      chr1    1512    99      34M     =       1339    -207    AAAACAGTCTAGATGAGAGAGAACTTCCCTGGAG      7<<1<<<7<+<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<      MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_595:1:209:345:87    83      chr1    1513    99      35M     =       1360    -188    AAACAGTCTAGATGAGAGAGAACTTCCCTGGAGGT     <<;<<<<5<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS218_1:4:73:42:1038  83      chr1    1513    99      35M     =       1349    -199    AAACAGTCTAGATGAGAGAGAACTTCCCTGGAGGT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_28:5:209:778:588        83      chr1    1514    99      36M     =       1326    -224    AACAGTCTAGATGAGAGAGAACTTCCCTGGAGGTCT    ;8;98;;;<3<<<<<<<<<;<<;<<<<<;<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_7:1:115:683:296 147     chr1    1514    99      35M     =       1320    -229    AACAGTCTAGATGAGAGAGAACTTCCCTGGAGGTC     <<<<;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_93:1:92:213:217   147     chr1    1515    99      35M     =       1333    -217    ACAGTCTAGATGAGAGAGAACTTCCCTGGAGGTCT     <<<<<:<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_99:6:177:562:806  147     chr1    1515    99      35M     =       1356    -194    ACAGTGTAGATGAGAGAGACCTTCCCTGGAGGTCT     )2<9;'/:<5<<<:<<:<:&5:&<8,<<+:<&<<<     MF:i:18 Aq:i:35 NM:i:2  UQ:i:11 H0:i:0  H1:i:1
+EAS1_103:3:320:505:814 147     chr1    1515    99      35M     =       1350    -200    ACAGTCTAGATGAGAGAGAACTTCCCTGGAGGTCT     <2<;;5<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS218_4:1:9:206:901   147     chr1    1517    99      35M     =       1344    -208    AGTCTAGATGAGAGAGAACTTCCCTGGAGGTCTGA     <<<<<<<<<<<<<.<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:4:71:707:568  83      chr1    1518    99      35M     =       1332    -221    GTCTAGATGAGAGAGAACTTCCCTGGAGGTCTGAT     ;9;<;<<<<<;<<<<<;<<<:<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_1:2:91:856:504  147     chr1    1520    99      35M     =       1366    -189    CTAGATGAGAGAGAACTTCCCTGGAGGTCTGATGG     :::<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<:<<<<<     MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:6:77:48:860   147     chr1    1521    99      35M     =       1348    -208    TAGATGAGAGAGAACTTCCCTGGAGGTCTGATGGC     ;8;8;<9<9<<<<<<<<<4<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_71:5:16:434:204  83      chr1    1522    99      34M     =       1340    -216    AGATGAGAGAGAACTTCCCTGGAGGTCTGATGGC      <:7:<<<<<<<<<<<9<<<+<<<<<<<<<<<<<<      MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_39:4:43:1047:1626       83      chr1    1523    99      35M     =       1369    -189    GATGAGAGAGAACTTCCCTGGAGGTCTGATGGCGT     <<4<<<<<<<<<<<:<<<;<<<<<:<7<<;<<<<<     MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS219_FC30151:3:81:1723:1820  147     chr1    1524    99      35M     =       1335    -224    ATGAGAGAGAACTTCCCTGGAGGTCTGATGGCGTT     ;6;;;<<<<<<<<<<<2<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS220_1:2:63:267:545  83      chr1    1524    99      35M     =       1354    -205    ATGAGAGAGAACTTCCCTGGAGGTCTGATGGCGTT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_39:7:90:406:631 83      chr1    1525    99      35M     =       1335    -225    TGAGAGAGAACTTCCCTGGAGGTCTGATGGCGTTT     <<<:<:<<<-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:1:14:420:712 147     chr1    1525    99      40M     =       1368    -197    TGAGAGAGAACTTCCCTGGAGGTCTGATGGCGTTTCTCCC        1::::<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<        MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_589:8:2:434:715     83      chr1    1527    99      35M     =       1363    -199    AGAGAGAACTTCCCTGGAGGTCTGATGGCGTTTCT     <<<<<<<<<:;<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_610:7:117:857:942   147     chr1    1527    99      35M     =       1372    -190    AGAGAGAACTTCCCTGGAGGTCTGATGGCGTTTCT     <<;<<<<<<<9<<<8<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS219_FC30151:5:70:348:972    83      chr1    1528    99      35M     =       1343    -220    GAGAGAACTTCCCTGGAGGTCTGATGGCGTTTCTC     <99<-7<<7<<<87<<<)<<<<<<8<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_93:6:132:717:233  147     chr1    1529    99      35M     =       1368    -196    AGAGAACTTCCCTGGAGGTCTGATGGAGTTTCTCC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+EAS188_7:4:21:443:404  147     chr1    1529    99      35M     =       1345    -219    AGAGAACTTCCCTGGAGGTCTGATGGCGTTTCTCC     =9=9=9==:==========================     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:1:148:286:316 83      chr1    1531    99      35M     =       1347    -219    AGAACTTCCCTGGAGGTCTGATGGCGTTTCTCCCT     ;::::;9/:<9<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_39:6:85:1224:625        147     chr1    1532    99      35M     =       1331    -236    GAACTCCCCTGGAGGTCTGATGGCGTTTCTCCCTC     17;;7&-;<;<;:<6<<:;<<<<<<<;<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_1:8:73:108:1621 147     chr1    1532    99      35M     =       1373    -194    GAACTTCCCTGGAGGTCTGATGGCGTTTCTCCCTC     <<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_71:4:73:182:444  147     chr1    1533    99      35M     =       1354    -214    AACTTCCCTGGAGGTCTGATGGCGTTTCTCCCTCG     :1<4;;::<<;<<<<;<<<<<<<<<<<;<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_7:2:152:765:744 83      chr1    1534    99      35M     =       1374    -195    ACTTCCCTGGAGGTCTGATGGCGTTTCTCCCTCGT     6<;6<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:2:170:326:433 147     chr1    1535    99      35M     =       1367    -203    CTTCCCTGGAGGTCTGATGGCGTTTCTCCCTCGTC     :44<<<<<<<<<<:6<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_591:8:4:841:340     73      chr2    1       99      36M     *       0       0       TTCAAATGAACTTCTGTAATTGAAAAATTCATTTAA    <<<<<<<<;<<<<<<<<;<<<<<;<;:<<<<<<<;;    MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_67:4:142:943:582 73      chr2    1       99      35M     *       0       0       TTCAAATGAACTTCTGTAATTGAAAAATTCATTTA     <<<<<<;<<<<<<:<<;<<<<;<<<;<<<:;<<<5     MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_67:6:43:859:229  153     chr2    1       66      35M     *       0       0       TTCAAATGAACTTCTGTAATTGAAAAATTCATTTA     +37<=<.;<<7.;77<5<<0<<<;<<<27<<<<<<     MF:i:32 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_93:2:286:923:549  73      chr2    2       99      35M     *       0       0       TCAAATGAACTTCTGTAATTGAAAAATTCATTTAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_99:8:117:578:853  73      chr2    5       99      35M     *       0       0       AATGAACTTCTGTAATTGAAAAATTCATTTAAGAA     <;<9<<<<<;<<;<<<<<<<<<<<,<98;<;;&92     MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_105:7:289:472:86  137     chr2    6       99      35M     *       0       0       ATGAACTTCTGTAATTGAAAAATTCATTTAAGAAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;;;     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_4:5:302:997:951 73      chr2    6       69      35M     *       0       0       ATGAACTTCTGTAATTGAAAAATTCATTTAAGAAA     <<<<<<<<<<;<<:<<52<<:;;<6<<;<:<2:9/     MF:i:64 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS218_1:8:13:1729:1844        73      chr2    6       99      35M     *       0       0       ATGAACTTCTGTAATTGAAAAATTCATTTAAGAAA     <<<;;<;7<<<<4<<<<762;6<<<<<<<;6;618     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:2:43:239:977    137     chr2    7       99      36M     *       0       0       TGAACTTCTGTAATTGAAAAATTCATTTAAGAAATT    <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7;7;<;    MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_66:3:233:191:520 73      chr2    7       99      35M     *       0       0       TGAACTTCTGTAATTGAAAAATTCATTTAAGAAAT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<2<8<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS218_1:4:75:555:1591 137     chr2    7       99      35M     *       0       0       TGAACTTCTGTAATTGAAAAATTCATTTAAGAAAT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<6<<<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS220_1:2:43:656:1866 137     chr2    7       99      35M     *       0       0       TGAACTTCTGTAATTGAAAAATTCATTTAAGAAAT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7;;:;     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_597:2:100:563:301   137     chr2    8       99      35M     *       0       0       GAACTTCTGTAATTGAAAAATTCATTTAAGAAATT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:;8;;;     MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_59:1:126:526:276 137     chr2    8       84      35M     *       0       0       GAACTTCTGTAATTGAAAAATTCATTTAAGAAATT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_30:3:161:366:544        137     chr2    11      99      35M     *       0       0       CTTCTGTAATTGAAAAATTCATTTAAGAAATTACA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_65:3:326:652:890 73      chr2    12      99      35M     *       0       0       TTCTGTAATTGAAAAATTCATTTAAGAAATTACAA     <<<<<<<<<<2<<<<<<<<<<<<<<+<8:<<9998     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_7:4:238:441:727 73      chr2    16      99      35M     *       0       0       GTAATTGAAAAATTCATTTAAGAAATTACAAAATA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<<<;;<<     MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_65:8:64:507:478  137     chr2    17      99      35M     *       0       0       TAATTGAAAAATTCATTTAAGAAATTACAAAATAT     <<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<;;;<<<;<<8;<;<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:8:118:440:850 137     chr2    18      99      35M     *       0       0       AATTGAAAAATTCATTTAAGAAATTACAAAATATA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<949<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_93:7:270:995:918  137     chr2    24      84      35M     *       0       0       AAAATTCATTTAAGAAATTACAAAATATAGTTGAA     <<<<<<<<<<<<<:<<<<<<8<8<8<<<<:<;4;4     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_65:8:305:819:245 73      chr2    25      98      35M     *       0       0       AAATTCATTTAAGAAATTACAAAATATAGTTGAAA     8<<<<8<;<<<<<;<8<<8<8<<<<8<<<899<<+     MF:i:18 Aq:i:27 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:1
+EAS114_26:7:13:172:720 73      chr2    26      99      35M     *       0       0       AATTCATTTAAGAAATTACAAAATATAGTTGAAAG     ============:3<==:====<=9=3===;==83     MF:i:18 Aq:i:28 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:1
+EAS56_63:7:34:334:825  73      chr2    30      99      35M     *       0       0       CATTTAAGAAATTACAAAATATAGTTGAAAGCTCT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<3;<<<<6<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:3:32:1379:738        137     chr2    33      99      35M     *       0       0       TTAAGAAATTACAAAATATAGTTGAAAGCTCTAAC     ;;;;;;;8;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;88888     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:1
+EAS139_19:5:70:318:1631        137     chr2    34      99      40M     *       0       0       TAAGAAATTACAAAATATAGTTGAAAGCTCTAACAATAGA        <<<<<<;<<<<<<<<<<<<;9:<<<<<<<<<<<<<:::78        MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_103:5:285:241:560 163     chr2    37      99      35M     =       200     198     GAAATTACAAAATATAGTTGAAAGCTCTAACAATA     <<<<<<<<<<;<<<<;<<<<<<<<<<<<;<;;;<.     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_28:1:168:389:889        99      chr2    37      99      36M     =       205     204     GAAATTACAAAATATAGTTGAAAGCTCTAACAATAG    <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<;9;;<<<<    MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_71:4:127:725:381 163     chr2    39      99      35M     =       209     204     AATTACAAAATATAGTTGAAAGCTCTAACAATAGA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<;;;;;<<8:     MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:1
+EAS1_93:5:66:372:343   163     chr2    40      99      35M     =       228     223     ATTACAAAATATAGTTGAAAGATCTAACAATAGAC     <<<<<<<<<<8<<<<<6<<<8&8<<<<<58<:<::     MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:0  H1:i:1
+EAS56_65:6:67:800:450  99      chr2    41      99      35M     =       221     215     TTACAAAATATAGTTGAAAGCTCTAACAATAGACT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<5<<<     MF:i:18 Aq:i:49 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS219_FC30151:3:90:1906:1528  163     chr2    41      99      35M     =       222     216     TTACAAAATATAGTTGAAAGCTCTAACAATAGACT     <<<<<<<<<<<<<<<:<<<:<<<<;<<<<<;:7:;     MF:i:18 Aq:i:49 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_26:3:117:284:589        163     chr2    43      99      35M     =       210     202     ACAAAATATAGTTGAAAGCTCTAACAATAGACTAA     ==================================0     MF:i:18 Aq:i:56 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS218_1:2:26:211:481  99      chr2    43      99      35M     =       222     214     ACAAAATATAGTTGAAAGCTCTAACAATAGACTAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<<<:<7<<<     MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS218_4:7:85:923:726  99      chr2    43      99      35M     =       199     191     ACAAAATATAGTTGAAAGCTCTAACAATAGACTAA     <<<<<<<7<<<<<<<<<<<55<<<9<*<<<991<4     MF:i:18 Aq:i:44 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_67:6:107:395:312 163     chr2    44      99      35M     =       224     215     CAAAATATAGTTGAAAGCTCTAACAATAGACTAAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;;<:<<<<     MF:i:18 Aq:i:27 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:1
+B7_597:7:5:753:806     163     chr2    45      99      35M     =       197     187     AAAATATAGTTGAAAGCTCTAACAATAGACTAAAC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7:-<;;3;;     MF:i:18 Aq:i:27 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:1
+EAS1_103:3:277:921:474 163     chr2    45      99      35M     =       241     231     AAAATATAGTTGAAAGCTCTAACAATAGACTAAAC     <<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<5<<;;;;;     MF:i:18 Aq:i:27 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:1
+EAS56_63:4:38:28:122   163     chr2    46      99      35M     =       227     216     AAATATAGTTGAAAGCTCTAACAATAGACTAAACC     <<<<<<;<<<<<<<;<<<<6<<<<<<:<<<<;;<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:1
+EAS221_3:8:50:1203:1094        163     chr2    46      99      35M     =       223     212     AAATATAGTTGAAAGCTCTAACAATAGACTAAACC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:1
+B7_591:2:223:583:968   99      chr2    47      88      36M     =       215     204     AATATAGTTGAAAGCTCTAACAATAGACTAAACCAA    <<<<<<<29<<<<4<<<<<<<<<<<7<<7<..<<47    MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:1
+EAS114_39:1:28:350:895 163     chr2    48      95      35M     =       215     202     ATATAGTTGAAAGCTCTAACAATAGACTAAACCAA     <<<<<<<<;<;<<<<<<<<<;;<<;<<<<<;;<;8     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:1
+EAS114_45:7:69:1130:832        99      chr2    50      94      35M     =       231     216     ATAGTTGAAAGCTCTAACAATAGACTAAACCAAGC     ;;2<;<;;<;9;<;;;;;;;7;8;;7;;;;77437     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:1
+EAS188_7:3:296:224:724 163     chr2    50      99      35M     =       234     219     ATAGTTGAAAGCTCTAACAATAGACTAAACCAAGC     <<<<;<<<<<<7;<<<<<6<<<06<<<<<<2(<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:1
+B7_595:4:319:250:718   163     chr2    52      99      35M     =       240     223     AGTTGAAAGCTCTAACAATAGACTAAACCAAGCAG     <<<<<<<<<<<;<<5<5;<851;85;)9;;8594;     MF:i:18 Aq:i:53 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:1
+EAS54_73:3:203:419:243 163     chr2    54      99      35M     =       237     218     TTGAAAGCTCTAACAATAGACTAAACCAAGCAGAA     <<<<<<<<<<<<<<<9<;<8<<<;<<<;<<<4<77     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:6:21:1601:1666       163     chr2    56      99      40M     =       228     212     GAAAGCTCTAACAATAGACTAAACCAAGCAGAAGAAAGAG        7<<<<<<<<:<<7<<<:<<<<<<4<<44<<914<;:5:::        MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_610:7:158:943:467   163     chr2    57      99      35M     =       225     203     AAAGCTCTAACAATAGACTAAACCAAGCAGAAGAA     <<<<<;<<<<<<<<<<<<<<;;<<<<<<<<<;8<<     MF:i:18 Aq:i:46 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS220_1:2:54:91:1232  99      chr2    57      99      35M     =       246     224     AAAGCTCTAACAATAGACTAAACCAAGCAGAAGAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_73:3:29:833:612  163     chr2    58      99      35M     =       224     201     AAGCTCTAACAATAGACTAAACCAAGCAGAAGAAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;;<<;;     MF:i:18 Aq:i:27 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:1
+EAS56_57:1:189:503:110 163     chr2    63      79      35M     =       229     201     CTAACAATAGACTAAACCAAGCAGAAGAAAGAGTT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:1  UQ:i:25 H0:i:2  H1:i:0
+EAS114_28:2:114:938:216        99      chr2    63      99      36M     =       218     191     CTAACAATAGACTAAACCAAGCAGAAGAAAGAGGTT    <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<4;    MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:2  H1:i:0
+EAS1_95:5:257:654:116  99      chr2    64      99      35M     =       231     202     TAACAATAGACTAAACCAAGCAGAAGAAAGAGGTT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;:<<<<<<<<<88     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:2  H1:i:0
+EAS1_97:3:277:144:848  163     chr2    64      99      35M     =       228     199     TAACAATAGACTAAACCAAGCAGAAGAAAGAGGTT     <<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<3<<9;;6;     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:2  H1:i:0
+EAS1_108:4:75:166:463  99      chr2    64      99      35M     =       250     221     TAACAATAGACTAAACCAAGCAGAAGAAAGAGGTT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<++3     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:2  H1:i:4
+B7_610:5:102:915:87    99      chr2    65      99      35M     =       222     192     AACAATAGACTAAACCAAGCAGAAGAAAGAGGTTC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<3<<;<<<<;     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:3  H1:i:0
+EAS54_71:3:78:855:352  163     chr2    65      99      35M     =       240     209     AACAATAGACTAAACCAAGCAGAAGAAAGAGGTTC     <<<<<<<<;<<<<<<<<<;<<<<<<<<;<;<<:<:     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:3  H1:i:0
+EAS56_57:2:206:873:186 163     chr2    66      99      35M     =       227     196     ACAATAGACTAAACCAAGCAGAAGAAAGAGGTTCA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:;53     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:2  H1:i:0
+EAS1_93:6:238:514:194  163     chr2    68      99      35M     =       265     232     AATAGACTAAACCAAGCAGAAGAAAGAGGTTCAGA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<;<;<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:1
+EAS56_57:3:285:489:327 99      chr2    68      99      35M     =       233     200     AATAGACTAAACCAAGCAGAAGAAAGAGGTTCAGA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:1
+EAS54_67:1:15:381:715  99      chr2    72      99      35M     =       237     200     GACTAAACCAAGCAGAAGAAAGAGGTTCAGAACTT     ;=====;===9==;===9;;;=4;9=====;====     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_32:6:199:818:124        99      chr2    73      99      35M     =       266     228     ACTAAACCAAGCAGAAGAAAGAGGTTCAGAACTTG     <<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;<<;7<<<<<<9<9;     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_59:3:182:1002:639        163     chr2    77      99      35M     =       246     204     AACCAAGCAGAAGAAAGAGGTTCAGAACTTGAAGA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9-<<<<4<;<;;<;     MF:i:18 Aq:i:48 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_1:2:3:945:2005  163     chr2    77      99      35M     =       262     220     AACCAAGCAGAAGAAAGAGGCTCAGAACTTGAAGA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<%<<<<<<;<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:44 NM:i:1  UQ:i:4  H0:i:0  H1:i:1
+B7_591:5:254:542:848   99      chr2    79      99      36M     =       233     190     CCAAGCAGAAGAAAGAGGTTCAGAACTTGAAGACAA    <<<;<<<<<<<<<<<<<<<;4<;8<<<;;9<9;8;9    MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_95:4:71:517:742   99      chr2    81      99      35M     =       266     220     AAGCAGAAGAAAGAGGTTCAGAACTTGAAGACAAG     <<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<48:4<<<<3     MF:i:18 Aq:i:49 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_105:8:254:617:73  163     chr2    83      99      35M     =       266     218     GCAGAAGAAAGAGGTTCAGAACTTGAAGACAAGTC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<6;:;4%     MF:i:18 Aq:i:51 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:2:13:1507:1146       99      chr2    84      99      35M     =       278     229     CAGAAGAAAGAGGTTCAGAACTTGAAGACAAGTCT     ;<9;;;;<<;;;;<<;<;;;;<;;<<;<;<99777     MF:i:18 Aq:i:49 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_11:5:32:686:735 99      chr2    84      78      35M     =       255     206     CAGAAGAAAGAGGTTCANANNNTGANGACAAGTCT     <<<<<<<<<<<<<<<<<!<!!!<<<!<<<<<<<<<     MF:i:130        Aq:i:78 NM:i:5  UQ:i:0  H0:i:0  H1:i:0
+EAS56_57:3:112:729:591 99      chr2    86      99      35M     =       283     232     GAAGAAAGAGGTTCAGAACTTGAAGACAAGTCTCT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_39:5:17:1222:783        163     chr2    87      99      35M     =       251     199     AAGAAAGAGGTTCAGAACTTGAAGACAAGTCTCGT     <<<<<<<)<<<16<<;<<<6<4<:<4<+://<7)<     MF:i:18 Aq:i:59 NM:i:1  UQ:i:8  H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_7:6:46:122:479  99      chr2    87      99      35M     =       248     196     AAGAAAGAGGTTCAGAACTTGAAGACAAGTCTCTT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:2:313:531:169   163     chr2    89      99      36M     =       250     197     GAAAGAGGTTCAGAACTTGAAGACAAGTCTCTTATG    <<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<:<<:<;<<;<2    MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_62:6:148:170:895 99      chr2    91      99      35M     =       247     191     AAGAGGTTCAGAACTTGAAGACAAGTCTCTTATGA     <<<<<<<<<<9<<<<<6<<<<<<<<<<<<<<<<6<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_39:6:34:380:815 163     chr2    91      99      35M     =       283     227     AAGAGGTTCAGAACTTGAAGACAAGTCTCTTATGA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;:     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_64:6:210:809:735 163     chr2    93      99      35M     =       291     233     GAGGTTCAGAACTTGAAGACAAGTCTCTTATGAAT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<5<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_81:8:40:925:442  163     chr2    93      99      35M     =       271     213     GAGGTTCAGAACTTGAAGACAAGTCTCTTATGAAT     ;<;<<<<<<<<<<<3;<7;:<;;<<<;<<:<32<<     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_71:4:169:256:888 163     chr2    94      99      35M     =       270     210     AGGTTCAGAACTTGAAGACAAGTCTCTTATGAATT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<;<<;<<:;;<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_65:8:117:156:84  99      chr2    95      99      35M     =       285     225     GGTTCAGAACTTGAAGACAAGTCTCTTATGAATTA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_26:1:35:522:294 163     chr2    95      99      35M     =       272     212     GGTTCAGAACTTGAAGACAAGTCTCTTATGAATTA     ===============================:=:=     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:3:41:653:1568        163     chr2    95      99      35M     =       266     206     GGTTCAGAACTTGAAGACAAGTCTCTTATGAATTA     ;;;;;;;8;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;88888     MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_28:7:178:276:693        163     chr2    96      99      36M     =       259     199     GTTCAGAACTTGAAGACAAGTCTCTTATGAATTAAC    <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;    MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_73:7:223:440:667 99      chr2    97      99      35M     =       282     220     TTCAGAACTTGAAGACAAGTCTCTTATGAATTAAC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<;<<<<;;     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_61:5:194:470:416 99      chr2    98      99      35M     =       265     202     TCAGAACTTGAAGACAAGTCTCTTATGAATTAACC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_39:5:61:1000:1534       163     chr2    104     99      35M     =       286     217     CTTGAAGACAAGTCTCTTATGAATTAACCCAGTCA     <<<<4:<:<1)<<<<<<<+<:44<</7<<<)4:<)     MF:i:18 Aq:i:63 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:5:145:383:182 163     chr2    105     99      35M     =       291     221     TTGAAGACAAGTCTCTTATGAATTAACCCAGTCAG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:;;;<;     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_11:2:63:816:921 163     chr2    106     99      35M     =       291     220     TGAAGACAAGTCTCTTATGAATTAACCCAGTCAGA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<4<846     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:4:77:1780:693        99      chr2    106     99      40M     =       276     210     TGAAGACAAGTCTCTTATGAATTAACCCAGTCAGACAAAA        <<<<<<<<<<<<;<<:<<;<<<<<<<<<<<<;<<<;;:69        MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:1:215:861:605   163     chr2    107     94      36M     =       262     191     NAAGACAAGTCTCTTATGAATTAACCCAGTCAGACA    !+++++++++++++++++++++++++++++++++++    MF:i:18 Aq:i:19 NM:i:1  UQ:i:0  H0:i:0  H1:i:1
+EAS221_3:2:22:1623:709 99      chr2    107     99      35M     =       287     215     GAAGACAAGTCTCTTATGAATTAACCCAGTCAGAC     <<<<<<<<<7<<<<<<<:<<<<<<<<:85:<:2<<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS219_FC30151:1:54:436:1452   163     chr2    108     99      35M     =       275     202     AAGACAAGTCTCTTATGAATTAACCCAGTCAGACA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<;<<<     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_11:2:42:333:516 163     chr2    109     99      35M     =       296     222     AGACAAGTCTCTTATGAATTAACCCAGTCAGACAA     <<<<<5<*<2<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<</     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_595:6:119:730:190   99      chr2    114     99      35M     =       301     222     AGTCTCTTATGAATTAACCCAGTCAGACAAAAATA     <<<9<;;<<<;<<<<<<<8<<<1<<918<;;;<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_97:7:63:727:203   99      chr2    114     99      35M     =       278     199     AGTCTCTTATGAATTAACCCAGTCAGACAAAAATA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;<<;     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS192_3:5:27:577:849  163     chr2    114     99      35M     =       316     237     AGTCTCTTATGAATTAACCCAGTCAGACAAAAATA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;:<<<;<<<<<<;;;     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS219_1:5:5:259:250   99      chr2    115     99      35M     =       269     189     GTCTCTTATGAATTAACCCAGTCAGACAAAAATAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<;5<<5<;7<::     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS112_34:4:17:989:186 99      chr2    120     91      35M     =       299     214     TTATGAATTAACCCAGTCAGACAAAAATAAAGAAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<;<7;::::     MF:i:18 Aq:i:20 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:5
+EAS114_45:2:33:1445:1357       99      chr2    121     85      35M     =       299     213     TATGAATTAACCCAGTCAGACAAAAATAAAGAAAA     ;;<;<<<<<<;;;<9:;:;;;;;:;:;;;;99777     MF:i:18 Aq:i:18 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:7
+EAS221_3:4:30:1452:1563        163     chr2    122     94      35M     =       313     226     ATGAATTAACCAAGTCAGACAAAAATAAAGAAAAA     <<<<<<<<<<<<<<:<<<<1<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:20 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+EAS114_45:1:77:1000:1780       163     chr2    123     66      35M     =       279     191     TGAATTAACCCAGTCAGACAAAAATAAAGAAAAAA     ;;;:;;;;;;;/;;;7:4;;7;;;;;;;;;77777     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:6  H1:i:47
+EAS114_45:4:48:310:473 99      chr2    123     66      35M     =       298     210     TGAATTAACCCAGTCAGACAAAAATAAAGAAAAAA     <<<;<<;;;<<;;<;;;;;;;;;;;;;;;;89799     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:6  H1:i:47
+B7_591:2:279:124:41    99      chr2    124     69      36M     =       307     219     GAATTAACCCAGTCAGACAAAAANNAAGAAAAAAGA    <<<<<<<7/<8<<<<<<<<<<4*!!<<7<7<<5<<3    MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:2  UQ:i:0  H0:i:0  H1:i:0
+EAS112_32:8:89:254:332 163     chr2    124     76      35M     =       291     202     GAATTAACCCAGTCAGACAAAAATAAAGAAAAAAG     ==================;=========;=7;;<;     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:4  H1:i:36
+B7_597:7:103:731:697   99      chr2    125     72      35M     =       304     214     AATTAACCCAGTCAGACAAAAATAAAGAAAAAAGA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<:<:<<6<<<<<<<:<;:     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:9  H1:i:55
+EAS139_11:2:71:83:58   163     chr2    148     77      9M2I24M =       349     236     AAAGAAAAAAGAATTTTAAAAATGAACAGAGCTTT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:130        Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:0  H1:i:0
+EAS192_3:4:63:5:870    163     chr2    148     75      9M2I24M =       330     217     AAAGAAAAAAGAATTTTAAAAATGAACAGAGCTTT     <<;<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<;;<<<     MF:i:130        Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:0  H1:i:0
+EAS139_19:2:29:1822:1881       163     chr2    150     74      7M2I31M =       328     218     AGAAAAAAGAATTTTAAAAATGAACAGAGCTTTCAAGAAG        <<<<<<<<<<<<4<<<<<<<<<<<<<<:<<<:<<;:::::        MF:i:130        Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:0  H1:i:0
+EAS221_3:2:100:1147:124        163     chr2    150     99      35M     =       345     230     AAAAAAGAATTTTAAAAATGAACAGAGCTTTCAAG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<     MF:i:18 Aq:i:29 NM:i:2  UQ:i:54 H0:i:0  H1:i:0
+EAS192_3:8:6:104:118   163     chr2    154     99      35M     =       323     204     AAGAATTTTAAAAATGAACAGAGCTTTCAAGAAGT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<=<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:27 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+B7_593:6:185:96:948    99      chr2    160     99      36M     =       324     200     TTTAAAAATGAACAGAGCTTTCAAGAAGTATGAGAT    <<<<<<<<<;6<<<<<<<<<;<<<;;<<<<<<<;<;    MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_7:7:213:309:373 163     chr2    161     99      35M     =       317     191     TTAAAAATGAACAGAGCTTTCAAGAAGTATGAGAT     <;<<<<<<;<7<<<<<-<<<<<<<<<<<<<<4<7<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_93:2:30:466:652   99      chr2    163     98      35M     =       332     204     AAAAATGAACAGAGCTTTCAAGAAGTATGAGATTA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<4;7<<<7     MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_32:4:156:21:69  163     chr2    163     99      35M     =       362     234     AAAAATGAACAGAGCTTTCAAGAAGTATGAGATTA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<4<<<:<;<;;     MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_93:5:197:52:58    163     chr2    165     99      35M     =       323     193     AAATGAACAGAGCTTTCAAGAAGTATGAGATTATG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<2<<<<<<;<<<<     MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_65:3:214:946:229 163     chr2    165     99      35M     =       339     209     AAATGAACAGAGCTTTCAAGAAGTATGATATTATG     <<<<<<<<<<<<<<<<<::<;;;<;<;7<:<<7<2     MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:1  H1:i:0
+EAS192_3:4:293:168:240 99      chr2    167     99      35M     =       340     208     ATGAACAGAGCTTTCAAGAAGTATGAGATTATGTA     <<<<;<<<;;;<;<<;;;<<;;<<::::<<;;+;7     MF:i:18 Aq:i:48 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_61:3:208:118:673 99      chr2    169     76      35M     =       332     198     GAACAGAGCTTTCAAGAAGTATGAGATTATGTAAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<;;     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_589:3:71:478:175    163     chr2    171     99      35M     =       317     181     ACAGAGCTTTCAAGAAGTATGAGATTATGTAAAGT     <<<<<<<<<<<;<<<<<;<<<<<<<<<<;<<<<<;     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_64:5:177:24:389  163     chr2    175     99      35M     =       365     225     AGCTTTCAAGAAGTATGAGATTATGTAAAGTAACT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<;;<;9969;     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:6:14:1211:1332       163     chr2    178     99      35M     =       351     208     TTTCAAGAAGTATGAGATTATGTAAAGTAACTGAA     ;;.;;;;;;;3;;;;;6;;;;;;8;;;;;;63777     MF:i:18 Aq:i:64 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_26:1:324:238:736        163     chr2    180     99      35M     =       367     222     TCAAGAAGTATGAGATTATGTAAAGTAACTGAACC     ===================================     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_97:7:9:648:712    99      chr2    182     99      35M     =       358     211     AAGAAGTATGAGATTATGTAAAGTAACTGAACCTA     <9<;<<<<<<<;<<<<<8<<<<9<<;<<8)<:1<:     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_3:4:41:1308:619 163     chr2    184     99      35M     =       360     211     GAAGTATGAGATTATGTAAAGTAACTGAACCTATG     <6+<*<<<<<<<:<<<<<<<:<<&<<<<1<6<11:     MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_30:4:328:537:640        99      chr2    185     99      35M     =       352     202     AAGTATGAGATTATGTAAAGTAACTGAACCTATGA     <;<<<<<<;<<<<<<<<<:;<<8<<<;:<<<;<;9     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_62:5:86:697:941  163     chr2    187     99      35M     =       341     189     GTATGAGATTATGTAAAGTAACTGAACCTATGAGT     =====================<=<==<<====;=5     MF:i:18 Aq:i:27 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_95:4:224:592:744  99      chr2    188     99      35M     =       383     230     TATGAGATTATGTAAAGTAACTGAACCTATGAGTC     <<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<7<<<<<<<&<*<<     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_99:6:135:354:66   99      chr2    188     99      35M     =       356     203     TATGAGATTATGTAAAGTAACTGAACCTATGAGTC     <<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<;<<2<;;;     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_30:7:71:311:202 163     chr2    188     99      35M     =       379     226     TATGAGATTATGTAAAGTAACTGAACCTATGAGTC     <<<<<<<<<<<<<<<<:4<<<<<<<<<<<<8;4;:     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_11:4:50:30:15   99      chr2    192     39      35M     =       358     201     AGATTATGTAAAGTAACTTAACCTATGAGTCCAAG     +:79.68872.:9&:92/.299169/5+/6/3/&2     MF:i:18 Aq:i:10 NM:i:3  UQ:i:45 H0:i:0  H1:i:1
+EAS192_3:5:287:334:110 73      chr2    196     73      35M     =       196     0       TATGTAAAGTAACTGAACCTATGAGTCACAGGTAT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<4;<<<<<<<::6<55:.     MF:i:64 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS192_3:5:287:334:110 133     chr2    196     0       *       =       196     0       GATGAATACTAAGATTGATGTAGCAGCTTTTGCAA     .5+7)09<))&-&:33953<-./&&&)((;+3399     MF:i:192
+B7_597:7:5:753:806     83      chr2    197     99      35M     =       45      -187    ATGTAAAGTAACTGAACCTATGAGTCACAGGTATT     ;:<:<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:27 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_28:4:149:572:877        163     chr2    197     99      36M     =       334     173     ATGTAAAGTAACTGAACCTATGAGTCACAGGTATTC    =>7><>;>+>>/;>>=>=>=:>><>=<<==;)<=8;    MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS218_4:7:85:923:726  147     chr2    199     99      35M     =       43      -191    GTAAAGTAACTGAACCTATGAGTCACAGGTATTCC     <:<<<%3<<1<<86<<-<<<<<<<<<<<<6<<1<<     MF:i:18 Aq:i:44 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_103:5:285:241:560 83      chr2    200     99      35M     =       37      -198    TAAAGTAACTGAACCTATGAGTCACAGGTATTCCT     :<<<<;<<,<<<<5<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_30:6:41:461:436 163     chr2    200     74      35M     =       389     224     TAAAGTAACTGAACCTATGAGTCACAGGTATTCCT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<;<;;;:;     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_61:6:25:949:33   99      chr2    201     99      35M     =       383     217     AAAGTAACTGAACCTATGAGTCACAGGTATTCCTG     =;===/8========*==&;6=&=&:=6&:=::67     MF:i:18 Aq:i:63 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_3:2:60:590:1760 99      chr2    201     99      35M     =       376     210     AAAGTAACTGAACCTATGAGTCACAGGTATTCCTG     <:<<<<<2<<<<:<::<<<::<<<<<6<<<<<<<6     MF:i:18 Aq:i:51 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:6:86:693:234 163     chr2    202     82      35M     =       388     221     AAGTAACTGAACCTATGAGTCACAGGTATTCCTGA     ;;;;;;;;;;;;;;;;9;;;;;;;;99;;&70777     MF:i:18 Aq:i:18 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:6:4:223:776   163     chr2    203     93      35M     =       387     219     AGTAACTGAACCTATGAGTCACAGGTATTCCTGAG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<:;<;2<     MF:i:18 Aq:i:19 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_39:3:88:84:1558 99      chr2    203     95      35M     =       394     226     AGTAACTGAACCTATGAGTCACAGGTATTCCTGTG     <<;<<<<<<<<<<<<;;<<<<<<<::<<<<<<7&<     MF:i:18 Aq:i:22 NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:1  H1:i:0
+B7_597:2:168:829:88    163     chr2    205     99      35M     =       369     199     TAACTGAACCTATGAGTCACAGGTATTCCTGAGGA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<6<<<<<<9;4;2     MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_28:1:168:389:889        147     chr2    205     99      36M     =       37      -204    TAACTGAACCTATGAGTCACAGGTATTCCTGAGGAA    ;<<;;56;==================8========8    MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_71:5:81:685:141  99      chr2    207     85      34M     =       382     210     ACTGAACCTATGAGTCACAGGTATTCCTGAGGAA      <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<;<<<',7,7      MF:i:18 Aq:i:17 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:4:26:1312:1400       99      chr2    207     99      40M     =       385     218     ACTGAACCTATGAGTCACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAA        <<<<;<<<:<<:<;<:<<<;:;<<<<<<:<8<1;;:::88        MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_71:4:127:725:381 83      chr2    209     99      34M     =       39      -204    TGAACCTATGAGTCACAGGTATTCCTGAGGAAAA      +<<.<<;<;<<<3;<;<<<<<<6<8;<<<<<<<1      MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_7:2:19:736:559  99      chr2    209     99      35M     =       370     196     TGAACCTATGAGTCACAGGTATTCCTGAGGAAAAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_26:3:117:284:589        83      chr2    210     99      35M     =       43      -202    GAACCTATGAGTCACAGGTATTCCTGAGGAAAAAG     ==8==;==================;==========     MF:i:18 Aq:i:56 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_610:5:120:596:847   163     chr2    211     83      35M     =       410     234     AACCTATGAGTCACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGA     <<<<<<<<<<<<<;<<<9<<<<<<<;:<62;58;2     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:1
+B7_610:5:51:904:391    163     chr2    212     97      35M     =       401     224     ACCTATGAGTCACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<;:;<2<6;;;;;     MF:i:18 Aq:i:24 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_11:8:96:1314:1448       163     chr2    213     93      35M     =       388     210     CCTATGAGTCACAGGTATTCCTGAGGAAAAATAAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<5<4<<<<-<<<     MF:i:18 Aq:i:18 NM:i:1  UQ:i:12 H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:3:73:1158:535        163     chr2    213     99      40M     =       377     204     CCTATGAGTCACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTG        <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<;;<<<<<9<<9::8:8        MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_591:2:223:583:968   147     chr2    215     88      36M     =       47      -204    TATGAGGCACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAG    1<';<<&%-:<<<<<:66%<<<<<<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_97:3:160:173:889  163     chr2    215     99      35M     =       379     199     TATGAGTCACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;0<7<<;<<<;7<09     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_39:1:28:350:895 83      chr2    215     95      35M     =       48      -202    TATGAGTCACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAA     :<;<<<:;<-<<<<<4;77<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_53:4:45:707:147  163     chr2    216     99      35M     =       424     243     ATGAGTCACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAG     <<<<<<<<<<<<&<<<<:<<9<<<9<<<<75;;;<     MF:i:18 Aq:i:51 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS220_1:8:18:1757:95  99      chr2    216     45      35M     =       374     193     ATGAGTCGCAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<1<:<<<<<<:<<<;:<     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+EAS51_66:6:310:747:415 163     chr2    217     99      35M     =       387     205     TGAGTCACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<;<<<<<;<;<;     MF:i:18 Aq:i:24 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_28:2:114:938:216        147     chr2    218     99      36M     =       63      -191    GAGTCACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGA    <<<<7<6<<<<<<<6<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_93:1:179:629:513  163     chr2    220     99      35M     =       409     224     GTCACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAG     <<<<<<<<<<<<<<<;<;<<<<<<<<<<<<<;<<<     MF:i:18 Aq:i:49 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:4:88:55:1187 99      chr2    220     66      35M     =       391     206     GTCACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAG     ;;<;;;<<99<<;;<;;;;;:;49;:;;;;87898     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_62:5:119:38:945  99      chr2    221     99      35M     =       428     242     TCACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGA     <<<<<<<<<<<<<<<8<<<<<8<<<8<;<<7<:<<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_65:6:67:800:450  147     chr2    221     99      35M     =       41      -215    TCACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGA     9-<9<;<<<<9;5<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:49 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_610:5:102:915:87    147     chr2    222     99      35M     =       65      -192    CACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAA     ;<8<;;<<<<7;<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_26:1:113:367:659        163     chr2    222     72      35M     =       390     203     CACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGCGAGAA     =9====8==========:=:=====9=:=&====5     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:1  H1:i:0
+EAS218_1:2:26:211:481  147     chr2    222     99      35M     =       43      -214    CACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAA     :<:<<<<<<9:5<<<<<<<<<<<<<<:<:<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS219_FC30151:3:90:1906:1528  83      chr2    222     99      35M     =       41      -216    CACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAA     :<<<<<<<<<3:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:49 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_591:2:13:100:876    163     chr2    223     73      36M     =       397     210     ACAGGGATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGT    <8<<<*<2<7<<<6<<<<<<6<<8<<<<5<<<<4<9    MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:1  UQ:i:9  H0:i:0  H1:i:1
+EAS56_63:5:117:570:971 163     chr2    223     99      35M     =       413     225     ACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAG     <<<<<<<<<<<<<;;;<<<<6<7;9;<:;<;<;;<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_3:8:50:1203:1094        83      chr2    223     99      35M     =       46      -212    ACAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAG     <7<<<<<5:+63<<<<<<<<<<<<<<<<2<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_67:6:107:395:312 83      chr2    224     99      35M     =       44      -215    CAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGT     ;<;;<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:27 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_73:3:29:833:612  83      chr2    224     99      35M     =       58      -201    CAGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGT     <<;<<<;<::<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:27 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_610:7:158:943:467   83      chr2    225     99      35M     =       57      -203    AGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGTT     <:<<;;<:5<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<;<<<     MF:i:18 Aq:i:46 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_59:2:201:768:529 163     chr2    225     99      35M     =       396     206     AGGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGTT     ==========================1=======;     MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_7:6:11:994:584  99      chr2    226     97      35M     =       417     226     GGTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGTTT     <<<<<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<<6<<<<<<3<6     MF:i:18 Aq:i:24 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:2:206:873:186 83      chr2    227     99      35M     =       66      -196    GTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTG     ;<<;--7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_63:4:38:28:122   83      chr2    227     99      35M     =       46      -216    GTATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTG     ;9;9;-1<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_93:5:66:372:343   83      chr2    228     99      35M     =       40      -223    TATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTGG     ;<1;89<<<<<;<9<<<<9<<<;8<9<;<<<<<;8     MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_97:3:277:144:848  83      chr2    228     99      35M     =       64      -199    TATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTGG     <<<)63<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:6:21:1601:1666       83      chr2    228     99      40M     =       56      -212    TATTACTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAA        -;;3&1<<<<<<<<<<<<1<<<</<<<<<</<<<<<<<<<        MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:1:189:503:110 83      chr2    229     79      35M     =       63      -201    ATTCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTGGA     =;;6:==============================     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_95:5:257:654:116  147     chr2    231     99      35M     =       64      -202    TCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTGGAAA     0+37<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:7:69:1130:832        147     chr2    231     94      35M     =       50      -216    TCCTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTGGAAA     6)377;3;;;;;;;;;1;;;;;;;;;;;;;;;;;;     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_591:5:254:542:848   147     chr2    233     99      36M     =       79      -190    CTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAAC    ,:4<8<<<<<<<<<<<<<;:<<<<<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:3:285:489:327 147     chr2    233     99      35M     =       68      -200    CTGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAA     9;;<<8<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<;<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:4:163:611:211 163     chr2    234     99      35M     =       405     206     TGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAAC     ============8===============;=6;;<;     MF:i:18 Aq:i:48 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_7:3:296:224:724 83      chr2    234     99      35M     =       50      -219    TGAGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAAC     8<<<5<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<<<;<9<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_39:4:58:271:612 99      chr2    236     99      35M     =       415     214     AGGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAACTA     <;<<<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<<<+47<<;<::     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_67:1:15:381:715  147     chr2    237     99      35M     =       72      -200    GGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAACTAT     <<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<97;<<<<<<<<9<<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_73:3:203:419:243 83      chr2    237     99      35M     =       54      -218    GGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAACTAT     ;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS218_4:3:41:1281:1785        99      chr2    237     99      35M     =       399     197     GGAAAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAACTAT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<;<<<<<<<8<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_26:7:218:858:445        99      chr2    239     99      35M     =       421     217     AAAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAACTATTT     ;===5=;=======;==3======9;,79==;===     MF:i:18 Aq:i:27 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_595:4:319:250:718   83      chr2    240     99      35M     =       52      -223    AAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAACTATTTG     <;:<<<<;<<<:<<<<<<49:<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:53 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_64:7:92:493:891  99      chr2    240     99      35M     =       408     203     AAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAACTATTTG     <<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<8     MF:i:18 Aq:i:49 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_71:3:78:855:352  83      chr2    240     99      34M     =       65      -209    AAAAGAAAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAACTATTT      2<<<<<<<9<<4<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<      MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_103:3:277:921:474 83      chr2    241     99      35M     =       45      -231    AAAGAAAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAACTATTTGA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:27 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:2:41:199:388 99      chr2    243     99      35M     =       403     195     AGAAAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAACTATTTGAGG     ;;<<<<<;;<<<<<<;;<;;<<;;<<<<<<99999     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:7:307:481:625   99      chr2    245     99      36M     =       410     201     AAAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAACTATTTGAGGAAG    <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;;;9<;    MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_53:3:134:126:465 99      chr2    245     99      35M     =       434     224     AAAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAACTATTTGAGGAA     <<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<5<<:<<41     MF:i:18 Aq:i:56 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:2:44:153:969  163     chr2    245     95      35M     =       447     237     AAAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAACTATTTGAGGAA     *:::7<77<:<<<<:<<(597:<:<9//7<529/0     MF:i:18 Aq:i:36 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_59:3:182:1002:639        83      chr2    246     99      35M     =       77      -204    AAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAACTATTTGAGGAAG     <<;;9;9<<<<<<;<7;<;<<<<;;<<<;<<7;<<     MF:i:18 Aq:i:48 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS220_1:2:54:91:1232  147     chr2    246     99      35M     =       57      -224    AAAAGTGAGAAGTTTGGAAAAACTATTTGAGGAAG     ;;;;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:2:204:737:61  163     chr2    247     99      35M     =       437     225     AAAGTGAGAAGTTTGGAAAAACTATTTGAGGAAGT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<9<+4:<0     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_62:6:148:170:895 147     chr2    247     99      35M     =       91      -191    AAAGTGAGAAGTTTGGAAAAACTATTTGAGGAAGT     <<9<<<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_7:6:46:122:479  147     chr2    248     99      35M     =       87      -196    AAGTGAGAAGTTTGGAAGAACTATTTGAGGAAGTA     <<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+EAS219_1:7:16:1343:1621        99      chr2    248     99      35M     =       426     213     AAGTGAGAAGTTTGGAAAAACTATTTGAGGAAGTA     <<<<<<<<8<<<<;<<<;<;<<<<<<<:;4;71:;     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:2:313:531:169   83      chr2    250     99      36M     =       89      -197    GTGAGAAGTTTGGAAAAACTATTTGAGGAAGTAATT    98;<;;<<;8<<<<<<<<<<<8<<<<<<<<8<<<<<    MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:4:75:166:463  147     chr2    250     99      35M     =       64      -221    GTGAGAAGTTTGGAAAAACTATTTGAGGAAGTAAT     <<<<<==============================     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_71:7:130:260:553 99      chr2    250     99      34M     =       439     224     GTGAGAAGTTTGGAAAAACTATTTGAGGAAGCAC      <<<<<1<<<<<<<<<<6<<81</<4*2;7:+90(      MF:i:18 Aq:i:42 NM:i:2  UQ:i:31 H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_59:2:60:677:921  99      chr2    250     96      35M     =       393     178     GTGAGAAGTTTGGAAAAACTATTTGAGGAAGTAAT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:22 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_1:6:60:1037:1146        99      chr2    250     99      35M     =       447     232     GTGAGAAGTTTGGAAAAACTATTTGAGGAAGTAAT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<:;;;;;;<     MF:i:18 Aq:i:53 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_39:5:17:1222:783        83      chr2    251     99      35M     =       87      -199    TGAGAAGTTTGGAAAAACTATTTGAGGAAGTAATT     6<<<8<69<8199<7<<<6<<<<<<<<<1:<:<<:     MF:i:18 Aq:i:59 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_1:6:96:491:1891 163     chr2    253     99      35M     =       409     191     AGAAGTTTGGAAAAACTATTTGAGGAAGTAATTGG     <:<<<<<::<<<<<<<<<<<<<<<<:<<::7<<:7     MF:i:18 Aq:i:46 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS112_34:6:75:615:555 99      chr2    255     99      35M     =       416     196     AAGTTTGGAAAAACTATTTGAGGAAGTAATTGGGG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;<<<29<;.484     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_11:5:32:686:735 147     chr2    255     78      35M     =       84      -206    AAGTTTGGAAAAACTATTTGAGGAAGTAATTGGGG     <<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:78 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS218_4:3:65:85:1547  163     chr2    257     99      35M     =       434     212     GTTTGGAAAAACTATTTGAGGAAGTAATTGGGGAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<:<<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS219_1:7:94:1655:1921        99      chr2    258     85      35M     =       447     224     TTTGGAAAAACTATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAA     <<<8<<<<<<<<<8<<8;8<;<;<;;<<9+868<;     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:1
+B7_610:7:177:469:800   99      chr2    259     99      35M     =       433     209     TTGGAAAAACTATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;;<<<;<;     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_28:7:178:276:693        83      chr2    259     99      36M     =       96      -199    TTGGAAAAACTATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAAC    :;<;<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_30:3:14:697:541 99      chr2    259     99      35M     =       432     208     TTGGAAAAACTATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<;;;;8;;<     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:6:37:156:134 163     chr2    261     99      35M     =       443     217     GGAAAAACTATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACC     ;;;;;;;;;;9;;;;;;;;;;;;;;;9;;;77679     MF:i:18 Aq:i:49 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:1:215:861:605   83      chr2    262     94      36M     =       107     -191    GAAAAACTATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTC    ;<<<<<;:<7:<<<;<<<<<<<;:<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:19 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_1:2:3:945:2005  83      chr2    262     99      35M     =       77      -220    GAAAAACTATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCT     7<<<<;;<<;<<<<<7<<<<<<<<<;<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:44 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_595:6:52:751:360    163     chr2    263     99      35M     =       443     215     AAAAACTATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:76<<<<;9:;:     MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_93:6:238:514:194  83      chr2    265     99      35M     =       68      -232    AAACTATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTT     <<6<<<<:9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_61:5:194:470:416 147     chr2    265     99      35M     =       98      -202    AAACTATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTT     <<<7<<;<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_95:4:71:517:742   147     chr2    266     99      35M     =       81      -220    AACTATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTT     <<<<<<2<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:49 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_105:8:254:617:73  83      chr2    266     99      35M     =       83      -218    AACTATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTT     <<:<<<9;<<<;;<:<-<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:51 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_32:6:199:818:124        147     chr2    266     99      35M     =       73      -228    AACTATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:3:41:653:1568        83      chr2    266     99      35M     =       95      -206    AACTATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTT     977979;:;<;;;;;;<<5;<;<;<<<;;;;;;;;     MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_65:5:211:84:84   99      chr2    268     99      35M     =       440     207     CTATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAG     <<<<<<<<<<<<<<<<:<<:<<:<<<44<4<<9<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_99:2:152:355:962  163     chr2    269     99      35M     =       456     222     TATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGT     <;<<<<<;8<<<<<<<<<;5;;88<<3<<<<<&0;     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_66:5:285:395:450 99      chr2    269     99      35M     =       458     224     TATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGT     <<<<<<<;<<<;<<<<<;:<:7<;<;7<7<<;;7<     MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_7:3:15:568:42   121     chr2    269     69      35M     =       269     0       TTTTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGT     !!;:<8<;<<<8<<<<<<<<8<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:64 Aq:i:0  NM:i:2  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_7:3:15:568:42   181     chr2    269     0       *       =       269     0       TTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTATA     !!!!!!!!!++++!!!!!!!!!!!!!!!!!!!,!,     MF:i:192
+EAS192_3:8:6:237:885   99      chr2    269     99      35M     =       433     199     TATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGT     <<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;;<;     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS219_1:5:5:259:250   147     chr2    269     99      35M     =       115     -189    TATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGT     8<83;<<<<<<<<<<5<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_64:6:206:994:556 73      chr2    270     75      35M     =       270     0       ATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGTC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<4<<;<<     MF:i:64 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_64:6:206:994:556 133     chr2    270     0       *       =       270     0       NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN     !!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!     MF:i:192
+EAS54_71:4:169:256:888 83      chr2    270     99      34M     =       94      -210    ATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGT      &<<:<;<<;;<8<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<      MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_81:2:317:72:221  163     chr2    270     99      35M     =       422     187     ATTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGTC     ===========;=======;;:==6=;=====;==     MF:i:18 Aq:i:53 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_81:8:40:925:442  83      chr2    271     99      35M     =       93      -213    TTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCT     =;=================================     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:2:158:909:321 163     chr2    271     99      35M     =       453     217     TTTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_26:1:35:522:294 83      chr2    272     99      35M     =       95      -212    TTGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_95:4:176:971:874  163     chr2    273     76      35M     =       432     195     TGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTG     <<<<<<<<<<<<<:<;<<<<<<<<<<<<<5<<<<7     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_81:7:226:869:36  99      chr2    273     99      35M     =       461     223     TGAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTG     :<<<<,:<;:.:<<:<<717,;2171717717116     MF:i:18 Aq:i:59 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_597:6:106:595:322   163     chr2    274     99      35M     =       440     201     GAGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTGC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<::     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS219_FC30151:1:54:436:1452   83      chr2    275     99      35M     =       108     -202    AGGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTGCT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:4:77:1780:693        147     chr2    276     99      40M     =       106     -210    GGAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGAT        :**::799<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<        MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_97:3:147:423:584  99      chr2    277     99      35M     =       451     209     GAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9;;96     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_99:2:188:782:483  163     chr2    277     99      35M     =       431     189     GAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<7<;77     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_3:4:78:1314:1275        99      chr2    277     99      35M     =       469     227     GAAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<6<<<<<<<<<<<<8     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_97:7:63:727:203   147     chr2    278     99      35M     =       114     -199    AAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAGA     <<;7<<;<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:2:13:1507:1146       147     chr2    278     99      35M     =       84      -229    AAGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAGA     88788;,;:-:2;;;;;;;;:;:;;;;;;;;;;;;     MF:i:18 Aq:i:49 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:1:77:1000:1780       83      chr2    279     66      35M     =       123     -191    AGTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAG     777774;;4-7;;;;;;:;;;:;;;<;;;;<<<<;     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_59:1:93:490:901  163     chr2    280     99      35M     =       445     200     GTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGA     <<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<;<<<<<:<<1+4-8     MF:i:18 Aq:i:53 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_59:6:227:657:95  99      chr2    280     99      35M     =       458     213     GTAATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<8<85     MF:i:18 Aq:i:59 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_28:7:57:324:546 163     chr2    281     99      36M     =       458     213     TAATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGATT    <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<8:8<<;::;;;    MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_73:7:223:440:667 147     chr2    282     99      35M     =       97      -220    AATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGATT     <<;;<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:4:26:274:1078        163     chr2    282     99      40M     =       458     216     AATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGATTTAGAC        <<<2<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;:;;;:::::        MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_62:7:196:511:896 163     chr2    283     99      35M     =       446     198     ATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGATTT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<4<88;<<     MF:i:18 Aq:i:52 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:3:112:729:591 147     chr2    283     99      35M     =       86      -232    ATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGATTT     ;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_39:6:34:380:815 83      chr2    283     99      35M     =       91      -227    ATTGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGATTT     ;;;;<<<<<<;<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<;<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_65:8:117:156:84  147     chr2    285     99      35M     =       95      -225    TGGGGAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGATTTAG     <;;<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_39:5:61:1000:1534       83      chr2    286     99      35M     =       104     -217    GGGGAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGATTTAGA     <<;<<<<;;<<;6;<<<;<4;<<7<<<<<;<<<<<     MF:i:18 Aq:i:63 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_3:2:22:1623:709 147     chr2    287     99      35M     =       107     -215    GGGAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGATTTAGAC     <'<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_61:7:7:682:201   163     chr2    288     99      35M     =       452     199     GGAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACA     <<<<<<<7<<7<<<<77&;-9<97<76<;<<993<     MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:5:91:89:666  153     chr2    289     60      35M     *       0       0       GAAAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACAT     74752;;4;;;;;;;;7);;;4;;;;)4;;;;;13     MF:i:32 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_26:6:46:13:880  99      chr2    290     99      35M     =       445     190     AAAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACATC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<7<3<<<9<+;;<9     MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_99:1:187:715:521  163     chr2    291     99      35M     =       451     195     AAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACATCT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<;<<;<;;     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_64:6:210:809:735 83      chr2    291     99      35M     =       93      -233    AAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACATCT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:5:145:383:182 83      chr2    291     99      35M     =       105     -221    AAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACATCT     <<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS112_32:8:89:254:332 83      chr2    291     76      35M     =       124     -202    AAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACATCT     <<<<<<:<;<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_11:2:63:816:921 83      chr2    291     99      35M     =       106     -220    AAACCTCTTTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACATCT     <<<<<<<<<4<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_105:2:280:662:939 99      chr2    294     99      35M     =       442     183     CCTCTTTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACATCTAAA     <<<<<<<<<<<<<;<<<;;7<<<<<<<<<<<<:8<     MF:i:18 Aq:i:48 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_28:3:250:628:423        163     chr2    295     99      36M     =       489     230     CTCTTTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACATCTAAATG    <<<<<<<<<<<<<<<<<<:;<<<<:<<<<;;;;;;4    MF:i:18 Aq:i:27 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS192_3:4:255:549:422 163     chr2    295     99      35M     =       456     196     CTCTTTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACATCTAAAT     <<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<:<<<<<<;;;<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_3:2:2:491:1886  89      chr2    295     75      35M     *       0       0       CTCTTTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACATCTAAAT     <<:<8:<<<:<<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<:     MF:i:32 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_71:3:267:821:860 163     chr2    296     99      35M     =       451     189     TCTTTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACATCTAAATG     ;<<<<<8<<<<<8<<;<8<<<<<5<;<<<<<2;<5     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_11:2:42:333:516 83      chr2    296     99      35M     =       109     -222    TCTTTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACATCTAAATG     <<<<<<<<7<63<7<<<<<<<<<<<7<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_63:2:119:161:322 99      chr2    297     99      35M     =       479     217     CTTTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACATCTAAATGA     <<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<;<<<<<<<<<</6     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:4:48:310:473 147     chr2    298     66      35M     =       123     -210    TTTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACATCTAAATGAA     77999;;6;;;;;;;;;;;;;;;9;;;;;;;;;;;     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_93:6:159:273:253  153     chr2    299     76      35M     *       0       0       TTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACATCTAAATGAAA     <<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:32 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_99:6:181:392:500  99      chr2    299     99      35M     =       470     206     TTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACATCTAAATGAAA     <<<<<:<<<2<<<<;5<<<<29+<<)</65<7.24     MF:i:18 Aq:i:63 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS112_34:4:17:989:186 147     chr2    299     91      35M     =       120     -214    TTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACATCTAAATGAAA     87;38$<3=/<==============9=========     MF:i:18 Aq:i:20 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:2:33:1445:1357       147     chr2    299     85      35M     =       121     -213    TTAGTCTTGCTAGAGATTTAGACATCTAAATGAAA     88888;;;;;;;:;;;;;;;:;9;;;;;;;;;;;;     MF:i:18 Aq:i:18 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_595:6:119:730:190   147     chr2    301     99      35M     =       114     -222    AGTCTTGCTAGAGATTTAGACATCTAAATGAAAGA     ;;;3;<<:<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_93:5:62:969:12    99      chr2    303     99      35M     =       464     196     TCTTGCTAGAGATTTAGACATCTAAATGAAAGAGG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_597:7:103:731:697   147     chr2    304     72      35M     =       125     -214    CTTGCTAGAGATTTAGACATCTAAATGAAAGAGGC     :::;3:<<<<<<<:<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_30:2:111:142:21 163     chr2    304     99      35M     =       479     210     CTTGCTAGAGATTTAGACATCTAAATGAAAGAGGC     <<<<<<<<:<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;9     MF:i:18 Aq:i:28 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_93:7:319:280:57   99      chr2    306     99      35M     =       467     196     TGCTAGAGATTTAGACATCTAAATGAAAGAGGCTC     ;==========;=====6;=========;=<;6;;     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_11:8:76:205:587 163     chr2    306     99      35M     =       483     212     TGCTAGAGATTTAGACATCTAAATGAAAGAGGCTC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:28 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_591:2:279:124:41    147     chr2    307     69      36M     =       124     -219    GCTAGAGATTTAGACATCTAAATGAAAGAGGCTCAA    :17<8<<<:&<<<<<<:;'<<<<<<<<<<;<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:3:10:349:1147        153     chr2    307     74      40M     *       0       0       GCTAGAGATTTAGACATCTAAATGAAAGAGGCTCAAAGAA        :/:::<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<        MF:i:32 Aq:i:16 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS219_1:1:22:490:2011 99      chr2    307     99      35M     =       485     213     GCTAGAGATTTAGACATCTAAATGAAAGAGGCTCA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_65:6:46:173:214  163     chr2    308     99      35M     =       487     214     CTAGAGATTTAGACATCTAAATGAAAGAGGCTCAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<3<<<<<<;     MF:i:18 Aq:i:29 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_32:2:283:577:398        99      chr2    308     99      35M     =       488     215     CTAGAGATTTAGACATCTAAATGAAAGAGGCTCAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<;<<<<<     MF:i:18 Aq:i:29 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_591:2:27:280:592    99      chr2    310     99      36M     =       484     210     AGAGATTTAGACATCTAAATGAAAGAGGCTCAAAGA    <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<5<    MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_39:3:11:1238:1728       163     chr2    310     99      35M     =       475     200     AGAGATTTAGACATCTAAATGAAAGAGGCTCAAAG     <<7<<<<<;<<<<<<<<<<<<;<<<;<<<<<<;;<     MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:6:118:121:760   89      chr2    311     77      36M     *       0       0       GAGATTTAGACATCTAAATGAAAGAGGCTCAAAGAA    :<<<;;<<<<6<;<<<;<<<<;<<<<<<<<<<<<<<    MF:i:32 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_59:7:318:679:883 153     chr2    313     75      35M     *       0       0       GATTTAGACATCTAAATGAAAGAGGCTCAAAGAAT     <<;4<<;<:<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:32 Aq:i:19 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_3:4:30:1452:1563        83      chr2    313     94      35M     =       122     -226    GATTTAGACATCTAAATGAAAGAGGCTCAAAGAAT     <<39<<<59<<:<<+<<<6<<:<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:20 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:1:189:130:136 99      chr2    314     79      35M     =       494     215     ATTTAGACATCTAAATGAAAGAGGCTCAAAGAATG     ==<<=================<<====<<=;=6==     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS192_3:5:27:577:849  83      chr2    316     99      35M     =       114     -237    TTAGACATCTAAATGAAAGAGGCTCAAAGAATGCC     5:<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_589:3:71:478:175    83      chr2    317     99      35M     =       171     -181    TAGACATCTAAATGAAAGAGGCTCAAAGAATGCCA     <<<<;<96<<<<;<<<<<<<<<77<<<<<<<<<<;     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_597:4:38:999:463    99      chr2    317     39      35M     =       503     221     TAGACATCTAAATGAAAGNNGCNNNAAGAATGCCA     7<<<<<<<<:07<<:<<7!!<<!!!::<88<<<<4     MF:i:130        Aq:i:39 NM:i:5  UQ:i:0  H0:i:0  H1:i:0
+EAS54_71:8:215:830:609 89      chr2    317     71      33M     *       0       0       AAGACATCTAAATGAAAGAGGCTCAAAGAATGC       +<)<:<<:<<<<<<<<<9<<<<<;<<<<<<<<<       MF:i:32 Aq:i:0  NM:i:1  UQ:i:11 H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_7:7:213:309:373 83      chr2    317     99      35M     =       161     -191    TAGACATCTAAATGAAAGAGGCTCAAAGAATGCCA     <<<86<82<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:7:45:1339:1807       153     chr2    319     64      35M     *       0       0       GACATCTAAATGAAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGG     77797;;:;::&:;;0:;8;;4;;:;;6;;;;;;;     MF:i:32 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_93:5:197:52:58    83      chr2    323     99      35M     =       165     -193    TCTAAATGAAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGA     <7;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS192_3:8:6:104:118   83      chr2    323     99      35M     =       154     -204    TCTAAATGAAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGA     ;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:27 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:6:185:96:948    147     chr2    324     99      36M     =       160     -200    CTAAATGAAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATA    6<;;<;<<;<<<<<747<<<<<<<<77<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_65:4:61:346:384  163     chr2    324     68      35M     =       496     207     CTAAATGAAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGAT     <<;<<<<<<<<9<;<<9;<6<2;<6<<<;9*558;     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_81:8:177:800:714 163     chr2    324     76      35M     =       497     208     CTAAATGAAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGAT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<;<;<<<<<;<     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_591:4:329:339:408   99      chr2    325     99      36M     =       515     226     TAAATGAAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATAC    <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<;    MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_30:6:214:565:337        99      chr2    326     99      35M     =       481     190     AAATGAAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATAC     <;<<<<<<<<<<<<<<;<<<<9<<<<<;;;;<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_4:7:296:401:60  89      chr2    327     68      35M     *       0       0       AATGAAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACA     <<*<<<<7<<)<<3<<<9<<<<<<<<<<<<<<;<<     MF:i:32 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS218_1:6:88:1413:14  89      chr2    327     76      35M     *       0       0       AATGAAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACA     <<<<<<<<<<<;;;<<<<<<;<;;<<<<<<<<<<<     MF:i:32 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_99:1:34:649:318   163     chr2    328     65      35M     =       481     188     ATGAAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACAT     9<<3<<<9<<<<<<<<<7<<9<<0<<.0<*:77,;     MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:2:29:1822:1881       83      chr2    328     74      40M     =       150     -218    ATGAAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACATTGCAA        ;87;;<<<;<5<5<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<:<<<<<<        MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_99:8:187:199:369  153     chr2    329     74      35M     *       0       0       TGAAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACATT     ;<><<<<<<<<7<<<<<<<<=<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:32 Aq:i:19 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:2:23:268:529  153     chr2    329     71      35M     *       0       0       TGAAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACATT     7;<<<<<<57;-<<<<<<:<77<<<<<<<;<;<<<     MF:i:32 Aq:i:28 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_26:2:315:219:7  153     chr2    330     69      35M     *       0       0       GAAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACATTG     7==::<2=8<<<=====>888<=2=>==>,>,>>8     MF:i:32 Aq:i:19 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS192_3:4:63:5:870    83      chr2    330     75      35M     =       148     -217    GAAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACATTG     :<;<;<<<4:;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_591:5:243:557:560   163     chr2    331     75      36M     =       499     204     AAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACATTGCA    <<<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<89<<9<;    MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:2:270:430:269   163     chr2    331     99      36M     =       519     224     AAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACATTGCA    <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;;7;:    MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_66:6:284:442:747 89      chr2    331     75      35M     *       0       0       AAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACATTGC     <;<<<<<:<;<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:32 Aq:i:29 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS218_4:7:71:31:1973  89      chr2    331     76      35M     *       0       0       AAAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACATTGC     <<<<<7<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:32 Aq:i:29 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_93:2:30:466:652   147     chr2    332     98      35M     =       163     -204    AAGAGGCTAAAAGAATGCCAGGAAGATACATTGCA     <<<<<;3;&<<<<<<<</6<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:0  H1:i:1
+EAS56_61:3:208:118:673 147     chr2    332     76      35M     =       169     -198    AAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACATTGCA     <<<<<;;<;<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:1:95:1530:28 163     chr2    332     74      35M     =       490     193     AAGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACATTGCA     ;;;;;;;;;;:;;;;;;;8;;;;;;;;;;;77747     MF:i:18 Aq:i:9  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_64:7:104:965:517 73      chr2    333     77      35M     =       333     0       AGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACATTGCAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<8<<;<<     MF:i:64 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_64:7:104:965:517 133     chr2    333     0       *       =       333     0       NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN     !!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!     MF:i:192
+EAS54_65:7:155:629:357 163     chr2    333     99      35M     =       521     223     AGAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACATTGCAA     <<<<<<<<8<8<<6<<<<<<<<;<9<5<;<;;941     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_28:4:149:572:877        83      chr2    334     99      36M     =       197     -173    GAGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACATTGCAAGA    6<94693<;<<<<;;<<<<<<<<<<;9<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:5:53:544:889  99      chr2    335     76      35M     =       495     195     AGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACATTGCAAGA     <<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<;<<     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_61:6:226:370:91  99      chr2    335     99      35M     =       482     182     AGGCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACATTGCAAGA     8<<<;<8<8<;<<<8<<;7<7;8784<<,;864<&     MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_59:4:119:651:88  163     chr2    337     99      35M     =       527     225     GCTCAAAGAATGCCAGGAAGATACATTGCAAGACA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9;<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_597:6:20:592:496    163     chr2    338     75      35M     =       498     195     CTCAAAGAATGCCAGGAAGATACATTGCAAGACAG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<==<<<<<<:<     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_65:3:214:946:229 83      chr2    339     99      35M     =       165     -209    ACAAAGAATGCCAGGAAGATACATTGCAAGACAGA     )+<<<*<<77;8<;7<<8<4<;<88<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:1  UQ:i:8  H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_7:5:163:982:695 99      chr2    339     77      35M     =       499     195     TCAAAGAATGCCAGGAAGATACATTGCAAGACAGA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<;     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS218_1:4:14:1872:1521        163     chr2    339     62      35M     =       500     196     TCAAAGAATGCCAGGAAGATACATTGCAAGTCAGA     7<<<<77<<<3<3<7.'<<<<<7<67<+.0%4*<4     MF:i:18 Aq:i:2  NM:i:1  UQ:i:4  H0:i:1  H1:i:0
+EAS192_3:4:293:168:240 147     chr2    340     99      35M     =       167     -208    CAAAGAATGCCAGGAAGATACATTGCAAGACAGAC     +;;;;<8<<86<<<<<<<;;8;7;<;<8<8;<<<<     MF:i:18 Aq:i:48 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_62:5:86:697:941  83      chr2    341     99      35M     =       187     -189    AAAAAAATCCCGGAAGATACATTGCAAGACAGACT     1<<%<<<1:<58<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:27 NM:i:4  UQ:i:67 H0:i:0  H1:i:0
+EAS54_71:4:14:88:306   99      chr2    341     99      34M     =       521     215     AAAGAATGCCAGGAAGATACATTGCAAGACAGAC      <<<<<<8<<<<<<;<<<3<<<8<<;<;;<15<:6      MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_26:6:183:697:555        163     chr2    341     84      35M     =       505     199     AAAGAATGCCAGGAAGATACATTGCCAGACAGACT     =====================:===&==:;==5;;     MF:i:18 Aq:i:37 NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:0  H1:i:1
+EAS56_57:3:41:739:907  163     chr2    344     99      35M     =       520     211     GAATGCCAGGAAGATACATTGCAAGACAGACTTCA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<9<<<;;;;;     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_3:2:100:1147:124        83      chr2    345     99      35M     =       150     -230    AATGCCAGGAAGATACATTGCAAGACAGACTTCAT     <<<<96<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:29 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_67:5:127:828:697 99      chr2    346     99      35M     =       552     241     ATGCCAGGAAGATACATTGCAAGACAGACTTCATC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;;<;     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_63:8:62:125:888  163     chr2    347     99      35M     =       504     192     TGCCAGGAAGATACATTGCAAGACAGACTTCATCA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<::<<<:7<::<:;<<:     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:1:1:1598:843 163     chr2    347     99      40M     =       500     193     TGCCAGGAAGATACATTGCAAGACAGACTTCATCAAGATA        <<<<<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<4:8::        MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_11:2:71:83:58   83      chr2    349     77      35M     =       148     -236    CCAGGAAGATACATTGCAAGACAGACTTCATCAAG     8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS219_FC30151:1:88:1454:418   163     chr2    349     99      35M     =       522     208     CCAGGAAGATACATTGCAAGACAGACTTCATCAAG     :<<:<<<<<<<<<<<::::<:<:<9<5<<<<<<8:     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_595:5:36:649:554    163     chr2    350     99      35M     =       523     208     CAGGAAGATACATTGCAAGACAGACTTCATCAAGA     <<<<<4<<8<<<<<<8<6<<88<<<<<<<-;<;0;     MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_610:2:189:831:878   163     chr2    351     99      35M     =       555     239     AGGAAGATACATTGCAAGACAGACTTCATCAAGAT     :<<<2<<<<<<<<<<:8<8<<<<<<<<<<87489;     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:6:14:1211:1332       83      chr2    351     99      35M     =       178     -208    AGGAAGATACATTGCAAGACAGACTTCATCAAGAT     978961;;991;97;<;;<;<<;;;;;<;;<:8:<     MF:i:18 Aq:i:64 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_30:4:328:537:640        147     chr2    352     99      35M     =       185     -202    GGAAGATACATTGCAAGACAGACTTCATCAAGATA     ;:<<;<<<<<::<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:1:85:361:418    99      chr2    353     99      36M     =       517     200     GAAGATACATTGCAAGACAGACTTCATCAAGATATG    <<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<;4;<<<<3    MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_28:2:329:437:643        99      chr2    354     99      36M     =       540     222     AAGATACATTGCAAGACAGACTTCATCAAGATATGT    <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;<<<<1    MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_99:6:135:354:66   147     chr2    356     99      35M     =       188     -203    GATACATTGCAAGACAGACTTCATCAAGATATGTA     ;;;;7<<<<:<<<<;<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_97:7:9:648:712    147     chr2    358     99      35M     =       182     -211    TACATTGCAAGACAGACTTCATCAAGATATGTAGT     *;0;;;95<<<<7<<<;;<<<;;<<<<;<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_11:4:36:1184:994        163     chr2    358     99      35M     =       518     195     TACATTGCAAGACAGACTTCATCAAGATATGTAGT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<<8<     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_11:4:50:30:15   147     chr2    358     10      35M     =       192     -201    TACATTGCAAGACAGTCGTCAGCAAGATATGTAGT     1-%-22&&)&11,&/&&176<&<<<222<,6,<<<     MF:i:18 Aq:i:10 NM:i:3  UQ:i:26 H0:i:0  H1:i:0
+EAS51_66:4:322:350:374 163     chr2    360     99      35M     =       546     221     CATTGCAAGACAGACTTCATCAAGATATGTAGTCA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_61:7:41:745:603  163     chr2    360     99      35M     =       536     211     CATTGCAAGACAGACTTCATCAAGATATGTAGTCA     <<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<6<:8<<:     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_63:8:138:186:459 163     chr2    360     97      35M     =       518     193     CATTGCAAGACAGACTTCATCAAGATATGTAGTCA     <*<<7<<0<7<<+<-:<<&<:6:4:0-:<<2.:5<     MF:i:18 Aq:i:37 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_3:4:41:1308:619 83      chr2    360     99      35M     =       184     -211    CATTGCAAGACAGACTTCATCAAGATATGTAGTCA     0<9476<<<<<0<<<2<&<0<.<<<<<<<<<.<<<     MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:1:125:884:276 163     chr2    362     99      35M     =       541     214     TTGCAAGACAGACTTCATCAAGATATGTAGTCATC     <<<<<<<<<<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<;     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_32:4:156:21:69  83      chr2    362     99      35M     =       163     -234    TTGCAAGACAGACTTCATCAAGATATGTAGTCATC     <:3:<<;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:5:66:1381:181        163     chr2    362     99      40M     =       544     222     TTGCAAGACAGACTTCATCAAGATATGTAGTCATCAGACT        <<6<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<::4:7        MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS219_FC30151:7:11:1261:1200  163     chr2    362     99      35M     =       558     231     TTGCAAGACAGACTTCATCAAGTTATGTAGTCATC     <<<<<<<<<<<;<<<<<<<<;<<<;<:<<8<<:<<     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+EAS1_99:5:191:885:623  163     chr2    363     99      35M     =       551     223     TGCAAGACAGACTTCATCAAGATATGTAGTCATCA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<;;;;     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_103:7:53:783:78   99      chr2    363     99      35M     =       561     233     TGCAAGACAGACTTCATCAAGATATGTAGTCATCA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;<7;<:;     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_64:5:177:24:389  83      chr2    365     99      35M     =       175     -225    CAAGACAGACTTCATCAAGATATGTAGTCATCAGA     +<<;<9<<<9<<;<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_597:5:58:684:520    99      chr2    367     99      35M     =       538     206     AGACAGACTTCATCAAGATATGTAGTCATCAGACT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:;;<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:6:71:187:824  99      chr2    367     99      35M     =       534     202     AGACAGACTTCATCAAGATATGTAGTCATCAGACT     ;===;======3==;==========4=;=7;;3;6     MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_26:1:324:238:736        83      chr2    367     99      35M     =       180     -222    AGACAGACTTCATCAAGATATGTAGTCATCAGACT     <<<9<<<70,<<4<<<<<7<4<7<<<<<0<<<<<7     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_11:6:19:306:982 99      chr2    368     99      35M     =       538     205     GACAGACTTCATCAAGATATGTAGTCATCAGACTA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<     MF:i:18 Aq:i:78 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_597:2:168:829:88    83      chr2    369     99      35M     =       205     -199    ACAGACTTCATCAAGATATGTAGTCATCAGACTAT     <,,;<838883;;;<<<<<;<8<8;<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_81:6:122:589:134 163     chr2    369     99      35M     =       562     228     ACAGACTTCATCAAGATATGTAGTCATCAGACTAT     <<:<<:<:<<<<<:<8<<<<<<<:<::<<<4:<;;     MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_95:3:303:970:243  163     chr2    370     99      35M     =       564     229     CAGACTTCATCAAGATATGTAGTCATCAGACTATC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<<<<<<<<8<8<     MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_7:2:19:736:559  147     chr2    370     99      35M     =       209     -196    AAGACTTCATCAAGATATGTAGTCATCAGACTATC     )<7<2;;4<<4<<<<;<<<<<<<<<<7<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:1  UQ:i:8  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_66:3:246:711:981 99      chr2    371     99      35M     =       559     223     AGACTTCATCAAGATATGTAGTCATCAGACTATCT     <<<<<<<<;<<<<:;<<;;<:<<<4<<:4;00<;<     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_1:6:89:1164:573 99      chr2    371     99      35M     =       560     224     AGACTTCATCAAGAGATGTAGTCATCAGACTATCT     <:<<;<2<<<<<<<&:2<;<;<<<<;,+;:<<4:<     MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:0  H1:i:1
+EAS220_1:8:18:1757:95  147     chr2    374     45      35M     =       216     -193    CTTCATCAAGATATGTAGTCATCAGACTATCTAAA     <<<6<&:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:2:284:597:682 99      chr2    375     99      35M     =       557     217     TTCATCAAGATATGTAGTCATCAGACTATCTAAAG     <<<<<<<9<<<<<;<<6<<<<<;<9<<<<<<1;;9     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_597:3:10:394:392    99      chr2    376     99      35M     =       542     201     TCATCAAGATATGTAGTCATCAGACTATCTAAATT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<;<<;;:6&;     MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_97:5:28:538:148   163     chr2    376     99      35M     =       557     216     TCATCAAGATATGTAGTCATCAGACTATCTAAAGT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<+771;     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_3:2:60:590:1760 147     chr2    376     99      35M     =       201     -210    TCATCAAGATATGTAGTCATCAGACTATCTAAAGT     <8<-<<<<<<<82<<<4<<<<<<<<<<<<<8<<<<     MF:i:18 Aq:i:51 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:3:73:1158:535        83      chr2    377     99      40M     =       213     -204    AATAAAGATATGTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACAT        +;6+;<;<<<<<<<<<0<<;<<<;<<<8<<<<<<<<<<<<        MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:2  UQ:i:20 H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_7:3:182:104:921 99      chr2    378     99      35M     =       575     232     ATCAAGATATGTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_97:3:160:173:889  83      chr2    379     99      35M     =       215     -199    TCAAGATATGTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAA     ;)<</<8<<<<<<</<;<<<<;<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_30:7:71:311:202 83      chr2    379     99      35M     =       188     -226    TCAAGATATGTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAA     ;6<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:4:315:201:673   163     chr2    381     45      36M     =       542     197     AAGATATGTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACAT    <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<<<:;    MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_95:2:228:915:631  163     chr2    381     66      35M     =       547     201     AAGATATGTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACA     =================;==========4======     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_103:1:228:736:747 163     chr2    381     68      35M     =       542     196     AAGATATGTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACA     <<<<<<<<<;<<<<<<<;;<<;<<<<;::<;;7;7     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_66:3:263:689:572 99      chr2    381     68      35M     =       553     207     AAGATATGTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACA     <<<<;<<<<<;<<<<<<&;;<<<;<<:<+;;7;;7     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_71:5:81:685:141  147     chr2    382     85      35M     =       207     -210    AGATATGTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACAT     ;+;(;)..=3.1=.7=;=8;==<4====;======     MF:i:18 Aq:i:17 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:2  H1:i:2
+EAS114_32:1:208:971:600        163     chr2    382     99      35M     =       559     212     AGATATGTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACAT     <<<<<<<<<<<<<<<<<8<<:<<<0;44<<:4<:<     MF:i:18 Aq:i:51 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_3:8:7:1864:1569 99      chr2    382     99      35M     =       561     214     AGATATGTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACAT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<8<<<<     MF:i:18 Aq:i:51 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_95:4:224:592:744  147     chr2    383     99      35M     =       188     -230    GATATGTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACATG     6<6<<<<<<9+<6-<<<:<:<:<<<<<:<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_61:6:25:949:33   147     chr2    383     99      35M     =       201     -217    GATATGTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACATG     -<4<666<<-7<5<<<<<(<<<<<<<<<<<<<<-<     MF:i:18 Aq:i:63 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:2  H1:i:1
+EAS54_73:5:271:874:367 163     chr2    384     99      35M     =       560     211     ATATGTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACATTA     <<<<<<<<<<<<<<4<;<;<:<;4<4<<99<7<+%     MF:i:18 Aq:i:51 NM:i:1  UQ:i:10 H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:4:26:1312:1400       147     chr2    385     99      40M     =       207     -218    TATGTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACATGAAGGAAA        ::77:<;:+6<+<<<;<<74<<<;<<;<<<<<<<<<<<;<        MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:2  H1:i:2
+EAS51_66:6:310:747:415 83      chr2    387     99      35M     =       217     -205    TGTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACATGAAGG     ;<<<;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:24 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:2  H1:i:6
+EAS56_57:6:4:223:776   83      chr2    387     93      35M     =       203     -219    TGTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACATGAAGG     <;9<;<0<<;<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:19 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:2  H1:i:6
+EAS114_28:3:32:492:907 99      chr2    387     95      36M     =       571     220     TGTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACATGAAGGA    <<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;;<<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:20 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:5
+EAS114_26:4:110:840:431        163     chr2    388     93      35M     =       567     214     GTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACATGAAGGA     =====================5:======54=+3+     MF:i:18 Aq:i:21 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:5
+EAS114_45:6:86:693:234 83      chr2    388     82      35M     =       202     -221    GTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACATGAAGGA     83997;<;;;;98;;3*6<<;<:8;;;;;<;;<<<     MF:i:18 Aq:i:18 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:3  H1:i:13
+EAS139_11:8:96:1314:1448       83      chr2    388     93      35M     =       213     -210    GTAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACATGAAGGA     <<<<7<<:<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:18 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:3  H1:i:8
+EAS114_30:6:41:461:436 83      chr2    389     74      35M     =       200     -224    TAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACATGAAGGAA     ;<986<;6<<<<<<<;<<<<<<<<<;<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:3  H1:i:13
+EAS221_3:8:55:932:613  163     chr2    389     77      35M     =       568     214     TAGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACATGAAGGAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:3  H1:i:10
+EAS1_97:5:219:174:684  163     chr2    390     71      35M     =       560     205     AGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACATGAAGGAAA     <<<<<<<<<<<8<8<<<7<<;<<<<<2<;&;;;;9     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:2  H1:i:14
+EAS56_57:5:24:284:360  163     chr2    390     76      35M     =       567     212     AGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACATGAAGGAAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<;<9;<;99;;     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:2  H1:i:14
+EAS114_26:1:113:367:659        83      chr2    390     72      35M     =       222     -203    AGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACATGAAGGAAA     <<5<0&9;<3<<<<<9<<<<4<;<9<9<<<<7<3<     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:3  H1:i:17
+EAS114_32:5:109:199:592        163     chr2    390     72      35M     =       576     221     AGTCATCAGACTATCTAAAGTCAACATGAAGGAAA     <<<<<<<<<<<;:<;;<<:;6<<;:;:<<+;;;<;     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:2  H1:i:14
+EAS114_45:4:88:55:1187 147     chr2    391     66      35M     =       220     -206    GTCATCAGACTATCTAAAGTCAACATGAAGGAAAA     7769,7;;;;;;;;;;;;;;9;;;;;;;;;;;;;;     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:2  H1:i:7
+EAS56_59:2:60:677:921  147     chr2    393     96      35M     =       250     -178    CATCAGACTATCTAAAGTCAACATGAAGGAAAAAA     ========9==;======8==>=============     MF:i:18 Aq:i:22 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:4  H1:i:13
+EAS114_39:3:88:84:1558 147     chr2    394     95      35M     =       203     -226    ATCAGACTATCTAAAGTCAACATGAAGGAAAAAAA     ;;<<;<<;<<5<<<<<<;<<:<<<;<<<<<<;<<<     MF:i:18 Aq:i:22 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:2  H1:i:3
+EAS56_59:2:201:768:529 83      chr2    396     99      35M     =       225     -206    CAGACTATCTAAAGTCAACATGAAGGAAAAAAATT     3<:<9<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_591:2:13:100:876    83      chr2    397     73      36M     =       223     -210    AGAATATATAAAGTCAACATGAAGGAAAAAAATTCT    ;9<$<<<$<<<<<<<<75<<<<<<<9<9<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:2  UQ:i:6  H0:i:1  H1:i:1
+EAS139_11:4:26:137:1382        99      chr2    397     99      35M     =       579     217     AGACTATCTAAAGTCAACATGAAGGAAAAAAATTC     <<<<<<7<<<77<<<<<<</<<+<<<<<<7<+<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:2
+EAS54_67:3:197:261:624 99      chr2    398     99      35M     =       587     224     GACTATCTAAAGTCAACATGAAGGAAAAAAATTCT     <<<<<<<<<<<;<<<<<<<;<<;<<<<<<;<<<9<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:1
+EAS218_4:3:41:1281:1785        147     chr2    399     99      35M     =       237     -197    ACTATCTAAAGTCAACATGAAGGAAAAAAATTCTA     <6<<<6<<<<<<:<<6<:<<<<<<<<<<<<6<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:3
+B7_610:5:51:904:391    83      chr2    401     97      35M     =       212     -224    TATCTAAAGTCAACATGAAGGAAAAAAATTCTAAA     ;<96<<<<<<7<<7<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:24 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:2
+EAS56_63:7:137:139:248 163     chr2    401     97      35M     =       569     203     TATCTAAAGTCAACATGAAGGAAAAAAATTCTAAA     <<<<<<<<<9<<<<<<<<<<;<<<<<<<;;<;<;<     MF:i:18 Aq:i:22 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:3  H1:i:2
+B7_610:7:15:696:693    163     chr2    403     34      35M     =       570     202     TCTAAAGTCAACATGAAGGAAAAAAATTCTAAAAT     2:+:7<<3<<<<<6+36<<<<<<<6<<6&<<;<.7     MF:i:18 Aq:i:10 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:2  H1:i:1
+EAS114_45:2:41:199:388 147     chr2    403     99      35M     =       243     -195    TCTAAAGTCAACATGAAGGAAAAAAATTCTAAAAT     84898;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:4:163:611:211 83      chr2    405     99      35M     =       234     -206    TAAAGTCAACATGAAGGAAAAAAATTCTAAAATCA     <<<<9<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:48 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS192_3:1:114:19:769  163     chr2    405     90      35M     =       572     202     TAAAGTCAACATGAAGGAAAAAAATTCTAAAATCA     <<<<<*2;6;<<<4.;;<&;;<.<40)<);5-/7;     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:2
+EAS51_64:7:92:493:891  147     chr2    408     99      35M     =       240     -203    AGTCAACATGAAGGAAAAAAATTCTAAAATCAGCA     <383<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:49 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS220_1:8:5:996:2000  163     chr2    408     99      35M     =       575     202     AGTCAACATGAAGGAAAAAAATTCTAAAATCAGCA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:1
+EAS1_93:1:179:629:513  83      chr2    409     99      35M     =       220     -224    GTCAACATGAAGGAAAAAAATTCTAAAATCAGCAA     <;,<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:49 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS218_4:1:84:1505:1037        99      chr2    409     99      35M     =       586     212     GTCAACATGAAGGAAAAAAATTCTAAAATCAGCAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<::)     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:1
+EAS221_1:6:96:491:1891 83      chr2    409     99      35M     =       253     -191    GTCAACATGAAGGAAAAAAATTCTAAAATCAGCAA     :;5<<7<;:<<;<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:46 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:7:307:481:625   147     chr2    410     99      36M     =       245     -201    TCAACATGAAGGAAAAAAATTCTAAAATCAGCAAGA    ;4<<4<;;<<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:2  H1:i:0
+B7_610:5:120:596:847   83      chr2    410     83      35M     =       211     -234    TCAACATGAAGGAAAAAAATTCTAAAATCAGCAAG     ;/<<:<;<<<<<<<<<<<<<;;<<<<<;<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:1
+EAS114_45:3:3:864:1888 99      chr2    411     99      35M     =       579     203     CAACATGAAGGAAAAAAATTCTAAAATCAGCAAGA     ;<<;;<<;;;<;;<<;<;<<;<<;8<<:<;79799     MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS218_4:1:34:1614:558 99      chr2    411     99      35M     =       569     193     CAACATGAAGGAAAAAAATTCTAAAATCAGCAAGA     <<<<<<<<<<<7<<<<<8<<<<<<2<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:37 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_63:5:117:570:971 83      chr2    413     99      35M     =       223     -225    ACATGAAGGAAAAAAATTCTAAAATCAGCAAGAGA     <,<9<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:2  H1:i:1
+EAS112_34:8:45:800:733 163     chr2    413     99      35M     =       607     229     ACATGAAGGAAAAAAATTCTAAAATCAGCAAGAGA     <<<</<<<<<<<<<<<<<<<2<9<<<<<5*5;599     MF:i:18 Aq:i:34 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:1
+EAS219_FC30151:7:87:1289:83    163     chr2    413     99      35M     =       585     207     ACATGAAGGAAAAAAATTCTAAAATCAGCAAGAGA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<;<<<<<<:     MF:i:18 Aq:i:49 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:1
+EAS114_39:4:58:271:612 147     chr2    415     99      35M     =       236     -214    ATGAAGGAAAAAAATTCTAAAATCAGCAAGAGCAA     ;:2=<<;<<<<<<:67:<<:<<<<<<<<<<<<,<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:1  UQ:i:11 H0:i:0  H1:i:2
+EAS1_108:1:33:779:821  163     chr2    416     99      35M     =       579     198     TGAAGGAAAAAAATTCTAAAATCAGCAAGAGAAAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:3
+EAS112_34:6:75:615:555 147     chr2    416     99      35M     =       255     -196    TGAAGGAAAAAAATTCTAAAATCAGCAAGAGAAAA     ;<<<;<<<<<<<<<:;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:2  H1:i:0
+EAS188_7:6:11:994:584  147     chr2    417     97      35M     =       226     -226    GAAGGAAAAAAATTCTAAAATCAGCAAGAGAAAAG     <<<<;<<<<<<<;<:<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:24 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:2  H1:i:0
+EAS114_26:7:218:858:445        147     chr2    421     99      35M     =       239     -217    GAAAAAAATTCTAAAATCAGCAAGAGAAAAGCATA     ;<<<<<<<8;:<<<<<<;<<:<<<<<<<<<<<<;<     MF:i:18 Aq:i:27 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:1
+EAS54_81:2:317:72:221  83      chr2    422     99      35M     =       270     -187    AAAAAAATTCTAAAATCAGCAAGAGAAAAGCATAC     =========:======;==;===============     MF:i:18 Aq:i:53 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS220_1:4:70:766:2016 163     chr2    422     99      35M     =       607     220     AAAAAAATTCTAAAATCAGCAAGAGAAAAGCATAC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:2  H1:i:0
+EAS56_53:4:45:707:147  83      chr2    424     99      35M     =       216     -243    AAAAATTCTAAAATCAGCAAGAGAAAAGCATACAG     <<<<<<;3<<<<<4;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:51 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS219_1:7:16:1343:1621        147     chr2    426     99      35M     =       248     -213    AAATTCTAAAATCAGCAAGAGAAAAGCATACAGTC     ;<<9;7=====;;==<==================<     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_595:5:184:912:258   99      chr2    428     99      35M     =       582     189     ATTCTAAAATCAGCAAGAGAAAAGCATACAGTCAT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_62:5:119:38:945  147     chr2    428     99      35M     =       221     -242    ATTCTAAAATCAGCAAGAGAAAAGCATACAGTCAT     =;;8=====:========<================     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:6:95:235:746  163     chr2    430     99      35M     =       598     203     TCTAAAATCAGCAAGAGAAAAGCATACAGACATCT     <<<<;<<<<<<<<79<<<<<<<<<<<<<<*;;;<9     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:1  UQ:i:9  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_99:2:188:782:483  83      chr2    431     99      35M     =       277     -189    CTAAAATCAGCAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTA     7<<<<<<4<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_30:3:39:348:594 163     chr2    431     99      35M     =       600     204     CTAAAATCAGCAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTA     <<;<<<<<<<<<;<;;<<<<<<<<<<;<<<:<:<:     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_95:4:176:971:874  83      chr2    432     76      9M1D26M =       273     -195    TAAAATCAGAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTATA     <<<<<:<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:130        Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:0  H1:i:0
+EAS114_30:3:14:697:541 147     chr2    432     99      35M     =       259     -208    TAAAAGCAGCAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTAT     8<<<<&6<;8<<<<<<<<<<<<;<<<<;<<<<<<8     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:1  H1:i:0
+B7_610:7:177:469:800   147     chr2    433     99      35M     =       259     -209    AAAATCAGCAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTATA     =<<<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:1:131:518:588 163     chr2    433     99      35M     =       607     209     AAAATCAGCAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTATA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<1<<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS192_3:8:6:237:885   147     chr2    433     99      35M     =       269     -199    AAAATCAGCAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTATA     <<<<1:<;:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_53:3:134:126:465 147     chr2    434     99      35M     =       245     -224    AAATCAGCAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTATAA     <<;:&<3)<<7<:<<<<.:<<<<<8<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:56 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_59:2:104:402:732 163     chr2    434     99      35M     =       610     211     AAATCAGCAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTATAA     =========================7=;===;=:=     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS218_4:3:65:85:1547  83      chr2    434     99      35M     =       257     -212    AAATCAGCAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTATAA     <<<<<<;:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_71:2:85:686:696  163     chr2    435     99      35M     =       594     193     AATCAGCAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTATAAA     ==================<=====:==<=<;=:==     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_28:1:144:242:602        163     chr2    436     99      36M     =       611     211     ATCAGCAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTATAAAGG    ========================;=====<;;<<;    MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:2:204:737:61  83      chr2    437     99      35M     =       247     -225    TCAGCAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTATAAAGG     (7=72=;==2=====<===<<==============     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_81:7:124:253:889 163     chr2    437     99      35M     =       598     196     TCAGCAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTATAAAGG     <<<<<<6<<:<<<<<<<<<<<<<;;<<;<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_30:7:310:155:312        163     chr2    438     99      35M     =       606     203     CAGCAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTATAAAGGA     ;<<<;<<<8<<<<<<<<<<<<;<<<<<8<<<<8<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS192_3:7:78:692:671  99      chr2    438     99      35M     =       610     207     CAGCAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTATAAAGGA     <<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<:<<:<<<:8<<0;;     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_71:7:130:260:553 147     chr2    439     99      35M     =       250     -224    AGCAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTATAAAGGAA     <*;<<7<);<<;9;<5<*<9<;<<;;<7<<<<<1<     MF:i:18 Aq:i:42 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_11:7:60:163:1612        163     chr2    439     99      35M     =       617     213     AGCAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTATAAAGGAA     <<<<<<<<<21<<<<<<<<<3<--<+<<<+<<63<     MF:i:18 Aq:i:59 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_597:6:106:595:322   83      chr2    440     99      35M     =       274     -201    GCAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTATAAAGGAAA     ;+<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<7<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_65:5:211:84:84   147     chr2    440     99      35M     =       268     -207    GCAAGAGAAAAGCATACAGTCATCTATAAAGGAAA     6:<<:<<<<<<9<<<<<<<<<<<;<<<;;;<;<3;     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_105:2:280:662:939 147     chr2    442     99      35M     =       294     -183    AAGAGAAAAGCATACAGTCATCTATAAAGGAAATC     <<;<;<<<<<:<<<;<<<;<<;<<<<<<<<<<<;<     MF:i:18 Aq:i:48 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_595:6:52:751:360    83      chr2    443     99      35M     =       263     -215    AGAGAAAAGCATACAGTCATCTATAAAGGAAATCC     <-<9<<<<<6<<<8<<;;<<9<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_103:2:234:167:381 163     chr2    443     99      35M     =       625     217     AGAGAAAAGCATACAGTCATCTATAAAGGAAATCC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<;;7<;;     MF:i:18 Aq:i:49 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:6:37:156:134 83      chr2    443     99      35M     =       261     -217    AGAGAAAAGCATACAGTCATCTATAAAGGAAATCC     99998<<<<:<<<<<<<;<<><<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:49 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_59:1:93:490:901  83      chr2    445     99      35M     =       280     -200    AGAAAAGCATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCA     <<<<<<<;<<<;<<<;<<;<<;<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:53 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS112_34:7:96:489:453 99      chr2    445     99      35M     =       625     215     AGAAAAGCATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;;;:     MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_26:6:46:13:880  147     chr2    445     99      35M     =       290     -190    AGAAAAGCATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCA     =&====8==========0=================     MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_28:2:167:905:852        163     chr2    445     99      36M     =       647     238     AGAAAAGCATACAGTCATCTATAAAGAAAATCCCAT    <<<7<<<<<<<<<<<<<<:<:<<:::&.<:<66:3<    MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:0  H1:i:1
+EAS219_FC30151:3:13:674:1717   163     chr2    445     99      35M     =       623     213     AGAAAAGCATGCAGTCATCTATAAAGGAAATCCCA     <<<<<<<<<<%<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;:;;;     MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:1  UQ:i:4  H0:i:0  H1:i:1
+EAS51_62:7:196:511:896 83      chr2    446     99      35M     =       283     -198    GAAAAGCATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCAT     8<<<<<;<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:52 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_53:1:154:118:488 163     chr2    447     99      35M     =       624     212     AAAAGCATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCATC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:7<<<<7<:;;::     MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:2:44:153:969  83      chr2    447     95      35M     =       245     -237    AAAAGCATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCATC     <<5<:7<72<51<7<*79<<<<<5<<<<<<<<<2<     MF:i:18 Aq:i:36 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_28:4:215:246:640        99      chr2    447     99      36M     =       624     213     AAAAGCATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCATCA    <<<<<<<<<<9<;<<<<<<<<<<9;<<<<<<3;<;3    MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS219_1:7:94:1655:1921        147     chr2    447     85      35M     =       258     -224    AAAAGCATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCATC     <<<<;:===<==;<==<;================;     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_1:6:60:1037:1146        147     chr2    447     99      35M     =       250     -232    AAAAGCATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCATC     <<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:53 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_65:1:23:536:229  99      chr2    448     99      35M     =       614     201     AAAGCATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCATCA     <<<<<<<<<<<<<<<<<:<8<:<<;<<<<<<7<<<     MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS112_34:6:130:865:838        163     chr2    448     99      35M     =       649     236     AAAGCATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCATCA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;:<;3     MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_59:2:239:1001:406        99      chr2    450     99      35M     =       634     219     AGCATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCATCAGA     <<<<<<7<<<<<<<<8<;<<<7<<<<36<<3<:33     MF:i:18 Aq:i:49 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_97:3:147:423:584  147     chr2    451     99      35M     =       277     -209    GCATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCATCAGAA     27<;<3<<<+<<;<<<;;-4<<<<<;<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_99:1:187:715:521  83      chr2    451     99      35M     =       291     -195    GCATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCATCAGAA     <7<:<9<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_67:3:172:196:746 99      chr2    451     99      35M     =       620     204     GCATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCATCAGAA     <<<<<<<<9<<<<9<<<<<<<<<;<<<<6<<<<;<     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_71:3:267:821:860 83      chr2    451     99      34M     =       296     -189    GCATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCATCAGA      $&<<<.<:;6<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<      MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:3
+EAS56_61:7:7:682:201   83      chr2    452     99      35M     =       288     -199    CATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCATCAGAAT     0:8;5<8<1:78<<<<<<<<<<<<:8<<2<<<<:<     MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_589:3:82:13:897     163     chr2    453     99      35M     =       606     188     ATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCAGCAGAATA     <<<<;<<<<<<;<;<;5<51;<1<<<<%<<<<,58     MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:1  UQ:i:4  H0:i:0  H1:i:1
+EAS56_53:6:180:695:621 99      chr2    453     99      35M     =       637     219     ATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCATCAGAATA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;::<<<     MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:2:158:909:321 83      chr2    453     99      35M     =       271     -217    ATACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCATCAGAATA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_26:2:237:497:165        99      chr2    454     99      35M     =       619     200     TACAGTCATCTATAAAGGAAATCCCATCAGAATAA     8===<8===========37=<===7=;7=8=====     MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_99:2:152:355:962  83      chr2    456     99      35M     =       269     -222    CAGTCATCTATAAAGGAAATCCCATCAGAATAACA     &<.9.<;+;<;<<<<<<<<<<::<<:<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:2
+EAS192_3:4:255:549:422 83      chr2    456     99      35M     =       295     -196    AAGTCATCTATAAAGGAAATCCCATCAGAATAACA     &<;;+<;4;<<<<<<<<<<<;<;<<;<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:1  H1:i:2
+EAS220_1:4:100:20:1199 163     chr2    456     99      35M     =       614     193     CAGTCATCTATAAAGGAAATCCCATCAGAATAACA     7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<4<<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_67:5:71:408:741  163     chr2    457     99      35M     =       637     215     AGTCATCTATAAAGGAAATCCCATCAGAATAACAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_66:5:285:395:450 147     chr2    458     99      35M     =       269     -224    GTCATCTATAAAGGAAATCCCATCAGAATAACAAT     8)3<8+;<)<<<<<<<<97:7<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_73:3:4:854:140   99      chr2    458     72      35M     =       638     215     GTCATCTATAAAGGAAATCCCATCAGAATAACAAT     <<<6<<<:<6<<<:36:<<<<3<<8:.6<38::4<     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_59:6:227:657:95  147     chr2    458     99      35M     =       280     -213    GTCATCTATAAAGGAAATCCCATCAGAATAACAAT     ;3;<);<<<<<<<<<<<<18<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:59 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_28:7:57:324:546 83      chr2    458     99      36M     =       281     -213    GTCATCTATAAAGGAAATCCCATCAGAATAACAATG    ;;5<;,<<<;;<<<<<<<97<<<<<<<<<<9<<<<<    MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:4:26:274:1078        83      chr2    458     99      40M     =       282     -216    GTCATCTATAAAGGAAATCCCATCAGAATAACAATGGGCT        9:*:64<<;<<<<<<<<<;8;<<:<<<<<<<<<<<<<<<<        MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_7:6:107:636:642 163     chr2    458     99      35M     =       630     207     GTCATCTATAAAGGAAATCCCATCAGAATAACAAT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_81:7:226:869:36  147     chr2    461     99      35M     =       273     -223    ATATATAAAGGAAATCCCATCAGAATAACAATGGG     <0/)</<<<:<<<<<)<<7<<<<<+55<<1<<<:<     MF:i:18 Aq:i:59 NM:i:1  UQ:i:14 H0:i:1  H1:i:0
+EAS192_3:4:312:915:751 99      chr2    461     99      35M     =       621     195     ATCTATAAAGGAAATCCCATCAGAATAACAATGGG     <2<<<<<<<8;<<<<<<<<:<<<<8<<<<<84,4:     MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_4:7:96:899:106  99      chr2    462     99      35M     =       636     209     TCTATAAAGGAAATCCCATCAGAATAACAATGGGC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_93:5:62:969:12    147     chr2    464     99      35M     =       303     -196    TATAAAGGAAATCCCATCAGAATAACAATGGGCTT     <<;<;<::<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_65:6:67:56:806   99      chr2    464     99      35M     =       637     208     TATAAAGGAAATCCCATCAGAATAACAATGGGCTT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<:7:     MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_65:5:37:611:267  99      chr2    464     99      35M     =       610     181     TATAAAGGAAATCCCATAAGAATAACAATGGGCTT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+EAS1_93:7:319:280:57   147     chr2    467     99      35M     =       306     -196    AAAGGAAATCCCATCAGAATAACAATGGGCTTCTC     <<<<<<<-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_105:8:96:720:940  163     chr2    467     99      35M     =       654     222     AAAGGAAATCCCATCAGAATAACAATGGGCTTCTC     <<<<<<;<<<<<<<<<<;9<<8<<6<;:;<;;.;;     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_53:2:59:286:290  99      chr2    467     99      35M     =       628     196     AAAGGAAATCCCATCAGAATAACAATGGGCTTCTC     <<<<<<<<;<<<;<<<<<<<<<<<<<;;;<<;7;<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:2:236:841:20  163     chr2    467     99      35M     =       652     220     AAAGGAAATCCCATCAGAATAACAATGGGCTTCTC     <<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<<:<<9<<<<;<:<9     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_30:6:49:656:507 99      chr2    468     99      35M     =       637     204     AAGGAAATCCCATCAGAATAACAATGGGCTTCTCA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<;9     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_3:4:78:1314:1275        147     chr2    469     99      35M     =       277     -227    AGGAAATCCCATCAGAATAACAATGGGCTTCTCAG     <<<<<<<<6:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<1<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_99:6:181:392:500  147     chr2    470     99      35M     =       299     -206    GGAAATCCCATCAGAATAACAATGGGCTTCTCAGC     /5<<;(88<<<;<;<<6<<<<<7<<<<<<<7<<<<     MF:i:18 Aq:i:63 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_62:2:133:8:379   163     chr2    470     99      35M     =       653     218     GGAAATCCCATCAGAATAACAATGGGCTTCTCAGC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8;<<8<<<:6<     MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_59:5:198:929:684 163     chr2    471     99      35M     =       624     188     GAAATCCCATCAGAATAACAATGGGCTTCTCAGCA     <7<<<<;<<<<<<<<<<<<;<<<<<:<<<<::<:7     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_30:3:181:582:435        99      chr2    471     99      35M     =       629     193     GAAATCCCATCAGAATAACAATGGGCTTCTCAGCA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;::     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_93:1:214:784:690  99      chr2    472     99      35M     =       657     220     AAATCCCATCAGAATAACAATGGGCTTCTCAGCGG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<4<44     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:1  UQ:i:19 H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_39:3:11:1238:1728       83      chr2    475     99      35M     =       310     -200    TCCCATCAGAATAACAATGGGCTTCTCAGCGGAAA     :677<;<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+EAS112_34:4:12:273:89  163     chr2    477     99      35M     =       631     189     CCATCAGAATAACAATGGGCTTCTCAGCGGAAACC     ==========<====:=========+===4414;;     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:1  UQ:i:28 H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_63:2:119:161:322 147     chr2    479     99      35M     =       297     -217    ATCAGAATAACAATGGGCTTCTCAGCAGAAACCTT     <83<;<<;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:1
+EAS114_30:2:111:142:21 83      chr2    479     99      35M     =       304     -210    ATCAGAATAACAATGGGCTTCACAGCGGAAACCTT     ;88<:<;;<6<;;<<<:<<<<;<<<<<<<<;<<<<     MF:i:18 Aq:i:28 NM:i:2  UQ:i:53 H0:i:0  H1:i:0
+EAS1_99:1:34:649:318   83      chr2    481     65      35M     =       328     -188    AAGAATAACAATGGGCTTCACAGCGGAACCCTTAC     )<7<<3<<<<<<+<1<;<8&<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:130        Aq:i:65 NM:i:3  UQ:i:59 H0:i:0  H1:i:0
+EAS114_30:6:214:565:337        147     chr2    481     99      35M     =       326     -190    CAGAATAACAATGGGCTTCTCAGCAGAAACCTTAC     ;;<;<1<9<<<8<<<<<;<<<<<<8<<<;<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_61:6:226:370:91  147     chr2    482     99      35M     =       335     -182    AGAATAACAATGGGCTTCTCAGCGGAAACCTTACA     <':<6<;<<<;2<;<-7;;;<<<<<<<;;;<<7;<     MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+EAS139_11:6:13:682:680 99      chr2    482     99      35M     =       685     238     AGAATAACAATGGGCTTCTCAGCGGAAACCTTACA     <<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<;<;<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+B7_593:2:273:348:37    163     chr2    483     99      36M     =       688     241     GAATAACAATGGGCTTCTCAGCAGAAACCTTACACG    <<<<<<<9<49<<<;<<<<*<<19<15;<</5<;.5    MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:1  UQ:i:13 H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_11:8:76:205:587 83      chr2    483     99      35M     =       306     -212    GAATAACAATGGGCTTCTCAGCGGAAACCTTACGA     8<<5<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<</<     MF:i:18 Aq:i:28 NM:i:2  UQ:i:41 H0:i:0  H1:i:0
+B7_591:2:27:280:592    147     chr2    484     99      36M     =       310     -210    AATAACAATGGGCTTCTCAGCGGAAACCTTACAAGC    <<<<<<<<<<<8<<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+EAS1_99:7:171:196:287  163     chr2    485     99      35M     =       658     208     ATAACAATGGGCTTCTCAGCAGAAACCTTACAAGC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;6<<<<<<2:8<0:     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_65:2:224:579:433 163     chr2    485     99      35M     =       662     212     ATAACAATGGGCTTCTCAGCAGAAACCTTACAAGC     <<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<8<+8;:     MF:i:18 Aq:i:31 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS219_1:1:22:490:2011 147     chr2    485     99      35M     =       307     -213    ATAACAATGGGCTTCTCAGCGGAAACCTTACAAGC     <7<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+EAS56_65:6:46:173:214  83      chr2    487     99      35M     =       308     -214    AACAATGGGCTTCTCAGCAGAAACCTTACAAGCCA     <<2<<<<<<<<<<<5<<5<7<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:29 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:4  H1:i:6
+EAS1_103:4:164:79:134  99      chr2    488     99      35M     =       656     203     ACAATGGGCTTCTCAGCGGAAACCTTACAAGCCAG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+EAS114_32:2:283:577:398        147     chr2    488     99      35M     =       308     -215    ACAATGGGCTTCTCAGCGGAAACCTTACAAGCCAG     ;8;;&<<<;<;67<;<;<<<<<<<<;<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:29 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:2
+EAS54_67:5:149:639:910 163     chr2    489     99      35M     =       669     215     CAATGGGCTTCTCAGCAGAAACCTTACAAGCCAGA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<;;<<;<<;<     MF:i:18 Aq:i:42 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_28:3:250:628:423        83      chr2    489     99      36M     =       295     -230    CAATGGGCTTCTCAGCGGAAACCTTACAAGCCAGAA    +<<4;;9;;7.;7<;7<;<<<;;<<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:27 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+EAS1_108:1:242:419:512 163     chr2    490     94      35M     =       672     217     AATGGGCTTCTCAGCAGAAACCTTACAAGCCAGAA     <<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<8<(<30     MF:i:18 Aq:i:24 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:2
+EAS114_45:1:95:1530:28 83      chr2    490     74      35M     =       332     -193    AATGGGCTTCTCAGCAGAAACCTTACAAGCCAGAA     77741(9;;994;5;;4;;1;;;;;1;<;<<<<;<     MF:i:18 Aq:i:9  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:42 H1:i:45
+EAS192_3:6:326:887:180 163     chr2    492     73      35M     =       672     215     TGGGCTTCTCAGCAGAAACCTTACAAGCCAGAAGC     ;<<<<<;<<<<<<<<<8<<<<<<<<<<<<0<;;<+     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:1  UQ:i:25 H0:i:3  H1:i:7
+EAS1_99:1:86:871:319   99      chr2    494     71      35M     =       651     192     GGCTTCTCAGCGGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGA     <<<<<:<<<:<:<<<<<<<<<<<<8<<:<1;<::)     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:1  UQ:i:25 H0:i:0  H1:i:4
+EAS56_57:1:189:130:136 147     chr2    494     79      35M     =       314     -215    GGCTTCTCAGCAGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGA     823;23<7<57<7<<<<<;<<;<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:63 H1:i:85
+EAS51_64:7:140:752:822 99      chr2    495     76      35M     =       667     207     GCTTCTCAGCGGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGAT     <<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<<;<:;     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:5
+EAS56_57:5:53:544:889  147     chr2    495     76      35M     =       335     -195    GCTTCTCAGCGGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGAT     ,<;<<<;<<<<<<<<<:;;<<<<<;;<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:2  H1:i:32
+EAS54_65:4:61:346:384  83      chr2    496     68      35M     =       324     -207    CAACTAAGAAGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGATT     7&$+&,<<+;;<;;<<6<<8<<<;<<;<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:3  UQ:i:19 H0:i:1  H1:i:53
+EAS54_81:8:177:800:714 83      chr2    497     76      35M     =       324     -208    TTCTCAGCAGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGATTG     =;3=+=<:=<========8================     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:29 H1:i:85
+B7_597:6:20:592:496    83      chr2    498     75      35M     =       338     -195    TCTCAGCGGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGATTGG     97<7;<;<;<<<<;<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:5  H1:i:48
+B7_591:5:243:557:560   83      chr2    499     75      36M     =       331     -204    CTAAGCAGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGATTGGAT    69&<;&<&<<;6.<<<+<<<;;<<<<<<<<;<<<<<    MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:1  H1:i:9
+EAS188_7:5:163:982:695 147     chr2    499     77      35M     =       339     -195    CTCAGCAGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGATTGGA     <:<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:7  H1:i:42
+EAS139_19:1:1:1598:843 83      chr2    500     99      40M     =       347     -193    TCAGCGGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGATTGGATCTAAT        1)::6::<<;<98<<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<        MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:1  UQ:i:25 H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:6:78:1029:512        163     chr2    500     99      40M     =       656     196     TCAGCAGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGATTGGATCTAAT        <0:;<<<<<<<<<:<<:;<<<;<7<<;<7;;;:6;::672        MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS218_1:4:14:1872:1521        83      chr2    500     62      35M     =       339     -196    TCATCAAAAACCTTACAAGCCAGAAGAGATTGGAT     /1<%73&7<1<3577,<<<7/733<<<<<<<<1<<     MF:i:18 Aq:i:2  NM:i:2  UQ:i:9  H0:i:1  H1:i:8
+EAS221_3:6:51:1486:1131        163     chr2    500     77      35M     =       685     220     TCAGCAGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGATTGGAT     <<<<<<<<<;<<<<<<<<<1<5<<8<<<'<;<<;1     MF:i:18 Aq:i:3  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:22 H1:i:22
+EAS192_3:6:45:183:25   163     chr2    501     95      35M     =       672     206     CAGCGGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGATTGGATC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<86;<;:;     MF:i:18 Aq:i:23 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:2
+B7_597:4:38:999:463    147     chr2    503     39      35M     =       317     -221    GCGGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGATTGGATCTA     .*:&<<0<0!<<+<<<<<<<<<<<<<0<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:39 NM:i:2  UQ:i:25 H0:i:0  H1:i:1
+EAS114_45:1:30:1882:1210       163     chr2    503     82      35M     =       665     197     GCAGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGATTGGATCTA     ;;::;;;;:;;;;;:;;;;;;9;;:7;;8:77777     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:2  H1:i:0
+EAS1_108:6:222:579:961 163     chr2    504     99      35M     =       679     210     CAGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGATTGGATCTAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<:7;;;68     MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_53:1:92:875:345  163     chr2    504     99      35M     =       690     221     CGGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGATTGGATCTAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+EAS56_63:8:62:125:888  83      chr2    504     99      35M     =       347     -192    CGGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGATTGGATCTAA     ,;3<<<8;;3<,<<<8;<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:1  UQ:i:26 H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_1:2:23:127:880  99      chr2    504     99      35M     =       686     217     CGGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGATTGGATCTAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+EAS51_66:8:43:972:506  163     chr2    505     99      35M     =       686     216     AGAAACCTTACAAGCCAGAAGAGATTGGATCTAAT     <;<<<<<<<<<<<<6;<;<<<<<<<<<<:;;<;<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_26:6:183:697:555        83      chr2    505     84      35M     =       341     -199    AGAAATCTTAGAAGCCAGAAGAGATTGGATCTAAT     <<<;&,.;);&96<84<<81<<&<<<9<<8<8<<1     MF:i:18 Aq:i:37 NM:i:2  UQ:i:16 H0:i:0  H1:i:1
+EAS221_3:8:65:463:703  99      chr2    506     99      35M     =       693     222     GAAACCTTACAAGCCAGAAGAGATTGGATCTAATT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_67:7:101:752:996 163     chr2    508     99      35M     =       687     214     AACCTTACAAGCCAGAAGAGATTGGATCTAATTTT     <<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<9<<<<<<;<<;;;;     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_105:6:267:953:459 99      chr2    509     99      35M     =       667     193     ACCTTACAAGCCAGAAGAGATTGGATCTAATTTTT     <<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_3:8:33:1240:846 99      chr2    509     99      35M     =       685     211     ACCTTACAAGCCAGAAGAGATTGGATCTAATTTTT     <<<<<<<<<<<<7<<2<;<<;<<<;<<<:6:<<<:     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS112_32:7:135:401:735        99      chr2    510     99      35M     =       703     228     CCTTACAAGCCAGAAGAGATTGGATCTAATTTTTG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<8<<<<<<;     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_59:6:3:186:68    99      chr2    512     99      35M     =       687     210     TTACAAGCCAGAAGAGATTGGATCTAATTTTTGTA     <<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<;;<<<<<&%8     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:1  UQ:i:4  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_78:7:164:727:977 163     chr2    513     99      35M     =       689     211     TACAAGCCAGAAGAGATTGGATCTAATTTTTCGAC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<;;79;     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:1  UQ:i:26 H0:i:1  H1:i:0
+B7_589:1:110:543:934   163     chr2    514     99      35M     =       700     221     ACAAGCCAGAAGAGATTGGATCTAATTTTTGGACT     <<<<<<<<<<<<;<<<<<;;<<<;;<<<<<,,;<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_591:4:329:339:408   147     chr2    515     99      36M     =       325     -226    CAATCCAGAAGAGATTGGATCTAATTTTTGGACTTC    7<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_59:5:325:544:349 163     chr2    515     99      35M     =       716     236     CAAGCCAGAAGAGATTGGATCTAATTTTTGGACTT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<6;;;<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_105:1:3:903:957   99      chr2    516     99      35M     =       661     180     AAGCCAGAAGAGATTGGATCTAATTTTTGGACTTC     <<<<<<<<<<<<<<<<;;<;<;<<<<<<66<;<<;     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:1:85:361:418    147     chr2    517     99      36M     =       353     -200    AGCCAGAAGAGATTGGATCTAATTTTTGGACTTCTT    ;;;5<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_63:8:138:186:459 83      chr2    518     97      35M     =       360     -193    GCCAGAAGAGATTGGAGCTAATTTTTGGACTTCTT     +/2/;<:<&7:7</<2&<<<&<<<<<<<<<8<<:3     MF:i:18 Aq:i:37 NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:0  H1:i:1
+EAS139_11:4:36:1184:994        83      chr2    518     99      35M     =       358     -195    GCCAGAAGAGATTGGATCTAATTTTTGGACTTCTT     <84<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:2:270:430:269   83      chr2    519     99      36M     =       331     -224    CCAGAAGAGATTGGATCTAATTTTTGGACTTCTTAA    28<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_62:5:295:882:282 163     chr2    520     99      35M     =       691     206     CAGAAGAGATTGGATCTAATTTTTGGACTTCTTAA     ========================<6<======8;     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:3:41:739:907  83      chr2    520     99      35M     =       344     -211    CAGAAGAGATTGGATCTAATTTTTGGACTTCTTAA     ;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_61:5:272:240:950 163     chr2    520     97      35M     =       696     211     CAGCAGAGCTTGGATCTAATTTTTGGACTTCTTCA     6<<&:<<<&<::;&7<<<3<;<<;<:;:<8:<<(<     MF:i:18 Aq:i:25 NM:i:3  UQ:i:17 H0:i:0  H1:i:0
+EAS54_65:7:155:629:357 83      chr2    521     99      35M     =       333     -223    AGAAGAGATTGGATCTAATTTTTGGACTTCTTAAA     <<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<6<<<<<<<<<;<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_71:4:14:88:306   147     chr2    521     99      35M     =       341     -215    AGAAGAGATTAGATCTAATTTTTGGACTTCTTAAA     <1;<;<;<4<&<<<:<<<:<<<<;<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:0  H1:i:1
+EAS1_108:5:115:193:231 163     chr2    522     99      35M     =       684     197     GAAGAGATTGGATCTAATTTTTGGACTTCTTAAAG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<<6<7     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS219_FC30151:1:88:1454:418   83      chr2    522     99      35M     =       349     -208    GAAGAGATTGGATCTAATTTTTGGACTTCTTAAAG     <<<<<<<<<<6<96<<<1911<<<1<<<<<<<<<1     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_595:5:36:649:554    83      chr2    523     99      35M     =       350     -208    AAGAGATTGGATCTAATTTTTGGACTTCTTAAAGA     <<<<<888;<<<;<<<;<;<8<<<<8<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_59:4:119:651:88  83      chr2    527     99      35M     =       337     -225    GATTGGATCTAATTTTTGGACTTCTTAAAGAAAAA     <<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:7:57:826:977  163     chr2    528     99      35M     =       693     200     ATTGGATCTAATTTTTGGACTTCTTAAAGAAAAAA     <<<<<<<<<<<<<<<<+<<<<<<<<6<9:6<<<<<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_64:3:285:417:147 99      chr2    529     99      35M     =       712     218     TTGGATCTAATTTTTGGACTTCTTAAAGAAAAAAA     <<<<<<<<<<<<<<<;8<<<<<<<<<;6<:<;<<;     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_105:8:160:130:351 99      chr2    530     99      35M     =       697     202     TGGATCTAATTTTTGGACTTCTTAAAGAAAAAAAA     <<<<<<<<<<<<<<<;<<<<4<<<<<;<<<:<<:<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_26:3:287:665:495        163     chr2    530     99      35M     =       702     207     TGGATCTAATTTTTGGACTTCTTAAAGAAAAAAAA     ==========================98====8=8     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:6:71:187:824  147     chr2    534     99      35M     =       367     -202    TCTAATTTTTGGACTTCTTAAAGAAAAAAAAACCT     0040;<7<<<<0<7<<<;<7*<<<<<7<<771<<<     MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS218_1:8:70:445:1289 99      chr2    535     99      35M     =       702     202     CTAATTTTTGGACTTCTTAAAGAAAAAAAAACCTG     <<<<<<<<<<2<<<<<<<<<<:<<<<<<<;;;;<:     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_61:7:41:745:603  83      chr2    536     99      35M     =       360     -211    TAATTTTTGGACTTCTTAAAGAAAAAAAAACCTGT     ;<<;;<;<8<<<<<<<<<<<;<<;<<<<<<<<<;<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_65:6:197:759:975 163     chr2    537     99      35M     =       698     196     AATTTTTGGACTTCTTAAAGAAAAAAAAACCTGTC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<;     MF:i:18 Aq:i:78 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_26:6:140:253:322        99      chr2    537     99      35M     =       689     187     AATTTTTGGACTTCTTAAAGAAAAAAAAACCTGTC     <<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<;;;<<;     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_597:5:58:684:520    147     chr2    538     99      35M     =       367     -206    ATTTTTGGACTTCTTAAAGAAAAAAAAACCTGTCA     <85;;:<<<7<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_11:6:19:306:982 147     chr2    538     99      35M     =       368     -205    ATTTTTGGACTTCTTAAAGAAAAAAAAACCTGTCA     <<<<<<<<<9<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:78 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:7:273:562:954 99      chr2    539     99      35M     =       722     218     TTTTTGGACTTCTTAAAGAAAAAAAAACCTGTCAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;:;;;;     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_11:5:78:775:555 99      chr2    539     99      35M     =       691     187     TTTTTGGACTTCTTAAAGAAAAAAAAACCTGTCAA     6:<<<<:<<<<6:<<)::8<6<<:<<)<::63832     MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_81:2:49:330:699  163     chr2    540     99      35M     =       722     217     TTTTGGACTTCTTAAAGAAAAAAAAACCTGTCAAA     ==;=================;======5;;;==5=     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_28:2:329:437:643        147     chr2    540     99      36M     =       354     -222    TTTTGGACTTCTTAAAGAAAAAAAAACCTGTCAAAC    885<8;;<;3,8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:1:125:884:276 83      chr2    541     99      35M     =       362     -214    TTTGGACTTCTTAAAGAAAAAAAAACCTGTCAAAC     ,;;3,<7<;7<<===;============;======     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:4:315:201:673   83      chr2    542     45      36M     =       381     -197    TTGGACTTATTAAAGAAAAAAAAACCTGTCAAACAC    ;;;;<-;;&;;<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:0  H1:i:1
+B7_597:3:10:394:392    147     chr2    542     99      35M     =       376     -201    TTGGACTTCTTAAAGAAAAAAAAACCTGTCAAACA     28-:;0-<0<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_103:1:228:736:747 83      chr2    542     68      35M     =       381     -196    TTGGACTTCTTAAAGAAAAAAAAACCTGTCAAACA     <07<<&<;+<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_59:4:267:394:437 163     chr2    544     99      35M     =       735     226     GGACTTCTTAAAGAAAAAAAAACCTGTCAAACACG     <<<<<<<<<<;<;<<<<<;;<<<<<;<<:;8<;<8     MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:5:66:1381:181        83      chr2    544     99      40M     =       362     -222    GGACTTCTTAAAGAAAAAAAAACCTGTCAAACACGAATGT        ;;;+;;&<7<<<+<<<<<<<;<;8<<<;<<<<8<<<;<<<        MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:5:74:668:424 99      chr2    545     99      40M     =       707     202     GACTTCTTAAAGAAAAAAAAACCTGTCAAACACGAATGTT        ;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;::;;        MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_66:4:322:350:374 83      chr2    546     99      35M     =       360     -221    ACTTCTTAAAGAAAAAAAAACCTGTCAAACACGAA     <+;8&84<<<:<<<<<<<<<<;<<<<<<<;<<<<<     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_61:6:307:208:477 163     chr2    546     99      35M     =       710     199     ACTTCTTAAAGAAAAAAAAACCTGTCAAACACGAA     <<<<<<<;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<;:<<<88;     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_95:2:228:915:631  83      chr2    547     66      35M     =       381     -201    ATTATTAAAGAAAAAAAAACCTGTCAAACACGAAT     &-))-*===/=========9====4==========     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:2  UQ:i:13 H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_93:5:246:177:525  99      chr2    549     98      35M     =       738     224     TCTTAAAGAAAAAAAAACCTGTCAAACACGAATGT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<1<<<<<<;;;<8;;     MF:i:18 Aq:i:27 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_589:7:93:634:323    99      chr2    550     99      35M     =       721     206     CTTAAAGAAAAAAAAACCTGTCAAACACGAATGTT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<<<<,<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_61:8:165:441:708 163     chr2    550     99      35M     =       737     222     CTTAAAGAAAAAAAAACCTGTCAAACACGAATGTT     =<===============================99     MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_99:5:191:885:623  83      chr2    551     99      35M     =       363     -223    TTAAAGAAAAAAAAACCTGTCAAACACGAATGTTA     66<<<<<<<<<<<<<2<<<<9<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_67:5:127:828:697 147     chr2    552     99      35M     =       346     -241    TAAAGAAAAAAAAACCTGTCAAACACGAATGTTAT     ;<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_7:5:115:249:673 163     chr2    552     99      35M     =       743     226     TAAAGAAAAAAAAACCTGTCAAACACGAATGTTAT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<6<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_66:3:263:689:572 147     chr2    553     68      35M     =       381     -207    AAAGAAAAAAAAACCTGTCAAACACGAATGTTATG     <9<2<<<<<<<<<22;;02<<<9<<;9<9<<;<<3     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:1:99:1632:76 99      chr2    553     99      40M     =       705     192     AAAGAAAAAAAACCCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTG        <<<<<<<<<<<<*<<<<8<9<<<<<<<<<9;;;;<18:;:        MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1  UQ:i:9  H0:i:0  H1:i:1
+EAS54_71:7:250:698:842 163     chr2    554     99      35M     =       753     233     AAGAAAAAAAAACCTGTCAAACACGAATGTTATGC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;<24     MF:i:18 Aq:i:39 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_11:5:41:314:1173        99      chr2    554     99      35M     =       718     199     AAGAAAAAAAAACCTGTCAAACACGAATGTTATGC     <;<<<<<<<;;<<<<<-<<<;;;<;8<*;;<<<<'     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_610:2:189:831:878   83      chr2    555     99      35M     =       351     -239    AGAAAAAAAAACCTGTCAAACACGAATGTTATGCC     <9<<<<<<<<<<;9<:<<<<<6<<<<<<<;<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_93:6:216:47:302   99      chr2    557     99      35M     =       729     207     AAAAAAAAACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCT     <<<<<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<+<<<<<//6;<     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_97:5:28:538:148   83      chr2    557     99      35M     =       376     -216    AAAAAAAAACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCT     <<<<<<<<<<7;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:2:284:597:682 147     chr2    557     99      35M     =       375     -217    AAAAAAAAACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCT     <<<<<<<<9;;7<;:<<<:<;<<<<<<<<;<<<<;     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS219_FC30151:7:11:1261:1200  83      chr2    558     99      35M     =       362     -231    AAAAAAAACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTG     <<<<<<<:<<6<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_66:3:246:711:981 147     chr2    559     99      35M     =       371     -223    AAAAAAACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGC     ;;:;7<<:5:<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_32:1:208:971:600        83      chr2    559     99      35M     =       382     -212    AAAAAAACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGC     <<<<<<<3*+<4/<<<<7<<<<0<<:<8<<<<0<<     MF:i:18 Aq:i:51 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_97:5:219:174:684  83      chr2    560     71      35M     =       390     -205    AAAAAAACTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCT     <<<<:;+9<<<;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:1  UQ:i:10 H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_66:7:4:234:610   163     chr2    560     84      35M     =       729     204     AAAAAACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTCCT     <<<<<<<<7;<<<;7<7;7;7<;-<-<&<<<0%06     MF:i:18 Aq:i:22 NM:i:1  UQ:i:4  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_73:5:271:874:367 83      chr2    560     99      35M     =       384     -211    AAAAAACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCT     <<<<<<5;<<<:<<<;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:51 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:7:2:168:1878 99      chr2    560     37      35M     =       743     218     AAAAAACCTGGCAAACACGAATGTTATGACATGTN     ;<:;;<:<;<;<;;;;:;<;:::&9:&:68&6&*!     MF:i:18 Aq:i:37 NM:i:5  UQ:i:61 H0:i:0  H1:i:1
+EAS221_1:6:89:1164:573 147     chr2    560     99      35M     =       371     -224    AAAAAACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCT     3<<<6<%7<<08<<4<3<<103<1<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_103:7:53:783:78   147     chr2    561     99      35M     =       363     -233    AAAAACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCTA     <;;;;<<0<,<<<<<<<<<;<<<;<;<<<<;<<<<     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_39:4:30:570:902 163     chr2    561     99      35M     =       730     204     AAAAACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCTA     <<<<<<<<<<<;4<<:<<44<<<<<<<<<<<4<<+     MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_3:8:7:1864:1569 147     chr2    561     99      35M     =       382     -214    AAAAACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCTA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:51 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:5:89:942:84   163     chr2    562     74      35M     =       759     232     AAAACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCTAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_81:6:122:589:134 83      chr2    562     99      35M     =       369     -228    AAAACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCTAA     ;<;4<<538<<;<<;<<<<';,:<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS218_1:6:77:1529:522 99      chr2    562     99      35M     =       722     195     AAAACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCTAA     <<;<<<<<<<<<<<4<<4<;;:;2:7<<<2*<;;8     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_597:8:48:805:860    99      chr2    563     78      35M     =       755     227     AAACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCTAAA     <<<<<<<;<<<<<<<41;<<8<<<<<<<8+<4,+;     MF:i:18 Aq:i:13 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_597:4:144:492:61    99      chr2    564     99      35M     =       728     199     AACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCTAAAC     <<<;<<<<<<<<<<<;<<<<<<7:<<<<::;9;;6     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_95:3:303:970:243  83      chr2    564     99      35M     =       370     -229    AACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCTAAAC     <<0+<<<,<4<:<:<<<<<<<<<<<::<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:4:78:806:800 163     chr2    564     99      40M     =       717     193     AACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCTAAACTAAGC        <<<<<<<<<<<<<<<<<<<4<<:<1<0<;<9;<:78::::        MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS219_FC30151:7:94:1440:2016  163     chr2    564     99      35M     =       751     222     AACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCTAAAC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;;;<<:<8:::75     MF:i:18 Aq:i:51 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_62:3:103:443:166 163     chr2    565     99      35M     =       747     217     ACCTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCTAAACT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<1<-;;;<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:5:24:284:360  83      chr2    567     76      35M     =       390     -212    CTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCTAAACTAA     :;<;:<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_59:3:166:626:836 163     chr2    567     99      35M     =       757     225     CTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCTAAACTAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<<;<;;;9     MF:i:18 Aq:i:28 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_26:4:110:840:431        83      chr2    567     93      35M     =       388     -214    CTGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCTAAACTAA     77<;7<<<<<<<<<4<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:21 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_64:4:116:738:142 99      chr2    568     99      35M     =       722     189     TGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCTAAACTAAG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<;<<<<<<<:;2     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_3:8:55:932:613  83      chr2    568     77      35M     =       389     -214    TGTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCTAAACTAAG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_63:7:137:139:248 83      chr2    569     97      35M     =       401     -203    GTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCTAAACTAAGC     ;;;99<<<;<;;<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:22 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS218_4:1:34:1614:558 147     chr2    569     99      35M     =       411     -193    GTCAAACACGAATGTTATGCCCTGCTAAACTAAGC     <<9<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:37 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_610:7:15:696:693    83      chr2    570     10      35M     =       403     -202    TCAAACACGAATGTTAATCCCTGCTAAACTAATCA     )6<:7<.7<6.<0&&<&3:&7<<7<0<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:10 NM:i:3  UQ:i:50 H0:i:0  H1:i:0
+EAS114_28:3:32:492:907 147     chr2    571     95      36M     =       387     -220    CAAACACGAATGTTATGCCCTGCTAAACTAAGCATC    8<;<4<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:20 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS192_3:1:114:19:769  83      chr2    572     90      35M     =       405     -202    AAACACGAATGTTATGCCCTGCTAAACTAAGCATC     5+;+3/6;<+;/8<8*/<7/59<97147<;;9<7<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_7:3:182:104:921 147     chr2    575     99      35M     =       378     -232    CACGAATGTTATGCCCTGCTAAACTAAGCATCATA     ;<;<<<<<<:<<<<<:<<:<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS220_1:8:5:996:2000  83      chr2    575     99      35M     =       408     -202    CACGAATGTTATGCCCTGCTAAACTAAGCATCATA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_32:5:109:199:592        83      chr2    576     72      35M     =       390     -221    ACGAATATTATGCCCTGCTAAACTAAGCATCATAA     ;9<9<:&:<<<<;;<;;<<<<<<<<<;<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:1  H1:i:0
+EAS219_1:3:90:219:528  163     chr2    576     75      35M     =       758     217     ACGAATGTTATGCCCTGCTAAACTAAGCATCATAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<9     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:6:94:294:387  163     chr2    578     99      35M     =       736     193     GAATGTTATGCCCTGCTAAACTAAGCATCATAAAT     <<<<<<<;<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<;)7;;     MF:i:18 Aq:i:51 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:1:33:779:821  83      chr2    579     99      35M     =       416     -198    AATGTTATGCCCTGCTAAACTAAGCATCATAAATG     <<730<<<<9<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_26:5:43:114:617 163     chr2    579     99      35M     =       738     194     AATGTTATGCCCTGCTAAACTAAGCATCATAAATG     =============;=========;===========     MF:i:18 Aq:i:52 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_28:5:23:944:377 99      chr2    579     75      36M     =       757     214     AATGTTATGCCCTGCTAAACTAAGCATCATAAATGA    <<<<<<<<9<<<<;<<<<<<<<<;<7<<<<;8;<<;    MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:3:3:864:1888 147     chr2    579     99      35M     =       411     -203    AATGTTATGCCCTGCTAAACTAAGCATCATAAATG     888588;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;8;;;;;;;;     MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_11:4:26:137:1382        147     chr2    579     99      35M     =       397     -217    AATGTTATGCCCTGCTAAACTAAGCATCATAAATG     <<-<8<<<<<<:<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_81:6:265:251:147 163     chr2    581     99      35M     =       754     208     TGTTATGCCCTGCTAAACTAAGCATCATAAATGAA     <<<<<<<<<<<<<<88<<<80:;<<<<<;:4;;:4     MF:i:18 Aq:i:50 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_595:5:184:912:258   147     chr2    582     99      35M     =       428     -189    GTTATGCCCTGCTAAACTAAGCATCATAAATGAAG     <;;<<<<;:<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_597:3:115:646:430   99      chr2    582     45      35M     =       768     217     GTTATGCCCTGCTAAACTTAGCATCATAAATGAAG     <7<<<<<<<<<<<<;<<<<<;<7<<<<;5;<;67<     MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+EAS1_108:3:24:319:429  163     chr2    582     99      35M     =       740     193     GTTATGCCCTGCTAAACTAAGCATCATAAATGAAG     <<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<1<<-6<<</<     MF:i:18 Aq:i:56 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_59:8:49:182:192  99      chr2    582     99      35M     =       750     203     GTTATGCCCTGCTAAACTGAGCATCATAAATGAAG     =====================;============<     MF:i:18 Aq:i:49 NM:i:1  UQ:i:28 H0:i:0  H1:i:1
+EAS114_45:1:100:979:1863       99      chr2    583     85      35M     =       757     209     TTATGCCCTGCTAAACTAAGCATCATAAATGAAGG     ;<;;;;;;;7;;;79;;77;9;;99;974;677-6     MF:i:18 Aq:i:23 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_11:7:53:458:581 73      chr2    583     77      35M     =       583     0       TTATGCCCTGCTAAACTAAGCATCATAAATGAAGG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:64 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_11:7:53:458:581 133     chr2    583     0       *       =       583     0       CTCAATTAATTGTTTTATAAAACCTGTGAGTTTTG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<99<<<<<     MF:i:192
+B7_589:6:108:958:42    163     chr2    584     81      35M     =       755     206     TATGCCCTGCTAAACTAAGCATCATAAATGAAGGG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<1<<<<<<9<<;<5<:     MF:i:18 Aq:i:9  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_59:6:89:457:591  99      chr2    585     69      35M     =       770     216     ATGCCCTGCTAAACTAAGCATCATAAATGAAGGGG     <<<<<<<<<<<4<<<<<<<<<<<<8<7/4<<<<4+     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS219_FC30151:7:87:1289:83    83      chr2    585     99      35M     =       413     -207    ATGCCCTGCTAAACTAAGCATCATAAATGAAGGGG     <<<::<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:49 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS218_4:1:84:1505:1037        147     chr2    586     99      35M     =       409     -212    TGCCCTGCTAAACTAAGCATCATAAATGAAGGGGA     <<966<<7<<<<7<<<<9<<;<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_67:3:197:261:624 147     chr2    587     99      35M     =       398     -224    GCCCTGCTAAACTAAGCATCATAAATGAAGGGGAA     866;2:/;<<<;:<<<;<;;<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_64:6:118:41:489  163     chr2    588     76      35M     =       779     226     CCCTGCTAAACTAAGCATCATAAATGAAGGGGAAA     <<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<95:     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_597:3:157:361:309   99      chr2    589     99      35M     =       747     193     CCTGCTAAACTAAGCATCATAAATGAAGGGGAAAT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;<;<<;<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:2
+EAS114_39:6:71:644:1792        163     chr2    589     84      35M     =       754     200     CCTGCTAAACTAAGCATCATAAATGAAGGGGAAAT     <<<<<<<;<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<;<;:<:<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:2
+B7_589:2:9:49:661      163     chr2    591     99      35M     =       747     191     TGCTAAACTAAGCATCATAAATGAAGCGGAAATAA     <<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<;:<<;;;7<9;9     MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+EAS54_71:2:85:686:696  83      chr2    594     99      34M     =       435     -193    TAAACTAAGCATCATAAATGAAGTGGAAATAAAG      :<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<      MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+EAS188_7:1:177:522:118 69      chr2    594     0       *       =       594     0       TCTCAATTAATTGTTTTATAAAACCTGTGAGTTTT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<57<<<<     MF:i:192
+EAS188_7:1:177:522:118 137     chr2    594     49      35M     =       594     0       TAAACTAAGCATCATAAATGAAGGGGAAATAAAGT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<     MF:i:64 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_4:5:103:870:105 99      chr2    595     44      35M     =       778     214     AAACTAAGCATCATAAATGAAGGGGAAATAAAGTC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<<<<<;<<7;     MF:i:18 Aq:i:44 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:1
+EAS51_62:8:52:967:804  73      chr2    596     76      35M     =       596     0       AACTAAGCATCATAAATGAAGGGGAAATAAAGTCA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<     MF:i:64 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_62:8:52:967:804  133     chr2    596     0       *       =       596     0       TTACCTAGTTGCTCTGTAGTCTCAATTAATTGTTT     ===============<=======<<===<======     MF:i:192
+EAS1_108:6:95:235:746  83      chr2    598     99      35M     =       430     -203    CTAAGCATCATAAATGAAGGGGAAATAAAGTCAAG     ==&=;===7=3===8======;=;8===8=====;     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_81:7:124:253:889 83      chr2    598     99      35M     =       437     -196    CTAAGCATCATAAATGAAGGGGAAATAAAGTCAAG     8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_95:6:174:650:125  99      chr2    600     76      35M     =       770     201     AAGCATCATAAATGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_30:3:39:348:594 83      chr2    600     99      35M     =       431     -204    AAGCATCATAAATGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTC     <<;;<;:<;<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_7:4:92:693:228  99      chr2    601     75      35M     =       770     200     AGCATCATAAATGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTCT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;9<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS192_3:3:285:349:797 163     chr2    604     76      35M     =       773     200     ATCATAAATGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_589:3:82:13:897     83      chr2    606     99      35M     =       453     -188    CATAAATGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCT     ,<2<;<<;<<<<;;;<<;<<<<<<<;;;;<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_30:7:310:155:312        83      chr2    606     99      35M     =       438     -203    CATAAATGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCT     2;<<;<<;<<;;/<<<<<<;<<<<8<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS220_1:8:45:178:1321 163     chr2    606     77      35M     =       771     196     CATAAATGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_97:2:193:420:78   99      chr2    607     99      35M     =       787     215     ATAAATGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<;     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:1:131:518:588 83      chr2    607     99      35M     =       433     -209    ATAAATGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTG     <.<<<<<<<<4<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS112_34:8:45:800:733 83      chr2    607     99      35M     =       413     -229    ATAAATGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTG     <7<<7&<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:34 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS220_1:4:70:766:2016 83      chr2    607     99      35M     =       422     -220    ATAAATGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:2:2:1217:398 163     chr2    608     99      40M     =       780     212     TAAATGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGC        <<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<7<<<3<<<<;<<<<9:7::        MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS219_FC30151:3:73:1458:1337  163     chr2    609     99      35M     =       806     232     AAATGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGAC     <<<<<;;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<7;;;;     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_59:2:104:402:732 83      chr2    610     99      35M     =       434     -211    AATGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_65:5:37:611:267  147     chr2    610     99      35M     =       464     -181    AATGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACA     <<4<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS192_3:7:78:692:671  147     chr2    610     99      35M     =       438     -207    AATGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACA     <<);<<;;<<<<<;<<<<<<<<<<<<<6<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_28:1:144:242:602        83      chr2    611     99      36M     =       436     -211    ATGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAG    <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS219_FC30151:5:6:1243:981    69      chr2    611     0       *       =       611     0       TTACCTAGTTGCTCTGTAGTCTCAATTAATTGTTT     <<<<8<<8<<<<2<<<<<<<<8<55<<8*<<8<<<     MF:i:192
+EAS219_FC30151:5:6:1243:981    137     chr2    611     68      35M     =       611     0       ATGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAA     <;<;;<<<;3;;3<<<;<<;<7%<<<.1<<<..<3     MF:i:64 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_591:3:291:404:199   163     chr2    612     76      36M     =       777     197     TGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGC    <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:    MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:2:266:994:429 99      chr2    612     76      35M     =       769     188     TGAAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAG     =====================9=======4===:=     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_65:7:159:253:353 163     chr2    613     67      35M     =       778     196     GAAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAGGC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<0,%4(+,     MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:1  UQ:i:7  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:5:175:149:296 163     chr2    614     99      35M     =       811     232     AAGGGGAAATAAAGTCAAGCCTTTCCTGACAAGCA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<49<<<<<<<<<<<<;4     MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:1  UQ:i:19 H0:i:0  H1:i:1
+EAS56_65:1:23:536:229  147     chr2    614     99      35M     =       448     -201    AAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCA     <<99<<<<<;<<<;2<<<<<<;<<<9<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS220_1:4:100:20:1199 83      chr2    614     99      35M     =       456     -193    AAGGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCA     :<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_59:5:181:713:140 99      chr2    615     84      35M     =       793     213     AGGGGAAATAAAGTCAAGTATTTCCTGACAAGCAA     <7<<<<<<<<<<<<7<7<6+<<<5;<;<2<;;+;;     MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:1  UQ:i:10 H0:i:0  H1:i:1
+EAS139_19:6:82:1051:921        163     chr2    616     99      40M     =       800     224     GGGGAAATAAAGTCAAGGCTTTCCTGACAAGCAAATGCTA        <<<<<9<799<<<<7::/<<<9<7:9:;2:7552+9''66        MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:1  UQ:i:14 H0:i:0  H1:i:1
+EAS192_3:3:309:187:267 163     chr2    616     99      35M     =       786     205     GGGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;<;<;68;;8     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:3:115:649:259   99      chr2    617     99      36M     =       782     201     GGGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATG    <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<;<<9    MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_97:4:261:267:597  163     chr2    617     86      35M     =       787     205     GGGTAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAAT     <<<<<<<<<;<<<<<7<<<<<<<<<:7<7<;44:;     MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+EAS114_26:4:123:1001:580       163     chr2    617     43      35M     =       771     185     GGGAANTAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAAT     =====!=====================1.8131*=     MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1  UQ:i:0  H0:i:0  H1:i:1
+EAS139_11:7:60:163:1612        83      chr2    617     99      35M     =       439     -213    GGGAACTAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAAT     -<<<<)<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:59 NM:i:1  UQ:i:8  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_65:4:325:795:213 163     chr2    618     99      35M     =       790     207     GGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATG     <<<<<<<;<<<<;;<<<<<<<<<<<<;:<</;/;;     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_61:3:165:665:220 163     chr2    618     76      35M     =       779     196     GGAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;;<<<;;<;<<;     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS112_34:4:22:206:150 163     chr2    619     99      35M     =       792     208     GAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGC     ==========================::=5&;<2<     MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_26:2:237:497:165        147     chr2    619     99      35M     =       454     -200    GAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGC     9=:=======2=27======<>&<=,==4>4=>>=     MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS218_1:8:82:1540:77  163     chr2    619     99      35M     =       786     202     GAAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<<<:8     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_67:3:172:196:746 147     chr2    620     99      35M     =       451     -204    AAATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGCT     <<<;><<+<<<<:<<<<2<;<<<;<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_73:7:97:892:419  163     chr2    621     99      35M     =       800     214     AATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGCTA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS192_3:4:312:915:751 147     chr2    621     99      35M     =       461     -195    AATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAAAGCTA     <:-<<<99:::);:7<4;8<<<<<<<;<2<+8<;<     MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:1  UQ:i:10 H0:i:0  H1:i:1
+EAS1_93:4:325:352:67   163     chr2    622     99      35M     =       794     207     ATAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGCTAA     ==================<========<=<;-===     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_97:4:83:731:540   99      chr2    623     99      35M     =       804     216     TAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGCTAAG     <<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<:<7<*;&;<;;9     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_7:5:74:329:459  163     chr2    623     99      35M     =       795     207     TAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGCTAAG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;<<;9;599     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS219_FC30151:3:13:674:1717   83      chr2    623     99      35M     =       445     -213    TAAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGCTAAG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_105:1:141:415:738 69      chr2    624     0       *       =       624     0       TTACCTAGTTGCTCTGTAGTCTCAATTAATTGTTT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<;<8<<<     MF:i:192
+EAS1_105:1:141:415:738 137     chr2    624     76      35M     =       624     0       AAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGCTAAGA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<;<<;<<<<6:     MF:i:64 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_53:1:154:118:488 83      chr2    624     99      35M     =       447     -212    AAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGCTAAGA     <<<;58<<95:<<;<;<<<;<<<;;<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_59:5:198:929:684 83      chr2    624     99      35M     =       471     -188    AAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGCTAAGA     <<;<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_28:4:215:246:640        147     chr2    624     99      36M     =       447     -213    AAAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGCTAAGAT    ;<<,<<<96<<:<:<9<6<97<<<<<9<<<<9<<9<    MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_103:2:234:167:381 83      chr2    625     99      35M     =       443     -217    AAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGCTAAGAT     <<;<;<<<<;<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:49 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS112_34:7:96:489:453 147     chr2    625     99      35M     =       445     -215    AAGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGCTAAGAT     ;<;;;<<<<5:<<:<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_93:3:79:879:15    99      chr2    626     99      35M     =       790     199     AGTCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGCTAAGATA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<2<;<<1<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_53:2:59:286:290  147     chr2    628     99      35M     =       467     -196    TCAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGCTAAGATAAT     77<<<<7<<<97<<,7<<<;<<<;<9<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_95:5:263:511:936  99      chr2    629     99      35M     =       801     207     CAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGCTAAGATAATT     <<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<;<<:<:<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_30:3:181:582:435        147     chr2    629     99      35M     =       471     -193    CAAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGCTAAGATAATT     <<<<<<<<;<<<<<;<<4<<<<<<;<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_7:6:107:636:642 83      chr2    630     99      35M     =       458     -207    AAGTCTTTCCTGACAAGCAAATGCTAAGATAATTC     <<<<<<<;<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS112_34:4:12:273:89  83      chr2    631     99      35M     =       477     -189    AGTCTTTCCTGACAAGCAAATGCTAAGATAATTCA     <:737<288<<<7<<<<<<<<<:9<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_59:2:239:1001:406        147     chr2    634     99      35M     =       450     -219    CTTTCCTGACAAGCAAATGCTAAGATAATTCATCA     0':.71;;:9==9=;====;=;=============     MF:i:18 Aq:i:49 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_4:7:96:899:106  147     chr2    636     99      35M     =       462     -209    TTCCTGACAAGCAAATGCTAAGATAATTCATCATC     ;;;;<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_65:6:67:56:806   147     chr2    637     99      35M     =       464     -208    TCCTGACAAGCAAATGCTAAGATAATTCATCATCA     844:8;7<88;8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_67:5:71:408:741  83      chr2    637     99      35M     =       457     -215    TCCTGACAAGCAAATGCTAAGATAATTCATCATCA     ;7;<;<0<<<<<<<<:;<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_53:6:180:695:621 147     chr2    637     99      35M     =       453     -219    TACTGAAAAGCAAATGCTAAGATAATTCATCATCA     ;&377<&<<;7<<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:2  UQ:i:10 H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_30:6:49:656:507 147     chr2    637     99      35M     =       468     -204    TCCTGACAAGCAAATGCTAAGATAATTCATCATCA     %44;;<:<<;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_73:3:4:854:140   147     chr2    638     72      35M     =       458     -215    CCTGACAAGCAAATGCTAAGATAATTCATCATCAC     :9':<;<<<;<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:1:85:1521:58 99      chr2    639     99      40M     =       813     214     CTGACAAGCAAATGCTAAGATAATTCATCATCACTAAACC        <<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<;;:7:        MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_39:2:57:1064:925        137     chr2    640     76      35M     *       0       0       TGACAAGCAAATGCTAAGATAATTCATCATCACTA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<     MF:i:32 Aq:i:29 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_103:3:323:196:855 163     chr2    642     99      35M     =       809     202     ACAAGCAAATGCTAAGATAATTCATCATCACTAAA     <<<<<<<7<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<;7:     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_67:5:117:33:262  163     chr2    642     99      35M     =       814     207     ACAAGCAAATGCTAAGATAATTCATCATCACTAAA     <<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_11:1:59:742:549 99      chr2    642     99      35M     =       816     209     ACAAGCAAATGCTAAGATAATTCATCATCACTAAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<     MF:i:18 Aq:i:48 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_28:2:55:562:403 163     chr2    643     99      36M     =       825     218     CAAGCAAATGCTAAGATAATTCATCATCACTAAACC    <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;<<<<<<<;<;:    MF:i:18 Aq:i:51 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_71:7:97:743:602  163     chr2    644     99      35M     =       821     211     AAGCAAATGCTAAGATAATTCATCATCACTAAACC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<:     MF:i:18 Aq:i:26 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_28:2:167:905:852        83      chr2    647     99      36M     =       445     -238    CAAATGCTAAGATAATTCATCATCACTAAACCAGTC    +<<<9;7;<<+<<<<<39<;9<;9<<7<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS112_34:6:130:865:838        83      chr2    649     99      35M     =       448     -236    AATGCTAAGATAATTCATCATCACTAAACCAGTCC     ;<:84<<<4<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS219_1:1:60:1420:660 163     chr2    649     99      35M     =       808     194     AATGCTAAGATAATTCATCATCACTAAACCAGTCC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<8<<<<     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:3:180:89:582    99      chr2    650     99      36M     =       809     195     ATGCTAAGATAATTCATCATCACTAAACCAGTCCTA    <<<<<<<<<7<<<<<<<<<7<<<:<<<:<<::77:<    MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_99:1:86:871:319   147     chr2    651     71      35M     =       494     -192    TGCTAAGATAATTCATCATCACTAAACCAGTCCTA     7;+1;<:<<<<<<<<;<<;<<9<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:2:236:841:20  83      chr2    652     99      35M     =       467     -220    GCTAAGATAATTCATCATCACTAAACCAGTCCTAT     7;<<<;<<<<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_62:2:133:8:379   83      chr2    653     99      35M     =       470     -218    ATAAGATAATTCATCATCACTAAACCAGTCCTATA     &=========='==7==0=2====28===00====     MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_105:8:96:720:940  83      chr2    654     99      35M     =       467     -222    TAAGATAATTCATCATCACTAAACCAGTCCTATAA     *<<<<;<<<9<<;,<;0<;<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:5:71:994:576  99      chr2    655     99      35M     =       805     185     AAGATAATTCATCATCACTAAACCAGTCCTATAAG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<5<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_103:4:164:79:134  147     chr2    656     99      35M     =       488     -203    AGATAATTCATCATCACTAAACCAGTCCTATAAGA     <;<;<<<;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:6:78:1029:512        83      chr2    656     99      40M     =       500     -196    AGATAATTCATCATCACTAAACCAGTCCTATAAGAAATGC        ;;;;;<;;<<<.<<6;<<;<;8<<<<::<<<<<<<<;<<<        MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_93:1:214:784:690  147     chr2    657     99      35M     =       472     -220    GATAATTCATCATCACTAAACCAGTCCTATAAGAA     -<7<<7<:<<2<<<<;<<<<<;<<<<3<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:1
+EAS220_1:4:6:1178:1105 99      chr2    657     93      35M     =       830     208     GATAATTCATCATCACTAAACCAGTCCTATAAGAA     <<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:17 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_99:7:171:196:287  83      chr2    658     99      35M     =       485     -208    ATAATTCATCATCACTAAACCAGTCCTATAAGAAA     <;;;98;<;&<;;<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_28:1:220:801:282        99      chr2    660     99      36M     =       837     213     AATTCATCATCACTAAACCAGTCCTATAAGAAATGC    <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<+<;<<<<<::<<:    MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:2
+EAS221_1:2:73:955:728  163     chr2    660     44      35M     =       823     198     AATTCATCATCACTAAACCAGTCCTATAAGAAATG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<     MF:i:18 Aq:i:14 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:2
+EAS1_105:1:3:903:957   147     chr2    661     99      35M     =       516     -180    ATTCATCATCACTAAACCAGTCCTATAAGAAATGC     <%12<&<<<;<:<<<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:1
+EAS56_65:2:224:579:433 83      chr2    662     99      35M     =       485     -212    TTCATCATCACTAAACCAGTCCTATAAGAAATGCT     '<08/8<+<</<<:<<<<<8<<9<38<<<<<<<<;     MF:i:18 Aq:i:31 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_61:5:209:824:866 163     chr2    665     73      35M     =       828     198     ATCATCACTAAACCAGTCCTATAAGAAATGCTCAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;     MF:i:18 Aq:i:19 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:1:30:1882:1210       83      chr2    665     82      35M     =       503     -197    ATCATCACTAAACCAGTCCTATAAGAAATGCTCAA     776778;5;;;;8;;7:8;;;;;;;<<<;;;;;<;     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_64:4:181:476:394 163     chr2    666     99      35M     =       847     216     TCATCACTAAACCAGTCCTATAAGAAATGCTCAAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<:<<<:;;     MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_105:6:267:953:459 147     chr2    667     99      35M     =       509     -193    CATCACTAAACCAGTCCTATAAGAAATGCTCAAAA     %<07<94========<<==================     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_64:7:140:752:822 147     chr2    667     76      35M     =       495     -207    CATCACTAAACCAGTCCTATAAGAAATGCTCAAAA     ;<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS112_32:7:322:391:742        99      chr2    667     99      35M     =       847     215     CATCACTAAACCAGTCCTATAAGAAATGCTCAAAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;;     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_67:5:149:639:910 83      chr2    669     99      35M     =       489     -215    TCACTAAACCAGTCCTATAAGAAATGCTCAAAAGA     <;49;<<;;<<<<8;<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<     MF:i:18 Aq:i:42 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:1:242:419:512 83      chr2    672     94      35M     =       490     -217    CTAAACCAGTCCTATAAGAAATGCTCAAAAGAATT     *:<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:24 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS192_3:6:45:183:25   83      chr2    672     95      35M     =       501     -206    CTAAACCAGTCCTATAAGAAATGCTCAAAAGAATT     ;1<<;<<<;;;;<<<<<+<<<<<<<<<9<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:23 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS192_3:6:326:887:180 83      chr2    672     73      35M     =       492     -215    CTAAACCAGTCCTATAAGAAATGCTCAAAAGAATT     8:<<:<5<<<;7<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_73:5:145:635:390 163     chr2    673     99      35M     =       860     222     TAAACCAGTCCTATAAGAAATGCTCAAAAGAATTG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<8<<<::;;;     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_11:2:31:628:1820        163     chr2    675     98      35M     =       828     188     AACCAGTCCTATAAGAAATGCTCAAAAGAATTGTA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:20 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_65:7:117:452:744 163     chr2    676     99      35M     =       850     209     ACCAGTCCTATAAGAAATGCTCAAAAGAATTGTAA     <<<<<<<<<<;<<<;<<<<<<<<<<:<<<<<<<;;     MF:i:18 Aq:i:50 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_30:2:297:949:26 163     chr2    676     99      35M     =       842     201     ACCAGTCCTATAAGAAATGCTCAAAAGAATTGTAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;     MF:i:18 Aq:i:51 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_11:8:17:437:1378        163     chr2    676     99      35M     =       847     206     ACCAGTCCTATAAGAAATGCTCAAAAGAATTGTAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:51 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:6:222:579:961 83      chr2    679     99      35M     =       504     -210    AGTCCTATAAGAAATGCTCAAAAGAATTGTAAAAG     =58====;==8=======;================     MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_597:5:98:995:929    163     chr2    680     99      35M     =       844     199     GTCCTATAAGAAATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGT     <;<;<8<;<<;1;<<<<<;<;;;08;<;<1&0+8<     MF:i:18 Aq:i:63 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:2:76:1765:700        163     chr2    680     99      35M     =       866     221     GTCCTATAAGAAATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGT     ;;6;;;;;;;;;6;;;;6;;;;;;;;;;;;88878     MF:i:18 Aq:i:63 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:5:68:306:409 99      chr2    682     99      40M     =       856     214     CCTATAAGAAATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATT        <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:;:;;        MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:5:115:193:231 83      chr2    684     99      35M     =       522     -197    TATAAGAAATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAA     =========7===========<=============     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_3:4:57:1675:720 99      chr2    684     99      35M     =       841     192     TATAAGAAATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_11:6:13:682:680 147     chr2    685     99      35M     =       482     -238    ATAAGAAATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAA     <<<<<<<<<<:<5<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_3:6:51:1486:1131        83      chr2    685     77      35M     =       500     -220    ATAAGAAATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAA     <<<<<<<<<<,<6<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<     MF:i:18 Aq:i:3  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_3:8:33:1240:846 147     chr2    685     99      35M     =       509     -211    ATAAGAAATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAA     <<<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_66:8:43:972:506  83      chr2    686     99      35M     =       505     -216    TAAGAAATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAAT     ;<<<<<<<+;<;<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_1:2:23:127:880  147     chr2    686     99      35M     =       504     -217    TAAGAAATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAAT     <<<<<<<<<%<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_67:7:101:752:996 83      chr2    687     99      35M     =       508     -214    AAGAAATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATT     <<<<<<<<7<7<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_59:6:3:186:68    147     chr2    687     99      35M     =       512     -210    AAGAAATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATT     <<;<<<<<&:,<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:2:273:348:37    83      chr2    688     99      36M     =       483     -241    AGAAATGCGCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAA    9;7;;0<++1<<<;<7<+;;1<<<;<17<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:1  UQ:i:10 H0:i:0  H1:i:1
+EAS51_78:7:164:727:977 83      chr2    689     99      35M     =       513     -211    GAAATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAA     ;<;<;<:<:<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_26:6:140:253:322        147     chr2    689     99      35M     =       537     -187    GAAATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAA     =;===;54:====================>>===>     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_105:2:146:374:692 99      chr2    690     99      35M     =       874     219     AAATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAAA     <<<<<<<<<<<<<<<</<<<<<<<<<<<<<<<<<:     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_53:1:92:875:345  83      chr2    690     99      35M     =       504     -221    AAATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAAA     <<<;<.;7<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_93:6:45:601:439   163     chr2    691     99      35M     =       864     208     AATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAAAG     <<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<4<<<<9<<<<<<;;     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_62:5:295:882:282 83      chr2    691     99      35M     =       520     -206    AATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAAAG     <<:<8<-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_11:5:78:775:555 147     chr2    691     99      35M     =       539     -187    AATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAAAG     <<-<%4/<<<<<<<<<<<<<<<<<5<<<0<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_73:5:255:796:239 99      chr2    692     99      35M     =       869     212     ATGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAAAGT     <<<<<<<<6<<<<<<<<<<<<<<<<;6<<<:<:<<     MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:7:57:826:977  83      chr2    693     99      35M     =       528     -200    TGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAAAGTT     875:6<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<;8<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_28:6:187:996:432        99      chr2    693     99      36M     =       860     203     TGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAAAGTTC    <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;<<;    MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_3:8:65:463:703  147     chr2    693     99      35M     =       506     -222    TGCTCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAAAGTT     <<3<9<<<<<<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:1:288:384:444 163     chr2    696     99      35M     =       855     194     TCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;;;     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_61:5:272:240:950 83      chr2    696     97      35M     =       520     -211    TCAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAA     37<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<;<<<<<<;     MF:i:18 Aq:i:25 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_105:8:160:130:351 147     chr2    697     99      35M     =       530     -202    CAAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAAT     4<;;<;<<<-<<<<<<<<<<;;<<<<;<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:7:189:530:40    163     chr2    698     99      36M     =       883     221     AAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAATAC    <<<<<<<<<<;<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<;<<<;    MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_105:7:168:247:414 99      chr2    698     99      35M     =       876     213     AAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAATA     <<<<<<<<<<<<<<<<*<<<<<<<<<;:6<<<<<;     MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_65:6:197:759:975 83      chr2    698     99      35M     =       537     -196    AAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAATA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:78 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:5:29:411:1208        99      chr2    698     99      40M     =       882     224     AAAAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAATACTCAC        <<<<;<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;;;;        MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_589:1:110:543:934   83      chr2    700     99      35M     =       514     -221    AAGAATTGTAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAATACT     <<<<<5<<;<<<<<<;<<<<<<<<<<<;<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_26:3:287:665:495        83      chr2    702     99      35M     =       530     -207    GAATTGTAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAATACTCA     ===,9=;;====7=====5===;==1=========     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS218_1:8:70:445:1289 147     chr2    702     99      35M     =       535     -202    GAATTGTAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAATACTCA     <<<:<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_105:6:172:827:592 163     chr2    703     99      35M     =       899     231     AATTGTAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAATACTCAC     =;=======;==;===:==========;==9<<.3     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS112_32:7:135:401:735        147     chr2    703     99      35M     =       510     -228    AATTGTAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAATACTCAC     <<::7<<<<<<::<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:3:39:208:644 99      chr2    704     99      35M     =       859     190     ATTGTAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAATACTCACC     <;<<<<<;;:<<;;<<<<<<;;;;;;.<;<79997     MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:1:99:1632:76 147     chr2    705     99      40M     =       553     -192    TTGTAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAATACTCACCATCATA        4641::<<4<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<        MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_1:2:52:1144:509 99      chr2    706     99      35M     =       867     196     TGTAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAATACTCACCAT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<;<;<<;<<     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_610:7:116:157:612   99      chr2    707     99      35M     =       889     217     GTAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAATACTCACCATC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:1:36:481:1079        163     chr2    707     99      40M     =       881     214     GTAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAATACTCACCATCATAAA        <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<::::8        MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:5:74:668:424 147     chr2    707     99      40M     =       545     -202    GTAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAATACTCACCATCATAAA        :::::<<96<<<<<;<<<;<<5<<<<<<<<<<<<<<<<<<        MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_65:7:122:398:994 163     chr2    708     99      35M     =       871     198     TAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAATACTCACCATCA     <:<9<<<<<<4<<<;9<<<<<98<;<<<:;<;<;7     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_11:4:36:1231:1381       99      chr2    708     99      35M     =       891     218     TAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAATACTCACCATCA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:5:57:366:844 163     chr2    708     99      40M     =       877     209     TAAAAGTCAAAATTAAAGTTCAATACTCACCATCATAAAT        <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<::::7:        MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_61:6:307:208:477 83      chr2    710     99      35M     =       546     -199    AAAGTCAAAATTAAAGTTCAATACTCACCATCATA     <<<<<.<<<<<<<<<<<<;<;<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_64:3:285:417:147 147     chr2    712     99      35M     =       529     -218    AGTCAAAATTAAAGTTCAATACTCACCATCATAAA     <..)<<<<;<<<<7<;-<<;<<<<<;8<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_59:5:325:544:349 83      chr2    716     99      35M     =       515     -236    AAAATTAAAGTTCAATACTCACCATCATAAATACA     <<<<57<<<7<;6<<<<;<7<7;<<7<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_63:2:33:357:858  163     chr2    716     99      35M     =       870     189     AAAATTAAAGTTCAATACTCACCATCATAAATACA     <<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<:<<<<;<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:4:78:806:800 83      chr2    717     99      40M     =       564     -193    AAATTAAAGTTCAATACTCACCATCATAAATACACACAAA        ::;9:<<<;<<:<<<<:<.<1:<<1<<<<<<;<<<<<<<<        MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_11:5:41:314:1173        147     chr2    718     99      35M     =       554     -199    AATTAAAGTTCAATACTCACCATCATAAATACACA     <<2**<<82/<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_30:2:82:963:128 163     chr2    719     99      35M     =       905     221     ATTAAAGTTCAATACTCACCATCATAAATACACAC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<;<<;     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_65:8:240:719:799 99      chr2    720     99      35M     =       900     215     TTAAAGTTCAATACTCACCATCATAAATACACACA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_589:7:93:634:323    147     chr2    721     99      35M     =       550     -206    TAAAGTTCAATACTCACCATCATAAATACACACAA     <<<<;<;<<<<;;<<2<:<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:2:12:1335:1372       163     chr2    721     99      40M     =       906     225     TAAAGTTCAATACTCACCATCATAAATACACACAAAAGTA        <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<99::.:        MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_64:4:116:738:142 147     chr2    722     99      35M     =       568     -189    AAAGTTCAATACTCACCATCATAAATACACACAAA     <:<7;+:<<:<<<;<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_81:2:49:330:699  83      chr2    722     99      35M     =       540     -217    AAAGTTCAATACTCACCATCATAAATACACACAAA     ===/=;========;=;==================     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:7:273:562:954 147     chr2    722     99      35M     =       539     -218    AAAGTTCAATACTCACCATCATAAATACACACAAA     ;<<+;95<<<;5;<<;:<<;<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS218_1:6:77:1529:522 147     chr2    722     99      35M     =       562     -195    AAAGTTCAATACTCACCATCATAAATACACACAAA     <<<;7;,<<<<<<.<,6<<6<<<<<<<;<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_3:2:67:1467:1447        163     chr2    722     99      35M     =       898     211     AAAGTTCAATACTCACCATCATAAATACACACAAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_28:2:251:819:772        99      chr2    726     99      36M     =       881     191     TTCAATACTCACCATCATAAATACACACAAAAGTAC    <3<<<9<9<3<</<<<<<<59<3<9<<</9/++*/'    MF:i:18 Aq:i:59 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_597:4:144:492:61    147     chr2    728     99      35M     =       564     -199    AAATACTCACCATCATAAATACACACAAAAGTACA     +;;3;,:7<:;<<7<<<<<<<;;<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:1  UQ:i:11 H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_73:7:200:65:291  99      chr2    728     99      35M     =       930     237     CAATACTCACCATCATAAATACACACAAAAGTACA     <<<<1<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<8<<<<:<;<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_26:2:130:609:467        99      chr2    728     99      35M     =       877     184     CAATACTCACCATCATAAATACACACAAAAGTACA     ==8=====;==8==;=4=;;8=====;6=177.==     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_93:6:216:47:302   147     chr2    729     99      35M     =       557     -207    AATACTCACCATCATAAATACACACAAAAGTACAA     <<;<8<:<6<<<;<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_66:7:4:234:610   83      chr2    729     84      35M     =       560     -204    AAAAATCAACATCACAAATACACACAAAAGTACAA     <:+:'+&<+'<+'2&<:<7<2<':2<:<<7<7<<<     MF:i:18 Aq:i:22 NM:i:4  UQ:i:31 H0:i:0  H1:i:0
+EAS54_81:8:271:180:509 99      chr2    729     99      35M     =       896     202     AATACTCACCATCATAAATACACACAAAAGTACAA     =============================='====     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_81:8:41:530:663  163     chr2    730     99      35M     =       908     213     ATACTCACCATCATAAATACACACAAAATTACAAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7;;;;<<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:1  UQ:i:22 H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_39:4:30:570:902 83      chr2    730     99      35M     =       561     -204    ATACTCACCATCATAAATACGCACAAAAGTACAAA     <:<6:6<&:<<6<<<<<<<<.<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1  UQ:i:13 H0:i:0  H1:i:1
+EAS1_105:1:87:430:995  99      chr2    731     67      35M     =       909     213     TACTCACCATCATAAATACACACAAAATTACAAAA     <<;<<7;;;<;<<777;7(77;;1;7;%117;,7(     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:1  UQ:i:4  H0:i:0  H1:i:1
+EAS114_28:7:215:863:521        163     chr2    732     99      36M     =       890     194     ACTCACCATCATAAATACACACAAAAGTACAAAACT    <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<;    MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_59:4:267:394:437 83      chr2    735     99      35M     =       544     -226    AAACATCATAAATACACACAAAAGTACAAAACTCA     &<&,<8.<;<<<;<8<8<7<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:2  UQ:i:10 H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:6:94:294:387  83      chr2    736     99      35M     =       578     -193    ACCATCATAAATACACACAAAAGTACAAAACTCAC     779=53=9===;=:=;=========;=========     MF:i:18 Aq:i:51 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:6:38:332:54     163     chr2    737     99      36M     =       904     203     CCATCATAAATACACACAAAAGTACAAAACTCACAG    <;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<0;;;<;;    MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_61:8:165:441:708 83      chr2    737     99      35M     =       550     -222    CCATCATAAATACACACAAAAGTACAAAACTCACA     6+<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_93:5:246:177:525  147     chr2    738     98      35M     =       549     -224    CATCATAAATACACACAAAAGTAAAAAACTCACAG     %<(4<2<<<<<:<;<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:27 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+EAS114_26:5:43:114:617 83      chr2    738     99      35M     =       579     -194    AATCATAAATACACACAAAAGTACAAAACTCACAG     +=22=6=================9===========     MF:i:18 Aq:i:52 NM:i:1  UQ:i:10 H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_99:8:152:778:228  163     chr2    739     99      35M     =       915     211     ATCATAAATACACACAAAAGTACAAAACTCACAGG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;     MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:3:24:319:429  83      chr2    740     99      35M     =       582     -193    TAATAAATACACACAAAAGTACAAAACTCACAGGT     0%=3%=3====<=9=====89==93==9=6=====     MF:i:18 Aq:i:56 NM:i:1  UQ:i:4  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_66:5:210:674:911 99      chr2    740     99      35M     =       904     199     TCATAAATACACACAAAAGTACAAAACTCACAGGT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<;     MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:7:88:451:1773        99      chr2    742     99      35M     =       902     195     ATAAATACACACAAAAGTACAAAACTCACAGGTTT     ;;:::<:;:<<;:6::;:;;:::;;<;;;367177     MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:7:2:168:1878 147     chr2    743     37      35M     =       560     -218    TAAATACACACAAAAGTAGAAAACGCACCAGTTTT     *3/6)9.;;;;;;;;5;;);;;3;(;;;+(;7.)3     MF:i:130        Aq:i:37 NM:i:4  UQ:i:32 H0:i:0  H1:i:0
+EAS188_7:5:115:249:673 83      chr2    743     99      35M     =       552     -226    TAAATACACACAAAAGTACAAAACTCACAGGTTTT     :<<<;<<<;<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_65:8:178:187:610 99      chr2    744     99      35M     =       903     194     AAATACACACAAAAGTACAAAACTCACAGGTTTTA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_589:2:9:49:661      83      chr2    747     99      35M     =       591     -191    TACACACAAAAGTACAAAACTCACAGGTTTTATAA     <<6<5<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_597:3:157:361:309   147     chr2    747     99      35M     =       589     -193    TACACACAAAAGTACAAAACTCACAGGTTTTATAA     :<-<5<0<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_62:3:103:443:166 83      chr2    747     99      35M     =       565     -217    TACACACAAAAGTACAAAACTCACAGGTTTTATAA     7<4<4<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_59:8:49:182:192  147     chr2    750     99      35M     =       582     -203    ACACAAAAGTACAAAACTCACAGGTTTTATAAAAC     <5<;<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:49 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS218_4:3:12:630:707  99      chr2    751     99      35M     =       915     199     CACAAAAGTACAAAACTCACAGGTTTTATAAAACA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS219_FC30151:7:94:1440:2016  83      chr2    751     99      35M     =       564     -222    CACAAAAGTACAAAACTCACAGGTTTTATAAAACA     :<8<<<<9<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:51 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_71:4:206:741:810 163     chr2    753     99      35M     =       929     210     CAAAAGTACAAAACTCACAGGTTTTATAAAACAAT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;:-;<<     MF:i:18 Aq:i:48 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_71:7:250:698:842 83      chr2    753     99      34M     =       554     -233    AAAAAGTACAAAACTCACAGGTTTTATAAAACAA      )<<<<<<<-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<      MF:i:18 Aq:i:39 NM:i:1  UQ:i:8  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_81:6:265:251:147 83      chr2    754     99      35M     =       581     -208    AAAAGTACAAAACTCACAGGTTTTATAAAACAATT     <<<<::<8<<<;<;8<8<<<<<<<<:<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:50 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_39:6:71:644:1792        83      chr2    754     84      35M     =       589     -200    AAAAGTACAAAACTCACAGGTTTTATAAAACAATT     <<<<;<<<<<<:;/<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_589:6:108:958:42    83      chr2    755     81      35M     =       584     -206    AAAGTACAAAACTCACAGGTTTTATAAAACAATTA     <<<;;</<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<+     MF:i:18 Aq:i:9  NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:3
+B7_597:8:48:805:860    147     chr2    755     78      35M     =       563     -227    AAAGTACAAAACTCACAGGTTTTATAAAACAATTA     <<<;3<;7<<97<7<<<<7<4<<<<<<<<<<;8<+     MF:i:18 Aq:i:13 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:3
+B7_591:3:179:496:161   163     chr2    756     99      36M     =       919     199     AAGTACAAAACTCACAGGTTTTATAAAACAATTAAT    <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<+    MF:i:18 Aq:i:49 NM:i:2  UQ:i:53 H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_59:3:166:626:836 83      chr2    757     99      35M     =       567     -225    AGTACAAAACTCACAGGTTTTATAAAACAATTAAT     <;;7<<<<<<;<7;<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<+     MF:i:18 Aq:i:28 NM:i:2  UQ:i:54 H0:i:0  H1:i:0
+EAS114_28:5:23:944:377 147     chr2    757     75      36M     =       579     -214    AGTACAAAACTCACAGGTTTTATAAAACAATTAATT    <;7;8<<<<:<;<:<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<;    MF:i:130        Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:0  H1:i:0
+EAS114_45:1:100:979:1863       147     chr2    757     85      35M     =       583     -209    ATTACAAAACTCACAGGTTTTATAAAACAATTAAT     6&,*3;6;66;9(572692;;;79;4)9;96;59+     MF:i:18 Aq:i:23 NM:i:3  UQ:i:51 H0:i:0  H1:i:0
+EAS219_1:3:90:219:528  83      chr2    758     75      35M     =       576     -217    GTACAAAACTCACAGGTTTTATAAAACAATTAATT     ;:<5<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:130        Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:0  H1:i:0
+EAS1_108:5:89:942:84   83      chr2    759     74      35M     =       562     -232    TACAAAACTCACAGGTTTTATAAAACAATTAATTG     ===================>=>>>==>>===>==>     MF:i:130        Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:0  H1:i:0
+EAS1_108:6:159:493:275 99      chr2    760     72      35M     =       939     214     ACAAAACTCACAGGTTTTATAAAACAATTAATTGA     =====3=============================     MF:i:130        Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:0  H1:i:0
+EAS139_11:1:81:1019:558        163     chr2    760     77      35M     =       926     201     ACAAAACTCACAGGTTTTATAAAACAATTAATTGA     <<<<<<<<<<<6<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<     MF:i:130        Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:0  H1:i:0
+EAS51_62:7:162:195:761 163     chr2    767     30      18M4I13M        =       922     190     TCACAGGTTTTATAAAACAATTAATTGAGACTACA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<:<<<<;;     MF:i:130        Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:0  H1:i:0
+B7_597:3:115:646:430   147     chr2    768     45      17M4I14M        =       582     -217    CACAGGTTTTATAAAACAATTAATTGAGACTACAG     5;5<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:130        Aq:i:45 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:0  H1:i:0
+EAS114_30:6:243:209:110        163     chr2    768     48      17M4I14M        =       920     187     CACAGGTTTTATAAAACAATTAATTGAGACTACAG     <<<<<;<;<<<;<<<<<<<<<<<;<:;<<:;;+85     MF:i:130        Aq:i:48 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:0  H1:i:0
+EAS1_108:2:266:994:429 147     chr2    769     76      16M4I15M        =       612     -188    ACAGGTTTTATAAAACAATTAATTGAGACTACAGA     </<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<;<<<<<<<<<<<     MF:i:130        Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:0  H1:i:0
+EAS114_30:5:32:461:154 99      chr2    769     71      16M4I15M        =       945     211     ACAGGTTTTATAAAACAATTAATTGAGACTACAGA     <<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<+<;;     MF:i:130        Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:0  H1:i:0
+EAS114_39:6:7:492:1088 99      chr2    769     57      16M4I15M        =       926     192     ACAGGTTTTATAAAACAATTAATTGAGACTACAGA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<:<<<<<<6;     MF:i:130        Aq:i:57 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:0  H1:i:0
+EAS1_95:6:174:650:125  147     chr2    770     76      15M4I16M        =       600     -201    CAGGTTTTATAAAACAATTAATTGAGACTACAGAG     ===;===============================     MF:i:130        Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:0  H1:i:0
+EAS56_59:6:89:457:591  147     chr2    770     69      15M4I16M        =       585     -216    CAGGTTTTATAAAACAATTAATTGAGACTACATAG     797<<9<<<<<<<3<7<<<<<<<<<<)<<<<<07<     MF:i:130        Aq:i:69 NM:i:1  UQ:i:15 H0:i:0  H1:i:0
+EAS114_39:2:38:670:564 99      chr2    770     73      15M4I16M        =       930     195     CAGGTTTTATAAAACAATTAATTGAGACTACAGAG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<:<<<<;<5<;     MF:i:130        Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:0  H1:i:0
+EAS188_7:4:92:693:228  147     chr2    770     75      14M4I17M        =       601     -200    AAGGTTTTATAAAAAAATTAATTGAGACTACAGAG     6=77=<<=======&====================     MF:i:130        Aq:i:75 NM:i:1  UQ:i:28 H0:i:0  H1:i:0
+EAS218_1:4:61:1369:440 163     chr2    770     47      15M4I16M        =       964     229     CAGGTTTTATAAAACAATTAATTGAGACTACAGAG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<8     MF:i:130        Aq:i:47 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:0  H1:i:0
+EAS114_26:4:123:1001:580       83      chr2    771     43      14M4I17M        =       617     -185    AGGTTTTATAAAACAATTAATTGAGACTACAGAGC     <.00..3<6<<<<<<<3;<<08<<<<<6<<<<<<<     MF:i:130        Aq:i:43 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:0  H1:i:0
+EAS114_39:4:10:1312:1558       163     chr2    771     76      14M4I17M        =       928     192     AGGTTTTATAAAACAATTAATTGAGACTACAGAGC     5<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<<<<;8;<     MF:i:130        Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:0  H1:i:0
+EAS220_1:8:45:178:1321 83      chr2    771     77      14M4I17M        =       606     -196    AGGTTTTATAAAACAATTAATTGAGACTACAGAGC     <<<<<<<<<<<<<<<<<:<<:<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:130        Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:0  H1:i:0
+EAS56_59:5:125:137:58  163     chr2    772     76      13M4I18M        =       932     195     GGTTTTATAAAACAATTAATTGAGACTACAGAGCA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<9;<     MF:i:130        Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:0  H1:i:0
+EAS192_3:3:285:349:797 83      chr2    773     76      12M4I19M        =       604     -200    GTTTTAAAAAACCAATAATTGAGACTACAGAGCAA     ;;<<<7.:<<<..<.<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:130        Aq:i:76 NM:i:1  UQ:i:13 H0:i:0  H1:i:0
+EAS114_45:5:56:1757:1319       163     chr2    775     67      10M4I21M        =       957     217     TTTATAAAACAATTAATTGAGACTACAGAGCAACT     ;;;;9;;;;;;;;;;;;;4;9;98;;;;;9388&7     MF:i:130        Aq:i:67 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:0  H1:i:0
+B7_591:3:291:404:199   83      chr2    777     76      8M4I24M =       612     -197    TATAAAACAATTAATTGAGACTACAGAGCAACTAGG    <<<<<<<7<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<    MF:i:130        Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:0  H1:i:0
+EAS54_65:7:159:253:353 83      chr2    778     67      7M4I24M =       613     -196    ATAAAACAATTAATTGAGACTACAGAGCAACTAGG     <8<<<<:<<;;<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<     MF:i:130        Aq:i:67 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:0  H1:i:0
+EAS56_57:1:122:38:103  163     chr2    778     79      7M4I24M =       972     229     ATAAAACAATTAATTGAGACTACAGAGCAACTAGG     <<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<3<<<<9<8;<     MF:i:130        Aq:i:79 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:0  H1:i:0
+EAS188_4:5:103:870:105 147     chr2    778     44      7M4I24M =       595     -214    ATAAAACAATTAATTGAGACTACAGAGCAACTAGG     <<<<<<<<<<<<<=<:<;<<<<<<<<<<*<<<<<<     MF:i:130        Aq:i:44 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:0  H1:i:0
+EAS1_105:8:24:718:322  163     chr2    779     23      35M     =       953     209     ACAATTAATTGAGACTACAGACCAATTATGTAAAA     5/7<3+<;<1<<1<95<.&&.&&.<&)5)1)17<%     MF:i:130        Aq:i:23 NM:i:3  UQ:i:18 H0:i:0  H1:i:0
+EAS51_64:6:118:41:489  83      chr2    779     76      35M     =       588     -226    ACAATTAATTGAGACTACAGAGCAACTAGGTAAAA     <+<<;<<<38<<<<5<<3<<<<3<<8<<<<<<<<<     MF:i:130        Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:0  H1:i:0
+EAS56_61:3:165:665:220 83      chr2    779     76      35M     =       618     -196    ACAATTAATTGAGACTACAGAGCAACTAGGTAAAA     <:<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:130        Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:0  H1:i:0
+EAS114_30:6:238:803:383        99      chr2    779     75      35M     =       954     210     ACAATTAATTGAGACTACAGAGCAACTAGGTAAAA     <<<<<<<<<<<<;<<<<<;<;<<;<<;<<<9<;<<     MF:i:130        Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:0  H1:i:0
+EAS1_105:3:232:364:583 99      chr2    780     71      35M     =       956     211     CAATTAATTGAGACTACAGAGCAACTAGGTAAAAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<     MF:i:130        Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:0  H1:i:0
+EAS139_19:2:2:1217:398 83      chr2    780     99      40M     =       608     -212    CAATTAATTGAGACTACAGAGCAACTAGGTAAAAAATTAA        +;;:9<<66<<<;+<<7<<<<;<<+;<<<<<<<<<<<<<<        MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:3  UQ:i:73 H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:2:81:435:410    99      chr2    782     99      36M     =       966     220     ATTAATTGAGACTACAGAGCAACTAGGTAAAAAATT    <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<;<<;;    MF:i:18 Aq:i:29 NM:i:2  UQ:i:54 H0:i:0  H1:i:0
+B7_593:3:115:649:259   147     chr2    782     99      36M     =       617     -201    ATTAATTGAGAATACAGAGCAACTAGGTAAAAAATT    ;<;<<;<<<<;&<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:3  UQ:i:58 H0:i:0  H1:i:1
+EAS1_93:3:181:93:694   163     chr2    783     99      35M     =       954     206     TTAATTGAGACTACAGAGCAACTAGGTAAAAAATT     ++<<<<<<;<<<<<<:;8<<;<<<5;<;<<<+<<<     MF:i:18 Aq:i:28 NM:i:2  UQ:i:54 H0:i:0  H1:i:0
+EAS114_30:1:188:863:790        163     chr2    783     98      35M     =       969     221     TTAATTGAGACTACAGAGCAACTAGGTAAAAAATT     ++<;<<;;;:<<<<:<:<<:1<<1<<<6:6;4;;4     MF:i:18 Aq:i:27 NM:i:2  UQ:i:54 H0:i:0  H1:i:0
+EAS1_93:2:313:711:530  163     chr2    784     99      35M     =       968     219     TAATTGAGACTACAGAGCAACTAGGTAAAAAATTA     +<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<:     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+B7_589:7:154:26:712    99      chr2    786     99      35M     =       959     208     ATTGAGACTACAGAGCAACTAGGTAAAAAATTAAC     <<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_28:6:185:87:475 163     chr2    786     99      36M     =       949     199     ATTGAGACTACAGAGCAACTAGGTAAAAAATTAACA    <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<6;    MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:4:69:1593:819        163     chr2    786     99      40M     =       977     231     ATTGAGACTACAGAGCAACTAGGTAAAAAATTAACATTAC        <<<<<<<<<<<<<<;<<<<<;;<:<<<<<:<<<<<:777:        MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS192_3:3:309:187:267 83      chr2    786     99      35M     =       616     -205    ATTGAGACTACAGAGCAACTAGGTAAAAAATTAAC     <:0;<;<4<<7<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS218_1:8:82:1540:77  83      chr2    786     99      35M     =       619     -202    ATTGAGACTACAGAGCAACTAGGTAAAAAATTAAC     <48;<;</;<<<<<<:<<0<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_97:2:193:420:78   147     chr2    787     99      35M     =       607     -215    TTGAGACTACAGAGCAACTAGGTAAAAAATTAACA     81<<;<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_97:4:261:267:597  83      chr2    787     86      35M     =       617     -205    TTGAGAATAAAGAGCAACTAGGTAAAAAATTAACA     *-1<9<+1<+<<<<:<<;9<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:2  UQ:i:20 H0:i:0  H1:i:1
+EAS56_59:4:262:928:237 99      chr2    787     99      35M     =       971     219     TTGAGACTACAGAGCAACTAGGTAAAAAATTAACA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_65:5:262:53:888  163     chr2    787     99      35M     =       965     213     TTGAGACTACAGAGCAACTAGGTAAAAAATTAACA     <<<<<<<<;<<<<<<<<<<;<<;<;<;6<<;<;;<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_597:4:138:211:582   99      chr2    788     99      35M     =       957     204     TGAGACTACAGAGCAAATAGGTAAAAAATTAACAT     <<;<<<<<<<<<<<<<&;<;<7<<;<<<<<<<5<<     MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:0  H1:i:1
+B7_597:7:113:408:211   99      chr2    789     99      35M     =       952     198     GAGACTACAGAGCAACTAGGTAAAAAATTAACATT     <<<<<<<<<<<<<<<:&<<<&:<<<<<<<<<<;:/     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_93:3:79:879:15    147     chr2    790     99      35M     =       626     -199    AGACTACAGAGCAACTAGGTAAAAAATTAACATTA     <;;5;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_65:4:325:795:213 83      chr2    790     99      35M     =       618     -207    AGACTACAGAGCAACTAGGTAAAAAATTAACATTA     <<<0<<;<<<<;<<;:<<<<<<<<<<<;<<<<<9<     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS112_34:4:22:206:150 83      chr2    792     99      35M     =       619     -208    AAAAAAGAGCAACTAGGTAAAAAATTAACATTACA     8&)<)<<<<+<<+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:3  UQ:i:21 H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_59:5:181:713:140 147     chr2    793     84      35M     =       615     -213    CTACAGAGCAACAAGGTAAAAAATTAACATTACAA     78<+<7<-7;;;&<5<7<<<<7<<<<<<<<<<<7<     MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:0  H1:i:1
+B7_589:7:76:306:561    163     chr2    794     89      35M     =       987     228     TACAGAGCAACTAGGTAAAAAATTAACATTACAAC     <<)<<<<<<8<<8<<<<<<<;;;<<1<<3;=7<<9     MF:i:18 Aq:i:20 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_93:4:325:352:67   83      chr2    794     99      35M     =       622     -207    TACAGAGCAACTAGGTAAAAAATTAACATTACAAC     ;<8<<<;;<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_66:4:310:287:420 99      chr2    794     99      35M     =       965     206     TACAGAGCAACTAGGTAAAAAATTAACATTACAAC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;;;     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_7:5:74:329:459  83      chr2    795     99      35M     =       623     -207    ACAGAGCAACTAGGTAAAAAATTAACATTACAACA     </<;<8/<<9<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_1:6:57:1342:1166        99      chr2    796     99      35M     =       964     203     CAGAGCAACTAGGTAAAAAATTAACATTACAACAG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;<;     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_1:2:3:542:428   163     chr2    797     99      35M     =       965     203     AGAGCAACTAGGTAAAAAATTAACATTACAACAGG     7<4<<<6<<,<9)<<<<6<,<<7<<7<<<<<<<<1     MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_73:7:97:892:419  83      chr2    800     99      35M     =       621     -214    GCAACTAGGTAAAAAATTAACATTACAACAGGAAC     ;8<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:6:82:1051:921        83      chr2    800     99      40M     =       616     -224    GCAAATAGGTAAAAAATTAACATTACAACAGGAACAAAAC        3-::-7<;+:9<;<<<5<;9,::53-;:3<<<<9<<3<<<        MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:1  UQ:i:12 H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_95:5:263:511:936  147     chr2    801     99      35M     =       629     -207    CAAATAGGTAAAAAATTAACATTACAACAGGAACA     +<<%<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:1  UQ:i:4  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_26:7:157:876:302        163     chr2    801     99      35M     =       964     198     CAACTAGGTAAAAAATTAACATTACAACACGAACA     2<<;<<<22<<<<<<77<<<<22<7<<<<%-<<1<     MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:1  UQ:i:4  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_65:2:127:288:655 163     chr2    803     99      35M     =       999     231     ACTAGGTAAAAAATTAACATTACAACAGGAACAAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;<<;;     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_97:4:83:731:540   147     chr2    804     99      35M     =       623     -216    CTAGGTAAAAAATTAACATTACAACAGGAACAAAA     ;7<:+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:5:82:843:1838        99      chr2    804     99      35M     =       999     230     CTAGGTAAAAAATTAACATTACAACAGGAACAAAA     ;<<;:;;<<<;;<<<<;;<<;;;;;<;;;;68887     MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:5:71:994:576  147     chr2    805     99      35M     =       655     -185    TAGGTAAAAAATTAACATTACAACAGGAACAAAAC     <<9;;<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_65:8:24:415:944  99      chr2    805     99      35M     =       974     204     TAGGTAAAAAATTAACATTACAACAGGAACAAAAC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS219_FC30151:3:73:1458:1337  83      chr2    806     99      35M     =       609     -232    AGGTAAAAAATTAACATTACAACAGGAACAAAACC     <</<<<<<<<6:<::<<<1<<:<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_95:2:142:353:398  163     chr2    807     99      35M     =       977     205     GGTAAAAAATTAACATTACAACAGGAACAAAACCT     =================================9=     MF:i:18 Aq:i:79 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_95:7:46:522:426   163     chr2    807     99      35M     =       964     192     GGTAAAAAATTAACATTACAACAGGAACAAAACCT     =======================:==;<===78==     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_30:7:59:871:351 163     chr2    808     99      35M     =       963     190     GTAAAAAATTAACATTACAACAGGAACAAAACCTC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<;     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS192_3:6:235:505:553 163     chr2    808     99      35M     =       987     214     GTAAAAAATTAACATTACAACAGGAACAAAACCTC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;:;:     MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS219_1:1:60:1420:660 83      chr2    808     99      35M     =       649     -194    GTAAAAAATTAACATTACAACAGGAACAAAACCTC     99<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:3:180:89:582    147     chr2    809     99      36M     =       650     -195    TAAAAAATTAACATTACAACAGGAACAAAACCTCAT    ;<<<<<<4<<<:<<<<<<<<<6<<<<<<<<<<;<<<    MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_103:3:323:196:855 83      chr2    809     99      35M     =       642     -202    TAAAAAATTAACATTACAACAGGAACAAAACCTCA     &<<<<<<09<<7<7;<;<<0<<<<<;<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_4:5:295:547:216 163     chr2    809     99      35M     =       970     196     TAAAAAATTAACATTACAACAGGAACAAAACCTCA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<;     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_99:7:126:361:250  99      chr2    810     99      35M     =       1002    227     AAAAAATTAACATTACAACAGGAACAAAACCTCAT     <<<<<<;9<<<<<<<<<<<<<<;;;<<<;<664;;     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:5:266:133:789 99      chr2    810     99      35M     =       988     213     AAAAAATTAACATTACAACAGGAACAAAACCTCAT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:5:175:149:296 83      chr2    811     99      35M     =       614     -232    AAAAATTAACATTACAACAGGAACAAAACCTCATA     =;==26==;==;================7======     MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_610:5:136:260:254   99      chr2    813     99      35M     =       988     210     AAATTAACATTACAACAGGAACAAAACCTCATATA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<><<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:1:85:1521:58 147     chr2    813     99      40M     =       639     -214    AAATTAACATTACAACAGGAACAAAACCTCATATATCAAT        :::86<<:<<8<<<<;<<8<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<        MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_7:4:164:719:947 99      chr2    813     99      35M     =       1005    227     AAATTAACATTACAACAGGAACAAAACCTCATATA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<;<<<<<     MF:i:18 Aq:i:64 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS219_1:1:50:257:341  163     chr2    813     99      35M     =       971     193     AAATTAACATTACAACAGGAACAAAACCTCATATA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<6<<<<     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_67:5:117:33:262  83      chr2    814     99      35M     =       642     -207    AATTAACATTACAACAGGAACAAAACCTCATATAT     <<;;<<;<:8<7<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS218_1:8:90:706:1276 163     chr2    814     99      35M     =       980     201     AATTAACATTACAACAGGAACAAAACCTCATATAT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<:<:<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:2:116:966:193 163     chr2    815     99      35M     =       967     187     ATTAACATTACAACAGGAACAAAACCTCATATATC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_11:1:59:742:549 147     chr2    816     99      35M     =       642     -209    TTAACATTACAACAGGAACAAAACCTCATATATCA     -<<<3<<<<6<<6<<<<<6<<<<6<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:48 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_11:7:74:213:877 99      chr2    816     99      35M     =       996     215     TTAACATTACAACAGGAACAAAACCTCATATATCA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:2
+B7_610:3:85:219:371    163     chr2    817     99      35M     =       967     185     TAACATTACAACAGGAACAAAACCTCATATATCAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<;<;     MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:2:176:653:957 163     chr2    819     82      35M     =       982     198     ACATTACAACAGGAACAAAACCTCATATATCAATA     ????????????<<???@<<<<<@<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_30:1:64:526:339 163     chr2    819     96      35M     =       1019    235     ACATTACAACAGGAACAAAACCTCATATATCAATA     <<<<<<<<;<<<<<<<<<<7<:<<<<<<<<<8:<:     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_71:7:97:743:602  83      chr2    821     99      34M     =       644     -211    ATTACAACAGGAACAAAACCTCATATATCAATAT      <(&<:<<&<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<      MF:i:18 Aq:i:26 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:2  H1:i:6
+B7_610:2:75:887:149    163     chr2    823     99      35M     =       1004    216     TACAACAGGAACAAAACCTCATATATCAATATTAA     <<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<;<<<<<<<;<;;;     MF:i:18 Aq:i:23 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:2
+EAS221_1:2:73:955:728  83      chr2    823     44      35M     =       660     -198    TACAACAGGAACAAAACCTCATATATCAATATTAA     ;<-<<6<;<<<6<<<<;7<6<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:14 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:3  H1:i:18
+EAS1_108:2:102:543:160 163     chr2    825     99      35M     =       977     187     CAACAGGAACAAAACCTCATATATCAATATTAACT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<6<:<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:2
+EAS114_28:2:55:562:403 83      chr2    825     99      36M     =       643     -218    CAACAGGAACAAAACCTCATATATCAATATTAACTT    +<<&<<<<<<<<<<+<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:51 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:5
+B7_593:1:19:695:59     99      chr2    826     99      36M     =       988     198     AACAGGAACAAAACCTCATATATCAATATTAACTTT    <<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<;<<;;<;<<7<<<<;    MF:i:18 Aq:i:49 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:3
+EAS221_1:2:8:327:522   163     chr2    826     99      35M     =       1001    210     AACAGGAACAAAACCTCATATATCAATATTAACTT     <<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<:<<<     MF:i:18 Aq:i:49 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:3
+EAS114_45:6:90:561:850 163     chr2    827     85      35M     =       1004    212     ACAGGAACAAAACCTCATATATCAATATTAACTTT     ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;9;9;6;77777     MF:i:18 Aq:i:19 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:2  H1:i:25
+EAS56_61:5:209:824:866 83      chr2    828     73      35M     =       665     -198    CAGCAACAAAACCTCATATATCAATATTAACTTTG     ;<:&<<:<<<<;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:19 NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:1  H1:i:7
+EAS139_11:2:31:628:1820        83      chr2    828     98      35M     =       675     -188    CAGGAACAAAACCTCATATATCAATATTAACTTTG     <<<<<<:<<<<:6<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:20 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:5
+EAS220_1:4:6:1178:1105 147     chr2    830     93      35M     =       657     -208    GGAACAAAACCTCATATATCAATATTAACTTTGAA     <:<<9<<<<::7<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:17 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:11
+EAS114_28:4:305:707:258        99      chr2    831     58      36M     =       992     197     GAACAAAACCTCATATATCAATATTAACTTTGAATA    9<<<<<<<<<<<<;<<-<<;;<;<<9<<;<<+99;7    MF:i:18 Aq:i:17 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:2  H1:i:9
+EAS54_67:3:114:736:433 163     chr2    832     63      35M     =       998     201     AACAAAACCTCATATATCAATATTAACTTTGAATA     ;<<9<8;<<<<8<8<;<<;;;0<<8;<;<<47;;;     MF:i:18 Aq:i:18 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:3
+B7_591:7:157:447:758   99      chr2    833     99      36M     =       994     197     ACAAAACCTCATATATCAATATTAACTTTGAATAAA    <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<;<    MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:2
+B7_591:4:159:508:571   99      chr2    834     84      36M     =       989     191     CAAAACCTCATATATCAATATTAACTTTGAATAAAA    <<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;    MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:3
+EAS54_65:7:68:825:405  163     chr2    835     30      35M     =       1015    215     AAAACCTCATATATCAATATTAACTTTGAATAAAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;;9     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:5
+B7_593:3:102:856:670   99      chr2    836     99      36M     =       1025    225     AAACCTCATATATCAATATTAACTTTGAATAAAAAG    <<<<<<<;<<<;<<;:<<<<<<<<<<:;;<<;<<<7    MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_61:3:260:827:289 163     chr2    836     99      35M     =       999     198     AAACCTCATATATCAATATTAACTTTGAATAAAAA     <<<<2<<<<;<<<<;<<<<<<:<<<&-<8<<88<3     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:5
+EAS114_28:1:220:801:282        147     chr2    837     99      36M     =       660     -213    AACCTCATATATCAATATTAACTTTGAATAAAAAGG    ;7;87;===;==;====:===<==7===========    MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_3:4:57:1675:720 147     chr2    841     99      35M     =       684     -192    TCATATATCAATATTAACTTTGAATAAAAAGGGAT     <,<<<<<<:<<<<<<<<:9<<<<<<<<;<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_30:2:297:949:26 83      chr2    842     99      35M     =       676     -201    CATATATCAATATTAACTTTGAATAAAAAGGGATT     5<;<;<;:<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:51 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS219_FC30151:1:76:34:691     89      chr2    843     58      35M     *       0       0       ATATATCAATATTAACTTTGAATAAAAAGGGATTA     <<<<<<16<<<<<916<<<499<966161919<<<     MF:i:32 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_597:5:98:995:929    83      chr2    844     99      35M     =       680     -199    TATAACAATATTAACTTTGAATAAAAAGGGATTAA     &<+<'7<<+<&<<<7+4<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:63 NM:i:1  UQ:i:6  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:3:58:923:1915        163     chr2    846     99      40M     =       1007    201     TATCAATATTAACTTTGAATAAAAAGGGATTAAATTCCCC        <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;<<<<<<<:::::        MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_64:4:181:476:394 83      chr2    847     99      35M     =       666     -216    AACAATATTAACTTTGAATAAAAAGGGATTAAATT     <+;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:1  UQ:i:10 H0:i:1  H1:i:0
+EAS112_32:7:322:391:742        147     chr2    847     99      35M     =       667     -215    ATCAATATTAACTTTGAATAAAAAGGGATTAAATT     <63<<<<9<<<:<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_11:8:17:437:1378        83      chr2    847     99      35M     =       676     -206    ATCAATATTAACTTTGAATAAAAAGGGATTAAATT     <<7<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:51 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_66:3:155:375:623 163     chr2    849     99      35M     =       1029    215     CAATATTAACTTTGAATAAAAAGGGATTAAATTCC     0<<<<<;<<<<<<<<<<<<<4<<8<<<<<<<<;<;     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_595:2:29:729:70     163     chr2    850     51      35M     =       1009    194     ANTATTANCTTTGANNAAAAAGGGATTAAATTCCC     :!<:<<8!::::5:!!:.77::33888633:8777     MF:i:130        Aq:i:51 NM:i:3  UQ:i:0  H0:i:0  H1:i:0
+EAS54_65:7:117:452:744 83      chr2    850     99      35M     =       676     -209    AATATTAACTTTGAATAAAAAGGGATTAAATTCCC     <;;<;<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:50 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:1:288:384:444 83      chr2    855     99      35M     =       696     -194    TAACTTTGAATAAAAAGGGATTAAATTCCCCCACT     ;=9;;<====<=;=/=9;<========<=======     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_28:7:133:514:754        163     chr2    855     63      36M     =       1036    217     TAAATTTGAATAAAAAGGGATTAAATTCCCCCACTT    ***&,,,+(*,*********+*)*(***(**((*)(    MF:i:18 Aq:i:19 NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:0  H1:i:1
+EAS139_19:5:68:306:409 147     chr2    856     99      40M     =       682     -214    AACTTTGAATAAAAAGGGATTAAATTCCCCCACTTAAGAG        ::2:7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<        MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_61:3:155:758:710 163     chr2    859     98      35M     =       1048    224     TTTGAATAAAAAGGGATTAAATTCCCCCACTTAAG     =======8================6=:7===:=:=     MF:i:18 Aq:i:22 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:3:39:208:644 147     chr2    859     99      35M     =       704     -190    TTTGAATAAAAAGGGATTAAATTCCCCCACTTAAG     78899;;;;4;;;;;;;;;;;;;;;;;;8;;8;;;     MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:1:16:438:245  89      chr2    860     65      35M     *       0       0       TTGAATAAAAAGGGATTAAATTCCCCCACTTAAGA     8*8<5'<77;;;;;7<7<<7-<;<<<;;<<<;;79     MF:i:32 Aq:i:65 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_73:5:145:635:390 83      chr2    860     99      35M     =       673     -222    TTGAATAAAAAGGGATTAAATTCCCCCACTTAAGA     +9;<<;<<<<<;;;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_28:6:187:996:432        147     chr2    860     99      36M     =       693     -203    TTGAATAAAAAGGGATTAAATTCCCCCACTTAAGAG    ;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_591:2:123:924:645   163     chr2    861     84      36M     =       1045    220     TGAATAAAAAGGGATTAAATTCCCCCACTTAAGAGA    <<<<<<<<<<<<;<<<<<<;<<<<<<<6:<7<1<+<    MF:i:18 Aq:i:11 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_597:4:146:961:63    163     chr2    861     86      35M     =       1041    215     TGAATAAAAAGGGCTTAAATTCCCCCACTTAAGGG     <<+<<<<::+1<;&<<88<<<<;;.<0;;85(;(8     MF:i:18 Aq:i:37 NM:i:2  UQ:i:12 H0:i:0  H1:i:1
+EAS114_30:6:4:665:771  69      chr2    862     0       *       =       862     0       GTGCTTTATCTGATATCAATGCCGATAAACTGCCT     <<<<<<<<<<<<%<8<3:7:77<(7,:3(:&2:(0     MF:i:192
+EAS114_30:6:4:665:771  137     chr2    862     71      35M     =       862     0       GAATAAAAAGGGATTAAATTCCCCCACTTAAGAGA     <;<<;<18<;<8<<<<;<;;<<<<1<<<<6;;;;;     MF:i:64 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_93:6:45:601:439   83      chr2    864     99      35M     =       691     -208    ATAAAAAGGGATTAAATTCCCCCACTTAAGAGATA     <8<<<<<<1<<<<<<<<)<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_65:4:126:966:514 163     chr2    865     99      35M     =       1027    197     TAAAAAGGGATTAAATTCCCCCACTTAAGAGATAT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<;<<<;     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:2:76:1765:700        83      chr2    866     99      35M     =       680     -221    AAAAAGGGATTAAATTCCCCCACTTAAGAGATATA     77777;;;;7;7;<;;;;+;;<9<<<79;<1<<77     MF:i:18 Aq:i:63 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_26:1:155:807:19 99      chr2    867     99      35M     =       1074    242     AAAAGGGATTAAATTCCCCCACTTAAGAGATATAG     <<<<<<<<<<<<<<<<9+<<<<<<9<<9;4<<<<:     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_30:2:226:885:729        99      chr2    867     98      35M     =       1037    205     AAAAGGGATTAAATTCCCCCACTTAAGAGATATAG     <<<;<<<<<<;<;<<<<<<<:;<<;4;%;<<;<<.     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:4:1:156:196  99      chr2    867     77      40M     =       1042    215     AAAAGGGATTAAATTCCCCCACTTAAGAGATATAGATTGG        <<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<:;9:9        MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_1:2:52:1144:509 147     chr2    867     99      35M     =       706     -196    AAAAGGGATTAAATTCCCCCACTTAAGAGATATAG     <<<<:<<<<<<<<<<;::;:<;<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:6:73:735:329  99      chr2    868     99      35M     =       1035    202     AAAGGGATTAAATTCCCCCACTTAAGAGATATAGA     ================;==;====;=;=======;     MF:i:18 Aq:i:39 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_81:6:11:801:386  163     chr2    868     97      35M     =       1061    228     AAAGGGATTAAATTCCCCCACTTAAGAGATATAGA     <<<<<<<<<<8<<<<<:4<::<854:5<:::;4+4     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_65:4:150:94:843  99      chr2    868     75      35M     =       1050    217     AAAGGGATTAAATTCCCCCACTTAAGAGATATAGA     <<<<<<<<7<<<6<<<<<<<<<<<6<<62<<<<<2     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_73:5:255:796:239 147     chr2    869     99      35M     =       692     -212    AAGGGATTAAATTCCCCCACTTAAGAGATAGAGAT     <<3;;<7:<<<;(7<<7;<<;<<<<<<<<<7<<<<     MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1  UQ:i:22 H0:i:0  H1:i:1
+B7_589:5:147:405:738   163     chr2    870     99      35M     =       1048    213     AGGGATTAAATTCCCCCACTTAAGAGATATAGATT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;;     MF:i:18 Aq:i:24 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_63:2:33:357:858  83      chr2    870     99      35M     =       716     -189    AGGGATTAAATTCCCCCACTTAAGAGATATAGATT     <;<:<<<<<<<<<;<9<<;<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_65:7:122:398:994 83      chr2    871     99      35M     =       708     -198    GGGATTAAATTCCCCCACTTAAGAGATATAGATTG     95:<9<<<<:9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:1
+EAS1_105:2:146:374:692 147     chr2    874     99      35M     =       690     -219    ATTAAATTCCCCCACTTAAGAGATATAGATTGGCA     <4:<<<1:<:<::<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<;     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:6:119:428:415   163     chr2    876     99      36M     =       1037    197     TAAATTCCCCCACTTAAGAGATATAGATTGGCAGAA    <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9;;<;;;    MF:i:18 Aq:i:46 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_105:7:168:247:414 147     chr2    876     99      35M     =       698     -213    TAAATTCCCCCACTTAAGAGATATAGATTGGCAGA     ,;;;,146<6;6<<8<<<<1<8<<<<<<<<<<;1<     MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_26:2:130:609:467        147     chr2    877     99      35M     =       728     -184    AAATTCCCCCACTTAAGAGATATAGATTGGCAGAA     ===:2===;<====>==>=>=>=>>>==>>>=>>>     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:5:57:366:844 83      chr2    877     99      40M     =       708     -209    AAATTCCCCCACTTAAGAGATATAGATTGGCAGAACAGAT        ;;;7:8&555<,;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<        MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_32:3:236:475:254        163     chr2    880     99      35M     =       1051    206     TTCCCCCACTTAAGAGATATAGATTGGCAGAACAG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:::<:;</;/     MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_28:2:251:819:772        147     chr2    881     99      36M     =       726     -191    TCCCCCACTTAAGAGATATAGATTGGCAGAACAGAT    6+7++1<<%<<<<<<<+<+<9<<99<9<<<<<<9<<    MF:i:18 Aq:i:59 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:1:36:481:1079        83      chr2    881     99      40M     =       707     -214    TCCCCCACTTAAGAGATATAGATTGGCAGAACAGATTTAA        :11+)*<4;<<<<<<<<<;;<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<        MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:5:29:411:1208        147     chr2    882     99      40M     =       698     -224    CCCCCACTTAAGAGATATAGATTGGCAGAACAGATTTAAA        766+6<996<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<        MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS219_1:7:62:1076:540 99      chr2    882     99      35M     =       1066    219     CCCCCACTTAAGAGATATAGATTGGCAGAACAGAT     <<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<;<7;     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:7:189:530:40    83      chr2    883     99      36M     =       698     -221    CCCCACTTAAGAGATATAGATTGGCAGAACAGATTT    883;<<<<<<<<<:<<<<<<<<3<;<<<<<<<<;<<    MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_71:8:113:856:319 163     chr2    884     99      35M     =       1067    216     CCCACTTAAGAGATATAGATTGGCAGAACAGATTT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_11:2:55:296:1457        99      chr2    884     99      35M     =       1061    212     CCCACTTAAGAGATATAGATTGGCAGAACAGATTT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_1:8:15:881:1932 99      chr2    886     92      35M     =       1061    210     CACTTAAGAGATATAGATTGGCAGAACAGATTTAA     <<<<<<<<<<<<<<<;<<<<:<<<2<26<8<<;;.     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_610:7:116:157:612   147     chr2    889     99      35M     =       707     -217    TTAAGAGATATAGATTGGCAGTACAGATTTAAAAA     ;;<<<<<<<<<<<<<<<<;<</<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:1  UQ:i:14 H0:i:0  H1:i:1
+EAS114_28:7:215:863:521        83      chr2    890     99      36M     =       732     -194    TAAGAGATATAGATTGGCAGAACAGATTTAAAAACA    ;<<<<<<<<<<<<<;<<;<;<<<<<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_73:7:254:572:431 163     chr2    891     97      35M     =       1048    192     AAGAGATATAGATTGGCAGAACAGATTTAAAAACA     <<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<99;;;;;     MF:i:18 Aq:i:22 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_81:6:273:424:207 163     chr2    891     99      35M     =       1066    210     AAGAGATATAGATTGGCAGAACAGATTTAAAAACA     <,<,<9<<9<<<<<<<<<<79<,599,<191<99+     MF:i:18 Aq:i:62 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_63:8:4:571:820   163     chr2    891     99      35M     =       1071    215     AAGAGATATAGATTGGCAGAACAGATTTAAAAACA     <<<<<<<<<<<9<<;9<;;;<;6;:<<<3:;;;:6     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_11:4:36:1231:1381       147     chr2    891     99      35M     =       708     -218    AAGAGATATAGATTGGCAGAACAGATTTAAAAACA     <<<<<<;<<<<<<<<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:3:66:718:481 99      chr2    891     99      40M     =       1072    221     AAGAGATATAGATTGGCAGAACAGATTTAAAAACATGAAC        <<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<;<<<<<<<;<<<:1:;:        MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_591:7:22:632:176    163     chr2    894     99      36M     =       1091    233     AGATATAGATTGGCAGAACAGATTTAAAAACATGAA    <<<<<;<<<<<<;<<;<:<<<:<<:<<<;<<<;;;:    MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_81:8:271:180:509 147     chr2    896     99      35M     =       729     -202    ATATAGATTGGCAGAACAGATTTAAAAACATGAAC     <<<<<<<<<9<:<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_589:5:198:564:731   163     chr2    898     99      35M     =       1089    226     ATAGATTGGCAGAACAGATTTAAAAACATGAACTA     <<<<<;<<<<<<;<<:<<;9<<<<<<<<1;<<58<     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_3:2:67:1467:1447        83      chr2    898     99      35M     =       722     -211    ATAGATTGGCAGAACAGATTTAAAAACATGAACTA     <<<<<::<<:<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_105:6:172:827:592 83      chr2    899     99      35M     =       703     -231    TAGATTGGCAGAACAGATTTAAAAACATGAACTAA     8<<<<;7;7<<<<;<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_65:8:240:719:799 147     chr2    900     99      35M     =       720     -215    AGATTGGCAGAACAGATTTAAAAACATGAACTAAC     <:<<<<<:<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_11:7:24:1345:1627       73      chr2    900     78      35M     =       900     0       AGATTGGCAGAACAGATTTAAAAACATGAACTAAC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<8<3     MF:i:64 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_11:7:24:1345:1627       133     chr2    900     0       *       =       900     0       NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN     !!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!     MF:i:192
+EAS139_19:1:58:726:1746        163     chr2    900     99      40M     =       1061    201     AGATTGGCAGAACAGATTTAAAAACATGAACTAACTATAT        <<<<<<<<<<<<<<<<<<<6<<<<8<<<<<<<<:8:8:88        MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:7:88:451:1773        147     chr2    902     99      35M     =       742     -195    ATTGGCAGAACAGATTTAAAAACATGAACTAACTA     973776;;;;;;;;;::;;;;;;;;;;;;;;3;;;     MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_65:8:178:187:610 147     chr2    903     99      35M     =       744     -194    TTGGCAGAACAGATTTAAAAACATGAACTAACTAT     66:,:<7<<<<<<<1<<<<<<<<<<<<<<<2<<<<     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:6:38:332:54     83      chr2    904     99      36M     =       737     -203    TGGCAGAACAGATTTAAAAACATGAACTAACTATAT    8;;&<;<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_66:5:210:674:911 147     chr2    904     99      35M     =       740     -199    TGGCAGAACAGATTTAAAAACATGAACTAACTATA     27;2<;<<5<<<<;;<<<<<;<<<<<<;<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_30:2:82:963:128 83      chr2    905     99      35M     =       719     -221    GGCAGAACAGATTTAAAAACATGAACTAACTATAT     585<;<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:2:12:1335:1372       83      chr2    906     99      40M     =       721     -225    GAAGAACAGATTTAAAAACATGAACTAACTATATGCTGTT        :&;;;<*<<<9<<<<<<<<<<<<<<4<<<<<<<<<<<<<<        MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_39:1:98:641:1040        163     chr2    907     99      35M     =       1085    213     CAGAACAGATTTAAAAACATGAACTAACTATATGC     <<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_81:8:41:530:663  83      chr2    908     99      35M     =       730     -213    AGAACAGATTTAAAAACATGAACTAACTATATGCT     =8=;*=5==;;=====:=====;===;========     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_105:1:87:430:995  147     chr2    909     67      35M     =       731     -213    GAAAAGAGTTAAAAACATGAACTAACTATATGCTG     1<4%81<..1<<<<<0<<<<<0.<<9<<(<6<<6<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:2  UQ:i:17 H0:i:0  H1:i:1
+B7_595:3:85:964:950    163     chr2    910     99      35M     =       1095    220     AACAGATTTAAAAACATGAACTAACTATATGCTGT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<;:     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_610:8:68:570:705    99      chr2    910     99      35M     =       1100    225     AACAGATTTAAAAACATGAACTAACTATATGCTGT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<8<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_67:6:198:503:669 99      chr2    912     99      35M     =       1107    230     CAGATTTAAAAACATGAACTAACTATATGCTGTTT     <<<<<<<<<<;8<<<<<;<<<<<<;<;<8<<8<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_66:5:273:545:1001        163     chr2    913     99      35M     =       1088    210     AGATTTAAAAACATGAACTAACTATATGCTGTTTA     <<<<<<<<<<<<<<<;;<<<<<<;<8;28<8;<<8     MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_99:8:152:778:228  83      chr2    915     99      35M     =       739     -211    ATTTAAAAACATGAACTAACTATATGCTGTTTACA     <;;7=<<<<<<;<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:1:53:463:1132        163     chr2    915     99      40M     =       1109    234     ATTTAAAAACATGAACTAACTATATGCTGTTTACANGAAA        <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<8<<<<<<<8<!1488        MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:1  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS218_4:3:12:630:707  147     chr2    915     99      35M     =       751     -199    ATTTAAAAACATGAACTAACTATATGCTGTTTACA     <:<<<<<<<;<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_105:8:179:119:876 163     chr2    917     60      35M     =       1112    230     TTAAAAACATGAACTAACTATATGCTGTTTACCAG     <<<<<<<7<<<<<<<8<<<6<<<<<<7<<<:0&<0     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:1  H1:i:1
+EAS1_97:6:308:667:658  99      chr2    918     10      35M     =       1116    233     TAAAAACATGAACTAACTATATCCTTCTTACAATA     9<96<<<;<96<<9<51<<<<<1:9++<9*%4;*5     MF:i:18 Aq:i:10 NM:i:4  UQ:i:45 H0:i:0  H1:i:0
+EAS114_28:5:163:832:715        163     chr2    918     99      36M     =       1085    203     TAAAAACATGAACTAACTATATGCTGTTTACAAGAA    <<0;<9<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<;;;<6    MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_591:3:179:496:161   83      chr2    919     99      36M     =       756     -199    AAAAACATGAACTAACTATATGCTGTTTACAAGAAA    <<<<<9<<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:49 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_93:8:13:325:483   163     chr2    919     99      35M     =       1101    217     AAAAACATGAACTAACTATATGCTGTTTACAAGAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;     MF:i:18 Aq:i:27 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:1
+EAS1_103:7:139:578:951 163     chr2    919     98      35M     =       1095    211     AAAAACATGAACTAACTATATGCTGTTTACAAGAA     <<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<0;;     MF:i:18 Aq:i:26 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:1
+EAS1_108:8:19:929:765  99      chr2    919     98      35M     =       1069    185     AAAAACATGAACTAACTATATGCTGTTTACAAGAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;77<     MF:i:18 Aq:i:27 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:1
+EAS56_57:5:214:644:390 163     chr2    919     72      35M     =       1082    198     AAAAACATGAACTAACTATATGCTGTTTACAAGAA     <<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;     MF:i:18 Aq:i:27 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:1
+EAS114_30:6:243:209:110        83      chr2    920     48      35M     =       768     -187    AAAACATGAACTAACTATATGCTGTTTACAAGAAA     ;<;;;:<:<:;<<;;<;<;<;7<<;<<;;<;<<<<     MF:i:18 Aq:i:48 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_32:2:247:900:123        99      chr2    920     99      35M     =       1123    238     AAAACATGAACTAACTATATGCTGTTTACAAGAAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9;<;     MF:i:18 Aq:i:51 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:1
+EAS51_62:7:162:195:761 83      chr2    922     30      35M     =       767     -190    AACATGAACTAACTATATGCTGTTTACAAGAAACT     <<8<<:<<:<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:2  H1:i:0
+EAS1_103:2:184:980:396 163     chr2    923     99      35M     =       1092    204     ACATGAACTAACTATATGCTGTTTACAAGAAACTC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<     MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_59:2:162:272:415 99      chr2    923     83      35M     =       1112    224     ACATGAACTAACTATATGCTGTTTACAAGAAACTC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<9;<<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS192_3:4:184:237:476 163     chr2    925     99      35M     =       1101    211     ATGAACTAACTATATGCTGTTTACAAGAAACTCAT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<;<;;<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_95:1:202:341:984  99      chr2    926     99      35M     =       1094    203     TGAACTAACTATATGCTGTTTACAAGAAACTCATT     =========================4;========     MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_53:3:107:738:484 99      chr2    926     75      35M     =       1097    206     TGAACTAACTATATGCTGTTTACAAGAAACTCATT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_39:6:7:492:1088 147     chr2    926     57      35M     =       769     -192    TGAACTAACTATATGCTGTTTACAAGAAACTCATT     4;<<75<<::<:<<<-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:57 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:1
+EAS139_11:1:81:1019:558        83      chr2    926     77      35M     =       760     -201    TGAACTAACTATATGCTGTTTACAAGAAACTCATT     <<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_39:4:10:1312:1558       83      chr2    928     76      35M     =       771     -192    AACTAACTATATGCTGTTTACAAGAAACTCATTAA     <<:<<<;<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_71:4:206:741:810 83      chr2    929     99      34M     =       753     -210    ACTAACTATATGCTGTTTACAAGAAACTCATTAA      <3<<;5<<<<<;:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<      MF:i:18 Aq:i:48 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_73:7:200:65:291  147     chr2    930     99      35M     =       728     -237    CTAACTATATGCTGTTTACAAGAAACTCATTAATA     ;9<;3<<9<7<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_39:2:38:670:564 147     chr2    930     73      35M     =       770     -195    CTAACTATATGCTGTTTACAAGAAACTCATTAATA     3<<<3:<<<<<:;<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_39:7:57:1114:2032       99      chr2    931     99      35M     =       1102    206     TAACTATATGCTGTTTACAAGAAACTCATTAATAA     <7<<<<<<<<<<<<<<<<<777<<<7<<<<<3<<7     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_59:5:125:137:58  83      chr2    932     76      35M     =       772     -195    AACTATATGCTGTTTACAAGAAACTCATTAATAAA     <<9;<<<<<;<;<<<<;<<<<<<;<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_62:1:38:250:647  163     chr2    933     71      35M     =       1100    202     ACTATATGCTGTTTACAAGAAACTCATTAATAAAT     <<<<<<<9<<9<<<<<<<6<<<<<<<<<<8<779%     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:1  UQ:i:4  H0:i:1  H1:i:0
+EAS192_3:6:116:464:261 99      chr2    934     99      35M     =       1107    208     CTATATGCTGTTTACAAGAAACTCATTAATAAAGA     <<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<;<<<<<<<<<;;8<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_589:1:168:69:249    163     chr2    936     99      35M     =       1125    224     ATATGCTGTTTACAAGAAACTCATTAATAAAGACA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;;<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_32:4:246:647:765        163     chr2    937     99      35M     =       1119    217     TATGCTGTTTACAAGAAACTCATTAATAAAGACAT     ;<<<<<<<<<;<&<<3+3<<<3<<9&</:/87</8     MF:i:18 Aq:i:62 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_32:3:307:113:346        163     chr2    938     99      35M     =       1123    220     ATGCTGTTTACAAGAAACTCATTAATAAAGACATG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<8     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:6:159:493:275 147     chr2    939     72      35M     =       760     -214    TGCTGTTTACAAGAAACTCATTAATAAAGACATGA     4949;<<<<<<<<<<<6<;<<<<;<<<<<*<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_71:3:257:288:731 99      chr2    939     99      34M     =       1131    227     TGCTGTTTACAAGAAACTCATTAATAAAGACATG      <<<<<<<<8<8<<;<;<<<;<<<5<;;88.8<6<      MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_103:4:231:815:626 163     chr2    940     99      35M     =       1119    214     GCTGTTTACAAGAAACTCATTAATAAAGACATGAG     <;<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;5<<<;:;     MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_39:4:93:77:1338 163     chr2    940     10      35M     =       1098    193     GCTGCTTACAAGAAGCGCATTAATAAAGACATGAG     <<<<*<2<<<:<4<&<6<8<4<::<8<<<<82;;7     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:3  UQ:i:35 H0:i:0  H1:i:0
+EAS114_45:2:54:1886:719        99      chr2    941     99      35M     =       1125    219     CTGTTTACAAGAAACTCATTAATAAAGACATGAGT     ;;;9;;<;;;9;;;;;:;<9;:;;;;9;;;99799     MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_597:7:94:273:165    99      chr2    945     99      35M     =       1128    218     TTACAAGAAACTCATTAATAAAGACATGAGTTCAG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:;;:7     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_30:5:32:461:154 147     chr2    945     71      35M     =       769     -211    TTACAAGAAACTCATTAATAAAGACATGAGTTCAG     ;;</<<<<<;:<.<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:3:303:131:673   163     chr2    947     99      36M     =       1112    201     ACAAGAAACTCATTAATAAAGACATGAGTTCAGGTA    <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<;;;    MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_61:6:10:106:737  163     chr2    947     99      35M     =       1106    194     ACAAGAAACTCATTAATAAAGACATGAGTTCAGGT     <<<;<1<;<<<<<<9<<<<;;<<<<<99<<94008     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_26:2:214:950:32 163     chr2    947     99      35M     =       1132    220     ACAAGAAACTCATTAATAAAGACATGAGTTCAGGT     >>=>>>>==>=>>>==>=>=:=====;=:=6:::6     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS218_1:2:10:686:1024 163     chr2    947     99      35M     =       1103    191     ACAAGAAACTCATTAATAAAGACATGAGTTCAGGT     <:<<<<:<<<<<<<<<<:<:<<<<<<<<<<<5<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_73:5:53:61:31    163     chr2    949     99      35M     =       1122    208     AAGAAACTCATTAATAAAGACATGAGTTCAGATAA     <<<7;<7<<<;7<;;<7<7<7<;5<73<<</%;/;     MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:1  UQ:i:4  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_28:6:185:87:475 83      chr2    949     99      36M     =       786     -199    AAGAAACTCATTAATAAAGACATGAGTTCAGGTAAA    <<4<<<+<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_103:4:235:899:847 99      chr2    950     99      35M     =       1112    197     AGAAACTCATTAATAAAGACATGAGTTCAGGTAAA     <<3<;<<<<<<<<<;;<<<<<<<+<<<+6<8<3/<     MF:i:18 Aq:i:51 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_597:6:193:661:771   163     chr2    952     99      35M     =       1129    212     AAACTCATTAATAAAGACATGAGTTCAGGTAAAGG     <<<<<<<<<;<<<;;;<<<<<;<<<=;<:;5:9::     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_597:7:113:408:211   147     chr2    952     99      35M     =       789     -198    AAACTCATTAATAAAGACATGAGTTCAGGTAAAGG     <:;:;:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_105:8:24:718:322  83      chr2    953     23      35M     =       779     -209    AACTCATTAATAATGTCATGAGTTCAGGTAAAGGG     5:+:0;**&+<00&<&<<<5<28<<;;<83<<<<<     MF:i:18 Aq:i:23 NM:i:2  UQ:i:10 H0:i:0  H1:i:0
+EAS56_61:5:263:314:696 163     chr2    953     99      35M     =       1117    199     AACTCATTAATAAAGACATGAGTTCAGGTAAAGGG     <<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<:<<;<775     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_39:5:93:312:331 163     chr2    953     99      35M     =       1145    227     AACTCATTAATAAAGACATGAGTTCAGGTAAAGGG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<=<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_93:3:181:93:694   83      chr2    954     99      35M     =       783     -206    ACTCATTAATAAAGACATGAGTTCAGGTAAAGGGG     <4;8<<+<<:<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:28 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_30:6:238:803:383        147     chr2    954     75      35M     =       779     -210    ACTCATTAATAAAGACATGAGTTCAGGTAAAGGGG     ;;<;;<<<<<<<<<<<<<<<<;:<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:6:44:77:1255 163     chr2    955     99      35M     =       1113    193     CTCATTAATAAAGACATGAGTTCAGGTAAAGGGGT     ;;;;;;;8;;;7;8;;;;;;;;;;886;;;76777     MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_105:3:232:364:583 147     chr2    956     71      35M     =       780     -211    TCATTAATAAAGACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTG     ;%;7;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:7:256:354:173   163     chr2    957     99      36M     =       1121    200     CATTAATAAAGACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGA    <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<3<<;    MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_597:4:138:211:582   147     chr2    957     99      35M     =       788     -204    CATTAATAAAGACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGG     :<8;<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_95:4:61:631:567   99      chr2    957     99      35M     =       1131    209     CATTAATAAAGACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:5:56:1757:1319       83      chr2    957     67      35M     =       775     -217    CATTAATAAAGACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGG     &7778<<<<<8<;<<:::;<:<4<<:<:;8<8<;<     MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_589:7:154:26:712    147     chr2    959     99      35M     =       786     -208    TTAATAAAGACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAA     ;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_65:8:10:975:766  163     chr2    959     99      35M     =       1166    242     TTAATAAAGACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGAAA     <<<<<<<<;<<<<;<:<<;<6;;<<<:6-:+1+;;     MF:i:18 Aq:i:64 NM:i:1  UQ:i:10 H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_73:5:220:733:736 99      chr2    959     99      35M     =       1143    219     TTAATAAAGACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<5<<;9     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS220_1:4:46:1566:668 163     chr2    959     99      35M     =       1148    224     TTAATAAAGACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:78 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_30:7:59:871:351 83      chr2    963     99      35M     =       808     -190    TAAAGACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAG     ;<<<<<:<;<<<4;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_95:7:46:522:426   83      chr2    964     99      35M     =       807     -192    AAAGACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGA     <<<<<:<<<<<<1/<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_26:7:157:876:302        83      chr2    964     99      35M     =       801     -198    AAAGACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGA     ===:=8=;==:892=,28==88==28====8=;;8     MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS218_1:4:61:1369:440 83      chr2    964     47      35M     =       770     -229    AAAGACATGATTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGA     <<<<<<<<<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1  UQ:i:23 H0:i:0  H1:i:1
+EAS221_1:6:57:1342:1166        147     chr2    964     99      35M     =       796     -203    AAAGACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGA     <<<<<;<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_66:4:310:287:420 147     chr2    965     99      35M     =       794     -206    AAGACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGAT     <<<<;<;<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_65:5:262:53:888  83      chr2    965     99      35M     =       787     -213    AAGACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGAT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_1:2:3:542:428   83      chr2    965     99      35M     =       797     -203    AAGACATGAGTTCAGGTACAGGGGTGGAAAAAGAT     <<876</3<8874:<8:<)<5<<<;<<<<7<<<:<     MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:1  UQ:i:8  H0:i:0  H1:i:1
+B7_593:2:81:435:410    147     chr2    966     99      36M     =       782     -220    AGACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGT    ;<;;<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:29 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_610:3:85:219:371    83      chr2    967     99      35M     =       817     -185    GACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGT     <<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:2:116:966:193 83      chr2    967     99      35M     =       815     -187    GACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGT     ===================================     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_39:4:30:432:228 163     chr2    967     99      35M     =       1145    213     GACATGAGTTCAGGGAAAGGGGTGGAAAAAGATGT     <<<<<<<<<<<<<<8<<<<<<<<<<<<:<<<<<;;     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1  UQ:i:23 H0:i:0  H1:i:1
+B7_610:1:12:88:200     163     chr2    968     99      35M     =       1133    200     ACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTT     <<<<<<<<<<<;<<<<<<<;<<<:<<<<<<9<<5<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_93:2:313:711:530  83      chr2    968     99      35M     =       784     -219    ACATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTT     <7;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_95:7:74:866:49    163     chr2    969     99      35M     =       1143    209     CATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTC     ====================9==91==<=6==;:=     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_62:7:248:17:435  99      chr2    969     99      35M     =       1139    205     CATGAGTTCAGGAAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTC     <<<<8<<<888<+<<<<<;<:<<<<8<<<<<;3<3     MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1  UQ:i:10 H0:i:0  H1:i:1
+EAS114_30:1:188:863:790        83      chr2    969     98      35M     =       783     -221    CATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTC     ;<7<<<55<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:27 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:6:75:1503:1399       163     chr2    969     99      40M     =       1130    201     CATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTACGC        <<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<;<<<<<<;<<<<:::711        MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_65:2:56:155:49   99      chr2    970     99      35M     =       1145    210     ATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;<<<;<9<9;     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_4:5:295:547:216 83      chr2    970     99      35M     =       809     -196    ATGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_59:4:262:928:237 147     chr2    971     99      35M     =       787     -219    TGAGTTCAGGTAAAGGTGTGGAAAAAGATGTTCTA     ;<<<<<;<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1  UQ:i:26 H0:i:0  H1:i:1
+EAS219_1:1:50:257:341  83      chr2    971     99      35M     =       813     -193    TGAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:1:122:38:103  83      chr2    972     79      35M     =       778     -229    GAGTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTAC     ===;3<===:=======<=================     MF:i:18 Aq:i:79 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_59:1:82:670:302  99      chr2    973     99      35M     =       1146    208     AGTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTACG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<5     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_65:8:24:415:944  147     chr2    974     99      35M     =       805     -204    GTTCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTACGC     <;;<<<<:<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<;<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:7:108:440:208 99      chr2    975     99      35M     =       1142    202     TTCAGGTAAAGGGGAGGAAAAAGATGTTCTACGCA     <<<;<<<<<<<<<</<<<<;<<<;<<;<;<64/:+     MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1  UQ:i:14 H0:i:0  H1:i:1
+B7_595:3:229:543:583   99      chr2    976     99      35M     =       1139    198     TCAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTACGCAA     <<<<<<<<<<8<8<9<<<<8<<588<<<<*<2:2*     MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_95:2:142:353:398  83      chr2    977     99      35M     =       807     -205    CAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAA     ===================================     MF:i:18 Aq:i:79 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:2:102:543:160 83      chr2    977     99      35M     =       825     -187    CAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAA     9==9=====;=====================<===     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_66:4:191:40:536  163     chr2    977     66      35M     =       1167    225     CAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAA     <<<<<<<<8<<;<<8<<;<;;<<8<<<<<</<74/     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS112_32:7:272:328:400        163     chr2    977     99      35M     =       1151    209     CAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAA     <<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<;:7     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:4:69:1593:819        83      chr2    977     99      40M     =       786     -231    CAGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAACAGAA        );::7<<<<:;<<<<<<<<<<<<<<<9<<9<3<<<<<<<<        MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:1
+B7_597:3:133:707:886   99      chr2    978     99      35M     =       1146    203     AGGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAAC     <<<<7;<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<5<;66<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:1
+B7_591:4:92:411:955    99      chr2    979     99      36M     =       1149    206     GGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAACAG    <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<;    MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:1
+EAS56_61:8:60:358:494  99      chr2    979     44      35M     =       1179    235     GGTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAACA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<:<<;;4;     MF:i:18 Aq:i:14 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:1
+B7_597:7:41:34:211     163     chr2    980     99      35M     =       1164    219     GTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAACAG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<3:;5;     MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS218_1:2:40:1291:1045        99      chr2    980     99      35M     =       1167    222     GTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTACGCAACAAG     <<<<<<<<<5<<5<<<<7<<<<<<<<<5<9<&%73     MF:i:18 Aq:i:39 NM:i:2  UQ:i:9  H0:i:1  H1:i:0
+EAS218_1:8:90:706:1276 83      chr2    980     99      35M     =       814     -201    GTAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAACAG     <;<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:1
+EAS114_32:4:5:396:292  163     chr2    981     99      35M     =       1155    209     TAAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAACAGA     <<<<<<<<<<<<<<;;<<<<:<<<<;;<;;3/&+8     MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:2:176:653:957 83      chr2    982     82      35M     =       819     -198    AAAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAACAGAA     ===::=============<==<====<========     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:1
+EAS54_71:6:264:705:89  99      chr2    983     99      34M     =       1155    207     AAGGGGTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAACAGAA      <<<<<<<<<<;8<<<<<<<<<<<<<<<&<<,;;(      MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_61:2:66:757:918  163     chr2    985     99      35M     =       1143    193     GGGGTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAACAGAAACC     ===================================     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_61:7:114:506:971 163     chr2    986     99      35M     =       1150    199     GGGTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAACAGAAACCA     ===================================     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_30:6:220:809:850        99      chr2    986     60      35M     =       1187    236     GGGGGGAAAAAGATGTGCTACACAAAAAGATTCCA     <<;7;<<0::8<-6:<0624-*<&-93-,8+(&08     MF:i:130        Aq:i:60 NM:i:4  UQ:i:64 H0:i:0  H1:i:0
+B7_589:7:76:306:561    83      chr2    987     89      35M     =       794     -228    GGTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAACAGAAACCAA     9<7<<9<<<<<<7<<71<71*7<<<<<<<<<<1<<     MF:i:18 Aq:i:20 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:1
+EAS192_3:6:235:505:553 83      chr2    987     99      35M     =       808     -214    GGTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAACAGAAACCAA     ;8518<<<<<;<;<<<;<<;<.<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:1:19:695:59     147     chr2    988     99      36M     =       826     -198    GTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAACAGAAACCAAAT    ;+;8<<<<<<<<<<<5<<+<:<<;<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:49 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_610:5:136:260:254   147     chr2    988     99      35M     =       813     -210    GTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAACAGAAACCAAA     ;:;;<<<<<<<<<<<<<<;<;<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:1
+EAS56_57:5:266:133:789 147     chr2    988     99      35M     =       810     -213    GTGGAAAAAGATGTTCTACGCAAACAGAAACCAAA     9;;<<<<<<<<<<<<5<<;<5<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:1
+B7_591:4:159:508:571   147     chr2    989     84      36M     =       834     -191    TGGAAAAAGATGTTCTACGCAAACAGAAACCAAATG    9<6<<<<<<<<<<<;<<;<<<<<;<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_103:7:166:84:766  163     chr2    990     99      35M     =       1167    212     GGAAAAAGATGTTCTACGCAAACAGAAACCAAATG     <<<<<<<<;<<<<<<<<;<<<<<<;<<<7<;::93     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:1
+EAS56_61:6:283:963:234 99      chr2    992     99      35M     =       1157    200     AAAAAGATGTTCTACGCAAACAGAAACCAAATGAG     <<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<;<<;<<;<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_63:4:184:659:377 99      chr2    992     99      35M     =       1173    216     AAAAAGATGTTCTACGCAAACAGAAACCAAATGAG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;;;;     MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_28:4:305:707:258        147     chr2    992     58      36M     =       831     -197    AAAAAGATGTTCTACGCAAGCAGAAACCAAATGAGA    3<<7<,;<<<<0<66<6+<%<<<.<<<<<<<<<9<<    MF:i:18 Aq:i:17 NM:i:1  UQ:i:4  H0:i:0  H1:i:1
+EAS219_1:7:20:1444:328 99      chr2    993     99      35M     =       1149    191     AAAAGATGTTCTACGCAAACAGAAACCAAATGAGA     <<<<;<<<<<<<<;<<<<<<<<;<<<<<;<;;8:7     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_591:7:157:447:758   147     chr2    994     99      36M     =       833     -197    AAAGATGTTCTACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGA    <<<;<<5<</<<6<5<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:7:37:763:1437        163     chr2    994     99      35M     =       1191    232     AAAGATGTTCTACGCAAACAGAAACCAAATGAGAG     ;;;;;6;;;;;;;;;:;6;5;5;;;;;76;767/7     MF:i:18 Aq:i:64 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_39:6:94:1273:1462       163     chr2    995     99      35M     =       1166    206     AAGATGTTCTACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGA     <<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<:<<<<:6:7;744;     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_11:7:74:213:877 147     chr2    996     99      35M     =       816     -215    AGATGTTCTACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAA     <<<<<<<&<<-<-<<<7<<<<<77<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_61:2:168:61:867  163     chr2    997     99      35M     =       1188    226     GATGTTCTACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAG     ====7====================7======6==     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_103:2:307:252:632 163     chr2    998     99      35M     =       1142    179     ATGTTCTACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:;;<;;     MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:4:37:604:389  99      chr2    998     99      35M     =       1188    225     ATGTTCTACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGG     <<<<<<<<<3<<<<<4<<<<<9<2;949<;35:95     MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_65:8:147:687:428 99      chr2    998     99      35M     =       1159    196     ATGTTCTACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:36 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_67:3:114:736:433 83      chr2    998     63      35M     =       832     -201    ATGTTCTACGCAAACAGAAACCAAGTGAGAGAAGG     <9<9+9;<6<9<<;9<<<<<;<<<99<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:18 NM:i:1  UQ:i:24 H0:i:0  H1:i:1
+B7_597:8:35:118:589    163     chr2    999     99      35M     =       1188    224     TGTTCTACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGGA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<:<<<<<9     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_65:2:127:288:655 83      chr2    999     99      35M     =       803     -231    TGTTCTACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGGA     <<:<3<<:<.<<<;<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_61:3:260:827:289 83      chr2    999     99      35M     =       836     -198    TGTTCTACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGGA     6;99+<<<<<<<<<<<<<<6<<<<<7<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:5:82:843:1838        147     chr2    999     99      35M     =       804     -230    TGTTCTACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGGA     888829;;;;;;;;;;;;;;:;;;;;;;;;;;;;;     MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_7:8:64:350:174  163     chr2    1000    99      35M     =       1166    201     GTTCTACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGGAG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<6<<<<<:<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_1:2:8:327:522   83      chr2    1001    99      35M     =       826     -210    TTCTACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGGAGT     ;;4;<-<-<<<7<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:49 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_99:7:126:361:250  147     chr2    1002    99      35M     =       810     -227    TCTACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGGAGTA     72:;7</<<<:<-7<<:<<<<<<<:<6<+:<<<<<     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_64:4:189:571:366 163     chr2    1002    99      35M     =       1194    227     TCTACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGGAGTA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<:<<99;;;     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_28:3:202:275:776        163     chr2    1002    99      36M     =       1196    230     TCTACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGGAGTAG    <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<9<;;<<<;<;<;    MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_7:6:194:998:663 163     chr2    1002    99      35M     =       1165    198     TCTACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGGAGTA     <<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:5:30:599:589    99      chr2    1003    99      36M     =       1188    221     CTACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGGAGCAGC    <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<;<&<<;    MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:1  H1:i:0
+EAS112_34:4:92:412:435 99      chr2    1003    89      35M     =       1184    216     CTACGCAAACAGAAACCAANTGAGAGAAGGAGTAG     <<<<<<<4<<<<<<<<<66!<<<<<<6<<77<<97     MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1  UQ:i:0  H0:i:0  H1:i:1
+B7_610:2:75:887:149    83      chr2    1004    99      35M     =       823     -216    TACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGGAGTAGC     :<:<0<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:23 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:1:2:1422:1820        163     chr2    1004    99      35M     =       1164    195     TACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGGAGTAGC     ;7;;;;;;;;:;;;;;;;;;;;;;;;;;;;77777     MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:6:90:561:850 83      chr2    1004    85      35M     =       827     -212    TACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGGAGTAGC     78376<;;9<;<<;:9<<<6;<;<;;8;;<;/;;;     MF:i:18 Aq:i:19 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_7:4:164:719:947 147     chr2    1005    99      35M     =       813     -227    ACGCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGGAGTAGCT     ===,=========6====)================     MF:i:18 Aq:i:64 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_97:5:154:952:558  99      chr2    1007    99      35M     =       1173    201     GCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGGAGTAGCTAT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<:<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:3:58:923:1915        83      chr2    1007    99      40M     =       846     -201    GCAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGGAGTAGCTATACTTA        :+;;;8<<<<<<,<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<        MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_103:3:253:175:31  99      chr2    1008    72      35M     =       1187    214     CAAACAGAAACCAAATGAGAGAAGGAGTAGCTATA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<:<;;;     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_595:2:29:729:70     83      chr2    1009    51      35M     =       850     -194    AAACAGAAACCAAATGAGAGAAGGAGTAGCTATAC     <<<:<<<<<<7<<<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:51 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_95:4:174:157:573  163     chr2    1012    99      35M     =       1191    214     CAGAAACCAAATGAGAGAAGGAGTAGCTATACTTA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_67:7:197:399:319 163     chr2    1012    99      35M     =       1189    212     TAGAAACCAAATGAGAGAAGGAGTAGCTATACTTA     +<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<;;<<;     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+EAS54_65:7:68:825:405  83      chr2    1015    30      35M     =       835     -215    AAACCAAATGAGAGAAGGAGTAGCTATACTTATAT     <<<;<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_28:4:13:701:55  99      chr2    1015    99      36M     =       1187    208     AAACCAAATGAGAGAAGGAGTAGCTATACTTATATC    <<<<<<<<<9<<<9<<<<<<6<<<<<<<6<<6<<6+    MF:i:18 Aq:i:48 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:2:128:555:941   153     chr2    1016    10      36M     *       0       0       AACCAAAAGAGAGAAGGAGTAGTTATACACATATCA    55--555560355$55555555.57757$7555577    MF:i:32 Aq:i:10 NM:i:4  UQ:i:58 H0:i:0  H1:i:0
+EAS219_FC30151:1:53:140:421    163     chr2    1016    99      35M     =       1185    204     AACCAAATGAGAGAAGGAGTAGCTATACTTATATC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:48 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_30:1:64:526:339 83      chr2    1019    96      35M     =       819     -235    CAAATGAGAGAAGGAGTATCTATACTTATATCAGA     3<<<7<<;<<<<<<<<<<<;<<<<;<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+EAS192_3:3:194:378:230 163     chr2    1022    99      35M     =       1198    211     ATGAGAGAAGGAGTAGCTATACTTATATCAGATAA     <<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:49 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_105:1:45:239:851  163     chr2    1023    61      35M     =       1211    223     TGAGAGAAGGAGTAGCTATACTTATATCAGATAAA     <<88;<208<9<;6<<<6269;94<&401-662&2     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:6:39:956:676 163     chr2    1023    99      35M     =       1191    203     TGAGAGAAGGAGTAGCTATACTTATATCAGATAAA     ;;;;;;;;;;;;9;;;;;;;;;;;;;;;9957777     MF:i:18 Aq:i:44 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS218_1:2:15:1763:1143        99      chr2    1023    99      35M     =       1193    205     TGAGAGAAGGAGTAGCTATACTTATATCAGATAAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:46 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:5:309:109:987 163     chr2    1024    99      35M     =       1194    205     GAGAGAAGGAGTAGCTATACTTATATCAGATAAAG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<;<;;;     MF:i:18 Aq:i:51 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:2
+B7_593:3:102:856:670   147     chr2    1025    99      36M     =       836     -225    AGAGAAGGAGTAGCTATACTTATATCAGATAAAGCA    ;;<<<<:<<<:<<4<<<<<<<<;<<;<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:4
+B7_610:6:107:252:533   163     chr2    1025    60      35M     =       1173    183     AGAGAAGGAGTAGCTATACTTATATCAGATAAAGC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;<<;9     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:3  H1:i:3
+EAS56_65:4:126:966:514 83      chr2    1027    99      35M     =       865     -197    AGAAGAAGTAGCTATACTTATATCAGATAAAGCAC     <4<<<%<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:1  UQ:i:4  H0:i:1  H1:i:1
+EAS114_26:1:171:527:247        163     chr2    1027    67      35M     =       1194    202     AGAAGGAGTAGCTAGACTTATATCAGATAAAGCAC     =4==4===8==99=&=8+9=19+.2.6'=99+999     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:0  H1:i:3
+EAS1_105:1:234:185:359 163     chr2    1029    46      35M     =       1183    189     AAGGAGTAGCTATACTTATATCAGATAAAGCACAC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;9--:     MF:i:18 Aq:i:17 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:11
+EAS51_66:3:155:375:623 83      chr2    1029    99      35M     =       849     -215    AAGGAGTAGCTATACTTATATCAGATAAAGCACAC     ;;;;<<:<<<<;<<;<<<<<<;<<;<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:1
+EAS139_19:5:4:939:2021 163     chr2    1031    99      40M     =       1197    206     GGAGTAGCTATACTTATATCAGATAAAGCACACTTTAAAT        <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<97<<<;<<;<7;<<:48::        MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:2  H1:i:2
+EAS220_1:2:50:513:882  163     chr2    1031    99      35M     =       1192    196     GGAGTAGCTATACTTATATCAGATAAAGCACACTT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;;;;     MF:i:18 Aq:i:23 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:2  H1:i:14
+EAS1_103:5:188:20:592  163     chr2    1032    95      35M     =       1202    205     GAGTAGCTATACTTATATCAGATAAAGCACACTTT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<<<:<<<;<;;<     MF:i:18 Aq:i:22 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:3  H1:i:16
+EAS114_45:3:35:896:1588        163     chr2    1032    91      35M     =       1205    208     GAGTAGCTATACTTATATCAGATAAAGCACACTTT     ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;8;;;;;8;;;88989     MF:i:18 Aq:i:21 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:3  H1:i:18
+EAS1_108:6:73:735:329  147     chr2    1035    99      35M     =       868     -202    TAGCTATACTTATATCAGATAAAGCACACTTTAAA     ;;;9;<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<2<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:39 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_28:7:133:514:754        83      chr2    1036    63      36M     =       855     -217    AGCTATACTTATATCAGATAAAGCACACTTTAAATC    ;;4;<;<;<<<<<<<<;<<<<<<;<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:19 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:1
+EAS218_1:4:62:561:531  163     chr2    1036    99      35M     =       1203    202     AGCTATACTTATATCAGATAAAGCACACTTTAAAT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:1
+B7_593:6:119:428:415   83      chr2    1037    99      36M     =       876     -197    GCTATACTTATATCAGATAAAGCACACTTTAAATCA    84<<<<;;<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:46 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:1
+EAS114_30:2:226:885:729        147     chr2    1037    98      35M     =       867     -205    GCTGAACTTACATCAGATAAAGCACACTTTAAATC     /*220%.(;<%<3.<<<4<<<<86;<8<<8<<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:3  UQ:i:36 H0:i:0  H1:i:1
+EAS1_108:1:189:863:213 163     chr2    1039    99      35M     =       1202    198     TATACTTATATCAGATAAAGCACACTTTAAATCAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<;<<<<;7<9;<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:2
+B7_597:4:146:961:63    83      chr2    1041    86      35M     =       861     -215    TACTTATATCAGATAAAGCACACTTTAAATCAACA     7;;<<<<<;<<<7<<<<<<<<;;<<;<;<<;<<<7     MF:i:18 Aq:i:37 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_62:3:68:996:104  99      chr2    1041    70      35M     =       1214    208     TACTTATATCAGATAAAGCACACTTTAAATCAACA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<     MF:i:18 Aq:i:21 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:6:47:1791:444        163     chr2    1041    74      35M     =       1213    207     TACTTATATCAGATAAAGCACACTTTAAATCAACA     ;3;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;877977     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:4:1:156:196  147     chr2    1042    77      40M     =       867     -215    ACTTATATCAGATAAAGCACACTTTAAATCAACAACAGTA        :::::<<<<<<<<<<<<<4<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<        MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_1:8:70:1349:1788        163     chr2    1043    99      35M     =       1203    195     ATTATATCAGATAAAGCACACTTTAAATCAACAAC     &<8<<<85:580;<:0-><;>588>9<>7:<0<9;     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:0  H1:i:1
+B7_589:2:30:644:942    99      chr2    1045    83      35M     =       1229    219     TATATCAGATAAAGCACACTTTAAATCAACAACAG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<9;<9<     MF:i:18 Aq:i:22 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:3
+B7_591:2:123:924:645   83      chr2    1045    84      36M     =       861     -220    TATATCAGATAAAGCACACTTTAAATCAACAACAGT    ;<<<<*<<<<<<</7<2<8<<<<<<<4<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:11 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:2
+B7_589:5:147:405:738   83      chr2    1048    99      35M     =       870     -213    ATCAGATAAAGCACACTTTAAATCAACAACAGTAA     <9/<:<<<<<<<<7</<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:24 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:2
+EAS54_61:3:155:758:710 83      chr2    1048    98      35M     =       859     -224    ATCAGATAAAGCACACTTTAAATCAACAACAGTAA     =46=4=5===:========:=7=7======11===     MF:i:18 Aq:i:22 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:2
+EAS54_73:7:254:572:431 83      chr2    1048    97      35M     =       891     -192    ATCAGATAAAGCACACTTTAAATCAACAACAGTAA     <63<;<;<<<:7<:<7;<:<<<<:<<<<7<<<<:<     MF:i:18 Aq:i:22 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:2
+EAS56_57:7:33:954:724  163     chr2    1049    97      35M     =       1210    196     TCAGATAAAGCACACTTTAAATCAACAACAGTAAA     ;<<<<<<<<<<<<<8<<<<:<;;<<;;<;<<;;;;     MF:i:18 Aq:i:24 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:2
+EAS56_63:6:102:816:260 99      chr2    1049    99      35M     =       1225    211     TCAGATAAAGCACACTTTAAATCAACAACAGTAAA     <<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;;;;     MF:i:18 Aq:i:23 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:2
+EAS192_3:5:197:914:256 99      chr2    1049    97      35M     =       1204    190     TCAGATAAAGCACACTTTAAATCAACAACAGTAAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8;:::     MF:i:18 Aq:i:24 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:2
+EAS56_65:4:150:94:843  147     chr2    1050    0       35M     =       868     -217    CAGATACATCCCACTTTAAATCAACCACAGTAAAA     4<9<41*747*7<:9<:7:::<72;+<;::<7<<<     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:4  UQ:i:47 H0:i:0  H1:i:0
+EAS1_108:5:321:712:224 163     chr2    1051    58      35M     =       1220    204     AGATAAAGCACACTTTAAATCAACAACAGAAAAAT     <<<<<<<<2<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<(<<:<,     MF:i:18 Aq:i:28 NM:i:1  UQ:i:7  H0:i:1  H1:i:2
+EAS114_32:3:236:475:254        83      chr2    1051    99      35M     =       880     -206    AGATAAAGCACACTTTAAATCAACAACAGTAAAAT     <:<<<<<;9<7<;<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS218_4:7:72:1288:1211        99      chr2    1052    84      35M     =       1235    218     GATAAAGCACACTTTAAATCAACAACAGTAAAATA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:2
+EAS54_65:2:264:157:150 99      chr2    1054    30      35M     =       1238    219     TAAAGCACACTTTAAATCAACAACAGTAAAATAAA     <<<<<<9<9<<<<.9;<<9&<97<;9933309605     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:2
+EAS1_95:7:310:800:761  163     chr2    1055    99      35M     =       1249    229     AAAGCACACTTTAAATCAACAACAGTAAAATAAAA     ===========================+=======     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS219_1:3:88:465:1877 99      chr2    1055    99      35M     =       1212    192     AAAGCACACTTTAAATCAACAACAGTAAAATAAAA     <<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS192_3:7:66:891:294  163     chr2    1057    99      35M     =       1233    211     AGCACACTTTAAATCAACAACAGTAAAATAAAACA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<;<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_7:3:100:735:530 163     chr2    1058    99      35M     =       1257    234     GCACACTTTAAATCAACAACAGTAAAATAAAACAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_589:5:68:440:424    99      chr2    1060    99      35M     =       1237    212     ACACTTTAAATCAACAACAGTAAAATAAAACAAAG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:2
+EAS220_1:8:66:1046:167 99      chr2    1060    99      35M     =       1241    216     ACACTTTAAATCAACAACAGTAAAATAAAACAAAG     <<<<<:<<<<<<<<<<<<<9<;77<9<7<<;<9;-     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:2
+EAS54_81:6:11:801:386  83      chr2    1061    97      35M     =       868     -228    CACTATAAATCAACAACAGTAAAATAAAACAAAGG     5<2:$6<<<38<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:1  UQ:i:3  H0:i:1  H1:i:1
+EAS114_28:2:141:7:963  163     chr2    1061    85      36M     =       1240    215     CACTTTAAATCAACAACAGTAAAATAAAACAAAGGA    <<<<<<<<<<<<;<:<<<<<<1<<&<;<;<<;,<;5    MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_11:2:55:296:1457        147     chr2    1061    99      35M     =       884     -212    CACTTTAAATCAACAACAGTAAAATAAAACAAAGG     -<%63<<<<<1<<<<<5<<<<<<<<<<<<<<<7<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:1
+EAS139_19:1:58:726:1746        83      chr2    1061    99      40M     =       900     -201    CAATTTAAATCAACAACAGTAAAATAAAACAAAGGAGGTC        &:&::;<<<76<<:<<6<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<        MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_1:8:15:881:1932 147     chr2    1061    92      35M     =       886     -210    CACTTTAAATCAACAACAGTAAAATAAAACAAAGG     )<4<<<<<<<4<<4<<4<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:1
+EAS1_95:5:284:212:932  99      chr2    1063    10      35M     =       1257    229     CTTTAAATCAACAACAATAAAAAAAAACAAAGGAG     <<9<<<<<<<<<<<<<&&<<<<5<<<<8<<<1:<:     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:2  UQ:i:25 H0:i:0  H1:i:0
+EAS139_19:4:18:1335:1514       99      chr2    1063    99      40M     =       1235    212     CTTTAAATCAACAACAGTAAAATAAAACAAAGGAGGTCAT        <<<;<<<<<<<<<<<<<<<;<:<<;<<<<<<;<;<;;;9;        MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_81:6:273:424:207 83      chr2    1066    99      35M     =       891     -210    TAAATCAACAACAGTAAAATAAAACAAAGGAGGTC     ;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:62 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS219_1:7:62:1076:540 147     chr2    1066    99      35M     =       882     -219    TAAATCAACAACAGTAAAATAAAACAAAGGAGGTC     6<<;:+=====5=:6===================2     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_71:8:113:856:319 83      chr2    1067    99      33M     =       884     -216    AAATCAACAACAGTAAAATAAAACAAAGGAGGT       <<<77<<:<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<       MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:8:19:929:765  147     chr2    1069    98      35M     =       919     -185    ATCAACAACAGTAAAATAAAACAAAGGAGGTCATC     <3+<<;<<;<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:27 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_67:1:88:54:900   163     chr2    1069    68      35M     =       1257    223     ATCAACAACAGAAAAATAAAACAAAGGAGGTCATC     .....&.....,.......................     MF:i:18 Aq:i:19 NM:i:1  UQ:i:11 H0:i:0  H1:i:1
+EAS56_63:7:109:22:383  163     chr2    1071    99      35M     =       1244    208     CAACAACAGTAAAATAAAACAAAGGAGGTCATCAT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;:<<;<<     MF:i:18 Aq:i:51 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_63:8:4:571:820   83      chr2    1071    99      35M     =       891     -215    CAACAACAGTAAAATAAAACAAAGGAGGTCATCAT     &<<7<<1<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_93:6:255:441:47   99      chr2    1072    99      35M     =       1237    200     AACAACAGTAAAATAAAACAAAGGAGGTCATCATA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<6<;:<;<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:3:66:718:481 147     chr2    1072    99      40M     =       891     -221    AACAACAGTAAAATAAAACAAAGGAGGTCATCATACAATG        ::5::1<;;<<<<<<1<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<<<<<        MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_26:1:155:807:19 147     chr2    1074    99      35M     =       867     -242    CAACAGTAAAATAAAACAAAGGAGGTCATCATACA     :==4=5:====:============:==========     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_11:3:43:1229:1855       163     chr2    1074    99      35M     =       1244    205     CAACAGTAAAATAAAACAAAGGAGGTCATCATACA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<4<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:48 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:2:125:875:553   99      chr2    1075    99      36M     =       1233    194     AACAGTAAAATAAAACAAAGGAGGTCATCATACAAT    <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;<;    MF:i:18 Aq:i:53 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_65:7:118:775:467 163     chr2    1075    99      35M     =       1245    205     AACAGTAAAATAAAACAAAGGAGGTCATCATACAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<;     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_105:2:301:161:195 99      chr2    1076    75      35M     =       1239    198     ACAGTAAAATAAAACAAAGGAGGTCATCATACAAT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<:<<<<     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_64:6:54:695:952  99      chr2    1076    99      35M     =       1264    223     ACAGTAAAATAAAACAAAGGAGGTCATCATACAAT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_95:1:77:589:741   163     chr2    1078    99      35M     =       1263    220     AGTAAAATAAAACAAAGGAGGTCATCATACAATGA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_62:3:200:263:280 163     chr2    1078    99      35M     =       1236    193     AGTAAAATAAAACAAAGGAGGTCATCATACAATGA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<;8<;1     MF:i:18 Aq:i:62 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_11:5:64:199:1288        99      chr2    1079    77      35M     =       1240    196     GTAAAATAAAACAAAGGAGGTCATCATACAATGAT     <<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<;<<<;<     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_99:8:27:228:31    99      chr2    1082    99      35M     =       1264    217     AAATAAAACAAAGGAGGTCATCATACAATGATAAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<;9<:;<<<<<<75<<<<<     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:5:214:644:390 83      chr2    1082    72      35M     =       919     -198    AAATAAAACAAAGGAGGTCATGATACAATGATAAA     <<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<&<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:27 NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:0  H1:i:1
+EAS114_45:2:79:554:354 99      chr2    1082    63      35M     =       1242    195     AAATAAAACAAAGGAGGTCATCATACAATGATAAA     17;<;;+<<;;;;93;;:;3;;;;1;;;;<77744     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:5:303:542:924 163     chr2    1083    76      35M     =       1242    194     AATAAAACAAAGGAGGTCATCATACAATGATAAAA     <<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_595:8:26:242:35     99      chr2    1084    99      35M     =       1251    202     ATAAAACAAAGGAGGTCATCATACAATGATAAAAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<;     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_28:5:163:832:715        83      chr2    1085    99      36M     =       918     -203    TAAAACAAAGGAGGTCATCATACAATGATAAAAAGA    ;<<<<9<<<<<<<<;;<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_39:1:98:641:1040        83      chr2    1085    99      35M     =       907     -213    TAAAACAAAGGAGGTCATCATACAATGATAAAAAG     4<<<<7<<<<<<<<<:<<;<;<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_39:7:32:562:1695        99      chr2    1085    76      35M     =       1258    208     TAAAACAAAGGAGGTCATCATACAATGATAAAAAG     <<<<<<<<<<<<<<8<<<<<:<<<<<<<:<8<<<<     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:7:6:758:988  163     chr2    1087    99      35M     =       1253    201     AAACAAAGGAGGTCATCATACAATGATAAAAAGAT     3+;0;0;;;0;;;;;;5;;;9;;;;90;;;57560     MF:i:18 Aq:i:51 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_66:5:273:545:1001        83      chr2    1088    99      35M     =       913     -210    AACAAAGGAGGTCATCATACAATGATAAAAAGATC     <7(<<72;<2;27<;:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_63:2:74:656:272  163     chr2    1088    99      35M     =       1245    192     AACAAAGGAGGTCATCATACAATGATAAAAAGATC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_589:5:198:564:731   83      chr2    1089    99      35M     =       898     -226    ACAAAGGAGGTCATCATACAATGATAAAAAGATCA     <6<;<<<<<<:7<<;<<<8<<+<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_105:6:23:885:274  99      chr2    1089    99      35M     =       1289    235     ACAAAGGAGGTCATCATACAATGATAAAAAGATCA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<4<;;<     MF:i:18 Aq:i:51 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_591:7:22:632:176    83      chr2    1091    99      36M     =       894     -233    AAAGGAGGTCATCATACAATGATAAAAAGATCAATT    <9<<<<<<<-;<;<<7;6;<<<<<<<<<;<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_103:2:184:980:396 83      chr2    1092    99      35M     =       923     -204    AAGGAGGTCATCATACAATGATAAAAAGATCAATT     <<;;<77;;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_28:3:110:984:98 99      chr2    1092    99      36M     =       1270    214     AAGGAGGTCATCATACAATGATAAAAAGATCAATTC    98<<<<<<2<<<<<<;;<;;<<<5;5;<<;;<<<<+    MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_95:1:202:341:984  147     chr2    1094    99      35M     =       926     -203    GGAGGTCATCATACAATGATAAAAAGATCAATTCA     <<<(<8&<92<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_65:7:219:40:833  163     chr2    1094    99      35M     =       1278    219     GGAGGTCATCATACAATGATAAAAAGATCAATTCA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_39:7:23:1126:1886       99      chr2    1094    99      35M     =       1268    209     GGAGGTCATCATACAATGATAAAAAGATCAATTCA     7<<<7<<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<<;8<;<<5<     MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_595:3:85:964:950    83      chr2    1095    99      35M     =       910     -220    GAGGTCATCATACAATGATAAAAAGATCAATTCAG     <<8::<<;;<<<;<<6<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_103:7:139:578:951 83      chr2    1095    98      35M     =       919     -211    GAGGTCATCATACAATGATAAAAAGATCAATTCAG     ;<0;:&<:9<<<7<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:26 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_53:3:107:738:484 147     chr2    1097    75      35M     =       926     -206    GGTCATCATACAATGATAAAAAGATCAATTCAGCA     .8/<<<7<8<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:1
+EAS114_39:4:93:77:1338 83      chr2    1098    10      35M     =       940     -193    GTCATCATACAATGAAAAAAAGATCAATTCAGCAA     <<7<7<<<<<1<7<<&97;;<1<;1<<7<;7<<;<     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:0  H1:i:1
+B7_610:8:68:570:705    147     chr2    1100    99      35M     =       910     -225    CATCATACAATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGA     4<;4<;;:<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<;<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:3
+EAS51_62:1:38:250:647  83      chr2    1100    71      35M     =       933     -202    AATAATAAAATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGA     +<&+<1<,<<7<<7<<<<<<<1,<<<<7<<2<<<<     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:3  UQ:i:34 H0:i:0  H1:i:3
+EAS1_93:8:13:325:483   83      chr2    1101    99      35M     =       919     -217    ATCATACAATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAA     ;:;<;=:========;==========;========     MF:i:18 Aq:i:27 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_59:1:128:584:952 163     chr2    1101    99      35M     =       1277    211     ATCATACAATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAA     <<<<<<<<<<<<<<+<;<<<<<<;<<<;<<<+<66     MF:i:18 Aq:i:61 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS192_3:4:184:237:476 83      chr2    1101    99      35M     =       925     -211    ATCATACAATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAA     <;2<;<4<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:4
+EAS51_64:6:300:622:86  163     chr2    1102    99      35M     =       1264    197     TCATACAATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_39:7:57:1114:2032       147     chr2    1102    99      35M     =       931     -206    TATTACAATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAG     ;+!5<4<<<<<<<<<<<<<;<&<;7<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:2  UQ:i:10 H0:i:1  H1:i:6
+B7_593:3:310:193:629   163     chr2    1103    99      36M     =       1267    200     CATACAATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGAT    <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<;    MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_610:2:6:529:366     99      chr2    1103    99      35M     =       1291    223     CATACAATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS218_1:2:10:686:1024 83      chr2    1103    99      35M     =       947     -191    CATACAATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGA     &<<<3<<<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<<<<7<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:3
+EAS114_45:7:14:978:1296        163     chr2    1104    90      35M     =       1249    180     ATACAATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGAT     ;6;;;;;;;;;;;:;;;;;;;6;;;;;;;;77777     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:5
+EAS56_57:2:237:855:581 99      chr2    1105    87      35M     =       1271    201     TACAATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGATA     <;4<7<<<;47<<74<:*<<2:<<7.799:2<<9:     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:4
+EAS139_19:7:85:262:751 163     chr2    1105    99      40M     =       1305    240     TACAATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGATATAACC        <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:::92        MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_61:6:10:106:737  83      chr2    1106    99      35M     =       947     -194    ACAATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGATAT     <-<<;<<<<<<<<<<<;<<<<;<<;<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:6
+B7_610:6:143:620:158   163     chr2    1107    99      35M     =       1283    211     CAATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGATATA     <<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:3
+EAS54_67:6:198:503:669 147     chr2    1107    99      35M     =       912     -230    CAATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGATATA     5<<:<<;<<<<<<<;;<<9<<<<<<<<;<<<<;<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:2
+EAS192_3:6:116:464:261 147     chr2    1107    99      35M     =       934     -208    CAATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGATATA     ;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:2
+EAS54_73:5:263:557:988 99      chr2    1108    84      35M     =       1289    216     AATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGATATAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<<<<<<<;<<<     MF:i:18 Aq:i:18 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:8
+EAS139_19:1:53:463:1132        83      chr2    1109    99      40M     =       915     -234    ATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGATATAACCATCC        ;::;:<<<<<<<<:<<;<<<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<        MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS220_1:8:46:1528:799 99      chr2    1109    96      35M     =       1306    232     ATGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGATATAAC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<     MF:i:18 Aq:i:19 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:7
+EAS54_81:7:324:472:791 99      chr2    1110    89      35M     =       1274    199     TGATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGATATAACC     <<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<:3     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:3
+EAS54_61:8:4:173:814   163     chr2    1111    99      35M     =       1289    213     GATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGATATAACCA     =====================<==========;==     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:4
+B7_593:3:303:131:673   83      chr2    1112    99      36M     =       947     -201    ATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGATATAACCATC    <;<<<<<<<<:<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_103:4:235:899:847 147     chr2    1112    99      35M     =       950     -197    ATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGATATAACCAT     <7<<<<<<<<:<<<<:<</<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:51 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:2
+EAS1_105:8:179:119:876 83      chr2    1112    60      35M     =       917     -230    ATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGATATAACCAT     <<<<<<<7<<<<<<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:2
+EAS56_59:2:162:272:415 147     chr2    1112    83      35M     =       923     -224    ATAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGATATAACCAT     =7=======;5==<<6==1==<=============     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:2
+EAS114_45:6:44:77:1255 83      chr2    1113    99      35M     =       955     -193    TAAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGATATAACCATC     79998;;;9:;<696<;.<;;<<;<;<;<;;;<8;     MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_99:2:162:257:203  163     chr2    1114    99      35M     =       1301    222     AAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGATATAACCATCC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_39:3:55:464:146 99      chr2    1114    99      35M     =       1295    216     AAAAAGATCAATTCAGCAAGAAGATATAACCATCC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_97:6:308:667:658  147     chr2    1116    34      35M     =       918     -233    AAAGATCACTTCAGCAATAAGATATAACCATCCTA     <9;;;45;&<;&.<5683;84+<;<;+8<;<<8;<     MF:i:18 Aq:i:10 NM:i:2  UQ:i:23 H0:i:0  H1:i:0
+EAS56_57:4:98:862:154  163     chr2    1116    99      35M     =       1290    209     AAAGATCAATTCAGCAAGAAGATATAACCATCCTA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<:99<;     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:2
+EAS56_61:5:263:314:696 83      chr2    1117    99      35M     =       953     -199    AAGATCAATTCAGCAAGAAGATATAACCATCCTAC     <<;<;:<<<<7<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS220_1:8:83:1456:1854        163     chr2    1117    99      35M     =       1275    193     AAGATCAATTCAGCAAGAAGATATAACCATCCTAC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<2<     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_103:4:231:815:626 83      chr2    1119    99      35M     =       940     -214    GATCAATACAGCAAGAAGATATAACCATCCTACTA     '<4%<<<22<<,<<;<<4;<<<<<<<<<<<<<<7<     MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:1  UQ:i:17 H0:i:0  H1:i:1
+EAS114_32:4:246:647:765        83      chr2    1119    99      35M     =       937     -217    GATCAATTCAGCAAGAAGATATAACCATCCTACTA     9<+,<<&,39<,<;<<<<<<<&<<<<;0<<3;<<<     MF:i:18 Aq:i:62 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:7:256:354:173   83      chr2    1121    99      36M     =       957     -200    TCAATTCAGCAAGAAGATATAACCATCCTACTAAAT    -9<<:9<<;6<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_73:5:53:61:31    83      chr2    1122    99      35M     =       949     -208    CAATTCAGCAAGAAGATATAACCATCCTACTAAAT     5;;<95<<5<<<<<<<<<<:5;<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_28:3:308:509:948        99      chr2    1123    99      36M     =       1298    211     AATTCAGCAAGAAGATATAACCATCCTACTAAATAC    <9<<<<<<<;<7<<;<<<<<<<;<<<<7<<;2;<<<    MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_32:2:247:900:123        147     chr2    1123    99      35M     =       920     -238    AATTCAGCAAGAAGATATAACCATCCTACTAAATA     ;;;;.<<4<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:51 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_32:3:307:113:346        83      chr2    1123    99      35M     =       938     -220    AATTCAGCAAGAAGATATAACCATCCTACTAAATA     <<<<9<<1<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_589:1:168:69:249    83      chr2    1125    99      35M     =       936     -224    TTCAGCAAGAAGATATAACCATCCTACTAAATACA     ;0;<;;<<<<<<<<<<<<<;<<<8<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:2:54:1886:719        147     chr2    1125    99      35M     =       941     -219    TTCAGCAAGAAGATATAACCATCCTACTAAATACA     883777;;:;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;     MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_597:7:94:273:165    147     chr2    1128    99      35M     =       945     -218    AGAAAGAAGATATAACCATCCTACTAAATACATAT     ;3&;;:<<:<-<-<<8:<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_95:7:155:530:532  163     chr2    1128    99      35M     =       1319    226     AGCAAGAAGATATAACCATCCTACTAAATACATAT     ===================================     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:5:61:1885:163        163     chr2    1128    99      40M     =       1281    193     AGCAAGAAGATATAACCATCCTACTAAATACATATGCACC        <<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<9::::4        MF:i:18 Aq:i:79 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_597:6:193:661:771   83      chr2    1129    99      35M     =       952     -212    GCAAGAAGATATAACCATCCTACTAAATACATATG     :&<<<<<<<<<<<<<;<<<;<<;<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:6:75:1503:1399       83      chr2    1130    99      40M     =       969     -201    CAAGAAGATATAACCATCCTACTAAATACATATGCACCTA        &;;8;<<<;<<<<,6<<70<<7<<<<<<9<<<<<<<<<<<        MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_597:2:42:28:552     163     chr2    1131    99      35M     =       1294    198     AAGAAGATATAACCATCCTACTAAATACATATGCA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;<3<:;9;8     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_95:4:61:631:567   147     chr2    1131    99      35M     =       957     -209    AAGAAGATATAACCATCCTACTAAATACATATGCA     <<7<<<<<<<<</<<;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_71:3:257:288:731 147     chr2    1131    99      35M     =       939     -227    AAGAAGATATAACCATCCTACTAAATACATATGCA     <<:<<7<<<<<;<5<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_26:2:214:950:32 83      chr2    1132    99      35M     =       947     -220    AGAAGATATAACCATCCTACTAAATACATATGCAC     =&==4======:;==6<==:===============     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_610:1:12:88:200     83      chr2    1133    99      35M     =       968     -200    GAAGATATAACCATCCTACTAAATACATATGCACC     9<<;<<<;<;6;<;:<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_93:5:256:444:399  163     chr2    1133    99      35M     =       1289    191     GAAGATATAACCATCCTACTAAATACATATGCACC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<<-;<<8     MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_65:4:174:753:617 99      chr2    1136    75      35M     =       1299    198     GATATAACCATCCTACTAAATACATATGCACCTAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<<<<     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_105:1:115:226:443 99      chr2    1137    99      35M     =       1314    212     ATATAACCATCCTACTAAATACATATGCACCTAAC     <<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<;<<<<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:3:26:1867:162        163     chr2    1137    70      35M     =       1299    197     ATATAACCATCCTACTAAATACATATGCACCTAAC     ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;78698     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_105:3:308:66:538  99      chr2    1138    99      35M     =       1321    218     TATAACCATCCTACTAAATACATATGCACCTAACA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<;<     MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_595:3:229:543:583   147     chr2    1139    99      35M     =       976     -198    ATAACCATCCTACTAAATACATATGCACCTAACAC     </<;+5<855;<6<<<<;<<<<<<9<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_99:1:17:595:863   163     chr2    1139    89      35M     =       1289    185     ATAACCATCCTACTAAATACACATGCACCTAACTC     :<4:<<1:<<<9<+<+1<%<7&&9-71<17)7</4     MF:i:18 Aq:i:33 NM:i:2  UQ:i:19 H0:i:0  H1:i:1
+EAS51_62:7:248:17:435  147     chr2    1139    99      35M     =       969     -205    ATAACCATCCTACTAAATACATATGCACCTAACAC     <1<<88++<:<<:;<;<<<:<<<;<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_81:6:35:186:412  99      chr2    1139    99      35M     =       1306    202     ATAACCATCCTACTAAATACATATGCACCTAACAC     <<<<<<<<4<<<<<:<<<<<<:<<<<<<<<<;;<:     MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_103:2:307:252:632 83      chr2    1142    99      35M     =       998     -179    ACCATCCTGCTAAATACATATGCACCTAACACAAG     <77<;,5<,9<<<<<<;<<<<<7<;<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1  UQ:i:11 H0:i:0  H1:i:1
+EAS1_108:7:108:440:208 147     chr2    1142    99      35M     =       975     -202    CCCATCCTACTAAATACATATGCACCTAACACAAG     +35:486<<4<<<<<<<<<<<-<<<<<7<<)<<<-     MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1  UQ:i:12 H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_95:7:74:866:49    83      chr2    1143    99      35M     =       969     -209    CCAACCTACTAAATACATATGCACCTAACACAAGA     :8<&<<<<7<<<<:<<<<<<8<5<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_61:2:66:757:918  83      chr2    1143    99      35M     =       985     -193    CCATCCTACTAAATACATATGCACCTAACACAAGA     <9<45;<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_73:5:220:733:736 147     chr2    1143    99      35M     =       959     -219    CCATCCTACTAAATACATATGCACCTAACACAAGA     :;<77;<<9<<<<<9;<<<<<<;<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:6:175:289:351 99      chr2    1144    99      35M     =       1319    210     CATCCTACTAAATACATATGCACCTAACACAAGAC     <<<<<<<<<<;<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<9<<<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_65:2:56:155:49   147     chr2    1145    99      35M     =       970     -210    ATCCTACTAAATACATATGCACCTAACACAAGACT     ;:5;;<5<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<=     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_65:5:299:336:613 99      chr2    1145    99      35M     =       1293    183     ATCCTACTAAATACATATGCACCTAACACAAGACT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_39:4:30:432:228 83      chr2    1145    99      35M     =       967     -213    ATCCTACTAAATACATATGCACCTAACACAAGACT     <76<<<:<<<<<<<;<:<<<<<:<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_39:5:93:312:331 83      chr2    1145    99      35M     =       953     -227    ATCCTACTAAATACATATGCACCTAACACAAGACT     <;;:;<6<<<<;<:<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_597:3:133:707:886   147     chr2    1146    99      35M     =       978     -203    ACCTAATAAATACATATGCACCTAACACAAGACTA     %5-2;&6<<<<<;<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:2  UQ:i:9  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_62:3:50:312:219  163     chr2    1146    99      35M     =       1288    177     TCCTACTAAATACATATGCACCTAACACAAGACTA     <<<<<<<<<<<;<<<<<;<;<<<;<<<<<<;;;;;     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_59:1:82:670:302  147     chr2    1146    99      35M     =       973     -208    TCCTACTAAATACATATGCACCTAACACAAGACTA     %448<7<<<<<<7<<<<<&<<7<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS220_1:2:47:591:698  99      chr2    1146    99      35M     =       1313    202     TCCTACTAAATACATATGCACCTAACACAAGACTA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<     MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_53:8:122:430:882 99      chr2    1147    99      35M     =       1338    226     CCTACTAAATACATATGCACCTAACACAAGACTAC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:;     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS220_1:4:46:1566:668 83      chr2    1148    99      35M     =       959     -224    CTACTAAATACATATGCACCTAACACAAGACTACC     5<<:<<<<<<<<<<<<:<:<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:78 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_591:4:92:411:955    147     chr2    1149    99      36M     =       979     -206    TACTAAATACATATGCACCTAACACAAGACTACCCA    2<+<<<<9<<<<<<<;+<;<<<<<<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_97:2:96:419:327   99      chr2    1149    99      35M     =       1331    217     TACTAAATACATATGCACCTAACACAAGACTACCC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<;;9<9     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS219_1:7:20:1444:328 147     chr2    1149    99      35M     =       993     -191    TACTAAATACATATGCACCTAACACAAGACTACCC     9<3<<==;=<===;=<=====<<===========<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_610:4:198:59:675    163     chr2    1150    99      35M     =       1315    200     ACTAAATACATATGCACCTAACACAAGACTATCCT     <.<<<<<<;<<<<<<<<<<<**<;<;2<;6;&*2&     MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:2  UQ:i:10 H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_61:7:114:506:971 83      chr2    1150    99      35M     =       986     -199    ACTAAATACATATGCACCTAACACAAGACTACCCA     ;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_65:2:94:356:809  163     chr2    1151    99      35M     =       1334    218     CTAAATACATATGCACCTAACACAAGACTACCCAG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<:;     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_65:3:155:541:234 163     chr2    1151    99      35M     =       1319    203     CTAAATACATATGCACCTAACACAAGACTACCCAG     <<7<<<<<<<<<<<<<<<4<<<<<<<<<<<;;;08     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS112_32:7:272:328:400        83      chr2    1151    99      35M     =       977     -209    CTAAATACATATGCACCTAACACAAGACTACCCAG     4;<<<<<7<;<<<-<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:7:283:186:707   163     chr2    1154    99      36M     =       1321    203     AATACATATGCACCTAACACAAGACTACCCAGATTC    <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<;<;<<<<8    MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_61:4:86:660:932  99      chr2    1154    99      35M     =       1338    219     AATACATATGCACCTAACACAAGACTACCCAGATT     ================================9:=     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_71:6:264:705:89  147     chr2    1155    99      35M     =       983     -207    AAACATATGCACCTAACACAAGACTACCCAGATTC     <(<2<&<)<<<7<8<<<<<<<<<<.<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:1  UQ:i:7  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_32:4:5:396:292  83      chr2    1155    99      35M     =       981     -209    ATACATATGCACCTAACACAAGACTACCCAGATTC     <:<6<7<:<:;;;<<<;<7<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_32:6:178:342:866        163     chr2    1155    72      35M     =       1311    191     ATACATATGCACCTAACACAAGACTACCCAGATTC     ;<<<<<;<<<8<<;<;<3<8/<<<<6<<</<8;<<     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:1:155:809:543 163     chr2    1156    99      35M     =       1352    231     TACATATGCACCTAACACAAGACTACCCAGATTCA     <<<<<<<<<<<<<<<<7<;<<<<<<<<<<<1<;<;     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_61:1:119:880:781 99      chr2    1157    99      35M     =       1312    190     ACATATGCACCTAACACAAGACTACCCAGATTCAT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<+<<<<7<<<<<     MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_61:6:283:963:234 147     chr2    1157    99      35M     =       992     -200    ACATATGCACCTAACACAAGACTACCCAGATTCAT     <5<;<;97;;:;<<7<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_105:1:28:745:352  99      chr2    1159    99      35M     =       1329    205     ATATGCACCTAACACAAGACTACCCAGATTCATAA     <<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_65:8:147:687:428 147     chr2    1159    99      35M     =       998     -196    ATATGCACCTAACACAAGACTACCCAGATTCATAA     ;1<''48;4)<<:<<<<;<<6;<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:36 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_53:3:101:809:776 99      chr2    1160    99      35M     =       1326    201     TATGCACCTAACACAAGACTACCCAGATTCATAAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:7:35:538:1882        163     chr2    1160    98      35M     =       1337    212     TATGCACCTAACACAAGACTACCCAGATTCATAAA     ;);43.50;3;93;;4;3;;;9-7.;*;;966*75     MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_597:7:41:34:211     83      chr2    1164    99      35M     =       980     -219    CACCTAACACAAGACTACCCAGATTCATAAAACAA     7</::<<7<<<<<<;<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:1:2:1422:1820        83      chr2    1164    99      35M     =       1004    -195    CACCTAACACAAGACTACCCAGATTCATAAAACAA     *4617;;4;1;;79;/7&,4;9;;;7<;;<<<;<<     MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_7:6:194:998:663 83      chr2    1165    99      35M     =       1002    -198    ACCTAACACAAGACTACCCAGATTCATAAAACAAA     ;</<<<7<<<<;<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_65:8:10:975:766  83      chr2    1166    99      35M     =       959     -242    AATAACACAAGACTACCCAGATTCATAAAACAAAT     ++4<<+<+<<<<8<<22;<<<<<2<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:64 NM:i:2  UQ:i:24 H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_39:6:94:1273:1462       83      chr2    1166    99      35M     =       995     -206    CCTAACACAAGACTACCCAGATTCATAAAACAAAT     8.<<<;<:<<<<;<<;;;<<<;<;<;<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_7:8:64:350:174  83      chr2    1166    99      35M     =       1000    -201    CCTAACACAAGACTACCCAGATTCATAAAACAAAT     709<<;<;<<<<<<<;7<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_103:7:166:84:766  83      chr2    1167    99      35M     =       990     -212    ATAACACAAGACTACCCAGATTCATAAAACAAATA     %8<=+<-<<<</<<<<8<<<<<;<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:1  UQ:i:4  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:2:85:580:481  163     chr2    1167    99      35M     =       1359    227     CTAACACAAGACTACCCAGATTCATAAAACAAATA     <<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<;<<<<6:<<     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_66:4:191:40:536  83      chr2    1167    66      35M     =       977     -225    ATAAAAAAAGACTACCCAGATTCATAAAACAAATA     +1<<,<&<<:<.;<7/7<<<<;.<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:3  UQ:i:27 H0:i:1  H1:i:0
+EAS218_1:2:40:1291:1045        147     chr2    1167    99      35M     =       980     -222    CTAACACAAGACTACCCAGATTCATAAAACAAATA     *<<<9<<<<<<:0<9<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:39 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS192_3:3:221:881:916 99      chr2    1168    96      35M     =       1327    194     TAACACAAGACTACCCAGATTCATAAAACAAATAC     <<;<<8<<;<<<<<<<;<<<<28<:<8<:;<;;;<     MF:i:18 Aq:i:24 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS219_1:7:35:392:2042 163     chr2    1168    99      35M     =       1332    199     TAACACAAGACTACCCAGATTCATAAAACNAATAC     ======;==========<<=======7=;!<7;;;     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:1  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_65:4:192:714:341 163     chr2    1170    99      35M     =       1346    211     ACACAAGACTACCCAGATTCATAAAACAAATACTA     <<9<<<<<<<<<<<8<<<<<;<<;8<<<88;;;;9     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:1:189:876:833   163     chr2    1173    99      36M     =       1349    212     CAAGACTACCCAGATTCATAAAACAAATACTACTAG    <<<<<<<<<<<8<8<<<<<;<;;<<;<<<<<;<<<6    MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:5:299:743:762   163     chr2    1173    99      36M     =       1345    208     CAAGACTACCCAGATTCATAAAACAAATACTACTAG    <<<;<<<<<<<<<:;<<<.<:<<<<<<<<<<;;;;;    MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_610:6:107:252:533   83      chr2    1173    60      35M     =       1025    -183    CAAGACTACCCAGATTCATAAAACAAATACTACTA     3<<<<+<<96<<<<<<;<<<<<<;<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:2  H1:i:1
+EAS1_97:5:154:952:558  147     chr2    1173    99      35M     =       1007    -201    AAAGACTACCCAGATTCATAAAACAAATACTACTA     %<<9;;<<;;;<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:1  UQ:i:4  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_63:4:184:659:377 147     chr2    1173    99      35M     =       992     -216    CAAAACTACCCAGATTCATAAAACAAATACTACTA     1;<+<;<6;66<<;<<<<;;<<<8<<<<8<<;<<<     MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:1  UQ:i:10 H0:i:1  H1:i:0
+B7_595:6:137:811:130   163     chr2    1175    99      35M     =       1351    211     AGACTACCCAGATTCATAAAACAAATACTACTAGA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9;;;     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_65:4:124:367:72  163     chr2    1175    99      35M     =       1377    237     AGACTACCCAGATTCATAAAACAAATACTACTAGA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_61:8:60:358:494  147     chr2    1179    44      35M     =       979     -235    TACCCAGATTCATAAAACAAATACTACTAGACCTA     7<77;<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:14 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:6  H1:i:36
+EAS114_30:7:319:11:255 163     chr2    1179    92      35M     =       1337    193     TACCCAGATTCATAAAACAAATACTACTAGACCTA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<:     MF:i:18 Aq:i:17 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:10
+B7_610:7:26:749:174    99      chr2    1183    78      35M     =       1357    209     CAGATTCATAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<9<8<<<9<;94     MF:i:18 Aq:i:11 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:6  H1:i:31
+EAS1_103:7:112:578:782 99      chr2    1183    89      35M     =       1366    218     CAGATTCATAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAG     <;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<     MF:i:18 Aq:i:20 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:5  H1:i:25
+EAS1_105:1:234:185:359 83      chr2    1183    46      35M     =       1029    -189    CAGATTCATAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAG     <<4<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:17 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:9
+EAS112_34:4:92:412:435 147     chr2    1184    89      35M     =       1003    -216    AGATTCATAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAGG     <;<52:=,====:=========<============     MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS220_1:6:24:105:1046 99      chr2    1184    99      35M     =       1377    228     AGATTCATAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAGG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:51 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:4  H1:i:2
+EAS1_97:2:128:629:484  163     chr2    1185    96      35M     =       1359    209     GATTCATAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAGGG     <<49<<<<<9<<<<99<<<<<<<<<<<<+<-)7))     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:4  H1:i:45
+EAS219_FC30151:1:53:140:421    83      chr2    1185    99      35M     =       1016    -204    GATTCATAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAGGG     <<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:48 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_595:6:99:557:427    163     chr2    1186    99      35M     =       1342    191     ATTCATAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAGGGA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<+;<7:8:;     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_103:3:253:175:31  147     chr2    1187    72      35M     =       1008    -214    TTCATAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAGGGAT     ;+;<;<<<<<<<<9<<9<<<<<;<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_28:4:13:701:55  147     chr2    1187    99      36M     =       1015    -208    TTCATAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAGGGATG    0:+<7<;9<;<<<<<<<3<<<<<;;<<<:<<3<<<<    MF:i:18 Aq:i:48 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_30:6:220:809:850        147     chr2    1187    60      35M     =       986     -236    TTCATAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAGGGAT     9+5<;*<<<2:0<<8:<*00<<<:<*<<<<<<<<&     MF:i:18 Aq:i:60 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:5:30:599:589    147     chr2    1188    99      36M     =       1003    -221    TCATAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAGGGATGA    90<;<<<<<<<<+<<<;;<;<;<<<<<<<<6<<8<<    MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_597:8:35:118:589    83      chr2    1188    99      35M     =       999     -224    TCATAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAGGGATG     67<<<<<;<<<<<<<:7<<<<:<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:4:37:604:389  147     chr2    1188    99      35M     =       998     -225    TCATAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAGGGATG     00;:;========9========<9========<==     MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_61:2:168:61:867  83      chr2    1188    99      35M     =       997     -226    TCATAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAGGGATG     ;7<<<<<<<<<<<<<7<<:<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_67:7:197:399:319 83      chr2    1189    99      35M     =       1012    -212    CAAAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAGGGATGA     &<+==<<5<<<8<89;;<<<<<<8<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1  UQ:i:10 H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_32:5:267:170:250        163     chr2    1189    99      35M     =       1377    223     CATAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAGGGATGA     <<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<;<<<<<<<<<<<<;     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_95:4:174:157:573  83      chr2    1191    99      35M     =       1012    -214    TAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAGGGATGAGA     8<<<<4<<<<<<<<;<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:6:39:956:676 83      chr2    1191    99      35M     =       1023    -203    TAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAGGGATGAGA     899985;;<;:9;;:9<;:9:5;<;;;<;<;<<<<     MF:i:18 Aq:i:44 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:7:37:763:1437        83      chr2    1191    99      35M     =       994     -232    TAAAACAAATACTACTAGACCTAAGAGGGATGAGA     79979;<;<;;;<;;;;;;6:;<:;<:8;<<<<;<     MF:i:18 Aq:i:64 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS220_1:2:50:513:882  83      chr2    1192    99      35M     =       1031    -196    AAAACAAATACTACTAGACCTAAGAGGGATGAGAA     <<<<:<<<<<:<<:<<<<::<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:23 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS218_1:2:15:1763:1143        147     chr2    1193    99      35M     =       1023    -205    AAACAAATACTACTAGACCTAAGAGGGATGAGAAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:46 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_64:4:189:571:366 83      chr2    1194    99      35M     =       1002    -227    AACAAATACTACTAGACCTAAGAGGGATGAGAAAT     <<;<<<<<:<<<;<<<;;;<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_66:3:166:532:438 99      chr2    1194    99      35M     =       1386    227     AACAAATACTACTAGACCTAAGAGGGATGAGAAAT     <<<<<<<<<<<<<<<;<<;<<;<<<<;<;:;;<;<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:5:309:109:987 83      chr2    1194    99      35M     =       1024    -205    AACAAATACTACTAGACCTAAGAGGGATGAGAAAT     <<<<<<:<<;<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:51 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_26:1:171:527:247        83      chr2    1194    67      35M     =       1027    -202    AACAAATGCTACTAGACCTAAGAGGGATGAGAAAT     <547*9)&&7+;+<<7<<<;<<<;3<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:0  H1:i:1
+B7_589:8:139:727:808   163     chr2    1195    99      35M     =       1363    203     ACAAATACTACTAGACCTAAGAGGGATGAGAAATT     <<<<<<<<<<<<<:<;<<<<<<<<9;<;9<6;<<9     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_28:3:202:275:776        83      chr2    1196    99      36M     =       1002    -230    CAAATACTACTAGACCTAAGAGGGATGAGAAATTAC    ;<<<<;;<<<<<<<;<<<<<<<;<<<<<<<<<<;<<    MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_62:6:12:484:836  163     chr2    1197    99      35M     =       1372    210     AAATACTACTAGACCTAAGAGGGATGAGAAATTAC     <<<<<<<<<<<<<<<<<7<:<<<<<<9<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:6:21:553:57   99      chr2    1197    99      35M     =       1358    196     AAATACTACTAGACCTAAGAGGGATGAGAAATTAC     <<<<<<<<<<<;;<<<;<<;<<;<<<;;9<;<;<9     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:5:4:939:2021 83      chr2    1197    99      40M     =       1031    -206    AAATACTACTAGACCTAAGAGGGATGAGAAATTACCTAAT        ;;;;:8;<5:<<<7/<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<        MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS192_3:3:194:378:230 83      chr2    1198    99      35M     =       1022    -211    AATACTACTAGACCTAAGAGGGATGAGAAATTACC     <<;<8<<:<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:49 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_591:7:68:242:834    163     chr2    1200    99      36M     =       1386    222     TACTACTAGACCTAAGAGGGATGAGAAATTACCTAA    <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<    MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_67:2:22:471:500  163     chr2    1200    99      35M     =       1365    200     TACTACTAGACCTAAGAGGGATGAGAAATTACCTA     =======<=<====:<2===9==;=;9;;=;;;;5     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_610:4:139:989:144   163     chr2    1201    99      35M     =       1387    221     ACTACTAGACCTAAGAGGGATGAGAAATTACCTAA     <<<<<<<<<<<<6<<<<<<<<<;<<<<<<<;;<;;     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_103:5:188:20:592  83      chr2    1202    95      35M     =       1032    -205    CTACTAGACCTAAGAGGGATGAGAAATTACCTAAT     2<<7;<<<<,;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:22 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:1:189:863:213 83      chr2    1202    99      35M     =       1039    -198    CTACTAGACCTAAGAGGGATGAGAAATTACCTAAT     7:<7<<<<44;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS218_1:4:62:561:531  83      chr2    1203    99      35M     =       1036    -202    TACTAGACCTAAGAGGGATGAGAAATTACCTAATT     <<7<<<<:<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_1:8:70:1349:1788        83      chr2    1203    99      35M     =       1043    -195    TACTAGACCTAAGAGGGATGAGAAATTACCTAATT     <7;<<8<74;;<1<<71<;7<;;<;<7<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS192_3:5:197:914:256 147     chr2    1204    97      35M     =       1049    -190    ACTAGACCTAAGAGGGATGAGAAATTACCTAATTG     <5;<8<5/;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:24 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:3:35:896:1588        83      chr2    1205    91      35M     =       1032    -208    CTAGACCTAAGAGGGATGAGAAATTACCTAATTGG     77999:.:<<;<;;;<<;<;<<<<<;<;;<<<<;;     MF:i:18 Aq:i:21 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS112_34:6:43:47:279  163     chr2    1206    99      35M     =       1405    234     TAGACCTAAGAGGGATGAGAAGTTACCTAATTGGT     <<<<<<<<<<<<<;:<-<<<<<<<<<<<<:;;+7;     MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+EAS1_95:2:211:954:174  99      chr2    1207    99      35M     =       1393    221     AGACCTAAGAGGGATGAGAAATTACCTAATTGGTA     ===============================777=     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_39:2:5:1219:137 99      chr2    1209    99      35M     =       1384    210     ACCTAAGAGGGATGAGAAATTACATAATTGGTACA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<(<<<<<<:9<;=     MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:1  UQ:i:7  H0:i:0  H1:i:1
+EAS56_57:7:33:954:724  83      chr2    1210    97      35M     =       1049    -196    CCTAAGAGGGATGAGAAATTACCTAATTGGTACAA     ;<;<;<<-7;<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;     MF:i:18 Aq:i:24 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_28:3:176:402:458        163     chr2    1210    99      36M     =       1376    202     CCTAAGAGGGATGAGAAATTACCTAATTGGTACAAT    <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<;;<;    MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_3:4:81:687:1379 163     chr2    1210    99      35M     =       1366    191     CCTAAGAGGGATGAGAAATTACCTAATTGGTACAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_105:1:45:239:851  83      chr2    1211    61      35M     =       1023    -223    CTAAGAGGGATGAGAAATTACCTAATTGGTACAAT     *2*0<<<<<<<<<<<<<<<<9<<3<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:1
+EAS56_65:5:312:985:871 163     chr2    1212    99      35M     =       1369    192     TAAGAGGGATGAGAAATTACCTAATTGGTACAATG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<9<<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_11:4:38:557:1441        163     chr2    1212    99      35M     =       1381    204     TAAGAGGGATGAGAAATTACCTAATTGGTACAATG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS219_1:3:88:465:1877 147     chr2    1212    99      35M     =       1055    -192    TAAGAGGGATGAGAAATTACCTAATTGGTACAATG     <<<<<<<:<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<7;<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_595:7:149:123:265   163     chr2    1213    99      35M     =       1395    217     AAGAGGGATGAGAAATTACCTAATTGGTACAATGT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9     MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:6:47:1791:444        83      chr2    1213    74      35M     =       1041    -207    AAGAGGGATGAGAAATTACCTAATTGGTACAATGT     978879;:;;<:;;<<;:<9<<<<;6;;;;<<<<;     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:6
+EAS51_62:3:68:996:104  147     chr2    1214    70      35M     =       1041    -208    AGAGGGATGAGAAATTACCTAATTGGTACAATGTA     <1<8<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:21 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:4
+B7_593:2:68:140:542    99      chr2    1217    95      36M     =       1398    217     GGGATGAGAAATTACCTAATTGGTACAATGTACAAT    <<<8;<<;<<<<<;<<;<<<<<8;<-<8<82;;;-8    MF:i:18 Aq:i:19 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:6
+EAS188_7:7:67:719:786  163     chr2    1218    43      35M     =       1383    200     GGATGAGAAATTACCTAATTGGTACACTGTACAAT     ;;<<<<<<&<<:13&<1<<<:<<<)/&/))<'6-<     MF:i:18 Aq:i:13 NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:0  H1:i:1
+EAS1_108:5:321:712:224 83      chr2    1220    58      35M     =       1051    -204    ATGAGAAATTACCTAATTGGTACAATGTACAATAT     =;===7;===7=========;=:;=========;=     MF:i:18 Aq:i:28 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:1
+EAS114_26:4:100:238:596        163     chr2    1220    56      35M     =       1403    218     ATGAGAAATTACCTAATTGGTACAATGTACAATAT     ======9=====;=======5===;====/=;===     MF:i:18 Aq:i:17 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:13
+EAS51_62:7:312:236:655 163     chr2    1222    99      35M     =       1412    225     GAGAAATTACCTAATTGGTACAATGTACAATATTC     <<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:5
+EAS56_63:6:102:816:260 147     chr2    1225    99      35M     =       1049    -211    AAATTACCTAATTGGTACAATGTACAATATTCTGA     <<<<<<::<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:23 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_610:7:34:144:868    163     chr2    1226    76      35M     =       1412    221     AATTACCTAATTGGTACAATGTACAATATTCTGAT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<4;<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_78:7:215:516:299 99      chr2    1226    99      35M     =       1406    215     AATTACCTAATTGGTACAATGTACAATATTCTGAT     <<<<<<;<<<<;;;;<;;<<<<;<<9<;<<1;7/;     MF:i:18 Aq:i:64 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_11:3:81:12:1231 163     chr2    1228    99      35M     =       1391    198     TTACCTAATTGGTACAATGTACAATATTCTGATGA     <<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<4<<6     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_589:2:30:644:942    147     chr2    1229    83      35M     =       1045    -219    TACCTAATTGGTACAATGTACAATATTCTGATGAT     85%+;<<9;<9<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:22 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_1:4:41:519:609  163     chr2    1229    99      35M     =       1401    207     TACCTAATTGGTACAATGGACAATATTCTGATGAT     1<<<<<<<<<<<<<<<4<-:<+6<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1  UQ:i:12 H0:i:0  H1:i:1
+B7_591:7:116:814:89    99      chr2    1231    99      36M     =       1408    213     CCTAATTGGTACAATGTACAATATTCTGATGATGGT    <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<<;<<;<<66<    MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_73:5:169:714:644 163     chr2    1231    99      35M     =       1437    241     CCTAATTGGTACAATGTACAATATTCTGATGATGG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_597:6:73:420:812    99      chr2    1232    66      35M     =       1414    217     CTAATTGGTACAATGTACAATATTCTGATGATGGT     <<<<<1<<<<::1<7<:<96<9<:<<:4<70:11<     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_11:6:17:1179:393        99      chr2    1232    99      35M     =       1412    215     CTAATTGGTACAATGTACAATATTCTGATGATGGT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<:4<     MF:i:18 Aq:i:78 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_589:8:118:829:36    99      chr2    1233    99      35M     =       1417    219     TAATTGGTACAATGTACAATATTCTGATGATGGTT     <<<<<<<<<:<2<<<<<<:<<<<<<<<<<<<71;<     MF:i:18 Aq:i:52 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:2:125:875:553   147     chr2    1233    99      36M     =       1075    -194    TAATTGGTACAATGTACAATATTCTGATGATGGTTA    -;<;:;<<;6<<<<<<6<;<:<<<<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:53 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:1
+EAS114_32:4:7:282:424  99      chr2    1233    83      35M     =       1397    199     TAATTGGTACAATGTACAATATTCTGATGATGGTT     <<<3<<<9<<<<3<<<<<9<<<9,<;;9;&*;3,.     MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_7:6:107:447:488 163     chr2    1233    99      35M     =       1412    214     TAATTGGTACAATGTACAATATTCTGATGATGGTT     <<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:53 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS192_3:7:66:891:294  83      chr2    1233    99      35M     =       1057    -211    TAATTGGTACAATGTACAATATTCTGATGATGGTT     :<<5;;<<<4<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:1
+EAS56_57:8:72:44:435   99      chr2    1235    76      35M     =       1392    192     ATTGGTACAATGTACAATATTCTGATGATGGTTAA     <<<<<<<<<<<2;<;<<;<<<;<<8<82<;22<8&     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:4:18:1335:1514       147     chr2    1235    99      40M     =       1063    -212    ATTGGTACAATGTACAATATTCTGATGATGGTTACACTAA        ::/::<<;<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<        MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS218_4:7:72:1288:1211        147     chr2    1235    84      35M     =       1052    -218    ATTGGTACAATGTACAATATTCTGATGATGGTTAC     <);<:<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_62:3:200:263:280 83      chr2    1236    99      35M     =       1078    -193    TTGGTACAATGTACAATATTCTGATGATGGTTACA     )<<<8<:<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:62 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_589:5:68:440:424    147     chr2    1237    99      35M     =       1060    -212    TGGTACAATGTACAATATTCTGATGATGGTTACAC     <<2<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_93:6:255:441:47   147     chr2    1237    99      35M     =       1072    -200    TGGTACAATGTACAATATTCTGATGATGGTTACAC     ;;7<;:<<<<<<<<<<;<<<<<<<<;<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS112_34:8:174:557:872        163     chr2    1237    99      35M     =       1423    221     TGGTACAATGTACAATATTCTGATGATGGTTACAC     <<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<7<<;<<6:<<2117     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:1
+EAS51_64:3:255:45:399  163     chr2    1238    99      35M     =       1404    201     GGTACAATGTACAATATTCTGATGATGGTTACACT     <<3<8<<8<0<<;<<<0<<<</+8<611<<;71;7     MF:i:18 Aq:i:57 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_65:2:264:157:150 147     chr2    1238    30      35M     =       1054    -219    GGAAAAATGGACAAGATTCTGATGAGGGTTACACT     .3%:+<<*;*<2<<1<1*,*<<7<<+<<<&<<<<<     MF:i:130        Aq:i:30 NM:i:3  UQ:i:35 H0:i:0  H1:i:0
+EAS139_19:5:95:944:247 99      chr2    1238    99      40M     =       1424    226     GGTACAATGTACAATATTCTGATGATGGTTACACTAAAAG        <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<:;:::        MF:i:18 Aq:i:78 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_105:2:301:161:195 147     chr2    1239    75      35M     =       1076    -198    GTACAATGTACAATATTCTGATGATGGTTACACTA     ''6%6<6<<<4<<<<<<<<)<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_28:2:141:7:963  83      chr2    1240    85      36M     =       1061    -215    TACAATGTACAATATTCTGATGATGGTTACACTAAA    95+<<9<<5<;;<<;<<;'<<<<<;<<<7<9<<<<<    MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:1
+EAS114_39:6:76:282:1668        99      chr2    1240    99      35M     =       1401    196     TACAATGTACAATATTCTGATGATGGTTACACTAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;<<<<<<;<;<<<8     MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_11:5:64:199:1288        147     chr2    1240    77      35M     =       1079    -196    TACAATGTACAATATTCTGATGATGGTTACACTAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:1:49:911:980  163     chr2    1241    99      35M     =       1434    228     ACAATGTACAATATTCTGATGATGGTTACACTAAA     <<<<<<<<<<;<<<<<<<8<<<<;<;<<88-<;33     MF:i:18 Aq:i:62 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS220_1:8:66:1046:167 147     chr2    1241    99      35M     =       1060    -216    ACAATGTACAATATTCTGATGATGGTTACACTAAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:5:303:542:924 83      chr2    1242    76      35M     =       1083    -194    CAATGTACAATATTCTGATGATGGTTACACTAAAA     +<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:1
+EAS114_45:2:79:554:354 147     chr2    1242    63      35M     =       1082    -195    CAATGTACAATATTCTGATGATGGTTACACTAAAA     98988;7;;;;:;;;;;;;;;;:;;;:;;;;;9;;     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_59:1:248:122:558 163     chr2    1243    99      35M     =       1436    228     AATGTACAATATTCTGATGATGGTTACACTAAAAG     <<<<:<<<<<<<<<<<<<;<<<<:<6:4<<::6:6     MF:i:18 Aq:i:52 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_63:7:109:22:383  83      chr2    1244    99      35M     =       1071    -208    ATGTACAATATTCTGATGATGGTTACACTAAAAGC     <;9;<8<<<<<<;<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:51 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_11:3:43:1229:1855       83      chr2    1244    99      35M     =       1074    -205    ATGTACAATATTCTGATGATGGTTACACTAAAAGC     8<<<<;8<<<;;5<<28<<<<<<<<<<<<7;;<<;     MF:i:18 Aq:i:48 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_63:2:74:656:272  83      chr2    1245    99      35M     =       1088    -192    TGTACAATATTCTGATGATGGTTACACTAAAAGCC     ;;;</<<<<<5;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:2
+EAS56_65:7:118:775:467 83      chr2    1245    99      35M     =       1075    -205    TGTACAATATTCTGATGATGGTTACACTAAAAGCC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:1
+B7_593:7:15:244:876    99      chr2    1246    43      36M     =       1440    230     GTACAATATTCTGATGATGGTTACACTAAAAGCCCA    <<<<<<;<<<<<<<<;<<;;;<<<<<:<<<9;<<<;    MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS219_1:1:63:28:1549  163     chr2    1247    77      35M     =       1439    227     TACAATATTCTGATGATGGTTACACTAAAAGCCCA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7;<<<<7     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_95:7:310:800:761  83      chr2    1249    99      35M     =       1055    -229    CAATATTCTGATGATGGTTACACTAAAAGCCCATA     1<<:<:<:<<<<:<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:7:14:978:1296        83      chr2    1249    90      35M     =       1104    -180    CAATATTCTGATGATGGTTACACTAAAAGCCCATA     77177;9;2:;;:;;(;;9;<;;;;:;;;:7;<<;     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_595:8:26:242:35     147     chr2    1251    99      35M     =       1084    -202    ATATTTTGATGATGGTTACACTAAAAGCCCATACT     <<<77!!7<;<<<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:2  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:8
+EAS114_45:7:6:758:988  83      chr2    1253    99      35M     =       1087    -201    ATTCTGATGATGGTTACACTAAAAGCCCATACTTT     3-7*73;;399:9;9;7<-(<;;<;;:;9::;;7;     MF:i:18 Aq:i:51 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_30:2:315:412:921        99      chr2    1254    99      35M     =       1424    205     TTCTGATGATGGTTACACTACAAGCCCATACTGTA     <;<;<<<<<<<;<<<<<<<<8<<<;<<:<<;;+<8     MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:2  UQ:i:33 H0:i:0  H1:i:1
+EAS114_30:3:215:840:760        163     chr2    1256    99      35M     =       1416    195     CTGATGATGGTTACACTAAAAGCCCATACTTTCCT     <<<<<<<<<<<<<<<;<<<88<+<<:<;3585,+:     MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:1  UQ:i:11 H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_95:5:284:212:932  147     chr2    1257    10      35M     =       1063    -229    TGATGATGGTTACGCTAAAAGTCCATGCTTTACTG     82%<8:<-:<<:**:<-<<8<)/2/<:/<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:3  UQ:i:42 H0:i:0  H1:i:0
+EAS1_97:4:290:121:79   163     chr2    1257    99      35M     =       1420    198     TGATGATGGTTACACTAAAAGCCCATACTTTACTG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<7;<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_67:1:88:54:900   83      chr2    1257    68      35M     =       1069    -223    TGATGATGGTTACACTAAAAGCCCATACTTCACTG     ============;=================;9===     MF:i:18 Aq:i:19 NM:i:1  UQ:i:26 H0:i:0  H1:i:1
+EAS188_7:3:100:735:530 83      chr2    1257    99      35M     =       1058    -234    TGATGATGGTTACACTAAAAGCCCATACTTTACTG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_39:7:32:562:1695        147     chr2    1258    76      35M     =       1085    -208    GATGATGGTTACACTAAAAGCCCATACTTTACTGC     :5:::<88/<:<<<<<<<<<7<9<<&<959<<<<<     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_28:3:173:627:465        163     chr2    1260    99      36M     =       1444    220     TGATGGTTACACTAAAAGCCCATACTTTACTGCTAC    <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<2;;4;;7    MF:i:18 Aq:i:51 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:1
+EAS1_95:1:77:589:741   83      chr2    1263    99      35M     =       1078    -220    TGGTTACACTAAAAGCCCATACTTTACTGCTACTC     8=;;==606;=========================     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_99:8:27:228:31    147     chr2    1264    99      35M     =       1082    -217    GGTTACACTAAAAGCCCATACTTTACTGCTACTCA     99;;;<<<<<<:<<;<;<<;<<<<;<<;<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_64:6:54:695:952  147     chr2    1264    99      35M     =       1076    -223    GGTTACACTAAAAGCCCATACTTTACTGCTACTCA     277%<9<4)<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_64:6:300:622:86  83      chr2    1264    99      35M     =       1102    -197    GGTTACACTAAAAGCCCATACTTTACTGCTACTCA     <:<<<:<6;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS112_34:7:71:62:254  163     chr2    1264    99      35M     =       1438    209     GGTTACACTAAAAGCCCATACTTTCCTGCTACTCA     <<<<<<7<<<<7<<<<<3<<<<<<&<<.<<::<:%     MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:0  H1:i:1
+EAS114_28:1:168:609:646        99      chr2    1264    99      36M     =       1436    208     GGTTACACTAAAAGCCCATACTTTACTGCTACTCAA    <<<<<<<<<<<;<<<<<:<8<<<<;<<<<<4<<<9<    MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_11:1:84:92:1246 163     chr2    1265    99      35M     =       1437    207     GTTACACTAAAAGCCCATACTTTACTGCTACTCAA     <<<<<<<<<<<<<<<<5<:<<5<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:78 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:3:310:193:629   83      chr2    1267    99      36M     =       1103    -200    TACACTAAAAGCCCATACTTTACTGCTACTCAATAT    9<9<6;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_610:6:111:379:700   73      chr2    1268    0       35M     =       1268    0       ACACTAAAAGCCCATACTTTACTGCTACTCAATAT     7<<:<<<<02<<6&<</<<</+9/98*<966/3/<     MF:i:64 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_610:6:111:379:700   133     chr2    1268    0       *       =       1268    0       CGCACTGGCAATATTTGTGTGTTTACTTTTTTGCA     :1+&;;6;:;918;);;):,19.9:).):::.&3(     MF:i:192
+EAS114_30:6:137:741:866        163     chr2    1268    99      35M     =       1429    196     ACACTAAAAGCCCATACTTTACTGCTACTCAATAT     <<<<8<<;;;<<<<;<<<;;;<;4<<8;<<;%<8;     MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_39:7:23:1126:1886       147     chr2    1268    99      35M     =       1094    -209    ACACTAAAAGCCCATACTTTACTGCTACTCAATAT     5*.:.5<<::<<<<<<<<:5<<<<<<<<<<:2<<<     MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_99:3:21:423:169   99      chr2    1270    99      35M     =       1468    233     ACTAAAAGCCCATACTTTACTGCTACTCAATATAT     <<<<<;<<<<<<;<<<<<;;<<<<<<<<9+:5<;;     MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_28:3:110:984:98 147     chr2    1270    99      36M     =       1092    -214    ACTAAAACCCCATACTTTACTGCTACTCAATATATC    :81<<<<+;;8<+<8<<<<<;<<<8;<<<<<<<<8;    MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:1  UQ:i:10 H0:i:1  H1:i:0
+EAS219_FC30151:5:54:1351:910   99      chr2    1270    99      35M     =       1448    213     ACTAAAAGCCCATACTTTACTGCTACTCAATATAT     <<<<<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<18<<:<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:2:237:855:581 147     chr2    1271    87      35M     =       1105    -201    CTAAACGCCCATACTTTACTGCTACTCAATATATC     /+<<<&)2;66;/;;+<;;3133<3<3;9;<999<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_59:8:80:542:549  163     chr2    1271    99      35M     =       1443    207     CTAAAAGCCCATACTTTACTGCTACTCAATATATC     <<<<<<<<;<<<<<<<<:<<<<-<;;<;7<;3;9;     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:4:7:1347:375 163     chr2    1271    99      35M     =       1436    200     CTAAAAGCCCATACTTTACTGCTACTCAATATATC     ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;9;;;8;;;;;97777     MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_7:6:191:540:493 99      chr2    1273    99      35M     =       1432    194     AAAAGCCCATACTTTACTGCTACTCAATATATCCA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;     MF:i:18 Aq:i:78 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_81:7:324:472:791 147     chr2    1274    89      35M     =       1110    -199    AAAGCCAATACTTTACTGCTACTCAATATATCCAT     <<.)5*&;;11<<<,5<33:-<<6<<<<:<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:1  H1:i:0
+EAS220_1:8:83:1456:1854        83      chr2    1275    99      35M     =       1117    -193    AAGCCCATACTTTACTGCTACTCAATATATCCATG     <<67<:<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_64:5:290:247:509 163     chr2    1276    99      35M     =       1450    209     AGCCCATACTTTACTGCTACTCAATATATCCATGT     <<<<<<<<<<<<<<<4<<<<<<92<;;;<;96;19     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_59:5:90:629:652  99      chr2    1276    99      35M     =       1456    215     AGCCCATACTTTACTGCTACTCAATATATCCATGT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<;<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS218_4:3:39:1671:1928        163     chr2    1276    99      35M     =       1453    212     AGCCCATACTTTACTGCTACTCAATATATCCATGT     <<<<<<<;<<<<;<<<<<4<<<;3<<<;<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_59:1:128:584:952 83      chr2    1277    99      35M     =       1101    -211    GCCCATACTTTACTGCTACTCAATATATCCATGTA     7<;9;0:<<<:<<:<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:61 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_97:7:28:979:519   163     chr2    1278    99      35M     =       1439    196     CCCATACTTTACTGCTACTCAATATATCCATGTAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;;;9:     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_65:7:219:40:833  83      chr2    1278    99      35M     =       1094    -219    CCCATACTTTACTGCTACTCAATATATCCATGTAA     <<*<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_66:1:289:207:323 163     chr2    1279    99      35M     =       1462    218     CCATACTTTACTGCTACTCAATATATCCATGTAAC     <<<:<<<<<:<<<<<<<<<<;<<899<<13)939;     MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_61:3:45:758:616  163     chr2    1280    99      35M     =       1473    228     CATACTTTACTGCTACTCAATATATCCATGTAACA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<6<<<<<<;;<     MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS112_32:7:42:804:114 163     chr2    1281    99      35M     =       1452    206     ATACTTTACTGCTACTCAATATATCCATGTAACAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<:<;;<;;     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:5:61:1885:163        83      chr2    1281    99      40M     =       1128    -193    ATACTTTACTGCTACTCAATATATCCATGTAACAAATCTG        ;:;;;;<<8<<:<<:<;<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<        MF:i:18 Aq:i:79 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_62:4:282:962:46  99      chr2    1282    99      35M     =       1437    190     TACTTTACTGCTACTCAATATATCCATGTAACAAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_610:6:143:620:158   83      chr2    1283    99      35M     =       1107    -211    ACTTTACTGCTACTCAATATATCCATGTAACAAAT     <4;<;<;<;6<<7<;<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_62:3:50:312:219  83      chr2    1288    99      35M     =       1146    -177    ACTGCTACTCAATATATCCATGTAACAAATCTGCG     <,;83:<::6<<<<<<<;:<;<<<<;<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_93:5:256:444:399  83      chr2    1289    99      35M     =       1133    -191    CTGCTACTCAATATATCCATGTAACAAATCTGCGC     ;+549<:<.<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_99:1:17:595:863   83      chr2    1289    89      35M     =       1139    -185    AAGCTACTCAATATATCCATGTAACAAATCTGCGC     ))55))+2&<<,:5<,0657<<<<:<:<:<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:33 NM:i:2  UQ:i:16 H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_105:6:23:885:274  147     chr2    1289    99      35M     =       1089    -235    CTACTACTCAATATATCCATGTAACAAATCTGCGC     2+*27==;;==<<.;:<=<=<==============     MF:i:18 Aq:i:51 NM:i:1  UQ:i:9  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_61:8:4:173:814   83      chr2    1289    99      35M     =       1111    -213    CTGCTACTCAATATATCCATGTAACAAATCTGCGC     <<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_73:5:263:557:988 147     chr2    1289    84      35M     =       1108    -216    CTGCTACTCAATATATCCATGTAACAAATCTGCGC     1-41:<15+<<<<<<599<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:18 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_64:2:326:153:231 163     chr2    1290    43      35M     =       1477    222     TGCTACTCAATATATCCATGTAACAAATCTGCGCT     <<<<<<<<<9<<<<<<<<<,<<<<<<8<<8.;.;4     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:4:98:862:154  83      chr2    1290    99      35M     =       1116    -209    TGCTACTCAATATATCCATGTAACAAATCTGCGCT     856:;7<:<<9<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_610:2:6:529:366     147     chr2    1291    99      35M     =       1103    -223    GCTACTCAATATATCCATGTAACAAATCTGCGCTT     9;8;8<:<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_65:5:299:336:613 147     chr2    1293    99      35M     =       1145    -183    TACTCAATATATCCATGTAACAAATCTGCGCTTGT     1;4(+<<5<4<1<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:3
+B7_597:2:42:28:552     83      chr2    1294    99      35M     =       1131    -198    ACTCAATATATCCATGTAACAAATCTGCGCTTGTA     </8:<<:<<<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:2
+EAS114_39:3:55:464:146 147     chr2    1295    99      35M     =       1114    -216    CTCAATATATCCATGTAACAAATCTGCGCTTGTAC     ;(;;;;<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:2
+EAS54_67:6:109:953:668 99      chr2    1297    99      35M     =       1485    223     CAATATATCCATGTAACAAATCTGCGCTTGTACTT     ;<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<;<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:1
+EAS139_19:1:82:946:392 163     chr2    1297    99      40M     =       1493    236     CAATATATCCATGTAACAAATCTGCGCTTGTACTTCAAAA        <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<<<8<<8<<:4488        MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:1  UQ:i:19 H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_28:3:308:509:948        147     chr2    1298    99      36M     =       1123    -211    AATATATCCATGTAACAAATCTGCGCTTGTACTTCT    ;;+;;;.8<<;;;<<<<<<<<<<<<<8<<<<<;<<<    MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_65:4:174:753:617 147     chr2    1299    75      35M     =       1136    -198    ATATATCCATGTAACAAATCTGCGCTTGTACTTCT     <;<;<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:3:26:1867:162        83      chr2    1299    70      35M     =       1137    -197    ATATATCCATGTAACAAATCTGCGCTTGTACTTCT     97999:;<<9;;<:<<;;;<;;<<<<<<<;;<<<<     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_99:2:162:257:203  83      chr2    1301    99      35M     =       1114    -222    ATATCCATGTAACAAATCTGCGCTTGTACTTCTAA     <;<;:<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:5:62:841:1994        121     chr2    1301    70      35M     =       1301    0       ATATCCATGTAACAAATCTGCGCTTGTACTTCTAA     87878;;6:;;:<<<<:<:;;;<;<<<;<;;<;<<     MF:i:64 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:5:62:841:1994        181     chr2    1301    0       *       =       1301    0       TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT     !!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!     MF:i:192
+EAS139_19:7:44:1807:833        99      chr2    1301    99      40M     =       1449    188     ATATCCATGTAACAAATCTGCGCTTGTACTTCTAAATCTA        <<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<;<<<;<<9<<<<<89;;;:        MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_95:7:280:607:113  163     chr2    1303    99      35M     =       1468    200     ATCCATGTAACAAATCTGCGCTTGTACTTCTAAAT     ===================;===;=====<=7=9:     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_62:2:260:147:818 163     chr2    1303    82      35M     =       1497    229     ATCCATGTAACAAATCTGCGCTTTTACTTCTAAAT     <<<<<<3<<<<<;<<<<)<1<<<&<7<<<;<4/9<     MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:0  H1:i:1
+EAS54_71:7:194:867:616 99      chr2    1303    99      34M     =       1481    213     ATCCATGTAACAAATCTGCGCTTGTACTTCTATT      <8<<<<<<<<<<<8<<4<<<<<<8<<3<<5<&(+      MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:2  UQ:i:23 H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:7:85:262:751 83      chr2    1305    99      40M     =       1105    -240    CCATGTAACAAATCTGCGCTTGTACTTCTAAATCTATAAC        22;99;<<8<<<<<<<;<;<<<<<;<<;<<<<<<<<<<<+        MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+EAS54_81:6:35:186:412  147     chr2    1306    99      35M     =       1139    -202    CATGTAACAAATCTGCGCTTGTACTTCTAAATCTA     <<4:6<;<&<:4<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS220_1:8:46:1528:799 147     chr2    1306    96      35M     =       1109    -232    CATGTAACAAATCTGCGCTTGTACTTCTAAATCTA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:19 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_591:5:124:978:501   163     chr2    1307    99      36M     =       1499    228     ATGTAACAAATCTGCGCTTGTACTTCTAAATCTATA    <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;    MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS192_3:3:88:866:774  163     chr2    1307    99      35M     =       1478    206     ATGTAACAAATCTGCTCTTGTACTTCTAAATCTAT     <<<;<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<68<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+EAS221_1:6:4:1131:104  163     chr2    1307    99      35M     =       1487    215     ATGTAACAAATCTGCGCTTGTACTTCTAAATCTAT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<<::     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_32:6:178:342:866        83      chr2    1311    72      35M     =       1155    -191    AACAAATCTGCGCTTGTACTTCTAAATCTATAAAA     <<9<<<&;;<<<<77<;<<<5;:<<<:<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_61:1:119:880:781 147     chr2    1312    99      35M     =       1157    -190    ACAAATCTGCGCTTGTACTTCTAAATCTATAACAA     ;8<<;<<<<:<84<<<<:<<<<<<<<<<<<<5<<<     MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+B7_591:2:46:220:58     99      chr2    1313    99      36M     =       1483    206     CAAATCTGCGCTTGTACTTCTAAATCTATAAAAAAA    <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<<:<;    MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS220_1:2:47:591:698  147     chr2    1313    99      35M     =       1146    -202    CAAATCTGCGCTTGTACTTCTAAATCTATAACAAA     7;;;;:<<:<:<<<<<7<<:<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+EAS1_105:1:115:226:443 147     chr2    1314    99      35M     =       1137    -212    AAATCTGCGCTTGTACTTCTAAATCTATAAAAAAA     <<;;<;<<<<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_610:4:198:59:675    83      chr2    1315    99      35M     =       1150    -200    AATCTGCGCTTGTACTTCTAAATCTATAACAAAAT     <<<<<4<4<:<<<;7<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+EAS221_3:2:76:1729:813 163     chr2    1317    99      35M     =       1506    224     TCTGCGCTTGTACTTCTAAATCTATAAAAAAATTA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:36 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_597:8:147:360:141   99      chr2    1319    47      35M     =       1501    218     TGCGCTTGTACTTCTAAATCTATAACAAAATTAAA     <<<<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+EAS1_95:7:155:530:532  83      chr2    1319    99      35M     =       1128    -226    TGCGCTTGTACTTCTAAATCTATAACAAAATTAAA     :<<<><<8<<<<<><<<<<><<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+EAS51_62:4:308:614:911 99      chr2    1319    90      35M     =       1493    209     TGCGCTTGTACTTCTAAATCTATAACAAAATTAAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<<<<8<     MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+EAS54_65:3:155:541:234 83      chr2    1319    99      35M     =       1151    -203    TGCGCTTGTACTTCTAAATCTATAAAAAAATTAAA     78;<7<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<;<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:6:175:289:351 147     chr2    1319    99      35M     =       1144    -210    TGCGCTTGTACTTCTAAATCTATAAAAAAATTAAA     9;;:+<<<<<;<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:7:283:186:707   83      chr2    1321    99      36M     =       1154    -203    CGCTTGTACTTCTAAATCTATAACAAAATTAAAATT    889;<7;<7<<7<<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+EAS1_105:3:308:66:538  147     chr2    1321    99      35M     =       1138    -218    CGCTTGTACTTCTAAATCTATAACAAAATTAAAAT     996999;<9;<:<<<<<:<<7<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+EAS1_108:5:11:555:330  163     chr2    1321    99      35M     =       1492    206     CGCTTGTACTTCTAAATCTATAAAAAAATTAAAAT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<4<;<     MF:i:18 Aq:i:56 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_66:7:84:411:336  73      chr2    1322    75      35M     *       0       0       GCTTGTACTTCTAAATCTATAAAAAAATTAAAATT     <<<;<<<;<<<<<<<<<<<<:<<;<<<<<<;8<;<     MF:i:32 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_11:5:52:1278:1478       163     chr2    1322    47      35M     =       1513    226     GCTTGTACTTCTAAATCTATAACAAAATTAAAATT     <<<<<<<<<<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<9<<<     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+EAS56_53:3:101:809:776 147     chr2    1326    99      35M     =       1160    -201    GTACTTCTAAATCTATAAAAAAATTAAAATTTAAC     <<<-<;7;<<<<:;<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS192_3:3:221:881:916 147     chr2    1327    96      35M     =       1168    -194    TAATTCTAAATCTAGAACAAAATTAAAATTTAACA     44%-4(5<;9/,:<68:1<:8<:<<84;<<<<<;<     MF:i:18 Aq:i:24 NM:i:3  UQ:i:41 H0:i:0  H1:i:0
+EAS1_105:1:28:745:352  147     chr2    1329    99      35M     =       1159    -205    CTTCTAAATCTATAACAAAATTAAAATTTAACAAA     4;;*;<<<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+EAS114_45:2:23:1754:796        99      chr2    1329    99      35M     =       1488    194     CTTCTAAATCTATAAAAAAATTAAAATTTAACAAA     ;<<;<;<;<;<;<<;;;;;<<<<;;<<<<<97999     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_97:2:96:419:327   147     chr2    1331    99      35M     =       1149    -217    TCTAAATCTATAACAAAATTAAAATTTAACAAAAG     ;1<<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+EAS1_97:4:274:287:423  163     chr2    1332    75      35M     =       1515    218     CTAAATCTATAAAAAAATTAAAATTTAACAAAAGT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS219_1:7:35:392:2042 83      chr2    1332    99      35M     =       1168    -199    ATAAATCTATAAAAAAATTAAAATTTAACAAAAGT     +<<<<</<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:1  UQ:i:10 H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_65:2:94:356:809  83      chr2    1334    99      35M     =       1151    -218    AAATCTATAACAAAATTAAAATTTAACAAAAGTAA     <<<<3<<<<;;<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:1  UQ:i:26 H0:i:0  H1:i:1
+EAS114_30:7:319:11:255 83      chr2    1337    92      35M     =       1179    -193    TCTATAAAAAAATTAAAATTTAACAAAAGTAAATA     ;8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<     MF:i:18 Aq:i:17 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:7:35:538:1882        83      chr2    1337    98      35M     =       1160    -212    TCTATAACAAAATTAAAATTTAACAAAAGTAAATA     73797;;3<;;<6;;<<<;8:;:;<;:<:;<<;;;     MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1  UQ:i:18 H0:i:0  H1:i:1
+EAS51_66:1:64:182:741  153     chr2    1338    10      35M     *       0       0       AAAAAAACAAATTAAACTCTAACAAAAGTAAATAA     (+;1&(9*%0<*(*&<*5,/+<,&<&<<6<<<<<<     MF:i:32 Aq:i:10 NM:i:6  UQ:i:63 H0:i:0  H1:i:0
+EAS54_61:4:86:660:932  147     chr2    1338    99      35M     =       1154    -219    ATATAAAAAAATTAAAATTTAACAAAAGTAAATAA     &<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_53:8:122:430:882 147     chr2    1338    99      35M     =       1147    -226    CTATAAAAAAATTAAAATTTAACAAAAGTAAATAA     0<<:<<<<<<<:3<<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_595:6:99:557:427    83      chr2    1342    99      35M     =       1186    -191    AACAAAATTAAAATTTAACAAAAGTAAATAAAACA     <<-<<<<9<<<<<:<<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:1  UQ:i:12 H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:5:299:743:762   83      chr2    1345    99      36M     =       1173    -208    AAAATTAAAATTTAACAAAAGTAAATAAAACACATA    ;<<<1<<<<<+<;<;7<<;<<<<<<<<<;<<;;<<7    MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_30:2:303:428:326        99      chr2    1345    74      35M     =       1515    205     AAAATTAAAATTTAACAAAAGTAAATAAAACACAT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<;     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_65:4:192:714:341 83      chr2    1346    99      35M     =       1170    -211    AAATTAAAATTTAACAAAAGTAAATAAAACACATA     <<<3;<<<<9:<<</<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:1:189:876:833   83      chr2    1349    99      36M     =       1173    -212    TTAAAATTTAACAAAAGTAAATAAAACACATAGCTA    7;<<<<:;;<</<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_26:7:37:79:581  163     chr2    1349    68      35M     =       1533    219     TTAAAATTTAAAAAAAGTAAATAAAACACATAGCT     <>4<>>>>;>>&>->9>9;4>->>>>,4>9>,<1>     MF:i:18 Aq:i:27 NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:0  H1:i:1
+EAS139_19:2:82:154:1333        99      chr2    1349    77      40M     =       1511    202     TTAAAATTTAACAAAAGTAAATAAAACACACAGCTAAAAC        <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;;<;;:;:        MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_7:1:290:286:763 99      chr2    1349    75      35M     =       1515    201     TTAAAATTTAACAAAAGTAAATAAAACACATAGCT     <<<<<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<8<<     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_1:4:3:248:1491  73      chr2    1349    99      35M     *       0       0       TTAAAATTTAACAAAAGTAAATAAAACACATAGCT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:8:<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_39:3:6:1064:1805        99      chr2    1350    99      35M     =       1502    187     TAAAATTTAACAAAAGTAAATAAAACACATAGCTA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_595:6:137:811:130   83      chr2    1351    99      35M     =       1175    -211    AAAATTTAACAAAAGTAAATAAAACACATAGCTAA     <<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:1:155:809:543 83      chr2    1352    99      35M     =       1156    -231    AAATTTAACAAAAGTAAATAAAACACATAGCTAAA     <<<+0<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_63:3:41:468:459  99      chr2    1352    75      35M     =       1513    196     AAATTTAACAAAAGTAAATAAAACACATAGCTAAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<;;7     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:4:31:622:216  73      chr2    1354    99      35M     *       0       0       ATTTAACAAAAGTAAATAAAACACATAGCTAAAAC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<8<<96<7     MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_71:8:105:854:975 163     chr2    1354    71      35M     =       1523    202     ATTTAACAAAAGTAAATAAAACACATAGCTAAAAC     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7:<;;;;5     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_610:7:26:749:174    147     chr2    1357    78      35M     =       1183    -209    TAACAAAAGTAAATAAAACACATAGCTAAAACTAA     (<<)<<<<6<<<<<<<<<<&:<3<<<6<<<)<:<<     MF:i:18 Aq:i:11 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:6:21:553:57   147     chr2    1358    99      35M     =       1197    -196    AACAAAAGTAAATAAAACACATAGCTAAAACTAAA     <<+<<<<<<<<<;<<<<8<<<<<<8<<<<<;<<<<     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_97:2:128:629:484  83      chr2    1359    96      35M     =       1185    -209    AAAAAAGTAAATAAAACACATAGCTAAAACTAAAA     :(::<</*;<<99<<<-<;<<<<4<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:1  UQ:i:7  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:2:85:580:481  83      chr2    1359    99      35M     =       1167    -227    AAAAAAGTAAATAAAACACATAGCTAAAACTAAAA     =)====77========8=3====3===========     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:1  UQ:i:8  H0:i:1  H1:i:0
+B7_589:8:139:727:808   83      chr2    1363    99      35M     =       1195    -203    AAGTAAATAAAACACATAGCTAAAACTAAAAAAGC     <<;<<<<<<<<<;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_67:2:22:471:500  83      chr2    1365    99      35M     =       1200    -200    GTAAATAAAACACATAGCTAAAACTAAAAAAGCAA     =9===0====;=77<==8;====;===========     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_103:7:112:578:782 147     chr2    1366    89      35M     =       1183    -218    AAAATAAAACACATAGCTAAAACTAAAAAAGCAAA     +<<<%<<<<6<;<<<<6:<<<<:<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:20 NM:i:1  UQ:i:10 H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_3:4:81:687:1379 83      chr2    1366    99      35M     =       1210    -191    TAAATAAAACACATAGCTAAAACTAAAAAAGCAAA     <<<<<<<<<<<:<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_65:3:320:20:250  99      chr2    1367    77      35M     =       1532    200     AAATAAAACACATAGCTAAAACTAAAAAAGCAAAA     <<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<;+:<;<<3     MF:i:18 Aq:i:6  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_65:5:312:985:871 83      chr2    1369    99      35M     =       1212    -192    ATAAAACACATAGCTAAAACTAAAAAAGCAAAAAC     <8<<<<.<.<<<<:<<<<<.<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_62:6:12:484:836  83      chr2    1372    99      35M     =       1197    -210    AAACACATAGCTAAAACTAAAAAAGCAAAAACAAA     <<<<</<4<<&7<<<<;<<<<<<<<<<<<<1<<<<     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_28:3:176:402:458        83      chr2    1376    99      36M     =       1210    -202    AAATAGCTAAAACTAAAAAAGCAAAAACAAAAACTA    </<+<4&;<<<<7<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:1  UQ:i:14 H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_11:7:50:1229:1313       163     chr2    1376    77      35M     =       1528    187     ACATAGCTAAAACTAAAAAAGCAAAAACAAAAACT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_65:4:124:367:72  83      chr2    1377    99      35M     =       1175    -237    CATAGCTAAAACTAAAAAAGCAAAAACAAAAACTA     ,<<<8,<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_32:5:267:170:250        83      chr2    1377    99      35M     =       1189    -223    CATAGCTAAAACTAAAAAAGCAAAAACAAAAACTA     -<;<5-:<<<<;<<<<<<<;;<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS220_1:6:24:105:1046 147     chr2    1377    99      35M     =       1184    -228    CATAGCTAAAACTAAAAAAGCAAAAACAAAAACTA     +<<<</<<<<<.<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:51 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_11:4:38:557:1441        83      chr2    1381    99      35M     =       1212    -204    GATAAAAATAAAAAAGCAAAAACAAAAACTATGCT     <&<<<<<,<<<<<<<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:2  UQ:i:16 H0:i:0  H1:i:1
+EAS188_7:7:67:719:786  83      chr2    1383    43      35M     =       1218    -200    TAAAAAAAAAAAAGCAAAAACAAAAACTATGCTAA     $<<;<-1<<<8<<*&<;<;,<<3<<<<33<<<33<     MF:i:18 Aq:i:13 NM:i:2  UQ:i:28 H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_39:2:5:1219:137 147     chr2    1384    99      35M     =       1209    -210    AAAACTAAAAAAGCAAAAACAAAAACTATGCTAAG     <<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<<     MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_591:7:68:242:834    83      chr2    1386    99      36M     =       1200    -222    AAATAAAAAAGCAAAAACAAAAACTATGCTAAGTAT    <<68<<<<<<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:1  UQ:i:21 H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_66:3:166:532:438 147     chr2    1386    99      35M     =       1194    -227    AACTAAAAAAGCAAAAACAAAAACTATGCTAAGTA     <<&7<<<<<<<+<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_610:4:139:989:144   83      chr2    1387    99      35M     =       1201    -221    ACTAAAAAAGCAAAAACAAAAACTATGCTAAGTAT     <&<<<<<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_11:3:81:12:1231 83      chr2    1391    99      35M     =       1228    -198    AAAAAGCAAAAACAAAAACTATGCTAAGTATTGGT     <<<<<<<7<<<<<<<5<'<6/<<<5<<<<<<2<<<     MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_57:8:72:44:435   147     chr2    1392    76      35M     =       1235    -192    AAAAGCAAAAACAAAAACTATGCTAAGTATTGGTA     <<<<;7;<<<<;<<<<<<<<<<;<<<;<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_95:2:211:954:174  147     chr2    1393    99      35M     =       1207    -221    AAAGAAAAAACAAAAACTATGCTAAGTATTGGTAA     ====*=====6========================     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:1  UQ:i:9  H0:i:1  H1:i:0
+B7_595:7:149:123:265   83      chr2    1395    99      35M     =       1213    -217    AGCAAAAACAAAAACTATGCTAAGTATTGGTAAAG     <;&<<<<<:<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_32:4:7:282:424  147     chr2    1397    83      35M     =       1233    -199    CAAAAACAAAAACTATGCTAAGTATTGTTAAAGAT     1<<<<<9<<<<<31<77;;;;7<3<<2+;<3<<<<     MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:1  UQ:i:10 H0:i:0  H1:i:1
+B7_593:2:68:140:542    147     chr2    1398    95      36M     =       1217    -217    AAAAACAAAAACTATGCTAAGTATTGGTAAAGATGT    ;;<<;7<<<<<<:<<<:<<<:<<<<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:19 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_39:6:76:282:1668        147     chr2    1401    99      35M     =       1240    -196    AACAAAAACTATGCTAAGTATTGGTAAAGATGTGG     <<<<<:<<<8<8<<<<<::<<<<7<<<<<<2<<<8     MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_1:4:41:519:609  83      chr2    1401    99      35M     =       1229    -207    AACAAAAACTATGCTAAGTATTGGTAAAGATGTGG     <4;<;<<<<<<<<;4:<<;<<<<<<<<<<<;<<<<     MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_26:4:100:238:596        83      chr2    1403    56      35M     =       1220    -218    CAAAAACTATTCTAAGTATTGGTAAAGATGTGGGG     4<<<<;<3<3&<3<1<5<31<<3<<<<<<2<<;<,     MF:i:18 Aq:i:17 NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:0  H1:i:1
+EAS51_64:3:255:45:399  83      chr2    1404    99      35M     =       1238    -201    AAAAACTATGCTAAGTATTGGTAAAGATGTGGGGA     <5<5<4$;;7/<<<177&7;<<<<<<;<<4<<<<<     MF:i:18 Aq:i:57 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS112_34:6:43:47:279  83      chr2    1405    99      35M     =       1206    -234    AAAACTATGCTAAGTATTGGTAAAGATGTGGGGAA     <:<<79<<<19<<<1<<9<<+<<<<<3<3<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_78:7:215:516:299 147     chr2    1406    99      35M     =       1226    -215    AAGCTATGCTAAGTATTGGTAAAGATGTGGGGAAA     ;;))7<8:855<<4<;:<<87<<<7<<;<<<*3<<     MF:i:18 Aq:i:64 NM:i:1  UQ:i:8  H0:i:1  H1:i:0
+B7_591:7:116:814:89    147     chr2    1408    99      36M     =       1231    -213    ACTATGCTAAGTATTGGTAAAGATGTGGGGAAAAAA    :38<;<;<<<<;<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_610:7:34:144:868    83      chr2    1412    76      35M     =       1226    -221    AGCTAAGGAATGGGAAAGGTGTGGGGAAAAAAGTA     &9+&7<&&0&<6<.0<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:130        Aq:i:76 NM:i:4  UQ:i:50 H0:i:0  H1:i:0
+EAS51_62:7:312:236:655 83      chr2    1412    99      35M     =       1222    -225    TGCTAAGTATTGGTAAAGATGTGGGGAAAAAAGTA     <<8;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_11:6:17:1179:393        147     chr2    1412    99      35M     =       1232    -215    TGCTAAGTATTGGTAAAGATGTGGGGAAAAAAGTA     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:78 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_7:6:107:447:488 83      chr2    1412    99      35M     =       1233    -214    TGCTAAGTATTGGTAAAGATGTGGGGAAAAAAGTA     <<3<<<<<<6<<<<<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:53 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_597:6:73:420:812    147     chr2    1414    66      35M     =       1232    -217    CTAAGTATTGGTAAAGATGTGGGGAAAAAAGTAAA     5'<<<,<&,<<,<<<<<7<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_30:3:215:840:760        83      chr2    1416    99      35M     =       1256    -195    AAGTATTGGTAAAGATGTGGGGAAAAAAGTAAACT     <<<8<::<;;<<<:<7<7<;;;<<<<<<<<<<;<<     MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_589:8:118:829:36    147     chr2    1417    99      35M     =       1233    -219    AGTATTGGTAAAGATGTGGGGAAAAAAGTAAACTC     <8<<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:52 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_97:4:290:121:79   83      chr2    1420    99      35M     =       1257    -198    ATTGGTAAAGATGTGGGGAAAAAAGTAAACTCTCA     <1<<:<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS112_34:8:174:557:872        83      chr2    1423    99      35M     =       1237    -221    GGTAAAGATGTGGGGAAAAAAGTAAACTCTCAAAT     .77<:<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_30:2:315:412:921        147     chr2    1424    99      35M     =       1254    -205    GTAAAGATGTGGGGAAAAAAGTAAACTCTCAAATA     4-<79;<<<4:;:<<<<<<<<4<<<38<<;<<<<<     MF:i:18 Aq:i:45 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:5:95:944:247 147     chr2    1424    99      40M     =       1238    -226    GTAAAGATGTGGGGAAAAAAGTAAACTCTCAAATATTGCT        :7::;<<<<<;;<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<        MF:i:18 Aq:i:78 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_30:6:137:741:866        83      chr2    1429    99      35M     =       1268    -196    GATGAGGGGAAAAAAGTAAACTCTCAAATATTGCT     <;0:%<:9<<<:<<<<;<<:<<;0;<<<<<::<<6     MF:i:18 Aq:i:70 NM:i:1  UQ:i:4  H0:i:1  H1:i:0
+EAS188_7:6:191:540:493 147     chr2    1432    99      35M     =       1273    -194    GTGGGGAAAAAAGTAAACTCTCAAATATTGCTAGT     <<9<1<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:78 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:1:49:911:980  83      chr2    1434    99      35M     =       1241    -228    GGGGAAAAAAGTAAACTCTCAAATATTGCTAGTGG     44:7<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:62 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_59:1:248:122:558 83      chr2    1436    99      35M     =       1243    -228    GGAAAAAAGTAAACTCTCAAATATTGCTAGTGGGA     <;<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:52 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_28:1:168:609:646        147     chr2    1436    99      36M     =       1264    -208    GGAAAAAAGTAAACTCTCAAATATTGCTAGTGGGAG    ;;<<<<=======;;:;======;==<=========    MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:4:7:1347:375 83      chr2    1436    99      35M     =       1271    -200    GGAAAAAAGTAAACTCTCAAATATTGCTAGTGGGA     47999<<<;;;;;;:5;:;<;;<;;;;;<;;;;;<     MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_62:4:282:962:46  147     chr2    1437    99      35M     =       1282    -190    GAAAAAAGTAAACTCTCAAATATTGCTAGTGGGAG     69<<<<<:<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_73:5:169:714:644 83      chr2    1437    99      35M     =       1231    -241    GAAAAAAGTAAACTCTCAAATATTGCTAGTGGGAG     ;<<<<<<;<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_11:1:84:92:1246 83      chr2    1437    99      35M     =       1265    -207    GAAAAAAGTAAACTCTCAAATATTGCTAGTGGGAG     <<<<<<<<<<<<<<<8<<<<<<5<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:78 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS112_34:7:71:62:254  83      chr2    1438    99      35M     =       1264    -209    AAAAAAGTAAACTCTCAAATATTGCTAGTGGGAGT     <<<<<<;8<<<<;<:<<<<<<<;<<;<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_97:7:28:979:519   83      chr2    1439    99      35M     =       1278    -196    AAAAAGTAAACTCTCAAATATTGCTAGTGGGAGTA     <<<<<6<<<<<<<<<<<<<<<8<<<<<<<<6<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS219_1:1:63:28:1549  83      chr2    1439    77      35M     =       1247    -227    AAAAAGTAAACTCTCAAATATTGCTAGTGGGAGTA     <<<<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_593:7:15:244:876    147     chr2    1440    43      36M     =       1246    -230    AAAAGTAAACTCTCAAATATTGCTAGTGTGAGTATA    ;<<<7<<<<<.2<-<<<<<<<<<:<<<<<<<<<2<<    MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:1
+EAS56_59:8:80:542:549  83      chr2    1443    99      35M     =       1271    -207    AGTAAACTCTCAAATATTGCTAGTGGGAGTATAAA     =9====7=;=======;;==;========<=====     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_28:3:173:627:465        83      chr2    1444    99      36M     =       1260    -220    GTAAACTCTCAAATATTGCTAGTGGGAGTATAAATT    :<<<<;<;<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:51 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS219_FC30151:5:54:1351:910   147     chr2    1448    99      35M     =       1270    -213    ACTCTCAAATATTGCTAGTGGGAGTATAAATTGTT     <7<7;;<<<<<;<<;;<<;<<<<<<<<<<<<<<;<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS139_19:7:44:1807:833        147     chr2    1449    99      40M     =       1301    -188    CTCTCAAATATTGCTAGTGGGAGTATAAATTGTTTTCCAC        :6:9:<<<6<88<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<        MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_64:5:290:247:509 83      chr2    1450    99      35M     =       1276    -209    TCTCAAATATTGCTAGTGGGAGTATAAATTGTTTT     49';<<<<<8;<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS112_32:7:42:804:114 83      chr2    1452    99      35M     =       1281    -206    TCAAATATTGCTAGTGGGAGTATAAATTGTTTTCC     ;9<<;<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS218_4:3:39:1671:1928        83      chr2    1453    99      35M     =       1276    -212    CAAATATTGCTAGTGGGAGTATAAATTGTTTTCCA     <<<<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_59:5:90:629:652  147     chr2    1456    99      35M     =       1276    -215    ATATTGCTAGTGGGAGTATAAATTGTTTTCCACTT     <:<7::<:<<<<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<<<7<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_66:1:289:207:323 83      chr2    1462    99      35M     =       1279    -218    CTAGTGGGAGTATAAATTGATTTCCACTTTGGAAA     &</<7<<:<7::<<<<+3<-7<<:<7<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:1  UQ:i:12 H0:i:0  H1:i:1
+EAS1_95:7:280:607:113  83      chr2    1468    99      35M     =       1303    -200    GGAGTATAAATTGTTTTCCACTTTGGAAAACAATT     18<-<<<<<<<<<<<<<8<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_99:3:21:423:169   147     chr2    1468    99      35M     =       1270    -233    GGAGTATAAATTGTTTTCCACTTTGGAAAACAATT     ;376;0<<<<99<<<<<<-;<4<<<<<<<<<;<<<     MF:i:18 Aq:i:68 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS56_61:3:45:758:616  83      chr2    1473    99      35M     =       1280    -228    ATAAATTGTTTTCCACTTTGGAAAACAATTTGGTA     <<;<:<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:54 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_64:2:326:153:231 83      chr2    1477    43      35M     =       1290    -222    ATTGTTTTCAACTTTGGAAAACAATTTGGTAATTT     ::6=68=<*$;*=========6=============     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:1  UQ:i:3  H0:i:0  H1:i:1
+EAS192_3:3:88:866:774  83      chr2    1478    99      35M     =       1307    -206    TTGTTTTCCACTTTGGAAAACAATTTGGTAATTTC     <<<;<<<<:<<<<<:<8<<<<<<<<<<8<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:47 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_71:7:194:867:616 147     chr2    1481    99      35M     =       1303    -213    TTTTCCACTTTGGAAAACAATTTGGTAATTTCGTT     38:;;:<:<<<<;<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_591:2:46:220:58     147     chr2    1483    99      36M     =       1313    -206    TTCCACTTTGGAAAACAATTTGGTAATTTCGTTTTT    98<<<2<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS54_67:6:109:953:668 147     chr2    1485    99      35M     =       1297    -223    CCACTTTGGAAAACAATTTGGTAATTTCGTTTTTT     <:)9<<<<<<<<8:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:30 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_1:6:4:1131:104  83      chr2    1487    99      35M     =       1307    -215    ACTTTGGAAAACAATTTGGTAATTTCGTTTTTTTT     61;;;<<<<<<<<<;:<<<:<<;<<<<;<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS114_45:2:23:1754:796        147     chr2    1488    99      35M     =       1329    -194    CTTTGGAAAACAATTTGGTAATTTCGTTTTTTTTT     88897;;;;:;:;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;     MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS1_108:5:11:555:330  83      chr2    1492    99      35M     =       1321    -206    GGAAAACAATTTGGTAATTTCGTTTTTTTTTTTTT     6;6;9766+<<<<9:2=<===6=============     MF:i:18 Aq:i:56 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_62:4:308:614:911 147     chr2    1493    90      35M     =       1319    -209    AAAAACAATTTGGTAATTTAGTTTTTTTTTTTTTC     %<<<;:<::<6,<<<<<<:<:<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:2  UQ:i:31 H0:i:0  H1:i:1
+EAS139_19:1:82:946:392 83      chr2    1493    99      40M     =       1297    -236    GAAAACAATTTGGTAATTTCGTTTTTTTTTTTTTCTTTTC        :;:;:,::<:;<<<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<        MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS51_62:2:260:147:818 83      chr2    1497    82      35M     =       1303    -229    AAAATTTGGTAATTTAGTTTTTTTTTTTTTCTTTT     6.=..++==6=76==&===========99======     MF:i:18 Aq:i:41 NM:i:2  UQ:i:18 H0:i:0  H1:i:1
+B7_591:5:124:978:501   83      chr2    1499    99      36M     =       1307    -228    AATTTGGTAATTTCGTTTTTTTTTTTTTCTTTTCTC    <9<;<<::<;<<;<4<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<    MF:i:18 Aq:i:77 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+B7_597:8:147:360:141   147     chr2    1501    47      13M1D22M        =       1319    -218    TTTGGTAATTTAGTTTTTTTTTTTTCTTTTCTCTT     <86<<<<73<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:130        Aq:i:47 NM:i:1  UQ:i:27 H0:i:0  H1:i:0
+EAS114_39:3:6:1064:1805        147     chr2    1502    99      35M     =       1350    -187    TTGGTAATTTCGTTTTTTTTTTTTTCTTTTCTCTT     ;88<;<;;<<;;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:76 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:1  H1:i:0
+EAS221_3:2:76:1729:813 83      chr2    1506    99      35M     =       1317    -224    TAATTTCGTTTTTTTTTTTTTCTTTTCTCTTTTTT     <+6<<<&1<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:36 NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:2  H1:i:0
+EAS54_65:6:326:71:741  153     chr2    1509    0       35M     *       0       0       TCTCGTTTTTTTTTCTTTCTTTTCTCTTTTTTTTT     !!<66<<<<<<<<<&<<7&<<<<:<*<<<<<<<<1     MF:i:32 Aq:i:0  NM:i:2  UQ:i:22 H0:i:1  H1:i:12
+EAS112_34:6:145:144:263        73      chr2    1509    0       35M     *       0       0       TTTCGTTTTTTTTTTTTTTTTTTCCCCTTTCTTTT     <<<<<<<<<<<<<<<<+4+4&+&(&&*2&8&&&)&     MF:i:32 Aq:i:0  NM:i:4  UQ:i:29 H0:i:0  H1:i:0
+EAS1_105:1:329:407:872 73      chr2    1510    0       35M     *       0       0       TTCGTTTTTTTTTTTTTTTTTTCCCTTTTTTTTTT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<6;<<&4::<++<(&;<<     MF:i:32 Aq:i:0  NM:i:2  UQ:i:46 H0:i:0  H1:i:0
+EAS139_19:2:82:154:1333        147     chr2    1511    77      40M     =       1349    -202    TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTT        :5'::<<<;<<<<<<</3<<<&4&7<<<<<<<<<<<<<<<        MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:85 H1:i:85
+EAS56_63:3:41:468:459  147     chr2    1513    0       35M     =       1352    -196    TTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTT     +;<<<<<<<<<<<;&<<;;88&<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:85 H1:i:85
+EAS114_28:6:11:151:750 153     chr2    1513    5       36M     *       0       0       GTTTTTATTTTTTTCCTCTCTCTTTTTTTTTTTTTT    :'1:%4;4<<<+;6;&9+6;/<<<<<<<<<<<<<<<    MF:i:32 Aq:i:5  NM:i:3  UQ:i:41 H0:i:0  H1:i:3
+EAS139_11:5:52:1278:1478       83      chr2    1513    47      35M     =       1322    -226    GTTTTTTTTTTTTTCTTTTCTCTTTTTTTTTTTTT     .8::<<<<<<<;<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:9  H1:i:85
+B7_591:2:309:798:997   153     chr2    1514    0       36M     *       0       0       TTTTTTTTTTTTTTTTTTCTCTTTTTTTTTTTTTTT    466;<<744077+&7097&%&4<9<<<9<<<::<<<    MF:i:32 Aq:i:0  NM:i:1  UQ:i:5  H0:i:12 H1:i:85
+EAS1_93:6:218:144:794  121     chr2    1514    0       35M     =       1514    0       TTTTTTTTTTTTTCTTTTCTCTTTTTTTTTTTTTT     ;92/;5:<6)+<5)67</9<&<&<<<:<<<57<<<     MF:i:64 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:22 H1:i:85
+EAS1_93:6:218:144:794  181     chr2    1514    0       *       =       1514    0       GGGTGCATTGCTATGTTGCGGTCGCTTTGCCTCCT     ++(3:&)5<9035<3):-<53<+&&-+)<<&)&<6     MF:i:192
+EAS1_97:6:222:305:337  153     chr2    1514    0       35M     *       0       0       TTTTTTTTTTTTTTTTTTCCCTTTTTTTTTTTTTT     ;;;;;<<';<<<<*;<<<78;7<7<;<<<<<<<<<     MF:i:32 Aq:i:0  NM:i:2  UQ:i:32 H0:i:0  H1:i:37
+EAS1_105:3:7:35:528    89      chr2    1514    0       35M     *       0       0       TTTTTTTTTTGTTCTTTACTCTTTTTTTTTTTTTT     <<<<<<<<<<5<<<(<<%<<-8<<<<<<<<<8<<<     MF:i:32 Aq:i:0  NM:i:2  UQ:i:24 H0:i:0  H1:i:0
+EAS54_65:2:182:924:833 137     chr2    1514    0       35M     *       0       0       TTTTTTTTTTTTTATTTGCGCTTTTTTTTTTTTTT     <<<<<<<<<<<<<)7<<)3/:07<<9<9<<==<7<     MF:i:32 Aq:i:0  NM:i:3  UQ:i:30 H0:i:0  H1:i:0
+EAS54_81:8:78:735:536  153     chr2    1514    0       35M     *       0       0       TTTTTTTTTTTTTCATTTCTCTTTTTTTTTTTTTT     ;9<<<<<<<.7<9'%1<<)2::<<<<<<<<<<<<<     MF:i:32 Aq:i:0  NM:i:1  UQ:i:4  H0:i:0  H1:i:15
+EAS56_59:5:232:336:46  137     chr2    1514    0       35M     *       0       0       ATTTTTTTTTTTTCTTTTCTCTTGTTTCTTTTTTT     +<<<<<<<<<<<<6<<<<;<6<<&&<,3<<<<3,,     MF:i:32 Aq:i:0  NM:i:3  UQ:i:50 H0:i:0  H1:i:0
+EAS188_4:5:308:552:77  89      chr2    1514    0       35M     *       0       0       TTTTCTTTTTTTTCTTTTCTCTTTTTTTTTTTTTT     1;-<%<;8<<<<<&<5-<58:5:<<<<<<<<<<<<     MF:i:32 Aq:i:0  NM:i:1  UQ:i:4  H0:i:30 H1:i:85
+B7_597:5:125:957:753   137     chr2    1515    0       35M     *       0       0       TTTTTTTTTTTTCTCTCCTCTTTTTTTTTTTTTTT     <8<<<;<8;8//++(,(+++&++(/+008880;;/     MF:i:32 Aq:i:0  NM:i:2  UQ:i:14 H0:i:0  H1:i:1
+EAS1_97:4:274:287:423  83      chr2    1515    0       35M     =       1332    -218    TTTTTTTTTTTTTTTTTCTCTTTTTTTTTTTTTTT     7<<<<9<<9<<<.<<<<90-<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:12 H1:i:85
+EAS54_71:8:234:21:950  89      chr2    1515    0       33M     *       0       0       TTTTTTTTTTTTCTCCTCTCTTTTTTTTTTTTT       <<<<<<<<<&<;2;&-<,<+;<<<7<<<;<;<;       MF:i:32 Aq:i:0  NM:i:2  UQ:i:17 H0:i:0  H1:i:7
+EAS56_61:6:256:67:461  117     chr2    1515    0       *       =       1515    0       TCATGTTTGTGTCTTTCTATGCATTTTTTTTTTTT     !!7181!63:6-:!-163(-1%-18<<4<<<<<<<     MF:i:192
+EAS56_61:6:256:67:461  185     chr2    1515    0       35M     =       1515    0       TTGTTTTTTCTTCTTTTCTCTTTTTTTTTTTTTTT     *.%53.:)1+9;3397;1795507+335;.&51)5     MF:i:64 Aq:i:0  NM:i:2  UQ:i:14 H0:i:2  H1:i:85
+EAS56_65:8:317:83:500  153     chr2    1515    0       35M     *       0       0       TTTTTTTTTTTTCTTTTCTCCTTTTTTTTTTGTTT     ;;;;;<<<<<<<3<<<)-;31<<)97<;9<<:<<<     MF:i:32 Aq:i:0  NM:i:2  UQ:i:41 H0:i:0  H1:i:0
+EAS114_30:2:303:428:326        147     chr2    1515    0       35M     =       1345    -205    TTTTTTTTTTTTTTTTTCTCTTTTTTTTTTTTTTT     4<;<<;<;<4<<8;;;;.8+;<<;<8<;<;<<<<<     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:11 H1:i:85
+EAS188_7:1:290:286:763 147     chr2    1515    75      35M     =       1349    -201    TTTTTTTTTTTTCTTTTCTCTTTTTTTTTTTTTTT     <<<<;<<<<<<<&<<<<&77<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:29 H1:i:85
+B7_591:7:89:67:709     89      chr2    1516    0       36M     *       0       0       TTTTTTTTTTTGTCTTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTT    :7:::9:7:<<7<'<<477<<<<<<<<<:<<<<<:<    MF:i:32 Aq:i:0  NM:i:2  UQ:i:28 H0:i:0  H1:i:17
+EAS56_65:3:47:64:359   89      chr2    1516    0       35M     *       0       0       TTTTTTTTTTTCTCTCCTCTTTTTTTTTTTTTTTT     <<<6<<<<<<<4<4</9<4@<<;<<<<<<<<<<<<     MF:i:32 Aq:i:0  NM:i:2  UQ:i:33 H0:i:0  H1:i:6
+EAS56_65:4:296:78:421  121     chr2    1518    0       35M     =       1518    0       TCTTTTTTTCTTTTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTT     !!<<<:<<<<..<::<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:64 Aq:i:0  NM:i:1  UQ:i:4  H0:i:85 H1:i:85
+EAS56_65:4:296:78:421  181     chr2    1518    0       *       =       1518    0       TGTTGGTGTTCGTTTTTTCTCCTGTTTCTTTTTCT     <<*<4<<<;:<0<<<<<<<<+;<9<<1<<;<<<+:     MF:i:192
+EAS1_95:4:238:124:196  89      chr2    1519    0       35M     *       0       0       TTTTTTTTCTTTTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTT     <0<9.<5.5<<<<9<1<<5<<85<5<<<9<:<<<<     MF:i:32 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:85 H1:i:85
+EAS54_65:7:56:57:985   117     chr2    1519    0       *       =       1519    0       TTCTGTCTTCTCTCCTGTCTTCTTTTCTCTTCTTT     <9'<.<7<<2<<;77<7<<<<7<7<<<<7<<<2<<     MF:i:192
+EAS54_65:7:56:57:985   185     chr2    1519    0       35M     =       1519    0       TTTTTTCTCTTTTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTT     666666*6&1666+64666666666&266666666     MF:i:64 Aq:i:0  NM:i:1  UQ:i:9  H0:i:85 H1:i:85
+EAS56_61:3:5:45:441    89      chr2    1519    0       35M     *       0       0       TTTTTTTTCTTTTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTT     ;;58:<:<(:<<11<&<1<<;<<<<><<<<<<<<<     MF:i:32 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:82 H1:i:85
+B7_589:6:33:356:636    73      chr2    1520    0       35M     *       0       0       TTTTTTTCTTTTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT     <<<<<<<8;<<<<<<<<<<<<<7<<<<<<<;;3&3     MF:i:32 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:14 H1:i:85
+EAS114_45:6:86:859:1779        137     chr2    1520    0       35M     *       0       0       TTTTTTTCATTTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT     ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;8;;)7699     MF:i:32 Aq:i:0  NM:i:1  UQ:i:26 H0:i:0  H1:i:15
+EAS54_71:8:105:854:975 83      chr2    1523    71      33M     =       1354    -202    TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTG       <<<<;<:<<;<&<;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<       MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:0  UQ:i:0  H0:i:85 H1:i:85
+EAS51_62:4:187:907:145 153     chr2    1524    28      35M     *       0       0       TTTCTTCTCTCTCTTTTTTTTTTTTTTTATTGCAT     <<<+;;,6<<<<6<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:32 Aq:i:28 NM:i:3  UQ:i:59 H0:i:0  H1:i:0
+EAS54_71:4:284:269:882 73      chr2    1524    0       34M     *       0       0       TTTCTTTTCTCTTTTTTTTTTTTTTGTTTTTGCA      <;<<<<<8<7<8;<<<;<7<<<<<;272;73&&)      MF:i:32 Aq:i:0  NM:i:1  UQ:i:17 H0:i:0  H1:i:85
+EAS56_63:4:141:9:811   137     chr2    1524    10      35M     *       0       0       TTTCTTTTCTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTCTACAT     <<<;<<<<<<<;<;<:<<<;<<<<<<<<..));;.     MF:i:32 Aq:i:0  NM:i:3  UQ:i:47 H0:i:2  H1:i:27
+EAS114_30:6:277:397:932        73      chr2    1524    0       35M     *       0       0       TTTCTTTTCACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACTT     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:8(,0%(     MF:i:32 Aq:i:0  NM:i:3  UQ:i:42 H0:i:2  H1:i:85
+EAS139_11:7:50:1229:1313       83      chr2    1528    77      35M     =       1376    -187    TTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCATGCCA     <<<<,<&<7<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:0  NM:i:1  UQ:i:11 H0:i:3  H1:i:7
+EAS54_65:3:320:20:250  147     chr2    1532    77      35M     =       1367    -200    TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCATGCCAGAAA     +'''/<<<<7:;+<;::<<<;;<<<<<<<<<<<<<     MF:i:18 Aq:i:6  NM:i:2  UQ:i:24 H0:i:1  H1:i:2
+EAS114_26:7:37:79:581  83      chr2    1533    68      35M     =       1349    -219    TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCATGCCAGAAAA     3,,,===6===<===<;=====-============     MF:i:18 Aq:i:27 NM:i:2  UQ:i:23 H0:i:0  H1:i:1
diff --git a/tests/pysam_data/softclip.sam b/tests/pysam_data/softclip.sam
new file mode 100644 (file)
index 0000000..b285471
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,6 @@
+@HD    VN:1.5  SO:coordinate
+@SQ    SN:ref  LN:45
+r001   0       ref     9       30      3S6M1P1I4M      *       0       0       AAAAGATAAGGATA  *
+r002   0       ref     9       30      5S6M    *       0       0       GCCTAAGCTAA     01234567890
+r003   0       ref     9       30      6M5S    *       0       0       GCCTAAGCTAA     01234567890
+r004   2064    ref     29      17      6H5M    *       0       0       TAGGC   01234
diff --git a/tests/pysam_data/tag_bug.sam b/tests/pysam_data/tag_bug.sam
new file mode 100644 (file)
index 0000000..9c0b1cc
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,16 @@
+@SQ    SN:2L   LN:23011544
+@SQ    SN:2LHet        LN:368872
+@SQ    SN:2R   LN:21146708
+@SQ    SN:2RHet        LN:3288761
+@SQ    SN:3L   LN:24543557
+@SQ    SN:3LHet        LN:2555491
+@SQ    SN:3R   LN:27905053
+@SQ    SN:3RHet        LN:2517507
+@SQ    SN:4    LN:1351857
+@SQ    SN:U    LN:10049037
+@SQ    SN:Uextra       LN:29004656
+@SQ    SN:X    LN:22422827
+@SQ    SN:XHet LN:204112
+@SQ    SN:YHet LN:347038
+@SQ    SN:dmel_mitochondrion_genome    LN:19517
+HWI-EAS241:138:4:17:7389-21153#0       256     2L      8878    3       36M     *       0       0       CGCTGGACTCGCAAAGTGGACTTGTTCAGCAAGGAC    FEAAEDBEEFEDGDGGG@88GBEED:BB<BGDGG<F    NM:i:0  NH:i:2  CC:A:X  CP:f:1.90973e+07        HI:i:0  XC:i:1
diff --git a/tests/pysam_data/test.gtf b/tests/pysam_data/test.gtf
new file mode 100644 (file)
index 0000000..39b2938
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,10 @@
+X      pseudogene      exon    170410  170513  .       +       .        gene_id "ENSG00000228572"; transcript_id "ENST00000431238"; exon_number "1"; gene_name "NCRNA00108"; transcript_name "NCRNA00108-001";
+X      pseudogene      exon    171604  171758  .       +       .        gene_id "ENSG00000228572"; transcript_id "ENST00000431238"; exon_number "2"; gene_name "NCRNA00108"; transcript_name "NCRNA00108-001";
+X      pseudogene      exon    172682  172712  .       +       .        gene_id "ENSG00000228572"; transcript_id "ENST00000431238"; exon_number "3"; gene_name "NCRNA00108"; transcript_name "NCRNA00108-001";
+X      protein_coding  exon    192989  193061  .       +       .        gene_id "ENSG00000182378"; transcript_id "ENST00000399012"; exon_number "1"; gene_name "PLCXD1"; transcript_name "PLCXD1-001";
+X      protein_coding  exon    198149  198351  .       +       .        gene_id "ENSG00000182378"; transcript_id "ENST00000399012"; exon_number "2"; gene_name "PLCXD1"; transcript_name "PLCXD1-001";
+X      protein_coding  exon    200834  200981  .       +       .        gene_id "ENSG00000182378"; transcript_id "ENST00000399012"; exon_number "3"; gene_name "PLCXD1"; transcript_name "PLCXD1-001";
+X      protein_coding  CDS     200855  200981  .       +       0        gene_id "ENSG00000182378"; transcript_id "ENST00000399012"; exon_number "3"; gene_name "PLCXD1"; transcript_name "PLCXD1-001"; protein_id "ENSP00000381976";
+X      protein_coding  start_codon     200855  200857  .       +       0        gene_id "ENSG00000182378"; transcript_id "ENST00000399012"; exon_number "3"; gene_name "PLCXD1"; transcript_name "PLCXD1-001";
+X      protein_coding  exon    205400  205536  .       +       .        gene_id "ENSG00000182378"; transcript_id "ENST00000399012"; exon_number "4"; gene_name "PLCXD1"; transcript_name "PLCXD1-001";
+X      protein_coding  CDS     205400  205536  .       +       2        gene_id "ENSG00000182378"; transcript_id "ENST00000399012"; exon_number "4"; gene_name "PLCXD1"; transcript_name "PLCXD1-001"; protein_id "ENSP00000381976";
diff --git a/tests/pysam_data/test.gtf.gz b/tests/pysam_data/test.gtf.gz
new file mode 100644 (file)
index 0000000..047ef93
Binary files /dev/null and b/tests/pysam_data/test.gtf.gz differ
diff --git a/tests/pysam_data/test_unaligned.sam b/tests/pysam_data/test_unaligned.sam
new file mode 100644 (file)
index 0000000..3cbb20a
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,6 @@
+@HD    VN:1.0  SO:queryname
+@RG    ID:myid PL:illumina     PU:P123456      LB:L123456      DT:2013-03-20T21:00:00-0700     SM:S123456      CN:MYCN
+B123456:6:1101:10000:137074    77      *       0       0       *       *       0       0       CATGTGTATCACCCAGTACAATGCCTGACACACAGCAGTCACTTAAAGAGTGCTATTGCTATTATACAGTCATACT    HHHHHHHHHHHHHHHHFHHHHHHHHHHGHHHHHHHBHHEFFHHHHHHHHHDHHHFHFHHHHHFHHEHFB@CDCCDE    RG:Z:myid       AM:i:0  SM:i:0
+B123456:6:1101:10000:137074    141     *       0       0       *       *       0       0       CAAGGAACTTTACAGTTCAGGGGAGTTTTCCAGTGGCAGAAAGTGGGAAGATGATGCTCCCAAGGAAGAAGTAGAT    HHHHHHHHHHHGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHFHGHFHDFEF?EFEDEFFHHHFHDFHHHFHHHEFBBHD@D=C#    RG:Z:myid       AM:i:0  SM:i:0
+B123456:6:1101:10000:171579    589     *       0       0       *       *       0       0       GAAGCATAGGACATGTCAATGATGGCCAGGTGTGTGAGGAAGAAGTACATGGGGGTGTGAAGCTTAGAGTCCAGGC    ############################################################################    RG:Z:myid       AM:i:0  SM:i:0
+B123456:6:1101:10000:171579    653     *       0       0       *       *       0       0       ACCCTGCTGGGGAATGGGGTCATCTTTGGGATTATCTGCCTGGACTCTAAGCTTCACACACCCATGTACTTCTTCC    8BBBB>6<C<53679<:6<@95>><937964@?:@@B;A@8>=<>CB=CD##########################    RG:Z:myid       AM:i:0  SM:i:23
diff --git a/tests/python_flagstat.py b/tests/python_flagstat.py
new file mode 100644 (file)
index 0000000..e9ec971
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,13 @@
+import pysam
+
+is_paired = 0
+is_proper = 0
+
+for read in pysam.AlignmentFile("ex1.bam", "rb"):
+    is_paired += read.is_paired
+    is_proper += read.is_proper_pair
+
+print ("there are alignments of %i paired reads" % is_paired)
+print ("there are %i proper paired alignments" % is_proper)
+
+
diff --git a/tests/refactoring.pl b/tests/refactoring.pl
new file mode 100644 (file)
index 0000000..3300111
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,60 @@
+while (<STDIN>) {
+    # Samfile refactoring
+    s/Samfile/AlignmentFile/g;
+
+    # AlignedRead refactoring
+    s/AlignedRead/AlignedSegment/g;
+    
+    # Do these patterns first as they match
+    # the new names
+    s/\.query/\.query_alignment_sequence/g;
+    s/\.positions/\.getReferencePositions()/g;
+
+    # Tabixfile, etc
+    s/Tabixfile/TabixFile/g;
+    s/Fastafile/FastaFile/g;
+    s/Fastqfile/FastqFile/g;
+
+    # basic attributes
+    s/\.qname/\.query_name/g;
+    s/\.tid/\.reference_id/g;
+    s/\.pos/\.reference_start/g;
+    s/\.mapq/\.mapping_quality/g;
+    s/\.rnext/\.next_reference_id/g;
+    s/\.pnext/\.next_reference_start/g;
+    s/\.tlen/\.query_length/g;
+    s/\.seq/\.query_sequence/g;
+    if (/\.qual =/) {
+       s/([[\].0-9a-zA-Z]*)\.qual = (\S*)/$1.query_qualities = pysam.fromQualityString($2)/g;
+    } else {
+       s/([[\].0-9a-zA-Z]*)\.qual/pysam.toQualityString($1\.query_qualities)/g;
+    }
+    s/\.alen/\.reference_length/g;
+    s/\.aend/\.reference_end/g;
+    s/\.rlen/\.query_alignment_length/g;
+    s/([[\].0-9a-zA-Z]*)\.qqual/pysam.toQualityString($1\.query_alignment_qualities)/g;
+    s/\.qstart/\.query_alignment_start/g;
+    s/\.qend/\.query_alignment_end/g;
+    s/\.qlen/\.query_alignment_length/g;
+    s/\.mrnm/\.next_reference_id/g;
+    s/\.rnext/\.next_reference_id/g;
+    s/\.mpos/\.next_reference_start/g;
+    s/\.rname/\.reference_id/g;
+    s/\.isize/\.query_length/g;
+    s/\.cigar/\.cigartuples/g unless (/\.cigarstring/);
+
+    s/\.blocks/\.getBlocks()/g;
+    s/\.aligned_pairs/\.getAlignedPairs()/g;
+    s/\.inferred_length/\.getInferredQueryLength()/g;
+
+    s/\.overlap()/\.getOverlap()/g;
+
+    # PileupProxy
+    s/\.n([^a-zA-Z])/\.nsegments$1/g;
+    
+    # if (/\.mrnm/ || /\.rnext/ || /\.mpos/ || /\.rname/)
+    # { 
+    #     warn "Deprecated tag $& at line $.\n";
+    # }
+    print;
+}
diff --git a/tests/refactoring.txt b/tests/refactoring.txt
new file mode 100644 (file)
index 0000000..75db3c7
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,198 @@
+;; This buffer is for notes you don't want to save, and for Lisp evaluation.
+;; If you want to create a file, visit that file with C-x C-f,
+;; then enter the text in that file's own buffer.
+
+Samfile -> AlignmentFile
+AlignedRead -> AlignedSegment
+Tabixfile -> TabixFile
+Fastafile -> FastaFile
+Fastqfile -> FastqFile
+
+Changes to the AlignedSegment.API:
+
+Basic attributes
+================
+
+qname -> query_name
+tid -> reference_id
+pos -> reference_start
+mapq -> mapping_quality
+rnext -> next_reference_id
+pnext -> next_reference_start
+cigar = alignment (now returns CigarAlignment object)
+cigarstring = cigarstring
+tlen -> query_length
+seq -> query_sequence
+qual -> query_qualities, now returns array
+tags = tags (now returns Tags object)
+
+
+Derived simple attributes
+=========================
+
+alen -> reference_length, reference is always "alignment", so removed
+aend -> reference_end
+rlen -> query_length 
+query -> query_alignment_sequence
+qqual -> query_alignment_qualities, now returns array
+qstart -> query_alignment_start
+qend -> query_alignment_end
+qlen -> query_alignment_length, kept, because can be computed without fetching the sequence
+mrnm -> next_reference_id   
+mpos -> next_reference_start
+rname -> reference_id
+isize -> query_length
+
+
+Complex attributes - functions
+===============================
+
+blocks -> getBlocks()
+aligned_pairs -> getAlignedPairs()
+inferred_length -> inferQueryLength()
+positions -> getReferencePositions()
+overlap() -> getOverlap()
+
+
+Backwards incompatible changes:
+================================
+
+1. Empty cigarstring now returns None (intstead of '')
+
+2. Empty cigar now returns None (instead of [])
+
+3. When using the extension classes in cython modules, AlignedRead
+   needs to be substituted with AlignedSegment. Automatic casting
+   of the base class to the derived class seems not to work?
+
+4. fancy_str() has been removed
+
+
+=====================================================
+
+Kevin's suggestions:
+
+
+* smarter file opener
+* CRAM support
+* CSI index support (create and use)
+* better attribute and property names
+* remove deprecated names
+* add object oriented CIGAR and tag handling
+* fetch query that recruits mate pairs that overlap query region
+* other commonly re-invented functionality
+
+        qname -> template_name
+        pos -> reference_start
+        aend -> reference_stop
+        alen -> reference_length
+        tid -> ref_id
+        qname -> template_name (not a high priority, but would be clearer)
+        qstart -> query_start (really segment_align_start)
+        qend -> query_stop (really segment_align_stop)
+        qlen -> query_length (really segment_align_length)
+        qqual -> query_qual (really segment_align_qual)
+        rlen -> drop in favor of len(align.seq)
+        inferred_length -> inferred_query_length
+        is_* -> replace with flag object that is a subclass of int
+        cigarstring -> str(align.cigar)
+        tags -> opts object with a mapping-like interface
+    Non-backward compatible:
+        rname, mrnm, mpos, isize -> remove
+        cigar -> CigarSequence object (or something similar)
+        All coordinate and length queries return None when a value is not available (currently some return None, some 0)
+        Store qualities as an array or bytes type
+
+
+Marcel's suggestions:
+
+    I recently sent in a pull request (which was merged) that improves the pysam doc a bit. While preparing that, I also wrote down some ways in which the API itself could be improved. I think the API is ok, but for someone like me who uses pysam not every day, some of the details are hard to remember and every time I do very basic things I end up looking them up again in the docs. I can recommend this article, written for C++, but many points still apply:
+    http://qt-project.org/wiki/API_Design_Principles .
+
+    Originally, I wanted to convert at least some of these suggestions to pull requests, but I'm not sure I have the time for that in the near future. So before I forget about this completely, I thought it's best to at least send this to the list. I'm concentrating on issues I found in Samfile and AlignedRead here.
+
+    - The terminology is inconsistent - often two words are used
+      to describe the same thing: opt vs. tag, query vs. read,
+      reference vs. target. My suggestion is to consistently use
+      the same terms as in the SAM spec: tag, query,
+      reference. This applies both to documentation and
+      function/property names.
+
+    - In line with the document linked to above (see the
+      section "The Art of Naming"): Do not abbreviate function
+      and property names. For example, tlen -> template_length,
+      pos -> position, mapq -> mapping_quality etc.
+
+    - Be consistent with multiword function and variable names. I
+      suggest to use the PEP8 convention. This isn't so visible
+      to the user in Samfile and AlignedRead, it seems, but there
+      are things like convertBinaryTagToList which could be
+      renamed to convert_binary_tag_to_list.
+
+    - Don't make functions that are not setters or getters a
+      property. This applies to
+      AlignedRead.positions/.inferred_length/.aligned_pairs/.blocks
+      and currently also Samfile.references, for example. Making
+      these a property implies to the user that access requires
+      constant time. This is important in code like this:
+
+    for i in range(n):
+     do_something_with(read.positions[i])
+
+    This looks inconspicuous, but is possibly inefficient since
+    .positions actually builds up the result it returns each time
+    it's accessed.
+
+    - Update the examples in the docs to use context manager
+      syntax.
+
+    Particular to Samfile:
+
+    - Deprecate Samfile.nreferences: propose to use
+      len(samfile.references) instead. Cache Samfile.references
+      so it's not re-created every time.
+
+    - Move Samfile.mapped/.unmapped/.nocoordinate into a .stats
+      attribute (Samfile.stats.mapped/.unmapped/.noocordinate).
+
+    Particular to AlignedRead:
+
+    - When read is an AlignedRead, print(read) should print out a
+      properly formatted SAM line.
+
+    - Force assignment to .qual/.seq to go through a function
+      that sets both at the same time. This avoids the problem
+      that they must be set in a particular order, which is easy
+      to forget and only 'enforced' through documentation.
+
+    - Deprecate rlen, use len(read.seq) instead.
+
+    - Handling of tags is a little awkward. Would be cool if this
+      worked:
+
+    read.tags['XK'] = 'hello'  # add a new tag if it doesn't exist
+    read.tags['AS'] += 17      # update the value of a tag
+    del read.tags['AS']
+    if 'AS' in read.tags: ...
+
+    - Add a property AlignedRead.qualities that behaves like a
+      Py3-bytes object in both Py2 and Py3. That is, accessing
+      read.qualities[0] gives you an int value that represents
+      the quality. The fact that qualities are encoded as
+      ASCII(q+33) is an implementation detail that can be hidden.
+
+      Done      
+
+    - And finally: Add a Cigar class. I guess this is already
+      what 'improved CIGAR string handling' refers to in the
+      roadmap. AlignedRead.cigar would then return a Cigar object
+      that can be printed, compared and concatenated to others,
+      whose length can be measured etc. The .unclipped and
+      .inferred length properties can also be moved here. Or
+      perhaps: Make this an Alignment class that even knows about
+      the two strings it is aligning. One could then also iterate
+      over all columns of the alignment. But I guess this goes
+      too far since that's what the AlignedRead itself should be.
+
+    Regards,
+    Marcel
diff --git a/tests/samtools_test.py b/tests/samtools_test.py
new file mode 100644 (file)
index 0000000..203c0a7
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,383 @@
+#!/usr/bin/env python
+'''unit testing code for pysam.
+
+Execute in the :file:`tests` directory as it requires the Makefile
+and data files located there.
+'''
+
+import pysam
+import unittest
+import os
+import re
+import sys
+import subprocess
+import shutil
+from TestUtils import checkBinaryEqual
+
+IS_PYTHON3 = sys.version_info[0] >= 3
+
+SAMTOOLS = "samtools"
+WORKDIR = "pysam_test_work"
+DATADIR = "pysam_data"
+
+
+def runSamtools(cmd):
+    '''run a samtools command'''
+
+    try:
+        retcode = subprocess.call(cmd, shell=True,
+                                  stderr=subprocess.PIPE)
+        if retcode < 0:
+            print("Child was terminated by signal", -retcode)
+    except OSError as e:
+        print("Execution failed:", e)
+
+
+def getSamtoolsVersion():
+    '''return samtools version'''
+
+    with subprocess.Popen(SAMTOOLS, shell=True, stderr=subprocess.PIPE).stderr as pipe:
+        lines = b"".join(pipe.readlines())
+
+    if IS_PYTHON3:
+        lines = lines.decode('ascii')
+    return re.search("Version:\s+(\S+)", lines).groups()[0]
+
+
+class BinaryTest(unittest.TestCase):
+
+    '''test samtools command line commands and compare
+    against pysam commands.
+
+    Tests fail, if the output is not binary identical.
+    '''
+
+    first_time = True
+
+    # a dictionary of commands to test
+    # first entry: (samtools output file, samtools command)
+    # second entry: (pysam output file, (pysam function, pysam options) )
+    commands = \
+        {
+            "view":
+            (
+                ("ex1.view", "view ex1.bam > ex1.view"),
+                ("pysam_ex1.view", (pysam.view, "ex1.bam")),
+            ),
+            "view2":
+            (
+                ("ex1.view", "view -bT ex1.fa -o ex1.view2 ex1.sam"),
+                # note that -o ex1.view2 throws exception.
+                ("pysam_ex1.view",
+                 (pysam.view, "-bT ex1.fa -oex1.view2 ex1.sam")),
+            ),
+            "sort":
+            (
+                ("ex1.sort.bam", "sort ex1.bam ex1.sort"),
+                ("pysam_ex1.sort.bam", (pysam.sort, "ex1.bam pysam_ex1.sort")),
+            ),
+            "mpileup":
+            (
+                ("ex1.pileup", "mpileup ex1.bam > ex1.pileup"),
+                ("pysam_ex1.mpileup", (pysam.mpileup, "ex1.bam")),
+            ),
+            "depth":
+            (
+                ("ex1.depth", "depth ex1.bam > ex1.depth"),
+                ("pysam_ex1.depth", (pysam.depth, "ex1.bam")),
+            ),
+            "faidx":
+            (
+                ("ex1.fa.fai", "faidx ex1.fa"),
+                ("pysam_ex1.fa.fai", (pysam.faidx, "ex1.fa")),
+            ),
+            "index":
+            (
+                ("ex1.bam.bai", "index ex1.bam"),
+                ("pysam_ex1.bam.bai", (pysam.index, "pysam_ex1.bam")),
+            ),
+            "idxstats":
+            (
+                ("ex1.idxstats", "idxstats ex1.bam > ex1.idxstats"),
+                ("pysam_ex1.idxstats", (pysam.idxstats, "pysam_ex1.bam")),
+            ),
+            "fixmate":
+            (
+                ("ex1.fixmate", "fixmate ex1.bam ex1.fixmate"),
+                ("pysam_ex1.fixmate",
+                 (pysam.fixmate, "pysam_ex1.bam pysam_ex1.fixmate")),
+            ),
+            "flagstat":
+            (
+                ("ex1.flagstat", "flagstat ex1.bam > ex1.flagstat"),
+                ("pysam_ex1.flagstat", (pysam.flagstat, "pysam_ex1.bam")),
+            ),
+            "calmd":
+            (
+                ("ex1.calmd", "calmd ex1.bam ex1.fa > ex1.calmd"),
+                ("pysam_ex1.calmd", (pysam.calmd, "pysam_ex1.bam ex1.fa")),
+            ),
+            "merge":
+            (
+                ("ex1.merge", "merge -f ex1.merge ex1.bam ex1.bam"),
+                # -f option does not work - following command will cause the subsequent
+                # command to fail
+                ("pysam_ex1.merge",
+                 (pysam.merge, "pysam_ex1.merge pysam_ex1.bam pysam_ex1.bam")),
+            ),
+            "rmdup":
+            (
+                ("ex1.rmdup", "rmdup ex1.bam ex1.rmdup"),
+                ("pysam_ex1.rmdup",
+                 (pysam.rmdup, "pysam_ex1.bam pysam_ex1.rmdup")),
+            ),
+            "reheader":
+            (
+                ("ex1.reheader", "reheader ex1.bam ex1.bam > ex1.reheader"),
+                ("pysam_ex1.reheader", (pysam.reheader, "ex1.bam ex1.bam")),
+            ),
+            "cat":
+            (
+                ("ex1.cat", "cat ex1.bam ex1.bam > ex1.cat"),
+                ("pysam_ex1.cat", (pysam.cat, "ex1.bam ex1.bam")),
+            ),
+            "targetcut":
+            (
+                ("ex1.targetcut", "targetcut ex1.bam > ex1.targetcut"),
+                ("pysam_ex1.targetcut", (pysam.targetcut, "pysam_ex1.bam")),
+            ),
+            "phase":
+            (
+                ("ex1.phase", "phase ex1.bam > ex1.phase"),
+                ("pysam_ex1.phase", (pysam.phase, "pysam_ex1.bam")),
+            ),
+            "import":
+            (
+                ("ex1.bam", "import ex1.fa.fai ex1.sam.gz ex1.bam"),
+                ("pysam_ex1.bam",
+                 (pysam.samimport, "ex1.fa.fai ex1.sam.gz pysam_ex1.bam")),
+            ),
+            "bam2fq":
+            (
+                ("ex1.bam2fq", "bam2fq ex1.bam > ex1.bam2fq"),
+                ("pysam_ex1.bam2fq", (pysam.bam2fq, "pysam_ex1.bam")),
+            ),
+            "pad2unpad":
+            (
+                ("ex2.unpad", "pad2unpad -T ex1.fa ex2.bam > ex2.unpad"),
+                ("pysam_ex2.unpad", (pysam.pad2unpad, "-T ex1.fa ex2.bam")),
+            ),
+            "bamshuf":
+            (
+                ("ex1.bamshuf.bam", "bamshuf ex1.bam ex1.bamshuf"),
+                ("pysam_ex1.bamshuf.bam",
+                 (pysam.bamshuf, "ex1.bam pysam_ex1.bamshuf")),
+            ),
+            "bedcov":
+            (
+                ("ex1.bedcov", "bedcov ex1.bed ex1.bam > ex1.bedcov"),
+                ("pysam_ex1.bedcov", (pysam.bedcov, "ex1.bed ex1.bam")),
+            ),
+        }
+
+    # some tests depend on others. The order specifies in which order
+    # the samtools commands are executed.
+    # The first three (faidx, import, index) need to be in that order,
+    # the rest is arbitrary.
+    order = ('faidx', 'import', 'index',
+             # 'pileup1', 'pileup2', deprecated
+             # 'glfview', deprecated
+             'view', 'view2',
+             'sort',
+             'mpileup',
+             'depth',
+             'idxstats',
+             # 'fixmate',
+             'flagstat',
+             # 'calmd',
+             'merge',
+             # 'rmdup',
+             'reheader',
+             'cat',
+             'bedcov',
+             'targetcut',
+             'phase',
+             # 'bamshuf',
+             'bam2fq',
+             # 'pad2unpad',
+             )
+
+    def setUp(self):
+        '''setup tests. 
+
+        For setup, all commands will be run before the first test is
+        executed. Individual tests will then just compare the output
+        files.
+        '''
+        if BinaryTest.first_time:
+
+            # remove previous files
+            if os.path.exists(WORKDIR):
+                shutil.rmtree(WORKDIR)
+                pass
+
+            # copy the source files to WORKDIR
+            os.makedirs(WORKDIR)
+
+            shutil.copy(os.path.join(DATADIR, "ex1.fa"),
+                        os.path.join(WORKDIR, "pysam_ex1.fa"))
+            shutil.copy(os.path.join(DATADIR, "ex1.fa"),
+                        os.path.join(WORKDIR, "ex1.fa"))
+            shutil.copy(os.path.join(DATADIR, "ex1.sam.gz"),
+                        os.path.join(WORKDIR, "ex1.sam.gz"))
+            shutil.copy(os.path.join(DATADIR, "ex1.sam"),
+                        os.path.join(WORKDIR, "ex1.sam"))
+            shutil.copy(os.path.join(DATADIR, "ex2.bam"),
+                        os.path.join(WORKDIR, "ex2.bam"))
+
+            # cd to workdir
+            savedir = os.getcwd()
+            os.chdir(WORKDIR)
+            for label in self.order:
+                # print ("command=", label)
+                command = self.commands[label]
+                # build samtools command and target and run
+                samtools_target, samtools_command = command[0]
+                runSamtools(" ".join((SAMTOOLS, samtools_command)))
+
+                # get pysam command and run
+                try:
+                    pysam_target, pysam_command = command[1]
+                except ValueError as msg:
+                    raise ValueError("error while setting up %s=%s: %s" %
+                                     (label, command, msg))
+
+                pysam_method, pysam_options = pysam_command
+
+                try:
+                    output = pysam_method(*pysam_options.split(" "), raw=True)
+                except pysam.SamtoolsError as msg:
+                    raise pysam.SamtoolsError(
+                        "error while executing %s: options=%s: msg=%s" %
+                        (label, pysam_options, msg))
+
+                if ">" in samtools_command:
+                    with open(pysam_target, "wb") as outfile:
+                        if type(output) == list:
+                            if IS_PYTHON3:
+                                for line in output:
+                                    outfile.write(line.encode('ascii'))
+                            else:
+                                for line in output:
+                                    outfile.write(line)
+                        else:
+                            outfile.write(output)
+
+            os.chdir(savedir)
+            BinaryTest.first_time = False
+
+        samtools_version = getSamtoolsVersion()
+
+        def _r(s):
+            # patch - remove any of the alpha/beta suffixes, i.e., 0.1.12a ->
+            # 0.1.12
+            if s.count('-') > 0:
+                s = s[0:s.find('-')]
+            return re.sub("[^0-9.]", "", s)
+
+        if _r(samtools_version) != _r(pysam.__samtools_version__):
+            raise ValueError("versions of pysam/samtools and samtools differ: %s != %s" %
+                             (pysam.__samtools_version__,
+                              samtools_version))
+
+    def checkCommand(self, command):
+        if command:
+            samtools_target, pysam_target = self.commands[
+                command][0][0], self.commands[command][1][0]
+            samtools_target = os.path.join(WORKDIR, samtools_target)
+            pysam_target = os.path.join(WORKDIR, pysam_target)
+            self.assertTrue(checkBinaryEqual(samtools_target, pysam_target),
+                            "%s failed: files %s and %s are not the same" % (command, samtools_target, pysam_target))
+
+    def testImport(self):
+        self.checkCommand("import")
+
+    def testIndex(self):
+        self.checkCommand("index")
+
+    def testSort(self):
+        self.checkCommand("sort")
+
+    def testMpileup(self):
+        self.checkCommand("mpileup")
+
+    def testDepth(self):
+        self.checkCommand("depth")
+
+    def testIdxstats(self):
+        self.checkCommand("idxstats")
+
+    # def testFixmate(self):
+    #     self.checkCommand("fixmate")
+
+    def testFlagstat(self):
+        self.checkCommand("flagstat")
+
+    def testMerge(self):
+        self.checkCommand("merge")
+
+    # def testRmdup(self):
+    #     self.checkCommand("rmdup")
+
+    def testReheader(self):
+        self.checkCommand("reheader")
+
+    def testCat(self):
+        self.checkCommand("cat")
+
+    def testTargetcut(self):
+        self.checkCommand("targetcut")
+
+    def testPhase(self):
+        self.checkCommand("phase")
+
+    def testBam2fq(self):
+        self.checkCommand("bam2fq")
+
+    def testBedcov(self):
+        self.checkCommand("bedcov")
+
+    # def testBamshuf(self):
+    #     self.checkCommand("bamshuf")
+
+    # def testPad2Unpad(self):
+    #     self.checkCommand("pad2unpad")
+
+    # def testPileup1( self ):
+    #     self.checkCommand( "pileup1" )
+
+    # def testPileup2( self ):
+    #     self.checkCommand( "pileup2" )
+
+    # deprecated
+    # def testGLFView( self ):
+    #     self.checkCommand( "glfview" )
+
+    def testView(self):
+        self.checkCommand("view")
+
+    def testEmptyIndex(self):
+        self.assertRaises(IOError, pysam.index, "exdoesntexist.bam")
+
+    def __del__(self):
+        if os.path.exists(WORKDIR):
+            pass
+        # shutil.rmtree( WORKDIR )
+
+if __name__ == "__main__":
+    # build data files
+    print ("building data files")
+    subprocess.call("make -C %s" % DATADIR, shell=True)
+    print ("starting tests")
+    unittest.main()
+    print ("completed tests")
diff --git a/tests/tabix_data/example.bed.gz b/tests/tabix_data/example.bed.gz
new file mode 100644 (file)
index 0000000..b67da76
Binary files /dev/null and b/tests/tabix_data/example.bed.gz differ
diff --git a/tests/tabix_data/example.bed.gz.tbi b/tests/tabix_data/example.bed.gz.tbi
new file mode 100644 (file)
index 0000000..a529607
Binary files /dev/null and b/tests/tabix_data/example.bed.gz.tbi differ
diff --git a/tests/tabix_data/example.gtf.gz b/tests/tabix_data/example.gtf.gz
new file mode 100644 (file)
index 0000000..693db0c
Binary files /dev/null and b/tests/tabix_data/example.gtf.gz differ
diff --git a/tests/tabix_data/example.gtf.gz.tbi b/tests/tabix_data/example.gtf.gz.tbi
new file mode 100644 (file)
index 0000000..6e4fb0b
Binary files /dev/null and b/tests/tabix_data/example.gtf.gz.tbi differ
diff --git a/tests/tabix_data/example.sam.gz b/tests/tabix_data/example.sam.gz
new file mode 100644 (file)
index 0000000..9d7cb5f
Binary files /dev/null and b/tests/tabix_data/example.sam.gz differ
diff --git a/tests/tabix_data/example.sam.gz.tbi b/tests/tabix_data/example.sam.gz.tbi
new file mode 100644 (file)
index 0000000..a6c84f1
Binary files /dev/null and b/tests/tabix_data/example.sam.gz.tbi differ
diff --git a/tests/tabix_data/example.vcf.gz b/tests/tabix_data/example.vcf.gz
new file mode 100644 (file)
index 0000000..277bd7b
Binary files /dev/null and b/tests/tabix_data/example.vcf.gz differ
diff --git a/tests/tabix_data/example.vcf.gz.tbi b/tests/tabix_data/example.vcf.gz.tbi
new file mode 100644 (file)
index 0000000..ddb120e
Binary files /dev/null and b/tests/tabix_data/example.vcf.gz.tbi differ
diff --git a/tests/tabix_data/example.vcf40 b/tests/tabix_data/example.vcf40
new file mode 100644 (file)
index 0000000..07e0746
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,23 @@
+##fileformat=VCFv4.0
+##fileDate=20090805
+##source=myImputationProgramV3.1
+##reference=1000GenomesPilot-NCBI36
+##phasing=partial
+##INFO=<ID=NS,Number=1,Type=Integer,Description="Number of Samples With Data">
+##INFO=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Total Depth">
+##INFO=<ID=AF,Number=.,Type=Float,Description="Allele Frequency">
+##INFO=<ID=AA,Number=1,Type=String,Description="Ancestral Allele">
+##INFO=<ID=DB,Number=0,Type=Flag,Description="dbSNP membership, build 129">
+##INFO=<ID=H2,Number=0,Type=Flag,Description="HapMap2 membership">
+##FILTER=<ID=q10,Description="Quality below 10">
+##FILTER=<ID=s50,Description="Less than 50% of samples have data">
+##FORMAT=<ID=GT,Number=1,Type=String,Description="Genotype">
+##FORMAT=<ID=GQ,Number=1,Type=Integer,Description="Genotype Quality">
+##FORMAT=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Read Depth">
+##FORMAT=<ID=HQ,Number=2,Type=Integer,Description="Haplotype Quality">
+#CHROM POS     ID      REF     ALT     QUAL    FILTER  INFO    FORMAT  NA00001 NA00002 NA00003
+M      1230237 .       T       .       47      PASS    NS=3;DP=13;AA=T GT:GQ:DP:HQ     0|0:54:7:56,60  0|0:48:4:51,51  0/0:61:2
+17     14370   rs6054257       G       A       29      PASS    NS=3;DP=14;AF=0.5;DB;H2 GT:GQ:DP:HQ     0|0:48:1:51,51  1|0:48:8:51,51  1/1:43:5:.,.
+20     17330   .       T       A       3       q10     NS=3;DP=11;AF=0.017     GT:GQ:DP:HQ     0|0:49:3:58,50  0|1:3:5:65,3    0/0:41:3
+20     1110696 rs6040355       A       G,T     67      PASS    NS=2;DP=10;AF=0.333,0.667;AA=T;DB       GT:GQ:DP:HQ     1|2:21:6:23,27  2|1:2:0:18,2    2/2:35:4
+20     1234567 microsat1       GTCT    G,GTACT 50      PASS    NS=3;DP=9;AA=G  GT:GQ:DP        0/1:35:4        0/2:17:2        1/1:40:3
diff --git a/tests/tabix_data/example_badcomments.bed.gz b/tests/tabix_data/example_badcomments.bed.gz
new file mode 100644 (file)
index 0000000..c31dca6
Binary files /dev/null and b/tests/tabix_data/example_badcomments.bed.gz differ
diff --git a/tests/tabix_data/example_badcomments.bed.gz.tbi b/tests/tabix_data/example_badcomments.bed.gz.tbi
new file mode 100644 (file)
index 0000000..0463180
Binary files /dev/null and b/tests/tabix_data/example_badcomments.bed.gz.tbi differ
diff --git a/tests/tabix_data/example_badcomments.gtf.gz b/tests/tabix_data/example_badcomments.gtf.gz
new file mode 100644 (file)
index 0000000..9d6b241
Binary files /dev/null and b/tests/tabix_data/example_badcomments.gtf.gz differ
diff --git a/tests/tabix_data/example_badcomments.gtf.gz.tbi b/tests/tabix_data/example_badcomments.gtf.gz.tbi
new file mode 100644 (file)
index 0000000..c7731fc
Binary files /dev/null and b/tests/tabix_data/example_badcomments.gtf.gz.tbi differ
diff --git a/tests/tabix_data/example_badcomments.sam.gz b/tests/tabix_data/example_badcomments.sam.gz
new file mode 100644 (file)
index 0000000..9d7cb5f
Binary files /dev/null and b/tests/tabix_data/example_badcomments.sam.gz differ
diff --git a/tests/tabix_data/example_badcomments.sam.gz.tbi b/tests/tabix_data/example_badcomments.sam.gz.tbi
new file mode 100644 (file)
index 0000000..a6c84f1
Binary files /dev/null and b/tests/tabix_data/example_badcomments.sam.gz.tbi differ
diff --git a/tests/tabix_data/example_badcomments.vcf.gz b/tests/tabix_data/example_badcomments.vcf.gz
new file mode 100644 (file)
index 0000000..d323cdf
Binary files /dev/null and b/tests/tabix_data/example_badcomments.vcf.gz differ
diff --git a/tests/tabix_data/example_badcomments.vcf.gz.tbi b/tests/tabix_data/example_badcomments.vcf.gz.tbi
new file mode 100644 (file)
index 0000000..366004b
Binary files /dev/null and b/tests/tabix_data/example_badcomments.vcf.gz.tbi differ
diff --git a/tests/tabix_data/example_comments.bed.gz b/tests/tabix_data/example_comments.bed.gz
new file mode 100644 (file)
index 0000000..5d810bb
Binary files /dev/null and b/tests/tabix_data/example_comments.bed.gz differ
diff --git a/tests/tabix_data/example_comments.bed.gz.tbi b/tests/tabix_data/example_comments.bed.gz.tbi
new file mode 100644 (file)
index 0000000..42544b2
Binary files /dev/null and b/tests/tabix_data/example_comments.bed.gz.tbi differ
diff --git a/tests/tabix_data/example_comments.gtf.gz b/tests/tabix_data/example_comments.gtf.gz
new file mode 100644 (file)
index 0000000..8a6b1c7
Binary files /dev/null and b/tests/tabix_data/example_comments.gtf.gz differ
diff --git a/tests/tabix_data/example_comments.gtf.gz.tbi b/tests/tabix_data/example_comments.gtf.gz.tbi
new file mode 100644 (file)
index 0000000..2f33d40
Binary files /dev/null and b/tests/tabix_data/example_comments.gtf.gz.tbi differ
diff --git a/tests/tabix_data/example_comments.sam.gz b/tests/tabix_data/example_comments.sam.gz
new file mode 100644 (file)
index 0000000..9d7cb5f
Binary files /dev/null and b/tests/tabix_data/example_comments.sam.gz differ
diff --git a/tests/tabix_data/example_comments.sam.gz.tbi b/tests/tabix_data/example_comments.sam.gz.tbi
new file mode 100644 (file)
index 0000000..a6c84f1
Binary files /dev/null and b/tests/tabix_data/example_comments.sam.gz.tbi differ
diff --git a/tests/tabix_data/example_comments.vcf.gz b/tests/tabix_data/example_comments.vcf.gz
new file mode 100644 (file)
index 0000000..d323cdf
Binary files /dev/null and b/tests/tabix_data/example_comments.vcf.gz differ
diff --git a/tests/tabix_data/example_comments.vcf.gz.tbi b/tests/tabix_data/example_comments.vcf.gz.tbi
new file mode 100644 (file)
index 0000000..366004b
Binary files /dev/null and b/tests/tabix_data/example_comments.vcf.gz.tbi differ
diff --git a/tests/tabix_data/example_unicode.vcf b/tests/tabix_data/example_unicode.vcf
new file mode 100644 (file)
index 0000000..4512a8f
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,23 @@
+##fileformat=VCFv4.0
+##fileDate=20090805
+##source=myImputationProgramV3.1
+##reference=1000GenomesPilot-NCBI36
+##phasing=partial
+##INFO=<ID=NS,Number=1,Type=Integer,Description="Number of Samples With Data">
+##INFO=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Total Depth">
+##INFO=<ID=AF,Number=.,Type=Float,Description="Allele Frequency">
+##INFO=<ID=AA,Number=1,Type=String,Description="Ancestral Allele">
+##INFO=<ID=DB,Number=0,Type=Flag,Description="dbSNP membership, build 129">
+##INFO=<ID=H2,Number=0,Type=Flag,Description="HapMap2 membership">
+##FILTER=<ID=q10,Description="Quality below 10">
+##FILTER=<ID=s50,Description="Less than 50% of samples have data">
+##FORMAT=<ID=GT,Number=1,Type=String,Description="Genotype">
+##FORMAT=<ID=GQ,Number=1,Type=Integer,Description="Genotype Quality">
+##FORMAT=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Read Depth">
+##FORMAT=<ID=HQ,Number=2,Type=Integer,Description="Haplotype Quality">
+#CHROM POS     ID      REF     ALT     QUAL    FILTER  INFO    FORMAT  Reneé  Grün   Señor
+M      1230237 .       T       .       47      PASS    NS=3;DP=13;AA=T GT:GQ:DP:HQ     0|0:54:7:56,60  0|0:48:4:51,51  0/0:61:2
+17     14370   Reneé  G       A       29      PASS    NS=3;DP=14;AF=0.5;DB;H2 GT:GQ:DP:HQ     0|0:48:1:51,51  1|0:48:8:51,51  1/1:43:5:.,.
+20     17330   .       T       A       3       q10     NS=3;DP=11;AF=0.017     GT:GQ:DP:HQ     0|0:49:3:58,50  0|1:3:5:65,3    0/0:41:3
+20     1110696 Grün   A       G,T     67      PASS    NS=2;DP=10;AF=0.333,0.667;AA=T;DB       GT:GQ:DP:HQ     1|2:21:6:23,27  2|1:2:0:18,2    2/2:35:4
+20     1234567 Señor  GTCT    G,GTACT 50      PASS    NS=3;DP=9;AA=G  GT:GQ:DP        0/1:35:4        0/2:17:2        1/1:40:3
diff --git a/tests/tabix_data/gtf_toofew_fields.gtf.gz b/tests/tabix_data/gtf_toofew_fields.gtf.gz
new file mode 100644 (file)
index 0000000..42b924d
Binary files /dev/null and b/tests/tabix_data/gtf_toofew_fields.gtf.gz differ
diff --git a/tests/tabix_data/gtf_toomany_fields.gtf.gz b/tests/tabix_data/gtf_toomany_fields.gtf.gz
new file mode 100644 (file)
index 0000000..901dc1e
Binary files /dev/null and b/tests/tabix_data/gtf_toomany_fields.gtf.gz differ
diff --git a/tests/tabix_data/gtf_wrong_fields.gtf.gz b/tests/tabix_data/gtf_wrong_fields.gtf.gz
new file mode 100644 (file)
index 0000000..901dc1e
Binary files /dev/null and b/tests/tabix_data/gtf_wrong_fields.gtf.gz differ
diff --git a/tests/tabix_data/vcf/10.vcf b/tests/tabix_data/vcf/10.vcf
new file mode 100644 (file)
index 0000000..4ec2daf
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,84 @@
+##fileformat=VCFv4.0
+##FILTER=<ID=HardyWeinbergViolation,Description="The validation is in Hardy-Weinberg violation">
+##FILTER=<ID=HighNoCallRate,Description="The validation no-call rate is too high">
+##FILTER=<ID=TooManyHomVars,Description="The validation homozygous variant rate is too high">
+##INFO=<ID=AC,Number=1,Type=Integer,Description="Allele count in genotypes, for each ALT allele, in the same order as listed">
+##INFO=<ID=AN,Number=1,Type=Integer,Description="Total number of alleles in called genotypes">
+##INFO=<ID=HW,Number=1,Type=Float,Description="Phred-scaled Hardy-Weinberg violation p-value">
+##INFO=<ID=HetPct,Number=1,Type=Float,Description="Percent of heterozygous genotypes">
+##INFO=<ID=HomRefPct,Number=1,Type=Float,Description="Percent of homozygous reference genotypes">
+##INFO=<ID=HomVarPct,Number=1,Type=Float,Description="Percent homozygous variant genotypes">
+##INFO=<ID=NoCallPct,Number=1,Type=Float,Description="Percent of no-calls">
+##ValidationMetrics_HardyWeinbergViolations="25 (8%)"
+##ValidationMetrics_HomVarViolations="0 (0%)"
+##ValidationMetrics_NoCallViolations="13 (4%)"
+##ValidationMetrics_PolymorphicPassingRecords="195 (75%)"
+##ValidationMetrics_RecordsPassingFilters="258 (87%)"
+##ValidationMetrics_RecordsProcessed=296
+##ValidationMetrics_SamplesAssayed=383
+##VariantValidationAssessor="analysis_type=VariantValidationAssessor input_file=[] sample_metadata=[] read_buffer_size=null phone_home=STANDARD read_filter=[] intervals=null excludeIntervals=null reference_sequence=/humgen/1kg/reference/human_g1k_v37.fasta rodBind=[rawData/plink.renamed.sorted.fixed.vcf] rodToIntervalTrackName=null BTI_merge_rule=UNION nonDeterministicRandomSeed=false DBSNP=null downsampling_type=null downsample_to_fraction=null downsample_to_coverage=null baq=OFF baqGapOpenPenalty=40.0 performanceLog=null useOriginalQualities=false defaultBaseQualities=-1 validation_strictness=SILENT unsafe=null num_threads=1 interval_merging=ALL read_group_black_list=null processingTracker=null restartProcessingTracker=false processingTrackerStatusFile=null processingTrackerID=-1 allow_intervals_with_unindexed_bam=false disable_experimental_low_memory_sharding=false logging_level=INFO log_to_file=null help=false out=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub NO_HEADER=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub sites_only=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub maxHardy=20.0 maxNoCall=0.05 maxHomVar=1.1"
+##source=PLINK
+#CHROM POS     ID      REF     ALT     QUAL    FILTER  INFO    FORMAT  HG00127 HG00128 HG00136 HG00137 HG00138 HG00139 HG00152 HG00156 HG00234 HG00235 HG00237 HG00242 HG00244 HG00262 HG01055 HG01079 NA19138 NA18974 NA18523 NA12717 NA19209 NA18577 NA18973 NA18943 NA12873 NA18623 NA18622 NA18948 NA19171 NA19204 NA06994 NA18563 NA18547 NA18861 NA18608 NA18995 NA10851 NA18976 NA18603 NA19200 HG01204 HG01191 HG01101 HG00146 HG00306 NA18985 HG00160 HG00635 HG00372 HG00357 HG00634 NA18541 NA18950 NA19759 HG00351 HG00257 HG00118 HG00336 HG00448 HG01354 NA18609 HG00428 HG00326 NA11894 NA18956 HG00173 HG00117 NA11893 HG01251 HG01441 HG01437 HG00182 HG00330 HG01060 HG00329 NA18960 NA18856 NA07346 NA18871 NA19057 NA18868 NA18636 NA12830 NA19007 NA18910 NA18874 NA19056 NA19064 NA19066 NA18487 NA18642 NA19236 NA07056 NA18637 NA19235 NA19309 NA19311 NA19334 NA19346 NA19347 NA19372 NA19376 NA19383 NA19384 NA19394 NA19428 NA19430 NA19451 NA19466 NA19313 NA19321 NA19324 NA19332 NA19390 NA19436 NA19439 NA19440 NA19463 NA19470 NA19471 NA19472 NA19676 NA19660 NA19661 NA19663 NA19722 NA19725 NA19728 NA19729 NA19731 NA19749 NA19755 NA19756 NA19758 NA19770 NA19773 NA19777 NA19780 NA19783 NA20525 NA20589 NA20765 NA20802 NA20804 NA18544 NA18602 NA18546 NA18610 NA18957 NA18615 NA18616 NA19010 NA18638 NA18639 NA18627 NA19072 NA18630 NA19074 NA19080 NA19081 NA19083 NA19085 NA19088 NA20287 NA19835 NA20276 NA19818 NA20278 NA20282 NA20342 NA20296 NA20314 NA20346 NA19712 NA19198 NA19108 NA18934 NA18916 NA18907 NA18917 NA06989 NA12058 NA12341 NA12546 NA12489 HG01197 NA18983 NA11843 NA11892 NA12749 NA12282 NA12751 NA18959 NA19331 NA19453 NA20537 NA12046 NA20515 NA20516 NA20521 NA20524 NA20528 NA20759 NA20768 NA20769 NA20774 NA20775 NA20783 NA20787 NA20790 NA20800 NA20819 NA20812 NA20505 NA20530 NA20540 NA20538 NA20581 NA20815 NA20544 NA20810 NA20807 NA20816 NA20504 NA20753 NA20502 NA12342 NA19150 NA19468 NA20336 NA19395 NA19257 NA19360 NA19700 NA18867 NA20317 NA18968 NA19107 HG00111 HG00108 NA19077 NA19684 NA18511 NA12044 NA19382 NA19457 NA18933 NA18923 NA18965 HG00141 NA20341 NA18740 HG00537 HG00346 HG01173 HG00702 HG00313 HG00150 NA18612 HG00339 NA12273 HG00250 NA18593 NA18621 HG00478 HG00251 HG01070 NA19160 HG00479 HG00608 NA18573 HG00375 NA19248 NA19093 HG01170 HG00534 HG01171 HG01522 NA18624 HG00683 HG01521 NA19005 NA20412 NA18971 HG00446 NA12748 HG00530 HG00690 HG01356 HG01516 NA20532 HG00344 HG00328 NA18542 HG00254 HG00321 HG00577 HG00656 HG00342 HG00524 HG00650 HG00557 HG00319 HG00457 HG00125 HG00578 HG00543 HG00638 HG00171 HG00699 HG00595 HG00187 HG00704 HG00533 HG00596 HG00268 HG01083 HG00651 HG01133 HG00671 HG00327 HG01148 HG00246 HG00672 HG00556 HG00436 HG00554 NA18633 NA20344 NA11993 NA07037 NA11930 HG01366 HG01389 HG00620 NA19740 HG00190 HG00419 NA18535 HG01495 NA18592 HG01497 HG00174 HG01140 NA12287 HG00689 HG01550 HG00334 HG01375 HG00637 NA18507 HG01113 NA18550 NA19129 HG01551 HG01462 HG00331 NA12413 HG01456 HG01360 HG00708 HG01350 HG00684 NA19099 HG00284 NA12399 NA12286 NA12777 HG00277 HG00266 NA19985 HG00353 HG01102 NA07347 NA07051 NA19900 NA18984 NA07048 HG00640 HG01066 NA12812 HG01174 HG01188
+20     676148  .       A       AC      .       PASS    AC=0;AN=758;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.0       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     1342549 .       A       AAGAT   .       PASS    AC=0;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     1366475 .       CT      C       .       PASS    AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     1550416 .       C       CT      .       PASS    AC=0;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     3700705 .       CTTTGGG C       .       PASS    AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     5724449 .       T       TC      .       PASS    AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     7942727 .       A       AC      .       PASS    AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     9231138 .       AT      A       .       PASS    AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     10090376        .       T       TG      .       PASS    AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     12094344        .       TCAGGAGGC       T       .       PASS    AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     12634463        .       TGA     T       .       PASS    AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     12837095        .       G       GA      .       PASS    AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     12928028        .       TG      T       .       PASS    AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     13365589        .       T       TG      .       PASS    AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     13926445        .       TA      T       .       PASS    AC=0;AN=756;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=98.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     14287634        .       AGT     A       .       PASS    AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     14983337        .       AGCC    A       .       PASS    AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     15037520        .       A       AG      .       PASS    AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     15141272        .       T       TC      .       PASS    AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     16192114        .       AT      A       .       PASS    AC=0;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     16259934        .       C       CAA     .       PASS    AC=0;AN=758;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.0       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     17250858        .       T       TC      .       PASS    AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     17753474        .       C       CA      .       PASS    AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     18520672        .       A       ATT     .       PASS    AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     19188693        .       T       TC      .       PASS    AC=0;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     19437778        .       GGCCTGGGATGTAAA G       .       PASS    AC=0;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     20434198        .       TA      T       .       PASS    AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     20990240        .       TC      T       .       PASS    AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     24710482        .       GT      G       .       PASS    AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     25905250        .       GT      G       .       PASS    AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     29589873        .       CCTT    C       .       PASS    AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     29628180        .       C       CCACAAGAAG      .       PASS    AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     29804699        .       A       AC      .       PASS    AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     30567910        .       T       TG      .       PASS    AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     31760870        .       CG      C       .       PASS    AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     32456076        .       GT      G       .       PASS    AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     32968409        .       GTC     G       .       PASS    AC=0;AN=754;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=98.4;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.6       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     34313574        .       A       AT      .       PASS    AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     35329008        .       ATC     A       .       PASS    AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     37954797        .       A       AGT     .       PASS    AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     39607037        .       C       CA      .       PASS    AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     39868369        .       T       TG      .       PASS    AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     40006262        .       TGAG    T       .       PASS    AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     40110981        .       A       AG      .       PASS    AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     40742257        .       TG      T       .       PASS    AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     41964672        .       A       AT      .       PASS    AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     42145613        .       TG      T       .       PASS    AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     42930748        .       A       AG      .       PASS    AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     43606638        .       T       TC      .       PASS    AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     43826992        .       GC      G       .       PASS    AC=0;AN=748;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=97.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=2.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     44470843        .       GAGTGTCGT       G       .       PASS    AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     45300827        .       CT      C       .       PASS    AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     46353646        .       A       AG      .       PASS    AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     47428163        .       C       CA      .       PASS    AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     49451656        .       T       TG      .       PASS    AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     49561273        .       A       AG      .       PASS    AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     49765611        .       A       AC      .       PASS    AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     50772065        .       T       TC      .       PASS    AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     53538294        .       T       TG      .       PASS    AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     54262948        .       A       AC      .       PASS    AC=0;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     55658161        .       GT      G       .       PASS    AC=0;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     59186675        .       TATTA   T       .       PASS    AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     61531765        .       AG      A       .       PASS    AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
diff --git a/tests/tabix_data/vcf/11.vcf b/tests/tabix_data/vcf/11.vcf
new file mode 100644 (file)
index 0000000..fe190df
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,216 @@
+##fileformat=VCFv4.0
+##FILTER=<ID=HardyWeinbergViolation,Description="The validation is in Hardy-Weinberg violation">
+##FILTER=<ID=HighNoCallRate,Description="The validation no-call rate is too high">
+##FILTER=<ID=TooManyHomVars,Description="The validation homozygous variant rate is too high">
+##INFO=<ID=AC,Number=1,Type=Integer,Description="Allele count in genotypes, for each ALT allele, in the same order as listed">
+##INFO=<ID=AN,Number=1,Type=Integer,Description="Total number of alleles in called genotypes">
+##INFO=<ID=HW,Number=1,Type=Float,Description="Phred-scaled Hardy-Weinberg violation p-value">
+##INFO=<ID=HetPct,Number=1,Type=Float,Description="Percent of heterozygous genotypes">
+##INFO=<ID=HomRefPct,Number=1,Type=Float,Description="Percent of homozygous reference genotypes">
+##INFO=<ID=HomVarPct,Number=1,Type=Float,Description="Percent homozygous variant genotypes">
+##INFO=<ID=NoCallPct,Number=1,Type=Float,Description="Percent of no-calls">
+##ValidationMetrics_HardyWeinbergViolations="25 (8%)"
+##ValidationMetrics_HomVarViolations="0 (0%)"
+##ValidationMetrics_NoCallViolations="13 (4%)"
+##ValidationMetrics_PolymorphicPassingRecords="195 (75%)"
+##ValidationMetrics_RecordsPassingFilters="258 (87%)"
+##ValidationMetrics_RecordsProcessed=296
+##ValidationMetrics_SamplesAssayed=383
+##VariantValidationAssessor="analysis_type=VariantValidationAssessor input_file=[] sample_metadata=[] read_buffer_size=null phone_home=STANDARD read_filter=[] intervals=null excludeIntervals=null reference_sequence=/humgen/1kg/reference/human_g1k_v37.fasta rodBind=[rawData/plink.renamed.sorted.fixed.vcf] rodToIntervalTrackName=null BTI_merge_rule=UNION nonDeterministicRandomSeed=false DBSNP=null downsampling_type=null downsample_to_fraction=null downsample_to_coverage=null baq=OFF baqGapOpenPenalty=40.0 performanceLog=null useOriginalQualities=false defaultBaseQualities=-1 validation_strictness=SILENT unsafe=null num_threads=1 interval_merging=ALL read_group_black_list=null processingTracker=null restartProcessingTracker=false processingTrackerStatusFile=null processingTrackerID=-1 allow_intervals_with_unindexed_bam=false disable_experimental_low_memory_sharding=false logging_level=INFO log_to_file=null help=false out=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub NO_HEADER=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub sites_only=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub maxHardy=20.0 maxNoCall=0.05 maxHomVar=1.1"
+##source=PLINK
+#CHROM POS     ID      REF     ALT     QUAL    FILTER  INFO    FORMAT  HG00127 HG00128 HG00136 HG00137 HG00138 HG00139 HG00152 HG00156 HG00234 HG00235 HG00237 HG00242 HG00244 HG00262 HG01055 HG01079 NA19138 NA18974 NA18523 NA12717 NA19209 NA18577 NA18973 NA18943 NA12873 NA18623 NA18622 NA18948 NA19171 NA19204 NA06994 NA18563 NA18547 NA18861 NA18608 NA18995 NA10851 NA18976 NA18603 NA19200 HG01204 HG01191 HG01101 HG00146 HG00306 NA18985 HG00160 HG00635 HG00372 HG00357 HG00634 NA18541 NA18950 NA19759 HG00351 HG00257 HG00118 HG00336 HG00448 HG01354 NA18609 HG00428 HG00326 NA11894 NA18956 HG00173 HG00117 NA11893 HG01251 HG01441 HG01437 HG00182 HG00330 HG01060 HG00329 NA18960 NA18856 NA07346 NA18871 NA19057 NA18868 NA18636 NA12830 NA19007 NA18910 NA18874 NA19056 NA19064 NA19066 NA18487 NA18642 NA19236 NA07056 NA18637 NA19235 NA19309 NA19311 NA19334 NA19346 NA19347 NA19372 NA19376 NA19383 NA19384 NA19394 NA19428 NA19430 NA19451 NA19466 NA19313 NA19321 NA19324 NA19332 NA19390 NA19436 NA19439 NA19440 NA19463 NA19470 NA19471 NA19472 NA19676 NA19660 NA19661 NA19663 NA19722 NA19725 NA19728 NA19729 NA19731 NA19749 NA19755 NA19756 NA19758 NA19770 NA19773 NA19777 NA19780 NA19783 NA20525 NA20589 NA20765 NA20802 NA20804 NA18544 NA18602 NA18546 NA18610 NA18957 NA18615 NA18616 NA19010 NA18638 NA18639 NA18627 NA19072 NA18630 NA19074 NA19080 NA19081 NA19083 NA19085 NA19088 NA20287 NA19835 NA20276 NA19818 NA20278 NA20282 NA20342 NA20296 NA20314 NA20346 NA19712 NA19198 NA19108 NA18934 NA18916 NA18907 NA18917 NA06989 NA12058 NA12341 NA12546 NA12489 HG01197 NA18983 NA11843 NA11892 NA12749 NA12282 NA12751 NA18959 NA19331 NA19453 NA20537 NA12046 NA20515 NA20516 NA20521 NA20524 NA20528 NA20759 NA20768 NA20769 NA20774 NA20775 NA20783 NA20787 NA20790 NA20800 NA20819 NA20812 NA20505 NA20530 NA20540 NA20538 NA20581 NA20815 NA20544 NA20810 NA20807 NA20816 NA20504 NA20753 NA20502 NA12342 NA19150 NA19468 NA20336 NA19395 NA19257 NA19360 NA19700 NA18867 NA20317 NA18968 NA19107 HG00111 HG00108 NA19077 NA19684 NA18511 NA12044 NA19382 NA19457 NA18933 NA18923 NA18965 HG00141 NA20341 NA18740 HG00537 HG00346 HG01173 HG00702 HG00313 HG00150 NA18612 HG00339 NA12273 HG00250 NA18593 NA18621 HG00478 HG00251 HG01070 NA19160 HG00479 HG00608 NA18573 HG00375 NA19248 NA19093 HG01170 HG00534 HG01171 HG01522 NA18624 HG00683 HG01521 NA19005 NA20412 NA18971 HG00446 NA12748 HG00530 HG00690 HG01356 HG01516 NA20532 HG00344 HG00328 NA18542 HG00254 HG00321 HG00577 HG00656 HG00342 HG00524 HG00650 HG00557 HG00319 HG00457 HG00125 HG00578 HG00543 HG00638 HG00171 HG00699 HG00595 HG00187 HG00704 HG00533 HG00596 HG00268 HG01083 HG00651 HG01133 HG00671 HG00327 HG01148 HG00246 HG00672 HG00556 HG00436 HG00554 NA18633 NA20344 NA11993 NA07037 NA11930 HG01366 HG01389 HG00620 NA19740 HG00190 HG00419 NA18535 HG01495 NA18592 HG01497 HG00174 HG01140 NA12287 HG00689 HG01550 HG00334 HG01375 HG00637 NA18507 HG01113 NA18550 NA19129 HG01551 HG01462 HG00331 NA12413 HG01456 HG01360 HG00708 HG01350 HG00684 NA19099 HG00284 NA12399 NA12286 NA12777 HG00277 HG00266 NA19985 HG00353 HG01102 NA07347 NA07051 NA19900 NA18984 NA07048 HG00640 HG01066 NA12812 HG01174 HG01188
+20     669442  .       TG      T       .       PASS    AC=54;AN=766;HW=6.74;HetPct=12.0;HomRefPct=86.9;HomVarPct=1.0;NoCallPct=0.0     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     719486  .       C       CT      .       PASS    AC=1;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     890696  .       C       CAT     .       PASS    AC=6;AN=766;HW=0.00;HetPct=1.6;HomRefPct=98.4;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     1102516 .       CT      C       .       PASS    AC=3;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=98.4;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8       GT      0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     1149576 .       CT      C       .       PASS    AC=2;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     1195706 .       AAG     A       .       PASS    AC=334;AN=764;HW=9.47;HetPct=44.9;HomRefPct=33.7;HomVarPct=21.1;NoCallPct=0.3   GT      0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     .       0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1
+20     1655540 .       AT      A       .       PASS    AC=4;AN=764;HW=0.00;HetPct=1.0;HomRefPct=98.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     2889034 .       AAAAT   A       .       PASS    AC=6;AN=762;HW=0.00;HetPct=1.6;HomRefPct=97.9;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     3203741 .       CT      C       .       PASS    AC=4;AN=762;HW=0.00;HetPct=1.0;HomRefPct=98.4;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     4037626 .       TC      T       .       PASS    AC=194;AN=764;HW=14.70;HetPct=33.4;HomRefPct=57.7;HomVarPct=8.6;NoCallPct=0.3   GT      0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     .       0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0
+20     4210074 .       G       GA      .       PASS    AC=197;AN=762;HW=14.95;HetPct=33.7;HomRefPct=56.9;HomVarPct=8.9;NoCallPct=0.5   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     .       0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     .       0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1
+20     4363519 .       CATT    C       .       PASS    AC=7;AN=764;HW=0.00;HetPct=1.8;HomRefPct=97.9;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     4366806 .       CAAAT   C       .       PASS    AC=2;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     4641550 .       CCTTGA  C       .       PASS    AC=3;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     5105482 .       C       CATTTTAGG       .       PASS    AC=101;AN=762;HW=14.11;HetPct=20.1;HomRefPct=76.2;HomVarPct=3.1;NoCallPct=0.5   GT      0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     5289619 .       GA      G       .       PASS    AC=377;AN=764;HW=5.70;HetPct=53.0;HomRefPct=24.0;HomVarPct=22.7;NoCallPct=0.3   GT      0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     .       0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0
+20     5416109 .       CA      C       .       PASS    AC=2;AN=752;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=97.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.8       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     5432262 .       AGT     A       .       PASS    AC=4;AN=752;HW=0.00;HetPct=1.0;HomRefPct=97.1;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.8       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     6877907 .       CA      C       .       PASS    AC=2;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     6969412 .       CAAAGAAT        C       .       PASS    AC=2;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     7229260 .       T       TA      .       PASS    AC=2;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     7239075 .       AG      A       .       PASS    AC=5;AN=766;HW=0.00;HetPct=1.3;HomRefPct=98.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     7950562 .       C       CT      .       PASS    AC=4;AN=760;HW=18.01;HetPct=0.5;HomRefPct=98.4;HomVarPct=0.3;NoCallPct=0.8      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     8195466 .       C       CT      .       PASS    AC=1;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     8233352 .       TACTC   T       .       PASS    AC=56;AN=764;HW=1.84;HetPct=13.1;HomRefPct=85.9;HomVarPct=0.8;NoCallPct=0.3     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     8504000 .       TAG     T       .       PASS    AC=5;AN=762;HW=0.00;HetPct=1.3;HomRefPct=98.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     9921724 .       AAAGT   A       .       PASS    AC=11;AN=758;HW=0.00;HetPct=2.9;HomRefPct=96.1;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.0      GT      0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     9925738 .       T       TG      .       PASS    AC=1;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     11229169        .       T       TA      .       PASS    AC=3;AN=756;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=97.9;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     11511920        .       AC      A       .       PASS    AC=2;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     11893900        .       ATTAG   A       .       PASS    AC=1;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     12021825        .       A       AG      .       PASS    AC=5;AN=756;HW=0.00;HetPct=1.3;HomRefPct=97.4;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     12063752        .       CTT     C       .       PASS    AC=1;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     12114989        .       CTA     C       .       PASS    AC=4;AN=764;HW=0.00;HetPct=1.0;HomRefPct=98.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     12371546        .       GACA    G       .       PASS    AC=10;AN=762;HW=0.00;HetPct=2.6;HomRefPct=96.9;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     12512723        .       G       GTT     .       PASS    AC=6;AN=762;HW=0.00;HetPct=1.6;HomRefPct=97.9;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     12692743        .       TTATC   T       .       PASS    AC=8;AN=762;HW=0.00;HetPct=2.1;HomRefPct=97.4;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     13003323        .       GGGA    G       .       PASS    AC=3;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=98.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     13128894        .       CT      C       .       PASS    AC=10;AN=764;HW=0.00;HetPct=2.6;HomRefPct=97.1;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     13287841        .       CAT     C       .       PASS    AC=134;AN=760;HW=0.21;HetPct=29.2;HomRefPct=67.1;HomVarPct=2.9;NoCallPct=0.8    GT      0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     .       0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0
+20     13566260        .       AAATTG  A       .       PASS    AC=374;AN=764;HW=3.95;HetPct=47.5;HomRefPct=27.2;HomVarPct=25.1;NoCallPct=0.3   GT      1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     .       0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1
+20     13685184        .       AT      A       .       PASS    AC=2;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     13716193        .       GAGAA   G       .       PASS    AC=2;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     13960028        .       TC      T       .       PASS    AC=188;AN=750;HW=2.44;HetPct=35.5;HomRefPct=55.6;HomVarPct=6.8;NoCallPct=2.1    GT      0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     .       0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     .       0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     .       0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     .       .       0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     .       0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0
+20     14159734        .       T       TA      .       PASS    AC=1;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     14383135        .       TA      T       .       PASS    AC=1;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     14669226        .       G       GA      .       PASS    AC=121;AN=766;HW=1.68;HetPct=25.8;HomRefPct=71.3;HomVarPct=2.9;NoCallPct=0.0    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1
+20     14697473        .       TTC     T       .       PASS    AC=9;AN=764;HW=10.31;HetPct=1.8;HomRefPct=97.7;HomVarPct=0.3;NoCallPct=0.3      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     15189597        .       GA      G       .       PASS    AC=311;AN=760;HW=2.80;HetPct=46.2;HomRefPct=35.5;HomVarPct=17.5;NoCallPct=0.8   GT      1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     .       0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     .       0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     .       1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1
+20     15265098        .       TG      T       .       PASS    AC=125;AN=766;HW=6.76;HetPct=25.3;HomRefPct=71.0;HomVarPct=3.7;NoCallPct=0.0    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1
+20     15410763        .       TGA     T       .       PASS    AC=29;AN=764;HW=0.00;HetPct=7.6;HomRefPct=92.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     15543319        .       AG      A       .       PASS    AC=7;AN=764;HW=0.00;HetPct=1.8;HomRefPct=97.9;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     15550845        .       TG      T       .       PASS    AC=34;AN=756;HW=0.00;HetPct=8.4;HomRefPct=90.1;HomVarPct=0.3;NoCallPct=1.3      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     15703503        .       TG      T       .       PASS    AC=87;AN=750;HW=3.63;HetPct=19.1;HomRefPct=77.0;HomVarPct=1.8;NoCallPct=2.1     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     .       0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     .       0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/1     0/0     0/1     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     .       0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     15871330        .       AG      A       .       PASS    AC=1;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     16016504        .       TA      T       .       PASS    AC=186;AN=764;HW=15.27;HetPct=32.4;HomRefPct=59.3;HomVarPct=8.1;NoCallPct=0.3   GT      0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1
+20     16312599        .       CTA     C       .       PASS    AC=2;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     16723642        .       GGTT    G       .       PASS    AC=6;AN=760;HW=0.00;HetPct=1.6;HomRefPct=97.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     16747221        .       CA      C       .       PASS    AC=291;AN=764;HW=3.13;HetPct=45.2;HomRefPct=39.2;HomVarPct=15.4;NoCallPct=0.3   GT      0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     .       0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1
+20     16813850        .       C       CA      .       PASS    AC=7;AN=758;HW=0.00;HetPct=1.8;HomRefPct=97.1;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.0       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     17331332        .       TA      T       .       PASS    AC=80;AN=762;HW=15.60;HetPct=16.2;HomRefPct=80.9;HomVarPct=2.3;NoCallPct=0.5    GT      0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/1     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     17473782        .       TGC     T       .       PASS    AC=1;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     17607627        .       A       AGT     .       PASS    AC=3;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     18417481        .       AC      A       .       PASS    AC=17;AN=766;HW=0.00;HetPct=4.4;HomRefPct=95.6;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     18445795        .       AAG     A       .       PASS    AC=5;AN=760;HW=0.00;HetPct=1.3;HomRefPct=97.9;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     18522725        .       ATTAAC  A       .       PASS    AC=1;AN=758;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=98.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.0       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     18915562        .       TAA     T       .       PASS    AC=3;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=98.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     19111235        .       C       CT      .       PASS    AC=4;AN=764;HW=0.00;HetPct=1.0;HomRefPct=98.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     19805154        .       CCTT    C       .       PASS    AC=3;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     20030869        .       CT      C       .       PASS    AC=362;AN=766;HW=6.74;HetPct=46.5;HomRefPct=29.5;HomVarPct=24.0;NoCallPct=0.0   GT      0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1
+20     20286529        .       A       AC      .       PASS    AC=1;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     20404656        .       ATTACAGACT      A       .       PASS    AC=7;AN=766;HW=0.00;HetPct=1.8;HomRefPct=98.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     20716329        .       CA      C       .       PASS    AC=4;AN=760;HW=0.00;HetPct=1.0;HomRefPct=98.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     20760474        .       TG      T       .       PASS    AC=15;AN=764;HW=5.83;HetPct=3.4;HomRefPct=96.1;HomVarPct=0.3;NoCallPct=0.3      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     20952825        .       T       TC      .       PASS    AC=1;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     21406859        .       ACTT    A       .       PASS    AC=1;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     21480245        .       AG      A       .       PASS    AC=1;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     21852048        .       CA      C       .       PASS    AC=330;AN=762;HW=4.15;HetPct=46.5;HomRefPct=33.2;HomVarPct=19.8;NoCallPct=0.5   GT      0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     .       0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     .       0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0
+20     21968507        .       AC      A       .       PASS    AC=7;AN=762;HW=12.61;HetPct=1.3;HomRefPct=97.9;HomVarPct=0.3;NoCallPct=0.5      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     22434333        .       C       CA      .       PASS    AC=8;AN=766;HW=0.00;HetPct=2.1;HomRefPct=97.9;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     22637424        .       C       CAGCCA  .       PASS    AC=3;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=98.4;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     22655862        .       TATC    T       .       PASS    AC=6;AN=766;HW=0.00;HetPct=1.6;HomRefPct=98.4;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     23200197        .       ATT     A       .       PASS    AC=1;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     23293728        .       CA      C       .       PASS    AC=8;AN=754;HW=11.33;HetPct=1.6;HomRefPct=96.6;HomVarPct=0.3;NoCallPct=1.6      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     23813095        .       CT      C       .       PASS    AC=26;AN=762;HW=1.46;HetPct=6.3;HomRefPct=93.0;HomVarPct=0.3;NoCallPct=0.5      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     23815381        .       CT      C       .       PASS    AC=1;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     23889003        .       GA      G       .       PASS    AC=2;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     24855121        .       CT      C       .       PASS    AC=6;AN=760;HW=0.00;HetPct=1.6;HomRefPct=97.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     25503211        .       CATA    C       .       PASS    AC=1;AN=758;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=98.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.0       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     29913425        .       TATATC  T       .       PASS    AC=15;AN=762;HW=5.82;HetPct=3.4;HomRefPct=95.8;HomVarPct=0.3;NoCallPct=0.5      GT      0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     30390854        .       TTATACTA        T       .       PASS    AC=3;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     30534847        .       ACAAT   A       .       PASS    AC=2;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     31412616        .       CT      C       .       PASS    AC=1;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     32015223        .       CT      C       .       PASS    AC=5;AN=764;HW=0.00;HetPct=1.3;HomRefPct=98.4;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     32158330        .       CAG     C       .       PASS    AC=4;AN=760;HW=0.00;HetPct=1.0;HomRefPct=98.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     32509752        .       A       AG      .       PASS    AC=1;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     32700247        .       GGCGTCTGA       G       .       PASS    AC=3;AN=754;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=97.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.6       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     33541746        .       A       AAG     .       PASS    AC=4;AN=766;HW=0.00;HetPct=1.0;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     34251969        .       C       CA      .       PASS    AC=3;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=98.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     34633573        .       TAA     T       .       PASS    AC=1;AN=754;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=98.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.6       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     34831930        .       CT      C       .       PASS    AC=7;AN=766;HW=0.00;HetPct=1.8;HomRefPct=98.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     35357903        .       GA      G       .       PASS    AC=5;AN=764;HW=0.00;HetPct=1.3;HomRefPct=98.4;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     35847597        .       CTT     C       .       PASS    AC=1;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     36658020        .       TG      T       .       PASS    AC=6;AN=764;HW=0.00;HetPct=1.6;HomRefPct=98.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     36704724        .       TC      T       .       PASS    AC=8;AN=756;HW=0.00;HetPct=2.1;HomRefPct=96.6;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     36711544        .       TAAAG   T       .       PASS    AC=1;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     36947086        .       ATAC    A       .       PASS    AC=33;AN=766;HW=0.12;HetPct=8.6;HomRefPct=91.4;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     37139725        .       CAG     C       .       PASS    AC=5;AN=760;HW=15.80;HetPct=0.8;HomRefPct=98.2;HomVarPct=0.3;NoCallPct=0.8      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     37278654        .       CAG     C       .       PASS    AC=7;AN=764;HW=0.00;HetPct=1.8;HomRefPct=97.9;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     37391272        .       TG      T       .       PASS    AC=4;AN=764;HW=0.00;HetPct=1.0;HomRefPct=98.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     37608002        .       CAT     C       .       PASS    AC=7;AN=762;HW=0.00;HetPct=1.8;HomRefPct=97.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     37678954        .       C       CTGG    .       PASS    AC=7;AN=762;HW=0.00;HetPct=1.8;HomRefPct=97.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     37712193        .       AAG     A       .       PASS    AC=29;AN=762;HW=0.00;HetPct=7.6;HomRefPct=91.9;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     37836124        .       AAAT    A       .       PASS    AC=3;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=98.4;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     37962643        .       T       TAA     .       PASS    AC=178;AN=764;HW=12.74;HetPct=31.9;HomRefPct=60.6;HomVarPct=7.3;NoCallPct=0.3   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     .       0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1
+20     38336199        .       TA      T       .       PASS    AC=1;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     38495835        .       T       TA      .       PASS    AC=14;AN=762;HW=0.00;HetPct=3.7;HomRefPct=95.8;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     38696054        .       GAAGA   G       .       PASS    AC=3;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     38784318        .       CCTT    C       .       PASS    AC=7;AN=762;HW=0.00;HetPct=1.8;HomRefPct=97.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     39042026        .       T       TG      .       PASS    AC=1;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     39420665        .       AG      A       .       PASS    AC=72;AN=760;HW=3.25;HetPct=16.2;HomRefPct=81.7;HomVarPct=1.3;NoCallPct=0.8     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0
+20     40445967        .       TG      T       .       PASS    AC=3;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=98.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     41000677        .       T       TG      .       PASS    AC=3;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     41149621        .       T       TATCA   .       PASS    AC=3;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=98.4;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     41364251        .       A       AAG     .       PASS    AC=1;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     41543685        .       CTAAGGAGGGAAAAAGATATAAT C       .       PASS    AC=12;AN=764;HW=0.00;HetPct=3.1;HomRefPct=96.6;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     41851636        .       TA      T       .       PASS    AC=83;AN=764;HW=18.52;HetPct=16.4;HomRefPct=80.7;HomVarPct=2.6;NoCallPct=0.3    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0
+20     42159695        .       GC      G       .       PASS    AC=87;AN=762;HW=7.05;HetPct=18.5;HomRefPct=78.9;HomVarPct=2.1;NoCallPct=0.5     GT      0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     .       0/0     .       0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1
+20     42261635        .       C       CATTT   .       PASS    AC=24;AN=764;HW=2.06;HetPct=5.7;HomRefPct=93.7;HomVarPct=0.3;NoCallPct=0.3      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     42470352        .       CACTT   C       .       PASS    AC=19;AN=764;HW=3.87;HetPct=4.4;HomRefPct=95.0;HomVarPct=0.3;NoCallPct=0.3      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     42585924        .       T       TA      .       PASS    AC=1;AN=754;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=98.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.6       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     42856201        .       CT      C       .       PASS    AC=3;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     42909154        .       T       TGGGTC  .       PASS    AC=3;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     42918721        .       AG      A       .       PASS    AC=1;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     43245783        .       AG      A       .       PASS    AC=8;AN=766;HW=11.40;HetPct=1.6;HomRefPct=98.2;HomVarPct=0.3;NoCallPct=0.0      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     43371647        .       GGGCTGTAA       G       .       PASS    AC=80;AN=760;HW=6.79;HetPct=17.2;HomRefPct=80.2;HomVarPct=1.8;NoCallPct=0.8     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0
+20     43434234        .       AG      A       .       PASS    AC=4;AN=766;HW=0.00;HetPct=1.0;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     43539258        .       T       TAG     .       PASS    AC=1;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     43993933        .       CA      C       .       PASS    AC=199;AN=764;HW=8.74;HetPct=35.2;HomRefPct=56.1;HomVarPct=8.4;NoCallPct=0.3    GT      0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1
+20     44071585        .       C       CT      .       PASS    AC=132;AN=764;HW=8.50;HetPct=26.1;HomRefPct=69.5;HomVarPct=4.2;NoCallPct=0.3    GT      0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1
+20     44220528        .       T       TC      .       PASS    AC=59;AN=766;HW=1.90;HetPct=14.9;HomRefPct=84.9;HomVarPct=0.3;NoCallPct=0.0     GT      0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0
+20     44340276        .       AACAG   A       .       PASS    AC=37;AN=758;HW=17.93;HetPct=7.6;HomRefPct=90.3;HomVarPct=1.0;NoCallPct=1.0     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     .       0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     44464600        .       T       TA      .       PASS    AC=19;AN=762;HW=3.86;HetPct=4.4;HomRefPct=94.8;HomVarPct=0.3;NoCallPct=0.5      GT      0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     44572563        .       GA      G       .       PASS    AC=1;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     44889286        .       G       GC      .       PASS    AC=13;AN=766;HW=0.00;HetPct=3.4;HomRefPct=96.6;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0
+20     45092013        .       GT      G       .       PASS    AC=4;AN=760;HW=0.00;HetPct=1.0;HomRefPct=98.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     45406096        .       T       TTC     .       PASS    AC=4;AN=760;HW=0.00;HetPct=1.0;HomRefPct=98.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     45668403        .       CTG     C       .       PASS    AC=86;AN=762;HW=16.06;HetPct=17.2;HomRefPct=79.6;HomVarPct=2.6;NoCallPct=0.5    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0
+20     46051811        .       T       TAAGC   .       PASS    AC=2;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     46413551        .       TC      T       .       PASS    AC=2;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=98.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     46569465        .       CTG     C       .       PASS    AC=10;AN=762;HW=0.00;HetPct=2.6;HomRefPct=96.9;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     46720983        .       ATACTTGG        A       .       PASS    AC=3;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     47032179        .       GC      G       .       PASS    AC=2;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=98.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     47136092        .       A       AGTC    .       PASS    AC=1;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     47335386        .       GC      G       .       PASS    AC=2;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     47988904        .       CA      C       .       PASS    AC=187;AN=760;HW=17.08;HetPct=32.1;HomRefPct=58.7;HomVarPct=8.4;NoCallPct=0.8   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     .       0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0
+20     48262933        .       CCTA    C       .       PASS    AC=7;AN=766;HW=0.00;HetPct=1.8;HomRefPct=98.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     49438742        .       G       GT      .       PASS    AC=8;AN=762;HW=11.37;HetPct=1.6;HomRefPct=97.7;HomVarPct=0.3;NoCallPct=0.5      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     49537420        .       AG      A       .       PASS    AC=3;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=98.4;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     50136971        .       TTTTC   T       .       PASS    AC=8;AN=764;HW=0.00;HetPct=2.1;HomRefPct=97.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     50373155        .       A       AT      .       PASS    AC=7;AN=762;HW=0.00;HetPct=1.8;HomRefPct=97.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     50806976        .       G       GAA     .       PASS    AC=128;AN=760;HW=0.17;HetPct=28.2;HomRefPct=68.4;HomVarPct=2.6;NoCallPct=0.8    GT      0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0
+20     50961401        .       G       GT      .       PASS    AC=4;AN=762;HW=0.00;HetPct=1.0;HomRefPct=98.4;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     51547787        .       AC      A       .       PASS    AC=1;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     51838824        .       GA      G       .       PASS    AC=4;AN=756;HW=17.99;HetPct=0.5;HomRefPct=97.9;HomVarPct=0.3;NoCallPct=1.3      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     51961394        .       ATTTG   A       .       PASS    AC=8;AN=760;HW=0.00;HetPct=2.1;HomRefPct=97.1;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8       GT      0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     53081927        .       CATGA   C       .       PASS    AC=5;AN=764;HW=0.00;HetPct=1.3;HomRefPct=98.4;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     53602394        .       T       TA      .       PASS    AC=7;AN=764;HW=0.00;HetPct=1.8;HomRefPct=97.9;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     54124185        .       T       TC      .       PASS    AC=2;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     54150907        .       CAG     C       .       PASS    AC=3;AN=754;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=97.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.6       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     54166824        .       AC      A       .       PASS    AC=2;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     54230743        .       CAT     C       .       PASS    AC=2;AN=758;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=98.4;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.0       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     54309727        .       TGAGC   T       .       PASS    AC=7;AN=762;HW=12.61;HetPct=1.3;HomRefPct=97.9;HomVarPct=0.3;NoCallPct=0.5      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     54379666        .       GT      G       .       PASS    AC=172;AN=766;HW=14.43;HetPct=30.8;HomRefPct=62.1;HomVarPct=7.0;NoCallPct=0.0   GT      0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0
+20     55264363        .       AG      A       .       PASS    AC=232;AN=762;HW=15.89;HetPct=37.1;HomRefPct=50.7;HomVarPct=11.7;NoCallPct=0.5  GT      0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1
+20     55608811        .       CT      C       .       PASS    AC=35;AN=762;HW=19.90;HetPct=7.0;HomRefPct=91.4;HomVarPct=1.0;NoCallPct=0.5     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     55611547        .       CAA     C       .       PASS    AC=1;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     55989765        .       CA      C       .       PASS    AC=208;AN=764;HW=5.71;HetPct=37.1;HomRefPct=54.0;HomVarPct=8.6;NoCallPct=0.3    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0
+20     56249865        .       T       TGAGG   .       PASS    AC=4;AN=756;HW=0.00;HetPct=1.0;HomRefPct=97.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     56344957        .       GT      G       .       PASS    AC=1;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     56419021        .       T       TG      .       PASS    AC=2;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     56915853        .       TG      T       .       PASS    AC=17;AN=764;HW=4.78;HetPct=3.9;HomRefPct=95.6;HomVarPct=0.3;NoCallPct=0.3      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     57676578        .       CCTTT   C       .       PASS    AC=7;AN=764;HW=0.00;HetPct=1.8;HomRefPct=97.9;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     58288793        .       TC      T       .       PASS    AC=44;AN=766;HW=12.53;HetPct=9.4;HomRefPct=89.6;HomVarPct=1.0;NoCallPct=0.0     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     59153061        .       CTG     C       .       PASS    AC=1;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     59349754        .       CCT     C       .       PASS    AC=168;AN=762;HW=8.71;HetPct=31.3;HomRefPct=61.9;HomVarPct=6.3;NoCallPct=0.5    GT      0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     .       0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     59365768        .       TG      T       .       PASS    AC=2;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     59769242        .       C       CT      .       PASS    AC=4;AN=762;HW=0.00;HetPct=1.0;HomRefPct=98.4;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     60337932        .       AC      A       .       PASS    AC=3;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     60925525        .       GC      G       .       PASS    AC=2;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     61000018        .       GC      G       .       PASS    AC=203;AN=762;HW=0.38;HetPct=39.4;HomRefPct=53.3;HomVarPct=6.8;NoCallPct=0.5    GT      0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     .       0/1     .       0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0
+20     61983510        .       TCTGC   T       .       PASS    AC=75;AN=766;HW=0.03;HetPct=18.0;HomRefPct=81.2;HomVarPct=0.8;NoCallPct=0.0     GT      0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     62154368        .       G       GA      .       PASS    AC=2;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=98.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     62310426        .       CTT     C       .       PASS    AC=1;AN=756;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=98.4;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     62871860        .       C       CCCGCA  .       PASS    AC=27;AN=764;HW=17.87;HetPct=5.5;HomRefPct=93.5;HomVarPct=0.8;NoCallPct=0.3     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
diff --git a/tests/tabix_data/vcf/12.vcf b/tests/tabix_data/vcf/12.vcf
new file mode 100644 (file)
index 0000000..e0d112c
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,1000 @@
+##fileformat=VCFv4.0
+#CHROM POS     ID      REF     ALT     QUAL    FILTER  INFO    FORMAT  DNA_pool_A
+chr1   1281168 .       A       G       14      .       DP=37;AF1=0.6243;CI95=0.5,1;DP4=4,0,6,0;MQ=15;PV4=1,0.027,1,1   PL:GT:GQ        43,0,4:0/1:6
+chr1   1281205 .       T       C       26      .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=41 PL:GT:GQ        58,9,0:1/1:63
+chr1   1281206 .       G       C       25      .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=41 PL:GT:GQ        57,9,0:1/1:63
+chr1   1922737 .       G       C       13.2    .       DP=21;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,21;MQ=22 PL:GT:GQ        46,63,0:1/1:99
+chr1   21197513        .       A       G       55.1    .       DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=41   PL:GT:GQ        88,21,0:1/1:84
+chr1   21343209        .       T       C       5.45    .       DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,17,0;MQ=14 PL:GT:GQ        37,51,0:1/1:99
+chr1   22097362        .       T       C       4.75    .       DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=30        PL:GT:GQ        35,9,0:1/1:63
+chr1   22254012        .       A       G       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=50 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr1   22650927        .       G       A       48.1    .       DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=24  PL:GT:GQ        81,21,0:1/1:84
+chr1   23535401        .       C       T       40.4    .       DP=25;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,16,0,5;MQ=19;PV4=1,0.2,1,1 PL:GT:GQ        73,13,0:1/1:65
+chr1   23543855        .       T       C       49.1    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=44 PL:GT:GQ        82,18,0:1/1:90
+chr1   24245107        .       C       G       32      .       DP=4;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,2;MQ=36;PV4=1,1,1,1      PL:GT:GQ        62,0,35:0/1:38
+chr1   24274412        .       G       C       39.5    .       DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=32 PL:GT:GQ        72,12,0:1/1:72
+chr1   36529832        .       C       T       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=46 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr1   37788090        .       A       G       89.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=49 PL:GT:GQ        122,12,0:1/1:72
+chr1   43120440        .       C       T       34      .       DP=3;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,2;MQ=49;PV4=1,1,1,1      PL:GT:GQ        64,0,31:0/1:34
+chr1   43980466        .       C       T       43      .       DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,15;MQ=19 PL:GT:GQ        76,45,0:1/1:99
+chr1   46047795        .       T       C       29.1    .       DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=31 PL:GT:GQ        62,18,0:1/1:90
+chr1   48860309        .       C       T       99      .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=46 PL:GT:GQ        141,18,0:1/1:90
+chr1   49415599        .       T       C       4.61    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=34 PL:GT:GQ        34,6,0:1/1:49
+chr1   51601816        .       G       T       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=50 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr1   51955459        .       G       C       89.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=49 PL:GT:GQ        122,12,0:1/1:72
+chr1   68479569        .       T       G       12      .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:GT:GQ        43,6,0:1/1:49
+chr1   69032455        .       A       G       15.1    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=29 PL:GT:GQ        47,9,0:1/1:63
+chr1   71888225        .       G       T       9.31    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=43 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr1   72381528        .       T       C       44      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=41 PL:GT:GQ        76,9,0:1/1:63
+chr1   82004013        .       A       G       37.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=50 PL:GT:GQ        70,12,0:1/1:72
+chr1   86289622        .       C       T       18      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=42 PL:GT:GQ        50,9,0:1/1:63
+chr1   90267663        .       A       G       22      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=45 PL:GT:GQ        54,9,0:1/1:63
+chr1   92699542        .       A       G       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=45 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr1   94867317        .       G       A       26.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=45 PL:GT:GQ        58,6,0:1/1:49
+chr1   96428713        .       C       G       3.98    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=27 PL:GT:GQ        33,6,0:1/1:49
+chr1   100466329       .       G       C       4.85    .       DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,6;MQ=22  PL:GT:GQ        36,18,0:1/1:90
+chr1   101909281       .       G       A       70      .       DP=11;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,5,0;MQ=46;PV4=1,1,0.096,1    PL:GT:GQ        100,0,88:0/1:91
+chr1   106216572       .       T       A       22      .       DP=18;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,16,0;MQ=21 PL:GT:GQ        55,48,0:1/1:99
+chr1   107901770       .       T       C       9.31    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr1   108431179       .       A       G       99      .       DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=41   PL:GT:GQ        155,24,0:1/1:96
+chr1   112005344       .       C       T       99      .       DP=52;AF1=1;CI95=1,1;DP4=7,0,27,0;MQ=44;PV4=1,1,1,1     PL:GT:GQ        196,25,0:1/1:99
+chr1   116625452       .       C       T       36      .       DP=44;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,23,0,20;MQ=49;PV4=1,2.3e-69,0.42,1     PL:GT:GQ        66,0,179:0/1:69
+chr1   118060710       .       G       T       6.98    .       DP=8;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,3,0;MQ=47;PV4=1,0.0071,1,1 PL:GT:GQ        36,0,73:0/1:39
+chr1   118198177       .       A       G       15.9    .       DP=23;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=43        PL:GT:GQ        47,6,0:1/1:49
+chr1   118586346       .       T       C       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr1   120809555       .       G       A       20      .       DP=8;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=6,0,2,0;MQ=46;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ        50,0,106:0/1:53
+chr1   130723110       .       C       A       20.7    .       DP=8;AF1=0.5939;CI95=0.5,1;DP4=0,6,0,2;MQ=26;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        50,0,5:0/1:7
+chr1   133979895       .       T       C       14.9    .       DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=43 PL:GT:GQ        46,6,0:1/1:49
+chr1   134977940       .       C       T       30      .       DP=3;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,2;MQ=38;PV4=1,1,0.26,1   PL:GT:GQ        60,0,31:0/1:34
+chr1   141768589       .       G       A       18.1    .       DP=15;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,4,0;MQ=51;PV4=1,2.7e-05,1,1  PL:GT:GQ        48,0,100:0/1:51
+chr1   141768590       .       G       A       22      .       DP=15;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,4,0;MQ=50;PV4=1,0.0033,1,1   PL:GT:GQ        52,0,40:0/1:43
+chr1   146506051       .       T       C       44      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=43 PL:GT:GQ        76,9,0:1/1:63
+chr1   150997009       .       G       A       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr1   162915612       .       G       C       13.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr1   168455400       .       A       G       4.12    .       DP=28;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,27;MQ=10 PL:GT:GQ        35,81,0:1/1:99
+chr1   172784744       .       T       C       17.8    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=48 PL:GT:GQ        49,6,0:1/1:49
+chr1   183627307       .       G       A       13.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr1   185789457       .       T       C       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=50 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr1   187081827       .       T       C       4.77    .       DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=17 PL:GT:GQ        36,30,0:1/1:99
+chr1   188468339       .       C       T       33      .       DP=25;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,13;MQ=24 PL:GT:GQ        66,39,0:1/1:99
+chr1   188595435       .       C       T       41.8    .       DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr1   188670561       .       G       C       3.55    .       DP=22;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,9;MQ=18  PL:GT:GQ        34,27,0:1/1:99
+chr1   188924877       .       G       A       6.2     .       DP=10;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=2,0,3,0;MQ=21;PV4=1,1,1,0.3     PL:GT:GQ        35,3,0:1/1:41
+chr1   190536295       .       G       A       68      .       DP=38;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,36,0;MQ=18 PL:GT:GQ        101,108,0:1/1:99
+chr1   191129408       .       T       A       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=48 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr1   195937816       .       T       C       13      .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35 PL:GT:GQ        44,6,0:1/1:49
+chr1   198857619       .       T       C       89      .       DP=61;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,38,0,17;MQ=30;PV4=1,0.032,1,1  PL:GT:GQ        119,0,139:0/1:99
+chr1   199057483       .       T       C       13      .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=32 PL:GT:GQ        44,6,0:1/1:49
+chr1   200133619       .       G       C       5.83    .       DP=49;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=2,0,8,0;MQ=17;PV4=1,0.059,1,0.2      PL:GT:GQ        37,12,0:1/1:72
+chr1   200729661       .       A       T       36      .       DP=15;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,14,0;MQ=27 PL:GT:GQ        69,42,0:1/1:99
+chr1   201374519       .       T       C       69.5    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=39 PL:GT:GQ        102,12,0:1/1:72
+chr1   202811668       .       G       A       20.2    .       DP=4;AF1=0.5163;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,3;MQ=24;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        50,0,12:0/1:15
+chr1   202960650       .       C       T       16.6    .       DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=27 PL:GT:GQ        49,12,0:1/1:72
+chr1   205686638       .       C       T       11.3    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=42 PL:GT:GQ        43,9,0:1/1:63
+chr1   205949857       .       A       G       3.14    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=21 PL:GT:GQ        33,15,0:1/1:75
+chr1   209806643       .       A       G       13.2    .       DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=21   PL:GT:GQ        46,24,0:1/1:96
+chr1   209871501       .       C       T       25      .       DP=12;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=5,0,4,0;MQ=41;PV4=1,7.7e-06,1,1  PL:GT:GQ        55,0,84:0/1:58
+chr1   211051323       .       G       A       99      .       DP=14;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=49  PL:GT:GQ        176,24,0:1/1:96
+chr1   211389716       .       C       T       12      .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=32 PL:GT:GQ        43,6,0:1/1:49
+chr1   211868415       .       G       A       3.54    .       DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,11;MQ=14 PL:GT:GQ        34,33,0:1/1:99
+chr1   211914531       .       C       T       84.5    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,4;MQ=46;PV4=1,1,1,1     PL:GT:GQ        116,7,0:1/1:57
+chr1   214691313       .       A       G       22      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=49 PL:GT:GQ        54,9,0:1/1:63
+chr1   215184650       .       C       T       40.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=46 PL:GT:GQ        72,6,0:1/1:49
+chr1   215995258       .       A       G       68      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=50 PL:GT:GQ        100,9,0:1/1:63
+chr1   217031394       .       G       C       13.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr1   217986960       .       T       C       44      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=36 PL:GT:GQ        76,9,0:1/1:63
+chr1   218086681       .       A       G       99      .       DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,9;MQ=34  PL:GT:GQ        142,27,0:1/1:99
+chr1   218546019       .       A       G       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=50 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr1   218632417       .       G       T       17.1    .       DP=19;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=26  PL:GT:GQ        50,21,0:1/1:84
+chr1   218833355       .       C       G       23      .       DP=7;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=5,0,2,0;MQ=39;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ        53,0,63:0/1:56
+chr1   219303186       .       T       C       7.79    .       DP=25;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,25;MQ=12 PL:GT:GQ        40,75,0:1/1:99
+chr1   219517634       .       G       A       26.5    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=42 PL:GT:GQ        59,12,0:1/1:72
+chr1   219590158       .       T       C       3.27    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=25 PL:GT:GQ        33,12,0:1/1:72
+chr1   219709853       .       A       T       99      .       DP=124;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=80,0,41,0;MQ=44;PV4=1,0.26,1,1  PL:GT:GQ        143,0,156:0/1:99
+chr1   222457988       .       A       G       11.1    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=23 PL:GT:GQ        42,6,0:1/1:49
+chr1   222477914       .       A       G       11.3    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=39 PL:GT:GQ        43,9,0:1/1:63
+chr1   223010233       .       A       G       18.6    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=25 PL:GT:GQ        51,12,0:1/1:72
+chr1   223796360       .       G       A       6.79    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=21 PL:GT:GQ        37,6,0:1/1:49
+chr1   224273784       .       A       T       14.2    .       DP=18;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=15 PL:GT:GQ        47,30,0:1/1:99
+chr1   224454685       .       C       T       46.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=32 PL:GT:GQ        79,15,0:1/1:75
+chr1   224514706       .       G       C       21      .       DP=38;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,38,0;MQ=19 PL:GT:GQ        54,114,0:1/1:99
+chr1   224515793       .       C       T       99      .       DP=26;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,26,0;MQ=45 PL:GT:GQ        211,78,0:1/1:99
+chr1   224692969       .       C       A       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=36 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr1   225607249       .       A       G       34      .       DP=3;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,2,0;MQ=45;PV4=1,1,0,1      PL:GT:GQ        64,0,31:0/1:34
+chr1   226923918       .       C       A       29.1    .       DP=52;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,10;MQ=27;PV4=1,1,1,1   PL:GT:GQ        62,18,0:1/1:90
+chr1   227125189       .       T       C       56.5    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=41 PL:GT:GQ        89,12,0:1/1:72
+chr1   227133712       .       A       T       20.1    .       DP=26;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=11,0,10,0;MQ=23;PV4=1,1,0.48,1   PL:GT:GQ        50,0,39:0/1:42
+chr1   227943954       .       G       C       47      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=37 PL:GT:GQ        79,9,0:1/1:63
+chr1   227943974       .       G       A       33.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=34 PL:GT:GQ        66,12,0:1/1:72
+chr1   228067480       .       A       G       42.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=45 PL:GT:GQ        75,15,0:1/1:75
+chr1   228067510       .       A       G       99      .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=45 PL:GT:GQ        140,15,0:1/1:75
+chr1   228088778       .       C       T       6.79    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=23 PL:GT:GQ        37,6,0:1/1:49
+chr1   228117888       .       A       C       13.9    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=40 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr1   228139641       .       T       C       44.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=35 PL:GT:GQ        77,12,0:1/1:72
+chr1   228577146       .       T       C       26      .       DP=41;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,25,0,14;MQ=22;PV4=1,1,1,0.027  PL:GT:GQ        56,0,77:0/1:59
+chr1   229001369       .       C       A       45      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=41 PL:GT:GQ        77,9,0:1/1:63
+chr1   229001386       .       C       T       8.44    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=42 PL:GT:GQ        39,6,0:1/1:49
+chr1   229348080       .       T       C       18.1    .       DP=3;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,2;MQ=40;PV4=1,0.33,0.17,0.33     PL:GT:GQ        48,0,31:0/1:34
+chr1   229439710       .       C       T       33.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=32 PL:GT:GQ        66,12,0:1/1:72
+chr1   229655149       .       T       C       30      .       DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=30   PL:GT:GQ        63,24,0:1/1:96
+chr1   229660873       .       C       G       81      .       DP=28;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,20,0,7;MQ=36;PV4=1,1,1,1       PL:GT:GQ        111,0,120:0/1:99
+chr2a  3661005 .       C       G       24      .       DP=13;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=7,0,4,0;MQ=27;PV4=1,1.1e-05,1,1       PL:GT:GQ        54,0,34:0/1:37
+chr2a  4140063 .       G       A       81      .       DP=26;AF1=0.6671;CI95=0.5,1;DP4=18,0,8,0;MQ=24;PV4=1,8.3e-09,1,1        PL:GT:GQ        110,0,3:0/1:5
+chr2a  4248440 .       T       C       20      .       DP=28;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=11,0,7,0;MQ=25;PV4=1,1,0.47,1    PL:GT:GQ        50,0,92:0/1:53
+chr2a  4707656 .       A       G       63      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=49 PL:GT:GQ        95,9,0:1/1:63
+chr2a  5194801 .       G       A       7.59    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=24 PL:GT:GQ        38,6,0:1/1:49
+chr2a  14111103        .       A       G       7.84    .       DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=20   PL:GT:GQ        40,21,0:1/1:84
+chr2a  17799746        .       A       G       11.3    .       DP=5;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=0,3,0,2;MQ=32;PV4=1,1,1,1      PL:GT:GQ        41,0,35:0/1:37
+chr2a  24728910        .       G       A       45.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=28 PL:GT:GQ        78,15,0:1/1:75
+chr2a  29627939        .       G       T       5.44    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=27 PL:GT:GQ        36,9,0:1/1:63
+chr2a  31373164        .       C       T       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=44 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr2a  33935228        .       T       C       41.8    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=51 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr2a  36311856        .       G       A       99      .       DP=30;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,29;MQ=44 PL:GT:GQ        213,87,0:1/1:99
+chr2a  39281204        .       T       C       68      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=49 PL:GT:GQ        100,9,0:1/1:63
+chr2a  41087565        .       C       T       74.5    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=38 PL:GT:GQ        107,12,0:1/1:72
+chr2a  45574768        .       C       A       11.3    .       DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=18 PL:GT:GQ        43,9,0:1/1:63
+chr2a  55464464        .       T       C       26.1    .       DP=7;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=5,0,2,0;MQ=26;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        55,1,0:1/1:23
+chr2a  63107673        .       T       A       70.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=34 PL:GT:GQ        103,12,0:1/1:72
+chr2a  63141732        .       A       T       22.8    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=42 PL:GT:GQ        54,6,0:1/1:49
+chr2a  63141910        .       G       A       3.41    .       DP=16;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=32        PL:GT:GQ        32,6,0:1/1:49
+chr2a  63141911        .       C       T       9.55    .       DP=16;AF1=0.5031;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,3;MQ=33;PV4=1,0.43,1,1  PL:GT:GQ        39,0,19:0/1:22
+chr2a  63143543        .       C       T       28      .       DP=18;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,0,17;MQ=16;PV4=1,1,1,1     PL:GT:GQ        61,42,0:1/1:99
+chr2a  66419805        .       G       A       3.69    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=23 PL:GT:GQ        34,15,0:1/1:75
+chr2a  66563922        .       C       T       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=51 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr2a  67719136        .       C       T       39.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=50 PL:GT:GQ        71,6,0:1/1:49
+chr2a  72781453        .       A       C       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=50 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr2a  76733211        .       G       A       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr2a  78190502        .       A       C       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr2a  85021209        .       A       G       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr2a  88554861        .       A       T       39      .       DP=74;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,7,0,4;MQ=46;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        69,0,92:0/1:72
+chr2a  88554877        .       A       G       92      .       DP=90;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,23,0,13;MQ=41;PV4=1,0.3,1,1    PL:GT:GQ        122,0,128:0/1:99
+chr2a  88824857        .       G       A       13.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=37 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr2a  93546675        .       C       T       26      .       DP=6;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,2,0;MQ=46;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ        56,0,87:0/1:59
+chr2a  94788853        .       A       G       34.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=43 PL:GT:GQ        67,15,0:1/1:75
+chr2a  96738146        .       T       C       11.3    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=40 PL:GT:GQ        43,9,0:1/1:63
+chr2a  102737384       .       A       G       12.3    .       DP=18;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,18,0;MQ=11 PL:GT:GQ        45,54,0:1/1:99
+chr2a  103407172       .       A       G       35      .       DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=19   PL:GT:GQ        68,24,0:1/1:96
+chr2a  105774580       .       T       G       99      .       DP=13;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,13,0;MQ=30 PL:GT:GQ        135,39,0:1/1:99
+chr2a  106376301       .       C       G       24.1    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=19 PL:GT:GQ        57,18,0:1/1:90
+chr2a  106376315       .       C       T       8.75    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=19 PL:GT:GQ        41,18,0:1/1:90
+chr2a  112422267       .       C       T       30      .       DP=20;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=14,0,5,0;MQ=39;PV4=1,1,1,1       PL:GT:GQ        60,0,131:0/1:63
+chr2b  3049384 .       A       C       14.9    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=42 PL:GT:GQ        46,6,0:1/1:49
+chr2b  3049385 .       G       C       14.9    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=42 PL:GT:GQ        46,6,0:1/1:49
+chr2b  3049406 .       C       G       99      .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=36 PL:GT:GQ        135,18,0:1/1:90
+chr2b  4213802 .       T       C       89.5    .       DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=49        PL:GT:GQ        122,12,0:1/1:72
+chr2b  5022895 .       G       A       66      .       DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,10;MQ=49 PL:GT:GQ        99,30,0:1/1:99
+chr2b  6037666 .       G       T       56      .       DP=18;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,13;MQ=17 PL:GT:GQ        89,39,0:1/1:99
+chr2b  13656952        .       G       A       19.2    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=21 PL:GT:GQ        52,18,0:1/1:90
+chr2b  15026944        .       A       G       6.79    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=32 PL:GT:GQ        37,6,0:1/1:49
+chr2b  23362613        .       A       G       5.64    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=22 PL:GT:GQ        37,15,0:1/1:75
+chr2b  45947861        .       C       G       68      .       DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,11;MQ=50 PL:GT:GQ        101,33,0:1/1:99
+chr2b  46597824        .       T       C       65.6    .       DP=39;AF1=0.5939;CI95=0.5,1;DP4=23,0,10,0;MQ=22;PV4=1,0.014,1,1 PL:GT:GQ        95,0,5:0/1:7
+chr2b  49665191        .       G       T       34.1    .       DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=37   PL:GT:GQ        67,21,0:1/1:84
+chr2b  61001546        .       A       G       48      .       DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=26   PL:GT:GQ        81,24,0:1/1:96
+chr2b  88502851        .       T       C       4.77    .       DP=4;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,2;MQ=37;PV4=1,1,0.46,1      PL:GT:GQ        33,0,34:0/1:33
+chr2b  91675431        .       C       T       30      .       DP=14;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=27  PL:GT:GQ        63,24,0:1/1:96
+chr2b  91870148        .       T       G       67      .       DP=14;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,0,13;MQ=47;PV4=1,1,1,1     PL:GT:GQ        100,31,0:1/1:99
+chr2b  97066826        .       G       A       20.1    .       DP=9;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=0,6,0,2;MQ=31;PV4=1,1,1,1      PL:GT:GQ        50,0,35:0/1:38
+chr2b  97670822        .       G       A       4.85    .       DP=6;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,6;MQ=18   PL:GT:GQ        36,18,0:1/1:90
+chr2b  102773175       .       A       G       17.1    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=38 PL:GT:GQ        49,9,0:1/1:63
+chr2b  109805532       .       T       C       99      .       DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=45   PL:GT:GQ        176,24,0:1/1:96
+chr2b  110841448       .       A       G       11.1    .       DP=20;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=44        PL:GT:GQ        42,6,0:1/1:49
+chr2b  123217025       .       T       C       31.5    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=37 PL:GT:GQ        64,12,0:1/1:72
+chr2b  123263214       .       A       G       11.3    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=35 PL:GT:GQ        43,9,0:1/1:63
+chr2b  127747292       .       C       T       68      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=52 PL:GT:GQ        100,9,0:1/1:63
+chr2b  130121958       .       A       G       89.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=43 PL:GT:GQ        122,15,0:1/1:75
+chr2b  130253633       .       A       G       14.9    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=42 PL:GT:GQ        46,6,0:1/1:49
+chr2b  130692761       .       C       T       49.1    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=51 PL:GT:GQ        82,18,0:1/1:90
+chr2b  130743365       .       A       G       99      .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=42 PL:GT:GQ        140,15,0:1/1:75
+chr2b  131553874       .       A       C       11.3    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=37 PL:GT:GQ        43,9,0:1/1:63
+chr2b  131716894       .       A       G       99      .       DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=40   PL:GT:GQ        137,24,0:1/1:96
+chr2b  131716936       .       G       A       99      .       DP=14;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,12;MQ=36 PL:GT:GQ        173,36,0:1/1:99
+chr2b  131716952       .       A       G       99      .       DP=22;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,7,0,14;MQ=36;PV4=1,1,1,1       PL:GT:GQ        152,0,43:0/1:46
+chr2b  133360184       .       C       T       99      .       DP=20;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,20;MQ=32 PL:GT:GQ        163,60,0:1/1:99
+chr2b  133644741       .       T       A       16.4    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=27 PL:GT:GQ        49,15,0:1/1:75
+chr2b  133720595       .       T       C       41      .       DP=15;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,12;MQ=29 PL:GT:GQ        74,36,0:1/1:99
+chr2b  133727192       .       C       T       19.3    .       DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=23 PL:GT:GQ        52,15,0:1/1:75
+chr2b  133727260       .       G       A       3.56    .       DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=18   PL:GT:GQ        34,24,0:1/1:95
+chr2b  133800294       .       A       G       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=23 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr2b  134582754       .       A       C       56.1    .       DP=37;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=36  PL:GT:GQ        89,21,0:1/1:84
+chr2b  134582763       .       G       C       78      .       DP=37;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,36;MQ=34 PL:GT:GQ        111,108,0:1/1:99
+chr2b  134809668       .       G       A       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr3   527814  .       C       G       46      .       DP=9;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=6,0,3,0;MQ=43;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ        76,0,106:0/1:79
+chr3   559510  .       G       A       38      .       DP=27;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=10,0,17,0;MQ=28;PV4=1,1,0.014,1  PL:GT:GQ        68,0,111:0/1:71
+chr3   879433  .       T       G       32      .       DP=4;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,2,0;MQ=43;PV4=1,1,1,1      PL:GT:GQ        62,0,34:0/1:37
+chr3   1809645 .       A       G       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=51 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr3   3235812 .       C       T       7.59    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=45 PL:GT:GQ        38,6,0:1/1:49
+chr3   3250176 .       A       G       83      .       DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=32   PL:GT:GQ        116,24,0:1/1:96
+chr3   5049073 .       T       A       99      .       DP=25;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=16,0,9,0;MQ=39;PV4=1,1,1,1       PL:GT:GQ        136,0,129:0/1:99
+chr3   5142874 .       G       A       99      .       DP=38;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,38,0;MQ=28 PL:GT:GQ        179,114,0:1/1:99
+chr3   5554864 .       T       C       3.54    .       DP=7;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=0,4,0,3;MQ=27;PV4=1,1,1,1      PL:GT:GQ        31,0,35:0/1:33
+chr3   5749648 .       G       A       21.2    .       DP=26;AF1=0.7303;CI95=0.5,1;DP4=0,7,0,7;MQ=26;PV4=1,0.16,1,0.17 PL:GT:GQ        50,0,2:0/1:3
+chr3   16451708        .       A       T       71.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=38 PL:GT:GQ        104,15,0:1/1:75
+chr3   23410276        .       G       A       99      .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=45 PL:GT:GQ        140,15,0:1/1:75
+chr3   51368824        .       A       G       28      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=48 PL:GT:GQ        60,9,0:1/1:63
+chr3   53000453        .       A       G       54      .       DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,10;MQ=19 PL:GT:GQ        87,30,0:1/1:99
+chr3   53000463        .       A       G       54      .       DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,10;MQ=19 PL:GT:GQ        87,30,0:1/1:99
+chr3   59077423        .       C       T       77.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=33 PL:GT:GQ        110,15,0:1/1:75
+chr3   60040501        .       T       C       11.3    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=35 PL:GT:GQ        43,9,0:1/1:63
+chr3   64203481        .       A       G       33.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=49 PL:GT:GQ        66,12,0:1/1:72
+chr3   67947441        .       C       T       17.6    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=25 PL:GT:GQ        50,12,0:1/1:72
+chr3   76372631        .       A       G       44      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=36 PL:GT:GQ        76,9,0:1/1:63
+chr3   80611316        .       C       G       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr3   81554381        .       G       T       17.6    .       DP=24;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=26        PL:GT:GQ        50,12,0:1/1:72
+chr3   87614647        .       A       G       13.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=34 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr3   93900455        .       A       T       11.6    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=13 PL:GT:GQ        44,15,0:1/1:75
+chr3   96174457        .       A       G       4.11    .       DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=24 PL:GT:GQ        34,9,0:1/1:63
+chr3   96215569        .       A       C       3.41    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=32 PL:GT:GQ        32,6,0:1/1:49
+chr3   96587998        .       A       C       7.08    .       DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,6,0;MQ=17   PL:GT:GQ        39,18,0:1/1:90
+chr3   99711220        .       A       C       12.8    .       DP=11;AF1=0.9998;CI95=0.5,1;DP4=1,0,2,0;MQ=35;PV4=1,1,1,1       PL:GT:GQ        42,2,0:1/1:37
+chr3   99789741        .       C       G       99      .       DP=18;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,17,0;MQ=47 PL:GT:GQ        210,51,0:1/1:99
+chr3   103667651       .       A       C       3.98    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=37 PL:GT:GQ        33,6,0:1/1:49
+chr3   104604896       .       G       C       55      .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=50 PL:GT:GQ        87,9,0:1/1:63
+chr3   104997217       .       G       A       33.1    .       DP=18;AF1=1;CI95=1,1;DP4=1,0,16,0;MQ=34;PV4=1,3e-10,0.17,0.36   PL:GT:GQ        66,19,0:1/1:76
+chr3   106097816       .       A       G       28      .       DP=15;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,15;MQ=26 PL:GT:GQ        61,45,0:1/1:99
+chr3   106822259       .       G       C       99      .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=50 PL:GT:GQ        140,15,0:1/1:75
+chr3   109946413       .       G       A       13      .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=34 PL:GT:GQ        44,6,0:1/1:49
+chr3   121238963       .       T       C       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=51 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr3   126248567       .       A       G       13.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=33 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr3   129733836       .       A       G       6.2     .       DP=4;AF1=0.5003;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,3,0;MQ=43;PV4=1,0.02,0.31,1        PL:GT:GQ        35,0,28:0/1:30
+chr3   131372785       .       C       T       44      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=34 PL:GT:GQ        76,9,0:1/1:63
+chr3   132290987       .       C       T       22      .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=45 PL:GT:GQ        54,9,0:1/1:63
+chr3   136054421       .       C       T       73      .       DP=82;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,78,0;MQ=28 PL:GT:GQ        106,235,0:1/1:99
+chr3   141075246       .       G       A       30.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=41 PL:GT:GQ        62,6,0:1/1:49
+chr3   141075262       .       T       G       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=41 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr3   141430649       .       G       T       81.8    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,4;MQ=41;PV4=1,0.34,1,0.25       PL:GT:GQ        113,6,0:1/1:49
+chr3   143617747       .       G       T       22      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=29 PL:GT:GQ        54,9,0:1/1:63
+chr3   163576128       .       C       T       5.6     .       DP=4;AF1=0.7302;CI95=0.5,1;DP4=2,0,2,0;MQ=23;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        33,0,2:0/1:3
+chr3   163839828       .       A       G       4.45    .       DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=26 PL:GT:GQ        35,12,0:1/1:72
+chr3   175839340       .       G       T       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=51 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr3   190193258       .       G       T       3.98    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35 PL:GT:GQ        33,6,0:1/1:49
+chr3   190777007       .       G       A       13      .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ        44,6,0:1/1:49
+chr3   190970350       .       A       G       61      .       DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=37 PL:GT:GQ        94,30,0:1/1:99
+chr3   198686408       .       G       A       36.6    .       DP=17;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,16;MQ=25;PV4=1,1,0.026,1       PL:GT:GQ        69,11,0:1/1:66
+chr3   199277478       .       T       C       3.61    .       DP=6;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,6;MQ=21   PL:GT:GQ        34,18,0:1/1:90
+chr3   199780181       .       G       T       77      .       DP=45;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,35,0,10;MQ=33;PV4=1,1,1,1      PL:GT:GQ        107,0,114:0/1:99
+chr3   199889335       .       A       C       9.54    .       DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=18  PL:GT:GQ        42,24,0:1/1:96
+chr3   200018161       .       A       G       13.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=31 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr4   195475  .       A       G       13      .       DP=13;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47        PL:GT:GQ        44,6,0:1/1:49
+chr4   639141  .       C       A       14.9    .       DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=42        PL:GT:GQ        46,6,0:1/1:49
+chr4   639152  .       C       T       15.2    .       DP=17;AF1=0.5016;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,2;MQ=33;PV4=1,1,1,1     PL:GT:GQ        45,0,22:0/1:25
+chr4   986497  .       G       T       99      .       DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=33 PL:GT:GQ        163,30,0:1/1:99
+chr4   986516  .       C       T       55.1    .       DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=37   PL:GT:GQ        88,21,0:1/1:84
+chr4   1207485 .       A       C       14.9    .       DP=22;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=45        PL:GT:GQ        46,6,0:1/1:49
+chr4   1323502 .       G       A       13.2    .       DP=13;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,11,0;MQ=22 PL:GT:GQ        46,33,0:1/1:99
+chr4   1613521 .       G       A       89      .       DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,16,0;MQ=32 PL:GT:GQ        122,48,0:1/1:99
+chr4   1748790 .       C       T       38      .       DP=21;AF1=0.5005;CI95=0.5,0.5;DP4=6,0,8,0;MQ=40;PV4=1,0.09,1,1  PL:GT:GQ        68,0,27:0/1:30
+chr4   2255732 .       T       C       99      .       DP=29;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,28,0;MQ=31 PL:GT:GQ        186,84,0:1/1:99
+chr4   3010159 .       C       T       13.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=31 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr4   3545023 .       A       G       99      .       DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,9;MQ=38   PL:GT:GQ        145,27,0:1/1:99
+chr4   3586344 .       C       T       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=44 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr4   3879337 .       A       G       16.6    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=25 PL:GT:GQ        49,12,0:1/1:72
+chr4   3940733 .       A       G       47.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=31 PL:GT:GQ        80,15,0:1/1:75
+chr4   4410338 .       T       C       13.5    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=31 PL:GT:GQ        46,15,0:1/1:75
+chr4   4796408 .       T       C       41      .       DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,16;MQ=17 PL:GT:GQ        74,48,0:1/1:99
+chr4   4796414 .       A       G       11.3    .       DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,15;MQ=17 PL:GT:GQ        44,45,0:1/1:99
+chr4   6436959 .       T       C       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=50 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr4   9494256 .       T       C       3.41    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=37 PL:GT:GQ        32,6,0:1/1:49
+chr4   24881479        .       G       A       14.1    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=42 PL:GT:GQ        46,9,0:1/1:63
+chr4   26128644        .       A       G       23      .       DP=18;AF1=0.5006;CI95=0.5,0.5;DP4=8,0,10,0;MQ=22;PV4=1,1,1,1    PL:GT:GQ        53,0,26:0/1:29
+chr4   42109100        .       G       A       17.1    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=48 PL:GT:GQ        49,9,0:1/1:63
+chr4   42309652        .       C       T       68      .       DP=17;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=50        PL:GT:GQ        100,9,0:1/1:63
+chr4   46913966        .       C       T       9.08    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=16 PL:GT:GQ        41,12,0:1/1:72
+chr4   50335142        .       A       G       44      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=41 PL:GT:GQ        76,9,0:1/1:63
+chr4   51658550        .       C       A       13      .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=48 PL:GT:GQ        44,6,0:1/1:49
+chr4   58258023        .       T       C       26      .       DP=5;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=0,3,0,2;MQ=34;PV4=1,1,1,0.05   PL:GT:GQ        56,0,32:0/1:35
+chr4   59219112        .       C       A       42.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=50 PL:GT:GQ        75,12,0:1/1:72
+chr4   62746067        .       C       T       13.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr4   67404338        .       G       T       33.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=39 PL:GT:GQ        66,12,0:1/1:72
+chr4   73353380        .       A       G       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr4   73946294        .       G       C       4.77    .       DP=51;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=0,5,0,3;MQ=40;PV4=1,0.19,0.37,0.11    PL:GT:GQ        33,0,64:0/1:36
+chr4   79607484        .       A       G       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr4   82337365        .       G       C       90      .       DP=54;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,16;MQ=28 PL:GT:GQ        123,48,0:1/1:99
+chr4   82653801        .       A       G       4.11    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=29 PL:GT:GQ        34,9,0:1/1:63
+chr4   87130164        .       C       T       11.3    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=26 PL:GT:GQ        43,9,0:1/1:63
+chr4   87130176        .       G       A       11.3    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=26 PL:GT:GQ        43,9,0:1/1:63
+chr4   91459729        .       C       A       13      .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ        44,6,0:1/1:49
+chr4   96130778        .       G       C       99      .       DP=19;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,19;MQ=45 PL:GT:GQ        211,57,0:1/1:99
+chr4   100709417       .       A       G       45.1    .       DP=16;AF1=0.505;CI95=0.5,0.5;DP4=12,0,4,0;MQ=24;PV4=1,1,1,1     PL:GT:GQ        75,0,17:0/1:20
+chr4   107276770       .       C       T       70      .       DP=15;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,9,0,6;MQ=31;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        100,0,97:0/1:98
+chr4   115327550       .       G       C       42      .       DP=67;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,0,66;MQ=35;PV4=1,3.2e-24,0.13,1    PL:GT:GQ        75,162,0:1/1:99
+chr4   136558502       .       A       G       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr4   159572459       .       G       A       15.1    .       DP=126;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,69,0,57;MQ=39;PV4=1,4.1e-96,0.077,1   PL:GT:GQ        45,0,175:0/1:48
+chr4   174968484       .       G       C       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=42 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr4   175030633       .       T       C       14.3    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=29 PL:GT:GQ        47,18,0:1/1:90
+chr4   183410027       .       G       T       6.2     .       DP=31;AF1=0.5003;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,2,0;MQ=45;PV4=1,0.035,1,0.21      PL:GT:GQ        35,0,28:0/1:30
+chr4   190907368       .       T       C       33.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=50 PL:GT:GQ        66,12,0:1/1:72
+chr4   192175690       .       A       G       76.8    .       DP=7;AF1=0.95;CI95=0.5,1;DP4=0,3,0,4;MQ=35;PV4=1,1,1,1  PL:GT:GQ        105,0,0:1/1:10
+chr4   192673268       .       G       A       14.2    .       DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,9,0;MQ=22   PL:GT:GQ        47,27,0:1/1:99
+chr4   192943966       .       T       C       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=44 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr4   195460104       .       C       G       23.1    .       DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=19   PL:GT:GQ        56,24,0:1/1:96
+chr4   198277830       .       A       G       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr5   170098  .       A       G       13      .       DP=12;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=30        PL:GT:GQ        44,6,0:1/1:49
+chr5   395814  .       T       C       4.77    .       DP=4;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,2;MQ=36;PV4=1,1,0.48,1      PL:GT:GQ        33,0,33:0/1:33
+chr5   414024  .       T       A       10.4    .       DP=17;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=20        PL:GT:GQ        42,9,0:1/1:63
+chr5   496767  .       T       C       13.9    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=36 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr5   805676  .       C       G       45      .       DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,17,0;MQ=32 PL:GT:GQ        78,51,0:1/1:99
+chr5   1252896 .       A       G       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr5   1418370 .       G       A       3.65    .       DP=8;AF1=0.7301;CI95=0.5,1;DP4=4,0,4,0;MQ=13;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        30,0,2:0/1:3
+chr5   1494911 .       G       C       62      .       DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=46   PL:GT:GQ        95,24,0:1/1:96
+chr5   1494932 .       C       T       6.98    .       DP=8;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,2,0;MQ=46;PV4=1,0.1,0.077,1        PL:GT:GQ        36,0,31:0/1:33
+chr5   1506037 .       T       C       24.1    .       DP=24;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=11,0,13,0;MQ=16;PV4=1,1,1,1  PL:GT:GQ        55,5,0:1/1:46
+chr5   1509406 .       A       G       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=47 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr5   1733649 .       A       G       99      .       DP=25;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,25;MQ=47 PL:GT:GQ        212,75,0:1/1:99
+chr5   1747304 .       A       G       12.3    .       DP=12;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,12;MQ=19 PL:GT:GQ        45,36,0:1/1:99
+chr5   1747308 .       C       A       44      .       DP=12;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,12;MQ=19 PL:GT:GQ        77,36,0:1/1:99
+chr5   3519783 .       C       T       21.1    .       DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=18   PL:GT:GQ        54,24,0:1/1:96
+chr5   4101593 .       A       G       69.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=43 PL:GT:GQ        102,12,0:1/1:72
+chr5   7204332 .       T       A       4.61    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=24 PL:GT:GQ        34,6,0:1/1:49
+chr5   11510398        .       A       C       34      .       DP=3;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,2,0;MQ=51;PV4=1,1,0,1      PL:GT:GQ        64,0,31:0/1:34
+chr5   15406720        .       T       C       6.02    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=51 PL:GT:GQ        36,6,0:1/1:49
+chr5   25152417        .       C       A       10.9    .       DP=28;AF1=0.5718;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,6;MQ=25;PV4=1,1,0.21,1    PL:GT:GQ        40,0,6:0/1:8
+chr5   39072637        .       A       G       35.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=50 PL:GT:GQ        68,15,0:1/1:75
+chr5   46022699        .       G       A       44      .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=35 PL:GT:GQ        76,9,0:1/1:63
+chr5   55664181        .       C       G       10.4    .       DP=8;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=3,0,5,0;MQ=18;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        40,3,0:1/1:41
+chr5   56253386        .       T       C       50.1    .       DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=36   PL:GT:GQ        83,21,0:1/1:84
+chr5   56253447        .       C       T       42.5    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=45 PL:GT:GQ        75,12,0:1/1:72
+chr5   71950166        .       G       T       11.3    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=40 PL:GT:GQ        43,9,0:1/1:63
+chr5   72703090        .       C       T       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=46 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr5   73570280        .       G       T       5.45    .       DP=41;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,41,0;MQ=15 PL:GT:GQ        37,123,0:1/1:99
+chr5   73701762        .       G       T       40.8    .       DP=13;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=43        PL:GT:GQ        72,6,0:1/1:49
+chr5   76956867        .       T       C       10.2    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=46 PL:GT:GQ        41,6,0:1/1:49
+chr5   79097961        .       C       G       22      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=40 PL:GT:GQ        54,9,0:1/1:63
+chr5   87026167        .       T       C       22      .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=49 PL:GT:GQ        54,9,0:1/1:63
+chr5   97680525        .       T       C       3.27    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=23 PL:GT:GQ        33,12,0:1/1:72
+chr5   100674737       .       C       T       13.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr5   105389966       .       T       C       3.52    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=15 PL:GT:GQ        33,9,0:1/1:63
+chr5   109998341       .       A       C       12.7    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=35 PL:GT:GQ        45,12,0:1/1:72
+chr5   120629105       .       C       T       6.79    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:GT:GQ        37,6,0:1/1:49
+chr5   128383954       .       C       T       23      .       DP=10;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,5,0,5;MQ=48;PV4=1,3.3e-07,1,1  PL:GT:GQ        53,0,98:0/1:56
+chr5   133925142       .       A       G       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr5   135375404       .       T       C       11.8    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=1,0,3,0;MQ=31;PV4=1,0.03,1,1  PL:GT:GQ        42,4,0:1/1:45
+chr5   136498281       .       T       G       13.9    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=37 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr5   136717285       .       A       G       82.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=48 PL:GT:GQ        115,12,0:1/1:72
+chr5   136910734       .       G       A       62      .       DP=19;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,0,13;MQ=23;PV4=1,1,1,1     PL:GT:GQ        95,31,0:1/1:99
+chr5   141208149       .       C       G       13      .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ        44,6,0:1/1:49
+chr5   148056348       .       C       A       37.1    .       DP=4;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=1,0,2,0;MQ=38;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        66,1,0:1/1:23
+chr5   151941534       .       G       T       46.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=34 PL:GT:GQ        79,12,0:1/1:72
+chr5   159967229       .       G       C       22.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=35 PL:GT:GQ        55,12,0:1/1:72
+chr5   174024541       .       T       G       29.5    .       DP=3;AF1=0.9998;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,2;MQ=32;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        59,2,0:1/1:37
+chr5   175525290       .       A       G       3.27    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=20 PL:GT:GQ        33,12,0:1/1:72
+chr5   175988954       .       A       C       14.2    .       DP=23;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,6,0,4;MQ=47;PV4=1,1,0.2,1      PL:GT:GQ        44,0,76:0/1:47
+chr5   176782226       .       T       C       9.31    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=43 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr5   179132834       .       C       G       99      .       DP=28;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,28;MQ=41 PL:GT:GQ        207,84,0:1/1:99
+chr5   180155809       .       G       C       3.01    .       DP=36;AF1=0.4997;CI95=0.5,0.5;DP4=25,0,9,0;MQ=35;PV4=1,1e-15,1,1        PL:GT:GQ        30,0,121:0/1:33
+chr5   181282819       .       T       G       38.3    .       DP=11;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,9;MQ=23;PV4=1,1,1,1    PL:GT:GQ        71,14,0:1/1:70
+chr5   182426125       .       G       C       29      .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=26 PL:GT:GQ        61,9,0:1/1:63
+chr5   182443682       .       G       A       3.69    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=21 PL:GT:GQ        34,15,0:1/1:75
+chr5   183008993       .       C       T       22      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=49 PL:GT:GQ        54,9,0:1/1:63
+chr5   183312016       .       G       T       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=47 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr6_cox_hap1  519146  .       G       A       17.1    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=30 PL:GT:GQ        49,9,0:1/1:63
+chr6_cox_hap1  687497  .       A       G       33      .       DP=6;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=2,0,4,0;MQ=35;PV4=1,0.0016,1,1   PL:GT:GQ        63,3,0:1/1:41
+chr6_qbl_hap2  120066  .       T       C       99      .       DP=12;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,9;MQ=37  PL:GT:GQ        139,27,0:1/1:99
+chr6   277954  .       C       T       53      .       DP=41;AF1=1;CI95=1,1;DP4=4,0,37,0;MQ=19;PV4=1,1,0.3,1   PL:GT:GQ        86,49,0:1/1:99
+chr6   593158  .       A       G       4.61    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=32 PL:GT:GQ        34,6,0:1/1:49
+chr6   2865562 .       T       G       25      .       DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,9,0;MQ=23   PL:GT:GQ        58,27,0:1/1:99
+chr6   3751403 .       G       A       42.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=32 PL:GT:GQ        75,15,0:1/1:75
+chr6   3884989 .       A       G       13.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=36 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr6   4127278 .       A       T       13.9    .       DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr6   5887783 .       C       G       99      .       DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=34   PL:GT:GQ        142,21,0:1/1:84
+chr6   5887811 .       C       T       55.1    .       DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=34   PL:GT:GQ        88,21,0:1/1:84
+chr6   6937170 .       G       C       99      .       DP=47;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,47;MQ=28 PL:GT:GQ        157,141,0:1/1:99
+chr6   7262317 .       C       T       13.2    .       DP=50;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=21,0,9,0;MQ=36;PV4=1,4e-05,0.17,0.26     PL:GT:GQ        43,0,158:0/1:46
+chr6   7533214 .       A       G       10.4    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=26 PL:GT:GQ        42,9,0:1/1:63
+chr6   20979907        .       A       G       44      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=38 PL:GT:GQ        76,9,0:1/1:63
+chr6   22321632        .       A       G       41      .       DP=5;AF1=0.5004;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,3,0;MQ=46;PV4=1,0.24,0.19,0.33     PL:GT:GQ        71,0,28:0/1:31
+chr6   25352296        .       G       A       7.8     .       DP=4;AF1=0.5003;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,3;MQ=38;PV4=1,1,0.16,1   PL:GT:GQ        37,0,28:0/1:30
+chr6   26298040        .       T       A       34      .       DP=3;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,2;MQ=48;PV4=1,1,0.21,0.33        PL:GT:GQ        64,0,31:0/1:34
+chr6   33428755        .       G       A       70      .       DP=14;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,9,0;MQ=32  PL:GT:GQ        103,27,0:1/1:99
+chr6   39512099        .       G       A       55.1    .       DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=50   PL:GT:GQ        88,21,0:1/1:84
+chr6   39961094        .       G       A       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr6   40452120        .       A       G       40.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=42 PL:GT:GQ        72,6,0:1/1:49
+chr6   43204766        .       A       G       99      .       DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=51   PL:GT:GQ        176,24,0:1/1:96
+chr6   52696512        .       C       T       70      .       DP=76;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,34,0,42;MQ=18;PV4=1,0.11,1,1   PL:GT:GQ        100,0,51:0/1:54
+chr6   53785550        .       A       G       99      .       DP=20;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,10;MQ=46 PL:GT:GQ        190,30,0:1/1:99
+chr6   53897484        .       C       T       13.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=36 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr6   57038290        .       C       T       10.2    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=36 PL:GT:GQ        41,6,0:1/1:49
+chr6   62925087        .       G       C       35      .       DP=5;AF1=0.5008;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,4,0;MQ=36;PV4=1,1,0.2,1    PL:GT:GQ        65,0,25:0/1:28
+chr6   62925094        .       T       C       25.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=36 PL:GT:GQ        58,15,0:1/1:75
+chr6   70834405        .       G       A       72.1    .       DP=13;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=29  PL:GT:GQ        105,21,0:1/1:84
+chr6   71026058        .       C       T       48.1    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=42 PL:GT:GQ        81,18,0:1/1:90
+chr6   74420752        .       T       C       44      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=39 PL:GT:GQ        76,9,0:1/1:63
+chr6   77498624        .       T       C       16.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=33 PL:GT:GQ        48,6,0:1/1:49
+chr6   80416836        .       T       C       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=50 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr6   113611590       .       A       G       68      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=46 PL:GT:GQ        100,9,0:1/1:63
+chr6   119308431       .       T       C       38.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=40 PL:GT:GQ        71,12,0:1/1:72
+chr6   151758592       .       T       C       3.07    .       DP=17;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=0,8,0,9;MQ=13;PV4=1,1,1,1       PL:GT:GQ        29,1,0:1/1:23
+chr6   151759358       .       A       G       99      .       DP=27;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=12,0,15,0;MQ=44;PV4=1,1,1,0.19   PL:GT:GQ        171,0,128:0/1:99
+chr6   154741755       .       G       A       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=50 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr6   161061053       .       C       A       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=52 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr6   161474189       .       C       T       6.02    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ        36,6,0:1/1:49
+chr6   164304657       .       C       T       10.4    .       DP=63;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,29,0,19;MQ=22;PV4=1,7.7e-11,1,0.049    PL:GT:GQ        40,0,37:0/1:38
+chr6   164703105       .       T       C       99      .       DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,10;MQ=40 PL:GT:GQ        165,30,0:1/1:99
+chr6   167518328       .       A       G       78      .       DP=41;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=27,0,14,0;MQ=33;PV4=1,0.026,0.43,0.056   PL:GT:GQ        108,0,149:0/1:99
+chr6   169906323       .       G       A       41.8    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr6   171893912       .       G       A       69.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=33 PL:GT:GQ        102,15,0:1/1:75
+chr6   173631604       .       A       G       6.98    .       DP=7;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,3,0;MQ=37;PV4=1,0.069,1,1     PL:GT:GQ        36,0,34:0/1:35
+chr7   835856  .       C       T       27.5    .       DP=13;AF1=0.9998;CI95=0.5,1;DP4=4,0,6,0;MQ=23;PV4=1,0.46,1,1    PL:GT:GQ        57,2,0:1/1:37
+chr7   1046005 .       C       T       11.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=36 PL:GT:GQ        43,9,0:1/1:63
+chr7   1564339 .       C       T       71      .       DP=66;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=36,0,24,0;MQ=29;PV4=1,1,0.35,1   PL:GT:GQ        101,0,134:0/1:99
+chr7   1806266 .       C       T       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr7   1936013 .       G       T       7.77    .       DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=17 PL:GT:GQ        39,9,0:1/1:63
+chr7   2319532 .       C       A       4.11    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=14 PL:GT:GQ        34,9,0:1/1:63
+chr7   2682121 .       C       T       13      .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=33 PL:GT:GQ        44,6,0:1/1:49
+chr7   3248116 .       T       C       36.5    .       DP=3;AF1=0.9998;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,2;MQ=37;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        66,2,0:1/1:37
+chr7   3624766 .       C       T       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=41 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr7   5291140 .       G       C       13.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=37 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr7   5314457 .       C       A       3.56    .       DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=18   PL:GT:GQ        34,24,0:1/1:95
+chr7   5595072 .       T       A       79      .       DP=13;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=8,0,5,0;MQ=31;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        109,0,57:0/1:60
+chr7   5646060 .       G       C       7.79    .       DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=10 PL:GT:GQ        40,30,0:1/1:99
+chr7   6056816 .       C       G       7.08    .       DP=6;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,3;MQ=23;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        35,1,0:1/1:23
+chr7   6412641 .       C       T       40      .       DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,11,0;MQ=33 PL:GT:GQ        73,33,0:1/1:99
+chr7   6766874 .       A       G       34.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=43 PL:GT:GQ        67,15,0:1/1:75
+chr7   8482729 .       C       T       5.08    .       DP=16;AF1=0.8276;CI95=0.5,1;DP4=3,0,3,0;MQ=22;PV4=1,1,1,0.19    PL:GT:GQ        32,0,1:1/1:5
+chr7   9238362 .       G       A       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr7   9687781 .       G       A       33      .       DP=29;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,16,0,12;MQ=48;PV4=1,6.5e-38,1,1        PL:GT:GQ        63,0,170:0/1:66
+chr7   9752803 .       A       T       14.2    .       DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,9,0;MQ=18  PL:GT:GQ        47,27,0:1/1:99
+chr7   10240910        .       T       C       45.5    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=35 PL:GT:GQ        78,12,0:1/1:72
+chr7   11046187        .       C       T       86.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=47 PL:GT:GQ        119,12,0:1/1:72
+chr7   11548207        .       C       G       14.6    .       DP=13;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=6,1,0,5;MQ=18;PV4=0.015,1,1,1        PL:GT:GQ        46,7,0:1/1:57
+chr7   11580317        .       C       T       42      .       DP=12;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,0,10;MQ=22;PV4=1,1,1,1     PL:GT:GQ        75,23,0:1/1:92
+chr7   11585384        .       G       A       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=46 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr7   13498356        .       A       G       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=47 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr7   13500887        .       G       A       15.1    .       DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=22 PL:GT:GQ        48,30,0:1/1:99
+chr7   13827079        .       C       T       6.02    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:GT:GQ        36,6,0:1/1:49
+chr7   14403976        .       T       G       59      .       DP=30;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=39  PL:GT:GQ        92,24,0:1/1:96
+chr7   14756588        .       A       G       44      .       DP=15;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=5,0,10,0;MQ=44;PV4=1,5.3e-18,1,1 PL:GT:GQ        74,0,70:0/1:72
+chr7   14756619        .       T       G       44      .       DP=15;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=5,0,10,0;MQ=44;PV4=1,6.4e-10,1,1 PL:GT:GQ        74,0,70:0/1:72
+chr7   36734598        .       A       C       11.1    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=40 PL:GT:GQ        42,6,0:1/1:49
+chr7   36734599        .       A       T       11.1    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=40 PL:GT:GQ        42,6,0:1/1:49
+chr7   36734603        .       G       C       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=40 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr7   40634921        .       A       C       55      .       DP=13;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,13,0;MQ=39 PL:GT:GQ        88,39,0:1/1:99
+chr7   48271285        .       A       T       73      .       DP=15;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=25 PL:GT:GQ        106,30,0:1/1:99
+chr7   56264700        .       G       A       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=51 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr7   62326003        .       C       A       26.1    .       DP=35;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=28        PL:GT:GQ        59,18,0:1/1:90
+chr7   109468934       .       T       G       5.13    .       DP=10;AF1=0.9998;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,2;MQ=39;PV4=1,0.031,1,1   PL:GT:GQ        33,2,0:1/1:37
+chr7   110208327       .       C       G       16.9    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=44 PL:GT:GQ        48,6,0:1/1:49
+chr7   125654934       .       A       G       4.11    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=27 PL:GT:GQ        34,9,0:1/1:63
+chr7   125770209       .       A       C       32      .       DP=31;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=11,0,13,0;MQ=34;PV4=1,0.00017,0.16,0.22  PL:GT:GQ        62,0,105:0/1:65
+chr7   125770265       .       G       C       36      .       DP=16;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,5,0,5;MQ=48;PV4=1,0.0047,0.016,0.035   PL:GT:GQ        66,0,110:0/1:69
+chr7   126687042       .       A       G       21.1    .       DP=36;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=22  PL:GT:GQ        54,21,0:1/1:84
+chr7   132292897       .       G       T       99      .       DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=43   PL:GT:GQ        167,21,0:1/1:84
+chr7   132334562       .       A       C       23      .       DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,10;MQ=23 PL:GT:GQ        56,30,0:1/1:99
+chr7   132431838       .       C       T       13.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=1,0,4,0;MQ=23;PV4=1,1,1,1     PL:GT:GQ        44,5,0:1/1:46
+chr7   136324945       .       T       C       13.7    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=35 PL:GT:GQ        46,12,0:1/1:72
+chr7   136957634       .       G       A       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=43 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr7   141746871       .       G       A       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=42 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr7   146831870       .       C       T       4.77    .       DP=14;AF1=0.5003;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,3,0;MQ=37;PV4=1,0.0029,0.28,1     PL:GT:GQ        33,0,28:0/1:30
+chr7   147142770       .       T       C       45      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=31 PL:GT:GQ        77,9,0:1/1:63
+chr7   147713906       .       C       T       4.77    .       DP=8;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,4,0;MQ=35;PV4=1,8.9e-06,0.48,0.27  PL:GT:GQ        33,0,29:0/1:31
+chr7   148742642       .       G       A       68      .       DP=14;AF1=0.5032;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,10,0;MQ=28;PV4=1,1,1,1    PL:GT:GQ        98,0,19:0/1:22
+chr7   148879148       .       C       T       22      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=48 PL:GT:GQ        54,9,0:1/1:63
+chr7   149484407       .       A       G       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=45 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr7   152444478       .       A       G       13      .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=36 PL:GT:GQ        44,6,0:1/1:49
+chr7   154106613       .       C       T       68      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=51 PL:GT:GQ        100,9,0:1/1:63
+chr7   154776891       .       G       T       14.4    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=31 PL:GT:GQ        47,15,0:1/1:75
+chr7   155882061       .       A       C       29      .       DP=24;AF1=0.502;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,4;MQ=46;PV4=1,0.018,0.15,0.29    PL:GT:GQ        59,0,21:0/1:24
+chr7   155956844       .       G       C       23      .       DP=11;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,7,0,4;MQ=38;PV4=1,1,0.38,1     PL:GT:GQ        53,0,103:0/1:56
+chr7   156277694       .       G       A       62      .       DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=46   PL:GT:GQ        95,24,0:1/1:96
+chr7   156720588       .       T       C       16.1    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=29 PL:GT:GQ        48,9,0:1/1:63
+chr7   156807649       .       T       C       3.01    .       DP=30;AF1=0.4997;CI95=0.5,0.5;DP4=0,4,0,3;MQ=43;PV4=1,0.16,0.15,1       PL:GT:GQ        30,0,72:0/1:33
+chr7   157331292       .       G       T       43.1    .       DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=34   PL:GT:GQ        76,21,0:1/1:84
+chr7   157382957       .       T       C       33.5    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=43 PL:GT:GQ        66,12,0:1/1:72
+chr8   556382  .       A       G       37.1    .       DP=5;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=2,0,3,0;MQ=31;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        66,1,0:1/1:23
+chr8   1661673 .       T       C       9.31    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr8   7379751 .       C       A       6.24    .       DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=19   PL:GT:GQ        38,21,0:1/1:84
+chr8   8160505 .       A       T       68.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=35 PL:GT:GQ        101,12,0:1/1:72
+chr8   8160508 .       C       T       24.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=35 PL:GT:GQ        57,12,0:1/1:72
+chr8   16781011        .       A       G       55.5    .       DP=9;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=34 PL:GT:GQ        88,12,0:1/1:72
+chr8   18716499        .       A       T       20      .       DP=10;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,4,0,2;MQ=29;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        50,0,52:0/1:51
+chr8   23326483        .       A       G       60      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=47 PL:GT:GQ        92,9,0:1/1:63
+chr8   25842819        .       T       A       12      .       DP=18;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=47        PL:GT:GQ        43,6,0:1/1:49
+chr8   26300279        .       T       C       34      .       DP=44;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,41,0;MQ=21 PL:GT:GQ        67,123,0:1/1:99
+chr8   29673470        .       A       G       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=41 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr8   29673473        .       C       G       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=41 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr8   31685466        .       C       T       34      .       DP=17;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=10,0,5,0;MQ=28;PV4=1,0.072,1,0.36        PL:GT:GQ        64,0,50:0/1:53
+chr8   37378739        .       C       T       13.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=34 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr8   51325952        .       G       A       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr8   59221963        .       G       A       16.1    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=29 PL:GT:GQ        48,9,0:1/1:63
+chr8   62764995        .       T       G       20      .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=32 PL:GT:GQ        52,9,0:1/1:63
+chr8   63157426        .       C       G       41.6    .       DP=22;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,7,0,15;MQ=19;PV4=1,1,1,0.25        PL:GT:GQ        74,11,0:1/1:66
+chr8   68710444        .       G       A       30      .       DP=5;AF1=0.6671;CI95=0.5,1;DP4=3,0,2,0;MQ=32;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        59,0,3:0/1:5
+chr8   76416560        .       G       A       89.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=46 PL:GT:GQ        122,12,0:1/1:72
+chr8   81425275        .       T       G       68      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=50 PL:GT:GQ        100,9,0:1/1:63
+chr8   89842286        .       G       C       4.61    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=30 PL:GT:GQ        34,6,0:1/1:49
+chr8   100926281       .       G       A       38      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=41 PL:GT:GQ        70,9,0:1/1:63
+chr8   102746002       .       G       C       13.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr8   107850176       .       C       T       43.1    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=45 PL:GT:GQ        76,18,0:1/1:90
+chr8   109966441       .       T       C       27.3    .       DP=9;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=38 PL:GT:GQ        60,15,0:1/1:75
+chr8   118811716       .       G       T       99      .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=50 PL:GT:GQ        155,18,0:1/1:90
+chr8   119440254       .       A       T       58.5    .       DP=5;AF1=0.8277;CI95=0.5,1;DP4=2,0,3,0;MQ=34;PV4=1,1,1,0.14     PL:GT:GQ        87,0,1:1/1:5
+chr8   121236024       .       G       A       39.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=48 PL:GT:GQ        71,6,0:1/1:49
+chr8   125489079       .       C       T       13      .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ        44,6,0:1/1:49
+chr8   128502549       .       A       G       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=45 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr8   128502551       .       A       G       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=45 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr8   130951113       .       G       A       4.61    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=19 PL:GT:GQ        34,6,0:1/1:49
+chr8   135307123       .       G       A       6.02    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=45 PL:GT:GQ        36,6,0:1/1:49
+chr8   138814155       .       C       T       57.1    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=46 PL:GT:GQ        90,18,0:1/1:90
+chr8   140566111       .       A       G       18.1    .       DP=12;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,12;MQ=15 PL:GT:GQ        51,36,0:1/1:99
+chr8   141586480       .       T       G       44      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=40 PL:GT:GQ        76,9,0:1/1:63
+chr8   143376712       .       A       G       13      .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35 PL:GT:GQ        44,6,0:1/1:49
+chr8   150662729       .       T       C       9.31    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr8   150741294       .       A       G       25.1    .       DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=34 PL:GT:GQ        58,18,0:1/1:90
+chr8   150975618       .       A       G       9.31    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr8   151580103       .       T       C       6.02    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=20 PL:GT:GQ        36,6,0:1/1:49
+chr8   151634410       .       G       T       48      .       DP=17;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,12,0,5;MQ=39;PV4=1,0.072,1,1   PL:GT:GQ        78,0,125:0/1:81
+chr8   151709267       .       G       A       91.1    .       DP=8;AF1=0.5064;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,7;MQ=40;PV4=1,1,0.28,0.37        PL:GT:GQ        121,0,16:0/1:19
+chr8   152636420       .       G       A       8.75    .       DP=3;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,2;MQ=30;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        37,1,0:1/1:23
+chr8   152706967       .       G       A       3.01    .       DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=16 PL:GT:GQ        33,30,0:1/1:99
+chr8   152786522       .       T       C       80.1    .       DP=16;AF1=0.5102;CI95=0.5,0.5;DP4=0,4,0,12;MQ=31;PV4=1,0.25,1,1 PL:GT:GQ        110,0,14:0/1:17
+chr8   152863132       .       T       G       5.44    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=30 PL:GT:GQ        36,9,0:1/1:63
+chr9   23235268        .       C       T       12      .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=32 PL:GT:GQ        43,6,0:1/1:49
+chr9   26391176        .       T       C       15.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35 PL:GT:GQ        47,6,0:1/1:49
+chr9   26868232        .       C       G       63      .       DP=20;AF1=0.5025;CI95=0.5,0.5;DP4=7,0,13,0;MQ=22;PV4=1,0.2,1,0.44       PL:GT:GQ        93,0,20:0/1:23
+chr9   34223668        .       C       T       22      .       DP=16;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,9,0,7;MQ=27;PV4=1,0.14,0.34,1  PL:GT:GQ        52,0,79:0/1:55
+chr9   39696645        .       G       A       11.3    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=41 PL:GT:GQ        43,9,0:1/1:63
+chr9   40654130        .       T       G       13      .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:GT:GQ        44,6,0:1/1:49
+chr9   41145321        .       T       G       46.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=33 PL:GT:GQ        79,12,0:1/1:72
+chr9   42273483        .       G       A       9.31    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr9   55633192        .       C       T       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr9   58705807        .       T       C       70      .       DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=24 PL:GT:GQ        103,30,0:1/1:99
+chr9   61697149        .       C       G       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr9   63152790        .       A       C       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr9   63703913        .       C       G       90.1    .       DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=38   PL:GT:GQ        123,21,0:1/1:84
+chr9   65116068        .       T       C       70      .       DP=13;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,13;MQ=49 PL:GT:GQ        103,39,0:1/1:99
+chr9   71266598        .       C       A       3.98    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35 PL:GT:GQ        33,6,0:1/1:49
+chr9   73188677        .       G       T       52      .       DP=294;AF1=1;CI95=1,1;DP4=44,0,245,0;MQ=33;PV4=1,0.28,0.0092,1  PL:GT:GQ        85,147,0:1/1:99
+chr9   78854179        .       G       T       22      .       DP=97;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=21,0,12,0;MQ=44;PV4=1,0.02,0.032,0.0033  PL:GT:GQ        52,0,158:0/1:55
+chr9   82964679        .       A       C       13.2    .       DP=19;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=36        PL:GT:GQ        45,9,0:1/1:63
+chr9   84124545        .       G       T       57      .       DP=11;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,3,0;MQ=49;PV4=1,1,0.024,1    PL:GT:GQ        87,0,59:0/1:62
+chr9   86552862        .       C       T       14.4    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=26 PL:GT:GQ        47,15,0:1/1:75
+chr9   87548941        .       A       G       22      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=49 PL:GT:GQ        54,9,0:1/1:63
+chr9   89021101        .       G       A       89.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=49 PL:GT:GQ        122,12,0:1/1:72
+chr9   90447825        .       G       A       9.31    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=46 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr9   92462035        .       C       A       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=36 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr9   93077294        .       T       G       5.44    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=31 PL:GT:GQ        36,9,0:1/1:63
+chr9   93998137        .       G       A       68      .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=46 PL:GT:GQ        100,9,0:1/1:63
+chr9   93998148        .       C       T       21.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=36 PL:GT:GQ        54,15,0:1/1:75
+chr9   95028964        .       C       A       99      .       DP=83;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,57,0,26;MQ=32;PV4=1,9.3e-08,1,0.092    PL:GT:GQ        134,0,120:0/1:99
+chr9   103829155       .       A       G       33      .       DP=96;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,96,0;MQ=16 PL:GT:GQ        66,255,0:1/1:99
+chr9   104981331       .       C       T       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=43 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr9   111070656       .       G       A       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr9   117395657       .       T       C       16.4    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=23 PL:GT:GQ        49,15,0:1/1:75
+chr9   117718907       .       A       G       46.1    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=29 PL:GT:GQ        79,18,0:1/1:90
+chr9   119149161       .       T       C       3.14    .       DP=65;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=22        PL:GT:GQ        33,15,0:1/1:75
+chr9   124528802       .       G       A       78      .       DP=23;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,13,0;MQ=25 PL:GT:GQ        111,39,0:1/1:99
+chr9   126707903       .       G       A       26      .       DP=37;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,21,0,8;MQ=46;PV4=1,2.6e-07,0.21,0.42   PL:GT:GQ        56,0,175:0/1:59
+chr9   128700686       .       C       G       33.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=50 PL:GT:GQ        66,12,0:1/1:72
+chr9   129084077       .       G       A       11.3    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=41 PL:GT:GQ        43,9,0:1/1:63
+chr9   129116900       .       A       T       20      .       DP=13;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=30        PL:GT:GQ        52,9,0:1/1:63
+chr9   130290720       .       C       G       21.8    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=42 PL:GT:GQ        53,6,0:1/1:49
+chr9   130306057       .       C       G       71      .       DP=14;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,14,0;MQ=28 PL:GT:GQ        104,42,0:1/1:99
+chr9   130528990       .       G       A       99      .       DP=31;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,31,0;MQ=27 PL:GT:GQ        174,93,0:1/1:99
+chr9   130529002       .       A       T       7.79    .       DP=30;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,11,0;MQ=15 PL:GT:GQ        40,33,0:1/1:99
+chr9   130639996       .       A       G       8.44    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=51 PL:GT:GQ        39,6,0:1/1:49
+chr9   130704890       .       A       G       3.27    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=26 PL:GT:GQ        33,12,0:1/1:72
+chr9   130708345       .       G       A       13.3    .       DP=11;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,3;MQ=38;PV4=1,0.096,1,1   PL:GT:GQ        42,1,0:1/1:23
+chr9   131001601       .       T       A       3.98    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=31 PL:GT:GQ        33,6,0:1/1:49
+chr9   131058539       .       T       A       13      .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=44 PL:GT:GQ        44,6,0:1/1:49
+chr9   131808965       .       C       T       42      .       DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,9;MQ=37   PL:GT:GQ        75,27,0:1/1:99
+chr9   132551867       .       C       T       17.1    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=25 PL:GT:GQ        49,9,0:1/1:63
+chr9   132685120       .       A       G       4.75    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=25 PL:GT:GQ        35,9,0:1/1:63
+chr9   133175050       .       A       G       18.1    .       DP=30;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,17,0;MQ=20 PL:GT:GQ        51,51,0:1/1:99
+chr9   133584978       .       A       G       99      .       DP=25;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,25,0;MQ=45 PL:GT:GQ        212,75,0:1/1:99
+chr9   133661895       .       A       G       99      .       DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,14,0;MQ=31 PL:GT:GQ        138,42,0:1/1:99
+chr9   133670376       .       T       C       68      .       DP=19;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,0,16;MQ=39;PV4=1,1.4e-20,1,1       PL:GT:GQ        101,39,0:1/1:99
+chr9   133843777       .       T       C       99      .       DP=9;AF1=0.5129;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,8,0;MQ=43;PV4=1,1,1,1      PL:GT:GQ        154,0,13:0/1:16
+chr9   134017265       .       G       C       3.27    .       DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=13        PL:GT:GQ        33,12,0:1/1:72
+chr9   134105563       .       T       C       34.1    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=39 PL:GT:GQ        67,18,0:1/1:90
+chr9   134608906       .       C       T       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=46 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr9   134861929       .       T       A       9.49    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=30 PL:GT:GQ        41,9,0:1/1:63
+chr10  796662  .       A       G       22      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=46 PL:GT:GQ        54,9,0:1/1:63
+chr10  1216716 .       T       A       18.6    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=25 PL:GT:GQ        51,12,0:1/1:72
+chr10  1220781 .       G       A       21      .       DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,9,0;MQ=18   PL:GT:GQ        54,27,0:1/1:99
+chr10  1225208 .       T       C       68      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=47 PL:GT:GQ        100,9,0:1/1:63
+chr10  1727946 .       T       C       14.2    .       DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=27   PL:GT:GQ        47,21,0:1/1:84
+chr10  5986542 .       T       C       83      .       DP=93;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=39 PL:GT:GQ        116,30,0:1/1:99
+chr10  6436277 .       G       A       6.02    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:GT:GQ        36,6,0:1/1:49
+chr10  7704114 .       C       A       35      .       DP=6;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,4;MQ=29;PV4=1,0.27,1,0.27  PL:GT:GQ        65,3,0:1/1:41
+chr10  10881734        .       A       G       9.52    .       DP=9;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,5,0;MQ=42;PV4=1,0.0026,0.14,1 PL:GT:GQ        39,0,91:0/1:42
+chr10  13099383        .       G       A       27.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=48 PL:GT:GQ        60,12,0:1/1:72
+chr10  15764077        .       G       C       11.3    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=40 PL:GT:GQ        43,9,0:1/1:63
+chr10  18091502        .       T       C       47      .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=38 PL:GT:GQ        79,9,0:1/1:63
+chr10  19645913        .       A       T       15.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=43 PL:GT:GQ        47,6,0:1/1:49
+chr10  22845062        .       C       T       18.1    .       DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=18   PL:GT:GQ        51,21,0:1/1:84
+chr10  28282802        .       T       C       69      .       DP=12;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,12,0;MQ=42 PL:GT:GQ        102,36,0:1/1:99
+chr10  28496872        .       T       G       8.44    .       DP=11;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=45        PL:GT:GQ        39,6,0:1/1:49
+chr10  32746793        .       G       A       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=46 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr10  41437604        .       T       G       11.3    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=39 PL:GT:GQ        43,9,0:1/1:63
+chr10  43051239        .       C       T       6.98    .       DP=3;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,2,0;MQ=40;PV4=1,0.33,0.33,1        PL:GT:GQ        36,0,31:0/1:33
+chr10  44455192        .       C       T       4.41    .       DP=6;AF1=0.8276;CI95=0.5,1;DP4=0,3,0,3;MQ=21;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        31,0,1:1/1:5
+chr10  48387336        .       A       G       13      .       DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35 PL:GT:GQ        44,6,0:1/1:49
+chr10  51561705        .       A       G       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=45 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr10  51561712        .       C       G       39.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=45 PL:GT:GQ        71,6,0:1/1:49
+chr10  55617954        .       G       A       8.44    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=31 PL:GT:GQ        39,6,0:1/1:49
+chr10  55718281        .       T       A       3.41    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=32 PL:GT:GQ        32,6,0:1/1:49
+chr10  55888771        .       T       C       23.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=43 PL:GT:GQ        56,12,0:1/1:72
+chr10  56025569        .       C       G       34.1    .       DP=3;AF1=0.5064;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,2;MQ=39;PV4=1,1,1,1      PL:GT:GQ        64,0,16:0/1:19
+chr10  57384943        .       G       T       84      .       DP=29;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=16,0,13,0;MQ=26;PV4=1,0.015,1,1  PL:GT:GQ        114,0,110:0/1:99
+chr10  59873077        .       T       G       49      .       DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=42   PL:GT:GQ        82,24,0:1/1:96
+chr10  61329572        .       C       T       15.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:GT:GQ        47,6,0:1/1:49
+chr10  63790636        .       T       G       32.1    .       DP=19;AF1=1;CI95=1,1;DP4=1,0,10,0;MQ=28;PV4=1,0.14,1,1  PL:GT:GQ        65,22,0:1/1:88
+chr10  64466048        .       C       G       18.2    .       DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=28 PL:GT:GQ        51,18,0:1/1:90
+chr10  65053440        .       G       T       99      .       DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=39 PL:GT:GQ        153,30,0:1/1:99
+chr10  65407358        .       C       G       84.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=45 PL:GT:GQ        117,15,0:1/1:75
+chr10  65605291        .       G       A       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=51 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr10  66104447        .       T       C       99      .       DP=47;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,25,0,21;MQ=34;PV4=1,1,0.15,1   PL:GT:GQ        136,0,162:0/1:99
+chr10  82160859        .       G       C       99      .       DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,13;MQ=36 PL:GT:GQ        153,39,0:1/1:99
+chr10  82198579        .       C       T       9.31    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr10  87086290        .       A       G       4.13    .       DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,9;MQ=17   PL:GT:GQ        35,27,0:1/1:99
+chr10  89550621        .       T       G       74      .       DP=47;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,45;MQ=45 PL:GT:GQ        107,135,0:1/1:99
+chr10  92325046        .       G       A       42.3    .       DP=18;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=45        PL:GT:GQ        75,15,0:1/1:75
+chr10  94488050        .       A       G       5.46    .       DP=4;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,2,0;MQ=43;PV4=1,0.16,1,1      PL:GT:GQ        34,0,34:0/1:34
+chr10  95024815        .       C       T       13.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=36 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr10  95466306        .       G       A       53      .       DP=7;AF1=0.6671;CI95=0.5,1;DP4=0,4,0,3;MQ=33;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        82,0,3:0/1:5
+chr10  100256777       .       T       G       3.83    .       DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=23 PL:GT:GQ        34,12,0:1/1:72
+chr10  101510485       .       T       C       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr10  101530760       .       C       T       13.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr10  101879744       .       T       C       22      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=44 PL:GT:GQ        54,9,0:1/1:63
+chr10  102147276       .       G       C       11.3    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=33 PL:GT:GQ        43,9,0:1/1:63
+chr10  102642248       .       T       G       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr10  107666616       .       T       C       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=43 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr10  108319945       .       C       G       11.3    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=29 PL:GT:GQ        43,9,0:1/1:63
+chr10  109734371       .       G       A       12.7    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=35 PL:GT:GQ        45,12,0:1/1:72
+chr10  112870604       .       C       T       46.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=36 PL:GT:GQ        79,12,0:1/1:72
+chr10  115304673       .       T       C       11.3    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=42 PL:GT:GQ        43,9,0:1/1:63
+chr10  119380588       .       G       A       14.2    .       DP=4;AF1=0.502;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,3,0;MQ=43;PV4=1,0.18,0.32,1 PL:GT:GQ        44,0,21:0/1:24
+chr10  123063756       .       C       T       14.1    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=23 PL:GT:GQ        46,9,0:1/1:63
+chr10  128424770       .       T       G       13.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=30 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr10  131229204       .       T       C       44      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=40 PL:GT:GQ        76,9,0:1/1:63
+chr10  132420570       .       G       C       89.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=49 PL:GT:GQ        122,12,0:1/1:72
+chr10  132528066       .       C       T       99      .       DP=19;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,19,0;MQ=42 PL:GT:GQ        213,57,0:1/1:99
+chr10  132644619       .       G       A       19.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=23 PL:GT:GQ        52,15,0:1/1:75
+chr10  132707581       .       G       C       9.11    .       DP=51;AF1=0.9998;CI95=0.5,1;DP4=1,0,2,0;MQ=25;PV4=1,1,1,1       PL:GT:GQ        38,2,0:1/1:37
+chr10  133026892       .       T       C       55.1    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=44 PL:GT:GQ        88,18,0:1/1:90
+chr11  768033  .       T       C       33.5    .       DP=4;AF1=0.8277;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,2;MQ=32;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        62,0,1:1/1:5
+chr11  768042  .       T       C       33.5    .       DP=6;AF1=0.8277;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,2;MQ=32;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        62,0,1:1/1:5
+chr11  874568  .       G       C       33.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=33 PL:GT:GQ        66,12,0:1/1:72
+chr11  1009210 .       T       C       4       .       DP=70;AF1=0.6241;CI95=0.5,1;DP4=0,3,0,8;MQ=24;PV4=1,1,0.5,1     PL:GT:GQ        31,0,4:0/1:6
+chr11  1016692 .       C       T       27      .       DP=39;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,38;MQ=22 PL:GT:GQ        60,114,0:1/1:99
+chr11  1034477 .       A       G       66      .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=42 PL:GT:GQ        98,9,0:1/1:63
+chr11  1074037 .       G       A       4.13    .       DP=9;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,5,0;MQ=24;PV4=1,1,0.43,1   PL:GT:GQ        32,0,30:0/1:31
+chr11  1556298 .       G       A       11.8    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=33 PL:GT:GQ        44,12,0:1/1:72
+chr11  1824777 .       T       C       27      .       DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=28 PL:GT:GQ        60,30,0:1/1:99
+chr11  3395801 .       C       T       22      .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=49 PL:GT:GQ        54,9,0:1/1:63
+chr11  3411901 .       G       A       4.75    .       DP=17;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=29        PL:GT:GQ        35,9,0:1/1:63
+chr11  3731606 .       A       C       11.3    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=39 PL:GT:GQ        43,9,0:1/1:63
+chr11  3783855 .       C       T       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=44 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr11  3967636 .       A       G       4.29    .       DP=20;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=24        PL:GT:GQ        35,15,0:1/1:75
+chr11  4385618 .       C       T       13.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=31 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr11  4424365 .       T       A       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr11  5295586 .       C       T       3.01    .       DP=52;AF1=0.4997;CI95=0.5,0.5;DP4=33,0,10,0;MQ=29;PV4=1,0.0045,0.3,0.17 PL:GT:GQ        30,0,131:0/1:33
+chr11  6157144 .       C       G       45.1    .       DP=14;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=35  PL:GT:GQ        78,21,0:1/1:84
+chr11  6352044 .       C       T       18      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=31 PL:GT:GQ        50,9,0:1/1:63
+chr11  6767356 .       T       C       9.63    .       DP=3;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=1,0,2,0;MQ=29;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        38,1,0:1/1:23
+chr11  6999404 .       G       C       21      .       DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=37 PL:GT:GQ        53,9,0:1/1:63
+chr11  9120930 .       C       G       17.6    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=25 PL:GT:GQ        50,12,0:1/1:72
+chr11  9373125 .       T       C       19.8    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:GT:GQ        51,6,0:1/1:49
+chr11  9585101 .       C       T       67      .       DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,14,0;MQ=45 PL:GT:GQ        100,42,0:1/1:99
+chr11  10266192        .       A       C       14.3    .       DP=22;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=27        PL:GT:GQ        47,18,0:1/1:90
+chr11  10303263        .       T       C       8.64    .       DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,17;MQ=18 PL:GT:GQ        41,51,0:1/1:99
+chr11  10420170        .       T       C       35      .       DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,0,15;MQ=28;PV4=1,0.12,1,0.4        PL:GT:GQ        68,36,0:1/1:99
+chr11  10912169        .       G       A       99      .       DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=49 PL:GT:GQ        155,18,0:1/1:90
+chr11  11315826        .       T       G       6.29    .       DP=27;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,6;MQ=19  PL:GT:GQ        38,18,0:1/1:90
+chr11  11603859        .       A       C       22      .       DP=15;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,9,0,6;MQ=34;PV4=1,9.5e-13,0.22,1       PL:GT:GQ        52,0,115:0/1:55
+chr11  11700034        .       C       T       33      .       DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,9,0;MQ=30  PL:GT:GQ        66,27,0:1/1:99
+chr11  11822758        .       G       A       15.1    .       DP=15;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,7,0,3;MQ=38;PV4=1,0.18,1,1     PL:GT:GQ        45,0,88:0/1:48
+chr11  11976636        .       C       T       22      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=24 PL:GT:GQ        54,9,0:1/1:63
+chr11  14380517        .       C       G       16.1    .       DP=10;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=5,0,5,0;MQ=48;PV4=1,2.1e-05,0.13,1       PL:GT:GQ        46,0,113:0/1:49
+chr11  14419212        .       A       G       91.1    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=38 PL:GT:GQ        124,18,0:1/1:90
+chr11  14846792        .       A       G       55      .       DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,11;MQ=19 PL:GT:GQ        88,33,0:1/1:99
+chr11  15494556        .       C       T       99      .       DP=38;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=22,0,14,0;MQ=34;PV4=1,0.0071,1,1 PL:GT:GQ        146,0,159:0/1:99
+chr11  16262879        .       A       C       16.1    .       DP=4;AF1=0.5004;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,3;MQ=43;PV4=1,0.061,0.24,0.33    PL:GT:GQ        46,0,28:0/1:31
+chr11  21514947        .       T       C       24.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=41 PL:GT:GQ        57,12,0:1/1:72
+chr11  22532576        .       C       G       28      .       DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,17;MQ=17 PL:GT:GQ        61,51,0:1/1:99
+chr11  23529238        .       G       T       4.29    .       DP=13;AF1=0.5334;CI95=0.5,1;DP4=1,0,3,0;MQ=37;PV4=1,1,0.34,0.21 PL:GT:GQ        32,0,9:0/1:12
+chr11  24249554        .       A       G       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=48 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr11  24853167        .       A       G       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=51 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr11  33353903        .       T       C       24.3    .       DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=36 PL:GT:GQ        57,15,0:1/1:75
+chr11  35126569        .       T       C       24.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=43 PL:GT:GQ        57,12,0:1/1:72
+chr11  35132248        .       C       T       18.6    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=25 PL:GT:GQ        51,12,0:1/1:72
+chr11  35155482        .       T       C       68      .       DP=22;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,22,0;MQ=46 PL:GT:GQ        101,66,0:1/1:99
+chr11  52494088        .       T       C       99      .       DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,9;MQ=37   PL:GT:GQ        140,27,0:1/1:99
+chr11  57899943        .       C       G       13      .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ        44,6,0:1/1:49
+chr11  62261460        .       G       T       19.1    .       DP=15;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,7,0,5;MQ=27;PV4=1,1.1e-06,1,1  PL:GT:GQ        49,0,58:0/1:51
+chr11  67456049        .       C       T       39.1    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=19 PL:GT:GQ        72,18,0:1/1:90
+chr11  68509708        .       C       G       3.65    .       DP=9;AF1=0.7301;CI95=0.5,1;DP4=0,5,0,4;MQ=17;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        30,0,2:0/1:3
+chr11  70115115        .       T       A       99      .       DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=49 PL:GT:GQ        140,15,0:1/1:75
+chr11  72643951        .       T       C       70      .       DP=23;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,22,0;MQ=39 PL:GT:GQ        103,66,0:1/1:99
+chr11  72647930        .       G       A       36      .       DP=4;AF1=0.5004;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,3;MQ=41;PV4=1,1,0.3,1    PL:GT:GQ        66,0,28:0/1:31
+chr11  73330148        .       C       T       13      .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35 PL:GT:GQ        44,6,0:1/1:49
+chr11  81720893        .       A       G       5.83    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=19 PL:GT:GQ        37,12,0:1/1:72
+chr11  83813797        .       A       G       23.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=43 PL:GT:GQ        56,12,0:1/1:72
+chr11  85949488        .       C       A       54      .       DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,14,0;MQ=37 PL:GT:GQ        87,42,0:1/1:99
+chr11  87634829        .       G       A       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=51 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr11  90913093        .       A       T       35.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=46 PL:GT:GQ        67,6,0:1/1:49
+chr11  93793348        .       G       A       99      .       DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=31   PL:GT:GQ        139,24,0:1/1:96
+chr11  100802294       .       T       C       16.6    .       DP=21;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=35        PL:GT:GQ        49,12,0:1/1:72
+chr11  107455449       .       C       T       8.44    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=26 PL:GT:GQ        39,6,0:1/1:49
+chr11  111344355       .       A       G       69.5    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=43 PL:GT:GQ        102,12,0:1/1:72
+chr11  111611115       .       C       T       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr11  113050466       .       G       C       6.02    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=30 PL:GT:GQ        36,6,0:1/1:49
+chr11  114332544       .       T       C       3.54    .       DP=17;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=0,4,0,5;MQ=37;PV4=1,0.32,0.13,1       PL:GT:GQ        31,0,37:0/1:33
+chr11  114332549       .       G       A       3.54    .       DP=17;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=0,9,0,8;MQ=36;PV4=1,3.1e-10,0.088,1   PL:GT:GQ        31,0,127:0/1:34
+chr11  114843578       .       G       C       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=50 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr11  115580279       .       A       G       99      .       DP=15;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,15,0;MQ=48 PL:GT:GQ        190,45,0:1/1:99
+chr11  116434328       .       G       A       17.6    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=25 PL:GT:GQ        50,12,0:1/1:72
+chr11  125914161       .       A       G       20.8    .       DP=7;AF1=0.95;CI95=0.5,1;DP4=3,0,4,0;MQ=38;PV4=1,0.074,1,1      PL:GT:GQ        49,0,0:1/1:10
+chr11  125917089       .       C       T       12.3    .       DP=41;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,28,0,12;MQ=44;PV4=1,4.7e-25,1,1        PL:GT:GQ        42,0,167:0/1:45
+chr11  127194100       .       A       G       60      .       DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=49   PL:GT:GQ        93,24,0:1/1:96
+chr12  70856   .       G       A       27.5    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=49 PL:GT:GQ        60,12,0:1/1:72
+chr12  153693  .       T       C       52.3    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=38 PL:GT:GQ        85,15,0:1/1:75
+chr12  924547  .       C       G       37.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=50 PL:GT:GQ        69,6,0:1/1:49
+chr12  1555916 .       G       A       7.18    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=23 PL:GT:GQ        39,15,0:1/1:75
+chr12  1919860 .       G       T       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr12  2283756 .       G       A       13.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=34 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr12  2805983 .       G       C       12.7    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=35 PL:GT:GQ        45,12,0:1/1:72
+chr12  6088203 .       T       C       72.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=37 PL:GT:GQ        105,15,0:1/1:75
+chr12  7099460 .       G       C       10.8    .       DP=6;AF1=0.8277;CI95=0.5,1;DP4=3,0,3,0;MQ=26;PV4=1,0.027,1,1    PL:GT:GQ        39,0,1:1/1:5
+chr12  7099464 .       G       A       13.3    .       DP=6;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=2,0,3,0;MQ=28;PV4=1,0.16,1,1     PL:GT:GQ        42,1,0:1/1:23
+chr12  7198516 .       T       G       4.61    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ        34,6,0:1/1:49
+chr12  23331895        .       C       T       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr12  28209020        .       T       G       14.4    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=31 PL:GT:GQ        47,15,0:1/1:75
+chr12  30074073        .       C       T       32.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35 PL:GT:GQ        64,6,0:1/1:49
+chr12  30563452        .       T       C       25      .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=46 PL:GT:GQ        57,9,0:1/1:63
+chr12  30563453        .       A       G       25      .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=46 PL:GT:GQ        57,9,0:1/1:63
+chr12  30563464        .       C       A       78.8    .       DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,5;MQ=34;PV4=1,0.29,1,1  PL:GT:GQ        110,6,0:1/1:49
+chr12  31505085        .       G       A       13.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr12  34041336        .       G       A       5.46    .       DP=5;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,2,0;MQ=36;PV4=1,1,0.48,0.21   PL:GT:GQ        34,0,34:0/1:34
+chr12  49003648        .       C       G       42      .       DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=39   PL:GT:GQ        75,24,0:1/1:96
+chr12  51280690        .       G       A       69      .       DP=98;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=13,0,18,0;MQ=45;PV4=1,1,0.051,1  PL:GT:GQ        99,0,84:0/1:87
+chr12  69206633        .       T       C       17.1    .       DP=12;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,11;MQ=17 PL:GT:GQ        50,33,0:1/1:99
+chr12  80417253        .       T       C       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=48 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr12  86633033        .       C       T       34      .       DP=3;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,2;MQ=43;PV4=1,1,0.33,1   PL:GT:GQ        64,0,31:0/1:34
+chr12  98097274        .       C       T       47.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=31 PL:GT:GQ        80,15,0:1/1:75
+chr12  105269319       .       C       T       19      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=26 PL:GT:GQ        51,9,0:1/1:63
+chr12  109053425       .       G       A       9.53    .       DP=8;AF1=0.5012;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,6,0;MQ=25;PV4=1,1,0.19,1   PL:GT:GQ        39,0,23:0/1:26
+chr12  111904540       .       A       G       3.41    .       DP=65;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=31        PL:GT:GQ        32,6,0:1/1:49
+chr12  115038686       .       T       C       15.2    .       DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=27   PL:GT:GQ        48,21,0:1/1:84
+chr12  115039419       .       A       G       4.11    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=30 PL:GT:GQ        34,9,0:1/1:63
+chr12  115103890       .       G       A       66      .       DP=39;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,38;MQ=49 PL:GT:GQ        99,114,0:1/1:99
+chr12  115833830       .       G       A       68      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=49 PL:GT:GQ        100,9,0:1/1:63
+chr12  116361873       .       T       G       6.34    .       DP=5;AF1=0.7302;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,2;MQ=23;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        34,0,2:0/1:3
+chr12  123583527       .       G       A       14.1    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=25 PL:GT:GQ        46,9,0:1/1:63
+chr12  124115330       .       A       G       44      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=38 PL:GT:GQ        76,9,0:1/1:63
+chr12  125062296       .       G       A       41.8    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=50 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr12  126718106       .       A       G       8.76    .       DP=50;AF1=0.5163;CI95=0.5,1;DP4=2,0,6,0;MQ=26;PV4=1,0.33,0.37,1 PL:GT:GQ        38,0,12:0/1:15
+chr12  133348311       .       G       A       24      .       DP=18;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=14,0,3,0;MQ=35;PV4=1,1,1,1       PL:GT:GQ        54,0,118:0/1:57
+chr12  134494475       .       C       T       28      .       DP=18;AF1=0.6671;CI95=0.5,1;DP4=8,0,10,0;MQ=18;PV4=1,1,1,1      PL:GT:GQ        57,0,3:0/1:5
+chr12  134831761       .       C       T       41.3    .       DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=27        PL:GT:GQ        74,15,0:1/1:75
+chr12  134992770       .       A       C,T     84      .       DP=47;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,26,0;MQ=29 PL:GT:GQ        117,72,114,0,44,114:1/1:99
+chr12  135261117       .       G       A       49.1    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=46 PL:GT:GQ        82,18,0:1/1:90
+chr12  135261144       .       A       G       99      .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=46 PL:GT:GQ        155,18,0:1/1:90
+chr12  135460302       .       G       A       99      .       DP=25;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,23,0;MQ=40 PL:GT:GQ        198,69,0:1/1:99
+chr12  135463758       .       A       G       83      .       DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,16;MQ=26 PL:GT:GQ        116,48,0:1/1:99
+chr12  135523325       .       G       A       99      .       DP=23;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,22,0;MQ=26 PL:GT:GQ        136,66,0:1/1:99
+chr12  135782401       .       T       C       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr12  135795472       .       G       T       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr13  18040027        .       G       C       42      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=33 PL:GT:GQ        74,9,0:1/1:63
+chr13  19494625        .       G       T       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr13  20121126        .       A       G       15.1    .       DP=36;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=25,0,9,0;MQ=36;PV4=1,1,0.13,1    PL:GT:GQ        45,0,153:0/1:48
+chr13  21536703        .       A       G       9.31    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr13  23160035        .       G       T       3.98    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=36 PL:GT:GQ        33,6,0:1/1:49
+chr13  23476554        .       C       A       6.79    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=52 PL:GT:GQ        37,6,0:1/1:49
+chr13  26632967        .       C       G       32      .       DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,9;MQ=34   PL:GT:GQ        65,27,0:1/1:99
+chr13  26790010        .       T       C       89.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=35 PL:GT:GQ        122,15,0:1/1:75
+chr13  36083571        .       T       C       43      .       DP=84;AF1=1;CI95=1,1;DP4=1,0,37,0;MQ=16;PV4=1,1,1,0.3   PL:GT:GQ        76,99,0:1/1:99
+chr13  44432419        .       C       T       3.58    .       DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=19   PL:GT:GQ        34,21,0:1/1:84
+chr13  46592359        .       T       C       16.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:GT:GQ        48,6,0:1/1:49
+chr13  52764657        .       A       T       3.14    .       DP=32;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=22        PL:GT:GQ        33,15,0:1/1:75
+chr13  53084193        .       C       T       9.11    .       DP=3;AF1=0.9998;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,2;MQ=29;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        38,2,0:1/1:37
+chr13  57763228        .       C       T       45      .       DP=555;AF1=1;CI95=1,1;DP4=2,0,21,0;MQ=23;PV4=1,0.00021,1,0.3    PL:GT:GQ        78,45,0:1/1:99
+chr13  73857921        .       G       C       31      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=49 PL:GT:GQ        63,9,0:1/1:63
+chr13  76718001        .       G       A       59      .       DP=4;AF1=0.5004;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,3,0;MQ=45;PV4=1,1,0.12,1   PL:GT:GQ        89,0,28:0/1:31
+chr13  100912695       .       A       T       23      .       DP=22;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,16,0,6;MQ=31;PV4=1,0.029,1,0.35        PL:GT:GQ        53,0,103:0/1:56
+chr13  101332001       .       G       C       21      .       DP=23;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,23,0;MQ=21 PL:GT:GQ        54,69,0:1/1:99
+chr13  102637334       .       C       T       68      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=49 PL:GT:GQ        100,9,0:1/1:63
+chr13  102895627       .       C       T       63      .       DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,9,0;MQ=48   PL:GT:GQ        96,27,0:1/1:99
+chr13  103830322       .       T       C       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=50 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr13  112842448       .       G       A       39      .       DP=18;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,9;MQ=27  PL:GT:GQ        72,27,0:1/1:99
+chr13  113310291       .       C       T       33.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=43 PL:GT:GQ        66,12,0:1/1:72
+chr13  114775162       .       A       G       80      .       DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,17,0;MQ=21 PL:GT:GQ        113,51,0:1/1:99
+chr13  115267482       .       A       G       16.1    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=29 PL:GT:GQ        48,9,0:1/1:63
+chr13  116068676       .       C       T       3.83    .       DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=27 PL:GT:GQ        34,12,0:1/1:72
+chr13  116455918       .       A       G       33      .       DP=29;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=13,0,15,0;MQ=42;PV4=1,1.8e-20,0.3,1      PL:GT:GQ        63,0,146:0/1:66
+chr13  116765012       .       G       A       30.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ        62,6,0:1/1:49
+chr13  116779773       .       C       T       17.1    .       DP=38;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=27,0,11,0;MQ=24;PV4=1,4.5e-35,1,1        PL:GT:GQ        47,0,106:0/1:50
+chr13  116779791       .       C       T       57      .       DP=38;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=24,0,14,0;MQ=24;PV4=1,1,1,1      PL:GT:GQ        87,0,103:0/1:90
+chr14  20159250        .       C       T       11.3    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=39 PL:GT:GQ        43,9,0:1/1:63
+chr14  23510676        .       T       C       52      .       DP=22;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,22,0;MQ=32 PL:GT:GQ        85,66,0:1/1:99
+chr14  24735256        .       G       A       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr14  29525577        .       G       A       21      .       DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,9,0;MQ=16  PL:GT:GQ        54,27,0:1/1:99
+chr14  36186389        .       C       T       6.79    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=20 PL:GT:GQ        37,6,0:1/1:49
+chr14  36186394        .       A       G       6.79    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=20 PL:GT:GQ        37,6,0:1/1:49
+chr14  37440609        .       A       G       13      .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=33 PL:GT:GQ        44,6,0:1/1:49
+chr14  40432807        .       A       G       18.6    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=23 PL:GT:GQ        51,12,0:1/1:72
+chr14  59466268        .       T       C       15.1    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=25 PL:GT:GQ        47,9,0:1/1:63
+chr14  61368162        .       G       T       7.18    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=17 PL:GT:GQ        39,15,0:1/1:75
+chr14  65152922        .       G       A       92      .       DP=33;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,18,0,15;MQ=36;PV4=1,0.059,0.35,1       PL:GT:GQ        122,0,144:0/1:99
+chr14  69749148        .       G       T       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=25 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr14  74877658        .       C       T       45      .       DP=48;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,0,12;MQ=36;PV4=1,0.02,1,0.39       PL:GT:GQ        78,28,0:1/1:99
+chr14  75546678        .       C       T       19.2    .       DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=17 PL:GT:GQ        52,18,0:1/1:90
+chr14  76439185        .       T       C       67.1    .       DP=7;AF1=0.505;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,6;MQ=33;PV4=1,1,0.056,0.29        PL:GT:GQ        97,0,17:0/1:20
+chr14  77313295        .       T       A       99      .       DP=12;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,10;MQ=48 PL:GT:GQ        191,30,0:1/1:99
+chr14  77673422        .       G       A       11.5    .       DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=24 PL:GT:GQ        44,18,0:1/1:90
+chr14  78646125        .       T       C       99      .       DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=40   PL:GT:GQ        153,24,0:1/1:96
+chr14  91702449        .       A       G       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr14  91769842        .       G       A       63      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=47 PL:GT:GQ        95,9,0:1/1:63
+chr14  91775899        .       C       G       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=45 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr14  91775924        .       A       G       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=45 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr14  93482918        .       A       C       68      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=49 PL:GT:GQ        100,9,0:1/1:63
+chr14  93665819        .       C       T       75      .       DP=7;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=0,3,0,4;MQ=42;PV4=1,1,1,1      PL:GT:GQ        105,0,31:0/1:34
+chr14  95422276        .       A       G       55.1    .       DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=45   PL:GT:GQ        88,21,0:1/1:84
+chr14  95731986        .       C       T       68      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=49 PL:GT:GQ        100,9,0:1/1:63
+chr14  96045464        .       A       G       13      .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=33 PL:GT:GQ        44,6,0:1/1:49
+chr14  97172020        .       C       T       68      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=51 PL:GT:GQ        100,9,0:1/1:63
+chr14  100515480       .       A       G       6.98    .       DP=3;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,2,0;MQ=45;PV4=1,0.14,0.085,0.33    PL:GT:GQ        36,0,30:0/1:32
+chr14  100770214       .       A       T       8.69    .       DP=20;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=16  PL:GT:GQ        41,21,0:1/1:84
+chr14  101258303       .       G       A       82      .       DP=15;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,15,0;MQ=26 PL:GT:GQ        115,45,0:1/1:99
+chr14  101701492       .       C       G       66      .       DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=49 PL:GT:GQ        99,30,0:1/1:99
+chr14  102113772       .       T       C       3.98    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=30 PL:GT:GQ        33,6,0:1/1:49
+chr14  102751431       .       A       C       36.5    .       DP=3;AF1=0.9998;CI95=0.5,1;DP4=1,0,2,0;MQ=35;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        66,2,0:1/1:37
+chr14  103708033       .       A       G       99      .       DP=13;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,12;MQ=27 PL:GT:GQ        141,36,0:1/1:99
+chr14  104744582       .       G       A       3.52    .       DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=25 PL:GT:GQ        33,9,0:1/1:63
+chr14  105989100       .       C       T       3.14    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=23 PL:GT:GQ        33,15,0:1/1:75
+chr14  105989162       .       C       T       3.65    .       DP=12;AF1=0.7301;CI95=0.5,1;DP4=0,6,0,6;MQ=15;PV4=1,1,1,1       PL:GT:GQ        30,0,2:0/1:3
+chr14  106234810       .       G       A       25.3    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=39 PL:GT:GQ        58,15,0:1/1:75
+chr14  106995572       .       A       G       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr14  107283057       .       T       C       5.5     .       DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=20   PL:GT:GQ        37,21,0:1/1:84
+chr14  107285319       .       T       C       33      .       DP=36;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,35;MQ=22 PL:GT:GQ        66,105,0:1/1:99
+chr14  107640449       .       A       G       11.8    .       DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=36 PL:GT:GQ        44,12,0:1/1:72
+chr15  20082092        .       T       G       18.3    .       DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=24        PL:GT:GQ        51,15,0:1/1:75
+chr15  22955884        .       T       C       67      .       DP=12;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,12,0;MQ=48 PL:GT:GQ        100,36,0:1/1:99
+chr15  22971987        .       A       G       5.29    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=22 PL:GT:GQ        35,6,0:1/1:49
+chr15  23233324        .       C       A       47      .       DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,14,0;MQ=31 PL:GT:GQ        80,42,0:1/1:99
+chr15  25175286        .       C       T       36.5    .       DP=3;AF1=0.9998;CI95=0.5,1;DP4=1,0,2,0;MQ=42;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        66,2,0:1/1:37
+chr15  25385709        .       G       A       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=48 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr15  27372396        .       A       G       44      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=40 PL:GT:GQ        76,9,0:1/1:63
+chr15  35998093        .       C       T       9.53    .       DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,9,0;MQ=17   PL:GT:GQ        42,27,0:1/1:99
+chr15  36716538        .       C       G       13.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=36 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr15  36793360        .       G       T       44      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=42 PL:GT:GQ        76,9,0:1/1:63
+chr15  53783097        .       A       G       10.5    .       DP=31;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=16  PL:GT:GQ        43,21,0:1/1:84
+chr15  54180175        .       C       T       10.4    .       DP=7;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,3,0;MQ=27;PV4=1,1.2e-05,1,1        PL:GT:GQ        40,0,32:0/1:34
+chr15  54939306        .       C       T       99      .       DP=34;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,18,0,16;MQ=49;PV4=1,1,0.18,1   PL:GT:GQ        172,0,181:0/1:99
+chr15  59377916        .       C       T       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=50 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr15  59685961        .       G       C       68      .       DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,11;MQ=36 PL:GT:GQ        101,33,0:1/1:99
+chr15  60306384        .       A       G       18.6    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=25 PL:GT:GQ        51,12,0:1/1:72
+chr15  60345642        .       G       C       14.9    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35 PL:GT:GQ        46,6,0:1/1:49
+chr15  60367387        .       G       A       13.2    .       DP=6;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=3,0,3,0;MQ=34;PV4=1,0.098,0.24,1       PL:GT:GQ        43,0,35:0/1:37
+chr15  60367446        .       C       T       44      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=41 PL:GT:GQ        76,9,0:1/1:63
+chr15  61763755        .       G       A       68      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=45 PL:GT:GQ        100,9,0:1/1:63
+chr15  61831362        .       C       G       11.3    .       DP=5;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,3;MQ=30;PV4=1,0.00077,0.47,1        PL:GT:GQ        41,0,42:0/1:41
+chr15  63978880        .       G       C       60      .       DP=6;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=2,0,4,0;MQ=35;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        90,3,0:1/1:41
+chr15  64342445        .       A       G       12.2    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=18 PL:GT:GQ        44,9,0:1/1:63
+chr15  65424859        .       T       C       11.3    .       DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,10;MQ=21 PL:GT:GQ        44,30,0:1/1:99
+chr15  65603698        .       C       T       60      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=49 PL:GT:GQ        92,9,0:1/1:63
+chr15  67005078        .       G       A       13.9    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr15  71133512        .       G       C       22.3    .       DP=19;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=25        PL:GT:GQ        55,15,0:1/1:75
+chr15  72619009        .       A       G       22      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=48 PL:GT:GQ        54,9,0:1/1:63
+chr15  73272688        .       C       T       70.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=39 PL:GT:GQ        103,15,0:1/1:75
+chr15  73699335        .       T       A       99      .       DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,9;MQ=45   PL:GT:GQ        175,27,0:1/1:99
+chr15  74513352        .       C       T       99      .       DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,10;MQ=37 PL:GT:GQ        139,30,0:1/1:99
+chr15  75540536        .       G       A       9.31    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=44 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr15  75822537        .       C       A       17.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=23 PL:GT:GQ        50,15,0:1/1:75
+chr15  78554005        .       T       C       12      .       DP=18;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=46        PL:GT:GQ        43,6,0:1/1:49
+chr15  80089369        .       G       A       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=28 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr15  83089149        .       C       G       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=33 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr15  86839307        .       T       C       90.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=43 PL:GT:GQ        123,15,0:1/1:75
+chr15  89836258        .       T       C       99      .       DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=39  PL:GT:GQ        141,24,0:1/1:96
+chr15  89837706        .       G       A       4.13    .       DP=8;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=0,4,0,4;MQ=30;PV4=1,1,0.25,1   PL:GT:GQ        32,0,59:0/1:35
+chr15  89857648        .       T       C       99      .       DP=27;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=8,0,8,0;MQ=40;PV4=1,1,0.3,1      PL:GT:GQ        133,0,130:0/1:99
+chr15  89864228        .       A       C       32      .       DP=4;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,2,0;MQ=42;PV4=1,1,1,1      PL:GT:GQ        62,0,31:0/1:34
+chr15  91261235        .       G       A       7.8     .       DP=4;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,2,0;MQ=44;PV4=1,1,0.32,1   PL:GT:GQ        37,0,30:0/1:32
+chr16  256990  .       A       C       10.4    .       DP=16;AF1=0.5008;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,3,0;MQ=23;PV4=1,0.34,1,1  PL:GT:GQ        40,0,25:0/1:28
+chr16  260794  .       T       C       3.01    .       DP=19;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=13,0,2,0;MQ=24;PV4=1,1,1,1    PL:GT:GQ        30,0,32:0/1:31
+chr16  419905  .       A       G       7.9     .       DP=5;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,3;MQ=22;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        36,1,0:1/1:23
+chr16  824086  .       T       C       22      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=48 PL:GT:GQ        54,9,0:1/1:63
+chr16  1085063 .       C       T       52      .       DP=12;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=6,0,6,0;MQ=42;PV4=1,1,0.014,1    PL:GT:GQ        82,0,128:0/1:85
+chr16  1221305 .       T       C       54      .       DP=7;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,3,0,3;MQ=40;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ        84,0,60:0/1:63
+chr16  1411728 .       A       G       32.3    .       DP=11;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=35        PL:GT:GQ        65,15,0:1/1:75
+chr16  1443197 .       C       G       64      .       DP=26;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,25,0;MQ=36 PL:GT:GQ        97,75,0:1/1:99
+chr16  1478746 .       A       T       32      .       DP=20;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=28  PL:GT:GQ        65,24,0:1/1:96
+chr16  1514438 .       A       C       45      .       DP=49;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,48,0;MQ=26 PL:GT:GQ        78,144,0:1/1:99
+chr16  1601989 .       T       C       99      .       DP=13;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,13,0;MQ=29 PL:GT:GQ        133,39,0:1/1:99
+chr16  2043883 .       C       T       30      .       DP=33;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,33;MQ=14 PL:GT:GQ        63,99,0:1/1:99
+chr16  2137470 .       A       C       39      .       DP=38;AF1=0.5016;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,6,0;MQ=34;PV4=1,0.02,1,1  PL:GT:GQ        69,0,22:0/1:25
+chr16  2537260 .       A       G       99      .       DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,11,0;MQ=40 PL:GT:GQ        177,33,0:1/1:99
+chr16  2564737 .       T       C       99      .       DP=25;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,22;MQ=41 PL:GT:GQ        199,66,0:1/1:99
+chr16  2612605 .       A       T       62.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=28 PL:GT:GQ        95,15,0:1/1:75
+chr16  2704518 .       G       A       41      .       DP=48;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,17,0,12;MQ=48;PV4=1,1.9e-23,0.24,0.034 PL:GT:GQ        71,0,175:0/1:74
+chr16  3274307 .       G       T       68      .       DP=39;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,30,0,8;MQ=37;PV4=1,1,1,1       PL:GT:GQ        98,0,138:0/1:99
+chr16  5467292 .       G       C       37.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ        69,6,0:1/1:49
+chr16  10079145        .       A       G       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr16  11483702        .       A       G       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=44 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr16  12038227        .       A       T       23      .       DP=47;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,22,0,23;MQ=32;PV4=1,4.4e-66,0.47,0.028 PL:GT:GQ        53,0,135:0/1:56
+chr16  21336880        .       G       C       55      .       DP=35;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,12,0,19;MQ=47;PV4=1,5.6e-21,1,1        PL:GT:GQ        85,0,121:0/1:88
+chr16  21980241        .       C       T       16.1    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=29 PL:GT:GQ        48,9,0:1/1:63
+chr16  23275383        .       C       G       13      .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:GT:GQ        44,6,0:1/1:49
+chr16  27546495        .       G       T       25      .       DP=35;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=43        PL:GT:GQ        57,9,0:1/1:63
+chr16  27700399        .       A       T       17.6    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=17 PL:GT:GQ        50,12,0:1/1:72
+chr16  28021935        .       A       G       18.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=23 PL:GT:GQ        51,15,0:1/1:75
+chr16  29070016        .       G       T       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr16  29478618        .       C       T       11.3    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=42 PL:GT:GQ        43,9,0:1/1:63
+chr16  29718140        .       C       T       46.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=31 PL:GT:GQ        79,15,0:1/1:75
+chr16  30700759        .       T       C       17.1    .       DP=14;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,14;MQ=14 PL:GT:GQ        50,42,0:1/1:99
+chr16  35139103        .       A       G       46.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=37 PL:GT:GQ        79,12,0:1/1:72
+chr16  35473348        .       G       A       3.83    .       DP=11;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=25        PL:GT:GQ        34,12,0:1/1:72
+chr16  36213667        .       A       G       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr16  36705528        .       G       A       14.4    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=32 PL:GT:GQ        47,15,0:1/1:75
+chr16  43831353        .       C       T       69.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=42 PL:GT:GQ        102,12,0:1/1:72
+chr16  44715166        .       A       C       25      .       DP=18;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=32  PL:GT:GQ        58,24,0:1/1:96
+chr16  44957661        .       T       C       7.03    .       DP=23;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=18  PL:GT:GQ        39,21,0:1/1:84
+chr16  44958698        .       C       T       42.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=49 PL:GT:GQ        75,15,0:1/1:75
+chr16  44959163        .       T       C       33.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=48 PL:GT:GQ        66,12,0:1/1:72
+chr16  45167959        .       C       T       4.45    .       DP=16;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=24        PL:GT:GQ        35,12,0:1/1:72
+chr16  50254956        .       C       T       13.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=36 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr16  52383122        .       A       C       46.5    .       DP=19;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=42        PL:GT:GQ        79,12,0:1/1:72
+chr16  55978159        .       C       T       10.7    .       DP=20;AF1=0.5336;CI95=0.5,1;DP4=2,0,5,0;MQ=35;PV4=1,0.038,1,0.059       PL:GT:GQ        40,0,9:0/1:12
+chr16  61358878        .       T       A       15.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=32 PL:GT:GQ        47,6,0:1/1:49
+chr16  61392487        .       G       A       13      .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=31 PL:GT:GQ        44,6,0:1/1:49
+chr16  61621603        .       G       T       6.59    .       DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=22        PL:GT:GQ        38,12,0:1/1:72
+chr16  69120890        .       G       C       51.3    .       DP=36;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=42        PL:GT:GQ        84,15,0:1/1:75
+chr16  70778219        .       A       G       21.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=39 PL:GT:GQ        53,6,0:1/1:49
+chr16  71899519        .       T       C       40      .       DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,11,0;MQ=33 PL:GT:GQ        73,33,0:1/1:99
+chr16  72079251        .       A       G       11.3    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=41 PL:GT:GQ        43,9,0:1/1:63
+chr16  72093003        .       G       C       9.31    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr16  72672428        .       A       G       68      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=49 PL:GT:GQ        100,9,0:1/1:63
+chr16  72864515        .       A       G       13.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr16  72890560        .       G       A       47.1    .       DP=10;AF1=0.5064;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,7;MQ=49;PV4=1,0.0019,0.0033,1   PL:GT:GQ        77,0,16:0/1:19
+chr16  73048929        .       A       G       6.29    .       DP=4;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=1,0,2,0;MQ=27;PV4=1,1,1,0.33     PL:GT:GQ        34,1,0:1/1:23
+chr16  73177179        .       A       G       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr16  73191468        .       C       T       69.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=40 PL:GT:GQ        102,12,0:1/1:72
+chr16  73367439        .       A       C       7.41    .       DP=36;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,13;MQ=26;PV4=1,1,0.027,1       PL:GT:GQ        37,4,0:1/1:45
+chr16  74259316        .       C       T       89.5    .       DP=13;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=49        PL:GT:GQ        122,12,0:1/1:72
+chr16  75271450        .       C       G       6.99    .       DP=15;AF1=0.5015;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,3;MQ=44;PV4=1,0.065,0.31,1      PL:GT:GQ        36,0,22:0/1:25
+chr16  76199870        .       G       A       26      .       DP=14;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=8,0,6,0;MQ=47;PV4=1,1.2e-06,0.32,1       PL:GT:GQ        56,0,141:0/1:59
+chr16  77723692        .       A       G       89.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=50 PL:GT:GQ        122,12,0:1/1:72
+chr17  165875  .       G       A       40.8    .       DP=11;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=42        PL:GT:GQ        72,6,0:1/1:49
+chr17  1443809 .       C       G       9.31    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=50 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr17  1618253 .       C       T       22      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=39 PL:GT:GQ        54,9,0:1/1:63
+chr17  2815309 .       T       G       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr17  3537486 .       T       G       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=50 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr17  3734367 .       C       A       23.5    .       DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=36        PL:GT:GQ        56,12,0:1/1:72
+chr17  5634764 .       T       C       13      .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ        44,6,0:1/1:49
+chr17  6408090 .       C       G       3.54    .       DP=5;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=3,0,2,0;MQ=40;PV4=1,1,0.36,1   PL:GT:GQ        31,0,66:0/1:34
+chr17  7089723 .       A       G       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=47 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr17  8731503 .       G       C       11.1    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=46 PL:GT:GQ        42,6,0:1/1:49
+chr17  9282935 .       T       C,G     24.5    .       DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=40        PL:GT:GQ        57,12,61,0,3,61:1/1:72
+chr17  17284831        .       T       C       29      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=25 PL:GT:GQ        61,9,0:1/1:63
+chr17  18439515        .       G       A       4.11    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=25 PL:GT:GQ        34,9,0:1/1:63
+chr17  18602146        .       C       T       4.76    .       DP=20;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,11;MQ=16 PL:GT:GQ        36,33,0:1/1:99
+chr17  19427888        .       C       T       57      .       DP=104;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=45,0,29,0;MQ=39;PV4=1,2.2e-12,1,1       PL:GT:GQ        87,0,131:0/1:90
+chr17  19604159        .       T       C       9.31    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=45 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr17  19610366        .       C       T       13      .       DP=13;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48        PL:GT:GQ        44,6,0:1/1:49
+chr17  20484706        .       C       G       51      .       DP=35;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=0,11,0,21;MQ=21;PV4=1,0.39,0.49,1     PL:GT:GQ        81,0,36:0/1:39
+chr17  20555720        .       A       G       26.3    .       DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=28 PL:GT:GQ        59,15,0:1/1:75
+chr17  24328984        .       A       C       15.4    .       DP=34;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=25        PL:GT:GQ        48,15,0:1/1:75
+chr17  26237090        .       G       A       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=44 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr17  28394766        .       C       A       13.9    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=31 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr17  31218277        .       A       G       3.62    .       DP=38;AF1=0.5161;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,2;MQ=38;PV4=1,0.26,1,1  PL:GT:GQ        31,0,12:0/1:15
+chr17  31254021        .       C       T       15.1    .       DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=35        PL:GT:GQ        47,9,0:1/1:63
+chr17  32516798        .       G       A       37.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ        69,6,0:1/1:49
+chr17  32600253        .       A       G       16.6    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=25 PL:GT:GQ        49,12,0:1/1:72
+chr17  34255214        .       G       C       19.2    .       DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=21 PL:GT:GQ        52,18,0:1/1:90
+chr17  34365900        .       T       C       93.1    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=38 PL:GT:GQ        126,18,0:1/1:90
+chr17  35380386        .       A       T       6.79    .       DP=44;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=46        PL:GT:GQ        37,6,0:1/1:49
+chr17  41993344        .       C       T       64      .       DP=41;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,41;MQ=16 PL:GT:GQ        97,123,0:1/1:99
+chr17  42128201        .       A       G       4.13    .       DP=5;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,2;MQ=52;PV4=1,0.0041,1,1 PL:GT:GQ        32,0,62:0/1:35
+chr17  42984490        .       C       A       56      .       DP=33;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=6,0,12,0;MQ=42;PV4=1,0.004,1,1        PL:GT:GQ        86,0,34:0/1:37
+chr17  43419457        .       G       A       99      .       DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,14;MQ=45 PL:GT:GQ        185,42,0:1/1:99
+chr17  43421225        .       A       G       65.1    .       DP=31;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,6,0,17;MQ=43;PV4=1,0.004,1,1       PL:GT:GQ        98,18,0:1/1:90
+chr17  45206897        .       G       A       22      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=47 PL:GT:GQ        54,9,0:1/1:63
+chr17  45381302        .       T       C       18.6    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=25 PL:GT:GQ        51,12,0:1/1:72
+chr17  45530812        .       C       A       3.54    .       DP=6;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=0,3,0,2;MQ=40;PV4=1,1,0.37,1   PL:GT:GQ        31,0,58:0/1:34
+chr17  50242633        .       G       A       44      .       DP=42;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,25,0,13;MQ=32;PV4=1,0.084,0.14,1       PL:GT:GQ        74,0,154:0/1:77
+chr17  51275317        .       G       A       14.9    .       DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=31        PL:GT:GQ        46,6,0:1/1:49
+chr17  52325530        .       C       T       29      .       DP=19;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,18;MQ=24 PL:GT:GQ        62,54,0:1/1:99
+chr17  52411748        .       T       G       18.6    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=25 PL:GT:GQ        51,12,0:1/1:72
+chr17  53190746        .       C       G       62.1    .       DP=20;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=40        PL:GT:GQ        95,18,0:1/1:90
+chr17  58289916        .       T       C       18.2    .       DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=22 PL:GT:GQ        51,18,0:1/1:90
+chr17  59796875        .       C       T       42      .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=35 PL:GT:GQ        74,9,0:1/1:63
diff --git a/tests/tabix_data/vcf/13.vcf b/tests/tabix_data/vcf/13.vcf
new file mode 100644 (file)
index 0000000..08b54e0
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,220 @@
+##fileformat=VCFv4.0
+##fileDate=2011-10-11
+##source=Platypus_Version_0.1.5
+##INFO=<ID=func,Number=1,Type=String,Description="Functional category: exnoic, intergenic etc">
+##INFO=<ID=gene,Number=2,Type=String,Description="RefSeq gene name">
+##INFO=<ID=exon_func,Number=1,Type=String,Description="Exonic function of the variant">
+##INFO=<ID=AAchange,Number=1,Type=String,Description="Amino Acid change">
+##INFO=<ID=cons46,Number=1,Type=String,Description="UCSC 46 species conservation score">
+##INFO=<ID=segdup,Number=1,Type=Float,Description="UCSC segment duplication score">
+##INFO=<ID=1000g,Number=1,Type=Float,Description="1000 genomes allelic frequency">
+##INFO=<ID=dbsnp,Number=1,Type=String,Description="dbSNP ID">
+##INFO=<ID=sift,Number=1,Type=Float,Description="SIFT score">
+##INFO=<ID=pp2,Number=1,Type=Float,Description="PolyPhen2 score">
+##INFO=<ID=phylop,Number=1,Type=Float,Description="Phylop score">
+##INFO=<ID=mutT,Number=1,Type=Float,Description="Mutation Taster score">
+##INFO=<ID=LRT,Number=1,Type=Float,Description="LRT score">
+##INFO=<ID=FR,Number=0,Type=Float,Description="Estimated population frequency">
+##INFO=<ID=RPV,Number=0,Type=Float,Description="Median minimum base quality for bases around variant">
+##INFO=<ID=RPV,Number=0,Type=Float,Description="Reverse strand p-value">
+##INFO=<ID=TCR,Number=0,Type=Integer,Description="Total reverse strand coverage at this locus">
+##INFO=<ID=HP,Number=1,Type=Integer,Description="Homopolmer run length">
+##INFO=<ID=ABPV,Number=0,Type=Float,Description="Allele-bias p-value. Testing for low variant coverage">
+##INFO=<ID=TR,Number=0,Type=Integer,Description="Total number of reads containing this variant">
+##INFO=<ID=PP,Number=0,Type=Float,Description="Posterior probability (phred scaled) that this variant segregates">
+##INFO=<ID=NF,Number=0,Type=Integer,Description="Total number of forward reads containing this variant">
+##INFO=<ID=SC,Number=1,Type=String,Description="Genomic sequence 10 bases either side of variant position">
+##INFO=<ID=FPV,Number=0,Type=Float,Description="Forward strand p-value">
+##INFO=<ID=TCF,Number=0,Type=Integer,Description="Total forward strand coverage at this locus">
+##INFO=<ID=NR,Number=0,Type=Integer,Description="Total number of reverse reads containing this variant">
+##INFO=<ID=RMP,Number=0,Type=Float,Description="RMS Position in reads of Variant">
+##INFO=<ID=TC,Number=0,Type=Integer,Description="Total coverage at this locus">
+##FILTER=<ID=sb,Description="Variant fails strand-bias filter">
+##FILTER=<ID=ab,Description="Variant fails allele-bias filter">
+##FILTER=<ID=badReads,Description="Variant supported only by reads with low quality bases close to variant position, and not present on both strands.">
+##FILTER=<ID=hp10,Description="Flanking sequence contains homopolymer of length 10 or greater">
+##FORMAT=<ID=GL,Number=.,Type=Float,Description="Genotype log-likelihoods (log10) for AA,AB and BB genotypes, where A = ref and B = variant. Only applicable for bi-allelic sites">
+##FORMAT=<ID=GT,Number=1,Type=String,Description="Unphased genotypes">
+##FORMAT=<ID=NR,Number=1,Type=Integer,Description="Number of reads covering variant in this sample">
+##FORMAT=<ID=GQ,Number=1,Type=Integer,Description="Genotype quality, as Phred score">
+##FORMAT=<ID=GT:GL:GQ:NR,Number=.,Type=String,Description="(Undefined tag)">
+#CHROM POS     ID      REF     ALT     QUAL    FILTER  INFO    FORMAT  WTCHG_27173_05.bam      WTCHG_27173_04.bam
+chr1   1451489 .       T       C       103     PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=7.56e-01;FR=0.2501;HP=7;MMLQ=30;NF=2;NR=18;PP=103;RMP=57.54;RPV=1.00e-00;SC=CCGGTGTGGGTGGGGAGGCCG;TC=42;TCF=7;TCR=35;TR=20;func=intronic;gene=ATAD3A;segdup=0.91;1000g=0.36;dbsnp=rs76717221  GT:GL:GQ:NR     0/0:-43.28,-51.0,-125.34:35:18  1/0:-135.58,-103.29,-138.87:100:24
+chr1   1451490 .       G       A       73      PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=9.29e-01;FR=0.2501;HP=3;MMLQ=30;NF=3;NR=16;PP=73;RMP=58.79;RPV=9.98e-01;SC=CGGTGTGGGTGGGGAGGCCGG;TC=42;TCF=7;TCR=35;TR=19;func=intronic;gene=ATAD3A;segdup=0.91;1000g=0.33;dbsnp=rs9439460    GT:GL:GQ:NR     0/0:-43.28,-50.99,-127.79:35:18 0/1:-135.58,-110.35,-146.87:100:24
+chr1   12939904        .       A       C       109     PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=7.66e-01;FR=0.2500;HP=1;MMLQ=37;NF=22;NR=1;PP=109;RMP=45.66;RPV=4.46e-06;SC=ATTGTGAGGAACTTTAACGAG;TC=132;TCF=79;TCR=53;TR=23  GT:GL:GQ:NR     0/0:-40.31,-50.48,-301.89:45:53 0/1:-121.0,-87.39,-396.61:100:79
+chr1   16902943        .       T       C       50      PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=2.90e-01;FR=0.2506;HP=2;MMLQ=34;NF=30;NR=18;PP=50;RMP=46.42;RPV=8.84e-01;SC=GGGTCAGCTCTCGTTCCTGAG;TC=191;TCF=133;TCR=58;TR=48 GT:GL:GQ:NR     0/0:-337.26,-342.92,-618.53:26:93       0/1:-428.71,-408.75,-668.15:84:98
+chr1   16902982        .       G       T       41      PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=5.26e-02;FR=0.2500;HP=1;MMLQ=36;NF=29;NR=10;PP=41;RMP=55.68;RPV=1.90e-02;SC=ATTGCCTAAGGTGAGACGGTA;TC=223;TCF=152;TCR=71;TR=39 GT:GL:GQ:NR     0/0:-282.16,-293.75,-760.18:52:108      0/1:-308.83,-290.99,-786.16:75:115
+chr1   16918180        .       C       T       200     PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=7.60e-05;FR=0.2500;HP=1;MMLQ=37;NF=8;NR=11;PP=200;RMP=57.84;RPV=6.15e-01;SC=TACTTTGGTACCTCTGTCTTC;TC=134;TCF=91;TCR=43;TR=19  GT:GL:GQ:NR     0/0:-48.3,-68.7,-289.28:90:47   0/1:-194.28,-132.13,-452.09:100:87
+chr1   17083652        .       C       T       200     PASS    ABPV=3.06e-02;FPV=6.38e-13;FR=0.2500;HP=2;MMLQ=36;NF=29;NR=3;PP=200;RMP=38.16;RPV=2.05e-02;SC=AAATCTCAACCTTGAGTACAA;TC=350;TCF=317;TCR=33;TR=32;func=ncRNA;gene=MST1P9;cons46=632 Name=lod=492;segdup=0.99;1000g=0.37;dbsnp=rs113710576 GT:GL:GQ:NR     0/0:-547.14,-559.85,-1017.76:56:159     0/1:-723.35,-656.42,-1167.76:100:191
+chr1   17083776        .       C       A       79      PASS    ABPV=1.08e-01;FPV=7.38e-01;FR=0.2500;HP=1;MMLQ=35;NF=1;NR=22;PP=79;RMP=76.99;RPV=1.13e-09;SC=CACAGAGACACGCGTGAAGAC;TC=238;TCF=4;TCR=234;TR=23;func=ncRNA;gene=MST1P9;cons46=632 Name=lod=492;segdup=0.99;1000g=0.20;dbsnp=rs56318124    GT:GL:GQ:NR     0/0:-442.45,-455.85,-790.66:59:121      0/1:-451.84,-425.21,-717.41:100:117
+chr1   17575714        .       G       A       59      PASS    ABPV=2.52e-01;FPV=3.10e-02;FR=0.2500;HP=1;MMLQ=31;NF=1;NR=4;PP=59;RMP=43.35;RPV=1.94e-02;SC=GACCCTCGTGGACATTTATGG;TC=58;TCF=19;TCR=39;TR=5      GT:GL:GQ:NR     0/0:-14.49,-33.87,-234.95:85:32 0/1:-39.36,-17.32,-168.9:93:26
+chr1   21751228        .       T       TCGCGCCCGGC     66      PASS    ABPV=3.86e-06;FPV=8.03e-37;FR=0.2500;HP=4;NF=1;NR=1;PP=66;RMP=15.56;RPV=1.98e-06;SC=CTCAAATGAGTAAAAGGCACT;TC=133;TCF=77;TCR=56;TR=2     GT:GL:GQ:NR     0/0:-178.34,-190.57,-398.5:54:72        0/1:-308.3,-271.14,-540.05:100:98
+chr1   21755539        .       C       A       27      PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=9.84e-01;FR=0.2503;HP=1;MMLQ=31;NF=2;NR=1;PP=27;RMP=65.83;RPV=4.98e-02;SC=GGCCAACAACCGCCAGGTGCG;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=3;func=intergenic;gene=ECE1(dist=83505) NBPF3(dist=11092);cons46=807 Name=lod=2532;segdup=0.99;1000g=0.80;dbsnp=rs3855556       GT:GL:GQ:NR     0/0:0.0,-6.22,-62.68:28:10      1/0:-21.51,-6.92,-52.98:61:10
+chr1   40798730        .       A       AT      59      PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=6.06e-01;FR=0.2504;HP=10;NF=7;NR=1;PP=59;RMP=50.29;RPV=7.38e-01;SC=GAAGTCTTCTATTTTTTTTTA;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=8;func=intergenic;gene=COL9A2(dist=15791) SMAP2(dist=40648);dbsnp=rs34372767   GT:GL:GQ:NR     0/0:0.0,-6.13,-39.37:28:12      0/1:-35.97,-10.49,-31.53:98:16
+chr1   142803580       .       TA      T       145     PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=6.35e-02;FR=0.2500;HP=6;NF=1;NR=11;PP=145;RMP=65.89;RPV=8.29e-02;SC=TTCATAGATTTAAAAAATTAT;TC=81;TCF=16;TCR=65;TR=12   GT:GL:GQ:NR     0/0:-39.18,-49.93,-242.54:48:33 1/0:-80.12,-35.74,-249.72:100:48
+chr1   144854799       .       C       T       50      PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=9.37e-01;FR=0.2504;HP=1;MMLQ=34;NF=1;NR=19;PP=50;RMP=60.89;RPV=9.86e-01;SC=GCCTCGGATACCTCCAGCTGA;TC=52;TCF=2;TCR=50;TR=20;func=intronic;gene=PDE4DIP;segdup=0.96;dbsnp=rs5004097      GT:GL:GQ:NR     0/0:-89.24,-95.22,-205.12:27:25 0/1:-177.25,-157.18,-246.67:85:27
+chr1   145116027       .       T       C       127     PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=1.00e+00;FR=0.2501;HP=2;MMLQ=34;NF=0;NR=7;PP=127;RMP=54.07;RPV=5.14e-01;SC=AAAAGAGATGTCCTGAAAATG;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=7;func=UTR3;gene=SEC22B;cons46=340 Name=lod=32;1000g=0.45;dbsnp=rs7550440      GT:GL:GQ:NR     0/0:0.0,-7.61,-92.94:34:11      0/1:-56.84,-19.14,-106.99:100:19
+chr1   146554532       .       C       T       57      PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=5.18e-01;FR=0.2501;HP=12;MMLQ=31;NF=4;NR=5;PP=57;RMP=66.19;RPV=4.68e-01;SC=CTTCTTCTTTCTTTTTTTTTA;TC=41;TCF=18;TCR=23;TR=9;func=intergenic;gene=LOC728989(dist=39933) PRKAB2(dist=72153);segdup=0.93;dbsnp=rs9662613   GT:GL:GQ:NR     0/0:-13.82,-21.42,-95.53:34:13  0/1:-131.76,-110.18,-223.87:91:28
+chr1   148344564       .       T       C       34      PASS    ABPV=3.69e-01;FPV=1.16e-03;FR=0.2500;HP=2;MMLQ=36;NF=24;NR=1;PP=34;RMP=22.65;RPV=1.98e-06;SC=TTCGTTCTTATTTCTCCCCGC;TC=218;TCF=162;TCR=56;TR=25  GT:GL:GQ:NR     0/0:-210.1,-224.84,-651.44:65:104       0/1:-232.74,-216.41,-586.14:69:114
+chr1   148853862       .       G       T       37      PASS    ABPV=3.79e-01;FPV=1.94e-02;FR=0.2500;HP=3;MMLQ=31;NF=6;NR=2;PP=37;RMP=50.34;RPV=2.58e-02;SC=CGCTCCTGGAGCCCAGCCCGG;TC=76;TCF=50;TCR=26;TR=8      GT:GL:GQ:NR     0/0:-247.75,-257.0,-317.61:41:35        1/0:-179.5,-162.62,-280.47:71:41
+chr1   148854004       .       C       T       32      PASS    ABPV=1.83e-01;FPV=3.17e-02;FR=0.2500;HP=1;MMLQ=34;NF=0;NR=3;PP=32;RMP=93.74;RPV=2.52e-02;SC=GCCCGCACTGCTGCAGCGCCC;TC=44;TCF=12;TCR=32;TR=3      GT:GL:GQ:NR     0/0:-75.02,-87.66,-197.34:56:26 1/0:-55.07,-39.25,-94.0:66:18
+chr1   152187606       .       G       A       200     PASS    ABPV=3.64e-01;FPV=4.08e-07;FR=0.2500;HP=2;MMLQ=32;NF=7;NR=16;PP=200;RMP=30.4;RPV=4.89e-02;SC=GAAGACTGACGGGAGCCAGAC;TC=202;TCF=109;TCR=93;TR=23;func=exonic;gene=HRNR;exon_func=nonsynonymous SNV;AAchange=NM_001009931:c.C6499T:p.R2167C;segdup=0.98;1000g=0.05;sift=0.2;pp2=0.269490;phylop=0.009549;mutT=0.062064;LRT=0.589002        GT:GL:GQ:NR     0/0:-190.82,-206.2,-650.62:68:98        0/1:-306.73,-239.37,-605.74:100:104
+chr1   152281007       .       A       G       38      PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=2.01e-01;FR=0.2500;HP=1;MMLQ=31;NF=37;NR=62;PP=38;RMP=56.83;RPV=9.75e-01;SC=GCCTGATCATAATGGGATCCT;TC=370;TCF=169;TCR=201;TR=99        GT:GL:GQ:NR     0/0:-830.31,-842.03,-1695.93:52:178     0/1:-1104.87,-1087.65,-1851.72:72:192
+chr1   152281008       .       A       G       56      PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=2.26e-01;FR=0.2500;HP=1;MMLQ=31;NF=37;NR=62;PP=56;RMP=57.69;RPV=9.75e-01;SC=CCTGATCATAATGGGATCCTT;TC=368;TCF=167;TCR=201;TR=99        GT:GL:GQ:NR     0/0:-836.29,-850.28,-1704.3:62:178      1/0:-1097.96,-1076.67,-1811.19:90:190
+chr1   152281466       .       C       T       200     PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=3.99e-04;FR=0.2500;HP=2;MMLQ=33;NF=26;NR=66;PP=200;RMP=66.62;RPV=7.23e-01;SC=TGCCCGTGACCGGCTCTGTCT;TC=430;TCF=180;TCR=250;TR=92       GT:GL:GQ:NR     0/0:-912.94,-966.99,-1954.85:100:223    1/0:-939.3,-872.22,-1720.42:100:207
+chr1   168549565       .       T       C       28      PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=1.00e+00;FR=0.2504;HP=2;MMLQ=37;NF=0;NR=8;PP=28;RMP=72.28;RPV=1.34e-01;SC=TCCTTATCAATCATGTCTTTC;TC=47;TCF=0;TCR=47;TR=8       GT:GL:GQ:NR     0/0:-27.57,-33.72,-167.32:28:21 1/0:-34.62,-19.62,-182.0:63:26
+chr1   236647542       .       G       T       46      PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=9.99e-01;FR=0.2500;HP=3;MMLQ=34;NF=16;NR=40;PP=46;RMP=62.31;RPV=1.00e-00;SC=GTGCAAGCTGGCCCAGGCCAA;TC=104;TCF=32;TCR=72;TR=56  GT:GL:GQ:NR     0/0:-318.17,-328.23,-521.3:45:54        1/0:-498.22,-479.17,-572.27:80:50
+chr1   236647562       .       T       C       73      PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=9.95e-01;FR=0.2503;HP=2;MMLQ=37;NF=11;NR=36;PP=73;RMP=64.25;RPV=1.00e-00;SC=ATGGTTGGTGTGTCATGGTGC;TC=85;TCF=23;TCR=62;TR=47   GT:GL:GQ:NR     0/0:-240.39,-246.81,-405.51:29:42       0/1:-421.95,-396.59,-483.66:100:43
+chr1   236700807       .       T       A       130     PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=5.12e-01;FR=0.2502;HP=2;MMLQ=33;NF=8;NR=7;PP=130;RMP=47.87;RPV=8.70e-01;SC=GTAATCCCGTTTGTTGGCACC;TC=55;TCF=34;TCR=21;TR=15;func=exonic;gene=LGALS8;exon_func=nonsynonymous SNV;AAchange=NM_201544:c.T56A:p.F19Y;cons46=463 Name=lod=102;1000g=0.62;dbsnp=rs2737713;pp2=0.0;phylop=0.983932;mutT=4.6E-5;LRT=0.999982   GT:GL:GQ:NR     0/0:-41.35,-48.14,-183.02:31:21 0/1:-204.57,-166.19,-295.14:100:34
+chr1   236700823       .       T       C       200     PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=6.24e-01;FR=0.2504;HP=2;MMLQ=32;NF=9;NR=8;PP=200;RMP=58.62;RPV=8.49e-01;SC=GCACCATTCCTGATCAGCTGG;TC=60;TCF=35;TCR=25;TR=17;func=exonic;gene=LGALS8;exon_func=synonymous SNV;AAchange=NM_201544:c.T72C:p.P24P;cons46=463 Name=lod=102;1000g=0.61;dbsnp=rs1041934       GT:GL:GQ:NR     0/0:-41.35,-47.43,-173.43:28:22 1/0:-232.08,-183.12,-325.41:100:38
+chr1   241663902       .       TGA     T       37      PASS    ABPV=2.57e-03;FPV=3.07e-05;FR=0.2507;HP=2;NF=0;NR=3;PP=37;RMP=44.45;RPV=2.39e-06;SC=TTTGAGTGAGTGAGAGAGAGA;TC=90;TCF=18;TCR=72;TR=3;func=intronic;gene=FH        GT:GL:GQ:NR     0/0:-115.58,-120.99,-206.17:25:29       1/0:-208.1,-188.38,-347.52:83:62
+chr10  52420020        .       G       A       135     PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=2.24e-01;FR=0.2502;HP=2;MMLQ=35;NF=3;NR=3;PP=135;RMP=58.04;RPV=7.75e-01;SC=GAGAACTTCCGGCTGCAGTAC;TC=30;TCF=20;TCR=10;TR=6     GT:GL:GQ:NR     0/0:-65.01,-71.52,-138.01:30:16 0/1:-83.86,-44.38,-74.93:100:14
+chr10  118380701       .       G       A       77      PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=5.15e-01;FR=0.2503;HP=3;MMLQ=32;NF=5;NR=0;PP=77;RMP=22.32;RPV=5.62e-01;SC=CCGGGTTGCGGGGCGTCTGTT;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=5       GT:GL:GQ:NR     0/0:-4.14,-10.38,-77.71:28:10   0/1:-51.41,-25.11,-83.53:100:14
+chr11  1651169 .       T       C       84      PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=9.98e-01;FR=0.2502;HP=2;MMLQ=33;NF=8;NR=26;PP=84;RMP=71.99;RPV=1.00e-00;SC=GCTGTGGCTCTGGCTGTGGGG;TC=71;TCF=14;TCR=57;TR=34;func=exonic;gene=KRTAP5-5;exon_func=synonymous SNV;AAchange=NM_001001480:c.T99C:p.S33S;1000g=0.29;dbsnp=rs71454095 GT:GL:GQ:NR     0/0:-199.38,-206.33,-365.55:31:38       0/1:-226.68,-198.86,-282.14:100:33
+chr11  3431576 .       G       A       33      PASS    ABPV=4.46e-01;FPV=4.99e-05;FR=0.2500;HP=1;MMLQ=30;NF=13;NR=10;PP=33;RMP=62.67;RPV=1.90e-02;SC=TCGTGTGTGAGTCCTACAGTG;TC=194;TCF=123;TCR=71;TR=23 GT:GL:GQ:NR     0/0:-71.93,-106.62,-693.75:100:102      1/0:-110.6,-94.58,-543.82:67:92
+chr11  43918703        .       C       CTTTTCATATTAT   36      PASS    ABPV=4.61e-02;FPV=1.12e-04;FR=0.2500;HP=3;NF=2;NR=0;PP=36;RMP=5.0;RPV=1.00e+00;SC=CTGACAGTGGCTTTATATATA;TC=49;TCF=49;TCR=0;TR=2 GT:GL:GQ:NR     0/0:-14.5,-34.6,-394.96:89:42   1/0:-47.66,-15.24,-223.69:100:36
+chr11  48366812        .       A       C       48      PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=9.80e-01;FR=0.2502;HP=1;MMLQ=35;NF=16;NR=2;PP=48;RMP=45.69;RPV=1.00e+00;SC=AGATAATTGAATGTCCCAAGT;TC=44;TCF=42;TCR=2;TR=18     GT:GL:GQ:NR     0/0:-92.79,-99.69,-183.18:31:18 0/1:-133.87,-114.4,-228.26:82:26
+chr11  48387506        .       A       G       48      PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=6.15e-01;FR=0.2500;HP=3;MMLQ=34;NF=28;NR=52;PP=48;RMP=59.69;RPV=1.00e-00;SC=AAATCCCCCGACCCATGCCAT;TC=227;TCF=109;TCR=118;TR=80;func=intergenic;gene=OR4C45(dist=13507) OR4A47(dist=122839);dbsnp=rs72898882;sift=0.42 GT:GL:GQ:NR     0/0:-665.75,-691.04,-1124.95:100:117    0/1:-697.01,-677.56,-1037.3:82:110
+chr11  56143357        .       G       A       91      PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=9.70e-04;FR=0.2500;HP=3;MMLQ=36;NF=7;NR=60;PP=91;RMP=66.63;RPV=1.00e-00;SC=GGAATTTCTTGTACAAACAAA;TC=221;TCF=72;TCR=149;TR=67;func=exonic;gene=OR8U1 OR8U8;exon_func=synonymous SNV;AAchange=NM_001005204:c.G258A:p.L86L;dbsnp=rs76949582      GT:GL:GQ:NR     0/0:-538.52,-560.54,-1080.28:97:104     1/0:-924.01,-894.57,-1497.61:100:131
+chr11  56468493        .       A       G       86      PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=1.31e-03;FR=0.2500;HP=1;MMLQ=30;NF=23;NR=16;PP=86;RMP=49.16;RPV=3.74e-01;SC=TCTGCCCCGCAGTGCTCATCC;TC=227;TCF=156;TCR=71;TR=39 GT:GL:GQ:NR     0/0:-212.22,-234.78,-819.52:99:105      0/1:-472.13,-443.86,-1063.46:100:122
+chr11  92592540        .       T       G       22      PASS    ABPV=9.72e-03;FPV=5.62e-02;FR=0.2501;HP=3;MMLQ=35;NF=0;NR=3;PP=22;RMP=99.66;RPV=8.62e-06;SC=GTTAGTGTTTTGGCTCTTGGA;TC=77;TCF=10;TCR=67;TR=3      GT:GL:GQ:NR     0/0:-302.47,-309.64,-322.1:32:36        0/1:-338.7,-325.07,-335.6:52:41
+chr11  123504959       .       C       G       200     PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=4.20e-01;FR=0.2508;HP=2;MMLQ=40;NF=0;NR=7;PP=200;RMP=63.62;RPV=9.72e-01;SC=CAGTGCCCAGCGTGGGAACAC;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=7;func=intronic;gene=SCN3B;1000g=0.72;dbsnp=rs1148110  GT:GL:GQ:NR     0/0:-1.61,-6.93,-61.43:24:8     1/0:-66.0,-7.62,-36.11:100:11
+chr12  92675   .       C       T       152     PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=7.38e-01;FR=0.2500;HP=1;MMLQ=37;NF=1;NR=7;PP=152;RMP=66.0;RPV=3.57e-01;SC=GGACTGTTTCCTGCTTGTAGC;TC=38;TCF=4;TCR=34;TR=8       GT:GL:GQ:NR     0/0:-41.61,-49.75,-120.62:37:14 1/0:-68.65,-25.34,-113.9:100:24
+chr12  11183642        .       A       G       154     PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=8.37e-01;FR=0.2500;HP=1;MMLQ=34;NF=47;NR=62;PP=154;RMP=57.25;RPV=1.00e-00;SC=GCTAGTAGCAAGCCAGTTGCT;TC=311;TCF=168;TCR=143;TR=109;func=exonic;gene=TAS2R31;exon_func=nonsynonymous SNV;AAchange=NM_176885:c.T293C:p.L98P;segdup=0.93;dbsnp=rs73049067  GT:GL:GQ:NR     0/0:-561.52,-579.71,-1246.3:80:152      0/1:-826.02,-782.04,-1401.37:100:159
+chr12  29908580        .       A       ATTGTT  200     PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=9.78e-01;FR=0.2507;HP=3;NF=10;NR=0;PP=200;RMP=36.19;RPV=1.00e+00;SC=TTTGGAAACTATTAAGTAATT;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=10;func=intronic;gene=TMTC1;dbsnp=rs3830194   GT:GL:GQ:NR     0/0:0.0,-5.55,-96.69:25:9       1/0:-151.5,-15.23,-76.28:100:17
+chr12  31282765        .       A       T       21      PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=8.68e-01;FR=0.2502;HP=2;MMLQ=35;NF=12;NR=5;PP=21;RMP=46.72;RPV=8.51e-01;SC=AATGAATACAAATTTTTTCAT;TC=53;TCF=38;TCR=15;TR=17    GT:GL:GQ:NR     0/0:-83.08,-89.72,-221.87:30:27 1/0:-63.64,-50.39,-170.59:55:26
+chr12  52843779        .       T       C       52      PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=1.21e-05;FR=0.2500;HP=4;MMLQ=20;NF=8;NR=16;PP=52;RMP=64.54;RPV=6.52e-01;SC=TTTGAACCCCTGGCTTCATCT;TC=161;TCF=100;TCR=61;TR=24;func=intronic;gene=KRT6B;segdup=0.93;dbsnp=rs380379      GT:GL:GQ:NR     0/0:-109.82,-139.81,-567.08:100:82      0/1:-186.27,-165.75,-481.84:87:79
+chr12  65471467        .       A       G       200     PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=6.42e-01;FR=0.2501;HP=2;MMLQ=36;NF=7;NR=0;PP=200;RMP=38.97;RPV=4.22e-01;SC=TGCATCTTAAATATTCTTATC;TC=30;TCF=27;TCR=3;TR=7;func=intronic;gene=WIF1;1000g=0.27;dbsnp=rs2289936   GT:GL:GQ:NR     0/0:0.0,-7.62,-98.02:34:12      1/0:-69.82,-23.48,-105.09:100:18
+chr12  99175091        .       AAC     A       86      PASS    ABPV=3.61e-01;FPV=7.09e-04;FR=0.2503;HP=1;NF=4;NR=0;PP=86;RMP=34.87;RPV=9.95e-03;SC=AAACAACAACAACACACACAC;TC=43;TCF=27;TCR=16;TR=4;func=intronic;gene=ANKS1B    GT:GL:GQ:NR     0/0:-4.37,-10.61,-100.0:28:17   0/1:-72.08,-41.09,-136.47:100:27
+chr12  104378526       .       G       GACACAGAAACT    200     PASS    ABPV=2.37e-01;FPV=8.53e-03;FR=0.2500;HP=1;NF=5;NR=0;PP=200;RMP=8.25;RPV=5.63e-02;SC=TGTGATTCTAGCTCTGCTATG;TC=59;TCF=49;TCR=10;TR=5      GT:GL:GQ:NR     0/0:0.0,-15.25,-297.25:67:32    1/0:-137.95,-64.82,-429.82:100:44
+chr13  25169091        .       A       G       41      PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=1.23e-02;FR=0.2501;HP=3;MMLQ=35;NF=18;NR=1;PP=41;RMP=17.52;RPV=3.10e-02;SC=AATAACCAAAACAGTTTTTTA;TC=133;TCF=114;TCR=19;TR=19  GT:GL:GQ:NR     0/0:-140.13,-147.81,-405.22:35:57       0/1:-204.4,-186.51,-512.07:75:76
+chr13  37795039        .       G       T       20      PASS    ABPV=5.69e-01;FPV=5.25e-01;FR=0.2502;HP=1;MMLQ=40;NF=2;NR=0;PP=20;RMP=33.0;RPV=7.49e-02;SC=TCCTTGGCCTGAGCTTCTTTG;TC=19;TCF=10;TCR=9;TR=2        GT:GL:GQ:NR     0/0:0.0,-6.93,-89.94:31:11      1/0:-22.03,-9.0,-57.23:54:8
+chr13  100517209       .       G       A       21      PASS    ABPV=2.00e-01;FPV=2.14e-03;FR=0.2500;HP=2;MMLQ=35;NF=6;NR=7;PP=21;RMP=94.07;RPV=9.71e-04;SC=GTGTGTGTGTGTATATGTGTG;TC=134;TCF=62;TCR=72;TR=13    GT:GL:GQ:NR     0/0:-265.23,-279.13,-623.6:62:70        1/0:-308.0,-294.6,-524.58:56:64
+chr13  114540947       .       C       CTCTGCTCTT      45      PASS    ABPV=1.42e-01;FPV=3.34e-03;FR=0.2500;HP=2;NF=2;NR=0;PP=45;RMP=1.0;RPV=5.62e-01;SC=CCACAGGAACCCAGCCAGCAG;TC=37;TCF=35;TCR=2;TR=2 GT:GL:GQ:NR     0/0:0.0,-11.09,-214.96:49:19    1/0:-74.37,-43.34,-288.0:100:27
+chr14  19118192        .       A       G       200     PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=1.32e-05;FR=0.2507;HP=2;MMLQ=32;NF=68;NR=76;PP=200;RMP=53.85;RPV=5.74e-02;SC=TGCTTGCCATATGTCATGGAT;TC=771;TCF=415;TCR=356;TR=144;func=intergenic;gene=NONE(dist=NONE) OR11H12(dist=259402);segdup=0.96;dbsnp=rs77434589       GT:GL:GQ:NR     0/0:-730.61,-736.03,-2441.78:25:349     1/0:-997.51,-891.65,-2847.93:100:422
+chr14  19500081        .       A       G       22      PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=1.61e-01;FR=0.2505;HP=3;MMLQ=22;NF=3;NR=0;PP=22;RMP=47.77;RPV=1.00e+00;SC=GGTGCACACCACTGTGGACGT;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=3       GT:GL:GQ:NR     0/0:-15.46,-21.36,-64.18:27:10  0/1:-27.84,-14.25,-57.82:57:12
+chr14  20137380        .       C       T       33      PASS    ABPV=1.24e-02;FPV=1.12e-09;FR=0.2500;HP=1;MMLQ=31;NF=8;NR=17;PP=33;RMP=61.98;RPV=3.46e-06;SC=TCACTGCCCTCGCCGCATGCA;TC=303;TCF=142;TCR=161;TR=25 GT:GL:GQ:NR     0/0:-373.48,-389.86,-1035.03:72:144     0/1:-475.48,-459.41,-1121.57:68:159
+chr14  64496872        .       G       C       96      PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=1.00e+00;FR=0.2503;HP=1;MMLQ=37;NF=0;NR=4;PP=96;RMP=55.12;RPV=5.17e-01;SC=AGAAATTCCAGTGGTATTCAG;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=4;func=intronic;gene=SYNE2;1000g=0.90;dbsnp=rs3866737   GT:GL:GQ:NR     0/0:0.0,-6.24,-83.73:28:9       0/1:-36.8,-6.24,-45.77:100:9
+chr14  106881425       .       A       G       71      PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=1.15e-01;FR=0.2500;HP=1;MMLQ=32;NF=4;NR=10;PP=71;RMP=49.71;RPV=2.88e-01;SC=CCATCCACTCAAGCCCTTGTC;TC=78;TCF=29;TCR=49;TR=14    GT:GL:GQ:NR     0/0:-39.35,-48.57,-258.02:41:30 1/0:-231.62,-206.72,-399.17:100:48
+chr14  106881452       .       T       C       66      PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=3.03e-01;FR=0.2509;HP=1;MMLQ=27;NF=3;NR=10;PP=66;RMP=65.33;RPV=1.89e-01;SC=CTGGTCACACTGAATTCATAC;TC=71;TCF=18;TCR=53;TR=13    GT:GL:GQ:NR     0/0:-57.13,-62.37,-258.3:24:30  0/1:-168.08,-144.38,-338.93:100:41
+chr14  107034967       .       T       C       105     PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=6.54e-01;FR=0.2500;HP=1;MMLQ=34;NF=6;NR=9;PP=105;RMP=58.51;RPV=6.64e-01;SC=ACAGGAGATCTTCAGAGACTC;TC=57;TCF=23;TCR=34;TR=15    GT:GL:GQ:NR     0/0:-163.23,-172.19,-255.57:40:20       1/0:-379.46,-346.84,-445.34:100:39
+chr15  20083754        .       G       A       54      PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=5.67e-01;FR=0.2500;HP=2;MMLQ=36;NF=33;NR=5;PP=54;RMP=47.07;RPV=4.22e-01;SC=AAATCATTATGTGCTTTGAGA;TC=155;TCF=131;TCR=24;TR=38  GT:GL:GQ:NR     0/0:-122.79,-137.29,-483.11:64:64       1/0:-176.25,-155.43,-655.46:88:91
+chr15  20446256        .       G       C       57      PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=1.00e+00;FR=0.2500;HP=2;MMLQ=34;NF=1;NR=7;PP=57;RMP=71.88;RPV=4.32e-01;SC=CATGCAAGAAGCTGGAAAGCC;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=8;func=intergenic;gene=NONE(dist=NONE) LOC646096(dist=41741);segdup=0.97;dbsnp=rs3907011        GT:GL:GQ:NR     0/0:-13.82,-23.14,-131.81:42:16 0/1:-45.04,-23.56,-104.26:91:17
+chr15  20875055        .       C       G       154     PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=7.50e-01;FR=0.2504;HP=3;MMLQ=37;NF=0;NR=12;PP=154;RMP=60.19;RPV=1.71e-01;SC=AATTTAAACGCAAATTAGTAA;TC=64;TCF=1;TCR=63;TR=12;func=ncRNA;gene=NBEAP1;segdup=0.93;1000g=0.26;dbsnp=rs7496378      GT:GL:GQ:NR     0/0:-9.2,-15.25,-188.16:27:22   0/1:-137.96,-94.13,-342.43:100:42
+chr15  20875100        .       A       G       21      PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=7.50e-01;FR=0.2502;HP=4;MMLQ=35;NF=0;NR=6;PP=21;RMP=81.39;RPV=2.77e-01;SC=AGAGGTTAAAAATAACTTTCT;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=6;func=ncRNA;gene=NBEAP1;cons46=243 Name=lod=13;segdup=0.93;1000g=0.28;dbsnp=rs7497715  GT:GL:GQ:NR     0/0:-7.83,-14.75,-92.12:31:10   1/0:-92.65,-79.35,-211.07:56:23
+chr15  21140945        .       C       T       26      PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=1.00e-01;FR=0.2506;HP=2;MMLQ=33;NF=1;NR=3;PP=26;RMP=65.04;RPV=7.12e-01;SC=ACATGTACAGCGCCACACTTC;TC=25;TCF=14;TCR=11;TR=4;func=intergenic;gene=NF1P2(dist=6320) LOC348120(dist=4822);cons46=679 Name=lod=765;segdup=1.00;1000g=0.24;dbsnp=rs12324229   GT:GL:GQ:NR     0/0:-16.95,-22.6,-60.18:26:13   0/1:-36.66,-22.19,-44.85:61:12
+chr15  28900400        .       G       T       133     PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=6.31e-01;FR=0.2502;HP=3;MMLQ=34;NF=14;NR=0;PP=133;RMP=36.99;RPV=4.21e-01;SC=GCTTGTCATTGTAAATTTTCT;TC=57;TCF=54;TCR=3;TR=14    GT:GL:GQ:NR     0/0:-26.38,-32.94,-192.24:30:27 1/0:-71.34,-32.36,-180.89:100:30
+chr15  75656200        .       G       A       75      PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=6.28e-01;FR=0.2507;HP=6;MMLQ=37;NF=4;NR=0;PP=75;RMP=47.43;RPV=1.00e+00;SC=CCAGCCCCCCGGCCCCGTTTT;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=4       GT:GL:GQ:NR     0/0:-7.14,-12.68,-76.44:25:8    0/1:-34.75,-8.99,-31.71:100:8
+chr15  76075732        .       A       C       29      PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=9.97e-01;FR=0.2501;HP=2;MMLQ=34;NF=11;NR=15;PP=29;RMP=61.41;RPV=9.58e-01;SC=ATCCCTATCTATCCAGGCCTT;TC=64;TCF=22;TCR=42;TR=26   GT:GL:GQ:NR     0/0:-89.15,-96.33,-237.9:32:31  1/0:-134.14,-119.09,-238.26:63:33
+chr15  100340178       .       C       G       52      PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=1.76e-01;FR=0.2500;HP=1;MMLQ=31;NF=5;NR=5;PP=52;RMP=87.78;RPV=1.32e-01;SC=AGTGTCTTCTCGTTCCCACGC;TC=64;TCF=31;TCR=33;TR=10;func=ncRNA;gene=DNM1P46;cons46=699 Name=lod=923;segdup=0.97;sift=0.27       GT:GL:GQ:NR     0/0:-139.12,-149.96,-310.47:37:36       1/0:-206.67,-186.19,-317.68:87:38
+chr15  102303399       .       C       T       65      PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=4.32e-02;FR=0.2500;HP=2;MMLQ=34;NF=5;NR=30;PP=65;RMP=65.58;RPV=1.00e-00;SC=AGAGCTGCTGCCCAACCTGCA;TC=90;TCF=40;TCR=50;TR=35;func=intergenic;gene=TARSL2(dist=38754) OR4F6(dist=42524);cons46=920 Name=lod=7327;segdup=0.98;1000g=0.50;dbsnp=rs71416239 GT:GL:GQ:NR     0/0:-129.26,-138.34,-250.21:41:46       0/1:-118.78,-95.27,-224.48:100:44
+chr15  102506389       .       C       T       50      PASS    ABPV=6.29e-01;FPV=1.27e-01;FR=0.2500;HP=1;MMLQ=34;NF=1;NR=3;PP=50;RMP=67.19;RPV=2.63e-01;SC=GGATGCCCTGCAGTACCTGCA;TC=32;TCF=13;TCR=19;TR=4      GT:GL:GQ:NR     0/0:-3.9,-15.65,-133.88:52:17   0/1:-31.25,-11.29,-72.06:84:15
+chr16  9250260 .       T       G       22      PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=1.00e-02;FR=0.2500;HP=2;MMLQ=29;NF=0;NR=4;PP=22;RMP=37.36;RPV=8.85e-01;SC=CACCTATTATTCCATGAATTC;TC=27;TCF=16;TCR=11;TR=4;func=intergenic;gene=C16orf72(dist=36705) MIR548X(dist=78514);cons46=749 Name=lod=1471;1000g=0.73;dbsnp=rs12929693   GT:GL:GQ:NR     0/0:-1.84,-10.83,-100.69:40:14  0/1:-25.85,-12.37,-70.66:56:13
+chr16  21747662        .       G       A       36      PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=2.01e-01;FR=0.2500;HP=1;MMLQ=34;NF=16;NR=6;PP=36;RMP=40.34;RPV=5.40e-05;SC=CTGTCTTTCAGTCTGTTCGGA;TC=159;TCF=79;TCR=80;TR=22   GT:GL:GQ:NR     0/0:-69.29,-88.69,-470.14:85:75 1/0:-171.53,-154.82,-534.35:70:84
+chr16  28618446        .       T       C       36      PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=8.61e-01;FR=0.2500;HP=3;MMLQ=32;NF=6;NR=14;PP=36;RMP=63.74;RPV=5.40e-01;SC=ACACAGCCTGTCCCAGGCCAG;TC=75;TCF=18;TCR=57;TR=20    GT:GL:GQ:NR     0/0:-33.24,-41.67,-205.86:38:27 0/1:-113.92,-97.17,-312.83:70:48
+chr16  33390329        .       G       C       24      PASS    ABPV=6.16e-01;FPV=4.32e-02;FR=0.2500;HP=2;MMLQ=34;NF=5;NR=0;PP=24;RMP=54.47;RPV=1.00e+00;SC=TTAGAAACAGGTTCACAATTG;TC=40;TCF=40;TCR=0;TR=5;func=intergenic;gene=LOC390705(dist=91627) LINC00273(dist=570723);segdup=0.97;1000g=0.32;dbsnp=rs12232434     GT:GL:GQ:NR     0/0:-6.09,-14.55,-170.95:38:21  0/1:-47.14,-33.16,-147.34:58:19
+chr16  33401967        .       G       A       116     PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=1.64e-02;FR=0.2500;HP=2;MMLQ=34;NF=16;NR=15;PP=116;RMP=51.2;RPV=2.96e-01;SC=GAGGTCTGCCGACAGCTGCAC;TC=172;TCF=102;TCR=70;TR=31;func=intergenic;gene=LOC390705(dist=103265) LINC00273(dist=559085);cons46=611 Name=lod=406;segdup=0.97;dbsnp=rs8047578  GT:GL:GQ:NR     0/0:-133.55,-144.14,-490.22:47:76       1/0:-209.17,-173.99,-648.51:100:96
+chr16  33407954        .       C       G       34      PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=4.21e-01;FR=0.2507;HP=3;MMLQ=34;NF=0;NR=3;PP=34;RMP=61.08;RPV=5.19e-01;SC=GAAATTGTCTCGGGCCTGAAG;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=3       GT:GL:GQ:NR     0/0:-10.82,-16.36,-77.44:25:9   1/0:-63.55,-47.37,-59.15:58:8
+chr16  46405120        .       C       G       37      PASS    ABPV=3.94e-02;FPV=4.07e-03;FR=0.2510;HP=2;MMLQ=40;NF=2;NR=1;PP=37;RMP=51.27;RPV=3.18e-03;SC=CGATTCCATTCGATAATGATT;TC=62;TCF=34;TCR=28;TR=3      GT:GL:GQ:NR     0/0:-129.24,-134.38,-161.33:24:28       0/1:-205.7,-188.69,-196.8:42:34
+chr16  58148083        .       C       CACACGCAGGTACA  31      PASS    ABPV=1.69e-01;FPV=1.00e+00;FR=0.2500;HP=2;NF=0;NR=2;PP=31;RMP=88.0;RPV=3.34e-03;SC=CAGGGAAGCACCCACCCTTGT;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=2        GT:GL:GQ:NR     0/0:-11.28,-21.68,-223.8:46:16  0/1:-62.86,-30.44,-243.59:100:20
+chr17  5036281 .       G       C       48      PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=8.00e-01;FR=0.2500;HP=1;MMLQ=32;NF=14;NR=49;PP=48;RMP=47.67;RPV=9.22e-01;SC=AAGCACAGTAGCAAAGTAATG;TC=214;TCF=48;TCR=166;TR=63 GT:GL:GQ:NR     0/0:-506.02,-514.23,-1090.2:37:117      0/1:-460.03,-440.62,-871.14:82:97
+chr17  6328747 .       T       G       200     PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=8.77e-01;FR=0.2507;HP=4;MMLQ=32;NF=8;NR=5;PP=200;RMP=59.22;RPV=9.45e-01;SC=GGCCACTTGCTCCCTGCCTGG;TC=36;TCF=24;TCR=12;TR=13    GT:GL:GQ:NR     0/0:-4.84,-10.37,-69.24:25:8    0/1:-116.1,-23.7,-86.84:100:28
+chr17  14140191        .       G       A       125     PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=3.98e-02;FR=0.2500;HP=1;MMLQ=34;NF=2;NR=11;PP=125;RMP=71.76;RPV=3.84e-02;SC=AGCTGTTTACGGCGCTGACTC;TC=95;TCF=24;TCR=71;TR=13;func=upstream;gene=CDRT15;segdup=0.99;1000g=0.17;dbsnp=rs28533558 GT:GL:GQ:NR     0/0:-146.51,-156.3,-338.05:44:40        0/1:-162.79,-125.58,-384.62:100:55
+chr17  21904955        .       G       A       29      PASS    ABPV=1.46e-01;FPV=3.00e-01;FR=0.2500;HP=2;MMLQ=33;NF=1;NR=7;PP=29;RMP=77.08;RPV=5.90e-05;SC=GTGGCACGGCGCTGTATCCTG;TC=95;TCF=9;TCR=86;TR=8       GT:GL:GQ:NR     0/0:-95.23,-110.26,-302.39:67:42        0/1:-104.15,-88.94,-334.7:64:53
+chr17_gl000205_random  114392  .       G       GC      200     PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=1.00e+00;FR=0.2503;HP=1;NF=1;NR=9;PP=200;RMP=62.13;RPV=8.86e-01;SC=GAGCTTCTATGAGGCGTGGGG;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=10;func=intergenic;gene=NONE(dist=NONE) MGC70870(dist=2231)    GT:GL:GQ:NR     0/0:0.0,-6.24,-93.01:28:9       0/1:-137.06,-63.68,-124.76:100:19
+chr17_gl000205_random  118186  .       TCGC    T       157     PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=4.85e-02;FR=0.2506;HP=1;NF=4;NR=5;PP=157;RMP=51.77;RPV=1.51e-01;SC=CCATCATAAGTCGCATCCCGG;TC=55;TCF=23;TCR=32;TR=9;func=ncRNA;gene=MGC70870;cons46=824 Name=lod=2972;segdup=0.90       GT:GL:GQ:NR     0/0:-80.93,-86.51,-246.22:26:23 0/1:-151.92,-104.34,-309.99:100:34
+chr17_gl000205_random  118289  .       G       A       30      PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=2.43e-02;FR=0.2500;HP=1;MMLQ=38;NF=1;NR=4;PP=30;RMP=51.3;RPV=5.18e-01;SC=TGAGCTCAGTGGTGCTACCTA;TC=38;TCF=20;TCR=18;TR=5       GT:GL:GQ:NR     0/0:-92.27,-100.53,-170.2:37:15 0/1:-193.59,-178.31,-262.43:64:23
+chr17_gl000205_random  122791  .       T       C       124     PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=6.72e-01;FR=0.2504;HP=1;MMLQ=34;NF=8;NR=0;PP=124;RMP=54.5;RPV=1.00e+00;SC=GATATAAACTTCTAAAATTCA;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=8;func=intergenic;gene=MGC70870(dist=3059) NONE(dist=NONE)      GT:GL:GQ:NR     0/0:-33.82,-39.98,-100.64:28:10 1/0:-177.82,-140.79,-190.46:100:20
+chr18  14183747        .       T       C       115     PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=9.72e-01;FR=0.2500;HP=5;MMLQ=36;NF=49;NR=88;PP=115;RMP=54.47;RPV=9.86e-01;SC=ACAAAGAAAATAGAACGCCTT;TC=444;TCF=156;TCR=288;TR=137      GT:GL:GQ:NR     0/0:-919.95,-948.86,-1765.89:100:211    0/1:-1189.4,-1154.37,-1918.79:100:233
+chr19  3611146 .       A       G       30      PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=5.15e-01;FR=0.2501;HP=1;MMLQ=24;NF=6;NR=1;PP=30;RMP=42.3;RPV=2.44e-01;SC=CCCTGTGCTCAGAGGTGGGGG;TC=36;TCF=26;TCR=10;TR=7;func=ncRNA;gene=C19orf29-AS1;1000g=0.56;dbsnp=rs2074786       GT:GL:GQ:NR     0/0:-27.63,-35.13,-121.04:34:15 0/1:-69.97,-54.53,-137.67:65:21
+chr19  12543121        .       C       G       200     PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=7.14e-01;FR=0.2502;HP=7;MMLQ=40;NF=11;NR=0;PP=200;RMP=33.87;RPV=7.50e-01;SC=TTCTTTGCTTCTTTTTAAATT;TC=41;TCF=40;TCR=1;TR=11;func=intronic;gene=ZNF443;segdup=0.96;dbsnp=rs74181652     GT:GL:GQ:NR     0/0:-8.47,-15.46,-153.74:32:20  0/1:-71.21,-15.46,-97.4:100:21
+chr19  15014189        .       T       C       90      PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=1.97e-01;FR=0.2500;HP=4;MMLQ=100;NF=2;NR=5;PP=90;RMP=90.56;RPV=4.68e-01;SC=GAGTGAGTTGTGGGTTGCAGC;TC=39;TCF=16;TCR=23;TR=7     GT:GL:GQ:NR     0/0:-190.71,-200.49,-255.11:44:24       1/0:-174.95,-145.84,-178.61:100:15
+chr19  41515263        .       A       G       88      PASS    ABPV=3.76e-01;FPV=1.82e-01;FR=0.2500;HP=2;MMLQ=33;NF=7;NR=3;PP=88;RMP=64.16;RPV=2.48e-04;SC=AGCGCCCCCAAGGACCTCATC;TC=93;TCF=40;TCR=53;TR=10;func=exonic;gene=CYP2B6;exon_func=nonsynonymous SNV;AAchange=NM_000767:c.A785G:p.K262R;segdup=0.92;1000g=0.20;dbsnp=rs2279343;pp2=0.0;phylop=0.086093;mutT=1.0E-6;LRT=0.999974      GT:GL:GQ:NR     0/0:-4.81,-28.32,-273.38:100:41 0/1:-65.82,-37.11,-263.4:100:52
+chr19  42188037        .       C       T       114     PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=6.06e-02;FR=0.2500;HP=4;MMLQ=34;NF=2;NR=8;PP=114;RMP=98.9;RPV=1.54e-02;SC=GTGTGGCCCCCTTGGTTCCCC;TC=73;TCF=11;TCR=62;TR=10     GT:GL:GQ:NR     0/0:-205.49,-214.25,-251.15:29:29       0/1:-379.34,-343.91,-357.8:15:44
+chr19  50474708        .       T       G       61      PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=7.17e-01;FR=0.2501;HP=2;MMLQ=30;NF=5;NR=1;PP=61;RMP=67.96;RPV=3.09e-02;SC=CTGGGCTCAGTGTCCCAGAGC;TC=37;TCF=18;TCR=19;TR=6      GT:GL:GQ:NR     0/0:-86.34,-93.74,-137.77:33:15 0/1:-129.81,-107.4,-147.05:95:22
+chr19  52977823        .       A       G       102     PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=3.15e-01;FR=0.2507;HP=2;MMLQ=35;NF=0;NR=4;PP=102;RMP=41.58;RPV=8.84e-01;SC=GTTTCTCTCCAGTATGAATTC;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=4;func=intronic;gene=ZNF578;cons46=395 Name=lod=54;1000g=0.94;dbsnp=rs1673901  GT:GL:GQ:NR     0/0:0.0,-5.54,-65.87:25:9       1/0:-36.12,-4.16,-18.86:71:6
+chr19  54726711        .       G       T       43      PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=1.00e-00;FR=0.2504;HP=3;MMLQ=31;NF=22;NR=2;PP=43;RMP=52.84;RPV=6.78e-01;SC=GTCCCCGCCCGGGTGCCTCCT;TC=53;TCF=45;TCR=8;TR=24     GT:GL:GQ:NR     0/0:-47.88,-54.03,-95.64:28:18  1/0:-164.89,-146.64,-206.88:77:35
+chr2   905553  .       G       C       76      PASS    ABPV=1.62e-02;FPV=5.75e-08;FR=0.2500;HP=2;MMLQ=31;NF=1;NR=7;PP=76;RMP=95.73;RPV=1.04e-02;SC=GCCTGCACTGGGTCTGGTGTT;TC=128;TCF=69;TCR=59;TR=8     GT:GL:GQ:NR     0/0:-314.19,-325.21,-450.94:49:57       0/1:-390.34,-364.48,-513.78:100:71
+chr2   905595  .       G       C       24      PASS    ABPV=1.21e-01;FPV=1.79e-02;FR=0.2500;HP=2;MMLQ=35;NF=5;NR=1;PP=24;RMP=13.0;RPV=6.96e-04;SC=GCCTGCACTGGGTCTGGTGTT;TC=79;TCF=45;TCR=34;TR=6       GT:GL:GQ:NR     0/0:-210.22,-219.58,-290.19:42:42       1/0:-197.49,-183.47,-250.46:59:38
+chr2   91885842        .       G       A       37      PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=2.46e-01;FR=0.2502;HP=1;MMLQ=36;NF=4;NR=0;PP=37;RMP=71.85;RPV=4.22e-01;SC=CCAACATTACGGAATTTGGAT;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=4       GT:GL:GQ:NR     0/0:-11.45,-18.39,-83.47:31:11  0/1:-59.01,-41.99,-86.53:72:16
+chr2   96525556        .       C       T       37      PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=1.00e-00;FR=0.2503;HP=1;MMLQ=37;NF=60;NR=2;PP=37;RMP=45.25;RPV=9.49e-01;SC=TCTCCTTATACGTCTTTAATA;TC=91;TCF=87;TCR=4;TR=62     GT:GL:GQ:NR     0/0:-304.4,-310.82,-406.42:29:43        0/1:-411.62,-394.62,-459.09:72:48
+chr2   107042620       .       C       T       45      PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=7.50e-01;FR=0.2500;HP=4;MMLQ=33;NF=0;NR=10;PP=45;RMP=77.64;RPV=2.94e-02;SC=GCAAGAGCTACAAATACAAAA;TC=69;TCF=1;TCR=68;TR=10;func=intronic;gene=RGPD3;cons46=333 Name=lod=30;segdup=0.99;dbsnp=rs2433787 GT:GL:GQ:NR     0/0:-9.17,-23.45,-154.19:63:21  1/0:-107.84,-88.96,-294.09:80:48
+chr2   132860931       .       G       A       113     PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=5.61e-01;FR=0.2507;HP=1;MMLQ=38;NF=0;NR=8;PP=113;RMP=69.43;RPV=9.58e-01;SC=GAAGAATGTGGTAAAGCCTTT;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=8      GT:GL:GQ:NR     0/0:-12.66,-18.1,-56.72:25:9    1/0:-57.64,-23.24,-50.67:100:13
+chr2   133020074       .       G       A       33      PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=9.94e-01;FR=0.2501;HP=2;MMLQ=36;NF=45;NR=12;PP=33;RMP=47.59;RPV=9.08e-01;SC=ATTTCAGAAGGGAAAATATCC;TC=167;TCF=131;TCR=36;TR=57;func=intergenic;gene=ANKRD30BL(dist=4532) GPR39(dist=154073);cons46=762 Name=lod=1662;segdup=0.91;dbsnp=rs111959326     GT:GL:GQ:NR     0/0:-698.84,-706.52,-798.38:35:80       1/0:-786.87,-770.7,-903.5:68:87
+chr2   133020186       .       T       C       66      PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=1.55e-01;FR=0.2500;HP=1;MMLQ=34;NF=52;NR=51;PP=66;RMP=46.69;RPV=9.65e-01;SC=TAGCTTTGTGTTCATACCACT;TC=402;TCF=237;TCR=165;TR=103;func=intergenic;gene=ANKRD30BL(dist=4644) GPR39(dist=153961);cons46=762 Name=lod=1662;segdup=0.91;dbsnp=rs112259198   GT:GL:GQ:NR     0/0:-1712.52,-1737.48,-1975.72:100:192  1/0:-1974.59,-1950.96,-2276.74:100:211
+chr2   133020542       .       G       A       50      PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=1.14e-01;FR=0.2503;HP=1;MMLQ=32;NF=3;NR=6;PP=50;RMP=53.94;RPV=7.08e-02;SC=CTATCCAAGTGGATCCAAATT;TC=66;TCF=24;TCR=42;TR=9;func=intergenic;gene=ANKRD30BL(dist=5000) GPR39(dist=153605);cons46=762 Name=lod=1662;segdup=0.93;dbsnp=rs2257591    GT:GL:GQ:NR     0/0:-181.04,-187.42,-271.44:29:29       1/0:-243.98,-224.07,-313.1:84:37
+chr2   166801924       .       C       G       78      PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=5.71e-01;FR=0.2507;HP=3;MMLQ=34;NF=4;NR=0;PP=78;RMP=67.75;RPV=7.49e-01;SC=TATTTACAAACTGGCAATAGA;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=4;func=ncRNA;gene=LOC100506134;1000g=0.64;dbsnp=rs6432853       GT:GL:GQ:NR     0/0:-34.05,-39.57,-91.24:25:8   1/0:-42.79,-16.34,-58.89:100:10
+chr2   204055943       .       T       C       59      PASS    ABPV=2.58e-01;FPV=8.29e-02;FR=0.2500;HP=2;MMLQ=33;NF=11;NR=2;PP=59;RMP=61.13;RPV=3.22e-06;SC=ATGGCCGCCATCCTCATGACA;TC=128;TCF=65;TCR=63;TR=13;func=intronic;gene=NBEAL1;cons46=702 Name=lod=950;dbsnp=rs4561645 GT:GL:GQ:NR     0/0:-41.52,-53.03,-440.53:51:70 1/0:-89.56,-67.55,-350.54:93:58
+chr2   210594540       .       A       G       200     PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=9.70e-01;FR=0.2507;HP=1;MMLQ=30;NF=10;NR=1;PP=200;RMP=52.61;RPV=9.37e-01;SC=CGAATGCAAGATATAGTTAAA;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=11;func=intronic;gene=MAP2;1000g=0.88;dbsnp=rs4673486 GT:GL:GQ:NR     0/0:0.0,-5.54,-62.54:25:8       0/1:-93.19,-14.77,-63.29:100:19
+chr2   211444533       .       GGT     G       32      PASS    ABPV=1.78e-01;FPV=1.96e-01;FR=0.2503;HP=2;NF=1;NR=3;PP=32;RMP=50.82;RPV=2.40e-03;SC=TGTTTCTTCGGGTGTGTGTGT;TC=54;TCF=11;TCR=43;TR=4      GT:GL:GQ:NR     0/0:-4.14,-10.38,-103.02:28:17  1/0:-41.6,-23.06,-172.26:78:37
+chr2   227659818       .       T       TCAAGTGAGGA     93      PASS    ABPV=3.68e-02;FPV=2.37e-01;FR=0.2500;HP=1;NF=0;NR=3;PP=93;RMP=91.0;RPV=7.64e-05;SC=CTCTCACCGCTGCCCAGGGGT;TC=63;TCF=5;TCR=58;TR=3        GT:GL:GQ:NR     0/0:-17.96,-35.28,-330.9:77:30  0/1:-94.07,-50.73,-458.79:100:41
+chr2   227954599       .       G       A       200     PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=9.19e-01;FR=0.2507;HP=2;MMLQ=31;NF=6;NR=4;PP=200;RMP=46.35;RPV=9.51e-01;SC=TCTCCTTTTGGGCCTCTTCCT;TC=25;TCF=16;TCR=9;TR=10;func=exonic;gene=COL4A4;exon_func=nonsynonymous SNV;AAchange=NM_000092:c.C1444T:p.P482S;1000g=0.55;dbsnp=rs2229814;sift=0.44;pp2=0.0;phylop=0.897442;mutT=9.0E-5;LRT=0.824593       GT:GL:GQ:NR     0/0:0.0,-5.54,-68.56:25:9       0/1:-80.77,-11.53,-34.97:100:16
+chr2   233273018       .       G       A       32      PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=3.62e-01;FR=0.2500;HP=3;MMLQ=34;NF=13;NR=4;PP=32;RMP=56.47;RPV=8.89e-03;SC=TTCCCATGGGGACCCCAGACC;TC=102;TCF=59;TCR=43;TR=17   GT:GL:GQ:NR     0/0:-50.24,-59.48,-309.03:41:45 0/1:-159.89,-144.07,-409.74:66:57
+chr20  29633938        .       A       G       28      PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=1.27e-01;FR=0.2500;HP=2;MMLQ=34;NF=16;NR=24;PP=28;RMP=56.91;RPV=2.94e-01;SC=AAATGACTGGAATTTTTGTTT;TC=192;TCF=84;TCR=108;TR=40;func=ncRNA;gene=FRG1B;cons46=514 Name=lod=163;segdup=0.96;dbsnp=rs4006818       GT:GL:GQ:NR     0/0:-963.63,-978.07,-1139.59:64:101     1/0:-1046.34,-1031.41,-1112.07:63:91
+chr20  33356511        .       C       T       44      PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=7.49e-01;FR=0.2507;HP=1;MMLQ=37;NF=0;NR=4;PP=44;RMP=57.46;RPV=6.28e-01;SC=AGTTTACCACCAGAAAAATGG;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=4;func=intronic;gene=NCOA6;cons46=243 Name=lod=13;1000g=0.36;dbsnp=rs2295353    GT:GL:GQ:NR     0/0:0.0,-5.54,-70.65:25:8       0/1:-49.75,-31.07,-63.51:79:9
+chr21  14424170        .       C       G       200     PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=7.37e-05;FR=0.2502;HP=1;MMLQ=31;NF=51;NR=68;PP=200;RMP=55.06;RPV=7.01e-02;SC=GGAAAGAACACCTGACACGGC;TC=637;TCF=318;TCR=319;TR=119      GT:GL:GQ:NR     0/0:-1068.97,-1075.78,-2090.04:31:272   1/0:-1608.82,-1559.51,-2814.14:100:365
+chr22  16256578        .       G       T       200     PASS    ABPV=2.18e-01;FPV=6.87e-08;FR=0.2502;HP=4;MMLQ=34;NF=19;NR=8;PP=200;RMP=40.16;RPV=2.46e-02;SC=TGGCTCTGATGTTTCATTATG;TC=253;TCF=194;TCR=59;TR=27 GT:GL:GQ:NR     0/0:-139.12,-145.98,-745.94:31:118      0/1:-324.53,-220.54,-788.14:100:135
+chr22  24640438        .       TCA     T       58      PASS    ABPV=5.57e-01;FPV=3.19e-02;FR=0.2503;HP=2;NF=2;NR=1;PP=58;RMP=48.68;RPV=9.37e-01;SC=ATACATTCACTCACACACACA;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=3       GT:GL:GQ:NR     0/0:-4.37,-10.61,-107.94:28:12  0/1:-47.48,-22.82,-120.6:100:15
+chr22  42524924        .       A       G       32      PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=1.78e-02;FR=0.2500;HP=2;MMLQ=35;NF=0;NR=4;PP=32;RMP=71.83;RPV=5.74e-01;SC=TGTCCAAGAGACCGTTGGGGC;TC=31;TCF=14;TCR=17;TR=4      GT:GL:GQ:NR     0/0:-1.84,-12.87,-112.28:49:17  1/0:-35.2,-19.47,-73.62:66:14
+chr3   6522043 .       G       A       62      PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=5.16e-01;FR=0.2507;HP=3;MMLQ=37;NF=4;NR=0;PP=62;RMP=44.82;RPV=7.49e-01;SC=TAACTGCAAAGTAGGAACACG;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=4       GT:GL:GQ:NR     0/0:0.0,-5.54,-65.36:25:9       1/0:-46.21,-23.49,-68.33:96:10
+chr3   135742089       .       GAAAATA G       56      PASS    ABPV=2.53e-02;FPV=5.62e-01;FR=0.2500;HP=4;NF=0;NR=2;PP=56;RMP=97.0;RPV=4.10e-05;SC=GTTTTGTTTTGAAAATATTTT;TC=55;TCF=2;TCR=53;TR=2        GT:GL:GQ:NR     0/0:-171.19,-180.69,-401.53:43:27       1/0:-163.7,-138.73,-368.83:100:28
+chr3   195453014       .       G       A       73      PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=9.99e-01;FR=0.2500;HP=3;MMLQ=31;NF=44;NR=44;PP=73;RMP=52.04;RPV=1.00e-00;SC=GACAGCACCCGGGGCCACGAC;TC=210;TCF=115;TCR=95;TR=88 GT:GL:GQ:NR     0/0:-596.82,-608.68,-929.74:53:99       0/1:-825.59,-800.41,-1040.36:100:111
+chr3   195453412       .       C       T       21      PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=1.25e-02;FR=0.2502;HP=2;MMLQ=25;NF=13;NR=52;PP=21;RMP=62.2;RPV=1.00e-00;SC=CCACGACTGCCCGGACGAGGC;TC=219;TCF=89;TCR=130;TR=65  GT:GL:GQ:NR     0/0:-275.62,-282.43,-681.47:31:103      0/1:-362.65,-349.41,-719.87:55:117
+chr3   195506775       .       G       A       87      PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=8.81e-01;FR=0.2500;HP=1;MMLQ=34;NF=11;NR=4;PP=87;RMP=30.23;RPV=4.10e-02;SC=AGGAAGTGTCGGTGACAGGAA;TC=69;TCF=34;TCR=35;TR=15;func=exonic;gene=MUC4;exon_func=synonymous SNV;AAchange=NM_018406:c.C11676T:p.H3892H;cons46=381 Name=lod=47;segdup=0.92;1000g=0.48;dbsnp=rs79609066        GT:GL:GQ:NR     0/0:-215.78,-225.62,-329.97:44:31       0/1:-253.55,-225.09,-324.19:100:38
+chr3   195507372       .       C       A       72      PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=9.50e-01;FR=0.2510;HP=1;MMLQ=31;NF=12;NR=10;PP=72;RMP=82.02;RPV=4.71e-01;SC=GAGGGGTGGCCTGACCTGTGG;TC=76;TCF=33;TCR=43;TR=22   GT:GL:GQ:NR     0/0:-85.59,-90.71,-175.03:23:27 0/1:-302.0,-277.02,-435.24:100:49
+chr3   195509974       .       A       G       107     PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=4.52e-02;FR=0.2501;HP=1;MMLQ=33;NF=7;NR=15;PP=107;RMP=66.83;RPV=1.62e-01;SC=ATGACCTGTGAACACTGAGGA;TC=127;TCF=50;TCR=77;TR=22  GT:GL:GQ:NR     0/0:-281.04,-289.1,-469.31:36:51        0/1:-474.46,-441.44,-679.46:100:76
+chr4   3589510 .       G       A       82      PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=1.00e-00;FR=0.2500;HP=1;MMLQ=35;NF=28;NR=15;PP=82;RMP=39.79;RPV=1.00e-00;SC=ACTTCCAGATGAGACTTCCTG;TC=89;TCF=62;TCR=27;TR=43;func=ncRNA;gene=FLJ35424  GT:GL:GQ:NR     0/0:-202.17,-216.0,-372.38:61:36        0/1:-618.94,-591.66,-690.1:100:53
+chr4   5747131 .       C       A       40      PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=6.32e-01;FR=0.2502;HP=2;MMLQ=33;NF=1;NR=19;PP=40;RMP=63.27;RPV=9.99e-01;SC=AAATTGGCTACATTAGAGAGA;TC=45;TCF=5;TCR=40;TR=20     GT:GL:GQ:NR     0/0:-175.23,-182.17,-227.63:31:19       1/0:-264.71,-246.95,-301.81:75:26
+chr4   70261725        .       G       A       25      PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=8.43e-01;FR=0.2503;HP=3;MMLQ=36;NF=1;NR=5;PP=25;RMP=77.58;RPV=8.09e-01;SC=TGTGGCCCTGGGGTAGTTACT;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=6       GT:GL:GQ:NR     0/0:-25.09,-31.31,-100.1:28:11  1/0:-62.48,-48.33,-68.8:59:8
+chr5   837488  .       C       A       84      PASS    ABPV=3.03e-01;FPV=2.26e-02;FR=0.2502;HP=2;MMLQ=35;NF=22;NR=3;PP=84;RMP=67.65;RPV=4.45e-09;SC=ACCTGGAGAACTCCTTTGTCC;TC=225;TCF=128;TCR=97;TR=25  GT:GL:GQ:NR     0/0:-71.02,-77.56,-596.34:30:92 0/1:-157.13,-129.33,-794.35:100:133
+chr5   34192944        .       A       G       136     PASS    ABPV=3.53e-01;FPV=1.29e-04;FR=0.2500;HP=1;MMLQ=31;NF=17;NR=13;PP=136;RMP=51.73;RPV=7.15e-05;SC=GCAGTGGATGAAGGCCCCTCA;TC=261;TCF=140;TCR=121;TR=30       GT:GL:GQ:NR     0/0:-120.41,-138.2,-806.35:79:120       0/1:-199.6,-159.91,-913.41:100:141
+chr5   36200413        .       G       A       33      PASS    ABPV=1.25e-02;FPV=1.03e-02;FR=0.2511;HP=3;MMLQ=34;NF=2;NR=4;PP=33;RMP=98.68;RPV=2.69e-06;SC=GAAAATGTATGTTATAAATAT;TC=109;TCF=30;TCR=79;TR=6     GT:GL:GQ:NR     0/0:-295.77,-300.82,-490.03:23:53       1/0:-290.08,-274.08,-469.93:67:56
+chr5   41909830        .       C       T       27      PASS    ABPV=5.28e-01;FPV=2.35e-03;FR=0.2504;HP=18;MMLQ=0;NF=0;NR=3;PP=27;RMP=14.14;RPV=9.29e-01;SC=AGATATCTTTCTTTTTTTTTT;TC=28;TCF=21;TCR=7;TR=3       GT:GL:GQ:NR     0/0:-4.61,-10.58,-40.73:26:11   0/1:-41.44,-26.72,-53.62:62:17
+chr5   54329850        .       C       CTGCTTTACTTA    68      PASS    ABPV=5.01e-01;FPV=1.00e+00;FR=0.2503;HP=1;NF=0;NR=2;PP=68;RMP=90.0;RPV=7.41e-02;SC=CATATGGGGTCCATTTTTGCA;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=2        GT:GL:GQ:NR     0/0:0.0,-6.24,-122.94:28:9      1/0:-45.59,-6.93,-110.5:100:12
+chr5   58121059        .       G       A       112     PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=4.22e-01;FR=0.2501;HP=2;MMLQ=35;NF=0;NR=5;PP=112;RMP=75.51;RPV=4.68e-01;SC=TACAGAGTCCGAGCTAATTGT;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=5      GT:GL:GQ:NR     0/0:-31.77,-39.38,-124.25:34:12 0/1:-43.94,-9.7,-79.61:100:15
+chr5   169535734       .       C       A       20      PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=1.00e+00;FR=0.2507;HP=1;MMLQ=34;NF=0;NR=2;PP=20;RMP=68.72;RPV=3.31e-01;SC=CAGGAGCCTCCGAGGAATCCA;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=2;func=UTR3;gene=FOXI1;1000g=0.35;dbsnp=rs6873124       GT:GL:GQ:NR     0/0:-5.3,-10.84,-76.27:25:8     1/0:-15.88,-2.77,-16.56:54:5
+chr5   175467765       .       A       C       34      PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=6.86e-01;FR=0.2503;HP=3;MMLQ=37;NF=4;NR=7;PP=34;RMP=58.23;RPV=9.60e-01;SC=AGGAAAGCAGATTTGTACATC;TC=32;TCF=15;TCR=17;TR=11     GT:GL:GQ:NR     0/0:-48.25,-54.62,-116.89:29:16 0/1:-64.43,-48.26,-102.15:68:18
+chr5   180047739       .       CGT     C       40      PASS    ABPV=3.01e-01;FPV=4.20e-02;FR=0.2503;HP=3;NF=0;NR=2;PP=40;RMP=66.37;RPV=1.63e-01;SC=AAGGGGCCGGCGTGTGTGTGT;TC=28;TCF=11;TCR=17;TR=2      GT:GL:GQ:NR     0/0:-15.43,-21.66,-115.16:28:17 0/1:-35.79,-15.44,-86.67:86:11
+chr6   26370657        .       A       G       26      PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=9.98e-01;FR=0.2500;HP=1;MMLQ=34;NF=25;NR=18;PP=26;RMP=46.67;RPV=9.65e-01;SC=ACAGTGGAGCAACGCCAAGGG;TC=112;TCF=61;TCR=51;TR=43  GT:GL:GQ:NR     0/0:-408.78,-416.97,-671.27:37:70       1/0:-270.25,-255.76,-422.39:61:42
+chr6   26370659        .       C       T       32      PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=9.98e-01;FR=0.2500;HP=2;MMLQ=34;NF=25;NR=17;PP=32;RMP=48.69;RPV=9.08e-01;SC=AGTGGAGCAACGCCAAGGGAG;TC=114;TCF=61;TCR=53;TR=42  GT:GL:GQ:NR     0/0:-408.78,-419.23,-664.68:47:70       1/0:-278.07,-262.18,-440.62:67:44
+chr6   35838820        .       A       ATTCTTACTTGG    44      PASS    ABPV=1.42e-01;FPV=7.50e-01;FR=0.2500;HP=1;NF=0;NR=2;PP=44;RMP=90.0;RPV=2.64e-03;SC=CTCTACCAGAATGAAAAGTCT;TC=37;TCF=1;TCR=36;TR=2        GT:GL:GQ:NR     0/0:-22.8,-33.89,-243.84:49:19  1/0:-50.19,-17.08,-221.97:100:21
+chr6   58777098        .       A       T       42      PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=2.57e-03;FR=0.2500;HP=2;MMLQ=34;NF=14;NR=25;PP=42;RMP=50.5;RPV=1.85e-01;SC=GTAACTCTAGATTGAAGAATT;TC=224;TCF=105;TCR=119;TR=39;func=intergenic;gene=GUSBP4(dist=489374) NONE(dist=NONE);dbsnp=rs4330557        GT:GL:GQ:NR     0/0:-1161.42,-1180.18,-1411.53:83:106   0/1:-1283.78,-1265.72,-1460.11:76:119
+chr6   116774635       .       C       G       38      PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=3.66e-01;FR=0.2504;HP=1;MMLQ=36;NF=4;NR=12;PP=38;RMP=76.7;RPV=4.76e-01;SC=CTTTTTCCACCACAAATTCTT;TC=72;TCF=21;TCR=51;TR=16     GT:GL:GQ:NR     0/0:-45.72,-51.81,-228.46:28:30 0/1:-179.58,-162.43,-353.98:72:42
+chr6   136599000       .       T       TCATCTGTGA      73      PASS    ABPV=2.21e-05;FPV=2.55e-09;FR=0.2505;HP=4;NF=2;NR=0;PP=73;RMP=1.41;RPV=3.11e-04;SC=TTTTAGTTTTTACCTTTTTAA;TC=118;TCF=90;TCR=28;TR=2;func=intronic;gene=BCLAF1;cons46=573 Name=lod=284;segdup=0.97        GT:GL:GQ:NR     0/0:-44.16,-49.89,-603.4:26:61  1/0:-105.25,-67.59,-750.95:100:79
+chr6   155757781       .       T       A       106     PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=3.16e-01;FR=0.2504;HP=2;MMLQ=36;NF=0;NR=5;PP=106;RMP=66.42;RPV=6.16e-01;SC=TACAGTGAGCTCTGAAATATC;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=5;func=intronic;gene=NOX3;1000g=0.22;dbsnp=rs231961    GT:GL:GQ:NR     0/0:0.0,-6.09,-69.03:28:9       0/1:-48.54,-15.69,-84.63:100:15
+chr7   65159983        .       A       G       128     PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=5.13e-01;FR=0.2500;HP=2;MMLQ=33;NF=9;NR=0;PP=128;RMP=42.05;RPV=1.33e-01;SC=TTGCTTAGTTACCAGGTAGAA;TC=45;TCF=38;TCR=7;TR=9;func=ncRNA;gene=INTS4L2 LOC441242;cons46=439 Name=lod=81;segdup=0.99;1000g=0.26;dbsnp=rs2949280      GT:GL:GQ:NR     0/0:0.0,-9.67,-99.87:43:16      0/1:-63.32,-25.43,-98.84:100:29
+chr7   100552044       .       T       G       46      PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=1.00e-00;FR=0.2500;HP=1;MMLQ=33;NF=133;NR=185;PP=46;RMP=54.24;RPV=1.00e-00;SC=CTGTTCCTTCTTCACCATACA;TC=776;TCF=387;TCR=389;TR=318     GT:GL:GQ:NR     0/0:-2768.08,-2799.9,-3980.82:100:373   0/1:-3148.55,-3129.5,-4372.1:80:403
+chr7   102319079       .       G       A       34      PASS    ABPV=4.40e-01;FPV=1.00e+00;FR=0.2500;HP=1;MMLQ=38;NF=0;NR=6;PP=34;RMP=53.53;RPV=6.65e-03;SC=TGTGAGATGCGTGTGAAAATG;TC=56;TCF=0;TCR=56;TR=6;func=intergenic;gene=POLR2J2(dist=6903) FAM185A(dist=70320);segdup=1.00;1000g=0.17;dbsnp=rs62458736   GT:GL:GQ:NR     0/0:-9.39,-20.95,-166.2:51:26   0/1:-46.26,-30.07,-176.58:68:30
+chr7   106272259       .       C       T       200     PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=1.51e-04;FR=0.2501;HP=2;MMLQ=31;NF=27;NR=25;PP=200;RMP=18.87;RPV=1.08e-05;SC=CTCATTCCAACCTCTGCTTCC;TC=391;TCF=192;TCR=199;TR=52       GT:GL:GQ:NR     0/0:-1599.11,-1606.25,-1841.06:32:195   0/1:-1703.84,-1621.18,-1787.33:100:196
+chr7   128492558       .       G       A       32      PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=9.80e-01;FR=0.2501;HP=6;MMLQ=35;NF=15;NR=1;PP=32;RMP=45.11;RPV=5.34e-01;SC=TGAGTCCAGGGGGGGCTGCTC;TC=45;TCF=39;TCR=6;TR=16     GT:GL:GQ:NR     0/0:-82.82,-89.89,-214.44:32:24 0/1:-137.27,-121.35,-194.99:67:21
+chr7   142223942       .       A       G       200     PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=1.00e-00;FR=0.2500;HP=1;MMLQ=33;NF=86;NR=42;PP=200;RMP=48.5;RPV=9.93e-01;SC=ACTGTGAATCATCTACTACAC;TC=282;TCF=160;TCR=122;TR=128       GT:GL:GQ:NR     0/0:-840.21,-856.54,-1228.56:72:124     1/0:-1069.18,-1023.08,-1489.98:100:158
+chr7   142498735       .       A       C       51      PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=9.39e-01;FR=0.2500;HP=4;MMLQ=34;NF=23;NR=20;PP=51;RMP=54.1;RPV=9.74e-01;SC=AGGACCTGAAAAACGTGTTCC;TC=127;TCF=71;TCR=56;TR=43;func=intergenic;gene=TRY6(dist=16336) EPHB6(dist=54057);sift=0.35 GT:GL:GQ:NR     0/0:-407.53,-415.97,-666.18:38:67       0/1:-407.94,-387.73,-626.55:86:62
+chr7   143295456       .       A       C       200     PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=7.75e-01;FR=0.2500;HP=1;MMLQ=26;NF=24;NR=7;PP=200;RMP=70.65;RPV=6.11e-02;SC=GCCTCCTCGCAGTGGGGGGCA;TC=135;TCF=87;TCR=48;TR=31  GT:GL:GQ:NR     0/0:-28.78,-39.63,-253.37:48:66 0/1:-158.76,-57.73,-187.94:100:69
+chr7   143453710       .       T       A       66      PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=5.62e-01;FR=0.2501;HP=3;MMLQ=36;NF=0;NR=15;PP=66;RMP=54.55;RPV=5.68e-01;SC=TCTTCCTTTGTTTTGTCCACT;TC=62;TCF=2;TCR=60;TR=15     GT:GL:GQ:NR     0/0:-65.41,-73.41,-216.2:36:31  0/1:-102.8,-79.18,-187.97:100:31
+chr7   143956461       .       T       C       37      PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=8.34e-02;FR=0.2500;HP=2;MMLQ=31;NF=5;NR=0;PP=37;RMP=48.38;RPV=1.00e+00;SC=TGGGCTTGGCTGGATGCAGGA;TC=36;TCF=36;TCR=0;TR=5       GT:GL:GQ:NR     0/0:-6.63,-15.42,-125.53:39:20  1/0:-33.93,-16.96,-77.4:71:16
+chr7   157367205       .       TGA     T       52      PASS    ABPV=3.26e-01;FPV=5.62e-01;FR=0.2503;HP=2;NF=0;NR=2;PP=52;RMP=55.44;RPV=3.19e-02;SC=AGAGTAATAATGAGAGAGAGA;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=2;func=intronic;gene=PTPRN2     GT:GL:GQ:NR     0/0:-10.36,-16.59,-113.87:28:16 1/0:-39.42,-16.12,-59.64:99:12
+chr8   8095880 .       C       T       131     PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=2.37e-01;FR=0.2500;HP=3;MMLQ=37;NF=0;NR=10;PP=131;RMP=64.63;RPV=8.71e-01;SC=GCCACATGGCCCCAGGCCCAA;TC=36;TCF=5;TCR=31;TR=10;func=ncRNA;gene=FLJ10661;segdup=0.98       GT:GL:GQ:NR     0/0:-78.8,-87.2,-171.27:38:18   0/1:-81.81,-43.3,-81.08:100:18
+chr8   12236123        .       T       G       111     PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=1.38e-39;FR=0.2500;HP=2;MMLQ=30;NF=16;NR=9;PP=111;RMP=18.14;RPV=9.45e-01;SC=GTATTTGTGTTTGTGTGTGTG;TC=103;TCF=79;TCR=24;TR=25  GT:GL:GQ:NR     0/0:-265.16,-270.76,-457.35:100:49      1/0:-317.4,-305.02,-585.97:25:76
+chr8   12428634        .       C       T       69      PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=7.50e-01;FR=0.2500;HP=1;MMLQ=36;NF=0;NR=5;PP=69;RMP=63.98;RPV=2.03e-01;SC=TCTTAACAACCGCCATGGTGC;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=5       GT:GL:GQ:NR     0/0:-10.77,-21.63,-134.62:48:17 1/0:-41.03,-16.59,-80.89:100:14
+chr8   35608374        .       T       C       24      PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=6.32e-01;FR=0.2502;HP=2;MMLQ=34;NF=1;NR=34;PP=24;RMP=69.53;RPV=1.00e-00;SC=TGAAAGTGTGTGTTTTCCAAA;TC=62;TCF=5;TCR=57;TR=35     GT:GL:GQ:NR     0/0:-248.65,-255.21,-376.27:30:35       1/0:-265.91,-251.92,-307.04:58:27
+chr8   121500323       .       A       AGTGGGATTGC     40      PASS    ABPV=2.19e-01;FPV=8.43e-03;FR=0.2500;HP=2;NF=2;NR=0;PP=40;RMP=1.0;RPV=7.50e-01;SC=ATTATATCCTATGGATCAAAT;TC=32;TCF=31;TCR=1;TR=2 GT:GL:GQ:NR     0/0:-2.07,-11.08,-162.96:40:13  1/0:-47.66,-16.63,-264.67:100:25
+chr9   14510   .       CTGT    C       200     PASS    ABPV=2.20e-01;FPV=4.66e-14;FR=0.2500;HP=1;NF=12;NR=0;PP=200;RMP=43.31;RPV=1.00e-02;SC=TAAAAGCACACTGTTGGTTTC;TC=123;TCF=107;TCR=16;TR=12 GT:GL:GQ:NR     0/0:-22.04,-38.67,-350.71:73:53 0/1:-133.83,-67.48,-425.73:100:75
+chr9   34724786        .       G       A       54      PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=5.46e-01;FR=0.2503;HP=2;MMLQ=31;NF=10;NR=18;PP=54;RMP=64.11;RPV=9.71e-01;SC=GGATTTCCACGGGACTAGGCT;TC=91;TCF=41;TCR=50;TR=28   GT:GL:GQ:NR     0/0:-77.92,-84.2,-224.15:29:46  1/0:-101.32,-80.48,-207.58:88:45
+chr9   44118498        .       G       C       200     PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=9.49e-01;FR=0.2503;HP=2;MMLQ=34;NF=2;NR=7;PP=200;RMP=65.44;RPV=6.41e-01;SC=GAGGGCAGCTGCCTGTCACCT;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=9;func=intergenic;gene=CNTNAP3B(dist=196025) FAM27C(dist=871738);segdup=0.98;1000g=0.77;dbsnp=rs28610048       GT:GL:GQ:NR     0/0:-11.97,-18.32,-91.33:29:13  0/1:-73.63,-27.61,-81.59:100:18
+chr9   67281836        .       T       G       200     PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=3.12e-01;FR=0.2500;HP=2;MMLQ=34;NF=6;NR=21;PP=200;RMP=63.02;RPV=5.58e-01;SC=GTGGACCTGATACAGTGGCCC;TC=115;TCF=31;TCR=84;TR=27;func=ncRNA;gene=AQP7P1;segdup=0.99;1000g=0.26;dbsnp=rs75812522   GT:GL:GQ:NR     0/0:-227.43,-240.42,-365.47:58:50       0/1:-353.09,-303.78,-464.7:100:65
+chr9   67293649        .       T       G       200     PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=2.40e-02;FR=0.2509;HP=2;MMLQ=32;NF=8;NR=20;PP=200;RMP=65.85;RPV=6.29e-01;SC=GTGTGCCAAGTGACTTCATCT;TC=136;TCF=59;TCR=77;TR=28  GT:GL:GQ:NR     0/0:-52.46,-57.7,-399.51:24:62  0/1:-141.44,-82.05,-400.07:100:74
+chr9   68358140        .       T       C       101     PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=4.09e-01;FR=0.2501;HP=2;MMLQ=31;NF=10;NR=13;PP=101;RMP=52.55;RPV=9.14e-01;SC=CCGCTTCAGATAGTGAAGAAG;TC=84;TCF=45;TCR=39;TR=23;func=intergenic;gene=ANKRD20A3(dist=387847) LOC642236(dist=69643);cons46=780 Name=lod=1967;segdup=0.98;dbsnp=rs62544188  GT:GL:GQ:NR     0/0:-99.49,-107.4,-306.63:36:46 0/1:-122.69,-91.06,-221.21:100:38
+chr9   92995102        .       C       T       25      PASS    ABPV=1.74e-02;FPV=2.34e-06;FR=0.2500;HP=3;MMLQ=33;NF=11;NR=10;PP=25;RMP=36.17;RPV=2.75e-07;SC=ATAAAATTGTCCCCTCCATTC;TC=258;TCF=127;TCR=131;TR=21;func=intergenic;gene=LOC286370(dist=191321) LOC340515(dist=229612);segdup=0.96 GT:GL:GQ:NR     0/0:-127.8,-170.89,-839.43:100:127      1/0:-164.37,-150.07,-829.28:60:131
+chr9   139572068       .       C       G       44      PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=4.21e-01;FR=0.2507;HP=2;MMLQ=29;NF=0;NR=3;PP=44;RMP=57.58;RPV=7.11e-01;SC=GGCTGGGGCGCGAAGGCCTGG;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=3;func=intronic;gene=AGPAT2;1000g=0.57;dbsnp=rs2236514  GT:GL:GQ:NR     0/0:0.0,-5.54,-62.14:25:9       1/0:-29.67,-11.06,-23.48:61:5
+chr9   140777194       .       A       AGAGCGGCT       200     PASS    ABPV=7.76e-05;FPV=4.77e-24;FR=0.2500;HP=2;NF=2;NR=1;PP=200;RMP=4.36;RPV=2.92e-05;SC=CGCTTCTCCTAGGACGACACG;TC=123;TCF=77;TCR=46;TR=3;func=splicing;gene=CACNA1B(NM_000718:c.390-2->CATGTCCGAGCGGCT NM_001243812:c.390-2->CATGTCCGAGCGGCT);cons46=573 Name=lod=285        GT:GL:GQ:NR     0/0:-260.4,-275.23,-819.04:71:85        0/1:-510.15,-408.95,-886.86:3:93
+chrUn_gl000214 53458   .       T       A       82      PASS    ABPV=4.34e-01;FPV=7.36e-06;FR=0.2500;HP=4;MMLQ=34;NF=22;NR=0;PP=82;RMP=47.4;RPV=5.62e-01;SC=AAACACTATATAAATATAATT;TC=187;TCF=185;TCR=2;TR=22;func=intergenic;gene=NONE(dist=NONE) NONE(dist=NONE);segdup=0.98   GT:GL:GQ:NR     0/0:-154.3,-180.61,-694.01:100:88       1/0:-304.62,-277.18,-752.95:100:99
+chrUn_gl000214 61035   .       A       G       25      PASS    ABPV=2.68e-01;FPV=1.27e-06;FR=0.2500;HP=2;MMLQ=34;NF=20;NR=0;PP=25;RMP=60.63;RPV=4.22e-01;SC=ATGTTTACCTATATAACAAAC;TC=187;TCF=184;TCR=3;TR=20   GT:GL:GQ:NR     0/0:-517.15,-538.58,-910.78:94:80       0/1:-812.82,-798.54,-1242.08:60:107
+chrUn_gl000214 74804   .       T       C       45      PASS    ABPV=5.69e-01;FPV=4.33e-02;FR=0.2500;HP=2;MMLQ=35;NF=5;NR=0;PP=45;RMP=36.66;RPV=5.62e-01;SC=ATCACTTGAATGCAGTAGGCA;TC=42;TCF=40;TCR=2;TR=5       GT:GL:GQ:NR     0/0:-65.35,-75.06,-177.61:43:16 0/1:-180.67,-161.94,-279.38:79:26
+chrUn_gl000220 121703  .       T       C       75      PASS    ABPV=9.31e-02;FPV=1.94e-05;FR=0.2500;HP=2;MMLQ=31;NF=5;NR=8;PP=75;RMP=52.13;RPV=2.81e-03;SC=GTGGGCACGGTACGCTCTGGT;TC=150;TCF=78;TCR=72;TR=13    GT:GL:GQ:NR     0/0:-64.92,-78.18,-505.13:59:80 1/0:-102.59,-76.78,-453.86:100:70
+chrUn_gl000220 128026  .       C       T       73      PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=1.39e-05;FR=0.2500;HP=1;MMLQ=37;NF=12;NR=5;PP=73;RMP=48.23;RPV=2.65e-03;SC=TCTCTGTCTCCGTCTCTGTCT;TC=117;TCF=62;TCR=55;TR=17   GT:GL:GQ:NR     0/0:-175.58,-193.94,-521.81:81:62       1/0:-151.61,-126.36,-397.61:100:57
+chrUn_gl000220 132074  .       G       A       200     PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=2.39e-03;FR=0.2500;HP=2;MMLQ=34;NF=10;NR=11;PP=200;RMP=61.51;RPV=6.72e-03;SC=CTCTCTGTCCGTCTCTGTCTT;TC=167;TCF=84;TCR=83;TR=21;func=intergenic;gene=LOC100507412(dist=5378) RN5-8S1(dist=23923);segdup=0.95    GT:GL:GQ:NR     0/0:-248.2,-257.69,-615.12:42:77        0/1:-290.71,-234.79,-658.31:100:90
+chrUn_gl000220 145002  .       C       T       28      PASS    ABPV=3.17e-02;FPV=7.56e-08;FR=0.2500;HP=4;MMLQ=31;NF=1;NR=3;PP=28;RMP=65.86;RPV=4.70e-03;SC=ACTAGCCGGGCGCGGTGGCAC;TC=76;TCF=36;TCR=40;TR=4      GT:GL:GQ:NR     0/0:-17.73,-43.17,-320.69:100:46        1/0:-67.96,-52.99,-236.43:63:37
+chrUn_gl000220 145368  .       T       C       30      PASS    ABPV=1.09e-01;FPV=1.31e-02;FR=0.2500;HP=1;MMLQ=29;NF=8;NR=2;PP=30;RMP=72.81;RPV=1.92e-05;SC=AGCCGGGCGCTGTGCTGTGCT;TC=119;TCF=63;TCR=56;TR=10;func=intergenic;gene=LOC100507412(dist=18672) RN5-8S1(dist=10629);dbsnp=rs3878955  GT:GL:GQ:NR     0/0:-48.56,-59.69,-409.13:50:53 0/1:-66.74,-51.46,-448.03:64:66
+chrUn_gl000225 30398   .       C       T       29      PASS    ABPV=1.13e-01;FPV=3.15e-04;FR=0.2502;HP=1;MMLQ=33;NF=1;NR=5;PP=29;RMP=58.12;RPV=2.55e-02;SC=CCTGCTCCTCCGAGCCTTTGA;TC=80;TCF=37;TCR=43;TR=6      GT:GL:GQ:NR     0/0:-195.73,-202.53,-342.72:31:35       1/0:-230.45,-215.31,-371.74:63:45
+chrUn_gl000225 43193   .       C       T       46      PASS    ABPV=1.00e+00;FPV=7.84e-02;FR=0.2507;HP=3;MMLQ=31;NF=8;NR=12;PP=46;RMP=44.42;RPV=4.19e-02;SC=GCCAGAGAGACGGGCCTCCCG;TC=126;TCF=51;TCR=75;TR=20   GT:GL:GQ:NR     0/0:-577.5,-583.01,-743.98:25:63        1/0:-604.31,-585.16,-703.98:81:63
+chrX   106390898       .       G       A       65      PASS    ABPV=4.78e-01;FPV=1.49e-02;FR=0.2500;HP=1;MMLQ=39;NF=5;NR=0;PP=65;RMP=43.16;RPV=1.00e+00;SC=GTTTGGTCATGGAGCATACAA;TC=46;TCF=46;TCR=0;TR=5       GT:GL:GQ:NR     0/0:0.0,-11.78,-148.84:52:17    1/0:-49.23,-25.85,-211.17:99:29
diff --git a/tests/tabix_data/vcf/15.vcf b/tests/tabix_data/vcf/15.vcf
new file mode 100644 (file)
index 0000000..9df9a1e
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,317 @@
+##fileformat=VCFv4.0
+##FILTER=<ID=HardyWeinbergViolation,Description="The validation is in Hardy-Weinberg violation">
+##FILTER=<ID=HighNoCallRate,Description="The validation no-call rate is too high">
+##FILTER=<ID=TooManyHomVars,Description="The validation homozygous variant rate is too high">
+##INFO=<ID=AC,Number=1,Type=Integer,Description="Allele count in genotypes, for each ALT allele, in the same order as listed">
+##INFO=<ID=AN,Number=1,Type=Integer,Description="Total number of alleles in called genotypes">
+##INFO=<ID=HW,Number=1,Type=Float,Description="Phred-scaled Hardy-Weinberg violation p-value">
+##INFO=<ID=HetPct,Number=1,Type=Float,Description="Percent of heterozygous genotypes">
+##INFO=<ID=HomRefPct,Number=1,Type=Float,Description="Percent of homozygous reference genotypes">
+##INFO=<ID=HomVarPct,Number=1,Type=Float,Description="Percent homozygous variant genotypes">
+##INFO=<ID=NoCallPct,Number=1,Type=Float,Description="Percent of no-calls">
+##ValidationMetrics_HardyWeinbergViolations="25 (8%)"
+##ValidationMetrics_HomVarViolations="0 (0%)"
+##ValidationMetrics_NoCallViolations="13 (4%)"
+##ValidationMetrics_PolymorphicPassingRecords="195 (75%)"
+##ValidationMetrics_RecordsPassingFilters="258 (87%)"
+##ValidationMetrics_RecordsProcessed=296
+##ValidationMetrics_SamplesAssayed=383
+##VariantValidationAssessor="analysis_type=VariantValidationAssessor input_file=[] sample_metadata=[] read_buffer_size=null phone_home=STANDARD read_filter=[] intervals=null excludeIntervals=null reference_sequence=/humgen/1kg/reference/human_g1k_v37.fasta rodBind=[rawData/plink.renamed.sorted.fixed.vcf] rodToIntervalTrackName=null BTI_merge_rule=UNION nonDeterministicRandomSeed=false DBSNP=null downsampling_type=null downsample_to_fraction=null downsample_to_coverage=null baq=OFF baqGapOpenPenalty=40.0 performanceLog=null useOriginalQualities=false defaultBaseQualities=-1 validation_strictness=SILENT unsafe=null num_threads=1 interval_merging=ALL read_group_black_list=null processingTracker=null restartProcessingTracker=false processingTrackerStatusFile=null processingTrackerID=-1 allow_intervals_with_unindexed_bam=false disable_experimental_low_memory_sharding=false logging_level=INFO log_to_file=null help=false out=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub NO_HEADER=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub sites_only=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub maxHardy=20.0 maxNoCall=0.05 maxHomVar=1.1"
+##source=PLINK
+#CHROM POS     ID      REF     ALT     QUAL    FILTER  INFO    FORMAT  HG00127 HG00128 HG00136 HG00137 HG00138 HG00139 HG00152 HG00156 HG00234 HG00235 HG00237 HG00242 HG00244 HG00262 HG01055 HG01079 NA19138 NA18974 NA18523 NA12717 NA19209 NA18577 NA18973 NA18943 NA12873 NA18623 NA18622 NA18948 NA19171 NA19204 NA06994 NA18563 NA18547 NA18861 NA18608 NA18995 NA10851 NA18976 NA18603 NA19200 HG01204 HG01191 HG01101 HG00146 HG00306 NA18985 HG00160 HG00635 HG00372 HG00357 HG00634 NA18541 NA18950 NA19759 HG00351 HG00257 HG00118 HG00336 HG00448 HG01354 NA18609 HG00428 HG00326 NA11894 NA18956 HG00173 HG00117 NA11893 HG01251 HG01441 HG01437 HG00182 HG00330 HG01060 HG00329 NA18960 NA18856 NA07346 NA18871 NA19057 NA18868 NA18636 NA12830 NA19007 NA18910 NA18874 NA19056 NA19064 NA19066 NA18487 NA18642 NA19236 NA07056 NA18637 NA19235 NA19309 NA19311 NA19334 NA19346 NA19347 NA19372 NA19376 NA19383 NA19384 NA19394 NA19428 NA19430 NA19451 NA19466 NA19313 NA19321 NA19324 NA19332 NA19390 NA19436 NA19439 NA19440 NA19463 NA19470 NA19471 NA19472 NA19676 NA19660 NA19661 NA19663 NA19722 NA19725 NA19728 NA19729 NA19731 NA19749 NA19755 NA19756 NA19758 NA19770 NA19773 NA19777 NA19780 NA19783 NA20525 NA20589 NA20765 NA20802 NA20804 NA18544 NA18602 NA18546 NA18610 NA18957 NA18615 NA18616 NA19010 NA18638 NA18639 NA18627 NA19072 NA18630 NA19074 NA19080 NA19081 NA19083 NA19085 NA19088 NA20287 NA19835 NA20276 NA19818 NA20278 NA20282 NA20342 NA20296 NA20314 NA20346 NA19712 NA19198 NA19108 NA18934 NA18916 NA18907 NA18917 NA06989 NA12058 NA12341 NA12546 NA12489 HG01197 NA18983 NA11843 NA11892 NA12749 NA12282 NA12751 NA18959 NA19331 NA19453 NA20537 NA12046 NA20515 NA20516 NA20521 NA20524 NA20528 NA20759 NA20768 NA20769 NA20774 NA20775 NA20783 NA20787 NA20790 NA20800 NA20819 NA20812 NA20505 NA20530 NA20540 NA20538 NA20581 NA20815 NA20544 NA20810 NA20807 NA20816 NA20504 NA20753 NA20502 NA12342 NA19150 NA19468 NA20336 NA19395 NA19257 NA19360 NA19700 NA18867 NA20317 NA18968 NA19107 HG00111 HG00108 NA19077 NA19684 NA18511 NA12044 NA19382 NA19457 NA18933 NA18923 NA18965 HG00141 NA20341 NA18740 HG00537 HG00346 HG01173 HG00702 HG00313 HG00150 NA18612 HG00339 NA12273 HG00250 NA18593 NA18621 HG00478 HG00251 HG01070 NA19160 HG00479 HG00608 NA18573 HG00375 NA19248 NA19093 HG01170 HG00534 HG01171 HG01522 NA18624 HG00683 HG01521 NA19005 NA20412 NA18971 HG00446 NA12748 HG00530 HG00690 HG01356 HG01516 NA20532 HG00344 HG00328 NA18542 HG00254 HG00321 HG00577 HG00656 HG00342 HG00524 HG00650 HG00557 HG00319 HG00457 HG00125 HG00578 HG00543 HG00638 HG00171 HG00699 HG00595 HG00187 HG00704 HG00533 HG00596 HG00268 HG01083 HG00651 HG01133 HG00671 HG00327 HG01148 HG00246 HG00672 HG00556 HG00436 HG00554 NA18633 NA20344 NA11993 NA07037 NA11930 HG01366 HG01389 HG00620 NA19740 HG00190 HG00419 NA18535 HG01495 NA18592 HG01497 HG00174 HG01140 NA12287 HG00689 HG01550 HG00334 HG01375 HG00637 NA18507 HG01113 NA18550 NA19129 HG01551 HG01462 HG00331 NA12413 HG01456 HG01360 HG00708 HG01350 HG00684 NA19099 HG00284 NA12399 NA12286 NA12777 HG00277 HG00266 NA19985 HG00353 HG01102 NA07347 NA07051 NA19900 NA18984 NA07048 HG00640 HG01066 NA12812 HG01174 HG01188
+20     439104  .       AG      A       .       HighNoCallRate  AC=0;AN=158;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=20.6;HomVarPct=0.0;NoCallPct=79.4      GT      .       0/0     .       .       .       .       0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     0/0     .       .       0/0     .       .       0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     0/0     .       .       0/0     0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     0/0     0/0     .       .       .       .       .       .       0/0     .       .       .       .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     .       .       .       .       0/0     .       .       0/0     .       .       0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     .       .       .       .       0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     .       .       .       .       .       0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     .       0/0     .       .       .       .       .       0/0     0/0     .       0/0     .       .       .       .       0/0     .       .       .       .       0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     .       0/0     .       .       .       0/0     .       .       .       .       0/0     0/0     .       0/0     .       .       .       .       .       0/0     .       .       0/0     .       0/0     .       .       .       .       .       .       0/0     .       .       .       0/0     .       0/0     .       .       0/0     .       0/0     .       .       0/0     .       .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       .       .       .       .
+20     669442  .       TG      T       .       PASS    AC=54;AN=766;HW=6.74;HetPct=12.0;HomRefPct=86.9;HomVarPct=1.0;NoCallPct=0.0     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     676148  .       A       AC      .       PASS    AC=0;AN=758;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.0       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     719486  .       C       CT      .       PASS    AC=1;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     890696  .       C       CAT     .       PASS    AC=6;AN=766;HW=0.00;HetPct=1.6;HomRefPct=98.4;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     1102516 .       CT      C       .       PASS    AC=3;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=98.4;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8       GT      0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     1149576 .       CT      C       .       PASS    AC=2;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     1195706 .       AAG     A       .       PASS    AC=334;AN=764;HW=9.47;HetPct=44.9;HomRefPct=33.7;HomVarPct=21.1;NoCallPct=0.3   GT      0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     .       0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1
+20     1342549 .       A       AAGAT   .       PASS    AC=0;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     1366475 .       CT      C       .       PASS    AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     1390810 .       T       TTC     .       HighNoCallRate  AC=0;AN=566;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=73.9;HomVarPct=0.0;NoCallPct=26.1      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     .       .       .       .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     .       .       0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     .       .       .       0/0     0/0     .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       .       0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       .       0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       .       .       0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     .       .       .       0/0     0/0     .       0/0     .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       .       0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       .       .       0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     .       .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     0/0     0/0     0/0
+20     1550416 .       C       CT      .       PASS    AC=0;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     1655540 .       AT      A       .       PASS    AC=4;AN=764;HW=0.00;HetPct=1.0;HomRefPct=98.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     2133769 .       GA      G       .       HardyWeinbergViolation  AC=379;AN=766;HW=85.69;HetPct=34.7;HomRefPct=33.2;HomVarPct=32.1;NoCallPct=0.0  GT      0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1
+20     2217137 .       CT      C       .       HighNoCallRate  AC=0;AN=704;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=91.9;HomVarPct=0.0;NoCallPct=8.1       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0
+20     2263095 .       TG      T       .       HardyWeinbergViolation  AC=358;AN=766;HW=812.29;HetPct=93.5;HomRefPct=6.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0   GT      0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1
+20     2426886 .       G       GAATT   .       HighNoCallRate  AC=11;AN=680;HW=0.00;HetPct=2.9;HomRefPct=85.9;HomVarPct=0.0;NoCallPct=11.2     GT      0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     .       .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       .       .       0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     0/0     0/0     0/1     .       0/1     .       0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     .       .       .       0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       .       0/1     .       .       0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0
+20     2889034 .       AAAAT   A       .       PASS    AC=6;AN=762;HW=0.00;HetPct=1.6;HomRefPct=97.9;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     3203741 .       CT      C       .       PASS    AC=4;AN=762;HW=0.00;HetPct=1.0;HomRefPct=98.4;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     3327993 .       CAA     C       .       HardyWeinbergViolation  AC=3;AN=766;HW=21.06;HetPct=0.3;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.3;NoCallPct=0.0      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     3700705 .       CTTTGGG C       .       PASS    AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     4037626 .       TC      T       .       PASS    AC=194;AN=764;HW=14.70;HetPct=33.4;HomRefPct=57.7;HomVarPct=8.6;NoCallPct=0.3   GT      0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     .       0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0
+20     4210074 .       G       GA      .       PASS    AC=197;AN=762;HW=14.95;HetPct=33.7;HomRefPct=56.9;HomVarPct=8.9;NoCallPct=0.5   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     .       0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     .       0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1
+20     4363519 .       CATT    C       .       PASS    AC=7;AN=764;HW=0.00;HetPct=1.8;HomRefPct=97.9;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     4366806 .       CAAAT   C       .       PASS    AC=2;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     4641550 .       CCTTGA  C       .       PASS    AC=3;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     5105482 .       C       CATTTTAGG       .       PASS    AC=101;AN=762;HW=14.11;HetPct=20.1;HomRefPct=76.2;HomVarPct=3.1;NoCallPct=0.5   GT      0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     5289619 .       GA      G       .       PASS    AC=377;AN=764;HW=5.70;HetPct=53.0;HomRefPct=24.0;HomVarPct=22.7;NoCallPct=0.3   GT      0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     .       0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0
+20     5416109 .       CA      C       .       PASS    AC=2;AN=752;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=97.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.8       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     5432262 .       AGT     A       .       PASS    AC=4;AN=752;HW=0.00;HetPct=1.0;HomRefPct=97.1;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.8       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     5724449 .       T       TC      .       PASS    AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     5928403 .       T       TA      .       HardyWeinbergViolation  AC=196;AN=762;HW=47.13;HetPct=29.2;HomRefPct=59.3;HomVarPct=11.0;NoCallPct=0.5  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     6877907 .       CA      C       .       PASS    AC=2;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     6969412 .       CAAAGAAT        C       .       PASS    AC=2;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     7035110 .       CT      C       .       HardyWeinbergViolation  AC=340;AN=758;HW=1038.45;HetPct=1.0;HomRefPct=54.0;HomVarPct=43.9;NoCallPct=1.0 GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     1/1     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     1/1     .       1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1
+20     7229260 .       T       TA      .       PASS    AC=2;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     7239075 .       AG      A       .       PASS    AC=5;AN=766;HW=0.00;HetPct=1.3;HomRefPct=98.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     7942727 .       A       AC      .       PASS    AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     7950562 .       C       CT      .       PASS    AC=4;AN=760;HW=18.01;HetPct=0.5;HomRefPct=98.4;HomVarPct=0.3;NoCallPct=0.8      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     8195466 .       C       CT      .       PASS    AC=1;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     8233352 .       TACTC   T       .       PASS    AC=56;AN=764;HW=1.84;HetPct=13.1;HomRefPct=85.9;HomVarPct=0.8;NoCallPct=0.3     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     8504000 .       TAG     T       .       PASS    AC=5;AN=762;HW=0.00;HetPct=1.3;HomRefPct=98.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     8779672 .       TG      T       .       HighNoCallRate  AC=0;AN=86;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=11.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=88.8       GT      .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     0/0     .       .       .       0/0     .       0/0     .       .       .       0/0     .       .       .       .       .       .       .       0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       .       0/0     .       .       .       .       .       0/0     0/0     .       .       .       .       0/0     .       .       0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     .       .       .       .       0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     .       .       .       .       .       .       0/0     .       .       .       .       .       .       .       0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     0/0     .       0/0     .       .       0/0     .       .       .       0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .
+20     8794142 .       AG      A       .       HardyWeinbergViolation  AC=52;AN=756;HW=57.86;HetPct=8.4;HomRefPct=87.7;HomVarPct=2.6;NoCallPct=1.3     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     .       1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0
+20     9231138 .       AT      A       .       PASS    AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     9900218 .       C       CT      .       HardyWeinbergViolation  AC=3;AN=766;HW=21.06;HetPct=0.3;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.3;NoCallPct=0.0      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     9921724 .       AAAGT   A       .       PASS    AC=11;AN=758;HW=0.00;HetPct=2.9;HomRefPct=96.1;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.0      GT      0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     9925738 .       T       TG      .       PASS    AC=1;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     10090376        .       T       TG      .       PASS    AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     10377174        .       ATAAAAC A       .       HighNoCallRate  AC=107;AN=514;HW=4.54;HetPct=20.6;HomRefPct=42.8;HomVarPct=3.7;NoCallPct=32.9   GT      .       .       0/0     0/0     .       0/0     .       0/1     .       0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     .       .       .       .       0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     .       0/1     0/0     .       .       0/0     .       0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     1/1     0/0     .       .       0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     .       .       .       .       .       .       0/0     .       1/1     .       0/0     .       0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     .       .       .       .       0/1     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     .       .       0/0     .       .       .       .       .       0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     0/0     .       .       .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       0/1     .       .       .       .       .       0/0     .       0/1     0/1     .       .       0/0     0/0     0/0     .       0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/1     0/1     0/1     .       0/1     0/1     0/0     .       0/1     0/0     .       .       0/0     .       .       .       .       .       0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     .       0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     .       .       .       0/0     0/0     0/0     0/1     .       .       0/1     .       .       .       0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       0/1     .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       0/1     0/0     .       0/0     .       0/1     0/1     .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     0/1     .       .       0/0     .       0/0     .       .       .       0/1     .       .       .       0/1     .       .       0/1     .       .       .       .       0/0     .       0/1     0/0     .       0/1     .       0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     .       .       .       1/1     0/1     .       .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     .       0/1     0/1     .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0
+20     11229169        .       T       TA      .       PASS    AC=3;AN=756;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=97.9;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     11511920        .       AC      A       .       PASS    AC=2;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     11893900        .       ATTAG   A       .       PASS    AC=1;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     12021825        .       A       AG      .       PASS    AC=5;AN=756;HW=0.00;HetPct=1.3;HomRefPct=97.4;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     12063752        .       CTT     C       .       PASS    AC=1;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     12094344        .       TCAGGAGGC       T       .       PASS    AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     12114989        .       CTA     C       .       PASS    AC=4;AN=764;HW=0.00;HetPct=1.0;HomRefPct=98.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     12371546        .       GACA    G       .       PASS    AC=10;AN=762;HW=0.00;HetPct=2.6;HomRefPct=96.9;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     12512723        .       G       GTT     .       PASS    AC=6;AN=762;HW=0.00;HetPct=1.6;HomRefPct=97.9;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     12634463        .       TGA     T       .       PASS    AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     12692743        .       TTATC   T       .       PASS    AC=8;AN=762;HW=0.00;HetPct=2.1;HomRefPct=97.4;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     12837095        .       G       GA      .       PASS    AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     12928028        .       TG      T       .       PASS    AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     13003323        .       GGGA    G       .       PASS    AC=3;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=98.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     13128894        .       CT      C       .       PASS    AC=10;AN=764;HW=0.00;HetPct=2.6;HomRefPct=97.1;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     13287841        .       CAT     C       .       PASS    AC=134;AN=760;HW=0.21;HetPct=29.2;HomRefPct=67.1;HomVarPct=2.9;NoCallPct=0.8    GT      0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     .       0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0
+20     13365589        .       T       TG      .       PASS    AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     13566260        .       AAATTG  A       .       PASS    AC=374;AN=764;HW=3.95;HetPct=47.5;HomRefPct=27.2;HomVarPct=25.1;NoCallPct=0.3   GT      1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     .       0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1
+20     13685184        .       AT      A       .       PASS    AC=2;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     13716193        .       GAGAA   G       .       PASS    AC=2;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     13926445        .       TA      T       .       PASS    AC=0;AN=756;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=98.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     13960028        .       TC      T       .       PASS    AC=188;AN=750;HW=2.44;HetPct=35.5;HomRefPct=55.6;HomVarPct=6.8;NoCallPct=2.1    GT      0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     .       0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     .       0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     .       0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     .       .       0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     .       0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0
+20     14159734        .       T       TA      .       PASS    AC=1;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     14287634        .       AGT     A       .       PASS    AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     14383135        .       TA      T       .       PASS    AC=1;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     14420574        .       GA      G       .       HardyWeinbergViolation  AC=3;AN=766;HW=21.06;HetPct=0.3;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.3;NoCallPct=0.0      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     14669226        .       G       GA      .       PASS    AC=121;AN=766;HW=1.68;HetPct=25.8;HomRefPct=71.3;HomVarPct=2.9;NoCallPct=0.0    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1
+20     14697473        .       TTC     T       .       PASS    AC=9;AN=764;HW=10.31;HetPct=1.8;HomRefPct=97.7;HomVarPct=0.3;NoCallPct=0.3      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     14983337        .       AGCC    A       .       PASS    AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     15037520        .       A       AG      .       PASS    AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     15141272        .       T       TC      .       PASS    AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     15189597        .       GA      G       .       PASS    AC=311;AN=760;HW=2.80;HetPct=46.2;HomRefPct=35.5;HomVarPct=17.5;NoCallPct=0.8   GT      1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     .       0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     .       0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     .       1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1
+20     15265098        .       TG      T       .       PASS    AC=125;AN=766;HW=6.76;HetPct=25.3;HomRefPct=71.0;HomVarPct=3.7;NoCallPct=0.0    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1
+20     15410763        .       TGA     T       .       PASS    AC=29;AN=764;HW=0.00;HetPct=7.6;HomRefPct=92.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     15543319        .       AG      A       .       PASS    AC=7;AN=764;HW=0.00;HetPct=1.8;HomRefPct=97.9;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     15550845        .       TG      T       .       PASS    AC=34;AN=756;HW=0.00;HetPct=8.4;HomRefPct=90.1;HomVarPct=0.3;NoCallPct=1.3      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     15703503        .       TG      T       .       PASS    AC=87;AN=750;HW=3.63;HetPct=19.1;HomRefPct=77.0;HomVarPct=1.8;NoCallPct=2.1     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     .       0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     .       0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/1     0/0     0/1     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     .       0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     15871330        .       AG      A       .       PASS    AC=1;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     16016504        .       TA      T       .       PASS    AC=186;AN=764;HW=15.27;HetPct=32.4;HomRefPct=59.3;HomVarPct=8.1;NoCallPct=0.3   GT      0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1
+20     16172883        .       G       GTAGC   .       HardyWeinbergViolation  AC=79;AN=762;HW=42.59;HetPct=13.8;HomRefPct=82.2;HomVarPct=3.4;NoCallPct=0.5    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     16192114        .       AT      A       .       PASS    AC=0;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     16259934        .       C       CAA     .       PASS    AC=0;AN=758;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.0       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     16312599        .       CTA     C       .       PASS    AC=2;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     16723642        .       GGTT    G       .       PASS    AC=6;AN=760;HW=0.00;HetPct=1.6;HomRefPct=97.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     16747221        .       CA      C       .       PASS    AC=291;AN=764;HW=3.13;HetPct=45.2;HomRefPct=39.2;HomVarPct=15.4;NoCallPct=0.3   GT      0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     .       0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1
+20     16769262        .       TTTC    T       .       HighNoCallRate  AC=8;AN=600;HW=0.00;HetPct=2.1;HomRefPct=76.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=21.7      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     .       0/0     .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       .       0/1     .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       .       .       0/0     0/1     .       0/1     .       .       0/1     0/0     0/0     .       .       .       0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       .       0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     .       0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     .       .       0/1     .       .       0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     .       .       .       .       .       0/0     .       .       .       0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     .       .       .       0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     .       .       0/0     .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       .       .       0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     16813850        .       C       CA      .       PASS    AC=7;AN=758;HW=0.00;HetPct=1.8;HomRefPct=97.1;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.0       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     17250858        .       T       TC      .       PASS    AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     17331332        .       TA      T       .       PASS    AC=80;AN=762;HW=15.60;HetPct=16.2;HomRefPct=80.9;HomVarPct=2.3;NoCallPct=0.5    GT      0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/1     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     17473782        .       TGC     T       .       PASS    AC=1;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     17607627        .       A       AGT     .       PASS    AC=3;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     17753474        .       C       CA      .       PASS    AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     18417481        .       AC      A       .       PASS    AC=17;AN=766;HW=0.00;HetPct=4.4;HomRefPct=95.6;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     18445795        .       AAG     A       .       PASS    AC=5;AN=760;HW=0.00;HetPct=1.3;HomRefPct=97.9;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     18520672        .       A       ATT     .       PASS    AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     18522725        .       ATTAAC  A       .       PASS    AC=1;AN=758;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=98.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.0       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     18915562        .       TAA     T       .       PASS    AC=3;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=98.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     19111235        .       C       CT      .       PASS    AC=4;AN=764;HW=0.00;HetPct=1.0;HomRefPct=98.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     19157532        .       T       TC      .       HardyWeinbergViolation  AC=3;AN=760;HW=21.02;HetPct=0.3;HomRefPct=98.7;HomVarPct=0.3;NoCallPct=0.8      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     19188693        .       T       TC      .       PASS    AC=0;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     19437778        .       GGCCTGGGATGTAAA G       .       PASS    AC=0;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     19805154        .       CCTT    C       .       PASS    AC=3;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     20030869        .       CT      C       .       PASS    AC=362;AN=766;HW=6.74;HetPct=46.5;HomRefPct=29.5;HomVarPct=24.0;NoCallPct=0.0   GT      0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1
+20     20286529        .       A       AC      .       PASS    AC=1;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     20404656        .       ATTACAGACT      A       .       PASS    AC=7;AN=766;HW=0.00;HetPct=1.8;HomRefPct=98.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     20434198        .       TA      T       .       PASS    AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     20716329        .       CA      C       .       PASS    AC=4;AN=760;HW=0.00;HetPct=1.0;HomRefPct=98.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     20760474        .       TG      T       .       PASS    AC=15;AN=764;HW=5.83;HetPct=3.4;HomRefPct=96.1;HomVarPct=0.3;NoCallPct=0.3      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     20952825        .       T       TC      .       PASS    AC=1;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     20990240        .       TC      T       .       PASS    AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     21406859        .       ACTT    A       .       PASS    AC=1;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     21480245        .       AG      A       .       PASS    AC=1;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     21852048        .       CA      C       .       PASS    AC=330;AN=762;HW=4.15;HetPct=46.5;HomRefPct=33.2;HomVarPct=19.8;NoCallPct=0.5   GT      0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     .       0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     .       0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0
+20     21968507        .       AC      A       .       PASS    AC=7;AN=762;HW=12.61;HetPct=1.3;HomRefPct=97.9;HomVarPct=0.3;NoCallPct=0.5      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     22411326        .       CA      C       .       HardyWeinbergViolation  AC=321;AN=762;HW=136.49;HetPct=29.5;HomRefPct=42.8;HomVarPct=27.2;NoCallPct=0.5 GT      0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     .       0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1
+20     22434333        .       C       CA      .       PASS    AC=8;AN=766;HW=0.00;HetPct=2.1;HomRefPct=97.9;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     22637424        .       C       CAGCCA  .       PASS    AC=3;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=98.4;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     22655862        .       TATC    T       .       PASS    AC=6;AN=766;HW=0.00;HetPct=1.6;HomRefPct=98.4;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     23169038        .       TGTC    T       .       HardyWeinbergViolation  AC=380;AN=766;HW=1034.24;HetPct=98.7;HomRefPct=1.0;HomVarPct=0.3;NoCallPct=0.0  GT      0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1
+20     23200197        .       ATT     A       .       PASS    AC=1;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     23293728        .       CA      C       .       PASS    AC=8;AN=754;HW=11.33;HetPct=1.6;HomRefPct=96.6;HomVarPct=0.3;NoCallPct=1.6      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     23319459        .       CAT     C       .       HardyWeinbergViolation  AC=10;AN=766;HW=26.72;HetPct=1.6;HomRefPct=97.9;HomVarPct=0.5;NoCallPct=0.0     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     23813095        .       CT      C       .       PASS    AC=26;AN=762;HW=1.46;HetPct=6.3;HomRefPct=93.0;HomVarPct=0.3;NoCallPct=0.5      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     23815381        .       CT      C       .       PASS    AC=1;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     23889003        .       GA      G       .       PASS    AC=2;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     24541328        .       TA      T       .       HighNoCallRate  AC=0;AN=430;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=56.1;HomVarPct=0.0;NoCallPct=43.9      GT      .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       .       .       .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       .       .       .       0/0     0/0     .       .       .       0/0     .       .       .       .       0/0     0/0     .       .       .       .       0/0     0/0     0/0     .       .       .       0/0     .       .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       .       .       .       0/0     .       .       .       0/0     0/0     .       .       0/0     0/0     .       0/0     .       .       0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     .       0/0     .       0/0     .       .       .       .       .       .       0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       .       .       .       .       .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       .       0/0     .       .       .       .       .       .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     .       .       .       .       0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       .       0/0     .       .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       .       0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     .       .       0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     .       .       0/0     .       .       .       .       .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       .       0/0     .       .       0/0     0/0     .       .       0/0     .       .       .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     .       .       .       0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     .       .       0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     .       0/0
+20     24710482        .       GT      G       .       PASS    AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     24855121        .       CT      C       .       PASS    AC=6;AN=760;HW=0.00;HetPct=1.6;HomRefPct=97.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     25283938        .       A       AG      .       HardyWeinbergViolation  AC=326;AN=762;HW=30.59;HetPct=40.2;HomRefPct=36.8;HomVarPct=22.5;NoCallPct=0.5  GT      0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     .       0/1     .       0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1
+20     25503211        .       CATA    C       .       PASS    AC=1;AN=758;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=98.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.0       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     25905250        .       GT      G       .       PASS    AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     29589873        .       CCTT    C       .       PASS    AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     29628180        .       C       CCACAAGAAG      .       PASS    AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     29804699        .       A       AC      .       PASS    AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     29913425        .       TATATC  T       .       PASS    AC=15;AN=762;HW=5.82;HetPct=3.4;HomRefPct=95.8;HomVarPct=0.3;NoCallPct=0.5      GT      0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     30390854        .       TTATACTA        T       .       PASS    AC=3;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     30534847        .       ACAAT   A       .       PASS    AC=2;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     30567910        .       T       TG      .       PASS    AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     31412616        .       CT      C       .       PASS    AC=1;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     31760870        .       CG      C       .       PASS    AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     31881479        .       AG      A       .       HardyWeinbergViolation  AC=40;AN=764;HW=34.05;HetPct=7.3;HomRefPct=90.9;HomVarPct=1.6;NoCallPct=0.3     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     32015223        .       CT      C       .       PASS    AC=5;AN=764;HW=0.00;HetPct=1.3;HomRefPct=98.4;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     32158330        .       CAG     C       .       PASS    AC=4;AN=760;HW=0.00;HetPct=1.0;HomRefPct=98.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     32456076        .       GT      G       .       PASS    AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     32477286        .       CA      C       .       HardyWeinbergViolation  AC=14;AN=766;HW=20.05;HetPct=2.6;HomRefPct=96.9;HomVarPct=0.5;NoCallPct=0.0     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     32509752        .       A       AG      .       PASS    AC=1;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     32700247        .       GGCGTCTGA       G       .       PASS    AC=3;AN=754;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=97.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.6       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     32968409        .       GTC     G       .       PASS    AC=0;AN=754;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=98.4;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.6       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     33541746        .       A       AAG     .       PASS    AC=4;AN=766;HW=0.00;HetPct=1.0;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     34251969        .       C       CA      .       PASS    AC=3;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=98.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     34313574        .       A       AT      .       PASS    AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     34633573        .       TAA     T       .       PASS    AC=1;AN=754;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=98.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.6       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     34831930        .       CT      C       .       PASS    AC=7;AN=766;HW=0.00;HetPct=1.8;HomRefPct=98.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     35329008        .       ATC     A       .       PASS    AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     35357903        .       GA      G       .       PASS    AC=5;AN=764;HW=0.00;HetPct=1.3;HomRefPct=98.4;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     35847597        .       CTT     C       .       PASS    AC=1;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     36250348        .       CG      C       .       HighNoCallRate  AC=0;AN=414;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=54.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=46.0      GT      0/0     .       0/0     .       .       0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       .       0/0     .       0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     .       .       0/0     .       .       0/0     .       0/0     .       .       .       0/0     .       0/0     .       .       .       0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     .       .       0/0     .       .       .       0/0     0/0     .       .       .       0/0     0/0     .       .       0/0     .       .       .       0/0     .       0/0     .       0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       .       .       .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       .       0/0     0/0     .       .       .       .       .       0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       .       .       0/0     0/0     .       .       0/0     .       .       0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     .       .       .       0/0     .       0/0     .       0/0     .       0/0     .       0/0     .       .       .       0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       .       0/0     .       0/0     0/0     .       .       0/0     0/0     .       0/0     .       .       .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       .       .       .       0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       .       .       .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       .       0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       .       .       .       0/0     .       .       0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     .       .       0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       .       .       .       0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       .       0/0     0/0     .       .       .       0/0     .       0/0     .       0/0     .       .       0/0     .       .       .       .
+20     36658020        .       TG      T       .       PASS    AC=6;AN=764;HW=0.00;HetPct=1.6;HomRefPct=98.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     36704724        .       TC      T       .       PASS    AC=8;AN=756;HW=0.00;HetPct=2.1;HomRefPct=96.6;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     36711544        .       TAAAG   T       .       PASS    AC=1;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     36947086        .       ATAC    A       .       PASS    AC=33;AN=766;HW=0.12;HetPct=8.6;HomRefPct=91.4;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     37139725        .       CAG     C       .       PASS    AC=5;AN=760;HW=15.80;HetPct=0.8;HomRefPct=98.2;HomVarPct=0.3;NoCallPct=0.8      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     37278654        .       CAG     C       .       PASS    AC=7;AN=764;HW=0.00;HetPct=1.8;HomRefPct=97.9;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     37391272        .       TG      T       .       PASS    AC=4;AN=764;HW=0.00;HetPct=1.0;HomRefPct=98.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     37608002        .       CAT     C       .       PASS    AC=7;AN=762;HW=0.00;HetPct=1.8;HomRefPct=97.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     37678954        .       C       CTGG    .       PASS    AC=7;AN=762;HW=0.00;HetPct=1.8;HomRefPct=97.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     37712193        .       AAG     A       .       PASS    AC=29;AN=762;HW=0.00;HetPct=7.6;HomRefPct=91.9;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     37836124        .       AAAT    A       .       PASS    AC=3;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=98.4;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     37954797        .       A       AGT     .       PASS    AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     37962643        .       T       TAA     .       PASS    AC=178;AN=764;HW=12.74;HetPct=31.9;HomRefPct=60.6;HomVarPct=7.3;NoCallPct=0.3   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     .       0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1
+20     38336199        .       TA      T       .       PASS    AC=1;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     38495835        .       T       TA      .       PASS    AC=14;AN=762;HW=0.00;HetPct=3.7;HomRefPct=95.8;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     38696054        .       GAAGA   G       .       PASS    AC=3;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     38784318        .       CCTT    C       .       PASS    AC=7;AN=762;HW=0.00;HetPct=1.8;HomRefPct=97.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     39042026        .       T       TG      .       PASS    AC=1;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     39420665        .       AG      A       .       PASS    AC=72;AN=760;HW=3.25;HetPct=16.2;HomRefPct=81.7;HomVarPct=1.3;NoCallPct=0.8     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0
+20     39607037        .       C       CA      .       PASS    AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     39868369        .       T       TG      .       PASS    AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     40006262        .       TGAG    T       .       PASS    AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     40110981        .       A       AG      .       PASS    AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     40445967        .       TG      T       .       PASS    AC=3;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=98.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     40742257        .       TG      T       .       PASS    AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     41000677        .       T       TG      .       PASS    AC=3;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     41149621        .       T       TATCA   .       PASS    AC=3;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=98.4;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     41364251        .       A       AAG     .       PASS    AC=1;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     41543685        .       CTAAGGAGGGAAAAAGATATAAT C       .       PASS    AC=12;AN=764;HW=0.00;HetPct=3.1;HomRefPct=96.6;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     41851636        .       TA      T       .       PASS    AC=83;AN=764;HW=18.52;HetPct=16.4;HomRefPct=80.7;HomVarPct=2.6;NoCallPct=0.3    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0
+20     41918747        .       TATC    T       .       HighNoCallRate  AC=3;AN=650;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=84.1;HomVarPct=0.0;NoCallPct=15.1      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       .       .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       .       .       0/0     .       0/0     0/0     .       .       0/0     0/0     .       .       .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       .       0/0     0/0     .       0/0     .       .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       .       .       0/0     0/0     0/0     .       .       .       .       0/0     .       .       .       .       .       0/0     .       0/0     .       .       .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     41964672        .       A       AT      .       PASS    AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     42145613        .       TG      T       .       PASS    AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     42159695        .       GC      G       .       PASS    AC=87;AN=762;HW=7.05;HetPct=18.5;HomRefPct=78.9;HomVarPct=2.1;NoCallPct=0.5     GT      0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     .       0/0     .       0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1
+20     42261635        .       C       CATTT   .       PASS    AC=24;AN=764;HW=2.06;HetPct=5.7;HomRefPct=93.7;HomVarPct=0.3;NoCallPct=0.3      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     42470352        .       CACTT   C       .       PASS    AC=19;AN=764;HW=3.87;HetPct=4.4;HomRefPct=95.0;HomVarPct=0.3;NoCallPct=0.3      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     42585924        .       T       TA      .       PASS    AC=1;AN=754;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=98.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.6       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     42856201        .       CT      C       .       PASS    AC=3;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     42909154        .       T       TGGGTC  .       PASS    AC=3;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     42918721        .       AG      A       .       PASS    AC=1;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     42930748        .       A       AG      .       PASS    AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     43245783        .       AG      A       .       PASS    AC=8;AN=766;HW=11.40;HetPct=1.6;HomRefPct=98.2;HomVarPct=0.3;NoCallPct=0.0      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     43371647        .       GGGCTGTAA       G       .       PASS    AC=80;AN=760;HW=6.79;HetPct=17.2;HomRefPct=80.2;HomVarPct=1.8;NoCallPct=0.8     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0
+20     43434234        .       AG      A       .       PASS    AC=4;AN=766;HW=0.00;HetPct=1.0;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     43539258        .       T       TAG     .       PASS    AC=1;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     43606638        .       T       TC      .       PASS    AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     43826992        .       GC      G       .       PASS    AC=0;AN=748;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=97.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=2.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     43993933        .       CA      C       .       PASS    AC=199;AN=764;HW=8.74;HetPct=35.2;HomRefPct=56.1;HomVarPct=8.4;NoCallPct=0.3    GT      0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1
+20     44071585        .       C       CT      .       PASS    AC=132;AN=764;HW=8.50;HetPct=26.1;HomRefPct=69.5;HomVarPct=4.2;NoCallPct=0.3    GT      0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1
+20     44220528        .       T       TC      .       PASS    AC=59;AN=766;HW=1.90;HetPct=14.9;HomRefPct=84.9;HomVarPct=0.3;NoCallPct=0.0     GT      0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0
+20     44340276        .       AACAG   A       .       PASS    AC=37;AN=758;HW=17.93;HetPct=7.6;HomRefPct=90.3;HomVarPct=1.0;NoCallPct=1.0     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     .       0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     44464600        .       T       TA      .       PASS    AC=19;AN=762;HW=3.86;HetPct=4.4;HomRefPct=94.8;HomVarPct=0.3;NoCallPct=0.5      GT      0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     44470843        .       GAGTGTCGT       G       .       PASS    AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     44572563        .       GA      G       .       PASS    AC=1;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     44889286        .       G       GC      .       PASS    AC=13;AN=766;HW=0.00;HetPct=3.4;HomRefPct=96.6;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0
+20     45092013        .       GT      G       .       PASS    AC=4;AN=760;HW=0.00;HetPct=1.0;HomRefPct=98.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     45300827        .       CT      C       .       PASS    AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     45406096        .       T       TTC     .       PASS    AC=4;AN=760;HW=0.00;HetPct=1.0;HomRefPct=98.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     45668403        .       CTG     C       .       PASS    AC=86;AN=762;HW=16.06;HetPct=17.2;HomRefPct=79.6;HomVarPct=2.6;NoCallPct=0.5    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0
+20     46011017        .       GAT     G       .       HighNoCallRate  AC=4;AN=706;HW=0.00;HetPct=1.0;HomRefPct=91.1;HomVarPct=0.0;NoCallPct=7.8       GT      .       .       0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     46051811        .       T       TAAGC   .       PASS    AC=2;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     46353646        .       A       AG      .       PASS    AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     46413551        .       TC      T       .       PASS    AC=2;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=98.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     46569465        .       CTG     C       .       PASS    AC=10;AN=762;HW=0.00;HetPct=2.6;HomRefPct=96.9;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     46720983        .       ATACTTGG        A       .       PASS    AC=3;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     47032179        .       GC      G       .       PASS    AC=2;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=98.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     47136092        .       A       AGTC    .       PASS    AC=1;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     47239432        .       T       TA      .       HardyWeinbergViolation  AC=3;AN=762;HW=21.03;HetPct=0.3;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.3;NoCallPct=0.5      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     47335386        .       GC      G       .       PASS    AC=2;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     47428163        .       C       CA      .       PASS    AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     47988904        .       CA      C       .       PASS    AC=187;AN=760;HW=17.08;HetPct=32.1;HomRefPct=58.7;HomVarPct=8.4;NoCallPct=0.8   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     .       0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0
+20     48262933        .       CCTA    C       .       PASS    AC=7;AN=766;HW=0.00;HetPct=1.8;HomRefPct=98.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     49438742        .       G       GT      .       PASS    AC=8;AN=762;HW=11.37;HetPct=1.6;HomRefPct=97.7;HomVarPct=0.3;NoCallPct=0.5      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     49451656        .       T       TG      .       PASS    AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     49537420        .       AG      A       .       PASS    AC=3;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=98.4;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     49561273        .       A       AG      .       PASS    AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     49765611        .       A       AC      .       PASS    AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     49823863        .       ACTTTT  A       .       HardyWeinbergViolation  AC=14;AN=764;HW=20.03;HetPct=2.6;HomRefPct=96.6;HomVarPct=0.5;NoCallPct=0.3     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     50136971        .       TTTTC   T       .       PASS    AC=8;AN=764;HW=0.00;HetPct=2.1;HomRefPct=97.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     50373155        .       A       AT      .       PASS    AC=7;AN=762;HW=0.00;HetPct=1.8;HomRefPct=97.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     50772065        .       T       TC      .       PASS    AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     50806976        .       G       GAA     .       PASS    AC=128;AN=760;HW=0.17;HetPct=28.2;HomRefPct=68.4;HomVarPct=2.6;NoCallPct=0.8    GT      0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0
+20     50961401        .       G       GT      .       PASS    AC=4;AN=762;HW=0.00;HetPct=1.0;HomRefPct=98.4;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     51547787        .       AC      A       .       PASS    AC=1;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     51758677        .       A       ATT     .       HardyWeinbergViolation  AC=87;AN=762;HW=72.50;HetPct=13.3;HomRefPct=81.5;HomVarPct=4.7;NoCallPct=0.5    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     51838824        .       GA      G       .       PASS    AC=4;AN=756;HW=17.99;HetPct=0.5;HomRefPct=97.9;HomVarPct=0.3;NoCallPct=1.3      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     51961394        .       ATTTG   A       .       PASS    AC=8;AN=760;HW=0.00;HetPct=2.1;HomRefPct=97.1;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8       GT      0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     53081927        .       CATGA   C       .       PASS    AC=5;AN=764;HW=0.00;HetPct=1.3;HomRefPct=98.4;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     53538294        .       T       TG      .       PASS    AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     53602394        .       T       TA      .       PASS    AC=7;AN=764;HW=0.00;HetPct=1.8;HomRefPct=97.9;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     54124185        .       T       TC      .       PASS    AC=2;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     54150907        .       CAG     C       .       PASS    AC=3;AN=754;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=97.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.6       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     54166824        .       AC      A       .       PASS    AC=2;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     54230743        .       CAT     C       .       PASS    AC=2;AN=758;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=98.4;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.0       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     54262948        .       A       AC      .       PASS    AC=0;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     54309727        .       TGAGC   T       .       PASS    AC=7;AN=762;HW=12.61;HetPct=1.3;HomRefPct=97.9;HomVarPct=0.3;NoCallPct=0.5      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     54379666        .       GT      G       .       PASS    AC=172;AN=766;HW=14.43;HetPct=30.8;HomRefPct=62.1;HomVarPct=7.0;NoCallPct=0.0   GT      0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0
+20     55264363        .       AG      A       .       PASS    AC=232;AN=762;HW=15.89;HetPct=37.1;HomRefPct=50.7;HomVarPct=11.7;NoCallPct=0.5  GT      0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1
+20     55286852        .       AAAC    A       .       HardyWeinbergViolation  AC=10;AN=764;HW=26.69;HetPct=1.6;HomRefPct=97.7;HomVarPct=0.5;NoCallPct=0.3     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     55608811        .       CT      C       .       PASS    AC=35;AN=762;HW=19.90;HetPct=7.0;HomRefPct=91.4;HomVarPct=1.0;NoCallPct=0.5     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     55611547        .       CAA     C       .       PASS    AC=1;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     55658161        .       GT      G       .       PASS    AC=0;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     55989765        .       CA      C       .       PASS    AC=208;AN=764;HW=5.71;HetPct=37.1;HomRefPct=54.0;HomVarPct=8.6;NoCallPct=0.3    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0
+20     56249865        .       T       TGAGG   .       PASS    AC=4;AN=756;HW=0.00;HetPct=1.0;HomRefPct=97.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     56344957        .       GT      G       .       PASS    AC=1;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     56419021        .       T       TG      .       PASS    AC=2;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     56915853        .       TG      T       .       PASS    AC=17;AN=764;HW=4.78;HetPct=3.9;HomRefPct=95.6;HomVarPct=0.3;NoCallPct=0.3      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     57125853        .       GA      G       .       HardyWeinbergViolation  AC=137;AN=764;HW=48.09;HetPct=22.2;HomRefPct=70.8;HomVarPct=6.8;NoCallPct=0.3   GT      0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0
+20     57676578        .       CCTTT   C       .       PASS    AC=7;AN=764;HW=0.00;HetPct=1.8;HomRefPct=97.9;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     57693627        .       AG      A       .       HighNoCallRate  AC=12;AN=292;HW=71.95;HetPct=0.5;HomRefPct=36.3;HomVarPct=1.3;NoCallPct=61.9    GT      .       .       0/0     .       .       .       0/0     .       .       .       .       0/0     .       1/1     .       .       0/0     .       0/0     .       0/0     .       .       .       .       .       .       .       0/0     0/0     .       .       .       0/0     .       .       .       .       .       0/0     .       0/0     .       .       0/0     0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     .       .       .       .       0/0     .       .       .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     .       .       0/0     0/0     .       0/0     .       .       .       0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     .       0/0     .       .       0/0     0/0     0/0     .       .       .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     .       .       .       .       .       .       .       0/0     .       .       .       0/0     .       .       .       .       .       .       0/0     1/1     .       .       .       0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     .       0/0     .       .       .       0/0     .       .       .       .       0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       .       .       .       0/0     .       0/0     .       .       .       .       0/0     .       .       0/0     .       .       1/1     .       0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/1     .       .       0/0     .       0/0     1/1     .       .       .       .       .       .       .       0/0     0/0     .       .       .       .       .       .       .       0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     .       .       .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       .       .       0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     .       .       .       .       .       0/0     .       0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       .       .       .       .       .       0/0     .       .       0/0     .       .       0/0     .       0/0     0/0     .       .       0/0     .       .       .       0/0     0/0     .       .       .       .       0/0     .       .       .       0/0     .       .       .       0/0     .       .       .       0/0     .       .       0/0     .       0/0     .       .       .       .       .       .       0/0     .       .       .       .       .       .       .       0/0     .       .       0/1     0/0     .       .       .       .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     .       .       0/0     .       .       0/0     .       .       .       .       0/0     .       .       .       .       .       0/0     .       0/0     .       .       0/0     .       0/0     .       .       .       0/0
+20     57781799        .       TGGG    T       .       HardyWeinbergViolation  AC=43;AN=764;HW=30.12;HetPct=8.1;HomRefPct=90.1;HomVarPct=1.6;NoCallPct=0.3     GT      0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     58288793        .       TC      T       .       PASS    AC=44;AN=766;HW=12.53;HetPct=9.4;HomRefPct=89.6;HomVarPct=1.0;NoCallPct=0.0     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     58790761        .       TG      T       .       HardyWeinbergViolation  AC=232;AN=762;HW=35.81;HetPct=33.9;HomRefPct=52.2;HomVarPct=13.3;NoCallPct=0.5  GT      0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     .       0/1     .       1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0
+20     59072457        .       AAGG    A       .       HardyWeinbergViolation  AC=12;AN=756;HW=41.94;HetPct=1.6;HomRefPct=96.3;HomVarPct=0.8;NoCallPct=1.3     GT      .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     59153061        .       CTG     C       .       PASS    AC=1;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     59186675        .       TATTA   T       .       PASS    AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     59349754        .       CCT     C       .       PASS    AC=168;AN=762;HW=8.71;HetPct=31.3;HomRefPct=61.9;HomVarPct=6.3;NoCallPct=0.5    GT      0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     .       0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     59365768        .       TG      T       .       PASS    AC=2;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     59769242        .       C       CT      .       PASS    AC=4;AN=762;HW=0.00;HetPct=1.0;HomRefPct=98.4;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     59955821        .       TG      T       .       HighNoCallRate  AC=0;AN=712;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=93.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=7.0       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     60337932        .       AC      A       .       PASS    AC=3;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.8;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     60925525        .       GC      G       .       PASS    AC=2;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     60961768        .       GA      G       .       HardyWeinbergViolation  AC=365;AN=766;HW=84.86;HetPct=34.7;HomRefPct=35.0;HomVarPct=30.3;NoCallPct=0.0  GT      0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1
+20     61000018        .       GC      G       .       PASS    AC=203;AN=762;HW=0.38;HetPct=39.4;HomRefPct=53.3;HomVarPct=6.8;NoCallPct=0.5    GT      0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     .       0/1     .       0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0
+20     61531765        .       AG      A       .       PASS    AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     61983510        .       TCTGC   T       .       PASS    AC=75;AN=766;HW=0.03;HetPct=18.0;HomRefPct=81.2;HomVarPct=0.8;NoCallPct=0.0     GT      0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     62154368        .       G       GA      .       PASS    AC=2;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.5;HomRefPct=98.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     62310426        .       CTT     C       .       PASS    AC=1;AN=756;HW=0.00;HetPct=0.3;HomRefPct=98.4;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     62871860        .       C       CCCGCA  .       PASS    AC=27;AN=764;HW=17.87;HetPct=5.5;HomRefPct=93.5;HomVarPct=0.8;NoCallPct=0.3     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
diff --git a/tests/tabix_data/vcf/16.vcf b/tests/tabix_data/vcf/16.vcf
new file mode 100644 (file)
index 0000000..eaa067e
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,369 @@
+##fileformat=VCFv4.0
+##ApplyRecalibration="analysis_type=ApplyRecalibration input_file=[] sample_metadata=[] read_buffer_size=null phone_home=STANDARD read_filter=[] intervals=[20] excludeIntervals=null reference_sequence=/humgen/1kg/reference/human_g1k_v37.fasta rodBind=[/humgen/gsa-hpprojects/dev/delangel/Phase1Calls/20110608VQSRConsensus/calls/combined.phase1.chr20.raw.indels.vcf] rodToIntervalTrackName=null BTI_merge_rule=UNION nonDeterministicRandomSeed=false DBSNP=null downsampling_type=null downsample_to_fraction=null downsample_to_coverage=null baq=OFF baqGapOpenPenalty=40.0 performanceLog=null useOriginalQualities=false defaultBaseQualities=-1 validation_strictness=SILENT unsafe=null num_threads=1 interval_merging=ALL read_group_black_list=null processingTracker=null restartProcessingTracker=false processingTrackerStatusFile=null processingTrackerID=-1 allow_intervals_with_unindexed_bam=false disable_experimental_low_memory_sharding=false logging_level=INFO log_to_file=null help=false recal_file=/humgen/gsa-scr1/delangel/VQSRIndels/data/trainMills75_truthMills75_p15_12_12_pctb0.05_std12.0_mG8_QD_FS_HS_RP_IC.recal tranches_file=/humgen/gsa-scr1/delangel/VQSRIndels/data/trainMills75_truthMills75_p15_12_12_pctb0.05_std12.0_mG8_QD_FS_HS_RP_IC.tranches out=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub NO_HEADER=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub sites_only=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub ts_filter_level=93.0 ignore_filter=null mode=INDEL"
+##CombineVariants="analysis_type=CombineVariants input_file=[] sample_metadata=[] read_buffer_size=null phone_home=STANDARD read_filter=[] intervals=[20:41000001-42000000] excludeIntervals=null reference_sequence=/humgen/1kg/reference/human_g1k_v37.fasta rodBind=[/humgen/gsa-hpprojects/dev/delangel/Phase1Calls/20110608VQSRConsensus/calls/chr20/AFR/AFR.phase1.chr20.42.raw.indels.vcf, /humgen/gsa-hpprojects/dev/delangel/Phase1Calls/20110608VQSRConsensus/calls/chr20/ASN/ASN.phase1.chr20.42.raw.indels.vcf, /humgen/gsa-hpprojects/dev/delangel/Phase1Calls/20110608VQSRConsensus/calls/chr20/AMR/AMR.phase1.chr20.42.raw.indels.vcf, /humgen/gsa-hpprojects/dev/delangel/Phase1Calls/20110608VQSRConsensus/calls/chr20/EUR/EUR.phase1.chr20.42.raw.indels.vcf, /humgen/gsa-hpprojects/dev/delangel/Phase1Calls/20110608VQSRConsensus/calls/chr20/AFR.admix/AFR.admix.phase1.chr20.42.raw.indels.vcf, /humgen/gsa-hpprojects/dev/delangel/Phase1Calls/20110608VQSRConsensus/calls/chr20/ASN.admix/ASN.admix.phase1.chr20.42.raw.indels.vcf, /humgen/gsa-hpprojects/dev/delangel/Phase1Calls/20110608VQSRConsensus/calls/chr20/AMR.admix/AMR.admix.phase1.chr20.42.raw.indels.vcf, /humgen/gsa-hpprojects/dev/delangel/Phase1Calls/20110608VQSRConsensus/calls/chr20/EUR.admix/EUR.admix.phase1.chr20.42.raw.indels.vcf] rodToIntervalTrackName=null BTI_merge_rule=UNION nonDeterministicRandomSeed=false DBSNP=null downsampling_type=null downsample_to_fraction=null downsample_to_coverage=null baq=OFF baqGapOpenPenalty=40.0 performanceLog=null useOriginalQualities=false defaultBaseQualities=-1 validation_strictness=SILENT unsafe=null num_threads=1 interval_merging=ALL read_group_black_list=null processingTracker=null restartProcessingTracker=false processingTrackerStatusFile=null processingTrackerID=-1 allow_intervals_with_unindexed_bam=false disable_experimental_low_memory_sharding=false logging_level=INFO log_to_file=null help=false out=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub NO_HEADER=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub sites_only=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub genotypemergeoption=PRIORITIZE filteredrecordsmergetype=KEEP_IF_ANY_UNFILTERED rod_priority_list=AFR.admix,AMR.admix,EUR.admix,ASN.admix,AFR,AMR,EUR,ASN printComplexMerges=false filteredAreUncalled=false minimalVCF=false setKey=set assumeIdenticalSamples=false minimumN=1 masterMerge=false mergeInfoWithMaxAC=true"
+##FILTER=<ID=BothStrands,Description="Variant not seen on both strands">
+##FILTER=<ID=HARD_TO_VALIDATE,Description="MQ0 >= 4 && (MQ0 / (1.0 * DP)) > 0.1">
+##FILTER=<ID=HP10,Description="Variant occurs in long homopolymer run (>10)">
+##FILTER=<ID=HaplotypeScore,Description="HaplotypeScore>20.0">
+##FILTER=<ID=HighCoverage,Description="Coverage at variant site is > 7500">
+##FILTER=<ID=HomopolymerRun,Description="HRun>=15">
+##FILTER=<ID=LongRepeat,Description="Variant occurs in long tandem repeat (as defined by 1kg phase one filters)">
+##FILTER=<ID=LowQual,Description="QUAL<30.0">
+##FILTER=<ID=PP20,Description="Variant posterior phred is < 20">
+##FILTER=<ID=QualByDepth,Description="QD<1.0">
+##FILTER=<ID=StrandBias,Description="SB>=-1.0">
+##FILTER=<ID=TruthSensitivityTranche93.00to94.00,Description="Truth sensitivity tranche level at VSQ Lod: 3.9628 <= x < 4.1824">
+##FILTER=<ID=TruthSensitivityTranche94.00to95.00,Description="Truth sensitivity tranche level at VSQ Lod: 3.7129 <= x < 3.9628">
+##FILTER=<ID=TruthSensitivityTranche95.00to96.00,Description="Truth sensitivity tranche level at VSQ Lod: 3.3717 <= x < 3.7129">
+##FILTER=<ID=TruthSensitivityTranche96.00to97.00,Description="Truth sensitivity tranche level at VSQ Lod: 2.8762 <= x < 3.3717">
+##FILTER=<ID=TruthSensitivityTranche97.00to98.00,Description="Truth sensitivity tranche level at VSQ Lod: 2.2618 <= x < 2.8762">
+##FILTER=<ID=TruthSensitivityTranche98.00to99.00+,Description="Truth sensitivity tranche level at VQS Lod < 1.2907">
+##FILTER=<ID=TruthSensitivityTranche98.00to99.00,Description="Truth sensitivity tranche level at VSQ Lod: 1.2907 <= x < 2.2618">
+##FORMAT=<ID=AA,Number=1,Type=Integer,Description="Alternate allele observations">
+##FORMAT=<ID=AD,Number=.,Type=Integer,Description="Allelic depths for the ref and alt alleles in the order listed">
+##FORMAT=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Read Depth (only filtered reads used for calling)">
+##FORMAT=<ID=FT,Number=1,Type=String,Description="Sample Genotype Filter">
+##FORMAT=<ID=GL,Number=3,Type=Integer,Description="Genotype Likelihood, log-scaled likeilhoods of the data given the called genotype for each possible genotype generated from the reference and alternate alleles given the sample ploidy">
+##FORMAT=<ID=GQ,Number=1,Type=Float,Description="Genotype Quality">
+##FORMAT=<ID=GT,Number=1,Type=String,Description="Genotype">
+##FORMAT=<ID=HQ,Number=.,Type=Integer,Description="Haplotype Quality">
+##FORMAT=<ID=PL,Number=3,Type=Float,Description="Normalized, Phred-scaled likelihoods for AA,AB,BB genotypes where A=ref and B=alt; not applicable if site is not biallelic">
+##FORMAT=<ID=RA,Number=1,Type=Integer,Description="Reference allele observations">
+##FORMAT=<ID=SA,Number=1,Type=Integer,Description="Number of alternate observations by strand, delimited by |: [forward]|[reverse]">
+##FORMAT=<ID=SP,Number=1,Type=Integer,Description="Phred-scaled strand bias P-value">
+##FORMAT=<ID=SR,Number=1,Type=Integer,Description="Number of reference observations by strand, delimited by |: [forward]|[reverse]">
+##INFO=<ID=AA,Number=1,Type=Integer,Description="Alternate allele observations">
+##INFO=<ID=AB,Number=1,Type=Float,Description="Allele balance at heterozygous sites: a number between 0 and 1 representing the ratio of reads showing the reference allele to all reads, considering only reads from individuals called as heterozygous">
+##INFO=<ID=ABA,Number=1,Type=Integer,Description="Alternate allele balance count: the number of sequence reads from apparent heterozygotes supporting the alternate allele">
+##INFO=<ID=ABP,Number=1,Type=Float,Description="Allele balance probability at heterozygous sites: Phred-scaled upper-bounds estimate of the probability of observing the deviation between ABR and ABA given E(ABR/ABA) ~ 0.5, derived using Hoeffding's inequality">
+##INFO=<ID=ABR,Number=1,Type=Integer,Description="Reference allele balance count: the number of sequence reads from apparent heterozygotes supporting the reference allele">
+##INFO=<ID=AC,Number=.,Type=Integer,Description="Allele count in genotypes, for each ALT allele, in the same order as listed">
+##INFO=<ID=AF,Number=.,Type=Float,Description="Allele Frequency, for each ALT allele, in the same order as listed">
+##INFO=<ID=AF1,Number=1,Type=Float,Description="Max-likelihood estimate of the site allele frequency of the first ALT allele">
+##INFO=<ID=AN,Number=1,Type=Integer,Description="Total number of alleles in called genotypes">
+##INFO=<ID=BL,Number=1,Type=Integer,Description="Base Pairs Left: number of base pairs in reads supporting the alternate to the left (5') of the alternate allele">
+##INFO=<ID=BR,Number=1,Type=Integer,Description="Base Pairs Right: number of base pairs in reads supporting the alternate to the right (3') of the alternate allele">
+##INFO=<ID=BVAR,Number=0,Type=Flag,Description="The best genotype combination in the posterior is variant (non homozygous).">
+##INFO=<ID=BaseQRankSum,Number=1,Type=Float,Description="Z-score from Wilcoxon rank sum test of Alt Vs. Ref base qualities">
+##INFO=<ID=CI95,Number=2,Type=Float,Description="Equal-tail Bayesian credible interval of the site allele frequency at the 95% level">
+##INFO=<ID=CpG,Number=0,Type=Flag,Description="CpG site (either CpG, TpG or CpA)">
+##INFO=<ID=DB,Number=0,Type=Flag,Description="dbSNP Membership">
+##INFO=<ID=DEL,Number=0,Type=Flag,Description="deletion allele">
+##INFO=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Filtered Depth">
+##INFO=<ID=DP4,Number=4,Type=Integer,Description="# high-quality ref-forward bases, ref-reverse, alt-forward and alt-reverse bases">
+##INFO=<ID=DS,Number=0,Type=Flag,Description="Were any of the samples downsampled?">
+##INFO=<ID=Dels,Number=1,Type=Float,Description="Fraction of Reads Containing Spanning Deletions">
+##INFO=<ID=EL,Number=1,Type=Integer,Description="Allele End Left: number of observations of the alternate where the alternate occurs in the left end of the read">
+##INFO=<ID=EPP,Number=1,Type=Float,Description="End Placement Probability: Phred-scaled upper-bounds estimate of the probability of observing the deviation between EL and ER given E(EL/ER) ~ 0.5, derived using Hoeffding's inequality">
+##INFO=<ID=ER,Number=1,Type=Integer,Description="Allele End Right: number of observations of the alternate where the alternate occurs in the right end of the read">
+##INFO=<ID=FQ,Number=1,Type=Float,Description="Phred probability that sample chromosomes are not all the same">
+##INFO=<ID=FR,Number=0,Type=Float,Description="Estimated population frequency">
+##INFO=<ID=FS,Number=1,Type=Float,Description="Phred-scaled p-value using Fisher's exact test to detect strand bias">
+##INFO=<ID=HETAR,Number=1,Type=Integer,Description="Number of individuals heterozygous alternate / reference">
+##INFO=<ID=HOMA,Number=1,Type=Integer,Description="Number of individuals homozygous for the alternate">
+##INFO=<ID=HOMR,Number=1,Type=Integer,Description="Number of individuals homozygous for the reference">
+##INFO=<ID=HP,Number=1,Type=Integer,Description="Homopolmer run length">
+##INFO=<ID=HPLen,Number=1,Type=Integer,Description="Homopolymer length">
+##INFO=<ID=HR,Number=1,Type=Integer,Description="Homopolymer run length">
+##INFO=<ID=HRun,Number=1,Type=Integer,Description="Largest Contiguous Homopolymer Run of Variant Allele In Either Direction">
+##INFO=<ID=HU,Number=1,Type=String,Description="Homopolymer run unit (stranded)">
+##INFO=<ID=HaplotypeScore,Number=1,Type=Float,Description="Consistency of the site with at most two segregating haplotypes">
+##INFO=<ID=INDEL,Number=0,Type=Flag,Description="Not provided in original VCF header">
+##INFO=<ID=INS,Number=0,Type=Flag,Description="insertion allele">
+##INFO=<ID=InbreedingCoeff,Number=1,Type=Float,Description="Inbreeding coefficient as estimated from the genotype likelihoods per-sample when compared against the Hardy-Weinberg expectation">
+##INFO=<ID=KGPilot123,Number=0,Type=Flag,Description="1000 Genome discovery all pilots 2010(1,2,3)">
+##INFO=<ID=LEN,Number=1,Type=Integer,Description="allele length">
+##INFO=<ID=LRB,Number=1,Type=Float,Description="((max(BR, BL) / (BR + BL)) - 0.5) * 2 : The proportion of base pairs in reads on one side of the alternate allele relative to total bases, scaled from [0.5,1] to [0,1]">
+##INFO=<ID=LRBP,Number=1,Type=Float,Description="Left-Right Balance Probability: Phred-scaled upper-bounds estimate of the probability of observing the deviation between BL and BR given E(BR/BL) ~ 0.5, derived using Hoeffding's inequality">
+##INFO=<ID=MNP,Number=0,Type=Flag,Description="MNP allele">
+##INFO=<ID=MQ,Number=1,Type=Float,Description="RMS Mapping Quality">
+##INFO=<ID=MQ0,Number=1,Type=Integer,Description="Total Mapping Quality Zero Reads">
+##INFO=<ID=MQ0Fraction,Number=1,Type=Float,Description="Fraction of Mapping Quality Zero Reads">
+##INFO=<ID=MQM,Number=1,Type=Float,Description="Mean mapping quality of observed alternate alleles">
+##INFO=<ID=MQRankSum,Number=1,Type=Float,Description="Z-score From Wilcoxon rank sum test of Alt vs. Ref read mapping qualities">
+##INFO=<ID=NF,Number=0,Type=Integer,Description="Total number of forward reads containing this variant">
+##INFO=<ID=NR,Number=0,Type=Integer,Description="Total number of reads containing this variant">
+##INFO=<ID=NS,Number=1,Type=Integer,Description="Number of samples with data">
+##INFO=<ID=PP,Number=0,Type=Float,Description="Posterior probability (phred scaled) that this variant segregates">
+##INFO=<ID=PV4,Number=4,Type=Float,Description="P-values for strand bias, baseQ bias, mapQ bias and tail distance bias">
+##INFO=<ID=QD,Number=1,Type=Float,Description="Variant Confidence/Quality by Depth">
+##INFO=<ID=RA,Number=1,Type=Integer,Description="Reference allele observations">
+##INFO=<ID=RL,Number=1,Type=Integer,Description="Reads Placed Left: number of reads supporting the alternate balanced to the left (5') of the alternate allele">
+##INFO=<ID=RPP,Number=1,Type=Float,Description="Read Placement Probability: Phred-scaled upper-bounds estimate of the probability of observing the deviation between RPL and RPR given E(RPL/RPR) ~ 0.5, derived using Hoeffding's inequality">
+##INFO=<ID=RR,Number=1,Type=Integer,Description="Reads Placed Right: number of reads supporting the alternate balanced to the right (3') of the alternate allele">
+##INFO=<ID=RUN,Number=1,Type=Integer,Description="Homopolymer run length: the number of consecutive nucleotides in the reference genome matching the alternate allele prior to the current position">
+##INFO=<ID=ReadPosRankSum,Number=1,Type=Float,Description="Z-score from Wilcoxon rank sum test of Alt vs. Ref read position bias">
+##INFO=<ID=SAB,Number=1,Type=Float,Description="Strand bias for the alternate allele: SAF / ( SAF + SAR )">
+##INFO=<ID=SAF,Number=1,Type=Integer,Description="Number of alternate observations on the forward strand">
+##INFO=<ID=SAP,Number=1,Type=Float,Description="Strand balance probability for the alternate allele: Phred-scaled upper-bounds estimate of the probability of observing the deviation between SAF and SAR given E(SAF/SAR) ~ 0.5, derived using Hoeffding's inequality">
+##INFO=<ID=SAR,Number=1,Type=Integer,Description="Number of alternate observations on the reverse strand">
+##INFO=<ID=SB,Number=1,Type=Float,Description="Strand Bias">
+##INFO=<ID=SC,Number=1,Type=String,Description="Genomic sequence 10 bases either side of variant position">
+##INFO=<ID=SNP,Number=0,Type=Flag,Description="SNP allele">
+##INFO=<ID=SRB,Number=1,Type=Float,Description="Strand bias for the reference allele: SRF / ( SRF + SRR )">
+##INFO=<ID=SRF,Number=1,Type=Integer,Description="Number of reference observations on the forward strand">
+##INFO=<ID=SRP,Number=1,Type=Float,Description="Strand balance probability for the reference allele: Phred-scaled upper-bounds estimate of the probability of observing the deviation between SRF and SRR given E(SRF/SRR) ~ 0.5, derived using Hoeffding's inequality">
+##INFO=<ID=SRR,Number=1,Type=Integer,Description="Number of reference observations on the reverse strand">
+##INFO=<ID=TC,Number=0,Type=Integer,Description="Total coverage">
+##INFO=<ID=TR,Number=1,Type=Integer,Description="Tandem repeat run length (bp)">
+##INFO=<ID=TS,Number=0,Type=Flag,Description="transition SNP">
+##INFO=<ID=TU,Number=1,Type=String,Description="tandem repeat run unit (stranded)">
+##INFO=<ID=TV,Number=0,Type=Flag,Description="transversion SNP">
+##INFO=<ID=VLD,Number=0,Type=Flag,Description="Is Validated.  This bit is set if the snp has 2+ minor allele count based on frequency or genotype data.">
+##INFO=<ID=VQSLOD,Number=1,Type=Float,Description="Log odds ratio of being a true variant versus being false under the trained gaussian mixture model">
+##INFO=<ID=dbSNP,Number=1,Type=Integer,Description="First SNP Build for RS">
+##INFO=<ID=set,Number=1,Type=String,Description="Source VCF for the merged record in CombineVariants">
+##LeftAlignVariants="analysis_type=LeftAlignVariants input_file=[] sample_metadata=[] read_buffer_size=null phone_home=STANDARD read_filter=[] intervals=[20] excludeIntervals=null reference_sequence=/seq/references/Homo_sapiens_assembly19/v1/Homo_sapiens_assembly19.fasta rodBind=[/humgen/gsa-scr1/ebanks/ALL.chr20.Oxford.20110407.indels.genotypes.vcf] rodToIntervalTrackName=null BTI_merge_rule=UNION nonDeterministicRandomSeed=false DBSNP=null downsampling_type=null downsample_to_fraction=null downsample_to_coverage=null baq=OFF baqGapOpenPenalty=40.0 performanceLog=null useOriginalQualities=false defaultBaseQualities=-1 validation_strictness=SILENT unsafe=null num_threads=1 interval_merging=ALL read_group_black_list=null processingTracker=null restartProcessingTracker=false processingTrackerStatusFile=null processingTrackerID=-1 allow_intervals_with_unindexed_bam=false disable_experimental_low_memory_sharding=false logging_level=INFO log_to_file=null help=false out=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub NO_HEADER=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub sites_only=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub"
+##SelectVariants="analysis_type=SelectVariants input_file=[] sample_metadata=[] read_buffer_size=null phone_home=STANDARD read_filter=[] intervals=[20] excludeIntervals=null reference_sequence=/seq/references/Homo_sapiens_assembly19/v1/Homo_sapiens_assembly19.fasta rodBind=[/humgen/gsa-scr1/delangel/officialCalls/20110201_chr20_phase1_indels/dindel/20110208.chr20.dindel2.ALL.sites.vcf] rodToIntervalTrackName=null BTI_merge_rule=UNION nonDeterministicRandomSeed=false DBSNP=null downsampling_type=null downsample_to_fraction=null downsample_to_coverage=null baq=OFF baqGapOpenPenalty=40.0 performanceLog=null useOriginalQualities=false defaultBaseQualities=-1 validation_strictness=SILENT unsafe=null num_threads=1 interval_merging=ALL read_group_black_list=null processingTracker=null restartProcessingTracker=false processingTrackerStatusFile=null processingTrackerID=-1 allow_intervals_with_unindexed_bam=false disable_experimental_low_memory_sharding=false logging_level=INFO log_to_file=null help=false out=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub NO_HEADER=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub sites_only=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub sample=null select_expressions=[] excludeNonVariants=false excludeFiltered=false discordance= concordance= family_structure= mendelianViolation=false mendelianViolationQualThreshold=0.0 select_random_number=0 select_random_fraction=0.0 selectSNPs=false selectIndels=true"
+##UnifiedGenotyper="analysis_type=UnifiedGenotyper input_file=[/broad/shptmp/delangel/calls/chr20/CHB.phase1.chr20.42.cleaned.bam, /broad/shptmp/delangel/calls/chr20/CHS.phase1.chr20.42.cleaned.bam, /broad/shptmp/delangel/calls/chr20/CLM.phase1.chr20.42.cleaned.bam, /broad/shptmp/delangel/calls/chr20/JPT.phase1.chr20.42.cleaned.bam, /broad/shptmp/delangel/calls/chr20/MXL.phase1.chr20.42.cleaned.bam, /broad/shptmp/delangel/calls/chr20/PUR.phase1.chr20.42.cleaned.bam] sample_metadata=[] read_buffer_size=null phone_home=STANDARD read_filter=[] intervals=[20:41000001-42000000] excludeIntervals=null reference_sequence=/humgen/1kg/reference/human_g1k_v37.fasta rodBind=[/humgen/gsa-scr1/delangel/otherIndelCallerAnalysis/ALL.indels.combined.chr20.vcf, /humgen/gsa-hpprojects/GATK/data/dbsnp_132_b37.leftAligned.vcf] rodToIntervalTrackName=null BTI_merge_rule=UNION nonDeterministicRandomSeed=false DBSNP=null downsampling_type=null downsample_to_fraction=null downsample_to_coverage=50 baq=OFF baqGapOpenPenalty=40.0 performanceLog=null useOriginalQualities=false defaultBaseQualities=-1 validation_strictness=SILENT unsafe=null num_threads=8 interval_merging=ALL read_group_black_list=null processingTracker=null restartProcessingTracker=false processingTrackerStatusFile=null processingTrackerID=-1 allow_intervals_with_unindexed_bam=false disable_experimental_low_memory_sharding=false logging_level=INFO log_to_file=null help=false genotype_likelihoods_model=INDEL p_nonref_model=EXACT heterozygosity=0.0010 pcr_error_rate=1.0E-4 genotyping_mode=GENOTYPE_GIVEN_ALLELES output_mode=EMIT_ALL_SITES standard_min_confidence_threshold_for_calling=4.0 standard_min_confidence_threshold_for_emitting=4.0 noSLOD=false assume_single_sample_reads=null abort_at_too_much_coverage=-1 min_base_quality_score=17 min_mapping_quality_score=20 max_deletion_fraction=0.05 min_indel_count_for_genotyping=5 indel_heterozygosity=1.25E-4 indelGapContinuationPenalty=10.0 indelGapOpenPenalty=45.0 indelHaplotypeSize=80 doContextDependentGapPenalties=true getGapPenaltiesFromData=false indel_recal_file=indel.recal_data.csv indelDebug=false dovit=false GSA_PRODUCTION_ONLY=false exactCalculation=LINEAR_EXPERIMENTAL ignoreSNPAlleles=true output_all_callable_bases=false genotype=false out=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub NO_HEADER=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub sites_only=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub debug_file=null metrics_file=null annotation=[MappingQualityZeroFraction]"
+##VariantFiltration="analysis_type=VariantFiltration input_file=[] sample_metadata=[] read_buffer_size=null phone_home=STANDARD read_filter=[] intervals=[/humgen/1kg/processing/pipeline_test_bams/chr22_chunked.hg19.intervals] excludeIntervals=null reference_sequence=/humgen/1kg/reference/human_g1k_v37.fasta rodBind=[/broad/shptmp/rpoplin/ALL.phase1.chr22.raw.indels.vcf] rodToIntervalTrackName=null BTI_merge_rule=UNION DBSNP=null downsampling_type=null downsample_to_fraction=null downsample_to_coverage=null baq=OFF baqGapOpenPenalty=40.0 performanceLog=null useOriginalQualities=false defaultBaseQualities=-1 validation_strictness=SILENT unsafe=null num_threads=1 interval_merging=ALL read_group_black_list=null processingTracker=null restartProcessingTracker=false processingTrackerStatusFile=null processingTrackerID=-1 allow_intervals_with_unindexed_bam=false enable_experimental_low_memory_sharding=false logging_level=INFO log_to_file=null quiet_output_mode=false debug_mode=false help=false out=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub NO_HEADER=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub sites_only=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub filterExpression=[MQ0 >= 4 && (MQ0 / (1.0 * DP)) > 0.1, QUAL<30.0, SB>=-1.0, QD<1.0, HRun>=15, HaplotypeScore>20.0] filterName=[HARD_TO_VALIDATE, LowQual, StrandBias, QualByDepth, HomopolymerRun, HaplotypeScore] genotypeFilterExpression=[] genotypeFilterName=[] clusterSize=3 clusterWindowSize=0 maskName=Mask missingValuesInExpressionsShouldEvaluateAsFailing=false"
+##commandline="/share/software/freebayes/bin/freebayes --stdin --min-alternate-count 2 --genotype-combo-step-max 20 --genotype-variant-threshold 4 --no-marginals --pvar 0.0001 --indels --mnps --no-filters --binomial-obs-priors --allele-balance-priors --region 20:0..100000 --vcf /d1/data/1000G/20101123/populations/finalised.phase1/integrated/including454/wg/ALL/Pipeline/none//freebayes/freebayes.20:0-100000.baq.20110328.vcf --fasta-reference /d2/data/references/build_37/human_reference_v37.fa"
+##fileDate=2011-03-28
+##filedate=2011-02-08
+##filter="( SNP | MNP ) & ( MQM > 65 | QUAL > 1 ) & ABP < 30 & AB < 0.9 | ( INS | DEL ) & QUAL > 500"
+##phasing=none
+##platypusOptions={'bamFiles': ['/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA06984', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA06985', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA06986', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA06989', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA06994', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA07000', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA07037', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA07048', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA07051', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA07056', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA07346', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA07347', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA07357', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA10847', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA10851', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA11829', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA11830', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA11831', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA11832', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA11843', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA11881', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA11892', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA11893', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA11894', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA11918', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA11919', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA11920', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA11930', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA11931', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA11932', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA11933', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA11992', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA11993', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA11994', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA11995', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12003', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12004', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12005', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12006', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12043', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12044', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12045', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12046', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12058', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12144', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12154', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12155', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12156', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12234', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12249', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12272', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12273', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12275', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12282', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12283', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12286', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12287', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12340', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12341', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12342', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12347', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12348', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12383', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12399', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12400', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12413', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12414', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12489', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12546', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12716', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12717', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12718', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12748', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12749', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12750', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12751', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12761', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12763', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12775', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12776', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12777', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12778', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12813', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12827', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12828', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12829', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12830', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12842', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12843', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12889', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12890', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18486', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18487', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18488', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18489', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18498', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18499', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18501', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18502', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18504', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18505', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18507', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18508', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18510', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18511', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18516', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18517', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18519', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18520', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18522', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18523', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18526', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18530', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18532', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18533', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18534', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18535', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18536', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18537', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18538', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18539', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18541', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18542', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18543', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18544', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18545', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18546', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18547', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18548', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18549', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18550', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18552', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18553', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18555', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18557', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18558', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18559', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18560', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18561', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18562', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18563', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18564', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18565', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18566', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18567', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18570', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18571', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18572', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18573', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18574', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18576', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18577', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18579', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18582', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18592', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18593', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18595', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18596', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18597', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18599', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18602', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18603', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18605', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18606', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18608', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18609', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18610', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18611', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18612', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18613', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18614', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18615', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18616', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18617', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18618', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18619', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18620', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18621', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18622', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18623', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18624', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18625', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18626', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18627', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18628', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18630', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18631', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18632', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18633', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18634', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18635', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18636', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18637', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18638', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18853', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18856', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18858', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18861', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18867', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18868', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18870', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18871', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18873', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18874', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18907', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18908', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18909', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18910', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18912', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18916', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18917', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18923', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18924', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18933', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18934', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18940', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18941', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18942', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18943', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18944', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18945', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18947', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18948', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18949', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18950', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18951', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18952', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18953', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18956', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18959', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18960', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18961', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18963', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18964', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18965', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18967', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18968', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18971', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18972', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18973', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18974', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18975', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18976', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18977', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18980', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18981', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18982', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18983', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18984', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18985', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18986', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18987', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18988', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18989', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18990', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18991', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18999', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19000', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19002', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19003', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19004', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19005', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19007', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19009', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19010', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19012', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19054', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19055', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19056', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19057', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19058', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19059', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19060', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19062', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19063', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19064', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19065', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19066', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19067', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19068', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19070', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19072', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19074', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19075', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19076', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19077', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19078', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19079', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19080', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19081', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19082', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19083', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19084', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19085', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19087', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19088', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19092', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19093', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19098', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19099', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19102', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19107', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19108', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19114', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19116', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19119', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19129', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19130', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19131', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19137', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19138', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19144', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19147', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19152', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19153', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19159', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19160', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19171', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19172', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19189', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19190', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19197', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19198', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19200', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19201', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19204', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19207', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19209', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19210', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19213', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19223', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19225', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19235', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19236', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19247', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19248', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19256', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19257', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19311', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19312', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19313', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19315', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19316', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19317', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19318', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19319', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19321', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19324', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19327', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19328', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19331', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19332', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19334', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19338', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19346', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19347', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19350', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19355', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19359', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19360', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19371', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19372', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19373', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19374', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19375', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19376', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19377', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19379', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19380', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19381', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19382', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19383', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19384', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19385', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19390', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19391', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19393', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19394', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19395', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19396', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19397', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19398', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19399', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19401', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19403', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19404', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19428', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19429', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19430', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19431', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19434', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19435', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19436', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19437', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19438', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19439', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19440', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19443', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19444', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19445', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19446', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19448', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19449', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19451', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19452', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19453', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19455', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19456', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19457', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19461', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19462', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19463', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19466', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19467', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19468', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19469', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19470', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19471', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19472', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19473', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19474', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19625', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19648', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19649', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19651', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19652', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19654', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19655', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19657', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19658', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19660', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19661', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19663', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19664', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19670', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19675', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19676', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19678', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19679', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19681', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19682', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19684', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19685', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19700', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19701', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19703', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19704', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19707', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19711', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19712', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19713', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19716', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19717', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19719', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19720', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19722', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19723', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19725', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19726', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19728', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19729', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19731', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19732', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19746', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19747', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19749', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19750', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19755', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19756', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19758', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19759', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19761', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19762', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19770', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19771', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19773', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19774', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19776', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19777', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19779', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19780', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19782', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19783', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19785', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19786', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19788', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19789', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19818', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19819', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19834', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19835', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19900', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19901', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19904', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19908', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19909', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19914', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19916', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19917', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19920', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19921', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19982', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19985', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20126', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20127', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20276', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20278', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20281', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20282', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20287', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20289', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20291', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20294', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20296', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20299', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20314', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20317', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20322', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20332', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20334', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20336', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20340', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20341', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20342', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20344', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20346', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20348', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20356', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20502', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20503', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20504', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20505', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20506', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20507', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20508', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20509', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20510', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20512', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20513', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20514', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20515', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20516', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20517', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20518', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20519', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20520', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20521', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20522', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20524', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20525', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20526', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20527', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20528', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20529', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20530', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20531', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20532', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20533', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20534', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20535', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20536', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20537', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20538', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20539', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20540', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20541', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20542', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20543', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20544', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20581', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20582', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20585', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20586', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20588', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20589', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20752', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20753', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20754', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20755', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20756', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20757', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20758', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20759', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20760', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20761', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20765', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20766', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20768', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20769', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20770', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20771', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20772', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20773', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20774', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20775', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20778', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20783', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20785', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20786', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20787', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20790', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20792', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20795', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20796', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20797', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20798', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20799', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20800', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20801', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20802', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20803', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20804', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20805', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20806', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20807', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20808', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20809', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20810', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20811', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20812', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20813', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20814', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20815', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20816', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20818', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20819', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20826', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20828', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00096', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00098', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00100', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00103', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00106', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00108', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00111', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00112', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00114', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00115', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00116', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00117', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00118', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00119', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00120', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00122', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00123', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00124', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00125', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00126', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00127', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00131', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00133', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00136', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00137', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00138', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00139', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00140', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00141', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00142', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00143', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00144', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00145', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00146', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00147', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00148', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00149', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00150', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00151', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00152', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00153', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00154', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00155', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00156', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00157', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00158', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00159', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00160', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00171', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00173', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00174', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00176', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00177', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00178', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00179', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00180', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00181', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00182', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00183', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00185', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00186', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00187', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00188', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00189', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00190', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00231', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00232', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00233', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00236', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00237', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00239', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00242', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00243', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00244', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00245', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00246', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00247', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00249', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00250', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00251', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00252', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00253', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00254', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00256', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00257', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00258', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00259', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00260', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00261', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00262', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00263', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00264', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00265', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00266', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00267', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00268', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00269', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00270', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00271', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00272', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00273', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00274', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00275', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00276', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00277', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00278', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00280', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00281', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00282', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00284', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00285', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00306', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00308', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00309', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00310', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00311', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00312', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00313', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00315', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00318', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00319', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00320', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00321', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00323', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00324', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00325', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00326', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00327', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00328', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00329', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00330', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00331', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00334', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00335', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00336', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00337', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00338', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00339', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00342', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00343', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00344', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00345', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00346', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00353', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00357', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00361', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00366', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00367', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00368', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00369', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00372', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00373', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00375', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00377', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00380', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00403', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00404', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00418', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00419', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00421', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00422', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00427', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00428', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00436', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00437', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00442', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00443', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00448', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00449', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00463', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00464', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00472', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00473', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00475', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00476', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00478', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00479', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00500', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00501', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00512', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00513', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00524', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00525', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00530', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00531', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00533', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00534', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00536', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00537', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00542', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00543', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00551', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00553', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00554', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00556', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00557', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00559', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00560', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00565', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00566', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00577', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00578', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00580', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00581', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00583', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00584', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00589', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00590', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00592', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00593', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00595', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00596', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00607', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00608', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00610', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00611', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00613', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00614', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00619', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00620', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00625', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00626', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00628', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00629', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00634', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00635', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00637', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00638', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00640', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00641', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00650', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00651', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00653', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00654', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00656', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00657', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00662', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00663', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00671', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00672', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00683', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00684', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00689', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00690', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00692', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00693', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00698', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00699', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00701', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00702', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00704', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00705', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00707', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00708', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00731', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00732', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00734', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00736', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00737', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00739', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00740', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01047', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01048', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01051', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01052', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01055', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01060', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01061', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01066', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01067', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01069', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01070', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01072', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01073', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01075', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01079', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01080', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01082', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01083', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01094', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01095', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01097', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01098', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01101', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01102', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01107', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01108', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01110', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01111', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01112', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01113', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01124', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01125', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01133', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01134', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01136', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01137', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01140', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01148', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01149', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01167', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01168', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01170', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01171', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01173', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01174', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01176', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01177', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01182', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01183', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01187', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01188', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01190', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01191', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01197', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01198', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01204', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01250', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01251', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01253', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01254', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01334', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01342', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01350', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01351', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01353', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01354', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01356', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01357', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01359', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01360', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01365', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01366', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01374', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01375', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01377', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01378', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01383', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01384', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01389', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01390', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01437', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01440', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01441', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01455', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01456', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01461', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01462', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01464', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01465', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01488', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01489', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01491', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01492', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01494', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01495', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01497', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01498', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01515', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01516', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01518', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01519', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01521', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01522', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01550', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01551'], 'minReads': 2, 'refFile': '/scratch/rimmer/Genomes/human_g1k_v37_ebv.fa', 'maxHaplotypes': 64, 'maxSize': 100, 'ploidy': 2, 'maxRegionSize': 10000, 'nCPU': 1, 'minFlank': 3, 'logFileName': 'LogsAllPhaseOne/ThousandGenomesPhaseOneCalls_20:1-100001.log', 'regions': ['20:1-100001'], 'maxVariants': 6, 'genIndels': 1, 'labels': None, 'dataType': 'population', 'minMapQual': 20, 'rlen': 100, 'nInd': 994, 'getVariantsFromBAMs': 1, 'genSNPs': 1, 'minReadQual': 20, 'maxCoverage': 1000000.0, 'verbosity': 2, 'sourceFile': None, 'callOnlyIndels': 1, 'output': 'VariantCallsAllPhaseOne/ThousandGenomesPhaseOneCalls_20:1-100001.vcf'}
+##reference=/lustre/scratch105/projects/g1k/ref/main_project/human_g1k_v37.fasta
+##source=Dindel2
+##source=SelectVariants
+##source_20110031.1=/nfs/users/nfs_p/pd3/cvs/vcftools/perl/vcf-annotate -d /nfs/users/nfs_p/pd3/sandbox/hapmap/dbSNP-b132/non-1kg-vld.desc -a /nfs/users/nfs_p/pd3/sandbox/hapmap/dbSNP-b132/non-1kg-vld.tab.gz -c CHROM,FROM,INFO/VLD,INFO/KGPilot123,INFO/dbSNP
+##vcfCTools=filter
+##vcfCtools=merge freebayes.20:0-100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:100000-200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:200000-300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:300000-400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:400000-500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:500000-600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:600000-700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:700000-800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:800000-900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:900000-1000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:1000000-1100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:1100000-1200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:1200000-1300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:1300000-1400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:1400000-1500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:1500000-1600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:1600000-1700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:1700000-1800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:1800000-1900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:1900000-2000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:2000000-2100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:2100000-2200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:2200000-2300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:2300000-2400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:2400000-2500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:2500000-2600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:2600000-2700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:2700000-2800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:2800000-2900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:2900000-3000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:3000000-3100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:3100000-3200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:3200000-3300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:3300000-3400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:3400000-3500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:3500000-3600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:3600000-3700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:3700000-3800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:3800000-3900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:3900000-4000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:4000000-4100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:4100000-4200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:4200000-4300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:4300000-4400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:4400000-4500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:4500000-4600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:4600000-4700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:4700000-4800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:4800000-4900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:4900000-5000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:5000000-5100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:5100000-5200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:5200000-5300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:5300000-5400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:5400000-5500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:5500000-5600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:5600000-5700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:5700000-5800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:5800000-5900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:5900000-6000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:6000000-6100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:6100000-6200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:6200000-6300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:6300000-6400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:6400000-6500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:6500000-6600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:6600000-6700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:6700000-6800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:6800000-6900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:6900000-7000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:7000000-7100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:7100000-7200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:7200000-7300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:7300000-7400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:7400000-7500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:7500000-7600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:7600000-7700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:7700000-7800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:7800000-7900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:7900000-8000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:8000000-8100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:8100000-8200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:8200000-8300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:8300000-8400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:8400000-8500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:8500000-8600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:8600000-8700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:8700000-8800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:8800000-8900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:8900000-9000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:9000000-9100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:9100000-9200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:9200000-9300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:9300000-9400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:9400000-9500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:9500000-9600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:9600000-9700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:9700000-9800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:9800000-9900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:9900000-10000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:10000000-10100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:10100000-10200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:10200000-10300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:10300000-10400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:10400000-10500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:10500000-10600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:10600000-10700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:10700000-10800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:10800000-10900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:10900000-11000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:11000000-11100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:11100000-11200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:11200000-11300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:11300000-11400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:11400000-11500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:11500000-11600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:11600000-11700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:11700000-11800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:11800000-11900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:11900000-12000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:12000000-12100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:12100000-12200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:12200000-12300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:12300000-12400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:12400000-12500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:12500000-12600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:12600000-12700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:12700000-12800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:12800000-12900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:12900000-13000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:13000000-13100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:13100000-13200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:13200000-13300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:13300000-13400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:13400000-13500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:13500000-13600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:13600000-13700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:13700000-13800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:13800000-13900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:13900000-14000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:14000000-14100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:14100000-14200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:14200000-14300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:14300000-14400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:14400000-14500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:14500000-14600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:14600000-14700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:14700000-14800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:14800000-14900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:14900000-15000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:15000000-15100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:15100000-15200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:15200000-15300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:15300000-15400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:15400000-15500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:15500000-15600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:15600000-15700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:15700000-15800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:15800000-15900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:15900000-16000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:16000000-16100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:16100000-16200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:16200000-16300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:16300000-16400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:16400000-16500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:16500000-16600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:16600000-16700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:16700000-16800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:16800000-16900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:16900000-17000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:17000000-17100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:17100000-17200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:17200000-17300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:17300000-17400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:17400000-17500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:17500000-17600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:17600000-17700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:17700000-17800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:17800000-17900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:17900000-18000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:18000000-18100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:18100000-18200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:18200000-18300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:18300000-18400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:18400000-18500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:18500000-18600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:18600000-18700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:18700000-18800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:18800000-18900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:18900000-19000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:19000000-19100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:19100000-19200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:19200000-19300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:19300000-19400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:19400000-19500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:19500000-19600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:19600000-19700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:19700000-19800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:19800000-19900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:19900000-20000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:20000000-20100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:20100000-20200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:20200000-20300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:20300000-20400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:20400000-20500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:20500000-20600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:20600000-20700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:20700000-20800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:20800000-20900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:20900000-21000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:21000000-21100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:21100000-21200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:21200000-21300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:21300000-21400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:21400000-21500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:21500000-21600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:21600000-21700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:21700000-21800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:21800000-21900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:21900000-22000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:22000000-22100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:22100000-22200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:22200000-22300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:22300000-22400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:22400000-22500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:22500000-22600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:22600000-22700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:22700000-22800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:22800000-22900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:22900000-23000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:23000000-23100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:23100000-23200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:23200000-23300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:23300000-23400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:23400000-23500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:23500000-23600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:23600000-23700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:23700000-23800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:23800000-23900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:23900000-24000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:24000000-24100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:24100000-24200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:24200000-24300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:24300000-24400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:24400000-24500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:24500000-24600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:24600000-24700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:24700000-24800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:24800000-24900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:24900000-25000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:25000000-25100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:25100000-25200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:25200000-25300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:25300000-25400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:25400000-25500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:25500000-25600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:25600000-25700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:25700000-25800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:25800000-25900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:25900000-26000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:26000000-26100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:26100000-26200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:26200000-26300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:26300000-26400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:26400000-26500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:26500000-26600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:26600000-26700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:26700000-26800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:26800000-26900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:26900000-27000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:27000000-27100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:27100000-27200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:27200000-27300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:27300000-27400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:27400000-27500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:27500000-27600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:27600000-27700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:27700000-27800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:27800000-27900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:27900000-28000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:28000000-28100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:28100000-28200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:28200000-28300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:28300000-28400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:28400000-28500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:28500000-28600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:28600000-28700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:28700000-28800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:28800000-28900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:28900000-29000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:29000000-29100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:29100000-29200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:29200000-29300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:29300000-29400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:29400000-29500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:29500000-29600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:29600000-29700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:29700000-29800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:29800000-29900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:29900000-30000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:30000000-30100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:30100000-30200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:30200000-30300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:30300000-30400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:30400000-30500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:30500000-30600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:30600000-30700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:30700000-30800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:30800000-30900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:30900000-31000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:31000000-31100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:31100000-31200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:31200000-31300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:31300000-31400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:31400000-31500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:31500000-31600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:31600000-31700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:31700000-31800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:31800000-31900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:31900000-32000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:32000000-32100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:32100000-32200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:32200000-32300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:32300000-32400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:32400000-32500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:32500000-32600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:32600000-32700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:32700000-32800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:32800000-32900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:32900000-33000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:33000000-33100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:33100000-33200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:33200000-33300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:33300000-33400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:33400000-33500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:33500000-33600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:33600000-33700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:33700000-33800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:33800000-33900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:33900000-34000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:34000000-34100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:34100000-34200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:34200000-34300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:34300000-34400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:34400000-34500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:34500000-34600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:34600000-34700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:34700000-34800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:34800000-34900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:34900000-35000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:35000000-35100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:35100000-35200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:35200000-35300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:35300000-35400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:35400000-35500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:35500000-35600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:35600000-35700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:35700000-35800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:35800000-35900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:35900000-36000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:36000000-36100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:36100000-36200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:36200000-36300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:36300000-36400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:36400000-36500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:36500000-36600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:36600000-36700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:36700000-36800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:36800000-36900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:36900000-37000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:37000000-37100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:37100000-37200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:37200000-37300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:37300000-37400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:37400000-37500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:37500000-37600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:37600000-37700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:37700000-37800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:37800000-37900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:37900000-38000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:38000000-38100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:38100000-38200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:38200000-38300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:38300000-38400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:38400000-38500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:38500000-38600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:38600000-38700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:38700000-38800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:38800000-38900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:38900000-39000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:39000000-39100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:39100000-39200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:39200000-39300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:39300000-39400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:39400000-39500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:39500000-39600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:39600000-39700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:39700000-39800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:39800000-39900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:39900000-40000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:40000000-40100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:40100000-40200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:40200000-40300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:40300000-40400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:40400000-40500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:40500000-40600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:40600000-40700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:40700000-40800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:40800000-40900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:40900000-41000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:41000000-41100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:41100000-41200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:41200000-41300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:41300000-41400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:41400000-41500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:41500000-41600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:41600000-41700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:41700000-41800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:41800000-41900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:41900000-42000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:42000000-42100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:42100000-42200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:42200000-42300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:42300000-42400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:42400000-42500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:42500000-42600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:42600000-42700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:42700000-42800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:42800000-42900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:42900000-43000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:43000000-43100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:43100000-43200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:43200000-43300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:43300000-43400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:43400000-43500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:43500000-43600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:43600000-43700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:43700000-43800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:43800000-43900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:43900000-44000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:44000000-44100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:44100000-44200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:44200000-44300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:44300000-44400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:44400000-44500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:44500000-44600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:44600000-44700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:44700000-44800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:44800000-44900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:44900000-45000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:45000000-45100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:45100000-45200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:45200000-45300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:45300000-45400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:45400000-45500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:45500000-45600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:45600000-45700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:45700000-45800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:45800000-45900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:45900000-46000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:46000000-46100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:46100000-46200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:46200000-46300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:46300000-46400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:46400000-46500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:46500000-46600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:46600000-46700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:46700000-46800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:46800000-46900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:46900000-47000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:47000000-47100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:47100000-47200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:47200000-47300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:47300000-47400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:47400000-47500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:47500000-47600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:47600000-47700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:47700000-47800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:47800000-47900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:47900000-48000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:48000000-48100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:48100000-48200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:48200000-48300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:48300000-48400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:48400000-48500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:48500000-48600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:48600000-48700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:48700000-48800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:48800000-48900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:48900000-49000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:49000000-49100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:49100000-49200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:49200000-49300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:49300000-49400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:49400000-49500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:49500000-49600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:49600000-49700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:49700000-49800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:49800000-49900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:49900000-50000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:50000000-50100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:50100000-50200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:50200000-50300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:50300000-50400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:50400000-50500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:50500000-50600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:50600000-50700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:50700000-50800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:50800000-50900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:50900000-51000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:51000000-51100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:51100000-51200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:51200000-51300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:51300000-51400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:51400000-51500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:51500000-51600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:51600000-51700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:51700000-51800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:51800000-51900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:51900000-52000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:52000000-52100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:52100000-52200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:52200000-52300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:52300000-52400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:52400000-52500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:52500000-52600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:52600000-52700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:52700000-52800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:52800000-52900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:52900000-53000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:53000000-53100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:53100000-53200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:53200000-53300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:53300000-53400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:53400000-53500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:53500000-53600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:53600000-53700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:53700000-53800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:53800000-53900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:53900000-54000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:54000000-54100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:54100000-54200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:54200000-54300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:54300000-54400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:54400000-54500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:54500000-54600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:54600000-54700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:54700000-54800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:54800000-54900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:54900000-55000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:55000000-55100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:55100000-55200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:55200000-55300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:55300000-55400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:55400000-55500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:55500000-55600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:55600000-55700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:55700000-55800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:55800000-55900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:55900000-56000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:56000000-56100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:56100000-56200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:56200000-56300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:56300000-56400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:56400000-56500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:56500000-56600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:56600000-56700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:56700000-56800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:56800000-56900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:56900000-57000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:57000000-57100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:57100000-57200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:57200000-57300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:57300000-57400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:57400000-57500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:57500000-57600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:57600000-57700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:57700000-57800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:57800000-57900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:57900000-58000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:58000000-58100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:58100000-58200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:58200000-58300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:58300000-58400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:58400000-58500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:58500000-58600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:58600000-58700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:58700000-58800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:58800000-58900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:58900000-59000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:59000000-59100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:59100000-59200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:59200000-59300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:59300000-59400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:59400000-59500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:59500000-59600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:59600000-59700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:59700000-59800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:59800000-59900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:59900000-60000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:60000000-60100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:60100000-60200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:60200000-60300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:60300000-60400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:60400000-60500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:60500000-60600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:60600000-60700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:60700000-60800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:60800000-60900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:60900000-61000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:61000000-61100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:61100000-61200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:61200000-61300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:61300000-61400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:61400000-61500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:61500000-61600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:61600000-61700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:61700000-61800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:61800000-61900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:61900000-62000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:62000000-62100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:62100000-62200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:62200000-62300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:62300000-62400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:62400000-62500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:62500000-62600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:62600000-62700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:62700000-62800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:62800000-62900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:62900000-63000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:63000000-63025520.baq.20110328.vcf
+#CHROM POS     ID      REF     ALT     QUAL    FILTER  INFO    
+20     458502  .       G       GA      4567.01 PASS    AA=20;AB=0.61111;ABA=14;ABP=6.8707;ABR=22;AC=38;AF=0.0544;AN=698;BL=374;BR=1129;BVAR;BaseQRankSum=13.364;DP=15979;DP4=1882,2188,45,37;Dels=0.00;EL=5;EPP=13.868;ER=15;FR;FS=6.503;HETAR=11;HOMA=2;HOMR=985;HP=1;HPLen=2;HR=2;HRun=0;HU=G;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0157;LEN=1;LRB=0.50233;LRBP=826.56;MQ=66.16;MQ0Fraction=0.0110;MQM=70.5;MQRankSum=-3.158;NF;NR;NS=998;PP;PV4=0.15,1,0.42,0.15;RA=3173;RL=1;RPP=38.188;RR=19;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.346;SAB=0.7;SAF=14;SAP=9.959;SAR=6;SC=GGGCGTGGTGGTGCATGTAAT;SRB=0.50047;SRF=1588;SRP=3.0165;SRR=1585;TC;TR=9;TU=GGT;VQSLOD=10.0079;set=Intersection;sumGLbyD=23.94
+20     539571  .       TG      T       18546   PASS    AA=71;AB=0.92482;ABA=63;ABP=1316.6;ABR=775;AC=42;AF=0.03512;AN=1196;BL=3915;BR=252;BVAR;BaseQRankSum=0.556;DEL;DP=10073;Dels=0.01;EL=47;EPP=19.189;ER=24;FS=2.124;HETAR=290;HOMA=156;HOMR=570;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0620;LEN=1;LRB=0.87905;LRBP=6995.1;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=127.99;MQRankSum=0.410;NS=1016;RA=3090;RL=71;RPP=157.18;RR=0;RUN=1;ReadPosRankSum=-11.038;SAB=0.66197;SAF=47;SAP=19.189;SAR=24;SRB=0.55016;SRF=1700;SRP=70.544;SRR=1390;VQSLOD=2.6772;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=4.71
+20     573764  .       TA      T       591.51  PASS    AC=91;AF=0.1987;AN=458;BaseQRankSum=0.137;DP=519;FS=3.153;HRun=1;HaplotypeScore=14.0744;InbreedingCoeff=0.1460;MQ=48.16;MQ0=26;MQ0Fraction=0.0501;MQRankSum=-1.636;QD=3.63;ReadPosRankSum=-4.140;SB=-408.14;VQSLOD=5.2458;set=VQSR
+20     766143  .       C       A,CATCTGGTA     5521.70 PASS    AA=24;AB=0.5;ABA=18;ABP=3.0103;ABR=18;AC=14;AF=0.0289;AF1=0.02038;AN=484;BL=655;BR=1542;BVAR;BaseQRankSum=3.801;CI95=0.01549,0.02655;DP=11749;DP4=2222,1998,14,8;Dels=0.00;EL=9;EPP=6.2675;ER=15;FQ=999;FR;FS=2.941;HETAR=9;HOMA=4;HOMR=901;HP=2;HPLen=2;HR=1;HRun=0;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0515;LEN=8;LRB=0.40373;LRBP=780.64;MQ=56.81;MQ0Fraction=0.0253;MQM=22.167;MQRankSum=-4.809;NF;NR;NS=914;PP;PV4=0.39,1,5.8e-07,1;RA=3093;RL=6;RPP=16.039;RR=18;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.827;SAB=0.625;SAF=15;SAP=6.2675;SAR=9;SC=GCTTTAAATTCATCTGGTACT;SRB=0.61623;SRF=1906;SRP=365.95;SRR=1187;TC;TR=1;TU=A;VQSLOD=7.0268;set=Intersection;sumGLbyD=50.23
+20     997076  rs11467490      CTG     C       15379.78        PASS    AA=195;AB=0.59878;ABA=132;ABP=30.896;ABR=197;AC=173;AF=0.14562;AN=1188;BL=7664;BR=7309;BVAR;BaseQRankSum=21.853;DB;DEL;DP=27127;DP4=1801,2002,241,282;Dels=0.13;EL=100;EPP=3.2887;ER=95;FQ=999;FR;FS=6.591;HETAR=77;HOMA=42;HOMR=815;HP=1;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=0.1284;LEN=2;LRB=0.023709;LRBP=21.287;MQ=61.18;MQ0Fraction=0.0214;MQM=43.041;MQRankSum=6.886;NF;NR;NS=934;PP;PV4=0.61,1.5e-78,1,1;RA=2800;RL=120;RPP=25.56;RR=75;RUN=1;ReadPosRankSum=4.504;SAB=0.62051;SAF=121;SAP=27.609;SAR=74;SC=CAGCTAATTACTGTATTTTTA;SRB=0.49821;SRF=1395;SRP=3.0879;SRR=1405;TC;TR=1;TU=T;VQSLOD=8.9396;set=Intersection;sumGLbyD=16.76
+20     1042261 rs10597473      CCCTG   C       168658.05       PASS    AA=4481;AB=0.29043;ABA=2128;ABP=1147.1;ABR=871;AC=1172;AF=0.97830;AN=1198;BL=169975;BR=194027;BVAR;BaseQRankSum=4.599;DB;DEL;DP=29418;DP4=29,47,1441,2403;Dels=0.84;EL=2358;EPP=29.772;ER=2123;FR;FS=9.122;HETAR=482;HOMA=559;HOMR=30;HP=2;HPLen=3;HR=3;HRun=0;HU=C;INDEL;InbreedingCoeff=0.0470;LEN=4;LRB=0.066077;LRBP=3454.1;MQ=104.58;MQ0=4;MQ0Fraction=0.0014;MQM=58.257;MQRankSum=-3.368;NF;NR;NS=1071;PP;PV4=0.91,6.8e-09,2.8e-05,1;RA=1039;RL=2088;RPP=48.09;RR=2393;RUN=1;ReadPosRankSum=5.288;SAB=0.41442;SAF=1857;SAP=288.09;SAR=2624;SC=CCAAACCCAACCCTGCCTGGC;SRB=0.48893;SRF=508;SRP=4.1159;SRR=531;TC;TR=8;TU=CCTG;VQSLOD=8.5148;dbSNP=120;set=Intersection;sumGLbyD=59.79
+20     1046297 rs33956316      C       CT,CTT,CTTT     17698   PASS    ABR=408;AC=432,79,230;AF=0.39779,0.07274,0.21179;BVAR;BaseQRankSum=-8.413;DB;DP=15649;DP4=147,199,534,436;FR;FS=11.580;HOMA=97;HOMR=457;HP=20;HR=16;HU=T;HaplotypeScore=16.0590;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.6018;KGPilot123;MQ0=19;MQ0Fraction=0.0093;MQRankSum=7.992;NF;NR;NS=767;PP;PV4=6e-05,1,1,1;QD=8.18;RA=1183;RUN=1;ReadPosRankSum=2.684;SB=-6384.08;SC=GGAAAATTTTCTTTTTTTTTT;SRB=0.40913;SRF=484;SRP=87.859;SRR=699;TC;TR=16;TU=T;VQSLOD=8.4941;dbSNP=132;set=Intersection
+20     1405740 .       T       TA      257.28  PASS    AF=0.0188;BaseQRankSum=-0.745;DP=3769;Dels=0.00;FS=0.742;HPLen=9;HRun=9;InbreedingCoeff=0.0462;MQ0Fraction=0.0151;MQRankSum=-0.090;ReadPosRankSum=-1.582;VQSLOD=5.6502;set=Intersection;sumGLbyD=6.94
+20     1690501 .       TC      T       27928   PASS    AA=108;AB=0.91372;ABA=100;ABP=1726.1;ABR=1059;AC=35;AF=0.02966;AN=1180;BL=593;BR=6973;BVAR;BaseQRankSum=7.567;DEL;DP=10612;Dels=0.01;EL=50;EPP=4.2971;ER=58;FS=0.000;HETAR=378;HOMA=184;HOMR=477;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0495;LEN=1;LRB=0.84325;LRBP=11685;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=87.361;MQRankSum=4.088;NS=1045;RA=3125;RL=3;RPP=212.2;RR=105;RUN=1;ReadPosRankSum=-13.096;SAB=0.56481;SAF=61;SAP=6.9511;SAR=47;SRB=0.51776;SRF=1618;SRP=11.572;SRR=1507;VQSLOD=3.9824;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=4.07
+20     1948787 .       GTC     G,GTCTC 78.70   PASS    AC=18,18;AF=0.01466,0.01466;AN=1228;BaseQRankSum=3.894;DP=19030;DP4=1874,1916,21,20;FR;FS=0.767;HP=2;HPLen=1;HR=1;HU=T;HaplotypeScore=16.5619;INDEL;InbreedingCoeff=0.2332;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=2.080;NF;NR;PP;PV4=0.88,1,0.094,0.47;QD=0.28;ReadPosRankSum=0.822;SB=-172.46;SC=CTCGACCCCTGTCTCTCTCTC;TC;TR=13;TU=CT;VQSLOD=3.7405;set=filterInVQSR-2of5
+20     1991285 rs113891396     TAA     T,TA,TAAA,TAAAAA,TAAAAAA,TAAAAAAA,TAAAAAAAA     39235.36        PASS    AC=5,251,20,39,188,52,79;AF=0.0056,0.2789,0.0222,0.0433,0.2089,0.0578,0.0878;AN=900;BVAR;BaseQRankSum=1.124;DB;DEL;DP=54393;DP4=906,772,824,579;Dels=0.21;FR;FS=37.525;HP=12;HR=12;HRun=12;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.6891;MQ=76.81;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-6.593;NF;NR;PP;PV4=0.0087,1,6.3e-19,1;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.184;SC=ATCTGCCACTTAAAAAAAAAA;TC;TR=12;TU=A;VQSLOD=9.0007;dbSNP=132;set=Intersection;sumGLbyD=11.45
+20     2355911 .       TA      T       11723   PASS    AA=79;AB=0.9393;ABA=57;ABP=1577;ABR=882;AC=38;AF=0.0411;AN=924;BL=644;BR=5536;BVAR;BaseQRankSum=2.434;DEL;DP=9687;Dels=0.00;EL=45;EPP=6.3362;ER=34;FS=3.043;HETAR=321;HOMA=182;HOMR=555;HRun=5;InbreedingCoeff=0.0412;LEN=1;LRB=0.79159;LRBP=8411.9;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=70.848;MQRankSum=0.137;NS=1058;RA=3415;RL=3;RPP=149.49;RR=76;RUN=1;ReadPosRankSum=-12.116;SAB=0.44304;SAF=35;SAP=5.2367;SAR=44;SRB=0.43572;SRF=1488;SRP=125.55;SRR=1927;VQSLOD=3.8910;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=4.88
+20     2512346 .       A       AC      11046.11        PASS    AC=673;AF=0.57034;AN=1180;BaseQRankSum=19.890;DP=2717;FS=26.809;HRun=0;HaplotypeScore=19.0575;InbreedingCoeff=0.3068;MQ=61.07;MQ0=25;MQ0Fraction=0.0092;MQRankSum=2.745;QD=5.80;ReadPosRankSum=3.139;SB=-4564.39;VQSLOD=4.3252;set=VQSR
+20     2597210 rs71329387      TAAAG   T       32206.62        PASS    AA=689;AB=0.5805;ABA=542;ABP=75.724;ABR=750;AC=253;AF=0.20738;BL=29921;BR=30215;BVAR;BaseQRankSum=20.638;DB;DEL;DP=29293;DP4=1750,1070,405,274;Dels=0.18;EL=345;EPP=3.0135;ER=344;FQ=999;FR;FS=1.827;HETAR=225;HOMA=55;HOMR=783;HP=7;HPLen=4;HR=3;HRun=0;HU=A;INDEL;InbreedingCoeff=0.1419;LEN=4;LRB=0.0048889;LRBP=6.1314;MQ=66.96;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=42.925;MQRankSum=-7.105;NF;NR;NS=1063;PP;PV4=0.25,1,9e-20,1;RA=4619;RL=345;RPP=3.0135;RR=344;RUN=1;ReadPosRankSum=2.719;SAB=0.53556;SAF=369;SAP=10.577;SAR=320;SC=GAAAGGAAAATAAAGAAGGAG;SRB=0.52414;SRF=2421;SRP=26.389;SRR=2198;TC;TR=3;TU=A;VQSLOD=9.7974;dbSNP=130;set=Intersection;sumGLbyD=33.30
+20     2771621 rs11479849      GT      G,GTT   1605.60 PASS    AA=80;AB=0.79825;ABA=69;ABP=267.24;ABR=273;AC=79,91;AF=0.06551,0.07546;AN=1206;BL=2593;BR=3805;BVAR;BaseQRankSum=7.825;DB;DP=9790;Dels=0.04;EL=37;EPP=3.9875;ER=43;FR;FS=4.751;HETAR=62;HOMA=5;HOMR=958;HP=11;HR=11;HRun=11;HU=T;INS;InbreedingCoeff=0.2646;LEN=1;LRB=0.18943;LRBP=501.57;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=52.45;MQRankSum=-0.560;NF;NR;NS=1025;PP;RA=3949;RL=29;RPP=16.148;RR=51;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.397;SAB=0.525;SAF=42;SAP=3.4446;SAR=38;SC=TCATTTTAACGTTTTTTTTTT;SRB=0.54368;SRF=2147;SRP=68.46;SRR=1802;TC;TR=11;TU=T;VQSLOD=3.5989;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.92
+20     2891235 .       G       GT,GTTT 2869.87 PASS    AC=236,246;AF=0.2803,0.2922;AN=842;BaseQRankSum=8.979;DP=1067;FS=3.911;HaplotypeScore=20.3595;InbreedingCoeff=0.6511;MQ=44.86;MQ0=114;MQ0Fraction=0.1068;MQRankSum=-2.273;QD=4.00;ReadPosRankSum=-6.601;SB=-991.85;VQSLOD=5.4379;set=VQSR
+20     3033550 .       TGAG    T       2005.90 PASS    AA=34;AB=0.51429;ABA=34;ABP=3.1344;ABR=36;AC=22;AF=0.0332;AN=662;BL=1374;BR=1649;BVAR;BaseQRankSum=5.192;DEL;DP=14639;DP4=2271,1492,12,21;Dels=0.02;EL=19;EPP=4.0322;ER=15;FR;FS=16.657;HETAR=17;HOMA=0;HOMR=914;HP=1;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=G;INDEL;InbreedingCoeff=-0.0454;LEN=3;LRB=0.090969;LRBP=57.333;MQ=53.99;MQ0Fraction=0.0304;MQM=46.735;MQRankSum=1.938;NF;NR;NS=931;PP;PV4=0.0068,9.4e-05,1,1;RA=2985;RL=11;RPP=12.207;RR=23;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.466;SAB=0.41176;SAF=14;SAP=5.3095;SAR=20;SC=CTTGGGAGGCTGAGGTGGGAG;SRB=0.62781;SRF=1874;SRP=426.52;SRR=1111;TC;TR=1;TU=G;VQSLOD=8.9194;set=Intersection;sumGLbyD=24.41
+20     3635363 .       T       TG      999     PASS    AA=16;AB=0.61905;ABA=16;ABP=8.1805;ABR=26;AF=0.0141;AF1=0.01726;AN=708;BL=614;BR=523;BVAR;BaseQRankSum=2.337;CI95=0.01106,0.02434;DP=14594;DP4=2128,2038,6,10;Dels=0.00;EL=7;EPP=3.5532;ER=9;FQ=999;FR;FS=5.579;HETAR=8;HOMA=0;HOMR=1055;HP=3;HPLen=3;HR=3;HRun=3;HU=G;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0633;LEN=1;LRB=0.080035;LRBP=18.826;MQ=100.74;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=51.312;MQRankSum=2.569;NF;NR;NS=1063;PP;PV4=0.32,1,1,1;RA=5628;RL=9;RPP=3.5532;RR=7;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.941;SAB=0.375;SAF=6;SAP=5.1818;SAR=10;SC=AAGGTTCGCTTGGGTGTGGAG;SRB=0.4984;SRF=2805;SRP=3.1353;SRR=2823;TC;TR=3;TU=G;VQSLOD=9.3275;set=Intersection;sumGLbyD=11.68
+20     3873327 rs61519218      A       AAG     683.85  PASS    AC=25;AF=0.0313;AN=800;BaseQRankSum=4.839;DB;DP=1718;FS=4.265;HRun=0;HaplotypeScore=20.5789;InbreedingCoeff=0.1055;MQ=53.70;MQ0=37;MQ0Fraction=0.0215;MQRankSum=2.468;QD=6.30;ReadPosRankSum=4.254;SB=-403.21;VQSLOD=6.1858;set=VQSR
+20     4028835 .       GC      G       2511.30 PASS    AA=66;AB=0.56954;ABA=65;ABP=9.3521;ABR=86;AC=22;AF=0.01836;AN=1198;BL=2303;BR=2463;BVAR;BaseQRankSum=7.621;DEL;DP=22795;DP4=1714,2774,22,37;Dels=0.02;EL=34;EPP=3.1419;ER=32;FQ=999;FR;FS=2.095;HETAR=21;HOMA=0;HOMR=1050;HP=2;HPLen=2;HR=2;HRun=2;HU=C;INDEL;InbreedingCoeff=0.0125;LEN=1;LRB=0.033571;LRBP=14.674;MQ=108.09;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=53.318;MQRankSum=5.257;NF;NR;NS=1071;PP;PV4=1,5.4e-13,1,0.075;RA=6185;RL=36;RPP=4.1947;RR=30;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.059;SAB=0.45455;SAF=30;SAP=4.1947;SAR=36;SC=TGCTGTCACTGCCTTCTCCTA;SRB=0.42118;SRF=2605;SRP=336.76;SRR=3580;TC;TR=2;TU=C;VQSLOD=10.2409;set=Intersection;sumGLbyD=12.71
+20     4039609 rs67812039      G       GA      43457   PASS    AA=909;AB=0.54639;ABA=572;ABP=26.583;ABR=689;AC=302;AF=0.3455;AN=874;BL=37070;BR=38211;BVAR;BaseQRankSum=20.147;DB;DP=25595;DP4=1483,1374,528,542;Dels=0.00;EL=467;EPP=4.5033;ER=442;FQ=999;FR;FS=5.441;HETAR=243;HOMA=127;HOMR=608;HP=4;HPLen=3;HR=3;HRun=3;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.1388;LEN=1;LRB=0.015157;LRBP=40.563;MQ=119.50;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=83.197;MQRankSum=1.080;NF;NR;NS=978;PP;PV4=0.16,1,3.6e-12,1;RA=3033;RL=443;RPP=4.274;RR=466;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.000;SAB=0.32233;SAF=293;SAP=252.24;SAR=616;SC=TATGTTGGGAGAAATATCAGT;SRB=0.38378;SRF=1164;SRP=358.85;SRR=1869;TC;TR=4;TU=AG;VQSLOD=9.9146;dbSNP=130;set=Intersection;sumGLbyD=16.79
+20     4390056 .       TC      T       49312   PASS    AA=91;AB=0.94353;ABA=86;ABP=2605.4;ABR=1437;AC=39;AF=0.03160;AN=1234;BL=6823;BR=731;BVAR;BaseQRankSum=2.727;DEL;DP=13149;Dels=0.00;EL=41;EPP=4.9431;ER=50;FS=4.002;HETAR=465;HOMA=313;HOMR=292;HRun=3;InbreedingCoeff=0.0326;LEN=1;LRB=0.80646;LRBP=10671;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=69.824;MQRankSum=-0.903;NS=1073;RA=3078;RL=89;RPP=183.62;RR=2;RUN=1;ReadPosRankSum=-12.526;SAB=0.45055;SAF=41;SAP=4.9431;SAR=50;SRB=0.52567;SRF=1618;SRP=20.622;SRR=1460;VQSLOD=4.3235;set=Intersection;sumGLbyD=3.53
+20     4474622 .       TA      AA,T,TAA,TAAA,TAAAA     94522.28        PASS    ABR=114;AC=38,68,16,900;AF=0.03333,0.05965,0.01404,0.78947;AN=1140;BVAR;BaseQRankSum=9.741;DB;DP=16656;Dels=0.00;FR;FS=2.355;HOMA=3;HOMR=936;HP=10;HPLen=10;HR=10;HRun=10;HU=A;INS;InbreedingCoeff=0.4516;MQ0=2;MQ0Fraction=0.0008;MQRankSum=-4.096;NF;NR;NS=980;PP;RA=3766;RUN=1;ReadPosRankSum=2.380;SC=AGAAAAAAATTAAAAAAAAAA;SRB=0.49734;SRF=1873;SRP=3.2409;SRR=1893;TC;TR=10;TU=A;VQSLOD=8.8186;set=Intersection;sumGLbyD=38.79
+20     4824911 .       AC      A       41998.70        PASS    AC=1172;AF=0.97342;AN=1204;BaseQRankSum=8.604;DP=3615;FS=9.934;HRun=1;HaplotypeScore=39.6843;InbreedingCoeff=0.0980;MQ=129.80;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0003;MQRankSum=3.378;QD=11.62;ReadPosRankSum=6.967;SB=-16955.28;VQSLOD=4.2689;set=VQSR
+20     4839897 rs35881880      TAA     T,TA,TAAA,TAAAAA        3906.80 PASS    AC=12,95,137,189;AF=0.01024,0.08106,0.11689,0.16126;AN=1172;BVAR;BaseQRankSum=15.271;DB;DEL;DP=15105;Dels=0.04;FR;FS=43.567;HP=19;HR=13;HRun=13;HU=A;INS;InbreedingCoeff=0.5716;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-2.569;NF;NR;PP;RUN=1;ReadPosRankSum=-13.794;SC=TGTTAAAAAATAAAAAAAAAA;TC;TR=13;TU=A;VQSLOD=8.1773;set=Intersection;sumGLbyD=3.77
+20     5071386 .       AT      A       45200.27        PASS    AC=685;AF=0.7495;AN=914;BaseQRankSum=11.006;DP=2725;FS=8.133;HRun=3;HaplotypeScore=50.5496;InbreedingCoeff=0.2364;MQ=81.40;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=2.411;QD=18.51;ReadPosRankSum=3.429;SB=-22405.85;VQSLOD=4.2872;set=VQSR
+20     5507414 .       G       GCC     439.08  PASS    AC=23;AF=0.01876;AN=1226;BaseQRankSum=3.051;DP=3023;FS=3.636;HRun=1;HaplotypeScore=30.3104;InbreedingCoeff=0.0204;MQ=112.09;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-2.065;QD=2.85;ReadPosRankSum=-2.709;SB=-302.22;VQSLOD=4.4311;set=VQSR
+20     5609676 .       GA      G,GAA   799.89  PASS    AA=42;AB=0.79096;ABA=37;ABP=133.16;ABR=140;AC=43,65;AF=0.03607,0.05453;AF1=0.02826;AN=1192;BL=1360;BR=2334;BVAR;BaseQRankSum=5.069;CI95=0.01242,0.04037;DP=15610;DP4=1548,2441,21,30;Dels=0.02;EL=18;EPP=4.8716;ER=24;FQ=12.1;FR;FS=0.000;HETAR=36;HOMA=1;HOMR=991;HP=13;HPLen=10;HR=10;HRun=10;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.2001;LEN=1;LRB=0.26367;LRBP=560.68;MQ=63.29;MQ0Fraction=0.0003;MQM=44.143;MQRankSum=1.755;NF;NR;NS=1028;PP;PV4=0.77,1,0.0087,0.0053;RA=4114;RL=15;RPP=10.455;RR=27;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.978;SAB=0.5;SAF=21;SAP=3.0103;SAR=21;SC=AAAAAAGAAAGAAAAAAAAAA;SRB=0.39742;SRF=1635;SRP=379;SRR=2479;TC;TR=11;TU=AAAG;VQSLOD=4.1229;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=7.95
+20     5736211 rs35303106      CT      C,CTT   4384.40 PASS    AA=117;AB=0.71499;ABA=116;ABP=166.4;ABR=291;AC=32,145;AF=0.02712,0.12288;AN=1180;BL=5556;BR=4901;BVAR;BaseQRankSum=2.708;DB;DP=9157;Dels=0.01;EL=54;EPP=4.5136;ER=63;FR;FS=2.802;HETAR=79;HOMA=1;HOMR=837;HP=16;HR=11;HRun=11;HU=T;INS;InbreedingCoeff=0.1903;LEN=1;LRB=0.062637;LRBP=92.1;MQ0Fraction=0.0273;MQM=48.932;MQRankSum=3.654;NF;NR;NS=917;PP;RA=2785;RL=79;RPP=34.209;RR=38;RUN=1;ReadPosRankSum=0.795;SAB=0.5641;SAF=66;SAP=7.1862;SAR=51;SC=TTTTCTTTTTCTTTTTTTTTT;SRB=0.41795;SRF=1164;SRP=165.85;SRR=1621;TC;TR=11;TU=T;VQSLOD=5.0895;set=Intersection;sumGLbyD=4.66
+20     5898626 rs34483659      CAAA    C,CA,CAA,CAAAAA 1140.16 PASS    ABR=34;AC=19,98,56,199;AF=0.0227,0.1172,0.0670,0.2380;AF1=0.08519;BVAR;BaseQRankSum=5.049;CI95=0.03727,0.1273;DB;DEL;DP=5091;DP4=539,408,121,123;FQ=4.43;FR;FS=5.701;HOMA=64;HOMR=156;HP=19;HR=18;HU=A;HaplotypeScore=11.5333;INDEL;InbreedingCoeff=0.7405;MQ0=117;MQ0Fraction=0.0986;MQRankSum=6.290;NF;NR;NS=240;PP;PV4=0.043,1,1,0.0087;QD=1.22;RA=204;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.684;SB=-1015.09;SC=ACTAAAAATACAAAAAAAAAA;SRB=0.35294;SRF=72;SRP=41.33;SRR=132;TC;TR=18;TU=A;VQSLOD=4.1696;set=filterInVQSR-2of5
+20     5975126 rs10541892      C       CAG     504.78  PASS    AC=79;AF=0.07004;AN=1128;BaseQRankSum=10.498;DB;DP=2050;FS=38.228;HRun=0;HaplotypeScore=14.1426;InbreedingCoeff=-0.0053;MQ=60.40;MQ0=80;MQ0Fraction=0.0390;MQRankSum=5.098;QD=1.63;ReadPosRankSum=-4.851;SB=-590.69;VQSLOD=4.8517;set=VQSR
+20     5992611 .       G       GT      799.56  PASS    AA=39;AB=0.8301;ABA=35;ABP=197.98;ABR=171;AC=13;AF=0.0183;AN=712;BL=1164;BR=1566;BVAR;BaseQRankSum=1.914;DP=9561;Dels=0.01;EL=16;EPP=5.7386;ER=23;FS=0.739;HETAR=32;HOMA=0;HOMR=1024;HRun=9;INS;InbreedingCoeff=0.0339;LEN=1;LRB=0.14725;LRBP=131.55;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=97.231;MQRankSum=0.764;NS=1056;RA=5204;RL=16;RPP=5.7386;RR=23;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.169;SAB=0.69231;SAF=27;SAP=15.538;SAR=12;SRB=0.56399;SRF=2935;SRP=188.09;SRR=2269;VQSLOD=4.6516;set=Intersection;sumGLbyD=5.96
+20     6040983 rs11087710      A       AAAAAAGAG,AAAAAGAG,AAAAGAG,AAAAGAGAG,AAAGAG,AAAGAGAG,AAGAG,AAGAGAG,AG,AGAG,AGAGAG       66894.55        PASS    ABR=468;AC=80,9,20,136,31,91,33,29,9,3,5;AF=0.0980,0.0110,0.0245,0.1667,0.0380,0.1115,0.0404,0.0355,0.0110,0.0037,0.0061;AN=816;BVAR;BaseQRankSum=-12.470;DB;DP=38726;DP4=426,611,310,472;Dels=0.00;FQ=999;FR;FS=6.635;HOMA=110;HOMR=506;HP=14;HR=15;HRun=0;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.8291;KGPilot123;MQ=54.22;MQ0Fraction=0.0168;MQRankSum=-5.329;NF;NR;NS=861;PP;PV4=0.56,1,6.9e-09,0.31;RA=1828;RUN=1;ReadPosRankSum=-7.857;SC=AAAAAAAAAAAAGAGAGAGAG;SRB=0.62418;SRF=1141;SRP=247.85;SRR=687;TC;TR=15;TU=A;VQSLOD=9.0574;dbSNP=131;set=Intersection;sumGLbyD=36.72
+20     6903392 .       TC      CC,T    999     PASS    AF=0.0000;AF1=0.01192;CI95=0.008547,0.01709;DP=10440;DP4=2544,2062,9,11;Dels=0.01;FQ=999;FR;HP=2;HPLen=3;HR=3;HRun=2;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=0.0324;MQ=62.78;MQ0=2;MQ0Fraction=0.0009;NF;NR;PP;PV4=0.38,0.0069,0.36,0.41;QD=8.05;SB=-320.13;SC=TTATTTTCTTTCCAATTTTTA;TC;TR=8;TU=CTTT;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=13.22
+20     7024548 .       G       GAT     5041.27 PASS    AC=123;AF=0.10336;AN=1190;BaseQRankSum=23.097;DP=3045;FS=7.979;HRun=0;HaplotypeScore=15.6967;InbreedingCoeff=0.1062;MQ=119.29;MQ0=2;MQ0Fraction=0.0007;MQRankSum=-3.725;QD=8.97;ReadPosRankSum=-1.636;SB=-2257.45;VQSLOD=5.9332;set=VQSR
+20     7484554 .       A       AT      5.09    PASS    AC=0;AF=0.0000;AN=710;BaseQRankSum=-0.696;DP=1862;FS=2.835;HRun=9;HaplotypeScore=13.5425;InbreedingCoeff=0.0567;MQ=76.92;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=1.932;ReadPosRankSum=-1.701;VQSLOD=4.3156;set=VQSR
+20     7632194 rs77286341      GAA     AAA,G   5324    PASS    AC=0;AF=0.0000;AN=700;BaseQRankSum=-1.741;DB;DP=1772;FR;HP=4;HPLen=3;HR=3;HRun=0;HU=A;HaplotypeScore=60.1795;InbreedingCoeff=0.0017;MQ=70.69;MQ0=13;MQ0Fraction=0.0073;MQRankSum=-1.315;NF;NR;PP;ReadPosRankSum=-3.650;SC=GAGAGAGAGAGAAAGGTGTAA;TC;TR=13;TU=AG;set=filterInVQSR-2of5
+20     7767508 rs71329674      G       GA      17914   PASS    AA=415;AB=0.61617;ABA=337;ABP=105.94;ABR=541;AC=141;AF=0.11614;AN=1214;BL=15187;BR=20323;BVAR;BaseQRankSum=-13.946;DB;DP=28222;Dels=0.00;EL=184;EPP=14.569;ER=231;FQ=999;FR;FS=13.296;HETAR=178;HOMA=35;HOMR=822;HP=14;HPLen=9;HR=9;HRun=9;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0714;LEN=1;LRB=0.14464;LRBP=1616.1;MQ=89.69;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0003;MQM=51.667;MQRankSum=0.664;NF;NR;NS=1035;PP;RA=3707;RL=171;RPP=30.894;RR=244;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.120;SAB=0.45301;SAF=188;SAP=10.969;SAR=227;SC=ATTCTAAAAAGAAAAAAAAAT;SRB=0.38495;SRF=1427;SRP=429.23;SRR=2280;TC;TR=9;TU=A;VQSLOD=9.0748;set=Intersection;sumGLbyD=11.09
+20     7920261 .       TA      T,TAA   802.15  PASS    AA=28;AB=0.8;ABA=28;ABP=112.45;ABR=112;AC=22,39;AF=0.01836,0.03255;AN=1198;BL=943;BR=1487;BVAR;BaseQRankSum=2.233;DP=10645;Dels=0.01;EL=11;EPP=5.8022;ER=17;FR;FS=1.691;HETAR=20;HOMA=0;HOMR=1007;HP=10;HPLen=9;HR=9;HRun=9;HU=A;INS;InbreedingCoeff=0.2256;LEN=1;LRB=0.22387;LRBP=267.46;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=57.571;MQRankSum=0.940;NF;NR;NS=1027;PP;RA=4776;RL=8;RPP=14.178;RR=20;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.567;SAB=0.53571;SAF=15;SAP=3.3205;SAR=13;SC=GTAACTGCTATAAAAAAAAAC;SRB=0.48576;SRF=2320;SRP=11.42;SRR=2456;TC;TR=9;TU=A;VQSLOD=4.0815;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=5.37
+20     8012465 rs10595338      TATGA   T       2104.41 PASS    AF=0.03339;BaseQRankSum=10.662;DB;DP=11772;DS;Dels=0.01;FR;FS=7.678;HP=1;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=A;InbreedingCoeff=0.0266;MQ0Fraction=0.0731;MQRankSum=0.603;NF;NR;PP;ReadPosRankSum=1.276;SC=TGTATGTATGTATGATGTATG;TC;TR=19;TU=ATGT;VQSLOD=4.1376;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=6.53
+20     8573999 .       CGTGT   C,CGT,CGTGTGT,TGTGT     45865.96        PASS    AC=458,0,731;AF=0.37727,0.00000,0.60214;AN=1214;BVAR;BaseQRankSum=-6.703;DEL;DP=37714;Dels=0.03;FR;FS=11.079;HP=2;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=G;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.7632;LEN=2;MQ0Fraction=0.0026;MQRankSum=-1.394;NF;NR;PP;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.102;SC=TGTGTGTGCGCGTGTGTGTGT;TC;TR=18;TU=GT;VQSLOD=6.1435;set=Intersection;sumGLbyD=3.53
+20     8610455 rs10571111      TTTTC   T       11763.51        PASS    AC=190;AF=0.17056;AN=1114;BaseQRankSum=-14.397;DB;DP=2323;FS=2.321;HRun=0;HaplotypeScore=39.8020;InbreedingCoeff=0.2502;MQ=53.39;MQ0=104;MQ0Fraction=0.0448;MQRankSum=3.519;QD=19.07;ReadPosRankSum=4.150;SB=-4067.02;VQSLOD=5.0554;set=VQSR
+20     9139079 .       ATT     A,AT,ATTT,ATTTT,ATTTTT  8777.90 PASS    AC=23,140,114,69,113;AF=0.01993,0.12132,0.09879,0.05979,0.09792;AN=1154;BVAR;BaseQRankSum=-0.022;DEL;DP=25109;DP4=502,657,278,313;FR;FS=11.929;HP=16;HR=16;HU=T;HaplotypeScore=20.2361;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.5704;MQ0=16;MQ0Fraction=0.0067;MQRankSum=2.624;NF;NR;PP;PV4=0.14,1,1,1;QD=1.48;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.480;SB=-2354.28;SC=CACCTGGCTAATTTTTTTTTT;TC;TR=16;TU=T;VQSLOD=6.9180;set=Intersection
+20     9862448 .       CT      C       49312   PASS    AA=60;AB=0.96003;ABA=53;ABP=2440.4;ABR=1273;AC=18;AF=0.01461;AN=1232;BL=3516;BR=140;BVAR;BaseQRankSum=-2.056;DEL;DP=11893;Dels=0.01;EL=35;EPP=6.6294;ER=25;FS=1.787;HETAR=396;HOMA=344;HOMR=334;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0379;LEN=1;LRB=0.92341;LRBP=6772.5;MQ0Fraction=0.0006;MQM=54.267;MQRankSum=-0.907;NS=1074;RA=2990;RL=60;RPP=133.3;RR=0;RUN=1;ReadPosRankSum=-10.579;SAB=0.58333;SAF=35;SAP=6.6294;SAR=25;SRB=0.47826;SRF=1430;SRP=15.284;SRR=1560;VQSLOD=3.0237;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=2.84
+20     9863736 rs73618103      G       GT      50570.21        PASS    AA=2247;AB=0.48878;ABA=1412;ABP=6.0324;ABR=1350;AC=546;AF=0.44463;AN=1228;BL=86886;BR=95862;BVAR;BaseQRankSum=-23.978;DB;DP=32517;DP4=1125,1133,1017,1048;Dels=0.00;EL=1089;EPP=7.6113;ER=1158;FQ=999;FR;FS=2.529;HETAR=445;HOMA=201;HOMR=393;HP=4;HPLen=4;HR=4;HRun=4;HU=T;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.1393;KGPilot123;LEN=1;LRB=0.049117;LRBP=960.35;MQ=68.10;MQ0=2;MQ0Fraction=0.0006;MQM=50.931;MQRankSum=-1.580;NF;NR;NS=1039;PP;PV4=0.71,1,0.11,1;RA=3139;RL=1089;RPP=7.6113;RR=1158;RUN=1;ReadPosRankSum=0.846;SAB=0.54161;SAF=1217;SAP=36.804;SAR=1030;SC=TGATTGTATGGTTTTGTCCTT;SRB=0.53425;SRF=1677;SRP=34.987;SRR=1462;TC;TR=4;TU=T;VLD;VQSLOD=10.1800;dbSNP=131;set=Intersection;sumGLbyD=18.20
+20     10640876        .       TA      T       42819   PASS    AA=86;AB=0.92316;ABA=75;ABP=1521;ABR=901;AC=40;AF=0.0447;AN=894;BL=6265;BR=415;BVAR;BaseQRankSum=-0.850;DEL;DP=8223;Dels=0.00;EL=41;EPP=3.4143;ER=45;FS=3.190;HETAR=336;HOMA=384;HOMR=290;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0173;LEN=1;LRB=0.87575;LRBP=11128;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=76.163;MQRankSum=1.314;NS=1034;RA=2046;RL=83;RPP=164.61;RR=3;RUN=1;ReadPosRankSum=-12.060;SAB=0.46512;SAF=40;SAP=3.9193;SAR=46;SRB=0.5523;SRF=1130;SRP=51.615;SRR=916;VQSLOD=3.9183;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=4.00
+20     10926959        .       AG      A       12239   PASS    AA=65;AB=0.92801;ABA=64;ABP=1417.6;ABR=825;AC=24;AF=0.0264;AN=908;BL=616;BR=3782;BVAR;BaseQRankSum=9.990;DEL;DP=10708;Dels=0.01;EL=37;EPP=5.7163;ER=28;FS=1.652;HETAR=275;HOMA=70;HOMR=724;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0102;LEN=1;LRB=0.71987;LRBP=4952;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0004;MQM=118.82;MQRankSum=1.018;NS=1069;RA=4746;RL=5;RPP=104.07;RR=60;RUN=1;ReadPosRankSum=-12.039;SAB=0.41538;SAF=27;SAP=7.0526;SAR=38;SRB=0.4764;SRF=2261;SRP=25.968;SRR=2485;VQSLOD=2.9713;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=4.10
+20     11299648        .       TG      T       49315   PASS    AA=62;AB=0.95292;ABA=54;ABP=2046.7;ABR=1093;AC=28;AF=0.0373;AN=750;BL=3126;BR=528;BVAR;BaseQRankSum=-4.929;DEL;DP=10764;Dels=0.01;EL=26;EPP=6.5127;ER=36;FS=3.851;HETAR=366;HOMA=383;HOMR=304;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0267;LEN=1;LRB=0.711;LRBP=4014.1;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0005;MQM=76.468;MQRankSum=1.327;NS=1070;RA=2588;RL=54;RPP=77.121;RR=8;RUN=1;ReadPosRankSum=-12.507;SAB=0.48387;SAF=30;SAP=3.1504;SAR=32;SRB=0.47643;SRF=1233;SRP=15.499;SRR=1355;VQSLOD=3.8673;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.00
+20     11561096        .       CTA     C       999     PASS    AC=2;AF=0.0029;AF1=0.005602;BaseQRankSum=3.190;CI95=0.004425,0.01106;DP=7521;DP4=1998,1794,2,4;Dels=0.00;FQ=999;FR;FS=5.422;HP=3;HPLen=2;HR=1;HRun=0;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=0.0056;MQ=113.88;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=0.297;NF;NR;PP;PV4=0.43,0.024,1,1;ReadPosRankSum=1.406;SC=CAATAGTATTCTATGTCAGTC;TC;TR=1;TU=T;VQSLOD=8.6243;set=Intersection;sumGLbyD=21.89
+20     11723671        .       C       CA      1096.60 PASS    AA=35;AB=0.69565;ABA=35;ABP=41.247;ABR=80;AC=10;AF=0.0141;AN=710;BL=2005;BR=1702;BVAR;BaseQRankSum=-3.427;DP=9819;Dels=0.00;EL=20;EPP=4.5614;ER=15;FR;FS=3.814;HETAR=20;HOMA=0;HOMR=1034;HP=8;HPLen=7;HR=7;HRun=7;HU=A;INS;InbreedingCoeff=0.0323;LEN=1;LRB=0.081737;LRBP=56.79;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=81.057;MQRankSum=0.050;NF;NR;NS=1054;PP;RA=5562;RL=22;RPP=8.0357;RR=13;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.012;SAB=0.71429;SAF=25;SAP=16.97;SAR=10;SC=ATATTGAAGACAAAAAAACAG;SRB=0.49371;SRF=2746;SRP=4.9233;SRR=2816;TC;TR=7;TU=A;VQSLOD=7.4342;set=Intersection;sumGLbyD=8.30
+20     11767787        .       CA      C       1382.10 PASS    AA=24;AB=0.56667;ABA=13;ABP=4.1684;ABR=17;AC=10;AF=0.00810;AN=1234;BL=967;BR=819;BVAR;BaseQRankSum=1.629;DEL;DP=22318;DP4=2190,2491,8,14;Dels=0.01;EL=16;EPP=8.8009;ER=8;FQ=999;FR;FS=2.536;HETAR=6;HOMA=3;HOMR=1051;HP=2;HPLen=1;HR=1;HRun=1;HU=A;INDEL;InbreedingCoeff=0.0823;LEN=1;LRB=0.082867;LRBP=29.642;MQ=65.44;MQ0Fraction=0.0032;MQM=50.583;MQRankSum=0.931;NF;NR;NS=1060;PP;PV4=0.39,0.018,1,0.37;RA=5568;RL=11;RPP=3.3722;RR=13;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.694;SAB=0.375;SAF=9;SAP=6.2675;SAR=15;SC=TGAACATGTACAGACTTGGTT;SRB=0.44325;SRF=2468;SRP=158.78;SRR=3100;TC;TR=1;TU=A;VQSLOD=9.9622;set=Intersection;sumGLbyD=15.42
+20     12021825        .       A       AG      1063.30 PASS    AA=26;AB=0.53704;ABA=25;ABP=3.6537;ABR=29;AC=12;AF=0.0214;AN=562;BL=1077;BR=815;BVAR;BaseQRankSum=-3.787;DP=22049;DP4=2650,2464,13,12;Dels=0.00;EL=18;EPP=11.362;ER=8;FR;FS=0.735;HETAR=12;HOMA=1;HOMR=1064;HP=1;HR=1;HRun=1;HU=G;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0876;LEN=1;LRB=0.13848;LRBP=81.794;MQ=102.78;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=85.538;MQRankSum=-0.126;NF;NR;NS=1077;PP;PV4=1,1,0.19,0.2;RA=6457;RL=17;RPP=8.3555;RR=9;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.941;SAB=0.57692;SAF=15;SAP=4.3466;SAR=11;SC=GTAGTTTAACAGTTTATCAGG;SRB=0.5182;SRF=3346;SRP=21.582;SRR=3111;TC;TR=1;TU=G;VQSLOD=8.0483;set=Intersection;sumGLbyD=13.94
+20     12238835        rs113904674     CTCTTCATGGTCT   C       1813.44 PASS    AA=7;AB=0.73077;ABA=7;ABP=15.037;ABR=19;AC=4;AF=0.0056;AN=712;BL=360;BR=368;BVAR;BaseQRankSum=3.891;DB;DEL;DP=10309;Dels=0.00;EL=4;EPP=3.3205;ER=3;FR;FS=0.000;HETAR=3;HOMA=0;HOMR=1076;HP=1;HPLen=2;HR=2;HRun=0;HU=C;InbreedingCoeff=-0.0381;LEN=12;LRB=0.010989;LRBP=3.2012;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=37;MQRankSum=-3.793;NF;NR;NS=1079;PP;RA=6085;RL=4;RPP=3.3205;RR=3;RUN=1;ReadPosRankSum=1.319;SAB=0.42857;SAF=3;SAP=3.3205;SAR=4;SC=CTTAATGCTCCTCTTCATGGT;SRB=0.51257;SRF=3119;SRP=11.364;SRR=2966;TC;TR=6;TU=CCT;VQSLOD=5.7551;set=Intersection;sumGLbyD=69.48
+20     12602812        .       AT      A       12344   PASS    AA=47;AB=0.94372;ABA=43;ABP=1309.5;ABR=721;AC=14;AF=0.0196;AN=716;BL=2714;BR=217;BVAR;BaseQRankSum=1.424;DEL;DP=10743;Dels=0.00;EL=24;EPP=3.0565;ER=23;FS=0.629;HETAR=228;HOMA=65;HOMR=769;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0233;LEN=1;LRB=0.85193;LRBP=4622.3;MQ0Fraction=0.0000;MQM=99.574;MQRankSum=1.901;NS=1080;RA=4839;RL=46;RPP=96.568;RR=1;RUN=1;ReadPosRankSum=-9.906;SAB=0.53191;SAF=25;SAP=3.4261;SAR=22;SRB=0.51106;SRF=2473;SRP=8.148;SRR=2366;VQSLOD=2.8161;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.67
+20     13600884        .       CTG     C,CTGTG 1278.10 PASS    AA=85;AB=0.77994;ABA=79;ABP=247.38;ABR=280;AC=71,22;AF=0.05907,0.01830;AN=1202;BL=3279;BR=3205;BVAR;BaseQRankSum=8.852;DEL;DP=24185;DP4=1317,931,52,49;Dels=0.03;EL=45;EPP=3.649;ER=40;FQ=999;FR;FS=31.826;HETAR=75;HOMA=4;HOMR=926;HP=2;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=0.1566;LEN=2;LRB=0.011413;LRBP=4.8442;MQ=65.06;MQ0Fraction=0.0012;MQM=48.671;MQRankSum=-0.511;NF;NR;NS=1005;PP;PV4=0.18,1,0.39,0.27;RA=3342;RL=35;RPP=8.7583;RR=50;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.329;SAB=0.43529;SAF=37;SAP=6.1015;SAR=48;SC=TCCCTTTACTCTGTGTGTGTG;SRB=0.59066;SRF=1974;SRP=241.62;SRR=1368;TC;TR=15;TU=GT;VQSLOD=3.8635;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=4.23
+20     13666265        .       T       TATAG   556.88  PASS    AC=21;AF=0.01959;AN=1072;BaseQRankSum=24.958;DP=2706;FS=2.581;HRun=0;HaplotypeScore=25.9952;InbreedingCoeff=0.1419;MQ=72.43;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=2.888;QD=4.38;ReadPosRankSum=2.552;SB=-417.04;VQSLOD=7.3380;set=VQSR
+20     13861245        rs72422273      C       CTCA    2685.46 PASS    AC=140;AF=0.11589;AN=1208;BaseQRankSum=24.355;DB;DP=2910;FS=6.808;HRun=0;HaplotypeScore=19.3095;InbreedingCoeff=-0.0991;MQ=78.25;MQ0=22;MQ0Fraction=0.0076;MQRankSum=3.225;QD=3.64;ReadPosRankSum=2.607;SB=-1861.38;VQSLOD=4.1974;set=VQSR
+20     13865746        .       T       TA,TAA  1416.23 PASS    AA=63;AB=0.80417;ABA=47;ABP=195.87;ABR=193;AC=122,21;AF=0.10133,0.01744;AN=1204;BL=3673;BR=1145;BVAR;BaseQRankSum=-3.336;DP=10513;Dels=0.00;EL=62;EPP=131.27;ER=1;FR;FS=716.583;HETAR=45;HOMA=1;HOMR=998;HP=2;HR=1;HRun=1;HU=A;INS;InbreedingCoeff=0.0814;LEN=1;LRB=0.5247;LRBP=2883.3;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=56.143;MQRankSum=-1.197;NF;NR;NS=1044;PP;RA=4529;RL=62;RPP=131.27;RR=1;RUN=1;ReadPosRankSum=-12.295;SAB=1;SAF=63;SAP=139.81;SAR=0;SC=GGAACATGGATACCCCCCTGC;SRB=0.52462;SRF=2376;SRP=26.853;SRR=2153;TC;TR=1;TU=A;VQSLOD=-4.2308;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=4.77
+20     13881703        .       CTT     C       152.85  PASS    AC=8;AF=0.0093;AN=862;BaseQRankSum=3.941;DP=2063;FS=0.962;HRun=5;HaplotypeScore=24.0313;InbreedingCoeff=0.0790;MQ=55.05;MQ0=49;MQ0Fraction=0.0238;MQRankSum=-1.418;QD=3.47;ReadPosRankSum=-0.605;SB=-93.04;VQSLOD=5.3874;set=VQSR
+20     14033345        .       A       AT      2718.30 PASS    AA=91;AB=0.80899;ABA=85;ABP=372.04;ABR=360;AC=43;AF=0.03895;AN=1104;BL=3916;BR=4753;BVAR;BaseQRankSum=-6.609;DP=8350;Dels=0.02;EL=46;EPP=3.0342;ER=45;FR;FS=0.498;HETAR=70;HOMA=1;HOMR=871;HP=11;HR=11;HRun=11;HU=T;INS;InbreedingCoeff=0.0952;LEN=1;LRB=0.096551;LRBP=178.49;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=54.879;MQRankSum=2.164;NF;NR;NS=942;PP;RA=3717;RL=37;RPP=9.9065;RR=54;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.447;SAB=0.48352;SAF=44;SAP=3.2251;SAR=47;SC=TTGCAAACAGATTTTTTTTTT;SRB=0.45252;SRF=1682;SRP=75.807;SRR=2035;TC;TR=11;TU=T;VQSLOD=3.8299;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.88
+20     14260090        rs73619828      A       AT      27935   PASS    AA=596;AB=0.59484;ABA=487;ABP=96.922;ABR=715;AC=204;AF=0.17000;AN=1200;BL=21718;BR=28458;BVAR;BaseQRankSum=0.756;DB;DP=23629;DP4=1385,1492,287,328;Dels=0.00;EL=299;EPP=3.0249;ER=297;FQ=999;FR;FS=6.187;HETAR=218;HOMA=38;HOMR=788;HP=9;HPLen=9;HR=9;HRun=9;HU=T;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0797;LEN=1;LRB=0.13433;LRBP=1969;MQ=100.81;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=57.084;MQRankSum=2.224;NF;NR;NS=1044;PP;PV4=0.53,1,1.2e-11,1;RA=4143;RL=238;RPP=55.475;RR=358;RUN=1;ReadPosRankSum=0.198;SAB=0.46812;SAF=279;SAP=8.2714;SAR=317;SC=CCTTAAGTTGATTTTTTTTTC;SRB=0.50374;SRF=2087;SRP=3.514;SRR=2056;TC;TR=9;TU=T;VQSLOD=9.0018;set=Intersection;sumGLbyD=10.82
+20     14260558        .       AC      A       238     PASS    AC=1;AF=0.0014;AF1=0.003368;BaseQRankSum=2.868;CI95=0.003106,0.006211;DP=9724;DP4=2075,2329,1,7;Dels=0.00;FQ=106;FR;FS=10.678;HP=1;HPLen=2;HR=2;HRun=1;HU=A;INDEL;InbreedingCoeff=-0.0406;MQ=114.37;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=0.862;NF;NR;PP;PV4=0.074,0.0096,0.017,1;ReadPosRankSum=-0.042;SC=ATCAGGAATAACTGTGTGACC;TC;TR=2;TU=A;VQSLOD=8.1618;set=Intersection;sumGLbyD=18.65
+20     14425481        .       GTA     G,GTATA 148.85  PASS    AC=43,23;AF=0.03473,0.01858;AN=1238;BaseQRankSum=6.289;DP=25167;DP4=1800,2021,38,49;FR;FS=9.416;HP=2;HPLen=1;HR=1;HU=T;HaplotypeScore=17.7453;INDEL;InbreedingCoeff=0.0995;MQ0=21;MQ0Fraction=0.0058;MQRankSum=-0.200;NF;NR;PP;PV4=0.59,1,0.04,0.023;QD=0.35;ReadPosRankSum=-1.689;SB=-367.50;SC=CTGTGTGTGTGTATATATATA;TC;TR=13;TU=AT;VQSLOD=3.5796;set=filterInVQSR-2of5
+20     14943522        rs11478299      GA      AA,G    1761.24 PASS    AA=117;AB=0.68142;ABA=108;ABP=99.919;ABR=231;AC=0;AF=0.0000;AF1=0.04204;AN=712;BL=4931;BR=5802;BVAR;BaseQRankSum=9.118;CI95=0.02876,0.05752;DB;DEL;DP=13717;DP4=1908,1684,59,58;Dels=0.05;EL=60;EPP=3.1773;ER=57;FQ=81.9;FR;HETAR=56;HOMA=1;HOMR=1011;HP=8;HPLen=8;HR=8;HU=A;INDEL;InbreedingCoeff=0.1264;LEN=1;LRB=0.081152;LRBP=156.5;MQ=106.93;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=96.855;MQRankSum=1.619;NF;NR;NS=1068;PP;PV4=0.57,1,0.0003,1;QD=7.40;RA=5080;RL=56;RPP=3.4743;RR=61;RUN=1;ReadPosRankSum=0.814;SAB=0.52137;SAF=61;SAP=3.4743;SAR=56;SB=-1122.51;SC=GTTGTTTGGGGAAAAAAAACT;SRB=0.51083;SRF=2595;SRP=8.1825;SRR=2485;TC;TR=8;TU=A;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=9.81
+20     14974486        .       A       AG      4101.40 PASS    AA=57;AB=0.57143;ABA=51;ABP=8.2839;ABR=68;AC=22;AF=0.01846;AN=1192;BL=2286;BR=2834;BVAR;BaseQRankSum=8.711;DP=20538;DP4=2172,2100,19,13;Dels=0.00;EL=32;EPP=4.877;ER=25;FS=0.517;HETAR=20;HOMA=4;HOMR=1027;HRun=1;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0677;LEN=1;LRB=0.10703;LRBP=130.37;MQ=126.07;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=56.088;MQRankSum=-10.756;NS=1051;PV4=0.38,3.5e-51,7.9e-34,1;RA=5203;RL=26;RPP=3.9627;RR=31;RUN=1;ReadPosRankSum=1.283;SAB=0.54386;SAF=31;SAP=3.9627;SAR=26;SRB=0.51816;SRF=2696;SRP=17.918;SRR=2507;VQSLOD=8.0072;set=Intersection;sumGLbyD=25.60
+20     15111137        .       GA      G       13533   PASS    AA=98;AB=0.84864;ABA=89;ABP=623.8;ABR=499;AC=47;AF=0.03796;AN=1238;BL=5324;BR=856;BVAR;BaseQRankSum=-11.577;DEL;DP=13384;Dels=0.01;EL=53;EPP=4.4284;ER=45;FS=6.099;HETAR=219;HOMA=845;HOMR=18;HRun=1;InbreedingCoeff=-0.0056;LEN=1;LRB=0.72298;LRBP=7017.4;MQ0Fraction=0.0003;MQM=90.449;MQRankSum=1.408;NS=1083;RA=590;RL=87;RPP=130.99;RR=11;RUN=1;ReadPosRankSum=-18.074;SAB=0.55102;SAF=54;SAP=5.2261;SAR=44;SRB=0.52373;SRF=309;SRP=5.8958;SRR=281;VQSLOD=4.1054;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.06
+20     15283028        .       A       AC,ACACACACACACAC       140844.83       PASS    AA=180;AB=0.61442;ABA=123;ABP=39.285;ABR=196;AC=13,817;AF=0.01111,0.69829;AN=1170;BL=4453;BR=11407;BVAR;BaseQRankSum=24.686;DP=6365;Dels=0.00;EL=124;EPP=58.793;ER=56;FR;FS=10.912;HETAR=87;HOMA=48;HOMR=683;HP=1;HR=1;HRun=1;HU=T;INS;InbreedingCoeff=0.2074;LEN=1;LRB=0.43846;LRBP=6624;MQ0Fraction=0.0558;MQM=38.211;MQRankSum=-21.111;NF;NR;NS=818;PP;RA=1732;RL=0;RPP=393.88;RR=180;RUN=1;ReadPosRankSum=-7.620;SAB=0.31111;SAF=56;SAP=58.793;SAR=124;SC=ACACACACACATACACACATA;SRB=0.54042;SRF=936;SRP=27.584;SRR=796;TC;TR=21;TU=AC;VQSLOD=4.7569;set=Intersection;sumGLbyD=18.36
+20     15361056        .       ATAACT  A       4892.81 PASS    AA=59;AB=0.63576;ABA=55;ABP=27.184;ABR=96;AC=34;AF=0.0487;AN=698;BL=3164;BR=1999;BVAR;BaseQRankSum=3.391;DEL;DP=7080;Dels=0.03;EL=27;EPP=3.9304;ER=32;FR;FS=4.816;HETAR=35;HOMA=6;HOMR=966;HP=2;HPLen=3;HR=3;HRun=0;HU=A;InbreedingCoeff=0.0785;LEN=5;LRB=0.22564;LRBP=573.84;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=70.034;MQRankSum=-8.732;NF;NR;NS=1008;PP;RA=3915;RL=42;RPP=26.013;RR=17;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.735;SAB=0.44068;SAF=26;SAP=4.8137;SAR=33;SC=AGATTAGGAAATAACTTAGGG;SRB=0.42682;SRF=1671;SRP=185.12;SRR=2244;TC;TR=3;TU=A;VQSLOD=7.0900;set=Intersection;sumGLbyD=43.38
+20     15579507        .       AATTAGTC        A,TATTAGTC      1936.38 PASS    AA=16;AB=0.58974;ABA=16;ABP=5.7386;ABR=23;AC=64;AF=0.05229;AN=1224;BL=699;BR=775;BVAR;BaseQRankSum=-21.390;DEL;DP=21920;DP4=2099,2403,6,6;Dels=0.00;EL=8;EPP=3.0103;ER=8;FR;FS=2.920;HETAR=5;HOMA=0;HOMR=1063;HP=3;HPLen=4;HR=4;HU=A;INDEL;InbreedingCoeff=-0.0143;LEN=7;LRB=0.05156;LRBP=11.519;MQ=129.49;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=51.938;MQRankSum=3.331;NF;NR;NS=1068;PP;PV4=1,0.019,1.3e-07,1;RA=5334;RL=5;RPP=7.8961;RR=11;RUN=1;ReadPosRankSum=-16.901;SAB=0.4375;SAF=7;SAP=3.5532;SAR=9;SC=CATACTACAAAATTAGTCATT;SRB=0.41695;SRF=2224;SRP=322.58;SRR=3110;TC;TR=4;TU=A;VQSLOD=3.2237;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=43.57
+20     15752535        .       CT      C,GT    3775.20 PASS    AA=92;AB=0.78636;ABA=47;ABP=159.71;ABR=173;AC=0;AF=0.0000;AN=608;BL=4955;BR=2380;BVAR;BaseQRankSum=2.910;DEL;DP=3429;Dels=0.04;EL=13;EPP=105.82;ER=79;FR;HETAR=92;HOMA=95;HOMR=544;HP=2;HPLen=2;HR=2;HU=T;InbreedingCoeff=0.0483;LEN=1;LRB=0.35106;LRBP=1966;MQ0Fraction=0.0232;MQM=35.293;MQRankSum=-2.199;NF;NR;NS=732;PP;QD=4.91;RA=1272;RL=81;RPP=118.66;RR=11;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.077;SAB=0.021739;SAF=2;SAP=185.79;SAR=90;SB=-59.51;SC=CAAGACCATCCTTGGCTAACA;SRB=0.14623;SRF=186;SRP=1385.8;SRR=1086;TC;TR=2;TU=T;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=9.70
+20     15883060        rs73619850      A       AT      1325.60 PASS    AA=38;AB=0.59302;ABA=35;ABP=9.4742;ABR=51;AC=14;AF=0.0156;AN=896;BL=1078;BR=1638;BVAR;BaseQRankSum=-4.526;DB;DP=19854;DP4=1632,1800,15,20;Dels=0.00;EL=18;EPP=3.2389;ER=20;FR;FS=0.000;HETAR=14;HOMA=1;HOMR=1014;HP=1;HPLen=1;HR=1;HRun=1;HU=T;INDEL;INS;InbreedingCoeff=-0.0131;LEN=1;LRB=0.20619;LRBP=253.74;MQ=118.40;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=56.526;MQRankSum=0.892;NF;NR;NS=1029;PP;PV4=0.61,1,0.25,0.14;RA=4439;RL=14;RPP=8.7247;RR=24;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.061;SAB=0.42105;SAF=16;SAP=5.0675;SAR=22;SC=GGATTGGCAGATAAAAAATGG;SRB=0.46429;SRF=2061;SRP=52.168;SRR=2378;TC;TR=1;TU=T;VQSLOD=9.7576;set=Intersection;sumGLbyD=15.69
+20     16073315        rs111824749     GA      G,GAA,GAAA      6400.63 PASS    AC=138,47,20;AF=0.11577,0.03943,0.01678;AN=1192;BVAR;BaseQRankSum=11.377;DB;DEL;DP=35284;DP4=1695,1547,60,56;Dels=0.08;FR;FS=9.576;HP=11;HPLen=10;HR=10;HRun=10;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.2137;MQ=106.87;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0003;MQRankSum=0.773;NF;NR;PP;PV4=0.92,1,0.024,0.45;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.224;SC=TATTTGAGGAGAAAAAAAAAA;TC;TR=10;TU=A;VQSLOD=9.3264;set=Intersection;sumGLbyD=8.64
+20     16122099        .       GA      G       12914   PASS    AA=85;AB=0.85915;ABA=80;ABP=639.4;ABR=488;AC=19;AF=0.01542;AN=1232;BL=805;BR=5457;BVAR;BaseQRankSum=-6.084;DEL;DP=13592;Dels=0.00;EL=45;EPP=3.649;ER=40;FS=0.935;HETAR=218;HOMA=841;HOMR=14;HRun=2;InbreedingCoeff=0.0250;LEN=1;LRB=0.74289;LRBP=7507.5;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=103.01;MQRankSum=2.843;NS=1075;RA=541;RL=2;RPP=170.62;RR=83;RUN=1;ReadPosRankSum=-16.222;SAB=0.49412;SAF=42;SAP=3.0358;SAR=43;SRB=0.44917;SRF=243;SRP=15.152;SRR=298;VQSLOD=3.9745;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=2.97
+20     16828509        .       G       GT      843.62  PASS    AA=30;AB=0.70103;ABA=29;ABP=37.06;ABR=68;AC=10;AF=0.0140;AN=714;BL=1368;BR=1786;BVAR;BaseQRankSum=-4.061;DP=8682;Dels=0.01;EL=14;EPP=3.2998;ER=16;FR;FS=2.681;HETAR=22;HOMA=1;HOMR=1020;HP=8;HPLen=8;HR=8;HRun=8;HU=T;INS;InbreedingCoeff=0.1389;LEN=1;LRB=0.13253;LRBP=123.3;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=62.8;MQRankSum=-1.491;NF;NR;NS=1043;PP;RA=4416;RL=11;RPP=7.6428;RR=19;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.718;SAB=0.76667;SAF=23;SAP=21.54;SAR=7;SC=CCTTCAAAAGGTTTTTTTTGG;SRB=0.5745;SRF=2537;SRP=215.91;SRR=1879;TC;TR=8;TU=T;VQSLOD=7.6258;set=Intersection;sumGLbyD=10.77
+20     17470034        .       GC      G       46975   PASS    AA=57;AB=0.96043;ABA=52;ABP=2422.5;ABR=1262;AC=34;AF=0.02773;AN=1226;BL=418;BR=3446;BVAR;BaseQRankSum=-6.250;DEL;DP=12035;Dels=0.00;EL=22;EPP=9.4485;ER=35;FS=1.350;HETAR=416;HOMA=409;HOMR=244;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0083;LEN=1;LRB=0.78364;LRBP=5155.6;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=99.509;MQRankSum=2.192;NS=1076;RA=2396;RL=5;RPP=87.164;RR=52;RUN=1;ReadPosRankSum=-15.199;SAB=0.5614;SAF=32;SAP=4.877;SAR=25;SRB=0.52963;SRF=1269;SRP=21.285;SRR=1127;VQSLOD=3.8440;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.06
+20     17471374        .       AGCGGC  A       850.03  PASS    AC=6;AF=0.0085;AF1=0.01301;AN=704;BaseQRankSum=6.259;CI95=0.00885,0.01991;DP=8180;DP4=2215,1878,4,5;Dels=0.01;FQ=131;FS=0.000;HRun=0;INDEL;InbreedingCoeff=0.0009;MQ=104.41;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-5.521;PV4=0.74,0.37,0.0005,1;ReadPosRankSum=2.468;VQSLOD=6.8773;set=Intersection;sumGLbyD=30.85
+20     18433202        rs35582929      G       GA      2506.90 PASS    AA=55;AB=0.5812;ABA=49;ABP=9.7103;ABR=68;AC=20;AF=0.0218;AN=918;BL=2263;BR=2175;BVAR;BaseQRankSum=-6.639;DB;DP=19467;DP4=1845,2365,27,26;Dels=0.00;EL=21;EPP=9.6826;ER=34;FQ=999;FR;FS=5.633;HETAR=16;HOMA=3;HOMR=1045;HP=2;HPLen=3;HR=3;HRun=1;HU=G;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0700;LEN=1;LRB=0.019829;LRBP=6.7994;MQ=114.03;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=83.345;MQRankSum=1.610;NF;NR;NS=1064;PP;PV4=0.33,1,1,1;RA=5380;RL=28;RPP=3.0498;RR=27;RUN=1;ReadPosRankSum=0.873;SAB=0.47273;SAF=26;SAP=3.3656;SAR=29;SC=TATTTCATGGGAGCATTAAAA;SRB=0.42862;SRF=2306;SRP=241.07;SRR=3074;TC;TR=3;TU=G;VQSLOD=10.0372;dbSNP=126;set=Intersection;sumGLbyD=13.10
+20     18551314        rs10659122      CA      C,CAA,CAAA,CAAAA,CAAAAA 18810.74        PASS    ABR=243;AC=19,169,216,164,188;AF=0.01816,0.16157,0.20650,0.15679,0.17973;BVAR;BaseQRankSum=-5.742;DB;DP=17637;DP4=136,77,560,237;FR;FS=2.693;HOMA=177;HOMR=299;HP=17;HR=17;HU=A;HaplotypeScore=15.5048;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.8901;MQ0=11;MQ0Fraction=0.0069;MQRankSum=1.845;NF;NR;NS=658;PP;PV4=0.08,1,1,1;QD=12.66;RA=673;RUN=1;ReadPosRankSum=0.283;SB=-3514.45;SC=GATTCCATCTCAAAAAAAAAA;SRB=0.63596;SRF=428;SRP=111.06;SRR=245;TC;TR=17;TU=A;VQSLOD=10.6964;dbSNP=130;set=Intersection
+20     18785519        .       G       GTC     415.55  PASS    AC=28;AF=0.0400;AN=700;BaseQRankSum=10.889;DP=1929;FS=8.778;HRun=0;HaplotypeScore=27.6448;InbreedingCoeff=0.0510;MQ=61.99;MQ0=36;MQ0Fraction=0.0187;MQRankSum=4.508;QD=3.08;ReadPosRankSum=8.080;SB=-437.03;VQSLOD=4.9313;set=VQSR
+20     19149501        .       A       AG      17.85   PASS    AC=1;AF=0.0015;AN=670;BaseQRankSum=0.769;DP=1635;FS=9.858;HRun=0;HaplotypeScore=12.1949;InbreedingCoeff=-0.0381;MQ=102.63;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=1.200;QD=3.23;ReadPosRankSum=0.292;SB=-7.06;VQSLOD=4.4695;set=VQSR
+20     19540281        .       AC      A       19710   PASS    AA=145;AB=0.81843;ABA=134;ABP=652.98;ABR=604;AC=115;AF=0.09583;AN=1200;BL=9637;BR=817;BVAR;BaseQRankSum=-13.669;DEL;DP=10963;Dels=0.01;EL=66;EPP=5.5412;ER=79;FS=1.252;HETAR=305;HOMA=681;HOMR=59;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0298;LEN=1;LRB=0.8437;LRBP=16162;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=118.51;MQRankSum=-2.194;NS=1046;RA=823;RL=141;RPP=284.09;RR=4;RUN=1;ReadPosRankSum=-20.775;SAB=0.45517;SAF=66;SAP=5.5412;SAR=79;SRB=0.452;SRF=372;SRP=19.477;SRR=451;VQSLOD=3.9584;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.29
+20     20015051        .       TGAGGGTGG       T       1820.73 PASS    AF=0.0112;AF1=0.01638;AN=714;BaseQRankSum=6.652;CI95=0.01106,0.02212;DP=9910;DP4=2812,1912,6,11;Dels=0.01;FQ=999;FR;FS=6.147;HP=1;HPLen=2;HR=2;HRun=0;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=0.0077;MQ=129.13;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-3.195;NF;NR;PP;PV4=0.049,1,5.5e-05,0.006;ReadPosRankSum=-1.989;SC=TTGGTGGAGTTGAGGGTGGGA;TC;TR=2;TU=T;VQSLOD=6.5963;set=Intersection;sumGLbyD=33.49
+20     20301041        rs35451634      ATATG   A       200.42  PASS    AC=21;AF=0.0449;AN=468;BaseQRankSum=5.251;DB;DP=579;FS=24.013;HRun=0;HaplotypeScore=27.8977;InbreedingCoeff=0.0113;MQ=78.47;MQ0=26;MQ0Fraction=0.0449;MQRankSum=-5.284;QD=3.06;ReadPosRankSum=1.793;SB=-55.76;VQSLOD=5.0981;set=VQSR
+20     20378174        .       TC      T       245.55  PASS    AC=23;AF=0.01879;AN=1224;BaseQRankSum=0.990;DP=3225;FS=10.413;HRun=1;HaplotypeScore=22.6109;InbreedingCoeff=0.0244;MQ=93.70;MQ0=3;MQ0Fraction=0.0009;MQRankSum=-3.349;QD=1.86;ReadPosRankSum=-7.227;SB=-188.62;VQSLOD=4.2553;set=VQSR
+20     20809160        rs10571503      TAA     AAA,T   3496    PASS    AC=0;AF=0.0000;AN=612;BaseQRankSum=1.968;DB;DP=1092;FR;HP=4;HPLen=3;HR=3;HRun=0;HU=A;HaplotypeScore=26.1253;InbreedingCoeff=0.0603;MQ=68.98;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0009;MQRankSum=1.520;NF;NR;PP;ReadPosRankSum=-4.042;SC=TATATATATATAAATTTAAAT;TC;TR=13;TU=AT;set=filterInVQSR-2of5
+20     22508765        .       CT      C       53877.84        PASS    AA=187;AB=0.78077;ABA=171;ABP=537.09;ABR=609;AC=1017;AF=0.91787;AN=1108;BL=12690;BR=1718;BVAR;BaseQRankSum=13.773;DEL;DP=7430;Dels=0.02;EL=73;EPP=22.53;ER=114;FR;FS=16.352;HETAR=152;HOMA=9;HOMR=786;HP=8;HR=4;HRun=4;HU=T;InbreedingCoeff=0.3885;LEN=1;LRB=0.76152;LRBP=18147;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=46.086;MQRankSum=0.971;NF;NR;NS=947;PP;RA=2868;RL=177;RPP=326.86;RR=10;RUN=1;ReadPosRankSum=9.951;SAB=0.34759;SAF=65;SAP=40.738;SAR=122;SC=AAAAAATTTTCTTTTGAACTG;SRB=0.46269;SRF=1327;SRP=37.684;SRR=1541;TC;TR=4;TU=T;VQSLOD=5.1182;set=Intersection;sumGLbyD=25.15
+20     22555082        rs11477526      AT      A       11503   PASS    AA=530;AB=0.50816;ABA=422;ABP=3.5063;ABR=436;AF=0.1614;AN=700;BL=21453;BR=23313;BVAR;BaseQRankSum=17.562;DB;DEL;DP=25587;DP4=1869,1600,283,201;Dels=0.14;EL=259;EPP=3.6003;ER=271;FQ=999;FR;FS=14.595;HETAR=159;HOMA=41;HOMR=846;HP=3;HPLen=3;HR=3;HRun=3;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=0.0995;LEN=1;LRB=0.041549;LRBP=170.83;MQ=95.89;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=72.162;MQRankSum=2.564;NF;NR;NS=1046;PP;PV4=0.058,6.6e-129,0.04,1;RA=4303;RL=264;RPP=3.0267;RR=266;RUN=1;ReadPosRankSum=0.176;SAB=0.58679;SAF=311;SAP=37.688;SAR=219;SC=GGGAAAGCTGATTTACTGATT;SRB=0.54892;SRF=2362;SRP=92.453;SRR=1941;TC;TR=3;TU=T;VQSLOD=8.7746;dbSNP=120;set=Intersection;sumGLbyD=15.27
+20     22590907        .       A       AC      4204.88 PASS    AA=67;AB=0.592;ABA=51;ABP=12.2;ABR=74;AF=0.0554;AF1=0.0468;AN=560;BL=2277;BR=2389;BVAR;BaseQRankSum=10.968;CI95=0.03759,0.05639;DP=14380;DP4=2514,2018,33,33;Dels=0.00;EL=22;EPP=20.155;ER=45;FQ=999;FR;FS=3.846;HETAR=25;HOMA=4;HOMR=1049;HP=4;HPLen=5;HR=5;HRun=0;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0719;LEN=1;LRB=0.024003;LRBP=8.8481;MQ=110.68;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=96.149;MQRankSum=2.668;NF;NR;NS=1078;PP;PV4=0.39,1,0.46,0.36;RA=5468;RL=33;RPP=3.0427;RR=34;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.097;SAB=0.50746;SAF=34;SAP=3.0427;SAR=33;SC=TCATATCAAAAACATTACGTT;SRB=0.54389;SRF=2974;SRP=94.508;SRR=2494;TC;TR=5;TU=A;VQSLOD=10.0712;set=Intersection;sumGLbyD=27.69
+20     22806326        rs11468890      ATTCCATCAC      A       105320.99       PASS    AC=567;AF=0.48795;AN=1162;BVAR;BaseQRankSum=32.858;DB;DEL;DP=26278;DP4=727,796,554,587;Dels=0.30;FQ=999;FR;FS=1.923;HP=3;HPLen=3;HR=2;HRun=0;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=0.2548;LEN=9;MQ=89.42;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-23.545;NF;NR;PP;PV4=0.7,1,1.3e-167,1;RUN=1;ReadPosRankSum=4.384;SC=GGCTGCTCCCATTCCATCACT;TC;TR=2;TU=T;VQSLOD=8.2594;set=Intersection;sumGLbyD=69.81
+20     22999898        rs55966257      CAGGA   C       8019.97 PASS    AA=23;AB=0.57778;ABA=19;ABP=5.3748;ABR=26;AC=214;AF=0.18838;AN=1136;BL=1143;BR=1040;BVAR;BaseQRankSum=29.294;DB;DEL;DP=8216;Dels=0.02;EL=11;EPP=3.1047;ER=12;FS=14.938;HETAR=14;HOMA=2;HOMR=948;HRun=0;InbreedingCoeff=0.0797;LEN=4;LRB=0.047183;LRBP=13.563;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=34.783;MQRankSum=-20.301;NS=964;RA=3637;RL=13;RPP=3.86;RR=10;RUN=1;ReadPosRankSum=-24.607;SAB=0.47826;SAF=11;SAP=3.1047;SAR=12;SRB=0.49024;SRF=1783;SRP=6.02;SRR=1854;VQSLOD=7.9163;set=Intersection;sumGLbyD=9.43
+20     23385964        rs57723772      GAA     G       8170.95 PASS    AC=257;AF=0.20928;AN=1228;BaseQRankSum=32.220;DB;DP=3291;FS=1.688;HRun=3;HaplotypeScore=22.6739;InbreedingCoeff=0.0171;MQ=58.44;MQ0=32;MQ0Fraction=0.0097;MQRankSum=-4.893;QD=6.55;ReadPosRankSum=-35.524;SB=-3631.67;VQSLOD=5.6549;set=VQSR
+20     23534530        .       TA      T       3542.10 PASS    AA=45;AB=0.75658;ABA=37;ABP=89.926;ABR=115;AC=35;AF=0.02991;AN=1170;BL=3090;BR=270;BVAR;BaseQRankSum=-6.892;DEL;DP=8108;Dels=0.00;EL=19;EPP=5.3748;ER=26;FS=1.026;HETAR=76;HOMA=896;HOMR=18;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0551;LEN=1;LRB=0.83929;LRBP=5142.4;MQ0Fraction=0.0017;MQM=41.578;MQRankSum=0.818;NS=991;RA=203;RL=43;RPP=84.127;RR=2;RUN=1;ReadPosRankSum=-12.923;SAB=0.37778;SAF=17;SAP=8.8491;SAR=28;SRB=0.5665;SRF=115;SRP=10.808;SRR=88;VQSLOD=4.2093;set=Intersection;sumGLbyD=3.49
+20     23976810        rs5841018       A       ATATTAAT        1782.38 PASS    AF=0.1387;AF1=0.01507;BaseQRankSum=3.717;CI95=0.00188,0.03947;DB;DP=1712;DP4=357,376,7,2;Dels=0.00;FQ=31.1;FS=14.489;HPLen=2;HRun=0;INDEL;InbreedingCoeff=0.1123;MQ=49.53;MQ0=2;MQ0Fraction=0.0055;MQRankSum=-4.928;PV4=0.1,1,0.00085,0.016;ReadPosRankSum=-4.456;VQSLOD=5.3140;dbSNP=116;set=Intersection;sumGLbyD=19.98
+20     24222100        .       CTTTTA  C       4219.36 PASS    AA=57;AB=0.59434;ABA=43;ABP=11.205;ABR=63;AF=0.01803;AF1=0.01547;AN=1220;BL=2073;BR=2345;BVAR;BaseQRankSum=7.990;CI95=0.0114,0.02137;DEL;DP=17536;DP4=2140,2346,7,12;Dels=0.01;EL=32;EPP=4.877;ER=25;FQ=104;FS=0.614;HETAR=21;HOMA=4;HOMR=1042;HRun=0;INDEL;InbreedingCoeff=0.1941;LEN=5;LRB=0.061566;LRBP=39.374;MQ=73.32;MQ0Fraction=0.0021;MQM=39.614;MQRankSum=-5.728;NS=1067;PV4=0.37,1.1e-39,3.5e-09,1;RA=5527;RL=28;RPP=3.0484;RR=29;RUN=1;ReadPosRankSum=0.214;SAB=0.54386;SAF=31;SAP=3.9627;SAR=26;SRB=0.49267;SRF=2723;SRP=5.588;SRR=2804;VQSLOD=7.5428;set=Intersection;sumGLbyD=38.08
+20     24395018        .       AT      A       49310   PASS    AA=146;AB=0.91198;ABA=130;ABP=2180.5;ABR=1347;AC=50;AF=0.04045;AN=1236;BL=587;BR=9625;BVAR;BaseQRankSum=-4.610;DEL;DP=12793;Dels=0.01;EL=54;EPP=24.487;ER=92;FS=22.108;HETAR=485;HOMA=384;HOMR=210;HRun=2;InbreedingCoeff=0.0374;LEN=1;LRB=0.88504;LRBP=17373;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=102.26;MQRankSum=2.256;NS=1080;RA=2377;RL=1;RPP=311.42;RR=145;RUN=1;ReadPosRankSum=-16.347;SAB=0.63699;SAF=93;SAP=26.807;SAR=53;SRB=0.52167;SRF=1240;SRP=12.702;SRR=1137;VQSLOD=3.2421;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.80
+20     24411517        .       C       CA      246.18  PASS    AF=0.01546;AF1=0.01095;BaseQRankSum=7.832;CI95=0.005698,0.01709;DP=7981;DP4=983,2037,7,7;Dels=0.00;FQ=27.9;FS=18.815;HPLen=3;HRun=3;INDEL;InbreedingCoeff=0.0175;MQ=60.28;MQ0Fraction=0.0137;MQRankSum=-7.243;PV4=0.25,1,2.7e-05,1;ReadPosRankSum=-0.143;VQSLOD=4.3701;set=Intersection;sumGLbyD=6.56
+20     24421169        .       AG      A       27480   PASS    AA=182;AB=0.8303;ABA=149;ABP=835;ABR=729;AC=89;AF=0.07224;AN=1232;BL=11276;BR=2214;BVAR;BaseQRankSum=-5.447;DEL;DP=11717;Dels=0.01;EL=103;EPP=9.8827;ER=79;FR;FS=15.492;HETAR=343;HOMA=607;HOMR=114;HP=4;HR=1;HRun=1;HU=G;InbreedingCoeff=0.0353;LEN=1;LRB=0.67176;LRBP=13222;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=88.324;MQRankSum=2.221;NF;NR;NS=1071;PP;RA=1226;RL=169;RPP=293.37;RR=13;RUN=1;ReadPosRankSum=-19.711;SAB=0.54945;SAF=100;SAP=6.876;SAR=82;SC=CCTTAGCCCCAGAAAACATCT;SRB=0.44535;SRF=546;SRP=34.814;SRR=680;TC;TR=1;TU=G;VQSLOD=4.2669;set=Intersection;sumGLbyD=3.91
+20     24765537        rs71841337      ATTT    A,AT,ATT,ATTTT,ATTTTT   37852   PASS    AC=13,120,527,51,92;AF=0.01102,0.10169,0.44661,0.04322,0.07797;AN=1180;BVAR;BaseQRankSum=8.172;DB;DEL;DP=39116;DP4=200,331,851,1169;FR;FS=2.394;HP=15;HR=15;HU=T;HaplotypeScore=20.8091;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.4815;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0003;MQRankSum=4.344;NF;NR;PP;PV4=0.067,1,1,0.1;QD=7.90;RUN=1;ReadPosRankSum=1.798;SB=-8371.96;SC=CTCTGCAACAATTTTTTTTTT;TC;TR=15;TU=T;VQSLOD=9.9679;dbSNP=120;set=Intersection
+20     25500689        .       A       AATTT   84980.72        PASS    AC=1005;AF=0.89096;AN=1128;BaseQRankSum=17.400;DP=2324;FS=6.721;HRun=0;HaplotypeScore=25.3376;InbreedingCoeff=0.2148;MQ=75.19;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0004;MQRankSum=-8.221;QD=38.28;ReadPosRankSum=4.504;SB=-34833.07;VQSLOD=4.6038;set=VQSR
+20     25550373        .       GA      G       11251.31        PASS    AA=246;AB=0.42963;ABA=154;ABP=14.624;ABR=116;AC=566;AF=0.6521;AN=868;BL=5230;BR=11845;BVAR;BaseQRankSum=7.418;DEL;DP=8885;Dels=0.02;EL=99;EPP=23.348;ER=147;FR;FS=50.357;HETAR=150;HOMA=849;HOMR=14;HP=1;HR=2;HRun=1;HU=G;InbreedingCoeff=0.1365;LEN=1;LRB=0.38741;LRBP=5567.9;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=97.561;MQRankSum=0.050;NF;NR;NS=1013;PP;RA=269;RL=75;RPP=84.361;RR=171;RUN=1;ReadPosRankSum=-7.128;SAB=0.52846;SAF=130;SAP=4.7404;SAR=116;SC=CACGGAGGCGGAGGAAGCAGC;SRB=0.42379;SRF=114;SRP=16.58;SRR=155;TC;TR=6;TU=AGG;VQSLOD=4.0103;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=4.58
+20     25903865        .       TTC     T       7459.23 PASS    AC=277;AF=0.23316;AN=1188;BaseQRankSum=31.479;DP=2969;FS=137.723;HRun=0;HaplotypeScore=37.3300;InbreedingCoeff=-0.1755;MQ=53.49;MQ0=50;MQ0Fraction=0.0168;MQRankSum=-25.506;QD=4.70;ReadPosRankSum=-5.913;SB=-1747.98;VQSLOD=5.4731;set=VQSR
+20     25934237        .       C       CCACTT  771.36  PASS    AC=37;AF=0.0426;AN=868;BaseQRankSum=16.331;DP=2253;FS=4.545;HRun=0;HaplotypeScore=29.9764;InbreedingCoeff=-0.0685;MQ=48.12;MQ0=87;MQ0Fraction=0.0386;MQRankSum=-12.497;QD=3.37;ReadPosRankSum=-8.428;SB=-297.70;VQSLOD=4.2324;set=VQSR
+20     26054751        rs112967123     TATC    T       33244   PASS    AA=1863;AB=0.79012;ABA=1788;ABP=6231;ABR=6731;AC=227;AF=0.18218;AN=1246;BL=74924;BR=72452;BVAR;BaseQRankSum=32.258;DB;DEL;DP=36404;DS;Dels=0.05;EL=931;EPP=3.0115;ER=932;FR;FS=265.752;HETAR=527;HOMA=2;HOMR=565;HP=1;HR=2;HRun=0;HU=T;InbreedingCoeff=-0.2137;LEN=3;LRB=0.016773;LRBP=93.048;MQ0Fraction=0.0127;MQM=28.797;MQRankSum=-5.329;NF;NR;NS=1094;PP;RA=14604;RL=1014;RPP=34.743;RR=849;RUN=1;ReadPosRankSum=8.394;SAB=0.65486;SAF=1220;SAP=391.07;SAR=643;SC=TCACCATCATTATCATCATTA;SRB=0.56717;SRF=8283;SRP=575.39;SRR=6321;TC;TR=8;TU=ATC;VQSLOD=1.0486;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=6.54
+20     26075169        .       CTTCATT C       34603   PASS    AA=311;AB=0.88905;ABA=298;ABP=3534.4;ABR=2388;AC=235;AF=0.18921;AN=1242;BL=17537;BR=5525;BVAR;BaseQRankSum=33.761;DEL;DP=20706;DS;Dels=0.01;EL=206;EPP=74.236;ER=105;FR;FS=94.549;HETAR=596;HOMA=99;HOMR=336;HP=3;HR=2;HRun=0;HU=T;InbreedingCoeff=-0.2083;LEN=6;LRB=0.52086;LRBP=13589;MQ0Fraction=0.0426;MQM=14.524;MQRankSum=-37.199;NF;NR;NS=1038;PP;RA=3600;RL=311;RPP=678.34;RR=0;RUN=1;ReadPosRankSum=-27.333;SAB=0.66238;SAF=206;SAP=74.236;SAR=105;SC=TCACCATCATCTTCATTATCA;SRB=0.55833;SRF=2010;SRP=109.41;SRR=1590;TC;TR=7;TU=ATC;VQSLOD=1.4394;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=4.96
+20     26120452        .       CAG     C       7863.19 PASS    AA=163;AB=0.70489;ABA=157;ABP=196.99;ABR=375;AC=171;AF=0.1908;AN=896;BL=3455;BR=4877;BVAR;BaseQRankSum=25.536;DEL;DP=7014;Dels=0.10;EL=58;EPP=32.438;ER=105;FS=231.723;HETAR=90;HOMA=5;HOMR=387;HRun=0;InbreedingCoeff=-0.1966;LEN=2;LRB=0.17067;LRBP=530;MQ0Fraction=0.0470;MQM=21.951;MQRankSum=-23.449;NS=482;RA=1117;RL=62;RPP=23.273;RR=101;RUN=1;ReadPosRankSum=1.904;SAB=0.37423;SAF=61;SAP=25.404;SAR=102;SRB=0.41719;SRF=466;SRP=69.544;SRR=651;VQSLOD=-0.9395;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=5.06
+20     26136208        .       A       AT      17172.04        PASS    AA=252;AB=0.73593;ABA=183;ABP=338.07;ABR=510;AC=381;AF=0.30775;AN=1238;BL=8304;BR=14158;BVAR;BaseQRankSum=41.520;DP=40036;DP4=2448,2564,317,366;Dels=0.00;EL=163;EPP=50.197;ER=89;FQ=999;FS=6.531;HETAR=149;HOMA=52;HOMR=708;HRun=1;INDEL;INS;InbreedingCoeff=-0.3996;LEN=1;LRB=0.26062;LRBP=3315.9;MQ=64.20;MQ0=22;MQ0Fraction=0.0048;MQM=25.706;MQRankSum=-29.318;NS=909;PV4=0.24,1.1e-119,3.2e-281,1;RA=2939;RL=58;RPP=162.39;RR=194;RUN=1;ReadPosRankSum=0.592;SAB=0.24206;SAF=61;SAP=148.64;SAR=191;SRB=0.4852;SRF=1426;SRP=8.6026;SRR=1513;VQSLOD=0.5981;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=5.77
+20     26185812        .       AG      A       322.58  PASS    AF=0.0342;BaseQRankSum=3.668;DP=3014;Dels=0.01;FR;FS=10.238;HP=8;HPLen=6;HR=6;HRun=6;HU=G;InbreedingCoeff=0.1504;MQ0Fraction=0.0473;MQRankSum=-5.464;NF;NR;PP;ReadPosRankSum=0.536;SC=GGGTGGGTGGAGGGGGGAGGG;TC;TR=6;TU=G;VQSLOD=5.0767;set=Intersection;sumGLbyD=8.46
+20     30963468        .       AGTTT   A       2041.12 PASS    AA=38;AB=0.75694;ABA=35;ABP=85.587;ABR=109;AC=34;AF=0.0377;AN=902;BL=1974;BR=668;BVAR;BaseQRankSum=3.060;DEL;DP=22806;DP4=1997,1747,28,36;Dels=0.02;EL=17;EPP=3.9246;ER=21;FR;FS=16.034;HETAR=29;HOMA=1;HOMR=1009;HP=1;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=G;INDEL;InbreedingCoeff=0.0752;LEN=4;LRB=0.49432;LRBP=1404.9;MQ=87.17;MQ0Fraction=0.0013;MQM=98.079;MQRankSum=6.021;NF;NR;NS=1039;PP;PV4=0.13,1.5e-07,1,0.051;RA=4052;RL=36;RPP=69.069;RR=2;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.847;SAB=0.5;SAF=19;SAP=3.0103;SAR=19;SC=AGAAGTAAGTAGTTTGTTTTT;SRB=0.53776;SRF=2179;SRP=53.19;SRR=1873;TC;TR=9;TU=AAGT;VQSLOD=7.3578;set=Intersection;sumGLbyD=14.03
+20     31963212        .       AAAAAAAAAAAAG   A       727.15  PASS    AC=5;AF=0.0080;AN=622;BaseQRankSum=4.037;DP=1480;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=43.3793;InbreedingCoeff=0.0350;MQ=51.77;MQ0=59;MQ0Fraction=0.0399;MQRankSum=-1.799;QD=22.72;ReadPosRankSum=3.591;SB=-364.04;VQSLOD=5.3166;set=VQSR
+20     31997272        .       CT      C,CTT,CTTT      1837.10 PASS    AA=63;AB=0.77559;ABA=57;ABP=170.57;ABR=197;AC=79,49,30;AF=0.06594,0.04090,0.02504;AN=1198;BL=2372;BR=2640;BVAR;BaseQRankSum=3.277;DP=9050;Dels=0.03;EL=24;EPP=10.766;ER=39;FR;FS=0.303;HETAR=45;HOMA=1;HOMR=981;HP=10;HPLen=10;HR=10;HRun=10;HU=T;INS;InbreedingCoeff=0.2796;LEN=1;LRB=0.053472;LRBP=34.128;MQ0Fraction=0.0000;MQM=50.889;MQRankSum=0.610;NF;NR;NS=1027;PP;RA=3776;RL=30;RPP=3.3205;RR=33;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.800;SAB=0.39683;SAF=25;SAP=8.8354;SAR=38;SC=ACCCAACTTCCTTTTTTTTTT;SRB=0.46213;SRF=1745;SRP=50.049;SRR=2031;TC;TR=10;TU=T;VQSLOD=4.1189;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.66
+20     33446974        rs113250263     TAA     T,TA,TAAA       17130.16        PASS    AC=65,417,184;AF=0.05941,0.38117,0.16819;AN=1094;BVAR;BaseQRankSum=3.400;DB;DEL;DP=22362;DP4=221,247,418,524;Dels=0.33;FR;FS=15.409;HP=15;HR=14;HRun=14;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.5215;MQ=61.32;MQ0Fraction=0.0021;MQRankSum=0.481;NF;NR;PP;PV4=0.33,1,1,1;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.056;SC=CTCCGTCTCATAAAAAAAAAA;TC;TR=14;TU=A;VQSLOD=8.0974;dbSNP=132;set=Intersection;sumGLbyD=12.78
+20     33877149        .       C       CT      1784.40 PASS    AA=58;AB=0.73096;ABA=53;ABP=94.289;ABR=144;AC=65;AF=0.05682;AN=1144;BL=3298;BR=1935;BVAR;BaseQRankSum=-2.066;DP=8074;Dels=0.02;EL=22;EPP=10.348;ER=36;FR;FS=11.452;HETAR=47;HOMA=3;HOMR=754;HP=16;HR=12;HRun=12;HU=T;INS;InbreedingCoeff=0.1178;LEN=1;LRB=0.26046;LRBP=773.91;MQ0Fraction=0.0165;MQM=52.259;MQRankSum=0.734;NF;NR;NS=804;PP;RA=2141;RL=43;RPP=32.363;RR=15;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.273;SAB=0.46552;SAF=27;SAP=3.6093;SAR=31;SC=ATTTTCTTTTCTTTTTTTTTT;SRB=0.37553;SRF=804;SRP=291.14;SRR=1337;TC;TR=12;TU=T;VQSLOD=3.1540;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=2.84
+20     34358698        .       A       AAAAAAT 583.61  PASS    AC=27;AF=0.02542;AN=1062;BaseQRankSum=5.228;DP=1997;FS=3.765;HRun=0;HaplotypeScore=27.7123;InbreedingCoeff=0.0566;MQ=55.50;MQ0=14;MQ0Fraction=0.0070;MQRankSum=-3.961;QD=5.21;ReadPosRankSum=0.862;SB=-399.69;VQSLOD=4.3826;set=VQSR
+20     34387589        rs112431805     CT      C,CTT   4039.10 PASS    AA=121;AB=0.75368;ABA=117;ABP=268.53;ABR=358;AC=84,139;AF=0.07047,0.11661;AN=1192;BL=5557;BR=3901;BVAR;BaseQRankSum=2.693;DB;DP=10157;Dels=0.03;EL=47;EPP=16.093;ER=74;FR;FS=7.639;HETAR=89;HOMA=2;HOMR=913;HP=13;HR=11;HRun=11;HU=T;INS;InbreedingCoeff=0.2097;LEN=1;LRB=0.17509;LRBP=632.63;MQ0Fraction=0.0000;MQM=49.802;MQRankSum=-0.801;NF;NR;NS=1004;PP;RA=3789;RL=77;RPP=22.554;RR=44;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.691;SAB=0.3719;SAF=45;SAP=20.256;SAR=76;SC=AAGAAGTGTTCTTTTTTTTTT;SRB=0.40987;SRF=1553;SRP=270.35;SRR=2236;TC;TR=11;TU=T;VQSLOD=4.0473;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=4.64
+20     34493409        rs73621682      C       CAG     62288.93        PASS    AA=1069;AB=0.54863;ABA=826;ABP=40.606;ABR=1004;AC=257;AF=0.3640;AN=706;BL=41524;BR=47039;BVAR;BaseQRankSum=-24.248;DB;DP=30195;DP4=1743,1636,614,487;Dels=0.00;EL=582;EPP=21.343;ER=487;FQ=999;FR;FS=5.080;HETAR=298;HOMA=63;HOMR=712;HP=1;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.1437;LEN=2;LRB=0.062272;LRBP=748.76;MQ=77.99;MQ0=3;MQ0Fraction=0.0015;MQM=54.446;MQRankSum=0.160;NF;NR;NS=1073;PP;PV4=0.016,1,0.01,1;RA=4461;RL=526;RPP=3.5973;RR=543;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.716;SAB=0.57343;SAF=613;SAP=53.08;SAR=456;SC=AGGAAGAGATCAGAGCTCCCC;SRB=0.52634;SRF=2348;SRP=29.892;SRR=2113;TC;TR=4;TU=AG;VQSLOD=8.7047;dbSNP=130;set=Intersection;sumGLbyD=49.82
+20     35086229        rs112534255     G       GAT     6109.24 PASS    AA=14;AB=0.71795;ABA=11;ABP=19.101;ABR=28;AC=35;AF=0.0509;AN=688;BL=846;BR=517;BVAR;BaseQRankSum=-7.153;DB;DP=15775;DP4=2064,2212,31,22;Dels=0.00;EL=7;EPP=3.0103;ER=7;FR;FS=0.000;HETAR=10;HOMA=2;HOMR=914;HP=3;HPLen=4;HR=4;HRun=0;HU=G;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.1170;LEN=2;LRB=0.24138;LRBP=175.46;MQ=54.65;MQ0Fraction=0.0118;MQM=45.643;MQRankSum=1.614;NF;NR;NS=926;PP;PV4=0.17,1,1,1;RA=2867;RL=11;RPP=12.937;RR=3;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.520;SAB=0.71429;SAF=10;SAP=8.5941;SAR=4;SC=TTTTAGTAAAGGGGATTTCAC;SRB=0.58249;SRF=1670;SRP=172.46;SRR=1197;TC;TR=4;TU=G;VQSLOD=10.3126;set=Intersection;sumGLbyD=42.13
+20     35575895        rs67189278      AGTGT   A,AGT,AGTGTGT,TGTGT     43809.26        PASS    AC=593,3,481;AF=0.53327,0.00270,0.43255;AN=1112;BVAR;BaseQRankSum=-8.327;DB;DEL;DP=8989;Dels=0.04;FR;FS=9.400;HP=2;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=G;INS;InbreedingCoeff=0.7735;LEN=2;MQ0Fraction=0.0400;MQRankSum=-2.719;NF;NR;PP;RUN=1;ReadPosRankSum=-9.301;SC=TGTGTGTGTGAGTGTGTGTGT;TC;TR=22;TU=GT;VQSLOD=8.6440;set=Intersection;sumGLbyD=6.01
+20     35957317        .       CTGACT  C,CGACT 4370.96 PASS    ABR=81;AC=22,1;AF=0.0321,0.0015;AF1=0.04523;AN=686;BVAR;BaseQRankSum=7.969;CI95=0.0354,0.05752;DEL;DP=16632;DP4=1942,1815,17,21;Dels=0.03;FQ=999;FR;FS=0.531;HOMA=1;HOMR=998;HP=2;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=0.0587;MQ=83.38;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-7.201;NF;NR;NS=1020;PP;PV4=0.42,0.00017,4.5e-12,1;RA=4620;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.007;SC=CCTCTCAGCTCTGACTGAGTC;SRB=0.50043;SRF=2312;SRP=3.0178;SRR=2308;TC;TR=8;TU=ACTG;VQSLOD=9.9778;dbSNP=130;set=Intersection;sumGLbyD=36.45
+20     36136198        .       GTGTC   G       2078.76 PASS    AA=35;AB=0.54167;ABA=33;ABP=4.096;ABR=39;AC=17;AF=0.01384;AN=1228;BL=1212;BR=1523;BVAR;BaseQRankSum=6.900;DEL;DP=22483;DP4=1696,2291,9,16;Dels=0.01;EL=9;EPP=20.94;ER=26;FQ=999;FR;FS=3.023;HETAR=13;HOMA=1;HOMR=1061;HP=1;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=0.1113;LEN=4;LRB=0.11371;LRBP=79.803;MQ=93.98;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0003;MQM=83.686;MQRankSum=-1.683;NF;NR;NS=1075;PP;PV4=0.55,1,0.0083,1;RA=5771;RL=19;RPP=3.5687;RR=16;RUN=1;ReadPosRankSum=0.618;SAB=0.37143;SAF=13;SAP=8.0357;SAR=22;SC=TATCATTTTAGTGTCTGTCTG;SRB=0.44966;SRF=2595;SRP=130.03;SRR=3176;TC;TR=11;TU=CTGT;VQSLOD=10.1935;set=Intersection;sumGLbyD=31.66
+20     36250522        .       CA      C       37933   PASS    AA=51;AB=0.95582;ABA=44;ABP=1800.5;ABR=952;AC=23;AF=0.01885;AN=1220;BL=691;BR=3464;BVAR;BaseQRankSum=-2.418;DEL;DP=11998;Dels=0.00;EL=18;EPP=12.59;ER=33;FS=2.307;HETAR=348;HOMA=534;HOMR=164;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0763;LEN=1;LRB=0.66739;LRBP=4021.7;MQ0=2;MQ0Fraction=0.0006;MQM=53.647;MQRankSum=1.083;NS=1047;RA=1663;RL=2;RPP=97.065;RR=49;RUN=1;ReadPosRankSum=-12.726;SAB=0.68627;SAF=35;SAP=18.381;SAR=16;SRB=0.59651;SRF=992;SRP=137.56;SRR=671;VQSLOD=4.1346;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.29
+20     36285033        rs34715186      AT      A       39417   PASS    AA=530;AB=0.5406;ABA=447;ABP=16.939;ABR=526;AC=88;AF=0.0950;AN=926;BL=20722;BR=20406;BVAR;BaseQRankSum=15.611;DB;DEL;DP=36713;DP4=2551,2475,236,218;Dels=0.09;EL=241;EPP=12.45;ER=289;FQ=999;FR;FS=1.290;HETAR=141;HOMA=16;HOMR=926;HP=2;HPLen=3;HR=3;HRun=1;HU=A;INDEL;InbreedingCoeff=0.0742;LEN=1;LRB=0.0076833;LRBP=8.2825;MQ=104.81;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=84.285;MQRankSum=-0.702;NF;NR;NS=1083;PP;PV4=0.62,1,1,1;RA=6562;RL=263;RPP=3.0759;RR=267;RUN=1;ReadPosRankSum=0.090;SAB=0.55849;SAF=296;SAP=18.76;SAR=234;SC=AAAAACACAAATCAGATCGTG;SRB=0.51707;SRF=3393;SRP=19.614;SRR=3169;TC;TR=3;TU=A;VQSLOD=10.5533;dbSNP=126;set=Intersection;sumGLbyD=14.15
+20     36384872        .       CTG     C       43532.41        PASS    AC=1213;AF=0.99589;AN=1218;BaseQRankSum=0.802;DP=3208;FS=9.727;HRun=0;HaplotypeScore=46.6153;InbreedingCoeff=0.1085;MQ=58.37;MQ0=50;MQ0Fraction=0.0156;MQRankSum=-1.672;QD=13.57;ReadPosRankSum=2.063;SB=-18894.12;VQSLOD=4.7353;set=VQSR
+20     36542802        .       GTA     G       31310.15        PASS    AA=1481;AB=0.67546;ABA=1378;ABP=1138.4;ABR=2868;AC=437;AF=0.35938;AN=1216;BL=25719;BR=95500;BVAR;BaseQRankSum=9.478;DEL;DP=18068;DS;Dels=0.10;EL=889;EPP=132.34;ER=592;FS=320.726;HETAR=591;HOMA=44;HOMR=378;HRun=0;InbreedingCoeff=-0.4197;LEN=2;LRB=0.57566;LRBP=87231;MQ0Fraction=0.0091;MQM=29.319;MQRankSum=-3.409;NS=1013;RA=4037;RL=3;RPP=3193;RR=1478;RUN=1;ReadPosRankSum=-6.687;SAB=0.40041;SAF=593;SAP=130.61;SAR=888;SRB=0.39014;SRF=1575;SRP=426.21;SRR=2462;VQSLOD=-1.6586;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=5.49
+20     36985025        .       CCA     C       4.57    PASS    AC=0;AF=0.0000;AN=682;BaseQRankSum=4.199;DP=1504;FS=1.036;HRun=0;HaplotypeScore=18.5241;InbreedingCoeff=0.0460;MQ=57.04;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-1.774;ReadPosRankSum=-2.105;VQSLOD=6.7455;set=VQSR
+20     37139725        .       CAG     C       250.77  PASS    AF=0.0084;AF1=0.0139;BaseQRankSum=4.131;CI95=0.00885,0.01991;DP=7973;DP4=1808,1990,2,7;Dels=0.01;FQ=104;FR;FS=11.160;HP=3;HPLen=2;HR=1;HRun=0;HU=A;INDEL;InbreedingCoeff=-0.0001;MQ=103.71;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-3.378;NF;NR;PP;PV4=0.18,0.0011,0.041,1;ReadPosRankSum=0.605;SC=AGATGGGGAACAGAGAGCAAG;TC;TR=6;TU=AG;VQSLOD=7.0630;set=Intersection;sumGLbyD=12.13
+20     37213224        .       G       GTA     3230.05 PASS    AA=32;AB=0.50769;ABA=32;ABP=3.0437;ABR=33;AC=12;AF=0.0168;AF1=0.02635;AN=714;BL=1271;BR=1743;BVAR;BaseQRankSum=-7.288;CI95=0.02212,0.03319;DP=14304;DP4=2180,2256,13,21;Dels=0.00;EL=20;EPP=7.3532;ER=12;FQ=999;FR;FS=7.863;HETAR=9;HOMA=0;HOMR=1043;HP=1;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=T;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0410;LEN=2;LRB=0.1566;LRBP=163.52;MQ=95.56;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0005;MQM=51.562;MQRankSum=0.420;NF;NR;NS=1052;PP;PV4=0.23,1,0.03,0.33;RA=5138;RL=11;RPP=9.7962;RR=21;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.122;SAB=0.28125;SAF=9;SAP=16.311;SAR=23;SC=TTTGCATCCAGTAGCACCACT;SRB=0.42293;SRF=2173;SRP=268.11;SRR=2965;TC;TR=1;TU=T;VQSLOD=9.7315;set=Intersection;sumGLbyD=36.69
+20     37282014        .       ATGG    A       2518.52 PASS    AF=0.03519;BaseQRankSum=11.994;DP=24592;DP4=415,3804,8,49;DS;Dels=0.01;FQ=999;FR;FS=2.049;HP=1;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=0.1028;MQ=51.01;MQ0Fraction=0.0139;MQRankSum=-5.912;NF;NR;PP;PV4=0.27,1,0.22,0.015;ReadPosRankSum=1.781;SC=GGTGGTGATGATGGTGGTGGT;TC;TR=17;TU=GGT;VQSLOD=2.1183;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=9.05
+20     37532218        .       GTCCGTCCA       ATCCGTCCA,G     76120.88        PASS    AC=998;AF=0.92924;AN=1074;BaseQRankSum=-2.877;DP=3087;FR;FS=9.889;HP=2;HPLen=2;HR=1;HRun=0;HU=T;HaplotypeScore=71.6244;InbreedingCoeff=-0.0027;MQ=52.68;MQ0=543;MQ0Fraction=0.1759;MQRankSum=-1.750;NF;NR;PP;QD=24.98;ReadPosRankSum=-0.850;SB=-36635.43;SC=CCGTCCGTCCGTCCGTCCATC;TC;TR=19;TU=CCGT;VQSLOD=5.3068;set=Intersection
+20     37712193        .       AAG     A       2670.33 PASS    AA=106;AB=0.62821;ABA=87;ABP=36.418;ABR=147;AC=53;AF=0.0759;AN=698;BL=4672;BR=4303;BVAR;BaseQRankSum=13.696;DEL;DP=15155;DP4=1340,1852,32,52;Dels=0.06;EL=57;EPP=4.3214;ER=49;FR;FS=0.824;HETAR=43;HOMA=7;HOMR=982;HP=1;HPLen=2;HR=2;HRun=0;HU=A;INDEL;InbreedingCoeff=0.0861;LEN=2;LRB=0.041114;LRBP=35.954;MQ=86.12;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=54.236;MQRankSum=-5.745;NF;NR;NS=1034;PP;PV4=0.5,7.3e-26,1.1e-10,1;RA=4423;RL=58;RPP=5.0589;RR=48;RUN=1;ReadPosRankSum=2.617;SAB=0.38679;SAF=41;SAP=14.81;SAR=65;SC=GAAAATTCTGAAGAGAGTCAG;SRB=0.43093;SRF=1906;SRP=186.29;SRR=2517;TC;TR=6;TU=AG;VQSLOD=9.8131;set=Intersection;sumGLbyD=14.20
+20     37739002        .       T       TCA     1395.38 PASS    AA=16;AB=0.48387;ABA=16;ABP=3.0803;ABR=15;AC=11;AF=0.00950;AN=1158;BL=504;BR=630;BVAR;BaseQRankSum=-3.257;DP=13617;DP4=1660,883,7,5;Dels=0.00;EL=7;EPP=3.5532;ER=9;FR;FS=1.114;HETAR=9;HOMA=0;HOMR=991;HP=1;HPLen=2;HR=2;HRun=0;HU=T;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0527;LEN=2;LRB=0.11111;LRBP=33.411;MQ=88.41;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=83.75;MQRankSum=1.713;NF;NR;NS=1000;PP;PV4=0.76,1,1,0.5;RA=3257;RL=6;RPP=5.1818;RR=10;RUN=1;ReadPosRankSum=1.190;SAB=0.6875;SAF=11;SAP=7.8961;SAR=5;SC=CCTTTTTTGTTCATTTCTGCA;SRB=0.68806;SRF=2241;SRP=1003.5;SRR=1016;TC;TR=2;TU=T;VQSLOD=10.2220;set=Intersection;sumGLbyD=41.32
+20     38122459        .       T       TG,TGG  1346.40 PASS    ABR=339;AC=37,26;AF=0.02989,0.02100;BVAR;BaseQRankSum=10.222;DP=16425;FS=601.551;HOMA=0;HOMR=1008;HaplotypeScore=20.6522;INS;InbreedingCoeff=0.0829;MQ=105.78;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-4.295;NS=1079;QD=0.40;RA=6208;RUN=1;ReadPosRankSum=-14.427;SAB=1;SAR=0;SB=-368.88;SRB=0.34907;SRF=2167;SRP=1231.4;SRR=4041;VQSLOD=-3.3455;set=filterInVQSR-2of5
+20     38395256        .       TTGAG   T       633.19  PASS    AF=0.0028;BaseQRankSum=5.667;DP=3839;Dels=0.00;FR;FS=10.238;HP=2;HPLen=3;HR=3;HRun=0;HU=T;InbreedingCoeff=-0.0097;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-1.276;NF;NR;PP;ReadPosRankSum=-1.016;SC=ATGTGTTTGTTTGAGTATGTT;TC;TR=10;TU=GTTT;VQSLOD=6.4906;set=Intersection;sumGLbyD=10.83
+20     38882632        rs72004513      AGTGTGTGTGT     A,AGT,AGTGT,AGTGTGT,AGTGTGTGT,AGTGTGTGTGTGT     12304.47        PASS    AC=57,24,51,78,89,186;AF=0.04664,0.01964,0.04173,0.06383,0.07283,0.15221;AN=1222;BVAR;BaseQRankSum=3.183;DB;DEL;DP=49261;DP4=144,106,104,101;Dels=0.05;FQ=999;FR;FS=5.209;HP=1;HPLen=2;HR=2;HRun=0;HU=A;INDEL;InbreedingCoeff=0.9090;MQ=87.48;MQ0Fraction=0.0071;MQRankSum=-0.897;NF;NR;PP;PV4=0.16,1,0.19,1;RUN=1;ReadPosRankSum=3.551;SC=TAACTCCTCAAGTGTGTGTGT;TC;TR=47;TU=GT;VQSLOD=9.9069;set=Intersection;sumGLbyD=5.30
+20     39345038        .       CTGAACCATAATGTG C,CCCATAATGTG   60744.52        PASS    AA=23;AB=0.67143;ABA=23;ABP=20.878;ABR=47;AC=232,2;AF=0.19366,0.00167;AN=1198;BL=1607;BR=1843;BVAR;BaseQRankSum=30.955;DEL;DP=31490;DP4=1729,2100,265,278;Dels=0.13;EL=6;EPP=14.434;ER=17;FQ=999;FR;FS=1.767;HETAR=18;HOMA=0;HOMR=1015;HP=1;HPLen=2;HR=2;HRun=0;HU=C;INDEL;InbreedingCoeff=0.1991;LEN=14;LRB=0.068406;LRBP=38.066;MQ=104.60;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=189.83;MQRankSum=-16.579;NF;NR;NS=1033;PP;PV4=0.12,1,5.5e-137,1;RA=5286;RL=14;RPP=5.3706;RR=9;RUN=1;ReadPosRankSum=4.323;SAB=0.56522;SAF=13;SAP=3.86;SAR=10;SC=TGGGCTGGACCTGAACCATAA;SRB=0.46311;SRF=2448;SRP=65.493;SRR=2838;TC;TR=2;TU=C;VQSLOD=6.2643;dbSNP=130;set=Intersection;sumGLbyD=65.43
+20     39418008        .       AG      A       46796   PASS    AA=113;AB=0.9511;ABA=80;ABP=2894.6;ABR=1556;AC=30;AF=0.02412;AN=1244;BL=638;BR=6936;BVAR;BaseQRankSum=7.280;DEL;DP=14307;Dels=0.00;EL=50;EPP=6.2579;ER=63;FR;FS=5.707;HETAR=473;HOMA=361;HOMR=246;HP=3;HR=3;HRun=3;HU=G;InbreedingCoeff=0.0272;LEN=1;LRB=0.83153;LRBP=11375;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=62.398;MQRankSum=3.530;NF;NR;NS=1089;PP;RA=3000;RL=3;RPP=223.02;RR=110;RUN=1;ReadPosRankSum=-18.601;SAB=0.58407;SAF=66;SAP=9.9475;SAR=47;SC=ACTGGGGGAAAGGGATTCTAG;SRB=0.494;SRF=1482;SRP=3.9484;SRR=1518;TC;TR=3;TU=G;VQSLOD=4.5834;set=Intersection;sumGLbyD=3.06
+20     39876961        .       GT      G,GTT,GTTT      2302.10 PASS    ABR=496;AC=45,51,45;AF=0.03664,0.04153,0.03664;AN=1228;BVAR;BaseQRankSum=4.462;DP=37649;DP4=1457,1975,57,59;Dels=0.02;FR;FS=9.938;HOMA=0;HOMR=978;HP=10;HPLen=10;HR=10;HRun=10;HU=T;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.2583;MQ=97.28;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=0.246;NF;NR;NS=1063;PP;PV4=0.15,1,1.9e-09,0.016;RA=5185;RUN=1;ReadPosRankSum=-4.954;SC=AGTTTCTCCGGTTTTTTTTTT;SRB=0.47464;SRF=2461;SRP=31.978;SRR=2724;TC;TR=10;TU=T;VQSLOD=4.9752;set=Intersection;sumGLbyD=4.39
+20     41013333        .       TC      T       20681   PASS    AA=137;AB=0.89211;ABA=134;ABP=1661.6;ABR=1108;AC=68;AF=0.05601;AN=1214;BL=1091;BR=8981;BVAR;BaseQRankSum=1.354;DEL;DP=12998;Dels=0.01;EL=57;EPP=11.395;ER=80;FS=0.758;HETAR=359;HOMA=100;HOMR=610;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0104;LEN=1;LRB=0.78336;LRBP=13424;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0003;MQM=67.745;MQRankSum=2.563;NS=1072;RA=4447;RL=5;RPP=258.66;RR=132;RUN=1;ReadPosRankSum=-14.092;SAB=0.59124;SAF=81;SAP=12.917;SAR=56;SRB=0.54194;SRF=2410;SRP=70.947;SRR=2037;VQSLOD=3.7531;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=4.14
+20     41453533        rs112736557     T       TA      1734.60 PASS    AA=44;AB=0.58025;ABA=34;ABP=7.5409;ABR=47;AC=23;AF=0.0345;AN=666;BL=2061;BR=2408;BVAR;BaseQRankSum=5.768;DB;DP=7437;Dels=0.00;EL=25;EPP=4.787;ER=19;FR;FS=3.680;HETAR=17;HOMA=5;HOMR=975;HP=7;HPLen=6;HR=6;HRun=6;HU=A;INS;InbreedingCoeff=0.1712;LEN=1;LRB=0.077646;LRBP=61.517;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=75.614;MQRankSum=-4.976;NF;NR;NS=997;PP;RA=4229;RL=21;RPP=3.2077;RR=23;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.039;SAB=0.5;SAF=22;SAP=3.0103;SAR=22;SC=CCTTTCTCCATAAAAAAGCTT;SRB=0.46299;SRF=1958;SRP=53.315;SRR=2271;TC;TR=6;TU=A;VQSLOD=7.8972;set=Intersection;sumGLbyD=13.16
+20     41659532        .       GC      G       40544   PASS    AA=42;AB=0.97149;ABA=39;ABP=2644.5;ABR=1329;AC=15;AF=0.0209;AN=716;BL=2531;BR=135;BVAR;BaseQRankSum=-2.537;DEL;DP=12219;Dels=0.00;EL=25;EPP=6.3192;ER=17;FS=2.656;HETAR=374;HOMA=155;HOMR=551;HRun=1;InbreedingCoeff=-0.0270;LEN=1;LRB=0.89872;LRBP=4678.9;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=103.31;MQRankSum=2.828;NS=1088;RA=4736;RL=41;RPP=85.733;RR=1;RUN=1;ReadPosRankSum=-9.702;SAB=0.57143;SAF=24;SAP=4.8716;SAR=18;SRB=0.5625;SRF=2664;SRP=163.7;SRR=2072;VQSLOD=4.3267;set=Intersection;sumGLbyD=3.22
+20     41687456        .       A       AT      19682   PASS    AA=446;AB=0.61202;ABA=426;ABP=122.69;ABR=672;AC=162;AF=0.13214;AN=1226;BL=15293;BR=20484;BVAR;BaseQRankSum=2.364;DP=29324;DP4=1993,1785,261,252;Dels=0.01;EL=214;EPP=4.5878;ER=232;FQ=999;FR;FS=1.923;HETAR=170;HOMA=7;HOMR=897;HP=11;HPLen=9;HR=9;HRun=9;HU=T;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0769;LEN=1;LRB=0.14509;LRBP=1638.5;MQ=91.55;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=57.168;MQRankSum=-0.764;NF;NR;NS=1074;PP;PV4=0.45,1,3.5e-08,1;RA=5437;RL=179;RPP=40.714;RR=267;RUN=1;ReadPosRankSum=0.356;SAB=0.51794;SAF=231;SAP=4.2567;SAR=215;SC=AGAAAACCTTATTTTTTTTTC;SRB=0.51094;SRF=2778;SRP=8.666;SRR=2659;TC;TR=9;TU=T;VQSLOD=9.6786;set=Intersection;sumGLbyD=10.93
+20     41845580        .       GA      G       49310   PASS    AA=83;AB=0.95258;ABA=69;ABP=2591.6;ABR=1386;AC=46;AF=0.03740;AN=1230;BL=1320;BR=5150;BVAR;BaseQRankSum=-1.121;DEL;DP=13336;Dels=0.00;EL=36;EPP=6.1759;ER=47;FR;FS=0.372;HETAR=442;HOMA=341;HOMR=295;HP=2;HR=3;HRun=1;HU=G;InbreedingCoeff=0.0238;LEN=1;LRB=0.59196;LRBP=4926.2;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=89.048;MQRankSum=0.897;NF;NR;NS=1080;PP;RA=3006;RL=5;RPP=142.43;RR=78;RUN=1;ReadPosRankSum=-15.412;SAB=0.55422;SAF=46;SAP=5.1294;SAR=37;SC=CCAGCTGTGGGAGAGAAACAT;SRB=0.47971;SRF=1442;SRP=13.762;SRR=1564;TC;TR=6;TU=AG;VQSLOD=4.4669;set=Intersection;sumGLbyD=3.65
+20     42209428        .       GC      G       13163   PASS    AA=89;AB=0.86677;ABA=83;ABP=730.96;ABR=540;AC=39;AF=0.03218;AN=1212;BL=950;BR=5334;BVAR;BaseQRankSum=-10.119;DEL;DP=10692;Dels=0.01;EL=48;EPP=4.2058;ER=41;FS=0.000;HETAR=259;HOMA=727;HOMR=54;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0448;LEN=1;LRB=0.69764;LRBP=6644.4;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=126.55;MQRankSum=4.223;NS=1040;RA=723;RL=12;RPP=106.09;RR=77;RUN=1;ReadPosRankSum=-17.362;SAB=0.39326;SAF=35;SAP=11.818;SAR=54;SRB=0.37898;SRF=274;SRP=94.99;SRR=449;VQSLOD=3.7157;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.48
+20     42281109        .       T       TAG     2321.12 PASS    AC=181;AF=0.3740;AN=484;BaseQRankSum=8.977;DP=435;FS=17.001;HRun=0;HaplotypeScore=14.6734;InbreedingCoeff=0.2340;MQ=53.88;MQ0=47;MQ0Fraction=0.1080;MQRankSum=0.762;QD=12.41;ReadPosRankSum=3.399;SB=-1299.73;VQSLOD=4.8926;set=VQSR
+20     42436117        .       TC      T       38933   PASS    AA=18;AB=0.98435;ABA=17;ABP=2215.9;ABR=1069;AC=15;AF=0.01223;AN=1226;BL=498;BR=428;BVAR;BaseQRankSum=-7.224;DEL;DP=12436;Dels=0.00;EL=1;EPP=33.893;ER=17;FS=2.469;HETAR=303;HOMA=614;HOMR=123;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0439;LEN=1;LRB=0.075594;LRBP=14.501;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=98.611;MQRankSum=1.086;NS=1075;RA=1656;RL=10;RPP=3.4928;RR=8;RUN=1;ReadPosRankSum=-17.765;SAB=0.5;SAF=9;SAP=3.0103;SAR=9;SRB=0.49879;SRF=826;SRP=3.0313;SRR=830;VQSLOD=4.0821;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.04
+20     42682214        .       C       A,CAT   3904.51 PASS    AA=24;AB=0.6383;ABA=17;ABP=10.818;ABR=30;AC=0;AF=0.0000;AN=636;BL=1119;BR=949;BVAR;BaseQRankSum=1.426;DP=6509;Dels=0.00;EL=9;EPP=6.2675;ER=15;FR;HETAR=12;HOMA=3;HOMR=876;HP=2;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=A;INS;InbreedingCoeff=0.0006;LEN=2;LRB=0.082205;LRBP=33.356;MQ0Fraction=0.0046;MQM=40.792;MQRankSum=-0.296;NF;NR;NS=891;PP;QD=32.81;RA=2679;RL=15;RPP=6.2675;RR=9;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.806;SAB=0.75;SAF=18;SAP=16.039;SAR=6;SB=-924.23;SC=TATACACACACATATATATAC;SRB=0.66293;SRF=1776;SRP=620.76;SRR=903;TC;TR=9;TU=AC;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=32.75
+20     42973456        .       CA      C,CAA,CAAA      2675    PASS    AA=90;AB=0.79177;ABA=86;ABP=308.39;ABR=327;AC=77,61,39;AF=0.06492,0.05143,0.03288;AN=1186;BL=2983;BR=4446;BVAR;BaseQRankSum=2.422;DP=9416;Dels=0.03;EL=39;EPP=6.4847;ER=51;FR;FS=31.555;HETAR=75;HOMA=1;HOMR=888;HP=11;HR=11;HRun=11;HU=A;INS;InbreedingCoeff=0.2696;LEN=1;LRB=0.19693;LRBP=628.63;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=55.567;MQRankSum=1.777;NF;NR;NS=964;PP;RA=3601;RL=37;RPP=9.1869;RR=53;RUN=1;ReadPosRankSum=-4.991;SAB=0.55556;SAF=50;SAP=5.423;SAR=40;SC=TAGTGACTGTCAAAAAAAAAA;SRB=0.60622;SRF=2183;SRP=355.91;SRR=1418;TC;TR=11;TU=A;VQSLOD=1.0763;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=4.05
+20     43091870        .       TC      T       2455.60 PASS    AA=120;AB=0.10619;ABA=101;ABP=155.22;ABR=12;AC=42;AF=0.03825;AN=1098;BL=573;BR=8744;BVAR;BaseQRankSum=-13.513;DEL;DP=9139;Dels=0.00;EL=64;EPP=4.1684;ER=56;FS=9.856;HETAR=118;HOMA=820;HOMR=0;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0833;LEN=1;LRB=0.877;LRBP=15564;MQ0Fraction=0.0017;MQM=45.1;MQRankSum=2.266;NS=938;RA=24;RL=1;RPP=254.97;RR=119;RUN=1;ReadPosRankSum=-15.803;SAB=0.475;SAF=57;SAP=3.6617;SAR=63;SRB=0.54167;SRF=13;SRP=3.3722;SRR=11;VQSLOD=3.9930;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.09
+20     43233648        rs74585029      GA      G,GAA   1504.40 PASS    AA=113;AB=0.78652;ABA=95;ABP=320.31;ABR=350;AC=41,65;AF=0.03394,0.05381;AF1=0.0115;AN=1208;BL=4677;BR=5548;BVAR;BaseQRankSum=6.744;CI95=0.004274,0.01852;DB;DEL;DP=13996;DP4=1736,1549,15,17;Dels=0.03;EL=69;EPP=15.021;ER=44;FQ=14;FR;FS=12.174;HETAR=119;HOMA=15;HOMR=892;HP=11;HPLen=10;HR=10;HRun=10;HU=A;INDEL;InbreedingCoeff=0.2359;LEN=1;LRB=0.085183;LRBP=164.12;MQ=89.12;MQ0Fraction=0.0000;MQM=69.867;MQRankSum=2.513;NF;NR;NS=1027;PP;PV4=0.59,1,0.065,0.33;RA=3845;RL=46;RPP=11.485;RR=67;RUN=1;ReadPosRankSum=-4.957;SAB=0.33628;SAF=38;SAP=29.318;SAR=75;SC=AAAACAGCCAGAAAAAAAAAA;SRB=0.43667;SRF=1679;SRP=136.95;SRR=2166;TC;TR=10;TU=A;VQSLOD=4.5121;set=Intersection;sumGLbyD=8.22
+20     43246548        .       AC      A,CC    41579.13        PASS    AA=382;AB=0.72402;ABA=316;ABP=502.11;ABR=829;AC=1197;AF=0.99254;AN=1206;BL=9889;BR=14293;BVAR;BaseQRankSum=1.373;DEL;DP=10477;DS;Dels=0.05;EL=243;EPP=64.494;ER=139;FS=29.162;HETAR=291;HOMA=85;HOMR=624;HPLen=10;InbreedingCoeff=0.1392;LEN=1;LRB=0.18212;LRBP=1744.6;MQ0Fraction=0.0024;MQM=48.471;MQRankSum=5.726;NS=1001;RA=3138;RL=174;RPP=9.5816;RR=208;RUN=1;ReadPosRankSum=5.755;SAB=0.79843;SAF=305;SAP=298.51;SAR=77;SRB=0.70363;SRF=2208;SRP=1133.2;SRR=930;VQSLOD=5.6318;set=Intersection;sumGLbyD=5.22
+20     43258646        .       T       TT      1107.17 PASS    AC=97;AF=0.08420;AN=1152;BaseQRankSum=4.525;DP=2345;FS=19.308;HRun=9;HaplotypeScore=13.6276;InbreedingCoeff=0.1299;MQ=76.70;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=1.395;QD=2.67;ReadPosRankSum=-4.696;SB=-899.41;VQSLOD=5.4523;set=VQSR
+20     43718299        .       ATTACT  A       5497.06 PASS    AA=56;AB=0.51818;ABA=53;ABP=3.3262;ABR=57;AC=18;AF=0.0251;AF1=0.03729;AN=718;BL=2321;BR=2591;BVAR;BaseQRankSum=11.142;CI95=0.03319,0.04425;DEL;DP=17576;DP4=2460,2692,31,22;Dels=0.02;EL=28;EPP=3.0103;ER=28;FQ=999;FR;FS=9.689;HETAR=15;HOMA=1;HOMR=1068;HP=2;HPLen=2;HR=2;HRun=0;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=0.0448;LEN=5;LRB=0.054967;LRBP=35.238;MQ=96.55;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=50.286;MQRankSum=-5.149;NF;NR;NS=1084;PP;PV4=0.13,1,1.2e-12,1;RA=6745;RL=28;RPP=3.0103;RR=28;RUN=1;ReadPosRankSum=0.828;SAB=0.5;SAF=28;SAP=3.0103;SAR=28;SC=ATGACAGTGGATTACTTTAGT;SRB=0.46835;SRF=3159;SRP=61.709;SRR=3586;TC;TR=2;TU=T;VQSLOD=7.8832;set=Intersection;sumGLbyD=46.60
+20     43981749        .       A       AAAAAAC,AC      20899.71        PASS    ABR=192;AC=91,0;AF=0.1285,0.0000;AN=708;BVAR;BaseQRankSum=7.858;DP=23372;DP4=1554,1457,55,42;Dels=0.00;FR;FS=0.000;HOMA=4;HOMR=995;HP=6;HPLen=7;HR=7;HRun=0;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.2109;MQ=95.59;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-12.081;NF;NR;NS=1051;PP;PV4=0.35,1,8.9e-73,1;RA=5027;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.359;SC=TACACTAGCAAAAAAACAAAA;SRB=0.48518;SRF=2439;SRP=12.6;SRR=2588;TC;TR=7;TU=A;VQSLOD=8.0916;set=Intersection;sumGLbyD=54.33
+20     43999274        .       TCAAA   T       2948.85 PASS    AA=59;AB=0.59441;ABA=58;ABP=14.08;ABR=85;AC=20;AF=0.0290;AF1=0.04249;AN=690;BL=2277;BR=2436;BVAR;BaseQRankSum=9.320;CI95=0.0354,0.05088;DEL;DP=14599;DP4=2052,2303,21,22;Dels=0.03;EL=32;EPP=3.9304;ER=27;FQ=999;FR;FS=0.000;HETAR=21;HOMA=0;HOMR=1043;HP=2;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=C;INDEL;InbreedingCoeff=-0.0037;LEN=4;LRB=0.033736;LRBP=14.658;MQ=90.05;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=75.339;MQRankSum=-1.294;NF;NR;NS=1064;PP;PV4=0.88,1,0.0026,1;RA=5732;RL=27;RPP=3.9304;RR=32;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.915;SAB=0.47458;SAF=28;SAP=3.3415;SAR=31;SC=GGTACACAGCTCAAACAGTCT;SRB=0.4836;SRF=2772;SRP=16.4;SRR=2960;TC;TR=1;TU=C;VQSLOD=9.8086;set=Intersection;sumGLbyD=27.09
+20     44098622        .       C       CG      1092.40 PASS    AA=129;AB=0.77301;ABA=74;ABP=214.06;ABR=252;AC=45;AF=0.0455;AN=988;BL=6586;BR=3029;BVAR;BaseQRankSum=2.802;DP=5177;Dels=0.00;EL=122;EPP=225.63;ER=7;FR;FS=355.273;HETAR=66;HOMA=11;HOMR=734;HP=6;HR=4;HRun=4;HU=G;INS;InbreedingCoeff=0.1759;LEN=1;LRB=0.36994;LRBP=2860.4;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=52.395;MQRankSum=1.946;NF;NR;NS=811;PP;RA=1981;RL=121;RPP=217.95;RR=8;RUN=1;ReadPosRankSum=-6.413;SAB=0.99225;SAF=128;SAP=274.51;SAR=1;SC=GCGGAAGTGGCGGGGACCCTT;SRB=0.41242;SRF=817;SRP=135;SRR=1164;TC;TR=4;TU=G;VQSLOD=-2.2690;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=4.04
+20     44327637        .       A       AG,AGGGGGG      14351.23        PASS    AC=9,211;AF=0.0103,0.2409;AN=876;BaseQRankSum=15.517;DP=1704;FS=6.768;HaplotypeScore=31.5906;InbreedingCoeff=0.1538;MQ=54.64;MQ0=4;MQ0Fraction=0.0023;MQRankSum=-12.691;QD=20.83;ReadPosRankSum=-3.583;SB=-6278.99;VQSLOD=5.1556;set=VQSR
+20     45202636        .       GA      G       13269   PASS    AA=25;AB=0.96162;ABA=18;ABP=871.09;ABR=451;AC=24;AF=0.02013;AN=1192;BL=567;BR=1728;BVAR;BaseQRankSum=-5.361;DEL;DP=10873;Dels=0.00;EL=10;EPP=5.1818;ER=15;FS=0.928;HETAR=169;HOMA=831;HOMR=45;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0999;LEN=1;LRB=0.50588;LRBP=1278.4;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=170.56;MQRankSum=0.161;NS=1049;RA=632;RL=2;RPP=41.315;RR=23;RUN=1;ReadPosRankSum=-14.760;SAB=0.68;SAF=17;SAP=10.046;SAR=8;SRB=0.51424;SRF=325;SRP=4.1235;SRR=307;VQSLOD=3.9290;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.90
+20     45417828        .       TGAGC   T,TGC   4672.90 PASS    ABR=317;AC=69,104;AF=0.05712,0.08609;BVAR;BaseQRankSum=18.527;DEL;DP=11835;DS;FS=184.873;HOMA=48;HOMR=575;HaplotypeScore=65.5875;InbreedingCoeff=0.0599;MQ=29.78;MQ0=2988;MQ0Fraction=0.3629;MQRankSum=5.052;NS=713;QD=1.11;RA=1581;RUN=1;ReadPosRankSum=6.574;SB=-2116.87;SRB=0.47502;SRF=751;SRP=11.582;SRR=830;VQSLOD=0.0651;set=filterInVQSR-2of5
+20     45525657        rs66759083      TA      AA,T    49315   PASS    AA=2361;AB=0.45241;ABA=1398;ABP=53.235;ABR=1155;AC=20;AF=0.01701;AN=1176;BL=94913;BR=100886;BVAR;BaseQRankSum=0.740;DB;DEL;DP=30636;DP4=1258,881,1206,999;Dels=0.48;EL=1133;EPP=11.311;ER=1228;FQ=999;FR;FS=7.072;HETAR=503;HOMA=310;HOMR=218;HP=6;HPLen=7;HR=7;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=0.2271;LEN=1;LRB=0.030506;LRBP=398.68;MQ=102.24;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=75.359;MQRankSum=0.148;NF;NR;NS=1031;PP;PV4=0.0064,0,4.6e-23,0.47;RA=2042;RL=1183;RPP=3.0333;RR=1178;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.999;SAB=0.52139;SAF=1231;SAP=12.392;SAR=1130;SC=AGGATTTTTTTAAAAAGTTTT;SRB=0.55093;SRF=1125;SRP=49.017;SRR=917;TC;TR=7;TU=T;VQSLOD=7.1651;dbSNP=114;set=Intersection;sumGLbyD=18.51
+20     45783456        .       T       TG      2355.68 PASS    AA=64;AB=0.78521;ABA=61;ABP=203.67;ABR=223;AC=15;AF=0.0165;AN=910;BL=815;BR=5486;BVAR;BaseQRankSum=8.593;DP=10348;Dels=0.00;EL=48;EPP=37.754;ER=16;FS=77.861;HETAR=56;HOMA=1;HOMR=970;HRun=1;INS;InbreedingCoeff=-0.0549;LEN=1;LRB=0.74131;LRBP=7522.1;MQ0Fraction=0.0122;MQM=44.562;MQRankSum=-1.258;NS=1027;RA=4750;RL=0;RPP=141.98;RR=64;RUN=1;ReadPosRankSum=-7.047;SAB=0.25;SAF=16;SAP=37.754;SAR=48;SRB=0.6;SRF=2850;SRP=415.59;SRR=1900;VQSLOD=1.3146;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=6.03
+20     46384744        .       CT      C       17791   PASS    AA=51;AB=0.94826;ABA=49;ABP=1655.8;ABR=898;AC=23;AF=0.01867;AN=1232;BL=120;BR=3678;BVAR;BaseQRankSum=-0.185;DEL;DP=13879;Dels=0.00;EL=23;EPP=4.0747;ER=28;FS=2.864;HETAR=262;HOMA=78;HOMR=722;HRun=2;InbreedingCoeff=0.0193;LEN=1;LRB=0.93681;LRBP=7240.9;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=66.667;MQRankSum=1.031;NS=1079;RA=5295;RL=0;RPP=113.76;RR=51;RUN=1;ReadPosRankSum=-12.934;SAB=0.54902;SAF=28;SAP=4.0747;SAR=23;SRB=0.54674;SRF=2895;SRP=103.49;SRR=2400;VQSLOD=3.0419;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.47
+20     46517110        .       C       CT      868.55  PASS    AC=15;AF=0.0218;AN=688;BaseQRankSum=8.522;DP=1752;FS=6.570;HRun=0;HaplotypeScore=14.9548;InbreedingCoeff=0.0452;MQ=77.73;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=3.874;QD=10.98;ReadPosRankSum=-0.733;SB=-396.78;VQSLOD=6.7740;set=VQSR
+20     46629361        .       TTTCTTTC        T,TTTTC 13000.91        PASS    AC=188,107;AF=0.2212,0.1259;AN=850;BaseQRankSum=7.214;DP=1846;FS=14.502;HaplotypeScore=40.8481;InbreedingCoeff=0.3210;MQ=50.74;MQ0=79;MQ0Fraction=0.0428;MQRankSum=-6.348;QD=13.59;ReadPosRankSum=3.943;SB=-3581.20;VQSLOD=5.9412;set=VQSR
+20     46951099        .       G       GT      1662.30 PASS    AA=55;AB=0.7713;ABA=51;ABP=145.58;ABR=172;AC=47;AF=0.03923;AN=1198;BL=3288;BR=2434;BVAR;BaseQRankSum=-4.014;DP=27423;DP4=1483,1590,58,42;Dels=0.01;EL=21;EPP=9.6826;ER=34;FR;FS=9.565;HETAR=48;HOMA=0;HOMR=913;HP=16;HPLen=10;HR=10;HRun=10;HU=T;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0952;LEN=1;LRB=0.14925;LRBP=279.78;MQ=70.36;MQ0Fraction=0.0124;MQM=52.545;MQRankSum=0.717;NF;NR;NS=961;PP;PV4=0.067,1,1,0.17;RA=3035;RL=38;RPP=20.422;RR=17;RUN=1;ReadPosRankSum=-3.014;SAB=0.47273;SAF=26;SAP=3.3656;SAR=29;SC=TTTGTTTTTTGTTTTTTTTTT;SRB=0.36013;SRF=1093;SRP=518.73;SRR=1942;TC;TR=10;TU=T;VQSLOD=5.4779;set=Intersection;sumGLbyD=3.49
+20     47201076        rs58052846      C       CT      982.16  PASS    AC=50;AF=0.0551;AN=908;BaseQRankSum=12.598;DB;DP=2449;FS=35.648;HRun=0;HaplotypeScore=29.4602;InbreedingCoeff=-0.0542;MQ=63.54;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=2.196;QD=3.16;ReadPosRankSum=-13.833;SB=-488.19;VQSLOD=6.0429;set=VQSR
+20     47965974        rs60011158      G       GA      999     PASS    AA=21;AB=0.57143;ABA=21;ABP=5.1818;ABR=28;AC=7;AF=0.0101;AF1=0.02061;AN=690;BL=1043;BR=577;BVAR;BaseQRankSum=-3.087;CI95=0.01549,0.02655;DB;DP=14578;DP4=1554,3055,6,17;Dels=0.00;EL=11;EPP=3.1137;ER=10;FQ=999;FR;FS=5.982;HETAR=7;HOMA=0;HOMR=1041;HP=2;HPLen=1;HR=1;HRun=1;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0356;LEN=1;LRB=0.28765;LRBP=294.09;MQ=80.17;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=64.19;MQRankSum=2.137;NF;NR;NS=1048;PP;PV4=0.51,1,1,1;RA=5224;RL=16;RPP=15.522;RR=5;RUN=1;ReadPosRankSum=0.236;SAB=0.38095;SAF=8;SAP=5.5954;SAR=13;SC=TTCATGTACAGAGCTGCTGTG;SRB=0.31183;SRF=1629;SRP=1609.6;SRR=3595;TC;TR=4;TU=AG;VQSLOD=9.5466;dbSNP=129;set=Intersection;sumGLbyD=13.83
+20     48402974        rs57331436      GA      G       27741   PASS    AA=401;AB=0.5372;ABA=311;ABP=11.089;ABR=361;AC=84;AF=0.1186;AN=708;BL=16591;BR=14776;BVAR;BaseQRankSum=14.621;DB;DEL;DP=30607;DP4=1928,2310,195,225;Dels=0.11;EL=189;EPP=5.8749;ER=212;FQ=999;FR;FS=15.568;HETAR=110;HOMA=30;HOMR=923;HP=4;HPLen=3;HR=1;HRun=3;HU=A;INDEL;InbreedingCoeff=0.1263;KGPilot123;LEN=1;LRB=0.057863;LRBP=231.06;MQ=106.68;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=63.005;MQRankSum=-2.010;NF;NR;NS=1063;PP;PV4=0.72,1,0.001,1;RA=5258;RL=223;RPP=13.976;RR=178;RUN=1;ReadPosRankSum=1.337;SAB=0.37656;SAF=151;SAP=56.084;SAR=250;SC=TGCCCTCAAAGAGAAAAAGGA;SRB=0.38075;SRF=2002;SRP=652.44;SRR=3256;TC;TR=5;TU=AG;VQSLOD=8.7259;dbSNP=132;set=Intersection;sumGLbyD=15.86
+20     48519434        rs56747320      TA      T,TAA   26754   PASS    AC=91,355;AF=0.07738,0.30187;AN=1176;BVAR;BaseQRankSum=-5.499;DB;DEL;DP=24872;DP4=726,883,443,502;Dels=0.04;FR;FS=1.430;HP=12;HR=12;HRun=12;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.2576;LEN=1;MQ=71.86;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0004;MQRankSum=-0.526;NF;NR;PP;PV4=0.41,1,0.00077,1;RUN=1;ReadPosRankSum=-4.130;SC=CGTCTTAAACTAAAAAAAAAA;TC;TR=12;TU=A;VQSLOD=7.3200;set=Intersection;sumGLbyD=10.43
+20     49086519        rs111404890     CA      C,CAA   1379.10 PASS    AA=43;AB=0.672;ABA=41;ABP=35.131;ABR=84;AC=7,14;AF=0.0100,0.0201;AN=698;BL=1097;BR=2286;BVAR;BaseQRankSum=-2.656;DB;DP=9319;Dels=0.00;EL=22;EPP=3.0608;ER=21;FR;FS=1.147;HETAR=20;HOMA=0;HOMR=1029;HP=11;HPLen=8;HR=8;HRun=8;HU=A;INS;InbreedingCoeff=0.0760;LEN=1;LRB=0.35146;LRBP=910.45;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=47.674;MQRankSum=2.682;NF;NR;NS=1049;PP;RA=5237;RL=10;RPP=29.724;RR=33;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.367;SAB=0.48837;SAF=21;SAP=3.0608;SAR=22;SC=GTAAAACAAACAAAAAAAATG;SRB=0.48635;SRF=2547;SRP=11.489;SRR=2690;TC;TR=11;TU=AAAC;VQSLOD=7.3084;set=Intersection;sumGLbyD=9.84
+20     49101936        .       C       CT      404.46  PASS    AC=40;AF=0.03559;AN=1124;BaseQRankSum=0.750;DP=2162;FS=14.291;HRun=2;HaplotypeScore=30.9513;InbreedingCoeff=-0.0082;MQ=49.78;MQ0=113;MQ0Fraction=0.0523;MQRankSum=-1.289;QD=1.94;ReadPosRankSum=-2.041;SB=-385.48;VQSLOD=4.6365;set=VQSR
+20     49681276        .       TC      T       40042   PASS    AA=72;AB=0.93908;ABA=70;ABP=1927.1;ABR=1079;AC=18;AF=0.0196;AN=918;BL=514;BR=4340;BVAR;BaseQRankSum=0.869;DEL;DP=10368;Dels=0.00;EL=33;EPP=4.096;ER=39;FS=17.302;HETAR=389;HOMA=269;HOMR=405;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0626;LEN=1;LRB=0.78822;LRBP=6551.6;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=123.06;MQRankSum=-1.047;NS=1064;RA=3095;RL=3;RPP=134.38;RR=69;RUN=1;ReadPosRankSum=-10.928;SAB=0.58333;SAF=42;SAP=7.3532;SAR=30;SRB=0.57738;SRF=1787;SRP=163.99;SRR=1308;VQSLOD=2.8517;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.69
+20     49690436        .       GT      G       473.74  PASS    AF=0.0263;AF1=0.02287;BaseQRankSum=3.830;CI95=0.01327,0.03319;DP=7473;DP4=2241,1740,14,12;Dels=0.01;FQ=129;FR;FS=0.000;HP=4;HPLen=4;HR=4;HRun=4;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=0.1310;MQ=51.71;MQ0Fraction=0.0407;MQRankSum=1.792;NF;NR;PP;PV4=0.84,5.7e-10,0.22,1;ReadPosRankSum=0.973;SC=GTAGGACGGGGTTTTACCATG;TC;TR=4;TU=T;VQSLOD=7.4809;set=Intersection;sumGLbyD=10.96
+20     49731218        .       ATTTTATTTTTTATT A,ATTTTATT      8398.93 PASS    AF=0.0656,0.0156;AF1=0.0996;BaseQRankSum=13.996;CI95=0.07743,0.1239;DP=6308;DP4=951,1311,23,35;Dels=0.05;FQ=999;FR;FS=12.503;HP=7;HPLen=4;HR=4;HRun=0;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=0.1892;MQ=57.61;MQ0Fraction=0.0145;MQRankSum=-5.208;NF;NR;PP;PV4=0.79,1,6.3e-06,0.16;ReadPosRankSum=-2.239;SC=TATTTTATTTATTTTATTTTT;TC;TR=11;TU=ATTT;VQSLOD=4.3191;set=Intersection;sumGLbyD=42.27
+20     49894989        .       TA      T       172.25  PASS    AF=0.0140;BaseQRankSum=7.220;DP=3882;Dels=0.00;FS=17.217;HPLen=2;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0531;MQ0Fraction=0.0214;MQRankSum=-0.661;ReadPosRankSum=-0.592;VQSLOD=3.0905;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=6.60
+20     50010923        rs66516522      C       CT,CTGG 35851   PASS    ABR=555;AC=310,11;AF=0.26451,0.00939;BVAR;BaseQRankSum=10.662;DB;DP=8188;FR;FS=34.411;HOMA=261;HOMR=399;HP=5;HR=6;HU=C;HaplotypeScore=45.1715;INS;InbreedingCoeff=0.2090;MQ=72.80;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=9.015;NF;NR;NS=831;PP;QD=9.69;RA=1986;RUN=1;ReadPosRankSum=-24.284;SB=-6038.55;SC=TGTCTGTCCCCCCTCAGCACT;SRB=0.45972;SRF=913;SRP=31.001;SRR=1073;TC;TR=6;TU=C;VQSLOD=6.1824;set=Intersection
+20     50059710        .       C       CCA     4175.86 PASS    AA=28;AB=0.62963;ABA=20;ABP=10.892;ABR=34;AC=36;AF=0.0738;AN=488;BL=1050;BR=1273;BVAR;BaseQRankSum=3.198;DP=9138;Dels=0.00;EL=10;EPP=7.9737;ER=18;FR;FS=19.190;HETAR=10;HOMA=2;HOMR=1053;HP=6;HPLen=7;HR=7;HRun=0;HU=C;INS;InbreedingCoeff=0.1390;LEN=2;LRB=0.095997;LRBP=49.496;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=57.464;MQRankSum=-1.875;NF;NR;NS=1065;PP;RA=5745;RL=12;RPP=4.2511;RR=16;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.894;SAB=0.5;SAF=14;SAP=3.0103;SAR=14;SC=GGAGACCCCCCCTTCATCCTA;SRB=0.48129;SRF=2765;SRP=20.482;SRR=2980;TC;TR=7;TU=C;VQSLOD=5.1567;set=Intersection;sumGLbyD=11.49
+20     50228709        rs71192536      TG      T       20517   PASS    AA=924;AB=0.50203;ABA=735;ABP=3.0633;ABR=741;AC=200;AF=0.16502;AN=1212;BL=35460;BR=34197;BVAR;BaseQRankSum=13.810;DB;DEL;DP=32402;DP4=1760,2065,395,449;Dels=0.16;EL=439;EPP=7.9831;ER=485;FQ=999;FR;FS=0.558;HETAR=242;HOMA=63;HOMR=764;HP=5;HPLen=3;HR=3;HRun=3;HU=G;INDEL;InbreedingCoeff=0.1050;LEN=1;LRB=0.018132;LRBP=52.738;MQ=105.83;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=75.87;MQRankSum=3.895;NF;NR;NS=1069;PP;PV4=0.7,1.5e-173,1,1;RA=4708;RL=486;RPP=8.4249;RR=438;RUN=1;ReadPosRankSum=1.586;SAB=0.43615;SAF=403;SAP=35.733;SAR=521;SC=GTTTTCCAGGTGGGAAGACCG;SRB=0.44074;SRF=2075;SRP=146.62;SRR=2633;TC;TR=3;TU=G;VQSLOD=10.4820;dbSNP=120;set=Intersection;sumGLbyD=15.35
+20     50236115        .       AGG     A,ACGGG,AG,AGGG 7429.57 PASS    AC=192,13,221,183;AF=0.2115,0.0143,0.2434,0.2015;AN=908;BaseQRankSum=1.045;DP=1177;FS=13.479;HaplotypeScore=11.8294;InbreedingCoeff=0.7959;MQ=52.98;MQ0=6;MQ0Fraction=0.0051;MQRankSum=-1.482;QD=7.28;ReadPosRankSum=-2.380;SB=-1229.31;VQSLOD=8.3762;set=VQSR
+20     51589568        .       TAAAC   AAAAC,T 12477.52        PASS    AF=0.27949;BaseQRankSum=-28.122;DP=3777;Dels=0.00;FR;FS=31.799;HP=7;HPLen=4;HR=3;HRun=0;HU=A;InbreedingCoeff=-0.1429;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-1.196;NF;NR;PP;ReadPosRankSum=-16.483;SC=AAATTCAAAATAAACAAACAA;TC;TR=18;TU=AAAC;VQSLOD=3.9201;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=52.43
+20     51617742        .       TGC     T,TGCGC 1374.91 PASS    AF=0.06000,0.02000;BaseQRankSum=12.051;DP=6231;Dels=0.00;FS=189.609;HPLen=1;HRun=0;InbreedingCoeff=0.0862;MQ0Fraction=0.0180;MQRankSum=-2.959;ReadPosRankSum=-5.090;VQSLOD=-2.8715;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.97
+20     51770354        .       AG      A       1010.90 PASS    AA=26;AB=0.52727;ABA=26;ABP=3.3656;ABR=29;AC=7;AF=0.0097;AF1=0.01637;AN=718;BL=1034;BR=964;BVAR;BaseQRankSum=5.588;CI95=0.01327,0.02212;DEL;DP=16259;DP4=2785,2239,15,10;Dels=0.01;EL=11;EPP=4.3466;ER=15;FQ=999;FR;FS=3.367;HETAR=8;HOMA=0;HOMR=1064;HP=2;HPLen=2;HR=2;HRun=2;HU=G;INDEL;InbreedingCoeff=0.0557;LEN=1;LRB=0.035035;LRBP=8.3357;MQ=90.48;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=61.346;MQRankSum=-0.019;NF;NR;NS=1072;PP;PV4=0.69,2.1e-08,0.078,1;RA=6173;RL=13;RPP=3.0103;RR=13;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.460;SAB=0.61538;SAF=16;SAP=6.017;SAR=10;SC=GTGGTCCTGCAGGTCAATAAT;SRB=0.56342;SRF=3478;SRP=218.68;SRR=2695;TC;TR=2;TU=G;VQSLOD=10.1601;set=Intersection;sumGLbyD=14.60
+20     51848430        .       AT      A,ATT   999     PASS    AA=39;AB=0.83408;ABA=37;ABP=219.19;ABR=186;AC=14,33;AF=0.0153,0.0359;AF1=0.03062;AN=918;BL=1676;BR=1732;BVAR;BaseQRankSum=3.338;CI95=0.02212,0.03982;DP=14886;DP4=1970,1762,22,31;Dels=0.01;EL=18;EPP=3.5114;ER=21;FQ=999;FR;FS=3.004;HETAR=31;HOMA=0;HOMR=1040;HP=10;HPLen=9;HR=9;HRun=9;HU=T;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.1629;LEN=1;LRB=0.016432;LRBP=5.0085;MQ=80.05;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=56.667;MQRankSum=0.325;NF;NR;NS=1071;PP;PV4=0.13,1,0.0095,0.064;RA=5318;RL=21;RPP=3.5114;RR=18;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.493;SAB=0.46154;SAF=18;SAP=3.5114;SAR=21;SC=ACAAAACAATATTTTTTTTTC;SRB=0.4968;SRF=2642;SRP=3.4823;SRR=2676;TC;TR=9;TU=T;VQSLOD=5.7417;set=Intersection;sumGLbyD=7.57
+20     51897203        .       T       TG      8427.20 PASS    AA=237;AB=0.69846;ABA=215;ABP=246.92;ABR=498;AC=117;AF=0.1662;AN=704;BL=14961;BR=5990;BVAR;BaseQRankSum=22.203;DP=9710;Dels=0.00;EL=83;EPP=49.198;ER=154;FR;FS=9.450;HETAR=123;HOMA=9;HOMR=895;HP=5;HPLen=6;HR=6;HRun=0;HU=T;INS;InbreedingCoeff=-0.0513;LEN=1;LRB=0.42819;LRBP=8344.3;MQ0Fraction=0.0291;MQM=45.861;MQRankSum=-10.426;NF;NR;NS=1027;PP;RA=4919;RL=210;RPP=309.85;RR=27;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.843;SAB=0.29536;SAF=70;SAP=89.219;SAR=167;SC=TTTGTTTGTTTTTTGTTGTTG;SRB=0.47794;SRF=2351;SRP=23.798;SRR=2568;TC;TR=23;TU=GTTT;VQSLOD=6.2670;set=Intersection;sumGLbyD=8.99
+20     52274070        .       AAG     A       1400.37 PASS    AA=30;AB=0.74227;ABA=25;ABP=52.462;ABR=72;AC=21;AF=0.01756;AN=1196;BL=412;BR=1966;BVAR;BaseQRankSum=6.660;DEL;DP=9362;Dels=0.01;EL=16;EPP=3.2998;ER=14;FS=1.485;HETAR=18;HOMA=2;HOMR=1004;HRun=0;InbreedingCoeff=0.0317;LEN=2;LRB=0.65349;LRBP=2208.2;MQ0Fraction=0.0022;MQM=46.133;MQRankSum=-4.743;NS=1024;RA=3931;RL=2;RPP=51.941;RR=28;RUN=1;ReadPosRankSum=-4.152;SAB=0.4;SAF=12;SAP=5.6161;SAR=18;SRB=0.49784;SRF=1957;SRP=3.1699;SRR=1974;VQSLOD=5.6452;set=Intersection;sumGLbyD=11.11
+20     52351501        .       TAC     T       199.59  PASS    AC=22;AF=0.0238;AN=926;BaseQRankSum=7.874;DP=22911;DP4=2146,1691,26,22;FR;FS=2.898;HP=4;HPLen=3;HR=1;HRun=0;HU=A;HaplotypeScore=18.6111;INDEL;InbreedingCoeff=-0.0326;MQ0=2;MQ0Fraction=0.0007;MQRankSum=1.011;NF;NR;PP;PV4=0.88,0.14,0.16,0.24;QD=1.10;ReadPosRankSum=-1.053;SB=-306.09;SC=GACACACAAATACACACACAC;TC;TR=13;TU=AC;VQSLOD=4.0486;set=filterInVQSR-2of5
+20     52447173        .       CA      C       503.89  PASS    AC=23;AF=0.01891;AN=1216;BaseQRankSum=0.801;DP=3266;FS=2.606;HRun=2;HaplotypeScore=22.1543;InbreedingCoeff=-0.0097;MQ=118.02;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-1.309;QD=2.65;ReadPosRankSum=-7.872;SB=-279.27;VQSLOD=4.1900;set=VQSR
+20     52498650        .       GT      G       24069   PASS    AA=74;AB=0.90594;ABA=57;ABP=870.4;ABR=549;AC=28;AF=0.02333;AN=1200;BL=505;BR=4514;BVAR;BaseQRankSum=-3.837;DEL;DP=9798;Dels=0.01;EL=41;EPP=4.8883;ER=33;FS=4.085;HETAR=209;HOMA=663;HOMR=121;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0334;LEN=1;LRB=0.79876;LRBP=6956.6;MQ0=2;MQ0Fraction=0.0007;MQM=57.784;MQRankSum=-2.951;NS=995;RA=957;RL=8;RPP=101.72;RR=66;RUN=1;ReadPosRankSum=-14.806;SAB=0.39189;SAF=29;SAP=10.522;SAR=45;SRB=0.39916;SRF=382;SRP=87.53;SRR=575;VQSLOD=3.8710;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=2.90
+20     52823602        rs11469056      CAAA    C,CA,CAA,CAAAA,CAAAAA,CAAAAAA,CAAAAAAA,CAAAAAAAA,CAAAAAAAAA,CAAAAAAAAAA 14515.17        PASS    AC=24,83,246,109,83,19,10,16,22,59;AF=0.02128,0.07358,0.21809,0.09663,0.07358,0.01684,0.00887,0.01418,0.01950,0.05230;AN=1128;BVAR;BaseQRankSum=4.150;DB;DEL;DP=28279;FR;FS=2.021;HP=17;HR=17;HU=A;HaplotypeScore=27.8032;INS;InbreedingCoeff=0.7740;MQ=69.00;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=1.418;NF;NR;PP;QD=7.90;RUN=1;ReadPosRankSum=-3.864;SB=-3244.40;SC=GGTCCTAAGGCAAAAAAAAAA;TC;TR=17;TU=A;VQSLOD=14.1033;set=Intersection
+20     53308906        .       CT      C,CTT   2276    PASS    AA=92;AB=0.84453;ABA=81;ABP=540.17;ABR=440;AC=53,81;AF=0.04351,0.06650;AN=1218;BL=3561;BR=4796;BVAR;BaseQRankSum=3.000;DP=11804;Dels=0.02;EL=48;EPP=3.3879;ER=44;FR;FS=13.197;HETAR=69;HOMA=3;HOMR=993;HP=11;HR=10;HRun=10;HU=T;INS;InbreedingCoeff=0.2297;LEN=1;LRB=0.14778;LRBP=399.32;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0003;MQM=56.348;MQRankSum=3.154;NF;NR;NS=1065;PP;RA=5520;RL=39;RPP=7.6365;RR=53;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.140;SAB=0.57609;SAF=53;SAP=7.6365;SAR=39;SC=AATCCAAAGTCTTTTTTTTTT;SRB=0.51576;SRF=2847;SRP=14.92;SRR=2673;TC;TR=10;TU=T;VQSLOD=2.4753;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=4.42
+20     53334602        .       T       TG,TGG  905.13  PASS    ABR=325;AC=44,22;AF=0.03624,0.01812;BVAR;BaseQRankSum=-4.608;DP=15015;FR;FS=494.901;HOMA=0;HOMR=1004;HP=1;HR=1;HU=G;HaplotypeScore=20.5023;INS;InbreedingCoeff=0.0799;MQ=116.70;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=8.022;NF;NR;NS=1064;PP;QD=0.35;RA=5690;RUN=1;ReadPosRankSum=-14.522;SB=-311.57;SC=AGCCATTGGCTGTTTCACTGA;SRB=0.40738;SRF=2318;SRP=426.97;SRR=3372;TC;TR=1;TU=G;VQSLOD=-2.3042;set=filterInVQSR-2of5
+20     53729115        .       T       TG      15.48   PASS    AC=1;AF=0.0015;AN=668;BaseQRankSum=-1.001;DP=1711;FS=9.048;HRun=2;HaplotypeScore=12.4681;InbreedingCoeff=-0.0320;MQ=131.36;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=0.193;QD=4.57;ReadPosRankSum=0.407;SB=-5.35;VQSLOD=4.8071;set=VQSR
+20     53960980        .       GC      G       588.40  PASS    AA=32;AB=0.78632;ABA=25;ABP=86.324;ABR=92;AF=0.0275;AF1=0.01689;AN=690;BL=1047;BR=1108;BVAR;BaseQRankSum=3.049;CI95=0.006637,0.02876;DEL;DP=11389;DP4=1514,1481,16,12;Dels=0.02;EL=27;EPP=35.854;ER=5;FQ=17.6;FS=0.652;HETAR=27;HOMA=3;HOMR=1006;HRun=1;INDEL;InbreedingCoeff=0.0473;LEN=1;LRB=0.028306;LRBP=6.7597;MQ=106.54;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=115.53;MQRankSum=1.395;NS=1036;PV4=0.57,0.0057,0.46,0.22;RA=4207;RL=14;RPP=4.096;RR=18;RUN=1;ReadPosRankSum=-5.581;SAB=0.40625;SAF=13;SAP=5.4532;SAR=19;SRB=0.48586;SRF=2044;SRP=10.32;SRR=2163;VQSLOD=6.0155;set=Intersection;sumGLbyD=7.94
+20     54033830        .       GTATTTTAAAATCA  G       2220.86 PASS    AF=0.0113;BaseQRankSum=5.506;DP=2577;Dels=0.01;FR;FS=6.533;HP=5;HPLen=4;HR=1;HRun=0;HU=T;InbreedingCoeff=0.0032;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-2.969;NF;NR;PP;ReadPosRankSum=1.322;SC=TCAATATTTTGTATTTTAAAA;TC;TR=1;TU=T;VQSLOD=5.5145;set=Intersection;sumGLbyD=95.65
+20     54375236        .       GT      G       626.13  PASS    AA=40;AB=0.63551;ABA=39;ABP=20.078;ABR=68;AC=18;AF=0.0256;AN=702;BL=1331;BR=1743;BVAR;BaseQRankSum=9.346;DEL;DP=8568;Dels=0.02;EL=26;EPP=10.828;ER=14;FS=0.610;HETAR=21;HOMA=1;HOMR=1035;HRun=1;InbreedingCoeff=-0.0056;LEN=1;LRB=0.13403;LRBP=122.92;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=67.125;MQRankSum=-2.537;NS=1058;RA=4870;RL=17;RPP=4.9646;RR=23;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.229;SAB=0.525;SAF=21;SAP=3.2274;SAR=19;SRB=0.5271;SRF=2567;SRP=34.087;SRR=2303;VQSLOD=7.9228;set=Intersection;sumGLbyD=10.77
+20     54457331        .       G       GA      1793.40 PASS    AA=77;AB=0.66667;ABA=74;ABP=56.573;ABR=148;AC=33;AF=0.02687;AN=1228;BL=3834;BR=1154;BVAR;BaseQRankSum=10.572;DP=10230;Dels=0.00;EL=77;EPP=170.21;ER=0;FS=139.433;HETAR=44;HOMA=1;HOMR=1001;HRun=1;INS;InbreedingCoeff=0.0023;LEN=1;LRB=0.53729;LRBP=3129.8;MQ0Fraction=0.0095;MQM=4.7013;MQRankSum=-8.116;NS=1046;RA=4009;RL=77;RPP=170.21;RR=0;RUN=1;ReadPosRankSum=-6.026;SAB=1;SAF=77;SAP=170.21;SAR=0;SRB=0.57022;SRF=2286;SRP=174.7;SRR=1723;VQSLOD=1.1887;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=5.90
+20     54469810        .       CA      C       1697.62 PASS    AA=93;AB=0.63855;ABA=90;ABP=44.53;ABR=159;AC=34;AF=0.0374;AF1=0.01719;AN=908;BL=3242;BR=5839;BVAR;BaseQRankSum=10.425;CI95=0.009317,0.02795;DEL;DP=15197;DP4=2134,1896,56,46;Dels=0.03;EL=34;EPP=17.604;ER=59;FQ=16;FR;FS=9.985;HETAR=41;HOMA=1;HOMR=1011;HP=9;HPLen=8;HR=8;HRun=8;HU=A;INDEL;InbreedingCoeff=-0.0472;LEN=1;LRB=0.28598;LRBP=1615.8;MQ=83.37;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0004;MQM=64.075;MQRankSum=3.036;NF;NR;NS=1053;PP;PV4=0.76,1,0.31,0.22;RA=5150;RL=28;RPP=34.975;RR=65;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.252;SAB=0.5914;SAF=55;SAP=9.7582;SAR=38;SC=ATTGCTAAGACAAAAAAAAGA;SRB=0.50621;SRF=2607;SRP=4.7374;SRR=2543;TC;TR=8;TU=A;VQSLOD=8.3677;set=Intersection;sumGLbyD=9.90
+20     54542453        .       GTATA   G,GTA   5109.66 PASS    ABR=112;AC=66,56;AF=0.0682,0.0579;AN=968;BVAR;BaseQRankSum=17.089;DB;DEL;DP=5519;DS;Dels=0.06;FS=99.502;HOMA=15;HOMR=409;HRun=0;InbreedingCoeff=0.1584;MQ0Fraction=0.0178;MQRankSum=-6.854;NS=460;RA=864;RUN=1;ReadPosRankSum=0.855;SRB=0.79282;SRF=685;SRP=646.5;SRR=179;VQSLOD=0.6375;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=8.53
+20     54629773        .       CA      C       1799.50 PASS    AA=49;AB=0.82707;ABA=46;ABP=250.17;ABR=220;AC=9;AF=0.00746;AN=1206;BL=173;BR=2277;BVAR;BaseQRankSum=5.240;DEL;DP=8557;Dels=0.01;EL=49;EPP=109.41;ER=0;FS=32.359;HETAR=35;HOMA=1;HOMR=325;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0892;LEN=1;LRB=0.85878;LRBP=3926.6;MQ0Fraction=0.0602;MQM=32.163;MQRankSum=-3.926;NS=361;RA=1091;RL=0;RPP=109.41;RR=49;RUN=1;ReadPosRankSum=-4.512;SAB=0;SAF=0;SAP=109.41;SAR=49;SRB=0.49404;SRF=539;SRP=3.3467;SRR=552;VQSLOD=1.1233;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.54
+20     54710245        .       TA      T       999     PASS    AF=0.0084;AF1=0.0148;BaseQRankSum=3.954;CI95=0.00885,0.02212;DP=8043;DP4=2000,1849,10,7;Dels=0.01;FQ=999;FR;FS=0.000;HP=9;HPLen=6;HR=3;HRun=6;HU=A;INDEL;InbreedingCoeff=0.1181;MQ=78.51;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=0.095;NF;NR;PP;PV4=0.63,0.00056,1,1;ReadPosRankSum=-0.448;SC=CAACAAAAAATAAATAAATAA;TC;TR=15;TU=AAAT;VQSLOD=7.8129;set=Intersection;sumGLbyD=19.02
+20     54968173        .       A       AAT,AATAT,AT,ATAT       89535.82        PASS    ABR=994;AC=561,278,2,3;AF=0.50179,0.24866,0.00179,0.00268;AN=1118;BVAR;BaseQRankSum=-2.699;DB;DP=27837;DP4=168,177,1045,866;Dels=0.00;FQ=999;FR;FS=12.472;HOMA=71;HOMR=455;HP=3;HPLen=4;HR=4;HRun=0;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.6391;KGPilot123;MQ=80.36;MQ0Fraction=0.0055;MQRankSum=-1.512;NF;NR;NS=913;PP;PV4=0.046,1,1,1;RA=2015;RUN=1;ReadPosRankSum=1.015;SC=GGCCACTTAAAATATATATAT;SRB=0.44864;SRF=904;SRP=49.187;SRR=1111;TC;TR=15;TU=AT;VQSLOD=9.0092;dbSNP=132;set=Intersection;sumGLbyD=42.33
+20     55176688        .       TA      T       421.84  PASS    AF=0.01322;AF1=0.01845;BaseQRankSum=5.383;CI95=0.01282,0.02564;DP=10531;DP4=1975,2017,16,14;Dels=0.01;FQ=91.2;FR;FS=7.401;HP=6;HPLen=5;HR=5;HRun=5;HU=A;INDEL;InbreedingCoeff=0.0829;MQ=75.80;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0003;MQRankSum=-0.471;NF;NR;PP;PV4=0.72,1,1,1;ReadPosRankSum=0.223;SC=CTGCAAAATATAAAAATTAGG;TC;TR=5;TU=A;VQSLOD=6.6000;set=Intersection;sumGLbyD=12.15
+20     55664086        .       GTT     ATT,G,GT,GTTT   5622.44 PASS    AC=6,71,136;AF=0.00498,0.05887,0.11277;AN=1206;BVAR;BaseQRankSum=3.173;DB;DEL;DP=40384;DP4=1567,1317,54,29;Dels=0.05;FR;FS=1.949;HP=14;HR=11;HRun=11;HU=T;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.3490;MQ=77.90;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=0.052;NF;NR;PP;PV4=0.057,1,0.2,1.2e-05;RUN=1;ReadPosRankSum=-13.646;SC=AATTTTATTTGTTTTTTTTTT;TC;TR=11;TU=T;VQSLOD=11.7964;set=Intersection;sumGLbyD=8.09
+20     56045006        .       TG      T       342.15  PASS    AC=72;AF=0.0940;AN=766;BaseQRankSum=4.992;DP=1238;FS=1.460;HRun=7;HaplotypeScore=20.2784;InbreedingCoeff=0.1795;MQ=66.42;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0008;MQRankSum=-0.937;QD=1.84;ReadPosRankSum=-4.385;SB=-320.83;VQSLOD=5.2383;set=VQSR
+20     56158711        .       AG      A       922.47  PASS    AA=18;AB=0.575;ABA=17;ABP=4.9646;ABR=23;AC=2;AF=0.0028;AN=714;BL=953;BR=808;BVAR;BaseQRankSum=3.129;DEL;DP=10462;Dels=0.01;EL=9;EPP=3.0103;ER=9;FR;FS=8.724;HETAR=4;HOMA=0;HOMR=1058;HP=1;HPLen=2;HR=2;HRun=1;HU=A;InbreedingCoeff=0.0262;LEN=1;LRB=0.08234;LRBP=28.936;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=55.889;MQRankSum=2.052;NF;NR;NS=1062;PP;RA=6300;RL=9;RPP=3.0103;RR=9;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.317;SAB=0.66667;SAF=12;SAP=7.3532;SAR=6;SC=TGGCCTAGCAAGCATCGTGAC;SRB=0.48143;SRF=3033;SRP=21.883;SRR=3267;TC;TR=8;TU=AAGC;VQSLOD=8.3252;set=Intersection;sumGLbyD=13.22
+20     56258618        rs113670927     T       C,TGC,TGTGC,TGTGTGC     37834.99        PASS    ABR=441;AC=11,100,43;AF=0.0123,0.1119,0.0481;AN=894;BVAR;BaseQRankSum=19.514;DB;DP=23173;DP4=541,920,413,579;Dels=0.00;FQ=999;FR;FS=1.238;HOMA=28;HOMR=808;HP=2;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=G;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.2154;MQ=57.25;MQ0Fraction=0.0275;MQRankSum=-6.684;NF;NR;NS=976;PP;PV4=0.023,1,1,1;RA=3294;RUN=1;ReadPosRankSum=11.873;SC=TGCGTGTGTGTGTGTGTGTGT;SRB=0.42441;SRF=1398;SRP=166.5;SRR=1896;TC;TR=30;TU=GT;VQSLOD=6.7457;dbSNP=114;set=Intersection;sumGLbyD=21.27
+20     56395857        .       T       TAGGCAG 6614.22 PASS    AA=30;AB=0.63415;ABA=30;ABP=15.827;ABR=52;AC=14;AF=0.0197;AF1=0.03154;AN=710;BL=991;BR=1813;BVAR;BaseQRankSum=-4.589;CI95=0.02434,0.04204;DP=13879;DP4=1543,1833,12,14;Dels=0.00;EL=14;EPP=3.2998;ER=16;FQ=999;FR;FS=1.482;HETAR=11;HOMA=0;HOMR=1051;HP=1;HPLen=2;HR=2;HRun=0;HU=T;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0774;LEN=6;LRB=0.29315;LRBP=526.27;MQ=90.42;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=39.433;MQRankSum=-7.011;NF;NR;NS=1062;PP;PV4=1,1,3.7e-09,1;RA=5322;RL=9;RPP=13.433;RR=21;RUN=1;ReadPosRankSum=0.679;SAB=0.43333;SAF=13;SAP=4.1684;SAR=17;SC=AAGAGCATCTTAGGCAGAGGC;SRB=0.47294;SRF=2517;SRP=36.853;SRR=2805;TC;TR=2;TU=T;VQSLOD=8.3045;set=Intersection;sumGLbyD=68.22
+20     56969289        .       GTTTGT  G       600.69  PASS    AF=0.0056;AF1=0.007726;BaseQRankSum=2.907;CI95=0.004425,0.01327;DP=9643;DP4=1892,1749,6,3;Dels=0.00;FQ=117;FR;FS=16.601;HP=5;HPLen=3;HR=3;HRun=0;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=0.0236;MQ=92.59;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-2.134;NF;NR;PP;PV4=0.51,1,0.07,0.3;ReadPosRankSum=0.236;SC=TAAGGACGTTGTTTGTTTTGT;TC;TR=10;TU=GTTT;VQSLOD=5.8458;set=Intersection;sumGLbyD=39.51
+20     57187557        .       AG      A,AGG   1486.69 PASS    AA=130;AB=0.55446;ABA=90;ABP=8.2132;ABR=112;AC=56,26;AF=0.0574,0.0266;AN=976;BL=3817;BR=5968;BVAR;BaseQRankSum=5.517;DEL;DP=14174;DP4=925,721,59,48;Dels=0.05;EL=52;EPP=14.302;ER=78;FR;FS=0.917;HETAR=44;HOMA=17;HOMR=864;HP=4;HPLen=4;HR=4;HRun=4;HU=G;INDEL;InbreedingCoeff=0.2856;LEN=1;LRB=0.21983;LRBP=1029.8;MQ=91.56;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=63.631;MQRankSum=1.900;NF;NR;NS=925;PP;PV4=0.84,1,1,0.39;RA=2746;RL=44;RPP=32.476;RR=86;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.639;SAB=0.44615;SAF=58;SAP=6.2842;SAR=72;SC=TCAGGCCCGCAGGGGTCAGGG;SRB=0.5772;SRF=1585;SRP=145.17;SRR=1161;TC;TR=4;TU=G;VQSLOD=7.7167;set=Intersection;sumGLbyD=14.85
+20     57282771        .       T       TG      506.43  PASS    AA=34;AB=0.70312;ABA=19;ABP=25.946;ABR=45;AC=34;AF=0.0373;AN=912;BL=886;BR=1938;BVAR;BaseQRankSum=3.744;DP=4276;Dels=0.00;EL=18;EPP=3.2658;ER=16;FR;FS=0.639;HETAR=17;HOMA=9;HOMR=737;HP=9;HR=8;HRun=8;HU=G;INS;InbreedingCoeff=0.2149;LEN=1;LRB=0.37252;LRBP=853.99;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=49.706;MQRankSum=-0.051;NF;NR;NS=763;PP;RA=1822;RL=9;RPP=19.36;RR=25;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.111;SAB=0.55882;SAF=19;SAP=4.0322;SAR=15;SC=TCGGGGGGCGTGGGGGGGGTG;SRB=0.51098;SRF=931;SRP=4.9172;SRR=891;TC;TR=8;TU=G;VQSLOD=5.7772;set=Intersection;sumGLbyD=7.95
+20     57419740        rs11481507      A       AT      82613.57        PASS    AA=3850;AB=0.41404;ABA=1786;ABP=198.63;ABR=1262;AC=919;AF=0.75328;AN=1220;BL=140665;BR=151383;BVAR;BaseQRankSum=-27.490;DB;DP=31794;DP4=588,585,1571,1721;Dels=0.00;EL=1924;EPP=3.0126;ER=1926;FQ=999;FR;FS=2.191;HETAR=482;HOMA=454;HOMR=135;HP=3;HPLen=3;HR=3;HRun=3;HU=T;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0861;LEN=1;LRB=0.036699;LRBP=857.15;MQ=123.92;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=91.654;MQRankSum=3.016;NF;NR;NS=1071;PP;PV4=0.16,1,0.12,1;RA=1850;RL=1874;RPP=8.8784;RR=1976;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.685;SAB=0.47636;SAF=1834;SAP=21.693;SAR=2016;SC=TACACTAGTGATTTAACCCTA;SRB=0.49027;SRF=907;SRP=4.5315;SRR=943;TC;TR=3;TU=T;VQSLOD=9.2768;dbSNP=126;set=Intersection;sumGLbyD=22.78
+20     57529209        .       TA      AA,T    1285.20 PASS    AA=52;AB=0.89572;ABA=39;ABP=511.72;ABR=335;AC=0;AF=0.0000;AN=694;BL=1317;BR=3667;BVAR;BaseQRankSum=1.788;DEL;DP=8008;Dels=0.00;EL=30;EPP=5.6829;ER=22;FR;HETAR=151;HOMA=83;HOMR=752;HP=7;HR=7;HU=A;InbreedingCoeff=0.1368;LEN=1;LRB=0.47151;LRBP=2409.1;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=58.288;MQRankSum=-0.490;NF;NR;NS=987;PP;QD=2.29;RA=2909;RL=4;RPP=83.856;RR=48;RUN=1;ReadPosRankSum=0.513;SAB=0.46154;SAF=24;SAP=3.6784;SAR=28;SB=-361.38;SC=CATAATTTTTTAAAAAAATAG;SRB=0.46855;SRF=1363;SRP=28.009;SRR=1546;TC;TR=7;TU=A;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=5.59
+20     57558194        .       CT      C,CTT,CTTT      6470.30 PASS    ABR=451;AC=104,161,177;AF=0.08919,0.13808,0.15180;BVAR;BaseQRankSum=1.172;DP=7985;FR;FS=2.202;HOMA=19;HOMR=778;HP=22;HR=15;HU=T;HaplotypeScore=16.1921;INS;InbreedingCoeff=0.6440;MQ=69.24;MQ0=27;MQ0Fraction=0.0109;MQRankSum=-0.003;NF;NR;NS=943;PP;QD=2.22;RA=2531;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.104;SB=-2096.85;SC=GCCTTTTTTTCTTTTTTTTTT;SRB=0.34848;SRF=882;SRP=507.73;SRR=1649;TC;TR=15;TU=T;VQSLOD=6.5151;set=Intersection
+20     57693627        .       AG      A       1991.90 PASS    AA=52;AB=0.49462;ABA=47;ABP=3.0336;ABR=46;AC=15;AF=0.01227;AN=1222;BL=1902;BR=1478;BVAR;BaseQRankSum=-6.121;DEL;DP=26459;DP4=2647,2873,16,20;Dels=0.01;EL=25;EPP=3.1773;ER=27;FR;FS=3.135;HETAR=15;HOMA=1;HOMR=1064;HP=2;HPLen=3;HR=3;HRun=2;HU=A;INDEL;InbreedingCoeff=0.0866;LEN=1;LRB=0.12544;LRBP=118.51;MQ=116.26;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=114.65;MQRankSum=1.942;NF;NR;NS=1080;PP;PV4=0.74,6.9e-08,1,0.38;RA=6781;RL=33;RPP=11.195;RR=19;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.795;SAB=0.5;SAF=26;SAP=3.0103;SAR=26;SC=ATTGGAGGAAAGGCTTTTTCA;SRB=0.46247;SRF=3136;SRP=85.976;SRR=3645;TC;TR=3;TU=A;VQSLOD=8.6672;set=Intersection;sumGLbyD=13.55
+20     57716287        .       A       AT      66.47   PASS    AC=6;AF=0.00506;AN=1186;BaseQRankSum=1.369;DP=2744;FS=3.834;HRun=8;HaplotypeScore=11.2046;InbreedingCoeff=0.1196;MQ=73.00;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-0.086;QD=2.14;ReadPosRankSum=-2.588;SB=-53.80;VQSLOD=4.2080;set=VQSR
+20     58121928        rs73625057      T       TGG     6649.17 PASS    AA=132;AB=0.57854;ABA=110;ABP=16.996;ABR=151;AC=57;AF=0.0617;AN=924;BL=4530;BR=4790;BVAR;BaseQRankSum=-13.456;DB;DP=30353;DP4=2107,2168,61,66;Dels=0.00;EL=67;EPP=3.0761;ER=65;FR;FS=0.708;HETAR=46;HOMA=8;HOMR=1023;HP=3;HPLen=2;HR=2;HRun=2;HU=G;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.1241;LEN=2;LRB=0.027897;LRBP=18.76;MQ=109.61;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0004;MQM=79.833;MQRankSum=-0.699;NF;NR;NS=1077;PP;PV4=0.79,1,0.49,0.036;RA=5754;RL=61;RPP=4.6554;RR=71;RUN=1;ReadPosRankSum=-3.309;SAB=0.45455;SAF=60;SAP=5.3792;SAR=72;SC=GATTAGAATGTGGATATCTTT;SRB=0.48836;SRF=2810;SRP=9.7866;SRR=2944;TC;TR=4;TU=GT;VQSLOD=8.5770;set=Intersection;sumGLbyD=27.19
+20     58287008        .       T       TC      23.57   PASS    AC=1;AF=0.0015;AN=678;BaseQRankSum=1.500;DP=1783;FS=0.000;HRun=1;HaplotypeScore=13.0585;InbreedingCoeff=0.0243;MQ=98.37;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=1.259;QD=5.43;ReadPosRankSum=1.115;SB=-40.33;VQSLOD=4.9523;set=VQSR
+20     58418087        .       TAC     T       1908.26 PASS    AA=64;AB=0.58667;ABA=62;ABP=12.796;ABR=88;AC=24;AF=0.0337;AN=712;BL=2841;BR=2706;BVAR;BaseQRankSum=12.276;DEL;DP=21427;DP4=2243,2398,22,31;Dels=0.03;EL=29;EPP=4.2318;ER=35;FQ=999;FR;FS=0.961;HETAR=21;HOMA=1;HOMR=1050;HP=2;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=A;INDEL;InbreedingCoeff=0.0008;LEN=2;LRB=0.024337;LRBP=10.145;MQ=93.02;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=51.109;MQRankSum=-3.746;NF;NR;NS=1072;PP;PV4=0.34,1.8e-11,2.3e-08,1;RA=6247;RL=37;RPP=6.4032;RR=27;RUN=1;ReadPosRankSum=0.418;SAB=0.4375;SAF=28;SAP=5.1818;SAR=36;SC=AGCCATAGGATACACAAAATC;SRB=0.47911;SRF=2993;SRP=26.689;SRR=3254;TC;TR=5;TU=AC;VQSLOD=10.5463;set=Intersection;sumGLbyD=12.25
+20     58468826        .       ACAAG   A       999     PASS    AF=0.0014;AF1=0.003429;BaseQRankSum=4.082;CI95=0.003106,0.006211;DP=8461;DP4=2500,1817,8,2;Dels=0.01;FQ=999;FR;FS=5.034;HP=2;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=C;INDEL;InbreedingCoeff=-0.0183;MQ=120.69;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=0.141;NF;NR;PP;PV4=0.21,1,0.054,1;ReadPosRankSum=2.096;SC=ATCCTGAAACACAAGAAGAAA;TC;TR=5;TU=AC;VQSLOD=7.4928;set=Intersection;sumGLbyD=29.17
+20     58731262        .       TC      T       999     PASS    AA=21;AB=0.48649;ABA=19;ABP=3.069;ABR=18;AC=7;AF=0.0101;AF1=0.01493;AN=694;BL=939;BR=848;BVAR;BaseQRankSum=4.205;CI95=0.01106,0.02212;DEL;DP=12598;DP4=1766,1428,11,15;Dels=0.01;EL=13;EPP=5.5954;ER=8;FQ=999;FR;FS=1.796;HETAR=8;HOMA=1;HOMR=1031;HP=7;HPLen=8;HR=8;HRun=2;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=-0.0030;LEN=1;LRB=0.050923;LRBP=13.073;MQ=124.57;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=67.905;MQRankSum=1.103;NF;NR;NS=1040;PP;PV4=0.23,1,1,1;RA=4884;RL=10;RPP=3.1137;RR=11;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.091;SAB=0.47619;SAF=10;SAP=3.1137;SAR=11;SC=TCATTTTTTTTCCTTGAAACT;SRB=0.58006;SRF=2833;SRP=274.9;SRR=2051;TC;TR=8;TU=T;VQSLOD=10.8783;set=Intersection;sumGLbyD=15.11
+20     59181229        rs11476579      CTT     C,CT,CTTT,CTTTT 7787.17 PASS    AC=19,195,104,91;AF=0.01599,0.16414,0.08754,0.07660;AF1=0.2124;AN=1188;BVAR;BaseQRankSum=6.347;CI95=0.146,0.2743;DB;DEL;DP=26140;DP4=932,880,352,375;Dels=0.13;FQ=85.6;FR;FS=11.914;HP=14;HR=14;HRun=14;HU=T;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.4183;MQ=86.88;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=1.469;NF;NR;PP;PV4=0.17,1,1,1;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.055;SC=GGTGAGAAAGCTTTTTTTTTT;TC;TR=14;TU=T;VQSLOD=7.4340;dbSNP=120;set=Intersection;sumGLbyD=7.02
+20     59213979        rs112141381     G       GC      9068    PASS    AA=131;AB=0.47115;ABA=110;ABP=4.5136;ABR=98;AF=0.0586;AN=700;BL=5395;BR=5816;BVAR;BaseQRankSum=15.453;DB;DP=23381;DP4=2191,2184,71,49;Dels=0.00;EL=66;EPP=3.0269;ER=65;FR;FS=7.907;HETAR=35;HOMA=5;HOMR=1019;HP=2;HPLen=3;HR=3;HRun=0;HU=G;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0283;LEN=1;LRB=0.037552;LRBP=37.34;MQ=72.13;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=54.496;MQRankSum=0.897;NF;NR;NS=1059;PP;PV4=0.052,1,0.066,1;RA=4976;RL=59;RPP=5.8117;RR=72;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.811;SAB=0.58015;SAF=76;SAP=10.32;SAR=55;SC=GATGGACTGGGACAGTGACTC;SRB=0.49457;SRF=2461;SRP=4.2828;SRR=2515;TC;TR=3;TU=G;VQSLOD=9.3917;set=Intersection;sumGLbyD=28.58
+20     59252945        .       CT      C,CTT   557.18  PASS    AA=24;AB=0.84868;ABA=23;ABP=163.53;ABR=129;AC=21,29;AF=0.01759,0.02429;BL=1217;BR=1336;BVAR;BaseQRankSum=5.135;DP=9970;Dels=0.01;EL=13;EPP=3.3722;ER=11;FS=2.302;HETAR=21;HOMA=1;HOMR=1012;HRun=9;INS;InbreedingCoeff=0.1549;LEN=1;LRB=0.046612;LRBP=15.055;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=67.208;MQRankSum=0.086;NS=1034;RA=4421;RL=11;RPP=3.3722;RR=13;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.826;SAB=0.41667;SAF=10;SAP=4.4579;SAR=14;SRB=0.49649;SRF=2195;SRP=3.4823;SRR=2226;VQSLOD=2.8923;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=5.47
+20     60016966        .       CT      C       42650   PASS    AA=37;AB=0.97834;ABA=31;ABP=2847;ABR=1400;AC=15;AF=0.0163;AN=920;BL=2596;BR=778;BVAR;BaseQRankSum=-0.632;DEL;DP=10967;Dels=0.00;EL=14;EPP=7.7641;ER=23;FS=4.094;HETAR=421;HOMA=256;HOMR=385;HRun=1;InbreedingCoeff=-0.0051;LEN=1;LRB=0.53883;LRBP=2130.2;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=120.3;MQRankSum=-0.911;NS=1072;RA=3413;RL=31;RPP=39.691;RR=6;RUN=1;ReadPosRankSum=-12.062;SAB=0.48649;SAF=18;SAP=3.069;SAR=19;SRB=0.47407;SRF=1618;SRP=22.943;SRR=1795;VQSLOD=3.3758;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.27
+20     60188651        .       AG      A       17624.52        PASS    AA=462;AB=0.76548;ABA=409;ABP=1070.7;ABR=1335;AC=403;AF=0.34444;AN=1170;BL=13877;BR=25909;BVAR;BaseQRankSum=6.180;DEL;DP=9900;Dels=0.08;EL=353;EPP=282.84;ER=109;FR;FS=2699.057;HETAR=346;HOMA=26;HOMR=633;HP=3;HR=4;HRun=1;HU=A;InbreedingCoeff=-0.2900;LEN=1;LRB=0.30242;LRBP=7904.3;MQ0Fraction=0.0004;MQM=56.119;MQRankSum=1.644;NF;NR;NS=1005;PP;RA=3521;RL=112;RPP=269.25;RR=350;RUN=1;ReadPosRankSum=2.490;SAB=0.0064935;SAF=3;SAP=980.34;SAR=459;SC=AGGCTTCAAAAGAAAAAAAAA;SRB=0.55978;SRF=1971;SRP=112.32;SRR=1550;TC;TR=4;TU=A;VQSLOD=-34.0667;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=7.81
+20     60195570        .       GTACATACATACA   ATACATACATACA,G,GTACATACA       20140   PASS    ABR=102;AC=105,2;AF=0.08794,0.00168;AN=1194;BVAR;BaseQRankSum=-28.899;DB;DEL;DP=14347;Dels=0.02;FR;FS=52.125;HOMA=1;HOMR=1006;HP=1;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=T;InbreedingCoeff=0.0695;MQ0Fraction=0.0007;MQRankSum=1.957;NF;NR;NS=1035;PP;RA=4759;RUN=1;ReadPosRankSum=-22.252;SAB=0.5;SAP=3.0103;SC=TGATAGATTCGTACATACATA;SRB=0.47615;SRF=2266;SRP=26.522;SRR=2493;TC;TR=21;TU=ACAT;VQSLOD=2.7673;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=19.14
+20     60670601        rs72127450      AT      A,ATT   6401.59 PASS    AC=177,79;AF=0.16239,0.07248;AF1=0.1602;AN=1090;BVAR;BaseQRankSum=8.618;CI95=0.1106,0.2058;DB;DEL;DP=17508;DP4=1285,1094,313,259;Dels=0.10;FQ=94.1;FR;FS=0.000;HP=12;HR=12;HRun=12;HU=T;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.1076;LEN=1;MQ=64.73;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=0.620;NF;NR;PP;PV4=0.78,1,0.012,1;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.294;SC=AGCCAGGCACATTTTTTTTTT;TC;TR=12;TU=T;VQSLOD=6.1650;dbSNP=130;set=Intersection;sumGLbyD=5.80
+20     60685780        .       TC      T       1123.58 PASS    AC=79;AF=0.07655;AN=1032;BaseQRankSum=14.949;DP=2084;FS=23.521;HRun=1;HaplotypeScore=19.7117;InbreedingCoeff=0.1356;MQ=53.57;MQ0=61;MQ0Fraction=0.0293;MQRankSum=-7.958;QD=4.35;ReadPosRankSum=-13.757;SB=-791.28;VQSLOD=6.3549;set=VQSR
+20     60744906        rs113528167     CG      C       422.53  PASS    AC=48;AF=0.0732;AN=656;BaseQRankSum=17.669;DB;DP=1189;FS=0.356;HRun=1;HaplotypeScore=15.1808;InbreedingCoeff=0.2111;MQ=82.83;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-10.455;QD=2.71;ReadPosRankSum=-16.887;SB=-326.46;VQSLOD=7.1707;set=VQSR
+20     60848742        .       CGT     C,CGTGT 999     PASS    AF=0.00980,0.01225;BaseQRankSum=5.597;DP=17065;DP4=1928,2188,17,13;Dels=0.01;FR;HP=1;HPLen=2;HR=2;HRun=0;HU=C;INDEL;InbreedingCoeff=0.2094;MQ=115.78;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=0.281;NF;NR;PP;PV4=0.36,0.4,0.12,0.12;ReadPosRankSum=-1.465;SB=-157.35;SC=TAGACGCTTCCGTGTGTGTGT;TC;TR=11;TU=GT;VQSLOD=1.7100;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=16.39
+20     61023668        rs57452309      G       GAGC    6896.67 PASS    AC=115;AF=0.1445;AN=796;BaseQRankSum=12.146;DB;DP=1423;FS=5.070;HRun=0;HaplotypeScore=29.8897;InbreedingCoeff=0.0740;MQ=77.02;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-9.005;QD=19.16;ReadPosRankSum=-17.440;SB=-3045.82;VQSLOD=4.5788;set=VQSR
+20     61180519        .       C       CA,CT   1774.30 PASS    ABR=135;AC=27,15;AF=0.02538,0.01410;BVAR;BaseQRankSum=-2.189;DP=8393;FR;FS=27.692;HOMA=2;HOMR=825;HP=6;HPLen=3;HR=3;HU=T;HaplotypeScore=19.5313;INS;InbreedingCoeff=0.0868;LEN=1;MQ=56.11;MQ0=172;MQ0Fraction=0.0667;MQRankSum=2.605;NF;NR;NS=854;PP;QD=1.99;RA=2868;RUN=1;ReadPosRankSum=-7.324;SB=-385.54;SC=TTCTTTCTTTCTTTCTTTCTT;SRB=0.32741;SRF=939;SRP=745.08;SRR=1929;TC;TR=69;TU=CTTT;VQSLOD=3.4398;set=filterInVQSR-2of5
+20     61184281        .       AC      A       9798.10 PASS    AA=24;AB=0.96507;ABA=16;ABP=863.43;ABR=442;AC=4;AF=0.00341;AN=1174;BL=349;BR=1039;BVAR;BaseQRankSum=2.048;DEL;DP=10073;Dels=0.00;EL=11;EPP=3.3722;ER=13;FS=2.097;HETAR=141;HOMA=69;HOMR=829;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0697;LEN=1;LRB=0.49712;LRBP=747.85;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=98.042;MQRankSum=1.881;NS=1042;RA=3625;RL=5;RPP=20.744;RR=19;RUN=1;ReadPosRankSum=-8.009;SAB=0.75;SAF=18;SAP=16.039;SAR=6;SRB=0.52662;SRF=1909;SRP=25.323;SRR=1716;VQSLOD=1.8117;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=5.55
+20     62067246        .       T       TCGA    60869.60        PASS    AC=1024;AF=0.88889;AN=1152;BaseQRankSum=17.328;DP=2144;FS=2.378;HRun=0;HaplotypeScore=22.0069;InbreedingCoeff=0.1400;MQ=86.75;MQ0=6;MQ0Fraction=0.0028;MQRankSum=-5.536;QD=29.45;ReadPosRankSum=1.266;SB=-24220.18;VQSLOD=6.4647;set=VQSR
+20     62074219        .       C       CTAT,CTGT       2328    PASS    ABR=99;AC=20,6;AF=0.01754,0.00526;BVAR;BaseQRankSum=11.221;DP=9498;DS;FS=4.510;HOMA=15;HOMR=645;HaplotypeScore=82.8868;INS;InbreedingCoeff=0.0880;LEN=3;MQ=29.88;MQ0=1378;MQ0Fraction=0.2286;MQRankSum=-5.309;NS=689;QD=0.77;RA=1679;RUN=1;ReadPosRankSum=-3.510;SAR=1;SB=-93.21;SRB=0.70697;SRF=1187;SRP=627.71;SRR=492;VQSLOD=1.8325;set=filterInVQSR-2of5
+20     62304449        .       CA      C,CAA   6680.17 PASS    AC=141,69;AF=0.12567,0.06150;AF1=0.08178;AN=1122;BVAR;BaseQRankSum=9.754;CI95=0.05088,0.1128;DEL;DP=15867;DP4=1252,1289,232,208;Dels=0.10;FQ=52.6;FR;FS=6.576;HP=11;HR=11;HRun=11;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.1950;LEN=1;MQ=60.48;MQ0Fraction=0.0004;MQRankSum=-0.049;NF;NR;PP;PV4=0.2,1,1,1;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.137;SC=GATTCTGTGTCAAAAAAAAAA;TC;TR=11;TU=A;VQSLOD=7.4714;set=Intersection;sumGLbyD=8.36
+20     62804895        rs57769591      CCTT    C       1148    PASS    AC=8;AF=0.0085;AF1=0.002839;AN=938;BaseQRankSum=4.952;CI95=0.002212,0.006637;DB;DP=8889;DP4=2574,1668,4,8;FQ=12.3;FS=2.289;HPLen=3;HRun=0;HaplotypeScore=29.4184;INDEL;InbreedingCoeff=-0.0270;MQ0=876;MQ0Fraction=0.2674;MQRankSum=-0.641;PV4=0.074,1,1,1;QD=1.03;ReadPosRankSum=0.118;SB=-65.30;VQSLOD=6.4881;dbSNP=126;set=Intersection
+20     62907688        .       AAT     A       6629.57 PASS    AC=164;AF=0.13735;AN=1194;BaseQRankSum=27.368;DP=2746;FS=5.985;HRun=0;HaplotypeScore=14.7748;InbreedingCoeff=0.1433;MQ=96.65;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-3.318;QD=10.81;ReadPosRankSum=0.789;SB=-2662.16;VQSLOD=6.1473;set=VQSR
+20     62952465        .       G       GT      9149.70 PASS    AA=156;AB=0.66667;ABA=110;ABP=82.631;ABR=220;AC=8;AF=0.00768;AN=1042;BL=6618;BR=3296;BVAR;BaseQRankSum=-0.466;DP=6244;Dels=0.00;EL=70;EPP=6.5737;ER=86;FS=2.927;HETAR=88;HOMA=34;HOMR=664;HRun=0;INS;InbreedingCoeff=0.0711;LEN=1;LRB=0.33508;LRBP=2420.2;MQ0Fraction=0.0431;MQM=29.506;MQRankSum=-3.251;NS=786;RA=1722;RL=146;RPP=260.47;RR=10;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.554;SAB=0.47436;SAF=74;SAP=3.9012;SAR=82;SRB=0.50523;SRF=870;SRP=3.4189;SRR=852;VQSLOD=6.1217;set=Intersection;sumGLbyD=16.58
diff --git a/tests/tabix_data/vcf/18.vcf b/tests/tabix_data/vcf/18.vcf
new file mode 100644 (file)
index 0000000..e0d112c
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,1000 @@
+##fileformat=VCFv4.0
+#CHROM POS     ID      REF     ALT     QUAL    FILTER  INFO    FORMAT  DNA_pool_A
+chr1   1281168 .       A       G       14      .       DP=37;AF1=0.6243;CI95=0.5,1;DP4=4,0,6,0;MQ=15;PV4=1,0.027,1,1   PL:GT:GQ        43,0,4:0/1:6
+chr1   1281205 .       T       C       26      .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=41 PL:GT:GQ        58,9,0:1/1:63
+chr1   1281206 .       G       C       25      .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=41 PL:GT:GQ        57,9,0:1/1:63
+chr1   1922737 .       G       C       13.2    .       DP=21;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,21;MQ=22 PL:GT:GQ        46,63,0:1/1:99
+chr1   21197513        .       A       G       55.1    .       DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=41   PL:GT:GQ        88,21,0:1/1:84
+chr1   21343209        .       T       C       5.45    .       DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,17,0;MQ=14 PL:GT:GQ        37,51,0:1/1:99
+chr1   22097362        .       T       C       4.75    .       DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=30        PL:GT:GQ        35,9,0:1/1:63
+chr1   22254012        .       A       G       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=50 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr1   22650927        .       G       A       48.1    .       DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=24  PL:GT:GQ        81,21,0:1/1:84
+chr1   23535401        .       C       T       40.4    .       DP=25;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,16,0,5;MQ=19;PV4=1,0.2,1,1 PL:GT:GQ        73,13,0:1/1:65
+chr1   23543855        .       T       C       49.1    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=44 PL:GT:GQ        82,18,0:1/1:90
+chr1   24245107        .       C       G       32      .       DP=4;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,2;MQ=36;PV4=1,1,1,1      PL:GT:GQ        62,0,35:0/1:38
+chr1   24274412        .       G       C       39.5    .       DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=32 PL:GT:GQ        72,12,0:1/1:72
+chr1   36529832        .       C       T       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=46 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr1   37788090        .       A       G       89.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=49 PL:GT:GQ        122,12,0:1/1:72
+chr1   43120440        .       C       T       34      .       DP=3;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,2;MQ=49;PV4=1,1,1,1      PL:GT:GQ        64,0,31:0/1:34
+chr1   43980466        .       C       T       43      .       DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,15;MQ=19 PL:GT:GQ        76,45,0:1/1:99
+chr1   46047795        .       T       C       29.1    .       DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=31 PL:GT:GQ        62,18,0:1/1:90
+chr1   48860309        .       C       T       99      .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=46 PL:GT:GQ        141,18,0:1/1:90
+chr1   49415599        .       T       C       4.61    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=34 PL:GT:GQ        34,6,0:1/1:49
+chr1   51601816        .       G       T       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=50 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr1   51955459        .       G       C       89.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=49 PL:GT:GQ        122,12,0:1/1:72
+chr1   68479569        .       T       G       12      .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:GT:GQ        43,6,0:1/1:49
+chr1   69032455        .       A       G       15.1    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=29 PL:GT:GQ        47,9,0:1/1:63
+chr1   71888225        .       G       T       9.31    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=43 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr1   72381528        .       T       C       44      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=41 PL:GT:GQ        76,9,0:1/1:63
+chr1   82004013        .       A       G       37.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=50 PL:GT:GQ        70,12,0:1/1:72
+chr1   86289622        .       C       T       18      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=42 PL:GT:GQ        50,9,0:1/1:63
+chr1   90267663        .       A       G       22      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=45 PL:GT:GQ        54,9,0:1/1:63
+chr1   92699542        .       A       G       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=45 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr1   94867317        .       G       A       26.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=45 PL:GT:GQ        58,6,0:1/1:49
+chr1   96428713        .       C       G       3.98    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=27 PL:GT:GQ        33,6,0:1/1:49
+chr1   100466329       .       G       C       4.85    .       DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,6;MQ=22  PL:GT:GQ        36,18,0:1/1:90
+chr1   101909281       .       G       A       70      .       DP=11;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,5,0;MQ=46;PV4=1,1,0.096,1    PL:GT:GQ        100,0,88:0/1:91
+chr1   106216572       .       T       A       22      .       DP=18;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,16,0;MQ=21 PL:GT:GQ        55,48,0:1/1:99
+chr1   107901770       .       T       C       9.31    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr1   108431179       .       A       G       99      .       DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=41   PL:GT:GQ        155,24,0:1/1:96
+chr1   112005344       .       C       T       99      .       DP=52;AF1=1;CI95=1,1;DP4=7,0,27,0;MQ=44;PV4=1,1,1,1     PL:GT:GQ        196,25,0:1/1:99
+chr1   116625452       .       C       T       36      .       DP=44;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,23,0,20;MQ=49;PV4=1,2.3e-69,0.42,1     PL:GT:GQ        66,0,179:0/1:69
+chr1   118060710       .       G       T       6.98    .       DP=8;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,3,0;MQ=47;PV4=1,0.0071,1,1 PL:GT:GQ        36,0,73:0/1:39
+chr1   118198177       .       A       G       15.9    .       DP=23;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=43        PL:GT:GQ        47,6,0:1/1:49
+chr1   118586346       .       T       C       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr1   120809555       .       G       A       20      .       DP=8;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=6,0,2,0;MQ=46;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ        50,0,106:0/1:53
+chr1   130723110       .       C       A       20.7    .       DP=8;AF1=0.5939;CI95=0.5,1;DP4=0,6,0,2;MQ=26;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        50,0,5:0/1:7
+chr1   133979895       .       T       C       14.9    .       DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=43 PL:GT:GQ        46,6,0:1/1:49
+chr1   134977940       .       C       T       30      .       DP=3;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,2;MQ=38;PV4=1,1,0.26,1   PL:GT:GQ        60,0,31:0/1:34
+chr1   141768589       .       G       A       18.1    .       DP=15;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,4,0;MQ=51;PV4=1,2.7e-05,1,1  PL:GT:GQ        48,0,100:0/1:51
+chr1   141768590       .       G       A       22      .       DP=15;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,4,0;MQ=50;PV4=1,0.0033,1,1   PL:GT:GQ        52,0,40:0/1:43
+chr1   146506051       .       T       C       44      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=43 PL:GT:GQ        76,9,0:1/1:63
+chr1   150997009       .       G       A       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr1   162915612       .       G       C       13.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr1   168455400       .       A       G       4.12    .       DP=28;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,27;MQ=10 PL:GT:GQ        35,81,0:1/1:99
+chr1   172784744       .       T       C       17.8    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=48 PL:GT:GQ        49,6,0:1/1:49
+chr1   183627307       .       G       A       13.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr1   185789457       .       T       C       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=50 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr1   187081827       .       T       C       4.77    .       DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=17 PL:GT:GQ        36,30,0:1/1:99
+chr1   188468339       .       C       T       33      .       DP=25;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,13;MQ=24 PL:GT:GQ        66,39,0:1/1:99
+chr1   188595435       .       C       T       41.8    .       DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr1   188670561       .       G       C       3.55    .       DP=22;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,9;MQ=18  PL:GT:GQ        34,27,0:1/1:99
+chr1   188924877       .       G       A       6.2     .       DP=10;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=2,0,3,0;MQ=21;PV4=1,1,1,0.3     PL:GT:GQ        35,3,0:1/1:41
+chr1   190536295       .       G       A       68      .       DP=38;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,36,0;MQ=18 PL:GT:GQ        101,108,0:1/1:99
+chr1   191129408       .       T       A       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=48 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr1   195937816       .       T       C       13      .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35 PL:GT:GQ        44,6,0:1/1:49
+chr1   198857619       .       T       C       89      .       DP=61;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,38,0,17;MQ=30;PV4=1,0.032,1,1  PL:GT:GQ        119,0,139:0/1:99
+chr1   199057483       .       T       C       13      .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=32 PL:GT:GQ        44,6,0:1/1:49
+chr1   200133619       .       G       C       5.83    .       DP=49;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=2,0,8,0;MQ=17;PV4=1,0.059,1,0.2      PL:GT:GQ        37,12,0:1/1:72
+chr1   200729661       .       A       T       36      .       DP=15;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,14,0;MQ=27 PL:GT:GQ        69,42,0:1/1:99
+chr1   201374519       .       T       C       69.5    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=39 PL:GT:GQ        102,12,0:1/1:72
+chr1   202811668       .       G       A       20.2    .       DP=4;AF1=0.5163;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,3;MQ=24;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        50,0,12:0/1:15
+chr1   202960650       .       C       T       16.6    .       DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=27 PL:GT:GQ        49,12,0:1/1:72
+chr1   205686638       .       C       T       11.3    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=42 PL:GT:GQ        43,9,0:1/1:63
+chr1   205949857       .       A       G       3.14    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=21 PL:GT:GQ        33,15,0:1/1:75
+chr1   209806643       .       A       G       13.2    .       DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=21   PL:GT:GQ        46,24,0:1/1:96
+chr1   209871501       .       C       T       25      .       DP=12;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=5,0,4,0;MQ=41;PV4=1,7.7e-06,1,1  PL:GT:GQ        55,0,84:0/1:58
+chr1   211051323       .       G       A       99      .       DP=14;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=49  PL:GT:GQ        176,24,0:1/1:96
+chr1   211389716       .       C       T       12      .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=32 PL:GT:GQ        43,6,0:1/1:49
+chr1   211868415       .       G       A       3.54    .       DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,11;MQ=14 PL:GT:GQ        34,33,0:1/1:99
+chr1   211914531       .       C       T       84.5    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,4;MQ=46;PV4=1,1,1,1     PL:GT:GQ        116,7,0:1/1:57
+chr1   214691313       .       A       G       22      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=49 PL:GT:GQ        54,9,0:1/1:63
+chr1   215184650       .       C       T       40.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=46 PL:GT:GQ        72,6,0:1/1:49
+chr1   215995258       .       A       G       68      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=50 PL:GT:GQ        100,9,0:1/1:63
+chr1   217031394       .       G       C       13.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr1   217986960       .       T       C       44      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=36 PL:GT:GQ        76,9,0:1/1:63
+chr1   218086681       .       A       G       99      .       DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,9;MQ=34  PL:GT:GQ        142,27,0:1/1:99
+chr1   218546019       .       A       G       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=50 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr1   218632417       .       G       T       17.1    .       DP=19;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=26  PL:GT:GQ        50,21,0:1/1:84
+chr1   218833355       .       C       G       23      .       DP=7;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=5,0,2,0;MQ=39;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ        53,0,63:0/1:56
+chr1   219303186       .       T       C       7.79    .       DP=25;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,25;MQ=12 PL:GT:GQ        40,75,0:1/1:99
+chr1   219517634       .       G       A       26.5    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=42 PL:GT:GQ        59,12,0:1/1:72
+chr1   219590158       .       T       C       3.27    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=25 PL:GT:GQ        33,12,0:1/1:72
+chr1   219709853       .       A       T       99      .       DP=124;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=80,0,41,0;MQ=44;PV4=1,0.26,1,1  PL:GT:GQ        143,0,156:0/1:99
+chr1   222457988       .       A       G       11.1    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=23 PL:GT:GQ        42,6,0:1/1:49
+chr1   222477914       .       A       G       11.3    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=39 PL:GT:GQ        43,9,0:1/1:63
+chr1   223010233       .       A       G       18.6    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=25 PL:GT:GQ        51,12,0:1/1:72
+chr1   223796360       .       G       A       6.79    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=21 PL:GT:GQ        37,6,0:1/1:49
+chr1   224273784       .       A       T       14.2    .       DP=18;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=15 PL:GT:GQ        47,30,0:1/1:99
+chr1   224454685       .       C       T       46.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=32 PL:GT:GQ        79,15,0:1/1:75
+chr1   224514706       .       G       C       21      .       DP=38;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,38,0;MQ=19 PL:GT:GQ        54,114,0:1/1:99
+chr1   224515793       .       C       T       99      .       DP=26;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,26,0;MQ=45 PL:GT:GQ        211,78,0:1/1:99
+chr1   224692969       .       C       A       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=36 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr1   225607249       .       A       G       34      .       DP=3;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,2,0;MQ=45;PV4=1,1,0,1      PL:GT:GQ        64,0,31:0/1:34
+chr1   226923918       .       C       A       29.1    .       DP=52;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,10;MQ=27;PV4=1,1,1,1   PL:GT:GQ        62,18,0:1/1:90
+chr1   227125189       .       T       C       56.5    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=41 PL:GT:GQ        89,12,0:1/1:72
+chr1   227133712       .       A       T       20.1    .       DP=26;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=11,0,10,0;MQ=23;PV4=1,1,0.48,1   PL:GT:GQ        50,0,39:0/1:42
+chr1   227943954       .       G       C       47      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=37 PL:GT:GQ        79,9,0:1/1:63
+chr1   227943974       .       G       A       33.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=34 PL:GT:GQ        66,12,0:1/1:72
+chr1   228067480       .       A       G       42.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=45 PL:GT:GQ        75,15,0:1/1:75
+chr1   228067510       .       A       G       99      .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=45 PL:GT:GQ        140,15,0:1/1:75
+chr1   228088778       .       C       T       6.79    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=23 PL:GT:GQ        37,6,0:1/1:49
+chr1   228117888       .       A       C       13.9    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=40 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr1   228139641       .       T       C       44.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=35 PL:GT:GQ        77,12,0:1/1:72
+chr1   228577146       .       T       C       26      .       DP=41;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,25,0,14;MQ=22;PV4=1,1,1,0.027  PL:GT:GQ        56,0,77:0/1:59
+chr1   229001369       .       C       A       45      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=41 PL:GT:GQ        77,9,0:1/1:63
+chr1   229001386       .       C       T       8.44    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=42 PL:GT:GQ        39,6,0:1/1:49
+chr1   229348080       .       T       C       18.1    .       DP=3;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,2;MQ=40;PV4=1,0.33,0.17,0.33     PL:GT:GQ        48,0,31:0/1:34
+chr1   229439710       .       C       T       33.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=32 PL:GT:GQ        66,12,0:1/1:72
+chr1   229655149       .       T       C       30      .       DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=30   PL:GT:GQ        63,24,0:1/1:96
+chr1   229660873       .       C       G       81      .       DP=28;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,20,0,7;MQ=36;PV4=1,1,1,1       PL:GT:GQ        111,0,120:0/1:99
+chr2a  3661005 .       C       G       24      .       DP=13;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=7,0,4,0;MQ=27;PV4=1,1.1e-05,1,1       PL:GT:GQ        54,0,34:0/1:37
+chr2a  4140063 .       G       A       81      .       DP=26;AF1=0.6671;CI95=0.5,1;DP4=18,0,8,0;MQ=24;PV4=1,8.3e-09,1,1        PL:GT:GQ        110,0,3:0/1:5
+chr2a  4248440 .       T       C       20      .       DP=28;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=11,0,7,0;MQ=25;PV4=1,1,0.47,1    PL:GT:GQ        50,0,92:0/1:53
+chr2a  4707656 .       A       G       63      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=49 PL:GT:GQ        95,9,0:1/1:63
+chr2a  5194801 .       G       A       7.59    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=24 PL:GT:GQ        38,6,0:1/1:49
+chr2a  14111103        .       A       G       7.84    .       DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=20   PL:GT:GQ        40,21,0:1/1:84
+chr2a  17799746        .       A       G       11.3    .       DP=5;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=0,3,0,2;MQ=32;PV4=1,1,1,1      PL:GT:GQ        41,0,35:0/1:37
+chr2a  24728910        .       G       A       45.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=28 PL:GT:GQ        78,15,0:1/1:75
+chr2a  29627939        .       G       T       5.44    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=27 PL:GT:GQ        36,9,0:1/1:63
+chr2a  31373164        .       C       T       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=44 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr2a  33935228        .       T       C       41.8    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=51 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr2a  36311856        .       G       A       99      .       DP=30;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,29;MQ=44 PL:GT:GQ        213,87,0:1/1:99
+chr2a  39281204        .       T       C       68      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=49 PL:GT:GQ        100,9,0:1/1:63
+chr2a  41087565        .       C       T       74.5    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=38 PL:GT:GQ        107,12,0:1/1:72
+chr2a  45574768        .       C       A       11.3    .       DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=18 PL:GT:GQ        43,9,0:1/1:63
+chr2a  55464464        .       T       C       26.1    .       DP=7;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=5,0,2,0;MQ=26;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        55,1,0:1/1:23
+chr2a  63107673        .       T       A       70.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=34 PL:GT:GQ        103,12,0:1/1:72
+chr2a  63141732        .       A       T       22.8    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=42 PL:GT:GQ        54,6,0:1/1:49
+chr2a  63141910        .       G       A       3.41    .       DP=16;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=32        PL:GT:GQ        32,6,0:1/1:49
+chr2a  63141911        .       C       T       9.55    .       DP=16;AF1=0.5031;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,3;MQ=33;PV4=1,0.43,1,1  PL:GT:GQ        39,0,19:0/1:22
+chr2a  63143543        .       C       T       28      .       DP=18;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,0,17;MQ=16;PV4=1,1,1,1     PL:GT:GQ        61,42,0:1/1:99
+chr2a  66419805        .       G       A       3.69    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=23 PL:GT:GQ        34,15,0:1/1:75
+chr2a  66563922        .       C       T       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=51 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr2a  67719136        .       C       T       39.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=50 PL:GT:GQ        71,6,0:1/1:49
+chr2a  72781453        .       A       C       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=50 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr2a  76733211        .       G       A       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr2a  78190502        .       A       C       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr2a  85021209        .       A       G       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr2a  88554861        .       A       T       39      .       DP=74;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,7,0,4;MQ=46;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        69,0,92:0/1:72
+chr2a  88554877        .       A       G       92      .       DP=90;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,23,0,13;MQ=41;PV4=1,0.3,1,1    PL:GT:GQ        122,0,128:0/1:99
+chr2a  88824857        .       G       A       13.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=37 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr2a  93546675        .       C       T       26      .       DP=6;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,2,0;MQ=46;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ        56,0,87:0/1:59
+chr2a  94788853        .       A       G       34.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=43 PL:GT:GQ        67,15,0:1/1:75
+chr2a  96738146        .       T       C       11.3    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=40 PL:GT:GQ        43,9,0:1/1:63
+chr2a  102737384       .       A       G       12.3    .       DP=18;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,18,0;MQ=11 PL:GT:GQ        45,54,0:1/1:99
+chr2a  103407172       .       A       G       35      .       DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=19   PL:GT:GQ        68,24,0:1/1:96
+chr2a  105774580       .       T       G       99      .       DP=13;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,13,0;MQ=30 PL:GT:GQ        135,39,0:1/1:99
+chr2a  106376301       .       C       G       24.1    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=19 PL:GT:GQ        57,18,0:1/1:90
+chr2a  106376315       .       C       T       8.75    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=19 PL:GT:GQ        41,18,0:1/1:90
+chr2a  112422267       .       C       T       30      .       DP=20;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=14,0,5,0;MQ=39;PV4=1,1,1,1       PL:GT:GQ        60,0,131:0/1:63
+chr2b  3049384 .       A       C       14.9    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=42 PL:GT:GQ        46,6,0:1/1:49
+chr2b  3049385 .       G       C       14.9    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=42 PL:GT:GQ        46,6,0:1/1:49
+chr2b  3049406 .       C       G       99      .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=36 PL:GT:GQ        135,18,0:1/1:90
+chr2b  4213802 .       T       C       89.5    .       DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=49        PL:GT:GQ        122,12,0:1/1:72
+chr2b  5022895 .       G       A       66      .       DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,10;MQ=49 PL:GT:GQ        99,30,0:1/1:99
+chr2b  6037666 .       G       T       56      .       DP=18;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,13;MQ=17 PL:GT:GQ        89,39,0:1/1:99
+chr2b  13656952        .       G       A       19.2    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=21 PL:GT:GQ        52,18,0:1/1:90
+chr2b  15026944        .       A       G       6.79    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=32 PL:GT:GQ        37,6,0:1/1:49
+chr2b  23362613        .       A       G       5.64    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=22 PL:GT:GQ        37,15,0:1/1:75
+chr2b  45947861        .       C       G       68      .       DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,11;MQ=50 PL:GT:GQ        101,33,0:1/1:99
+chr2b  46597824        .       T       C       65.6    .       DP=39;AF1=0.5939;CI95=0.5,1;DP4=23,0,10,0;MQ=22;PV4=1,0.014,1,1 PL:GT:GQ        95,0,5:0/1:7
+chr2b  49665191        .       G       T       34.1    .       DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=37   PL:GT:GQ        67,21,0:1/1:84
+chr2b  61001546        .       A       G       48      .       DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=26   PL:GT:GQ        81,24,0:1/1:96
+chr2b  88502851        .       T       C       4.77    .       DP=4;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,2;MQ=37;PV4=1,1,0.46,1      PL:GT:GQ        33,0,34:0/1:33
+chr2b  91675431        .       C       T       30      .       DP=14;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=27  PL:GT:GQ        63,24,0:1/1:96
+chr2b  91870148        .       T       G       67      .       DP=14;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,0,13;MQ=47;PV4=1,1,1,1     PL:GT:GQ        100,31,0:1/1:99
+chr2b  97066826        .       G       A       20.1    .       DP=9;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=0,6,0,2;MQ=31;PV4=1,1,1,1      PL:GT:GQ        50,0,35:0/1:38
+chr2b  97670822        .       G       A       4.85    .       DP=6;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,6;MQ=18   PL:GT:GQ        36,18,0:1/1:90
+chr2b  102773175       .       A       G       17.1    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=38 PL:GT:GQ        49,9,0:1/1:63
+chr2b  109805532       .       T       C       99      .       DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=45   PL:GT:GQ        176,24,0:1/1:96
+chr2b  110841448       .       A       G       11.1    .       DP=20;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=44        PL:GT:GQ        42,6,0:1/1:49
+chr2b  123217025       .       T       C       31.5    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=37 PL:GT:GQ        64,12,0:1/1:72
+chr2b  123263214       .       A       G       11.3    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=35 PL:GT:GQ        43,9,0:1/1:63
+chr2b  127747292       .       C       T       68      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=52 PL:GT:GQ        100,9,0:1/1:63
+chr2b  130121958       .       A       G       89.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=43 PL:GT:GQ        122,15,0:1/1:75
+chr2b  130253633       .       A       G       14.9    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=42 PL:GT:GQ        46,6,0:1/1:49
+chr2b  130692761       .       C       T       49.1    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=51 PL:GT:GQ        82,18,0:1/1:90
+chr2b  130743365       .       A       G       99      .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=42 PL:GT:GQ        140,15,0:1/1:75
+chr2b  131553874       .       A       C       11.3    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=37 PL:GT:GQ        43,9,0:1/1:63
+chr2b  131716894       .       A       G       99      .       DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=40   PL:GT:GQ        137,24,0:1/1:96
+chr2b  131716936       .       G       A       99      .       DP=14;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,12;MQ=36 PL:GT:GQ        173,36,0:1/1:99
+chr2b  131716952       .       A       G       99      .       DP=22;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,7,0,14;MQ=36;PV4=1,1,1,1       PL:GT:GQ        152,0,43:0/1:46
+chr2b  133360184       .       C       T       99      .       DP=20;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,20;MQ=32 PL:GT:GQ        163,60,0:1/1:99
+chr2b  133644741       .       T       A       16.4    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=27 PL:GT:GQ        49,15,0:1/1:75
+chr2b  133720595       .       T       C       41      .       DP=15;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,12;MQ=29 PL:GT:GQ        74,36,0:1/1:99
+chr2b  133727192       .       C       T       19.3    .       DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=23 PL:GT:GQ        52,15,0:1/1:75
+chr2b  133727260       .       G       A       3.56    .       DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=18   PL:GT:GQ        34,24,0:1/1:95
+chr2b  133800294       .       A       G       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=23 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr2b  134582754       .       A       C       56.1    .       DP=37;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=36  PL:GT:GQ        89,21,0:1/1:84
+chr2b  134582763       .       G       C       78      .       DP=37;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,36;MQ=34 PL:GT:GQ        111,108,0:1/1:99
+chr2b  134809668       .       G       A       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr3   527814  .       C       G       46      .       DP=9;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=6,0,3,0;MQ=43;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ        76,0,106:0/1:79
+chr3   559510  .       G       A       38      .       DP=27;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=10,0,17,0;MQ=28;PV4=1,1,0.014,1  PL:GT:GQ        68,0,111:0/1:71
+chr3   879433  .       T       G       32      .       DP=4;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,2,0;MQ=43;PV4=1,1,1,1      PL:GT:GQ        62,0,34:0/1:37
+chr3   1809645 .       A       G       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=51 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr3   3235812 .       C       T       7.59    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=45 PL:GT:GQ        38,6,0:1/1:49
+chr3   3250176 .       A       G       83      .       DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=32   PL:GT:GQ        116,24,0:1/1:96
+chr3   5049073 .       T       A       99      .       DP=25;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=16,0,9,0;MQ=39;PV4=1,1,1,1       PL:GT:GQ        136,0,129:0/1:99
+chr3   5142874 .       G       A       99      .       DP=38;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,38,0;MQ=28 PL:GT:GQ        179,114,0:1/1:99
+chr3   5554864 .       T       C       3.54    .       DP=7;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=0,4,0,3;MQ=27;PV4=1,1,1,1      PL:GT:GQ        31,0,35:0/1:33
+chr3   5749648 .       G       A       21.2    .       DP=26;AF1=0.7303;CI95=0.5,1;DP4=0,7,0,7;MQ=26;PV4=1,0.16,1,0.17 PL:GT:GQ        50,0,2:0/1:3
+chr3   16451708        .       A       T       71.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=38 PL:GT:GQ        104,15,0:1/1:75
+chr3   23410276        .       G       A       99      .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=45 PL:GT:GQ        140,15,0:1/1:75
+chr3   51368824        .       A       G       28      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=48 PL:GT:GQ        60,9,0:1/1:63
+chr3   53000453        .       A       G       54      .       DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,10;MQ=19 PL:GT:GQ        87,30,0:1/1:99
+chr3   53000463        .       A       G       54      .       DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,10;MQ=19 PL:GT:GQ        87,30,0:1/1:99
+chr3   59077423        .       C       T       77.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=33 PL:GT:GQ        110,15,0:1/1:75
+chr3   60040501        .       T       C       11.3    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=35 PL:GT:GQ        43,9,0:1/1:63
+chr3   64203481        .       A       G       33.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=49 PL:GT:GQ        66,12,0:1/1:72
+chr3   67947441        .       C       T       17.6    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=25 PL:GT:GQ        50,12,0:1/1:72
+chr3   76372631        .       A       G       44      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=36 PL:GT:GQ        76,9,0:1/1:63
+chr3   80611316        .       C       G       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr3   81554381        .       G       T       17.6    .       DP=24;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=26        PL:GT:GQ        50,12,0:1/1:72
+chr3   87614647        .       A       G       13.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=34 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr3   93900455        .       A       T       11.6    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=13 PL:GT:GQ        44,15,0:1/1:75
+chr3   96174457        .       A       G       4.11    .       DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=24 PL:GT:GQ        34,9,0:1/1:63
+chr3   96215569        .       A       C       3.41    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=32 PL:GT:GQ        32,6,0:1/1:49
+chr3   96587998        .       A       C       7.08    .       DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,6,0;MQ=17   PL:GT:GQ        39,18,0:1/1:90
+chr3   99711220        .       A       C       12.8    .       DP=11;AF1=0.9998;CI95=0.5,1;DP4=1,0,2,0;MQ=35;PV4=1,1,1,1       PL:GT:GQ        42,2,0:1/1:37
+chr3   99789741        .       C       G       99      .       DP=18;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,17,0;MQ=47 PL:GT:GQ        210,51,0:1/1:99
+chr3   103667651       .       A       C       3.98    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=37 PL:GT:GQ        33,6,0:1/1:49
+chr3   104604896       .       G       C       55      .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=50 PL:GT:GQ        87,9,0:1/1:63
+chr3   104997217       .       G       A       33.1    .       DP=18;AF1=1;CI95=1,1;DP4=1,0,16,0;MQ=34;PV4=1,3e-10,0.17,0.36   PL:GT:GQ        66,19,0:1/1:76
+chr3   106097816       .       A       G       28      .       DP=15;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,15;MQ=26 PL:GT:GQ        61,45,0:1/1:99
+chr3   106822259       .       G       C       99      .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=50 PL:GT:GQ        140,15,0:1/1:75
+chr3   109946413       .       G       A       13      .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=34 PL:GT:GQ        44,6,0:1/1:49
+chr3   121238963       .       T       C       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=51 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr3   126248567       .       A       G       13.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=33 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr3   129733836       .       A       G       6.2     .       DP=4;AF1=0.5003;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,3,0;MQ=43;PV4=1,0.02,0.31,1        PL:GT:GQ        35,0,28:0/1:30
+chr3   131372785       .       C       T       44      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=34 PL:GT:GQ        76,9,0:1/1:63
+chr3   132290987       .       C       T       22      .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=45 PL:GT:GQ        54,9,0:1/1:63
+chr3   136054421       .       C       T       73      .       DP=82;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,78,0;MQ=28 PL:GT:GQ        106,235,0:1/1:99
+chr3   141075246       .       G       A       30.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=41 PL:GT:GQ        62,6,0:1/1:49
+chr3   141075262       .       T       G       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=41 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr3   141430649       .       G       T       81.8    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,4;MQ=41;PV4=1,0.34,1,0.25       PL:GT:GQ        113,6,0:1/1:49
+chr3   143617747       .       G       T       22      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=29 PL:GT:GQ        54,9,0:1/1:63
+chr3   163576128       .       C       T       5.6     .       DP=4;AF1=0.7302;CI95=0.5,1;DP4=2,0,2,0;MQ=23;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        33,0,2:0/1:3
+chr3   163839828       .       A       G       4.45    .       DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=26 PL:GT:GQ        35,12,0:1/1:72
+chr3   175839340       .       G       T       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=51 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr3   190193258       .       G       T       3.98    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35 PL:GT:GQ        33,6,0:1/1:49
+chr3   190777007       .       G       A       13      .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ        44,6,0:1/1:49
+chr3   190970350       .       A       G       61      .       DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=37 PL:GT:GQ        94,30,0:1/1:99
+chr3   198686408       .       G       A       36.6    .       DP=17;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,16;MQ=25;PV4=1,1,0.026,1       PL:GT:GQ        69,11,0:1/1:66
+chr3   199277478       .       T       C       3.61    .       DP=6;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,6;MQ=21   PL:GT:GQ        34,18,0:1/1:90
+chr3   199780181       .       G       T       77      .       DP=45;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,35,0,10;MQ=33;PV4=1,1,1,1      PL:GT:GQ        107,0,114:0/1:99
+chr3   199889335       .       A       C       9.54    .       DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=18  PL:GT:GQ        42,24,0:1/1:96
+chr3   200018161       .       A       G       13.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=31 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr4   195475  .       A       G       13      .       DP=13;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47        PL:GT:GQ        44,6,0:1/1:49
+chr4   639141  .       C       A       14.9    .       DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=42        PL:GT:GQ        46,6,0:1/1:49
+chr4   639152  .       C       T       15.2    .       DP=17;AF1=0.5016;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,2;MQ=33;PV4=1,1,1,1     PL:GT:GQ        45,0,22:0/1:25
+chr4   986497  .       G       T       99      .       DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=33 PL:GT:GQ        163,30,0:1/1:99
+chr4   986516  .       C       T       55.1    .       DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=37   PL:GT:GQ        88,21,0:1/1:84
+chr4   1207485 .       A       C       14.9    .       DP=22;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=45        PL:GT:GQ        46,6,0:1/1:49
+chr4   1323502 .       G       A       13.2    .       DP=13;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,11,0;MQ=22 PL:GT:GQ        46,33,0:1/1:99
+chr4   1613521 .       G       A       89      .       DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,16,0;MQ=32 PL:GT:GQ        122,48,0:1/1:99
+chr4   1748790 .       C       T       38      .       DP=21;AF1=0.5005;CI95=0.5,0.5;DP4=6,0,8,0;MQ=40;PV4=1,0.09,1,1  PL:GT:GQ        68,0,27:0/1:30
+chr4   2255732 .       T       C       99      .       DP=29;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,28,0;MQ=31 PL:GT:GQ        186,84,0:1/1:99
+chr4   3010159 .       C       T       13.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=31 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr4   3545023 .       A       G       99      .       DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,9;MQ=38   PL:GT:GQ        145,27,0:1/1:99
+chr4   3586344 .       C       T       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=44 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr4   3879337 .       A       G       16.6    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=25 PL:GT:GQ        49,12,0:1/1:72
+chr4   3940733 .       A       G       47.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=31 PL:GT:GQ        80,15,0:1/1:75
+chr4   4410338 .       T       C       13.5    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=31 PL:GT:GQ        46,15,0:1/1:75
+chr4   4796408 .       T       C       41      .       DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,16;MQ=17 PL:GT:GQ        74,48,0:1/1:99
+chr4   4796414 .       A       G       11.3    .       DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,15;MQ=17 PL:GT:GQ        44,45,0:1/1:99
+chr4   6436959 .       T       C       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=50 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr4   9494256 .       T       C       3.41    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=37 PL:GT:GQ        32,6,0:1/1:49
+chr4   24881479        .       G       A       14.1    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=42 PL:GT:GQ        46,9,0:1/1:63
+chr4   26128644        .       A       G       23      .       DP=18;AF1=0.5006;CI95=0.5,0.5;DP4=8,0,10,0;MQ=22;PV4=1,1,1,1    PL:GT:GQ        53,0,26:0/1:29
+chr4   42109100        .       G       A       17.1    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=48 PL:GT:GQ        49,9,0:1/1:63
+chr4   42309652        .       C       T       68      .       DP=17;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=50        PL:GT:GQ        100,9,0:1/1:63
+chr4   46913966        .       C       T       9.08    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=16 PL:GT:GQ        41,12,0:1/1:72
+chr4   50335142        .       A       G       44      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=41 PL:GT:GQ        76,9,0:1/1:63
+chr4   51658550        .       C       A       13      .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=48 PL:GT:GQ        44,6,0:1/1:49
+chr4   58258023        .       T       C       26      .       DP=5;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=0,3,0,2;MQ=34;PV4=1,1,1,0.05   PL:GT:GQ        56,0,32:0/1:35
+chr4   59219112        .       C       A       42.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=50 PL:GT:GQ        75,12,0:1/1:72
+chr4   62746067        .       C       T       13.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr4   67404338        .       G       T       33.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=39 PL:GT:GQ        66,12,0:1/1:72
+chr4   73353380        .       A       G       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr4   73946294        .       G       C       4.77    .       DP=51;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=0,5,0,3;MQ=40;PV4=1,0.19,0.37,0.11    PL:GT:GQ        33,0,64:0/1:36
+chr4   79607484        .       A       G       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr4   82337365        .       G       C       90      .       DP=54;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,16;MQ=28 PL:GT:GQ        123,48,0:1/1:99
+chr4   82653801        .       A       G       4.11    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=29 PL:GT:GQ        34,9,0:1/1:63
+chr4   87130164        .       C       T       11.3    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=26 PL:GT:GQ        43,9,0:1/1:63
+chr4   87130176        .       G       A       11.3    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=26 PL:GT:GQ        43,9,0:1/1:63
+chr4   91459729        .       C       A       13      .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ        44,6,0:1/1:49
+chr4   96130778        .       G       C       99      .       DP=19;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,19;MQ=45 PL:GT:GQ        211,57,0:1/1:99
+chr4   100709417       .       A       G       45.1    .       DP=16;AF1=0.505;CI95=0.5,0.5;DP4=12,0,4,0;MQ=24;PV4=1,1,1,1     PL:GT:GQ        75,0,17:0/1:20
+chr4   107276770       .       C       T       70      .       DP=15;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,9,0,6;MQ=31;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        100,0,97:0/1:98
+chr4   115327550       .       G       C       42      .       DP=67;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,0,66;MQ=35;PV4=1,3.2e-24,0.13,1    PL:GT:GQ        75,162,0:1/1:99
+chr4   136558502       .       A       G       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr4   159572459       .       G       A       15.1    .       DP=126;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,69,0,57;MQ=39;PV4=1,4.1e-96,0.077,1   PL:GT:GQ        45,0,175:0/1:48
+chr4   174968484       .       G       C       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=42 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr4   175030633       .       T       C       14.3    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=29 PL:GT:GQ        47,18,0:1/1:90
+chr4   183410027       .       G       T       6.2     .       DP=31;AF1=0.5003;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,2,0;MQ=45;PV4=1,0.035,1,0.21      PL:GT:GQ        35,0,28:0/1:30
+chr4   190907368       .       T       C       33.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=50 PL:GT:GQ        66,12,0:1/1:72
+chr4   192175690       .       A       G       76.8    .       DP=7;AF1=0.95;CI95=0.5,1;DP4=0,3,0,4;MQ=35;PV4=1,1,1,1  PL:GT:GQ        105,0,0:1/1:10
+chr4   192673268       .       G       A       14.2    .       DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,9,0;MQ=22   PL:GT:GQ        47,27,0:1/1:99
+chr4   192943966       .       T       C       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=44 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr4   195460104       .       C       G       23.1    .       DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=19   PL:GT:GQ        56,24,0:1/1:96
+chr4   198277830       .       A       G       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr5   170098  .       A       G       13      .       DP=12;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=30        PL:GT:GQ        44,6,0:1/1:49
+chr5   395814  .       T       C       4.77    .       DP=4;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,2;MQ=36;PV4=1,1,0.48,1      PL:GT:GQ        33,0,33:0/1:33
+chr5   414024  .       T       A       10.4    .       DP=17;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=20        PL:GT:GQ        42,9,0:1/1:63
+chr5   496767  .       T       C       13.9    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=36 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr5   805676  .       C       G       45      .       DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,17,0;MQ=32 PL:GT:GQ        78,51,0:1/1:99
+chr5   1252896 .       A       G       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr5   1418370 .       G       A       3.65    .       DP=8;AF1=0.7301;CI95=0.5,1;DP4=4,0,4,0;MQ=13;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        30,0,2:0/1:3
+chr5   1494911 .       G       C       62      .       DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=46   PL:GT:GQ        95,24,0:1/1:96
+chr5   1494932 .       C       T       6.98    .       DP=8;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,2,0;MQ=46;PV4=1,0.1,0.077,1        PL:GT:GQ        36,0,31:0/1:33
+chr5   1506037 .       T       C       24.1    .       DP=24;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=11,0,13,0;MQ=16;PV4=1,1,1,1  PL:GT:GQ        55,5,0:1/1:46
+chr5   1509406 .       A       G       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=47 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr5   1733649 .       A       G       99      .       DP=25;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,25;MQ=47 PL:GT:GQ        212,75,0:1/1:99
+chr5   1747304 .       A       G       12.3    .       DP=12;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,12;MQ=19 PL:GT:GQ        45,36,0:1/1:99
+chr5   1747308 .       C       A       44      .       DP=12;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,12;MQ=19 PL:GT:GQ        77,36,0:1/1:99
+chr5   3519783 .       C       T       21.1    .       DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=18   PL:GT:GQ        54,24,0:1/1:96
+chr5   4101593 .       A       G       69.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=43 PL:GT:GQ        102,12,0:1/1:72
+chr5   7204332 .       T       A       4.61    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=24 PL:GT:GQ        34,6,0:1/1:49
+chr5   11510398        .       A       C       34      .       DP=3;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,2,0;MQ=51;PV4=1,1,0,1      PL:GT:GQ        64,0,31:0/1:34
+chr5   15406720        .       T       C       6.02    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=51 PL:GT:GQ        36,6,0:1/1:49
+chr5   25152417        .       C       A       10.9    .       DP=28;AF1=0.5718;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,6;MQ=25;PV4=1,1,0.21,1    PL:GT:GQ        40,0,6:0/1:8
+chr5   39072637        .       A       G       35.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=50 PL:GT:GQ        68,15,0:1/1:75
+chr5   46022699        .       G       A       44      .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=35 PL:GT:GQ        76,9,0:1/1:63
+chr5   55664181        .       C       G       10.4    .       DP=8;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=3,0,5,0;MQ=18;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        40,3,0:1/1:41
+chr5   56253386        .       T       C       50.1    .       DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=36   PL:GT:GQ        83,21,0:1/1:84
+chr5   56253447        .       C       T       42.5    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=45 PL:GT:GQ        75,12,0:1/1:72
+chr5   71950166        .       G       T       11.3    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=40 PL:GT:GQ        43,9,0:1/1:63
+chr5   72703090        .       C       T       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=46 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr5   73570280        .       G       T       5.45    .       DP=41;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,41,0;MQ=15 PL:GT:GQ        37,123,0:1/1:99
+chr5   73701762        .       G       T       40.8    .       DP=13;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=43        PL:GT:GQ        72,6,0:1/1:49
+chr5   76956867        .       T       C       10.2    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=46 PL:GT:GQ        41,6,0:1/1:49
+chr5   79097961        .       C       G       22      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=40 PL:GT:GQ        54,9,0:1/1:63
+chr5   87026167        .       T       C       22      .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=49 PL:GT:GQ        54,9,0:1/1:63
+chr5   97680525        .       T       C       3.27    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=23 PL:GT:GQ        33,12,0:1/1:72
+chr5   100674737       .       C       T       13.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr5   105389966       .       T       C       3.52    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=15 PL:GT:GQ        33,9,0:1/1:63
+chr5   109998341       .       A       C       12.7    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=35 PL:GT:GQ        45,12,0:1/1:72
+chr5   120629105       .       C       T       6.79    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:GT:GQ        37,6,0:1/1:49
+chr5   128383954       .       C       T       23      .       DP=10;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,5,0,5;MQ=48;PV4=1,3.3e-07,1,1  PL:GT:GQ        53,0,98:0/1:56
+chr5   133925142       .       A       G       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr5   135375404       .       T       C       11.8    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=1,0,3,0;MQ=31;PV4=1,0.03,1,1  PL:GT:GQ        42,4,0:1/1:45
+chr5   136498281       .       T       G       13.9    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=37 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr5   136717285       .       A       G       82.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=48 PL:GT:GQ        115,12,0:1/1:72
+chr5   136910734       .       G       A       62      .       DP=19;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,0,13;MQ=23;PV4=1,1,1,1     PL:GT:GQ        95,31,0:1/1:99
+chr5   141208149       .       C       G       13      .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ        44,6,0:1/1:49
+chr5   148056348       .       C       A       37.1    .       DP=4;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=1,0,2,0;MQ=38;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        66,1,0:1/1:23
+chr5   151941534       .       G       T       46.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=34 PL:GT:GQ        79,12,0:1/1:72
+chr5   159967229       .       G       C       22.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=35 PL:GT:GQ        55,12,0:1/1:72
+chr5   174024541       .       T       G       29.5    .       DP=3;AF1=0.9998;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,2;MQ=32;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        59,2,0:1/1:37
+chr5   175525290       .       A       G       3.27    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=20 PL:GT:GQ        33,12,0:1/1:72
+chr5   175988954       .       A       C       14.2    .       DP=23;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,6,0,4;MQ=47;PV4=1,1,0.2,1      PL:GT:GQ        44,0,76:0/1:47
+chr5   176782226       .       T       C       9.31    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=43 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr5   179132834       .       C       G       99      .       DP=28;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,28;MQ=41 PL:GT:GQ        207,84,0:1/1:99
+chr5   180155809       .       G       C       3.01    .       DP=36;AF1=0.4997;CI95=0.5,0.5;DP4=25,0,9,0;MQ=35;PV4=1,1e-15,1,1        PL:GT:GQ        30,0,121:0/1:33
+chr5   181282819       .       T       G       38.3    .       DP=11;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,9;MQ=23;PV4=1,1,1,1    PL:GT:GQ        71,14,0:1/1:70
+chr5   182426125       .       G       C       29      .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=26 PL:GT:GQ        61,9,0:1/1:63
+chr5   182443682       .       G       A       3.69    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=21 PL:GT:GQ        34,15,0:1/1:75
+chr5   183008993       .       C       T       22      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=49 PL:GT:GQ        54,9,0:1/1:63
+chr5   183312016       .       G       T       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=47 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr6_cox_hap1  519146  .       G       A       17.1    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=30 PL:GT:GQ        49,9,0:1/1:63
+chr6_cox_hap1  687497  .       A       G       33      .       DP=6;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=2,0,4,0;MQ=35;PV4=1,0.0016,1,1   PL:GT:GQ        63,3,0:1/1:41
+chr6_qbl_hap2  120066  .       T       C       99      .       DP=12;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,9;MQ=37  PL:GT:GQ        139,27,0:1/1:99
+chr6   277954  .       C       T       53      .       DP=41;AF1=1;CI95=1,1;DP4=4,0,37,0;MQ=19;PV4=1,1,0.3,1   PL:GT:GQ        86,49,0:1/1:99
+chr6   593158  .       A       G       4.61    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=32 PL:GT:GQ        34,6,0:1/1:49
+chr6   2865562 .       T       G       25      .       DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,9,0;MQ=23   PL:GT:GQ        58,27,0:1/1:99
+chr6   3751403 .       G       A       42.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=32 PL:GT:GQ        75,15,0:1/1:75
+chr6   3884989 .       A       G       13.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=36 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr6   4127278 .       A       T       13.9    .       DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr6   5887783 .       C       G       99      .       DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=34   PL:GT:GQ        142,21,0:1/1:84
+chr6   5887811 .       C       T       55.1    .       DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=34   PL:GT:GQ        88,21,0:1/1:84
+chr6   6937170 .       G       C       99      .       DP=47;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,47;MQ=28 PL:GT:GQ        157,141,0:1/1:99
+chr6   7262317 .       C       T       13.2    .       DP=50;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=21,0,9,0;MQ=36;PV4=1,4e-05,0.17,0.26     PL:GT:GQ        43,0,158:0/1:46
+chr6   7533214 .       A       G       10.4    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=26 PL:GT:GQ        42,9,0:1/1:63
+chr6   20979907        .       A       G       44      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=38 PL:GT:GQ        76,9,0:1/1:63
+chr6   22321632        .       A       G       41      .       DP=5;AF1=0.5004;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,3,0;MQ=46;PV4=1,0.24,0.19,0.33     PL:GT:GQ        71,0,28:0/1:31
+chr6   25352296        .       G       A       7.8     .       DP=4;AF1=0.5003;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,3;MQ=38;PV4=1,1,0.16,1   PL:GT:GQ        37,0,28:0/1:30
+chr6   26298040        .       T       A       34      .       DP=3;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,2;MQ=48;PV4=1,1,0.21,0.33        PL:GT:GQ        64,0,31:0/1:34
+chr6   33428755        .       G       A       70      .       DP=14;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,9,0;MQ=32  PL:GT:GQ        103,27,0:1/1:99
+chr6   39512099        .       G       A       55.1    .       DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=50   PL:GT:GQ        88,21,0:1/1:84
+chr6   39961094        .       G       A       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr6   40452120        .       A       G       40.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=42 PL:GT:GQ        72,6,0:1/1:49
+chr6   43204766        .       A       G       99      .       DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=51   PL:GT:GQ        176,24,0:1/1:96
+chr6   52696512        .       C       T       70      .       DP=76;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,34,0,42;MQ=18;PV4=1,0.11,1,1   PL:GT:GQ        100,0,51:0/1:54
+chr6   53785550        .       A       G       99      .       DP=20;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,10;MQ=46 PL:GT:GQ        190,30,0:1/1:99
+chr6   53897484        .       C       T       13.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=36 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr6   57038290        .       C       T       10.2    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=36 PL:GT:GQ        41,6,0:1/1:49
+chr6   62925087        .       G       C       35      .       DP=5;AF1=0.5008;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,4,0;MQ=36;PV4=1,1,0.2,1    PL:GT:GQ        65,0,25:0/1:28
+chr6   62925094        .       T       C       25.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=36 PL:GT:GQ        58,15,0:1/1:75
+chr6   70834405        .       G       A       72.1    .       DP=13;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=29  PL:GT:GQ        105,21,0:1/1:84
+chr6   71026058        .       C       T       48.1    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=42 PL:GT:GQ        81,18,0:1/1:90
+chr6   74420752        .       T       C       44      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=39 PL:GT:GQ        76,9,0:1/1:63
+chr6   77498624        .       T       C       16.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=33 PL:GT:GQ        48,6,0:1/1:49
+chr6   80416836        .       T       C       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=50 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr6   113611590       .       A       G       68      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=46 PL:GT:GQ        100,9,0:1/1:63
+chr6   119308431       .       T       C       38.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=40 PL:GT:GQ        71,12,0:1/1:72
+chr6   151758592       .       T       C       3.07    .       DP=17;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=0,8,0,9;MQ=13;PV4=1,1,1,1       PL:GT:GQ        29,1,0:1/1:23
+chr6   151759358       .       A       G       99      .       DP=27;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=12,0,15,0;MQ=44;PV4=1,1,1,0.19   PL:GT:GQ        171,0,128:0/1:99
+chr6   154741755       .       G       A       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=50 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr6   161061053       .       C       A       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=52 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr6   161474189       .       C       T       6.02    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ        36,6,0:1/1:49
+chr6   164304657       .       C       T       10.4    .       DP=63;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,29,0,19;MQ=22;PV4=1,7.7e-11,1,0.049    PL:GT:GQ        40,0,37:0/1:38
+chr6   164703105       .       T       C       99      .       DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,10;MQ=40 PL:GT:GQ        165,30,0:1/1:99
+chr6   167518328       .       A       G       78      .       DP=41;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=27,0,14,0;MQ=33;PV4=1,0.026,0.43,0.056   PL:GT:GQ        108,0,149:0/1:99
+chr6   169906323       .       G       A       41.8    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr6   171893912       .       G       A       69.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=33 PL:GT:GQ        102,15,0:1/1:75
+chr6   173631604       .       A       G       6.98    .       DP=7;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,3,0;MQ=37;PV4=1,0.069,1,1     PL:GT:GQ        36,0,34:0/1:35
+chr7   835856  .       C       T       27.5    .       DP=13;AF1=0.9998;CI95=0.5,1;DP4=4,0,6,0;MQ=23;PV4=1,0.46,1,1    PL:GT:GQ        57,2,0:1/1:37
+chr7   1046005 .       C       T       11.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=36 PL:GT:GQ        43,9,0:1/1:63
+chr7   1564339 .       C       T       71      .       DP=66;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=36,0,24,0;MQ=29;PV4=1,1,0.35,1   PL:GT:GQ        101,0,134:0/1:99
+chr7   1806266 .       C       T       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr7   1936013 .       G       T       7.77    .       DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=17 PL:GT:GQ        39,9,0:1/1:63
+chr7   2319532 .       C       A       4.11    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=14 PL:GT:GQ        34,9,0:1/1:63
+chr7   2682121 .       C       T       13      .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=33 PL:GT:GQ        44,6,0:1/1:49
+chr7   3248116 .       T       C       36.5    .       DP=3;AF1=0.9998;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,2;MQ=37;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        66,2,0:1/1:37
+chr7   3624766 .       C       T       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=41 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr7   5291140 .       G       C       13.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=37 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr7   5314457 .       C       A       3.56    .       DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=18   PL:GT:GQ        34,24,0:1/1:95
+chr7   5595072 .       T       A       79      .       DP=13;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=8,0,5,0;MQ=31;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        109,0,57:0/1:60
+chr7   5646060 .       G       C       7.79    .       DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=10 PL:GT:GQ        40,30,0:1/1:99
+chr7   6056816 .       C       G       7.08    .       DP=6;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,3;MQ=23;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        35,1,0:1/1:23
+chr7   6412641 .       C       T       40      .       DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,11,0;MQ=33 PL:GT:GQ        73,33,0:1/1:99
+chr7   6766874 .       A       G       34.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=43 PL:GT:GQ        67,15,0:1/1:75
+chr7   8482729 .       C       T       5.08    .       DP=16;AF1=0.8276;CI95=0.5,1;DP4=3,0,3,0;MQ=22;PV4=1,1,1,0.19    PL:GT:GQ        32,0,1:1/1:5
+chr7   9238362 .       G       A       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr7   9687781 .       G       A       33      .       DP=29;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,16,0,12;MQ=48;PV4=1,6.5e-38,1,1        PL:GT:GQ        63,0,170:0/1:66
+chr7   9752803 .       A       T       14.2    .       DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,9,0;MQ=18  PL:GT:GQ        47,27,0:1/1:99
+chr7   10240910        .       T       C       45.5    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=35 PL:GT:GQ        78,12,0:1/1:72
+chr7   11046187        .       C       T       86.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=47 PL:GT:GQ        119,12,0:1/1:72
+chr7   11548207        .       C       G       14.6    .       DP=13;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=6,1,0,5;MQ=18;PV4=0.015,1,1,1        PL:GT:GQ        46,7,0:1/1:57
+chr7   11580317        .       C       T       42      .       DP=12;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,0,10;MQ=22;PV4=1,1,1,1     PL:GT:GQ        75,23,0:1/1:92
+chr7   11585384        .       G       A       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=46 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr7   13498356        .       A       G       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=47 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr7   13500887        .       G       A       15.1    .       DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=22 PL:GT:GQ        48,30,0:1/1:99
+chr7   13827079        .       C       T       6.02    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:GT:GQ        36,6,0:1/1:49
+chr7   14403976        .       T       G       59      .       DP=30;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=39  PL:GT:GQ        92,24,0:1/1:96
+chr7   14756588        .       A       G       44      .       DP=15;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=5,0,10,0;MQ=44;PV4=1,5.3e-18,1,1 PL:GT:GQ        74,0,70:0/1:72
+chr7   14756619        .       T       G       44      .       DP=15;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=5,0,10,0;MQ=44;PV4=1,6.4e-10,1,1 PL:GT:GQ        74,0,70:0/1:72
+chr7   36734598        .       A       C       11.1    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=40 PL:GT:GQ        42,6,0:1/1:49
+chr7   36734599        .       A       T       11.1    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=40 PL:GT:GQ        42,6,0:1/1:49
+chr7   36734603        .       G       C       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=40 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr7   40634921        .       A       C       55      .       DP=13;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,13,0;MQ=39 PL:GT:GQ        88,39,0:1/1:99
+chr7   48271285        .       A       T       73      .       DP=15;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=25 PL:GT:GQ        106,30,0:1/1:99
+chr7   56264700        .       G       A       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=51 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr7   62326003        .       C       A       26.1    .       DP=35;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=28        PL:GT:GQ        59,18,0:1/1:90
+chr7   109468934       .       T       G       5.13    .       DP=10;AF1=0.9998;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,2;MQ=39;PV4=1,0.031,1,1   PL:GT:GQ        33,2,0:1/1:37
+chr7   110208327       .       C       G       16.9    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=44 PL:GT:GQ        48,6,0:1/1:49
+chr7   125654934       .       A       G       4.11    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=27 PL:GT:GQ        34,9,0:1/1:63
+chr7   125770209       .       A       C       32      .       DP=31;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=11,0,13,0;MQ=34;PV4=1,0.00017,0.16,0.22  PL:GT:GQ        62,0,105:0/1:65
+chr7   125770265       .       G       C       36      .       DP=16;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,5,0,5;MQ=48;PV4=1,0.0047,0.016,0.035   PL:GT:GQ        66,0,110:0/1:69
+chr7   126687042       .       A       G       21.1    .       DP=36;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=22  PL:GT:GQ        54,21,0:1/1:84
+chr7   132292897       .       G       T       99      .       DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=43   PL:GT:GQ        167,21,0:1/1:84
+chr7   132334562       .       A       C       23      .       DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,10;MQ=23 PL:GT:GQ        56,30,0:1/1:99
+chr7   132431838       .       C       T       13.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=1,0,4,0;MQ=23;PV4=1,1,1,1     PL:GT:GQ        44,5,0:1/1:46
+chr7   136324945       .       T       C       13.7    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=35 PL:GT:GQ        46,12,0:1/1:72
+chr7   136957634       .       G       A       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=43 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr7   141746871       .       G       A       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=42 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr7   146831870       .       C       T       4.77    .       DP=14;AF1=0.5003;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,3,0;MQ=37;PV4=1,0.0029,0.28,1     PL:GT:GQ        33,0,28:0/1:30
+chr7   147142770       .       T       C       45      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=31 PL:GT:GQ        77,9,0:1/1:63
+chr7   147713906       .       C       T       4.77    .       DP=8;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,4,0;MQ=35;PV4=1,8.9e-06,0.48,0.27  PL:GT:GQ        33,0,29:0/1:31
+chr7   148742642       .       G       A       68      .       DP=14;AF1=0.5032;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,10,0;MQ=28;PV4=1,1,1,1    PL:GT:GQ        98,0,19:0/1:22
+chr7   148879148       .       C       T       22      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=48 PL:GT:GQ        54,9,0:1/1:63
+chr7   149484407       .       A       G       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=45 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr7   152444478       .       A       G       13      .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=36 PL:GT:GQ        44,6,0:1/1:49
+chr7   154106613       .       C       T       68      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=51 PL:GT:GQ        100,9,0:1/1:63
+chr7   154776891       .       G       T       14.4    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=31 PL:GT:GQ        47,15,0:1/1:75
+chr7   155882061       .       A       C       29      .       DP=24;AF1=0.502;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,4;MQ=46;PV4=1,0.018,0.15,0.29    PL:GT:GQ        59,0,21:0/1:24
+chr7   155956844       .       G       C       23      .       DP=11;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,7,0,4;MQ=38;PV4=1,1,0.38,1     PL:GT:GQ        53,0,103:0/1:56
+chr7   156277694       .       G       A       62      .       DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=46   PL:GT:GQ        95,24,0:1/1:96
+chr7   156720588       .       T       C       16.1    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=29 PL:GT:GQ        48,9,0:1/1:63
+chr7   156807649       .       T       C       3.01    .       DP=30;AF1=0.4997;CI95=0.5,0.5;DP4=0,4,0,3;MQ=43;PV4=1,0.16,0.15,1       PL:GT:GQ        30,0,72:0/1:33
+chr7   157331292       .       G       T       43.1    .       DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=34   PL:GT:GQ        76,21,0:1/1:84
+chr7   157382957       .       T       C       33.5    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=43 PL:GT:GQ        66,12,0:1/1:72
+chr8   556382  .       A       G       37.1    .       DP=5;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=2,0,3,0;MQ=31;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        66,1,0:1/1:23
+chr8   1661673 .       T       C       9.31    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr8   7379751 .       C       A       6.24    .       DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=19   PL:GT:GQ        38,21,0:1/1:84
+chr8   8160505 .       A       T       68.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=35 PL:GT:GQ        101,12,0:1/1:72
+chr8   8160508 .       C       T       24.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=35 PL:GT:GQ        57,12,0:1/1:72
+chr8   16781011        .       A       G       55.5    .       DP=9;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=34 PL:GT:GQ        88,12,0:1/1:72
+chr8   18716499        .       A       T       20      .       DP=10;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,4,0,2;MQ=29;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        50,0,52:0/1:51
+chr8   23326483        .       A       G       60      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=47 PL:GT:GQ        92,9,0:1/1:63
+chr8   25842819        .       T       A       12      .       DP=18;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=47        PL:GT:GQ        43,6,0:1/1:49
+chr8   26300279        .       T       C       34      .       DP=44;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,41,0;MQ=21 PL:GT:GQ        67,123,0:1/1:99
+chr8   29673470        .       A       G       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=41 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr8   29673473        .       C       G       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=41 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr8   31685466        .       C       T       34      .       DP=17;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=10,0,5,0;MQ=28;PV4=1,0.072,1,0.36        PL:GT:GQ        64,0,50:0/1:53
+chr8   37378739        .       C       T       13.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=34 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr8   51325952        .       G       A       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr8   59221963        .       G       A       16.1    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=29 PL:GT:GQ        48,9,0:1/1:63
+chr8   62764995        .       T       G       20      .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=32 PL:GT:GQ        52,9,0:1/1:63
+chr8   63157426        .       C       G       41.6    .       DP=22;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,7,0,15;MQ=19;PV4=1,1,1,0.25        PL:GT:GQ        74,11,0:1/1:66
+chr8   68710444        .       G       A       30      .       DP=5;AF1=0.6671;CI95=0.5,1;DP4=3,0,2,0;MQ=32;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        59,0,3:0/1:5
+chr8   76416560        .       G       A       89.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=46 PL:GT:GQ        122,12,0:1/1:72
+chr8   81425275        .       T       G       68      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=50 PL:GT:GQ        100,9,0:1/1:63
+chr8   89842286        .       G       C       4.61    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=30 PL:GT:GQ        34,6,0:1/1:49
+chr8   100926281       .       G       A       38      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=41 PL:GT:GQ        70,9,0:1/1:63
+chr8   102746002       .       G       C       13.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr8   107850176       .       C       T       43.1    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=45 PL:GT:GQ        76,18,0:1/1:90
+chr8   109966441       .       T       C       27.3    .       DP=9;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=38 PL:GT:GQ        60,15,0:1/1:75
+chr8   118811716       .       G       T       99      .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=50 PL:GT:GQ        155,18,0:1/1:90
+chr8   119440254       .       A       T       58.5    .       DP=5;AF1=0.8277;CI95=0.5,1;DP4=2,0,3,0;MQ=34;PV4=1,1,1,0.14     PL:GT:GQ        87,0,1:1/1:5
+chr8   121236024       .       G       A       39.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=48 PL:GT:GQ        71,6,0:1/1:49
+chr8   125489079       .       C       T       13      .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ        44,6,0:1/1:49
+chr8   128502549       .       A       G       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=45 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr8   128502551       .       A       G       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=45 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr8   130951113       .       G       A       4.61    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=19 PL:GT:GQ        34,6,0:1/1:49
+chr8   135307123       .       G       A       6.02    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=45 PL:GT:GQ        36,6,0:1/1:49
+chr8   138814155       .       C       T       57.1    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=46 PL:GT:GQ        90,18,0:1/1:90
+chr8   140566111       .       A       G       18.1    .       DP=12;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,12;MQ=15 PL:GT:GQ        51,36,0:1/1:99
+chr8   141586480       .       T       G       44      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=40 PL:GT:GQ        76,9,0:1/1:63
+chr8   143376712       .       A       G       13      .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35 PL:GT:GQ        44,6,0:1/1:49
+chr8   150662729       .       T       C       9.31    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr8   150741294       .       A       G       25.1    .       DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=34 PL:GT:GQ        58,18,0:1/1:90
+chr8   150975618       .       A       G       9.31    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr8   151580103       .       T       C       6.02    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=20 PL:GT:GQ        36,6,0:1/1:49
+chr8   151634410       .       G       T       48      .       DP=17;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,12,0,5;MQ=39;PV4=1,0.072,1,1   PL:GT:GQ        78,0,125:0/1:81
+chr8   151709267       .       G       A       91.1    .       DP=8;AF1=0.5064;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,7;MQ=40;PV4=1,1,0.28,0.37        PL:GT:GQ        121,0,16:0/1:19
+chr8   152636420       .       G       A       8.75    .       DP=3;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,2;MQ=30;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        37,1,0:1/1:23
+chr8   152706967       .       G       A       3.01    .       DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=16 PL:GT:GQ        33,30,0:1/1:99
+chr8   152786522       .       T       C       80.1    .       DP=16;AF1=0.5102;CI95=0.5,0.5;DP4=0,4,0,12;MQ=31;PV4=1,0.25,1,1 PL:GT:GQ        110,0,14:0/1:17
+chr8   152863132       .       T       G       5.44    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=30 PL:GT:GQ        36,9,0:1/1:63
+chr9   23235268        .       C       T       12      .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=32 PL:GT:GQ        43,6,0:1/1:49
+chr9   26391176        .       T       C       15.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35 PL:GT:GQ        47,6,0:1/1:49
+chr9   26868232        .       C       G       63      .       DP=20;AF1=0.5025;CI95=0.5,0.5;DP4=7,0,13,0;MQ=22;PV4=1,0.2,1,0.44       PL:GT:GQ        93,0,20:0/1:23
+chr9   34223668        .       C       T       22      .       DP=16;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,9,0,7;MQ=27;PV4=1,0.14,0.34,1  PL:GT:GQ        52,0,79:0/1:55
+chr9   39696645        .       G       A       11.3    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=41 PL:GT:GQ        43,9,0:1/1:63
+chr9   40654130        .       T       G       13      .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:GT:GQ        44,6,0:1/1:49
+chr9   41145321        .       T       G       46.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=33 PL:GT:GQ        79,12,0:1/1:72
+chr9   42273483        .       G       A       9.31    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr9   55633192        .       C       T       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr9   58705807        .       T       C       70      .       DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=24 PL:GT:GQ        103,30,0:1/1:99
+chr9   61697149        .       C       G       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr9   63152790        .       A       C       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr9   63703913        .       C       G       90.1    .       DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=38   PL:GT:GQ        123,21,0:1/1:84
+chr9   65116068        .       T       C       70      .       DP=13;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,13;MQ=49 PL:GT:GQ        103,39,0:1/1:99
+chr9   71266598        .       C       A       3.98    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35 PL:GT:GQ        33,6,0:1/1:49
+chr9   73188677        .       G       T       52      .       DP=294;AF1=1;CI95=1,1;DP4=44,0,245,0;MQ=33;PV4=1,0.28,0.0092,1  PL:GT:GQ        85,147,0:1/1:99
+chr9   78854179        .       G       T       22      .       DP=97;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=21,0,12,0;MQ=44;PV4=1,0.02,0.032,0.0033  PL:GT:GQ        52,0,158:0/1:55
+chr9   82964679        .       A       C       13.2    .       DP=19;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=36        PL:GT:GQ        45,9,0:1/1:63
+chr9   84124545        .       G       T       57      .       DP=11;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,3,0;MQ=49;PV4=1,1,0.024,1    PL:GT:GQ        87,0,59:0/1:62
+chr9   86552862        .       C       T       14.4    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=26 PL:GT:GQ        47,15,0:1/1:75
+chr9   87548941        .       A       G       22      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=49 PL:GT:GQ        54,9,0:1/1:63
+chr9   89021101        .       G       A       89.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=49 PL:GT:GQ        122,12,0:1/1:72
+chr9   90447825        .       G       A       9.31    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=46 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr9   92462035        .       C       A       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=36 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr9   93077294        .       T       G       5.44    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=31 PL:GT:GQ        36,9,0:1/1:63
+chr9   93998137        .       G       A       68      .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=46 PL:GT:GQ        100,9,0:1/1:63
+chr9   93998148        .       C       T       21.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=36 PL:GT:GQ        54,15,0:1/1:75
+chr9   95028964        .       C       A       99      .       DP=83;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,57,0,26;MQ=32;PV4=1,9.3e-08,1,0.092    PL:GT:GQ        134,0,120:0/1:99
+chr9   103829155       .       A       G       33      .       DP=96;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,96,0;MQ=16 PL:GT:GQ        66,255,0:1/1:99
+chr9   104981331       .       C       T       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=43 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr9   111070656       .       G       A       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr9   117395657       .       T       C       16.4    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=23 PL:GT:GQ        49,15,0:1/1:75
+chr9   117718907       .       A       G       46.1    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=29 PL:GT:GQ        79,18,0:1/1:90
+chr9   119149161       .       T       C       3.14    .       DP=65;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=22        PL:GT:GQ        33,15,0:1/1:75
+chr9   124528802       .       G       A       78      .       DP=23;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,13,0;MQ=25 PL:GT:GQ        111,39,0:1/1:99
+chr9   126707903       .       G       A       26      .       DP=37;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,21,0,8;MQ=46;PV4=1,2.6e-07,0.21,0.42   PL:GT:GQ        56,0,175:0/1:59
+chr9   128700686       .       C       G       33.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=50 PL:GT:GQ        66,12,0:1/1:72
+chr9   129084077       .       G       A       11.3    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=41 PL:GT:GQ        43,9,0:1/1:63
+chr9   129116900       .       A       T       20      .       DP=13;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=30        PL:GT:GQ        52,9,0:1/1:63
+chr9   130290720       .       C       G       21.8    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=42 PL:GT:GQ        53,6,0:1/1:49
+chr9   130306057       .       C       G       71      .       DP=14;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,14,0;MQ=28 PL:GT:GQ        104,42,0:1/1:99
+chr9   130528990       .       G       A       99      .       DP=31;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,31,0;MQ=27 PL:GT:GQ        174,93,0:1/1:99
+chr9   130529002       .       A       T       7.79    .       DP=30;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,11,0;MQ=15 PL:GT:GQ        40,33,0:1/1:99
+chr9   130639996       .       A       G       8.44    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=51 PL:GT:GQ        39,6,0:1/1:49
+chr9   130704890       .       A       G       3.27    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=26 PL:GT:GQ        33,12,0:1/1:72
+chr9   130708345       .       G       A       13.3    .       DP=11;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,3;MQ=38;PV4=1,0.096,1,1   PL:GT:GQ        42,1,0:1/1:23
+chr9   131001601       .       T       A       3.98    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=31 PL:GT:GQ        33,6,0:1/1:49
+chr9   131058539       .       T       A       13      .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=44 PL:GT:GQ        44,6,0:1/1:49
+chr9   131808965       .       C       T       42      .       DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,9;MQ=37   PL:GT:GQ        75,27,0:1/1:99
+chr9   132551867       .       C       T       17.1    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=25 PL:GT:GQ        49,9,0:1/1:63
+chr9   132685120       .       A       G       4.75    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=25 PL:GT:GQ        35,9,0:1/1:63
+chr9   133175050       .       A       G       18.1    .       DP=30;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,17,0;MQ=20 PL:GT:GQ        51,51,0:1/1:99
+chr9   133584978       .       A       G       99      .       DP=25;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,25,0;MQ=45 PL:GT:GQ        212,75,0:1/1:99
+chr9   133661895       .       A       G       99      .       DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,14,0;MQ=31 PL:GT:GQ        138,42,0:1/1:99
+chr9   133670376       .       T       C       68      .       DP=19;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,0,16;MQ=39;PV4=1,1.4e-20,1,1       PL:GT:GQ        101,39,0:1/1:99
+chr9   133843777       .       T       C       99      .       DP=9;AF1=0.5129;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,8,0;MQ=43;PV4=1,1,1,1      PL:GT:GQ        154,0,13:0/1:16
+chr9   134017265       .       G       C       3.27    .       DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=13        PL:GT:GQ        33,12,0:1/1:72
+chr9   134105563       .       T       C       34.1    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=39 PL:GT:GQ        67,18,0:1/1:90
+chr9   134608906       .       C       T       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=46 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr9   134861929       .       T       A       9.49    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=30 PL:GT:GQ        41,9,0:1/1:63
+chr10  796662  .       A       G       22      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=46 PL:GT:GQ        54,9,0:1/1:63
+chr10  1216716 .       T       A       18.6    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=25 PL:GT:GQ        51,12,0:1/1:72
+chr10  1220781 .       G       A       21      .       DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,9,0;MQ=18   PL:GT:GQ        54,27,0:1/1:99
+chr10  1225208 .       T       C       68      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=47 PL:GT:GQ        100,9,0:1/1:63
+chr10  1727946 .       T       C       14.2    .       DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=27   PL:GT:GQ        47,21,0:1/1:84
+chr10  5986542 .       T       C       83      .       DP=93;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=39 PL:GT:GQ        116,30,0:1/1:99
+chr10  6436277 .       G       A       6.02    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:GT:GQ        36,6,0:1/1:49
+chr10  7704114 .       C       A       35      .       DP=6;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,4;MQ=29;PV4=1,0.27,1,0.27  PL:GT:GQ        65,3,0:1/1:41
+chr10  10881734        .       A       G       9.52    .       DP=9;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,5,0;MQ=42;PV4=1,0.0026,0.14,1 PL:GT:GQ        39,0,91:0/1:42
+chr10  13099383        .       G       A       27.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=48 PL:GT:GQ        60,12,0:1/1:72
+chr10  15764077        .       G       C       11.3    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=40 PL:GT:GQ        43,9,0:1/1:63
+chr10  18091502        .       T       C       47      .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=38 PL:GT:GQ        79,9,0:1/1:63
+chr10  19645913        .       A       T       15.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=43 PL:GT:GQ        47,6,0:1/1:49
+chr10  22845062        .       C       T       18.1    .       DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=18   PL:GT:GQ        51,21,0:1/1:84
+chr10  28282802        .       T       C       69      .       DP=12;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,12,0;MQ=42 PL:GT:GQ        102,36,0:1/1:99
+chr10  28496872        .       T       G       8.44    .       DP=11;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=45        PL:GT:GQ        39,6,0:1/1:49
+chr10  32746793        .       G       A       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=46 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr10  41437604        .       T       G       11.3    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=39 PL:GT:GQ        43,9,0:1/1:63
+chr10  43051239        .       C       T       6.98    .       DP=3;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,2,0;MQ=40;PV4=1,0.33,0.33,1        PL:GT:GQ        36,0,31:0/1:33
+chr10  44455192        .       C       T       4.41    .       DP=6;AF1=0.8276;CI95=0.5,1;DP4=0,3,0,3;MQ=21;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        31,0,1:1/1:5
+chr10  48387336        .       A       G       13      .       DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35 PL:GT:GQ        44,6,0:1/1:49
+chr10  51561705        .       A       G       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=45 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr10  51561712        .       C       G       39.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=45 PL:GT:GQ        71,6,0:1/1:49
+chr10  55617954        .       G       A       8.44    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=31 PL:GT:GQ        39,6,0:1/1:49
+chr10  55718281        .       T       A       3.41    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=32 PL:GT:GQ        32,6,0:1/1:49
+chr10  55888771        .       T       C       23.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=43 PL:GT:GQ        56,12,0:1/1:72
+chr10  56025569        .       C       G       34.1    .       DP=3;AF1=0.5064;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,2;MQ=39;PV4=1,1,1,1      PL:GT:GQ        64,0,16:0/1:19
+chr10  57384943        .       G       T       84      .       DP=29;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=16,0,13,0;MQ=26;PV4=1,0.015,1,1  PL:GT:GQ        114,0,110:0/1:99
+chr10  59873077        .       T       G       49      .       DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=42   PL:GT:GQ        82,24,0:1/1:96
+chr10  61329572        .       C       T       15.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:GT:GQ        47,6,0:1/1:49
+chr10  63790636        .       T       G       32.1    .       DP=19;AF1=1;CI95=1,1;DP4=1,0,10,0;MQ=28;PV4=1,0.14,1,1  PL:GT:GQ        65,22,0:1/1:88
+chr10  64466048        .       C       G       18.2    .       DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=28 PL:GT:GQ        51,18,0:1/1:90
+chr10  65053440        .       G       T       99      .       DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=39 PL:GT:GQ        153,30,0:1/1:99
+chr10  65407358        .       C       G       84.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=45 PL:GT:GQ        117,15,0:1/1:75
+chr10  65605291        .       G       A       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=51 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr10  66104447        .       T       C       99      .       DP=47;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,25,0,21;MQ=34;PV4=1,1,0.15,1   PL:GT:GQ        136,0,162:0/1:99
+chr10  82160859        .       G       C       99      .       DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,13;MQ=36 PL:GT:GQ        153,39,0:1/1:99
+chr10  82198579        .       C       T       9.31    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr10  87086290        .       A       G       4.13    .       DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,9;MQ=17   PL:GT:GQ        35,27,0:1/1:99
+chr10  89550621        .       T       G       74      .       DP=47;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,45;MQ=45 PL:GT:GQ        107,135,0:1/1:99
+chr10  92325046        .       G       A       42.3    .       DP=18;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=45        PL:GT:GQ        75,15,0:1/1:75
+chr10  94488050        .       A       G       5.46    .       DP=4;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,2,0;MQ=43;PV4=1,0.16,1,1      PL:GT:GQ        34,0,34:0/1:34
+chr10  95024815        .       C       T       13.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=36 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr10  95466306        .       G       A       53      .       DP=7;AF1=0.6671;CI95=0.5,1;DP4=0,4,0,3;MQ=33;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        82,0,3:0/1:5
+chr10  100256777       .       T       G       3.83    .       DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=23 PL:GT:GQ        34,12,0:1/1:72
+chr10  101510485       .       T       C       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr10  101530760       .       C       T       13.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr10  101879744       .       T       C       22      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=44 PL:GT:GQ        54,9,0:1/1:63
+chr10  102147276       .       G       C       11.3    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=33 PL:GT:GQ        43,9,0:1/1:63
+chr10  102642248       .       T       G       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr10  107666616       .       T       C       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=43 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr10  108319945       .       C       G       11.3    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=29 PL:GT:GQ        43,9,0:1/1:63
+chr10  109734371       .       G       A       12.7    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=35 PL:GT:GQ        45,12,0:1/1:72
+chr10  112870604       .       C       T       46.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=36 PL:GT:GQ        79,12,0:1/1:72
+chr10  115304673       .       T       C       11.3    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=42 PL:GT:GQ        43,9,0:1/1:63
+chr10  119380588       .       G       A       14.2    .       DP=4;AF1=0.502;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,3,0;MQ=43;PV4=1,0.18,0.32,1 PL:GT:GQ        44,0,21:0/1:24
+chr10  123063756       .       C       T       14.1    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=23 PL:GT:GQ        46,9,0:1/1:63
+chr10  128424770       .       T       G       13.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=30 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr10  131229204       .       T       C       44      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=40 PL:GT:GQ        76,9,0:1/1:63
+chr10  132420570       .       G       C       89.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=49 PL:GT:GQ        122,12,0:1/1:72
+chr10  132528066       .       C       T       99      .       DP=19;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,19,0;MQ=42 PL:GT:GQ        213,57,0:1/1:99
+chr10  132644619       .       G       A       19.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=23 PL:GT:GQ        52,15,0:1/1:75
+chr10  132707581       .       G       C       9.11    .       DP=51;AF1=0.9998;CI95=0.5,1;DP4=1,0,2,0;MQ=25;PV4=1,1,1,1       PL:GT:GQ        38,2,0:1/1:37
+chr10  133026892       .       T       C       55.1    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=44 PL:GT:GQ        88,18,0:1/1:90
+chr11  768033  .       T       C       33.5    .       DP=4;AF1=0.8277;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,2;MQ=32;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        62,0,1:1/1:5
+chr11  768042  .       T       C       33.5    .       DP=6;AF1=0.8277;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,2;MQ=32;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        62,0,1:1/1:5
+chr11  874568  .       G       C       33.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=33 PL:GT:GQ        66,12,0:1/1:72
+chr11  1009210 .       T       C       4       .       DP=70;AF1=0.6241;CI95=0.5,1;DP4=0,3,0,8;MQ=24;PV4=1,1,0.5,1     PL:GT:GQ        31,0,4:0/1:6
+chr11  1016692 .       C       T       27      .       DP=39;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,38;MQ=22 PL:GT:GQ        60,114,0:1/1:99
+chr11  1034477 .       A       G       66      .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=42 PL:GT:GQ        98,9,0:1/1:63
+chr11  1074037 .       G       A       4.13    .       DP=9;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,5,0;MQ=24;PV4=1,1,0.43,1   PL:GT:GQ        32,0,30:0/1:31
+chr11  1556298 .       G       A       11.8    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=33 PL:GT:GQ        44,12,0:1/1:72
+chr11  1824777 .       T       C       27      .       DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=28 PL:GT:GQ        60,30,0:1/1:99
+chr11  3395801 .       C       T       22      .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=49 PL:GT:GQ        54,9,0:1/1:63
+chr11  3411901 .       G       A       4.75    .       DP=17;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=29        PL:GT:GQ        35,9,0:1/1:63
+chr11  3731606 .       A       C       11.3    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=39 PL:GT:GQ        43,9,0:1/1:63
+chr11  3783855 .       C       T       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=44 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr11  3967636 .       A       G       4.29    .       DP=20;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=24        PL:GT:GQ        35,15,0:1/1:75
+chr11  4385618 .       C       T       13.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=31 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr11  4424365 .       T       A       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr11  5295586 .       C       T       3.01    .       DP=52;AF1=0.4997;CI95=0.5,0.5;DP4=33,0,10,0;MQ=29;PV4=1,0.0045,0.3,0.17 PL:GT:GQ        30,0,131:0/1:33
+chr11  6157144 .       C       G       45.1    .       DP=14;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=35  PL:GT:GQ        78,21,0:1/1:84
+chr11  6352044 .       C       T       18      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=31 PL:GT:GQ        50,9,0:1/1:63
+chr11  6767356 .       T       C       9.63    .       DP=3;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=1,0,2,0;MQ=29;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        38,1,0:1/1:23
+chr11  6999404 .       G       C       21      .       DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=37 PL:GT:GQ        53,9,0:1/1:63
+chr11  9120930 .       C       G       17.6    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=25 PL:GT:GQ        50,12,0:1/1:72
+chr11  9373125 .       T       C       19.8    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:GT:GQ        51,6,0:1/1:49
+chr11  9585101 .       C       T       67      .       DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,14,0;MQ=45 PL:GT:GQ        100,42,0:1/1:99
+chr11  10266192        .       A       C       14.3    .       DP=22;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=27        PL:GT:GQ        47,18,0:1/1:90
+chr11  10303263        .       T       C       8.64    .       DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,17;MQ=18 PL:GT:GQ        41,51,0:1/1:99
+chr11  10420170        .       T       C       35      .       DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,0,15;MQ=28;PV4=1,0.12,1,0.4        PL:GT:GQ        68,36,0:1/1:99
+chr11  10912169        .       G       A       99      .       DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=49 PL:GT:GQ        155,18,0:1/1:90
+chr11  11315826        .       T       G       6.29    .       DP=27;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,6;MQ=19  PL:GT:GQ        38,18,0:1/1:90
+chr11  11603859        .       A       C       22      .       DP=15;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,9,0,6;MQ=34;PV4=1,9.5e-13,0.22,1       PL:GT:GQ        52,0,115:0/1:55
+chr11  11700034        .       C       T       33      .       DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,9,0;MQ=30  PL:GT:GQ        66,27,0:1/1:99
+chr11  11822758        .       G       A       15.1    .       DP=15;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,7,0,3;MQ=38;PV4=1,0.18,1,1     PL:GT:GQ        45,0,88:0/1:48
+chr11  11976636        .       C       T       22      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=24 PL:GT:GQ        54,9,0:1/1:63
+chr11  14380517        .       C       G       16.1    .       DP=10;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=5,0,5,0;MQ=48;PV4=1,2.1e-05,0.13,1       PL:GT:GQ        46,0,113:0/1:49
+chr11  14419212        .       A       G       91.1    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=38 PL:GT:GQ        124,18,0:1/1:90
+chr11  14846792        .       A       G       55      .       DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,11;MQ=19 PL:GT:GQ        88,33,0:1/1:99
+chr11  15494556        .       C       T       99      .       DP=38;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=22,0,14,0;MQ=34;PV4=1,0.0071,1,1 PL:GT:GQ        146,0,159:0/1:99
+chr11  16262879        .       A       C       16.1    .       DP=4;AF1=0.5004;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,3;MQ=43;PV4=1,0.061,0.24,0.33    PL:GT:GQ        46,0,28:0/1:31
+chr11  21514947        .       T       C       24.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=41 PL:GT:GQ        57,12,0:1/1:72
+chr11  22532576        .       C       G       28      .       DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,17;MQ=17 PL:GT:GQ        61,51,0:1/1:99
+chr11  23529238        .       G       T       4.29    .       DP=13;AF1=0.5334;CI95=0.5,1;DP4=1,0,3,0;MQ=37;PV4=1,1,0.34,0.21 PL:GT:GQ        32,0,9:0/1:12
+chr11  24249554        .       A       G       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=48 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr11  24853167        .       A       G       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=51 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr11  33353903        .       T       C       24.3    .       DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=36 PL:GT:GQ        57,15,0:1/1:75
+chr11  35126569        .       T       C       24.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=43 PL:GT:GQ        57,12,0:1/1:72
+chr11  35132248        .       C       T       18.6    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=25 PL:GT:GQ        51,12,0:1/1:72
+chr11  35155482        .       T       C       68      .       DP=22;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,22,0;MQ=46 PL:GT:GQ        101,66,0:1/1:99
+chr11  52494088        .       T       C       99      .       DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,9;MQ=37   PL:GT:GQ        140,27,0:1/1:99
+chr11  57899943        .       C       G       13      .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ        44,6,0:1/1:49
+chr11  62261460        .       G       T       19.1    .       DP=15;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,7,0,5;MQ=27;PV4=1,1.1e-06,1,1  PL:GT:GQ        49,0,58:0/1:51
+chr11  67456049        .       C       T       39.1    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=19 PL:GT:GQ        72,18,0:1/1:90
+chr11  68509708        .       C       G       3.65    .       DP=9;AF1=0.7301;CI95=0.5,1;DP4=0,5,0,4;MQ=17;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        30,0,2:0/1:3
+chr11  70115115        .       T       A       99      .       DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=49 PL:GT:GQ        140,15,0:1/1:75
+chr11  72643951        .       T       C       70      .       DP=23;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,22,0;MQ=39 PL:GT:GQ        103,66,0:1/1:99
+chr11  72647930        .       G       A       36      .       DP=4;AF1=0.5004;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,3;MQ=41;PV4=1,1,0.3,1    PL:GT:GQ        66,0,28:0/1:31
+chr11  73330148        .       C       T       13      .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35 PL:GT:GQ        44,6,0:1/1:49
+chr11  81720893        .       A       G       5.83    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=19 PL:GT:GQ        37,12,0:1/1:72
+chr11  83813797        .       A       G       23.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=43 PL:GT:GQ        56,12,0:1/1:72
+chr11  85949488        .       C       A       54      .       DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,14,0;MQ=37 PL:GT:GQ        87,42,0:1/1:99
+chr11  87634829        .       G       A       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=51 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr11  90913093        .       A       T       35.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=46 PL:GT:GQ        67,6,0:1/1:49
+chr11  93793348        .       G       A       99      .       DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=31   PL:GT:GQ        139,24,0:1/1:96
+chr11  100802294       .       T       C       16.6    .       DP=21;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=35        PL:GT:GQ        49,12,0:1/1:72
+chr11  107455449       .       C       T       8.44    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=26 PL:GT:GQ        39,6,0:1/1:49
+chr11  111344355       .       A       G       69.5    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=43 PL:GT:GQ        102,12,0:1/1:72
+chr11  111611115       .       C       T       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr11  113050466       .       G       C       6.02    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=30 PL:GT:GQ        36,6,0:1/1:49
+chr11  114332544       .       T       C       3.54    .       DP=17;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=0,4,0,5;MQ=37;PV4=1,0.32,0.13,1       PL:GT:GQ        31,0,37:0/1:33
+chr11  114332549       .       G       A       3.54    .       DP=17;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=0,9,0,8;MQ=36;PV4=1,3.1e-10,0.088,1   PL:GT:GQ        31,0,127:0/1:34
+chr11  114843578       .       G       C       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=50 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr11  115580279       .       A       G       99      .       DP=15;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,15,0;MQ=48 PL:GT:GQ        190,45,0:1/1:99
+chr11  116434328       .       G       A       17.6    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=25 PL:GT:GQ        50,12,0:1/1:72
+chr11  125914161       .       A       G       20.8    .       DP=7;AF1=0.95;CI95=0.5,1;DP4=3,0,4,0;MQ=38;PV4=1,0.074,1,1      PL:GT:GQ        49,0,0:1/1:10
+chr11  125917089       .       C       T       12.3    .       DP=41;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,28,0,12;MQ=44;PV4=1,4.7e-25,1,1        PL:GT:GQ        42,0,167:0/1:45
+chr11  127194100       .       A       G       60      .       DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=49   PL:GT:GQ        93,24,0:1/1:96
+chr12  70856   .       G       A       27.5    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=49 PL:GT:GQ        60,12,0:1/1:72
+chr12  153693  .       T       C       52.3    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=38 PL:GT:GQ        85,15,0:1/1:75
+chr12  924547  .       C       G       37.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=50 PL:GT:GQ        69,6,0:1/1:49
+chr12  1555916 .       G       A       7.18    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=23 PL:GT:GQ        39,15,0:1/1:75
+chr12  1919860 .       G       T       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr12  2283756 .       G       A       13.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=34 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr12  2805983 .       G       C       12.7    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=35 PL:GT:GQ        45,12,0:1/1:72
+chr12  6088203 .       T       C       72.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=37 PL:GT:GQ        105,15,0:1/1:75
+chr12  7099460 .       G       C       10.8    .       DP=6;AF1=0.8277;CI95=0.5,1;DP4=3,0,3,0;MQ=26;PV4=1,0.027,1,1    PL:GT:GQ        39,0,1:1/1:5
+chr12  7099464 .       G       A       13.3    .       DP=6;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=2,0,3,0;MQ=28;PV4=1,0.16,1,1     PL:GT:GQ        42,1,0:1/1:23
+chr12  7198516 .       T       G       4.61    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ        34,6,0:1/1:49
+chr12  23331895        .       C       T       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr12  28209020        .       T       G       14.4    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=31 PL:GT:GQ        47,15,0:1/1:75
+chr12  30074073        .       C       T       32.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35 PL:GT:GQ        64,6,0:1/1:49
+chr12  30563452        .       T       C       25      .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=46 PL:GT:GQ        57,9,0:1/1:63
+chr12  30563453        .       A       G       25      .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=46 PL:GT:GQ        57,9,0:1/1:63
+chr12  30563464        .       C       A       78.8    .       DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,5;MQ=34;PV4=1,0.29,1,1  PL:GT:GQ        110,6,0:1/1:49
+chr12  31505085        .       G       A       13.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr12  34041336        .       G       A       5.46    .       DP=5;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,2,0;MQ=36;PV4=1,1,0.48,0.21   PL:GT:GQ        34,0,34:0/1:34
+chr12  49003648        .       C       G       42      .       DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=39   PL:GT:GQ        75,24,0:1/1:96
+chr12  51280690        .       G       A       69      .       DP=98;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=13,0,18,0;MQ=45;PV4=1,1,0.051,1  PL:GT:GQ        99,0,84:0/1:87
+chr12  69206633        .       T       C       17.1    .       DP=12;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,11;MQ=17 PL:GT:GQ        50,33,0:1/1:99
+chr12  80417253        .       T       C       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=48 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr12  86633033        .       C       T       34      .       DP=3;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,2;MQ=43;PV4=1,1,0.33,1   PL:GT:GQ        64,0,31:0/1:34
+chr12  98097274        .       C       T       47.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=31 PL:GT:GQ        80,15,0:1/1:75
+chr12  105269319       .       C       T       19      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=26 PL:GT:GQ        51,9,0:1/1:63
+chr12  109053425       .       G       A       9.53    .       DP=8;AF1=0.5012;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,6,0;MQ=25;PV4=1,1,0.19,1   PL:GT:GQ        39,0,23:0/1:26
+chr12  111904540       .       A       G       3.41    .       DP=65;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=31        PL:GT:GQ        32,6,0:1/1:49
+chr12  115038686       .       T       C       15.2    .       DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=27   PL:GT:GQ        48,21,0:1/1:84
+chr12  115039419       .       A       G       4.11    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=30 PL:GT:GQ        34,9,0:1/1:63
+chr12  115103890       .       G       A       66      .       DP=39;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,38;MQ=49 PL:GT:GQ        99,114,0:1/1:99
+chr12  115833830       .       G       A       68      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=49 PL:GT:GQ        100,9,0:1/1:63
+chr12  116361873       .       T       G       6.34    .       DP=5;AF1=0.7302;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,2;MQ=23;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        34,0,2:0/1:3
+chr12  123583527       .       G       A       14.1    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=25 PL:GT:GQ        46,9,0:1/1:63
+chr12  124115330       .       A       G       44      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=38 PL:GT:GQ        76,9,0:1/1:63
+chr12  125062296       .       G       A       41.8    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=50 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr12  126718106       .       A       G       8.76    .       DP=50;AF1=0.5163;CI95=0.5,1;DP4=2,0,6,0;MQ=26;PV4=1,0.33,0.37,1 PL:GT:GQ        38,0,12:0/1:15
+chr12  133348311       .       G       A       24      .       DP=18;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=14,0,3,0;MQ=35;PV4=1,1,1,1       PL:GT:GQ        54,0,118:0/1:57
+chr12  134494475       .       C       T       28      .       DP=18;AF1=0.6671;CI95=0.5,1;DP4=8,0,10,0;MQ=18;PV4=1,1,1,1      PL:GT:GQ        57,0,3:0/1:5
+chr12  134831761       .       C       T       41.3    .       DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=27        PL:GT:GQ        74,15,0:1/1:75
+chr12  134992770       .       A       C,T     84      .       DP=47;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,26,0;MQ=29 PL:GT:GQ        117,72,114,0,44,114:1/1:99
+chr12  135261117       .       G       A       49.1    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=46 PL:GT:GQ        82,18,0:1/1:90
+chr12  135261144       .       A       G       99      .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=46 PL:GT:GQ        155,18,0:1/1:90
+chr12  135460302       .       G       A       99      .       DP=25;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,23,0;MQ=40 PL:GT:GQ        198,69,0:1/1:99
+chr12  135463758       .       A       G       83      .       DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,16;MQ=26 PL:GT:GQ        116,48,0:1/1:99
+chr12  135523325       .       G       A       99      .       DP=23;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,22,0;MQ=26 PL:GT:GQ        136,66,0:1/1:99
+chr12  135782401       .       T       C       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr12  135795472       .       G       T       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr13  18040027        .       G       C       42      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=33 PL:GT:GQ        74,9,0:1/1:63
+chr13  19494625        .       G       T       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr13  20121126        .       A       G       15.1    .       DP=36;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=25,0,9,0;MQ=36;PV4=1,1,0.13,1    PL:GT:GQ        45,0,153:0/1:48
+chr13  21536703        .       A       G       9.31    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr13  23160035        .       G       T       3.98    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=36 PL:GT:GQ        33,6,0:1/1:49
+chr13  23476554        .       C       A       6.79    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=52 PL:GT:GQ        37,6,0:1/1:49
+chr13  26632967        .       C       G       32      .       DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,9;MQ=34   PL:GT:GQ        65,27,0:1/1:99
+chr13  26790010        .       T       C       89.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=35 PL:GT:GQ        122,15,0:1/1:75
+chr13  36083571        .       T       C       43      .       DP=84;AF1=1;CI95=1,1;DP4=1,0,37,0;MQ=16;PV4=1,1,1,0.3   PL:GT:GQ        76,99,0:1/1:99
+chr13  44432419        .       C       T       3.58    .       DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=19   PL:GT:GQ        34,21,0:1/1:84
+chr13  46592359        .       T       C       16.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:GT:GQ        48,6,0:1/1:49
+chr13  52764657        .       A       T       3.14    .       DP=32;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=22        PL:GT:GQ        33,15,0:1/1:75
+chr13  53084193        .       C       T       9.11    .       DP=3;AF1=0.9998;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,2;MQ=29;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        38,2,0:1/1:37
+chr13  57763228        .       C       T       45      .       DP=555;AF1=1;CI95=1,1;DP4=2,0,21,0;MQ=23;PV4=1,0.00021,1,0.3    PL:GT:GQ        78,45,0:1/1:99
+chr13  73857921        .       G       C       31      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=49 PL:GT:GQ        63,9,0:1/1:63
+chr13  76718001        .       G       A       59      .       DP=4;AF1=0.5004;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,3,0;MQ=45;PV4=1,1,0.12,1   PL:GT:GQ        89,0,28:0/1:31
+chr13  100912695       .       A       T       23      .       DP=22;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,16,0,6;MQ=31;PV4=1,0.029,1,0.35        PL:GT:GQ        53,0,103:0/1:56
+chr13  101332001       .       G       C       21      .       DP=23;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,23,0;MQ=21 PL:GT:GQ        54,69,0:1/1:99
+chr13  102637334       .       C       T       68      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=49 PL:GT:GQ        100,9,0:1/1:63
+chr13  102895627       .       C       T       63      .       DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,9,0;MQ=48   PL:GT:GQ        96,27,0:1/1:99
+chr13  103830322       .       T       C       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=50 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr13  112842448       .       G       A       39      .       DP=18;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,9;MQ=27  PL:GT:GQ        72,27,0:1/1:99
+chr13  113310291       .       C       T       33.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=43 PL:GT:GQ        66,12,0:1/1:72
+chr13  114775162       .       A       G       80      .       DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,17,0;MQ=21 PL:GT:GQ        113,51,0:1/1:99
+chr13  115267482       .       A       G       16.1    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=29 PL:GT:GQ        48,9,0:1/1:63
+chr13  116068676       .       C       T       3.83    .       DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=27 PL:GT:GQ        34,12,0:1/1:72
+chr13  116455918       .       A       G       33      .       DP=29;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=13,0,15,0;MQ=42;PV4=1,1.8e-20,0.3,1      PL:GT:GQ        63,0,146:0/1:66
+chr13  116765012       .       G       A       30.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ        62,6,0:1/1:49
+chr13  116779773       .       C       T       17.1    .       DP=38;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=27,0,11,0;MQ=24;PV4=1,4.5e-35,1,1        PL:GT:GQ        47,0,106:0/1:50
+chr13  116779791       .       C       T       57      .       DP=38;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=24,0,14,0;MQ=24;PV4=1,1,1,1      PL:GT:GQ        87,0,103:0/1:90
+chr14  20159250        .       C       T       11.3    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=39 PL:GT:GQ        43,9,0:1/1:63
+chr14  23510676        .       T       C       52      .       DP=22;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,22,0;MQ=32 PL:GT:GQ        85,66,0:1/1:99
+chr14  24735256        .       G       A       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr14  29525577        .       G       A       21      .       DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,9,0;MQ=16  PL:GT:GQ        54,27,0:1/1:99
+chr14  36186389        .       C       T       6.79    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=20 PL:GT:GQ        37,6,0:1/1:49
+chr14  36186394        .       A       G       6.79    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=20 PL:GT:GQ        37,6,0:1/1:49
+chr14  37440609        .       A       G       13      .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=33 PL:GT:GQ        44,6,0:1/1:49
+chr14  40432807        .       A       G       18.6    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=23 PL:GT:GQ        51,12,0:1/1:72
+chr14  59466268        .       T       C       15.1    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=25 PL:GT:GQ        47,9,0:1/1:63
+chr14  61368162        .       G       T       7.18    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=17 PL:GT:GQ        39,15,0:1/1:75
+chr14  65152922        .       G       A       92      .       DP=33;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,18,0,15;MQ=36;PV4=1,0.059,0.35,1       PL:GT:GQ        122,0,144:0/1:99
+chr14  69749148        .       G       T       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=25 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr14  74877658        .       C       T       45      .       DP=48;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,0,12;MQ=36;PV4=1,0.02,1,0.39       PL:GT:GQ        78,28,0:1/1:99
+chr14  75546678        .       C       T       19.2    .       DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=17 PL:GT:GQ        52,18,0:1/1:90
+chr14  76439185        .       T       C       67.1    .       DP=7;AF1=0.505;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,6;MQ=33;PV4=1,1,0.056,0.29        PL:GT:GQ        97,0,17:0/1:20
+chr14  77313295        .       T       A       99      .       DP=12;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,10;MQ=48 PL:GT:GQ        191,30,0:1/1:99
+chr14  77673422        .       G       A       11.5    .       DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=24 PL:GT:GQ        44,18,0:1/1:90
+chr14  78646125        .       T       C       99      .       DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=40   PL:GT:GQ        153,24,0:1/1:96
+chr14  91702449        .       A       G       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr14  91769842        .       G       A       63      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=47 PL:GT:GQ        95,9,0:1/1:63
+chr14  91775899        .       C       G       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=45 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr14  91775924        .       A       G       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=45 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr14  93482918        .       A       C       68      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=49 PL:GT:GQ        100,9,0:1/1:63
+chr14  93665819        .       C       T       75      .       DP=7;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=0,3,0,4;MQ=42;PV4=1,1,1,1      PL:GT:GQ        105,0,31:0/1:34
+chr14  95422276        .       A       G       55.1    .       DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=45   PL:GT:GQ        88,21,0:1/1:84
+chr14  95731986        .       C       T       68      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=49 PL:GT:GQ        100,9,0:1/1:63
+chr14  96045464        .       A       G       13      .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=33 PL:GT:GQ        44,6,0:1/1:49
+chr14  97172020        .       C       T       68      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=51 PL:GT:GQ        100,9,0:1/1:63
+chr14  100515480       .       A       G       6.98    .       DP=3;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,2,0;MQ=45;PV4=1,0.14,0.085,0.33    PL:GT:GQ        36,0,30:0/1:32
+chr14  100770214       .       A       T       8.69    .       DP=20;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=16  PL:GT:GQ        41,21,0:1/1:84
+chr14  101258303       .       G       A       82      .       DP=15;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,15,0;MQ=26 PL:GT:GQ        115,45,0:1/1:99
+chr14  101701492       .       C       G       66      .       DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=49 PL:GT:GQ        99,30,0:1/1:99
+chr14  102113772       .       T       C       3.98    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=30 PL:GT:GQ        33,6,0:1/1:49
+chr14  102751431       .       A       C       36.5    .       DP=3;AF1=0.9998;CI95=0.5,1;DP4=1,0,2,0;MQ=35;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        66,2,0:1/1:37
+chr14  103708033       .       A       G       99      .       DP=13;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,12;MQ=27 PL:GT:GQ        141,36,0:1/1:99
+chr14  104744582       .       G       A       3.52    .       DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=25 PL:GT:GQ        33,9,0:1/1:63
+chr14  105989100       .       C       T       3.14    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=23 PL:GT:GQ        33,15,0:1/1:75
+chr14  105989162       .       C       T       3.65    .       DP=12;AF1=0.7301;CI95=0.5,1;DP4=0,6,0,6;MQ=15;PV4=1,1,1,1       PL:GT:GQ        30,0,2:0/1:3
+chr14  106234810       .       G       A       25.3    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=39 PL:GT:GQ        58,15,0:1/1:75
+chr14  106995572       .       A       G       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr14  107283057       .       T       C       5.5     .       DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=20   PL:GT:GQ        37,21,0:1/1:84
+chr14  107285319       .       T       C       33      .       DP=36;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,35;MQ=22 PL:GT:GQ        66,105,0:1/1:99
+chr14  107640449       .       A       G       11.8    .       DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=36 PL:GT:GQ        44,12,0:1/1:72
+chr15  20082092        .       T       G       18.3    .       DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=24        PL:GT:GQ        51,15,0:1/1:75
+chr15  22955884        .       T       C       67      .       DP=12;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,12,0;MQ=48 PL:GT:GQ        100,36,0:1/1:99
+chr15  22971987        .       A       G       5.29    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=22 PL:GT:GQ        35,6,0:1/1:49
+chr15  23233324        .       C       A       47      .       DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,14,0;MQ=31 PL:GT:GQ        80,42,0:1/1:99
+chr15  25175286        .       C       T       36.5    .       DP=3;AF1=0.9998;CI95=0.5,1;DP4=1,0,2,0;MQ=42;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        66,2,0:1/1:37
+chr15  25385709        .       G       A       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=48 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr15  27372396        .       A       G       44      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=40 PL:GT:GQ        76,9,0:1/1:63
+chr15  35998093        .       C       T       9.53    .       DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,9,0;MQ=17   PL:GT:GQ        42,27,0:1/1:99
+chr15  36716538        .       C       G       13.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=36 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr15  36793360        .       G       T       44      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=42 PL:GT:GQ        76,9,0:1/1:63
+chr15  53783097        .       A       G       10.5    .       DP=31;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=16  PL:GT:GQ        43,21,0:1/1:84
+chr15  54180175        .       C       T       10.4    .       DP=7;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,3,0;MQ=27;PV4=1,1.2e-05,1,1        PL:GT:GQ        40,0,32:0/1:34
+chr15  54939306        .       C       T       99      .       DP=34;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,18,0,16;MQ=49;PV4=1,1,0.18,1   PL:GT:GQ        172,0,181:0/1:99
+chr15  59377916        .       C       T       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=50 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr15  59685961        .       G       C       68      .       DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,11;MQ=36 PL:GT:GQ        101,33,0:1/1:99
+chr15  60306384        .       A       G       18.6    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=25 PL:GT:GQ        51,12,0:1/1:72
+chr15  60345642        .       G       C       14.9    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35 PL:GT:GQ        46,6,0:1/1:49
+chr15  60367387        .       G       A       13.2    .       DP=6;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=3,0,3,0;MQ=34;PV4=1,0.098,0.24,1       PL:GT:GQ        43,0,35:0/1:37
+chr15  60367446        .       C       T       44      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=41 PL:GT:GQ        76,9,0:1/1:63
+chr15  61763755        .       G       A       68      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=45 PL:GT:GQ        100,9,0:1/1:63
+chr15  61831362        .       C       G       11.3    .       DP=5;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,3;MQ=30;PV4=1,0.00077,0.47,1        PL:GT:GQ        41,0,42:0/1:41
+chr15  63978880        .       G       C       60      .       DP=6;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=2,0,4,0;MQ=35;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        90,3,0:1/1:41
+chr15  64342445        .       A       G       12.2    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=18 PL:GT:GQ        44,9,0:1/1:63
+chr15  65424859        .       T       C       11.3    .       DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,10;MQ=21 PL:GT:GQ        44,30,0:1/1:99
+chr15  65603698        .       C       T       60      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=49 PL:GT:GQ        92,9,0:1/1:63
+chr15  67005078        .       G       A       13.9    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr15  71133512        .       G       C       22.3    .       DP=19;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=25        PL:GT:GQ        55,15,0:1/1:75
+chr15  72619009        .       A       G       22      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=48 PL:GT:GQ        54,9,0:1/1:63
+chr15  73272688        .       C       T       70.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=39 PL:GT:GQ        103,15,0:1/1:75
+chr15  73699335        .       T       A       99      .       DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,9;MQ=45   PL:GT:GQ        175,27,0:1/1:99
+chr15  74513352        .       C       T       99      .       DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,10;MQ=37 PL:GT:GQ        139,30,0:1/1:99
+chr15  75540536        .       G       A       9.31    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=44 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr15  75822537        .       C       A       17.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=23 PL:GT:GQ        50,15,0:1/1:75
+chr15  78554005        .       T       C       12      .       DP=18;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=46        PL:GT:GQ        43,6,0:1/1:49
+chr15  80089369        .       G       A       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=28 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr15  83089149        .       C       G       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=33 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr15  86839307        .       T       C       90.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=43 PL:GT:GQ        123,15,0:1/1:75
+chr15  89836258        .       T       C       99      .       DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=39  PL:GT:GQ        141,24,0:1/1:96
+chr15  89837706        .       G       A       4.13    .       DP=8;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=0,4,0,4;MQ=30;PV4=1,1,0.25,1   PL:GT:GQ        32,0,59:0/1:35
+chr15  89857648        .       T       C       99      .       DP=27;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=8,0,8,0;MQ=40;PV4=1,1,0.3,1      PL:GT:GQ        133,0,130:0/1:99
+chr15  89864228        .       A       C       32      .       DP=4;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,2,0;MQ=42;PV4=1,1,1,1      PL:GT:GQ        62,0,31:0/1:34
+chr15  91261235        .       G       A       7.8     .       DP=4;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,2,0;MQ=44;PV4=1,1,0.32,1   PL:GT:GQ        37,0,30:0/1:32
+chr16  256990  .       A       C       10.4    .       DP=16;AF1=0.5008;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,3,0;MQ=23;PV4=1,0.34,1,1  PL:GT:GQ        40,0,25:0/1:28
+chr16  260794  .       T       C       3.01    .       DP=19;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=13,0,2,0;MQ=24;PV4=1,1,1,1    PL:GT:GQ        30,0,32:0/1:31
+chr16  419905  .       A       G       7.9     .       DP=5;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,3;MQ=22;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        36,1,0:1/1:23
+chr16  824086  .       T       C       22      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=48 PL:GT:GQ        54,9,0:1/1:63
+chr16  1085063 .       C       T       52      .       DP=12;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=6,0,6,0;MQ=42;PV4=1,1,0.014,1    PL:GT:GQ        82,0,128:0/1:85
+chr16  1221305 .       T       C       54      .       DP=7;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,3,0,3;MQ=40;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ        84,0,60:0/1:63
+chr16  1411728 .       A       G       32.3    .       DP=11;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=35        PL:GT:GQ        65,15,0:1/1:75
+chr16  1443197 .       C       G       64      .       DP=26;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,25,0;MQ=36 PL:GT:GQ        97,75,0:1/1:99
+chr16  1478746 .       A       T       32      .       DP=20;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=28  PL:GT:GQ        65,24,0:1/1:96
+chr16  1514438 .       A       C       45      .       DP=49;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,48,0;MQ=26 PL:GT:GQ        78,144,0:1/1:99
+chr16  1601989 .       T       C       99      .       DP=13;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,13,0;MQ=29 PL:GT:GQ        133,39,0:1/1:99
+chr16  2043883 .       C       T       30      .       DP=33;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,33;MQ=14 PL:GT:GQ        63,99,0:1/1:99
+chr16  2137470 .       A       C       39      .       DP=38;AF1=0.5016;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,6,0;MQ=34;PV4=1,0.02,1,1  PL:GT:GQ        69,0,22:0/1:25
+chr16  2537260 .       A       G       99      .       DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,11,0;MQ=40 PL:GT:GQ        177,33,0:1/1:99
+chr16  2564737 .       T       C       99      .       DP=25;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,22;MQ=41 PL:GT:GQ        199,66,0:1/1:99
+chr16  2612605 .       A       T       62.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=28 PL:GT:GQ        95,15,0:1/1:75
+chr16  2704518 .       G       A       41      .       DP=48;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,17,0,12;MQ=48;PV4=1,1.9e-23,0.24,0.034 PL:GT:GQ        71,0,175:0/1:74
+chr16  3274307 .       G       T       68      .       DP=39;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,30,0,8;MQ=37;PV4=1,1,1,1       PL:GT:GQ        98,0,138:0/1:99
+chr16  5467292 .       G       C       37.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ        69,6,0:1/1:49
+chr16  10079145        .       A       G       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr16  11483702        .       A       G       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=44 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr16  12038227        .       A       T       23      .       DP=47;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,22,0,23;MQ=32;PV4=1,4.4e-66,0.47,0.028 PL:GT:GQ        53,0,135:0/1:56
+chr16  21336880        .       G       C       55      .       DP=35;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,12,0,19;MQ=47;PV4=1,5.6e-21,1,1        PL:GT:GQ        85,0,121:0/1:88
+chr16  21980241        .       C       T       16.1    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=29 PL:GT:GQ        48,9,0:1/1:63
+chr16  23275383        .       C       G       13      .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:GT:GQ        44,6,0:1/1:49
+chr16  27546495        .       G       T       25      .       DP=35;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=43        PL:GT:GQ        57,9,0:1/1:63
+chr16  27700399        .       A       T       17.6    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=17 PL:GT:GQ        50,12,0:1/1:72
+chr16  28021935        .       A       G       18.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=23 PL:GT:GQ        51,15,0:1/1:75
+chr16  29070016        .       G       T       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr16  29478618        .       C       T       11.3    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=42 PL:GT:GQ        43,9,0:1/1:63
+chr16  29718140        .       C       T       46.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=31 PL:GT:GQ        79,15,0:1/1:75
+chr16  30700759        .       T       C       17.1    .       DP=14;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,14;MQ=14 PL:GT:GQ        50,42,0:1/1:99
+chr16  35139103        .       A       G       46.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=37 PL:GT:GQ        79,12,0:1/1:72
+chr16  35473348        .       G       A       3.83    .       DP=11;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=25        PL:GT:GQ        34,12,0:1/1:72
+chr16  36213667        .       A       G       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr16  36705528        .       G       A       14.4    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=32 PL:GT:GQ        47,15,0:1/1:75
+chr16  43831353        .       C       T       69.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=42 PL:GT:GQ        102,12,0:1/1:72
+chr16  44715166        .       A       C       25      .       DP=18;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=32  PL:GT:GQ        58,24,0:1/1:96
+chr16  44957661        .       T       C       7.03    .       DP=23;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=18  PL:GT:GQ        39,21,0:1/1:84
+chr16  44958698        .       C       T       42.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=49 PL:GT:GQ        75,15,0:1/1:75
+chr16  44959163        .       T       C       33.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=48 PL:GT:GQ        66,12,0:1/1:72
+chr16  45167959        .       C       T       4.45    .       DP=16;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=24        PL:GT:GQ        35,12,0:1/1:72
+chr16  50254956        .       C       T       13.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=36 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr16  52383122        .       A       C       46.5    .       DP=19;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=42        PL:GT:GQ        79,12,0:1/1:72
+chr16  55978159        .       C       T       10.7    .       DP=20;AF1=0.5336;CI95=0.5,1;DP4=2,0,5,0;MQ=35;PV4=1,0.038,1,0.059       PL:GT:GQ        40,0,9:0/1:12
+chr16  61358878        .       T       A       15.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=32 PL:GT:GQ        47,6,0:1/1:49
+chr16  61392487        .       G       A       13      .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=31 PL:GT:GQ        44,6,0:1/1:49
+chr16  61621603        .       G       T       6.59    .       DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=22        PL:GT:GQ        38,12,0:1/1:72
+chr16  69120890        .       G       C       51.3    .       DP=36;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=42        PL:GT:GQ        84,15,0:1/1:75
+chr16  70778219        .       A       G       21.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=39 PL:GT:GQ        53,6,0:1/1:49
+chr16  71899519        .       T       C       40      .       DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,11,0;MQ=33 PL:GT:GQ        73,33,0:1/1:99
+chr16  72079251        .       A       G       11.3    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=41 PL:GT:GQ        43,9,0:1/1:63
+chr16  72093003        .       G       C       9.31    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr16  72672428        .       A       G       68      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=49 PL:GT:GQ        100,9,0:1/1:63
+chr16  72864515        .       A       G       13.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr16  72890560        .       G       A       47.1    .       DP=10;AF1=0.5064;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,7;MQ=49;PV4=1,0.0019,0.0033,1   PL:GT:GQ        77,0,16:0/1:19
+chr16  73048929        .       A       G       6.29    .       DP=4;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=1,0,2,0;MQ=27;PV4=1,1,1,0.33     PL:GT:GQ        34,1,0:1/1:23
+chr16  73177179        .       A       G       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr16  73191468        .       C       T       69.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=40 PL:GT:GQ        102,12,0:1/1:72
+chr16  73367439        .       A       C       7.41    .       DP=36;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,13;MQ=26;PV4=1,1,0.027,1       PL:GT:GQ        37,4,0:1/1:45
+chr16  74259316        .       C       T       89.5    .       DP=13;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=49        PL:GT:GQ        122,12,0:1/1:72
+chr16  75271450        .       C       G       6.99    .       DP=15;AF1=0.5015;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,3;MQ=44;PV4=1,0.065,0.31,1      PL:GT:GQ        36,0,22:0/1:25
+chr16  76199870        .       G       A       26      .       DP=14;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=8,0,6,0;MQ=47;PV4=1,1.2e-06,0.32,1       PL:GT:GQ        56,0,141:0/1:59
+chr16  77723692        .       A       G       89.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=50 PL:GT:GQ        122,12,0:1/1:72
+chr17  165875  .       G       A       40.8    .       DP=11;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=42        PL:GT:GQ        72,6,0:1/1:49
+chr17  1443809 .       C       G       9.31    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=50 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr17  1618253 .       C       T       22      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=39 PL:GT:GQ        54,9,0:1/1:63
+chr17  2815309 .       T       G       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr17  3537486 .       T       G       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=50 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr17  3734367 .       C       A       23.5    .       DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=36        PL:GT:GQ        56,12,0:1/1:72
+chr17  5634764 .       T       C       13      .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ        44,6,0:1/1:49
+chr17  6408090 .       C       G       3.54    .       DP=5;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=3,0,2,0;MQ=40;PV4=1,1,0.36,1   PL:GT:GQ        31,0,66:0/1:34
+chr17  7089723 .       A       G       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=47 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr17  8731503 .       G       C       11.1    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=46 PL:GT:GQ        42,6,0:1/1:49
+chr17  9282935 .       T       C,G     24.5    .       DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=40        PL:GT:GQ        57,12,61,0,3,61:1/1:72
+chr17  17284831        .       T       C       29      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=25 PL:GT:GQ        61,9,0:1/1:63
+chr17  18439515        .       G       A       4.11    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=25 PL:GT:GQ        34,9,0:1/1:63
+chr17  18602146        .       C       T       4.76    .       DP=20;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,11;MQ=16 PL:GT:GQ        36,33,0:1/1:99
+chr17  19427888        .       C       T       57      .       DP=104;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=45,0,29,0;MQ=39;PV4=1,2.2e-12,1,1       PL:GT:GQ        87,0,131:0/1:90
+chr17  19604159        .       T       C       9.31    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=45 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr17  19610366        .       C       T       13      .       DP=13;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48        PL:GT:GQ        44,6,0:1/1:49
+chr17  20484706        .       C       G       51      .       DP=35;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=0,11,0,21;MQ=21;PV4=1,0.39,0.49,1     PL:GT:GQ        81,0,36:0/1:39
+chr17  20555720        .       A       G       26.3    .       DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=28 PL:GT:GQ        59,15,0:1/1:75
+chr17  24328984        .       A       C       15.4    .       DP=34;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=25        PL:GT:GQ        48,15,0:1/1:75
+chr17  26237090        .       G       A       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=44 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr17  28394766        .       C       A       13.9    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=31 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr17  31218277        .       A       G       3.62    .       DP=38;AF1=0.5161;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,2;MQ=38;PV4=1,0.26,1,1  PL:GT:GQ        31,0,12:0/1:15
+chr17  31254021        .       C       T       15.1    .       DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=35        PL:GT:GQ        47,9,0:1/1:63
+chr17  32516798        .       G       A       37.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ        69,6,0:1/1:49
+chr17  32600253        .       A       G       16.6    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=25 PL:GT:GQ        49,12,0:1/1:72
+chr17  34255214        .       G       C       19.2    .       DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=21 PL:GT:GQ        52,18,0:1/1:90
+chr17  34365900        .       T       C       93.1    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=38 PL:GT:GQ        126,18,0:1/1:90
+chr17  35380386        .       A       T       6.79    .       DP=44;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=46        PL:GT:GQ        37,6,0:1/1:49
+chr17  41993344        .       C       T       64      .       DP=41;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,41;MQ=16 PL:GT:GQ        97,123,0:1/1:99
+chr17  42128201        .       A       G       4.13    .       DP=5;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,2;MQ=52;PV4=1,0.0041,1,1 PL:GT:GQ        32,0,62:0/1:35
+chr17  42984490        .       C       A       56      .       DP=33;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=6,0,12,0;MQ=42;PV4=1,0.004,1,1        PL:GT:GQ        86,0,34:0/1:37
+chr17  43419457        .       G       A       99      .       DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,14;MQ=45 PL:GT:GQ        185,42,0:1/1:99
+chr17  43421225        .       A       G       65.1    .       DP=31;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,6,0,17;MQ=43;PV4=1,0.004,1,1       PL:GT:GQ        98,18,0:1/1:90
+chr17  45206897        .       G       A       22      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=47 PL:GT:GQ        54,9,0:1/1:63
+chr17  45381302        .       T       C       18.6    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=25 PL:GT:GQ        51,12,0:1/1:72
+chr17  45530812        .       C       A       3.54    .       DP=6;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=0,3,0,2;MQ=40;PV4=1,1,0.37,1   PL:GT:GQ        31,0,58:0/1:34
+chr17  50242633        .       G       A       44      .       DP=42;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,25,0,13;MQ=32;PV4=1,0.084,0.14,1       PL:GT:GQ        74,0,154:0/1:77
+chr17  51275317        .       G       A       14.9    .       DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=31        PL:GT:GQ        46,6,0:1/1:49
+chr17  52325530        .       C       T       29      .       DP=19;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,18;MQ=24 PL:GT:GQ        62,54,0:1/1:99
+chr17  52411748        .       T       G       18.6    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=25 PL:GT:GQ        51,12,0:1/1:72
+chr17  53190746        .       C       G       62.1    .       DP=20;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=40        PL:GT:GQ        95,18,0:1/1:90
+chr17  58289916        .       T       C       18.2    .       DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=22 PL:GT:GQ        51,18,0:1/1:90
+chr17  59796875        .       C       T       42      .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=35 PL:GT:GQ        74,9,0:1/1:63
diff --git a/tests/tabix_data/vcf/2.vcf b/tests/tabix_data/vcf/2.vcf
new file mode 100644 (file)
index 0000000..c77f2c4
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,334 @@
+##fileformat=VCFv4.0
+##ApplyRecalibration="analysis_type=ApplyRecalibration input_file=[] sample_metadata=[] read_buffer_size=null phone_home=STANDARD read_filter=[] intervals=[20] excludeIntervals=null reference_sequence=/humgen/1kg/reference/human_g1k_v37.fasta rodBind=[/humgen/gsa-hpprojects/dev/delangel/Phase1Calls/20110608VQSRConsensus/calls/combined.phase1.chr20.raw.indels.vcf] rodToIntervalTrackName=null BTI_merge_rule=UNION nonDeterministicRandomSeed=false DBSNP=null downsampling_type=null downsample_to_fraction=null downsample_to_coverage=null baq=OFF baqGapOpenPenalty=40.0 performanceLog=null useOriginalQualities=false defaultBaseQualities=-1 validation_strictness=SILENT unsafe=null num_threads=1 interval_merging=ALL read_group_black_list=null processingTracker=null restartProcessingTracker=false processingTrackerStatusFile=null processingTrackerID=-1 allow_intervals_with_unindexed_bam=false disable_experimental_low_memory_sharding=false logging_level=INFO log_to_file=null help=false recal_file=/humgen/gsa-scr1/delangel/VQSRIndels/data/trainMills75_truthMills75_p15_12_12_pctb0.05_std12.0_mG8_QD_FS_HS_RP_IC.recal tranches_file=/humgen/gsa-scr1/delangel/VQSRIndels/data/trainMills75_truthMills75_p15_12_12_pctb0.05_std12.0_mG8_QD_FS_HS_RP_IC.tranches out=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub NO_HEADER=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub sites_only=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub ts_filter_level=93.0 ignore_filter=null mode=INDEL"
+##CombineVariants="analysis_type=CombineVariants input_file=[] sample_metadata=[] read_buffer_size=null phone_home=STANDARD read_filter=[] intervals=[20:41000001-42000000] excludeIntervals=null reference_sequence=/humgen/1kg/reference/human_g1k_v37.fasta rodBind=[/humgen/gsa-hpprojects/dev/delangel/Phase1Calls/20110608VQSRConsensus/calls/chr20/AFR/AFR.phase1.chr20.42.raw.indels.vcf, /humgen/gsa-hpprojects/dev/delangel/Phase1Calls/20110608VQSRConsensus/calls/chr20/ASN/ASN.phase1.chr20.42.raw.indels.vcf, /humgen/gsa-hpprojects/dev/delangel/Phase1Calls/20110608VQSRConsensus/calls/chr20/AMR/AMR.phase1.chr20.42.raw.indels.vcf, /humgen/gsa-hpprojects/dev/delangel/Phase1Calls/20110608VQSRConsensus/calls/chr20/EUR/EUR.phase1.chr20.42.raw.indels.vcf, /humgen/gsa-hpprojects/dev/delangel/Phase1Calls/20110608VQSRConsensus/calls/chr20/AFR.admix/AFR.admix.phase1.chr20.42.raw.indels.vcf, /humgen/gsa-hpprojects/dev/delangel/Phase1Calls/20110608VQSRConsensus/calls/chr20/ASN.admix/ASN.admix.phase1.chr20.42.raw.indels.vcf, /humgen/gsa-hpprojects/dev/delangel/Phase1Calls/20110608VQSRConsensus/calls/chr20/AMR.admix/AMR.admix.phase1.chr20.42.raw.indels.vcf, /humgen/gsa-hpprojects/dev/delangel/Phase1Calls/20110608VQSRConsensus/calls/chr20/EUR.admix/EUR.admix.phase1.chr20.42.raw.indels.vcf] rodToIntervalTrackName=null BTI_merge_rule=UNION nonDeterministicRandomSeed=false DBSNP=null downsampling_type=null downsample_to_fraction=null downsample_to_coverage=null baq=OFF baqGapOpenPenalty=40.0 performanceLog=null useOriginalQualities=false defaultBaseQualities=-1 validation_strictness=SILENT unsafe=null num_threads=1 interval_merging=ALL read_group_black_list=null processingTracker=null restartProcessingTracker=false processingTrackerStatusFile=null processingTrackerID=-1 allow_intervals_with_unindexed_bam=false disable_experimental_low_memory_sharding=false logging_level=INFO log_to_file=null help=false out=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub NO_HEADER=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub sites_only=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub genotypemergeoption=PRIORITIZE filteredrecordsmergetype=KEEP_IF_ANY_UNFILTERED rod_priority_list=AFR.admix,AMR.admix,EUR.admix,ASN.admix,AFR,AMR,EUR,ASN printComplexMerges=false filteredAreUncalled=false minimalVCF=false setKey=set assumeIdenticalSamples=false minimumN=1 masterMerge=false mergeInfoWithMaxAC=true"
+##FILTER=<ID=BothStrands,Description="Variant not seen on both strands">
+##FILTER=<ID=HARD_TO_VALIDATE,Description="MQ0 >= 4 && (MQ0 / (1.0 * DP)) > 0.1">
+##FILTER=<ID=HP10,Description="Variant occurs in long homopolymer run (>10)">
+##FILTER=<ID=HaplotypeScore,Description="HaplotypeScore>20.0">
+##FILTER=<ID=HighCoverage,Description="Coverage at variant site is > 7500">
+##FILTER=<ID=HomopolymerRun,Description="HRun>=15">
+##FILTER=<ID=LongRepeat,Description="Variant occurs in long tandem repeat (as defined by 1kg phase one filters)">
+##FILTER=<ID=LowQual,Description="QUAL<30.0">
+##FILTER=<ID=PP20,Description="Variant posterior phred is < 20">
+##FILTER=<ID=QualByDepth,Description="QD<1.0">
+##FILTER=<ID=StrandBias,Description="SB>=-1.0">
+##FILTER=<ID=TruthSensitivityTranche93.00to94.00,Description="Truth sensitivity tranche level at VSQ Lod: 3.9628 <= x < 4.1824">
+##FILTER=<ID=TruthSensitivityTranche94.00to95.00,Description="Truth sensitivity tranche level at VSQ Lod: 3.7129 <= x < 3.9628">
+##FILTER=<ID=TruthSensitivityTranche95.00to96.00,Description="Truth sensitivity tranche level at VSQ Lod: 3.3717 <= x < 3.7129">
+##FILTER=<ID=TruthSensitivityTranche96.00to97.00,Description="Truth sensitivity tranche level at VSQ Lod: 2.8762 <= x < 3.3717">
+##FILTER=<ID=TruthSensitivityTranche97.00to98.00,Description="Truth sensitivity tranche level at VSQ Lod: 2.2618 <= x < 2.8762">
+##FILTER=<ID=TruthSensitivityTranche98.00to99.00+,Description="Truth sensitivity tranche level at VQS Lod < 1.2907">
+##FILTER=<ID=TruthSensitivityTranche98.00to99.00,Description="Truth sensitivity tranche level at VSQ Lod: 1.2907 <= x < 2.2618">
+##FORMAT=<ID=AA,Number=1,Type=Integer,Description="Alternate allele observations">
+##FORMAT=<ID=AD,Number=.,Type=Integer,Description="Allelic depths for the ref and alt alleles in the order listed">
+##FORMAT=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Read Depth (only filtered reads used for calling)">
+##FORMAT=<ID=FT,Number=1,Type=String,Description="Sample Genotype Filter">
+##FORMAT=<ID=GL,Number=3,Type=Integer,Description="Genotype Likelihood, log-scaled likeilhoods of the data given the called genotype for each possible genotype generated from the reference and alternate alleles given the sample ploidy">
+##FORMAT=<ID=GQ,Number=1,Type=Float,Description="Genotype Quality">
+##FORMAT=<ID=GT,Number=1,Type=String,Description="Genotype">
+##FORMAT=<ID=HQ,Number=.,Type=Integer,Description="Haplotype Quality">
+##FORMAT=<ID=PL,Number=3,Type=Float,Description="Normalized, Phred-scaled likelihoods for AA,AB,BB genotypes where A=ref and B=alt; not applicable if site is not biallelic">
+##FORMAT=<ID=RA,Number=1,Type=Integer,Description="Reference allele observations">
+##FORMAT=<ID=SA,Number=1,Type=Integer,Description="Number of alternate observations by strand, delimited by |: [forward]|[reverse]">
+##FORMAT=<ID=SP,Number=1,Type=Integer,Description="Phred-scaled strand bias P-value">
+##FORMAT=<ID=SR,Number=1,Type=Integer,Description="Number of reference observations by strand, delimited by |: [forward]|[reverse]">
+##INFO=<ID=AA,Number=1,Type=Integer,Description="Alternate allele observations">
+##INFO=<ID=AB,Number=1,Type=Float,Description="Allele balance at heterozygous sites: a number between 0 and 1 representing the ratio of reads showing the reference allele to all reads, considering only reads from individuals called as heterozygous">
+##INFO=<ID=ABA,Number=1,Type=Integer,Description="Alternate allele balance count: the number of sequence reads from apparent heterozygotes supporting the alternate allele">
+##INFO=<ID=ABP,Number=1,Type=Float,Description="Allele balance probability at heterozygous sites: Phred-scaled upper-bounds estimate of the probability of observing the deviation between ABR and ABA given E(ABR/ABA) ~ 0.5, derived using Hoeffding's inequality">
+##INFO=<ID=ABR,Number=1,Type=Integer,Description="Reference allele balance count: the number of sequence reads from apparent heterozygotes supporting the reference allele">
+##INFO=<ID=AC,Number=.,Type=Integer,Description="Allele count in genotypes, for each ALT allele, in the same order as listed">
+##INFO=<ID=AF,Number=.,Type=Float,Description="Allele Frequency, for each ALT allele, in the same order as listed">
+##INFO=<ID=AF1,Number=1,Type=Float,Description="Max-likelihood estimate of the site allele frequency of the first ALT allele">
+##INFO=<ID=AN,Number=1,Type=Integer,Description="Total number of alleles in called genotypes">
+##INFO=<ID=BL,Number=1,Type=Integer,Description="Base Pairs Left: number of base pairs in reads supporting the alternate to the left (5') of the alternate allele">
+##INFO=<ID=BR,Number=1,Type=Integer,Description="Base Pairs Right: number of base pairs in reads supporting the alternate to the right (3') of the alternate allele">
+##INFO=<ID=BVAR,Number=0,Type=Flag,Description="The best genotype combination in the posterior is variant (non homozygous).">
+##INFO=<ID=BaseQRankSum,Number=1,Type=Float,Description="Z-score from Wilcoxon rank sum test of Alt Vs. Ref base qualities">
+##INFO=<ID=CI95,Number=2,Type=Float,Description="Equal-tail Bayesian credible interval of the site allele frequency at the 95% level">
+##INFO=<ID=CpG,Number=0,Type=Flag,Description="CpG site (either CpG, TpG or CpA)">
+##INFO=<ID=DB,Number=0,Type=Flag,Description="dbSNP Membership">
+##INFO=<ID=DEL,Number=0,Type=Flag,Description="deletion allele">
+##INFO=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Filtered Depth">
+##INFO=<ID=DP4,Number=4,Type=Integer,Description="# high-quality ref-forward bases, ref-reverse, alt-forward and alt-reverse bases">
+##INFO=<ID=DS,Number=0,Type=Flag,Description="Were any of the samples downsampled?">
+##INFO=<ID=Dels,Number=1,Type=Float,Description="Fraction of Reads Containing Spanning Deletions">
+##INFO=<ID=EL,Number=1,Type=Integer,Description="Allele End Left: number of observations of the alternate where the alternate occurs in the left end of the read">
+##INFO=<ID=EPP,Number=1,Type=Float,Description="End Placement Probability: Phred-scaled upper-bounds estimate of the probability of observing the deviation between EL and ER given E(EL/ER) ~ 0.5, derived using Hoeffding's inequality">
+##INFO=<ID=ER,Number=1,Type=Integer,Description="Allele End Right: number of observations of the alternate where the alternate occurs in the right end of the read">
+##INFO=<ID=FQ,Number=1,Type=Float,Description="Phred probability that sample chromosomes are not all the same">
+##INFO=<ID=FR,Number=0,Type=Float,Description="Estimated population frequency">
+##INFO=<ID=FS,Number=1,Type=Float,Description="Phred-scaled p-value using Fisher's exact test to detect strand bias">
+##INFO=<ID=HETAR,Number=1,Type=Integer,Description="Number of individuals heterozygous alternate / reference">
+##INFO=<ID=HOMA,Number=1,Type=Integer,Description="Number of individuals homozygous for the alternate">
+##INFO=<ID=HOMR,Number=1,Type=Integer,Description="Number of individuals homozygous for the reference">
+##INFO=<ID=HP,Number=1,Type=Integer,Description="Homopolmer run length">
+##INFO=<ID=HPLen,Number=1,Type=Integer,Description="Homopolymer length">
+##INFO=<ID=HR,Number=1,Type=Integer,Description="Homopolymer run length">
+##INFO=<ID=HRun,Number=1,Type=Integer,Description="Largest Contiguous Homopolymer Run of Variant Allele In Either Direction">
+##INFO=<ID=HU,Number=1,Type=String,Description="Homopolymer run unit (stranded)">
+##INFO=<ID=HaplotypeScore,Number=1,Type=Float,Description="Consistency of the site with at most two segregating haplotypes">
+##INFO=<ID=INDEL,Number=0,Type=Flag,Description="Not provided in original VCF header">
+##INFO=<ID=INS,Number=0,Type=Flag,Description="insertion allele">
+##INFO=<ID=InbreedingCoeff,Number=1,Type=Float,Description="Inbreeding coefficient as estimated from the genotype likelihoods per-sample when compared against the Hardy-Weinberg expectation">
+##INFO=<ID=IndelType,Number=1,Type=String,Description="Indel type description">
+##INFO=<ID=KGPilot123,Number=0,Type=Flag,Description="1000 Genome discovery all pilots 2010(1,2,3)">
+##INFO=<ID=LEN,Number=1,Type=Integer,Description="allele length">
+##INFO=<ID=LRB,Number=1,Type=Float,Description="((max(BR, BL) / (BR + BL)) - 0.5) * 2 : The proportion of base pairs in reads on one side of the alternate allele relative to total bases, scaled from [0.5,1] to [0,1]">
+##INFO=<ID=LRBP,Number=1,Type=Float,Description="Left-Right Balance Probability: Phred-scaled upper-bounds estimate of the probability of observing the deviation between BL and BR given E(BR/BL) ~ 0.5, derived using Hoeffding's inequality">
+##INFO=<ID=MNP,Number=0,Type=Flag,Description="MNP allele">
+##INFO=<ID=MQ,Number=1,Type=Float,Description="RMS Mapping Quality">
+##INFO=<ID=MQ0,Number=1,Type=Integer,Description="Total Mapping Quality Zero Reads">
+##INFO=<ID=MQ0Fraction,Number=1,Type=Float,Description="Fraction of Mapping Quality Zero Reads">
+##INFO=<ID=MQM,Number=1,Type=Float,Description="Mean mapping quality of observed alternate alleles">
+##INFO=<ID=MQRankSum,Number=1,Type=Float,Description="Z-score From Wilcoxon rank sum test of Alt vs. Ref read mapping qualities">
+##INFO=<ID=NF,Number=0,Type=Integer,Description="Total number of forward reads containing this variant">
+##INFO=<ID=NR,Number=0,Type=Integer,Description="Total number of reads containing this variant">
+##INFO=<ID=NS,Number=1,Type=Integer,Description="Number of samples with data">
+##INFO=<ID=PP,Number=0,Type=Float,Description="Posterior probability (phred scaled) that this variant segregates">
+##INFO=<ID=PV4,Number=4,Type=Float,Description="P-values for strand bias, baseQ bias, mapQ bias and tail distance bias">
+##INFO=<ID=QD,Number=1,Type=Float,Description="Variant Confidence/Quality by Depth">
+##INFO=<ID=RA,Number=1,Type=Integer,Description="Reference allele observations">
+##INFO=<ID=RL,Number=1,Type=Integer,Description="Reads Placed Left: number of reads supporting the alternate balanced to the left (5') of the alternate allele">
+##INFO=<ID=RPP,Number=1,Type=Float,Description="Read Placement Probability: Phred-scaled upper-bounds estimate of the probability of observing the deviation between RPL and RPR given E(RPL/RPR) ~ 0.5, derived using Hoeffding's inequality">
+##INFO=<ID=RR,Number=1,Type=Integer,Description="Reads Placed Right: number of reads supporting the alternate balanced to the right (3') of the alternate allele">
+##INFO=<ID=RUN,Number=1,Type=Integer,Description="Homopolymer run length: the number of consecutive nucleotides in the reference genome matching the alternate allele prior to the current position">
+##INFO=<ID=ReadPosRankSum,Number=1,Type=Float,Description="Z-score from Wilcoxon rank sum test of Alt vs. Ref read position bias">
+##INFO=<ID=SAB,Number=1,Type=Float,Description="Strand bias for the alternate allele: SAF / ( SAF + SAR )">
+##INFO=<ID=SAF,Number=1,Type=Integer,Description="Number of alternate observations on the forward strand">
+##INFO=<ID=SAP,Number=1,Type=Float,Description="Strand balance probability for the alternate allele: Phred-scaled upper-bounds estimate of the probability of observing the deviation between SAF and SAR given E(SAF/SAR) ~ 0.5, derived using Hoeffding's inequality">
+##INFO=<ID=SAR,Number=1,Type=Integer,Description="Number of alternate observations on the reverse strand">
+##INFO=<ID=SB,Number=1,Type=Float,Description="Strand Bias">
+##INFO=<ID=SC,Number=1,Type=String,Description="Genomic sequence 10 bases either side of variant position">
+##INFO=<ID=SNP,Number=0,Type=Flag,Description="SNP allele">
+##INFO=<ID=SRB,Number=1,Type=Float,Description="Strand bias for the reference allele: SRF / ( SRF + SRR )">
+##INFO=<ID=SRF,Number=1,Type=Integer,Description="Number of reference observations on the forward strand">
+##INFO=<ID=SRP,Number=1,Type=Float,Description="Strand balance probability for the reference allele: Phred-scaled upper-bounds estimate of the probability of observing the deviation between SRF and SRR given E(SRF/SRR) ~ 0.5, derived using Hoeffding's inequality">
+##INFO=<ID=SRR,Number=1,Type=Integer,Description="Number of reference observations on the reverse strand">
+##INFO=<ID=TC,Number=0,Type=Integer,Description="Total coverage">
+##INFO=<ID=TR,Number=1,Type=Integer,Description="Tandem repeat run length (bp)">
+##INFO=<ID=TS,Number=0,Type=Flag,Description="transition SNP">
+##INFO=<ID=TU,Number=1,Type=String,Description="tandem repeat run unit (stranded)">
+##INFO=<ID=TV,Number=0,Type=Flag,Description="transversion SNP">
+##INFO=<ID=VLD,Number=0,Type=Flag,Description="Is Validated.  This bit is set if the snp has 2+ minor allele count based on frequency or genotype data.">
+##INFO=<ID=VQSLOD,Number=1,Type=Float,Description="Log odds ratio of being a true variant versus being false under the trained gaussian mixture model">
+##INFO=<ID=dbSNP,Number=1,Type=Integer,Description="First SNP Build for RS">
+##INFO=<ID=set,Number=1,Type=String,Description="Source VCF for the merged record in CombineVariants">
+##LeftAlignVariants="analysis_type=LeftAlignVariants input_file=[] sample_metadata=[] read_buffer_size=null phone_home=STANDARD read_filter=[] intervals=[20] excludeIntervals=null reference_sequence=/seq/references/Homo_sapiens_assembly19/v1/Homo_sapiens_assembly19.fasta rodBind=[/humgen/gsa-scr1/ebanks/ALL.chr20.Oxford.20110407.indels.genotypes.vcf] rodToIntervalTrackName=null BTI_merge_rule=UNION nonDeterministicRandomSeed=false DBSNP=null downsampling_type=null downsample_to_fraction=null downsample_to_coverage=null baq=OFF baqGapOpenPenalty=40.0 performanceLog=null useOriginalQualities=false defaultBaseQualities=-1 validation_strictness=SILENT unsafe=null num_threads=1 interval_merging=ALL read_group_black_list=null processingTracker=null restartProcessingTracker=false processingTrackerStatusFile=null processingTrackerID=-1 allow_intervals_with_unindexed_bam=false disable_experimental_low_memory_sharding=false logging_level=INFO log_to_file=null help=false out=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub NO_HEADER=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub sites_only=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub"
+##SelectVariants="analysis_type=SelectVariants input_file=[] sample_metadata=[] read_buffer_size=null phone_home=STANDARD read_filter=[] intervals=[20] excludeIntervals=null reference_sequence=/seq/references/Homo_sapiens_assembly19/v1/Homo_sapiens_assembly19.fasta rodBind=[/humgen/gsa-scr1/delangel/officialCalls/20110201_chr20_phase1_indels/dindel/20110208.chr20.dindel2.ALL.sites.vcf] rodToIntervalTrackName=null BTI_merge_rule=UNION nonDeterministicRandomSeed=false DBSNP=null downsampling_type=null downsample_to_fraction=null downsample_to_coverage=null baq=OFF baqGapOpenPenalty=40.0 performanceLog=null useOriginalQualities=false defaultBaseQualities=-1 validation_strictness=SILENT unsafe=null num_threads=1 interval_merging=ALL read_group_black_list=null processingTracker=null restartProcessingTracker=false processingTrackerStatusFile=null processingTrackerID=-1 allow_intervals_with_unindexed_bam=false disable_experimental_low_memory_sharding=false logging_level=INFO log_to_file=null help=false out=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub NO_HEADER=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub sites_only=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub sample=null select_expressions=[] excludeNonVariants=false excludeFiltered=false discordance= concordance= family_structure= mendelianViolation=false mendelianViolationQualThreshold=0.0 select_random_number=0 select_random_fraction=0.0 selectSNPs=false selectIndels=true"
+##UnifiedGenotyper="analysis_type=UnifiedGenotyper input_file=[/broad/shptmp/delangel/calls/chr20/CHB.phase1.chr20.42.cleaned.bam, /broad/shptmp/delangel/calls/chr20/CHS.phase1.chr20.42.cleaned.bam, /broad/shptmp/delangel/calls/chr20/CLM.phase1.chr20.42.cleaned.bam, /broad/shptmp/delangel/calls/chr20/JPT.phase1.chr20.42.cleaned.bam, /broad/shptmp/delangel/calls/chr20/MXL.phase1.chr20.42.cleaned.bam, /broad/shptmp/delangel/calls/chr20/PUR.phase1.chr20.42.cleaned.bam] sample_metadata=[] read_buffer_size=null phone_home=STANDARD read_filter=[] intervals=[20:41000001-42000000] excludeIntervals=null reference_sequence=/humgen/1kg/reference/human_g1k_v37.fasta rodBind=[/humgen/gsa-scr1/delangel/otherIndelCallerAnalysis/ALL.indels.combined.chr20.vcf, /humgen/gsa-hpprojects/GATK/data/dbsnp_132_b37.leftAligned.vcf] rodToIntervalTrackName=null BTI_merge_rule=UNION nonDeterministicRandomSeed=false DBSNP=null downsampling_type=null downsample_to_fraction=null downsample_to_coverage=50 baq=OFF baqGapOpenPenalty=40.0 performanceLog=null useOriginalQualities=false defaultBaseQualities=-1 validation_strictness=SILENT unsafe=null num_threads=8 interval_merging=ALL read_group_black_list=null processingTracker=null restartProcessingTracker=false processingTrackerStatusFile=null processingTrackerID=-1 allow_intervals_with_unindexed_bam=false disable_experimental_low_memory_sharding=false logging_level=INFO log_to_file=null help=false genotype_likelihoods_model=INDEL p_nonref_model=EXACT heterozygosity=0.0010 pcr_error_rate=1.0E-4 genotyping_mode=GENOTYPE_GIVEN_ALLELES output_mode=EMIT_ALL_SITES standard_min_confidence_threshold_for_calling=4.0 standard_min_confidence_threshold_for_emitting=4.0 noSLOD=false assume_single_sample_reads=null abort_at_too_much_coverage=-1 min_base_quality_score=17 min_mapping_quality_score=20 max_deletion_fraction=0.05 min_indel_count_for_genotyping=5 indel_heterozygosity=1.25E-4 indelGapContinuationPenalty=10.0 indelGapOpenPenalty=45.0 indelHaplotypeSize=80 doContextDependentGapPenalties=true getGapPenaltiesFromData=false indel_recal_file=indel.recal_data.csv indelDebug=false dovit=false GSA_PRODUCTION_ONLY=false exactCalculation=LINEAR_EXPERIMENTAL ignoreSNPAlleles=true output_all_callable_bases=false genotype=false out=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub NO_HEADER=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub sites_only=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub debug_file=null metrics_file=null annotation=[MappingQualityZeroFraction]"
+##VariantAnnotator="analysis_type=VariantAnnotator input_file=[] sample_metadata=[] read_buffer_size=null phone_home=STANDARD read_filter=[] intervals=null excludeIntervals=null reference_sequence=/humgen/1kg/reference/human_g1k_v37.fasta rodBind=[./ALL.chr20.vqsr_2of5_union_sites_for_validation_boosted.vcf] rodToIntervalTrackName=variant BTI_merge_rule=UNION nonDeterministicRandomSeed=false DBSNP=null downsampling_type=null downsample_to_fraction=null downsample_to_coverage=null baq=OFF baqGapOpenPenalty=40.0 performanceLog=null useOriginalQualities=false defaultBaseQualities=-1 validation_strictness=SILENT unsafe=null num_threads=1 interval_merging=ALL read_group_black_list=null processingTracker=null restartProcessingTracker=false processingTrackerStatusFile=null processingTrackerID=-1 allow_intervals_with_unindexed_bam=false disable_experimental_low_memory_sharding=false logging_level=INFO log_to_file=null help=false out=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub NO_HEADER=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub sites_only=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub sampleName=null annotation=[IndelType] group=[] expression=[] useAllAnnotations=false list=false assume_single_sample_reads=null vcfContainsOnlyIndels=false"
+##VariantFiltration="analysis_type=VariantFiltration input_file=[] sample_metadata=[] read_buffer_size=null phone_home=STANDARD read_filter=[] intervals=[/humgen/1kg/processing/pipeline_test_bams/chr22_chunked.hg19.intervals] excludeIntervals=null reference_sequence=/humgen/1kg/reference/human_g1k_v37.fasta rodBind=[/broad/shptmp/rpoplin/ALL.phase1.chr22.raw.indels.vcf] rodToIntervalTrackName=null BTI_merge_rule=UNION DBSNP=null downsampling_type=null downsample_to_fraction=null downsample_to_coverage=null baq=OFF baqGapOpenPenalty=40.0 performanceLog=null useOriginalQualities=false defaultBaseQualities=-1 validation_strictness=SILENT unsafe=null num_threads=1 interval_merging=ALL read_group_black_list=null processingTracker=null restartProcessingTracker=false processingTrackerStatusFile=null processingTrackerID=-1 allow_intervals_with_unindexed_bam=false enable_experimental_low_memory_sharding=false logging_level=INFO log_to_file=null quiet_output_mode=false debug_mode=false help=false out=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub NO_HEADER=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub sites_only=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub filterExpression=[MQ0 >= 4 && (MQ0 / (1.0 * DP)) > 0.1, QUAL<30.0, SB>=-1.0, QD<1.0, HRun>=15, HaplotypeScore>20.0] filterName=[HARD_TO_VALIDATE, LowQual, StrandBias, QualByDepth, HomopolymerRun, HaplotypeScore] genotypeFilterExpression=[] genotypeFilterName=[] clusterSize=3 clusterWindowSize=0 maskName=Mask missingValuesInExpressionsShouldEvaluateAsFailing=false"
+##commandline="/share/software/freebayes/bin/freebayes --stdin --min-alternate-count 2 --genotype-combo-step-max 20 --genotype-variant-threshold 4 --no-marginals --pvar 0.0001 --indels --mnps --no-filters --binomial-obs-priors --allele-balance-priors --region 20:0..100000 --vcf /d1/data/1000G/20101123/populations/finalised.phase1/integrated/including454/wg/ALL/Pipeline/none//freebayes/freebayes.20:0-100000.baq.20110328.vcf --fasta-reference /d2/data/references/build_37/human_reference_v37.fa"
+##fileDate=2011-03-28
+##filedate=2011-02-08
+##filter="( SNP | MNP ) & ( MQM > 65 | QUAL > 1 ) & ABP < 30 & AB < 0.9 | ( INS | DEL ) & QUAL > 500"
+##phasing=none
+##platypusOptions={'bamFiles': ['/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA06984', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA06985', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA06986', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA06989', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA06994', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA07000', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA07037', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA07048', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA07051', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA07056', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA07346', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA07347', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA07357', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA10847', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA10851', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA11829', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA11830', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA11831', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA11832', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA11843', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA11881', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA11892', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA11893', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA11894', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA11918', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA11919', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA11920', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA11930', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA11931', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA11932', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA11933', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA11992', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA11993', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA11994', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA11995', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12003', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12004', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12005', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12006', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12043', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12044', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12045', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12046', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12058', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12144', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12154', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12155', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12156', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12234', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12249', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12272', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12273', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12275', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12282', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12283', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12286', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12287', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12340', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12341', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12342', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12347', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12348', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12383', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12399', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12400', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12413', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12414', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12489', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12546', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12716', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12717', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12718', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12748', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12749', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12750', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12751', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12761', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12763', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12775', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12776', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12777', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12778', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12813', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12827', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12828', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12829', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12830', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12842', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12843', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12889', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA12890', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18486', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18487', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18488', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18489', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18498', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18499', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18501', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18502', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18504', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18505', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18507', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18508', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18510', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18511', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18516', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18517', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18519', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18520', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18522', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18523', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18526', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18530', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18532', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18533', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18534', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18535', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18536', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18537', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18538', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18539', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18541', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18542', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18543', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18544', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18545', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18546', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18547', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18548', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18549', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18550', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18552', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18553', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18555', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18557', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18558', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18559', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18560', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18561', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18562', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18563', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18564', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18565', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18566', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18567', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18570', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18571', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18572', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18573', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18574', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18576', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18577', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18579', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18582', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18592', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18593', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18595', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18596', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18597', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18599', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18602', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18603', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18605', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18606', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18608', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18609', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18610', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18611', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18612', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18613', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18614', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18615', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18616', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18617', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18618', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18619', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18620', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18621', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18622', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18623', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18624', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18625', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18626', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18627', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18628', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18630', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18631', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18632', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18633', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18634', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18635', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18636', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18637', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18638', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18853', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18856', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18858', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18861', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18867', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18868', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18870', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18871', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18873', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18874', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18907', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18908', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18909', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18910', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18912', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18916', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18917', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18923', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18924', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18933', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18934', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18940', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18941', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18942', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18943', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18944', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18945', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18947', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18948', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18949', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18950', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18951', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18952', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18953', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18956', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18959', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18960', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18961', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18963', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18964', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18965', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18967', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18968', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18971', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18972', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18973', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18974', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18975', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18976', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18977', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18980', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18981', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18982', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18983', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18984', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18985', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18986', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18987', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18988', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18989', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18990', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18991', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA18999', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19000', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19002', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19003', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19004', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19005', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19007', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19009', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19010', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19012', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19054', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19055', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19056', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19057', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19058', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19059', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19060', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19062', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19063', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19064', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19065', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19066', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19067', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19068', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19070', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19072', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19074', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19075', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19076', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19077', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19078', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19079', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19080', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19081', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19082', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19083', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19084', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19085', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19087', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19088', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19092', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19093', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19098', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19099', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19102', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19107', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19108', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19114', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19116', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19119', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19129', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19130', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19131', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19137', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19138', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19144', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19147', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19152', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19153', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19159', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19160', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19171', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19172', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19189', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19190', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19197', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19198', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19200', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19201', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19204', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19207', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19209', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19210', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19213', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19223', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19225', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19235', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19236', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19247', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19248', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19256', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19257', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19311', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19312', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19313', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19315', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19316', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19317', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19318', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19319', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19321', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19324', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19327', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19328', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19331', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19332', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19334', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19338', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19346', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19347', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19350', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19355', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19359', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19360', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19371', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19372', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19373', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19374', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19375', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19376', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19377', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19379', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19380', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19381', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19382', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19383', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19384', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19385', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19390', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19391', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19393', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19394', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19395', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19396', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19397', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19398', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19399', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19401', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19403', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19404', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19428', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19429', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19430', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19431', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19434', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19435', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19436', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19437', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19438', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19439', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19440', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19443', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19444', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19445', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19446', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19448', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19449', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19451', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19452', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19453', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19455', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19456', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19457', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19461', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19462', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19463', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19466', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19467', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19468', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19469', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19470', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19471', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19472', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19473', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19474', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19625', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19648', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19649', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19651', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19652', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19654', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19655', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19657', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19658', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19660', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19661', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19663', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19664', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19670', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19675', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19676', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19678', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19679', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19681', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19682', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19684', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19685', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19700', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19701', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19703', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19704', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19707', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19711', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19712', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19713', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19716', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19717', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19719', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19720', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19722', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19723', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19725', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19726', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19728', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19729', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19731', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19732', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19746', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19747', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19749', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19750', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19755', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19756', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19758', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19759', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19761', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19762', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19770', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19771', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19773', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19774', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19776', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19777', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19779', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19780', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19782', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19783', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19785', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19786', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19788', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19789', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19818', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19819', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19834', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19835', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19900', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19901', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19904', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19908', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19909', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19914', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19916', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19917', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19920', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19921', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19982', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA19985', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20126', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20127', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20276', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20278', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20281', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20282', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20287', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20289', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20291', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20294', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20296', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20299', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20314', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20317', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20322', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20332', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20334', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20336', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20340', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20341', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20342', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20344', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20346', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20348', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20356', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20502', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20503', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20504', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20505', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20506', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20507', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20508', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20509', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20510', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20512', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20513', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20514', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20515', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20516', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20517', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20518', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20519', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20520', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20521', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20522', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20524', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20525', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20526', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20527', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20528', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20529', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20530', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20531', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20532', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20533', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20534', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20535', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20536', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20537', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20538', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20539', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20540', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20541', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20542', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20543', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20544', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20581', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20582', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20585', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20586', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20588', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20589', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20752', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20753', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20754', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20755', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20756', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20757', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20758', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20759', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20760', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20761', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20765', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20766', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20768', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20769', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20770', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20771', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20772', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20773', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20774', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20775', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20778', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20783', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20785', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20786', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20787', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20790', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20792', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20795', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20796', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20797', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20798', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20799', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20800', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20801', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20802', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20803', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20804', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20805', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20806', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20807', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20808', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20809', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20810', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20811', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20812', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20813', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20814', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20815', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20816', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20818', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20819', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20826', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/NA20828', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00096', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00098', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00100', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00103', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00106', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00108', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00111', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00112', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00114', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00115', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00116', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00117', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00118', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00119', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00120', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00122', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00123', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00124', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00125', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00126', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00127', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00131', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00133', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00136', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00137', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00138', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00139', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00140', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00141', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00142', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00143', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00144', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00145', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00146', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00147', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00148', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00149', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00150', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00151', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00152', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00153', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00154', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00155', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00156', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00157', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00158', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00159', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00160', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00171', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00173', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00174', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00176', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00177', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00178', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00179', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00180', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00181', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00182', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00183', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00185', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00186', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00187', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00188', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00189', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00190', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00231', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00232', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00233', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00236', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00237', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00239', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00242', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00243', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00244', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00245', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00246', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00247', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00249', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00250', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00251', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00252', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00253', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00254', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00256', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00257', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00258', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00259', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00260', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00261', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00262', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00263', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00264', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00265', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00266', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00267', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00268', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00269', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00270', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00271', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00272', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00273', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00274', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00275', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00276', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00277', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00278', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00280', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00281', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00282', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00284', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00285', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00306', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00308', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00309', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00310', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00311', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00312', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00313', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00315', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00318', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00319', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00320', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00321', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00323', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00324', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00325', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00326', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00327', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00328', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00329', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00330', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00331', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00334', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00335', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00336', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00337', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00338', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00339', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00342', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00343', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00344', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00345', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00346', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00353', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00357', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00361', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00366', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00367', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00368', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00369', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00372', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00373', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00375', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00377', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00380', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00403', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00404', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00418', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00419', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00421', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00422', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00427', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00428', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00436', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00437', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00442', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00443', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00448', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00449', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00463', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00464', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00472', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00473', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00475', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00476', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00478', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00479', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00500', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00501', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00512', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00513', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00524', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00525', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00530', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00531', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00533', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00534', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00536', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00537', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00542', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00543', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00551', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00553', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00554', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00556', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00557', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00559', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00560', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00565', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00566', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00577', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00578', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00580', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00581', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00583', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00584', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00589', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00590', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00592', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00593', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00595', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00596', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00607', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00608', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00610', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00611', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00613', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00614', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00619', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00620', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00625', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00626', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00628', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00629', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00634', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00635', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00637', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00638', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00640', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00641', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00650', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00651', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00653', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00654', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00656', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00657', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00662', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00663', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00671', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00672', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00683', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00684', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00689', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00690', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00692', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00693', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00698', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00699', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00701', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00702', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00704', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00705', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00707', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00708', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00731', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00732', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00734', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00736', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00737', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00739', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG00740', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01047', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01048', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01051', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01052', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01055', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01060', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01061', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01066', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01067', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01069', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01070', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01072', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01073', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01075', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01079', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01080', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01082', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01083', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01094', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01095', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01097', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01098', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01101', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01102', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01107', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01108', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01110', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01111', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01112', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01113', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01124', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01125', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01133', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01134', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01136', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01137', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01140', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01148', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01149', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01167', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01168', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01170', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01171', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01173', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01174', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01176', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01177', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01182', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01183', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01187', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01188', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01190', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01191', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01197', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01198', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01204', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01250', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01251', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01253', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01254', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01334', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01342', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01350', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01351', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01353', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01354', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01356', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01357', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01359', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01360', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01365', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01366', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01374', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01375', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01377', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01378', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01383', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01384', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01389', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01390', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01437', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01440', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01441', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01455', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01456', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01461', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01462', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01464', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01465', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01488', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01489', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01491', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01492', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01494', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01495', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01497', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01498', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01515', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01516', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01518', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01519', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01521', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01522', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01550', '/scratch/rimmer/ThousandGenomes/PhaseOneBAMs/HG01551'], 'minReads': 2, 'refFile': '/scratch/rimmer/Genomes/human_g1k_v37_ebv.fa', 'maxHaplotypes': 64, 'maxSize': 100, 'ploidy': 2, 'maxRegionSize': 10000, 'nCPU': 1, 'minFlank': 3, 'logFileName': 'LogsAllPhaseOne/ThousandGenomesPhaseOneCalls_20:1-100001.log', 'regions': ['20:1-100001'], 'maxVariants': 6, 'genIndels': 1, 'labels': None, 'dataType': 'population', 'minMapQual': 20, 'rlen': 100, 'nInd': 994, 'getVariantsFromBAMs': 1, 'genSNPs': 1, 'minReadQual': 20, 'maxCoverage': 1000000.0, 'verbosity': 2, 'sourceFile': None, 'callOnlyIndels': 1, 'output': 'VariantCallsAllPhaseOne/ThousandGenomesPhaseOneCalls_20:1-100001.vcf'}
+##reference=/lustre/scratch105/projects/g1k/ref/main_project/human_g1k_v37.fasta
+##source=Dindel2
+##source=SelectVariants
+##source_20110031.1=/nfs/users/nfs_p/pd3/cvs/vcftools/perl/vcf-annotate -d /nfs/users/nfs_p/pd3/sandbox/hapmap/dbSNP-b132/non-1kg-vld.desc -a /nfs/users/nfs_p/pd3/sandbox/hapmap/dbSNP-b132/non-1kg-vld.tab.gz -c CHROM,FROM,INFO/VLD,INFO/KGPilot123,INFO/dbSNP
+##vcfCTools=filter
+##vcfCtools=merge freebayes.20:0-100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:100000-200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:200000-300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:300000-400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:400000-500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:500000-600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:600000-700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:700000-800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:800000-900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:900000-1000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:1000000-1100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:1100000-1200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:1200000-1300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:1300000-1400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:1400000-1500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:1500000-1600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:1600000-1700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:1700000-1800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:1800000-1900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:1900000-2000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:2000000-2100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:2100000-2200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:2200000-2300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:2300000-2400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:2400000-2500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:2500000-2600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:2600000-2700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:2700000-2800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:2800000-2900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:2900000-3000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:3000000-3100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:3100000-3200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:3200000-3300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:3300000-3400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:3400000-3500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:3500000-3600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:3600000-3700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:3700000-3800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:3800000-3900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:3900000-4000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:4000000-4100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:4100000-4200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:4200000-4300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:4300000-4400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:4400000-4500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:4500000-4600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:4600000-4700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:4700000-4800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:4800000-4900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:4900000-5000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:5000000-5100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:5100000-5200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:5200000-5300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:5300000-5400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:5400000-5500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:5500000-5600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:5600000-5700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:5700000-5800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:5800000-5900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:5900000-6000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:6000000-6100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:6100000-6200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:6200000-6300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:6300000-6400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:6400000-6500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:6500000-6600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:6600000-6700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:6700000-6800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:6800000-6900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:6900000-7000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:7000000-7100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:7100000-7200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:7200000-7300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:7300000-7400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:7400000-7500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:7500000-7600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:7600000-7700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:7700000-7800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:7800000-7900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:7900000-8000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:8000000-8100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:8100000-8200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:8200000-8300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:8300000-8400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:8400000-8500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:8500000-8600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:8600000-8700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:8700000-8800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:8800000-8900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:8900000-9000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:9000000-9100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:9100000-9200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:9200000-9300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:9300000-9400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:9400000-9500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:9500000-9600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:9600000-9700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:9700000-9800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:9800000-9900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:9900000-10000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:10000000-10100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:10100000-10200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:10200000-10300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:10300000-10400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:10400000-10500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:10500000-10600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:10600000-10700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:10700000-10800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:10800000-10900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:10900000-11000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:11000000-11100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:11100000-11200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:11200000-11300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:11300000-11400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:11400000-11500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:11500000-11600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:11600000-11700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:11700000-11800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:11800000-11900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:11900000-12000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:12000000-12100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:12100000-12200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:12200000-12300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:12300000-12400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:12400000-12500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:12500000-12600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:12600000-12700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:12700000-12800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:12800000-12900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:12900000-13000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:13000000-13100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:13100000-13200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:13200000-13300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:13300000-13400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:13400000-13500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:13500000-13600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:13600000-13700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:13700000-13800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:13800000-13900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:13900000-14000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:14000000-14100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:14100000-14200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:14200000-14300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:14300000-14400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:14400000-14500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:14500000-14600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:14600000-14700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:14700000-14800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:14800000-14900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:14900000-15000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:15000000-15100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:15100000-15200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:15200000-15300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:15300000-15400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:15400000-15500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:15500000-15600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:15600000-15700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:15700000-15800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:15800000-15900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:15900000-16000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:16000000-16100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:16100000-16200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:16200000-16300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:16300000-16400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:16400000-16500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:16500000-16600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:16600000-16700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:16700000-16800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:16800000-16900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:16900000-17000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:17000000-17100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:17100000-17200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:17200000-17300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:17300000-17400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:17400000-17500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:17500000-17600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:17600000-17700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:17700000-17800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:17800000-17900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:17900000-18000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:18000000-18100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:18100000-18200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:18200000-18300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:18300000-18400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:18400000-18500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:18500000-18600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:18600000-18700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:18700000-18800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:18800000-18900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:18900000-19000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:19000000-19100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:19100000-19200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:19200000-19300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:19300000-19400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:19400000-19500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:19500000-19600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:19600000-19700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:19700000-19800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:19800000-19900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:19900000-20000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:20000000-20100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:20100000-20200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:20200000-20300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:20300000-20400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:20400000-20500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:20500000-20600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:20600000-20700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:20700000-20800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:20800000-20900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:20900000-21000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:21000000-21100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:21100000-21200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:21200000-21300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:21300000-21400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:21400000-21500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:21500000-21600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:21600000-21700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:21700000-21800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:21800000-21900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:21900000-22000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:22000000-22100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:22100000-22200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:22200000-22300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:22300000-22400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:22400000-22500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:22500000-22600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:22600000-22700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:22700000-22800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:22800000-22900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:22900000-23000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:23000000-23100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:23100000-23200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:23200000-23300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:23300000-23400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:23400000-23500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:23500000-23600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:23600000-23700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:23700000-23800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:23800000-23900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:23900000-24000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:24000000-24100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:24100000-24200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:24200000-24300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:24300000-24400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:24400000-24500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:24500000-24600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:24600000-24700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:24700000-24800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:24800000-24900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:24900000-25000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:25000000-25100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:25100000-25200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:25200000-25300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:25300000-25400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:25400000-25500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:25500000-25600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:25600000-25700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:25700000-25800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:25800000-25900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:25900000-26000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:26000000-26100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:26100000-26200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:26200000-26300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:26300000-26400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:26400000-26500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:26500000-26600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:26600000-26700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:26700000-26800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:26800000-26900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:26900000-27000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:27000000-27100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:27100000-27200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:27200000-27300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:27300000-27400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:27400000-27500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:27500000-27600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:27600000-27700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:27700000-27800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:27800000-27900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:27900000-28000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:28000000-28100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:28100000-28200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:28200000-28300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:28300000-28400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:28400000-28500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:28500000-28600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:28600000-28700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:28700000-28800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:28800000-28900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:28900000-29000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:29000000-29100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:29100000-29200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:29200000-29300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:29300000-29400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:29400000-29500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:29500000-29600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:29600000-29700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:29700000-29800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:29800000-29900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:29900000-30000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:30000000-30100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:30100000-30200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:30200000-30300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:30300000-30400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:30400000-30500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:30500000-30600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:30600000-30700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:30700000-30800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:30800000-30900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:30900000-31000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:31000000-31100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:31100000-31200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:31200000-31300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:31300000-31400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:31400000-31500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:31500000-31600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:31600000-31700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:31700000-31800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:31800000-31900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:31900000-32000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:32000000-32100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:32100000-32200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:32200000-32300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:32300000-32400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:32400000-32500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:32500000-32600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:32600000-32700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:32700000-32800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:32800000-32900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:32900000-33000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:33000000-33100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:33100000-33200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:33200000-33300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:33300000-33400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:33400000-33500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:33500000-33600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:33600000-33700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:33700000-33800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:33800000-33900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:33900000-34000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:34000000-34100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:34100000-34200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:34200000-34300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:34300000-34400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:34400000-34500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:34500000-34600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:34600000-34700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:34700000-34800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:34800000-34900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:34900000-35000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:35000000-35100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:35100000-35200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:35200000-35300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:35300000-35400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:35400000-35500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:35500000-35600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:35600000-35700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:35700000-35800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:35800000-35900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:35900000-36000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:36000000-36100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:36100000-36200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:36200000-36300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:36300000-36400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:36400000-36500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:36500000-36600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:36600000-36700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:36700000-36800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:36800000-36900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:36900000-37000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:37000000-37100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:37100000-37200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:37200000-37300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:37300000-37400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:37400000-37500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:37500000-37600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:37600000-37700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:37700000-37800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:37800000-37900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:37900000-38000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:38000000-38100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:38100000-38200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:38200000-38300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:38300000-38400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:38400000-38500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:38500000-38600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:38600000-38700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:38700000-38800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:38800000-38900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:38900000-39000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:39000000-39100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:39100000-39200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:39200000-39300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:39300000-39400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:39400000-39500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:39500000-39600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:39600000-39700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:39700000-39800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:39800000-39900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:39900000-40000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:40000000-40100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:40100000-40200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:40200000-40300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:40300000-40400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:40400000-40500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:40500000-40600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:40600000-40700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:40700000-40800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:40800000-40900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:40900000-41000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:41000000-41100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:41100000-41200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:41200000-41300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:41300000-41400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:41400000-41500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:41500000-41600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:41600000-41700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:41700000-41800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:41800000-41900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:41900000-42000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:42000000-42100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:42100000-42200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:42200000-42300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:42300000-42400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:42400000-42500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:42500000-42600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:42600000-42700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:42700000-42800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:42800000-42900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:42900000-43000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:43000000-43100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:43100000-43200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:43200000-43300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:43300000-43400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:43400000-43500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:43500000-43600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:43600000-43700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:43700000-43800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:43800000-43900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:43900000-44000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:44000000-44100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:44100000-44200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:44200000-44300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:44300000-44400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:44400000-44500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:44500000-44600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:44600000-44700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:44700000-44800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:44800000-44900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:44900000-45000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:45000000-45100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:45100000-45200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:45200000-45300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:45300000-45400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:45400000-45500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:45500000-45600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:45600000-45700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:45700000-45800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:45800000-45900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:45900000-46000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:46000000-46100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:46100000-46200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:46200000-46300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:46300000-46400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:46400000-46500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:46500000-46600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:46600000-46700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:46700000-46800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:46800000-46900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:46900000-47000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:47000000-47100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:47100000-47200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:47200000-47300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:47300000-47400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:47400000-47500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:47500000-47600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:47600000-47700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:47700000-47800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:47800000-47900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:47900000-48000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:48000000-48100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:48100000-48200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:48200000-48300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:48300000-48400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:48400000-48500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:48500000-48600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:48600000-48700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:48700000-48800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:48800000-48900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:48900000-49000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:49000000-49100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:49100000-49200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:49200000-49300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:49300000-49400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:49400000-49500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:49500000-49600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:49600000-49700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:49700000-49800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:49800000-49900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:49900000-50000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:50000000-50100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:50100000-50200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:50200000-50300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:50300000-50400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:50400000-50500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:50500000-50600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:50600000-50700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:50700000-50800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:50800000-50900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:50900000-51000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:51000000-51100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:51100000-51200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:51200000-51300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:51300000-51400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:51400000-51500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:51500000-51600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:51600000-51700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:51700000-51800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:51800000-51900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:51900000-52000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:52000000-52100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:52100000-52200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:52200000-52300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:52300000-52400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:52400000-52500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:52500000-52600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:52600000-52700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:52700000-52800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:52800000-52900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:52900000-53000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:53000000-53100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:53100000-53200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:53200000-53300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:53300000-53400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:53400000-53500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:53500000-53600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:53600000-53700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:53700000-53800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:53800000-53900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:53900000-54000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:54000000-54100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:54100000-54200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:54200000-54300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:54300000-54400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:54400000-54500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:54500000-54600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:54600000-54700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:54700000-54800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:54800000-54900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:54900000-55000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:55000000-55100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:55100000-55200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:55200000-55300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:55300000-55400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:55400000-55500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:55500000-55600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:55600000-55700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:55700000-55800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:55800000-55900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:55900000-56000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:56000000-56100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:56100000-56200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:56200000-56300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:56300000-56400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:56400000-56500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:56500000-56600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:56600000-56700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:56700000-56800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:56800000-56900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:56900000-57000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:57000000-57100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:57100000-57200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:57200000-57300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:57300000-57400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:57400000-57500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:57500000-57600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:57600000-57700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:57700000-57800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:57800000-57900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:57900000-58000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:58000000-58100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:58100000-58200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:58200000-58300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:58300000-58400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:58400000-58500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:58500000-58600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:58600000-58700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:58700000-58800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:58800000-58900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:58900000-59000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:59000000-59100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:59100000-59200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:59200000-59300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:59300000-59400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:59400000-59500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:59500000-59600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:59600000-59700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:59700000-59800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:59800000-59900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:59900000-60000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:60000000-60100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:60100000-60200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:60200000-60300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:60300000-60400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:60400000-60500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:60500000-60600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:60600000-60700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:60700000-60800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:60800000-60900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:60900000-61000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:61000000-61100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:61100000-61200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:61200000-61300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:61300000-61400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:61400000-61500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:61500000-61600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:61600000-61700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:61700000-61800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:61800000-61900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:61900000-62000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:62000000-62100000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:62100000-62200000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:62200000-62300000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:62300000-62400000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:62400000-62500000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:62500000-62600000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:62600000-62700000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:62700000-62800000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:62800000-62900000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:62900000-63000000.baq.20110328.vcf, freebayes.20:63000000-63025520.baq.20110328.vcf
+#CHROM POS     ID      REF     ALT     QUAL    FILTER  INFO    
+20     458502  .       G       GA      4567.01 PASS    AA=20;AB=0.61111;ABA=14;ABP=6.8707;ABR=22;AC=38;AF=0.0544;AN=698;BL=374;BR=1129;BVAR;BaseQRankSum=13.364;DP=15979;DP4=1882,2188,45,37;Dels=0.00;EL=5;EPP=13.868;ER=15;FR;FS=6.503;HETAR=11;HOMA=2;HOMR=985;HP=1;HPLen=2;HR=2;HRun=0;HU=G;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0157;IndelType=INS.NOVEL_1.Novel_A.;LEN=1;LRB=0.50233;LRBP=826.56;MQ=66.16;MQ0Fraction=0.0110;MQM=70.5;MQRankSum=-3.158;NF;NR;NS=998;PP;PV4=0.15,1,0.42,0.15;RA=3173;RL=1;RPP=38.188;RR=19;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.346;SAB=0.7;SAF=14;SAP=9.959;SAR=6;SC=GGGCGTGGTGGTGCATGTAAT;SRB=0.50047;SRF=1588;SRP=3.0165;SRR=1585;TC;TR=9;TU=GGT;VQSLOD=10.0079;set=Intersection;sumGLbyD=23.94
+20     573764  .       TA      T       591.51  PASS    AC=91;AF=0.1987;AN=458;BaseQRankSum=0.137;DP=519;FS=3.153;HRun=1;HaplotypeScore=14.0744;InbreedingCoeff=0.1460;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;MQ=48.16;MQ0=26;MQ0Fraction=0.0501;MQRankSum=-1.636;QD=3.63;ReadPosRankSum=-4.140;SB=-408.14;VQSLOD=5.2458;set=VQSR
+20     766143  .       C       CATCTGGTA       5521.70 PASS    AA=24;AB=0.5;ABA=18;ABP=3.0103;ABR=18;AC=14;AF=0.0289;AF1=0.02038;AN=484;BL=655;BR=1542;BVAR;BaseQRankSum=3.801;CI95=0.01549,0.02655;DP=11749;DP4=2222,1998,14,8;Dels=0.00;EL=9;EPP=6.2675;ER=15;FQ=999;FR;FS=2.941;HETAR=9;HOMA=4;HOMR=901;HP=2;HPLen=2;HR=1;HRun=0;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0515;IndelType=INS.NumRepetitions_1.EventLength_8.;LEN=8;LRB=0.40373;LRBP=780.64;MQ=56.81;MQ0Fraction=0.0253;MQM=22.167;MQRankSum=-4.809;NF;NR;NS=914;PP;PV4=0.39,1,5.8e-07,1;RA=3093;RL=6;RPP=16.039;RR=18;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.827;SAB=0.625;SAF=15;SAP=6.2675;SAR=9;SC=GCTTTAAATTCATCTGGTACT;SRB=0.61623;SRF=1906;SRP=365.95;SRR=1187;TC;TR=1;TU=A;VQSLOD=7.0268;set=Intersection;sumGLbyD=50.23
+20     997076  rs11467490      CTG     C       15379.78        PASS    AA=195;AB=0.59878;ABA=132;ABP=30.896;ABR=197;AC=173;AF=0.14562;AN=1188;BL=7664;BR=7309;BVAR;BaseQRankSum=21.853;DB;DEL;DP=27127;DP4=1801,2002,241,282;Dels=0.13;EL=100;EPP=3.2887;ER=95;FQ=999;FR;FS=6.591;HETAR=77;HOMA=42;HOMR=815;HP=1;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=0.1284;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_2.RepeatExpansion_TG.;LEN=2;LRB=0.023709;LRBP=21.287;MQ=61.18;MQ0Fraction=0.0214;MQM=43.041;MQRankSum=6.886;NF;NR;NS=934;PP;PV4=0.61,1.5e-78,1,1;RA=2800;RL=120;RPP=25.56;RR=75;RUN=1;ReadPosRankSum=4.504;SAB=0.62051;SAF=121;SAP=27.609;SAR=74;SC=CAGCTAATTACTGTATTTTTA;SRB=0.49821;SRF=1395;SRP=3.0879;SRR=1405;TC;TR=1;TU=T;VQSLOD=8.9396;set=Intersection;sumGLbyD=16.76
+20     1042261 rs10597473      CCCTG   C       168658.05       PASS    AA=4481;AB=0.29043;ABA=2128;ABP=1147.1;ABR=871;AC=1172;AF=0.97830;AN=1198;BL=169975;BR=194027;BVAR;BaseQRankSum=4.599;DB;DEL;DP=29418;DP4=29,47,1441,2403;Dels=0.84;EL=2358;EPP=29.772;ER=2123;FR;FS=9.122;HETAR=482;HOMA=559;HOMR=30;HP=2;HPLen=3;HR=3;HRun=0;HU=C;INDEL;InbreedingCoeff=0.0470;IndelType=DEL.NumRepetitions_2.EventLength_4.;LEN=4;LRB=0.066077;LRBP=3454.1;MQ=104.58;MQ0=4;MQ0Fraction=0.0014;MQM=58.257;MQRankSum=-3.368;NF;NR;NS=1071;PP;PV4=0.91,6.8e-09,2.8e-05,1;RA=1039;RL=2088;RPP=48.09;RR=2393;RUN=1;ReadPosRankSum=5.288;SAB=0.41442;SAF=1857;SAP=288.09;SAR=2624;SC=CCAAACCCAACCCTGCCTGGC;SRB=0.48893;SRF=508;SRP=4.1159;SRR=531;TC;TR=8;TU=CCTG;VQSLOD=8.5148;dbSNP=120;set=Intersection;sumGLbyD=59.79
+20     1046297 rs33956316      C       CT,CTT,CTTT     17698   PASS    ABR=408;AC=432,79,230;AF=0.39779,0.07274,0.21179;BVAR;BaseQRankSum=-8.413;DB;DP=15649;DP4=147,199,534,436;FR;FS=11.580;HOMA=97;HOMR=457;HP=20;HR=16;HU=T;HaplotypeScore=16.0590;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.6018;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;KGPilot123;MQ0=19;MQ0Fraction=0.0093;MQRankSum=7.992;NF;NR;NS=767;PP;PV4=6e-05,1,1,1;QD=8.18;RA=1183;RUN=1;ReadPosRankSum=2.684;SB=-6384.08;SC=GGAAAATTTTCTTTTTTTTTT;SRB=0.40913;SRF=484;SRP=87.859;SRR=699;TC;TR=16;TU=T;VQSLOD=8.4941;dbSNP=132;set=Intersection
+20     1405740 .       T       TA      257.28  PASS    AF=0.0188;BaseQRankSum=-0.745;DP=3769;Dels=0.00;FS=0.742;HPLen=9;HRun=9;InbreedingCoeff=0.0462;IndelType=INS.NumRepetitions_9.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;MQ0Fraction=0.0151;MQRankSum=-0.090;ReadPosRankSum=-1.582;VQSLOD=5.6502;set=Intersection;sumGLbyD=6.94
+20     1690501 .       TC      T       27928   PASS    AA=108;AB=0.91372;ABA=100;ABP=1726.1;ABR=1059;AC=35;AF=0.02966;AN=1180;BL=593;BR=6973;BVAR;BaseQRankSum=7.567;DEL;DP=10612;Dels=0.01;EL=50;EPP=4.2971;ER=58;FS=0.000;HETAR=378;HOMA=184;HOMR=477;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0495;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_C.;LEN=1;LRB=0.84325;LRBP=11685;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=87.361;MQRankSum=4.088;NS=1045;RA=3125;RL=3;RPP=212.2;RR=105;RUN=1;ReadPosRankSum=-13.096;SAB=0.56481;SAF=61;SAP=6.9511;SAR=47;SRB=0.51776;SRF=1618;SRP=11.572;SRR=1507;VQSLOD=3.9824;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=4.07
+20     1991285 rs113891396     TAA     T,TA,TAAA,TAAAAA,TAAAAAA,TAAAAAAA,TAAAAAAAA     39235.36        PASS    AC=5,251,20,39,188,52,79;AF=0.0056,0.2789,0.0222,0.0433,0.2089,0.0578,0.0878;AN=900;BVAR;BaseQRankSum=1.124;DB;DEL;DP=54393;DP4=906,772,824,579;Dels=0.21;FR;FS=37.525;HP=12;HR=12;HRun=12;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.6891;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ=76.81;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-6.593;NF;NR;PP;PV4=0.0087,1,6.3e-19,1;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.184;SC=ATCTGCCACTTAAAAAAAAAA;TC;TR=12;TU=A;VQSLOD=9.0007;dbSNP=132;set=Intersection;sumGLbyD=11.45
+20     2355911 .       TA      T       11723   PASS    AA=79;AB=0.9393;ABA=57;ABP=1577;ABR=882;AC=38;AF=0.0411;AN=924;BL=644;BR=5536;BVAR;BaseQRankSum=2.434;DEL;DP=9687;Dels=0.00;EL=45;EPP=6.3362;ER=34;FS=3.043;HETAR=321;HOMA=182;HOMR=555;HRun=5;InbreedingCoeff=0.0412;IndelType=DEL.NumRepetitions_5.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;LEN=1;LRB=0.79159;LRBP=8411.9;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=70.848;MQRankSum=0.137;NS=1058;RA=3415;RL=3;RPP=149.49;RR=76;RUN=1;ReadPosRankSum=-12.116;SAB=0.44304;SAF=35;SAP=5.2367;SAR=44;SRB=0.43572;SRF=1488;SRP=125.55;SRR=1927;VQSLOD=3.8910;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=4.88
+20     2771621 rs11479849      GT      G,GTT   1605.60 PASS    AA=80;AB=0.79825;ABA=69;ABP=267.24;ABR=273;AC=79,91;AF=0.06551,0.07546;AN=1206;BL=2593;BR=3805;BVAR;BaseQRankSum=7.825;DB;DP=9790;Dels=0.04;EL=37;EPP=3.9875;ER=43;FR;FS=4.751;HETAR=62;HOMA=5;HOMR=958;HP=11;HR=11;HRun=11;HU=T;INS;InbreedingCoeff=0.2646;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;LEN=1;LRB=0.18943;LRBP=501.57;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=52.45;MQRankSum=-0.560;NF;NR;NS=1025;PP;RA=3949;RL=29;RPP=16.148;RR=51;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.397;SAB=0.525;SAF=42;SAP=3.4446;SAR=38;SC=TCATTTTAACGTTTTTTTTTT;SRB=0.54368;SRF=2147;SRP=68.46;SRR=1802;TC;TR=11;TU=T;VQSLOD=3.5989;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.92
+20     2891235 .       G       GT,GTTT 2869.87 PASS    AC=236,246;AF=0.2803,0.2922;AN=842;BaseQRankSum=8.979;DP=1067;FS=3.911;HaplotypeScore=20.3595;InbreedingCoeff=0.6511;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ=44.86;MQ0=114;MQ0Fraction=0.1068;MQRankSum=-2.273;QD=4.00;ReadPosRankSum=-6.601;SB=-991.85;VQSLOD=5.4379;set=VQSR
+20     3033550 .       TGAG    T       2005.90 PASS    AA=34;AB=0.51429;ABA=34;ABP=3.1344;ABR=36;AC=22;AF=0.0332;AN=662;BL=1374;BR=1649;BVAR;BaseQRankSum=5.192;DEL;DP=14639;DP4=2271,1492,12,21;Dels=0.02;EL=19;EPP=4.0322;ER=15;FR;FS=16.657;HETAR=17;HOMA=0;HOMR=914;HP=1;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=G;INDEL;InbreedingCoeff=-0.0454;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_3.;LEN=3;LRB=0.090969;LRBP=57.333;MQ=53.99;MQ0Fraction=0.0304;MQM=46.735;MQRankSum=1.938;NF;NR;NS=931;PP;PV4=0.0068,9.4e-05,1,1;RA=2985;RL=11;RPP=12.207;RR=23;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.466;SAB=0.41176;SAF=14;SAP=5.3095;SAR=20;SC=CTTGGGAGGCTGAGGTGGGAG;SRB=0.62781;SRF=1874;SRP=426.52;SRR=1111;TC;TR=1;TU=G;VQSLOD=8.9194;set=Intersection;sumGLbyD=24.41
+20     3873327 rs61519218      A       AAG     683.85  PASS    AC=25;AF=0.0313;AN=800;BaseQRankSum=4.839;DB;DP=1718;FS=4.265;HRun=0;HaplotypeScore=20.5789;InbreedingCoeff=0.1055;IndelType=INS.NOVEL_2.;MQ=53.70;MQ0=37;MQ0Fraction=0.0215;MQRankSum=2.468;QD=6.30;ReadPosRankSum=4.254;SB=-403.21;VQSLOD=6.1858;set=VQSR
+20     4028835 .       GC      G       2511.30 PASS    AA=66;AB=0.56954;ABA=65;ABP=9.3521;ABR=86;AC=22;AF=0.01836;AN=1198;BL=2303;BR=2463;BVAR;BaseQRankSum=7.621;DEL;DP=22795;DP4=1714,2774,22,37;Dels=0.02;EL=34;EPP=3.1419;ER=32;FQ=999;FR;FS=2.095;HETAR=21;HOMA=0;HOMR=1050;HP=2;HPLen=2;HR=2;HRun=2;HU=C;INDEL;InbreedingCoeff=0.0125;IndelType=DEL.NumRepetitions_2.EventLength_1.RepeatExpansion_C.;LEN=1;LRB=0.033571;LRBP=14.674;MQ=108.09;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=53.318;MQRankSum=5.257;NF;NR;NS=1071;PP;PV4=1,5.4e-13,1,0.075;RA=6185;RL=36;RPP=4.1947;RR=30;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.059;SAB=0.45455;SAF=30;SAP=4.1947;SAR=36;SC=TGCTGTCACTGCCTTCTCCTA;SRB=0.42118;SRF=2605;SRP=336.76;SRR=3580;TC;TR=2;TU=C;VQSLOD=10.2409;set=Intersection;sumGLbyD=12.71
+20     4039609 rs67812039      G       GA      43457   PASS    AA=909;AB=0.54639;ABA=572;ABP=26.583;ABR=689;AC=302;AF=0.3455;AN=874;BL=37070;BR=38211;BVAR;BaseQRankSum=20.147;DB;DP=25595;DP4=1483,1374,528,542;Dels=0.00;EL=467;EPP=4.5033;ER=442;FQ=999;FR;FS=5.441;HETAR=243;HOMA=127;HOMR=608;HP=4;HPLen=3;HR=3;HRun=3;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.1388;IndelType=INS.NumRepetitions_3.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;LEN=1;LRB=0.015157;LRBP=40.563;MQ=119.50;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=83.197;MQRankSum=1.080;NF;NR;NS=978;PP;PV4=0.16,1,3.6e-12,1;RA=3033;RL=443;RPP=4.274;RR=466;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.000;SAB=0.32233;SAF=293;SAP=252.24;SAR=616;SC=TATGTTGGGAGAAATATCAGT;SRB=0.38378;SRF=1164;SRP=358.85;SRR=1869;TC;TR=4;TU=AG;VQSLOD=9.9146;dbSNP=130;set=Intersection;sumGLbyD=16.79
+20     4390056 .       TC      T       49312   PASS    AA=91;AB=0.94353;ABA=86;ABP=2605.4;ABR=1437;AC=39;AF=0.03160;AN=1234;BL=6823;BR=731;BVAR;BaseQRankSum=2.727;DEL;DP=13149;Dels=0.00;EL=41;EPP=4.9431;ER=50;FS=4.002;HETAR=465;HOMA=313;HOMR=292;HRun=3;InbreedingCoeff=0.0326;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_C.;LEN=1;LRB=0.80646;LRBP=10671;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=69.824;MQRankSum=-0.903;NS=1073;RA=3078;RL=89;RPP=183.62;RR=2;RUN=1;ReadPosRankSum=-12.526;SAB=0.45055;SAF=41;SAP=4.9431;SAR=50;SRB=0.52567;SRF=1618;SRP=20.622;SRR=1460;VQSLOD=4.3235;set=Intersection;sumGLbyD=3.53
+20     4474622 .       TA      T,TAA,TAAA,TAAAA        94522.28        PASS    ABR=114;AC=38,68,16,900;AF=0.03333,0.05965,0.01404,0.78947;AN=1140;BVAR;BaseQRankSum=9.741;DB;DP=16656;Dels=0.00;FR;FS=2.355;HOMA=3;HOMR=936;HP=10;HPLen=10;HR=10;HRun=10;HU=A;INS;InbreedingCoeff=0.4516;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ0=2;MQ0Fraction=0.0008;MQRankSum=-4.096;NF;NR;NS=980;PP;RA=3766;RUN=1;ReadPosRankSum=2.380;SC=AGAAAAAAATTAAAAAAAAAA;SRB=0.49734;SRF=1873;SRP=3.2409;SRR=1893;TC;TR=10;TU=A;VQSLOD=8.8186;set=Intersection;sumGLbyD=38.79
+20     4824911 .       AC      A       41998.70        PASS    AC=1172;AF=0.97342;AN=1204;BaseQRankSum=8.604;DP=3615;FS=9.934;HRun=1;HaplotypeScore=39.6843;InbreedingCoeff=0.0980;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_C.;MQ=129.80;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0003;MQRankSum=3.378;QD=11.62;ReadPosRankSum=6.967;SB=-16955.28;VQSLOD=4.2689;set=VQSR
+20     4839897 rs35881880      TAA     T,TA,TAAA,TAAAAA        3906.80 PASS    AC=12,95,137,189;AF=0.01024,0.08106,0.11689,0.16126;AN=1172;BVAR;BaseQRankSum=15.271;DB;DEL;DP=15105;Dels=0.04;FR;FS=43.567;HP=19;HR=13;HRun=13;HU=A;INS;InbreedingCoeff=0.5716;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-2.569;NF;NR;PP;RUN=1;ReadPosRankSum=-13.794;SC=TGTTAAAAAATAAAAAAAAAA;TC;TR=13;TU=A;VQSLOD=8.1773;set=Intersection;sumGLbyD=3.77
+20     5507414 .       G       GCC     439.08  PASS    AC=23;AF=0.01876;AN=1226;BaseQRankSum=3.051;DP=3023;FS=3.636;HRun=1;HaplotypeScore=30.3104;InbreedingCoeff=0.0204;IndelType=INS.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_C.;MQ=112.09;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-2.065;QD=2.85;ReadPosRankSum=-2.709;SB=-302.22;VQSLOD=4.4311;set=VQSR
+20     5609676 .       GA      G,GAA   799.89  PASS    AA=42;AB=0.79096;ABA=37;ABP=133.16;ABR=140;AC=43,65;AF=0.03607,0.05453;AF1=0.02826;AN=1192;BL=1360;BR=2334;BVAR;BaseQRankSum=5.069;CI95=0.01242,0.04037;DP=15610;DP4=1548,2441,21,30;Dels=0.02;EL=18;EPP=4.8716;ER=24;FQ=12.1;FR;FS=0.000;HETAR=36;HOMA=1;HOMR=991;HP=13;HPLen=10;HR=10;HRun=10;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.2001;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;LEN=1;LRB=0.26367;LRBP=560.68;MQ=63.29;MQ0Fraction=0.0003;MQM=44.143;MQRankSum=1.755;NF;NR;NS=1028;PP;PV4=0.77,1,0.0087,0.0053;RA=4114;RL=15;RPP=10.455;RR=27;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.978;SAB=0.5;SAF=21;SAP=3.0103;SAR=21;SC=AAAAAAGAAAGAAAAAAAAAA;SRB=0.39742;SRF=1635;SRP=379;SRR=2479;TC;TR=11;TU=AAAG;VQSLOD=4.1229;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=7.95
+20     5736211 rs35303106      CT      C,CTT   4384.40 PASS    AA=117;AB=0.71499;ABA=116;ABP=166.4;ABR=291;AC=32,145;AF=0.02712,0.12288;AN=1180;BL=5556;BR=4901;BVAR;BaseQRankSum=2.708;DB;DP=9157;Dels=0.01;EL=54;EPP=4.5136;ER=63;FR;FS=2.802;HETAR=79;HOMA=1;HOMR=837;HP=16;HR=11;HRun=11;HU=T;INS;InbreedingCoeff=0.1903;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;LEN=1;LRB=0.062637;LRBP=92.1;MQ0Fraction=0.0273;MQM=48.932;MQRankSum=3.654;NF;NR;NS=917;PP;RA=2785;RL=79;RPP=34.209;RR=38;RUN=1;ReadPosRankSum=0.795;SAB=0.5641;SAF=66;SAP=7.1862;SAR=51;SC=TTTTCTTTTTCTTTTTTTTTT;SRB=0.41795;SRF=1164;SRP=165.85;SRR=1621;TC;TR=11;TU=T;VQSLOD=5.0895;set=Intersection;sumGLbyD=4.66
+20     5898626 rs34483659      CAAA    C,CA,CAA,CAAAAA 1140.16 PASS    ABR=34;AC=19,98,56,199;AF=0.0227,0.1172,0.0670,0.2380;AF1=0.08519;BVAR;BaseQRankSum=5.049;CI95=0.03727,0.1273;DB;DEL;DP=5091;DP4=539,408,121,123;FQ=4.43;FR;FS=5.701;HOMA=64;HOMR=156;HP=19;HR=18;HU=A;HaplotypeScore=11.5333;INDEL;InbreedingCoeff=0.7405;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ0=117;MQ0Fraction=0.0986;MQRankSum=6.290;NF;NR;NS=240;PP;PV4=0.043,1,1,0.0087;QD=1.22;RA=204;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.684;SB=-1015.09;SC=ACTAAAAATACAAAAAAAAAA;SRB=0.35294;SRF=72;SRP=41.33;SRR=132;TC;TR=18;TU=A;VQSLOD=4.1696;set=filterInVQSR-2of5
+20     5975126 rs10541892      C       CAG     504.78  PASS    AC=79;AF=0.07004;AN=1128;BaseQRankSum=10.498;DB;DP=2050;FS=38.228;HRun=0;HaplotypeScore=14.1426;InbreedingCoeff=-0.0053;IndelType=INS.NOVEL_2.;MQ=60.40;MQ0=80;MQ0Fraction=0.0390;MQRankSum=5.098;QD=1.63;ReadPosRankSum=-4.851;SB=-590.69;VQSLOD=4.8517;set=VQSR
+20     6040983 rs11087710      A       AAAAAAGAG,AAAAAGAG,AAAAGAG,AAAAGAGAG,AAAGAG,AAAGAGAG,AAGAG,AAGAGAG,AG,AGAG,AGAGAG       66894.55        PASS    ABR=468;AC=80,9,20,136,31,91,33,29,9,3,5;AF=0.0980,0.0110,0.0245,0.1667,0.0380,0.1115,0.0404,0.0355,0.0110,0.0037,0.0061;AN=816;BVAR;BaseQRankSum=-12.470;DB;DP=38726;DP4=426,611,310,472;Dels=0.00;FQ=999;FR;FS=6.635;HOMA=110;HOMR=506;HP=14;HR=15;HRun=0;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.8291;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;KGPilot123;MQ=54.22;MQ0Fraction=0.0168;MQRankSum=-5.329;NF;NR;NS=861;PP;PV4=0.56,1,6.9e-09,0.31;RA=1828;RUN=1;ReadPosRankSum=-7.857;SC=AAAAAAAAAAAAGAGAGAGAG;SRB=0.62418;SRF=1141;SRP=247.85;SRR=687;TC;TR=15;TU=A;VQSLOD=9.0574;dbSNP=131;set=Intersection;sumGLbyD=36.72
+20     7024548 .       G       GAT     5041.27 PASS    AC=123;AF=0.10336;AN=1190;BaseQRankSum=23.097;DP=3045;FS=7.979;HRun=0;HaplotypeScore=15.6967;InbreedingCoeff=0.1062;IndelType=INS.NumRepetitions_5.EventLength_2.RepeatExpansion_AT.;MQ=119.29;MQ0=2;MQ0Fraction=0.0007;MQRankSum=-3.725;QD=8.97;ReadPosRankSum=-1.636;SB=-2257.45;VQSLOD=5.9332;set=VQSR
+20     7484554 .       A       AT      5.09    PASS    AC=0;AF=0.0000;AN=710;BaseQRankSum=-0.696;DP=1862;FS=2.835;HRun=9;HaplotypeScore=13.5425;InbreedingCoeff=0.0567;IndelType=INS.NumRepetitions_9.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;MQ=76.92;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=1.932;ReadPosRankSum=-1.701;VQSLOD=4.3156;set=VQSR
+20     7632194 rs77286341      GAA     AAA,G   5324    PASS    AC=0;AF=0.0000;AN=700;BaseQRankSum=-1.741;DB;DP=1772;FR;HP=4;HPLen=3;HR=3;HRun=0;HU=A;HaplotypeScore=60.1795;InbreedingCoeff=0.0017;IndelType=MIXED;MQ=70.69;MQ0=13;MQ0Fraction=0.0073;MQRankSum=-1.315;NF;NR;PP;ReadPosRankSum=-3.650;SC=GAGAGAGAGAGAAAGGTGTAA;TC;TR=13;TU=AG;set=filterInVQSR-2of5
+20     7767508 rs71329674      G       GA      17914   PASS    AA=415;AB=0.61617;ABA=337;ABP=105.94;ABR=541;AC=141;AF=0.11614;AN=1214;BL=15187;BR=20323;BVAR;BaseQRankSum=-13.946;DB;DP=28222;Dels=0.00;EL=184;EPP=14.569;ER=231;FQ=999;FR;FS=13.296;HETAR=178;HOMA=35;HOMR=822;HP=14;HPLen=9;HR=9;HRun=9;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0714;IndelType=INS.NumRepetitions_9.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;LEN=1;LRB=0.14464;LRBP=1616.1;MQ=89.69;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0003;MQM=51.667;MQRankSum=0.664;NF;NR;NS=1035;PP;RA=3707;RL=171;RPP=30.894;RR=244;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.120;SAB=0.45301;SAF=188;SAP=10.969;SAR=227;SC=ATTCTAAAAAGAAAAAAAAAT;SRB=0.38495;SRF=1427;SRP=429.23;SRR=2280;TC;TR=9;TU=A;VQSLOD=9.0748;set=Intersection;sumGLbyD=11.09
+20     7920261 .       TA      T,TAA   802.15  PASS    AA=28;AB=0.8;ABA=28;ABP=112.45;ABR=112;AC=22,39;AF=0.01836,0.03255;AN=1198;BL=943;BR=1487;BVAR;BaseQRankSum=2.233;DP=10645;Dels=0.01;EL=11;EPP=5.8022;ER=17;FR;FS=1.691;HETAR=20;HOMA=0;HOMR=1007;HP=10;HPLen=9;HR=9;HRun=9;HU=A;INS;InbreedingCoeff=0.2256;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;LEN=1;LRB=0.22387;LRBP=267.46;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=57.571;MQRankSum=0.940;NF;NR;NS=1027;PP;RA=4776;RL=8;RPP=14.178;RR=20;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.567;SAB=0.53571;SAF=15;SAP=3.3205;SAR=13;SC=GTAACTGCTATAAAAAAAAAC;SRB=0.48576;SRF=2320;SRP=11.42;SRR=2456;TC;TR=9;TU=A;VQSLOD=4.0815;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=5.37
+20     8012465 rs10595338      TATGA   T       2104.41 PASS    AF=0.03339;BaseQRankSum=10.662;DB;DP=11772;DS;Dels=0.01;FR;FS=7.678;HP=1;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=A;InbreedingCoeff=0.0266;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_4.;MQ0Fraction=0.0731;MQRankSum=0.603;NF;NR;PP;ReadPosRankSum=1.276;SC=TGTATGTATGTATGATGTATG;TC;TR=19;TU=ATGT;VQSLOD=4.1376;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=6.53
+20     8573999 .       CGTGT   C,CGT,CGTGTGT,TGTGT     45865.96        PASS    AC=458,0,731;AF=0.37727,0.00000,0.60214;AN=1214;BVAR;BaseQRankSum=-6.703;DEL;DP=37714;Dels=0.03;FR;FS=11.079;HP=2;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=G;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.7632;IndelType=MIXED;LEN=2;MQ0Fraction=0.0026;MQRankSum=-1.394;NF;NR;PP;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.102;SC=TGTGTGTGCGCGTGTGTGTGT;TC;TR=18;TU=GT;VQSLOD=6.1435;set=Intersection;sumGLbyD=3.53
+20     8610455 rs10571111      TTTTC   T       11763.51        PASS    AC=190;AF=0.17056;AN=1114;BaseQRankSum=-14.397;DB;DP=2323;FS=2.321;HRun=0;HaplotypeScore=39.8020;InbreedingCoeff=0.2502;IndelType=DEL.NumRepetitions_2.EventLength_4.;MQ=53.39;MQ0=104;MQ0Fraction=0.0448;MQRankSum=3.519;QD=19.07;ReadPosRankSum=4.150;SB=-4067.02;VQSLOD=5.0554;set=VQSR
+20     9139079 .       ATT     A,AT,ATTT,ATTTT,ATTTTT  8777.90 PASS    AC=23,140,114,69,113;AF=0.01993,0.12132,0.09879,0.05979,0.09792;AN=1154;BVAR;BaseQRankSum=-0.022;DEL;DP=25109;DP4=502,657,278,313;FR;FS=11.929;HP=16;HR=16;HU=T;HaplotypeScore=20.2361;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.5704;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ0=16;MQ0Fraction=0.0067;MQRankSum=2.624;NF;NR;PP;PV4=0.14,1,1,1;QD=1.48;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.480;SB=-2354.28;SC=CACCTGGCTAATTTTTTTTTT;TC;TR=16;TU=T;VQSLOD=6.9180;set=Intersection
+20     9862448 .       CT      C       49312   PASS    AA=60;AB=0.96003;ABA=53;ABP=2440.4;ABR=1273;AC=18;AF=0.01461;AN=1232;BL=3516;BR=140;BVAR;BaseQRankSum=-2.056;DEL;DP=11893;Dels=0.01;EL=35;EPP=6.6294;ER=25;FS=1.787;HETAR=396;HOMA=344;HOMR=334;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0379;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;LEN=1;LRB=0.92341;LRBP=6772.5;MQ0Fraction=0.0006;MQM=54.267;MQRankSum=-0.907;NS=1074;RA=2990;RL=60;RPP=133.3;RR=0;RUN=1;ReadPosRankSum=-10.579;SAB=0.58333;SAF=35;SAP=6.6294;SAR=25;SRB=0.47826;SRF=1430;SRP=15.284;SRR=1560;VQSLOD=3.0237;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=2.84
+20     9863736 rs73618103      G       GT      50570.21        PASS    AA=2247;AB=0.48878;ABA=1412;ABP=6.0324;ABR=1350;AC=546;AF=0.44463;AN=1228;BL=86886;BR=95862;BVAR;BaseQRankSum=-23.978;DB;DP=32517;DP4=1125,1133,1017,1048;Dels=0.00;EL=1089;EPP=7.6113;ER=1158;FQ=999;FR;FS=2.529;HETAR=445;HOMA=201;HOMR=393;HP=4;HPLen=4;HR=4;HRun=4;HU=T;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.1393;IndelType=INS.NumRepetitions_4.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;KGPilot123;LEN=1;LRB=0.049117;LRBP=960.35;MQ=68.10;MQ0=2;MQ0Fraction=0.0006;MQM=50.931;MQRankSum=-1.580;NF;NR;NS=1039;PP;PV4=0.71,1,0.11,1;RA=3139;RL=1089;RPP=7.6113;RR=1158;RUN=1;ReadPosRankSum=0.846;SAB=0.54161;SAF=1217;SAP=36.804;SAR=1030;SC=TGATTGTATGGTTTTGTCCTT;SRB=0.53425;SRF=1677;SRP=34.987;SRR=1462;TC;TR=4;TU=T;VLD;VQSLOD=10.1800;dbSNP=131;set=Intersection;sumGLbyD=18.20
+20     10926959        .       AG      A       12239   PASS    AA=65;AB=0.92801;ABA=64;ABP=1417.6;ABR=825;AC=24;AF=0.0264;AN=908;BL=616;BR=3782;BVAR;BaseQRankSum=9.990;DEL;DP=10708;Dels=0.01;EL=37;EPP=5.7163;ER=28;FS=1.652;HETAR=275;HOMA=70;HOMR=724;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0102;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_G.;LEN=1;LRB=0.71987;LRBP=4952;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0004;MQM=118.82;MQRankSum=1.018;NS=1069;RA=4746;RL=5;RPP=104.07;RR=60;RUN=1;ReadPosRankSum=-12.039;SAB=0.41538;SAF=27;SAP=7.0526;SAR=38;SRB=0.4764;SRF=2261;SRP=25.968;SRR=2485;VQSLOD=2.9713;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=4.10
+20     11299648        .       TG      T       49315   PASS    AA=62;AB=0.95292;ABA=54;ABP=2046.7;ABR=1093;AC=28;AF=0.0373;AN=750;BL=3126;BR=528;BVAR;BaseQRankSum=-4.929;DEL;DP=10764;Dels=0.01;EL=26;EPP=6.5127;ER=36;FS=3.851;HETAR=366;HOMA=383;HOMR=304;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0267;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_G.;LEN=1;LRB=0.711;LRBP=4014.1;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0005;MQM=76.468;MQRankSum=1.327;NS=1070;RA=2588;RL=54;RPP=77.121;RR=8;RUN=1;ReadPosRankSum=-12.507;SAB=0.48387;SAF=30;SAP=3.1504;SAR=32;SRB=0.47643;SRF=1233;SRP=15.499;SRR=1355;VQSLOD=3.8673;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.00
+20     11561096        .       CTA     C       999     PASS    AC=2;AF=0.0029;AF1=0.005602;BaseQRankSum=3.190;CI95=0.004425,0.01106;DP=7521;DP4=1998,1794,2,4;Dels=0.00;FQ=999;FR;FS=5.422;HP=3;HPLen=2;HR=1;HRun=0;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=0.0056;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_2.RepeatExpansion_TA.;MQ=113.88;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=0.297;NF;NR;PP;PV4=0.43,0.024,1,1;ReadPosRankSum=1.406;SC=CAATAGTATTCTATGTCAGTC;TC;TR=1;TU=T;VQSLOD=8.6243;set=Intersection;sumGLbyD=21.89
+20     11723671        .       C       CA      1096.60 PASS    AA=35;AB=0.69565;ABA=35;ABP=41.247;ABR=80;AC=10;AF=0.0141;AN=710;BL=2005;BR=1702;BVAR;BaseQRankSum=-3.427;DP=9819;Dels=0.00;EL=20;EPP=4.5614;ER=15;FR;FS=3.814;HETAR=20;HOMA=0;HOMR=1034;HP=8;HPLen=7;HR=7;HRun=7;HU=A;INS;InbreedingCoeff=0.0323;IndelType=INS.NumRepetitions_7.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;LEN=1;LRB=0.081737;LRBP=56.79;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=81.057;MQRankSum=0.050;NF;NR;NS=1054;PP;RA=5562;RL=22;RPP=8.0357;RR=13;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.012;SAB=0.71429;SAF=25;SAP=16.97;SAR=10;SC=ATATTGAAGACAAAAAAACAG;SRB=0.49371;SRF=2746;SRP=4.9233;SRR=2816;TC;TR=7;TU=A;VQSLOD=7.4342;set=Intersection;sumGLbyD=8.30
+20     12238835        rs113904674     CTCTTCATGGTCT   C       1813.44 PASS    AA=7;AB=0.73077;ABA=7;ABP=15.037;ABR=19;AC=4;AF=0.0056;AN=712;BL=360;BR=368;BVAR;BaseQRankSum=3.891;DB;DEL;DP=10309;Dels=0.00;EL=4;EPP=3.3205;ER=3;FR;FS=0.000;HETAR=3;HOMA=0;HOMR=1076;HP=1;HPLen=2;HR=2;HRun=0;HU=C;InbreedingCoeff=-0.0381;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_10orMore.;LEN=12;LRB=0.010989;LRBP=3.2012;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=37;MQRankSum=-3.793;NF;NR;NS=1079;PP;RA=6085;RL=4;RPP=3.3205;RR=3;RUN=1;ReadPosRankSum=1.319;SAB=0.42857;SAF=3;SAP=3.3205;SAR=4;SC=CTTAATGCTCCTCTTCATGGT;SRB=0.51257;SRF=3119;SRP=11.364;SRR=2966;TC;TR=6;TU=CCT;VQSLOD=5.7551;set=Intersection;sumGLbyD=69.48
+20     12602812        .       AT      A       12344   PASS    AA=47;AB=0.94372;ABA=43;ABP=1309.5;ABR=721;AC=14;AF=0.0196;AN=716;BL=2714;BR=217;BVAR;BaseQRankSum=1.424;DEL;DP=10743;Dels=0.00;EL=24;EPP=3.0565;ER=23;FS=0.629;HETAR=228;HOMA=65;HOMR=769;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0233;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;LEN=1;LRB=0.85193;LRBP=4622.3;MQ0Fraction=0.0000;MQM=99.574;MQRankSum=1.901;NS=1080;RA=4839;RL=46;RPP=96.568;RR=1;RUN=1;ReadPosRankSum=-9.906;SAB=0.53191;SAF=25;SAP=3.4261;SAR=22;SRB=0.51106;SRF=2473;SRP=8.148;SRR=2366;VQSLOD=2.8161;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.67
+20     13600884        .       CTG     C,CTGTG 1278.10 PASS    AA=85;AB=0.77994;ABA=79;ABP=247.38;ABR=280;AC=71,22;AF=0.05907,0.01830;AN=1202;BL=3279;BR=3205;BVAR;BaseQRankSum=8.852;DEL;DP=24185;DP4=1317,931,52,49;Dels=0.03;EL=45;EPP=3.649;ER=40;FQ=999;FR;FS=31.826;HETAR=75;HOMA=4;HOMR=926;HP=2;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=0.1566;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;LEN=2;LRB=0.011413;LRBP=4.8442;MQ=65.06;MQ0Fraction=0.0012;MQM=48.671;MQRankSum=-0.511;NF;NR;NS=1005;PP;PV4=0.18,1,0.39,0.27;RA=3342;RL=35;RPP=8.7583;RR=50;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.329;SAB=0.43529;SAF=37;SAP=6.1015;SAR=48;SC=TCCCTTTACTCTGTGTGTGTG;SRB=0.59066;SRF=1974;SRP=241.62;SRR=1368;TC;TR=15;TU=GT;VQSLOD=3.8635;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=4.23
+20     13666265        .       T       TATAG   556.88  PASS    AC=21;AF=0.01959;AN=1072;BaseQRankSum=24.958;DP=2706;FS=2.581;HRun=0;HaplotypeScore=25.9952;InbreedingCoeff=0.1419;IndelType=INS.NOVEL_4.;MQ=72.43;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=2.888;QD=4.38;ReadPosRankSum=2.552;SB=-417.04;VQSLOD=7.3380;set=VQSR
+20     13861245        rs72422273      C       CTCA    2685.46 PASS    AC=140;AF=0.11589;AN=1208;BaseQRankSum=24.355;DB;DP=2910;FS=6.808;HRun=0;HaplotypeScore=19.3095;InbreedingCoeff=-0.0991;IndelType=INS.NumRepetitions_1.EventLength_3.;MQ=78.25;MQ0=22;MQ0Fraction=0.0076;MQRankSum=3.225;QD=3.64;ReadPosRankSum=2.607;SB=-1861.38;VQSLOD=4.1974;set=VQSR
+20     13865746        .       T       TA,TAA  1416.23 PASS    AA=63;AB=0.80417;ABA=47;ABP=195.87;ABR=193;AC=122,21;AF=0.10133,0.01744;AN=1204;BL=3673;BR=1145;BVAR;BaseQRankSum=-3.336;DP=10513;Dels=0.00;EL=62;EPP=131.27;ER=1;FR;FS=716.583;HETAR=45;HOMA=1;HOMR=998;HP=2;HR=1;HRun=1;HU=A;INS;InbreedingCoeff=0.0814;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;LEN=1;LRB=0.5247;LRBP=2883.3;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=56.143;MQRankSum=-1.197;NF;NR;NS=1044;PP;RA=4529;RL=62;RPP=131.27;RR=1;RUN=1;ReadPosRankSum=-12.295;SAB=1;SAF=63;SAP=139.81;SAR=0;SC=GGAACATGGATACCCCCCTGC;SRB=0.52462;SRF=2376;SRP=26.853;SRR=2153;TC;TR=1;TU=A;VQSLOD=-4.2308;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=4.77
+20     13881703        .       CTT     C       152.85  PASS    AC=8;AF=0.0093;AN=862;BaseQRankSum=3.941;DP=2063;FS=0.962;HRun=5;HaplotypeScore=24.0313;InbreedingCoeff=0.0790;IndelType=DEL.NumRepetitions_5.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;MQ=55.05;MQ0=49;MQ0Fraction=0.0238;MQRankSum=-1.418;QD=3.47;ReadPosRankSum=-0.605;SB=-93.04;VQSLOD=5.3874;set=VQSR
+20     14260090        rs73619828      A       AT      27935   PASS    AA=596;AB=0.59484;ABA=487;ABP=96.922;ABR=715;AC=204;AF=0.17000;AN=1200;BL=21718;BR=28458;BVAR;BaseQRankSum=0.756;DB;DP=23629;DP4=1385,1492,287,328;Dels=0.00;EL=299;EPP=3.0249;ER=297;FQ=999;FR;FS=6.187;HETAR=218;HOMA=38;HOMR=788;HP=9;HPLen=9;HR=9;HRun=9;HU=T;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0797;IndelType=INS.NumRepetitions_9.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;LEN=1;LRB=0.13433;LRBP=1969;MQ=100.81;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=57.084;MQRankSum=2.224;NF;NR;NS=1044;PP;PV4=0.53,1,1.2e-11,1;RA=4143;RL=238;RPP=55.475;RR=358;RUN=1;ReadPosRankSum=0.198;SAB=0.46812;SAF=279;SAP=8.2714;SAR=317;SC=CCTTAAGTTGATTTTTTTTTC;SRB=0.50374;SRF=2087;SRP=3.514;SRR=2056;TC;TR=9;TU=T;VQSLOD=9.0018;set=Intersection;sumGLbyD=10.82
+20     14260558        .       AC      A       238     PASS    AC=1;AF=0.0014;AF1=0.003368;BaseQRankSum=2.868;CI95=0.003106,0.006211;DP=9724;DP4=2075,2329,1,7;Dels=0.00;FQ=106;FR;FS=10.678;HP=1;HPLen=2;HR=2;HRun=1;HU=A;INDEL;InbreedingCoeff=-0.0406;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_C.;MQ=114.37;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=0.862;NF;NR;PP;PV4=0.074,0.0096,0.017,1;ReadPosRankSum=-0.042;SC=ATCAGGAATAACTGTGTGACC;TC;TR=2;TU=A;VQSLOD=8.1618;set=Intersection;sumGLbyD=18.65
+20     14425481        .       GTA     G,GTATA 148.85  PASS    AC=43,23;AF=0.03473,0.01858;AN=1238;BaseQRankSum=6.289;DP=25167;DP4=1800,2021,38,49;FR;FS=9.416;HP=2;HPLen=1;HR=1;HU=T;HaplotypeScore=17.7453;INDEL;InbreedingCoeff=0.0995;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ0=21;MQ0Fraction=0.0058;MQRankSum=-0.200;NF;NR;PP;PV4=0.59,1,0.04,0.023;QD=0.35;ReadPosRankSum=-1.689;SB=-367.50;SC=CTGTGTGTGTGTATATATATA;TC;TR=13;TU=AT;VQSLOD=3.5796;set=filterInVQSR-2of5
+20     14943522        rs11478299      GA      AA,G    1761.24 PASS    AA=117;AB=0.68142;ABA=108;ABP=99.919;ABR=231;AC=0;AF=0.0000;AF1=0.04204;AN=712;BL=4931;BR=5802;BVAR;BaseQRankSum=9.118;CI95=0.02876,0.05752;DB;DEL;DP=13717;DP4=1908,1684,59,58;Dels=0.05;EL=60;EPP=3.1773;ER=57;FQ=81.9;FR;HETAR=56;HOMA=1;HOMR=1011;HP=8;HPLen=8;HR=8;HU=A;INDEL;InbreedingCoeff=0.1264;IndelType=MIXED;LEN=1;LRB=0.081152;LRBP=156.5;MQ=106.93;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=96.855;MQRankSum=1.619;NF;NR;NS=1068;PP;PV4=0.57,1,0.0003,1;QD=7.40;RA=5080;RL=56;RPP=3.4743;RR=61;RUN=1;ReadPosRankSum=0.814;SAB=0.52137;SAF=61;SAP=3.4743;SAR=56;SB=-1122.51;SC=GTTGTTTGGGGAAAAAAAACT;SRB=0.51083;SRF=2595;SRP=8.1825;SRR=2485;TC;TR=8;TU=A;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=9.81
+20     14974486        .       A       AG      4101.40 PASS    AA=57;AB=0.57143;ABA=51;ABP=8.2839;ABR=68;AC=22;AF=0.01846;AN=1192;BL=2286;BR=2834;BVAR;BaseQRankSum=8.711;DP=20538;DP4=2172,2100,19,13;Dels=0.00;EL=32;EPP=4.877;ER=25;FS=0.517;HETAR=20;HOMA=4;HOMR=1027;HRun=1;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0677;IndelType=INS.NOVEL_1.Novel_G.;LEN=1;LRB=0.10703;LRBP=130.37;MQ=126.07;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=56.088;MQRankSum=-10.756;NS=1051;PV4=0.38,3.5e-51,7.9e-34,1;RA=5203;RL=26;RPP=3.9627;RR=31;RUN=1;ReadPosRankSum=1.283;SAB=0.54386;SAF=31;SAP=3.9627;SAR=26;SRB=0.51816;SRF=2696;SRP=17.918;SRR=2507;VQSLOD=8.0072;set=Intersection;sumGLbyD=25.60
+20     15111137        .       GA      G       13533   PASS    AA=98;AB=0.84864;ABA=89;ABP=623.8;ABR=499;AC=47;AF=0.03796;AN=1238;BL=5324;BR=856;BVAR;BaseQRankSum=-11.577;DEL;DP=13384;Dels=0.01;EL=53;EPP=4.4284;ER=45;FS=6.099;HETAR=219;HOMA=845;HOMR=18;HRun=1;InbreedingCoeff=-0.0056;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;LEN=1;LRB=0.72298;LRBP=7017.4;MQ0Fraction=0.0003;MQM=90.449;MQRankSum=1.408;NS=1083;RA=590;RL=87;RPP=130.99;RR=11;RUN=1;ReadPosRankSum=-18.074;SAB=0.55102;SAF=54;SAP=5.2261;SAR=44;SRB=0.52373;SRF=309;SRP=5.8958;SRR=281;VQSLOD=4.1054;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.06
+20     15283028        .       A       AC,ACACACACACACAC       140844.83       PASS    AA=180;AB=0.61442;ABA=123;ABP=39.285;ABR=196;AC=13,817;AF=0.01111,0.69829;AN=1170;BL=4453;BR=11407;BVAR;BaseQRankSum=24.686;DP=6365;Dels=0.00;EL=124;EPP=58.793;ER=56;FR;FS=10.912;HETAR=87;HOMA=48;HOMR=683;HP=1;HR=1;HRun=1;HU=T;INS;InbreedingCoeff=0.2074;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;LEN=1;LRB=0.43846;LRBP=6624;MQ0Fraction=0.0558;MQM=38.211;MQRankSum=-21.111;NF;NR;NS=818;PP;RA=1732;RL=0;RPP=393.88;RR=180;RUN=1;ReadPosRankSum=-7.620;SAB=0.31111;SAF=56;SAP=58.793;SAR=124;SC=ACACACACACATACACACATA;SRB=0.54042;SRF=936;SRP=27.584;SRR=796;TC;TR=21;TU=AC;VQSLOD=4.7569;set=Intersection;sumGLbyD=18.36
+20     15361056        .       ATAACT  A       4892.81 PASS    AA=59;AB=0.63576;ABA=55;ABP=27.184;ABR=96;AC=34;AF=0.0487;AN=698;BL=3164;BR=1999;BVAR;BaseQRankSum=3.391;DEL;DP=7080;Dels=0.03;EL=27;EPP=3.9304;ER=32;FR;FS=4.816;HETAR=35;HOMA=6;HOMR=966;HP=2;HPLen=3;HR=3;HRun=0;HU=A;InbreedingCoeff=0.0785;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_5.;LEN=5;LRB=0.22564;LRBP=573.84;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=70.034;MQRankSum=-8.732;NF;NR;NS=1008;PP;RA=3915;RL=42;RPP=26.013;RR=17;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.735;SAB=0.44068;SAF=26;SAP=4.8137;SAR=33;SC=AGATTAGGAAATAACTTAGGG;SRB=0.42682;SRF=1671;SRP=185.12;SRR=2244;TC;TR=3;TU=A;VQSLOD=7.0900;set=Intersection;sumGLbyD=43.38
+20     15579507        .       AATTAGTC        A,TATTAGTC      1936.38 PASS    AA=16;AB=0.58974;ABA=16;ABP=5.7386;ABR=23;AC=64;AF=0.05229;AN=1224;BL=699;BR=775;BVAR;BaseQRankSum=-21.390;DEL;DP=21920;DP4=2099,2403,6,6;Dels=0.00;EL=8;EPP=3.0103;ER=8;FR;FS=2.920;HETAR=5;HOMA=0;HOMR=1063;HP=3;HPLen=4;HR=4;HU=A;INDEL;InbreedingCoeff=-0.0143;IndelType=MIXED;LEN=7;LRB=0.05156;LRBP=11.519;MQ=129.49;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=51.938;MQRankSum=3.331;NF;NR;NS=1068;PP;PV4=1,0.019,1.3e-07,1;RA=5334;RL=5;RPP=7.8961;RR=11;RUN=1;ReadPosRankSum=-16.901;SAB=0.4375;SAF=7;SAP=3.5532;SAR=9;SC=CATACTACAAAATTAGTCATT;SRB=0.41695;SRF=2224;SRP=322.58;SRR=3110;TC;TR=4;TU=A;VQSLOD=3.2237;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=43.57
+20     15752535        .       CT      C,GT    3775.20 PASS    AA=92;AB=0.78636;ABA=47;ABP=159.71;ABR=173;AC=0;AF=0.0000;AN=608;BL=4955;BR=2380;BVAR;BaseQRankSum=2.910;DEL;DP=3429;Dels=0.04;EL=13;EPP=105.82;ER=79;FR;HETAR=92;HOMA=95;HOMR=544;HP=2;HPLen=2;HR=2;HU=T;InbreedingCoeff=0.0483;IndelType=MIXED;LEN=1;LRB=0.35106;LRBP=1966;MQ0Fraction=0.0232;MQM=35.293;MQRankSum=-2.199;NF;NR;NS=732;PP;QD=4.91;RA=1272;RL=81;RPP=118.66;RR=11;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.077;SAB=0.021739;SAF=2;SAP=185.79;SAR=90;SB=-59.51;SC=CAAGACCATCCTTGGCTAACA;SRB=0.14623;SRF=186;SRP=1385.8;SRR=1086;TC;TR=2;TU=T;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=9.70
+20     15883060        rs73619850      A       AT      1325.60 PASS    AA=38;AB=0.59302;ABA=35;ABP=9.4742;ABR=51;AC=14;AF=0.0156;AN=896;BL=1078;BR=1638;BVAR;BaseQRankSum=-4.526;DB;DP=19854;DP4=1632,1800,15,20;Dels=0.00;EL=18;EPP=3.2389;ER=20;FR;FS=0.000;HETAR=14;HOMA=1;HOMR=1014;HP=1;HPLen=1;HR=1;HRun=1;HU=T;INDEL;INS;InbreedingCoeff=-0.0131;IndelType=INS.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;LEN=1;LRB=0.20619;LRBP=253.74;MQ=118.40;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=56.526;MQRankSum=0.892;NF;NR;NS=1029;PP;PV4=0.61,1,0.25,0.14;RA=4439;RL=14;RPP=8.7247;RR=24;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.061;SAB=0.42105;SAF=16;SAP=5.0675;SAR=22;SC=GGATTGGCAGATAAAAAATGG;SRB=0.46429;SRF=2061;SRP=52.168;SRR=2378;TC;TR=1;TU=T;VQSLOD=9.7576;set=Intersection;sumGLbyD=15.69
+20     16122099        .       GA      G       12914   PASS    AA=85;AB=0.85915;ABA=80;ABP=639.4;ABR=488;AC=19;AF=0.01542;AN=1232;BL=805;BR=5457;BVAR;BaseQRankSum=-6.084;DEL;DP=13592;Dels=0.00;EL=45;EPP=3.649;ER=40;FS=0.935;HETAR=218;HOMA=841;HOMR=14;HRun=2;InbreedingCoeff=0.0250;IndelType=DEL.NumRepetitions_2.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;LEN=1;LRB=0.74289;LRBP=7507.5;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=103.01;MQRankSum=2.843;NS=1075;RA=541;RL=2;RPP=170.62;RR=83;RUN=1;ReadPosRankSum=-16.222;SAB=0.49412;SAF=42;SAP=3.0358;SAR=43;SRB=0.44917;SRF=243;SRP=15.152;SRR=298;VQSLOD=3.9745;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=2.97
+20     16828509        .       G       GT      843.62  PASS    AA=30;AB=0.70103;ABA=29;ABP=37.06;ABR=68;AC=10;AF=0.0140;AN=714;BL=1368;BR=1786;BVAR;BaseQRankSum=-4.061;DP=8682;Dels=0.01;EL=14;EPP=3.2998;ER=16;FR;FS=2.681;HETAR=22;HOMA=1;HOMR=1020;HP=8;HPLen=8;HR=8;HRun=8;HU=T;INS;InbreedingCoeff=0.1389;IndelType=INS.NumRepetitions_8.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;LEN=1;LRB=0.13253;LRBP=123.3;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=62.8;MQRankSum=-1.491;NF;NR;NS=1043;PP;RA=4416;RL=11;RPP=7.6428;RR=19;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.718;SAB=0.76667;SAF=23;SAP=21.54;SAR=7;SC=CCTTCAAAAGGTTTTTTTTGG;SRB=0.5745;SRF=2537;SRP=215.91;SRR=1879;TC;TR=8;TU=T;VQSLOD=7.6258;set=Intersection;sumGLbyD=10.77
+20     17470034        .       GC      G       46975   PASS    AA=57;AB=0.96043;ABA=52;ABP=2422.5;ABR=1262;AC=34;AF=0.02773;AN=1226;BL=418;BR=3446;BVAR;BaseQRankSum=-6.250;DEL;DP=12035;Dels=0.00;EL=22;EPP=9.4485;ER=35;FS=1.350;HETAR=416;HOMA=409;HOMR=244;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0083;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_C.;LEN=1;LRB=0.78364;LRBP=5155.6;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=99.509;MQRankSum=2.192;NS=1076;RA=2396;RL=5;RPP=87.164;RR=52;RUN=1;ReadPosRankSum=-15.199;SAB=0.5614;SAF=32;SAP=4.877;SAR=25;SRB=0.52963;SRF=1269;SRP=21.285;SRR=1127;VQSLOD=3.8440;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.06
+20     17471374        .       AGCGGC  A       850.03  PASS    AC=6;AF=0.0085;AF1=0.01301;AN=704;BaseQRankSum=6.259;CI95=0.00885,0.01991;DP=8180;DP4=2215,1878,4,5;Dels=0.01;FQ=131;FS=0.000;HRun=0;INDEL;InbreedingCoeff=0.0009;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_5.;MQ=104.41;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-5.521;PV4=0.74,0.37,0.0005,1;ReadPosRankSum=2.468;VQSLOD=6.8773;set=Intersection;sumGLbyD=30.85
+20     18433202        rs35582929      G       GA      2506.90 PASS    AA=55;AB=0.5812;ABA=49;ABP=9.7103;ABR=68;AC=20;AF=0.0218;AN=918;BL=2263;BR=2175;BVAR;BaseQRankSum=-6.639;DB;DP=19467;DP4=1845,2365,27,26;Dels=0.00;EL=21;EPP=9.6826;ER=34;FQ=999;FR;FS=5.633;HETAR=16;HOMA=3;HOMR=1045;HP=2;HPLen=3;HR=3;HRun=1;HU=G;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0700;IndelType=INS.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;LEN=1;LRB=0.019829;LRBP=6.7994;MQ=114.03;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=83.345;MQRankSum=1.610;NF;NR;NS=1064;PP;PV4=0.33,1,1,1;RA=5380;RL=28;RPP=3.0498;RR=27;RUN=1;ReadPosRankSum=0.873;SAB=0.47273;SAF=26;SAP=3.3656;SAR=29;SC=TATTTCATGGGAGCATTAAAA;SRB=0.42862;SRF=2306;SRP=241.07;SRR=3074;TC;TR=3;TU=G;VQSLOD=10.0372;dbSNP=126;set=Intersection;sumGLbyD=13.10
+20     18551314        rs10659122      CA      C,CAA,CAAA,CAAAA,CAAAAA 18810.74        PASS    ABR=243;AC=19,169,216,164,188;AF=0.01816,0.16157,0.20650,0.15679,0.17973;BVAR;BaseQRankSum=-5.742;DB;DP=17637;DP4=136,77,560,237;FR;FS=2.693;HOMA=177;HOMR=299;HP=17;HR=17;HU=A;HaplotypeScore=15.5048;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.8901;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ0=11;MQ0Fraction=0.0069;MQRankSum=1.845;NF;NR;NS=658;PP;PV4=0.08,1,1,1;QD=12.66;RA=673;RUN=1;ReadPosRankSum=0.283;SB=-3514.45;SC=GATTCCATCTCAAAAAAAAAA;SRB=0.63596;SRF=428;SRP=111.06;SRR=245;TC;TR=17;TU=A;VQSLOD=10.6964;dbSNP=130;set=Intersection
+20     18785519        .       G       GTC     415.55  PASS    AC=28;AF=0.0400;AN=700;BaseQRankSum=10.889;DP=1929;FS=8.778;HRun=0;HaplotypeScore=27.6448;InbreedingCoeff=0.0510;IndelType=INS.NOVEL_2.;MQ=61.99;MQ0=36;MQ0Fraction=0.0187;MQRankSum=4.508;QD=3.08;ReadPosRankSum=8.080;SB=-437.03;VQSLOD=4.9313;set=VQSR
+20     20301041        rs35451634      ATATG   A       200.42  PASS    AC=21;AF=0.0449;AN=468;BaseQRankSum=5.251;DB;DP=579;FS=24.013;HRun=0;HaplotypeScore=27.8977;InbreedingCoeff=0.0113;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_4.;MQ=78.47;MQ0=26;MQ0Fraction=0.0449;MQRankSum=-5.284;QD=3.06;ReadPosRankSum=1.793;SB=-55.76;VQSLOD=5.0981;set=VQSR
+20     20378174        .       TC      T       245.55  PASS    AC=23;AF=0.01879;AN=1224;BaseQRankSum=0.990;DP=3225;FS=10.413;HRun=1;HaplotypeScore=22.6109;InbreedingCoeff=0.0244;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_C.;MQ=93.70;MQ0=3;MQ0Fraction=0.0009;MQRankSum=-3.349;QD=1.86;ReadPosRankSum=-7.227;SB=-188.62;VQSLOD=4.2553;set=VQSR
+20     20809160        rs10571503      TAA     AAA,T   3496    PASS    AC=0;AF=0.0000;AN=612;BaseQRankSum=1.968;DB;DP=1092;FR;HP=4;HPLen=3;HR=3;HRun=0;HU=A;HaplotypeScore=26.1253;InbreedingCoeff=0.0603;IndelType=MIXED;MQ=68.98;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0009;MQRankSum=1.520;NF;NR;PP;ReadPosRankSum=-4.042;SC=TATATATATATAAATTTAAAT;TC;TR=13;TU=AT;set=filterInVQSR-2of5
+20     22508765        .       CT      C       53877.84        PASS    AA=187;AB=0.78077;ABA=171;ABP=537.09;ABR=609;AC=1017;AF=0.91787;AN=1108;BL=12690;BR=1718;BVAR;BaseQRankSum=13.773;DEL;DP=7430;Dels=0.02;EL=73;EPP=22.53;ER=114;FR;FS=16.352;HETAR=152;HOMA=9;HOMR=786;HP=8;HR=4;HRun=4;HU=T;InbreedingCoeff=0.3885;IndelType=DEL.NumRepetitions_4.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;LEN=1;LRB=0.76152;LRBP=18147;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=46.086;MQRankSum=0.971;NF;NR;NS=947;PP;RA=2868;RL=177;RPP=326.86;RR=10;RUN=1;ReadPosRankSum=9.951;SAB=0.34759;SAF=65;SAP=40.738;SAR=122;SC=AAAAAATTTTCTTTTGAACTG;SRB=0.46269;SRF=1327;SRP=37.684;SRR=1541;TC;TR=4;TU=T;VQSLOD=5.1182;set=Intersection;sumGLbyD=25.15
+20     22555082        rs11477526      AT      A       11503   PASS    AA=530;AB=0.50816;ABA=422;ABP=3.5063;ABR=436;AF=0.1614;AN=700;BL=21453;BR=23313;BVAR;BaseQRankSum=17.562;DB;DEL;DP=25587;DP4=1869,1600,283,201;Dels=0.14;EL=259;EPP=3.6003;ER=271;FQ=999;FR;FS=14.595;HETAR=159;HOMA=41;HOMR=846;HP=3;HPLen=3;HR=3;HRun=3;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=0.0995;IndelType=DEL.NumRepetitions_3.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;LEN=1;LRB=0.041549;LRBP=170.83;MQ=95.89;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=72.162;MQRankSum=2.564;NF;NR;NS=1046;PP;PV4=0.058,6.6e-129,0.04,1;RA=4303;RL=264;RPP=3.0267;RR=266;RUN=1;ReadPosRankSum=0.176;SAB=0.58679;SAF=311;SAP=37.688;SAR=219;SC=GGGAAAGCTGATTTACTGATT;SRB=0.54892;SRF=2362;SRP=92.453;SRR=1941;TC;TR=3;TU=T;VQSLOD=8.7746;dbSNP=120;set=Intersection;sumGLbyD=15.27
+20     22590907        .       A       AC      4204.88 PASS    AA=67;AB=0.592;ABA=51;ABP=12.2;ABR=74;AF=0.0554;AF1=0.0468;AN=560;BL=2277;BR=2389;BVAR;BaseQRankSum=10.968;CI95=0.03759,0.05639;DP=14380;DP4=2514,2018,33,33;Dels=0.00;EL=22;EPP=20.155;ER=45;FQ=999;FR;FS=3.846;HETAR=25;HOMA=4;HOMR=1049;HP=4;HPLen=5;HR=5;HRun=0;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0719;IndelType=INS.NOVEL_1.Novel_C.;LEN=1;LRB=0.024003;LRBP=8.8481;MQ=110.68;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=96.149;MQRankSum=2.668;NF;NR;NS=1078;PP;PV4=0.39,1,0.46,0.36;RA=5468;RL=33;RPP=3.0427;RR=34;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.097;SAB=0.50746;SAF=34;SAP=3.0427;SAR=33;SC=TCATATCAAAAACATTACGTT;SRB=0.54389;SRF=2974;SRP=94.508;SRR=2494;TC;TR=5;TU=A;VQSLOD=10.0712;set=Intersection;sumGLbyD=27.69
+20     22806326        rs11468890      ATTCCATCAC      A       105320.99       PASS    AC=567;AF=0.48795;AN=1162;BVAR;BaseQRankSum=32.858;DB;DEL;DP=26278;DP4=727,796,554,587;Dels=0.30;FQ=999;FR;FS=1.923;HP=3;HPLen=3;HR=2;HRun=0;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=0.2548;IndelType=DEL.NumRepetitions_2.EventLength_9.;LEN=9;MQ=89.42;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-23.545;NF;NR;PP;PV4=0.7,1,1.3e-167,1;RUN=1;ReadPosRankSum=4.384;SC=GGCTGCTCCCATTCCATCACT;TC;TR=2;TU=T;VQSLOD=8.2594;set=Intersection;sumGLbyD=69.81
+20     22999898        rs55966257      CAGGA   C       8019.97 PASS    AA=23;AB=0.57778;ABA=19;ABP=5.3748;ABR=26;AC=214;AF=0.18838;AN=1136;BL=1143;BR=1040;BVAR;BaseQRankSum=29.294;DB;DEL;DP=8216;Dels=0.02;EL=11;EPP=3.1047;ER=12;FS=14.938;HETAR=14;HOMA=2;HOMR=948;HRun=0;InbreedingCoeff=0.0797;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_4.;LEN=4;LRB=0.047183;LRBP=13.563;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=34.783;MQRankSum=-20.301;NS=964;RA=3637;RL=13;RPP=3.86;RR=10;RUN=1;ReadPosRankSum=-24.607;SAB=0.47826;SAF=11;SAP=3.1047;SAR=12;SRB=0.49024;SRF=1783;SRP=6.02;SRR=1854;VQSLOD=7.9163;set=Intersection;sumGLbyD=9.43
+20     23385964        rs57723772      GAA     G       8170.95 PASS    AC=257;AF=0.20928;AN=1228;BaseQRankSum=32.220;DB;DP=3291;FS=1.688;HRun=3;HaplotypeScore=22.6739;InbreedingCoeff=0.0171;IndelType=DEL.NumRepetitions_3.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;MQ=58.44;MQ0=32;MQ0Fraction=0.0097;MQRankSum=-4.893;QD=6.55;ReadPosRankSum=-35.524;SB=-3631.67;VQSLOD=5.6549;set=VQSR
+20     23534530        .       TA      T       3542.10 PASS    AA=45;AB=0.75658;ABA=37;ABP=89.926;ABR=115;AC=35;AF=0.02991;AN=1170;BL=3090;BR=270;BVAR;BaseQRankSum=-6.892;DEL;DP=8108;Dels=0.00;EL=19;EPP=5.3748;ER=26;FS=1.026;HETAR=76;HOMA=896;HOMR=18;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0551;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;LEN=1;LRB=0.83929;LRBP=5142.4;MQ0Fraction=0.0017;MQM=41.578;MQRankSum=0.818;NS=991;RA=203;RL=43;RPP=84.127;RR=2;RUN=1;ReadPosRankSum=-12.923;SAB=0.37778;SAF=17;SAP=8.8491;SAR=28;SRB=0.5665;SRF=115;SRP=10.808;SRR=88;VQSLOD=4.2093;set=Intersection;sumGLbyD=3.49
+20     23976810        rs5841018       A       ATATTAAT        1782.38 PASS    AF=0.1387;AF1=0.01507;BaseQRankSum=3.717;CI95=0.00188,0.03947;DB;DP=1712;DP4=357,376,7,2;Dels=0.00;FQ=31.1;FS=14.489;HPLen=2;HRun=0;INDEL;InbreedingCoeff=0.1123;IndelType=INS.NumRepetitions_1.EventLength_7.;MQ=49.53;MQ0=2;MQ0Fraction=0.0055;MQRankSum=-4.928;PV4=0.1,1,0.00085,0.016;ReadPosRankSum=-4.456;VQSLOD=5.3140;dbSNP=116;set=Intersection;sumGLbyD=19.98
+20     24222100        .       CTTTTA  C       4219.36 PASS    AA=57;AB=0.59434;ABA=43;ABP=11.205;ABR=63;AF=0.01803;AF1=0.01547;AN=1220;BL=2073;BR=2345;BVAR;BaseQRankSum=7.990;CI95=0.0114,0.02137;DEL;DP=17536;DP4=2140,2346,7,12;Dels=0.01;EL=32;EPP=4.877;ER=25;FQ=104;FS=0.614;HETAR=21;HOMA=4;HOMR=1042;HRun=0;INDEL;InbreedingCoeff=0.1941;IndelType=DEL.NumRepetitions_2.EventLength_5.;LEN=5;LRB=0.061566;LRBP=39.374;MQ=73.32;MQ0Fraction=0.0021;MQM=39.614;MQRankSum=-5.728;NS=1067;PV4=0.37,1.1e-39,3.5e-09,1;RA=5527;RL=28;RPP=3.0484;RR=29;RUN=1;ReadPosRankSum=0.214;SAB=0.54386;SAF=31;SAP=3.9627;SAR=26;SRB=0.49267;SRF=2723;SRP=5.588;SRR=2804;VQSLOD=7.5428;set=Intersection;sumGLbyD=38.08
+20     24395018        .       AT      A       49310   PASS    AA=146;AB=0.91198;ABA=130;ABP=2180.5;ABR=1347;AC=50;AF=0.04045;AN=1236;BL=587;BR=9625;BVAR;BaseQRankSum=-4.610;DEL;DP=12793;Dels=0.01;EL=54;EPP=24.487;ER=92;FS=22.108;HETAR=485;HOMA=384;HOMR=210;HRun=2;InbreedingCoeff=0.0374;IndelType=DEL.NumRepetitions_2.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;LEN=1;LRB=0.88504;LRBP=17373;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=102.26;MQRankSum=2.256;NS=1080;RA=2377;RL=1;RPP=311.42;RR=145;RUN=1;ReadPosRankSum=-16.347;SAB=0.63699;SAF=93;SAP=26.807;SAR=53;SRB=0.52167;SRF=1240;SRP=12.702;SRR=1137;VQSLOD=3.2421;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.80
+20     24411517        .       C       CA      246.18  PASS    AF=0.01546;AF1=0.01095;BaseQRankSum=7.832;CI95=0.005698,0.01709;DP=7981;DP4=983,2037,7,7;Dels=0.00;FQ=27.9;FS=18.815;HPLen=3;HRun=3;INDEL;InbreedingCoeff=0.0175;IndelType=INS.NumRepetitions_3.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;MQ=60.28;MQ0Fraction=0.0137;MQRankSum=-7.243;PV4=0.25,1,2.7e-05,1;ReadPosRankSum=-0.143;VQSLOD=4.3701;set=Intersection;sumGLbyD=6.56
+20     24421169        .       AG      A       27480   PASS    AA=182;AB=0.8303;ABA=149;ABP=835;ABR=729;AC=89;AF=0.07224;AN=1232;BL=11276;BR=2214;BVAR;BaseQRankSum=-5.447;DEL;DP=11717;Dels=0.01;EL=103;EPP=9.8827;ER=79;FR;FS=15.492;HETAR=343;HOMA=607;HOMR=114;HP=4;HR=1;HRun=1;HU=G;InbreedingCoeff=0.0353;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_G.;LEN=1;LRB=0.67176;LRBP=13222;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=88.324;MQRankSum=2.221;NF;NR;NS=1071;PP;RA=1226;RL=169;RPP=293.37;RR=13;RUN=1;ReadPosRankSum=-19.711;SAB=0.54945;SAF=100;SAP=6.876;SAR=82;SC=CCTTAGCCCCAGAAAACATCT;SRB=0.44535;SRF=546;SRP=34.814;SRR=680;TC;TR=1;TU=G;VQSLOD=4.2669;set=Intersection;sumGLbyD=3.91
+20     24765537        rs71841337      ATTT    A,AT,ATT,ATTTT,ATTTTT   37852   PASS    AC=13,120,527,51,92;AF=0.01102,0.10169,0.44661,0.04322,0.07797;AN=1180;BVAR;BaseQRankSum=8.172;DB;DEL;DP=39116;DP4=200,331,851,1169;FR;FS=2.394;HP=15;HR=15;HU=T;HaplotypeScore=20.8091;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.4815;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0003;MQRankSum=4.344;NF;NR;PP;PV4=0.067,1,1,0.1;QD=7.90;RUN=1;ReadPosRankSum=1.798;SB=-8371.96;SC=CTCTGCAACAATTTTTTTTTT;TC;TR=15;TU=T;VQSLOD=9.9679;dbSNP=120;set=Intersection
+20     25500689        .       A       AATTT   84980.72        PASS    AC=1005;AF=0.89096;AN=1128;BaseQRankSum=17.400;DP=2324;FS=6.721;HRun=0;HaplotypeScore=25.3376;InbreedingCoeff=0.2148;IndelType=INS.NumRepetitions_1.EventLength_4.;MQ=75.19;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0004;MQRankSum=-8.221;QD=38.28;ReadPosRankSum=4.504;SB=-34833.07;VQSLOD=4.6038;set=VQSR
+20     25550373        .       GA      G       11251.31        PASS    AA=246;AB=0.42963;ABA=154;ABP=14.624;ABR=116;AC=566;AF=0.6521;AN=868;BL=5230;BR=11845;BVAR;BaseQRankSum=7.418;DEL;DP=8885;Dels=0.02;EL=99;EPP=23.348;ER=147;FR;FS=50.357;HETAR=150;HOMA=849;HOMR=14;HP=1;HR=2;HRun=1;HU=G;InbreedingCoeff=0.1365;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;LEN=1;LRB=0.38741;LRBP=5567.9;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=97.561;MQRankSum=0.050;NF;NR;NS=1013;PP;RA=269;RL=75;RPP=84.361;RR=171;RUN=1;ReadPosRankSum=-7.128;SAB=0.52846;SAF=130;SAP=4.7404;SAR=116;SC=CACGGAGGCGGAGGAAGCAGC;SRB=0.42379;SRF=114;SRP=16.58;SRR=155;TC;TR=6;TU=AGG;VQSLOD=4.0103;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=4.58
+20     25903865        .       TTC     T       7459.23 PASS    AC=277;AF=0.23316;AN=1188;BaseQRankSum=31.479;DP=2969;FS=137.723;HRun=0;HaplotypeScore=37.3300;InbreedingCoeff=-0.1755;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_2.RepeatExpansion_TC.;MQ=53.49;MQ0=50;MQ0Fraction=0.0168;MQRankSum=-25.506;QD=4.70;ReadPosRankSum=-5.913;SB=-1747.98;VQSLOD=5.4731;set=VQSR
+20     25934237        .       C       CCACTT  771.36  PASS    AC=37;AF=0.0426;AN=868;BaseQRankSum=16.331;DP=2253;FS=4.545;HRun=0;HaplotypeScore=29.9764;InbreedingCoeff=-0.0685;IndelType=INS.NOVEL_5.;MQ=48.12;MQ0=87;MQ0Fraction=0.0386;MQRankSum=-12.497;QD=3.37;ReadPosRankSum=-8.428;SB=-297.70;VQSLOD=4.2324;set=VQSR
+20     26054751        rs112967123     TATC    T       33244   PASS    AA=1863;AB=0.79012;ABA=1788;ABP=6231;ABR=6731;AC=227;AF=0.18218;AN=1246;BL=74924;BR=72452;BVAR;BaseQRankSum=32.258;DB;DEL;DP=36404;DS;Dels=0.05;EL=931;EPP=3.0115;ER=932;FR;FS=265.752;HETAR=527;HOMA=2;HOMR=565;HP=1;HR=2;HRun=0;HU=T;InbreedingCoeff=-0.2137;IndelType=DEL.NumRepetitions_2.EventLength_3.;LEN=3;LRB=0.016773;LRBP=93.048;MQ0Fraction=0.0127;MQM=28.797;MQRankSum=-5.329;NF;NR;NS=1094;PP;RA=14604;RL=1014;RPP=34.743;RR=849;RUN=1;ReadPosRankSum=8.394;SAB=0.65486;SAF=1220;SAP=391.07;SAR=643;SC=TCACCATCATTATCATCATTA;SRB=0.56717;SRF=8283;SRP=575.39;SRR=6321;TC;TR=8;TU=ATC;VQSLOD=1.0486;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=6.54
+20     26120452        .       CAG     C       7863.19 PASS    AA=163;AB=0.70489;ABA=157;ABP=196.99;ABR=375;AC=171;AF=0.1908;AN=896;BL=3455;BR=4877;BVAR;BaseQRankSum=25.536;DEL;DP=7014;Dels=0.10;EL=58;EPP=32.438;ER=105;FS=231.723;HETAR=90;HOMA=5;HOMR=387;HRun=0;InbreedingCoeff=-0.1966;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_2.RepeatExpansion_AG.;LEN=2;LRB=0.17067;LRBP=530;MQ0Fraction=0.0470;MQM=21.951;MQRankSum=-23.449;NS=482;RA=1117;RL=62;RPP=23.273;RR=101;RUN=1;ReadPosRankSum=1.904;SAB=0.37423;SAF=61;SAP=25.404;SAR=102;SRB=0.41719;SRF=466;SRP=69.544;SRR=651;VQSLOD=-0.9395;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=5.06
+20     26185812        .       AG      A       322.58  PASS    AF=0.0342;BaseQRankSum=3.668;DP=3014;Dels=0.01;FR;FS=10.238;HP=8;HPLen=6;HR=6;HRun=6;HU=G;InbreedingCoeff=0.1504;IndelType=DEL.NumRepetitions_6.EventLength_1.RepeatExpansion_G.;MQ0Fraction=0.0473;MQRankSum=-5.464;NF;NR;PP;ReadPosRankSum=0.536;SC=GGGTGGGTGGAGGGGGGAGGG;TC;TR=6;TU=G;VQSLOD=5.0767;set=Intersection;sumGLbyD=8.46
+20     30963468        .       AGTTT   A       2041.12 PASS    AA=38;AB=0.75694;ABA=35;ABP=85.587;ABR=109;AC=34;AF=0.0377;AN=902;BL=1974;BR=668;BVAR;BaseQRankSum=3.060;DEL;DP=22806;DP4=1997,1747,28,36;Dels=0.02;EL=17;EPP=3.9246;ER=21;FR;FS=16.034;HETAR=29;HOMA=1;HOMR=1009;HP=1;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=G;INDEL;InbreedingCoeff=0.0752;IndelType=DEL.NumRepetitions_2.EventLength_4.;LEN=4;LRB=0.49432;LRBP=1404.9;MQ=87.17;MQ0Fraction=0.0013;MQM=98.079;MQRankSum=6.021;NF;NR;NS=1039;PP;PV4=0.13,1.5e-07,1,0.051;RA=4052;RL=36;RPP=69.069;RR=2;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.847;SAB=0.5;SAF=19;SAP=3.0103;SAR=19;SC=AGAAGTAAGTAGTTTGTTTTT;SRB=0.53776;SRF=2179;SRP=53.19;SRR=1873;TC;TR=9;TU=AAGT;VQSLOD=7.3578;set=Intersection;sumGLbyD=14.03
+20     31963212        .       AAAAAAAAAAAAG   A       727.15  PASS    AC=5;AF=0.0080;AN=622;BaseQRankSum=4.037;DP=1480;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=43.3793;InbreedingCoeff=0.0350;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_10orMore.;MQ=51.77;MQ0=59;MQ0Fraction=0.0399;MQRankSum=-1.799;QD=22.72;ReadPosRankSum=3.591;SB=-364.04;VQSLOD=5.3166;set=VQSR
+20     31997272        .       CT      C,CTT,CTTT      1837.10 PASS    AA=63;AB=0.77559;ABA=57;ABP=170.57;ABR=197;AC=79,49,30;AF=0.06594,0.04090,0.02504;AN=1198;BL=2372;BR=2640;BVAR;BaseQRankSum=3.277;DP=9050;Dels=0.03;EL=24;EPP=10.766;ER=39;FR;FS=0.303;HETAR=45;HOMA=1;HOMR=981;HP=10;HPLen=10;HR=10;HRun=10;HU=T;INS;InbreedingCoeff=0.2796;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;LEN=1;LRB=0.053472;LRBP=34.128;MQ0Fraction=0.0000;MQM=50.889;MQRankSum=0.610;NF;NR;NS=1027;PP;RA=3776;RL=30;RPP=3.3205;RR=33;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.800;SAB=0.39683;SAF=25;SAP=8.8354;SAR=38;SC=ACCCAACTTCCTTTTTTTTTT;SRB=0.46213;SRF=1745;SRP=50.049;SRR=2031;TC;TR=10;TU=T;VQSLOD=4.1189;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.66
+20     33446974        rs113250263     TAA     T,TA,TAAA       17130.16        PASS    AC=65,417,184;AF=0.05941,0.38117,0.16819;AN=1094;BVAR;BaseQRankSum=3.400;DB;DEL;DP=22362;DP4=221,247,418,524;Dels=0.33;FR;FS=15.409;HP=15;HR=14;HRun=14;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.5215;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ=61.32;MQ0Fraction=0.0021;MQRankSum=0.481;NF;NR;PP;PV4=0.33,1,1,1;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.056;SC=CTCCGTCTCATAAAAAAAAAA;TC;TR=14;TU=A;VQSLOD=8.0974;dbSNP=132;set=Intersection;sumGLbyD=12.78
+20     33877149        .       C       CT      1784.40 PASS    AA=58;AB=0.73096;ABA=53;ABP=94.289;ABR=144;AC=65;AF=0.05682;AN=1144;BL=3298;BR=1935;BVAR;BaseQRankSum=-2.066;DP=8074;Dels=0.02;EL=22;EPP=10.348;ER=36;FR;FS=11.452;HETAR=47;HOMA=3;HOMR=754;HP=16;HR=12;HRun=12;HU=T;INS;InbreedingCoeff=0.1178;IndelType=INS.NumRepetitions_10orMore.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;LEN=1;LRB=0.26046;LRBP=773.91;MQ0Fraction=0.0165;MQM=52.259;MQRankSum=0.734;NF;NR;NS=804;PP;RA=2141;RL=43;RPP=32.363;RR=15;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.273;SAB=0.46552;SAF=27;SAP=3.6093;SAR=31;SC=ATTTTCTTTTCTTTTTTTTTT;SRB=0.37553;SRF=804;SRP=291.14;SRR=1337;TC;TR=12;TU=T;VQSLOD=3.1540;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=2.84
+20     34387589        rs112431805     CT      C,CTT   4039.10 PASS    AA=121;AB=0.75368;ABA=117;ABP=268.53;ABR=358;AC=84,139;AF=0.07047,0.11661;AN=1192;BL=5557;BR=3901;BVAR;BaseQRankSum=2.693;DB;DP=10157;Dels=0.03;EL=47;EPP=16.093;ER=74;FR;FS=7.639;HETAR=89;HOMA=2;HOMR=913;HP=13;HR=11;HRun=11;HU=T;INS;InbreedingCoeff=0.2097;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;LEN=1;LRB=0.17509;LRBP=632.63;MQ0Fraction=0.0000;MQM=49.802;MQRankSum=-0.801;NF;NR;NS=1004;PP;RA=3789;RL=77;RPP=22.554;RR=44;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.691;SAB=0.3719;SAF=45;SAP=20.256;SAR=76;SC=AAGAAGTGTTCTTTTTTTTTT;SRB=0.40987;SRF=1553;SRP=270.35;SRR=2236;TC;TR=11;TU=T;VQSLOD=4.0473;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=4.64
+20     34493409        rs73621682      C       CAG     62288.93        PASS    AA=1069;AB=0.54863;ABA=826;ABP=40.606;ABR=1004;AC=257;AF=0.3640;AN=706;BL=41524;BR=47039;BVAR;BaseQRankSum=-24.248;DB;DP=30195;DP4=1743,1636,614,487;Dels=0.00;EL=582;EPP=21.343;ER=487;FQ=999;FR;FS=5.080;HETAR=298;HOMA=63;HOMR=712;HP=1;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.1437;IndelType=INS.NumRepetitions_2.EventLength_2.RepeatExpansion_AG.;LEN=2;LRB=0.062272;LRBP=748.76;MQ=77.99;MQ0=3;MQ0Fraction=0.0015;MQM=54.446;MQRankSum=0.160;NF;NR;NS=1073;PP;PV4=0.016,1,0.01,1;RA=4461;RL=526;RPP=3.5973;RR=543;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.716;SAB=0.57343;SAF=613;SAP=53.08;SAR=456;SC=AGGAAGAGATCAGAGCTCCCC;SRB=0.52634;SRF=2348;SRP=29.892;SRR=2113;TC;TR=4;TU=AG;VQSLOD=8.7047;dbSNP=130;set=Intersection;sumGLbyD=49.82
+20     35957317        .       CTGACT  C,CGACT 4370.96 PASS    ABR=81;AC=22,1;AF=0.0321,0.0015;AF1=0.04523;AN=686;BVAR;BaseQRankSum=7.969;CI95=0.0354,0.05752;DEL;DP=16632;DP4=1942,1815,17,21;Dels=0.03;FQ=999;FR;FS=0.531;HOMA=1;HOMR=998;HP=2;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=0.0587;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ=83.38;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-7.201;NF;NR;NS=1020;PP;PV4=0.42,0.00017,4.5e-12,1;RA=4620;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.007;SC=CCTCTCAGCTCTGACTGAGTC;SRB=0.50043;SRF=2312;SRP=3.0178;SRR=2308;TC;TR=8;TU=ACTG;VQSLOD=9.9778;dbSNP=130;set=Intersection;sumGLbyD=36.45
+20     36136198        .       GTGTC   G       2078.76 PASS    AA=35;AB=0.54167;ABA=33;ABP=4.096;ABR=39;AC=17;AF=0.01384;AN=1228;BL=1212;BR=1523;BVAR;BaseQRankSum=6.900;DEL;DP=22483;DP4=1696,2291,9,16;Dels=0.01;EL=9;EPP=20.94;ER=26;FQ=999;FR;FS=3.023;HETAR=13;HOMA=1;HOMR=1061;HP=1;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=0.1113;IndelType=DEL.NumRepetitions_2.EventLength_4.;LEN=4;LRB=0.11371;LRBP=79.803;MQ=93.98;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0003;MQM=83.686;MQRankSum=-1.683;NF;NR;NS=1075;PP;PV4=0.55,1,0.0083,1;RA=5771;RL=19;RPP=3.5687;RR=16;RUN=1;ReadPosRankSum=0.618;SAB=0.37143;SAF=13;SAP=8.0357;SAR=22;SC=TATCATTTTAGTGTCTGTCTG;SRB=0.44966;SRF=2595;SRP=130.03;SRR=3176;TC;TR=11;TU=CTGT;VQSLOD=10.1935;set=Intersection;sumGLbyD=31.66
+20     36250522        .       CA      C       37933   PASS    AA=51;AB=0.95582;ABA=44;ABP=1800.5;ABR=952;AC=23;AF=0.01885;AN=1220;BL=691;BR=3464;BVAR;BaseQRankSum=-2.418;DEL;DP=11998;Dels=0.00;EL=18;EPP=12.59;ER=33;FS=2.307;HETAR=348;HOMA=534;HOMR=164;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0763;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;LEN=1;LRB=0.66739;LRBP=4021.7;MQ0=2;MQ0Fraction=0.0006;MQM=53.647;MQRankSum=1.083;NS=1047;RA=1663;RL=2;RPP=97.065;RR=49;RUN=1;ReadPosRankSum=-12.726;SAB=0.68627;SAF=35;SAP=18.381;SAR=16;SRB=0.59651;SRF=992;SRP=137.56;SRR=671;VQSLOD=4.1346;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.29
+20     36285033        rs34715186      AT      A       39417   PASS    AA=530;AB=0.5406;ABA=447;ABP=16.939;ABR=526;AC=88;AF=0.0950;AN=926;BL=20722;BR=20406;BVAR;BaseQRankSum=15.611;DB;DEL;DP=36713;DP4=2551,2475,236,218;Dels=0.09;EL=241;EPP=12.45;ER=289;FQ=999;FR;FS=1.290;HETAR=141;HOMA=16;HOMR=926;HP=2;HPLen=3;HR=3;HRun=1;HU=A;INDEL;InbreedingCoeff=0.0742;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;LEN=1;LRB=0.0076833;LRBP=8.2825;MQ=104.81;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=84.285;MQRankSum=-0.702;NF;NR;NS=1083;PP;PV4=0.62,1,1,1;RA=6562;RL=263;RPP=3.0759;RR=267;RUN=1;ReadPosRankSum=0.090;SAB=0.55849;SAF=296;SAP=18.76;SAR=234;SC=AAAAACACAAATCAGATCGTG;SRB=0.51707;SRF=3393;SRP=19.614;SRR=3169;TC;TR=3;TU=A;VQSLOD=10.5533;dbSNP=126;set=Intersection;sumGLbyD=14.15
+20     36384872        .       CTG     C       43532.41        PASS    AC=1213;AF=0.99589;AN=1218;BaseQRankSum=0.802;DP=3208;FS=9.727;HRun=0;HaplotypeScore=46.6153;InbreedingCoeff=0.1085;IndelType=DEL.NumRepetitions_7.EventLength_2.RepeatExpansion_TG.;MQ=58.37;MQ0=50;MQ0Fraction=0.0156;MQRankSum=-1.672;QD=13.57;ReadPosRankSum=2.063;SB=-18894.12;VQSLOD=4.7353;set=VQSR
+20     36542802        .       GTA     G       31310.15        PASS    AA=1481;AB=0.67546;ABA=1378;ABP=1138.4;ABR=2868;AC=437;AF=0.35938;AN=1216;BL=25719;BR=95500;BVAR;BaseQRankSum=9.478;DEL;DP=18068;DS;Dels=0.10;EL=889;EPP=132.34;ER=592;FS=320.726;HETAR=591;HOMA=44;HOMR=378;HRun=0;InbreedingCoeff=-0.4197;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_2.RepeatExpansion_TA.;LEN=2;LRB=0.57566;LRBP=87231;MQ0Fraction=0.0091;MQM=29.319;MQRankSum=-3.409;NS=1013;RA=4037;RL=3;RPP=3193;RR=1478;RUN=1;ReadPosRankSum=-6.687;SAB=0.40041;SAF=593;SAP=130.61;SAR=888;SRB=0.39014;SRF=1575;SRP=426.21;SRR=2462;VQSLOD=-1.6586;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=5.49
+20     36985025        .       CCA     C       4.57    PASS    AC=0;AF=0.0000;AN=682;BaseQRankSum=4.199;DP=1504;FS=1.036;HRun=0;HaplotypeScore=18.5241;InbreedingCoeff=0.0460;IndelType=DEL.NumRepetitions_6.EventLength_2.RepeatExpansion_CA.;MQ=57.04;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-1.774;ReadPosRankSum=-2.105;VQSLOD=6.7455;set=VQSR
+20     37139725        .       CAG     C       250.77  PASS    AF=0.0084;AF1=0.0139;BaseQRankSum=4.131;CI95=0.00885,0.01991;DP=7973;DP4=1808,1990,2,7;Dels=0.01;FQ=104;FR;FS=11.160;HP=3;HPLen=2;HR=1;HRun=0;HU=A;INDEL;InbreedingCoeff=-0.0001;IndelType=DEL.NumRepetitions_3.EventLength_2.RepeatExpansion_AG.;MQ=103.71;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-3.378;NF;NR;PP;PV4=0.18,0.0011,0.041,1;ReadPosRankSum=0.605;SC=AGATGGGGAACAGAGAGCAAG;TC;TR=6;TU=AG;VQSLOD=7.0630;set=Intersection;sumGLbyD=12.13
+20     37213224        .       G       GTA     3230.05 PASS    AA=32;AB=0.50769;ABA=32;ABP=3.0437;ABR=33;AC=12;AF=0.0168;AF1=0.02635;AN=714;BL=1271;BR=1743;BVAR;BaseQRankSum=-7.288;CI95=0.02212,0.03319;DP=14304;DP4=2180,2256,13,21;Dels=0.00;EL=20;EPP=7.3532;ER=12;FQ=999;FR;FS=7.863;HETAR=9;HOMA=0;HOMR=1043;HP=1;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=T;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0410;IndelType=INS.NumRepetitions_1.EventLength_2.RepeatExpansion_TA.;LEN=2;LRB=0.1566;LRBP=163.52;MQ=95.56;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0005;MQM=51.562;MQRankSum=0.420;NF;NR;NS=1052;PP;PV4=0.23,1,0.03,0.33;RA=5138;RL=11;RPP=9.7962;RR=21;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.122;SAB=0.28125;SAF=9;SAP=16.311;SAR=23;SC=TTTGCATCCAGTAGCACCACT;SRB=0.42293;SRF=2173;SRP=268.11;SRR=2965;TC;TR=1;TU=T;VQSLOD=9.7315;set=Intersection;sumGLbyD=36.69
+20     37282014        .       ATGG    A       2518.52 PASS    AF=0.03519;BaseQRankSum=11.994;DP=24592;DP4=415,3804,8,49;DS;Dels=0.01;FQ=999;FR;FS=2.049;HP=1;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=0.1028;IndelType=DEL.NumRepetitions_5.EventLength_3.;MQ=51.01;MQ0Fraction=0.0139;MQRankSum=-5.912;NF;NR;PP;PV4=0.27,1,0.22,0.015;ReadPosRankSum=1.781;SC=GGTGGTGATGATGGTGGTGGT;TC;TR=17;TU=GGT;VQSLOD=2.1183;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=9.05
+20     37532218        .       GTCCGTCCA       ATCCGTCCA,G     76120.88        PASS    AC=998;AF=0.92924;AN=1074;BaseQRankSum=-2.877;DP=3087;FR;FS=9.889;HP=2;HPLen=2;HR=1;HRun=0;HU=T;HaplotypeScore=71.6244;InbreedingCoeff=-0.0027;IndelType=MIXED;MQ=52.68;MQ0=543;MQ0Fraction=0.1759;MQRankSum=-1.750;NF;NR;PP;QD=24.98;ReadPosRankSum=-0.850;SB=-36635.43;SC=CCGTCCGTCCGTCCGTCCATC;TC;TR=19;TU=CCGT;VQSLOD=5.3068;set=Intersection
+20     37712193        .       AAG     A       2670.33 PASS    AA=106;AB=0.62821;ABA=87;ABP=36.418;ABR=147;AC=53;AF=0.0759;AN=698;BL=4672;BR=4303;BVAR;BaseQRankSum=13.696;DEL;DP=15155;DP4=1340,1852,32,52;Dels=0.06;EL=57;EPP=4.3214;ER=49;FR;FS=0.824;HETAR=43;HOMA=7;HOMR=982;HP=1;HPLen=2;HR=2;HRun=0;HU=A;INDEL;InbreedingCoeff=0.0861;IndelType=DEL.NumRepetitions_3.EventLength_2.RepeatExpansion_AG.;LEN=2;LRB=0.041114;LRBP=35.954;MQ=86.12;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=54.236;MQRankSum=-5.745;NF;NR;NS=1034;PP;PV4=0.5,7.3e-26,1.1e-10,1;RA=4423;RL=58;RPP=5.0589;RR=48;RUN=1;ReadPosRankSum=2.617;SAB=0.38679;SAF=41;SAP=14.81;SAR=65;SC=GAAAATTCTGAAGAGAGTCAG;SRB=0.43093;SRF=1906;SRP=186.29;SRR=2517;TC;TR=6;TU=AG;VQSLOD=9.8131;set=Intersection;sumGLbyD=14.20
+20     37739002        .       T       TCA     1395.38 PASS    AA=16;AB=0.48387;ABA=16;ABP=3.0803;ABR=15;AC=11;AF=0.00950;AN=1158;BL=504;BR=630;BVAR;BaseQRankSum=-3.257;DP=13617;DP4=1660,883,7,5;Dels=0.00;EL=7;EPP=3.5532;ER=9;FR;FS=1.114;HETAR=9;HOMA=0;HOMR=991;HP=1;HPLen=2;HR=2;HRun=0;HU=T;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0527;IndelType=INS.NumRepetitions_1.EventLength_2.RepeatExpansion_CA.;LEN=2;LRB=0.11111;LRBP=33.411;MQ=88.41;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=83.75;MQRankSum=1.713;NF;NR;NS=1000;PP;PV4=0.76,1,1,0.5;RA=3257;RL=6;RPP=5.1818;RR=10;RUN=1;ReadPosRankSum=1.190;SAB=0.6875;SAF=11;SAP=7.8961;SAR=5;SC=CCTTTTTTGTTCATTTCTGCA;SRB=0.68806;SRF=2241;SRP=1003.5;SRR=1016;TC;TR=2;TU=T;VQSLOD=10.2220;set=Intersection;sumGLbyD=41.32
+20     38395256        .       TTGAG   T       633.19  PASS    AF=0.0028;BaseQRankSum=5.667;DP=3839;Dels=0.00;FR;FS=10.238;HP=2;HPLen=3;HR=3;HRun=0;HU=T;InbreedingCoeff=-0.0097;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_4.;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-1.276;NF;NR;PP;ReadPosRankSum=-1.016;SC=ATGTGTTTGTTTGAGTATGTT;TC;TR=10;TU=GTTT;VQSLOD=6.4906;set=Intersection;sumGLbyD=10.83
+20     39345038        .       CTGAACCATAATGTG C,CCCATAATGTG   60744.52        PASS    AA=23;AB=0.67143;ABA=23;ABP=20.878;ABR=47;AC=232,2;AF=0.19366,0.00167;AN=1198;BL=1607;BR=1843;BVAR;BaseQRankSum=30.955;DEL;DP=31490;DP4=1729,2100,265,278;Dels=0.13;EL=6;EPP=14.434;ER=17;FQ=999;FR;FS=1.767;HETAR=18;HOMA=0;HOMR=1015;HP=1;HPLen=2;HR=2;HRun=0;HU=C;INDEL;InbreedingCoeff=0.1991;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;LEN=14;LRB=0.068406;LRBP=38.066;MQ=104.60;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=189.83;MQRankSum=-16.579;NF;NR;NS=1033;PP;PV4=0.12,1,5.5e-137,1;RA=5286;RL=14;RPP=5.3706;RR=9;RUN=1;ReadPosRankSum=4.323;SAB=0.56522;SAF=13;SAP=3.86;SAR=10;SC=TGGGCTGGACCTGAACCATAA;SRB=0.46311;SRF=2448;SRP=65.493;SRR=2838;TC;TR=2;TU=C;VQSLOD=6.2643;dbSNP=130;set=Intersection;sumGLbyD=65.43
+20     39418008        .       AG      A       46796   PASS    AA=113;AB=0.9511;ABA=80;ABP=2894.6;ABR=1556;AC=30;AF=0.02412;AN=1244;BL=638;BR=6936;BVAR;BaseQRankSum=7.280;DEL;DP=14307;Dels=0.00;EL=50;EPP=6.2579;ER=63;FR;FS=5.707;HETAR=473;HOMA=361;HOMR=246;HP=3;HR=3;HRun=3;HU=G;InbreedingCoeff=0.0272;IndelType=DEL.NumRepetitions_3.EventLength_1.RepeatExpansion_G.;LEN=1;LRB=0.83153;LRBP=11375;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=62.398;MQRankSum=3.530;NF;NR;NS=1089;PP;RA=3000;RL=3;RPP=223.02;RR=110;RUN=1;ReadPosRankSum=-18.601;SAB=0.58407;SAF=66;SAP=9.9475;SAR=47;SC=ACTGGGGGAAAGGGATTCTAG;SRB=0.494;SRF=1482;SRP=3.9484;SRR=1518;TC;TR=3;TU=G;VQSLOD=4.5834;set=Intersection;sumGLbyD=3.06
+20     39876961        .       GT      G,GTT,GTTT      2302.10 PASS    ABR=496;AC=45,51,45;AF=0.03664,0.04153,0.03664;AN=1228;BVAR;BaseQRankSum=4.462;DP=37649;DP4=1457,1975,57,59;Dels=0.02;FR;FS=9.938;HOMA=0;HOMR=978;HP=10;HPLen=10;HR=10;HRun=10;HU=T;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.2583;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ=97.28;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=0.246;NF;NR;NS=1063;PP;PV4=0.15,1,1.9e-09,0.016;RA=5185;RUN=1;ReadPosRankSum=-4.954;SC=AGTTTCTCCGGTTTTTTTTTT;SRB=0.47464;SRF=2461;SRP=31.978;SRR=2724;TC;TR=10;TU=T;VQSLOD=4.9752;set=Intersection;sumGLbyD=4.39
+20     41013333        .       TC      T       20681   PASS    AA=137;AB=0.89211;ABA=134;ABP=1661.6;ABR=1108;AC=68;AF=0.05601;AN=1214;BL=1091;BR=8981;BVAR;BaseQRankSum=1.354;DEL;DP=12998;Dels=0.01;EL=57;EPP=11.395;ER=80;FS=0.758;HETAR=359;HOMA=100;HOMR=610;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0104;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_C.;LEN=1;LRB=0.78336;LRBP=13424;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0003;MQM=67.745;MQRankSum=2.563;NS=1072;RA=4447;RL=5;RPP=258.66;RR=132;RUN=1;ReadPosRankSum=-14.092;SAB=0.59124;SAF=81;SAP=12.917;SAR=56;SRB=0.54194;SRF=2410;SRP=70.947;SRR=2037;VQSLOD=3.7531;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=4.14
+20     41659532        .       GC      G       40544   PASS    AA=42;AB=0.97149;ABA=39;ABP=2644.5;ABR=1329;AC=15;AF=0.0209;AN=716;BL=2531;BR=135;BVAR;BaseQRankSum=-2.537;DEL;DP=12219;Dels=0.00;EL=25;EPP=6.3192;ER=17;FS=2.656;HETAR=374;HOMA=155;HOMR=551;HRun=1;InbreedingCoeff=-0.0270;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_C.;LEN=1;LRB=0.89872;LRBP=4678.9;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=103.31;MQRankSum=2.828;NS=1088;RA=4736;RL=41;RPP=85.733;RR=1;RUN=1;ReadPosRankSum=-9.702;SAB=0.57143;SAF=24;SAP=4.8716;SAR=18;SRB=0.5625;SRF=2664;SRP=163.7;SRR=2072;VQSLOD=4.3267;set=Intersection;sumGLbyD=3.22
+20     41845580        .       GA      G       49310   PASS    AA=83;AB=0.95258;ABA=69;ABP=2591.6;ABR=1386;AC=46;AF=0.03740;AN=1230;BL=1320;BR=5150;BVAR;BaseQRankSum=-1.121;DEL;DP=13336;Dels=0.00;EL=36;EPP=6.1759;ER=47;FR;FS=0.372;HETAR=442;HOMA=341;HOMR=295;HP=2;HR=3;HRun=1;HU=G;InbreedingCoeff=0.0238;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;LEN=1;LRB=0.59196;LRBP=4926.2;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=89.048;MQRankSum=0.897;NF;NR;NS=1080;PP;RA=3006;RL=5;RPP=142.43;RR=78;RUN=1;ReadPosRankSum=-15.412;SAB=0.55422;SAF=46;SAP=5.1294;SAR=37;SC=CCAGCTGTGGGAGAGAAACAT;SRB=0.47971;SRF=1442;SRP=13.762;SRR=1564;TC;TR=6;TU=AG;VQSLOD=4.4669;set=Intersection;sumGLbyD=3.65
+20     42209428        .       GC      G       13163   PASS    AA=89;AB=0.86677;ABA=83;ABP=730.96;ABR=540;AC=39;AF=0.03218;AN=1212;BL=950;BR=5334;BVAR;BaseQRankSum=-10.119;DEL;DP=10692;Dels=0.01;EL=48;EPP=4.2058;ER=41;FS=0.000;HETAR=259;HOMA=727;HOMR=54;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0448;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_C.;LEN=1;LRB=0.69764;LRBP=6644.4;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=126.55;MQRankSum=4.223;NS=1040;RA=723;RL=12;RPP=106.09;RR=77;RUN=1;ReadPosRankSum=-17.362;SAB=0.39326;SAF=35;SAP=11.818;SAR=54;SRB=0.37898;SRF=274;SRP=94.99;SRR=449;VQSLOD=3.7157;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.48
+20     42281109        .       T       TAG     2321.12 PASS    AC=181;AF=0.3740;AN=484;BaseQRankSum=8.977;DP=435;FS=17.001;HRun=0;HaplotypeScore=14.6734;InbreedingCoeff=0.2340;IndelType=INS.NOVEL_2.;MQ=53.88;MQ0=47;MQ0Fraction=0.1080;MQRankSum=0.762;QD=12.41;ReadPosRankSum=3.399;SB=-1299.73;VQSLOD=4.8926;set=VQSR
+20     42436117        .       TC      T       38933   PASS    AA=18;AB=0.98435;ABA=17;ABP=2215.9;ABR=1069;AC=15;AF=0.01223;AN=1226;BL=498;BR=428;BVAR;BaseQRankSum=-7.224;DEL;DP=12436;Dels=0.00;EL=1;EPP=33.893;ER=17;FS=2.469;HETAR=303;HOMA=614;HOMR=123;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0439;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_C.;LEN=1;LRB=0.075594;LRBP=14.501;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=98.611;MQRankSum=1.086;NS=1075;RA=1656;RL=10;RPP=3.4928;RR=8;RUN=1;ReadPosRankSum=-17.765;SAB=0.5;SAF=9;SAP=3.0103;SAR=9;SRB=0.49879;SRF=826;SRP=3.0313;SRR=830;VQSLOD=4.0821;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.04
+20     42682214        .       C       A,CAT   3904.51 PASS    AA=24;AB=0.6383;ABA=17;ABP=10.818;ABR=30;AC=0;AF=0.0000;AN=636;BL=1119;BR=949;BVAR;BaseQRankSum=1.426;DP=6509;Dels=0.00;EL=9;EPP=6.2675;ER=15;FR;HETAR=12;HOMA=3;HOMR=876;HP=2;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=A;INS;InbreedingCoeff=0.0006;IndelType=MIXED;LEN=2;LRB=0.082205;LRBP=33.356;MQ0Fraction=0.0046;MQM=40.792;MQRankSum=-0.296;NF;NR;NS=891;PP;QD=32.81;RA=2679;RL=15;RPP=6.2675;RR=9;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.806;SAB=0.75;SAF=18;SAP=16.039;SAR=6;SB=-924.23;SC=TATACACACACATATATATAC;SRB=0.66293;SRF=1776;SRP=620.76;SRR=903;TC;TR=9;TU=AC;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=32.75
+20     42973456        .       CA      C,CAA,CAAA      2675    PASS    AA=90;AB=0.79177;ABA=86;ABP=308.39;ABR=327;AC=77,61,39;AF=0.06492,0.05143,0.03288;AN=1186;BL=2983;BR=4446;BVAR;BaseQRankSum=2.422;DP=9416;Dels=0.03;EL=39;EPP=6.4847;ER=51;FR;FS=31.555;HETAR=75;HOMA=1;HOMR=888;HP=11;HR=11;HRun=11;HU=A;INS;InbreedingCoeff=0.2696;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;LEN=1;LRB=0.19693;LRBP=628.63;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=55.567;MQRankSum=1.777;NF;NR;NS=964;PP;RA=3601;RL=37;RPP=9.1869;RR=53;RUN=1;ReadPosRankSum=-4.991;SAB=0.55556;SAF=50;SAP=5.423;SAR=40;SC=TAGTGACTGTCAAAAAAAAAA;SRB=0.60622;SRF=2183;SRP=355.91;SRR=1418;TC;TR=11;TU=A;VQSLOD=1.0763;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=4.05
+20     43091870        .       TC      T       2455.60 PASS    AA=120;AB=0.10619;ABA=101;ABP=155.22;ABR=12;AC=42;AF=0.03825;AN=1098;BL=573;BR=8744;BVAR;BaseQRankSum=-13.513;DEL;DP=9139;Dels=0.00;EL=64;EPP=4.1684;ER=56;FS=9.856;HETAR=118;HOMA=820;HOMR=0;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0833;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_C.;LEN=1;LRB=0.877;LRBP=15564;MQ0Fraction=0.0017;MQM=45.1;MQRankSum=2.266;NS=938;RA=24;RL=1;RPP=254.97;RR=119;RUN=1;ReadPosRankSum=-15.803;SAB=0.475;SAF=57;SAP=3.6617;SAR=63;SRB=0.54167;SRF=13;SRP=3.3722;SRR=11;VQSLOD=3.9930;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.09
+20     43233648        rs74585029      GA      G,GAA   1504.40 PASS    AA=113;AB=0.78652;ABA=95;ABP=320.31;ABR=350;AC=41,65;AF=0.03394,0.05381;AF1=0.0115;AN=1208;BL=4677;BR=5548;BVAR;BaseQRankSum=6.744;CI95=0.004274,0.01852;DB;DEL;DP=13996;DP4=1736,1549,15,17;Dels=0.03;EL=69;EPP=15.021;ER=44;FQ=14;FR;FS=12.174;HETAR=119;HOMA=15;HOMR=892;HP=11;HPLen=10;HR=10;HRun=10;HU=A;INDEL;InbreedingCoeff=0.2359;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;LEN=1;LRB=0.085183;LRBP=164.12;MQ=89.12;MQ0Fraction=0.0000;MQM=69.867;MQRankSum=2.513;NF;NR;NS=1027;PP;PV4=0.59,1,0.065,0.33;RA=3845;RL=46;RPP=11.485;RR=67;RUN=1;ReadPosRankSum=-4.957;SAB=0.33628;SAF=38;SAP=29.318;SAR=75;SC=AAAACAGCCAGAAAAAAAAAA;SRB=0.43667;SRF=1679;SRP=136.95;SRR=2166;TC;TR=10;TU=A;VQSLOD=4.5121;set=Intersection;sumGLbyD=8.22
+20     43246548        .       AC      A,CC    41579.13        PASS    AA=382;AB=0.72402;ABA=316;ABP=502.11;ABR=829;AC=1197;AF=0.99254;AN=1206;BL=9889;BR=14293;BVAR;BaseQRankSum=1.373;DEL;DP=10477;DS;Dels=0.05;EL=243;EPP=64.494;ER=139;FS=29.162;HETAR=291;HOMA=85;HOMR=624;HPLen=10;InbreedingCoeff=0.1392;IndelType=MIXED;LEN=1;LRB=0.18212;LRBP=1744.6;MQ0Fraction=0.0024;MQM=48.471;MQRankSum=5.726;NS=1001;RA=3138;RL=174;RPP=9.5816;RR=208;RUN=1;ReadPosRankSum=5.755;SAB=0.79843;SAF=305;SAP=298.51;SAR=77;SRB=0.70363;SRF=2208;SRP=1133.2;SRR=930;VQSLOD=5.6318;set=Intersection;sumGLbyD=5.22
+20     43258646        .       T       TT      1107.17 PASS    AC=97;AF=0.08420;AN=1152;BaseQRankSum=4.525;DP=2345;FS=19.308;HRun=9;HaplotypeScore=13.6276;InbreedingCoeff=0.1299;IndelType=INS.NumRepetitions_10orMore.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;MQ=76.70;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=1.395;QD=2.67;ReadPosRankSum=-4.696;SB=-899.41;VQSLOD=5.4523;set=VQSR
+20     43718299        .       ATTACT  A       5497.06 PASS    AA=56;AB=0.51818;ABA=53;ABP=3.3262;ABR=57;AC=18;AF=0.0251;AF1=0.03729;AN=718;BL=2321;BR=2591;BVAR;BaseQRankSum=11.142;CI95=0.03319,0.04425;DEL;DP=17576;DP4=2460,2692,31,22;Dels=0.02;EL=28;EPP=3.0103;ER=28;FQ=999;FR;FS=9.689;HETAR=15;HOMA=1;HOMR=1068;HP=2;HPLen=2;HR=2;HRun=0;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=0.0448;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_5.;LEN=5;LRB=0.054967;LRBP=35.238;MQ=96.55;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=50.286;MQRankSum=-5.149;NF;NR;NS=1084;PP;PV4=0.13,1,1.2e-12,1;RA=6745;RL=28;RPP=3.0103;RR=28;RUN=1;ReadPosRankSum=0.828;SAB=0.5;SAF=28;SAP=3.0103;SAR=28;SC=ATGACAGTGGATTACTTTAGT;SRB=0.46835;SRF=3159;SRP=61.709;SRR=3586;TC;TR=2;TU=T;VQSLOD=7.8832;set=Intersection;sumGLbyD=46.60
+20     43981749        .       A       AAAAAAC,AC      20899.71        PASS    ABR=192;AC=91,0;AF=0.1285,0.0000;AN=708;BVAR;BaseQRankSum=7.858;DP=23372;DP4=1554,1457,55,42;Dels=0.00;FR;FS=0.000;HOMA=4;HOMR=995;HP=6;HPLen=7;HR=7;HRun=0;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.2109;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ=95.59;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-12.081;NF;NR;NS=1051;PP;PV4=0.35,1,8.9e-73,1;RA=5027;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.359;SC=TACACTAGCAAAAAAACAAAA;SRB=0.48518;SRF=2439;SRP=12.6;SRR=2588;TC;TR=7;TU=A;VQSLOD=8.0916;set=Intersection;sumGLbyD=54.33
+20     43999274        .       TCAAA   T       2948.85 PASS    AA=59;AB=0.59441;ABA=58;ABP=14.08;ABR=85;AC=20;AF=0.0290;AF1=0.04249;AN=690;BL=2277;BR=2436;BVAR;BaseQRankSum=9.320;CI95=0.0354,0.05088;DEL;DP=14599;DP4=2052,2303,21,22;Dels=0.03;EL=32;EPP=3.9304;ER=27;FQ=999;FR;FS=0.000;HETAR=21;HOMA=0;HOMR=1043;HP=2;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=C;INDEL;InbreedingCoeff=-0.0037;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_4.;LEN=4;LRB=0.033736;LRBP=14.658;MQ=90.05;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=75.339;MQRankSum=-1.294;NF;NR;NS=1064;PP;PV4=0.88,1,0.0026,1;RA=5732;RL=27;RPP=3.9304;RR=32;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.915;SAB=0.47458;SAF=28;SAP=3.3415;SAR=31;SC=GGTACACAGCTCAAACAGTCT;SRB=0.4836;SRF=2772;SRP=16.4;SRR=2960;TC;TR=1;TU=C;VQSLOD=9.8086;set=Intersection;sumGLbyD=27.09
+20     44098622        .       C       CG      1092.40 PASS    AA=129;AB=0.77301;ABA=74;ABP=214.06;ABR=252;AC=45;AF=0.0455;AN=988;BL=6586;BR=3029;BVAR;BaseQRankSum=2.802;DP=5177;Dels=0.00;EL=122;EPP=225.63;ER=7;FR;FS=355.273;HETAR=66;HOMA=11;HOMR=734;HP=6;HR=4;HRun=4;HU=G;INS;InbreedingCoeff=0.1759;IndelType=INS.NumRepetitions_4.EventLength_1.RepeatExpansion_G.;LEN=1;LRB=0.36994;LRBP=2860.4;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=52.395;MQRankSum=1.946;NF;NR;NS=811;PP;RA=1981;RL=121;RPP=217.95;RR=8;RUN=1;ReadPosRankSum=-6.413;SAB=0.99225;SAF=128;SAP=274.51;SAR=1;SC=GCGGAAGTGGCGGGGACCCTT;SRB=0.41242;SRF=817;SRP=135;SRR=1164;TC;TR=4;TU=G;VQSLOD=-2.2690;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=4.04
+20     44327637        .       A       AG,AGGGGGG      14351.23        PASS    AC=9,211;AF=0.0103,0.2409;AN=876;BaseQRankSum=15.517;DP=1704;FS=6.768;HaplotypeScore=31.5906;InbreedingCoeff=0.1538;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ=54.64;MQ0=4;MQ0Fraction=0.0023;MQRankSum=-12.691;QD=20.83;ReadPosRankSum=-3.583;SB=-6278.99;VQSLOD=5.1556;set=VQSR
+20     45202636        .       GA      G       13269   PASS    AA=25;AB=0.96162;ABA=18;ABP=871.09;ABR=451;AC=24;AF=0.02013;AN=1192;BL=567;BR=1728;BVAR;BaseQRankSum=-5.361;DEL;DP=10873;Dels=0.00;EL=10;EPP=5.1818;ER=15;FS=0.928;HETAR=169;HOMA=831;HOMR=45;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0999;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;LEN=1;LRB=0.50588;LRBP=1278.4;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=170.56;MQRankSum=0.161;NS=1049;RA=632;RL=2;RPP=41.315;RR=23;RUN=1;ReadPosRankSum=-14.760;SAB=0.68;SAF=17;SAP=10.046;SAR=8;SRB=0.51424;SRF=325;SRP=4.1235;SRR=307;VQSLOD=3.9290;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.90
+20     45417828        .       TGAGC   T,TGC   4672.90 PASS    ABR=317;AC=69,104;AF=0.05712,0.08609;BVAR;BaseQRankSum=18.527;DEL;DP=11835;DS;FS=184.873;HOMA=48;HOMR=575;HaplotypeScore=65.5875;InbreedingCoeff=0.0599;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ=29.78;MQ0=2988;MQ0Fraction=0.3629;MQRankSum=5.052;NS=713;QD=1.11;RA=1581;RUN=1;ReadPosRankSum=6.574;SB=-2116.87;SRB=0.47502;SRF=751;SRP=11.582;SRR=830;VQSLOD=0.0651;set=filterInVQSR-2of5
+20     45525657        rs66759083      TA      AA,T    49315   PASS    AA=2361;AB=0.45241;ABA=1398;ABP=53.235;ABR=1155;AC=20;AF=0.01701;AN=1176;BL=94913;BR=100886;BVAR;BaseQRankSum=0.740;DB;DEL;DP=30636;DP4=1258,881,1206,999;Dels=0.48;EL=1133;EPP=11.311;ER=1228;FQ=999;FR;FS=7.072;HETAR=503;HOMA=310;HOMR=218;HP=6;HPLen=7;HR=7;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=0.2271;IndelType=MIXED;LEN=1;LRB=0.030506;LRBP=398.68;MQ=102.24;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=75.359;MQRankSum=0.148;NF;NR;NS=1031;PP;PV4=0.0064,0,4.6e-23,0.47;RA=2042;RL=1183;RPP=3.0333;RR=1178;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.999;SAB=0.52139;SAF=1231;SAP=12.392;SAR=1130;SC=AGGATTTTTTTAAAAAGTTTT;SRB=0.55093;SRF=1125;SRP=49.017;SRR=917;TC;TR=7;TU=T;VQSLOD=7.1651;dbSNP=114;set=Intersection;sumGLbyD=18.51
+20     45783456        .       T       TG      2355.68 PASS    AA=64;AB=0.78521;ABA=61;ABP=203.67;ABR=223;AC=15;AF=0.0165;AN=910;BL=815;BR=5486;BVAR;BaseQRankSum=8.593;DP=10348;Dels=0.00;EL=48;EPP=37.754;ER=16;FS=77.861;HETAR=56;HOMA=1;HOMR=970;HRun=1;INS;InbreedingCoeff=-0.0549;IndelType=INS.NOVEL_1.Novel_G.;LEN=1;LRB=0.74131;LRBP=7522.1;MQ0Fraction=0.0122;MQM=44.562;MQRankSum=-1.258;NS=1027;RA=4750;RL=0;RPP=141.98;RR=64;RUN=1;ReadPosRankSum=-7.047;SAB=0.25;SAF=16;SAP=37.754;SAR=48;SRB=0.6;SRF=2850;SRP=415.59;SRR=1900;VQSLOD=1.3146;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=6.03
+20     46517110        .       C       CT      868.55  PASS    AC=15;AF=0.0218;AN=688;BaseQRankSum=8.522;DP=1752;FS=6.570;HRun=0;HaplotypeScore=14.9548;InbreedingCoeff=0.0452;IndelType=INS.NOVEL_1.Novel_T.;MQ=77.73;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=3.874;QD=10.98;ReadPosRankSum=-0.733;SB=-396.78;VQSLOD=6.7740;set=VQSR
+20     46629361        .       TTTCTTTC        T,TTTTC 13000.91        PASS    AC=188,107;AF=0.2212,0.1259;AN=850;BaseQRankSum=7.214;DP=1846;FS=14.502;HaplotypeScore=40.8481;InbreedingCoeff=0.3210;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ=50.74;MQ0=79;MQ0Fraction=0.0428;MQRankSum=-6.348;QD=13.59;ReadPosRankSum=3.943;SB=-3581.20;VQSLOD=5.9412;set=VQSR
+20     46951099        .       G       GT      1662.30 PASS    AA=55;AB=0.7713;ABA=51;ABP=145.58;ABR=172;AC=47;AF=0.03923;AN=1198;BL=3288;BR=2434;BVAR;BaseQRankSum=-4.014;DP=27423;DP4=1483,1590,58,42;Dels=0.01;EL=21;EPP=9.6826;ER=34;FR;FS=9.565;HETAR=48;HOMA=0;HOMR=913;HP=16;HPLen=10;HR=10;HRun=10;HU=T;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0952;IndelType=INS.NumRepetitions_10orMore.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;LEN=1;LRB=0.14925;LRBP=279.78;MQ=70.36;MQ0Fraction=0.0124;MQM=52.545;MQRankSum=0.717;NF;NR;NS=961;PP;PV4=0.067,1,1,0.17;RA=3035;RL=38;RPP=20.422;RR=17;RUN=1;ReadPosRankSum=-3.014;SAB=0.47273;SAF=26;SAP=3.3656;SAR=29;SC=TTTGTTTTTTGTTTTTTTTTT;SRB=0.36013;SRF=1093;SRP=518.73;SRR=1942;TC;TR=10;TU=T;VQSLOD=5.4779;set=Intersection;sumGLbyD=3.49
+20     47201076        rs58052846      C       CT      982.16  PASS    AC=50;AF=0.0551;AN=908;BaseQRankSum=12.598;DB;DP=2449;FS=35.648;HRun=0;HaplotypeScore=29.4602;InbreedingCoeff=-0.0542;IndelType=INS.NOVEL_1.Novel_T.;MQ=63.54;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=2.196;QD=3.16;ReadPosRankSum=-13.833;SB=-488.19;VQSLOD=6.0429;set=VQSR
+20     47965974        rs60011158      G       GA      999     PASS    AA=21;AB=0.57143;ABA=21;ABP=5.1818;ABR=28;AC=7;AF=0.0101;AF1=0.02061;AN=690;BL=1043;BR=577;BVAR;BaseQRankSum=-3.087;CI95=0.01549,0.02655;DB;DP=14578;DP4=1554,3055,6,17;Dels=0.00;EL=11;EPP=3.1137;ER=10;FQ=999;FR;FS=5.982;HETAR=7;HOMA=0;HOMR=1041;HP=2;HPLen=1;HR=1;HRun=1;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0356;IndelType=INS.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;LEN=1;LRB=0.28765;LRBP=294.09;MQ=80.17;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=64.19;MQRankSum=2.137;NF;NR;NS=1048;PP;PV4=0.51,1,1,1;RA=5224;RL=16;RPP=15.522;RR=5;RUN=1;ReadPosRankSum=0.236;SAB=0.38095;SAF=8;SAP=5.5954;SAR=13;SC=TTCATGTACAGAGCTGCTGTG;SRB=0.31183;SRF=1629;SRP=1609.6;SRR=3595;TC;TR=4;TU=AG;VQSLOD=9.5466;dbSNP=129;set=Intersection;sumGLbyD=13.83
+20     48402974        rs57331436      GA      G       27741   PASS    AA=401;AB=0.5372;ABA=311;ABP=11.089;ABR=361;AC=84;AF=0.1186;AN=708;BL=16591;BR=14776;BVAR;BaseQRankSum=14.621;DB;DEL;DP=30607;DP4=1928,2310,195,225;Dels=0.11;EL=189;EPP=5.8749;ER=212;FQ=999;FR;FS=15.568;HETAR=110;HOMA=30;HOMR=923;HP=4;HPLen=3;HR=1;HRun=3;HU=A;INDEL;InbreedingCoeff=0.1263;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;KGPilot123;LEN=1;LRB=0.057863;LRBP=231.06;MQ=106.68;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=63.005;MQRankSum=-2.010;NF;NR;NS=1063;PP;PV4=0.72,1,0.001,1;RA=5258;RL=223;RPP=13.976;RR=178;RUN=1;ReadPosRankSum=1.337;SAB=0.37656;SAF=151;SAP=56.084;SAR=250;SC=TGCCCTCAAAGAGAAAAAGGA;SRB=0.38075;SRF=2002;SRP=652.44;SRR=3256;TC;TR=5;TU=AG;VQSLOD=8.7259;dbSNP=132;set=Intersection;sumGLbyD=15.86
+20     49101936        .       C       CT      404.46  PASS    AC=40;AF=0.03559;AN=1124;BaseQRankSum=0.750;DP=2162;FS=14.291;HRun=2;HaplotypeScore=30.9513;InbreedingCoeff=-0.0082;IndelType=INS.NumRepetitions_2.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;MQ=49.78;MQ0=113;MQ0Fraction=0.0523;MQRankSum=-1.289;QD=1.94;ReadPosRankSum=-2.041;SB=-385.48;VQSLOD=4.6365;set=VQSR
+20     49731218        .       ATTTTATTTTTTATT A,ATTTTATT      8398.93 PASS    AF=0.0656,0.0156;AF1=0.0996;BaseQRankSum=13.996;CI95=0.07743,0.1239;DP=6308;DP4=951,1311,23,35;Dels=0.05;FQ=999;FR;FS=12.503;HP=7;HPLen=4;HR=4;HRun=0;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=0.1892;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ=57.61;MQ0Fraction=0.0145;MQRankSum=-5.208;NF;NR;PP;PV4=0.79,1,6.3e-06,0.16;ReadPosRankSum=-2.239;SC=TATTTTATTTATTTTATTTTT;TC;TR=11;TU=ATTT;VQSLOD=4.3191;set=Intersection;sumGLbyD=42.27
+20     49894989        .       TA      T       172.25  PASS    AF=0.0140;BaseQRankSum=7.220;DP=3882;Dels=0.00;FS=17.217;HPLen=2;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0531;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;MQ0Fraction=0.0214;MQRankSum=-0.661;ReadPosRankSum=-0.592;VQSLOD=3.0905;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=6.60
+20     50010923        rs66516522      C       CT,CTGG 35851   PASS    ABR=555;AC=310,11;AF=0.26451,0.00939;BVAR;BaseQRankSum=10.662;DB;DP=8188;FR;FS=34.411;HOMA=261;HOMR=399;HP=5;HR=6;HU=C;HaplotypeScore=45.1715;INS;InbreedingCoeff=0.2090;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ=72.80;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=9.015;NF;NR;NS=831;PP;QD=9.69;RA=1986;RUN=1;ReadPosRankSum=-24.284;SB=-6038.55;SC=TGTCTGTCCCCCCTCAGCACT;SRB=0.45972;SRF=913;SRP=31.001;SRR=1073;TC;TR=6;TU=C;VQSLOD=6.1824;set=Intersection
+20     50228709        rs71192536      TG      T       20517   PASS    AA=924;AB=0.50203;ABA=735;ABP=3.0633;ABR=741;AC=200;AF=0.16502;AN=1212;BL=35460;BR=34197;BVAR;BaseQRankSum=13.810;DB;DEL;DP=32402;DP4=1760,2065,395,449;Dels=0.16;EL=439;EPP=7.9831;ER=485;FQ=999;FR;FS=0.558;HETAR=242;HOMA=63;HOMR=764;HP=5;HPLen=3;HR=3;HRun=3;HU=G;INDEL;InbreedingCoeff=0.1050;IndelType=DEL.NumRepetitions_3.EventLength_1.RepeatExpansion_G.;LEN=1;LRB=0.018132;LRBP=52.738;MQ=105.83;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=75.87;MQRankSum=3.895;NF;NR;NS=1069;PP;PV4=0.7,1.5e-173,1,1;RA=4708;RL=486;RPP=8.4249;RR=438;RUN=1;ReadPosRankSum=1.586;SAB=0.43615;SAF=403;SAP=35.733;SAR=521;SC=GTTTTCCAGGTGGGAAGACCG;SRB=0.44074;SRF=2075;SRP=146.62;SRR=2633;TC;TR=3;TU=G;VQSLOD=10.4820;dbSNP=120;set=Intersection;sumGLbyD=15.35
+20     50236115        .       AGG     A,ACGGG,AG,AGGG 7429.57 PASS    AC=192,13,221,183;AF=0.2115,0.0143,0.2434,0.2015;AN=908;BaseQRankSum=1.045;DP=1177;FS=13.479;HaplotypeScore=11.8294;InbreedingCoeff=0.7959;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ=52.98;MQ0=6;MQ0Fraction=0.0051;MQRankSum=-1.482;QD=7.28;ReadPosRankSum=-2.380;SB=-1229.31;VQSLOD=8.3762;set=VQSR
+20     51589568        .       TAAAC   AAAAC,T 12477.52        PASS    AF=0.27949;BaseQRankSum=-28.122;DP=3777;Dels=0.00;FR;FS=31.799;HP=7;HPLen=4;HR=3;HRun=0;HU=A;InbreedingCoeff=-0.1429;IndelType=MIXED;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-1.196;NF;NR;PP;ReadPosRankSum=-16.483;SC=AAATTCAAAATAAACAAACAA;TC;TR=18;TU=AAAC;VQSLOD=3.9201;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=52.43
+20     51617742        .       TGC     T,TGCGC 1374.91 PASS    AF=0.06000,0.02000;BaseQRankSum=12.051;DP=6231;Dels=0.00;FS=189.609;HPLen=1;HRun=0;InbreedingCoeff=0.0862;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ0Fraction=0.0180;MQRankSum=-2.959;ReadPosRankSum=-5.090;VQSLOD=-2.8715;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.97
+20     51770354        .       AG      A       1010.90 PASS    AA=26;AB=0.52727;ABA=26;ABP=3.3656;ABR=29;AC=7;AF=0.0097;AF1=0.01637;AN=718;BL=1034;BR=964;BVAR;BaseQRankSum=5.588;CI95=0.01327,0.02212;DEL;DP=16259;DP4=2785,2239,15,10;Dels=0.01;EL=11;EPP=4.3466;ER=15;FQ=999;FR;FS=3.367;HETAR=8;HOMA=0;HOMR=1064;HP=2;HPLen=2;HR=2;HRun=2;HU=G;INDEL;InbreedingCoeff=0.0557;IndelType=DEL.NumRepetitions_2.EventLength_1.RepeatExpansion_G.;LEN=1;LRB=0.035035;LRBP=8.3357;MQ=90.48;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=61.346;MQRankSum=-0.019;NF;NR;NS=1072;PP;PV4=0.69,2.1e-08,0.078,1;RA=6173;RL=13;RPP=3.0103;RR=13;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.460;SAB=0.61538;SAF=16;SAP=6.017;SAR=10;SC=GTGGTCCTGCAGGTCAATAAT;SRB=0.56342;SRF=3478;SRP=218.68;SRR=2695;TC;TR=2;TU=G;VQSLOD=10.1601;set=Intersection;sumGLbyD=14.60
+20     51848430        .       AT      A,ATT   999     PASS    AA=39;AB=0.83408;ABA=37;ABP=219.19;ABR=186;AC=14,33;AF=0.0153,0.0359;AF1=0.03062;AN=918;BL=1676;BR=1732;BVAR;BaseQRankSum=3.338;CI95=0.02212,0.03982;DP=14886;DP4=1970,1762,22,31;Dels=0.01;EL=18;EPP=3.5114;ER=21;FQ=999;FR;FS=3.004;HETAR=31;HOMA=0;HOMR=1040;HP=10;HPLen=9;HR=9;HRun=9;HU=T;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.1629;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;LEN=1;LRB=0.016432;LRBP=5.0085;MQ=80.05;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=56.667;MQRankSum=0.325;NF;NR;NS=1071;PP;PV4=0.13,1,0.0095,0.064;RA=5318;RL=21;RPP=3.5114;RR=18;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.493;SAB=0.46154;SAF=18;SAP=3.5114;SAR=21;SC=ACAAAACAATATTTTTTTTTC;SRB=0.4968;SRF=2642;SRP=3.4823;SRR=2676;TC;TR=9;TU=T;VQSLOD=5.7417;set=Intersection;sumGLbyD=7.57
+20     51897203        .       T       TG      8427.20 PASS    AA=237;AB=0.69846;ABA=215;ABP=246.92;ABR=498;AC=117;AF=0.1662;AN=704;BL=14961;BR=5990;BVAR;BaseQRankSum=22.203;DP=9710;Dels=0.00;EL=83;EPP=49.198;ER=154;FR;FS=9.450;HETAR=123;HOMA=9;HOMR=895;HP=5;HPLen=6;HR=6;HRun=0;HU=T;INS;InbreedingCoeff=-0.0513;IndelType=INS.NOVEL_1.Novel_G.;LEN=1;LRB=0.42819;LRBP=8344.3;MQ0Fraction=0.0291;MQM=45.861;MQRankSum=-10.426;NF;NR;NS=1027;PP;RA=4919;RL=210;RPP=309.85;RR=27;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.843;SAB=0.29536;SAF=70;SAP=89.219;SAR=167;SC=TTTGTTTGTTTTTTGTTGTTG;SRB=0.47794;SRF=2351;SRP=23.798;SRR=2568;TC;TR=23;TU=GTTT;VQSLOD=6.2670;set=Intersection;sumGLbyD=8.99
+20     52274070        .       AAG     A       1400.37 PASS    AA=30;AB=0.74227;ABA=25;ABP=52.462;ABR=72;AC=21;AF=0.01756;AN=1196;BL=412;BR=1966;BVAR;BaseQRankSum=6.660;DEL;DP=9362;Dels=0.01;EL=16;EPP=3.2998;ER=14;FS=1.485;HETAR=18;HOMA=2;HOMR=1004;HRun=0;InbreedingCoeff=0.0317;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_2.RepeatExpansion_AG.;LEN=2;LRB=0.65349;LRBP=2208.2;MQ0Fraction=0.0022;MQM=46.133;MQRankSum=-4.743;NS=1024;RA=3931;RL=2;RPP=51.941;RR=28;RUN=1;ReadPosRankSum=-4.152;SAB=0.4;SAF=12;SAP=5.6161;SAR=18;SRB=0.49784;SRF=1957;SRP=3.1699;SRR=1974;VQSLOD=5.6452;set=Intersection;sumGLbyD=11.11
+20     52351501        .       TAC     T       199.59  PASS    AC=22;AF=0.0238;AN=926;BaseQRankSum=7.874;DP=22911;DP4=2146,1691,26,22;FR;FS=2.898;HP=4;HPLen=3;HR=1;HRun=0;HU=A;HaplotypeScore=18.6111;INDEL;InbreedingCoeff=-0.0326;IndelType=DEL.NumRepetitions_6.EventLength_2.RepeatExpansion_AC.;MQ0=2;MQ0Fraction=0.0007;MQRankSum=1.011;NF;NR;PP;PV4=0.88,0.14,0.16,0.24;QD=1.10;ReadPosRankSum=-1.053;SB=-306.09;SC=GACACACAAATACACACACAC;TC;TR=13;TU=AC;VQSLOD=4.0486;set=filterInVQSR-2of5
+20     52447173        .       CA      C       503.89  PASS    AC=23;AF=0.01891;AN=1216;BaseQRankSum=0.801;DP=3266;FS=2.606;HRun=2;HaplotypeScore=22.1543;InbreedingCoeff=-0.0097;IndelType=DEL.NumRepetitions_2.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;MQ=118.02;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-1.309;QD=2.65;ReadPosRankSum=-7.872;SB=-279.27;VQSLOD=4.1900;set=VQSR
+20     52498650        .       GT      G       24069   PASS    AA=74;AB=0.90594;ABA=57;ABP=870.4;ABR=549;AC=28;AF=0.02333;AN=1200;BL=505;BR=4514;BVAR;BaseQRankSum=-3.837;DEL;DP=9798;Dels=0.01;EL=41;EPP=4.8883;ER=33;FS=4.085;HETAR=209;HOMA=663;HOMR=121;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0334;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;LEN=1;LRB=0.79876;LRBP=6956.6;MQ0=2;MQ0Fraction=0.0007;MQM=57.784;MQRankSum=-2.951;NS=995;RA=957;RL=8;RPP=101.72;RR=66;RUN=1;ReadPosRankSum=-14.806;SAB=0.39189;SAF=29;SAP=10.522;SAR=45;SRB=0.39916;SRF=382;SRP=87.53;SRR=575;VQSLOD=3.8710;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=2.90
+20     52823602        rs11469056      CAAA    C,CA,CAA,CAAAA,CAAAAA,CAAAAAA,CAAAAAAA,CAAAAAAAA,CAAAAAAAAA,CAAAAAAAAAA 14515.17        PASS    AC=24,83,246,109,83,19,10,16,22,59;AF=0.02128,0.07358,0.21809,0.09663,0.07358,0.01684,0.00887,0.01418,0.01950,0.05230;AN=1128;BVAR;BaseQRankSum=4.150;DB;DEL;DP=28279;FR;FS=2.021;HP=17;HR=17;HU=A;HaplotypeScore=27.8032;INS;InbreedingCoeff=0.7740;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ=69.00;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=1.418;NF;NR;PP;QD=7.90;RUN=1;ReadPosRankSum=-3.864;SB=-3244.40;SC=GGTCCTAAGGCAAAAAAAAAA;TC;TR=17;TU=A;VQSLOD=14.1033;set=Intersection
+20     53308906        .       CT      C,CTT   2276    PASS    AA=92;AB=0.84453;ABA=81;ABP=540.17;ABR=440;AC=53,81;AF=0.04351,0.06650;AN=1218;BL=3561;BR=4796;BVAR;BaseQRankSum=3.000;DP=11804;Dels=0.02;EL=48;EPP=3.3879;ER=44;FR;FS=13.197;HETAR=69;HOMA=3;HOMR=993;HP=11;HR=10;HRun=10;HU=T;INS;InbreedingCoeff=0.2297;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;LEN=1;LRB=0.14778;LRBP=399.32;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0003;MQM=56.348;MQRankSum=3.154;NF;NR;NS=1065;PP;RA=5520;RL=39;RPP=7.6365;RR=53;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.140;SAB=0.57609;SAF=53;SAP=7.6365;SAR=39;SC=AATCCAAAGTCTTTTTTTTTT;SRB=0.51576;SRF=2847;SRP=14.92;SRR=2673;TC;TR=10;TU=T;VQSLOD=2.4753;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=4.42
+20     53334602        .       T       TG,TGG  905.13  PASS    ABR=325;AC=44,22;AF=0.03624,0.01812;BVAR;BaseQRankSum=-4.608;DP=15015;FR;FS=494.901;HOMA=0;HOMR=1004;HP=1;HR=1;HU=G;HaplotypeScore=20.5023;INS;InbreedingCoeff=0.0799;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ=116.70;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=8.022;NF;NR;NS=1064;PP;QD=0.35;RA=5690;RUN=1;ReadPosRankSum=-14.522;SB=-311.57;SC=AGCCATTGGCTGTTTCACTGA;SRB=0.40738;SRF=2318;SRP=426.97;SRR=3372;TC;TR=1;TU=G;VQSLOD=-2.3042;set=filterInVQSR-2of5
+20     53729115        .       T       TG      15.48   PASS    AC=1;AF=0.0015;AN=668;BaseQRankSum=-1.001;DP=1711;FS=9.048;HRun=2;HaplotypeScore=12.4681;InbreedingCoeff=-0.0320;IndelType=INS.NumRepetitions_2.EventLength_1.RepeatExpansion_G.;MQ=131.36;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=0.193;QD=4.57;ReadPosRankSum=0.407;SB=-5.35;VQSLOD=4.8071;set=VQSR
+20     54033830        .       GTATTTTAAAATCA  G       2220.86 PASS    AF=0.0113;BaseQRankSum=5.506;DP=2577;Dels=0.01;FR;FS=6.533;HP=5;HPLen=4;HR=1;HRun=0;HU=T;InbreedingCoeff=0.0032;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_10orMore.;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-2.969;NF;NR;PP;ReadPosRankSum=1.322;SC=TCAATATTTTGTATTTTAAAA;TC;TR=1;TU=T;VQSLOD=5.5145;set=Intersection;sumGLbyD=95.65
+20     54375236        .       GT      G       626.13  PASS    AA=40;AB=0.63551;ABA=39;ABP=20.078;ABR=68;AC=18;AF=0.0256;AN=702;BL=1331;BR=1743;BVAR;BaseQRankSum=9.346;DEL;DP=8568;Dels=0.02;EL=26;EPP=10.828;ER=14;FS=0.610;HETAR=21;HOMA=1;HOMR=1035;HRun=1;InbreedingCoeff=-0.0056;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;LEN=1;LRB=0.13403;LRBP=122.92;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=67.125;MQRankSum=-2.537;NS=1058;RA=4870;RL=17;RPP=4.9646;RR=23;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.229;SAB=0.525;SAF=21;SAP=3.2274;SAR=19;SRB=0.5271;SRF=2567;SRP=34.087;SRR=2303;VQSLOD=7.9228;set=Intersection;sumGLbyD=10.77
+20     54457331        .       G       GA      1793.40 PASS    AA=77;AB=0.66667;ABA=74;ABP=56.573;ABR=148;AC=33;AF=0.02687;AN=1228;BL=3834;BR=1154;BVAR;BaseQRankSum=10.572;DP=10230;Dels=0.00;EL=77;EPP=170.21;ER=0;FS=139.433;HETAR=44;HOMA=1;HOMR=1001;HRun=1;INS;InbreedingCoeff=0.0023;IndelType=INS.NOVEL_1.Novel_A.;LEN=1;LRB=0.53729;LRBP=3129.8;MQ0Fraction=0.0095;MQM=4.7013;MQRankSum=-8.116;NS=1046;RA=4009;RL=77;RPP=170.21;RR=0;RUN=1;ReadPosRankSum=-6.026;SAB=1;SAF=77;SAP=170.21;SAR=0;SRB=0.57022;SRF=2286;SRP=174.7;SRR=1723;VQSLOD=1.1887;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=5.90
+20     54469810        .       CA      C       1697.62 PASS    AA=93;AB=0.63855;ABA=90;ABP=44.53;ABR=159;AC=34;AF=0.0374;AF1=0.01719;AN=908;BL=3242;BR=5839;BVAR;BaseQRankSum=10.425;CI95=0.009317,0.02795;DEL;DP=15197;DP4=2134,1896,56,46;Dels=0.03;EL=34;EPP=17.604;ER=59;FQ=16;FR;FS=9.985;HETAR=41;HOMA=1;HOMR=1011;HP=9;HPLen=8;HR=8;HRun=8;HU=A;INDEL;InbreedingCoeff=-0.0472;IndelType=DEL.NumRepetitions_8.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;LEN=1;LRB=0.28598;LRBP=1615.8;MQ=83.37;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0004;MQM=64.075;MQRankSum=3.036;NF;NR;NS=1053;PP;PV4=0.76,1,0.31,0.22;RA=5150;RL=28;RPP=34.975;RR=65;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.252;SAB=0.5914;SAF=55;SAP=9.7582;SAR=38;SC=ATTGCTAAGACAAAAAAAAGA;SRB=0.50621;SRF=2607;SRP=4.7374;SRR=2543;TC;TR=8;TU=A;VQSLOD=8.3677;set=Intersection;sumGLbyD=9.90
+20     54542453        .       GTATA   G,GTA   5109.66 PASS    ABR=112;AC=66,56;AF=0.0682,0.0579;AN=968;BVAR;BaseQRankSum=17.089;DB;DEL;DP=5519;DS;Dels=0.06;FS=99.502;HOMA=15;HOMR=409;HRun=0;InbreedingCoeff=0.1584;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ0Fraction=0.0178;MQRankSum=-6.854;NS=460;RA=864;RUN=1;ReadPosRankSum=0.855;SRB=0.79282;SRF=685;SRP=646.5;SRR=179;VQSLOD=0.6375;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=8.53
+20     54629773        .       CA      C       1799.50 PASS    AA=49;AB=0.82707;ABA=46;ABP=250.17;ABR=220;AC=9;AF=0.00746;AN=1206;BL=173;BR=2277;BVAR;BaseQRankSum=5.240;DEL;DP=8557;Dels=0.01;EL=49;EPP=109.41;ER=0;FS=32.359;HETAR=35;HOMA=1;HOMR=325;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0892;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;LEN=1;LRB=0.85878;LRBP=3926.6;MQ0Fraction=0.0602;MQM=32.163;MQRankSum=-3.926;NS=361;RA=1091;RL=0;RPP=109.41;RR=49;RUN=1;ReadPosRankSum=-4.512;SAB=0;SAF=0;SAP=109.41;SAR=49;SRB=0.49404;SRF=539;SRP=3.3467;SRR=552;VQSLOD=1.1233;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.54
+20     54710245        .       TA      T       999     PASS    AF=0.0084;AF1=0.0148;BaseQRankSum=3.954;CI95=0.00885,0.02212;DP=8043;DP4=2000,1849,10,7;Dels=0.01;FQ=999;FR;FS=0.000;HP=9;HPLen=6;HR=3;HRun=6;HU=A;INDEL;InbreedingCoeff=0.1181;IndelType=DEL.NumRepetitions_3.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;MQ=78.51;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=0.095;NF;NR;PP;PV4=0.63,0.00056,1,1;ReadPosRankSum=-0.448;SC=CAACAAAAAATAAATAAATAA;TC;TR=15;TU=AAAT;VQSLOD=7.8129;set=Intersection;sumGLbyD=19.02
+20     54968173        .       A       AAT,AATAT,AT,ATAT       89535.82        PASS    ABR=994;AC=561,278,2,3;AF=0.50179,0.24866,0.00179,0.00268;AN=1118;BVAR;BaseQRankSum=-2.699;DB;DP=27837;DP4=168,177,1045,866;Dels=0.00;FQ=999;FR;FS=12.472;HOMA=71;HOMR=455;HP=3;HPLen=4;HR=4;HRun=0;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.6391;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;KGPilot123;MQ=80.36;MQ0Fraction=0.0055;MQRankSum=-1.512;NF;NR;NS=913;PP;PV4=0.046,1,1,1;RA=2015;RUN=1;ReadPosRankSum=1.015;SC=GGCCACTTAAAATATATATAT;SRB=0.44864;SRF=904;SRP=49.187;SRR=1111;TC;TR=15;TU=AT;VQSLOD=9.0092;dbSNP=132;set=Intersection;sumGLbyD=42.33
+20     55176688        .       TA      T       421.84  PASS    AF=0.01322;AF1=0.01845;BaseQRankSum=5.383;CI95=0.01282,0.02564;DP=10531;DP4=1975,2017,16,14;Dels=0.01;FQ=91.2;FR;FS=7.401;HP=6;HPLen=5;HR=5;HRun=5;HU=A;INDEL;InbreedingCoeff=0.0829;IndelType=DEL.NumRepetitions_5.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;MQ=75.80;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0003;MQRankSum=-0.471;NF;NR;PP;PV4=0.72,1,1,1;ReadPosRankSum=0.223;SC=CTGCAAAATATAAAAATTAGG;TC;TR=5;TU=A;VQSLOD=6.6000;set=Intersection;sumGLbyD=12.15
+20     55664086        .       GTT     ATT,G,GT,GTTT   5622.44 PASS    AC=6,71,136;AF=0.00498,0.05887,0.11277;AN=1206;BVAR;BaseQRankSum=3.173;DB;DEL;DP=40384;DP4=1567,1317,54,29;Dels=0.05;FR;FS=1.949;HP=14;HR=11;HRun=11;HU=T;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.3490;IndelType=MIXED;MQ=77.90;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=0.052;NF;NR;PP;PV4=0.057,1,0.2,1.2e-05;RUN=1;ReadPosRankSum=-13.646;SC=AATTTTATTTGTTTTTTTTTT;TC;TR=11;TU=T;VQSLOD=11.7964;set=Intersection;sumGLbyD=8.09
+20     56045006        .       TG      T       342.15  PASS    AC=72;AF=0.0940;AN=766;BaseQRankSum=4.992;DP=1238;FS=1.460;HRun=7;HaplotypeScore=20.2784;InbreedingCoeff=0.1795;IndelType=DEL.NumRepetitions_7.EventLength_1.RepeatExpansion_G.;MQ=66.42;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0008;MQRankSum=-0.937;QD=1.84;ReadPosRankSum=-4.385;SB=-320.83;VQSLOD=5.2383;set=VQSR
+20     56158711        .       AG      A       922.47  PASS    AA=18;AB=0.575;ABA=17;ABP=4.9646;ABR=23;AC=2;AF=0.0028;AN=714;BL=953;BR=808;BVAR;BaseQRankSum=3.129;DEL;DP=10462;Dels=0.01;EL=9;EPP=3.0103;ER=9;FR;FS=8.724;HETAR=4;HOMA=0;HOMR=1058;HP=1;HPLen=2;HR=2;HRun=1;HU=A;InbreedingCoeff=0.0262;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_G.;LEN=1;LRB=0.08234;LRBP=28.936;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=55.889;MQRankSum=2.052;NF;NR;NS=1062;PP;RA=6300;RL=9;RPP=3.0103;RR=9;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.317;SAB=0.66667;SAF=12;SAP=7.3532;SAR=6;SC=TGGCCTAGCAAGCATCGTGAC;SRB=0.48143;SRF=3033;SRP=21.883;SRR=3267;TC;TR=8;TU=AAGC;VQSLOD=8.3252;set=Intersection;sumGLbyD=13.22
+20     56258618        rs113670927     T       C,TGC,TGTGC,TGTGTGC     37834.99        PASS    ABR=441;AC=11,100,43;AF=0.0123,0.1119,0.0481;AN=894;BVAR;BaseQRankSum=19.514;DB;DP=23173;DP4=541,920,413,579;Dels=0.00;FQ=999;FR;FS=1.238;HOMA=28;HOMR=808;HP=2;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=G;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.2154;IndelType=MIXED;MQ=57.25;MQ0Fraction=0.0275;MQRankSum=-6.684;NF;NR;NS=976;PP;PV4=0.023,1,1,1;RA=3294;RUN=1;ReadPosRankSum=11.873;SC=TGCGTGTGTGTGTGTGTGTGT;SRB=0.42441;SRF=1398;SRP=166.5;SRR=1896;TC;TR=30;TU=GT;VQSLOD=6.7457;dbSNP=114;set=Intersection;sumGLbyD=21.27
+20     56395857        .       T       TAGGCAG 6614.22 PASS    AA=30;AB=0.63415;ABA=30;ABP=15.827;ABR=52;AC=14;AF=0.0197;AF1=0.03154;AN=710;BL=991;BR=1813;BVAR;BaseQRankSum=-4.589;CI95=0.02434,0.04204;DP=13879;DP4=1543,1833,12,14;Dels=0.00;EL=14;EPP=3.2998;ER=16;FQ=999;FR;FS=1.482;HETAR=11;HOMA=0;HOMR=1051;HP=1;HPLen=2;HR=2;HRun=0;HU=T;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0774;IndelType=INS.NumRepetitions_2.EventLength_6.;LEN=6;LRB=0.29315;LRBP=526.27;MQ=90.42;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=39.433;MQRankSum=-7.011;NF;NR;NS=1062;PP;PV4=1,1,3.7e-09,1;RA=5322;RL=9;RPP=13.433;RR=21;RUN=1;ReadPosRankSum=0.679;SAB=0.43333;SAF=13;SAP=4.1684;SAR=17;SC=AAGAGCATCTTAGGCAGAGGC;SRB=0.47294;SRF=2517;SRP=36.853;SRR=2805;TC;TR=2;TU=T;VQSLOD=8.3045;set=Intersection;sumGLbyD=68.22
+20     56969289        .       GTTTGT  G       600.69  PASS    AF=0.0056;AF1=0.007726;BaseQRankSum=2.907;CI95=0.004425,0.01327;DP=9643;DP4=1892,1749,6,3;Dels=0.00;FQ=117;FR;FS=16.601;HP=5;HPLen=3;HR=3;HRun=0;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=0.0236;IndelType=DEL.NumRepetitions_3.EventLength_5.;MQ=92.59;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-2.134;NF;NR;PP;PV4=0.51,1,0.07,0.3;ReadPosRankSum=0.236;SC=TAAGGACGTTGTTTGTTTTGT;TC;TR=10;TU=GTTT;VQSLOD=5.8458;set=Intersection;sumGLbyD=39.51
+20     57187557        .       AG      A,AGG   1486.69 PASS    AA=130;AB=0.55446;ABA=90;ABP=8.2132;ABR=112;AC=56,26;AF=0.0574,0.0266;AN=976;BL=3817;BR=5968;BVAR;BaseQRankSum=5.517;DEL;DP=14174;DP4=925,721,59,48;Dels=0.05;EL=52;EPP=14.302;ER=78;FR;FS=0.917;HETAR=44;HOMA=17;HOMR=864;HP=4;HPLen=4;HR=4;HRun=4;HU=G;INDEL;InbreedingCoeff=0.2856;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;LEN=1;LRB=0.21983;LRBP=1029.8;MQ=91.56;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=63.631;MQRankSum=1.900;NF;NR;NS=925;PP;PV4=0.84,1,1,0.39;RA=2746;RL=44;RPP=32.476;RR=86;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.639;SAB=0.44615;SAF=58;SAP=6.2842;SAR=72;SC=TCAGGCCCGCAGGGGTCAGGG;SRB=0.5772;SRF=1585;SRP=145.17;SRR=1161;TC;TR=4;TU=G;VQSLOD=7.7167;set=Intersection;sumGLbyD=14.85
+20     57282771        .       T       TG      506.43  PASS    AA=34;AB=0.70312;ABA=19;ABP=25.946;ABR=45;AC=34;AF=0.0373;AN=912;BL=886;BR=1938;BVAR;BaseQRankSum=3.744;DP=4276;Dels=0.00;EL=18;EPP=3.2658;ER=16;FR;FS=0.639;HETAR=17;HOMA=9;HOMR=737;HP=9;HR=8;HRun=8;HU=G;INS;InbreedingCoeff=0.2149;IndelType=INS.NumRepetitions_8.EventLength_1.RepeatExpansion_G.;LEN=1;LRB=0.37252;LRBP=853.99;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=49.706;MQRankSum=-0.051;NF;NR;NS=763;PP;RA=1822;RL=9;RPP=19.36;RR=25;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.111;SAB=0.55882;SAF=19;SAP=4.0322;SAR=15;SC=TCGGGGGGCGTGGGGGGGGTG;SRB=0.51098;SRF=931;SRP=4.9172;SRR=891;TC;TR=8;TU=G;VQSLOD=5.7772;set=Intersection;sumGLbyD=7.95
+20     57419740        rs11481507      A       AT      82613.57        PASS    AA=3850;AB=0.41404;ABA=1786;ABP=198.63;ABR=1262;AC=919;AF=0.75328;AN=1220;BL=140665;BR=151383;BVAR;BaseQRankSum=-27.490;DB;DP=31794;DP4=588,585,1571,1721;Dels=0.00;EL=1924;EPP=3.0126;ER=1926;FQ=999;FR;FS=2.191;HETAR=482;HOMA=454;HOMR=135;HP=3;HPLen=3;HR=3;HRun=3;HU=T;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0861;IndelType=INS.NumRepetitions_3.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;LEN=1;LRB=0.036699;LRBP=857.15;MQ=123.92;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=91.654;MQRankSum=3.016;NF;NR;NS=1071;PP;PV4=0.16,1,0.12,1;RA=1850;RL=1874;RPP=8.8784;RR=1976;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.685;SAB=0.47636;SAF=1834;SAP=21.693;SAR=2016;SC=TACACTAGTGATTTAACCCTA;SRB=0.49027;SRF=907;SRP=4.5315;SRR=943;TC;TR=3;TU=T;VQSLOD=9.2768;dbSNP=126;set=Intersection;sumGLbyD=22.78
+20     57558194        .       CT      C,CTT,CTTT      6470.30 PASS    ABR=451;AC=104,161,177;AF=0.08919,0.13808,0.15180;BVAR;BaseQRankSum=1.172;DP=7985;FR;FS=2.202;HOMA=19;HOMR=778;HP=22;HR=15;HU=T;HaplotypeScore=16.1921;INS;InbreedingCoeff=0.6440;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ=69.24;MQ0=27;MQ0Fraction=0.0109;MQRankSum=-0.003;NF;NR;NS=943;PP;QD=2.22;RA=2531;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.104;SB=-2096.85;SC=GCCTTTTTTTCTTTTTTTTTT;SRB=0.34848;SRF=882;SRP=507.73;SRR=1649;TC;TR=15;TU=T;VQSLOD=6.5151;set=Intersection
+20     57693627        .       AG      A       1991.90 PASS    AA=52;AB=0.49462;ABA=47;ABP=3.0336;ABR=46;AC=15;AF=0.01227;AN=1222;BL=1902;BR=1478;BVAR;BaseQRankSum=-6.121;DEL;DP=26459;DP4=2647,2873,16,20;Dels=0.01;EL=25;EPP=3.1773;ER=27;FR;FS=3.135;HETAR=15;HOMA=1;HOMR=1064;HP=2;HPLen=3;HR=3;HRun=2;HU=A;INDEL;InbreedingCoeff=0.0866;IndelType=DEL.NumRepetitions_2.EventLength_1.RepeatExpansion_G.;LEN=1;LRB=0.12544;LRBP=118.51;MQ=116.26;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=114.65;MQRankSum=1.942;NF;NR;NS=1080;PP;PV4=0.74,6.9e-08,1,0.38;RA=6781;RL=33;RPP=11.195;RR=19;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.795;SAB=0.5;SAF=26;SAP=3.0103;SAR=26;SC=ATTGGAGGAAAGGCTTTTTCA;SRB=0.46247;SRF=3136;SRP=85.976;SRR=3645;TC;TR=3;TU=A;VQSLOD=8.6672;set=Intersection;sumGLbyD=13.55
+20     57716287        .       A       AT      66.47   PASS    AC=6;AF=0.00506;AN=1186;BaseQRankSum=1.369;DP=2744;FS=3.834;HRun=8;HaplotypeScore=11.2046;InbreedingCoeff=0.1196;IndelType=INS.NumRepetitions_8.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;MQ=73.00;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-0.086;QD=2.14;ReadPosRankSum=-2.588;SB=-53.80;VQSLOD=4.2080;set=VQSR
+20     58121928        rs73625057      T       TGG     6649.17 PASS    AA=132;AB=0.57854;ABA=110;ABP=16.996;ABR=151;AC=57;AF=0.0617;AN=924;BL=4530;BR=4790;BVAR;BaseQRankSum=-13.456;DB;DP=30353;DP4=2107,2168,61,66;Dels=0.00;EL=67;EPP=3.0761;ER=65;FR;FS=0.708;HETAR=46;HOMA=8;HOMR=1023;HP=3;HPLen=2;HR=2;HRun=2;HU=G;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.1241;IndelType=INS.NumRepetitions_2.EventLength_1.RepeatExpansion_G.;LEN=2;LRB=0.027897;LRBP=18.76;MQ=109.61;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0004;MQM=79.833;MQRankSum=-0.699;NF;NR;NS=1077;PP;PV4=0.79,1,0.49,0.036;RA=5754;RL=61;RPP=4.6554;RR=71;RUN=1;ReadPosRankSum=-3.309;SAB=0.45455;SAF=60;SAP=5.3792;SAR=72;SC=GATTAGAATGTGGATATCTTT;SRB=0.48836;SRF=2810;SRP=9.7866;SRR=2944;TC;TR=4;TU=GT;VQSLOD=8.5770;set=Intersection;sumGLbyD=27.19
+20     58468826        .       ACAAG   A       999     PASS    AF=0.0014;AF1=0.003429;BaseQRankSum=4.082;CI95=0.003106,0.006211;DP=8461;DP4=2500,1817,8,2;Dels=0.01;FQ=999;FR;FS=5.034;HP=2;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=C;INDEL;InbreedingCoeff=-0.0183;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_4.;MQ=120.69;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=0.141;NF;NR;PP;PV4=0.21,1,0.054,1;ReadPosRankSum=2.096;SC=ATCCTGAAACACAAGAAGAAA;TC;TR=5;TU=AC;VQSLOD=7.4928;set=Intersection;sumGLbyD=29.17
+20     58731262        .       TC      T       999     PASS    AA=21;AB=0.48649;ABA=19;ABP=3.069;ABR=18;AC=7;AF=0.0101;AF1=0.01493;AN=694;BL=939;BR=848;BVAR;BaseQRankSum=4.205;CI95=0.01106,0.02212;DEL;DP=12598;DP4=1766,1428,11,15;Dels=0.01;EL=13;EPP=5.5954;ER=8;FQ=999;FR;FS=1.796;HETAR=8;HOMA=1;HOMR=1031;HP=7;HPLen=8;HR=8;HRun=2;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=-0.0030;IndelType=DEL.NumRepetitions_2.EventLength_1.RepeatExpansion_C.;LEN=1;LRB=0.050923;LRBP=13.073;MQ=124.57;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=67.905;MQRankSum=1.103;NF;NR;NS=1040;PP;PV4=0.23,1,1,1;RA=4884;RL=10;RPP=3.1137;RR=11;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.091;SAB=0.47619;SAF=10;SAP=3.1137;SAR=11;SC=TCATTTTTTTTCCTTGAAACT;SRB=0.58006;SRF=2833;SRP=274.9;SRR=2051;TC;TR=8;TU=T;VQSLOD=10.8783;set=Intersection;sumGLbyD=15.11
+20     59181229        rs11476579      CTT     C,CT,CTTT,CTTTT 7787.17 PASS    AC=19,195,104,91;AF=0.01599,0.16414,0.08754,0.07660;AF1=0.2124;AN=1188;BVAR;BaseQRankSum=6.347;CI95=0.146,0.2743;DB;DEL;DP=26140;DP4=932,880,352,375;Dels=0.13;FQ=85.6;FR;FS=11.914;HP=14;HR=14;HRun=14;HU=T;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.4183;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ=86.88;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=1.469;NF;NR;PP;PV4=0.17,1,1,1;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.055;SC=GGTGAGAAAGCTTTTTTTTTT;TC;TR=14;TU=T;VQSLOD=7.4340;dbSNP=120;set=Intersection;sumGLbyD=7.02
+20     59213979        rs112141381     G       GC      9068    PASS    AA=131;AB=0.47115;ABA=110;ABP=4.5136;ABR=98;AF=0.0586;AN=700;BL=5395;BR=5816;BVAR;BaseQRankSum=15.453;DB;DP=23381;DP4=2191,2184,71,49;Dels=0.00;EL=66;EPP=3.0269;ER=65;FR;FS=7.907;HETAR=35;HOMA=5;HOMR=1019;HP=2;HPLen=3;HR=3;HRun=0;HU=G;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0283;IndelType=INS.NOVEL_1.Novel_C.;LEN=1;LRB=0.037552;LRBP=37.34;MQ=72.13;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=54.496;MQRankSum=0.897;NF;NR;NS=1059;PP;PV4=0.052,1,0.066,1;RA=4976;RL=59;RPP=5.8117;RR=72;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.811;SAB=0.58015;SAF=76;SAP=10.32;SAR=55;SC=GATGGACTGGGACAGTGACTC;SRB=0.49457;SRF=2461;SRP=4.2828;SRR=2515;TC;TR=3;TU=G;VQSLOD=9.3917;set=Intersection;sumGLbyD=28.58
+20     59252945        .       CT      C,CTT   557.18  PASS    AA=24;AB=0.84868;ABA=23;ABP=163.53;ABR=129;AC=21,29;AF=0.01759,0.02429;BL=1217;BR=1336;BVAR;BaseQRankSum=5.135;DP=9970;Dels=0.01;EL=13;EPP=3.3722;ER=11;FS=2.302;HETAR=21;HOMA=1;HOMR=1012;HRun=9;INS;InbreedingCoeff=0.1549;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;LEN=1;LRB=0.046612;LRBP=15.055;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=67.208;MQRankSum=0.086;NS=1034;RA=4421;RL=11;RPP=3.3722;RR=13;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.826;SAB=0.41667;SAF=10;SAP=4.4579;SAR=14;SRB=0.49649;SRF=2195;SRP=3.4823;SRR=2226;VQSLOD=2.8923;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=5.47
+20     60016966        .       CT      C       42650   PASS    AA=37;AB=0.97834;ABA=31;ABP=2847;ABR=1400;AC=15;AF=0.0163;AN=920;BL=2596;BR=778;BVAR;BaseQRankSum=-0.632;DEL;DP=10967;Dels=0.00;EL=14;EPP=7.7641;ER=23;FS=4.094;HETAR=421;HOMA=256;HOMR=385;HRun=1;InbreedingCoeff=-0.0051;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;LEN=1;LRB=0.53883;LRBP=2130.2;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=120.3;MQRankSum=-0.911;NS=1072;RA=3413;RL=31;RPP=39.691;RR=6;RUN=1;ReadPosRankSum=-12.062;SAB=0.48649;SAF=18;SAP=3.069;SAR=19;SRB=0.47407;SRF=1618;SRP=22.943;SRR=1795;VQSLOD=3.3758;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.27
+20     60188651        .       AG      A       17624.52        PASS    AA=462;AB=0.76548;ABA=409;ABP=1070.7;ABR=1335;AC=403;AF=0.34444;AN=1170;BL=13877;BR=25909;BVAR;BaseQRankSum=6.180;DEL;DP=9900;Dels=0.08;EL=353;EPP=282.84;ER=109;FR;FS=2699.057;HETAR=346;HOMA=26;HOMR=633;HP=3;HR=4;HRun=1;HU=A;InbreedingCoeff=-0.2900;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_G.;LEN=1;LRB=0.30242;LRBP=7904.3;MQ0Fraction=0.0004;MQM=56.119;MQRankSum=1.644;NF;NR;NS=1005;PP;RA=3521;RL=112;RPP=269.25;RR=350;RUN=1;ReadPosRankSum=2.490;SAB=0.0064935;SAF=3;SAP=980.34;SAR=459;SC=AGGCTTCAAAAGAAAAAAAAA;SRB=0.55978;SRF=1971;SRP=112.32;SRR=1550;TC;TR=4;TU=A;VQSLOD=-34.0667;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=7.81
+20     60195570        .       GTACATACATACA   ATACATACATACA,G,GTACATACA       20140   PASS    ABR=102;AC=105,2;AF=0.08794,0.00168;AN=1194;BVAR;BaseQRankSum=-28.899;DB;DEL;DP=14347;Dels=0.02;FR;FS=52.125;HOMA=1;HOMR=1006;HP=1;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=T;InbreedingCoeff=0.0695;IndelType=MIXED;MQ0Fraction=0.0007;MQRankSum=1.957;NF;NR;NS=1035;PP;RA=4759;RUN=1;ReadPosRankSum=-22.252;SAB=0.5;SAP=3.0103;SC=TGATAGATTCGTACATACATA;SRB=0.47615;SRF=2266;SRP=26.522;SRR=2493;TC;TR=21;TU=ACAT;VQSLOD=2.7673;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=19.14
+20     60670601        rs72127450      AT      A,ATT   6401.59 PASS    AC=177,79;AF=0.16239,0.07248;AF1=0.1602;AN=1090;BVAR;BaseQRankSum=8.618;CI95=0.1106,0.2058;DB;DEL;DP=17508;DP4=1285,1094,313,259;Dels=0.10;FQ=94.1;FR;FS=0.000;HP=12;HR=12;HRun=12;HU=T;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.1076;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;LEN=1;MQ=64.73;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=0.620;NF;NR;PP;PV4=0.78,1,0.012,1;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.294;SC=AGCCAGGCACATTTTTTTTTT;TC;TR=12;TU=T;VQSLOD=6.1650;dbSNP=130;set=Intersection;sumGLbyD=5.80
+20     60685780        .       TC      T       1123.58 PASS    AC=79;AF=0.07655;AN=1032;BaseQRankSum=14.949;DP=2084;FS=23.521;HRun=1;HaplotypeScore=19.7117;InbreedingCoeff=0.1356;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_C.;MQ=53.57;MQ0=61;MQ0Fraction=0.0293;MQRankSum=-7.958;QD=4.35;ReadPosRankSum=-13.757;SB=-791.28;VQSLOD=6.3549;set=VQSR
+20     60744906        rs113528167     CG      C       422.53  PASS    AC=48;AF=0.0732;AN=656;BaseQRankSum=17.669;DB;DP=1189;FS=0.356;HRun=1;HaplotypeScore=15.1808;InbreedingCoeff=0.2111;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_G.;MQ=82.83;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-10.455;QD=2.71;ReadPosRankSum=-16.887;SB=-326.46;VQSLOD=7.1707;set=VQSR
+20     60848742        .       CGT     C,CGTGT 999     PASS    AF=0.00980,0.01225;BaseQRankSum=5.597;DP=17065;DP4=1928,2188,17,13;Dels=0.01;FR;HP=1;HPLen=2;HR=2;HRun=0;HU=C;INDEL;InbreedingCoeff=0.2094;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ=115.78;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=0.281;NF;NR;PP;PV4=0.36,0.4,0.12,0.12;ReadPosRankSum=-1.465;SB=-157.35;SC=TAGACGCTTCCGTGTGTGTGT;TC;TR=11;TU=GT;VQSLOD=1.7100;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=16.39
+20     61023668        rs57452309      G       GAGC    6896.67 PASS    AC=115;AF=0.1445;AN=796;BaseQRankSum=12.146;DB;DP=1423;FS=5.070;HRun=0;HaplotypeScore=29.8897;InbreedingCoeff=0.0740;IndelType=INS.NOVEL_3.;MQ=77.02;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-9.005;QD=19.16;ReadPosRankSum=-17.440;SB=-3045.82;VQSLOD=4.5788;set=VQSR
+20     61180519        .       C       CA,CT   1774.30 PASS    ABR=135;AC=27,15;AF=0.02538,0.01410;BVAR;BaseQRankSum=-2.189;DP=8393;FR;FS=27.692;HOMA=2;HOMR=825;HP=6;HPLen=3;HR=3;HU=T;HaplotypeScore=19.5313;INS;InbreedingCoeff=0.0868;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;LEN=1;MQ=56.11;MQ0=172;MQ0Fraction=0.0667;MQRankSum=2.605;NF;NR;NS=854;PP;QD=1.99;RA=2868;RUN=1;ReadPosRankSum=-7.324;SB=-385.54;SC=TTCTTTCTTTCTTTCTTTCTT;SRB=0.32741;SRF=939;SRP=745.08;SRR=1929;TC;TR=69;TU=CTTT;VQSLOD=3.4398;set=filterInVQSR-2of5
+20     61184281        .       AC      A       9798.10 PASS    AA=24;AB=0.96507;ABA=16;ABP=863.43;ABR=442;AC=4;AF=0.00341;AN=1174;BL=349;BR=1039;BVAR;BaseQRankSum=2.048;DEL;DP=10073;Dels=0.00;EL=11;EPP=3.3722;ER=13;FS=2.097;HETAR=141;HOMA=69;HOMR=829;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0697;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_C.;LEN=1;LRB=0.49712;LRBP=747.85;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=98.042;MQRankSum=1.881;NS=1042;RA=3625;RL=5;RPP=20.744;RR=19;RUN=1;ReadPosRankSum=-8.009;SAB=0.75;SAF=18;SAP=16.039;SAR=6;SRB=0.52662;SRF=1909;SRP=25.323;SRR=1716;VQSLOD=1.8117;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=5.55
+20     62074219        .       C       CTAT,CTGT       2328    PASS    ABR=99;AC=20,6;AF=0.01754,0.00526;BVAR;BaseQRankSum=11.221;DP=9498;DS;FS=4.510;HOMA=15;HOMR=645;HaplotypeScore=82.8868;INS;InbreedingCoeff=0.0880;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;LEN=3;MQ=29.88;MQ0=1378;MQ0Fraction=0.2286;MQRankSum=-5.309;NS=689;QD=0.77;RA=1679;RUN=1;ReadPosRankSum=-3.510;SAR=1;SB=-93.21;SRB=0.70697;SRF=1187;SRP=627.71;SRR=492;VQSLOD=1.8325;set=filterInVQSR-2of5
+20     62304449        .       CA      C,CAA   6680.17 PASS    AC=141,69;AF=0.12567,0.06150;AF1=0.08178;AN=1122;BVAR;BaseQRankSum=9.754;CI95=0.05088,0.1128;DEL;DP=15867;DP4=1252,1289,232,208;Dels=0.10;FQ=52.6;FR;FS=6.576;HP=11;HR=11;HRun=11;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.1950;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;LEN=1;MQ=60.48;MQ0Fraction=0.0004;MQRankSum=-0.049;NF;NR;PP;PV4=0.2,1,1,1;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.137;SC=GATTCTGTGTCAAAAAAAAAA;TC;TR=11;TU=A;VQSLOD=7.4714;set=Intersection;sumGLbyD=8.36
+20     62804895        rs57769591      CCTT    C       1148    PASS    AC=8;AF=0.0085;AF1=0.002839;AN=938;BaseQRankSum=4.952;CI95=0.002212,0.006637;DB;DP=8889;DP4=2574,1668,4,8;FQ=12.3;FS=2.289;HPLen=3;HRun=0;HaplotypeScore=29.4184;INDEL;InbreedingCoeff=-0.0270;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_3.;MQ0=876;MQ0Fraction=0.2674;MQRankSum=-0.641;PV4=0.074,1,1,1;QD=1.03;ReadPosRankSum=0.118;SB=-65.30;VQSLOD=6.4881;dbSNP=126;set=Intersection
+20     62907688        .       AAT     A       6629.57 PASS    AC=164;AF=0.13735;AN=1194;BaseQRankSum=27.368;DP=2746;FS=5.985;HRun=0;HaplotypeScore=14.7748;InbreedingCoeff=0.1433;IndelType=DEL.NumRepetitions_2.EventLength_2.RepeatExpansion_AT.;MQ=96.65;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-3.318;QD=10.81;ReadPosRankSum=0.789;SB=-2662.16;VQSLOD=6.1473;set=VQSR
diff --git a/tests/tabix_data/vcf/20.vcf b/tests/tabix_data/vcf/20.vcf
new file mode 100644 (file)
index 0000000..e14beb5
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,307 @@
+##fileformat=VCFv4.1\r
+##INFO=<ID=PacBio,Number=1,Type=String,Description="Status of PacBio for this site">\r
+##INFO=<ID=Sqnm,Number=1,Type=String,Description="Status of Sequenom for this site">\r
+##INFO=<ID=Sanger,Number=1,Type=String,Description="Status of Sanger Sequencing for this site">\r
+##INFO=<ID=NotCalledInValidationSamples,Number=.,Type=Flag,Description="Was not called polymorphic in sequencing for any of the passing validation samples; could still be polymorphic">\r
+##reference=file:///humgen/1kg/reference/human_g1k_v37.fasta\r
+#CHROM POS     ID      REF     ALT     QUAL    FILTER  INFO    \r
+20     207414  .       G       A       .       .       PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall\r
+20     792106  .       C       G       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=NoCall\r
+20     894031  .       G       A       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     1508892 .       A       G       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     1686745 .       G       A       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=NoCall\r
+20     1818886 .       C       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     2062981 .       A       G       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     2773229 .       A       G       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     2817761 .       T       C       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     2994966 .       G       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     3126723 .       C       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     3523369 .       G       A       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     3635082 .       A       G       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     3714080 .       C       G       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     3905791 .       G       A       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=NoCall\r
+20     3907250 .       A       G       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     4171994 .       C       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     4246375 .       T       C       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=NoCall\r
+20     4375206 .       C       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     4434727 .       A       T       .       .       PacBio=NoCall;Sqnm=Mono;Sanger=Mono\r
+20     4495199 .       G       C       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     4835415 .       C       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     4915769 .       T       C       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=NoCall\r
+20     4983198 .       T       C       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     5441171 .       C       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=NoCall\r
+20     5978029 .       T       C       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     6061317 .       C       A       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     6328925 .       C       A       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     6675461 .       C       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=NoCall\r
+20     6976115 .       C       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     7013349 .       G       A       .       .       PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall\r
+20     7039302 .       C       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     7638704 .       C       A       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     7688381 .       G       A       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     7726350 .       G       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     7733957 .       C       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     7850516 .       T       C       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     8095059 .       G       A       .       .       PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall\r
+20     8232012 .       T       A       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     8415290 .       A       C       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     8438535 .       T       C       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=NoCall\r
+20     8815233 .       G       A       .       .       PacBio=Mono;Sqnm=NoCall\r
+20     8953629 .       C       G       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     9237267 .       T       A       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     9744549 .       T       C       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     9780416 .       C       A       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     10252552        .       T       C       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     10314038        .       C       G       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     10757416        .       T       C       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     11087688        .       A       G       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     11094107        .       G       A       .       .       PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall\r
+20     11098680        .       G       A       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     11353163        .       G       C       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     11510559        .       A       G       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     11787224        .       C       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     11821024        .       T       C       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     11932295        .       A       G       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     11965311        .       G       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     12023599        .       C       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     12505523        .       G       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     12570054        .       A       C       .       .       PacBio=NoCall;Sqnm=Poly\r
+20     12667452        .       A       G       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     12678271        .       G       A       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Mono\r
+20     12704885        .       T       C       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     12733996        .       C       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=NoCall\r
+20     12737269        .       C       T       .       .       PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall\r
+20     12788981        .       G       A       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     12828594        .       T       C       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     12999157        .       T       C       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     13083804        .       C       G       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     13197077        .       G       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=NoCall\r
+20     13217896        .       A       G       .       .       PacBio=NoCall;Sqnm=Poly\r
+20     13276778        .       G       A       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     13375116        .       G       A       .       .       PacBio=Mono;Sqnm=NoCall;NotCalledInValidationSamples\r
+20     13648056        .       T       C       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     13672895        .       C       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     14160159        .       C       G       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     14266815        .       T       A       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     14865143        .       C       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     14882868        .       T       G       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     15244725        .       C       A       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     15277072        .       G       A       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     15390867        .       C       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     15785205        .       T       C       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     15833020        .       A       G       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     15847620        .       C       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     15953253        .       G       A       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=NoCall\r
+20     15964434        .       G       C       .       .       PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall\r
+20     16183922        .       G       A       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     16190824        .       A       G       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     16557779        .       A       G       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     16730061        .       C       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     16794015        .       T       C       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     17048741        .       G       A       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     17299827        .       G       A       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     17299845        .       C       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     17390323        .       G       A       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     17624973        .       C       G       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     17666040        .       G       A       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     17735813        .       T       C       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     17794990        .       A       G       .       .       PacBio=Mono;Sqnm=Mono;NotCalledInValidationSamples\r
+20     17809418        .       G       A       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     17860794        .       C       T       .       .       PacBio=Mono;Sqnm=NoCall\r
+20     17881936        .       A       G       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     17893097        .       C       G       .       .       PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall\r
+20     18188883        .       A       G       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     18199319        .       G       A       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     18233699        .       C       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     18536869        .       G       A       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     18637785        .       T       C       .       .       PacBio=NoCall;Sqnm=Mono;Sanger=Mono;NotCalledInValidationSamples\r
+20     18763166        .       G       A       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     19102715        .       A       G       .       .       PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall\r
+20     19244609        .       C       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     19573719        .       C       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     19815613        .       A       G       .       .       PacBio=NoCall;Sqnm=Poly\r
+20     20511479        .       C       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly;Sanger=Poly\r
+20     20639358        .       T       C       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     21278490        .       T       C       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     21297718        .       C       G       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     21418269        .       A       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     21560553        .       A       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     21618451        .       G       A       .       .       PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall\r
+20     21705723        .       C       A       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     22076189        .       A       G       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     22118677        .       T       A       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     22320721        .       C       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     22368918        .       C       A       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     23020003        .       A       G       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     23214163        .       G       A       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     23273877        .       T       C       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     23335790        .       C       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=NoCall\r
+20     23790659        .       C       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     23830388        .       T       C       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=NoCall\r
+20     23837678        .       C       G       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     23901081        .       A       C       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     23946361        .       C       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     23949242        .       A       G       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     24539119        .       A       G       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     24986457        .       C       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     25183729        .       G       A       .       .       PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall\r
+20     25277133        .       C       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     25292464        .       C       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=NoCall\r
+20     25528915        .       G       C       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     25851836        .       A       G       .       .       PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall\r
+20     25970163        .       C       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     29920798        .       C       T       .       .       PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall\r
+20     30007713        .       T       C       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     30051768        .       T       C       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     30183598        .       T       C       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     30604408        .       G       A       .       .       PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall\r
+20     30759940        .       G       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     30881454        .       G       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     31356560        .       C       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     31450036        .       A       G       .       .       PacBio=NoCall;Sqnm=Mono\r
+20     31589920        .       A       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     31922121        .       C       T       .       .       PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall\r
+20     32801430        .       G       C       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     32943975        .       G       T       .       .       PacBio=Mono;Sqnm=Mono\r
+20     33155812        .       C       A       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     34090682        .       C       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     34254080        .       C       T       .       .       PacBio=Mono;Sqnm=NoCall;NotCalledInValidationSamples\r
+20     34312126        .       C       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=NoCall\r
+20     34481504        .       G       A       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     34694577        .       G       A       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     35026572        .       T       C       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     35472344        .       T       G       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     35882698        .       G       A       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=NoCall\r
+20     36044719        .       G       A       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=NoCall\r
+20     36047623        .       C       A       .       .       PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall\r
+20     36204890        .       C       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=NoCall\r
+20     36469514        .       G       C       .       .       PacBio=NoCall;Sqnm=Poly\r
+20     36840217        .       T       C       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     37460945        .       C       T       .       .       PacBio=Mono;Sqnm=Poly\r
+20     37665246        .       G       A       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=NoCall\r
+20     37732397        .       A       G       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     37874645        .       G       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     37958191        .       T       C       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     37996273        .       C       T       .       .       PacBio=Mono;Sqnm=NoCall;NotCalledInValidationSamples\r
+20     38016547        .       C       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     38435682        .       A       G       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     38505534        .       A       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     38803278        .       A       G       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     38963803        .       G       C       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     38971986        .       A       G       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     39269586        .       G       A       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     39289390        .       C       A       .       .       PacBio=Mono;Sqnm=Mono;NotCalledInValidationSamples\r
+20     39318956        .       T       A       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     39736197        .       A       G       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     40241339        .       T       C       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     41473555        .       G       A       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     41878576        .       T       G       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     42022716        .       A       G       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     42033671        .       A       C       .       .       PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall\r
+20     42270334        .       C       T       .       .       PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall\r
+20     42449590        .       C       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=NoCall\r
+20     42521157        .       T       G       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     42624300        .       C       A       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     42984548        .       G       A       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     43200148        .       G       C       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     43425384        .       T       G       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     43521990        .       C       G       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     43565804        .       G       A       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     43591237        .       T       C       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     43805929        .       C       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     43866692        .       A       G       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     43902088        .       C       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     44478507        .       C       A       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     44768810        .       C       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     45151582        .       G       A       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     45414003        .       G       A       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     45776825        .       G       C       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     46454905        .       G       A       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=NoCall\r
+20     46823642        .       C       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     47001376        .       C       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     47079360        .       G       C       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=NoCall\r
+20     47248953        .       G       A       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     47480655        .       C       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     47529099        .       T       C       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     47703355        .       A       C       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     47919541        .       A       G       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     48126120        .       A       C       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     48157380        .       G       A       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     48233077        .       C       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     48488571        .       G       A       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     48534468        .       G       A       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=NoCall\r
+20     48631385        .       G       C       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     48654970        .       G       A       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=NoCall\r
+20     48708007        .       C       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     48979827        .       C       A       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     49100106        .       G       A       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     49509102        .       G       A       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     49631170        .       G       A       .       .       PacBio=Mono;Sqnm=Mono;NotCalledInValidationSamples\r
+20     50210361        .       C       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     50309600        .       C       A       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     50681296        .       T       C       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     50750138        .       A       G       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     51639257        .       G       A       .       .       PacBio=Mono;Sqnm=Poly\r
+20     51814664        .       T       C       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     51891088        .       C       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     52299250        .       A       G       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     52363435        .       G       A       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=NoCall\r
+20     52583941        .       C       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     52787584        .       C       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     53256945        .       G       A       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     54155398        .       A       G       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     54172374        .       G       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     54209446        .       A       G       .       .       PacBio=Mono;Sqnm=Mono;NotCalledInValidationSamples;Sanger=Poly\r
+20     54317862        .       C       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     54852735        .       C       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=NoCall\r
+20     54889864        .       G       A       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     55208711        .       G       A       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     55220477        .       G       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     55224856        .       G       T       .       .       PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall\r
+20     55441530        .       C       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=NoCall\r
+20     55585710        .       C       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     55630163        .       C       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     56031994        .       A       G       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     56316071        .       T       G       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     56366198        .       C       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     56703987        .       G       A       .       .       PacBio=Mono;Sqnm=Mono;NotCalledInValidationSamples;Sanger=Poly\r
+20     56794829        .       G       C       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     56797026        .       G       A       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     56922427        .       A       G       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     57025102        .       A       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     57104529        .       G       A       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     57360225        .       C       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     57630386        .       T       A       .       .       PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall\r
+20     57754033        .       G       A       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     57956631        .       C       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     57997801        .       C       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=NoCall\r
+20     58046279        .       C       G       .       .       PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall\r
+20     58186723        .       A       G       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     58214460        .       C       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     58317759        .       A       G       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     58491642        .       A       C       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     58560045        .       C       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     58629232        .       C       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     58805192        .       G       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     58869523        .       A       G       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     59337535        .       T       C       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     59441596        .       G       A       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     59445223        .       G       A       .       .       PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall\r
+20     59605846        .       C       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     59864395        .       G       C       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     60099821        .       G       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     60290551        .       A       G       .       .       PacBio=Mono;Sqnm=Mono;NotCalledInValidationSamples;Sanger=Poly\r
+20     60362527        .       G       C       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     60516358        .       C       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     60559594        .       C       T       .       .       PacBio=NoCall;Sqnm=Poly\r
+20     60745115        .       G       A       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     60831300        .       G       A       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     60907675        .       G       A       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     61458191        .       G       A       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     61717607        .       C       T       .       .       PacBio=Mono;Sqnm=Poly\r
+20     61771154        .       G       A       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     61950497        .       G       A       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     62000091        .       C       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     62550780        .       C       T       .       .       PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall\r
+20     62558259        .       T       C       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
+20     62727205        .       C       T       .       .       PacBio=Poly;Sqnm=Poly\r
diff --git a/tests/tabix_data/vcf/21.vcf b/tests/tabix_data/vcf/21.vcf
new file mode 100644 (file)
index 0000000..db6cec6
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,310 @@
+##fileformat=VCFv4.1\r
+##INFO=<ID=Consensus,Number=1,Type=String,Description="Consensus validation result">\r
+##INFO=<ID=PacBio,Number=1,Type=String,Description="Status of PacBio for this site">\r
+##INFO=<ID=Sqnm,Number=1,Type=String,Description="Status of Sequenom for this site">\r
+##INFO=<ID=Sanger,Number=1,Type=String,Description="Status of Sanger Sequencing for this site">\r
+##INFO=<ID=NotCalledInValidationSamples,Number=.,Type=Flag,Description="Was not called polymorphic in sequencing for any of the passing validation samples; could still be polymorphic">\r
+##INFO=<ID=pcr454_ss,Number=1,Type=String,Description="Status of PCR-Roche 454 single-sample experiment for this site">\r
+##INFO=<ID=pcr454_ps,Number=1,Type=String,Description="Status of PCR-Roche 454 pooled-samples experiment for this site">\r
+##reference=file:///humgen/1kg/reference/human_g1k_v37.fasta\r
+#CHROM POS     ID      REF     ALT     QUAL    FILTER  INFO\r
+20     207414  .       G       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     792106  .       C       G       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     894031  .       G       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     1508892 .       A       G       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     1686745 .       G       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     1818886 .       C       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     2062981 .       A       G       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     2773229 .       A       G       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     2817761 .       T       C       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     2994966 .       G       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     3126723 .       C       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=NoCall;pcr454_ps=NoCall\r
+20     3523369 .       G       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     3635082 .       A       G       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     3714080 .       C       G       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     3905791 .       G       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     3907250 .       A       G       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     4171994 .       C       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     4246375 .       T       C       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     4375206 .       C       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     4434727 .       A       T       0       .       Consensus=Mono;PacBio=Mono;Sqnm=Mono;Sanger=Mono;pcr454_ss=NoCall;pcr454_ps=Poly\r
+20     4495199 .       G       C       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     4835415 .       C       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     4915769 .       T       C       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=NoCall;pcr454_ps=NoCall\r
+20     4983198 .       T       C       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     5441171 .       C       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     5978029 .       T       C       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     6061317 .       C       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Mono;pcr454_ps=Poly\r
+20     6328925 .       C       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     6675461 .       C       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     6976115 .       C       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     7013349 .       G       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     7039302 .       C       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     7638704 .       C       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     7688381 .       G       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     7726350 .       G       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=NoCall;pcr454_ps=NoCall\r
+20     7733957 .       C       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     7850516 .       T       C       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     8095059 .       G       A       0       .       Consensus=Mono;PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=NoCall;pcr454_ps=NoCall\r
+20     8232012 .       T       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     8415290 .       A       C       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     8438535 .       T       C       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     8815233 .       G       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Mono;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     8953629 .       C       G       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Mono;pcr454_ps=Poly\r
+20     9237267 .       T       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=NoCall;pcr454_ps=NoCall\r
+20     9744549 .       T       C       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     9780416 .       C       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     10252552        .       T       C       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     10314038        .       C       G       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     10757416        .       T       C       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     11087688        .       A       G       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     11094107        .       G       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     11098680        .       G       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     11353163        .       G       C       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     11510559        .       A       G       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     11787224        .       C       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     11821024        .       T       C       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=NoCall;pcr454_ps=NoCall\r
+20     11932295        .       A       G       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     11965311        .       G       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     12023599        .       C       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     12505523        .       G       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     12570054        .       A       C       0       .       Consensus=Poly;PacBio=NoCall;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     12667452        .       A       G       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=NoCall;pcr454_ps=NoCall\r
+20     12678271        .       G       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Mono;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     12704885        .       T       C       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     12733996        .       C       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     12737269        .       C       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     12788981        .       G       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     12828594        .       T       C       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     12999157        .       T       C       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     13083804        .       C       G       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     13197077        .       G       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     13217896        .       A       G       0       .       Consensus=Poly;PacBio=NoCall;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     13276778        .       G       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     13375116        .       G       A       0       .       Consensus=Mono;PacBio=Mono;Sqnm=NoCall;NotCalledInValidationSamples;pcr454_ss=Mono;pcr454_ps=Mono\r
+20     13648056        .       T       C       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     13672895        .       C       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     14160159        .       C       G       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     14266815        .       T       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     14865143        .       C       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     14882868        .       T       G       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     15244725        .       C       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     15277072        .       G       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=NoCall;pcr454_ps=NoCall\r
+20     15390867        .       C       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     15785205        .       T       C       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     15833020        .       A       G       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     15847620        .       C       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     15953253        .       G       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     15964434        .       G       C       0       .       Consensus=NoCall;PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=NoCall;pcr454_ps=NoCall\r
+20     16183922        .       G       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     16190824        .       A       G       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     16557779        .       A       G       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=NoCall;pcr454_ps=NoCall\r
+20     16730061        .       C       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     16794015        .       T       C       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     17048741        .       G       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     17299827        .       G       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=NoCall;pcr454_ps=NoCall\r
+20     17299845        .       C       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     17390323        .       G       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=NoCall;pcr454_ps=NoCall\r
+20     17624973        .       C       G       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     17666040        .       G       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     17735813        .       T       C       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     17794990        .       A       G       0       .       Consensus=Mono;PacBio=Mono;Sqnm=Mono;NotCalledInValidationSamples;pcr454_ss=NoCall;pcr454_ps=NoCall\r
+20     17809418        .       G       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     17860794        .       C       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Mono;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     17881936        .       A       G       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     17893097        .       C       G       0       .       Consensus=Mono;PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Mono;pcr454_ps=Mono\r
+20     18188883        .       A       G       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=NoCall;pcr454_ps=NoCall\r
+20     18199319        .       G       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     18233699        .       C       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     18536869        .       G       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     18637785        .       T       C       0       .       Consensus=Mono;PacBio=NoCall;Sqnm=Mono;Sanger=Mono;NotCalledInValidationSamples;pcr454_ss=Mono;pcr454_ps=Mono\r
+20     18763166        .       G       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     19102715        .       A       G       0       .       Consensus=Mono;PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Mono;pcr454_ps=Mono\r
+20     19244609        .       C       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     19573719        .       C       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     19815613        .       A       G       0       .       Consensus=Poly;PacBio=NoCall;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     20511479        .       C       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;Sanger=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     20639358        .       T       C       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     21278490        .       T       C       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     21297718        .       C       G       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=NoCall;pcr454_ps=NoCall\r
+20     21418269        .       A       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     21560553        .       A       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     21618451        .       G       A       0       .       Consensus=NoCall;PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=NoCall;pcr454_ps=NoCall\r
+20     21705723        .       C       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     22076189        .       A       G       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     22118677        .       T       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     22320721        .       C       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     22368918        .       C       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     23020003        .       A       G       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     23214163        .       G       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     23273877        .       T       C       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     23335790        .       C       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Mono\r
+20     23790659        .       C       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     23830388        .       T       C       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     23837678        .       C       G       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     23901081        .       A       C       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     23946361        .       C       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     23949242        .       A       G       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     24539119        .       A       G       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=NoCall;pcr454_ps=NoCall\r
+20     24986457        .       C       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     25183729        .       G       A       0       .       Consensus=Mono;PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Mono;pcr454_ps=Mono\r
+20     25277133        .       C       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     25292464        .       C       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     25528915        .       G       C       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     25851836        .       A       G       0       .       Consensus=Poly;PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     25970163        .       C       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     29920798        .       C       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     30007713        .       T       C       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     30051768        .       T       C       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     30183598        .       T       C       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     30604408        .       G       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     30759940        .       G       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     30881454        .       G       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=NoCall;pcr454_ps=Poly\r
+20     31356560        .       C       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     31450036        .       A       G       0       .       Consensus=Poly;PacBio=NoCall;Sqnm=Mono;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     31589920        .       A       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     31922121        .       C       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     32801430        .       G       C       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     32943975        .       G       T       0       .       Consensus=Mono;PacBio=Mono;Sqnm=Mono;pcr454_ss=NoCall;pcr454_ps=NoCall\r
+20     33155812        .       C       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     34090682        .       C       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     34254080        .       C       T       0       .       Consensus=Mono;PacBio=Mono;Sqnm=NoCall;NotCalledInValidationSamples;pcr454_ss=Mono;pcr454_ps=Mono\r
+20     34312126        .       C       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     34481504        .       G       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     34694577        .       G       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     35026572        .       T       C       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=NoCall;pcr454_ps=NoCall\r
+20     35472344        .       T       G       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=NoCall;pcr454_ps=NoCall\r
+20     35882698        .       G       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     36044719        .       G       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     36047623        .       C       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     36204890        .       C       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     36469514        .       G       C       0       .       Consensus=Poly;PacBio=NoCall;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     36840217        .       T       C       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=NoCall;pcr454_ps=NoCall\r
+20     37460945        .       C       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Mono;Sqnm=Poly;pcr454_ss=NoCall;pcr454_ps=NoCall\r
+20     37665246        .       G       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     37732397        .       A       G       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     37874645        .       G       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     37958191        .       T       C       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     37996273        .       C       T       0       .       Consensus=Mono;PacBio=Mono;Sqnm=NoCall;NotCalledInValidationSamples;pcr454_ss=Mono;pcr454_ps=Mono\r
+20     38016547        .       C       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     38435682        .       A       G       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=NoCall;pcr454_ps=NoCall\r
+20     38505534        .       A       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     38803278        .       A       G       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     38963803        .       G       C       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     38971986        .       A       G       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     39269586        .       G       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     39289390        .       C       A       0       .       Consensus=Mono;PacBio=Mono;Sqnm=Mono;NotCalledInValidationSamples;pcr454_ss=NoCall;pcr454_ps=NoCall\r
+20     39318956        .       T       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=NoCall;pcr454_ps=Poly\r
+20     39736197        .       A       G       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     40241339        .       T       C       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     41473555        .       G       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     41878576        .       T       G       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     42022716        .       A       G       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=NoCall;pcr454_ps=NoCall\r
+20     42033671        .       A       C       0       .       Consensus=Poly;PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     42270334        .       C       T       0       .       Consensus=NoCall;PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=NoCall;pcr454_ps=NoCall\r
+20     42449590        .       C       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     42521157        .       T       G       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     42624300        .       C       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     42984548        .       G       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     43200148        .       G       C       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     43425384        .       T       G       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     43521990        .       C       G       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     43565804        .       G       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     43591237        .       T       C       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     43805929        .       C       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     43866692        .       A       G       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     43902088        .       C       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=NoCall;pcr454_ps=NoCall\r
+20     44478507        .       C       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=NoCall;pcr454_ps=NoCall\r
+20     44768810        .       C       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     45151582        .       G       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     45414003        .       G       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Mono;pcr454_ps=Mono\r
+20     45776825        .       G       C       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=NoCall;pcr454_ps=NoCall\r
+20     46454905        .       G       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     46823642        .       C       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     47001376        .       C       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     47079360        .       G       C       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     47248953        .       G       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     47480655        .       C       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     47529099        .       T       C       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     47703355        .       A       C       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     47919541        .       A       G       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     48126120        .       A       C       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     48157380        .       G       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     48233077        .       C       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=NoCall;pcr454_ps=NoCall\r
+20     48488571        .       G       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     48534468        .       G       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     48631385        .       G       C       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     48654970        .       G       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     48708007        .       C       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     48979827        .       C       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     49100106        .       G       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     49509102        .       G       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     49631170        .       G       A       0       .       Consensus=Mono;PacBio=Mono;Sqnm=Mono;NotCalledInValidationSamples;pcr454_ss=Mono;pcr454_ps=Mono\r
+20     50210361        .       C       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     50309600        .       C       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     50681296        .       T       C       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     50750138        .       A       G       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     51639257        .       G       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Mono;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Mono;pcr454_ps=Mono\r
+20     51814664        .       T       C       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     51891088        .       C       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     52299250        .       A       G       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     52363435        .       G       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     52583941        .       C       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     52787584        .       C       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     53256945        .       G       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     54155398        .       A       G       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     54172374        .       G       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=NoCall;pcr454_ps=Poly\r
+20     54209446        .       A       G       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Mono;Sqnm=Mono;NotCalledInValidationSamples;Sanger=Poly;pcr454_ss=Mono;pcr454_ps=Mono\r
+20     54317862        .       C       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     54852735        .       C       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     54889864        .       G       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     55208711        .       G       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     55220477        .       G       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     55224856        .       G       T       0       .       Consensus=NoCall;PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=NoCall;pcr454_ps=NoCall\r
+20     55441530        .       C       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     55585710        .       C       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     55630163        .       C       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     56031994        .       A       G       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     56316071        .       T       G       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=NoCall;pcr454_ps=NoCall\r
+20     56366198        .       C       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     56703987        .       G       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Mono;Sqnm=Mono;NotCalledInValidationSamples;Sanger=Poly;pcr454_ss=Mono;pcr454_ps=Mono\r
+20     56794829        .       G       C       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     56797026        .       G       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     56922427        .       A       G       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     57025102        .       A       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     57104529        .       G       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     57360225        .       C       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     57630386        .       T       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     57754033        .       G       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=NoCall;pcr454_ps=NoCall\r
+20     57956631        .       C       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=NoCall;pcr454_ps=NoCall\r
+20     57997801        .       C       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     58046279        .       C       G       0       .       Consensus=Poly;PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     58186723        .       A       G       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     58214460        .       C       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     58317759        .       A       G       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     58491642        .       A       C       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     58560045        .       C       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     58629232        .       C       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     58805192        .       G       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     58869523        .       A       G       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     59337535        .       T       C       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     59441596        .       G       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     59445223        .       G       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     59605846        .       C       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     59864395        .       G       C       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=NoCall;pcr454_ps=NoCall\r
+20     60099821        .       G       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     60290551        .       A       G       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Mono;Sqnm=Mono;NotCalledInValidationSamples;Sanger=Poly;pcr454_ss=Mono;pcr454_ps=Mono\r
+20     60362527        .       G       C       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     60516358        .       C       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     60559594        .       C       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=NoCall;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     60745115        .       G       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     60831300        .       G       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     60907675        .       G       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     61458191        .       G       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     61717607        .       C       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Mono;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Mono;pcr454_ps=Mono\r
+20     61771154        .       G       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     61950497        .       G       A       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     62000091        .       C       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     62550780        .       C       T       0       .       Consensus=NoCall;PacBio=NoCall;Sqnm=NoCall;pcr454_ss=NoCall;pcr454_ps=NoCall\r
+20     62558259        .       T       C       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
+20     62727205        .       C       T       0       .       Consensus=Poly;PacBio=Poly;Sqnm=Poly;pcr454_ss=Poly;pcr454_ps=Poly\r
diff --git a/tests/tabix_data/vcf/22.vcf b/tests/tabix_data/vcf/22.vcf
new file mode 100644 (file)
index 0000000..ffb2fce
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,1000 @@
+##fileformat=VCFv4.0
+##FORMAT=<ID=GT,Number=1,Type=String,Description="Genotype">
+##FilterLiftedVariants="analysis_type=FilterLiftedVariants input_file=[] sample_metadata=[] read_buffer_size=null phone_home=STANDARD read_filter=[] intervals=null excludeIntervals=null reference_sequence=/local/sequence/reference/BWA_ref/hg19/hg19.fasta rodBind=[/local/scratch/xyliu/0.915136538286792.sorted.vcf] rodToIntervalTrackName=null BTI_merge_rule=UNION DBSNP=null downsampling_type=null downsample_to_fraction=null downsample_to_coverage=null baq=OFF baqGapOpenPenalty=40.0 performanceLog=null useOriginalQualities=false defaultBaseQualities=-1 validation_strictness=SILENT unsafe=null num_threads=1 interval_merging=ALL read_group_black_list=null processingTracker=null restartProcessingTracker=false processingTrackerStatusFile=null processingTrackerID=-1 allow_intervals_with_unindexed_bam=false enable_experimental_low_memory_sharding=false logging_level=INFO log_to_file=null quiet_output_mode=false debug_mode=false help=false out=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub NO_HEADER=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub sites_only=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub"
+##INFO=<ID=VC,Number=1,Type=String,Description="Variation Class">
+##INFO=<ID=AC,Number=.,Type=Integer,Description="Allele count in genotypes, for each ALT allele, in the same order as listed">
+##INFO=<ID=AF,Number=.,Type=Float,Description="Allele Frequency, for each ALT allele, in the same order as listed">
+##INFO=<ID=AN,Number=1,Type=Integer,Description="Total number of alleles in called genotypes">
+##INFO=<ID=DB,Number=0,Type=Flag,Description="dbSNP Membership">
+#CHROM POS     ID      REF     ALT     QUAL    FILTER  INFO    FORMAT  NA15029 NA15036 NA15038 NA15056b        NA15072 NA15144C        NA15213_006     NA15215A        NA15216_A2      NA15221b        NA15223_6v2     NA15224_4       NA15226A        NA15227b        NA15236_6       NA15242_005     NA15245v2       NA15268 NA15324_A1      NA15385b        NA15386A        NA15510_A1      NA15590_4       NA15594_005     NA18500b        NA18501 NA18502 NA18503 NA18504 NA18505 NA18506 NA18507 NA18508 NA18515 NA18516 NA18517 NA18521 NA18522 NA18523 NA18524_B1      NA18526_B2      NA18529_B1      NA18532_B1      NA18537_B1      NA18540_B1      NA18542_B1      NA18545_5       NA18547_B1      NA18550_B1      NA18555_A2      NA18561_A3      NA18562_B1      NA18563 NA18564_4       NA18566_3       NA18570_3       NA18571_3       NA18572_3       NA18573_B3      NA18576_4       NA18577_B1      NA18579_B1      NA18582_B1      NA18592_2       NA18593_B1      NA18594_B1      NA18603_B1      NA18605_B1      NA18608_B1      NA18609_B1      NA18611_B1      NA18612_B1      NA18620_3       NA18621_B1      NA18622_B1      NA18623_B1      NA18624 NA18632_3       NA18635_A1      NA18637_2       NA18852 NA18853 NA18854 NA18855 NA18856 NA18857 NA18858 NA18859 NA18860 NA18861 NA18862 NA18863 NA18870 NA18871 NA18872 NA18912 NA18913 NA18914 NA18940_3       NA19092 NA19093 NA19094 NA19098 NA19099 NA19100 NA19101 NA19102 NA19103 NA19116 NA19119b        NA19120 NA19127 NA19128 NA19129 NA19130b        NA19131 NA19132b        NA19137 NA19138 NA19139 NA19140b        NA19141 NA19142 NA19143 NA19144 NA19145 NA19152 NA19153 NA19154 NA19159 NA19160 NA19161 NA19171 NA19172 NA19173 NA19192 NA19193 NA19194 NA19200 NA19201 NA19202 NA19203 NA19204 NA19205 NA19206 NA19207 NA19208v2       NA19209 NA19210 NA19211 NA19221 NA19222 NA19223 NA19238 NA19239 NA19240 NA_pos103a      NS12911_1
+chr1   5911136 .       T       TGCCATTCCAAAGAGGCACTCA  .       PASS    VC=INDEL;AC=28;AF=0.09;AN=316   GT      0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   17054990        .       G       GA      .       PASS    VC=INDEL;AC=25;AF=0.12;AN=200   GT      ./.     ./.     0/1     ./.     0/0     ./.     ./.     ./.     ./.     0/0     0/1     ./.     ./.     0/0     ./.     ./.     0/1     ./.     ./.     ./.     ./.     0/0     0/1     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     ./.     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     ./.     ./.     ./.     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/1     ./.     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     ./.     ./.     0/1     0/1     ./.     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     ./.     0/1     ./.     ./.     0/0     ./.     ./.     ./.     ./.     ./.     ./.     ./.     0/1     0/1     ./.
+chr1   17390953        .       CT      C       .       PASS    VC=INDEL;AC=118;AF=0.37;AN=316  GT      0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1
+chr1   17754916        .       CCT     C       .       PASS    VC=INDEL;AC=66;AF=0.21;AN=316;refseq.name=NM_018715;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1
+chr1   18293100        .       C       CCTC    .       PASS    VC=INDEL;AC=263;AF=0.84;AN=314  GT      1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1
+chr1   18823397        .       T       TTAAT   .       PASS    VC=INDEL;AC=87;AF=0.28;AN=316   GT      0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   19215209        .       G       GAG     .       PASS    VC=INDEL;AC=2;AF=0.01;AN=316;refseq.name=NM_003748;refseq.positionType=intron   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1
+chr1   19943821        .       CACAG   C       .       PASS    VC=INDEL;AC=12;AF=0.04;AN=308;refseq.name=NM_001032363;refseq.positionType=intron       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   20092486        .       GAAG    G       .       PASS    VC=INDEL;AC=7;AF=0.02;AN=314;refseq.name=NM_181719;refseq.positionType=intron   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   20977854        .       A       ATTC    .       PASS    VC=INDEL;AC=152;AF=0.52;AN=292;refseq.name=NM_032409;refseq.positionType=exon   GT      0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     ./.     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     ./.     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     ./.     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     ./.     ./.     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     ./.     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     ./.     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     1/1     0/1     1/1     0/0     ./.     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1
+chr1   21275058        .       CTTTG   C       .       PASS    VC=INDEL;AC=30;AF=0.1;AN=296;refseq.name=NM_003760;refseq.positionType=intron   GT      ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0
+chr1   22642904        .       A       AAC     .       PASS    VC=INDEL;AC=255;AF=0.85;AN=300  GT      1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     ./.     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     ./.     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1
+chr1   22844297        .       ATCT    A       .       PASS    VC=INDEL;AC=162;AF=0.51;AN=316;refseq.name=NM_001083621;refseq.positionType=intron      GT      0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0
+chr1   22844299        .       CTTC    C       .       PASS    VC=INDEL;AC=160;AF=0.51;AN=314;refseq.name=NM_001083621;refseq.positionType=intron      GT      0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     ./.     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0
+chr1   23162393        .       AA      A       .       PASS    VC=INDEL;AC=44;AF=0.14;AN=316;refseq.name=NM_004442;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1
+chr1   23882634        .       T       TAGGTG  .       PASS    VC=INDEL;AC=24;AF=0.08;AN=284   GT      0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     ./.     0/1     0/1     ./.     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0
+chr1   25799681        .       CTCTG   C       .       PASS    VC=INDEL;AC=49;AF=0.21;AN=230;refseq.name=NM_018202;refseq.positionType=intron  GT      0/1     ./.     1/1     ./.     0/1     ./.     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     ./.     ./.     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     1/1     ./.     1/1     0/0     0/1     1/1     ./.     0/1     ./.     0/1     ./.     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     ./.     ./.     0/1     ./.     1/1     0/1     ./.     0/1     1/1     ./.     ./.     0/1     ./.     0/1     ./.     ./.     1/1     ./.     0/1     ./.     1/1     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     ./.     ./.     0/0     ./.     ./.     ./.     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1
+chr1   26081170        .       CA      C       .       PASS    VC=INDEL;AC=17;AF=0.06;AN=308;refseq.name=NM_020379;refseq.positionType=intron  GT      0/0     ./.     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   26240086        .       GAT     G       .       PASS    VC=INDEL;AC=31;AF=0.1;AN=316    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   26725650        .       A       ATGAAG  .       PASS    VC=INDEL;AC=300;AF=0.95;AN=316  GT      1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1
+chr1   26725655        .       G       GTGAAG  .       PASS    VC=INDEL;AC=300;AF=0.95;AN=316  GT      1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1
+chr1   27425097        .       CTGG    C       .       PASS    VC=INDEL;AC=40;AF=0.16;AN=248;refseq.name=NM_003047;refseq.positionType=terminator      GT      1/1     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     ./.     ./.     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     ./.     ./.     ./.     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     0/1     0/1     0/1     ./.     ./.     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0
+chr1   27737240        .       A       AT      .       PASS    VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316;refseq.name=NM_006990;refseq.positionType=intron      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   27744410        .       GATCCATG        G       .       PASS    VC=INDEL;AC=166;AF=0.56;AN=296;refseq.name=NM_006990;refseq.positionType=intron GT      0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     ./.     0/1     0/0     ./.     0/0     ./.     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     0/0     ./.     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     ./.     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     0/1     1/1     ./.     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     ./.     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     ./.
+chr1   28156589        .       G       GGATG   .       PASS    VC=INDEL;AC=127;AF=0.4;AN=314;refseq.name=NM_002713;refseq.positionType=promoter        GT      0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     ./.     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0
+chr1   28721777        .       TA      T       .       PASS    VC=INDEL;AC=287;AF=0.91;AN=316;refseq.name=NM_001048183;refseq.positionType=intron      GT      1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1
+chr1   28721778        .       AA      A       .       PASS    VC=INDEL;AC=287;AF=0.91;AN=316;refseq.name=NM_001048183;refseq.positionType=intron      GT      1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1
+chr1   28907201        .       GT      G       .       PASS    VC=INDEL;AC=3;AF=0.01;AN=224    GT      0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     ./.     ./.     0/0     ./.     ./.     0/0     ./.     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/1     0/1     ./.     ./.     0/0     ./.     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     ./.     ./.     ./.     ./.
+chr1   29223339        .       G       GTGAG   .       PASS    VC=INDEL;AC=203;AF=0.7;AN=292;refseq.name=NM_004437;refseq.positionType=intron  GT      1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     ./.     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     ./.     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     0/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     ./.     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     ./.     ./.     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     ./.     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     ./.     1/1     0/1
+chr1   29223342        .       A       AGCAA   .       PASS    VC=INDEL;AC=71;AF=0.29;AN=242;refseq.name=NM_004437;refseq.positionType=intron  GT      0/1     0/1     1/1     ./.     0/1     0/1     0/1     0/0     ./.     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     ./.     1/1     0/1     ./.     ./.     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     ./.     0/1     ./.     0/1     ./.     0/1     0/1     ./.     0/1     0/1     ./.     ./.     0/1     ./.     ./.     ./.     ./.     0/1     ./.     0/0     ./.     ./.     ./.     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     ./.     ./.     0/0     0/0     ./.     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/1     ./.     ./.     0/0
+chr1   29865521        .       G       GCTCCGT .       PASS    VC=INDEL;AC=115;AF=0.36;AN=316  GT      0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0
+chr1   31128790        .       C       CT      .       PASS    VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   31135886        .       A       AG      .       PASS    VC=INDEL;AC=246;AF=0.92;AN=268  GT      ./.     1/1     0/1     1/1     0/1     ./.     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     ./.     ./.     ./.     1/1     ./.     1/1     0/1     0/1     0/1     ./.     1/1     1/1     ./.     ./.     0/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     ./.     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     1/1     1/1     1/1     ./.     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     ./.     ./.     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.
+chr1   31503645        .       AAAAGA  A       .       PASS    VC=INDEL;AC=5;AF=0.02;AN=314;refseq.name=NM_001020658;refseq.positionType=intron        GT      0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   31504005        .       C       CAT     .       PASS    VC=INDEL;AC=84;AF=0.27;AN=316;refseq.name=NM_001020658;refseq.positionType=intron       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0
+chr1   31731414        .       CCTCT   C       .       PASS    VC=INDEL;AC=40;AF=0.13;AN=314   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   31775152        .       A       ACTA    .       PASS    VC=INDEL;AC=47;AF=0.15;AN=308;refseq.name=NM_016505;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   31882582        .       G       GGCCTCA .       PASS    VC=INDEL;AC=163;AF=0.59;AN=274  GT      1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     ./.     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     ./.     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     ./.     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     ./.     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     ./.     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     ./.     ./.     ./.     1/1     ./.     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     ./.     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     ./.     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     ./.     1/1     0/1     ./.     0/1     0/1     0/1     ./.     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     ./.     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     ./.     0/1     0/1     0/1     ./.     ./.     0/1     0/1     ./.     0/0     0/1     ./.     0/1     ./.     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1
+chr1   32010706        .       GG      G       .       PASS    VC=INDEL;AC=312;AF=1;AN=312     GT      1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1
+chr1   32078865        .       G       GT      .       PASS    VC=INDEL;AC=78;AF=0.25;AN=316   GT      0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1
+chr1   33422344        .       G       GAA     .       PASS    VC=INDEL;AC=123;AF=0.39;AN=316;refseq.name=NM_153341;refseq.positionType=intron GT      1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1
+chr1   33634618        .       TC      T       .       PASS    VC=INDEL;AC=238;AF=0.75;AN=316;refseq.name=NM_018207;refseq.positionType=intron GT      0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1
+chr1   33965999        .       CCCAGTTC        C       .       PASS    VC=INDEL;AC=203;AF=0.65;AN=314  GT      0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     ./.     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1
+chr1   34176371        .       GAAACATAAG      G       .       PASS    VC=INDEL;AC=252;AF=0.95;AN=266;refseq.name=NM_052896;refseq.positionType=intron GT      0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     ./.     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     ./.     0/1     1/1     ./.     ./.     ./.     0/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     ./.     0/1     1/1     ./.     0/1     0/1     1/1     ./.     ./.     1/1     1/1     0/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     ./.     1/1
+chr1   34931817        .       AT      A       .       PASS    VC=INDEL;AC=38;AF=0.12;AN=316   GT      0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1
+chr1   35879227        .       CAT     C       .       PASS    VC=INDEL;AC=31;AF=0.1;AN=316;refseq.name=NM_005095;refseq.positionType=intron   GT      0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   36429590        .       A       AG      .       PASS    VC=INDEL;AC=181;AF=0.57;AN=316;refseq.name=NM_024852;refseq.positionType=intron GT      0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0
+chr1   36558240        .       C       CAC     .       PASS    VC=INDEL;AC=11;AF=0.03;AN=316;refseq.name=NM_017825;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   37034721        .       ATACT   A       .       PASS    VC=INDEL;AC=44;AF=0.16;AN=282   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     ./.     ./.     ./.     0/1     0/1     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     ./.     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0
+chr1   37142202        .       AATA    A       .       PASS    VC=INDEL;AC=24;AF=0.08;AN=314   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   37169424        .       TA      T       .       PASS    VC=INDEL;AC=176;AF=0.56;AN=316  GT      0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0
+chr1   37169427        .       AA      A       .       PASS    VC=INDEL;AC=173;AF=0.56;AN=308  GT      0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     ./.     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     ./.     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0
+chr1   37638341        .       T       TAT     .       PASS    VC=INDEL;AC=11;AF=0.05;AN=222   GT      0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/1     ./.     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/1     ./.     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     ./.     0/0     ./.     ./.     ./.     0/0     0/1     ./.     ./.     ./.     ./.     ./.     ./.     ./.     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     0/1     ./.     ./.     0/0     ./.     ./.     ./.     ./.     0/0     0/0     0/1     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     ./.     ./.     0/0
+chr1   38077349        .       CTTATCCCCATACTAGTTATTATCGAAACCATCAGCCTACTCATTCAACCAATAGCCCTGGCCGTACGCCTA        C       .       PASS    VC=INDEL;AC=209;AF=0.77;AN=272;refseq.name=NM_001038633;refseq.positionType=intron      GT      0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/1     1/1     ./.     1/1     ./.     0/1     1/1     1/1     1/1     ./.     ./.     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     ./.     ./.     1/1     1/1     ./.     0/1     ./.     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     ./.     ./.     ./.     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     ./.     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     ./.     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     ./.     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     ./.     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     ./.     ./.     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     ./.     1/1     0/1     1/1     0/1
+chr1   38392549        .       AT      A       .       PASS    VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316;refseq.name=NM_005540;refseq.positionType=intron      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   38664242        .       TA      T       .       PASS    VC=INDEL;AC=93;AF=0.29;AN=316   GT      0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0
+chr1   38739177        .       GTG     G       .       PASS    VC=INDEL;AC=32;AF=0.1;AN=316    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   39288395        .       CTTC    C       .       PASS    VC=INDEL;AC=36;AF=0.12;AN=306   GT      0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1
+chr1   39615407        .       C       CGATAT  .       PASS    VC=INDEL;AC=192;AF=0.63;AN=306;refseq.name=NM_012090;refseq.positionType=intron GT      1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     ./.     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     ./.     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     ./.     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     ./.     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1
+chr1   39615412        .       T       TGATAT  .       PASS    VC=INDEL;AC=200;AF=0.63;AN=316;refseq.name=NM_012090;refseq.positionType=intron GT      1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1
+chr1   39736467        .       T       TATAT   .       PASS    VC=INDEL;AC=27;AF=0.09;AN=316;refseq.name=NM_012090;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   39936801        .       GTG     G       .       PASS    VC=INDEL;AC=23;AF=0.07;AN=314;refseq.name=NM_012090;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   40525320        .       AACACAAGAAC     A       .       PASS    VC=INDEL;AC=21;AF=0.11;AN=196;refseq.name=NM_006367;refseq.positionType=intron  GT      ./.     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     ./.     1/1     ./.     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     ./.     ./.     0/1     ./.     0/0     ./.     ./.     ./.     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     ./.     ./.     ./.     ./.     ./.     ./.     ./.     0/0     0/0     ./.     ./.     ./.     0/1     0/1     0/0     ./.     ./.     ./.     ./.     ./.     0/0     ./.     ./.     ./.     ./.     ./.     ./.     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     ./.     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     ./.     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.
+chr1   40728529        .       TA      T       .       PASS    VC=INDEL;AC=216;AF=0.68;AN=316;refseq.name=NM_005857;refseq.positionType=intron GT      0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1
+chr1   41281719        .       CT      C       .       PASS    VC=INDEL;AC=142;AF=0.45;AN=316;refseq.name=NM_004700;refseq.positionType=intron GT      0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0
+chr1   41808814        .       CT      C       .       PASS    VC=INDEL;AC=32;AF=0.1;AN=308    GT      0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1
+chr1   41991662        .       CCA     C       .       PASS    VC=INDEL;AC=17;AF=0.06;AN=304;refseq.name=NM_024503;refseq.positionType=intron  GT      0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     ./.
+chr1   42083551        .       C       CT      .       PASS    VC=INDEL;AC=139;AF=0.44;AN=316;refseq.name=NM_024503;refseq.positionType=intron GT      0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0
+chr1   42531504        .       G       GATAG   .       PASS    VC=INDEL;AC=199;AF=0.66;AN=302  GT      0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     ./.     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     ./.     1/1     1/1     1/1     ./.     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     ./.     0/1     0/1     0/1     0/0     ./.     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1
+chr1   42835720        .       C       CTTG    .       PASS    VC=INDEL;AC=297;AF=0.94;AN=316  GT      1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1
+chr1   42835723        .       G       GTTG    .       PASS    VC=INDEL;AC=297;AF=0.94;AN=316  GT      1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1
+chr1   42880843        .       A       ACA     .       PASS    VC=INDEL;AC=179;AF=0.57;AN=316;refseq.name=NM_173642;refseq.positionType=exon   GT      0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1
+chr1   44114854        .       C       CGC     .       PASS    VC=INDEL;AC=107;AF=0.45;AN=238;refseq.name=NM_014663;refseq.positionType=promoter       GT      0/0     1/1     1/1     ./.     0/0     ./.     ./.     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     ./.     0/1     1/1     ./.     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     ./.     ./.     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     0/1     1/1     ./.     1/1     0/1     0/1     0/1     ./.     0/1     0/0     0/1     ./.     0/1     0/1     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     ./.     0/0     0/0     0/1     0/1     ./.     ./.     ./.     0/0     0/0     0/1     0/1     ./.     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     ./.     0/1     ./.     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     ./.     0/1     0/1     0/1     ./.     ./.     ./.     0/1     ./.     0/1     ./.     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     ./.     ./.     1/1     ./.     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     ./.     ./.     0/1     1/1     0/1     ./.     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     ./.     ./.     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     ./.     ./.     ./.     0/1     ./.     0/0     0/1
+chr1   44231607        .       CA      C       .       PASS    VC=INDEL;AC=216;AF=0.69;AN=314;refseq.name=NM_006279;refseq.positionType=intron GT      1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     ./.     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1
+chr1   44231608        .       AA      A       .       PASS    VC=INDEL;AC=215;AF=0.68;AN=314;refseq.name=NM_006279;refseq.positionType=intron GT      1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     ./.     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1
+chr1   44327106        .       GCTGTCAGGACTTGTATAGA    G       .       PASS    VC=INDEL;AC=193;AF=0.66;AN=294;refseq.name=NM_006279;refseq.positionType=intron GT      1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     ./.     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     0/1     0/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     ./.     1/1     ./.     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     ./.     0/1     ./.     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     ./.     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     0/1     ./.     1/1     1/1
+chr1   44730823        .       G       GGAGA   .       PASS    VC=INDEL;AC=295;AF=0.96;AN=306;refseq.name=NM_024066;refseq.positionType=intron GT      1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1
+chr1   44881687        .       GCAT    G       .       PASS    VC=INDEL;AC=29;AF=0.09;AN=314;refseq.name=NM_018150;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0
+chr1   45223909        .       GATTAGCTG       G       .       PASS    VC=INDEL;AC=167;AF=0.55;AN=306;refseq.name=NM_006845;refseq.positionType=intron GT      0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     ./.     0/1     ./.     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     ./.     0/1     1/1     1/1     ./.     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1
+chr1   46900444        .       T       TGTGGGAATGC     .       PASS    VC=INDEL;AC=2;AF=0.01;AN=296    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   46900720        .       C       CTT     .       PASS    VC=INDEL;AC=244;AF=0.79;AN=308  GT      1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     ./.     1/1     ./.     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1
+chr1   46900721        .       T       TTT     .       PASS    VC=INDEL;AC=241;AF=0.79;AN=304  GT      1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     ./.     1/1     ./.     1/1     0/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     ./.     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1
+chr1   47052336        .       TGAAA   T       .       PASS    VC=INDEL;AC=76;AF=0.24;AN=316;refseq.name=NM_003684;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0
+chr1   47167062        .       TT      T       .       PASS    VC=INDEL;AC=174;AF=0.64;AN=272;refseq.name=NM_014774;refseq.positionType=intron GT      ./.     0/1     0/1     0/1     ./.     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     ./.     ./.     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     ./.     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     ./.     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     ./.     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     0/1     0/1     0/0     0/1     ./.     1/1     1/1     1/1     ./.     ./.     0/0     ./.     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     ./.     0/1     1/1     ./.     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     ./.     1/1     ./.     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     ./.     0/1     ./.     0/1     1/1     0/1     1/1     ./.     1/1     ./.     0/0
+chr1   47324578        .       CTACTACAAA      C       .       PASS    VC=INDEL;AC=150;AF=0.65;AN=232  GT      1/1     ./.     ./.     ./.     ./.     0/1     0/0     0/1     0/0     ./.     ./.     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     ./.     0/1     0/1     0/0     0/1     ./.     0/1     0/0     ./.     0/0     1/1     1/1     ./.     0/1     1/1     1/1     ./.     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     ./.     0/1     ./.     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     0/1     ./.     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     ./.     ./.     0/1     0/1     0/1     ./.     1/1     0/1     0/0     0/1     ./.     0/1     1/1     0/1     ./.     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     1/1     ./.     0/0     0/1     0/0     ./.     1/1     1/1     1/1     ./.     ./.     1/1     ./.     ./.     0/0     ./.     0/1     0/1     ./.     ./.     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     ./.     ./.     ./.     0/1     ./.     0/1     0/1     0/1     ./.     0/1
+chr1   47325281        .       CA      C       .       PASS    VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   47891688        .       AT      A       .       PASS    VC=INDEL;AC=84;AF=0.29;AN=294   GT      1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     ./.     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     ./.     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     ./.     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     ./.     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/1     0/1     ./.     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0
+chr1   47931769        .       TTCTC   T       .       PASS    VC=INDEL;AC=2;AF=0.01;AN=316    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1
+chr1   48000154        .       G       GTTT    .       PASS    VC=INDEL;AC=11;AF=0.05;AN=232   GT      ./.     0/1     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     ./.     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     ./.     0/1     0/1     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     ./.     ./.     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     0/1     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0
+chr1   48146050        .       CCTGA   C       .       PASS    VC=INDEL;AC=28;AF=0.09;AN=316   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   48520865        .       CAGGGTGAGTAGGCCTGGGCAG  C       .       PASS    VC=INDEL;AC=4;AF=0.01;AN=316    GT      0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   48520886        .       GAG     G       .       PASS    VC=INDEL;AC=31;AF=0.14;AN=216   GT      ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     ./.     0/0     ./.     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     ./.     ./.     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     ./.     ./.     ./.     ./.     0/0     ./.     0/1     0/1     ./.     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     ./.     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     ./.     0/0     ./.     ./.     ./.     0/0     1/1     0/0     0/1     ./.     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     ./.     0/1     0/1     0/0     ./.     ./.     ./.
+chr1   48544917        .       G       GTGTT   .       PASS    VC=INDEL;AC=43;AF=0.14;AN=314   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   49109456        .       AGAGC   A       .       PASS    VC=INDEL;AC=31;AF=0.14;AN=226;refseq.name=NM_032785;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/1     0/1     ./.     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     ./.     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     ./.     ./.     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/1     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     ./.     ./.     0/0     0/1     ./.     ./.     ./.     ./.     0/1     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     ./.     0/0     ./.     0/0     ./.     ./.     ./.     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/1     ./.     ./.     ./.     0/1     0/1     0/1
+chr1   49124365        .       C       CGAG    .       PASS    VC=INDEL;AC=93;AF=0.29;AN=316;refseq.name=NM_032785;refseq.positionType=intron  GT      0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1
+chr1   49124368        .       G       GGAG    .       PASS    VC=INDEL;AC=93;AF=0.29;AN=316;refseq.name=NM_032785;refseq.positionType=intron  GT      0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1
+chr1   49126514        .       C       CTG     .       PASS    VC=INDEL;AC=89;AF=0.3;AN=296;refseq.name=NM_032785;refseq.positionType=intron   GT      0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     ./.     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     ./.     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     ./.     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1
+chr1   50107735        .       G       GA      .       PASS    VC=INDEL;AC=68;AF=0.22;AN=312   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     ./.     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   50539498        .       T       TCT     .       PASS    VC=INDEL;AC=312;AF=0.99;AN=316  GT      1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1
+chr1   50652516        .       A       AGAA    .       PASS    VC=INDEL;AC=247;AF=0.78;AN=316;refseq.name=NM_021952;refseq.positionType=intron GT      1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1
+chr1   51315116        .       ACTG    A       .       PASS    VC=INDEL;AC=13;AF=0.04;AN=316;refseq.name=NM_007051;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   52336500        .       TAATACA T       .       PASS    VC=INDEL;AC=17;AF=0.07;AN=230;refseq.name=NM_002525;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     ./.     0/1     ./.     ./.     ./.     0/0     ./.     ./.     0/0     ./.     ./.     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     ./.     0/1     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     ./.     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     ./.     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     ./.     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.
+chr1   52798171        .       A       AT      .       PASS    VC=INDEL;AC=307;AF=0.97;AN=316;refseq.name=NM_004799;refseq.positionType=intron GT      1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1
+chr1   53554533        .       A       AT      .       PASS    VC=INDEL;AC=33;AF=0.11;AN=294;refseq.name=NM_006671;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     0/1     0/0     0/0     ./.     0/1     ./.     0/1     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     ./.     ./.     0/1
+chr1   53986946        .       TG      T       .       PASS    VC=INDEL;AC=188;AF=0.59;AN=316;refseq.name=NM_147193;refseq.positionType=intron GT      1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1
+chr1   54168427        .       C       CTCTG   .       PASS    VC=INDEL;AC=109;AF=0.35;AN=308;refseq.name=NM_147193;refseq.positionType=intron GT      0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     ./.     1/1     0/0     0/0     ./.     1/1     0/1     0/1     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0
+chr1   54558546        .       T       TAGAC   .       PASS    VC=INDEL;AC=66;AF=0.21;AN=316;refseq.name=NM_153035;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   54558548        .       G       GACAG   .       PASS    VC=INDEL;AC=66;AF=0.21;AN=316;refseq.name=NM_153035;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   54619996        .       AC      A       .       PASS    VC=INDEL;AC=193;AF=0.64;AN=302;refseq.name=NM_201546;refseq.positionType=promoter       GT      1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     ./.     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     ./.     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     ./.     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     ./.     ./.     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     ./.     0/1     0/0     0/1     ./.     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1
+chr1   54757161        .       C       CCA     .       PASS    VC=INDEL;AC=186;AF=0.59;AN=314;refseq.name=NM_001009955;refseq.positionType=intron      GT      0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1
+chr1   54757166        .       C       CAC     .       PASS    VC=INDEL;AC=185;AF=0.59;AN=312;refseq.name=NM_001009955;refseq.positionType=intron      GT      0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1
+chr1   55566411        .       TTAGTC  T       .       PASS    VC=INDEL;AC=207;AF=0.66;AN=316;refseq.name=NM_015306;refseq.positionType=intron GT      1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1
+chr1   55743440        .       C       CCT     .       PASS    VC=INDEL;AC=261;AF=0.84;AN=312  GT      1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     ./.     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1
+chr1   55888273        .       T       TC      .       PASS    VC=INDEL;AC=265;AF=0.88;AN=302  GT      0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     ./.     0/1     ./.     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     ./.     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     0/1     0/1     1/1     ./.     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1
+chr1   55888274        .       C       CC      .       PASS    VC=INDEL;AC=271;AF=0.89;AN=306  GT      0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     ./.     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     ./.     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     ./.     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1
+chr1   55892282        .       T       TAGAAAA .       PASS    VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   55998244        .       CGCACGCTC       C       .       PASS    VC=INDEL;AC=265;AF=0.84;AN=314  GT      1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     ./.     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1
+chr1   56495367        .       CTGAG   C       .       PASS    VC=INDEL;AC=76;AF=0.24;AN=316   GT      0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   57353886        .       C       CTA     .       PASS    VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316;refseq.name=NM_000562;refseq.positionType=intron      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   57854490        .       AAT     A       .       PASS    VC=INDEL;AC=24;AF=0.08;AN=312;refseq.name=NM_021080;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   58391942        .       G       GAAA    .       PASS    VC=INDEL;AC=10;AF=0.03;AN=314;refseq.name=NM_021080;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1
+chr1   58413348        .       A       AG      .       PASS    VC=INDEL;AC=50;AF=0.22;AN=226;refseq.name=NM_021080;refseq.positionType=intron  GT      0/0     ./.     ./.     0/1     0/0     ./.     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     ./.     ./.     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     ./.     0/1     ./.     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     ./.     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     ./.     ./.     0/1     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     ./.     0/1     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     ./.     ./.     ./.     ./.     ./.     ./.     0/1     0/1     ./.     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/1     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     ./.     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/1     ./.     0/1     ./.     1/1     ./.     1/1
+chr1   58550673        .       CT      C       .       PASS    VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316;refseq.name=NM_021080;refseq.positionType=intron      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   58629900        .       CAGA    C       .       PASS    VC=INDEL;AC=15;AF=0.05;AN=316;refseq.name=NM_021080;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   58999156        .       AT      A       .       PASS    VC=INDEL;AC=151;AF=0.53;AN=286;refseq.name=NM_145243;refseq.positionType=intron GT      ./.     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     ./.     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     ./.     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     ./.     0/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     ./.     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     ./.     1/1     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     ./.     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     0/1     ./.     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     ./.     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1
+chr1   59009401        .       T       TT      .       PASS    VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316;refseq.name=NM_145243;refseq.positionType=intron      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   59104181        .       GA      G       .       PASS    VC=INDEL;AC=271;AF=0.89;AN=304  GT      1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     ./.     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1
+chr1   59319761        .       AG      A       .       PASS    VC=INDEL;AC=195;AF=0.67;AN=290  GT      0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     ./.     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     ./.     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     ./.     0/1     1/1     0/1     ./.     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     ./.     1/1     1/1     ./.     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     ./.     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     ./.     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     1/1     1/1     1/1     0/1
+chr1   59319762        .       GG      G       .       PASS    VC=INDEL;AC=200;AF=0.68;AN=296  GT      0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     ./.     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     ./.     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     ./.     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     0/1     ./.     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     ./.     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     ./.     1/1     ./.     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     1/1     1/1     1/1     0/1
+chr1   59630873        .       CT      C       .       PASS    VC=INDEL;AC=155;AF=0.49;AN=316  GT      1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0
+chr1   59635600        .       TAT     T       .       PASS    VC=INDEL;AC=287;AF=0.91;AN=316  GT      1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1
+chr1   60128716        .       G       GC      .       PASS    VC=INDEL;AC=309;AF=0.98;AN=316;refseq.name=NM_018291;refseq.positionType=intron GT      1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1
+chr1   60128717        .       C       CC      .       PASS    VC=INDEL;AC=309;AF=0.98;AN=316;refseq.name=NM_018291;refseq.positionType=intron GT      1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1
+chr1   60228311        .       T       TCT     .       PASS    VC=INDEL;AC=250;AF=0.8;AN=314;refseq.name=NM_018291;refseq.positionType=exon    GT      1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     ./.     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1
+chr1   60460874        .       A       ACTA    .       PASS    VC=INDEL;AC=316;AF=1;AN=316;refseq.name=NM_152377;refseq.positionType=intron    GT      1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1
+chr1   61786308        .       ATCTTA  A       .       PASS    VC=INDEL;AC=126;AF=0.4;AN=316;refseq.name=NM_005595;refseq.positionType=intron  GT      0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0
+chr1   62087979        .       T       TGACCTACTGTGCT  .       PASS    VC=INDEL;AC=194;AF=0.63;AN=310  GT      1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     ./.     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1
+chr1   62128942        .       CTTGCACA        C       .       PASS    VC=INDEL;AC=123;AF=0.39;AN=316  GT      0/0     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0
+chr1   62940266        .       T       TG      .       PASS    VC=INDEL;AC=133;AF=0.43;AN=312;refseq.name=NM_033407;refseq.positionType=intron GT      0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1
+chr1   63331690        .       TA      T       .       PASS    VC=INDEL;AC=234;AF=0.74;AN=316  GT      1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1
+chr1   63331691        .       AA      A       .       PASS    VC=INDEL;AC=232;AF=0.74;AN=314  GT      1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     ./.     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1
+chr1   63423181        .       T       TCAT    .       PASS    VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   63907866        .       A       AATGTTT .       PASS    VC=INDEL;AC=229;AF=0.76;AN=300;refseq.name=NM_014288;refseq.positionType=intron GT      1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     ./.     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     ./.     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     0/1     0/1     ./.     1/1     ./.     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     ./.     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1
+chr1   63907868        .       T       TGTTTAT .       PASS    VC=INDEL;AC=229;AF=0.77;AN=298;refseq.name=NM_014288;refseq.positionType=intron GT      ./.     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     ./.     ./.     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     0/1     ./.     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     ./.     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     ./.     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1
+chr1   63985884        .       ATCAT   A       .       PASS    VC=INDEL;AC=91;AF=0.31;AN=298;refseq.name=NM_014288;refseq.positionType=intron  GT      ./.     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     ./.     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     ./.     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     ./.     0/1     0/1     ./.     0/0     0/0     ./.     0/1
+chr1   63987096        .       ATG     A       .       PASS    VC=INDEL;AC=37;AF=0.18;AN=202;refseq.name=NM_014288;refseq.positionType=intron  GT      ./.     0/0     0/1     ./.     ./.     ./.     0/0     0/1     ./.     ./.     ./.     0/0     ./.     0/1     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     ./.     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/1     0/0     ./.     0/0     ./.     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/1     0/1     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     ./.     0/1     ./.     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     ./.     0/1     ./.     ./.     ./.     ./.     0/0     ./.     ./.     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     ./.     ./.     0/1     0/0     0/1     ./.     ./.     0/1     0/0     0/1     ./.     ./.     0/1     0/0     0/1     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     ./.     0/1     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     ./.     ./.     ./.     0/0     ./.     0/0     0/1     ./.     0/0     0/1     0/0     0/1     ./.     ./.     0/0     0/1     ./.     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1
+chr1   64264921        .       TTGTGTCAT       T       .       PASS    VC=INDEL;AC=136;AF=0.46;AN=298;refseq.name=NM_005012;refseq.positionType=intron GT      0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     ./.     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     ./.     0/1     ./.     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     ./.     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1
+chr1   64463351        .       GT      G       .       PASS    VC=INDEL;AC=244;AF=0.77;AN=316;refseq.name=NM_005012;refseq.positionType=intron GT      1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1
+chr1   64627261        .       A       AAA     .       PASS    VC=INDEL;AC=79;AF=0.25;AN=316;refseq.name=NM_005012;refseq.positionType=intron  GT      0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   65237568        .       G       GGTTA   .       PASS    VC=INDEL;AC=237;AF=0.75;AN=316;refseq.name=NM_018211;refseq.positionType=intron GT      0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1
+chr1   65299673        .       T       TTAAG   .       PASS    VC=INDEL;AC=10;AF=0.03;AN=314;refseq.name=NM_002227;refseq.positionType=exon    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   65545194        .       A       AT      .       PASS    VC=INDEL;AC=316;AF=1;AN=316     GT      1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1
+chr1   65545195        .       T       TT      .       PASS    VC=INDEL;AC=316;AF=1;AN=316     GT      1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1
+chr1   66063617        .       ATGT    A       .       PASS    VC=INDEL;AC=212;AF=0.67;AN=316;refseq.name=NM_002303;refseq.positionType=intron GT      0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1
+chr1   66198019        .       A       ACCATCCA        .       PASS    VC=INDEL;AC=76;AF=0.26;AN=296   GT      0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     ./.     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     ./.     ./.     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     1/1     0/0     ./.     0/0     ./.     ./.     1/1     0/1     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/1
+chr1   66460193        .       T       TC      .       PASS    VC=INDEL;AC=301;AF=0.95;AN=316;refseq.name=NM_001037341;refseq.positionType=intron      GT      1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1
+chr1   66801086        .       TGT     T       .       PASS    VC=INDEL;AC=19;AF=0.06;AN=316;refseq.name=NM_001037341;refseq.positionType=intron       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   66952677        .       A       ATC     .       PASS    VC=INDEL;AC=158;AF=0.65;AN=244  GT      0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     ./.     ./.     0/1     0/0     0/1     ./.     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     ./.     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     ./.     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     ./.     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     ./.     1/1     ./.     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     ./.     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     ./.     0/1     0/1     0/1     ./.     0/1     ./.     0/1     ./.     ./.     1/1     0/1     ./.     ./.     0/1     0/1     0/1     ./.     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     0/1     ./.     0/1     0/1     1/1     ./.     ./.     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     ./.     0/1     0/0     ./.     0/1     ./.     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     ./.     0/0     0/1     ./.     1/1     0/1     0/1     ./.     ./.     0/1     ./.     0/1     ./.     0/1     1/1     1/1     0/1     ./.     0/1     0/1     ./.     0/1     1/1
+chr1   67152254        .       ATAATTTCACGA    A       .       PASS    VC=INDEL;AC=9;AF=0.03;AN=316;refseq.name=NM_032291;refseq.positionType=intron   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   67206037        .       AATTG   A       .       PASS    VC=INDEL;AC=50;AF=0.19;AN=268;refseq.name=NM_032291;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/1     0/1     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/1     ./.     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     ./.     ./.     0/1     0/0     ./.     ./.     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     ./.     ./.     0/1     0/1     0/1     ./.     0/0     0/1     0/0     ./.     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1
+chr1   67459726        .       T       TT      .       PASS    VC=INDEL;AC=54;AF=0.18;AN=300   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     0/1     0/1     0/0     0/1     ./.     ./.     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     ./.     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     ./.
+chr1   68038796        .       ACA     A       .       PASS    VC=INDEL;AC=21;AF=0.08;AN=264   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     ./.     0/1     0/0     ./.     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0
+chr1   68291788        .       GC      G       .       PASS    VC=INDEL;AC=19;AF=0.06;AN=316;refseq.name=NM_018841;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0
+chr1   68570194        .       CCCT    C       .       PASS    VC=INDEL;AC=110;AF=0.35;AN=310;refseq.name=NM_001002292;refseq.positionType=intron      GT      0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     ./.     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0
+chr1   69008683        .       C       CA      .       PASS    VC=INDEL;AC=68;AF=0.3;AN=230    GT      0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     ./.     0/1     0/0     ./.     ./.     0/0     1/1     ./.     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     ./.     0/1     1/1     ./.     ./.     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     ./.     0/1     0/1     0/0     ./.     ./.     ./.     1/1     0/1     1/1     0/0     ./.     1/1     0/1     ./.     0/1     0/0     ./.     0/0     0/1     ./.     0/1     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     ./.     ./.     1/1     ./.     ./.     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     ./.     1/1     1/1     ./.     0/1     0/0     1/1     ./.     ./.     ./.     0/0     ./.     1/1     ./.     ./.     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     0/1     ./.     ./.     ./.     0/1     0/1     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.
+chr1   69398928        .       CAAC    C       .       PASS    VC=INDEL;AC=66;AF=0.21;AN=316   GT      0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0
+chr1   69424885        .       AG      A       .       PASS    VC=INDEL;AC=257;AF=0.81;AN=316  GT      1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1
+chr1   69424886        .       GG      G       .       PASS    VC=INDEL;AC=257;AF=0.81;AN=316  GT      1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1
+chr1   69702172        .       T       TT      .       PASS    VC=INDEL;AC=186;AF=0.59;AN=316  GT      1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1
+chr1   69947085        .       T       TT      .       PASS    VC=INDEL;AC=199;AF=0.87;AN=230  GT      ./.     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     ./.     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     ./.     ./.     ./.     0/0     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     ./.     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     ./.     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     ./.     ./.     0/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     ./.     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     0/1     ./.     0/0     ./.     ./.     1/1     ./.     1/1     ./.     ./.     1/1     0/1     ./.     0/1     ./.     1/1     1/1     ./.     1/1     ./.     0/1     0/0     1/1     ./.     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     ./.     1/1     1/1     ./.     ./.     ./.     ./.     ./.     ./.     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     ./.     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     ./.     ./.     1/1     1/1
+chr1   70116412        .       T       TAAT    .       PASS    VC=INDEL;AC=236;AF=0.77;AN=308  GT      0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     ./.     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     ./.     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     ./.     1/1     1/1     0/1     0/1
+chr1   70794740        .       AAAAC   A       .       PASS    VC=INDEL;AC=49;AF=0.17;AN=288;refseq.name=NM_030816;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     ./.     ./.     0/1     ./.     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     ./.     ./.     ./.     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   70796576        .       TTACTT  T       .       PASS    VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316;refseq.name=NM_030816;refseq.positionType=intron      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   71101845        .       TG      T       .       PASS    VC=INDEL;AC=38;AF=0.12;AN=310   GT      0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   71353307        .       AT      A       .       PASS    VC=INDEL;AC=88;AF=0.28;AN=310;refseq.name=NM_000957;refseq.positionType=intron  GT      0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/1     ./.     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1
+chr1   71366228        .       AA      A       .       PASS    VC=INDEL;AC=123;AF=0.39;AN=314;refseq.name=NM_000957;refseq.positionType=intron GT      1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/0     1/1     ./.     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1
+chr1   71366595        .       A       AAGTG   .       PASS    VC=INDEL;AC=108;AF=0.34;AN=316;refseq.name=NM_000957;refseq.positionType=intron GT      0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1
+chr1   71366598        .       T       TGAGT   .       PASS    VC=INDEL;AC=109;AF=0.34;AN=316;refseq.name=NM_000957;refseq.positionType=intron GT      0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1
+chr1   71693491        .       TGAG    T       .       PASS    VC=INDEL;AC=32;AF=0.1;AN=312    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     ./.     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   71693493        .       AGGA    A       .       PASS    VC=INDEL;AC=34;AF=0.11;AN=316   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   72053145        .       AG      A       .       PASS    VC=INDEL;AC=229;AF=0.72;AN=316;refseq.name=NM_173808;refseq.positionType=intron GT      1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1
+chr1   72321086        .       AA      A       .       PASS    VC=INDEL;AC=54;AF=0.17;AN=314;refseq.name=NM_173808;refseq.positionType=intron  GT      0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1
+chr1   73854019        .       T       TTTTA   .       PASS    VC=INDEL;AC=181;AF=0.59;AN=308  GT      0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     ./.     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     ./.     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     ./.     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1
+chr1   74227801        .       AG      A       .       PASS    VC=INDEL;AC=2;AF=0.01;AN=316    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1
+chr1   74404505        .       TTT     T       .       PASS    VC=INDEL;AC=23;AF=0.07;AN=316   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   74892891        .       AG      A       .       PASS    VC=INDEL;AC=75;AF=0.24;AN=316;refseq.name=NM_001112808;refseq.positionType=intron       GT      0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1
+chr1   74896404        .       ACTCAA  A       .       PASS    VC=INDEL;AC=26;AF=0.08;AN=316;refseq.name=NM_001112808;refseq.positionType=intron       GT      0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   75049490        .       C       CT      .       PASS    VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316;refseq.name=NM_001002912;refseq.positionType=intron   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   75156563        .       GCTT    G       .       PASS    VC=INDEL;AC=259;AF=0.82;AN=316  GT      0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1
+chr1   75661521        .       TTCTT   T       .       PASS    VC=INDEL;AC=7;AF=0.02;AN=312    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   76005746        .       A       AC      .       PASS    VC=INDEL;AC=184;AF=0.58;AN=316;refseq.name=NM_152697;refseq.positionType=intron GT      0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0
+chr1   76054645        .       AT      A       .       PASS    VC=INDEL;AC=14;AF=0.05;AN=290;refseq.name=NM_152697;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0
+chr1   76110056        .       ATCAT   A       .       PASS    VC=INDEL;AC=202;AF=0.7;AN=290   GT      0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     ./.     1/1     ./.     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     ./.     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     ./.     0/1     0/1     1/1     ./.     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     ./.     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     ./.     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     ./.     1/1
+chr1   76110059        .       ATTCA   A       .       PASS    VC=INDEL;AC=198;AF=0.68;AN=290  GT      ./.     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     ./.     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     ./.     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     ./.     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     ./.     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     ./.     0/1     0/1     ./.     1/1     0/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     ./.     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/1     0/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     ./.     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1
+chr1   76603385        .       A       AA      .       PASS    VC=INDEL;AC=45;AF=0.14;AN=316;refseq.name=NM_152996;refseq.positionType=intron  GT      0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0
+chr1   76647177        .       T       TA      .       PASS    VC=INDEL;AC=44;AF=0.15;AN=292;refseq.name=NM_152996;refseq.positionType=intron  GT      0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     0/1     0/1     0/0     0/1     ./.     ./.     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     ./.     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0
+chr1   76772246        .       TAG     T       .       PASS    VC=INDEL;AC=71;AF=0.22;AN=316;refseq.name=NM_152996;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1
+chr1   77019040        .       G       GA      .       PASS    VC=INDEL;AC=123;AF=0.39;AN=316;refseq.name=NM_152996;refseq.positionType=intron GT      0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1
+chr1   77019568        .       TTCTG   T       .       PASS    VC=INDEL;AC=72;AF=0.23;AN=316;refseq.name=NM_152996;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1
+chr1   77147457        .       T       TG      .       PASS    VC=INDEL;AC=307;AF=0.97;AN=316  GT      1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1
+chr1   77154589        .       T       TA      .       PASS    VC=INDEL;AC=300;AF=0.95;AN=316  GT      1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1
+chr1   77350958        .       GT      G       .       PASS    VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316;refseq.name=NM_030965;refseq.positionType=intron      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   77412672        .       T       TCAAA   .       PASS    VC=INDEL;AC=183;AF=0.58;AN=316;refseq.name=NM_030965;refseq.positionType=intron GT      0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1
+chr1   77412677        .       C       CAAAC   .       PASS    VC=INDEL;AC=183;AF=0.58;AN=316;refseq.name=NM_030965;refseq.positionType=intron GT      0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1
+chr1   77761353        .       ATTCT   A       .       PASS    VC=INDEL;AC=87;AF=0.28;AN=310;refseq.name=NM_174858;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     ./.     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1
+chr1   78436001        .       T       TCT     .       PASS    VC=INDEL;AC=139;AF=0.45;AN=308;refseq.name=NM_003902;refseq.positionType=intron GT      0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     ./.     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     ./.     1/1     1/1     ./.     1/1     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0
+chr1   78477804        .       T       TAAGAC  .       PASS    VC=INDEL;AC=294;AF=0.93;AN=316;refseq.name=NM_007034;refseq.positionType=intron GT      1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1
+chr1   78533885        .       CAG     C       .       PASS    VC=INDEL;AC=126;AF=0.4;AN=316;refseq.name=NM_017655;refseq.positionType=intron  GT      0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1
+chr1   78533886        .       AGA     A       .       PASS    VC=INDEL;AC=126;AF=0.4;AN=316;refseq.name=NM_017655;refseq.positionType=intron  GT      0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1
+chr1   78752617        .       TC      T       .       PASS    VC=INDEL;AC=160;AF=0.51;AN=314  GT      0/1     1/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     ./.     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1
+chr1   79595269        .       T       TC      .       PASS    VC=INDEL;AC=37;AF=0.12;AN=312   GT      0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1
+chr1   79694557        .       CTTGT   C       .       PASS    VC=INDEL;AC=173;AF=0.68;AN=254  GT      0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     ./.     ./.     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     ./.     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     ./.     ./.     ./.     ./.     0/0     0/1     0/1     ./.     0/1     0/1     ./.     0/0     0/1     ./.     ./.     0/1     1/1     0/1     0/1     ./.     0/1     0/1     ./.     ./.     0/1     ./.     1/1     ./.     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     ./.     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     ./.     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     ./.     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     ./.     ./.     1/1     0/1     1/1     ./.     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     0/1     0/1     ./.     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0
+chr1   80133716        .       CA      C       .       PASS    VC=INDEL;AC=74;AF=0.27;AN=276   GT      0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     ./.     0/0     ./.     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     ./.     ./.     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     0/1     1/1     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     ./.     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     ./.     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     ./.     ./.     0/1     ./.     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     ./.     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0
+chr1   80193527        .       CA      C       .       PASS    VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=314       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   80279810        .       T       TT      .       PASS    VC=INDEL;AC=69;AF=0.22;AN=314   GT      0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1
+chr1   80415715        .       C       CATGTCTATTAT    .       PASS    VC=INDEL;AC=197;AF=0.62;AN=316  GT      0/1     0/0     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1
+chr1   80415717        .       T       TGTCTATTATAT    .       PASS    VC=INDEL;AC=197;AF=0.62;AN=316  GT      0/1     0/0     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1
+chr1   80606020        .       GTAGGC  G       .       PASS    VC=INDEL;AC=282;AF=0.89;AN=316  GT      1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1
+chr1   80684057        .       A       AA      .       PASS    VC=INDEL;AC=217;AF=0.69;AN=316  GT      1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1
+chr1   80857688        .       AAATA   A       .       PASS    VC=INDEL;AC=97;AF=0.31;AN=316   GT      0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0
+chr1   81007659        .       A       AC      .       PASS    VC=INDEL;AC=185;AF=0.59;AN=312  GT      0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     ./.     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     ./.     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0
+chr1   81007660        .       C       CC      .       PASS    VC=INDEL;AC=185;AF=0.59;AN=314  GT      0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     ./.     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0
+chr1   81912884        .       C       CT      .       PASS    VC=INDEL;AC=15;AF=0.05;AN=298   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0
+chr1   82042397        .       TCTT    T       .       PASS    VC=INDEL;AC=5;AF=0.02;AN=316    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   82264610        .       TG      T       .       PASS    VC=INDEL;AC=167;AF=0.54;AN=312;refseq.name=NM_012302;refseq.positionType=promoter       GT      0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     ./.     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     ./.     0/1     0/1     0/0
+chr1   82264994        .       G       GGTAG   .       PASS    VC=INDEL;AC=49;AF=0.16;AN=316;refseq.name=NM_012302;refseq.positionType=promoter        GT      0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0
+chr1   82280496        .       ATGT    A       .       PASS    VC=INDEL;AC=84;AF=0.27;AN=316;refseq.name=NM_012302;refseq.positionType=intron  GT      0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   82315714        .       G       GAGTG   .       PASS    VC=INDEL;AC=38;AF=0.12;AN=306;refseq.name=NM_012302;refseq.positionType=intron  GT      0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1
+chr1   82316526        .       TT      T       .       PASS    VC=INDEL;AC=209;AF=0.67;AN=312;refseq.name=NM_012302;refseq.positionType=intron GT      0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     ./.     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     ./.     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0
+chr1   82329993        .       CATAT   C       .       PASS    VC=INDEL;AC=305;AF=0.97;AN=316;refseq.name=NM_012302;refseq.positionType=intron GT      1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1
+chr1   82710650        .       AA      A       .       PASS    VC=INDEL;AC=297;AF=0.96;AN=310  GT      1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1
+chr1   83144930        .       TC      T       .       PASS    VC=INDEL;AC=153;AF=0.55;AN=278  GT      1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     ./.     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     ./.     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     1/1     0/1     ./.     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     0/1     0/1     ./.     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     ./.     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     ./.     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     ./.     1/1     0/0     ./.     0/1     0/1     0/0     0/1     ./.     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     ./.     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     ./.     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     ./.     0/0     1/1     ./.     ./.     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     ./.     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1
+chr1   83208212        .       C       CAGAT   .       PASS    VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   83208213        .       A       AGATA   .       PASS    VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   83581070        .       C       CCAGA   .       PASS    VC=INDEL;AC=188;AF=0.74;AN=254  GT      ./.     ./.     1/1     0/1     ./.     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     ./.     1/1     0/1     ./.     ./.     ./.     1/1     1/1     ./.     0/0     0/1     0/1     1/1     ./.     0/1     1/1     0/1     0/1     ./.     0/0     1/1     0/1     0/1     ./.     ./.     0/1     1/1     ./.     1/1     0/1     0/1     ./.     ./.     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     ./.     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     ./.     0/1     0/0     0/1     ./.     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     ./.     1/1     0/1     0/1     ./.     ./.     ./.     0/1     1/1     ./.     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     ./.     0/1     0/1     ./.     1/1     0/1     1/1     ./.     ./.     0/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     ./.     1/1
+chr1   84127066        .       TCT     T       .       PASS    VC=INDEL;AC=71;AF=0.22;AN=316   GT      1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1
+chr1   84822658        .       TCAATTAAAACTCACAG       T       .       PASS    VC=INDEL;AC=45;AF=0.16;AN=286   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     ./.     0/1     1/1     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     ./.     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     ./.     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     ./.     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0
+chr1   85570521        .       GTTC    G       .       PASS    VC=INDEL;AC=166;AF=0.53;AN=316;refseq.name=NM_145172;refseq.positionType=intron GT      0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1
+chr1   86565855        .       T       TCT     .       PASS    VC=INDEL;AC=20;AF=0.06;AN=316;refseq.name=NM_152890;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0
+chr1   86714492        .       T       TA      .       PASS    VC=INDEL;AC=263;AF=0.88;AN=300  GT      0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     ./.     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     ./.     1/1     1/1     ./.     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     ./.     1/1     1/1
+chr1   86786541        .       CAG     C       .       PASS    VC=INDEL;AC=7;AF=0.02;AN=316    GT      0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   86839425        .       TACTT   T       .       PASS    VC=INDEL;AC=15;AF=0.05;AN=280;refseq.name=NM_001007022;refseq.positionType=intron       GT      0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     ./.     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0
+chr1   87558067        .       CACATAC C       .       PASS    VC=INDEL;AC=285;AF=0.97;AN=294;refseq.name=NM_012262;refseq.positionType=intron GT      1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     ./.     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     ./.     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     ./.     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     ./.     0/1     1/1     1/1
+chr1   88184554        .       T       TCA     .       PASS    VC=INDEL;AC=40;AF=0.14;AN=276   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     ./.     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     ./.     0/0     ./.     ./.     0/0     ./.     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     ./.     0/1     0/1
+chr1   88351056        .       A       AGT     .       PASS    VC=INDEL;AC=222;AF=0.7;AN=316   GT      0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0
+chr1   88391828        .       C       CCTT    .       PASS    VC=INDEL;AC=216;AF=0.7;AN=310   GT      0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     ./.     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1
+chr1   88391834        .       T       TCTT    .       PASS    VC=INDEL;AC=219;AF=0.69;AN=316  GT      0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1
+chr1   88423056        .       T       TA      .       PASS    VC=INDEL;AC=210;AF=0.8;AN=262   GT      1/1     0/0     1/1     ./.     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     ./.     ./.     ./.     1/1     1/1     ./.     0/1     0/1     0/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     ./.     0/1     1/1     0/1     0/1     ./.     ./.     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     ./.     ./.     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     ./.     1/1     ./.     0/0     0/1     1/1     ./.     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     ./.     1/1     1/1     ./.     1/1     0/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1
+chr1   88878932        .       TGAAG   T       .       PASS    VC=INDEL;AC=222;AF=0.71;AN=314  GT      0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1
+chr1   88934449        .       T       TA      .       PASS    VC=INDEL;AC=215;AF=0.71;AN=304  GT      0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     ./.     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     ./.     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     ./.     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0
+chr1   89147233        .       C       CTG     .       PASS    VC=INDEL;AC=270;AF=0.94;AN=288;refseq.name=NM_006256;refseq.positionType=promoter       GT      0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     ./.     1/1     ./.     ./.     1/1     1/1     0/1     0/1     ./.     1/1     1/1     1/1     ./.     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     ./.     ./.     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1
+chr1   89147234        .       T       TGT     .       PASS    VC=INDEL;AC=193;AF=0.91;AN=212;refseq.name=NM_006256;refseq.positionType=promoter       GT      ./.     1/1     1/1     1/1     ./.     ./.     1/1     1/1     ./.     1/1     ./.     ./.     1/1     1/1     ./.     1/1     ./.     ./.     ./.     ./.     ./.     1/1     1/1     ./.     0/1     1/1     0/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     ./.     ./.     ./.     1/1     1/1     ./.     0/1     ./.     1/1     1/1     1/1     ./.     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     ./.     ./.     ./.     ./.     ./.     ./.     1/1     ./.     1/1     ./.     ./.     ./.     0/1     ./.     1/1     ./.     ./.     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     ./.     ./.     1/1     1/1     ./.     1/1     0/1     0/1     ./.     0/0     0/1     ./.     ./.     ./.     ./.     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     ./.     ./.     1/1     ./.     ./.     ./.     1/1
+chr1   90055475        .       TT      T       .       PASS    VC=INDEL;AC=35;AF=0.11;AN=316;refseq.name=NM_015350;refseq.positionType=intron  GT      0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0
+chr1   90055577        .       TATG    T       .       PASS    VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316;refseq.name=NM_015350;refseq.positionType=intron      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   90305331        .       G       GA      .       PASS    VC=INDEL;AC=301;AF=0.95;AN=316;refseq.name=NM_018103;refseq.positionType=intron GT      1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1
+chr1   91238816        .       G       GT      .       PASS    VC=INDEL;AC=86;AF=0.29;AN=296   GT      0/0     0/0     ./.     1/1     0/0     0/0     0/1     ./.     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     ./.     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     ./.     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     ./.     0/1
+chr1   91308113        .       GC      G       .       PASS    VC=INDEL;AC=8;AF=0.03;AN=282    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/1     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0
+chr1   91354296        .       TT      T       .       PASS    VC=INDEL;AC=252;AF=0.83;AN=304  GT      1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     ./.     1/1     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     ./.     ./.     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     ./.     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1
+chr1   91544957        .       ACT     A       .       PASS    VC=INDEL;AC=99;AF=0.32;AN=314   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0
+chr1   91566585        .       GTTA    G       .       PASS    VC=INDEL;AC=139;AF=0.45;AN=312  GT      0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     ./.     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1
+chr1   92219769        .       C       CTCCTCAA        .       PASS    VC=INDEL;AC=54;AF=0.17;AN=314;refseq.name=NM_003243;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   93167519        .       C       CTG     .       PASS    VC=INDEL;AC=276;AF=1;AN=276;refseq.name=NM_005665;refseq.positionType=intron    GT      1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     ./.     1/1     ./.     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     ./.     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1
+chr1   93628710        .       TACTC   T       .       PASS    VC=INDEL;AC=94;AF=0.31;AN=304;refseq.name=NM_016040;refseq.positionType=intron  GT      0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     ./.     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/0     ./.     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1
+chr1   93704043        .       T       TCTAGAAAAATC    .       PASS    VC=INDEL;AC=7;AF=0.02;AN=306;refseq.name=NM_206886;refseq.positionType=intron   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   94443843        .       G       GAGAG   .       PASS    VC=INDEL;AC=88;AF=0.3;AN=292    GT      0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     ./.     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/1     ./.     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     ./.     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     ./.     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     ./.     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0
+chr1   94634727        .       TGAGT   T       .       PASS    VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316;refseq.name=NM_004815;refseq.positionType=exon        GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   95103314        .       AGCATCCTAAA     A       .       PASS    VC=INDEL;AC=6;AF=0.03;AN=240    GT      ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/1     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     ./.     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/1     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   95167241        .       TTAAC   T       .       PASS    VC=INDEL;AC=115;AF=0.36;AN=316  GT      0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1
+chr1   95167244        .       ACTAA   A       .       PASS    VC=INDEL;AC=116;AF=0.37;AN=316  GT      0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1
+chr1   95266356        .       A       AAAATAAGAATCCA  .       PASS    VC=INDEL;AC=212;AF=0.83;AN=256  GT      1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     ./.     1/1     1/1     1/1     ./.     ./.     ./.     0/0     1/1     0/0     0/1     ./.     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     ./.     0/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     ./.     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     ./.     1/1     ./.     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     ./.     ./.     0/1     ./.     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     ./.     0/1     ./.     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     ./.     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     ./.     ./.     ./.     0/1     0/1     1/1     ./.     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     ./.     0/1     ./.     1/1     ./.     ./.     ./.
+chr1   95349846        .       G       GG      .       PASS    VC=INDEL;AC=195;AF=0.65;AN=302;refseq.name=NM_001114106;refseq.positionType=intron      GT      1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     ./.     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     ./.     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     ./.     1/1     0/1     ./.     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     ./.     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     ./.     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     ./.     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1
+chr1   95638470        .       GTAG    G       .       PASS    VC=INDEL;AC=9;AF=0.03;AN=306;refseq.name=NM_152487;refseq.positionType=intron   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   96578762        .       CAG     C       .       PASS    VC=INDEL;AC=78;AF=0.25;AN=314   GT      1/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1
+chr1   97069290        .       G       GT      .       PASS    VC=INDEL;AC=57;AF=0.18;AN=316   GT      0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0
+chr1   97352585        .       A       AGA     .       PASS    VC=INDEL;AC=167;AF=0.53;AN=316  GT      0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1
+chr1   97471673        .       T       TTA     .       PASS    VC=INDEL;AC=39;AF=0.16;AN=238   GT      0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     0/1     0/0     1/1     ./.     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     1/1     ./.     0/1     ./.     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     ./.     ./.     0/1     0/0     0/0     0/1     ./.     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     ./.     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     ./.     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     ./.     ./.     ./.     0/0     0/1     ./.     ./.     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     ./.     0/1     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/1
+chr1   97654513        .       GTTAT   G       .       PASS    VC=INDEL;AC=17;AF=0.06;AN=302;refseq.name=NM_000110;refseq.positionType=intron  GT      ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   97728316        .       AATA    A       .       PASS    VC=INDEL;AC=15;AF=0.05;AN=316;refseq.name=NM_000110;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0
+chr1   97862494        .       TCCT    T       .       PASS    VC=INDEL;AC=47;AF=0.18;AN=256;refseq.name=NM_000110;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/1     ./.     0/1     0/0     0/1     ./.     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     ./.     0/1     1/1     0/0     0/0     ./.     ./.     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/1     0/1     0/0     ./.     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     ./.     0/1     0/1     ./.     ./.     0/1     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     1/1     ./.     0/1     0/1     0/1     ./.     0/1     0/1     0/1     0/0     ./.     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.
+chr1   97940369        .       TAACT   T       .       PASS    VC=INDEL;AC=37;AF=0.12;AN=306;refseq.name=NM_000110;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     ./.     ./.     0/1     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0
+chr1   98400957        .       C       CGATAT  .       PASS    VC=INDEL;AC=290;AF=0.92;AN=316  GT      1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1
+chr1   99032443        .       T       TTC     .       PASS    VC=INDEL;AC=230;AF=0.79;AN=292  GT      0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     ./.     ./.     ./.     ./.     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     ./.     0/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     ./.     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     ./.     0/0     1/1
+chr1   99032444        .       T       TCT     .       PASS    VC=INDEL;AC=236;AF=0.8;AN=296   GT      0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     ./.     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     ./.     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     ./.     0/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     ./.     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1
+chr1   99662955        .       A       AAGA    .       PASS    VC=INDEL;AC=146;AF=0.46;AN=316  GT      0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0
+chr1   99714941        .       GTTACAG G       .       PASS    VC=INDEL;AC=6;AF=0.02;AN=316    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   99848725        .       AT      A       .       PASS    VC=INDEL;AC=50;AF=0.16;AN=316   GT      0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   100194878       .       C       CCT     .       PASS    VC=INDEL;AC=248;AF=0.78;AN=316;refseq.name=NM_001013660;refseq.positionType=intron      GT      1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1
+chr1   100194903       .       C       CT      .       PASS    VC=INDEL;AC=7;AF=0.02;AN=316;refseq.name=NM_001013660;refseq.positionType=intron        GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   100567908       .       C       CT      .       PASS    VC=INDEL;AC=43;AF=0.14;AN=300;refseq.name=NM_194292;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     ./.     ./.     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0
+chr1   100793875       .       CACTC   C       .       PASS    VC=INDEL;AC=105;AF=0.38;AN=274  GT      0/0     0/1     0/1     ./.     0/1     1/1     0/0     ./.     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     ./.     0/1     0/1     0/0     ./.     0/1     ./.     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     ./.     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     ./.     0/1     0/1     ./.     0/1     0/1     0/0     ./.     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     ./.     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     ./.     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     ./.     1/1     0/1     ./.     ./.     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     0/1     0/1     0/1     0/0
+chr1   100808351       .       TT      T       .       PASS    VC=INDEL;AC=27;AF=0.09;AN=294   GT      ./.     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     ./.     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     ./.     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   100856872       .       T       TT      .       PASS    VC=INDEL;AC=79;AF=0.25;AN=316;refseq.name=NM_003672;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0
+chr1   101093845       .       TTCTGTAGTCAC    T       .       PASS    VC=INDEL;AC=24;AF=0.08;AN=316   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1
+chr1   101295925       .       CTA     C       .       PASS    VC=INDEL;AC=82;AF=0.26;AN=314   GT      0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1
+chr1   101442572       .       T       TT      .       PASS    VC=INDEL;AC=99;AF=0.31;AN=316;refseq.name=NM_133496;refseq.positionType=exon    GT      0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1
+chr1   101482924       .       CTGTG   C       .       PASS    VC=INDEL;AC=32;AF=0.1;AN=316;refseq.name=NM_001077394;refseq.positionType=intron        GT      0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1
+chr1   101859015       .       G       GA      .       PASS    VC=INDEL;AC=107;AF=0.34;AN=316  GT      1/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0
+chr1   102315705       .       A       ATCTC   .       PASS    VC=INDEL;AC=185;AF=0.59;AN=316;refseq.name=NM_058170;refseq.positionType=intron GT      0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1
+chr1   102315708       .       T       TCTCT   .       PASS    VC=INDEL;AC=185;AF=0.59;AN=316;refseq.name=NM_058170;refseq.positionType=intron GT      0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1
+chr1   103391817       .       TTA     T       .       PASS    VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=244;refseq.name=NM_001854;refseq.positionType=intron      GT      0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     ./.     ./.     ./.     ./.     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     ./.     ./.     0/0     0/0
+chr1   103722297       .       TGT     T       .       PASS    VC=INDEL;AC=32;AF=0.1;AN=316    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0
+chr1   104533187       .       A       AGTT    .       PASS    VC=INDEL;AC=148;AF=0.47;AN=316  GT      0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1
+chr1   104896267       .       GAG     G       .       PASS    VC=INDEL;AC=48;AF=0.15;AN=312   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0
+chr1   104896390       .       ATATT   A       .       PASS    VC=INDEL;AC=38;AF=0.14;AN=268   GT      0/0     0/1     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     ./.     0/0     1/1     0/0     ./.     0/1     1/1     ./.     1/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     ./.     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     1/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     ./.     0/1     0/0
+chr1   105259435       .       CACTAAACGTGCC   C       .       PASS    VC=INDEL;AC=6;AF=0.02;AN=250    GT      ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     ./.     ./.     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     ./.     ./.     0/1     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/1     ./.     0/0
+chr1   105451424       .       A       ATCTAGT .       PASS    VC=INDEL;AC=98;AF=0.31;AN=316   GT      0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1
+chr1   105504523       .       C       CTTT    .       PASS    VC=INDEL;AC=82;AF=0.29;AN=282   GT      ./.     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     0/1     0/0     ./.     0/1     0/1     0/1     ./.     1/1     0/0     0/1     0/0     ./.     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     ./.     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     ./.     ./.     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     ./.     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     ./.     0/0     0/1     ./.     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1
+chr1   105837170       .       T       TAA     .       PASS    VC=INDEL;AC=67;AF=0.24;AN=280   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     ./.     0/0     0/1     1/1     1/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     0/1     0/1     0/0     0/1     ./.     ./.     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     ./.     0/1     1/1     0/1     1/1     ./.     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/1     ./.     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     ./.     0/0
+chr1   105868766       .       ATACTT  A       .       PASS    VC=INDEL;AC=92;AF=0.34;AN=274   GT      ./.     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     ./.     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     1/1     0/1     0/0     ./.     1/1     ./.     1/1     0/1     1/1     0/0     ./.     ./.     ./.     0/0     0/1     0/1     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     ./.     1/1     0/1     ./.     0/1     ./.     1/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1
+chr1   106762526       .       AACT    A       .       PASS    VC=INDEL;AC=87;AF=0.28;AN=316   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0
+chr1   106908645       .       AC      A       .       PASS    VC=INDEL;AC=25;AF=0.08;AN=316   GT      0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1
+chr1   107217236       .       A       AGGATCA .       PASS    VC=INDEL;AC=240;AF=0.79;AN=302  GT      1/1     1/1     ./.     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     ./.     1/1     1/1     ./.     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     ./.     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     1/1     ./.     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1
+chr1   107979567       .       TT      T       .       PASS    VC=INDEL;AC=150;AF=0.55;AN=274;refseq.name=NM_001113226;refseq.positionType=intron      GT      1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     ./.     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     ./.     ./.     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     ./.     0/1     0/0     1/1     ./.     ./.     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     ./.     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     0/0     1/1     ./.     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     ./.     0/1     ./.     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     1/1     ./.     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     ./.     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     0/1     0/1     ./.     0/1     0/1     0/0     0/1     ./.     1/1     ./.     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     ./.     0/0     1/1     0/1     ./.     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     ./.     0/1     0/1     0/1     ./.     1/1     1/1     0/1     1/1
+chr1   108737087       .       GG      G       .       PASS    VC=INDEL;AC=99;AF=0.32;AN=308;refseq.name=NM_013386;refseq.positionType=intron  GT      1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     ./.     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1
+chr1   109186604       .       A       ATA     .       PASS    VC=INDEL;AC=3;AF=0.01;AN=316    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   109295950       .       TA      T       .       PASS    VC=INDEL;AC=54;AF=0.17;AN=312;refseq.name=NM_007269;refseq.positionType=intron  GT      0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0
+chr1   109295955       .       TTA     T       .       PASS    VC=INDEL;AC=57;AF=0.18;AN=310;refseq.name=NM_007269;refseq.positionType=intron  GT      0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     ./.     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     ./.     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     ./.     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0
+chr1   109303951       .       GTATAG  G       .       PASS    VC=INDEL;AC=89;AF=0.28;AN=316;refseq.name=NM_007269;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1
+chr1   109429108       .       G       GGAGAAAT        .       PASS    VC=INDEL;AC=33;AF=0.14;AN=234;refseq.name=NM_013296;refseq.positionType=intron  GT      0/1     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/1     0/0     ./.     0/1     ./.     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     ./.     0/1     ./.     ./.     0/1     ./.     0/1     0/1     ./.     ./.     ./.     0/1     ./.     0/1     ./.     0/1     0/1     ./.     ./.     0/1     ./.     0/1     0/1     ./.     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     ./.     ./.     0/1     ./.     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1
+chr1   109565068       .       C       CTC     .       PASS    VC=INDEL;AC=304;AF=0.96;AN=316;refseq.name=NM_014969;refseq.positionType=intron GT      1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1
+chr1   110418161       .       CTTAG   C       .       PASS    VC=INDEL;AC=56;AF=0.18;AN=316   GT      0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1
+chr1   110911466       .       AT      A       .       PASS    VC=INDEL;AC=67;AF=0.22;AN=310;refseq.name=NM_004696;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1
+chr1   111820993       .       TTAAG   T       .       PASS    VC=INDEL;AC=46;AF=0.2;AN=232    GT      0/1     ./.     1/1     ./.     0/0     ./.     0/1     0/1     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     ./.     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     ./.     0/0     0/0     0/1     ./.     ./.     ./.     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     ./.     0/0     0/1     ./.     ./.     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     ./.     ./.     0/1     ./.     ./.     0/0     0/1     ./.     0/0     ./.     0/1     ./.     0/0     ./.     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/1     0/0     ./.     ./.     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     ./.     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/1     0/1     ./.     ./.     ./.
+chr1   111894729       .       C       CATG    .       PASS    VC=INDEL;AC=32;AF=0.11;AN=302;refseq.name=NM_181643;refseq.positionType=exon    GT      0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     ./.     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0
+chr1   112384059       .       G       GG      .       PASS    VC=INDEL;AC=111;AF=0.35;AN=314;refseq.name=NM_004980;refseq.positionType=intron GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1
+chr1   112440856       .       A       ACTTA   .       PASS    VC=INDEL;AC=138;AF=0.44;AN=312;refseq.name=NM_004980;refseq.positionType=intron GT      1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     ./.     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0
+chr1   112896532       .       CTAAC   C       .       PASS    VC=INDEL;AC=1;AF=0;AN=316       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1
+chr1   112896636       .       CA      C       .       PASS    VC=INDEL;AC=199;AF=0.64;AN=312  GT      0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     ./.     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     ./.     1/1
+chr1   112896637       .       AA      A       .       PASS    VC=INDEL;AC=199;AF=0.63;AN=316  GT      0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1
+chr1   113322895       .       TTCTA   T       .       PASS    VC=INDEL;AC=73;AF=0.3;AN=246    GT      0/0     ./.     0/1     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     ./.     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     ./.     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     ./.     ./.     ./.     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     ./.     ./.     0/0     ./.     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     ./.     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     ./.     0/0     0/0     ./.     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     ./.     ./.     ./.     ./.     0/0     0/1     1/1     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     ./.     0/1     0/0     0/0     ./.     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0
+chr1   113467083       .       CC      C       .       PASS    VC=INDEL;AC=1;AF=0;AN=316;refseq.name=NM_003051;refseq.positionType=intron      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1
+chr1   113635187       .       C       CTTTG   .       PASS    VC=INDEL;AC=261;AF=0.83;AN=316;refseq.name=NM_014813;refseq.positionType=intron GT      1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1
+chr1   113635190       .       T       TGTTT   .       PASS    VC=INDEL;AC=261;AF=0.83;AN=316;refseq.name=NM_014813;refseq.positionType=intron GT      1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1
+chr1   113640553       .       GA      G       .       PASS    VC=INDEL;AC=111;AF=0.35;AN=314;refseq.name=NM_014813;refseq.positionType=intron GT      0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     ./.     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1
+chr1   113640556       .       AA      A       .       PASS    VC=INDEL;AC=112;AF=0.35;AN=316;refseq.name=NM_014813;refseq.positionType=intron GT      0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1
+chr1   113689905       .       GAG     G       .       PASS    VC=INDEL;AC=41;AF=0.13;AN=316   GT      0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   114240320       .       A       AA      .       PASS    VC=INDEL;AC=229;AF=0.72;AN=316;refseq.name=NM_006608;refseq.positionType=exon   GT      0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1
+chr1   114339956       .       C       CTAAA   .       PASS    VC=INDEL;AC=210;AF=0.78;AN=270;refseq.name=NM_018364;refseq.positionType=intron GT      1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     ./.     ./.     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     ./.     1/1     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     ./.     ./.     ./.     0/0     0/1     0/1     ./.     ./.     0/0     0/1     0/0     0/1     ./.     0/0     ./.     0/1     0/1     1/1     ./.     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     ./.     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     0/1     0/1     ./.     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1
+chr1   114565357       .       CGGAGG  C       .       PASS    VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   116298599       .       A       ACTT    .       PASS    VC=INDEL;AC=54;AF=0.17;AN=316;refseq.name=NM_001232;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0
+chr1   116435014       .       ATAACCGA        A       .       PASS    VC=INDEL;AC=66;AF=0.26;AN=250   GT      1/1     1/1     ./.     1/1     0/1     0/1     0/1     ./.     0/0     0/0     ./.     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     ./.     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/1     0/1     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     ./.     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     1/1     ./.     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     ./.     1/1     1/1     0/1     0/1     ./.     0/0     1/1     ./.     0/0     1/1     0/1     1/1     ./.     1/1     0/0     ./.     1/1     0/1     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     ./.     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/1     0/1     0/0     0/0     ./.     0/1     0/1
+chr1   116551982       .       T       TTAAAGC .       PASS    VC=INDEL;AC=31;AF=0.1;AN=304;refseq.name=NM_018420;refseq.positionType=intron   GT      0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     ./.     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   116662025       .       T       TGA     .       PASS    VC=INDEL;AC=55;AF=0.17;AN=316;refseq.name=NM_152367;refseq.positionType=intron  GT      0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   116662028       .       G       GAG     .       PASS    VC=INDEL;AC=55;AF=0.17;AN=316;refseq.name=NM_152367;refseq.positionType=intron  GT      0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   117459931       .       AAC     A       .       PASS    VC=INDEL;AC=90;AF=0.28;AN=316;refseq.name=NM_020440;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   117459932       .       ACA     A       .       PASS    VC=INDEL;AC=90;AF=0.28;AN=316;refseq.name=NM_020440;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   117592136       .       TTG     T       .       PASS    VC=INDEL;AC=24;AF=0.08;AN=300   GT      0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.
+chr1   117722836       .       C       CA      .       PASS    VC=INDEL;AC=36;AF=0.11;AN=316;refseq.name=NM_024626;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0
+chr1   120034138       .       TCTAT   T       .       PASS    VC=INDEL;AC=99;AF=0.35;AN=284   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     ./.     0/1     0/1     0/1     ./.     0/1     0/1     0/1     ./.     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     ./.     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     ./.     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     ./.     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     0/1     ./.     1/1     1/1     0/0     0/0
+chr1   120185496       .       G       GGATT   .       PASS    VC=INDEL;AC=264;AF=0.84;AN=314;refseq.name=NM_001080470;refseq.positionType=intron      GT      0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1
+chr1   120280730       .       TAA     T       .       PASS    VC=INDEL;AC=73;AF=0.23;AN=314;refseq.name=NM_006623;refseq.positionType=intron  GT      0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   144995277       .       AG      A       .       PASS    VC=INDEL;AC=41;AF=0.16;AN=258;refseq.name=NM_014644;refseq.positionType=promoter        GT      0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     0/1     0/0     ./.     0/1     ./.     ./.     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     ./.     0/1     0/1     0/1     0/0     ./.     ./.     ./.     0/0     ./.     ./.     0/0     0/1     0/1     ./.     0/1     0/1     0/0     0/0     ./.     ./.     ./.     0/1     0/0     ./.     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     ./.     0/1     ./.     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0
+chr1   145060382       .       A       AG      .       PASS    VC=INDEL;AC=316;AF=1;AN=316;refseq.name=NM_022359;refseq.positionType=intron    GT      1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1
+chr1   146556039       .       CCAAC   C       .       PASS    VC=INDEL;AC=64;AF=0.21;AN=310   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   146768690       .       TC      T       .       PASS    VC=INDEL;AC=289;AF=0.91;AN=316  GT      0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1
+chr1   146979526       .       CCT     C       .       PASS    VC=INDEL;AC=63;AF=0.2;AN=316    GT      1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0
+chr1   147047674       .       AA      A       .       PASS    VC=INDEL;AC=101;AF=0.32;AN=314;refseq.name=NM_004326;refseq.positionType=intron GT      0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1
+chr1   147108091       .       A       AC      .       PASS    VC=INDEL;AC=227;AF=0.72;AN=314  GT      1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     ./.     1/1
+chr1   147392223       .       CATGGCTC        C       .       PASS    VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   147393527       .       A       AAGAA   .       PASS    VC=INDEL;AC=10;AF=0.05;AN=218   GT      0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     ./.     ./.     ./.     ./.     ./.     ./.     ./.     ./.     ./.     ./.     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     ./.     ./.     ./.     0/0     0/1     ./.     ./.     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/1     ./.     ./.     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0
+chr1   147823728       .       A       AC      .       PASS    VC=INDEL;AC=2;AF=0.01;AN=266    GT      0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     ./.     ./.     ./.     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0
+chr1   151094921       .       T       TA      .       PASS    VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   151094936       .       CCTTA   C       .       PASS    VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   151743871       .       AA      A       .       PASS    VC=INDEL;AC=98;AF=0.32;AN=308;refseq.name=NM_016178;refseq.positionType=terminator      GT      1/1     0/1     ./.     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     ./.     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     ./.     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     ./.     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1
+chr1   152348228       .       TTAT    T       .       PASS    VC=INDEL;AC=9;AF=0.03;AN=316    GT      0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   152442163       .       AAACA   A       .       PASS    VC=INDEL;AC=212;AF=0.68;AN=310  GT      0/1     ./.     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     ./.     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1
+chr1   152572426       .       G       GT      .       PASS    VC=INDEL;AC=70;AF=0.25;AN=280;refseq.name=NM_178434;refseq.positionType=promoter        GT      0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     1/1     0/0     0/1     ./.     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     ./.     0/1     ./.     0/0     ./.     ./.     0/1     0/1     ./.     1/1     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     1/1     ./.     1/1     0/1     0/1     ./.     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     1/1     0/1     0/0
+chr1   152797773       .       C       CC      .       PASS    VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316;refseq.name=NM_178348;refseq.positionType=promoter    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   153703019       .       TGTGTCTCTGCTT   T       .       PASS    VC=INDEL;AC=1;AF=0;AN=316;refseq.name=NM_023015;refseq.positionType=intron      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   154741714       .       TAT     T       .       PASS    VC=INDEL;AC=1;AF=0;AN=316;refseq.name=NM_002249;refseq.positionType=intron      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1
+chr1   155303581       .       AT      A       .       PASS    VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   155559888       .       C       CTTAT   .       PASS    VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   156565049       .       A       AAC     .       PASS    VC=INDEL;AC=314;AF=0.99;AN=316;refseq.name=NM_015590;refseq.positionType=exon   GT      1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1
+chr1   156572952       .       T       TGAA    .       PASS    VC=INDEL;AC=39;AF=0.12;AN=312;refseq.name=NM_015590;refseq.positionType=promoter        GT      0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   156859572       .       C       CCT     .       PASS    VC=INDEL;AC=219;AF=0.73;AN=300  GT      1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     ./.     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     ./.     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     ./.     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1
+chr1   156910892       .       GCTCGTCTT       G       .       PASS    VC=INDEL;AC=39;AF=0.14;AN=270;refseq.name=NM_014784;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     ./.     ./.     0/0     0/1     ./.     ./.     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     ./.     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     ./.     0/0     0/1     ./.     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     0/1     0/0     0/1     ./.     ./.     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   157531425       .       CA      C       .       PASS    VC=INDEL;AC=16;AF=0.06;AN=260   GT      0/1     0/1     ./.     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     ./.     0/1     ./.     ./.     0/1     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     ./.     0/0     0/1     ./.     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     ./.     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0
+chr1   157807166       .       TGTTA   T       .       PASS    VC=INDEL;AC=250;AF=0.81;AN=310;refseq.name=NM_005894;refseq.positionType=intron GT      1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0
+chr1   157818429       .       AC      A       .       PASS    VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   157924621       .       ATAAG   A       .       PASS    VC=INDEL;AC=24;AF=0.08;AN=316   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   157932325       .       T       TT      .       PASS    VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   158154060       .       CT      C       .       PASS    VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316;refseq.name=NM_001766;refseq.positionType=exon        GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   158684734       .       CA      C       .       PASS    VC=INDEL;AC=90;AF=0.28;AN=316   GT      0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1
+chr1   158886780       .       A       AAGAT   .       PASS    VC=INDEL;AC=241;AF=0.76;AN=316  GT      0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1
+chr1   158886783       .       A       ATAGA   .       PASS    VC=INDEL;AC=240;AF=0.76;AN=314  GT      0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     ./.     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1
+chr1   158984187       .       G       GAGGC   .       PASS    VC=INDEL;AC=26;AF=0.13;AN=198;refseq.name=NM_005531;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     ./.     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     1/1     ./.     ./.     0/0     ./.     0/0     ./.     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     ./.     0/0     ./.     ./.     0/0     ./.     ./.     ./.     0/0     ./.     ./.     ./.     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     ./.     0/0     1/1     1/1     ./.     0/0     ./.     0/0     ./.     ./.     0/0     ./.     ./.     ./.     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     ./.     ./.     ./.     ./.     ./.     1/1     1/1
+chr1   158984259       .       AATT    A       .       PASS    VC=INDEL;AC=130;AF=0.49;AN=266;refseq.name=NM_005531;refseq.positionType=intron GT      ./.     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     ./.     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     ./.     1/1     1/1     0/1     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     ./.     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     ./.     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     ./.     0/1     ./.     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     ./.     ./.     0/0     0/0     ./.     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     ./.     ./.     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     ./.     0/1     0/1     ./.     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/1     0/1     ./.     0/1     0/1     ./.     ./.     ./.     ./.     ./.     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0
+chr1   159500234       .       CT      C       .       PASS    VC=INDEL;AC=19;AF=0.06;AN=316   GT      0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1
+chr1   159741079       .       TGT     T       .       PASS    VC=INDEL;AC=163;AF=0.52;AN=314  GT      0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     ./.     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1
+chr1   160004099       .       GATGTAGATAG     G       .       PASS    VC=INDEL;AC=3;AF=0.01;AN=314;refseq.name=NM_145167;refseq.positionType=promoter GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   160081222       .       TGAAAAG T       .       PASS    VC=INDEL;AC=5;AF=0.02;AN=312    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   160430789       .       C       CAG     .       PASS    VC=INDEL;AC=51;AF=0.16;AN=314   GT      0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   160464965       .       AGTGAATTTTAGA   A       .       PASS    VC=INDEL;AC=12;AF=0.06;AN=214;refseq.name=NM_052931;refseq.positionType=intron  GT      ./.     0/0     0/0     ./.     ./.     ./.     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     ./.     0/0     ./.     ./.     0/0     ./.     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     ./.     0/1     ./.     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     ./.     ./.     ./.     ./.     0/1     0/1     0/1     ./.     ./.     0/1     ./.     0/0     0/0     ./.     ./.     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/1     ./.     0/1     ./.     0/1
+chr1   160578541       .       C       CA      .       PASS    VC=INDEL;AC=277;AF=0.88;AN=316  GT      1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1
+chr1   161765879       .       T       TCTT    .       PASS    VC=INDEL;AC=77;AF=0.25;AN=310;refseq.name=NM_007348;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     ./.     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0
+chr1   161826110       .       TT      T       .       PASS    VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=308;refseq.name=NM_007348;refseq.positionType=intron      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   162354200       .       AACAC   A       .       PASS    VC=INDEL;AC=32;AF=0.12;AN=262;refseq.name=NM_001085375;refseq.positionType=exon GT      0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     ./.     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     ./.     0/0     0/0     ./.     0/1     ./.     0/0     ./.     ./.     0/0     0/1     ./.     ./.     ./.     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1
+chr1   162629796       .       C       CGTT    .       PASS    VC=INDEL;AC=238;AF=0.75;AN=316;refseq.name=NM_001014796;refseq.positionType=intron      GT      1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1
+chr1   163132415       .       TCCTGAACA       T       .       PASS    VC=INDEL;AC=7;AF=0.02;AN=314;refseq.name=NM_003617;refseq.positionType=intron   GT      0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1
+chr1   163135904       .       C       CAGA    .       PASS    VC=INDEL;AC=217;AF=0.84;AN=258;refseq.name=NM_003617;refseq.positionType=intron GT      1/1     1/1     1/1     ./.     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     ./.     0/1     0/0     ./.     0/1     0/0     ./.     1/1     ./.     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     ./.     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     ./.     1/1     ./.     1/1     0/1     ./.     0/1     ./.     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     ./.     ./.     ./.     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     ./.     ./.     0/1     ./.     0/1     ./.     0/1     ./.     1/1     1/1     1/1     0/1     ./.     ./.     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     ./.     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     ./.     1/1
+chr1   163136054       .       T       TTC     .       PASS    VC=INDEL;AC=266;AF=0.84;AN=316;refseq.name=NM_003617;refseq.positionType=intron GT      1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1
+chr1   163136055       .       T       TCT     .       PASS    VC=INDEL;AC=265;AF=0.84;AN=314;refseq.name=NM_003617;refseq.positionType=intron GT      1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1
+chr1   164351168       .       ATTG    A       .       PASS    VC=INDEL;AC=261;AF=0.83;AN=316  GT      1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1
+chr1   164448310       .       AAAC    A       .       PASS    VC=INDEL;AC=236;AF=0.75;AN=316  GT      0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1
+chr1   164548574       .       TT      T       .       PASS    VC=INDEL;AC=11;AF=0.04;AN=308;refseq.name=NM_002585;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   164790567       .       C       CT      .       PASS    VC=INDEL;AC=164;AF=0.52;AN=314;refseq.name=NM_002585;refseq.positionType=intron GT      1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     ./.     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0
+chr1   165207456       .       TAGA    T       .       PASS    VC=INDEL;AC=17;AF=0.05;AN=316;refseq.name=NM_177398;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1
+chr1   165218477       .       AGAGATTACTCTG   A       .       PASS    VC=INDEL;AC=79;AF=0.28;AN=280;refseq.name=NM_177398;refseq.positionType=intron  GT      0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     ./.     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     ./.     1/1     1/1     0/0     0/1     ./.     ./.     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     ./.     0/1     1/1     1/1     ./.     0/1     0/1     1/1     ./.     0/0     0/1     ./.     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     ./.     1/1     ./.     0/1     1/1     0/1     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1
+chr1   165261980       .       TA      T       .       PASS    VC=INDEL;AC=129;AF=0.42;AN=308;refseq.name=NM_177398;refseq.positionType=intron GT      0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     ./.     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     ./.     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     1/1     ./.     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     ./.     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1
+chr1   165286489       .       AA      A       .       PASS    VC=INDEL;AC=23;AF=0.07;AN=314;refseq.name=NM_177398;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1
+chr1   165349359       .       G       GT      .       PASS    VC=INDEL;AC=130;AF=0.42;AN=306  GT      0/1     ./.     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     ./.     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     ./.     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     ./.     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     ./.     0/1     0/1
+chr1   165475542       .       CT      C       .       PASS    VC=INDEL;AC=157;AF=0.5;AN=316   GT      0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1
+chr1   165627134       .       AT      A       .       PASS    VC=INDEL;AC=144;AF=0.46;AN=314  GT      0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     ./.     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1
+chr1   165652540       .       GTTAA   G       .       PASS    VC=INDEL;AC=202;AF=0.66;AN=304;refseq.name=NM_000696;refseq.positionType=intron GT      0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     ./.     ./.     1/1     0/1     1/1     0/0     ./.     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     ./.     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     ./.     1/1
+chr1   165685796       .       GGCACAGAT       G       .       PASS    VC=INDEL;AC=155;AF=0.49;AN=314  GT      0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     ./.     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0
+chr1   165686450       .       TAGG    T       .       PASS    VC=INDEL;AC=144;AF=0.46;AN=316  GT      0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1
+chr1   165686452       .       GGAG    G       .       PASS    VC=INDEL;AC=145;AF=0.46;AN=316  GT      1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1
+chr1   166083223       .       CCAC    C       .       PASS    VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316;refseq.name=NM_001017961;refseq.positionType=intron   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   166602705       .       TTGT    T       .       PASS    VC=INDEL;AC=73;AF=0.23;AN=316   GT      0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0
+chr1   166639248       .       A       AAT     .       PASS    VC=INDEL;AC=289;AF=0.91;AN=316  GT      0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1
+chr1   166708316       .       G       GTAG    .       PASS    VC=INDEL;AC=102;AF=0.32;AN=316  GT      0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   167512714       .       TTCCAAAACCGA    T       .       PASS    VC=INDEL;AC=7;AF=0.02;AN=316;refseq.name=NM_003851;refseq.positionType=intron   GT      0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1
+chr1   167513042       .       CA      C       .       PASS    VC=INDEL;AC=7;AF=0.02;AN=316;refseq.name=NM_003851;refseq.positionType=intron   GT      0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1
+chr1   167516739       .       T       TAA     .       PASS    VC=INDEL;AC=1;AF=0;AN=316;refseq.name=NM_003851;refseq.positionType=intron      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1
+chr1   167675717       .       T       TTC     .       PASS    VC=INDEL;AC=22;AF=0.07;AN=296;refseq.name=NM_052862;refseq.positionType=terminator      GT      0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   167682039       .       CCAAA   C       .       PASS    VC=INDEL;AC=68;AF=0.22;AN=316   GT      0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1
+chr1   167682041       .       AAACA   A       .       PASS    VC=INDEL;AC=68;AF=0.22;AN=316   GT      0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1
+chr1   167697899       .       GTG     G       .       PASS    VC=INDEL;AC=50;AF=0.16;AN=316;refseq.name=NM_003953;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0
+chr1   167985326       .       TG      T       .       PASS    VC=INDEL;AC=144;AF=0.49;AN=294;refseq.name=NM_001017977;refseq.positionType=intron      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     ./.     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     ./.     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     ./.     ./.     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     ./.     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     ./.     1/1     ./.     0/1     1/1     0/1     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     ./.     0/1     1/1     0/1
+chr1   168053859       .       ACTCA   A       .       PASS    VC=INDEL;AC=11;AF=0.03;AN=316;refseq.name=NM_153832;refseq.positionType=terminator      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0
+chr1   168133510       .       CCTAAC  C       .       PASS    VC=INDEL;AC=96;AF=0.3;AN=316    GT      0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1
+chr1   168200152       .       GT      G       .       PASS    VC=INDEL;AC=135;AF=0.43;AN=316;refseq.name=NM_199344;refseq.positionType=intron GT      1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0
+chr1   168423776       .       AGC     A       .       PASS    VC=INDEL;AC=4;AF=0.01;AN=316    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1
+chr1   169066627       .       T       TC      .       PASS    VC=INDEL;AC=301;AF=0.95;AN=316  GT      1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0
+chr1   169066629       .       C       CC      .       PASS    VC=INDEL;AC=301;AF=0.95;AN=316  GT      1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0
+chr1   169095586       .       T       TAT     .       PASS    VC=INDEL;AC=165;AF=0.52;AN=316;refseq.name=NM_001001787;refseq.positionType=intron      GT      0/0     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1
+chr1   169214437       .       CA      C       .       PASS    VC=INDEL;AC=10;AF=0.03;AN=316;refseq.name=NM_013330;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   169875635       .       AG      A       .       PASS    VC=INDEL;AC=2;AF=0.01;AN=314    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   170054566       .       CAAAT   C       .       PASS    VC=INDEL;AC=2;AF=0.01;AN=316    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   170213713       .       C       CA      .       PASS    VC=INDEL;AC=302;AF=0.96;AN=314  GT      1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1
+chr1   170231599       .       C       CA      .       PASS    VC=INDEL;AC=178;AF=0.57;AN=314  GT      0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1
+chr1   170412385       .       A       AA      .       PASS    VC=INDEL;AC=247;AF=0.79;AN=312  GT      1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     ./.     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1
+chr1   171564547       .       T       TT      .       PASS    VC=INDEL;AC=141;AF=0.68;AN=206  GT      1/1     1/1     1/1     ./.     0/1     ./.     1/1     0/1     ./.     0/1     ./.     ./.     ./.     1/1     1/1     ./.     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     ./.     1/1     ./.     1/1     1/1     ./.     ./.     ./.     0/1     0/1     ./.     ./.     ./.     0/1     0/1     ./.     1/1     0/1     ./.     0/1     1/1     ./.     1/1     ./.     ./.     0/1     ./.     0/1     ./.     ./.     ./.     ./.     0/1     ./.     1/1     ./.     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     ./.     ./.     ./.     ./.     ./.     0/1     0/1     1/1     0/1     ./.     0/1     1/1     ./.     0/1     0/1     0/1     ./.     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     ./.     0/0     0/1     ./.     0/1     0/1     1/1     ./.     1/1     1/1     ./.     0/1     1/1     0/1     0/1     ./.     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     ./.     ./.     ./.     ./.     1/1     ./.     ./.     0/1     1/1     1/1     ./.     0/1     1/1     ./.     ./.     0/1     ./.     ./.     0/1     ./.     0/1     ./.     ./.     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     0/1
+chr1   171668398       .       C       CATC    .       PASS    VC=INDEL;AC=42;AF=0.13;AN=316   GT      0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   171779854       .       AAAG    A       .       PASS    VC=INDEL;AC=128;AF=0.46;AN=278  GT      0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     ./.     0/1     0/1     ./.     ./.     ./.     1/1     0/1     ./.     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     ./.     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     ./.     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     ./.     1/1     0/1     0/1     1/1     ./.     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     ./.     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     0/1     ./.     1/1     ./.     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     ./.     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     ./.     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     ./.     0/1     0/1
+chr1   171799766       .       A       ACT     .       PASS    VC=INDEL;AC=48;AF=0.18;AN=268   GT      0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     0/1     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     ./.     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     ./.     0/1     ./.     0/0     0/1     ./.     0/1     0/1     0/0     0/0     ./.     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     ./.     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/1     0/1     0/0     0/0
+chr1   171806532       .       C       CAT     .       PASS    VC=INDEL;AC=14;AF=0.05;AN=308   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0
+chr1   172312482       .       AAG     A       .       PASS    VC=INDEL;AC=5;AF=0.02;AN=316;refseq.name=NM_015569;refseq.positionType=intron   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   172415351       .       GA      G       .       PASS    VC=INDEL;AC=75;AF=0.24;AN=316;refseq.name=NM_139240;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1
+chr1   172620138       .       A       ACT     .       PASS    VC=INDEL;AC=134;AF=0.42;AN=316  GT      0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1
+chr1   172620139       .       C       CTC     .       PASS    VC=INDEL;AC=134;AF=0.43;AN=314  GT      0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     ./.     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1
+chr1   173063473       .       A       ATGTC   .       PASS    VC=INDEL;AC=124;AF=0.62;AN=200  GT      0/0     0/1     0/1     ./.     0/1     ./.     ./.     1/1     0/1     0/0     0/1     ./.     0/1     1/1     ./.     ./.     0/0     0/1     0/1     ./.     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/0     1/1     ./.     1/1     0/0     1/1     1/1     ./.     ./.     ./.     ./.     ./.     ./.     1/1     ./.     0/1     ./.     1/1     0/1     1/1     ./.     1/1     ./.     0/1     ./.     0/1     1/1     ./.     1/1     0/1     ./.     0/1     0/1     ./.     ./.     0/1     0/1     ./.     ./.     0/1     ./.     0/1     ./.     ./.     0/1     ./.     1/1     0/1     ./.     1/1     ./.     ./.     0/1     ./.     1/1     1/1     ./.     1/1     0/1     ./.     ./.     0/0     ./.     0/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     0/0     ./.     ./.     0/1     0/0     ./.     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     ./.     1/1     0/1     0/1     ./.     ./.     0/1     0/1     0/1     0/0     ./.     ./.     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     ./.     ./.     1/1     0/0     ./.     0/1     ./.     ./.     1/1     0/0     ./.     ./.     ./.     1/1     0/1     ./.     0/1     1/1     ./.
+chr1   173541560       .       CAA     C       .       PASS    VC=INDEL;AC=233;AF=0.74;AN=316;refseq.name=NM_178527;refseq.positionType=intron GT      0/0     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0
+chr1   173749093       .       T       TC      .       PASS    VC=INDEL;AC=316;AF=1;AN=316;refseq.name=NM_014458;refseq.positionType=intron    GT      1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1
+chr1   173755936       .       T       TGAAG   .       PASS    VC=INDEL;AC=182;AF=0.58;AN=316;refseq.name=NM_014458;refseq.positionType=terminator     GT      0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0
+chr1   173870326       .       ACTA    A       .       PASS    VC=INDEL;AC=235;AF=0.74;AN=316  GT      0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0
+chr1   174411392       .       T       TTGTAT  .       PASS    VC=INDEL;AC=251;AF=0.8;AN=314;refseq.name=NM_014857;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0
+chr1   174524160       .       T       TAT     .       PASS    VC=INDEL;AC=212;AF=0.67;AN=316;refseq.name=NM_014857;refseq.positionType=intron GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0
+chr1   175131961       .       GA      G       .       PASS    VC=INDEL;AC=85;AF=0.28;AN=306   GT      1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     ./.     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     ./.     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     ./.     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     ./.     0/1     0/1     1/1     ./.     0/1     0/0     0/1
+chr1   175299777       .       CAT     C       .       PASS    VC=INDEL;AC=18;AF=0.06;AN=316;refseq.name=NM_003285;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0
+chr1   175355790       .       GG      G       .       PASS    VC=INDEL;AC=199;AF=0.74;AN=270;refseq.name=NM_003285;refseq.positionType=intron GT      1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     ./.     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     ./.     ./.     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     ./.     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     ./.     0/1     1/1     1/1     0/1     ./.     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     ./.     1/1     ./.     ./.     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     ./.     ./.     0/0     0/1     ./.     0/1
+chr1   175418807       .       A       AACA    .       PASS    VC=INDEL;AC=118;AF=0.37;AN=316;refseq.name=NM_003285;refseq.positionType=intron GT      0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1
+chr1   175420618       .       A       AG      .       PASS    VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316;refseq.name=NM_003285;refseq.positionType=intron      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   175443036       .       AGGAGA  A       .       PASS    VC=INDEL;AC=1;AF=0;AN=316;refseq.name=NM_003285;refseq.positionType=intron      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   175472120       .       C       CTAATCAGGATCTTGACATGTGACACAAGATCCTTGAG  .       PASS    VC=INDEL;AC=14;AF=0.04;AN=316;refseq.name=NM_003285;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   175584762       .       CT      C       .       PASS    VC=INDEL;AC=45;AF=0.14;AN=314;refseq.name=NM_003285;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1
+chr1   177236388       .       C       CG      .       PASS    VC=INDEL;AC=167;AF=0.54;AN=312;refseq.name=NM_021165;refseq.positionType=intron GT      1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     ./.     0/1     ./.     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1
+chr1   177236389       .       G       GG      .       PASS    VC=INDEL;AC=166;AF=0.53;AN=316;refseq.name=NM_021165;refseq.positionType=intron GT      1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1
+chr1   177558539       .       G       GAGA    .       PASS    VC=INDEL;AC=7;AF=0.02;AN=290    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   177558541       .       G       GAAG    .       PASS    VC=INDEL;AC=10;AF=0.03;AN=296   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   178521563       .       TAAGAC  T       .       PASS    VC=INDEL;AC=21;AF=0.09;AN=246   GT      0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     ./.     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     1/1     1/1     ./.     ./.     0/0     ./.     0/0     ./.     ./.     ./.     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     0/1     ./.     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     ./.     ./.     ./.     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0
+chr1   179038241       .       GT      G       .       PASS    VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316;refseq.name=NM_014864;refseq.positionType=intron      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   179293907       .       CAA     C       .       PASS    VC=INDEL;AC=34;AF=0.11;AN=314;refseq.name=NM_003101;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1
+chr1   179724329       .       G       GG      .       PASS    VC=INDEL;AC=307;AF=0.97;AN=316;refseq.name=NM_173509;refseq.positionType=intron GT      1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1
+chr1   179762445       .       GT      G       .       PASS    VC=INDEL;AC=85;AF=0.27;AN=316;refseq.name=NM_173509;refseq.positionType=intron  GT      0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0
+chr1   179762446       .       TT      T       .       PASS    VC=INDEL;AC=85;AF=0.27;AN=316;refseq.name=NM_173509;refseq.positionType=intron  GT      0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0
+chr1   179773170       .       CTTGTC  C       .       PASS    VC=INDEL;AC=77;AF=0.28;AN=274;refseq.name=NM_173509;refseq.positionType=intron  GT      1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     ./.     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     ./.     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     1/1     ./.     ./.     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/1     0/1     ./.     0/1     1/1     1/1     0/0     ./.     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     ./.     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     ./.     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     ./.     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     1/1     0/1
+chr1   180108217       .       T       TTATC   .       PASS    VC=INDEL;AC=229;AF=0.72;AN=316  GT      1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1
+chr1   180722815       .       TACTC   T       .       PASS    VC=INDEL;AC=4;AF=0.01;AN=316;refseq.name=NM_004736;refseq.positionType=intron   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   180722816       .       ACTCA   A       .       PASS    VC=INDEL;AC=5;AF=0.02;AN=316;refseq.name=NM_004736;refseq.positionType=intron   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   180762626       .       CAT     C       .       PASS    VC=INDEL;AC=12;AF=0.04;AN=296;refseq.name=NM_004736;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1
+chr1   180866670       .       CCC     C       .       PASS    VC=INDEL;AC=73;AF=0.29;AN=256   GT      0/0     0/1     0/1     0/0     ./.     0/0     ./.     0/1     ./.     0/0     ./.     0/1     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     ./.     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     ./.     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     ./.     0/1     0/1     0/1     ./.     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     ./.     0/1     0/1     0/0     0/1     ./.     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     ./.     0/1     ./.     0/1     ./.     0/1     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     ./.     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     ./.     0/1     0/1     0/1     0/1
+chr1   180974402       .       A       AA      .       PASS    VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=298;refseq.name=NM_005819;refseq.positionType=intron      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0
+chr1   181233905       .       AA      A       .       PASS    VC=INDEL;AC=1;AF=0;AN=266       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     ./.     ./.     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0
+chr1   181456872       .       CC      C       .       PASS    VC=INDEL;AC=2;AF=0.01;AN=300;refseq.name=NM_000721;refseq.positionType=intron   GT      ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   181610646       .       CT      C       .       PASS    VC=INDEL;AC=58;AF=0.18;AN=314;refseq.name=NM_000721;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0
+chr1   182087446       .       G       GTCT    .       PASS    VC=INDEL;AC=198;AF=0.68;AN=292  GT      0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     ./.     1/1     0/1     0/1     0/1     ./.     0/1     ./.     ./.     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     ./.     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     ./.     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     1/1     ./.     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     ./.     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     ./.     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0
+chr1   182739634       .       TAAGA   T       .       PASS    VC=INDEL;AC=65;AF=0.21;AN=316   GT      0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1
+chr1   182951675       .       AGA     A       .       PASS    VC=INDEL;AC=78;AF=0.25;AN=316   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0
+chr1   183032447       .       C       CTAAG   .       PASS    VC=INDEL;AC=125;AF=0.4;AN=316;refseq.name=NM_002293;refseq.positionType=intron  GT      0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1
+chr1   183073109       .       T       TTG     .       PASS    VC=INDEL;AC=125;AF=0.4;AN=316;refseq.name=NM_002293;refseq.positionType=intron  GT      0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1
+chr1   183073111       .       G       GTG     .       PASS    VC=INDEL;AC=125;AF=0.4;AN=316;refseq.name=NM_002293;refseq.positionType=intron  GT      0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1
+chr1   183077296       .       A       AG      .       PASS    VC=INDEL;AC=126;AF=0.4;AN=316;refseq.name=NM_002293;refseq.positionType=intron  GT      0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1
+chr1   183097956       .       G       GTTA    .       PASS    VC=INDEL;AC=127;AF=0.4;AN=314;refseq.name=NM_002293;refseq.positionType=intron  GT      0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1
+chr1   183145207       .       G       GTAG    .       PASS    VC=INDEL;AC=35;AF=0.11;AN=312   GT      0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0
+chr1   183180446       .       GG      G       .       PASS    VC=INDEL;AC=54;AF=0.17;AN=316;refseq.name=NM_005562;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   183330737       .       TAA     T       .       PASS    VC=INDEL;AC=197;AF=0.63;AN=312;refseq.name=NM_015039;refseq.positionType=intron GT      0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     ./.     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1
+chr1   183589923       .       A       ATCTT   .       PASS    VC=INDEL;AC=117;AF=0.37;AN=314  GT      0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     ./.     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0
+chr1   183712910       .       AC      A       .       PASS    VC=INDEL;AC=131;AF=0.42;AN=312;refseq.name=NM_015149;refseq.positionType=intron GT      1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     ./.     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1
+chr1   183806728       .       T       TG      .       PASS    VC=INDEL;AC=229;AF=0.85;AN=270;refseq.name=NM_015149;refseq.positionType=intron GT      1/1     ./.     1/1     ./.     ./.     0/1     0/1     ./.     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     ./.     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     ./.     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     ./.     ./.     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     ./.     0/1     ./.     ./.     0/0     ./.     1/1     1/1     0/0     1/1     ./.     1/1     0/0     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     ./.     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     ./.     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     ./.     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1
+chr1   183996005       .       C       CTATTA  .       PASS    VC=INDEL;AC=27;AF=0.09;AN=316;refseq.name=NM_015101;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   184391018       .       C       CTA     .       PASS    VC=INDEL;AC=68;AF=0.22;AN=312;refseq.name=NM_030806;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     ./.     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0
+chr1   184561827       .       CAGA    C       .       PASS    VC=INDEL;AC=47;AF=0.15;AN=316;refseq.name=NM_030806;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   184577643       .       T       TC      .       PASS    VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316;refseq.name=NM_030806;refseq.positionType=intron      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   185540897       .       T       TCCAG   .       PASS    VC=INDEL;AC=136;AF=0.48;AN=286  GT      0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     ./.     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     ./.     1/1     ./.     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     ./.     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/1     0/1     ./.     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     ./.     0/1     1/1     1/1     1/1     ./.     0/1     1/1     ./.     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     ./.     0/0     0/0     ./.     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0
+chr1   185865550       .       C       CAT     .       PASS    VC=INDEL;AC=53;AF=0.17;AN=310;refseq.name=NM_031935;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0
+chr1   186378142       .       CAGTT   C       .       PASS    VC=INDEL;AC=55;AF=0.21;AN=266;refseq.name=NM_017847;refseq.positionType=intron  GT      0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     0/1     1/1     0/1     ./.     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     0/1     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     ./.     ./.     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     ./.     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     ./.     0/0     0/1     ./.     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     ./.     0/1     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0
+chr1   186769215       .       T       TA      .       PASS    VC=INDEL;AC=45;AF=0.14;AN=316   GT      0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   186933480       .       T       TTAAT   .       PASS    VC=INDEL;AC=135;AF=0.43;AN=316;refseq.name=NM_024420;refseq.positionType=intron GT      0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0
+chr1   187372829       .       AGGCTT  A       .       PASS    VC=INDEL;AC=34;AF=0.11;AN=304   GT      ./.     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1
+chr1   187372830       .       GGCTTG  G       .       PASS    VC=INDEL;AC=32;AF=0.1;AN=306    GT      0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     ./.     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1
+chr1   187685847       .       CAATT   C       .       PASS    VC=INDEL;AC=112;AF=0.36;AN=314  GT      0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1
+chr1   187781028       .       C       CT      .       PASS    VC=INDEL;AC=278;AF=0.9;AN=310   GT      1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     ./.     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1
+chr1   187815820       .       A       ACAA    .       PASS    VC=INDEL;AC=21;AF=0.07;AN=314   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0
+chr1   187899550       .       AAA     A       .       PASS    VC=INDEL;AC=65;AF=0.21;AN=314   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0
+chr1   188075358       .       GTAAG   G       .       PASS    VC=INDEL;AC=63;AF=0.2;AN=316    GT      0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0
+chr1   188110355       .       C       CT      .       PASS    VC=INDEL;AC=222;AF=0.71;AN=312  GT      1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     ./.     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     ./.     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1
+chr1   188372559       .       CAAG    C       .       PASS    VC=INDEL;AC=230;AF=0.73;AN=314  GT      0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     ./.     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1
+chr1   188397016       .       C       CA      .       PASS    VC=INDEL;AC=9;AF=0.03;AN=316    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0
+chr1   188526820       .       C       CT      .       PASS    VC=INDEL;AC=262;AF=0.91;AN=288  GT      1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     0/1     ./.     1/1     0/1     1/1     ./.     1/1     1/1     ./.     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     ./.     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     ./.     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1
+chr1   188533586       .       G       GTTCT   .       PASS    VC=INDEL;AC=290;AF=0.92;AN=316  GT      1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1
+chr1   188628449       .       CAACT   C       .       PASS    VC=INDEL;AC=100;AF=0.32;AN=314  GT      0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     ./.     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1
+chr1   189027168       .       C       CTG     .       PASS    VC=INDEL;AC=146;AF=0.69;AN=212  GT      1/1     ./.     ./.     ./.     ./.     ./.     0/1     1/1     0/1     0/1     ./.     0/1     ./.     0/1     ./.     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     ./.     ./.     ./.     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     ./.     ./.     1/1     ./.     1/1     1/1     0/0     1/1     0/0     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     ./.     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     ./.     ./.     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     ./.     0/1     0/1     ./.     ./.     0/1     ./.     1/1     ./.     ./.     ./.     0/1     0/1     0/1     ./.     1/1     0/1     ./.     0/1     0/1     0/0     0/1     ./.     0/1     ./.     1/1     ./.     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     1/1     1/1     0/1     ./.     ./.     1/1     ./.     ./.     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     ./.     ./.     ./.     ./.     ./.     1/1     0/1     ./.     ./.     ./.     ./.     1/1     1/1     ./.     ./.     1/1     1/1     1/1     ./.     ./.     1/1     ./.     ./.     ./.
+chr1   189046798       .       C       CA      .       PASS    VC=INDEL;AC=86;AF=0.27;AN=316   GT      0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1
+chr1   189087000       .       TTA     T       .       PASS    VC=INDEL;AC=159;AF=0.53;AN=302  GT      0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     ./.     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     ./.     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     ./.     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     ./.     0/0     0/1     ./.     0/0     0/1     1/1
+chr1   189190273       .       AT      A       .       PASS    VC=INDEL;AC=2;AF=0.01;AN=316    GT      0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1
+chr1   189547870       .       A       AAT     .       PASS    VC=INDEL;AC=194;AF=0.79;AN=246  GT      0/1     ./.     ./.     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     1/1     ./.     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     ./.     ./.     0/1     ./.     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     ./.     ./.     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     ./.     ./.     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     ./.     0/1     ./.     ./.     0/1     1/1     0/0     ./.     1/1     1/1     ./.     ./.     ./.     0/0     1/1     ./.     ./.     1/1     ./.     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     ./.     0/0     1/1     ./.     0/1     1/1     1/1     1/1     ./.     ./.     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     ./.     ./.     0/1     ./.     1/1     0/1     1/1     ./.     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     ./.     ./.     0/1     1/1     1/1     ./.     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1
+chr1   189629285       .       A       ATAACT  .       PASS    VC=INDEL;AC=158;AF=0.59;AN=266  GT      0/1     1/1     0/0     1/1     ./.     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     ./.     1/1     ./.     0/1     ./.     0/1     0/1     1/1     0/1     ./.     ./.     0/1     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     ./.     0/1     ./.     0/0     0/0     1/1     0/1     ./.     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     ./.     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     ./.     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     ./.     ./.     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     ./.     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     ./.     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     ./.     ./.     0/0     ./.     0/1     ./.     0/1     0/1     ./.     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     ./.     ./.     1/1     1/1     1/1     ./.     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     ./.     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1
+chr1   189867802       .       G       GC      .       PASS    VC=INDEL;AC=23;AF=0.07;AN=316   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0
+chr1   190095126       .       CTAACA  C       .       PASS    VC=INDEL;AC=143;AF=0.45;AN=316;refseq.name=NM_199051;refseq.positionType=intron GT      0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1
+chr1   190095129       .       ACATAA  A       .       PASS    VC=INDEL;AC=143;AF=0.45;AN=316;refseq.name=NM_199051;refseq.positionType=intron GT      0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1
+chr1   190636901       .       C       CTAA    .       PASS    VC=INDEL;AC=131;AF=0.42;AN=314  GT      0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0
+chr1   190886420       .       AA      A       .       PASS    VC=INDEL;AC=76;AF=0.26;AN=292   GT      0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     ./.     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     ./.     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     0/1     ./.     0/0     0/0     0/1     0/1     ./.     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1
+chr1   191196527       .       A       AAT     .       PASS    VC=INDEL;AC=191;AF=0.6;AN=316   GT      0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1
+chr1   191340485       .       TTAGA   T       .       PASS    VC=INDEL;AC=175;AF=0.59;AN=296  GT      1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     ./.     0/1     1/1     1/1     1/1     ./.     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     ./.     0/0     ./.     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     ./.     0/1     ./.     ./.     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     ./.     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     ./.     0/1     0/1     0/0     0/1     ./.     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1
+chr1   191464816       .       A       ATTA    .       PASS    VC=INDEL;AC=213;AF=0.7;AN=306   GT      0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/0     1/1     ./.     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     ./.     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     ./.     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0
+chr1   191588586       .       C       CA      .       PASS    VC=INDEL;AC=190;AF=0.61;AN=310  GT      1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     ./.     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     ./.     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1
+chr1   191588587       .       A       AA      .       PASS    VC=INDEL;AC=186;AF=0.61;AN=304  GT      1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     ./.     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     ./.     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1
+chr1   191752595       .       T       TCTTT   .       PASS    VC=INDEL;AC=132;AF=0.42;AN=316  GT      0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0
+chr1   192047581       .       TT      T       .       PASS    VC=INDEL;AC=1;AF=0;AN=314       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   192460381       .       T       TT      .       PASS    VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   192612585       .       T       TCA     .       PASS    VC=INDEL;AC=80;AF=0.25;AN=316;refseq.name=NM_002927;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0
+chr1   192726770       .       C       CT      .       PASS    VC=INDEL;AC=121;AF=0.39;AN=314  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     ./.     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1
+chr1   193118950       .       AGACT   A       .       PASS    VC=INDEL;AC=7;AF=0.02;AN=316;refseq.name=NM_024529;refseq.positionType=intron   GT      0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   193158515       .       CTG     C       .       PASS    VC=INDEL;AC=7;AF=0.02;AN=316;refseq.name=NM_003783;refseq.positionType=promoter GT      0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   193261423       .       AAAGTA  A       .       PASS    VC=INDEL;AC=7;AF=0.02;AN=316    GT      0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   193421510       .       A       ATCT    .       PASS    VC=INDEL;AC=102;AF=0.33;AN=310  GT      0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     ./.     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     1/1     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0
+chr1   193482947       .       CAA     C       .       PASS    VC=INDEL;AC=71;AF=0.22;AN=316   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1
+chr1   193569090       .       C       CG      .       PASS    VC=INDEL;AC=85;AF=0.27;AN=312   GT      0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0
+chr1   193877310       .       GG      G       .       PASS    VC=INDEL;AC=106;AF=0.34;AN=316  GT      0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0
+chr1   193881567       .       T       TT      .       PASS    VC=INDEL;AC=4;AF=0.01;AN=314    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1
+chr1   194004698       .       TCTT    T       .       PASS    VC=INDEL;AC=34;AF=0.11;AN=314   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1
+chr1   194047765       .       TAT     T       .       PASS    VC=INDEL;AC=48;AF=0.2;AN=238    GT      ./.     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     ./.     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     ./.     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     ./.     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     ./.     0/1     0/1     0/0     0/1     ./.     ./.     0/0     ./.     ./.     0/1     0/1     0/0     0/0     ./.     ./.     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     0/1     ./.     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     ./.     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     ./.     ./.     ./.     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     0/1     ./.     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     ./.     0/1     ./.     1/1     0/1     ./.     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1
+chr1   194160203       .       TTAGT   T       .       PASS    VC=INDEL;AC=25;AF=0.12;AN=206   GT      0/1     0/0     0/1     0/0     ./.     0/1     0/0     ./.     ./.     ./.     0/1     ./.     0/0     ./.     0/1     ./.     0/0     0/1     0/1     0/1     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/1     0/0     ./.     ./.     0/1     0/0     ./.     ./.     ./.     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     ./.     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     ./.     0/0     ./.     ./.     ./.     ./.     0/1     ./.     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     ./.     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     ./.     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     ./.     0/1     ./.     ./.     0/1     0/1     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/1
+chr1   194193740       .       A       AG      .       PASS    VC=INDEL;AC=316;AF=1;AN=316     GT      1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1
+chr1   194339262       .       ATGT    A       .       PASS    VC=INDEL;AC=67;AF=0.21;AN=316   GT      0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0
+chr1   194487871       .       C       CCTAT   .       PASS    VC=INDEL;AC=302;AF=0.97;AN=312  GT      1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1
+chr1   194520551       .       GG      G       .       PASS    VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   194563981       .       TAAT    T       .       PASS    VC=INDEL;AC=169;AF=0.53;AN=316  GT      1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1
+chr1   194738670       .       T       TTT     .       PASS    VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   194763917       .       CATG    C       .       PASS    VC=INDEL;AC=267;AF=0.84;AN=316  GT      1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1
+chr1   195047681       .       GG      G       .       PASS    VC=INDEL;AC=29;AF=0.1;AN=278    GT      0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     ./.     0/0     1/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/1     ./.     ./.     ./.     0/1     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     ./.     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1
+chr1   195637390       .       TA      T       .       PASS    VC=INDEL;AC=90;AF=0.29;AN=314   GT      1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1
+chr1   195637391       .       AA      A       .       PASS    VC=INDEL;AC=89;AF=0.28;AN=316   GT      1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1
+chr1   195877296       .       T       TAA     .       PASS    VC=INDEL;AC=232;AF=0.73;AN=316  GT      1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1
+chr1   195877297       .       A       AAA     .       PASS    VC=INDEL;AC=232;AF=0.73;AN=316  GT      1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1
+chr1   195934123       .       CCTAT   C       .       PASS    VC=INDEL;AC=185;AF=0.59;AN=312  GT      1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     ./.     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0
+chr1   195934125       .       TATCT   T       .       PASS    VC=INDEL;AC=184;AF=0.59;AN=312  GT      1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     ./.     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0
+chr1   196163677       .       TT      T       .       PASS    VC=INDEL;AC=284;AF=0.9;AN=316   GT      1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1
+chr1   196344374       .       C       CA      .       PASS    VC=INDEL;AC=153;AF=0.53;AN=290;refseq.name=NM_198503;refseq.positionType=intron GT      0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     1/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     ./.     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     0/1     ./.     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     0/1     ./.     ./.     0/0
+chr1   196448625       .       ATG     A       .       PASS    VC=INDEL;AC=7;AF=0.03;AN=266;refseq.name=NM_198503;refseq.positionType=intron   GT      ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     ./.     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0
+chr1   196448626       .       TGTA    T       .       PASS    VC=INDEL;AC=8;AF=0.03;AN=302;refseq.name=NM_198503;refseq.positionType=intron   GT      ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0
+chr1   197406760       .       GAA     G       .       PASS    VC=INDEL;AC=78;AF=0.25;AN=312;refseq.name=NM_201253;refseq.positionType=intron  GT      0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     ./.     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0
+chr1   197613756       .       ACCT    A       .       PASS    VC=INDEL;AC=25;AF=0.08;AN=316;refseq.name=NM_144977;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1
+chr1   197690664       .       T       TG      .       PASS    VC=INDEL;AC=291;AF=0.92;AN=316;refseq.name=NM_144977;refseq.positionType=intron GT      1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1
+chr1   198792990       .       T       TG      .       PASS    VC=INDEL;AC=131;AF=0.41;AN=316  GT      0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0
+chr1   198940301       .       C       CCTT    .       PASS    VC=INDEL;AC=258;AF=0.82;AN=316  GT      1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1
+chr1   198940306       .       T       TTCT    .       PASS    VC=INDEL;AC=258;AF=0.82;AN=316  GT      1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1
+chr1   199277515       .       AC      A       .       PASS    VC=INDEL;AC=36;AF=0.11;AN=316   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0
+chr1   200575750       .       AAATA   A       .       PASS    VC=INDEL;AC=97;AF=0.31;AN=314;refseq.name=NM_014875;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     ./.     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1
+chr1   201173407       .       AA      A       .       PASS    VC=INDEL;AC=56;AF=0.18;AN=314   GT      0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0
+chr1   201288249       .       TATC    T       .       PASS    VC=INDEL;AC=209;AF=0.66;AN=316;refseq.name=NM_000299;refseq.positionType=intron GT      1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/0     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1
+chr1   201457641       .       AA      A       .       PASS    VC=INDEL;AC=55;AF=0.18;AN=310;refseq.name=NM_004078;refseq.positionType=intron  GT      1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     1/1     1/1
+chr1   201587178       .       CA      C       .       PASS    VC=INDEL;AC=145;AF=0.47;AN=310  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     ./.     0/1     1/1     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0
+chr1   201733889       .       G       GG      .       PASS    VC=INDEL;AC=46;AF=0.15;AN=316;refseq.name=NM_020443;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1
+chr1   203792216       .       AA      A       .       PASS    VC=INDEL;AC=265;AF=0.93;AN=286;refseq.name=NM_014827;refseq.positionType=intron GT      0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     ./.     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     ./.     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     ./.     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     ./.     1/1     ./.     ./.     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     0/1     1/1     ./.     ./.     1/1
+chr1   203829389       .       CTCAAC  C       .       PASS    VC=INDEL;AC=195;AF=0.62;AN=316;refseq.name=NM_003094;refseq.positionType=promoter       GT      0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1
+chr1   203848383       .       C       CTT     .       PASS    VC=INDEL;AC=275;AF=0.87;AN=316  GT      0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1
+chr1   203848384       .       T       TTT     .       PASS    VC=INDEL;AC=275;AF=0.87;AN=316  GT      0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1
+chr1   204049028       .       T       TG      .       PASS    VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316;refseq.name=NM_005686;refseq.positionType=intron      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   204452618       .       T       TGT     .       PASS    VC=INDEL;AC=141;AF=0.47;AN=300;refseq.name=NM_002646;refseq.positionType=intron GT      1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     ./.     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     ./.     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     ./.     1/1     0/1     0/0     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     ./.     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1
+chr1   205036040       .       T       TG      .       PASS    VC=INDEL;AC=69;AF=0.23;AN=302;refseq.name=NM_005076;refseq.positionType=intron  GT      0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     ./.     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     ./.     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     ./.     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1
+chr1   205036041       .       G       GG      .       PASS    VC=INDEL;AC=71;AF=0.23;AN=310;refseq.name=NM_005076;refseq.positionType=intron  GT      0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     ./.     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1
+chr1   206303222       .       C       CAGCCTAGCT      .       PASS    VC=INDEL;AC=105;AF=0.33;AN=316  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0
+chr1   206571046       .       G       GA      .       PASS    VC=INDEL;AC=2;AF=0.01;AN=290;refseq.name=NM_015326;refseq.positionType=intron   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     ./.     0/0     ./.
+chr1   206862605       .       G       GA      .       PASS    VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316;refseq.name=NM_004759;refseq.positionType=intron      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   206955760       .       TGTAA   T       .       PASS    VC=INDEL;AC=95;AF=0.31;AN=310   GT      0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     ./.     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1
+chr1   207260285       .       T       TCAATTCACAGGAGTATGTGA   .       PASS    VC=INDEL;AC=197;AF=0.62;AN=316;refseq.name=NM_001017365;refseq.positionType=promoter    GT      1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1
+chr1   207277350       .       CC      C       .       PASS    VC=INDEL;AC=201;AF=0.64;AN=316;refseq.name=NM_000715;refseq.positionType=promoter       GT      0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0
+chr1   207641329       .       TTAAG   T       .       PASS    VC=INDEL;AC=13;AF=0.06;AN=216;refseq.name=NM_001006658;refseq.positionType=intron       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     ./.     ./.     ./.     ./.     ./.     ./.     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     ./.     ./.     ./.     ./.     0/0     ./.     0/1     ./.     0/0     0/0     ./.     ./.     ./.     ./.     0/0     0/0     0/1     ./.     ./.     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     1/1     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     ./.     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     ./.     0/0     ./.
+chr1   207824638       .       A       AATTC   .       PASS    VC=INDEL;AC=153;AF=0.48;AN=316;refseq.name=NM_175710;refseq.positionType=intron GT      0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1
+chr1   208201207       .       GT      G       .       PASS    VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316;refseq.name=NM_025179;refseq.positionType=intron      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   208514674       .       GTTAC   G       .       PASS    VC=INDEL;AC=165;AF=0.53;AN=314  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     ./.     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0
+chr1   208514676       .       TACTT   T       .       PASS    VC=INDEL;AC=166;AF=0.53;AN=314  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     ./.     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0
+chr1   208609280       .       GGAAG   G       .       PASS    VC=INDEL;AC=55;AF=0.21;AN=256   GT      0/0     ./.     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     ./.     0/1     ./.     1/1     0/1     ./.     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     ./.     1/1     0/0     1/1     0/1     ./.     ./.     0/1     1/1     ./.     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     ./.     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1
+chr1   208643013       .       CA      C       .       PASS    VC=INDEL;AC=36;AF=0.12;AN=310   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     ./.     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1
+chr1   208643015       .       AA      A       .       PASS    VC=INDEL;AC=39;AF=0.12;AN=316   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1
+chr1   208763800       .       C       CA      .       PASS    VC=INDEL;AC=175;AF=0.55;AN=316  GT      1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1
+chr1   209124169       .       T       TA      .       PASS    VC=INDEL;AC=226;AF=0.72;AN=316  GT      0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1
+chr1   209124171       .       A       AA      .       PASS    VC=INDEL;AC=226;AF=0.72;AN=316  GT      0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1
+chr1   209639686       .       A       AG      .       PASS    VC=INDEL;AC=203;AF=0.64;AN=316  GT      0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1
+chr1   209662878       .       T       TG      .       PASS    VC=INDEL;AC=205;AF=0.65;AN=316  GT      0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1
+chr1   209936964       .       T       TCA     .       PASS    VC=INDEL;AC=184;AF=0.58;AN=316;refseq.name=NM_025228;refseq.positionType=intron GT      0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0
+chr1   210007940       .       TCT     T       .       PASS    VC=INDEL;AC=190;AF=0.6;AN=316;refseq.name=NM_014388;refseq.positionType=intron  GT      1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1
+chr1   210483472       .       TG      T       .       PASS    VC=INDEL;AC=13;AF=0.04;AN=316   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   210485101       .       A       AGGAC   .       PASS    VC=INDEL;AC=232;AF=0.8;AN=290   GT      0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     ./.     ./.     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     ./.     0/0     1/1     0/1     0/0     ./.     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     ./.     0/1     ./.     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     ./.
+chr1   210713503       .       TT      T       .       PASS    VC=INDEL;AC=303;AF=0.96;AN=316;refseq.name=NM_018194;refseq.positionType=intron GT      1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1
+chr1   211710916       .       CC      C       .       PASS    VC=INDEL;AC=55;AF=0.17;AN=316   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   211786200       .       TA      T       .       PASS    VC=INDEL;AC=147;AF=0.56;AN=264  GT      ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     ./.     0/0     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     ./.     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     0/1     0/0     ./.     ./.     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     ./.     ./.     0/0     ./.     0/1     0/1     ./.     ./.     0/0     ./.     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     ./.     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     ./.     1/1     0/0     0/0     1/1     ./.     1/1     0/1
+chr1   212767202       .       TTT     T       .       PASS    VC=INDEL;AC=63;AF=0.2;AN=316;refseq.name=NM_001030287;refseq.positionType=intron        GT      0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0
+chr1   213150090       .       T       TGT     .       PASS    VC=INDEL;AC=64;AF=0.21;AN=300;refseq.name=NM_024749;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     ./.     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     ./.     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     ./.     0/1     0/0     ./.     ./.     0/0
+chr1   213160084       .       A       AG      .       PASS    VC=INDEL;AC=129;AF=0.41;AN=312;refseq.name=NM_024749;refseq.positionType=intron GT      0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     ./.     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     ./.     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1
+chr1   213160085       .       G       GG      .       PASS    VC=INDEL;AC=129;AF=0.41;AN=314;refseq.name=NM_024749;refseq.positionType=intron GT      0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     ./.     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1
+chr1   213393510       .       AG      A       .       PASS    VC=INDEL;AC=62;AF=0.2;AN=316;refseq.name=NM_012424;refseq.positionType=intron   GT      0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1
+chr1   213790399       .       C       CGA     .       PASS    VC=INDEL;AC=2;AF=0.01;AN=316    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   214136369       .       CTTC    C       .       PASS    VC=INDEL;AC=93;AF=0.29;AN=316   GT      0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0
+chr1   214365999       .       C       CTG     .       PASS    VC=INDEL;AC=164;AF=0.59;AN=278  GT      1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     ./.     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     ./.     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     ./.     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     ./.     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     ./.     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     ./.     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     ./.     0/1     0/1     ./.     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     ./.     0/1     0/1     ./.     ./.     ./.     1/1     ./.     ./.     1/1     0/1     ./.     1/1     1/1     1/1     0/1     ./.     0/1     0/0     0/1     0/0     ./.     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     ./.     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     ./.     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1
+chr1   214573392       .       G       GTTC    .       PASS    VC=INDEL;AC=271;AF=0.86;AN=316;refseq.name=NM_005401;refseq.positionType=intron GT      1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1
+chr1   215120715       .       AA      A       .       PASS    VC=INDEL;AC=36;AF=0.12;AN=312   GT      0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0
+chr1   216179286       .       T       TCAAT   .       PASS    VC=INDEL;AC=30;AF=0.09;AN=316;refseq.name=NM_206933;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0
+chr1   216298294       .       C       CAG     .       PASS    VC=INDEL;AC=113;AF=0.36;AN=316;refseq.name=NM_206933;refseq.positionType=intron GT      0/0     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1
+chr1   216298296       .       G       GAG     .       PASS    VC=INDEL;AC=112;AF=0.35;AN=316;refseq.name=NM_206933;refseq.positionType=intron GT      0/0     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1
+chr1   216454053       .       A       AACA    .       PASS    VC=INDEL;AC=224;AF=0.71;AN=316;refseq.name=NM_206933;refseq.positionType=intron GT      0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1
+chr1   216780749       .       C       CC      .       PASS    VC=INDEL;AC=10;AF=0.03;AN=316;refseq.name=NM_206594;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0
+chr1   216835074       .       A       AGTTT   .       PASS    VC=INDEL;AC=89;AF=0.28;AN=316;refseq.name=NM_206594;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1
+chr1   217026745       .       AA      A       .       PASS    VC=INDEL;AC=13;AF=0.04;AN=304;refseq.name=NM_206594;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0
+chr1   217057204       .       G       GC      .       PASS    VC=INDEL;AC=231;AF=0.73;AN=316;refseq.name=NM_206594;refseq.positionType=intron GT      0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1
+chr1   217363476       .       CTATT   C       .       PASS    VC=INDEL;AC=40;AF=0.19;AN=212   GT      0/0     1/1     1/1     0/0     0/1     ./.     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     1/1     1/1     0/0     ./.     1/1     1/1     ./.     ./.     ./.     0/0     0/0     ./.     1/1     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     ./.     ./.     ./.     ./.     ./.     ./.     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     ./.     ./.     ./.     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     ./.     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     ./.     0/0     ./.     ./.     0/0     ./.     ./.     ./.     ./.     ./.     ./.     ./.
+chr1   218217904       .       C       CG      .       PASS    VC=INDEL;AC=130;AF=0.43;AN=302  GT      0/1     0/1     0/1     ./.     1/1     0/1     ./.     0/1     0/0     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     ./.     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     ./.     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.
+chr1   218473680       .       CGAG    C       .       PASS    VC=INDEL;AC=16;AF=0.05;AN=316;refseq.name=NM_016052;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1
+chr1   218574584       .       A       AT      .       PASS    VC=INDEL;AC=21;AF=0.09;AN=236;refseq.name=NM_003238;refseq.positionType=intron  GT      0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     ./.     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/1     ./.     0/0     ./.     0/1     0/1     0/1     0/0     ./.     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     ./.     ./.     0/1     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   218845277       .       TTTGT   T       .       PASS    VC=INDEL;AC=97;AF=0.31;AN=314   GT      0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     ./.     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   219001503       .       T       TC      .       PASS    VC=INDEL;AC=176;AF=0.56;AN=316  GT      1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1
+chr1   219293844       .       A       ACT     .       PASS    VC=INDEL;AC=274;AF=0.89;AN=308  GT      1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     ./.     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     ./.     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1
+chr1   219293846       .       T       TCT     .       PASS    VC=INDEL;AC=199;AF=0.9;AN=222   GT      1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     ./.     ./.     ./.     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     ./.     0/1     ./.     ./.     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     ./.     ./.     1/1     ./.     ./.     ./.     1/1     1/1     ./.     1/1     ./.     1/1     ./.     ./.     0/1     0/0     1/1     ./.     1/1     1/1     ./.     ./.     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     ./.     1/1     1/1     0/1     ./.     0/1     ./.     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     ./.     1/1     1/1     0/1     ./.     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     ./.     ./.     1/1     1/1     ./.     ./.     0/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     ./.     ./.     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     ./.     0/1     1/1     ./.     0/1     ./.     1/1     0/1     ./.     0/0     ./.     1/1     ./.     1/1     ./.
+chr1   219467766       .       AAC     A       .       PASS    VC=INDEL;AC=102;AF=0.32;AN=314  GT      0/0     1/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     ./.     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1
+chr1   219839015       .       C       CATGG   .       PASS    VC=INDEL;AC=73;AF=0.24;AN=306   GT      1/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     ./.     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     1/1     0/1
+chr1   221137225       .       T       TCTT    .       PASS    VC=INDEL;AC=159;AF=0.61;AN=262  GT      0/0     ./.     0/1     0/1     0/1     ./.     1/1     1/1     ./.     0/1     1/1     1/1     0/1     ./.     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     ./.     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     ./.     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     ./.     ./.     0/1     0/0     0/1     0/1     ./.     1/1     0/1     1/1     ./.     0/1     1/1     0/0     0/1     ./.     ./.     ./.     0/1     ./.     0/1     ./.     0/1     1/1     0/1     0/1     ./.     0/1     0/1     0/0     0/0     ./.     0/1     ./.     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     ./.     1/1     1/1     ./.     0/1     0/1     0/0     ./.     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     ./.     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     ./.     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     ./.     1/1     0/1     0/1     0/1     ./.     0/1     0/0     1/1     ./.     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0
+chr1   221202698       .       GA      G       .       PASS    VC=INDEL;AC=82;AF=0.26;AN=310   GT      0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   221279126       .       CC      C       .       PASS    VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=312       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   221315912       .       TTCT    T       .       PASS    VC=INDEL;AC=94;AF=0.3;AN=312    GT      1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0
+chr1   222205539       .       AATTGACC        A       .       PASS    VC=INDEL;AC=90;AF=0.29;AN=310   GT      1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     ./.     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1
+chr1   222493300       .       T       TGA     .       PASS    VC=INDEL;AC=310;AF=0.98;AN=316  GT      1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1
+chr1   222493301       .       G       GAG     .       PASS    VC=INDEL;AC=310;AF=0.98;AN=316  GT      1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1
+chr1   222990213       .       ATTTG   A       .       PASS    VC=INDEL;AC=9;AF=0.04;AN=254    GT      0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     ./.     ./.     ./.     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     ./.     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     ./.     ./.     0/0     0/0     0/1
+chr1   223387015       .       CTG     C       .       PASS    VC=INDEL;AC=6;AF=0.02;AN=316    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   223657734       .       A       ATGAG   .       PASS    VC=INDEL;AC=231;AF=0.99;AN=234  GT      1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     ./.     ./.     1/1     ./.     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     ./.     ./.     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     ./.     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     ./.     ./.     ./.     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     ./.     1/1     ./.     1/1     1/1     ./.     1/1     ./.     ./.     0/1     ./.     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     0/1     ./.     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     ./.     ./.     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     ./.     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1
+chr1   223984835       .       G       GAA     .       PASS    VC=INDEL;AC=194;AF=0.63;AN=306;refseq.name=NM_001031685;refseq.positionType=intron      GT      ./.     1/1     0/1     ./.     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0
+chr1   224264255       .       A       AG      .       PASS    VC=INDEL;AC=150;AF=0.66;AN=228  GT      0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     ./.     0/1     ./.     1/1     1/1     ./.     ./.     ./.     1/1     ./.     0/1     0/0     ./.     ./.     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     ./.     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     ./.     1/1     ./.     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     ./.     0/1     1/1     ./.     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     0/1     ./.     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     ./.     0/1     1/1     0/1     1/1     ./.     1/1     ./.     0/1     1/1     0/0     ./.     1/1     1/1     ./.     ./.     1/1     1/1     0/1     ./.     0/0     0/1     0/1     ./.     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     ./.     1/1     ./.     ./.     1/1     0/0     0/1     ./.     1/1     0/0     ./.     0/1     0/0     0/1     ./.     ./.     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     ./.     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     ./.     0/0     1/1     ./.     ./.     ./.     ./.     1/1     ./.     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     ./.     1/1     ./.     ./.     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     ./.     0/1     0/1     0/1     ./.     ./.
+chr1   224264346       .       TGAG    T       .       PASS    VC=INDEL;AC=154;AF=0.63;AN=244  GT      0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     ./.     ./.     1/1     ./.     1/1     0/0     1/1     1/1     ./.     0/1     ./.     0/1     ./.     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     ./.     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     ./.     0/1     0/1     0/0     ./.     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     ./.     0/1     1/1     ./.     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     0/1     ./.     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     ./.     ./.     ./.     0/1     ./.     1/1     0/1     ./.     0/0     ./.     ./.     1/1     0/1     ./.     1/1     ./.     0/1     ./.     0/0     0/1     0/1     ./.     0/0     1/1     0/1     0/1     ./.     1/1     ./.     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     ./.     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     ./.     0/1     0/1     ./.     0/1     0/1     ./.     0/1     0/0     0/0     1/1     ./.     0/1     1/1     0/1     ./.     0/1     1/1     0/1     ./.     1/1     0/1     0/1     ./.     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     ./.     1/1     0/1
+chr1   224833844       .       A       AAGACGTAAGACAGT .       PASS    VC=INDEL;AC=215;AF=0.68;AN=314;refseq.name=NM_152495;refseq.positionType=intron GT      0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     ./.     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0
+chr1   225662220       .       CT      C       .       PASS    VC=INDEL;AC=203;AF=0.66;AN=306  GT      0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     ./.     0/0     ./.     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     ./.     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     ./.     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1
+chr1   225974486       .       T       TG      .       PASS    VC=INDEL;AC=187;AF=0.6;AN=310;refseq.name=NM_003133;refseq.positionType=intron  GT      0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     ./.     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     ./.     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     ./.     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1
+chr1   225974487       .       G       GG      .       PASS    VC=INDEL;AC=189;AF=0.6;AN=314;refseq.name=NM_003133;refseq.positionType=intron  GT      0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     ./.     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1
+chr1   226014266       .       ATGG    A       .       PASS    VC=INDEL;AC=30;AF=0.1;AN=310;refseq.name=NM_000120;refseq.positionType=intron   GT      0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.
+chr1   226014267       .       TGGT    T       .       PASS    VC=INDEL;AC=31;AF=0.1;AN=316;refseq.name=NM_000120;refseq.positionType=intron   GT      0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1
+chr1   226878226       .       ACTC    A       .       PASS    VC=INDEL;AC=45;AF=0.15;AN=306;refseq.name=NM_002221;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     ./.     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0
+chr1   226878233       .       CTAC    C       .       PASS    VC=INDEL;AC=60;AF=0.21;AN=292;refseq.name=NM_002221;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     ./.     ./.     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     1/1     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     ./.     0/0     ./.     0/1     0/0
+chr1   226913049       .       GCCA    G       .       PASS    VC=INDEL;AC=14;AF=0.05;AN=302;refseq.name=NM_002221;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   226913051       .       CACC    C       .       PASS    VC=INDEL;AC=6;AF=0.02;AN=280;refseq.name=NM_002221;refseq.positionType=intron   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   227051261       .       G       GC      .       PASS    VC=INDEL;AC=21;AF=0.07;AN=314   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   227252431       .       TTTC    T       .       PASS    VC=INDEL;AC=21;AF=0.07;AN=316;refseq.name=NM_003607;refseq.positionType=intron  GT      0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1
+chr1   227401072       .       GC      G       .       PASS    VC=INDEL;AC=122;AF=0.39;AN=316;refseq.name=NM_003607;refseq.positionType=intron GT      0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0
+chr1   227560279       .       G       GTCATAG .       PASS    VC=INDEL;AC=316;AF=1;AN=316     GT      1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1
+chr1   228479392       .       ATG     A       .       PASS    VC=INDEL;AC=12;AF=0.04;AN=316;refseq.name=NM_001098623;refseq.positionType=intron       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   229074693       .       TAGAGG  T       .       PASS    VC=INDEL;AC=102;AF=0.32;AN=316  GT      0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1
+chr1   229075090       .       ATAGCCTG        A       .       PASS    VC=INDEL;AC=30;AF=0.11;AN=264   GT      1/1     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     ./.     0/0     ./.     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     ./.     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.
+chr1   229336842       .       CATTT   C       .       PASS    VC=INDEL;AC=19;AF=0.06;AN=300   GT      ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/1     0/1     0/1     ./.     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0
+chr1   229631495       .       A       AC      .       PASS    VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316;refseq.name=NM_018230;refseq.positionType=intron      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   229922597       .       CCTT    C       .       PASS    VC=INDEL;AC=144;AF=0.46;AN=316  GT      0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1
+chr1   229922599       .       TTCT    T       .       PASS    VC=INDEL;AC=142;AF=0.45;AN=314  GT      0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     ./.     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1
+chr1   230272407       .       GAG     G       .       PASS    VC=INDEL;AC=15;AF=0.05;AN=314;refseq.name=NM_004481;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   230625946       .       T       TGA     .       PASS    VC=INDEL;AC=302;AF=0.96;AN=316  GT      1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1
+chr1   230626726       .       CTTTAAGTCCTGT   C       .       PASS    VC=INDEL;AC=59;AF=0.19;AN=314   GT      0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   230626728       .       TTAAGTCCTGTTT   T       .       PASS    VC=INDEL;AC=59;AF=0.19;AN=316   GT      0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   230697057       .       ACA     A       .       PASS    VC=INDEL;AC=152;AF=0.48;AN=316  GT      0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0
+chr1   230952100       .       GG      G       .       PASS    VC=INDEL;AC=34;AF=0.11;AN=316   GT      0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1
+chr1   232200072       .       CGACT   C       .       PASS    VC=INDEL;AC=86;AF=0.28;AN=312   GT      0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     ./.     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     ./.     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1
+chr1   232606995       .       GTCTG   G       .       PASS    VC=INDEL;AC=54;AF=0.17;AN=316;refseq.name=NM_020808;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1
+chr1   232883964       .       G       GTT     .       PASS    VC=INDEL;AC=279;AF=0.88;AN=316  GT      1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1
+chr1   232883965       .       T       TTT     .       PASS    VC=INDEL;AC=279;AF=0.88;AN=316  GT      1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1
+chr1   232944224       .       AAGAA   A       .       PASS    VC=INDEL;AC=17;AF=0.05;AN=316;refseq.name=NM_019090;refseq.positionType=exon    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   233013835       .       C       CT      .       PASS    VC=INDEL;AC=38;AF=0.18;AN=214   GT      0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     ./.     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/1     1/1     ./.     ./.     ./.     1/1     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     ./.     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/1     0/0     ./.     ./.     ./.     0/1     ./.     0/1     0/1     ./.     ./.     ./.     0/0     0/1     ./.     0/1     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     ./.     1/1     0/1     ./.     1/1     0/1     0/0     ./.     0/0     1/1     ./.     ./.     0/0     1/1     ./.     ./.     0/0     ./.     1/1     ./.     1/1     ./.     ./.     0/0     ./.     ./.
+chr1   233013837       .       T       TT      .       PASS    VC=INDEL;AC=78;AF=0.25;AN=310   GT      0/1     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   233458691       .       ACAC    A       .       PASS    VC=INDEL;AC=18;AF=0.06;AN=314   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/1
+chr1   233593090       .       TT      T       .       PASS    VC=INDEL;AC=257;AF=0.82;AN=312  GT      1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     ./.     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1
+chr1   233991847       .       T       TCA     .       PASS    VC=INDEL;AC=220;AF=0.72;AN=306  GT      1/1     1/1     ./.     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     ./.     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     ./.     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1
+chr1   234635298       .       G       GT      .       PASS    VC=INDEL;AC=205;AF=0.65;AN=316  GT      0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0
+chr1   234704346       .       TCT     T       .       PASS    VC=INDEL;AC=36;AF=0.12;AN=312   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0
+chr1   235770627       .       AATTA   A       .       PASS    VC=INDEL;AC=56;AF=0.18;AN=316;refseq.name=NM_004485;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   236043714       .       ATCCTGTGTTGATTTA        A       .       PASS    VC=INDEL;AC=6;AF=0.02;AN=294    GT      ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   236043717       .       CTGTGTTGATTTATTA        C       .       PASS    VC=INDEL;AC=5;AF=0.02;AN=316    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   236118487       .       TT      T       .       PASS    VC=INDEL;AC=12;AF=0.04;AN=316   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   236195380       .       GTG     G       .       PASS    VC=INDEL;AC=163;AF=0.52;AN=316;refseq.name=NM_002508;refseq.positionType=intron GT      0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1
+chr1   236375505       .       T       TG      .       PASS    VC=INDEL;AC=130;AF=0.42;AN=310  GT      0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0
+chr1   236555148       .       T       TA      .       PASS    VC=INDEL;AC=3;AF=0.01;AN=316;refseq.name=NM_145861;refseq.positionType=promoter GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0
+chr1   236723352       .       CGACCTCGCTCAGACTCTGTGAGGTGCTGAATAAGCAACA        C       .       PASS    VC=INDEL;AC=72;AF=0.23;AN=314;refseq.name=NM_018072;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0
+chr1   236723354       .       ACCTCGCTCAGACTCTGTGAGGTGCTGAATAAGCAACAGA        A       .       PASS    VC=INDEL;AC=72;AF=0.23;AN=312;refseq.name=NM_018072;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0
+chr1   236848307       .       A       AG      .       PASS    VC=INDEL;AC=62;AF=0.21;AN=300;refseq.name=NM_001103;refseq.positionType=promoter        GT      0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     ./.     ./.     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     ./.     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/1     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   237009685       .       TAGC    T       .       PASS    VC=INDEL;AC=6;AF=0.02;AN=292;refseq.name=NM_000254;refseq.positionType=intron   GT      0/1     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   237009687       .       GCAG    G       .       PASS    VC=INDEL;AC=3;AF=0.01;AN=304;refseq.name=NM_000254;refseq.positionType=intron   GT      0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   237055125       .       CA      C       .       PASS    VC=INDEL;AC=9;AF=0.03;AN=284;refseq.name=NM_000254;refseq.positionType=intron   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   237277023       .       C       CA      .       PASS    VC=INDEL;AC=18;AF=0.06;AN=312;refseq.name=NM_001035;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1
+chr1   237535965       .       AA      A       .       PASS    VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=280;refseq.name=NM_001035;refseq.positionType=intron      GT      0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0
+chr1   237539975       .       GCTTGA  G       .       PASS    VC=INDEL;AC=3;AF=0.01;AN=316;refseq.name=NM_001035;refseq.positionType=intron   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0
+chr1   237649833       .       C       CTCTT   .       PASS    VC=INDEL;AC=140;AF=0.45;AN=312;refseq.name=NM_001035;refseq.positionType=intron GT      1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     ./.     0/0     1/1     0/1     ./.     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1
+chr1   237649835       .       C       CTTTC   .       PASS    VC=INDEL;AC=138;AF=0.44;AN=312;refseq.name=NM_001035;refseq.positionType=intron GT      1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     ./.     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     ./.     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1
+chr1   237995162       .       T       TTTGA   .       PASS    VC=INDEL;AC=301;AF=0.96;AN=312;refseq.name=NM_001035;refseq.positionType=intron GT      1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1
+chr1   238017296       .       T       TCT     .       PASS    VC=INDEL;AC=80;AF=0.25;AN=316   GT      0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0
+chr1   238125441       .       AGA     A       .       PASS    VC=INDEL;AC=26;AF=0.08;AN=316   GT      0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1
+chr1   238152842       .       C       CGTAA   .       PASS    VC=INDEL;AC=165;AF=0.52;AN=316  GT      0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0
+chr1   238152845       .       A       AAGTA   .       PASS    VC=INDEL;AC=166;AF=0.53;AN=316  GT      0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0
+chr1   238257585       .       TGAT    T       .       PASS    VC=INDEL;AC=159;AF=0.61;AN=262  GT      1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     ./.     1/1     0/1     ./.     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     ./.     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     0/1     ./.     1/1     1/1     0/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     ./.     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/1     ./.     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     ./.     0/1     0/1     ./.     0/1     ./.     0/1     ./.     0/1     0/0     ./.     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     ./.     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     ./.     1/1     0/1     1/1     ./.     ./.     0/0     1/1     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/1     0/1     ./.     ./.     ./.     0/1     0/1     ./.     ./.     0/1     1/1     1/1
+chr1   238476744       .       A       ATCTA   .       PASS    VC=INDEL;AC=283;AF=0.98;AN=290  GT      1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     ./.     1/1     ./.     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     ./.     1/1
+chr1   238497833       .       G       GAGAA   .       PASS    VC=INDEL;AC=232;AF=0.76;AN=304  GT      0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     ./.     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     ./.     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     ./.     0/0     ./.     ./.     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1
+chr1   238623394       .       C       CTTGA   .       PASS    VC=INDEL;AC=178;AF=0.58;AN=308  GT      0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     ./.     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     ./.     ./.     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     ./.     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1
+chr1   238699979       .       T       TATCT   .       PASS    VC=INDEL;AC=97;AF=0.31;AN=314   GT      0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     ./.     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1
+chr1   238921290       .       CATTCAT C       .       PASS    VC=INDEL;AC=188;AF=0.59;AN=316  GT      0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0
+chr1   238933453       .       C       CA      .       PASS    VC=INDEL;AC=26;AF=0.08;AN=314   GT      0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   238933454       .       A       AA      .       PASS    VC=INDEL;AC=25;AF=0.08;AN=314   GT      0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   239644576       .       C       CAA     .       PASS    VC=INDEL;AC=46;AF=0.15;AN=300   GT      0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     ./.     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     ./.     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   240115184       .       GAAG    G       .       PASS    VC=INDEL;AC=62;AF=0.2;AN=316    GT      0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1
+chr1   240170484       .       ATCA    A       .       PASS    VC=INDEL;AC=30;AF=0.1;AN=310    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0
+chr1   240469105       .       A       ACT     .       PASS    VC=INDEL;AC=44;AF=0.14;AN=308;refseq.name=NM_020066;refseq.positionType=intron  GT      0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0
+chr1   240556294       .       A       AG      .       PASS    VC=INDEL;AC=180;AF=0.73;AN=248;refseq.name=NM_020066;refseq.positionType=intron GT      ./.     0/1     1/1     ./.     1/1     0/1     1/1     1/1     ./.     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     ./.     0/0     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     ./.     ./.     ./.     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     ./.     0/1     0/1     0/1     ./.     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     ./.     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     ./.     0/0     0/0     0/1     ./.     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     ./.     ./.     ./.     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     ./.     0/1     1/1     0/1     ./.     1/1     1/1     ./.     1/1     0/1     ./.     ./.     0/1     ./.     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     ./.     ./.     1/1     0/1     1/1     ./.     ./.     ./.     ./.     1/1     1/1     1/1     ./.     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     0/1     0/1     0/0     ./.     0/0     0/1     ./.     0/1     1/1     0/1
+chr1   240750353       .       A       AT      .       PASS    VC=INDEL;AC=1;AF=0;AN=208;refseq.name=NM_022469;refseq.positionType=intron      GT      0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     ./.     ./.     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     ./.     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.
+chr1   241292738       .       CGAC    C       .       PASS    VC=INDEL;AC=16;AF=0.06;AN=254;refseq.name=NM_002924;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     ./.     0/1     ./.     ./.     0/0     ./.     ./.     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     ./.     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     ./.     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     ./.     ./.     ./.     0/0     ./.     0/1     0/1     0/0     0/0
+chr1   241342365       .       TTCAA   T       .       PASS    VC=INDEL;AC=54;AF=0.18;AN=308;refseq.name=NM_002924;refseq.positionType=intron  GT      0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     ./.     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     ./.     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1
+chr1   241864983       .       A       AGTCAAAC        .       PASS    VC=INDEL;AC=235;AF=0.75;AN=314;refseq.name=NM_144625;refseq.positionType=intron GT      0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0
+chr1   241901460       .       ACTG    A       .       PASS    VC=INDEL;AC=126;AF=0.4;AN=316;refseq.name=NM_144625;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0
+chr1   241920499       .       TGTAG   T       .       PASS    VC=INDEL;AC=5;AF=0.02;AN=316;refseq.name=NM_144625;refseq.positionType=intron   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1
+chr1   241920501       .       TAGGT   T       .       PASS    VC=INDEL;AC=5;AF=0.02;AN=316;refseq.name=NM_144625;refseq.positionType=intron   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1
+chr1   242055743       .       C       CTG     .       PASS    VC=INDEL;AC=47;AF=0.15;AN=314   GT      0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0
+chr1   242257290       .       TC      T       .       PASS    VC=INDEL;AC=59;AF=0.22;AN=270;refseq.name=NM_152666;refseq.positionType=intron  GT      0/1     ./.     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     ./.     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     ./.     ./.     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/1     ./.     ./.     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     ./.     0/0     ./.     0/1     0/1     0/0     ./.     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/1     ./.     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     ./.     0/1     0/1     0/1     0/0
+chr1   242281287       .       T       TCT     .       PASS    VC=INDEL;AC=296;AF=0.95;AN=312;refseq.name=NM_152666;refseq.positionType=intron GT      1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1
+chr1   242328018       .       CATTACACTACTTTT C       .       PASS    VC=INDEL;AC=97;AF=0.4;AN=244;refseq.name=NM_152666;refseq.positionType=intron   GT      1/1     0/1     0/1     ./.     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     ./.     0/0     ./.     0/1     0/0     0/1     0/1     ./.     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     ./.     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     ./.     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     ./.     0/0     ./.     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     ./.     ./.     ./.     0/1     0/1     ./.     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     0/1     ./.     1/1     ./.     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     ./.     1/1     0/1     1/1     0/1     ./.     ./.     1/1     0/1     0/1     0/1     ./.     ./.     0/0     1/1     0/1     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     ./.     ./.     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     ./.     0/0     0/1     0/1     0/1     ./.     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     ./.     ./.     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     ./.     ./.     ./.     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     ./.     0/0     0/0
+chr1   242602261       .       CC      C       .       PASS    VC=INDEL;AC=51;AF=0.16;AN=316;refseq.name=NM_152666;refseq.positionType=intron  GT      0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1
+chr1   243409926       .       AAGTT   A       .       PASS    VC=INDEL;AC=99;AF=0.32;AN=312;refseq.name=NM_014812;refseq.positionType=intron  GT      1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1
+chr1   243410210       .       G       GTAT    .       PASS    VC=INDEL;AC=137;AF=0.43;AN=316;refseq.name=NM_014812;refseq.positionType=intron GT      0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1
+chr1   243435760       .       CATT    C       .       PASS    VC=INDEL;AC=26;AF=0.1;AN=272;refseq.name=NM_006642;refseq.positionType=intron   GT      0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     ./.     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     ./.     0/0     0/1     ./.     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.
+chr1   244015225       .       GTCTG   G       .       PASS    VC=INDEL;AC=70;AF=0.22;AN=316   GT      0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1
+chr1   244033256       .       GTTGA   G       .       PASS    VC=INDEL;AC=18;AF=0.06;AN=316   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   244186794       .       T       TT      .       PASS    VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   244216819       .       T       TA      .       PASS    VC=INDEL;AC=79;AF=0.25;AN=316;refseq.name=NM_006352;refseq.positionType=exon    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0
+chr1   244216822       .       A       AA      .       PASS    VC=INDEL;AC=79;AF=0.25;AN=312;refseq.name=NM_006352;refseq.positionType=exon    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0
+chr1   244371962       .       CAACTGGTCAAC    C       .       PASS    VC=INDEL;AC=2;AF=0.01;AN=314    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   244372739       .       C       CTA     .       PASS    VC=INDEL;AC=70;AF=0.22;AN=312   GT      0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1
+chr1   244517491       .       A       AG      .       PASS    VC=INDEL;AC=229;AF=0.72;AN=316;refseq.name=NM_001012970;refseq.positionType=intron      GT      1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1
+chr1   244552134       .       CATTT   C       .       PASS    VC=INDEL;AC=41;AF=0.13;AN=314;refseq.name=NM_001012970;refseq.positionType=intron       GT      0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   244794244       .       T       TAAC    .       PASS    VC=INDEL;AC=2;AF=0.01;AN=316;refseq.name=NM_173807;refseq.positionType=intron   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   245242885       .       A       ATT     .       PASS    VC=INDEL;AC=3;AF=0.01;AN=316;refseq.name=NM_032328;refseq.positionType=intron   GT      0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1
+chr1   245242887       .       T       TTT     .       PASS    VC=INDEL;AC=3;AF=0.01;AN=316;refseq.name=NM_032328;refseq.positionType=intron   GT      0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1
+chr1   245310839       .       T       TTAAAG  .       PASS    VC=INDEL;AC=156;AF=0.59;AN=266  GT      0/1     ./.     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     ./.     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     ./.     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     ./.     1/1     0/0     0/0     0/1     ./.     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     ./.     ./.     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     ./.     0/1     ./.     0/0     ./.     ./.     ./.     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     ./.     1/1     1/1     ./.     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     ./.     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     ./.     1/1     ./.     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     ./.     0/1     ./.     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     ./.     ./.     ./.     0/1     ./.     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     ./.     1/1
+chr1   245453003       .       G       GCCAA   .       PASS    VC=INDEL;AC=80;AF=0.26;AN=308;refseq.name=NM_018012;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     ./.     0/0     0/1     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     0/1     0/1     0/0     0/1
+chr1   245709104       .       A       AGTCAAC .       PASS    VC=INDEL;AC=221;AF=0.7;AN=316;refseq.name=NM_018012;refseq.positionType=intron  GT      1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1
+chr1   245868167       .       G       GTCTT   .       PASS    VC=INDEL;AC=138;AF=0.44;AN=316  GT      0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0
+chr1   245868172       .       T       TCTTT   .       PASS    VC=INDEL;AC=137;AF=0.43;AN=316  GT      0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0
+chr1   246124841       .       A       AAACAGAAG       .       PASS    VC=INDEL;AC=316;AF=1;AN=316;refseq.name=NM_022743;refseq.positionType=intron    GT      1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1
+chr1   246124843       .       A       ACAGAAGAA       .       PASS    VC=INDEL;AC=316;AF=1;AN=316;refseq.name=NM_022743;refseq.positionType=intron    GT      1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1
+chr1   246149511       .       C       CT      .       PASS    VC=INDEL;AC=69;AF=0.32;AN=214;refseq.name=NM_022743;refseq.positionType=intron  GT      1/1     ./.     0/1     0/1     1/1     ./.     0/1     1/1     0/0     ./.     ./.     1/1     ./.     ./.     ./.     0/1     ./.     0/0     ./.     ./.     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     ./.     ./.     ./.     0/1     ./.     1/1     0/1     ./.     ./.     ./.     1/1     0/1     ./.     ./.     1/1     ./.     1/1     0/1     1/1     ./.     0/1     0/1     1/1     ./.     0/1     1/1     0/1     ./.     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     ./.     0/1     1/1     ./.     ./.     1/1     ./.     1/1     0/1     ./.     0/1     0/1     ./.     0/1     0/1     0/0     ./.     0/1     ./.     0/0     0/1     ./.     0/1     0/1     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/1     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     ./.     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     ./.     ./.     0/1     ./.
+chr1   246152615       .       GC      G       .       PASS    VC=INDEL;AC=164;AF=0.52;AN=316;refseq.name=NM_022743;refseq.positionType=intron GT      1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1
+chr1   247110970       .       T       TCA     .       PASS    VC=INDEL;AC=157;AF=0.5;AN=316   GT      0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1
+chr1   247340579       .       TTTCTT  T       .       PASS    VC=INDEL;AC=232;AF=0.74;AN=312  GT      1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     ./.     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     ./.     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1
+chr1   247694106       .       C       CTCCGTGGCCTAAACGGGCAGCCGAGCCCG  .       PASS    VC=INDEL;AC=124;AF=0.62;AN=200;refseq.name=NM_198074;refseq.positionType=exon   GT      ./.     ./.     1/1     1/1     1/1     0/1     ./.     1/1     0/1     ./.     1/1     1/1     0/1     0/1     ./.     0/1     ./.     1/1     ./.     1/1     1/1     ./.     1/1     ./.     0/1     0/1     ./.     0/1     0/1     ./.     0/1     0/1     0/1     ./.     0/1     ./.     ./.     0/1     0/1     ./.     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     0/1     0/1     0/1     ./.     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     0/1     ./.     0/1     0/1     ./.     0/1     0/1     ./.     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     0/1     0/1     ./.     ./.     ./.     0/1     ./.     ./.     ./.     0/1     0/1     1/1     0/1     ./.     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     0/1     0/1     ./.     1/1     0/1     ./.     ./.     ./.     1/1     0/1     1/1     ./.     ./.     1/1     0/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     ./.     ./.     ./.     ./.     ./.     ./.     ./.     0/1     0/1     ./.     0/1     ./.     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     0/1     0/1     0/1     ./.     0/1     ./.     ./.     ./.     0/1     ./.     0/1     ./.     ./.     0/1     ./.     ./.     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.
+chr1   248807991       .       TATGA   T       .       PASS    VC=INDEL;AC=85;AF=0.34;AN=252   GT      0/0     ./.     0/1     0/1     ./.     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     ./.     ./.     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     ./.     0/0     1/1     0/0     ./.     0/1     0/1     ./.     ./.     0/0     0/1     0/0     ./.     ./.     0/1     ./.     0/1     ./.     0/1     0/1     0/0     1/1     ./.     ./.     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     ./.     0/1     1/1     0/0     ./.     ./.     0/1     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     ./.     0/1     ./.     0/0     ./.     0/1     0/1     1/1     0/1     ./.     ./.     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     ./.     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/1     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     ./.     1/1     0/1     0/1     ./.     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1
+chr1   248809274       .       GAACA   G       .       PASS    VC=INDEL;AC=79;AF=0.26;AN=304   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1
+chr1   248809275       .       AACAA   A       .       PASS    VC=INDEL;AC=79;AF=0.26;AN=306   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1
+chr1   248809277       .       C       CAATT   .       PASS    VC=INDEL;AC=9;AF=0.03;AN=316    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr1   249122808       .       C       CAT     .       PASS    VC=INDEL;AC=176;AF=0.58;AN=304;refseq.name=NM_030645;refseq.positionType=promoter       GT      0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     ./.     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     ./.     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     ./.     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     ./.     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     ./.     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1
+chr1   249129038       .       GCCTCTAACTT     G       .       PASS    VC=INDEL;AC=2;AF=0.01;AN=316    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr2   311906  .       TA      T       .       PASS    VC=INDEL;AC=148;AF=0.48;AN=308  GT      0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     ./.     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     ./.     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1
+chr2   341060  .       TC      T       .       PASS    VC=INDEL;AC=52;AF=0.17;AN=314   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0
+chr2   623863  .       GTTC    G       .       PASS    VC=INDEL;AC=278;AF=0.9;AN=310   GT      1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     ./.     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1
+chr2   623869  .       CTTC    C       .       PASS    VC=INDEL;AC=283;AF=0.9;AN=314   GT      1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1
+chr2   872231  .       G       GCC     .       PASS    VC=INDEL;AC=46;AF=0.16;AN=284   GT      1/1     0/1     0/0     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr2   872234  .       C       CCC     .       PASS    VC=INDEL;AC=53;AF=0.21;AN=248   GT      1/1     0/1     0/0     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     ./.     0/0     0/1     0/1     ./.     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/1     ./.     ./.     ./.     0/0     0/0     ./.     ./.     ./.     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     ./.     0/1     0/0     ./.     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/1     ./.     ./.     ./.     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     ./.
+chr2   1131016 .       TTTAGG  T       .       PASS    VC=INDEL;AC=189;AF=0.6;AN=316;refseq.name=NM_018968;refseq.positionType=intron  GT      0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1
+chr2   1146399 .       T       TA      .       PASS    VC=INDEL;AC=280;AF=0.89;AN=316;refseq.name=NM_018968;refseq.positionType=intron GT      1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1
+chr2   1146400 .       A       AA      .       PASS    VC=INDEL;AC=280;AF=0.89;AN=316;refseq.name=NM_018968;refseq.positionType=intron GT      1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1
+chr2   1184342 .       CAACTT  C       .       PASS    VC=INDEL;AC=94;AF=0.3;AN=316;refseq.name=NM_018968;refseq.positionType=intron   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1
+chr2   1369823 .       AGC     A       .       PASS    VC=INDEL;AC=243;AF=0.77;AN=316;refseq.name=NM_018968;refseq.positionType=intron GT      1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0
+chr2   1371776 .       T       TTTAA   .       PASS    VC=INDEL;AC=50;AF=0.16;AN=312;refseq.name=NM_018968;refseq.positionType=terminator      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     ./.     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0
+chr2   1371779 .       A       AATTA   .       PASS    VC=INDEL;AC=38;AF=0.13;AN=282;refseq.name=NM_018968;refseq.positionType=terminator      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     ./.     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     ./.     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     ./.     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     ./.     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     ./.     ./.     1/1     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.
+chr2   1379755 .       A       AA      .       PASS    VC=INDEL;AC=5;AF=0.02;AN=316    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr2   1789405 .       A       AT      .       PASS    VC=INDEL;AC=63;AF=0.2;AN=316    GT      0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1
+chr2   2440845 .       A       AA      .       PASS    VC=INDEL;AC=87;AF=0.32;AN=272   GT      ./.     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     ./.     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     ./.     1/1     0/1     1/1     ./.     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     ./.     ./.     0/1     ./.     0/1     ./.     0/0     ./.     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     ./.     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     ./.     0/1     ./.     0/1     ./.     1/1     1/1     ./.     0/1     ./.     1/1     0/1     0/1     0/1     ./.     0/0     0/1
+chr2   2656901 .       TG      T       .       PASS    VC=INDEL;AC=278;AF=0.9;AN=310   GT      1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1
+chr2   3126017 .       G       GG      .       PASS    VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr2   3424142 .       CGCTGAC C       .       PASS    VC=INDEL;AC=112;AF=0.46;AN=244;refseq.name=NM_016030;refseq.positionType=intron GT      0/1     0/1     ./.     0/0     0/1     ./.     1/1     0/1     0/1     0/0     ./.     1/1     0/0     0/1     ./.     ./.     0/1     0/0     0/0     0/1     ./.     0/1     1/1     ./.     0/0     0/1     ./.     1/1     0/1     0/1     0/1     ./.     ./.     0/0     0/0     ./.     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     ./.     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     0/1     ./.     ./.     ./.     0/1     0/1     1/1     1/1     ./.     1/1     ./.     0/0     ./.     0/1     0/0     1/1     ./.     ./.     1/1     ./.     0/1     0/0     0/1     ./.     0/1     ./.     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     ./.     0/1     0/1     0/1     ./.     0/0     0/1     ./.     ./.     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     ./.     0/1     1/1     0/1     0/1     ./.     0/0     0/1     ./.     ./.     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     0/1     1/1     1/1     ./.
+chr2   3658789 .       ACAAA   A       .       PASS    VC=INDEL;AC=95;AF=0.33;AN=284;refseq.name=NM_024027;refseq.positionType=intron  GT      0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     0/1     0/1     ./.     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     ./.     0/1     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     ./.     0/1     0/0     ./.     0/0     0/1     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     ./.     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     ./.     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     ./.     0/0     ./.     0/0     ./.     0/1
+chr2   3749151 .       GGAA    G       .       PASS    VC=INDEL;AC=163;AF=0.53;AN=310;refseq.name=NM_018436;refseq.positionType=exon   GT      0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     ./.     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1
+chr2   3749158 .       GAAG    G       .       PASS    VC=INDEL;AC=164;AF=0.53;AN=308;refseq.name=NM_018436;refseq.positionType=exon   GT      0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     1/1     0/1     0/1     ./.     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     ./.     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     ./.     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1
+chr2   4140967 .       G       GA      .       PASS    VC=INDEL;AC=125;AF=0.4;AN=312   GT      0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     ./.     1/1     1/1     0/1
+chr2   4184693 .       AGAG    A       .       PASS    VC=INDEL;AC=60;AF=0.22;AN=274   GT      1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     ./.     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     ./.     ./.     ./.     ./.     ./.     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     ./.     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     ./.     1/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     ./.     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     ./.     0/0
+chr2   4296243 .       ACCTGGCCTTTT    A       .       PASS    VC=INDEL;AC=19;AF=0.06;AN=312   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0
+chr2   4604536 .       ATCTG   A       .       PASS    VC=INDEL;AC=82;AF=0.27;AN=308   GT      0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     ./.     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     ./.     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     ./.     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1
+chr2   4607815 .       TAT     T       .       PASS    VC=INDEL;AC=90;AF=0.28;AN=316   GT      0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1
+chr2   4874174 .       CAT     C       .       PASS    VC=INDEL;AC=203;AF=0.64;AN=316  GT      1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0
+chr2   4933418 .       GATC    G       .       PASS    VC=INDEL;AC=86;AF=0.28;AN=304   GT      1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     ./.     0/1     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0
+chr2   4987676 .       A       ACT     .       PASS    VC=INDEL;AC=100;AF=0.32;AN=316  GT      0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0
+chr2   4994909 .       G       GT      .       PASS    VC=INDEL;AC=122;AF=0.41;AN=294  GT      0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     ./.     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     ./.     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     ./.     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     0/0     0/0     0/1     0/1     ./.     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     ./.     0/0     ./.     0/1     ./.     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     ./.     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0
+chr2   5222830 .       CTGTT   C       .       PASS    VC=INDEL;AC=127;AF=0.4;AN=314   GT      0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     ./.     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1
+chr2   5418395 .       T       TAA     .       PASS    VC=INDEL;AC=147;AF=0.47;AN=314  GT      1/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     ./.     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1
+chr2   5821332 .       TTCAGTCCCCCTAATGCC      T       .       PASS    VC=INDEL;AC=261;AF=0.83;AN=316  GT      0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1
+chr2   5821334 .       CAGTCCCCCTAATGCCTC      C       .       PASS    VC=INDEL;AC=261;AF=0.83;AN=316  GT      0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1
+chr2   7238500 .       A       ACTT    .       PASS    VC=INDEL;AC=184;AF=0.58;AN=316  GT      0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0
+chr2   7238505 .       T       TTCT    .       PASS    VC=INDEL;AC=184;AF=0.58;AN=316  GT      0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0
+chr2   7616680 .       C       CA      .       PASS    VC=INDEL;AC=196;AF=0.62;AN=314  GT      ./.     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1
+chr2   10714143        .       CAA     C       .       PASS    VC=INDEL;AC=143;AF=0.47;AN=306;refseq.name=NM_024894;refseq.positionType=intron GT      0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     ./.     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     0/1     ./.     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     ./.     0/1
+chr2   11163207        .       TCA     T       .       PASS    VC=INDEL;AC=63;AF=0.2;AN=316    GT      0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr2   11163209        .       ACA     A       .       PASS    VC=INDEL;AC=63;AF=0.2;AN=316    GT      0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr2   11454443        .       TTGTC   T       .       PASS    VC=INDEL;AC=85;AF=0.27;AN=310;refseq.name=NM_004850;refseq.positionType=intron  GT      0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1
+chr2   11600452        .       TT      T       .       PASS    VC=INDEL;AC=316;AF=1;AN=316;refseq.name=NM_198256;refseq.positionType=intron    GT      1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1
+chr2   11843046        .       C       CAACT   .       PASS    VC=INDEL;AC=157;AF=0.5;AN=316   GT      0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0
+chr2   11843047        .       A       AACTA   .       PASS    VC=INDEL;AC=157;AF=0.5;AN=316   GT      0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0
+chr2   12317135        .       T       TT      .       PASS    VC=INDEL;AC=2;AF=0.01;AN=316    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr2   12787834        .       GT      G       .       PASS    VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=314       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr2   12877501        .       G       GA      .       PASS    VC=INDEL;AC=241;AF=0.76;AN=316;refseq.name=NM_021643;refseq.positionType=intron GT      1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1
+chr2   13123234        .       A       ACTTA   .       PASS    VC=INDEL;AC=273;AF=0.89;AN=308  GT      ./.     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     ./.     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     ./.     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1
+chr2   13297277        .       GC      G       .       PASS    VC=INDEL;AC=23;AF=0.07;AN=314   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr2   13446741        .       T       TCACT   .       PASS    VC=INDEL;AC=105;AF=0.41;AN=256  GT      0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     ./.     ./.     0/1     0/1     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     ./.     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     ./.     0/1     ./.     ./.     0/1     ./.     0/1     0/0     0/1     ./.     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     ./.     0/1     0/1     ./.     ./.     0/1     0/1     0/0     0/1     ./.     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/1     ./.     0/0     ./.     0/1     0/1     ./.     0/1     0/1     ./.     0/1     ./.     1/1     0/1     1/1     0/1     ./.     0/1     1/1     1/1     ./.     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     ./.     0/0     0/1     1/1     ./.     ./.     0/0
+chr2   13637137        .       TTGCTG  T       .       PASS    VC=INDEL;AC=19;AF=0.06;AN=308   GT      0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1
+chr2   13829513        .       T       TT      .       PASS    VC=INDEL;AC=91;AF=0.29;AN=314   GT      0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     ./.     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1
+chr2   13967190        .       TAGAT   T       .       PASS    VC=INDEL;AC=22;AF=0.07;AN=316   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0
+chr2   14096044        .       AAA     A       .       PASS    VC=INDEL;AC=47;AF=0.16;AN=298   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     ./.     0/0     ./.     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     ./.     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     1/1     0/0     0/0
+chr2   14214846        .       C       CT      .       PASS    VC=INDEL;AC=40;AF=0.13;AN=316   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0
+chr2   14381137        .       A       ATC     .       PASS    VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=280       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr2   14428427        .       G       GC      .       PASS    VC=INDEL;AC=242;AF=0.77;AN=316  GT      1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1
+chr2   14428428        .       C       CC      .       PASS    VC=INDEL;AC=241;AF=0.77;AN=314  GT      1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1
+chr2   14685393        .       C       CTTC    .       PASS    VC=INDEL;AC=29;AF=0.09;AN=316   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0
+chr2   15208721        .       A       AC      .       PASS    VC=INDEL;AC=116;AF=0.38;AN=304  GT      0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     ./.     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     ./.     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     ./.     1/1     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     ./.     1/1     0/1
+chr2   15263072        .       A       AAGGA   .       PASS    VC=INDEL;AC=86;AF=0.33;AN=262   GT      0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     ./.     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     1/1     ./.     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     ./.     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     ./.     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/1     0/1     0/0     0/0     ./.     1/1     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/1     0/1     0/1     ./.     0/0     ./.     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     ./.     0/0     1/1     ./.     0/1     0/0     1/1     ./.     0/1     0/1     0/1     ./.     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     ./.     ./.     0/1     0/0     0/0
+chr2   15744484        .       CT      C       .       PASS    VC=INDEL;AC=48;AF=0.15;AN=314;refseq.name=NM_004939;refseq.positionType=intron  GT      0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     ./.     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0
+chr2   15907161        .       G       GACTG   .       PASS    VC=INDEL;AC=60;AF=0.19;AN=314   GT      0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0
+chr2   16916657        .       T       TAGAA   .       PASS    VC=INDEL;AC=153;AF=0.51;AN=298  GT      0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     ./.     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     ./.     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     ./.     0/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0
+chr2   16916659        .       G       GAAAG   .       PASS    VC=INDEL;AC=145;AF=0.49;AN=294  GT      0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     ./.     ./.     0/1     ./.     0/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     ./.     1/1     ./.     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     ./.     ./.     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0
+chr2   17460258        .       C       CC      .       PASS    VC=INDEL;AC=54;AF=0.17;AN=316   GT      0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1
+chr2   18018674        .       TAT     T       .       PASS    VC=INDEL;AC=71;AF=0.23;AN=314   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0
+chr2   18139969        .       T       TT      .       PASS    VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr2   18291829        .       TCT     T       .       PASS    VC=INDEL;AC=276;AF=0.87;AN=316  GT      0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0
+chr2   18382578        .       G       GC      .       PASS    VC=INDEL;AC=304;AF=0.97;AN=314  GT      1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1
+chr2   18386046        .       ACAGA   A       .       PASS    VC=INDEL;AC=1;AF=0;AN=314       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr2   18673070        .       CT      C       .       PASS    VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=314       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr2   18704268        .       C       CCATGACAAGAACTGCT       .       PASS    VC=INDEL;AC=210;AF=0.66;AN=316  GT      1/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1
+chr2   18954606        .       T       TGTA    .       PASS    VC=INDEL;AC=272;AF=0.87;AN=314  GT      1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1
+chr2   19229223        .       A       AG      .       PASS    VC=INDEL;AC=230;AF=0.82;AN=280  GT      1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     ./.     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     ./.     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     0/1     ./.     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     0/1     ./.     0/1     0/1     ./.     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     0/1     1/1     0/1     ./.     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     ./.     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     0/1     1/1     ./.     ./.     1/1
+chr2   19416083        .       CAAT    C       .       PASS    VC=INDEL;AC=26;AF=0.08;AN=312   GT      0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr2   19486700        .       C       CGT     .       PASS    VC=INDEL;AC=200;AF=0.9;AN=222   GT      0/1     ./.     ./.     ./.     0/1     0/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     ./.     1/1     0/1     1/1     ./.     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     0/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     ./.     ./.     ./.     0/1     ./.     1/1     ./.     0/1     ./.     0/1     0/1     0/1     ./.     1/1     ./.     ./.     ./.     ./.     0/1     1/1     ./.     ./.     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     ./.     0/1     1/1     0/1     1/1     ./.     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     ./.     ./.     ./.     1/1     1/1     ./.     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     ./.     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     ./.     ./.     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     0/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     ./.     ./.     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     ./.
+chr2   19792293        .       AAA     A       .       PASS    VC=INDEL;AC=92;AF=0.29;AN=316   GT      0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1
+chr2   19850365        .       ATA     A       .       PASS    VC=INDEL;AC=17;AF=0.06;AN=302   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/1     0/0     ./.     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0
+chr2   20061297        .       A       AATCA   .       PASS    VC=INDEL;AC=10;AF=0.03;AN=316   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr2   20902911        .       G       GC      .       PASS    VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316;refseq.name=NM_021925;refseq.positionType=intron      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr2   21209314        .       GTG     G       .       PASS    VC=INDEL;AC=13;AF=0.04;AN=316   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr2   21319809        .       GACAA   G       .       PASS    VC=INDEL;AC=64;AF=0.2;AN=316    GT      0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr2   21692599        .       AA      A       .       PASS    VC=INDEL;AC=78;AF=0.25;AN=314   GT      0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     ./.     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0
+chr2   22508039        .       GCCT    G       .       PASS    VC=INDEL;AC=70;AF=0.23;AN=300   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     ./.     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     ./.     0/1     0/0     0/1     ./.     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     ./.     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     ./.     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0
+chr2   23055890        .       CTT     C       .       PASS    VC=INDEL;AC=32;AF=0.1;AN=310    GT      0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr2   23059421        .       CC      C       .       PASS    VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr2   23080285        .       C       CC      .       PASS    VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr2   23252488        .       T       TGTTT   .       PASS    VC=INDEL;AC=261;AF=0.83;AN=314  GT      0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     ./.     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1
+chr2   23656105        .       CT      C       .       PASS    VC=INDEL;AC=78;AF=0.25;AN=314   GT      0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr2   23929327        .       T       TAACT   .       PASS    VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr2   25136190        .       TC      T       .       PASS    VC=INDEL;AC=190;AF=0.68;AN=280;refseq.name=NM_004036;refseq.positionType=intron GT      0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     ./.     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     ./.     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     ./.     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     0/0     0/1     ./.     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     ./.     ./.     ./.     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     ./.     1/1     1/1     ./.     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     0/1     0/1     ./.     ./.     ./.     ./.     0/1     0/1
+chr2   25696290        .       CA      C       .       PASS    VC=INDEL;AC=7;AF=0.02;AN=314;refseq.name=NM_021907;refseq.positionType=intron   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1
+chr2   25971939        .       A       AGTAAA  .       PASS    VC=INDEL;AC=90;AF=0.28;AN=316;refseq.name=NM_018263;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1
+chr2   26471341        .       T       TTTC    .       PASS    VC=INDEL;AC=10;AF=0.03;AN=316;refseq.name=NM_000183;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0
+chr2   26547936        .       GAC     G       .       PASS    VC=INDEL;AC=69;AF=0.22;AN=308;refseq.name=NM_153835;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     ./.     ./.     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0
+chr2   26849198        .       ACGGTT  A       .       PASS    VC=INDEL;AC=85;AF=0.28;AN=308;refseq.name=NM_001029881;refseq.positionType=intron       GT      1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     1/1     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/1     ./.     0/0     0/1
+chr2   26849199        .       CGGTTC  C       .       PASS    VC=INDEL;AC=83;AF=0.27;AN=302;refseq.name=NM_001029881;refseq.positionType=intron       GT      1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     1/1     0/0     0/1     ./.     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     ./.     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/1     ./.     0/0     0/1
+chr2   27134249        .       ATA     A       .       PASS    VC=INDEL;AC=100;AF=0.32;AN=316;refseq.name=NM_020134;refseq.positionType=intron GT      0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1
+chr2   27787778        .       AAATTAAAATTCTAC A       .       PASS    VC=INDEL;AC=10;AF=0.03;AN=316   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr2   28368075        .       CACAG   C       .       PASS    VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=306;refseq.name=NM_199193;refseq.positionType=intron      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr2   28792105        .       A       AATA    .       PASS    VC=INDEL;AC=100;AF=0.32;AN=308;refseq.name=NM_153021;refseq.positionType=intron GT      0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     ./.     1/1     ./.     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     ./.     1/1     0/1
+chr2   29191749        .       GA      G       .       PASS    VC=INDEL;AC=87;AF=0.28;AN=316   GT      0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1
+chr2   29191750        .       AA      A       .       PASS    VC=INDEL;AC=86;AF=0.27;AN=316   GT      0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1
+chr2   29738576        .       TA      T       .       PASS    VC=INDEL;AC=284;AF=0.9;AN=316;refseq.name=NM_004304;refseq.positionType=intron  GT      1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1
+chr2   29738577        .       AA      A       .       PASS    VC=INDEL;AC=284;AF=0.9;AN=316;refseq.name=NM_004304;refseq.positionType=intron  GT      1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1
+chr2   30158127        .       C       CA      .       PASS    VC=INDEL;AC=192;AF=0.61;AN=316  GT      1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0
+chr2   30158129        .       A       AA      .       PASS    VC=INDEL;AC=192;AF=0.61;AN=316  GT      1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0
+chr2   30645653        .       A       AAGCTTTTCTAATGAACATCTACAAGACTGTTGTG     .       PASS    VC=INDEL;AC=303;AF=0.96;AN=316  GT      0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1
+chr2   30727159        .       C       CAGTCTATATGCC   .       PASS    VC=INDEL;AC=189;AF=0.6;AN=316;refseq.name=NM_182551;refseq.positionType=intron  GT      0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1
+chr2   30727390        .       GTTG    G       .       PASS    VC=INDEL;AC=31;AF=0.1;AN=314;refseq.name=NM_182551;refseq.positionType=intron   GT      0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr2   30855218        .       CCATGGGA        C       .       PASS    VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316;refseq.name=NM_182551;refseq.positionType=intron      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr2   30937800        .       GATTTT  G       .       PASS    VC=INDEL;AC=14;AF=0.06;AN=244   GT      0/0     ./.     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/1     ./.     ./.     ./.     0/0     0/1     0/0     ./.     0/1     0/1     0/1     ./.     ./.     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     ./.     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     ./.     ./.     0/1     ./.     ./.
+chr2   31084461        .       AATAAAATACAG    A       .       PASS    VC=INDEL;AC=36;AF=0.11;AN=316   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr2   31249797        .       ATATC   A       .       PASS    VC=INDEL;AC=34;AF=0.11;AN=316;refseq.name=NM_024572;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1
+chr2   31249799        .       ATCTA   A       .       PASS    VC=INDEL;AC=47;AF=0.16;AN=302;refseq.name=NM_024572;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1
+chr2   31374768        .       AGTA    A       .       PASS    VC=INDEL;AC=13;AF=0.05;AN=278   GT      0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/1     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr2   31499486        .       C       CC      .       PASS    VC=INDEL;AC=11;AF=0.03;AN=316   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr2   32845664        .       A       AT      .       PASS    VC=INDEL;AC=138;AF=0.44;AN=316  GT      0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1
+chr2   32845666        .       T       TT      .       PASS    VC=INDEL;AC=138;AF=0.44;AN=316  GT      0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1
+chr2   33393523        .       AGCAA   A       .       PASS    VC=INDEL;AC=10;AF=0.03;AN=308;refseq.name=NM_206943;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr2   33403610        .       ATTG    A       .       PASS    VC=INDEL;AC=46;AF=0.15;AN=316;refseq.name=NM_206943;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0
+chr2   33478311        .       TGAGT   T       .       PASS    VC=INDEL;AC=2;AF=0.01;AN=314;refseq.name=NM_206943;refseq.positionType=intron   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr2   33542959        .       TT      T       .       PASS    VC=INDEL;AC=258;AF=0.82;AN=316;refseq.name=NM_206943;refseq.positionType=intron GT      1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1
+chr2   33760624        .       C       CC      .       PASS    VC=INDEL;AC=5;AF=0.02;AN=216;refseq.name=NM_170672;refseq.positionType=intron   GT      0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     ./.     ./.     ./.     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     ./.     ./.     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0
+chr2   33899643        .       G       GGAG    .       PASS    VC=INDEL;AC=261;AF=0.83;AN=316  GT      1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0
+chr2   34119549        .       A       AA      .       PASS    VC=INDEL;AC=45;AF=0.14;AN=316   GT      1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1
+chr2   34427438        .       A       AT      .       PASS    VC=INDEL;AC=175;AF=0.76;AN=230  GT      0/1     0/1     ./.     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     ./.     ./.     0/1     1/1     ./.     ./.     ./.     ./.     0/0     0/1     0/1     ./.     ./.     ./.     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     ./.     0/1     1/1     ./.     1/1     ./.     1/1     0/1     ./.     ./.     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     ./.     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     ./.     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     ./.     1/1     1/1     ./.     0/1     1/1     ./.     0/1     ./.     ./.     ./.     ./.     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     0/1     ./.     1/1     0/1     0/1     1/1     ./.     0/1     1/1     0/1     ./.     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     ./.     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     ./.     ./.     1/1     1/1     ./.     1/1     0/1     0/1     ./.     1/1     ./.     0/1     0/1     0/1     1/1     ./.     ./.     0/1     0/1     ./.     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1
+chr2   34841691        .       TGAAT   T       .       PASS    VC=INDEL;AC=165;AF=0.79;AN=210  GT      ./.     ./.     ./.     1/1     ./.     ./.     ./.     0/1     ./.     1/1     0/1     ./.     1/1     ./.     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     ./.     ./.     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     ./.     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     ./.     ./.     1/1     1/1     ./.     ./.     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     0/1     0/1     0/0     ./.     ./.     ./.     ./.     1/1     ./.     0/1     1/1     ./.     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     ./.     ./.     ./.     0/1     ./.     ./.     1/1     0/1     ./.     ./.     0/1     ./.     ./.     0/1     0/1     1/1     ./.     0/1     ./.     ./.     ./.     0/1     ./.     0/1     0/0     1/1     ./.     0/1     ./.     0/1     0/1     ./.     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     ./.     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     ./.     ./.     0/1     1/1     0/1     ./.     ./.
+chr2   35025338        .       G       GG      .       PASS    VC=INDEL;AC=227;AF=0.72;AN=314  GT      0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     ./.     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0
+chr2   35255151        .       TCT     T       .       PASS    VC=INDEL;AC=29;AF=0.09;AN=316   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr2   35667838        .       A       AGG     .       PASS    VC=INDEL;AC=54;AF=0.21;AN=252   GT      0/0     ./.     ./.     ./.     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     ./.     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     ./.     ./.     ./.     ./.     0/1     0/0     0/1     ./.     0/1     0/1     0/1     0/0     ./.     0/1     0/1     0/1     ./.     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     ./.     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     ./.     0/1     ./.     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     ./.     0/1     0/1     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/0     ./.     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0
+chr2   35668564        .       A       AG      .       PASS    VC=INDEL;AC=275;AF=0.87;AN=316  GT      0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1
+chr2   36779604        .       C       CTT     .       PASS    VC=INDEL;AC=130;AF=0.44;AN=298;refseq.name=NM_001042548;refseq.positionType=exon        GT      1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     ./.     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     ./.     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/1     0/1     ./.     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     ./.     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     ./.     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0
+chr2   37233064        .       ACT     A       .       PASS    VC=INDEL;AC=48;AF=0.16;AN=302;refseq.name=NM_019024;refseq.positionType=intron  GT      0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     ./.     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     ./.     0/0
+chr2   37865906        .       GA      G       .       PASS    VC=INDEL;AC=161;AF=0.51;AN=314  GT      0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     ./.     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0
+chr2   37960289        .       A       AG      .       PASS    VC=INDEL;AC=1;AF=0;AN=302       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.
+chr2   38003881        .       T       TAGA    .       PASS    VC=INDEL;AC=312;AF=0.99;AN=316  GT      1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1
+chr2   38079466        .       CAT     C       .       PASS    VC=INDEL;AC=93;AF=0.3;AN=308    GT      0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0
+chr2   38476518        .       T       TCA     .       PASS    VC=INDEL;AC=179;AF=0.57;AN=316  GT      0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1
+chr2   38682923        .       T       TTTCTCTCT       .       PASS    VC=INDEL;AC=35;AF=0.11;AN=316   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0
+chr2   38990657        .       C       CACTT   .       PASS    VC=INDEL;AC=241;AF=0.76;AN=316  GT      0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1
+chr2   39202671        .       TCAC    T       .       PASS    VC=INDEL;AC=68;AF=0.22;AN=314   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     ./.     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0
+chr2   39848964        .       GACTA   G       .       PASS    VC=INDEL;AC=92;AF=0.3;AN=304    GT      0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     ./.     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     ./.     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     ./.     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1
+chr2   40095196        .       TCTT    T       .       PASS    VC=INDEL;AC=22;AF=0.07;AN=316   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr2   40207026        .       AA      A       .       PASS    VC=INDEL;AC=1;AF=0;AN=314       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1
+chr2   40328669        .       A       ATC     .       PASS    VC=INDEL;AC=182;AF=0.58;AN=316  GT      1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1
+chr2   40396501        .       G       GTCAG   .       PASS    VC=INDEL;AC=13;AF=0.04;AN=310;refseq.name=NM_001112802;refseq.positionType=intron       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0
+chr2   40446174        .       T       TCTACCTGCAACCCTTGATTGGCCTC      .       PASS    VC=INDEL;AC=196;AF=0.62;AN=314;refseq.name=NM_001112802;refseq.positionType=intron      GT      1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     ./.     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1
+chr2   40527545        .       T       TGC     .       PASS    VC=INDEL;AC=69;AF=0.22;AN=316;refseq.name=NM_001112802;refseq.positionType=intron       GT      0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0
+chr2   40764424        .       TATG    T       .       PASS    VC=INDEL;AC=6;AF=0.02;AN=314    GT      ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr2   40840587        .       A       ATTG    .       PASS    VC=INDEL;AC=15;AF=0.06;AN=242   GT      ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     ./.     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     ./.     ./.     ./.     ./.     0/0     ./.     ./.     0/0     0/1     0/0     0/1     ./.     0/0     ./.     1/1     0/0     ./.     0/1     0/0     0/1     ./.     ./.     ./.     ./.     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     ./.     0/0     0/1     ./.     ./.     ./.     0/0     0/0
+chr2   41367520        .       A       AT      .       PASS    VC=INDEL;AC=187;AF=0.6;AN=314   GT      1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1
+chr2   41554849        .       TCAGA   T       .       PASS    VC=INDEL;AC=231;AF=0.74;AN=314  GT      ./.     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1
+chr2   41554851        .       AGACA   A       .       PASS    VC=INDEL;AC=233;AF=0.74;AN=316  GT      1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1
+chr2   41628974        .       G       GA      .       PASS    VC=INDEL;AC=282;AF=0.9;AN=314   GT      0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1
+chr2   41628975        .       A       AA      .       PASS    VC=INDEL;AC=281;AF=0.9;AN=312   GT      0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     ./.     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1
+chr2   41838136        .       GGC     G       .       PASS    VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr2   42604189        .       CTTATGGGTTAC    C       .       PASS    VC=INDEL;AC=3;AF=0.01;AN=316    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr2   42773644        .       C       CC      .       PASS    VC=INDEL;AC=111;AF=0.35;AN=316  GT      0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1
+chr2   43140881        .       TA      T       .       PASS    VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr2   43205232        .       A       AAG     .       PASS    VC=INDEL;AC=287;AF=0.91;AN=316  GT      0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1
+chr2   43324908        .       C       CA      .       PASS    VC=INDEL;AC=316;AF=1;AN=316     GT      1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1
+chr2   43570900        .       TCT     T       .       PASS    VC=INDEL;AC=84;AF=0.27;AN=316;refseq.name=NM_022065;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0
+chr2   44397082        .       AAGAGTA A       .       PASS    VC=INDEL;AC=39;AF=0.12;AN=316;refseq.name=NM_177968;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0
+chr2   44735716        .       TAAAC   T       .       PASS    VC=INDEL;AC=189;AF=0.6;AN=316;refseq.name=NM_024766;refseq.positionType=intron  GT      1/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1
+chr2   45472533        .       T       TATA    .       PASS    VC=INDEL;AC=284;AF=0.92;AN=308  GT      1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     ./.     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1
+chr2   45472535        .       T       TAAT    .       PASS    VC=INDEL;AC=291;AF=0.92;AN=316  GT      1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1
+chr2   47399270        .       TCA     T       .       PASS    VC=INDEL;AC=140;AF=0.44;AN=316;refseq.name=NM_001743;refseq.positionType=intron GT      1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1
+chr2   48032874        .       ACTAT   A       .       PASS    VC=INDEL;AC=254;AF=0.8;AN=316;refseq.name=NM_000179;refseq.positionType=intron  GT      0/0     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0
+chr2   49026643        .       A       AA      .       PASS    VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr2   49468159        .       C       CTCTT   .       PASS    VC=INDEL;AC=57;AF=0.18;AN=316   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr2   49514324        .       GAAGAA  G       .       PASS    VC=INDEL;AC=179;AF=0.58;AN=310  GT      1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     ./.     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     ./.     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1
+chr2   49982314        .       T       TT      .       PASS    VC=INDEL;AC=196;AF=0.64;AN=304  GT      1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     ./.     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     ./.     0/1     0/1     0/0     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     ./.     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1
+chr2   50152899        .       TTTTC   T       .       PASS    VC=INDEL;AC=26;AF=0.1;AN=268;refseq.name=NM_004801;refseq.positionType=intron   GT      ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     ./.     0/0     0/0     ./.     0/1     ./.     0/0     0/1     0/1     0/0     ./.     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     ./.     ./.     ./.     0/1     0/0     0/1     ./.     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     ./.     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0
+chr2   50693504        .       AAC     A       .       PASS    VC=INDEL;AC=193;AF=0.63;AN=306;refseq.name=NM_004801;refseq.positionType=intron GT      0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     ./.     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     ./.     1/1     0/1     ./.     ./.     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     ./.     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1
+chr2   50703696        .       C       CTG     .       PASS    VC=INDEL;AC=287;AF=0.91;AN=314;refseq.name=NM_004801;refseq.positionType=intron GT      1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1
+chr2   50703699        .       T       TGT     .       PASS    VC=INDEL;AC=285;AF=0.9;AN=316;refseq.name=NM_004801;refseq.positionType=intron  GT      1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1
+chr2   51260591        .       T       TAT     .       PASS    VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316;refseq.name=NM_004801;refseq.positionType=promoter    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr2   51281539        .       TT      T       .       PASS    VC=INDEL;AC=252;AF=0.8;AN=316   GT      0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1
+chr2   51315220        .       A       ATT     .       PASS    VC=INDEL;AC=55;AF=0.19;AN=292   GT      0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     ./.     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     ./.     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     ./.     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     ./.     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/1
+chr2   51315221        .       T       TTT     .       PASS    VC=INDEL;AC=56;AF=0.19;AN=300   GT      0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     ./.     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1
+chr2   51355364        .       TTT     T       .       PASS    VC=INDEL;AC=30;AF=0.1;AN=304    GT      0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0
+chr2   52397945        .       A       ATGCTATTCCAATATCTCAG    .       PASS    VC=INDEL;AC=33;AF=0.15;AN=214   GT      0/1     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     ./.     0/1     ./.     ./.     ./.     0/1     ./.     0/1     0/1     ./.     0/1     0/1     ./.     0/1     ./.     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     0/0     0/0     ./.     ./.     0/1     0/0     ./.     0/1     ./.     ./.     0/1     0/0     0/1     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     ./.     ./.     0/1     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/1     ./.     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/1     ./.     ./.     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1
+chr2   52643648        .       G       GAG     .       PASS    VC=INDEL;AC=140;AF=0.53;AN=266  GT      0/1     ./.     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     1/1     ./.     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     ./.     ./.     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     ./.     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     ./.     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     ./.     ./.     ./.     0/0     ./.     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     1/1     1/1     0/1     ./.     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     ./.     0/1     0/1     1/1     ./.     ./.     ./.     0/1     1/1     ./.     1/1     0/1     ./.     ./.     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     ./.     0/1     1/1     ./.     0/1     1/1     1/1     ./.     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     ./.     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     1/1
+chr2   53056176        .       G       GAG     .       PASS    VC=INDEL;AC=131;AF=0.49;AN=270  GT      1/1     0/0     0/1     ./.     ./.     0/0     ./.     1/1     0/1     0/1     0/1     ./.     ./.     ./.     ./.     0/1     1/1     0/1     ./.     0/1     ./.     0/1     ./.     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     ./.     1/1     ./.     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     ./.     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     ./.     0/1     0/0     ./.     0/0     0/1     0/1     ./.     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     ./.     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     ./.     1/1
+chr2   53674036        .       AA      A       .       PASS    VC=INDEL;AC=106;AF=0.34;AN=310  GT      0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     ./.     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     ./.     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1
+chr2   53737951        .       AGGAT   A       .       PASS    VC=INDEL;AC=107;AF=0.35;AN=302  GT      0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     ./.     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     ./.     1/1     1/1     0/1     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     ./.     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     ./.     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0
+chr2   54573230        .       AACA    A       .       PASS    VC=INDEL;AC=62;AF=0.2;AN=316;refseq.name=NM_001100396;refseq.positionType=intron        GT      0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1
+chr2   54726113        .       G       GA      .       PASS    VC=INDEL;AC=269;AF=0.87;AN=308;refseq.name=NM_003128;refseq.positionType=intron GT      1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     ./.     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     ./.     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1
+chr2   54726287        .       T       TGTTA   .       PASS    VC=INDEL;AC=269;AF=0.85;AN=316;refseq.name=NM_003128;refseq.positionType=intron GT      1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1
+chr2   54783793        .       C       CTT     .       PASS    VC=INDEL;AC=270;AF=0.85;AN=316;refseq.name=NM_003128;refseq.positionType=intron GT      0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1
+chr2   55080611        .       GCTTT   G       .       PASS    VC=INDEL;AC=3;AF=0.01;AN=310    GT      0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr2   55174675        .       AC      A       .       PASS    VC=INDEL;AC=6;AF=0.02;AN=306    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.
+chr2   55208953        .       A       ATATGAATCACATACAAGCTAAGAAAC     .       PASS    VC=INDEL;AC=211;AF=0.67;AN=316;refseq.name=NM_020532;refseq.positionType=intron GT      1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1
+chr2   55208955        .       A       ATGAATCACATACAAGCTAAGAAACTA     .       PASS    VC=INDEL;AC=211;AF=0.67;AN=316;refseq.name=NM_020532;refseq.positionType=intron GT      1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1
+chr2   55284481        .       AA      A       .       PASS    VC=INDEL;AC=90;AF=0.28;AN=316   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0
+chr2   55355370        .       CTG     C       .       PASS    VC=INDEL;AC=0;AF=0;AN=316       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr2   55473492        .       AA      A       .       PASS    VC=INDEL;AC=27;AF=0.11;AN=236;refseq.name=NM_002453;refseq.positionType=exon    GT      0/1     ./.     0/0     ./.     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     ./.     0/1     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/1     0/1     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     ./.     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     ./.     ./.     0/1     0/0     0/1     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.
+chr2   56088199        .       TA      T       .       PASS    VC=INDEL;AC=21;AF=0.07;AN=316   GT      0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+chr2   56603301        .       G       GT      .       PASS    VC=INDEL;AC=118;AF=0.39;AN=306;refseq.name=NM_001080433;refseq.positionType=intron      GT      1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     ./.     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0
+chr2   57161556        .       CCTT    C       .       PASS    VC=INDEL;AC=24;AF=0.1;AN=230    GT      0/1     ./.     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     ./.     0/1     ./.     0/0     0/0     ./.     ./.     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     0/1     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     ./.     ./.     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/0     ./.     ./.     ./.     0/0     ./.     0/1     0/1     ./.     0/1     ./.     0/1     0/1     ./.     ./.     ./.     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     0/1     ./.     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     0/1     ./.     0/1     0/0     0/0     ./.     ./.     ./.     0/1     ./.     ./.     ./.     ./.     0/0
+chr2   58167700        .       AA      A       .       PASS    VC=INDEL;AC=220;AF=0.73;AN=300  GT      0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/0     1/1     0/0     1/1     ./.     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     ./.     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     ./.     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     ./.     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     ./.     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     ./.     0/1     1/1
+chr2   58193832        .       A       ACAA    .       PASS    VC=INDEL;AC=35;AF=0.16;AN=222   GT      0/1     0/1     ./.     0/0     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/0     ./.     ./.     0/1     1/1     ./.     ./.     ./.     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     ./.     0/0     0/0     ./.     ./.     0/0     ./.     0/0     0/1     1/1     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     0/1     ./.     ./.     0/0     0/1     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0     0/1     0/0     ./.     0/1     ./.     ./.     0/0     ./.     0/1     ./.     ./.     ./.     ./.     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     ./.     0/0     ./.     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     ./.     ./.     1/1     0/0     0/1     0/0     ./.     0/1     ./.     0/1     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/1     ./.     0/0     ./.     0/0     0/0
+chr2   58274884        .       C       CAGG    .       PASS    VC=INDEL;AC=125;AF=0.4;AN=314;refseq.name=NM_006296;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     ./.     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0
+chr2   58274891        .       A       AGGA    .       PASS    VC=INDEL;AC=123;AF=0.4;AN=308;refseq.name=NM_006296;refseq.positionType=intron  GT      0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     ./.     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     ./.     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     ./.     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     ./.     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0
+chr2   58283746        .       A       ACT     .       PASS    VC=INDEL;AC=268;AF=0.88;AN=304;refseq.name=NM_006296;refseq.positionType=intron GT      0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     ./.     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     ./.     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     ./.     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1
+chr2   58283749        .       C       CTC     .       PASS    VC=INDEL;AC=266;AF=0.86;AN=308;refseq.name=NM_006296;refseq.positionType=intron GT      0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     ./.     0/1     0/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     ./.     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     ./.     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1
+chr2   58385305        .       T       TCTTA   .       PASS    VC=INDEL;AC=79;AF=0.25;AN=316;refseq.name=NM_006296;refseq.positionType=intron  GT      0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0
+chr2   58385307        .       T       TTACT   .       PASS    VC=INDEL;AC=79;AF=0.25;AN=316;refseq.name=NM_006296;refseq.positionType=intron  GT      0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0
diff --git a/tests/tabix_data/vcf/23.vcf b/tests/tabix_data/vcf/23.vcf
new file mode 100644 (file)
index 0000000..9c9ed12
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,419 @@
+##fileformat=VCFv4.1
+##ApplyRecalibration="analysis_type=ApplyRecalibration input_file=[] sample_metadata=[] read_buffer_size=null phone_home=STANDARD read_filter=[] intervals=[20] excludeIntervals=null reference_sequence=/humgen/1kg/reference/human_g1k_v37.fasta rodBind=[/humgen/gsa-hpprojects/dev/delangel/Phase1Calls/20110608VQSRConsensus/calls/combined.phase1.chr20.raw.indels.vcf] rodToIntervalTrackName=null BTI_merge_rule=UNION nonDeterministicRandomSeed=false DBSNP=null downsampling_type=null downsample_to_fraction=null downsample_to_coverage=null baq=OFF baqGapOpenPenalty=40.0 performanceLog=null useOriginalQualities=false defaultBaseQualities=-1 validation_strictness=SILENT unsafe=null num_threads=1 interval_merging=ALL read_group_black_list=null processingTracker=null restartProcessingTracker=false processingTrackerStatusFile=null processingTrackerID=-1 allow_intervals_with_unindexed_bam=false disable_experimental_low_memory_sharding=false logging_level=INFO log_to_file=null help=false recal_file=/humgen/gsa-scr1/delangel/VQSRIndels/data/trainMills75_truthMills75_p15_12_12_pctb0.05_std12.0_mG8_QD_FS_HS_RP_IC.recal tranches_file=/humgen/gsa-scr1/delangel/VQSRIndels/data/trainMills75_truthMills75_p15_12_12_pctb0.05_std12.0_mG8_QD_FS_HS_RP_IC.tranches out=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub NO_HEADER=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub sites_only=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub ts_filter_level=93.0 ignore_filter=null mode=INDEL"
+##CombineVariants="analysis_type=CombineVariants input_file=[] sample_metadata=[] read_buffer_size=null phone_home=STANDARD read_filter=[] intervals=[20:41000001-42000000] excludeIntervals=null reference_sequence=/humgen/1kg/reference/human_g1k_v37.fasta rodBind=[/humgen/gsa-hpprojects/dev/delangel/Phase1Calls/20110608VQSRConsensus/calls/chr20/AFR/AFR.phase1.chr20.42.raw.indels.vcf, /humgen/gsa-hpprojects/dev/delangel/Phase1Calls/20110608VQSRConsensus/calls/chr20/ASN/ASN.phase1.chr20.42.raw.indels.vcf, /humgen/gsa-hpprojects/dev/delangel/Phase1Calls/20110608VQSRConsensus/calls/chr20/AMR/AMR.phase1.chr20.42.raw.indels.vcf, /humgen/gsa-hpprojects/dev/delangel/Phase1Calls/20110608VQSRConsensus/calls/chr20/EUR/EUR.phase1.chr20.42.raw.indels.vcf, /humgen/gsa-hpprojects/dev/delangel/Phase1Calls/20110608VQSRConsensus/calls/chr20/AFR.admix/AFR.admix.phase1.chr20.42.raw.indels.vcf, /humgen/gsa-hpprojects/dev/delangel/Phase1Calls/20110608VQSRConsensus/calls/chr20/ASN.admix/ASN.admix.phase1.chr20.42.raw.indels.vcf, /humgen/gsa-hpprojects/dev/delangel/Phase1Calls/20110608VQSRConsensus/calls/chr20/AMR.admix/AMR.admix.phase1.chr20.42.raw.indels.vcf, /humgen/gsa-hpprojects/dev/delangel/Phase1Calls/20110608VQSRConsensus/calls/chr20/EUR.admix/EUR.admix.phase1.chr20.42.raw.indels.vcf] rodToIntervalTrackName=null BTI_merge_rule=UNION nonDeterministicRandomSeed=false DBSNP=null downsampling_type=null downsample_to_fraction=null downsample_to_coverage=null baq=OFF baqGapOpenPenalty=40.0 performanceLog=null useOriginalQualities=false defaultBaseQualities=-1 validation_strictness=SILENT unsafe=null num_threads=1 interval_merging=ALL read_group_black_list=null processingTracker=null restartProcessingTracker=false processingTrackerStatusFile=null processingTrackerID=-1 allow_intervals_with_unindexed_bam=false disable_experimental_low_memory_sharding=false logging_level=INFO log_to_file=null help=false out=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub NO_HEADER=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub sites_only=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub genotypemergeoption=PRIORITIZE filteredrecordsmergetype=KEEP_IF_ANY_UNFILTERED rod_priority_list=AFR.admix,AMR.admix,EUR.admix,ASN.admix,AFR,AMR,EUR,ASN printComplexMerges=false filteredAreUncalled=false minimalVCF=false setKey=set assumeIdenticalSamples=false minimumN=1 masterMerge=false mergeInfoWithMaxAC=true"
+##FILTER=<ID=BothStrands,Description="Variant not seen on both strands">
+##FILTER=<ID=HARD_TO_VALIDATE,Description="MQ0 >= 4 && (MQ0 / (1.0 * DP)) > 0.1">
+##FILTER=<ID=HP10,Description="Variant occurs in long homopolymer run (>10)">
+##FILTER=<ID=HaplotypeScore,Description="HaplotypeScore>20.0">
+##FILTER=<ID=HighCoverage,Description="Coverage at variant site is > 7500">
+##FILTER=<ID=HomopolymerRun,Description="HRun>=15">
+##FILTER=<ID=LongRepeat,Description="Variant occurs in long tandem repeat (as defined by 1kg phase one filters)">
+##FILTER=<ID=LowQual,Description="QUAL<30.0">
+##FILTER=<ID=PP20,Description="Variant posterior phred is < 20">
+##FILTER=<ID=QualByDepth,Description="QD<1.0">
+##FILTER=<ID=StrandBias,Description="SB>=-1.0">
+##FILTER=<ID=TruthSensitivityTranche93.00to94.00,Description="Truth sensitivity tranche level at VSQ Lod: 3.9628 <= x < 4.1824">
+##FILTER=<ID=TruthSensitivityTranche94.00to95.00,Description="Truth sensitivity tranche level at VSQ Lod: 3.7129 <= x < 3.9628">
+##FILTER=<ID=TruthSensitivityTranche95.00to96.00,Description="Truth sensitivity tranche level at VSQ Lod: 3.3717 <= x < 3.7129">
+##FILTER=<ID=TruthSensitivityTranche96.00to97.00,Description="Truth sensitivity tranche level at VSQ Lod: 2.8762 <= x < 3.3717">
+##FILTER=<ID=TruthSensitivityTranche97.00to98.00,Description="Truth sensitivity tranche level at VSQ Lod: 2.2618 <= x < 2.8762">
+##FILTER=<ID=TruthSensitivityTranche98.00to99.00+,Description="Truth sensitivity tranche level at VQS Lod < 1.2907">
+##FILTER=<ID=TruthSensitivityTranche98.00to99.00,Description="Truth sensitivity tranche level at VSQ Lod: 1.2907 <= x < 2.2618">
+##FORMAT=<ID=AA,Number=1,Type=Integer,Description="Alternate allele observations">
+##FORMAT=<ID=AD,Number=.,Type=Integer,Description="Allelic depths for the ref and alt alleles in the order listed">
+##FORMAT=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Read Depth (only filtered reads used for calling)">
+##FORMAT=<ID=FT,Number=1,Type=String,Description="Sample Genotype Filter">
+##FORMAT=<ID=GL,Number=3,Type=Integer,Description="Genotype Likelihood, log-scaled likeilhoods of the data given the called genotype for each possible genotype generated from the reference and alternate alleles given the sample ploidy">
+##FORMAT=<ID=GQ,Number=1,Type=Float,Description="Genotype Quality">
+##FORMAT=<ID=GT,Number=1,Type=String,Description="Genotype">
+##FORMAT=<ID=HQ,Number=.,Type=Integer,Description="Haplotype Quality">
+##FORMAT=<ID=PL,Number=3,Type=Float,Description="Normalized, Phred-scaled likelihoods for AA,AB,BB genotypes where A=ref and B=alt; not applicable if site is not biallelic">
+##FORMAT=<ID=RA,Number=1,Type=Integer,Description="Reference allele observations">
+##FORMAT=<ID=SA,Number=1,Type=Integer,Description="Number of alternate observations by strand, delimited by |: [forward]|[reverse]">
+##FORMAT=<ID=SP,Number=1,Type=Integer,Description="Phred-scaled strand bias P-value">
+##FORMAT=<ID=SR,Number=1,Type=Integer,Description="Number of reference observations by strand, delimited by |: [forward]|[reverse]">
+##INFO=<ID=AA,Number=1,Type=Integer,Description="Alternate allele observations">
+##INFO=<ID=AB,Number=1,Type=Float,Description="Allele balance at heterozygous sites: a number between 0 and 1 representing the ratio of reads showing the reference allele to all reads, considering only reads from individuals called as heterozygous">
+##INFO=<ID=ABA,Number=1,Type=Integer,Description="Alternate allele balance count: the number of sequence reads from apparent heterozygotes supporting the alternate allele">
+##INFO=<ID=ABP,Number=1,Type=Float,Description="Allele balance probability at heterozygous sites: Phred-scaled upper-bounds estimate of the probability of observing the deviation between ABR and ABA given E(ABR/ABA) ~ 0.5, derived using Hoeffding's inequality">
+##INFO=<ID=ABR,Number=1,Type=Integer,Description="Reference allele balance count: the number of sequence reads from apparent heterozygotes supporting the reference allele">
+##INFO=<ID=AC,Number=.,Type=Integer,Description="Allele count in genotypes, for each ALT allele, in the same order as listed">
+##INFO=<ID=AF,Number=.,Type=Float,Description="Allele Frequency, for each ALT allele, in the same order as listed">
+##INFO=<ID=AF1,Number=1,Type=Float,Description="Max-likelihood estimate of the site allele frequency of the first ALT allele">
+##INFO=<ID=AN,Number=1,Type=Integer,Description="Total number of alleles in called genotypes">
+##INFO=<ID=BL,Number=1,Type=Integer,Description="Base Pairs Left: number of base pairs in reads supporting the alternate to the left (5') of the alternate allele">
+##INFO=<ID=BR,Number=1,Type=Integer,Description="Base Pairs Right: number of base pairs in reads supporting the alternate to the right (3') of the alternate allele">
+##INFO=<ID=BVAR,Number=0,Type=Flag,Description="The best genotype combination in the posterior is variant (non homozygous).">
+##INFO=<ID=BaseQRankSum,Number=1,Type=Float,Description="Z-score from Wilcoxon rank sum test of Alt Vs. Ref base qualities">
+##INFO=<ID=CI95,Number=2,Type=Float,Description="Equal-tail Bayesian credible interval of the site allele frequency at the 95% level">
+##INFO=<ID=CpG,Number=0,Type=Flag,Description="CpG site (either CpG, TpG or CpA)">
+##INFO=<ID=DB,Number=0,Type=Flag,Description="dbSNP Membership">
+##INFO=<ID=DEL,Number=0,Type=Flag,Description="deletion allele">
+##INFO=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Filtered Depth">
+##INFO=<ID=DP4,Number=4,Type=Integer,Description="# high-quality ref-forward bases, ref-reverse, alt-forward and alt-reverse bases">
+##INFO=<ID=DS,Number=0,Type=Flag,Description="Were any of the samples downsampled?">
+##INFO=<ID=Dels,Number=1,Type=Float,Description="Fraction of Reads Containing Spanning Deletions">
+##INFO=<ID=EL,Number=1,Type=Integer,Description="Allele End Left: number of observations of the alternate where the alternate occurs in the left end of the read">
+##INFO=<ID=EPP,Number=1,Type=Float,Description="End Placement Probability: Phred-scaled upper-bounds estimate of the probability of observing the deviation between EL and ER given E(EL/ER) ~ 0.5, derived using Hoeffding's inequality">
+##INFO=<ID=ER,Number=1,Type=Integer,Description="Allele End Right: number of observations of the alternate where the alternate occurs in the right end of the read">
+##INFO=<ID=FQ,Number=1,Type=Float,Description="Phred probability that sample chromosomes are not all the same">
+##INFO=<ID=FR,Number=0,Type=Float,Description="Estimated population frequency">
+##INFO=<ID=FS,Number=1,Type=Float,Description="Phred-scaled p-value using Fisher's exact test to detect strand bias">
+##INFO=<ID=HETAR,Number=1,Type=Integer,Description="Number of individuals heterozygous alternate / reference">
+##INFO=<ID=HOMA,Number=1,Type=Integer,Description="Number of individuals homozygous for the alternate">
+##INFO=<ID=HOMR,Number=1,Type=Integer,Description="Number of individuals homozygous for the reference">
+##INFO=<ID=HP,Number=1,Type=Integer,Description="Homopolmer run length">
+##INFO=<ID=HPLen,Number=1,Type=Integer,Description="Homopolymer length">
+##INFO=<ID=HR,Number=1,Type=Integer,Description="Homopolymer run length">
+##INFO=<ID=HRun,Number=1,Type=Integer,Description="Largest Contiguous Homopolymer Run of Variant Allele In Either Direction">
+##INFO=<ID=HU,Number=1,Type=String,Description="Homopolymer run unit (stranded)">
+##INFO=<ID=HaplotypeScore,Number=1,Type=Float,Description="Consistency of the site with at most two segregating haplotypes">
+##INFO=<ID=INDEL,Number=0,Type=Flag,Description="Not provided in original VCF header">
+##INFO=<ID=INS,Number=0,Type=Flag,Description="insertion allele">
+##INFO=<ID=InbreedingCoeff,Number=1,Type=Float,Description="Inbreeding coefficient as estimated from the genotype likelihoods per-sample when compared against the Hardy-Weinberg expectation">
+##INFO=<ID=IndelType,Number=1,Type=String,Description="Indel type description">
+##INFO=<ID=KGPilot123,Number=0,Type=Flag,Description="1000 Genome discovery all pilots 2010(1,2,3)">
+##INFO=<ID=LEN,Number=1,Type=Integer,Description="allele length">
+##INFO=<ID=LRB,Number=1,Type=Float,Description="((max(BR, BL) / (BR + BL)) - 0.5) * 2 : The proportion of base pairs in reads on one side of the alternate allele relative to total bases, scaled from [0.5,1] to [0,1]">
+##INFO=<ID=LRBP,Number=1,Type=Float,Description="Left-Right Balance Probability: Phred-scaled upper-bounds estimate of the probability of observing the deviation between BL and BR given E(BR/BL) ~ 0.5, derived using Hoeffding's inequality">
+##INFO=<ID=MNP,Number=0,Type=Flag,Description="MNP allele">
+##INFO=<ID=MQ,Number=1,Type=Float,Description="RMS Mapping Quality">
+##INFO=<ID=MQ0,Number=1,Type=Integer,Description="Total Mapping Quality Zero Reads">
+##INFO=<ID=MQ0Fraction,Number=1,Type=Float,Description="Fraction of Mapping Quality Zero Reads">
+##INFO=<ID=MQM,Number=1,Type=Float,Description="Mean mapping quality of observed alternate alleles">
+##INFO=<ID=MQRankSum,Number=1,Type=Float,Description="Z-score From Wilcoxon rank sum test of Alt vs. Ref read mapping qualities">
+##INFO=<ID=NF,Number=0,Type=Integer,Description="Total number of forward reads containing this variant">
+##INFO=<ID=NR,Number=0,Type=Integer,Description="Total number of reads containing this variant">
+##INFO=<ID=NS,Number=1,Type=Integer,Description="Number of samples with data">
+##INFO=<ID=PP,Number=0,Type=Float,Description="Posterior probability (phred scaled) that this variant segregates">
+##INFO=<ID=PV4,Number=4,Type=Float,Description="P-values for strand bias, baseQ bias, mapQ bias and tail distance bias">
+##INFO=<ID=QD,Number=1,Type=Float,Description="Variant Confidence/Quality by Depth">
+##INFO=<ID=RA,Number=1,Type=Integer,Description="Reference allele observations">
+##INFO=<ID=RL,Number=1,Type=Integer,Description="Reads Placed Left: number of reads supporting the alternate balanced to the left (5') of the alternate allele">
+##INFO=<ID=RPP,Number=1,Type=Float,Description="Read Placement Probability: Phred-scaled upper-bounds estimate of the probability of observing the deviation between RPL and RPR given E(RPL/RPR) ~ 0.5, derived using Hoeffding's inequality">
+##INFO=<ID=RR,Number=1,Type=Integer,Description="Reads Placed Right: number of reads supporting the alternate balanced to the right (3') of the alternate allele">
+##INFO=<ID=RUN,Number=1,Type=Integer,Description="Homopolymer run length: the number of consecutive nucleotides in the reference genome matching the alternate allele prior to the current position">
+##INFO=<ID=ReadPosRankSum,Number=1,Type=Float,Description="Z-score from Wilcoxon rank sum test of Alt vs. Ref read position bias">
+##INFO=<ID=SAB,Number=1,Type=Float,Description="Strand bias for the alternate allele: SAF / ( SAF + SAR )">
+##INFO=<ID=SAF,Number=1,Type=Integer,Description="Number of alternate observations on the forward strand">
+##INFO=<ID=SAP,Number=1,Type=Float,Description="Strand balance probability for the alternate allele: Phred-scaled upper-bounds estimate of the probability of observing the deviation between SAF and SAR given E(SAF/SAR) ~ 0.5, derived using Hoeffding's inequality">
+##INFO=<ID=SAR,Number=1,Type=Integer,Description="Number of alternate observations on the reverse strand">
+##INFO=<ID=SB,Number=1,Type=Float,Description="Strand Bias">
+##INFO=<ID=SC,Number=1,Type=String,Description="Genomic sequence 10 bases either side of variant position">
+##INFO=<ID=SET_INTEGRATION,Number=0,Type=Flag,Description="SET_INTEGRATION Membership">
+##INFO=<ID=SET_WGVQSR,Number=0,Type=Flag,Description="SET_WGVQSR Membership">
+##INFO=<ID=SNP,Number=0,Type=Flag,Description="SNP allele">
+##INFO=<ID=SRB,Number=1,Type=Float,Description="Strand bias for the reference allele: SRF / ( SRF + SRR )">
+##INFO=<ID=SRF,Number=1,Type=Integer,Description="Number of reference observations on the forward strand">
+##INFO=<ID=SRP,Number=1,Type=Float,Description="Strand balance probability for the reference allele: Phred-scaled upper-bounds estimate of the probability of observing the deviation between SRF and SRR given E(SRF/SRR) ~ 0.5, derived using Hoeffding's inequality">
+##INFO=<ID=SRR,Number=1,Type=Integer,Description="Number of reference observations on the reverse strand">
+##INFO=<ID=TC,Number=0,Type=Integer,Description="Total coverage">
+##INFO=<ID=TR,Number=1,Type=Integer,Description="Tandem repeat run length (bp)">
+##INFO=<ID=TS,Number=0,Type=Flag,Description="transition SNP">
+##INFO=<ID=TU,Number=1,Type=String,Description="tandem repeat run unit (stranded)">
+##INFO=<ID=TV,Number=0,Type=Flag,Description="transversion SNP">
+##INFO=<ID=VLD,Number=0,Type=Flag,Description="Is Validated.  This bit is set if the snp has 2+ minor allele count based on frequency or genotype data.">
+##INFO=<ID=VQSLOD,Number=1,Type=Float,Description="Log odds ratio of being a true variant versus being false under the trained gaussian mixture model">
+##INFO=<ID=dbSNP,Number=1,Type=Integer,Description="First SNP Build for RS">
+##INFO=<ID=set,Number=1,Type=String,Description="Source VCF for the merged record in CombineVariants">
+##LeftAlignVariants="analysis_type=LeftAlignVariants input_file=[] sample_metadata=[] read_buffer_size=null phone_home=STANDARD read_filter=[] intervals=[20] excludeIntervals=null reference_sequence=/seq/references/Homo_sapiens_assembly19/v1/Homo_sapiens_assembly19.fasta rodBind=[/humgen/gsa-scr1/ebanks/ALL.chr20.Oxford.20110407.indels.genotypes.vcf] rodToIntervalTrackName=null BTI_merge_rule=UNION nonDeterministicRandomSeed=false DBSNP=null downsampling_type=null downsample_to_fraction=null downsample_to_coverage=null baq=OFF baqGapOpenPenalty=40.0 performanceLog=null useOriginalQualities=false defaultBaseQualities=-1 validation_strictness=SILENT unsafe=null num_threads=1 interval_merging=ALL read_group_black_list=null processingTracker=null restartProcessingTracker=false processingTrackerStatusFile=null processingTrackerID=-1 allow_intervals_with_unindexed_bam=false disable_experimental_low_memory_sharding=false logging_level=INFO log_to_file=null help=false out=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub NO_HEADER=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub sites_only=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub"
+##SelectVariants="analysis_type=SelectVariants input_file=[] sample_metadata=[] read_buffer_size=null phone_home=STANDARD read_filter=[] intervals=[20] excludeIntervals=null reference_sequence=/seq/references/Homo_sapiens_assembly19/v1/Homo_sapiens_assembly19.fasta rodBind=[/humgen/gsa-scr1/delangel/officialCalls/20110201_chr20_phase1_indels/dindel/20110208.chr20.dindel2.ALL.sites.vcf] rodToIntervalTrackName=null BTI_merge_rule=UNION nonDeterministicRandomSeed=false DBSNP=null downsampling_type=null downsample_to_fraction=null downsample_to_coverage=null baq=OFF baqGapOpenPenalty=40.0 performanceLog=null useOriginalQualities=false defaultBaseQualities=-1 validation_strictness=SILENT unsafe=null num_threads=1 interval_merging=ALL read_group_black_list=null processingTracker=null restartProcessingTracker=false processingTrackerStatusFile=null processingTrackerID=-1 allow_intervals_with_unindexed_bam=false disable_experimental_low_memory_sharding=false logging_level=INFO log_to_file=null help=false out=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub NO_HEADER=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub sites_only=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub sample=null select_expressions=[] excludeNonVariants=false excludeFiltered=false discordance= concordance= family_structure= mendelianViolation=false mendelianViolationQualThreshold=0.0 select_random_number=0 select_random_fraction=0.0 selectSNPs=false selectIndels=true"
+##UnifiedGenotyper="analysis_type=UnifiedGenotyper input_file=[/broad/shptmp/delangel/calls/chr20/CHB.phase1.chr20.42.cleaned.bam, /broad/shptmp/delangel/calls/chr20/CHS.phase1.chr20.42.cleaned.bam, /broad/shptmp/delangel/calls/chr20/CLM.phase1.chr20.42.cleaned.bam, /broad/shptmp/delangel/calls/chr20/JPT.phase1.chr20.42.cleaned.bam, /broad/shptmp/delangel/calls/chr20/MXL.phase1.chr20.42.cleaned.bam, /broad/shptmp/delangel/calls/chr20/PUR.phase1.chr20.42.cleaned.bam] sample_metadata=[] read_buffer_size=null phone_home=STANDARD read_filter=[] intervals=[20:41000001-42000000] excludeIntervals=null reference_sequence=/humgen/1kg/reference/human_g1k_v37.fasta rodBind=[/humgen/gsa-scr1/delangel/otherIndelCallerAnalysis/ALL.indels.combined.chr20.vcf, /humgen/gsa-hpprojects/GATK/data/dbsnp_132_b37.leftAligned.vcf] rodToIntervalTrackName=null BTI_merge_rule=UNION nonDeterministicRandomSeed=false DBSNP=null downsampling_type=null downsample_to_fraction=null downsample_to_coverage=50 baq=OFF baqGapOpenPenalty=40.0 performanceLog=null useOriginalQualities=false defaultBaseQualities=-1 validation_strictness=SILENT unsafe=null num_threads=8 interval_merging=ALL read_group_black_list=null processingTracker=null restartProcessingTracker=false processingTrackerStatusFile=null processingTrackerID=-1 allow_intervals_with_unindexed_bam=false disable_experimental_low_memory_sharding=false logging_level=INFO log_to_file=null help=false genotype_likelihoods_model=INDEL p_nonref_model=EXACT heterozygosity=0.0010 pcr_error_rate=1.0E-4 genotyping_mode=GENOTYPE_GIVEN_ALLELES output_mode=EMIT_ALL_SITES standard_min_confidence_threshold_for_calling=4.0 standard_min_confidence_threshold_for_emitting=4.0 noSLOD=false assume_single_sample_reads=null abort_at_too_much_coverage=-1 min_base_quality_score=17 min_mapping_quality_score=20 max_deletion_fraction=0.05 min_indel_count_for_genotyping=5 indel_heterozygosity=1.25E-4 indelGapContinuationPenalty=10.0 indelGapOpenPenalty=45.0 indelHaplotypeSize=80 doContextDependentGapPenalties=true getGapPenaltiesFromData=false indel_recal_file=indel.recal_data.csv indelDebug=false dovit=false GSA_PRODUCTION_ONLY=false exactCalculation=LINEAR_EXPERIMENTAL ignoreSNPAlleles=true output_all_callable_bases=false genotype=false out=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub NO_HEADER=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub sites_only=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub debug_file=null metrics_file=null annotation=[MappingQualityZeroFraction]"
+##VariantAnnotator="analysis_type=VariantAnnotator input_file=[] sample_metadata=[] read_buffer_size=null phone_home=STANDARD read_filter=[] intervals=null excludeIntervals=null reference_sequence=/humgen/1kg/reference/human_g1k_v37.fasta rodBind=[./ALL.chr20.vqsr_2of5_union_sites_for_validation_boosted.vcf] rodToIntervalTrackName=variant BTI_merge_rule=UNION nonDeterministicRandomSeed=false DBSNP=null downsampling_type=null downsample_to_fraction=null downsample_to_coverage=null baq=OFF baqGapOpenPenalty=40.0 performanceLog=null useOriginalQualities=false defaultBaseQualities=-1 validation_strictness=SILENT unsafe=null num_threads=1 interval_merging=ALL read_group_black_list=null processingTracker=null restartProcessingTracker=false processingTrackerStatusFile=null processingTrackerID=-1 allow_intervals_with_unindexed_bam=false disable_experimental_low_memory_sharding=false logging_level=INFO log_to_file=null help=false out=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub NO_HEADER=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub sites_only=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub sampleName=null annotation=[IndelType] group=[] expression=[] useAllAnnotations=false list=false assume_single_sample_reads=null vcfContainsOnlyIndels=false"
+##VariantFiltration="analysis_type=VariantFiltration input_file=[] sample_metadata=[] read_buffer_size=null phone_home=STANDARD read_filter=[] intervals=[/humgen/1kg/processing/pipeline_test_bams/chr22_chunked.hg19.intervals] excludeIntervals=null reference_sequence=/humgen/1kg/reference/human_g1k_v37.fasta rodBind=[/broad/shptmp/rpoplin/ALL.phase1.chr22.raw.indels.vcf] rodToIntervalTrackName=null BTI_merge_rule=UNION DBSNP=null downsampling_type=null downsample_to_fraction=null downsample_to_coverage=null baq=OFF baqGapOpenPenalty=40.0 performanceLog=null useOriginalQualities=false defaultBaseQualities=-1 validation_strictness=SILENT unsafe=null num_threads=1 interval_merging=ALL read_group_black_list=null processingTracker=null restartProcessingTracker=false processingTrackerStatusFile=null processingTrackerID=-1 allow_intervals_with_unindexed_bam=false enable_experimental_low_memory_sharding=false logging_level=INFO log_to_file=null quiet_output_mode=false debug_mode=false help=false out=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub NO_HEADER=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub sites_only=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub filterExpression=[MQ0 >= 4 && (MQ0 / (1.0 * DP)) > 0.1, QUAL<30.0, SB>=-1.0, QD<1.0, HRun>=15, HaplotypeScore>20.0] filterName=[HARD_TO_VALIDATE, LowQual, StrandBias, QualByDepth, HomopolymerRun, HaplotypeScore] genotypeFilterExpression=[] genotypeFilterName=[] clusterSize=3 clusterWindowSize=0 maskName=Mask missingValuesInExpressionsShouldEvaluateAsFailing=false"
+##commandline="/share/software/freebayes/bin/freebayes --stdin --min-alternate-count 2 --genotype-combo-step-max 20 --genotype-variant-threshold 4 --no-marginals --pvar 0.0001 --indels --mnps --no-filters --binomial-obs-priors --allele-balance-priors --region 20:0..100000 --vcf /d1/data/1000G/20101123/populations/finalised.phase1/integrated/including454/wg/ALL/Pipeline/none//freebayes/freebayes.20:0-100000.baq.20110328.vcf --fasta-reference /d2/data/references/build_37/human_reference_v37.fa"
+##contig=<ID=1,length=249250621,assembly=b37>
+##contig=<ID=10,length=135534747,assembly=b37>
+##contig=<ID=11,length=135006516,assembly=b37>
+##contig=<ID=12,length=133851895,assembly=b37>
+##contig=<ID=13,length=115169878,assembly=b37>
+##contig=<ID=14,length=107349540,assembly=b37>
+##contig=<ID=15,length=102531392,assembly=b37>
+##contig=<ID=16,length=90354753,assembly=b37>
+##contig=<ID=17,length=81195210,assembly=b37>
+##contig=<ID=18,length=78077248,assembly=b37>
+##contig=<ID=19,length=59128983,assembly=b37>
+##contig=<ID=2,length=243199373,assembly=b37>
+##contig=<ID=20,length=63025520,assembly=b37>
+##contig=<ID=21,length=48129895,assembly=b37>
+##contig=<ID=22,length=51304566,assembly=b37>
+##contig=<ID=3,length=198022430,assembly=b37>
+##contig=<ID=4,length=191154276,assembly=b37>
+##contig=<ID=5,length=180915260,assembly=b37>
+##contig=<ID=6,length=171115067,assembly=b37>
+##contig=<ID=7,length=159138663,assembly=b37>
+##contig=<ID=8,length=146364022,assembly=b37>
+##contig=<ID=9,length=141213431,assembly=b37>
+##contig=<ID=GL000191.1,length=106433,assembly=b37>
+##contig=<ID=GL000192.1,length=547496,assembly=b37>
+##contig=<ID=GL000193.1,length=189789,assembly=b37>
+##contig=<ID=GL000194.1,length=191469,assembly=b37>
+##contig=<ID=GL000195.1,length=182896,assembly=b37>
+##contig=<ID=GL000196.1,length=38914,assembly=b37>
+##contig=<ID=GL000197.1,length=37175,assembly=b37>
+##contig=<ID=GL000198.1,length=90085,assembly=b37>
+##contig=<ID=GL000199.1,length=169874,assembly=b37>
+##contig=<ID=GL000200.1,length=187035,assembly=b37>
+##contig=<ID=GL000201.1,length=36148,assembly=b37>
+##contig=<ID=GL000202.1,length=40103,assembly=b37>
+##contig=<ID=GL000203.1,length=37498,assembly=b37>
+##contig=<ID=GL000204.1,length=81310,assembly=b37>
+##contig=<ID=GL000205.1,length=174588,assembly=b37>
+##contig=<ID=GL000206.1,length=41001,assembly=b37>
+##contig=<ID=GL000207.1,length=4262,assembly=b37>
+##contig=<ID=GL000208.1,length=92689,assembly=b37>
+##contig=<ID=GL000209.1,length=159169,assembly=b37>
+##contig=<ID=GL000210.1,length=27682,assembly=b37>
+##contig=<ID=GL000211.1,length=166566,assembly=b37>
+##contig=<ID=GL000212.1,length=186858,assembly=b37>
+##contig=<ID=GL000213.1,length=164239,assembly=b37>
+##contig=<ID=GL000214.1,length=137718,assembly=b37>
+##contig=<ID=GL000215.1,length=172545,assembly=b37>
+##contig=<ID=GL000216.1,length=172294,assembly=b37>
+##contig=<ID=GL000217.1,length=172149,assembly=b37>
+##contig=<ID=GL000218.1,length=161147,assembly=b37>
+##contig=<ID=GL000219.1,length=179198,assembly=b37>
+##contig=<ID=GL000220.1,length=161802,assembly=b37>
+##contig=<ID=GL000221.1,length=155397,assembly=b37>
+##contig=<ID=GL000222.1,length=186861,assembly=b37>
+##contig=<ID=GL000223.1,length=180455,assembly=b37>
+##contig=<ID=GL000224.1,length=179693,assembly=b37>
+##contig=<ID=GL000225.1,length=211173,assembly=b37>
+##contig=<ID=GL000226.1,length=15008,assembly=b37>
+##contig=<ID=GL000227.1,length=128374,assembly=b37>
+##contig=<ID=GL000228.1,length=129120,assembly=b37>
+##contig=<ID=GL000229.1,length=19913,assembly=b37>
+##contig=<ID=GL000230.1,length=43691,assembly=b37>
+##contig=<ID=GL000231.1,length=27386,assembly=b37>
+##contig=<ID=GL000232.1,length=40652,assembly=b37>
+##contig=<ID=GL000233.1,length=45941,assembly=b37>
+##contig=<ID=GL000234.1,length=40531,assembly=b37>
+##contig=<ID=GL000235.1,length=34474,assembly=b37>
+##contig=<ID=GL000236.1,length=41934,assembly=b37>
+##contig=<ID=GL000237.1,length=45867,assembly=b37>
+##contig=<ID=GL000238.1,length=39939,assembly=b37>
+##contig=<ID=GL000239.1,length=33824,assembly=b37>
+##contig=<ID=GL000240.1,length=41933,assembly=b37>
+##contig=<ID=GL000241.1,length=42152,assembly=b37>
+##contig=<ID=GL000242.1,length=43523,assembly=b37>
+##contig=<ID=GL000243.1,length=43341,assembly=b37>
+##contig=<ID=GL000244.1,length=39929,assembly=b37>
+##contig=<ID=GL000245.1,length=36651,assembly=b37>
+##contig=<ID=GL000246.1,length=38154,assembly=b37>
+##contig=<ID=GL000247.1,length=36422,assembly=b37>
+##contig=<ID=GL000248.1,length=39786,assembly=b37>
+##contig=<ID=GL000249.1,length=38502,assembly=b37>
+##contig=<ID=MT,length=16569,assembly=b37>
+##contig=<ID=X,length=155270560,assembly=b37>
+##contig=<ID=Y,length=59373566,assembly=b37>
+##fileDate=2011-03-28
+##filedate=2011-02-08
+##filter="( SNP | MNP ) & ( MQM > 65 | QUAL > 1 ) & ABP < 30 & AB < 0.9 | ( INS | DEL ) & QUAL > 500"
+##phasing=none
+##reference=/lustre/scratch105/projects/g1k/ref/main_project/human_g1k_v37.fasta
+##reference=file:///humgen/1kg/reference/human_g1k_v37.fasta
+##source=Dindel2
+##source=SelectVariants
+##source_20110031.1=/nfs/users/nfs_p/pd3/cvs/vcftools/perl/vcf-annotate -d /nfs/users/nfs_p/pd3/sandbox/hapmap/dbSNP-b132/non-1kg-vld.desc -a /nfs/users/nfs_p/pd3/sandbox/hapmap/dbSNP-b132/non-1kg-vld.tab.gz -c CHROM,FROM,INFO/VLD,INFO/KGPilot123,INFO/dbSNP
+##vcfCTools=filter
+#CHROM POS     ID      REF     ALT     QUAL    FILTER  INFO    
+20     458502  .       G       GA      4567.01 PASS    AA=20;AB=0.61111;ABA=14;ABP=6.8707;ABR=22;AC=38;AF=0.0544;AN=698;BL=374;BR=1129;BVAR;BaseQRankSum=13.364;DP=15979;DP4=1882,2188,45,37;Dels=0.00;EL=5;EPP=13.868;ER=15;FR;FS=6.503;HETAR=11;HOMA=2;HOMR=985;HP=1;HPLen=2;HR=2;HRun=0;HU=G;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0157;IndelType=INS.NOVEL_1.Novel_A.;LEN=1;LRB=0.50233;LRBP=826.56;MQ=66.16;MQ0Fraction=0.0110;MQM=70.5;MQRankSum=-3.158;NF;NR;NS=998;PP;PV4=0.15,1,0.42,0.15;RA=3173;RL=1;RPP=38.188;RR=19;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.346;SAB=0.7;SAF=14;SAP=9.959;SAR=6;SC=GGGCGTGGTGGTGCATGTAAT;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.50047;SRF=1588;SRP=3.0165;SRR=1585;TC;TR=9;TU=GGT;VQSLOD=10.0079;set=Intersection;sumGLbyD=23.94
+20     573764  .       TA      T       591.51  PASS    AC=91;AF=0.1987;AN=458;BaseQRankSum=0.137;DP=519;FS=3.153;HRun=1;HaplotypeScore=14.0744;InbreedingCoeff=0.1460;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;MQ=48.16;MQ0=26;MQ0Fraction=0.0501;MQRankSum=-1.636;QD=3.63;ReadPosRankSum=-4.140;SB=-408.14;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;VQSLOD=5.2458;set=VQSR
+20     766143  .       C       CATCTGGTA       5521.70 PASS    AA=24;AB=0.5;ABA=18;ABP=3.0103;ABR=18;AC=14;AF=0.0289;AF1=0.02038;AN=484;BL=655;BR=1542;BVAR;BaseQRankSum=3.801;CI95=0.01549,0.02655;DP=11749;DP4=2222,1998,14,8;Dels=0.00;EL=9;EPP=6.2675;ER=15;FQ=999;FR;FS=2.941;HETAR=9;HOMA=4;HOMR=901;HP=2;HPLen=2;HR=1;HRun=0;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0515;IndelType=INS.NumRepetitions_1.EventLength_8.;LEN=8;LRB=0.40373;LRBP=780.64;MQ=56.81;MQ0Fraction=0.0253;MQM=22.167;MQRankSum=-4.809;NF;NR;NS=914;PP;PV4=0.39,1,5.8e-07,1;RA=3093;RL=6;RPP=16.039;RR=18;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.827;SAB=0.625;SAF=15;SAP=6.2675;SAR=9;SC=GCTTTAAATTCATCTGGTACT;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.61623;SRF=1906;SRP=365.95;SRR=1187;TC;TR=1;TU=A;VQSLOD=7.0268;set=Intersection;sumGLbyD=50.23
+20     997076  rs11467490      CTG     C       15379.78        PASS    AA=195;AB=0.59878;ABA=132;ABP=30.896;ABR=197;AC=173;AF=0.14562;AN=1188;BL=7664;BR=7309;BVAR;BaseQRankSum=21.853;DB;DEL;DP=27127;DP4=1801,2002,241,282;Dels=0.13;EL=100;EPP=3.2887;ER=95;FQ=999;FR;FS=6.591;HETAR=77;HOMA=42;HOMR=815;HP=1;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=0.1284;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_2.RepeatExpansion_TG.;LEN=2;LRB=0.023709;LRBP=21.287;MQ=61.18;MQ0Fraction=0.0214;MQM=43.041;MQRankSum=6.886;NF;NR;NS=934;PP;PV4=0.61,1.5e-78,1,1;RA=2800;RL=120;RPP=25.56;RR=75;RUN=1;ReadPosRankSum=4.504;SAB=0.62051;SAF=121;SAP=27.609;SAR=74;SC=CAGCTAATTACTGTATTTTTA;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.49821;SRF=1395;SRP=3.0879;SRR=1405;TC;TR=1;TU=T;VQSLOD=8.9396;set=Intersection;sumGLbyD=16.76
+20     1042261 rs10597473      CCCTG   C       168658.05       PASS    AA=4481;AB=0.29043;ABA=2128;ABP=1147.1;ABR=871;AC=1172;AF=0.97830;AN=1198;BL=169975;BR=194027;BVAR;BaseQRankSum=4.599;DB;DEL;DP=29418;DP4=29,47,1441,2403;Dels=0.84;EL=2358;EPP=29.772;ER=2123;FR;FS=9.122;HETAR=482;HOMA=559;HOMR=30;HP=2;HPLen=3;HR=3;HRun=0;HU=C;INDEL;InbreedingCoeff=0.0470;IndelType=DEL.NumRepetitions_2.EventLength_4.;LEN=4;LRB=0.066077;LRBP=3454.1;MQ=104.58;MQ0=4;MQ0Fraction=0.0014;MQM=58.257;MQRankSum=-3.368;NF;NR;NS=1071;PP;PV4=0.91,6.8e-09,2.8e-05,1;RA=1039;RL=2088;RPP=48.09;RR=2393;RUN=1;ReadPosRankSum=5.288;SAB=0.41442;SAF=1857;SAP=288.09;SAR=2624;SC=CCAAACCCAACCCTGCCTGGC;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.48893;SRF=508;SRP=4.1159;SRR=531;TC;TR=8;TU=CCTG;VQSLOD=8.5148;dbSNP=120;set=Intersection;sumGLbyD=59.79
+20     1046297 rs33956316      C       CT,CTT,CTTT     17698   PASS    ABR=408;AC=432,79,230;AF=0.39779,0.07274,0.21179;BVAR;BaseQRankSum=-8.413;DB;DP=15649;DP4=147,199,534,436;FR;FS=11.580;HOMA=97;HOMR=457;HP=20;HR=16;HU=T;HaplotypeScore=16.0590;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.6018;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;KGPilot123;MQ0=19;MQ0Fraction=0.0093;MQRankSum=7.992;NF;NR;NS=767;PP;PV4=6e-05,1,1,1;QD=8.18;RA=1183;RUN=1;ReadPosRankSum=2.684;SB=-6384.08;SC=GGAAAATTTTCTTTTTTTTTT;SET_WGVQSR;SRB=0.40913;SRF=484;SRP=87.859;SRR=699;TC;TR=16;TU=T;VQSLOD=8.4941;dbSNP=132;set=Intersection
+20     1405740 .       T       TA      257.28  PASS    AF=0.0188;BaseQRankSum=-0.745;DP=3769;Dels=0.00;FS=0.742;HPLen=9;HRun=9;InbreedingCoeff=0.0462;IndelType=INS.NumRepetitions_9.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;MQ0Fraction=0.0151;MQRankSum=-0.090;ReadPosRankSum=-1.582;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;VQSLOD=5.6502;set=Intersection;sumGLbyD=6.94
+20     1690501 .       TC      T       27928   PASS    AA=108;AB=0.91372;ABA=100;ABP=1726.1;ABR=1059;AC=35;AF=0.02966;AN=1180;BL=593;BR=6973;BVAR;BaseQRankSum=7.567;DEL;DP=10612;Dels=0.01;EL=50;EPP=4.2971;ER=58;FS=0.000;HETAR=378;HOMA=184;HOMR=477;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0495;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_C.;LEN=1;LRB=0.84325;LRBP=11685;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=87.361;MQRankSum=4.088;NS=1045;RA=3125;RL=3;RPP=212.2;RR=105;RUN=1;ReadPosRankSum=-13.096;SAB=0.56481;SAF=61;SAP=6.9511;SAR=47;SRB=0.51776;SRF=1618;SRP=11.572;SRR=1507;VQSLOD=3.9824;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=4.07
+20     1991285 rs113891396     TAA     T,TA,TAAA,TAAAAA,TAAAAAA,TAAAAAAA,TAAAAAAAA     39235.36        PASS    AC=5,251,20,39,188,52,79;AF=0.0056,0.2789,0.0222,0.0433,0.2089,0.0578,0.0878;AN=900;BVAR;BaseQRankSum=1.124;DB;DEL;DP=54393;DP4=906,772,824,579;Dels=0.21;FR;FS=37.525;HP=12;HR=12;HRun=12;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.6891;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ=76.81;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-6.593;NF;NR;PP;PV4=0.0087,1,6.3e-19,1;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.184;SC=ATCTGCCACTTAAAAAAAAAA;SET_WGVQSR;TC;TR=12;TU=A;VQSLOD=9.0007;dbSNP=132;set=Intersection;sumGLbyD=11.45
+20     2355911 .       TA      T       11723   PASS    AA=79;AB=0.9393;ABA=57;ABP=1577;ABR=882;AC=38;AF=0.0411;AN=924;BL=644;BR=5536;BVAR;BaseQRankSum=2.434;DEL;DP=9687;Dels=0.00;EL=45;EPP=6.3362;ER=34;FS=3.043;HETAR=321;HOMA=182;HOMR=555;HRun=5;InbreedingCoeff=0.0412;IndelType=DEL.NumRepetitions_5.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;LEN=1;LRB=0.79159;LRBP=8411.9;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=70.848;MQRankSum=0.137;NS=1058;RA=3415;RL=3;RPP=149.49;RR=76;RUN=1;ReadPosRankSum=-12.116;SAB=0.44304;SAF=35;SAP=5.2367;SAR=44;SRB=0.43572;SRF=1488;SRP=125.55;SRR=1927;VQSLOD=3.8910;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=4.88
+20     2771621 rs11479849      GT      G,GTT   1605.60 PASS    AA=80;AB=0.79825;ABA=69;ABP=267.24;ABR=273;AC=79,91;AF=0.06551,0.07546;AN=1206;BL=2593;BR=3805;BVAR;BaseQRankSum=7.825;DB;DP=9790;Dels=0.04;EL=37;EPP=3.9875;ER=43;FR;FS=4.751;HETAR=62;HOMA=5;HOMR=958;HP=11;HR=11;HRun=11;HU=T;INS;InbreedingCoeff=0.2646;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;LEN=1;LRB=0.18943;LRBP=501.57;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=52.45;MQRankSum=-0.560;NF;NR;NS=1025;PP;RA=3949;RL=29;RPP=16.148;RR=51;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.397;SAB=0.525;SAF=42;SAP=3.4446;SAR=38;SC=TCATTTTAACGTTTTTTTTTT;SET_WGVQSR;SRB=0.54368;SRF=2147;SRP=68.46;SRR=1802;TC;TR=11;TU=T;VQSLOD=3.5989;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.92
+20     2891235 .       G       GT,GTTT 2869.87 PASS    AC=236,246;AF=0.2803,0.2922;AN=842;BaseQRankSum=8.979;DP=1067;FS=3.911;HaplotypeScore=20.3595;InbreedingCoeff=0.6511;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ=44.86;MQ0=114;MQ0Fraction=0.1068;MQRankSum=-2.273;QD=4.00;ReadPosRankSum=-6.601;SB=-991.85;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;VQSLOD=5.4379;set=VQSR
+20     3033550 .       TGAG    T       2005.90 PASS    AA=34;AB=0.51429;ABA=34;ABP=3.1344;ABR=36;AC=22;AF=0.0332;AN=662;BL=1374;BR=1649;BVAR;BaseQRankSum=5.192;DEL;DP=14639;DP4=2271,1492,12,21;Dels=0.02;EL=19;EPP=4.0322;ER=15;FR;FS=16.657;HETAR=17;HOMA=0;HOMR=914;HP=1;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=G;INDEL;InbreedingCoeff=-0.0454;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_3.;LEN=3;LRB=0.090969;LRBP=57.333;MQ=53.99;MQ0Fraction=0.0304;MQM=46.735;MQRankSum=1.938;NF;NR;NS=931;PP;PV4=0.0068,9.4e-05,1,1;RA=2985;RL=11;RPP=12.207;RR=23;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.466;SAB=0.41176;SAF=14;SAP=5.3095;SAR=20;SC=CTTGGGAGGCTGAGGTGGGAG;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.62781;SRF=1874;SRP=426.52;SRR=1111;TC;TR=1;TU=G;VQSLOD=8.9194;set=Intersection;sumGLbyD=24.41
+20     3873327 rs61519218      A       AAG     683.85  PASS    AC=25;AF=0.0313;AN=800;BaseQRankSum=4.839;DB;DP=1718;FS=4.265;HRun=0;HaplotypeScore=20.5789;InbreedingCoeff=0.1055;IndelType=INS.NOVEL_2.;MQ=53.70;MQ0=37;MQ0Fraction=0.0215;MQRankSum=2.468;QD=6.30;ReadPosRankSum=4.254;SB=-403.21;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;VQSLOD=6.1858;set=VQSR
+20     4028835 .       GC      G       2511.30 PASS    AA=66;AB=0.56954;ABA=65;ABP=9.3521;ABR=86;AC=22;AF=0.01836;AN=1198;BL=2303;BR=2463;BVAR;BaseQRankSum=7.621;DEL;DP=22795;DP4=1714,2774,22,37;Dels=0.02;EL=34;EPP=3.1419;ER=32;FQ=999;FR;FS=2.095;HETAR=21;HOMA=0;HOMR=1050;HP=2;HPLen=2;HR=2;HRun=2;HU=C;INDEL;InbreedingCoeff=0.0125;IndelType=DEL.NumRepetitions_2.EventLength_1.RepeatExpansion_C.;LEN=1;LRB=0.033571;LRBP=14.674;MQ=108.09;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=53.318;MQRankSum=5.257;NF;NR;NS=1071;PP;PV4=1,5.4e-13,1,0.075;RA=6185;RL=36;RPP=4.1947;RR=30;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.059;SAB=0.45455;SAF=30;SAP=4.1947;SAR=36;SC=TGCTGTCACTGCCTTCTCCTA;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.42118;SRF=2605;SRP=336.76;SRR=3580;TC;TR=2;TU=C;VQSLOD=10.2409;set=Intersection;sumGLbyD=12.71
+20     4039609 rs67812039      G       GA      43457   PASS    AA=909;AB=0.54639;ABA=572;ABP=26.583;ABR=689;AC=302;AF=0.3455;AN=874;BL=37070;BR=38211;BVAR;BaseQRankSum=20.147;DB;DP=25595;DP4=1483,1374,528,542;Dels=0.00;EL=467;EPP=4.5033;ER=442;FQ=999;FR;FS=5.441;HETAR=243;HOMA=127;HOMR=608;HP=4;HPLen=3;HR=3;HRun=3;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.1388;IndelType=INS.NumRepetitions_3.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;LEN=1;LRB=0.015157;LRBP=40.563;MQ=119.50;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=83.197;MQRankSum=1.080;NF;NR;NS=978;PP;PV4=0.16,1,3.6e-12,1;RA=3033;RL=443;RPP=4.274;RR=466;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.000;SAB=0.32233;SAF=293;SAP=252.24;SAR=616;SC=TATGTTGGGAGAAATATCAGT;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.38378;SRF=1164;SRP=358.85;SRR=1869;TC;TR=4;TU=AG;VQSLOD=9.9146;dbSNP=130;set=Intersection;sumGLbyD=16.79
+20     4390056 .       TC      T       49312   PASS    AA=91;AB=0.94353;ABA=86;ABP=2605.4;ABR=1437;AC=39;AF=0.03160;AN=1234;BL=6823;BR=731;BVAR;BaseQRankSum=2.727;DEL;DP=13149;Dels=0.00;EL=41;EPP=4.9431;ER=50;FS=4.002;HETAR=465;HOMA=313;HOMR=292;HRun=3;InbreedingCoeff=0.0326;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_C.;LEN=1;LRB=0.80646;LRBP=10671;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=69.824;MQRankSum=-0.903;NS=1073;RA=3078;RL=89;RPP=183.62;RR=2;RUN=1;ReadPosRankSum=-12.526;SAB=0.45055;SAF=41;SAP=4.9431;SAR=50;SRB=0.52567;SRF=1618;SRP=20.622;SRR=1460;VQSLOD=4.3235;set=Intersection;sumGLbyD=3.53
+20     4474622 .       TA      T,TAA,TAAA,TAAAA        94522.28        PASS    ABR=114;AC=38,68,16,900;AF=0.03333,0.05965,0.01404,0.78947;AN=1140;BVAR;BaseQRankSum=9.741;DB;DP=16656;Dels=0.00;FR;FS=2.355;HOMA=3;HOMR=936;HP=10;HPLen=10;HR=10;HRun=10;HU=A;INS;InbreedingCoeff=0.4516;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ0=2;MQ0Fraction=0.0008;MQRankSum=-4.096;NF;NR;NS=980;PP;RA=3766;RUN=1;ReadPosRankSum=2.380;SC=AGAAAAAAATTAAAAAAAAAA;SET_WGVQSR;SRB=0.49734;SRF=1873;SRP=3.2409;SRR=1893;TC;TR=10;TU=A;VQSLOD=8.8186;set=Intersection;sumGLbyD=38.79
+20     4824911 .       AC      A       41998.70        PASS    AC=1172;AF=0.97342;AN=1204;BaseQRankSum=8.604;DP=3615;FS=9.934;HRun=1;HaplotypeScore=39.6843;InbreedingCoeff=0.0980;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_C.;MQ=129.80;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0003;MQRankSum=3.378;QD=11.62;ReadPosRankSum=6.967;SB=-16955.28;VQSLOD=4.2689;set=VQSR
+20     4839897 rs35881880      TAA     T,TA,TAAA,TAAAAA        3906.80 PASS    AC=12,95,137,189;AF=0.01024,0.08106,0.11689,0.16126;AN=1172;BVAR;BaseQRankSum=15.271;DB;DEL;DP=15105;Dels=0.04;FR;FS=43.567;HP=19;HR=13;HRun=13;HU=A;INS;InbreedingCoeff=0.5716;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-2.569;NF;NR;PP;RUN=1;ReadPosRankSum=-13.794;SC=TGTTAAAAAATAAAAAAAAAA;TC;TR=13;TU=A;VQSLOD=8.1773;set=Intersection;sumGLbyD=3.77
+20     5507414 .       G       GCC     439.08  PASS    AC=23;AF=0.01876;AN=1226;BaseQRankSum=3.051;DP=3023;FS=3.636;HRun=1;HaplotypeScore=30.3104;InbreedingCoeff=0.0204;IndelType=INS.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_C.;MQ=112.09;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-2.065;QD=2.85;ReadPosRankSum=-2.709;SB=-302.22;VQSLOD=4.4311;set=VQSR
+20     5609676 .       GA      G,GAA   799.89  PASS    AA=42;AB=0.79096;ABA=37;ABP=133.16;ABR=140;AC=43,65;AF=0.03607,0.05453;AF1=0.02826;AN=1192;BL=1360;BR=2334;BVAR;BaseQRankSum=5.069;CI95=0.01242,0.04037;DP=15610;DP4=1548,2441,21,30;Dels=0.02;EL=18;EPP=4.8716;ER=24;FQ=12.1;FR;FS=0.000;HETAR=36;HOMA=1;HOMR=991;HP=13;HPLen=10;HR=10;HRun=10;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.2001;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;LEN=1;LRB=0.26367;LRBP=560.68;MQ=63.29;MQ0Fraction=0.0003;MQM=44.143;MQRankSum=1.755;NF;NR;NS=1028;PP;PV4=0.77,1,0.0087,0.0053;RA=4114;RL=15;RPP=10.455;RR=27;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.978;SAB=0.5;SAF=21;SAP=3.0103;SAR=21;SC=AAAAAAGAAAGAAAAAAAAAA;SET_WGVQSR;SRB=0.39742;SRF=1635;SRP=379;SRR=2479;TC;TR=11;TU=AAAG;VQSLOD=4.1229;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=7.95
+20     5736211 rs35303106      CT      C,CTT   4384.40 PASS    AA=117;AB=0.71499;ABA=116;ABP=166.4;ABR=291;AC=32,145;AF=0.02712,0.12288;AN=1180;BL=5556;BR=4901;BVAR;BaseQRankSum=2.708;DB;DP=9157;Dels=0.01;EL=54;EPP=4.5136;ER=63;FR;FS=2.802;HETAR=79;HOMA=1;HOMR=837;HP=16;HR=11;HRun=11;HU=T;INS;InbreedingCoeff=0.1903;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;LEN=1;LRB=0.062637;LRBP=92.1;MQ0Fraction=0.0273;MQM=48.932;MQRankSum=3.654;NF;NR;NS=917;PP;RA=2785;RL=79;RPP=34.209;RR=38;RUN=1;ReadPosRankSum=0.795;SAB=0.5641;SAF=66;SAP=7.1862;SAR=51;SC=TTTTCTTTTTCTTTTTTTTTT;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.41795;SRF=1164;SRP=165.85;SRR=1621;TC;TR=11;TU=T;VQSLOD=5.0895;set=Intersection;sumGLbyD=4.66
+20     5898626 rs34483659      CAAA    C,CA,CAA,CAAAAA 1140.16 PASS    ABR=34;AC=19,98,56,199;AF=0.0227,0.1172,0.0670,0.2380;AF1=0.08519;BVAR;BaseQRankSum=5.049;CI95=0.03727,0.1273;DB;DEL;DP=5091;DP4=539,408,121,123;FQ=4.43;FR;FS=5.701;HOMA=64;HOMR=156;HP=19;HR=18;HU=A;HaplotypeScore=11.5333;INDEL;InbreedingCoeff=0.7405;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ0=117;MQ0Fraction=0.0986;MQRankSum=6.290;NF;NR;NS=240;PP;PV4=0.043,1,1,0.0087;QD=1.22;RA=204;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.684;SB=-1015.09;SC=ACTAAAAATACAAAAAAAAAA;SET_WGVQSR;SRB=0.35294;SRF=72;SRP=41.33;SRR=132;TC;TR=18;TU=A;VQSLOD=4.1696;set=filterInVQSR-2of5
+20     5975126 rs10541892      C       CAG     504.78  PASS    AC=79;AF=0.07004;AN=1128;BaseQRankSum=10.498;DB;DP=2050;FS=38.228;HRun=0;HaplotypeScore=14.1426;InbreedingCoeff=-0.0053;IndelType=INS.NOVEL_2.;MQ=60.40;MQ0=80;MQ0Fraction=0.0390;MQRankSum=5.098;QD=1.63;ReadPosRankSum=-4.851;SB=-590.69;VQSLOD=4.8517;set=VQSR
+20     6040983 rs11087710      A       AAAAAAGAG,AAAAAGAG,AAAAGAG,AAAAGAGAG,AAAGAG,AAAGAGAG,AAGAG,AAGAGAG,AG,AGAG,AGAGAG       66894.55        PASS    ABR=468;AC=80,9,20,136,31,91,33,29,9,3,5;AF=0.0980,0.0110,0.0245,0.1667,0.0380,0.1115,0.0404,0.0355,0.0110,0.0037,0.0061;AN=816;BVAR;BaseQRankSum=-12.470;DB;DP=38726;DP4=426,611,310,472;Dels=0.00;FQ=999;FR;FS=6.635;HOMA=110;HOMR=506;HP=14;HR=15;HRun=0;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.8291;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;KGPilot123;MQ=54.22;MQ0Fraction=0.0168;MQRankSum=-5.329;NF;NR;NS=861;PP;PV4=0.56,1,6.9e-09,0.31;RA=1828;RUN=1;ReadPosRankSum=-7.857;SC=AAAAAAAAAAAAGAGAGAGAG;SET_WGVQSR;SRB=0.62418;SRF=1141;SRP=247.85;SRR=687;TC;TR=15;TU=A;VQSLOD=9.0574;dbSNP=131;set=Intersection;sumGLbyD=36.72
+20     7024548 .       G       GAT     5041.27 PASS    AC=123;AF=0.10336;AN=1190;BaseQRankSum=23.097;DP=3045;FS=7.979;HRun=0;HaplotypeScore=15.6967;InbreedingCoeff=0.1062;IndelType=INS.NumRepetitions_5.EventLength_2.RepeatExpansion_AT.;MQ=119.29;MQ0=2;MQ0Fraction=0.0007;MQRankSum=-3.725;QD=8.97;ReadPosRankSum=-1.636;SB=-2257.45;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;VQSLOD=5.9332;set=VQSR
+20     7484554 .       A       AT      5.09    PASS    AC=0;AF=0.0000;AN=710;BaseQRankSum=-0.696;DP=1862;FS=2.835;HRun=9;HaplotypeScore=13.5425;InbreedingCoeff=0.0567;IndelType=INS.NumRepetitions_9.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;MQ=76.92;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=1.932;ReadPosRankSum=-1.701;VQSLOD=4.3156;set=VQSR
+20     7632194 rs77286341      GAA     AAA,G   5324    PASS    AC=0;AF=0.0000;AN=700;BaseQRankSum=-1.741;DB;DP=1772;FR;HP=4;HPLen=3;HR=3;HRun=0;HU=A;HaplotypeScore=60.1795;InbreedingCoeff=0.0017;IndelType=MIXED;MQ=70.69;MQ0=13;MQ0Fraction=0.0073;MQRankSum=-1.315;NF;NR;PP;ReadPosRankSum=-3.650;SC=GAGAGAGAGAGAAAGGTGTAA;TC;TR=13;TU=AG;set=filterInVQSR-2of5
+20     7767508 rs71329674      G       GA      17914   PASS    AA=415;AB=0.61617;ABA=337;ABP=105.94;ABR=541;AC=141;AF=0.11614;AN=1214;BL=15187;BR=20323;BVAR;BaseQRankSum=-13.946;DB;DP=28222;Dels=0.00;EL=184;EPP=14.569;ER=231;FQ=999;FR;FS=13.296;HETAR=178;HOMA=35;HOMR=822;HP=14;HPLen=9;HR=9;HRun=9;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0714;IndelType=INS.NumRepetitions_9.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;LEN=1;LRB=0.14464;LRBP=1616.1;MQ=89.69;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0003;MQM=51.667;MQRankSum=0.664;NF;NR;NS=1035;PP;RA=3707;RL=171;RPP=30.894;RR=244;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.120;SAB=0.45301;SAF=188;SAP=10.969;SAR=227;SC=ATTCTAAAAAGAAAAAAAAAT;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.38495;SRF=1427;SRP=429.23;SRR=2280;TC;TR=9;TU=A;VQSLOD=9.0748;set=Intersection;sumGLbyD=11.09
+20     7920261 .       TA      T,TAA   802.15  PASS    AA=28;AB=0.8;ABA=28;ABP=112.45;ABR=112;AC=22,39;AF=0.01836,0.03255;AN=1198;BL=943;BR=1487;BVAR;BaseQRankSum=2.233;DP=10645;Dels=0.01;EL=11;EPP=5.8022;ER=17;FR;FS=1.691;HETAR=20;HOMA=0;HOMR=1007;HP=10;HPLen=9;HR=9;HRun=9;HU=A;INS;InbreedingCoeff=0.2256;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;LEN=1;LRB=0.22387;LRBP=267.46;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=57.571;MQRankSum=0.940;NF;NR;NS=1027;PP;RA=4776;RL=8;RPP=14.178;RR=20;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.567;SAB=0.53571;SAF=15;SAP=3.3205;SAR=13;SC=GTAACTGCTATAAAAAAAAAC;SET_WGVQSR;SRB=0.48576;SRF=2320;SRP=11.42;SRR=2456;TC;TR=9;TU=A;VQSLOD=4.0815;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=5.37
+20     8012465 rs10595338      TATGA   T       2104.41 PASS    AF=0.03339;BaseQRankSum=10.662;DB;DP=11772;DS;Dels=0.01;FR;FS=7.678;HP=1;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=A;InbreedingCoeff=0.0266;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_4.;MQ0Fraction=0.0731;MQRankSum=0.603;NF;NR;PP;ReadPosRankSum=1.276;SC=TGTATGTATGTATGATGTATG;TC;TR=19;TU=ATGT;VQSLOD=4.1376;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=6.53
+20     8573999 .       CGTGT   C,CGT,CGTGTGT,TGTGT     45865.96        PASS    AC=458,0,731;AF=0.37727,0.00000,0.60214;AN=1214;BVAR;BaseQRankSum=-6.703;DEL;DP=37714;Dels=0.03;FR;FS=11.079;HP=2;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=G;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.7632;IndelType=MIXED;LEN=2;MQ0Fraction=0.0026;MQRankSum=-1.394;NF;NR;PP;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.102;SC=TGTGTGTGCGCGTGTGTGTGT;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;TC;TR=18;TU=GT;VQSLOD=6.1435;set=Intersection;sumGLbyD=3.53
+20     8610455 rs10571111      TTTTC   T       11763.51        PASS    AC=190;AF=0.17056;AN=1114;BaseQRankSum=-14.397;DB;DP=2323;FS=2.321;HRun=0;HaplotypeScore=39.8020;InbreedingCoeff=0.2502;IndelType=DEL.NumRepetitions_2.EventLength_4.;MQ=53.39;MQ0=104;MQ0Fraction=0.0448;MQRankSum=3.519;QD=19.07;ReadPosRankSum=4.150;SB=-4067.02;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;VQSLOD=5.0554;set=VQSR
+20     9139079 .       ATT     A,AT,ATTT,ATTTT,ATTTTT  8777.90 PASS    AC=23,140,114,69,113;AF=0.01993,0.12132,0.09879,0.05979,0.09792;AN=1154;BVAR;BaseQRankSum=-0.022;DEL;DP=25109;DP4=502,657,278,313;FR;FS=11.929;HP=16;HR=16;HU=T;HaplotypeScore=20.2361;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.5704;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ0=16;MQ0Fraction=0.0067;MQRankSum=2.624;NF;NR;PP;PV4=0.14,1,1,1;QD=1.48;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.480;SB=-2354.28;SC=CACCTGGCTAATTTTTTTTTT;SET_WGVQSR;TC;TR=16;TU=T;VQSLOD=6.9180;set=Intersection
+20     9862448 .       CT      C       49312   PASS    AA=60;AB=0.96003;ABA=53;ABP=2440.4;ABR=1273;AC=18;AF=0.01461;AN=1232;BL=3516;BR=140;BVAR;BaseQRankSum=-2.056;DEL;DP=11893;Dels=0.01;EL=35;EPP=6.6294;ER=25;FS=1.787;HETAR=396;HOMA=344;HOMR=334;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0379;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;LEN=1;LRB=0.92341;LRBP=6772.5;MQ0Fraction=0.0006;MQM=54.267;MQRankSum=-0.907;NS=1074;RA=2990;RL=60;RPP=133.3;RR=0;RUN=1;ReadPosRankSum=-10.579;SAB=0.58333;SAF=35;SAP=6.6294;SAR=25;SRB=0.47826;SRF=1430;SRP=15.284;SRR=1560;VQSLOD=3.0237;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=2.84
+20     9863736 rs73618103      G       GT      50570.21        PASS    AA=2247;AB=0.48878;ABA=1412;ABP=6.0324;ABR=1350;AC=546;AF=0.44463;AN=1228;BL=86886;BR=95862;BVAR;BaseQRankSum=-23.978;DB;DP=32517;DP4=1125,1133,1017,1048;Dels=0.00;EL=1089;EPP=7.6113;ER=1158;FQ=999;FR;FS=2.529;HETAR=445;HOMA=201;HOMR=393;HP=4;HPLen=4;HR=4;HRun=4;HU=T;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.1393;IndelType=INS.NumRepetitions_4.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;KGPilot123;LEN=1;LRB=0.049117;LRBP=960.35;MQ=68.10;MQ0=2;MQ0Fraction=0.0006;MQM=50.931;MQRankSum=-1.580;NF;NR;NS=1039;PP;PV4=0.71,1,0.11,1;RA=3139;RL=1089;RPP=7.6113;RR=1158;RUN=1;ReadPosRankSum=0.846;SAB=0.54161;SAF=1217;SAP=36.804;SAR=1030;SC=TGATTGTATGGTTTTGTCCTT;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.53425;SRF=1677;SRP=34.987;SRR=1462;TC;TR=4;TU=T;VLD;VQSLOD=10.1800;dbSNP=131;set=Intersection;sumGLbyD=18.20
+20     10926959        .       AG      A       12239   PASS    AA=65;AB=0.92801;ABA=64;ABP=1417.6;ABR=825;AC=24;AF=0.0264;AN=908;BL=616;BR=3782;BVAR;BaseQRankSum=9.990;DEL;DP=10708;Dels=0.01;EL=37;EPP=5.7163;ER=28;FS=1.652;HETAR=275;HOMA=70;HOMR=724;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0102;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_G.;LEN=1;LRB=0.71987;LRBP=4952;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0004;MQM=118.82;MQRankSum=1.018;NS=1069;RA=4746;RL=5;RPP=104.07;RR=60;RUN=1;ReadPosRankSum=-12.039;SAB=0.41538;SAF=27;SAP=7.0526;SAR=38;SRB=0.4764;SRF=2261;SRP=25.968;SRR=2485;VQSLOD=2.9713;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=4.10
+20     11299648        .       TG      T       49315   PASS    AA=62;AB=0.95292;ABA=54;ABP=2046.7;ABR=1093;AC=28;AF=0.0373;AN=750;BL=3126;BR=528;BVAR;BaseQRankSum=-4.929;DEL;DP=10764;Dels=0.01;EL=26;EPP=6.5127;ER=36;FS=3.851;HETAR=366;HOMA=383;HOMR=304;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0267;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_G.;LEN=1;LRB=0.711;LRBP=4014.1;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0005;MQM=76.468;MQRankSum=1.327;NS=1070;RA=2588;RL=54;RPP=77.121;RR=8;RUN=1;ReadPosRankSum=-12.507;SAB=0.48387;SAF=30;SAP=3.1504;SAR=32;SRB=0.47643;SRF=1233;SRP=15.499;SRR=1355;VQSLOD=3.8673;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.00
+20     11561096        .       CTA     C       999     PASS    AC=2;AF=0.0029;AF1=0.005602;BaseQRankSum=3.190;CI95=0.004425,0.01106;DP=7521;DP4=1998,1794,2,4;Dels=0.00;FQ=999;FR;FS=5.422;HP=3;HPLen=2;HR=1;HRun=0;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=0.0056;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_2.RepeatExpansion_TA.;MQ=113.88;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=0.297;NF;NR;PP;PV4=0.43,0.024,1,1;ReadPosRankSum=1.406;SC=CAATAGTATTCTATGTCAGTC;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;TC;TR=1;TU=T;VQSLOD=8.6243;set=Intersection;sumGLbyD=21.89
+20     11723671        .       C       CA      1096.60 PASS    AA=35;AB=0.69565;ABA=35;ABP=41.247;ABR=80;AC=10;AF=0.0141;AN=710;BL=2005;BR=1702;BVAR;BaseQRankSum=-3.427;DP=9819;Dels=0.00;EL=20;EPP=4.5614;ER=15;FR;FS=3.814;HETAR=20;HOMA=0;HOMR=1034;HP=8;HPLen=7;HR=7;HRun=7;HU=A;INS;InbreedingCoeff=0.0323;IndelType=INS.NumRepetitions_7.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;LEN=1;LRB=0.081737;LRBP=56.79;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=81.057;MQRankSum=0.050;NF;NR;NS=1054;PP;RA=5562;RL=22;RPP=8.0357;RR=13;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.012;SAB=0.71429;SAF=25;SAP=16.97;SAR=10;SC=ATATTGAAGACAAAAAAACAG;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.49371;SRF=2746;SRP=4.9233;SRR=2816;TC;TR=7;TU=A;VQSLOD=7.4342;set=Intersection;sumGLbyD=8.30
+20     12238835        rs113904674     CTCTTCATGGTCT   C       1813.44 PASS    AA=7;AB=0.73077;ABA=7;ABP=15.037;ABR=19;AC=4;AF=0.0056;AN=712;BL=360;BR=368;BVAR;BaseQRankSum=3.891;DB;DEL;DP=10309;Dels=0.00;EL=4;EPP=3.3205;ER=3;FR;FS=0.000;HETAR=3;HOMA=0;HOMR=1076;HP=1;HPLen=2;HR=2;HRun=0;HU=C;InbreedingCoeff=-0.0381;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_10orMore.;LEN=12;LRB=0.010989;LRBP=3.2012;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=37;MQRankSum=-3.793;NF;NR;NS=1079;PP;RA=6085;RL=4;RPP=3.3205;RR=3;RUN=1;ReadPosRankSum=1.319;SAB=0.42857;SAF=3;SAP=3.3205;SAR=4;SC=CTTAATGCTCCTCTTCATGGT;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.51257;SRF=3119;SRP=11.364;SRR=2966;TC;TR=6;TU=CCT;VQSLOD=5.7551;set=Intersection;sumGLbyD=69.48
+20     12602812        .       AT      A       12344   PASS    AA=47;AB=0.94372;ABA=43;ABP=1309.5;ABR=721;AC=14;AF=0.0196;AN=716;BL=2714;BR=217;BVAR;BaseQRankSum=1.424;DEL;DP=10743;Dels=0.00;EL=24;EPP=3.0565;ER=23;FS=0.629;HETAR=228;HOMA=65;HOMR=769;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0233;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;LEN=1;LRB=0.85193;LRBP=4622.3;MQ0Fraction=0.0000;MQM=99.574;MQRankSum=1.901;NS=1080;RA=4839;RL=46;RPP=96.568;RR=1;RUN=1;ReadPosRankSum=-9.906;SAB=0.53191;SAF=25;SAP=3.4261;SAR=22;SRB=0.51106;SRF=2473;SRP=8.148;SRR=2366;VQSLOD=2.8161;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.67
+20     13600884        .       CTG     C,CTGTG 1278.10 PASS    AA=85;AB=0.77994;ABA=79;ABP=247.38;ABR=280;AC=71,22;AF=0.05907,0.01830;AN=1202;BL=3279;BR=3205;BVAR;BaseQRankSum=8.852;DEL;DP=24185;DP4=1317,931,52,49;Dels=0.03;EL=45;EPP=3.649;ER=40;FQ=999;FR;FS=31.826;HETAR=75;HOMA=4;HOMR=926;HP=2;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=0.1566;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;LEN=2;LRB=0.011413;LRBP=4.8442;MQ=65.06;MQ0Fraction=0.0012;MQM=48.671;MQRankSum=-0.511;NF;NR;NS=1005;PP;PV4=0.18,1,0.39,0.27;RA=3342;RL=35;RPP=8.7583;RR=50;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.329;SAB=0.43529;SAF=37;SAP=6.1015;SAR=48;SC=TCCCTTTACTCTGTGTGTGTG;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.59066;SRF=1974;SRP=241.62;SRR=1368;TC;TR=15;TU=GT;VQSLOD=3.8635;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=4.23
+20     13666265        .       T       TATAG   556.88  PASS    AC=21;AF=0.01959;AN=1072;BaseQRankSum=24.958;DP=2706;FS=2.581;HRun=0;HaplotypeScore=25.9952;InbreedingCoeff=0.1419;IndelType=INS.NOVEL_4.;MQ=72.43;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=2.888;QD=4.38;ReadPosRankSum=2.552;SB=-417.04;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;VQSLOD=7.3380;set=VQSR
+20     13861245        rs72422273      C       CTCA    2685.46 PASS    AC=140;AF=0.11589;AN=1208;BaseQRankSum=24.355;DB;DP=2910;FS=6.808;HRun=0;HaplotypeScore=19.3095;InbreedingCoeff=-0.0991;IndelType=INS.NumRepetitions_1.EventLength_3.;MQ=78.25;MQ0=22;MQ0Fraction=0.0076;MQRankSum=3.225;QD=3.64;ReadPosRankSum=2.607;SB=-1861.38;VQSLOD=4.1974;set=VQSR
+20     13865746        .       T       TA,TAA  1416.23 PASS    AA=63;AB=0.80417;ABA=47;ABP=195.87;ABR=193;AC=122,21;AF=0.10133,0.01744;AN=1204;BL=3673;BR=1145;BVAR;BaseQRankSum=-3.336;DP=10513;Dels=0.00;EL=62;EPP=131.27;ER=1;FR;FS=716.583;HETAR=45;HOMA=1;HOMR=998;HP=2;HR=1;HRun=1;HU=A;INS;InbreedingCoeff=0.0814;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;LEN=1;LRB=0.5247;LRBP=2883.3;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=56.143;MQRankSum=-1.197;NF;NR;NS=1044;PP;RA=4529;RL=62;RPP=131.27;RR=1;RUN=1;ReadPosRankSum=-12.295;SAB=1;SAF=63;SAP=139.81;SAR=0;SC=GGAACATGGATACCCCCCTGC;SRB=0.52462;SRF=2376;SRP=26.853;SRR=2153;TC;TR=1;TU=A;VQSLOD=-4.2308;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=4.77
+20     13881703        .       CTT     C       152.85  PASS    AC=8;AF=0.0093;AN=862;BaseQRankSum=3.941;DP=2063;FS=0.962;HRun=5;HaplotypeScore=24.0313;InbreedingCoeff=0.0790;IndelType=DEL.NumRepetitions_5.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;MQ=55.05;MQ0=49;MQ0Fraction=0.0238;MQRankSum=-1.418;QD=3.47;ReadPosRankSum=-0.605;SB=-93.04;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;VQSLOD=5.3874;set=VQSR
+20     14260090        rs73619828      A       AT      27935   PASS    AA=596;AB=0.59484;ABA=487;ABP=96.922;ABR=715;AC=204;AF=0.17000;AN=1200;BL=21718;BR=28458;BVAR;BaseQRankSum=0.756;DB;DP=23629;DP4=1385,1492,287,328;Dels=0.00;EL=299;EPP=3.0249;ER=297;FQ=999;FR;FS=6.187;HETAR=218;HOMA=38;HOMR=788;HP=9;HPLen=9;HR=9;HRun=9;HU=T;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0797;IndelType=INS.NumRepetitions_9.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;LEN=1;LRB=0.13433;LRBP=1969;MQ=100.81;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=57.084;MQRankSum=2.224;NF;NR;NS=1044;PP;PV4=0.53,1,1.2e-11,1;RA=4143;RL=238;RPP=55.475;RR=358;RUN=1;ReadPosRankSum=0.198;SAB=0.46812;SAF=279;SAP=8.2714;SAR=317;SC=CCTTAAGTTGATTTTTTTTTC;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.50374;SRF=2087;SRP=3.514;SRR=2056;TC;TR=9;TU=T;VQSLOD=9.0018;set=Intersection;sumGLbyD=10.82
+20     14260558        .       AC      A       238     PASS    AC=1;AF=0.0014;AF1=0.003368;BaseQRankSum=2.868;CI95=0.003106,0.006211;DP=9724;DP4=2075,2329,1,7;Dels=0.00;FQ=106;FR;FS=10.678;HP=1;HPLen=2;HR=2;HRun=1;HU=A;INDEL;InbreedingCoeff=-0.0406;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_C.;MQ=114.37;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=0.862;NF;NR;PP;PV4=0.074,0.0096,0.017,1;ReadPosRankSum=-0.042;SC=ATCAGGAATAACTGTGTGACC;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;TC;TR=2;TU=A;VQSLOD=8.1618;set=Intersection;sumGLbyD=18.65
+20     14425481        .       GTA     G,GTATA 148.85  PASS    AC=43,23;AF=0.03473,0.01858;AN=1238;BaseQRankSum=6.289;DP=25167;DP4=1800,2021,38,49;FR;FS=9.416;HP=2;HPLen=1;HR=1;HU=T;HaplotypeScore=17.7453;INDEL;InbreedingCoeff=0.0995;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ0=21;MQ0Fraction=0.0058;MQRankSum=-0.200;NF;NR;PP;PV4=0.59,1,0.04,0.023;QD=0.35;ReadPosRankSum=-1.689;SB=-367.50;SC=CTGTGTGTGTGTATATATATA;SET_WGVQSR;TC;TR=13;TU=AT;VQSLOD=3.5796;set=filterInVQSR-2of5
+20     14943522        rs11478299      GA      AA,G    1761.24 PASS    AA=117;AB=0.68142;ABA=108;ABP=99.919;ABR=231;AC=0;AF=0.0000;AF1=0.04204;AN=712;BL=4931;BR=5802;BVAR;BaseQRankSum=9.118;CI95=0.02876,0.05752;DB;DEL;DP=13717;DP4=1908,1684,59,58;Dels=0.05;EL=60;EPP=3.1773;ER=57;FQ=81.9;FR;HETAR=56;HOMA=1;HOMR=1011;HP=8;HPLen=8;HR=8;HU=A;INDEL;InbreedingCoeff=0.1264;IndelType=MIXED;LEN=1;LRB=0.081152;LRBP=156.5;MQ=106.93;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=96.855;MQRankSum=1.619;NF;NR;NS=1068;PP;PV4=0.57,1,0.0003,1;QD=7.40;RA=5080;RL=56;RPP=3.4743;RR=61;RUN=1;ReadPosRankSum=0.814;SAB=0.52137;SAF=61;SAP=3.4743;SAR=56;SB=-1122.51;SC=GTTGTTTGGGGAAAAAAAACT;SET_WGVQSR;SRB=0.51083;SRF=2595;SRP=8.1825;SRR=2485;TC;TR=8;TU=A;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=9.81
+20     14974486        .       A       AG      4101.40 PASS    AA=57;AB=0.57143;ABA=51;ABP=8.2839;ABR=68;AC=22;AF=0.01846;AN=1192;BL=2286;BR=2834;BVAR;BaseQRankSum=8.711;DP=20538;DP4=2172,2100,19,13;Dels=0.00;EL=32;EPP=4.877;ER=25;FS=0.517;HETAR=20;HOMA=4;HOMR=1027;HRun=1;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0677;IndelType=INS.NOVEL_1.Novel_G.;LEN=1;LRB=0.10703;LRBP=130.37;MQ=126.07;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=56.088;MQRankSum=-10.756;NS=1051;PV4=0.38,3.5e-51,7.9e-34,1;RA=5203;RL=26;RPP=3.9627;RR=31;RUN=1;ReadPosRankSum=1.283;SAB=0.54386;SAF=31;SAP=3.9627;SAR=26;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.51816;SRF=2696;SRP=17.918;SRR=2507;VQSLOD=8.0072;set=Intersection;sumGLbyD=25.60
+20     15111137        .       GA      G       13533   PASS    AA=98;AB=0.84864;ABA=89;ABP=623.8;ABR=499;AC=47;AF=0.03796;AN=1238;BL=5324;BR=856;BVAR;BaseQRankSum=-11.577;DEL;DP=13384;Dels=0.01;EL=53;EPP=4.4284;ER=45;FS=6.099;HETAR=219;HOMA=845;HOMR=18;HRun=1;InbreedingCoeff=-0.0056;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;LEN=1;LRB=0.72298;LRBP=7017.4;MQ0Fraction=0.0003;MQM=90.449;MQRankSum=1.408;NS=1083;RA=590;RL=87;RPP=130.99;RR=11;RUN=1;ReadPosRankSum=-18.074;SAB=0.55102;SAF=54;SAP=5.2261;SAR=44;SRB=0.52373;SRF=309;SRP=5.8958;SRR=281;VQSLOD=4.1054;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.06
+20     15283028        .       A       AC,ACACACACACACAC       140844.83       PASS    AA=180;AB=0.61442;ABA=123;ABP=39.285;ABR=196;AC=13,817;AF=0.01111,0.69829;AN=1170;BL=4453;BR=11407;BVAR;BaseQRankSum=24.686;DP=6365;Dels=0.00;EL=124;EPP=58.793;ER=56;FR;FS=10.912;HETAR=87;HOMA=48;HOMR=683;HP=1;HR=1;HRun=1;HU=T;INS;InbreedingCoeff=0.2074;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;LEN=1;LRB=0.43846;LRBP=6624;MQ0Fraction=0.0558;MQM=38.211;MQRankSum=-21.111;NF;NR;NS=818;PP;RA=1732;RL=0;RPP=393.88;RR=180;RUN=1;ReadPosRankSum=-7.620;SAB=0.31111;SAF=56;SAP=58.793;SAR=124;SC=ACACACACACATACACACATA;SRB=0.54042;SRF=936;SRP=27.584;SRR=796;TC;TR=21;TU=AC;VQSLOD=4.7569;set=Intersection;sumGLbyD=18.36
+20     15361056        .       ATAACT  A       4892.81 PASS    AA=59;AB=0.63576;ABA=55;ABP=27.184;ABR=96;AC=34;AF=0.0487;AN=698;BL=3164;BR=1999;BVAR;BaseQRankSum=3.391;DEL;DP=7080;Dels=0.03;EL=27;EPP=3.9304;ER=32;FR;FS=4.816;HETAR=35;HOMA=6;HOMR=966;HP=2;HPLen=3;HR=3;HRun=0;HU=A;InbreedingCoeff=0.0785;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_5.;LEN=5;LRB=0.22564;LRBP=573.84;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=70.034;MQRankSum=-8.732;NF;NR;NS=1008;PP;RA=3915;RL=42;RPP=26.013;RR=17;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.735;SAB=0.44068;SAF=26;SAP=4.8137;SAR=33;SC=AGATTAGGAAATAACTTAGGG;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.42682;SRF=1671;SRP=185.12;SRR=2244;TC;TR=3;TU=A;VQSLOD=7.0900;set=Intersection;sumGLbyD=43.38
+20     15579507        .       AATTAGTC        A,TATTAGTC      1936.38 PASS    AA=16;AB=0.58974;ABA=16;ABP=5.7386;ABR=23;AC=64;AF=0.05229;AN=1224;BL=699;BR=775;BVAR;BaseQRankSum=-21.390;DEL;DP=21920;DP4=2099,2403,6,6;Dels=0.00;EL=8;EPP=3.0103;ER=8;FR;FS=2.920;HETAR=5;HOMA=0;HOMR=1063;HP=3;HPLen=4;HR=4;HU=A;INDEL;InbreedingCoeff=-0.0143;IndelType=MIXED;LEN=7;LRB=0.05156;LRBP=11.519;MQ=129.49;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=51.938;MQRankSum=3.331;NF;NR;NS=1068;PP;PV4=1,0.019,1.3e-07,1;RA=5334;RL=5;RPP=7.8961;RR=11;RUN=1;ReadPosRankSum=-16.901;SAB=0.4375;SAF=7;SAP=3.5532;SAR=9;SC=CATACTACAAAATTAGTCATT;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.41695;SRF=2224;SRP=322.58;SRR=3110;TC;TR=4;TU=A;VQSLOD=3.2237;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=43.57
+20     15752535        .       CT      C,GT    3775.20 PASS    AA=92;AB=0.78636;ABA=47;ABP=159.71;ABR=173;AC=0;AF=0.0000;AN=608;BL=4955;BR=2380;BVAR;BaseQRankSum=2.910;DEL;DP=3429;Dels=0.04;EL=13;EPP=105.82;ER=79;FR;HETAR=92;HOMA=95;HOMR=544;HP=2;HPLen=2;HR=2;HU=T;InbreedingCoeff=0.0483;IndelType=MIXED;LEN=1;LRB=0.35106;LRBP=1966;MQ0Fraction=0.0232;MQM=35.293;MQRankSum=-2.199;NF;NR;NS=732;PP;QD=4.91;RA=1272;RL=81;RPP=118.66;RR=11;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.077;SAB=0.021739;SAF=2;SAP=185.79;SAR=90;SB=-59.51;SC=CAAGACCATCCTTGGCTAACA;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.14623;SRF=186;SRP=1385.8;SRR=1086;TC;TR=2;TU=T;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=9.70
+20     15883060        rs73619850      A       AT      1325.60 PASS    AA=38;AB=0.59302;ABA=35;ABP=9.4742;ABR=51;AC=14;AF=0.0156;AN=896;BL=1078;BR=1638;BVAR;BaseQRankSum=-4.526;DB;DP=19854;DP4=1632,1800,15,20;Dels=0.00;EL=18;EPP=3.2389;ER=20;FR;FS=0.000;HETAR=14;HOMA=1;HOMR=1014;HP=1;HPLen=1;HR=1;HRun=1;HU=T;INDEL;INS;InbreedingCoeff=-0.0131;IndelType=INS.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;LEN=1;LRB=0.20619;LRBP=253.74;MQ=118.40;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=56.526;MQRankSum=0.892;NF;NR;NS=1029;PP;PV4=0.61,1,0.25,0.14;RA=4439;RL=14;RPP=8.7247;RR=24;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.061;SAB=0.42105;SAF=16;SAP=5.0675;SAR=22;SC=GGATTGGCAGATAAAAAATGG;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.46429;SRF=2061;SRP=52.168;SRR=2378;TC;TR=1;TU=T;VQSLOD=9.7576;set=Intersection;sumGLbyD=15.69
+20     16122099        .       GA      G       12914   PASS    AA=85;AB=0.85915;ABA=80;ABP=639.4;ABR=488;AC=19;AF=0.01542;AN=1232;BL=805;BR=5457;BVAR;BaseQRankSum=-6.084;DEL;DP=13592;Dels=0.00;EL=45;EPP=3.649;ER=40;FS=0.935;HETAR=218;HOMA=841;HOMR=14;HRun=2;InbreedingCoeff=0.0250;IndelType=DEL.NumRepetitions_2.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;LEN=1;LRB=0.74289;LRBP=7507.5;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=103.01;MQRankSum=2.843;NS=1075;RA=541;RL=2;RPP=170.62;RR=83;RUN=1;ReadPosRankSum=-16.222;SAB=0.49412;SAF=42;SAP=3.0358;SAR=43;SRB=0.44917;SRF=243;SRP=15.152;SRR=298;VQSLOD=3.9745;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=2.97
+20     16828509        .       G       GT      843.62  PASS    AA=30;AB=0.70103;ABA=29;ABP=37.06;ABR=68;AC=10;AF=0.0140;AN=714;BL=1368;BR=1786;BVAR;BaseQRankSum=-4.061;DP=8682;Dels=0.01;EL=14;EPP=3.2998;ER=16;FR;FS=2.681;HETAR=22;HOMA=1;HOMR=1020;HP=8;HPLen=8;HR=8;HRun=8;HU=T;INS;InbreedingCoeff=0.1389;IndelType=INS.NumRepetitions_8.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;LEN=1;LRB=0.13253;LRBP=123.3;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=62.8;MQRankSum=-1.491;NF;NR;NS=1043;PP;RA=4416;RL=11;RPP=7.6428;RR=19;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.718;SAB=0.76667;SAF=23;SAP=21.54;SAR=7;SC=CCTTCAAAAGGTTTTTTTTGG;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.5745;SRF=2537;SRP=215.91;SRR=1879;TC;TR=8;TU=T;VQSLOD=7.6258;set=Intersection;sumGLbyD=10.77
+20     17470034        .       GC      G       46975   PASS    AA=57;AB=0.96043;ABA=52;ABP=2422.5;ABR=1262;AC=34;AF=0.02773;AN=1226;BL=418;BR=3446;BVAR;BaseQRankSum=-6.250;DEL;DP=12035;Dels=0.00;EL=22;EPP=9.4485;ER=35;FS=1.350;HETAR=416;HOMA=409;HOMR=244;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0083;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_C.;LEN=1;LRB=0.78364;LRBP=5155.6;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=99.509;MQRankSum=2.192;NS=1076;RA=2396;RL=5;RPP=87.164;RR=52;RUN=1;ReadPosRankSum=-15.199;SAB=0.5614;SAF=32;SAP=4.877;SAR=25;SRB=0.52963;SRF=1269;SRP=21.285;SRR=1127;VQSLOD=3.8440;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.06
+20     17471374        .       AGCGGC  A       850.03  PASS    AC=6;AF=0.0085;AF1=0.01301;AN=704;BaseQRankSum=6.259;CI95=0.00885,0.01991;DP=8180;DP4=2215,1878,4,5;Dels=0.01;FQ=131;FS=0.000;HRun=0;INDEL;InbreedingCoeff=0.0009;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_5.;MQ=104.41;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-5.521;PV4=0.74,0.37,0.0005,1;ReadPosRankSum=2.468;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;VQSLOD=6.8773;set=Intersection;sumGLbyD=30.85
+20     18433202        rs35582929      G       GA      2506.90 PASS    AA=55;AB=0.5812;ABA=49;ABP=9.7103;ABR=68;AC=20;AF=0.0218;AN=918;BL=2263;BR=2175;BVAR;BaseQRankSum=-6.639;DB;DP=19467;DP4=1845,2365,27,26;Dels=0.00;EL=21;EPP=9.6826;ER=34;FQ=999;FR;FS=5.633;HETAR=16;HOMA=3;HOMR=1045;HP=2;HPLen=3;HR=3;HRun=1;HU=G;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0700;IndelType=INS.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;LEN=1;LRB=0.019829;LRBP=6.7994;MQ=114.03;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=83.345;MQRankSum=1.610;NF;NR;NS=1064;PP;PV4=0.33,1,1,1;RA=5380;RL=28;RPP=3.0498;RR=27;RUN=1;ReadPosRankSum=0.873;SAB=0.47273;SAF=26;SAP=3.3656;SAR=29;SC=TATTTCATGGGAGCATTAAAA;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.42862;SRF=2306;SRP=241.07;SRR=3074;TC;TR=3;TU=G;VQSLOD=10.0372;dbSNP=126;set=Intersection;sumGLbyD=13.10
+20     18551314        rs10659122      CA      C,CAA,CAAA,CAAAA,CAAAAA 18810.74        PASS    ABR=243;AC=19,169,216,164,188;AF=0.01816,0.16157,0.20650,0.15679,0.17973;BVAR;BaseQRankSum=-5.742;DB;DP=17637;DP4=136,77,560,237;FR;FS=2.693;HOMA=177;HOMR=299;HP=17;HR=17;HU=A;HaplotypeScore=15.5048;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.8901;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ0=11;MQ0Fraction=0.0069;MQRankSum=1.845;NF;NR;NS=658;PP;PV4=0.08,1,1,1;QD=12.66;RA=673;RUN=1;ReadPosRankSum=0.283;SB=-3514.45;SC=GATTCCATCTCAAAAAAAAAA;SET_WGVQSR;SRB=0.63596;SRF=428;SRP=111.06;SRR=245;TC;TR=17;TU=A;VQSLOD=10.6964;dbSNP=130;set=Intersection
+20     18785519        .       G       GTC     415.55  PASS    AC=28;AF=0.0400;AN=700;BaseQRankSum=10.889;DP=1929;FS=8.778;HRun=0;HaplotypeScore=27.6448;InbreedingCoeff=0.0510;IndelType=INS.NOVEL_2.;MQ=61.99;MQ0=36;MQ0Fraction=0.0187;MQRankSum=4.508;QD=3.08;ReadPosRankSum=8.080;SB=-437.03;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;VQSLOD=4.9313;set=VQSR
+20     20301041        rs35451634      ATATG   A       200.42  PASS    AC=21;AF=0.0449;AN=468;BaseQRankSum=5.251;DB;DP=579;FS=24.013;HRun=0;HaplotypeScore=27.8977;InbreedingCoeff=0.0113;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_4.;MQ=78.47;MQ0=26;MQ0Fraction=0.0449;MQRankSum=-5.284;QD=3.06;ReadPosRankSum=1.793;SB=-55.76;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;VQSLOD=5.0981;set=VQSR
+20     20378174        .       TC      T       245.55  PASS    AC=23;AF=0.01879;AN=1224;BaseQRankSum=0.990;DP=3225;FS=10.413;HRun=1;HaplotypeScore=22.6109;InbreedingCoeff=0.0244;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_C.;MQ=93.70;MQ0=3;MQ0Fraction=0.0009;MQRankSum=-3.349;QD=1.86;ReadPosRankSum=-7.227;SB=-188.62;VQSLOD=4.2553;set=VQSR
+20     20809160        rs10571503      TAA     AAA,T   3496    PASS    AC=0;AF=0.0000;AN=612;BaseQRankSum=1.968;DB;DP=1092;FR;HP=4;HPLen=3;HR=3;HRun=0;HU=A;HaplotypeScore=26.1253;InbreedingCoeff=0.0603;IndelType=MIXED;MQ=68.98;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0009;MQRankSum=1.520;NF;NR;PP;ReadPosRankSum=-4.042;SC=TATATATATATAAATTTAAAT;TC;TR=13;TU=AT;set=filterInVQSR-2of5
+20     22508765        .       CT      C       53877.84        PASS    AA=187;AB=0.78077;ABA=171;ABP=537.09;ABR=609;AC=1017;AF=0.91787;AN=1108;BL=12690;BR=1718;BVAR;BaseQRankSum=13.773;DEL;DP=7430;Dels=0.02;EL=73;EPP=22.53;ER=114;FR;FS=16.352;HETAR=152;HOMA=9;HOMR=786;HP=8;HR=4;HRun=4;HU=T;InbreedingCoeff=0.3885;IndelType=DEL.NumRepetitions_4.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;LEN=1;LRB=0.76152;LRBP=18147;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=46.086;MQRankSum=0.971;NF;NR;NS=947;PP;RA=2868;RL=177;RPP=326.86;RR=10;RUN=1;ReadPosRankSum=9.951;SAB=0.34759;SAF=65;SAP=40.738;SAR=122;SC=AAAAAATTTTCTTTTGAACTG;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.46269;SRF=1327;SRP=37.684;SRR=1541;TC;TR=4;TU=T;VQSLOD=5.1182;set=Intersection;sumGLbyD=25.15
+20     22555082        rs11477526      AT      A       11503   PASS    AA=530;AB=0.50816;ABA=422;ABP=3.5063;ABR=436;AF=0.1614;AN=700;BL=21453;BR=23313;BVAR;BaseQRankSum=17.562;DB;DEL;DP=25587;DP4=1869,1600,283,201;Dels=0.14;EL=259;EPP=3.6003;ER=271;FQ=999;FR;FS=14.595;HETAR=159;HOMA=41;HOMR=846;HP=3;HPLen=3;HR=3;HRun=3;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=0.0995;IndelType=DEL.NumRepetitions_3.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;LEN=1;LRB=0.041549;LRBP=170.83;MQ=95.89;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=72.162;MQRankSum=2.564;NF;NR;NS=1046;PP;PV4=0.058,6.6e-129,0.04,1;RA=4303;RL=264;RPP=3.0267;RR=266;RUN=1;ReadPosRankSum=0.176;SAB=0.58679;SAF=311;SAP=37.688;SAR=219;SC=GGGAAAGCTGATTTACTGATT;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.54892;SRF=2362;SRP=92.453;SRR=1941;TC;TR=3;TU=T;VQSLOD=8.7746;dbSNP=120;set=Intersection;sumGLbyD=15.27
+20     22590907        .       A       AC      4204.88 PASS    AA=67;AB=0.592;ABA=51;ABP=12.2;ABR=74;AF=0.0554;AF1=0.0468;AN=560;BL=2277;BR=2389;BVAR;BaseQRankSum=10.968;CI95=0.03759,0.05639;DP=14380;DP4=2514,2018,33,33;Dels=0.00;EL=22;EPP=20.155;ER=45;FQ=999;FR;FS=3.846;HETAR=25;HOMA=4;HOMR=1049;HP=4;HPLen=5;HR=5;HRun=0;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0719;IndelType=INS.NOVEL_1.Novel_C.;LEN=1;LRB=0.024003;LRBP=8.8481;MQ=110.68;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=96.149;MQRankSum=2.668;NF;NR;NS=1078;PP;PV4=0.39,1,0.46,0.36;RA=5468;RL=33;RPP=3.0427;RR=34;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.097;SAB=0.50746;SAF=34;SAP=3.0427;SAR=33;SC=TCATATCAAAAACATTACGTT;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.54389;SRF=2974;SRP=94.508;SRR=2494;TC;TR=5;TU=A;VQSLOD=10.0712;set=Intersection;sumGLbyD=27.69
+20     22806326        rs11468890      ATTCCATCAC      A       105320.99       PASS    AC=567;AF=0.48795;AN=1162;BVAR;BaseQRankSum=32.858;DB;DEL;DP=26278;DP4=727,796,554,587;Dels=0.30;FQ=999;FR;FS=1.923;HP=3;HPLen=3;HR=2;HRun=0;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=0.2548;IndelType=DEL.NumRepetitions_2.EventLength_9.;LEN=9;MQ=89.42;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-23.545;NF;NR;PP;PV4=0.7,1,1.3e-167,1;RUN=1;ReadPosRankSum=4.384;SC=GGCTGCTCCCATTCCATCACT;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;TC;TR=2;TU=T;VQSLOD=8.2594;set=Intersection;sumGLbyD=69.81
+20     22999898        rs55966257      CAGGA   C       8019.97 PASS    AA=23;AB=0.57778;ABA=19;ABP=5.3748;ABR=26;AC=214;AF=0.18838;AN=1136;BL=1143;BR=1040;BVAR;BaseQRankSum=29.294;DB;DEL;DP=8216;Dels=0.02;EL=11;EPP=3.1047;ER=12;FS=14.938;HETAR=14;HOMA=2;HOMR=948;HRun=0;InbreedingCoeff=0.0797;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_4.;LEN=4;LRB=0.047183;LRBP=13.563;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=34.783;MQRankSum=-20.301;NS=964;RA=3637;RL=13;RPP=3.86;RR=10;RUN=1;ReadPosRankSum=-24.607;SAB=0.47826;SAF=11;SAP=3.1047;SAR=12;SRB=0.49024;SRF=1783;SRP=6.02;SRR=1854;VQSLOD=7.9163;set=Intersection;sumGLbyD=9.43
+20     23385964        rs57723772      GAA     G       8170.95 PASS    AC=257;AF=0.20928;AN=1228;BaseQRankSum=32.220;DB;DP=3291;FS=1.688;HRun=3;HaplotypeScore=22.6739;InbreedingCoeff=0.0171;IndelType=DEL.NumRepetitions_3.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;MQ=58.44;MQ0=32;MQ0Fraction=0.0097;MQRankSum=-4.893;QD=6.55;ReadPosRankSum=-35.524;SB=-3631.67;VQSLOD=5.6549;set=VQSR
+20     23534530        .       TA      T       3542.10 PASS    AA=45;AB=0.75658;ABA=37;ABP=89.926;ABR=115;AC=35;AF=0.02991;AN=1170;BL=3090;BR=270;BVAR;BaseQRankSum=-6.892;DEL;DP=8108;Dels=0.00;EL=19;EPP=5.3748;ER=26;FS=1.026;HETAR=76;HOMA=896;HOMR=18;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0551;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;LEN=1;LRB=0.83929;LRBP=5142.4;MQ0Fraction=0.0017;MQM=41.578;MQRankSum=0.818;NS=991;RA=203;RL=43;RPP=84.127;RR=2;RUN=1;ReadPosRankSum=-12.923;SAB=0.37778;SAF=17;SAP=8.8491;SAR=28;SRB=0.5665;SRF=115;SRP=10.808;SRR=88;VQSLOD=4.2093;set=Intersection;sumGLbyD=3.49
+20     23976810        rs5841018       A       ATATTAAT        1782.38 PASS    AF=0.1387;AF1=0.01507;BaseQRankSum=3.717;CI95=0.00188,0.03947;DB;DP=1712;DP4=357,376,7,2;Dels=0.00;FQ=31.1;FS=14.489;HPLen=2;HRun=0;INDEL;InbreedingCoeff=0.1123;IndelType=INS.NumRepetitions_1.EventLength_7.;MQ=49.53;MQ0=2;MQ0Fraction=0.0055;MQRankSum=-4.928;PV4=0.1,1,0.00085,0.016;ReadPosRankSum=-4.456;VQSLOD=5.3140;dbSNP=116;set=Intersection;sumGLbyD=19.98
+20     24222100        .       CTTTTA  C       4219.36 PASS    AA=57;AB=0.59434;ABA=43;ABP=11.205;ABR=63;AF=0.01803;AF1=0.01547;AN=1220;BL=2073;BR=2345;BVAR;BaseQRankSum=7.990;CI95=0.0114,0.02137;DEL;DP=17536;DP4=2140,2346,7,12;Dels=0.01;EL=32;EPP=4.877;ER=25;FQ=104;FS=0.614;HETAR=21;HOMA=4;HOMR=1042;HRun=0;INDEL;InbreedingCoeff=0.1941;IndelType=DEL.NumRepetitions_2.EventLength_5.;LEN=5;LRB=0.061566;LRBP=39.374;MQ=73.32;MQ0Fraction=0.0021;MQM=39.614;MQRankSum=-5.728;NS=1067;PV4=0.37,1.1e-39,3.5e-09,1;RA=5527;RL=28;RPP=3.0484;RR=29;RUN=1;ReadPosRankSum=0.214;SAB=0.54386;SAF=31;SAP=3.9627;SAR=26;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.49267;SRF=2723;SRP=5.588;SRR=2804;VQSLOD=7.5428;set=Intersection;sumGLbyD=38.08
+20     24395018        .       AT      A       49310   PASS    AA=146;AB=0.91198;ABA=130;ABP=2180.5;ABR=1347;AC=50;AF=0.04045;AN=1236;BL=587;BR=9625;BVAR;BaseQRankSum=-4.610;DEL;DP=12793;Dels=0.01;EL=54;EPP=24.487;ER=92;FS=22.108;HETAR=485;HOMA=384;HOMR=210;HRun=2;InbreedingCoeff=0.0374;IndelType=DEL.NumRepetitions_2.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;LEN=1;LRB=0.88504;LRBP=17373;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=102.26;MQRankSum=2.256;NS=1080;RA=2377;RL=1;RPP=311.42;RR=145;RUN=1;ReadPosRankSum=-16.347;SAB=0.63699;SAF=93;SAP=26.807;SAR=53;SRB=0.52167;SRF=1240;SRP=12.702;SRR=1137;VQSLOD=3.2421;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.80
+20     24411517        .       C       CA      246.18  PASS    AF=0.01546;AF1=0.01095;BaseQRankSum=7.832;CI95=0.005698,0.01709;DP=7981;DP4=983,2037,7,7;Dels=0.00;FQ=27.9;FS=18.815;HPLen=3;HRun=3;INDEL;InbreedingCoeff=0.0175;IndelType=INS.NumRepetitions_3.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;MQ=60.28;MQ0Fraction=0.0137;MQRankSum=-7.243;PV4=0.25,1,2.7e-05,1;ReadPosRankSum=-0.143;VQSLOD=4.3701;set=Intersection;sumGLbyD=6.56
+20     24421169        .       AG      A       27480   PASS    AA=182;AB=0.8303;ABA=149;ABP=835;ABR=729;AC=89;AF=0.07224;AN=1232;BL=11276;BR=2214;BVAR;BaseQRankSum=-5.447;DEL;DP=11717;Dels=0.01;EL=103;EPP=9.8827;ER=79;FR;FS=15.492;HETAR=343;HOMA=607;HOMR=114;HP=4;HR=1;HRun=1;HU=G;InbreedingCoeff=0.0353;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_G.;LEN=1;LRB=0.67176;LRBP=13222;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=88.324;MQRankSum=2.221;NF;NR;NS=1071;PP;RA=1226;RL=169;RPP=293.37;RR=13;RUN=1;ReadPosRankSum=-19.711;SAB=0.54945;SAF=100;SAP=6.876;SAR=82;SC=CCTTAGCCCCAGAAAACATCT;SRB=0.44535;SRF=546;SRP=34.814;SRR=680;TC;TR=1;TU=G;VQSLOD=4.2669;set=Intersection;sumGLbyD=3.91
+20     24765537        rs71841337      ATTT    A,AT,ATT,ATTTT,ATTTTT   37852   PASS    AC=13,120,527,51,92;AF=0.01102,0.10169,0.44661,0.04322,0.07797;AN=1180;BVAR;BaseQRankSum=8.172;DB;DEL;DP=39116;DP4=200,331,851,1169;FR;FS=2.394;HP=15;HR=15;HU=T;HaplotypeScore=20.8091;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.4815;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0003;MQRankSum=4.344;NF;NR;PP;PV4=0.067,1,1,0.1;QD=7.90;RUN=1;ReadPosRankSum=1.798;SB=-8371.96;SC=CTCTGCAACAATTTTTTTTTT;SET_WGVQSR;TC;TR=15;TU=T;VQSLOD=9.9679;dbSNP=120;set=Intersection
+20     25500689        .       A       AATTT   84980.72        PASS    AC=1005;AF=0.89096;AN=1128;BaseQRankSum=17.400;DP=2324;FS=6.721;HRun=0;HaplotypeScore=25.3376;InbreedingCoeff=0.2148;IndelType=INS.NumRepetitions_1.EventLength_4.;MQ=75.19;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0004;MQRankSum=-8.221;QD=38.28;ReadPosRankSum=4.504;SB=-34833.07;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;VQSLOD=4.6038;set=VQSR
+20     25550373        .       GA      G       11251.31        PASS    AA=246;AB=0.42963;ABA=154;ABP=14.624;ABR=116;AC=566;AF=0.6521;AN=868;BL=5230;BR=11845;BVAR;BaseQRankSum=7.418;DEL;DP=8885;Dels=0.02;EL=99;EPP=23.348;ER=147;FR;FS=50.357;HETAR=150;HOMA=849;HOMR=14;HP=1;HR=2;HRun=1;HU=G;InbreedingCoeff=0.1365;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;LEN=1;LRB=0.38741;LRBP=5567.9;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=97.561;MQRankSum=0.050;NF;NR;NS=1013;PP;RA=269;RL=75;RPP=84.361;RR=171;RUN=1;ReadPosRankSum=-7.128;SAB=0.52846;SAF=130;SAP=4.7404;SAR=116;SC=CACGGAGGCGGAGGAAGCAGC;SRB=0.42379;SRF=114;SRP=16.58;SRR=155;TC;TR=6;TU=AGG;VQSLOD=4.0103;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=4.58
+20     25903865        .       TTC     T       7459.23 PASS    AC=277;AF=0.23316;AN=1188;BaseQRankSum=31.479;DP=2969;FS=137.723;HRun=0;HaplotypeScore=37.3300;InbreedingCoeff=-0.1755;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_2.RepeatExpansion_TC.;MQ=53.49;MQ0=50;MQ0Fraction=0.0168;MQRankSum=-25.506;QD=4.70;ReadPosRankSum=-5.913;SB=-1747.98;VQSLOD=5.4731;set=VQSR
+20     25934237        .       C       CCACTT  771.36  PASS    AC=37;AF=0.0426;AN=868;BaseQRankSum=16.331;DP=2253;FS=4.545;HRun=0;HaplotypeScore=29.9764;InbreedingCoeff=-0.0685;IndelType=INS.NOVEL_5.;MQ=48.12;MQ0=87;MQ0Fraction=0.0386;MQRankSum=-12.497;QD=3.37;ReadPosRankSum=-8.428;SB=-297.70;VQSLOD=4.2324;set=VQSR
+20     26054751        rs112967123     TATC    T       33244   PASS    AA=1863;AB=0.79012;ABA=1788;ABP=6231;ABR=6731;AC=227;AF=0.18218;AN=1246;BL=74924;BR=72452;BVAR;BaseQRankSum=32.258;DB;DEL;DP=36404;DS;Dels=0.05;EL=931;EPP=3.0115;ER=932;FR;FS=265.752;HETAR=527;HOMA=2;HOMR=565;HP=1;HR=2;HRun=0;HU=T;InbreedingCoeff=-0.2137;IndelType=DEL.NumRepetitions_2.EventLength_3.;LEN=3;LRB=0.016773;LRBP=93.048;MQ0Fraction=0.0127;MQM=28.797;MQRankSum=-5.329;NF;NR;NS=1094;PP;RA=14604;RL=1014;RPP=34.743;RR=849;RUN=1;ReadPosRankSum=8.394;SAB=0.65486;SAF=1220;SAP=391.07;SAR=643;SC=TCACCATCATTATCATCATTA;SRB=0.56717;SRF=8283;SRP=575.39;SRR=6321;TC;TR=8;TU=ATC;VQSLOD=1.0486;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=6.54
+20     26120452        .       CAG     C       7863.19 PASS    AA=163;AB=0.70489;ABA=157;ABP=196.99;ABR=375;AC=171;AF=0.1908;AN=896;BL=3455;BR=4877;BVAR;BaseQRankSum=25.536;DEL;DP=7014;Dels=0.10;EL=58;EPP=32.438;ER=105;FS=231.723;HETAR=90;HOMA=5;HOMR=387;HRun=0;InbreedingCoeff=-0.1966;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_2.RepeatExpansion_AG.;LEN=2;LRB=0.17067;LRBP=530;MQ0Fraction=0.0470;MQM=21.951;MQRankSum=-23.449;NS=482;RA=1117;RL=62;RPP=23.273;RR=101;RUN=1;ReadPosRankSum=1.904;SAB=0.37423;SAF=61;SAP=25.404;SAR=102;SRB=0.41719;SRF=466;SRP=69.544;SRR=651;VQSLOD=-0.9395;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=5.06
+20     26185812        .       AG      A       322.58  PASS    AF=0.0342;BaseQRankSum=3.668;DP=3014;Dels=0.01;FR;FS=10.238;HP=8;HPLen=6;HR=6;HRun=6;HU=G;InbreedingCoeff=0.1504;IndelType=DEL.NumRepetitions_6.EventLength_1.RepeatExpansion_G.;MQ0Fraction=0.0473;MQRankSum=-5.464;NF;NR;PP;ReadPosRankSum=0.536;SC=GGGTGGGTGGAGGGGGGAGGG;SET_WGVQSR;TC;TR=6;TU=G;VQSLOD=5.0767;set=Intersection;sumGLbyD=8.46
+20     30963468        .       AGTTT   A       2041.12 PASS    AA=38;AB=0.75694;ABA=35;ABP=85.587;ABR=109;AC=34;AF=0.0377;AN=902;BL=1974;BR=668;BVAR;BaseQRankSum=3.060;DEL;DP=22806;DP4=1997,1747,28,36;Dels=0.02;EL=17;EPP=3.9246;ER=21;FR;FS=16.034;HETAR=29;HOMA=1;HOMR=1009;HP=1;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=G;INDEL;InbreedingCoeff=0.0752;IndelType=DEL.NumRepetitions_2.EventLength_4.;LEN=4;LRB=0.49432;LRBP=1404.9;MQ=87.17;MQ0Fraction=0.0013;MQM=98.079;MQRankSum=6.021;NF;NR;NS=1039;PP;PV4=0.13,1.5e-07,1,0.051;RA=4052;RL=36;RPP=69.069;RR=2;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.847;SAB=0.5;SAF=19;SAP=3.0103;SAR=19;SC=AGAAGTAAGTAGTTTGTTTTT;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.53776;SRF=2179;SRP=53.19;SRR=1873;TC;TR=9;TU=AAGT;VQSLOD=7.3578;set=Intersection;sumGLbyD=14.03
+20     31963212        .       AAAAAAAAAAAAG   A       727.15  PASS    AC=5;AF=0.0080;AN=622;BaseQRankSum=4.037;DP=1480;FS=0.000;HRun=0;HaplotypeScore=43.3793;InbreedingCoeff=0.0350;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_10orMore.;MQ=51.77;MQ0=59;MQ0Fraction=0.0399;MQRankSum=-1.799;QD=22.72;ReadPosRankSum=3.591;SB=-364.04;VQSLOD=5.3166;set=VQSR
+20     31997272        .       CT      C,CTT,CTTT      1837.10 PASS    AA=63;AB=0.77559;ABA=57;ABP=170.57;ABR=197;AC=79,49,30;AF=0.06594,0.04090,0.02504;AN=1198;BL=2372;BR=2640;BVAR;BaseQRankSum=3.277;DP=9050;Dels=0.03;EL=24;EPP=10.766;ER=39;FR;FS=0.303;HETAR=45;HOMA=1;HOMR=981;HP=10;HPLen=10;HR=10;HRun=10;HU=T;INS;InbreedingCoeff=0.2796;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;LEN=1;LRB=0.053472;LRBP=34.128;MQ0Fraction=0.0000;MQM=50.889;MQRankSum=0.610;NF;NR;NS=1027;PP;RA=3776;RL=30;RPP=3.3205;RR=33;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.800;SAB=0.39683;SAF=25;SAP=8.8354;SAR=38;SC=ACCCAACTTCCTTTTTTTTTT;SET_WGVQSR;SRB=0.46213;SRF=1745;SRP=50.049;SRR=2031;TC;TR=10;TU=T;VQSLOD=4.1189;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.66
+20     33446974        rs113250263     TAA     T,TA,TAAA       17130.16        PASS    AC=65,417,184;AF=0.05941,0.38117,0.16819;AN=1094;BVAR;BaseQRankSum=3.400;DB;DEL;DP=22362;DP4=221,247,418,524;Dels=0.33;FR;FS=15.409;HP=15;HR=14;HRun=14;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.5215;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ=61.32;MQ0Fraction=0.0021;MQRankSum=0.481;NF;NR;PP;PV4=0.33,1,1,1;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.056;SC=CTCCGTCTCATAAAAAAAAAA;SET_WGVQSR;TC;TR=14;TU=A;VQSLOD=8.0974;dbSNP=132;set=Intersection;sumGLbyD=12.78
+20     33877149        .       C       CT      1784.40 PASS    AA=58;AB=0.73096;ABA=53;ABP=94.289;ABR=144;AC=65;AF=0.05682;AN=1144;BL=3298;BR=1935;BVAR;BaseQRankSum=-2.066;DP=8074;Dels=0.02;EL=22;EPP=10.348;ER=36;FR;FS=11.452;HETAR=47;HOMA=3;HOMR=754;HP=16;HR=12;HRun=12;HU=T;INS;InbreedingCoeff=0.1178;IndelType=INS.NumRepetitions_10orMore.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;LEN=1;LRB=0.26046;LRBP=773.91;MQ0Fraction=0.0165;MQM=52.259;MQRankSum=0.734;NF;NR;NS=804;PP;RA=2141;RL=43;RPP=32.363;RR=15;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.273;SAB=0.46552;SAF=27;SAP=3.6093;SAR=31;SC=ATTTTCTTTTCTTTTTTTTTT;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.37553;SRF=804;SRP=291.14;SRR=1337;TC;TR=12;TU=T;VQSLOD=3.1540;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=2.84
+20     34387589        rs112431805     CT      C,CTT   4039.10 PASS    AA=121;AB=0.75368;ABA=117;ABP=268.53;ABR=358;AC=84,139;AF=0.07047,0.11661;AN=1192;BL=5557;BR=3901;BVAR;BaseQRankSum=2.693;DB;DP=10157;Dels=0.03;EL=47;EPP=16.093;ER=74;FR;FS=7.639;HETAR=89;HOMA=2;HOMR=913;HP=13;HR=11;HRun=11;HU=T;INS;InbreedingCoeff=0.2097;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;LEN=1;LRB=0.17509;LRBP=632.63;MQ0Fraction=0.0000;MQM=49.802;MQRankSum=-0.801;NF;NR;NS=1004;PP;RA=3789;RL=77;RPP=22.554;RR=44;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.691;SAB=0.3719;SAF=45;SAP=20.256;SAR=76;SC=AAGAAGTGTTCTTTTTTTTTT;SET_WGVQSR;SRB=0.40987;SRF=1553;SRP=270.35;SRR=2236;TC;TR=11;TU=T;VQSLOD=4.0473;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=4.64
+20     34493409        rs73621682      C       CAG     62288.93        PASS    AA=1069;AB=0.54863;ABA=826;ABP=40.606;ABR=1004;AC=257;AF=0.3640;AN=706;BL=41524;BR=47039;BVAR;BaseQRankSum=-24.248;DB;DP=30195;DP4=1743,1636,614,487;Dels=0.00;EL=582;EPP=21.343;ER=487;FQ=999;FR;FS=5.080;HETAR=298;HOMA=63;HOMR=712;HP=1;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.1437;IndelType=INS.NumRepetitions_2.EventLength_2.RepeatExpansion_AG.;LEN=2;LRB=0.062272;LRBP=748.76;MQ=77.99;MQ0=3;MQ0Fraction=0.0015;MQM=54.446;MQRankSum=0.160;NF;NR;NS=1073;PP;PV4=0.016,1,0.01,1;RA=4461;RL=526;RPP=3.5973;RR=543;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.716;SAB=0.57343;SAF=613;SAP=53.08;SAR=456;SC=AGGAAGAGATCAGAGCTCCCC;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.52634;SRF=2348;SRP=29.892;SRR=2113;TC;TR=4;TU=AG;VQSLOD=8.7047;dbSNP=130;set=Intersection;sumGLbyD=49.82
+20     35957317        .       CTGACT  C,CGACT 4370.96 PASS    ABR=81;AC=22,1;AF=0.0321,0.0015;AF1=0.04523;AN=686;BVAR;BaseQRankSum=7.969;CI95=0.0354,0.05752;DEL;DP=16632;DP4=1942,1815,17,21;Dels=0.03;FQ=999;FR;FS=0.531;HOMA=1;HOMR=998;HP=2;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=0.0587;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ=83.38;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-7.201;NF;NR;NS=1020;PP;PV4=0.42,0.00017,4.5e-12,1;RA=4620;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.007;SC=CCTCTCAGCTCTGACTGAGTC;SET_WGVQSR;SRB=0.50043;SRF=2312;SRP=3.0178;SRR=2308;TC;TR=8;TU=ACTG;VQSLOD=9.9778;dbSNP=130;set=Intersection;sumGLbyD=36.45
+20     36136198        .       GTGTC   G       2078.76 PASS    AA=35;AB=0.54167;ABA=33;ABP=4.096;ABR=39;AC=17;AF=0.01384;AN=1228;BL=1212;BR=1523;BVAR;BaseQRankSum=6.900;DEL;DP=22483;DP4=1696,2291,9,16;Dels=0.01;EL=9;EPP=20.94;ER=26;FQ=999;FR;FS=3.023;HETAR=13;HOMA=1;HOMR=1061;HP=1;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=0.1113;IndelType=DEL.NumRepetitions_2.EventLength_4.;LEN=4;LRB=0.11371;LRBP=79.803;MQ=93.98;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0003;MQM=83.686;MQRankSum=-1.683;NF;NR;NS=1075;PP;PV4=0.55,1,0.0083,1;RA=5771;RL=19;RPP=3.5687;RR=16;RUN=1;ReadPosRankSum=0.618;SAB=0.37143;SAF=13;SAP=8.0357;SAR=22;SC=TATCATTTTAGTGTCTGTCTG;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.44966;SRF=2595;SRP=130.03;SRR=3176;TC;TR=11;TU=CTGT;VQSLOD=10.1935;set=Intersection;sumGLbyD=31.66
+20     36250522        .       CA      C       37933   PASS    AA=51;AB=0.95582;ABA=44;ABP=1800.5;ABR=952;AC=23;AF=0.01885;AN=1220;BL=691;BR=3464;BVAR;BaseQRankSum=-2.418;DEL;DP=11998;Dels=0.00;EL=18;EPP=12.59;ER=33;FS=2.307;HETAR=348;HOMA=534;HOMR=164;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0763;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;LEN=1;LRB=0.66739;LRBP=4021.7;MQ0=2;MQ0Fraction=0.0006;MQM=53.647;MQRankSum=1.083;NS=1047;RA=1663;RL=2;RPP=97.065;RR=49;RUN=1;ReadPosRankSum=-12.726;SAB=0.68627;SAF=35;SAP=18.381;SAR=16;SRB=0.59651;SRF=992;SRP=137.56;SRR=671;VQSLOD=4.1346;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.29
+20     36285033        rs34715186      AT      A       39417   PASS    AA=530;AB=0.5406;ABA=447;ABP=16.939;ABR=526;AC=88;AF=0.0950;AN=926;BL=20722;BR=20406;BVAR;BaseQRankSum=15.611;DB;DEL;DP=36713;DP4=2551,2475,236,218;Dels=0.09;EL=241;EPP=12.45;ER=289;FQ=999;FR;FS=1.290;HETAR=141;HOMA=16;HOMR=926;HP=2;HPLen=3;HR=3;HRun=1;HU=A;INDEL;InbreedingCoeff=0.0742;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;LEN=1;LRB=0.0076833;LRBP=8.2825;MQ=104.81;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=84.285;MQRankSum=-0.702;NF;NR;NS=1083;PP;PV4=0.62,1,1,1;RA=6562;RL=263;RPP=3.0759;RR=267;RUN=1;ReadPosRankSum=0.090;SAB=0.55849;SAF=296;SAP=18.76;SAR=234;SC=AAAAACACAAATCAGATCGTG;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.51707;SRF=3393;SRP=19.614;SRR=3169;TC;TR=3;TU=A;VQSLOD=10.5533;dbSNP=126;set=Intersection;sumGLbyD=14.15
+20     36384872        .       CTG     C       43532.41        PASS    AC=1213;AF=0.99589;AN=1218;BaseQRankSum=0.802;DP=3208;FS=9.727;HRun=0;HaplotypeScore=46.6153;InbreedingCoeff=0.1085;IndelType=DEL.NumRepetitions_7.EventLength_2.RepeatExpansion_TG.;MQ=58.37;MQ0=50;MQ0Fraction=0.0156;MQRankSum=-1.672;QD=13.57;ReadPosRankSum=2.063;SB=-18894.12;VQSLOD=4.7353;set=VQSR
+20     36542802        .       GTA     G       31310.15        PASS    AA=1481;AB=0.67546;ABA=1378;ABP=1138.4;ABR=2868;AC=437;AF=0.35938;AN=1216;BL=25719;BR=95500;BVAR;BaseQRankSum=9.478;DEL;DP=18068;DS;Dels=0.10;EL=889;EPP=132.34;ER=592;FS=320.726;HETAR=591;HOMA=44;HOMR=378;HRun=0;InbreedingCoeff=-0.4197;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_2.RepeatExpansion_TA.;LEN=2;LRB=0.57566;LRBP=87231;MQ0Fraction=0.0091;MQM=29.319;MQRankSum=-3.409;NS=1013;RA=4037;RL=3;RPP=3193;RR=1478;RUN=1;ReadPosRankSum=-6.687;SAB=0.40041;SAF=593;SAP=130.61;SAR=888;SRB=0.39014;SRF=1575;SRP=426.21;SRR=2462;VQSLOD=-1.6586;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=5.49
+20     36985025        .       CCA     C       4.57    PASS    AC=0;AF=0.0000;AN=682;BaseQRankSum=4.199;DP=1504;FS=1.036;HRun=0;HaplotypeScore=18.5241;InbreedingCoeff=0.0460;IndelType=DEL.NumRepetitions_6.EventLength_2.RepeatExpansion_CA.;MQ=57.04;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-1.774;ReadPosRankSum=-2.105;VQSLOD=6.7455;set=VQSR
+20     37139725        .       CAG     C       250.77  PASS    AF=0.0084;AF1=0.0139;BaseQRankSum=4.131;CI95=0.00885,0.01991;DP=7973;DP4=1808,1990,2,7;Dels=0.01;FQ=104;FR;FS=11.160;HP=3;HPLen=2;HR=1;HRun=0;HU=A;INDEL;InbreedingCoeff=-0.0001;IndelType=DEL.NumRepetitions_3.EventLength_2.RepeatExpansion_AG.;MQ=103.71;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-3.378;NF;NR;PP;PV4=0.18,0.0011,0.041,1;ReadPosRankSum=0.605;SC=AGATGGGGAACAGAGAGCAAG;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;TC;TR=6;TU=AG;VQSLOD=7.0630;set=Intersection;sumGLbyD=12.13
+20     37213224        .       G       GTA     3230.05 PASS    AA=32;AB=0.50769;ABA=32;ABP=3.0437;ABR=33;AC=12;AF=0.0168;AF1=0.02635;AN=714;BL=1271;BR=1743;BVAR;BaseQRankSum=-7.288;CI95=0.02212,0.03319;DP=14304;DP4=2180,2256,13,21;Dels=0.00;EL=20;EPP=7.3532;ER=12;FQ=999;FR;FS=7.863;HETAR=9;HOMA=0;HOMR=1043;HP=1;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=T;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0410;IndelType=INS.NumRepetitions_1.EventLength_2.RepeatExpansion_TA.;LEN=2;LRB=0.1566;LRBP=163.52;MQ=95.56;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0005;MQM=51.562;MQRankSum=0.420;NF;NR;NS=1052;PP;PV4=0.23,1,0.03,0.33;RA=5138;RL=11;RPP=9.7962;RR=21;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.122;SAB=0.28125;SAF=9;SAP=16.311;SAR=23;SC=TTTGCATCCAGTAGCACCACT;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.42293;SRF=2173;SRP=268.11;SRR=2965;TC;TR=1;TU=T;VQSLOD=9.7315;set=Intersection;sumGLbyD=36.69
+20     37282014        .       ATGG    A       2518.52 PASS    AF=0.03519;BaseQRankSum=11.994;DP=24592;DP4=415,3804,8,49;DS;Dels=0.01;FQ=999;FR;FS=2.049;HP=1;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=0.1028;IndelType=DEL.NumRepetitions_5.EventLength_3.;MQ=51.01;MQ0Fraction=0.0139;MQRankSum=-5.912;NF;NR;PP;PV4=0.27,1,0.22,0.015;ReadPosRankSum=1.781;SC=GGTGGTGATGATGGTGGTGGT;TC;TR=17;TU=GGT;VQSLOD=2.1183;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=9.05
+20     37532218        .       GTCCGTCCA       ATCCGTCCA,G     76120.88        PASS    AC=998;AF=0.92924;AN=1074;BaseQRankSum=-2.877;DP=3087;FR;FS=9.889;HP=2;HPLen=2;HR=1;HRun=0;HU=T;HaplotypeScore=71.6244;InbreedingCoeff=-0.0027;IndelType=MIXED;MQ=52.68;MQ0=543;MQ0Fraction=0.1759;MQRankSum=-1.750;NF;NR;PP;QD=24.98;ReadPosRankSum=-0.850;SB=-36635.43;SC=CCGTCCGTCCGTCCGTCCATC;TC;TR=19;TU=CCGT;VQSLOD=5.3068;set=Intersection
+20     37712193        .       AAG     A       2670.33 PASS    AA=106;AB=0.62821;ABA=87;ABP=36.418;ABR=147;AC=53;AF=0.0759;AN=698;BL=4672;BR=4303;BVAR;BaseQRankSum=13.696;DEL;DP=15155;DP4=1340,1852,32,52;Dels=0.06;EL=57;EPP=4.3214;ER=49;FR;FS=0.824;HETAR=43;HOMA=7;HOMR=982;HP=1;HPLen=2;HR=2;HRun=0;HU=A;INDEL;InbreedingCoeff=0.0861;IndelType=DEL.NumRepetitions_3.EventLength_2.RepeatExpansion_AG.;LEN=2;LRB=0.041114;LRBP=35.954;MQ=86.12;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=54.236;MQRankSum=-5.745;NF;NR;NS=1034;PP;PV4=0.5,7.3e-26,1.1e-10,1;RA=4423;RL=58;RPP=5.0589;RR=48;RUN=1;ReadPosRankSum=2.617;SAB=0.38679;SAF=41;SAP=14.81;SAR=65;SC=GAAAATTCTGAAGAGAGTCAG;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.43093;SRF=1906;SRP=186.29;SRR=2517;TC;TR=6;TU=AG;VQSLOD=9.8131;set=Intersection;sumGLbyD=14.20
+20     37739002        .       T       TCA     1395.38 PASS    AA=16;AB=0.48387;ABA=16;ABP=3.0803;ABR=15;AC=11;AF=0.00950;AN=1158;BL=504;BR=630;BVAR;BaseQRankSum=-3.257;DP=13617;DP4=1660,883,7,5;Dels=0.00;EL=7;EPP=3.5532;ER=9;FR;FS=1.114;HETAR=9;HOMA=0;HOMR=991;HP=1;HPLen=2;HR=2;HRun=0;HU=T;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0527;IndelType=INS.NumRepetitions_1.EventLength_2.RepeatExpansion_CA.;LEN=2;LRB=0.11111;LRBP=33.411;MQ=88.41;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=83.75;MQRankSum=1.713;NF;NR;NS=1000;PP;PV4=0.76,1,1,0.5;RA=3257;RL=6;RPP=5.1818;RR=10;RUN=1;ReadPosRankSum=1.190;SAB=0.6875;SAF=11;SAP=7.8961;SAR=5;SC=CCTTTTTTGTTCATTTCTGCA;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.68806;SRF=2241;SRP=1003.5;SRR=1016;TC;TR=2;TU=T;VQSLOD=10.2220;set=Intersection;sumGLbyD=41.32
+20     38395256        .       TTGAG   T       633.19  PASS    AF=0.0028;BaseQRankSum=5.667;DP=3839;Dels=0.00;FR;FS=10.238;HP=2;HPLen=3;HR=3;HRun=0;HU=T;InbreedingCoeff=-0.0097;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_4.;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-1.276;NF;NR;PP;ReadPosRankSum=-1.016;SC=ATGTGTTTGTTTGAGTATGTT;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;TC;TR=10;TU=GTTT;VQSLOD=6.4906;set=Intersection;sumGLbyD=10.83
+20     39345038        .       CTGAACCATAATGTG C,CCCATAATGTG   60744.52        PASS    AA=23;AB=0.67143;ABA=23;ABP=20.878;ABR=47;AC=232,2;AF=0.19366,0.00167;AN=1198;BL=1607;BR=1843;BVAR;BaseQRankSum=30.955;DEL;DP=31490;DP4=1729,2100,265,278;Dels=0.13;EL=6;EPP=14.434;ER=17;FQ=999;FR;FS=1.767;HETAR=18;HOMA=0;HOMR=1015;HP=1;HPLen=2;HR=2;HRun=0;HU=C;INDEL;InbreedingCoeff=0.1991;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;LEN=14;LRB=0.068406;LRBP=38.066;MQ=104.60;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=189.83;MQRankSum=-16.579;NF;NR;NS=1033;PP;PV4=0.12,1,5.5e-137,1;RA=5286;RL=14;RPP=5.3706;RR=9;RUN=1;ReadPosRankSum=4.323;SAB=0.56522;SAF=13;SAP=3.86;SAR=10;SC=TGGGCTGGACCTGAACCATAA;SET_WGVQSR;SRB=0.46311;SRF=2448;SRP=65.493;SRR=2838;TC;TR=2;TU=C;VQSLOD=6.2643;dbSNP=130;set=Intersection;sumGLbyD=65.43
+20     39418008        .       AG      A       46796   PASS    AA=113;AB=0.9511;ABA=80;ABP=2894.6;ABR=1556;AC=30;AF=0.02412;AN=1244;BL=638;BR=6936;BVAR;BaseQRankSum=7.280;DEL;DP=14307;Dels=0.00;EL=50;EPP=6.2579;ER=63;FR;FS=5.707;HETAR=473;HOMA=361;HOMR=246;HP=3;HR=3;HRun=3;HU=G;InbreedingCoeff=0.0272;IndelType=DEL.NumRepetitions_3.EventLength_1.RepeatExpansion_G.;LEN=1;LRB=0.83153;LRBP=11375;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=62.398;MQRankSum=3.530;NF;NR;NS=1089;PP;RA=3000;RL=3;RPP=223.02;RR=110;RUN=1;ReadPosRankSum=-18.601;SAB=0.58407;SAF=66;SAP=9.9475;SAR=47;SC=ACTGGGGGAAAGGGATTCTAG;SRB=0.494;SRF=1482;SRP=3.9484;SRR=1518;TC;TR=3;TU=G;VQSLOD=4.5834;set=Intersection;sumGLbyD=3.06
+20     39876961        .       GT      G,GTT,GTTT      2302.10 PASS    ABR=496;AC=45,51,45;AF=0.03664,0.04153,0.03664;AN=1228;BVAR;BaseQRankSum=4.462;DP=37649;DP4=1457,1975,57,59;Dels=0.02;FR;FS=9.938;HOMA=0;HOMR=978;HP=10;HPLen=10;HR=10;HRun=10;HU=T;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.2583;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ=97.28;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=0.246;NF;NR;NS=1063;PP;PV4=0.15,1,1.9e-09,0.016;RA=5185;RUN=1;ReadPosRankSum=-4.954;SC=AGTTTCTCCGGTTTTTTTTTT;SET_WGVQSR;SRB=0.47464;SRF=2461;SRP=31.978;SRR=2724;TC;TR=10;TU=T;VQSLOD=4.9752;set=Intersection;sumGLbyD=4.39
+20     41013333        .       TC      T       20681   PASS    AA=137;AB=0.89211;ABA=134;ABP=1661.6;ABR=1108;AC=68;AF=0.05601;AN=1214;BL=1091;BR=8981;BVAR;BaseQRankSum=1.354;DEL;DP=12998;Dels=0.01;EL=57;EPP=11.395;ER=80;FS=0.758;HETAR=359;HOMA=100;HOMR=610;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0104;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_C.;LEN=1;LRB=0.78336;LRBP=13424;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0003;MQM=67.745;MQRankSum=2.563;NS=1072;RA=4447;RL=5;RPP=258.66;RR=132;RUN=1;ReadPosRankSum=-14.092;SAB=0.59124;SAF=81;SAP=12.917;SAR=56;SRB=0.54194;SRF=2410;SRP=70.947;SRR=2037;VQSLOD=3.7531;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=4.14
+20     41659532        .       GC      G       40544   PASS    AA=42;AB=0.97149;ABA=39;ABP=2644.5;ABR=1329;AC=15;AF=0.0209;AN=716;BL=2531;BR=135;BVAR;BaseQRankSum=-2.537;DEL;DP=12219;Dels=0.00;EL=25;EPP=6.3192;ER=17;FS=2.656;HETAR=374;HOMA=155;HOMR=551;HRun=1;InbreedingCoeff=-0.0270;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_C.;LEN=1;LRB=0.89872;LRBP=4678.9;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=103.31;MQRankSum=2.828;NS=1088;RA=4736;RL=41;RPP=85.733;RR=1;RUN=1;ReadPosRankSum=-9.702;SAB=0.57143;SAF=24;SAP=4.8716;SAR=18;SRB=0.5625;SRF=2664;SRP=163.7;SRR=2072;VQSLOD=4.3267;set=Intersection;sumGLbyD=3.22
+20     41845580        .       GA      G       49310   PASS    AA=83;AB=0.95258;ABA=69;ABP=2591.6;ABR=1386;AC=46;AF=0.03740;AN=1230;BL=1320;BR=5150;BVAR;BaseQRankSum=-1.121;DEL;DP=13336;Dels=0.00;EL=36;EPP=6.1759;ER=47;FR;FS=0.372;HETAR=442;HOMA=341;HOMR=295;HP=2;HR=3;HRun=1;HU=G;InbreedingCoeff=0.0238;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;LEN=1;LRB=0.59196;LRBP=4926.2;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=89.048;MQRankSum=0.897;NF;NR;NS=1080;PP;RA=3006;RL=5;RPP=142.43;RR=78;RUN=1;ReadPosRankSum=-15.412;SAB=0.55422;SAF=46;SAP=5.1294;SAR=37;SC=CCAGCTGTGGGAGAGAAACAT;SRB=0.47971;SRF=1442;SRP=13.762;SRR=1564;TC;TR=6;TU=AG;VQSLOD=4.4669;set=Intersection;sumGLbyD=3.65
+20     42209428        .       GC      G       13163   PASS    AA=89;AB=0.86677;ABA=83;ABP=730.96;ABR=540;AC=39;AF=0.03218;AN=1212;BL=950;BR=5334;BVAR;BaseQRankSum=-10.119;DEL;DP=10692;Dels=0.01;EL=48;EPP=4.2058;ER=41;FS=0.000;HETAR=259;HOMA=727;HOMR=54;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0448;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_C.;LEN=1;LRB=0.69764;LRBP=6644.4;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=126.55;MQRankSum=4.223;NS=1040;RA=723;RL=12;RPP=106.09;RR=77;RUN=1;ReadPosRankSum=-17.362;SAB=0.39326;SAF=35;SAP=11.818;SAR=54;SRB=0.37898;SRF=274;SRP=94.99;SRR=449;VQSLOD=3.7157;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.48
+20     42281109        .       T       TAG     2321.12 PASS    AC=181;AF=0.3740;AN=484;BaseQRankSum=8.977;DP=435;FS=17.001;HRun=0;HaplotypeScore=14.6734;InbreedingCoeff=0.2340;IndelType=INS.NOVEL_2.;MQ=53.88;MQ0=47;MQ0Fraction=0.1080;MQRankSum=0.762;QD=12.41;ReadPosRankSum=3.399;SB=-1299.73;SET_INTEGRATION;VQSLOD=4.8926;set=VQSR
+20     42436117        .       TC      T       38933   PASS    AA=18;AB=0.98435;ABA=17;ABP=2215.9;ABR=1069;AC=15;AF=0.01223;AN=1226;BL=498;BR=428;BVAR;BaseQRankSum=-7.224;DEL;DP=12436;Dels=0.00;EL=1;EPP=33.893;ER=17;FS=2.469;HETAR=303;HOMA=614;HOMR=123;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0439;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_C.;LEN=1;LRB=0.075594;LRBP=14.501;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=98.611;MQRankSum=1.086;NS=1075;RA=1656;RL=10;RPP=3.4928;RR=8;RUN=1;ReadPosRankSum=-17.765;SAB=0.5;SAF=9;SAP=3.0103;SAR=9;SRB=0.49879;SRF=826;SRP=3.0313;SRR=830;VQSLOD=4.0821;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.04
+20     42682214        .       C       A,CAT   3904.51 PASS    AA=24;AB=0.6383;ABA=17;ABP=10.818;ABR=30;AC=0;AF=0.0000;AN=636;BL=1119;BR=949;BVAR;BaseQRankSum=1.426;DP=6509;Dels=0.00;EL=9;EPP=6.2675;ER=15;FR;HETAR=12;HOMA=3;HOMR=876;HP=2;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=A;INS;InbreedingCoeff=0.0006;IndelType=MIXED;LEN=2;LRB=0.082205;LRBP=33.356;MQ0Fraction=0.0046;MQM=40.792;MQRankSum=-0.296;NF;NR;NS=891;PP;QD=32.81;RA=2679;RL=15;RPP=6.2675;RR=9;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.806;SAB=0.75;SAF=18;SAP=16.039;SAR=6;SB=-924.23;SC=TATACACACACATATATATAC;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.66293;SRF=1776;SRP=620.76;SRR=903;TC;TR=9;TU=AC;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=32.75
+20     42973456        .       CA      C,CAA,CAAA      2675    PASS    AA=90;AB=0.79177;ABA=86;ABP=308.39;ABR=327;AC=77,61,39;AF=0.06492,0.05143,0.03288;AN=1186;BL=2983;BR=4446;BVAR;BaseQRankSum=2.422;DP=9416;Dels=0.03;EL=39;EPP=6.4847;ER=51;FR;FS=31.555;HETAR=75;HOMA=1;HOMR=888;HP=11;HR=11;HRun=11;HU=A;INS;InbreedingCoeff=0.2696;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;LEN=1;LRB=0.19693;LRBP=628.63;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=55.567;MQRankSum=1.777;NF;NR;NS=964;PP;RA=3601;RL=37;RPP=9.1869;RR=53;RUN=1;ReadPosRankSum=-4.991;SAB=0.55556;SAF=50;SAP=5.423;SAR=40;SC=TAGTGACTGTCAAAAAAAAAA;SET_WGVQSR;SRB=0.60622;SRF=2183;SRP=355.91;SRR=1418;TC;TR=11;TU=A;VQSLOD=1.0763;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=4.05
+20     43091870        .       TC      T       2455.60 PASS    AA=120;AB=0.10619;ABA=101;ABP=155.22;ABR=12;AC=42;AF=0.03825;AN=1098;BL=573;BR=8744;BVAR;BaseQRankSum=-13.513;DEL;DP=9139;Dels=0.00;EL=64;EPP=4.1684;ER=56;FS=9.856;HETAR=118;HOMA=820;HOMR=0;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0833;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_C.;LEN=1;LRB=0.877;LRBP=15564;MQ0Fraction=0.0017;MQM=45.1;MQRankSum=2.266;NS=938;RA=24;RL=1;RPP=254.97;RR=119;RUN=1;ReadPosRankSum=-15.803;SAB=0.475;SAF=57;SAP=3.6617;SAR=63;SRB=0.54167;SRF=13;SRP=3.3722;SRR=11;VQSLOD=3.9930;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.09
+20     43233648        rs74585029      GA      G,GAA   1504.40 PASS    AA=113;AB=0.78652;ABA=95;ABP=320.31;ABR=350;AC=41,65;AF=0.03394,0.05381;AF1=0.0115;AN=1208;BL=4677;BR=5548;BVAR;BaseQRankSum=6.744;CI95=0.004274,0.01852;DB;DEL;DP=13996;DP4=1736,1549,15,17;Dels=0.03;EL=69;EPP=15.021;ER=44;FQ=14;FR;FS=12.174;HETAR=119;HOMA=15;HOMR=892;HP=11;HPLen=10;HR=10;HRun=10;HU=A;INDEL;InbreedingCoeff=0.2359;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;LEN=1;LRB=0.085183;LRBP=164.12;MQ=89.12;MQ0Fraction=0.0000;MQM=69.867;MQRankSum=2.513;NF;NR;NS=1027;PP;PV4=0.59,1,0.065,0.33;RA=3845;RL=46;RPP=11.485;RR=67;RUN=1;ReadPosRankSum=-4.957;SAB=0.33628;SAF=38;SAP=29.318;SAR=75;SC=AAAACAGCCAGAAAAAAAAAA;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.43667;SRF=1679;SRP=136.95;SRR=2166;TC;TR=10;TU=A;VQSLOD=4.5121;set=Intersection;sumGLbyD=8.22
+20     43246548        .       AC      A,CC    41579.13        PASS    AA=382;AB=0.72402;ABA=316;ABP=502.11;ABR=829;AC=1197;AF=0.99254;AN=1206;BL=9889;BR=14293;BVAR;BaseQRankSum=1.373;DEL;DP=10477;DS;Dels=0.05;EL=243;EPP=64.494;ER=139;FS=29.162;HETAR=291;HOMA=85;HOMR=624;HPLen=10;InbreedingCoeff=0.1392;IndelType=MIXED;LEN=1;LRB=0.18212;LRBP=1744.6;MQ0Fraction=0.0024;MQM=48.471;MQRankSum=5.726;NS=1001;RA=3138;RL=174;RPP=9.5816;RR=208;RUN=1;ReadPosRankSum=5.755;SAB=0.79843;SAF=305;SAP=298.51;SAR=77;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.70363;SRF=2208;SRP=1133.2;SRR=930;VQSLOD=5.6318;set=Intersection;sumGLbyD=5.22
+20     43258646        .       T       TT      1107.17 PASS    AC=97;AF=0.08420;AN=1152;BaseQRankSum=4.525;DP=2345;FS=19.308;HRun=9;HaplotypeScore=13.6276;InbreedingCoeff=0.1299;IndelType=INS.NumRepetitions_10orMore.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;MQ=76.70;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=1.395;QD=2.67;ReadPosRankSum=-4.696;SB=-899.41;VQSLOD=5.4523;set=VQSR
+20     43718299        .       ATTACT  A       5497.06 PASS    AA=56;AB=0.51818;ABA=53;ABP=3.3262;ABR=57;AC=18;AF=0.0251;AF1=0.03729;AN=718;BL=2321;BR=2591;BVAR;BaseQRankSum=11.142;CI95=0.03319,0.04425;DEL;DP=17576;DP4=2460,2692,31,22;Dels=0.02;EL=28;EPP=3.0103;ER=28;FQ=999;FR;FS=9.689;HETAR=15;HOMA=1;HOMR=1068;HP=2;HPLen=2;HR=2;HRun=0;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=0.0448;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_5.;LEN=5;LRB=0.054967;LRBP=35.238;MQ=96.55;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=50.286;MQRankSum=-5.149;NF;NR;NS=1084;PP;PV4=0.13,1,1.2e-12,1;RA=6745;RL=28;RPP=3.0103;RR=28;RUN=1;ReadPosRankSum=0.828;SAB=0.5;SAF=28;SAP=3.0103;SAR=28;SC=ATGACAGTGGATTACTTTAGT;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.46835;SRF=3159;SRP=61.709;SRR=3586;TC;TR=2;TU=T;VQSLOD=7.8832;set=Intersection;sumGLbyD=46.60
+20     43981749        .       A       AAAAAAC,AC      20899.71        PASS    ABR=192;AC=91,0;AF=0.1285,0.0000;AN=708;BVAR;BaseQRankSum=7.858;DP=23372;DP4=1554,1457,55,42;Dels=0.00;FR;FS=0.000;HOMA=4;HOMR=995;HP=6;HPLen=7;HR=7;HRun=0;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.2109;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ=95.59;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-12.081;NF;NR;NS=1051;PP;PV4=0.35,1,8.9e-73,1;RA=5027;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.359;SC=TACACTAGCAAAAAAACAAAA;SET_WGVQSR;SRB=0.48518;SRF=2439;SRP=12.6;SRR=2588;TC;TR=7;TU=A;VQSLOD=8.0916;set=Intersection;sumGLbyD=54.33
+20     43999274        .       TCAAA   T       2948.85 PASS    AA=59;AB=0.59441;ABA=58;ABP=14.08;ABR=85;AC=20;AF=0.0290;AF1=0.04249;AN=690;BL=2277;BR=2436;BVAR;BaseQRankSum=9.320;CI95=0.0354,0.05088;DEL;DP=14599;DP4=2052,2303,21,22;Dels=0.03;EL=32;EPP=3.9304;ER=27;FQ=999;FR;FS=0.000;HETAR=21;HOMA=0;HOMR=1043;HP=2;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=C;INDEL;InbreedingCoeff=-0.0037;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_4.;LEN=4;LRB=0.033736;LRBP=14.658;MQ=90.05;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=75.339;MQRankSum=-1.294;NF;NR;NS=1064;PP;PV4=0.88,1,0.0026,1;RA=5732;RL=27;RPP=3.9304;RR=32;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.915;SAB=0.47458;SAF=28;SAP=3.3415;SAR=31;SC=GGTACACAGCTCAAACAGTCT;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.4836;SRF=2772;SRP=16.4;SRR=2960;TC;TR=1;TU=C;VQSLOD=9.8086;set=Intersection;sumGLbyD=27.09
+20     44098622        .       C       CG      1092.40 PASS    AA=129;AB=0.77301;ABA=74;ABP=214.06;ABR=252;AC=45;AF=0.0455;AN=988;BL=6586;BR=3029;BVAR;BaseQRankSum=2.802;DP=5177;Dels=0.00;EL=122;EPP=225.63;ER=7;FR;FS=355.273;HETAR=66;HOMA=11;HOMR=734;HP=6;HR=4;HRun=4;HU=G;INS;InbreedingCoeff=0.1759;IndelType=INS.NumRepetitions_4.EventLength_1.RepeatExpansion_G.;LEN=1;LRB=0.36994;LRBP=2860.4;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=52.395;MQRankSum=1.946;NF;NR;NS=811;PP;RA=1981;RL=121;RPP=217.95;RR=8;RUN=1;ReadPosRankSum=-6.413;SAB=0.99225;SAF=128;SAP=274.51;SAR=1;SC=GCGGAAGTGGCGGGGACCCTT;SRB=0.41242;SRF=817;SRP=135;SRR=1164;TC;TR=4;TU=G;VQSLOD=-2.2690;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=4.04
+20     44327637        .       A       AG,AGGGGGG      14351.23        PASS    AC=9,211;AF=0.0103,0.2409;AN=876;BaseQRankSum=15.517;DP=1704;FS=6.768;HaplotypeScore=31.5906;InbreedingCoeff=0.1538;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ=54.64;MQ0=4;MQ0Fraction=0.0023;MQRankSum=-12.691;QD=20.83;ReadPosRankSum=-3.583;SB=-6278.99;VQSLOD=5.1556;set=VQSR
+20     45202636        .       GA      G       13269   PASS    AA=25;AB=0.96162;ABA=18;ABP=871.09;ABR=451;AC=24;AF=0.02013;AN=1192;BL=567;BR=1728;BVAR;BaseQRankSum=-5.361;DEL;DP=10873;Dels=0.00;EL=10;EPP=5.1818;ER=15;FS=0.928;HETAR=169;HOMA=831;HOMR=45;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0999;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;LEN=1;LRB=0.50588;LRBP=1278.4;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=170.56;MQRankSum=0.161;NS=1049;RA=632;RL=2;RPP=41.315;RR=23;RUN=1;ReadPosRankSum=-14.760;SAB=0.68;SAF=17;SAP=10.046;SAR=8;SRB=0.51424;SRF=325;SRP=4.1235;SRR=307;VQSLOD=3.9290;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.90
+20     45417828        .       TGAGC   T,TGC   4672.90 PASS    ABR=317;AC=69,104;AF=0.05712,0.08609;BVAR;BaseQRankSum=18.527;DEL;DP=11835;DS;FS=184.873;HOMA=48;HOMR=575;HaplotypeScore=65.5875;InbreedingCoeff=0.0599;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ=29.78;MQ0=2988;MQ0Fraction=0.3629;MQRankSum=5.052;NS=713;QD=1.11;RA=1581;RUN=1;ReadPosRankSum=6.574;SB=-2116.87;SRB=0.47502;SRF=751;SRP=11.582;SRR=830;VQSLOD=0.0651;set=filterInVQSR-2of5
+20     45525657        rs66759083      TA      AA,T    49315   PASS    AA=2361;AB=0.45241;ABA=1398;ABP=53.235;ABR=1155;AC=20;AF=0.01701;AN=1176;BL=94913;BR=100886;BVAR;BaseQRankSum=0.740;DB;DEL;DP=30636;DP4=1258,881,1206,999;Dels=0.48;EL=1133;EPP=11.311;ER=1228;FQ=999;FR;FS=7.072;HETAR=503;HOMA=310;HOMR=218;HP=6;HPLen=7;HR=7;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=0.2271;IndelType=MIXED;LEN=1;LRB=0.030506;LRBP=398.68;MQ=102.24;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=75.359;MQRankSum=0.148;NF;NR;NS=1031;PP;PV4=0.0064,0,4.6e-23,0.47;RA=2042;RL=1183;RPP=3.0333;RR=1178;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.999;SAB=0.52139;SAF=1231;SAP=12.392;SAR=1130;SC=AGGATTTTTTTAAAAAGTTTT;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.55093;SRF=1125;SRP=49.017;SRR=917;TC;TR=7;TU=T;VQSLOD=7.1651;dbSNP=114;set=Intersection;sumGLbyD=18.51
+20     45783456        .       T       TG      2355.68 PASS    AA=64;AB=0.78521;ABA=61;ABP=203.67;ABR=223;AC=15;AF=0.0165;AN=910;BL=815;BR=5486;BVAR;BaseQRankSum=8.593;DP=10348;Dels=0.00;EL=48;EPP=37.754;ER=16;FS=77.861;HETAR=56;HOMA=1;HOMR=970;HRun=1;INS;InbreedingCoeff=-0.0549;IndelType=INS.NOVEL_1.Novel_G.;LEN=1;LRB=0.74131;LRBP=7522.1;MQ0Fraction=0.0122;MQM=44.562;MQRankSum=-1.258;NS=1027;RA=4750;RL=0;RPP=141.98;RR=64;RUN=1;ReadPosRankSum=-7.047;SAB=0.25;SAF=16;SAP=37.754;SAR=48;SRB=0.6;SRF=2850;SRP=415.59;SRR=1900;VQSLOD=1.3146;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=6.03
+20     46517110        .       C       CT      868.55  PASS    AC=15;AF=0.0218;AN=688;BaseQRankSum=8.522;DP=1752;FS=6.570;HRun=0;HaplotypeScore=14.9548;InbreedingCoeff=0.0452;IndelType=INS.NOVEL_1.Novel_T.;MQ=77.73;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=3.874;QD=10.98;ReadPosRankSum=-0.733;SB=-396.78;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;VQSLOD=6.7740;set=VQSR
+20     46629361        .       TTTCTTTC        T,TTTTC 13000.91        PASS    AC=188,107;AF=0.2212,0.1259;AN=850;BaseQRankSum=7.214;DP=1846;FS=14.502;HaplotypeScore=40.8481;InbreedingCoeff=0.3210;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ=50.74;MQ0=79;MQ0Fraction=0.0428;MQRankSum=-6.348;QD=13.59;ReadPosRankSum=3.943;SB=-3581.20;VQSLOD=5.9412;set=VQSR
+20     46951099        .       G       GT      1662.30 PASS    AA=55;AB=0.7713;ABA=51;ABP=145.58;ABR=172;AC=47;AF=0.03923;AN=1198;BL=3288;BR=2434;BVAR;BaseQRankSum=-4.014;DP=27423;DP4=1483,1590,58,42;Dels=0.01;EL=21;EPP=9.6826;ER=34;FR;FS=9.565;HETAR=48;HOMA=0;HOMR=913;HP=16;HPLen=10;HR=10;HRun=10;HU=T;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0952;IndelType=INS.NumRepetitions_10orMore.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;LEN=1;LRB=0.14925;LRBP=279.78;MQ=70.36;MQ0Fraction=0.0124;MQM=52.545;MQRankSum=0.717;NF;NR;NS=961;PP;PV4=0.067,1,1,0.17;RA=3035;RL=38;RPP=20.422;RR=17;RUN=1;ReadPosRankSum=-3.014;SAB=0.47273;SAF=26;SAP=3.3656;SAR=29;SC=TTTGTTTTTTGTTTTTTTTTT;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.36013;SRF=1093;SRP=518.73;SRR=1942;TC;TR=10;TU=T;VQSLOD=5.4779;set=Intersection;sumGLbyD=3.49
+20     47201076        rs58052846      C       CT      982.16  PASS    AC=50;AF=0.0551;AN=908;BaseQRankSum=12.598;DB;DP=2449;FS=35.648;HRun=0;HaplotypeScore=29.4602;InbreedingCoeff=-0.0542;IndelType=INS.NOVEL_1.Novel_T.;MQ=63.54;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=2.196;QD=3.16;ReadPosRankSum=-13.833;SB=-488.19;VQSLOD=6.0429;set=VQSR
+20     47965974        rs60011158      G       GA      999     PASS    AA=21;AB=0.57143;ABA=21;ABP=5.1818;ABR=28;AC=7;AF=0.0101;AF1=0.02061;AN=690;BL=1043;BR=577;BVAR;BaseQRankSum=-3.087;CI95=0.01549,0.02655;DB;DP=14578;DP4=1554,3055,6,17;Dels=0.00;EL=11;EPP=3.1137;ER=10;FQ=999;FR;FS=5.982;HETAR=7;HOMA=0;HOMR=1041;HP=2;HPLen=1;HR=1;HRun=1;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0356;IndelType=INS.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;LEN=1;LRB=0.28765;LRBP=294.09;MQ=80.17;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=64.19;MQRankSum=2.137;NF;NR;NS=1048;PP;PV4=0.51,1,1,1;RA=5224;RL=16;RPP=15.522;RR=5;RUN=1;ReadPosRankSum=0.236;SAB=0.38095;SAF=8;SAP=5.5954;SAR=13;SC=TTCATGTACAGAGCTGCTGTG;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.31183;SRF=1629;SRP=1609.6;SRR=3595;TC;TR=4;TU=AG;VQSLOD=9.5466;dbSNP=129;set=Intersection;sumGLbyD=13.83
+20     48402974        rs57331436      GA      G       27741   PASS    AA=401;AB=0.5372;ABA=311;ABP=11.089;ABR=361;AC=84;AF=0.1186;AN=708;BL=16591;BR=14776;BVAR;BaseQRankSum=14.621;DB;DEL;DP=30607;DP4=1928,2310,195,225;Dels=0.11;EL=189;EPP=5.8749;ER=212;FQ=999;FR;FS=15.568;HETAR=110;HOMA=30;HOMR=923;HP=4;HPLen=3;HR=1;HRun=3;HU=A;INDEL;InbreedingCoeff=0.1263;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;KGPilot123;LEN=1;LRB=0.057863;LRBP=231.06;MQ=106.68;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=63.005;MQRankSum=-2.010;NF;NR;NS=1063;PP;PV4=0.72,1,0.001,1;RA=5258;RL=223;RPP=13.976;RR=178;RUN=1;ReadPosRankSum=1.337;SAB=0.37656;SAF=151;SAP=56.084;SAR=250;SC=TGCCCTCAAAGAGAAAAAGGA;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.38075;SRF=2002;SRP=652.44;SRR=3256;TC;TR=5;TU=AG;VQSLOD=8.7259;dbSNP=132;set=Intersection;sumGLbyD=15.86
+20     49101936        .       C       CT      404.46  PASS    AC=40;AF=0.03559;AN=1124;BaseQRankSum=0.750;DP=2162;FS=14.291;HRun=2;HaplotypeScore=30.9513;InbreedingCoeff=-0.0082;IndelType=INS.NumRepetitions_2.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;MQ=49.78;MQ0=113;MQ0Fraction=0.0523;MQRankSum=-1.289;QD=1.94;ReadPosRankSum=-2.041;SB=-385.48;VQSLOD=4.6365;set=VQSR
+20     49731218        .       ATTTTATTTTTTATT A,ATTTTATT      8398.93 PASS    AF=0.0656,0.0156;AF1=0.0996;BaseQRankSum=13.996;CI95=0.07743,0.1239;DP=6308;DP4=951,1311,23,35;Dels=0.05;FQ=999;FR;FS=12.503;HP=7;HPLen=4;HR=4;HRun=0;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=0.1892;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ=57.61;MQ0Fraction=0.0145;MQRankSum=-5.208;NF;NR;PP;PV4=0.79,1,6.3e-06,0.16;ReadPosRankSum=-2.239;SC=TATTTTATTTATTTTATTTTT;TC;TR=11;TU=ATTT;VQSLOD=4.3191;set=Intersection;sumGLbyD=42.27
+20     49894989        .       TA      T       172.25  PASS    AF=0.0140;BaseQRankSum=7.220;DP=3882;Dels=0.00;FS=17.217;HPLen=2;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0531;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;MQ0Fraction=0.0214;MQRankSum=-0.661;ReadPosRankSum=-0.592;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;VQSLOD=3.0905;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=6.60
+20     50010923        rs66516522      C       CT,CTGG 35851   PASS    ABR=555;AC=310,11;AF=0.26451,0.00939;BVAR;BaseQRankSum=10.662;DB;DP=8188;FR;FS=34.411;HOMA=261;HOMR=399;HP=5;HR=6;HU=C;HaplotypeScore=45.1715;INS;InbreedingCoeff=0.2090;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ=72.80;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=9.015;NF;NR;NS=831;PP;QD=9.69;RA=1986;RUN=1;ReadPosRankSum=-24.284;SB=-6038.55;SC=TGTCTGTCCCCCCTCAGCACT;SRB=0.45972;SRF=913;SRP=31.001;SRR=1073;TC;TR=6;TU=C;VQSLOD=6.1824;set=Intersection
+20     50228709        rs71192536      TG      T       20517   PASS    AA=924;AB=0.50203;ABA=735;ABP=3.0633;ABR=741;AC=200;AF=0.16502;AN=1212;BL=35460;BR=34197;BVAR;BaseQRankSum=13.810;DB;DEL;DP=32402;DP4=1760,2065,395,449;Dels=0.16;EL=439;EPP=7.9831;ER=485;FQ=999;FR;FS=0.558;HETAR=242;HOMA=63;HOMR=764;HP=5;HPLen=3;HR=3;HRun=3;HU=G;INDEL;InbreedingCoeff=0.1050;IndelType=DEL.NumRepetitions_3.EventLength_1.RepeatExpansion_G.;LEN=1;LRB=0.018132;LRBP=52.738;MQ=105.83;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=75.87;MQRankSum=3.895;NF;NR;NS=1069;PP;PV4=0.7,1.5e-173,1,1;RA=4708;RL=486;RPP=8.4249;RR=438;RUN=1;ReadPosRankSum=1.586;SAB=0.43615;SAF=403;SAP=35.733;SAR=521;SC=GTTTTCCAGGTGGGAAGACCG;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.44074;SRF=2075;SRP=146.62;SRR=2633;TC;TR=3;TU=G;VQSLOD=10.4820;dbSNP=120;set=Intersection;sumGLbyD=15.35
+20     50236115        .       AGG     A,ACGGG,AG,AGGG 7429.57 PASS    AC=192,13,221,183;AF=0.2115,0.0143,0.2434,0.2015;AN=908;BaseQRankSum=1.045;DP=1177;FS=13.479;HaplotypeScore=11.8294;InbreedingCoeff=0.7959;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ=52.98;MQ0=6;MQ0Fraction=0.0051;MQRankSum=-1.482;QD=7.28;ReadPosRankSum=-2.380;SB=-1229.31;SET_WGVQSR;VQSLOD=8.3762;set=VQSR
+20     51589568        .       TAAAC   AAAAC,T 12477.52        PASS    AF=0.27949;BaseQRankSum=-28.122;DP=3777;Dels=0.00;FR;FS=31.799;HP=7;HPLen=4;HR=3;HRun=0;HU=A;InbreedingCoeff=-0.1429;IndelType=MIXED;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-1.196;NF;NR;PP;ReadPosRankSum=-16.483;SC=AAATTCAAAATAAACAAACAA;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;TC;TR=18;TU=AAAC;VQSLOD=3.9201;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=52.43
+20     51617742        .       TGC     T,TGCGC 1374.91 PASS    AF=0.06000,0.02000;BaseQRankSum=12.051;DP=6231;Dels=0.00;FS=189.609;HPLen=1;HRun=0;InbreedingCoeff=0.0862;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ0Fraction=0.0180;MQRankSum=-2.959;ReadPosRankSum=-5.090;VQSLOD=-2.8715;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.97
+20     51770354        .       AG      A       1010.90 PASS    AA=26;AB=0.52727;ABA=26;ABP=3.3656;ABR=29;AC=7;AF=0.0097;AF1=0.01637;AN=718;BL=1034;BR=964;BVAR;BaseQRankSum=5.588;CI95=0.01327,0.02212;DEL;DP=16259;DP4=2785,2239,15,10;Dels=0.01;EL=11;EPP=4.3466;ER=15;FQ=999;FR;FS=3.367;HETAR=8;HOMA=0;HOMR=1064;HP=2;HPLen=2;HR=2;HRun=2;HU=G;INDEL;InbreedingCoeff=0.0557;IndelType=DEL.NumRepetitions_2.EventLength_1.RepeatExpansion_G.;LEN=1;LRB=0.035035;LRBP=8.3357;MQ=90.48;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=61.346;MQRankSum=-0.019;NF;NR;NS=1072;PP;PV4=0.69,2.1e-08,0.078,1;RA=6173;RL=13;RPP=3.0103;RR=13;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.460;SAB=0.61538;SAF=16;SAP=6.017;SAR=10;SC=GTGGTCCTGCAGGTCAATAAT;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.56342;SRF=3478;SRP=218.68;SRR=2695;TC;TR=2;TU=G;VQSLOD=10.1601;set=Intersection;sumGLbyD=14.60
+20     51848430        .       AT      A,ATT   999     PASS    AA=39;AB=0.83408;ABA=37;ABP=219.19;ABR=186;AC=14,33;AF=0.0153,0.0359;AF1=0.03062;AN=918;BL=1676;BR=1732;BVAR;BaseQRankSum=3.338;CI95=0.02212,0.03982;DP=14886;DP4=1970,1762,22,31;Dels=0.01;EL=18;EPP=3.5114;ER=21;FQ=999;FR;FS=3.004;HETAR=31;HOMA=0;HOMR=1040;HP=10;HPLen=9;HR=9;HRun=9;HU=T;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.1629;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;LEN=1;LRB=0.016432;LRBP=5.0085;MQ=80.05;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=56.667;MQRankSum=0.325;NF;NR;NS=1071;PP;PV4=0.13,1,0.0095,0.064;RA=5318;RL=21;RPP=3.5114;RR=18;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.493;SAB=0.46154;SAF=18;SAP=3.5114;SAR=21;SC=ACAAAACAATATTTTTTTTTC;SET_WGVQSR;SRB=0.4968;SRF=2642;SRP=3.4823;SRR=2676;TC;TR=9;TU=T;VQSLOD=5.7417;set=Intersection;sumGLbyD=7.57
+20     51897203        .       T       TG      8427.20 PASS    AA=237;AB=0.69846;ABA=215;ABP=246.92;ABR=498;AC=117;AF=0.1662;AN=704;BL=14961;BR=5990;BVAR;BaseQRankSum=22.203;DP=9710;Dels=0.00;EL=83;EPP=49.198;ER=154;FR;FS=9.450;HETAR=123;HOMA=9;HOMR=895;HP=5;HPLen=6;HR=6;HRun=0;HU=T;INS;InbreedingCoeff=-0.0513;IndelType=INS.NOVEL_1.Novel_G.;LEN=1;LRB=0.42819;LRBP=8344.3;MQ0Fraction=0.0291;MQM=45.861;MQRankSum=-10.426;NF;NR;NS=1027;PP;RA=4919;RL=210;RPP=309.85;RR=27;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.843;SAB=0.29536;SAF=70;SAP=89.219;SAR=167;SC=TTTGTTTGTTTTTTGTTGTTG;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.47794;SRF=2351;SRP=23.798;SRR=2568;TC;TR=23;TU=GTTT;VQSLOD=6.2670;set=Intersection;sumGLbyD=8.99
+20     52274070        .       AAG     A       1400.37 PASS    AA=30;AB=0.74227;ABA=25;ABP=52.462;ABR=72;AC=21;AF=0.01756;AN=1196;BL=412;BR=1966;BVAR;BaseQRankSum=6.660;DEL;DP=9362;Dels=0.01;EL=16;EPP=3.2998;ER=14;FS=1.485;HETAR=18;HOMA=2;HOMR=1004;HRun=0;InbreedingCoeff=0.0317;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_2.RepeatExpansion_AG.;LEN=2;LRB=0.65349;LRBP=2208.2;MQ0Fraction=0.0022;MQM=46.133;MQRankSum=-4.743;NS=1024;RA=3931;RL=2;RPP=51.941;RR=28;RUN=1;ReadPosRankSum=-4.152;SAB=0.4;SAF=12;SAP=5.6161;SAR=18;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.49784;SRF=1957;SRP=3.1699;SRR=1974;VQSLOD=5.6452;set=Intersection;sumGLbyD=11.11
+20     52351501        .       TAC     T       199.59  PASS    AC=22;AF=0.0238;AN=926;BaseQRankSum=7.874;DP=22911;DP4=2146,1691,26,22;FR;FS=2.898;HP=4;HPLen=3;HR=1;HRun=0;HU=A;HaplotypeScore=18.6111;INDEL;InbreedingCoeff=-0.0326;IndelType=DEL.NumRepetitions_6.EventLength_2.RepeatExpansion_AC.;MQ0=2;MQ0Fraction=0.0007;MQRankSum=1.011;NF;NR;PP;PV4=0.88,0.14,0.16,0.24;QD=1.10;ReadPosRankSum=-1.053;SB=-306.09;SC=GACACACAAATACACACACAC;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;TC;TR=13;TU=AC;VQSLOD=4.0486;set=filterInVQSR-2of5
+20     52447173        .       CA      C       503.89  PASS    AC=23;AF=0.01891;AN=1216;BaseQRankSum=0.801;DP=3266;FS=2.606;HRun=2;HaplotypeScore=22.1543;InbreedingCoeff=-0.0097;IndelType=DEL.NumRepetitions_2.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;MQ=118.02;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-1.309;QD=2.65;ReadPosRankSum=-7.872;SB=-279.27;VQSLOD=4.1900;set=VQSR
+20     52498650        .       GT      G       24069   PASS    AA=74;AB=0.90594;ABA=57;ABP=870.4;ABR=549;AC=28;AF=0.02333;AN=1200;BL=505;BR=4514;BVAR;BaseQRankSum=-3.837;DEL;DP=9798;Dels=0.01;EL=41;EPP=4.8883;ER=33;FS=4.085;HETAR=209;HOMA=663;HOMR=121;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0334;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;LEN=1;LRB=0.79876;LRBP=6956.6;MQ0=2;MQ0Fraction=0.0007;MQM=57.784;MQRankSum=-2.951;NS=995;RA=957;RL=8;RPP=101.72;RR=66;RUN=1;ReadPosRankSum=-14.806;SAB=0.39189;SAF=29;SAP=10.522;SAR=45;SRB=0.39916;SRF=382;SRP=87.53;SRR=575;VQSLOD=3.8710;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=2.90
+20     52823602        rs11469056      CAAA    C,CA,CAA,CAAAA,CAAAAA,CAAAAAA,CAAAAAAA,CAAAAAAAA,CAAAAAAAAA,CAAAAAAAAAA 14515.17        PASS    AC=24,83,246,109,83,19,10,16,22,59;AF=0.02128,0.07358,0.21809,0.09663,0.07358,0.01684,0.00887,0.01418,0.01950,0.05230;AN=1128;BVAR;BaseQRankSum=4.150;DB;DEL;DP=28279;FR;FS=2.021;HP=17;HR=17;HU=A;HaplotypeScore=27.8032;INS;InbreedingCoeff=0.7740;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ=69.00;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=1.418;NF;NR;PP;QD=7.90;RUN=1;ReadPosRankSum=-3.864;SB=-3244.40;SC=GGTCCTAAGGCAAAAAAAAAA;SET_WGVQSR;TC;TR=17;TU=A;VQSLOD=14.1033;set=Intersection
+20     53308906        .       CT      C,CTT   2276    PASS    AA=92;AB=0.84453;ABA=81;ABP=540.17;ABR=440;AC=53,81;AF=0.04351,0.06650;AN=1218;BL=3561;BR=4796;BVAR;BaseQRankSum=3.000;DP=11804;Dels=0.02;EL=48;EPP=3.3879;ER=44;FR;FS=13.197;HETAR=69;HOMA=3;HOMR=993;HP=11;HR=10;HRun=10;HU=T;INS;InbreedingCoeff=0.2297;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;LEN=1;LRB=0.14778;LRBP=399.32;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0003;MQM=56.348;MQRankSum=3.154;NF;NR;NS=1065;PP;RA=5520;RL=39;RPP=7.6365;RR=53;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.140;SAB=0.57609;SAF=53;SAP=7.6365;SAR=39;SC=AATCCAAAGTCTTTTTTTTTT;SET_WGVQSR;SRB=0.51576;SRF=2847;SRP=14.92;SRR=2673;TC;TR=10;TU=T;VQSLOD=2.4753;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=4.42
+20     53334602        .       T       TG,TGG  905.13  PASS    ABR=325;AC=44,22;AF=0.03624,0.01812;BVAR;BaseQRankSum=-4.608;DP=15015;FR;FS=494.901;HOMA=0;HOMR=1004;HP=1;HR=1;HU=G;HaplotypeScore=20.5023;INS;InbreedingCoeff=0.0799;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ=116.70;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=8.022;NF;NR;NS=1064;PP;QD=0.35;RA=5690;RUN=1;ReadPosRankSum=-14.522;SB=-311.57;SC=AGCCATTGGCTGTTTCACTGA;SRB=0.40738;SRF=2318;SRP=426.97;SRR=3372;TC;TR=1;TU=G;VQSLOD=-2.3042;set=filterInVQSR-2of5
+20     53729115        .       T       TG      15.48   PASS    AC=1;AF=0.0015;AN=668;BaseQRankSum=-1.001;DP=1711;FS=9.048;HRun=2;HaplotypeScore=12.4681;InbreedingCoeff=-0.0320;IndelType=INS.NumRepetitions_2.EventLength_1.RepeatExpansion_G.;MQ=131.36;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=0.193;QD=4.57;ReadPosRankSum=0.407;SB=-5.35;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;VQSLOD=4.8071;set=VQSR
+20     54033830        .       GTATTTTAAAATCA  G       2220.86 PASS    AF=0.0113;BaseQRankSum=5.506;DP=2577;Dels=0.01;FR;FS=6.533;HP=5;HPLen=4;HR=1;HRun=0;HU=T;InbreedingCoeff=0.0032;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_10orMore.;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-2.969;NF;NR;PP;ReadPosRankSum=1.322;SC=TCAATATTTTGTATTTTAAAA;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;TC;TR=1;TU=T;VQSLOD=5.5145;set=Intersection;sumGLbyD=95.65
+20     54375236        .       GT      G       626.13  PASS    AA=40;AB=0.63551;ABA=39;ABP=20.078;ABR=68;AC=18;AF=0.0256;AN=702;BL=1331;BR=1743;BVAR;BaseQRankSum=9.346;DEL;DP=8568;Dels=0.02;EL=26;EPP=10.828;ER=14;FS=0.610;HETAR=21;HOMA=1;HOMR=1035;HRun=1;InbreedingCoeff=-0.0056;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;LEN=1;LRB=0.13403;LRBP=122.92;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=67.125;MQRankSum=-2.537;NS=1058;RA=4870;RL=17;RPP=4.9646;RR=23;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.229;SAB=0.525;SAF=21;SAP=3.2274;SAR=19;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.5271;SRF=2567;SRP=34.087;SRR=2303;VQSLOD=7.9228;set=Intersection;sumGLbyD=10.77
+20     54457331        .       G       GA      1793.40 PASS    AA=77;AB=0.66667;ABA=74;ABP=56.573;ABR=148;AC=33;AF=0.02687;AN=1228;BL=3834;BR=1154;BVAR;BaseQRankSum=10.572;DP=10230;Dels=0.00;EL=77;EPP=170.21;ER=0;FS=139.433;HETAR=44;HOMA=1;HOMR=1001;HRun=1;INS;InbreedingCoeff=0.0023;IndelType=INS.NOVEL_1.Novel_A.;LEN=1;LRB=0.53729;LRBP=3129.8;MQ0Fraction=0.0095;MQM=4.7013;MQRankSum=-8.116;NS=1046;RA=4009;RL=77;RPP=170.21;RR=0;RUN=1;ReadPosRankSum=-6.026;SAB=1;SAF=77;SAP=170.21;SAR=0;SRB=0.57022;SRF=2286;SRP=174.7;SRR=1723;VQSLOD=1.1887;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=5.90
+20     54469810        .       CA      C       1697.62 PASS    AA=93;AB=0.63855;ABA=90;ABP=44.53;ABR=159;AC=34;AF=0.0374;AF1=0.01719;AN=908;BL=3242;BR=5839;BVAR;BaseQRankSum=10.425;CI95=0.009317,0.02795;DEL;DP=15197;DP4=2134,1896,56,46;Dels=0.03;EL=34;EPP=17.604;ER=59;FQ=16;FR;FS=9.985;HETAR=41;HOMA=1;HOMR=1011;HP=9;HPLen=8;HR=8;HRun=8;HU=A;INDEL;InbreedingCoeff=-0.0472;IndelType=DEL.NumRepetitions_8.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;LEN=1;LRB=0.28598;LRBP=1615.8;MQ=83.37;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0004;MQM=64.075;MQRankSum=3.036;NF;NR;NS=1053;PP;PV4=0.76,1,0.31,0.22;RA=5150;RL=28;RPP=34.975;RR=65;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.252;SAB=0.5914;SAF=55;SAP=9.7582;SAR=38;SC=ATTGCTAAGACAAAAAAAAGA;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.50621;SRF=2607;SRP=4.7374;SRR=2543;TC;TR=8;TU=A;VQSLOD=8.3677;set=Intersection;sumGLbyD=9.90
+20     54542453        .       GTATA   G,GTA   5109.66 PASS    ABR=112;AC=66,56;AF=0.0682,0.0579;AN=968;BVAR;BaseQRankSum=17.089;DB;DEL;DP=5519;DS;Dels=0.06;FS=99.502;HOMA=15;HOMR=409;HRun=0;InbreedingCoeff=0.1584;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ0Fraction=0.0178;MQRankSum=-6.854;NS=460;RA=864;RUN=1;ReadPosRankSum=0.855;SRB=0.79282;SRF=685;SRP=646.5;SRR=179;VQSLOD=0.6375;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=8.53
+20     54629773        .       CA      C       1799.50 PASS    AA=49;AB=0.82707;ABA=46;ABP=250.17;ABR=220;AC=9;AF=0.00746;AN=1206;BL=173;BR=2277;BVAR;BaseQRankSum=5.240;DEL;DP=8557;Dels=0.01;EL=49;EPP=109.41;ER=0;FS=32.359;HETAR=35;HOMA=1;HOMR=325;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0892;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;LEN=1;LRB=0.85878;LRBP=3926.6;MQ0Fraction=0.0602;MQM=32.163;MQRankSum=-3.926;NS=361;RA=1091;RL=0;RPP=109.41;RR=49;RUN=1;ReadPosRankSum=-4.512;SAB=0;SAF=0;SAP=109.41;SAR=49;SRB=0.49404;SRF=539;SRP=3.3467;SRR=552;VQSLOD=1.1233;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.54
+20     54710245        .       TA      T       999     PASS    AF=0.0084;AF1=0.0148;BaseQRankSum=3.954;CI95=0.00885,0.02212;DP=8043;DP4=2000,1849,10,7;Dels=0.01;FQ=999;FR;FS=0.000;HP=9;HPLen=6;HR=3;HRun=6;HU=A;INDEL;InbreedingCoeff=0.1181;IndelType=DEL.NumRepetitions_3.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;MQ=78.51;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=0.095;NF;NR;PP;PV4=0.63,0.00056,1,1;ReadPosRankSum=-0.448;SC=CAACAAAAAATAAATAAATAA;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;TC;TR=15;TU=AAAT;VQSLOD=7.8129;set=Intersection;sumGLbyD=19.02
+20     54968173        .       A       AAT,AATAT,AT,ATAT       89535.82        PASS    ABR=994;AC=561,278,2,3;AF=0.50179,0.24866,0.00179,0.00268;AN=1118;BVAR;BaseQRankSum=-2.699;DB;DP=27837;DP4=168,177,1045,866;Dels=0.00;FQ=999;FR;FS=12.472;HOMA=71;HOMR=455;HP=3;HPLen=4;HR=4;HRun=0;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.6391;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;KGPilot123;MQ=80.36;MQ0Fraction=0.0055;MQRankSum=-1.512;NF;NR;NS=913;PP;PV4=0.046,1,1,1;RA=2015;RUN=1;ReadPosRankSum=1.015;SC=GGCCACTTAAAATATATATAT;SET_WGVQSR;SRB=0.44864;SRF=904;SRP=49.187;SRR=1111;TC;TR=15;TU=AT;VQSLOD=9.0092;dbSNP=132;set=Intersection;sumGLbyD=42.33
+20     55176688        .       TA      T       421.84  PASS    AF=0.01322;AF1=0.01845;BaseQRankSum=5.383;CI95=0.01282,0.02564;DP=10531;DP4=1975,2017,16,14;Dels=0.01;FQ=91.2;FR;FS=7.401;HP=6;HPLen=5;HR=5;HRun=5;HU=A;INDEL;InbreedingCoeff=0.0829;IndelType=DEL.NumRepetitions_5.EventLength_1.RepeatExpansion_A.;MQ=75.80;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0003;MQRankSum=-0.471;NF;NR;PP;PV4=0.72,1,1,1;ReadPosRankSum=0.223;SC=CTGCAAAATATAAAAATTAGG;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;TC;TR=5;TU=A;VQSLOD=6.6000;set=Intersection;sumGLbyD=12.15
+20     55664086        .       GTT     ATT,G,GT,GTTT   5622.44 PASS    AC=6,71,136;AF=0.00498,0.05887,0.11277;AN=1206;BVAR;BaseQRankSum=3.173;DB;DEL;DP=40384;DP4=1567,1317,54,29;Dels=0.05;FR;FS=1.949;HP=14;HR=11;HRun=11;HU=T;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.3490;IndelType=MIXED;MQ=77.90;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=0.052;NF;NR;PP;PV4=0.057,1,0.2,1.2e-05;RUN=1;ReadPosRankSum=-13.646;SC=AATTTTATTTGTTTTTTTTTT;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;TC;TR=11;TU=T;VQSLOD=11.7964;set=Intersection;sumGLbyD=8.09
+20     56045006        .       TG      T       342.15  PASS    AC=72;AF=0.0940;AN=766;BaseQRankSum=4.992;DP=1238;FS=1.460;HRun=7;HaplotypeScore=20.2784;InbreedingCoeff=0.1795;IndelType=DEL.NumRepetitions_7.EventLength_1.RepeatExpansion_G.;MQ=66.42;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0008;MQRankSum=-0.937;QD=1.84;ReadPosRankSum=-4.385;SB=-320.83;VQSLOD=5.2383;set=VQSR
+20     56158711        .       AG      A       922.47  PASS    AA=18;AB=0.575;ABA=17;ABP=4.9646;ABR=23;AC=2;AF=0.0028;AN=714;BL=953;BR=808;BVAR;BaseQRankSum=3.129;DEL;DP=10462;Dels=0.01;EL=9;EPP=3.0103;ER=9;FR;FS=8.724;HETAR=4;HOMA=0;HOMR=1058;HP=1;HPLen=2;HR=2;HRun=1;HU=A;InbreedingCoeff=0.0262;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_G.;LEN=1;LRB=0.08234;LRBP=28.936;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=55.889;MQRankSum=2.052;NF;NR;NS=1062;PP;RA=6300;RL=9;RPP=3.0103;RR=9;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.317;SAB=0.66667;SAF=12;SAP=7.3532;SAR=6;SC=TGGCCTAGCAAGCATCGTGAC;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.48143;SRF=3033;SRP=21.883;SRR=3267;TC;TR=8;TU=AAGC;VQSLOD=8.3252;set=Intersection;sumGLbyD=13.22
+20     56258618        rs113670927     T       C,TGC,TGTGC,TGTGTGC     37834.99        PASS    ABR=441;AC=11,100,43;AF=0.0123,0.1119,0.0481;AN=894;BVAR;BaseQRankSum=19.514;DB;DP=23173;DP4=541,920,413,579;Dels=0.00;FQ=999;FR;FS=1.238;HOMA=28;HOMR=808;HP=2;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=G;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.2154;IndelType=MIXED;MQ=57.25;MQ0Fraction=0.0275;MQRankSum=-6.684;NF;NR;NS=976;PP;PV4=0.023,1,1,1;RA=3294;RUN=1;ReadPosRankSum=11.873;SC=TGCGTGTGTGTGTGTGTGTGT;SRB=0.42441;SRF=1398;SRP=166.5;SRR=1896;TC;TR=30;TU=GT;VQSLOD=6.7457;dbSNP=114;set=Intersection;sumGLbyD=21.27
+20     56395857        .       T       TAGGCAG 6614.22 PASS    AA=30;AB=0.63415;ABA=30;ABP=15.827;ABR=52;AC=14;AF=0.0197;AF1=0.03154;AN=710;BL=991;BR=1813;BVAR;BaseQRankSum=-4.589;CI95=0.02434,0.04204;DP=13879;DP4=1543,1833,12,14;Dels=0.00;EL=14;EPP=3.2998;ER=16;FQ=999;FR;FS=1.482;HETAR=11;HOMA=0;HOMR=1051;HP=1;HPLen=2;HR=2;HRun=0;HU=T;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0774;IndelType=INS.NumRepetitions_2.EventLength_6.;LEN=6;LRB=0.29315;LRBP=526.27;MQ=90.42;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=39.433;MQRankSum=-7.011;NF;NR;NS=1062;PP;PV4=1,1,3.7e-09,1;RA=5322;RL=9;RPP=13.433;RR=21;RUN=1;ReadPosRankSum=0.679;SAB=0.43333;SAF=13;SAP=4.1684;SAR=17;SC=AAGAGCATCTTAGGCAGAGGC;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.47294;SRF=2517;SRP=36.853;SRR=2805;TC;TR=2;TU=T;VQSLOD=8.3045;set=Intersection;sumGLbyD=68.22
+20     56969289        .       GTTTGT  G       600.69  PASS    AF=0.0056;AF1=0.007726;BaseQRankSum=2.907;CI95=0.004425,0.01327;DP=9643;DP4=1892,1749,6,3;Dels=0.00;FQ=117;FR;FS=16.601;HP=5;HPLen=3;HR=3;HRun=0;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=0.0236;IndelType=DEL.NumRepetitions_3.EventLength_5.;MQ=92.59;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-2.134;NF;NR;PP;PV4=0.51,1,0.07,0.3;ReadPosRankSum=0.236;SC=TAAGGACGTTGTTTGTTTTGT;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;TC;TR=10;TU=GTTT;VQSLOD=5.8458;set=Intersection;sumGLbyD=39.51
+20     57187557        .       AG      A,AGG   1486.69 PASS    AA=130;AB=0.55446;ABA=90;ABP=8.2132;ABR=112;AC=56,26;AF=0.0574,0.0266;AN=976;BL=3817;BR=5968;BVAR;BaseQRankSum=5.517;DEL;DP=14174;DP4=925,721,59,48;Dels=0.05;EL=52;EPP=14.302;ER=78;FR;FS=0.917;HETAR=44;HOMA=17;HOMR=864;HP=4;HPLen=4;HR=4;HRun=4;HU=G;INDEL;InbreedingCoeff=0.2856;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;LEN=1;LRB=0.21983;LRBP=1029.8;MQ=91.56;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=63.631;MQRankSum=1.900;NF;NR;NS=925;PP;PV4=0.84,1,1,0.39;RA=2746;RL=44;RPP=32.476;RR=86;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.639;SAB=0.44615;SAF=58;SAP=6.2842;SAR=72;SC=TCAGGCCCGCAGGGGTCAGGG;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.5772;SRF=1585;SRP=145.17;SRR=1161;TC;TR=4;TU=G;VQSLOD=7.7167;set=Intersection;sumGLbyD=14.85
+20     57282771        .       T       TG      506.43  PASS    AA=34;AB=0.70312;ABA=19;ABP=25.946;ABR=45;AC=34;AF=0.0373;AN=912;BL=886;BR=1938;BVAR;BaseQRankSum=3.744;DP=4276;Dels=0.00;EL=18;EPP=3.2658;ER=16;FR;FS=0.639;HETAR=17;HOMA=9;HOMR=737;HP=9;HR=8;HRun=8;HU=G;INS;InbreedingCoeff=0.2149;IndelType=INS.NumRepetitions_8.EventLength_1.RepeatExpansion_G.;LEN=1;LRB=0.37252;LRBP=853.99;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=49.706;MQRankSum=-0.051;NF;NR;NS=763;PP;RA=1822;RL=9;RPP=19.36;RR=25;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.111;SAB=0.55882;SAF=19;SAP=4.0322;SAR=15;SC=TCGGGGGGCGTGGGGGGGGTG;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.51098;SRF=931;SRP=4.9172;SRR=891;TC;TR=8;TU=G;VQSLOD=5.7772;set=Intersection;sumGLbyD=7.95
+20     57419740        rs11481507      A       AT      82613.57        PASS    AA=3850;AB=0.41404;ABA=1786;ABP=198.63;ABR=1262;AC=919;AF=0.75328;AN=1220;BL=140665;BR=151383;BVAR;BaseQRankSum=-27.490;DB;DP=31794;DP4=588,585,1571,1721;Dels=0.00;EL=1924;EPP=3.0126;ER=1926;FQ=999;FR;FS=2.191;HETAR=482;HOMA=454;HOMR=135;HP=3;HPLen=3;HR=3;HRun=3;HU=T;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0861;IndelType=INS.NumRepetitions_3.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;LEN=1;LRB=0.036699;LRBP=857.15;MQ=123.92;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=91.654;MQRankSum=3.016;NF;NR;NS=1071;PP;PV4=0.16,1,0.12,1;RA=1850;RL=1874;RPP=8.8784;RR=1976;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.685;SAB=0.47636;SAF=1834;SAP=21.693;SAR=2016;SC=TACACTAGTGATTTAACCCTA;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.49027;SRF=907;SRP=4.5315;SRR=943;TC;TR=3;TU=T;VQSLOD=9.2768;dbSNP=126;set=Intersection;sumGLbyD=22.78
+20     57558194        .       CT      C,CTT,CTTT      6470.30 PASS    ABR=451;AC=104,161,177;AF=0.08919,0.13808,0.15180;BVAR;BaseQRankSum=1.172;DP=7985;FR;FS=2.202;HOMA=19;HOMR=778;HP=22;HR=15;HU=T;HaplotypeScore=16.1921;INS;InbreedingCoeff=0.6440;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ=69.24;MQ0=27;MQ0Fraction=0.0109;MQRankSum=-0.003;NF;NR;NS=943;PP;QD=2.22;RA=2531;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.104;SB=-2096.85;SC=GCCTTTTTTTCTTTTTTTTTT;SET_WGVQSR;SRB=0.34848;SRF=882;SRP=507.73;SRR=1649;TC;TR=15;TU=T;VQSLOD=6.5151;set=Intersection
+20     57693627        .       AG      A       1991.90 PASS    AA=52;AB=0.49462;ABA=47;ABP=3.0336;ABR=46;AC=15;AF=0.01227;AN=1222;BL=1902;BR=1478;BVAR;BaseQRankSum=-6.121;DEL;DP=26459;DP4=2647,2873,16,20;Dels=0.01;EL=25;EPP=3.1773;ER=27;FR;FS=3.135;HETAR=15;HOMA=1;HOMR=1064;HP=2;HPLen=3;HR=3;HRun=2;HU=A;INDEL;InbreedingCoeff=0.0866;IndelType=DEL.NumRepetitions_2.EventLength_1.RepeatExpansion_G.;LEN=1;LRB=0.12544;LRBP=118.51;MQ=116.26;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=114.65;MQRankSum=1.942;NF;NR;NS=1080;PP;PV4=0.74,6.9e-08,1,0.38;RA=6781;RL=33;RPP=11.195;RR=19;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.795;SAB=0.5;SAF=26;SAP=3.0103;SAR=26;SC=ATTGGAGGAAAGGCTTTTTCA;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.46247;SRF=3136;SRP=85.976;SRR=3645;TC;TR=3;TU=A;VQSLOD=8.6672;set=Intersection;sumGLbyD=13.55
+20     57716287        .       A       AT      66.47   PASS    AC=6;AF=0.00506;AN=1186;BaseQRankSum=1.369;DP=2744;FS=3.834;HRun=8;HaplotypeScore=11.2046;InbreedingCoeff=0.1196;IndelType=INS.NumRepetitions_8.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;MQ=73.00;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-0.086;QD=2.14;ReadPosRankSum=-2.588;SB=-53.80;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;VQSLOD=4.2080;set=VQSR
+20     58121928        rs73625057      T       TGG     6649.17 PASS    AA=132;AB=0.57854;ABA=110;ABP=16.996;ABR=151;AC=57;AF=0.0617;AN=924;BL=4530;BR=4790;BVAR;BaseQRankSum=-13.456;DB;DP=30353;DP4=2107,2168,61,66;Dels=0.00;EL=67;EPP=3.0761;ER=65;FR;FS=0.708;HETAR=46;HOMA=8;HOMR=1023;HP=3;HPLen=2;HR=2;HRun=2;HU=G;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.1241;IndelType=INS.NumRepetitions_2.EventLength_1.RepeatExpansion_G.;LEN=2;LRB=0.027897;LRBP=18.76;MQ=109.61;MQ0=1;MQ0Fraction=0.0004;MQM=79.833;MQRankSum=-0.699;NF;NR;NS=1077;PP;PV4=0.79,1,0.49,0.036;RA=5754;RL=61;RPP=4.6554;RR=71;RUN=1;ReadPosRankSum=-3.309;SAB=0.45455;SAF=60;SAP=5.3792;SAR=72;SC=GATTAGAATGTGGATATCTTT;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.48836;SRF=2810;SRP=9.7866;SRR=2944;TC;TR=4;TU=GT;VQSLOD=8.5770;set=Intersection;sumGLbyD=27.19
+20     58468826        .       ACAAG   A       999     PASS    AF=0.0014;AF1=0.003429;BaseQRankSum=4.082;CI95=0.003106,0.006211;DP=8461;DP4=2500,1817,8,2;Dels=0.01;FQ=999;FR;FS=5.034;HP=2;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=C;INDEL;InbreedingCoeff=-0.0183;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_4.;MQ=120.69;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=0.141;NF;NR;PP;PV4=0.21,1,0.054,1;ReadPosRankSum=2.096;SC=ATCCTGAAACACAAGAAGAAA;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;TC;TR=5;TU=AC;VQSLOD=7.4928;set=Intersection;sumGLbyD=29.17
+20     58731262        .       TC      T       999     PASS    AA=21;AB=0.48649;ABA=19;ABP=3.069;ABR=18;AC=7;AF=0.0101;AF1=0.01493;AN=694;BL=939;BR=848;BVAR;BaseQRankSum=4.205;CI95=0.01106,0.02212;DEL;DP=12598;DP4=1766,1428,11,15;Dels=0.01;EL=13;EPP=5.5954;ER=8;FQ=999;FR;FS=1.796;HETAR=8;HOMA=1;HOMR=1031;HP=7;HPLen=8;HR=8;HRun=2;HU=T;INDEL;InbreedingCoeff=-0.0030;IndelType=DEL.NumRepetitions_2.EventLength_1.RepeatExpansion_C.;LEN=1;LRB=0.050923;LRBP=13.073;MQ=124.57;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=67.905;MQRankSum=1.103;NF;NR;NS=1040;PP;PV4=0.23,1,1,1;RA=4884;RL=10;RPP=3.1137;RR=11;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.091;SAB=0.47619;SAF=10;SAP=3.1137;SAR=11;SC=TCATTTTTTTTCCTTGAAACT;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.58006;SRF=2833;SRP=274.9;SRR=2051;TC;TR=8;TU=T;VQSLOD=10.8783;set=Intersection;sumGLbyD=15.11
+20     59181229        rs11476579      CTT     C,CT,CTTT,CTTTT 7787.17 PASS    AC=19,195,104,91;AF=0.01599,0.16414,0.08754,0.07660;AF1=0.2124;AN=1188;BVAR;BaseQRankSum=6.347;CI95=0.146,0.2743;DB;DEL;DP=26140;DP4=932,880,352,375;Dels=0.13;FQ=85.6;FR;FS=11.914;HP=14;HR=14;HRun=14;HU=T;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.4183;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ=86.88;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=1.469;NF;NR;PP;PV4=0.17,1,1,1;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.055;SC=GGTGAGAAAGCTTTTTTTTTT;SET_WGVQSR;TC;TR=14;TU=T;VQSLOD=7.4340;dbSNP=120;set=Intersection;sumGLbyD=7.02
+20     59213979        rs112141381     G       GC      9068    PASS    AA=131;AB=0.47115;ABA=110;ABP=4.5136;ABR=98;AF=0.0586;AN=700;BL=5395;BR=5816;BVAR;BaseQRankSum=15.453;DB;DP=23381;DP4=2191,2184,71,49;Dels=0.00;EL=66;EPP=3.0269;ER=65;FR;FS=7.907;HETAR=35;HOMA=5;HOMR=1019;HP=2;HPLen=3;HR=3;HRun=0;HU=G;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.0283;IndelType=INS.NOVEL_1.Novel_C.;LEN=1;LRB=0.037552;LRBP=37.34;MQ=72.13;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=54.496;MQRankSum=0.897;NF;NR;NS=1059;PP;PV4=0.052,1,0.066,1;RA=4976;RL=59;RPP=5.8117;RR=72;RUN=1;ReadPosRankSum=-0.811;SAB=0.58015;SAF=76;SAP=10.32;SAR=55;SC=GATGGACTGGGACAGTGACTC;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;SRB=0.49457;SRF=2461;SRP=4.2828;SRR=2515;TC;TR=3;TU=G;VQSLOD=9.3917;set=Intersection;sumGLbyD=28.58
+20     59252945        .       CT      C,CTT   557.18  PASS    AA=24;AB=0.84868;ABA=23;ABP=163.53;ABR=129;AC=21,29;AF=0.01759,0.02429;BL=1217;BR=1336;BVAR;BaseQRankSum=5.135;DP=9970;Dels=0.01;EL=13;EPP=3.3722;ER=11;FS=2.302;HETAR=21;HOMA=1;HOMR=1012;HRun=9;INS;InbreedingCoeff=0.1549;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;LEN=1;LRB=0.046612;LRBP=15.055;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=67.208;MQRankSum=0.086;NS=1034;RA=4421;RL=11;RPP=3.3722;RR=13;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.826;SAB=0.41667;SAF=10;SAP=4.4579;SAR=14;SET_WGVQSR;SRB=0.49649;SRF=2195;SRP=3.4823;SRR=2226;VQSLOD=2.8923;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=5.47
+20     60016966        .       CT      C       42650   PASS    AA=37;AB=0.97834;ABA=31;ABP=2847;ABR=1400;AC=15;AF=0.0163;AN=920;BL=2596;BR=778;BVAR;BaseQRankSum=-0.632;DEL;DP=10967;Dels=0.00;EL=14;EPP=7.7641;ER=23;FS=4.094;HETAR=421;HOMA=256;HOMR=385;HRun=1;InbreedingCoeff=-0.0051;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_T.;LEN=1;LRB=0.53883;LRBP=2130.2;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=120.3;MQRankSum=-0.911;NS=1072;RA=3413;RL=31;RPP=39.691;RR=6;RUN=1;ReadPosRankSum=-12.062;SAB=0.48649;SAF=18;SAP=3.069;SAR=19;SRB=0.47407;SRF=1618;SRP=22.943;SRR=1795;VQSLOD=3.3758;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=3.27
+20     60188651        .       AG      A       17624.52        PASS    AA=462;AB=0.76548;ABA=409;ABP=1070.7;ABR=1335;AC=403;AF=0.34444;AN=1170;BL=13877;BR=25909;BVAR;BaseQRankSum=6.180;DEL;DP=9900;Dels=0.08;EL=353;EPP=282.84;ER=109;FR;FS=2699.057;HETAR=346;HOMA=26;HOMR=633;HP=3;HR=4;HRun=1;HU=A;InbreedingCoeff=-0.2900;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_G.;LEN=1;LRB=0.30242;LRBP=7904.3;MQ0Fraction=0.0004;MQM=56.119;MQRankSum=1.644;NF;NR;NS=1005;PP;RA=3521;RL=112;RPP=269.25;RR=350;RUN=1;ReadPosRankSum=2.490;SAB=0.0064935;SAF=3;SAP=980.34;SAR=459;SC=AGGCTTCAAAAGAAAAAAAAA;SRB=0.55978;SRF=1971;SRP=112.32;SRR=1550;TC;TR=4;TU=A;VQSLOD=-34.0667;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=7.81
+20     60195570        .       GTACATACATACA   ATACATACATACA,G,GTACATACA       20140   PASS    ABR=102;AC=105,2;AF=0.08794,0.00168;AN=1194;BVAR;BaseQRankSum=-28.899;DB;DEL;DP=14347;Dels=0.02;FR;FS=52.125;HOMA=1;HOMR=1006;HP=1;HPLen=1;HR=1;HRun=0;HU=T;InbreedingCoeff=0.0695;IndelType=MIXED;MQ0Fraction=0.0007;MQRankSum=1.957;NF;NR;NS=1035;PP;RA=4759;RUN=1;ReadPosRankSum=-22.252;SAB=0.5;SAP=3.0103;SC=TGATAGATTCGTACATACATA;SET_INTEGRATION;SRB=0.47615;SRF=2266;SRP=26.522;SRR=2493;TC;TR=21;TU=ACAT;VQSLOD=2.7673;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=19.14
+20     60670601        rs72127450      AT      A,ATT   6401.59 PASS    AC=177,79;AF=0.16239,0.07248;AF1=0.1602;AN=1090;BVAR;BaseQRankSum=8.618;CI95=0.1106,0.2058;DB;DEL;DP=17508;DP4=1285,1094,313,259;Dels=0.10;FQ=94.1;FR;FS=0.000;HP=12;HR=12;HRun=12;HU=T;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.1076;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;LEN=1;MQ=64.73;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=0.620;NF;NR;PP;PV4=0.78,1,0.012,1;RUN=1;ReadPosRankSum=-1.294;SC=AGCCAGGCACATTTTTTTTTT;SET_WGVQSR;TC;TR=12;TU=T;VQSLOD=6.1650;dbSNP=130;set=Intersection;sumGLbyD=5.80
+20     60685780        .       TC      T       1123.58 PASS    AC=79;AF=0.07655;AN=1032;BaseQRankSum=14.949;DP=2084;FS=23.521;HRun=1;HaplotypeScore=19.7117;InbreedingCoeff=0.1356;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_C.;MQ=53.57;MQ0=61;MQ0Fraction=0.0293;MQRankSum=-7.958;QD=4.35;ReadPosRankSum=-13.757;SB=-791.28;VQSLOD=6.3549;set=VQSR
+20     60744906        rs113528167     CG      C       422.53  PASS    AC=48;AF=0.0732;AN=656;BaseQRankSum=17.669;DB;DP=1189;FS=0.356;HRun=1;HaplotypeScore=15.1808;InbreedingCoeff=0.2111;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_G.;MQ=82.83;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-10.455;QD=2.71;ReadPosRankSum=-16.887;SB=-326.46;VQSLOD=7.1707;set=VQSR
+20     60848742        .       CGT     C,CGTGT 999     PASS    AF=0.00980,0.01225;BaseQRankSum=5.597;DP=17065;DP4=1928,2188,17,13;Dels=0.01;FR;HP=1;HPLen=2;HR=2;HRun=0;HU=C;INDEL;InbreedingCoeff=0.2094;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;MQ=115.78;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=0.281;NF;NR;PP;PV4=0.36,0.4,0.12,0.12;ReadPosRankSum=-1.465;SB=-157.35;SC=TAGACGCTTCCGTGTGTGTGT;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;TC;TR=11;TU=GT;VQSLOD=1.7100;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=16.39
+20     61023668        rs57452309      G       GAGC    6896.67 PASS    AC=115;AF=0.1445;AN=796;BaseQRankSum=12.146;DB;DP=1423;FS=5.070;HRun=0;HaplotypeScore=29.8897;InbreedingCoeff=0.0740;IndelType=INS.NOVEL_3.;MQ=77.02;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-9.005;QD=19.16;ReadPosRankSum=-17.440;SB=-3045.82;VQSLOD=4.5788;set=VQSR
+20     61180519        .       C       CA,CT   1774.30 PASS    ABR=135;AC=27,15;AF=0.02538,0.01410;BVAR;BaseQRankSum=-2.189;DP=8393;FR;FS=27.692;HOMA=2;HOMR=825;HP=6;HPLen=3;HR=3;HU=T;HaplotypeScore=19.5313;INS;InbreedingCoeff=0.0868;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;LEN=1;MQ=56.11;MQ0=172;MQ0Fraction=0.0667;MQRankSum=2.605;NF;NR;NS=854;PP;QD=1.99;RA=2868;RUN=1;ReadPosRankSum=-7.324;SB=-385.54;SC=TTCTTTCTTTCTTTCTTTCTT;SRB=0.32741;SRF=939;SRP=745.08;SRR=1929;TC;TR=69;TU=CTTT;VQSLOD=3.4398;set=filterInVQSR-2of5
+20     61184281        .       AC      A       9798.10 PASS    AA=24;AB=0.96507;ABA=16;ABP=863.43;ABR=442;AC=4;AF=0.00341;AN=1174;BL=349;BR=1039;BVAR;BaseQRankSum=2.048;DEL;DP=10073;Dels=0.00;EL=11;EPP=3.3722;ER=13;FS=2.097;HETAR=141;HOMA=69;HOMR=829;HRun=1;InbreedingCoeff=0.0697;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_1.RepeatExpansion_C.;LEN=1;LRB=0.49712;LRBP=747.85;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQM=98.042;MQRankSum=1.881;NS=1042;RA=3625;RL=5;RPP=20.744;RR=19;RUN=1;ReadPosRankSum=-8.009;SAB=0.75;SAF=18;SAP=16.039;SAR=6;SRB=0.52662;SRF=1909;SRP=25.323;SRR=1716;VQSLOD=1.8117;set=filterInVQSR-2of5;sumGLbyD=5.55
+20     62074219        .       C       CTAT,CTGT       2328    PASS    ABR=99;AC=20,6;AF=0.01754,0.00526;BVAR;BaseQRankSum=11.221;DP=9498;DS;FS=4.510;HOMA=15;HOMR=645;HaplotypeScore=82.8868;INS;InbreedingCoeff=0.0880;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;LEN=3;MQ=29.88;MQ0=1378;MQ0Fraction=0.2286;MQRankSum=-5.309;NS=689;QD=0.77;RA=1679;RUN=1;ReadPosRankSum=-3.510;SAR=1;SB=-93.21;SRB=0.70697;SRF=1187;SRP=627.71;SRR=492;VQSLOD=1.8325;set=filterInVQSR-2of5
+20     62304449        .       CA      C,CAA   6680.17 PASS    AC=141,69;AF=0.12567,0.06150;AF1=0.08178;AN=1122;BVAR;BaseQRankSum=9.754;CI95=0.05088,0.1128;DEL;DP=15867;DP4=1252,1289,232,208;Dels=0.10;FQ=52.6;FR;FS=6.576;HP=11;HR=11;HRun=11;HU=A;INDEL;INS;InbreedingCoeff=0.1950;IndelType=MULTIALLELIC_INDEL;LEN=1;MQ=60.48;MQ0Fraction=0.0004;MQRankSum=-0.049;NF;NR;PP;PV4=0.2,1,1,1;RUN=1;ReadPosRankSum=-2.137;SC=GATTCTGTGTCAAAAAAAAAA;SET_WGVQSR;TC;TR=11;TU=A;VQSLOD=7.4714;set=Intersection;sumGLbyD=8.36
+20     62804895        rs57769591      CCTT    C       1148    PASS    AC=8;AF=0.0085;AF1=0.002839;AN=938;BaseQRankSum=4.952;CI95=0.002212,0.006637;DB;DP=8889;DP4=2574,1668,4,8;FQ=12.3;FS=2.289;HPLen=3;HRun=0;HaplotypeScore=29.4184;INDEL;InbreedingCoeff=-0.0270;IndelType=DEL.NumRepetitions_1.EventLength_3.;MQ0=876;MQ0Fraction=0.2674;MQRankSum=-0.641;PV4=0.074,1,1,1;QD=1.03;ReadPosRankSum=0.118;SB=-65.30;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;VQSLOD=6.4881;dbSNP=126;set=Intersection
+20     62907688        .       AAT     A       6629.57 PASS    AC=164;AF=0.13735;AN=1194;BaseQRankSum=27.368;DP=2746;FS=5.985;HRun=0;HaplotypeScore=14.7748;InbreedingCoeff=0.1433;IndelType=DEL.NumRepetitions_2.EventLength_2.RepeatExpansion_AT.;MQ=96.65;MQ0=0;MQ0Fraction=0.0000;MQRankSum=-3.318;QD=10.81;ReadPosRankSum=0.789;SB=-2662.16;SET_INTEGRATION;SET_WGVQSR;VQSLOD=6.1473;set=VQSR
diff --git a/tests/tabix_data/vcf/24.vcf b/tests/tabix_data/vcf/24.vcf
new file mode 100644 (file)
index 0000000..a62e424
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,724 @@
+##fileformat=VCFv4.1\r
+##INFO=<ID=Sample,Number=1,Type=String,Description="Sample picked for single sample pooled 454-PCR validation">\r
+##INFO=<ID=GT,Number=1,Type=String,Description="Genotype">\r
+##INFO=<ID=PCR_454_AR,Number=1,Type=Integer,Description="Number of alternative reads in 454-PCR sequencing data">\r
+##INFO=<ID=PCR_454_RR,Number=1,Type=Integer,Description="Number of reference reads in 454-PCR sequencing data">\r
+##reference=file:///humgen/1kg/reference/human_g1k_v37.fasta\r
+#CHROM  POS     ID      REF     ALT     QUAL    FILTER  INFO\r
+20     256726  .       T       A       .       .       Sample=HG00097;GT=0/1;PCR_454_AR=739;PCR_454_RR=885\r
+20     256726  .       T       A       .       .       Sample=HG00099;GT=0/1;PCR_454_AR=723;PCR_454_RR=714\r
+20     256726  .       T       A       .       .       Sample=HG00106;GT=0/1;PCR_454_AR=1092;PCR_454_RR=1102\r
+20     256726  .       T       A       .       .       Sample=HG00112;GT=0/1;PCR_454_AR=947;PCR_454_RR=1005\r
+20     256726  .       T       A       .       .       Sample=HG00104;GT=1/1;PCR_454_AR=1970;PCR_454_RR=52\r
+20     257977  .       G       C       .       .       Sample=NA19438;GT=0/1;PCR_454_AR=1312;PCR_454_RR=1123\r
+20     330407  .       C       G       .       .       Sample=HG00134;GT=0/1;PCR_454_AR=1034;PCR_454_RR=1037\r
+20     330407  .       C       G       .       .       Sample=HG00148;GT=0/1;PCR_454_AR=840;PCR_454_RR=820\r
+20     330407  .       C       G       .       .       Sample=HG00151;GT=0/1;PCR_454_AR=952;PCR_454_RR=982\r
+20     330407  .       C       G       .       .       Sample=HG00358;GT=0/1;PCR_454_AR=880;PCR_454_RR=957\r
+20     330407  .       C       G       .       .       Sample=HG01277;GT=0/1;PCR_454_AR=914;PCR_454_RR=984\r
+20     368826  .       G       A       .       .       Sample=NA20346;GT=0/1;PCR_454_AR=632;PCR_454_RR=591\r
+20     371957  .       G       A       .       .       Sample=HG00150;GT=0/1;PCR_454_AR=403;PCR_454_RR=424\r
+20     371957  .       G       A       .       .       Sample=NA12287;GT=0/1;PCR_454_AR=401;PCR_454_RR=435\r
+20     467031  .       T       A       .       .       Sample=NA20510;GT=0/0;PCR_454_AR=5;PCR_454_RR=1763\r
+20     741858  .       G       A       .       .       Sample=NA18634;GT=0/1;PCR_454_AR=1273;PCR_454_RR=1301\r
+20     947853  .       C       T       .       .       Sample=HG00578;GT=0/0;PCR_454_AR=0;PCR_454_RR=197\r
+20     947853  .       C       T       .       .       Sample=NA18861;GT=0/1;PCR_454_AR=40;PCR_454_RR=39\r
+20     947853  .       C       T       .       .       Sample=NA18868;GT=0/1;PCR_454_AR=88;PCR_454_RR=80\r
+20     947853  .       C       T       .       .       Sample=NA18870;GT=0/1;PCR_454_AR=66;PCR_454_RR=99\r
+20     947853  .       C       T       .       .       Sample=NA18917;GT=0/1;PCR_454_AR=96;PCR_454_RR=111\r
+20     947908  .       C       T       .       .       Sample=NA11993;GT=0/1;PCR_454_AR=598;PCR_454_RR=2114\r
+20     947908  .       C       T       .       .       Sample=NA18501;GT=0/1;PCR_454_AR=392;PCR_454_RR=1687\r
+20     947908  .       C       T       .       .       Sample=NA18504;GT=0/1;PCR_454_AR=635;PCR_454_RR=2218\r
+20     947908  .       C       T       .       .       Sample=NA18505;GT=0/1;PCR_454_AR=1312;PCR_454_RR=1429\r
+20     947908  .       C       T       .       .       Sample=NA18507;GT=0/1;PCR_454_AR=598;PCR_454_RR=2127\r
+20     948715  .       T       G       .       .       Sample=NA06989;GT=0/0;PCR_454_AR=4;PCR_454_RR=1252\r
+20     1144999 .       C       T       .       .       Sample=NA18510;GT=0/1;PCR_454_AR=450;PCR_454_RR=447\r
+20     1144999 .       C       T       .       .       Sample=NA19172;GT=0/1;PCR_454_AR=541;PCR_454_RR=531\r
+20     1285858 .       A       C       .       .       Sample=NA19311;GT=0/1;PCR_454_AR=1210;PCR_454_RR=1315\r
+20     1285932 .       G       A       .       .       Sample=HG00097;GT=0/1;PCR_454_AR=868;PCR_454_RR=867\r
+20     1285932 .       G       A       .       .       Sample=HG00106;GT=0/1;PCR_454_AR=745;PCR_454_RR=680\r
+20     1285932 .       G       A       .       .       Sample=HG00126;GT=0/1;PCR_454_AR=780;PCR_454_RR=838\r
+20     1285932 .       G       A       .       .       Sample=HG00134;GT=0/1;PCR_454_AR=978;PCR_454_RR=944\r
+20     1285932 .       G       A       .       .       Sample=HG00128;GT=1/1;PCR_454_AR=1499;PCR_454_RR=14\r
+20     1286090 .       A       G       .       .       Sample=HG00235;GT=0/1;PCR_454_AR=1223;PCR_454_RR=1352\r
+20     1286090 .       A       G       .       .       Sample=HG00351;GT=0/1;PCR_454_AR=799;PCR_454_RR=823\r
+20     1286090 .       A       G       .       .       Sample=HG01125;GT=0/1;PCR_454_AR=1167;PCR_454_RR=1149\r
+20     1286090 .       A       G       .       .       Sample=NA19773;GT=0/1;PCR_454_AR=1070;PCR_454_RR=1130\r
+20     1546804 .       G       A       .       .       Sample=HG00141;GT=0/1;PCR_454_AR=1174;PCR_454_RR=1231\r
+20     1546804 .       G       A       .       .       Sample=HG00149;GT=0/1;PCR_454_AR=1029;PCR_454_RR=1050\r
+20     1546804 .       G       A       .       .       Sample=HG00151;GT=0/1;PCR_454_AR=1135;PCR_454_RR=1034\r
+20     1546804 .       G       A       .       .       Sample=HG00177;GT=0/1;PCR_454_AR=1063;PCR_454_RR=1118\r
+20     1546804 .       G       A       .       .       Sample=HG00179;GT=0/1;PCR_454_AR=1118;PCR_454_RR=954\r
+20     1551579 .       T       G       .       .       Sample=NA20515;GT=0/0;PCR_454_AR=5;PCR_454_RR=1812\r
+20     1551579 .       T       G       .       .       Sample=NA19466;GT=0/1;PCR_454_AR=1011;PCR_454_RR=1042\r
+20     1559334 .       C       T       .       .       Sample=NA18941;GT=0/0;PCR_454_AR=1;PCR_454_RR=1193\r
+20     1615980 .       G       A       .       .       Sample=NA19914;GT=0/1;PCR_454_AR=441;PCR_454_RR=492\r
+20     1616047 .       C       G       .       .       Sample=NA07048;GT=0/1;PCR_454_AR=508;PCR_454_RR=813\r
+20     1629751 .       T       C       .       .       Sample=HG00156;GT=0/1;PCR_454_AR=285;PCR_454_RR=282\r
+20     1896011 .       C       T       .       .       Sample=NA18639;GT=0/0;PCR_454_AR=0;PCR_454_RR=29\r
+20     1896011 .       C       T       .       .       Sample=NA19314;GT=0/0;PCR_454_AR=0;PCR_454_RR=47\r
+20     2291684 .       T       C       .       .       Sample=NA19036;GT=0/1;PCR_454_AR=873;PCR_454_RR=1025\r
+20     2291684 .       T       C       .       .       Sample=NA19347;GT=0/1;PCR_454_AR=1116;PCR_454_RR=1217\r
+20     2375127 .       G       A       .       .       Sample=NA18615;GT=0/1;PCR_454_AR=1016;PCR_454_RR=1016\r
+20     2777844 .       T       C       .       .       Sample=NA20819;GT=0/1;PCR_454_AR=908;PCR_454_RR=970\r
+20     2844678 .       G       A       .       .       Sample=HG00360;GT=0/1;PCR_454_AR=1081;PCR_454_RR=1071\r
+20     2944927 .       A       T       .       .       Sample=NA12347;GT=0/1;PCR_454_AR=704;PCR_454_RR=752\r
+20     2969014 .       C       G       .       .       Sample=HG00151;GT=0/1;PCR_454_AR=684;PCR_454_RR=809\r
+20     2969014 .       C       G       .       .       Sample=NA18511;GT=0/1;PCR_454_AR=666;PCR_454_RR=704\r
+20     2969014 .       C       G       .       .       Sample=NA18523;GT=0/1;PCR_454_AR=767;PCR_454_RR=802\r
+20     2969014 .       C       G       .       .       Sample=NA18549;GT=0/1;PCR_454_AR=772;PCR_454_RR=838\r
+20     2969014 .       C       G       .       .       Sample=NA18858;GT=1/1;PCR_454_AR=1313;PCR_454_RR=8\r
+20     3026344 .       A       C       .       .       Sample=NA18640;GT=0/1;PCR_454_AR=1652;PCR_454_RR=1336\r
+20     3128885 .       G       A       .       .       Sample=NA19473;GT=0/1;PCR_454_AR=620;PCR_454_RR=669\r
+20     3128950 .       G       A       .       .       Sample=NA18624;GT=0/1;PCR_454_AR=570;PCR_454_RR=517\r
+20     3128950 .       G       A       .       .       Sample=NA18953;GT=0/1;PCR_454_AR=685;PCR_454_RR=700\r
+20     3128950 .       G       A       .       .       Sample=NA18998;GT=0/1;PCR_454_AR=606;PCR_454_RR=638\r
+20     3128950 .       G       A       .       .       Sample=NA19076;GT=0/1;PCR_454_AR=663;PCR_454_RR=643\r
+20     3128950 .       G       A       .       .       Sample=NA19088;GT=0/1;PCR_454_AR=492;PCR_454_RR=472\r
+20     3171356 .       T       C       .       .       Sample=NA12003;GT=0/0;PCR_454_AR=6;PCR_454_RR=1919\r
+20     3171356 .       T       C       .       .       Sample=NA12872;GT=0/0;PCR_454_AR=6;PCR_454_RR=2324\r
+20     3193990 .       G       T       .       .       Sample=NA12815;GT=0/0;PCR_454_AR=0;PCR_454_RR=1570\r
+20     3193990 .       G       T       .       .       Sample=NA18505;GT=0/0;PCR_454_AR=0;PCR_454_RR=1586\r
+20     3204083 .       G       A       .       .       Sample=HG00104;GT=0/1;PCR_454_AR=1059;PCR_454_RR=982\r
+20     3204083 .       G       A       .       .       Sample=HG00118;GT=0/1;PCR_454_AR=1190;PCR_454_RR=1178\r
+20     3204083 .       G       A       .       .       Sample=HG00122;GT=0/1;PCR_454_AR=1156;PCR_454_RR=1277\r
+20     3204083 .       G       A       .       .       Sample=HG00099;GT=1/1;PCR_454_AR=2171;PCR_454_RR=12\r
+20     3204083 .       G       A       .       .       Sample=HG00106;GT=1/1;PCR_454_AR=2027;PCR_454_RR=19\r
+20     3214580 .       C       T       .       .       Sample=HG00097;GT=0/1;PCR_454_AR=852;PCR_454_RR=784\r
+20     3214580 .       C       T       .       .       Sample=HG00099;GT=0/1;PCR_454_AR=628;PCR_454_RR=682\r
+20     3214580 .       C       T       .       .       Sample=HG00129;GT=0/1;PCR_454_AR=869;PCR_454_RR=844\r
+20     3214580 .       C       T       .       .       Sample=HG00130;GT=0/1;PCR_454_AR=651;PCR_454_RR=767\r
+20     3214580 .       C       T       .       .       Sample=HG00128;GT=1/1;PCR_454_AR=1378;PCR_454_RR=3\r
+20     3214802 .       T       C       .       .       Sample=NA18526;GT=0/1;PCR_454_AR=969;PCR_454_RR=1018\r
+20     3235915 .       T       C       .       .       Sample=HG00560;GT=0/1;PCR_454_AR=795;PCR_454_RR=798\r
+20     3235915 .       T       C       .       .       Sample=HG00566;GT=0/1;PCR_454_AR=688;PCR_454_RR=650\r
+20     3235915 .       T       C       .       .       Sample=HG00596;GT=0/1;PCR_454_AR=863;PCR_454_RR=935\r
+20     3235915 .       T       C       .       .       Sample=HG01124;GT=0/1;PCR_454_AR=802;PCR_454_RR=836\r
+20     3235915 .       T       C       .       .       Sample=NA18487;GT=0/1;PCR_454_AR=942;PCR_454_RR=968\r
+20     3274851 .       C       T       .       .       Sample=NA19704;GT=0/1;PCR_454_AR=486;PCR_454_RR=479\r
+20     3274851 .       C       T       .       .       Sample=NA20334;GT=0/1;PCR_454_AR=512;PCR_454_RR=512\r
+20     3274851 .       C       T       .       .       Sample=NA20336;GT=0/1;PCR_454_AR=510;PCR_454_RR=440\r
+20     3324372 .       G       C       .       .       Sample=NA19003;GT=0/1;PCR_454_AR=1902;PCR_454_RR=1898\r
+20     3362102 .       T       G       .       .       Sample=NA06994;GT=0/0;PCR_454_AR=0;PCR_454_RR=526\r
+20     3362102 .       T       G       .       .       Sample=NA12249;GT=0/0;PCR_454_AR=0;PCR_454_RR=465\r
+20     3515923 .       G       A       .       .       Sample=HG00122;GT=0/1;PCR_454_AR=237;PCR_454_RR=261\r
+20     3515923 .       G       A       .       .       Sample=HG00126;GT=0/1;PCR_454_AR=299;PCR_454_RR=293\r
+20     3515923 .       G       A       .       .       Sample=HG00130;GT=0/1;PCR_454_AR=307;PCR_454_RR=279\r
+20     3515923 .       G       A       .       .       Sample=HG00128;GT=1/1;PCR_454_AR=633;PCR_454_RR=4\r
+20     3515923 .       G       A       .       .       Sample=HG00129;GT=1/1;PCR_454_AR=580;PCR_454_RR=2\r
+20     3641233 .       G       T       .       .       Sample=NA20773;GT=0/0;PCR_454_AR=3;PCR_454_RR=1477\r
+20     3650204 .       G       A       .       .       Sample=HG00118;GT=0/1;PCR_454_AR=737;PCR_454_RR=771\r
+20     3650204 .       G       A       .       .       Sample=HG00126;GT=0/1;PCR_454_AR=518;PCR_454_RR=552\r
+20     3650204 .       G       A       .       .       Sample=HG00141;GT=0/1;PCR_454_AR=643;PCR_454_RR=668\r
+20     3650204 .       G       A       .       .       Sample=HG00143;GT=0/1;PCR_454_AR=549;PCR_454_RR=613\r
+20     3650204 .       G       A       .       .       Sample=HG00148;GT=0/1;PCR_454_AR=708;PCR_454_RR=830\r
+20     3652397 .       G       A       .       .       Sample=NA18635;GT=0/1;PCR_454_AR=1604;PCR_454_RR=1658\r
+20     3672827 .       A       T       .       .       Sample=HG00130;GT=0/0;PCR_454_AR=0;PCR_454_RR=941\r
+20     3672827 .       A       T       .       .       Sample=HG00349;GT=0/0;PCR_454_AR=2;PCR_454_RR=943\r
+20     3675119 .       G       T       .       .       Sample=NA20544;GT=0/1;PCR_454_AR=577;PCR_454_RR=657\r
+20     3687329 .       T       C       .       .       Sample=NA18532;GT=0/1;PCR_454_AR=702;PCR_454_RR=746\r
+20     3842125 .       C       G       .       .       Sample=NA12155;GT=0/1;PCR_454_AR=1193;PCR_454_RR=1178\r
+20     4680289 .       G       A       .       .       Sample=NA18856;GT=0/1;PCR_454_AR=1335;PCR_454_RR=1278\r
+20     4680289 .       G       A       .       .       Sample=NA19130;GT=0/1;PCR_454_AR=1273;PCR_454_RR=1286\r
+20     4680289 .       G       A       .       .       Sample=NA19213;GT=0/1;PCR_454_AR=1305;PCR_454_RR=1241\r
+20     4680289 .       G       A       .       .       Sample=NA19311;GT=0/1;PCR_454_AR=1332;PCR_454_RR=1400\r
+20     4680289 .       G       A       .       .       Sample=NA19332;GT=0/1;PCR_454_AR=1272;PCR_454_RR=1275\r
+20     4848511 .       G       A       .       .       Sample=NA19440;GT=0/0;PCR_454_AR=8;PCR_454_RR=2951\r
+20     4848511 .       G       A       .       .       Sample=NA19448;GT=0/1;PCR_454_AR=1278;PCR_454_RR=1434\r
+20     4848511 .       G       A       .       .       Sample=NA19461;GT=0/1;PCR_454_AR=1412;PCR_454_RR=1478\r
+20     5099300 .       A       G       .       .       Sample=NA19138;GT=0/1;PCR_454_AR=511;PCR_454_RR=496\r
+20     5903387 .       A       C       .       .       Sample=HG00566;GT=0/1;PCR_454_AR=1400;PCR_454_RR=1384\r
+20     5903387 .       A       C       .       .       Sample=HG01124;GT=0/1;PCR_454_AR=856;PCR_454_RR=1007\r
+20     5903387 .       A       C       .       .       Sample=HG01125;GT=0/1;PCR_454_AR=891;PCR_454_RR=816\r
+20     5903387 .       A       C       .       .       Sample=HG01149;GT=0/1;PCR_454_AR=1011;PCR_454_RR=959\r
+20     5903387 .       A       C       .       .       Sample=HG01278;GT=0/1;PCR_454_AR=1077;PCR_454_RR=1049\r
+20     5923222 .       C       T       .       .       Sample=HG00592;GT=0/1;PCR_454_AR=968;PCR_454_RR=950\r
+20     5923222 .       C       T       .       .       Sample=NA18567;GT=0/1;PCR_454_AR=678;PCR_454_RR=728\r
+20     5923222 .       C       T       .       .       Sample=NA18602;GT=0/1;PCR_454_AR=926;PCR_454_RR=988\r
+20     5923222 .       C       T       .       .       Sample=NA18624;GT=0/1;PCR_454_AR=991;PCR_454_RR=963\r
+20     5923222 .       C       T       .       .       Sample=NA18632;GT=0/1;PCR_454_AR=892;PCR_454_RR=906\r
+20     5943955 .       G       C       .       .       Sample=HG00565;GT=0/1;PCR_454_AR=259;PCR_454_RR=227\r
+20     5943955 .       G       C       .       .       Sample=HG00566;GT=0/1;PCR_454_AR=245;PCR_454_RR=235\r
+20     5943955 .       G       C       .       .       Sample=HG00577;GT=0/1;PCR_454_AR=264;PCR_454_RR=305\r
+20     5943955 .       G       C       .       .       Sample=HG00578;GT=0/1;PCR_454_AR=210;PCR_454_RR=261\r
+20     5943955 .       G       C       .       .       Sample=HG00593;GT=0/1;PCR_454_AR=261;PCR_454_RR=238\r
+20     6015109 .       G       A       .       .       Sample=NA20796;GT=0/1;PCR_454_AR=440;PCR_454_RR=500\r
+20     6060150 .       C       T       .       .       Sample=NA18961;GT=0/1;PCR_454_AR=384;PCR_454_RR=464\r
+20     7967973 .       G       A       .       .       Sample=NA19371;GT=0/1;PCR_454_AR=281;PCR_454_RR=506\r
+20     7967973 .       G       A       .       .       Sample=NA19390;GT=0/1;PCR_454_AR=410;PCR_454_RR=538\r
+20     8665657 .       G       A       .       .       Sample=NA19740;GT=0/1;PCR_454_AR=724;PCR_454_RR=703\r
+20     9453955 .       C       A       .       .       Sample=NA20314;GT=0/1;PCR_454_AR=1048;PCR_454_RR=1147\r
+20     9520132 .       G       A       .       .       Sample=HG00143;GT=0/1;PCR_454_AR=472;PCR_454_RR=583\r
+20     9520132 .       G       A       .       .       Sample=HG01624;GT=0/1;PCR_454_AR=589;PCR_454_RR=589\r
+20     9520132 .       G       A       .       .       Sample=NA12046;GT=0/1;PCR_454_AR=688;PCR_454_RR=708\r
+20     9520132 .       G       A       .       .       Sample=NA18517;GT=0/1;PCR_454_AR=566;PCR_454_RR=585\r
+20     9520132 .       G       A       .       .       Sample=NA18858;GT=0/1;PCR_454_AR=550;PCR_454_RR=561\r
+20     9543621 .       C       T       .       .       Sample=HG00097;GT=0/1;PCR_454_AR=499;PCR_454_RR=480\r
+20     9543621 .       C       T       .       .       Sample=HG00104;GT=0/1;PCR_454_AR=524;PCR_454_RR=480\r
+20     9543621 .       C       T       .       .       Sample=HG00112;GT=0/1;PCR_454_AR=467;PCR_454_RR=406\r
+20     9543621 .       C       T       .       .       Sample=HG00099;GT=1/1;PCR_454_AR=1321;PCR_454_RR=9\r
+20     9543621 .       C       T       .       .       Sample=HG00106;GT=1/1;PCR_454_AR=802;PCR_454_RR=6\r
+20     9547022 .       G       A       .       .       Sample=NA18924;GT=0/1;PCR_454_AR=853;PCR_454_RR=944\r
+20     9560813 .       T       C       .       .       Sample=NA12761;GT=0/1;PCR_454_AR=692;PCR_454_RR=734\r
+20     10030206        .       C       T       .       .       Sample=NA19175;GT=0/1;PCR_454_AR=784;PCR_454_RR=759\r
+20     10030206        .       C       T       .       .       Sample=NA19380;GT=0/1;PCR_454_AR=781;PCR_454_RR=739\r
+20     10030206        .       C       T       .       .       Sample=NA19446;GT=0/1;PCR_454_AR=533;PCR_454_RR=540\r
+20     13098183        .       A       C       .       .       Sample=NA19453;GT=0/1;PCR_454_AR=857;PCR_454_RR=1146\r
+20     16253907        .       C       A       .       .       Sample=NA19087;GT=0/1;PCR_454_AR=868;PCR_454_RR=854\r
+20     16254032        .       G       A       .       .       Sample=NA19651;GT=0/1;PCR_454_AR=299;PCR_454_RR=263\r
+20     16485159        .       T       G       .       .       Sample=NA18625;GT=0/1;PCR_454_AR=160;PCR_454_RR=1004\r
+20     17474781        .       G       A       .       .       Sample=NA18870;GT=0/1;PCR_454_AR=496;PCR_454_RR=536\r
+20     17585255        .       C       G       .       .       Sample=NA18528;GT=0/1;PCR_454_AR=370;PCR_454_RR=390\r
+20     17923814        .       C       T       .       .       Sample=HG00104;GT=0/0;PCR_454_AR=1;PCR_454_RR=1854\r
+20     17923814        .       C       T       .       .       Sample=HG00126;GT=0/0;PCR_454_AR=1;PCR_454_RR=1724\r
+20     17928182        .       T       G       .       .       Sample=NA18522;GT=0/1;PCR_454_AR=222;PCR_454_RR=1564\r
+20     17931030        .       C       G       .       .       Sample=NA20508;GT=0/1;PCR_454_AR=495;PCR_454_RR=446\r
+20     17933265        .       G       A       .       .       Sample=NA19137;GT=0/1;PCR_454_AR=300;PCR_454_RR=315\r
+20     17968811        .       C       G       .       .       Sample=NA19222;GT=0/1;PCR_454_AR=150;PCR_454_RR=189\r
+20     18123396        .       A       G       .       .       Sample=NA20507;GT=0/0;PCR_454_AR=5;PCR_454_RR=2239\r
+20     18125941        .       T       C       .       .       Sample=NA12006;GT=0/0;PCR_454_AR=2;PCR_454_RR=2354\r
+20     18125941        .       T       C       .       .       Sample=NA12762;GT=0/0;PCR_454_AR=4;PCR_454_RR=1116\r
+20     18374912        .       T       A       .       .       Sample=NA19189;GT=0/1;PCR_454_AR=896;PCR_454_RR=888\r
+20     18440904        .       G       C       .       .       Sample=NA19058;GT=0/1;PCR_454_AR=685;PCR_454_RR=881\r
+20     19698200        .       C       T       .       .       Sample=NA18574;GT=0/1;PCR_454_AR=1012;PCR_454_RR=1086\r
+20     20020489        .       T       C       .       .       Sample=NA19000;GT=0/1;PCR_454_AR=459;PCR_454_RR=436\r
+20     20028425        .       C       T       .       .       Sample=NA20787;GT=0/1;PCR_454_AR=687;PCR_454_RR=739\r
+20     20033171        .       G       A       .       .       Sample=NA19468;GT=0/0;PCR_454_AR=109;PCR_454_RR=1866\r
+20     20051634        .       A       G       .       .       Sample=NA19711;GT=0/1;PCR_454_AR=659;PCR_454_RR=2324\r
+20     20051634        .       A       G       .       .       Sample=NA20126;GT=0/1;PCR_454_AR=687;PCR_454_RR=2379\r
+20     20177371        .       T       C       .       .       Sample=NA19713;GT=0/1;PCR_454_AR=882;PCR_454_RR=785\r
+20     21346240        .       C       T       .       .       Sample=HG01125;GT=0/1;PCR_454_AR=707;PCR_454_RR=711\r
+20     21346240        .       C       T       .       .       Sample=NA18489;GT=0/1;PCR_454_AR=670;PCR_454_RR=648\r
+20     21346240        .       C       T       .       .       Sample=NA18498;GT=0/1;PCR_454_AR=706;PCR_454_RR=667\r
+20     21346240        .       C       T       .       .       Sample=NA18502;GT=0/1;PCR_454_AR=698;PCR_454_RR=678\r
+20     21346240        .       C       T       .       .       Sample=NA18505;GT=1/1;PCR_454_AR=1096;PCR_454_RR=2\r
+20     21494183        .       C       T       .       .       Sample=HG00128;GT=0/1;PCR_454_AR=556;PCR_454_RR=605\r
+20     21494183        .       C       T       .       .       Sample=HG00151;GT=0/1;PCR_454_AR=465;PCR_454_RR=425\r
+20     21494183        .       C       T       .       .       Sample=HG00234;GT=0/1;PCR_454_AR=583;PCR_454_RR=487\r
+20     21494183        .       C       T       .       .       Sample=HG00355;GT=0/1;PCR_454_AR=608;PCR_454_RR=521\r
+20     21494183        .       C       T       .       .       Sample=HG00362;GT=0/1;PCR_454_AR=518;PCR_454_RR=577\r
+20     21687304        .       C       T       .       .       Sample=NA19657;GT=0/1;PCR_454_AR=804;PCR_454_RR=862\r
+20     23028428        .       C       T       .       .       Sample=NA18970;GT=0/1;PCR_454_AR=360;PCR_454_RR=418\r
+20     23028637        .       C       G       .       .       Sample=NA18517;GT=0/1;PCR_454_AR=358;PCR_454_RR=374\r
+20     23028637        .       C       G       .       .       Sample=NA19118;GT=0/1;PCR_454_AR=502;PCR_454_RR=432\r
+20     23420987        .       G       T       .       .       Sample=NA19076;GT=0/0;PCR_454_AR=20;PCR_454_RR=1732\r
+20     23420993        .       C       G       .       .       Sample=NA19076;GT=0/0;PCR_454_AR=40;PCR_454_RR=3495\r
+20     23424637        .       C       T       .       .       Sample=HG00126;GT=0/1;PCR_454_AR=766;PCR_454_RR=721\r
+20     23424637        .       C       T       .       .       Sample=HG00150;GT=0/1;PCR_454_AR=444;PCR_454_RR=435\r
+20     23424637        .       C       T       .       .       Sample=HG00247;GT=0/1;PCR_454_AR=510;PCR_454_RR=486\r
+20     23424637        .       C       T       .       .       Sample=HG00565;GT=0/1;PCR_454_AR=684;PCR_454_RR=609\r
+20     23424637        .       C       T       .       .       Sample=HG00593;GT=0/1;PCR_454_AR=640;PCR_454_RR=676\r
+20     23545657        .       A       C       .       .       Sample=NA18924;GT=0/1;PCR_454_AR=767;PCR_454_RR=780\r
+20     23548918        .       T       C       .       .       Sample=NA18501;GT=0/1;PCR_454_AR=1397;PCR_454_RR=1168\r
+20     23548918        .       T       C       .       .       Sample=NA18502;GT=0/1;PCR_454_AR=1373;PCR_454_RR=1383\r
+20     23548918        .       T       C       .       .       Sample=NA18856;GT=0/1;PCR_454_AR=1376;PCR_454_RR=1446\r
+20     23548918        .       T       C       .       .       Sample=NA18907;GT=0/1;PCR_454_AR=1522;PCR_454_RR=1533\r
+20     23548918        .       T       C       .       .       Sample=NA19036;GT=0/1;PCR_454_AR=1549;PCR_454_RR=1624\r
+20     23667793        .       G       T       .       .       Sample=NA11994;GT=0/0;PCR_454_AR=135;PCR_454_RR=1637\r
+20     23667793        .       G       T       .       .       Sample=NA12400;GT=0/1;PCR_454_AR=651;PCR_454_RR=619\r
+20     23667793        .       G       T       .       .       Sample=NA18527;GT=0/1;PCR_454_AR=816;PCR_454_RR=732\r
+20     23667793        .       G       T       .       .       Sample=NA18566;GT=0/1;PCR_454_AR=928;PCR_454_RR=2446\r
+20     23667793        .       G       T       .       .       Sample=NA19064;GT=0/1;PCR_454_AR=892;PCR_454_RR=2346\r
+20     23667834        .       A       C       .       .       Sample=NA18510;GT=0/0;PCR_454_AR=27;PCR_454_RR=622\r
+20     23667834        .       A       C       .       .       Sample=NA18858;GT=0/0;PCR_454_AR=32;PCR_454_RR=615\r
+20     23731469        .       G       T       .       .       Sample=NA20544;GT=0/1;PCR_454_AR=292;PCR_454_RR=376\r
+20     23804690        .       A       C       .       .       Sample=NA19749;GT=0/1;PCR_454_AR=1141;PCR_454_RR=1145\r
+20     23807156        .       G       C       .       .       Sample=HG00129;GT=0/0;PCR_454_AR=0;PCR_454_RR=1447\r
+20     23807156        .       G       C       .       .       Sample=HG00130;GT=0/0;PCR_454_AR=0;PCR_454_RR=1603\r
+20     23860201        .       C       T       .       .       Sample=NA18553;GT=0/1;PCR_454_AR=722;PCR_454_RR=657\r
+20     23965921        .       G       A       .       .       Sample=NA18549;GT=0/0;PCR_454_AR=21;PCR_454_RR=582\r
+20     23965921        .       G       A       .       .       Sample=NA19000;GT=0/0;PCR_454_AR=19;PCR_454_RR=337\r
+20     24523782        .       G       A       .       .       Sample=NA19921;GT=0/1;PCR_454_AR=933;PCR_454_RR=1005\r
+20     24523986        .       C       A       .       .       Sample=HG00104;GT=0/1;PCR_454_AR=1056;PCR_454_RR=1346\r
+20     24954343        .       G       A       .       .       Sample=NA19146;GT=0/1;PCR_454_AR=1208;PCR_454_RR=1132\r
+20     25058490        .       T       G       .       .       Sample=NA11830;GT=0/0;PCR_454_AR=5;PCR_454_RR=1757\r
+20     25187224        .       A       G       .       .       Sample=NA19137;GT=0/1;PCR_454_AR=69;PCR_454_RR=566\r
+20     25203611        .       T       C       .       .       Sample=NA12006;GT=0/1;PCR_454_AR=1326;PCR_454_RR=1209\r
+20     25252066        .       A       G       .       .       Sample=NA18637;GT=0/1;PCR_454_AR=1208;PCR_454_RR=1230\r
+20     25262768        .       G       A       .       .       Sample=HG00099;GT=0/1;PCR_454_AR=920;PCR_454_RR=727\r
+20     25262768        .       G       A       .       .       Sample=HG00106;GT=0/1;PCR_454_AR=733;PCR_454_RR=613\r
+20     25262768        .       G       A       .       .       Sample=HG00112;GT=0/1;PCR_454_AR=756;PCR_454_RR=723\r
+20     25262768        .       G       A       .       .       Sample=HG00130;GT=0/1;PCR_454_AR=854;PCR_454_RR=827\r
+20     25262768        .       G       A       .       .       Sample=HG00152;GT=0/1;PCR_454_AR=798;PCR_454_RR=764\r
+20     25277132        .       C       T       .       .       Sample=NA18861;GT=0/1;PCR_454_AR=415;PCR_454_RR=446\r
+20     25434162        .       C       T       .       .       Sample=NA19346;GT=0/1;PCR_454_AR=566;PCR_454_RR=613\r
+20     25434162        .       C       T       .       .       Sample=NA19395;GT=0/1;PCR_454_AR=504;PCR_454_RR=531\r
+20     25439088        .       C       T       .       .       Sample=NA19095;GT=0/0;PCR_454_AR=1;PCR_454_RR=1220\r
+20     25439088        .       C       T       .       .       Sample=NA19923;GT=0/1;PCR_454_AR=575;PCR_454_RR=834\r
+20     25457145        .       G       A       .       .       Sample=NA12842;GT=0/1;PCR_454_AR=333;PCR_454_RR=438\r
+20     25457559        .       G       A       .       .       Sample=NA19159;GT=0/1;PCR_454_AR=1225;PCR_454_RR=1285\r
+20     25457665        .       C       T       .       .       Sample=NA20341;GT=0/1;PCR_454_AR=627;PCR_454_RR=1348\r
+20     25459659        .       T       C       .       .       Sample=NA18647;GT=0/0;PCR_454_AR=5;PCR_454_RR=2809\r
+20     25459659        .       T       C       .       .       Sample=NA18748;GT=0/0;PCR_454_AR=5;PCR_454_RR=2184\r
+20     25459659        .       T       C       .       .       Sample=HG01274;GT=0/1;PCR_454_AR=1246;PCR_454_RR=1375\r
+20     25459659        .       T       C       .       .       Sample=NA12275;GT=0/1;PCR_454_AR=1183;PCR_454_RR=1148\r
+20     25459659        .       T       C       .       .       Sample=NA12718;GT=0/1;PCR_454_AR=1017;PCR_454_RR=1225\r
+20     25478961        .       G       A       .       .       Sample=HG00104;GT=0/0;PCR_454_AR=1;PCR_454_RR=1933\r
+20     25478961        .       G       A       .       .       Sample=HG00234;GT=0/0;PCR_454_AR=0;PCR_454_RR=1964\r
+20     25478961        .       G       A       .       .       Sample=HG00364;GT=0/0;PCR_454_AR=2;PCR_454_RR=1909\r
+20     25478961        .       G       A       .       .       Sample=HG00593;GT=0/0;PCR_454_AR=2;PCR_454_RR=2173\r
+20     25478961        .       G       A       .       .       Sample=HG01271;GT=0/0;PCR_454_AR=0;PCR_454_RR=2082\r
+20     30407977        .       A       G       .       .       Sample=NA12287;GT=0/1;PCR_454_AR=1313;PCR_454_RR=1488\r
+20     30432438        .       C       T       .       .       Sample=NA19352;GT=0/1;PCR_454_AR=1043;PCR_454_RR=964\r
+20     30432438        .       C       T       .       .       Sample=NA19654;GT=0/1;PCR_454_AR=937;PCR_454_RR=1465\r
+20     30432570        .       T       C       .       .       Sample=NA18510;GT=0/1;PCR_454_AR=1224;PCR_454_RR=1413\r
+20     30432570        .       T       C       .       .       Sample=NA18858;GT=0/1;PCR_454_AR=1050;PCR_454_RR=1052\r
+20     30432570        .       T       C       .       .       Sample=NA18868;GT=0/1;PCR_454_AR=1087;PCR_454_RR=966\r
+20     30432570        .       T       C       .       .       Sample=NA18871;GT=0/1;PCR_454_AR=1178;PCR_454_RR=1344\r
+20     30432570        .       T       C       .       .       Sample=NA18522;GT=1/1;PCR_454_AR=1873;PCR_454_RR=7\r
+20     30602754        .       C       T       .       .       Sample=NA19749;GT=0/1;PCR_454_AR=63;PCR_454_RR=409\r
+20     30729618        .       G       A       .       .       Sample=NA11994;GT=0/0;PCR_454_AR=0;PCR_454_RR=1866\r
+20     30729618        .       G       A       .       .       Sample=NA07037;GT=0/1;PCR_454_AR=1373;PCR_454_RR=1435\r
+20     30729618        .       G       A       .       .       Sample=NA12058;GT=0/1;PCR_454_AR=963;PCR_454_RR=990\r
+20     30729618        .       G       A       .       .       Sample=NA12144;GT=0/1;PCR_454_AR=1419;PCR_454_RR=1136\r
+20     30729618        .       G       A       .       .       Sample=NA12282;GT=0/1;PCR_454_AR=1353;PCR_454_RR=1148\r
+20     30789767        .       G       A       .       .       Sample=HG00350;GT=0/0;PCR_454_AR=36;PCR_454_RR=553\r
+20     30897726        .       G       A       .       .       Sample=NA20507;GT=0/0;PCR_454_AR=239;PCR_454_RR=2404\r
+20     30918043        .       C       T       .       .       Sample=NA19707;GT=0/1;PCR_454_AR=1147;PCR_454_RR=1123\r
+20     30918043        .       C       T       .       .       Sample=NA20775;GT=0/1;PCR_454_AR=1234;PCR_454_RR=1140\r
+20     31021429        .       G       C       .       .       Sample=NA18870;GT=0/1;PCR_454_AR=747;PCR_454_RR=929\r
+20     31021429        .       G       C       .       .       Sample=NA19319;GT=0/1;PCR_454_AR=585;PCR_454_RR=657\r
+20     31021429        .       G       C       .       .       Sample=NA19445;GT=0/1;PCR_454_AR=531;PCR_454_RR=553\r
+20     31021429        .       G       C       .       .       Sample=NA20127;GT=0/1;PCR_454_AR=661;PCR_454_RR=679\r
+20     31021429        .       G       C       .       .       Sample=NA20317;GT=0/1;PCR_454_AR=874;PCR_454_RR=917\r
+20     31022764        .       C       T       .       .       Sample=NA18498;GT=0/1;PCR_454_AR=1455;PCR_454_RR=1259\r
+20     31022764        .       C       T       .       .       Sample=NA18507;GT=0/1;PCR_454_AR=1020;PCR_454_RR=972\r
+20     31022764        .       C       T       .       .       Sample=NA18511;GT=0/1;PCR_454_AR=1339;PCR_454_RR=1297\r
+20     31022764        .       C       T       .       .       Sample=NA18856;GT=0/1;PCR_454_AR=1582;PCR_454_RR=1572\r
+20     31022764        .       C       T       .       .       Sample=NA18870;GT=0/1;PCR_454_AR=1642;PCR_454_RR=1613\r
+20     31024033        .       G       A       .       .       Sample=HG01356;GT=0/1;PCR_454_AR=1045;PCR_454_RR=1002\r
+20     31024033        .       G       A       .       .       Sample=NA18537;GT=0/1;PCR_454_AR=794;PCR_454_RR=788\r
+20     31024033        .       G       A       .       .       Sample=NA18557;GT=0/1;PCR_454_AR=830;PCR_454_RR=795\r
+20     31024033        .       G       A       .       .       Sample=NA18558;GT=0/1;PCR_454_AR=833;PCR_454_RR=878\r
+20     31024033        .       G       A       .       .       Sample=NA18637;GT=1/1;PCR_454_AR=1528;PCR_454_RR=6\r
+20     31040782        .       G       A       .       .       Sample=HG00097;GT=0/1;PCR_454_AR=978;PCR_454_RR=1231\r
+20     31040782        .       G       A       .       .       Sample=HG00179;GT=0/1;PCR_454_AR=1054;PCR_454_RR=993\r
+20     31040782        .       G       A       .       .       Sample=HG01620;GT=0/1;PCR_454_AR=1091;PCR_454_RR=1111\r
+20     31040782        .       G       A       .       .       Sample=NA12273;GT=0/1;PCR_454_AR=1073;PCR_454_RR=1182\r
+20     31040782        .       G       A       .       .       Sample=NA12341;GT=0/1;PCR_454_AR=1102;PCR_454_RR=1318\r
+20     31375167        .       G       A       .       .       Sample=NA18486;GT=0/1;PCR_454_AR=563;PCR_454_RR=523\r
+20     31375167        .       G       A       .       .       Sample=NA19113;GT=0/1;PCR_454_AR=628;PCR_454_RR=620\r
+20     31388076        .       C       T       .       .       Sample=NA18504;GT=0/1;PCR_454_AR=809;PCR_454_RR=773\r
+20     31388076        .       C       T       .       .       Sample=NA18519;GT=0/1;PCR_454_AR=683;PCR_454_RR=752\r
+20     31388076        .       C       T       .       .       Sample=NA18856;GT=0/1;PCR_454_AR=1012;PCR_454_RR=1073\r
+20     31388076        .       C       T       .       .       Sample=NA18917;GT=0/1;PCR_454_AR=888;PCR_454_RR=931\r
+20     31388076        .       C       T       .       .       Sample=NA18522;GT=1/1;PCR_454_AR=1422;PCR_454_RR=2\r
+20     31424592        .       C       T       .       .       Sample=NA19146;GT=0/1;PCR_454_AR=237;PCR_454_RR=257\r
+20     31434427        .       A       G       .       .       Sample=NA11995;GT=0/1;PCR_454_AR=325;PCR_454_RR=325\r
+20     31604884        .       A       G       .       .       Sample=NA12748;GT=0/1;PCR_454_AR=1098;PCR_454_RR=1153\r
+20     31606483        .       G       C       .       .       Sample=NA18740;GT=0/1;PCR_454_AR=595;PCR_454_RR=964\r
+20     31606907        .       G       A       .       .       Sample=NA19753;GT=0/0;PCR_454_AR=0;PCR_454_RR=1627\r
+20     31606907        .       G       A       .       .       Sample=NA19747;GT=0/1;PCR_454_AR=952;PCR_454_RR=884\r
+20     31622899        .       A       G       .       .       Sample=NA19038;GT=0/1;PCR_454_AR=196;PCR_454_RR=111\r
+20     31626754        .       G       A       .       .       Sample=NA18579;GT=0/1;PCR_454_AR=941;PCR_454_RR=902\r
+20     31643241        .       A       C       .       .       Sample=NA18622;GT=0/1;PCR_454_AR=832;PCR_454_RR=877\r
+20     31659074        .       G       A       .       .       Sample=NA19449;GT=0/1;PCR_454_AR=915;PCR_454_RR=863\r
+20     31672711        .       A       G       .       .       Sample=NA20754;GT=0/1;PCR_454_AR=762;PCR_454_RR=820\r
+20     31680333        .       C       T       .       .       Sample=HG00156;GT=0/1;PCR_454_AR=446;PCR_454_RR=438\r
+20     31680333        .       C       T       .       .       Sample=HG00235;GT=0/1;PCR_454_AR=525;PCR_454_RR=435\r
+20     31680333        .       C       T       .       .       Sample=HG01125;GT=0/1;PCR_454_AR=433;PCR_454_RR=415\r
+20     31680333        .       C       T       .       .       Sample=NA12043;GT=0/1;PCR_454_AR=559;PCR_454_RR=477\r
+20     31680333        .       C       T       .       .       Sample=NA12046;GT=0/1;PCR_454_AR=364;PCR_454_RR=330\r
+20     31695565        .       C       T       .       .       Sample=NA19054;GT=0/1;PCR_454_AR=988;PCR_454_RR=944\r
+20     31889182        .       T       C       .       .       Sample=HG01277;GT=0/1;PCR_454_AR=594;PCR_454_RR=639\r
+20     31889182        .       T       C       .       .       Sample=HG01278;GT=0/1;PCR_454_AR=533;PCR_454_RR=540\r
+20     31889182        .       T       C       .       .       Sample=HG01623;GT=0/1;PCR_454_AR=703;PCR_454_RR=668\r
+20     31889182        .       T       C       .       .       Sample=NA18487;GT=0/1;PCR_454_AR=644;PCR_454_RR=647\r
+20     31889182        .       T       C       .       .       Sample=NA18486;GT=1/1;PCR_454_AR=1419;PCR_454_RR=15\r
+20     31890796        .       G       A       .       .       Sample=NA18595;GT=0/1;PCR_454_AR=36;PCR_454_RR=49\r
+20     31967485        .       T       C       .       .       Sample=NA18757;GT=0/0;PCR_454_AR=4;PCR_454_RR=1506\r
+20     32162066        .       G       C       .       .       Sample=HG00099;GT=0/1;PCR_454_AR=98;PCR_454_RR=92\r
+20     32162066        .       G       C       .       .       Sample=NA12282;GT=0/1;PCR_454_AR=72;PCR_454_RR=74\r
+20     32162066        .       G       C       .       .       Sample=NA12342;GT=0/1;PCR_454_AR=105;PCR_454_RR=134\r
+20     32162066        .       G       C       .       .       Sample=NA12778;GT=0/1;PCR_454_AR=94;PCR_454_RR=122\r
+20     32162066        .       G       C       .       .       Sample=NA19773;GT=0/1;PCR_454_AR=84;PCR_454_RR=115\r
+20     32295637        .       A       G       .       .       Sample=NA19204;GT=0/1;PCR_454_AR=1263;PCR_454_RR=1230\r
+20     32298533        .       G       A       .       .       Sample=HG01125;GT=0/1;PCR_454_AR=1577;PCR_454_RR=1574\r
+20     32298533        .       G       A       .       .       Sample=NA18510;GT=0/1;PCR_454_AR=1537;PCR_454_RR=1597\r
+20     32298533        .       G       A       .       .       Sample=NA18520;GT=0/1;PCR_454_AR=1689;PCR_454_RR=1754\r
+20     32298533        .       G       A       .       .       Sample=NA19099;GT=0/1;PCR_454_AR=1900;PCR_454_RR=1940\r
+20     32298533        .       G       A       .       .       Sample=NA19129;GT=0/1;PCR_454_AR=1900;PCR_454_RR=1840\r
+20     32336754        .       G       A       .       .       Sample=HG00358;GT=0/1;PCR_454_AR=1185;PCR_454_RR=1161\r
+20     32336754        .       G       A       .       .       Sample=HG00565;GT=0/1;PCR_454_AR=1018;PCR_454_RR=958\r
+20     32336754        .       G       A       .       .       Sample=HG00595;GT=0/1;PCR_454_AR=1201;PCR_454_RR=1222\r
+20     32336754        .       G       A       .       .       Sample=NA18532;GT=0/1;PCR_454_AR=1204;PCR_454_RR=1235\r
+20     32336754        .       G       A       .       .       Sample=NA18542;GT=1/1;PCR_454_AR=2997;PCR_454_RR=11\r
+20     32358043        .       A       T       .       .       Sample=NA18955;GT=0/1;PCR_454_AR=1050;PCR_454_RR=1022\r
+20     32881901        .       T       C       .       .       Sample=NA19257;GT=0/1;PCR_454_AR=1007;PCR_454_RR=966\r
+20     33328321        .       C       T       .       .       Sample=NA18487;GT=0/1;PCR_454_AR=637;PCR_454_RR=629\r
+20     33328321        .       C       T       .       .       Sample=NA18516;GT=0/1;PCR_454_AR=613;PCR_454_RR=605\r
+20     33328321        .       C       T       .       .       Sample=NA19044;GT=0/1;PCR_454_AR=629;PCR_454_RR=661\r
+20     33328321        .       C       T       .       .       Sample=NA19102;GT=0/1;PCR_454_AR=680;PCR_454_RR=625\r
+20     33328321        .       C       T       .       .       Sample=NA19175;GT=0/1;PCR_454_AR=652;PCR_454_RR=703\r
+20     33330691        .       C       G       .       .       Sample=NA19189;GT=0/1;PCR_454_AR=604;PCR_454_RR=575\r
+20     33433247        .       G       A       .       .       Sample=NA11919;GT=0/1;PCR_454_AR=196;PCR_454_RR=195\r
+20     33447313        .       C       T       .       .       Sample=HG01125;GT=0/1;PCR_454_AR=260;PCR_454_RR=285\r
+20     33447313        .       C       T       .       .       Sample=NA18504;GT=0/1;PCR_454_AR=231;PCR_454_RR=217\r
+20     33447313        .       C       T       .       .       Sample=NA18517;GT=0/1;PCR_454_AR=298;PCR_454_RR=311\r
+20     33447313        .       C       T       .       .       Sample=NA18520;GT=0/1;PCR_454_AR=254;PCR_454_RR=256\r
+20     33447313        .       C       T       .       .       Sample=NA18522;GT=0/1;PCR_454_AR=286;PCR_454_RR=277\r
+20     33517251        .       C       T       .       .       Sample=HG00126;GT=0/1;PCR_454_AR=685;PCR_454_RR=676\r
+20     33517301        .       G       A       .       .       Sample=NA20282;GT=0/1;PCR_454_AR=1082;PCR_454_RR=1076\r
+20     33523396        .       A       C       .       .       Sample=NA18910;GT=0/1;PCR_454_AR=879;PCR_454_RR=933\r
+20     33572880        .       C       T       .       .       Sample=NA20516;GT=0/1;PCR_454_AR=935;PCR_454_RR=847\r
+20     33575007        .       C       T       .       .       Sample=NA19118;GT=0/1;PCR_454_AR=793;PCR_454_RR=659\r
+20     33575043        .       C       T       .       .       Sample=NA19036;GT=0/1;PCR_454_AR=972;PCR_454_RR=919\r
+20     33575043        .       C       T       .       .       Sample=NA19308;GT=0/1;PCR_454_AR=801;PCR_454_RR=728\r
+20     33575043        .       C       T       .       .       Sample=NA19434;GT=0/1;PCR_454_AR=825;PCR_454_RR=915\r
+20     33575043        .       C       T       .       .       Sample=NA19439;GT=0/1;PCR_454_AR=1001;PCR_454_RR=1073\r
+20     33575043        .       C       T       .       .       Sample=NA19466;GT=0/1;PCR_454_AR=936;PCR_454_RR=931\r
+20     33583330        .       A       G       .       .       Sample=HG00097;GT=1/1;PCR_454_AR=651;PCR_454_RR=5\r
+20     33583330        .       A       G       .       .       Sample=HG00099;GT=1/1;PCR_454_AR=326;PCR_454_RR=0\r
+20     33583330        .       A       G       .       .       Sample=HG00104;GT=1/1;PCR_454_AR=430;PCR_454_RR=2\r
+20     33583330        .       A       G       .       .       Sample=HG00106;GT=1/1;PCR_454_AR=613;PCR_454_RR=3\r
+20     33583330        .       A       G       .       .       Sample=HG00112;GT=1/1;PCR_454_AR=632;PCR_454_RR=6\r
+20     33584196        .       C       T       .       .       Sample=NA12286;GT=0/1;PCR_454_AR=989;PCR_454_RR=1638\r
+20     33584196        .       C       T       .       .       Sample=NA12750;GT=0/1;PCR_454_AR=886;PCR_454_RR=1206\r
+20     33584196        .       C       T       .       .       Sample=NA19750;GT=0/1;PCR_454_AR=1179;PCR_454_RR=1155\r
+20     33584196        .       C       T       .       .       Sample=NA20807;GT=0/1;PCR_454_AR=1089;PCR_454_RR=1724\r
+20     33584196        .       C       T       .       .       Sample=NA20826;GT=0/1;PCR_454_AR=1373;PCR_454_RR=1259\r
+20     33587399        .       G       A       .       .       Sample=NA19328;GT=0/1;PCR_454_AR=893;PCR_454_RR=754\r
+20     33711732        .       T       A       .       .       Sample=NA19347;GT=0/1;PCR_454_AR=887;PCR_454_RR=946\r
+20     33874473        .       C       A       .       .       Sample=NA18626;GT=0/1;PCR_454_AR=1001;PCR_454_RR=1012\r
+20     33874719        .       C       T       .       .       Sample=HG00099;GT=0/1;PCR_454_AR=585;PCR_454_RR=542\r
+20     33874719        .       C       T       .       .       Sample=HG00141;GT=0/1;PCR_454_AR=499;PCR_454_RR=508\r
+20     33874719        .       C       T       .       .       Sample=HG00142;GT=0/1;PCR_454_AR=541;PCR_454_RR=540\r
+20     33874719        .       C       T       .       .       Sample=HG00143;GT=0/1;PCR_454_AR=699;PCR_454_RR=604\r
+20     33874719        .       C       T       .       .       Sample=HG00156;GT=0/1;PCR_454_AR=722;PCR_454_RR=617\r
+20     34092317        .       C       A       .       .       Sample=HG00128;GT=0/0;PCR_454_AR=0;PCR_454_RR=1205\r
+20     34092317        .       C       A       .       .       Sample=HG00266;GT=0/0;PCR_454_AR=3;PCR_454_RR=3354\r
+20     34218898        .       A       G       .       .       Sample=NA12763;GT=0/1;PCR_454_AR=295;PCR_454_RR=291\r
+20     34292440        .       T       C       .       .       Sample=NA18639;GT=0/1;PCR_454_AR=481;PCR_454_RR=572\r
+20     34317286        .       G       A       .       .       Sample=NA19204;GT=0/1;PCR_454_AR=665;PCR_454_RR=705\r
+20     34611604        .       C       T       .       .       Sample=NA11893;GT=0/1;PCR_454_AR=1180;PCR_454_RR=1243\r
+20     35060852        .       G       A       .       .       Sample=NA12283;GT=0/1;PCR_454_AR=433;PCR_454_RR=444\r
+20     35060852        .       G       A       .       .       Sample=NA19676;GT=0/1;PCR_454_AR=368;PCR_454_RR=421\r
+20     35068262        .       A       C       .       .       Sample=NA20759;GT=0/1;PCR_454_AR=1272;PCR_454_RR=1190\r
+20     35075140        .       C       T       .       .       Sample=NA19444;GT=0/1;PCR_454_AR=1174;PCR_454_RR=605\r
+20     35075140        .       C       T       .       .       Sample=NA19448;GT=0/1;PCR_454_AR=1574;PCR_454_RR=932\r
+20     35075309        .       G       A       .       .       Sample=NA18549;GT=0/1;PCR_454_AR=923;PCR_454_RR=1559\r
+20     35075309        .       G       A       .       .       Sample=NA19391;GT=0/1;PCR_454_AR=1114;PCR_454_RR=1064\r
+20     35075309        .       G       A       .       .       Sample=NA19397;GT=0/1;PCR_454_AR=1198;PCR_454_RR=1233\r
+20     35176551        .       A       G       .       .       Sample=NA20289;GT=0/1;PCR_454_AR=532;PCR_454_RR=1682\r
+20     35207263        .       G       A       .       .       Sample=HG00234;GT=0/1;PCR_454_AR=235;PCR_454_RR=221\r
+20     35219406        .       G       C       .       .       Sample=HG00105;GT=0/0;PCR_454_AR=57;PCR_454_RR=585\r
+20     35219406        .       G       C       .       .       Sample=HG00130;GT=0/0;PCR_454_AR=58;PCR_454_RR=574\r
+20     35438474        .       G       A       .       .       Sample=NA18642;GT=0/1;PCR_454_AR=1030;PCR_454_RR=1093\r
+20     35507540        .       G       A       .       .       Sample=NA19740;GT=0/1;PCR_454_AR=466;PCR_454_RR=584\r
+20     35539699        .       T       C       .       .       Sample=NA12717;GT=0/1;PCR_454_AR=336;PCR_454_RR=421\r
+20     35812756        .       C       T       .       .       Sample=NA19726;GT=0/1;PCR_454_AR=1085;PCR_454_RR=1070\r
+20     35944759        .       A       C       .       .       Sample=NA11831;GT=0/0;PCR_454_AR=1;PCR_454_RR=1726\r
+20     35944759        .       A       C       .       .       Sample=NA11832;GT=0/0;PCR_454_AR=3;PCR_454_RR=1809\r
+20     36024598        .       C       T       .       .       Sample=NA19682;GT=0/1;PCR_454_AR=677;PCR_454_RR=797\r
+20     36024598        .       C       T       .       .       Sample=NA20528;GT=0/1;PCR_454_AR=691;PCR_454_RR=703\r
+20     36030944        .       T       C       .       .       Sample=NA18618;GT=0/0;PCR_454_AR=0;PCR_454_RR=985\r
+20     36030944        .       T       C       .       .       Sample=NA18626;GT=0/0;PCR_454_AR=2;PCR_454_RR=778\r
+20     36030944        .       T       C       .       .       Sample=NA18916;GT=0/1;PCR_454_AR=454;PCR_454_RR=444\r
+20     36030944        .       T       C       .       .       Sample=NA19150;GT=0/1;PCR_454_AR=471;PCR_454_RR=509\r
+20     36488331        .       A       G       .       .       Sample=NA20340;GT=0/1;PCR_454_AR=1388;PCR_454_RR=1472\r
+20     36640610        .       C       G       .       .       Sample=NA18508;GT=0/1;PCR_454_AR=985;PCR_454_RR=1026\r
+20     36641870        .       G       A       .       .       Sample=HG00106;GT=0/1;PCR_454_AR=1062;PCR_454_RR=1095\r
+20     36641870        .       G       A       .       .       Sample=NA11893;GT=0/1;PCR_454_AR=976;PCR_454_RR=1033\r
+20     36641870        .       G       A       .       .       Sample=NA12399;GT=0/1;PCR_454_AR=971;PCR_454_RR=973\r
+20     36641870        .       G       A       .       .       Sample=NA12489;GT=0/1;PCR_454_AR=1107;PCR_454_RR=1037\r
+20     36641870        .       G       A       .       .       Sample=NA12749;GT=0/1;PCR_454_AR=947;PCR_454_RR=885\r
+20     36775155        .       A       G       .       .       Sample=NA19067;GT=0/1;PCR_454_AR=771;PCR_454_RR=772\r
+20     36775233        .       G       A       .       .       Sample=NA19352;GT=0/1;PCR_454_AR=732;PCR_454_RR=723\r
+20     36784261        .       G       A       .       .       Sample=NA19171;GT=0/1;PCR_454_AR=1197;PCR_454_RR=1200\r
+20     36841848        .       C       T       .       .       Sample=NA19449;GT=0/1;PCR_454_AR=402;PCR_454_RR=394\r
+20     36869075        .       G       A       .       .       Sample=NA19185;GT=0/1;PCR_454_AR=1430;PCR_454_RR=1382\r
+20     36869206        .       C       T       .       .       Sample=NA20287;GT=0/1;PCR_454_AR=584;PCR_454_RR=626\r
+20     36979308        .       T       A       .       .       Sample=NA11894;GT=0/1;PCR_454_AR=973;PCR_454_RR=1087\r
+20     37001736        .       C       T       .       .       Sample=NA18987;GT=0/1;PCR_454_AR=122;PCR_454_RR=88\r
+20     39798902        .       C       T       .       .       Sample=NA18994;GT=0/1;PCR_454_AR=1212;PCR_454_RR=1202\r
+20     39981307        .       G       T       .       .       Sample=NA18595;GT=0/1;PCR_454_AR=1273;PCR_454_RR=1102\r
+20     39981307        .       G       T       .       .       Sample=NA18622;GT=0/1;PCR_454_AR=635;PCR_454_RR=623\r
+20     39981307        .       G       T       .       .       Sample=NA18977;GT=0/1;PCR_454_AR=1251;PCR_454_RR=1141\r
+20     39981307        .       G       T       .       .       Sample=NA18978;GT=0/1;PCR_454_AR=1286;PCR_454_RR=1331\r
+20     39981307        .       G       T       .       .       Sample=NA18998;GT=0/1;PCR_454_AR=1174;PCR_454_RR=1225\r
+20     39986913        .       G       A       .       .       Sample=NA20317;GT=0/1;PCR_454_AR=627;PCR_454_RR=535\r
+20     39987386        .       G       A       .       .       Sample=NA19437;GT=0/1;PCR_454_AR=989;PCR_454_RR=971\r
+20     39992390        .       G       A       .       .       Sample=NA18636;GT=0/1;PCR_454_AR=925;PCR_454_RR=969\r
+20     39993723        .       C       T       .       .       Sample=NA18489;GT=0/1;PCR_454_AR=677;PCR_454_RR=819\r
+20     39993723        .       C       T       .       .       Sample=NA18505;GT=0/1;PCR_454_AR=603;PCR_454_RR=578\r
+20     39993723        .       C       T       .       .       Sample=NA18517;GT=0/1;PCR_454_AR=791;PCR_454_RR=747\r
+20     39993723        .       C       T       .       .       Sample=NA19380;GT=0/1;PCR_454_AR=869;PCR_454_RR=972\r
+20     39993790        .       G       A       .       .       Sample=NA18871;GT=0/1;PCR_454_AR=2297;PCR_454_RR=2512\r
+20     40033848        .       A       G       .       .       Sample=HG00559;GT=0/0;PCR_454_AR=6;PCR_454_RR=2130\r
+20     40050233        .       T       G       .       .       Sample=HG01133;GT=0/0;PCR_454_AR=2;PCR_454_RR=1613\r
+20     40050233        .       T       G       .       .       Sample=NA18502;GT=0/0;PCR_454_AR=4;PCR_454_RR=1967\r
+20     40162202        .       T       C       .       .       Sample=NA12874;GT=0/1;PCR_454_AR=171;PCR_454_RR=157\r
+20     42143783        .       A       G       .       .       Sample=NA20334;GT=0/1;PCR_454_AR=1011;PCR_454_RR=632\r
+20     42143783        .       A       G       .       .       Sample=NA20336;GT=0/1;PCR_454_AR=1556;PCR_454_RR=492\r
+20     42196587        .       G       A       .       .       Sample=NA19312;GT=0/1;PCR_454_AR=522;PCR_454_RR=486\r
+20     42196587        .       G       A       .       .       Sample=NA19383;GT=0/1;PCR_454_AR=693;PCR_454_RR=821\r
+20     42333997        .       C       T       .       .       Sample=NA19058;GT=0/1;PCR_454_AR=994;PCR_454_RR=994\r
+20     42680115        .       G       A       .       .       Sample=NA18611;GT=0/1;PCR_454_AR=1042;PCR_454_RR=1086\r
+20     42747246        .       C       T       .       .       Sample=HG00097;GT=0/1;PCR_454_AR=1132;PCR_454_RR=1174\r
+20     42747246        .       C       T       .       .       Sample=HG00106;GT=0/1;PCR_454_AR=899;PCR_454_RR=983\r
+20     42747246        .       C       T       .       .       Sample=HG00112;GT=0/1;PCR_454_AR=901;PCR_454_RR=960\r
+20     42747246        .       C       T       .       .       Sample=HG00135;GT=0/1;PCR_454_AR=677;PCR_454_RR=680\r
+20     42747246        .       C       T       .       .       Sample=HG00142;GT=0/1;PCR_454_AR=928;PCR_454_RR=956\r
+20     42939738        .       C       T       .       .       Sample=NA18611;GT=0/1;PCR_454_AR=1131;PCR_454_RR=984\r
+20     43243299        .       G       C       .       .       Sample=NA18633;GT=0/1;PCR_454_AR=1194;PCR_454_RR=1277\r
+20     43255152        .       G       A       .       .       Sample=HG00130;GT=0/0;PCR_454_AR=0;PCR_454_RR=2287\r
+20     43255152        .       G       A       .       .       Sample=HG00234;GT=0/0;PCR_454_AR=1;PCR_454_RR=2172\r
+20     43255152        .       G       A       .       .       Sample=NA18618;GT=0/0;PCR_454_AR=2;PCR_454_RR=2266\r
+20     43255152        .       G       A       .       .       Sample=NA18956;GT=0/0;PCR_454_AR=0;PCR_454_RR=2152\r
+20     43255152        .       G       A       .       .       Sample=NA19083;GT=0/1;PCR_454_AR=986;PCR_454_RR=974\r
+20     43723672        .       G       A       .       .       Sample=NA18530;GT=0/1;PCR_454_AR=356;PCR_454_RR=401\r
+20     43723672        .       G       A       .       .       Sample=NA18622;GT=0/1;PCR_454_AR=449;PCR_454_RR=391\r
+20     43739354        .       G       A       .       .       Sample=NA18504;GT=0/1;PCR_454_AR=455;PCR_454_RR=1477\r
+20     43934213        .       G       T       .       .       Sample=HG01345;GT=0/1;PCR_454_AR=1327;PCR_454_RR=1169\r
+20     44190750        .       T       G       .       .       Sample=HG00143;GT=0/1;PCR_454_AR=898;PCR_454_RR=938\r
+20     44190750        .       T       G       .       .       Sample=NA12340;GT=0/1;PCR_454_AR=882;PCR_454_RR=872\r
+20     44424037        .       G       A       .       .       Sample=HG00152;GT=0/1;PCR_454_AR=603;PCR_454_RR=593\r
+20     44469565        .       C       T       .       .       Sample=NA18549;GT=0/1;PCR_454_AR=999;PCR_454_RR=246\r
+20     44485866        .       T       A       .       .       Sample=NA12890;GT=0/1;PCR_454_AR=536;PCR_454_RR=596\r
+20     44506417        .       G       A       .       .       Sample=HG00099;GT=0/1;PCR_454_AR=1320;PCR_454_RR=1305\r
+20     44506417        .       G       A       .       .       Sample=HG00118;GT=0/1;PCR_454_AR=1559;PCR_454_RR=1533\r
+20     44506417        .       G       A       .       .       Sample=HG00097;GT=1/1;PCR_454_AR=3211;PCR_454_RR=20\r
+20     44506417        .       G       A       .       .       Sample=HG00112;GT=1/1;PCR_454_AR=2632;PCR_454_RR=20\r
+20     44506417        .       G       A       .       .       Sample=HG00122;GT=1/1;PCR_454_AR=2875;PCR_454_RR=6\r
+20     44506987        .       G       C       .       .       Sample=NA19117;GT=0/1;PCR_454_AR=1387;PCR_454_RR=1532\r
+20     44511253        .       C       T       .       .       Sample=NA20799;GT=0/1;PCR_454_AR=1286;PCR_454_RR=1280\r
+20     44519372        .       G       A       .       .       Sample=NA19437;GT=0/0;PCR_454_AR=0;PCR_454_RR=2075\r
+20     44519372        .       G       A       .       .       Sample=NA19917;GT=0/1;PCR_454_AR=1243;PCR_454_RR=1234\r
+20     44576246        .       G       A       .       .       Sample=NA18912;GT=0/1;PCR_454_AR=458;PCR_454_RR=2154\r
+20     44576246        .       G       A       .       .       Sample=NA18924;GT=0/1;PCR_454_AR=1131;PCR_454_RR=1078\r
+20     44576246        .       G       A       .       .       Sample=NA20276;GT=0/1;PCR_454_AR=860;PCR_454_RR=852\r
+20     44576246        .       G       A       .       .       Sample=NA20289;GT=0/1;PCR_454_AR=492;PCR_454_RR=2174\r
+20     44580998        .       T       C       .       .       Sample=NA18566;GT=0/1;PCR_454_AR=877;PCR_454_RR=925\r
+20     44680318        .       C       G       .       .       Sample=HG00592;GT=0/0;PCR_454_AR=0;PCR_454_RR=3602\r
+20     44680318        .       C       G       .       .       Sample=HG01139;GT=0/0;PCR_454_AR=1;PCR_454_RR=3510\r
+20     44856207        .       G       A       .       .       Sample=NA11995;GT=0/1;PCR_454_AR=127;PCR_454_RR=17\r
+20     44980779        .       G       A       .       .       Sample=NA18553;GT=0/1;PCR_454_AR=993;PCR_454_RR=1022\r
+20     45919012        .       C       T       .       .       Sample=NA19445;GT=0/1;PCR_454_AR=265;PCR_454_RR=525\r
+20     46271051        .       C       G       .       .       Sample=NA18486;GT=0/1;PCR_454_AR=754;PCR_454_RR=749\r
+20     47262594        .       C       A       .       .       Sample=NA20291;GT=0/1;PCR_454_AR=1210;PCR_454_RR=1153\r
+20     47558430        .       C       T       .       .       Sample=NA20296;GT=0/1;PCR_454_AR=699;PCR_454_RR=682\r
+20     47733688        .       T       C       .       .       Sample=NA18630;GT=0/0;PCR_454_AR=0;PCR_454_RR=806\r
+20     47739668        .       G       A       .       .       Sample=NA19036;GT=0/0;PCR_454_AR=1;PCR_454_RR=2292\r
+20     47886859        .       C       T       .       .       Sample=NA18956;GT=0/0;PCR_454_AR=1;PCR_454_RR=2153\r
+20     47990798        .       C       G       .       .       Sample=HG00105;GT=0/0;PCR_454_AR=0;PCR_454_RR=387\r
+20     47990798        .       C       G       .       .       Sample=HG00122;GT=0/0;PCR_454_AR=0;PCR_454_RR=534\r
+20     48124475        .       C       T       .       .       Sample=NA19257;GT=0/1;PCR_454_AR=628;PCR_454_RR=644\r
+20     48273201        .       A       C       .       .       Sample=NA19914;GT=0/1;PCR_454_AR=338;PCR_454_RR=323\r
+20     48713355        .       T       C       .       .       Sample=NA12155;GT=0/0;PCR_454_AR=8;PCR_454_RR=1686\r
+20     48713355        .       T       C       .       .       Sample=NA12815;GT=0/0;PCR_454_AR=10;PCR_454_RR=1607\r
+20     49218698        .       C       T       .       .       Sample=NA19338;GT=0/1;PCR_454_AR=776;PCR_454_RR=682\r
+20     49218698        .       C       T       .       .       Sample=NA19457;GT=0/1;PCR_454_AR=803;PCR_454_RR=759\r
+20     49219065        .       C       T       .       .       Sample=NA18599;GT=0/1;PCR_454_AR=1018;PCR_454_RR=1080\r
+20     49354597        .       A       G       .       .       Sample=HG00177;GT=0/1;PCR_454_AR=580;PCR_454_RR=617\r
+20     49354597        .       A       G       .       .       Sample=NA11829;GT=0/1;PCR_454_AR=778;PCR_454_RR=869\r
+20     49354597        .       A       G       .       .       Sample=NA20510;GT=0/1;PCR_454_AR=518;PCR_454_RR=631\r
+20     49354597        .       A       G       .       .       Sample=NA20512;GT=0/1;PCR_454_AR=238;PCR_454_RR=333\r
+20     49354597        .       A       G       .       .       Sample=NA20586;GT=0/1;PCR_454_AR=562;PCR_454_RR=642\r
+20     50048925        .       G       C       .       .       Sample=NA20507;GT=0/1;PCR_454_AR=774;PCR_454_RR=809\r
+20     50051804        .       C       T       .       .       Sample=NA19102;GT=0/1;PCR_454_AR=136;PCR_454_RR=155\r
+20     50071136        .       C       T       .       .       Sample=NA18637;GT=0/1;PCR_454_AR=334;PCR_454_RR=349\r
+20     50140178        .       G       A       .       .       Sample=NA18924;GT=0/1;PCR_454_AR=540;PCR_454_RR=481\r
+20     50140178        .       G       A       .       .       Sample=NA19321;GT=0/1;PCR_454_AR=481;PCR_454_RR=652\r
+20     50235576        .       G       A       .       .       Sample=HG00106;GT=0/1;PCR_454_AR=982;PCR_454_RR=886\r
+20     50235576        .       G       A       .       .       Sample=HG00122;GT=0/1;PCR_454_AR=838;PCR_454_RR=717\r
+20     50235576        .       G       A       .       .       Sample=HG00126;GT=0/1;PCR_454_AR=795;PCR_454_RR=769\r
+20     50235576        .       G       A       .       .       Sample=HG00135;GT=0/1;PCR_454_AR=972;PCR_454_RR=930\r
+20     50235576        .       G       A       .       .       Sample=HG00148;GT=0/1;PCR_454_AR=933;PCR_454_RR=931\r
+20     50310567        .       C       T       .       .       Sample=NA19152;GT=0/1;PCR_454_AR=689;PCR_454_RR=773\r
+20     50310567        .       C       T       .       .       Sample=NA19377;GT=0/1;PCR_454_AR=736;PCR_454_RR=683\r
+20     50406859        .       G       A       .       .       Sample=NA19921;GT=0/1;PCR_454_AR=1045;PCR_454_RR=930\r
+20     50407501        .       A       C       .       .       Sample=HG00118;GT=0/1;PCR_454_AR=569;PCR_454_RR=608\r
+20     50407508        .       C       T       .       .       Sample=NA20534;GT=0/1;PCR_454_AR=753;PCR_454_RR=2120\r
+20     50408613        .       A       G       .       .       Sample=NA18487;GT=0/1;PCR_454_AR=637;PCR_454_RR=634\r
+20     50408613        .       A       G       .       .       Sample=NA18502;GT=0/1;PCR_454_AR=561;PCR_454_RR=553\r
+20     50408613        .       A       G       .       .       Sample=NA18519;GT=0/1;PCR_454_AR=571;PCR_454_RR=554\r
+20     50408613        .       A       G       .       .       Sample=NA18908;GT=0/1;PCR_454_AR=731;PCR_454_RR=791\r
+20     50408613        .       A       G       .       .       Sample=NA18909;GT=0/1;PCR_454_AR=683;PCR_454_RR=634\r
+20     50803476        .       G       A       .       .       Sample=NA19046;GT=0/1;PCR_454_AR=692;PCR_454_RR=685\r
+20     50803476        .       G       A       .       .       Sample=NA19375;GT=0/1;PCR_454_AR=735;PCR_454_RR=803\r
+20     50803476        .       G       A       .       .       Sample=NA19376;GT=0/1;PCR_454_AR=892;PCR_454_RR=831\r
+20     51872037        .       G       A       .       .       Sample=NA18502;GT=0/1;PCR_454_AR=602;PCR_454_RR=654\r
+20     51872037        .       G       A       .       .       Sample=NA18504;GT=0/1;PCR_454_AR=717;PCR_454_RR=760\r
+20     51872037        .       G       A       .       .       Sample=NA18507;GT=0/1;PCR_454_AR=790;PCR_454_RR=822\r
+20     51872037        .       G       A       .       .       Sample=NA18508;GT=0/1;PCR_454_AR=868;PCR_454_RR=914\r
+20     51872037        .       G       A       .       .       Sample=NA18501;GT=1/1;PCR_454_AR=1687;PCR_454_RR=5\r
+20     52192483        .       T       C       .       .       Sample=HG00266;GT=0/1;PCR_454_AR=1044;PCR_454_RR=1029\r
+20     52198279        .       G       A       .       .       Sample=NA19065;GT=0/1;PCR_454_AR=1001;PCR_454_RR=1070\r
+20     52561468        .       A       G       .       .       Sample=HG00118;GT=0/1;PCR_454_AR=398;PCR_454_RR=501\r
+20     52561468        .       A       G       .       .       Sample=HG00126;GT=0/1;PCR_454_AR=228;PCR_454_RR=250\r
+20     52561468        .       A       G       .       .       Sample=HG00130;GT=0/1;PCR_454_AR=472;PCR_454_RR=535\r
+20     52561468        .       A       G       .       .       Sample=HG00134;GT=0/1;PCR_454_AR=462;PCR_454_RR=543\r
+20     52561468        .       A       G       .       .       Sample=HG00143;GT=0/1;PCR_454_AR=355;PCR_454_RR=404\r
+20     52779394        .       G       T       .       .       Sample=NA20540;GT=0/1;PCR_454_AR=470;PCR_454_RR=557\r
+20     53205268        .       T       C       .       .       Sample=NA19038;GT=0/1;PCR_454_AR=447;PCR_454_RR=421\r
+20     53226967        .       G       A       .       .       Sample=NA19462;GT=0/1;PCR_454_AR=770;PCR_454_RR=792\r
+20     54961540        .       A       T       .       .       Sample=HG00106;GT=0/1;PCR_454_AR=457;PCR_454_RR=411\r
+20     54961540        .       A       T       .       .       Sample=HG00112;GT=0/1;PCR_454_AR=466;PCR_454_RR=483\r
+20     54961540        .       A       T       .       .       Sample=HG00134;GT=0/1;PCR_454_AR=480;PCR_454_RR=467\r
+20     54961540        .       A       T       .       .       Sample=HG00143;GT=0/1;PCR_454_AR=522;PCR_454_RR=458\r
+20     54961540        .       A       T       .       .       Sample=HG00097;GT=1/1;PCR_454_AR=937;PCR_454_RR=4\r
+20     54970682        .       C       T       .       .       Sample=NA18912;GT=0/1;PCR_454_AR=683;PCR_454_RR=745\r
+20     54970682        .       C       T       .       .       Sample=NA19171;GT=0/1;PCR_454_AR=819;PCR_454_RR=792\r
+20     55021021        .       G       A       .       .       Sample=NA19087;GT=0/1;PCR_454_AR=1018;PCR_454_RR=1144\r
+20     55108414        .       G       A       .       .       Sample=NA20756;GT=1/1;PCR_454_AR=1220;PCR_454_RR=3\r
+20     55206884        .       C       T       .       .       Sample=NA19726;GT=0/1;PCR_454_AR=806;PCR_454_RR=864\r
+20     55206884        .       C       T       .       .       Sample=NA19738;GT=0/1;PCR_454_AR=988;PCR_454_RR=1033\r
+20     56087684        .       C       T       .       .       Sample=NA18599;GT=0/1;PCR_454_AR=1158;PCR_454_RR=1234\r
+20     56089789        .       C       T       .       .       Sample=HG01277;GT=0/1;PCR_454_AR=737;PCR_454_RR=779\r
+20     56137833        .       A       G       .       .       Sample=HG00099;GT=0/1;PCR_454_AR=794;PCR_454_RR=777\r
+20     56137833        .       A       G       .       .       Sample=HG00106;GT=0/1;PCR_454_AR=1272;PCR_454_RR=1196\r
+20     56137833        .       A       G       .       .       Sample=HG00097;GT=1/1;PCR_454_AR=1763;PCR_454_RR=4\r
+20     56137833        .       A       G       .       .       Sample=HG00104;GT=1/1;PCR_454_AR=1726;PCR_454_RR=5\r
+20     56137833        .       A       G       .       .       Sample=HG00112;GT=1/1;PCR_454_AR=1821;PCR_454_RR=3\r
+20     57036354        .       C       T       .       .       Sample=NA19080;GT=0/1;PCR_454_AR=1722;PCR_454_RR=1581\r
+20     57036538        .       C       T       .       .       Sample=NA19248;GT=0/1;PCR_454_AR=1224;PCR_454_RR=902\r
+20     57415535        .       C       T       .       .       Sample=NA19722;GT=0/1;PCR_454_AR=291;PCR_454_RR=1503\r
+20     57415601        .       G       A       .       .       Sample=NA20296;GT=0/1;PCR_454_AR=1262;PCR_454_RR=350\r
+20     57428947        .       G       T       .       .       Sample=NA19311;GT=0/1;PCR_454_AR=1304;PCR_454_RR=553\r
+20     57572729        .       C       T       .       .       Sample=NA19707;GT=0/1;PCR_454_AR=840;PCR_454_RR=1015\r
+20     57576684        .       T       G       .       .       Sample=NA18747;GT=0/0;PCR_454_AR=3;PCR_454_RR=1578\r
+20     57597952        .       C       T       .       .       Sample=NA20529;GT=0/1;PCR_454_AR=816;PCR_454_RR=883\r
+20     57768304        .       G       A       .       .       Sample=NA20818;GT=0/1;PCR_454_AR=710;PCR_454_RR=535\r
+20     57769546        .       C       T       .       .       Sample=NA18917;GT=0/0;PCR_454_AR=61;PCR_454_RR=810\r
+20     57769738        .       A       G       .       .       Sample=NA18527;GT=0/1;PCR_454_AR=799;PCR_454_RR=792\r
+20     57769738        .       A       G       .       .       Sample=NA18530;GT=0/1;PCR_454_AR=558;PCR_454_RR=527\r
+20     57769738        .       A       G       .       .       Sample=NA18532;GT=0/1;PCR_454_AR=734;PCR_454_RR=719\r
+20     57769738        .       A       G       .       .       Sample=NA18545;GT=0/1;PCR_454_AR=524;PCR_454_RR=502\r
+20     57769738        .       A       G       .       .       Sample=NA18593;GT=0/1;PCR_454_AR=809;PCR_454_RR=835\r
+20     58444902        .       C       T       .       .       Sample=NA19095;GT=0/1;PCR_454_AR=164;PCR_454_RR=144\r
+20     58467100        .       C       T       .       .       Sample=NA19324;GT=0/1;PCR_454_AR=312;PCR_454_RR=301\r
+20     58560056        .       C       T       .       .       Sample=HG00593;GT=0/1;PCR_454_AR=1491;PCR_454_RR=1378\r
+20     58560056        .       C       T       .       .       Sample=NA18553;GT=0/1;PCR_454_AR=1226;PCR_454_RR=1216\r
+20     58564005        .       G       A       .       .       Sample=NA19355;GT=0/0;PCR_454_AR=0;PCR_454_RR=2602\r
+20     58567458        .       A       C       .       .       Sample=HG00143;GT=0/0;PCR_454_AR=1;PCR_454_RR=878\r
+20     58567458        .       A       C       .       .       Sample=HG00149;GT=0/0;PCR_454_AR=0;PCR_454_RR=883\r
+20     58571705        .       C       T       .       .       Sample=NA19319;GT=0/1;PCR_454_AR=342;PCR_454_RR=265\r
+20     60504808        .       C       T       .       .       Sample=NA18639;GT=0/1;PCR_454_AR=1079;PCR_454_RR=1027\r
+20     60504808        .       C       T       .       .       Sample=NA19921;GT=0/1;PCR_454_AR=914;PCR_454_RR=890\r
+20     60701482        .       T       A       .       .       Sample=NA19651;GT=0/1;PCR_454_AR=540;PCR_454_RR=612\r
+20     60708462        .       T       C       .       .       Sample=NA18962;GT=0/1;PCR_454_AR=891;PCR_454_RR=784\r
+20     60738559        .       G       A       .       .       Sample=NA18965;GT=0/1;PCR_454_AR=1072;PCR_454_RR=896\r
+20     60838713        .       C       T       .       .       Sample=NA20506;GT=0/1;PCR_454_AR=618;PCR_454_RR=642\r
+20     60866830        .       A       C       .       .       Sample=NA18923;GT=0/0;PCR_454_AR=0;PCR_454_RR=211\r
+20     60868936        .       C       T       .       .       Sample=NA19119;GT=0/1;PCR_454_AR=1424;PCR_454_RR=1554\r
+20     60878814        .       G       A       .       .       Sample=NA18638;GT=0/1;PCR_454_AR=223;PCR_454_RR=1299\r
+20     60884465        .       G       A       .       .       Sample=NA19681;GT=0/1;PCR_454_AR=928;PCR_454_RR=1002\r
+20     60885810        .       C       T       .       .       Sample=HG00134;GT=0/0;PCR_454_AR=2;PCR_454_RR=2017\r
+20     60885810        .       C       T       .       .       Sample=HG00350;GT=0/0;PCR_454_AR=4;PCR_454_RR=1963\r
+20     60886712        .       T       C       .       .       Sample=NA19438;GT=0/1;PCR_454_AR=929;PCR_454_RR=721\r
+20     60891010        .       C       T       .       .       Sample=NA19700;GT=0/1;PCR_454_AR=334;PCR_454_RR=389\r
+20     60893610        .       C       T       .       .       Sample=HG00359;GT=0/0;PCR_454_AR=2;PCR_454_RR=2041\r
+20     60893610        .       C       T       .       .       Sample=NA19758;GT=0/1;PCR_454_AR=1173;PCR_454_RR=1158\r
+20     60893636        .       C       T       .       .       Sample=NA20520;GT=0/1;PCR_454_AR=847;PCR_454_RR=1197\r
+20     60893636        .       C       T       .       .       Sample=NA20540;GT=0/1;PCR_454_AR=776;PCR_454_RR=1355\r
+20     60893960        .       C       T       .       .       Sample=NA19236;GT=0/1;PCR_454_AR=1310;PCR_454_RR=1388\r
+20     60897486        .       C       T       .       .       Sample=HG00099;GT=0/1;PCR_454_AR=454;PCR_454_RR=403\r
+20     60897486        .       C       T       .       .       Sample=HG00122;GT=0/1;PCR_454_AR=465;PCR_454_RR=352\r
+20     60897486        .       C       T       .       .       Sample=HG00097;GT=1/1;PCR_454_AR=849;PCR_454_RR=3\r
+20     60897486        .       C       T       .       .       Sample=HG00104;GT=1/1;PCR_454_AR=925;PCR_454_RR=4\r
+20     60897486        .       C       T       .       .       Sample=HG00118;GT=1/1;PCR_454_AR=799;PCR_454_RR=7\r
+20     60907674        .       G       A       .       .       Sample=HG00104;GT=0/1;PCR_454_AR=279;PCR_454_RR=228\r
+20     60907674        .       G       A       .       .       Sample=HG00106;GT=0/1;PCR_454_AR=334;PCR_454_RR=295\r
+20     60907674        .       G       A       .       .       Sample=HG00097;GT=1/1;PCR_454_AR=739;PCR_454_RR=4\r
+20     60907674        .       G       A       .       .       Sample=HG00099;GT=1/1;PCR_454_AR=395;PCR_454_RR=3\r
+20     60907674        .       G       A       .       .       Sample=HG00112;GT=1/1;PCR_454_AR=980;PCR_454_RR=6\r
+20     60911433        .       A       C       .       .       Sample=NA11920;GT=0/1;PCR_454_AR=341;PCR_454_RR=380\r
+20     60911433        .       A       C       .       .       Sample=NA20278;GT=0/1;PCR_454_AR=398;PCR_454_RR=444\r
+20     60913173        .       C       T       .       .       Sample=NA18522;GT=0/1;PCR_454_AR=1062;PCR_454_RR=1032\r
+20     60920914        .       T       C       .       .       Sample=NA18530;GT=0/1;PCR_454_AR=937;PCR_454_RR=877\r
+20     60920914        .       T       C       .       .       Sample=NA18873;GT=0/1;PCR_454_AR=791;PCR_454_RR=836\r
+20     60920914        .       T       C       .       .       Sample=NA19038;GT=0/1;PCR_454_AR=895;PCR_454_RR=857\r
+20     60920914        .       T       C       .       .       Sample=NA19099;GT=0/1;PCR_454_AR=1115;PCR_454_RR=1150\r
+20     60920914        .       T       C       .       .       Sample=NA19317;GT=0/1;PCR_454_AR=1165;PCR_454_RR=1206\r
+20     60927411        .       G       A       .       .       Sample=HG00099;GT=0/1;PCR_454_AR=330;PCR_454_RR=345\r
+20     60927411        .       G       A       .       .       Sample=HG00112;GT=0/1;PCR_454_AR=389;PCR_454_RR=468\r
+20     60927411        .       G       A       .       .       Sample=HG00118;GT=0/1;PCR_454_AR=1434;PCR_454_RR=538\r
+20     60927411        .       G       A       .       .       Sample=HG00097;GT=1/1;PCR_454_AR=993;PCR_454_RR=7\r
+20     60927411        .       G       A       .       .       Sample=HG00104;GT=1/1;PCR_454_AR=837;PCR_454_RR=8\r
+20     60937543        .       A       G       .       .       Sample=HG00115;GT=0/0;PCR_454_AR=2;PCR_454_RR=3444\r
+20     60963387        .       C       T       .       .       Sample=NA18992;GT=0/1;PCR_454_AR=689;PCR_454_RR=728\r
+20     60986026        .       T       C       .       .       Sample=NA18511;GT=0/1;PCR_454_AR=510;PCR_454_RR=522\r
+20     60986026        .       T       C       .       .       Sample=NA18520;GT=0/1;PCR_454_AR=384;PCR_454_RR=403\r
+20     60986026        .       T       C       .       .       Sample=NA18861;GT=0/1;PCR_454_AR=372;PCR_454_RR=432\r
+20     60986026        .       T       C       .       .       Sample=NA18908;GT=0/1;PCR_454_AR=428;PCR_454_RR=386\r
+20     60989186        .       G       T       .       .       Sample=HG00351;GT=0/0;PCR_454_AR=0;PCR_454_RR=299\r
+20     60989186        .       G       T       .       .       Sample=HG00099;GT=0/1;PCR_454_AR=1182;PCR_454_RR=966\r
+20     60989186        .       G       T       .       .       Sample=HG01344;GT=0/1;PCR_454_AR=654;PCR_454_RR=302\r
+20     60989186        .       G       T       .       .       Sample=NA12045;GT=0/1;PCR_454_AR=504;PCR_454_RR=534\r
+20     60989186        .       G       T       .       .       Sample=HG00130;GT=1/1;PCR_454_AR=76;PCR_454_RR=2\r
+20     60992370        .       C       T       .       .       Sample=NA18917;GT=0/1;PCR_454_AR=598;PCR_454_RR=363\r
+20     60992370        .       C       T       .       .       Sample=NA19453;GT=0/1;PCR_454_AR=541;PCR_454_RR=677\r
+20     61288592        .       G       A       .       .       Sample=HG01625;GT=0/1;PCR_454_AR=852;PCR_454_RR=871\r
+20     61288592        .       G       A       .       .       Sample=NA12383;GT=0/1;PCR_454_AR=794;PCR_454_RR=737\r
+20     61288592        .       G       A       .       .       Sample=NA19780;GT=0/1;PCR_454_AR=1012;PCR_454_RR=880\r
+20     61288592        .       G       A       .       .       Sample=NA20508;GT=0/1;PCR_454_AR=913;PCR_454_RR=773\r
+20     61512157        .       C       T       .       .       Sample=NA18933;GT=0/1;PCR_454_AR=1227;PCR_454_RR=1206\r
+20     61512157        .       C       T       .       .       Sample=NA18934;GT=0/1;PCR_454_AR=1110;PCR_454_RR=1182\r
+20     61512157        .       C       T       .       .       Sample=NA19771;GT=0/1;PCR_454_AR=1250;PCR_454_RR=1148\r
+20     61512982        .       T       A       .       .       Sample=NA18559;GT=0/1;PCR_454_AR=1255;PCR_454_RR=1117\r
+20     61513433        .       T       C       .       .       Sample=NA20810;GT=0/0;PCR_454_AR=1;PCR_454_RR=550\r
+20     61525226        .       G       A       .       .       Sample=NA19428;GT=0/1;PCR_454_AR=719;PCR_454_RR=719\r
+20     61542496        .       G       C       .       .       Sample=NA19648;GT=0/1;PCR_454_AR=237;PCR_454_RR=1305\r
+20     61574860        .       C       T       .       .       Sample=NA19762;GT=0/1;PCR_454_AR=703;PCR_454_RR=488\r
+20     61591950        .       T       G       .       .       Sample=HG00106;GT=0/0;PCR_454_AR=2;PCR_454_RR=1219\r
+20     61591950        .       T       G       .       .       Sample=HG00122;GT=0/0;PCR_454_AR=0;PCR_454_RR=1227\r
+20     61833992        .       G       A       .       .       Sample=NA18489;GT=0/1;PCR_454_AR=738;PCR_454_RR=786\r
+20     61833992        .       G       A       .       .       Sample=NA19093;GT=0/1;PCR_454_AR=839;PCR_454_RR=739\r
+20     61834856        .       G       A       .       .       Sample=NA19041;GT=0/1;PCR_454_AR=389;PCR_454_RR=374\r
+20     61834856        .       G       A       .       .       Sample=NA19095;GT=0/1;PCR_454_AR=383;PCR_454_RR=364\r
+20     61834856        .       G       A       .       .       Sample=NA19113;GT=0/1;PCR_454_AR=322;PCR_454_RR=325\r
+20     61834856        .       G       A       .       .       Sample=NA19318;GT=0/1;PCR_454_AR=434;PCR_454_RR=399\r
+20     61834856        .       G       A       .       .       Sample=NA19334;GT=0/1;PCR_454_AR=380;PCR_454_RR=343\r
+20     61943307        .       G       C       .       .       Sample=NA19201;GT=0/1;PCR_454_AR=920;PCR_454_RR=890\r
+20     61943346        .       G       A       .       .       Sample=NA19758;GT=0/1;PCR_454_AR=683;PCR_454_RR=705\r
+20     62187372        .       C       G       .       .       Sample=NA19117;GT=0/0;PCR_454_AR=0;PCR_454_RR=963\r
+20     62187668        .       C       T       .       .       Sample=NA12154;GT=0/1;PCR_454_AR=905;PCR_454_RR=664\r
+20     62194106        .       C       T       .       .       Sample=NA18910;GT=0/1;PCR_454_AR=1083;PCR_454_RR=1040\r
+20     62194106        .       C       T       .       .       Sample=NA19338;GT=0/1;PCR_454_AR=784;PCR_454_RR=854\r
+20     62194106        .       C       T       .       .       Sample=NA19346;GT=0/1;PCR_454_AR=757;PCR_454_RR=817\r
+20     62194106        .       C       T       .       .       Sample=NA19376;GT=0/1;PCR_454_AR=1152;PCR_454_RR=962\r
+20     62194106        .       C       T       .       .       Sample=NA19439;GT=0/1;PCR_454_AR=1387;PCR_454_RR=1456\r
+20     62194211        .       C       A       .       .       Sample=HG00156;GT=0/1;PCR_454_AR=1116;PCR_454_RR=536\r
+20     62194211        .       C       A       .       .       Sample=NA07051;GT=0/1;PCR_454_AR=2089;PCR_454_RR=259\r
+20     62194211        .       C       A       .       .       Sample=NA12003;GT=0/1;PCR_454_AR=1330;PCR_454_RR=796\r
+20     62194290        .       C       T       .       .       Sample=NA19346;GT=0/1;PCR_454_AR=1000;PCR_454_RR=751\r
+20     62194290        .       C       T       .       .       Sample=NA19351;GT=0/1;PCR_454_AR=901;PCR_454_RR=771\r
+20     62198552        .       G       C       .       .       Sample=NA20542;GT=0/1;PCR_454_AR=1527;PCR_454_RR=1010\r
+20     62198883        .       C       T       .       .       Sample=NA19346;GT=0/1;PCR_454_AR=1447;PCR_454_RR=1455\r
+20     62198883        .       C       T       .       .       Sample=NA19351;GT=0/1;PCR_454_AR=903;PCR_454_RR=1401\r
+20     62198883        .       C       T       .       .       Sample=NA20340;GT=0/1;PCR_454_AR=843;PCR_454_RR=892\r
+20     62198960        .       G       A       .       .       Sample=NA20534;GT=0/1;PCR_454_AR=1223;PCR_454_RR=864\r
+20     62200240        .       G       A       .       .       Sample=NA18910;GT=0/1;PCR_454_AR=1221;PCR_454_RR=1347\r
+20     62226984        .       G       C       .       .       Sample=HG00559;GT=0/0;PCR_454_AR=2;PCR_454_RR=1774\r
+20     62226984        .       G       C       .       .       Sample=NA12003;GT=0/0;PCR_454_AR=1;PCR_454_RR=1871\r
+20     62250734        .       C       T       .       .       Sample=NA19473;GT=0/1;PCR_454_AR=607;PCR_454_RR=722\r
+20     62297382        .       A       T       .       .       Sample=NA11993;GT=0/0;PCR_454_AR=3;PCR_454_RR=2573\r
+20     62297382        .       A       T       .       .       Sample=NA19117;GT=0/0;PCR_454_AR=5;PCR_454_RR=1753\r
+20     62305427        .       G       A       .       .       Sample=HG00104;GT=0/0;PCR_454_AR=10;PCR_454_RR=803\r
+20     62305427        .       G       A       .       .       Sample=HG00122;GT=0/0;PCR_454_AR=28;PCR_454_RR=1300\r
+20     62319912        .       G       T       .       .       Sample=HG00128;GT=0/0;PCR_454_AR=1;PCR_454_RR=1911\r
+20     62319912        .       G       T       .       .       Sample=HG00560;GT=0/0;PCR_454_AR=0;PCR_454_RR=2111\r
+20     62324258        .       C       G       .       .       Sample=NA18562;GT=0/1;PCR_454_AR=1126;PCR_454_RR=1126\r
+20     62324622        .       C       G       .       .       Sample=NA18574;GT=0/1;PCR_454_AR=1153;PCR_454_RR=1158\r
+20     62325731        .       G       A       .       .       Sample=NA18548;GT=0/1;PCR_454_AR=779;PCR_454_RR=2199\r
+20     62325821        .       G       A       .       .       Sample=NA20278;GT=0/1;PCR_454_AR=819;PCR_454_RR=764\r
+20     62325821        .       G       A       .       .       Sample=NA20507;GT=0/1;PCR_454_AR=1163;PCR_454_RR=1060\r
+20     62326150        .       G       A       .       .       Sample=NA18870;GT=0/1;PCR_454_AR=1080;PCR_454_RR=892\r
+20     62326234        .       C       T       .       .       Sample=HG00128;GT=0/0;PCR_454_AR=0;PCR_454_RR=761\r
+20     62326234        .       C       T       .       .       Sample=HG00179;GT=0/0;PCR_454_AR=1;PCR_454_RR=1158\r
+20     62326811        .       G       T       .       .       Sample=HG00149;GT=0/0;PCR_454_AR=0;PCR_454_RR=1467\r
+20     62326811        .       G       T       .       .       Sample=HG00151;GT=0/0;PCR_454_AR=1;PCR_454_RR=1492\r
+20     62407154        .       C       T       .       .       Sample=NA18987;GT=0/0;PCR_454_AR=181;PCR_454_RR=2041\r
+20     62421536        .       C       T       .       .       Sample=NA20521;GT=0/1;PCR_454_AR=856;PCR_454_RR=910\r
+20     62421536        .       C       T       .       .       Sample=NA20543;GT=0/1;PCR_454_AR=865;PCR_454_RR=854\r
+20     62593676        .       C       T       .       .       Sample=NA20291;GT=0/1;PCR_454_AR=1038;PCR_454_RR=995\r
+20     62594479        .       C       T       .       .       Sample=NA19746;GT=0/1;PCR_454_AR=349;PCR_454_RR=347\r
+20     62595981        .       C       T       .       .       Sample=NA19172;GT=0/1;PCR_454_AR=440;PCR_454_RR=415\r
+20     62630426        .       C       T       .       .       Sample=NA19428;GT=0/1;PCR_454_AR=1246;PCR_454_RR=1277\r
+20     62632542        .       C       T       .       .       Sample=NA18501;GT=0/1;PCR_454_AR=1203;PCR_454_RR=1150\r
+20     62657404        .       C       T       .       .       Sample=NA18612;GT=0/1;PCR_454_AR=1480;PCR_454_RR=1071\r
+20     62700725        .       G       A       .       .       Sample=NA19020;GT=0/1;PCR_454_AR=832;PCR_454_RR=815\r
+20     62700725        .       G       A       .       .       Sample=NA19036;GT=0/1;PCR_454_AR=1024;PCR_454_RR=966\r
+20     62729481        .       C       T       .       .       Sample=NA20276;GT=0/1;PCR_454_AR=401;PCR_454_RR=408\r
+20     62899302        .       T       C       .       .       Sample=HG00104;GT=0/0;PCR_454_AR=10;PCR_454_RR=871\r
+20     62899302        .       T       C       .       .       Sample=HG00128;GT=0/0;PCR_454_AR=2;PCR_454_RR=950\r
diff --git a/tests/tabix_data/vcf/3.vcf b/tests/tabix_data/vcf/3.vcf
new file mode 100644 (file)
index 0000000..a3f2e0f
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,1000 @@
+##fileformat=VCFv4.0
+##filedate=2010-06-21
+##reference=NCBI36
+##INFO=<ID=GC, Number=0, Type=Flag, Description="Overlap with Gencode CCDS coding sequence">
+##INFO=<ID=DP, Number=1, Type=Integer, Description="Total number of reads in haplotype window">
+##INFO=<ID=AF, Number=1, Type=Float, Description="Dindel estimated population allele frequency">
+##INFO=<ID=CA, Number=1, Type=String, Description="Pilot 1 callability mask">
+##INFO=<ID=HP, Number=1, Type=Integer, Description="Reference homopolymer tract length">
+##INFO=<ID=NS, Number=1, Type=Integer, Description="Number of samples with data">
+##INFO=<ID=DB, Number=0, Type=Flag, Description="dbSNP membership build 129 - type match and indel sequence length match within 25 bp">
+##INFO=<ID=NR, Number=1, Type=Integer, Description="Number of reads covering non-ref variant on reverse strand">
+##INFO=<ID=NF, Number=1, Type=Integer, Description="Number of reads covering non-ref variant on forward strand">
+##FILTER=<ID=NoQCALL, Description="Variant called by Dindel but not confirmed by QCALL">
+#CHROM POS     ID      REF     ALT     QUAL    FILTER  INFO
+1      1000153 .       TCACAC  TC      100     PASS    AF=0.115095;HP=1;NF=16;NR=13;NS=52;CA=0;DP=615
+1      1000906 .       CAG     CG      48      PASS    AF=0.0772696;HP=1;NF=2;NR=9;NS=51;CA=0;DP=281
+1      1000950 rs60561655;-/G  CGG     CG      100     PASS    AF=0.447771;HP=5;DB;NF=10;NR=20;NS=50;CA=M;DP=291
+1      1010786 rs36095298;-/G,mills,venter     AC      AGC     100     PASS    AF=0.774334;HP=1;DB;NF=21;NR=27;NS=51;CA=0;DP=306
+1      1026158 .       TG      TGGGGGG 100     PASS    AF=0.115637;HP=1;NF=5;NR=2;NS=52;CA=0;DP=591
+1      1028860 mills,venter    ACTCC   AC      10      PASS    AF=0.0107751;HP=1;NF=5;NR=4;NS=52;CA=0;DP=522
+1      1040517 .       CA      CAA     100     PASS    AF=0.0577672;HP=1;NF=7;NR=4;NS=52;CA=0;DP=426
+1      1043690 rs5772037;-/G,venter    TG      TGG     100     PASS    AF=0.065857;HP=3;DB;NF=5;NR=8;NS=51;CA=0;DP=427
+1      1049375 .       TA      TACACACCTGAGCACACACACCTGTGCA    100     PASS    AF=0.0808078;HP=1;NF=1;NR=1;NS=51;CA=M;DP=643
+1      1055459 venter  ACC     AC      100     PASS    AF=0.936429;HP=2;NF=13;NR=24;NS=51;CA=M;DP=342
+1      1056251 rs34287831;-/A,venter   CT      CTT     100     PASS    AF=0.725164;HP=1;DB;NF=31;NR=20;NS=52;CA=0;DP=375
+1      1057459 rs55853944;-/AG,venter  CAGG    CG      100     PASS    AF=0.525146;HP=1;DB;NF=16;NR=18;NS=51;CA=0;DP=331
+1      1057537 rs35574593;-/CC,watson  TG      TGGG    100     PASS    AF=0.591248;HP=1;DB;NF=30;NR=12;NS=50;CA=0;DP=341
+1      1058532 rs34990026;-/A  GTT     GT      100     PASS    AF=0.702381;HP=4;DB;NF=29;NR=32;NS=52;CA=0;DP=405
+1      1058695 rs56086046;-/GCCTGCCTGCCCGGCC,watson    CGCCGCCTGCCTGCCCGG      CG      100     PASS    AF=0.601284;HP=1;DB;NF=24;NR=23;NS=51;CA=0;DP=365
+1      1073880 .       AC      ACC     13      PASS    AF=0.0555821;HP=2;NF=1;NR=6;NS=52;CA=0;DP=457
+1      1087270 mills,venter,watson     CCCCAC  CC      100     PASS    AF=0.990156;HP=4;NF=32;NR=27;NS=50;CA=0;DP=339
+1      1088683 rs5772039;-/C,venter    TCC     TC      100     PASS    AF=0.957928;HP=9;DB;NF=31;NR=26;NS=49;CA=0;DP=336
+1      1093553 .       TC      TCAC    100     PASS    AF=0.962343;HP=5;NF=44;NR=17;NS=51;CA=0;DP=324
+1      1111698 rs57346441;-/TG,watson  CA      CTGA    100     PASS    AF=0.0986662;HP=1;DB;NF=8;NR=5;NS=52;CA=0;DP=528
+1      1117471 .       GT      GTT     48      PASS    AF=0.04843;HP=6;NF=20;NR=8;NS=52;CA=0;DP=510
+1      1118641 .       CT      CTTAT   38      PASS    AF=0.0574453;HP=1;NF=5;NR=1;NS=51;CA=0;DP=424
+1      1119225 rs60117456;-/C  AC      ACC     50      PASS    AF=0.0255886;HP=4;DB;NF=8;NR=5;NS=52;CA=0;DP=522
+1      1121774 .       GCTGTTCAGACCTG  GG      100     PASS    AF=0.0749767;HP=1;NF=6;NR=6;NS=51;CA=0;DP=508
+1      1123178 .       AACA    AA      14      PASS    AF=0.0195065;HP=3;NF=2;NR=3;NS=49;CA=0;DP=329
+1      1134362 .       GGAG    GG      100     PASS    AF=0.142028;HP=2;NF=12;NR=17;NS=51;CA=0;DP=407
+1      1140087 .       TCA     TA      19      PASS    AF=0.0635822;HP=1;NF=2;NR=5;NS=51;CA=0;DP=446
+1      1141951 .       CTG     CG      100     PASS    AF=0.100135;HP=1;NF=7;NR=7;NS=52;CA=0;DP=463
+1      1148304 rs34808371;-/GT,venter  GCAC    GC      100     PASS    AF=0.0786699;HP=1;DB;NF=11;NR=18;NS=52;CA=0;DP=687
+1      1148425 rs57524763;-/AC AACA    AA      100     PASS    AF=0.0744913;HP=2;DB;NF=17;NR=8;NS=51;CA=0;DP=647
+1      1149524 .       GTTTTAT GT      100     PASS    AF=0.0475567;HP=4;NF=19;NR=14;NS=50;CA=0;DP=395
+1      1150963 .       CGCCACAGACACGGGCCACACACTCCACATG CG      100     PASS    AF=0.111384;HP=1;NF=46;NR=28;NS=50;CA=0;DP=510
+1      1151863 .       GT      GCT     100     PASS    AF=0.126132;HP=1;NF=8;NR=7;NS=52;CA=0;DP=416
+1      1153674 rs3831195;-/ACAG        GG      GGACAG  18      PASS    AF=0.0388728;HP=2;DB;NF=3;NR=2;NS=51;CA=0;DP=418
+1      1154612 .       GT      GCT     100     PASS    AF=0.0630518;HP=1;NF=7;NR=4;NS=52;CA=0;DP=531
+1      1155143 .       GCAC    GC      100     PASS    AF=0.0991605;HP=1;NF=25;NR=23;NS=52;CA=0;DP=540
+1      1155183 .       CATG    CG      100     PASS    AF=0.0714383;HP=1;NF=5;NR=8;NS=52;CA=0;DP=527
+1      1156953 rs57672822;-/ACCCCGGGA  CCCCCGGGAAC     CC      59      PASS    AF=0.0847102;HP=5;DB;NF=5;NR=8;NS=50;CA=0;DP=312
+1      1164370 .       AA      AACATGCATCCA    100     PASS    AF=0.0550752;HP=2;NF=2;NR=1;NS=51;CA=0;DP=481
+1      1166826 .       AC      ACC     11      PASS    AF=0.0735648;HP=1;NF=1;NR=10;NS=52;CA=0;DP=379
+1      1167781 rs3835300;-/T   CTG     CG      100     PASS    AF=0.0719128;HP=1;DB;NF=3;NR=3;NS=50;CA=0;DP=360
+1      1180776 rs35025185;-/T,mills    CTT     CT      15      PASS    AF=0.0182173;HP=3;DB;NF=5;NR=1;NS=52;CA=0;DP=526
+1      1184391 .       GC      GCAC    16      PASS    AF=0.0187867;HP=1;NF=2;NR=6;NS=51;CA=M;DP=521
+1      1204971 .       TGG     TG      100     PASS    AF=0.0564084;HP=6;NF=11;NR=6;NS=50;CA=0;DP=419
+1      1207801 rs35647244;-/GT,watson  CC      CCAC    100     PASS    AF=0.034013;HP=2;DB;NF=9;NR=4;NS=52;CA=0;DP=624
+1      1213486 .       GTCT    GT      100     PASS    AF=0.504039;HP=1;NF=9;NR=5;NS=50;CA=M;DP=372
+1      1217527 rs3831920;-/CTCA,watson TTGAGT  TT      100     PASS    AF=0.098042;HP=2;DB;NF=11;NR=14;NS=51;CA=0;DP=444
+1      1224625 .       AGG     AG      40      PASS    AF=0.0395551;HP=5;NF=4;NR=4;NS=51;CA=0;DP=406
+1      1228918 rs35156558;-/GGA,venter CC      CCCTC   100     PASS    AF=0.999996;HP=5;DB;NF=24;NR=30;NS=49;CA=0;DP=268
+1      1232491 .       CTACCTGACCTTC   CC      13      PASS    AF=0.0510512;HP=1;NF=5;NR=5;NS=52;CA=0;DP=510
+1      1236119 .       CGGCTCTGGGTCACAGGTG     CG      17      PASS    AF=0.0581287;HP=2;NF=6;NR=8;NS=49;CA=M;DP=277
+1      1245266 rs5772041;-/G,venter    TGG     TG      100     PASS    AF=0.928175;HP=4;DB;NF=39;NR=39;NS=52;CA=0;DP=431
+1      1286232 venter,watson   GACA    GA      100     PASS    AF=0.878082;HP=1;NF=31;NR=15;NS=50;CA=0;DP=249
+1      1292184 watson  TG      TGTGTGCAG       100     PASS    AF=0.92351;HP=1;NF=36;NR=17;NS=51;CA=0;DP=633
+1      1475307 rs35008066;-/G,venter   GCC     GC      59      PASS    AF=0.0854422;HP=2;DB;NF=2;NR=3;NS=52;CA=0;DP=372
+1      1476800 rs3835461;-/C   AG      AGG     100     PASS    AF=0.239098;HP=1;DB;NF=13;NR=18;NS=52;CA=0;DP=491
+1      1482738 rs34962853;-/AT,watson  CATA    CA      100     PASS    AF=0.1747;HP=1;DB;NF=28;NR=14;NS=51;CA=0;DP=441
+1      1483969 rs3835460;-/T,mills     CG      CAG     100     PASS    AF=0.180671;HP=5;DB;NF=6;NR=13;NS=52;CA=0;DP=512
+1      1484993 rs35384209;-/CT CA      CAGA    100     PASS    AF=0.182804;HP=1;DB;NF=9;NR=15;NS=52;CA=0;DP=441
+1      1485720 .       TC      TCGTAC  39      PASS    AF=0.0207216;HP=1;NF=1;NR=3;NS=51;CA=0;DP=498
+1      1487504 rs35885836;-/AGAA,venter,watson TTTTCT  TT      100     PASS    AF=0.210263;HP=4;DB;NF=16;NR=20;NS=52;CA=0;DP=574
+1      1490348 rs3835459;-/CATGATCCGCCTGCCTT   CAAGGCAGGCGGATCATGA     CA      59      PASS    AF=0.230233;HP=2;DB;NF=5;NR=66;NS=51;CA=M;DP=377
+1      1490873 .       GT      GGGCCCGACGGTGCT 100     PASS    AF=0.133846;HP=1;NF=8;NR=3;NS=52;CA=0;DP=572
+1      1495811 venter  ACC     AC      100     PASS    AF=0.232263;HP=8;NF=12;NR=29;NS=52;CA=0;DP=481
+1      1502734 rs35576478;-/G,venter   AC      ACC     100     PASS    AF=0.221604;HP=4;DB;NF=16;NR=9;NS=51;CA=0;DP=388
+1      1507556 .       AC      ACC     42      PASS    AF=0.0176775;HP=1;NF=1;NR=4;NS=51;CA=0;DP=511
+1      1508235 .       CT      CTT     100     PASS    AF=0.2555;HP=1;NF=18;NR=15;NS=51;CA=0;DP=535
+1      1508689 .       CG      CGG     100     PASS    AF=0.0922424;HP=5;NF=19;NR=17;NS=51;CA=0;DP=568
+1      1510533 .       TTTTGT  TT      100     PASS    AF=0.423696;HP=7;NF=37;NR=39;NS=52;CA=0;DP=387
+1      1511216 .       TA      TAATAATAATAAAA  39      PASS    AF=0.542394;HP=2;NF=7;NR=3;NS=51;CA=0;DP=331
+1      1512041 .       CAAAAGTAAA      CA      33      PASS    AF=0.0333379;HP=4;NF=12;NR=13;NS=52;CA=0;DP=440
+1      1514403 .       TTTTAT  TT      100     PASS    AF=0.771875;HP=5;NF=24;NR=58;NS=50;CA=0;DP=243
+1      1520133 rs34595829;-/GT,venter  GA      GACA    100     PASS    AF=0.432871;HP=1;DB;NF=24;NR=19;NS=52;CA=0;DP=966
+1      1520238 venter,watson   TG      TGAGACAG        100     PASS    AF=0.606404;HP=1;NF=52;NR=36;NS=52;CA=M;DP=847
+1      1520271 .       CA      CAGA    100     PASS    AF=0.169509;HP=1;NF=48;NR=39;NS=52;CA=M;DP=736
+1      1520357 .       CAGAGAGA        CA      100     PASS    AF=0.218715;HP=1;NF=44;NR=30;NS=52;CA=M;DP=708
+1      1520549 .       CAGA    CA      100     PASS    AF=0.257166;HP=1;NF=41;NR=40;NS=52;CA=0;DP=790
+1      1520595 .       CAGA    CA      100     PASS    AF=0.107822;HP=1;NF=52;NR=44;NS=52;CA=M;DP=804
+1      1520983 .       GA      GAGAGAGACA      34      PASS    AF=0.0372679;HP=1;NF=2;NR=3;NS=52;CA=0;DP=610
+1      1521139 .       GA      GAGACA  100     PASS    AF=0.667375;HP=1;NF=10;NR=7;NS=52;CA=M;DP=537
+1      1521387 .       GAGACA  GA      100     PASS    AF=0.361313;HP=1;NF=13;NR=34;NS=52;CA=M;DP=598
+1      1521833 .       GACA    GA      100     PASS    AF=0.193306;HP=1;NF=23;NR=17;NS=52;CA=0;DP=737
+1      1522371 .       CC      CCCTCAGCTGGACTC 100     PASS    AF=0.480499;HP=3;NF=11;NR=12;NS=51;CA=0;DP=535
+1      1530305 .       AG      AGG     15      PASS    AF=0.0737746;HP=3;NF=13;NR=4;NS=51;CA=0;DP=569
+1      1536491 rs36101309;-/GA ATCT    AT      100     PASS    AF=0.128408;HP=1;DB;NF=22;NR=14;NS=51;CA=0;DP=621
+1      1537805 venter  TT      TCT     100     PASS    AF=0.350404;HP=8;NF=3;NR=18;NS=52;CA=M;DP=419
+1      1539301 .       CAAAAGA CA      56      PASS    AF=0.0156055;HP=4;NF=9;NR=2;NS=51;CA=0;DP=577
+1      1549566 venter  ATT     AT      100     PASS    AF=0.505899;HP=3;NF=25;NR=27;NS=52;CA=0;DP=451
+1      1554815 .       TGG     TG      100     PASS    AF=0.158582;HP=6;NF=12;NR=6;NS=48;CA=0;DP=271
+1      1575329 .       GCAAC   GC      12      PASS    AF=0.0174116;HP=1;NF=27;NR=21;NS=52;CA=0;DP=554
+1      1575977 rs35072492;-/A  TCC     TC      100     PASS    AF=0.626664;HP=3;DB;NF=23;NR=50;NS=51;CA=0;DP=361
+1      1577203 venter,watson   AA      AAAACA  100     PASS    AF=0.979791;HP=4;NF=59;NR=37;NS=52;CA=0;DP=498
+1      1584062 rs5772057;-/T,venter    CT      CTT     100     PASS    AF=0.992883;HP=1;DB;NF=34;NR=22;NS=46;CA=0;DP=291
+1      1589954 .       TTGT    TT      100     PASS    AF=0.0452889;HP=8;NF=5;NR=13;NS=51;CA=0;DP=424
+1      1611607 venter  ATA     AA      100     PASS    AF=0.528232;HP=1;NF=7;NR=10;NS=50;CA=M;DP=243
+1      1615408 venter  AC      ACGC    100     PASS    AF=0.553544;HP=9;NF=16;NR=20;NS=51;CA=M;DP=247
+1      1618248 .       CTGA    CA      100     PASS    AF=0.0412633;HP=1;NF=5;NR=2;NS=51;CA=0;DP=789
+1      1637509 venter  CG      CTG     100     PASS    AF=0.956642;HP=1;NF=57;NR=41;NS=52;CA=M;DP=533
+1      1637828 rs34259364;-/AT,mills   CG      CATG    100     PASS    AF=0.24683;HP=1;DB;NF=5;NR=57;NS=52;CA=0;DP=744
+1      1638199 .       GA      GATGTTAA        100     PASS    AF=0.962724;HP=1;NF=22;NR=22;NS=52;CA=0;DP=480
+1      1638366 venter  AT      ATT     100     PASS    AF=0.471703;HP=4;NF=50;NR=16;NS=52;CA=0;DP=738
+1      1638469 rs34392519;-/AGC,mills  GA      GAGCA   100     PASS    AF=0.428728;HP=1;DB;NF=34;NR=23;NS=52;CA=0;DP=804
+1      1639339 rs36127854;-/CT,venter  TA      TAGA    100     PASS    AF=0.27562;HP=1;DB;NF=10;NR=15;NS=52;CA=0;DP=961
+1      1639610 .       ATTCTC  AC      59      PASS    AF=0.0697107;HP=2;NF=31;NR=24;NS=52;CA=M;DP=817
+1      1640937 venter  CG      CTCGCTCTGTCACCCAGGCTG   100     PASS    AF=0.639983;HP=2;NF=4;NR=3;NS=52;CA=M;DP=638
+1      1641995 rs34986248;-/ATT,venter,watson  CT      CTTAT   100     PASS    AF=0.924551;HP=2;DB;NF=33;NR=29;NS=52;CA=0;DP=414
+1      1654133 rs34171153;-/ATCG       TA      TATCGA  100     PASS    AF=0.2409;HP=1;DB;NF=10;NR=13;NS=52;CA=0;DP=463
+1      1656307 rs35516110;-/GTTT,venter        GT      GGTTTT  100     PASS    AF=0.686901;HP=6;DB;NF=22;NR=20;NS=51;CA=0;DP=293
+1      1674207 venter  CC      CCCTC   100     PASS    AF=0.303909;HP=3;NF=26;GC;NR=29;NS=52;CA=0;DP=534
+1      1675781 .       TCCCTGGGACCGAAGTCGCCCCAC        TC      100     PASS    AF=0.270579;HP=3;NF=25;NR=24;NS=52;CA=0;DP=473
+1      1679986 rs35357728;-/TG,mills,venter,watson     AA      AACA    100     PASS    AF=0.956895;HP=4;DB;NF=60;NR=58;NS=52;CA=0;DP=520
+1      1684058 .       AAATGA  AA      100     PASS    AF=0.508762;HP=4;NF=48;NR=55;NS=52;CA=0;DP=471
+1      1684177 .       TG      TGGGGGGGG       100     PASS    AF=0.126497;HP=1;NF=5;NR=3;NS=51;CA=0;DP=449
+1      1691268 rs35459537;-/AAAAACAAAAAC,mills,venter  CAAAACAAAAACAA  CA      100     PASS    AF=0.305762;HP=4;DB;NF=54;NR=62;NS=51;CA=0;DP=443
+1      1697760 mills,venter    GAAACA  GA      100     PASS    AF=0.276545;HP=3;NF=21;NR=43;NS=52;CA=0;DP=564
+1      1700966 rs34974144;-/AT,venter  TT      TTGT    100     PASS    AF=0.37365;HP=3;DB;NF=34;NR=30;NS=52;CA=0;DP=445
+1      1715347 .       TG      TGGGGGG 24      PASS    AF=0.0415083;HP=1;NF=4;NR=5;NS=52;CA=0;DP=519
+1      1717050 rs56070879;-/ACAAAAAA,venter    TC      TCAAAAAAAC      100     PASS    AF=0.90619;HP=1;DB;NF=11;NR=7;NS=52;CA=0;DP=442
+1      1729683 .       ACT     AT      100     PASS    AF=0.104273;HP=1;NF=9;NR=11;NS=52;CA=0;DP=587
+1      1729941 rs55730045;-/TTTG,watson        TTTTGT  TT      100     PASS    AF=0.270089;HP=5;DB;NF=25;NR=44;NS=52;CA=M;DP=458
+1      1733706 rs4012956;-/GT,mills,venter     TA      TACA    100     PASS    AF=0.737658;HP=1;DB;NF=58;NR=26;NS=52;CA=M;DP=547
+1      1750193 rs34820549;-/TG,venter  TA      TACA    100     PASS    AF=0.417596;HP=1;DB;NF=42;NR=29;NS=52;CA=0;DP=495
+1      1761838 .       GCAC    GC      17      PASS    AF=0.0186129;HP=1;NF=23;NR=23;NS=52;CA=0;DP=566
+1      1767123 .       TACACACACACACACACACACACACACACACA        TA      100     PASS    AF=0.205885;HP=1;NF=32;NR=32;NS=52;CA=0;DP=560
+1      1767308 .       AG      ATG     12      PASS    AF=0.363076;HP=2;NF=25;NR=12;NS=52;CA=0;DP=611
+1      1768358 .       ACA     AA      11      NoQCALL AF=0.0311546;HP=1;NF=1;NR=4;NS=52;CA=0;DP=502
+1      1768592 .       AC      ACAACAAAATCCCTTTTTC     100     PASS    AF=0.0974177;HP=1;NF=2;NR=5;NS=52;CA=0;DP=597
+1      1769336 rs34011234;-/TA,venter,watson   CT      CTAT    100     PASS    AF=0.385782;HP=1;DB;NF=21;NR=42;NS=52;CA=0;DP=534
+1      1769673 rs56979938;-/A,venter   AGA     AA      21      PASS    AF=0.232442;HP=1;DB;NF=9;NR=3;NS=52;CA=0;DP=465
+1      1771291 .       TG      TGG     100     PASS    AF=0.18937;HP=2;NF=5;NR=15;NS=52;CA=0;DP=590
+1      1778545 .       TA      TAAA    100     PASS    AF=0.155668;HP=3;NF=5;NR=12;NS=52;CA=0;DP=621
+1      1778604 rs34483468;-/AGCC,venter        GG      GGGCTG  100     PASS    AF=0.135521;HP=4;DB;NF=22;NR=28;NS=52;CA=0;DP=629
+1      1786587 watson  ACCA    AA      26      PASS    AF=0.0677562;HP=2;NF=15;NR=22;NS=52;CA=M;DP=404
+1      1797136 rs59528461;-/C,venter   TCC     TC      100     PASS    AF=0.94689;HP=10;DB;NF=58;NR=57;NS=52;CA=0;DP=531
+1      1797791 rs35226472;-/CT,venter  CG      CGAG    100     PASS    AF=0.383219;HP=1;DB;NF=64;NR=38;NS=52;CA=0;DP=673
+1      1802225 rs34339560;-/A,mills,venter     CAA     CA      100     PASS    AF=0.973419;HP=2;DB;NF=64;NR=71;NS=52;CA=0;DP=635
+1      1802305 .       GGAG    GG      100     PASS    AF=0.273326;HP=2;NF=41;NR=34;NS=52;CA=0;DP=695
+1      1806743 .       TTAGAT  TT      100     PASS    AF=0.179706;HP=2;NF=9;NR=6;NS=52;CA=0;DP=377
+1      1809681 .       AG      AGG     21      PASS    AF=0.133833;HP=2;NF=7;NR=3;NS=52;CA=0;DP=482
+1      1810283 .       AC      ACC     30      PASS    AF=0.0430128;HP=2;NF=4;NR=11;NS=52;CA=0;DP=523
+1      1810555 .       CTTAAT  CT      100     PASS    AF=0.0498379;HP=2;NF=9;NR=7;NS=52;CA=0;DP=521
+1      1812953 rs34135959;-/TCTC       CA      CAGAGA  100     PASS    AF=0.311555;HP=1;DB;NF=6;NR=8;NS=42;CA=0;DP=242
+1      1819911 .       CATG    CG      100     PASS    AF=0.0319085;HP=1;NF=3;NR=6;NS=52;CA=0;DP=765
+1      1819947 rs60517384;-/AAGTTGGATATACACACAT        CACACACATAAGTTGGATATA   CA      100     PASS    AF=0.0935091;HP=1;DB;NF=59;NR=69;NS=52;CA=0;DP=854
+1      1825723 venter  AA      AAAATAAATAAATA  100     PASS    AF=0.348026;HP=4;NF=9;NR=10;NS=52;CA=0;DP=373
+1      1835530 .       GTGAGAGTTGTTG   GG      100     PASS    AF=0.15298;HP=1;NF=12;NR=1;NS=51;CA=0;DP=528
+1      1838692 rs5772055;-/AC,mills    AA      AACA    100     PASS    AF=0.0441449;HP=3;DB;NF=2;NR=3;NS=51;CA=0;DP=360
+1      1843475 rs3039777;-/ACTG,venter,watson  TC      TCTGAC  100     PASS    AF=0.999998;HP=1;DB;NF=38;NR=39;NS=50;CA=0;DP=422
+1      1850674 .       AGG     AG      100     PASS    AF=0.474687;HP=3;NF=7;NR=1;NS=49;CA=0;DP=271
+1      1855740 watson  GT      GTGTAT  100     PASS    AF=0.646893;HP=1;NF=42;NR=28;NS=51;CA=0;DP=653
+1      1856762 .       CACAGG  CG      14      PASS    AF=0.0324715;HP=1;NF=1;NR=2;NS=50;CA=M;DP=379
+1      1857166 .       TACA    TA      100     PASS    AF=0.0531955;HP=1;NF=39;NR=29;NS=52;CA=0;DP=634
+1      1859140 mills   ACACCAGGTCCACCTCTGGACACAGGTCCACCC       AC      100     PASS    AF=0.180806;HP=1;NF=26;NR=15;NS=52;CA=0;DP=672
+1      1859353 rs35385292;-/TC,venter  ACTC    AC      100     PASS    AF=0.493919;HP=1;DB;NF=26;NR=38;NS=52;CA=M;DP=641
+1      1859424 rs34242289;-/CA,venter  TCAG    TG      100     PASS    AF=0.3962;HP=1;DB;NF=40;NR=32;NS=52;CA=M;DP=695
+1      1859520 .       TCAC    TC      100     PASS    AF=0.234548;HP=1;NF=26;NR=23;NS=52;CA=0;DP=729
+1      1859631 rs35205487;-/GA,venter  AC      ACTC    100     PASS    AF=0.347295;HP=1;DB;NF=15;NR=28;NS=52;CA=0;DP=710
+1      1859792 rs34050188;-/AT,watson  CG      CATG    100     PASS    AF=0.715253;HP=1;DB;NF=35;NR=44;NS=52;CA=0;DP=590
+1      1864576 .       CG      CGG     13      PASS    AF=0.0158703;HP=1;NF=3;NR=2;NS=51;CA=0;DP=556
+1      1867274 rs34832935;-/C  TGG     TG      100     PASS    AF=0.304336;HP=8;DB;NF=38;NR=23;NS=51;CA=0;DP=538
+1      1869711 rs56005703;-/ATAT,watson        AA      AATATA  100     PASS    AF=0.652198;HP=3;DB;NF=16;NR=16;NS=51;CA=0;DP=349
+1      1870233 .       TC      TCCCTCCCTTCTTTCCTTCCCTTTCCCTCC  100     PASS    AF=0.408049;HP=2;NF=11;NR=9;NS=52;CA=0;DP=814
+1      1870305 .       CC      CCTTTCCCTCCCTTACTCCTTCCTTCCTTC  100     PASS    AF=0.121733;HP=4;NF=1;NR=5;NS=52;CA=0;DP=680
+1      1870363 .       CT      CTT     100     PASS    AF=0.11398;HP=2;NF=4;NR=6;NS=52;CA=0;DP=680
+1      1870863 rs35875775;-/C,venter   TT      TGT     100     PASS    AF=0.744276;HP=2;DB;NF=43;NR=22;NS=52;CA=0;DP=455
+1      1873164 .       GT      GTT     100     PASS    AF=0.387355;HP=3;NF=20;NR=18;NS=52;CA=0;DP=523
+1      1873889 rs58267869;-/AAGA       AA      AAAAGA  100     PASS    AF=0.252999;HP=5;DB;NF=57;NR=31;NS=52;CA=0;DP=536
+1      1874122 rs35595511;-/T  TAA     TA      100     PASS    AF=0.338059;HP=9;DB;NF=38;NR=38;NS=51;CA=0;DP=519
+1      1876064 watson  AG      AGAGTG  100     PASS    AF=0.0829624;HP=1;NF=6;NR=5;NS=52;CA=0;DP=465
+1      1876204 .       AC      ACAGC   100     PASS    AF=0.256855;HP=1;NF=14;NR=10;NS=52;CA=0;DP=483
+1      1876616 .       GC      GCTGGTGCGCGTC   100     PASS    AF=0.0656988;HP=1;NF=5;NR=2;NS=51;CA=0;DP=420
+1      1876971 rs3838975;-/G   GCC     GC      21      PASS    AF=0.201137;HP=2;DB;NF=15;NR=6;NS=52;CA=0;DP=439
+1      1877704 .       CCTGC   CC      19      PASS    AF=0.0183173;HP=2;NF=7;NR=13;NS=52;CA=0;DP=436
+1      1884832 rs34937714;-/T  CA      CAA     100     PASS    AF=0.254902;HP=3;DB;NF=27;NR=6;NS=52;CA=0;DP=449
+1      1886549 rs3838974;-/T   GG      GAG     100     PASS    AF=0.153123;HP=4;DB;NF=11;NR=10;NS=52;CA=0;DP=456
+1      1889260 rs55954278;-/ATGA       GT      GTGAAT  100     PASS    AF=0.630203;HP=1;DB;NF=12;NR=17;NS=52;CA=0;DP=656
+1      1889311 .       GTGAAT  GT      100     PASS    AF=0.167491;HP=1;NF=33;NR=18;NS=52;CA=0;DP=606
+1      1889402 rs34520694;-/GTGA       AT      ATGAGT  100     PASS    AF=0.306146;HP=1;DB;NF=24;NR=32;NS=52;CA=0;DP=916
+1      1889884 rs56985589;-/G  TGC     TC      100     PASS    AF=0.347999;HP=1;DB;NF=20;NR=28;NS=51;CA=0;DP=537
+1      1889966 rs61233860;-/CCT,watson TC      TCTCC   100     PASS    AF=0.211403;HP=1;DB;NF=12;NR=14;NS=52;CA=0;DP=554
+1      1892548 .       ACTC    AC      21      PASS    AF=0.0207771;HP=1;NF=4;NR=3;NS=52;CA=0;DP=750
+1      1900826 .       AACA    AA      100     PASS    AF=0.122368;HP=2;NF=13;NR=6;NS=52;CA=M;DP=435
+1      1908846 venter  CT      CTT     100     PASS    AF=0.30139;HP=10;NF=11;NR=28;NS=51;CA=0;DP=350
+1      1910458 .       TGAG    TG      15      PASS    AF=0.0208928;HP=1;NF=23;NR=12;NS=52;CA=0;DP=514
+1      1927207 rs61162553;-/GTTCTCTCTCTCTCTCTCTC,venter        CTCTCTCTCTCTCTCTCTCGTT  CT      100     PASS    AF=0.399955;HP=1;DB;NF=34;NR=47;NS=51;CA=0;DP=427
+1      1929307 rs36066718;-/T  CAA     CA      30      PASS    AF=0.114706;HP=10;DB;NF=24;NR=15;NS=52;CA=0;DP=520
+1      1933578 .       CA      CAAAATAAAATA    100     PASS    AF=0.562689;HP=4;NF=21;NR=28;NS=52;CA=0;DP=359
+1      1947079 rs3831907;-/C   CGG     CG      100     PASS    AF=0.131218;HP=3;DB;NF=4;NR=10;NS=52;CA=0;DP=316
+1      1949721 rs35354651;-/G  GC      GCC     100     PASS    AF=0.218024;HP=1;DB;NF=11;NR=5;NS=51;CA=0;DP=306
+1      1965555 rs56225932;-/CA,venter  TACA    TA      100     PASS    AF=0.743144;HP=1;DB;NF=50;NR=67;NS=52;CA=0;DP=679
+1      1966402 venter,watson   GC      GCCGCC  100     PASS    AF=0.988372;HP=2;NF=36;NR=16;NS=46;CA=0;DP=232
+1      1989567 .       AC      ACC     12      PASS    AF=0.0334278;HP=6;NF=10;NR=9;NS=52;CA=0;DP=367
+1      1992350 .       CA      CACCTGGGCGTGTGA 56      PASS    AF=0.19029;HP=1;NF=6;NR=3;NS=52;CA=0;DP=412
+1      1993852 rs34106910;-/G,venter   GCC     GC      100     PASS    AF=0.178292;HP=2;DB;NF=15;NR=7;NS=51;CA=0;DP=388
+1      1996153 .       GT      GTT     59      PASS    AF=0.126167;HP=8;NF=7;NR=14;NS=51;CA=0;DP=436
+1      2010531 rs35300904;-/C,venter   CA      CGA     100     PASS    AF=0.2131;HP=1;DB;NF=18;NR=7;NS=52;CA=0;DP=418
+1      2019409 rs55716481;-/AGTGACTAAGGTGACCAGG,venter CA      CAGGTGACCAGGAGTGACTAA   100     PASS    AF=0.901172;HP=1;DB;NF=17;NR=16;NS=52;CA=0;DP=600
+1      2019867 rs58602729;-/CT CCTC    CC      100     PASS    AF=0.15521;HP=3;DB;NF=6;NR=12;NS=52;CA=0;DP=542
+1      2019961 mills   CGTTTTGTTTTG    CG      100     PASS    AF=0.239816;HP=1;NF=44;NR=59;NS=52;CA=0;DP=513
+1      2027926 .       CT      CTT     100     PASS    AF=0.591615;HP=1;NF=7;NR=4;NS=51;CA=M;DP=262
+1      2028042 .       CT      CTT     100     PASS    AF=0.242884;HP=1;NF=28;NR=12;NS=51;CA=M;DP=738
+1      2031773 .       GA      GGGTA   100     PASS    AF=0.197429;HP=1;NF=15;NR=7;NS=51;CA=0;DP=405
+1      2036771 .       AC      ACCCC   100     PASS    AF=0.173415;HP=3;NF=1;NR=5;NS=52;CA=0;DP=532
+1      2040362 venter  CT      CTT     100     PASS    AF=0.61548;HP=3;NF=31;NR=33;NS=52;CA=0;DP=522
+1      2042747 .       CG      CGGGGG  100     PASS    AF=0.132985;HP=2;NF=11;NR=6;NS=51;CA=0;DP=880
+1      2042976 .       GT      GTTATT  100     PASS    AF=0.225391;HP=2;NF=13;NR=25;NS=51;CA=M;DP=882
+1      2045297 .       GT      GTAGTTATT       36      PASS    AF=0.513037;HP=2;NF=5;NR=16;NS=46;CA=M;DP=269
+1      2048642 rs56348719;-/A  CAG     CG      100     PASS    AF=0.626672;HP=1;DB;NF=15;NR=37;NS=51;CA=0;DP=337
+1      2055895 watson  AT      AATT    100     PASS    AF=0.183323;HP=1;NF=10;NR=14;NS=52;CA=0;DP=511
+1      2058884 watson  GCCTC   GC      100     PASS    AF=0.258368;HP=2;NF=23;NR=18;NS=51;CA=0;DP=533
+1      2068674 .       CTCTAT  CT      100     PASS    AF=0.0693035;HP=1;NF=7;NR=5;NS=52;CA=0;DP=600
+1      2076576 .       GTGAT   GT      100     PASS    AF=0.0691863;HP=1;NF=32;NR=24;NS=52;CA=0;DP=918
+1      2076741 .       GTGAT   GT      49      PASS    AF=0.200249;HP=1;NF=13;NR=21;NS=51;CA=0;DP=758
+1      2076895 .       GTGAT   GT      100     PASS    AF=0.134423;HP=1;NF=21;NR=19;NS=51;CA=0;DP=658
+1      2076954 rs60433546;-/ATG        AA      AATGA   100     PASS    AF=0.310432;HP=2;DB;NF=12;NR=27;NS=52;CA=0;DP=664
+1      2079377 rs3835418;-/T   CT      CTT     100     PASS    AF=0.201153;HP=1;DB;NF=13;NR=15;NS=52;CA=0;DP=451
+1      2081537 rs56068331;-/GTGT       CGTGTG  CG      13      PASS    AF=0.276967;HP=1;DB;NF=58;NR=66;NS=52;CA=0;DP=516
+1      2085600 rs3835419;-/CTGGGCCAACCC        GA      GACCCCTGGGCCAA  100     PASS    AF=0.243746;HP=1;DB;NF=11;NR=6;NS=52;CA=0;DP=535
+1      2087974 .       GCC     GC      15      PASS    AF=0.0623565;HP=8;NF=7;NR=14;NS=52;CA=0;DP=325
+1      2089182 rs34571180;-/CTC,mills,venter   GCCTC   GC      100     PASS    AF=0.116512;HP=2;DB;NF=9;NR=4;NS=51;CA=0;DP=440
+1      2089950 .       CG      CGGGG   100     PASS    AF=0.178382;HP=2;NF=20;NR=7;NS=51;CA=0;DP=444
+1      2091793 rs56317708;-/GATA,venter,watson AA      AAGATA  100     PASS    AF=0.896718;HP=2;DB;NF=37;NR=55;NS=52;CA=0;DP=525
+1      2094394 watson  TCCACC  TC      100     PASS    AF=0.191274;HP=2;NF=15;NR=11;NS=52;CA=0;DP=554
+1      2099298 .       TG      TGG     100     PASS    AF=0.234547;HP=1;NF=15;NR=4;NS=51;CA=0;DP=434
+1      2101678 .       AGACG   AG      100     PASS    AF=0.0220699;HP=1;NF=10;NR=4;NS=51;CA=0;DP=533
+1      2104518 rs55672189;-/CGTCTC,venter      AG      AGTCTCCG        32      PASS    AF=0.0318159;HP=1;DB;NF=1;NR=2;NS=51;CA=0;DP=303
+1      2110593 rs34825103;-/C  TG      TGG     100     PASS    AF=0.0674605;HP=1;DB;NF=1;NR=4;NS=52;CA=M;DP=336
+1      2114205 .       TT      TTTGT   14      PASS    AF=0.0440601;HP=4;NF=24;NR=27;NS=52;CA=0;DP=414
+1      2118677 rs35613376;-/T,venter   GA      GAA     100     PASS    AF=0.110597;HP=1;DB;NF=4;NR=6;NS=51;CA=0;DP=395
+1      2129208 venter  CGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG  CG      100     PASS    AF=0.312577;HP=1;NF=50;NR=42;NS=51;CA=0;DP=395
+1      2136104 rs34745034;-/AC,venter,watson   CTGT    CT      100     PASS    AF=0.148774;HP=1;DB;NF=9;NR=15;NS=51;CA=0;DP=394
+1      2147798 .       CGG     CG      100     PASS    AF=0.069257;HP=5;NF=3;NR=7;NS=51;CA=0;DP=433
+1      2156467 rs34646035;-/A,venter   GG      GTG     100     PASS    AF=0.0650203;HP=2;DB;NF=3;NR=2;NS=51;CA=0;DP=299
+1      2163248 rs34969427;-/CA,venter,watson   CT      CTGT    59      PASS    AF=0.323344;HP=1;DB;NF=36;NR=42;NS=52;CA=0;DP=622
+1      2168152 rs34184068;-/C  TG      TGG     100     PASS    AF=0.267631;HP=8;DB;NF=12;NR=25;NS=52;CA=0;DP=462
+1      2173905 rs59705675;-/C,venter   GCC     GC      100     PASS    AF=0.519185;HP=4;DB;NF=28;NR=31;NS=52;CA=0;DP=472
+1      2178426 .       ATCTCT  AT      59      PASS    AF=0.0153899;HP=1;NF=1;NR=2;NS=52;CA=0;DP=558
+1      2180516 .       TG      TGGG    15      PASS    AF=0.10873;HP=1;NF=7;NR=3;NS=52;CA=0;DP=495
+1      2193017 rs35691128;-/C,venter   TG      TGG     100     PASS    AF=0.296206;HP=9;DB;NF=9;NR=11;NS=52;CA=0;DP=367
+1      2204648 .       AGGGG   AG      100     PASS    AF=0.0847086;HP=8;NF=9;NR=7;NS=52;CA=0;DP=441
+1      2211603 .       TG      TGGGGGGGGGG     100     PASS    AF=0.176;HP=1;NF=5;NR=9;NS=52;CA=0;DP=507
+1      2211835 rs35471620;-/C,venter   CG      CGG     100     PASS    AF=0.403922;HP=3;DB;NF=20;NR=20;NS=51;CA=0;DP=363
+1      2213004 rs35841716;-/G,mills,venter     TGG     TG      100     PASS    AF=0.938006;HP=7;DB;NF=35;NR=9;NS=52;CA=0;DP=297
+1      2214726 .       GC      GCC     100     PASS    AF=0.415474;HP=9;NF=18;NR=19;NS=51;CA=0;DP=416
+1      2220552 rs35472917;-/C,venter   AGG     AG      100     PASS    AF=0.609848;HP=9;DB;NF=24;NR=22;NS=51;CA=0;DP=385
+1      2221276 .       GC      GCC     23      PASS    AF=0.0895016;HP=2;NF=1;NR=11;NS=50;CA=0;DP=396
+1      2222657 .       AC      ACC     16      PASS    AF=0.0530452;HP=2;NF=1;NR=3;NS=51;CA=0;DP=404
+1      2223900 .       CAGGA   CA      100     PASS    AF=0.105506;HP=1;NF=9;NR=6;NS=52;CA=0;DP=517
+1      2232109 .       CAGG    CG      100     PASS    AF=0.220422;HP=1;NF=14;NR=13;NS=51;CA=0;DP=430
+1      2233476 rs34394327;-/CGTTT,mills,venter,watson  CC      CCGTTTC 100     PASS    AF=0.982218;HP=3;DB;NF=18;NR=31;NS=52;CA=0;DP=378
+1      2238242 rs56200665;-/C,mills    GG      GCG     100     PASS    AF=0.745403;HP=4;DB;NF=37;NR=40;NS=51;CA=0;DP=419
+1      2242260 rs34121936;-/C  AGG     AG      100     PASS    AF=0.107749;HP=4;DB;NF=7;NR=6;NS=51;CA=0;DP=427
+1      2246276 rs61120130;-/TGC,venter GG      GGCTG   100     PASS    AF=0.447977;HP=3;DB;NF=13;NR=17;NS=51;CA=0;DP=403
+1      2246469 .       TT      TTCCCTCCCTTCCTTCCTTCCCTCCCT     100     PASS    AF=0.0710328;HP=3;NF=8;NR=6;NS=51;CA=B;DP=731
+1      2246586 rs59175712;-/CT CC      CCTC    100     PASS    AF=0.378253;HP=2;DB;NF=33;NR=29;NS=50;CA=0;DP=515
+1      2248450 rs61135926;-/CACA       AA      AACACA  100     PASS    AF=0.367115;HP=3;DB;NF=24;NR=19;NS=51;CA=0;DP=445
+1      2248486 .       CAGA    CA      100     PASS    AF=0.108968;HP=1;NF=14;NR=11;NS=51;CA=M;DP=382
+1      2248806 rs59142249;-/A  CA      CAA     100     PASS    AF=0.0756571;HP=1;DB;NF=4;NR=12;NS=51;CA=0;DP=728
+1      2255198 .       TGCTGGAAAGAACAG TG      100     PASS    AF=0.115149;HP=1;NF=9;NR=12;NS=51;CA=0;DP=470
+1      2267148 .       ACACACAGA       AA      100     PASS    AF=0.128331;HP=1;NF=4;NR=6;NS=51;CA=0;DP=681
+1      2268675 .       TG      TGG     10      PASS    AF=0.0406249;HP=1;NF=7;NR=3;NS=52;CA=0;DP=508
+1      2269958 .       GCACGCACACGCAC  GC      40      PASS    AF=0.0297002;HP=1;NF=6;NR=7;NS=50;CA=0;DP=288
+1      2270248 .       CCTG    CG      100     PASS    AF=0.21901;HP=4;NF=14;NR=17;NS=52;CA=0;DP=478
+1      2272049 .       AGGGGTGGCACGG   AG      100     PASS    AF=0.0657391;HP=4;NF=20;NR=19;NS=52;CA=0;DP=465
+1      2272576 rs35424701;-/T  TA      TAA     100     PASS    AF=0.0794139;HP=1;DB;NF=5;NR=5;NS=51;CA=0;DP=426
+1      2273487 .       TAA     TA      10      PASS    AF=0.0158231;HP=10;NF=25;NR=9;NS=51;CA=0;DP=564
+1      2282631 rs59328016;-/G  AG      AGG     100     PASS    AF=0.230902;HP=1;DB;NF=1;NR=6;NS=52;CA=M;DP=310
+1      2282847 rs34534255;-/AG AC      ACTC    100     PASS    AF=0.108076;HP=1;DB;NF=5;NR=4;NS=50;CA=0;DP=293
+1      2284162 .       CA      CAA     12      PASS    AF=0.0508845;HP=10;NF=7;NR=7;NS=52;CA=0;DP=406
+1      2285124 .       TAAAAA  TA      100     PASS    AF=0.226133;HP=8;NF=14;NR=5;NS=52;CA=0;DP=315
+1      2288255 rs56670882;-/TACATAGAAAAA,venter,watson CAAAATACATAGAA  CA      100     PASS    AF=0.154865;HP=4;DB;NF=46;NR=50;NS=51;CA=0;DP=466
+1      2291012 venter  ATAATT  AT      100     PASS    AF=0.140631;HP=1;NF=7;NR=9;NS=51;CA=0;DP=365
+1      2292525 rs60502597;-/CACAACAAC,venter   CA      CACAACCACAA     100     PASS    AF=0.411828;HP=1;DB;NF=18;NR=3;NS=52;CA=0;DP=515
+1      2305015 rs35699260;-/T,venter   CAG     CG      100     PASS    AF=0.283002;HP=1;DB;NF=14;NR=17;NS=51;CA=0;DP=451
+1      2310430 .       AA      AAAGA   100     PASS    AF=0.382413;HP=6;NF=20;NR=11;NS=52;CA=0;DP=408
+1      2314333 venter  CG      CGGACGCCAGGCAGAGGACTTCATCCCAGGCTTCAGTGCTCCTG    100     PASS    AF=0.736856;HP=2;NF=1;NR=2;NS=52;CA=0;DP=679
+1      2319273 rs57204595;-/C  ACC     AC      100     PASS    AF=0.125223;HP=2;DB;NF=7;NR=13;NS=52;CA=0;DP=523
+1      2322519 .       TCCT    TT      100     PASS    AF=0.200476;HP=2;NF=2;NR=10;NS=50;CA=0;DP=413
+1      2322562 .       TCCACCCTCC      TC      100     PASS    AF=0.3747;HP=2;NF=8;NR=15;NS=51;CA=0;DP=325
+1      2322680 .       CT      CTT     100     PASS    AF=0.284453;HP=1;NF=26;NR=24;NS=52;CA=M;DP=388
+1      2323804 venter  TC      TCC     100     PASS    AF=0.865363;HP=3;NF=38;NR=47;NS=50;CA=0;DP=438
+1      2325452 .       CG      CGG     39      PASS    AF=0.0242463;HP=3;NF=5;NR=8;NS=51;CA=0;DP=547
+1      2332518 .       GA      GAA     100     PASS    AF=0.0862532;HP=1;NF=5;NR=13;NS=51;CA=0;DP=414
+1      2337697 rs55744642;-/CGACA,venter,watson        GG      GGGACAG 100     PASS    AF=0.867582;HP=3;DB;NF=16;NR=23;NS=51;CA=0;DP=383
+1      2338712 rs34210450;-/AGCTTCCC,mills,venter      GC      GCCCAGCTTC      100     PASS    AF=0.431742;HP=3;DB;NF=24;NR=15;NS=52;CA=0;DP=504
+1      2341261 .       TCC     TC      20      PASS    AF=0.13716;HP=9;NF=4;NR=20;NS=51;CA=0;DP=258
+1      2343280 rs60532031;-/AAAAG,watson       GA      GAAGAAA 100     PASS    AF=0.0544808;HP=2;DB;NF=2;NR=10;NS=49;CA=0;DP=348
+1      2343570 venter  AA      AAAACA  100     PASS    AF=0.0882931;HP=6;NF=28;NR=18;NS=52;CA=0;DP=434
+1      2344468 .       TTTTGT  TT      100     PASS    AF=0.233529;HP=7;NF=49;NR=55;NS=52;CA=0;DP=493
+1      2345597 rs35560781;-/T,venter   TAA     TA      100     PASS    AF=0.501718;HP=6;DB;NF=36;NR=26;NS=52;CA=0;DP=532
+1      2352446 .       CGTG    CG      16      PASS    AF=0.0185013;HP=1;NF=10;NR=25;NS=52;CA=0;DP=432
+1      2352629 rs35263617;-/CA,venter  CG      CGTG    100     PASS    AF=0.4693;HP=1;DB;NF=44;NR=38;NS=51;CA=0;DP=539
+1      2355283 rs35314501;-/G  TC      TCC     100     PASS    AF=0.408524;HP=4;DB;NF=21;NR=18;NS=52;CA=0;DP=436
+1      2356275 rs34090130;-/G,mills    AGG     AG      100     PASS    AF=0.172214;HP=6;DB;NF=16;NR=9;NS=51;CA=0;DP=415
+1      2356753 rs58056215;-/TGGAGGC    TGGCTGGAG       TG      100     PASS    AF=0.178356;HP=2;DB;NF=43;NR=59;NS=51;CA=0;DP=429
+1      2357119 .       TGG     TG      100     PASS    AF=0.179635;HP=6;NF=12;NR=18;NS=52;CA=0;DP=495
+1      2357323 .       TCCCT   TT      100     PASS    AF=0.0931072;HP=3;NF=8;NR=9;NS=52;CA=0;DP=484
+1      2357636 .       CTCCACCTTT      CT      100     PASS    AF=0.252701;HP=1;NF=11;NR=9;NS=47;CA=M;DP=266
+1      2358758 .       CAA     CA      26      PASS    AF=0.0241071;HP=3;NF=1;NR=3;NS=51;CA=0;DP=486
+1      2360543 rs34299371;-/G,venter   GCC     GC      100     PASS    AF=0.460241;HP=7;DB;NF=18;NR=28;NS=51;CA=0;DP=403
+1      2365835 rs35499456;-/A  GT      GTT     100     PASS    AF=0.299753;HP=3;DB;NF=19;NR=20;NS=52;CA=0;DP=431
+1      2370798 .       AAACCA  AA      100     PASS    AF=0.315002;HP=4;NF=56;NR=52;NS=52;CA=0;DP=505
+1      2379981 rs35697743;-/C,venter   TGC     TC      100     PASS    AF=0.0396508;HP=1;DB;NF=1;NR=5;NS=50;CA=0;DP=425
+1      2383170 rs35931789;-/T,venter   CC      CAC     100     PASS    AF=0.441832;HP=7;DB;NF=24;NR=21;NS=52;CA=0;DP=453
+1      2383775 .       ACC     AC      19      PASS    AF=0.0298335;HP=5;NF=6;NR=2;NS=52;CA=0;DP=442
+1      2388741 watson  GCCTTCCTCAC     GC      100     PASS    AF=0.134128;HP=2;NF=6;NR=9;NS=47;CA=0;DP=257
+1      2394261 rs34886292;-/T,venter   CA      CAA     100     PASS    AF=0.640008;HP=1;DB;NF=28;NR=33;NS=51;CA=0;DP=459
+1      2395694 venter  AGG     AG      100     PASS    AF=0.518622;HP=3;NF=29;NR=23;NS=50;CA=0;DP=387
+1      2406522 rs35886782;-/CTCTGGACGCT,venter,watson  TG      TGCTCTCTGGACG   100     PASS    AF=0.531691;HP=1;DB;NF=12;NR=19;NS=51;CA=0;DP=452
+1      2429911 rs3831090;-/AT,mills    TT      TTAT    100     PASS    AF=0.138967;HP=3;DB;NF=24;NR=13;NS=52;CA=0;DP=328
+1      2458287 .       CGTG    CG      100     PASS    AF=0.0696687;HP=1;NF=38;NR=32;NS=52;CA=0;DP=613
+1      2458465 .       AGTG    AG      31      PASS    AF=0.0212179;HP=1;NF=18;NR=32;NS=51;CA=0;DP=600
+1      2460527 .       TG      TGCGGCCCATCTCAG 51      PASS    AF=0.164756;HP=1;NF=1;NR=4;NS=51;CA=0;DP=496
+1      2477778 .       AC      ACCC    100     PASS    AF=0.157812;HP=2;NF=2;NR=11;NS=51;CA=0;DP=389
+1      2501833 rs34000217;-/ATT        AA      AAATA   100     PASS    AF=0.437274;HP=5;DB;NF=19;NR=23;NS=51;CA=0;DP=337
+1      2503512 rs59345997;-/CAAA       AAAACA  AA      100     PASS    AF=0.46764;HP=4;DB;NF=44;NR=29;NS=52;CA=0;DP=456
+1      2506681 .       TG      TGGG    46      PASS    AF=0.310909;HP=9;NF=14;NR=8;NS=51;CA=0;DP=273
+1      2513520 rs5772070;-/G,mills     CGG     CG      100     PASS    AF=0.652792;HP=8;DB;NF=8;NR=34;NS=51;CA=0;DP=275
+1      2517761 .       TGC     TC      100     PASS    AF=0.0839269;HP=1;NF=3;NR=6;NS=50;CA=0;DP=359
+1      2520201 rs34705971;-/C,venter   AG      AGG     100     PASS    AF=0.612406;HP=1;DB;NF=42;NR=46;NS=52;CA=0;DP=518
+1      2521983 .       TCAAACAAACAAAC  TC      100     PASS    AF=0.365407;HP=1;NF=35;NR=29;NS=52;CA=0;DP=501
+1      2522019 .       CT      CTGTT   100     PASS    AF=0.523695;HP=1;NF=28;NR=12;NS=52;CA=0;DP=410
+1      2522313 rs34791736;-/A,venter   CT      CTT     100     PASS    AF=0.621139;HP=1;DB;NF=47;NR=24;NS=52;CA=0;DP=472
+1      2524952 rs35090174;-/CT ACTC    AC      100     PASS    AF=0.224915;HP=1;DB;NF=19;NR=15;NS=51;CA=0;DP=517
+1      2529806 .       CATA    CA      100     PASS    AF=0.236462;HP=1;NF=22;NR=13;NS=51;CA=0;DP=625
+1      2529841 .       CACATA  CA      100     PASS    AF=0.190786;HP=1;NF=20;NR=19;NS=51;CA=0;DP=663
+1      2530205 rs61132608;-/CATATA,watson      CA      CACATATA        100     PASS    AF=0.547698;HP=1;DB;NF=20;NR=28;NS=52;CA=0;DP=660
+1      2543402 rs5772073;-/GAG,mills   TAGGA   TA      100     PASS    AF=0.24689;HP=1;DB;NF=12;NR=31;NS=52;CA=0;DP=543
+1      2547236 rs58240187;-/AGA,venter,watson  GG      GGAAG   100     PASS    AF=0.531939;HP=2;DB;NF=25;NR=25;NS=52;CA=0;DP=444
+1      2551119 rs35955733;-/CCC,venter,watson  GCCCC   GC      100     PASS    AF=0.606107;HP=9;DB;NF=24;NR=35;NS=52;CA=0;DP=492
+1      2551885 rs36036408;-/AC,venter  CGTG    CG      100     PASS    AF=0.356574;HP=1;DB;NF=39;NR=38;NS=52;CA=0;DP=803
+1      2552076 .       CGTG    CG      100     PASS    AF=0.066645;HP=1;NF=25;NR=15;NS=51;CA=0;DP=782
+1      2552384 .       CTGT    CT      12      PASS    AF=0.0121638;HP=1;NF=13;NR=25;NS=52;CA=0;DP=612
+1      2556252 .       ACACTC  AC      59      PASS    AF=0.143579;HP=1;NF=12;NR=9;NS=49;CA=0;DP=331
+1      2578474 .       CCACACCCCCAG    CG      100     PASS    AF=0.930867;HP=3;NF=16;NR=12;NS=51;CA=M;DP=281
+1      2688911 rs34425096;-/TC,venter  TTCT    TT      100     PASS    AF=0.26327;HP=5;DB;NF=17;NR=12;NS=52;CA=0;DP=451
+1      2691366 rs36213670;-/CTCTGGGCCA,mills,venter    GCTCTGGGCCAC    GC      39      PASS    AF=0.191253;HP=1;DB;NF=21;NR=36;NS=52;CA=0;DP=344
+1      2691723 rs57511628;-/ACCCCAGGAGATCCCTGC TA      TACCCCAGGAGATCCCTGCA    100     PASS    AF=0.332823;HP=1;DB;NF=6;NR=7;NS=52;CA=0;DP=453
+1      2703254 .       CA      CAA     100     PASS    AF=0.111948;HP=3;NF=8;NR=13;NS=51;CA=0;DP=502
+1      2703885 .       AC      ACC     100     PASS    AF=0.0959517;HP=6;NF=24;NR=11;NS=51;CA=0;DP=531
+1      2725125 rs34936518;-/C,venter   GCT     GT      100     PASS    AF=0.375093;HP=1;DB;NF=33;NR=32;NS=52;CA=0;DP=621
+1      2725735 .       AACACA  AA      24      PASS    AF=0.0139746;HP=2;NF=16;NR=4;NS=51;CA=0;DP=639
+1      2726135 rs34620269;-/CA GCAC    GC      100     PASS    AF=0.0410325;HP=1;DB;NF=28;NR=22;NS=52;CA=0;DP=626
+1      2726213 .       GC      GCAC    13      PASS    AF=0.0257105;HP=1;NF=8;NR=9;NS=52;CA=0;DP=552
+1      2746483 .       AC      ACC     40      PASS    AF=0.0544668;HP=1;NF=4;NR=12;NS=51;CA=0;DP=544
+1      2747281 .       TG      TGAGAG  100     PASS    AF=0.152256;HP=1;NF=11;NR=8;NS=52;CA=0;DP=855
+1      2754002 rs36202379;-/CTGCTTGT,mills,watson      ATTGTCTGCT      AT      100     PASS    AF=0.260861;HP=2;DB;NF=32;NR=35;NS=52;CA=0;DP=496
+1      2755160 rs34916159;-/A  TA      TAA     100     PASS    AF=0.532865;HP=7;DB;NF=10;NR=34;NS=52;CA=0;DP=533
+1      2755983 .       GCC     GC      100     PASS    AF=0.106339;HP=3;NF=18;NR=26;NS=52;CA=M;DP=700
+1      2765711 .       AA      AAGGAAGGA       100     PASS    AF=0.686149;HP=2;NF=11;NR=8;NS=50;CA=0;DP=364
+1      2765863 .       AG      AGG     100     PASS    AF=0.999885;HP=1;NF=14;NR=36;NS=49;CA=0;DP=364
+1      2765952 .       AG      AGG     100     PASS    AF=0.0789769;HP=1;NF=29;NR=29;NS=51;CA=B;DP=851
+1      2779479 .       TTTTCTTCTCTTTCT TT      100     PASS    AF=0.712577;HP=4;NF=29;NR=22;NS=50;CA=0;DP=322
+1      2794338 rs34131736;-/T  CTG     CG      100     PASS    AF=0.089184;HP=1;DB;NF=7;NR=4;NS=51;CA=0;DP=440
+1      2801123 .       TCCTCCCCACCCTGAC        TC      48      PASS    AF=0.0412327;HP=2;NF=13;NR=18;NS=51;CA=0;DP=343
+1      2803308 watson  CATG    CG      100     PASS    AF=0.160766;HP=1;NF=23;NR=20;NS=52;CA=0;DP=816
+1      2805468 rs56260225;-/ACAA       AAAACA  AA      100     PASS    AF=0.859977;HP=4;DB;NF=62;NR=35;NS=51;CA=0;DP=433
+1      2806441 rs34966309;-/G  CG      CGG     100     PASS    AF=0.211987;HP=4;DB;NF=20;NR=11;NS=52;CA=0;DP=441
+1      2810388 .       GCC     GC      100     PASS    AF=0.11183;HP=2;NF=8;NR=5;NS=51;CA=0;DP=431
+1      2822166 .       TACATGCACACA    TA      100     PASS    AF=0.150719;HP=1;NF=43;NR=52;NS=52;CA=0;DP=844
+1      2822270 rs59677991;-/GC GGCG    GG      18      NoQCALL AF=0.0194725;HP=2;DB;NF=15;NR=5;NS=52;CA=0;DP=806
+1      2822473 .       CACACAC CC      100     PASS    AF=0.138944;HP=1;NF=6;NR=7;NS=52;CA=0;DP=951
+1      2827616 .       CAAGC   CC      52      PASS    AF=0.132317;HP=2;NF=8;NR=4;NS=51;CA=0;DP=300
+1      2828576 .       CG      CTG     100     PASS    AF=0.168378;HP=1;NF=8;NR=2;NS=52;CA=0;DP=325
+1      2829365 rs35758696;-/A  TAA     TA      100     PASS    AF=0.216995;HP=6;DB;NF=20;NR=20;NS=51;CA=0;DP=531
+1      2833106 .       TG      TGTTGGG 100     PASS    AF=0.237115;HP=1;NF=11;NR=4;NS=52;CA=0;DP=336
+1      2834384 .       AC      ACC     32      PASS    AF=0.0617917;HP=1;NF=3;NR=5;NS=52;CA=0;DP=592
+1      2835704 rs35824541;-/G  AGG     AG      100     PASS    AF=0.188967;HP=3;DB;NF=15;NR=11;NS=52;CA=0;DP=691
+1      2836635 rs56691957;-/AT CATG    CG      100     PASS    AF=0.126742;HP=1;DB;NF=8;NR=13;NS=52;CA=0;DP=611
+1      2851063 .       ATGTGTGTCT      AT      100     PASS    AF=0.224053;HP=1;NF=34;NR=32;NS=52;CA=0;DP=798
+1      2859183 rs34869376;-/CT ACTC    AC      100     PASS    AF=0.228335;HP=1;DB;NF=11;NR=14;NS=52;CA=0;DP=446
+1      2859269 rs34009406;-/C  AC      ACC     100     PASS    AF=0.168197;HP=2;DB;NF=8;NR=14;NS=52;CA=0;DP=460
+1      2862455 rs34488344;-/T  GT      GTT     100     PASS    AF=0.140555;HP=10;DB;NF=25;NR=16;NS=52;CA=0;DP=484
+1      2866073 .       AC      ACC     56      PASS    AF=0.0758065;HP=1;NF=2;NR=11;NS=51;CA=0;DP=513
+1      2871504 .       TA      TACTAA  100     PASS    AF=0.128765;HP=1;NF=11;NR=12;NS=52;CA=0;DP=676
+1      2871601 rs60410855;-/TCCA       CC      CCCATC  100     PASS    AF=0.11635;HP=3;DB;NF=19;NR=14;NS=52;CA=0;DP=682
+1      2874709 .       GT      GTT     100     PASS    AF=0.138394;HP=9;NF=8;NR=12;NS=51;CA=0;DP=534
+1      2876814 rs5772089;-/A,mills,venter      GG      GAG     100     PASS    AF=0.999994;HP=10;DB;NF=39;NR=42;NS=50;CA=0;DP=343
+1      2877421 rs35085736;-/C,venter   GC      GCC     100     PASS    AF=0.582204;HP=6;DB;NF=29;NR=37;NS=50;CA=0;DP=426
+1      2881114 .       GG      GTG     100     PASS    AF=0.586283;HP=5;NF=16;NR=5;NS=47;CA=M;DP=256
+1      2883970 .       GG      GCG     16      PASS    AF=0.516075;HP=4;NF=6;NR=2;NS=51;CA=M;DP=332
+1      2885504 .       TCC     TC      29      PASS    AF=0.140908;HP=9;NF=12;NR=8;NS=51;CA=0;DP=353
+1      2886983 .       AG      AGG     50      PASS    AF=0.0436199;HP=3;NF=7;NR=2;NS=50;CA=0;DP=401
+1      2887864 rs57379840;-/T,venter   CG      CTG     100     PASS    AF=0.770236;HP=2;DB;NF=41;NR=25;NS=51;CA=0;DP=375
+1      2892284 .       CAT     CT      100     PASS    AF=0.0885935;HP=1;NF=23;NR=17;NS=52;CA=0;DP=685
+1      2892433 venter  AT      ATCCATCCTCCATCCT        100     PASS    AF=0.814532;HP=1;NF=13;NR=12;NS=52;CA=0;DP=620
+1      2892472 .       CCCATC  CC      100     PASS    AF=0.181828;HP=3;NF=50;NR=61;NS=52;CA=0;DP=633
+1      2899352 .       CTA     CA      100     PASS    AF=0.0433393;HP=1;NF=5;NR=2;NS=51;CA=0;DP=512
+1      2902379 .       TAGA    TA      40      PASS    AF=0.0165292;HP=1;NF=3;NR=2;NS=51;CA=0;DP=476
+1      2903930 rs36097640;-/A  TAA     TA      12      PASS    AF=0.0522384;HP=8;DB;NF=13;NR=15;NS=51;CA=0;DP=535
+1      2907194 rs35693840;-/G  AG      AGG     100     PASS    AF=0.136995;HP=5;DB;NF=14;NR=8;NS=52;CA=0;DP=516
+1      2916313 .       AC      ACC     40      PASS    AF=0.0606632;HP=1;NF=1;NR=13;NS=52;CA=0;DP=529
+1      2923107 .       GA      GGGGGGAA        35      PASS    AF=0.311458;HP=1;NF=1;NR=2;NS=50;CA=0;DP=285
+1      2923994 .       AAGGA   AA      100     PASS    AF=0.136914;HP=3;NF=4;NR=16;NS=52;CA=0;DP=475
+1      2926544 rs58065168;-/G  TG      TGG     100     PASS    AF=0.231871;HP=7;DB;NF=23;NR=13;NS=51;CA=0;DP=445
+1      2927774 .       GTCT    GT      100     PASS    AF=0.039848;HP=1;NF=24;NR=39;NS=52;CA=0;DP=466
+1      2928267 rs4013154;-/TCT CAGAA   CA      100     PASS    AF=0.176094;HP=1;DB;NF=10;GC;NR=20;NS=52;CA=0;DP=390
+1      2931584 .       GTGGTGTTTTCATT  GT      100     PASS    AF=0.171247;HP=1;NF=23;NR=10;NS=52;CA=0;DP=486
+1      2932462 .       GT      GTGAT   56      PASS    AF=0.766604;HP=1;NF=33;NR=13;NS=52;CA=M;DP=790
+1      2932531 .       GT      GTGGTGAT        56      PASS    AF=0.365205;HP=1;NF=19;NR=4;NS=52;CA=M;DP=738
+1      2938240 rs57953122;-/AAGCC      AC      ACCAAGC 100     PASS    AF=0.229942;HP=2;DB;NF=5;NR=7;NS=52;CA=0;DP=387
+1      2939820 rs35035410;-/C,venter   GCC     GC      100     PASS    AF=0.270114;HP=6;DB;NF=15;NR=21;NS=52;CA=0;DP=477
+1      2940602 .       GA      GAA     100     PASS    AF=0.245189;HP=10;NF=31;NR=30;NS=52;CA=0;DP=516
+1      2941986 .       ACCC    AC      100     PASS    AF=0.242307;HP=10;NF=20;NR=20;NS=52;CA=0;DP=471
+1      2943041 rs34450334;-/G,mills    CGG     CG      100     PASS    AF=0.212427;HP=8;DB;NF=13;NR=12;NS=52;CA=0;DP=523
+1      2943605 rs5772091;-/C,mills     GC      GCC     100     PASS    AF=0.155328;HP=1;DB;NF=7;NR=7;NS=52;CA=0;DP=349
+1      2946559 .       TT      TTGT    100     PASS    AF=0.174249;HP=3;NF=13;NR=14;NS=52;CA=0;DP=596
+1      2948391 .       TT      TTTTTCT 100     PASS    AF=0.137955;HP=5;NF=19;NR=16;NS=52;CA=0;DP=557
+1      2949076 rs33910396;-/G,mills    CG      CGG     100     PASS    AF=0.102902;HP=1;DB;NF=3;NR=8;NS=52;CA=0;DP=413
+1      2950056 .       TC      TCAAACAAAC      100     PASS    AF=0.133966;HP=1;NF=9;NR=9;NS=51;CA=0;DP=587
+1      2950689 rs60031908;-/A  CAA     CA      100     PASS    AF=0.200188;HP=8;DB;NF=20;NR=25;NS=51;CA=0;DP=517
+1      2958314 .       CC      CCCATC  100     PASS    AF=0.190271;HP=3;NF=39;NR=18;NS=52;CA=M;DP=454
+1      2961502 rs60708459;-/T  AT      ATT     100     PASS    AF=0.219472;HP=3;DB;NF=14;NR=16;NS=52;CA=0;DP=460
+1      2968615 .       AG      AGG     100     PASS    AF=0.288912;HP=2;NF=11;NR=13;NS=51;CA=0;DP=324
+1      2982005 .       GT      GGGTT   100     PASS    AF=0.189932;HP=5;NF=6;NR=5;NS=52;CA=0;DP=460
+1      2984462 rs34471979;-/C,venter   TCC     TC      100     PASS    AF=0.423837;HP=2;DB;NF=20;NR=27;NS=51;CA=0;DP=459
+1      2985828 rs5772093;-/TTCGGGG,mills,venter,watson CT      CTTCGGGGT       100     PASS    AF=0.888966;HP=1;DB;NF=22;NR=15;NS=49;CA=0;DP=372
+1      2987353 .       AGTG    AG      39      PASS    AF=0.0534166;HP=1;NF=13;NR=12;NS=51;CA=0;DP=341
+1      2990018 .       TC      TGC     51      PASS    AF=0.347647;HP=1;NF=9;NR=5;NS=52;CA=0;DP=328
+1      2992552 rs55740340;-/TTGT,mills,venter,watson   CT      CTGTTT  100     PASS    AF=0.633228;HP=1;DB;NF=31;NR=31;NS=52;CA=0;DP=471
+1      2994869 .       TT      TTTAT   48      PASS    AF=0.246512;HP=4;NF=8;NR=15;NS=49;CA=0;DP=238
+1      2996339 rs60239912;-/TCATTCAT   CT      CTCATTCATT      100     PASS    AF=0.288255;HP=1;DB;NF=27;NR=24;NS=52;CA=0;DP=550
+1      2996940 .       TG      TGGG    52      PASS    AF=0.252534;HP=1;NF=5;NR=3;NS=51;CA=0;DP=485
+1      2997430 rs58914207;-/TC TTCT    TT      17      PASS    AF=0.0239916;HP=3;DB;NF=1;NR=3;NS=51;CA=0;DP=533
+1      2998548 rs3067411;-/GC,mills,watson     TT      TGCT    100     PASS    AF=0.513959;HP=2;DB;NF=16;NR=33;NS=51;CA=0;DP=457
+1      2998746 rs33948447;-/CTGAGGGTAT,mills,watson    CCTGAGGGTATC    CC      100     PASS    AF=0.567187;HP=2;DB;NF=32;NR=26;NS=51;CA=0;DP=446
+1      2998922 rs3067390;-/CA,mills,watson     CTGT    CT      100     PASS    AF=0.344398;HP=1;DB;NF=25;NR=25;NS=52;CA=0;DP=544
+1      3001309 .       TCTTCC  TC      100     PASS    AF=0.122521;HP=1;NF=13;NR=16;NS=51;CA=0;DP=463
+1      3003643 rs34727240;-/A  CA      CAA     100     PASS    AF=0.30407;HP=4;DB;NF=23;NR=14;NS=51;CA=0;DP=462
+1      3003980 .       ATTCT   AT      100     PASS    AF=0.0770408;HP=2;NF=12;NR=8;NS=51;CA=0;DP=436
+1      3015507 rs36215320;-/AATAAT,mills       AAATAATA        AA      100     PASS    AF=0.341849;HP=4;DB;NF=19;NR=21;NS=52;CA=M;DP=287
+1      3020627 .       GC      GCGCGCAC        45      PASS    AF=0.0864166;HP=1;NF=3;NR=4;NS=52;CA=0;DP=675
+1      3020729 .       GCAC    GC      100     PASS    AF=0.270815;HP=1;NF=26;NR=22;NS=52;CA=0;DP=511
+1      3020780 .       GCAC    GC      100     PASS    AF=0.0529136;HP=1;NF=14;NR=13;NS=52;CA=0;DP=580
+1      3020851 rs36140038;-/G,venter   CC      CGC     100     PASS    AF=0.0570603;HP=2;DB;NF=7;NR=8;NS=52;CA=0;DP=580
+1      3020930 .       GCAC    GC      100     PASS    AF=0.0608239;HP=1;NF=21;NR=20;NS=52;CA=0;DP=662
+1      3020996 .       ACT     AT      100     PASS    AF=0.0376658;HP=1;NF=4;NR=2;NS=52;CA=0;DP=646
+1      3021049 rs58793198;-/CA AA      AACA    100     PASS    AF=0.0822964;HP=2;DB;NF=19;NR=18;NS=52;CA=0;DP=756
+1      3024532 .       TGTGTGCG        TG      100     PASS    AF=0.0453628;HP=1;NF=12;NR=35;NS=51;CA=0;DP=585
+1      3035092 venter,watson   CTCCCACCATGCTACTGGAGACCAT       CT      100     PASS    AF=0.175148;HP=1;NF=41;NR=54;NS=51;CA=0;DP=464
+1      3035605 rs56967751;-/TG,venter,watson   AG      AGTG    100     PASS    AF=0.387697;HP=1;DB;NF=30;NR=25;NS=51;CA=0;DP=671
+1      3035812 .       CGTG    CG      100     PASS    AF=0.051827;HP=1;NF=28;NR=20;NS=51;CA=0;DP=643
+1      3035887 .       ATGT    AT      50      PASS    AF=0.0421027;HP=1;NF=24;NR=34;NS=52;CA=0;DP=556
+1      3036291 rs36033160;-/CCG        CT      CCCGT   100     PASS    AF=0.0605711;HP=1;DB;NF=3;NR=5;NS=51;CA=0;DP=428
+1      3037949 rs34840011;-/A,venter   TA      TAA     100     PASS    AF=0.096326;HP=8;DB;NF=5;NR=6;NS=52;CA=0;DP=462
+1      3046082 rs35271327;-/T  AT      ATT     19      PASS    AF=0.0473995;HP=7;DB;NF=9;NR=8;NS=52;CA=0;DP=430
+1      3049499 .       ACC     AC      27      PASS    AF=0.0269129;HP=3;NF=3;NR=1;NS=51;CA=0;DP=373
+1      3053337 .       TGG     TG      100     PASS    AF=0.205181;HP=7;NF=15;NR=19;NS=52;CA=0;DP=424
+1      3058772 .       TCATCC  TC      100     PASS    AF=0.716787;HP=1;NF=61;NR=51;NS=52;CA=0;DP=435
+1      3069377 .       CATGGT  CT      100     PASS    AF=0.42044;HP=1;NF=3;NR=14;NS=48;CA=M;DP=257
+1      3076481 rs35945121;-/T,mills    ATT     AT      100     PASS    AF=0.33892;HP=10;DB;NF=9;NR=38;NS=52;CA=0;DP=438
+1      3079028 .       TA      TCA     100     PASS    AF=0.0528803;HP=1;NF=5;NR=3;NS=51;CA=0;DP=475
+1      3084256 watson  AGTTTAGATACTG   AG      100     PASS    AF=0.123981;HP=1;NF=18;NR=14;NS=52;CA=0;DP=554
+1      3087172 rs34468831;-/A  GAA     GA      100     PASS    AF=0.0618762;HP=3;DB;NF=2;NR=5;NS=50;CA=0;DP=475
+1      3087517 .       CACACGCAGTCTTA  CA      100     PASS    AF=0.637316;HP=1;NF=41;NR=37;NS=52;CA=0;DP=973
+1      3087777 .       TA      TACA    100     PASS    AF=0.377666;HP=1;NF=43;NR=55;NS=52;CA=M;DP=966
+1      3087871 .       CACGGTCTTA      CA      100     PASS    AF=0.589214;HP=1;NF=16;NR=14;NS=51;CA=0;DP=710
+1      3087938 .       AG      AGTCTTACACAAGCGG        100     PASS    AF=0.469462;HP=1;NF=28;NR=29;NS=52;CA=M;DP=816
+1      3088154 .       GG      GCAG    100     PASS    AF=0.0511127;HP=2;NF=11;NR=10;NS=52;CA=M;DP=894
+1      3088232 rs35125658;-/TT GG      GCAG    100     PASS    AF=0.0967781;HP=2;DB;NF=3;NR=24;NS=51;CA=M;DP=938
+1      3088301 .       CT      CTTGCACACGCAGTTT        47      PASS    AF=0.0188781;HP=2;NF=5;NR=2;NS=51;CA=M;DP=684
+1      3105704 rs35372326;-/G,mills    CGG     CG      100     PASS    AF=0.0956114;HP=2;DB;NF=6;NR=4;NS=52;CA=0;DP=378
+1      3107408 rs5772098;-/G,mills     AG      AGG     100     PASS    AF=0.107417;HP=5;DB;NF=19;NR=15;NS=52;CA=0;DP=504
+1      3107714 rs34461209;-/G,venter   TG      TGG     100     PASS    AF=0.61875;HP=3;DB;NF=21;NR=28;NS=52;CA=0;DP=454
+1      3108534 rs59512254;-/GA GGAG    GG      100     PASS    AF=0.184609;HP=2;DB;NF=17;NR=11;NS=52;CA=0;DP=510
+1      3121064 .       TG      TGAG    59      PASS    AF=0.0221492;HP=1;NF=7;NR=3;NS=52;CA=0;DP=555
+1      3131583 rs57750843;-/A  GAA     GA      100     PASS    AF=0.166149;HP=9;DB;NF=21;NR=20;NS=52;CA=0;DP=490
+1      3131742 .       GT      GGGGGGGGGTT     27      PASS    AF=0.243052;HP=3;NF=2;NR=1;NS=49;CA=0;DP=394
+1      3135855 rs34340862;-/TAA,mills  CT      CTAAT   100     PASS    AF=0.183257;HP=1;DB;NF=11;NR=9;NS=51;CA=0;DP=520
+1      3146366 .       GGAG    GG      100     PASS    AF=0.040688;HP=4;NF=13;NR=14;NS=51;CA=0;DP=434
+1      3152159 .       AT      ATT     100     PASS    AF=0.0396994;HP=4;NF=8;NR=9;NS=52;CA=0;DP=489
+1      3157729 venter,watson   AG      AGGGGTGAGGTG    100     PASS    AF=0.830079;HP=4;NF=30;NR=23;NS=51;CA=0;DP=548
+1      3158807 .       AGG     AG      100     PASS    AF=0.705976;HP=6;NF=35;NR=30;NS=52;CA=0;DP=371
+1      3158885 .       CATG    CG      100     PASS    AF=0.09216;HP=1;NF=6;NR=6;NS=51;CA=0;DP=375
+1      3163280 .       CAAAATA CA      100     PASS    AF=0.148526;HP=4;NF=13;NR=1;NS=49;CA=M;DP=326
+1      3164018 rs5772100;-/A,mills,venter      TAA     TA      100     PASS    AF=0.999998;HP=3;DB;NF=67;NR=69;NS=52;CA=0;DP=511
+1      3174387 .       CAGG    CG      17      PASS    AF=0.0141709;HP=1;NF=1;NR=2;NS=51;CA=0;DP=428
+1      3176024 .       GACAGTCCCAGAGGAGCA      GA      44      PASS    AF=0.0444872;HP=1;NF=3;NR=10;NS=52;CA=M;DP=480
+1      3177102 .       AG      AGAGGAGGACAGTCGGGGAGGACAGTCCCGG 100     PASS    AF=0.346135;HP=1;NF=8;NR=13;NS=52;CA=0;DP=550
+1      3179862 rs35987870;-/GTGG       ATGTGT  AT      100     PASS    AF=0.0762534;HP=1;DB;NF=17;NR=17;NS=51;CA=0;DP=618
+1      3183094 rs33953525;-/GGTGCCGTGAACAGAGCCAGCGAGG,mills    AG      AGGTGCCGTGAACAGAGCCAGCGAGGG     100     PASS    AF=0.665581;HP=2;DB;NF=15;NR=15;NS=52;CA=0;DP=424
+1      3183166 rs35451643;-/C,venter   TCC     TC      100     PASS    AF=0.123295;HP=4;DB;NF=12;NR=6;NS=52;CA=0;DP=460
+1      3184208 rs59663829;-/GCACACACAA TA      TGCACACACAAA    100     PASS    AF=0.152939;HP=1;DB;NF=4;NR=4;NS=52;CA=0;DP=733
+1      3186299 .       ACC     AC      100     PASS    AF=0.951135;HP=8;NF=16;NR=14;NS=51;CA=0;DP=311
+1      3202609 .       TG      TGGGGGGG        11      PASS    AF=0.122471;HP=1;NF=3;NR=3;NS=52;CA=0;DP=479
+1      3292566 .       TC      TCGGGGTGCCC     12      PASS    AF=0.209628;HP=1;NF=22;NR=17;NS=51;CA=0;DP=462
+1      3292669 .       AAGA    AA      100     PASS    AF=0.312194;HP=8;NF=13;NR=14;NS=51;CA=0;DP=483
+1      3293018 rs35846516;-/A,venter   GAA     GA      100     PASS    AF=0.791047;HP=9;DB;NF=59;NR=44;NS=51;CA=0;DP=507
+1      3293422 rs34150215;-/A,mills,venter     TA      TAA     100     PASS    AF=0.418316;HP=7;DB;NF=27;NR=18;NS=52;CA=0;DP=481
+1      3307979 rs35082175;-/A,venter   CAT     CT      100     PASS    AF=0.379363;HP=1;DB;NF=36;NR=25;NS=52;CA=0;DP=659
+1      3308056 .       CATA    CA      100     PASS    AF=0.0313721;HP=1;NF=4;NR=5;NS=52;CA=0;DP=699
+1      3308306 rs34659426;-/AA CAAA    CA      100     PASS    AF=0.238591;HP=3;DB;NF=23;NR=22;NS=52;CA=0;DP=732
+1      3308692 .       GC      GCC     100     PASS    AF=0.610676;HP=6;NF=23;NR=26;NS=52;CA=0;DP=447
+1      3309461 .       ACCCTCCTCTGAGTCTTCCTCCCCTTCCCGTGC       AC      100     PASS    AF=0.218197;HP=3;NF=28;NR=41;NS=51;CA=0;DP=430
+1      3313004 .       ATT     AT      18      PASS    AF=0.117282;HP=10;NF=22;NR=12;NS=51;CA=0;DP=407
+1      3315219 rs35154920;-/GT CG      CGTG    100     PASS    AF=0.407055;HP=1;DB;NF=23;NR=17;NS=52;CA=0;DP=498
+1      3315279 rs34306698;-/AT CG      CATG    100     PASS    AF=0.27165;HP=1;DB;NF=18;NR=10;NS=51;CA=0;DP=460
+1      3315552 rs61650876;-/ATGT       CATGTG  CG      100     PASS    AF=0.074251;HP=1;DB;NF=10;NR=7;NS=52;CA=0;DP=612
+1      3315608 .       CGTG    CG      44      PASS    AF=0.0200264;HP=1;NF=15;NR=25;NS=52;CA=0;DP=622
+1      3316180 rs34769314;-/GTGA       TGTGAG  TG      100     PASS    AF=0.13026;HP=1;DB;NF=29;NR=21;NS=52;CA=0;DP=930
+1      3316258 rs57503175;-/TGTATGTGCGTGTGTGTGGTGTG    GG      GGTGTGTGGTGTGTGTATGTGCGTG       100     PASS    AF=0.277124;HP=3;DB;NF=3;NR=11;NS=52;CA=0;DP=898
+1      3316338 rs34133894;-/GT GGTG    GG      100     PASS    AF=0.121606;HP=2;DB;NF=18;NR=27;NS=52;CA=0;DP=901
+1      3316408 .       TGG     TG      100     PASS    AF=0.153074;HP=7;NF=23;NR=10;NS=52;CA=0;DP=898
+1      3316476 rs60842130;-/GTG        TGTGG   TG      43      PASS    AF=0.0151943;HP=1;DB;NF=4;NR=1;NS=52;CA=0;DP=732
+1      3317481 rs34240659;-/AT CATA    CA      100     PASS    AF=0.127605;HP=1;DB;NF=14;NR=8;NS=52;CA=0;DP=538
+1      3319964 .       ACC     AC      100     PASS    AF=0.0511239;HP=5;NF=12;NR=4;NS=52;CA=0;DP=505
+1      3327173 rs56093721;-/A,venter   TAA     TA      100     PASS    AF=0.89527;HP=9;DB;NF=37;NR=68;NS=52;CA=0;DP=540
+1      3328302 .       AG      AGGGGGG 53      PASS    AF=0.124625;HP=2;NF=13;NR=2;NS=52;CA=0;DP=585
+1      3335208 .       CGG     CG      100     PASS    AF=0.0438559;HP=2;NF=3;NR=3;NS=52;CA=0;DP=448
+1      3335551 rs34869178;-/T  CTC     CC      100     PASS    AF=0.0947355;HP=1;DB;NF=4;NR=8;NS=52;CA=0;DP=487
+1      3342021 rs34485545;-/A  TA      TAA     100     PASS    AF=0.154806;HP=9;DB;NF=25;NR=23;NS=52;CA=0;DP=444
+1      3347098 venter  CG      CAG     100     PASS    AF=0.931731;HP=1;NF=49;NR=54;NS=52;CA=0;DP=497
+1      3348129 rs55866341;-/G,venter   CG      CGG     100     PASS    AF=0.883294;HP=1;DB;NF=55;NR=55;NS=52;CA=0;DP=521
+1      3352897 .       AA      ACA     46      PASS    AF=0.0385898;HP=6;NF=2;NR=6;NS=51;CA=0;DP=407
+1      3353821 rs34792713;-/T  AT      ATT     36      PASS    AF=0.0290672;HP=1;DB;NF=3;NR=3;NS=52;CA=0;DP=428
+1      3356271 .       TTCCT   TT      15      PASS    AF=0.00990969;HP=3;NF=1;NR=1;NS=52;CA=0;DP=537
+1      3356391 rs4018597;-/TA  TT      TTAT    100     PASS    AF=0.0517593;HP=2;DB;NF=13;NR=11;NS=52;CA=0;DP=475
+1      3356436 rs5772104;-/GT  CGTG    CG      100     PASS    AF=0.82813;HP=1;DB;NF=59;NR=53;NS=51;CA=0;DP=449
+1      3356871 .       CATG    CG      26      PASS    AF=0.0193592;HP=1;NF=1;NR=3;NS=51;CA=0;DP=430
+1      3359412 rs34037774;-/G,venter   TGG     TG      59      PASS    AF=0.0301496;HP=2;DB;NF=4;NR=5;NS=52;CA=0;DP=451
+1      3370575 rs35597752;-/TG,venter,watson   CTGT    CT      100     PASS    AF=0.760154;HP=1;DB;NF=43;NR=36;NS=52;CA=0;DP=405
+1      3372018 rs34109718;-/G,venter   CGG     CG      100     PASS    AF=0.891318;HP=3;DB;NF=46;NR=36;NS=51;CA=0;DP=349
+1      3383745 rs57207202;-/C  AC      ACC     100     PASS    AF=0.182529;HP=4;DB;NF=9;NR=7;NS=47;CA=D;DP=229
+1      3384084 rs5772105;-/G,mills,venter      CG      CGG     100     PASS    AF=0.937697;HP=2;DB;NF=49;NR=47;NS=50;CA=0;DP=457
+1      3385833 rs5772106;-/CC,mills,venter,watson      ACCC    AC      100     PASS    AF=0.778535;HP=5;DB;NF=33;NR=14;NS=51;CA=0;DP=418
+1      3387275 rs56102150;-/TC,venter  CC      CCTC    100     PASS    AF=0.999995;HP=4;DB;NF=16;NR=36;NS=50;CA=0;DP=364
+1      3388739 rs58188396;-/GGGGGGCGGGTAGCC    GG      GGGGGGGCGGGTAGCCG       40      PASS    AF=0.263678;HP=7;DB;NF=3;NR=2;NS=48;CA=0;DP=326
+1      3393157 .       AAAAAATA        AA      100     PASS    AF=0.0549314;HP=6;NF=23;NR=18;NS=51;CA=0;DP=468
+1      3393524 .       GGTGTG  GG      23      PASS    AF=0.017751;HP=2;NF=1;NR=19;NS=49;CA=0;DP=266
+1      3409800 .       AAGA    AA      100     PASS    AF=0.0431791;HP=3;NF=1;NR=8;NS=51;CA=0;DP=643
+1      3410131 rs58666986;-/GTGT       ATGTGT  AT      100     PASS    AF=0.0433727;HP=1;DB;NF=7;NR=13;NS=52;CA=0;DP=603
+1      3411485 rs60864742;-/ACACCGGTAGCAAGGCA,mills    ACACCGGTAGCAAGGCACC     AC      100     PASS    AF=0.0858716;HP=1;DB;NF=8;NR=17;NS=52;CA=0;DP=523
+1      3417374 .       GCACACGCCCCCACCC        GC      20      PASS    AF=0.0294079;HP=1;NF=4;NR=3;NS=50;CA=0;DP=447
+1      3429498 rs56204236;-/G  CG      CGG     100     PASS    AF=0.596026;HP=10;DB;NF=6;NR=7;NS=51;CA=0;DP=322
+1      3435396 .       CACAGA  CA      100     PASS    AF=0.0433621;HP=1;NF=2;NR=6;NS=52;CA=0;DP=457
+1      3442767 rs36106109;-/G  CG      CGG     100     PASS    AF=0.112939;HP=5;DB;NF=5;NR=6;NS=50;CA=0;DP=369
+1      3451064 rs36030995;-/C  GC      GCC     100     PASS    AF=0.385449;HP=5;DB;NF=22;NR=12;NS=50;CA=0;DP=388
+1      3456931 rs35289361;-/G  AG      AGG     100     PASS    AF=0.0676076;HP=4;DB;NF=11;NR=9;NS=52;CA=0;DP=554
+1      3467274 watson  GGGCTG  GG      100     PASS    AF=0.132596;HP=3;NF=16;NR=12;NS=51;CA=0;DP=428
+1      3475422 rs61428836;-/G  TG      TGG     100     PASS    AF=0.0480433;HP=3;DB;NF=6;NR=10;NS=52;CA=0;DP=468
+1      3482055 .       CA      CGTCTTATA       100     PASS    AF=0.593516;HP=1;NF=10;NR=11;NS=49;CA=M;DP=256
+1      3482413 mills,watson    TCTCC   TC      100     PASS    AF=0.414589;HP=1;NF=24;NR=32;NS=51;CA=0;DP=496
+1      3485140 venter,watson   CCAAC   CC      100     PASS    AF=0.714294;HP=2;NF=21;NR=32;NS=52;CA=0;DP=460
+1      3486991 rs35452084;-/G,venter   AGG     AG      100     PASS    AF=0.744909;HP=4;DB;NF=15;NR=35;NS=50;CA=0;DP=363
+1      3492812 .       CGTG    CG      14      PASS    AF=0.0148914;HP=1;NF=22;NR=26;NS=51;CA=0;DP=585
+1      3494290 .       AC      ACAGGACCGGCC    100     PASS    AF=0.117184;HP=1;NF=2;NR=22;NS=52;CA=0;DP=464
+1      3496820 rs34860893;-/C,mills,venter     ACC     AC      100     PASS    AF=0.924032;HP=7;DB;NF=33;NR=48;NS=52;CA=0;DP=386
+1      3504928 rs36094767;-/C,venter   TC      TCC     100     PASS    AF=0.786142;HP=4;DB;NF=23;NR=43;NS=51;CA=0;DP=405
+1      3511572 rs3072238;-/TCAC,venter ACACTC  AC      100     PASS    AF=0.160871;HP=1;DB;NF=22;NR=22;NS=52;CA=0;DP=824
+1      3511789 rs59801836;-/CTCA,watson        ACACTC  AC      100     PASS    AF=0.620819;HP=1;DB;NF=54;NR=52;NS=52;CA=0;DP=740
+1      3511919 .       TACA    TA      100     PASS    AF=0.049568;HP=1;NF=20;NR=22;NS=52;CA=0;DP=729
+1      3511980 rs57128321;-/ACTC,venter,watson AC      ACACTC  100     PASS    AF=0.937206;HP=1;DB;NF=63;NR=38;NS=52;CA=0;DP=712
+1      3512089 rs61705210;-/TCACAC,venter,watson       AACTCACA        AA      100     PASS    AF=0.658764;HP=3;DB;NF=65;NR=52;NS=52;CA=0;DP=808
+1      3516936 rs60239345;-/CA,venter  CG      CCAG    100     PASS    AF=0.999997;HP=1;DB;NF=52;NR=26;NS=52;CA=0;DP=391
+1      3519155 rs35740208;-/G,venter   AGG     AG      100     PASS    AF=0.108418;HP=3;DB;NF=7;NR=11;NS=51;CA=0;DP=505
+1      3523781 rs56339243;-/GGCTCC,venter,watson       AC      ACCGGCTC        100     PASS    AF=0.603986;HP=3;DB;NF=20;NR=23;NS=52;CA=0;DP=449
+1      3526023 .       GGCACTTCCCGCCCCCGTCACCCCTGCCGCCATG      GG      100     PASS    AF=0.227609;HP=2;NF=10;NR=15;NS=52;CA=0;DP=454
+1      3526486 rs35020651;-/C,venter   TC      TCC     100     PASS    AF=0.389171;HP=3;DB;NF=32;NR=20;NS=52;CA=0;DP=470
+1      3530060 .       TGG     TG      100     PASS    AF=0.033793;HP=3;NF=6;NR=1;NS=52;CA=0;DP=540
+1      3531966 rs3838971;-/C   TG      TGG     100     PASS    AF=0.155382;HP=6;DB;NF=14;NR=11;NS=49;CA=0;DP=292
+1      3534095 rs35816205;-/A,mills,venter     TAA     TA      100     PASS    AF=0.160054;HP=3;DB;NF=9;NR=10;NS=52;CA=0;DP=455
+1      3535035 rs58849058;-/TCTGGGAGCTCCTCCCCCT,venter,watson  GTTCTGGGAGCTCCTCCCCCT   GT      100     PASS    AF=0.609724;HP=2;DB;NF=50;NR=48;NS=52;CA=0;DP=487
+1      3535985 .       CCAAAC  CC      100     PASS    AF=0.116123;HP=2;NF=10;NR=13;NS=51;CA=0;DP=553
+1      3536124 rs55905548;-/GGCG,venter,watson CCGGGC  CC      100     PASS    AF=0.45742;HP=3;DB;NF=28;NR=31;NS=51;CA=0;DP=499
+1      3543853 .       TC      TCC     100     PASS    AF=0.156605;HP=6;NF=12;NR=13;NS=52;CA=0;DP=527
+1      3549495 .       AC      ACCCCC  34      PASS    AF=0.0959154;HP=1;NF=1;NR=3;NS=52;CA=0;DP=496
+1      3553372 rs34514629;-/C,venter   GCA     GA      100     PASS    AF=0.652107;HP=1;DB;NF=45;NR=47;NS=52;CA=0;DP=551
+1      3556485 rs3831025;-/CAGCCTGC,venter,watson      AGCAGGCTGC      AC      100     PASS    AF=0.38103;HP=1;DB;NF=13;NR=9;NS=49;CA=0;DP=292
+1      3556883 .       CA      CATA    14      PASS    AF=0.0221011;HP=1;NF=9;NR=13;NS=50;CA=0;DP=436
+1      3563429 .       CG      CGGGGG  56      PASS    AF=0.17049;HP=2;NF=3;NR=7;NS=52;CA=0;DP=586
+1      3564334 rs3034639;-/GT,mills    GA      GACA    100     PASS    AF=0.227635;HP=1;DB;NF=10;NR=13;NS=50;CA=0;DP=364
+1      3564964 rs5772113;-/G   TGG     TG      100     PASS    AF=0.220888;HP=2;DB;NF=11;NR=18;NS=50;CA=0;DP=408
+1      3565238 venter  GGTCTCCTACAGTCATATTTTGGGGTGACGTATTCTAG  GG      100     PASS    AF=0.145422;HP=2;NF=1;NR=10;NS=52;CA=M;DP=323
+1      3566253 rs57149403;-/GTCCAGC    AC      ACGTCCAGC       100     PASS    AF=0.0476733;HP=1;DB;NF=3;NR=3;NS=52;CA=0;DP=363
+1      3567114 .       ATG     AG      100     PASS    AF=0.0358982;HP=1;NF=3;NR=5;NS=52;CA=0;DP=555
+1      3568146 rs3034606;-/TA  GTAT    GT      100     PASS    AF=0.533957;HP=1;DB;NF=12;NR=29;NS=51;CA=0;DP=247
+1      3570893 rs34305694;-/C  TCC     TC      100     PASS    AF=0.0467251;HP=2;DB;NF=5;NR=3;NS=52;CA=0;DP=443
+1      3574939 .       CG      CGTGTGTG        23      PASS    AF=0.401022;HP=1;NF=46;NR=32;NS=52;CA=0;DP=481
+1      3586002 .       ACTC    AC      100     PASS    AF=0.157197;HP=1;NF=17;NR=24;NS=52;CA=0;DP=691
+1      3586231 rs61542341;-/GTCTCT     CTCTCTGT        CT      12      PASS    AF=0.0310208;HP=1;DB;NF=1;NR=11;NS=52;CA=M;DP=400
+1      3586281 .       CTTT    CT      21      PASS    AF=0.115475;HP=3;NF=1;NR=3;NS=51;CA=M;DP=469
+1      3589610 rs57492244;-/G  TGG     TG      100     PASS    AF=0.0691843;HP=7;DB;NF=11;NR=8;NS=51;CA=0;DP=527
+1      3593995 rs57765962;-/AT,watson  AATG    AG      100     PASS    AF=0.127015;HP=2;DB;NF=10;NR=8;NS=52;CA=0;DP=423
+1      3603570 .       GCGGGGCCCACCTCGCACCCGCGGCCCACGTCGCACCC  GC      100     PASS    AF=0.0758905;HP=1;NF=8;NR=12;NS=51;CA=0;DP=414
+1      3606881 rs5772119;-/A,venter    TAG     TG      100     PASS    AF=0.333638;HP=1;DB;NF=12;NR=36;NS=51;CA=0;DP=522
+1      3618309 rs3841787;-/TG,watson   CATG    CG      100     PASS    AF=0.219932;HP=1;DB;NF=14;NR=14;NS=50;CA=0;DP=449
+1      3619353 venter  GCCCCTGCC       GC      100     PASS    AF=0.290838;HP=4;NF=18;NR=8;NS=51;CA=0;DP=322
+1      3629994 rs35939665;-/CTGC,mills,venter,watson   TCTGCC  TC      100     PASS    AF=0.953969;HP=1;DB;NF=43;NR=31;NS=51;CA=0;DP=364
+1      3630547 rs35380007;-/A,venter   TA      TAA     100     PASS    AF=0.373122;HP=2;DB;NF=20;NR=12;NS=51;CA=0;DP=293
+1      3632819 rs61728692;-/CGGA       GT      GCGGAT  100     PASS    AF=0.63605;HP=1;DB;NF=18;NR=3;NS=48;CA=0;DP=238
+1      3632891 .       GGATTG  GG      46      PASS    AF=0.024415;HP=2;NF=4;NR=2;NS=49;CA=0;DP=381
+1      3633325 .       CG      CGATGGATGGGTGG  100     PASS    AF=0.870192;HP=1;NF=3;NR=4;NS=52;CA=0;DP=751
+1      3635416 rs3034587;-/CTCTCT,mills,venter AA      AAGAGAGA        100     PASS    AF=0.707697;HP=3;DB;NF=37;NR=27;NS=52;CA=0;DP=538
+1      3643833 .       AC      ACCC    25      PASS    AF=0.0664372;HP=1;NF=3;NR=3;NS=51;CA=0;DP=511
+1      3648954 rs3216059;-/G   AG      AGG     100     PASS    AF=0.42719;HP=4;DB;NF=35;NR=35;NS=51;CA=0;DP=551
+1      3660684 .       GA      GCA     100     PASS    AF=0.136632;HP=1;NF=2;NR=10;NS=49;CA=0;DP=480
+1      3663009 rs35440871;-/AA CAAG    CG      100     PASS    AF=0.2595;HP=2;DB;NF=19;NR=14;NS=51;CA=0;DP=498
+1      3665663 rs60798590;-/TATTTAAAAAT,watson CA      CAATTATTTAAAA   33      PASS    AF=0.0338921;HP=2;DB;NF=8;NR=3;NS=51;CA=0;DP=388
+1      3665995 .       TTTGAAACT       TT      33      PASS    AF=0.00986571;HP=4;NF=1;NR=3;NS=52;CA=0;DP=507
+1      3668078 .       AGG     AG      100     PASS    AF=0.341281;HP=8;NF=21;NR=29;NS=52;CA=0;DP=467
+1      3677245 rs36002367;-/AG AAGA    AA      100     PASS    AF=0.137474;HP=3;DB;NF=6;NR=10;NS=52;CA=0;DP=521
+1      3680208 .       TG      TGG     10      PASS    AF=0.0239017;HP=1;NF=7;NR=5;NS=51;CA=0;DP=448
+1      3681294 venter  CC      CGCAC   100     PASS    AF=0.200075;HP=8;NF=7;NR=2;NS=50;CA=0;DP=245
+1      3682989 rs35616712;-/C  TCC     TC      100     PASS    AF=0.0813904;HP=3;DB;NF=9;NR=3;NS=51;CA=0;DP=447
+1      3684305 venter  CG      CGG     100     PASS    AF=0.0596707;HP=3;NF=4;NR=6;NS=51;CA=0;DP=416
+1      3686623 rs35661250;-/AG CA      CAGA    100     PASS    AF=0.0609898;HP=1;DB;NF=5;NR=6;NS=52;CA=0;DP=626
+1      3691009 rs35756038;-/A,venter   CAA     CA      100     PASS    AF=0.444393;HP=2;DB;NF=24;NR=32;NS=52;CA=0;DP=562
+1      3696676 .       CCTG    CG      100     PASS    AF=0.102585;HP=4;NF=7;NR=6;NS=52;CA=0;DP=502
+1      3697316 rs34679063;-/C,venter   GC      GCC     100     PASS    AF=0.8246;HP=1;DB;NF=51;NR=32;NS=52;CA=0;DP=438
+1      3704105 .       TT      TTAATTTTTATATTAACCGTGTTAATAT    100     PASS    AF=0.377269;HP=2;NF=17;NR=26;NS=52;CA=0;DP=476
+1      3708451 watson  TG      TGGAGG  43      PASS    AF=0.0406373;HP=2;NF=3;NR=4;NS=52;CA=0;DP=587
+1      3710853 rs35447451;-/G,venter   AG      AGG     100     PASS    AF=0.272856;HP=4;DB;NF=25;NR=31;NS=52;CA=0;DP=507
+1      3711553 rs36007194;-/T  AT      ATT     100     PASS    AF=0.093968;HP=10;DB;NF=11;NR=13;NS=52;CA=0;DP=515
+1      3712668 rs35364504;-/GA,venter  GGAG    GG      100     PASS    AF=0.369523;HP=5;DB;NF=18;NR=34;NS=51;CA=0;DP=320
+1      3713867 venter  TTTTATTTAT      TT      100     PASS    AF=0.301438;HP=5;NF=21;NR=36;NS=49;CA=0;DP=294
+1      3714365 rs58666367;-/CTCAT,venter,watson        GA      GATCTCA 100     PASS    AF=0.431722;HP=1;DB;NF=24;NR=17;NS=52;CA=0;DP=484
+1      3721514 rs3838969;-/A,venter    CG      CTG     100     PASS    AF=0.472733;HP=2;DB;NF=27;NR=26;NS=52;CA=0;DP=461
+1      3726918 rs34085838;-/G  CG      CGG     100     PASS    AF=0.242958;HP=1;DB;NF=17;NR=14;NS=52;CA=0;DP=479
+1      3728638 rs61301856;-/GA,venter,watson   TGAG    TG      100     PASS    AF=0.446341;HP=1;DB;NF=54;NR=33;NS=52;CA=0;DP=666
+1      3729131 rs56900717;-/A  TT      TAT     100     PASS    AF=0.489357;HP=2;DB;NF=33;NR=22;NS=52;CA=0;DP=466
+1      3733293 rs5772126;-/G,venter    TG      TGG     100     PASS    AF=0.701257;HP=2;DB;NF=17;NR=26;NS=51;CA=0;DP=451
+1      3733413 .       CA      CAA     100     PASS    AF=0.107016;HP=5;NF=12;NR=16;NS=52;CA=0;DP=523
+1      3735276 venter  TA      TAAA    100     PASS    AF=0.491527;HP=1;NF=29;NR=33;NS=52;CA=0;DP=477
+1      3737219 rs61056063;-/A  AGA     AA      11      PASS    AF=0.205567;HP=1;DB;NF=13;NR=6;NS=51;CA=0;DP=431
+1      3740075 rs35801288;-/C  ACA     AA      100     PASS    AF=0.438207;HP=1;DB;NF=35;NR=12;NS=52;CA=0;DP=395
+1      3741588 rs34966926;-/T,venter   GT      GTT     100     PASS    AF=0.212825;HP=10;DB;NF=21;NR=22;NS=51;CA=0;DP=541
+1      3748510 mills   TTTTTTAT        TT      53      PASS    AF=0.0323102;HP=7;NF=21;NR=15;NS=51;CA=0;DP=420
+1      3759325 .       CG      CGGCCAAGGAG     100     PASS    AF=0.391954;HP=2;NF=19;NR=18;NS=52;CA=0;DP=465
+1      3759824 .       CG      CGGG    22      PASS    AF=0.0355289;HP=5;NF=4;NR=8;NS=52;CA=0;DP=591
+1      3760224 rs61309375;-/A,venter   CAG     CG      100     PASS    AF=0.303624;HP=1;DB;NF=27;NR=13;NS=51;CA=0;DP=447
+1      3773150 .       CTT     CT      12      NoQCALL AF=0.0786801;HP=2;NF=1;NR=9;NS=52;CA=0;DP=540
+1      3774838 .       GT      GTT     11      PASS    AF=0.0109686;HP=1;NF=2;NR=1;NS=52;CA=0;DP=492
+1      3774974 venter  CG      CTG     100     PASS    AF=0.552417;HP=1;NF=26;NR=38;NS=52;CA=0;DP=559
+1      3776839 .       TGG     TG      100     PASS    AF=0.0926011;HP=3;NF=5;NR=5;NS=52;CA=0;DP=441
+1      3780438 venter  CT      CTTT    100     PASS    AF=0.113197;HP=2;NF=10;NR=13;NS=52;CA=0;DP=654
+1      3780687 rs34664006;-/G  TGT     TT      50      PASS    AF=0.0614825;HP=1;DB;NF=4;NR=8;NS=50;CA=M;DP=299
+1      3784253 venter  ACTGTGCCGGCTTTCTATTC    AC      100     PASS    AF=0.0567473;HP=1;NF=81;NR=75;NS=52;CA=0;DP=627
+1      3786092 .       TACTCA  TA      100     PASS    AF=0.0330531;HP=1;NF=1;NR=6;NS=52;CA=0;DP=497
+1      3788460 rs35600694;-/ATA,watson CA      CAATA   100     PASS    AF=0.42686;HP=1;DB;NF=20;NR=17;NS=51;CA=0;DP=533
+1      3788666 rs34172576;-/T,venter   GT      GTT     100     PASS    AF=0.481873;HP=1;DB;NF=26;NR=12;NS=52;CA=0;DP=409
+1      3804956 rs60302317;-/CAACA      AACAACA AA      46      PASS    AF=0.0866272;HP=2;DB;NF=6;NR=2;NS=52;CA=M;DP=556
+1      3805210 rs58663935;-/AAAG       CA      CAAAGA  100     PASS    AF=0.0920558;HP=3;DB;NF=9;NR=2;NS=52;CA=0;DP=523
+1      3805480 .       GAA     GA      55      PASS    AF=0.0675729;HP=8;NF=13;NR=11;NS=52;CA=0;DP=539
+1      3805914 .       CCAGACACTGGCACCCCCCTTC  CC      100     PASS    AF=0.0288464;HP=2;NF=5;NR=4;NS=52;CA=0;DP=613
+1      3806447 rs35704040;-/C,mills    GCC     GC      100     PASS    AF=0.0700176;HP=6;DB;NF=4;NR=8;NS=52;CA=0;DP=350
+1      3807398 rs35759189;-/G,venter   AGG     AG      100     PASS    AF=0.324114;HP=3;DB;NF=21;NR=8;NS=50;CA=0;DP=355
+1      3808303 venter  GT      GTTCTTTTCTTT    100     PASS    AF=0.475205;HP=2;NF=19;NR=9;NS=52;CA=0;DP=264
+1      3809301 .       TACA    TA      100     PASS    AF=0.028676;HP=1;NF=26;NR=22;NS=52;CA=0;DP=553
+1      3813066 rs34938659;-/T  ATT     AT      100     PASS    AF=0.131264;HP=2;DB;NF=8;NR=6;NS=52;CA=0;DP=521
+1      3814885 .       TCACACACACACACACAC      TC      34      PASS    AF=0.149965;HP=1;NF=6;NR=2;NS=52;CA=M;DP=644
+1      3818483 .       AC      ACC     29      PASS    AF=0.0676027;HP=3;NF=1;NR=7;NS=50;CA=0;DP=412
+1      3820456 .       TGG     TG      12      PASS    AF=0.0215117;HP=4;NF=5;NR=1;NS=51;CA=0;DP=417
+1      3824944 .       GCTC    GC      100     PASS    AF=0.174164;HP=1;NF=9;NR=17;NS=50;CA=0;DP=277
+1      3825911 .       CG      CGGGGGG 100     PASS    AF=0.29134;HP=2;NF=24;NR=12;NS=52;CA=0;DP=514
+1      3827024 .       TTCCCT  TT      16      PASS    AF=0.0318298;HP=2;NF=34;NR=70;NS=51;CA=M;DP=394
+1      3827604 .       TG      TGG     40      PASS    AF=0.0159039;HP=1;NF=2;NR=5;NS=52;CA=0;DP=571
+1      3833062 watson  TC      TCCACC  100     PASS    AF=0.312659;HP=2;NF=17;NR=16;NS=52;CA=0;DP=463
+1      3833266 venter,watson   AT      ATCAGT  100     PASS    AF=0.497122;HP=1;NF=10;NR=19;NS=51;CA=0;DP=412
+1      3833395 .       CTATCTT CT      24      PASS    AF=0.0218407;HP=1;NF=7;NR=3;NS=50;CA=0;DP=400
+1      3833485 .       GTCTAT  GT      100     PASS    AF=0.417779;HP=1;NF=11;NR=12;NS=50;CA=0;DP=323
+1      3833578 watson  TTATCT  TT      100     PASS    AF=0.329625;HP=2;NF=27;NR=26;NS=51;CA=0;DP=388
+1      3833880 watson  CA      CATCTA  100     PASS    AF=0.347946;HP=1;NF=11;NR=13;NS=52;CA=0;DP=458
+1      3906706 .       TGG     TG      100     PASS    AF=0.149111;HP=3;NF=11;NR=9;NS=52;CA=0;DP=498
+1      3907565 rs34088401;-/C,mills    TCC     TC      100     PASS    AF=0.191109;HP=6;DB;NF=11;NR=14;NS=51;CA=0;DP=478
+1      3909253 .       AC      ACC     100     PASS    AF=0.0974891;HP=2;NF=10;NR=9;NS=52;CA=0;DP=591
+1      3909917 rs35302885;-/T,venter   CTT     CT      100     PASS    AF=0.766256;HP=7;DB;NF=45;NR=61;NS=52;CA=0;DP=605
+1      3916501 rs55698528;-/A,venter   GA      GAA     100     PASS    AF=0.624637;HP=1;DB;NF=37;NR=28;NS=52;CA=0;DP=488
+1      3920626 rs59758170;-/TAAATAAATA AATAAATAAATA    AA      100     PASS    AF=0.276985;HP=3;DB;NF=6;NR=6;NS=50;CA=M;DP=308
+1      3923069 .       TCG     TG      100     PASS    AF=0.224119;HP=1;NF=23;NR=7;NS=52;CA=0;DP=488
+1      3925431 rs34400281;-/T,venter   CTT     CT      100     PASS    AF=0.372459;HP=2;DB;NF=14;NR=10;NS=51;CA=0;DP=500
+1      3933527 .       ATTCCCCACAGTGTCTATGGGGACTCTAGCACGGTCAGGGACCCT   AT      100     PASS    AF=0.0367516;HP=2;NF=29;NR=33;NS=51;CA=0;DP=622
+1      3934862 venter  GCAC    GC      100     PASS    AF=0.565308;HP=1;NF=47;NR=42;NS=51;CA=0;DP=648
+1      3935044 .       TCAC    TC      40      PASS    AF=0.0156518;HP=1;NF=25;NR=8;NS=52;CA=0;DP=717
+1      3937578 rs56700097;-/A,venter   TG      TAG     100     PASS    AF=0.540707;HP=1;DB;NF=40;NR=17;NS=52;CA=0;DP=392
+1      3938627 rs58820377;-/ATAG       TTAGAT  TT      100     PASS    AF=0.0846429;HP=2;DB;NF=10;NR=11;NS=52;CA=0;DP=489
+1      3945777 .       CAGA    CA      100     PASS    AF=0.442957;HP=1;NF=49;NR=35;NS=52;CA=M;DP=511
+1      3967107 venter  GAGAA   GA      100     PASS    AF=0.226936;HP=1;NF=10;NR=15;NS=52;CA=0;DP=543
+1      3971955 rs56102422;-/T  AT      ATT     100     PASS    AF=0.275646;HP=10;DB;NF=12;NR=15;NS=52;CA=0;DP=477
+1      3973109 rs56883229;-/T,venter   ATT     AT      100     PASS    AF=0.374332;HP=8;DB;NF=7;NR=38;NS=52;CA=0;DP=398
+1      3974590 .       ATT     AT      100     PASS    AF=0.373956;HP=8;NF=19;NR=19;NS=51;CA=0;DP=352
+1      3976220 .       TTCCAGCTGTTGGACTGGCAAACAGT      TT      100     PASS    AF=0.155908;HP=3;NF=51;NR=67;NS=52;CA=0;DP=702
+1      3983232 .       GC      GCC     100     PASS    AF=0.153929;HP=3;NF=2;NR=12;NS=51;CA=0;DP=479
+1      3989673 rs34117538;-/T  CTT     CT      100     PASS    AF=0.138005;HP=7;DB;NF=10;NR=16;NS=52;CA=0;DP=480
+1      3991472 .       GT      GTT     41      PASS    AF=0.0921994;HP=10;NF=23;NR=19;NS=52;CA=0;DP=490
+1      3995340 .       GAATA   GA      100     PASS    AF=0.126804;HP=2;NF=18;NR=25;NS=51;CA=0;DP=456
+1      3995701 rs35842317;-/A  GA      GAA     100     PASS    AF=0.287765;HP=3;DB;NF=16;NR=28;NS=52;CA=0;DP=515
+1      3998289 rs34690250;-/C  AT      ATT     31      PASS    AF=0.0505667;HP=1;DB;NF=5;NR=6;NS=50;CA=0;DP=373
+1      3998556 rs35439065;-/C,venter   AC      ACC     100     PASS    AF=0.152989;HP=1;DB;NF=17;NR=4;NS=52;CA=0;DP=565
+1      4003805 .       CCCTTC  CC      100     PASS    AF=0.497734;HP=3;NF=13;NR=9;NS=52;CA=M;DP=357
+1      4004467 .       TA      TAA     100     PASS    AF=0.178845;HP=10;NF=39;NR=12;NS=52;CA=0;DP=482
+1      4005161 .       AAGA    AA      10      PASS    AF=0.109604;HP=8;NF=5;NR=3;NS=52;CA=0;DP=418
+1      4009724 .       GGAGAGGGAGAAG   GG      100     PASS    AF=0.0443217;HP=4;NF=7;NR=9;NS=51;CA=0;DP=347
+1      4010638 rs59300943;-/T  CT      CTT     100     PASS    AF=0.238748;HP=5;DB;NF=17;NR=13;NS=52;CA=0;DP=424
+1      4018608 .       GGGAG   GG      14      PASS    AF=0.0210215;HP=3;NF=11;NR=22;NS=52;CA=0;DP=439
+1      4020045 rs60135555;-/AAA,venter TA      TAAAA   55      PASS    AF=0.669408;HP=9;DB;NF=19;NR=3;NS=52;CA=0;DP=315
+1      4021381 .       CTGGGAAC        CC      26      PASS    AF=0.0682584;HP=1;NF=1;NR=7;NS=52;CA=0;DP=500
+1      4022270 .       TG      TCG     59      PASS    AF=0.0269606;HP=6;NF=2;NR=3;NS=52;CA=0;DP=522
+1      4022431 rs58149124;-/CC,watson  TC      TCCC    100     PASS    AF=0.833755;HP=1;DB;NF=29;NR=41;NS=52;CA=0;DP=574
+1      4024133 rs56013829;-/GTCA,venter        ACAGTC  AC      100     PASS    AF=0.444062;HP=1;DB;NF=29;NR=25;NS=52;CA=0;DP=599
+1      4024168 rs56372495;-/AC,venter  TCAC    TC      100     PASS    AF=0.370935;HP=1;DB;NF=14;NR=39;NS=52;CA=0;DP=645
+1      4024408 rs55816119;-/TT,watson  TC      TCAC    100     PASS    AF=0.479654;HP=1;DB;NF=17;NR=29;NS=52;CA=0;DP=726
+1      4024524 .       ACTC    AC      100     PASS    AF=0.220192;HP=1;NF=11;NR=5;NS=52;CA=0;DP=721
+1      4024673 .       TT      TTCACT  100     PASS    AF=0.173855;HP=2;NF=11;NR=13;NS=52;CA=0;DP=887
+1      4024704 .       TCAG    TG      100     PASS    AF=0.0291681;HP=1;NF=6;NR=1;NS=52;CA=0;DP=750
+1      4024735 venter  TC      TCAC    100     PASS    AF=0.247468;HP=1;NF=19;NR=5;NS=52;CA=0;DP=775
+1      4024928 .       CTCAGT  CT      100     PASS    AF=0.0974879;HP=1;NF=11;NR=7;NS=52;CA=0;DP=919
+1      4025065 .       TCAC    TC      100     PASS    AF=0.273013;HP=1;NF=7;NR=12;NS=52;CA=0;DP=714
+1      4025127 .       ACTC    AC      100     PASS    AF=0.380734;HP=1;NF=17;NR=20;NS=52;CA=M;DP=574
+1      4025165 .       TC      TCACTCAC        100     PASS    AF=0.0820414;HP=1;NF=1;NR=9;NS=52;CA=M;DP=574
+1      4025232 watson  TC      TCAC    100     PASS    AF=0.631924;HP=1;NF=15;NR=11;NS=52;CA=M;DP=459
+1      4025339 .       TTCACT  TT      53      PASS    AF=0.159738;HP=2;NF=17;NR=14;NS=51;CA=0;DP=609
+1      4025399 .       CA      CATA    100     PASS    AF=0.0862676;HP=1;NF=4;NR=7;NS=52;CA=0;DP=506
+1      4025472 .       CA      CATTTA  39      PASS    AF=0.0270865;HP=1;NF=2;NR=1;NS=52;CA=0;DP=538
+1      4025543 venter,watson   TC      TCAC    100     PASS    AF=0.26036;HP=1;NF=9;NR=12;NS=52;CA=0;DP=482
+1      4025589 .       AC      ACTC    53      PASS    AF=0.0696821;HP=1;NF=1;NR=1;NS=52;CA=0;DP=575
+1      4025678 watson  TACTCA  TA      100     PASS    AF=0.299176;HP=1;NF=14;NR=7;NS=52;CA=0;DP=549
+1      4025718 .       CATT    CT      100     PASS    AF=0.0815807;HP=1;NF=8;NR=6;NS=52;CA=0;DP=570
+1      4025810 watson  TC      TCAC    100     PASS    AF=0.240222;HP=1;NF=8;NR=8;NS=52;CA=0;DP=442
+1      4025920 .       ACTCACACTC      AC      15      PASS    AF=0.0440807;HP=1;NF=5;NR=6;NS=52;CA=0;DP=439
+1      4025988 .       ATCACT  AT      100     PASS    AF=0.115745;HP=1;NF=7;NR=3;NS=52;CA=M;DP=409
+1      4026021 .       ATTCGC  AC      19      PASS    AF=0.0230633;HP=2;NF=4;NR=4;NS=52;CA=0;DP=408
+1      4026091 .       ACAGTC  AC      100     PASS    AF=0.239672;HP=1;NF=10;NR=12;NS=52;CA=0;DP=418
+1      4026188 .       GTCACTCGTT      GT      100     PASS    AF=0.0942528;HP=1;NF=17;NR=15;NS=51;CA=M;DP=704
+1      4026243 .       AC      ACTCACTC        100     PASS    AF=0.0701669;HP=1;NF=8;NR=2;NS=52;CA=0;DP=852
+1      4026341 .       AC      ACTC    100     PASS    AF=0.180464;HP=1;NF=7;NR=12;NS=52;CA=0;DP=797
+1      4026433 .       AC      ACTCACAGTC      100     PASS    AF=0.0755971;HP=1;NF=10;NR=4;NS=52;CA=0;DP=727
+1      4026489 .       CCACTC  CC      100     PASS    AF=0.152175;HP=2;NF=20;NR=14;NS=52;CA=0;DP=896
+1      4026521 .       AT      ACT     18      PASS    AF=0.0348752;HP=1;NF=8;NR=8;NS=52;CA=0;DP=896
+1      4026676 .       ACACTC  AC      100     PASS    AF=0.345964;HP=1;NF=25;NR=27;NS=52;CA=0;DP=805
+1      4026745 .       ACTC    AC      100     PASS    AF=0.277096;HP=1;NF=6;NR=11;NS=52;CA=0;DP=625
+1      4026831 .       AC      ACTC    100     PASS    AF=0.158736;HP=1;NF=13;NR=9;NS=52;CA=0;DP=585
+1      4026904 .       TACTCA  TA      59      PASS    AF=0.094457;HP=1;NF=7;NR=4;NS=52;CA=0;DP=594
+1      4026996 .       TT      TTCACT  100     PASS    AF=0.0816069;HP=2;NF=19;NR=16;NS=52;CA=0;DP=668
+1      4027100 watson  GT      GTCACT  100     PASS    AF=0.51624;HP=1;NF=22;NR=20;NS=52;CA=0;DP=958
+1      4027153 .       AC      ACTCACACTC      100     PASS    AF=0.221157;HP=1;NF=11;NR=7;NS=52;CA=0;DP=694
+1      4027249 .       ACACTCGCTCAGTC  AC      100     PASS    AF=0.191741;HP=1;NF=20;NR=16;NS=52;CA=0;DP=528
+1      4027301 .       TCAC    TC      100     PASS    AF=0.21653;HP=1;NF=6;NR=9;NS=52;CA=0;DP=511
+1      4027378 .       TT      TTCACT  100     PASS    AF=0.23813;HP=2;NF=19;NR=16;NS=52;CA=0;DP=565
+1      4027440 .       TT      TTCACT  100     PASS    AF=0.351897;HP=2;NF=28;NR=13;NS=52;CA=0;DP=736
+1      4031776 venter,watson   GC      GCTGCTCC        100     PASS    AF=0.57914;HP=1;NF=17;NR=13;NS=52;CA=0;DP=475
+1      4046995 rs60127181;-/ATG,watson GC      GGATC   100     PASS    AF=0.863384;HP=1;DB;NF=37;NR=32;NS=51;CA=0;DP=427
+1      4053051 .       AC      AACC    10      PASS    AF=0.0731381;HP=1;NF=2;NR=3;NS=52;CA=0;DP=453
+1      4056743 rs57501900;-/T,venter   ATT     AT      100     PASS    AF=0.863012;HP=6;DB;NF=63;NR=45;NS=52;CA=0;DP=485
+1      4078234 venter,watson   CTGCCTGTGTGAGCAAGAT     CT      100     PASS    AF=0.308447;HP=1;NF=26;NR=18;NS=52;CA=0;DP=484
+1      4080449 rs35774756;-/T  GTT     GT      100     PASS    AF=0.285891;HP=2;DB;NF=20;NR=24;NS=51;CA=0;DP=526
+1      4082493 rs35701497;-/G  CGG     CG      100     PASS    AF=0.277913;HP=4;DB;NF=14;NR=16;NS=52;CA=0;DP=416
+1      4086137 .       CA      CTA     100     PASS    AF=0.0260425;HP=1;NF=4;NR=2;NS=52;CA=0;DP=569
+1      4088196 .       TTCT    TT      100     PASS    AF=0.0658972;HP=3;NF=67;NR=77;NS=51;CA=B;DP=647
+1      4091673 rs56198003;-/TTA        GTTAT   GT      100     PASS    AF=0.0274099;HP=2;DB;NF=4;NR=7;NS=52;CA=0;DP=489
+1      4093407 rs35442233;-/G,venter   TGG     TG      100     PASS    AF=0.056726;HP=4;DB;NF=4;NR=5;NS=51;CA=0;DP=432
+1      4097902 rs5772141;-/ATT,mills,venter,watson     CA      CATTA   100     PASS    AF=0.999995;HP=1;DB;NF=38;NR=34;NS=52;CA=0;DP=432
+1      4106716 .       AC      ACACACACACACGC  100     PASS    AF=0.316911;HP=1;NF=1;NR=1;NS=52;CA=0;DP=601
+1      4114274 rs60603556;-/CAT,watson AATCA   AA      100     PASS    AF=0.135224;HP=3;DB;NF=17;NR=9;NS=51;CA=0;DP=587
+1      4114592 rs56285575;-/ACA,venter AAACA   AA      100     PASS    AF=0.254759;HP=3;DB;NF=21;NR=18;NS=52;CA=0;DP=554
+1      4114812 .       TTAT    TT      33      PASS    AF=0.14738;HP=3;NF=5;NR=4;NS=52;CA=0;DP=411
+1      4114996 .       AA      AATTATTA        11      PASS    AF=0.228122;HP=2;NF=26;NR=29;NS=49;CA=0;DP=276
+1      4120825 .       GAA     GA      43      PASS    AF=0.147904;HP=2;NF=11;NR=17;NS=51;CA=0;DP=328
+1      4121802 .       ATGT    AT      11      PASS    AF=0.0113836;HP=1;NF=24;NR=16;NS=52;CA=0;DP=570
+1      4131826 .       ATTGTTT AT      100     PASS    AF=0.999996;HP=2;NF=38;NR=35;NS=52;CA=0;DP=456
+1      4134659 rs35271731;-/G  TG      TGG     100     PASS    AF=0.417516;HP=5;DB;NF=21;NR=19;NS=52;CA=0;DP=429
+1      4139315 rs35859581;-/T,venter   GT      GTT     100     PASS    AF=0.371694;HP=2;DB;NF=12;NR=16;NS=52;CA=0;DP=444
+1      4144542 .       CAA     CA      100     PASS    AF=0.0915309;HP=2;NF=7;NR=8;NS=52;CA=M;DP=461
+1      4149378 rs35644791;-/CCT,venter,watson  AC      ACCTC   100     PASS    AF=0.955034;HP=2;DB;NF=35;NR=24;NS=52;CA=0;DP=461
+1      4150078 .       ATC     AC      100     PASS    AF=0.0248618;HP=1;NF=3;NR=1;NS=52;CA=0;DP=489
+1      4158176 rs61115653;-/A  CA      CAA     100     PASS    AF=0.109858;HP=9;DB;NF=9;NR=8;NS=52;CA=0;DP=480
+1      4158371 rs35550030;-/G  AGA     AA      100     PASS    AF=0.282272;HP=1;DB;NF=22;NR=13;NS=52;CA=0;DP=508
+1      4160853 .       AG      AGTG    100     PASS    AF=0.883963;HP=1;NF=52;NR=40;NS=52;CA=0;DP=475
+1      4163479 rs35439066;-/T,venter   ATT     AT      100     PASS    AF=0.421487;HP=7;DB;NF=35;NR=40;NS=52;CA=0;DP=580
+1      4165518 rs5772143;-/A,mills     CAT     CT      100     PASS    AF=0.0997002;HP=1;DB;NF=8;NR=9;NS=52;CA=0;DP=569
+1      4168412 .       TG      TGG     100     PASS    AF=0.0597927;HP=5;NF=7;NR=5;NS=50;CA=0;DP=411
+1      4174019 .       CCTTTC  CC      100     PASS    AF=0.223832;HP=2;NF=5;NR=11;NS=51;CA=M;DP=369
+1      4176371 rs5772145;-/GGGCT,mills,venter,watson   GG      GGGGCTG 100     PASS    AF=0.965127;HP=4;DB;NF=37;NR=39;NS=51;CA=0;DP=577
+1      4180359 rs35134459;-/T,venter   CG      CTG     100     PASS    AF=0.994644;HP=2;DB;NF=70;NR=40;NS=52;CA=0;DP=510
+1      4198168 .       GCCATTTACATCCCACC       GC      100     PASS    AF=0.0947023;HP=2;NF=47;NR=53;NS=52;CA=0;DP=625
+1      4203370 .       TCAC    TC      22      PASS    AF=0.151126;HP=1;NF=40;NR=22;NS=51;CA=0;DP=481
+1      4224147 .       ATGT    AT      100     PASS    AF=0.459042;HP=1;NF=45;NR=57;NS=52;CA=0;DP=508
+1      4236168 venter,watson   GT      GTCCTGTT        100     PASS    AF=0.465028;HP=1;NF=21;NR=21;NS=51;CA=0;DP=473
+1      4238553 .       TAG     TG      100     PASS    AF=0.0884036;HP=1;NF=3;NR=3;NS=52;CA=0;DP=313
+1      4243904 .       TG      TGGGGG  28      PASS    AF=0.177328;HP=1;NF=6;NR=9;NS=52;CA=0;DP=598
+1      4252300 .       AATTTA  AA      27      PASS    AF=0.0160294;HP=2;NF=16;NR=12;NS=52;CA=0;DP=550
+1      4256051 .       CC      CCTCAC  100     PASS    AF=0.423907;HP=2;NF=10;NR=6;NS=52;CA=M;DP=450
+1      4256251 rs56817136;-/AATCCATC   TC      TCATCAATCC      27      PASS    AF=0.483921;HP=1;DB;NF=24;NR=28;NS=52;CA=M;DP=501
+1      4256338 rs59859709;-/CCAT       CCCATC  CC      100     PASS    AF=0.420087;HP=3;DB;NF=47;NR=73;NS=52;CA=0;DP=510
+1      4258560 rs35749795;-/G,venter   TGG     TG      100     PASS    AF=0.563751;HP=3;DB;NF=30;NR=43;NS=52;CA=0;DP=533
+1      4270968 rs5772150;-/A,mills,venter      TAA     TA      100     PASS    AF=0.863858;HP=2;DB;NF=66;NR=65;NS=52;CA=0;DP=554
+1      4272781 rs34523387;-/CA,venter,watson   TCAC    TC      100     PASS    AF=0.221206;HP=1;DB;NF=55;NR=32;NS=52;CA=0;DP=555
+1      4276688 rs56762609;-/A  CA      CAA     25      PASS    AF=0.0168189;HP=4;DB;NF=5;NR=7;NS=52;CA=0;DP=567
+1      4278344 rs33957131;-/A,mills    TAT     TT      100     PASS    AF=0.260307;HP=1;DB;NF=13;NR=14;NS=52;CA=M;DP=390
+1      4280264 rs35972891;-/G,venter   TG      TGG     100     PASS    AF=0.36321;HP=6;DB;NF=16;NR=21;NS=52;CA=0;DP=487
+1      4280920 rs3058085;-/AGA,mills,venter,watson     AT      ATCTT   100     PASS    AF=0.75024;HP=1;DB;NF=34;NR=50;NS=52;CA=0;DP=518
+1      4281851 rs59086076;-/TTGT       CTGTTT  CT      100     PASS    AF=0.15371;HP=1;DB;NF=12;NR=13;NS=52;CA=0;DP=454
+1      4287207 rs3986843;-/CCT CA      CAGGA   100     PASS    AF=0.100002;HP=1;DB;NF=8;NR=1;NS=52;CA=0;DP=451
+1      4289708 .       GTGTTAG GG      37      PASS    AF=0.0904846;HP=1;NF=3;NR=9;NS=52;CA=0;DP=447
+1      4291813 .       CGC     CC      41      PASS    AF=0.05598;HP=1;NF=1;NR=9;NS=52;CA=0;DP=504
+1      4291856 rs33950418;-/C,mills    ACA     AA      53      PASS    AF=0.0424203;HP=1;DB;NF=2;NR=10;NS=52;CA=M;DP=504
+1      4292024 rs33982329;-/CA,mills   CG      CATG    100     PASS    AF=0.0974178;HP=1;DB;NF=14;NR=14;NS=52;CA=0;DP=697
+1      4296830 .       CTT     CT      100     PASS    AF=0.101792;HP=2;NF=15;NR=4;NS=52;CA=0;DP=805
+1      4298115 rs34054009;-/G,venter   AG      AGG     100     PASS    AF=0.314255;HP=2;DB;NF=25;NR=10;NS=52;CA=0;DP=565
+1      4310246 rs35999105;-/A  TA      TAA     100     PASS    AF=0.229765;HP=5;DB;NF=23;NR=13;NS=52;CA=0;DP=488
+1      4310305 venter  GA      GAA     39      PASS    AF=0.078696;HP=9;NF=15;NR=5;NS=52;CA=0;DP=455
+1      4312461 .       GAAAGAAA        GA      24      PASS    AF=0.0372797;HP=3;NF=23;NR=6;NS=52;CA=M;DP=401
+1      4313453 .       GG      GTG     23      PASS    AF=0.026167;HP=2;NF=2;NR=5;NS=52;CA=0;DP=614
+1      4315016 rs34078493;-/T,venter   CT      CTT     100     PASS    AF=0.459017;HP=1;DB;NF=25;NR=37;NS=52;CA=0;DP=493
+1      4316236 rs35864764;-/TC ATCT    AT      100     PASS    AF=0.164629;HP=1;DB;NF=18;NR=15;NS=52;CA=0;DP=434
+1      4317119 rs35907112;-/AG AAGA    AA      100     PASS    AF=0.210583;HP=3;DB;NF=19;NR=13;NS=52;CA=0;DP=652
+1      4319781 rs34098980;-/AAAAA,mills,venter CC      CAAAAAC 100     PASS    AF=0.451406;HP=2;DB;NF=9;NR=1;NS=52;CA=0;DP=605
+1      4323411 .       GT      GTT     41      PASS    AF=0.0448346;HP=6;NF=4;NR=5;NS=52;CA=0;DP=498
+1      4326343 .       CG      CGGGGGGGGGGG    100     PASS    AF=0.212625;HP=2;NF=5;NR=11;NS=52;CA=0;DP=475
+1      4329138 .       GTGAT   GT      47      PASS    AF=0.0168095;HP=1;NF=35;NR=37;NS=52;CA=0;DP=675
+1      4329500 venter  ATGGTGATGGT     AT      100     PASS    AF=0.0491;HP=1;NF=35;NR=49;NS=52;CA=0;DP=718
+1      4333035 .       CCACTC  CC      100     PASS    AF=0.0536691;HP=2;NF=18;NR=17;NS=52;CA=0;DP=614
+1      4333090 .       CCCATC  CC      100     PASS    AF=0.896174;HP=3;NF=52;NR=56;NS=52;CA=0;DP=564
+1      4333868 rs34013096;-/CCAT       AC      ACCATC  100     PASS    AF=0.411752;HP=2;DB;NF=63;NR=59;NS=52;CA=0;DP=556
+1      4352929 .       TAA     TA      100     PASS    AF=0.0606075;HP=5;NF=10;NR=5;NS=51;CA=0;DP=422
+1      4360308 .       CAA     CA      100     PASS    AF=0.160821;HP=3;NF=12;NR=13;NS=52;CA=0;DP=502
+1      4360675 rs55750624;-/A  GAA     GA      100     PASS    AF=0.209252;HP=2;DB;NF=18;NR=10;NS=52;CA=0;DP=456
+1      4362123 rs57250327;-/AAATT      TA      TAATTAA 100     PASS    AF=0.202867;HP=2;DB;NF=23;NR=24;NS=52;CA=0;DP=404
+1      4372014 rs34773421;-/A,venter   TAA     TA      100     PASS    AF=0.507594;HP=2;DB;NF=43;NR=31;NS=52;CA=0;DP=496
+1      4373092 .       CATTTA  CA      100     PASS    AF=0.155807;HP=1;NF=19;NR=10;NS=52;CA=0;DP=440
+1      4375952 .       TCT     TT      100     PASS    AF=0.0215948;HP=1;NF=3;NR=2;NS=52;CA=0;DP=530
+1      4376164 rs57973702;-/TG,venter  CG      CGTG    100     PASS    AF=0.555727;HP=1;DB;NF=33;NR=60;NS=52;CA=0;DP=552
+1      4382255 .       GT      GTT     100     PASS    AF=0.134524;HP=8;NF=12;NR=14;NS=52;CA=0;DP=445
+1      4382929 .       CG      CGCCGTGCCCTGCTCAG       100     PASS    AF=0.293977;HP=1;NF=3;NR=1;NS=52;CA=0;DP=423
+1      4386769 rs34696074;-/G  TGG     TG      100     PASS    AF=0.524405;HP=3;DB;NF=43;NR=31;NS=51;CA=0;DP=586
+1      4386900 rs35831569;-/GTGA,watson        TG      TGTGAG  100     PASS    AF=0.786341;HP=1;DB;NF=49;NR=47;NS=52;CA=0;DP=728
+1      4387089 rs35106948;-/GA,venter,watson   TGAG    TG      100     PASS    AF=0.76407;HP=1;DB;NF=42;NR=48;NS=52;CA=0;DP=730
+1      4398343 rs56075652;-/AGCTAG,mills,venter,watson GGAGCTAG        GG      100     PASS    AF=0.850798;HP=2;DB;NF=51;NR=52;NS=52;CA=0;DP=535
+1      4403445 .       ATC     AC      100     PASS    AF=0.0257077;HP=1;NF=3;NR=3;NS=52;CA=0;DP=579
+1      4413424 .       GGAAG   GG      100     PASS    AF=0.0911622;HP=2;NF=13;NR=11;NS=52;CA=0;DP=539
+1      4415363 rs35655214;-/A,mills,venter     CAA     CA      100     PASS    AF=0.279808;HP=10;DB;NF=16;NR=13;NS=52;CA=0;DP=623
+1      4419729 rs34301403;-/T,venter   CT      CTT     100     PASS    AF=0.276688;HP=3;DB;NF=23;NR=17;NS=52;CA=0;DP=491
+1      4429935 .       ACC     AC      100     PASS    AF=0.121066;HP=2;NF=8;NR=7;NS=52;CA=0;DP=509
+1      4432975 rs35185885;-/TTAT,venter        TT      TTTTAT  100     PASS    AF=0.370788;HP=4;DB;NF=7;NR=50;NS=51;CA=0;DP=329
+1      4433724 .       AC      ACC     100     PASS    AF=0.191535;HP=2;NF=16;NR=17;NS=52;CA=0;DP=609
+1      4434361 .       GA      GATGATATTGAAA   100     PASS    AF=0.175787;HP=1;NF=8;NR=5;NS=52;CA=0;DP=496
+1      4439328 rs55695069;-/TGTG,watson        TGTGAG  TG      100     PASS    AF=0.115075;HP=1;DB;NF=13;NR=10;NS=51;CA=0;DP=510
+1      4444447 .       GC      GCC     100     PASS    AF=0.126735;HP=1;NF=8;NR=6;NS=52;CA=0;DP=442
+1      4444562 watson  TTCG    TG      100     PASS    AF=0.167206;HP=3;NF=13;NR=9;NS=52;CA=0;DP=477
+1      4448379 rs55971665;-/A,venter   GAA     GA      100     PASS    AF=0.999997;HP=5;DB;NF=29;NR=34;NS=51;CA=0;DP=398
+1      4456774 rs34368344;-/CTCA,watson        TCTCAC  TC      100     PASS    AF=0.4985;HP=1;DB;NF=46;NR=35;NS=52;CA=0;DP=679
+1      4456823 .       TT      TTTTCTCTCT      100     PASS    AF=0.281015;HP=3;NF=18;NR=7;NS=52;CA=0;DP=566
+1      4460399 .       CAGA    CA      17      PASS    AF=0.0162627;HP=1;NF=4;NR=1;NS=52;CA=0;DP=437
+1      4461064 .       TG      TGGG    100     PASS    AF=0.136493;HP=8;NF=11;NR=12;NS=52;CA=0;DP=516
+1      4461120 .       GAGTCA  GA      100     PASS    AF=0.106497;HP=1;NF=4;NR=10;NS=52;CA=0;DP=513
+1      4462914 rs35786528;-/T,venter   GTT     GT      100     PASS    AF=0.636288;HP=9;DB;NF=46;NR=44;NS=52;CA=0;DP=457
+1      4464201 rs35933446;-/G  AGC     AC      100     PASS    AF=0.0422945;HP=1;DB;NF=3;NR=5;NS=52;CA=0;DP=559
+1      4465553 rs33984734;-/C,mills,venter     GCC     GC      100     PASS    AF=0.832437;HP=3;DB;NF=43;NR=36;NS=52;CA=0;DP=507
+1      4465878 rs55781312;-/GAACA,watson       TACAGAA TA      100     PASS    AF=0.547352;HP=1;DB;NF=48;NR=55;NS=52;CA=0;DP=612
+1      4466414 rs34356738;-/T,venter   AT      ATT     100     PASS    AF=0.0343632;HP=4;DB;NF=5;NR=2;NS=52;CA=0;DP=523
+1      4468803 .       CT      CTTTTCTTTTCTTT  100     PASS    AF=0.185641;HP=2;NF=2;NR=1;NS=51;CA=0;DP=271
+1      4469024 .       TT      TTGTGT  26      PASS    AF=0.65093;HP=2;NF=51;NR=54;NS=51;CA=0;DP=465
+1      4470162 rs34280110;-/T,venter   CT      CTT     100     PASS    AF=0.19103;HP=3;DB;NF=13;NR=16;NS=52;CA=0;DP=581
+1      4472390 rs35540877;-/AAG        TAAGA   TA      100     PASS    AF=0.0513799;HP=2;DB;NF=4;NR=3;NS=52;CA=0;DP=531
+1      4481812 rs34806922;-/A,venter   GAA     GA      100     PASS    AF=0.0356083;HP=3;DB;NF=4;NR=4;NS=52;CA=0;DP=576
+1      4482705 .       CA      CATCTA  100     PASS    AF=0.203301;HP=1;NF=34;NR=52;NS=50;CA=M;DP=382
+1      4482808 .       CTA     CA      16      PASS    AF=0.0550307;HP=1;NF=1;NR=1;NS=51;CA=M;DP=356
+1      4482848 rs5772166;-/TCTCTCTC,mills      ATCTCTCTCT      AT      100     PASS    AF=0.561639;HP=1;DB;NF=52;NR=17;NS=51;CA=M;DP=311
+1      4484471 rs3059158;-/CT,mills,watson     AG      ACTG    100     PASS    AF=0.497825;HP=1;DB;NF=31;NR=34;NS=52;CA=0;DP=538
+1      4486660 rs34976033;-/CCCT,mills,venter,watson   GCTCCC  GC      100     PASS    AF=0.593551;HP=1;DB;NF=42;NR=55;NS=52;CA=0;DP=566
+1      4486840 rs35808993;-/A,venter   GAT     GT      100     PASS    AF=0.0446408;HP=1;DB;NF=4;NR=4;NS=52;CA=0;DP=539
+1      4495865 watson  TGACCT  TT      100     PASS    AF=0.477912;HP=1;NF=15;NR=22;NS=52;CA=0;DP=386
+1      4498895 .       TAAACTCA        TA      100     PASS    AF=0.365307;HP=3;NF=30;NR=28;NS=52;CA=0;DP=561
+1      4499763 .       TT      TTTTAGTTTAGTTTAGTTTAGTTTAGT     15      PASS    AF=0.437504;HP=4;NF=5;NR=8;NS=51;CA=0;DP=440
+1      4500994 rs57293099;-/A,venter   GG      GAG     19      PASS    AF=0.533167;HP=5;DB;NF=26;NR=15;NS=51;CA=0;DP=466
+1      4501978 rs34937816;-/T,mills,venter     GT      GTT     100     PASS    AF=0.677682;HP=1;DB;NF=47;NR=42;NS=52;CA=0;DP=475
+1      4504724 venter,watson   TAGACA  TA      100     PASS    AF=0.381777;HP=1;NF=34;NR=33;NS=52;CA=0;DP=728
+1      4504861 venter  TACAGAGAGAGACAGAGAGA    TA      100     PASS    AF=0.208225;HP=1;NF=42;NR=31;NS=52;CA=0;DP=820
+1      4506249 rs56013880;-/T,mills,venter     GC      GTC     100     PASS    AF=0.652109;HP=2;DB;NF=41;NR=48;NS=52;CA=0;DP=522
+1      4506287 venter  TAG     TG      100     PASS    AF=0.348604;HP=1;NF=23;NR=27;NS=52;CA=0;DP=534
+1      4510123 rs35963445;-/C,venter   TC      TCC     100     PASS    AF=0.750939;HP=6;DB;NF=32;NR=50;NS=52;CA=0;DP=488
+1      4511427 rs34235356;-/T,venter   AT      ATT     100     PASS    AF=0.559297;HP=8;DB;NF=40;NR=27;NS=52;CA=0;DP=549
+1      4512561 rs57315980;-/GAG        TGGAG   TG      100     PASS    AF=0.0276885;HP=2;DB;NF=7;NR=4;NS=52;CA=0;DP=581
+1      4512788 rs56318426;-/GGATAGTGTG TC      TGTGTGGGATAC    100     PASS    AF=0.145759;HP=1;DB;NF=7;NR=6;NS=52;CA=0;DP=570
+1      4513234 rs5772168;-/ATCA,venter,watson  TA      TATCAA  100     PASS    AF=0.761132;HP=1;DB;NF=45;NR=38;NS=52;CA=0;DP=478
+1      4513552 rs34248962;-/G,venter   CTC     CC      100     PASS    AF=0.397344;HP=1;DB;NF=19;NR=21;NS=52;CA=0;DP=502
+1      4518079 .       CTTTATGTCAAC    CC      31      PASS    AF=0.0537494;HP=3;NF=13;NR=6;NS=52;CA=0;DP=567
+1      4519870 .       CATAA   CA      100     PASS    AF=0.156873;HP=1;NF=25;NR=19;NS=52;CA=0;DP=518
+1      4520552 venter,watson   ATATT   AT      100     PASS    AF=0.0454741;HP=1;NF=13;NR=21;NS=52;CA=0;DP=523
+1      4524683 rs60936673;-/A,venter   GAC     GC      100     PASS    AF=0.0433734;HP=1;DB;NF=5;NR=1;NS=51;CA=0;DP=407
+1      4531795 .       CG      CGAGCAGATAG     100     PASS    AF=0.0529244;HP=1;NF=2;NR=3;NS=52;CA=0;DP=598
+1      4533811 rs61232512;-/TCCCTCCTGGACAGCCAGG,watson TCCTCCTGGACAGCCAGGTCC   TC      100     PASS    AF=0.455665;HP=2;DB;NF=9;NR=12;NS=52;CA=0;DP=455
+1      4535415 rs34971058;-/C,mills,venter     GC      GCC     100     PASS    AF=0.872856;HP=1;DB;NF=71;NR=50;NS=52;CA=0;DP=585
+1      4540778 rs5772169;-/T,mills     CTG     CG      100     PASS    AF=0.129616;HP=1;DB;NF=9;NR=6;NS=52;CA=0;DP=518
+1      4541031 .       TT      TTTTCT  100     PASS    AF=0.0665496;HP=6;NF=18;NR=24;NS=51;CA=0;DP=371
+1      4541492 rs5772170;-/G,mills,venter      TG      TGG     100     PASS    AF=0.912727;HP=3;DB;NF=57;NR=39;NS=52;CA=0;DP=454
+1      4542962 .       CC      CCTCTCTCTCTC    100     PASS    AF=0.767807;HP=2;NF=57;NR=35;NS=52;CA=0;DP=481
+1      4544333 rs3059964;-/CT,venter   ACTC    AC      100     PASS    AF=0.941425;HP=1;DB;NF=54;NR=73;NS=52;CA=0;DP=591
+1      4547027 rs34146010;-/C  ACC     AC      100     PASS    AF=0.974502;HP=2;DB;NF=55;NR=74;NS=52;CA=0;DP=535
+1      4547927 rs34056554;-/T,venter   ATT     AT      100     PASS    AF=0.867021;HP=3;DB;NF=7;NR=12;NS=51;CA=0;DP=398
+1      4551259 rs34018288;-/TG,venter,watson   CT      CTGT    100     PASS    AF=0.964821;HP=1;DB;NF=25;NR=27;NS=52;CA=0;DP=445
+1      4552887 .       GT      GTCT    100     PASS    AF=0.155774;HP=1;NF=6;NR=7;NS=52;CA=0;DP=507
+1      4556585 rs3833958;-/GGGCT,venter        GA      GAGCCCA 100     PASS    AF=0.248571;HP=1;DB;NF=9;NR=9;NS=52;CA=0;DP=416
+1      4558195 rs58248788;-/T,venter   ATT     AT      100     PASS    AF=0.949748;HP=4;DB;NF=38;NR=18;NS=51;CA=0;DP=446
+1      4558625 .       AGA     AA      100     PASS    AF=0.105248;HP=1;NF=12;NR=4;NS=52;CA=0;DP=526
+1      4570630 .       GT      GGGTTT  14      PASS    AF=0.0570941;HP=1;NF=4;NR=2;NS=52;CA=0;DP=480
+1      4574298 .       GC      GAC     41      PASS    AF=0.0333335;HP=2;NF=1;NR=4;NS=52;CA=0;DP=497
+1      4574507 .       TT      TTCCTCTAATGCT   100     PASS    AF=0.406213;HP=2;NF=13;NR=8;NS=52;CA=0;DP=437
+1      4577694 rs33988719;-/G,mills,venter     TG      TGG     100     PASS    AF=0.999997;HP=1;DB;NF=52;NR=28;NS=52;CA=0;DP=381
+1      4578235 .       TAT     TT      26      PASS    AF=0.292482;HP=1;NF=8;NR=14;NS=51;CA=0;DP=330
+1      4580634 .       ATAAAATA        AA      100     PASS    AF=0.328083;HP=1;NF=11;NR=4;NS=51;CA=M;DP=372
+1      4581760 .       CTT     CT      100     PASS    AF=0.0551414;HP=2;NF=4;NR=7;NS=52;CA=0;DP=578
+1      4583153 rs35427335;-/CA,venter,watson   GCAC    GC      100     PASS    AF=0.0310016;HP=1;DB;NF=3;NR=4;NS=52;CA=0;DP=483
+1      4586257 rs34899280;-/T  GTC     GC      100     PASS    AF=0.311452;HP=1;DB;NF=16;NR=8;NS=51;CA=0;DP=441
+1      4589959 venter,watson   GG      GGGCCTG 100     PASS    AF=0.0494854;HP=3;NF=3;NR=4;NS=52;CA=0;DP=469
+1      4590830 rs34057361;-/GCAAAGC,mills,venter,watson        TGCAAAGCG       TG      100     PASS    AF=0.739178;HP=1;DB;NF=42;NR=52;NS=50;CA=0;DP=465
+1      4595540 rs56784481;-/T  TCT     TT      53      PASS    AF=0.154234;HP=1;DB;NF=7;NR=21;NS=52;CA=0;DP=439
+1      4596270 .       AC      ACGCTGAGGCTGCAGCACCCCTCGTGGAGC  100     PASS    AF=0.171201;HP=1;NF=6;NR=1;NS=52;CA=0;DP=498
+1      4600396 rs36042545;-/AT,venter  CATA    CA      100     PASS    AF=0.185579;HP=1;DB;NF=24;NR=23;NS=52;CA=0;DP=357
+1      4603645 rs60786353;-/C,venter   AC      ACC     100     PASS    AF=0.999998;HP=1;DB;NF=76;NR=57;NS=52;CA=0;DP=571
+1      4607282 .       GTGAT   GT      100     PASS    AF=0.287968;HP=1;NF=38;NR=26;NS=52;CA=0;DP=810
+1      4607435 .       GTGAT   GT      100     PASS    AF=0.347474;HP=1;NF=39;NR=53;NS=52;CA=0;DP=674
+1      4611309 .       CGTGTG  CG      100     PASS    AF=0.311775;HP=1;NF=38;NR=31;NS=52;CA=0;DP=486
+1      4621966 rs35610947;-/GT TTGT    TT      100     PASS    AF=0.252136;HP=3;DB;NF=41;NR=42;NS=52;CA=0;DP=612
+1      4623256 rs59174221;-/CTCCAGAAAGCAC      GGAAAGCACCTCCAG GG      100     PASS    AF=0.248792;HP=2;DB;NF=24;NR=28;NS=52;CA=0;DP=458
+1      4623618 rs60584333;-/GTGTCGGGAGCAGAGACTG,venter GC      GCTGGTGTCGGGAGCAGAGAC   100     PASS    AF=0.624955;HP=1;DB;NF=8;NR=16;NS=51;CA=0;DP=518
+1      4628242 rs56871532;-/TG,venter,watson   CTGT    CT      100     PASS    AF=0.630417;HP=1;DB;NF=46;NR=41;NS=52;CA=0;DP=605
+1      4631325 watson  GAGGACATA       GA      100     PASS    AF=0.0694082;HP=1;NF=14;NR=10;NS=51;CA=0;DP=388
+1      4633949 .       TCC     TC      100     PASS    AF=0.223776;HP=7;NF=13;NR=4;NS=51;CA=0;DP=492
+1      4637510 .       TAAA    TA      18      PASS    AF=0.0428857;HP=9;NF=13;NR=6;NS=52;CA=0;DP=456
+1      4639728 .       GGTGTGTGTGTGTGTG        GG      56      PASS    AF=0.223403;HP=3;NF=39;NR=66;NS=51;CA=0;DP=466
+1      4645583 rs59275910;-/G,venter   AG      AGG     100     PASS    AF=0.999998;HP=1;DB;NF=41;NR=59;NS=51;CA=0;DP=416
+1      4649824 .       CTT     CT      100     PASS    AF=0.0615007;HP=2;NF=3;NR=3;NS=52;CA=0;DP=371
+1      4653490 .       GAG     GG      19      PASS    AF=0.016501;HP=1;NF=1;NR=2;NS=52;CA=0;DP=448
+1      4654099 rs3086606;-/GTCTGCA,mills       CC      CCAGTCTGC       100     PASS    AF=0.299705;HP=2;DB;NF=11;NR=10;NS=52;CA=0;DP=440
+1      4655877 rs58828516;-/G  TG      TGG     100     PASS    AF=0.083803;HP=6;DB;NF=13;NR=14;NS=52;CA=0;DP=553
+1      4656096 rs34592768;-/G,mills    TGG     TG      100     PASS    AF=0.0586852;HP=2;DB;NF=6;NR=4;NS=52;CA=0;DP=486
+1      4656943 .       GGTGTG  GG      53      PASS    AF=0.0156574;HP=2;NF=15;NR=18;NS=52;CA=0;DP=804
+1      4668803 .       CTT     CT      39      PASS    AF=0.0748695;HP=8;NF=8;NR=6;NS=52;CA=0;DP=401
+1      4670089 rs34058244;-/AC,venter  GA      GACA    100     PASS    AF=0.471432;HP=1;DB;NF=47;NR=39;NS=52;CA=0;DP=789
+1      4670383 rs35737766;-/TCAC,watson        ACACTC  AC      100     PASS    AF=0.331554;HP=1;DB;NF=20;NR=35;NS=52;CA=0;DP=609
+1      4676654 .       AGATG   AG      10      PASS    AF=0.011049;HP=1;NF=15;NR=18;NS=52;CA=0;DP=617
+1      4684590 .       TCCTGCACCTGCTGTGCCCCTGGCTCCCAGCACC      TC      100     PASS    AF=0.0368566;HP=2;NF=13;NR=7;NS=52;CA=0;DP=543
+1      4689505 .       TC      TCTGTCCTCTCTCCTAGCTCTGGTGCCCTGAGATGC    100     PASS    AF=0.355136;HP=1;NF=2;NR=3;NS=52;CA=0;DP=597
+1      4693342 rs3835539;-/TTCA        CC      CCATTC  100     PASS    AF=0.307703;HP=2;DB;NF=60;NR=61;NS=52;CA=0;DP=594
+1      4695582 venter  TGTGAGG TG      100     PASS    AF=0.630317;HP=1;NF=17;NR=29;NS=52;CA=0;DP=408
+1      4700273 .       GCCT    GT      51      PASS    AF=0.154012;HP=2;NF=3;NR=3;NS=52;CA=0;DP=402
+1      4700727 rs34897087;-/A,venter   CG      CGG     13      PASS    AF=0.0702045;HP=8;DB;NF=22;NR=6;NS=51;CA=M;DP=305
+1      4702014 rs34592315;-/AA,venter  TAAA    TA      100     PASS    AF=0.183045;HP=3;DB;NF=9;NR=20;NS=52;CA=0;DP=551
+1      4702135 .       GCC     GC      100     PASS    AF=0.132917;HP=5;NF=18;NR=10;NS=52;CA=0;DP=561
+1      4702842 rs3835540;-/GAC TGACG   TG      100     PASS    AF=0.333162;HP=1;DB;NF=25;NR=19;NS=52;CA=0;DP=517
+1      4703849 rs35422518;-/TCTCCAGGC,mills,venter,watson      AGCTCTCCAGG     AG      100     PASS    AF=0.461699;HP=1;DB;NF=52;NR=39;NS=52;CA=0;DP=558
+1      4704242 .       ATT     AT      100     PASS    AF=0.124811;HP=6;NF=16;NR=12;NS=52;CA=0;DP=518
+1      4704545 .       GCACAC  GC      43      PASS    AF=0.374122;HP=1;NF=68;NR=46;NS=52;CA=0;DP=586
+1      4709952 rs55677440;-/GT TT      TTGT    100     PASS    AF=0.111566;HP=3;DB;NF=37;NR=55;NS=52;CA=0;DP=757
+1      4712998 rs35177072;-/CTC,mills,venter,watson    TCTCC   TC      100     PASS    AF=0.409205;HP=1;DB;NF=23;NR=30;NS=52;CA=0;DP=527
+1      4714785 rs3835541;-/A,venter    CAA     CA      100     PASS    AF=0.207747;HP=2;DB;NF=12;NR=9;NS=52;CA=0;DP=525
+1      4715739 .       GT      GTT     100     PASS    AF=0.0593871;HP=1;NF=4;NR=4;NS=52;CA=0;DP=486
+1      4717874 rs33969697;-/C,mills,venter     TCA     TA      100     PASS    AF=0.644689;HP=1;DB;NF=37;NR=47;NS=52;CA=0;DP=521
+1      4720164 rs5772181;-/GA,mills,venter,watson      TG      TGAG    100     PASS    AF=0.660601;HP=1;DB;NF=60;NR=61;NS=52;CA=0;DP=723
+1      4725394 venter  AG      AGAGAGACATGAGTGAAGAAGG  100     PASS    AF=0.486541;HP=1;NF=34;NR=40;NS=52;CA=0;DP=600
+1      4726136 rs35816653;-/T,venter   CT      CTT     100     PASS    AF=0.325542;HP=7;DB;NF=25;NR=33;NS=52;CA=0;DP=561
+1      4728249 rs35594902;-/TGTT       CT      CTGTTT  100     PASS    AF=0.236832;HP=1;DB;NF=16;NR=16;NS=52;CA=0;DP=595
+1      4730619 rs56688128;-/AAGGC,venter,watson        ACAAGGC AC      100     PASS    AF=0.197783;HP=1;DB;NF=14;NR=10;NS=52;CA=0;DP=450
+1      4738491 .       ATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT  AT      100     PASS    AF=0.109332;HP=1;NF=34;NR=36;NS=52;CA=0;DP=556
+1      4743143 rs34960969;-/T,venter   ATT     AT      100     PASS    AF=0.443382;HP=2;DB;NF=27;NR=29;NS=51;CA=0;DP=521
+1      4750482 .       AC      ACC     44      PASS    AF=0.0773717;HP=1;NF=1;NR=10;NS=52;CA=0;DP=532
+1      4751808 .       CC      CTC     100     PASS    AF=0.287743;HP=6;NF=22;NR=19;NS=52;CA=0;DP=549
+1      4753639 rs56735073;-/G  AG      AGG     100     PASS    AF=0.354197;HP=6;DB;NF=26;NR=25;NS=52;CA=0;DP=499
+1      4756338 .       TGG     TG      100     PASS    AF=0.145276;HP=6;NF=12;NR=22;NS=52;CA=0;DP=505
+1      4756654 .       CTGT    CT      100     PASS    AF=0.0253358;HP=1;NF=2;NR=3;NS=52;CA=0;DP=502
+1      4768227 rs34482713;-/A,venter   CAC     CC      100     PASS    AF=0.624286;HP=1;DB;NF=16;NR=29;NS=52;CA=0;DP=382
+1      4769408 rs3030792;-/CA,venter   TC      TCAC    100     PASS    AF=0.564397;HP=1;DB;NF=37;NR=45;NS=51;CA=0;DP=550
+1      4771107 rs59952959;-/TTATCGGTGGTTT      ATTATCGGTGGTTTC AC      100     PASS    AF=0.43732;HP=2;DB;NF=24;NR=26;NS=52;CA=0;DP=437
+1      4771150 .       AGGCAGAGGATTTAGGGGGCAGTGAAACTA  AA      100     PASS    AF=0.365014;HP=2;NF=25;NR=17;NS=51;CA=0;DP=446
+1      4773228 .       AACA    AA      100     PASS    AF=0.358433;HP=4;NF=49;NR=37;NS=51;CA=0;DP=403
+1      4779293 rs35799766;-/A,venter   GAA     GA      100     PASS    AF=0.620558;HP=4;DB;NF=40;NR=44;NS=52;CA=0;DP=539
+1      4783405 .       TACGTATATACATATACA      TA      100     PASS    AF=0.346752;HP=1;NF=20;NR=40;NS=52;CA=0;DP=331
+1      4784171 .       TA      TAAGA   100     PASS    AF=0.058761;HP=2;NF=4;NR=4;NS=52;CA=0;DP=522
+1      4787548 rs35350740;-/CA,mills   AACA    AA      100     PASS    AF=0.294238;HP=3;DB;NF=43;NR=40;NS=52;CA=0;DP=565
+1      4790642 rs5772184;-/T,venter    ATT     AT      100     PASS    AF=0.360239;HP=10;DB;NF=23;NR=25;NS=52;CA=0;DP=544
+1      4794867 .       AATA    AA      59      PASS    AF=0.0541594;HP=2;NF=6;NR=24;NS=52;CA=0;DP=316
+1      4794934 .       CT      CTCTCTTT        21      PASS    AF=0.322809;HP=1;NF=7;NR=9;NS=50;CA=M;DP=241
+1      4800829 rs35005833;-/C,venter   TC      TCC     100     PASS    AF=0.404199;HP=5;DB;NF=48;NR=15;NS=52;CA=0;DP=479
+1      4806476 .       GC      GCC     100     PASS    AF=0.0973173;HP=6;NF=8;NR=8;NS=52;CA=M;DP=398
+1      4808450 rs34573971;-/A,venter   GAA     GA      100     PASS    AF=0.332411;HP=9;DB;NF=26;NR=22;NS=52;CA=0;DP=474
+1      4809140 rs60726929;-/TCCA,venter,watson TC      TCATCC  100     PASS    AF=0.348085;HP=1;DB;NF=49;NR=32;NS=52;CA=0;DP=579
+1      4810276 rs3030822;-/TAGT,watson ATAGTT  AT      100     PASS    AF=0.242205;HP=1;DB;NF=27;NR=13;NS=52;CA=0;DP=582
+1      4831434 .       TA      TACCACACACACA   100     PASS    AF=0.49717;HP=1;NF=18;NR=17;NS=52;CA=0;DP=675
+1      4831567 rs34042090;-/CA CCAC    CC      100     PASS    AF=0.535527;HP=4;DB;NF=52;NR=45;NS=52;CA=0;DP=738
+1      4833596 rs35226825;-/T  AT      ATT     100     PASS    AF=0.237481;HP=5;DB;NF=19;NR=19;NS=52;CA=0;DP=498
+1      4839967 .       TCCTGCCAGCCGGGGGC       TC      100     PASS    AF=0.0394386;HP=2;NF=5;NR=2;NS=52;CA=0;DP=565
+1      4840948 rs59349393;-/AAACCACATCCCTTGAACT        GACTAAACCACATCCCTTGAA   GA      100     PASS    AF=0.144437;HP=1;DB;NF=16;NR=17;NS=52;CA=0;DP=578
+1      4846284 rs36118323;-/T,venter   CT      CTT     100     PASS    AF=0.130437;HP=7;DB;NF=12;NR=15;NS=52;CA=0;DP=415
+1      4855247 venter  GA      GACACA  100     PASS    AF=0.301971;HP=1;NF=19;NR=3;NS=52;CA=0;DP=635
+1      4864897 venter  AT      ATT     100     PASS    AF=0.215684;HP=6;NF=17;NR=20;NS=52;CA=0;DP=450
+1      4865373 rs34273857;-/A,venter   CA      CAA     100     PASS    AF=0.169967;HP=6;DB;NF=17;NR=15;NS=52;CA=0;DP=533
diff --git a/tests/tabix_data/vcf/4.vcf b/tests/tabix_data/vcf/4.vcf
new file mode 100644 (file)
index 0000000..65ed14e
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,318 @@
+##fileformat=VCFv4.1
+##INFO=<ID=BCM.AC,Number=1,Type=Integer,Description="Allele count from BCM's (sequencing-based) genotypes subsetted to the 383 validation samples">
+##INFO=<ID=DB,Number=0,Type=Flag,Description="dbSNP Membership">
+##INFO=<ID=SEQUENOM.AC,Number=1,Type=Integer,Description="Allele count from Sequenom genotyping">
+##INFO=<ID=SRC,Number=1,Type=String,Description="Type of SNPs submitted for validation; VQSR refers to preliminary consensus set, not the final one">
+##INFO=<ID=PQ,Number=1,Type=Integer,Description="BWA mapping quality of the PCR primers">
+##FILTER=<ID=AMBIGUOUS_SEQUENOM_CALLS,Description="Possible Sequenom miscalls based on manual review of cluster plots">
+##FILTER=<ID=HIGH_NO_CALL_RATE,Description="Extremely high no-call rate">
+##FILTER=<ID=INCORRECT_SEQUENOM_CALLS,Description="Clear Sequenom miscalls that cannot easily be fixed based on manual review of cluster plots">
+##FILTER=<ID=NOT_DESIGNED,Description="Primer not designed">
+##FILTER=<ID=NOT_TYPED,Description="Not typed">
+##FILTER=<ID=POLYMORPHIC_SAMPLES_FAILED,Description="All polymorphic samples from sequencing were no-called">
+##FILTER=<ID=POSSIBLE_PROBE_FAILURE,Description="Suspicious genotyping based on nearby SNPs">
+##FILTER=<ID=PQ10,Description="PQ<10">
+##fileDate=20110524
+##reference=ftp://ftp.1000genomes.ebi.ac.uk/vol1/ftp/technical/reference/human_g1k_v37.fasta.gz
+##source=EricBanksValidationQC;fromGoncaloAbecasisValidationSelection
+#CHROM POS     ID      REF     ALT     QUAL    FILTER  INFO    FORMAT  HG00127 HG00128 HG00136 HG00137 HG00138 HG00139 HG00152 HG00156 HG00234 HG00235 HG00237 HG00242 HG00244 HG00262 HG01055 HG01079 NA19138 NA18974 NA18523 NA12717 NA19209 NA18577 NA18973 NA18943 NA12873 NA18623 NA18622 NA18948 NA19171 NA19204 NA06994 NA18563 NA18547 NA18861 NA18608 NA12282 NA12751 NA18959 NA19331 NA19453 NA20537 NA12046 NA20515 NA20516 NA20521 NA20524 NA20528 NA20759 NA20768 NA20769 NA20774 NA20775 NA20783 NA20787 NA20790 NA20800 NA20819 NA20812 NA20505 NA20530 NA20540 NA20538 NA20581 NA20815 NA20544 NA20810 NA20807 NA20816 NA20504 NA20753 NA20502 NA12342 NA19150 NA19468 NA20336 NA19395 NA19257 NA19360 NA19700 NA18867 NA20317 NA18968 NA19107 HG00111 HG00108 NA19077 NA19684 NA18511 NA12044 NA19382 NA19457 NA18933 NA18923 NA18965 HG00141 NA20341 NA18740 HG00537 HG00346 HG01173 HG00702 HG00313 HG00150 NA18612 HG00339 NA12273 HG00250 NA18593 NA18621 HG00478 HG00251 HG01070 NA19160 NA18995 NA10851 NA18976 NA18603 NA19200 HG01204 HG01191 HG01101 HG00146 HG00306 NA18985 HG00160 HG00635 HG00372 HG00357 HG00634 NA18541 NA18950 NA19759 HG00351 HG00257 HG00118 HG00336 HG00448 HG01354 NA18609 HG00428 HG00326 NA11894 NA18956 HG00173 HG00117 NA11893 HG01251 HG01441 HG01437 HG00182 HG00330 HG01060 HG00329 NA18960 NA18856 NA07346 NA18871 NA19057 NA18868 NA18636 NA12830 NA19007 NA18910 NA18874 NA19056 NA19064 NA19066 NA18487 NA18642 NA19236 NA07056 NA18637 NA19235 NA19309 NA19311 NA19334 NA19346 NA19347 NA19372 NA19376 NA19383 NA19384 NA19394 NA19428 NA19430 NA19451 NA19466 NA19313 NA19321 NA19324 NA19332 HG00479 HG00608 NA18573 HG00375 NA19248 NA19093 HG01170 HG00534 HG01171 HG01522 NA18624 HG00683 HG01521 NA19005 NA20412 NA18971 HG00446 NA12748 HG00530 HG00690 HG01356 HG01516 NA20532 HG00344 HG00328 NA18542 HG00254 HG00321 HG00577 HG00656 HG00342 HG00524 HG00650 HG00557 HG00319 HG00457 HG00125 HG00578 HG00543 HG00638 HG00171 HG00699 HG00595 HG00187 HG00704 HG00533 HG00596 HG00268 HG01083 HG00651 HG01133 HG00671 HG00327 HG01148 HG00246 HG00672 HG00556 HG00436 HG00554 NA18633 NA20344 NA11993 NA07037 NA11930 HG01366 HG01389 HG00620 NA19740 HG00190 HG00419 NA18535 HG01495 NA18592 HG01497 HG00174 HG01140 NA12287 HG00689 HG01550 HG00334 HG01375 HG00637 NA18507 HG01113 NA18550 NA19129 HG01551 HG01462 HG00331 NA12413 HG01456 HG01360 HG00708 HG01350 HG00684 NA19099 HG00284 NA12399 NA12286 NA12777 HG00277 HG00266 NA19985 HG00353 HG01102 NA07347 NA07051 NA19900 NA18984 NA07048 HG00640 HG01066 NA12812 HG01174 HG01188 NA19390 NA19436 NA19439 NA19440 NA19463 NA19470 NA19471 NA19472 NA19676 NA19660 NA19661 NA19663 NA19722 NA19725 NA19728 NA19729 NA19731 NA19749 NA19755 NA19756 NA19758 NA19770 NA19773 NA19777 NA19780 NA19783 NA20525 NA20589 NA20765 NA20802 NA20804 NA18544 NA18602 NA18546 NA18610 NA18957 NA18615 NA18616 NA19010 NA18638 NA18639 NA18627 NA19072 NA18630 NA19074 NA19080 NA19081 NA19083 NA19085 NA19088 NA20287 NA19835 NA20276 NA19818 NA20278 NA20282 NA20342 NA20296 NA20314 NA20346 NA19712 NA19198 NA19108 NA18934 NA18916 NA18907 NA18917 NA06989 NA12058 NA12341 NA12546 NA12489 HG01197 NA18983 NA11843 NA11892 NA12749
+20     82176   rs11906362      T       C       318     NOT_TYPED;PQ10  BCM.AC=16;DB;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=0
+20     249843  rs112456910     C       T       1304    PASS    BCM.AC=14;DB;SEQUENOM.AC=12;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=29 GT      0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     .       .       .       0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     0/1     .       .       0/0     0/0     .       0/0     .       .       .       0/0     .       0/0     0/0     0/1     0/0     .       .       .       0/0     .       0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       .       .       .       .       0/0     0/0     .       .       0/0     .       .       0/0     0/0     0/0     .       .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       .       .       .       .       0/0     0/0     .       .       0/1     .       .       0/0     .       0/1     .       0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     .       .       .       .       .       0/0     .       .       .       .       .       0/0     .       0/1     .       .       .       .       0/0     .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     .       .       .       0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     .       .       .       0/0     0/1     0/0     .       .       .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       .       .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     .       .       .       .       .       .       .       0/0     .       0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     .       0/0     .       .       0/0     0/0     .       .       .       .       .       0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       .       0/0     .       .       0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       0/1     0/1     0/0     .       .       0/0     0/0     .       .       0/0     0/1     .       .       0/1     .       .       .       0/0     0/0     0/0     .       .       .       .       .       0/0     .
+20     688672  rs116071340     C       T       56      PASS    BCM.AC=1;DB;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=52 GT      .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     987773  rs6077519       T       G       474     PASS    DB;SEQUENOM.AC=73;SRC=VQSR-ONLY;PQ=42   GT      .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     1/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     1/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/1     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     1166164 .       G       T       26      NOT_DESIGNED    BCM.AC=20;SRC=VQSR+2-OF-7
+20     1333317 .       A       G       4       PASS    SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR-ONLY;PQ=32       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     1372898 rs112426678     C       A       833     PASS    BCM.AC=7;DB;SEQUENOM.AC=6;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=46   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     1526045 rs11908182      A       G       847     PQ10    BCM.AC=6;DB;SEQUENOM.AC=6;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=0  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     1565049 .       C       T       100     PASS    SEQUENOM.AC=3;SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=19     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     1577285 .       G       A       4       HIGH_NO_CALL_RATE       SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR-ONLY;PQ=57       GT      .       .       .       0/0     0/0     .       0/0     .       .       .       0/0     0/0     .       0/0     .       .       0/0     0/0     .       .       .       0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     .       .       0/0     .       .       .       0/0     .       0/0     .       .       .       0/0     .       .       .       .       .       .       0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     .       .       .       0/0     .       .       .       .       .       0/0     0/0     .       .       .       .       0/0     0/0     .       0/0     .       .       0/0     0/0     .       .       .       .       .       0/0     .       0/0     .       .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       .       0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       .       .       0/0     .       .       0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       .       .       .       0/0     .       0/0     .       0/0     .       .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       .       .       0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     .       .       .       0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     .       .       0/0     0/0     .       0/0     .       .       0/0     .       0/0     .       0/0     .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     .       .       .       0/0     .       .       .       0/0     0/0     .       .       0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       .       0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     .       0/0     0/0     .       .       .       .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       .       0/0     0/0     .       .       .       0/0     .       0/0     .       .       .       0/0     .       0/0     0/0     .       .       0/0     .       0/0     0/0     .       .       0/0     .       .       .       .       .       .       0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     .       .       .       0/0     .       .       .       0/0     .       0/0     0/0     .       .       .       .       0/0     0/0     0/0     .       .       .       .       0/0     0/0     .       .       .       .       .       .       0/0     0/0     .       .       .       .       0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     0/0     .       .       .       .       0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     .       0/0     .       0/0     .       .       .       .       .       0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     0/0
+20     1577845 .       G       A       267     HIGH_NO_CALL_RATE       BCM.AC=42;SEQUENOM.AC=5;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=37   GT      0/0     .       .       0/0     .       .       .       .       .       .       0/0     .       .       0/0     .       .       0/0     0/0     .       .       .       .       0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     .       .       0/0     0/0     .       1/1     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     .       .       0/0     .       .       .       .       .       0/0     .       0/0     .       0/0     .       .       .       .       .       .       0/0     .       0/0     .       0/0     .       .       0/0     .       .       .       0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     0/0     .       0/0     .       .       0/0     0/0     0/0     .       .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       .       0/0     0/0     .       0/0     .       .       0/0     .       .       0/0     .       .       0/0     0/0     .       .       0/0     .       .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       .       .       0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     .       .       .       .       .       .       0/0     .       0/0     .       0/0     .       .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       .       .       0/0     .       .       0/0     .       .       .       .       .       0/0     .       .       .       .       0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     .       .       0/0     0/0     .       0/0     .       .       0/0     .       0/0     .       0/0     .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     .       .       .       0/0     0/0     .       .       0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       .       0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     .       0/0     0/0     .       .       .       .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       .       0/0     0/0     .       .       .       0/0     .       0/0     .       .       .       0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       .       0/0     .       0/0     .       .       .       .       .       .       0/0     0/0     .       0/0     .       .       .       0/0     .       .       0/0     0/0     0/0     .       .       .       .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       .       0/0     0/0     .       .       .       .       0/0     .       0/0     0/0     .       .       .       .       0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       .       .       .       0/0     0/0     0/0     .       .       .       .       0/0     0/0     0/1     .       0/0     .       .       .       0/0     .       1/1     .       .       0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     .       .       0/0     0/0
+20     1590306 .       A       G       16      AMBIGUOUS_SEQUENOM_CALLS        SEQUENOM.AC=177;SRC=VQSR-ONLY;PQ=15     GT      0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     .       0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     .       0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     .       0/0     .       0/1     0/1     0/1     .       0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     .       0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       .       .       0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     .       0/1     0/1     0/1     0/1     .       0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     .       0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     .       .       0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     .       0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     .       0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     .       0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0
+20     1643825 .       G       T       24      PQ10    BCM.AC=3;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR-ONLY;PQ=0       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     1746733 .       G       A       9       NOT_DESIGNED    SRC=VQSR-ONLY
+20     1896670 .       G       C       16      PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=60    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     1934851 rs6045641       T       C       53      NOT_DESIGNED    BCM.AC=29;DB;SRC=VQSR-ONLY
+20     2083617 .       G       A       9       NOT_DESIGNED    BCM.AC=4;SRC=VQSR+2-OF-7
+20     2280790 rs214779        T       A       57436   NOT_DESIGNED    BCM.AC=758;DB;SRC=VQSR+2-OF-7
+20     2843004 rs118020362     T       C       131     PASS    BCM.AC=4;DB;SEQUENOM.AC=4;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=57   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     2854191 .       C       T       78      POSSIBLE_PROBE_FAILURE  BCM.AC=25;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=60   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     2999522 .       G       A       5       NOT_DESIGNED    SRC=VQSR-ONLY
+20     3935503 .       G       A       95      NOT_TYPED;PQ10  BCM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=9
+20     4015187 .       G       C       93      NOT_TYPED;PQ10  BCM.AC=14;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=0
+20     4260976 rs75912589      A       G       8109    PASS    BCM.AC=94;DB;SEQUENOM.AC=95;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=60 GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0
+20     4557512 .       C       A       8       NOT_TYPED       SRC=VQSR-ONLY;PQ=48
+20     4603711 .       C       T       20      PQ10    SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR-ONLY;PQ=9        GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     5021712 rs115278430     C       A       76      NOT_TYPED       BCM.AC=2;DB;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=15
+20     5137904 .       C       T       70      PASS    BCM.AC=0;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=60    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     5500990 rs116723001     C       A       1701    PASS    BCM.AC=14;DB;SEQUENOM.AC=13;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=31 GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     5524677 .       C       T       21      PASS    BCM.AC=3;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=57    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     5601529 rs6085225       G       A       1415    PQ10    BCM.AC=33;DB;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=0 GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     5773125 .       G       A       165     NOT_TYPED       BCM.AC=3;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=13
+20     5986950 rs6085343       G       A       1226    PASS    BCM.AC=68;DB;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=60        GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     6242013 .       G       A       10      NOT_TYPED;PQ10  SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=0
+20     6320495 .       C       A       16      NOT_TYPED       BCM.AC=2;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=29
+20     6575066 .       T       C       9.19    PASS    BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=2;SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=60    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     7228334 .       A       G       108     PQ10    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=0     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     7274968 .       C       T       39      PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=46    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     7321986 .       C       G       5       PQ10    SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=0      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     7377337 .       C       T       180     PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=57      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     7400995 rs114967944     C       T       426     PASS    BCM.AC=8;DB;SEQUENOM.AC=6;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=57   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     7466093 .       C       G       4.11    PASS    SEQUENOM.AC=0;SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=36     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     7575759 rs28491496      A       G       308     POSSIBLE_PROBE_FAILURE;PQ10     BCM.AC=17;DB;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=0 GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     7678819 rs11699779      A       G       12976   PASS    BCM.AC=95;DB;SEQUENOM.AC=93;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=37 GT      .       0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     .       0/1     .       .       0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     .       0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     .       0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1
+20     7924363 .       G       A       301     PASS    BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=3;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=60      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     8165430 rs61262870      T       C       1699    NOT_DESIGNED    DB;SRC=VQSR+2-OF-7
+20     8642873 .       A       G       19      NOT_DESIGNED    BCM.AC=58;SRC=VQSR+2-OF-7
+20     8700342 .       T       G       102     PASS    BCM.AC=0;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=53    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     8799615 .       C       T       38      PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=29    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     9149281 .       C       T       11      PASS    BCM.AC=0;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=60    GT      .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     9214590 .       T       C       99      PASS    BCM.AC=3;SEQUENOM.AC=3;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=57    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     9276871 .       C       T       695     NOT_TYPED;PQ10  BCM.AC=11;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=9
+20     10226915        rs74843547      G       A       120     PASS    BCM.AC=1;DB;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=60   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     10259160        .       T       A       10      PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=57    GT      .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     10482699        .       G       A       101     PASS    BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=60    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     10625431        .       T       C       17      PASS    BCM.AC=0;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR-ONLY;PQ=60      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     11506447        .       G       C       100     PASS    SEQUENOM.AC=1;SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=55     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     11565628        .       G       A       22      PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=3;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=60    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     11625368        rs111669054     A       G       138     PASS    BCM.AC=2;DB;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=38   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     11798908        .       A       G       14      PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=60    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     12006592        .       A       G       57      PASS    SEQUENOM.AC=6;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=29     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     12025988        .       C       T       34      NOT_DESIGNED    BCM.AC=43;SRC=VQSR+2-OF-7
+20     12142653        .       T       A       12      PASS    BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=3;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=60    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     12171235        .       A       G       60      PASS    BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=52    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     12326082        .       C       T       118     NOT_TYPED;PQ10  SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=0
+20     12364163        .       A       G       8       PASS    SEQUENOM.AC=2;SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=53     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     12718574        rs112953117     G       C       656     PASS    BCM.AC=3;DB;SEQUENOM.AC=3;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=40   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     13241902        .       A       C       52      PQ10    BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=0     GT      .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     13339930        rs6042043       A       G       839     NOT_TYPED;PQ10  BCM.AC=143;DB;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=0
+20     13410135        rs77634879      T       A       50      PASS    BCM.AC=39;DB;SEQUENOM.AC=37;SRC=VQSR-ONLY;PQ=60 GT      0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/1     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     13764237        .       C       T       51      NOT_TYPED       BCM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=37
+20     14283363        rs111719158     G       A       197     NOT_TYPED;PQ10  BCM.AC=6;DB;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=0
+20     14589314        rs2209596       G       T       30806   INCORRECT_SEQUENOM_CALLS        BCM.AC=253;DB;SEQUENOM.AC=315;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=60       GT      .       0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     .       0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     .       1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     .       0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     .       0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     .       0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1
+20     14843271        .       A       G       78      NOT_DESIGNED    BCM.AC=343;SRC=VQSR+2-OF-7
+20     15193914        .       C       T       48      PASS    BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=60    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     15581882        .       C       G       51      PASS    BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=60    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     15699667        .       C       T       59      PASS    BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=3;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=52    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     15913614        .       G       T       9       PASS    SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=60     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     16397068        .       C       G       1.16    PASS    SEQUENOM.AC=0;SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=20     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     16475471        rs73597775      C       T       234     HIGH_NO_CALL_RATE       DB;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=60  GT      .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     .       .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     16487648        rs12479901      G       A       1025    PASS    BCM.AC=14;DB;SEQUENOM.AC=15;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=23 GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0
+20     16936995        .       C       A       102     PASS    BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=60    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     17430784        .       T       C       18      PQ10    BCM.AC=7;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=0     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     17828256        .       C       T       77      PASS    BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=4;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=60      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     17938631        .       T       C       218     PASS    BCM.AC=8;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=60    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     17980474        .       G       A       34      PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=23    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     17991241        .       C       T       49      NOT_DESIGNED    SRC=VQSR-ONLY
+20     18180100        .       A       G       100     NOT_TYPED;PQ10  SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=0
+20     18198917        .       C       T       15      PASS    SEQUENOM.AC=3;SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=60     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     18232143        rs77523268      C       T       952     PASS    BCM.AC=8;DB;SEQUENOM.AC=8;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=57   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     18584068        .       C       A       81      NOT_TYPED;PQ10  SRC=VQSR-ONLY;PQ=0
+20     19212550        .       C       A       11      PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR-ONLY;PQ=46      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     19966683        rs199601        G       A       56556   PASS    BCM.AC=562;DB;SEQUENOM.AC=560;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=60       GT      0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     .       1/1     .       1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1
+20     20157470        rs74569344      G       T       159     NOT_TYPED;PQ10  DB;SRC=VQSR-ONLY;PQ=0
+20     20850592        .       G       A       11.30   NOT_TYPED;PQ10  BCM.AC=1;SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=0
+20     20987147        .       T       C       58      PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=60    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     21056309        .       T       C       12.30   PASS    SEQUENOM.AC=2;SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=33     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     21195714        .       A       C       12      NOT_DESIGNED    BCM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7
+20     21477015        .       G       A       140     NOT_TYPED;PQ10  BCM.AC=2;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=9
+20     21491513        .       C       T       11      NOT_DESIGNED    BCM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7
+20     21530607        rs4627653       G       A       3116    PASS    BCM.AC=21;DB;SEQUENOM.AC=21;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=46       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     21569638        .       G       C       35      PASS    BCM.AC=0;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=29    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     21579389        .       C       T       169     NOT_DESIGNED    SRC=VQSR-ONLY
+20     21624143        .       T       C       63      PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=43    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     21734208        .       A       G       5.74    PASS    SEQUENOM.AC=0;SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=55     GT      .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     21754065        .       G       A       16      PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=60    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     21764267        .       G       A       164     PASS    BCM.AC=3;SEQUENOM.AC=4;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=41      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     21863337        .       T       C       174     PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=60      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     21910648        .       C       A       145     PQ10    BCM.AC=5;SEQUENOM.AC=4;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=0     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     22016989        .       G       A       7       NOT_TYPED;PQ10  SRC=VQSR-ONLY;PQ=0
+20     22168952        .       G       T       107     PQ10    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=0     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     23102548        .       G       C       15      PASS    BCM.AC=0;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=57    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     23470735        .       A       T       12      NOT_DESIGNED    SRC=VQSR-ONLY
+20     23665595        .       C       T       205     PASS    BCM.AC=4;SEQUENOM.AC=3;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=43    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       .       .       .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     .       .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     0/0     .       .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       .       .       .       0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       .       .       .       0/0     .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       .       .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     .       .       .       0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       .       .       .       0/0     .       .       0/0     0/0     .       .       .       0/0     0/0     .       .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       .       .
+20     23758844        rs117686838     A       T       1.18    NOT_DESIGNED    DB;SRC=2-OF-7-ONLY
+20     23785676        .       G       A       90      PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=23    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     24126594        .       C       T       16      PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=60    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     24247752        .       C       T       6107    NOT_DESIGNED    BCM.AC=42;SRC=VQSR+2-OF-7
+20     24432806        .       T       C       21      PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR-ONLY;PQ=57      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     24450030        .       G       A       8       NOT_TYPED       SRC=VQSR-ONLY;PQ=60
+20     24792588        .       C       T       17      NOT_DESIGNED    SRC=VQSR+2-OF-7
+20     24875997        rs6106960       T       C       35367   PASS    BCM.AC=238;DB;SEQUENOM.AC=233;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=60       GT      0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     .       0/0     .       1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     .       0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     .       0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1
+20     25133654        .       G       A       13.40   PQ10    SEQUENOM.AC=0;SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=0      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     25388911        .       G       T       28      PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=53    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     25574143        .       G       A       77      PQ10    SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=0      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     25659422        .       A       G       11      NOT_TYPED;PQ10  BCM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=0
+20     25700728        rs6037216       C       G       1553    POSSIBLE_PROBE_FAILURE;PQ10     BCM.AC=7;DB;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=0    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     25741857        rs73347142      G       T       41907   PQ10    DB;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR-ONLY;PQ=9     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     25750038        .       T       G       86      NOT_TYPED;PQ10  BCM.AC=493;SRC=VQSR-ONLY;PQ=0
+20     25751184        .       G       C       100     NOT_TYPED;PQ10  BCM.AC=180;SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=0
+20     25766473        .       T       A       124     NOT_TYPED;PQ10  SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=0
+20     25789517        .       A       T       40      NOT_TYPED;PQ10  BCM.AC=319;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=0
+20     25794555        .       G       A       18      NOT_TYPED;PQ10  BCM.AC=181;SRC=VQSR-ONLY;PQ=0
+20     25922316        .       T       C       26      PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=18    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     25999667        .       C       G       32      INCORRECT_SEQUENOM_CALLS;PQ10   BCM.AC=61;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR-ONLY;PQ=0      GT      .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     26046637        .       G       A       26      NOT_TYPED;PQ10  BCM.AC=354;SRC=VQSR-ONLY;PQ=0
+20     26057903        .       G       A       100     NOT_TYPED;PQ10  SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=0
+20     26071009        .       T       C       9       AMBIGUOUS_SEQUENOM_CALLS;PQ10   BCM.AC=586;SEQUENOM.AC=59;SRC=VQSR-ONLY;PQ=0    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     26126724        .       G       C       23737   PASS    SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR-ONLY;PQ=18       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     26217247        .       C       A       374     PQ10    BCM.AC=3;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=0     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     26246019        rs79506355      C       A       999     NOT_TYPED       DB;SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=11
+20     26258231        rs79859288      C       T       527     NOT_TYPED       DB;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=13
+20     26265474        .       G       T       460.59  PQ10    SEQUENOM.AC=0;SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=9      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     26272553        .       C       G       100     PQ10    SEQUENOM.AC=0;SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=0      GT      .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     26275939        .       A       G       81      NOT_TYPED       SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=12
+20     26293152        .       T       C       100     PASS    BCM.AC=14;SEQUENOM.AC=17;SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=10  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0
+20     26301426        .       A       G       63      AMBIGUOUS_SEQUENOM_CALLS        SEQUENOM.AC=0;SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=11     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     26301793        .       C       G       8       PASS    SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR-ONLY;PQ=47       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     26304696        rs6051307       G       A       100     PQ10    DB;SEQUENOM.AC=0;SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=0   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     29494622        rs78775502      C       T       935     PQ10    DB;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=0   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     29514290        rs6087354       T       A       19181   AMBIGUOUS_SEQUENOM_CALLS;PQ10   DB;SEQUENOM.AC=278;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=0 GT      1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     .       1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     .       0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1
+20     29518801        rs113500384     G       A       702.91  PQ10    DB;SEQUENOM.AC=0;SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=0   GT      .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     29574811        rs73620522      G       A       16281   HIGH_NO_CALL_RATE       DB;SEQUENOM.AC=24;SRC=VQSR-ONLY;PQ=15   GT      0/1     1/1     1/1     .       1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     .       1/1     1/1     .       .       0/0     .       .       1/1     .       1/1     1/1     .       1/1     1/1     0/1     1/1     .       .       1/1     0/0     .       1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     .       1/1     1/1     .       1/1     .       .       1/1     .       .       .       .       1/1     1/1     .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     .       1/1     1/1     .       .       .       .       .       1/1     .       1/1     .       0/1     .       .       .       0/1     .       1/1     .       1/1     .       1/1     1/1     0/1     1/1     .       .       1/1     .       1/1     .       .       .       1/1     1/1     .       .       1/1     .       .       .       1/1     1/1     1/1     .       1/1     1/1     .       1/1     1/1     .       1/1     1/1     .       1/1     1/1     .       1/1     .       0/1     1/1     1/1     .       1/1     .       .       1/1     1/1     .       1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     .       1/1     1/1     .       .       1/1     .       1/1     1/1     .       .       .       .       .       1/1     .       1/1     1/1     .       1/1     1/1     .       1/1     1/1     .       1/1     1/1     .       1/1     .       .       1/1     1/1     .       1/1     .       .       1/1     .       .       .       0/0     .       1/1     1/1     .       .       .       .       1/1     1/1     .       1/1     1/1     .       1/1     .       .       .       1/1     .       1/1     1/1     .       1/1     .       .       .       1/1     1/1     1/1     1/1     .       1/1     .       1/1     .       .       .       .       .       .       .       1/1     .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     .       .       .       .       .       1/1     1/1     1/1     .       1/1     .       .       .       .       .       .       .       1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     .       1/1     .       .       .       .       .       .       1/1     1/1     1/1     .       1/1     0/0     .       .       .       .       .       1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     .       .       1/1     .       1/1     .       0/1     1/1     1/1     .       1/1     1/1     1/1     .       .       .       .       1/1     .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       1/1     1/1     .       .       1/1     1/1     .       1/1     .       0/0     .       .       .       .       .       .       .       0/0     .       .       .       .       1/1     .       1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     .       1/1     .       .       .       .       1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     .       .       .       1/1     .       .       1/1     .       1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     .       1/1     1/1     .       1/1     .       1/1     .       .       1/1     1/1     1/1     0/0
+20     29598472        rs73612735      T       G       10639   NOT_TYPED;PQ10  DB;SRC=VQSR-ONLY;PQ=0
+20     29632410        .       T       C       5.11    NOT_TYPED;PQ10  SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=0
+20     29642272        rs77298479      T       A       100     NOT_TYPED;PQ10  DB;SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=9
+20     29827087        rs62641496      G       C       100     NOT_DESIGNED    DB;SRC=2-OF-7-ONLY
+20     30120025        .       C       G       1113    POSSIBLE_PROBE_FAILURE;PQ10     BCM.AC=9;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=0     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     30595334        rs62206358      C       A       62      PASS    BCM.AC=3;DB;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=20 GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     30616314        .       G       A       176     PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=52      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     30696393        rs76882848      T       C       150     PASS    BCM.AC=3;DB;SEQUENOM.AC=3;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=60 GT      .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     30884360        .       C       A       6       PQ10    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR-ONLY;PQ=9       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     30910907        .       A       T       24      NOT_DESIGNED    SRC=VQSR-ONLY
+20     31107862        .       T       C       46      PQ10    BCM.AC=6;SEQUENOM.AC=0;SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=0     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     31316775        .       T       G       47      PASS    BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR-ONLY;PQ=37      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     31576854        .       C       T       66      PQ10    BCM.AC=8;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=8     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     32840139        .       G       A       1158    PQ10    BCM.AC=11;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=0      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     33588848        .       C       T       17      PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR-ONLY;PQ=34      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     33974818        .       G       A       959     NOT_TYPED       BCM.AC=12;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=16
+20     34147834        rs368386        G       A       105     NOT_DESIGNED    BCM.AC=3;DB;SRC=VQSR+2-OF-7
+20     34155930        .       T       C       1200    NOT_DESIGNED    BCM.AC=23;SRC=VQSR+2-OF-7
+20     34589611        .       C       T       39      PQ10    SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=0      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     34595073        .       T       G       518     POSSIBLE_PROBE_FAILURE;PQ10     BCM.AC=4;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=8       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     35255604        .       C       T       367     POSSIBLE_PROBE_FAILURE  BCM.AC=5;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=46      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     35644471        rs8115057       C       T       10677   PQ10    BCM.AC=174;DB;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=0        GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     36480073        .       T       C       428     PASS    BCM.AC=6;SEQUENOM.AC=6;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=25      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     36563396        .       G       A       2.68    PASS    SEQUENOM.AC=1;SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=60     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     36645837        rs79088417      T       C       342     NOT_DESIGNED    DB;SRC=VQSR+2-OF-7
+20     36667909        .       C       T       659     NOT_TYPED;PQ10  BCM.AC=6;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=0
+20     36932648        rs5743498       C       T       107     PASS    BCM.AC=3;DB;SEQUENOM.AC=3;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=53   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     37398143        .       T       A       31      PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR-ONLY;PQ=60      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     37790289        .       G       A       26      PASS    BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=46    GT      .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     37817201        .       A       G       222     PASS    BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=37    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     37873327        .       A       T       445     PASS    BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=60    GT      .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     37980382        .       A       G       78      PASS    BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=20      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     38302429        rs73906408      C       T       5149    PASS    BCM.AC=24;DB;SEQUENOM.AC=24;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=60 GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     38369195        .       C       T       43      NOT_TYPED;PQ10  BCM.AC=56;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=0
+20     38901146        .       C       T       2046    NOT_TYPED;PQ10  BCM.AC=60;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=0
+20     39110108        .       C       T       4.13    PASS    SEQUENOM.AC=0;SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=60     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     39624865        .       G       A       584     NOT_TYPED       BCM.AC=9;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=29
+20     40505598        .       A       G       16      PASS    SEQUENOM.AC=1;SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=41     GT      .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     40927704        .       T       C       12      PASS    BCM.AC=0;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=60    GT      .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     41093733        .       T       C       5       NOT_DESIGNED    SRC=VQSR-ONLY
+20     41137712        rs230167        C       T       24      NOT_DESIGNED    DB;SRC=VQSR+2-OF-7
+20     41311175        .       C       T       75      PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=57    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     41642529        .       T       G       72      PQ10    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=9     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     41756929        .       C       T       32      PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=60    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     41818162        rs117637352     G       A       391     PASS    BCM.AC=30;DB;SEQUENOM.AC=29;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=60       GT      0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     42153349        .       C       T       25      PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=57    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     42171267        .       A       G       88.70   PASS    SEQUENOM.AC=13;SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=60    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     42330199        .       G       A       590     PASS    BCM.AC=5;SEQUENOM.AC=3;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=60      GT      .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     42474396        .       G       A       100     PASS    BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=23    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     42483892        .       T       C       112     NOT_TYPED       BCM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=29
+20     42500754        rs6513891       C       A       619     PQ10    DB;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR-ONLY;PQ=0     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     42575810        .       T       C       3.60    PASS    SEQUENOM.AC=2;SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=60     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     42762553        rs5014517       C       T       759.47  NOT_DESIGNED    BCM.AC=366;DB;SRC=2-OF-7-ONLY
+20     42908494        .       T       C       42      PASS    BCM.AC=3;SEQUENOM.AC=3;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=60    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     42927494        .       C       G       17      PQ10    BCM.AC=3;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR-ONLY;PQ=0       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     43033625        .       G       A       100     NOT_DESIGNED    SRC=2-OF-7-ONLY
+20     43066015        rs6093982       C       T       290     PASS    BCM.AC=2;DB;SEQUENOM.AC=5;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=31 GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     43506182        .       T       C       28      PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=60    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     43582424        rs79775916      C       T       9       PASS    BCM.AC=1;DB;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=43 GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     43744100        .       G       C       4.80    PASS    SEQUENOM.AC=0;SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=43     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     43899736        .       G       A       35      PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=46    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     44373763        .       C       T       730     PASS    BCM.AC=6;SEQUENOM.AC=6;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=43      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     45097507        rs454429        C       T       25449   PASS    BCM.AC=302;DB;SEQUENOM.AC=300;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=60       GT      0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/1     .       0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     .       0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     .       0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     .       1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     .       0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     45919615        .       T       C       46      PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=29    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     46997402        rs34772061      C       G       19      NOT_TYPED;PQ10  DB;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=0
+20     47502684        .       G       A       66      PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=55    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     48045398        .       A       G       20      PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=37    GT      .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     48124745        .       C       T       10.30   PASS    SEQUENOM.AC=1;SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=39     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     48422538        rs73269151      A       G       13012   NOT_TYPED;PQ10  BCM.AC=282;DB;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=0
+20     48669886        rs73276465      G       C       106     NOT_TYPED       BCM.AC=8;DB;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=60
+20     48691248        .       A       G       95      PASS    BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=23    GT      .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     48917711        rs116072324     T       C       129     NOT_DESIGNED    BCM.AC=1;DB;SRC=VQSR+2-OF-7
+20     49098380        .       A       T       115     PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=60    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     49206794        rs116083969     G       A       19      PASS    BCM.AC=1;DB;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=60 GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     49360238        .       G       A       50      PQ10    BCM.AC=3;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=0     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     49712636        rs113933231     T       A       93      PASS    BCM.AC=3;DB;SEQUENOM.AC=3;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=52   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     50309600        .       C       A       46      PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=46    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     50599968        rs6096700       T       C       10667   NOT_TYPED;PQ10  BCM.AC=426;DB;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=0
+20     50601297        .       A       T       7       PASS    BCM.AC=0;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=57    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     50603254        rs6021599       A       G       13052   NOT_TYPED;PQ10  BCM.AC=520;DB;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=0
+20     50810123        rs28420712      A       T       2671    NOT_DESIGNED    BCM.AC=228;DB;SRC=VQSR+2-OF-7
+20     50892806        .       A       G       37      NOT_DESIGNED    BCM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7
+20     51511870        .       C       T       116     PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=43    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     51818730        .       C       T       130     PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=54      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     51958269        .       G       C       48      PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=23    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     52285202        rs113200595     T       G       11071   NOT_DESIGNED    BCM.AC=198;DB;SRC=VQSR+2-OF-7
+20     52308503        .       T       C       651     PASS    BCM.AC=5;SEQUENOM.AC=5;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=60      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     52470222        rs28606974      A       G       72      NOT_DESIGNED    BCM.AC=22;DB;SRC=VQSR-ONLY
+20     52485230        .       G       T       74      NOT_DESIGNED    BCM.AC=21;SRC=VQSR-ONLY
+20     53017837        rs112388078     T       C       1190    PASS    BCM.AC=8;DB;SEQUENOM.AC=8;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=37 GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     53031638        .       T       G       4       PASS    SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=60     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     53272023        rs4362623       G       A       70728   PASS    BCM.AC=692;DB;SEQUENOM.AC=690;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=57       GT      0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     .       1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1
+20     53423667        .       T       A       214     PASS    BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=55      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     53580904        .       T       C       32      PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=60      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     53599478        .       C       T       34      NOT_TYPED;PQ10  BCM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=9
+20     54004274        rs114966870     A       G       602     PASS    BCM.AC=40;DB;SEQUENOM.AC=9;SRC=VQSR-ONLY;PQ=57  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     54096380        .       G       A       46      PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=60    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     54146938        .       G       A       27      POLYMORPHIC_SAMPLES_FAILED      BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=53    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     54163701        .       A       G       130     PASS    BCM.AC=3;SEQUENOM.AC=3;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=60      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .
+20     54199759        .       T       C       198     NOT_DESIGNED    BCM.AC=9;SRC=VQSR+2-OF-7
+20     54313664        rs112885916     A       T       98      PASS    BCM.AC=10;DB;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=57        GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     54424603        .       T       C       116     PQ10    BCM.AC=8;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=0     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     54542220        .       C       T       33      NOT_DESIGNED    SRC=VQSR-ONLY
+20     54628591        .       G       A       87      POLYMORPHIC_SAMPLES_FAILED;PQ10 BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=4;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=0     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     54793377        .       C       T       8       HIGH_NO_CALL_RATE       BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR-ONLY;PQ=60      GT      .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     0/0     0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .
+20     55067830        .       G       A       6       PASS    SEQUENOM.AC=1;SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=60     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     55113534        .       T       G       21      PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=16    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     55195413        .       A       G       20      PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=60    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     55483325        .       C       T       17      NOT_TYPED;PQ10  BCM.AC=1;SRC=VQSR-ONLY;PQ=0
+20     55598554        .       T       C       22.30   PASS    SEQUENOM.AC=1;SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=48     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     55790632        .       G       T       39      HIGH_NO_CALL_RATE       BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=60    GT      0/0     0/0     .       .       0/0     .       .       .       .       0/0     0/0     .       .       0/0     .       .       0/0     .       .       .       .       .       .       .       0/0     0/0     0/0     .       .       .       0/0     0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     0/0     0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       .       .       .       .       .       0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       .       0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     .       .       0/0     0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     0/0     0/0     .       .       .       .       .       0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     .       .       .       .       .       .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       .       .       .       .       .       0/0     .       .       .       0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     0/0     .       .       .       .       0/0     .       .       .       .       .       .       0/0     0/0     .       .       .       .       .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       .       .       .       0/0     0/0     .       .       0/0     0/0     0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       .
+20     55870101        .       C       T       129     PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=60    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     56029723        rs74833660      G       A       21      PASS    BCM.AC=1;DB;SEQUENOM.AC=3;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=29 GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     56309506        .       C       G       6.38    PASS    SEQUENOM.AC=1;SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=60     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     56335703        .       G       C       33      PASS    BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=35    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     56549982        rs6099866       T       C       999     PASS    DB;SEQUENOM.AC=9;SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=32  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     56792927        .       C       T       207     PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=60      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     57266953        .       C       A       46      PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=60    GT      .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     57566637        rs149265        C       T       58555   PASS    BCM.AC=513;DB;SEQUENOM.AC=505;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=60       GT      1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     .       1/1     1/1     1/1     1/1     .       0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     .       1/1     .       1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     .       1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     .       0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     .       1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1
+20     57653509        rs6026678       C       T       489     PASS    BCM.AC=4;DB;SEQUENOM.AC=4;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=60   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     57728647        .       C       T       13      PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=60    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     58308048        .       A       G       35      PASS    BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=4;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=60    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     58335635        .       C       T       7       PQ10    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=3     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     59211281        .       A       G       4.33    PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=43    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     59286435        .       T       C       5.69    PASS    SEQUENOM.AC=1;SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=60     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     60262734        rs73915327      C       A       576     PASS    BCM.AC=10;DB;SEQUENOM.AC=10;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=60 GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     60291372        .       A       G       100     NOT_DESIGNED    BCM.AC=21;SRC=2-OF-7-ONLY
+20     60520698        .       T       C       428     NOT_DESIGNED    SRC=VQSR-ONLY
+20     60547414        .       G       T       10      PASS    SEQUENOM.AC=0;SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=60     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     60560062        .       C       T       25      NOT_TYPED       BCM.AC=343;SRC=VQSR-ONLY;PQ=50
+20     60578895        .       G       T       34      PASS    BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=52    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     60641243        .       G       A       16      NOT_DESIGNED    BCM.AC=150;SRC=VQSR+2-OF-7
+20     60641369        .       G       A       16      PASS    BCM.AC=159;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=43  GT      .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     60730826        .       G       A       11      AMBIGUOUS_SEQUENOM_CALLS        BCM.AC=0;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR-ONLY;PQ=60      GT      .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     61206227        .       C       T       4.25    NOT_TYPED       SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=37
+20     61286252        rs13433258      C       T       123     PASS    BCM.AC=3;DB;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=60   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     61497927        .       A       C       47      PQ10    BCM.AC=3;SEQUENOM.AC=0;SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=9     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     61766484        .       G       T       58      NOT_DESIGNED    BCM.AC=157;SRC=VQSR+2-OF-7
+20     61788338        .       C       G       7       NOT_DESIGNED    SRC=VQSR-ONLY
+20     61830486        .       G       A       48      PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=60    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     62191452        rs113748232     C       T       143     PASS    BCM.AC=7;DB;SEQUENOM.AC=7;SRC=VQSR+INTERSECTION;PQ=60   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     62462285        .       G       A       66      NOT_DESIGNED    BCM.AC=304;SRC=VQSR+2-OF-7
+20     62480353        .       T       A       100     PASS    SEQUENOM.AC=0;SRC=2-OF-7-ONLY;PQ=11     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     62724959        .       G       T       10      NOT_DESIGNED    SRC=VQSR-ONLY
+20     62888718        .       T       C       57      POLYMORPHIC_SAMPLES_FAILED      BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=60    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     62918298        .       G       A       33      NOT_DESIGNED    SRC=VQSR+2-OF-7
+20     62961477        .       T       C       17      AMBIGUOUS_SEQUENOM_CALLS;PQ10   SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7;PQ=0      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
diff --git a/tests/tabix_data/vcf/5.vcf b/tests/tabix_data/vcf/5.vcf
new file mode 100644 (file)
index 0000000..a23ed89
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,1000 @@
+##fileformat=VCFv4.0
+##fileDate=2011-07-18
+##source=Platypus_Version_0.1
+##platypusOptions={'bamFiles': ['/data/lindah/illumina_projects/rimmer_indels/AllData.bam'], 'labels': None, 'refFile': '/ib/groups/bsg/scratch/rimmer/Genomes/human_g1k_v37_ebv.fa', 'maxHaplotypes': 256, 'maxSize': 250, 'parseNCBI': 0, 'ploidy': 2, 'bufferSize': 1000000, 'nCPU': 1, 'minFlank': 3, 'minPosterior': 5, 'logFileName': 'log.txt', 'regions': ['20'], 'processRegionSize': 30000000, 'maxVariants': 8, 'maxReads': 5000000, 'genIndels': 1, 'minReads': 2, 'dataType': 'population', 'minMapQual': 20, 'rlen': 150, 'nInd': 1, 'getVariantsFromBAMs': 1, 'genSNPs': 1, 'strandFilter': 0, 'verbosity': 2, 'sourceFile': None, 'callOnlyIndels': 0, 'output': 'test.vcf', 'minBaseQual': 20}
+##INFO=<ID=FR,Number=0,Type=Float,Description="Estimated population frequency">
+##INFO=<ID=HP,Number=1,Type=Integer,Description="Homopolmer run length">
+##INFO=<ID=TR,Number=0,Type=Integer,Description="Total number of reads containing this variant">
+##INFO=<ID=PP,Number=0,Type=Float,Description="Posterior probability (phred scaled) that this variant segregates">
+##INFO=<ID=NF,Number=0,Type=Integer,Description="Total number of forward reads containing this variant">
+##INFO=<ID=SC,Number=1,Type=String,Description="Genomic sequence 10 bases either side of variant position">
+##INFO=<ID=NR,Number=0,Type=Integer,Description="Total number of reverse reads containing this variant">
+##INFO=<ID=TC,Number=0,Type=Integer,Description="Total coverage at this locus">
+##FILTER=<ID=sb,Description="Variant not seen at least once on both strands">
+##FILTER=<ID=pp10,Description="Posterior probability phred-score is less than 10">
+##FILTER=<ID=pp5,Description="Posterior probability phred-score is less than 5">
+##FILTER=<ID=hp10,Description="Inside a homopolymer of length greater than 10">
+##FORMAT=<ID=GT,Number=1,Type=String,Description="Unphased genotypes">
+##FORMAT=<ID=FT,Number=1,Type=String,Description="Sample Genotype Filter">
+##FORMAT=<ID=GQ,Number=1,Type=Integer,Description="Genotype quality, as Phred score">
+##FORMAT=<ID=HQ,Number=.,Type=Integer,Description="Haplotype Quality">
+##FORMAT=<ID=GL,Number=.,Type=Float,Description="Genotype log-likelihoods (log10) for AA,AB and BB genotypes, where A = ref and B = variant. Only applicable for bi-allelic sites">
+##FORMAT=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Read depth at this position for this sample">
+#CHROM POS     ID      REF     ALT     QUAL    FILTER  INFO    FORMAT  AllData.bam
+20     67500   .       T       TTGGTATCTAG     .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=6;NR=2;PP=100.0;SC=CCTGATTTCCTTGGTATTAAA;TC=20;TR=8      GT:GL:GQ        0/1:-198.02,-21.47,-166.02:100
+20     69506   .       G       GAC,GACACAC     .       PASS    FR=0.5,0.5;HP=1;NF=1,3;NR=1,0;PP=44.0,72.0;SC=TGGACACGTGGACACACACAC;TC=20;TR=2,3        GT:GL:GQ        1/2:-1.0,-1.0,-1.0:100
+20     70484   .       CTCTT   C       .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=13;NR=3;PP=100.0;SC=GTCTATGTCTCTCTTTCTCTT;TC=31;TR=16    GT:GL:GQ        0/1:-189.04,-24.53,-147.47:100
+20     72104   .       TA      T       .       PASS    FR=0.5;HP=4;NF=9;NR=10;PP=100.0;SC=TTTAAGTCTGTAAAACCATAC;TC=39;TR=19    GT:GL:GQ        0/1:-173.69,-34.04,-169.85:100
+20     74729   .       G       GT      .       PASS    FR=0.5;HP=9;NF=4;NR=4;PP=100.0;SC=AAGTTTTTTGGTTTTTTTTTA;TC=29;TR=8      GT:GL:GQ        0/1:-83.86,-25.71,-59.16:100
+20     117309  .       G       GCAGGATTTCAT    .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=4;NR=4;PP=100.0;SC=CAGGATTTCTGCAGGATTTCA;TC=25;TR=8      GT:GL:GQ        0/1:-259.57,-46.67,-146.18:100
+20     119645  .       G       GT      .       PASS    FR=1.0;HP=5;NF=6;NR=5;PP=100.0;SC=TTGTTTGTTTGTTGTTGTTGT;TC=16;TR=11     GT:GL:GQ        1/1:-157.48,-18.84,-7.1:77
+20     120122  .       A       AAG     .       PASS    FR=1.0;HP=6;NF=10;NR=8;PP=100.0;SC=ATAAAGAAAAAAATTTTAAAA;TC=27;TR=18    GT:GL:GQ        1/1:-266.98,-24.1,-5.49:100
+20     120750  .       C       CAATT   .       PASS    FR=1.0;HP=6;NF=10;NR=10;PP=100.0;SC=TTTTATAAAACAATTGAGACT;TC=21;TR=20   GT:GL:GQ        1/1:-319.22,-18.71,-2.07:100
+20     122806  .       T       TTA     .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=8;NR=7;PP=100.0;SC=CAGAAAAGAATTATATATATA;TC=29;TR=15     GT:GL:GQ        0/1:-181.3,-19.86,-96.14:100
+20     126155  .       GCAAA   G       .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=5;NR=5;PP=100.0;SC=GCAATGTGCGGCAAACAAAGG;TC=32;TR=10     GT:GL:GQ        0/1:-122.73,-27.0,-209.16:100
+20     126310  .       ACC     A       .       PASS    FR=0.5;HP=5;NF=3;NR=8;PP=100.0;SC=GATGGCTCCTACCCCCGTTTC;TC=26;TR=11     GT:GL:GQ        0/1:-153.97,-42.91,-110.82:100
+20     131505  .       CTCT    C       .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=11;NR=11;PP=100.0;SC=TACTTGTGATCTCTTGTCTTT;TC=24;TR=22   GT:GL:GQ        1/1:-487.46,-251.24,-235.3:100
+20     131948  .       C       CCA     .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=2;NR=11;PP=100.0;SC=TTATCTTACACCACACACACA;TC=27;TR=13    GT:GL:GQ        1/1:-201.6,-36.32,-23.94:100
+20     135116  .       T       TTTGCATTCACAGGAAGACTATAAATA     .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=2;NR=1;PP=100.0;SC=TCTAGAGAAGTGCTCTCCAAT;TC=15;TR=3      GT:GL:GQ        1/1:-603.73,-461.77,-448.12:100
+20     135119  .       TC      T       .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=2;NR=2;PP=100.0;SC=AGAGAAGTGCTCTCCAATAGA;TC=21;TR=4      GT:GL:GQ        1/1:-603.73,-576.89,-572.06:100
+20     137518  .       GTA     G       .       PASS    FR=0.5005;HP=2;NF=5;NR=5;PP=100.0;SC=GTGTGTGTGTGTATATATATA;TC=21;TR=10  GT:GL:GQ        1/0:-210.61,-46.97,-32.7:29
+20     138178  .       GC      G       .       PASS    FR=1.0;HP=3;NF=21;NR=5;PP=100.0;SC=CTTCTGGAAAGCCTGGCCATG;TC=29;TR=26    GT:GL:GQ        1/1:-267.55,-29.21,-9.21:100
+20     138570  .       ATATGTGTGTG     ATG,A   .       PASS    FR=0.5,0.5;HP=2;NF=6,2;NR=9,2;PP=100.0,10.0;SC=TCAAATATATATATGTGTGTG;TC=28;TR=15,4      GT:GL:GQ        1/2:-1.0,-1.0,-1.0:65
+20     140396  .       TTTG    T       .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=15;NR=4;PP=100.0;SC=AGGTTTTTGCTTTGTTGTTGT;TC=34;TR=19    GT:GL:GQ        1/1:-246.82,-30.67,-15.42:100
+20     144832  .       C       CT      .       PASS    FR=1.0;HP=3;NF=12;NR=22;PP=100.0;SC=TCCTAAAACTCTTGTAATATC;TC=35;TR=34   GT:GL:GQ        1/1:-541.89,-322.78,-299.72:100
+20     144884  .       CCTT    C       .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=9;NR=16;PP=100.0;SC=TGTAATGACACCTTCTTTTTC;TC=29;TR=25    GT:GL:GQ        1/1:-590.4,-430.25,-411.02:100
+20     145257  .       G       GC      .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=11;NR=8;PP=100.0;SC=ATGGTGGCAGGGCCTGTAATC;TC=21;TR=19    GT:GL:GQ        1/1:-258.74,-106.61,-91.83:100
+20     153298  .       T       TTC     .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=13;NR=17;PP=100.0;SC=CAGGATTTCTTTGTTTTAAGA;TC=34;TR=30   GT:GL:GQ        1/1:-447.58,-228.67,-205.19:100
+20     160111  .       A       AT      .       PASS    FR=1.0;HP=10;NF=8;NR=9;PP=100.0;SC=GAGCTCTTGAATTTTTTTTTT;TC=25;TR=17    GT:GL:GQ        1/1:-115.49,-38.32,-28.08:85
+20     163607  .       A       AAT     .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=12;NR=14;PP=100.0;SC=ACATTAAATGATTCAAATGAT;TC=31;TR=26   GT:GL:GQ        1/1:-308.34,-35.98,-14.5:100
+20     163741  .       T       TACACAC .       PASS    FR=0.5243;HP=1;NF=13;NR=6;PP=100.0;SC=GAACCCTCTGTACACACACAC;TC=28;TR=19 GT:GL:GQ        0/1:-416.01,-75.48,-55.48:13
+20     164279  .       G       GAAAAC  .       PASS    FR=0.5;HP=8;NF=1;NR=1;PP=100.0;SC=GAAAAGAAAAGAAAAGAAAAC;TC=34;TR=2      GT:GL:GQ        0/1:-492.01,-428.61,-448.28:100
+20     164284  .       G       GAAAAC,C        .       PASS    FR=0.5,0.5;HP=8;NF=5,10;NR=11,9;PP=100.0,100.0;SC=GAAAAGAAAAGAAAACTCATC;TC=33;TR=16,19  GT:GL:GQ        1/2:-1.0,-1.0,-1.0:100
+20     176386  .       CGTGTGT C       .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=3;NR=2;PP=100.0;SC=TAATCCCATTCGTGTGTGTGT;TC=25;TR=5      GT:GL:GQ        1/1:-176.18,-68.1,-61.92:77
+20     179735  .       TTAAAA  T       .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=4;NR=4;PP=100.0;SC=ACCTTTGATCTTAAAATAAAA;TC=27;TR=8      GT:GL:GQ        0/1:-142.0,-61.37,-164.64:100
+20     218255  .       A       AG      .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=5;NR=3;PP=100.0;SC=TGCTCACTGCAATAAAAAGAA;TC=17;TR=8      GT:GL:GQ        0/1:-99.61,-20.66,-85.67:100
+20     222539  .       C       CA      .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=1;NR=9;PP=100.0;SC=TACCCAGCTACTTCTCTTAAG;TC=31;TR=10     GT:GL:GQ        0/1:-113.51,-40.72,-197.06:100
+20     230058  .       CAT     C       .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=6;NR=2;PP=100.0;SC=GACTCCATCTCATAAAAAAAA;TC=33;TR=8      GT:GL:GQ        0/1:-215.64,-148.07,-177.0:100
+20     236459  .       G       GAT     .       PASS    FR=0.5001;HP=2;NF=1;NR=1;PP=100.0;SC=TTGGAATACAGATATATATAT;TC=14;TR=2   GT:GL:GQ        0/1:-82.0,-46.74,-54.25:35
+20     237649  .       CAGAT   C       .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=1;NR=1;PP=79.0;SC=AGATAGATGACAGATAGATAG;TC=23;TR=2       GT:GL:GQ        0/1:-209.52,-180.44,-254.54:100
+20     237816  .       A       AT      .       PASS    FR=0.5;HP=4;NF=4;NR=7;PP=100.0;SC=CATTTTCATCATTTTAATAAC;TC=32;TR=11     GT:GL:GQ        0/1:-124.3,-28.61,-145.84:100
+20     243223  .       C       CT      .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=12;NR=4;PP=100.0;SC=ATCTGTGTGACTGTGATCAAA;TC=33;TR=16    GT:GL:GQ        0/1:-191.55,-34.68,-144.05:100
+20     246483  .       T       TTAAA   .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=3;NR=4;PP=100.0;SC=AGACTCCATCTTAAATAAATA;TC=25;TR=7      GT:GL:GQ        0/1:-110.34,-17.05,-40.1:100
+20     251373  .       ACTT    A       .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=1;NR=4;PP=100.0;SC=TTGCTCCAGCACTTCTTCTGG;TC=19;TR=5      GT:GL:GQ        0/1:-99.2,-52.91,-150.48:100
+20     271135  .       G       GC      .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=3;NR=4;PP=100.0;SC=AAGACCGAGGGCGACCTCGAG;TC=16;TR=7      GT:GL:GQ        1/1:-163.65,-94.48,-85.08:78
+20     286648  .       TAAATA  T       .       PASS    FR=0.5;HP=6;NF=5;NR=5;PP=100.0;SC=TCTAAATAAATAAATAAAAGG;TC=22;TR=10     GT:GL:GQ        0/1:-240.51,-100.72,-176.05:100
+20     299585  .       AC      A       .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=4;NR=7;PP=21.0;SC=ACAGGGAGAGACCTTGTCGAA;TC=14;TR=11      GT:GL:GQ        1/1:-152.36,-140.91,-138.05:46
+20     334317  .       TC      T       .       PASS    FR=1.0;HP=6;NF=9;NR=8;PP=100.0;SC=CCTGGATCCTTCCCCCCTTCT;TC=24;TR=17     GT:GL:GQ        1/1:-177.37,-48.79,-33.34:100
+20     337392  .       ACC     A       .       PASS    FR=0.5;HP=6;NF=5;NR=1;PP=100.0;SC=CCTTGTTACCACCCCTCCCTG;TC=19;TR=6      GT:GL:GQ        0/1:-91.61,-45.67,-115.7:100
+20     340044  .       GCAC    G       .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=2;NR=5;PP=100.0;SC=ATGAAGGCTGGCACCACCAGT;TC=22;TR=7      GT:GL:GQ        0/1:-122.54,-28.81,-115.11:100
+20     343323  .       A       ATG     .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=8;NR=4;PP=100.0;SC=GATAAACAGGATGTCCACCAG;TC=23;TR=12     GT:GL:GQ        0/1:-150.99,-48.03,-125.5:100
+20     346702  .       AGCCTCCCAAAGGAG A       .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=4;NR=3;PP=100.0;SC=CACCCACCTCAGCCTCCCAAA;TC=17;TR=7      GT:GL:GQ        0/1:-191.1,-120.01,-173.49:100
+20     347858  .       A       AAAACAAAC       .       PASS    FR=0.5;HP=4;NF=2;NR=1;PP=100.0;SC=TCCGTCTCCAAAAACAAACAA;TC=22;TR=3      GT:GL:GQ        0/1:-270.04,-201.07,-226.88:100
+20     347878  .       A       AAAAC   .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=2;NR=1;PP=100.0;SC=AAAAAACAAAACAAACAAACA;TC=22;TR=3      GT:GL:GQ        0/1:-258.23,-262.98,-327.72:100
+20     348365  .       G       GT      .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=5;NR=4;PP=100.0;SC=ACGGCCCATGGGATCGAATAG;TC=19;TR=9      GT:GL:GQ        0/1:-127.12,-35.07,-72.46:100
+20     349321  .       ACT     A       .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=10;NR=3;PP=100.0;SC=CCAGGCCTCCACTCTCTGCTG;TC=20;TR=13    GT:GL:GQ        0/1:-183.61,-95.19,-129.48:100
+20     355549  .       A       AC      .       PASS    FR=1.0;HP=10;NF=12;NR=9;PP=100.0;SC=AACAACAACAAAAAAAAAAAC;TC=24;TR=21   GT:GL:GQ        1/1:-171.74,-97.15,-84.12:100
+20     356670  .       T       TCAAA   .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=4;NR=2;PP=100.0;SC=AGACACTGCCTCAAAAAAACA;TC=16;TR=6      GT:GL:GQ        0/1:-204.44,-131.78,-155.8:100
+20     356675  .       A       AAAAC   .       PASS    FR=1.0;HP=6;NF=2;NR=3;PP=100.0;SC=CTGCCTCAAAAAAACAAACAA;TC=17;TR=5      GT:GL:GQ        1/1:-201.68,-85.68,-76.1:85
+20     358147  .       CA      C       .       PASS    FR=1.0;HP=4;NF=10;NR=5;PP=100.0;SC=TGGGATTTGACAAACCCAGCT;TC=18;TR=15    GT:GL:GQ        1/1:-150.87,-32.16,-20.25:100
+20     360927  .       TAA     T       .       PASS    FR=1.0;HP=7;NF=4;NR=7;PP=100.0;SC=ATGTGCTTTATAAAAAAGGGG;TC=18;TR=11     GT:GL:GQ        1/1:-185.94,-114.38,-104.3:84
+20     380790  .       C       CT      .       PASS    FR=1.0;HP=3;NF=16;NR=12;PP=100.0;SC=CACCACACCCCGACCCTAATT;TC=32;TR=28   GT:GL:GQ        1/1:-323.67,-24.71,-1.84:100
+20     385989  .       T       TA      .       PASS    FR=0.5;HP=7;NF=7;NR=4;PP=100.0;SC=AGATTTTTTTTAAAAAACTCT;TC=29;TR=11     GT:GL:GQ        0/1:-131.67,-23.75,-80.28:100
+20     386575  .       GTTCT   G       .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=2;NR=3;PP=100.0;SC=TGATAAGAATGTTCTTTCTTT;TC=24;TR=5      GT:GL:GQ        0/1:-109.28,-29.71,-86.14:100
+20     387657  .       G       GA      .       PASS    FR=1.0;HP=8;NF=13;NR=19;PP=100.0;SC=ATGCTGAGAAGAAAAAATGAA;TC=38;TR=32   GT:GL:GQ        1/1:-284.64,-52.81,-28.53:100
+20     396023  .       A       AAAAC   .       PASS    FR=1.0;HP=4;NF=9;NR=9;PP=100.0;SC=AAAAAAAACAAAAACAAACAA;TC=25;TR=18     GT:GL:GQ        1/1:-279.26,-33.44,-17.73:100
+20     403158  .       GA      G       .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=4;NR=7;PP=89.0;SC=ATCTATGAAGGAAGGACAGCA;TC=20;TR=11      GT:GL:GQ        0/1:-137.87,-107.23,-160.58:100
+20     405057  .       A       AC      .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=5;NR=4;PP=100.0;SC=AAACACATACACAGACCTCCT;TC=25;TR=9      GT:GL:GQ        0/1:-136.78,-33.82,-124.47:100
+20     421805  .       T       TCCA    .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=2;NR=4;PP=100.0;SC=AGAACACATTTCCAACTAAAC;TC=29;TR=6      GT:GL:GQ        0/1:-108.14,-30.52,-185.93:100
+20     425206  .       GTTTT   G       .       PASS    FR=0.5;HP=7;NF=2;NR=7;PP=100.0;SC=TTGTTTGTTTGTTTTGTTTTT;TC=25;TR=9      GT:GL:GQ        0/1:-158.57,-21.01,-100.22:100
+20     430158  .       GA      G       .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=2;NR=4;PP=100.0;SC=AGAGTCGCTTGAAACCCAGGA;TC=16;TR=6      GT:GL:GQ        0/1:-74.97,-35.93,-74.51:100
+20     434939  .       G       GA      .       PASS    FR=0.5;HP=10;NF=6;NR=2;PP=100.0;SC=AAGAAAAAAGGAAAAAAAAAA;TC=22;TR=8     GT:GL:GQ        0/1:-99.4,-65.02,-85.64:92
+20     436981  .       TTTCATCCA       T       .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=1;NR=2;PP=100.0;SC=AGGTGTGTCCTTTCATCCATT;TC=27;TR=3      GT:GL:GQ        0/1:-88.19,-26.08,-154.96:100
+20     525046  .       G       GT      .       PASS    FR=0.5;HP=10;NF=5;NR=8;PP=100.0;SC=AAAATACAGTGTTTTTTTTTC;TC=33;TR=13    GT:GL:GQ        0/1:-160.44,-103.25,-141.37:100
+20     538639  .       C       CA      .       PASS    FR=1.0;HP=9;NF=14;NR=9;PP=100.0;SC=ACCACCACAACAAAAAAACCC;TC=36;TR=23    GT:GL:GQ        1/1:-261.69,-66.02,-42.16:100
+20     539756  .       G       GT      .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=6;NR=2;PP=100.0;SC=AATGTGAGCAGTCTAGGTAAA;TC=24;TR=8      GT:GL:GQ        0/1:-130.62,-70.51,-165.77:100
+20     540198  .       T       TG      .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=9;NR=16;PP=100.0;SC=AGAGTCGCTGTTATTAAAACC;TC=26;TR=25    GT:GL:GQ        1/1:-262.05,-37.69,-19.11:100
+20     545849  .       A       AT      .       PASS    FR=1.0;HP=9;NF=6;NR=13;PP=100.0;SC=CTCTGGACTGATTTTTTTTTA;TC=24;TR=19    GT:GL:GQ        1/1:-225.47,-140.74,-126.39:100
+20     555243  .       C       CT      .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=3;NR=4;PP=100.0;SC=TTGGGGCCTCCTGGGTCCCAG;TC=23;TR=7      GT:GL:GQ        0/1:-124.01,-59.66,-144.99:100
+20     559298  .       TACAC   T       .       PASS    FR=0.5081;HP=1;NF=1;NR=1;PP=100.0;SC=GGCACACATGTACACACACAC;TC=20;TR=2   GT:GL:GQ        0/1:-95.31,-59.31,-62.75:17
+20     570945  .       A       AACAC   .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=7;NR=2;PP=100.0;SC=AGAAGGCAATAACACACACAC;TC=28;TR=9      GT:GL:GQ        1/1:-281.44,-73.27,-58.53:100
+20     576287  .       T       TTTA    .       PASS    FR=1.0;HP=3;NF=2;NR=9;PP=100.0;SC=CTGGAAAAGTTTTATTATTAT;TC=26;TR=11     GT:GL:GQ        1/1:-188.46,-27.21,-14.74:100
+20     593205  .       AG      A       .       PASS    FR=0.5;HP=6;NF=2;NR=2;PP=100.0;SC=GGGAGTGCGGAGGGGACTCCT;TC=14;TR=4      GT:GL:GQ        0/1:-90.79,-21.16,-46.9:100
+20     635817  .       C       CAGAAAAAAA      .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=6;NR=7;PP=100.0;SC=GAGACTCTCTCAGAAAAAAAA;TC=23;TR=13     GT:GL:GQ        1/1:-318.1,-28.61,-13.35:100
+20     666340  .       AAATAATAATAAT   AAATAAT,A       .       PASS    FR=0.5,0.5;HP=2;NF=1,2;NR=3,3;PP=100.0,100.0;SC=ATACAAATACAAATAATAATA;TC=16;TR=4,5      GT:GL:GQ        1/2:-1.0,-1.0,-1.0:100
+20     671463  .       AGTGT   A       .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=6;NR=2;PP=100.0;SC=CATGCATGCAAGTGTGTGTGT;TC=25;TR=8      GT:GL:GQ        1/1:-248.41,-147.67,-140.04:63
+20     675799  .       G       GTA     .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=7;NR=3;PP=100.0;SC=TAATGAACATGTATATATACA;TC=20;TR=10     GT:GL:GQ        0/1:-154.12,-35.67,-66.33:100
+20     704073  .       CTCT    C       .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=3;NR=3;PP=100.0;SC=CTTCATTCTTCTCTTTTCTTT;TC=20;TR=6      GT:GL:GQ        0/1:-159.89,-91.96,-171.96:100
+20     704111  .       C       CTTTCT  .       PASS    FR=0.5;HP=4;NF=2;NR=3;PP=100.0;SC=TTCCTCCTCTCTTTGTCTAGT;TC=20;TR=5      GT:GL:GQ        0/1:-189.74,-115.92,-237.08:100
+20     714136  .       TA      T       .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=12;NR=13;PP=100.0;SC=CTGTGGTTGTTAACTGTAGTC;TC=30;TR=25   GT:GL:GQ        1/1:-253.68,-26.24,-6.67:100
+20     715254  .       G       GGT,GGTGTGT     .       PASS    FR=0.5,0.5;HP=1;NF=3,4;NR=0,1;PP=57.0,100.0;SC=ATAGTTTATAGGTGTGTGTGT;TC=23;TR=3,5       GT:GL:GQ        1/2:-1.0,-1.0,-1.0:100
+20     715847  .       C       CA      .       PASS    FR=1.0;HP=7;NF=10;NR=6;PP=100.0;SC=GGCTCCGTCTCAAAAAAATAA;TC=26;TR=16    GT:GL:GQ        1/1:-157.25,-40.0,-26.17:100
+20     718268  .       A       AAATAAT .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=1;NR=1;PP=81.0;SC=AAAAAATACAAAATAATAATA;TC=15;TR=2       GT:GL:GQ        0/1:-64.86,-29.69,-87.73:100
+20     724447  .       A       AG      .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=12;NR=9;PP=100.0;SC=GGGTGTTGTGAGACTGATTGA;TC=42;TR=21    GT:GL:GQ        0/1:-229.53,-40.83,-188.06:100
+20     726275  .       CAGA    C       .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=10;NR=10;PP=100.0;SC=ACATATATAACAGAAGGAGAG;TC=41;TR=20   GT:GL:GQ        0/1:-286.26,-52.94,-197.08:100
+20     728851  .       CT      C       .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=5;NR=1;PP=21.0;SC=GATCACACCACTGCAGTCCAG;TC=22;TR=6       GT:GL:GQ        0/1:-200.76,-185.85,-212.48:67
+20     732117  .       CTTTATTTTAT     C       .       PASS    FR=0.9998;HP=4;NF=1;NR=1;PP=80.0;SC=TCAGGTATGTCTTTATTTTAT;TC=14;TR=2    GT:GL:GQ        1/1:-96.6,-68.07,-66.69:34
+20     739616  .       CGTGTGTGT       C       .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=4;NR=4;PP=100.0;SC=TAAAAGTGCTCGTGTGTGTGT;TC=20;TR=8      GT:GL:GQ        1/1:-222.59,-24.43,-16.81:63
+20     744662  .       A       ACAGGTCAAT      .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=3;NR=4;PP=100.0;SC=AAAGGACAAGACAGATCCCTG;TC=16;TR=7      GT:GL:GQ        0/1:-105.45,-32.23,-150.03:100
+20     746855  .       A       AG      .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=9;NR=5;PP=100.0;SC=CTGGGATTACAGTGTGAGCCA;TC=22;TR=14     GT:GL:GQ        1/1:-242.45,-177.27,-167.62:80
+20     747680  .       A       ATAG    .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=3;NR=3;PP=100.0;SC=CTTGTTGGTAATAGCAAGTTA;TC=17;TR=6      GT:GL:GQ        0/1:-177.8,-96.72,-120.09:100
+20     755106  .       C       CA      .       PASS    FR=1.0;HP=3;NF=7;NR=15;PP=100.0;SC=GCTGAGAGGTCAAACCACAAA;TC=27;TR=22    GT:GL:GQ        1/1:-255.81,-41.84,-23.33:100
+20     757564  .       T       TG      .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=3;NR=1;PP=78.0;SC=GGTGGAGCCATGGGTGTCAAA;TC=10;TR=4       GT:GL:GQ        0/1:-67.44,-38.36,-58.29:89
+20     757919  .       A       AC      .       PASS    FR=0.5;HP=9;NF=3;NR=9;PP=100.0;SC=AAAAAACAAAAAAAAAACACC;TC=27;TR=12     GT:GL:GQ        0/1:-172.2,-112.42,-144.61:100
+20     762893  .       G       GA      .       PASS    FR=1.0;HP=6;NF=8;NR=9;PP=100.0;SC=TCTTGGGGGGGAAAAAATGGG;TC=24;TR=17     GT:GL:GQ        1/1:-215.19,-64.36,-48.0:100
+20     782496  .       CAAATAAAT       C       .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=2;NR=1;PP=100.0;SC=GACTCTGCCTCAAATAAATAA;TC=17;TR=3      GT:GL:GQ        0/1:-87.5,-27.65,-92.5:100
+20     786252  .       AAG     A       .       PASS    FR=1.0;HP=5;NF=4;NR=13;PP=100.0;SC=TTAATTAAAAAAGATATTGCA;TC=19;TR=17    GT:GL:GQ        1/1:-216.25,-31.31,-17.45:100
+20     786764  .       T       TA      .       PASS    FR=1.0;HP=3;NF=17;NR=12;PP=100.0;SC=ACTATATATATAATATATTTT;TC=33;TR=29   GT:GL:GQ        1/1:-388.27,-147.23,-125.36:100
+20     787870  .       T       TTTTATTTATTTATTTATTTA   .       PASS    FR=1.0;HP=3;NF=2;NR=1;PP=100.0;SC=ATATCAAGCATTTTATTTATT;TC=19;TR=3      GT:GL:GQ        1/1:-317.88,-65.36,-53.59:99
+20     787893  .       T       TATTTATTTA      .       PASS    FR=0.5;HP=4;NF=1;NR=1;PP=100.0;SC=TTTATTTATTTTTGAGATGGA;TC=20;TR=2      GT:GL:GQ        0/1:-356.98,-227.18,-263.76:5
+20     789767  .       T       TA      .       PASS    FR=1.0;HP=10;NF=8;NR=5;PP=100.0;SC=CAAAGCCAATTAAAAAAAAAA;TC=29;TR=13    GT:GL:GQ        1/1:-124.57,-44.47,-30.25:100
+20     795148  .       T       TTTTA   .       PASS    FR=1.0;HP=4;NF=9;NR=1;PP=100.0;SC=ATAAGTTTATTTTTATTTATT;TC=16;TR=10     GT:GL:GQ        1/1:-136.44,-12.46,-4.83:63
+20     797336  .       GA      G       .       PASS    FR=1.0;HP=10;NF=18;NR=11;PP=100.0;SC=CCATTTATGTGAAAAAAAAAA;TC=35;TR=29  GT:GL:GQ        1/1:-156.82,-42.02,-20.72:100
+20     801157  .       T       TTTC    .       PASS    FR=1.0;HP=6;NF=1;NR=6;PP=100.0;SC=CTTCTCTTTCTTTTTTTCTTT;TC=13;TR=7      GT:GL:GQ        1/1:-142.57,-41.24,-32.92:92
+20     825082  .       TGCCCAGGTC      T       .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=5;NR=1;PP=100.0;SC=CTGCTCAGGTTGCCCAGGTCG;TC=8;TR=6       GT:GL:GQ        1/0:-180.72,-60.67,-71.61:61
+20     833239  .       ACT     A       .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=3;NR=5;PP=100.0;SC=GGAGAAATAGACTCTCTCTCT;TC=21;TR=8      GT:GL:GQ        0/1:-96.13,-31.34,-89.12:100
+20     835500  .       TTGTG   T       .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=8;NR=2;PP=100.0;SC=GTGTTTGTGTTTGTGTGTGTG;TC=29;TR=10     GT:GL:GQ        1/1:-258.26,-62.01,-52.79:77
+20     855678  .       TC      T       .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=3;NR=5;PP=100.0;SC=TCTTTTTCTTTCTTTTTTTTC;TC=28;TR=8      GT:GL:GQ        0/1:-124.38,-62.93,-124.85:100
+20     860945  .       A       AG      .       PASS    FR=0.5;HP=6;NF=2;NR=6;PP=100.0;SC=GTATATTAAGAGGGGGTGAAA;TC=23;TR=8      GT:GL:GQ        0/1:-96.52,-33.16,-85.46:100
+20     863148  .       C       CTAT    .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=3;NR=12;PP=100.0;SC=CCAGAGAAGGCTATTGCTCTC;TC=37;TR=15    GT:GL:GQ        0/1:-223.19,-48.7,-208.9:100
+20     899789  .       CTCTT   C       .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=1;NR=3;PP=100.0;SC=TTTCCTTCTTCTCTTTCTTTC;TC=21;TR=4      GT:GL:GQ        0/1:-62.34,-23.94,-85.48:100
+20     900698  .       T       TC      .       PASS    FR=1.0;HP=4;NF=11;NR=5;PP=100.0;SC=AGGAAGGCAGTCCCCTTTCCT;TC=29;TR=16    GT:GL:GQ        1/1:-292.54,-113.13,-95.49:100
+20     902060  .       T       TG,G    .       PASS    FR=0.5,0.5;HP=5;NF=2,7;NR=2,4;PP=100.0,100.0;SC=TTGACTGCCCTCCTCCACTTT;TC=19;TR=4,11     GT:GL:GQ        1/2:-1.0,-1.0,-1.0:100
+20     909945  .       TTATGG  TTGG,T  .       PASS    FR=0.5,0.5;HP=2;NF=10,8;NR=5,5;PP=100.0,100.0;SC=TTAGTTTAGTTTATGGTATCC;TC=32;TR=15,13   GT:GL:GQ        1/2:-1.0,-1.0,-1.0:100
+20     913303  .       A       AT      .       PASS    FR=1.0;HP=10;NF=9;NR=4;PP=100.0;SC=AGATTTAAAGATTTTTTTTTT;TC=21;TR=13    GT:GL:GQ        1/1:-227.97,-180.37,-171.35:75
+20     922916  .       A       AT      .       PASS    FR=1.0;HP=6;NF=2;NR=1;PP=27.0;SC=TTATTTATTTATTTATTTTTT;TC=7;TR=3        GT:GL:GQ        1/1:-68.71,-54.63,-52.11:41
+20     933970  .       GTTAT   G       .       PASS    FR=1.0;HP=4;NF=5;NR=5;PP=100.0;SC=CAGGCTAATTGTTATTTATTT;TC=24;TR=10     GT:GL:GQ        1/1:-169.08,-10.86,-0.46:87
+20     934153  .       A       AT      .       PASS    FR=1.0;HP=7;NF=4;NR=5;PP=100.0;SC=ATTTTTTTGTATTTTTTAATA;TC=11;TR=9      GT:GL:GQ        1/1:-123.08,-66.05,-59.03:57
+20     945474  .       CAT     C       .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=2;NR=6;PP=100.0;SC=CACACACACACATATATATAT;TC=31;TR=8      GT:GL:GQ        1/1:-229.9,-58.37,-41.73:100
+20     954102  .       A       ATTGT   .       PASS    FR=0.5;HP=6;NF=4;NR=1;PP=100.0;SC=TGTTTGTTTTATTGTTTGTTT;TC=30;TR=5      GT:GL:GQ        0/1:-77.28,-28.19,-134.91:100
+20     972071  .       A       AT      .       PASS    FR=0.5;HP=8;NF=7;NR=5;PP=100.0;SC=ATTAAAAAAGATTTTTTTTGT;TC=27;TR=12     GT:GL:GQ        0/1:-76.99,-19.47,-57.49:100
+20     995685  .       CAAAT   C       .       PASS    FR=1.0;HP=3;NF=3;NR=2;PP=100.0;SC=AACTCTATCTCAAATAAATAA;TC=15;TR=5      GT:GL:GQ        1/1:-96.06,-12.82,-6.68:77
+20     1000562 .       TTTCA   T       .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=10;NR=1;PP=100.0;SC=TCACCCTTTCTTTCATTCACT;TC=23;TR=11    GT:GL:GQ        0/1:-127.76,-31.92,-110.25:100
+20     1005659 .       CTCAG   C       .       PASS    FR=1.0;HP=3;NF=15;NR=6;PP=100.0;SC=AACAAACAAACTCAGTCTGTC;TC=34;TR=21    GT:GL:GQ        1/1:-379.32,-49.71,-26.34:100
+20     1018266 .       CAAT    C       .       PASS    FR=1.0;HP=4;NF=10;NR=7;PP=100.0;SC=GAAGTAACAACAATAATAATA;TC=26;TR=17    GT:GL:GQ        1/1:-307.78,-61.51,-42.82:100
+20     1023817 .       C       CCCT    .       PASS    FR=1.0;HP=3;NF=7;NR=3;PP=100.0;SC=CAGTGCCCACCCCTCCTCTCC;TC=22;TR=10     GT:GL:GQ        1/1:-230.45,-50.55,-37.14:100
+20     1024121 .       A       AT      .       PASS    FR=1.0;HP=6;NF=5;NR=3;PP=100.0;SC=CGGGTCAGGCATTTTTTATCA;TC=16;TR=8      GT:GL:GQ        1/1:-95.55,-28.09,-20.26:65
+20     1042261 .       CCCTG   C       .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=10;NR=10;PP=100.0;SC=CCAAACCCAACCCTGCCTGGC;TC=25;TR=20   GT:GL:GQ        1/1:-365.29,-133.94,-117.57:100
+20     1050585 .       AT      A       .       PASS    FR=1.0;HP=10;NF=9;NR=15;PP=100.0;SC=TTCTAATTCCATTTTTTTTTT;TC=33;TR=24   GT:GL:GQ        1/1:-288.37,-205.98,-189.27:100
+20     1059991 .       G       GAATT   .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=10;NR=6;PP=100.0;SC=AACATTTGTTGAATTAATTAA;TC=25;TR=16    GT:GL:GQ        1/1:-290.89,-32.75,-16.81:100
+20     1072882 .       CAG     C       .       PASS    FR=0.5;HP=6;NF=5;NR=6;PP=100.0;SC=ATCAGAAAAACAGAGACCACA;TC=23;TR=11     GT:GL:GQ        0/1:-124.42,-26.5,-135.46:100
+20     1084744 .       TG      T       .       PASS    FR=1.0;HP=5;NF=9;NR=12;PP=100.0;SC=ACCATAAATGTGGGGCTACTG;TC=23;TR=21    GT:GL:GQ        1/1:-326.86,-192.89,-179.07:100
+20     1100621 .       TAG     T       .       PASS    FR=0.5;HP=4;NF=6;NR=3;PP=100.0;SC=GCTTCTCAAATAGAGTCTTAA;TC=23;TR=9      GT:GL:GQ        0/1:-166.5,-71.13,-124.84:100
+20     1105206 .       C       CAT     .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=15;NR=11;PP=100.0;SC=AATTTATCCACGTGTACCAGA;TC=32;TR=26   GT:GL:GQ        1/1:-427.57,-192.92,-171.28:100
+20     1114638 .       C       CTCTT   .       PASS    FR=1.0;HP=4;NF=9;NR=17;PP=100.0;SC=TGTGTCCTCTCTTTGTATTTG;TC=34;TR=26    GT:GL:GQ        1/1:-420.88,-72.2,-49.92:100
+20     1118278 .       GAA     G       .       PASS    FR=1.0;HP=5;NF=13;NR=8;PP=100.0;SC=AGAAAAGGGAGAAAAGGAGGC;TC=24;TR=21    GT:GL:GQ        1/1:-206.9,-16.17,-0.92:100
+20     1127807 .       TCATCATCATCATCAC        T       .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=2;NR=3;PP=100.0;SC=ATCATCATCATCATCATCATC;TC=18;TR=5      GT:GL:GQ        1/0:-246.11,-143.41,-171.3:100
+20     1133620 .       GC      G       .       PASS    FR=1.0;HP=3;NF=17;NR=8;PP=100.0;SC=TAAGGACCAAGCCCTGTTTAT;TC=28;TR=25    GT:GL:GQ        1/1:-266.52,-52.99,-34.3:100
+20     1162839 .       AG      A       .       PASS    FR=0.5;HP=10;NF=1;NR=6;PP=100.0;SC=GGGGTGGGGGAGGGGGTAGAA;TC=27;TR=7     GT:GL:GQ        0/1:-154.34,-117.72,-158.43:100
+20     1165265 .       TACAC   T       .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=2;NR=1;PP=100.0;SC=CACACGCGCGTACACACACAC;TC=13;TR=3      GT:GL:GQ        1/1:-65.7,-24.93,-20.64:52
+20     1168799 .       T       TAC     .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=1;NR=3;PP=100.0;SC=ATATATATAATACACACACAC;TC=33;TR=4      GT:GL:GQ        0/1:-146.28,-74.63,-149.77:100
+20     1194678 .       A       AT      .       PASS    FR=1.0;HP=8;NF=13;NR=12;PP=100.0;SC=TACAAGATTAATTTTTTTTGT;TC=37;TR=25   GT:GL:GQ        1/1:-428.37,-300.25,-279.55:89
+20     1195705 .       AAAG    A       .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=10;NR=12;PP=100.0;SC=AGAGATGGCCAAAGAAGACAT;TC=27;TR=22   GT:GL:GQ        1/1:-481.8,-237.54,-219.64:100
+20     1200593 .       GA      G       .       PASS    FR=0.5;HP=5;NF=7;NR=5;PP=100.0;SC=TTTTTTAAAAGATCAACAAAA;TC=31;TR=12     GT:GL:GQ        0/1:-291.7,-258.36,-302.47:100
+20     1202056 .       C       CT      .       PASS    FR=0.5;HP=6;NF=2;NR=1;PP=73.0;SC=TTCTTTCTTTCTTTCTTTCTT;TC=17;TR=3       GT:GL:GQ        0/1:-78.02,-50.24,-96.3:100
+20     1217230 .       C       CT      .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=6;NR=7;PP=100.0;SC=TGAATCTGAACTTTCTCTATT;TC=29;TR=13     GT:GL:GQ        0/1:-136.34,-37.11,-139.78:100
+20     1238533 .       TATC    T       .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=6;NR=8;PP=100.0;SC=ATTCCCTTATTATCCTTTTAA;TC=32;TR=14     GT:GL:GQ        0/1:-203.0,-27.66,-145.09:100
+20     1258183 .       GTGTC   G       .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=9;NR=7;PP=100.0;SC=CTGTGCATGTGTGTCTGTGTG;TC=40;TR=16     GT:GL:GQ        0/1:-393.66,-270.04,-334.02:100
+20     1258199 .       C       CTG     .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=10;NR=8;PP=100.0;SC=GTGTGTGTATCTGTGTGTGTG;TC=39;TR=18    GT:GL:GQ        1/1:-443.43,-273.82,-255.93:100
+20     1258268 .       C       CTG     .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=14;NR=7;PP=100.0;SC=GTATGTGTGCCTGTGTGTGTG;TC=36;TR=21    GT:GL:GQ        1/1:-385.28,-210.98,-205.13:73
+20     1258437 .       GTGTGCCTGTGTGTGTC       G       .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=3;NR=4;PP=100.0;SC=GCCTGTGTATGTGTGCCTGTG;TC=40;TR=7      GT:GL:GQ        0/1:-300.85,-170.75,-363.46:100
+20     1258704 .       C       CTGTT   .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=6;NR=3;PP=100.0;SC=GTGTGTGTGTCTGTGTGTGTA;TC=34;TR=9      GT:GL:GQ        0/1:-182.12,-58.28,-233.67:100
+20     1270442 .       CA      C       .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=5;NR=12;PP=100.0;SC=CACTGCACTCCAAGCCTAGGT;TC=17;TR=17    GT:GL:GQ        1/1:-162.61,-26.2,-14.46:98
+20     1272295 .       CTCTGT  C       .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=13;NR=7;PP=100.0;SC=CCAAGTTCTGCTCTGTTGATT;TC=25;TR=20    GT:GL:GQ        1/1:-389.78,-103.27,-85.17:100
+20     1272815 .       C       CATAG   .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=11;NR=10;PP=100.0;SC=TAGTCTAAGGCATAGCATCCT;TC=27;TR=21   GT:GL:GQ        1/1:-368.78,-50.48,-32.46:100
+20     1291149 .       GCAA    G       .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=2;NR=3;PP=100.0;SC=CCTGGATACAGCAACAACAGT;TC=25;TR=5      GT:GL:GQ        0/1:-151.35,-93.7,-185.23:100
+20     1292033 .       C       CTTGT   .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=7;NR=5;PP=100.0;SC=CTTACATTTGCTTGTTTGATA;TC=29;TR=12     GT:GL:GQ        0/1:-444.32,-314.49,-337.3:100
+20     1292718 .       GT      G       .       PASS    FR=1.0;HP=8;NF=9;NR=3;PP=100.0;SC=TAATTTTTTAGTTTTTTTTGT;TC=17;TR=12     GT:GL:GQ        1/1:-140.26,-85.11,-76.3:73
+20     1292776 .       T       TA      .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=14;NR=10;PP=100.0;SC=CTCCTGGACTTAGTGATCCTC;TC=25;TR=24   GT:GL:GQ        1/1:-310.19,-119.02,-102.21:100
+20     1303648 .       A       AG      .       PASS    FR=0.5;HP=4;NF=6;NR=2;PP=100.0;SC=GGCAACACTCACCCGGCTGAG;TC=19;TR=8      GT:GL:GQ        0/1:-115.57,-32.83,-76.0:100
+20     1312294 .       A       AT      .       PASS    FR=1.0;HP=7;NF=5;NR=6;PP=100.0;SC=CACCTGGCTAATTTTTTTATT;TC=17;TR=11     GT:GL:GQ        1/1:-196.82,-109.27,-98.21:93
+20     1318554 .       TCCCACAGAGAAGTCC        T       .       PASS    FR=1.0;HP=3;NF=5;NR=4;PP=100.0;SC=ACCTAAGCATTCCCACAGAGA;TC=12;TR=9      GT:GL:GQ        1/1:-228.16,-15.45,-7.14:62
+20     1322791 .       G       GCACACA,GCACACACA       .       PASS    FR=0.5,0.5;HP=1;NF=3,3;NR=0,4;PP=43.0,100.0;SC=GAGAACAAATGCACACACACA;TC=18;TR=3,7       GT:GL:GQ        1/2:-1.0,-1.0,-1.0:100
+20     1333430 .       C       CT      .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=18;NR=9;PP=100.0;SC=ATGAAGGTGACTTCTCAGGTG;TC=32;TR=27    GT:GL:GQ        1/1:-276.34,-27.55,-7.09:100
+20     1342649 .       AT      A       .       PASS    FR=1.0;HP=6;NF=17;NR=10;PP=100.0;SC=AGTGTATGAGATTTTTTGTTA;TC=29;TR=27   GT:GL:GQ        1/1:-209.72,-24.22,-4.14:100
+20     1349439 .       C       CCCT    .       PASS    FR=0.5;HP=4;NF=2;NR=6;PP=100.0;SC=CCCACATTCCCCCTCCTCTGA;TC=22;TR=8      GT:GL:GQ        0/1:-157.47,-56.31,-133.86:100
+20     1358694 .       C       CAGTTTGGGCACTAACACCTACTT        .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=4;NR=1;PP=100.0;SC=CTATACGGGTCAGTTTGGGCA;TC=19;TR=5      GT:GL:GQ        0/1:-272.45,-105.91,-212.24:100
+20     1364390 .       G       GA      .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=9;NR=6;PP=100.0;SC=GATCAAGTGGGAGATCACTTG;TC=25;TR=15     GT:GL:GQ        1/1:-334.68,-154.31,-139.66:100
+20     1369478 .       CG      C       .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=7;NR=4;PP=100.0;SC=TAAAAACCAACGAGGCTCCAC;TC=23;TR=11     GT:GL:GQ        0/1:-184.87,-113.86,-180.77:100
+20     1372404 .       GA      G       .       PASS    FR=1.0;HP=7;NF=8;NR=5;PP=100.0;SC=GAGGGAGTGGGAAAAAAAGAG;TC=17;TR=13     GT:GL:GQ        1/1:-147.21,-77.38,-68.31:75
+20     1379453 .       C       CTG     .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=4;NR=11;PP=100.0;SC=TGCCAGGACTCTCCTCGCTGT;TC=19;TR=15    GT:GL:GQ        1/1:-192.19,-47.83,-35.2:100
+20     1381135 .       AG      A       .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=3;NR=5;PP=100.0;SC=CTTGAGGACAAGGCATTATAG;TC=26;TR=8      GT:GL:GQ        0/1:-99.07,-46.56,-212.4:100
+20     1386382 .       AGAG    A       .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=7;NR=1;PP=100.0;SC=ACTAATTAAAAGAGAACCCTG;TC=26;TR=8      GT:GL:GQ        0/1:-184.22,-117.09,-276.56:100
+20     1389225 .       CGTGTGT C       .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=1;NR=1;PP=100.0;SC=TATGAAGACTCGTGTGTGTGT;TC=12;TR=2      GT:GL:GQ        1/1:-80.8,-37.12,-33.18:48
+20     1392633 .       AT      A       .       PASS    FR=0.5;HP=9;NF=8;NR=5;PP=100.0;SC=AAGCCAACACATTTTTTTTTC;TC=29;TR=13     GT:GL:GQ        0/1:-142.17,-103.31,-156.4:100
+20     1399660 .       A       AAAAAC  .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=1;NR=7;PP=100.0;SC=TGTTTATGTTAGAAACAAAAC;TC=28;TR=8      GT:GL:GQ        0/1:-237.24,-123.87,-245.2:100
+20     1401887 .       T       TC      .       PASS    FR=0.5;HP=6;NF=3;NR=5;PP=100.0;SC=TGACTTTTTTTCTCCCTGAGA;TC=26;TR=8      GT:GL:GQ        0/1:-140.81,-26.64,-103.7:100
+20     1403888 .       G       GT      .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=3;NR=5;PP=100.0;SC=CAGAGAGGGCGTAAGATTGGA;TC=18;TR=8      GT:GL:GQ        0/1:-134.33,-94.6,-144.84:100
+20     1411174 .       G       GT      .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=14;NR=18;PP=100.0;SC=TTCCAACAGTGACAAGGGTTT;TC=34;TR=32   GT:GL:GQ        1/1:-370.91,-42.86,-18.85:100
+20     1411544 .       TG      T       .       PASS    FR=0.5;HP=4;NF=7;NR=2;PP=36.0;SC=ATTTATAAAATGTTTTTGTTG;TC=28;TR=9       GT:GL:GQ        0/1:-275.92,-257.59,-310.84:82
+20     1420200 .       CT      C       .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=13;NR=7;PP=100.0;SC=AAGATGGAACCTTAAGTTCAA;TC=24;TR=20    GT:GL:GQ        1/1:-229.24,-45.08,-29.19:100
+20     1421627 .       GC      G       .       PASS    FR=1.0;HP=4;NF=12;NR=6;PP=100.0;SC=GGAGCCCAACGCCCATTTAAA;TC=24;TR=18    GT:GL:GQ        1/1:-219.35,-32.03,-15.65:100
+20     1428402 .       A       ATCTAT  .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=6;NR=3;PP=100.0;SC=AATAGCTGATATCAGTTAAGG;TC=30;TR=9      GT:GL:GQ        0/1:-414.87,-348.43,-419.1:100
+20     1428454 .       TC      T       .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=11;NR=7;PP=100.0;SC=TTACACCGACTCTGTGCAGGT;TC=37;TR=18    GT:GL:GQ        0/1:-456.05,-415.06,-465.1:100
+20     1448428 .       AC      A       .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=12;NR=6;PP=100.0;SC=ACGGTAAACAACCTTCCCGCG;TC=21;TR=18    GT:GL:GQ        1/1:-289.43,-190.83,-179.1:98
+20     1450561 .       A       AAATAAT .       PASS    FR=1.0;HP=8;NF=6;NR=4;PP=100.0;SC=CTGTCTCAAAAAAAAATAATA;TC=23;TR=10     GT:GL:GQ        1/1:-324.02,-170.06,-160.02:94
+20     1454025 .       GCACACACGCA     G       .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=5;NR=3;PP=100.0;SC=ACGCACACATGCACACACGCA;TC=23;TR=8      GT:GL:GQ        1/1:-298.98,-49.31,-43.52:72
+20     1455718 .       AC      A       .       PASS    FR=0.5;HP=8;NF=5;NR=3;PP=100.0;SC=TGGTGGTAGCACCCCCCCAGG;TC=26;TR=8      GT:GL:GQ        0/1:-122.23,-68.33,-113.23:100
+20     1466298 .       C       CCA     .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=3;NR=2;PP=100.0;SC=CACACACACACCACACACACA;TC=25;TR=5      GT:GL:GQ        0/1:-174.97,-31.68,-40.82:42
+20     1470727 .       TG      T       .       PASS    FR=1.0;HP=4;NF=9;NR=10;PP=100.0;SC=CAACAATCATTGGGGAATATT;TC=24;TR=19    GT:GL:GQ        1/1:-243.08,-66.7,-50.7:100
+20     1473489 .       ATAATT  A       .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=13;NR=9;PP=100.0;SC=TTACTTACAAATAATTTTATT;TC=35;TR=22    GT:GL:GQ        0/1:-297.03,-26.79,-121.41:100
+20     1475430 .       C       CTCT    .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=5;NR=7;PP=100.0;SC=CTCATTTCTTCTCTTTTCATT;TC=31;TR=12     GT:GL:GQ        0/1:-179.5,-26.21,-143.42:100
+20     1477952 .       AGTCTACACGT     A       .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=1;NR=2;PP=100.0;SC=TTGTCTTTTCAGTCTACACGT;TC=26;TR=3      GT:GL:GQ        0/1:-132.31,-83.49,-272.8:100
+20     1485444 .       TGAGAGAGA       T       .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=1;NR=2;PP=100.0;SC=TGTGTGTGTGTGAGAGAGAGA;TC=17;TR=3      GT:GL:GQ        1/0:-294.27,-239.82,-244.87:100
+20     1498426 .       G       GA      .       PASS    FR=1.0;HP=6;NF=18;NR=13;PP=100.0;SC=TACAACGGAAGAAAAGCCTAA;TC=33;TR=31   GT:GL:GQ        1/1:-335.62,-79.86,-57.15:100
+20     1499276 .       TGAGA   T       .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=4;NR=2;PP=100.0;SC=TCAAAGTGAATGAGAGAGAGG;TC=23;TR=6      GT:GL:GQ        0/1:-190.39,-128.87,-245.46:100
+20     1500650 .       A       AG      .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=9;NR=8;PP=100.0;SC=AAGGAGCAGCAGTTCTGAGAG;TC=19;TR=17     GT:GL:GQ        1/1:-187.24,-32.97,-19.25:100
+20     1510246 .       CA      C       .       PASS    FR=1.0;HP=10;NF=15;NR=6;PP=100.0;SC=AACTCTGTCTCAAAAAAAAAA;TC=29;TR=21   GT:GL:GQ        1/1:-113.89,-25.37,-8.27:100
+20     1510966 .       C       CTA     .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=10;NR=3;PP=100.0;SC=TTTTATCTCTCTGTGTCATTT;TC=21;TR=13    GT:GL:GQ        1/1:-215.34,-14.55,0.0:100
+20     1512623 .       TTGTC   T       .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=2;NR=7;PP=100.0;SC=ACTCCATAGATTGTCTGGGTA;TC=27;TR=9      GT:GL:GQ        0/1:-204.17,-64.36,-220.46:100
+20     1516154 .       A       AAG     .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=9;NR=1;PP=100.0;SC=GTTTTATAAGAAGAGAGAGAG;TC=28;TR=10     GT:GL:GQ        0/1:-197.81,-103.51,-159.44:100
+20     1524117 .       G       GTGA    .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=12;NR=14;PP=100.0;SC=TGGGATCAGGGTATTCCCTTC;TC=27;TR=26   GT:GL:GQ        1/1:-368.49,-35.51,-15.43:100
+20     1525024 .       CT      C       .       PASS    FR=0.5;HP=7;NF=3;NR=3;PP=96.0;SC=CCTTCTTTGTCTTTTTTGATC;TC=18;TR=6       GT:GL:GQ        0/1:-53.12,-20.94,-98.55:100
+20     1525853 .       G       GT      .       PASS    FR=0.5;HP=5;NF=7;NR=4;PP=100.0;SC=CCTGAAGTGTGTTTTCCAACT;TC=29;TR=11     GT:GL:GQ        0/1:-133.05,-52.13,-148.67:100
+20     1597255 .       TG      T       .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=13;NR=3;PP=100.0;SC=GTAAAAGTACTGGAAGAAAAG;TC=39;TR=16    GT:GL:GQ        0/1:-269.31,-182.14,-334.79:100
+20     1627288 .       ATTTGT  A       .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=4;NR=2;PP=100.0;SC=ACTTTTTTTCATTTGTTTTGT;TC=20;TR=6      GT:GL:GQ        0/1:-133.15,-70.66,-175.26:100
+20     1629280 .       T       TAATAAAATAA     .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=1;NR=4;PP=100.0;SC=ACTTAAAGTATAATAAAATAA;TC=18;TR=5      GT:GL:GQ        0/1:-155.63,-27.66,-95.67:100
+20     1648829 .       CTTTCTTTTTCTTTTCT       C       .       PASS    FR=0.5;HP=6;NF=1;NR=1;PP=74.0;SC=TTCTTTCTTTCTTTCTTTTTC;TC=20;TR=2       GT:GL:GQ        0/1:-191.4,-160.88,-232.59:100
+20     1653387 .       T       TTTG    .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=2;NR=7;PP=100.0;SC=CGGCCAATCATTTGTTGTTGT;TC=25;TR=9      GT:GL:GQ        0/1:-189.9,-54.75,-106.65:100
+20     1656519 .       GT      G       .       PASS    FR=0.5;HP=9;NF=4;NR=5;PP=100.0;SC=GAGCTGCACTGTTTTTTTTCT;TC=20;TR=9      GT:GL:GQ        0/1:-62.34,-19.97,-47.7:100
+20     1658890 .       ACT     A       .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=6;NR=2;PP=100.0;SC=CATGTGATACACTGTGGGCCC;TC=27;TR=8      GT:GL:GQ        0/1:-198.65,-163.08,-324.51:100
+20     1660493 .       AT      A       .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=6;NR=5;PP=100.0;SC=CATTTGGGAGATGCTATTACC;TC=31;TR=11     GT:GL:GQ        0/1:-160.86,-59.8,-177.36:100
+20     1661355 .       TG      T       .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=6;NR=7;PP=100.0;SC=GAAAAACACATGATTATCCAT;TC=34;TR=13     GT:GL:GQ        0/1:-171.31,-99.84,-269.81:100
+20     1661478 .       G       GT      .       PASS    FR=0.5;HP=9;NF=7;NR=5;PP=100.0;SC=ATACTTTCTTGTTTTTTTGGC;TC=35;TR=12     GT:GL:GQ        0/1:-150.06,-61.16,-108.32:100
+20     1661816 .       C       CA      .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=1;NR=6;PP=100.0;SC=AATTTGCAATCATACAGAAAG;TC=24;TR=7      GT:GL:GQ        0/1:-96.53,-29.07,-136.56:100
+20     1662592 .       GATATAACTA      G       .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=4;NR=5;PP=100.0;SC=TATGGATATGGATATAACTAA;TC=23;TR=9      GT:GL:GQ        0/1:-238.09,-62.84,-220.35:100
+20     1665050 .       A       ATG     .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=6;NR=6;PP=100.0;SC=ATACACACATATATATATGTA;TC=34;TR=12     GT:GL:GQ        0/1:-151.91,-67.61,-244.28:100
+20     1667770 .       TG      T       .       PASS    FR=0.5;HP=6;NF=5;NR=5;PP=100.0;SC=AGGGTTATGATGGGGGGAGAA;TC=29;TR=10     GT:GL:GQ        0/1:-75.51,-17.52,-115.09:100
+20     1674714 .       A       AT      .       PASS    FR=1.0;HP=6;NF=12;NR=9;PP=100.0;SC=AAGGAGAATCATTTTTTCTTA;TC=26;TR=21    GT:GL:GQ        1/1:-198.16,-29.36,-11.98:100
+20     1679689 .       TACACAC TACACACACAC,T   .       PASS    FR=0.5,0.5;HP=3;NF=2,1;NR=0,1;PP=100.0,100.0;SC=TTAGATGCCCTACACACACAC;TC=23;TR=2,2      GT:GL:GQ        1/2:-1.0,-1.0,-1.0:100
+20     1680048 .       G       GA      .       PASS    FR=0.5;HP=9;NF=4;NR=9;PP=100.0;SC=GAAAACAACAGAAAAAAAACT;TC=30;TR=13     GT:GL:GQ        0/1:-157.3,-90.19,-130.66:100
+20     1680109 .       GA      G       .       PASS    FR=0.5;HP=4;NF=9;NR=8;PP=100.0;SC=AACAGCAAGAGAAATTATAAA;TC=32;TR=17     GT:GL:GQ        0/1:-210.03,-97.05,-217.17:100
+20     1682621 .       A       AT      .       PASS    FR=1.0;HP=3;NF=18;NR=11;PP=100.0;SC=AATATATCATATTACACAGTG;TC=31;TR=29   GT:GL:GQ        1/1:-304.45,-32.07,-10.59:100
+20     1683112 .       T       TC      .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=6;NR=11;PP=100.0;SC=CAAACCCTCTTCCTATACCAC;TC=23;TR=17    GT:GL:GQ        1/1:-265.19,-181.47,-172.55:74
+20     1683153 .       CA      C       .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=5;NR=7;PP=100.0;SC=GCAGCAGCTGCAAGAAGTCTC;TC=22;TR=12     GT:GL:GQ        0/1:-291.99,-237.27,-279.09:100
+20     1683250 .       ATAGCTCTACCAGT  A       .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=5;NR=4;PP=100.0;SC=AGTTCGAATCATAGCTCTACC;TC=22;TR=9      GT:GL:GQ        0/1:-267.9,-88.45,-154.18:100
+20     1683813 .       C       CT      .       PASS    FR=0.5;HP=6;NF=12;NR=13;PP=100.0;SC=AAGAGAATGTCTTTTTAAAAT;TC=53;TR=25   GT:GL:GQ        0/1:-327.36,-122.23,-224.07:100
+20     1683959 .       C       CA      .       PASS    FR=0.5;HP=8;NF=4;NR=9;PP=100.0;SC=TCAACAATGACAAAAAAAGCA;TC=24;TR=13     GT:GL:GQ        0/1:-130.55,-27.62,-42.34:66
+20     1684576 .       A       AATGTATAATAC    .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=5;NR=4;PP=96.0;SC=ATACTGTTTAAATATTTCCTG;TC=24;TR=9       GT:GL:GQ        0/1:-370.23,-353.25,-494.05:100
+20     1688002 .       AAAAC   A       .       PASS    FR=1.0;HP=3;NF=4;NR=6;PP=100.0;SC=ACTCCCTCTCAAAACAAACAA;TC=22;TR=10     GT:GL:GQ        1/1:-132.2,-18.69,-9.78:74
+20     1690549 .       CCT     C       .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=6;NR=6;PP=100.0;SC=GAAATCTTCCCCTGTCTGTGA;TC=32;TR=12     GT:GL:GQ        0/1:-184.81,-148.16,-332.53:100
+20     1694183 .       CT      C       .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=8;NR=5;PP=100.0;SC=TATACAAAGACTTTATAACCA;TC=29;TR=13     GT:GL:GQ        0/1:-144.04,-44.56,-141.78:100
+20     1699510 .       T       TCCCA   .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=10;NR=2;PP=100.0;SC=AATGTCTCATTCCCACATCCT;TC=19;TR=12    GT:GL:GQ        0/1:-164.23,-17.54,-74.37:100
+20     1701571 .       TTAAAATAAAA     T       .       PASS    FR=0.5;HP=4;NF=5;NR=2;PP=100.0;SC=CATCTCAAAATTAAAATAAAA;TC=21;TR=7      GT:GL:GQ        0/1:-177.13,-95.66,-194.53:100
+20     1716144 .       A       AGTGT   .       PASS    FR=0.5;HP=8;NF=3;NR=4;PP=100.0;SC=GGTTTTTTTTAGTGTGTGTGT;TC=23;TR=7      GT:GL:GQ        0/1:-151.21,-52.44,-109.8:100
+20     1719870 .       TG      T       .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=3;NR=11;PP=100.0;SC=ATCAAACCTCTGTGGGAGAGA;TC=27;TR=14    GT:GL:GQ        0/1:-146.54,-22.92,-111.48:100
+20     1721789 .       GT      G       .       PASS    FR=0.5;HP=9;NF=6;NR=4;PP=100.0;SC=GCACTTGGGAGTTTTTTTTTC;TC=23;TR=10     GT:GL:GQ        0/1:-60.27,-22.43,-60.17:100
+20     1722316 .       CCTTT   C       .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=2;NR=1;PP=100.0;SC=TTTCTCTCTTCCTTTCTTTCT;TC=7;TR=3       GT:GL:GQ        1/1:-85.7,-30.24,-25.46:57
+20     1727042 .       T       TA      .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=10;NR=8;PP=100.0;SC=AATTAAATTATATAGAGGAAG;TC=20;TR=18    GT:GL:GQ        1/1:-223.19,-104.73,-92.26:100
+20     1728298 .       G       GT      .       PASS    FR=1.0;HP=4;NF=11;NR=14;PP=100.0;SC=AAGAACAGAGGTTTTAAGCAT;TC=28;TR=25   GT:GL:GQ        1/1:-297.24,-94.99,-75.97:100
+20     1730788 .       T       TGATA   .       PASS    FR=1.0;HP=3;NF=3;NR=6;PP=100.0;SC=AGATGATAAATGATAGATAGA;TC=36;TR=9      GT:GL:GQ        1/1:-190.89,-23.51,-13.12:87
+20     1731625 .       CA      C       .       PASS    FR=1.0;HP=9;NF=5;NR=8;PP=100.0;SC=GACTCCATCTCAAAAAAAAAG;TC=23;TR=13     GT:GL:GQ        1/1:-93.68,-29.69,-18.4:95
+20     1734082 .       AAAAAT  A       .       PASS    FR=0.5;HP=4;NF=6;NR=3;PP=100.0;SC=CAATAGCTATAAAAATAAAAT;TC=38;TR=9      GT:GL:GQ        0/1:-124.98,-23.78,-220.83:100
+20     1738324 .       T       TC      .       PASS    FR=1.0;HP=3;NF=7;NR=10;PP=100.0;SC=ACACTCCTTTTCCTTCATGAT;TC=22;TR=17    GT:GL:GQ        1/1:-213.69,-47.59,-33.85:100
+20     1738519 .       A       AG      .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=13;NR=11;PP=100.0;SC=CTGTCAAACTAGCCTCTGGCT;TC=29;TR=24   GT:GL:GQ        1/1:-269.52,-42.45,-23.17:100
+20     1741051 .       T       TAA     .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=12;NR=12;PP=100.0;SC=TAAATATATATGACTATTTTT;TC=35;TR=24   GT:GL:GQ        1/1:-395.96,-52.09,-26.1:100
+20     1745352 .       A       ACAATAATCACATCAAAGAT    .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=4;NR=8;PP=100.0;SC=CAAGACCATTACACTAATCAC;TC=17;TR=12     GT:GL:GQ        1/1:-425.27,-43.37,-23.58:100
+20     1746606 .       GTA     G       .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=1;NR=4;PP=100.0;SC=ATATATATGTGTATATATATA;TC=9;TR=5       GT:GL:GQ        1/1:-98.72,-49.48,-45.34:50
+20     1768362 .       G       GAA     .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=7;NR=14;PP=100.0;SC=TAGAGTGATGGAAGAGACTGG;TC=27;TR=21    GT:GL:GQ        1/1:-269.69,-41.32,-23.11:100
+20     1778684 .       A       AGTGCTT .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=1;NR=1;PP=83.0;SC=ATTGCCCTCCATTGGAGGCTG;TC=14;TR=2       GT:GL:GQ        1/0:-256.33,-220.54,-244.27:69
+20     1833292 .       TA      T       .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=5;NR=5;PP=100.0;SC=ATATTATGTATAATCTCAATT;TC=25;TR=10     GT:GL:GQ        0/1:-147.42,-89.75,-210.06:100
+20     1848829 .       CTTTTCT C       .       PASS    FR=1.0;HP=8;NF=6;NR=15;PP=100.0;SC=CTTTTCTTTTCTTTTCTTTTC;TC=25;TR=21    GT:GL:GQ        1/1:-409.42,-172.01,-156.56:100
+20     1848853 .       CTT     C       .       PASS    FR=0.5;HP=4;NF=3;NR=4;PP=100.0;SC=CTTTCTTTCTCTTTCTTTCTT;TC=26;TR=7      GT:GL:GQ        0/1:-469.4,-397.68,-416.1:83
+20     1848877 .       C       CTT     .       PASS    FR=0.9999;HP=4;NF=2;NR=1;PP=100.0;SC=TTCTTTCTTTCTCTTTCTTTC;TC=26;TR=3   GT:GL:GQ        1/1:-373.17,-284.63,-280.27:37
+20     1852149 .       CCA     C       .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=4;NR=1;PP=100.0;SC=CACCCCCTCTCCACACACACA;TC=23;TR=5      GT:GL:GQ        0/1:-139.51,-90.17,-161.53:100
+20     1855569 .       AACACAC A       .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=7;NR=3;PP=100.0;SC=GTCACTCTACAACACACACAC;TC=14;TR=10     GT:GL:GQ        1/1:-159.46,-18.21,-11.49:84
+20     1857852 .       TC      T       .       PASS    FR=1.0;HP=6;NF=4;NR=19;PP=100.0;SC=CCCGTGTCCATCCCCCCTGTA;TC=58;TR=23    GT:GL:GQ        1/1:-667.45,-637.23,-632.11:63
+20     1857976 .       G       GT      .       PASS    FR=1.0;HP=5;NF=12;NR=1;PP=100.0;SC=GCTTTGTTTTGTCAGTTGTTT;TC=22;TR=13    GT:GL:GQ        1/1:-196.6,-28.45,-14.03:100
+20     1872437 .       AT      A       .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=2;NR=4;PP=100.0;SC=TCCCTGGCTAATTCCCCCCAC;TC=23;TR=6      GT:GL:GQ        0/1:-111.11,-55.77,-134.66:100
+20     1890990 .       CTT     C       .       PASS    FR=1.0;HP=5;NF=11;NR=12;PP=100.0;SC=TGTTTCATTACTTTTTAACTT;TC=24;TR=23   GT:GL:GQ        1/1:-245.45,-38.39,-20.54:100
+20     1895466 .       T       TATAG   .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=11;NR=5;PP=100.0;SC=AGATTAGAATTAGCCCAGCTC;TC=24;TR=16    GT:GL:GQ        1/1:-500.31,-454.72,-448.18:79
+20     1895484 .       ACT     A       .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=14;NR=4;PP=52.0;SC=CTCAGATGTGACTCTTCCAGA;TC=23;TR=18     GT:GL:GQ        1/1:-454.69,-436.37,-433.13:53
+20     1912065 .       AC      A       .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=7;NR=8;PP=100.0;SC=TGCCTTCATCACTGTTCCCAT;TC=25;TR=15     GT:GL:GQ        0/1:-166.95,-40.53,-113.76:100
+20     1930288 .       TAAG    T       .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=9;NR=4;PP=100.0;SC=TATAAGTTGTTAAGAAGAAAA;TC=31;TR=13     GT:GL:GQ        0/1:-196.67,-58.02,-140.92:100
+20     1940722 .       GTT     G       .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=6;NR=7;PP=100.0;SC=AAAAACCCAGGTTATATATAC;TC=25;TR=13     GT:GL:GQ        0/1:-178.3,-32.72,-93.72:100
+20     1940980 .       G       GA      .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=5;NR=3;PP=100.0;SC=AACTACTCAGGGGCTGAGATG;TC=20;TR=8      GT:GL:GQ        0/1:-91.81,-43.36,-126.02:100
+20     1941170 .       A       AC      .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=10;NR=2;PP=100.0;SC=ATACCTGTATAGAAAAAAAGT;TC=31;TR=12    GT:GL:GQ        0/1:-250.35,-208.27,-291.77:100
+20     1943171 .       T       TG      .       PASS    FR=0.5;HP=7;NF=1;NR=1;PP=56.0;SC=AGGGGAAGCCTGGGGGGGTTG;TC=19;TR=2       GT:GL:GQ        0/1:-65.38,-41.58,-85.08:100
+20     1949783 .       C       CT      .       PASS    FR=0.5;HP=10;NF=3;NR=4;PP=100.0;SC=GTGCTGAGCCCTTTTTTTTTT;TC=26;TR=7     GT:GL:GQ        0/1:-82.34,-46.95,-63.27:73
+20     1959266 .       A       ATG     .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=3;NR=4;PP=100.0;SC=CAACCTGAATATGTGTGTGTG;TC=24;TR=7      GT:GL:GQ        0/1:-140.42,-42.47,-66.02:100
+20     1967894 .       GATGA   G       .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=2;NR=4;PP=100.0;SC=TTGAGTGATTGATGAATGAAT;TC=24;TR=6      GT:GL:GQ        0/1:-113.7,-41.87,-83.28:100
+20     1977448 .       A       ACACACACACG     .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=1;NR=1;PP=100.0;SC=ACACACACACATAGAAGGCCA;TC=32;TR=2      GT:GL:GQ        0/1:-253.96,-71.96,-163.76:100
+20     1996777 .       CT      C       .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=4;NR=7;PP=100.0;SC=GTGTTTTAGGCTGTTATTTCA;TC=21;TR=11     GT:GL:GQ        0/1:-127.06,-33.79,-125.68:100
+20     1997708 .       CAT     C       .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=5;NR=4;PP=100.0;SC=CACACACACACATACAAAATA;TC=31;TR=9      GT:GL:GQ        0/1:-145.15,-85.85,-245.36:100
+20     2004765 .       T       TG      .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=2;NR=2;PP=76.0;SC=AGGATTTTTCTATCAGTCCAC;TC=12;TR=4       GT:GL:GQ        0/1:-54.31,-25.7,-84.4:100
+20     2034931 .       G       GTTC    .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=6;NR=4;PP=100.0;SC=AGATAGGTAAGTTCTTCCCCA;TC=24;TR=10     GT:GL:GQ        0/1:-162.21,-52.77,-146.87:100
+20     2035677 .       AACACAC AAC,A   .       PASS    FR=0.5,0.5;HP=2;NF=2,3;NR=0,2;PP=39.0,100.0;SC=TTTTATAATAAACACACACAC;TC=29;TR=2,5       GT:GL:GQ        1/2:-1.0,-1.0,-1.0:88
+20     2050099 .       AATTG   A       .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=10;NR=5;PP=100.0;SC=TCTTATTCTTAATTGATCTAA;TC=35;TR=15    GT:GL:GQ        0/1:-259.54,-91.86,-224.89:100
+20     2052246 .       AC      A       .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=3;NR=6;PP=100.0;SC=GGTCCCAGCTACTCAGGAGGC;TC=19;TR=9      GT:GL:GQ        0/1:-113.96,-44.77,-115.57:100
+20     2053863 .       C       CA      .       PASS    FR=0.5;HP=9;NF=3;NR=4;PP=96.0;SC=ACTAAAAATACAAAAAAAATA;TC=16;TR=7       GT:GL:GQ        0/1:-46.07,-13.04,-34.97:98
+20     2054845 .       AAAGAGGAAAAAG   A       .       PASS    FR=0.5;HP=4;NF=7;NR=1;PP=100.0;SC=AAAAGAGGAAAAAGAGGAAAA;TC=27;TR=8      GT:GL:GQ        0/1:-251.05,-86.54,-294.87:100
+20     2055452 .       AAAGG   A       .       PASS    FR=0.5;HP=4;NF=4;NR=4;PP=100.0;SC=AAGAAAAGAAAAAGGAAGGAA;TC=27;TR=8      GT:GL:GQ        0/1:-227.92,-152.39,-281.38:100
+20     2077127 .       AAC     A       .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=1;NR=3;PP=97.0;SC=TCTCTACTAAAACACACACAC;TC=17;TR=4       GT:GL:GQ        0/1:-57.31,-24.65,-94.33:100
+20     2078747 .       CCT     C       .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=3;NR=2;PP=100.0;SC=AGAAAATTCCCCTGTGGCCCT;TC=15;TR=5      GT:GL:GQ        0/1:-78.54,-32.73,-103.05:100
+20     2120509 .       AAAGGT  A       .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=8;NR=1;PP=100.0;SC=CTGAAATGAGAAAGGTAAGGA;TC=19;TR=9      GT:GL:GQ        0/1:-189.27,-90.48,-174.84:100
+20     2122413 .       CT      C       .       PASS    FR=0.5;HP=4;NF=3;NR=8;PP=100.0;SC=GTAACCTACCCTTTTCCACCT;TC=23;TR=11     GT:GL:GQ        0/1:-132.75,-34.8,-69.03:100
+20     2126052 .       T       TCTATGTGA       .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=3;NR=1;PP=100.0;SC=CATTTCCGTTTCTATGTGACC;TC=22;TR=4      GT:GL:GQ        0/1:-179.74,-76.1,-178.95:100
+20     2131707 .       T       TGG     .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=7;NR=1;PP=100.0;SC=CCCTGTTGCCTGACCTGAGCC;TC=20;TR=8      GT:GL:GQ        0/1:-145.56,-92.76,-163.87:100
+20     2153043 .       C       CTTTATTTA       .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=1;NR=2;PP=100.0;SC=GGTGACATCACTTTATTTATT;TC=21;TR=3      GT:GL:GQ        0/1:-97.11,-28.78,-48.32:87
+20     2155932 .       C       CAT     .       PASS    FR=0.5;HP=7;NF=4;NR=3;PP=100.0;SC=AATTAAAAAACATATATATAT;TC=32;TR=7      GT:GL:GQ        0/1:-176.17,-66.01,-150.43:100
+20     2160585 .       AT      A       .       PASS    FR=0.5;HP=7;NF=9;NR=11;PP=100.0;SC=GTTTTTAAATATTTTTTAATT;TC=41;TR=20    GT:GL:GQ        0/1:-237.9,-137.73,-264.06:100
+20     2162113 .       A       ATT     .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=2;NR=4;PP=100.0;SC=TATCAGGAATAATTTTTTTTT;TC=25;TR=6      GT:GL:GQ        0/1:-145.37,-128.61,-213.61:100
+20     2165761 .       GTTAT   G       .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=4;NR=1;PP=100.0;SC=CTAATAACCTGTTATTTATTT;TC=28;TR=5      GT:GL:GQ        0/1:-79.63,-28.99,-73.78:100
+20     2171122 .       CAAACA  C       .       PASS    FR=0.5;HP=4;NF=4;NR=1;PP=100.0;SC=AACAAACAGACAAACAAAACA;TC=18;TR=5      GT:GL:GQ        0/1:-113.12,-57.95,-91.54:100
+20     2171346 .       TA      T       .       PASS    FR=0.5;HP=8;NF=4;NR=5;PP=100.0;SC=AATTTTTTTTTAAAATCCTTA;TC=20;TR=9      GT:GL:GQ        0/1:-174.43,-122.88,-194.49:100
+20     2171402 .       T       TA      .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=3;NR=1;PP=92.0;SC=TGATTGATCCTAACTTAATGA;TC=23;TR=4       GT:GL:GQ        0/1:-112.12,-79.99,-224.63:100
+20     2198337 .       AAG     A       .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=17;NR=3;PP=100.0;SC=CAACCAAAGAAAGAATGGGAG;TC=38;TR=20    GT:GL:GQ        0/1:-234.35,-51.22,-161.95:100
+20     2199055 .       G       GCCACACACTTCTAAA        .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=2;NR=5;PP=100.0;SC=AGGGGGAAGTGCCATCAGATG;TC=20;TR=7      GT:GL:GQ        0/1:-318.25,-129.11,-238.35:100
+20     2199168 .       T       TG      .       PASS    FR=0.5;HP=9;NF=3;NR=6;PP=100.0;SC=TGAGATTTGGTGGGGGGGACA;TC=37;TR=9      GT:GL:GQ        0/1:-144.44,-70.03,-129.92:100
+20     2209336 .       A       AGTG    .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=4;NR=1;PP=100.0;SC=GCTGGAGTGCAGTGGTACAAT;TC=18;TR=5      GT:GL:GQ        0/1:-105.48,-46.83,-99.81:100
+20     2215492 .       T       TA      .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=17;NR=16;PP=100.0;SC=TGGATGAACGTATTTATTTAA;TC=37;TR=33   GT:GL:GQ        1/1:-589.49,-315.53,-293.02:100
+20     2215506 .       G       GT      .       PASS    FR=1.0;HP=3;NF=18;NR=13;PP=100.0;SC=TATTTAACCAGTTTCTCTTGA;TC=36;TR=31   GT:GL:GQ        1/1:-602.79,-346.63,-325.98:100
+20     2216792 .       CAG     C       .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=6;NR=7;PP=100.0;SC=TGCGTTCATGCAGTTTATGGG;TC=25;TR=13     GT:GL:GQ        0/1:-181.42,-37.01,-108.03:100
+20     2217535 .       CCT     C       .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=6;NR=6;PP=100.0;SC=CATTGCATCACCTGCCTCTGA;TC=32;TR=12     GT:GL:GQ        0/1:-224.94,-75.19,-157.78:100
+20     2218702 .       CA      C       .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=3;NR=5;PP=100.0;SC=AATCACGACTCATTGTAGCCT;TC=18;TR=8      GT:GL:GQ        0/1:-111.7,-55.95,-90.25:100
+20     2221607 .       TTTTCTTTCTTTCTTTTTCC    T       .       PASS    FR=0.5;HP=4;NF=4;NR=2;PP=100.0;SC=AAAGTTTTCTTTTTCTTTCTT;TC=29;TR=6      GT:GL:GQ        0/1:-196.61,-29.28,-142.76:100
+20     2241427 .       AAAAC   A       .       PASS    FR=1.0;HP=4;NF=4;NR=3;PP=100.0;SC=CTTGTCTCTAAAAACAAACAA;TC=19;TR=7      GT:GL:GQ        1/1:-166.73,-37.97,-27.83:84
+20     2263098 .       TG      T       .       PASS    FR=1.0;HP=4;NF=5;NR=5;PP=100.0;SC=TGACGGATGGTGGAGTGAGAA;TC=12;TR=10     GT:GL:GQ        1/1:-115.83,-17.15,-8.29:71
+20     2278675 .       A       ATGAATGGCACT    .       PASS    FR=1.0;HP=4;NF=8;NR=9;PP=100.0;SC=ACTCTGAAAAATGGTCACAGA;TC=18;TR=17     GT:GL:GQ        1/1:-567.99,-218.0,-199.44:100
+20     2280081 .       C       CT      .       PASS    FR=1.0;HP=3;NF=15;NR=9;PP=100.0;SC=TAACTTCATGCGGCTCCACCC;TC=30;TR=24    GT:GL:GQ        1/1:-287.69,-60.5,-41.43:100
+20     2280751 .       TA      T       .       PASS    FR=1.0;HP=10;NF=11;NR=3;PP=100.0;SC=AGACTCCATTTAAAAAAAAAA;TC=22;TR=14   GT:GL:GQ        1/1:-139.24,-88.42,-77.92:88
+20     2280882 .       A       AAAAG   .       PASS    FR=1.0;HP=6;NF=2;NR=2;PP=100.0;SC=AAGAAAGAAAAAAAGAAAGAA;TC=21;TR=4      GT:GL:GQ        1/1:-160.24,-78.2,-70.5:63
+20     2285898 .       AGTCACTG        A       .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=9;NR=3;PP=100.0;SC=CCAAGTCTCTAGTCACTGGTT;TC=19;TR=12     GT:GL:GQ        1/1:-272.68,-30.42,-16.26:99
+20     2287002 .       TAAG    T       .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=12;NR=8;PP=100.0;SC=GAAAAATCTCTAAGAAGGCTC;TC=24;TR=20    GT:GL:GQ        1/1:-245.61,-20.38,-4.14:100
+20     2294297 .       A       ACT     .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=5;NR=3;PP=100.0;SC=AATCACACACACTCTCTCTCT;TC=24;TR=8      GT:GL:GQ        1/1:-199.54,-41.84,-28.04:100
+20     2297084 .       AT      A       .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=10;NR=7;PP=100.0;SC=GGTGGCACGCATTAACACCAG;TC=18;TR=17    GT:GL:GQ        1/1:-184.14,-27.34,-14.78:100
+20     2297605 .       CT      C       .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=4;NR=6;PP=100.0;SC=CAATCATGGCCTTTGGCTTCC;TC=24;TR=10     GT:GL:GQ        0/1:-137.24,-29.13,-84.17:100
+20     2298589 .       C       CAT,T   .       PASS    FR=0.5,0.5;HP=1;NF=5,2;NR=2,3;PP=100.0,100.0;SC=ATATATATATCATATATATAT;TC=23;TR=7,5      GT:GL:GQ        1/2:-1.0,-1.0,-1.0:100
+20     2316853 .       G       GC      .       PASS    FR=1.0;HP=4;NF=3;NR=6;PP=100.0;SC=TCACCCTGTAGCCCCTGTGCC;TC=15;TR=9      GT:GL:GQ        1/1:-147.72,-38.92,-28.94:83
+20     2318317 .       GATCACACC       G       .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=8;NR=8;PP=100.0;SC=AGTGAGCCGAGATCACACCAC;TC=22;TR=16     GT:GL:GQ        1/1:-356.42,-104.52,-90.96:100
+20     2318716 .       AG      A       .       PASS    FR=1.0;HP=3;NF=13;NR=4;PP=100.0;SC=CACTCAGAGCAGGGCACCGAT;TC=26;TR=17    GT:GL:GQ        1/1:-256.21,-181.8,-170.54:94
+20     2323655 .       A       AT      .       PASS    FR=1.0;HP=8;NF=11;NR=9;PP=100.0;SC=AGGAAAAAAAAACACTGATGT;TC=31;TR=20    GT:GL:GQ        1/1:-290.56,-28.0,-5.91:100
+20     2326944 .       G       GA      .       PASS    FR=1.0;HP=5;NF=6;NR=12;PP=100.0;SC=AGATACAGAGGAAAAATGAAG;TC=25;TR=18    GT:GL:GQ        1/1:-204.47,-32.24,-15.14:100
+20     2329825 .       T       TC      .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=16;NR=4;PP=100.0;SC=ATATGGGTTGTCTTTGAGACT;TC=22;TR=20    GT:GL:GQ        1/1:-212.37,-32.28,-17.55:100
+20     2334719 .       CTAT    C       .       PASS    FR=1.0;HP=3;NF=14;NR=16;PP=100.0;SC=TTCCCAGGTTCTATTATGTAG;TC=36;TR=30   GT:GL:GQ        1/1:-368.57,-33.34,-9.9:100
+20     2335944 .       C       CTG     .       PASS    FR=1.0;HP=4;NF=10;NR=19;PP=100.0;SC=GCTGAGAAAACTATATCCAAA;TC=34;TR=29   GT:GL:GQ        1/1:-370.96,-31.85,-8.29:100
+20     2340299 .       TTGTC   T       .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=10;NR=15;PP=100.0;SC=ATCCTGTAGGTTGTCTGTTTA;TC=27;TR=25   GT:GL:GQ        1/1:-327.39,-42.17,-22.8:100
+20     2342117 .       T       TG      .       PASS    FR=1.0;HP=5;NF=14;NR=14;PP=100.0;SC=TGCTTATTTTTTCCACTTAAT;TC=32;TR=28   GT:GL:GQ        1/1:-450.6,-326.69,-308.08:100
+20     2344369 .       TAAG    T       .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=13;NR=10;PP=100.0;SC=TGAGAGGTGGTAAGAAGAAGA;TC=36;TR=23   GT:GL:GQ        1/1:-351.7,-76.99,-56.29:100
+20     2344451 .       G       GAGGA   .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=12;NR=3;PP=100.0;SC=ACACCCAACAGAGGAAGGTTA;TC=20;TR=15    GT:GL:GQ        1/1:-372.02,-158.89,-145.61:100
+20     2344539 .       T       TTTTGTTTG       .       PASS    FR=1.0;HP=3;NF=8;NR=4;PP=100.0;SC=ACTACCCCAGTTTTGTTTGTT;TC=23;TR=12     GT:GL:GQ        1/1:-243.77,-36.7,-24.92:99
+20     2345269 .       TCCTGGC T       .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=7;NR=13;PP=100.0;SC=ATCGAGACCATCCTGGCTAAC;TC=21;TR=20    GT:GL:GQ        1/1:-260.12,-24.22,-9.67:100
+20     2346660 .       T       TAATAAATAAATAAATA       .       PASS    FR=1.0;HP=3;NF=3;NR=4;PP=100.0;SC=CAATTCCTTATAATAAATAAA;TC=13;TR=7      GT:GL:GQ        1/1:-305.93,-18.69,-7.6:93
+20     2352930 .       AC      A       .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=10;NR=8;PP=100.0;SC=TTTCAGGCCTACCTCTCAAGC;TC=21;TR=18    GT:GL:GQ        1/1:-216.23,-90.38,-78.46:100
+20     2362643 .       C       CTG     .       PASS    FR=1.0;HP=3;NF=11;NR=8;PP=100.0;SC=AAGAACTTGTCTTAGATGCTG;TC=21;TR=19    GT:GL:GQ        1/1:-259.19,-87.0,-72.75:100
+20     2379170 .       TC      T       .       PASS    FR=0.5;HP=4;NF=1;NR=3;PP=99.0;SC=AGCTTGGGCTTCCCCACAATA;TC=23;TR=4       GT:GL:GQ        0/1:-84.89,-51.93,-137.5:100
+20     2401510 .       ATGT    A       .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=2;NR=4;PP=100.0;SC=CATTATATGGATGTACACAGT;TC=23;TR=6      GT:GL:GQ        0/1:-138.83,-80.65,-217.86:100
+20     2406090 .       AACT    A       .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=8;NR=7;PP=100.0;SC=GTTGCCACAAAACTTCAATTT;TC=36;TR=15     GT:GL:GQ        0/1:-277.31,-158.31,-369.27:100
+20     2407722 .       A       AT      .       PASS    FR=0.5;HP=9;NF=4;NR=11;PP=100.0;SC=AATTGCTATAATTTTTTTTTC;TC=38;TR=15    GT:GL:GQ        0/1:-112.13,-34.3,-69.71:100
+20     2409340 .       C       CAATA   .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=4;NR=3;PP=100.0;SC=CATAATAAATCAATCAATAAA;TC=22;TR=7      GT:GL:GQ        0/1:-189.45,-43.56,-132.72:100
+20     2409613 .       G       GCA     .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=6;NR=4;PP=57.0;SC=GGGATTATAGGCACAACACCA;TC=25;TR=10      GT:GL:GQ        0/1:-231.71,-206.44,-319.84:100
+20     2411731 .       CAG     C       .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=1;NR=2;PP=36.0;SC=GTGGATGAGCCAGAGAGAAGT;TC=13;TR=3       GT:GL:GQ        0/1:-55.56,-36.89,-120.4:84
+20     2414786 .       G       GA      .       PASS    FR=1.0;HP=8;NF=8;NR=10;PP=100.0;SC=GAAGCTTTCAGAAAAAAACCC;TC=23;TR=18    GT:GL:GQ        1/1:-173.45,-78.53,-65.46:100
+20     2418166 .       GTGTT   G       .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=1;NR=4;PP=100.0;SC=CACCTGGCTAGTGTTTGTTTG;TC=21;TR=5      GT:GL:GQ        0/1:-134.79,-72.62,-117.78:100
+20     2425523 .       A       ATTTATTTTATTTTAT        .       PASS    FR=0.5;HP=7;NF=3;NR=2;PP=100.0;SC=ATTTTATTTTATTTATTTTAT;TC=23;TR=5      GT:GL:GQ        0/1:-149.61,-12.23,-46.02:100
+20     2425934 .       T       TA      .       PASS    FR=0.5;HP=8;NF=8;NR=4;PP=67.0;SC=TTAATCAATTTAAAAAAAATG;TC=25;TR=12      GT:GL:GQ        0/1:-160.28,-133.72,-162.95:100
+20     2430943 .       ATGTG   A       .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=1;NR=1;PP=100.0;SC=GTGCGTGTGCATGTGTGTGTG;TC=29;TR=2      GT:GL:GQ        0/1:-164.1,-78.49,-99.2:92
+20     2433931 .       TC      T       .       PASS    FR=0.5;HP=5;NF=1;NR=1;PP=26.0;SC=CCCTGGAAGCTCCCCTTTGTG;TC=10;TR=2       GT:GL:GQ        0/1:-34.79,-18.58,-53.81:73
+20     2436455 .       A       AAAAAAG,AAAAAG  .       PASS    FR=0.5,0.5;HP=9;NF=3,3;NR=1,4;PP=50.0,100.0;SC=CTACCAAAAAAAAAAGAAAAG;TC=25;TR=4,7       GT:GL:GQ        1/2:-1.0,-1.0,-1.0:100
+20     2436835 .       A       AC      .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=7;NR=8;PP=100.0;SC=ACAATGATGTACATTTTTCAG;TC=37;TR=15     GT:GL:GQ        0/1:-177.52,-36.56,-198.23:100
+20     2448573 .       CCT     C       .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=6;NR=5;PP=100.0;SC=CCCATGCCACCCTGTTTTAGC;TC=34;TR=11     GT:GL:GQ        0/1:-159.22,-114.6,-320.68:100
+20     2450954 .       CA      C       .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=1;NR=4;PP=100.0;SC=CAAACTTCCGCAAGTCTGAGC;TC=22;TR=5      GT:GL:GQ        0/1:-106.22,-51.15,-126.38:100
+20     2452700 .       TAAAAAAGAA      T       .       PASS    FR=0.5;HP=6;NF=4;NR=5;PP=100.0;SC=TTTCTTGGATTAAAAAAGAAA;TC=32;TR=9      GT:GL:GQ        0/1:-216.2,-29.76,-153.35:100
+20     2458350 .       G       GA      .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=4;NR=6;PP=100.0;SC=CAAGGTGGGAGAATTGCTTGA;TC=27;TR=10     GT:GL:GQ        0/1:-156.97,-38.22,-122.55:100
+20     2477736 .       A       AT      .       PASS    FR=0.5;HP=10;NF=4;NR=3;PP=100.0;SC=AAAAAAAAAAATTTTACCATC;TC=23;TR=7     GT:GL:GQ        0/1:-89.51,-39.15,-127.81:100
+20     2498012 .       GTA     G       .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=3;NR=6;PP=100.0;SC=GTATATGTGTGTATATATATA;TC=22;TR=9      GT:GL:GQ        0/1:-140.02,-17.32,-103.73:100
+20     2516178 .       GA      G       .       PASS    FR=0.5;HP=8;NF=3;NR=5;PP=100.0;SC=GTTTAATTGGGAAAAAAAATA;TC=17;TR=8      GT:GL:GQ        0/1:-52.67,-14.95,-45.28:100
+20     2520604 .       T       TAGCA   .       PASS    FR=0.5;HP=4;NF=4;NR=3;PP=100.0;SC=CTCCCGCAAATAGCACACAAG;TC=20;TR=7      GT:GL:GQ        0/1:-194.0,-75.16,-105.67:100
+20     2522684 .       G       GA      .       PASS    FR=0.5;HP=7;NF=5;NR=6;PP=83.0;SC=TTTCTTATTTGAAAAAAACTT;TC=31;TR=11      GT:GL:GQ        0/1:-153.71,-123.52,-187.08:100
+20     2523586 .       T       TA      .       PASS    FR=1.0;HP=4;NF=11;NR=6;PP=100.0;SC=TTTTTCTTTTTAAAACAAAAT;TC=23;TR=17    GT:GL:GQ        1/1:-179.22,-18.0,-3.45:100
+20     2526468 .       GAAGA   G       .       PASS    FR=0.5001;HP=2;NF=2;NR=4;PP=100.0;SC=AGAGGAAGAGGAAGAAAGAAA;TC=25;TR=6   GT:GL:GQ        0/1:-210.76,-128.72,-136.62:37
+20     2526552 .       A       AAG     .       PASS    FR=0.5;HP=6;NF=5;NR=8;PP=100.0;SC=GAAAGAAAGAAAAAAAGAAAG;TC=30;TR=13     GT:GL:GQ        0/1:-215.19,-78.8,-144.35:100
+20     2527129 .       G       GTTGGGCATAAGCTGTAGATC   .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=3;NR=1;PP=100.0;SC=AACCTGCAGAGTTGGGCATAA;TC=18;TR=4      GT:GL:GQ        0/1:-243.57,-136.91,-199.82:100
+20     2534184 .       T       TGTTTTGTGTGAC   .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=5;NR=9;PP=100.0;SC=GATACAGGTCTGTTTTTGTCT;TC=31;TR=14     GT:GL:GQ        0/1:-444.44,-61.75,-181.17:100
+20     2546156 .       TGG     T       .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=4;NR=12;PP=100.0;SC=CCCAAAGTGCTGGGATTACAG;TC=31;TR=16    GT:GL:GQ        0/1:-172.01,-63.37,-146.93:100
+20     2568176 .       G       GT      .       PASS    FR=1.0;HP=10;NF=12;NR=9;PP=100.0;SC=ATTTGGGAATGTTTTTTTTTA;TC=27;TR=21   GT:GL:GQ        1/1:-116.08,-18.72,-6.68:100
+20     2577356 .       A       AAT     .       PASS    FR=0.5;HP=6;NF=1;NR=2;PP=100.0;SC=ATCAGAAAAAAATATATATGT;TC=26;TR=3      GT:GL:GQ        0/1:-199.48,-88.19,-98.9:49
+20     2579040 .       C       CTTTATTTA       .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=1;NR=2;PP=100.0;SC=CTTGCCTCTACTTTATTTATT;TC=16;TR=3      GT:GL:GQ        0/1:-103.59,-10.59,-52.57:100
+20     2586119 .       GGA     G       .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=2;NR=1;PP=30.0;SC=GCATGTGCATGGAGAGAGAGA;TC=23;TR=3       GT:GL:GQ        0/1:-35.49,-18.23,-170.44:77
+20     2594696 .       A       AT      .       PASS    FR=0.5;HP=8;NF=2;NR=7;PP=100.0;SC=TTTCTGTCACATTTTTTTTCG;TC=24;TR=9      GT:GL:GQ        0/1:-70.9,-30.05,-77.99:100
+20     2597210 .       TAAAG   T       .       PASS    FR=0.5;HP=7;NF=2;NR=2;PP=100.0;SC=GAAAGGAAAATAAAGAAGGAG;TC=20;TR=4      GT:GL:GQ        0/1:-85.33,-27.89,-144.98:100
+20     2611781 .       A       ATATCT  .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=8;NR=8;PP=100.0;SC=ATTATAATTAATATAACAAAC;TC=31;TR=16     GT:GL:GQ        0/1:-408.96,-183.07,-309.58:100
+20     2613623 .       T       TTTG    .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=2;NR=2;PP=100.0;SC=CTTCCATGGGTTTGTTGTTGT;TC=18;TR=4      GT:GL:GQ        0/1:-165.53,-112.66,-139.53:100
+20     2613971 .       TA      T       .       PASS    FR=0.5;HP=4;NF=4;NR=7;PP=100.0;SC=CTTGGACACATAAACAGCCCT;TC=27;TR=11     GT:GL:GQ        0/1:-121.36,-29.89,-140.29:100
+20     2614405 .       T       TGGGTAGG        .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=2;NR=2;PP=52.0;SC=ACTACAGAACTGGGTAGGGGA;TC=30;TR=4       GT:GL:GQ        0/1:-185.89,-156.26,-363.71:100
+20     2616002 .       C       CT      .       PASS    FR=0.5;HP=4;NF=5;NR=5;PP=100.0;SC=ACCTCCACCTCCCCCTCTCAG;TC=22;TR=10     GT:GL:GQ        0/1:-182.46,-117.29,-171.16:100
+20     2617861 .       C       CCT     .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=2;NR=5;PP=100.0;SC=ATGGTGAACCCGTCTCTACTA;TC=17;TR=7      GT:GL:GQ        0/1:-111.22,-36.32,-97.76:100
+20     2625967 .       TGAG    T       .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=2;NR=3;PP=100.0;SC=CTGAGTAGGCTGAGGAGGAGG;TC=15;TR=5      GT:GL:GQ        0/1:-133.1,-85.47,-137.74:100
+20     2627766 .       TTTTATTTA       T       .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=1;NR=1;PP=86.0;SC=ACTGAATTTATTTTATTTATT;TC=19;TR=2       GT:GL:GQ        0/1:-102.46,-70.95,-132.69:100
+20     2630436 .       T       TACC    .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=6;NR=5;PP=100.0;SC=ACATGCCAGGTACACCATTGT;TC=23;TR=11     GT:GL:GQ        0/1:-159.47,-31.83,-143.4:100
+20     2634285 .       CTG     C       .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=3;NR=15;PP=100.0;SC=CTTGTGGGCACTGTAGTGACA;TC=29;TR=18    GT:GL:GQ        0/1:-229.42,-26.07,-86.72:100
+20     2641823 .       C       CTG     .       PASS    FR=0.5;HP=5;NF=2;NR=2;PP=100.0;SC=ATTGCATTTTCTGTGTGTGTG;TC=21;TR=4      GT:GL:GQ        0/1:-96.78,-48.19,-99.13:100
+20     2643833 .       G       GAAATGCAAT      .       PASS    FR=0.5;HP=4;NF=9;NR=2;PP=100.0;SC=TGGTATTCCAGAAATGCAATG;TC=31;TR=11     GT:GL:GQ        0/1:-379.88,-109.48,-180.95:100
+20     2650007 .       T       TACACACACACACACACAC     .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=3;NR=1;PP=100.0;SC=ACCCTTTTCTTACACACACAC;TC=19;TR=4      GT:GL:GQ        1/1:-231.82,-84.82,-75.66:76
+20     2650235 .       C       CT      .       PASS    FR=1.0;HP=9;NF=12;NR=9;PP=100.0;SC=TTTATTGGGCCTTTTTTTTTG;TC=28;TR=21    GT:GL:GQ        1/1:-325.44,-296.08,-289.77:79
+20     2656886 .       AT      A       .       PASS    FR=1.0;HP=6;NF=17;NR=6;PP=100.0;SC=ATAAATAATAATTTTTTAAAA;TC=29;TR=23    GT:GL:GQ        1/1:-339.94,-246.4,-231.12:100
+20     2663020 .       G       GGAA    .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=8;NR=7;PP=100.0;SC=AAGAGGAAGAGGAAGAAGACA;TC=28;TR=15     GT:GL:GQ        1/1:-408.26,-206.61,-189.41:100
+20     2665268 .       TA      T       .       PASS    FR=1.0;HP=8;NF=2;NR=1;PP=43.0;SC=TATGCAGCCATAAAAAAATGA;TC=4;TR=3        GT:GL:GQ        1/1:-20.74,-4.04,-1.38:43
+20     2665956 .       AG      A       .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=9;NR=5;PP=100.0;SC=CCCAGGCTATAGTGCAGTGGC;TC=16;TR=14     GT:GL:GQ        1/1:-156.94,-33.67,-23.62:84
+20     2666401 .       TA      T       .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=8;NR=7;PP=100.0;SC=ACTTTTCTATTAAGAAACGCA;TC=38;TR=15     GT:GL:GQ        0/1:-158.74,-28.32,-160.06:100
+20     2668149 .       A       ATG     .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=1;NR=2;PP=100.0;SC=ATATATATATATGTGTGTGTG;TC=17;TR=3      GT:GL:GQ        0/1:-54.4,-18.57,-68.0:100
+20     2671350 .       GTA     G       .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=8;NR=5;PP=100.0;SC=ATATATATGTGTATATATATA;TC=23;TR=13     GT:GL:GQ        1/1:-348.62,-348.37,-348.16:60
+20     2676135 .       C       CAG     .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=6;NR=2;PP=100.0;SC=TGCTGGGATGCAGAGGGCTTC;TC=17;TR=8      GT:GL:GQ        0/1:-189.45,-108.27,-131.01:100
+20     2678198 .       A       AAAAG   .       PASS    FR=1.0;HP=10;NF=1;NR=2;PP=100.0;SC=CTCAAAAAAAAAAAGAAAGAA;TC=16;TR=3     GT:GL:GQ        1/1:-113.89,-62.27,-58.08:51
+20     2691794 .       AAAT    A       .       PASS    FR=1.0;HP=3;NF=2;NR=4;PP=100.0;SC=ACCCTGTCTAAAATAATAATA;TC=12;TR=6      GT:GL:GQ        1/1:-83.97,-10.76,-5.22:69
+20     2713483 .       C       CAG     .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=7;NR=1;PP=100.0;SC=TTTTTTGAGACGGAATTATAA;TC=28;TR=8      GT:GL:GQ        0/1:-114.91,-36.16,-205.08:100
+20     2717474 .       A       ACAAAGGTCTC     .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=9;NR=5;PP=100.0;SC=AGTCATAAGGACAAAGGACCC;TC=17;TR=14     GT:GL:GQ        1/1:-343.26,-32.05,-17.5:94
+20     2724519 .       AG      A       .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=6;NR=7;PP=100.0;SC=CCAGATATTTAGGGTGTCCAT;TC=28;TR=13     GT:GL:GQ        0/1:-149.48,-35.03,-149.61:100
+20     2734607 .       C       CCCCCTTGGTTTTGAAACTTT   .       PASS    FR=1.0;HP=4;NF=2;NR=4;PP=100.0;SC=TCTGTGGGCACCCCCTTGGGC;TC=12;TR=6      GT:GL:GQ        1/1:-301.3,-108.37,-98.31:100
+20     2742852 .       C       CCAGCAATCCTCAGT .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=1;NR=5;PP=100.0;SC=CTCAATAGCACCTGAGGATGA;TC=16;TR=6      GT:GL:GQ        0/1:-233.59,-35.77,-130.91:100
+20     2766949 .       C       CT      .       PASS    FR=1.0;HP=10;NF=5;NR=10;PP=100.0;SC=ACTTCATTCCCTTTTTTTTTT;TC=28;TR=15   GT:GL:GQ        1/1:-134.68,-37.76,-21.4:100
+20     2782855 .       AC      A       .       PASS    FR=1.0;HP=4;NF=3;NR=8;PP=100.0;SC=AATCACTTGTACCCCGGGGGC;TC=25;TR=11     GT:GL:GQ        1/1:-262.64,-187.36,-174.92:100
+20     2789088 .       AC      A       .       PASS    FR=1.0;HP=9;NF=1;NR=4;PP=100.0;SC=CAAAAAAAAAACCAAAAAACA;TC=13;TR=5      GT:GL:GQ        1/1:-119.81,-36.46,-27.82:89
+20     2796485 .       C       CCTTTT  .       PASS    FR=0.5;HP=4;NF=1;NR=4;PP=100.0;SC=CATCAGGCCCCCTTTTCTCCT;TC=18;TR=5      GT:GL:GQ        0/1:-128.25,-42.55,-123.81:100
+20     2797764 .       AG      A       .       PASS    FR=1.0;HP=3;NF=1;NR=4;PP=100.0;SC=CTGCCTTGGCAGGGCCCAGAC;TC=14;TR=5      GT:GL:GQ        1/1:-134.46,-67.08,-59.42:63
+20     2834884 .       T       TAC     .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=2;NR=1;PP=100.0;SC=ACCCCGTCTCTACACACACAC;TC=22;TR=3      GT:GL:GQ        0/1:-64.62,-28.32,-80.82:100
+20     2849974 .       AT      A       .       PASS    FR=0.5;HP=10;NF=4;NR=6;PP=99.0;SC=TTGGTTTGCAATTTTTTTTTT;TC=36;TR=10     GT:GL:GQ        0/1:-66.95,-34.01,-107.66:100
+20     2850721 .       ACT     A       .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=4;NR=4;PP=100.0;SC=CCAGTGAAAGACTCTTGGGGT;TC=17;TR=8      GT:GL:GQ        0/1:-88.06,-17.99,-74.67:100
+20     2858849 .       GT      G       .       PASS    FR=0.5;HP=8;NF=1;NR=5;PP=52.0;SC=GACAGCTGTAGTTTTTTTTAA;TC=15;TR=6       GT:GL:GQ        0/1:-33.96,-11.94,-50.39:98
+20     2867547 .       AT      A       .       PASS    FR=0.5;HP=6;NF=5;NR=6;PP=100.0;SC=AAATAAAAAAATGTAGTATCT;TC=32;TR=11     GT:GL:GQ        0/1:-115.49,-28.1,-161.94:100
+20     2880787 .       C       CCT     .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=4;NR=5;PP=100.0;SC=GAAAAATCTGCCTCCTTTTTT;TC=27;TR=9      GT:GL:GQ        0/1:-140.77,-68.5,-172.28:100
+20     2890657 .       C       CAT     .       PASS    FR=0.5003;HP=1;NF=2;NR=1;PP=100.0;SC=TATCATATATCATATATAATC;TC=5;TR=3    GT:GL:GQ        0/1:-44.82,-3.47,-10.33:32
+20     2890805 .       CAT     C       .       PASS    FR=0.5017;HP=1;NF=1;NR=6;PP=100.0;SC=TACTATACGTCATATATAATA;TC=9;TR=7    GT:GL:GQ        0/1:-87.98,-14.06,-19.03:24
+20     2894312 .       CTTATT  C       .       PASS    FR=0.5;HP=4;NF=3;NR=5;PP=100.0;SC=GTGCTGTGTTCTTATTTTATC;TC=22;TR=8      GT:GL:GQ        0/1:-141.94,-29.98,-159.98:100
+20     2896142 .       T       TTATC   .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=9;NR=10;PP=100.0;SC=TAAGAGTTCTTTATTCTGATA;TC=30;TR=19    GT:GL:GQ        1/1:-399.17,-94.52,-74.73:100
+20     2912364 .       T       TTG     .       PASS    FR=0.5004;HP=1;NF=1;NR=1;PP=75.0;SC=GGGTCTTGGCTTGTGTGTGTG;TC=20;TR=2    GT:GL:GQ        0/1:-121.99,-92.59,-99.11:31
+20     2926228 .       GGTGTGTGT       G       .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=1;NR=9;PP=100.0;SC=ATAATTGGCAGGTGTGTGTGT;TC=27;TR=10     GT:GL:GQ        0/1:-233.62,-33.54,-77.33:100
+20     2937307 .       AAAATAAAT       A       .       PASS    FR=0.5;HP=4;NF=3;NR=3;PP=100.0;SC=TCAGTAAATAAAAATAAATAA;TC=17;TR=6      GT:GL:GQ        0/1:-165.86,-12.93,-101.78:100
+20     2950624 .       T       TAATA,TAATAAATAAATA     .       PASS    FR=0.5,0.5;HP=5;NF=5,2;NR=2,2;PP=100.0,100.0;SC=TCTAAATAAATAATAAATAAA;TC=24;TR=7,4      GT:GL:GQ        1/2:-1.0,-1.0,-1.0:100
+20     2966530 .       CTTGTTTGT       CTTGT,C .       PASS    FR=0.5,0.5;HP=2;NF=1,1;NR=2,1;PP=100.0,27.0;SC=CAGCTGTCTCCTTGTTTGTTT;TC=22;TR=3,2       GT:GL:GQ        1/2:-1.0,-1.0,-1.0:80
+20     2973326 .       T       TTTAGGGTTTTTC   .       PASS    FR=0.5;HP=4;NF=1;NR=5;PP=100.0;SC=CATATCCAAATATTACGATTC;TC=15;TR=6      GT:GL:GQ        0/0:-275.74,-159.4,-213.4:3
+20     2977781 .       CATAT   C       .       PASS    FR=0.5;HP=5;NF=3;NR=6;PP=100.0;SC=TGTGAGAAAACATATGTGGGA;TC=26;TR=9      GT:GL:GQ        0/1:-131.98,-30.22,-206.04:100
+20     2979576 .       T       TTATTA  .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=2;NR=5;PP=100.0;SC=TATTTATAATTTATTATATAT;TC=21;TR=7      GT:GL:GQ        0/1:-148.89,-17.32,-97.42:100
+20     2982245 .       CT      C       .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=8;NR=4;PP=100.0;SC=CTGTGGAAATCTTATGTGAAG;TC=27;TR=12     GT:GL:GQ        0/1:-126.56,-21.8,-132.46:100
+20     2982823 .       CA      C       .       PASS    FR=1.0;HP=7;NF=10;NR=9;PP=100.0;SC=TTCCATCTGACAAAAAATTGG;TC=21;TR=19    GT:GL:GQ        1/1:-196.74,-95.2,-82.42:100
+20     2989926 .       AT      A       .       PASS    FR=0.5;HP=10;NF=2;NR=5;PP=29.0;SC=GAGTTGTGTGATTTTTTTTTT;TC=36;TR=7      GT:GL:GQ        0/1:-66.0,-49.11,-118.97:76
+20     3005541 .       TC      T       .       PASS    FR=0.5;HP=5;NF=7;NR=7;PP=100.0;SC=AGCAGTTTTTTCTGTAAGAGC;TC=32;TR=14     GT:GL:GQ        0/1:-167.85,-53.03,-186.47:100
+20     3007694 .       A       AGGT    .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=4;NR=5;PP=100.0;SC=CCAGGGCCTGAGGTGGGAGCA;TC=22;TR=9      GT:GL:GQ        0/1:-162.22,-42.91,-117.4:100
+20     3012419 .       C       CTGTT   .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=5;NR=3;PP=100.0;SC=CCTCCTTACTCTGTGTGTTTT;TC=26;TR=8      GT:GL:GQ        0/1:-154.4,-24.26,-143.38:100
+20     3022136 .       GAATT   G       .       PASS    FR=0.5;HP=7;NF=8;NR=1;PP=100.0;SC=AAAAGAAAAAGAATTAATTAA;TC=20;TR=9      GT:GL:GQ        1/0:-190.17,-78.0,-90.9:100
+20     3039218 .       GT      G       .       PASS    FR=1.0;HP=5;NF=12;NR=13;PP=100.0;SC=TGTTGTTGTTGTTTGTTTGTT;TC=29;TR=25   GT:GL:GQ        1/1:-226.7,-48.88,-31.11:100
+20     3042034 .       T       TA      .       PASS    FR=1.0;HP=10;NF=5;NR=14;PP=100.0;SC=AAGACACTGATAAAAAAAAAT;TC=25;TR=19   GT:GL:GQ        1/1:-125.74,-31.3,-15.65:100
+20     3047853 .       A       ATTCCCCCATT     .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=6;NR=1;PP=100.0;SC=ACTCCCTCTCATTCCCCCATT;TC=20;TR=7      GT:GL:GQ        0/1:-258.31,-36.83,-99.91:100
+20     3050529 .       A       AT      .       PASS    FR=0.5;HP=10;NF=4;NR=1;PP=23.0;SC=GCAAAAAAAAAAATTTTTATT;TC=22;TR=5      GT:GL:GQ        0/1:-257.11,-262.46,-292.84:73
+20     3050531 .       A       ATTT,T  .       PASS    FR=0.5,0.5;HP=10;NF=3,13;NR=0,6;PP=97.0,100.0;SC=AAAAAAAAAAATTTTTATTTT;TC=22;TR=3,19    GT:GL:GQ        1/2:-1.0,-1.0,-1.0:100
+20     3051123 .       A       AT      .       PASS    FR=0.5;HP=6;NF=2;NR=1;PP=69.0;SC=TCAAGAAAAAAATATATATAT;TC=17;TR=3       GT:GL:GQ        0/1:-107.95,-81.12,-160.4:100
+20     3058938 .       C       CTT     .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=19;NR=9;PP=100.0;SC=ACTGGATACTCTGAACTCCTA;TC=30;TR=28    GT:GL:GQ        1/1:-404.4,-115.7,-94.26:100
+20     3060201 .       C       CAAT    .       PASS    FR=0.5;HP=4;NF=13;NR=9;PP=100.0;SC=ACAAAGTCAACAATAATTCAT;TC=44;TR=22    GT:GL:GQ        0/1:-325.42,-43.13,-189.79:100
+20     3062903 .       T       TC      .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=1;NR=5;PP=94.0;SC=TCCAGGCCTTTCCCTCTCTGC;TC=19;TR=6       GT:GL:GQ        0/1:-95.35,-62.58,-147.62:100
+20     3072606 .       A       AAGG    .       PASS    FR=1.0;HP=5;NF=4;NR=4;PP=100.0;SC=CCAAGTAAAAAAGGGCGGGGG;TC=22;TR=8      GT:GL:GQ        1/1:-220.94,-78.12,-65.62:100
+20     3126086 .       CCT     TCT,C   .       PASS    FR=0.5,0.5;HP=7;NF=1,1;NR=3,1;PP=8.0,36.0;SC=GCCTTTTTTTCCTTTTTTTTT;TC=19;TR=4,2 GT:GL:GQ        2/1:-1.0,-1.0,-1.0:42
+20     3159346 .       C       CA      .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=3;NR=12;PP=100.0;SC=GCTGGGACTACGGCATTTACT;TC=15;TR=15    GT:GL:GQ        1/1:-149.15,-11.32,-0.92:87
+20     3161722 .       C       CAGAT,CAGATAGAT .       PASS    FR=0.5,0.5;HP=2;NF=2,1;NR=2,2;PP=35.0,42.0;SC=GATAGATAGACAGATAGATAG;TC=18;TR=4,3        GT:GL:GQ        1/2:-1.0,-1.0,-1.0:99
+20     3161783 .       CTA     C       .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=9;NR=7;PP=100.0;SC=TTTTATATATCTATATATATA;TC=25;TR=16     GT:GL:GQ        1/1:-263.89,-139.12,-127.54:97
+20     3162560 .       CAT     C       .       PASS    FR=0.5369;HP=2;NF=1;NR=3;PP=100.0;SC=CACACACACACATGGTCCATG;TC=6;TR=4    GT:GL:GQ        0/1:-84.99,-50.52,-52.5:11
+20     3169476 .       T       TTTG    .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=5;NR=9;PP=100.0;SC=AATGTTTACTTTTAATAAACT;TC=35;TR=14     GT:GL:GQ        0/1:-273.66,-64.07,-202.46:100
+20     3169541 .       A       AT      .       PASS    FR=0.5;HP=7;NF=5;NR=9;PP=100.0;SC=AGGATCATAGATTTTTTTCCT;TC=23;TR=14     GT:GL:GQ        0/1:-204.2,-123.3,-145.94:100
+20     3172618 .       GACAC   G       .       PASS    FR=0.7893;HP=1;NF=3;NR=1;PP=100.0;SC=TTGCTCCCCTGACACACACAC;TC=16;TR=4   GT:GL:GQ        1/1:-154.29,-100.95,-101.25:3
+20     3172771 .       C       CAT     .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=13;NR=6;PP=100.0;SC=CCGAGACACACGAGTGGTAAT;TC=24;TR=19    GT:GL:GQ        1/1:-267.07,-44.87,-28.98:100
+20     3177159 .       T       TA      .       PASS    FR=1.0;HP=5;NF=6;NR=3;PP=87.0;SC=CTGTCTCCACTAAAAATACAA;TC=15;TR=9       GT:GL:GQ        1/1:-169.92,-142.98,-139.57:56
+20     3177517 .       C       CAT     .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=15;NR=10;PP=100.0;SC=TAATAAATAACGTTACTGGAT;TC=26;TR=25   GT:GL:GQ        1/1:-294.64,-37.59,-18.88:100
+20     3188342 .       A       AAACAACAACAACAAC        .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=2;NR=2;PP=100.0;SC=CTCCATCTCAAAACAACAACA;TC=17;TR=4      GT:GL:GQ        0/1:-131.35,-46.51,-82.74:100
+20     3192138 .       T       TTTTGTTTGTTTG   .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=3;NR=1;PP=99.0;SC=TTTTGTTTTGTTTTGTTTGTT;TC=17;TR=4       GT:GL:GQ        0/1:-79.23,-33.31,-124.52:100
+20     3192798 .       C       CAG     .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=2;NR=6;PP=100.0;SC=GCCTGGGTGACAGAGAGAGAG;TC=20;TR=8      GT:GL:GQ        0/1:-108.84,-41.85,-123.5:100
+20     3198551 .       G       GTT     .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=1;NR=2;PP=63.0;SC=AGTTTTTGTGGGTTTTTTTTT;TC=22;TR=3       GT:GL:GQ        0/1:-111.88,-112.41,-193.71:91
+20     3202220 .       GTGGC   G       .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=2;NR=5;PP=100.0;SC=TGTCCCGGGTGTGGCTGGCGA;TC=19;TR=7      GT:GL:GQ        0/1:-150.53,-63.82,-136.14:100
+20     3276659 .       CT      C       .       PASS    FR=1.0;HP=3;NF=5;NR=6;PP=100.0;SC=ACATCGGGAACTTTCGGTTTC;TC=16;TR=11     GT:GL:GQ        1/1:-135.26,-24.21,-14.73:79
+20     3290980 .       A       AAAAG   .       PASS    FR=0.9998;HP=4;NF=1;NR=1;PP=30.0;SC=AAGAGAAAGAAAAAGAAAGAA;TC=7;TR=2     GT:GL:GQ        1/1:-37.89,-18.65,-17.26:34
+20     3313547 .       G       GGTGT   .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=1;NR=3;PP=100.0;SC=GTGTGCGTGTGGTGTGTGTGT;TC=20;TR=4      GT:GL:GQ        1/1:-194.22,-148.74,-144.19:56
+20     3314333 .       G       GT      .       PASS    FR=1.0;HP=10;NF=9;NR=9;PP=100.0;SC=CTTATTAAAGGTTTTTTTTTT;TC=34;TR=18    GT:GL:GQ        1/1:-126.24,-28.85,-19.8:75
+20     3317061 .       G       GT      .       PASS    FR=1.0;HP=10;NF=5;NR=7;PP=100.0;SC=GTTTTGTTCAGTTTTTTTTTT;TC=20;TR=12    GT:GL:GQ        1/1:-81.13,-22.72,-13.12:80
+20     3318622 .       TATAAAATATATAATAC       T       .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=3;NR=5;PP=100.0;SC=ATATATAATATATAAAATATA;TC=21;TR=8      GT:GL:GQ        1/0:-309.41,-50.93,-55.49:45
+20     3320964 .       AGTTT   A       .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=6;NR=12;PP=100.0;SC=AATCATACCTAGTTTGTACTA;TC=22;TR=18    GT:GL:GQ        1/1:-403.07,-167.86,-153.33:100
+20     3320971 .       A       AC      .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=6;NR=13;PP=100.0;SC=CCTAGTTTGTACTATAAAAAA;TC=19;TR=19    GT:GL:GQ        1/1:-403.07,-261.66,-248.63:100
+20     3323678 .       AT      A       .       PASS    FR=1.0;HP=5;NF=3;NR=1;PP=100.0;SC=TCTGATGATTATTTCTATTGC;TC=28;TR=4      GT:GL:GQ        1/1:-575.25,-570.95,-570.67:100
+20     3323683 .       T       TAAA    .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=13;NR=11;PP=100.0;SC=TGATTATTTCTATTGCTGTGC;TC=29;TR=24   GT:GL:GQ        1/1:-597.36,-560.99,-550.34:86
+20     3323709 .       T       TA      .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=16;NR=21;PP=100.0;SC=CATGTTCATTTGTTAGGTCCC;TC=38;TR=37   GT:GL:GQ        1/1:-694.83,-570.91,-558.14:100
+20     3325237 .       TACACACAC       T       .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=4;NR=2;PP=100.0;SC=TACACACACATACACACACAC;TC=33;TR=6      GT:GL:GQ        1/1:-276.44,-185.04,-177.42:63
+20     3332481 .       TTTTA   T       .       PASS    FR=1.0;HP=3;NF=7;NR=10;PP=100.0;SC=GTTTGTGTTATTTTATTTATT;TC=28;TR=17    GT:GL:GQ        1/1:-276.75,-43.8,-27.83:100
+20     3333166 .       TCA     T       .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=9;NR=10;PP=100.0;SC=TGGCTGTCATTCACATTCCAG;TC=22;TR=19    GT:GL:GQ        1/1:-222.99,-23.7,-9.78:100
+20     3333493 .       T       TTA     .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=6;NR=7;PP=100.0;SC=TTCAAAATATTTATATATATA;TC=27;TR=13     GT:GL:GQ        1/1:-272.96,-96.81,-86.7:65
+20     3336192 .       G       GC      .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=5;NR=10;PP=100.0;SC=CTGCACTCCAGCCTGGGTGAC;TC=18;TR=15    GT:GL:GQ        1/1:-163.64,-31.05,-19.12:100
+20     3338276 .       G       GCTTAT  .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=8;NR=10;PP=100.0;SC=CACCCATCCAGCTTTATCTTT;TC=23;TR=18    GT:GL:GQ        1/1:-329.33,-26.75,-8.74:100
+20     3345587 .       C       CT      .       PASS    FR=1.0;HP=6;NF=1;NR=10;PP=100.0;SC=CCTTCTTTTCCTTTTTTCTTT;TC=27;TR=11    GT:GL:GQ        1/1:-267.74,-155.91,-141.96:100
+20     3346020 .       TTTTATTTA       T       .       PASS    FR=1.0;HP=3;NF=7;NR=6;PP=100.0;SC=TTTGATAACATTTTATTTATT;TC=29;TR=13     GT:GL:GQ        1/1:-347.46,-36.68,-23.65:100
+20     3349612 .       T       TA      .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=8;NR=3;PP=100.0;SC=ACCCCATTTCTCTAAAAATAC;TC=11;TR=11     GT:GL:GQ        1/1:-135.85,-60.43,-52.97:61
+20     3377965 .       G       GTTTTGTT        .       PASS    FR=1.0;HP=8;NF=3;NR=2;PP=100.0;SC=TTTTTGTTTTGTTTTGTTTTT;TC=16;TR=5      GT:GL:GQ        1/1:-157.49,-62.9,-56.59:79
+20     3378366 .       TG      T       .       PASS    FR=1.0;HP=10;NF=6;NR=4;PP=100.0;SC=AGATTTTTTTTGGGGGGGGGG;TC=22;TR=10    GT:GL:GQ        1/1:-84.99,-30.32,-19.67:66
+20     3382249 .       T       TA      .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=7;NR=9;PP=100.0;SC=AATTATTATCTTTCATTCAAT;TC=19;TR=16     GT:GL:GQ        1/1:-178.1,-44.13,-31.76:100
+20     3382515 .       TC      T       .       PASS    FR=1.0;HP=6;NF=2;NR=10;PP=100.0;SC=TGGGGAGGGCTCCCCCGCCCC;TC=19;TR=12    GT:GL:GQ        1/1:-132.42,-42.62,-32.12:88
+20     3398847 .       T       TAC     .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=2;NR=1;PP=82.0;SC=AATAACAACATACACACACAC;TC=26;TR=3       GT:GL:GQ        0/1:-87.09,-56.01,-103.69:100
+20     3418279 .       TACACACACAC     T       .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=2;NR=1;PP=100.0;SC=CACACGAGGGTACACACACAC;TC=17;TR=3      GT:GL:GQ        0/1:-117.7,-66.19,-77.13:50
+20     3419562 .       TACAC   T       .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=2;NR=2;PP=100.0;SC=TCAAAATACATACACACACAC;TC=29;TR=4      GT:GL:GQ        0/1:-141.17,-79.46,-166.16:100
+20     3426771 .       T       TC      .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=13;NR=10;PP=100.0;SC=TTGCAGAAACTGACAAAATAG;TC=25;TR=23   GT:GL:GQ        1/1:-297.92,-207.29,-192.68:100
+20     3439128 .       AT      A       .       PASS    FR=1.0;HP=4;NF=4;NR=3;PP=100.0;SC=TGTCTCAAAAATATATATATA;TC=13;TR=7      GT:GL:GQ        1/1:-127.06,-48.08,-43.43:57
+20     3439712 .       CATTTATTTATTT   CATTTATTT,C     .       PASS    FR=0.5,0.5;HP=1;NF=2,5;NR=1,1;PP=100.0,100.0;SC=AACATAAAATCATTTATTTAT;TC=23;TR=3,6      GT:GL:GQ        1/2:-1.0,-1.0,-1.0:100
+20     3441674 .       G       GA      .       PASS    FR=0.5;HP=7;NF=13;NR=3;PP=100.0;SC=TTCTTATTAGGAAAAAAACCA;TC=23;TR=16    GT:GL:GQ        0/1:-122.74,-20.86,-35.93:68
+20     3456629 .       CA      C       .       PASS    FR=0.5;HP=8;NF=3;NR=5;PP=100.0;SC=TCCTCACTACCAAAAAAAAGA;TC=22;TR=8      GT:GL:GQ        0/1:-62.73,-25.03,-67.91:100
+20     3462307 .       A       ATTC    .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=7;NR=2;PP=100.0;SC=TAAATTTTTAATTAAGTTTTC;TC=17;TR=9      GT:GL:GQ        0/1:-213.54,-117.72,-169.88:100
+20     3465413 .       G       GTTA    .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=4;NR=7;PP=100.0;SC=TATATTTCCAGTTTAGGTCTC;TC=32;TR=11     GT:GL:GQ        0/1:-171.48,-39.39,-198.21:100
+20     3465556 .       AATT    A       .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=3;NR=3;PP=100.0;SC=TGGATTTTAAAATTATTATTA;TC=23;TR=6      GT:GL:GQ        0/1:-128.2,-26.49,-64.94:100
+20     3467027 .       TTTTCC  T       .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=3;NR=10;PP=100.0;SC=GTTGTTTTTCTTTTCCTTTTT;TC=35;TR=13    GT:GL:GQ        0/1:-205.57,-36.22,-212.27:100
+20     3468732 .       AT      A       .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=7;NR=3;PP=100.0;SC=GTTGGCTAACATGTTCCCTGC;TC=24;TR=10     GT:GL:GQ        0/1:-129.57,-23.07,-107.21:100
+20     3472426 .       T       TA      .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=4;NR=5;PP=100.0;SC=CCCCAAAACTTATCTAAGTAT;TC=30;TR=9      GT:GL:GQ        0/1:-164.9,-36.91,-163.8:100
+20     3473769 .       TTGTGTGTGTG     TTGTGTGTG,T     .       PASS    FR=0.5,0.5;HP=2;NF=3,2;NR=1,0;PP=100.0,100.0;SC=GTACGTTTGTTTGTGTGTGTG;TC=10;TR=4,2      GT:GL:GQ        1/2:-1.0,-1.0,-1.0:100
+20     3489906 .       C       CAG     .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=7;NR=5;PP=100.0;SC=TGTAATGAGTCAAATATTGAA;TC=30;TR=12     GT:GL:GQ        0/1:-218.47,-143.39,-285.84:100
+20     3495915 .       T       TG      .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=8;NR=2;PP=100.0;SC=GTGTTACCATTCTAGAGATGA;TC=24;TR=10     GT:GL:GQ        0/1:-170.31,-150.44,-250.52:100
+20     3509359 .       CTAAAA  C       .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=7;NR=9;PP=100.0;SC=CCCCTTGAACCTAAAATAAAA;TC=36;TR=16     GT:GL:GQ        0/1:-259.32,-75.45,-201.38:100
+20     3516100 .       GA      G       .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=4;NR=5;PP=100.0;SC=AACATTACTTGATAACCTTTC;TC=24;TR=9      GT:GL:GQ        0/1:-89.87,-17.09,-134.48:100
+20     3517232 .       T       TA      .       PASS    FR=0.5;HP=4;NF=5;NR=10;PP=100.0;SC=TTTATTCATTTAAAAGCAACA;TC=33;TR=15    GT:GL:GQ        0/1:-148.46,-23.56,-134.17:100
+20     3518135 .       TTG     T       .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=2;NR=7;PP=100.0;SC=TATTTTTTTCTTGTTTTTTTT;TC=24;TR=9      GT:GL:GQ        0/1:-164.48,-76.63,-118.93:100
+20     3520111 .       TGAGAAACAGAAA   T       .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=6;NR=4;PP=100.0;SC=GTCAAATACTTGAGAAACAGA;TC=30;TR=10     GT:GL:GQ        0/1:-291.42,-56.72,-205.51:100
+20     3533082 .       C       CTA     .       PASS    FR=0.5;HP=6;NF=5;NR=7;PP=100.0;SC=CCAGATGTCCCCCCCAGTTAA;TC=28;TR=12     GT:GL:GQ        0/1:-172.54,-164.36,-281.23:100
+20     3536203 .       CA      C       .       PASS    FR=0.5;HP=5;NF=5;NR=1;PP=100.0;SC=TGGTAGACCACAAAACAAAAT;TC=20;TR=6      GT:GL:GQ        0/1:-93.07,-22.5,-78.34:100
+20     3549166 .       A       AT      .       PASS    FR=0.5;HP=7;NF=6;NR=5;PP=100.0;SC=ACTCAAAAAAAATATATTTCA;TC=27;TR=11     GT:GL:GQ        0/1:-132.66,-26.81,-119.92:100
+20     3550790 .       AT      A       .       PASS    FR=0.5;HP=10;NF=9;NR=3;PP=100.0;SC=AATTGTCTCAATTTTTTTTTT;TC=36;TR=12    GT:GL:GQ        0/1:-95.8,-54.46,-109.39:100
+20     3554405 .       TTTTA   T       .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=5;NR=3;PP=100.0;SC=TTTTATTTTATTTTATTTATT;TC=28;TR=8      GT:GL:GQ        0/1:-169.52,-76.02,-126.65:100
+20     3557342 .       G       GTCTATCTATCTATCTATCTA,GTCTGTCTGTCTATCTA .       PASS    FR=0.5,0.5;HP=2;NF=0,1;NR=2,1;PP=100.0,100.0;SC=CTGTCTGTCTGTCTATCTATC;TC=14;TR=2,2      GT:GL:GQ        1/2:-1.0,-1.0,-1.0:100
+20     3577359 .       AACTTT  A       .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=8;NR=4;PP=100.0;SC=GTTCTCTTAAAACTTTACTTT;TC=28;TR=12     GT:GL:GQ        0/1:-187.21,-26.31,-190.0:100
+20     3587084 .       A       ACT     .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=5;NR=2;PP=100.0;SC=TTCTCTCTTCACTGTTTCCTG;TC=27;TR=7      GT:GL:GQ        0/1:-175.39,-93.87,-225.08:100
+20     3587106 .       TGTG    T       .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=4;NR=3;PP=100.0;SC=ATGTGGGACTTGTGGTGCCAC;TC=26;TR=7      GT:GL:GQ        0/1:-197.29,-142.58,-281.02:100
+20     3597598 .       AT      A       .       PASS    FR=0.5;HP=5;NF=5;NR=7;PP=29.0;SC=CAAGGATCGCATTTTTATCCC;TC=39;TR=12      GT:GL:GQ        0/1:-225.54,-208.64,-370.51:76
+20     3599489 .       G       GGTT    .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=6;NR=4;PP=100.0;SC=TGGTGGTGGTGGTTTTGTTTC;TC=28;TR=10     GT:GL:GQ        0/1:-173.69,-38.78,-110.57:100
+20     3601166 .       T       TAC     .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=1;NR=5;PP=100.0;SC=GTACTGGGATTAGGCGTGAGC;TC=23;TR=6      GT:GL:GQ        0/1:-99.56,-38.65,-114.14:100
+20     3607044 .       TAAAAA  T       .       PASS    FR=0.5;HP=5;NF=6;NR=1;PP=100.0;SC=TTTTCTCTCTTAAAAAGAAAA;TC=23;TR=7      GT:GL:GQ        0/1:-96.17,-24.47,-167.72:100
+20     3608928 .       A       AAG     .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=6;NR=2;PP=100.0;SC=GAAAACTAGAAAGAAACTTCT;TC=32;TR=8      GT:GL:GQ        0/1:-96.19,-24.02,-201.47:100
+20     3610589 .       G       GT      .       PASS    FR=0.5;HP=7;NF=7;NR=8;PP=100.0;SC=ATCATTCTGAGTTTTTTTATT;TC=36;TR=15     GT:GL:GQ        0/1:-148.28,-61.67,-123.51:100
+20     3612124 .       A       AC      .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=5;NR=1;PP=100.0;SC=GTCTGTTGAGACTGTGTCCTA;TC=17;TR=6      GT:GL:GQ        0/1:-86.01,-27.19,-97.39:100
+20     3627840 .       C       CA      .       PASS    FR=0.5;HP=6;NF=4;NR=7;PP=100.0;SC=CTCAACTGTGCAAAAAACAAA;TC=27;TR=11     GT:GL:GQ        0/1:-99.01,-25.59,-91.79:100
+20     3627925 .       A       ATTAAC  .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=2;NR=9;PP=100.0;SC=AGTCAGATGAATTGTTTTCAT;TC=29;TR=11     GT:GL:GQ        0/1:-210.42,-38.37,-176.36:100
+20     3635158 .       A       AT      .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=8;NR=5;PP=100.0;SC=CAAGAAAGCCATAGACCGGAA;TC=23;TR=13     GT:GL:GQ        0/1:-191.76,-111.36,-148.51:100
+20     3642221 .       TTC     T       .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=12;NR=3;PP=100.0;SC=TCGCCACCATTTCTCCAGAAC;TC=20;TR=15    GT:GL:GQ        1/1:-312.08,-172.82,-161.67:43
+20     3643129 .       TC      T       .       PASS    FR=1.0;HP=9;NF=4;NR=4;PP=100.0;SC=CGGGGTGGTATCCCCCCCCCA;TC=20;TR=8      GT:GL:GQ        1/1:-89.01,-45.99,-37.4:71
+20     3645120 .       AAAAC   A       .       PASS    FR=1.0;HP=5;NF=1;NR=4;PP=100.0;SC=TTTTTTTTAAAAAACAAACAA;TC=18;TR=5      GT:GL:GQ        1/1:-88.2,-13.8,-7.58:77
+20     3650540 .       A       ACACCACC        .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=3;NR=4;PP=100.0;SC=CCAGGCTCTGACAGCAGCCTG;TC=12;TR=7      GT:GL:GQ        1/1:-183.63,-21.64,-13.12:68
+20     3664603 .       AG      A       .       PASS    FR=1.0;HP=6;NF=3;NR=9;PP=100.0;SC=TTCTGTAGACAGGGGGGTCTC;TC=16;TR=12     GT:GL:GQ        1/1:-110.02,-26.49,-16.31:85
+20     3667748 .       C       CG      .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=12;NR=5;PP=100.0;SC=AAAGTTCACCCGCCCCCAACT;TC=24;TR=17    GT:GL:GQ        1/1:-221.42,-44.79,-28.21:100
+20     3677095 .       T       TGCTG   .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=4;NR=13;PP=100.0;SC=GGAGGCCTTCTGCTGGCTGGA;TC=22;TR=17    GT:GL:GQ        1/1:-297.16,-58.83,-44.05:100
+20     3685444 .       A       AT      .       PASS    FR=1.0;HP=7;NF=6;NR=4;PP=100.0;SC=TTGTTTTTTAATTTTTTTGTA;TC=15;TR=10     GT:GL:GQ        1/1:-93.4,-15.67,-6.68:75
+20     3699376 .       AAAAT   A       .       PASS    FR=1.0;HP=5;NF=4;NR=2;PP=100.0;SC=CAAAAAATAAAAAATAAATAA;TC=21;TR=6      GT:GL:GQ        1/1:-124.16,-19.34,-11.28:66
+20     3700024 .       TTTAC   T       .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=3;NR=4;PP=100.0;SC=TATTTATTTATTTACTTACTT;TC=22;TR=7      GT:GL:GQ        0/1:-142.54,-24.82,-34.29:44
+20     3702676 .       C       CT      .       PASS    FR=1.0;HP=9;NF=9;NR=6;PP=100.0;SC=ATATGTTGAACTTTTTTTTTA;TC=20;TR=15     GT:GL:GQ        1/1:-102.25,-23.87,-11.51:100
+20     3703373 .       GAATA   G       .       PASS    FR=1.0;HP=3;NF=3;NR=4;PP=100.0;SC=TATACATGGAGAATAAATAAA;TC=24;TR=7      GT:GL:GQ        1/1:-129.84,-26.73,-19.11:63
+20     3705235 .       G       GGAAA   .       PASS    FR=1.0;HP=3;NF=3;NR=2;PP=100.0;SC=AAGAAAGAAAGGAAAGAAATA;TC=24;TR=5      GT:GL:GQ        1/1:-319.51,-157.83,-145.36:98
+20     3717704 .       AAAATAAATAAATAAAT       AAAATAAATAAAT,A .       PASS    FR=0.5,0.5;HP=4;NF=1,0;NR=1,2;PP=100.0,55.0;SC=CTCTGCCTCAAAAATAAATAA;TC=12;TR=2,2       GT:GL:GQ        1/2:-1.0,-1.0,-1.0:100
+20     3719488 .       AGT     A       .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=4;NR=6;PP=100.0;SC=TCTGTGAGTGAGTGTGTGTGT;TC=28;TR=10     GT:GL:GQ        0/1:-149.53,-25.54,-102.21:100
+20     3736407 .       CCCCCAGCCCAGTGG C       .       PASS    FR=0.5;HP=4;NF=3;NR=1;PP=100.0;SC=AGCTGATCGACCCCCAGCCCA;TC=22;TR=4      GT:GL:GQ        0/1:-177.03,-114.74,-207.47:100
+20     3740620 .       GCA     G       .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=4;NR=6;PP=100.0;SC=ACTCACACATGCACACACACA;TC=17;TR=10     GT:GL:GQ        1/1:-154.32,-36.11,-25.75:86
+20     3751453 .       G       GT      .       PASS    FR=1.0;HP=6;NF=1;NR=1;PP=100.0;SC=CAAACACACGGTTTTTTGTTT;TC=25;TR=2      GT:GL:GQ        1/1:-234.3,-199.49,-191.92:62
+20     3752464 .       A       AACAC,AACACAC   .       PASS    FR=0.5,0.5;HP=3;NF=4,3;NR=3,3;PP=100.0,100.0;SC=AAAAAGAGAAAACACACACAC;TC=29;TR=7,6      GT:GL:GQ        1/2:-1.0,-1.0,-1.0:100
+20     3755004 .       G       GACA    .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=1;NR=7;PP=100.0;SC=GACAGAGTGAGACATCTCATA;TC=13;TR=8      GT:GL:GQ        1/1:-134.63,-25.28,-17.61:63
+20     3768789 .       A       AAAAG   .       PASS    FR=0.5;HP=8;NF=4;NR=3;PP=100.0;SC=ATCTCAAAAAAAAAGAAAGAA;TC=28;TR=7      GT:GL:GQ        0/1:-141.47,-38.74,-119.72:100
+20     3770324 .       T       TAATAATA        .       PASS    FR=0.5;HP=8;NF=1;NR=2;PP=29.0;SC=GGCCAAAAAATAATAATAAAT;TC=11;TR=3       GT:GL:GQ        0/1:-67.44,-43.02,-52.14:42
+20     3774219 .       AATTTT  A       .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=2;NR=3;PP=100.0;SC=GGTTTTAGAGAATTTTATTTT;TC=20;TR=5      GT:GL:GQ        0/1:-126.4,-91.22,-154.58:100
+20     3775162 .       GTT     G       .       PASS    FR=0.5;HP=10;NF=3;NR=6;PP=100.0;SC=TCTCGGGGCAGTTTTTTTTTT;TC=26;TR=9     GT:GL:GQ        0/1:-103.9,-68.26,-117.09:100
+20     3776005 .       C       CA      .       PASS    FR=0.5;HP=8;NF=1;NR=4;PP=23.0;SC=GACTCCATCCCAAAAAAAACA;TC=14;TR=5       GT:GL:GQ        0/1:-145.51,-129.15,-148.62:73
+20     3776021 .       AAAC    A       .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=3;NR=1;PP=100.0;SC=AAACAAAACAAAACAAAAAGA;TC=21;TR=4      GT:GL:GQ        0/1:-163.41,-119.44,-232.96:100
+20     3780857 .       T       TGGACTGGAGACCTGGTGCTAG  .       PASS    FR=0.5;HP=6;NF=4;NR=1;PP=100.0;SC=TACTCCCCCCTGGACTGGGGG;TC=10;TR=5      GT:GL:GQ        0/1:-153.98,-19.16,-34.72:70
+20     3786892 .       C       CT      .       PASS    FR=1.0;HP=4;NF=10;NR=2;PP=100.0;SC=CTTGTCCCTTCTTCTCCCAAT;TC=16;TR=12    GT:GL:GQ        1/1:-171.33,-64.44,-53.38:92
+20     3787614 .       CAT     C       .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=11;NR=13;PP=100.0;SC=AGTGCACACACATGTCAGGCA;TC=30;TR=24   GT:GL:GQ        1/1:-451.43,-312.17,-297.5:100
+20     3789927 .       C       CCCG    .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=2;NR=10;PP=100.0;SC=AGTTACCACGCGCTCTCTTTC;TC=17;TR=12    GT:GL:GQ        1/1:-241.99,-120.76,-110.7:78
+20     3790246 .       ATATAT  A       .       PASS    FR=1.0;HP=8;NF=5;NR=2;PP=92.0;SC=TCAAAAAAAAATATATATATA;TC=14;TR=7       GT:GL:GQ        1/1:-198.37,-176.0,-172.1:52
+20     3795480 .       AGGCGTGAGCCACCGCGCCC    A       .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=2;NR=2;PP=100.0;SC=CTGGGATTACAGGCGTGAGCC;TC=12;TR=4      GT:GL:GQ        0/1:-109.14,-46.17,-99.46:100
+20     3824585 .       TTTTAC  T       .       PASS    FR=1.0;HP=3;NF=18;NR=4;PP=100.0;SC=AGATGATTTATTTTACTTTAT;TC=28;TR=22    GT:GL:GQ        1/1:-337.35,-36.39,-16.32:100
+20     3843259 .       A       AT      .       PASS    FR=0.5;HP=10;NF=3;NR=7;PP=100.0;SC=AGTTTTCCAAATTTTTTTTTT;TC=31;TR=10    GT:GL:GQ        0/1:-80.23,-37.02,-73.45:100
+20     3859483 .       TCACACACACA     TCA,T   .       PASS    FR=0.5,0.5;HP=1;NF=1,2;NR=1,1;PP=100.0,85.0;SC=TGAGACTCTGTCACACACACA;TC=21;TR=2,3       GT:GL:GQ        1/2:-1.0,-1.0,-1.0:100
+20     3860757 .       AAAAC   A       .       PASS    FR=0.5;HP=4;NF=5;NR=2;PP=100.0;SC=GTCTCTACTAAAAACAAACAA;TC=18;TR=7      GT:GL:GQ        0/1:-108.81,-21.22,-75.5:100
+20     3860858 .       GC      G       .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=5;NR=1;PP=100.0;SC=AACCCAGGAGGCGGAGCTTGT;TC=16;TR=6      GT:GL:GQ        0/1:-84.65,-31.03,-99.29:100
+20     3865910 .       A       AGGC    .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=8;NR=4;PP=100.0;SC=TCTGTCACCCAGGCTCAAGTT;TC=27;TR=12     GT:GL:GQ        0/1:-249.42,-106.14,-180.19:100
+20     3873092 .       TTTTA   T       .       PASS    FR=1.0;HP=5;NF=6;NR=8;PP=100.0;SC=ACTAAATCTTTTTTATTTATT;TC=25;TR=14     GT:GL:GQ        1/1:-225.87,-50.85,-37.99:100
+20     3879882 .       AGT     A       .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=4;NR=4;PP=100.0;SC=GCAGTGATGTAGTGTAGGCTC;TC=17;TR=8      GT:GL:GQ        1/1:-213.63,-128.83,-121.45:61
+20     3882311 .       TTTTG   T       .       PASS    FR=1.0;HP=3;NF=15;NR=11;PP=100.0;SC=AAGTCAGTACTTTTGTTTATT;TC=29;TR=26   GT:GL:GQ        1/1:-341.87,-21.25,-0.46:100
+20     3883619 .       GACACACACACACACAC       G       .       PASS    FR=0.5013;HP=2;NF=4;NR=1;PP=100.0;SC=GATGTGTATAGACACACACAC;TC=14;TR=5   GT:GL:GQ        0/1:-204.43,-28.1,-33.39:25
+20     3885810 .       GACTGCACC       G       .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=4;NR=7;PP=100.0;SC=CATCGCTTGTGACTGCACCAC;TC=19;TR=11     GT:GL:GQ        1/1:-301.58,-43.69,-32.0:95
+20     3899973 .       T       TTGA    .       PASS    FR=1.0;HP=3;NF=18;NR=6;PP=100.0;SC=AGAAAAACCCTTGAACATTCC;TC=30;TR=24    GT:GL:GQ        1/1:-376.13,-29.44,-7.6:100
+20     3900864 .       T       TA      .       PASS    FR=1.0;HP=10;NF=11;NR=11;PP=100.0;SC=AAGTTAACCTTAAAAAAAAAA;TC=30;TR=22  GT:GL:GQ        1/1:-160.94,-53.86,-35.6:100
+20     3929292 .       G       GA      .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=16;NR=6;PP=100.0;SC=TACATACCAGGATAACTGTTG;TC=29;TR=22    GT:GL:GQ        1/1:-330.17,-190.24,-173.09:100
+20     3930806 .       T       TGACTGG .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=7;NR=14;PP=100.0;SC=CCTTGTATAGTGATGAATGTG;TC=26;TR=21    GT:GL:GQ        1/1:-450.24,-61.65,-40.95:100
+20     3945171 .       A       AT      .       PASS    FR=1.0;HP=10;NF=7;NR=12;PP=100.0;SC=TTTTCAAGTAATTTTTTTTTT;TC=29;TR=19   GT:GL:GQ        1/1:-126.38,-32.45,-22.97:79
+20     3956227 .       C       CA      .       PASS    FR=1.0;HP=5;NF=12;NR=13;PP=100.0;SC=ATTGTGTTCTCAAAAAGATAT;TC=28;TR=25   GT:GL:GQ        1/1:-249.31,-33.1,-13.35:100
+20     3965697 .       AACC    A       .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=9;NR=9;PP=100.0;SC=GAACAACAACAACCACAACAA;TC=26;TR=18     GT:GL:GQ        1/1:-461.94,-340.35,-326.48:100
+20     3971557 .       G       GTTCCATGATAACAT .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=12;NR=8;PP=100.0;SC=ATTTGGCACAGTTCCATGATA;TC=27;TR=20    GT:GL:GQ        1/1:-553.38,-41.98,-23.08:100
+20     3990695 .       CACAAACAA       C       .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=6;NR=4;PP=100.0;SC=GAGACCCTGTCACAAACAAAC;TC=23;TR=10     GT:GL:GQ        1/1:-176.37,-39.86,-31.94:65
+20     3995386 .       GCACACA G       .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=1;NR=1;PP=100.0;SC=ACTTGAATGCGCACACACACA;TC=18;TR=2      GT:GL:GQ        1/1:-95.82,-46.66,-41.67:61
+20     4008931 .       C       CTCTT   .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=1;NR=4;PP=100.0;SC=TCTCATCTCTCTGTCTTTCTC;TC=9;TR=5       GT:GL:GQ        1/1:-127.43,-46.42,-40.22:77
+20     4021562 .       C       CGA     .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=8;NR=2;PP=100.0;SC=GAAGAGAAAGCGAGAGAGAGA;TC=21;TR=10     GT:GL:GQ        1/1:-216.37,-85.41,-73.73:98
+20     4025709 .       TGA     T       .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=12;NR=9;PP=100.0;SC=AAATACATAATGAGAGAGAGA;TC=26;TR=21    GT:GL:GQ        1/1:-247.4,-21.57,-4.6:100
+20     4035810 .       T       TGTTTGTATTACA   .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=10;NR=4;PP=100.0;SC=TAGCTGGGCATGGTGGCGGGT;TC=15;TR=14    GT:GL:GQ        1/1:-361.94,-174.62,-163.57:92
+20     4042278 .       A       AT      .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=7;NR=15;PP=100.0;SC=AAACACATAAATCTCTCTCTC;TC=29;TR=22    GT:GL:GQ        1/1:-269.48,-66.17,-47.18:100
+20     4044153 .       C       CA      .       PASS    FR=1.0;HP=6;NF=8;NR=10;PP=100.0;SC=GCCCCAGGGACGGGGGGCTGG;TC=21;TR=18    GT:GL:GQ        1/1:-167.11,-27.75,-13.35:100
+20     4048870 .       AGAGTTATCTTGCCTGAG      A       .       PASS    FR=0.5;HP=4;NF=9;NR=5;PP=100.0;SC=CACGTGCCCCAGAGTTATCTT;TC=24;TR=14     GT:GL:GQ        1/0:-626.63,-331.02,-449.96:74
+20     4050067 .       A       AT      .       PASS    FR=1.0;HP=8;NF=14;NR=11;PP=100.0;SC=TAAGTTTTAAATTTTTTTTGT;TC=36;TR=25   GT:GL:GQ        1/1:-400.71,-316.84,-301.94:100
+20     4052527 .       A       AT      .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=15;NR=9;PP=100.0;SC=CTAAGCATGAAGTGGTCTCAG;TC=27;TR=24    GT:GL:GQ        1/1:-335.51,-240.21,-229.69:88
+20     4057207 .       G       GT      .       PASS    FR=1.0;HP=3;NF=17;NR=11;PP=100.0;SC=TAGATTATTTGGTTTTTTTTT;TC=40;TR=28   GT:GL:GQ        1/1:-398.27,-278.49,-261.61:100
+20     4057861 .       T       TTTCC   .       PASS    FR=1.0;HP=4;NF=8;NR=13;PP=100.0;SC=CTGATGATTTTTATGTTTTCT;TC=33;TR=21    GT:GL:GQ        1/1:-430.04,-131.81,-113.85:100
+20     4058335 .       T       TATTA   .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=14;NR=5;PP=100.0;SC=TTAATATGTTTATTATACATA;TC=19;TR=19    GT:GL:GQ        1/1:-424.99,-369.88,-364.34:69
+20     4060198 .       CTCTT   C       .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=8;NR=6;PP=100.0;SC=TTCTATTGTTCTCTTTGTTTT;TC=37;TR=14     GT:GL:GQ        0/1:-273.47,-128.98,-306.0:100
+20     4060592 .       C       CTTTA   .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=4;NR=8;PP=100.0;SC=ATAATTTTTGCTTTATTTATT;TC=31;TR=12     GT:GL:GQ        0/1:-163.9,-38.86,-129.26:100
+20     4070170 .       GTA     G       .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=3;NR=2;PP=100.0;SC=GTGTGTGTGTGTATATATATA;TC=25;TR=5      GT:GL:GQ        0/1:-276.88,-237.9,-267.79:100
+20     4070252 .       A       ATGTATATATG     .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=3;NR=1;PP=100.0;SC=GTGTGTATATATGTATATATG;TC=16;TR=4      GT:GL:GQ        1/1:-231.61,-30.38,-18.61:81
+20     4070382 .       ATATGTGTGTGTG   A       .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=1;NR=2;PP=100.0;SC=ATGTGTATATATATGTGTGTG;TC=25;TR=3      GT:GL:GQ        1/1:-347.8,-231.66,-223.35:51
+20     4070396 .       GTGTGTGTGTGTGTATATATATATATA     G       .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=4;NR=4;PP=100.0;SC=GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG;TC=18;TR=8      GT:GL:GQ        1/0:-384.34,-235.32,-225.8:62
+20     4071341 .       CA      C       .       PASS    FR=0.5026;HP=9;NF=5;NR=5;PP=100.0;SC=CTGATTATGGCAAAAAAAAAC;TC=20;TR=10  GT:GL:GQ        0/1:-155.5,-119.13,-123.71:22
+20     4071895 .       G       GT      .       PASS    FR=0.5;HP=8;NF=3;NR=3;PP=72.0;SC=TGGGACCTTTGTTTTTGCAAA;TC=22;TR=6       GT:GL:GQ        0/1:-127.95,-100.32,-170.75:100
+20     4074739 .       G       GA      .       PASS    FR=0.5;HP=9;NF=2;NR=4;PP=75.0;SC=ACTACATCTCGAAAAAAAAAG;TC=16;TR=6       GT:GL:GQ        0/1:-104.75,-76.46,-99.49:100
+20     4077346 .       ATATTAT A       .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=2;NR=2;PP=100.0;SC=TATGAGGACAATATTATTATT;TC=23;TR=4      GT:GL:GQ        0/1:-62.56,-10.62,-98.18:100
+20     4092195 .       G       GTCAGCCAGAGAGGCTC       .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=7;NR=5;PP=100.0;SC=AGGTAAGACAGTCAGCCAGAG;TC=21;TR=12     GT:GL:GQ        1/1:-408.88,-45.59,-29.88:100
+20     4092421 .       A       AT      .       PASS    FR=0.5;HP=4;NF=5;NR=6;PP=100.0;SC=CTGGCAGCAGATTTTCCCTTA;TC=31;TR=11     GT:GL:GQ        0/1:-137.54,-52.61,-154.29:100
+20     4095639 .       T       TATAC   .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=3;NR=6;PP=100.0;SC=TATATATATATACACACACAT;TC=30;TR=9      GT:GL:GQ        0/1:-239.61,-67.33,-166.02:100
+20     4096614 .       T       TG      .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=3;NR=8;PP=100.0;SC=TTTGATGGCTTGTGAAGCCCA;TC=42;TR=11     GT:GL:GQ        0/1:-166.13,-48.49,-243.23:100
+20     4099234 .       C       CTCT    .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=2;NR=7;PP=100.0;SC=CTTCTTCTTCCTCTTCTTCCT;TC=17;TR=9      GT:GL:GQ        1/1:-213.81,-121.18,-113.85:91
+20     4106279 .       C       CA      .       PASS    FR=1.0;HP=4;NF=9;NR=14;PP=100.0;SC=ATGATCCACCCCCTTGGCCTC;TC=27;TR=23    GT:GL:GQ        1/1:-261.7,-33.57,-14.72:100
+20     4106498 .       AC      A       .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=4;NR=6;PP=100.0;SC=ACCCGCCACCACGTCAAGCTA;TC=17;TR=10     GT:GL:GQ        0/1:-151.03,-63.2,-86.55:100
+20     4107003 .       T       TCTAA   .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=4;NR=9;PP=100.0;SC=TGGAGGTAACTCTAGGACATA;TC=28;TR=13     GT:GL:GQ        0/1:-216.14,-60.6,-196.15:100
+20     4108348 .       A       AC      .       PASS    FR=1.0;HP=3;NF=9;NR=6;PP=100.0;SC=TTCTATGGAAAAGAGCAGTCA;TC=22;TR=15     GT:GL:GQ        1/1:-263.65,-164.58,-152.76:96
+20     4111438 .       CA      C       .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=13;NR=9;PP=100.0;SC=GGTGATCACACAGGGGCATGG;TC=27;TR=22    GT:GL:GQ        1/1:-393.14,-310.63,-301.96:68
+20     4111530 .       T       TG      .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=13;NR=14;PP=100.0;SC=CATCAAAACTTGCAGAAGTAT;TC=30;TR=27   GT:GL:GQ        1/1:-576.34,-531.28,-526.81:55
+20     4112367 .       TA      T       .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=7;NR=2;PP=100.0;SC=AGACTTTAGTTAATAATAATA;TC=25;TR=9      GT:GL:GQ        0/1:-105.53,-48.17,-185.05:100
+20     4124037 .       TACAC   TAC,T   .       PASS    FR=0.5,0.5;HP=2;NF=0,1;NR=6,6;PP=100.0,100.0;SC=TGTATGTGTATACACACACAC;TC=29;TR=6,7      GT:GL:GQ        1/2:-1.0,-1.0,-1.0:100
+20     4165244 .       C       CAG     .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=9;NR=7;PP=100.0;SC=TAAAACTCAACAGTTATATTT;TC=28;TR=16     GT:GL:GQ        0/1:-164.36,-34.34,-133.84:100
+20     4189405 .       A       AGTGTTCT        .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=8;NR=19;PP=100.0;SC=TGATCACAGAAGTGTTGAATG;TC=31;TR=27    GT:GL:GQ        1/1:-510.65,-52.94,-31.94:100
+20     4193006 .       T       TA      .       PASS    FR=1.0;HP=9;NF=5;NR=11;PP=100.0;SC=TGTGTTTGATTAAAAAAAAAT;TC=25;TR=16    GT:GL:GQ        1/1:-189.06,-113.86,-103.2:89
+20     4204545 .       CAACAGGTTT      C       .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=5;NR=5;PP=100.0;SC=TTTCAATTTACAACAGGTTTA;TC=29;TR=10     GT:GL:GQ        0/1:-264.93,-66.16,-208.86:100
+20     4210072 .       T       TA      .       PASS    FR=0.5;HP=5;NF=7;NR=3;PP=100.0;SC=GGAAGGAAGATGGGGGCGAGT;TC=33;TR=10     GT:GL:GQ        0/1:-169.78,-122.55,-232.56:100
+20     4211685 .       T       TTTTCTTTC       .       PASS    FR=1.0;HP=4;NF=3;NR=1;PP=100.0;SC=CTTTCTTTCTTTTTCTTTCTT;TC=17;TR=4      GT:GL:GQ        1/1:-163.69,-62.85,-59.76:50
+20     4222606 .       TG      T,AG    .       PASS    FR=0.5,0.5;HP=2;NF=14,3;NR=8,0;PP=72.0,7.0;SC=CAGCACAGCCTGATGGCTCTG;TC=29;TR=22,3       GT:GL:GQ        1/2:-1.0,-1.0,-1.0:41
+20     4223993 .       CG      C       .       PASS    FR=1.0;HP=4;NF=10;NR=1;PP=100.0;SC=CTGGGCTCCTCGGGGCATCCG;TC=14;TR=11    GT:GL:GQ        1/1:-180.73,-119.68,-111.91:64
+20     4255571 .       TGAAA   T       .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=5;NR=4;PP=100.0;SC=AGGTATGCTCTGAAAGGAAGA;TC=15;TR=9      GT:GL:GQ        1/1:-155.75,-66.2,-58.38:79
+20     4260218 .       C       CA      .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=1;NR=9;PP=100.0;SC=CTGGTCTCCCCAGCATCTAGT;TC=27;TR=10     GT:GL:GQ        0/1:-138.73,-38.26,-150.01:100
+20     4280077 .       G       GTGA    .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=2;NR=4;PP=100.0;SC=GATGTCTTTGGTGATGATGAT;TC=23;TR=6      GT:GL:GQ        0/1:-118.58,-26.45,-67.22:100
+20     4300671 .       G       GT      .       PASS    FR=1.0;HP=9;NF=9;NR=7;PP=100.0;SC=TATTTTTTAAGTTTTTTTTTC;TC=22;TR=16     GT:GL:GQ        1/1:-112.49,-30.96,-17.5:100
+20     4305010 .       C       CCTGT   .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=9;NR=14;PP=100.0;SC=AGGTTTGGCTCCTGTCTGACA;TC=27;TR=23    GT:GL:GQ        1/1:-478.98,-124.12,-105.32:100
+20     4306264 .       GT      G       .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=7;NR=4;PP=100.0;SC=ACAATATAAGGTTTACTTCAA;TC=24;TR=11     GT:GL:GQ        0/1:-115.0,-27.63,-111.62:100
+20     4310291 .       T       TC      .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=20;NR=9;PP=100.0;SC=CTCCTACGTGTCATGCCAGCT;TC=32;TR=29    GT:GL:GQ        1/1:-333.81,-66.33,-44.4:100
+20     4310977 .       GC      G       .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=14;NR=6;PP=100.0;SC=CCTGAAACTGGCGTAATTTAT;TC=41;TR=20    GT:GL:GQ        0/1:-231.9,-39.91,-159.66:100
+20     4321071 .       A       AG      .       PASS    FR=0.5;HP=5;NF=3;NR=2;PP=100.0;SC=AAGTCAAATCAGGGGGAGGAA;TC=19;TR=5      GT:GL:GQ        0/1:-50.11,-15.88,-71.26:100
+20     4322091 .       CA      C       .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=11;NR=7;PP=100.0;SC=GCCGTGTGTCCAGCCAAAACT;TC=33;TR=18    GT:GL:GQ        0/1:-210.17,-46.06,-156.61:100
+20     4329185 .       TC      T       .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=8;NR=2;PP=100.0;SC=AATTCTAGGTTCTTTCTCTCA;TC=28;TR=10     GT:GL:GQ        0/1:-148.46,-71.81,-182.2:100
+20     4330761 .       GGTGTGTGT       G       .       PASS    FR=1.0;HP=3;NF=1;NR=3;PP=100.0;SC=TAATTCATGGGGTGTGTGTGT;TC=30;TR=4      GT:GL:GQ        1/1:-224.07,-44.24,-35.58:72
+20     4332044 .       TG      T       .       PASS    FR=1.0;HP=6;NF=5;NR=2;PP=57.0;SC=TTTGTTTTTTTGTTTTTTTTT;TC=24;TR=7       GT:GL:GQ        1/1:-226.96,-113.86,-100.61:42
+20     4343821 .       TA      T       .       PASS    FR=0.5;HP=8;NF=5;NR=8;PP=100.0;SC=CATTTTTTTTTAAAATTTTTG;TC=35;TR=13     GT:GL:GQ        1/0:-274.8,-111.87,-90.41:100
+20     4349378 .       A       AT      .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=11;NR=7;PP=100.0;SC=TTTTGAAGGCATTTCCAGGGT;TC=27;TR=18    GT:GL:GQ        0/1:-181.47,-28.52,-69.89:100
+20     4366637 .       AAAAC   A       .       PASS    FR=1.0;HP=3;NF=8;NR=10;PP=100.0;SC=AAAACAAAACAAAACAAACAA;TC=29;TR=18    GT:GL:GQ        1/1:-255.42,-38.69,-23.59:100
+20     4378952 .       A       AAAC    .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=5;NR=8;PP=100.0;SC=CAAAACAAACAAACAACAACA;TC=26;TR=13     GT:GL:GQ        1/1:-242.03,-34.58,-19.38:100
+20     4380979 .       CACAT   C       .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=6;NR=6;PP=100.0;SC=CACACACACACACATACAAGC;TC=29;TR=12     GT:GL:GQ        1/1:-310.99,-41.83,-21.18:100
+20     4381267 .       T       TGTGTATTGTGGA   .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=4;NR=9;PP=100.0;SC=GACAGCCTCCTTCAACAAAAA;TC=23;TR=13     GT:GL:GQ        1/1:-573.3,-462.6,-447.82:96
+20     4381268 .       TC      T       .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=4;NR=9;PP=100.0;SC=ACAGCCTCCTTCAACAAAAAA;TC=27;TR=13     GT:GL:GQ        1/1:-573.3,-567.48,-566.42:96
+20     4384878 .       TAGAC   T       .       PASS    FR=0.5;HP=4;NF=7;NR=6;PP=100.0;SC=ATGGAAGAAATAGACAGAGAG;TC=32;TR=13     GT:GL:GQ        0/1:-215.18,-58.15,-186.03:100
+20     4390996 .       ACT     A       .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=5;NR=4;PP=100.0;SC=AACACTCGAGACTCTCCAGCT;TC=25;TR=9      GT:GL:GQ        0/1:-160.6,-43.63,-115.25:100
+20     4392384 .       T       TTG     .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=2;NR=1;PP=100.0;SC=GGGAATATAGTTGTGTGTGTG;TC=26;TR=3      GT:GL:GQ        0/1:-141.31,-92.22,-156.97:100
+20     4403198 .       CGT     CGTGT,C .       PASS    FR=0.5,0.5;HP=2;NF=3,3;NR=2,0;PP=100.0,91.0;SC=TGTGTGTGTGCGTGTGTGTGT;TC=16;TR=5,3       GT:GL:GQ        1/2:-1.0,-1.0,-1.0:100
+20     4418283 .       TCC     T       .       PASS    FR=1.0;HP=5;NF=9;NR=17;PP=100.0;SC=TGAAAAATGCTCCCCAGGTTT;TC=26;TR=26    GT:GL:GQ        1/1:-235.22,-17.92,0.0:100
+20     4422138 .       A       AAGAGGCAAGGCTTCCCCACATGCTCAGAATGG,G     .       PASS    FR=0.5,0.5;HP=1;NF=2,3;NR=0,5;PP=100.0,87.0;SC=CTACAGAAAGATGATGGAGGT;TC=14;TR=2,8       GT:GL:GQ        1/2:-1.0,-1.0,-1.0:23
+20     4422142 .       T       TG      .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=8;NR=6;PP=100.0;SC=AGAAAGATGATGGAGGTACTA;TC=19;TR=14     GT:GL:GQ        1/1:-319.37,-289.62,-286.77:23
+20     4427312 .       A       AGCTTCTAT       .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=1;NR=1;PP=100.0;SC=TGTATAATAGAGTCCAGAGTC;TC=11;TR=2      GT:GL:GQ        1/0:-513.43,-441.06,-437.62:42
+20     4431651 .       TA      T       .       PASS    FR=0.5;HP=5;NF=9;NR=13;PP=100.0;SC=TCTAGACCCTTAAAAATAACA;TC=34;TR=22    GT:GL:GQ        0/1:-196.04,-30.01,-107.67:100
+20     4438168 .       T       TTACACAAATGTAACCTATGTAACAA      .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=2;NR=3;PP=100.0;SC=CCTGCACATGTACCCTTGAAC;TC=16;TR=5      GT:GL:GQ        0/1:-418.07,-256.53,-367.22:100
+20     4439599 .       GT      G       .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=11;NR=12;PP=100.0;SC=TGTGGGGAGAGTTAGCAAGAG;TC=36;TR=23   GT:GL:GQ        0/1:-329.81,-228.22,-300.4:100
+20     4442338 .       CTTTATTTTATTTTAT        CTTTATTTTAT,C   .       PASS    FR=0.5,0.5;HP=3;NF=2,1;NR=0,3;PP=100.0,100.0;SC=AAGTATCTAACTTTATTTTAT;TC=21;TR=2,4      GT:GL:GQ        1/2:-1.0,-1.0,-1.0:100
+20     4445547 .       T       TAA     .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=18;NR=22;PP=100.0;SC=TGTTTCCAGTTGTTATACTTT;TC=39;TR=40   GT:GL:GQ        1/1:-459.22,-244.89,-221.84:100
+20     4452980 .       TACAC   T       .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=1;NR=2;PP=100.0;SC=TTAATTCTTATACACACACAC;TC=21;TR=3      GT:GL:GQ        1/1:-75.87,-32.41,-30.31:43
+20     4460649 .       G       GA      .       PASS    FR=0.5;HP=9;NF=5;NR=8;PP=100.0;SC=TTTCCTCGGAGAAAAAAAACA;TC=39;TR=13     GT:GL:GQ        0/1:-191.57,-119.31,-159.65:100
+20     4462152 .       GGTCAATGTTATAAACTTTGC   G       .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=6;NR=5;PP=100.0;SC=CTACTTCTTGGGTCAATGTTA;TC=18;TR=11     GT:GL:GQ        1/0:-501.72,-174.1,-171.31:67
+20     4462516 .       T       TTC     .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=16;NR=1;PP=100.0;SC=GGGTTTAAAGTTCTCTAATGA;TC=41;TR=17    GT:GL:GQ        0/1:-181.56,-38.08,-223.18:100
+20     4462799 .       C       CTT     .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=1;NR=1;PP=100.0;SC=TCTTCTTCGTCCTTTTTTTTT;TC=36;TR=2      GT:GL:GQ        0/1:-520.7,-504.74,-499.84:81
+20     4465737 .       TG      T       .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=9;NR=18;PP=100.0;SC=CTCCTTGACATGGACTGAGAA;TC=27;TR=27    GT:GL:GQ        1/1:-258.03,-34.15,-15.14:100
+20     4468340 .       TA      T       .       PASS    FR=0.5;HP=10;NF=5;NR=2;PP=57.0;SC=ATATATATATTAAAAAAAAAA;TC=21;TR=7      GT:GL:GQ        0/1:-41.89,-18.73,-52.45:100
+20     4469569 .       C       CT      .       PASS    FR=0.5;HP=4;NF=3;NR=6;PP=100.0;SC=CAAGTAAAGACTTTTGATTGT;TC=23;TR=9      GT:GL:GQ        0/1:-113.7,-24.95,-84.55:100
+20     4474613 .       GA      G       .       PASS    FR=0.5;HP=8;NF=4;NR=6;PP=100.0;SC=ATTAGGAACAGAAAAAAATTA;TC=37;TR=10     GT:GL:GQ        0/1:-311.99,-245.02,-353.92:100
+20     4474629 .       A       AAAT    .       PASS    FR=0.5;HP=9;NF=11;NR=5;PP=100.0;SC=AATTAAAAAAAAAATATACAC;TC=32;TR=16    GT:GL:GQ        0/1:-322.36,-111.27,-187.62:100
+20     4475883 .       AT      A       .       PASS    FR=0.5;HP=5;NF=1;NR=3;PP=100.0;SC=AAATATATATATTTTAATATA;TC=14;TR=4      GT:GL:GQ        0/1:-74.26,-40.07,-92.44:100
+20     4481373 .       A       AG      .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=5;NR=6;PP=100.0;SC=TCTTTTTTCAAGTTTTTAGCT;TC=13;TR=11     GT:GL:GQ        1/1:-84.43,-9.42,-0.46:74
+20     4484587 .       T       TA      .       PASS    FR=0.5;HP=9;NF=4;NR=9;PP=100.0;SC=TCTCTGATTTTAAAAAAAAAG;TC=46;TR=13     GT:GL:GQ        0/1:-163.36,-92.55,-141.98:100
+20     4487527 .       TG      T       .       PASS    FR=0.5006;HP=5;NF=8;NR=7;PP=100.0;SC=TACTAGGGGCTGGGGGCAGGG;TC=34;TR=15  GT:GL:GQ        0/1:-421.09,-350.88,-356.92:29
+20     4492336 .       C       CA      .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=11;NR=14;PP=100.0;SC=ACATTCTTGCCACCTTTGGTA;TC=27;TR=25   GT:GL:GQ        1/1:-281.59,-90.33,-72.03:100
+20     4493592 .       C       CG      .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=20;NR=17;PP=100.0;SC=GCATTTTGGACATCTCACCCT;TC=39;TR=37   GT:GL:GQ        1/1:-454.89,-182.56,-157.87:100
+20     4497462 .       TTA     T       .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=2;NR=2;PP=88.0;SC=TAAATCAACTTTATATATATA;TC=14;TR=4       GT:GL:GQ        1/0:-149.41,-117.69,-112.45:46
+20     4500613 .       G       GC      .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=12;NR=13;PP=100.0;SC=ATGCCCAAGGGTGTCCCAGAG;TC=29;TR=25   GT:GL:GQ        1/1:-293.02,-49.83,-29.64:100
+20     4502874 .       CT      C       .       PASS    FR=1.0;HP=4;NF=11;NR=7;PP=100.0;SC=TACAGCCCTTCTTGGGAGCCC;TC=24;TR=18    GT:GL:GQ        1/1:-204.97,-36.44,-20.43:100
+20     4512447 .       AAAACAAAC       AAAAC,A .       PASS    FR=0.5,0.5;HP=3;NF=3,4;NR=0,1;PP=100.0,100.0;SC=ACTCCATCTCAAAACAAACAA;TC=20;TR=3,5      GT:GL:GQ        1/2:-1.0,-1.0,-1.0:100
+20     4519983 .       GA      G       .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=7;NR=13;PP=100.0;SC=TCCAAACTAAGACAGGTATTA;TC=36;TR=20    GT:GL:GQ        0/1:-201.76,-27.24,-148.43:100
+20     4524299 .       AGTGTGT A       .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=2;NR=1;PP=100.0;SC=TCTGTGCTTTAGTGTGTGTGT;TC=28;TR=3      GT:GL:GQ        0/1:-144.55,-75.64,-138.78:100
+20     4530940 .       CTT     C       .       PASS    FR=0.5002;HP=6;NF=2;NR=9;PP=80.0;SC=TTCTTTCTTTCTTTCTCTCTC;TC=25;TR=11   GT:GL:GQ        0/1:-323.77,-294.9,-301.87:33
+20     4541935 .       A       AGAG    .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=8;NR=4;PP=100.0;SC=GTGGCAGATTAGAGGAGACAT;TC=32;TR=12     GT:GL:GQ        0/1:-211.5,-48.19,-198.54:100
+20     4547067 .       G       GA      .       PASS    FR=0.5116;HP=10;NF=5;NR=1;PP=100.0;SC=TATAGAGAGAGAAAAAAAAAC;TC=18;TR=6  GT:GL:GQ        0/1:-156.12,-119.31,-122.4:16
+20     4553580 .       GT      G       .       PASS    FR=0.5;HP=10;NF=1;NR=1;PP=71.0;SC=TTTTGTTTTTGTTTTTGTTTT;TC=17;TR=2      GT:GL:GQ        1/0:-197.42,-152.57,-154.01:100
+20     4553925 .       T       TC      .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=7;NR=5;PP=100.0;SC=CGGCCCCTCTTCACTTTTAAG;TC=16;TR=12     GT:GL:GQ        1/1:-135.25,-18.29,-7.82:87
+20     4560578 .       C       CCTTA   .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=11;NR=12;PP=100.0;SC=ATGTTATATACCTTTTAGAGA;TC=32;TR=23   GT:GL:GQ        1/1:-416.23,-42.65,-19.11:100
+20     4566007 .       G       GC      .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=9;NR=3;PP=100.0;SC=AGCTGGGGCTGACTCATCTGA;TC=27;TR=12     GT:GL:GQ        0/1:-150.18,-87.47,-213.89:100
+20     4572622 .       T       TA      .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=5;NR=4;PP=100.0;SC=AAAGGGGTGCTAGGAATTCCA;TC=21;TR=9      GT:GL:GQ        0/1:-105.47,-33.77,-107.56:100
+20     4580659 .       ATTG    A       .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=9;NR=11;PP=100.0;SC=AATAATTTATATTGTTATTAT;TC=41;TR=20    GT:GL:GQ        0/1:-343.69,-136.17,-313.1:100
+20     4580822 .       AAC     A       .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=7;NR=7;PP=100.0;SC=TATCTTACATAACAGTGTATC;TC=27;TR=14     GT:GL:GQ        0/1:-159.59,-31.47,-183.78:100
+20     4589159 .       TAC     T       .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=5;NR=5;PP=100.0;SC=CACACACACGTACACACACAC;TC=25;TR=10     GT:GL:GQ        0/1:-134.67,-33.29,-88.29:100
+20     4590266 .       T       TCTGGCC .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=3;NR=4;PP=100.0;SC=GCTGGCAGCCTCTGGCCCTGG;TC=20;TR=7      GT:GL:GQ        0/1:-180.62,-56.12,-103.3:100
+20     4613873 .       T       TATA    .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=6;NR=2;PP=100.0;SC=CTCTTTCTTTTATAATAATAA;TC=26;TR=8      GT:GL:GQ        0/1:-121.23,-16.51,-65.45:100
+20     4616453 .       G       GAGTAGA .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=5;NR=7;PP=100.0;SC=CACAGAGTAGGGGTTCAATAA;TC=22;TR=12     GT:GL:GQ        0/1:-211.56,-25.38,-113.94:100
+20     4617264 .       G       GAGAA   .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=3;NR=1;PP=100.0;SC=GAAAGCAAGAGAGAAAGAAGA;TC=22;TR=4      GT:GL:GQ        0/1:-126.22,-46.88,-138.67:100
+20     4617272 .       AG      A       .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=1;NR=3;PP=20.0;SC=GAGAGAAAGAAGAGAAGAGAA;TC=22;TR=4       GT:GL:GQ        0/1:-134.04,-119.35,-223.11:66
+20     4617303 .       G       GAGGA   .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=2;NR=3;PP=100.0;SC=GGGAGGGAGAGAGGAAGGAAG;TC=19;TR=5      GT:GL:GQ        0/1:-154.78,-90.63,-135.29:100
+20     4655424 .       G       GA      .       PASS    FR=0.5;HP=8;NF=13;NR=4;PP=100.0;SC=GTTCTTTAGAGAAAAAAAGAT;TC=30;TR=17    GT:GL:GQ        0/1:-186.33,-114.25,-152.75:100
+20     4668235 .       AT      A       .       PASS    FR=0.5;HP=10;NF=12;NR=5;PP=100.0;SC=TAGGAAATAGATTTTTTTTTT;TC=33;TR=17   GT:GL:GQ        0/1:-91.71,-31.87,-60.05:100
+20     4673330 .       C       CTTT    .       PASS    FR=0.5;HP=5;NF=6;NR=8;PP=100.0;SC=TGAAGAAAATCTTTTCTTCCT;TC=24;TR=14     GT:GL:GQ        0/1:-183.35,-23.94,-71.42:100
+20     4684173 .       TG      T       .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=5;NR=1;PP=100.0;SC=CAGGCACAGTTGCTCACGCCT;TC=17;TR=6      GT:GL:GQ        0/1:-81.87,-25.35,-94.89:100
+20     4691383 .       CA      C       .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=14;NR=12;PP=100.0;SC=TGGGGTCATCCAAGCATGGCT;TC=29;TR=26   GT:GL:GQ        1/1:-259.65,-39.57,-19.54:100
+20     4692075 .       C       CA      .       PASS    FR=0.5;HP=9;NF=5;NR=3;PP=95.0;SC=AGTAATTGGACAAAAAAAACA;TC=26;TR=8       GT:GL:GQ        0/1:-67.83,-34.9,-96.78:100
+20     4704696 .       A       ATG     .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=5;NR=3;PP=100.0;SC=ATATGTATATATGTGTGTGTA;TC=30;TR=8      GT:GL:GQ        0/1:-168.25,-105.64,-257.19:100
+20     4706654 .       GTGCCATCA       G       .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=7;NR=4;PP=100.0;SC=TTACAGGTGTGTGCCATCATG;TC=17;TR=11     GT:GL:GQ        1/1:-236.92,-30.58,-21.39:67
+20     4727159 .       C       CATTTTATTTT     .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=2;NR=4;PP=100.0;SC=ATAGCATTTGCATTTTATTTT;TC=27;TR=6      GT:GL:GQ        1/1:-510.26,-402.24,-397.15:63
+20     4735780 .       T       TTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTC,C  .       PASS    FR=0.5,0.5;HP=3;NF=0,5;NR=3,16;PP=100.0,100.0;SC=CCTTTCTTTCTTTTCTTTCTT;TC=27;TR=3,21    GT:GL:GQ        1/2:-1.0,-1.0,-1.0:100
+20     4737530 .       T       TA      .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=11;NR=14;PP=100.0;SC=TTAAATGTATTGAGGCTCATT;TC=26;TR=25   GT:GL:GQ        1/1:-245.38,-21.97,-3.97:100
+20     4737701 .       T       TTGA    .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=12;NR=7;PP=100.0;SC=ACTTTCTGTCTTGACCTGTCT;TC=19;TR=19    GT:GL:GQ        1/1:-227.02,-18.69,-5.52:100
+20     4741155 .       G       GGA     .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=5;NR=11;PP=100.0;SC=AACACACCAGGTGTGTCAAAA;TC=22;TR=16    GT:GL:GQ        1/1:-218.41,-31.08,-15.98:100
+20     4743693 .       G       GTTAA   .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=6;NR=7;PP=100.0;SC=AGCCCAGGAGGTTAAGTCTGC;TC=16;TR=13     GT:GL:GQ        1/1:-225.23,-59.89,-50.88:75
+20     4743774 .       A       AAAATAAAT       .       PASS    FR=1.0;HP=5;NF=4;NR=3;PP=100.0;SC=AAAAGGAGAAAAAATAAATAA;TC=16;TR=7      GT:GL:GQ        1/1:-319.93,-209.77,-203.54:78
+20     4748739 .       A       ACTAT   .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=12;NR=7;PP=100.0;SC=TCTTTCACCAACTATTTTCAC;TC=23;TR=19    GT:GL:GQ        1/1:-501.66,-334.66,-319.16:100
+20     4761877 .       T       TG      .       PASS    FR=0.5;HP=8;NF=1;NR=4;PP=100.0;SC=ACAGATATTTTGGGGGGGGCA;TC=23;TR=5      GT:GL:GQ        0/1:-97.23,-58.4,-90.76:100
+20     4768475 .       A       AAGGGACT        .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=7;NR=8;PP=100.0;SC=CAGGGGTCCAAAGGCACCTTA;TC=23;TR=15     GT:GL:GQ        1/1:-372.13,-36.56,-17.94:100
+20     4783543 .       CATAT   C       .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=1;NR=2;PP=100.0;SC=TATATATATACATATATATAT;TC=23;TR=3      GT:GL:GQ        0/1:-115.71,-29.18,-62.14:100
+20     4794428 .       CGT     C       .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=3;NR=2;PP=100.0;SC=CAGTGTGTGGCGTGTGTGTGT;TC=28;TR=5      GT:GL:GQ        0/1:-119.46,-68.74,-106.78:100
+20     4796034 .       TACC    T       .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=7;NR=5;PP=100.0;SC=TATCTGAGGCTACCACCACCC;TC=27;TR=12     GT:GL:GQ        0/1:-222.6,-98.55,-189.77:100
+20     4802486 .       G       GCC     .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=5;NR=4;PP=100.0;SC=GACTGCCACAGCCTAGGCATC;TC=24;TR=9      GT:GL:GQ        0/1:-135.36,-38.11,-126.44:100
+20     4803072 .       CT      C       .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=1;NR=5;PP=100.0;SC=GTGCACGCAGCTGTTGAGAGG;TC=15;TR=6      GT:GL:GQ        0/1:-82.81,-37.85,-91.55:100
+20     4823348 .       AT      A       .       PASS    FR=1.0;HP=8;NF=17;NR=7;PP=100.0;SC=AATATTTTCCATTTTTTTTGA;TC=32;TR=24    GT:GL:GQ        1/1:-298.64,-180.3,-160.97:100
+20     4850186 .       GAC     G       .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=3;NR=2;PP=49.0;SC=ATCTCCAAATGACACACACAC;TC=34;TR=5       GT:GL:GQ        0/1:-186.75,-165.14,-349.63:96
+20     4880132 .       AGCTCAATGCCTTCTGC       A       .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=3;NR=4;PP=100.0;SC=CAAACGGCGCAGCTCAATGCC;TC=17;TR=7      GT:GL:GQ        1/1:-255.52,-55.88,-53.61:44
+20     4883735 .       G       GGA     .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=13;NR=18;PP=100.0;SC=GGTGAAAAGAGTAATTCTAAA;TC=34;TR=31   GT:GL:GQ        1/1:-361.9,-346.05,-342.67:97
+20     4886527 .       GA      G       .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=5;NR=6;PP=100.0;SC=ACTCTACTGAGAAGAACAGAT;TC=19;TR=11     GT:GL:GQ        0/1:-166.67,-86.72,-123.24:100
+20     4892485 .       AATTT   A       .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=2;NR=7;PP=100.0;SC=TTTATTTATGAATTTATTTAT;TC=34;TR=9      GT:GL:GQ        0/1:-148.07,-23.75,-121.86:100
+20     4922648 .       CTAAACTAACT     C       .       PASS    FR=0.5;HP=5;NF=1;NR=10;PP=100.0;SC=TCTATATTTTCTAAACTAACT;TC=33;TR=11    GT:GL:GQ        0/1:-284.06,-37.14,-228.78:100
+20     4942899 .       C       CA      .       PASS    FR=0.5;HP=7;NF=4;NR=3;PP=100.0;SC=ACCCCCGCCCCAAAAAAACAG;TC=28;TR=7      GT:GL:GQ        0/1:-99.42,-46.78,-95.55:100
+20     4947451 .       G       GTTTGA  .       PASS    FR=0.5;HP=4;NF=4;NR=4;PP=100.0;SC=ACTTTTGATAGTTTTACACAC;TC=18;TR=8      GT:GL:GQ        0/1:-283.81,-185.62,-217.52:100
+20     4947582 .       TG      T       .       PASS    FR=0.5;HP=4;NF=9;NR=4;PP=100.0;SC=GATTACATGATGGGGAGCAGG;TC=22;TR=13     GT:GL:GQ        0/1:-139.84,-55.72,-119.49:100
+20     4947775 .       T       TA      .       PASS    FR=0.5;HP=6;NF=8;NR=4;PP=100.0;SC=GAAATCTAAATAAACACAGGG;TC=24;TR=12     GT:GL:GQ        0/1:-128.76,-21.0,-91.02:100
+20     4949766 .       CTT     C       .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=8;NR=4;PP=100.0;SC=GAGTTTCCCTCTTGTTACCCA;TC=25;TR=12     GT:GL:GQ        0/1:-147.72,-32.95,-112.56:100
+20     4954109 .       G       GGACTT  .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=4;NR=8;PP=100.0;SC=ATGGCTGGAAGGACTTAACTA;TC=30;TR=12     GT:GL:GQ        0/1:-203.74,-23.32,-169.48:100
+20     4965192 .       C       CT      .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=5;NR=3;PP=100.0;SC=GAGCAAGACTCTGTCTCAAAA;TC=26;TR=8      GT:GL:GQ        0/1:-134.47,-59.87,-111.38:100
+20     4969015 .       AG      A       .       PASS    FR=1.0;HP=8;NF=4;NR=5;PP=100.0;SC=TGGGAAACCGAGGGGGGGCCA;TC=12;TR=9      GT:GL:GQ        1/1:-67.79,-12.99,-5.52:61
+20     4970270 .       C       CTTAATAT        .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=4;NR=1;PP=100.0;SC=TGCAGTGAGCCATGATCTTGC;TC=22;TR=5      GT:GL:GQ        0/1:-247.44,-164.56,-281.24:100
+20     4972366 .       TCA     TCACACA,T       .       PASS    FR=0.5,0.5;HP=2;NF=1,0;NR=1,2;PP=100.0,49.0;SC=AGACTCCGTTTCACACACACA;TC=15;TR=2,2       GT:GL:GQ        1/2:-1.0,-1.0,-1.0:97
+20     4979252 .       ATGAGG  A       .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=5;NR=2;PP=100.0;SC=AAATGAATTAATGAGGTGAGG;TC=24;TR=7      GT:GL:GQ        0/1:-146.48,-63.04,-172.38:100
+20     4985646 .       A       AAAAT   .       PASS    FR=0.5;HP=4;NF=2;NR=1;PP=100.0;SC=CTCCGTCTCAAAAATAAATAA;TC=22;TR=3      GT:GL:GQ        0/1:-69.57,-20.73,-73.7:100
+20     4987193 .       T       TTTTA   .       PASS    FR=1.0;HP=3;NF=5;NR=7;PP=100.0;SC=GTAAAAGCCATTTTATTTATT;TC=33;TR=12     GT:GL:GQ        1/1:-198.93,-19.38,-8.29:93
+20     5003823 .       C       CA      .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=2;NR=1;PP=69.0;SC=CTCAGCCTCCCAGTAGCTGGG;TC=5;TR=3        GT:GL:GQ        1/1:-35.46,-12.52,-9.15:55
+20     5006924 .       GTATATATATGTGTA G       .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=3;NR=1;PP=100.0;SC=ATGTATATATGTATATATATG;TC=17;TR=4      GT:GL:GQ        0/1:-102.23,-17.74,-69.04:100
+20     5019857 .       C       CT      .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=5;NR=1;PP=100.0;SC=CACCCCTGCACTCCAGCCTGG;TC=10;TR=6      GT:GL:GQ        1/1:-78.84,-38.79,-34.59:51
+20     5021323 .       T       TC      .       PASS    FR=1.0;HP=10;NF=8;NR=5;PP=100.0;SC=CTTTTTTTTTTTCAATGGCAA;TC=18;TR=13    GT:GL:GQ        1/1:-164.3,-19.64,-6.44:82
+20     5021471 .       G       GA      .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=11;NR=14;PP=100.0;SC=ACATAATGCTGGTTAAAGAGG;TC=33;TR=25   GT:GL:GQ        1/1:-406.51,-306.39,-293.23:100
+20     5033824 .       G       GTATA   .       PASS    FR=1.0;HP=8;NF=6;NR=6;PP=100.0;SC=CCAAAAAAAAGTATATATATA;TC=19;TR=12     GT:GL:GQ        1/1:-293.31,-92.78,-80.65:100
+20     5034013 .       GGCAT   G       .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=8;NR=10;PP=100.0;SC=ATGACAGCCAGGCATGGGGGC;TC=24;TR=18    GT:GL:GQ        1/1:-275.61,-34.13,-17.26:100
+20     5044461 .       A       AAATTTTTAT      .       PASS    FR=1.0;HP=4;NF=13;NR=12;PP=100.0;SC=GTTAACTTGGAAAAATTTCTA;TC=29;TR=25   GT:GL:GQ        1/1:-660.59,-158.53,-137.22:100
+20     5058110 .       G       GGGGGCT .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=6;NR=6;PP=100.0;SC=CAACATTTTGGGAGGTGGGTG;TC=14;TR=12     GT:GL:GQ        1/1:-206.1,-87.92,-82.33:69
+20     5062840 .       AAAG    A       .       PASS    FR=1.0;HP=4;NF=12;NR=4;PP=100.0;SC=AATTTTTTAAAAAGAAGAAGA;TC=21;TR=16    GT:GL:GQ        1/1:-217.23,-55.74,-43.97:99
+20     5079870 .       AAATAAATAAATCAATC       A       .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=4;NR=6;PP=100.0;SC=ATAAATAAATAAATAAATAAA;TC=24;TR=10     GT:GL:GQ        1/0:-419.18,-202.82,-208.38:27
+20     5094493 .       T       TA      .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=7;NR=16;PP=100.0;SC=AAAATGAACTTACTACTGGAC;TC=26;TR=23    GT:GL:GQ        1/1:-300.98,-148.38,-131.87:100
+20     5097837 .       AC      A       .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=15;NR=5;PP=100.0;SC=TAAAGGTTATACGCCTAACTT;TC=25;TR=20    GT:GL:GQ        1/1:-243.65,-32.97,-15.65:100
+20     5100990 .       AAG     A       .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=10;NR=6;PP=100.0;SC=TTGCAGCCTGAAGAGAGTACA;TC=18;TR=16    GT:GL:GQ        1/1:-198.64,-18.46,-5.29:100
+20     5105482 .       C       CATTTTAGG       .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=6;NR=11;PP=100.0;SC=GTTCAGACCACATGTTATCCA;TC=22;TR=17    GT:GL:GQ        1/1:-471.45,-181.5,-164.38:100
+20     5118209 .       A       AT      .       PASS    FR=0.5;HP=8;NF=3;NR=2;PP=100.0;SC=TTTAAGTCTTATTTTTTCAAA;TC=16;TR=5      GT:GL:GQ        0/1:-55.51,-21.15,-68.35:100
+20     5145860 .       A       AC      .       PASS    FR=0.5;HP=5;NF=6;NR=2;PP=100.0;SC=TTTTTTGGAAACCCCCGTATT;TC=29;TR=8      GT:GL:GQ        0/1:-81.29,-28.9,-130.37:100
+20     5150896 .       G       GC      .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=2;NR=5;PP=100.0;SC=ACCTCGCTGTGCCCAGAGGAG;TC=17;TR=7      GT:GL:GQ        0/1:-79.22,-17.13,-53.13:100
+20     5156258 .       CCT     C       .       PASS    FR=0.5093;HP=2;NF=6;NR=6;PP=100.0;SC=ATGGTGAAACCCTGTCTCTAC;TC=16;TR=12  GT:GL:GQ        0/1:-101.9,-26.13,-29.44:17
+20     5156432 .       AAAAC   A       .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=5;NR=3;PP=100.0;SC=ACTCCATCTCAAAACAAACAA;TC=23;TR=8      GT:GL:GQ        0/1:-98.71,-15.69,-97.38:100
+20     5173014 .       C       CA      .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=8;NR=13;PP=100.0;SC=GAAGGGGGGTCTAGGAAGCCG;TC=22;TR=21    GT:GL:GQ        1/1:-250.84,-61.97,-47.15:100
+20     5178081 .       C       CCT     .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=5;NR=6;PP=100.0;SC=AGAGGTCAGCCGTGTCTGCCC;TC=22;TR=11     GT:GL:GQ        0/1:-193.35,-72.27,-102.13:100
+20     5181165 .       C       CA      .       PASS    FR=0.5;HP=8;NF=1;NR=6;PP=91.0;SC=TTAGACACAACAAAAAAGAGA;TC=22;TR=7       GT:GL:GQ        0/1:-61.45,-29.38,-90.08:100
+20     5187401 .       A       AC      .       PASS    FR=0.5;HP=6;NF=4;NR=3;PP=100.0;SC=TTTTCATGTCACCCCCGAGGT;TC=17;TR=7      GT:GL:GQ        0/1:-139.03,-104.99,-121.15:73
+20     5187831 .       G       GAATC   .       PASS    FR=0.5;HP=5;NF=5;NR=3;PP=100.0;SC=TGAAAGGAAAGAAGCATGTTT;TC=22;TR=8      GT:GL:GQ        0/1:-144.73,-26.29,-132.63:100
+20     5192127 .       A       AATT    .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=2;NR=7;PP=100.0;SC=AATGTGTTAAAATTATATAAG;TC=32;TR=9      GT:GL:GQ        0/1:-228.5,-119.37,-283.27:100
+20     5212592 .       TA      T       .       PASS    FR=1.0;HP=9;NF=20;NR=10;PP=100.0;SC=CCTGCCATATTAAAAAAAAAC;TC=39;TR=30   GT:GL:GQ        1/1:-191.03,-64.37,-41.93:100
+20     5223122 .       TA      T       .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=2;NR=4;PP=100.0;SC=GAATAAGACCTAGTATTTGCT;TC=11;TR=6      GT:GL:GQ        0/1:-63.8,-25.4,-69.29:100
+20     5234499 .       AAC     A       .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=1;NR=1;PP=25.0;SC=GTGCCTTCACAACACACACAC;TC=26;TR=2       GT:GL:GQ        0/1:-75.14,-59.09,-216.84:72
+20     5236854 .       A       AATTAT  .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=17;NR=9;PP=100.0;SC=AAAAGACATGAATTATCATTA;TC=29;TR=26    GT:GL:GQ        1/1:-427.74,-26.55,-5.07:100
+20     5240296 .       CT      C       .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=7;NR=6;PP=100.0;SC=AATTGATACACTACAATGGCC;TC=39;TR=13     GT:GL:GQ        0/1:-220.75,-129.27,-297.86:100
+20     5242946 .       A       AC      .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=6;NR=5;PP=100.0;SC=AGCTGGAACCACTGTTGTGGA;TC=22;TR=11     GT:GL:GQ        0/1:-141.29,-37.29,-109.65:100
+20     5246342 .       GC      G       .       PASS    FR=0.5;HP=7;NF=6;NR=8;PP=100.0;SC=AACCGAGACAGCCCCCCCTTT;TC=21;TR=14     GT:GL:GQ        0/1:-107.74,-25.34,-35.96:49
+20     5247531 .       T       TTGCAGTAGAGAAACTCCC     .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=3;NR=5;PP=100.0;SC=TTGCAGGTTATTGCAGTAGAG;TC=31;TR=8      GT:GL:GQ        0/1:-296.8,-101.13,-189.63:100
+20     5251109 .       ACTCTCTCTCTCTCTCTCT     A       .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=3;NR=2;PP=37.0;SC=CATCCAGTGTACTCTCTCTCT;TC=27;TR=5       GT:GL:GQ        0/1:-322.05,-299.54,-356.33:100
+20     5251154 .       G       GTGTA   .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=1;NR=4;PP=100.0;SC=CTCTGTGTGTGTGTATGTGTG;TC=19;TR=5      GT:GL:GQ        0/1:-297.98,-257.24,-280.47:100
+20     5256228 .       GAAAAAC G       .       PASS    FR=0.5;HP=5;NF=8;NR=3;PP=100.0;SC=CAAATGTTTTGAAAAACAAAA;TC=29;TR=11     GT:GL:GQ        0/1:-159.47,-21.9,-134.38:100
+20     5256836 .       CT      C       .       PASS    FR=0.5;HP=10;NF=4;NR=7;PP=58.0;SC=TCTCAACTCACTTTTTTTTTT;TC=23;TR=11     GT:GL:GQ        0/1:-145.3,-121.72,-154.45:100
+20     5260631 .       G       GA      .       PASS    FR=0.5;HP=9;NF=6;NR=2;PP=100.0;SC=TTTAATGAAGGAAAAAAAAAT;TC=25;TR=8      GT:GL:GQ        0/1:-133.97,-86.93,-109.55:100
+20     5261161 .       ACT     A       .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=9;NR=8;PP=100.0;SC=CTTGAATGAAACTTATCTAAC;TC=33;TR=17     GT:GL:GQ        0/1:-246.04,-189.54,-319.81:100
+20     5275657 .       CAAAATAACTATTACAAATAACA C       .       PASS    FR=0.5;HP=6;NF=2;NR=1;PP=100.0;SC=TCAAACATAACAAAATAACTA;TC=27;TR=3      GT:GL:GQ        0/1:-135.83,-52.75,-276.31:100
+20     5277471 .       C       CCTT    .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=11;NR=5;PP=100.0;SC=GTATCCATGTCCTAGGGTACA;TC=27;TR=16    GT:GL:GQ        0/1:-278.16,-87.4,-130.16:100
+20     5278336 .       TA      T       .       PASS    FR=0.5;HP=4;NF=3;NR=6;PP=100.0;SC=TTGAACTCTTTAAAAGTTTGA;TC=24;TR=9      GT:GL:GQ        0/1:-132.29,-83.79,-178.99:100
+20     5280465 .       TTG     T       .       PASS    FR=0.5;HP=4;NF=6;NR=8;PP=100.0;SC=GATGGGGTTTTTGGCCATGTT;TC=30;TR=14     GT:GL:GQ        0/1:-161.14,-49.68,-168.09:100
+20     5280839 .       T       TATA    .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=9;NR=3;PP=100.0;SC=ACCACAAATGTATAATACAAA;TC=30;TR=12     GT:GL:GQ        0/1:-228.47,-89.38,-201.59:100
+20     5285786 .       T       TG      .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=3;NR=2;PP=21.0;SC=GGCTAATCAGTTCACTCTAAG;TC=24;TR=5       GT:GL:GQ        0/1:-80.46,-64.62,-184.45:71
+20     5289619 .       GA      G       .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=9;NR=5;PP=100.0;SC=GAAGATCTAGGATGAAGCTGG;TC=22;TR=14     GT:GL:GQ        0/1:-219.59,-148.82,-190.02:100
+20     5291220 .       TGATCA  T       .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=6;NR=6;PP=100.0;SC=GTTTAGAACCTGATCAGAGAA;TC=27;TR=12     GT:GL:GQ        0/1:-284.71,-179.16,-294.64:100
+20     5291304 .       G       GACTTATGGGGAGCTGGGGTATAAATACCCCAGCTCCCTCCT      .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=1;NR=1;PP=100.0;SC=CCTCATCAATGACCTCCCACC;TC=8;TR=2       GT:GL:GQ        0/1:-488.84,-441.13,-506.41:71
+20     5293792 .       ATG     A       .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=6;NR=12;PP=100.0;SC=TACAATTATTATGTGTCAATT;TC=42;TR=18    GT:GL:GQ        0/1:-201.09,-30.39,-231.82:100
+20     5303337 .       CAGCT   C       .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=7;NR=7;PP=100.0;SC=AAATGTCACACAGCTAGCTGG;TC=32;TR=14     GT:GL:GQ        0/1:-273.85,-111.21,-258.62:100
+20     5313928 .       TA      T       .       PASS    FR=0.5;HP=10;NF=9;NR=8;PP=100.0;SC=ATACAGTTGATAAAAAAAAAC;TC=39;TR=17    GT:GL:GQ        0/1:-100.8,-36.94,-107.23:100
+20     5316589 .       GT      G       .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=7;NR=11;PP=100.0;SC=GAATATCTGGGTAAAATTTAA;TC=22;TR=18    GT:GL:GQ        1/1:-227.4,-66.98,-52.55:100
+20     5320851 .       AT      A       .       PASS    FR=0.5;HP=6;NF=5;NR=10;PP=100.0;SC=ATCTCAATAGATTTTTTAAAA;TC=39;TR=15    GT:GL:GQ        0/1:-177.77,-103.88,-250.39:100
+20     5323468 .       GA      G       .       PASS    FR=0.5;HP=10;NF=2;NR=4;PP=85.0;SC=GGCAACAAAAGAAAAAATAGA;TC=23;TR=6      GT:GL:GQ        0/1:-61.27,-31.53,-121.44:100
+20     5326511 .       G       GT      .       PASS    FR=0.5;HP=9;NF=11;NR=2;PP=100.0;SC=TTGATTCAAAGTTTTTTTTTA;TC=29;TR=13    GT:GL:GQ        0/1:-178.07,-139.61,-153.82:64
+20     5326660 .       T       TA      .       PASS    FR=0.5;HP=8;NF=4;NR=6;PP=100.0;SC=CTTTATCCTTTAAAAAAAATC;TC=26;TR=10     GT:GL:GQ        0/1:-181.43,-128.15,-159.02:100
+20     5328799 .       CA      C       .       PASS    FR=1.0;HP=4;NF=10;NR=6;PP=100.0;SC=AACCACCTTCCAAAATGTGGA;TC=20;TR=16    GT:GL:GQ        1/1:-179.33,-21.23,-7.37:100
+20     5351875 .       T       TACACACAC       .       PASS    FR=0.5;HP=6;NF=1;NR=1;PP=38.0;SC=ATCTTAAAAATACACACACAC;TC=12;TR=2       GT:GL:GQ        0/1:-48.31,-20.86,-63.23:100
+20     5354510 .       G       GGC     .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=5;NR=5;PP=100.0;SC=CCTCCTCCCTGCAGAGCTCCT;TC=28;TR=10     GT:GL:GQ        0/1:-148.18,-38.3,-173.54:100
+20     5373349 .       A       AATTT   .       PASS    FR=0.5;HP=6;NF=1;NR=2;PP=96.0;SC=CTAATTTTTTAATTTTTTTTT;TC=20;TR=3       GT:GL:GQ        0/1:-100.6,-64.12,-96.6:100
+20     5390447 .       C       CA      .       PASS    FR=0.5;HP=6;NF=4;NR=5;PP=100.0;SC=CATTAGCATACAAAAACCATC;TC=26;TR=9      GT:GL:GQ        0/1:-88.65,-28.46,-120.44:100
+20     5408475 .       AAAAC   A       .       PASS    FR=0.5;HP=4;NF=4;NR=5;PP=100.0;SC=CTCTGTCTCAAAAACAAACAA;TC=29;TR=9      GT:GL:GQ        0/1:-128.94,-29.02,-144.52:100
+20     5410361 .       G       GA      .       PASS    FR=1.0;HP=9;NF=6;NR=7;PP=100.0;SC=CTGGGTTGGGGAAAAAAAAAG;TC=25;TR=13     GT:GL:GQ        1/1:-119.78,-34.18,-19.33:100
+20     5419440 .       CTCCCTGTG       C       .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=1;NR=4;PP=100.0;SC=TGTTGTTCCCCTCCCTGTGTC;TC=19;TR=5      GT:GL:GQ        0/1:-128.97,-30.52,-125.82:100
+20     5432204 .       A       AG      .       PASS    FR=0.5;HP=8;NF=2;NR=3;PP=100.0;SC=AAAGAAAGAGAAAAAAAAAGG;TC=19;TR=5      GT:GL:GQ        0/1:-83.51,-76.05,-116.49:100
+20     5432394 .       G       GT      .       PASS    FR=1.0;HP=5;NF=9;NR=14;PP=100.0;SC=TTCCTCAATTGAAAAATCTTA;TC=26;TR=23    GT:GL:GQ        1/1:-328.05,-211.91,-196.14:100
+20     5435136 .       GAGAAAA G       .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=3;NR=6;PP=44.0;SC=AAAAAAAGGGGAGAAAAAGAA;TC=24;TR=9       GT:GL:GQ        0/1:-190.59,-169.15,-271.82:96
+20     5435153 .       A       ATTT    .       PASS    FR=0.5;HP=8;NF=4;NR=10;PP=100.0;SC=AGAAAAAAAAATTTTAATGTT;TC=22;TR=14    GT:GL:GQ        0/1:-325.96,-275.2,-333.88:100
+20     5435908 .       G       GTTAAT  .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=5;NR=2;PP=100.0;SC=ACCAGGCCCAGTTATTTTTTG;TC=16;TR=7      GT:GL:GQ        0/1:-176.12,-112.78,-176.63:100
+20     5443418 .       A       ACAGGGGCAC      .       PASS    FR=0.5;HP=4;NF=3;NR=1;PP=100.0;SC=GCTTTGTCCCACAGCCTGATG;TC=15;TR=4      GT:GL:GQ        0/1:-94.87,-42.4,-160.11:100
+20     5443724 .       C       CT      .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=6;NR=4;PP=38.0;SC=GTTACCTTTCCCCTGAGATGC;TC=20;TR=10      GT:GL:GQ        0/1:-163.73,-143.91,-199.73:89
+20     5452897 .       G       GA      .       PASS    FR=0.5;HP=10;NF=2;NR=2;PP=26.0;SC=TCAGTCAGAAGAAAAAAAATT;TC=15;TR=4      GT:GL:GQ        0/1:-34.37,-17.3,-53.75:77
+20     5460271 .       C       CA      .       PASS    FR=0.5;HP=10;NF=2;NR=2;PP=67.0;SC=ACCCCTGTCTCAAAAAAAAAA;TC=21;TR=4      GT:GL:GQ        0/1:-56.83,-30.33,-56.83:100
+20     5473577 .       A       AGT     .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=2;NR=8;PP=100.0;SC=AACTGAGCAGAGTTCCTTTTT;TC=29;TR=10     GT:GL:GQ        0/1:-165.26,-86.94,-217.65:100
+20     5475853 .       CTTATTTAT       CTTATTTATTTAT,C .       PASS    FR=0.5,0.5;HP=4;NF=1,1;NR=2,2;PP=100.0,100.0;SC=GAAGGCTCTTCTTATTTATTT;TC=18;TR=3,3      GT:GL:GQ        1/2:-1.0,-1.0,-1.0:100
+20     5485434 .       C       CT      .       PASS    FR=0.5001;HP=10;NF=4;NR=1;PP=63.0;SC=TTTTTATCTTCTTTTTTTTCC;TC=9;TR=5    GT:GL:GQ        0/1:-37.99,-12.58,-20.26:36
+20     5518456 .       C       CG      .       PASS    FR=0.5;HP=7;NF=7;NR=6;PP=100.0;SC=GTGACAAATGCGGGGGGTCTT;TC=27;TR=13     GT:GL:GQ        0/1:-115.32,-28.55,-76.08:100
+20     5546352 .       A       AAG     .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=13;NR=12;PP=100.0;SC=AAGTAGTCACAAGCTGTGATT;TC=26;TR=25   GT:GL:GQ        1/1:-322.1,-20.79,0.0:100
+20     5596481 .       TTATG   T       .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=4;NR=4;PP=100.0;SC=TGCTACTGGTTTATGTATGTA;TC=20;TR=8      GT:GL:GQ        1/1:-167.17,-32.77,-22.47:86
+20     5596891 .       ATGTGTGTG       A       .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=3;NR=4;PP=100.0;SC=AATTTGGGGTATGTGTGTGTG;TC=23;TR=7      GT:GL:GQ        1/1:-241.36,-45.12,-34.38:90
+20     5600458 .       A       AG      .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=3;NR=3;PP=100.0;SC=TCTTGACCTGAGTGATACACC;TC=16;TR=6      GT:GL:GQ        1/1:-146.08,-65.05,-55.59:79
+20     5613790 .       GA      G       .       PASS    FR=1.0;HP=4;NF=11;NR=9;PP=100.0;SC=CATGATTTCTGAAAACAAGCT;TC=26;TR=20    GT:GL:GQ        1/1:-222.44,-43.9,-26.57:100
+20     5624959 .       C       CCTCCTTACCCT    .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=1;NR=1;PP=100.0;SC=AACTTGTCCACCTCCATTACC;TC=28;TR=2      GT:GL:GQ        0/1:-225.26,-176.16,-303.27:100
+20     5627592 .       AT      A       .       PASS    FR=0.5;HP=6;NF=4;NR=3;PP=100.0;SC=TCTCAAAAAAATAATAAAGTT;TC=19;TR=7      GT:GL:GQ        0/1:-112.89,-28.55,-78.51:100
+20     5629324 .       T       TTAC    .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=3;NR=3;PP=100.0;SC=ATTATTACTATTATTATTATT;TC=26;TR=6      GT:GL:GQ        1/0:-227.05,-75.82,-72.8:100
+20     5635153 .       TGGAATATGAAAGAG T       .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=7;NR=11;PP=100.0;SC=CAAGCCTGTTTGGAATATGAA;TC=27;TR=18    GT:GL:GQ        1/1:-490.0,-56.65,-38.89:100
+20     5635246 .       T       TTGTGTG,TTGTGTGTG       .       PASS    FR=0.5,0.5;HP=1;NF=2,0;NR=2,3;PP=100.0,100.0;SC=AAAATGAATATTGTGTGTGTG;TC=22;TR=4,3      GT:GL:GQ        1/2:-1.0,-1.0,-1.0:100
+20     5644716 .       GTCTCTCTCTCTC   G       .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=1;NR=6;PP=100.0;SC=ATGAGACCTCGTCTCTCTCTC;TC=22;TR=7      GT:GL:GQ        1/1:-261.18,-61.24,-58.02:52
+20     5654462 .       C       CGTGTGTGTGTGTGT .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=3;NR=1;PP=100.0;SC=TATACATATACGTGTGTGTGT;TC=16;TR=4      GT:GL:GQ        0/1:-129.11,-28.26,-136.2:100
+20     5654661 .       AAAAAAATTTTTTTTGCTT     A       .       PASS    FR=0.5;HP=6;NF=7;NR=3;PP=100.0;SC=ATTTTTTGCCAAAAAAATTTT;TC=21;TR=10     GT:GL:GQ        0/1:-264.68,-158.41,-268.38:100
+20     5655925 .       ACG     A       .       PASS    FR=0.5047;HP=2;NF=4;NR=3;PP=100.0;SC=TTGCATGCGCACGCGCGCACA;TC=34;TR=7   GT:GL:GQ        0/1:-234.34,-106.46,-110.43:20
+20     5674501 .       T       TTTTG   .       PASS    FR=0.5;HP=4;NF=2;NR=2;PP=100.0;SC=AGATTTAGATTTTTGTTTGTT;TC=22;TR=4      GT:GL:GQ        0/1:-64.3,-21.33,-64.69:100
+20     5691054 .       A       AC      .       PASS    FR=0.5;HP=6;NF=4;NR=5;PP=100.0;SC=GTATAGTGAGACCCCCCATCT;TC=18;TR=9      GT:GL:GQ        0/1:-137.75,-89.82,-120.86:100
+20     5696589 .       AAAG    A       .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=3;NR=9;PP=100.0;SC=AGAAAACCATAAAGAAGAGAA;TC=35;TR=12     GT:GL:GQ        0/1:-142.07,-32.31,-238.04:100
+20     5706639 .       T       TA      .       PASS    FR=0.5;HP=9;NF=5;NR=2;PP=98.0;SC=TTGTCTCAATTAAAAAAAAAT;TC=31;TR=7       GT:GL:GQ        0/1:-60.75,-27.2,-75.24:100
+20     5707109 .       A       ATTTTTCCC       .       PASS    FR=0.5;HP=7;NF=2;NR=2;PP=100.0;SC=TGCCCAGCTGATTTTTTTAAA;TC=15;TR=4      GT:GL:GQ        0/1:-95.63,-40.43,-104.52:100
+20     5740635 .       T       TAC,TACAC       .       PASS    FR=0.5,0.5;HP=2;NF=3,1;NR=7,4;PP=100.0,100.0;SC=TGTATTTTTATACACACACAC;TC=23;TR=10,5     GT:GL:GQ        1/2:-1.0,-1.0,-1.0:100
+20     5747768 .       ATTTTC  ATTTTCTTTTC,A   .       PASS    FR=0.5,0.5;HP=4;NF=1,4;NR=1,1;PP=100.0,100.0;SC=CTCCATTCACATTTTCTTTTC;TC=17;TR=2,5      GT:GL:GQ        1/2:-1.0,-1.0,-1.0:100
+20     5754003 .       A       AT      .       PASS    FR=0.5;HP=9;NF=6;NR=4;PP=100.0;SC=AGAGAGTGGAATTTTTTTTTG;TC=33;TR=10     GT:GL:GQ        0/1:-69.42,-30.04,-87.94:100
+20     5762289 .       A       AT      .       PASS    FR=0.5;HP=8;NF=2;NR=3;PP=95.0;SC=CTGCCCAGCTATTTTTTTGTA;TC=13;TR=5       GT:GL:GQ        0/1:-43.82,-10.94,-28.53:79
+20     5767540 .       AGATCATTT       A       .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=5;NR=6;PP=100.0;SC=TTCTCAAGCCAGATCATTTGA;TC=16;TR=11     GT:GL:GQ        1/1:-333.85,-224.08,-215.75:69
+20     5768941 .       AGTT    A       .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=4;NR=9;PP=100.0;SC=TATATTCAGTAGTTGTTGTTT;TC=21;TR=13     GT:GL:GQ        0/1:-159.07,-13.83,-29.97:73
+20     5771896 .       CAAATAAATA      C       .       PASS    FR=1.0;HP=3;NF=11;NR=5;PP=100.0;SC=AAAATCTTAGCAAATAAATAA;TC=26;TR=16    GT:GL:GQ        1/1:-433.86,-58.29,-43.98:62
+20     5778212 .       AAAG    A       .       PASS    FR=1.0;HP=5;NF=6;NR=12;PP=100.0;SC=CCATCTCAAAAAAGAAGAAGA;TC=23;TR=18    GT:GL:GQ        1/1:-251.53,-37.12,-21.87:100
+20     5781503 .       GCGTA   G       .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=9;NR=6;PP=100.0;SC=GTGTGTGTGTGCGTATGTCTA;TC=23;TR=15     GT:GL:GQ        1/1:-450.31,-256.77,-243.2:93
+20     5788895 .       C       CAGCCTGGGTGACAG .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=3;NR=6;PP=100.0;SC=CACTGCACTCCAGCAAGACTC;TC=11;TR=9      GT:GL:GQ        1/1:-304.26,-23.03,-12.43:73
+20     5798352 .       CTGGCATTA       C       .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=1;NR=3;PP=100.0;SC=CTGGCTGTGCCTGGCATTATG;TC=29;TR=4      GT:GL:GQ        1/0:-390.33,-302.72,-305.99:100
+20     5798359 .       T       TGC     .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=6;NR=6;PP=100.0;SC=TGCCTGGCATTATGACTTAGT;TC=26;TR=12     GT:GL:GQ        0/1:-390.33,-366.98,-362.46:100
+20     5807781 .       T       TG      .       PASS    FR=1.0;HP=3;NF=7;NR=3;PP=100.0;SC=TGAGTGGGCGTGGCACCCACA;TC=10;TR=10     GT:GL:GQ        1/1:-98.15,-11.06,-4.14:57
+20     5808542 .       C       CT      .       PASS    FR=1.0;HP=3;NF=16;NR=16;PP=100.0;SC=ATCATTCACTCTTGTGGGTAG;TC=33;TR=32   GT:GL:GQ        1/1:-408.08,-203.57,-182.32:100
+20     5808967 .       T       TGTGTAGTAG      .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=7;NR=18;PP=100.0;SC=CTTAGAACAGTGTGATAGGTC;TC=28;TR=25    GT:GL:GQ        1/1:-678.96,-93.79,-70.92:100
+20     5809144 .       TTGA    T       .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=10;NR=16;PP=100.0;SC=GAGTCATTTCTTGATGACTCC;TC=34;TR=26   GT:GL:GQ        1/1:-408.43,-70.02,-46.73:100
+20     5809747 .       CCTGGGCTCA      C       .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=13;NR=15;PP=100.0;SC=GGTCTCAACTCCTGGGCTCAA;TC=33;TR=28   GT:GL:GQ        1/1:-583.71,-71.8,-56.82:48
+20     5810527 .       G       GA      .       PASS    FR=1.0;HP=9;NF=9;NR=9;PP=100.0;SC=TCTTCTTTAGGAAAAAAAAAC;TC=26;TR=18     GT:GL:GQ        1/1:-296.92,-216.99,-203.12:100
+20     5820132 .       A       AAGATAGAT,AAGATAGATAGAT .       PASS    FR=0.5,0.5;HP=2;NF=4,2;NR=2,6;PP=100.0,100.0;SC=ATTAGATAGAAAGATAGATAG;TC=36;TR=6,8      GT:GL:GQ        1/2:-1.0,-1.0,-1.0:100
+20     5822610 .       A       AAAG    .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=4;NR=6;PP=100.0;SC=GACTATGGAGAAAGAGAACAT;TC=30;TR=10     GT:GL:GQ        0/1:-160.25,-33.5,-176.54:100
+20     5830758 .       C       CAATAATAAT      .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=2;NR=2;PP=100.0;SC=GACCCCGTCTCAATAATAATA;TC=8;TR=4       GT:GL:GQ        1/1:-112.77,-19.78,-14.93:60
+20     5848219 .       C       CAAAAT  .       PASS    FR=1.0;HP=7;NF=10;NR=13;PP=100.0;SC=ATTAAACACTCAAAAAAATAA;TC=29;TR=23   GT:GL:GQ        1/1:-431.75,-125.0,-103.09:100
+20     5848530 .       A       AAT     .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=13;NR=10;PP=100.0;SC=ATATATATAGAATATATATAT;TC=33;TR=23   GT:GL:GQ        1/1:-409.72,-328.74,-317.3:96
+20     5850230 .       A       AT      .       PASS    FR=1.0;HP=6;NF=1;NR=1;PP=100.0;SC=TAATTTTTGCATTTTTTGTTT;TC=22;TR=2      GT:GL:GQ        1/1:-134.01,-105.23,-98.33:86
+20     5854908 .       A       AATTTTATTTT     .       PASS    FR=1.0;HP=3;NF=3;NR=7;PP=100.0;SC=CATATACTTTAATTTTATTTT;TC=28;TR=10     GT:GL:GQ        1/1:-352.01,-27.1,-12.2:100
+20     5856355 .       CTAAA   C       .       PASS    FR=1.0;HP=4;NF=2;NR=2;PP=100.0;SC=GACCCTATTTCTAAATAAATA;TC=15;TR=4      GT:GL:GQ        1/1:-57.0,-6.23,-2.76:42
+20     5860647 .       TGAG    T       .       PASS    FR=1.0;HP=4;NF=8;NR=6;PP=100.0;SC=AGAAAGAAAATGAGGAGCGAA;TC=18;TR=14     GT:GL:GQ        1/1:-182.28,-15.91,-4.13:99
+20     5879792 .       CAA     C       .       PASS    FR=1.0;HP=10;NF=14;NR=15;PP=100.0;SC=ACAATAACATCAAAAAAAAAA;TC=39;TR=29  GT:GL:GQ        1/1:-170.66,-28.34,-5.76:100
+20     5898748 .       GAA     G       .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=5;NR=5;PP=100.0;SC=AGCCAAGATTGAACTCCATTG;TC=13;TR=10     GT:GL:GQ        1/1:-132.95,-97.25,-91.93:66
+20     5900669 .       G       GC      .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=4;NR=2;PP=100.0;SC=CATGACAGATGCATTTCCCTG;TC=15;TR=6      GT:GL:GQ        0/1:-72.42,-12.46,-72.17:100
+20     5911588 .       TCA     T       .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=6;NR=1;PP=100.0;SC=CTGGCAAATCTCACACACACA;TC=19;TR=7      GT:GL:GQ        0/1:-115.11,-26.04,-76.51:100
+20     5923828 .       CAGAGAGAATACATGCTTA     C       .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=3;NR=5;PP=100.0;SC=TGTATTCTTCCAGAGAGAATA;TC=22;TR=8      GT:GL:GQ        0/1:-297.99,-115.43,-361.46:100
+20     5928403 .       T       TA      .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=3;NR=2;PP=100.0;SC=ACCTAGGTGCTTTGAAACACT;TC=18;TR=5      GT:GL:GQ        0/1:-52.7,-18.59,-121.61:100
+20     5930573 .       A       AG      .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=4;NR=4;PP=100.0;SC=ACAGGTGATTAGGGTGTGGAG;TC=26;TR=8      GT:GL:GQ        0/1:-121.38,-46.04,-144.61:100
+20     5932104 .       C       CT      .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=5;NR=6;PP=100.0;SC=TCTTTATTTACTTGTATACTT;TC=20;TR=11     GT:GL:GQ        0/1:-138.34,-48.83,-107.16:100
+20     5934084 .       GGTGT   GGT,G   .       PASS    FR=0.5,0.5;HP=3;NF=1,2;NR=3,2;PP=100.0,100.0;SC=TCTCATGAGGGGTGTGTGTGT;TC=32;TR=4,4      GT:GL:GQ        1/2:-1.0,-1.0,-1.0:100
+20     5938650 .       A       AT      .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=3;NR=6;PP=100.0;SC=TTTTCCTTAAATTTCTTTTTT;TC=36;TR=9      GT:GL:GQ        0/1:-182.01,-137.8,-289.15:100
+20     5939638 .       G       GT      .       PASS    FR=0.5;HP=7;NF=8;NR=7;PP=100.0;SC=ATTAGTGTCTGTTTTTTACCT;TC=37;TR=15     GT:GL:GQ        0/1:-244.24,-166.31,-240.23:100
+20     5946414 .       TTTTACTTCTTAGAGTATGC    T       .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=2;NR=4;PP=100.0;SC=TAAGTGCTGGTTTTACTTCTT;TC=34;TR=6      GT:GL:GQ        0/1:-213.07,-102.23,-466.92:100
+20     5948421 .       CATT    C       .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=6;NR=8;PP=100.0;SC=CTAGTTGAGTCATTGTAGGGA;TC=25;TR=14     GT:GL:GQ        0/1:-180.5,-26.28,-114.93:100
+20     5958367 .       TATA    T       .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=1;NR=12;PP=100.0;SC=TAAATCAGGATATAATAATAC;TC=28;TR=13    GT:GL:GQ        0/1:-168.03,-21.02,-138.69:100
+20     5958971 .       AT      A       .       PASS    FR=0.5;HP=8;NF=7;NR=10;PP=100.0;SC=ATTTGTGATCATTTTTTTTAA;TC=36;TR=17    GT:GL:GQ        0/1:-190.15,-122.85,-187.1:100
+20     5972522 .       TC      T       .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=3;NR=8;PP=100.0;SC=AGTTTTCATCTCTTCAGCTTC;TC=35;TR=11     GT:GL:GQ        0/1:-138.05,-67.95,-261.75:100
+20     5974701 .       T       TTTTG   .       PASS    FR=0.5;HP=6;NF=12;NR=8;PP=100.0;SC=TTAGCTTGATTTTTTTCAGCT;TC=40;TR=20    GT:GL:GQ        0/1:-282.01,-46.13,-199.33:100
+20     5979818 .       CTA     C       .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=4;NR=2;PP=100.0;SC=CACACACACACTATATAGAGT;TC=23;TR=6      GT:GL:GQ        0/1:-148.54,-97.12,-217.3:100
+20     5979861 .       T       TAG     .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=1;NR=6;PP=100.0;SC=GTATATATACTAGTGTGTATA;TC=23;TR=7      GT:GL:GQ        0/1:-206.33,-148.87,-246.11:100
+20     5979921 .       ATATATATTATATATAC       A       .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=2;NR=3;PP=100.0;SC=TCTATAAAGTATATATATTAT;TC=15;TR=5      GT:GL:GQ        0/1:-143.6,-52.22,-114.36:100
+20     5980041 .       CTATA   C       .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=6;NR=4;PP=100.0;SC=TATATATACACTATATATAGT;TC=35;TR=10     GT:GL:GQ        0/1:-130.29,-26.74,-240.87:100
+20     5982833 .       CTT     C       .       PASS    FR=0.5;HP=5;NF=2;NR=5;PP=100.0;SC=GCAATGCACTCTTTTGCTTAC;TC=22;TR=7      GT:GL:GQ        0/1:-154.07,-87.47,-142.2:100
+20     5984269 .       CTT     C       .       PASS    FR=0.5;HP=5;NF=6;NR=7;PP=100.0;SC=AATCCTTTCTCTTTTCACGTT;TC=31;TR=13     GT:GL:GQ        0/1:-161.92,-47.17,-162.99:100
+20     5986173 .       A       ATAATT  .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=9;NR=5;PP=100.0;SC=AAAATTTAAAATAAAAACTAT;TC=31;TR=14     GT:GL:GQ        0/1:-275.95,-89.41,-205.85:100
+20     5997120 .       T       TGTGTGA .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=2;NR=2;PP=100.0;SC=TGTGTGTGTGTGAGTTTTCTT;TC=20;TR=4      GT:GL:GQ        0/1:-128.89,-41.21,-139.69:100
+20     5999929 .       G       GTTA    .       PASS    FR=0.5;HP=5;NF=7;NR=6;PP=100.0;SC=CTTTTGACCAGTTTTTAAGTT;TC=34;TR=13     GT:GL:GQ        0/1:-145.72,-26.46,-192.55:100
+20     6013970 .       C       CG      .       PASS    FR=0.5;HP=4;NF=4;NR=1;PP=100.0;SC=TTAGTAGAGACGGGGTTTCAC;TC=18;TR=5      GT:GL:GQ        0/1:-76.07,-30.4,-70.18:100
+20     6019907 .       TTGTGTGTGTGTGTGTG       T       .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=1;NR=1;PP=100.0;SC=GCAGTTTTGTTTGTGTGTGTG;TC=27;TR=2      GT:GL:GQ        0/1:-146.39,-89.3,-170.65:100
+20     6052252 .       CT      C       .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=5;NR=9;PP=100.0;SC=ATCCCCAGCCCTTCCTGGCTT;TC=21;TR=14     GT:GL:GQ        1/1:-166.42,-15.59,-2.3:100
+20     6054897 .       T       TG      .       PASS    FR=1.0;HP=3;NF=4;NR=7;PP=100.0;SC=TGGGCAAGGCTGGGAAGGAAG;TC=16;TR=11     GT:GL:GQ        1/1:-170.6,-33.42,-22.33:90
+20     6056042 .       T       TA      .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=8;NR=17;PP=100.0;SC=ACATCAAGTATATACGGTACA;TC=29;TR=25    GT:GL:GQ        1/1:-301.61,-48.56,-28.73:100
+20     6163149 .       CATTT   C       .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=11;NR=10;PP=100.0;SC=AACCTCTGAGCATTTATTTCA;TC=24;TR=21   GT:GL:GQ        1/1:-265.47,-16.86,-0.92:100
+20     6169158 .       C       CT      .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=11;NR=21;PP=100.0;SC=AATTGCAAGACCTTAAGAACC;TC=38;TR=32   GT:GL:GQ        1/1:-377.27,-55.22,-28.98:100
+20     6186522 .       G       GC      .       PASS    FR=1.0;HP=6;NF=10;NR=10;PP=100.0;SC=TAAAAAATGTGTTTTTAATCA;TC=21;TR=20   GT:GL:GQ        1/1:-309.42,-177.87,-163.8:100
+20     6186628 .       C       CA      .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=5;NR=12;PP=100.0;SC=TTCATCACCTCAAACATTTAT;TC=33;TR=17    GT:GL:GQ        0/1:-173.72,-30.0,-131.16:100
+20     6189872 .       C       CCTT    .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=1;NR=10;PP=100.0;SC=CTTCCTCCCTCCTTTCCCTCT;TC=26;TR=11    GT:GL:GQ        0/1:-217.8,-111.28,-184.18:100
+20     6190124 .       C       CTT     .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=2;NR=4;PP=92.0;SC=TCCTGCCTCTCTCTTTCCTCC;TC=16;TR=6       GT:GL:GQ        0/1:-129.79,-96.5,-151.55:100
+20     6190921 .       A       AT      .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=5;NR=4;PP=100.0;SC=CCATAAGTACATTAAAAAAAA;TC=24;TR=9      GT:GL:GQ        0/1:-121.19,-85.53,-104.7:86
+20     6202427 .       C       CT      .       PASS    FR=1.0;HP=6;NF=6;NR=13;PP=100.0;SC=GAAATCCTTTCTTTCCCCCTA;TC=20;TR=19    GT:GL:GQ        1/1:-165.74,-14.09,-0.92:100
+20     6211244 .       GT      G       .       PASS    FR=0.5;HP=10;NF=5;NR=6;PP=100.0;SC=TTGATTTCCAGTTTTTTTTTT;TC=33;TR=11    GT:GL:GQ        0/1:-97.67,-63.78,-117.4:100
+20     6217057 .       T       TA      .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=4;NR=7;PP=100.0;SC=TCTCTACAACTAACCATCAAC;TC=33;TR=11     GT:GL:GQ        0/1:-151.16,-56.84,-189.09:100
+20     6227811 .       TTTTTCTTTTC     T       .       PASS    FR=0.5;HP=6;NF=3;NR=2;PP=100.0;SC=TATACTGCTTTTTTTCTTTTC;TC=28;TR=5      GT:GL:GQ        0/1:-171.28,-80.47,-279.48:100
+20     6228139 .       TA      T       .       PASS    FR=0.5;HP=8;NF=6;NR=7;PP=100.0;SC=ACTGGTTGTTTAAAAAAAACA;TC=27;TR=13     GT:GL:GQ        0/1:-101.53,-37.68,-71.46:100
+20     6229361 .       G       GTA     .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=7;NR=5;PP=100.0;SC=TGCTTTTGAAGTATACCTTTA;TC=28;TR=12     GT:GL:GQ        0/1:-168.24,-128.05,-263.48:100
+20     6232719 .       T       TA      .       PASS    FR=1.0;HP=4;NF=10;NR=14;PP=100.0;SC=CGTACCTCAATAAGTACTGTT;TC=26;TR=24   GT:GL:GQ        1/1:-246.13,-19.86,-1.84:100
+20     6235756 .       T       TA      .       PASS    FR=0.5;HP=10;NF=4;NR=2;PP=51.0;SC=ATATAAAAGTTAAAAAAAAAA;TC=22;TR=6      GT:GL:GQ        0/1:-59.89,-37.16,-67.02:100
+20     6242610 .       GCAGACC G       .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=7;NR=3;PP=100.0;SC=ACTGGGAGAGGCAGACCCACC;TC=27;TR=10     GT:GL:GQ        0/1:-180.6,-46.65,-174.85:100
+20     6245977 .       A       AT      .       PASS    FR=0.5;HP=6;NF=7;NR=5;PP=100.0;SC=CTTAGTTTTCATTTTTTAGCA;TC=29;TR=12     GT:GL:GQ        0/1:-149.75,-66.4,-136.45:100
+20     6258987 .       CT      C       .       PASS    FR=0.5;HP=6;NF=4;NR=10;PP=100.0;SC=GTATGTTCTTCTTTTGTCCCC;TC=34;TR=14    GT:GL:GQ        0/1:-185.84,-121.45,-268.81:100
+20     6272029 .       T       TA      .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=4;NR=9;PP=100.0;SC=TAATAGCTGGTAAACCCAACC;TC=39;TR=13     GT:GL:GQ        0/1:-151.49,-56.11,-226.05:100
+20     6293812 .       G       GA      .       PASS    FR=1.0;HP=7;NF=15;NR=12;PP=100.0;SC=GGAAAAGAAAGAAAAGAAAAA;TC=35;TR=27   GT:GL:GQ        1/1:-393.29,-260.24,-242.04:100
+20     6296458 .       T       TA      .       PASS    FR=1.0;HP=8;NF=5;NR=17;PP=100.0;SC=GAAAGCACAATTTTTTTTTCT;TC=39;TR=22    GT:GL:GQ        1/1:-284.36,-128.48,-104.71:100
+20     6304002 .       A       ATG     .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=6;NR=5;PP=100.0;SC=ATATATATATATATGTGTGTG;TC=30;TR=11     GT:GL:GQ        1/1:-328.64,-256.07,-245.8:100
+20     6307745 .       GTA     G       .       PASS    FR=1.0;HP=3;NF=4;NR=7;PP=100.0;SC=TATATATGTTGTATATATATA;TC=16;TR=11     GT:GL:GQ        1/1:-114.94,-15.25,-6.19:75
+20     6307849 .       TATATATATGGTATATATATC   T       .       PASS    FR=0.5034;HP=1;NF=2;NR=2;PP=100.0;SC=ATATATGGTGTATATATATGG;TC=11;TR=4   GT:GL:GQ        0/1:-108.24,-70.67,-74.96:21
+20     6307908 .       TG      T       .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=3;NR=4;PP=100.0;SC=ATATCATATATGGTGTATATA;TC=21;TR=7      GT:GL:GQ        0/1:-127.13,-92.55,-148.07:100
+20     6308166 .       G       GTA,GTATA       .       PASS    FR=0.5,0.5;HP=2;NF=2,1;NR=0,3;PP=86.0,100.0;SC=GTGTGTGTGTGTATATATATA;TC=16;TR=2,4       GT:GL:GQ        1/2:-1.0,-1.0,-1.0:100
+20     6308279 .       G       GTA     .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=5;NR=4;PP=100.0;SC=TATATATGGTGTATATATATA;TC=12;TR=9      GT:GL:GQ        1/1:-129.24,-92.18,-87.75:54
+20     6308322 .       GTGTGTGTATATATATATATATATA       G       .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=1;NR=2;PP=88.0;SC=ATGTATGTGTGTGTGTGTATA;TC=16;TR=3       GT:GL:GQ        1/1:-227.62,-141.11,-132.99:40
+20     6319701 .       G       GGT     .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=1;NR=5;PP=100.0;SC=GAGTCTATGTGGTGTGTGTGT;TC=19;TR=6      GT:GL:GQ        0/1:-99.44,-38.84,-115.36:100
+20     6345189 .       G       GT      .       PASS    FR=0.5;HP=8;NF=8;NR=3;PP=100.0;SC=ATTGTTTTCAGTTTTTTTTCT;TC=31;TR=11     GT:GL:GQ        0/1:-92.31,-34.03,-73.88:100
+20     6346428 .       C       CTCTGTATG       .       PASS    FR=0.5;HP=4;NF=5;NR=1;PP=45.0;SC=TATTCTCTATCTTTAATTTAA;TC=31;TR=6       GT:GL:GQ        0/1:-234.84,-191.03,-405.18:86
+20     6349738 .       TAC     T       .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=2;NR=1;PP=86.0;SC=GACACATACGTACACACACAC;TC=15;TR=3       GT:GL:GQ        0/1:-95.85,-65.71,-99.67:100
+20     6364214 .       ACTCTT  A       .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=5;NR=10;PP=100.0;SC=TCTTTACAAAACTCTTCTAGA;TC=36;TR=15    GT:GL:GQ        0/1:-210.3,-34.68,-236.21:100
+20     6373382 .       TCTACCTAC       T       .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=9;NR=8;PP=100.0;SC=ATTTCCTCTATCTACCTACCT;TC=38;TR=17     GT:GL:GQ        1/1:-510.97,-41.39,-20.72:100
+20     6384835 .       TACACACAC       TAC,T   .       PASS    FR=0.5,0.5;HP=2;NF=2,2;NR=7,1;PP=100.0,51.0;SC=GGATGACACATACACACACAC;TC=32;TR=9,3       GT:GL:GQ        1/2:-1.0,-1.0,-1.0:100
+20     6390974 .       TAA     T       .       PASS    FR=1.0;HP=3;NF=19;NR=16;PP=100.0;SC=CTGCCTACCTTAAACACATAA;TC=42;TR=35   GT:GL:GQ        1/1:-376.88,-34.87,-5.52:100
+20     6401100 .       A       AT      .       PASS    FR=1.0;HP=9;NF=15;NR=9;PP=100.0;SC=TTCAAAAAGCATTTTTTTTTG;TC=34;TR=24    GT:GL:GQ        1/1:-148.27,-28.49,-8.51:100
+20     6406758 .       C       CT      .       PASS    FR=1.0;HP=7;NF=4;NR=16;PP=100.0;SC=TCTCTCCCCTCTTTTTTCTCC;TC=31;TR=20    GT:GL:GQ        1/1:-235.73,-83.65,-66.42:100
+20     6410888 .       CAGGGCTTGGCCCTGGAGT     C       .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=2;NR=4;PP=100.0;SC=TTCTCCACTCCAGGGCTTGGC;TC=24;TR=6      GT:GL:GQ        0/1:-188.53,-25.15,-199.92:100
+20     6426272 .       T       TCTC,TTTC       .       PASS    FR=0.5,0.5;HP=1;NF=11,6;NR=5,5;PP=100.0,100.0;SC=TTAAAAATTATCTCATTTCCT;TC=28;TR=16,11   GT:GL:GQ        1/2:-1.0,-1.0,-1.0:100
+20     6428681 .       CA      C       .       PASS    FR=0.5009;HP=2;NF=4;NR=5;PP=100.0;SC=GGTGGGCCACCAACAGTGTCT;TC=20;TR=9   GT:GL:GQ        0/1:-312.7,-243.18,-248.77:27
+20     6430456 .       A       AT      .       PASS    FR=0.5;HP=10;NF=10;NR=6;PP=100.0;SC=TAATATTTAAATTTTTTTTTT;TC=35;TR=16   GT:GL:GQ        0/1:-143.54,-83.39,-119.6:100
+20     6438083 .       TA      T       .       PASS    FR=0.5;HP=7;NF=2;NR=8;PP=100.0;SC=AACAGATATATAAAAAATGCT;TC=21;TR=10     GT:GL:GQ        0/1:-86.86,-14.54,-78.87:100
+20     6441903 .       C       CT      .       PASS    FR=0.5;HP=9;NF=10;NR=11;PP=100.0;SC=AAATTAAATACTTTTTTTTTA;TC=43;TR=21   GT:GL:GQ        0/1:-221.48,-121.14,-137.31:73
+20     6443155 .       TTA     T       .       PASS    FR=0.5005;HP=5;NF=2;NR=2;PP=100.0;SC=AAACAGTTTTTTATATATATA;TC=14;TR=4   GT:GL:GQ        0/1:-162.1,-119.94,-126.23:30
+20     6443546 .       G       GTA     .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=1;NR=2;PP=100.0;SC=ATATATATGTGTATATATATA;TC=14;TR=3      GT:GL:GQ        0/1:-156.72,-103.24,-116.61:61
+20     6447485 .       C       CA      .       PASS    FR=0.5;HP=3;NF=4;NR=13;PP=100.0;SC=TTTTGAATTTCAAATATTTTC;TC=38;TR=17    GT:GL:GQ        0/1:-255.09,-105.01,-200.26:100
+20     6448179 .       TAATAA  T       .       PASS    FR=0.5;HP=5;NF=3;NR=4;PP=100.0;SC=TATCTCGAAATAATAAAATAA;TC=36;TR=7      GT:GL:GQ        0/1:-185.97,-96.1,-256.82:100
+20     6456952 .       ATT     AT,A    .       PASS    FR=0.5,0.5;HP=10;NF=7,8;NR=4,5;PP=100.0,100.0;SC=CAATGATGTCATTTTTTTTTT;TC=27;TR=11,13   GT:GL:GQ        1/2:-1.0,-1.0,-1.0:100
+20     6458185 .       GA      G       .       PASS    FR=0.5;HP=10;NF=11;NR=4;PP=100.0;SC=AAATAAAAATGAAAAAAAAAA;TC=48;TR=15   GT:GL:GQ        0/1:-255.96,-202.85,-273.91:100
+20     6459292 .       G       GA      .       PASS    FR=0.5;HP=10;NF=2;NR=6;PP=49.0;SC=TATCCTATCAGAAAAAAAAAC;TC=30;TR=8      GT:GL:GQ        0/1:-83.74,-61.52,-111.1:99
+20     6473904 .       TAGGTGAAATTTTCTTTTCTGTTTTTTTAA  T       .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=2;NR=1;PP=100.0;SC=TCCCTAATTCTAGGTGAAATT;TC=25;TR=3      GT:GL:GQ        0/1:-202.85,-99.33,-502.66:100
+20     6481086 .       T       TTGTC   .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=7;NR=5;PP=100.0;SC=TTGTTCCTCTTTGTCAGAGCA;TC=21;TR=12     GT:GL:GQ        1/1:-268.34,-19.84,-4.6:100
+20     6488178 .       CTTG    C       .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=13;NR=13;PP=100.0;SC=AAGCTACTTGCTTGTTGTTGA;TC=32;TR=26   GT:GL:GQ        1/1:-335.98,-26.27,-4.81:100
+20     6520175 .       C       CTT     .       PASS    FR=1.0;HP=3;NF=12;NR=17;PP=100.0;SC=TTACTTAAGACTTTCTATTGA;TC=35;TR=29   GT:GL:GQ        1/1:-362.42,-32.47,-7.59:100
+20     6524976 .       GACTAC  G       .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=12;NR=13;PP=100.0;SC=CTATGAAATTGACTACACTAC;TC=32;TR=25   GT:GL:GQ        1/1:-403.49,-65.81,-45.47:100
+20     6531643 .       GT      G       .       PASS    FR=1.0;HP=4;NF=17;NR=11;PP=100.0;SC=CAGATAAAGTGTTTAATTCAT;TC=31;TR=28   GT:GL:GQ        1/1:-281.56,-58.08,-38.11:100
+20     6544912 .       CAGAT   CAGATAGATAGATAGAT,C     .       PASS    FR=0.5,0.5;HP=1;NF=1,1;NR=4,1;PP=100.0,100.0;SC=TATTCACTGCCAGATAGATAG;TC=24;TR=5,2      GT:GL:GQ        1/2:-1.0,-1.0,-1.0:100
+20     6548435 .       A       AAGAG   .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=5;NR=8;PP=100.0;SC=GAGAAACAGAAAGAGAGAGAG;TC=33;TR=13     GT:GL:GQ        1/1:-316.58,-47.12,-29.98:100
+20     6549783 .       C       CTT     .       PASS    FR=1.0;HP=9;NF=3;NR=10;PP=100.0;SC=TGGTCCAGGCCTTTTTTTTTG;TC=24;TR=13    GT:GL:GQ        1/1:-145.52,-61.65,-53.62:66
+20     6553955 .       TTATA   T       .       PASS    FR=1.0;HP=3;NF=12;NR=6;PP=100.0;SC=ATTTTACATTTTATATATATA;TC=30;TR=18    GT:GL:GQ        1/1:-272.92,-35.6,-20.34:100
+20     6563467 .       CTAGGTAGGTAGG   C       .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=3;NR=6;PP=100.0;SC=ACATGCATTCCTAGGTAGGTA;TC=22;TR=9      GT:GL:GQ        1/1:-367.98,-150.14,-139.95:85
+20     6565618 .       CGTGT   C       .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=4;NR=3;PP=100.0;SC=TGTGTGTGTTCGTGTGTGTGT;TC=19;TR=7      GT:GL:GQ        1/1:-220.73,-126.68,-119.85:85
+20     6565651 .       G       GTA     .       PASS    FR=0.5286;HP=2;NF=3;NR=2;PP=100.0;SC=GTGTATATGTGTATATATATA;TC=16;TR=5   GT:GL:GQ        0/1:-258.66,-193.34,-195.57:12
+20     6585232 .       C       CT      .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=15;NR=16;PP=100.0;SC=ACAAACCCATCTCCTAAAATC;TC=33;TR=31   GT:GL:GQ        1/1:-314.24,-29.76,-6.91:100
+20     6590623 .       C       CCTGCTT .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=17;NR=14;PP=100.0;SC=AGAGTTATCTCCTGCTGTCAT;TC=32;TR=31   GT:GL:GQ        1/1:-527.33,-38.07,-14.51:100
+20     6603635 .       C       CA      .       PASS    FR=1.0;HP=4;NF=12;NR=8;PP=100.0;SC=TTAGTCAAGCCAAAATCACAT;TC=27;TR=20    GT:GL:GQ        1/1:-325.58,-214.53,-199.34:100
+20     6609608 .       CTT     C       .       PASS    FR=1.0;HP=3;NF=10;NR=9;PP=100.0;SC=TGTTTTGATGCTTTCTGGCTT;TC=27;TR=19    GT:GL:GQ        1/1:-576.75,-576.47,-576.51:100
+20     6609611 .       T       TGGAGGAGGA      .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=9;NR=9;PP=100.0;SC=TTTGATGCTTTCTGGCTTGGA;TC=23;TR=18     GT:GL:GQ        1/1:-576.75,-311.9,-294.35:100
+20     6644452 .       C       CTGTAG  .       PASS    FR=1.0;HP=1;NF=14;NR=16;PP=100.0;SC=ATAAAAGGCACTGTAGCATAG;TC=35;TR=30   GT:GL:GQ        1/1:-563.91,-35.77,-9.44:100
+20     6647434 .       A       ATC     .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=4;NR=14;PP=100.0;SC=GGATACTGAGATTCTAAGTAG;TC=21;TR=18    GT:GL:GQ        1/1:-241.28,-23.07,-7.83:100
+20     6655343 .       T       TG      .       PASS    FR=1.0;HP=6;NF=6;NR=9;PP=100.0;SC=AGTCTAAAGATTTTTTTCTGG;TC=18;TR=15     GT:GL:GQ        1/1:-141.83,-27.31,-14.91:95
+20     6655876 .       GTATATA GTA,G   .       PASS    FR=0.5,0.5;HP=1;NF=8,2;NR=11,1;PP=100.0,58.0;SC=TACATATATAGTATATATATA;TC=31;TR=19,3     GT:GL:GQ        1/2:-1.0,-1.0,-1.0:100
+20     6664331 .       C       CTG     .       PASS    FR=1.0;HP=5;NF=5;NR=10;PP=100.0;SC=GGTTTAAAAACTGTGTGTGTG;TC=30;TR=15    GT:GL:GQ        1/1:-232.49,-35.13,-29.16:74
+20     6668238 .       CT      C       .       PASS    FR=1.0;HP=10;NF=7;NR=15;PP=100.0;SC=ACTGGAGAAACTTTTTTTTTT;TC=30;TR=22   GT:GL:GQ        1/1:-332.94,-279.88,-269.29:89
+20     6677392 .       CTGTGTG C       .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=1;NR=6;PP=100.0;SC=GTGTGTGGCCCTGTGTGTGTG;TC=24;TR=7      GT:GL:GQ        0/1:-156.67,-56.12,-128.5:100
+20     6687137 .       CAT     C       .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=12;NR=13;PP=100.0;SC=ATAAGATCCACATGAGACAAT;TC=26;TR=25   GT:GL:GQ        1/1:-279.85,-22.16,-4.14:100
+20     6690400 .       T       TG      .       PASS    FR=1.0;HP=2;NF=22;NR=8;PP=100.0;SC=TTAATACATTTGTATGCCCTG;TC=31;TR=30    GT:GL:GQ        1/1:-315.1,-40.57,-19.1:100
+20     6694813 .       GAA     G       .       PASS    FR=1.0;HP=6;NF=5;NR=4;PP=100.0;SC=AAGAAAGAAAGAAAGAGAAAG;TC=13;TR=9      GT:GL:GQ        1/1:-119.78,-18.28,-9.43:64
+20     6717401 .       G       GA      .       PASS    FR=1.0;HP=10;NF=14;NR=6;PP=100.0;SC=CTCTCTTAAGGAAAAAAAAAA;TC=27;TR=20   GT:GL:GQ        1/1:-134.21,-33.86,-20.0:100
+20     6723994 .       A       AAC     .       PASS    FR=1.0;HP=4;NF=10;NR=3;PP=100.0;SC=CACATACAAAAACACACACAC;TC=23;TR=13    GT:GL:GQ        1/1:-174.48,-22.71,-13.76:74
+20     6746236 .       C       CTTAT   .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=2;NR=4;PP=100.0;SC=CTGGAGACTACTTATTTATTT;TC=23;TR=6      GT:GL:GQ        0/1:-115.46,-26.87,-109.86:100
+20     6759758 .       A       AAT     .       PASS    FR=0.5;HP=2;NF=2;NR=3;PP=100.0;SC=TAAATACATAAATATATATAT;TC=21;TR=5      GT:GL:GQ        0/1:-98.2,-23.97,-51.3:100
+20     6765134 .       A       AACAC   .       PASS    FR=0.5;HP=1;NF=2;NR=5;PP=100.0;SC=TTGAGAATCTAACACACACAC;TC=25;TR=7      GT:GL:GQ        0/1:-145.56,-56.64,-151.12:100
diff --git a/tests/tabix_data/vcf/6.vcf b/tests/tabix_data/vcf/6.vcf
new file mode 100644 (file)
index 0000000..fa039b1
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,278 @@
+##fileformat=VCFv4.1
+##INFO=<ID=CallsetAC,Number=.,Type=Integer,Description="">
+##INFO=<ID=CallsetAC2,Number=.,Type=Integer,Description="">
+##INFO=<ID=HW_VIOLATION,Number=0,Type=Flag,Description="Genotypes violate Hardy-Weinberg">
+##INFO=<ID=SEQUENCING.AC,Number=1,Type=Integer,Description="Allele count from sequencing-based genotypes over all samples">
+##INFO=<ID=SEQUENOM.AC,Number=1,Type=Integer,Description="Allele count from Sequenom genotyping">
+##INFO=<ID=Groups,Number=.,Type=String,Description="Center that called this variant">
+##INFO=<ID=HR,Number=1,Type=Integer,Description="Homopolymer run length">
+##INFO=<ID=TR,Number=1,Type=Integer,Description="Tandem repeat run length (bp)">
+##INFO=<ID=TU,Number=1,Type=String,Description="tandem repeat run unit (stranded)">
+##INFO=<ID=HU,Number=1,Type=String,Description="Homopolymer run unit (stranded)">
+##INFO=<ID=IH,Number=1,Type=Character,Description="Indel hotspot: estimated local rate exceeds SNP rate">
+##INFO=<ID=Set,Number=1,Type=String,Description="Set from which this site was chosen for validation">
+##FILTER=<ID=AMBIGUOUS_SEQUENOM_CALLS,Description="Possible Sequenom miscalls based on manual review of cluster plots">
+##FILTER=<ID=INCORRECT_SEQUENOM_CALLS,Description="Clear Sequenom miscalls based on manual review of cluster plots">
+##FILTER=<ID=TOO_MANY_ALT_ALLELES,Description="Extremely high value (many times more or greater than 700) for SEQUENOM.AC given the SEQUENCING.AC">
+##fileDate=20110531
+##reference=ftp://ftp.1000genomes.ebi.ac.uk/vol1/ftp/technical/reference/human_g1k_v37.fasta.gz
+##source=EricBanksValidationQC;fromGertonLunterValidationSelection
+#CHROM POS     ID      REF     ALT     QUAL    FILTER  INFO    FORMAT  HG00127 HG00128 HG00136 HG00137 HG00138 HG00139 HG00152 HG00156 HG00234 HG00235 HG00237 HG00242 HG00244 HG00262 HG01055 HG01079 NA19138 NA18974 NA18523 NA12717 NA19209 NA18577 NA18973 NA18943 NA12873 NA18623 NA18622 NA18948 NA19171 NA19204 NA06994 NA18563 NA18547 NA18861 NA18608 NA18995 NA10851 NA18976 NA18603 NA19200 HG01204 HG01191 HG01101 HG00146 HG00306 NA18985 HG00160 HG00635 HG00372 HG00357 HG00634 NA18541 NA18950 NA19759 HG00351 HG00257 HG00118 HG00336 HG00448 HG01354 NA18609 HG00428 HG00326 NA11894 NA18956 HG00173 HG00117 NA11893 HG01251 HG01441 HG01437 HG00182 HG00330 HG01060 HG00329 NA18960 NA18856 NA07346 NA18871 NA19057 NA18868 NA18636 NA12830 NA19007 NA18910 NA18874 NA19056 NA19064 NA19066 NA18487 NA18642 NA19236 NA07056 NA18637 NA19235 NA19309 NA19311 NA19334 NA19346 NA19347 NA19372 NA19376 NA19383 NA19384 NA19394 NA19428 NA19430 NA19451 NA19466 NA19313 NA19321 NA19324 NA19332 NA19390 NA19436 NA19439 NA19440 NA19463 NA19470 NA19471 NA19472 NA19676 NA19660 NA19661 NA19663 NA19722 NA19725 NA19728 NA19729 NA19731 NA19749 NA19755 NA19756 NA19758 NA19770 NA19773 NA19777 NA19780 NA19783 NA20525 NA20589 NA20765 NA20802 NA20804 NA18544 NA18602 NA18546 NA18610 NA18957 NA18615 NA18616 NA19010 NA18638 NA18639 NA18627 NA19072 NA18630 NA19074 NA19080 NA19081 NA19083 NA19085 NA19088 NA20287 NA19835 NA20276 NA19818 NA20278 NA20282 NA20342 NA20296 NA20314 NA20346 NA19712 NA19198 NA19108 NA18934 NA18916 NA18907 NA18917 NA06989 NA12058 NA12341 NA12546 NA12489 HG01197 NA18983 NA11843 NA11892 NA12749 NA12282 NA12751 NA18959 NA19331 NA19453 NA20537 NA12046 NA20515 NA20516 NA20521 NA20524 NA20528 NA20759 NA20768 NA20769 NA20774 NA20775 NA20783 NA20787 NA20790 NA20800 NA20819 NA20812 NA20505 NA20530 NA20540 NA20538 NA20581 NA20815 NA20544 NA20810 NA20807 NA20816 NA20504 NA20753 NA20502 NA12342 NA19150 NA19468 NA20336 NA19395 NA19257 NA19360 NA19700 NA18867 NA20317 NA18968 NA19107 HG00111 HG00108 NA19077 NA19684 NA18511 NA12044 NA19382 NA19457 NA18933 NA18923 NA18965 HG00141 NA20341 NA18740 HG00537 HG00346 HG01173 HG00702 HG00313 HG00150 NA18612 HG00339 NA12273 HG00250 NA18593 NA18621 HG00478 HG00251 HG01070 NA19160 HG00479 HG00608 NA18573 HG00375 NA19248 NA19093 HG01170 HG00534 HG01171 HG01522 NA18624 HG00683 HG01521 NA19005 NA20412 NA18971 HG00446 NA12748 HG00530 HG00690 HG01356 HG01516 NA20532 HG00344 HG00328 NA18542 HG00254 HG00321 HG00577 HG00656 HG00342 HG00524 HG00650 HG00557 HG00319 HG00457 HG00125 HG00578 HG00543 HG00638 HG00171 HG00699 HG00595 HG00187 HG00704 HG00533 HG00596 HG00268 HG01083 HG00651 HG01133 HG00671 HG00327 HG01148 HG00246 HG00672 HG00556 HG00436 HG00554 NA18633 NA20344 NA11993 NA07037 NA11930 HG01366 HG01389 HG00620 NA19740 HG00190 HG00419 NA18535 HG01495 NA18592 HG01497 HG00174 HG01140 NA12287 HG00689 HG01550 HG00334 HG01375 HG00637 NA18507 HG01113 NA18550 NA19129 HG01551 HG01462 HG00331 NA12413 HG01456 HG01360 HG00708 HG01350 HG00684 NA19099 HG00284 NA12399 NA12286 NA12777 HG00277 HG00266 NA19985 HG00353 HG01102 NA07347 NA07051 NA19900 NA18984 NA07048 HG00640 HG01066 NA12812 HG01174 HG01188
+20     669442  .       TG      T       99      PASS    SEQUENCING.AC=101;CallSetAC=116,128,155,72,71;CallSetAC2=2,2,2,2,2;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=7;HU=G;IH=1;TR=7;TU=G;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=54 GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     676148  .       A       AC      99      PASS    SEQUENCING.AC=3;CallSetAC=0,0,3,0,0;CallSetAC2=0,0,1,0,0;Groups=DINDEL;HR=3;HU=A;IH=0;TR=6;TU=AAG;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=0      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     719486  .       C       CT      99      PASS    SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,0,2,1,2;CallSetAC2=0,0,1,1,1;Groups=DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=C;IH=0;TR=2;TU=C;Set=OX;SEQUENOM.AC=1        GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     890696  .       C       CAT     99      PASS    SEQUENCING.AC=6;CallSetAC=8,7,0,6,9;CallSetAC2=1,2,0,2,2;Groups=BC,BI,OX,SAMTOOLS;HR=3;HU=C;IH=0;TR=3;TU=C;Set=OX;SEQUENOM.AC=6 GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     1102516 .       CT      C       99      PASS    SEQUENCING.AC=6;CallSetAC=0,7,11,4,7;CallSetAC2=0,0,2,0,0;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=3;HU=T;IH=0;TR=3;TU=T;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=3      GT      0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     1149576 .       CT      C       99      PASS    SEQUENCING.AC=2;CallSetAC=0,3,2,2,0;CallSetAC2=0,1,1,1,0;Groups=BI,DINDEL,OX;HR=5;HU=T;IH=0;TR=5;TU=T;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=2  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     1195706 .       AAG     A       99      PASS    SEQUENCING.AC=273;CallSetAC=0,569,0,0,4;CallSetAC2=0,8,0,0,0;Groups=BI,SAMTOOLS;HR=3;HU=A;IH=0;TR=7;TU=AAG;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=334 GT      0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     .       0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1
+20     1342549 .       A       AAGAT   99      PASS    SEQUENCING.AC=7;CallSetAC=8,6,12,8,7;CallSetAC2=0,0,2,0,0;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=A;IH=0;TR=2;TU=A;Set=OX;SEQUENOM.AC=0 GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     1366475 .       CT      C       99      PASS    SEQUENCING.AC=12;CallSetAC=0,0,12,0,0;CallSetAC2=0,0,1,0,0;Groups=DINDEL;HR=2;HU=T;IH=0;TR=2;TU=T;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=0      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     1550416 .       C       CT      99      PASS    SEQUENCING.AC=28;CallSetAC=32,0,0,0,0;CallSetAC2=1,0,0,0,0;Groups=BC;HR=2;HU=T;IH=0;TR=2;TU=T;Set=BC;SEQUENOM.AC=0      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     1655540 .       AT      A       99      PASS    SEQUENCING.AC=4;CallSetAC=7,5,4,4,4;CallSetAC2=1,1,1,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=3;HU=A;IH=0;TR=3;TU=A;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=4      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     2889034 .       AAAAT   A       99      PASS    SEQUENCING.AC=8;CallSetAC=10,9,10,7,8;CallSetAC2=1,1,1,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=5;HU=A;IH=0;TR=5;TU=A;Set=BC;SEQUENOM.AC=6        GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     3203741 .       CT      C       99      PASS    SEQUENCING.AC=5;CallSetAC=12,5,9,6,6;CallSetAC2=2,1,0,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=7;HU=C;IH=1;TR=7;TU=C;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=4   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     3700705 .       CTTTGGG C       99      PASS    SEQUENCING.AC=3;CallSetAC=4,0,0,0,0;CallSetAC2=1,0,0,0,0;Groups=BC;HR=3;HU=T;IH=0;TR=7;TU=CTT;Set=BC;SEQUENOM.AC=0      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     4037626 .       TC      T       99      TOO_MANY_ALT_ALLELES    SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=2,0,0,0,0;CallSetAC2=1,0,0,0,0;Groups=BC;HR=3;HU=C;IH=0;TR=3;TU=C;Set=BC;SEQUENOM.AC=194      GT      0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     .       0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0
+20     4210074 .       G       GA      99      PASS    SEQUENCING.AC=1124;CallSetAC=159,1498,819,1501,0;CallSetAC2=0,11,5,8,0;Groups=BC,BI,DINDEL,OX;HR=5;HU=G;IH=0;TR=5;TU=G;Set=BC;SEQUENOM.AC=565   GT      1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     .       1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     .       1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1
+20     4363519 .       CATT    C       99      PASS    SEQUENCING.AC=15;CallSetAC=18,20,15,14,16;CallSetAC2=0,1,0,0,0;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=A;IH=0;TR=1;TU=A;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=7      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     4366806 .       CAAAT   C       99      PASS    SEQUENCING.AC=2;CallSetAC=0,1,44,1,4;CallSetAC2=0,0,1,0,0;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=3;HU=A;IH=0;TR=3;TU=A;Set=BI;SEQUENOM.AC=2    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     4641550 .       CCTTGA  C       99      PASS    SEQUENCING.AC=3;CallSetAC=0,0,13,4,3;CallSetAC2=0,0,2,1,1;Groups=DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=C;IH=0;TR=2;TU=C;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=3 GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     5105482 .       C       CATTTTAGG       99      PASS    SEQUENCING.AC=150;CallSetAC=165,256,230,156,127;CallSetAC2=1,1,1,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=A;IH=0;TR=4;TU=AC;Set=OX;SEQUENOM.AC=101   GT      0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     5289619 .       GA      G       99      PASS    SEQUENCING.AC=968;CallSetAC=1106,1033,956,1020,1090;CallSetAC2=9,10,9,9,9;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=G;IH=0;TR=2;TU=G;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=377   GT      0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     .       0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0
+20     5416109 .       CA      C       99      PASS    SEQUENCING.AC=5;CallSetAC=0,7,6,5,6;CallSetAC2=0,1,1,1,1;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=3;HU=A;IH=0;TR=3;TU=A;Set=BI;SEQUENOM.AC=2     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     5432262 .       AGT     A       99      PASS    SEQUENCING.AC=8;CallSetAC=9,10,9,8,9;CallSetAC2=1,1,2,0,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=G;IH=0;TR=7;TU=GT;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=4    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     5724449 .       T       TC      99      PASS    SEQUENCING.AC=15;CallSetAC=0,0,15,0,0;CallSetAC2=0,0,1,0,0;Groups=DINDEL;HR=4;HU=T;IH=0;TR=4;TU=T;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=0      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     6877907 .       CA      C       99      PASS    SEQUENCING.AC=2;CallSetAC=0,2,3,2,4;CallSetAC2=0,1,2,1,1;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=A;IH=0;TR=2;TU=A;Set=OX;SEQUENOM.AC=2     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     6969412 .       CAAAGAAT        C       99      PASS    SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,0,4,1,1;CallSetAC2=0,0,1,0,0;Groups=DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=3;HU=A;IH=0;TR=3;TU=A;Set=OX;SEQUENOM.AC=2        GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     7229260 .       T       TA      99      PASS    SEQUENCING.AC=4;CallSetAC=0,3,0,5,5;CallSetAC2=0,1,0,1,1;Groups=BI,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=A;IH=0;TR=1;TU=A;Set=BI;SEQUENOM.AC=2    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     7239075 .       AG      A       99      PASS    SEQUENCING.AC=6;CallSetAC=0,6,8,7,6;CallSetAC2=0,1,1,1,1;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=3;HU=G;IH=0;TR=3;TU=G;Set=OX;SEQUENOM.AC=5     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     7942727 .       A       AC      99      PASS    SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,0,0,0,1;CallSetAC2=0,0,0,0,1;Groups=SAMTOOLS;HR=2;HU=C;IH=0;TR=2;TU=C;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=0    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     7950562 .       C       CT      99      PASS    SEQUENCING.AC=5;CallSetAC=0,6,7,4,5;CallSetAC2=0,1,2,0,1;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=T;IH=0;TR=4;TU=AC;Set=BI;SEQUENOM.AC=4    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     8195466 .       C       CT      99      PASS    SEQUENCING.AC=6;CallSetAC=14,3,9,6,7;CallSetAC2=1,0,0,0,0;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=6;HU=T;IH=1;TR=6;TU=T;Set=OX;SEQUENOM.AC=1 GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     8233352 .       TACTC   T       99      PASS    SEQUENCING.AC=146;CallSetAC=167,156,155,119,140;CallSetAC2=1,1,0,0,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=T;IH=0;TR=2;TU=T;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=56       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     8504000 .       TAG     T       99      PASS    SEQUENCING.AC=11;CallSetAC=16,10,39,10,13;CallSetAC2=1,1,0,0,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=T;IH=0;TR=4;TU=AG;Set=BI;SEQUENOM.AC=5   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     9231138 .       AT      A       99      PASS    SEQUENCING.AC=11;CallSetAC=0,0,11,0,0;CallSetAC2=0,0,1,0,0;Groups=DINDEL;HR=4;HU=T;IH=0;TR=7;TU=AT;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=0     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     9921724 .       AAAGT   A       99      PASS    SEQUENCING.AC=10;CallSetAC=12,15,22,11,12;CallSetAC2=0,1,0,0,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=3;HU=A;IH=0;TR=3;TU=A;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=11       GT      0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     9925738 .       T       TG      99      PASS    SEQUENCING.AC=2;CallSetAC=3,3,3,3,3;CallSetAC2=1,1,1,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=T;IH=0;TR=2;TU=T;Set=OX;SEQUENOM.AC=1  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     10090376        .       T       TG      99      PASS    SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,0,0,0,2;CallSetAC2=0,0,0,0,1;Groups=SAMTOOLS;HR=3;HU=T;IH=0;TR=3;TU=T;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=0    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     11229169        .       T       TA      99      PASS    SEQUENCING.AC=4;CallSetAC=0,5,0,4,0;CallSetAC2=0,1,0,1,0;Groups=BI,OX;HR=6;HU=A;IH=1;TR=6;TU=A;Set=OX;SEQUENOM.AC=3     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     11511920        .       AC      A       99      PASS    SEQUENCING.AC=3;CallSetAC=0,4,4,4,3;CallSetAC2=0,1,1,1,1;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=3;HU=C;IH=0;TR=3;TU=C;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=2       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     11893900        .       ATTAG   A       99      PASS    SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,0,4,1,1;CallSetAC2=0,0,2,0,0;Groups=DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=T;IH=0;TR=7;TU=ATT;Set=OX;SEQUENOM.AC=1      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     12021825        .       A       AG      99      PASS    SEQUENCING.AC=11;CallSetAC=14,10,15,11,13;CallSetAC2=1,0,0,0,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=G;IH=0;TR=1;TU=G;Set=BI;SEQUENOM.AC=5    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     12063752        .       CTT     C       99      PASS    SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,0,5,2,2;CallSetAC2=0,0,1,1,1;Groups=DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=T;IH=0;TR=6;TU=CT;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=1   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     12094344        .       TCAGGAGGC       T       99      PASS    SEQUENCING.AC=29;CallSetAC=37,59,27,15,33;CallSetAC2=1,2,1,1,2;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=3;HU=T;IH=0;TR=3;TU=T;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=0      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     12114989        .       CTA     C       99      PASS    SEQUENCING.AC=3;CallSetAC=0,4,4,3,4;CallSetAC2=0,1,1,1,1;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=T;IH=0;TR=1;TU=T;Set=BI;SEQUENOM.AC=4     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     12371546        .       GACA    G       99      PASS    SEQUENCING.AC=20;CallSetAC=27,23,20,17,22;CallSetAC2=1,1,1,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=A;IH=0;TR=7;TU=AAC;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=10   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     12512723        .       G       GTT     99      PASS    SEQUENCING.AC=13;CallSetAC=15,16,27,14,13;CallSetAC2=1,1,1,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=3;HU=T;IH=0;TR=3;TU=T;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=6      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     12634463        .       TGA     T       99      PASS    SEQUENCING.AC=182;CallSetAC=208,0,0,0,0;CallSetAC2=1,0,0,0,0;Groups=BC;HR=2;HU=T;IH=0;TR=2;TU=T;Set=BC;SEQUENOM.AC=0    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     12692743        .       TTATC   T       99      PASS    SEQUENCING.AC=10;CallSetAC=0,12,61,10,10;CallSetAC2=0,0,1,0,0;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=3;HU=T;IH=0;TR=3;TU=T;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=8  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     12837095        .       G       GA      99      PASS    SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,0,0,0,1;CallSetAC2=0,0,0,0,1;Groups=SAMTOOLS;HR=1;HU=T;IH=0;TR=1;TU=T;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=0    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     12928028        .       TG      T       99      PASS    SEQUENCING.AC=22;CallSetAC=0,32,0,15,0;CallSetAC2=0,1,0,1,0;Groups=BI,OX;HR=6;HU=T;IH=1;TR=6;TU=T;Set=BI;SEQUENOM.AC=0  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     13003323        .       GGGA    G       99      PASS    SEQUENCING.AC=2;CallSetAC=0,3,5,3,3;CallSetAC2=0,1,1,1,1;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=4;HU=G;IH=0;TR=7;TU=AGG;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     13128894        .       CT      C       99      PASS    SEQUENCING.AC=27;CallSetAC=31,29,29,26,27;CallSetAC2=0,1,0,0,0;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=4;HU=C;IH=0;TR=4;TU=C;Set=OX;SEQUENOM.AC=10   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     13287841        .       CAT     C       99      TOO_MANY_ALT_ALLELES    SEQUENCING.AC=36;CallSetAC=0,64,0,38,18;CallSetAC2=0,1,0,0,0;Groups=BI,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=A;IH=0;TR=1;TU=A;Set=BI;SEQUENOM.AC=626      GT      0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     .       1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     .       1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     .       1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1
+20     13365589        .       T       TG      99      PASS    SEQUENCING.AC=9;CallSetAC=11,9,9,8,11;CallSetAC2=1,1,1,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=3;HU=G;IH=0;TR=3;TU=G;Set=BI;SEQUENOM.AC=0        GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     13566260        rs78090544      AAATTG  A       99      TOO_MANY_ALT_ALLELES    SEQUENCING.AC=6;CallSetAC=0,161,6,5,0;CallSetAC2=0,2,0,0,0;Groups=BI,DINDEL,OX;HR=3;HU=A;IH=0;TR=3;TU=A;Set=OX;SEQUENOM.AC=390  GT      0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     .       0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0
+20     13685184        .       AT      A       99      PASS    SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,2,10,2,2;CallSetAC2=0,1,1,1,1;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=T;IH=0;TR=2;TU=T;Set=BI;SEQUENOM.AC=2    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     13716193        .       GAGAA   G       99      PASS    SEQUENCING.AC=2;CallSetAC=0,3,0,0,3;CallSetAC2=0,1,0,0,1;Groups=BI,SAMTOOLS;HR=1;HU=A;IH=0;TR=6;TU=AG;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=2        GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     13926445        .       TA      T       99      PASS    SEQUENCING.AC=7;CallSetAC=0,0,7,0,0;CallSetAC2=0,0,1,0,0;Groups=DINDEL;HR=2;HU=A;IH=0;TR=2;TU=A;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=0        GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     13960028        .       TC      T       99      TOO_MANY_ALT_ALLELES    SEQUENCING.AC=8;CallSetAC=10,0,0,0,0;CallSetAC2=1,0,0,0,0;Groups=BC;HR=3;HU=T;IH=0;TR=3;TU=T;Set=BC;SEQUENOM.AC=188     GT      0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     .       0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     .       0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     .       0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     .       .       0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     .       0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0
+20     14159734        .       T       TA      99      PASS    SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,1,1,3,1;CallSetAC2=0,0,0,1,0;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=A;IH=0;TR=1;TU=A;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=1 GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     14287634        .       AGT     A       99      PASS    SEQUENCING.AC=2;CallSetAC=0,0,0,0,3;CallSetAC2=0,0,0,0,1;Groups=SAMTOOLS;HR=3;HU=A;IH=0;TR=5;TU=GT;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=0   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     14383135        .       TA      T       99      PASS    SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,0,15,1,1;CallSetAC2=0,0,1,0,0;Groups=DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=A;IH=0;TR=6;TU=ATC;Set=OX;SEQUENOM.AC=1     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     14669226        .       G       GA      99      AMBIGUOUS_SEQUENOM_CALLS        SEQUENCING.AC=268;CallSetAC=306,304,274,234,282;CallSetAC2=0,1,2,0,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=3;HU=A;IH=0;TR=3;TU=A;Set=OX;SEQUENOM.AC=121    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1
+20     14697473        .       TTC     T       99      PASS    SEQUENCING.AC=17;CallSetAC=20,22,17,15,16;CallSetAC2=0,1,0,0,0;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=T;IH=0;TR=2;TU=T;Set=BC;SEQUENOM.AC=9    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     14983337        .       AGCC    A       99      PASS    SEQUENCING.AC=3;CallSetAC=0,4,0,0,0;CallSetAC2=0,1,0,0,0;Groups=BI;HR=6;HU=A;IH=1;TR=6;TU=A;Set=BI;SEQUENOM.AC=0        GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     15037520        .       A       AG      99      PASS    SEQUENCING.AC=6;CallSetAC=0,0,6,0,0;CallSetAC2=0,0,1,0,0;Groups=DINDEL;HR=1;HU=G;IH=0;TR=1;TU=G;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=0        GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     15141272        .       T       TC      99      PASS    SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,0,0,0,1;CallSetAC2=0,0,0,0,1;Groups=SAMTOOLS;HR=2;HU=C;IH=0;TR=2;TU=C;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=0    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     15189597        .       GA      G       99      TOO_MANY_ALT_ALLELES    SEQUENCING.AC=5;CallSetAC=6,0,0,0,0;CallSetAC2=1,0,0,0,0;Groups=BC;HR=1;HU=A;IH=0;TR=1;TU=A;Set=BC;SEQUENOM.AC=311      GT      1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     .       0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     .       0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     .       1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1
+20     15265098        .       TG      T       99      PASS    SEQUENCING.AC=31;CallSetAC=27,79,0,41,4;CallSetAC2=1,1,0,1,0;Groups=BC,BI,OX,SAMTOOLS;HR=6;HU=T;IH=1;TR=6;TU=T;Set=BC;SEQUENOM.AC=125   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1
+20     15410763        .       TGA     T       99      PASS    SEQUENCING.AC=54;CallSetAC=55,68,57,57,56;CallSetAC2=1,2,0,1,0;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=G;IH=0;TR=1;TU=G;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=29     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     15543319        .       AG      A       99      PASS    SEQUENCING.AC=11;CallSetAC=13,12,10,12,14;CallSetAC2=1,1,1,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=3;HU=G;IH=0;TR=3;TU=G;Set=BC;SEQUENOM.AC=7    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     15550845        .       TG      T       99      PASS    SEQUENCING.AC=50;CallSetAC=58,58,56,47,53;CallSetAC2=2,2,2,1,2;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=T;IH=0;TR=7;TU=GTT;Set=BC;SEQUENOM.AC=34 GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     15703503        .       TG      T       99      TOO_MANY_ALT_ALLELES    SEQUENCING.AC=9;CallSetAC=11,0,0,0,0;CallSetAC2=1,0,0,0,0;Groups=BC;HR=4;HU=T;IH=0;TR=4;TU=T;Set=BC;SEQUENOM.AC=87      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     .       0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     .       0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/1     0/0     0/1     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     .       0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     15871330        .       AG      A       99      PASS    SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=2,2,2,2,2;CallSetAC2=0,0,1,0,0;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=3;HU=A;IH=0;TR=3;TU=A;Set=BC;SEQUENOM.AC=1  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     16016504        .       TA      T       99      TOO_MANY_ALT_ALLELES    SEQUENCING.AC=17;CallSetAC=4,36,0,18,0;CallSetAC2=0,1,0,0,0;Groups=BC,BI,OX;HR=1;HU=A;IH=0;TR=1;TU=A;Set=OX;SEQUENOM.AC=578     GT      0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     .       1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1
+20     16192114        .       AT      A       99      INCORRECT_SEQUENOM_CALLS        SEQUENCING.AC=45;CallSetAC=52,49,48,42,48;CallSetAC2=3,2,3,2,3;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=3;HU=A;IH=0;TR=4;TU=CT;Set=BC;SEQUENOM.AC=0   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     16259934        .       C       CAA     99      PASS    SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,2,0,0,2;CallSetAC2=0,1,0,0,1;Groups=BI,SAMTOOLS;HR=1;HU=T;IH=0;TR=4;TU=CT;Set=BI;SEQUENOM.AC=0      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     16312599        .       CTA     C       99      PASS    SEQUENCING.AC=5;CallSetAC=0,6,5,3,6;CallSetAC2=0,1,0,0,0;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=T;IH=0;TR=1;TU=T;Set=BI;SEQUENOM.AC=2     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     16723642        .       GGTT    G       99      PASS    SEQUENCING.AC=9;CallSetAC=11,11,9,9,11;CallSetAC2=1,1,1,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=G;IH=0;TR=2;TU=G;Set=BI;SEQUENOM.AC=6       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     16747221        .       CA      C       99      TOO_MANY_ALT_ALLELES    SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=1,0,0,0,0;CallSetAC2=1,0,0,0,0;Groups=BC;HR=1;HU=A;IH=0;TR=1;TU=A;Set=BC;SEQUENOM.AC=473      GT      1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     .       0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1
+20     16813850        .       C       CA      99      PASS    SEQUENCING.AC=10;CallSetAC=12,12,11,7,8;CallSetAC2=1,1,3,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=5;HU=A;IH=0;TR=5;TU=A;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=7        GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     17250858        .       T       TC      99      PASS    SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,0,0,0,1;CallSetAC2=0,0,0,0,1;Groups=SAMTOOLS;HR=1;HU=C;IH=0;TR=4;TU=CT;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=0   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     17331332        .       TA      T       99      TOO_MANY_ALT_ALLELES    SEQUENCING.AC=18;CallSetAC=0,0,0,19,0;CallSetAC2=0,0,0,1,0;Groups=OX;HR=2;HU=T;IH=0;TR=2;TU=T;Set=OX;SEQUENOM.AC=682    GT      1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     .       0/1     .       1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1
+20     17473782        .       TGC     T       99      PASS    SEQUENCING.AC=2;CallSetAC=0,3,4,2,3;CallSetAC2=0,1,1,1,1;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=T;IH=0;TR=2;TU=T;Set=BI;SEQUENOM.AC=1     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     17607627        .       A       AGT     99      PASS    SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,2,2,2,2;CallSetAC2=0,1,1,1,1;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=G;IH=0;TR=4;TU=AG;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=3      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     17753474        .       C       CA      99      PASS    SEQUENCING.AC=3;CallSetAC=0,0,3,0,0;CallSetAC2=0,0,1,0,0;Groups=DINDEL;HR=1;HU=A;IH=0;TR=4;TU=AC;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=0       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     18417481        .       AC      A       99      PASS    SEQUENCING.AC=8;CallSetAC=9,0,0,0,0;CallSetAC2=1,0,0,0,0;Groups=BC;HR=6;HU=A;IH=1;TR=6;TU=A;Set=BC;SEQUENOM.AC=17       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     18445795        .       AAG     A       99      PASS    SEQUENCING.AC=15;CallSetAC=20,20,15,14,16;CallSetAC2=1,1,0,0,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=3;HU=A;IH=0;TR=4;TU=AG;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     18520672        .       A       ATT     99      PASS    SEQUENCING.AC=85;CallSetAC=98,0,0,0,0;CallSetAC2=1,0,0,0,0;Groups=BC;HR=4;HU=A;IH=0;TR=4;TU=A;Set=BC;SEQUENOM.AC=0      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     18522725        .       ATTAAC  A       99      PASS    SEQUENCING.AC=4;CallSetAC=0,5,5,4,5;CallSetAC2=0,1,1,1,1;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=T;IH=0;TR=2;TU=T;Set=BI;SEQUENOM.AC=1     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     18915562        .       TAA     T       99      PASS    SEQUENCING.AC=6;CallSetAC=0,8,6,5,8;CallSetAC2=0,2,1,1,2;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=A;IH=0;TR=6;TU=AAT;Set=BI;SEQUENOM.AC=3   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     19111235        .       C       CT      99      PASS    SEQUENCING.AC=7;CallSetAC=8,7,9,7,8;CallSetAC2=1,1,1,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=T;IH=0;TR=1;TU=T;Set=OX;SEQUENOM.AC=4  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     19188693        .       T       TC      99      PASS    SEQUENCING.AC=15;CallSetAC=0,0,15,0,0;CallSetAC2=0,0,1,0,0;Groups=DINDEL;HR=1;HU=G;IH=0;TR=1;TU=G;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=0      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     19437778        .       GGCCTGGGATGTAAA G       99      PASS    SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,0,2,1,0;CallSetAC2=0,0,1,0,0;Groups=DINDEL,OX;HR=2;HU=G;IH=0;TR=4;TU=GT;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=0    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     19805154        .       CCTT    C       99      PASS    SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,0,1,1,1;CallSetAC2=0,0,1,1,1;Groups=DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=3;HU=C;IH=0;TR=6;TU=CTT;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=3        GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     20030869        .       CT      C       99      TOO_MANY_ALT_ALLELES    SEQUENCING.AC=5;CallSetAC=1,11,0,0,0;CallSetAC2=0,1,0,0,0;Groups=BC,BI;HR=1;HU=T;IH=0;TR=1;TU=T;Set=BI;SEQUENOM.AC=404  GT      0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1
+20     20286529        .       A       AC      99      PASS    SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,1,1,0,1;CallSetAC2=0,1,1,0,1;Groups=BI,DINDEL,SAMTOOLS;HR=2;HU=C;IH=0;TR=2;TU=C;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=1  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     20404656        .       ATTACAGACT      A       99      PASS    SEQUENCING.AC=11;CallSetAC=12,19,14,11,13;CallSetAC2=1,1,1,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=3;HU=A;IH=0;TR=3;TU=A;Set=OX;SEQUENOM.AC=7    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     20434198        .       TA      T       99      PASS    SEQUENCING.AC=17;CallSetAC=0,0,0,18,0;CallSetAC2=0,0,0,1,0;Groups=OX;HR=3;HU=T;IH=0;TR=3;TU=T;Set=OX;SEQUENOM.AC=0      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     20716329        .       CA      C       99      PASS    SEQUENCING.AC=4;CallSetAC=0,5,6,4,5;CallSetAC2=0,1,1,1,1;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=3;HU=A;IH=0;TR=3;TU=A;Set=BI;SEQUENOM.AC=4     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     20760474        .       TG      T       99      PASS    SEQUENCING.AC=21;CallSetAC=28,23,21,19,24;CallSetAC2=2,1,2,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=G;IH=0;TR=1;TU=G;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=15       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     20952825        .       T       TC      99      PASS    SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,1,2,1,1;CallSetAC2=0,1,2,1,1;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=C;IH=0;TR=4;TU=CT;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=1      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     20990240        .       TC      T       99      PASS    SEQUENCING.AC=16;CallSetAC=0,0,16,0,0;CallSetAC2=0,0,2,0,0;Groups=DINDEL;HR=2;HU=C;IH=0;TR=2;TU=C;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=0      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     21406859        .       ACTT    A       99      PASS    SEQUENCING.AC=3;CallSetAC=4,4,4,4,4;CallSetAC2=1,1,1,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=4;HU=A;IH=0;TR=6;TU=CTT;Set=BI;SEQUENOM.AC=1        GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     21480245        .       AG      A       99      PASS    SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,1,3,1,1;CallSetAC2=0,1,1,1,1;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=3;HU=A;IH=0;TR=3;TU=A;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=1       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     21852048        .       CA      C       99      TOO_MANY_ALT_ALLELES    SEQUENCING.AC=13;CallSetAC=12,49,0,14,0;CallSetAC2=1,0,0,0,0;Groups=BC,BI,OX;HR=2;HU=C;IH=0;TR=2;TU=C;Set=OX;SEQUENOM.AC=432    GT      0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     .       0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     .       1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1
+20     21968507        .       AC      A       99      PASS    SEQUENCING.AC=10;CallSetAC=0,12,10,12,7;CallSetAC2=0,1,0,0,0;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=5;HU=C;IH=0;TR=5;TU=C;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=7     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     22434333        .       C       CA      99      PASS    SEQUENCING.AC=26;CallSetAC=30,32,31,23,26;CallSetAC2=0,1,0,0,0;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=4;HU=C;IH=0;TR=4;TU=C;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=8      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     22637424        .       C       CAGCCA  99      PASS    SEQUENCING.AC=4;CallSetAC=0,5,4,4,6;CallSetAC2=0,1,1,1,1;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=A;IH=0;TR=1;TU=A;Set=OX;SEQUENOM.AC=3     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     22655862        .       TATC    T       99      PASS    SEQUENCING.AC=12;CallSetAC=14,15,18,11,14;CallSetAC2=1,1,0,0,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=A;IH=0;TR=4;TU=AT;Set=OX;SEQUENOM.AC=6   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     23200197        .       ATT     A       99      PASS    SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,0,0,0,1;CallSetAC2=0,0,0,0,1;Groups=SAMTOOLS;HR=4;HU=T;IH=0;TR=4;TU=T;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=1    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     23293728        .       CA      C       99      PASS    SEQUENCING.AC=11;CallSetAC=15,12,15,9,13;CallSetAC2=1,1,1,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=A;IH=0;TR=1;TU=A;Set=BI;SEQUENOM.AC=8     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     23813095        .       CT      C       99      PASS    SEQUENCING.AC=18;CallSetAC=0,27,17,0,21;CallSetAC2=0,1,0,0,0;Groups=BI,DINDEL,SAMTOOLS;HR=4;HU=C;IH=0;TR=4;TU=C;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=26       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     23815381        .       CT      C       99      PASS    SEQUENCING.AC=2;CallSetAC=0,4,3,2,2;CallSetAC2=0,1,2,1,1;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=T;IH=0;TR=6;TU=CTT;Set=OX;SEQUENOM.AC=1   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     23889003        .       GA      G       99      PASS    SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=2,1,1,2,3;CallSetAC2=1,1,1,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=A;IH=0;TR=6;TU=ATG;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=2    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     24710482        .       GT      G       99      PASS    SEQUENCING.AC=9;CallSetAC=0,0,9,0,0;CallSetAC2=0,0,1,0,0;Groups=DINDEL;HR=5;HU=T;IH=0;TR=5;TU=T;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=0        GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     24855121        .       CT      C       99      PASS    SEQUENCING.AC=11;CallSetAC=14,13,10,12,12;CallSetAC2=1,1,1,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=5;HU=C;IH=0;TR=5;TU=C;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=6        GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     25503211        .       CATA    C       99      PASS    SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,1,2,1,1;CallSetAC2=0,1,2,1,1;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=A;IH=0;TR=7;TU=AAT;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=1     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     25905250        .       GT      G       99      TOO_MANY_ALT_ALLELES    SEQUENCING.AC=56;CallSetAC=0,58,57,0,0;CallSetAC2=0,1,1,0,0;Groups=BI,DINDEL;HR=6;HU=T;IH=1;TR=6;TU=T;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=764        GT      1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     .       1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1
+20     29589873        .       CCTT    C       99      PASS    SEQUENCING.AC=239;CallSetAC=333,196,0,0,0;CallSetAC2=1,1,0,0,0;Groups=BC,BI;HR=2;HU=C;IH=0;TR=6;TU=CTT;Set=BC;SEQUENOM.AC=0     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     29628180        .       C       CCACAAGAAG      99      PASS    SEQUENCING.AC=7;CallSetAC=0,8,0,0,0;CallSetAC2=0,1,0,0,0;Groups=BI;HR=2;HU=C;IH=0;TR=6;TU=CTT;Set=BI;SEQUENOM.AC=0      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     29804699        .       A       AC      99      PASS    SEQUENCING.AC=23;CallSetAC=27,0,0,0,0;CallSetAC2=1,0,0,0,0;Groups=BC;HR=2;HU=A;IH=0;TR=2;TU=A;Set=BC;SEQUENOM.AC=0      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     29913425        .       TATATC  T       99      PASS    SEQUENCING.AC=24;CallSetAC=30,25,82,25,26;CallSetAC2=0,0,1,0,0;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=T;IH=0;TR=5;TU=AT;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=15    GT      0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     30390854        .       TTATACTA        T       99      PASS    SEQUENCING.AC=4;CallSetAC=0,6,5,4,4;CallSetAC2=0,1,1,1,1;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=T;IH=0;TR=4;TU=AT;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=3      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     30534847        .       ACAAT   A       99      PASS    SEQUENCING.AC=3;CallSetAC=0,3,5,2,4;CallSetAC2=0,0,2,0,0;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=3;HU=A;IH=0;TR=3;TU=A;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=2       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     30567910        .       T       TG      99      PASS    SEQUENCING.AC=45;CallSetAC=52,7,0,48,0;CallSetAC2=1,0,0,1,0;Groups=BC,BI,OX;HR=3;HU=G;IH=0;TR=3;TU=G;Set=BC;SEQUENOM.AC=0       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     31412616        .       CT      C       99      PASS    SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,0,0,0,2;CallSetAC2=0,0,0,0,1;Groups=SAMTOOLS;HR=3;HU=T;IH=0;TR=3;TU=T;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=1    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     31760870        .       CG      C       99      PASS    SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=2,0,0,0,0;CallSetAC2=1,0,0,0,0;Groups=BC;HR=2;HU=G;IH=0;TR=4;TU=AC;Set=BC;SEQUENOM.AC=0       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     32015223        .       CT      C       99      PASS    SEQUENCING.AC=9;CallSetAC=11,11,11,9,9;CallSetAC2=1,1,1,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=T;IH=0;TR=2;TU=T;Set=BC;SEQUENOM.AC=5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     32158330        .       CAG     C       99      PASS    SEQUENCING.AC=18;CallSetAC=23,24,16,15,21;CallSetAC2=0,1,0,0,0;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=A;IH=0;TR=4;TU=AG;Set=OX;SEQUENOM.AC=4   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     32456076        .       GT      G       99      PASS    SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,1,6,1,1;CallSetAC2=0,0,1,0,0;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=3;HU=G;IH=0;TR=4;TU=GT;Set=OX;SEQUENOM.AC=0    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     32509752        .       A       AG      99      PASS    SEQUENCING.AC=2;CallSetAC=0,0,0,3,3;CallSetAC2=0,0,0,1,1;Groups=OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=G;IH=0;TR=2;TU=G;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=1 GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     32700247        .       GGCGTCTGA       G       99      PASS    SEQUENCING.AC=3;CallSetAC=0,4,7,4,4;CallSetAC2=0,1,1,1,1;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=G;IH=0;TR=6;TU=CGG;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     32968409        .       GTC     G       99      PASS    SEQUENCING.AC=121;CallSetAC=0,127,0,0,0;CallSetAC2=0,1,0,0,0;Groups=BI;HR=1;HU=T;IH=0;TR=6;TU=ATG;Set=BI;SEQUENOM.AC=0  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     33541746        .       A       AAG     99      PASS    SEQUENCING.AC=8;CallSetAC=9,11,9,9,10;CallSetAC2=0,1,1,0,0;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=4;HU=A;IH=0;TR=5;TU=AG;Set=BC;SEQUENOM.AC=4       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     34251969        .       C       CA      99      PASS    SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,2,0,0,2;CallSetAC2=0,1,0,0,1;Groups=BI,SAMTOOLS;HR=1;HU=A;IH=0;TR=4;TU=AG;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=3        GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     34313574        .       A       AT      99      PASS    SEQUENCING.AC=8;CallSetAC=0,9,0,0,0;CallSetAC2=0,1,0,0,0;Groups=BI;HR=4;HU=T;IH=0;TR=4;TU=T;Set=BI;SEQUENOM.AC=0        GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     34633573        .       TAA     T       99      PASS    SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,2,3,2,2;CallSetAC2=0,1,1,1,1;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=6;HU=T;IH=1;TR=6;TU=T;Set=OX;SEQUENOM.AC=1     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     34831930        .       CT      C       99      PASS    SEQUENCING.AC=13;CallSetAC=22,14,20,14,14;CallSetAC2=1,1,1,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=4;HU=T;IH=0;TR=4;TU=T;Set=OX;SEQUENOM.AC=7    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     35329008        .       ATC     A       99      PASS    SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,0,3,1,1;CallSetAC2=0,0,2,0,0;Groups=DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=T;IH=0;TR=6;TU=ATC;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=0  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     35357903        .       GA      G       99      PASS    SEQUENCING.AC=11;CallSetAC=12,12,12,12,11;CallSetAC2=2,2,2,2,2;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=A;IH=0;TR=2;TU=A;Set=BC;SEQUENOM.AC=5    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     35847597        .       CTT     C       99      PASS    SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,1,7,1,2;CallSetAC2=0,1,1,1,1;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=5;HU=T;IH=0;TR=5;TU=T;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=1       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     36658020        .       TG      T       99      PASS    SEQUENCING.AC=11;CallSetAC=15,12,12,8,12;CallSetAC2=1,1,1,0,0;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=G;IH=0;TR=2;TU=G;Set=OX;SEQUENOM.AC=6     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     36704724        .       TC      T       99      PASS    SEQUENCING.AC=12;CallSetAC=15,13,14,10,14;CallSetAC2=1,1,1,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=C;IH=0;TR=2;TU=C;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=8        GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     36711544        .       TAAAG   T       99      PASS    SEQUENCING.AC=2;CallSetAC=0,0,3,0,1;CallSetAC2=0,0,1,0,1;Groups=DINDEL,SAMTOOLS;HR=3;HU=A;IH=0;TR=3;TU=A;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=1     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     36947086        .       ATAC    A       99      PASS    SEQUENCING.AC=93;CallSetAC=107,109,94,86,100;CallSetAC2=1,1,1,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=T;IH=0;TR=6;TU=ACT;Set=OX;SEQUENOM.AC=33      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     37139725        .       CAG     C       99      PASS    SEQUENCING.AC=5;CallSetAC=0,6,6,5,7;CallSetAC2=0,1,1,1,1;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=A;IH=0;TR=6;TU=AG;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=5        GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     37278654        .       CAG     C       99      PASS    SEQUENCING.AC=17;CallSetAC=20,18,17,13,17;CallSetAC2=0,1,1,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=A;IH=0;TR=1;TU=A;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=7        GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     37391272        .       TG      T       99      PASS    SEQUENCING.AC=8;CallSetAC=14,9,9,9,10;CallSetAC2=1,0,0,0,0;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=G;IH=0;TR=2;TU=G;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=4    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     37608002        .       CAT     C       99      PASS    SEQUENCING.AC=8;CallSetAC=8,13,12,9,10;CallSetAC2=0,1,1,0,0;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=A;IH=0;TR=5;TU=AC;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=7        GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     37678954        .       C       CTGG    99      PASS    SEQUENCING.AC=7;CallSetAC=0,10,22,6,4;CallSetAC2=0,1,1,0,0;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=G;IH=0;TR=4;TU=CG;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=7    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     37712193        .       AAG     A       99      PASS    SEQUENCING.AC=44;CallSetAC=52,57,44,21,47;CallSetAC2=1,1,2,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=A;IH=0;TR=6;TU=AG;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=29    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     37836124        .       AAAT    A       99      PASS    SEQUENCING.AC=3;CallSetAC=4,4,6,3,3;CallSetAC2=1,1,1,0,0;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=4;HU=A;IH=0;TR=4;TU=A;Set=BC;SEQUENOM.AC=3  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     37954797        .       A       AGT     99      PASS    SEQUENCING.AC=110;CallSetAC=126,0,0,0,0;CallSetAC2=1,0,0,0,0;Groups=BC;HR=1;HU=T;IH=0;TR=5;TU=AT;Set=BC;SEQUENOM.AC=0   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     37962643        .       T       TAA     99      PASS    SEQUENCING.AC=370;CallSetAC=395,424,394,367,423;CallSetAC2=4,4,4,3,3;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=A;IH=0;TR=4;TU=AT;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=178       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     .       0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1
+20     38336199        .       TA      T       99      PASS    SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,2,4,2,2;CallSetAC2=0,1,1,1,1;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=T;IH=0;TR=2;TU=T;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=1       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     38495835        .       T       TA      99      AMBIGUOUS_SEQUENOM_CALLS        SEQUENCING.AC=147;CallSetAC=0,0,0,153,0;CallSetAC2=0,0,0,1,0;Groups=OX;HR=3;HU=A;IH=0;TR=4;TU=AT;Set=OX;SEQUENOM.AC=14  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     38696054        .       GAAGA   G       99      PASS    SEQUENCING.AC=2;CallSetAC=0,3,5,3,3;CallSetAC2=0,1,1,1,1;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=A;IH=0;TR=6;TU=AAG;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=3     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     38784318        .       CCTT    C       99      PASS    SEQUENCING.AC=17;CallSetAC=20,19,19,15,17;CallSetAC2=2,1,1,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=C;IH=0;TR=7;TU=CTT;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=7    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     39042026        .       T       TG      99      PASS    SEQUENCING.AC=11;CallSetAC=0,0,11,0,0;CallSetAC2=0,0,3,0,0;Groups=DINDEL;HR=4;HU=T;IH=0;TR=4;TU=T;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=1      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     39420665        .       AG      A       99      TOO_MANY_ALT_ALLELES    SEQUENCING.AC=24;CallSetAC=3,51,0,25,0;CallSetAC2=0,2,0,1,0;Groups=BC,BI,OX;HR=2;HU=A;IH=0;TR=4;TU=GT;Set=OX;SEQUENOM.AC=688    GT      1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     .       1/1     .       1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     .       1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1
+20     39607037        .       C       CA      99      AMBIGUOUS_SEQUENOM_CALLS        SEQUENCING.AC=4;CallSetAC=0,0,4,0,0;CallSetAC2=0,0,1,0,0;Groups=DINDEL;HR=1;HU=T;IH=0;TR=1;TU=T;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=0        GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     39868369        .       T       TG      99      PASS    SEQUENCING.AC=5;CallSetAC=0,6,0,0,0;CallSetAC2=0,1,0,0,0;Groups=BI;HR=2;HU=T;IH=0;TR=4;TU=GT;Set=BI;SEQUENOM.AC=3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     40006262        .       TGAG    T       99      AMBIGUOUS_SEQUENOM_CALLS        SEQUENCING.AC=4;CallSetAC=0,4,6,0,0;CallSetAC2=0,0,2,0,0;Groups=BI,DINDEL;HR=1;HU=G;IH=0;TR=6;TU=AGG;Set=BI;SEQUENOM.AC=0       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     40110981        .       A       AG      99      PASS    SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,0,0,0,1;CallSetAC2=0,0,0,0,1;Groups=SAMTOOLS;HR=1;HU=G;IH=0;TR=4;TU=AG;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=0   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     40445967        .       TG      T       99      PASS    SEQUENCING.AC=4;CallSetAC=5,5,15,6,5;CallSetAC2=1,1,2,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=G;IH=0;TR=4;TU=GT;Set=BI;SEQUENOM.AC=3        GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     40742257        .       TG      T       99      PASS    SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,2,10,2,2;CallSetAC2=0,0,2,0,0;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=G;IH=0;TR=2;TU=G;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=0      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     41000677        .       T       TG      99      PASS    SEQUENCING.AC=4;CallSetAC=0,5,8,5,0;CallSetAC2=0,1,2,1,0;Groups=BI,DINDEL,OX;HR=6;HU=G;IH=1;TR=6;TU=G;Set=BI;SEQUENOM.AC=3      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     41149621        .       T       TATCA   99      PASS    SEQUENCING.AC=6;CallSetAC=6,6,10,8,0;CallSetAC2=0,1,1,1,0;Groups=BC,BI,DINDEL,OX;HR=1;HU=A;IH=0;TR=1;TU=A;Set=BC;SEQUENOM.AC=3  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     41364251        .       A       AAG     99      PASS    SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,0,0,0,1;CallSetAC2=0,0,0,0,1;Groups=SAMTOOLS;HR=3;HU=A;IH=0;TR=4;TU=AC;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=1   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     41543685        .       CTAAGGAGGGAAAAAGATATAAT C       99      PASS    SEQUENCING.AC=29;CallSetAC=0,36,29,22,0;CallSetAC2=0,1,1,1,0;Groups=BI,DINDEL,OX;HR=1;HU=T;IH=0;TR=1;TU=T;Set=OX;SEQUENOM.AC=12 GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     41851636        .       TA      T       99      PASS    SEQUENCING.AC=208;CallSetAC=234,229,215,195,238;CallSetAC2=3,4,3,2,3;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=A;IH=0;TR=1;TU=A;Set=OX;SEQUENOM.AC=83     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0
+20     41964672        .       A       AT      99      PASS    SEQUENCING.AC=243;CallSetAC=0,0,0,253,0;CallSetAC2=0,0,0,1,0;Groups=OX;HR=2;HU=T;IH=0;TR=2;TU=T;Set=OX;SEQUENOM.AC=0    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     42145613        .       TG      T       99      TOO_MANY_ALT_ALLELES    SEQUENCING.AC=300;CallSetAC=88,565,0,544,14;CallSetAC2=1,8,0,3,0;Groups=BC,BI,OX,SAMTOOLS;HR=5;HU=T;IH=0;TR=5;TU=T;Set=OX;SEQUENOM.AC=762       GT      1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     .       1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     .       1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1
+20     42159695        .       GC      G       99      TOO_MANY_ALT_ALLELES    SEQUENCING.AC=6;CallSetAC=7,0,0,0,0;CallSetAC2=1,0,0,0,0;Groups=BC;HR=3;HU=G;IH=0;TR=3;TU=G;Set=BC;SEQUENOM.AC=87       GT      0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     .       0/0     .       0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1
+20     42261635        .       C       CATTT   99      PASS    SEQUENCING.AC=54;CallSetAC=62,75,76,57,58;CallSetAC2=1,1,1,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=A;IH=0;TR=5;TU=AC;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=24      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     42470352        .       CACTT   C       99      PASS    SEQUENCING.AC=37;CallSetAC=43,44,42,37,41;CallSetAC2=1,1,1,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=A;IH=0;TR=7;TU=AC;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=19      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     42585924        .       T       TA      99      PASS    SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,0,1,1,1;CallSetAC2=0,0,1,1,1;Groups=DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=A;IH=0;TR=2;TU=A;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=1  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     42856201        .       CT      C       99      PASS    SEQUENCING.AC=4;CallSetAC=0,5,5,3,4;CallSetAC2=0,1,2,1,1;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=4;HU=C;IH=0;TR=4;TU=C;Set=OX;SEQUENOM.AC=3     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     42909154        .       T       TGGGTC  99      PASS    SEQUENCING.AC=5;CallSetAC=5,6,8,7,4;CallSetAC2=0,1,1,1,0;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=3;HU=G;IH=0;TR=3;TU=G;Set=OX;SEQUENOM.AC=3  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     42918721        .       AG      A       99      PASS    SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,1,1,1,1;CallSetAC2=0,1,1,1,1;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=G;IH=0;TR=2;TU=G;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=1       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     42930748        .       A       AG      99      PASS    SEQUENCING.AC=30;CallSetAC=48,20,0,0,0;CallSetAC2=1,0,0,0,0;Groups=BC,BI;HR=2;HU=G;IH=0;TR=2;TU=G;Set=BI;SEQUENOM.AC=0  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     43245783        .       AG      A       99      PASS    SEQUENCING.AC=2;CallSetAC=3,0,0,0,0;CallSetAC2=1,0,0,0,0;Groups=BC;HR=3;HU=A;IH=0;TR=3;TU=A;Set=BC;SEQUENOM.AC=8        GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     43371647        .       GGGCTGTAA       G       99      PASS    SEQUENCING.AC=138;CallSetAC=158,179,179,128,155;CallSetAC2=0,2,1,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=3;HU=G;IH=0;TR=3;TU=G;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=80       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0
+20     43434234        .       AG      A       99      PASS    SEQUENCING.AC=7;CallSetAC=8,8,16,7,6;CallSetAC2=1,1,3,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=G;IH=0;TR=2;TU=G;Set=BC;SEQUENOM.AC=4 GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     43539258        .       T       TAG     99      PASS    SEQUENCING.AC=2;CallSetAC=0,3,18,3,3;CallSetAC2=0,0,2,0,0;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=A;IH=0;TR=1;TU=A;Set=OX;SEQUENOM.AC=1    GT      0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     43606638        .       T       TC      99      PASS    SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,0,0,0,2;CallSetAC2=0,0,0,0,1;Groups=SAMTOOLS;HR=2;HU=C;IH=0;TR=2;TU=C;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=0    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     43826992        .       GC      G       99      PASS    SEQUENCING.AC=9;CallSetAC=11,0,0,0,0;CallSetAC2=1,0,0,0,0;Groups=BC;HR=3;HU=G;IH=0;TR=3;TU=G;Set=BC;SEQUENOM.AC=0       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     43993933        .       CA      C       99      TOO_MANY_ALT_ALLELES    SEQUENCING.AC=12;CallSetAC=5,22,0,0,0;CallSetAC2=0,1,0,0,0;Groups=BC,BI;HR=2;HU=C;IH=0;TR=2;TU=C;Set=BC;SEQUENOM.AC=565 GT      0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     .       1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1
+20     44071585        .       C       CT      99      PASS    SEQUENCING.AC=293;CallSetAC=310,351,323,302,335;CallSetAC2=0,1,0,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=T;IH=0;TR=4;TU=CT;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=132     GT      0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1
+20     44220528        .       T       TC      99      PASS    SEQUENCING.AC=29;CallSetAC=34,38,0,0,18;CallSetAC2=0,1,0,0,0;Groups=BC,BI,SAMTOOLS;HR=5;HU=T;IH=0;TR=5;TU=T;Set=BI;SEQUENOM.AC=59       GT      0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0
+20     44340276        .       AACAG   A       99      PASS    SEQUENCING.AC=36;CallSetAC=42,88,46,33,36;CallSetAC2=1,1,0,0,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=3;HU=A;IH=0;TR=3;TU=A;Set=BC;SEQUENOM.AC=37   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     .       0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     44464600        .       T       TA      99      PASS    SEQUENCING.AC=57;CallSetAC=66,63,74,53,52;CallSetAC2=1,1,1,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=4;HU=T;IH=0;TR=4;TU=T;Set=BC;SEQUENOM.AC=19   GT      0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     44470843        .       GAGTGTCGT       G       99      PASS    SEQUENCING.AC=8;CallSetAC=0,31,0,9,5;CallSetAC2=0,1,0,0,0;Groups=BI,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=A;IH=0;TR=1;TU=A;Set=OX;SEQUENOM.AC=0   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     44572563        .       GA      G       99      PASS    SEQUENCING.AC=3;CallSetAC=6,4,4,4,4;CallSetAC2=1,1,1,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=A;IH=0;TR=1;TU=A;Set=BC;SEQUENOM.AC=1  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     44889286        .       G       GC      99      PASS    SEQUENCING.AC=25;CallSetAC=29,28,39,22,26;CallSetAC2=0,0,1,0,0;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=C;IH=0;TR=2;TU=C;Set=BC;SEQUENOM.AC=13   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0
+20     45092013        .       GT      G       99      PASS    SEQUENCING.AC=5;CallSetAC=5,7,6,6,6;CallSetAC2=0,1,1,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=T;IH=0;TR=2;TU=T;Set=BI;SEQUENOM.AC=4  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     45300827        .       CT      C       99      PASS    SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,0,3,1,1;CallSetAC2=0,0,2,0,0;Groups=DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=T;IH=0;TR=1;TU=T;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=0  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     45406096        .       T       TTC     99      PASS    SEQUENCING.AC=8;CallSetAC=9,13,7,7,9;CallSetAC2=1,1,1,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=3;HU=T;IH=0;TR=5;TU=CT;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=4    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     45668403        .       CTG     C       99      PASS    SEQUENCING.AC=186;CallSetAC=213,221,191,166,197;CallSetAC2=2,3,2,1,2;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=T;IH=0;TR=4;TU=GT;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=86      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0
+20     46051811        .       T       TAAGC   99      PASS    SEQUENCING.AC=6;CallSetAC=0,4,9,9,3;CallSetAC2=0,0,1,1,0;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=T;IH=0;TR=2;TU=T;Set=BI;SEQUENOM.AC=2     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     46353646        .       A       AG      99      PASS    SEQUENCING.AC=3;CallSetAC=0,0,3,0,0;CallSetAC2=0,0,1,0,0;Groups=DINDEL;HR=3;HU=A;IH=0;TR=3;TU=A;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=0        GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     46413551        .       TC      T       99      PASS    SEQUENCING.AC=5;CallSetAC=6,6,9,3,4;CallSetAC2=1,1,1,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=C;IH=0;TR=1;TU=C;Set=BI;SEQUENOM.AC=2  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     46569465        .       CTG     C       99      PASS    SEQUENCING.AC=14;CallSetAC=15,18,16,15,15;CallSetAC2=1,1,1,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=T;IH=0;TR=1;TU=T;Set=BC;SEQUENOM.AC=10   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     46720983        .       ATACTTGG        A       99      PASS    SEQUENCING.AC=5;CallSetAC=0,8,5,4,7;CallSetAC2=0,1,0,0,1;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=A;IH=0;TR=2;TU=A;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=3 GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     47032179        .       GC      G       99      PASS    SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,2,3,2,2;CallSetAC2=0,1,2,1,1;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=C;IH=0;TR=2;TU=C;Set=BI;SEQUENOM.AC=2     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     47136092        .       A       AGTC    99      PASS    SEQUENCING.AC=4;CallSetAC=6,5,5,4,5;CallSetAC2=0,0,1,0,0;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=3;HU=A;IH=0;TR=3;TU=A;Set=BI;SEQUENOM.AC=1  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     47335386        .       GC      G       99      PASS    SEQUENCING.AC=4;CallSetAC=7,4,4,4,5;CallSetAC2=1,1,1,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=3;HU=G;IH=0;TR=3;TU=G;Set=OX;SEQUENOM.AC=2  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     47428163        .       C       CA      99      TOO_MANY_ALT_ALLELES    SEQUENCING.AC=141;CallSetAC=70,232,0,0,0;CallSetAC2=0,2,0,0,0;Groups=BC,BI;HR=7;HU=C;IH=1;TR=7;TU=C;Set=BC;SEQUENOM.AC=766      GT      1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1
+20     47988904        .       CA      C       99      TOO_MANY_ALT_ALLELES    SEQUENCING.AC=2;CallSetAC=3,0,0,0,0;CallSetAC2=1,0,0,0,0;Groups=BC;HR=1;HU=A;IH=0;TR=4;TU=CT;Set=BC;SEQUENOM.AC=187     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     .       0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0
+20     48262933        .       CCTA    C       99      PASS    SEQUENCING.AC=29;CallSetAC=33,32,30,27,31;CallSetAC2=1,1,1,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=3;HU=C;IH=0;TR=3;TU=C;Set=OX;SEQUENOM.AC=7    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     49438742        .       G       GT      99      PASS    SEQUENCING.AC=11;CallSetAC=13,15,16,10,10;CallSetAC2=0,1,0,0,0;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=T;IH=0;TR=1;TU=T;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=8        GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     49451656        .       T       TG      99      PASS    SEQUENCING.AC=6;CallSetAC=0,0,6,0,0;CallSetAC2=0,0,1,0,0;Groups=DINDEL;HR=4;HU=T;IH=0;TR=4;TU=T;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=0        GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     49537420        .       AG      A       99      PASS    SEQUENCING.AC=10;CallSetAC=12,11,12,9,11;CallSetAC2=1,1,1,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=3;HU=G;IH=0;TR=3;TU=G;Set=BI;SEQUENOM.AC=3     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     49561273        .       A       AG      99      PASS    SEQUENCING.AC=2;CallSetAC=0,0,4,2,0;CallSetAC2=0,0,1,0,0;Groups=DINDEL,OX;HR=2;HU=G;IH=0;TR=4;TU=AG;Set=OX;SEQUENOM.AC=0        GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     49765611        .       A       AC      99      PASS    SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,0,1,0,0;CallSetAC2=0,0,1,0,0;Groups=DINDEL;HR=1;HU=C;IH=0;TR=1;TU=C;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=0        GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     50136971        .       TTTTC   T       99      PASS    SEQUENCING.AC=10;CallSetAC=0,20,12,8,9;CallSetAC2=0,1,1,0,1;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=4;HU=T;IH=0;TR=4;TU=T;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=8      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     50373155        .       A       AT      99      PASS    SEQUENCING.AC=10;CallSetAC=12,11,13,11,11;CallSetAC2=1,1,1,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=T;IH=0;TR=4;TU=AT;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=7     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     50772065        .       T       TC      99      PASS    SEQUENCING.AC=7;CallSetAC=0,0,7,0,0;CallSetAC2=0,0,2,0,0;Groups=DINDEL;HR=7;HU=T;IH=1;TR=7;TU=T;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=0        GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     50806976        .       G       GAA     99      PASS    SEQUENCING.AC=309;CallSetAC=357,333,309,296,330;CallSetAC2=0,1,0,1,0;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=G;IH=0;TR=7;TU=AGG;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=128      GT      0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0
+20     50961401        .       G       GT      99      PASS    SEQUENCING.AC=10;CallSetAC=12,11,13,10,11;CallSetAC2=1,1,1,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=T;IH=0;TR=1;TU=T;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=4      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     51547787        .       AC      A       99      PASS    SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,1,14,1,1;CallSetAC2=0,0,2,0,0;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=3;HU=A;IH=0;TR=3;TU=A;Set=OX;SEQUENOM.AC=1    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     51838824        .       GA      G       99      PASS    SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=2,0,0,0,0;CallSetAC2=1,0,0,0,0;Groups=BC;HR=3;HU=G;IH=0;TR=4;TU=AC;Set=BC;SEQUENOM.AC=4       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     51961394        .       ATTTG   A       99      PASS    SEQUENCING.AC=14;CallSetAC=19,15,18,15,14;CallSetAC2=0,0,2,0,0;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=3;HU=T;IH=0;TR=3;TU=T;Set=OX;SEQUENOM.AC=8    GT      0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     53081927        .       CATGA   C       99      PASS    SEQUENCING.AC=9;CallSetAC=11,11,10,8,9;CallSetAC2=1,1,1,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=A;IH=0;TR=1;TU=A;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=5 GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     53538294        .       T       TG      99      PASS    SEQUENCING.AC=2;CallSetAC=0,0,2,0,0;CallSetAC2=0,0,2,0,0;Groups=DINDEL;HR=1;HU=G;IH=0;TR=7;TU=GT;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=0       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     53602394        .       T       TA      99      PASS    SEQUENCING.AC=15;CallSetAC=18,18,15,15,14;CallSetAC2=1,1,1,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=A;IH=0;TR=4;TU=AC;Set=BC;SEQUENOM.AC=7   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     54124185        .       T       TC      99      PASS    SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,0,0,0,1;CallSetAC2=0,0,0,0,1;Groups=SAMTOOLS;HR=2;HU=T;IH=0;TR=5;TU=CT;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=2   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     54150907        .       CAG     C       99      PASS    SEQUENCING.AC=3;CallSetAC=0,4,3,4,4;CallSetAC2=0,1,1,1,1;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=A;IH=0;TR=4;TU=AG;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=3      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     54166824        .       AC      A       99      PASS    SEQUENCING.AC=5;CallSetAC=6,6,8,4,5;CallSetAC2=1,1,2,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=4;HU=A;IH=0;TR=4;TU=A;Set=OX;SEQUENOM.AC=2  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     54230743        .       CAT     C       99      PASS    SEQUENCING.AC=6;CallSetAC=8,7,8,6,6;CallSetAC2=2,1,2,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=A;IH=0;TR=4;TU=AC;Set=BI;SEQUENOM.AC=2 GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     54262948        .       A       AC      99      PASS    SEQUENCING.AC=684;CallSetAC=0,0,0,710,0;CallSetAC2=0,0,0,3,0;Groups=OX;HR=6;HU=A;IH=1;TR=6;TU=A;Set=OX;SEQUENOM.AC=0    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     54309727        .       TGAGC   T       99      PASS    SEQUENCING.AC=19;CallSetAC=24,20,0,12,22;CallSetAC2=1,1,0,1,1;Groups=BC,BI,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=G;IH=0;TR=1;TU=G;Set=BC;SEQUENOM.AC=7    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     54379666        .       GT      G       99      TOO_MANY_ALT_ALLELES    SEQUENCING.AC=8;CallSetAC=4,15,0,0,0;CallSetAC2=0,1,0,0,0;Groups=BC,BI;HR=1;HU=T;IH=0;TR=1;TU=T;Set=BC;SEQUENOM.AC=172  GT      0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0
+20     55264363        .       AG      A       99      TOO_MANY_ALT_ALLELES    SEQUENCING.AC=12;CallSetAC=7,0,0,19,0;CallSetAC2=1,0,0,0,0;Groups=BC,OX;HR=1;HU=G;IH=0;TR=5;TU=AG;Set=OX;SEQUENOM.AC=530        GT      1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     .       1/1     .       1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1
+20     55608811        .       CT      C       99      TOO_MANY_ALT_ALLELES    SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=2,0,0,0,0;CallSetAC2=1,0,0,0,0;Groups=BC;HR=2;HU=C;IH=0;TR=4;TU=CT;Set=BC;SEQUENOM.AC=35      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     55611547        .       CAA     C       99      PASS    SEQUENCING.AC=2;CallSetAC=0,3,6,3,3;CallSetAC2=0,1,1,1,1;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=3;HU=A;IH=0;TR=3;TU=A;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=1       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     55658161        .       GT      G       99      PASS    SEQUENCING.AC=129;CallSetAC=0,136,0,0,0;CallSetAC2=0,1,0,0,0;Groups=BI;HR=1;HU=T;IH=0;TR=5;TU=GT;Set=BI;SEQUENOM.AC=0   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     55989765        .       CA      C       99      TOO_MANY_ALT_ALLELES    SEQUENCING.AC=15;CallSetAC=17,0,0,0,0;CallSetAC2=1,0,0,0,0;Groups=BC;HR=1;HU=A;IH=0;TR=1;TU=A;Set=BC;SEQUENOM.AC=208    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0
+20     56249865        .       T       TGAGG   99      PASS    SEQUENCING.AC=5;CallSetAC=0,6,5,6,6;CallSetAC2=0,1,1,1,1;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=T;IH=0;TR=2;TU=T;Set=BI;SEQUENOM.AC=4     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     56344957        .       GT      G       99      PASS    SEQUENCING.AC=3;CallSetAC=0,4,5,4,4;CallSetAC2=0,1,1,1,1;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=3;HU=T;IH=0;TR=3;TU=T;Set=OX;SEQUENOM.AC=1     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     56419021        .       T       TG      99      PASS    SEQUENCING.AC=10;CallSetAC=0,11,0,0,0;CallSetAC2=0,1,0,0,0;Groups=BI;HR=1;HU=G;IH=0;TR=1;TU=G;Set=BI;SEQUENOM.AC=2      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     56915853        .       TG      T       99      PASS    SEQUENCING.AC=27;CallSetAC=36,29,37,24,29;CallSetAC2=2,2,2,2,2;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=4;HU=G;IH=0;TR=6;TU=GGT;Set=BC;SEQUENOM.AC=17 GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     57676578        .       CCTTT   C       99      PASS    SEQUENCING.AC=10;CallSetAC=14,11,14,8,9;CallSetAC2=1,1,1,1,0;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=C;IH=0;TR=2;TU=C;Set=BI;SEQUENOM.AC=7      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     58288793        .       TC      T       99      PASS    SEQUENCING.AC=87;CallSetAC=101,106,87,65,66;CallSetAC2=2,3,2,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=C;IH=0;TR=1;TU=C;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=44   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     59153061        .       CTG     C       99      PASS    SEQUENCING.AC=2;CallSetAC=0,2,5,3,3;CallSetAC2=0,0,2,0,0;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=T;IH=0;TR=1;TU=T;Set=DINDEL;SEQUENOM.AC=1 GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     59186675        .       TATTA   T       99      PASS    SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,0,13,1,1;CallSetAC2=0,0,2,0,0;Groups=DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=A;IH=0;TR=7;TU=AT;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=0        GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     59349754        .       CCT     C       99      PASS    SEQUENCING.AC=26;CallSetAC=108,28,0,0,30;CallSetAC2=0,1,0,0,0;Groups=BC,BI,SAMTOOLS;HR=3;HU=C;IH=0;TR=3;TU=C;Set=BI;SEQUENOM.AC=168     GT      0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     .       0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     59365768        .       TG      T       99      PASS    SEQUENCING.AC=4;CallSetAC=0,5,26,4,5;CallSetAC2=0,0,1,0,0;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=G;IH=0;TR=2;TU=G;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=2      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     59769242        .       C       CT      99      PASS    SEQUENCING.AC=4;CallSetAC=7,4,8,5,5;CallSetAC2=1,1,1,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=T;IH=0;TR=1;TU=T;Set=BC;SEQUENOM.AC=4  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     60337932        .       AC      A       99      PASS    SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,2,6,2,2;CallSetAC2=0,1,1,1,1;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=2;HU=A;IH=0;TR=6;TU=AAC;Set=OX;SEQUENOM.AC=3   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     60925525        .       GC      G       99      PASS    SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,2,6,0,2;CallSetAC2=0,1,1,0,1;Groups=BI,DINDEL,SAMTOOLS;HR=2;HU=C;IH=0;TR=2;TU=C;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=2  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     61000018        .       GC      G       99      PASS    SEQUENCING.AC=318;CallSetAC=0,348,0,317,0;CallSetAC2=0,1,0,2,0;Groups=BI,OX;HR=3;HU=G;IH=0;TR=3;TU=G;Set=OX;SEQUENOM.AC=203     GT      0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     .       0/1     .       0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0
+20     61531765        .       AG      A       99      PASS    SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,2,8,2,2;CallSetAC2=0,0,2,0,0;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=G;IH=0;TR=4;TU=CG;Set=BI;SEQUENOM.AC=0    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     61983510        .       TCTGC   T       99      PASS    SEQUENCING.AC=124;CallSetAC=142,187,162,95,108;CallSetAC2=0,0,2,1,0;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=1;HU=C;IH=0;TR=7;TU=CCT;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=75      GT      0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     62154368        .       G       GA      99      PASS    SEQUENCING.AC=2;CallSetAC=0,3,0,0,3;CallSetAC2=0,1,0,0,1;Groups=BI,SAMTOOLS;HR=4;HU=G;IH=0;TR=4;TU=G;Set=BI;SEQUENOM.AC=2       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     62310426        .       CTT     C       99      PASS    SEQUENCING.AC=1;CallSetAC=0,2,6,2,2;CallSetAC2=0,0,2,0,0;Groups=BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=4;HU=T;IH=0;TR=4;TU=T;Set=OX;SEQUENOM.AC=1     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     62871860        .       C       CCCGCA  99      PASS    SEQUENCING.AC=26;CallSetAC=29,49,32,20,30;CallSetAC2=0,1,2,1,1;Groups=BC,BI,DINDEL,OX,SAMTOOLS;HR=4;HU=C;IH=0;TR=4;TU=C;Set=SAMTOOLS;SEQUENOM.AC=27     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
diff --git a/tests/tabix_data/vcf/7.vcf b/tests/tabix_data/vcf/7.vcf
new file mode 100644 (file)
index 0000000..33e3ca7
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,317 @@
+##fileformat=VCFv4.1
+##INFO=<ID=BCM.AC,Number=1,Type=Integer,Description="Allele count from BCM's (sequencing-based) genotypes subsetted to the 383 validation samples">
+##INFO=<ID=DB,Number=0,Type=Flag,Description="dbSNP Membership">
+##INFO=<ID=HW_VIOLATION,Number=0,Type=Flag,Description="Genotypes violate Hardy-Weinberg">
+##INFO=<ID=SEQUENOM.AC,Number=1,Type=Integer,Description="Allele count from Sequenom genotyping">
+##INFO=<ID=SRC,Number=1,Type=String,Description="Type of SNPs submitted for validation; VQSR refers to preliminary consensus set, not the final one">
+##FILTER=<ID=AMBIGUOUS_SEQUENOM_CALLS,Description="Possible Sequenom miscalls based on manual review of cluster plots">
+##FILTER=<ID=DUPLICATE_MAPPING,Description="Site did not map uniquely in the genome">
+##FILTER=<ID=HIGH_NO_CALL_RATE,Description="Extremely high no-call rate">
+##FILTER=<ID=INCORRECT_SEQUENOM_CALLS,Description="Clear Sequenom miscalls that cannot easily be fixed based on manual review of cluster plots">
+##FILTER=<ID=NOT_DESIGNED,Description="Site did not design or genotype">
+##FILTER=<ID=POLYMORPHIC_SAMPLES_FAILED,Description="All polymorphic samples from sequencing were no-called">
+##FILTER=<ID=POSSIBLE_PROBE_FAILURE,Description="Suspicious genotyping based on nearby SNPs">
+##fileDate=20110524
+##reference=ftp://ftp.1000genomes.ebi.ac.uk/vol1/ftp/technical/reference/human_g1k_v37.fasta.gz
+##source=EricBanksValidationQC;fromGoncaloAbecasisValidationSelection
+#CHROM POS     ID      REF     ALT     QUAL    FILTER  INFO    FORMAT  HG00127 HG00128 HG00136 HG00137 HG00138 HG00139 HG00152 HG00156 HG00234 HG00235 HG00237 HG00242 HG00244 HG00262 HG01055 HG01079 NA19138 NA18974 NA18523 NA12717 NA19209 NA18577 NA18973 NA18943 NA12873 NA18623 NA18622 NA18948 NA19171 NA19204 NA06994 NA18563 NA18547 NA18861 NA18608 NA12282 NA12751 NA18959 NA19331 NA19453 NA20537 NA12046 NA20515 NA20516 NA20521 NA20524 NA20528 NA20759 NA20768 NA20769 NA20774 NA20775 NA20783 NA20787 NA20790 NA20800 NA20819 NA20812 NA20505 NA20530 NA20540 NA20538 NA20581 NA20815 NA20544 NA20810 NA20807 NA20816 NA20504 NA20753 NA20502 NA12342 NA19150 NA19468 NA20336 NA19395 NA19257 NA19360 NA19700 NA18867 NA20317 NA18968 NA19107 HG00111 HG00108 NA19077 NA19684 NA18511 NA12044 NA19382 NA19457 NA18933 NA18923 NA18965 HG00141 NA20341 NA18740 HG00537 HG00346 HG01173 HG00702 HG00313 HG00150 NA18612 HG00339 NA12273 HG00250 NA18593 NA18621 HG00478 HG00251 HG01070 NA19160 NA18995 NA10851 NA18976 NA18603 NA19200 HG01204 HG01191 HG01101 HG00146 HG00306 NA18985 HG00160 HG00635 HG00372 HG00357 HG00634 NA18541 NA18950 NA19759 HG00351 HG00257 HG00118 HG00336 HG00448 HG01354 NA18609 HG00428 HG00326 NA11894 NA18956 HG00173 HG00117 NA11893 HG01251 HG01441 HG01437 HG00182 HG00330 HG01060 HG00329 NA18960 NA18856 NA07346 NA18871 NA19057 NA18868 NA18636 NA12830 NA19007 NA18910 NA18874 NA19056 NA19064 NA19066 NA18487 NA18642 NA19236 NA07056 NA18637 NA19235 NA19309 NA19311 NA19334 NA19346 NA19347 NA19372 NA19376 NA19383 NA19384 NA19394 NA19428 NA19430 NA19451 NA19466 NA19313 NA19321 NA19324 NA19332 HG00479 HG00608 NA18573 HG00375 NA19248 NA19093 HG01170 HG00534 HG01171 HG01522 NA18624 HG00683 HG01521 NA19005 NA20412 NA18971 HG00446 NA12748 HG00530 HG00690 HG01356 HG01516 NA20532 HG00344 HG00328 NA18542 HG00254 HG00321 HG00577 HG00656 HG00342 HG00524 HG00650 HG00557 HG00319 HG00457 HG00125 HG00578 HG00543 HG00638 HG00171 HG00699 HG00595 HG00187 HG00704 HG00533 HG00596 HG00268 HG01083 HG00651 HG01133 HG00671 HG00327 HG01148 HG00246 HG00672 HG00556 HG00436 HG00554 NA18633 NA20344 NA11993 NA07037 NA11930 HG01366 HG01389 HG00620 NA19740 HG00190 HG00419 NA18535 HG01495 NA18592 HG01497 HG00174 HG01140 NA12287 HG00689 HG01550 HG00334 HG01375 HG00637 NA18507 HG01113 NA18550 NA19129 HG01551 HG01462 HG00331 NA12413 HG01456 HG01360 HG00708 HG01350 HG00684 NA19099 HG00284 NA12399 NA12286 NA12777 HG00277 HG00266 NA19985 HG00353 HG01102 NA07347 NA07051 NA19900 NA18984 NA07048 HG00640 HG01066 NA12812 HG01174 HG01188 NA19390 NA19436 NA19439 NA19440 NA19463 NA19470 NA19471 NA19472 NA19676 NA19660 NA19661 NA19663 NA19722 NA19725 NA19728 NA19729 NA19731 NA19749 NA19755 NA19756 NA19758 NA19770 NA19773 NA19777 NA19780 NA19783 NA20525 NA20589 NA20765 NA20802 NA20804 NA18544 NA18602 NA18546 NA18610 NA18957 NA18615 NA18616 NA19010 NA18638 NA18639 NA18627 NA19072 NA18630 NA19074 NA19080 NA19081 NA19083 NA19085 NA19088 NA20287 NA19835 NA20276 NA19818 NA20278 NA20282 NA20342 NA20296 NA20314 NA20346 NA19712 NA19198 NA19108 NA18934 NA18916 NA18907 NA18917 NA06989 NA12058 NA12341 NA12546 NA12489 HG01197 NA18983 NA11843 NA11892 NA12749
+20     82176   rs11906362      T       C       318     NOT_DESIGNED    BCM.AC=16;DB;SRC=VQSR+2-OF-7
+20     249843  rs112456910     C       T       1304    PASS    BCM.AC=14;DB;SEQUENOM.AC=12;SRC=VQSR+INTERSECTION       GT      0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     .       .       .       0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     0/1     .       .       0/0     0/0     .       0/0     .       .       .       0/0     .       0/0     0/0     0/1     0/0     .       .       .       0/0     .       0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       .       .       .       .       0/0     0/0     .       .       0/0     .       .       0/0     0/0     0/0     .       .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       .       .       .       .       0/0     0/0     .       .       0/1     .       .       0/0     .       0/1     .       0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     .       .       .       .       .       0/0     .       .       .       .       .       0/0     .       0/1     .       .       .       .       0/0     .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     .       .       .       0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     .       .       .       0/0     0/1     0/0     .       .       .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       .       .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     .       .       .       .       .       .       .       0/0     .       0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     .       0/0     .       .       0/0     0/0     .       .       .       .       .       0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       .       0/0     .       .       0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       0/1     0/1     0/0     .       .       0/0     0/0     .       .       0/0     0/1     .       .       0/1     .       .       .       0/0     0/0     0/0     .       .       .       .       .       0/0     .
+20     688672  rs116071340     C       T       56      PASS    BCM.AC=1;DB;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR+2-OF-7       GT      .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     987773  rs6077519       T       G       474     PASS    DB;HW_VIOLATION;SEQUENOM.AC=73;SRC=VQSR-ONLY    GT      .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     1/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     1/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/1     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     1166164 .       G       T       26      NOT_DESIGNED    BCM.AC=20;SRC=VQSR+2-OF-7
+20     1333317 .       A       G       4       PASS    SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR-ONLY     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     1372898 rs112426678     C       A       833     PASS    BCM.AC=7;DB;SEQUENOM.AC=6;SRC=VQSR+INTERSECTION GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     1526045 rs11908182      A       G       847     PASS    BCM.AC=6;DB;SEQUENOM.AC=6;SRC=VQSR+2-OF-7       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     1565049 .       C       T       100     PASS    SEQUENOM.AC=3;SRC=2-OF-7-ONLY   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     1577285 .       G       A       4       HIGH_NO_CALL_RATE       SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR-ONLY     GT      .       .       .       0/0     0/0     .       0/0     .       .       .       0/0     0/0     .       0/0     .       .       0/0     0/0     .       .       .       0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     .       .       0/0     .       .       .       0/0     .       0/0     .       .       .       0/0     .       .       .       .       .       .       0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     .       .       .       0/0     .       .       .       .       .       0/0     0/0     .       .       .       .       0/0     0/0     .       0/0     .       .       0/0     0/0     .       .       .       .       .       0/0     .       0/0     .       .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       .       0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       .       .       0/0     .       .       0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       .       .       .       0/0     .       0/0     .       0/0     .       .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       .       .       0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     .       .       .       0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     .       .       0/0     0/0     .       0/0     .       .       0/0     .       0/0     .       0/0     .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     .       .       .       0/0     .       .       .       0/0     0/0     .       .       0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       .       0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     .       0/0     0/0     .       .       .       .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       .       0/0     0/0     .       .       .       0/0     .       0/0     .       .       .       0/0     .       0/0     0/0     .       .       0/0     .       0/0     0/0     .       .       0/0     .       .       .       .       .       .       0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     .       .       .       0/0     .       .       .       0/0     .       0/0     0/0     .       .       .       .       0/0     0/0     0/0     .       .       .       .       0/0     0/0     .       .       .       .       .       .       0/0     0/0     .       .       .       .       0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     0/0     .       .       .       .       0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     .       0/0     .       0/0     .       .       .       .       .       0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     0/0
+20     1577845 .       G       A       267     HIGH_NO_CALL_RATE       BCM.AC=42;SEQUENOM.AC=5;SRC=VQSR+2-OF-7 GT      0/0     .       .       0/0     .       .       .       .       .       .       0/0     .       .       0/0     .       .       0/0     0/0     .       .       .       .       0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     .       .       0/0     0/0     .       1/1     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     .       .       0/0     .       .       .       .       .       0/0     .       0/0     .       0/0     .       .       .       .       .       .       0/0     .       0/0     .       0/0     .       .       0/0     .       .       .       0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     0/0     .       0/0     .       .       0/0     0/0     0/0     .       .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       .       0/0     0/0     .       0/0     .       .       0/0     .       .       0/0     .       .       0/0     0/0     .       .       0/0     .       .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       .       .       0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     .       .       .       .       .       .       0/0     .       0/0     .       0/0     .       .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       .       .       0/0     .       .       0/0     .       .       .       .       .       0/0     .       .       .       .       0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     .       .       0/0     0/0     .       0/0     .       .       0/0     .       0/0     .       0/0     .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     .       .       .       0/0     0/0     .       .       0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       .       0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     .       0/0     0/0     .       .       .       .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       .       0/0     0/0     .       .       .       0/0     .       0/0     .       .       .       0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       .       0/0     .       0/0     .       .       .       .       .       .       0/0     0/0     .       0/0     .       .       .       0/0     .       .       0/0     0/0     0/0     .       .       .       .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       .       0/0     0/0     .       .       .       .       0/0     .       0/0     0/0     .       .       .       .       0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       .       .       .       0/0     0/0     0/0     .       .       .       .       0/0     0/0     0/1     .       0/0     .       .       .       0/0     .       1/1     .       .       0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     .       .       0/0     0/0
+20     1590306 .       A       G       16      AMBIGUOUS_SEQUENOM_CALLS        SEQUENOM.AC=177;SRC=VQSR-ONLY   GT      0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     .       0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     .       0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     .       0/0     .       0/1     0/1     0/1     .       0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     .       0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       .       .       0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     .       0/1     0/1     0/1     0/1     .       0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     .       0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     .       .       0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     .       0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     .       0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     .       0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0
+20     1643825 .       G       T       24      PASS    BCM.AC=3;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR-ONLY    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     1746733 .       G       A       9       NOT_DESIGNED    SRC=VQSR-ONLY
+20     1896670 .       G       C       16      PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     1934851 rs6045641       T       C       53      NOT_DESIGNED    BCM.AC=29;DB;SRC=VQSR-ONLY
+20     2083617 .       G       A       9       NOT_DESIGNED    BCM.AC=4;SRC=VQSR+2-OF-7
+20     2280790 rs214779        T       A       57436   NOT_DESIGNED    BCM.AC=758;DB;SRC=VQSR+2-OF-7
+20     2843004 rs118020362     T       C       131     PASS    BCM.AC=4;DB;SEQUENOM.AC=4;SRC=VQSR+INTERSECTION GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     2854191 .       C       T       78      POSSIBLE_PROBE_FAILURE  BCM.AC=25;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7 GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     2999522 .       G       A       5       NOT_DESIGNED    SRC=VQSR-ONLY
+20     3935503 .       G       A       95      NOT_DESIGNED    BCM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7
+20     4015187 .       G       C       93      DUPLICATE_MAPPING       BCM.AC=14;SRC=VQSR+2-OF-7
+20     4260976 rs75912589      A       G       8109    PASS    BCM.AC=94;DB;SEQUENOM.AC=95;SRC=VQSR+INTERSECTION       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0
+20     4557512 .       C       A       8       NOT_DESIGNED    SRC=VQSR-ONLY
+20     4603711 .       C       T       20      PASS    SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR-ONLY     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     5021712 rs115278430     C       A       76      NOT_DESIGNED    BCM.AC=2;DB;SRC=VQSR+2-OF-7
+20     5137904 .       C       T       70      PASS    BCM.AC=0;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     5500990 rs116723001     C       A       1701    PASS    BCM.AC=14;DB;SEQUENOM.AC=13;SRC=VQSR+INTERSECTION       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     5524677 .       C       T       21      PASS    BCM.AC=3;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     5601529 rs6085225       G       A       1415    PASS    BCM.AC=33;DB;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     5773125 .       G       A       165     NOT_DESIGNED    BCM.AC=3;SRC=VQSR+INTERSECTION
+20     5986950 rs6085343       G       A       1226    PASS    BCM.AC=68;DB;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     6242013 .       G       A       10      DUPLICATE_MAPPING       SRC=2-OF-7-ONLY
+20     6320495 .       C       A       16      NOT_DESIGNED    BCM.AC=2;SRC=VQSR+2-OF-7
+20     6575066 .       T       C       9.19    PASS    BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=2;SRC=2-OF-7-ONLY  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     7228334 .       A       G       108     PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     7274968 .       C       T       39      PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     7321986 .       C       G       5       PASS    SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     7377337 .       C       T       180     PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR+INTERSECTION    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     7400995 rs114967944     C       T       426     PASS    BCM.AC=8;DB;SEQUENOM.AC=6;SRC=VQSR+INTERSECTION GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     7466093 .       C       G       4.11    PASS    SEQUENOM.AC=0;SRC=2-OF-7-ONLY   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     7575759 rs28491496      A       G       308     POSSIBLE_PROBE_FAILURE  BCM.AC=17;DB;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     7678819 rs11699779      A       G       12976   PASS    BCM.AC=95;DB;SEQUENOM.AC=93;SRC=VQSR+INTERSECTION       GT      .       0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     .       0/1     .       .       0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     .       0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     .       0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1
+20     7924363 .       G       A       301     PASS    BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=3;SRC=VQSR+INTERSECTION    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     8165430 rs61262870      T       C       1699    NOT_DESIGNED    DB;SRC=VQSR+2-OF-7
+20     8642873 .       A       G       19      NOT_DESIGNED    BCM.AC=58;SRC=VQSR+2-OF-7
+20     8700342 .       T       G       102     PASS    BCM.AC=0;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     8799615 .       C       T       38      PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     9149281 .       C       T       11      PASS    BCM.AC=0;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7  GT      .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     9214590 .       T       C       99      PASS    BCM.AC=3;SEQUENOM.AC=3;SRC=VQSR+2-OF-7  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     9276871 .       C       T       695     NOT_DESIGNED    BCM.AC=11;SRC=VQSR+2-OF-7
+20     10226915        rs74843547      G       A       120     PASS    BCM.AC=1;DB;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR+INTERSECTION GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     10259160        .       T       A       10      PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7  GT      .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     10482699        .       G       A       101     PASS    BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR+2-OF-7  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     10625431        .       T       C       17      PASS    BCM.AC=0;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR-ONLY    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     11506447        .       G       C       100     PASS    SEQUENOM.AC=1;SRC=2-OF-7-ONLY   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     11565628        .       G       A       22      PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=3;SRC=VQSR+2-OF-7  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     11625368        rs111669054     A       G       138     PASS    BCM.AC=2;DB;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR+INTERSECTION GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     11798908        .       A       G       14      PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     12006592        .       A       G       57      PASS    SEQUENOM.AC=6;SRC=VQSR+2-OF-7   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     12025988        .       C       T       34      NOT_DESIGNED    BCM.AC=43;SRC=VQSR+2-OF-7
+20     12142653        .       T       A       12      PASS    BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=3;SRC=VQSR+2-OF-7  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     12171235        .       A       G       60      PASS    BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR+2-OF-7  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     12326082        .       C       T       118     NOT_DESIGNED    SRC=VQSR+2-OF-7
+20     12364163        .       A       G       8       PASS    SEQUENOM.AC=2;SRC=2-OF-7-ONLY   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     12718574        rs112953117     G       C       656     PASS    BCM.AC=3;DB;SEQUENOM.AC=3;SRC=VQSR+INTERSECTION GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     13241902        .       A       C       52      PASS    BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7  GT      .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     13339930        rs6042043       A       G       839     NOT_DESIGNED    BCM.AC=143;DB;SRC=VQSR+2-OF-7
+20     13410135        rs77634879      T       A       50      PASS    BCM.AC=39;DB;SEQUENOM.AC=37;SRC=VQSR-ONLY       GT      0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/1     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     13764237        .       C       T       51      NOT_DESIGNED    BCM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7
+20     14283363        rs111719158     G       A       197     NOT_DESIGNED    BCM.AC=6;DB;SRC=VQSR+INTERSECTION
+20     14589314        rs2209596       G       T       30806   INCORRECT_SEQUENOM_CALLS        BCM.AC=253;DB;SEQUENOM.AC=315;SRC=VQSR+INTERSECTION     GT      .       0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     .       0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     .       0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     .       0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     .       0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     .       0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1
+20     14843271        .       A       G       78      NOT_DESIGNED    BCM.AC=343;SRC=VQSR+2-OF-7
+20     15193914        .       C       T       48      PASS    BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     15581882        .       C       G       51      PASS    BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR+2-OF-7  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     15699667        .       C       T       59      PASS    BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=3;SRC=VQSR+2-OF-7  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     15913614        .       G       T       9       PASS    SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     16397068        .       C       G       1.16    PASS    SEQUENOM.AC=0;SRC=2-OF-7-ONLY   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     16475471        rs73597775      C       T       234     HIGH_NO_CALL_RATE       DB;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7        GT      .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     .       .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     16487648        rs12479901      G       A       1025    PASS    BCM.AC=14;DB;SEQUENOM.AC=15;SRC=VQSR+INTERSECTION       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0
+20     16936995        .       C       A       102     PASS    BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR+2-OF-7  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     17430784        .       T       C       18      PASS    BCM.AC=7;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     17828256        .       C       T       77      PASS    BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=4;SRC=VQSR+INTERSECTION    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     17938631        .       T       C       218     PASS    BCM.AC=8;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR+2-OF-7  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     17980474        .       G       A       34      PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     17991241        .       C       T       49      NOT_DESIGNED    SRC=VQSR-ONLY
+20     18180100        .       A       G       100     NOT_DESIGNED    SRC=2-OF-7-ONLY
+20     18198917        .       C       T       15      PASS    SEQUENOM.AC=3;SRC=2-OF-7-ONLY   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     18232143        rs77523268      C       T       952     PASS    BCM.AC=8;DB;SEQUENOM.AC=8;SRC=VQSR+INTERSECTION GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     18584068        .       C       A       81      DUPLICATE_MAPPING       SRC=VQSR-ONLY
+20     19212550        .       C       A       11      PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR-ONLY    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     19966683        rs199601        G       A       56556   PASS    BCM.AC=562;DB;SEQUENOM.AC=560;SRC=VQSR+INTERSECTION     GT      0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     .       1/1     .       1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     1/1
+20     20157470        rs74569344      G       T       159     NOT_DESIGNED    DB;SRC=VQSR-ONLY
+20     20850592        .       G       A       11.30   NOT_DESIGNED    BCM.AC=1;SRC=2-OF-7-ONLY
+20     20987147        .       T       C       58      PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     21056309        .       T       C       12.30   PASS    SEQUENOM.AC=2;SRC=2-OF-7-ONLY   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     21195714        .       A       C       12      NOT_DESIGNED    BCM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7
+20     21477015        .       G       A       140     NOT_DESIGNED    BCM.AC=2;SRC=VQSR+2-OF-7
+20     21491513        .       C       T       11      NOT_DESIGNED    BCM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7
+20     21530607        rs4627653       G       A       3116    PASS    BCM.AC=21;DB;SEQUENOM.AC=21;SRC=VQSR+2-OF-7     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     21569638        .       G       C       35      PASS    BCM.AC=0;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     21579389        .       C       T       169     NOT_DESIGNED    SRC=VQSR-ONLY
+20     21624143        .       T       C       63      PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     21734208        .       A       G       5.74    PASS    SEQUENOM.AC=0;SRC=2-OF-7-ONLY   GT      .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     21754065        .       G       A       16      PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     21764267        .       G       A       164     PASS    BCM.AC=3;SEQUENOM.AC=4;SRC=VQSR+INTERSECTION    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     21863337        .       T       C       174     PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+INTERSECTION    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     21910648        .       C       A       145     PASS    BCM.AC=5;SEQUENOM.AC=4;SRC=VQSR+2-OF-7  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     22016989        .       G       A       7       NOT_DESIGNED    SRC=VQSR-ONLY
+20     22168952        .       G       T       107     PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     23102548        .       G       C       15      PASS    BCM.AC=0;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     23470735        .       A       T       12      NOT_DESIGNED    SRC=VQSR-ONLY
+20     23665595        .       C       T       205     PASS    BCM.AC=4;SEQUENOM.AC=3;SRC=VQSR+2-OF-7  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       .       .       .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     .       .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     0/0     .       .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       .       .       .       0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       .       .       .       0/0     .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       .       .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     .       .       .       0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       .       .       .       0/0     .       .       0/0     0/0     .       .       .       0/0     0/0     .       .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       .       .
+20     23758844        rs117686838     A       T       1.18    NOT_DESIGNED    DB;SRC=2-OF-7-ONLY
+20     23785676        .       G       A       90      PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     24126594        .       C       T       16      PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR+2-OF-7  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     24247752        .       C       T       6107    NOT_DESIGNED    BCM.AC=42;SRC=VQSR+2-OF-7
+20     24432806        .       T       C       21      PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR-ONLY    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     24450030        .       G       A       8       NOT_DESIGNED    SRC=VQSR-ONLY
+20     24792588        .       C       T       17      NOT_DESIGNED    SRC=VQSR+2-OF-7
+20     24875997        rs6106960       T       C       35367   PASS    BCM.AC=238;DB;SEQUENOM.AC=233;SRC=VQSR+INTERSECTION     GT      0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     .       0/0     .       1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     .       0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     .       0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1
+20     25133654        .       G       A       13.40   PASS    SEQUENOM.AC=0;SRC=2-OF-7-ONLY   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     25388911        .       G       T       28      PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     25574143        .       G       A       77      PASS    SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     25659422        .       A       G       11      NOT_DESIGNED    BCM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7
+20     25700728        rs6037216       C       G       1553    POSSIBLE_PROBE_FAILURE  BCM.AC=7;DB;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+INTERSECTION GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     25741857        rs73347142      G       T       41907   PASS    DB;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR-ONLY  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     25750038        .       T       G       86      DUPLICATE_MAPPING       BCM.AC=493;SRC=VQSR-ONLY
+20     25751184        .       G       C       100     DUPLICATE_MAPPING       BCM.AC=180;SRC=2-OF-7-ONLY
+20     25766473        .       T       A       124     DUPLICATE_MAPPING       SRC=VQSR+2-OF-7
+20     25789517        .       A       T       40      DUPLICATE_MAPPING       BCM.AC=319;SRC=VQSR+2-OF-7
+20     25794555        .       G       A       18      DUPLICATE_MAPPING       BCM.AC=181;SRC=VQSR-ONLY
+20     25922316        .       T       C       26      PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     25999667        .       C       G       32      DUPLICATE_MAPPING;INCORRECT_SEQUENOM_CALLS      BCM.AC=61;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR-ONLY   GT      .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     26046637        .       G       A       26      DUPLICATE_MAPPING       BCM.AC=354;SRC=VQSR-ONLY
+20     26057903        .       G       A       100     NOT_DESIGNED    SRC=2-OF-7-ONLY
+20     26071009        .       T       C       9       DUPLICATE_MAPPING;AMBIGUOUS_SEQUENOM_CALLS      BCM.AC=586;SEQUENOM.AC=59;SRC=VQSR-ONLY GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     26126724        .       G       C       23737   PASS    SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR-ONLY     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     26217247        .       C       A       374     PASS    BCM.AC=3;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     26246019        rs79506355      C       A       999     NOT_DESIGNED    DB;SRC=2-OF-7-ONLY
+20     26258231        rs79859288      C       T       527     NOT_DESIGNED    DB;SRC=VQSR+2-OF-7
+20     26265474        .       G       T       460.59  PASS    SEQUENOM.AC=0;SRC=2-OF-7-ONLY   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     26272553        .       C       G       100     PASS    SEQUENOM.AC=0;SRC=2-OF-7-ONLY   GT      .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     26275939        .       A       G       81      NOT_DESIGNED    SRC=2-OF-7-ONLY
+20     26293152        .       T       C       100     PASS    BCM.AC=14;SEQUENOM.AC=17;SRC=2-OF-7-ONLY        GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0
+20     26301426        .       A       G       63      AMBIGUOUS_SEQUENOM_CALLS        SEQUENOM.AC=0;SRC=2-OF-7-ONLY   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     26301793        .       C       G       8       PASS    SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR-ONLY     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     26304696        rs6051307       G       A       100     PASS    DB;SEQUENOM.AC=0;SRC=2-OF-7-ONLY        GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     29494622        rs78775502      C       T       935     PASS    DB;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7        GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     29514290        rs6087354       T       A       19181   AMBIGUOUS_SEQUENOM_CALLS        DB;SEQUENOM.AC=278;SRC=VQSR+2-OF-7      GT      0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     .       0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     .       0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0
+20     29518801        rs113500384     G       A       702.91  PASS    DB;SEQUENOM.AC=0;SRC=2-OF-7-ONLY        GT      .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     29574811        rs73620522      G       A       16281   HIGH_NO_CALL_RATE       DB;SEQUENOM.AC=24;SRC=VQSR-ONLY GT      0/1     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       .       1/1     .       .       0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/1     0/0     .       .       0/0     1/1     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     .       .       0/0     .       .       .       .       0/0     0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       .       .       .       .       0/0     .       0/0     .       0/1     .       .       .       0/1     .       0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/1     0/0     .       .       0/0     .       0/0     .       .       .       0/0     0/0     .       .       0/0     .       .       .       0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     .       0/1     0/0     0/0     .       0/0     .       .       0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       .       0/0     .       0/0     0/0     .       .       .       .       .       0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     .       .       0/0     0/0     .       0/0     .       .       0/0     .       .       .       1/1     .       0/0     0/0     .       .       .       .       0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     .       .       .       0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     .       .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     .       .       .       .       .       .       .       0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       .       .       .       0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       .       .       .       .       .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       .       .       .       .       .       0/0     0/0     0/0     .       0/0     1/1     .       .       .       .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     .       0/0     .       0/1     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     .       .       .       .       0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     0/0     .       .       0/0     0/0     .       0/0     .       1/1     .       .       .       .       .       .       .       1/1     .       .       .       .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       .       .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     .       .       .       0/0     .       .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     .       .       0/0     0/0     0/0     1/1
+20     29598472        rs73612735      T       G       10639   NOT_DESIGNED    DB;SRC=VQSR-ONLY
+20     29632410        .       T       C       5.11    NOT_DESIGNED    SRC=2-OF-7-ONLY
+20     29642272        rs77298479      T       A       100     NOT_DESIGNED    DB;SRC=2-OF-7-ONLY
+20     29827087        rs62641496      G       C       100     NOT_DESIGNED    DB;SRC=2-OF-7-ONLY
+20     30120025        .       C       G       1113    POSSIBLE_PROBE_FAILURE  BCM.AC=9;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     30595334        rs62206358      C       A       62      PASS    BCM.AC=3;DB;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     30616314        .       G       A       176     PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+INTERSECTION    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     30696393        rs76882848      T       C       150     PASS    BCM.AC=3;DB;SEQUENOM.AC=3;SRC=VQSR+2-OF-7       GT      .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     30884360        .       C       A       6       PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR-ONLY    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     30910907        .       A       T       24      NOT_DESIGNED    SRC=VQSR-ONLY
+20     31107862        .       T       C       46      PASS    BCM.AC=6;SEQUENOM.AC=0;SRC=2-OF-7-ONLY  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     31316775        .       T       G       47      PASS    BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR-ONLY    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     31576854        .       C       T       66      PASS    BCM.AC=8;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     32840139        .       G       A       1158    PASS    BCM.AC=11;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+INTERSECTION   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     33588848        .       C       T       17      PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR-ONLY    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     33974818        .       G       A       959     NOT_DESIGNED    BCM.AC=12;SRC=VQSR+INTERSECTION
+20     34147834        rs368386        G       A       105     NOT_DESIGNED    BCM.AC=3;DB;SRC=VQSR+2-OF-7
+20     34155930        .       T       C       1200    NOT_DESIGNED    BCM.AC=23;SRC=VQSR+2-OF-7
+20     34589611        .       C       T       39      PASS    SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     34595073        .       T       G       518     POSSIBLE_PROBE_FAILURE  BCM.AC=4;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+INTERSECTION    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     35255604        .       C       T       367     POSSIBLE_PROBE_FAILURE  BCM.AC=5;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+INTERSECTION    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     35644471        rs8115057       C       T       10677   PASS    BCM.AC=174;DB;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7     GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     36480073        .       T       C       428     PASS    BCM.AC=6;SEQUENOM.AC=6;SRC=VQSR+INTERSECTION    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     36563396        .       G       A       2.68    PASS    SEQUENOM.AC=1;SRC=2-OF-7-ONLY   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     36645837        rs79088417      T       C       342     NOT_DESIGNED    DB;SRC=VQSR+2-OF-7
+20     36667909        .       C       T       659     NOT_DESIGNED    BCM.AC=6;SRC=VQSR+INTERSECTION
+20     36932648        rs5743498       C       T       107     PASS    BCM.AC=3;DB;SEQUENOM.AC=3;SRC=VQSR+INTERSECTION GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     37398143        .       T       A       31      PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR-ONLY    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     37790289        .       G       A       26      PASS    BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR+2-OF-7  GT      .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     37817201        .       A       G       222     PASS    BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     37873327        .       A       T       445     PASS    BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR+2-OF-7  GT      .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     37980382        .       A       G       78      PASS    BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR+INTERSECTION    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     38302429        rs73906408      C       T       5149    PASS    BCM.AC=24;DB;SEQUENOM.AC=24;SRC=VQSR+INTERSECTION       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     38369195        .       C       T       43      DUPLICATE_MAPPING       BCM.AC=56;SRC=VQSR+2-OF-7
+20     38901146        .       C       T       2046    NOT_DESIGNED    BCM.AC=60;SRC=VQSR+2-OF-7
+20     39110108        .       C       T       4.13    PASS    SEQUENOM.AC=0;SRC=2-OF-7-ONLY   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     39624865        .       G       A       584     NOT_DESIGNED    BCM.AC=9;SRC=VQSR+2-OF-7
+20     40505598        .       A       G       16      PASS    SEQUENOM.AC=1;SRC=2-OF-7-ONLY   GT      .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     40927704        .       T       C       12      PASS    BCM.AC=0;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7  GT      .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     41093733        .       T       C       5       NOT_DESIGNED    SRC=VQSR-ONLY
+20     41137712        rs230167        C       T       24      NOT_DESIGNED    DB;SRC=VQSR+2-OF-7
+20     41311175        .       C       T       75      PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     41642529        .       T       G       72      PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     41756929        .       C       T       32      PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     41818162        rs117637352     G       A       391     PASS    BCM.AC=30;DB;SEQUENOM.AC=29;SRC=VQSR+2-OF-7     GT      0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     42153349        .       C       T       25      PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=2-OF-7-ONLY  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     42171267        .       A       G       88.70   PASS    SEQUENOM.AC=13;SRC=2-OF-7-ONLY  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     42330199        .       G       A       590     PASS    BCM.AC=5;SEQUENOM.AC=3;SRC=VQSR+INTERSECTION    GT      .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     42474396        .       G       A       100     PASS    BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR+2-OF-7  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     42483892        .       T       C       112     NOT_DESIGNED    BCM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7
+20     42500754        rs6513891       C       A       619     PASS    DB;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR-ONLY  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     42575810        .       T       C       3.60    PASS    SEQUENOM.AC=2;SRC=2-OF-7-ONLY   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     42762553        rs5014517       C       T       759.47  NOT_DESIGNED    BCM.AC=366;DB;SRC=2-OF-7-ONLY
+20     42908494        .       T       C       42      PASS    BCM.AC=3;SEQUENOM.AC=3;SRC=VQSR+2-OF-7  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     42927494        .       C       G       17      PASS    BCM.AC=3;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR-ONLY    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     43033625        .       G       A       100     NOT_DESIGNED    SRC=2-OF-7-ONLY
+20     43066015        rs6093982       C       T       290     PASS    BCM.AC=2;DB;SEQUENOM.AC=5;SRC=VQSR+2-OF-7       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     43506182        .       T       C       28      PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     43582424        rs79775916      C       T       9       PASS    BCM.AC=1;DB;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     43744100        .       G       C       4.80    PASS    SEQUENOM.AC=0;SRC=2-OF-7-ONLY   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     43899736        .       G       A       35      PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     44373763        .       C       T       730     PASS    BCM.AC=6;SEQUENOM.AC=6;SRC=VQSR+INTERSECTION    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     45097507        rs454429        C       T       25449   PASS    BCM.AC=302;DB;SEQUENOM.AC=300;SRC=VQSR+INTERSECTION     GT      0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/1     .       0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     .       0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     .       0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     .       1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     .       0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     1/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     45919615        .       T       C       46      PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     46997402        rs34772061      C       G       19      NOT_DESIGNED    DB;SRC=VQSR+2-OF-7
+20     47502684        .       G       A       66      PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     48045398        .       A       G       20      PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7  GT      .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     48124745        .       C       T       10.30   PASS    SEQUENOM.AC=1;SRC=2-OF-7-ONLY   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     48422538        rs73269151      A       G       13012   NOT_DESIGNED    BCM.AC=282;DB;SRC=VQSR+INTERSECTION
+20     48669886        rs73276465      G       C       106     NOT_DESIGNED    BCM.AC=8;DB;SRC=VQSR+2-OF-7
+20     48691248        .       A       G       95      PASS    BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7  GT      .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     48917711        rs116072324     T       C       129     NOT_DESIGNED    BCM.AC=1;DB;SRC=VQSR+2-OF-7
+20     49098380        .       A       T       115     PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR+2-OF-7  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     49206794        rs116083969     G       A       19      PASS    BCM.AC=1;DB;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     49360238        .       G       A       50      PASS    BCM.AC=3;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     49712636        rs113933231     T       A       93      PASS    BCM.AC=3;DB;SEQUENOM.AC=3;SRC=VQSR+INTERSECTION GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     50309600        .       C       A       46      PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     50599968        rs6096700       T       C       10667   NOT_DESIGNED    BCM.AC=426;DB;SRC=VQSR+2-OF-7
+20     50601297        .       A       T       7       PASS    BCM.AC=0;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     50603254        rs6021599       A       G       13052   NOT_DESIGNED    BCM.AC=520;DB;SRC=VQSR+2-OF-7
+20     50810123        rs28420712      A       T       2671    NOT_DESIGNED    BCM.AC=228;DB;SRC=VQSR+2-OF-7
+20     50892806        .       A       G       37      NOT_DESIGNED    BCM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7
+20     51511870        .       C       T       116     PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     51818730        .       C       T       130     PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+INTERSECTION    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     51958269        .       G       C       48      PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     52285202        rs113200595     T       G       11071   NOT_DESIGNED    BCM.AC=198;DB;SRC=VQSR+2-OF-7
+20     52308503        .       T       C       651     PASS    BCM.AC=5;SEQUENOM.AC=5;SRC=VQSR+INTERSECTION    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     52470222        rs28606974      A       G       72      NOT_DESIGNED    BCM.AC=22;DB;SRC=VQSR-ONLY
+20     52485230        .       G       T       74      NOT_DESIGNED    BCM.AC=21;SRC=VQSR-ONLY
+20     53017837        rs112388078     T       C       1190    PASS    BCM.AC=8;DB;SEQUENOM.AC=8;SRC=VQSR+2-OF-7       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     53031638        .       T       G       4       PASS    SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     53272023        rs4362623       G       A       70728   PASS    BCM.AC=692;DB;SEQUENOM.AC=690;SRC=VQSR+INTERSECTION     GT      0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     .       1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1
+20     53423667        .       T       A       214     PASS    BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR+INTERSECTION    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     53580904        .       T       C       32      PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR+INTERSECTION    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     53599478        .       C       T       34      NOT_DESIGNED    BCM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7
+20     54004274        rs114966870     A       G       602     PASS    BCM.AC=40;DB;SEQUENOM.AC=9;SRC=VQSR-ONLY        GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     54096380        .       G       A       46      PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     54146938        .       G       A       27      POLYMORPHIC_SAMPLES_FAILED      BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     54163701        .       A       G       130     PASS    BCM.AC=3;SEQUENOM.AC=3;SRC=VQSR+INTERSECTION    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .
+20     54199759        .       T       C       198     NOT_DESIGNED    BCM.AC=9;SRC=VQSR+2-OF-7
+20     54313664        rs112885916     A       T       98      PASS    BCM.AC=10;DB;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     54424603        .       T       C       116     PASS    BCM.AC=8;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     54542220        .       C       T       33      NOT_DESIGNED    SRC=VQSR-ONLY
+20     54628591        .       G       A       87      POLYMORPHIC_SAMPLES_FAILED      BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=4;SRC=VQSR+2-OF-7  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     54793377        .       C       T       8       HIGH_NO_CALL_RATE       BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR-ONLY    GT      .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     0/0     0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .
+20     55067830        .       G       A       6       PASS    SEQUENOM.AC=1;SRC=2-OF-7-ONLY   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     55113534        .       T       G       21      PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     55195413        .       A       G       20      PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=2-OF-7-ONLY  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     55483325        .       C       T       17      NOT_DESIGNED    BCM.AC=1;SRC=VQSR-ONLY
+20     55598554        .       T       C       22.30   PASS    SEQUENOM.AC=1;SRC=2-OF-7-ONLY   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     55790632        .       G       T       39      HIGH_NO_CALL_RATE       BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7  GT      0/0     0/0     .       .       0/0     .       .       .       .       0/0     0/0     .       .       0/0     .       .       0/0     .       .       .       .       .       .       .       0/0     0/0     0/0     .       .       .       0/0     0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     0/0     0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       .       .       .       .       .       0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     .       .       0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       0/0     .       .       0/0     0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     0/0     0/0     .       .       .       .       .       0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     .       .       .       .       .       .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       .       .       .       .       .       0/0     .       .       .       0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     0/0     .       .       .       .       0/0     .       .       .       .       .       .       0/0     0/0     .       .       .       .       .       .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       .       .       .       .       0/0     0/0     .       .       0/0     0/0     0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       .       0/0     .       .       .       .       .       .       .       .       .
+20     55870101        .       C       T       129     PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     56029723        rs74833660      G       A       21      PASS    BCM.AC=1;DB;SEQUENOM.AC=3;SRC=VQSR+2-OF-7       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     56309506        .       C       G       6.38    PASS    SEQUENOM.AC=1;SRC=2-OF-7-ONLY   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     56335703        .       G       C       33      PASS    BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     56549982        rs6099866       T       C       999     PASS    DB;SEQUENOM.AC=9;SRC=2-OF-7-ONLY        GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     56792927        .       C       T       207     PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+INTERSECTION    GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     57266953        .       C       A       46      PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR+2-OF-7  GT      .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     57566637        rs149265        C       T       58555   PASS    BCM.AC=513;DB;SEQUENOM.AC=505;SRC=VQSR+INTERSECTION     GT      1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     .       1/1     1/1     1/1     1/1     .       0/1     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     .       1/1     .       1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     .       1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/0     0/0     0/0     1/1     1/1     0/0     0/0     1/1     0/1     1/1     0/0     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/0     0/1     1/1     0/1     0/0     0/1     1/1     1/1     0/1     0/0     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     .       0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/0     1/1     1/1     0/0     0/1     0/1     0/0     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     .       1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     1/1     0/0     1/1     0/0     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/1     1/1     0/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     1/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/0     0/0     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     1/1     0/1     0/1     0/1     0/1
+20     57653509        rs6026678       C       T       489     PASS    BCM.AC=4;DB;SEQUENOM.AC=4;SRC=VQSR+INTERSECTION GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     57728647        .       C       T       13      PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     58308048        .       A       G       35      PASS    BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=4;SRC=VQSR+2-OF-7  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     1/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     58335635        .       C       T       7       PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     59211281        .       A       G       4.33    PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=2-OF-7-ONLY  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     59286435        .       T       C       5.69    PASS    SEQUENOM.AC=1;SRC=2-OF-7-ONLY   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     60262734        rs73915327      C       A       576     PASS    BCM.AC=10;DB;SEQUENOM.AC=10;SRC=VQSR+INTERSECTION       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/1     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     60291372        .       A       G       100     NOT_DESIGNED    BCM.AC=21;SRC=2-OF-7-ONLY
+20     60520698        .       T       C       428     NOT_DESIGNED    SRC=VQSR-ONLY
+20     60547414        .       G       T       10      PASS    SEQUENOM.AC=0;SRC=2-OF-7-ONLY   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     60560062        .       C       T       25      NOT_DESIGNED    BCM.AC=343;SRC=VQSR-ONLY
+20     60578895        .       G       T       34      PASS    BCM.AC=2;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR+2-OF-7  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     60641243        .       G       A       16      NOT_DESIGNED    BCM.AC=150;SRC=VQSR+2-OF-7
+20     60641369        .       G       A       16      PASS    BCM.AC=159;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7        GT      .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     60730826        .       G       A       11      AMBIGUOUS_SEQUENOM_CALLS        BCM.AC=0;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR-ONLY    GT      .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     61206227        .       C       T       4.25    NOT_DESIGNED    SRC=2-OF-7-ONLY
+20     61286252        rs13433258      C       T       123     PASS    BCM.AC=3;DB;SEQUENOM.AC=2;SRC=VQSR+INTERSECTION GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     61497927        .       A       C       47      PASS    BCM.AC=3;SEQUENOM.AC=0;SRC=2-OF-7-ONLY  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     61766484        .       G       T       58      NOT_DESIGNED    BCM.AC=157;SRC=VQSR+2-OF-7
+20     61788338        .       C       G       7       NOT_DESIGNED    SRC=VQSR-ONLY
+20     61830486        .       G       A       48      PASS    BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=1;SRC=VQSR+2-OF-7  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     62191452        rs113748232     C       T       143     PASS    BCM.AC=7;DB;SEQUENOM.AC=7;SRC=VQSR+INTERSECTION GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/1     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     62462285        .       G       A       66      NOT_DESIGNED    BCM.AC=304;SRC=VQSR+2-OF-7
+20     62480353        .       T       A       100     PASS    SEQUENOM.AC=0;SRC=2-OF-7-ONLY   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     62724959        .       G       T       10      NOT_DESIGNED    SRC=VQSR-ONLY
+20     62888718        .       T       C       57      POLYMORPHIC_SAMPLES_FAILED      BCM.AC=1;SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7  GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     62918298        .       G       A       33      NOT_DESIGNED    SRC=VQSR+2-OF-7
+20     62961477        .       T       C       17      AMBIGUOUS_SEQUENOM_CALLS        SEQUENOM.AC=0;SRC=VQSR+2-OF-7   GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
diff --git a/tests/tabix_data/vcf/8.vcf b/tests/tabix_data/vcf/8.vcf
new file mode 100644 (file)
index 0000000..4ec2daf
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,84 @@
+##fileformat=VCFv4.0
+##FILTER=<ID=HardyWeinbergViolation,Description="The validation is in Hardy-Weinberg violation">
+##FILTER=<ID=HighNoCallRate,Description="The validation no-call rate is too high">
+##FILTER=<ID=TooManyHomVars,Description="The validation homozygous variant rate is too high">
+##INFO=<ID=AC,Number=1,Type=Integer,Description="Allele count in genotypes, for each ALT allele, in the same order as listed">
+##INFO=<ID=AN,Number=1,Type=Integer,Description="Total number of alleles in called genotypes">
+##INFO=<ID=HW,Number=1,Type=Float,Description="Phred-scaled Hardy-Weinberg violation p-value">
+##INFO=<ID=HetPct,Number=1,Type=Float,Description="Percent of heterozygous genotypes">
+##INFO=<ID=HomRefPct,Number=1,Type=Float,Description="Percent of homozygous reference genotypes">
+##INFO=<ID=HomVarPct,Number=1,Type=Float,Description="Percent homozygous variant genotypes">
+##INFO=<ID=NoCallPct,Number=1,Type=Float,Description="Percent of no-calls">
+##ValidationMetrics_HardyWeinbergViolations="25 (8%)"
+##ValidationMetrics_HomVarViolations="0 (0%)"
+##ValidationMetrics_NoCallViolations="13 (4%)"
+##ValidationMetrics_PolymorphicPassingRecords="195 (75%)"
+##ValidationMetrics_RecordsPassingFilters="258 (87%)"
+##ValidationMetrics_RecordsProcessed=296
+##ValidationMetrics_SamplesAssayed=383
+##VariantValidationAssessor="analysis_type=VariantValidationAssessor input_file=[] sample_metadata=[] read_buffer_size=null phone_home=STANDARD read_filter=[] intervals=null excludeIntervals=null reference_sequence=/humgen/1kg/reference/human_g1k_v37.fasta rodBind=[rawData/plink.renamed.sorted.fixed.vcf] rodToIntervalTrackName=null BTI_merge_rule=UNION nonDeterministicRandomSeed=false DBSNP=null downsampling_type=null downsample_to_fraction=null downsample_to_coverage=null baq=OFF baqGapOpenPenalty=40.0 performanceLog=null useOriginalQualities=false defaultBaseQualities=-1 validation_strictness=SILENT unsafe=null num_threads=1 interval_merging=ALL read_group_black_list=null processingTracker=null restartProcessingTracker=false processingTrackerStatusFile=null processingTrackerID=-1 allow_intervals_with_unindexed_bam=false disable_experimental_low_memory_sharding=false logging_level=INFO log_to_file=null help=false out=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub NO_HEADER=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub sites_only=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub maxHardy=20.0 maxNoCall=0.05 maxHomVar=1.1"
+##source=PLINK
+#CHROM POS     ID      REF     ALT     QUAL    FILTER  INFO    FORMAT  HG00127 HG00128 HG00136 HG00137 HG00138 HG00139 HG00152 HG00156 HG00234 HG00235 HG00237 HG00242 HG00244 HG00262 HG01055 HG01079 NA19138 NA18974 NA18523 NA12717 NA19209 NA18577 NA18973 NA18943 NA12873 NA18623 NA18622 NA18948 NA19171 NA19204 NA06994 NA18563 NA18547 NA18861 NA18608 NA18995 NA10851 NA18976 NA18603 NA19200 HG01204 HG01191 HG01101 HG00146 HG00306 NA18985 HG00160 HG00635 HG00372 HG00357 HG00634 NA18541 NA18950 NA19759 HG00351 HG00257 HG00118 HG00336 HG00448 HG01354 NA18609 HG00428 HG00326 NA11894 NA18956 HG00173 HG00117 NA11893 HG01251 HG01441 HG01437 HG00182 HG00330 HG01060 HG00329 NA18960 NA18856 NA07346 NA18871 NA19057 NA18868 NA18636 NA12830 NA19007 NA18910 NA18874 NA19056 NA19064 NA19066 NA18487 NA18642 NA19236 NA07056 NA18637 NA19235 NA19309 NA19311 NA19334 NA19346 NA19347 NA19372 NA19376 NA19383 NA19384 NA19394 NA19428 NA19430 NA19451 NA19466 NA19313 NA19321 NA19324 NA19332 NA19390 NA19436 NA19439 NA19440 NA19463 NA19470 NA19471 NA19472 NA19676 NA19660 NA19661 NA19663 NA19722 NA19725 NA19728 NA19729 NA19731 NA19749 NA19755 NA19756 NA19758 NA19770 NA19773 NA19777 NA19780 NA19783 NA20525 NA20589 NA20765 NA20802 NA20804 NA18544 NA18602 NA18546 NA18610 NA18957 NA18615 NA18616 NA19010 NA18638 NA18639 NA18627 NA19072 NA18630 NA19074 NA19080 NA19081 NA19083 NA19085 NA19088 NA20287 NA19835 NA20276 NA19818 NA20278 NA20282 NA20342 NA20296 NA20314 NA20346 NA19712 NA19198 NA19108 NA18934 NA18916 NA18907 NA18917 NA06989 NA12058 NA12341 NA12546 NA12489 HG01197 NA18983 NA11843 NA11892 NA12749 NA12282 NA12751 NA18959 NA19331 NA19453 NA20537 NA12046 NA20515 NA20516 NA20521 NA20524 NA20528 NA20759 NA20768 NA20769 NA20774 NA20775 NA20783 NA20787 NA20790 NA20800 NA20819 NA20812 NA20505 NA20530 NA20540 NA20538 NA20581 NA20815 NA20544 NA20810 NA20807 NA20816 NA20504 NA20753 NA20502 NA12342 NA19150 NA19468 NA20336 NA19395 NA19257 NA19360 NA19700 NA18867 NA20317 NA18968 NA19107 HG00111 HG00108 NA19077 NA19684 NA18511 NA12044 NA19382 NA19457 NA18933 NA18923 NA18965 HG00141 NA20341 NA18740 HG00537 HG00346 HG01173 HG00702 HG00313 HG00150 NA18612 HG00339 NA12273 HG00250 NA18593 NA18621 HG00478 HG00251 HG01070 NA19160 HG00479 HG00608 NA18573 HG00375 NA19248 NA19093 HG01170 HG00534 HG01171 HG01522 NA18624 HG00683 HG01521 NA19005 NA20412 NA18971 HG00446 NA12748 HG00530 HG00690 HG01356 HG01516 NA20532 HG00344 HG00328 NA18542 HG00254 HG00321 HG00577 HG00656 HG00342 HG00524 HG00650 HG00557 HG00319 HG00457 HG00125 HG00578 HG00543 HG00638 HG00171 HG00699 HG00595 HG00187 HG00704 HG00533 HG00596 HG00268 HG01083 HG00651 HG01133 HG00671 HG00327 HG01148 HG00246 HG00672 HG00556 HG00436 HG00554 NA18633 NA20344 NA11993 NA07037 NA11930 HG01366 HG01389 HG00620 NA19740 HG00190 HG00419 NA18535 HG01495 NA18592 HG01497 HG00174 HG01140 NA12287 HG00689 HG01550 HG00334 HG01375 HG00637 NA18507 HG01113 NA18550 NA19129 HG01551 HG01462 HG00331 NA12413 HG01456 HG01360 HG00708 HG01350 HG00684 NA19099 HG00284 NA12399 NA12286 NA12777 HG00277 HG00266 NA19985 HG00353 HG01102 NA07347 NA07051 NA19900 NA18984 NA07048 HG00640 HG01066 NA12812 HG01174 HG01188
+20     676148  .       A       AC      .       PASS    AC=0;AN=758;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.0       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     1342549 .       A       AAGAT   .       PASS    AC=0;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     1366475 .       CT      C       .       PASS    AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     1550416 .       C       CT      .       PASS    AC=0;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     3700705 .       CTTTGGG C       .       PASS    AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     5724449 .       T       TC      .       PASS    AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     7942727 .       A       AC      .       PASS    AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     9231138 .       AT      A       .       PASS    AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     10090376        .       T       TG      .       PASS    AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     12094344        .       TCAGGAGGC       T       .       PASS    AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     12634463        .       TGA     T       .       PASS    AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     12837095        .       G       GA      .       PASS    AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     12928028        .       TG      T       .       PASS    AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     13365589        .       T       TG      .       PASS    AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     13926445        .       TA      T       .       PASS    AC=0;AN=756;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=98.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     14287634        .       AGT     A       .       PASS    AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     14983337        .       AGCC    A       .       PASS    AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     15037520        .       A       AG      .       PASS    AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     15141272        .       T       TC      .       PASS    AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     16192114        .       AT      A       .       PASS    AC=0;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     16259934        .       C       CAA     .       PASS    AC=0;AN=758;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.0       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     17250858        .       T       TC      .       PASS    AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     17753474        .       C       CA      .       PASS    AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     18520672        .       A       ATT     .       PASS    AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     19188693        .       T       TC      .       PASS    AC=0;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     19437778        .       GGCCTGGGATGTAAA G       .       PASS    AC=0;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     20434198        .       TA      T       .       PASS    AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     20990240        .       TC      T       .       PASS    AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     24710482        .       GT      G       .       PASS    AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     25905250        .       GT      G       .       PASS    AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     29589873        .       CCTT    C       .       PASS    AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     29628180        .       C       CCACAAGAAG      .       PASS    AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     29804699        .       A       AC      .       PASS    AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     30567910        .       T       TG      .       PASS    AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     31760870        .       CG      C       .       PASS    AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     32456076        .       GT      G       .       PASS    AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     32968409        .       GTC     G       .       PASS    AC=0;AN=754;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=98.4;HomVarPct=0.0;NoCallPct=1.6       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     34313574        .       A       AT      .       PASS    AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     35329008        .       ATC     A       .       PASS    AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     37954797        .       A       AGT     .       PASS    AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     39607037        .       C       CA      .       PASS    AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     39868369        .       T       TG      .       PASS    AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     40006262        .       TGAG    T       .       PASS    AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     40110981        .       A       AG      .       PASS    AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     40742257        .       TG      T       .       PASS    AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     41964672        .       A       AT      .       PASS    AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     42145613        .       TG      T       .       PASS    AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     42930748        .       A       AG      .       PASS    AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     43606638        .       T       TC      .       PASS    AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     43826992        .       GC      G       .       PASS    AC=0;AN=748;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=97.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=2.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     44470843        .       GAGTGTCGT       G       .       PASS    AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     45300827        .       CT      C       .       PASS    AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     46353646        .       A       AG      .       PASS    AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     47428163        .       C       CA      .       PASS    AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     49451656        .       T       TG      .       PASS    AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     49561273        .       A       AG      .       PASS    AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     49765611        .       A       AC      .       PASS    AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     50772065        .       T       TC      .       PASS    AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     53538294        .       T       TG      .       PASS    AC=0;AN=764;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.7;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.3       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     54262948        .       A       AC      .       PASS    AC=0;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     55658161        .       GT      G       .       PASS    AC=0;AN=760;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.2;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.8       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     59186675        .       TATTA   T       .       PASS    AC=0;AN=762;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=99.5;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.5       GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     .       0/0     .       0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
+20     61531765        .       AG      A       .       PASS    AC=0;AN=766;HW=0.00;HetPct=0.0;HomRefPct=100.0;HomVarPct=0.0;NoCallPct=0.0      GT      0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0     0/0
diff --git a/tests/tabix_data/vcf/9.vcf b/tests/tabix_data/vcf/9.vcf
new file mode 100644 (file)
index 0000000..e0d112c
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,1000 @@
+##fileformat=VCFv4.0
+#CHROM POS     ID      REF     ALT     QUAL    FILTER  INFO    FORMAT  DNA_pool_A
+chr1   1281168 .       A       G       14      .       DP=37;AF1=0.6243;CI95=0.5,1;DP4=4,0,6,0;MQ=15;PV4=1,0.027,1,1   PL:GT:GQ        43,0,4:0/1:6
+chr1   1281205 .       T       C       26      .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=41 PL:GT:GQ        58,9,0:1/1:63
+chr1   1281206 .       G       C       25      .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=41 PL:GT:GQ        57,9,0:1/1:63
+chr1   1922737 .       G       C       13.2    .       DP=21;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,21;MQ=22 PL:GT:GQ        46,63,0:1/1:99
+chr1   21197513        .       A       G       55.1    .       DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=41   PL:GT:GQ        88,21,0:1/1:84
+chr1   21343209        .       T       C       5.45    .       DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,17,0;MQ=14 PL:GT:GQ        37,51,0:1/1:99
+chr1   22097362        .       T       C       4.75    .       DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=30        PL:GT:GQ        35,9,0:1/1:63
+chr1   22254012        .       A       G       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=50 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr1   22650927        .       G       A       48.1    .       DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=24  PL:GT:GQ        81,21,0:1/1:84
+chr1   23535401        .       C       T       40.4    .       DP=25;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,16,0,5;MQ=19;PV4=1,0.2,1,1 PL:GT:GQ        73,13,0:1/1:65
+chr1   23543855        .       T       C       49.1    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=44 PL:GT:GQ        82,18,0:1/1:90
+chr1   24245107        .       C       G       32      .       DP=4;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,2;MQ=36;PV4=1,1,1,1      PL:GT:GQ        62,0,35:0/1:38
+chr1   24274412        .       G       C       39.5    .       DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=32 PL:GT:GQ        72,12,0:1/1:72
+chr1   36529832        .       C       T       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=46 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr1   37788090        .       A       G       89.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=49 PL:GT:GQ        122,12,0:1/1:72
+chr1   43120440        .       C       T       34      .       DP=3;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,2;MQ=49;PV4=1,1,1,1      PL:GT:GQ        64,0,31:0/1:34
+chr1   43980466        .       C       T       43      .       DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,15;MQ=19 PL:GT:GQ        76,45,0:1/1:99
+chr1   46047795        .       T       C       29.1    .       DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=31 PL:GT:GQ        62,18,0:1/1:90
+chr1   48860309        .       C       T       99      .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=46 PL:GT:GQ        141,18,0:1/1:90
+chr1   49415599        .       T       C       4.61    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=34 PL:GT:GQ        34,6,0:1/1:49
+chr1   51601816        .       G       T       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=50 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr1   51955459        .       G       C       89.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=49 PL:GT:GQ        122,12,0:1/1:72
+chr1   68479569        .       T       G       12      .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:GT:GQ        43,6,0:1/1:49
+chr1   69032455        .       A       G       15.1    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=29 PL:GT:GQ        47,9,0:1/1:63
+chr1   71888225        .       G       T       9.31    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=43 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr1   72381528        .       T       C       44      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=41 PL:GT:GQ        76,9,0:1/1:63
+chr1   82004013        .       A       G       37.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=50 PL:GT:GQ        70,12,0:1/1:72
+chr1   86289622        .       C       T       18      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=42 PL:GT:GQ        50,9,0:1/1:63
+chr1   90267663        .       A       G       22      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=45 PL:GT:GQ        54,9,0:1/1:63
+chr1   92699542        .       A       G       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=45 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr1   94867317        .       G       A       26.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=45 PL:GT:GQ        58,6,0:1/1:49
+chr1   96428713        .       C       G       3.98    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=27 PL:GT:GQ        33,6,0:1/1:49
+chr1   100466329       .       G       C       4.85    .       DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,6;MQ=22  PL:GT:GQ        36,18,0:1/1:90
+chr1   101909281       .       G       A       70      .       DP=11;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,5,0;MQ=46;PV4=1,1,0.096,1    PL:GT:GQ        100,0,88:0/1:91
+chr1   106216572       .       T       A       22      .       DP=18;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,16,0;MQ=21 PL:GT:GQ        55,48,0:1/1:99
+chr1   107901770       .       T       C       9.31    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr1   108431179       .       A       G       99      .       DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=41   PL:GT:GQ        155,24,0:1/1:96
+chr1   112005344       .       C       T       99      .       DP=52;AF1=1;CI95=1,1;DP4=7,0,27,0;MQ=44;PV4=1,1,1,1     PL:GT:GQ        196,25,0:1/1:99
+chr1   116625452       .       C       T       36      .       DP=44;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,23,0,20;MQ=49;PV4=1,2.3e-69,0.42,1     PL:GT:GQ        66,0,179:0/1:69
+chr1   118060710       .       G       T       6.98    .       DP=8;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,3,0;MQ=47;PV4=1,0.0071,1,1 PL:GT:GQ        36,0,73:0/1:39
+chr1   118198177       .       A       G       15.9    .       DP=23;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=43        PL:GT:GQ        47,6,0:1/1:49
+chr1   118586346       .       T       C       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr1   120809555       .       G       A       20      .       DP=8;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=6,0,2,0;MQ=46;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ        50,0,106:0/1:53
+chr1   130723110       .       C       A       20.7    .       DP=8;AF1=0.5939;CI95=0.5,1;DP4=0,6,0,2;MQ=26;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        50,0,5:0/1:7
+chr1   133979895       .       T       C       14.9    .       DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=43 PL:GT:GQ        46,6,0:1/1:49
+chr1   134977940       .       C       T       30      .       DP=3;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,2;MQ=38;PV4=1,1,0.26,1   PL:GT:GQ        60,0,31:0/1:34
+chr1   141768589       .       G       A       18.1    .       DP=15;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,4,0;MQ=51;PV4=1,2.7e-05,1,1  PL:GT:GQ        48,0,100:0/1:51
+chr1   141768590       .       G       A       22      .       DP=15;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,4,0;MQ=50;PV4=1,0.0033,1,1   PL:GT:GQ        52,0,40:0/1:43
+chr1   146506051       .       T       C       44      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=43 PL:GT:GQ        76,9,0:1/1:63
+chr1   150997009       .       G       A       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr1   162915612       .       G       C       13.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr1   168455400       .       A       G       4.12    .       DP=28;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,27;MQ=10 PL:GT:GQ        35,81,0:1/1:99
+chr1   172784744       .       T       C       17.8    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=48 PL:GT:GQ        49,6,0:1/1:49
+chr1   183627307       .       G       A       13.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr1   185789457       .       T       C       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=50 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr1   187081827       .       T       C       4.77    .       DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=17 PL:GT:GQ        36,30,0:1/1:99
+chr1   188468339       .       C       T       33      .       DP=25;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,13;MQ=24 PL:GT:GQ        66,39,0:1/1:99
+chr1   188595435       .       C       T       41.8    .       DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr1   188670561       .       G       C       3.55    .       DP=22;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,9;MQ=18  PL:GT:GQ        34,27,0:1/1:99
+chr1   188924877       .       G       A       6.2     .       DP=10;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=2,0,3,0;MQ=21;PV4=1,1,1,0.3     PL:GT:GQ        35,3,0:1/1:41
+chr1   190536295       .       G       A       68      .       DP=38;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,36,0;MQ=18 PL:GT:GQ        101,108,0:1/1:99
+chr1   191129408       .       T       A       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=48 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr1   195937816       .       T       C       13      .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35 PL:GT:GQ        44,6,0:1/1:49
+chr1   198857619       .       T       C       89      .       DP=61;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,38,0,17;MQ=30;PV4=1,0.032,1,1  PL:GT:GQ        119,0,139:0/1:99
+chr1   199057483       .       T       C       13      .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=32 PL:GT:GQ        44,6,0:1/1:49
+chr1   200133619       .       G       C       5.83    .       DP=49;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=2,0,8,0;MQ=17;PV4=1,0.059,1,0.2      PL:GT:GQ        37,12,0:1/1:72
+chr1   200729661       .       A       T       36      .       DP=15;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,14,0;MQ=27 PL:GT:GQ        69,42,0:1/1:99
+chr1   201374519       .       T       C       69.5    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=39 PL:GT:GQ        102,12,0:1/1:72
+chr1   202811668       .       G       A       20.2    .       DP=4;AF1=0.5163;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,3;MQ=24;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        50,0,12:0/1:15
+chr1   202960650       .       C       T       16.6    .       DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=27 PL:GT:GQ        49,12,0:1/1:72
+chr1   205686638       .       C       T       11.3    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=42 PL:GT:GQ        43,9,0:1/1:63
+chr1   205949857       .       A       G       3.14    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=21 PL:GT:GQ        33,15,0:1/1:75
+chr1   209806643       .       A       G       13.2    .       DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=21   PL:GT:GQ        46,24,0:1/1:96
+chr1   209871501       .       C       T       25      .       DP=12;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=5,0,4,0;MQ=41;PV4=1,7.7e-06,1,1  PL:GT:GQ        55,0,84:0/1:58
+chr1   211051323       .       G       A       99      .       DP=14;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=49  PL:GT:GQ        176,24,0:1/1:96
+chr1   211389716       .       C       T       12      .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=32 PL:GT:GQ        43,6,0:1/1:49
+chr1   211868415       .       G       A       3.54    .       DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,11;MQ=14 PL:GT:GQ        34,33,0:1/1:99
+chr1   211914531       .       C       T       84.5    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,4;MQ=46;PV4=1,1,1,1     PL:GT:GQ        116,7,0:1/1:57
+chr1   214691313       .       A       G       22      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=49 PL:GT:GQ        54,9,0:1/1:63
+chr1   215184650       .       C       T       40.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=46 PL:GT:GQ        72,6,0:1/1:49
+chr1   215995258       .       A       G       68      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=50 PL:GT:GQ        100,9,0:1/1:63
+chr1   217031394       .       G       C       13.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr1   217986960       .       T       C       44      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=36 PL:GT:GQ        76,9,0:1/1:63
+chr1   218086681       .       A       G       99      .       DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,9;MQ=34  PL:GT:GQ        142,27,0:1/1:99
+chr1   218546019       .       A       G       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=50 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr1   218632417       .       G       T       17.1    .       DP=19;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=26  PL:GT:GQ        50,21,0:1/1:84
+chr1   218833355       .       C       G       23      .       DP=7;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=5,0,2,0;MQ=39;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ        53,0,63:0/1:56
+chr1   219303186       .       T       C       7.79    .       DP=25;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,25;MQ=12 PL:GT:GQ        40,75,0:1/1:99
+chr1   219517634       .       G       A       26.5    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=42 PL:GT:GQ        59,12,0:1/1:72
+chr1   219590158       .       T       C       3.27    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=25 PL:GT:GQ        33,12,0:1/1:72
+chr1   219709853       .       A       T       99      .       DP=124;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=80,0,41,0;MQ=44;PV4=1,0.26,1,1  PL:GT:GQ        143,0,156:0/1:99
+chr1   222457988       .       A       G       11.1    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=23 PL:GT:GQ        42,6,0:1/1:49
+chr1   222477914       .       A       G       11.3    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=39 PL:GT:GQ        43,9,0:1/1:63
+chr1   223010233       .       A       G       18.6    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=25 PL:GT:GQ        51,12,0:1/1:72
+chr1   223796360       .       G       A       6.79    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=21 PL:GT:GQ        37,6,0:1/1:49
+chr1   224273784       .       A       T       14.2    .       DP=18;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=15 PL:GT:GQ        47,30,0:1/1:99
+chr1   224454685       .       C       T       46.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=32 PL:GT:GQ        79,15,0:1/1:75
+chr1   224514706       .       G       C       21      .       DP=38;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,38,0;MQ=19 PL:GT:GQ        54,114,0:1/1:99
+chr1   224515793       .       C       T       99      .       DP=26;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,26,0;MQ=45 PL:GT:GQ        211,78,0:1/1:99
+chr1   224692969       .       C       A       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=36 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr1   225607249       .       A       G       34      .       DP=3;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,2,0;MQ=45;PV4=1,1,0,1      PL:GT:GQ        64,0,31:0/1:34
+chr1   226923918       .       C       A       29.1    .       DP=52;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,10;MQ=27;PV4=1,1,1,1   PL:GT:GQ        62,18,0:1/1:90
+chr1   227125189       .       T       C       56.5    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=41 PL:GT:GQ        89,12,0:1/1:72
+chr1   227133712       .       A       T       20.1    .       DP=26;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=11,0,10,0;MQ=23;PV4=1,1,0.48,1   PL:GT:GQ        50,0,39:0/1:42
+chr1   227943954       .       G       C       47      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=37 PL:GT:GQ        79,9,0:1/1:63
+chr1   227943974       .       G       A       33.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=34 PL:GT:GQ        66,12,0:1/1:72
+chr1   228067480       .       A       G       42.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=45 PL:GT:GQ        75,15,0:1/1:75
+chr1   228067510       .       A       G       99      .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=45 PL:GT:GQ        140,15,0:1/1:75
+chr1   228088778       .       C       T       6.79    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=23 PL:GT:GQ        37,6,0:1/1:49
+chr1   228117888       .       A       C       13.9    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=40 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr1   228139641       .       T       C       44.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=35 PL:GT:GQ        77,12,0:1/1:72
+chr1   228577146       .       T       C       26      .       DP=41;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,25,0,14;MQ=22;PV4=1,1,1,0.027  PL:GT:GQ        56,0,77:0/1:59
+chr1   229001369       .       C       A       45      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=41 PL:GT:GQ        77,9,0:1/1:63
+chr1   229001386       .       C       T       8.44    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=42 PL:GT:GQ        39,6,0:1/1:49
+chr1   229348080       .       T       C       18.1    .       DP=3;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,2;MQ=40;PV4=1,0.33,0.17,0.33     PL:GT:GQ        48,0,31:0/1:34
+chr1   229439710       .       C       T       33.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=32 PL:GT:GQ        66,12,0:1/1:72
+chr1   229655149       .       T       C       30      .       DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=30   PL:GT:GQ        63,24,0:1/1:96
+chr1   229660873       .       C       G       81      .       DP=28;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,20,0,7;MQ=36;PV4=1,1,1,1       PL:GT:GQ        111,0,120:0/1:99
+chr2a  3661005 .       C       G       24      .       DP=13;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=7,0,4,0;MQ=27;PV4=1,1.1e-05,1,1       PL:GT:GQ        54,0,34:0/1:37
+chr2a  4140063 .       G       A       81      .       DP=26;AF1=0.6671;CI95=0.5,1;DP4=18,0,8,0;MQ=24;PV4=1,8.3e-09,1,1        PL:GT:GQ        110,0,3:0/1:5
+chr2a  4248440 .       T       C       20      .       DP=28;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=11,0,7,0;MQ=25;PV4=1,1,0.47,1    PL:GT:GQ        50,0,92:0/1:53
+chr2a  4707656 .       A       G       63      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=49 PL:GT:GQ        95,9,0:1/1:63
+chr2a  5194801 .       G       A       7.59    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=24 PL:GT:GQ        38,6,0:1/1:49
+chr2a  14111103        .       A       G       7.84    .       DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=20   PL:GT:GQ        40,21,0:1/1:84
+chr2a  17799746        .       A       G       11.3    .       DP=5;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=0,3,0,2;MQ=32;PV4=1,1,1,1      PL:GT:GQ        41,0,35:0/1:37
+chr2a  24728910        .       G       A       45.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=28 PL:GT:GQ        78,15,0:1/1:75
+chr2a  29627939        .       G       T       5.44    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=27 PL:GT:GQ        36,9,0:1/1:63
+chr2a  31373164        .       C       T       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=44 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr2a  33935228        .       T       C       41.8    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=51 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr2a  36311856        .       G       A       99      .       DP=30;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,29;MQ=44 PL:GT:GQ        213,87,0:1/1:99
+chr2a  39281204        .       T       C       68      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=49 PL:GT:GQ        100,9,0:1/1:63
+chr2a  41087565        .       C       T       74.5    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=38 PL:GT:GQ        107,12,0:1/1:72
+chr2a  45574768        .       C       A       11.3    .       DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=18 PL:GT:GQ        43,9,0:1/1:63
+chr2a  55464464        .       T       C       26.1    .       DP=7;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=5,0,2,0;MQ=26;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        55,1,0:1/1:23
+chr2a  63107673        .       T       A       70.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=34 PL:GT:GQ        103,12,0:1/1:72
+chr2a  63141732        .       A       T       22.8    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=42 PL:GT:GQ        54,6,0:1/1:49
+chr2a  63141910        .       G       A       3.41    .       DP=16;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=32        PL:GT:GQ        32,6,0:1/1:49
+chr2a  63141911        .       C       T       9.55    .       DP=16;AF1=0.5031;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,3;MQ=33;PV4=1,0.43,1,1  PL:GT:GQ        39,0,19:0/1:22
+chr2a  63143543        .       C       T       28      .       DP=18;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,0,17;MQ=16;PV4=1,1,1,1     PL:GT:GQ        61,42,0:1/1:99
+chr2a  66419805        .       G       A       3.69    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=23 PL:GT:GQ        34,15,0:1/1:75
+chr2a  66563922        .       C       T       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=51 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr2a  67719136        .       C       T       39.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=50 PL:GT:GQ        71,6,0:1/1:49
+chr2a  72781453        .       A       C       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=50 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr2a  76733211        .       G       A       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr2a  78190502        .       A       C       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr2a  85021209        .       A       G       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr2a  88554861        .       A       T       39      .       DP=74;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,7,0,4;MQ=46;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        69,0,92:0/1:72
+chr2a  88554877        .       A       G       92      .       DP=90;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,23,0,13;MQ=41;PV4=1,0.3,1,1    PL:GT:GQ        122,0,128:0/1:99
+chr2a  88824857        .       G       A       13.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=37 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr2a  93546675        .       C       T       26      .       DP=6;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,2,0;MQ=46;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ        56,0,87:0/1:59
+chr2a  94788853        .       A       G       34.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=43 PL:GT:GQ        67,15,0:1/1:75
+chr2a  96738146        .       T       C       11.3    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=40 PL:GT:GQ        43,9,0:1/1:63
+chr2a  102737384       .       A       G       12.3    .       DP=18;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,18,0;MQ=11 PL:GT:GQ        45,54,0:1/1:99
+chr2a  103407172       .       A       G       35      .       DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=19   PL:GT:GQ        68,24,0:1/1:96
+chr2a  105774580       .       T       G       99      .       DP=13;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,13,0;MQ=30 PL:GT:GQ        135,39,0:1/1:99
+chr2a  106376301       .       C       G       24.1    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=19 PL:GT:GQ        57,18,0:1/1:90
+chr2a  106376315       .       C       T       8.75    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=19 PL:GT:GQ        41,18,0:1/1:90
+chr2a  112422267       .       C       T       30      .       DP=20;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=14,0,5,0;MQ=39;PV4=1,1,1,1       PL:GT:GQ        60,0,131:0/1:63
+chr2b  3049384 .       A       C       14.9    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=42 PL:GT:GQ        46,6,0:1/1:49
+chr2b  3049385 .       G       C       14.9    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=42 PL:GT:GQ        46,6,0:1/1:49
+chr2b  3049406 .       C       G       99      .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=36 PL:GT:GQ        135,18,0:1/1:90
+chr2b  4213802 .       T       C       89.5    .       DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=49        PL:GT:GQ        122,12,0:1/1:72
+chr2b  5022895 .       G       A       66      .       DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,10;MQ=49 PL:GT:GQ        99,30,0:1/1:99
+chr2b  6037666 .       G       T       56      .       DP=18;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,13;MQ=17 PL:GT:GQ        89,39,0:1/1:99
+chr2b  13656952        .       G       A       19.2    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=21 PL:GT:GQ        52,18,0:1/1:90
+chr2b  15026944        .       A       G       6.79    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=32 PL:GT:GQ        37,6,0:1/1:49
+chr2b  23362613        .       A       G       5.64    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=22 PL:GT:GQ        37,15,0:1/1:75
+chr2b  45947861        .       C       G       68      .       DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,11;MQ=50 PL:GT:GQ        101,33,0:1/1:99
+chr2b  46597824        .       T       C       65.6    .       DP=39;AF1=0.5939;CI95=0.5,1;DP4=23,0,10,0;MQ=22;PV4=1,0.014,1,1 PL:GT:GQ        95,0,5:0/1:7
+chr2b  49665191        .       G       T       34.1    .       DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=37   PL:GT:GQ        67,21,0:1/1:84
+chr2b  61001546        .       A       G       48      .       DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=26   PL:GT:GQ        81,24,0:1/1:96
+chr2b  88502851        .       T       C       4.77    .       DP=4;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,2;MQ=37;PV4=1,1,0.46,1      PL:GT:GQ        33,0,34:0/1:33
+chr2b  91675431        .       C       T       30      .       DP=14;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=27  PL:GT:GQ        63,24,0:1/1:96
+chr2b  91870148        .       T       G       67      .       DP=14;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,0,13;MQ=47;PV4=1,1,1,1     PL:GT:GQ        100,31,0:1/1:99
+chr2b  97066826        .       G       A       20.1    .       DP=9;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=0,6,0,2;MQ=31;PV4=1,1,1,1      PL:GT:GQ        50,0,35:0/1:38
+chr2b  97670822        .       G       A       4.85    .       DP=6;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,6;MQ=18   PL:GT:GQ        36,18,0:1/1:90
+chr2b  102773175       .       A       G       17.1    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=38 PL:GT:GQ        49,9,0:1/1:63
+chr2b  109805532       .       T       C       99      .       DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=45   PL:GT:GQ        176,24,0:1/1:96
+chr2b  110841448       .       A       G       11.1    .       DP=20;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=44        PL:GT:GQ        42,6,0:1/1:49
+chr2b  123217025       .       T       C       31.5    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=37 PL:GT:GQ        64,12,0:1/1:72
+chr2b  123263214       .       A       G       11.3    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=35 PL:GT:GQ        43,9,0:1/1:63
+chr2b  127747292       .       C       T       68      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=52 PL:GT:GQ        100,9,0:1/1:63
+chr2b  130121958       .       A       G       89.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=43 PL:GT:GQ        122,15,0:1/1:75
+chr2b  130253633       .       A       G       14.9    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=42 PL:GT:GQ        46,6,0:1/1:49
+chr2b  130692761       .       C       T       49.1    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=51 PL:GT:GQ        82,18,0:1/1:90
+chr2b  130743365       .       A       G       99      .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=42 PL:GT:GQ        140,15,0:1/1:75
+chr2b  131553874       .       A       C       11.3    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=37 PL:GT:GQ        43,9,0:1/1:63
+chr2b  131716894       .       A       G       99      .       DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=40   PL:GT:GQ        137,24,0:1/1:96
+chr2b  131716936       .       G       A       99      .       DP=14;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,12;MQ=36 PL:GT:GQ        173,36,0:1/1:99
+chr2b  131716952       .       A       G       99      .       DP=22;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,7,0,14;MQ=36;PV4=1,1,1,1       PL:GT:GQ        152,0,43:0/1:46
+chr2b  133360184       .       C       T       99      .       DP=20;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,20;MQ=32 PL:GT:GQ        163,60,0:1/1:99
+chr2b  133644741       .       T       A       16.4    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=27 PL:GT:GQ        49,15,0:1/1:75
+chr2b  133720595       .       T       C       41      .       DP=15;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,12;MQ=29 PL:GT:GQ        74,36,0:1/1:99
+chr2b  133727192       .       C       T       19.3    .       DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=23 PL:GT:GQ        52,15,0:1/1:75
+chr2b  133727260       .       G       A       3.56    .       DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=18   PL:GT:GQ        34,24,0:1/1:95
+chr2b  133800294       .       A       G       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=23 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr2b  134582754       .       A       C       56.1    .       DP=37;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=36  PL:GT:GQ        89,21,0:1/1:84
+chr2b  134582763       .       G       C       78      .       DP=37;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,36;MQ=34 PL:GT:GQ        111,108,0:1/1:99
+chr2b  134809668       .       G       A       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr3   527814  .       C       G       46      .       DP=9;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=6,0,3,0;MQ=43;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ        76,0,106:0/1:79
+chr3   559510  .       G       A       38      .       DP=27;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=10,0,17,0;MQ=28;PV4=1,1,0.014,1  PL:GT:GQ        68,0,111:0/1:71
+chr3   879433  .       T       G       32      .       DP=4;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,2,0;MQ=43;PV4=1,1,1,1      PL:GT:GQ        62,0,34:0/1:37
+chr3   1809645 .       A       G       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=51 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr3   3235812 .       C       T       7.59    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=45 PL:GT:GQ        38,6,0:1/1:49
+chr3   3250176 .       A       G       83      .       DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=32   PL:GT:GQ        116,24,0:1/1:96
+chr3   5049073 .       T       A       99      .       DP=25;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=16,0,9,0;MQ=39;PV4=1,1,1,1       PL:GT:GQ        136,0,129:0/1:99
+chr3   5142874 .       G       A       99      .       DP=38;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,38,0;MQ=28 PL:GT:GQ        179,114,0:1/1:99
+chr3   5554864 .       T       C       3.54    .       DP=7;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=0,4,0,3;MQ=27;PV4=1,1,1,1      PL:GT:GQ        31,0,35:0/1:33
+chr3   5749648 .       G       A       21.2    .       DP=26;AF1=0.7303;CI95=0.5,1;DP4=0,7,0,7;MQ=26;PV4=1,0.16,1,0.17 PL:GT:GQ        50,0,2:0/1:3
+chr3   16451708        .       A       T       71.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=38 PL:GT:GQ        104,15,0:1/1:75
+chr3   23410276        .       G       A       99      .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=45 PL:GT:GQ        140,15,0:1/1:75
+chr3   51368824        .       A       G       28      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=48 PL:GT:GQ        60,9,0:1/1:63
+chr3   53000453        .       A       G       54      .       DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,10;MQ=19 PL:GT:GQ        87,30,0:1/1:99
+chr3   53000463        .       A       G       54      .       DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,10;MQ=19 PL:GT:GQ        87,30,0:1/1:99
+chr3   59077423        .       C       T       77.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=33 PL:GT:GQ        110,15,0:1/1:75
+chr3   60040501        .       T       C       11.3    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=35 PL:GT:GQ        43,9,0:1/1:63
+chr3   64203481        .       A       G       33.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=49 PL:GT:GQ        66,12,0:1/1:72
+chr3   67947441        .       C       T       17.6    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=25 PL:GT:GQ        50,12,0:1/1:72
+chr3   76372631        .       A       G       44      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=36 PL:GT:GQ        76,9,0:1/1:63
+chr3   80611316        .       C       G       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr3   81554381        .       G       T       17.6    .       DP=24;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=26        PL:GT:GQ        50,12,0:1/1:72
+chr3   87614647        .       A       G       13.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=34 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr3   93900455        .       A       T       11.6    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=13 PL:GT:GQ        44,15,0:1/1:75
+chr3   96174457        .       A       G       4.11    .       DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=24 PL:GT:GQ        34,9,0:1/1:63
+chr3   96215569        .       A       C       3.41    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=32 PL:GT:GQ        32,6,0:1/1:49
+chr3   96587998        .       A       C       7.08    .       DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,6,0;MQ=17   PL:GT:GQ        39,18,0:1/1:90
+chr3   99711220        .       A       C       12.8    .       DP=11;AF1=0.9998;CI95=0.5,1;DP4=1,0,2,0;MQ=35;PV4=1,1,1,1       PL:GT:GQ        42,2,0:1/1:37
+chr3   99789741        .       C       G       99      .       DP=18;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,17,0;MQ=47 PL:GT:GQ        210,51,0:1/1:99
+chr3   103667651       .       A       C       3.98    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=37 PL:GT:GQ        33,6,0:1/1:49
+chr3   104604896       .       G       C       55      .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=50 PL:GT:GQ        87,9,0:1/1:63
+chr3   104997217       .       G       A       33.1    .       DP=18;AF1=1;CI95=1,1;DP4=1,0,16,0;MQ=34;PV4=1,3e-10,0.17,0.36   PL:GT:GQ        66,19,0:1/1:76
+chr3   106097816       .       A       G       28      .       DP=15;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,15;MQ=26 PL:GT:GQ        61,45,0:1/1:99
+chr3   106822259       .       G       C       99      .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=50 PL:GT:GQ        140,15,0:1/1:75
+chr3   109946413       .       G       A       13      .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=34 PL:GT:GQ        44,6,0:1/1:49
+chr3   121238963       .       T       C       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=51 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr3   126248567       .       A       G       13.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=33 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr3   129733836       .       A       G       6.2     .       DP=4;AF1=0.5003;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,3,0;MQ=43;PV4=1,0.02,0.31,1        PL:GT:GQ        35,0,28:0/1:30
+chr3   131372785       .       C       T       44      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=34 PL:GT:GQ        76,9,0:1/1:63
+chr3   132290987       .       C       T       22      .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=45 PL:GT:GQ        54,9,0:1/1:63
+chr3   136054421       .       C       T       73      .       DP=82;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,78,0;MQ=28 PL:GT:GQ        106,235,0:1/1:99
+chr3   141075246       .       G       A       30.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=41 PL:GT:GQ        62,6,0:1/1:49
+chr3   141075262       .       T       G       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=41 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr3   141430649       .       G       T       81.8    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,4;MQ=41;PV4=1,0.34,1,0.25       PL:GT:GQ        113,6,0:1/1:49
+chr3   143617747       .       G       T       22      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=29 PL:GT:GQ        54,9,0:1/1:63
+chr3   163576128       .       C       T       5.6     .       DP=4;AF1=0.7302;CI95=0.5,1;DP4=2,0,2,0;MQ=23;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        33,0,2:0/1:3
+chr3   163839828       .       A       G       4.45    .       DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=26 PL:GT:GQ        35,12,0:1/1:72
+chr3   175839340       .       G       T       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=51 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr3   190193258       .       G       T       3.98    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35 PL:GT:GQ        33,6,0:1/1:49
+chr3   190777007       .       G       A       13      .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ        44,6,0:1/1:49
+chr3   190970350       .       A       G       61      .       DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=37 PL:GT:GQ        94,30,0:1/1:99
+chr3   198686408       .       G       A       36.6    .       DP=17;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,16;MQ=25;PV4=1,1,0.026,1       PL:GT:GQ        69,11,0:1/1:66
+chr3   199277478       .       T       C       3.61    .       DP=6;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,6;MQ=21   PL:GT:GQ        34,18,0:1/1:90
+chr3   199780181       .       G       T       77      .       DP=45;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,35,0,10;MQ=33;PV4=1,1,1,1      PL:GT:GQ        107,0,114:0/1:99
+chr3   199889335       .       A       C       9.54    .       DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=18  PL:GT:GQ        42,24,0:1/1:96
+chr3   200018161       .       A       G       13.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=31 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr4   195475  .       A       G       13      .       DP=13;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47        PL:GT:GQ        44,6,0:1/1:49
+chr4   639141  .       C       A       14.9    .       DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=42        PL:GT:GQ        46,6,0:1/1:49
+chr4   639152  .       C       T       15.2    .       DP=17;AF1=0.5016;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,2;MQ=33;PV4=1,1,1,1     PL:GT:GQ        45,0,22:0/1:25
+chr4   986497  .       G       T       99      .       DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=33 PL:GT:GQ        163,30,0:1/1:99
+chr4   986516  .       C       T       55.1    .       DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=37   PL:GT:GQ        88,21,0:1/1:84
+chr4   1207485 .       A       C       14.9    .       DP=22;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=45        PL:GT:GQ        46,6,0:1/1:49
+chr4   1323502 .       G       A       13.2    .       DP=13;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,11,0;MQ=22 PL:GT:GQ        46,33,0:1/1:99
+chr4   1613521 .       G       A       89      .       DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,16,0;MQ=32 PL:GT:GQ        122,48,0:1/1:99
+chr4   1748790 .       C       T       38      .       DP=21;AF1=0.5005;CI95=0.5,0.5;DP4=6,0,8,0;MQ=40;PV4=1,0.09,1,1  PL:GT:GQ        68,0,27:0/1:30
+chr4   2255732 .       T       C       99      .       DP=29;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,28,0;MQ=31 PL:GT:GQ        186,84,0:1/1:99
+chr4   3010159 .       C       T       13.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=31 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr4   3545023 .       A       G       99      .       DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,9;MQ=38   PL:GT:GQ        145,27,0:1/1:99
+chr4   3586344 .       C       T       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=44 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr4   3879337 .       A       G       16.6    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=25 PL:GT:GQ        49,12,0:1/1:72
+chr4   3940733 .       A       G       47.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=31 PL:GT:GQ        80,15,0:1/1:75
+chr4   4410338 .       T       C       13.5    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=31 PL:GT:GQ        46,15,0:1/1:75
+chr4   4796408 .       T       C       41      .       DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,16;MQ=17 PL:GT:GQ        74,48,0:1/1:99
+chr4   4796414 .       A       G       11.3    .       DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,15;MQ=17 PL:GT:GQ        44,45,0:1/1:99
+chr4   6436959 .       T       C       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=50 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr4   9494256 .       T       C       3.41    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=37 PL:GT:GQ        32,6,0:1/1:49
+chr4   24881479        .       G       A       14.1    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=42 PL:GT:GQ        46,9,0:1/1:63
+chr4   26128644        .       A       G       23      .       DP=18;AF1=0.5006;CI95=0.5,0.5;DP4=8,0,10,0;MQ=22;PV4=1,1,1,1    PL:GT:GQ        53,0,26:0/1:29
+chr4   42109100        .       G       A       17.1    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=48 PL:GT:GQ        49,9,0:1/1:63
+chr4   42309652        .       C       T       68      .       DP=17;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=50        PL:GT:GQ        100,9,0:1/1:63
+chr4   46913966        .       C       T       9.08    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=16 PL:GT:GQ        41,12,0:1/1:72
+chr4   50335142        .       A       G       44      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=41 PL:GT:GQ        76,9,0:1/1:63
+chr4   51658550        .       C       A       13      .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=48 PL:GT:GQ        44,6,0:1/1:49
+chr4   58258023        .       T       C       26      .       DP=5;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=0,3,0,2;MQ=34;PV4=1,1,1,0.05   PL:GT:GQ        56,0,32:0/1:35
+chr4   59219112        .       C       A       42.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=50 PL:GT:GQ        75,12,0:1/1:72
+chr4   62746067        .       C       T       13.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr4   67404338        .       G       T       33.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=39 PL:GT:GQ        66,12,0:1/1:72
+chr4   73353380        .       A       G       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr4   73946294        .       G       C       4.77    .       DP=51;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=0,5,0,3;MQ=40;PV4=1,0.19,0.37,0.11    PL:GT:GQ        33,0,64:0/1:36
+chr4   79607484        .       A       G       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr4   82337365        .       G       C       90      .       DP=54;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,16;MQ=28 PL:GT:GQ        123,48,0:1/1:99
+chr4   82653801        .       A       G       4.11    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=29 PL:GT:GQ        34,9,0:1/1:63
+chr4   87130164        .       C       T       11.3    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=26 PL:GT:GQ        43,9,0:1/1:63
+chr4   87130176        .       G       A       11.3    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=26 PL:GT:GQ        43,9,0:1/1:63
+chr4   91459729        .       C       A       13      .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ        44,6,0:1/1:49
+chr4   96130778        .       G       C       99      .       DP=19;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,19;MQ=45 PL:GT:GQ        211,57,0:1/1:99
+chr4   100709417       .       A       G       45.1    .       DP=16;AF1=0.505;CI95=0.5,0.5;DP4=12,0,4,0;MQ=24;PV4=1,1,1,1     PL:GT:GQ        75,0,17:0/1:20
+chr4   107276770       .       C       T       70      .       DP=15;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,9,0,6;MQ=31;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        100,0,97:0/1:98
+chr4   115327550       .       G       C       42      .       DP=67;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,0,66;MQ=35;PV4=1,3.2e-24,0.13,1    PL:GT:GQ        75,162,0:1/1:99
+chr4   136558502       .       A       G       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr4   159572459       .       G       A       15.1    .       DP=126;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,69,0,57;MQ=39;PV4=1,4.1e-96,0.077,1   PL:GT:GQ        45,0,175:0/1:48
+chr4   174968484       .       G       C       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=42 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr4   175030633       .       T       C       14.3    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=29 PL:GT:GQ        47,18,0:1/1:90
+chr4   183410027       .       G       T       6.2     .       DP=31;AF1=0.5003;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,2,0;MQ=45;PV4=1,0.035,1,0.21      PL:GT:GQ        35,0,28:0/1:30
+chr4   190907368       .       T       C       33.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=50 PL:GT:GQ        66,12,0:1/1:72
+chr4   192175690       .       A       G       76.8    .       DP=7;AF1=0.95;CI95=0.5,1;DP4=0,3,0,4;MQ=35;PV4=1,1,1,1  PL:GT:GQ        105,0,0:1/1:10
+chr4   192673268       .       G       A       14.2    .       DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,9,0;MQ=22   PL:GT:GQ        47,27,0:1/1:99
+chr4   192943966       .       T       C       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=44 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr4   195460104       .       C       G       23.1    .       DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=19   PL:GT:GQ        56,24,0:1/1:96
+chr4   198277830       .       A       G       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr5   170098  .       A       G       13      .       DP=12;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=30        PL:GT:GQ        44,6,0:1/1:49
+chr5   395814  .       T       C       4.77    .       DP=4;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,2;MQ=36;PV4=1,1,0.48,1      PL:GT:GQ        33,0,33:0/1:33
+chr5   414024  .       T       A       10.4    .       DP=17;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=20        PL:GT:GQ        42,9,0:1/1:63
+chr5   496767  .       T       C       13.9    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=36 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr5   805676  .       C       G       45      .       DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,17,0;MQ=32 PL:GT:GQ        78,51,0:1/1:99
+chr5   1252896 .       A       G       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr5   1418370 .       G       A       3.65    .       DP=8;AF1=0.7301;CI95=0.5,1;DP4=4,0,4,0;MQ=13;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        30,0,2:0/1:3
+chr5   1494911 .       G       C       62      .       DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=46   PL:GT:GQ        95,24,0:1/1:96
+chr5   1494932 .       C       T       6.98    .       DP=8;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,2,0;MQ=46;PV4=1,0.1,0.077,1        PL:GT:GQ        36,0,31:0/1:33
+chr5   1506037 .       T       C       24.1    .       DP=24;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=11,0,13,0;MQ=16;PV4=1,1,1,1  PL:GT:GQ        55,5,0:1/1:46
+chr5   1509406 .       A       G       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=47 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr5   1733649 .       A       G       99      .       DP=25;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,25;MQ=47 PL:GT:GQ        212,75,0:1/1:99
+chr5   1747304 .       A       G       12.3    .       DP=12;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,12;MQ=19 PL:GT:GQ        45,36,0:1/1:99
+chr5   1747308 .       C       A       44      .       DP=12;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,12;MQ=19 PL:GT:GQ        77,36,0:1/1:99
+chr5   3519783 .       C       T       21.1    .       DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=18   PL:GT:GQ        54,24,0:1/1:96
+chr5   4101593 .       A       G       69.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=43 PL:GT:GQ        102,12,0:1/1:72
+chr5   7204332 .       T       A       4.61    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=24 PL:GT:GQ        34,6,0:1/1:49
+chr5   11510398        .       A       C       34      .       DP=3;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,2,0;MQ=51;PV4=1,1,0,1      PL:GT:GQ        64,0,31:0/1:34
+chr5   15406720        .       T       C       6.02    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=51 PL:GT:GQ        36,6,0:1/1:49
+chr5   25152417        .       C       A       10.9    .       DP=28;AF1=0.5718;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,6;MQ=25;PV4=1,1,0.21,1    PL:GT:GQ        40,0,6:0/1:8
+chr5   39072637        .       A       G       35.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=50 PL:GT:GQ        68,15,0:1/1:75
+chr5   46022699        .       G       A       44      .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=35 PL:GT:GQ        76,9,0:1/1:63
+chr5   55664181        .       C       G       10.4    .       DP=8;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=3,0,5,0;MQ=18;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        40,3,0:1/1:41
+chr5   56253386        .       T       C       50.1    .       DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=36   PL:GT:GQ        83,21,0:1/1:84
+chr5   56253447        .       C       T       42.5    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=45 PL:GT:GQ        75,12,0:1/1:72
+chr5   71950166        .       G       T       11.3    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=40 PL:GT:GQ        43,9,0:1/1:63
+chr5   72703090        .       C       T       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=46 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr5   73570280        .       G       T       5.45    .       DP=41;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,41,0;MQ=15 PL:GT:GQ        37,123,0:1/1:99
+chr5   73701762        .       G       T       40.8    .       DP=13;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=43        PL:GT:GQ        72,6,0:1/1:49
+chr5   76956867        .       T       C       10.2    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=46 PL:GT:GQ        41,6,0:1/1:49
+chr5   79097961        .       C       G       22      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=40 PL:GT:GQ        54,9,0:1/1:63
+chr5   87026167        .       T       C       22      .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=49 PL:GT:GQ        54,9,0:1/1:63
+chr5   97680525        .       T       C       3.27    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=23 PL:GT:GQ        33,12,0:1/1:72
+chr5   100674737       .       C       T       13.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr5   105389966       .       T       C       3.52    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=15 PL:GT:GQ        33,9,0:1/1:63
+chr5   109998341       .       A       C       12.7    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=35 PL:GT:GQ        45,12,0:1/1:72
+chr5   120629105       .       C       T       6.79    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:GT:GQ        37,6,0:1/1:49
+chr5   128383954       .       C       T       23      .       DP=10;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,5,0,5;MQ=48;PV4=1,3.3e-07,1,1  PL:GT:GQ        53,0,98:0/1:56
+chr5   133925142       .       A       G       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr5   135375404       .       T       C       11.8    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=1,0,3,0;MQ=31;PV4=1,0.03,1,1  PL:GT:GQ        42,4,0:1/1:45
+chr5   136498281       .       T       G       13.9    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=37 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr5   136717285       .       A       G       82.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=48 PL:GT:GQ        115,12,0:1/1:72
+chr5   136910734       .       G       A       62      .       DP=19;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,0,13;MQ=23;PV4=1,1,1,1     PL:GT:GQ        95,31,0:1/1:99
+chr5   141208149       .       C       G       13      .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ        44,6,0:1/1:49
+chr5   148056348       .       C       A       37.1    .       DP=4;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=1,0,2,0;MQ=38;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        66,1,0:1/1:23
+chr5   151941534       .       G       T       46.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=34 PL:GT:GQ        79,12,0:1/1:72
+chr5   159967229       .       G       C       22.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=35 PL:GT:GQ        55,12,0:1/1:72
+chr5   174024541       .       T       G       29.5    .       DP=3;AF1=0.9998;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,2;MQ=32;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        59,2,0:1/1:37
+chr5   175525290       .       A       G       3.27    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=20 PL:GT:GQ        33,12,0:1/1:72
+chr5   175988954       .       A       C       14.2    .       DP=23;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,6,0,4;MQ=47;PV4=1,1,0.2,1      PL:GT:GQ        44,0,76:0/1:47
+chr5   176782226       .       T       C       9.31    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=43 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr5   179132834       .       C       G       99      .       DP=28;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,28;MQ=41 PL:GT:GQ        207,84,0:1/1:99
+chr5   180155809       .       G       C       3.01    .       DP=36;AF1=0.4997;CI95=0.5,0.5;DP4=25,0,9,0;MQ=35;PV4=1,1e-15,1,1        PL:GT:GQ        30,0,121:0/1:33
+chr5   181282819       .       T       G       38.3    .       DP=11;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,9;MQ=23;PV4=1,1,1,1    PL:GT:GQ        71,14,0:1/1:70
+chr5   182426125       .       G       C       29      .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=26 PL:GT:GQ        61,9,0:1/1:63
+chr5   182443682       .       G       A       3.69    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=21 PL:GT:GQ        34,15,0:1/1:75
+chr5   183008993       .       C       T       22      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=49 PL:GT:GQ        54,9,0:1/1:63
+chr5   183312016       .       G       T       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=47 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr6_cox_hap1  519146  .       G       A       17.1    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=30 PL:GT:GQ        49,9,0:1/1:63
+chr6_cox_hap1  687497  .       A       G       33      .       DP=6;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=2,0,4,0;MQ=35;PV4=1,0.0016,1,1   PL:GT:GQ        63,3,0:1/1:41
+chr6_qbl_hap2  120066  .       T       C       99      .       DP=12;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,9;MQ=37  PL:GT:GQ        139,27,0:1/1:99
+chr6   277954  .       C       T       53      .       DP=41;AF1=1;CI95=1,1;DP4=4,0,37,0;MQ=19;PV4=1,1,0.3,1   PL:GT:GQ        86,49,0:1/1:99
+chr6   593158  .       A       G       4.61    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=32 PL:GT:GQ        34,6,0:1/1:49
+chr6   2865562 .       T       G       25      .       DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,9,0;MQ=23   PL:GT:GQ        58,27,0:1/1:99
+chr6   3751403 .       G       A       42.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=32 PL:GT:GQ        75,15,0:1/1:75
+chr6   3884989 .       A       G       13.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=36 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr6   4127278 .       A       T       13.9    .       DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr6   5887783 .       C       G       99      .       DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=34   PL:GT:GQ        142,21,0:1/1:84
+chr6   5887811 .       C       T       55.1    .       DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=34   PL:GT:GQ        88,21,0:1/1:84
+chr6   6937170 .       G       C       99      .       DP=47;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,47;MQ=28 PL:GT:GQ        157,141,0:1/1:99
+chr6   7262317 .       C       T       13.2    .       DP=50;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=21,0,9,0;MQ=36;PV4=1,4e-05,0.17,0.26     PL:GT:GQ        43,0,158:0/1:46
+chr6   7533214 .       A       G       10.4    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=26 PL:GT:GQ        42,9,0:1/1:63
+chr6   20979907        .       A       G       44      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=38 PL:GT:GQ        76,9,0:1/1:63
+chr6   22321632        .       A       G       41      .       DP=5;AF1=0.5004;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,3,0;MQ=46;PV4=1,0.24,0.19,0.33     PL:GT:GQ        71,0,28:0/1:31
+chr6   25352296        .       G       A       7.8     .       DP=4;AF1=0.5003;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,3;MQ=38;PV4=1,1,0.16,1   PL:GT:GQ        37,0,28:0/1:30
+chr6   26298040        .       T       A       34      .       DP=3;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,2;MQ=48;PV4=1,1,0.21,0.33        PL:GT:GQ        64,0,31:0/1:34
+chr6   33428755        .       G       A       70      .       DP=14;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,9,0;MQ=32  PL:GT:GQ        103,27,0:1/1:99
+chr6   39512099        .       G       A       55.1    .       DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=50   PL:GT:GQ        88,21,0:1/1:84
+chr6   39961094        .       G       A       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr6   40452120        .       A       G       40.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=42 PL:GT:GQ        72,6,0:1/1:49
+chr6   43204766        .       A       G       99      .       DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=51   PL:GT:GQ        176,24,0:1/1:96
+chr6   52696512        .       C       T       70      .       DP=76;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,34,0,42;MQ=18;PV4=1,0.11,1,1   PL:GT:GQ        100,0,51:0/1:54
+chr6   53785550        .       A       G       99      .       DP=20;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,10;MQ=46 PL:GT:GQ        190,30,0:1/1:99
+chr6   53897484        .       C       T       13.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=36 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr6   57038290        .       C       T       10.2    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=36 PL:GT:GQ        41,6,0:1/1:49
+chr6   62925087        .       G       C       35      .       DP=5;AF1=0.5008;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,4,0;MQ=36;PV4=1,1,0.2,1    PL:GT:GQ        65,0,25:0/1:28
+chr6   62925094        .       T       C       25.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=36 PL:GT:GQ        58,15,0:1/1:75
+chr6   70834405        .       G       A       72.1    .       DP=13;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=29  PL:GT:GQ        105,21,0:1/1:84
+chr6   71026058        .       C       T       48.1    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=42 PL:GT:GQ        81,18,0:1/1:90
+chr6   74420752        .       T       C       44      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=39 PL:GT:GQ        76,9,0:1/1:63
+chr6   77498624        .       T       C       16.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=33 PL:GT:GQ        48,6,0:1/1:49
+chr6   80416836        .       T       C       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=50 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr6   113611590       .       A       G       68      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=46 PL:GT:GQ        100,9,0:1/1:63
+chr6   119308431       .       T       C       38.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=40 PL:GT:GQ        71,12,0:1/1:72
+chr6   151758592       .       T       C       3.07    .       DP=17;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=0,8,0,9;MQ=13;PV4=1,1,1,1       PL:GT:GQ        29,1,0:1/1:23
+chr6   151759358       .       A       G       99      .       DP=27;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=12,0,15,0;MQ=44;PV4=1,1,1,0.19   PL:GT:GQ        171,0,128:0/1:99
+chr6   154741755       .       G       A       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=50 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr6   161061053       .       C       A       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=52 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr6   161474189       .       C       T       6.02    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ        36,6,0:1/1:49
+chr6   164304657       .       C       T       10.4    .       DP=63;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,29,0,19;MQ=22;PV4=1,7.7e-11,1,0.049    PL:GT:GQ        40,0,37:0/1:38
+chr6   164703105       .       T       C       99      .       DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,10;MQ=40 PL:GT:GQ        165,30,0:1/1:99
+chr6   167518328       .       A       G       78      .       DP=41;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=27,0,14,0;MQ=33;PV4=1,0.026,0.43,0.056   PL:GT:GQ        108,0,149:0/1:99
+chr6   169906323       .       G       A       41.8    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr6   171893912       .       G       A       69.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=33 PL:GT:GQ        102,15,0:1/1:75
+chr6   173631604       .       A       G       6.98    .       DP=7;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,3,0;MQ=37;PV4=1,0.069,1,1     PL:GT:GQ        36,0,34:0/1:35
+chr7   835856  .       C       T       27.5    .       DP=13;AF1=0.9998;CI95=0.5,1;DP4=4,0,6,0;MQ=23;PV4=1,0.46,1,1    PL:GT:GQ        57,2,0:1/1:37
+chr7   1046005 .       C       T       11.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=36 PL:GT:GQ        43,9,0:1/1:63
+chr7   1564339 .       C       T       71      .       DP=66;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=36,0,24,0;MQ=29;PV4=1,1,0.35,1   PL:GT:GQ        101,0,134:0/1:99
+chr7   1806266 .       C       T       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr7   1936013 .       G       T       7.77    .       DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=17 PL:GT:GQ        39,9,0:1/1:63
+chr7   2319532 .       C       A       4.11    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=14 PL:GT:GQ        34,9,0:1/1:63
+chr7   2682121 .       C       T       13      .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=33 PL:GT:GQ        44,6,0:1/1:49
+chr7   3248116 .       T       C       36.5    .       DP=3;AF1=0.9998;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,2;MQ=37;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        66,2,0:1/1:37
+chr7   3624766 .       C       T       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=41 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr7   5291140 .       G       C       13.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=37 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr7   5314457 .       C       A       3.56    .       DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=18   PL:GT:GQ        34,24,0:1/1:95
+chr7   5595072 .       T       A       79      .       DP=13;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=8,0,5,0;MQ=31;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        109,0,57:0/1:60
+chr7   5646060 .       G       C       7.79    .       DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=10 PL:GT:GQ        40,30,0:1/1:99
+chr7   6056816 .       C       G       7.08    .       DP=6;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,3;MQ=23;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        35,1,0:1/1:23
+chr7   6412641 .       C       T       40      .       DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,11,0;MQ=33 PL:GT:GQ        73,33,0:1/1:99
+chr7   6766874 .       A       G       34.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=43 PL:GT:GQ        67,15,0:1/1:75
+chr7   8482729 .       C       T       5.08    .       DP=16;AF1=0.8276;CI95=0.5,1;DP4=3,0,3,0;MQ=22;PV4=1,1,1,0.19    PL:GT:GQ        32,0,1:1/1:5
+chr7   9238362 .       G       A       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr7   9687781 .       G       A       33      .       DP=29;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,16,0,12;MQ=48;PV4=1,6.5e-38,1,1        PL:GT:GQ        63,0,170:0/1:66
+chr7   9752803 .       A       T       14.2    .       DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,9,0;MQ=18  PL:GT:GQ        47,27,0:1/1:99
+chr7   10240910        .       T       C       45.5    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=35 PL:GT:GQ        78,12,0:1/1:72
+chr7   11046187        .       C       T       86.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=47 PL:GT:GQ        119,12,0:1/1:72
+chr7   11548207        .       C       G       14.6    .       DP=13;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=6,1,0,5;MQ=18;PV4=0.015,1,1,1        PL:GT:GQ        46,7,0:1/1:57
+chr7   11580317        .       C       T       42      .       DP=12;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,0,10;MQ=22;PV4=1,1,1,1     PL:GT:GQ        75,23,0:1/1:92
+chr7   11585384        .       G       A       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=46 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr7   13498356        .       A       G       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=47 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr7   13500887        .       G       A       15.1    .       DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=22 PL:GT:GQ        48,30,0:1/1:99
+chr7   13827079        .       C       T       6.02    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:GT:GQ        36,6,0:1/1:49
+chr7   14403976        .       T       G       59      .       DP=30;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=39  PL:GT:GQ        92,24,0:1/1:96
+chr7   14756588        .       A       G       44      .       DP=15;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=5,0,10,0;MQ=44;PV4=1,5.3e-18,1,1 PL:GT:GQ        74,0,70:0/1:72
+chr7   14756619        .       T       G       44      .       DP=15;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=5,0,10,0;MQ=44;PV4=1,6.4e-10,1,1 PL:GT:GQ        74,0,70:0/1:72
+chr7   36734598        .       A       C       11.1    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=40 PL:GT:GQ        42,6,0:1/1:49
+chr7   36734599        .       A       T       11.1    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=40 PL:GT:GQ        42,6,0:1/1:49
+chr7   36734603        .       G       C       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=40 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr7   40634921        .       A       C       55      .       DP=13;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,13,0;MQ=39 PL:GT:GQ        88,39,0:1/1:99
+chr7   48271285        .       A       T       73      .       DP=15;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=25 PL:GT:GQ        106,30,0:1/1:99
+chr7   56264700        .       G       A       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=51 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr7   62326003        .       C       A       26.1    .       DP=35;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=28        PL:GT:GQ        59,18,0:1/1:90
+chr7   109468934       .       T       G       5.13    .       DP=10;AF1=0.9998;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,2;MQ=39;PV4=1,0.031,1,1   PL:GT:GQ        33,2,0:1/1:37
+chr7   110208327       .       C       G       16.9    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=44 PL:GT:GQ        48,6,0:1/1:49
+chr7   125654934       .       A       G       4.11    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=27 PL:GT:GQ        34,9,0:1/1:63
+chr7   125770209       .       A       C       32      .       DP=31;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=11,0,13,0;MQ=34;PV4=1,0.00017,0.16,0.22  PL:GT:GQ        62,0,105:0/1:65
+chr7   125770265       .       G       C       36      .       DP=16;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,5,0,5;MQ=48;PV4=1,0.0047,0.016,0.035   PL:GT:GQ        66,0,110:0/1:69
+chr7   126687042       .       A       G       21.1    .       DP=36;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=22  PL:GT:GQ        54,21,0:1/1:84
+chr7   132292897       .       G       T       99      .       DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=43   PL:GT:GQ        167,21,0:1/1:84
+chr7   132334562       .       A       C       23      .       DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,10;MQ=23 PL:GT:GQ        56,30,0:1/1:99
+chr7   132431838       .       C       T       13.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=1,0,4,0;MQ=23;PV4=1,1,1,1     PL:GT:GQ        44,5,0:1/1:46
+chr7   136324945       .       T       C       13.7    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=35 PL:GT:GQ        46,12,0:1/1:72
+chr7   136957634       .       G       A       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=43 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr7   141746871       .       G       A       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=42 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr7   146831870       .       C       T       4.77    .       DP=14;AF1=0.5003;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,3,0;MQ=37;PV4=1,0.0029,0.28,1     PL:GT:GQ        33,0,28:0/1:30
+chr7   147142770       .       T       C       45      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=31 PL:GT:GQ        77,9,0:1/1:63
+chr7   147713906       .       C       T       4.77    .       DP=8;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,4,0;MQ=35;PV4=1,8.9e-06,0.48,0.27  PL:GT:GQ        33,0,29:0/1:31
+chr7   148742642       .       G       A       68      .       DP=14;AF1=0.5032;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,10,0;MQ=28;PV4=1,1,1,1    PL:GT:GQ        98,0,19:0/1:22
+chr7   148879148       .       C       T       22      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=48 PL:GT:GQ        54,9,0:1/1:63
+chr7   149484407       .       A       G       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=45 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr7   152444478       .       A       G       13      .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=36 PL:GT:GQ        44,6,0:1/1:49
+chr7   154106613       .       C       T       68      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=51 PL:GT:GQ        100,9,0:1/1:63
+chr7   154776891       .       G       T       14.4    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=31 PL:GT:GQ        47,15,0:1/1:75
+chr7   155882061       .       A       C       29      .       DP=24;AF1=0.502;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,4;MQ=46;PV4=1,0.018,0.15,0.29    PL:GT:GQ        59,0,21:0/1:24
+chr7   155956844       .       G       C       23      .       DP=11;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,7,0,4;MQ=38;PV4=1,1,0.38,1     PL:GT:GQ        53,0,103:0/1:56
+chr7   156277694       .       G       A       62      .       DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=46   PL:GT:GQ        95,24,0:1/1:96
+chr7   156720588       .       T       C       16.1    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=29 PL:GT:GQ        48,9,0:1/1:63
+chr7   156807649       .       T       C       3.01    .       DP=30;AF1=0.4997;CI95=0.5,0.5;DP4=0,4,0,3;MQ=43;PV4=1,0.16,0.15,1       PL:GT:GQ        30,0,72:0/1:33
+chr7   157331292       .       G       T       43.1    .       DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=34   PL:GT:GQ        76,21,0:1/1:84
+chr7   157382957       .       T       C       33.5    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=43 PL:GT:GQ        66,12,0:1/1:72
+chr8   556382  .       A       G       37.1    .       DP=5;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=2,0,3,0;MQ=31;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        66,1,0:1/1:23
+chr8   1661673 .       T       C       9.31    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr8   7379751 .       C       A       6.24    .       DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=19   PL:GT:GQ        38,21,0:1/1:84
+chr8   8160505 .       A       T       68.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=35 PL:GT:GQ        101,12,0:1/1:72
+chr8   8160508 .       C       T       24.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=35 PL:GT:GQ        57,12,0:1/1:72
+chr8   16781011        .       A       G       55.5    .       DP=9;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=34 PL:GT:GQ        88,12,0:1/1:72
+chr8   18716499        .       A       T       20      .       DP=10;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,4,0,2;MQ=29;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        50,0,52:0/1:51
+chr8   23326483        .       A       G       60      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=47 PL:GT:GQ        92,9,0:1/1:63
+chr8   25842819        .       T       A       12      .       DP=18;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=47        PL:GT:GQ        43,6,0:1/1:49
+chr8   26300279        .       T       C       34      .       DP=44;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,41,0;MQ=21 PL:GT:GQ        67,123,0:1/1:99
+chr8   29673470        .       A       G       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=41 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr8   29673473        .       C       G       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=41 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr8   31685466        .       C       T       34      .       DP=17;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=10,0,5,0;MQ=28;PV4=1,0.072,1,0.36        PL:GT:GQ        64,0,50:0/1:53
+chr8   37378739        .       C       T       13.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=34 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr8   51325952        .       G       A       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr8   59221963        .       G       A       16.1    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=29 PL:GT:GQ        48,9,0:1/1:63
+chr8   62764995        .       T       G       20      .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=32 PL:GT:GQ        52,9,0:1/1:63
+chr8   63157426        .       C       G       41.6    .       DP=22;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,7,0,15;MQ=19;PV4=1,1,1,0.25        PL:GT:GQ        74,11,0:1/1:66
+chr8   68710444        .       G       A       30      .       DP=5;AF1=0.6671;CI95=0.5,1;DP4=3,0,2,0;MQ=32;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        59,0,3:0/1:5
+chr8   76416560        .       G       A       89.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=46 PL:GT:GQ        122,12,0:1/1:72
+chr8   81425275        .       T       G       68      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=50 PL:GT:GQ        100,9,0:1/1:63
+chr8   89842286        .       G       C       4.61    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=30 PL:GT:GQ        34,6,0:1/1:49
+chr8   100926281       .       G       A       38      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=41 PL:GT:GQ        70,9,0:1/1:63
+chr8   102746002       .       G       C       13.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr8   107850176       .       C       T       43.1    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=45 PL:GT:GQ        76,18,0:1/1:90
+chr8   109966441       .       T       C       27.3    .       DP=9;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=38 PL:GT:GQ        60,15,0:1/1:75
+chr8   118811716       .       G       T       99      .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=50 PL:GT:GQ        155,18,0:1/1:90
+chr8   119440254       .       A       T       58.5    .       DP=5;AF1=0.8277;CI95=0.5,1;DP4=2,0,3,0;MQ=34;PV4=1,1,1,0.14     PL:GT:GQ        87,0,1:1/1:5
+chr8   121236024       .       G       A       39.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=48 PL:GT:GQ        71,6,0:1/1:49
+chr8   125489079       .       C       T       13      .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ        44,6,0:1/1:49
+chr8   128502549       .       A       G       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=45 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr8   128502551       .       A       G       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=45 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr8   130951113       .       G       A       4.61    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=19 PL:GT:GQ        34,6,0:1/1:49
+chr8   135307123       .       G       A       6.02    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=45 PL:GT:GQ        36,6,0:1/1:49
+chr8   138814155       .       C       T       57.1    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=46 PL:GT:GQ        90,18,0:1/1:90
+chr8   140566111       .       A       G       18.1    .       DP=12;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,12;MQ=15 PL:GT:GQ        51,36,0:1/1:99
+chr8   141586480       .       T       G       44      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=40 PL:GT:GQ        76,9,0:1/1:63
+chr8   143376712       .       A       G       13      .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35 PL:GT:GQ        44,6,0:1/1:49
+chr8   150662729       .       T       C       9.31    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr8   150741294       .       A       G       25.1    .       DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=34 PL:GT:GQ        58,18,0:1/1:90
+chr8   150975618       .       A       G       9.31    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr8   151580103       .       T       C       6.02    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=20 PL:GT:GQ        36,6,0:1/1:49
+chr8   151634410       .       G       T       48      .       DP=17;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,12,0,5;MQ=39;PV4=1,0.072,1,1   PL:GT:GQ        78,0,125:0/1:81
+chr8   151709267       .       G       A       91.1    .       DP=8;AF1=0.5064;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,7;MQ=40;PV4=1,1,0.28,0.37        PL:GT:GQ        121,0,16:0/1:19
+chr8   152636420       .       G       A       8.75    .       DP=3;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,2;MQ=30;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        37,1,0:1/1:23
+chr8   152706967       .       G       A       3.01    .       DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=16 PL:GT:GQ        33,30,0:1/1:99
+chr8   152786522       .       T       C       80.1    .       DP=16;AF1=0.5102;CI95=0.5,0.5;DP4=0,4,0,12;MQ=31;PV4=1,0.25,1,1 PL:GT:GQ        110,0,14:0/1:17
+chr8   152863132       .       T       G       5.44    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=30 PL:GT:GQ        36,9,0:1/1:63
+chr9   23235268        .       C       T       12      .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=32 PL:GT:GQ        43,6,0:1/1:49
+chr9   26391176        .       T       C       15.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35 PL:GT:GQ        47,6,0:1/1:49
+chr9   26868232        .       C       G       63      .       DP=20;AF1=0.5025;CI95=0.5,0.5;DP4=7,0,13,0;MQ=22;PV4=1,0.2,1,0.44       PL:GT:GQ        93,0,20:0/1:23
+chr9   34223668        .       C       T       22      .       DP=16;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,9,0,7;MQ=27;PV4=1,0.14,0.34,1  PL:GT:GQ        52,0,79:0/1:55
+chr9   39696645        .       G       A       11.3    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=41 PL:GT:GQ        43,9,0:1/1:63
+chr9   40654130        .       T       G       13      .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:GT:GQ        44,6,0:1/1:49
+chr9   41145321        .       T       G       46.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=33 PL:GT:GQ        79,12,0:1/1:72
+chr9   42273483        .       G       A       9.31    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr9   55633192        .       C       T       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr9   58705807        .       T       C       70      .       DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=24 PL:GT:GQ        103,30,0:1/1:99
+chr9   61697149        .       C       G       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr9   63152790        .       A       C       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr9   63703913        .       C       G       90.1    .       DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=38   PL:GT:GQ        123,21,0:1/1:84
+chr9   65116068        .       T       C       70      .       DP=13;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,13;MQ=49 PL:GT:GQ        103,39,0:1/1:99
+chr9   71266598        .       C       A       3.98    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35 PL:GT:GQ        33,6,0:1/1:49
+chr9   73188677        .       G       T       52      .       DP=294;AF1=1;CI95=1,1;DP4=44,0,245,0;MQ=33;PV4=1,0.28,0.0092,1  PL:GT:GQ        85,147,0:1/1:99
+chr9   78854179        .       G       T       22      .       DP=97;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=21,0,12,0;MQ=44;PV4=1,0.02,0.032,0.0033  PL:GT:GQ        52,0,158:0/1:55
+chr9   82964679        .       A       C       13.2    .       DP=19;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=36        PL:GT:GQ        45,9,0:1/1:63
+chr9   84124545        .       G       T       57      .       DP=11;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,3,0;MQ=49;PV4=1,1,0.024,1    PL:GT:GQ        87,0,59:0/1:62
+chr9   86552862        .       C       T       14.4    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=26 PL:GT:GQ        47,15,0:1/1:75
+chr9   87548941        .       A       G       22      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=49 PL:GT:GQ        54,9,0:1/1:63
+chr9   89021101        .       G       A       89.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=49 PL:GT:GQ        122,12,0:1/1:72
+chr9   90447825        .       G       A       9.31    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=46 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr9   92462035        .       C       A       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=36 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr9   93077294        .       T       G       5.44    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=31 PL:GT:GQ        36,9,0:1/1:63
+chr9   93998137        .       G       A       68      .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=46 PL:GT:GQ        100,9,0:1/1:63
+chr9   93998148        .       C       T       21.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=36 PL:GT:GQ        54,15,0:1/1:75
+chr9   95028964        .       C       A       99      .       DP=83;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,57,0,26;MQ=32;PV4=1,9.3e-08,1,0.092    PL:GT:GQ        134,0,120:0/1:99
+chr9   103829155       .       A       G       33      .       DP=96;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,96,0;MQ=16 PL:GT:GQ        66,255,0:1/1:99
+chr9   104981331       .       C       T       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=43 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr9   111070656       .       G       A       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr9   117395657       .       T       C       16.4    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=23 PL:GT:GQ        49,15,0:1/1:75
+chr9   117718907       .       A       G       46.1    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=29 PL:GT:GQ        79,18,0:1/1:90
+chr9   119149161       .       T       C       3.14    .       DP=65;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=22        PL:GT:GQ        33,15,0:1/1:75
+chr9   124528802       .       G       A       78      .       DP=23;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,13,0;MQ=25 PL:GT:GQ        111,39,0:1/1:99
+chr9   126707903       .       G       A       26      .       DP=37;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,21,0,8;MQ=46;PV4=1,2.6e-07,0.21,0.42   PL:GT:GQ        56,0,175:0/1:59
+chr9   128700686       .       C       G       33.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=50 PL:GT:GQ        66,12,0:1/1:72
+chr9   129084077       .       G       A       11.3    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=41 PL:GT:GQ        43,9,0:1/1:63
+chr9   129116900       .       A       T       20      .       DP=13;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=30        PL:GT:GQ        52,9,0:1/1:63
+chr9   130290720       .       C       G       21.8    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=42 PL:GT:GQ        53,6,0:1/1:49
+chr9   130306057       .       C       G       71      .       DP=14;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,14,0;MQ=28 PL:GT:GQ        104,42,0:1/1:99
+chr9   130528990       .       G       A       99      .       DP=31;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,31,0;MQ=27 PL:GT:GQ        174,93,0:1/1:99
+chr9   130529002       .       A       T       7.79    .       DP=30;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,11,0;MQ=15 PL:GT:GQ        40,33,0:1/1:99
+chr9   130639996       .       A       G       8.44    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=51 PL:GT:GQ        39,6,0:1/1:49
+chr9   130704890       .       A       G       3.27    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=26 PL:GT:GQ        33,12,0:1/1:72
+chr9   130708345       .       G       A       13.3    .       DP=11;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,3;MQ=38;PV4=1,0.096,1,1   PL:GT:GQ        42,1,0:1/1:23
+chr9   131001601       .       T       A       3.98    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=31 PL:GT:GQ        33,6,0:1/1:49
+chr9   131058539       .       T       A       13      .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=44 PL:GT:GQ        44,6,0:1/1:49
+chr9   131808965       .       C       T       42      .       DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,9;MQ=37   PL:GT:GQ        75,27,0:1/1:99
+chr9   132551867       .       C       T       17.1    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=25 PL:GT:GQ        49,9,0:1/1:63
+chr9   132685120       .       A       G       4.75    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=25 PL:GT:GQ        35,9,0:1/1:63
+chr9   133175050       .       A       G       18.1    .       DP=30;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,17,0;MQ=20 PL:GT:GQ        51,51,0:1/1:99
+chr9   133584978       .       A       G       99      .       DP=25;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,25,0;MQ=45 PL:GT:GQ        212,75,0:1/1:99
+chr9   133661895       .       A       G       99      .       DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,14,0;MQ=31 PL:GT:GQ        138,42,0:1/1:99
+chr9   133670376       .       T       C       68      .       DP=19;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,0,16;MQ=39;PV4=1,1.4e-20,1,1       PL:GT:GQ        101,39,0:1/1:99
+chr9   133843777       .       T       C       99      .       DP=9;AF1=0.5129;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,8,0;MQ=43;PV4=1,1,1,1      PL:GT:GQ        154,0,13:0/1:16
+chr9   134017265       .       G       C       3.27    .       DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=13        PL:GT:GQ        33,12,0:1/1:72
+chr9   134105563       .       T       C       34.1    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=39 PL:GT:GQ        67,18,0:1/1:90
+chr9   134608906       .       C       T       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=46 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr9   134861929       .       T       A       9.49    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=30 PL:GT:GQ        41,9,0:1/1:63
+chr10  796662  .       A       G       22      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=46 PL:GT:GQ        54,9,0:1/1:63
+chr10  1216716 .       T       A       18.6    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=25 PL:GT:GQ        51,12,0:1/1:72
+chr10  1220781 .       G       A       21      .       DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,9,0;MQ=18   PL:GT:GQ        54,27,0:1/1:99
+chr10  1225208 .       T       C       68      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=47 PL:GT:GQ        100,9,0:1/1:63
+chr10  1727946 .       T       C       14.2    .       DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=27   PL:GT:GQ        47,21,0:1/1:84
+chr10  5986542 .       T       C       83      .       DP=93;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=39 PL:GT:GQ        116,30,0:1/1:99
+chr10  6436277 .       G       A       6.02    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:GT:GQ        36,6,0:1/1:49
+chr10  7704114 .       C       A       35      .       DP=6;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,4;MQ=29;PV4=1,0.27,1,0.27  PL:GT:GQ        65,3,0:1/1:41
+chr10  10881734        .       A       G       9.52    .       DP=9;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,5,0;MQ=42;PV4=1,0.0026,0.14,1 PL:GT:GQ        39,0,91:0/1:42
+chr10  13099383        .       G       A       27.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=48 PL:GT:GQ        60,12,0:1/1:72
+chr10  15764077        .       G       C       11.3    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=40 PL:GT:GQ        43,9,0:1/1:63
+chr10  18091502        .       T       C       47      .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=38 PL:GT:GQ        79,9,0:1/1:63
+chr10  19645913        .       A       T       15.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=43 PL:GT:GQ        47,6,0:1/1:49
+chr10  22845062        .       C       T       18.1    .       DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=18   PL:GT:GQ        51,21,0:1/1:84
+chr10  28282802        .       T       C       69      .       DP=12;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,12,0;MQ=42 PL:GT:GQ        102,36,0:1/1:99
+chr10  28496872        .       T       G       8.44    .       DP=11;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=45        PL:GT:GQ        39,6,0:1/1:49
+chr10  32746793        .       G       A       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=46 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr10  41437604        .       T       G       11.3    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=39 PL:GT:GQ        43,9,0:1/1:63
+chr10  43051239        .       C       T       6.98    .       DP=3;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,2,0;MQ=40;PV4=1,0.33,0.33,1        PL:GT:GQ        36,0,31:0/1:33
+chr10  44455192        .       C       T       4.41    .       DP=6;AF1=0.8276;CI95=0.5,1;DP4=0,3,0,3;MQ=21;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        31,0,1:1/1:5
+chr10  48387336        .       A       G       13      .       DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35 PL:GT:GQ        44,6,0:1/1:49
+chr10  51561705        .       A       G       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=45 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr10  51561712        .       C       G       39.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=45 PL:GT:GQ        71,6,0:1/1:49
+chr10  55617954        .       G       A       8.44    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=31 PL:GT:GQ        39,6,0:1/1:49
+chr10  55718281        .       T       A       3.41    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=32 PL:GT:GQ        32,6,0:1/1:49
+chr10  55888771        .       T       C       23.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=43 PL:GT:GQ        56,12,0:1/1:72
+chr10  56025569        .       C       G       34.1    .       DP=3;AF1=0.5064;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,2;MQ=39;PV4=1,1,1,1      PL:GT:GQ        64,0,16:0/1:19
+chr10  57384943        .       G       T       84      .       DP=29;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=16,0,13,0;MQ=26;PV4=1,0.015,1,1  PL:GT:GQ        114,0,110:0/1:99
+chr10  59873077        .       T       G       49      .       DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=42   PL:GT:GQ        82,24,0:1/1:96
+chr10  61329572        .       C       T       15.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:GT:GQ        47,6,0:1/1:49
+chr10  63790636        .       T       G       32.1    .       DP=19;AF1=1;CI95=1,1;DP4=1,0,10,0;MQ=28;PV4=1,0.14,1,1  PL:GT:GQ        65,22,0:1/1:88
+chr10  64466048        .       C       G       18.2    .       DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=28 PL:GT:GQ        51,18,0:1/1:90
+chr10  65053440        .       G       T       99      .       DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=39 PL:GT:GQ        153,30,0:1/1:99
+chr10  65407358        .       C       G       84.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=45 PL:GT:GQ        117,15,0:1/1:75
+chr10  65605291        .       G       A       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=51 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr10  66104447        .       T       C       99      .       DP=47;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,25,0,21;MQ=34;PV4=1,1,0.15,1   PL:GT:GQ        136,0,162:0/1:99
+chr10  82160859        .       G       C       99      .       DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,13;MQ=36 PL:GT:GQ        153,39,0:1/1:99
+chr10  82198579        .       C       T       9.31    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr10  87086290        .       A       G       4.13    .       DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,9;MQ=17   PL:GT:GQ        35,27,0:1/1:99
+chr10  89550621        .       T       G       74      .       DP=47;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,45;MQ=45 PL:GT:GQ        107,135,0:1/1:99
+chr10  92325046        .       G       A       42.3    .       DP=18;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=45        PL:GT:GQ        75,15,0:1/1:75
+chr10  94488050        .       A       G       5.46    .       DP=4;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,2,0;MQ=43;PV4=1,0.16,1,1      PL:GT:GQ        34,0,34:0/1:34
+chr10  95024815        .       C       T       13.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=36 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr10  95466306        .       G       A       53      .       DP=7;AF1=0.6671;CI95=0.5,1;DP4=0,4,0,3;MQ=33;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        82,0,3:0/1:5
+chr10  100256777       .       T       G       3.83    .       DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=23 PL:GT:GQ        34,12,0:1/1:72
+chr10  101510485       .       T       C       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr10  101530760       .       C       T       13.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr10  101879744       .       T       C       22      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=44 PL:GT:GQ        54,9,0:1/1:63
+chr10  102147276       .       G       C       11.3    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=33 PL:GT:GQ        43,9,0:1/1:63
+chr10  102642248       .       T       G       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr10  107666616       .       T       C       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=43 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr10  108319945       .       C       G       11.3    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=29 PL:GT:GQ        43,9,0:1/1:63
+chr10  109734371       .       G       A       12.7    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=35 PL:GT:GQ        45,12,0:1/1:72
+chr10  112870604       .       C       T       46.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=36 PL:GT:GQ        79,12,0:1/1:72
+chr10  115304673       .       T       C       11.3    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=42 PL:GT:GQ        43,9,0:1/1:63
+chr10  119380588       .       G       A       14.2    .       DP=4;AF1=0.502;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,3,0;MQ=43;PV4=1,0.18,0.32,1 PL:GT:GQ        44,0,21:0/1:24
+chr10  123063756       .       C       T       14.1    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=23 PL:GT:GQ        46,9,0:1/1:63
+chr10  128424770       .       T       G       13.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=30 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr10  131229204       .       T       C       44      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=40 PL:GT:GQ        76,9,0:1/1:63
+chr10  132420570       .       G       C       89.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=49 PL:GT:GQ        122,12,0:1/1:72
+chr10  132528066       .       C       T       99      .       DP=19;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,19,0;MQ=42 PL:GT:GQ        213,57,0:1/1:99
+chr10  132644619       .       G       A       19.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=23 PL:GT:GQ        52,15,0:1/1:75
+chr10  132707581       .       G       C       9.11    .       DP=51;AF1=0.9998;CI95=0.5,1;DP4=1,0,2,0;MQ=25;PV4=1,1,1,1       PL:GT:GQ        38,2,0:1/1:37
+chr10  133026892       .       T       C       55.1    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=44 PL:GT:GQ        88,18,0:1/1:90
+chr11  768033  .       T       C       33.5    .       DP=4;AF1=0.8277;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,2;MQ=32;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        62,0,1:1/1:5
+chr11  768042  .       T       C       33.5    .       DP=6;AF1=0.8277;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,2;MQ=32;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        62,0,1:1/1:5
+chr11  874568  .       G       C       33.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=33 PL:GT:GQ        66,12,0:1/1:72
+chr11  1009210 .       T       C       4       .       DP=70;AF1=0.6241;CI95=0.5,1;DP4=0,3,0,8;MQ=24;PV4=1,1,0.5,1     PL:GT:GQ        31,0,4:0/1:6
+chr11  1016692 .       C       T       27      .       DP=39;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,38;MQ=22 PL:GT:GQ        60,114,0:1/1:99
+chr11  1034477 .       A       G       66      .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=42 PL:GT:GQ        98,9,0:1/1:63
+chr11  1074037 .       G       A       4.13    .       DP=9;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,5,0;MQ=24;PV4=1,1,0.43,1   PL:GT:GQ        32,0,30:0/1:31
+chr11  1556298 .       G       A       11.8    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=33 PL:GT:GQ        44,12,0:1/1:72
+chr11  1824777 .       T       C       27      .       DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=28 PL:GT:GQ        60,30,0:1/1:99
+chr11  3395801 .       C       T       22      .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=49 PL:GT:GQ        54,9,0:1/1:63
+chr11  3411901 .       G       A       4.75    .       DP=17;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=29        PL:GT:GQ        35,9,0:1/1:63
+chr11  3731606 .       A       C       11.3    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=39 PL:GT:GQ        43,9,0:1/1:63
+chr11  3783855 .       C       T       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=44 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr11  3967636 .       A       G       4.29    .       DP=20;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=24        PL:GT:GQ        35,15,0:1/1:75
+chr11  4385618 .       C       T       13.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=31 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr11  4424365 .       T       A       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr11  5295586 .       C       T       3.01    .       DP=52;AF1=0.4997;CI95=0.5,0.5;DP4=33,0,10,0;MQ=29;PV4=1,0.0045,0.3,0.17 PL:GT:GQ        30,0,131:0/1:33
+chr11  6157144 .       C       G       45.1    .       DP=14;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=35  PL:GT:GQ        78,21,0:1/1:84
+chr11  6352044 .       C       T       18      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=31 PL:GT:GQ        50,9,0:1/1:63
+chr11  6767356 .       T       C       9.63    .       DP=3;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=1,0,2,0;MQ=29;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        38,1,0:1/1:23
+chr11  6999404 .       G       C       21      .       DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=37 PL:GT:GQ        53,9,0:1/1:63
+chr11  9120930 .       C       G       17.6    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=25 PL:GT:GQ        50,12,0:1/1:72
+chr11  9373125 .       T       C       19.8    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:GT:GQ        51,6,0:1/1:49
+chr11  9585101 .       C       T       67      .       DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,14,0;MQ=45 PL:GT:GQ        100,42,0:1/1:99
+chr11  10266192        .       A       C       14.3    .       DP=22;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=27        PL:GT:GQ        47,18,0:1/1:90
+chr11  10303263        .       T       C       8.64    .       DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,17;MQ=18 PL:GT:GQ        41,51,0:1/1:99
+chr11  10420170        .       T       C       35      .       DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,0,15;MQ=28;PV4=1,0.12,1,0.4        PL:GT:GQ        68,36,0:1/1:99
+chr11  10912169        .       G       A       99      .       DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=49 PL:GT:GQ        155,18,0:1/1:90
+chr11  11315826        .       T       G       6.29    .       DP=27;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,6;MQ=19  PL:GT:GQ        38,18,0:1/1:90
+chr11  11603859        .       A       C       22      .       DP=15;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,9,0,6;MQ=34;PV4=1,9.5e-13,0.22,1       PL:GT:GQ        52,0,115:0/1:55
+chr11  11700034        .       C       T       33      .       DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,9,0;MQ=30  PL:GT:GQ        66,27,0:1/1:99
+chr11  11822758        .       G       A       15.1    .       DP=15;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,7,0,3;MQ=38;PV4=1,0.18,1,1     PL:GT:GQ        45,0,88:0/1:48
+chr11  11976636        .       C       T       22      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=24 PL:GT:GQ        54,9,0:1/1:63
+chr11  14380517        .       C       G       16.1    .       DP=10;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=5,0,5,0;MQ=48;PV4=1,2.1e-05,0.13,1       PL:GT:GQ        46,0,113:0/1:49
+chr11  14419212        .       A       G       91.1    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=38 PL:GT:GQ        124,18,0:1/1:90
+chr11  14846792        .       A       G       55      .       DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,11;MQ=19 PL:GT:GQ        88,33,0:1/1:99
+chr11  15494556        .       C       T       99      .       DP=38;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=22,0,14,0;MQ=34;PV4=1,0.0071,1,1 PL:GT:GQ        146,0,159:0/1:99
+chr11  16262879        .       A       C       16.1    .       DP=4;AF1=0.5004;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,3;MQ=43;PV4=1,0.061,0.24,0.33    PL:GT:GQ        46,0,28:0/1:31
+chr11  21514947        .       T       C       24.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=41 PL:GT:GQ        57,12,0:1/1:72
+chr11  22532576        .       C       G       28      .       DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,17;MQ=17 PL:GT:GQ        61,51,0:1/1:99
+chr11  23529238        .       G       T       4.29    .       DP=13;AF1=0.5334;CI95=0.5,1;DP4=1,0,3,0;MQ=37;PV4=1,1,0.34,0.21 PL:GT:GQ        32,0,9:0/1:12
+chr11  24249554        .       A       G       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=48 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr11  24853167        .       A       G       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=51 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr11  33353903        .       T       C       24.3    .       DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=36 PL:GT:GQ        57,15,0:1/1:75
+chr11  35126569        .       T       C       24.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=43 PL:GT:GQ        57,12,0:1/1:72
+chr11  35132248        .       C       T       18.6    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=25 PL:GT:GQ        51,12,0:1/1:72
+chr11  35155482        .       T       C       68      .       DP=22;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,22,0;MQ=46 PL:GT:GQ        101,66,0:1/1:99
+chr11  52494088        .       T       C       99      .       DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,9;MQ=37   PL:GT:GQ        140,27,0:1/1:99
+chr11  57899943        .       C       G       13      .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ        44,6,0:1/1:49
+chr11  62261460        .       G       T       19.1    .       DP=15;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,7,0,5;MQ=27;PV4=1,1.1e-06,1,1  PL:GT:GQ        49,0,58:0/1:51
+chr11  67456049        .       C       T       39.1    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=19 PL:GT:GQ        72,18,0:1/1:90
+chr11  68509708        .       C       G       3.65    .       DP=9;AF1=0.7301;CI95=0.5,1;DP4=0,5,0,4;MQ=17;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        30,0,2:0/1:3
+chr11  70115115        .       T       A       99      .       DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=49 PL:GT:GQ        140,15,0:1/1:75
+chr11  72643951        .       T       C       70      .       DP=23;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,22,0;MQ=39 PL:GT:GQ        103,66,0:1/1:99
+chr11  72647930        .       G       A       36      .       DP=4;AF1=0.5004;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,3;MQ=41;PV4=1,1,0.3,1    PL:GT:GQ        66,0,28:0/1:31
+chr11  73330148        .       C       T       13      .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35 PL:GT:GQ        44,6,0:1/1:49
+chr11  81720893        .       A       G       5.83    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=19 PL:GT:GQ        37,12,0:1/1:72
+chr11  83813797        .       A       G       23.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=43 PL:GT:GQ        56,12,0:1/1:72
+chr11  85949488        .       C       A       54      .       DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,14,0;MQ=37 PL:GT:GQ        87,42,0:1/1:99
+chr11  87634829        .       G       A       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=51 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr11  90913093        .       A       T       35.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=46 PL:GT:GQ        67,6,0:1/1:49
+chr11  93793348        .       G       A       99      .       DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=31   PL:GT:GQ        139,24,0:1/1:96
+chr11  100802294       .       T       C       16.6    .       DP=21;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=35        PL:GT:GQ        49,12,0:1/1:72
+chr11  107455449       .       C       T       8.44    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=26 PL:GT:GQ        39,6,0:1/1:49
+chr11  111344355       .       A       G       69.5    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=43 PL:GT:GQ        102,12,0:1/1:72
+chr11  111611115       .       C       T       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr11  113050466       .       G       C       6.02    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=30 PL:GT:GQ        36,6,0:1/1:49
+chr11  114332544       .       T       C       3.54    .       DP=17;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=0,4,0,5;MQ=37;PV4=1,0.32,0.13,1       PL:GT:GQ        31,0,37:0/1:33
+chr11  114332549       .       G       A       3.54    .       DP=17;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=0,9,0,8;MQ=36;PV4=1,3.1e-10,0.088,1   PL:GT:GQ        31,0,127:0/1:34
+chr11  114843578       .       G       C       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=50 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr11  115580279       .       A       G       99      .       DP=15;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,15,0;MQ=48 PL:GT:GQ        190,45,0:1/1:99
+chr11  116434328       .       G       A       17.6    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=25 PL:GT:GQ        50,12,0:1/1:72
+chr11  125914161       .       A       G       20.8    .       DP=7;AF1=0.95;CI95=0.5,1;DP4=3,0,4,0;MQ=38;PV4=1,0.074,1,1      PL:GT:GQ        49,0,0:1/1:10
+chr11  125917089       .       C       T       12.3    .       DP=41;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,28,0,12;MQ=44;PV4=1,4.7e-25,1,1        PL:GT:GQ        42,0,167:0/1:45
+chr11  127194100       .       A       G       60      .       DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=49   PL:GT:GQ        93,24,0:1/1:96
+chr12  70856   .       G       A       27.5    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=49 PL:GT:GQ        60,12,0:1/1:72
+chr12  153693  .       T       C       52.3    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=38 PL:GT:GQ        85,15,0:1/1:75
+chr12  924547  .       C       G       37.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=50 PL:GT:GQ        69,6,0:1/1:49
+chr12  1555916 .       G       A       7.18    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=23 PL:GT:GQ        39,15,0:1/1:75
+chr12  1919860 .       G       T       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr12  2283756 .       G       A       13.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=34 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr12  2805983 .       G       C       12.7    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=35 PL:GT:GQ        45,12,0:1/1:72
+chr12  6088203 .       T       C       72.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=37 PL:GT:GQ        105,15,0:1/1:75
+chr12  7099460 .       G       C       10.8    .       DP=6;AF1=0.8277;CI95=0.5,1;DP4=3,0,3,0;MQ=26;PV4=1,0.027,1,1    PL:GT:GQ        39,0,1:1/1:5
+chr12  7099464 .       G       A       13.3    .       DP=6;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=2,0,3,0;MQ=28;PV4=1,0.16,1,1     PL:GT:GQ        42,1,0:1/1:23
+chr12  7198516 .       T       G       4.61    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ        34,6,0:1/1:49
+chr12  23331895        .       C       T       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr12  28209020        .       T       G       14.4    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=31 PL:GT:GQ        47,15,0:1/1:75
+chr12  30074073        .       C       T       32.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35 PL:GT:GQ        64,6,0:1/1:49
+chr12  30563452        .       T       C       25      .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=46 PL:GT:GQ        57,9,0:1/1:63
+chr12  30563453        .       A       G       25      .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=46 PL:GT:GQ        57,9,0:1/1:63
+chr12  30563464        .       C       A       78.8    .       DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,5;MQ=34;PV4=1,0.29,1,1  PL:GT:GQ        110,6,0:1/1:49
+chr12  31505085        .       G       A       13.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr12  34041336        .       G       A       5.46    .       DP=5;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,2,0;MQ=36;PV4=1,1,0.48,0.21   PL:GT:GQ        34,0,34:0/1:34
+chr12  49003648        .       C       G       42      .       DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=39   PL:GT:GQ        75,24,0:1/1:96
+chr12  51280690        .       G       A       69      .       DP=98;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=13,0,18,0;MQ=45;PV4=1,1,0.051,1  PL:GT:GQ        99,0,84:0/1:87
+chr12  69206633        .       T       C       17.1    .       DP=12;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,11;MQ=17 PL:GT:GQ        50,33,0:1/1:99
+chr12  80417253        .       T       C       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=48 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr12  86633033        .       C       T       34      .       DP=3;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,2;MQ=43;PV4=1,1,0.33,1   PL:GT:GQ        64,0,31:0/1:34
+chr12  98097274        .       C       T       47.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=31 PL:GT:GQ        80,15,0:1/1:75
+chr12  105269319       .       C       T       19      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=26 PL:GT:GQ        51,9,0:1/1:63
+chr12  109053425       .       G       A       9.53    .       DP=8;AF1=0.5012;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,6,0;MQ=25;PV4=1,1,0.19,1   PL:GT:GQ        39,0,23:0/1:26
+chr12  111904540       .       A       G       3.41    .       DP=65;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=31        PL:GT:GQ        32,6,0:1/1:49
+chr12  115038686       .       T       C       15.2    .       DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=27   PL:GT:GQ        48,21,0:1/1:84
+chr12  115039419       .       A       G       4.11    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=30 PL:GT:GQ        34,9,0:1/1:63
+chr12  115103890       .       G       A       66      .       DP=39;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,38;MQ=49 PL:GT:GQ        99,114,0:1/1:99
+chr12  115833830       .       G       A       68      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=49 PL:GT:GQ        100,9,0:1/1:63
+chr12  116361873       .       T       G       6.34    .       DP=5;AF1=0.7302;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,2;MQ=23;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        34,0,2:0/1:3
+chr12  123583527       .       G       A       14.1    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=25 PL:GT:GQ        46,9,0:1/1:63
+chr12  124115330       .       A       G       44      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=38 PL:GT:GQ        76,9,0:1/1:63
+chr12  125062296       .       G       A       41.8    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=50 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr12  126718106       .       A       G       8.76    .       DP=50;AF1=0.5163;CI95=0.5,1;DP4=2,0,6,0;MQ=26;PV4=1,0.33,0.37,1 PL:GT:GQ        38,0,12:0/1:15
+chr12  133348311       .       G       A       24      .       DP=18;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=14,0,3,0;MQ=35;PV4=1,1,1,1       PL:GT:GQ        54,0,118:0/1:57
+chr12  134494475       .       C       T       28      .       DP=18;AF1=0.6671;CI95=0.5,1;DP4=8,0,10,0;MQ=18;PV4=1,1,1,1      PL:GT:GQ        57,0,3:0/1:5
+chr12  134831761       .       C       T       41.3    .       DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=27        PL:GT:GQ        74,15,0:1/1:75
+chr12  134992770       .       A       C,T     84      .       DP=47;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,26,0;MQ=29 PL:GT:GQ        117,72,114,0,44,114:1/1:99
+chr12  135261117       .       G       A       49.1    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=46 PL:GT:GQ        82,18,0:1/1:90
+chr12  135261144       .       A       G       99      .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=46 PL:GT:GQ        155,18,0:1/1:90
+chr12  135460302       .       G       A       99      .       DP=25;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,23,0;MQ=40 PL:GT:GQ        198,69,0:1/1:99
+chr12  135463758       .       A       G       83      .       DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,16;MQ=26 PL:GT:GQ        116,48,0:1/1:99
+chr12  135523325       .       G       A       99      .       DP=23;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,22,0;MQ=26 PL:GT:GQ        136,66,0:1/1:99
+chr12  135782401       .       T       C       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr12  135795472       .       G       T       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr13  18040027        .       G       C       42      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=33 PL:GT:GQ        74,9,0:1/1:63
+chr13  19494625        .       G       T       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr13  20121126        .       A       G       15.1    .       DP=36;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=25,0,9,0;MQ=36;PV4=1,1,0.13,1    PL:GT:GQ        45,0,153:0/1:48
+chr13  21536703        .       A       G       9.31    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr13  23160035        .       G       T       3.98    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=36 PL:GT:GQ        33,6,0:1/1:49
+chr13  23476554        .       C       A       6.79    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=52 PL:GT:GQ        37,6,0:1/1:49
+chr13  26632967        .       C       G       32      .       DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,9;MQ=34   PL:GT:GQ        65,27,0:1/1:99
+chr13  26790010        .       T       C       89.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=35 PL:GT:GQ        122,15,0:1/1:75
+chr13  36083571        .       T       C       43      .       DP=84;AF1=1;CI95=1,1;DP4=1,0,37,0;MQ=16;PV4=1,1,1,0.3   PL:GT:GQ        76,99,0:1/1:99
+chr13  44432419        .       C       T       3.58    .       DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=19   PL:GT:GQ        34,21,0:1/1:84
+chr13  46592359        .       T       C       16.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:GT:GQ        48,6,0:1/1:49
+chr13  52764657        .       A       T       3.14    .       DP=32;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=22        PL:GT:GQ        33,15,0:1/1:75
+chr13  53084193        .       C       T       9.11    .       DP=3;AF1=0.9998;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,2;MQ=29;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        38,2,0:1/1:37
+chr13  57763228        .       C       T       45      .       DP=555;AF1=1;CI95=1,1;DP4=2,0,21,0;MQ=23;PV4=1,0.00021,1,0.3    PL:GT:GQ        78,45,0:1/1:99
+chr13  73857921        .       G       C       31      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=49 PL:GT:GQ        63,9,0:1/1:63
+chr13  76718001        .       G       A       59      .       DP=4;AF1=0.5004;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,3,0;MQ=45;PV4=1,1,0.12,1   PL:GT:GQ        89,0,28:0/1:31
+chr13  100912695       .       A       T       23      .       DP=22;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,16,0,6;MQ=31;PV4=1,0.029,1,0.35        PL:GT:GQ        53,0,103:0/1:56
+chr13  101332001       .       G       C       21      .       DP=23;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,23,0;MQ=21 PL:GT:GQ        54,69,0:1/1:99
+chr13  102637334       .       C       T       68      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=49 PL:GT:GQ        100,9,0:1/1:63
+chr13  102895627       .       C       T       63      .       DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,9,0;MQ=48   PL:GT:GQ        96,27,0:1/1:99
+chr13  103830322       .       T       C       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=50 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr13  112842448       .       G       A       39      .       DP=18;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,9;MQ=27  PL:GT:GQ        72,27,0:1/1:99
+chr13  113310291       .       C       T       33.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=43 PL:GT:GQ        66,12,0:1/1:72
+chr13  114775162       .       A       G       80      .       DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,17,0;MQ=21 PL:GT:GQ        113,51,0:1/1:99
+chr13  115267482       .       A       G       16.1    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=29 PL:GT:GQ        48,9,0:1/1:63
+chr13  116068676       .       C       T       3.83    .       DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=27 PL:GT:GQ        34,12,0:1/1:72
+chr13  116455918       .       A       G       33      .       DP=29;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=13,0,15,0;MQ=42;PV4=1,1.8e-20,0.3,1      PL:GT:GQ        63,0,146:0/1:66
+chr13  116765012       .       G       A       30.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ        62,6,0:1/1:49
+chr13  116779773       .       C       T       17.1    .       DP=38;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=27,0,11,0;MQ=24;PV4=1,4.5e-35,1,1        PL:GT:GQ        47,0,106:0/1:50
+chr13  116779791       .       C       T       57      .       DP=38;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=24,0,14,0;MQ=24;PV4=1,1,1,1      PL:GT:GQ        87,0,103:0/1:90
+chr14  20159250        .       C       T       11.3    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=39 PL:GT:GQ        43,9,0:1/1:63
+chr14  23510676        .       T       C       52      .       DP=22;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,22,0;MQ=32 PL:GT:GQ        85,66,0:1/1:99
+chr14  24735256        .       G       A       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr14  29525577        .       G       A       21      .       DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,9,0;MQ=16  PL:GT:GQ        54,27,0:1/1:99
+chr14  36186389        .       C       T       6.79    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=20 PL:GT:GQ        37,6,0:1/1:49
+chr14  36186394        .       A       G       6.79    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=20 PL:GT:GQ        37,6,0:1/1:49
+chr14  37440609        .       A       G       13      .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=33 PL:GT:GQ        44,6,0:1/1:49
+chr14  40432807        .       A       G       18.6    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=23 PL:GT:GQ        51,12,0:1/1:72
+chr14  59466268        .       T       C       15.1    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=25 PL:GT:GQ        47,9,0:1/1:63
+chr14  61368162        .       G       T       7.18    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=17 PL:GT:GQ        39,15,0:1/1:75
+chr14  65152922        .       G       A       92      .       DP=33;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,18,0,15;MQ=36;PV4=1,0.059,0.35,1       PL:GT:GQ        122,0,144:0/1:99
+chr14  69749148        .       G       T       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=25 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr14  74877658        .       C       T       45      .       DP=48;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,0,12;MQ=36;PV4=1,0.02,1,0.39       PL:GT:GQ        78,28,0:1/1:99
+chr14  75546678        .       C       T       19.2    .       DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=17 PL:GT:GQ        52,18,0:1/1:90
+chr14  76439185        .       T       C       67.1    .       DP=7;AF1=0.505;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,6;MQ=33;PV4=1,1,0.056,0.29        PL:GT:GQ        97,0,17:0/1:20
+chr14  77313295        .       T       A       99      .       DP=12;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,10;MQ=48 PL:GT:GQ        191,30,0:1/1:99
+chr14  77673422        .       G       A       11.5    .       DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=24 PL:GT:GQ        44,18,0:1/1:90
+chr14  78646125        .       T       C       99      .       DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=40   PL:GT:GQ        153,24,0:1/1:96
+chr14  91702449        .       A       G       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr14  91769842        .       G       A       63      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=47 PL:GT:GQ        95,9,0:1/1:63
+chr14  91775899        .       C       G       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=45 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr14  91775924        .       A       G       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=45 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr14  93482918        .       A       C       68      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=49 PL:GT:GQ        100,9,0:1/1:63
+chr14  93665819        .       C       T       75      .       DP=7;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=0,3,0,4;MQ=42;PV4=1,1,1,1      PL:GT:GQ        105,0,31:0/1:34
+chr14  95422276        .       A       G       55.1    .       DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=45   PL:GT:GQ        88,21,0:1/1:84
+chr14  95731986        .       C       T       68      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=49 PL:GT:GQ        100,9,0:1/1:63
+chr14  96045464        .       A       G       13      .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=33 PL:GT:GQ        44,6,0:1/1:49
+chr14  97172020        .       C       T       68      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=51 PL:GT:GQ        100,9,0:1/1:63
+chr14  100515480       .       A       G       6.98    .       DP=3;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,2,0;MQ=45;PV4=1,0.14,0.085,0.33    PL:GT:GQ        36,0,30:0/1:32
+chr14  100770214       .       A       T       8.69    .       DP=20;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=16  PL:GT:GQ        41,21,0:1/1:84
+chr14  101258303       .       G       A       82      .       DP=15;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,15,0;MQ=26 PL:GT:GQ        115,45,0:1/1:99
+chr14  101701492       .       C       G       66      .       DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=49 PL:GT:GQ        99,30,0:1/1:99
+chr14  102113772       .       T       C       3.98    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=30 PL:GT:GQ        33,6,0:1/1:49
+chr14  102751431       .       A       C       36.5    .       DP=3;AF1=0.9998;CI95=0.5,1;DP4=1,0,2,0;MQ=35;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        66,2,0:1/1:37
+chr14  103708033       .       A       G       99      .       DP=13;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,12;MQ=27 PL:GT:GQ        141,36,0:1/1:99
+chr14  104744582       .       G       A       3.52    .       DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=25 PL:GT:GQ        33,9,0:1/1:63
+chr14  105989100       .       C       T       3.14    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=23 PL:GT:GQ        33,15,0:1/1:75
+chr14  105989162       .       C       T       3.65    .       DP=12;AF1=0.7301;CI95=0.5,1;DP4=0,6,0,6;MQ=15;PV4=1,1,1,1       PL:GT:GQ        30,0,2:0/1:3
+chr14  106234810       .       G       A       25.3    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=39 PL:GT:GQ        58,15,0:1/1:75
+chr14  106995572       .       A       G       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr14  107283057       .       T       C       5.5     .       DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=20   PL:GT:GQ        37,21,0:1/1:84
+chr14  107285319       .       T       C       33      .       DP=36;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,35;MQ=22 PL:GT:GQ        66,105,0:1/1:99
+chr14  107640449       .       A       G       11.8    .       DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=36 PL:GT:GQ        44,12,0:1/1:72
+chr15  20082092        .       T       G       18.3    .       DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=24        PL:GT:GQ        51,15,0:1/1:75
+chr15  22955884        .       T       C       67      .       DP=12;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,12,0;MQ=48 PL:GT:GQ        100,36,0:1/1:99
+chr15  22971987        .       A       G       5.29    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=22 PL:GT:GQ        35,6,0:1/1:49
+chr15  23233324        .       C       A       47      .       DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,14,0;MQ=31 PL:GT:GQ        80,42,0:1/1:99
+chr15  25175286        .       C       T       36.5    .       DP=3;AF1=0.9998;CI95=0.5,1;DP4=1,0,2,0;MQ=42;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        66,2,0:1/1:37
+chr15  25385709        .       G       A       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=48 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr15  27372396        .       A       G       44      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=40 PL:GT:GQ        76,9,0:1/1:63
+chr15  35998093        .       C       T       9.53    .       DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,9,0;MQ=17   PL:GT:GQ        42,27,0:1/1:99
+chr15  36716538        .       C       G       13.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=36 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr15  36793360        .       G       T       44      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=42 PL:GT:GQ        76,9,0:1/1:63
+chr15  53783097        .       A       G       10.5    .       DP=31;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=16  PL:GT:GQ        43,21,0:1/1:84
+chr15  54180175        .       C       T       10.4    .       DP=7;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,3,0;MQ=27;PV4=1,1.2e-05,1,1        PL:GT:GQ        40,0,32:0/1:34
+chr15  54939306        .       C       T       99      .       DP=34;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,18,0,16;MQ=49;PV4=1,1,0.18,1   PL:GT:GQ        172,0,181:0/1:99
+chr15  59377916        .       C       T       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=50 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr15  59685961        .       G       C       68      .       DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,11;MQ=36 PL:GT:GQ        101,33,0:1/1:99
+chr15  60306384        .       A       G       18.6    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=25 PL:GT:GQ        51,12,0:1/1:72
+chr15  60345642        .       G       C       14.9    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35 PL:GT:GQ        46,6,0:1/1:49
+chr15  60367387        .       G       A       13.2    .       DP=6;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=3,0,3,0;MQ=34;PV4=1,0.098,0.24,1       PL:GT:GQ        43,0,35:0/1:37
+chr15  60367446        .       C       T       44      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=41 PL:GT:GQ        76,9,0:1/1:63
+chr15  61763755        .       G       A       68      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=45 PL:GT:GQ        100,9,0:1/1:63
+chr15  61831362        .       C       G       11.3    .       DP=5;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,3;MQ=30;PV4=1,0.00077,0.47,1        PL:GT:GQ        41,0,42:0/1:41
+chr15  63978880        .       G       C       60      .       DP=6;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=2,0,4,0;MQ=35;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        90,3,0:1/1:41
+chr15  64342445        .       A       G       12.2    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=18 PL:GT:GQ        44,9,0:1/1:63
+chr15  65424859        .       T       C       11.3    .       DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,10;MQ=21 PL:GT:GQ        44,30,0:1/1:99
+chr15  65603698        .       C       T       60      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=49 PL:GT:GQ        92,9,0:1/1:63
+chr15  67005078        .       G       A       13.9    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr15  71133512        .       G       C       22.3    .       DP=19;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=25        PL:GT:GQ        55,15,0:1/1:75
+chr15  72619009        .       A       G       22      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=48 PL:GT:GQ        54,9,0:1/1:63
+chr15  73272688        .       C       T       70.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=39 PL:GT:GQ        103,15,0:1/1:75
+chr15  73699335        .       T       A       99      .       DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,9;MQ=45   PL:GT:GQ        175,27,0:1/1:99
+chr15  74513352        .       C       T       99      .       DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,10;MQ=37 PL:GT:GQ        139,30,0:1/1:99
+chr15  75540536        .       G       A       9.31    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=44 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr15  75822537        .       C       A       17.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=23 PL:GT:GQ        50,15,0:1/1:75
+chr15  78554005        .       T       C       12      .       DP=18;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=46        PL:GT:GQ        43,6,0:1/1:49
+chr15  80089369        .       G       A       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=28 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr15  83089149        .       C       G       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=33 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr15  86839307        .       T       C       90.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=43 PL:GT:GQ        123,15,0:1/1:75
+chr15  89836258        .       T       C       99      .       DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=39  PL:GT:GQ        141,24,0:1/1:96
+chr15  89837706        .       G       A       4.13    .       DP=8;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=0,4,0,4;MQ=30;PV4=1,1,0.25,1   PL:GT:GQ        32,0,59:0/1:35
+chr15  89857648        .       T       C       99      .       DP=27;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=8,0,8,0;MQ=40;PV4=1,1,0.3,1      PL:GT:GQ        133,0,130:0/1:99
+chr15  89864228        .       A       C       32      .       DP=4;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,2,0;MQ=42;PV4=1,1,1,1      PL:GT:GQ        62,0,31:0/1:34
+chr15  91261235        .       G       A       7.8     .       DP=4;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,2,0;MQ=44;PV4=1,1,0.32,1   PL:GT:GQ        37,0,30:0/1:32
+chr16  256990  .       A       C       10.4    .       DP=16;AF1=0.5008;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,3,0;MQ=23;PV4=1,0.34,1,1  PL:GT:GQ        40,0,25:0/1:28
+chr16  260794  .       T       C       3.01    .       DP=19;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=13,0,2,0;MQ=24;PV4=1,1,1,1    PL:GT:GQ        30,0,32:0/1:31
+chr16  419905  .       A       G       7.9     .       DP=5;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,3;MQ=22;PV4=1,1,1,1        PL:GT:GQ        36,1,0:1/1:23
+chr16  824086  .       T       C       22      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=48 PL:GT:GQ        54,9,0:1/1:63
+chr16  1085063 .       C       T       52      .       DP=12;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=6,0,6,0;MQ=42;PV4=1,1,0.014,1    PL:GT:GQ        82,0,128:0/1:85
+chr16  1221305 .       T       C       54      .       DP=7;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,3,0,3;MQ=40;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ        84,0,60:0/1:63
+chr16  1411728 .       A       G       32.3    .       DP=11;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=35        PL:GT:GQ        65,15,0:1/1:75
+chr16  1443197 .       C       G       64      .       DP=26;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,25,0;MQ=36 PL:GT:GQ        97,75,0:1/1:99
+chr16  1478746 .       A       T       32      .       DP=20;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=28  PL:GT:GQ        65,24,0:1/1:96
+chr16  1514438 .       A       C       45      .       DP=49;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,48,0;MQ=26 PL:GT:GQ        78,144,0:1/1:99
+chr16  1601989 .       T       C       99      .       DP=13;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,13,0;MQ=29 PL:GT:GQ        133,39,0:1/1:99
+chr16  2043883 .       C       T       30      .       DP=33;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,33;MQ=14 PL:GT:GQ        63,99,0:1/1:99
+chr16  2137470 .       A       C       39      .       DP=38;AF1=0.5016;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,6,0;MQ=34;PV4=1,0.02,1,1  PL:GT:GQ        69,0,22:0/1:25
+chr16  2537260 .       A       G       99      .       DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,11,0;MQ=40 PL:GT:GQ        177,33,0:1/1:99
+chr16  2564737 .       T       C       99      .       DP=25;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,22;MQ=41 PL:GT:GQ        199,66,0:1/1:99
+chr16  2612605 .       A       T       62.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=28 PL:GT:GQ        95,15,0:1/1:75
+chr16  2704518 .       G       A       41      .       DP=48;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,17,0,12;MQ=48;PV4=1,1.9e-23,0.24,0.034 PL:GT:GQ        71,0,175:0/1:74
+chr16  3274307 .       G       T       68      .       DP=39;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,30,0,8;MQ=37;PV4=1,1,1,1       PL:GT:GQ        98,0,138:0/1:99
+chr16  5467292 .       G       C       37.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ        69,6,0:1/1:49
+chr16  10079145        .       A       G       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr16  11483702        .       A       G       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=44 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr16  12038227        .       A       T       23      .       DP=47;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,22,0,23;MQ=32;PV4=1,4.4e-66,0.47,0.028 PL:GT:GQ        53,0,135:0/1:56
+chr16  21336880        .       G       C       55      .       DP=35;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,12,0,19;MQ=47;PV4=1,5.6e-21,1,1        PL:GT:GQ        85,0,121:0/1:88
+chr16  21980241        .       C       T       16.1    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=29 PL:GT:GQ        48,9,0:1/1:63
+chr16  23275383        .       C       G       13      .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:GT:GQ        44,6,0:1/1:49
+chr16  27546495        .       G       T       25      .       DP=35;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=43        PL:GT:GQ        57,9,0:1/1:63
+chr16  27700399        .       A       T       17.6    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=17 PL:GT:GQ        50,12,0:1/1:72
+chr16  28021935        .       A       G       18.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=23 PL:GT:GQ        51,15,0:1/1:75
+chr16  29070016        .       G       T       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr16  29478618        .       C       T       11.3    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=42 PL:GT:GQ        43,9,0:1/1:63
+chr16  29718140        .       C       T       46.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=31 PL:GT:GQ        79,15,0:1/1:75
+chr16  30700759        .       T       C       17.1    .       DP=14;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,14;MQ=14 PL:GT:GQ        50,42,0:1/1:99
+chr16  35139103        .       A       G       46.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=37 PL:GT:GQ        79,12,0:1/1:72
+chr16  35473348        .       G       A       3.83    .       DP=11;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=25        PL:GT:GQ        34,12,0:1/1:72
+chr16  36213667        .       A       G       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr16  36705528        .       G       A       14.4    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=32 PL:GT:GQ        47,15,0:1/1:75
+chr16  43831353        .       C       T       69.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=42 PL:GT:GQ        102,12,0:1/1:72
+chr16  44715166        .       A       C       25      .       DP=18;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=32  PL:GT:GQ        58,24,0:1/1:96
+chr16  44957661        .       T       C       7.03    .       DP=23;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=18  PL:GT:GQ        39,21,0:1/1:84
+chr16  44958698        .       C       T       42.3    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=49 PL:GT:GQ        75,15,0:1/1:75
+chr16  44959163        .       T       C       33.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=48 PL:GT:GQ        66,12,0:1/1:72
+chr16  45167959        .       C       T       4.45    .       DP=16;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=24        PL:GT:GQ        35,12,0:1/1:72
+chr16  50254956        .       C       T       13.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=36 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr16  52383122        .       A       C       46.5    .       DP=19;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=42        PL:GT:GQ        79,12,0:1/1:72
+chr16  55978159        .       C       T       10.7    .       DP=20;AF1=0.5336;CI95=0.5,1;DP4=2,0,5,0;MQ=35;PV4=1,0.038,1,0.059       PL:GT:GQ        40,0,9:0/1:12
+chr16  61358878        .       T       A       15.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=32 PL:GT:GQ        47,6,0:1/1:49
+chr16  61392487        .       G       A       13      .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=31 PL:GT:GQ        44,6,0:1/1:49
+chr16  61621603        .       G       T       6.59    .       DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=22        PL:GT:GQ        38,12,0:1/1:72
+chr16  69120890        .       G       C       51.3    .       DP=36;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=42        PL:GT:GQ        84,15,0:1/1:75
+chr16  70778219        .       A       G       21.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=39 PL:GT:GQ        53,6,0:1/1:49
+chr16  71899519        .       T       C       40      .       DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,11,0;MQ=33 PL:GT:GQ        73,33,0:1/1:99
+chr16  72079251        .       A       G       11.3    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=41 PL:GT:GQ        43,9,0:1/1:63
+chr16  72093003        .       G       C       9.31    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr16  72672428        .       A       G       68      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=49 PL:GT:GQ        100,9,0:1/1:63
+chr16  72864515        .       A       G       13.9    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr16  72890560        .       G       A       47.1    .       DP=10;AF1=0.5064;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,7;MQ=49;PV4=1,0.0019,0.0033,1   PL:GT:GQ        77,0,16:0/1:19
+chr16  73048929        .       A       G       6.29    .       DP=4;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=1,0,2,0;MQ=27;PV4=1,1,1,0.33     PL:GT:GQ        34,1,0:1/1:23
+chr16  73177179        .       A       G       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr16  73191468        .       C       T       69.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=40 PL:GT:GQ        102,12,0:1/1:72
+chr16  73367439        .       A       C       7.41    .       DP=36;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,13;MQ=26;PV4=1,1,0.027,1       PL:GT:GQ        37,4,0:1/1:45
+chr16  74259316        .       C       T       89.5    .       DP=13;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=49        PL:GT:GQ        122,12,0:1/1:72
+chr16  75271450        .       C       G       6.99    .       DP=15;AF1=0.5015;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,3;MQ=44;PV4=1,0.065,0.31,1      PL:GT:GQ        36,0,22:0/1:25
+chr16  76199870        .       G       A       26      .       DP=14;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=8,0,6,0;MQ=47;PV4=1,1.2e-06,0.32,1       PL:GT:GQ        56,0,141:0/1:59
+chr16  77723692        .       A       G       89.5    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=50 PL:GT:GQ        122,12,0:1/1:72
+chr17  165875  .       G       A       40.8    .       DP=11;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=42        PL:GT:GQ        72,6,0:1/1:49
+chr17  1443809 .       C       G       9.31    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=50 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr17  1618253 .       C       T       22      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=39 PL:GT:GQ        54,9,0:1/1:63
+chr17  2815309 .       T       G       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr17  3537486 .       T       G       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=50 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr17  3734367 .       C       A       23.5    .       DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=36        PL:GT:GQ        56,12,0:1/1:72
+chr17  5634764 .       T       C       13      .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ        44,6,0:1/1:49
+chr17  6408090 .       C       G       3.54    .       DP=5;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=3,0,2,0;MQ=40;PV4=1,1,0.36,1   PL:GT:GQ        31,0,66:0/1:34
+chr17  7089723 .       A       G       9.31    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=47 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr17  8731503 .       G       C       11.1    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=46 PL:GT:GQ        42,6,0:1/1:49
+chr17  9282935 .       T       C,G     24.5    .       DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=40        PL:GT:GQ        57,12,61,0,3,61:1/1:72
+chr17  17284831        .       T       C       29      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=25 PL:GT:GQ        61,9,0:1/1:63
+chr17  18439515        .       G       A       4.11    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=25 PL:GT:GQ        34,9,0:1/1:63
+chr17  18602146        .       C       T       4.76    .       DP=20;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,11;MQ=16 PL:GT:GQ        36,33,0:1/1:99
+chr17  19427888        .       C       T       57      .       DP=104;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=45,0,29,0;MQ=39;PV4=1,2.2e-12,1,1       PL:GT:GQ        87,0,131:0/1:90
+chr17  19604159        .       T       C       9.31    .       DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=45 PL:GT:GQ        40,6,0:1/1:49
+chr17  19610366        .       C       T       13      .       DP=13;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48        PL:GT:GQ        44,6,0:1/1:49
+chr17  20484706        .       C       G       51      .       DP=35;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=0,11,0,21;MQ=21;PV4=1,0.39,0.49,1     PL:GT:GQ        81,0,36:0/1:39
+chr17  20555720        .       A       G       26.3    .       DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=28 PL:GT:GQ        59,15,0:1/1:75
+chr17  24328984        .       A       C       15.4    .       DP=34;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=25        PL:GT:GQ        48,15,0:1/1:75
+chr17  26237090        .       G       A       41.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=44 PL:GT:GQ        73,6,0:1/1:49
+chr17  28394766        .       C       A       13.9    .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=31 PL:GT:GQ        45,6,0:1/1:49
+chr17  31218277        .       A       G       3.62    .       DP=38;AF1=0.5161;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,2;MQ=38;PV4=1,0.26,1,1  PL:GT:GQ        31,0,12:0/1:15
+chr17  31254021        .       C       T       15.1    .       DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=35        PL:GT:GQ        47,9,0:1/1:63
+chr17  32516798        .       G       A       37.8    .       DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ        69,6,0:1/1:49
+chr17  32600253        .       A       G       16.6    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=25 PL:GT:GQ        49,12,0:1/1:72
+chr17  34255214        .       G       C       19.2    .       DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=21 PL:GT:GQ        52,18,0:1/1:90
+chr17  34365900        .       T       C       93.1    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=38 PL:GT:GQ        126,18,0:1/1:90
+chr17  35380386        .       A       T       6.79    .       DP=44;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=46        PL:GT:GQ        37,6,0:1/1:49
+chr17  41993344        .       C       T       64      .       DP=41;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,41;MQ=16 PL:GT:GQ        97,123,0:1/1:99
+chr17  42128201        .       A       G       4.13    .       DP=5;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,2;MQ=52;PV4=1,0.0041,1,1 PL:GT:GQ        32,0,62:0/1:35
+chr17  42984490        .       C       A       56      .       DP=33;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=6,0,12,0;MQ=42;PV4=1,0.004,1,1        PL:GT:GQ        86,0,34:0/1:37
+chr17  43419457        .       G       A       99      .       DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,14;MQ=45 PL:GT:GQ        185,42,0:1/1:99
+chr17  43421225        .       A       G       65.1    .       DP=31;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,6,0,17;MQ=43;PV4=1,0.004,1,1       PL:GT:GQ        98,18,0:1/1:90
+chr17  45206897        .       G       A       22      .       DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=47 PL:GT:GQ        54,9,0:1/1:63
+chr17  45381302        .       T       C       18.6    .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=25 PL:GT:GQ        51,12,0:1/1:72
+chr17  45530812        .       C       A       3.54    .       DP=6;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=0,3,0,2;MQ=40;PV4=1,1,0.37,1   PL:GT:GQ        31,0,58:0/1:34
+chr17  50242633        .       G       A       44      .       DP=42;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,25,0,13;MQ=32;PV4=1,0.084,0.14,1       PL:GT:GQ        74,0,154:0/1:77
+chr17  51275317        .       G       A       14.9    .       DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=31        PL:GT:GQ        46,6,0:1/1:49
+chr17  52325530        .       C       T       29      .       DP=19;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,18;MQ=24 PL:GT:GQ        62,54,0:1/1:99
+chr17  52411748        .       T       G       18.6    .       DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=25 PL:GT:GQ        51,12,0:1/1:72
+chr17  53190746        .       C       G       62.1    .       DP=20;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=40        PL:GT:GQ        95,18,0:1/1:90
+chr17  58289916        .       T       C       18.2    .       DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=22 PL:GT:GQ        51,18,0:1/1:90
+chr17  59796875        .       C       T       42      .       DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=35 PL:GT:GQ        74,9,0:1/1:63
diff --git a/tests/tabix_data/vcf/README.txt b/tests/tabix_data/vcf/README.txt
new file mode 100644 (file)
index 0000000..d6d26ec
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,11 @@
+Edits that were necessary to parse these files:
+
+23.vcf: change
+##INFO=<ID=MQ0Fraction,Number=1,Type=Integer,Description="Fraction of Mapping Quality Zero Reads">
+to
+##INFO=<ID=MQ0Fraction,Number=1,Type=Float,Description="Fraction of Mapping Quality Zero Reads">
+
+similar changes in 16.vcf and 2.vcf
+
+13.vcf
+Flag should not have a value.
diff --git a/tests/tabix_data/vcf/issue85.vcf b/tests/tabix_data/vcf/issue85.vcf
new file mode 100644 (file)
index 0000000..31695cc
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,26 @@
+##fileformat=VCFv4.1
+##samtoolsVersion=0.1.18 (r982:295)
+##INFO=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Raw read depth">
+##INFO=<ID=DP4,Number=4,Type=Integer,Description="# high-quality ref-forward bases, ref-reverse, alt-forward and alt-reverse bases">
+##INFO=<ID=MQ,Number=1,Type=Integer,Description="Root-mean-square mapping quality of covering reads">
+##INFO=<ID=FQ,Number=1,Type=Float,Description="Phred probability of all samples being the same">
+##INFO=<ID=AF1,Number=1,Type=Float,Description="Max-likelihood estimate of the first ALT allele frequency (assuming HWE)">
+##INFO=<ID=AC1,Number=1,Type=Float,Description="Max-likelihood estimate of the first ALT allele count (no HWE assumption)">
+##INFO=<ID=G3,Number=3,Type=Float,Description="ML estimate of genotype frequencies">
+##INFO=<ID=HWE,Number=1,Type=Float,Description="Chi^2 based HWE test P-value based on G3">
+##INFO=<ID=CLR,Number=1,Type=Integer,Description="Log ratio of genotype likelihoods with and without the constraint">
+##INFO=<ID=UGT,Number=1,Type=String,Description="The most probable unconstrained genotype configuration in the trio">
+##INFO=<ID=CGT,Number=1,Type=String,Description="The most probable constrained genotype configuration in the trio">
+##INFO=<ID=PV4,Number=4,Type=Float,Description="P-values for strand bias, baseQ bias, mapQ bias and tail distance bias">
+##INFO=<ID=INDEL,Number=0,Type=Flag,Description="Indicates that the variant is an INDEL.">
+##INFO=<ID=PC2,Number=2,Type=Integer,Description="Phred probability of the nonRef allele frequency in group1 samples being larger (,smaller) than in group2.">
+##INFO=<ID=PCHI2,Number=1,Type=Float,Description="Posterior weighted chi^2 P-value for testing the association between group1 and group2 samples.">
+##INFO=<ID=QCHI2,Number=1,Type=Integer,Description="Phred scaled PCHI2.">
+##INFO=<ID=PR,Number=1,Type=Integer,Description="# permutations yielding a smaller PCHI2.">
+##INFO=<ID=VDB,Number=1,Type=Float,Description="Variant Distance Bias">
+##FORMAT=<ID=GT,Number=1,Type=String,Description="Genotype">
+##FORMAT=<ID=GQ,Number=1,Type=Integer,Description="Genotype Quality">
+##FORMAT=<ID=GL,Number=3,Type=Float,Description="Likelihoods for RR,RA,AA genotypes (R=ref,A=alt)">
+##FORMAT=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="# high-quality bases">
+##FORMAT=<ID=SP,Number=1,Type=Integer,Description="Phred-scaled strand bias P-value">
+##FORMAT=<ID=PL,Number=G,Type=Integer,Description="List of Phred-scaled genotype likelihoods">
diff --git a/tests/tabix_test.py b/tests/tabix_test.py
new file mode 100644 (file)
index 0000000..bc3c80a
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,1020 @@
+#!/usr/bin/env python
+'''unit testing code for pysam.
+
+Execute in the :file:`tests` directory as it requires the Makefile
+and data files located there.
+'''
+
+import sys
+import os
+import shutil
+import gzip
+import pysam
+import unittest
+import glob
+import re
+
+DATADIR = 'tabix_data'
+
+IS_PYTHON3 = sys.version_info[0] >= 3
+
+
+def myzip_open(infile, mode="r"):
+    '''open compressed file and decode.'''
+
+    def _convert(f):
+        for l in f:
+            yield l.decode("ascii")
+
+    if IS_PYTHON3:
+        if mode == "r":
+            return _convert(gzip.open(infile, "r"))
+    else:
+        return gzip.open(mode)
+
+
+def loadAndConvert(infile, encode=True):
+    '''load data from infile and convert all fields to string.
+
+    Infile can be either plain or compressed (ending in .gz).
+    '''
+    data = []
+    if infile.endswith(".gz"):
+        for line in gzip.open(infile):
+            line = line.decode("ascii")
+            if line.startswith("#"):
+                continue
+            d = line.strip().split("\t")
+            data.append(d)
+    else:
+        with open(infile) as f:
+            for line in f:
+                if line.startswith("#"):
+                    continue
+                d = line.strip().split("\t")
+                data.append(d)
+
+    return data
+
+
+def splitToBytes(s):
+    '''split string and return list of bytes.'''
+    return [x.encode("ascii") for x in s.split("\t")]
+
+
+def checkBinaryEqual(filename1, filename2):
+    '''return true if the two files are binary equal.'''
+    if os.path.getsize(filename1) != os.path.getsize(filename2):
+        return False
+
+    infile1 = open(filename1, "rb")
+    infile2 = open(filename2, "rb")
+
+    d1, d2 = infile1.read(), infile2.read()
+    found = False
+    for c1, c2 in zip(d1, d2):
+        if c1 != c2:
+            break
+    else:
+        found = True
+
+    infile1.close()
+    infile2.close()
+    return found
+
+
+class TestIndexing(unittest.TestCase):
+    filename = os.path.join(DATADIR, "example.gtf.gz")
+    filename_idx = os.path.join(DATADIR, "example.gtf.gz.tbi")
+
+    def setUp(self):
+
+        self.tmpfilename = "tmp_%i.gtf.gz" % id(self)
+        shutil.copyfile(self.filename, self.tmpfilename)
+
+    def testIndexPreset(self):
+        '''test indexing via preset.'''
+
+        pysam.tabix_index(self.tmpfilename, preset="gff")
+        checkBinaryEqual(self.tmpfilename + ".tbi", self.filename_idx)
+
+    def tearDown(self):
+        os.unlink(self.tmpfilename)
+        os.unlink(self.tmpfilename + ".tbi")
+
+
+class TestCompression(unittest.TestCase):
+    filename = os.path.join(DATADIR, "example.gtf.gz")
+    filename_idx = os.path.join(DATADIR, "example.gtf.gz.tbi")
+    preset = "gff"
+
+    def setUp(self):
+
+        self.tmpfilename = "tmp_%i" % id(self)
+        infile = gzip.open(self.filename, "rb")
+        outfile = open(self.tmpfilename, "wb")
+        outfile.write(infile.read())
+        outfile.close()
+        infile.close()
+
+    def testCompression(self):
+        '''see also issue 106'''
+        pysam.tabix_compress(self.tmpfilename, self.tmpfilename + ".gz")
+        checkBinaryEqual(self.tmpfilename, self.tmpfilename + ".gz")
+
+    def testIndexPresetUncompressed(self):
+        '''test indexing via preset.'''
+
+        pysam.tabix_index(self.tmpfilename, preset=self.preset)
+        # check if uncompressed file has been removed
+        self.assertEqual(os.path.exists(self.tmpfilename), False)
+        checkBinaryEqual(self.tmpfilename + ".gz", self.filename)
+        checkBinaryEqual(self.tmpfilename + ".gz.tbi", self.filename_idx)
+
+    def testIndexPresetCompressed(self):
+        '''test indexing via preset.'''
+
+        pysam.tabix_compress(self.tmpfilename, self.tmpfilename + ".gz")
+        pysam.tabix_index(self.tmpfilename + ".gz", preset=self.preset)
+        checkBinaryEqual(self.tmpfilename + ".gz", self.filename)
+        checkBinaryEqual(self.tmpfilename + ".gz.tbi", self.filename_idx)
+
+    def tearDown(self):
+
+        try:
+            os.unlink(self.tmpfilename)
+            os.unlink(self.tmpfilename + ".gz")
+            os.unlink(self.tmpfilename + ".gz.tbi")
+        except OSError:
+            pass
+
+
+class TestCompressionSam(TestCompression):
+    filename = os.path.join(DATADIR, "example.sam.gz")
+    filename_index = os.path.join(DATADIR, "example.sam.gz.tbi")
+    preset = "sam"
+
+
+class TestCompressionBed(TestCompression):
+    filename = os.path.join(DATADIR, "example.bed.gz")
+    filename_index = os.path.join(DATADIR, "example.bed.gz.tbi")
+    preset = "bed"
+
+
+class TestCompressionVCF(TestCompression):
+    filename = os.path.join(DATADIR, "example.vcf.gz")
+    filename_index = os.path.join(DATADIR, "example.vcf.gz.tbi")
+    preset = "vcf"
+
+
+class IterationTest(unittest.TestCase):
+
+    with_comments = False
+
+    def setUp(self):
+
+        lines = []
+        inf = gzip.open(self.filename, "rb")
+        for line in inf:
+            line = line.decode('ascii')
+            if line.startswith("#"):
+                if not self.with_comments:
+                    continue
+            lines.append(line)
+        inf.close()
+
+        # creates index of contig, start, end, adds content without newline.
+        self.compare = [
+            (x[0][0], int(x[0][3]), int(x[0][4]), x[1])
+            for x in [(y.split("\t"), y[:-1]) for y in lines
+                      if not y.startswith("#")]]
+
+        self.comments = [x[:-1] for x in lines if x.startswith("#")]
+
+    def getSubset(self, contig=None, start=None, end=None):
+
+        if contig is None:
+            # all lines
+            subset = [x[3] for x in self.compare]
+        else:
+            if start is not None and end is None:
+                # until end of contig
+                subset = [x[3]
+                          for x in self.compare if x[0] == contig
+                          and x[2] > start]
+            elif start is None and end is not None:
+                # from start of contig
+                subset = [x[3]
+                          for x in self.compare if x[0] == contig
+                          and x[1] <= end]
+            elif start is None and end is None:
+                subset = [x[3] for x in self.compare if x[0] == contig]
+            else:
+                # all within interval
+                subset = [x[3] for x in self.compare if x[0] == contig
+                          and min(x[2], end) - max(x[1], start) > 0]
+
+        if self.with_comments:
+            subset.extend(self.comments)
+
+        return subset
+
+    def checkPairwise(self, result, ref):
+        '''check pairwise results.
+        '''
+        result.sort()
+        ref.sort()
+        a = set(result)
+        b = set(ref)
+
+        self.assertEqual(
+            len(result), len(ref),
+            "unexpected number of results: "
+            "result=%i, expected ref=%i, differences are %s: %s"
+            % (len(result), len(ref),
+               a.difference(b),
+               b.difference(a)))
+
+        for x, d in enumerate(list(zip(result, ref))):
+            self.assertEqual(
+                d[0], d[1],
+                "unexpected results in pair %i:\n'%s', expected\n'%s'" %
+                (x, d[0], d[1]))
+
+
+class TestGZFile(IterationTest):
+
+    filename = os.path.join(DATADIR, "example.gtf.gz")
+    with_comments = True
+
+    def setUp(self):
+
+        IterationTest.setUp(self)
+
+        self.iter = pysam.GZIterator(self.filename)
+
+    def testAll(self):
+        result = list(self.iter)
+        ref = self.getSubset()
+        self.checkPairwise(result, ref)
+
+
+class TestIterationWithoutComments(IterationTest):
+    '''test iterating with TabixFile.fetch() when
+    there are no comments in the file.'''
+
+    filename = os.path.join(DATADIR,
+                            "example.gtf.gz")
+
+    def setUp(self):
+        IterationTest.setUp(self)
+        self.tabix = pysam.TabixFile(self.filename)
+
+    def testRegionStrings(self):
+        """test if access with various region strings
+        works"""
+
+        self.assertEqual(218, len(list(
+            self.tabix.fetch("chr1"))))
+        self.assertEqual(218, len(list(
+            self.tabix.fetch("chr1", 1000))))
+        self.assertEqual(218, len(list(
+            self.tabix.fetch("chr1", end=1000000))))
+        self.assertEqual(218, len(list(
+            self.tabix.fetch("chr1", 1000, 1000000))))
+
+    def testAll(self):
+        result = list(self.tabix.fetch())
+        ref = self.getSubset()
+        self.checkPairwise(result, ref)
+
+    def testPerContig(self):
+        for contig in ("chr1", "chr2", "chr1", "chr2"):
+            result = list(self.tabix.fetch(contig))
+            ref = self.getSubset(contig)
+            self.checkPairwise(result, ref)
+
+    def testPerContigToEnd(self):
+
+        end = None
+        for contig in ("chr1", "chr2", "chr1", "chr2"):
+            for start in range(0, 200000, 1000):
+                result = list(self.tabix.fetch(contig, start, end))
+                ref = self.getSubset(contig, start, end)
+                self.checkPairwise(result, ref)
+
+    def testPerContigFromStart(self):
+
+        start = None
+        for contig in ("chr1", "chr2", "chr1", "chr2"):
+            for end in range(0, 200000, 1000):
+                result = list(self.tabix.fetch(contig, start, end))
+                ref = self.getSubset(contig, start, end)
+                self.checkPairwise(result, ref)
+
+    def testPerContig2(self):
+
+        start, end = None, None
+        for contig in ("chr1", "chr2", "chr1", "chr2"):
+            result = list(self.tabix.fetch(contig, start, end))
+            ref = self.getSubset(contig, start, end)
+            self.checkPairwise(result, ref)
+
+    def testPerInterval(self):
+
+        start, end = None, None
+        for contig in ("chr1", "chr2", "chr1", "chr2"):
+            for start in range(0, 200000, 2000):
+                for end in range(start, start + 2000, 500):
+                    result = list(self.tabix.fetch(contig, start, end))
+                    ref = self.getSubset(contig, start, end)
+                    self.checkPairwise(result, ref)
+
+    def testInvalidIntervals(self):
+
+        # invalid intervals (start > end)
+        self.assertRaises(ValueError, self.tabix.fetch, "chr1", 0, -10)
+        self.assertRaises(ValueError, self.tabix.fetch, "chr1", 200, 0)
+
+        # out of range intervals
+        self.assertRaises(ValueError, self.tabix.fetch, "chr1", -10, 200)
+        self.assertRaises(ValueError, self.tabix.fetch, "chr1", -10, -20)
+
+        # unknown chromosome
+        self.assertRaises(ValueError, self.tabix.fetch, "chrUn")
+
+        # out of range access
+        # to be implemented
+        # self.assertRaises(IndexError, self.tabix.fetch, "chr1", 1000000, 2000000)
+
+        # raise no error for invalid intervals
+        self.tabix.fetch("chr1", 100, 100)
+
+
+    def testGetContigs(self):
+        self.assertEqual(sorted(self.tabix.contigs), [b"chr1", b"chr2"])
+        # check that contigs is read-only
+        self.assertRaises(
+            AttributeError, setattr, self.tabix, "contigs", ["chr1", "chr2"])
+
+    def testHeader(self):
+        ref = []
+        inf = gzip.open(self.filename)
+        for x in inf:
+            x = x.decode("ascii")
+            if not x.startswith("#"):
+                break
+            ref.append(x[:-1].encode('ascii'))
+        inf.close()
+
+        header = list(self.tabix.header)
+        self.assertEqual(ref, header)
+
+    def testReopening(self):
+        '''test repeated opening of the same file.'''
+        def func1():
+            # opens any tabix file
+            inf = pysam.TabixFile(self.filename)
+            return
+
+        for i in range(10000):
+            func1()
+
+
+class TestIterationWithComments(TestIterationWithoutComments):
+    '''test iterating with TabixFile.fetch() when
+    there are comments in the file.
+
+    Tests will create plenty of warnings on stderr.
+    '''
+
+    filename = os.path.join(DATADIR, "example_comments.gtf.gz")
+
+    def setUp(self):
+        TestIterationWithoutComments.setUp(self)
+
+
+class TestParser(unittest.TestCase):
+
+    filename = os.path.join(DATADIR, "example.gtf.gz")
+
+    def setUp(self):
+
+        self.tabix = pysam.TabixFile(self.filename)
+        self.compare = loadAndConvert(self.filename)
+
+    def testRead(self):
+
+        for x, r in enumerate(self.tabix.fetch(parser=pysam.asTuple())):
+            self.assertEqual(self.compare[x], list(r))
+            self.assertEqual(len(self.compare[x]), len(r))
+
+            # test indexing
+            for c in range(0, len(r)):
+                self.assertEqual(self.compare[x][c], r[c])
+
+            # test slicing access
+            for c in range(0, len(r) - 1):
+                for cc in range(c + 1, len(r)):
+                    self.assertEqual(self.compare[x][c:cc],
+                                     r[c:cc])
+
+    def testWrite(self):
+
+        for x, r in enumerate(self.tabix.fetch(parser=pysam.asTuple())):
+            self.assertEqual(self.compare[x], list(r))
+            c = list(r)
+            for y in range(len(r)):
+                r[y] = "test_%05i" % y
+                c[y] = "test_%05i" % y
+            self.assertEqual([x for x in c], list(r))
+            self.assertEqual("\t".join(c), str(r))
+            # check second assignment
+            for y in range(len(r)):
+                r[y] = "test_%05i" % y
+            self.assertEqual([x for x in c], list(r))
+            self.assertEqual("\t".join(c), str(r))
+
+    def testUnset(self):
+        for x, r in enumerate(self.tabix.fetch(parser=pysam.asTuple())):
+            self.assertEqual(self.compare[x], list(r))
+            c = list(r)
+            e = list(r)
+            for y in range(len(r)):
+                r[y] = None
+                c[y] = None
+                e[y] = ""
+                self.assertEqual(c, list(r))
+                self.assertEqual("\t".join(e), str(r))
+
+    def testIteratorCompressed(self):
+        '''test iteration from compressed file.'''
+        with gzip.open(self.filename) as infile:
+            for x, r in enumerate(pysam.tabix_iterator(
+                    infile, pysam.asTuple())):
+                self.assertEqual(self.compare[x], list(r))
+                self.assertEqual(len(self.compare[x]), len(r))
+
+                # test indexing
+                for c in range(0, len(r)):
+                    self.assertEqual(self.compare[x][c], r[c])
+
+                # test slicing access
+                for c in range(0, len(r) - 1):
+                    for cc in range(c + 1, len(r)):
+                        self.assertEqual(self.compare[x][c:cc],
+                                         r[c:cc])
+
+    def testIteratorUncompressed(self):
+        '''test iteration from uncompressed file.'''
+        tmpfilename = 'tmp_testIteratorUncompressed'
+        infile = gzip.open(self.filename, "rb")
+        outfile = open(tmpfilename, "wb")
+        outfile.write(infile.read())
+        outfile.close()
+        infile.close()
+
+        with open(tmpfilename) as infile:
+            for x, r in enumerate(pysam.tabix_iterator(
+                    infile, pysam.asTuple())):
+                self.assertEqual(self.compare[x], list(r))
+                self.assertEqual(len(self.compare[x]), len(r))
+
+                # test indexing
+                for c in range(0, len(r)):
+                    self.assertEqual(self.compare[x][c], r[c])
+
+                # test slicing access
+                for c in range(0, len(r) - 1):
+                    for cc in range(c + 1, len(r)):
+                        self.assertEqual(self.compare[x][c:cc],
+                                         r[c:cc])
+
+        os.unlink(tmpfilename)
+
+
+class TestIterators(unittest.TestCase):
+
+    filename = os.path.join(DATADIR, "example.gtf.gz")
+
+    iterator = pysam.tabix_generic_iterator
+    parser = pysam.asTuple
+    is_compressed = False
+
+    def setUp(self):
+
+        self.tabix = pysam.TabixFile(self.filename)
+        self.compare = loadAndConvert(self.filename)
+        self.tmpfilename_uncompressed = 'tmp_TestIterators'
+        infile = gzip.open(self.filename, "rb")
+        outfile = open(self.tmpfilename_uncompressed, "wb")
+        outfile.write(infile.read())
+        outfile.close()
+        infile.close()
+
+    def open(self):
+
+        if self.is_compressed:
+            infile = gzip.open(self.filename)
+        else:
+            infile = open(self.tmpfilename_uncompressed)
+        return infile
+
+    def testIteration(self):
+
+        infile = self.open()
+
+        for x, r in enumerate(self.iterator(infile, self.parser())):
+            self.assertEqual(self.compare[x], list(r))
+            self.assertEqual(len(self.compare[x]), len(r))
+
+            # test indexing
+            for c in range(0, len(r)):
+                self.assertEqual(self.compare[x][c], r[c])
+
+            # test slicing access
+            for c in range(0, len(r) - 1):
+                for cc in range(c + 1, len(r)):
+                    self.assertEqual(self.compare[x][c:cc],
+                                     r[c:cc])
+
+    def testClosedFile(self):
+        '''test for error when iterating from closed file.'''
+        infile = self.open()
+        infile.close()
+
+        # iterating from a closed file should raise a value error
+        self.assertRaises(ValueError, self.iterator, infile, self.parser())
+
+    def testClosedFileIteration(self):
+        '''test for error when iterating from file that has been closed'''
+
+        infile = self.open()
+
+        i = self.iterator(infile, self.parser())
+        x = i.next()
+        infile.close()
+        # Not implemented
+        # self.assertRaises(ValueError, i.next)
+
+    def tearUp(self):
+        os.unlink(self.tmpfilename_uncompressed)
+
+
+class TestIteratorsGenericCompressed(TestIterators):
+    is_compressed = True
+
+
+class TestIteratorsFileCompressed(TestIterators):
+    iterator = pysam.tabix_file_iterator
+    is_compressed = True
+
+
+class TestIteratorsFileUncompressed(TestIterators):
+    iterator = pysam.tabix_file_iterator
+    is_compressed = False
+
+
+class TestGTF(TestParser):
+
+    def testRead(self):
+
+        for x, r in enumerate(self.tabix.fetch(parser=pysam.asGTF())):
+            c = self.compare[x]
+            self.assertEqual(len(c), len(r))
+            self.assertEqual(list(c), list(r))
+            self.assertEqual(c, str(r).split("\t"))
+            self.assertTrue(r.gene_id.startswith("ENSG"))
+            if r.feature != 'gene':
+                self.assertTrue(r.transcript_id.startswith("ENST"))
+            self.assertEqual(c[0], r.contig)
+
+
+class TestIterationMalformattedGTFFiles(unittest.TestCase):
+    '''test reading from malformatted gtf files.'''
+
+    parser = pysam.asGTF
+    iterator = pysam.tabix_generic_iterator
+    parser = pysam.asGTF
+
+    def testGTFTooManyFields(self):
+
+        iterator = self.iterator(
+            gzip.open(os.path.join(DATADIR,
+                                   "gtf_toomany_fields.gtf.gz")),
+            parser=self.parser())
+        self.assertRaises(ValueError, iterator.next)
+
+    def testGTFTooFewFields(self):
+
+        iterator = self.iterator(
+            gzip.open(os.path.join(DATADIR,
+                                   "gtf_toofew_fields.gtf.gz")),
+            parser=self.parser())
+        self.assertRaises(ValueError, iterator.next)
+
+
+class TestBed(unittest.TestCase):
+    filename = os.path.join(DATADIR, "example.bed.gz")
+
+    def setUp(self):
+
+        self.tabix = pysam.TabixFile(self.filename)
+        self.compare = loadAndConvert(self.filename)
+
+    def testRead(self):
+
+        for x, r in enumerate(self.tabix.fetch(parser=pysam.asBed())):
+            c = self.compare[x]
+            self.assertEqual(len(c), len(r))
+            self.assertEqual(c, str(r).split("\t"))
+            self.assertEqual(c[0], r.contig)
+            self.assertEqual(int(c[1]), r.start)
+            self.assertEqual(int(c[2]), r.end)
+            self.assertEqual(list(c), list(r))
+
+    def testWrite(self):
+
+        for x, r in enumerate(self.tabix.fetch(parser=pysam.asBed())):
+            c = self.compare[x]
+            self.assertEqual(c, str(r).split("\t"))
+            self.assertEqual(list(c), list(r))
+
+            r.contig = "test"
+            self.assertEqual("test", r.contig)
+            self.assertEqual("test", r[0])
+
+            r.start += 1
+            self.assertEqual(int(c[1]) + 1, r.start)
+            self.assertEqual(str(int(c[1]) + 1), r[1])
+
+            r.end += 1
+            self.assertEqual(int(c[2]) + 1, r.end)
+            self.assertEqual(str(int(c[2]) + 1), r[2])
+
+
+class TestVCF(unittest.TestCase):
+
+    filename = os.path.join(DATADIR, "example.vcf40")
+
+    def setUp(self):
+        self.tmpfilename = "tmp_%s.vcf" % id(self)
+        shutil.copyfile(self.filename, self.tmpfilename)
+        pysam.tabix_index(self.tmpfilename, preset="vcf")
+
+    def tearDown(self):
+        os.unlink(self.tmpfilename + ".gz")
+        if os.path.exists(self.tmpfilename + ".gz.tbi"):
+            os.unlink(self.tmpfilename + ".gz.tbi")
+
+
+if IS_PYTHON3:
+    class TestUnicode(unittest.TestCase):
+        '''test reading from a file with non-ascii characters.'''
+
+        filename = os.path.join(DATADIR, "example_unicode.vcf")
+
+        def setUp(self):
+            self.tmpfilename = "tmp_%s.vcf" % id(self)
+            shutil.copyfile(self.filename, self.tmpfilename)
+            pysam.tabix_index(self.tmpfilename, preset="vcf")
+
+        def testFromTabix(self):
+
+            # use ascii encoding - should raise error
+            t = pysam.TabixFile(self.tmpfilename + ".gz", encoding="ascii")
+            results = list(t.fetch(parser=pysam.asVCF()))
+            self.assertRaises(UnicodeDecodeError, getattr, results[1], "id")
+
+            t = pysam.TabixFile(self.tmpfilename + ".gz", encoding="utf-8")
+            results = list(t.fetch(parser=pysam.asVCF()))
+            self.assertEqual(getattr(results[1], "id"), u"Rene\xe9")
+
+        def testFromVCF(self):
+            self.vcf = pysam.VCF()
+            self.assertRaises(
+                UnicodeDecodeError,
+                self.vcf.connect, self.tmpfilename + ".gz", "ascii")
+            self.vcf.connect(self.tmpfilename + ".gz", encoding="utf-8")
+            v = self.vcf.getsamples()[0]
+
+
+class TestVCFFromTabix(TestVCF):
+
+    columns = ("contig", "pos", "id",
+               "ref", "alt", "qual",
+               "filter", "info", "format")
+
+    def setUp(self):
+
+        TestVCF.setUp(self)
+
+        self.tabix = pysam.TabixFile(self.tmpfilename + ".gz")
+        self.compare = loadAndConvert(self.filename)
+
+    def testRead(self):
+
+        ncolumns = len(self.columns)
+
+        for x, r in enumerate(self.tabix.fetch(parser=pysam.asVCF())):
+            c = self.compare[x]
+            for y, field in enumerate(self.columns):
+                # it is ok to have a missing format column
+                if y == 8 and y == len(c):
+                    continue
+                if field == "pos":
+                    self.assertEqual(int(c[y]) - 1, getattr(r, field))
+                    self.assertEqual(int(c[y]) - 1, r.pos)
+                else:
+                    self.assertEqual(c[y], getattr(r, field),
+                                     "mismatch in field %s: %s != %s" %
+                                     (field, c[y], getattr(r, field)))
+            if len(c) == 8:
+                self.assertEqual(0, len(r))
+            else:
+                self.assertEqual(len(c), len(r) + ncolumns)
+
+            for y in range(len(c) - ncolumns):
+                self.assertEqual(c[ncolumns + y], r[y])
+
+    def testWrite(self):
+
+        ncolumns = len(self.columns)
+
+        for x, r in enumerate(self.tabix.fetch(parser=pysam.asVCF())):
+            c = self.compare[x]
+            # check unmodified string
+            cmp_string = str(r)
+            ref_string = "\t".join([x for x in c])
+
+            self.assertEqual(ref_string, cmp_string)
+
+            # set fields and compare field-wise
+            for y, field in enumerate(self.columns):
+                # it is ok to have a missing format column
+                if y == 8 and y == len(c):
+                    continue
+                if field == "pos":
+                    rpos = getattr(r, field)
+                    self.assertEqual(int(c[y]) - 1, rpos)
+                    self.assertEqual(int(c[y]) - 1, r.pos)
+                    # increment pos by 1
+                    setattr(r, field, rpos + 1)
+                    self.assertEqual(getattr(r, field), rpos + 1)
+                    c[y] = str(int(c[y]) + 1)
+                else:
+                    setattr(r, field, "test_%i" % y)
+                    c[y] = "test_%i" % y
+                    self.assertEqual(c[y], getattr(r, field),
+                                     "mismatch in field %s: %s != %s" %
+                                     (field, c[y], getattr(r, field)))
+
+            if len(c) == 8:
+                self.assertEqual(0, len(r))
+            else:
+                self.assertEqual(len(c), len(r) + ncolumns)
+
+            for y in range(len(c) - ncolumns):
+                c[ncolumns + y] = "test_%i" % y
+                r[y] = "test_%i" % y
+                self.assertEqual(c[ncolumns + y], r[y])
+
+
+class TestVCFFromVCF(TestVCF):
+
+    columns = ("chrom", "pos", "id",
+               "ref", "alt", "qual",
+               "filter", "info", "format")
+
+    # tests failing while parsing
+    fail_on_parsing = (
+        (5, "Flag fields should not have a value"),
+        (9, "aouao"),
+        (13, "aoeu"),
+        (18, "Error BAD_NUMBER_OF_PARAMETERS"),
+        (24, "Error HEADING_NOT_SEPARATED_BY_TABS"))
+
+    # tests failing on opening
+    fail_on_opening = ((24, "Error HEADING_NOT_SEPARATED_BY_TABS"),
+                       )
+
+    def setUp(self):
+
+        TestVCF.setUp(self)
+
+        self.vcf = pysam.VCF()
+        self.compare = loadAndConvert(self.filename, encode=False)
+
+    def testConnecting(self):
+
+        fn = os.path.basename(self.filename)
+        for x, msg in self.fail_on_opening:
+            if "%i.vcf" % x == fn:
+                self.assertRaises(ValueError,
+                                  self.vcf.connect,
+                                  self.tmpfilename + ".gz")
+            else:
+                self.vcf.connect(self.tmpfilename + ".gz")
+
+    def testParsing(self):
+
+        fn = os.path.basename(self.filename)
+        with open(self.filename) as f:
+
+            for x, msg in self.fail_on_opening:
+                if "%i.vcf" % x == fn:
+                    self.assertRaises(ValueError, self.vcf.parse, f)
+                    return
+            else:
+                iter = self.vcf.parse(f)
+
+            for x, msg in self.fail_on_parsing:
+                if "%i.vcf" % x == fn:
+                    self.assertRaises(ValueError, list, iter)
+                    break
+                    # python 2.7
+                    # self.assertRaisesRegexp(
+                    # ValueError, re.compile(msg), self.vcf.parse, f)
+            else:
+                # do the actual parsing
+                for x, r in enumerate(iter):
+                    c = self.compare[x]
+                    for y, field in enumerate(self.columns):
+                        # it is ok to have a missing format column
+                        if y == 8 and y == len(c):
+                            continue
+
+                        val = r[field]
+                        if field == "pos":
+                            self.assertEqual(int(c[y]) - 1, val)
+                        elif field == "alt":
+                            if c[y] == ".":
+                                # convert . to empty list
+                                self.assertEqual(
+                                    [], val,
+                                    "mismatch in field %s: expected %s, got %s" %
+                                    (field, c[y], val))
+                            else:
+                                # convert to list
+                                self.assertEqual(
+                                    c[y].split(","), val,
+                                    "mismatch in field %s: expected %s, got %s" %
+                                    (field, c[y], val))
+                                
+                        elif field == "filter":
+                            if c[y] == "PASS" or c[y] == ".":
+                                # convert PASS to empty list
+                                self.assertEqual(
+                                    [], val,
+                                    "mismatch in field %s: expected %s, got %s" %
+                                    (field, c[y], val))
+                            else:
+                                # convert to list
+                                self.assertEqual(
+                                    c[y].split(";"), val,
+                                    "mismatch in field %s: expected %s, got %s" %
+                                    (field, c[y], val))
+
+                        elif field == "info":
+                            # tests for info field not implemented
+                            pass
+                        elif field == "qual" and c[y] == ".":
+                            self.assertEqual(
+                                -1, val,
+                                "mismatch in field %s: expected %s, got %s" %
+                                (field, c[y], val))
+
+                        elif field == "format":
+                            # format field converted to list
+                            self.assertEqual(
+                                c[y].split(":"), val,
+                                "mismatch in field %s: expected %s, got %s" %
+                                (field, c[y], val))
+
+                        elif type(val) in (int, float):
+                            if c[y] == ".":
+                                self.assertEqual(
+                                    None, val,
+                                    "mismatch in field %s: expected %s, got %s" %
+                                    (field, c[y], val))
+                            else:
+                                self.assertEqual(
+                                    float(c[y]), float(val),
+                                    "mismatch in field %s: expected %s, got %s" %
+                                    (field, c[y], val))
+                        else:
+                            self.assertEqual(
+                                c[y], val,
+                                "mismatch in field %s: expected %s, got %s" %
+                                (field, c[y], val))
+
+############################################################################
+# create a test class for each example vcf file.
+# Two samples are created -
+# 1. Testing pysam/tabix access
+# 2. Testing the VCF class
+vcf_files = glob.glob(os.path.join(DATADIR, "vcf", "*.vcf"))
+
+for vcf_file in vcf_files:
+    n = "VCFFromTabixTest_%s" % os.path.basename(vcf_file[:-4])
+    globals()[n] = type(n, (TestVCFFromTabix,), dict(filename=vcf_file,))
+    n = "VCFFromVCFTest_%s" % os.path.basename(vcf_file[:-4])
+    globals()[n] = type(n, (TestVCFFromVCF,), dict(filename=vcf_file,))
+
+############################################################################
+
+
+class TestRemoteFileHTTP(unittest.TestCase):
+
+    url = "http://genserv.anat.ox.ac.uk/downloads/pysam/test/example_htslib.gtf.gz"
+    region = "chr1:1-1000"
+    local = os.path.join(DATADIR, "example.gtf.gz")
+
+    def testFetchAll(self):
+        remote_file = pysam.TabixFile(self.url, "r")
+        remote_result = list(remote_file.fetch())
+        local_file = pysam.TabixFile(self.local, "r")
+        local_result = list(local_file.fetch())
+
+        self.assertEqual(len(remote_result), len(local_result))
+        for x, y in zip(remote_result, local_result):
+            self.assertEqual(x, y)
+
+
+class TestIndexArgument(unittest.TestCase):
+
+    filename_src = os.path.join(DATADIR, "example.vcf.gz")
+    filename_dst = "tmp_example.vcf.gz"
+    index_src = os.path.join(DATADIR, "example.vcf.gz.tbi")
+    index_dst = "tmp_index_example.vcf.gz.tbi"
+    preset = "vcf"
+
+    def testFetchAll(self):
+        shutil.copyfile(self.filename_src, self.filename_dst)
+        shutil.copyfile(self.index_src, self.index_dst)
+        same_basename_file = pysam.TabixFile(
+            self.filename_src, "r", index=self.index_src)
+        same_basename_results = list(same_basename_file.fetch())
+        diff_index_file = pysam.TabixFile(
+            self.filename_dst, "r", index=self.index_dst)
+        diff_index_result = list(diff_index_file.fetch())
+
+        self.assertEqual(len(same_basename_results), len(diff_index_result))
+        for x, y in zip(same_basename_results, diff_index_result):
+            self.assertEqual(x, y)
+
+
+def _TestMultipleIteratorsHelper(filename, multiple_iterators):
+    '''open file within scope, return iterator.'''
+
+    tabix = pysam.TabixFile(filename)
+    iterator = tabix.fetch(parser=pysam.asGTF(),
+                           multiple_iterators=multiple_iterators)
+    tabix.close()
+    return iterator
+
+
+class TestMultipleIterators(unittest.TestCase):
+
+    filename = os.path.join(DATADIR, "example.gtf.gz")
+
+    def testJoinedIterators(self):
+
+        # two iterators working on the same file
+        tabix = pysam.TabixFile(self.filename)
+        a = tabix.fetch(parser=pysam.asGTF()).next()
+        b = tabix.fetch(parser=pysam.asGTF()).next()
+        # the first two lines differ only by the feature field
+        self.assertEqual(a.feature, "UTR")
+        self.assertEqual(b.feature, "exon")
+        self.assertEqual(re.sub("UTR", "", str(a)),
+                         re.sub("exon", "", str(b)))
+
+    def testDisjointIterators(self):
+        # two iterators working on the same file
+        tabix = pysam.TabixFile(self.filename)
+        a = tabix.fetch(parser=pysam.asGTF(), multiple_iterators=True).next()
+        b = tabix.fetch(parser=pysam.asGTF(), multiple_iterators=True).next()
+        # both iterators are at top of file
+        self.assertEqual(str(a), str(b))
+
+    def testScope(self):
+        # technically it does not really test if the scope is correct
+        i = _TestMultipleIteratorsHelper(self.filename,
+                                         multiple_iterators=True)
+        self.assertTrue(i.next())
+        i = _TestMultipleIteratorsHelper(self.filename,
+                                         multiple_iterators=False)
+        self.assertRaises(IOError, i.next)
+
+    def testDoubleFetch(self):
+
+        f = pysam.TabixFile(self.filename)
+
+        for a, b in zip(f.fetch(multiple_iterators=True),
+                        f.fetch(multiple_iterators=True)):
+            self.assertEqual(str(a), str(b))
+
+
+if __name__ == "__main__":
+    unittest.main()